INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 881627 G/A 1 39 38 77 17.3422096995216 21.1024623440558 -3.76025264453419 A:G G A 10 0.555327956422522 0.422801222485516 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 949570 G/A 1 1537 1534 3071 683.460930978584 851.873085152149 -168.412154173565 A:C:G G A 10 0.555327956422522 1.14108697516383e-09 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 985305 G/A 1 67 68 135 29.793026919691 37.7623010367315 -7.96927411704047 A:G G A 10 0.555327956422522 0.193748872995916 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_985283_985417:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_985283_985417:AGRN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 1231656 G/A 1 8 13 21 3.55737634861982 7.21926343349279 -3.66188708487296 A:G G A 10 0.555327956422522 0.126067912845854 ENSG00000131584:ENST00000354700:exon_1231591_1231660:ACAP3;ENSG00000131584:ENST00000353662:exon_1231591_1231660:ACAP3;ENSG00000131584:ENST00000492936:exon_1231591_1231660:ACAP3;ENSG00000131584:ENST00000467278:exon_1231591_1231660:ACAP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 63 47 110 28.0143387453811 26.1004139518585 1.91392479352259 C:G C G 10 0.555327956422522 0.773721185521241 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 1262966 C/T 1 12 19 31 5.33606452292974 10.5512311720279 -5.21516664909818 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0705072935874214 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 1263144 G/A 1 15 12 27 6.67008065366217 6.66393547707026 0.0061451765919065 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 1342612 G/C 1 182 222 404 80.930311931101 123.2828063258 -42.3524943946989 C:G G C 10 0.555327956422522 2.48623341782827e-05 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 1421531 C/A 1 11 6 17 4.89139247935226 3.33196773853513 1.55942474081713 A:C C A 10 0.555327956422522 0.477388500584111 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 11 15 26 4.89139247935226 8.32991934633783 -3.43852686698557 T:C T C 10 0.555327956422522 0.235826270274551 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 1430985 C/T 1 31 19 50 13.7848333509018 10.5512311720279 3.2336021788739 T:C C T 10 0.555327956422522 0.395239520040955 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 1558792 T/C 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1558769_1558862:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000512004:exon_1558502_1558862:MIB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 8 11 19 3.55737634861982 6.10860752064774 -2.55123117202792 T:C C T 10 0.555327956422522 0.2564170773856 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 2340200 T/C 1 14 15 29 6.22540861008469 8.32991934633783 -2.10451073625314 T:C T C 10 0.555327956422522 0.459182512082066 ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000510434:exon_2339895_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000508384:exon_2339969_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000515760:exon_2340022_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000502666:exon_2340043_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000504111:exon_2340074_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000514502:exon_2340194_2340297:PEX10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 2441358 T/C 1 11 10 21 4.89139247935226 5.55327956422522 -0.661887084872961 T:C T C 10 0.555327956422522 0.828131296920228 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2441232_2441369:PANK4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 2452569 T/C 1 13 14 27 5.78073656650721 7.77459138991531 -1.99385482340809 T:C T C 10 0.555327956422522 0.446307655179609 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000486396:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502770:exon_2452540_2453380:PANK4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 3638674 C/T 1 7 10 17 3.11270430504235 5.55327956422522 -2.44057525918287 T:C C T 10 0.555327956422522 0.329183052237539 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3638585_3638771:TP73 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 3644715 C/T 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:C C T 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3644693_3644781:TP73 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 3644754 T/C 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 T:C T C 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3644693_3644781:TP73 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 3649403 G/A 1 12 7 19 5.33606452292974 3.88729569495765 1.44876882797208 A:G G A 10 0.555327956422522 0.645874384560469 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3649311_3649856:TP73 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 3649562 G/A 1 8 11 19 3.55737634861982 6.10860752064774 -2.55123117202792 A:G G A 10 0.555327956422522 0.2564170773856 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3649311_3649856:TP73 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 3659742 C/T 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 T:C C T 10 0.555327956422522 0.775730055964994 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 3745924 G/A 1 12 8 20 5.33606452292974 4.44262365138018 0.893440871549561 A:G G A 10 0.555327956422522 0.823148310222236 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000461667:exon_3745830_3745937:KIAA0562 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 3753136 A/T 1 9 1 10 4.0020483921973 0.555327956422522 3.44672043577478 A:T A T 10 0.555327956422522 0.0504158529035674 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3753059_3753256:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3753059_3753256:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3753059_3753256:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000443466:exon_3753059_3753256:KIAA0562 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 3755675 T/C 1 4 10 14 1.77868817430991 5.55327956422522 -3.77459138991531 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0577678010140113 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3755647_3755683:KIAA0562 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 3761479 C/T 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 T:C C T 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494951:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378223:exon_3761471_3761547:KIAA0562 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 6155332 T/C 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 T:C T C 10 0.555327956422522 1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 6614535 G/A 1 20 20 40 8.89344087154956 11.1065591284504 -2.21311825690088 A:G G A 10 0.555327956422522 0.526214098904355 ENSG00000162408:ENST00000377705:exon_6614167_6614595:NOL9;ENSG00000162408:ENST00000464665:exon_6614167_6614560:NOL9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 6659505 G/A 1 14 13 27 6.22540861008469 7.21926343349279 -0.993854823408094 A:G G A 10 0.555327956422522 0.703574709140118 ENSG00000162413:ENST00000377658:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000377663:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000467612:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000496707:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000463043:exon_6659107_6659512:KLHL21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 33 24 57 14.6741774380568 13.3278709541405 1.34630648391625 A:G A G 10 0.555327956422522 0.790404467991722 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 6694574 G/A 1 25 28 53 11.116801089437 15.5491827798306 -4.43238169039367 A:G G A 10 0.555327956422522 0.268692827622960 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 6704635 A/G 1 19 17 36 8.44876882797208 9.44057525918287 -0.99180643121079 A:G A G 10 0.555327956422522 0.740708520659872 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000472414:exon_6704618_6704734:DNAJC11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 7889941 C/T 0 0 14 14 0 7.77459138991531 -7.77459138991531 T C T 10 0.555327956422522 1.18183696210375e-05 ENSG00000049246:ENST00000377532:exon_7889894_7890221:PER3;ENSG00000049246:ENST00000361923:exon_7889897_7890221:PER3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 8418644 C/A 1 61 33 94 27.1249946582262 18.3258225619432 8.79917209628293 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0773658393359478 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 8418650 T/C 1 57 35 92 25.3463064839162 19.4364784747883 5.90982800912798 T:C T C 10 0.555327956422522 0.248525041874714 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 8421092 C/T 1 21 17 38 9.33811291512704 9.44057525918287 -0.102462344055835 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8420172_8421550:RERE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 8421203 T/C 1 33 32 65 14.6741774380568 17.7704946055207 -3.09631716746393 T:C T C 10 0.555327956422522 0.455999483145975 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8420172_8421550:RERE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 9416151 G/A 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000171621:ENST00000328089:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000450402:exon_9415802_9416556:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000357898:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000377399:exon_9415766_9416644:SPSB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 11114940 G/T 1 182 182 364 80.930311931101 101.069688068899 -20.139376137798 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0349038709007617 ENSG00000116649:ENST00000475189:exon_11114641_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000376957:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000489073:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 11130972 G/A 1 60 48 108 26.6803226146487 26.6557419082811 0.024580706367626 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11130957_11131030:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11130957_11131030:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11130957_11131045:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11130957_11131030:EXOSC10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 11132217 G/A 1 34 30 64 15.1188494816343 16.6598386926757 -1.54098921104141 A:G G A 10 0.555327956422522 0.707683831748983 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11132144_11132452:EXOSC10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 11137661 A/G 1 22 35 57 9.78278495870452 19.4364784747883 -9.65369351608375 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0111604267482177 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11136899_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000470611:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000498576:exon_11137658_11137708:EXOSC10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 11150682 C/T 1 13 29 42 5.78073656650721 16.1045107362531 -10.3237741697459 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00164120446577423 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11150611_11150725:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11150611_11150725:EXOSC10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 11159823 T/C 1 8 11 19 3.55737634861982 6.10860752064774 -2.55123117202792 T:C T C 10 0.555327956422522 0.2564170773856 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11159778_11159938:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11159778_11159926:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000460196:exon_11159778_11159911:EXOSC10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 11850927 C/T 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11845780_11850955:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11845810_11850955:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11846660_11850955:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11848351_11850955:MTHFR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 11854476 T/G 1 11 11 22 4.89139247935226 6.10860752064774 -1.21721504129548 T:G T G 10 0.555327956422522 0.670344781787442 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11854415_11854595:MTHFR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 11854896 G/A 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11854786_11854920:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11854786_11854920:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11854786_11854920:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11854786_11854920:MTHFR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 11863057 G/A 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11862938_11863302:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11862938_11863186:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11862938_11863186:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11862938_11863186:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000418034:exon_11862938_11863186:MTHFR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 11897082 C/T 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 T:C C T 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000011021:ENST00000312413:exon_11897056_11897213:CLCN6;ENSG00000011021:ENST00000376487:exon_11897056_11897213:CLCN6;ENSG00000011021:ENST00000376493:exon_11897056_11897213:CLCN6;ENSG00000011021:ENST00000346436:exon_11897056_11897213:CLCN6;ENSG00000011021:ENST00000376496:exon_11897056_11897213:CLCN6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 T:C C T 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 T:C C T 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12034805 T/C 1 20 22 42 8.89344087154956 12.2172150412955 -3.32377416974592 T:C T C 10 0.555327956422522 0.352103954403424 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000481933:exon_12034710_12035593:PLOD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12049375 C/A 1 26 20 46 11.5614731330144 11.1065591284504 0.454914004563991 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000116688:ENST00000444836:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000235329:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000484391:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000497302:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000412236:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000413450:exon_12049222_12049400:MFN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12049390 C/T 1 28 20 48 12.4508172201694 11.1065591284504 1.34425809171895 T:C C T 10 0.555327956422522 0.772218674347073 ENSG00000116688:ENST00000444836:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000235329:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000484391:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000497302:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000412236:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000413450:exon_12049222_12049400:MFN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12056309 A/T 1 14 8 22 6.22540861008469 4.44262365138018 1.78278495870452 A:T A T 10 0.555327956422522 0.523473069933469 ENSG00000116688:ENST00000444836:exon_12056213_12056375:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000235329:exon_12056213_12056375:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000413450:exon_12056213_12056375:MFN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12065841 C/T 1 32 19 51 14.2295053944793 10.5512311720279 3.67827422245138 T:C C T 10 0.555327956422522 0.326479481966488 ENSG00000116688:ENST00000444836:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000235329:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000376337:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000413450:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000376320:exon_12065768_12065988:MFN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12089142 C/G 1 12 11 23 5.33606452292974 6.10860752064774 -0.772542997718006 C:G C G 10 0.555327956422522 0.834806358038955 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000492256:exon_12088778_12089198:MIIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12089163 A/G 1 17 13 30 7.55942474081713 7.21926343349279 0.340161307324341 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000492256:exon_12088778_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12089153_12089198:MIIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12089359 A/T 1 11 5 16 4.89139247935226 2.77663978211261 2.11475269723965 A:T A T 10 0.555327956422522 0.325169767810241 ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089280_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000492256:exon_12089280_12089664:MIIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12089845 C/T 1 28 17 45 12.4508172201694 9.44057525918287 3.01024196098651 T:C C T 10 0.555327956422522 0.453651156786093 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12089822_12089912:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089280_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12089822_12089951:MIIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12089851 C/T 1 22 15 37 9.78278495870452 8.32991934633783 1.45286561236669 T:C C T 10 0.555327956422522 0.74140646380221 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12089822_12089912:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089280_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12089822_12089951:MIIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12089946 C/G 1 33 27 60 14.6741774380568 14.9938548234081 -0.319677385351318 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089280_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12089822_12089951:MIIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12090154 C/T 1 39 47 86 17.3422096995216 26.1004139518585 -8.75820425233689 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0648584932782135 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12090085_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12090085_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12090085_12090181:MIIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12091753 C/T 1 2 7 9 0.889344087154956 3.88729569495765 -2.9979516078027 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0877066993700078 ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12091598_12092082:MIIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12164437 C/T 1 17 7 24 7.55942474081713 3.88729569495765 3.67212904585947 T:C C T 10 0.555327956422522 0.153115971856089 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12164436_12164588:TNFRSF8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 12186058 A/G 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12185956_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000479933:exon_12185991_12186109:TNFRSF8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 15541607 T/C 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 T:C T C 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000171729:ENST00000428417:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376014:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000451326:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000400796:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000434578:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376008:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000303840:exon_15541391_15541927:TMEM51 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 15844615 A/G 1 3 8 11 1.33401613073243 4.44262365138018 -3.10860752064774 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0718999345122269 ENSG00000132906:ENST00000333868:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000348549:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375890:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375874:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000400777:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000447522:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000474305:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000440484:exon_15844605_15844890:CASP9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 15909850 C/G 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 15911349 G/A 1 6 10 16 2.66803226146487 5.55327956422522 -2.88524730276035 A:G G A 10 0.555327956422522 0.207537445170925 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15911191_15911605:AGMAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 16056364 G/A 1 33 28 61 14.6741774380568 15.5491827798306 -0.875005341773841 A:G G A 10 0.555327956422522 0.897643159894651 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16056340_16056424:PLEKHM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 16256007 T/C 1 22 25 47 9.78278495870452 13.883198910563 -4.10041395185853 T:C T C 10 0.555327956422522 0.242748815640483 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 16259813 A/G 1 54 41 95 24.0122903531838 22.7684462133234 1.24384413986041 A:T:G A G 10 0.555327956422522 0.83688896957004 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 16272250 A/G 1 12 4 16 5.33606452292974 2.22131182569009 3.11475269723965 A:G A G 10 0.555327956422522 0.136543787545186 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 16578151 G/A 1 17 12 29 7.55942474081713 6.66393547707026 0.895489263746863 A:G G A 10 0.555327956422522 0.852446590248957 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 17312743 C/T 1 9 24 33 4.0020483921973 13.3278709541405 -9.32582256194322 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00131754002832052 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312454_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17312476_17312853:ATP13A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 17313343 G/A 1 9 6 15 4.0020483921973 3.33196773853513 0.670080653662171 A:G G A 10 0.555327956422522 0.799910806218814 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312958_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313300_17313451:ATP13A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 17313654 C/T 1 9 9 18 4.0020483921973 4.9979516078027 -0.995903215605395 T:C C T 10 0.555327956422522 0.643952874691603 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313541_17313764:ATP13A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 17314702 C/T 1 10 7 17 4.44672043577478 3.88729569495765 0.559424740817127 T:C C T 10 0.555327956422522 0.813340797660957 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314633_17314729:ATP13A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 17314942 G/A 1 12 12 24 5.33606452292974 6.66393547707026 -1.32787095414053 A:G G A 10 0.555327956422522 0.682467369666187 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314817_17314969:ATP13A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 17319011 G/A 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 A:G G A 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000503552:exon_17318981_17319076:ATP13A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 34 41 75 15.1188494816343 22.7684462133234 -7.64959673168915 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0816776566141294 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 19411129 A/G 1 48 46 94 21.3442580917189 25.545085995436 -4.20082790371707 A:G A G 10 0.555327956422522 0.407178893751851 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19410998_19411192:UBR4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 19413261 T/A 1 20 21 41 8.89344087154956 11.661887084873 -2.7684462133234 A:T T A 10 0.555327956422522 0.433171725971936 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19413173_19413315:UBR4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 19415304 C/T 1 52 72 124 23.1229462660289 39.9836128624216 -16.8606665963927 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00274321468325585 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 19433449 A/G 1 41 48 89 18.2315537866766 26.6557419082811 -8.42418812160446 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0873669010317332 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000494503:exon_19433331_19433460:UBR4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 19447843 C/G 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000425413:exon_19447694_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000417040:exon_19447707_19447928:UBR4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 19565344 C/G 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 C:G C G 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19565289_19565351:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19565289_19565348:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19565289_19565351:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375197:exon_19565289_19565348:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19565289_19565351:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000467423:exon_19565121_19566479:KIAA0090 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 107 79 186 47.5799086627901 43.8709085573792 3.70900010541091 A:G G A 10 0.555327956422522 0.60611737242677 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 20987838 C/A 1 81 62 143 36.0184355297757 34.4303332981964 1.58810223157936 A:C C A 10 0.555327956422522 0.8014127580422 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20987690_20988000:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20987690_20987894:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000464364:exon_20987690_20987881:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000477229:exon_20987690_20987862:DDOST HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 21276573 G/A 1 14 7 21 6.22540861008469 3.88729569495765 2.33811291512704 A:G G A 10 0.555327956422522 0.382150972530821 ENSG00000075151:ENST00000264211:exon_21276496_21276604:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400422:exon_21276496_21276604:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400415:exon_21276496_21276604:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374935:exon_21276496_21276604:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374937:exon_21276496_21276604:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000356916:exon_21276496_21276604:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374927:exon_21276496_21276604:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000438975:exon_21276499_21276604:EIF4G3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 22109370 G/A 1 50 62 112 22.2336021788739 34.4303332981964 -12.1967311193225 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0223572947527821 ENSG00000090686:ENST00000400301:exon_22109317_22109688:USP48;ENSG00000090686:ENST00000308271:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000529637:exon_22109317_22109484:USP48;ENSG00000090686:ENST00000421625:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000532737:exon_22109317_22109384:USP48;ENSG00000090686:ENST00000489108:exon_22109317_22109436:USP48 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 22150120 C/T 0 0 15 15 0 8.32991934633783 -8.32991934633783 T C T 10 0.555327956422522 5.25529857114072e-06 ENSG00000187942:ENST00000344642:exon_22148695_22151714:LDLRAD2;ENSG00000142798:ENST00000486901:exon_22150109_22150212:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000374695:exon_22150109_22150212:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000457597:exon_22150109_22150212:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000481644:exon_22150109_22150759:HSPG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 22150160 G/T 1 2 17 19 0.889344087154956 9.44057525918287 -8.55123117202792 T:G G T 10 0.555327956422522 7.38900320821525e-05 ENSG00000187942:ENST00000344642:exon_22148695_22151714:LDLRAD2;ENSG00000142798:ENST00000486901:exon_22150109_22150212:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000374695:exon_22150109_22150212:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000457597:exon_22150109_22150212:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000481644:exon_22150109_22150759:HSPG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 32 41 73 14.2295053944793 22.7684462133234 -8.5389408188441 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0459047774910823 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 24180962 T/C 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24180850_24181050:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24180850_24181050:FUCA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 21 5 26 9.33811291512704 2.77663978211261 6.56147313301443 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00968994457222343 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 20 6 26 8.89344087154956 3.33196773853513 5.56147313301443 T:C C T 10 0.555327956422522 0.030067450712797 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 24201094 G/C 1 13 5 18 5.78073656650721 2.77663978211261 3.0040967843946 C:G G C 10 0.555327956422522 0.234861389233214 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 24201109 C/T 1 14 5 19 6.22540861008469 2.77663978211261 3.44876882797208 T:C C T 10 0.555327956422522 0.164530353380396 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 A:G A G 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 24201357 A/G 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 24201448 C/T 1 12 6 18 5.33606452292974 3.33196773853513 2.0040967843946 T:C C T 10 0.555327956422522 0.477948616778315 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 10 12 22 4.44672043577478 6.66393547707026 -2.21721504129548 A:G G A 10 0.555327956422522 0.393799982731658 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 24201919 T/C 1 12 5 17 5.33606452292974 2.77663978211261 2.55942474081713 T:C T C 10 0.555327956422522 0.233437199703189 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 24201920 T/C 1 13 5 18 5.78073656650721 2.77663978211261 3.0040967843946 T:C T C 10 0.555327956422522 0.234861389233214 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 25291010 A/T 1 25 27 52 11.116801089437 14.9938548234081 -3.87705373397114 A:T A T 10 0.555327956422522 0.328850770622475 ENSG00000020633:ENST00000399916:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000428150:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000338888:exon_25291005_25291159:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000479341:exon_25291005_25291070:RUNX3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 25570081 T/C 1 68 58 126 30.2376989632685 32.2090214725063 -1.97132250923777 T:C T C 10 0.555327956422522 0.721047419308866 ENSG00000117616:ENST00000498238:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000243189:exon_25570041_25570124:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000473314:exon_25570041_25570715:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000417642:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000475766:exon_25570041_25570124:C1orf63 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 26496651 T/C 1 113 125 238 50.247940924255 69.4159945528152 -19.1680536285602 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0131476085373342 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 26582091 G/A 1 11 15 26 4.89139247935226 8.32991934633783 -3.43852686698557 A:G G A 10 0.555327956422522 0.235826270274551 ENSG00000130695:ENST00000476272:exon_26581662_26582356:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000252992:exon_26581662_26582356:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000451429:exon_26581662_26582356:CCDC21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 26608782 C/T 0 12 0 12 5.33606452292974 0 5.33606452292974 C C 10 0.555327956422522 0.00091995938163399 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26607819_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26608772_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26608773_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26608773_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26608775_26608846:UBXN11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 10 7 17 4.44672043577478 3.88729569495765 0.559424740817127 T:C C T 10 0.555327956422522 0.813340797660957 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 26610891 A/C 1 11 5 16 4.89139247935226 2.77663978211261 2.11475269723965 A:C A C 10 0.555327956422522 0.325169767810241 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26610853_26612032:UBXN11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 773 512 1285 343.73148968539 284.327913688331 59.4035759970592 A:G A G 10 0.555327956422522 0.000833643294354032 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 776 520 1296 345.065505816123 288.770537339711 56.2949684764115 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00173556831498752 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 27480757 A/G 1 2 9 11 0.889344087154956 4.9979516078027 -4.10860752064774 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0150596095234126 ENSG00000090020:ENST00000263980:exon_27480474_27481401:SLC9A1;ENSG00000090020:ENST00000374086:exon_27480474_27481089:SLC9A1;ENSG00000090020:ENST00000374084:exon_27480473_27480852:SLC9A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 27676925 G/A 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 A:G G A 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27676463_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27675889_27678549:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27675889_27677827:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000496001:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000485269:exon_27676463_27676976:SYTL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 27679797 A/G 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 27679954 G/A 1 25 17 42 11.116801089437 9.44057525918287 1.67622583025408 A:G G A 10 0.555327956422522 0.64411754906678 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 13 7 20 5.78073656650721 3.88729569495765 1.89344087154956 A:G A G 10 0.555327956422522 0.501729600552412 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 27876482 C/A 1 3 11 14 1.33401613073243 6.10860752064774 -4.77459138991531 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0135137734901899 ENSG00000126705:ENST00000247087:exon_27873772_27878700:AHDC1;ENSG00000126705:ENST00000374011:exon_27873772_27878700:AHDC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 228 95 323 101.385225935665 52.7561558601396 48.6290700755254 A:G A G 10 0.555327956422522 3.29361102481583e-08 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 190 60 250 84.4876882797208 33.3196773853513 51.1680108943695 T:C T C 10 0.555327956422522 2.86482984587281e-11 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 191 60 251 84.9323603232983 33.3196773853513 51.612682937947 A:G A G 10 0.555327956422522 2.00817799150221e-11 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 28476862 G/T 1 39 59 98 17.3422096995216 32.7643494289288 -15.4221397294072 T:G G T 10 0.555327956422522 0.00214601896741418 ENSG00000169403:ENST00000373857:exon_28473677_28477570:PTAFR;ENSG00000169403:ENST00000305392:exon_28476184_28477570:PTAFR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 28599898 G/A 1 16 17 33 7.11475269723965 9.44057525918287 -2.32582256194322 A:G G A 10 0.555327956422522 0.484522039393785 ENSG00000130766:ENST00000253063:exon_28599869_28600019:SESN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 286 345 631 127.176204463159 191.58814496577 -64.4119405026114 T:C T C 10 0.555327956422522 3.3223525940977e-07 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 31426815 A/G 1 27 33 60 12.0061451765919 18.3258225619432 -6.31967738535132 A:G A G 10 0.555327956422522 0.118642868868949 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 31732892 G/A 1 77 53 130 34.2397473554658 29.4323816903937 4.80736566507214 A:G G A 10 0.555327956422522 0.427560011351796 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 31897643 G/A 1 17 41 58 7.55942474081713 22.7684462133234 -15.2090214725063 A:G G A 10 0.555327956422522 9.01090791192387e-05 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31897530_31897720:SERINC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 31898234 T/C 1 61 32 93 27.1249946582262 17.7704946055207 9.35450005270546 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0598751449973076 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31898177_31898256:SERINC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 82 80 162 36.4631075733532 44.4262365138018 -7.96312894044856 A:G A G 10 0.555327956422522 0.235593082141742 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 33790496 G/A 1 15 16 31 6.67008065366217 8.88524730276035 -2.21516664909818 A:G G A 10 0.555327956422522 0.471945862571681 ENSG00000134686:ENST00000431992:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000419414:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000307890:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000361167:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000257118:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373422:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373418:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000485928:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000467894:exon_33790290_33790620:PHC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 35864571 A/G 1 9 11 20 4.0020483921973 6.10860752064774 -2.10655912845044 A:G A G 10 0.555327956422522 0.374427217398125 ENSG00000146463:ENST00000314607:exon_35864465_35864644:ZMYM4;ENSG00000146463:ENST00000373297:exon_35864465_35864644:ZMYM4;ENSG00000146463:ENST00000457946:exon_35864465_35864644:ZMYM4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 36074848 C/T 1 137 117 254 60.9200699701145 64.9733709014351 -4.05330093132059 T:C C T 10 0.555327956422522 0.614035677432087 ENSG00000126067:ENST00000373240:exon_36074847_36075009:PSMB2;ENSG00000126067:ENST00000373237:exon_36074847_36075009:PSMB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 36225948 T/C 1 16 10 26 7.11475269723965 5.55327956422522 1.56147313301443 T:C T C 10 0.555327956422522 0.561847305125949 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 36602943 C/T 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 T:C C T 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000054116:ENST00000462715:exon_36602182_36603579:TRAPPC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 36642420 T/C 1 88 67 155 39.1311398348181 37.206973080309 1.92416675450909 T:C T C 10 0.555327956422522 0.808560237223453 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36642298_36642435:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36642318_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36642407_36642443:MAP7D1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 36752152 C/T 1 113 119 232 50.247940924255 66.0840268142801 -15.8360858900251 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0404007836082357 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 36787888 G/A 1 17 22 39 7.55942474081713 12.2172150412955 -4.65779030047836 A:G G A 10 0.555327956422522 0.148270380292886 ENSG00000142694:ENST00000270824:exon_36787632_36788326:FAM176B;ENSG00000142694:ENST00000490466:exon_36787882_36788326:FAM176B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 38289383 T/C 0 10 0 10 4.44672043577478 0 4.44672043577478 T T 10 0.555327956422522 0.00309157318156107 ENSG00000188786:ENST00000373036:exon_38289382_38289484:MTF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 T:C C T 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 39797491 G/A 1 8 3 11 3.55737634861982 1.66598386926757 1.89139247935226 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0.365636833821238 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 40030428 T/C 1 126 135 261 56.0286774907622 74.9692741170405 -18.9405966262782 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0210287381982982 ENSG00000090621:ENST00000441204:exon_40030358_40030445:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372862:exon_40030358_40030445:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372858:exon_40030358_40030445:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372857:exon_40030358_40030445:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372856:exon_40030358_40030445:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000421687:exon_40030358_40030445:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000525045:exon_40030358_40030445:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000527718:exon_40030373_40030445:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000483770:exon_40030358_40030445:PABPC4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 40349131 G/A 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40348990_40349145:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40348990_40349176:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40348990_40349183:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000491865:exon_40348990_40349152:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40348990_40349153:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40348990_40349147:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40348990_40349168:TRIT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 40773123 G/C 1 4 9 13 1.77868817430991 4.9979516078027 -3.21926343349279 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0940602799732446 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 40773149 T/C 1 11 2 13 4.89139247935226 1.11065591284504 3.78073656650721 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0478368011171907 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 40773150 G/A 1 10 2 12 4.44672043577478 1.11065591284504 3.33606452292974 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0782461275271357 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 10 7 17 4.44672043577478 3.88729569495765 0.559424740817127 T:C C T 10 0.555327956422522 0.813340797660957 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 41978960 G/A 1 39 58 97 17.3422096995216 32.2090214725063 -14.8668117729846 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00288535813690254 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 43215957 G/A 1 18 12 30 8.0040967843946 6.66393547707026 1.34016130732434 A:G G A 10 0.555327956422522 0.714800037991546 ENSG00000117385:ENST00000460031:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000495874:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000296388:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000431412:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000481465:exon_43215572_43216007:LEPRE1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 43218322 C/A 1 14 20 34 6.22540861008469 11.1065591284504 -4.88115051836575 A:C C A 10 0.555327956422522 0.119328286684192 ENSG00000117385:ENST00000460031:exon_43218208_43218335:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43218208_43218335:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000495874:exon_43218208_43218335:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000296388:exon_43218208_43218335:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000431412:exon_43218208_43218335:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000481465:exon_43218208_43218335:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000447502:exon_43218208_43218335:LEPRE1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 43396414 G/A 1 17 12 29 7.55942474081713 6.66393547707026 0.895489263746863 A:G G A 10 0.555327956422522 0.852446590248957 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000475162:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43396297_43396611:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43395990_43396537:SLC2A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 45205598 T/C 1 10 8 18 4.44672043577478 4.44262365138018 0.00409678439460492 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000142945:ENST00000452259:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000493027:exon_45205497_45205674:KIF2C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 45218895 A/T 1 24 26 50 10.6721290458595 14.4385268669856 -3.7663978211261 A:T A T 10 0.555327956422522 0.319947172088006 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000455186:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45218804_45218926:KIF2C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 45224998 A/C 1 27 33 60 12.0061451765919 18.3258225619432 -6.31967738535132 A:C A C 10 0.555327956422522 0.118642868868949 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45224878_45225020:KIF2C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 45226084 G/A 1 34 34 68 15.1188494816343 18.8811505183657 -3.76230103673149 A:G G A 10 0.555327956422522 0.393709810132503 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45225952_45226156:KIF2C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 45270024 G/C 1 12 17 29 5.33606452292974 9.44057525918287 -4.10451073625314 C:G G C 10 0.555327956422522 0.137511299610045 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45270011_45270451:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461769:exon_45270011_45270173:PLK3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 45444038 G/A 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000480675:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000477953:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372182:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000487532:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000497010:exon_45443987_45444132:EIF2B3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 45476663 G/A 1 12 11 23 5.33606452292974 6.10860752064774 -0.772542997718006 A:G G A 10 0.555327956422522 0.834806358038955 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45476561_45477001:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45476561_45477027:HECTD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 46660295 T/C 1 21 16 37 9.33811291512704 8.88524730276035 0.452865612366686 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000085998:ENST00000371984:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371992:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000396420:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371986:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000477114:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000497439:exon_46660254_46660323:POMGNT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 20 21 41 8.89344087154956 11.661887084873 -2.7684462133234 A:G A G 10 0.555327956422522 0.433171725971936 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 47027222 G/A 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 A:G G A 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000079277:ENST00000342571:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371946:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371945:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371944:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000341183:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000528077:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000428112:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000532897:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000530528:exon_47027149_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000531355:exon_47027154_47027345:MKNK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 29 26 55 12.8954892637469 14.4385268669856 -1.54303760323871 A:G A G 10 0.555327956422522 0.686132872440229 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 47746678 G/C 1 17 12 29 7.55942474081713 6.66393547707026 0.895489263746863 C:G G C 10 0.555327956422522 0.852446590248957 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47746618_47746728:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000447475:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000418131:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000436811:exon_47746618_47746729:STIL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 47767914 G/A 1 13 13 26 5.78073656650721 7.21926343349279 -1.43852686698557 A:G G A 10 0.555327956422522 0.693891745956565 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000447475:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000413565:exon_47767906_47768018:STIL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 52991638 C/T 1 30 25 55 13.3401613073243 13.883198910563 -0.543037603238709 T:C C T 10 0.555327956422522 0.892861697309363 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 53153432 T/C 1 21 21 42 9.33811291512704 11.661887084873 -2.32377416974592 T:C T C 10 0.555327956422522 0.535380009317526 ENSG00000162377:ENST00000371538:exon_53152508_53153840:C1orf163;ENSG00000162377:ENST00000486918:exon_53153234_53153840:C1orf163 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 53387379 G/C 1 8 9 17 3.55737634861982 4.9979516078027 -1.44057525918287 C:G G C 10 0.555327956422522 0.626853565320545 ENSG00000121310:ENST00000460612:exon_53387225_53387434:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000358358:exon_53387225_53387398:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000476477:exon_53387225_53387446:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000467988:exon_53387225_53387390:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000495920:exon_53387225_53387386:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000474789:exon_53387225_53387393:ECHDC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 53679229 A/G 1 33 41 74 14.6741774380568 22.7684462133234 -8.09426877526663 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0617535044149583 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53678936_53679869:CPT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 53681699 T/G 1 51 76 127 22.6782742224514 42.2049246881117 -19.5266504656603 T:G T G 10 0.555327956422522 0.000634760334756654 ENSG00000162384:ENST00000294360:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000483739:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000470385:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000478839:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000371480:exon_53681663_53681728:C1orf123 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 53716416 G/A 1 14 12 26 6.22540861008469 6.66393547707026 -0.438526866985572 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53716362_53716534:LRP8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 53732315 G/T 1 25 24 49 11.116801089437 13.3278709541405 -2.21106986470358 T:G G T 10 0.555327956422522 0.566653602834593 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000459674:exon_53732145_53734270:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000475501:exon_53732145_53732319:LRP8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 54273460 C/A 1 12 5 17 5.33606452292974 2.77663978211261 2.55942474081713 A:C C A 10 0.555327956422522 0.233437199703189 ENSG00000058804:ENST00000371429:exon_54273329_54273464:TMEM48;ENSG00000058804:ENST00000360494:exon_54273329_54273464:TMEM48;ENSG00000058804:ENST00000234725:exon_54273329_54273464:TMEM48 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 54293777 T/C 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000058804:ENST00000371429:exon_54293672_54293846:TMEM48;ENSG00000058804:ENST00000360494:exon_54293672_54293846:TMEM48;ENSG00000058804:ENST00000234725:exon_54293672_54293846:TMEM48;ENSG00000058804:ENST00000480952:exon_54293672_54293846:TMEM48 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 33 43 76 14.6741774380568 23.8791021261684 -9.20492468811167 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0375596642189528 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 120 92 212 53.3606452292974 51.090171990872 2.27047323842534 C:G C G 10 0.555327956422522 0.78246244610767 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 54683925 G/A 1 49 22 71 21.7889301352964 12.2172150412955 9.57171509400094 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0231828602451059 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 55182300 T/A 1 9 10 19 4.0020483921973 5.55327956422522 -1.55123117202792 A:T T A 10 0.555327956422522 0.496869552202761 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000486621:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55182273_55182390:TTC4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 55319902 A/G 1 50 45 95 22.2336021788739 24.9897580390135 -2.75615586013959 A:G A G 10 0.555327956422522 0.60624839905492 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 58999853 T/C 1 18 8 26 8.0040967843946 4.44262365138018 3.56147313301443 T:C T C 10 0.555327956422522 0.172932735572506 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58999830_59000003:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58999830_59000003:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58999830_59000003:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_58999830_59000003:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_58999830_59000003:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000467063:exon_58999830_59000003:OMA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 59125683 C/T 1 3 8 11 1.33401613073243 4.44262365138018 -3.10860752064774 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0718999345122269 ENSG00000162601:ENST00000472487:exon_59120411_59125827:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000493821:exon_59120412_59125827:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000401044:exon_59124825_59125827:MYSM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 63991267 T/C 1 12 9 21 5.33606452292974 4.9979516078027 0.338112915127039 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000203965:ENST00000480886:exon_63991243_63991430:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000371088:exon_63991243_63991430:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000448122:exon_63991243_63991430:EFCAB7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 63999826 C/T 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 T:C C T 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000203965:ENST00000371088:exon_63999766_63999887:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000448122:exon_63999766_63999887:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000493605:exon_63999766_64000038:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000496956:exon_63999804_63999887:EFCAB7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 65310489 T/C 1 11 18 29 4.89139247935226 9.9959032156054 -5.10451073625314 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0627746776963758 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65310437_65310572:JAK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 65311262 G/A 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 A:G G A 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 65890990 C/T 1 12 12 24 5.33606452292974 6.66393547707026 -1.32787095414053 T:C C T 10 0.555327956422522 0.682467369666187 ENSG00000213625:ENST00000371065:exon_65890986_65891061:LEPROT;ENSG00000213625:ENST00000475108:exon_65890986_65891061:LEPROT;ENSG00000213625:ENST00000497874:exon_65890986_65891061:LEPROT;ENSG00000213625:ENST00000488747:exon_65890986_65891061:LEPROT;ENSG00000213625:ENST00000484243:exon_65890986_65891061:LEPROT;ENSG00000116678:ENST00000349533:exon_65890986_65891061:LEPR;ENSG00000116678:ENST00000371060:exon_65890986_65891061:LEPR;ENSG00000116678:ENST00000371059:exon_65890986_65891061:LEPR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 66838270 C/T 1 17 10 27 7.55942474081713 5.55327956422522 2.00614517659191 T:C C T 10 0.555327956422522 0.562156482279236 ENSG00000184588:ENST00000329654:exon_66837996_66839961:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000341517:exon_66837996_66839187:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000371049:exon_66837996_66838361:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000423207:exon_66837996_66840256:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000371045:exon_66837996_66840259:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000480109:exon_66837996_66838421:PDE4B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 67861520 C/A 1 24 12 36 10.6721290458595 6.66393547707026 4.00819356878921 A:C C A 10 0.555327956422522 0.2400131411827 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67861230_67862583:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67861230_67862583:IL12RB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 78201745 G/T 1 8 13 21 3.55737634861982 7.21926343349279 -3.66188708487296 T:G G T 10 0.555327956422522 0.126067912845854 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000524536:exon_78201741_78201843:USP33 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 79093818 A/G 1 144 335 479 64.0327742751568 186.034865401545 -122.002091126388 A:G A G 10 0.555327956422522 2.68573313913843e-29 ENSG00000137959:ENST00000452835:exon_79093591_79093892:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 79094081 T/A 1 18 8 26 8.0040967843946 4.44262365138018 3.56147313301443 A:T T A 10 0.555327956422522 0.172932735572506 ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 79095526 G/A 1 91 155 246 40.4651559655505 86.0758332454909 -45.6106772799404 A:G G A 10 0.555327956422522 5.54953558178933e-09 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 79102726 C/T 1 104 87 191 46.2458925320577 48.3135322087594 -2.0676396767017 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.771305866819967 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79102717_79102846:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000494910:exon_79102377_79102888:IFI44L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 79120775 C/T 1 144 114 258 64.0327742751568 63.3073870321675 0.725387242989335 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.950109428999922 ENSG00000137965:ENST00000470323:exon_79120699_79120894:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000370747:exon_79120699_79120894:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000438486:exon_79120699_79120894:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000495254:exon_79120699_79120894:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000467790:exon_79120699_79121196:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000472152:exon_79120699_79120894:IFI44 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 84944989 A/G 1 70 70 140 31.1270430504235 38.8729569495765 -7.74591389915308 A:G A G 10 0.555327956422522 0.20226664709933 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 85031630 G/A 1 5 11 16 2.22336021788739 6.10860752064774 -3.88524730276035 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0753333982593944 ENSG00000122432:ENST00000263717:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000361426:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000460286:exon_85031544_85031877:SPATA1;ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85031524_85031695:CTBS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 85039955 G/A 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 A:G G A 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85039922_85040163:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85039922_85040147:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85039599_85040104:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85039599_85040113:CTBS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 85733374 C/T 1 19 21 40 8.44876882797208 11.661887084873 -3.21311825690088 T:C C T 10 0.555327956422522 0.341360637779387 ENSG00000142867:ENST00000394761:exon_85731464_85733665:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000370580:exon_85731931_85733665:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000271015:exon_85731931_85733665:BCL10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 T:C T C 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 3 8 11 1.33401613073243 4.44262365138018 -3.10860752064774 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0718999345122269 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 89414937 C/A 1 24 17 41 10.6721290458595 9.44057525918287 1.2315537866766 A:C C A 10 0.555327956422522 0.754944363310101 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89414774_89414960:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89414774_89414960:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89414774_89414960:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89414774_89414960:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89414774_89414960:CCBL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 89522646 G/C 1 12 4 16 5.33606452292974 2.22131182569009 3.11475269723965 C:G G C 10 0.555327956422522 0.136543787545186 ENSG00000117228:ENST00000422952:exon_89522537_89522728:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89522537_89522817:GBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 89579941 T/C 1 36 10 46 16.0081935687892 5.55327956422522 10.454914004564 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00166730937857304 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89579699_89579979:GBP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 89582690 G/C 1 17 5 22 7.55942474081713 2.77663978211261 4.78278495870452 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0518516835843347 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 89582702 A/G 1 5 14 19 2.22336021788739 7.77459138991531 -5.55123117202792 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0183760951760472 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 89583390 G/A 1 10 8 18 4.44672043577478 4.44262365138018 0.00409678439460492 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89583260_89583456:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89583260_89583456:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89583260_89585903:GBP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 90486412 T/G 1 8 3 11 3.55737634861982 1.66598386926757 1.89139247935226 T:G T G 10 0.555327956422522 0.365636833821238 ENSG00000162664:ENST00000394590:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000394583:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000340281:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000370447:exon_90486351_90486481:ZNF326 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 91405699 G/A 1 14 15 29 6.22540861008469 8.32991934633783 -2.10451073625314 A:G G A 10 0.555327956422522 0.459182512082066 ENSG00000122482:ENST00000370440:exon_91403829_91406866:ZNF644;ENSG00000122482:ENST00000337393:exon_91403829_91406866:ZNF644 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 91980447 A/G 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 A:G A G 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000097046:ENST00000430031:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000370415:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000234626:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000428239:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000486509:exon_91980376_91980554:CDC7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 93306317 G/A 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 A:G G A 10 0.555327956422522 0.764420046735623 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 93720153 G/A 1 24 12 36 10.6721290458595 6.66393547707026 4.00819356878921 A:G G A 10 0.555327956422522 0.2400131411827 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000447456:exon_93720074_93720171:CCDC18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 35 47 82 15.5635215252117 26.1004139518585 -10.5368924266468 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0256438891379669 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 94342564 C/A 1 103 55 158 45.8012204884802 30.5430376032387 15.2581828852415 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0161050095344934 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 94343023 A/G 1 68 96 164 30.2376989632685 53.3114838165621 -23.0737848532936 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0003755960281772 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 94343233 T/C 1 79 114 193 35.1290914426208 63.3073870321675 -28.1782955895467 T:C T C 10 0.555327956422522 6.07271066710496e-05 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94343029_94343439:DNTTIP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 94344716 C/T 1 19 21 40 8.44876882797208 11.661887084873 -3.21311825690088 T:C C T 10 0.555327956422522 0.341360637779387 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94344633_94344762:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94344633_94344718:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94344104_94345474:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94344633_94344720:DNTTIP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 99164434 G/A 1 7 10 17 3.11270430504235 5.55327956422522 -2.44057525918287 A:G G A 10 0.555327956422522 0.329183052237539 ENSG00000162627:ENST00000529992:exon_99164262_99164461:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000306121:exon_99164262_99164461:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000439833:exon_99164262_99164461:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000351590:exon_99164262_99164461:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000415097:exon_99164262_99164461:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000528824:exon_99164262_99164461:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000370189:exon_99164262_99164461:SNX7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 100550937 C/T 1 7 10 17 3.11270430504235 5.55327956422522 -2.44057525918287 T:C C T 10 0.555327956422522 0.329183052237539 ENSG00000156876:ENST00000287482:exon_100549119_100550990:SASS6;ENSG00000156876:ENST00000462159:exon_100549119_100550990:SASS6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 110091282 C/T 1 50 34 84 22.2336021788739 18.8811505183657 3.35245166050816 T:C C T 10 0.555327956422522 0.510698539135696 ENSG00000065135:ENST00000369851:exon_110091233_110091460:GNAI3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 110173775 G/T 1 36 30 66 16.0081935687892 16.6598386926757 -0.65164512388645 T:G G T 10 0.555327956422522 0.901805685745058 ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110173565_110174163:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110173565_110173839:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110173565_110174671:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000476688:exon_110173565_110174190:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528958:exon_110173565_110174122:AMPD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 110882444 A/G 1 17 17 34 7.55942474081713 9.44057525918287 -1.88115051836575 A:G A G 10 0.555327956422522 0.605422040477597 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 110950277 G/A 1 48 43 91 21.3442580917189 23.8791021261684 -2.5348440344495 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0.599548751535375 ENSG00000134248:ENST00000483260:exon_110950208_110950290:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000474861:exon_110949655_110950293:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000464240:exon_110948940_110950316:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000369775:exon_110950208_110950560:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000256644:exon_110950208_110950564:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000531779:exon_110950208_110950286:HBXIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 375 300 675 166.752016341554 166.598386926757 0.153629414797649 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 111726213 A/G 1 9 2 11 4.0020483921973 1.11065591284504 2.89139247935226 A:G A G 10 0.555327956422522 0.126524523010841 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 112308895 A/C 1 25 26 51 11.116801089437 14.4385268669856 -3.32172577754862 A:C A C 10 0.555327956422522 0.398449939089232 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 113657092 A/C 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 A:C A C 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000198799:ENST00000361127:exon_113657049_113657498:LRIG2;ENSG00000198799:ENST00000492207:exon_113657049_113657498:LRIG2;ENSG00000198799:ENST00000466161:exon_113657049_113657498:LRIG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 113657233 T/G 1 10 6 16 4.44672043577478 3.33196773853513 1.11475269723965 T:G T G 10 0.555327956422522 0.624513862012014 ENSG00000198799:ENST00000361127:exon_113657049_113657498:LRIG2;ENSG00000198799:ENST00000492207:exon_113657049_113657498:LRIG2;ENSG00000198799:ENST00000466161:exon_113657049_113657498:LRIG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 114301335 C/T 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114301281_114301470:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000446739:exon_114301281_114301780:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000493212:exon_114301281_114302111:PHTF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 114448389 C/T 1 5 10 15 2.22336021788739 5.55327956422522 -3.32991934633783 T:C C T 10 0.555327956422522 0.117258617190494 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114447763_114448397:DCLRE1B;ENSG00000118655:ENST00000466480:exon_114448031_114448397:DCLRE1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 114449662 T/C 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114449618_114449783:DCLRE1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 114948281 A/G 1 22 21 43 9.78278495870452 11.661887084873 -1.87910212616845 A:G A G 10 0.555327956422522 0.645850639619903 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000476908:exon_114946948_114948381:TRIM33 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 117057477 A/C 1 18 24 42 8.0040967843946 13.3278709541405 -5.32377416974592 A:C A C 10 0.555327956422522 0.119927124185076 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 117617705 A/G 1 33 55 88 14.6741774380568 30.5430376032387 -15.8688601651819 A:G A G 10 0.555327956422522 0.000802020219008268 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 117618067 C/T 1 46 44 90 20.454914004564 24.434430082591 -3.97951607802698 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.398689157296562 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 120285546 G/A 1 18 21 39 8.0040967843946 11.661887084873 -3.65779030047836 A:G G A 10 0.555327956422522 0.261448779310206 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120285430_120285667:PHGDH HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 120458924 G/A 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 A:G G A 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000134250:ENST00000256646:exon_120454176_120459317:NOTCH2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 144909956 G/A 1 9 6 15 4.0020483921973 3.33196773853513 0.670080653662171 A:G G A 10 0.555327956422522 0.799910806218814 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144909869_144909960:PDE4DIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 144912153 A/G 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 A:G A G 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 1 14 1 15 6.22540861008469 0.555327956422522 5.67008065366217 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00288101873546526 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 144916748 C/G 0 10 0 10 4.44672043577478 0 4.44672043577478 C C 10 0.555327956422522 0.00309157318156107 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144916705_144916749:PDE4DIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 144918957 T/A 1 8 1 9 3.55737634861982 0.555327956422522 3.0020483921973 A:T T A 10 0.555327956422522 0.0495403730021064 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000525886:exon_144918833_144919011:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144918833_144918991:PDE4DIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 144930596 C/A 0 8 0 8 3.55737634861982 0 3.55737634861982 C C 10 0.555327956422522 0.0105734315433712 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 144930940 T/C 1 13 1 14 5.78073656650721 0.555327956422522 5.22540861008469 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00513485269272785 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 144931087 T/C 1 20 1 21 8.89344087154956 0.555327956422522 8.33811291512704 T:C T C 10 0.555327956422522 9.13859485167445e-05 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 144931251 C/T 0 14 0 14 6.22540861008469 0 6.22540861008469 C C 10 0.555327956422522 0.000483722581978021 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 144931330 C/T 0 11 0 11 4.89139247935226 0 4.89139247935226 C C 10 0.555327956422522 0.00168338880649373 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 144931461 A/T 0 12 0 12 5.33606452292974 0 5.33606452292974 A A 10 0.555327956422522 0.00091995938163399 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 92 92 0 51.090171990872 -51.090171990872 C T C 10 0.555327956422522 4.16547009964939e-33 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 59 59 0 32.7643494289288 -32.7643494289288 T G T 10 0.555327956422522 1.71533817445732e-21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 43 43 0 23.8791021261684 -23.8791021261684 A C A 10 0.555327956422522 7.34027839508526e-16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 92 0 92 40.909828009128 0 40.909828009128 G G 10 0.555327956422522 3.80341412287108e-24 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 69 69 0 38.317628993154 -38.317628993154 C T C 10 0.555327956422522 5.18499110929747e-25 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 106 106 0 58.8647633807873 -58.8647633807873 T C T 10 0.555327956422522 4.92290652830363e-38 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 145112501 C/T 0 146 0 146 64.9221183623118 0 64.9221183623118 C C 10 0.555327956422522 6.1344518523685e-38 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 146714392 G/T 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 T:G G T 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146714334_146714480:CHD1L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 146740502 C/G 1 18 15 33 8.0040967843946 8.32991934633783 -0.325822561943225 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146740441_146740537:CHD1L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 146758149 C/T 1 27 17 44 12.0061451765919 9.44057525918287 2.56556991740903 T:C C T 10 0.555327956422522 0.45328213887835 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146757975_146758177:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146757975_146758177:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146757975_146758177:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146757975_146758177:CHD1L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 147096794 A/G 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 A:G A G 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000116128:ENST00000234739:exon_147095643_147098017:BCL9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 149895842 G/T 1 91 96 187 40.4651559655505 53.3114838165621 -12.8463278510116 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0656235090382676 ENSG00000143368:ENST00000271628:exon_149895733_149895906:SF3B4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 150123132 C/G 1 56 55 111 24.9016344403388 30.5430376032387 -5.64140316289994 C:G C G 10 0.555327956422522 0.294340817319322 ENSG00000023902:ENST00000369126:exon_150123102_150123248:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150123102_150123248:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000025469:exon_150123102_150123248:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150123102_150123248:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000479194:exon_150122797_150123248:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000492304:exon_150122827_150123248:PLEKHO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 107 112 219 47.5799086627901 62.1967311193225 -14.6168224565323 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0487165851114976 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 150999737 A/G 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 A:G A G 10 0.555327956422522 0.605558868068935 ENSG00000143363:ENST00000467771:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000462440:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000475722:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000450884:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_150999709_150999803:PRUNE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 151006537 G/A 1 24 15 39 10.6721290458595 8.32991934633783 2.34220969952164 A:G G A 10 0.555327956422522 0.520690575426974 ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_151006282_151007683:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_151006282_151006589:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_151006282_151008187:PRUNE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 151209063 C/T 1 10 6 16 4.44672043577478 3.33196773853513 1.11475269723965 T:C C T 10 0.555327956422522 0.624513862012014 ENSG00000143398:ENST00000414290:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000464105:exon_151209034_151209223:PIP5K1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 207 239 446 92.0471130205379 132.723381584983 -40.6762685644448 T:C T C 10 0.555327956422522 0.000132715072916644 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 43 51 94 19.1208978738316 28.3217257775486 -9.20082790371707 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0616975534293535 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 151735545 A/G 1 61 47 108 27.1249946582262 26.1004139518585 1.02458070636763 A:G A G 10 0.555327956422522 0.922927627324616 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151735426_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000478926:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000486707:exon_151735431_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000481777:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000461182:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000462783:exon_151735093_151735622:MRPL9;ENSG00000143450:ENST00000418982:exon_151735445_151735643:OAZ3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 151823502 C/G 1 4 7 11 1.77868817430991 3.88729569495765 -2.10860752064774 C:G C G 10 0.555327956422522 0.234416927909769 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 151955625 C/T 1 5 8 13 2.22336021788739 4.44262365138018 -2.21926343349279 T:C C T 10 0.555327956422522 0.268109731741661 ENSG00000197747:ENST00000368811:exon_151955391_151955800:S100A10;ENSG00000197747:ENST00000368809:exon_151955394_151955800:S100A10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 151955747 A/G 1 4 12 16 1.77868817430991 6.66393547707026 -4.88524730276035 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0208050125539413 ENSG00000197747:ENST00000368811:exon_151955391_151955800:S100A10;ENSG00000197747:ENST00000368809:exon_151955394_151955800:S100A10;ENSG00000197747:ENST00000478574:exon_151955708_151955800:S100A10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 152882610 A/G 1 19 34 53 8.44876882797208 18.8811505183657 -10.4323816903937 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00523235018789933 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 152883608 G/A 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 A:G G A 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 152883680 A/G 1 6 10 16 2.66803226146487 5.55327956422522 -2.88524730276035 A:G A G 10 0.555327956422522 0.207537445170925 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 152883711 G/C 1 6 8 14 2.66803226146487 4.44262365138018 -1.77459138991531 C:G G C 10 0.555327956422522 0.423022312731772 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 153745128 G/C 1 46 44 90 20.454914004564 24.434430082591 -3.97951607802698 C:G G C 10 0.555327956422522 0.398689157296562 ENSG00000143624:ENST00000318967:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000428986:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000456435:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000435409:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000481797:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000512605:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000476843:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000503133:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368670:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368669:exon_153744816_153745187:INTS3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 153791388 A/G 1 20 14 34 8.89344087154956 7.77459138991531 1.11884948163425 A:G A G 10 0.555327956422522 0.73341319325584 ENSG00000143614:ENST00000368655:exon_153791267_153791398:GATAD2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 153906724 C/G 1 17 12 29 7.55942474081713 6.66393547707026 0.895489263746863 C:G C G 10 0.555327956422522 0.852446590248957 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153906611_153906778:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153906611_153906778:DENND4B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 154317153 C/T 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 T:C C T 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000143515:ENST00000368489:exon_154317117_154317261:ATP8B2;ENSG00000143515:ENST00000341831:exon_154317117_154317261:ATP8B2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 154561925 C/T 1 98 79 177 43.5778602705928 43.8709085573792 -0.293048286786394 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154561845_154561938:ADAR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 154573967 T/C 1 258 276 534 114.725387242989 153.270515972616 -38.5451287296267 T:C T C 10 0.555327956422522 0.000918789790763521 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000463920:exon_154572653_154574724:ADAR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 154960993 G/A 1 34 50 84 15.1188494816343 27.7663978211261 -12.6475483394918 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00595602739657828 ENSG00000160688:ENST00000368433:exon_154960581_154961325:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000315144:exon_154960581_154961325:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000368432:exon_154960581_154961325:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000368434:exon_154960581_154961325:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000368431:exon_154959942_154961488:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000292180:exon_154960581_154961325:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000405236:exon_154960506_154961325:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000295530:exon_154960533_154961325:FLAD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 154987526 C/T 1 27 30 57 12.0061451765919 16.6598386926757 -4.65369351608375 T:C C T 10 0.555327956422522 0.231688627825925 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000487542:exon_154987131_154987785:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154986924_154988290:ZBTB7B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 155030557 A/C 1 11 10 21 4.89139247935226 5.55327956422522 -0.661887084872961 A:C A C 10 0.555327956422522 0.828131296920228 ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000360674:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368412:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368410:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368413:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000447332:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155030327_155030631:ADAM15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 155221353 C/G 1 13 7 20 5.78073656650721 3.88729569495765 1.89344087154956 C:G C G 10 0.555327956422522 0.501729600552412 ENSG00000160767:ENST00000350210:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000368370:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000423573:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000368366:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000368368:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000361361:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000333966:exon_155221304_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000323361:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000491082:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000497941:exon_155221293_155221859:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000472550:exon_155221293_155221392:FAM189B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 98 122 220 43.5778602705928 67.7500106835477 -24.1721504129548 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00110762559777033 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 155289545 T/G 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 T:G T G 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000160752:ENST00000492887:exon_155289402_155289676:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000489324:exon_155289446_155289719:FDPS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 155735012 T/C 1 25 16 41 11.116801089437 8.88524730276035 2.2315537866766 T:C T C 10 0.555327956422522 0.53214987030037 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 155829511 C/T 1 13 17 30 5.78073656650721 9.44057525918287 -3.65983869267566 T:C C T 10 0.555327956422522 0.200611829751137 ENSG00000132718:ENST00000368324:exon_155829300_155829586:SYT11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 156107534 C/T 1 22 24 46 9.78278495870452 13.3278709541405 -3.54508599543601 T:C C T 10 0.555327956422522 0.302665007003409 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156107499_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156107445_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156107445_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000498722:exon_156107445_156107952:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000506981:exon_156107253_156107534:LMNA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 156146218 C/T 1 52 62 114 23.1229462660289 34.4303332981964 -11.3073870321675 T:C C T 10 0.555327956422522 0.037833487357309 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000484155:exon_156146196_156146447:SEMA4A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 156209400 G/A 1 91 61 152 40.4651559655505 33.8750053417738 6.59015062377666 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0.289931859467524 ENSG00000160783:ENST00000368279:exon_156209339_156209831:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368273:exon_156209339_156209642:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156209339_156209833:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156209339_156209576:PMF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 156213921 C/T 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 T:C C T 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000160781:ENST00000292291:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000492619:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000360733:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000335852:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000356983:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368271:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000340183:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000491107:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368270:exon_156213214_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000468632:exon_156213214_156214194:PAQR6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 156233189 C/T 1 15 12 27 6.67008065366217 6.66393547707026 0.0061451765919065 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156233186_156233361:SMG5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 156263940 T/C 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 T:C T C 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 156264000 G/A 1 13 6 19 5.78073656650721 3.33196773853513 2.44876882797208 A:G G A 10 0.555327956422522 0.356616392245917 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 156907081 T/C 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 T:C T C 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000132694:ENST00000368194:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000413909:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000487682:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000361409:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000315174:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000492592:exon_156907041_156907288:ARHGEF11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 156907115 T/C 1 11 6 17 4.89139247935226 3.33196773853513 1.55942474081713 T:C T C 10 0.555327956422522 0.477388500584111 ENSG00000132694:ENST00000368194:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000413909:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000487682:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000361409:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000315174:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000492592:exon_156907041_156907288:ARHGEF11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 157668194 A/C 0 12 0 12 5.33606452292974 0 5.33606452292974 A A 10 0.555327956422522 0.00091995938163399 ENSG00000160856:ENST00000477837:exon_157668174_157668419:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000492769:exon_157668174_157668419:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000480682:exon_157668174_157668419:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000494724:exon_157668174_157668419:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000368186:exon_157668174_157668419:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000485028:exon_157668174_157668419:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000368184:exon_157668174_157668419:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000292392:exon_157668174_157668419:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000392274:exon_157668174_157668419:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000496769:exon_157668174_157668419:FCRL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 246 247 493 109.38932272006 137.166005236363 -27.7766825163033 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0126381145364055 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 238 240 478 105.83194637144 133.278709541405 -27.4467631699655 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0128706660717368 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 135 135 270 60.0307258829595 74.9692741170405 -14.9385482340809 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0755749747845364 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 123 120 243 54.6946613600298 66.6393547707026 -11.9446934106728 A:T:C T A 10 0.555327956422522 0.137492270158681 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 159024668 A/T 1 197 188 385 87.6003925847632 104.401655807434 -16.801263222671 A:T:G A T 10 0.555327956422522 0.0905325416280169 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159024611_159024945:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159024611_159024918:IFI16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 160062340 G/A 1 13 15 28 5.78073656650721 8.32991934633783 -2.54918277983062 A:G G A 10 0.555327956422522 0.347681760793844 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 33 18 51 14.6741774380568 9.9959032156054 4.67827422245138 A:G G A 10 0.555327956422522 0.206481082368669 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 2007 1202 3209 892.456791459998 667.504203619871 224.952587840127 A:T:G G A 10 0.555327956422522 8.91098923502135e-16 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 160793442 A/G 1 38 26 64 16.8975376559442 14.4385268669856 2.4590107889586 A:G A G 10 0.555327956422522 0.615326521125616 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 160793560 A/G 1 45 48 93 20.0102419609865 26.6557419082811 -6.64549994729454 A:G A G 10 0.555327956422522 0.175677105648357 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 160990875 T/C 0 9 0 9 4.0020483921973 0 4.0020483921973 T T 10 0.555327956422522 0.00570256386102925 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 160990876 C/A 0 11 0 11 4.89139247935226 0 4.89139247935226 C C 10 0.555327956422522 0.00168338880649373 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 160990878 C/T 0 11 0 11 4.89139247935226 0 4.89139247935226 C C 10 0.555327956422522 0.00168338880649373 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 161017445 A/C 1 89 73 162 39.5758118783955 40.5389408188441 -0.963128940448563 A:C A C 10 0.555327956422522 0.874792743095823 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161016738_161018145:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 161088583 T/G 1 13 22 35 5.78073656650721 12.2172150412955 -6.43647847478827 T:G T G 10 0.555327956422522 0.0397457724274228 ENSG00000158793:ENST00000368009:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000392190:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000453609:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000486962:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000492411:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000478277:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000496861:exon_161088010_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000491497:exon_161088171_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000485594:exon_161088576_161088671:NIT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 161094190 A/G 1 19 21 40 8.44876882797208 11.661887084873 -3.21311825690088 A:G A G 10 0.555327956422522 0.341360637779387 ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161093931_161095235:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000479728:exon_161093931_161094601:NIT1;ENSG00000158796:ENST00000368006:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000392188:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000458050:exon_161094130_161094252:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000368005:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000464113:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000473679:exon_161094130_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000490843:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000463227:exon_161093928_161094316:DEDD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 161143801 G/A 1 20 20 40 8.89344087154956 11.1065591284504 -2.21311825690088 A:G G A 10 0.555327956422522 0.526214098904355 ENSG00000158850:ENST00000319769:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000470882:exon_161143395_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000407555:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000310413:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367998:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367997:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000466504:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000465740:exon_161143649_161143839:B4GALT3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 161145005 C/T 1 23 20 43 10.227457002282 11.1065591284504 -0.879102126168444 T:C C T 10 0.555327956422522 0.878299608285348 ENSG00000158850:ENST00000319769:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000470882:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000407555:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000310413:exon_161144924_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367998:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367997:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000466504:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000465740:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000493164:exon_161144697_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000496313:exon_161144785_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000487004:exon_161144842_161145018:B4GALT3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 161172233 C/A 1 54 37 91 24.0122903531838 20.5471343876333 3.4651559655505 A:C C A 10 0.555327956422522 0.527103145770904 ENSG00000158864:ENST00000479948:exon_161171937_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000496133:exon_161171937_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161171937_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000496553:exon_161171836_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000467295:exon_161172139_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000475570:exon_161172162_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000478866:exon_161172166_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161172169_161172270:NDUFS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 161183516 C/T 1 52 68 120 23.1229462660289 37.7623010367315 -14.6393547707026 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0076612879061591 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161183439_161184086:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000492153:exon_161183439_161183522:NDUFS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 161682948 T/C 1 78 93 171 34.6844193990433 51.6454999472945 -16.9610805482513 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0109027327133249 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 124 130 254 55.1393334036073 72.1926343349279 -17.0533009313206 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0319328343888609 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 161748056 C/T 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 T:C C T 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161748034_161748110:ATF6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 161753802 T/C 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 161753841 G/A 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 A:G G A 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 161761276 G/C 1 11 8 19 4.89139247935226 4.44262365138018 0.448768827972082 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 161761312 C/T 1 23 19 42 10.227457002282 10.5512311720279 -0.323774169745922 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 47 22 69 20.8995860481415 12.2172150412955 8.68237100684598 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0391811762025879 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 163309219 A/T 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 A:T A T 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000442820:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163309071_163309267:NUF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 150 197 347 66.7008065366217 109.399607415237 -42.6988008786151 A:G A G 10 0.555327956422522 5.14425338993186e-06 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 169823718 T/C 1 34 26 60 15.1188494816343 14.4385268669856 0.680322614648682 T:C T C 10 0.555327956422522 0.89726547557794 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 23 23 46 10.227457002282 12.772542997718 -2.54508599543601 T:C T C 10 0.555327956422522 0.46184947730117 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 22 12 34 9.78278495870452 6.66393547707026 3.11884948163425 A:G A G 10 0.555327956422522 0.305382089405312 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 12 22 34 5.33606452292974 12.2172150412955 -6.88115051836575 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0236012616604526 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 94 109 203 41.7991720962829 60.5307472500549 -18.731575153772 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00888798866319394 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 73 81 154 32.4610591811559 44.9815644702243 -12.5205052890684 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0429862595819324 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 179012947 C/G 1 11 4 15 4.89139247935226 2.22131182569009 2.67008065366217 C:G C G 10 0.555327956422522 0.199926509979624 ENSG00000116199:ENST00000440702:exon_179012850_179013359:FAM20B;ENSG00000116199:ENST00000263733:exon_179012850_179013359:FAM20B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 179051300 T/C 1 84 82 166 37.3524516605082 45.5368924266468 -8.18444076613865 T:C T C 10 0.555327956422522 0.211800074092836 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179050512_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000367625:exon_179051205_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179051213_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179051221_179051522:TOR3A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 179310262 C/T 1 14 26 40 6.22540861008469 14.4385268669856 -8.21311825690088 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0104765672170103 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 179312752 C/T 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 T:C C T 10 0.555327956422522 0.150211231786478 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179312725_179312770:SOAT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 179319541 C/G 1 25 21 46 11.116801089437 11.661887084873 -0.545085995436011 C:G C G 10 0.555327956422522 0.883074147030052 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179319431_179319566:SOAT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 179320578 A/G 1 38 37 75 16.8975376559442 20.5471343876333 -3.64959673168915 A:G A G 10 0.555327956422522 0.417389622864165 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179320452_179320597:SOAT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 180003148 A/G 1 11 4 15 4.89139247935226 2.22131182569009 2.67008065366217 A:G A G 10 0.555327956422522 0.199926509979624 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180002997_180003217:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180002997_180003217:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000367606:exon_180002997_180003217:CEP350 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 180010874 A/G 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000367606:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000418229:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000490047:exon_180010797_180010937:CEP350 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 180471194 C/A 1 47 36 83 20.8995860481415 19.9918064312108 0.907779616930679 A:C C A 10 0.555327956422522 0.912188698858363 ENSG00000135847:ENST00000367595:exon_180471180_180472089:ACBD6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 181018236 A/G 1 12 18 30 5.33606452292974 9.9959032156054 -4.65983869267566 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0991449163238243 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181018188_181018833:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181018188_181018448:MR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 181058891 C/T 1 110 82 192 48.9139247935226 45.5368924266468 3.37703236687578 T:C C T 10 0.555327956422522 0.663269810790914 ENSG00000162783:ENST00000367577:exon_181057638_181059977:IER5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 182844020 C/T 1 41 42 83 18.2315537866766 23.3237741697459 -5.09222038306932 T:C C T 10 0.555327956422522 0.270917044165407 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182843989_182844089:DHX9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 182993025 C/T 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_182992597_182993269:LAMC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 183072590 T/C 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183072463_183072767:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000484114:exon_183072462_183072767:LAMC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 183085755 A/G 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 A:G A G 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183085712_183085810:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000479499:exon_183085712_183085810:LAMC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 183093875 T/C 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 T:C T C 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183093766_183094011:LAMC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 183105534 T/C 1 16 21 37 7.11475269723965 11.661887084873 -4.54713438763331 T:C T C 10 0.555327956422522 0.139568461922462 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 184663537 A/C 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 A:C A C 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184663178_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184659637_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184663197_184663606:EDEM3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 184663581 T/C 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184663178_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184659637_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184663197_184663606:EDEM3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 184677464 G/A 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:G G A 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184677287_184677478:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184677287_184677478:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184677287_184677478:EDEM3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 186363119 C/G 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 C:G C G 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000157181:ENST00000287859:exon_186363079_186363147:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000419367:exon_186363079_186363147:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000432021:exon_186363079_186363147:C1orf27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 192545099 G/A 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 A:G G A 10 0.555327956422522 0.150211231786478 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 193051815 A/G 1 31 31 62 13.7848333509018 17.2151666490982 -3.43033329819636 A:G A G 10 0.555327956422522 0.443496921378228 ENSG00000116747:ENST00000400968:exon_193051692_193051838:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000432079:exon_193051692_193051838:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000460715:exon_193051692_193051838:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000400969:exon_193051692_193051838:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000416058:exon_193051692_193051838:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367446:exon_193051692_193051838:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367443:exon_193051692_193051838:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367445:exon_193051692_193051838:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367444:exon_193051692_193051838:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367441:exon_193051692_193051838:TROVE2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 193053762 C/T 1 18 18 36 8.0040967843946 9.9959032156054 -1.99180643121079 T:C C T 10 0.555327956422522 0.507892993773159 ENSG00000116747:ENST00000400968:exon_193053709_193054011:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000432079:exon_193053709_193060349:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000460715:exon_193053709_193054365:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000400969:exon_193053709_193053787:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000416058:exon_193053709_193053861:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367446:exon_193053709_193055115:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367443:exon_193053709_193053787:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367445:exon_193053709_193053828:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367444:exon_193053709_193053787:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367441:exon_193053709_193053996:TROVE2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 197071424 C/T 1 16 20 36 7.11475269723965 11.1065591284504 -3.99180643121079 T:C C T 10 0.555327956422522 0.184657826083378 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 200534248 C/T 1 6 8 14 2.66803226146487 4.44262365138018 -1.77459138991531 T:C C T 10 0.555327956422522 0.423022312731772 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200534197_200534381:KIF14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 200558363 T/C 1 9 10 19 4.0020483921973 5.55327956422522 -1.55123117202792 T:C T C 10 0.555327956422522 0.496869552202761 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200558345_200558497:KIF14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 200635550 T/C 1 16 16 32 7.11475269723965 8.88524730276035 -1.7704946055207 T:C T C 10 0.555327956422522 0.595024882931205 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 200635560 T/C 1 25 12 37 11.116801089437 6.66393547707026 4.45286561236669 T:C T C 10 0.555327956422522 0.185064185859084 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 200945910 G/A 1 11 6 17 4.89139247935226 3.33196773853513 1.55942474081713 A:G G A 10 0.555327956422522 0.477388500584111 ENSG00000116852:ENST00000477146:exon_200945904_200946021:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000332129:exon_200945904_200946021:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000360529:exon_200945904_200946021:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000461742:exon_200945904_200946021:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000422435:exon_200945904_200946021:KIF21B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 200956288 A/G 1 12 13 25 5.33606452292974 7.21926343349279 -1.88319891056305 A:G A G 10 0.555327956422522 0.547039280437458 ENSG00000116852:ENST00000477146:exon_200956124_200956329:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000332129:exon_200956124_200956329:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000360529:exon_200956124_200956329:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000461742:exon_200956124_200956329:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000422435:exon_200956124_200956329:KIF21B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 200959302 G/A 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 A:G G A 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000116852:ENST00000477146:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000332129:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000360529:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000461742:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000422435:exon_200959266_200959460:KIF21B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 200959305 G/A 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 A:G G A 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000116852:ENST00000477146:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000332129:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000360529:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000461742:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000422435:exon_200959266_200959460:KIF21B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 22 23 45 9.78278495870452 12.772542997718 -2.98975803901349 A:G A G 10 0.555327956422522 0.372989596784527 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 43 37 80 19.1208978738316 20.5471343876333 -1.42623651380176 A:G G A 10 0.555327956422522 0.822157109656556 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 33 79 112 14.6741774380568 43.8709085573792 -29.1967311193225 A:G G A 10 0.555327956422522 3.10379000050432e-08 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 201981218 C/G 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 C:G C G 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000163435:ENST00000359651:exon_201981085_201981306:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000367284:exon_201981085_201981306:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000367283:exon_201981085_201981306:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000495848:exon_201981085_201981699:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000310044:exon_201981085_201981306:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000490203:exon_201981085_201981564:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000446188:exon_201981085_201981306:ELF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 202888947 T/C 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 T:C T C 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000117153:ENST00000367261:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000435533:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367260:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367258:exon_202888883_202889036:KLHL12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 202935911 T/C 1 11 7 18 4.89139247935226 3.88729569495765 1.0040967843946 T:C T C 10 0.555327956422522 0.813417267911682 ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000473599:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000478009:exon_202935877_202936026:CYB5R1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 203743653 C/T 1 12 6 18 5.33606452292974 3.33196773853513 2.0040967843946 T:C C T 10 0.555327956422522 0.477948616778315 ENSG00000122188:ENST00000442561:exon_203743003_203745245:LAX1;ENSG00000122188:ENST00000367217:exon_203743003_203743850:LAX1;ENSG00000122188:ENST00000367215:exon_203743003_203745361:LAX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 204403659 A/G 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:G A G 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204403567_204403736:PIK3C2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 204425028 G/A 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204424984_204425179:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000496872:exon_204424984_204425419:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000438854:exon_204424984_204425179:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000424712:exon_204424984_204425179:PIK3C2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 206669465 C/T 1 11 8 19 4.89139247935226 4.44262365138018 0.448768827972082 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206669445_206670223:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000462698:exon_206669445_206670220:IKBKE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 206944233 A/G 1 5 10 15 2.22336021788739 5.55327956422522 -3.32991934633783 A:G A G 10 0.555327956422522 0.117258617190494 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 207087435 C/T 1 138 168 306 61.364742013692 93.2950966789837 -31.9303546652917 T:C C T 10 0.555327956422522 0.000278620506099126 ENSG00000162894:ENST00000420007:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000367091:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000463473:exon_207087207_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000525793:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000529560:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000533312:exon_207086977_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000530505:exon_207087146_207087439:FAIM3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 207658849 T/C 1 11 6 17 4.89139247935226 3.33196773853513 1.55942474081713 T:C T C 10 0.555327956422522 0.477388500584111 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207658809_207658917:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207658809_207658917:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207658809_207658917:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207658809_207658917:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207658809_207658899:CR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 209936914 C/T 1 24 22 46 10.6721290458595 12.2172150412955 -1.54508599543601 T:C C T 10 0.555327956422522 0.65899014290951 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 210004199 C/G 1 10 5 15 4.44672043577478 2.77663978211261 1.67008065366217 C:G C G 10 0.555327956422522 0.445339902559564 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210004148_210004388:C1orf107 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 210006603 C/T 1 2 11 13 0.889344087154956 6.10860752064774 -5.21926343349279 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00416894943100623 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210006530_210006703:C1orf107 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 26 35 61 11.5614731330144 19.4364784747883 -7.87500534177384 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0525355255654911 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 211840498 T/C 1 8 16 24 3.55737634861982 8.88524730276035 -5.32787095414053 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0382967038854731 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000489633:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211839772_211840573:NEK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 211846876 A/G 1 15 15 30 6.67008065366217 8.32991934633783 -1.65983869267566 A:G A G 10 0.555327956422522 0.584377790818652 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 212276276 A/G 1 15 15 30 6.67008065366217 8.32991934633783 -1.65983869267566 A:G A G 10 0.555327956422522 0.584377790818652 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212276184_212278348:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212276184_212278186:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212276184_212277936:DTL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 68 61 129 30.2376989632685 33.8750053417738 -3.63730637850534 T:C T C 10 0.555327956422522 0.535957326242911 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 212791644 A/G 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 A:G A G 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000162772:ENST00000465155:exon_212791469_212792589:ATF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 42 38 80 18.6762258302541 21.1024623440558 -2.42623651380176 T:C T C 10 0.555327956422522 0.652989369742898 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 214531239 C/T 0 8 0 8 3.55737634861982 0 3.55737634861982 C C 10 0.555327956422522 0.0105734315433712 ENSG00000152104:ENST00000366956:exon_214530851_214531393:PTPN14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 215793834 G/A 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 A:G G A 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000136636:ENST00000259154:exon_215793399_215795073:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000444044:exon_215793399_215795147:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000495537:exon_215793399_215795073:KCTD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 220156704 T/C 1 49 25 74 21.7889301352964 13.883198910563 7.90573122473337 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0786860752906906 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000485821:exon_220156531_220156740:EPRS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 220156729 C/T 1 57 33 90 25.3463064839162 18.3258225619432 7.02048392197302 T:C C T 10 0.555327956422522 0.139292885512358 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000485821:exon_220156531_220156740:EPRS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 220162004 C/T 1 49 64 113 21.7889301352964 35.5409892110414 -13.752059075745 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0104113530334480 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220161932_220162165:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220161932_220162165:EPRS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 220298664 A/G 1 34 18 52 15.1188494816343 9.9959032156054 5.12294626602886 A:G A G 10 0.555327956422522 0.164836435478774 ENSG00000067704:ENST00000366922:exon_220298579_220298681:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000302637:exon_220298579_220298681:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000490891:exon_220298579_220298681:IARS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 220928313 T/C 0 0 20 20 0 11.1065591284504 -11.1065591284504 C T C 10 0.555327956422522 9.13685065738176e-08 ENSG00000117791:ENST00000469583:exon_220928289_220928402:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220928289_220928462:MOSC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 220928334 A/G 0 0 13 13 0 7.21926343349279 -7.21926343349279 G A G 10 0.555327956422522 2.65777212481276e-05 ENSG00000117791:ENST00000469583:exon_220928289_220928402:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220928314_220928462:MOSC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 220928376 T/C 0 0 9 9 0 4.9979516078027 -4.9979516078027 C T C 10 0.555327956422522 0.00067976443209644 ENSG00000117791:ENST00000469583:exon_220928289_220928402:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220928314_220928462:MOSC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 220936372 G/A 0 0 20 20 0 11.1065591284504 -11.1065591284504 A G A 10 0.555327956422522 9.13685065738176e-08 ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220936252_220936392:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220936252_220936392:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220936252_220936392:MOSC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 220955168 A/G 0 0 40 40 0 22.2131182569009 -22.2131182569009 G A G 10 0.555327956422522 8.34820399352978e-15 ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220955120_220955274:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000472447:exon_220955120_220955274:MOSC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 48 63 111 21.3442580917189 34.9856612546189 -13.6414031628999 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00984575020833388 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 48 65 113 21.3442580917189 36.0963171674639 -14.752059075745 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00590293511766425 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 222802376 A/G 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 222802803 T/G 1 7 16 23 3.11270430504235 8.88524730276035 -5.77254299771801 T:G T G 10 0.555327956422522 0.0197369722085317 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 6 27 33 2.66803226146487 14.9938548234081 -12.3258225619432 T:G T G 10 0.555327956422522 1.35838490191299e-05 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 226555302 A/G 1 188 213 401 83.5983441925659 118.284854717997 -34.6865105254313 A:G A G 10 0.555327956422522 0.000518468580877027 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226555181_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226555181_226555309:PARP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 226570840 T/C 1 323 320 643 143.629070075525 177.704946055207 -34.0758759796816 T:C:G T C 10 0.555327956422522 0.00779818540524903 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 243 235 478 108.055306589327 130.502069759293 -22.4467631699655 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0427617993250683 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 147 148 295 65.3667904058893 82.1885375505333 -16.821747144644 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.0530811551568177 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 226595647 C/G 1 59 70 129 26.2356505710712 38.8729569495765 -12.6373063785053 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0267638339924589 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226595511_226595774:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226595511_226595776:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226595511_226595717:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226595511_226595683:PARP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 226923264 G/A 1 8 10 18 3.55737634861982 5.55327956422522 -1.9959032156054 A:G G A 10 0.555327956422522 0.354494673636837 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 226924642 C/T 1 14 7 21 6.22540861008469 3.88729569495765 2.33811291512704 T:C C T 10 0.555327956422522 0.382150972530821 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 227069737 C/T 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000495488:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227069589_227069749:PSEN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 227216662 T/C 1 32 21 53 14.2295053944793 11.661887084873 2.56761830960633 T:C T C 10 0.555327956422522 0.493642527442102 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000429440:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000441725:exon_227216358_227216951:CDC42BPA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 227216775 C/T 1 22 16 38 9.78278495870452 8.88524730276035 0.897537655944165 T:C C T 10 0.555327956422522 0.870781297793979 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000429440:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000441725:exon_227216358_227216951:CDC42BPA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 227504794 T/C 1 10 6 16 4.44672043577478 3.33196773853513 1.11475269723965 T:C T C 10 0.555327956422522 0.624513862012014 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227504706_227506175:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227504706_227504883:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227504706_227505826:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227504706_227505826:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227504706_227505826:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227504706_227505826:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227504706_227505415:CDC42BPA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 227920103 G/A 1 31 26 57 13.7848333509018 14.4385268669856 -0.653693516083752 A:G G A 10 0.555327956422522 0.894438143068177 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 227921241 G/A 1 20 11 31 8.89344087154956 6.10860752064774 2.78483335090182 A:G G A 10 0.555327956422522 0.3684833918503 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227920582_227922078:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227921115_227921382:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227921115_227921382:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000480590:exon_227920849_227921382:JMJD4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 29 28 57 12.8954892637469 15.5491827798306 -2.65369351608375 A:G A G 10 0.555327956422522 0.506846736590378 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 228335125 C/T 1 164 175 339 72.9262151467064 97.1823923739413 -24.2561772272349 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.00865409449277077 ENSG00000143774:ENST00000366730:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000462807:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485838:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000312726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000492871:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366728:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366727:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000453943:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366723:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366729:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000391865:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366722:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498092:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000435153:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366721:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000460224:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000472939:exon_228335107_228335146:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000412265:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366719:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366720:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366718:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366715:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470040:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366716:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485168:exon_228335107_228335188:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000478725:exon_228335107_228335260:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000420445:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000495999:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000486668:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000464858:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470155:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000481341:exon_228335111_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498115:exon_228335107_228335400:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470740:exon_228335107_228335239:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000465025:exon_228335125_228335245:GUK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 228588680 A/C 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 A:C A C 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228588665_228588895:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228588640_228588892:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000366699:exon_228588665_228588895:TRIM11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 229730452 G/A 1 12 14 26 5.33606452292974 7.77459138991531 -2.43852686698557 A:G G A 10 0.555327956422522 0.430498156832276 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229728858_229730841:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229728868_229730841:TAF5L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 229772932 A/G 1 16 10 26 7.11475269723965 5.55327956422522 1.56147313301443 A:G A G 10 0.555327956422522 0.561847305125949 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 229773441 C/T 1 8 13 21 3.55737634861982 7.21926343349279 -3.66188708487296 T:C C T 10 0.555327956422522 0.126067912845854 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 230384937 T/C 1 28 25 53 12.4508172201694 13.883198910563 -1.43238169039367 T:C T C 10 0.555327956422522 0.78252863659632 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230384930_230385017:GALNT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 230415148 G/A 1 40 43 83 17.7868817430991 23.8791021261684 -6.09222038306932 A:G G A 10 0.555327956422522 0.18629645048017 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 230415244 T/C 1 70 57 127 31.1270430504235 31.6536935160838 -0.526650465660289 T:C T C 10 0.555327956422522 0.9290968667181 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 13 11 24 5.78073656650721 6.10860752064774 -0.327870954140527 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 231488524 C/T 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 T:C C T 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000010072:ENST00000391858:exon_231487050_231488878:C1orf124;ENSG00000010072:ENST00000295050:exon_231488356_231490769:C1orf124 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 233091463 T/A 1 18 1 19 8.0040967843946 0.555327956422522 7.44876882797208 A:T T A 10 0.555327956422522 0.000287039915614063 ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000479125:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000487953:exon_233091404_233091465:C1orf57 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 29 29 58 12.8954892637469 16.1045107362531 -3.20902147250627 T:C C T 10 0.555327956422522 0.429149411748609 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 31 35 66 13.7848333509018 19.4364784747883 -5.65164512388645 A:G G A 10 0.555327956422522 0.173996868514989 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 235652513 T/C 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C T C 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000162885:ENST00000366600:exon_235652473_235652573:B3GALNT2;ENSG00000162885:ENST00000366599:exon_235652473_235652573:B3GALNT2;ENSG00000162885:ENST00000313984:exon_235652473_235652573:B3GALNT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236141174 T/C 1 34 27 61 15.1188494816343 14.9938548234081 0.124994658226161 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236139130_236141288:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236139130_236141288:NID1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236144951 A/G 1 24 38 62 10.6721290458595 21.1024623440558 -10.4303332981964 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0100482643997936 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236144911_236145082:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236144911_236145082:NID1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236175327 C/A 1 10 11 21 4.44672043577478 6.10860752064774 -1.66188708487296 A:C C A 10 0.555327956422522 0.514389688550212 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236175221_236175343:NID1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236702210 A/G 1 22 15 37 9.78278495870452 8.32991934633783 1.45286561236669 A:G A G 10 0.555327956422522 0.74140646380221 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236706278 G/T 1 7 1 8 3.11270430504235 0.555327956422522 2.55737634861982 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0837859633971926 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236706215_236706290:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236706283 G/A 1 8 1 9 3.55737634861982 0.555327956422522 3.0020483921973 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0495403730021064 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236706215_236706290:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236706300 T/A 0 9 0 9 4.0020483921973 0 4.0020483921973 T T 10 0.555327956422522 0.00570256386102925 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 14 10 24 6.22540861008469 5.55327956422522 0.672129045859473 C:G G C 10 0.555327956422522 0.839730194130565 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236718052 T/A 1 51 25 76 22.6782742224514 13.883198910563 8.79507531188833 A:T T A 10 0.555327956422522 0.0492319698865266 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236719135 T/C 1 54 34 88 24.0122903531838 18.8811505183657 5.13113983481807 T:C T C 10 0.555327956422522 0.285164195265101 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 24 13 37 10.6721290458595 7.21926343349279 3.45286561236669 A:G G A 10 0.555327956422522 0.321143198310201 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 14 5 19 6.22540861008469 2.77663978211261 3.44876882797208 T:C T C 10 0.555327956422522 0.164530353380396 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236723074 G/C 1 26 11 37 11.5614731330144 6.10860752064774 5.45286561236669 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0967725467321335 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236723108 C/T 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236729956 T/C 1 17 14 31 7.55942474081713 7.77459138991531 -0.215166649098181 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236729946_236730176:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236729946_236730176:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236737983 A/G 1 38 20 58 16.8975376559442 11.1065591284504 5.79097852749373 A:G A G 10 0.555327956422522 0.146184297116590 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236737961_236738203:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000490339:exon_236737961_236738075:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236746443 C/T 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236746313_236746496:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236746313_236746496:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236748433 G/A 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 A:G G A 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236748505 T/C 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 T:C T C 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236749626 C/T 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:C C T 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236749730 C/T 1 8 12 20 3.55737634861982 6.66393547707026 -3.10655912845044 T:C C T 10 0.555327956422522 0.181542604683008 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236755837 C/T 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236755823_236755933:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236755823_236755933:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236758887 T/C 1 27 10 37 12.0061451765919 5.55327956422522 6.45286561236669 T:C T C 10 0.555327956422522 0.045626792975298 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236758840_236758973:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236758840_236758973:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 236767330 A/G 1 16 15 31 7.11475269723965 8.32991934633783 -1.21516664909818 A:G A G 10 0.555327956422522 0.719325364600599 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366579:exon_236767254_236767427:HEATR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 237054569 A/G 1 3 10 13 1.33401613073243 5.55327956422522 -4.21926343349279 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0239466351830008 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237054433_237054629:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237054433_237054629:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237054433_237054629:MTR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 237058744 C/A 1 2 12 14 0.889344087154956 6.66393547707026 -5.77459138991531 A:C C A 10 0.555327956422522 0.00216105207299794 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000470570:exon_237057641_237058850:MTR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 237058828 C/T 1 5 13 18 2.22336021788739 7.21926343349279 -4.9959032156054 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0297547757208393 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000470570:exon_237057641_237058850:MTR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 241798631 C/T 1 14 8 22 6.22540861008469 4.44262365138018 1.78278495870452 T:C C T 10 0.555327956422522 0.523473069933469 ENSG00000203668:ENST00000366553:exon_241792155_241799232:CHML HGDP00721_parsed_pileup.txt . 1 246021941 T/C 1 10 4 14 4.44672043577478 2.22131182569009 2.22540861008469 T:C T C 10 0.555327956422522 0.288383222971717 ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 60 70 130 26.6803226146487 38.8729569495765 -12.1926343349279 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0340813986146656 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 1060218 G/A 1 144 131 275 64.0327742751568 72.7479622913504 -8.71518801619354 A:G G A 10 0.555327956422522 0.302522299707389 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1060187_1060252:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000483839:exon_1060193_1060252:GTPBP4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 1061767 G/A 1 61 62 123 27.1249946582262 34.4303332981964 -7.3053386399702 A:G G A 10 0.555327956422522 0.20404286638342 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1061693_1061836:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000483839:exon_1061693_1061836:GTPBP4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 3172121 C/T 1 95 94 189 42.2438441398604 52.2008279037171 -9.95698376385665 T:C C T 10 0.555327956422522 0.164167905281871 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 3175479 G/A 1 55 66 121 24.4569623967613 36.6516451238865 -12.1946827271252 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0280200688244852 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3175395_3175506:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3175395_3175506:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3175395_3175506:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3175395_3175506:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3175395_3175506:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3175395_3175506:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000433193:exon_3175427_3175506:PFKP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 3178804 G/A 1 159 188 347 70.702854928819 104.401655807434 -33.6988008786151 A:G G A 10 0.555327956422522 0.000289350459088916 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 3178815 G/C 1 182 161 343 80.930311931101 89.407800984026 -8.47748905292504 C:G G C 10 0.555327956422522 0.356374323341704 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 54 43 97 24.0122903531838 23.8791021261684 0.133188227015371 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 23 25 48 10.227457002282 13.883198910563 -3.65574190828105 T:C C T 10 0.555327956422522 0.311204408143141 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 T:C C T 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 3197856 C/G 1 15 9 24 6.67008065366217 4.9979516078027 1.67212904585947 C:G C G 10 0.555327956422522 0.543438783557522 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3197783_3197921:PITRM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 17 17 34 7.55942474081713 9.44057525918287 -1.88115051836575 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.605422040477597 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 3202065 T/C 1 33 22 55 14.6741774380568 12.2172150412955 2.45696239676129 T:C T C 10 0.555327956422522 0.587846132163564 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 3206027 A/G 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 A:G A G 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 5808086 G/A 1 272 214 486 120.950795853074 118.84018267442 2.11061317865432 A:T:C:G G A 10 0.555327956422522 0.855279573108587 ENSG00000057608:ENST00000380191:exon_5807186_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000435969:exon_5807186_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380131:exon_5807187_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380153:exon_5807187_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000479928:exon_5807192_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000447751:exon_5807812_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380181:exon_5807917_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380132:exon_5807917_5808115:GDI2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 6002368 T/G 1 15 10 25 6.67008065366217 5.55327956422522 1.11680108943695 T:G T G 10 0.555327956422522 0.692593351989186 ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 21 14 35 9.33811291512704 7.77459138991531 1.56352152521173 A:G A G 10 0.555327956422522 0.615320962333974 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 2 13 15 0.889344087154956 7.21926343349279 -6.32991934633783 A:T A T 10 0.555327956422522 0.00111162449871957 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 3 13 16 1.33401613073243 7.21926343349279 -5.88524730276035 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00416520738747262 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 78 56 134 34.6844193990433 31.0983655596612 3.58605383938205 A:C:G A G 10 0.555327956422522 0.544338336983398 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 12867598 C/G 1 9 15 24 4.0020483921973 8.32991934633783 -4.32787095414053 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0990620091275335 ENSG00000183049:ENST00000378847:exon_12867572_12867689:CAMK1D;ENSG00000183049:ENST00000378845:exon_12867572_12868142:CAMK1D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 13151224 G/A 1 48 52 100 21.3442580917189 28.8770537339711 -7.5327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.132408827740741 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000487935:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13151097_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13151112_13151288:OPTN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 13152400 T/A 1 61 62 123 27.1249946582262 34.4303332981964 -7.3053386399702 A:T T A 10 0.555327956422522 0.20404286638342 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13152180_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13152274_13152476:OPTN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 13178766 G/A 1 32 36 68 14.2295053944793 19.9918064312108 -5.76230103673149 A:G G A 10 0.555327956422522 0.179679504464696 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13178745_13180291:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13178745_13180291:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13178745_13180276:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13178745_13180291:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13178745_13180291:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13178745_13180291:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13178745_13180291:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000469025:exon_13178745_13178918:OPTN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 16547058 A/G 1 16 11 27 7.11475269723965 6.10860752064774 1.00614517659191 A:G A G 10 0.555327956422522 0.846938067616076 ENSG00000165983:ENST00000343656:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000378000:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000298942:exon_16547019_16547159:PTER HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 16796919 C/A 1 21 26 47 9.33811291512704 14.4385268669856 -5.10041395185853 A:C C A 10 0.555327956422522 0.143875822696293 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16796870_16796988:RSU1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 16858993 T/C 1 18 33 51 8.0040967843946 18.3258225619432 -10.3217257775486 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00446467550820183 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16858972_16859083:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16858972_16859382:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16858972_16859083:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16858972_16859083:RSU1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 18828371 C/T 1 15 13 28 6.67008065366217 7.21926343349279 -0.549182779830615 T:C C T 10 0.555327956422522 0.851250752295518 ENSG00000165995:ENST00000324631:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000352115:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377328:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000282343:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377331:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000396576:exon_18828159_18830798:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000340194:exon_18828159_18830791:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377319:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377329:exon_18828159_18830038:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377315:exon_18828159_18830056:CACNB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 21962545 T/G 1 15 19 34 6.67008065366217 10.5512311720279 -3.88115051836575 T:G T G 10 0.555327956422522 0.226744754730006 ENSG00000078403:ENST00000377072:exon_21962279_21962848:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000307729:exon_21962279_21962848:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000446906:exon_21962279_21962848:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377059:exon_21962279_21962848:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000420525:exon_21962507_21962848:MLLT10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 24908686 T/C 1 13 15 28 5.78073656650721 8.32991934633783 -2.54918277983062 T:C T C 10 0.555327956422522 0.347681760793844 ENSG00000107863:ENST00000396432:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000320481:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000486374:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000376410:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000445703:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000446003:exon_24908402_24910298:ARHGAP21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 25312689 A/G 0 8 0 8 3.55737634861982 0 3.55737634861982 A A 10 0.555327956422522 0.0105734315433712 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 13 8 21 5.78073656650721 4.44262365138018 1.33811291512704 T:C C T 10 0.555327956422522 0.66298519208265 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 27324405 G/A 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:G G A 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27323725_27324681:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27323725_27324681:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27323725_27324681:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27323725_27324681:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27323725_27324681:ANKRD26 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 27389314 C/T 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C C T 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27389014_27389405:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27389014_27389427:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27389014_27389427:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27389014_27389421:ANKRD26 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 27437964 T/C 1 91 89 180 40.4651559655505 49.4241881216045 -8.95903215605396 T:C T C 10 0.555327956422522 0.202190640550954 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000493741:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27437835_27437969:YME1L1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 27458898 C/A 1 11 16 27 4.89139247935226 8.88524730276035 -3.99385482340809 A:C C A 10 0.555327956422522 0.126560104686365 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 27499771 G/A 1 26 14 40 11.5614731330144 7.77459138991531 3.78688174309912 A:G G A 10 0.555327956422522 0.266632510667905 ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27499743_27500010:ACBD5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 27499804 T/C 1 24 19 43 10.6721290458595 10.5512311720279 0.120897873831556 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27499743_27500010:ACBD5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 27499979 G/T 1 18 16 34 8.0040967843946 8.88524730276035 -0.881150518365747 T:G G T 10 0.555327956422522 0.863350207608527 ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27499743_27500010:ACBD5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 27506961 G/A 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000426079:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000412279:exon_27506912_27507112:ACBD5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 31138817 G/A 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:G G A 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000183621:ENST00000331737:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000361310:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000413025:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000436087:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000442986:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000452305:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000444692:exon_31137460_31139296:ZNF438 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 35302705 C/T 1 40 26 66 17.7868817430991 14.4385268669856 3.34835487611355 T:C C T 10 0.555327956422522 0.458183722221579 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35302627_35302728:CUL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 38407519 A/G 1 17 8 25 7.55942474081713 4.44262365138018 3.11680108943695 A:G A G 10 0.555327956422522 0.232942365111759 ENSG00000075407:ENST00000361085:exon_38406318_38411511:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000351773:exon_38406318_38412276:ZNF37A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 43088919 T/G 1 12 15 27 5.33606452292974 8.32991934633783 -2.99385482340809 T:G T G 10 0.555327956422522 0.252692291269657 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 43089965 G/A 1 6 11 17 2.66803226146487 6.10860752064774 -3.44057525918287 A:G G A 10 0.555327956422522 0.140894133470777 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 43315693 G/A 1 43 45 88 19.1208978738316 24.9897580390135 -5.86886016518193 A:G G A 10 0.555327956422522 0.237974218840302 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43315684_43315872:BMS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 43319197 G/A 1 42 52 94 18.6762258302541 28.8770537339711 -10.2008279037171 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0377854416034572 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43319057_43319232:BMS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 46121429 A/G 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 A:G A G 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000172671:ENST00000374366:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000344646:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374370:exon_46121399_46122553:ANUBL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 50740600 C/T 1 5 9 14 2.22336021788739 4.9979516078027 -2.77459138991531 T:C C T 10 0.555327956422522 0.179216881393606 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000447839:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000515869:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000342592:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000462247:exon_50740589_50741024:ERCC6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 50740876 G/C 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 C:G G C 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000447839:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000515869:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000342592:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000462247:exon_50740589_50741024:ERCC6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 52026532 G/A 0 24 0 24 10.6721290458595 0 10.6721290458595 G G 10 0.555327956422522 8.50571616019602e-07 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 17 32 49 7.55942474081713 17.7704946055207 -10.2110698647036 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00380497361050386 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 53458047 A/G 1 42 62 104 18.6762258302541 34.4303332981964 -15.7541074679423 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00212773654066296 ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 53458998 A/G 1 36 62 98 16.0081935687892 34.4303332981964 -18.4221397294071 A:G A G 10 0.555327956422522 0.000220804071629343 ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 59956041 C/T 1 11 5 16 4.89139247935226 2.77663978211261 2.11475269723965 T:C C T 10 0.555327956422522 0.325169767810241 ENSG00000151151:ENST00000373935:exon_59951278_59956459:IPMK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 61552692 G/T 1 16 21 37 7.11475269723965 11.661887084873 -4.54713438763331 T:G G T 10 0.555327956422522 0.139568461922462 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552607_61552732:CCDC6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 61552774 C/T 1 14 11 25 6.22540861008469 6.10860752064774 0.11680108943695 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552735_61552869:CCDC6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 62553763 A/G 1 16 17 33 7.11475269723965 9.44057525918287 -2.32582256194322 A:G A G 10 0.555327956422522 0.484522039393785 ENSG00000170312:ENST00000395284:exon_62553635_62554610:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000316629:exon_62553635_62554601:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000448257:exon_62553635_62554586:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000373809:exon_62553635_62554610:CDK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 16 10 26 7.11475269723965 5.55327956422522 1.56147313301443 A:G G A 10 0.555327956422522 0.561847305125949 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 64973907 C/A 1 18 10 28 8.0040967843946 5.55327956422522 2.45081722016939 A:C C A 10 0.555327956422522 0.447757015649459 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 64974380 G/C 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 C:G G C 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 69666598 T/C 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 T:C T C 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000096717:ENST00000212015:exon_69666547_69666694:SIRT1;ENSG00000096717:ENST00000432464:exon_69666547_69666694:SIRT1;ENSG00000096717:ENST00000473922:exon_69666547_69666636:SIRT1;ENSG00000096717:ENST00000406900:exon_69666547_69666694:SIRT1;ENSG00000096717:ENST00000403579:exon_69666547_69666694:SIRT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 69773841 G/A 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69773783_69773943:HERC4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 70502288 G/A 1 20 27 47 8.89344087154956 14.9938548234081 -6.10041395185853 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0791336575527212 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70502133_70502326:CCAR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 70696713 C/T 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70696692_70696851:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70696692_70696851:DDX50 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 70947404 C/T 1 11 5 16 4.89139247935226 2.77663978211261 2.11475269723965 T:C C T 10 0.555327956422522 0.325169767810241 ENSG00000156502:ENST00000359655:exon_70947398_70947512:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000471069:exon_70947398_70947512:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000483572:exon_70947398_70947512:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000478227:exon_70947398_70947512:SUPV3L1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 71103597 C/G 1 14 18 32 6.22540861008469 9.9959032156054 -3.7704946055207 C:G C G 10 0.555327956422522 0.213585949813489 ENSG00000156515:ENST00000450646:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000464803:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000480047:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483077:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000476368:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483054:exon_71103583_71103646:HK1;ENSG00000156515:ENST00000421088:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000436817:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000493591:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000450557:exon_71103583_71103745:HK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 71874048 G/A 1 36 41 77 16.0081935687892 22.7684462133234 -6.76025264453419 A:G G A 10 0.555327956422522 0.136033803763642 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71873901_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71872030_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71872030_71874085:AIFM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 51 54 105 22.6782742224514 29.9877096468162 -7.30943542436481 T:C C T 10 0.555327956422522 0.169139962353103 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 71880858 A/G 1 25 14 39 11.116801089437 7.77459138991531 3.34220969952164 A:G A G 10 0.555327956422522 0.334702054721937 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71880848_71880967:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71880848_71880967:AIFM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 71905695 A/G 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 71906150 T/C 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 T:C T C 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 72289701 G/A 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000107719:ENST00000263563:exon_72289645_72289824:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000373214:exon_72289645_72289824:KIAA1274 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 72307101 C/T 1 10 1 11 4.44672043577478 0.555327956422522 3.89139247935226 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0287031751756666 ENSG00000107719:ENST00000263563:exon_72307062_72307202:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000373214:exon_72307062_72307202:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000426268:exon_72307062_72307202:KIAA1274 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 72358475 G/C 1 2 50 52 0.889344087154956 27.7663978211261 -26.8770537339711 C:G G C 10 0.555327956422522 1.06479309083078e-15 ENSG00000180644:ENST00000373209:exon_72357104_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000441259:exon_72357105_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000318971:exon_72357105_72358937:PRF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 75506674 T/C 1 49 58 107 21.7889301352964 32.2090214725063 -10.4200913372099 T:C T C 10 0.555327956422522 0.051238976314436 ENSG00000176986:ENST00000411652:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000345254:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000465076:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000339365:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000477008:exon_75506625_75506762:SEC24C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 75527708 A/G 1 25 17 42 11.116801089437 9.44057525918287 1.67622583025408 A:G A G 10 0.555327956422522 0.64411754906678 ENSG00000176986:ENST00000411652:exon_75527595_75527765:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000345254:exon_75527595_75527765:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000465076:exon_75527595_75527765:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000339365:exon_75527595_75527765:SEC24C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 75533177 A/C 1 6 13 19 2.66803226146487 7.21926343349279 -4.55123117202792 A:C A C 10 0.555327956422522 0.0395254330154768 ENSG00000196968:ENST00000372841:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000394790:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000465695:exon_75532952_75534881:FUT11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 75558867 G/A 1 19 22 41 8.44876882797208 12.2172150412955 -3.7684462133234 A:G G A 10 0.555327956422522 0.272032670141761 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 75559077 G/A 1 16 14 30 7.11475269723965 7.77459138991531 -0.65983869267566 A:G G A 10 0.555327956422522 0.85539905852902 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 78084184 C/T 1 12 21 33 5.33606452292974 11.661887084873 -6.32582256194323 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0343656255017199 ENSG00000148655:ENST00000354343:exon_78084159_78084243:C10orf11;ENSG00000148655:ENST00000372499:exon_78084159_78084243:C10orf11;ENSG00000148655:ENST00000488655:exon_78084159_78084243:C10orf11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 86131003 T/C 1 3 9 12 1.33401613073243 4.9979516078027 -3.66393547707026 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0418446542055081 ENSG00000107771:ENST00000359979:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86130770_86132225:FAM190B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 86131059 A/G 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 A:G A G 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000107771:ENST00000359979:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86130770_86132225:FAM190B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 8 2 10 3.55737634861982 1.11065591284504 2.44672043577478 T:C T C 10 0.555327956422522 0.201545371859033 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 88277457 C/T 1 51 56 107 22.6782742224514 31.0983655596612 -8.42009133720985 T:C C T 10 0.555327956422522 0.119231901448225 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88277328_88277848:WAPAL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 88930381 G/A 1 7 15 22 3.11270430504235 8.32991934633783 -5.21721504129548 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0310519344066395 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 13 12 25 5.78073656650721 6.66393547707026 -0.883198910563049 A:C:G C G 10 0.555327956422522 0.841067314696951 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 91065809 T/C 1 38 28 66 16.8975376559442 15.5491827798306 1.34835487611355 T:C T C 10 0.555327956422522 0.804831286044213 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 91162182 C/T 1 55 68 123 24.4569623967613 37.7623010367315 -13.3053386399702 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0180757026929598 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 91162677 C/T 1 50 49 99 22.2336021788739 27.2110698647036 -4.97746768582968 T:C C T 10 0.555327956422522 0.314197921338313 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 91404448 C/G 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000152782:ENST00000307534:exon_91404357_91405215:PANK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 91468925 C/G 1 15 12 27 6.67008065366217 6.66393547707026 0.0061451765919065 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000447580:exon_91468924_91469010:KIF20B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 91470834 A/C 1 7 1 8 3.11270430504235 0.555327956422522 2.55737634861982 A:C A C 10 0.555327956422522 0.0837859633971926 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000447580:exon_91470718_91470847:KIF20B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 91487649 A/T 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 A:T A T 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91487613_91487653:KIF20B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 91488979 A/T 1 10 6 16 4.44672043577478 3.33196773853513 1.11475269723965 A:T A T 10 0.555327956422522 0.624513862012014 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91488885_91489004:KIF20B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 21 18 39 9.33811291512704 9.9959032156054 -0.657790300478357 A:T T A 10 0.555327956422522 0.87279129294191 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 11 12 23 4.89139247935226 6.66393547707026 -1.77254299771801 A:G A G 10 0.555327956422522 0.531120817504268 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 13 13 26 5.78073656650721 7.21926343349279 -1.43852686698557 A:G A G 10 0.555327956422522 0.693891745956565 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 A:G A G 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 95276742 G/C 1 26 38 64 11.5614731330144 21.1024623440558 -9.5409892110414 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0228053951350692 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 13 26 39 5.78073656650721 14.4385268669856 -8.65779030047836 A:T A T 10 0.555327956422522 0.0059139698571815 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 27 21 48 12.0061451765919 11.661887084873 0.344258091718945 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 15 20 35 6.67008065366217 11.1065591284504 -4.43647847478827 A:G A G 10 0.555327956422522 0.17276317127097 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 96997670 A/G 1 642 518 1160 285.479451976741 287.659881426866 -2.18042945012547 A:C:G A G 10 0.555327956422522 0.905950887446864 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 96997820 A/G 1 303 283 586 134.735629203976 157.157811667574 -22.4221824635979 A:T:G A G 10 0.555327956422522 0.0673336344869033 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000492511:exon_96997697_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_96997767_96997868:PDLIM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 98287792 G/T 1 53 43 96 23.5676183096063 23.8791021261684 -0.311483816562109 T:G G T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000077147:ENST00000371142:exon_98287788_98287934:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000485093:exon_98287788_98287930:TM9SF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 98369536 A/G 1 31 21 52 13.7848333509018 11.661887084873 2.12294626602886 A:G A G 10 0.555327956422522 0.579834100291356 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000467625:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98369469_98369624:PIK3AP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 98380137 T/C 1 54 43 97 24.0122903531838 23.8791021261684 0.133188227015371 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98380109_98380168:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000461252:exon_98380109_98380191:PIK3AP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 30 43 73 13.3401613073243 23.8791021261684 -10.5389408188441 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0178796962250020 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 98469507 C/A 1 9 11 20 4.0020483921973 6.10860752064774 -2.10655912845044 A:C C A 10 0.555327956422522 0.374427217398125 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 44 46 90 19.565569917409 25.545085995436 -5.97951607802698 T:C C T 10 0.555327956422522 0.205320229520911 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 99133378 G/A 1 14 12 26 6.22540861008469 6.66393547707026 -0.438526866985572 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99133332_99133494:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99133332_99133494:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99133332_99133494:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000490815:exon_99133332_99133494:RRP12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 99160965 A/G 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 A:G A G 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99160850_99161100:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99160850_99161040:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99160850_99161127:RRP12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 99220707 C/T 1 17 24 41 7.55942474081713 13.3278709541405 -5.7684462133234 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0834111646322127 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 99225846 C/T 1 17 8 25 7.55942474081713 4.44262365138018 3.11680108943695 T:C C T 10 0.555327956422522 0.232942365111759 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99225816_99225913:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434392:exon_99225816_99225916:MMS19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 101166544 C/T 1 46 50 96 20.454914004564 27.7663978211261 -7.31148381656211 T:C C T 10 0.555327956422522 0.150372017978738 ENSG00000120053:ENST00000370508:exon_101166483_101166606:GOT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 101716484 G/A 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 A:G G A 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101714971_101716962:DNMBP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 101912064 T/C 1 15 10 25 6.67008065366217 5.55327956422522 1.11680108943695 T:C T C 10 0.555327956422522 0.692593351989186 ENSG00000107566:ENST00000370410:exon_101909848_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000421367:exon_101909851_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000407654:exon_101911565_101912109:ERLIN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 102006681 C/T 1 19 6 25 8.44876882797208 3.33196773853513 5.11680108943695 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0442424474389262 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000468709:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000482452:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000466955:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000496796:exon_102006552_102006692:CWF19L1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 102116311 A/C 1 106 114 220 47.1352366192127 63.3073870321675 -16.1721504129548 A:C A C 10 0.555327956422522 0.0299071951747362 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102116289_102116367:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102116289_102116521:SCD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 102703849 A/C 1 3 10 13 1.33401613073243 5.55327956422522 -4.21926343349279 A:C A C 10 0.555327956422522 0.0239466351830008 ENSG00000119906:ENST00000238961:exon_102703783_102703885:FAM178A;ENSG00000119906:ENST00000370269:exon_102703783_102703885:FAM178A;ENSG00000119906:ENST00000481654:exon_102703411_102703885:FAM178A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 103825747 G/A 1 21 16 37 9.33811291512704 8.88524730276035 0.452865612366686 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000166189:ENST00000299238:exon_103825147_103827790:HPS6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 104140348 G/A 1 30 36 66 13.3401613073243 19.9918064312108 -6.65164512388645 A:G G A 10 0.555327956422522 0.107899117760708 ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104140263_104140443:GBF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 104157711 T/G 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 T:G T G 10 0.555327956422522 0.739711191898725 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 104572963 T/C 1 21 7 28 9.33811291512704 3.88729569495765 5.45081722016938 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0552248516291591 ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 104573017 G/T 1 15 7 22 6.67008065366217 3.88729569495765 2.78278495870452 T:G G T 10 0.555327956422522 0.285994739228917 ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 36 44 80 16.0081935687892 24.434430082591 -8.42623651380176 A:G G A 10 0.555327956422522 0.07122968377303 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 104934709 T/C 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 T:C T C 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000452156:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000461461:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369853:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000470299:exon_104934615_104934739:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000467380:exon_104934615_104934739:NT5C2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 29 25 54 12.8954892637469 13.883198910563 -0.987709646816187 T:C C T 10 0.555327956422522 0.786122279703696 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 105205302 A/C 1 31 21 52 13.7848333509018 11.661887084873 2.12294626602886 A:C A C 10 0.555327956422522 0.579834100291356 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105205135_105206049:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000478543:exon_105205135_105205481:PDCD11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 53 19 72 23.5676183096063 10.5512311720279 13.0163871375784 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00191177732644567 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 105657363 C/G 1 17 11 28 7.55942474081713 6.10860752064774 1.45081722016938 C:G C G 10 0.555327956422522 0.704654895104891 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105657306_105657477:OBFC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 105882765 A/G 1 8 4 12 3.55737634861982 2.22131182569009 1.33606452292974 A:G A G 10 0.555327956422522 0.56621841747708 ENSG00000156384:ENST00000369729:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000463224:exon_105882723_105883121:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000369727:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000336358:exon_105882524_105882844:C10orf78 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 106027059 G/A 1 70 55 125 31.1270430504235 30.5430376032387 0.584005447184754 A:G G A 10 0.555327956422522 0.9285917359402 ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106027010_106027215:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369710:exon_106027010_106027211:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106027010_106027123:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000432659:exon_106027010_106027162:GSTO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 114154815 C/T 1 15 12 27 6.67008065366217 6.66393547707026 0.0061451765919065 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000197142:ENST00000354655:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000479936:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000393081:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000356116:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000433418:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000369410:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000354273:exon_114154676_114154860:ACSL5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 114169276 A/G 1 23 27 50 10.227457002282 14.9938548234081 -4.7663978211261 A:G A G 10 0.555327956422522 0.200588244921778 ENSG00000197142:ENST00000354655:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000393081:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000356116:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000433418:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000369410:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000354273:exon_114169265_114169443:ACSL5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 114200355 G/A 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 A:G G A 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000023041:ENST00000369405:exon_114200292_114200453:ZDHHC6;ENSG00000023041:ENST00000369404:exon_114200292_114200453:ZDHHC6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 115922774 G/A 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369286:exon_115921367_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369285:exon_115921367_115923088:C10orf118 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 116615045 T/C 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 T:C T C 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000151553:ENST00000369248:exon_116614956_116615099:FAM160B1;ENSG00000151553:ENST00000369250:exon_116614956_116615099:FAM160B1;ENSG00000151553:ENST00000392942:exon_116614956_116615099:FAM160B1;ENSG00000151553:ENST00000455766:exon_116614956_116615099:FAM160B1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 116702425 A/C 1 14 15 29 6.22540861008469 8.32991934633783 -2.10451073625314 A:C A C 10 0.555327956422522 0.459182512082066 ENSG00000165832:ENST00000298746:exon_116702404_116702502:TRUB1;ENSG00000165832:ENST00000485065:exon_116702404_116702502:TRUB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 119133968 G/C 1 5 10 15 2.22336021788739 5.55327956422522 -3.32991934633783 C:G G C 10 0.555327956422522 0.117258617190494 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119133867_119134978:PDZD8;ENSG00000165650:ENST00000489491:exon_119133867_119133992:PDZD8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 119134058 T/C 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119133867_119134978:PDZD8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 120810098 C/T 1 218 201 419 96.9385054998902 111.620919240927 -14.6824137410367 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.154102501279320 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120810033_120810186:EIF3A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 120828969 A/G 1 91 64 155 40.4651559655505 35.5409892110414 4.92416675450909 A:G A G 10 0.555327956422522 0.467190830503882 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120828958_120829166:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120828958_120828985:EIF3A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 120920588 T/C 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 T:C T C 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 123549691 T/G 1 13 20 33 5.78073656650721 11.1065591284504 -5.32582256194322 T:G T G 10 0.555327956422522 0.0787801500475162 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000485281:exon_123549684_123549741:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000470613:exon_123549378_123549804:ATE1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 123724850 C/T 1 36 23 59 16.0081935687892 12.772542997718 3.2356505710712 T:C C T 10 0.555327956422522 0.433616178282923 ENSG00000107672:ENST00000369023:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000489266:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000468209:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000482078:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000369017:exon_123724801_123724900:NSMCE4A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 124742792 G/A 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 124742858 G/A 1 6 8 14 2.66803226146487 4.44262365138018 -1.77459138991531 A:G G A 10 0.555327956422522 0.423022312731772 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000496079:exon_124742806_124742986:PSTK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 124742895 G/C 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 C:G G C 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000496079:exon_124742806_124742986:PSTK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 127452054 G/A 1 14 20 34 6.22540861008469 11.1065591284504 -4.88115051836575 A:G G A 10 0.555327956422522 0.119328286684192 ENSG00000107938:ENST00000419769:exon_127451870_127452148:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000481600:exon_127451870_127452093:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000356792:exon_127451870_127452220:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368815:exon_127451870_127452220:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000337623:exon_127451870_127452708:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000433226:exon_127451870_127452703:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000450404:exon_127451870_127452703:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000527655:exon_127451870_127452275:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368812:exon_127451870_127452712:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000525358:exon_127451870_127452151:C10orf137 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 4 9 13 1.77868817430991 4.9979516078027 -3.21926343349279 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0940602799732446 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 129903802 A/G 1 182 141 323 80.930311931101 78.3012418555756 2.62907007552541 A:G A G 10 0.555327956422522 0.7798248077342 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 129904036 C/T 1 177 170 347 78.7069517132136 94.4057525918287 -15.6988008786151 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0940639017802097 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 129904560 C/T 1 135 152 287 60.0307258829595 84.4098493762233 -24.3791234932638 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00429064000921202 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 129904917 G/A 1 183 164 347 81.3749839746785 91.0737848532936 -9.69880087861512 A:G G A 10 0.555327956422522 0.304947314901397 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 129917560 T/C 1 43 47 90 19.1208978738316 26.1004139518585 -6.97951607802698 A:T:C T C 10 0.555327956422522 0.167582270875400 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129917517_129917583:MKI67 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 131959150 C/T 1 51 42 93 22.6782742224514 23.3237741697459 -0.645499947294546 T:C C T 10 0.555327956422522 0.917133410959695 ENSG00000108010:ENST00000331244:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000368644:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000481034:exon_131959060_131959261:GLRX3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 133769482 G/C 1 49 60 109 21.7889301352964 33.3196773853513 -11.5307472500549 T:C:G G C 10 0.555327956422522 0.0334930819502011 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 1 11 1 12 4.89139247935226 0.555327956422522 4.33606452292974 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0162334658720244 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 1 10 1 11 4.44672043577478 0.555327956422522 3.89139247935226 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0287031751756666 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 13 1 14 5.78073656650721 0.555327956422522 5.22540861008469 T:G G T 10 0.555327956422522 0.00513485269272785 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 1 8 9 0.444672043577478 4.44262365138018 -3.9979516078027 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0133428681828177 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 134459388 A/G 1 8 2 10 3.55737634861982 1.11065591284504 2.44672043577478 A:G A G 10 0.555327956422522 0.201545371859033 ENSG00000068383:ENST00000368594:exon_134459372_134459472:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000368593:exon_134459372_134459472:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000432898:exon_134459372_134459472:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000368595:exon_134459372_134459472:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000451873:exon_134459372_134459472:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000342652:exon_134459372_134459472:INPP5A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 135076523 C/A 1 132 99 231 58.6967097522271 54.9774676858297 3.71924206639743 A:C C A 10 0.555327956422522 0.643478088762148 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 135076596 T/C 1 87 65 152 38.6864677912406 36.0963171674639 2.59015062377666 T:C T C 10 0.555327956422522 0.684208156348256 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 135076758 T/C 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 T:C T C 10 0.555327956422522 0.198922593064512 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 135082346 A/G 1 44 30 74 19.565569917409 16.6598386926757 2.90573122473337 A:G A G 10 0.555327956422522 0.559160167702209 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 135085321 C/T 1 37 25 62 16.4528656123667 13.883198910563 2.56966670180364 T:C C T 10 0.555327956422522 0.526261090986247 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 135085426 A/G 1 61 61 122 27.1249946582262 33.8750053417738 -6.75001068354768 A:G A G 10 0.555327956422522 0.236550677393657 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 135087521 G/A 1 39 28 67 17.3422096995216 15.5491827798306 1.79302691969103 A:G G A 10 0.555327956422522 0.713139315267676 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 135097434 A/G 1 21 27 48 9.33811291512704 14.9938548234081 -5.65574190828105 A:G A G 10 0.555327956422522 0.110847873905305 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135097386_135097506:TUBGCP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 135098672 G/A 1 17 23 40 7.55942474081713 12.772542997718 -5.21311825690088 A:G G A 10 0.555327956422522 0.11184424593338 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135098589_135098717:TUBGCP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 135112940 C/T 1 19 22 41 8.44876882797208 12.2172150412955 -3.7684462133234 T:C C T 10 0.555327956422522 0.272032670141761 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000487796:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135112939_135113107:TUBGCP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 10 135122507 G/A 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 A:G G A 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135122327_135122644:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135122327_135122638:TUBGCP2;ENSG00000198546:ENST00000361518:exon_135121979_135122600:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000359035:exon_135122445_135122600:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000482153:exon_135122453_135122600:ZNF511 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 562219 C/G 1 21 12 33 9.33811291512704 6.66393547707026 2.67417743805677 C:G C G 10 0.555327956422522 0.385332191758548 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 562421 G/A 1 10 10 20 4.44672043577478 5.55327956422522 -1.10655912845044 A:G G A 10 0.555327956422522 0.657502601953682 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_562385_562776:RASSF7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 563257 G/A 1 15 11 26 6.67008065366217 6.10860752064774 0.561473133014428 A:G G A 10 0.555327956422522 0.84687533574258 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563189_563478:RASSF7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 563649 C/T 1 7 14 21 3.11270430504235 7.77459138991531 -4.66188708487296 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0482087998619483 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563558_564018:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563558_564021:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563558_563685:RASSF7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 653968 T/C 1 13 30 43 5.78073656650721 16.6598386926757 -10.8791021261684 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00105517039723711 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_653941_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_653962_654051:DEAF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 654043 G/A 1 19 8 27 8.44876882797208 4.44262365138018 4.00614517659191 A:G G A 10 0.555327956422522 0.174107580548536 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_653941_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_653962_654051:DEAF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 674499 G/A 1 8 2 10 3.55737634861982 1.11065591284504 2.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 0.201545371859033 ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_674372_674783:DEAF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 13 19 32 5.78073656650721 10.5512311720279 -4.7704946055207 A:G A G 10 0.555327956422522 0.109011061329792 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 793588 G/A 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000177542:ENST00000320230:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531214:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000481290:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531437:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000529351:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000533385:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000526152:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000528606:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000527734:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000527723:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531514:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000528936:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000456706:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000532484:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000524891:exon_793478_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000529066:exon_793587_793619:SLC25A22 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 823799 C/G 1 49 40 89 21.7889301352964 22.2131182569009 -0.424188121604455 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_823694_823855:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_823527_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_823694_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000526083:exon_823648_823855:PNPLA2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 823809 C/G 1 50 37 87 22.2336021788739 20.5471343876333 1.68646779124059 C:G C G 10 0.555327956422522 0.747189190738801 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_823694_823855:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_823527_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_823694_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000526083:exon_823648_823855:PNPLA2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 972118 C/A 1 17 23 40 7.55942474081713 12.772542997718 -5.21311825690088 A:C C A 10 0.555327956422522 0.11184424593338 ENSG00000183020:ENST00000529818:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000529125:exon_972062_972124:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000531548:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534485:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527024:exon_972062_972216:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000526753:exon_972062_972197:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000530801:exon_972062_972191:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000524559:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_972102_972255:AP2A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 985547 C/T 1 16 13 29 7.11475269723965 7.21926343349279 -0.104510736253137 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_985435_985586:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_985435_985597:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_983146_987654:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527917:exon_985384_985582:AP2A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 1874404 C/T 1 344 209 553 152.967182990652 116.063542892307 36.9036400983453 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00153435035546805 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1874200_1874427:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1874200_1874427:LSP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 1902768 G/A 1 203 164 367 90.268424846228 91.0737848532936 -0.805360007065559 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0.95812617779498 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000421485:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000446808:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381775:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381758:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000405957:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000451814:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000457279:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000429923:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000406638:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000418975:exon_1902662_1902782:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000417766:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381768:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000472974:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000432093:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000485341:exon_1902662_1902826:LSP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 1959707 C/T 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C C T 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000130595:ENST00000278317:exon_1959668_1959936:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381549:exon_1959668_1959935:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381561:exon_1959668_1959935:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000397309:exon_1959668_1959935:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381548:exon_1959668_1959935:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000360603:exon_1959668_1959935:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381589:exon_1959668_1959936:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381579:exon_1959668_1959936:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381557:exon_1959668_1959931:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381563:exon_1959668_1959722:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000344578:exon_1959668_1959722:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381558:exon_1959668_1959936:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000397301:exon_1959668_1959722:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000397304:exon_1959668_1959722:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000446240:exon_1959668_1959722:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000473100:exon_1959668_1959932:TNNT3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 2943671 G/C 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 C:G G C 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000463571:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000441077:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449603:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000495518:exon_2943666_2943786:SLC22A18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 3028140 G/A 1 21 51 72 9.33811291512704 28.3217257775486 -18.9836128624216 A:G G A 10 0.555327956422522 7.62816495676076e-06 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000484484:exon_3028109_3028240:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000466442:exon_3028109_3030127:CARS;ENSG00000110619:ENST00000470221:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3028109_3028189:CARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 17 15 32 7.55942474081713 8.32991934633783 -0.770494605520703 C:G G C 10 0.555327956422522 0.859436806449628 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 3714489 C/T 1 14 17 31 6.22540861008469 9.44057525918287 -3.21516664909818 T:C C T 10 0.555327956422522 0.279937122020371 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000429801:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000524563:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000530345:exon_3714287_3714605:NUP98 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 4411278 C/T 1 46 38 84 20.454914004564 21.1024623440558 -0.647548339491845 T:C C T 10 0.555327956422522 0.912847193303019 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4411232_4411688:TRIM21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 5688940 C/T 1 15 15 30 6.67008065366217 8.32991934633783 -1.65983869267566 T:C C T 10 0.555327956422522 0.584377790818652 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5688919_5688941:TRIM5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 26 13 39 11.5614731330144 7.21926343349279 4.34220969952164 T:C T C 10 0.555327956422522 0.197530044502360 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 5701281 G/A 1 43 35 78 19.1208978738316 19.4364784747883 -0.315580600956714 A:T:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 5701409 G/C 1 28 22 50 12.4508172201694 12.2172150412955 0.2336021788739 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 125 126 251 55.5840054471848 69.9713225092378 -14.387317062053 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0751746255840534 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 168 144 312 74.7049033210163 79.9672257248432 -5.26232240382686 A:G G A 10 0.555327956422522 0.569077577477473 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 185 98 283 82.2643280618334 54.4221397294072 27.8421883324263 T:C T C 10 0.555327956422522 0.000968931334321763 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 221 157 378 98.2725216306226 87.1864891583359 11.0860324722867 T:C:G G C 10 0.555327956422522 0.255358752371165 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 6340525 A/T 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 A:T A T 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 6340706 A/G 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 6519642 G/A 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 A:G G A 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6519001_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000354685:exon_6518815_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000477562:exon_6519538_6519919:DNHD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 6520164 T/A 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 A:T T A 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000179532:ENST00000473019:exon_6519953_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6519001_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000354685:exon_6518815_6520191:DNHD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 6622218 G/A 1 11 7 18 4.89139247935226 3.88729569495765 1.0040967843946 A:G G A 10 0.555327956422522 0.813417267911682 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622156_6622285:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000526352:exon_6622156_6622534:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 6622714 G/A 1 17 20 37 7.55942474081713 11.1065591284504 -3.54713438763331 A:G G A 10 0.555327956422522 0.251085232136404 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 89 89 178 39.5758118783955 49.4241881216045 -9.84837624320892 T:C C T 10 0.555327956422522 0.151753075624064 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 97 123 220 43.1331882270154 68.3053386399702 -25.1721504129548 A:G G A 10 0.555327956422522 0.000678191354975142 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 6631016 C/T 1 121 129 250 53.8053172728748 71.6373063785053 -17.8319891056305 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.0257779519789372 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630955_6631046:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 6632450 C/T 1 244 219 463 108.499978632905 121.616822456532 -13.1168438236277 T:C C T 10 0.555327956422522 0.224275837412787 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000299424:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000527248:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000531760:exon_6632419_6632534:TAF10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 6636106 T/A 1 41 39 80 18.2315537866766 21.6577903004784 -3.42623651380176 A:T T A 10 0.555327956422522 0.499932806237923 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000429085:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000524611:exon_6636097_6636222:TPP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 7673015 G/A 1 13 15 28 5.78073656650721 8.32991934633783 -2.54918277983062 A:G G A 10 0.555327956422522 0.347681760793844 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 8977830 A/G 1 9 16 25 4.0020483921973 8.88524730276035 -4.88319891056305 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0682222779667574 ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 9225486 C/G 1 15 15 30 6.67008065366217 8.32991934633783 -1.65983869267566 C:G C G 10 0.555327956422522 0.584377790818652 ENSG00000184014:ENST00000328194:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000530044:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000526707:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000532696:exon_9225079_9225864:DENND5A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 9754221 C/T 1 51 37 88 22.6782742224514 20.5471343876333 2.13113983481806 T:C C T 10 0.555327956422522 0.669390402874231 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9754076_9754257:SWAP70 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 9769483 C/T 1 76 88 164 33.7950753118883 48.8688601651819 -15.0737848532936 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0184663978734918 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 9769562 C/G 1 105 85 190 46.6905645756352 47.2028762959144 -0.512311720279172 C:G C G 10 0.555327956422522 0.941948786359244 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 10786142 C/T 1 24 36 60 10.6721290458595 19.9918064312108 -9.31967738535132 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0188130311812128 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 11354346 T/C 1 8 1 9 3.55737634861982 0.555327956422522 3.0020483921973 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0495403730021064 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11354241_11354378:GALNTL4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 11913585 G/T 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 T:G G T 10 0.555327956422522 0.605558868068935 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11913515_11913653:USP47;ENSG00000170242:ENST00000525267:exon_11913537_11913653:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11913515_11913653:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11913515_11913653:USP47 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 11976628 G/A 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11976581_11976711:USP47 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 13408159 A/C 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 A:C A C 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000133794:ENST00000389707:exon_13408143_13408813:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000401424:exon_13408143_13408813:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000403290:exon_13408143_13408813:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000361003:exon_13408143_13408808:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000389708:exon_13408143_13408808:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000403510:exon_13408143_13408810:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000339640:exon_13408143_13408808:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000403482:exon_13408143_13408813:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000524392:exon_13408143_13408813:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000472842:exon_13408143_13408810:ARNTL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 13410371 A/G 1 21 15 36 9.33811291512704 8.32991934633783 1.00819356878921 A:G A G 10 0.555327956422522 0.867132456195878 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13409548_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13409571_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13410230_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13410249_13410688:BTBD10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 18505552 G/A 1 20 24 44 8.89344087154956 13.3278709541405 -4.43443008259097 A:G G A 10 0.555327956422522 0.224518747568463 ENSG00000074319:ENST00000357193:exon_18505417_18505619:TSG101;ENSG00000074319:ENST00000251968:exon_18505417_18505619:TSG101 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 18633897 T/C 1 14 14 28 6.22540861008469 7.77459138991531 -1.54918277983062 T:C T C 10 0.555327956422522 0.573526479524123 ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 20404613 T/G 1 34 36 70 15.1188494816343 19.9918064312108 -4.87295694957654 T:G T G 10 0.555327956422522 0.279093135130167 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 20404757 T/C 1 44 48 92 19.565569917409 26.6557419082811 -7.09017199087202 T:C T C 10 0.555327956422522 0.142860319439172 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 22647366 G/A 1 10 4 14 4.44672043577478 2.22131182569009 2.22540861008469 A:G G A 10 0.555327956422522 0.288383222971717 ENSG00000183161:ENST00000327470:exon_22644079_22647387:FANCF HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 32417945 T/C 1 7 1 8 3.11270430504235 0.555327956422522 2.55737634861982 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0837859633971926 ENSG00000184937:ENST00000379079:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000379077:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000332351:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000448076:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000530998:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000452863:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000527882:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000526685:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000527775:exon_32417912_32417953:WT1;ENSG00000254439:ENST00000526998:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000254611:ENST00000524721:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000254922:ENST00000527201:exon_32417803_32417953:AL049692.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 32874926 G/A 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 A:G G A 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 33053107 C/T 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000121690:ENST00000241051:exon_33052924_33053135:DEPDC7;ENSG00000121690:ENST00000311388:exon_33052924_33053135:DEPDC7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 33065394 C/T 1 11 14 25 4.89139247935226 7.77459138991531 -2.88319891056305 T:C C T 10 0.555327956422522 0.3145412245025 ENSG00000176148:ENST00000532687:exon_33065296_33065658:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33065301_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528898:exon_33065296_33065482:TCP11L1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 33076191 T/C 1 12 17 29 5.33606452292974 9.44057525918287 -4.10451073625314 T:C T C 10 0.555327956422522 0.137511299610045 ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33076139_33076271:TCP11L1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 34489900 C/T 1 13 14 27 5.78073656650721 7.77459138991531 -1.99385482340809 T:C C T 10 0.555327956422522 0.446307655179609 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34489835_34489942:CAT;ENSG00000121691:ENST00000525707:exon_34489835_34490078:CAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 12 20 32 5.33606452292974 11.1065591284504 -5.7704946055207 T:C C T 10 0.555327956422522 0.04951094379604 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 34916657 C/T 1 14 11 25 6.22540861008469 6.10860752064774 0.11680108943695 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34916557_34916657:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34916557_34916657:APIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 11 10 21 4.89139247935226 5.55327956422522 -0.661887084872961 A:G G A 10 0.555327956422522 0.828131296920228 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 34969112 A/G 1 13 11 24 5.78073656650721 6.10860752064774 -0.327870954140527 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000110435:ENST00000533550:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34969053_34969153:PDHX HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 43913604 G/A 1 21 13 34 9.33811291512704 7.21926343349279 2.11884948163425 A:G G A 10 0.555327956422522 0.495256249707322 ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43913591_43913679:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529366:exon_43913591_43913679:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530754:exon_43913591_43913679:ALKBH3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 44089352 G/A 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 A:G G A 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000110455:ENST00000524990:exon_44089178_44089465:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44089178_44089465:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44089178_44089465:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44089178_44089465:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000526577:exon_44089178_44089465:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000533404:exon_44089178_44089409:ACCS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 44129290 C/A 1 4 10 14 1.77868817430991 5.55327956422522 -3.77459138991531 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0577678010140113 ENSG00000151348:ENST00000533608:exon_44129233_44129798:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000395673:exon_44129178_44129798:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000532479:exon_44129233_44129409:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000527014:exon_44129233_44129599:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000358681:exon_44129233_44129798:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000343631:exon_44129233_44129798:EXT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 44639932 G/A 0 0 8 8 0 4.44262365138018 -4.44262365138018 A G A 10 0.555327956422522 0.00152868713451737 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 407 367 774 180.981521736034 203.805360007066 -22.823838271032 A:G A G 10 0.555327956422522 0.103595885866109 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 45827350 A/G 1 14 14 28 6.22540861008469 7.77459138991531 -1.54918277983062 A:G A G 10 0.555327956422522 0.573526479524123 ENSG00000181830:ENST00000314134:exon_45825957_45827887:SLC35C1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 29 18 47 12.8954892637469 9.9959032156054 2.89958604814147 A:C:G A G 10 0.555327956422522 0.46380978093646 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 45975130 C/T 1 18 13 31 8.0040967843946 7.21926343349279 0.784833350901819 T:C C T 10 0.555327956422522 0.857621437102788 ENSG00000135365:ENST00000257821:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527401:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000323180:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000418153:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527753:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000534766:exon_45975078_45975166:PHF21A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 46812106 G/C 1 43 34 77 19.1208978738316 18.8811505183657 0.239747355465809 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000175216:ENST00000529230:exon_46812020_46812133:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000415402:exon_46812020_46812133:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000312055:exon_46812020_46812133:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000378629:exon_46812020_46812133:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000354558:exon_46812020_46812133:CKAP5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 47298360 G/A 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 A:G G A 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000428807:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000489415:exon_47298256_47298414:MADD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 47303275 T/C 1 9 14 23 4.0020483921973 7.77459138991531 -3.77254299771801 T:C T C 10 0.555327956422522 0.141766408043743 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000489415:exon_47303126_47303304:MADD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 47306585 G/A 1 17 10 27 7.55942474081713 5.55327956422522 2.00614517659191 A:G G A 10 0.555327956422522 0.562156482279236 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000524530:exon_47306497_47306616:MADD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 47434986 G/A 1 12 14 26 5.33606452292974 7.77459138991531 -2.43852686698557 A:G G A 10 0.555327956422522 0.430498156832276 ENSG00000165915:ENST00000533076:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000441589:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000362021:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000354884:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000526614:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000524928:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000529740:exon_47434951_47435058:SLC39A13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 47640429 G/C 1 42 45 87 18.6762258302541 24.9897580390135 -6.31353220875941 C:G G C 10 0.555327956422522 0.195457795654912 ENSG00000109919:ENST00000302503:exon_47638868_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000534074:exon_47640256_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000531669:exon_47640262_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000525649:exon_47640391_47640471:MTCH2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 47869855 C/T 1 11 6 17 4.89139247935226 3.33196773853513 1.55942474081713 T:C C T 10 0.555327956422522 0.477388500584111 ENSG00000030066:ENST00000378460:exon_47869771_47870019:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000426372:exon_47869771_47870057:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000530326:exon_47869771_47869865:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000263764:exon_47869771_47870057:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000532747:exon_47869771_47869882:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000526870:exon_47869771_47870107:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000529863:exon_47869771_47869886:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000458312:exon_47869771_47870057:NUP160 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 57193653 A/G 1 79 59 138 35.1290914426208 32.7643494289288 2.36474201369197 A:G A G 10 0.555327956422522 0.732159564739438 ENSG00000134802:ENST00000395123:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000395124:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000352187:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000428603:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529554:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533524:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530005:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528098:exon_57193462_57193952:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000442654:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000525474:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529112:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526125:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528187:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529494:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533245:exon_57193462_57193845:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533235:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000524863:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532795:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533051:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529896:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526621:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530316:exon_57193513_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529748:exon_57193580_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532278:exon_57193641_57193825:SLC43A3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 57463500 T/C 1 21 26 47 9.33811291512704 14.4385268669856 -5.10041395185853 T:C T C 10 0.555327956422522 0.143875822696293 ENSG00000156599:ENST00000527985:exon_57463392_57463515:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000287169:exon_57463392_57463515:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000529480:exon_57463392_57463515:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000529447:exon_57463392_57463515:ZDHHC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 57563991 C/T 1 16 18 34 7.11475269723965 9.9959032156054 -2.88115051836575 T:C C T 10 0.555327956422522 0.388695221433277 ENSG00000198561:ENST00000524630:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529919:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000399039:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361796:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000360682:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529526:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000426142:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000399050:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361391:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361332:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532463:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529986:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000358694:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532787:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532649:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000528621:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530748:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000428599:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000528232:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529873:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532844:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526357:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530094:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000415361:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532245:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000534579:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526938:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530068:exon_57563929_57564056:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000534647:exon_57563929_57564464:CTNND1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 58378424 A/G 1 19 22 41 8.44876882797208 12.2172150412955 -3.7684462133234 A:G A G 10 0.555327956422522 0.272032670141761 ENSG00000186660:ENST00000316059:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000186660:ENST00000389918:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000255073:ENST00000389919:exon_58378423_58378527:AP001350.3;ENSG00000255073:ENST00000422974:exon_58378423_58378527:AP001350.3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 58892521 A/G 1 46 29 75 20.454914004564 16.1045107362531 4.35040326831085 A:G A G 10 0.555327956422522 0.35316369688586 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 58892558 C/T 1 38 22 60 16.8975376559442 12.2172150412955 4.68032261464868 T:C C T 10 0.555327956422522 0.244055156804747 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 58919813 A/G 1 39 34 73 17.3422096995216 18.8811505183657 -1.5389408188441 A:G A G 10 0.555327956422522 0.725331234326913 ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 58940278 G/T 1 39 34 73 17.3422096995216 18.8811505183657 -1.5389408188441 T:G G T 10 0.555327956422522 0.725331234326913 ENSG00000110042:ENST00000227451:exon_58939965_58940279:DTX4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 61906374 T/C 1 10 12 22 4.44672043577478 6.66393547707026 -2.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.393799982731658 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61906360_61906477:INCENP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 62293948 G/A 1 18 6 24 8.0040967843946 3.33196773853513 4.67212904585947 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0645487273517298 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 62296586 T/C 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:C T C 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62296097_62301147:AHNAK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 62342994 C/T 1 22 21 43 9.78278495870452 11.661887084873 -1.87910212616845 T:C C T 10 0.555327956422522 0.645850639619903 ENSG00000149016:ENST00000476907:exon_62342520_62343716:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000469480:exon_62342530_62344489:TUT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 62407135 C/T 1 48 44 92 21.3442580917189 24.434430082591 -3.09017199087202 T:C C T 10 0.555327956422522 0.5304700137564 ENSG00000089597:ENST00000532402:exon_62407099_62407203:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000346178:exon_62407099_62407203:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000356638:exon_62407099_62407203:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000531841:exon_62407099_62407203:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000534613:exon_62407099_62407203:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000526210:exon_62407099_62407203:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000529737:exon_62407103_62407203:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000534419:exon_62407099_62407203:GANAB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 62496519 T/C 1 33 59 92 14.6741774380568 32.7643494289288 -18.090171990872 T:C T C 10 0.555327956422522 0.000203249717907132 ENSG00000162222:ENST00000530625:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000294161:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62496011_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62496295_62496558:TTC9C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 62559385 T/C 1 23 15 38 10.227457002282 8.32991934633783 1.89753765594416 T:C T C 10 0.555327956422522 0.625367432232606 ENSG00000168569:ENST00000528367:exon_62559151_62559464:TMEM223;ENSG00000168569:ENST00000525631:exon_62559151_62559469:TMEM223;ENSG00000168569:ENST00000307366:exon_62559151_62559493:TMEM223 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 62575025 A/T 1 93 70 163 41.3545000527055 38.8729569495765 2.48154310312891 A:T A T 10 0.555327956422522 0.752699898109778 ENSG00000162236:ENST00000377897:exon_62574369_62575138:STX5;ENSG00000162236:ENST00000294179:exon_62574369_62575100:STX5;ENSG00000162236:ENST00000394690:exon_62574397_62575100:STX5;ENSG00000162236:ENST00000492066:exon_62574408_62575100:STX5;ENSG00000162236:ENST00000491231:exon_62574409_62575100:STX5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 62592961 T/C 1 59 46 105 26.2356505710712 25.545085995436 0.690564575635193 T:C T C 10 0.555327956422522 0.922036571571027 ENSG00000162236:ENST00000377897:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000294179:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000394690:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000492066:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000491231:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000431400:exon_62592895_62592998:STX5;ENSG00000162236:ENST00000488303:exon_62592959_62593011:STX5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 62602983 A/G 1 66 42 108 29.3483548761136 23.3237741697459 6.02458070636763 A:T:C:G A G 10 0.555327956422522 0.286801965943208 ENSG00000133316:ENST00000311713:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000529106:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525239:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000278856:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525752:exon_62602903_62603004:WDR74 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 62623017 C/A 1 14 17 31 6.22540861008469 9.44057525918287 -3.21516664909818 A:C C A 10 0.555327956422522 0.279937122020371 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 62623019 A/G 1 14 16 30 6.22540861008469 8.88524730276035 -2.65983869267566 A:G A G 10 0.555327956422522 0.361419251986498 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 62623051 T/C 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 T:C T C 10 0.555327956422522 0.831864543663915 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 62652779 C/T 1 118 121 239 52.4713011421424 67.1946827271252 -14.7233815849827 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0590437101961851 ENSG00000168003:ENST00000377891:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377892:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377889:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377890:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000338663:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000422606:exon_62652649_62652829:SLC3A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 63585804 C/A 1 63 54 117 28.0143387453811 29.9877096468162 -1.97337090143507 A:C C A 10 0.555327956422522 0.711059541847078 ENSG00000168005:ENST00000294244:exon_63585688_63585837:C11orf84 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 63967459 C/T 1 115 131 246 51.13728501141 72.7479622913504 -21.6106772799404 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00578541686914255 ENSG00000168439:ENST00000358794:exon_63967412_63967508:STIP1;ENSG00000168439:ENST00000305218:exon_63967412_63967508:STIP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 63987031 G/C 1 120 131 251 53.3606452292974 72.7479622913504 -19.387317062053 A:C:G G C 10 0.555327956422522 0.0156576606120249 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63986996_63987130:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63986996_63987130:FERMT3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 63988045 G/A 1 165 180 345 73.3708871902839 99.959032156054 -26.5881449657701 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00477665794496815 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 63990541 C/T 1 143 105 248 63.5881022315794 58.3094354243648 5.27866680721455 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.523193730173249 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63990520_63990661:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63990520_63990661:FERMT3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 63992934 C/G 1 3 9 12 1.33401613073243 4.9979516078027 -3.66393547707026 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0418446542055081 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 64022913 C/T 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64022868_64022921:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64022868_64022921:PLCB3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 64032784 G/A 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:G G A 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64032782_64032974:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64032782_64032974:PLCB3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 64034911 G/A 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64034825_64035394:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64034825_64035394:PLCB3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 64039136 G/A 1 30 18 48 13.3401613073243 9.9959032156054 3.34425809171895 A:G G A 10 0.555327956422522 0.384505541119117 ENSG00000002330:ENST00000394532:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000309032:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000394531:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000493798:exon_64039085_64039340:BAD;ENSG00000002330:ENST00000492141:exon_64039085_64039275:BAD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 64074673 A/T 1 17 21 38 7.55942474081713 11.661887084873 -4.10246234405584 A:T A T 10 0.555327956422522 0.194191222889409 ENSG00000173153:ENST00000406310:exon_64074640_64074976:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000000442:exon_64074640_64074976:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000405666:exon_64074640_64074976:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000468670:exon_64074640_64074980:ESRRA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 64109148 G/A 1 24 24 48 10.6721290458595 13.3278709541405 -2.65574190828105 A:G G A 10 0.555327956422522 0.469745292824653 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 64138805 T/C 1 14 9 23 6.22540861008469 4.9979516078027 1.22745700228199 T:C T C 10 0.555327956422522 0.678479253472011 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64138755_64138813:RPS6KA4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 64138905 T/G 1 16 5 21 7.11475269723965 2.77663978211261 4.33811291512704 T:G T G 10 0.555327956422522 0.0771512171661889 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 64572018 T/C 1 31 30 61 13.7848333509018 16.6598386926757 -2.87500534177384 T:C T C 10 0.555327956422522 0.519882876612183 ENSG00000133895:ENST00000377316:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64571806_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64571847_64572288:MEN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 64695360 G/A 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000068971:ENST00000526559:exon_64695274_64695375:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000164133:exon_64695274_64695375:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000532850:exon_64695274_64695375:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000527441:exon_64695274_64695375:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000359279:exon_64695274_64695375:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000528530:exon_64695206_64695375:PPP2R5B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 64799998 T/C 1 10 7 17 4.44672043577478 3.88729569495765 0.559424740817127 T:C T C 10 0.555327956422522 0.813340797660957 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000525648:exon_64799903_64800023:SNX15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 15 13 28 6.67008065366217 7.21926343349279 -0.549182779830615 T:C C T 10 0.555327956422522 0.851250752295518 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 60 62 122 26.6803226146487 34.4303332981964 -7.75001068354768 T:C C T 10 0.555327956422522 0.171906422092389 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 64972286 G/C 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 C:G G C 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533079:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530495:exon_64972154_64972329:CAPN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 64977890 G/A 1 34 37 71 15.1188494816343 20.5471343876333 -5.42828490599906 A:G G A 10 0.555327956422522 0.232197445941527 ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64977807_64977923:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64977807_64977923:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64977807_64977923:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64977807_64977923:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64977807_64977923:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64977807_64977923:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528165:exon_64977807_64977923:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530567:exon_64977807_64977923:CAPN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 65161129 C/T 1 10 10 20 4.44672043577478 5.55327956422522 -1.10655912845044 T:C C T 10 0.555327956422522 0.657502601953682 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000528854:exon_65161044_65161226:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65161044_65161145:FRMD8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 65168281 C/T 1 16 7 23 7.11475269723965 3.88729569495765 3.22745700228199 T:C C T 10 0.555327956422522 0.210713456641927 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65168195_65168338:FRMD8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 66031660 C/T 1 39 18 57 17.3422096995216 9.9959032156054 7.34630648391625 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0612790186300538 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66031517_66031690:KLC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 68174122 G/A 1 11 10 21 4.89139247935226 5.55327956422522 -0.661887084872961 A:G G A 10 0.555327956422522 0.828131296920228 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68173992_68174281:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68173992_68174281:LRP5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 68192690 G/A 1 9 13 22 4.0020483921973 7.21926343349279 -3.21721504129548 A:G G A 10 0.555327956422522 0.199625660043352 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 68705820 G/A 1 7 9 16 3.11270430504235 4.9979516078027 -1.88524730276035 A:G G A 10 0.555327956422522 0.451827358588768 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68705650_68705822:IGHMBP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 68855363 G/A 1 12 6 18 5.33606452292974 3.33196773853513 2.0040967843946 A:G G A 10 0.555327956422522 0.477948616778315 ENSG00000162341:ENST00000294309:exon_68855343_68858072:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000442692:exon_68855343_68858072:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000356782:exon_68855343_68858072:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000450354:exon_68855343_68858072:TPCN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 44 57 101 19.565569917409 31.6536935160838 -12.0881235986747 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0162978370709264 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 71146691 A/G 1 43 52 95 19.1208978738316 28.8770537339711 -9.75615586013959 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0495709551096127 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 71152461 A/G 1 80 57 137 35.5737634861982 31.6536935160838 3.92006997011449 A:T:G A G 10 0.555327956422522 0.547586562145296 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71152406_71152486:DHCR7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 71155153 A/G 1 27 23 50 12.0061451765919 12.772542997718 -0.766397821126098 A:G A G 10 0.555327956422522 0.887168416612352 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71155039_71155165:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 71155171 C/T 1 29 20 49 12.8954892637469 11.1065591284504 1.78893013529642 T:C C T 10 0.555327956422522 0.667619460958624 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 15 10 25 6.67008065366217 5.55327956422522 1.11680108943695 C:G G C 10 0.555327956422522 0.692593351989186 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 71185479 T/C 1 13 14 27 5.78073656650721 7.77459138991531 -1.99385482340809 T:C T C 10 0.555327956422522 0.446307655179609 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 71185518 T/C 1 10 17 27 4.44672043577478 9.44057525918287 -4.99385482340809 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0793657979175034 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 71941212 A/G 1 44 34 78 19.565569917409 18.8811505183657 0.684419399043286 A:G A G 10 0.555327956422522 0.909706736013773 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71941165_71941315:INPPL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 71949064 C/G 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 C:G C G 10 0.555327956422522 0.198922593064512 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 72408657 C/T 1 43 65 108 19.1208978738316 36.0963171674639 -16.9754192936324 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00129414022079701 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408643_72408694:ARAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 73688981 C/T 1 79 91 170 35.1290914426208 50.5348440344495 -15.4057525918287 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0203577821158496 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 11 21 32 4.89139247935226 11.661887084873 -6.7704946055207 T:C T C 10 0.555327956422522 0.019867489356194 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 74559446 G/C 1 4 9 13 1.77868817430991 4.9979516078027 -3.21926343349279 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0940602799732446 ENSG00000166435:ENST00000530562:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000340360:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000321448:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000398418:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000344880:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531849:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531449:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000527087:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000431210:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000530280:exon_74559170_74559507:XRRA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 74559481 C/T 1 2 7 9 0.889344087154956 3.88729569495765 -2.9979516078027 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0877066993700078 ENSG00000166435:ENST00000530562:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000340360:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000321448:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000398418:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000344880:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531849:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531449:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000527087:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000431210:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000530280:exon_74559170_74559507:XRRA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 75110589 A/G 1 353 287 640 156.96923138285 159.379123493264 -2.40989211041406 A:G A G 10 0.555327956422522 0.873612883579156 ENSG00000149273:ENST00000531188:exon_75110530_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000529173:exon_75110559_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000531810:exon_75110561_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000528439:exon_75110562_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530164:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530689:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530721:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000405680:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000422465:exon_75110564_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000278572:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000532872:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000534440:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527446:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000526608:exon_75110581_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527273:exon_75110586_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000524851:exon_75110587_75110621:RPS3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 75277757 C/G 1 24 30 54 10.6721290458595 16.6598386926757 -5.98770964681619 C:G C G 10 0.555327956422522 0.131230808799670 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 75279846 C/T 1 29 18 47 12.8954892637469 9.9959032156054 2.89958604814147 T:C C T 10 0.555327956422522 0.46380978093646 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 43 40 83 19.1208978738316 22.2131182569009 -3.09222038306932 A:G G A 10 0.555327956422522 0.509109431584431 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 77378388 T/C 1 20 21 41 8.89344087154956 11.661887084873 -2.7684462133234 T:C T C 10 0.555327956422522 0.433171725971936 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 77378505 A/G 1 32 31 63 14.2295053944793 17.2151666490982 -2.98566125461888 A:G A G 10 0.555327956422522 0.450317455798752 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 77409568 T/C 1 14 9 23 6.22540861008469 4.9979516078027 1.22745700228199 T:C T C 10 0.555327956422522 0.678479253472011 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531026:exon_77409532_77409573:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531768:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000532556:exon_77409532_77409738:RSF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 T:C T C 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 78279790 T/G 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 T:G T G 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000526709:exon_78279761_78279798:NARS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 25 29 54 11.116801089437 16.1045107362531 -4.98770964681619 T:C C T 10 0.555327956422522 0.174187114040741 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 14 10 24 6.22540861008469 5.55327956422522 0.672129045859473 A:C A C 10 0.555327956422522 0.839730194130565 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 85374993 C/T 1 13 16 29 5.78073656650721 8.88524730276035 -3.10451073625314 T:C C T 10 0.555327956422522 0.266234224731931 ENSG00000137504:ENST00000490820:exon_85374568_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000528561:exon_85374568_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000260058:exon_85374859_85375697:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527529:exon_85374859_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000525639:exon_85374859_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000398294:exon_85374859_85375269:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527447:exon_85372110_85376146:CREBZF HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 85375601 G/A 1 27 26 53 12.0061451765919 14.4385268669856 -2.43238169039366 A:G G A 10 0.555327956422522 0.580778089508469 ENSG00000137504:ENST00000490820:exon_85374568_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000260058:exon_85374859_85375697:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000525639:exon_85374859_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527447:exon_85372110_85376146:CREBZF HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 85692181 A/C 1 21 22 43 9.33811291512704 12.2172150412955 -2.87910212616845 A:C A C 10 0.555327956422522 0.443426847321452 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530692:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529760:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532603:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529016:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526961:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530542:exon_85692172_85692271:PICALM HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 85725937 C/T 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 T:C C T 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000534412:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000531771:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000531558:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000531930:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532041:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000525162:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528256:exon_85725913_85726006:PICALM HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 93212161 A/G 1 13 16 29 5.78073656650721 8.88524730276035 -3.10451073625314 A:G A G 10 0.555327956422522 0.266234224731931 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 93212254 C/T 1 20 26 46 8.89344087154956 14.4385268669856 -5.54508599543601 T:C C T 10 0.555327956422522 0.104686331219101 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 93464175 A/C 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:C A C 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 93913036 A/G 1 6 13 19 2.66803226146487 7.21926343349279 -4.55123117202792 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0395254330154768 ENSG00000110218:ENST00000227638:exon_93912768_93913423:PANX1;ENSG00000110218:ENST00000436171:exon_93912768_93913423:PANX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 94231323 A/T 1 23 20 43 10.227457002282 11.1065591284504 -0.879102126168444 A:T A T 10 0.555327956422522 0.878299608285348 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 95532502 G/A 1 33 18 51 14.6741774380568 9.9959032156054 4.67827422245138 A:G G A 10 0.555327956422522 0.206481082368669 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95532396_95532552:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95532396_95532552:CEP57 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 95825797 A/G 1 1 7 8 0.444672043577478 3.88729569495765 -3.44262365138018 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0258462190222723 ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95825056_95826681:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95825056_95826684:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95825056_95826681:MAML2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 102201848 G/A 1 91 104 195 40.4651559655505 57.7541074679423 -17.2889515023918 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0.0141513342720027 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102201730_102201972:BIRC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 103780394 G/T 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:G G T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000170962:ENST00000393158:exon_103777914_103780547:PDGFD;ENSG00000170962:ENST00000302251:exon_103777917_103780547:PDGFD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 108043988 C/T 1 11 10 21 4.89139247935226 5.55327956422522 -0.661887084872961 T:C C T 10 0.555327956422522 0.828131296920228 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000533535:exon_108041859_108044578:NPAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 108044091 T/A 1 13 8 21 5.78073656650721 4.44262365138018 1.33811291512704 A:T T A 10 0.555327956422522 0.66298519208265 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000533535:exon_108041859_108044578:NPAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 111724133 C/T 1 5 12 17 2.22336021788739 6.66393547707026 -4.44057525918287 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0476549732727157 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527714:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111724103_111724208:FDXACB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 111747297 A/G 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 A:G A G 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527377:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000528274:exon_111747205_111747363:AP001781.3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 39 33 72 17.3422096995216 18.3258225619432 -0.983612862421584 A:C A C 10 0.555327956422522 0.813817640286669 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 111896324 C/T 1 19 22 41 8.44876882797208 12.2172150412955 -3.7684462133234 T:C C T 10 0.555327956422522 0.272032670141761 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111896320_111896475:DLAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 111908162 T/C 1 24 32 56 10.6721290458595 17.7704946055207 -7.09836555966123 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0603570937798912 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111907997_111908184:DLAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 111916647 G/A 1 11 10 21 4.89139247935226 5.55327956422522 -0.661887084872961 A:G G A 10 0.555327956422522 0.828131296920228 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111916587_111916694:DLAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 113679119 C/T 1 6 8 14 2.66803226146487 4.44262365138018 -1.77459138991531 T:C C T 10 0.555327956422522 0.423022312731772 ENSG00000048028:ENST00000260188:exon_113679020_113679159:USP28;ENSG00000048028:ENST00000003302:exon_113679020_113679159:USP28 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 117054503 C/T 1 20 18 38 8.89344087154956 9.9959032156054 -1.10246234405583 T:C C T 10 0.555327956422522 0.746082769898358 ENSG00000149577:ENST00000324225:exon_117054495_117054594:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000278951:exon_117054495_117054594:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000524842:exon_117054495_117054594:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000530948:exon_117054495_117054594:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000531255:exon_117054495_117054594:SIDT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 27 33 60 12.0061451765919 18.3258225619432 -6.31967738535132 A:G A G 10 0.555327956422522 0.118642868868949 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 117859209 G/A 1 8 13 21 3.55737634861982 7.21926343349279 -3.66188708487296 A:G G A 10 0.555327956422522 0.126067912845854 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000531365:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117857452_117859217:IL10RA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 117864047 A/G 1 8 4 12 3.55737634861982 2.22131182569009 1.33606452292974 A:G A G 10 0.555327956422522 0.56621841747708 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534335:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117863723_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117863773_117864125:IL10RA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 117869591 C/T 1 12 26 38 5.33606452292974 14.4385268669856 -9.10246234405583 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00480823471374183 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117869430_117872194:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117869430_117870513:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117869430_117870592:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117869430_117870503:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117869430_117870613:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117869430_117872196:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117869430_117869660:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000525467:exon_117869430_117870174:IL10RA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 118430519 C/T 1 9 6 15 4.0020483921973 3.33196773853513 0.670080653662171 T:C C T 10 0.555327956422522 0.799910806218814 ENSG00000118096:ENST00000264021:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000264020:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000530872:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000531939:exon_118430500_118431137:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000534156:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000534114:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000528378:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000533918:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000530185:exon_118430500_118430579:IFT46 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 118471423 T/C 1 50 48 98 22.2336021788739 26.6557419082811 -4.42213972940715 T:C T C 10 0.555327956422522 0.416281413291842 ENSG00000095139:ENST00000392859:exon_118471340_118471708:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000359415:exon_118471340_118473643:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000264028:exon_118471340_118473643:ARCN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 118769442 A/G 1 16 11 27 7.11475269723965 6.10860752064774 1.00614517659191 A:G A G 10 0.555327956422522 0.846938067616076 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118766849_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118768455_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000525300:exon_118768459_118769773:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118769124_118769771:BCL9L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 119003810 C/T 1 8 11 19 3.55737634861982 6.10860752064774 -2.55123117202792 T:C C T 10 0.555327956422522 0.2564170773856 ENSG00000172273:ENST00000437496:exon_119003805_119003929:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000350777:exon_119003805_119003929:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527410:exon_119003805_119003929:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000531022:exon_119003805_119003883:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527755:exon_119003805_119003929:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000529808:exon_119003805_119003929:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000532860:exon_119003805_119004608:HINFP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 119045920 A/C 1 10 4 14 4.44672043577478 2.22131182569009 2.22540861008469 A:C A C 10 0.555327956422522 0.288383222971717 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119045162_119045983:NLRX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 119050849 C/T 1 11 6 17 4.89139247935226 3.33196773853513 1.55942474081713 T:C C T 10 0.555327956422522 0.477388500584111 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119050402_119050997:NLRX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 121367626 T/C 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 T:C T C 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121367578_121367758:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532451:exon_121367578_121367758:SORL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 121475922 T/A 1 34 40 74 15.1188494816343 22.2131182569009 -7.09426877526662 A:T T A 10 0.555327956422522 0.102346258946779 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 1150 1146 2296 511.3728501141 636.40583806021 -125.03298794611 A:T:C:G A G 10 0.555327956422522 1.66866082183124e-07 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 1057 970 2027 470.018350061394 538.668117729846 -68.6497676684521 A:T:G T G 10 0.555327956422522 0.00219756097516951 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 60 36 96 26.6803226146487 19.9918064312108 6.68851618343789 A:G G A 10 0.555327956422522 0.182587648853834 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 125488374 C/T 1 30 45 75 13.3401613073243 24.9897580390135 -11.6495967316891 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00741201439099599 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525946:exon_125488268_125488456:STT3A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 37 29 66 16.4528656123667 16.1045107362531 0.34835487611355 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 17 9 26 7.55942474081713 4.9979516078027 2.56147313301443 A:C C A 10 0.555327956422522 0.332317546529893 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 125766173 A/C 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:C A C 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 126081403 T/C 1 12 11 23 5.33606452292974 6.10860752064774 -0.772542997718006 T:C T C 10 0.555327956422522 0.834806358038955 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126081345_126081587:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126081345_126081541:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126081345_126081524:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000532674:exon_126081345_126081587:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000532800:exon_126081345_126081525:RPUSD4;ENSG00000197798:ENST00000533050:exon_126081309_126081725:FAM118B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 126162862 C/T 1 4 11 15 1.77868817430991 6.10860752064774 -4.32991934633783 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0349050371317493 ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000438974:exon_126162372_126163012:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392678:exon_126162372_126163139:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126162372_126162950:TIRAP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 126163612 T/G 1 4 11 15 1.77868817430991 6.10860752064774 -4.32991934633783 T:G T G 10 0.555327956422522 0.0349050371317493 ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126163563_126164828:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126163582_126163687:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126163563_126164579:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126163563_126164534:TIRAP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 126174038 C/T 1 39 29 68 17.3422096995216 16.1045107362531 1.23769896326851 T:C C T 10 0.555327956422522 0.807974242118942 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 77 55 132 34.2397473554658 30.5430376032387 3.6967097522271 T:C T C 10 0.555327956422522 0.540767781594471 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 129739763 C/G 1 14 9 23 6.22540861008469 4.9979516078027 1.22745700228199 C:G C G 10 0.555327956422522 0.678479253472011 ENSG00000170322:ENST00000304521:exon_129739389_129740156:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000446488:exon_129739389_129740156:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524794:exon_129739389_129740156:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524746:exon_129739389_129740156:NFRKB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 11 129746707 G/T 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 T:G G T 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000170322:ENST00000304521:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000446488:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524794:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524746:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000531755:exon_129746616_129746790:NFRKB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 438158 C/T 1 11 13 24 4.89139247935226 7.21926343349279 -2.32787095414053 T:C C T 10 0.555327956422522 0.412507168985383 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_438001_438195:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_438001_438195:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_438001_438195:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_438001_438195:KDM5A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 520947 A/C 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 A:C A C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_520913_521144:CCDC77 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 547683 T/C 1 3 21 24 1.33401613073243 11.661887084873 -10.3278709541405 T:C T C 10 0.555327956422522 1.64713261818525e-05 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_547501_547720:CCDC77 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 863517 G/A 1 17 6 23 7.55942474081713 3.33196773853513 4.22745700228199 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0932569471468184 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 939302 A/G 1 51 23 74 22.6782742224514 12.772542997718 9.90573122473337 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0255848269019506 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_939169_939326:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_939169_939326:WNK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 971291 C/T 1 110 117 227 48.9139247935226 64.9733709014351 -16.0594461079125 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.0327036485537348 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_971249_971436:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_971249_971436:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_971249_971436:WNK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 993930 C/T 1 106 101 207 47.1352366192127 56.0881235986747 -8.95288697946205 T:C C T 10 0.555327956422522 0.234398696071336 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 998365 G/T 1 19 24 43 8.44876882797208 13.3278709541405 -4.87910212616844 T:G G T 10 0.555327956422522 0.166700980758595 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_998306_998389:WNK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 999638 C/T 1 31 25 56 13.7848333509018 13.883198910563 -0.0983655596612305 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_999619_999679:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_999619_999679:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_999619_999679:WNK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 1023218 G/T 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 T:G G T 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000002016:ENST00000358495:exon_1023060_1023287:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000228345:exon_1023060_1023287:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000430095:exon_1023060_1023287:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000468231:exon_1023060_1023287:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000481052:exon_1023060_1023287:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000488642:exon_1023060_1023287:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000461568:exon_1023060_1023287:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000463750:exon_1023060_1023287:RAD52 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 43 33 76 19.1208978738316 18.3258225619432 0.795075311888329 A:G A G 10 0.555327956422522 0.908374330525177 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 2973615 T/C 1 11 11 22 4.89139247935226 6.10860752064774 -1.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.670344781787442 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 54 51 105 24.0122903531838 28.3217257775486 -4.30943542436481 A:G G A 10 0.555327956422522 0.432448705197841 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 3046802 A/G 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 A:G A G 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000078246:ENST00000228245:exon_3046797_3046895:TULP3;ENSG00000078246:ENST00000448120:exon_3046797_3046895:TULP3;ENSG00000078246:ENST00000397132:exon_3046797_3046895:TULP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 4714102 G/C 1 9 9 18 4.0020483921973 4.9979516078027 -0.995903215605395 C:G G C 10 0.555327956422522 0.643952874691603 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4714080_4714252:DYRK4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 6560573 G/T 1 217 139 356 96.4938334563127 77.1905859427306 19.3032475135822 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0426011450923033 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6560434_6560884:CD27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 6562293 C/T 0 50 0 50 22.2336021788739 0 22.2336021788739 C C 10 0.555327956422522 2.70155111092606e-13 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 6562768 G/C 1 21 8 29 9.33811291512704 4.44262365138018 4.89548926374686 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0911233863226607 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 6715527 G/A 1 40 47 87 17.7868817430991 26.1004139518585 -8.31353220875941 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0839892469035537 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6715440_6715617:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6715440_6715617:CHD4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 6729460 T/C 1 11 11 22 4.89139247935226 6.10860752064774 -1.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.670344781787442 ENSG00000184574:ENST00000329858:exon_6728001_6730630:LPAR5;ENSG00000184574:ENST00000431922:exon_6728001_6730630:LPAR5;ENSG00000184574:ENST00000435659:exon_6729326_6730414:LPAR5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 6879279 A/G 1 2 7 9 0.889344087154956 3.88729569495765 -2.9979516078027 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0877066993700078 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 6887020 T/C 1 60 55 115 26.6803226146487 30.5430376032387 -3.86271498859003 T:C T C 10 0.555327956422522 0.511539130685452 ENSG00000089692:ENST00000203629:exon_6886957_6887087:LAG3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 6978818 C/T 1 4 7 11 1.77868817430991 3.88729569495765 -2.10860752064774 T:C C T 10 0.555327956422522 0.234416927909769 ENSG00000111669:ENST00000482209:exon_6978712_6978937:TPI1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 7022085 T/A 1 1 8 9 0.444672043577478 4.44262365138018 -3.9979516078027 A:T T A 10 0.555327956422522 0.0133428681828177 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 10 16 26 4.44672043577478 8.88524730276035 -4.43852686698557 A:G A G 10 0.555327956422522 0.112681249078794 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 7053257 C/T 1 62 80 142 27.5696667018036 44.4262365138018 -16.8565698119981 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.00517910688348268 ENSG00000111678:ENST00000229281:exon_7053203_7053336:C12orf57 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 7055860 T/C 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 T:C T C 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000111679:ENST00000399448:exon_7055740_7055902:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000416215:exon_7055754_7055902:PTPN6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 7287956 C/T 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 T:C C T 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000139182:ENST00000266546:exon_7287923_7288131:CLSTN3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 9094548 A/G 1 30 16 46 13.3401613073243 8.88524730276035 4.45491400456399 A:G A G 10 0.555327956422522 0.235034431403573 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 11992168 G/A 1 3 10 13 1.33401613073243 5.55327956422522 -4.21926343349279 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0239466351830008 ENSG00000139083:ENST00000266427:exon_11992074_11992238:ETV6;ENSG00000139083:ENST00000396373:exon_11992074_11992238:ETV6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 12618690 G/A 1 16 20 36 7.11475269723965 11.1065591284504 -3.99180643121079 A:G G A 10 0.555327956422522 0.184657826083378 ENSG00000165714:ENST00000314565:exon_12618480_12619838:LOH12CR1;ENSG00000165714:ENST00000298571:exon_12618480_12619838:LOH12CR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 14587301 A/G 1 19 15 34 8.44876882797208 8.32991934633783 0.118849481634253 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14587271_14587357:ATF7IP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 16516994 G/A 1 289 144 433 128.510220593891 79.9672257248432 48.542994869048 A:G G A 10 0.555327956422522 2.48169257300739e-06 ENSG00000008394:ENST00000010404:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396210:exon_16516729_16517342:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396209:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396207:exon_16516729_16517343:MGST1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 19626205 T/C 1 38 28 66 16.8975376559442 15.5491827798306 1.34835487611355 T:C T C 10 0.555327956422522 0.804831286044213 ENSG00000139154:ENST00000398864:exon_19626182_19626289:AEBP2;ENSG00000139154:ENST00000266508:exon_19626182_19626289:AEBP2;ENSG00000139154:ENST00000435841:exon_19626182_19626289:AEBP2;ENSG00000139154:ENST00000360995:exon_19626182_19626289:AEBP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 58 67 125 25.7909785274937 37.206973080309 -11.4159945528152 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0473042254115724 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 25362777 A/G 1 17 16 33 7.55942474081713 8.88524730276035 -1.32582256194322 A:G A G 10 0.555327956422522 0.726914463925943 ENSG00000133703:ENST00000311936:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000256078:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000406761:exon_25362729_25362845:KRAS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 26810777 T/C 1 8 11 19 3.55737634861982 6.10860752064774 -2.55123117202792 T:C T C 10 0.555327956422522 0.2564170773856 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26810640_26810825:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26810640_26810825:ITPR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 27064232 C/T 1 37 58 95 16.4528656123667 32.2090214725063 -15.7561558601396 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00129441204258934 ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27064111_27064250:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27064111_27064250:C12orf11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 27540204 A/G 1 24 18 42 10.6721290458595 9.9959032156054 0.676225830254078 A:G A G 10 0.555327956422522 0.87768344949826 ENSG00000029153:ENST00000261178:exon_27540161_27540253:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000266503:exon_27540161_27540253:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000311001:exon_27540161_27540253:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000457040:exon_27540161_27540253:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000395901:exon_27540161_27540253:ARNTL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 27788021 G/A 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000110841:ENST00000318304:exon_27787843_27788048:PPFIBP1;ENSG00000110841:ENST00000228425:exon_27787843_27788048:PPFIBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 27867727 G/A 1 34 20 54 15.1188494816343 11.1065591284504 4.01229035318381 A:G G A 10 0.555327956422522 0.337877614784130 ENSG00000061794:ENST00000081029:exon_27867713_27867753:MRPS35;ENSG00000061794:ENST00000321446:exon_27867713_27867753:MRPS35 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 29486745 T/C 1 9 12 21 4.0020483921973 6.66393547707026 -2.66188708487296 T:C T C 10 0.555327956422522 0.276109114103641 ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29486565_29487005:FAR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 30837288 C/T 1 10 7 17 4.44672043577478 3.88729569495765 0.559424740817127 T:C C T 10 0.555327956422522 0.813340797660957 ENSG00000133704:ENST00000256079:exon_30837235_30837391:IPO8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 31255405 C/T 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 T:C C T 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31255361_31255461:DDX11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 32481093 G/C 1 9 14 23 4.0020483921973 7.77459138991531 -3.77254299771801 C:G G C 10 0.555327956422522 0.141766408043743 ENSG00000151746:ENST00000457150:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000281474:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000395758:exon_32480395_32481489:BICD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 32490764 G/A 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 A:G G A 10 0.555327956422522 0.759189275590932 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 38710819 C/T 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000175548:ENST00000308742:exon_38710557_38710866:ALG10B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 40742254 G/A 1 2 7 9 0.889344087154956 3.88729569495765 -2.9979516078027 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0877066993700078 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40742211_40742311:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40742211_40742311:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40742211_40742311:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40742211_40742311:LRRK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 40758652 T/C 1 8 11 19 3.55737634861982 6.10860752064774 -2.55123117202792 T:C T C 10 0.555327956422522 0.2564170773856 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40758644_40763087:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40758644_40758935:LRRK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 42503467 T/C 1 1 11 12 0.444672043577478 6.10860752064774 -5.66393547707026 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00181567237233340 ENSG00000151233:ENST00000398675:exon_42503368_42503493:GXYLT1;ENSG00000151233:ENST00000280876:exon_42503368_42503493:GXYLT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 42554505 A/G 1 25 41 66 11.116801089437 22.7684462133234 -11.6516451238864 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00426714796128303 ENSG00000015153:ENST00000327791:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000380790:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000442791:exon_42552837_42554628:YAF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 44148259 T/C 1 8 4 12 3.55737634861982 2.22131182569009 1.33606452292974 T:C T C 10 0.555327956422522 0.56621841747708 ENSG00000129317:ENST00000416848:exon_44148139_44149064:PUS7L;ENSG00000129317:ENST00000344862:exon_44148139_44149064:PUS7L;ENSG00000129317:ENST00000431332:exon_44148139_44149064:PUS7L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 44180295 G/A 1 20 17 37 8.89344087154956 9.44057525918287 -0.547134387633312 A:G G A 10 0.555327956422522 0.869997748652473 ENSG00000198001:ENST00000448290:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000431837:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000440781:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000356669:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000446056:exon_44180202_44180360:IRAK4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 45803231 A/G 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000177119:ENST00000425752:exon_45803140_45803270:ANO6;ENSG00000177119:ENST00000320560:exon_45803140_45803270:ANO6;ENSG00000177119:ENST00000426898:exon_45803140_45803270:ANO6;ENSG00000177119:ENST00000435642:exon_45803140_45803270:ANO6;ENSG00000177119:ENST00000441606:exon_45803140_45803270:ANO6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 46322449 C/T 1 45 56 101 20.0102419609865 31.0983655596612 -11.0881235986747 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0277373998558985 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 66 59 125 29.3483548761136 32.7643494289288 -3.41599455281525 T:G T G 10 0.555327956422522 0.589388833058215 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 49255798 G/C 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000172602:ENST00000309739:exon_49255792_49255901:RND1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 49317547 G/C 1 11 3 14 4.89139247935226 1.66598386926757 3.22540861008469 C:G G C 10 0.555327956422522 0.107343149248364 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 49434409 G/A 1 4 13 17 1.77868817430991 7.21926343349279 -5.44057525918287 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0122609762671924 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49433507_49435318:MLL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 50189807 C/A 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 A:C C A 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 50529736 G/A 1 18 6 24 8.0040967843946 3.33196773853513 4.67212904585947 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0645487273517298 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50529724_50529852:LASS5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 51457647 G/A 1 10 8 18 4.44672043577478 4.44262365138018 0.00409678439460492 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000110925:ENST00000228515:exon_51454990_51458452:CSRNP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 51632627 G/C 1 26 18 44 11.5614731330144 9.9959032156054 1.56556991740903 C:G G C 10 0.555327956422522 0.653043555958764 ENSG00000183283:ENST00000425012:exon_51632508_51632704:DAZAP2;ENSG00000183283:ENST00000436900:exon_51632508_51632704:DAZAP2;ENSG00000183283:ENST00000412716:exon_51632508_51632704:DAZAP2;ENSG00000183283:ENST00000449723:exon_51632508_51632704:DAZAP2;ENSG00000183283:ENST00000440849:exon_51632508_51632704:DAZAP2;ENSG00000183283:ENST00000439799:exon_51632508_51632704:DAZAP2;ENSG00000183283:ENST00000332845:exon_51632610_51632704:DAZAP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 52448157 G/A 1 14 8 22 6.22540861008469 4.44262365138018 1.78278495870452 A:G G A 10 0.555327956422522 0.523473069933469 ENSG00000123358:ENST00000360284:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000478250:exon_52448111_52449745:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394825:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000243050:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394824:exon_52448111_52448988:NR4A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 52467406 A/G 1 23 32 55 10.227457002282 17.7704946055207 -7.54303760323871 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0425709161545429 ENSG00000123395:ENST00000433776:exon_52467359_52467686:C12orf44;ENSG00000123395:ENST00000336854:exon_52467359_52467686:C12orf44 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 52470979 C/T 1 39 31 70 17.3422096995216 17.2151666490982 0.127043050423463 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000123395:ENST00000433776:exon_52470570_52471278:C12orf44;ENSG00000123395:ENST00000336854:exon_52470570_52471278:C12orf44 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 53433486 C/T 1 10 11 21 4.44672043577478 6.10860752064774 -1.66188708487296 T:C C T 10 0.555327956422522 0.514389688550212 ENSG00000063046:ENST00000420463:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000416762:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000430205:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000262056:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000438209:exon_53433414_53433486:EIF4B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 53581376 C/T 1 5 12 17 2.22336021788739 6.66393547707026 -4.44057525918287 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0476549732727157 ENSG00000139651:ENST00000416904:exon_53581285_53584654:ZNF740;ENSG00000139651:ENST00000267122:exon_53581285_53584654:ZNF740 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 54675113 G/A 1 17 25 42 7.55942474081713 13.883198910563 -6.32377416974592 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0615458868244714 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 54767812 G/A 1 2 9 11 0.889344087154956 4.9979516078027 -4.10860752064774 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0150596095234126 ENSG00000161642:ENST00000352268:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000338010:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000394313:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000413859:exon_54767757_54767919:ZNF385A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 56398454 G/C,T 0 0 8 8 0 4.44262365138018 -4.44262365138018 T:C G C 10 0.555327956422522 0.00152868713451737 ENSG00000139531:ENST00000266971:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394115:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000356124:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394109:exon_56397402_56399309:SUOX HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 56716514 T/C 1 18 18 36 8.0040967843946 9.9959032156054 -1.99180643121079 T:C T C 10 0.555327956422522 0.507892993773159 ENSG00000135473:ENST00000425394:exon_56716399_56716542:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000379495:exon_56716399_56716542:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000257931:exon_56716399_56716542:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000440411:exon_56716399_56716542:PAN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 17 24 41 7.55942474081713 13.3278709541405 -5.7684462133234 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0834111646322127 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 57637593 G/A 1 8 38 46 3.55737634861982 21.1024623440558 -17.545085995436 A:G G A 10 0.555327956422522 1.33678960173985e-07 ENSG00000185482:ENST00000332782:exon_57637242_57637693:STAC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 57649840 C/T 1 11 15 26 4.89139247935226 8.32991934633783 -3.43852686698557 T:C C T 10 0.555327956422522 0.235826270274551 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57649773_57649857:R3HDM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 57873042 T/C 1 25 33 58 11.116801089437 18.3258225619432 -7.20902147250628 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0642365143656141 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57872874_57873207:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57872874_57873207:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57872874_57873207:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57872874_57873207:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57872874_57873207:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57872874_57873424:ARHGAP9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 57905612 A/G 1 121 78 199 53.8053172728748 43.3155806009567 10.4897366719181 A:G A G 10 0.555327956422522 0.153531373057649 ENSG00000166986:ENST00000262027:exon_57905481_57905651:MARS;ENSG00000166986:ENST00000447721:exon_57905481_57905651:MARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 57906548 G/A 1 112 132 244 49.8032688806775 73.3032902477729 -23.5000213670954 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00296970154266698 ENSG00000166986:ENST00000262027:exon_57906534_57906747:MARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 57911160 G/A 1 29 22 51 12.8954892637469 12.2172150412955 0.678274222451378 A:G G A 10 0.555327956422522 0.888746713520935 ENSG00000175197:ENST00000346473:exon_57911052_57911221:DDIT3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 57926791 T/G 1 87 52 139 38.6864677912406 28.8770537339711 9.80941405726945 T:G T G 10 0.555327956422522 0.104750359484374 ENSG00000175203:ENST00000434715:exon_57926767_57926805:DCTN2;ENSG00000175203:ENST00000354743:exon_57926767_57926805:DCTN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 58001003 C/T 1 27 22 49 12.0061451765919 12.2172150412955 -0.211069864703576 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000178498:ENST00000413885:exon_58000667_58001396:DTX3;ENSG00000178498:ENST00000337737:exon_58000648_58001396:DTX3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 58010163 A/G 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 A:G A G 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000240771:ENST00000333972:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000286494:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000471370:exon_58010067_58010278:ARHGEF25 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 214 159 373 95.1598173255803 88.297145071181 6.8626722543993 A:G A G 10 0.555327956422522 0.49835859373638 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 58126234 C/A 1 8 4 12 3.55737634861982 2.22131182569009 1.33606452292974 A:C C A 10 0.555327956422522 0.56621841747708 ENSG00000135439:ENST00000257897:exon_58126186_58126295:AGAP2;ENSG00000135439:ENST00000328568:exon_58126186_58126295:AGAP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 21 28 49 9.33811291512704 15.5491827798306 -6.21106986470358 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0845359141037232 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 58174306 T/C 1 2 6 8 0.889344087154956 3.33196773853513 -2.44262365138018 T:C T C 10 0.555327956422522 0.150542848470395 ENSG00000123427:ENST00000300209:exon_58174038_58176321:FAM119B;ENSG00000123427:ENST00000333012:exon_58174038_58176321:FAM119B;ENSG00000123427:ENST00000414072:exon_58174039_58174429:FAM119B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 58176614 T/C 1 19 35 54 8.44876882797208 19.4364784747883 -10.9877096468162 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00363040859715404 ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58176372_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58176559_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000417094:exon_58176564_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000434359:exon_58176586_58176660:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000457189:exon_58176601_58176690:TSFM HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 58345606 T/C 1 6 10 16 2.66803226146487 5.55327956422522 -2.88524730276035 T:C T C 10 0.555327956422522 0.207537445170925 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58345541_58345678:XRCC6BP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 23 35 58 10.227457002282 19.4364784747883 -9.20902147250628 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0170834820188156 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 62696599 C/T 1 9 10 19 4.0020483921973 5.55327956422522 -1.55123117202792 T:C C T 10 0.555327956422522 0.496869552202761 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000312635:exon_62696571_62696701:USP15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 62926398 G/A 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 A:G G A 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62926218_62926450:MON2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 62928633 G/A 1 10 5 15 4.44672043577478 2.77663978211261 1.67008065366217 A:G G A 10 0.555327956422522 0.445339902559564 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62928625_62928706:MON2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 20 29 49 8.89344087154956 16.1045107362531 -7.21106986470357 A:T T A 10 0.555327956422522 0.0438812509281898 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 21 75 96 9.33811291512704 41.6495967316892 -32.3114838165621 A:G A G 10 0.555327956422522 3.30506978842752e-11 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 66700273 G/A 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 A:G G A 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66700125_66700294:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66700125_66700294:HELB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 66725116 G/A 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 A:G G A 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 68052178 G/T 1 17 7 24 7.55942474081713 3.88729569495765 3.67212904585947 T:G G T 10 0.555327956422522 0.153115971856089 ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 69082805 G/A 1 10 16 26 4.44672043577478 8.88524730276035 -4.43852686698557 A:G G A 10 0.555327956422522 0.112681249078794 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69082742_69082833:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69082742_69082833:NUP107 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 69115698 G/A 1 13 4 17 5.78073656650721 2.22131182569009 3.55942474081713 A:G G A 10 0.555327956422522 0.092105841480131 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69115621_69115766:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69115621_69115766:NUP107 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 69986788 A/G 1 110 117 227 48.9139247935226 64.9733709014351 -16.0594461079125 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0327036485537348 ENSG00000166226:ENST00000299300:exon_69986756_69986883:CCT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 69995039 C/A 0 10 0 10 4.44672043577478 0 4.44672043577478 C C 10 0.555327956422522 0.00309157318156107 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 72018028 A/G 1 24 16 40 10.6721290458595 8.88524730276035 1.78688174309912 A:G A G 10 0.555327956422522 0.634893171030186 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72017884_72018072:ZFC3H1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 72164395 C/T 1 35 33 68 15.5635215252117 18.3258225619432 -2.7623010367315 T:C C T 10 0.555327956422522 0.542525737081754 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 80014907 A/C,T 0 0 15 15 0 8.32991934633783 -8.32991934633783 T:C A C 10 0.555327956422522 5.25529857114072e-06 ENSG00000177425:ENST00000328827:exon_80014856_80014987:PAWR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 61 48 109 27.1249946582262 26.6557419082811 0.469252749945106 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 C:G G C 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 88500847 T/C 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 T:C T C 10 0.555327956422522 0.150211231786478 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88500773_88500875:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88500773_88500875:CEP290 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 94543506 C/T 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94542748_94543809:PLXNC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 94673277 G/A 0 10 0 10 4.44672043577478 0 4.44672043577478 G G 10 0.555327956422522 0.00309157318156107 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94673248_94673425:PLXNC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 95906603 C/A 1 15 20 35 6.67008065366217 11.1065591284504 -4.43647847478827 A:C C A 10 0.555327956422522 0.17276317127097 ENSG00000111142:ENST00000261220:exon_95906577_95906692:METAP2;ENSG00000111142:ENST00000323666:exon_95906577_95906692:METAP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 101018014 T/C 1 12 3 15 5.33606452292974 1.66598386926757 3.67008065366217 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0693182581616467 ENSG00000139354:ENST00000266754:exon_101017340_101018681:GAS2L3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 101732655 C/T 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 T:C C T 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101732591_101732735:UTP20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 101732670 C/T 1 8 2 10 3.55737634861982 1.11065591284504 2.44672043577478 T:C C T 10 0.555327956422522 0.201545371859033 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101732591_101732735:UTP20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 101755809 T/C 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 T:C T C 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101755740_101755838:UTP20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 102108301 T/C 1 7 15 22 3.11270430504235 8.32991934633783 -5.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0310519344066395 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102108282_102108423:CHPT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 102120152 C/T 1 9 4 13 4.0020483921973 2.22131182569009 1.78073656650721 T:C C T 10 0.555327956422522 0.408523981318449 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102120072_102120182:CHPT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 102295219 C/T 0 14 0 14 6.22540861008469 0 6.22540861008469 C C 10 0.555327956422522 0.000483722581978021 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 104171742 C/T 1 4 7 11 1.77868817430991 3.88729569495765 -2.10860752064774 T:C C T 10 0.555327956422522 0.234416927909769 ENSG00000111696:ENST00000447799:exon_104170822_104171859:NT5DC3;ENSG00000111696:ENST00000392876:exon_104166088_104171859:NT5DC3;ENSG00000111696:ENST00000339146:exon_104171607_104171832:NT5DC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 104186946 G/T 1 1 9 10 0.444672043577478 4.9979516078027 -4.55327956422522 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0068664951108094 ENSG00000111696:ENST00000392876:exon_104186942_104187043:NT5DC3;ENSG00000111696:ENST00000339146:exon_104186942_104187043:NT5DC3;ENSG00000111696:ENST00000415849:exon_104186942_104187043:NT5DC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 104851127 C/G 1 40 21 61 17.7868817430991 11.661887084873 6.12499465822616 C:G C G 10 0.555327956422522 0.123240742332999 ENSG00000171310:ENST00000303694:exon_104851048_104851307:CHST11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 105380152 A/C 1 12 6 18 5.33606452292974 3.33196773853513 2.0040967843946 A:C A C 10 0.555327956422522 0.477948616778315 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105380098_105380245:C12orf45 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 105589122 G/A 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000136044:ENST00000258530:exon_105589039_105589127:APPL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 107360943 G/A 1 26 21 47 11.5614731330144 11.661887084873 -0.100413951858533 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000151135:ENST00000280756:exon_107360889_107360958:C12orf23 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 108096769 G/C 1 9 11 20 4.0020483921973 6.10860752064774 -2.10655912845044 C:G G C 10 0.555327956422522 0.374427217398125 ENSG00000136045:ENST00000412830:exon_108096712_108096808:PWP1;ENSG00000136045:ENST00000258531:exon_108096712_108096808:PWP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 109017898 C/T 1 21 30 51 9.33811291512704 16.6598386926757 -7.32172577754862 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0477885646755809 ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109017694_109018088:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 109962278 G/A 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000151148:ENST00000342494:exon_109962243_109962308:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000434735:exon_109962243_109962308:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000449510:exon_109962243_109962308:UBE3B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 110983773 G/A 1 7 1 8 3.11270430504235 0.555327956422522 2.55737634861982 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0837859633971926 ENSG00000196850:ENST00000354300:exon_110983685_110983883:PPTC7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 112330774 G/A 1 54 39 93 24.0122903531838 21.6577903004784 2.35450005270546 A:G G A 10 0.555327956422522 0.676901963110584 ENSG00000089022:ENST00000431199:exon_112330771_112330962:MAPKAPK5;ENSG00000089022:ENST00000202788:exon_112330771_112331227:MAPKAPK5;ENSG00000089022:ENST00000428907:exon_112330771_112331227:MAPKAPK5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 112622312 G/A 1 9 9 18 4.0020483921973 4.9979516078027 -0.995903215605395 A:G G A 10 0.555327956422522 0.643952874691603 ENSG00000173064:ENST00000430131:exon_112621991_112623297:C12orf51;ENSG00000173064:ENST00000377560:exon_112621991_112623297:C12orf51 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 114374887 T/C 1 18 21 39 8.0040967843946 11.661887084873 -3.65779030047836 T:C T C 10 0.555327956422522 0.261448779310206 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114374812_114374941:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114374812_114374941:RBM19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 114377835 A/G 1 13 7 20 5.78073656650721 3.88729569495765 1.89344087154956 A:G A G 10 0.555327956422522 0.501729600552412 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 114377877 T/C 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 114383651 C/T 1 8 9 17 3.55737634861982 4.9979516078027 -1.44057525918287 T:C C T 10 0.555327956422522 0.626853565320545 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114383633_114383729:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114383633_114383729:RBM19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 114386639 A/G 1 21 26 47 9.33811291512704 14.4385268669856 -5.10041395185853 A:G A G 10 0.555327956422522 0.143875822696293 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114386638_114386841:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114386638_114386841:RBM19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 114395651 T/C 1 43 38 81 19.1208978738316 21.1024623440558 -1.98156447022428 T:C T C 10 0.555327956422522 0.656730792704083 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114395587_114395855:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114395587_114395855:RBM19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 116408538 A/G 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 A:G A G 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000123066:ENST00000281928:exon_116408399_116408575:MED13L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 116429689 A/G 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:G A G 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000123066:ENST00000281928:exon_116428825_116429762:MED13L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 116446445 C/T 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 T:C C T 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000123066:ENST00000281928:exon_116446206_116446937:MED13L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 117584066 G/A 1 12 8 20 5.33606452292974 4.44262365138018 0.893440871549561 A:G G A 10 0.555327956422522 0.823148310222236 ENSG00000135108:ENST00000330622:exon_117581586_117584082:FBXO21;ENSG00000135108:ENST00000427718:exon_117581586_117584082:FBXO21;ENSG00000135108:ENST00000257563:exon_117581586_117584082:FBXO21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 26 26 52 11.5614731330144 14.4385268669856 -2.87705373397114 T:C T C 10 0.555327956422522 0.485828284509982 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 118682751 C/T 1 12 15 27 5.33606452292974 8.32991934633783 -2.99385482340809 T:C C T 10 0.555327956422522 0.252692291269657 ENSG00000135090:ENST00000392533:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000359811:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000419821:exon_118682699_118682770:TAOK3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 120436408 G/A 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000135127:ENST00000397558:exon_120436325_120436540:CCDC64;ENSG00000135127:ENST00000446727:exon_120436325_120436540:CCDC64;ENSG00000135127:ENST00000257583:exon_120436325_120436540:CCDC64;ENSG00000135127:ENST00000357093:exon_120436325_120436540:CCDC64 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 120589160 A/G 1 14 26 40 6.22540861008469 14.4385268669856 -8.21311825690088 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0104765672170103 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 120720457 C/T 0 0 133 133 0 73.8586182041954 -73.8586182041954 T C T 10 0.555327956422522 1.54631119634659e-47 ENSG00000123009:ENST00000242630:exon_120719940_120720632:NME2P1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 120884328 C/T 1 15 11 26 6.67008065366217 6.10860752064774 0.561473133014428 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.84687533574258 ENSG00000111780:ENST00000229384:exon_120884284_120884364:GATC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 120966921 A/G 1 28 12 40 12.4508172201694 6.66393547707026 5.78688174309912 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0794595170991502 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120966743_120966964:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120966743_120966953:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120966743_120966953:COQ5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 121017171 A/G 1 75 46 121 33.3504032683108 25.545085995436 7.80531727287484 A:G A G 10 0.555327956422522 0.170099334835938 ENSG00000167272:ENST00000357500:exon_121016849_121017215:POP5;ENSG00000167272:ENST00000341039:exon_121016849_121017215:POP5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 121131891 C/T 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 13 14 27 5.78073656650721 7.77459138991531 -1.99385482340809 T:C T C 10 0.555327956422522 0.446307655179609 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 27 27 54 12.0061451765919 14.9938548234081 -2.98770964681619 A:G G A 10 0.555327956422522 0.415371111688778 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 19 17 36 8.44876882797208 9.44057525918287 -0.99180643121079 T:C C T 10 0.555327956422522 0.740708520659872 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 28 27 55 12.4508172201694 14.9938548234081 -2.54303760323871 C:G G C 10 0.555327956422522 0.500500871846427 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 37 68 105 16.4528656123667 37.7623010367315 -21.3094354243648 T:C C T 10 0.555327956422522 3.14760315602952e-05 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 65 93 158 28.9036828325361 51.6454999472945 -22.7418171147585 A:G G A 10 0.555327956422522 0.000298716502615356 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 61 95 156 27.1249946582262 52.7561558601396 -25.6311612019134 A:G G A 10 0.555327956422522 4.87308874350476e-05 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 63 76 139 28.0143387453811 42.2049246881117 -14.1905859427306 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0167561475053766 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 100 85 185 44.4672043577478 47.2028762959144 -2.73567193816656 T:C T C 10 0.555327956422522 0.711708863345495 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 122326812 T/C 1 16 11 27 7.11475269723965 6.10860752064774 1.00614517659191 T:C T C 10 0.555327956422522 0.846938067616076 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122326646_122326900:PSMD9;ENSG00000110801:ENST00000340175:exon_122326646_122326900:PSMD9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 32 23 55 14.2295053944793 12.772542997718 1.45696239676129 A:G A G 10 0.555327956422522 0.786482493380705 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 123105143 C/T 1 24 17 41 10.6721290458595 9.44057525918287 1.2315537866766 T:C C T 10 0.555327956422522 0.754944363310101 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000196917:ENST00000356987:exon_123104824_123105249:GPR81 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 17 19 36 7.55942474081713 10.5512311720279 -2.99180643121079 T:C C T 10 0.555327956422522 0.320267909966196 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 123645803 G/A 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 123798209 T/C 1 11 5 16 4.89139247935226 2.77663978211261 2.11475269723965 T:C T C 10 0.555327956422522 0.325169767810241 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123798167_123798266:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123798167_123798266:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123798167_123798266:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123798167_123798266:SBNO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 123799974 A/G 1 8 15 23 3.55737634861982 8.32991934633783 -4.77254299771801 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0578021904179636 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 123810873 G/A 1 20 15 35 8.89344087154956 8.32991934633783 0.563521525211732 A:G G A 10 0.555327956422522 0.867078000918724 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123810699_123810881:SBNO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 123815032 C/T 1 11 9 20 4.89139247935226 4.9979516078027 -0.106559128450439 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123814966_123815056:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123814966_123815056:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123814966_123815056:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123814966_123815056:SBNO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 124821696 C/T 1 41 66 107 18.2315537866766 36.6516451238865 -18.4200913372099 T:C C T 10 0.555327956422522 0.000416108956713563 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000440187:exon_124821650_124821726:NCOR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 124826598 T/C 1 46 65 111 20.454914004564 36.0963171674639 -15.6414031628999 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00301186761428544 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 124856618 A/G 1 75 51 126 33.3504032683108 28.3217257775486 5.02867749076223 A:G A G 10 0.555327956422522 0.419913031641645 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 125263061 C/T 1 109 71 180 48.4692527499451 39.4282849059991 9.04096784394605 T:C C T 10 0.555327956422522 0.177988520898609 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125262186_125263132:SCARB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 125267201 G/A 1 15 29 44 6.67008065366217 16.1045107362531 -9.43443008259097 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00572027358653229 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 125284748 A/G 1 78 58 136 34.6844193990433 32.2090214725063 2.47539792653701 A:G A G 10 0.555327956422522 0.730163829423333 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125284670_125284788:SCARB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 125398039 G/C 1 1654 1467 3121 735.487560077149 814.66611207184 -79.1785519946911 A:T:C:G G C 10 0.555327956422522 0.00442852517588992 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 125434580 C/T 1 20 20 40 8.89344087154956 11.1065591284504 -2.21311825690088 T:C C T 10 0.555327956422522 0.526214098904355 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434532_125434605:DHX37 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 125434716 G/A 1 20 22 42 8.89344087154956 12.2172150412955 -3.32377416974592 A:G G A 10 0.555327956422522 0.352103954403424 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434695_125434789:DHX37 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 125437019 T/C 1 17 20 37 7.55942474081713 11.1065591284504 -3.54713438763331 T:C T C 10 0.555327956422522 0.251085232136404 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125436944_125437116:DHX37 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 125438516 T/C 1 15 6 21 6.67008065366217 3.33196773853513 3.33811291512704 T:C T C 10 0.555327956422522 0.187868673759137 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 125438523 C/T 1 12 7 19 5.33606452292974 3.88729569495765 1.44876882797208 T:C C T 10 0.555327956422522 0.645874384560469 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 125441359 T/C 1 34 22 56 15.1188494816343 12.2172150412955 2.90163444033877 T:C T C 10 0.555327956422522 0.502063336613151 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 125626685 C/T 1 30 27 57 13.3401613073243 14.9938548234081 -1.65369351608375 T:C C T 10 0.555327956422522 0.69053268551265 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125626638_125627871:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125626638_125627861:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125626638_125627861:AACS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 131622735 T/C 1 5 9 14 2.22336021788739 4.9979516078027 -2.77459138991531 T:C T C 10 0.555327956422522 0.179216881393606 ENSG00000111452:ENST00000261654:exon_131622682_131622774:GPR133;ENSG00000111452:ENST00000376682:exon_131622682_131622774:GPR133;ENSG00000111452:ENST00000335486:exon_131622682_131622774:GPR133;ENSG00000111452:ENST00000446583:exon_131622682_131622774:GPR133 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 132401102 C/T 1 10 6 16 4.44672043577478 3.33196773853513 1.11475269723965 T:C C T 10 0.555327956422522 0.624513862012014 ENSG00000177169:ENST00000321867:exon_132400943_132401136:ULK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 132401566 C/T 1 10 6 16 4.44672043577478 3.33196773853513 1.11475269723965 T:C C T 10 0.555327956422522 0.624513862012014 ENSG00000177169:ENST00000321867:exon_132401498_132401607:ULK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 132405879 G/A 1 18 7 25 8.0040967843946 3.88729569495765 4.11680108943695 A:G G A 10 0.555327956422522 0.109913495548130 ENSG00000177169:ENST00000321867:exon_132405851_132407696:ULK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 132416813 G/A 1 21 16 37 9.33811291512704 8.88524730276035 0.452865612366686 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000177192:ENST00000443358:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000440818:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000376649:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000322060:exon_132416720_132416857:PUS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 132490820 G/A 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 A:G G A 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132490657_132490847:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132490657_132490847:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132490657_132490847:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132490657_132490847:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132490657_132490847:EP400 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 132508389 A/G 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 A:G A G 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132508322_132508486:EP400 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 132527986 G/A 1 23 17 40 10.227457002282 9.44057525918287 0.786881743099121 A:G G A 10 0.555327956422522 0.874297431714736 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132527849_132528007:EP400 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 6 14 20 2.66803226146487 7.77459138991531 -5.10655912845044 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0246812283603920 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 31 19 50 13.7848333509018 10.5512311720279 3.2336021788739 T:C:G T C 10 0.555327956422522 0.395239520040955 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 133218277 G/A 1 22 15 37 9.78278495870452 8.32991934633783 1.45286561236669 A:G G A 10 0.555327956422522 0.74140646380221 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133218233_133218437:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133218233_133218437:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133218233_133218437:POLE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 133219831 T/C 1 19 13 32 8.44876882797208 7.21926343349279 1.2295053944793 T:C T C 10 0.555327956422522 0.724371704529355 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133219810_133219916:POLE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 133236000 C/T 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133235881_133236095:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133235881_133236095:POLE;ENSG00000177084:ENST00000376577:exon_133235881_133236095:POLE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 133423662 C/T 1 13 8 21 5.78073656650721 4.44262365138018 1.33811291512704 T:C C T 10 0.555327956422522 0.66298519208265 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133423629_133423716:CHFR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 7 24 31 3.11270430504235 13.3278709541405 -10.2151666490982 T:C T C 10 0.555327956422522 0.000226414369837919 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 12 133778796 C/T 1 5 8 13 2.22336021788739 4.44262365138018 -2.21926343349279 T:C C T 10 0.555327956422522 0.268109731741661 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133778730_133778955:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133778730_133781730:ZNF268 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 19271676 A/T 0 45 0 45 20.0102419609865 0 20.0102419609865 A A 10 0.555327956422522 3.42930534410484e-12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 21063524 A/G 1 8 11 19 3.55737634861982 6.10860752064774 -2.55123117202792 A:G A G 10 0.555327956422522 0.2564170773856 ENSG00000165475:ENST00000298248:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000382812:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000480748:exon_21063509_21063575:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000421925:exon_21063509_21063635:CRYL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 24876752 T/C 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 T:C T C 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000182957:ENST00000466831:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382095:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000424834:exon_24876736_24881207:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382108:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000438694:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000434675:exon_24876736_24877259:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000399949:exon_24876736_24878042:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000409126:exon_24876736_24877344:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000343003:exon_24876736_24881204:SPATA13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 25487103 T/C 1 13 10 23 5.78073656650721 5.55327956422522 0.227457002281995 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25486720_25487229:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25486720_25487229:CENPJ HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 25825889 T/C 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 T:C T C 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25825787_25825913:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25825787_25825913:MTMR6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 25876011 G/A 1 29 27 56 12.8954892637469 14.9938548234081 -2.09836555966123 A:G G A 10 0.555327956422522 0.59271150241693 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25875662_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000481980:exon_25875694_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000490231:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000480187:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000460326:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000465068:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25875771_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000495460:exon_25875783_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25875785_25876018:NUPL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 25914221 A/G 1 49 34 83 21.7889301352964 18.8811505183657 2.90777961693068 A:G A G 10 0.555327956422522 0.58123954902559 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25914103_25916544:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25914103_25914856:NUPL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 26789638 T/C 1 42 31 73 18.6762258302541 17.2151666490982 1.4610591811559 T:C T C 10 0.555327956422522 0.814033342496971 ENSG00000127870:ENST00000468480:exon_26789611_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000498039:exon_26789276_26789729:RNF6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 26793644 T/C 1 32 45 77 14.2295053944793 24.9897580390135 -10.7602526445342 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0157144021745623 ENSG00000127870:ENST00000468480:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000498039:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000476347:exon_26793433_26793804:RNF6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 28197436 C/T 1 133 87 220 59.1413817958046 48.3135322087594 10.8278495870452 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.154248657867436 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 28239940 G/C 1 141 100 241 62.6987581444244 55.5327956422522 7.16596250217221 C:G G C 10 0.555327956422522 0.364784407171489 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 183 132 315 81.3749839746785 73.3032902477729 8.07169372690558 A:G G A 10 0.555327956422522 0.365062538103925 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 31231806 T/C 1 5 9 14 2.22336021788739 4.9979516078027 -2.77459138991531 T:C T C 10 0.555327956422522 0.179216881393606 ENSG00000132952:ENST00000255304:exon_31231611_31233686:USPL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 31232366 G/A 1 20 15 35 8.89344087154956 8.32991934633783 0.563521525211732 A:G G A 10 0.555327956422522 0.867078000918724 ENSG00000132952:ENST00000255304:exon_31231611_31233686:USPL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 31233063 G/A 1 21 13 34 9.33811291512704 7.21926343349279 2.11884948163425 A:G G A 10 0.555327956422522 0.495256249707322 ENSG00000132952:ENST00000255304:exon_31231611_31233686:USPL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 32929232 A/G 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 A:G A G 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000139618:ENST00000380152:exon_32928998_32929425:BRCA2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 33232435 A/G 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 A:G A G 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000083642:ENST00000315596:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000482955:exon_33232376_33232486:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000400481:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000421084:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000456898:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000498550:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000450460:exon_33232376_33232462:PDS5B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 33284140 C/T 1 6 8 14 2.66803226146487 4.44262365138018 -1.77459138991531 T:C C T 10 0.555327956422522 0.423022312731772 ENSG00000083642:ENST00000315596:exon_33284083_33284243:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000400481:exon_33284083_33284243:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000421084:exon_33284083_33284243:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000456898:exon_33284083_33284243:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000450460:exon_33284083_33284243:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000481616:exon_33284083_33284205:PDS5B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 36886469 T/C 1 8 10 18 3.55737634861982 5.55327956422522 -1.9959032156054 T:C T C 10 0.555327956422522 0.354494673636837 ENSG00000133104:ENST00000438666:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000355182:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000451493:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000423217:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000494062:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000491805:exon_36886456_36886721:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000460126:exon_36886456_36886548:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000475603:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000482146:exon_36886456_36886614:SPG20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 16 7 23 7.11475269723965 3.88729569495765 3.22745700228199 A:G G A 10 0.555327956422522 0.210713456641927 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 21 26 47 9.33811291512704 14.4385268669856 -5.10041395185853 A:G G A 10 0.555327956422522 0.143875822696293 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 39586343 G/C 1 37 27 64 16.4528656123667 14.9938548234081 1.45901078895859 C:G G C 10 0.555327956422522 0.801678977573186 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 39587166 A/G 1 46 48 94 20.454914004564 26.6557419082811 -6.20082790371707 A:G A G 10 0.555327956422522 0.213487036638838 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 39587677 A/G 1 48 41 89 21.3442580917189 22.7684462133234 -1.42418812160446 A:G A G 10 0.555327956422522 0.8312306342431 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 39587865 A/C 1 47 53 100 20.8995860481415 29.4323816903937 -8.5327956422522 A:C A C 10 0.555327956422522 0.0880382261013402 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 39587889 T/C 1 49 53 102 21.7889301352964 29.4323816903937 -7.64345155509724 T:C T C 10 0.555327956422522 0.135566800444322 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 40229891 G/A 1 4 11 15 1.77868817430991 6.10860752064774 -4.32991934633783 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0349050371317493 ENSG00000133103:ENST00000255468:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000416691:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000422759:exon_40229799_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000455146:exon_40229814_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000356576:exon_40229881_40230016:COG6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 41382711 A/T 1 9 14 23 4.0020483921973 7.77459138991531 -3.77254299771801 A:T A T 10 0.555327956422522 0.141766408043743 ENSG00000102743:ENST00000443985:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000379523:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000426521:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000338625:exon_41382574_41382732:SLC25A15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 43462352 T/C 1 38 34 72 16.8975376559442 18.8811505183657 -1.98361286242158 T:C T C 10 0.555327956422522 0.637597390955133 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 14 14 28 6.22540861008469 7.77459138991531 -1.54918277983062 A:C A C 10 0.555327956422522 0.573526479524123 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 0 66 0 66 29.3483548761136 0 29.3483548761136 G G 10 0.555327956422522 2.46961543649221e-17 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 45563464 G/C 1 17 10 27 7.55942474081713 5.55327956422522 2.00614517659191 C:G G C 10 0.555327956422522 0.562156482279236 ENSG00000083635:ENST00000379161:exon_45563160_45563618:NUFIP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 45781569 A/G 1 9 10 19 4.0020483921973 5.55327956422522 -1.55123117202792 A:G A G 10 0.555327956422522 0.496869552202761 ENSG00000188342:ENST00000340473:exon_45781559_45781640:GTF2F2;ENSG00000188342:ENST00000494087:exon_45780490_45781640:GTF2F2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 46067593 G/A 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0.605558868068935 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46067482_46067621:COG3;ENSG00000136152:ENST00000465942:exon_46067482_46067621:COG3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 47255902 G/A 1 17 7 24 7.55942474081713 3.88729569495765 3.67212904585947 A:G G A 10 0.555327956422522 0.153115971856089 ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47255876_47255981:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47255876_47255981:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000443945:exon_47255876_47255981:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47255876_47255981:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47255876_47255981:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000463929:exon_47255876_47255981:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000478412:exon_47255876_47255981:LRCH1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 47354101 C/T 1 87 127 214 38.6864677912406 70.5266504656603 -31.8401826744197 T:C C T 10 0.555327956422522 1.32664581220324e-05 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 49776080 A/G 1 26 26 52 11.5614731330144 14.4385268669856 -2.87705373397114 A:G A G 10 0.555327956422522 0.485828284509982 ENSG00000102531:ENST00000492622:exon_49775936_49776102:FNDC3A;ENSG00000102531:ENST00000484074:exon_49775936_49776102:FNDC3A;ENSG00000102531:ENST00000337156:exon_49775936_49776102:FNDC3A;ENSG00000102531:ENST00000398316:exon_49775936_49776102:FNDC3A;ENSG00000102531:ENST00000497644:exon_49775936_49776102:FNDC3A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 50050620 A/G 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:G A G 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50050612_50051175:SETDB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 115 125 240 51.13728501141 69.4159945528152 -18.2787095414053 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0192599068673061 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 50108252 T/C 1 3 9 12 1.33401613073243 4.9979516078027 -3.66393547707026 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0418446542055081 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50106082_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50106090_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000471984:exon_50108054_50108398:RCBTB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 50123622 G/C 1 1 10 11 0.444672043577478 5.55327956422522 -5.10860752064774 C:G G C 10 0.555327956422522 0.00352985127998045 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50123594_50123784:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50123594_50123784:RCBTB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 50123649 G/A 1 8 2 10 3.55737634861982 1.11065591284504 2.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 0.201545371859033 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50123594_50123784:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50123594_50123784:RCBTB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 50123688 G/T 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 T:G G T 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50123594_50123784:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50123594_50123784:RCBTB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 50204880 G/A 1 14 9 23 6.22540861008469 4.9979516078027 1.22745700228199 A:G G A 10 0.555327956422522 0.678479253472011 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 52709938 A/C 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 A:C A C 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000136098:ENST00000400357:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000378101:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000339406:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000258597:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000452082:exon_52709865_52709999:NEK3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 53039451 C/G 1 50 39 89 22.2336021788739 21.6577903004784 0.575811878395545 C:G C G 10 0.555327956422522 0.91557642720475 ENSG00000136108:ENST00000398044:exon_53039430_53039600:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000258607:exon_53039430_53039600:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378034:exon_53039430_53039945:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378037:exon_53039430_53039600:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000490903:exon_53039430_53039600:CKAP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 73319171 T/C 1 14 10 24 6.22540861008469 5.55327956422522 0.672129045859473 T:C T C 10 0.555327956422522 0.839730194130565 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73319119_73319345:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000377814:exon_73319119_73319317:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000471712:exon_73319119_73319183:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73319119_73319345:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000464754:exon_73319119_73319274:C13orf34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 10 8 18 4.44672043577478 4.44262365138018 0.00409678439460492 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 73343039 C/T 1 28 26 54 12.4508172201694 14.4385268669856 -1.98770964681619 T:C C T 10 0.555327956422522 0.587262893573705 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73342923_73343050:DIS3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 73349359 G/C 1 43 53 96 19.1208978738316 29.4323816903937 -10.3114838165621 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0396036677289374 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 73350194 G/A 1 33 12 45 14.6741774380568 6.66393547707026 8.01024196098651 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0163536896642006 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73350063_73350230:DIS3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 73369642 A/G 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 A:G A G 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000083535:ENST00000326291:exon_73369497_73369695:PIBF1;ENSG00000083535:ENST00000489797:exon_73369497_73369695:PIBF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 74339104 G/T 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 T:G G T 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000118922:ENST00000377669:exon_74339075_74339137:KLF12;ENSG00000118922:ENST00000377666:exon_74339075_74339137:KLF12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 77738664 A/G 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 A:G A G 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77738589_77738676:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77738589_77738676:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000360084:exon_77738589_77738676:MYCBP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 77751892 C/T 1 9 10 19 4.0020483921973 5.55327956422522 -1.55123117202792 T:C C T 10 0.555327956422522 0.496869552202761 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77751883_77752089:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77751883_77752089:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000360084:exon_77751883_77752089:MYCBP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 79219099 C/T 1 10 7 17 4.44672043577478 3.88729569495765 0.559424740817127 T:C C T 10 0.555327956422522 0.813340797660957 ENSG00000152193:ENST00000282003:exon_79218997_79219132:RNF219 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 79940811 T/C 1 17 23 40 7.55942474081713 12.772542997718 -5.21311825690088 T:C T C 10 0.555327956422522 0.11184424593338 ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000461008:exon_79940768_79940845:RBM26 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 95714976 C/T 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 T:C C T 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95714958_95715113:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95714958_95715113:ABCC4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 95727780 T/C 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 T:C T C 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95727686_95727805:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95727686_95727805:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000467685:exon_95727686_95728273:ABCC4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 95861804 A/G 1 3 9 12 1.33401613073243 4.9979516078027 -3.66393547707026 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0418446542055081 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95861688_95861851:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95861688_95861851:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95861688_95861851:ABCC4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 98645253 A/G 1 56 39 95 24.9016344403388 21.6577903004784 3.24384413986041 A:G A G 10 0.555327956422522 0.536668829821945 ENSG00000065150:ENST00000261574:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000357602:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000490680:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000389591:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000469360:exon_98645146_98645268:IPO5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 5 15 20 2.22336021788739 8.32991934633783 -6.10655912845044 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00669247932999867 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 103257170 G/A 1 13 17 30 5.78073656650721 9.44057525918287 -3.65983869267566 A:G G A 10 0.555327956422522 0.200611829751137 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103257143_103257271:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103257143_103257271:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000490010:exon_103257143_103257271:TPP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 18 23 41 8.0040967843946 12.772542997718 -4.7684462133234 T:C T C 10 0.555327956422522 0.157329387783005 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 103518162 C/A 1 30 35 65 13.3401613073243 19.4364784747883 -6.09631716746393 A:C C A 10 0.555327956422522 0.135426792683773 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103518017_103518261:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103518017_103518261:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103517068_103518731:ERCC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 111279844 G/A 1 2 9 11 0.889344087154956 4.9979516078027 -4.10860752064774 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0150596095234126 ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111279786_111279899:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000424185:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000397191:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000439607:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111279786_111279894:CARKD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 111340342 G/A 1 26 20 46 11.5614731330144 11.1065591284504 0.454914004563991 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111340294_111340365:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000465145:exon_111340294_111340365:CARS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 111532288 G/A 1 32 45 77 14.2295053944793 24.9897580390135 -10.7602526445342 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0157144021745623 ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111530887_111532459:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000485844:exon_111532115_111532459:ANKRD10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 111563052 C/T 1 23 29 52 10.227457002282 16.1045107362531 -5.87705373397114 T:C C T 10 0.555327956422522 0.124141167581142 ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000310847:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000465753:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000489973:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000494859:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000375758:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000460846:exon_111562965_111563117:ANKRD10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 113153217 C/A 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 A:C C A 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000126216:ENST00000375669:exon_113153123_113153250:TUBGCP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 113508839 G/C 1 3 16 19 1.33401613073243 8.88524730276035 -7.55123117202792 C:G G C 10 0.555327956422522 0.000674841527813295 ENSG00000068650:ENST00000487903:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375630:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375645:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000283558:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000431624:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000459908:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000418678:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000432166:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000489577:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000471555:exon_113508593_113508844:ATP11A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 114150107 C/T 1 17 20 37 7.55942474081713 11.1065591284504 -3.54713438763331 T:C C T 10 0.555327956422522 0.251085232136404 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 114175038 G/A 1 14 8 22 6.22540861008469 4.44262365138018 1.78278495870452 A:G G A 10 0.555327956422522 0.523473069933469 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 114542858 G/A 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 A:G G A 10 0.555327956422522 0.775730055964994 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 13 114780764 A/G 1 9 4 13 4.0020483921973 2.22131182569009 1.78073656650721 A:G A G 10 0.555327956422522 0.408523981318449 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114780685_114780808:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114780685_114780808:RASA3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20764585 A/C 1 4 7 11 1.77868817430991 3.88729569495765 -2.10860752064774 A:C A C 10 0.555327956422522 0.234416927909769 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20764549_20764605:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20764549_20764605:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20764549_20764605:TTC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20770036 T/C 1 8 9 17 3.55737634861982 4.9979516078027 -1.44057525918287 T:C T C 10 0.555327956422522 0.626853565320545 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20769992_20770124:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20769992_20770124:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20769992_20770124:TTC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 25 12 37 11.116801089437 6.66393547707026 4.45286561236669 A:C A C 10 0.555327956422522 0.185064185859084 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 24 24 48 10.6721290458595 13.3278709541405 -2.65574190828105 C:G G C 10 0.555327956422522 0.469745292824653 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20841707 C/T 1 13 10 23 5.78073656650721 5.55327956422522 0.227457002281995 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20841666_20841742:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20841666_20841742:TEP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20847202 A/G 1 7 16 23 3.11270430504235 8.88524730276035 -5.77254299771801 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0197369722085317 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20847140_20847264:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20847140_20847264:TEP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20850093 C/T 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 T:C C T 10 0.555327956422522 0.150211231786478 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20850072_20850222:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20850072_20850222:TEP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20850156 C/G 1 6 9 15 2.66803226146487 4.9979516078027 -2.32991934633783 C:G C G 10 0.555327956422522 0.299710241961317 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20850072_20850222:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20850072_20850222:TEP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20852029 A/G 1 8 18 26 3.55737634861982 9.9959032156054 -6.43852686698557 A:C:G A G 10 0.555327956422522 0.0162193051941255 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20851902_20852077:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20851902_20852077:TEP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20852817 G/A 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 A:G G A 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20852759_20852872:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20852759_20852872:TEP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20876253 A/G 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20876032_20876622:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20876032_20876622:TEP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 23 22 45 10.227457002282 12.2172150412955 -1.98975803901349 T:C T C 10 0.555327956422522 0.552749496507651 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 14 19 33 6.22540861008469 10.5512311720279 -4.32582256194322 T:C T C 10 0.555327956422522 0.160689908592126 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20920340 A/G 1 8 2 10 3.55737634861982 1.11065591284504 2.44672043577478 A:G A G 10 0.555327956422522 0.201545371859033 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 190 179 369 84.4876882797208 99.4037041996314 -14.9160159199106 T:C:G T G 10 0.555327956422522 0.128652256421008 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 20928359 C/A 1 27 27 54 12.0061451765919 14.9938548234081 -2.98770964681619 A:C C A 10 0.555327956422522 0.415371111688778 ENSG00000165782:ENST00000250489:exon_20928351_20928457:TMEM55B;ENSG00000165782:ENST00000398020:exon_20928351_20928457:TMEM55B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 21463050 G/C 1 25 25 50 11.116801089437 13.883198910563 -2.7663978211261 C:G G C 10 0.555327956422522 0.477751613634868 ENSG00000165792:ENST00000339374:exon_21462953_21463060:METT11D1;ENSG00000165792:ENST00000382985:exon_21462953_21463060:METT11D1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 21464336 T/C 1 6 8 14 2.66803226146487 4.44262365138018 -1.77459138991531 T:C T C 10 0.555327956422522 0.423022312731772 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 21861835 T/C 1 45 39 84 20.0102419609865 21.6577903004784 -1.64754833949184 T:C T C 10 0.555327956422522 0.742634268494538 ENSG00000100888:ENST00000430710:exon_21861635_21862354:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000399982:exon_21861635_21862354:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000262707:exon_21861635_21862354:CHD8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 28 26 54 12.4508172201694 14.4385268669856 -1.98770964681619 T:C T C 10 0.555327956422522 0.587262893573705 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 41 38 79 18.2315537866766 21.1024623440558 -2.87090855737923 A:G G A 10 0.555327956422522 0.571703900883583 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 21967438 G/A 1 9 14 23 4.0020483921973 7.77459138991531 -3.77254299771801 A:G G A 10 0.555327956422522 0.141766408043743 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 25 37 62 11.116801089437 20.5471343876333 -9.43033329819636 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0207177569521508 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 21991626 C/G 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 C:G C G 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000165821:ENST00000450879:exon_21990967_21993065:SALL2;ENSG00000165821:ENST00000327430:exon_21989234_21993788:SALL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 183 154 337 81.3749839746785 85.5205052890684 -4.1455213143899 T:C T C 10 0.555327956422522 0.661272220225252 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 48 57 105 21.3442580917189 31.6536935160838 -10.3094354243648 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0492000875914347 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 23549785 T/C 1 111 113 224 49.3585968371001 62.752059075745 -13.3934622386449 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0802671282871633 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 23745533 C/T 1 28 22 50 12.4508172201694 12.2172150412955 0.2336021788739 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 23777099 G/A 1 10 21 31 4.44672043577478 11.661887084873 -7.21516664909818 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0108242511713790 ENSG00000129473:ENST00000250405:exon_23776969_23777408:BCL2L2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 23944505 G/A 1 21 16 37 9.33811291512704 8.88524730276035 0.452865612366686 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 23944514 C/A 1 30 22 52 13.3401613073243 12.2172150412955 1.12294626602886 A:C C A 10 0.555327956422522 0.782030717885423 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24030666 G/A 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 A:G G A 10 0.555327956422522 0.554274589281642 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24572812 G/A 1 41 31 72 18.2315537866766 17.2151666490982 1.01638713757842 A:G G A 10 0.555327956422522 0.905716650667588 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24572719_24573339:PCK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 15 30 45 6.67008065366217 16.6598386926757 -9.98975803901349 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00386377122064144 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24617238 C/T 1 42 31 73 18.6762258302541 17.2151666490982 1.4610591811559 T:C C T 10 0.555327956422522 0.814033342496971 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24617185_24617331:RNF31 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24629744 G/A 1 39 25 64 17.3422096995216 13.883198910563 3.45901078895859 A:G G A 10 0.555327956422522 0.450810083461726 ENSG00000092098:ENST00000382682:exon_24629729_24629870:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000491351:exon_24629729_24629869:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24629729_24629866:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000382687:exon_24629729_24629870:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000483895:exon_24629729_24629814:RNF31 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24702789 C/T 1 43 42 85 19.1208978738316 23.3237741697459 -4.20287629591437 T:C C T 10 0.555327956422522 0.383446650918021 ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24702685_24702804:GMPR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 22 23 45 9.78278495870452 12.772542997718 -2.98975803901349 A:G G A 10 0.555327956422522 0.372989596784527 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 29 18 47 12.8954892637469 9.9959032156054 2.89958604814147 T:C T C 10 0.555327956422522 0.46380978093646 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24760764 G/A 1 15 5 20 6.67008065366217 2.77663978211261 3.89344087154956 A:G G A 10 0.555327956422522 0.113443509114618 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24761467 G/T 1 10 8 18 4.44672043577478 4.44262365138018 0.00409678439460492 T:G G T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24761390_24761536:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24761390_24761536:DHRS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24785088 C/A 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 A:C C A 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000213903:ENST00000345363:exon_24784843_24786152:LTB4R;ENSG00000213903:ENST00000396789:exon_24784843_24787061:LTB4R;ENSG00000213903:ENST00000396782:exon_24784843_24787242:LTB4R HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24785254 A/C 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:C A C 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000213903:ENST00000345363:exon_24784843_24786152:LTB4R;ENSG00000213903:ENST00000396789:exon_24784843_24787061:LTB4R;ENSG00000213903:ENST00000396782:exon_24784843_24787242:LTB4R HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24805463 G/T 1 9 11 20 4.0020483921973 6.10860752064774 -2.10655912845044 A:T:G G T 10 0.555327956422522 0.374427217398125 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24805227_24805601:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24805228_24805601:RIPK3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 20 18 38 8.89344087154956 9.9959032156054 -1.10246234405583 A:C A C 10 0.555327956422522 0.746082769898358 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24901276 G/T 1 26 24 50 11.5614731330144 13.3278709541405 -1.7663978211261 T:G G T 10 0.555327956422522 0.670282040426826 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24906515 C/T 1 28 32 60 12.4508172201694 17.7704946055207 -5.31967738535132 T:C C T 10 0.555327956422522 0.193861783295179 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24906534 G/A 1 22 30 52 9.78278495870452 16.6598386926757 -6.87705373397114 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0688022369122516 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24909281 C/T 1 77 108 185 34.2397473554658 59.9754192936324 -25.7356719381666 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.000152730646269606 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24909362 T/C 1 70 109 179 31.1270430504235 60.5307472500549 -29.4037041996314 T:C T C 10 0.555327956422522 1.12233076899915e-05 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24909475 C/G 1 61 81 142 27.1249946582262 44.9815644702243 -17.8565698119981 C:G C G 10 0.555327956422522 0.00301223469756284 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24909629 C/A 1 87 63 150 38.6864677912406 34.9856612546189 3.70080653662171 A:C C A 10 0.555327956422522 0.56600848745113 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24909731 C/T 1 65 43 108 28.9036828325361 23.8791021261684 5.02458070636763 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.383623695953862 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24910846 C/T 1 13 2 15 5.78073656650721 1.11065591284504 4.67008065366217 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0174561035186964 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24910876 G/A 1 9 1 10 4.0020483921973 0.555327956422522 3.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0504158529035674 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24910973 T/G 1 34 33 67 15.1188494816343 18.3258225619432 -3.20697308030897 T:G T G 10 0.555327956422522 0.461848906718988 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24910974 T/A 1 34 31 65 15.1188494816343 17.2151666490982 -2.09631716746393 A:T T A 10 0.555327956422522 0.61930708858527 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 24911452 T/C 1 13 20 33 5.78073656650721 11.1065591284504 -5.32582256194322 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0787801500475162 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24911384_24911466:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24911384_24911466:SDR39U1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 31354296 T/G 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:G T G 10 0.555327956422522 0.479662189097226 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 15 31 46 6.67008065366217 17.2151666490982 -10.545085995436 C:G C G 10 0.555327956422522 0.00259312816510477 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 29 26 55 12.8954892637469 14.4385268669856 -1.54303760323871 A:G G A 10 0.555327956422522 0.686132872440229 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 35546373 T/C 1 3 10 13 1.33401613073243 5.55327956422522 -4.21926343349279 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0239466351830008 ENSG00000151327:ENST00000396472:exon_35546356_35546422:FAM177A1;ENSG00000151327:ENST00000382406:exon_35546356_35546422:FAM177A1;ENSG00000151327:ENST00000280987:exon_35546356_35546422:FAM177A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 20 34 54 8.89344087154956 18.8811505183657 -9.98770964681619 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00865215698335459 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 580 472 1052 257.909785274937 262.11479543143 -4.20501015649313 A:T:C:G G A 10 0.555327956422522 0.804034209743213 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 39818028 A/G 1 18 14 32 8.0040967843946 7.77459138991531 0.229505394479297 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 23 27 50 10.227457002282 14.9938548234081 -4.7663978211261 A:G G A 10 0.555327956422522 0.200588244921778 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 45696037 T/G 1 18 8 26 8.0040967843946 4.44262365138018 3.56147313301443 T:C:G T G 10 0.555327956422522 0.172932735572506 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45695946_45696039:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45696029_45696039:C14orf106 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 45711594 T/C 1 17 12 29 7.55942474081713 6.66393547707026 0.895489263746863 T:C T C 10 0.555327956422522 0.852446590248957 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45711237_45711683:C14orf106 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 50246320 C/T 1 22 15 37 9.78278495870452 8.32991934633783 1.45286561236669 T:C C T 10 0.555327956422522 0.74140646380221 ENSG00000165516:ENST00000298307:exon_50246313_50246393:KLHDC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 50246934 T/C 1 13 11 24 5.78073656650721 6.10860752064774 -0.327870954140527 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000165516:ENST00000298307:exon_50246931_50247040:KLHDC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 50298962 T/A 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 A:T T A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50298925_50298995:SDCCAG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 51111694 T/C 1 8 11 19 3.55737634861982 6.10860752064774 -2.55123117202792 T:C T C 10 0.555327956422522 0.2564170773856 ENSG00000151748:ENST00000324679:exon_51111462_51111732:SAV1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 48 56 104 21.3442580917189 31.0983655596612 -9.75410746794229 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0606360646111859 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 51223804 T/C 1 14 28 42 6.22540861008469 15.5491827798306 -9.32377416974592 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00472624603680665 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 51224881 C/T 1 11 20 31 4.89139247935226 11.1065591284504 -6.21516664909818 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0294966063556148 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 51225049 G/C 1 8 23 31 3.55737634861982 12.772542997718 -9.21516664909818 C:G G C 10 0.555327956422522 0.000955523706834743 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 51225132 G/T 1 26 16 42 11.5614731330144 8.88524730276035 2.67622583025408 T:G G T 10 0.555327956422522 0.440894103867154 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 51716188 T/G 1 48 46 94 21.3442580917189 25.545085995436 -4.20082790371707 T:G T G 10 0.555327956422522 0.407178893751851 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716186_51716287:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716186_51716287:TMX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 51716467 G/A 1 52 56 108 23.1229462660289 31.0983655596612 -7.97541929363237 A:G G A 10 0.555327956422522 0.146054917554746 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716411_51716483:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716411_51716483:TMX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 55408294 C/T 1 17 23 40 7.55942474081713 12.772542997718 -5.21311825690088 T:C C T 10 0.555327956422522 0.11184424593338 ENSG00000198554:ENST00000360586:exon_55405668_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000359167:exon_55406942_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000475379:exon_55407989_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000421192:exon_55408208_55408408:WDHD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 55604935 C/A 1 90 103 193 40.020483921973 57.1987795115198 -17.1782955895467 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0137280123984214 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 70 99 169 31.1270430504235 54.9774676858297 -23.8504246354062 A:C A C 10 0.555327956422522 0.000256862993160214 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 55619311 A/G 1 32 27 59 14.2295053944793 14.9938548234081 -0.764349428928796 A:G A G 10 0.555327956422522 0.896034534534726 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55619308_55619365:DLGAP5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 55817708 T/C 1 12 5 17 5.33606452292974 2.77663978211261 2.55942474081713 T:C T C 10 0.555327956422522 0.233437199703189 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 55818517 T/A 1 16 8 24 7.11475269723965 4.44262365138018 2.67212904585947 A:T T A 10 0.555327956422522 0.309745230341374 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 55818706 T/C 1 22 18 40 9.78278495870452 9.9959032156054 -0.213118256900879 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 55864130 A/G 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000126775:ENST00000247178:exon_55864090_55864152:ATG14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 56103882 A/G 1 7 1 8 3.11270430504235 0.555327956422522 2.55737634861982 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0837859633971926 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 57876265 G/A 1 10 13 23 4.44672043577478 7.21926343349279 -2.772542997718 A:G G A 10 0.555327956422522 0.295526802222298 ENSG00000139977:ENST00000298406:exon_57876097_57879466:NAA30;ENSG00000139977:ENST00000395257:exon_57876097_57879466:NAA30 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 58820529 C/T 1 21 15 36 9.33811291512704 8.32991934633783 1.00819356878921 T:C C T 10 0.555327956422522 0.867132456195878 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58820376_58820573:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58820376_58820573:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58820376_58820573:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58820376_58820573:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58820376_58820573:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000469635:exon_58820172_58820573:ARID4A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 58827705 C/T 1 13 7 20 5.78073656650721 3.88729569495765 1.89344087154956 T:C C T 10 0.555327956422522 0.501729600552412 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58827619_58827760:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58827619_58827760:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58827619_58827760:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58827619_58827760:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58827619_58827760:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000469635:exon_58827619_58827709:ARID4A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 58831142 A/G 1 20 14 34 8.89344087154956 7.77459138991531 1.11884948163425 A:G A G 10 0.555327956422522 0.73341319325584 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 58831305 T/C 1 24 15 39 10.6721290458595 8.32991934633783 2.34220969952164 T:C T C 10 0.555327956422522 0.520690575426974 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 58838668 A/G 1 13 13 26 5.78073656650721 7.21926343349279 -1.43852686698557 A:G A G 10 0.555327956422522 0.693891745956565 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58838604_58838678:ARID4A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 58838701 C/T 1 16 9 25 7.11475269723965 4.9979516078027 2.11680108943695 T:C C T 10 0.555327956422522 0.428150577551636 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 59113160 G/A 1 10 13 23 4.44672043577478 7.21926343349279 -2.772542997718 A:G G A 10 0.555327956422522 0.295526802222298 ENSG00000165617:ENST00000395151:exon_59111976_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000395153:exon_59112087_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000335867:exon_59111976_59113888:DACT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 59789727 G/A 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 A:G G A 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59789610_59789943:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59789610_59789943:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59789610_59789943:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59789610_59789943:DAAM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 59789892 G/T 1 6 13 19 2.66803226146487 7.21926343349279 -4.55123117202792 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0395254330154768 ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59789610_59789943:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59789610_59789943:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59789610_59789943:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59789610_59789943:DAAM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 59939804 G/A 1 13 5 18 5.78073656650721 2.77663978211261 3.0040967843946 A:G G A 10 0.555327956422522 0.234861389233214 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59939335_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000463432:exon_59939579_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000532049:exon_59939583_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000478430:exon_59939585_59939808:C14orf149 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 61857969 A/G 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61857943_61858006:PRKCH HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 62244837 A/G 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 A:G A G 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000023608:ENST00000216294:exon_62244790_62244858:SNAPC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 64612845 C/T 1 15 13 28 6.67008065366217 7.21926343349279 -0.549182779830615 T:C C T 10 0.555327956422522 0.851250752295518 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64612786_64612941:SYNE2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 64612858 C/A 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 A:C C A 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64612786_64612941:SYNE2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 64637147 C/A 1 17 13 30 7.55942474081713 7.21926343349279 0.340161307324341 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64636946_64637180:SYNE2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 64656855 T/C 1 16 18 34 7.11475269723965 9.9959032156054 -2.88115051836575 T:C T C 10 0.555327956422522 0.388695221433277 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64656789_64656955:SYNE2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 64908845 G/A 1 72 65 137 32.0163871375784 36.0963171674639 -4.07993002988551 A:G G A 10 0.555327956422522 0.492651472349342 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64908772_64908883:MTHFD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 64988279 A/G 1 40 38 78 17.7868817430991 21.1024623440558 -3.31558060095671 A:G A G 10 0.555327956422522 0.494690062798639 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 64988924 T/C 1 38 46 84 16.8975376559442 25.545085995436 -8.64754833949184 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0621568449457136 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 68117421 T/C 1 9 14 23 4.0020483921973 7.77459138991531 -3.77254299771801 T:C T C 10 0.555327956422522 0.141766408043743 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 68118132 C/T 1 61 50 111 27.1249946582262 27.7663978211261 -0.641403162899937 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.924096432685378 ENSG00000081181:ENST00000261783:exon_68117432_68118437:ARG2;ENSG00000100568:ENST00000216456:exon_68117869_68118198:VTI1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 68251991 G/A 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 A:G G A 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000072121:ENST00000347230:exon_68251776_68251994:ZFYVE26;ENSG00000072121:ENST00000411699:exon_68251776_68251994:ZFYVE26 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 69352230 G/A 1 16 18 34 7.11475269723965 9.9959032156054 -2.88115051836575 A:G G A 10 0.555327956422522 0.388695221433277 ENSG00000072110:ENST00000193403:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000438964:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000394419:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000376839:exon_69352142_69352292:ACTN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 70634801 T/C 1 9 11 20 4.0020483921973 6.10860752064774 -2.10655912845044 T:C T C 10 0.555327956422522 0.374427217398125 ENSG00000100678:ENST00000381269:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000356921:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000494208:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000357887:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000358407:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000534137:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000528359:exon_70633356_70635201:SLC8A3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 71374702 G/A 1 2 7 9 0.889344087154956 3.88729569495765 -2.9979516078027 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0877066993700078 ENSG00000100731:ENST00000238570:exon_71374122_71374720:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000304743:exon_71374122_71374720:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000439984:exon_71374122_71374720:PCNX HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 71444788 G/A 1 22 8 30 9.78278495870452 4.44262365138018 5.34016130732434 A:G G A 10 0.555327956422522 0.064765902659164 ENSG00000100731:ENST00000238570:exon_71443659_71445365:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000304743:exon_71443659_71445365:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000439984:exon_71443659_71445365:PCNX HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 23 34 57 10.227457002282 18.8811505183657 -8.65369351608375 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0233486058223528 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 74061968 T/C 1 9 15 24 4.0020483921973 8.32991934633783 -4.32787095414053 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0990620091275335 ENSG00000177465:ENST00000326303:exon_74061753_74062468:ACOT4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 74196686 T/C 1 30 23 53 13.3401613073243 12.772542997718 0.567618309606335 T:C T C 10 0.555327956422522 0.891214205866966 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74196343_74196688:C14orf43 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 74203789 G/A 1 25 19 44 11.116801089437 10.5512311720279 0.565569917409034 A:G G A 10 0.555327956422522 0.880943123846544 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74203701_74204000:C14orf43 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 74205878 C/T 1 12 8 20 5.33606452292974 4.44262365138018 0.893440871549561 T:C C T 10 0.555327956422522 0.823148310222236 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74205263_74206177:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 74206481 T/C 1 17 16 33 7.55942474081713 8.88524730276035 -1.32582256194322 T:C T C 10 0.555327956422522 0.726914463925943 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 74206658 G/A 1 17 16 33 7.55942474081713 8.88524730276035 -1.32582256194322 A:G G A 10 0.555327956422522 0.726914463925943 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000421708:exon_74206515_74206958:C14orf43 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 74428548 C/A 1 17 13 30 7.55942474081713 7.21926343349279 0.340161307324341 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 75483812 T/C 1 5 14 19 2.22336021788739 7.77459138991531 -5.55123117202792 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0183760951760472 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75480467_75483904:MLH3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 75513828 G/A 1 11 6 17 4.89139247935226 3.33196773853513 1.55942474081713 A:G G A 10 0.555327956422522 0.477388500584111 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 7 10 17 3.11270430504235 5.55327956422522 -2.44057525918287 A:G A G 10 0.555327956422522 0.329183052237539 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 76117924 C/G 1 101 86 187 44.9118764013253 47.7582042523369 -2.84632785101161 C:G C G 10 0.555327956422522 0.713081581591058 ENSG00000133935:ENST00000256319:exon_76116134_76117977:C14orf1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 10 10 20 4.44672043577478 5.55327956422522 -1.10655912845044 A:G G A 10 0.555327956422522 0.657502601953682 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 77272992 C/G 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000013523:ENST00000251089:exon_77272759_77273192:ANGEL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 77492891 G/A 1 39 61 100 17.3422096995216 33.8750053417738 -16.5327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00117247240792678 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 90398907 G/A 1 3 9 12 1.33401613073243 4.9979516078027 -3.66393547707026 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0418446542055081 ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90398870_90398971:C14orf143 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 90420298 C/T 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 T:C C T 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90420250_90420345:C14orf143 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 90429749 A/G 1 26 28 54 11.5614731330144 15.5491827798306 -3.98770964681619 A:G A G 10 0.555327956422522 0.277272455465373 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 90756760 A/T 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 A:T A T 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90756565_90756951:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90756565_90756951:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90756565_90756951:C14orf102 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 14 11 25 6.22540861008469 6.10860752064774 0.11680108943695 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 91739081 A/G 1 18 14 32 8.0040967843946 7.77459138991531 0.229505394479297 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000427583:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000334448:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000331194:exon_91738969_91739562:CCDC88C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 91773568 T/C 1 10 12 22 4.44672043577478 6.66393547707026 -2.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.393799982731658 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91773382_91773570:CCDC88C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 91779520 C/T 1 13 14 27 5.78073656650721 7.77459138991531 -1.99385482340809 T:C C T 10 0.555327956422522 0.446307655179609 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91779424_91780494:CCDC88C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 92487996 A/G 1 8 9 17 3.55737634861982 4.9979516078027 -1.44057525918287 A:G A G 10 0.555327956422522 0.626853565320545 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92487900_92488175:TRIP11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 123 104 227 54.6946613600298 57.7541074679423 -3.05944610791249 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.689125961141299 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 93119407 C/T 1 127 101 228 56.4733495343397 56.0881235986747 0.385225935664991 A:T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 93199080 C/T 1 31 26 57 13.7848333509018 14.4385268669856 -0.653693516083752 T:C C T 10 0.555327956422522 0.894438143068177 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93198994_93199160:LGMN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 94401102 C/T 1 3 18 21 1.33401613073243 9.9959032156054 -8.66188708487296 T:C C T 10 0.555327956422522 0.000196634742187008 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94400499_94401138:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94400513_94401138:ASB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 94417421 G/A 1 17 5 22 7.55942474081713 2.77663978211261 4.78278495870452 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0518516835843347 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 94417586 G/A 1 17 6 23 7.55942474081713 3.33196773853513 4.22745700228199 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0932569471468184 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 94847415 A/G 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 A:G A G 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000197249:ENST00000440909:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000355814:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000449399:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437397:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000426226:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437074:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448140:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448921:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393087:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000489769:exon_94846988_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393088:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000404814:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000402629:exon_94847208_94847478:SERPINA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 97299853 A/G 1 38 36 74 16.8975376559442 19.9918064312108 -3.09426877526662 A:G A G 10 0.555327956422522 0.484572767174993 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97299804_97299968:VRK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 97321689 C/T 1 35 26 61 15.5635215252117 14.4385268669856 1.12499465822616 T:C C T 10 0.555327956422522 0.798119108960228 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97321561_97321693:VRK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 99876505 A/G 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99876141_99876552:SETD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 100759277 C/T 1 36 15 51 16.0081935687892 8.32991934633783 7.67827422245138 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0341309097356394 ENSG00000197119:ENST00000359232:exon_100757448_100759369:SLC25A29;ENSG00000197119:ENST00000392908:exon_100757448_100759369:SLC25A29 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 100803525 C/T 1 227 204 431 100.940553892088 113.286903110194 -12.346349218107 T:C C T 10 0.555327956422522 0.244751507126427 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100803399_100803539:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100803399_100803539:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100803399_100803539:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100803399_100803539:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100803399_100803539:WARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 102463407 A/G 1 11 12 23 4.89139247935226 6.66393547707026 -1.77254299771801 A:G A G 10 0.555327956422522 0.531120817504268 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102463372_102463611:DYNC1H1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 102493761 A/G 1 17 36 53 7.55942474081713 19.9918064312108 -12.4323816903937 A:G A G 10 0.555327956422522 0.000759170539521745 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102493720_102493881:DYNC1H1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 102514227 T/C 1 24 46 70 10.6721290458595 25.545085995436 -14.8729569495765 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00041931373190168 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 103440473 G/C 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 A:C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000198752:ENST00000361246:exon_103440353_103440486:CDC42BPB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 105167744 G/A 1 6 8 14 2.66803226146487 4.44262365138018 -1.77459138991531 A:G G A 10 0.555327956422522 0.423022312731772 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105167694_105168093:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105167694_105168093:INF2;ENSG00000203485:ENST00000398337:exon_105167694_105168093:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105167694_105168093:INF2;ENSG00000203485:ENST00000450528:exon_105167694_105168093:INF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 105180652 C/T 1 15 16 31 6.67008065366217 8.88524730276035 -2.21516664909818 T:C C T 10 0.555327956422522 0.471945862571681 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 105477507 G/A 1 102 92 194 45.3565484449028 51.090171990872 -5.73362354596927 A:G G A 10 0.555327956422522 0.427128657905918 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 105477613 T/C 1 75 93 168 33.3504032683108 51.6454999472945 -18.2950966789837 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00508816088442168 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 105518336 G/T 1 12 13 25 5.33606452292974 7.21926343349279 -1.88319891056305 T:G G T 10 0.555327956422522 0.547039280437458 ENSG00000183484:ENST00000392585:exon_105515728_105518439:GPR132;ENSG00000183484:ENST00000329797:exon_105515739_105518439:GPR132 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 105930406 G/A 1 29 28 57 12.8954892637469 15.5491827798306 -2.65369351608375 A:G G A 10 0.555327956422522 0.506846736590378 ENSG00000182979:ENST00000435036:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000490198:exon_105930369_105930484:MTA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 14 106092383 C/G 0 43 0 43 19.1208978738316 0 19.1208978738316 C C 10 0.555327956422522 1.14403627977482e-11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 21937964 A/G 0 17 0 17 7.55942474081713 0 7.55942474081713 A A 10 0.555327956422522 6.85306168211226e-05 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 22933849 G/T 1 13 24 37 5.78073656650721 13.3278709541405 -7.54713438763331 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0192696287115965 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22933748_22933876:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22933748_22933876:CYFIP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 22960868 G/C 1 30 35 65 13.3401613073243 19.4364784747883 -6.09631716746393 C:G G C 10 0.555327956422522 0.135426792683773 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22960793_22960889:CYFIP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 34159986 T/C 1 8 3 11 3.55737634861982 1.66598386926757 1.89139247935226 T:C T C 10 0.555327956422522 0.365636833821238 ENSG00000169857:ENST00000306730:exon_34159696_34160056:AVEN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 35273620 C/T 1 22 23 45 9.78278495870452 12.772542997718 -2.98975803901349 T:C C T 10 0.555327956422522 0.372989596784527 ENSG00000198146:ENST00000356321:exon_35270542_35275691:ZNF770 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 40259848 A/C 1 44 28 72 19.565569917409 15.5491827798306 4.01638713757842 A:C A C 10 0.555327956422522 0.40666652330926 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40259545_40260080:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40259545_40260080:EIF2AK4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 40327290 A/G 1 77 42 119 34.2397473554658 23.3237741697459 10.9159731857199 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0522977465370587 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 73 47 120 32.4610591811559 26.1004139518585 6.36064522929736 A:G G A 10 0.555327956422522 0.270521160907978 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 40330564 C/T 1 174 135 309 77.3729355824812 74.9692741170405 2.40366146544071 T:C C T 10 0.555327956422522 0.818971222971671 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 41191646 C/T 1 16 12 28 7.11475269723965 6.66393547707026 0.450817220169385 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000104142:ENST00000220509:exon_41191342_41193212:VPS18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 41247888 C/T 1 25 21 46 11.116801089437 11.661887084873 -0.545085995436011 T:C C T 10 0.555327956422522 0.883074147030052 ENSG00000128965:ENST00000446533:exon_41247571_41248717:CHAC1;ENSG00000128965:ENST00000444189:exon_41247748_41248717:CHAC1;ENSG00000128965:ENST00000397434:exon_41247748_41247972:CHAC1;ENSG00000128965:ENST00000249798:exon_41247571_41248709:CHAC1;ENSG00000128965:ENST00000487220:exon_41247571_41248365:CHAC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 41772414 T/C 1 18 17 35 8.0040967843946 9.44057525918287 -1.43647847478827 T:C T C 10 0.555327956422522 0.734278463498667 ENSG00000137815:ENST00000389629:exon_41772412_41772523:RTF1;ENSG00000137815:ENST00000389628:exon_41772412_41772523:RTF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 41813279 C/T 1 10 16 26 4.44672043577478 8.88524730276035 -4.43852686698557 T:C C T 10 0.555327956422522 0.112681249078794 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41812589_41813345:RPAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 41820200 C/T 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C C T 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41820058_41820225:RPAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 41829230 A/G 1 10 6 16 4.44672043577478 3.33196773853513 1.11475269723965 A:G A G 10 0.555327956422522 0.624513862012014 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41829143_41829399:RPAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 42115747 G/C 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000137802:ENST00000457542:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000512970:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000389931:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000221214:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000260357:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000505373:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000456763:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000505061:exon_42115645_42116259:MAPKBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 42139642 C/T 1 9 6 15 4.0020483921973 3.33196773853513 0.670080653662171 T:C C T 10 0.555327956422522 0.799910806218814 ENSG00000168970:ENST00000490848:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000382448:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000491746:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000487292:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000458483:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000452633:exon_42139535_42139721:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000483748:exon_42139535_42139721:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000484140:exon_42139535_42139721:PLA2G4B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 42235316 C/T 1 79 90 169 35.1290914426208 49.979516078027 -14.8504246354062 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0245626433759815 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42235265_42235362:EHD4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 42565588 C/A 1 5 13 18 2.22336021788739 7.21926343349279 -4.9959032156054 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0297547757208393 ENSG00000103978:ENST00000389834:exon_42565453_42565755:TMEM87A;ENSG00000103978:ENST00000448392:exon_42565453_42565638:TMEM87A;ENSG00000103978:ENST00000307216:exon_42565453_42565755:TMEM87A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 42602621 C/T 1 11 8 19 4.89139247935226 4.44262365138018 0.448768827972082 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42602481_42602661:GANC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 43017426 T/G 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 T:G T G 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43017342_43017449:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43017342_43017449:CDAN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 43020983 G/A 1 8 10 18 3.55737634861982 5.55327956422522 -1.9959032156054 A:G G A 10 0.555327956422522 0.354494673636837 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43020850_43021008:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43020850_43021008:CDAN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 43028592 G/A 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43028502_43028978:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43028500_43028978:CDAN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 0 13 0 13 5.78073656650721 0 5.78073656650721 A A 10 0.555327956422522 0.000935755410675861 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 45654327 A/G 1 38 42 80 16.8975376559442 23.3237741697459 -6.42623651380176 A:G A G 10 0.555327956422522 0.176671057507981 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45653324_45654419:GATM HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 45661678 T/A 1 63 56 119 28.0143387453811 31.0983655596612 -3.08402681428012 A:T:G T A 10 0.555327956422522 0.581009805334623 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45661524_45661719:GATM HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 45694610 C/T 1 5 11 16 2.22336021788739 6.10860752064774 -3.88524730276035 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0753333982593944 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 45695382 G/A 1 8 12 20 3.55737634861982 6.66393547707026 -3.10655912845044 A:G G A 10 0.555327956422522 0.181542604683008 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 45695695 G/A 1 12 12 24 5.33606452292974 6.66393547707026 -1.32787095414053 A:G G A 10 0.555327956422522 0.682467369666187 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 8 12 20 3.55737634861982 6.66393547707026 -3.10655912845044 A:G A G 10 0.555327956422522 0.181542604683008 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 52664408 G/A 1 5 14 19 2.22336021788739 7.77459138991531 -5.55123117202792 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0183760951760472 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52664321_52664560:MYO5A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 52901914 T/C 1 10 7 17 4.44672043577478 3.88729569495765 0.559424740817127 T:C T C 10 0.555327956422522 0.813340797660957 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 54919047 A/G 1 25 13 38 11.116801089437 7.21926343349279 3.89753765594417 A:G A G 10 0.555327956422522 0.253327046612756 ENSG00000137766:ENST00000260323:exon_54919026_54920806:UNC13C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 55611433 A/G 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:G A G 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000069943:ENST00000164305:exon_55611133_55611611:PIGB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 56386514 T/A 1 11 7 18 4.89139247935226 3.88729569495765 1.0040967843946 A:T T A 10 0.555327956422522 0.813417267911682 ENSG00000181827:ENST00000422057:exon_56385831_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000423270:exon_56382732_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000317318:exon_56382732_56388818:RFX7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 56959028 C/T 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 T:C C T 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000137871:ENST00000267807:exon_56958877_56959184:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000455329:exon_56958877_56959184:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000396250:exon_56958877_56959184:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000260435:exon_56958998_56959184:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000396245:exon_56958877_56959184:ZNF280D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 59347929 C/A 1 7 9 16 3.11270430504235 4.9979516078027 -1.88524730276035 A:C C A 10 0.555327956422522 0.451827358588768 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59347881_59348044:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59347881_59348044:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59347881_59348044:RNF111 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 59368167 G/A 1 12 13 25 5.33606452292974 7.21926343349279 -1.88319891056305 A:G G A 10 0.555327956422522 0.547039280437458 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59368153_59368414:RNF111 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 59464112 A/T 1 40 48 88 17.7868817430991 26.6557419082811 -8.86886016518193 A:T A T 10 0.555327956422522 0.0677311483724042 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59464096_59464241:MYO1E HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 62199580 T/A 1 2 10 12 0.889344087154956 5.55327956422522 -4.66393547707026 A:T T A 10 0.555327956422522 0.00796802576440693 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62199463_62199589:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62199463_62199589:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62199463_62199589:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62199463_62199589:VPS13C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 62259637 C/T 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 T:C C T 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62259567_62259646:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62259567_62259646:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62259567_62259646:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62259567_62259646:VPS13C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 18 23 41 8.0040967843946 12.772542997718 -4.7684462133234 A:G G A 10 0.555327956422522 0.157329387783005 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 64448365 C/T 1 15 11 26 6.67008065366217 6.10860752064774 0.561473133014428 T:C C T 10 0.555327956422522 0.84687533574258 ENSG00000157734:ENST00000325881:exon_64446586_64449680:SNX22 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 64508763 G/A 1 10 6 16 4.44672043577478 3.33196773853513 1.11475269723965 A:G G A 10 0.555327956422522 0.624513862012014 ENSG00000169118:ENST00000303052:exon_64508761_64508912:CSNK1G1;ENSG00000169118:ENST00000447727:exon_64508761_64508912:CSNK1G1;ENSG00000169118:ENST00000303032:exon_64508761_64508912:CSNK1G1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 64737225 G/A 1 16 9 25 7.11475269723965 4.9979516078027 2.11680108943695 A:G G A 10 0.555327956422522 0.428150577551636 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64737205_64737307:TRIP4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 64792017 C/G 1 25 20 45 11.116801089437 11.1065591284504 0.0102419609865123 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000180357:ENST00000416172:exon_64791492_64795257:ZNF609;ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64791619_64792365:ZNF609 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 64885206 G/A 0 8 0 8 3.55737634861982 0 3.55737634861982 G G 10 0.555327956422522 0.0105734315433712 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 65042560 G/A 1 31 37 68 13.7848333509018 20.5471343876333 -6.7623010367315 A:G G A 10 0.555327956422522 0.112550907694391 ENSG00000166831:ENST00000300069:exon_65042542_65042580:RBPMS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 65108479 T/C 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 T:C T C 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 65153690 G/A 1 26 24 50 11.5614731330144 13.3278709541405 -1.7663978211261 A:G G A 10 0.555327956422522 0.670282040426826 ENSG00000249240:ENST00000502574:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000249240:ENST00000437723:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65153676_65153774:PLEKHO2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 65157482 C/T 1 39 41 80 17.3422096995216 22.7684462133234 -5.42623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 0.260479359624725 ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65157098_65160206:PLEKHO2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 65295478 T/C 1 19 7 26 8.44876882797208 3.88729569495765 4.56147313301443 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0780579063446087 ENSG00000103707:ENST00000220058:exon_65293851_65295594:MTFMT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 66612965 T/C 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 T:C T C 10 0.555327956422522 0.150211231786478 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000441424:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000524795:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66612909_66613070:DIS3L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 66629403 C/A 1 30 16 46 13.3401613073243 8.88524730276035 4.45491400456399 A:C C A 10 0.555327956422522 0.235034431403573 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66629052_66629519:TIPIN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 66793480 C/T 1 11 9 20 4.89139247935226 4.9979516078027 -0.106559128450439 T:C C T 10 0.555327956422522 1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 67528374 T/G 1 13 5 18 5.78073656650721 2.77663978211261 3.0040967843946 T:G T G 10 0.555327956422522 0.234861389233214 ENSG00000103591:ENST00000261880:exon_67528317_67528406:AAGAB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 69728530 A/C 1 13 13 26 5.78073656650721 7.21926343349279 -1.43852686698557 A:C A C 10 0.555327956422522 0.693891745956565 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728477_69728600:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728477_69728600:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728477_69728600:KIF23 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 25 25 50 11.116801089437 13.883198910563 -2.7663978211261 T:C C T 10 0.555327956422522 0.477751613634868 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 30 27 57 13.3401613073243 14.9938548234081 -1.65369351608375 T:C C T 10 0.555327956422522 0.69053268551265 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 70351788 T/C 1 43 23 66 19.1208978738316 12.772542997718 6.34835487611355 T:C T C 10 0.555327956422522 0.136924583818264 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70351749_70351799:TLE3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 72190144 T/C 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 T:C T C 10 0.555327956422522 0.150211231786478 ENSG00000066933:ENST00000356056:exon_72189802_72191373:MYO9A;ENSG00000066933:ENST00000424560:exon_72189802_72191373:MYO9A;ENSG00000066933:ENST00000446448:exon_72189802_72191373:MYO9A;ENSG00000066933:ENST00000444904:exon_72189802_72191373:MYO9A;ENSG00000066933:ENST00000261864:exon_72189802_72191373:MYO9A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 73027478 T/C 1 8 4 12 3.55737634861982 2.22131182569009 1.33606452292974 T:C T C 10 0.555327956422522 0.56621841747708 ENSG00000140463:ENST00000268057:exon_73027454_73027523:BBS4;ENSG00000140463:ENST00000395205:exon_73027454_73027523:BBS4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 75091247 C/T 1 306 269 575 136.069645334708 149.383220277658 -13.3135749429501 T:C C T 10 0.555327956422522 0.275306270911251 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75091167_75091279:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75091167_75091279:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75091167_75091279:CSK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 75091664 G/A 1 231 240 471 102.719242066397 133.278709541405 -30.5594674750078 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00535079398142254 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75091613_75091832:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75091613_75091832:CSK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 267 241 508 118.727435635187 133.834037497828 -15.1066018626412 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.180664249970844 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 75130093 T/C 1 26 1 27 11.5614731330144 0.555327956422522 11.0061451765919 T:C T C 10 0.555327956422522 4.83869508965073e-06 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75130092_75130139:ULK3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 75131959 A/G 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 A:G A G 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75131899_75132054:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75131899_75132054:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75131899_75132054:ULK3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 75499602 C/A 1 84 82 166 37.3524516605082 45.5368924266468 -8.18444076613865 A:C C A 10 0.555327956422522 0.211800074092836 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 75499619 T/C 1 85 69 154 37.7971237040856 38.317628993154 -0.520505289068382 T:C T C 10 0.555327956422522 0.935563009890998 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 75499861 G/A 1 81 68 149 36.0184355297757 37.7623010367315 -1.74386550695577 A:G G A 10 0.555327956422522 0.804886619938427 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 75499995 T/G 1 112 85 197 49.8032688806775 47.2028762959144 2.60039258476317 T:G T G 10 0.555327956422522 0.720673113461512 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 75503147 G/A 1 65 88 153 28.9036828325361 48.8688601651819 -19.9651773326459 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00143502914952736 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75503090_75504510:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75503090_75504510:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000446981:exon_75503090_75504508:C15orf39 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 75648650 C/T 0 91 0 91 40.4651559655505 0 40.4651559655505 C C 10 0.555327956422522 7.06205297800821e-24 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75648642_75648790:MAN2C1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 75890689 G/T 1 44 38 82 19.565569917409 21.1024623440558 -1.5368924266468 T:G G T 10 0.555327956422522 0.74012660430747 ENSG00000169371:ENST00000308588:exon_75890424_75891022:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000371091:exon_75890424_75891022:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000432476:exon_75890424_75891022:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000394932:exon_75890424_75891022:SNUPN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 77 73 150 34.2397473554658 40.5389408188441 -6.29919346337829 T:G G T 10 0.555327956422522 0.324374652250512 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 76726465 G/T 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:G G T 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000140386:ENST00000324767:exon_76726419_76726651:SCAPER;ENSG00000140386:ENST00000303521:exon_76726419_76726651:SCAPER HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 77325279 C/T 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 T:C C T 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000140368:ENST00000379595:exon_77325203_77325293:PSTPIP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 36 36 72 16.0081935687892 19.9918064312108 -3.98361286242158 A:T T A 10 0.555327956422522 0.345915934470456 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 77407114 C/G 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000173517:ENST00000312493:exon_77400471_77407661:AC087465.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 78317837 C/G 1 11 33 44 4.89139247935226 18.3258225619432 -13.434430082591 C:G C G 10 0.555327956422522 5.15769486824218e-05 ENSG00000167202:ENST00000418039:exon_78317601_78317839:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000409931:exon_78317601_78317839:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000300584:exon_78317601_78317839:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000420639:exon_78317601_78317839:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000486703:exon_78317601_78317970:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000435468:exon_78317601_78317839:TBC1D2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 78585106 C/T 1 30 33 63 13.3401613073243 18.3258225619432 -4.98566125461889 T:C C T 10 0.555327956422522 0.207991731778025 ENSG00000140395:ENST00000267973:exon_78584958_78585130:WDR61 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 78885574 T/A 1 12 6 18 5.33606452292974 3.33196773853513 2.0040967843946 A:T T A 10 0.555327956422522 0.477948616778315 ENSG00000169684:ENST00000299565:exon_78885434_78887611:CHRNA5;ENSG00000169684:ENST00000394802:exon_78885434_78887611:CHRNA5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 79224747 C/T 1 98 73 171 43.5778602705928 40.5389408188441 3.03891945174874 T:C C T 10 0.555327956422522 0.700556388562371 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 12 59 71 5.33606452292974 32.7643494289288 -27.4282849059991 T:C T C 10 0.555327956422522 2.58569990639406e-11 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 140 91 231 62.2540861008469 50.5348440344495 11.7192420663974 A:C A C 10 0.555327956422522 0.127946315859049 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 105 82 187 46.6905645756352 45.5368924266468 1.15367214898839 T:C C T 10 0.555327956422522 0.88325727532371 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 82443939 G/A 1 12 17 29 5.33606452292974 9.44057525918287 -4.10451073625314 A:G G A 10 0.555327956422522 0.137511299610045 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 82444663 T/C 1 12 14 26 5.33606452292974 7.77459138991531 -2.43852686698557 T:C T C 10 0.555327956422522 0.430498156832276 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 82456227 T/C 1 7 11 18 3.11270430504235 6.10860752064774 -2.9959032156054 T:C T C 10 0.555327956422522 0.163703578976710 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82456194_82456325:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82456194_82456325:EFTUD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 83686759 T/C 1 58 57 115 25.7909785274937 31.6536935160838 -5.86271498859003 T:C:G T C 10 0.555327956422522 0.302075995809999 ENSG00000064726:ENST00000261721:exon_83685174_83686977:BTBD1;ENSG00000064726:ENST00000379403:exon_83685185_83686977:BTBD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 83735926 C/G 1 29 28 57 12.8954892637469 15.5491827798306 -2.65369351608375 C:G C G 10 0.555327956422522 0.506846736590378 ENSG00000064726:ENST00000261721:exon_83735503_83736106:BTBD1;ENSG00000064726:ENST00000379403:exon_83735503_83736106:BTBD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86122654 T/C 1 5 8 13 2.22336021788739 4.44262365138018 -2.21926343349279 T:C T C 10 0.555327956422522 0.268109731741661 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86122779 T/C 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 T:C T C 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86122916 T/C 1 14 6 20 6.22540861008469 3.33196773853513 2.89344087154956 T:C T C 10 0.555327956422522 0.261033291477746 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86123019 C/T 1 8 1 9 3.55737634861982 0.555327956422522 3.0020483921973 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0495403730021064 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86123462 T/C 1 13 8 21 5.78073656650721 4.44262365138018 1.33811291512704 T:C T C 10 0.555327956422522 0.66298519208265 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86123833 T/C 1 6 9 15 2.66803226146487 4.9979516078027 -2.32991934633783 T:C T C 10 0.555327956422522 0.299710241961317 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86123924 C/T 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 T:C C T 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86123988 G/A 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 A:G G A 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86124419 C/T 1 12 8 20 5.33606452292974 4.44262365138018 0.893440871549561 T:C C T 10 0.555327956422522 0.823148310222236 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86124483 C/G 1 16 10 26 7.11475269723965 5.55327956422522 1.56147313301443 C:G C G 10 0.555327956422522 0.561847305125949 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86124555 G/A 1 20 16 36 8.89344087154956 8.88524730276035 0.00819356878920985 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86124946 T/C 1 10 4 14 4.44672043577478 2.22131182569009 2.22540861008469 T:C T C 10 0.555327956422522 0.288383222971717 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86124968 G/A 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 A:G G A 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86125031 G/A 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 A:G G A 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86125304 C/T 1 9 9 18 4.0020483921973 4.9979516078027 -0.995903215605395 T:C C T 10 0.555327956422522 0.643952874691603 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 52 48 100 23.1229462660289 26.6557419082811 -3.5327956422522 T:C C T 10 0.555327956422522 0.482962617157947 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 86287867 G/A 1 35 39 74 15.5635215252117 21.6577903004784 -6.09426877526663 A:G G A 10 0.555327956422522 0.161668029606198 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 90168693 T/A 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:T T A 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 90170237 C/T 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 T:C C T 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90170187_90171250:C15orf42 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 90226947 C/A 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 A:C C A 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000166821:ENST00000300056:exon_90224762_90227179:PEX11A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 90610677 T/C 1 7 10 17 3.11270430504235 5.55327956422522 -2.44057525918287 T:C T C 10 0.555327956422522 0.329183052237539 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90610342_90611827:ZNF710 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 90768320 C/T 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000379122:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90768200_90768410:SEMA4B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 90771750 T/G 1 9 12 21 4.0020483921973 6.66393547707026 -2.66188708487296 T:G T G 10 0.555327956422522 0.276109114103641 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 90774259 G/C 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 C:G G C 10 0.555327956422522 1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 91449702 A/T 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:T A T 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91449600_91449727:MAN2A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 91456590 A/G 1 9 16 25 4.0020483921973 8.88524730276035 -4.88319891056305 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0682222779667574 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91456503_91456604:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91456503_91456636:MAN2A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 91478544 A/C 1 9 9 18 4.0020483921973 4.9979516078027 -0.995903215605395 A:C A C 10 0.555327956422522 0.643952874691603 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91478174_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000495068:exon_91478515_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000497152:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91478516_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000439771:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000486253:exon_91478540_91478605:UNC45A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 91499986 G/T 1 15 6 21 6.67008065366217 3.33196773853513 3.33811291512704 T:G G T 10 0.555327956422522 0.187868673759137 ENSG00000166965:ENST00000394258:exon_91499842_91500130:RCCD1;ENSG00000166965:ENST00000300233:exon_91499840_91500130:RCCD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 91525197 C/T 1 65 62 127 28.9036828325361 34.4303332981964 -5.52665046566029 T:C C T 10 0.555327956422522 0.327494891010000 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 94841691 G/A 1 12 8 20 5.33606452292974 4.44262365138018 0.893440871549561 A:G G A 10 0.555327956422522 0.823148310222236 ENSG00000140563:ENST00000357742:exon_94841430_94841959:MCTP2;ENSG00000140563:ENST00000451018:exon_94841430_94841959:MCTP2;ENSG00000140563:ENST00000456504:exon_94841430_94841959:MCTP2;ENSG00000140563:ENST00000331706:exon_94841495_94841959:MCTP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 99715352 A/G 1 9 1 10 4.0020483921973 0.555327956422522 3.44672043577478 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0504158529035674 ENSG00000103852:ENST00000459771:exon_99715255_99715360:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394132:exon_99715255_99715360:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000434186:exon_99715255_99715360:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394136:exon_99715255_99715360:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000262074:exon_99715255_99715360:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000427087:exon_99715255_99715360:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000421732:exon_99715255_99715360:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000413876:exon_99715255_99715360:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000494567:exon_99715255_99715360:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394135:exon_99715255_99715360:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394130:exon_99715255_99715360:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394129:exon_99715255_99715360:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000431450:exon_99715255_99715360:TTC23 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 100246936 T/C 1 40 27 67 17.7868817430991 14.9938548234081 2.79302691969103 T:C T C 10 0.555327956422522 0.539899810800946 ENSG00000068305:ENST00000354410:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000346108:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000449277:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000338042:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000453228:exon_100246934_100247060:MEF2A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 100269635 G/C 1 9 9 18 4.0020483921973 4.9979516078027 -0.995903215605395 C:G G C 10 0.555327956422522 0.643952874691603 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 100269680 G/C 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 100269737 G/A 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000484050:exon_100269703_100269936:LYSMD4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 100269749 G/A 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 A:G G A 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000484050:exon_100269703_100269936:LYSMD4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101109677 C/A 1 16 14 30 7.11475269723965 7.77459138991531 -0.65983869267566 A:C C A 10 0.555327956422522 0.85539905852902 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101109794 C/G 1 11 9 20 4.89139247935226 4.9979516078027 -0.106559128450439 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 6 11 17 2.66803226146487 6.10860752064774 -3.44057525918287 A:G G A 10 0.555327956422522 0.140894133470777 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101109893 C/A 1 20 9 29 8.89344087154956 4.9979516078027 3.89548926374686 A:C C A 10 0.555327956422522 0.190477687227125 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101110265 T/A 1 14 6 20 6.22540861008469 3.33196773853513 2.89344087154956 A:T T A 10 0.555327956422522 0.261033291477746 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101110302 C/G 1 13 7 20 5.78073656650721 3.88729569495765 1.89344087154956 C:G C G 10 0.555327956422522 0.501729600552412 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101113862 C/T 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101113950 A/G 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101114418 G/A 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101120963 T/C 1 14 7 21 6.22540861008469 3.88729569495765 2.33811291512704 T:C T C 10 0.555327956422522 0.382150972530821 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101120649_101121152:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101120649_101121150:LINS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101562793 G/A 1 12 14 26 5.33606452292974 7.77459138991531 -2.43852686698557 A:G G A 10 0.555327956422522 0.430498156832276 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101562588_101562802:LRRK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101591923 A/G 1 25 31 56 11.116801089437 17.2151666490982 -6.09836555966123 A:T:G A G 10 0.555327956422522 0.107745186463605 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101591916_101592165:LRRK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101595257 G/A 1 12 16 28 5.33606452292974 8.88524730276035 -3.54918277983062 A:G G A 10 0.555327956422522 0.187908971200259 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101595151_101595428:LRRK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101598200 G/A 1 24 20 44 10.6721290458595 11.1065591284504 -0.434430082590966 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101598314 C/T 1 19 20 39 8.44876882797208 11.1065591284504 -2.65779030047836 T:C C T 10 0.555327956422522 0.422929473783178 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101717680 G/T 1 22 19 41 9.78278495870452 10.5512311720279 -0.768446213323401 T:G G T 10 0.555327956422522 0.875562949353059 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101718106 G/A 1 25 45 70 11.116801089437 24.9897580390135 -13.8729569495765 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00104103815181931 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101718190 C/T 1 25 28 53 11.116801089437 15.5491827798306 -4.43238169039367 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.268692827622960 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101718529 T/C 1 22 29 51 9.78278495870452 16.1045107362531 -6.32172577754862 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0902632476497996 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101718700 G/A 1 24 19 43 10.6721290458595 10.5512311720279 0.120897873831556 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101718950 T/C 1 21 19 40 9.33811291512704 10.5512311720279 -1.21311825690088 T:C T C 10 0.555327956422522 0.751440820706528 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101827137 C/T 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 T:C C T 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000131876:ENST00000254193:exon_101827113_101827215:SNRPA1;ENSG00000131876:ENST00000394082:exon_101825931_101827215:SNRPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 15 101827855 C/T 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 T:C C T 10 0.555327956422522 0.527797798104687 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 270650 C/A 1 19 10 29 8.44876882797208 5.55327956422522 2.89548926374686 A:C C A 10 0.555327956422522 0.351058594008537 ENSG00000007392:ENST00000337351:exon_270648_270746:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000293872:exon_270648_270746:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000426094:exon_270648_270746:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000397783:exon_270648_270746:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000490762:exon_270648_270746:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000415507:exon_270648_270746:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000419516:exon_270648_270746:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000397780:exon_270648_270746:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000418978:exon_270648_270746:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000443357:exon_270648_270746:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000494366:exon_270648_270746:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000469109:exon_270170_270746:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000428363:exon_270648_270746:LUC7L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 309998 C/T 1 17 7 24 7.55942474081713 3.88729569495765 3.67212904585947 T:C C T 10 0.555327956422522 0.153115971856089 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000438220:exon_309995_310002:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000453430:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000449945:exon_309995_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420046:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420500:exon_309968_310008:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000421000:exon_309968_310159:ITFG3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 107 71 178 47.5799086627901 39.4282849059991 8.15162375679109 A:G A G 10 0.555327956422522 0.228202976233600 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 419154 G/A 1 83 40 123 36.9077796169307 22.2131182569009 14.6946613600298 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0.00830088825297736 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 420140 G/A 1 91 78 169 40.4651559655505 43.3155806009567 -2.85042463540621 A:G G A 10 0.555327956422522 0.698908347323282 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 420179 G/A 1 93 87 180 41.3545000527055 48.3135322087594 -6.95903215605396 A:G G A 10 0.555327956422522 0.329584875324812 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 49 36 85 21.7889301352964 19.9918064312108 1.79712370408563 T:C T C 10 0.555327956422522 0.743954285472511 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 41 27 68 18.2315537866766 14.9938548234081 3.23769896326851 T:C T C 10 0.555327956422522 0.465597169550356 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 35 13 48 15.5635215252117 7.21926343349279 8.34425809171895 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0192178156408377 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 427784 G/A 1 34 16 50 15.1188494816343 8.88524730276035 6.2336021788739 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0875974533161174 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427671_427805:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427671_427807:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 427820 C/T 1 34 10 44 15.1188494816343 5.55327956422522 9.56556991740903 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00361669403917416 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 602313 C/A 1 27 30 57 12.0061451765919 16.6598386926757 -4.65369351608375 A:C C A 10 0.555327956422522 0.231688627825925 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 602595 G/C 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 C:G G C 10 0.555327956422522 0.764420046735623 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 784765 C/T 1 16 19 35 7.11475269723965 10.5512311720279 -3.43647847478827 T:C C T 10 0.555327956422522 0.307461285769473 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_784737_784871:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_784737_784871:NARFL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 847743 C/T 1 25 16 41 11.116801089437 8.88524730276035 2.2315537866766 T:C C T 10 0.555327956422522 0.53214987030037 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847694_847751:CHTF18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 1503879 T/A 1 18 14 32 8.0040967843946 7.77459138991531 0.229505394479297 A:T T A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000103249:ENST00000448525:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000428756:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000262318:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000382745:exon_1503835_1503895:CLCN7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 1544301 G/C 1 16 8 24 7.11475269723965 4.44262365138018 2.67212904585947 C:G G C 10 0.555327956422522 0.309745230341374 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 1544302 A/G 1 16 9 25 7.11475269723965 4.9979516078027 2.11680108943695 A:G A G 10 0.555327956422522 0.428150577551636 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 1797050 C/T 1 17 19 36 7.55942474081713 10.5512311720279 -2.99180643121079 T:C C T 10 0.555327956422522 0.320267909966196 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1797030_1797276:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1797030_1797276:MAPK8IP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 1814440 A/G 1 24 30 54 10.6721290458595 16.6598386926757 -5.98770964681619 A:G A G 10 0.555327956422522 0.131230808799670 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 41 97 138 18.2315537866766 53.8668117729846 -35.635257986308 A:T:G T A 10 0.555327956422522 1.49004765362858e-09 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 1823456 C/T 1 6 14 20 2.66803226146487 7.77459138991531 -5.10655912845044 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0246812283603920 ENSG00000197774:ENST00000454910:exon_1823229_1823475:EME2;ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1823229_1823475:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1823327_1823475:EME2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 1827836 T/C 1 23 20 43 10.227457002282 11.1065591284504 -0.879102126168444 T:C T C 10 0.555327956422522 0.878299608285348 ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000162032:ENST00000301717:exon_1827748_1827873:SPSB3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 1838640 T/C 1 64 65 129 28.4590107889586 36.0963171674639 -7.63730637850534 T:C T C 10 0.555327956422522 0.184463101315793 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 1877494 T/C 1 19 16 35 8.44876882797208 8.88524730276035 -0.436478474788268 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 1877558 G/A 1 23 29 52 10.227457002282 16.1045107362531 -5.87705373397114 A:G G A 10 0.555327956422522 0.124141167581142 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2014283 A/G 1 90 28 118 40.020483921973 15.5491827798306 24.4713011421424 A:G A G 10 0.555327956422522 4.14985871585854e-06 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533186:exon_2014277_2014357:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000532746:exon_2014277_2014368:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533872:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2013654_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000534461:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2014591 C/T 1 299 62 361 132.956941029666 34.4303332981964 98.5266077314696 T:C C T 10 0.555327956422522 6.1246899973329e-28 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 21 29 50 9.33811291512704 16.1045107362531 -6.7663978211261 A:C A C 10 0.555327956422522 0.063850266658256 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2025604 G/C 1 54 41 95 24.0122903531838 22.7684462133234 1.24384413986041 C:G G C 10 0.555327956422522 0.83688896957004 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2025678 C/A 1 26 26 52 11.5614731330144 14.4385268669856 -2.87705373397114 A:C C A 10 0.555327956422522 0.485828284509982 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 33 51 84 14.6741774380568 28.3217257775486 -13.6475483394918 A:C A C 10 0.555327956422522 0.002953712872273 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2036048 T/C 1 68 61 129 30.2376989632685 33.8750053417738 -3.63730637850534 T:C T C 10 0.555327956422522 0.535957326242911 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2048796 C/T 1 35 44 79 15.5635215252117 24.434430082591 -8.87090855737924 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0537085507602595 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2048826 C/G 1 19 32 51 8.44876882797208 17.7704946055207 -9.32172577754862 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0106568189856687 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 67 63 130 29.793026919691 34.9856612546189 -5.19263433492786 A:G A G 10 0.555327956422522 0.378097288023870 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2049728 C/T 1 59 61 120 26.2356505710712 33.8750053417738 -7.63935477070264 T:C C T 10 0.555327956422522 0.168823299419417 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2049849 T/C 1 70 61 131 31.1270430504235 33.8750053417738 -2.74796229135038 T:C T C 10 0.555327956422522 0.66061327699535 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2050192 G/T 1 40 33 73 17.7868817430991 18.3258225619432 -0.538940818844104 T:G G T 10 0.555327956422522 0.90677689954173 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2160494 C/T 1 7 11 18 3.11270430504235 6.10860752064774 -2.9959032156054 T:C C T 10 0.555327956422522 0.163703578976710 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2158253_2161872:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2158253_2161872:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2158253_2161872:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2158253_2161872:PKD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2161153 C/T 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:C C T 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2158253_2161872:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2158253_2161872:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2158253_2161872:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2160596_2161651:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2158253_2161872:PKD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2256461 C/G 1 1 14 15 0.444672043577478 7.77459138991531 -7.32991934633783 C:G C G 10 0.555327956422522 0.000103701364319592 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2257105 C/G 1 32 42 74 14.2295053944793 23.3237741697459 -9.09426877526663 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0354694109634636 ENSG00000167965:ENST00000382450:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301724:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000397124:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301725:exon_2257036_2257111:MLST8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 279 255 534 124.063500158116 141.608628887743 -17.5451287296267 A:C C A 10 0.555327956422522 0.127719381806536 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 2983483 C/G 1 25 28 53 11.116801089437 15.5491827798306 -4.43238169039367 C:G C G 10 0.555327956422522 0.268692827622960 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3073240 G/T 1 29 47 76 12.8954892637469 26.1004139518585 -13.2049246881117 T:G G T 10 0.555327956422522 0.00257175358565596 ENSG00000103145:ENST00000354679:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000396916:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000248089:exon_3073234_3073362:HCFC1R1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3452193 T/G 1 12 5 17 5.33606452292974 2.77663978211261 2.55942474081713 T:G T G 10 0.555327956422522 0.233437199703189 ENSG00000103343:ENST00000344823:exon_3451190_3452406:ZNF174;ENSG00000103343:ENST00000268655:exon_3451420_3452406:ZNF174 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 42 28 70 18.6762258302541 15.5491827798306 3.12704305042346 A:C:G C G 10 0.555327956422522 0.473032286570823 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3534892 G/A 1 48 47 95 21.3442580917189 26.1004139518585 -4.75615586013959 A:G G A 10 0.555327956422522 0.353310311344476 ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3534699_3535061:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3534699_3535083:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000421765:exon_3534691_3534926:NAT15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3551067 T/C 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 T:C T C 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000103351:ENST00000341633:exon_3550963_3551089:CLUAP1;ENSG00000103351:ENST00000417763:exon_3551017_3551089:CLUAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3554799 T/C 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000103351:ENST00000341633:exon_3554720_3554831:CLUAP1;ENSG00000103351:ENST00000417763:exon_3554720_3554831:CLUAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3613904 C/G 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000167984:ENST00000448023:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000301749:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000359128:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000419350:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000324659:exon_3611703_3614613:NLRC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3613928 A/G 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 A:G A G 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000167984:ENST00000448023:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000301749:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000359128:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000419350:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000324659:exon_3611703_3614613:NLRC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3639977 G/A 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 A:G G A 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3640274 G/A 1 11 10 21 4.89139247935226 5.55327956422522 -0.661887084872961 A:G G A 10 0.555327956422522 0.828131296920228 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3640784 G/A 1 13 3 16 5.78073656650721 1.66598386926757 4.11475269723965 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0443257801951099 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3640785 C/T 1 13 3 16 5.78073656650721 1.66598386926757 4.11475269723965 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0443257801951099 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3647692 A/C 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 A:C A C 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3647380_3647696:SLX4;ENSG00000188827:ENST00000466154:exon_3647380_3647696:SLX4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3650987 T/C 1 8 2 10 3.55737634861982 1.11065591284504 2.44672043577478 T:C T C 10 0.555327956422522 0.201545371859033 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3650980_3651192:SLX4;ENSG00000188827:ENST00000466154:exon_3650980_3652308:SLX4;ENSG00000188827:ENST00000486524:exon_3650622_3652308:SLX4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3650991 T/C 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 T:C T C 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3650980_3651192:SLX4;ENSG00000188827:ENST00000466154:exon_3650980_3652308:SLX4;ENSG00000188827:ENST00000486524:exon_3650622_3652308:SLX4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3656680 G/A 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3656475_3656699:SLX4;ENSG00000188827:ENST00000466154:exon_3656475_3656699:SLX4;ENSG00000188827:ENST00000486524:exon_3656475_3656699:SLX4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3724352 G/A 1 153 114 267 68.0348226673541 63.3073870321675 4.72743563518663 A:G G A 10 0.555327956422522 0.579820375042774 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3726074 G/C 1 76 25 101 33.7950753118883 13.883198910563 19.9118764013253 C:G G C 10 0.555327956422522 5.1564813278525e-05 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3726037_3726146:TRAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3726075 G/A 1 72 25 97 32.0163871375784 13.883198910563 18.1331882270154 A:G G A 10 0.555327956422522 0.000200879169822031 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3726037_3726146:TRAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3729714 G/A 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 A:G G A 10 0.555327956422522 1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3778337 G/A 1 21 19 40 9.33811291512704 10.5512311720279 -1.21311825690088 A:G G A 10 0.555327956422522 0.751440820706528 ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3775055_3779875:CREBBP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3795292 G/T 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:G G T 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3795278_3795355:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3795278_3795355:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3795278_3795355:CREBBP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 3820667 C/T 1 21 6 27 9.33811291512704 3.33196773853513 6.00614517659191 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0202836310543445 ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3820571_3820987:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3820571_3820987:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3820571_3820987:CREBBP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:C C T 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 37 23 60 16.4528656123667 12.772542997718 3.68032261464868 T:C T C 10 0.555327956422522 0.365385827635971 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 27 23 50 12.0061451765919 12.772542997718 -0.766397821126098 A:T A T 10 0.555327956422522 0.887168416612352 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 19 16 35 8.44876882797208 8.88524730276035 -0.436478474788268 A:T T A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 4855279 A/G 1 47 49 96 20.8995860481415 27.2110698647036 -6.31148381656211 A:G A G 10 0.555327956422522 0.217855416970550 ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4853204_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000436648:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4855102_4855311:GLYR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 4930100 C/T 1 15 8 23 6.67008065366217 4.44262365138018 2.22745700228199 T:C C T 10 0.555327956422522 0.40594380768443 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4930084_4932361:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4930084_4932361:UBN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 8722629 G/C 1 21 14 35 9.33811291512704 7.77459138991531 1.56352152521173 T:C:G G C 10 0.555327956422522 0.615320962333974 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 8729124 G/A 1 13 7 20 5.78073656650721 3.88729569495765 1.89344087154956 A:G G A 10 0.555327956422522 0.501729600552412 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 8904954 C/T 1 24 23 47 10.6721290458595 12.772542997718 -2.10041395185853 T:C C T 10 0.555327956422522 0.559655419240777 ENSG00000140650:ENST00000268261:exon_8904936_8905035:PMM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 10575824 C/A 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 A:C C A 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10575693_10577494:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10575693_10577494:ATF7IP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 53 69 122 23.5676183096063 38.317628993154 -14.7500106835477 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0080910537605302 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 10989219 C/G 1 9 12 21 4.0020483921973 6.66393547707026 -2.66188708487296 C:G C G 10 0.555327956422522 0.276109114103641 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_10989139_10989285:CIITA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 11001421 C/A 1 35 17 52 15.5635215252117 9.44057525918287 6.12294626602886 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0949393780842482 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 11016045 C/T 1 13 21 34 5.78073656650721 11.661887084873 -5.88115051836575 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0562620626821101 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11016024_11016107:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11016024_11016107:CIITA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 11154770 G/A 1 9 3 12 4.0020483921973 1.66598386926757 2.33606452292974 A:G G A 10 0.555327956422522 0.247371341375508 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000465491:exon_11154759_11154879:CLEC16A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 11769948 C/T 1 31 23 54 13.7848333509018 12.772542997718 1.01229035318381 T:C C T 10 0.555327956422522 0.891258773061341 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 34 26 60 15.1188494816343 14.4385268669856 0.680322614648682 T:C C T 10 0.555327956422522 0.89726547557794 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 11773662 C/G 1 90 69 159 40.020483921973 38.317628993154 1.70285492881901 C:G C G 10 0.555327956422522 0.811185005701972 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 11940390 T/C 1 284 263 547 126.286860376004 146.051252539123 -19.7643921631195 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0933527116439974 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11940358_11940459:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11940358_11940459:RSL1D1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 57 59 116 25.3463064839162 32.7643494289288 -7.41804294501255 C:G G C 10 0.555327956422522 0.190688701910131 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 15133882 G/C 1 18 30 48 8.0040967843946 16.6598386926757 -8.65574190828105 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0133409281978138 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 16138322 T/C 1 16 16 32 7.11475269723965 8.88524730276035 -1.7704946055207 T:C T C 10 0.555327956422522 0.595024882931205 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16138307_16138537:ABCC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 16139714 T/C 1 11 11 22 4.89139247935226 6.10860752064774 -1.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.670344781787442 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16139693_16139870:ABCC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 20748331 C/A 1 41 47 88 18.2315537866766 26.1004139518585 -7.86886016518193 A:C C A 10 0.555327956422522 0.107211293902353 ENSG00000066654:ENST00000381337:exon_20748182_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000396083:exon_20744991_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000431224:exon_20746723_20748608:THUMPD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 20796387 G/C 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000005187:ENST00000289416:exon_20796306_20796429:ACSM3;ENSG00000005187:ENST00000440284:exon_20796306_20796429:ACSM3;ENSG00000005187:ENST00000450120:exon_20796306_20796429:ACSM3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 20855309 A/G 1 3 8 11 1.33401613073243 4.44262365138018 -3.10860752064774 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0718999345122269 ENSG00000005189:ENST00000261377:exon_20855256_20855348:AC004381.6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 21531457 T/C 0 10 0 10 4.44672043577478 0 4.44672043577478 T T 10 0.555327956422522 0.00309157318156107 ENSG00000233959:ENST00000435197:exon_21531021_21531686:SLC7A5P2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 21531473 G/A 0 8 0 8 3.55737634861982 0 3.55737634861982 G G 10 0.555327956422522 0.0105734315433712 ENSG00000233959:ENST00000435197:exon_21531021_21531686:SLC7A5P2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 23555918 G/A 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 A:G G A 10 0.555327956422522 0.150211231786478 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23555835_23556024:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23555835_23556024:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23555835_23556024:EARS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 23646396 C/T 1 9 14 23 4.0020483921973 7.77459138991531 -3.77254299771801 T:C C T 10 0.555327956422522 0.141766408043743 ENSG00000083093:ENST00000261584:exon_23646183_23647655:PALB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 23672560 A/T 1 8 12 20 3.55737634861982 6.66393547707026 -3.10655912845044 A:T A T 10 0.555327956422522 0.181542604683008 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23672491_23672602:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23672491_23672563:DCTN5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 23701458 G/A 1 59 58 117 26.2356505710712 32.2090214725063 -5.97337090143507 A:G G A 10 0.555327956422522 0.266226124883752 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 24166130 T/C 1 5 9 14 2.22336021788739 4.9979516078027 -2.77459138991531 T:C T C 10 0.555327956422522 0.179216881393606 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 24202458 C/T 1 14 29 43 6.22540861008469 16.1045107362531 -9.87910212616844 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00313768764291005 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000466124:exon_24202411_24202909:PRKCB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 24581760 A/G 1 46 48 94 20.454914004564 26.6557419082811 -6.20082790371707 A:G A G 10 0.555327956422522 0.213487036638838 ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24580066_24581820:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24580066_24581820:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24580066_24581820:RBBP6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 25251124 G/A 1 10 5 15 4.44672043577478 2.77663978211261 1.67008065366217 A:G G A 10 0.555327956422522 0.445339902559564 ENSG00000155592:ENST00000328086:exon_25247326_25252059:ZKSCAN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 32 43 75 14.2295053944793 23.8791021261684 -9.64959673168915 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0272171466160137 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 28847246 T/C 1 14 7 21 6.22540861008469 3.88729569495765 2.33811291512704 T:C T C 10 0.555327956422522 0.382150972530821 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 28944700 G/T 1 72 72 144 32.0163871375784 39.9836128624216 -7.96722572484316 T:G G T 10 0.555327956422522 0.208323755077171 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944555_28944830:CD19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 29994922 C/T 1 24 18 42 10.6721290458595 9.9959032156054 0.676225830254078 T:C C T 10 0.555327956422522 0.87768344949826 ENSG00000149930:ENST00000416441:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000279394:exon_29994824_29994985:TAOK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:G A G 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 30094660 G/A 1 8 10 18 3.55737634861982 5.55327956422522 -1.9959032156054 A:G G A 10 0.555327956422522 0.354494673636837 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 30536672 A/G 1 46 54 100 20.454914004564 29.9877096468162 -9.5327956422522 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0564947593194597 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 30666367 C/T 1 29 21 50 12.8954892637469 11.661887084873 1.2336021788739 T:C C T 10 0.555327956422522 0.777178932006747 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 30900235 G/A 1 78 44 122 34.6844193990433 24.434430082591 10.2499893164523 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0.0682901575124699 ENSG00000099385:ENST00000380317:exon_30900181_30900266:BCL7C;ENSG00000099385:ENST00000215115:exon_30900181_30900266:BCL7C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 31473299 C/T 1 11 9 20 4.89139247935226 4.9979516078027 -0.106559128450439 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31473243_31473350:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31473243_31473350:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31473243_31473350:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31473243_31473350:ARMC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 46629489 T/C 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000171241:ENST00000303383:exon_46629464_46629582:SHCBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 53326860 G/A 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 A:G G A 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53326745_53326964:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53326745_53326964:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53326745_53326964:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53326745_53326964:CHD9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 53331053 G/A 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53330868_53331070:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53330868_53331070:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53330868_53331070:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53330868_53331070:CHD9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 53341748 T/G 1 4 7 11 1.77868817430991 3.88729569495765 -2.10860752064774 T:G T G 10 0.555327956422522 0.234416927909769 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53341593_53341817:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53341593_53341817:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53341593_53341865:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53341593_53341865:CHD9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 53358439 A/G 1 11 15 26 4.89139247935226 8.32991934633783 -3.43852686698557 A:G A G 10 0.555327956422522 0.235826270274551 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53357932_53358807:CHD9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 56873495 C/T 1 26 23 49 11.5614731330144 12.772542997718 -1.21106986470358 T:C C T 10 0.555327956422522 0.77457305657742 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56873433_56873516:NUP93 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57059427 C/T 1 22 27 49 9.78278495870452 14.9938548234081 -5.21106986470358 T:C C T 10 0.555327956422522 0.151070316195741 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57060340 T/C 1 23 30 53 10.227457002282 16.6598386926757 -6.43238169039367 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0963021415177265 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57060353 T/C 1 27 29 56 12.0061451765919 16.1045107362531 -4.09836555966123 T:C T C 10 0.555327956422522 0.284280882596747 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57060480 C/A 1 32 22 54 14.2295053944793 12.2172150412955 2.01229035318381 A:C C A 10 0.555327956422522 0.681634436702732 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57068106 A/G 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 A:G A G 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57068080_57068163:NLRC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57068107 C/T 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 T:C C T 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57068080_57068163:NLRC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57071113 T/C 0 11 0 11 4.89139247935226 0 4.89139247935226 T T 10 0.555327956422522 0.00168338880649373 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57071107_57071196:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57071107_57071196:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57071107_57071196:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57071107_57071196:NLRC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57085465 C/T 1 10 11 21 4.44672043577478 6.10860752064774 -1.66188708487296 T:C C T 10 0.555327956422522 0.514389688550212 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57085450_57085533:NLRC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57091977 T/C 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 T:C T C 10 0.555327956422522 0.605558868068935 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57091977_57092060:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57091977_57092060:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57091977_57092060:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57091977_57092060:NLRC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57101340 T/C 1 6 16 22 2.66803226146487 8.88524730276035 -6.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0092388818981735 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57101299_57101382:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57101299_57101382:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57101299_57101382:NLRC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57101373 A/G 1 6 16 22 2.66803226146487 8.88524730276035 -6.21721504129548 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0092388818981735 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57101299_57101382:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57101299_57101382:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57101299_57101382:NLRC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57111232 C/T 1 21 17 38 9.33811291512704 9.44057525918287 -0.102462344055835 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57111208_57111291:NLRC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57392733 A/C 1 20 56 76 8.89344087154956 31.0983655596612 -22.2049246881117 A:C A C 10 0.555327956422522 3.35015216970335e-07 ENSG00000102962:ENST00000219235:exon_57392684_57392801:CCL22 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57499902 T/C 1 62 57 119 27.5696667018036 31.6536935160838 -4.08402681428012 T:C T C 10 0.555327956422522 0.461753364847019 ENSG00000102978:ENST00000219252:exon_57499865_57499933:POLR2C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57786711 C/T 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786690_57786840:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786690_57786840:KATNB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 57787027 C/T 1 15 12 27 6.67008065366217 6.66393547707026 0.0061451765919065 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786989_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786989_57787179:KATNB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 58030634 C/T 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 T:C C T 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000166188:ENST00000299237:exon_58028573_58032426:ZNF319 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 58201628 T/C 1 24 13 37 10.6721290458595 7.21926343349279 3.45286561236669 T:C T C 10 0.555327956422522 0.321143198310201 ENSG00000070770:ENST00000262506:exon_58201589_58201699:CSNK2A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 58575489 G/A 1 61 56 117 27.1249946582262 31.0983655596612 -3.97337090143507 A:G G A 10 0.555327956422522 0.45869846046029 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58575405_58575524:CNOT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 58579274 C/T 1 77 63 140 34.2397473554658 34.9856612546189 -0.745913899153074 T:C C T 10 0.555327956422522 0.93230819165746 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58579265_58579395:CNOT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 58587737 C/T 1 37 29 66 16.4528656123667 16.1045107362531 0.34835487611355 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58587686_58587764:CNOT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 66583994 G/C 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 C:G G C 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000166548:ENST00000451102:exon_66583841_66584315:TK2;ENSG00000166548:ENST00000299697:exon_66583841_66584315:TK2;ENSG00000166548:ENST00000417693:exon_66583841_66584315:TK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 66584002 T/C 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 T:C T C 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000166548:ENST00000451102:exon_66583841_66584315:TK2;ENSG00000166548:ENST00000299697:exon_66583841_66584315:TK2;ENSG00000166548:ENST00000417693:exon_66583841_66584315:TK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 66638804 G/A 1 18 19 37 8.0040967843946 10.5512311720279 -2.54713438763331 A:G G A 10 0.555327956422522 0.41275461605703 ENSG00000140931:ENST00000424011:exon_66638634_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000360086:exon_66638634_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000361909:exon_66638634_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000394108:exon_66638567_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000332807:exon_66638635_66638832:CMTM3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 67116169 C/T 1 68 41 109 30.2376989632685 22.7684462133234 7.46925274994511 T:C C T 10 0.555327956422522 0.176990321656071 ENSG00000067955:ENST00000290858:exon_67116116_67116242:CBFB;ENSG00000067955:ENST00000412916:exon_67116116_67116211:CBFB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 67198846 C/T 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 T:C C T 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000102878:ENST00000518227:exon_67198344_67199545:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000523077:exon_67198803_67199533:HSF4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 67210855 G/C 1 5 9 14 2.22336021788739 4.9979516078027 -2.77459138991531 C:G G C 10 0.555327956422522 0.179216881393606 ENSG00000196123:ENST00000440525:exon_67209507_67210878:KIAA0895L;ENSG00000196123:ENST00000290881:exon_67209509_67210878:KIAA0895L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 67264083 C/A 1 30 24 54 13.3401613073243 13.3278709541405 0.012290353183813 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67263969_67264131:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67263969_67264131:FHOD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 67265360 C/A 1 16 12 28 7.11475269723965 6.66393547707026 0.450817220169385 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265333_67265452:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265333_67265452:FHOD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 67266065 T/C 1 31 27 58 13.7848333509018 14.9938548234081 -1.20902147250627 T:C T C 10 0.555327956422522 0.792255145278151 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265942_67266097:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265942_67266097:FHOD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 67865937 T/C 1 32 32 64 14.2295053944793 17.7704946055207 -3.54098921104141 T:C T C 10 0.555327956422522 0.38136943679804 ENSG00000102901:ENST00000219172:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000440851:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000436104:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000445712:exon_67865915_67866011:CENPT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 67964203 T/C 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 T:C T C 10 0.555327956422522 0.605558868068935 ENSG00000141086:ENST00000319955:exon_67964088_67964221:CTRL;ENSG00000141086:ENST00000432773:exon_67963848_67964221:CTRL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 204 175 379 90.7130968898055 97.1823923739413 -6.46929548413583 A:C:G A G 10 0.555327956422522 0.502233411487423 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 68055495 G/C 1 18 24 42 8.0040967843946 13.3278709541405 -5.32377416974592 C:G G C 10 0.555327956422522 0.119927124185076 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 68344363 A/C 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 A:C A C 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344238_68344516:SLC7A6OS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 68344696 C/T 1 9 3 12 4.0020483921973 1.66598386926757 2.33606452292974 T:C C T 10 0.555327956422522 0.247371341375508 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 68387457 C/T 1 15 29 44 6.67008065366217 16.1045107362531 -9.43443008259097 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00572027358653229 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68387395_68387469:PRMT7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 68598007 A/G 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 A:G A G 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000184939:ENST00000398253:exon_68596947_68601039:ZFP90 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 69354963 A/G 1 81 82 163 36.0184355297757 45.5368924266468 -9.51845689687108 A:G A G 10 0.555327956422522 0.135089436559346 ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 69373414 T/C 1 13 11 24 5.78073656650721 6.10860752064774 -0.327870954140527 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69373079_69373513:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69373079_69373460:COG8;ENSG00000132603:ENST00000254940:exon_69373343_69373788:NIP7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 14 15 29 6.22540861008469 8.32991934633783 -2.10451073625314 A:G G A 10 0.555327956422522 0.459182512082066 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 69778914 C/T 1 105 104 209 46.6905645756352 57.7541074679423 -11.0635428923071 T:C C T 10 0.555327956422522 0.126173606181421 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69778776_69778920:NOB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 69874062 C/T 1 11 13 24 4.89139247935226 7.21926343349279 -2.32787095414053 T:C C T 10 0.555327956422522 0.412507168985383 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69874029_69874166:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69874029_69874166:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69874029_69874166:WWP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 70164334 A/G 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 A:G A G 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70164326_70164447:PDPR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 70190401 C/T 1 14 18 32 6.22540861008469 9.9959032156054 -3.7704946055207 T:C C T 10 0.555327956422522 0.213585949813489 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70190378_70195205:PDPR;ENSG00000090857:ENST00000205055:exon_70190378_70190765:PDPR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 70303580 G/A 1 43 38 81 19.1208978738316 21.1024623440558 -1.98156447022428 A:G G A 10 0.555327956422522 0.656730792704083 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 14 10 24 6.22540861008469 5.55327956422522 0.672129045859473 T:C C T 10 0.555327956422522 0.839730194130565 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 35 25 60 15.5635215252117 13.883198910563 1.68032261464868 A:T A T 10 0.555327956422522 0.698427002212733 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 48 77 125 21.3442580917189 42.7602526445342 -21.4159945528152 T:C C T 10 0.555327956422522 0.000139290236630236 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 70726795 C/A 1 13 10 23 5.78073656650721 5.55327956422522 0.227457002281995 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70726724_70726874:VAC14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 71317721 A/G 1 15 16 31 6.67008065366217 8.88524730276035 -2.21516664909818 A:G A G 10 0.555327956422522 0.471945862571681 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 71319646 G/A 1 21 14 35 9.33811291512704 7.77459138991531 1.56352152521173 A:G G A 10 0.555327956422522 0.615320962333974 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 28 0 28 12.4508172201694 0 12.4508172201694 C C 10 0.555327956422522 7.53936732649681e-08 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 74664743 T/C 1 13 10 23 5.78073656650721 5.55327956422522 0.227457002281995 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 75204282 C/A 1 17 13 30 7.55942474081713 7.21926343349279 0.340161307324341 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000184517:ENST00000332307:exon_75203151_75206129:ZFP1;ENSG00000184517:ENST00000464850:exon_75203151_75205898:ZFP1;ENSG00000184517:ENST00000393430:exon_75203151_75206114:ZFP1;ENSG00000184517:ENST00000378686:exon_75203151_75206129:ZFP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 75269110 C/T 1 29 24 53 12.8954892637469 13.3278709541405 -0.432381690393665 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 75276908 C/T 1 22 15 37 9.78278495870452 8.32991934633783 1.45286561236669 T:C C T 10 0.555327956422522 0.74140646380221 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75276368_75276988:BCAR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 75481583 G/A 1 18 12 30 8.0040967843946 6.66393547707026 1.34016130732434 A:G G A 10 0.555327956422522 0.714800037991546 ENSG00000166822:ENST00000357613:exon_75476952_75481586:TMEM170A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 75642772 A/G 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 A:G A G 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75642741_75642886:ADAT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 75646576 G/T 1 7 13 20 3.11270430504235 7.21926343349279 -4.10655912845044 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0737347832885448 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 81929488 C/T 1 66 64 130 29.3483548761136 35.5409892110414 -6.19263433492786 T:C C T 10 0.555327956422522 0.290116179304972 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 84088026 T/C 1 22 12 34 9.78278495870452 6.66393547707026 3.11884948163425 T:C T C 10 0.555327956422522 0.305382089405312 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 84088047 C/T 1 12 24 36 5.33606452292974 13.3278709541405 -7.99180643121079 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0108229843191116 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 84218565 T/C 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84218457_84218666:TAF1C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 84691044 C/T 1 21 22 43 9.33811291512704 12.2172150412955 -2.87910212616845 T:C C T 10 0.555327956422522 0.443426847321452 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84690477_84691550:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84690477_84691519:KLHL36 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 84808824 C/G 1 20 25 45 8.89344087154956 13.883198910563 -4.98975803901349 C:G C G 10 0.555327956422522 0.137010789034248 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84808766_84808831:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84808766_84808831:USP10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 85706047 A/C 1 14 14 28 6.22540861008469 7.77459138991531 -1.54918277983062 A:C A C 10 0.555327956422522 0.573526479524123 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85706011_85706960:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85706011_85706499:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85706011_85706102:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000471070:exon_85706011_85706254:KIAA0182 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 85711860 C/T 1 50 49 99 22.2336021788739 27.2110698647036 -4.97746768582968 T:C C T 10 0.555327956422522 0.314197921338313 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 88713501 A/G 1 5 10 15 2.22336021788739 5.55327956422522 -3.32991934633783 A:G A G 10 0.555327956422522 0.117258617190494 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 88779032 G/C 1 18 27 45 8.0040967843946 14.9938548234081 -6.98975803901349 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0499360682996502 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779030_88779313:CTU2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 18 26 44 8.0040967843946 14.4385268669856 -6.43443008259097 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0675188910707721 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 25 30 55 11.116801089437 16.6598386926757 -5.54303760323871 A:G A G 10 0.555327956422522 0.137656286566486 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 76 72 148 33.7950753118883 39.9836128624216 -6.18853755053325 A:G A G 10 0.555327956422522 0.32144628406138 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 88874632 C/G 1 67 60 127 29.793026919691 33.3196773853513 -3.52665046566029 C:G C G 10 0.555327956422522 0.533307244586358 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89167140 G/C 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 C:G G C 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89167395 C/T 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 T:C C T 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89167404 T/C 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 T:C T C 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89167431 G/C 0 8 0 8 3.55737634861982 0 3.55737634861982 G G 10 0.555327956422522 0.0105734315433712 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89167443 T/C 1 9 2 11 4.0020483921973 1.11065591284504 2.89139247935226 T:C T C 10 0.555327956422522 0.126524523010841 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89167458 C/A 1 10 2 12 4.44672043577478 1.11065591284504 3.33606452292974 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0782461275271357 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89180883 G/A 1 6 13 19 2.66803226146487 7.21926343349279 -4.55123117202792 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0395254330154768 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89346774 G/T 1 28 15 43 12.4508172201694 8.32991934633783 4.12089787383155 T:G G T 10 0.555327956422522 0.222740019644215 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89348038 G/C 1 31 32 63 13.7848333509018 17.7704946055207 -3.98566125461888 C:G G C 10 0.555327956422522 0.314005042569906 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89350178 G/A 1 54 53 107 24.0122903531838 29.4323816903937 -5.42009133720985 A:G G A 10 0.555327956422522 0.330716563549497 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89620328 G/A 1 22 24 46 9.78278495870452 13.3278709541405 -3.54508599543601 A:G G A 10 0.555327956422522 0.302665007003409 ENSG00000197912:ENST00000268704:exon_89620202_89620368:SPG7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89627460 T/G 1 1182 980 2162 525.602355508579 544.221397294071 -18.6190417854924 T:G T G 10 0.555327956422522 0.423382241149549 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627119_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89627671 C/T 1 2772 2556 5328 1232.63090479677 1419.41825661597 -186.787351819197 A:T:C:G C T 10 0.555327956422522 2.89936304135852e-07 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89662063 T/C 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 T:C T C 10 0.555327956422522 0.605558868068935 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89662875 G/C 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 C:G G C 10 0.555327956422522 0.790013880012186 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89662990 T/C 1 19 21 40 8.44876882797208 11.661887084873 -3.21311825690088 T:C T C 10 0.555327956422522 0.341360637779387 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89712374 A/C 1 34 20 54 15.1188494816343 11.1065591284504 4.01229035318381 A:C A C 10 0.555327956422522 0.337877614784130 ENSG00000131165:ENST00000253475:exon_89710846_89712495:CHMP1A;ENSG00000131165:ENST00000397901:exon_89710846_89712495:CHMP1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89712380 G/A 1 36 19 55 16.0081935687892 10.5512311720279 5.45696239676129 A:G G A 10 0.555327956422522 0.174349942609108 ENSG00000131165:ENST00000253475:exon_89710846_89712495:CHMP1A;ENSG00000131165:ENST00000397901:exon_89710846_89712495:CHMP1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89764237 C/T 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 T:C C T 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000158792:ENST00000289805:exon_89762751_89764713:SPATA2L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89782989 A/G 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000075399:ENST00000389386:exon_89782870_89783032:C16orf7;ENSG00000075399:ENST00000261625:exon_89782870_89783032:C16orf7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89789898 T/C 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 T:C T C 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89789668_89790117:ZNF276 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89799950 C/T 1 16 10 26 7.11475269723965 5.55327956422522 1.56147313301443 T:C C T 10 0.555327956422522 0.561847305125949 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89799890_89799965:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89799890_89799965:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89799890_89799965:ZNF276 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89805914 T/C 1 31 18 49 13.7848333509018 9.9959032156054 3.78893013529642 T:C T C 10 0.555327956422522 0.315522991320606 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89805886_89805961:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89805886_89805961:FANCA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89805977 G/A 1 10 13 23 4.44672043577478 7.21926343349279 -2.772542997718 A:G G A 10 0.555327956422522 0.295526802222298 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89807233 C/G 1 18 25 43 8.0040967843946 13.883198910563 -5.87910212616844 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0904392286419934 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89807212_89807274:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89807212_89807274:FANCA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89809319 T/C 1 12 12 24 5.33606452292974 6.66393547707026 -1.32787095414053 T:C T C 10 0.555327956422522 0.682467369666187 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89809208_89809346:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89809208_89809346:FANCA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89839766 G/C 1 7 9 16 3.11270430504235 4.9979516078027 -1.88524730276035 C:G G C 10 0.555327956422522 0.451827358588768 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89839679_89839792:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89839679_89839792:FANCA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89965055 G/A 1 31 26 57 13.7848333509018 14.4385268669856 -0.653693516083752 A:G G A 10 0.555327956422522 0.894438143068177 ENSG00000141002:ENST00000263346:exon_89964965_89965057:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000263347:exon_89964965_89965057:TCF25 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 89967217 T/C 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 T:C T C 10 0.555327956422522 0.355948609276717 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 90075226 C/T 1 33 23 56 14.6741774380568 12.772542997718 1.90163444033877 T:C C T 10 0.555327956422522 0.687278447743607 ENSG00000003249:ENST00000304733:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000002501:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000392973:exon_90075192_90075332:DBNDD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 90097748 C/T 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90097707_90097904:GAS8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 16 90103659 G/A 1 17 16 33 7.55942474081713 8.88524730276035 -1.32582256194322 A:G G A 10 0.555327956422522 0.726914463925943 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90103640_90103807:GAS8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 15 13 28 6.67008065366217 7.21926343349279 -0.549182779830615 A:G G A 10 0.555327956422522 0.851250752295518 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 505129 A/C 1 13 10 23 5.78073656650721 5.55327956422522 0.227457002281995 A:C A C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_505035_505136:VPS53 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 55 50 105 24.4569623967613 27.7663978211261 -3.30943542436481 T:C C T 10 0.555327956422522 0.556099256617859 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 649336 G/A 1 16 13 29 7.11475269723965 7.21926343349279 -0.104510736253137 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 1387472 C/T 1 62 61 123 27.5696667018036 33.8750053417738 -6.30533863997021 T:C C T 10 0.555327956422522 0.276418901276635 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1387442_1387597:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1387442_1387597:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1387442_1387597:MYO1C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 1494567 G/A 1 17 33 50 7.55942474081713 18.3258225619432 -10.7663978211261 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00256773216159657 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 1636934 A/G 1 9 2 11 4.0020483921973 1.11065591284504 2.89139247935226 A:G A G 10 0.555327956422522 0.126524523010841 ENSG00000167716:ENST00000468539:exon_1636821_1636939:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000418841:exon_1636821_1636973:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 1637074 A/G 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 1640793 C/T 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 T:C C T 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 1782957 C/T 1 85 60 145 37.7971237040856 33.3196773853513 4.47744631873432 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.503988294664294 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1782854_1782993:RPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 1795180 T/C 1 32 30 62 14.2295053944793 16.6598386926757 -2.43033329819636 T:C T C 10 0.555327956422522 0.609599371745769 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1795127_1795234:RPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 2186100 C/T 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C C T 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2185941_2186153:SMG6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 2202943 T/C 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 T:C T C 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 2203167 T/G 1 19 17 36 8.44876882797208 9.44057525918287 -0.99180643121079 T:G T G 10 0.555327956422522 0.740708520659872 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 2203453 A/G 1 7 17 24 3.11270430504235 9.44057525918287 -6.32787095414053 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0123983114373730 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 2236404 T/C 1 55 53 108 24.4569623967613 29.4323816903937 -4.97541929363237 T:C T C 10 0.555327956422522 0.335088811861627 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2236255_2236418:TSR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 3526637 C/T 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 T:C C T 10 0.555327956422522 0.605558868068935 ENSG00000197417:ENST00000225519:exon_3526633_3526785:SHPK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 3564068 G/A 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 A:G G A 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 3568012 A/G 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3567973_3568092:TAX1BP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 3572542 A/C 1 77 75 152 34.2397473554658 41.6495967316892 -7.40984937622334 A:T:C A C 10 0.555327956422522 0.253146976021633 ENSG00000127774:ENST00000397133:exon_3572392_3572962:TMEM93;ENSG00000127774:ENST00000248378:exon_3572392_3572962:TMEM93 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 3577146 C/T 1 17 22 39 7.55942474081713 12.2172150412955 -4.65779030047836 T:C C T 10 0.555327956422522 0.148270380292886 ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3576521_3577171:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000345901:exon_3576524_3577171:P2RX5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 3627473 C/T 1 7 11 18 3.11270430504235 6.10860752064774 -2.9959032156054 T:C C T 10 0.555327956422522 0.163703578976710 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 3627840 G/A 1 4 10 14 1.77868817430991 5.55327956422522 -3.77459138991531 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0577678010140113 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 3628212 T/C 1 9 14 23 4.0020483921973 7.77459138991531 -3.77254299771801 T:C T C 10 0.555327956422522 0.141766408043743 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 3628362 T/C 1 6 13 19 2.66803226146487 7.21926343349279 -4.55123117202792 T:C:G T C 10 0.555327956422522 0.0395254330154768 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 4449228 C/T 1 46 56 102 20.454914004564 31.0983655596612 -10.6434515550972 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0364368279738749 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4449141_4449237:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4449141_4449237:MYBBP1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 4451453 C/T 1 32 27 59 14.2295053944793 14.9938548234081 -0.764349428928796 T:C C T 10 0.555327956422522 0.896034534534726 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4451438_4451605:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4451438_4451605:MYBBP1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 4700993 C/G 1 96 81 177 42.6885161834379 44.9815644702243 -2.29304828678639 C:G C G 10 0.555327956422522 0.762414214038542 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 73 95 168 32.4610591811559 52.7561558601396 -20.2950966789837 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00184086354501658 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 4712395 A/T 1 10 4 14 4.44672043577478 2.22131182569009 2.22540861008469 A:T A T 10 0.555327956422522 0.288383222971717 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4712395_4712500:PLD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 4712617 C/T 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4712593_4712658:PLD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 4718776 G/A 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 A:G G A 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4718771_4718881:PLD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 4797305 G/A 1 27 42 69 12.0061451765919 23.3237741697459 -11.317628993154 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00736086849072765 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4797283_4797388:MINK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 4849284 G/A 1 1441 1562 3003 640.772414795146 867.422267931979 -226.649853136833 A:T:C:G G A 10 0.555327956422522 1.25104335837491e-16 ENSG00000108518:ENST00000225655:exon_4848947_4849292:PFN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 4856376 A/G 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 A:G A G 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000108515:ENST00000520221:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522798:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522301:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521811:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519602:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000441285:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000381335:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000323997:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000422083:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519834:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522249:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521659:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000518175:exon_4856346_4856404:ENO3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 4875566 T/C 1 19 21 40 8.44876882797208 11.661887084873 -3.21311825690088 T:C T C 10 0.555327956422522 0.341360637779387 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 4883045 C/T 1 15 18 33 6.67008065366217 9.9959032156054 -3.32582256194322 T:C C T 10 0.555327956422522 0.293705287922686 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4882979_4883916:CAMTA2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 4883818 C/G 1 6 8 14 2.66803226146487 4.44262365138018 -1.77459138991531 C:G C G 10 0.555327956422522 0.423022312731772 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4882979_4883916:CAMTA2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 4926882 A/G 1 44 61 105 19.565569917409 33.8750053417738 -14.3094354243648 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00577713693991329 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 70 72 142 31.1270430504235 39.9836128624216 -8.85656981199812 A:G A G 10 0.555327956422522 0.150989318312255 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 46 48 94 20.454914004564 26.6557419082811 -6.20082790371707 T:C T C 10 0.555327956422522 0.213487036638838 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 20 21 41 8.89344087154956 11.661887084873 -2.7684462133234 T:C C T 10 0.555327956422522 0.433171725971936 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 53 59 112 23.5676183096063 32.7643494289288 -9.19673111932246 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0870669629732851 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 46 60 106 20.454914004564 33.3196773853513 -12.8647633807873 T:C:G C G 10 0.555327956422522 0.0142299837631065 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 5336791 G/T 1 2 9 11 0.889344087154956 4.9979516078027 -4.10860752064774 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0150596095234126 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 5347576 G/A 1 17 10 27 7.55942474081713 5.55327956422522 2.00614517659191 A:G G A 10 0.555327956422522 0.562156482279236 ENSG00000005100:ENST00000225296:exon_5344232_5347833:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000457531:exon_5345596_5347833:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000433302:exon_5345596_5347833:DHX33 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 5356913 C/T 1 8 14 22 3.55737634861982 7.77459138991531 -4.21721504129548 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0860332203503745 ENSG00000005100:ENST00000225296:exon_5356900_5356988:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000457531:exon_5356900_5356988:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000433302:exon_5356900_5356988:DHX33 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 5392173 A/C 1 30 23 53 13.3401613073243 12.772542997718 0.567618309606335 A:C A C 10 0.555327956422522 0.891214205866966 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 22 30 52 9.78278495870452 16.6598386926757 -6.87705373397114 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0688022369122516 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 6511781 A/G 1 2 12 14 0.889344087154956 6.66393547707026 -5.77459138991531 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00216105207299794 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6511668_6511784:KIAA0753 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 6513329 G/A 1 2 12 14 0.889344087154956 6.66393547707026 -5.77459138991531 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00216105207299794 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6513314_6513480:KIAA0753 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 6515387 A/G 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6515239_6515468:KIAA0753 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 6515454 C/T 1 9 3 12 4.0020483921973 1.66598386926757 2.33606452292974 T:C C T 10 0.555327956422522 0.247371341375508 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6515239_6515468:KIAA0753 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 6524298 T/A 1 8 3 11 3.55737634861982 1.66598386926757 1.89139247935226 A:T T A 10 0.555327956422522 0.365636833821238 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6524108_6524318:KIAA0753 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 6531648 A/G 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 A:G A G 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6531437_6532061:KIAA0753 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 6538355 G/A 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:G G A 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6538331_6538491:KIAA0753 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 6663894 G/A 1 13 11 24 5.78073656650721 6.10860752064774 -0.327870954140527 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 7245371 A/G 1 45 51 96 20.0102419609865 28.3217257775486 -8.31148381656211 A:G A G 10 0.555327956422522 0.100082465619644 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7245267_7245386:ACAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 7246851 C/T 1 80 54 134 35.5737634861982 29.9877096468162 5.58605383938206 T:C C T 10 0.555327956422522 0.340511224475931 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7246698_7246881:ACAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 7251605 G/C 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 C:G G C 10 0.555327956422522 0.775730055964994 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 7293715 C/T 1 34 21 55 15.1188494816343 11.661887084873 3.45696239676129 T:C C T 10 0.555327956422522 0.415969200776244 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7293055_7293760:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7293055_7293760:PLSCR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 7297452 A/G 1 14 16 30 6.22540861008469 8.88524730276035 -2.65983869267566 A:G A G 10 0.555327956422522 0.361419251986498 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7297423_7297590:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7297423_7297590:PLSCR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 7346430 C/T 1 45 39 84 20.0102419609865 21.6577903004784 -1.64754833949184 T:C C T 10 0.555327956422522 0.742634268494538 ENSG00000161958:ENST00000293829:exon_7346395_7348256:FGF11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 7365651 G/A 1 15 12 27 6.67008065366217 6.66393547707026 0.0061451765919065 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000174282:ENST00000311403:exon_7362685_7367209:ZBTB4;ENSG00000174282:ENST00000380599:exon_7362688_7367209:ZBTB4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 7750232 T/C 1 5 13 18 2.22336021788739 7.21926343349279 -4.9959032156054 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0297547757208393 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750137_7750334:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750137_7750334:KDM6B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 7751778 G/A 1 18 17 35 8.0040967843946 9.44057525918287 -1.43647847478827 A:G G A 10 0.555327956422522 0.734278463498667 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 91 81 172 40.4651559655505 44.9815644702243 -4.51640850467378 A:G G A 10 0.555327956422522 0.490962375974663 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 37 32 69 16.4528656123667 17.7704946055207 -1.31762899315402 A:G A G 10 0.555327956422522 0.808874725613079 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 7761512 C/A 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000182224:ENST00000332439:exon_7761064_7761612:CYB5D1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 8046772 C/G 1 10 23 33 4.44672043577478 12.772542997718 -8.32582256194322 C:G C G 10 0.555327956422522 0.00447673016304902 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8046584_8047194:PER1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 8053085 T/G 1 12 10 22 5.33606452292974 5.55327956422522 -0.217215041295483 T:G T G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000413754:exon_8053073_8053194:PER1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 8064083 T/G 1 64 60 124 28.4590107889586 33.3196773853513 -4.86066659639273 T:G T G 10 0.555327956422522 0.416255349971253 ENSG00000220205:ENST00000316509:exon_8062467_8064189:VAMP2;ENSG00000220205:ENST00000404970:exon_8063724_8064842:VAMP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 8092694 T/G 1 16 13 29 7.11475269723965 7.21926343349279 -0.104510736253137 T:C:G T G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000196544:ENST00000389017:exon_8091652_8093564:C17orf59;ENSG00000196544:ENST00000357939:exon_8092385_8093056:C17orf59 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 8108331 A/G 1 116 62 178 51.5819570549874 34.4303332981964 17.1516237567911 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0102077802303677 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 117 61 178 52.0266290985649 33.8750053417738 18.1516237567911 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00650628130223885 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 8132763 T/C 1 37 28 65 16.4528656123667 15.5491827798306 0.90368283253607 T:C T C 10 0.555327956422522 0.900872399720333 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8132620_8132764:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8132620_8132764:C17orf68 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 8157310 C/T 1 20 17 37 8.89344087154956 9.44057525918287 -0.547134387633312 T:C C T 10 0.555327956422522 0.869997748652473 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8157177_8157397:PFAS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 8161149 C/T 1 22 14 36 9.78278495870452 7.77459138991531 2.00819356878921 T:C C T 10 0.555327956422522 0.615541397669078 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8161125_8161256:PFAS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 8167600 T/C 1 10 8 18 4.44672043577478 4.44262365138018 0.00409678439460492 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8167530_8167655:PFAS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 8168224 T/C 1 12 11 23 5.33606452292974 6.10860752064774 -0.772542997718006 T:C T C 10 0.555327956422522 0.834806358038955 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8168213_8168443:PFAS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 8792029 A/G 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 A:G A G 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 8792514 G/A 1 8 2 10 3.55737634861982 1.11065591284504 2.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 0.201545371859033 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8792456_8792539:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8792456_8792539:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8792456_8792539:PIK3R5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 10595250 T/C 1 39 40 79 17.3422096995216 22.2131182569009 -4.87090855737923 T:C T C 10 0.555327956422522 0.308345704508797 ENSG00000133028:ENST00000255390:exon_10595189_10595281:SCO1;ENSG00000133028:ENST00000396047:exon_10595189_10595281:SCO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 10608307 G/A 1 14 12 26 6.22540861008469 6.66393547707026 -0.438526866985572 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10608227_10608844:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10608227_10608932:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000527582:exon_10608227_10609245:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10608244_10608844:C17orf48 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 13972955 C/T 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13972846_13972965:COX10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 13980058 A/T 1 22 18 40 9.78278495870452 9.9959032156054 -0.213118256900879 A:T A T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 15611495 T/C 1 9 13 22 4.0020483921973 7.21926343349279 -3.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.199625660043352 ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 17394611 G/A 1 34 33 67 15.1188494816343 18.3258225619432 -3.20697308030897 A:G G A 10 0.555327956422522 0.461848906718988 ENSG00000141026:ENST00000268711:exon_17394593_17396535:MED9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 17409560 C/T 1 13 5 18 5.78073656650721 2.77663978211261 3.0040967843946 T:C C T 10 0.555327956422522 0.234861389233214 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000490392:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000484838:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000477595:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000482906:exon_17409541_17409615:PEMT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 17425631 C/T 1 12 6 18 5.33606452292974 3.33196773853513 2.0040967843946 T:C C T 10 0.555327956422522 0.477948616778315 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000421096:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000461404:exon_17425594_17425709:PEMT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 17700899 A/G 1 42 24 66 18.6762258302541 13.3278709541405 5.34835487611355 A:G A G 10 0.555327956422522 0.215638401070080 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17700698_17701668:RAI1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 66 67 133 29.3483548761136 37.206973080309 -7.85861820419542 A:G G A 10 0.555327956422522 0.190514308929019 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 18149231 C/T 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 T:C C T 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000177731:ENST00000465046:exon_18148668_18149322:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487693:exon_18149058_18149376:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493600:exon_18148869_18149376:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493401:exon_18149152_18149376:FLII;ENSG00000177731:ENST00000476369:exon_18149152_18149309:FLII HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 18167505 T/C 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000177427:ENST00000323019:exon_18167024_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395704:exon_18167098_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395706:exon_18167024_18169095:SMCR7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 18219835 T/C 1 7 24 31 3.11270430504235 13.3278709541405 -10.2151666490982 T:C T C 10 0.555327956422522 0.000226414369837919 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 18220770 G/A 1 21 10 31 9.33811291512704 5.55327956422522 3.78483335090182 A:G G A 10 0.555327956422522 0.206837442668999 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 18221010 A/G 1 11 12 23 4.89139247935226 6.66393547707026 -1.77254299771801 A:G A G 10 0.555327956422522 0.531120817504268 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 20911204 G/T 1 36 20 56 16.0081935687892 11.1065591284504 4.90163444033877 T:G G T 10 0.555327956422522 0.226159009908459 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20911183_20911309:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20911183_20911309:USP22;ENSG00000124422:ENST00000478443:exon_20911183_20911309:USP22 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 70 0 70 31.1270430504235 0 31.1270430504235 T T 10 0.555327956422522 1.85330142401468e-18 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 65 0 65 28.9036828325361 0 28.9036828325361 T T 10 0.555327956422522 4.78843345378995e-17 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 66 0 66 29.3483548761136 0 29.3483548761136 G G 10 0.555327956422522 2.46961543649221e-17 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 69 0 69 30.682371006846 0 30.682371006846 G G 10 0.555327956422522 3.5106442573723e-18 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 67 0 67 29.793026919691 0 29.793026919691 C C 10 0.555327956422522 1.28132153182869e-17 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 21203964 C/G 0 53 0 53 23.5676183096063 0 23.5676183096063 C C 10 0.555327956422522 3.95305790933713e-14 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 34 0 34 15.1188494816343 0 15.1188494816343 C C 10 0.555327956422522 3.055601736333e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 97 0 97 43.1331882270154 0 43.1331882270154 C C 10 0.555327956422522 1.81267630855563e-25 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 60 0 60 26.6803226146487 0 26.6803226146487 C C 10 0.555327956422522 5.23949973473667e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 36 0 36 16.0081935687892 0 16.0081935687892 C C 10 0.555327956422522 8.560851995329e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 57 0 57 25.3463064839162 0 25.3463064839162 C C 10 0.555327956422522 3.26655668564015e-15 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 68 0 68 30.2376989632685 0 30.2376989632685 G G 10 0.555327956422522 6.68747175038766e-18 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 149 0 149 66.2561344930442 0 66.2561344930442 G G 10 0.555327956422522 9.78124822376444e-39 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 25628820 T/C 1 70 47 117 31.1270430504235 26.1004139518585 5.02662909856493 T:C T C 10 0.555327956422522 0.402572696880346 ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000427287:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25628814_25628982:WSB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 26676135 C/T 1 69 72 141 30.682371006846 39.9836128624216 -9.3012418555756 T:C C T 10 0.555327956422522 0.127075490767919 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 26686416 G/A 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000244045:ENST00000292114:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000509083:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000457710:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000483505:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000395404:exon_26686338_26686427:TMEM199 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 27009749 C/T 1 48 68 116 21.3442580917189 37.7623010367315 -16.4180429450125 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00265355533528068 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27009745_27009874:SUPT6H;ENSG00000109111:ENST00000347486:exon_27009745_27009874:SUPT6H HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 27530413 T/C 0 15 0 15 6.67008065366217 0 6.67008065366217 T T 10 0.555327956422522 0.000251015038114268 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 19 16 35 8.44876882797208 8.88524730276035 -0.436478474788268 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 30533970 A/G 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:G A G 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000126858:ENST00000333942:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000394692:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000358365:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000354266:exon_30533929_30534048:RHOT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 33289046 G/C 1 16 16 32 7.11475269723965 8.88524730276035 -1.7704946055207 C:G G C 10 0.555327956422522 0.595024882931205 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 33690466 C/A 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 A:C C A 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000172716:ENST00000308377:exon_33689758_33690845:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000394566:exon_33689758_33690845:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000321335:exon_33689758_33690845:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000442678:exon_33689758_33690849:SLFN11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 33998802 G/C 1 19 16 35 8.44876882797208 8.88524730276035 -0.436478474788268 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 34416537 G/A 1 508 233 741 225.893398137359 129.391413846448 96.5019842909112 A:C:G G A 10 0.555327956422522 5.4821701905112e-13 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 34432663 A/G 1 235 51 286 104.497930240707 28.3217257775486 76.1762044631587 A:G A G 10 0.555327956422522 2.60959811756005e-21 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 34432664 T/A 1 235 51 286 104.497930240707 28.3217257775486 76.1762044631587 A:T T A 10 0.555327956422522 2.60959811756005e-21 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 34842521 A/G 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000108278:ENST00000225410:exon_34842479_34842629:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000490126:exon_34842501_34842629:ZNHIT3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 34851258 T/C 1 55 34 89 24.4569623967613 18.8811505183657 5.57581187839554 T:C T C 10 0.555327956422522 0.242735600147851 ENSG00000108278:ENST00000225410:exon_34851067_34851666:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000490126:exon_34851067_34851667:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000434102:exon_34851067_34851662:ZNHIT3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 20 12 32 8.89344087154956 6.66393547707026 2.2295053944793 A:G G A 10 0.555327956422522 0.480113678066947 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 34 21 55 15.1188494816343 11.661887084873 3.45696239676129 A:G G A 10 0.555327956422522 0.415969200776244 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 35956391 G/C 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 C:G G C 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000378189:exon_35956270_35956391:SYNRG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 14 10 24 6.22540861008469 5.55327956422522 0.672129045859473 T:C C T 10 0.555327956422522 0.839730194130565 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 44 46 90 19.565569917409 25.545085995436 -5.97951607802698 A:G G A 10 0.555327956422522 0.205320229520911 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 36909499 A/T 1 101 70 171 44.9118764013253 38.8729569495765 6.03891945174874 A:T A T 10 0.555327956422522 0.397390278904734 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909403_36909587:PSMB3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 36926731 T/G 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 T:G T G 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 36926767 G/A 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 A:G G A 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 37054772 C/T 1 64 80 144 28.4590107889586 44.4262365138018 -15.9672257248432 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00911085479958551 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37054665_37054772:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37054665_37054772:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37054665_37054772:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000443937:exon_37054665_37055078:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37054665_37054772:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37054665_37054772:LASP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 38990834 G/C 1 8 21 29 3.55737634861982 11.661887084873 -8.10451073625314 C:G G C 10 0.555327956422522 0.00416865468925487 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 38991003 T/C 1 14 20 34 6.22540861008469 11.1065591284504 -4.88115051836575 T:C T C 10 0.555327956422522 0.119328286684192 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 17 16 33 7.55942474081713 8.88524730276035 -1.32582256194322 A:T T A 10 0.555327956422522 0.726914463925943 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 39925925 A/G 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 A:G A G 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000449889:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437187:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000420370:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000424457:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437369:exon_39925878_39925929:JUP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 40125864 G/A 1 36 33 69 16.0081935687892 18.3258225619432 -2.31762899315402 A:G G A 10 0.555327956422522 0.628494067589504 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 40255812 C/T 0 22 0 22 9.78278495870452 0 9.78278495870452 C C 10 0.555327956422522 2.91376917313232e-06 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40255626_40255816:DHX58 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 40257163 T/C 1 27 8 35 12.0061451765919 4.44262365138018 7.56352152521173 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0102861203310011 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 40280291 G/A 1 57 58 115 25.3463064839162 32.2090214725063 -6.86271498859002 A:G G A 10 0.555327956422522 0.222476337760824 ENSG00000108774:ENST00000346213:exon_40280279_40280401:RAB5C;ENSG00000108774:ENST00000393860:exon_40280279_40280401:RAB5C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 40344455 C/T 1 25 24 49 11.116801089437 13.3278709541405 -2.21106986470358 T:C C T 10 0.555327956422522 0.566653602834593 ENSG00000167925:ENST00000454210:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000393854:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000428494:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000301671:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000414034:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000377472:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000436923:exon_40344259_40344760:GHDC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 40459737 C/T 1 69 32 101 30.682371006846 17.7704946055207 12.9118764013253 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0119283361901519 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40459611_40459741:STAT5A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 40725379 A/T 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 A:T A T 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000131470:ENST00000253789:exon_40725329_40725382:PSMC3IP;ENSG00000131470:ENST00000393795:exon_40725329_40725382:PSMC3IP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 40926695 A/T 1 89 72 161 39.5758118783955 39.9836128624216 -0.407800984026039 A:T A T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40926664_40926717:VPS25 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 43 54 97 19.1208978738316 29.9877096468162 -10.8668117729846 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0314687423949559 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 42476409 G/A 1 25 18 43 11.116801089437 9.9959032156054 1.12089787383156 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.761359494764192 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 42953409 A/G 1 14 13 27 6.22540861008469 7.21926343349279 -0.993854823408094 A:G A G 10 0.555327956422522 0.703574709140118 ENSG00000108883:ENST00000426333:exon_42953302_42953468:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000402521:exon_42953302_42953468:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000262414:exon_42953302_42953468:EFTUD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 46 45 91 20.454914004564 24.9897580390135 -4.5348440344495 A:G G A 10 0.555327956422522 0.344442654541045 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 45822141 C/A 1 125 78 203 55.5840054471848 43.3155806009567 12.268424846228 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0900173128321468 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45822114_45823485:TBX21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 46926615 G/A 1 89 80 169 39.5758118783955 44.4262365138018 -4.85042463540621 A:G G A 10 0.555327956422522 0.486218467211104 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509415:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000505071:exon_46926614_46926631:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000502761:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46926614_46926739:CALCOCO2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 46929908 T/C 1 21 32 53 9.33811291512704 17.7704946055207 -8.43238169039367 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0261025208272936 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514006:exon_46929868_46930220:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000511816:exon_46929868_46930007:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509112:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000506971:exon_46929702_46929990:CALCOCO2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 47778793 C/T 1 5 10 15 2.22336021788739 5.55327956422522 -3.32991934633783 T:C C T 10 0.555327956422522 0.117258617190494 ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47778305_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47778649_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47778682_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47778683_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508749:exon_47778690_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507477:exon_47778690_47780373:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47778701_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47778701_47778872:SLC35B1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 47788755 G/A 1 45 42 87 20.0102419609865 23.3237741697459 -3.31353220875941 A:G G A 10 0.555327956422522 0.517879497909315 ENSG00000121104:ENST00000240364:exon_47787694_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000513602:exon_47788357_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000503573:exon_47788707_47788917:FAM117A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 48174908 C/T 0 10 0 10 4.44672043577478 0 4.44672043577478 C C 10 0.555327956422522 0.00309157318156107 ENSG00000005882:ENST00000007708:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000508030:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000503176:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000503614:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000442211:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000508960:exon_48174787_48175160:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000505897:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000505440:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000512238:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000515040:exon_48174877_48174928:PDK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 48431032 G/A 1 5 21 26 2.22336021788739 11.661887084873 -9.43852686698557 A:G G A 10 0.555327956422522 0.000223323976353714 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000509778:exon_48430991_48431035:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 48431197 C/T 1 9 17 26 4.0020483921973 9.44057525918287 -5.43852686698557 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0463758134411358 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 48432324 G/C 1 7 9 16 3.11270430504235 4.9979516078027 -1.88524730276035 C:G G C 10 0.555327956422522 0.451827358588768 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48432215_48432417:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48432215_48432417:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48432215_48432417:XYLT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 48433958 T/C 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 T:C T C 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48433872_48434134:XYLT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 48452776 A/C 1 6 10 16 2.66803226146487 5.55327956422522 -2.88524730276035 A:C A C 10 0.555327956422522 0.207537445170925 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48452546_48453344:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48452546_48453344:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511711:exon_48452546_48452873:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511519:exon_48452546_48452873:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48452546_48452873:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48452546_48453344:EME1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 48455985 A/T 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 A:T A T 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511519:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48455956_48456042:EME1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 48940422 T/C 1 22 19 41 9.78278495870452 10.5512311720279 -0.768446213323401 T:C T C 10 0.555327956422522 0.875562949353059 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1;ENSG00000141232:ENST00000268957:exon_48940341_48941524:TOB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 54978794 G/A 1 43 31 74 19.1208978738316 17.2151666490982 1.90573122473338 A:G G A 10 0.555327956422522 0.726071798270022 ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54978780_54978939:TRIM25 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 55183203 T/C 1 21 18 39 9.33811291512704 9.9959032156054 -0.657790300478357 T:C T C 10 0.555327956422522 0.87279129294191 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 55183716 T/C 1 27 22 49 12.0061451765919 12.2172150412955 -0.211069864703576 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 55926640 G/T 1 101 97 198 44.9118764013253 53.8668117729846 -8.95493537165935 T:G G T 10 0.555327956422522 0.224033408270383 ENSG00000181610:ENST00000313608:exon_55926601_55926771:MRPS23 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 60040329 C/T 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 T:C C T 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000108510:ENST00000262436:exon_60040113_60040332:MED13;ENSG00000108510:ENST00000397786:exon_60040113_60040332:MED13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 65184668 A/G 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 A:G A G 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000198265:ENST00000358691:exon_65184435_65184732:HELZ HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 65212042 C/T 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 T:C C T 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000198265:ENST00000358691:exon_65212015_65212051:HELZ HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 65362552 T/A 1 18 35 53 8.0040967843946 19.4364784747883 -11.4323816903937 A:T T A 10 0.555327956422522 0.00207794729276830 ENSG00000197170:ENST00000356126:exon_65362528_65362743:PSMD12;ENSG00000197170:ENST00000357146:exon_65362528_65362721:PSMD12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 65739627 A/G 1 20 24 44 8.89344087154956 13.3278709541405 -4.43443008259097 A:G A G 10 0.555327956422522 0.224518747568463 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65739595_65739702:NOL11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 111 129 240 49.3585968371001 71.6373063785053 -22.2787095414053 A:C:G A G 10 0.555327956422522 0.00420193892988381 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 59 45 104 26.2356505710712 24.9897580390135 1.24589253205772 A:T T A 10 0.555327956422522 0.843970185894929 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 67267317 T/C 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:C T C 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67267303_67267433:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67267303_67267430:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67267303_67267430:ABCA5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 67273882 C/A 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67273782_67273983:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67273782_67273983:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67273782_67273983:ABCA5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 67290840 T/C 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C T C 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67290796_67290854:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67290796_67290854:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67290796_67290854:ABCA5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 71192663 G/A 1 4 9 13 1.77868817430991 4.9979516078027 -3.21926343349279 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0940602799732446 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71192646_71192890:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71192646_71192890:COG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 71196809 A/G 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 A:G A G 10 0.555327956422522 0.150211231786478 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71196705_71196915:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71196705_71196915:COG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 27 32 59 12.0061451765919 17.7704946055207 -5.7643494289288 A:G G A 10 0.555327956422522 0.149619677418313 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 71232687 T/C 1 22 21 43 9.78278495870452 11.661887084873 -1.87910212616845 T:C T C 10 0.555327956422522 0.645850639619903 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 71232807 T/C 1 16 7 23 7.11475269723965 3.88729569495765 3.22745700228199 T:C T C 10 0.555327956422522 0.210713456641927 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 26 16 42 11.5614731330144 8.88524730276035 2.67622583025408 A:C:G G C 10 0.555327956422522 0.440894103867154 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 71233130 A/G 1 10 4 14 4.44672043577478 2.22131182569009 2.22540861008469 A:G A G 10 0.555327956422522 0.288383222971717 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 71238433 G/A 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 A:G G A 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71238383_71238490:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71238383_71238490:C17orf80 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 72443192 G/T 1 4 9 13 1.77868817430991 4.9979516078027 -3.21926343349279 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0940602799732446 ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000481232:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72442988_72443566:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000417745:exon_72442988_72443566:GPRC5C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 72862593 C/T 1 14 12 26 6.22540861008469 6.66393547707026 -0.438526866985572 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72862568_72862690:FDXR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 73125173 A/G 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 A:G A G 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 C:G G C 10 0.555327956422522 0.121065279657040 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 73221439 C/T 1 37 33 70 16.4528656123667 18.3258225619432 -1.87295694957654 T:C C T 10 0.555327956422522 0.718572418142477 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73221437_73221559:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000449421:exon_73221437_73221559:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73221437_73221559:NUP85 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 73230796 T/C 1 27 12 39 12.0061451765919 6.66393547707026 5.34220969952164 T:C T C 10 0.555327956422522 0.106394082134201 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73230732_73230883:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73230732_73231009:NUP85 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 73236124 A/G 1 25 31 56 11.116801089437 17.2151666490982 -6.09836555966123 A:G A G 10 0.555327956422522 0.107745186463605 ENSG00000125447:ENST00000245541:exon_73235870_73236189:GGA3;ENSG00000125447:ENST00000351904:exon_73235870_73236189:GGA3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 73263012 C/T 1 37 35 72 16.4528656123667 19.4364784747883 -2.98361286242158 T:C C T 10 0.555327956422522 0.479738888150087 ENSG00000125457:ENST00000245551:exon_73262313_73263048:MIF4GD;ENSG00000125457:ENST00000325102:exon_73263000_73263035:MIF4GD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 73279624 A/G 1 6 14 20 2.66803226146487 7.77459138991531 -5.10655912845044 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0246812283603920 ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73279504_73279674:SLC25A19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 73488794 C/T 1 20 21 41 8.89344087154956 11.661887084873 -2.7684462133234 T:C C T 10 0.555327956422522 0.433171725971936 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73488555_73488870:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73488555_73488870:KIAA0195 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 73489567 C/G 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 C:G C G 10 0.555327956422522 0.78392575562472 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 73625286 G/A 1 12 15 27 5.33606452292974 8.32991934633783 -2.99385482340809 A:G G A 10 0.555327956422522 0.252692291269657 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 73625430 G/A 1 8 11 19 3.55737634861982 6.10860752064774 -2.55123117202792 A:G G A 10 0.555327956422522 0.2564170773856 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 74152374 T/G 1 16 11 27 7.11475269723965 6.10860752064774 1.00614517659191 T:G T G 10 0.555327956422522 0.846938067616076 ENSG00000141576:ENST00000269391:exon_74152291_74152402:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000319945:exon_74152291_74152402:RNF157 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 74163821 G/A 1 16 12 28 7.11475269723965 6.66393547707026 0.450817220169385 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000141576:ENST00000269391:exon_74163732_74163878:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000319945:exon_74163732_74163878:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000301610:exon_74163732_74163878:RNF157 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 74387284 C/T 1 33 28 61 14.6741774380568 15.5491827798306 -0.875005341773841 T:C C T 10 0.555327956422522 0.897643159894651 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74385614_74387694:UBE2O HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 74733099 G/A 1 300 267 567 133.401613073243 148.272564364813 -14.87095129157 A:G G A 10 0.555327956422522 0.220399202613973 ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74732881_74733412:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732969_74733413:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732881_74733242:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74733066_74733242:SRSF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 76113528 G/A 1 25 10 35 11.116801089437 5.55327956422522 5.56352152521173 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0625471262436118 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 76121004 G/A 1 69 79 148 30.682371006846 43.8709085573792 -13.1885375505333 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0314395245773135 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120970_76121066:TMC6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 76129903 C/T 1 12 11 23 5.33606452292974 6.10860752064774 -0.772542997718006 T:C C T 10 0.555327956422522 0.834806358038955 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 76166939 C/G 1 277 226 503 123.174156070961 125.50411815149 -2.32996208052855 T:C:G C G 10 0.555327956422522 0.85761084013806 ENSG00000108639:ENST00000225777:exon_76166898_76167135:SYNGR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 76167047 C/T 1 520 545 1065 231.229462660289 302.653736250274 -71.4242735899859 T:C C T 10 0.555327956422522 1.16901969537525e-05 ENSG00000108639:ENST00000225777:exon_76166898_76167135:SYNGR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 76170830 C/T 1 91 77 168 40.4651559655505 42.7602526445342 -2.29509667898369 T:C C T 10 0.555327956422522 0.756336070401828 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76170160_76171031:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76170773_76171031:TK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 76178751 C/T 1 21 18 39 9.33811291512704 9.9959032156054 -0.657790300478357 T:C C T 10 0.555327956422522 0.87279129294191 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 18 24 42 8.0040967843946 13.3278709541405 -5.32377416974592 T:C T C 10 0.555327956422522 0.119927124185076 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 24 27 51 10.6721290458595 14.9938548234081 -4.32172577754862 A:C:G A G 10 0.555327956422522 0.259841693470513 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 76803659 T/C 1 23 24 47 10.227457002282 13.3278709541405 -3.10041395185853 T:C T C 10 0.555327956422522 0.3813122088619 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76803041_76803718:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76803041_76803718:USP36 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 76967846 T/C 1 86 14 100 38.2417957476631 7.77459138991531 30.4672043577478 T:C T C 10 0.555327956422522 1.04094306695163e-10 ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76967337_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000418895:exon_76967338_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000431152:exon_76967658_76968641:LGALS3BP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 19 19 38 8.44876882797208 10.5512311720279 -2.10246234405583 A:G G A 10 0.555327956422522 0.517033830009147 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 76989782 G/A 1 23 27 50 10.227457002282 14.9938548234081 -4.7663978211261 A:G G A 10 0.555327956422522 0.200588244921778 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 77078109 A/G 1 11 4 15 4.89139247935226 2.22131182569009 2.67008065366217 A:T:G A G 10 0.555327956422522 0.199926509979624 ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77077980_77078145:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77077980_77078145:ENGASE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 77080700 C/T 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 T:C C T 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77080620_77080768:ENGASE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 78078709 T/C 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C T C 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78078354_78078931:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78078354_78078931:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78078354_78078931:GAA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 78079669 G/A 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78079548_78079693:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78079548_78079693:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78079548_78079693:GAA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 78082504 G/A 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78082496_78082627:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78082496_78082627:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78082496_78082627:GAA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 78087041 G/A 1 9 9 18 4.0020483921973 4.9979516078027 -0.995903215605395 A:G G A 10 0.555327956422522 0.643952874691603 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78087017_78087165:GAA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 78087109 A/G 1 10 5 15 4.44672043577478 2.77663978211261 1.67008065366217 A:G A G 10 0.555327956422522 0.445339902559564 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78087017_78087165:GAA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 78091405 G/A 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 A:G G A 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 78319136 G/A 1 14 15 29 6.22540861008469 8.32991934633783 -2.10451073625314 A:G G A 10 0.555327956422522 0.459182512082066 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 78319380 G/C 1 15 12 27 6.67008065366217 6.66393547707026 0.0061451765919065 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 78327358 G/A 1 12 18 30 5.33606452292974 9.9959032156054 -4.65983869267566 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0991449163238243 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78327312_78327466:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78327312_78327466:RNF213;ENSG00000234591:ENST00000434136:exon_78327100_78327744:AC124319.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 78332222 T/C 1 12 9 21 5.33606452292974 4.9979516078027 0.338112915127039 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78332088_78332279:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78332088_78332279:RNF213 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 78354661 C/T 1 26 11 37 11.5614731330144 6.10860752064774 5.45286561236669 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0967725467321335 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78354631_78354787:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78354631_78354787:RNF213 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 78865546 T/C 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 T:C T C 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78865520_78865637:RPTOR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 78865630 A/G 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 A:G A G 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78865520_78865637:RPTOR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 79180603 C/T 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 T:C C T 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79180544_79180671:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79180544_79180671:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79180544_79180671:AZI1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 79205672 G/A 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 A:G G A 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79205647_79205821:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79205647_79205821:C17orf56 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 79514263 G/A 1 20 32 52 8.89344087154956 17.7704946055207 -8.87705373397114 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0169498712361753 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 79637352 C/T 1 25 24 49 11.116801089437 13.3278709541405 -2.21106986470358 T:C C T 10 0.555327956422522 0.566653602834593 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79637255_79637483:CCDC137 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 79648788 A/C 1 42 54 96 18.6762258302541 29.9877096468162 -11.3114838165621 A:C A C 10 0.555327956422522 0.0235071896293269 ENSG00000214087:ENST00000397498:exon_79648250_79648909:ARL16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 79801977 C/T 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 T:C C T 10 0.555327956422522 1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 79803101 A/G 1 454 490 944 201.881107784175 272.110698647036 -70.2295908628607 A:G A G 10 0.555327956422522 5.11533729083706e-06 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000473021:exon_79803020_79803332:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79803043_79803106:P4HB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 79954544 T/A 1 18 20 38 8.0040967843946 11.1065591284504 -3.10246234405583 A:T T A 10 0.555327956422522 0.330727415667330 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79954296_79954722:ASPSCR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 17 14 31 7.55942474081713 7.77459138991531 -0.215166649098181 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 80006558 C/T 1 20 24 44 8.89344087154956 13.3278709541405 -4.43443008259097 T:C C T 10 0.555327956422522 0.224518747568463 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80005778_80006683:RFNG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 80041950 G/A 0 115 0 115 51.13728501141 0 51.13728501141 G G 10 0.555327956422522 4.57288069555987e-30 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80041851_80042029:FASN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 80051183 A/G 1 56 40 96 24.9016344403388 22.2131182569009 2.68851618343789 A:G A G 10 0.555327956422522 0.608832031848963 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80051095_80051295:FASN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 80059596 T/C 1 82 65 147 36.4631075733532 36.0963171674639 0.366790405889269 T:C:G T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80059566_80059742:CCDC57 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 80585094 C/T 1 13 5 18 5.78073656650721 2.77663978211261 3.0040967843946 T:C C T 10 0.555327956422522 0.234861389233214 ENSG00000141580:ENST00000392325:exon_80585080_80585167:WDR45L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 80863857 T/C 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 T:C T C 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80863812_80863929:TBCD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 13 10 23 5.78073656650721 5.55327956422522 0.227457002281995 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 161 148 309 71.592199015974 82.1885375505333 -10.5963385345593 T:C C T 10 0.555327956422522 0.229717427459269 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 674320 A/G 1 37 26 63 16.4528656123667 14.4385268669856 2.01433874538112 A:G A G 10 0.555327956422522 0.704045544538866 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_674161_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_673859_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_673861_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_674038_674406:ENOSF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 691266 A/G 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 A:C:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_691204_691276:ENOSF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 2920288 G/A 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000101577:ENST00000261596:exon_2916992_2920435:LPIN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 2920357 C/T 1 11 7 18 4.89139247935226 3.88729569495765 1.0040967843946 T:C C T 10 0.555327956422522 0.813417267911682 ENSG00000101577:ENST00000261596:exon_2916992_2920435:LPIN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 3729175 C/T 1 11 7 18 4.89139247935226 3.88729569495765 1.0040967843946 T:C C T 10 0.555327956422522 0.813417267911682 ENSG00000170579:ENST00000315677:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400147:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400150:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400149:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400155:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400145:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000485480:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000498188:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000478161:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000486430:exon_3729135_3729378:DLGAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 10691357 G/A 1 7 1 8 3.11270430504235 0.555327956422522 2.55737634861982 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0837859633971926 ENSG00000154864:ENST00000503781:exon_10691223_10691381:FAM38B;ENSG00000154864:ENST00000285141:exon_10691223_10691381:FAM38B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 12971245 C/T 1 33 20 53 14.6741774380568 11.1065591284504 3.56761830960634 T:C C T 10 0.555327956422522 0.337406825494301 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12971152_12971250:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12971152_12971250:SEH1L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 43 27 70 19.1208978738316 14.9938548234081 4.12704305042346 A:C C A 10 0.555327956422522 0.338383072391747 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 13068109 G/A 1 12 8 20 5.33606452292974 4.44262365138018 0.893440871549561 A:G G A 10 0.555327956422522 0.823148310222236 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13068093_13068236:CEP192 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 13068132 T/C 1 11 9 20 4.89139247935226 4.9979516078027 -0.106559128450439 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13068093_13068236:CEP192 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 13069782 C/T 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000507254:exon_13069749_13069855:CEP192 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 13095609 T/C 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13095502_13095680:CEP192 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 13 8 21 5.78073656650721 4.44262365138018 1.33811291512704 T:G G T 10 0.555327956422522 0.66298519208265 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 19153494 C/T 1 11 13 24 4.89139247935226 7.21926343349279 -2.32787095414053 T:C C T 10 0.555327956422522 0.412507168985383 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 21100240 C/T 1 18 29 47 8.0040967843946 16.1045107362531 -8.10041395185853 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0189080131316613 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 21739725 T/C 1 11 1 12 4.89139247935226 0.555327956422522 4.33606452292974 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0162334658720244 ENSG00000154040:ENST00000399496:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399478:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000463087:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000486759:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000327201:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399499:exon_21739436_21740033:CABYR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 23865851 C/T 1 10 15 25 4.44672043577478 8.32991934633783 -3.88319891056305 T:C C T 10 0.555327956422522 0.157828971143109 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23865846_23866463:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23865846_23866463:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23865846_23866463:TAF4B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 23872235 A/G 1 17 24 41 7.55942474081713 13.3278709541405 -5.7684462133234 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0834111646322127 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23872195_23872345:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23872210_23872345:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23872210_23872345:TAF4B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 23873463 T/C 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 T:C T C 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23873390_23873495:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23873390_23873495:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23873390_23873495:TAF4B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 29477770 G/A 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29477749_29477854:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29477749_29477854:TRAPPC8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 32822382 G/T 1 17 13 30 7.55942474081713 7.21926343349279 0.340161307324341 T:G G T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000186812:ENST00000330501:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000261333:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000355632:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000421371:exon_32822355_32822848:ZNF397 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 32834095 T/C 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 T:C T C 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000186814:ENST00000333206:exon_32832819_32834345:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000420878:exon_32833423_32834187:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000360932:exon_32833423_32834285:ZSCAN30 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 32834186 T/G 1 3 8 11 1.33401613073243 4.44262365138018 -3.10860752064774 T:G T G 10 0.555327956422522 0.0718999345122269 ENSG00000186814:ENST00000333206:exon_32832819_32834345:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000420878:exon_32833423_32834187:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000360932:exon_32833423_32834285:ZSCAN30 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 33557466 A/G 1 21 18 39 9.33811291512704 9.9959032156054 -0.657790300478357 A:G A G 10 0.555327956422522 0.87279129294191 ENSG00000141428:ENST00000333234:exon_33557373_33557563:C18orf21;ENSG00000141428:ENST00000269194:exon_33557373_33557563:C18orf21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 34205551 C/T 1 11 26 37 4.89139247935226 14.4385268669856 -9.54713438763331 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00240183173280498 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34205474_34205712:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34205474_34205712:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34205474_34205712:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34205474_34205712:FHOD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 34310668 C/T 1 18 8 26 8.0040967843946 4.44262365138018 3.56147313301443 T:C C T 10 0.555327956422522 0.172932735572506 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34310609_34310767:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34310609_34310767:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34310609_34310767:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34310609_34310767:FHOD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 34324091 G/A 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 A:G G A 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34323995_34324156:FHOD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 34376830 C/T 1 48 26 74 21.3442580917189 14.4385268669856 6.90573122473337 T:C C T 10 0.555327956422522 0.127898907580615 ENSG00000134779:ENST00000334295:exon_34376035_34377013:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000383056:exon_34376035_34377013:C18orf10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 43565380 A/G 1 4 11 15 1.77868817430991 6.10860752064774 -4.32991934633783 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0349050371317493 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 43565399 C/A 1 3 13 16 1.33401613073243 7.21926343349279 -5.88524730276035 A:C C A 10 0.555327956422522 0.00416520738747262 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 43568717 T/C 1 4 18 22 1.77868817430991 9.9959032156054 -8.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.000427342447009589 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43568668_43568725:PSTPIP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 45371695 A/G 1 4 9 13 1.77868817430991 4.9979516078027 -3.21926343349279 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0940602799732446 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 47093864 C/T 1 9 4 13 4.0020483921973 2.22131182569009 1.78073656650721 T:C C T 10 0.555327956422522 0.408523981318449 ENSG00000101670:ENST00000261292:exon_47093812_47093991:LIPG;ENSG00000101670:ENST00000427224:exon_47093812_47093991:LIPG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 47318626 T/C 1 31 14 45 13.7848333509018 7.77459138991531 6.01024196098651 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0737031011687068 ENSG00000167315:ENST00000285093:exon_47318522_47318697:ACAA2;ENSG00000167315:ENST00000398549:exon_47318522_47318697:ACAA2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 48703840 G/A 1 24 13 37 10.6721290458595 7.21926343349279 3.45286561236669 A:G G A 10 0.555327956422522 0.321143198310201 ENSG00000176624:ENST00000406189:exon_48700920_48703946:MEX3C;ENSG00000176624:ENST00000336573:exon_48700922_48703946:MEX3C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 54694452 C/T 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000091157:ENST00000254442:exon_54694235_54698828:WDR7;ENSG00000091157:ENST00000444065:exon_54694235_54697036:WDR7;ENSG00000091157:ENST00000357574:exon_54694235_54697036:WDR7;ENSG00000091157:ENST00000398311:exon_54694235_54697042:WDR7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 56202982 A/T 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 A:T A T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 21 9 30 9.33811291512704 4.9979516078027 4.34016130732434 C:G G C 10 0.555327956422522 0.141164510315933 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 23 10 33 10.227457002282 5.55327956422522 4.67417743805678 A:G A G 10 0.555327956422522 0.116059286874870 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 T:G G T 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 4 7 11 1.77868817430991 3.88729569495765 -2.10860752064774 T:G T G 10 0.555327956422522 0.234416927909769 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 5 12 17 2.22336021788739 6.66393547707026 -4.44057525918287 A:C A C 10 0.555327956422522 0.0476549732727157 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 56204489 C/G 1 9 3 12 4.0020483921973 1.66598386926757 2.33606452292974 C:G C G 10 0.555327956422522 0.247371341375508 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 56204747 G/A 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 A:G G A 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 56825944 T/C 1 21 15 36 9.33811291512704 8.32991934633783 1.00819356878921 T:C T C 10 0.555327956422522 0.867132456195878 ENSG00000166562:ENST00000299714:exon_56825864_56826068:SEC11C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 60021761 C/T 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C C T 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000141655:ENST00000382790:exon_60021624_60021767:TNFRSF11A;ENSG00000141655:ENST00000269485:exon_60021624_60021767:TNFRSF11A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 60227833 T/C 1 1 8 9 0.444672043577478 4.44262365138018 -3.9979516078027 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0133428681828177 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60227820_60227877:ZCCHC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 60241699 T/C 1 14 17 31 6.22540861008469 9.44057525918287 -3.21516664909818 T:C T C 10 0.555327956422522 0.279937122020371 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60241290_60242783:ZCCHC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 60241732 C/T 1 17 10 27 7.55942474081713 5.55327956422522 2.00614517659191 T:C C T 10 0.555327956422522 0.562156482279236 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60241290_60242783:ZCCHC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 60985879 T/C 1 86 91 177 38.2417957476631 50.5348440344495 -12.2930482867864 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0693410467890447 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 17 15 32 7.55942474081713 8.32991934633783 -0.770494605520703 T:C C T 10 0.555327956422522 0.859436806449628 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 61582867 A/G 1 8 81 89 3.55737634861982 44.9815644702243 -41.4241881216045 A:G A G 10 0.555327956422522 2.27833847501524e-20 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 61587053 G/A 1 3 22 25 1.33401613073243 12.2172150412955 -10.883198910563 A:G G A 10 0.555327956422522 8.3216124159429e-06 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 61587067 C/T 1 2 28 30 0.889344087154956 15.5491827798306 -14.6598386926757 T:C C T 10 0.555327956422522 1.97994922990032e-08 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 61600384 C/T 1 7 39 46 3.11270430504235 21.6577903004784 -18.545085995436 T:C C T 10 0.555327956422522 3.40378865114893e-08 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61600282_61600437:SERPINB10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 61602495 C/T 1 4 45 49 1.77868817430991 24.9897580390135 -23.2110698647036 T:C C T 10 0.555327956422522 3.44307737723110e-12 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61602072_61603345:SERPINB10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 71822419 T/C 1 16 22 38 7.11475269723965 12.2172150412955 -5.10246234405584 T:C T C 10 0.555327956422522 0.104141902689037 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71822380_71822442:C18orf55 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 15 15 30 6.67008065366217 8.32991934633783 -1.65983869267566 A:G G A 10 0.555327956422522 0.584377790818652 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 74091311 G/A 1 7 9 16 3.11270430504235 4.9979516078027 -1.88524730276035 A:G G A 10 0.555327956422522 0.451827358588768 ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 74092244 C/T 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 T:C C T 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 77067000 T/G 1 9 3 12 4.0020483921973 1.66598386926757 2.33606452292974 T:G T G 10 0.555327956422522 0.247371341375508 ENSG00000166377:ENST00000426216:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000359184:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000440332:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000307671:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000490210:exon_77066986_77067234:ATP9B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 77171061 T/G 1 19 7 26 8.44876882797208 3.88729569495765 4.56147313301443 T:G T G 10 0.555327956422522 0.0780579063446087 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 18 77477822 T/C 1 22 18 40 9.78278495870452 9.9959032156054 -0.213118256900879 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77477810_77478016:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77477810_77478016:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77477810_77478016:CTDP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 532066 C/T 1 28 29 57 12.4508172201694 16.1045107362531 -3.65369351608375 T:C C T 10 0.555327956422522 0.352536986672254 ENSG00000099804:ENST00000215574:exon_531733_532108:CDC34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 579627 C/T 1 144 377 521 64.0327742751568 209.358639571291 -145.325865296134 A:T:C C T 10 0.555327956422522 6.62332229063969e-38 ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 580388 C/G 1 217 501 718 96.4938334563127 278.219306167683 -181.725472711371 C:G C G 10 0.555327956422522 1.49198551327743e-42 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580379_580461:BSG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 348 144 492 154.745871164962 79.9672257248432 74.7786454401192 T:C T C 10 0.555327956422522 5.1655145538364e-12 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 621063 A/G 1 9 10 19 4.0020483921973 5.55327956422522 -1.55123117202792 A:G A G 10 0.555327956422522 0.496869552202761 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 621070 G/A 1 8 15 23 3.55737634861982 8.32991934633783 -4.77254299771801 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0578021904179636 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 621561 C/A 1 34 32 66 15.1188494816343 17.7704946055207 -2.65164512388645 A:C C A 10 0.555327956422522 0.537159979917104 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_621259_621846:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 621808 C/T 1 30 30 60 13.3401613073243 16.6598386926757 -3.31967738535132 T:C C T 10 0.555327956422522 0.436267769978803 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_621259_621846:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 880066 G/A 1 17 12 29 7.55942474081713 6.66393547707026 0.895489263746863 A:G G A 10 0.555327956422522 0.852446590248957 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 881602 G/A 1 26 23 49 11.5614731330144 12.772542997718 -1.21106986470358 A:G G A 10 0.555327956422522 0.77457305657742 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_881559_881714:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_881559_881714:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_881559_881714:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_881559_881714:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_881559_881714:MED16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 55 50 105 24.4569623967613 27.7663978211261 -3.30943542436481 A:G A G 10 0.555327956422522 0.556099256617859 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 984533 T/C 1 80 33 113 35.5737634861982 18.3258225619432 17.247940924255 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00119207361534204 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 990281 G/A 1 29 21 50 12.8954892637469 11.661887084873 1.2336021788739 A:G G A 10 0.555327956422522 0.777178932006747 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_990223_990364:WDR18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 56 81 137 24.9016344403388 44.9815644702243 -20.0799300298855 A:G A G 10 0.555327956422522 0.000740513342777577 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1036456 C/G 1 118 92 210 52.4713011421424 51.090171990872 1.38112915127039 C:G C G 10 0.555327956422522 0.889628868879634 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1036468 A/G 1 123 93 216 54.6946613600298 51.6454999472945 3.04916141273525 A:T:G A G 10 0.555327956422522 0.732201715908319 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1037941 G/T 1 70 30 100 31.1270430504235 16.6598386926757 14.4672043577478 T:G G T 10 0.555327956422522 0.00343507603201121 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1037624_1039060:CNN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1056492 G/C 1 9 2 11 4.0020483921973 1.11065591284504 2.89139247935226 C:G G C 10 0.555327956422522 0.126524523010841 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1056329_1056498:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1056329_1056498:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1056329_1056498:ABCA7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1074000 A/T 1 73 54 127 32.4610591811559 29.9877096468162 2.47334953433971 A:T A T 10 0.555327956422522 0.721163402709255 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1073947_1074013:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1073947_1074013:HMHA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1080189 G/C 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 C:G G C 10 0.555327956422522 1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1080311 G/C 1 127 143 270 56.4733495343397 79.4118977684206 -22.9385482340809 T:C:G G C 10 0.555327956422522 0.0057652170487921 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1080254_1080378:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1080254_1080378:HMHA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1081617 A/G 1 70 83 153 31.1270430504235 46.0922203830693 -14.9651773326459 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0180376219015764 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1081549_1081737:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1081549_1081737:HMHA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 90 69 159 40.020483921973 38.317628993154 1.70285492881901 A:G A G 10 0.555327956422522 0.811185005701972 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 31 55 86 13.7848333509018 30.5430376032387 -16.7582042523369 T:C C T 10 0.555327956422522 0.000308732802062713 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1095352 C/G 1 22 8 30 9.78278495870452 4.44262365138018 5.34016130732434 C:G C G 10 0.555327956422522 0.064765902659164 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1095355 C/T 1 18 2 20 8.0040967843946 1.11065591284504 6.89344087154956 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00131252059969926 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1110829 G/A 1 29 26 55 12.8954892637469 14.4385268669856 -1.54303760323871 A:G G A 10 0.555327956422522 0.686132872440229 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1110711_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1110744_1110887:SBNO2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1113701 G/A 1 25 30 55 11.116801089437 16.6598386926757 -5.54303760323871 A:G G A 10 0.555327956422522 0.137656286566486 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1113534_1113703:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1113534_1113703:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1113534_1113703:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1113534_1113703:SBNO2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1119019 C/T 1 16 22 38 7.11475269723965 12.2172150412955 -5.10246234405584 T:C C T 10 0.555327956422522 0.104141902689037 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1119010_1119163:SBNO2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1242048 C/T 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 T:C C T 10 0.555327956422522 0.597849528390556 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 40 46 86 17.7868817430991 25.545085995436 -7.75820425233689 T:C C T 10 0.555327956422522 0.103508696999937 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1360575 G/A 1 23 23 46 10.227457002282 12.772542997718 -2.54508599543601 A:G G A 10 0.555327956422522 0.46184947730117 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1360135_1361031:MUM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 63 47 110 28.0143387453811 26.1004139518585 1.91392479352259 T:C C T 10 0.555327956422522 0.773721185521241 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1615796 G/A 1 69 68 137 30.682371006846 37.7623010367315 -7.07993002988551 A:G G A 10 0.555327956422522 0.229696326391467 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1615284_1615820:TCF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1619333 G/A 1 78 10 88 34.6844193990433 5.55327956422522 29.1311398348181 A:G G A 10 0.555327956422522 3.67592936402348e-11 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1619348 G/A 1 69 5 74 30.682371006846 2.77663978211261 27.9057312247334 A:G G A 10 0.555327956422522 1.22820032809854e-12 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1619350 C/T 1 70 9 79 31.1270430504235 4.9979516078027 26.1290914426208 T:C C T 10 0.555327956422522 3.64714319866467e-10 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1821637 A/G 1 17 24 41 7.55942474081713 13.3278709541405 -5.7684462133234 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0834111646322127 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1821518_1821681:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1821518_1821681:REXO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1912817 C/T 0 15 0 15 6.67008065366217 0 6.67008065366217 C C 10 0.555327956422522 0.000251015038114268 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1990783 G/A 1 56 32 88 24.9016344403388 17.7704946055207 7.13113983481806 A:G G A 10 0.555327956422522 0.13402218958441 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1990716_1990821:BTBD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 33 44 77 14.6741774380568 24.434430082591 -9.76025264453419 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0289984402748869 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2041032 T/C 1 24 38 62 10.6721290458595 21.1024623440558 -10.4303332981964 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0100482643997936 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2078221 G/C 1 179 132 311 79.5962958003686 73.3032902477729 6.29300555259566 A:C:G G C 10 0.555327956422522 0.493793884524661 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 170 135 305 75.5942474081713 74.9692741170405 0.6249732911308 A:G A G 10 0.555327956422522 0.954124569397366 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 182 178 360 80.930311931101 98.8483762432089 -17.9180643121079 T:C T C 10 0.555327956422522 0.063302332555628 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2097986 T/C 1 4 7 11 1.77868817430991 3.88729569495765 -2.10860752064774 T:C T C 10 0.555327956422522 0.234416927909769 ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2098015 T/C 1 2 9 11 0.889344087154956 4.9979516078027 -4.10860752064774 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0150596095234126 ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 62 47 109 27.5696667018036 26.1004139518585 1.46925274994511 A:G G A 10 0.555327956422522 0.84728296212977 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 26 21 47 11.5614731330144 11.661887084873 -0.100413951858533 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2337468 G/A 1 17 15 32 7.55942474081713 8.32991934633783 -0.770494605520703 A:G G A 10 0.555327956422522 0.859436806449628 ENSG00000005206:ENST00000382189:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000432705:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2337442_2337624:AC004410.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 19 20 39 8.44876882797208 11.1065591284504 -2.65779030047836 A:C C A 10 0.555327956422522 0.422929473783178 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2433890 A/G 1 77 76 153 34.2397473554658 42.2049246881117 -7.96517733264586 A:G A G 10 0.555327956422522 0.222263020007365 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2433824_2433897:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2732741 G/A 1 26 19 45 11.5614731330144 10.5512311720279 1.01024196098651 A:G G A 10 0.555327956422522 0.880991898881775 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 28 37 65 12.4508172201694 20.5471343876333 -8.09631716746393 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0461971826478515 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2834808 T/C 1 1 8 9 0.444672043577478 4.44262365138018 -3.9979516078027 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0133428681828177 ENSG00000172006:ENST00000317243:exon_2833679_2836733:ZNF554 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2917186 T/C 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 T:C T C 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 2934282 T/C 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 T:C T C 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000175691:ENST00000444249:exon_2933536_2934388:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000341064:exon_2933536_2934393:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 3162909 C/T 1 32 19 51 14.2295053944793 10.5512311720279 3.67827422245138 T:C C T 10 0.555327956422522 0.326479481966488 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3162791_3163766:GNA15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 3186085 G/T 1 10 7 17 4.44672043577478 3.88729569495765 0.559424740817127 T:G G T 10 0.555327956422522 0.813340797660957 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3185875_3186212:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3185875_3186212:NCLN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 31 38 69 13.7848333509018 21.1024623440558 -7.31762899315402 T:C T C 10 0.555327956422522 0.089468340565546 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 59 61 120 26.2356505710712 33.8750053417738 -7.63935477070264 A:G A G 10 0.555327956422522 0.168823299419417 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4028783 C/T 1 21 11 32 9.33811291512704 6.10860752064774 3.2295053944793 T:C C T 10 0.555327956422522 0.288515045544524 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4028718_4028846:PIAS4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4033462 T/C 1 13 11 24 5.78073656650721 6.10860752064774 -0.327870954140527 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4033418_4033578:PIAS4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4101062 G/T 1 42 37 79 18.6762258302541 20.5471343876333 -1.87090855737924 T:G G T 10 0.555327956422522 0.734415823354662 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4100962_4101141:MAP2K2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4102449 G/A 1 54 61 115 24.0122903531838 33.8750053417738 -9.86271498859003 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0742593892458093 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4102374_4103202:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4102374_4102502:MAP2K2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4180836 C/T 1 9 9 18 4.0020483921973 4.9979516078027 -0.995903215605395 T:C C T 10 0.555327956422522 0.643952874691603 ENSG00000077463:ENST00000337491:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000305232:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000269860:exon_4180779_4180906:SIRT6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4352959 A/G 1 9 18 27 4.0020483921973 9.9959032156054 -5.99385482340809 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0311614405270642 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4362691 G/C 1 23 31 54 10.227457002282 17.2151666490982 -6.98770964681619 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0740604837010203 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4362609_4362733:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4362609_4362733:SH3GL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4454000 G/A 1 10 22 32 4.44672043577478 12.2172150412955 -7.7704946055207 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00699295240170062 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4457650 C/T 1 22 23 45 9.78278495870452 12.772542997718 -2.98975803901349 T:C C T 10 0.555327956422522 0.372989596784527 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4457612_4457694:UBXN6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4816241 G/A 1 59 37 96 26.2356505710712 20.5471343876333 5.68851618343789 A:G G A 10 0.555327956422522 0.259687207660512 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 63 41 104 28.0143387453811 22.7684462133234 5.24589253205772 T:C T C 10 0.555327956422522 0.324612564566305 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4847713 A/G 1 39 27 66 17.3422096995216 14.9938548234081 2.34835487611355 A:G A G 10 0.555327956422522 0.621069954440955 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4847874 A/G 1 52 40 92 23.1229462660289 22.2131182569009 0.909828009127981 A:G A G 10 0.555327956422522 0.916564606122637 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4852106 A/G 1 33 34 67 14.6741774380568 18.8811505183657 -4.20697308030897 A:C:G A G 10 0.555327956422522 0.326357614198786 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4929413 T/C 1 5 15 20 2.22336021788739 8.32991934633783 -6.10655912845044 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00669247932999867 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4929473 A/G 1 24 23 47 10.6721290458595 12.772542997718 -2.10041395185853 A:G A G 10 0.555327956422522 0.559655419240777 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 4930838 G/A 1 9 14 23 4.0020483921973 7.77459138991531 -3.77254299771801 A:G G A 10 0.555327956422522 0.141766408043743 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4930728_4930888:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4930728_4930888:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4930728_4930888:UHRF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 5110794 A/G 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000127663:ENST00000159111:exon_5110633_5110829:KDM4B;ENSG00000127663:ENST00000381759:exon_5110633_5110829:KDM4B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 5590291 G/T 1 43 49 92 19.1208978738316 27.2110698647036 -8.09017199087202 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0938974765101127 ENSG00000130254:ENST00000252542:exon_5590289_5590419:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000434962:exon_5590289_5590419:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000394625:exon_5590289_5590419:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000415313:exon_5590289_5590419:SAFB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 5616266 C/T 1 39 33 72 17.3422096995216 18.3258225619432 -0.983612862421584 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.813817640286669 ENSG00000130254:ENST00000252542:exon_5616143_5616346:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000434962:exon_5616123_5616346:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000394625:exon_5616109_5616346:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000415313:exon_5616143_5616346:SAFB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 5654449 G/A 1 81 87 168 36.0184355297757 48.3135322087594 -12.2950966789837 A:G G A 10 0.555327956422522 0.062262866199576 ENSG00000160633:ENST00000433404:exon_5654379_5654467:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000292123:exon_5654379_5654467:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000454510:exon_5654379_5654467:SAFB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 5692192 C/T 1 101 126 227 44.9118764013253 69.9713225092378 -25.0594461079125 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00102285741577638 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5691845_5692219:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5691846_5692219:LONP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 5696101 C/T 1 51 60 111 22.6782742224514 33.3196773853513 -10.6414031628999 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0449620578514796 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 5783905 G/A 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000212123:ENST00000390672:exon_5782971_5784610:PRR22;ENSG00000212123:ENST00000419421:exon_5782971_5784064:PRR22 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 18 12 30 8.0040967843946 6.66393547707026 1.34016130732434 A:G G A 10 0.555327956422522 0.714800037991546 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 5789565 T/C 1 12 6 18 5.33606452292974 3.33196773853513 2.0040967843946 T:C T C 10 0.555327956422522 0.477948616778315 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 6458240 G/C 1 22 21 43 9.78278495870452 11.661887084873 -1.87910212616845 C:G G C 10 0.555327956422522 0.645850639619903 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6458209_6458335:SLC25A23 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 565 537 1102 251.239704621275 298.211112598894 -46.9714079776192 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00479854959243195 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 6669934 G/A 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 A:G G A 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000125735:ENST00000245912:exon_6669862_6670169:TNFSF14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 6731057 T/C 1 35 10 45 15.5635215252117 5.55327956422522 10.0102419609865 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00246066669641414 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 7524855 C/T 1 11 14 25 4.89139247935226 7.77459138991531 -2.88319891056305 T:C C T 10 0.555327956422522 0.3145412245025 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7524789_7524880:ARHGEF18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 7584223 A/G 1 12 24 36 5.33606452292974 13.3278709541405 -7.99180643121079 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0108229843191116 ENSG00000198816:ENST00000361576:exon_7584091_7585912:ZNF358;ENSG00000198816:ENST00000394341:exon_7584088_7585911:ZNF358 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 7593729 G/A 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 A:G G A 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000090674:ENST00000264079:exon_7593707_7593856:MCOLN1;ENSG00000090674:ENST00000394321:exon_7593707_7593856:MCOLN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 7605566 C/T 1 23 28 51 10.227457002282 15.5491827798306 -5.32172577754862 T:C C T 10 0.555327956422522 0.158566252785769 ENSG00000032444:ENST00000221249:exon_7605516_7605596:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000414982:exon_7605516_7605596:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000450331:exon_7605516_7605596:PNPLA6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 64 31 95 28.4590107889586 17.2151666490982 11.2438441398604 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0227612234145998 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 67 41 108 29.793026919691 22.7684462133234 7.02458070636763 A:G A G 10 0.555327956422522 0.176970143621708 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 7712585 T/G 1 2 6 8 0.889344087154956 3.33196773853513 -2.44262365138018 T:G T G 10 0.555327956422522 0.150542848470395 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 7755056 G/A 1 145 283 428 64.4774463187343 157.157811667574 -92.6803653488394 A:G G A 10 0.555327956422522 2.41980478813231e-19 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7755045_7755151:FCER2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 7761812 A/G 1 3 12 15 1.33401613073243 6.66393547707026 -5.32991934633783 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00753835852794186 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 7976127 C/G 1 2 6 8 0.889344087154956 3.33196773853513 -2.44262365138018 C:G C G 10 0.555327956422522 0.150542848470395 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 8028646 G/A 1 112 110 222 49.8032688806775 61.0860752064774 -11.2828063257999 A:G G A 10 0.555327956422522 0.137326356944199 ENSG00000066044:ENST00000351593:exon_8023458_8028691:ELAVL1;ENSG00000066044:ENST00000407627:exon_8023458_8028691:ELAVL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 51 35 86 22.6782742224514 19.4364784747883 3.24179574766311 A:G G A 10 0.555327956422522 0.516191153703435 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 8468485 C/T 1 68 69 137 30.2376989632685 38.317628993154 -8.07993002988551 T:C C T 10 0.555327956422522 0.169760502214045 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 8486884 G/A 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8486607_8486900:MARCH2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 8576670 C/T 1 16 21 37 7.11475269723965 11.661887084873 -4.54713438763331 T:C C T 10 0.555327956422522 0.139568461922462 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8576501_8576844:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8576501_8576844:ZNF414 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 8578000 G/A 1 21 24 45 9.33811291512704 13.3278709541405 -3.98975803901349 A:G G A 10 0.555327956422522 0.234586818523213 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 8578118 A/G 1 14 18 32 6.22540861008469 9.9959032156054 -3.7704946055207 A:G A G 10 0.555327956422522 0.213585949813489 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 8578199 T/C 1 19 14 33 8.44876882797208 7.77459138991531 0.674177438056775 T:C T C 10 0.555327956422522 0.862490050438795 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 9267292 G/A 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 A:G G A 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000130803:ENST00000419608:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9267288_9267424:ZNF317 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 9271969 C/A 1 28 18 46 12.4508172201694 9.9959032156054 2.45491400456399 A:C C A 10 0.555327956422522 0.553511992484837 ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9270790_9274089:ZNF317 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 23 35 58 10.227457002282 19.4364784747883 -9.20902147250628 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0170834820188156 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 10220616 G/A 1 70 71 141 31.1270430504235 39.4282849059991 -8.30124185557559 A:G G A 10 0.555327956422522 0.175138149339089 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10220589_10220696:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10220589_10220696:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10220589_10220696:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10220589_10220696:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10220589_10220696:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10220589_10220696:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000466025:exon_10220589_10220696:PPAN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 19 30 49 8.44876882797208 16.6598386926757 -8.21106986470358 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0210704522762748 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 20 30 50 8.89344087154956 16.6598386926757 -7.7663978211261 A:C C A 10 0.555327956422522 0.032225891745934 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 10599965 G/A 1 21 21 42 9.33811291512704 11.661887084873 -2.32377416974592 A:G G A 10 0.555327956422522 0.535380009317526 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10599868_10600044:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10599868_10600044:KEAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 10668383 T/C 1 10 7 17 4.44672043577478 3.88729569495765 0.559424740817127 T:C T C 10 0.555327956422522 0.813340797660957 ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 43 23 66 19.1208978738316 12.772542997718 6.34835487611355 C:G C G 10 0.555327956422522 0.136924583818264 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 10671890 G/A 1 23 23 46 10.227457002282 12.772542997718 -2.54508599543601 A:G G A 10 0.555327956422522 0.46184947730117 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10671845_10671941:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10671845_10671941:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10671845_10671941:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10671845_10671941:KRI1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 17 26 43 7.55942474081713 14.4385268669856 -6.87910212616844 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0449619781161851 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 10676423 G/A 1 10 20 30 4.44672043577478 11.1065591284504 -6.65983869267566 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0165868446227244 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10676393_10676696:KRI1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 11034846 C/T 1 19 23 42 8.44876882797208 12.772542997718 -4.32377416974592 T:C C T 10 0.555327956422522 0.214174658638324 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 11105608 T/C 1 42 54 96 18.6762258302541 29.9877096468162 -11.3114838165621 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0235071896293269 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 11319491 G/A 1 10 3 13 4.44672043577478 1.66598386926757 2.78073656650721 A:G G A 10 0.555327956422522 0.164202722608268 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11319362_11319505:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11319362_11319505:DOCK6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 11326119 A/G 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 A:G A G 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11326063_11326147:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11326063_11326147:DOCK6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 11326125 C/T 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 T:C C T 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11326063_11326147:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11326063_11326147:DOCK6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 C:G G C 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 11892553 T/A 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 A:T T A 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000197044:ENST00000454339:exon_11890834_11894886:ZNF441;ENSG00000197044:ENST00000409902:exon_11890834_11893301:ZNF441;ENSG00000197044:ENST00000357901:exon_11890834_11894893:ZNF441 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 11943552 G/A 1 8 2 10 3.55737634861982 1.11065591284504 2.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 0.201545371859033 ENSG00000171295:ENST00000304060:exon_11942183_11946016:ZNF440 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 11979305 C/G 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 C:G C G 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000171291:ENST00000455282:exon_11978121_11980297:ZNF439;ENSG00000171291:ENST00000304030:exon_11978121_11980306:ZNF439 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 12256358 T/G 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 T:G T G 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000213297:ENST00000434822:exon_12256073_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000455799:exon_12255705_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000355738:exon_12255711_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000439556:exon_12256080_12257039:ZNF625 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 12541795 C/A 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:C C A 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000180855:ENST00000301547:exon_12540521_12542794:ZNF443;ENSG00000180855:ENST00000411622:exon_12541336_12542794:ZNF443 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 12800806 G/A 1 10 8 18 4.44672043577478 4.44262365138018 0.00409678439460492 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12800776_12800924:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12800776_12801014:FBXW9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 65 63 128 28.9036828325361 34.9856612546189 -6.08197842208281 T:C C T 10 0.555327956422522 0.286934908506544 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 278 274 552 123.618828114539 152.159860059771 -28.5410319452321 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0163947399300819 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 14024245 G/A 1 24 25 49 10.6721290458595 13.883198910563 -3.21106986470358 A:G G A 10 0.555327956422522 0.389814311107083 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14024217_14024451:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14024217_14024451:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14024217_14024451:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14024217_14024451:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14024217_14024451:CC2D1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 14030689 T/C 1 18 12 30 8.0040967843946 6.66393547707026 1.34016130732434 T:C T C 10 0.555327956422522 0.714800037991546 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14030631_14030764:CC2D1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 14231243 C/T 1 125 82 207 55.5840054471848 45.5368924266468 10.0471130205379 T:C C T 10 0.555327956422522 0.162651378965829 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 14231325 C/G 1 112 77 189 49.8032688806775 42.7602526445342 7.04301623614334 C:G C G 10 0.555327956422522 0.306768193674696 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 14231330 A/G 1 113 79 192 50.247940924255 43.8709085573792 6.37703236687578 A:G A G 10 0.555327956422522 0.383723655623129 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 14492265 T/C 1 13 10 23 5.78073656650721 5.55327956422522 0.227457002281995 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 14492272 T/C 1 17 17 34 7.55942474081713 9.44057525918287 -1.88115051836575 T:C T C 10 0.555327956422522 0.605422040477597 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 14580776 G/A 1 85 89 174 37.7971237040856 49.4241881216045 -11.6270644175188 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.0795427656954105 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580724_14580800:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580724_14580800:PKN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 14582468 G/A 1 87 82 169 38.6864677912406 45.5368924266468 -6.85042463540621 A:G G A 10 0.555327956422522 0.314387979178014 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 1 4 9 13 1.77868817430991 4.9979516078027 -3.21926343349279 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0940602799732446 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 29 20 49 12.8954892637469 11.1065591284504 1.78893013529642 A:G G A 10 0.555327956422522 0.667619460958624 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 14682804 G/C 1 40 40 80 17.7868817430991 22.2131182569009 -4.42623651380175 C:G G C 10 0.555327956422522 0.368233186486957 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14682701_14682886:NDUFB7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 31 14 45 13.7848333509018 7.77459138991531 6.01024196098651 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0737031011687068 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 24 15 39 10.6721290458595 8.32991934633783 2.34220969952164 A:G G A 10 0.555327956422522 0.520690575426974 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 15229993 A/G 1 18 24 42 8.0040967843946 13.3278709541405 -5.32377416974592 A:C:G A G 10 0.555327956422522 0.119927124185076 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 8 15 23 3.55737634861982 8.32991934633783 -4.77254299771801 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0578021904179636 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 16631322 T/C 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C T C 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000105072:ENST00000221671:exon_16630905_16632163:C19orf44 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 16633950 T/C 1 19 33 52 8.44876882797208 18.3258225619432 -9.87705373397114 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00749307665088232 ENSG00000085872:ENST00000198939:exon_16633863_16634101:CHERP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 16790859 C/T 1 11 13 24 4.89139247935226 7.21926343349279 -2.32787095414053 T:C C T 10 0.555327956422522 0.412507168985383 ENSG00000072954:ENST00000187762:exon_16790795_16790951:TMEM38A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 16976289 T/C 1 19 6 25 8.44876882797208 3.33196773853513 5.11680108943695 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0442424474389262 ENSG00000127511:ENST00000379803:exon_16976221_16976459:SIN3B;ENSG00000127511:ENST00000248054:exon_16976221_16976459:SIN3B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 17000778 C/T 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:C C T 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000127533:ENST00000248076:exon_17000384_17002830:F2RL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 9 11 20 4.0020483921973 6.10860752064774 -2.10655912845044 T:C C T 10 0.555327956422522 0.374427217398125 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 17330060 T/C 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 T:C T C 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000053501:ENST00000263897:exon_17330022_17330196:USE1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 17337871 A/G 1 15 5 20 6.67008065366217 2.77663978211261 3.89344087154956 A:G A G 10 0.555327956422522 0.113443509114618 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 17337882 C/G 1 17 5 22 7.55942474081713 2.77663978211261 4.78278495870452 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0518516835843347 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 17339112 G/A 1 19 19 38 8.44876882797208 10.5512311720279 -2.10246234405583 A:G G A 10 0.555327956422522 0.517033830009147 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17339065_17339118:OCEL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 17412218 C/T 1 20 6 26 8.89344087154956 3.33196773853513 5.56147313301443 T:C C T 10 0.555327956422522 0.030067450712797 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 17448961 A/C 1 16 8 24 7.11475269723965 4.44262365138018 2.67212904585947 A:C A C 10 0.555327956422522 0.309745230341374 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17448817_17449064:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17448817_17449064:GTPBP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 17450016 T/C 1 7 20 27 3.11270430504235 11.1065591284504 -7.99385482340809 T:C:G T C 10 0.555327956422522 0.00290260598307539 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 17451981 G/A 1 10 10 20 4.44672043577478 5.55327956422522 -1.10655912845044 A:G G A 10 0.555327956422522 0.657502601953682 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17451853_17452131:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17451853_17452131:GTPBP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 44 34 78 19.565569917409 18.8811505183657 0.684419399043286 A:G A G 10 0.555327956422522 0.909706736013773 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 17837090 C/T 1 23 21 44 10.227457002282 11.661887084873 -1.43443008259097 T:C C T 10 0.555327956422522 0.761995935351521 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 17837512 G/A 1 39 41 80 17.3422096995216 22.7684462133234 -5.42623651380176 A:G G A 10 0.555327956422522 0.260479359624725 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 17838236 A/G 1 31 46 77 13.7848333509018 25.545085995436 -11.7602526445342 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00809577300043598 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 17886940 G/A 1 8 4 12 3.55737634861982 2.22131182569009 1.33606452292974 A:G G A 10 0.555327956422522 0.56621841747708 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17886792_17886970:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17886792_17886970:FCHO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18186575 G/A 1 10 12 22 4.44672043577478 6.66393547707026 -2.21721504129548 A:G G A 10 0.555327956422522 0.393799982731658 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18186618 T/C 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 T:C T C 10 0.555327956422522 0.605558868068935 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18191664 C/G 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 C:G C G 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18191642_18191811:IL12RB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18234441 C/T 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 T:C C T 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18234390_18234465:MAST3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18245512 C/T 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 T:C C T 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18245389_18245521:MAST3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18255359 G/A 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18255276_18255503:MAST3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18288069 A/G 1 855 776 1631 380.194597258744 430.934494183877 -50.7398969251333 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0118453509999725 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18497141 T/A 1 4 20 24 1.77868817430991 11.1065591284504 -9.32787095414053 A:T T A 10 0.555327956422522 0.000123025629203507 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18499422 C/G 1 9 1 10 4.0020483921973 0.555327956422522 3.44672043577478 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0504158529035674 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18538742 A/C 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 A:C A C 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000130511:ENST00000348495:exon_18538708_18538792:SSBP4;ENSG00000130511:ENST00000270061:exon_18538708_18538792:SSBP4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18546678 T/C 1 22 26 48 9.78278495870452 14.4385268669856 -4.65574190828105 T:C T C 10 0.555327956422522 0.192526491235171 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18546567_18546731:ISYNA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18679379 C/G 1 62 68 130 27.5696667018036 37.7623010367315 -10.1926343349279 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0775975599830185 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 1 80 3 83 35.5737634861982 1.66598386926757 33.9077796169307 A:T:C C A 10 0.555327956422522 4.74553437113757e-17 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18685964 G/T 1 1324 1034 2358 588.745785696581 574.209106940888 14.5366787556932 A:T:G G T 10 0.555327956422522 0.561802919243598 ENSG00000221983:ENST00000430157:exon_18685867_18688269:UBA52;ENSG00000221983:ENST00000442744:exon_18685867_18688269:UBA52 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18775077 C/T 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 T:C C T 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000167487:ENST00000431920:exon_18775071_18775253:KLHL26;ENSG00000167487:ENST00000300976:exon_18775071_18775253:KLHL26 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 18965450 G/T 1 26 20 46 11.5614731330144 11.1065591284504 0.454914004563991 T:G G T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000005007:ENST00000262803:exon_18965410_18965518:UPF1;ENSG00000005007:ENST00000418384:exon_18965410_18965518:UPF1;ENSG00000005007:ENST00000447615:exon_18965410_18965518:UPF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 19120728 G/C 1 34 46 80 15.1188494816343 25.545085995436 -10.4262365138018 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0238778960456883 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000456085:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19120664_19121151:SUGP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 19312496 C/G 1 71 51 122 31.5717150940009 28.3217257775486 3.24998931645232 C:G C G 10 0.555327956422522 0.585401616782381 ENSG00000064490:ENST00000353145:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000303088:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000456252:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000407360:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000392324:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000184162:ENST00000331552:exon_19312226_19312850:NR2C2AP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 37 41 78 16.4528656123667 22.7684462133234 -6.31558060095671 A:G G A 10 0.555327956422522 0.171457997609318 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 19648346 G/C 1 5 10 15 2.22336021788739 5.55327956422522 -3.32991934633783 C:G G C 10 0.555327956422522 0.117258617190494 ENSG00000250067:ENST00000458210:exon_19648121_19648387:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000514277:exon_19648121_19648390:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000436027:exon_19648128_19648393:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000397179:exon_19648128_19648393:YJEFN3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 19740729 C/G 1 118 97 215 52.4713011421424 53.8668117729846 -1.39551063084222 C:G C G 10 0.555327956422522 0.89088167787844 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 19767899 T/C 1 18 19 37 8.0040967843946 10.5512311720279 -2.54713438763331 T:C T C 10 0.555327956422522 0.41275461605703 ENSG00000105726:ENST00000291503:exon_19767803_19767958:ATP13A1;ENSG00000105726:ENST00000357324:exon_19767803_19767958:ATP13A1;ENSG00000105726:ENST00000474955:exon_19767803_19767958:ATP13A1;ENSG00000105726:ENST00000492774:exon_19767695_19767958:ATP13A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 19790159 A/C 1 21 24 45 9.33811291512704 13.3278709541405 -3.98975803901349 A:C A C 10 0.555327956422522 0.234586818523213 ENSG00000181896:ENST00000318110:exon_19789990_19791412:ZNF101;ENSG00000181896:ENST00000415440:exon_19789990_19791412:ZNF101 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 20003576 C/G 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 C:G C G 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 21477379 C/T 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000182141:ENST00000356929:exon_21473963_21477541:ZNF708 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 21477431 T/C 1 2 9 11 0.889344087154956 4.9979516078027 -4.10860752064774 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0150596095234126 ENSG00000182141:ENST00000356929:exon_21473963_21477541:ZNF708 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 21909733 C/T 1 16 4 20 7.11475269723965 2.22131182569009 4.89344087154956 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0401781588255163 ENSG00000197020:ENST00000358296:exon_21906844_21910791:ZNF100;ENSG00000197020:ENST00000445015:exon_21906844_21910791:ZNF100 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 19 28 47 8.44876882797208 15.5491827798306 -7.10041395185853 A:G G A 10 0.555327956422522 0.040270057800337 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 32873698 A/G 1 25 16 41 11.116801089437 8.88524730276035 2.2315537866766 A:G A G 10 0.555327956422522 0.53214987030037 ENSG00000168813:ENST00000355898:exon_32873623_32878572:ZNF507;ENSG00000168813:ENST00000311921:exon_32873623_32878572:ZNF507 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 33096786 G/A 1 14 5 19 6.22540861008469 2.77663978211261 3.44876882797208 A:G G A 10 0.555327956422522 0.164530353380396 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 21 14 35 9.33811291512704 7.77459138991531 1.56352152521173 T:C C T 10 0.555327956422522 0.615320962333974 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 11 9 20 4.89139247935226 4.9979516078027 -0.106559128450439 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 33117666 T/C 1 11 6 17 4.89139247935226 3.33196773853513 1.55942474081713 T:C T C 10 0.555327956422522 0.477388500584111 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33117618_33117733:ANKRD27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 33183291 G/A 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 A:G G A 10 0.555327956422522 0.605558868068935 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 33467515 T/C 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 33882222 G/A 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 A:G G A 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33882201_33882385:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33882201_33882385:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33882201_33882385:PEPD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 34884832 G/A 1 434 316 750 192.987666912625 175.483634229517 17.5040326831085 A:G G A 10 0.555327956422522 0.211569805066054 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34884819_34884971:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34884819_34884971:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34884819_34884971:GPI HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 35175775 C/T 1 15 7 22 6.67008065366217 3.88729569495765 2.78278495870452 T:C C T 10 0.555327956422522 0.285994739228917 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 35660508 G/A 1 299 287 586 132.956941029666 159.379123493264 -26.4221824635979 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0305839925147768 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35660469_35660536:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 35757427 G/A 1 42 37 79 18.6762258302541 20.5471343876333 -1.87090855737924 A:G G A 10 0.555327956422522 0.734415823354662 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35757262_35757435:LSR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 35758261 C/T 1 54 31 85 24.0122903531838 17.2151666490982 6.79712370408564 T:C C T 10 0.555327956422522 0.156018030040462 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35758012_35758637:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35758012_35758637:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35758012_35758637:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35758012_35758637:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35758012_35758637:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35758012_35758637:LSR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 35836530 G/A 1 277 229 506 123.174156070961 127.170102020758 -3.99594594979611 A:G G A 10 0.555327956422522 0.720716335173064 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35836505_35836623:CD22 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 35836600 C/A 1 183 186 369 81.3749839746785 103.290999894589 -21.9160159199106 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0241795366571569 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35836505_35836623:CD22 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 9 13 22 4.0020483921973 7.21926343349279 -3.21721504129548 A:G A G 10 0.555327956422522 0.199625660043352 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 36218478 C/T 1 14 14 28 6.22540861008469 7.77459138991531 -1.54918277983062 T:C C T 10 0.555327956422522 0.573526479524123 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36218339_36218523:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36218339_36218523:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36218339_36218523:AD000671.3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 36224705 A/G 1 20 17 37 8.89344087154956 9.44057525918287 -0.547134387633312 A:G A G 10 0.555327956422522 0.869997748652473 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 36259415 G/A 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 A:G G A 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36259306_36260077:C19orf55;ENSG00000167595:ENST00000396908:exon_36259306_36259447:C19orf55 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 36268771 C/T 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36268726_36268810:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36268726_36268810:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36268726_36268810:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000221905:exon_36268726_36268810:ARHGAP33 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 36530428 G/A 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000161277:ENST00000292894:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000392182:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000522483:exon_36530225_36530620:THAP8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 36727365 G/A 1 75 86 161 33.3504032683108 47.7582042523369 -14.407800984026 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0261116039562622 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 37004938 T/C 1 12 10 22 5.33606452292974 5.55327956422522 -0.217215041295483 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 37038416 T/C 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 T:C T C 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 37039069 A/C 1 6 8 14 2.66803226146487 4.44262365138018 -1.77459138991531 A:C A C 10 0.555327956422522 0.423022312731772 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 37853375 T/C 1 22 21 43 9.78278495870452 11.661887084873 -1.87910212616845 T:C T C 10 0.555327956422522 0.645850639619903 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853011_37853489:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 22 24 46 9.78278495870452 13.3278709541405 -3.54508599543601 T:G G T 10 0.555327956422522 0.302665007003409 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 37854288 G/A 1 17 21 38 7.55942474081713 11.661887084873 -4.10246234405584 A:G G A 10 0.555327956422522 0.194191222889409 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39086580 A/G 1 68 93 161 30.2376989632685 51.6454999472945 -21.407800984026 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00081977644137381 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 71 76 147 31.5717150940009 42.2049246881117 -10.6332095941107 T:C T C 10 0.555327956422522 0.081579248717722 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39098707 A/C 1 1 7 8 0.444672043577478 3.88729569495765 -3.44262365138018 A:C A C 10 0.555327956422522 0.0258462190222723 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39098766 G/A 1 58 67 125 25.7909785274937 37.206973080309 -11.4159945528152 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0473042254115724 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39098752_39098810:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39098752_39098810:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39098752_39098810:MAP4K1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39224413 A/G 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 A:G A G 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000182472:ENST00000328867:exon_39224343_39224421:CAPN12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39307103 C/T 1 140 119 259 62.2540861008469 66.0840268142801 -3.82994071343318 T:C C T 10 0.555327956422522 0.661754969274331 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39307093_39307163:ECH1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39329520 G/A 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 A:G G A 10 0.555327956422522 0.759189275590932 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39338125 G/A 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.121065279657040 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39362311 G/A 1 17 11 28 7.55942474081713 6.10860752064774 1.45081722016938 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.704654895104891 ENSG00000187994:ENST00000340740:exon_39362287_39362351:RINL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39416887 C/T 1 13 10 23 5.78073656650721 5.55327956422522 0.227457002281995 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39416845_39416940:FBXO17 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39820242 G/A 1 129 64 193 57.3626936214947 35.5409892110414 21.8217044104533 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00176999378164369 ENSG00000130755:ENST00000253054:exon_39820184_39820266:GMFG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39874134 C/T 1 12 4 16 5.33606452292974 2.22131182569009 3.11475269723965 T:C C T 10 0.555327956422522 0.136543787545186 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39888390 G/C 1 41 50 91 18.2315537866766 27.7663978211261 -9.5348440344495 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0455774631342322 ENSG00000063322:ENST00000315588:exon_39888097_39891201:MED29;ENSG00000063322:ENST00000435462:exon_39888167_39888397:MED29 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39907036 C/T 1 10 13 23 4.44672043577478 7.21926343349279 -2.772542997718 T:C C T 10 0.555327956422522 0.295526802222298 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000451354:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39906988_39907054:PLEKHG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39908574 C/T 1 12 7 19 5.33606452292974 3.88729569495765 1.44876882797208 T:C C T 10 0.555327956422522 0.645874384560469 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000478523:exon_39908485_39908745:PLEKHG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 26 30 56 11.5614731330144 16.6598386926757 -5.09836555966123 A:G G A 10 0.555327956422522 0.180472409455814 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 12 13 25 5.33606452292974 7.21926343349279 -1.88319891056305 A:G G A 10 0.555327956422522 0.547039280437458 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 17 17 34 7.55942474081713 9.44057525918287 -1.88115051836575 C:G C G 10 0.555327956422522 0.605422040477597 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39923952 G/A 1 2889 3001 5890 1284.65753389533 1666.53919722399 -381.881663328654 A:T:C:G G A 10 0.555327956422522 1.91320960824239e-23 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39923852_39924058:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39923852_39924058:RPS16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39924129 T/C 1 12 17 29 5.33606452292974 9.44057525918287 -4.10451073625314 T:C T C 10 0.555327956422522 0.137511299610045 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 39963828 T/A 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 A:T T A 10 0.555327956422522 0.479662189097226 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 40030704 C/T 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 T:C C T 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 40316901 G/A 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000105204:ENST00000323039:exon_40316820_40316926:DYRK1B;ENSG00000105204:ENST00000430012:exon_40316820_40316926:DYRK1B;ENSG00000105204:ENST00000348817:exon_40316820_40316926:DYRK1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 40744854 G/A 1 52 50 102 23.1229462660289 27.7663978211261 -4.64345155509724 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0.370915235541039 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40744812_40744880:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40744812_40745407:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40744812_40744880:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000311278:exon_40744812_40744880:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000424901:exon_40744812_40744880:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000391845:exon_40744812_40744880:AKT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 40928944 A/G 1 10 19 29 4.44672043577478 10.5512311720279 -6.10451073625314 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0251377380545549 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 40964312 G/A 1 14 15 29 6.22540861008469 8.32991934633783 -2.10451073625314 A:G G A 10 0.555327956422522 0.459182512082066 ENSG00000090013:ENST00000263368:exon_40964288_40964452:BLVRB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 41128309 C/T 1 10 13 23 4.44672043577478 7.21926343349279 -2.772542997718 T:C C T 10 0.555327956422522 0.295526802222298 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41128306_41128572:LTBP4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 41129842 C/T 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41129841_41129987:LTBP4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 41889748 T/C 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41889620_41889985:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41889466_41889985:TMEM91 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 46 28 74 20.454914004564 15.5491827798306 4.90573122473337 A:G G A 10 0.555327956422522 0.292621525333338 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 89 53 142 39.5758118783955 29.4323816903937 10.1434301880019 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0915026167107526 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 83 83 166 36.9077796169307 46.0922203830693 -9.18444076613865 A:G A G 10 0.555327956422522 0.160042684705858 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 41939297 C/G 1 16 16 32 7.11475269723965 8.88524730276035 -1.7704946055207 C:G C G 10 0.555327956422522 0.595024882931205 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 21 22 43 9.33811291512704 12.2172150412955 -2.87910212616845 T:C T C 10 0.555327956422522 0.443426847321452 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 27 42 69 12.0061451765919 23.3237741697459 -11.317628993154 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00736086849072765 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 43999432 A/T 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 A:T A T 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43999408_43999491:PHLDB3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 44001345 C/T 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 T:C C T 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_44001270_44001431:PHLDB3;ENSG00000176531:ENST00000314735:exon_44000186_44001431:PHLDB3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 44098963 C/G 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 C:G C G 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000167378:ENST00000422989:exon_44098961_44099492:IRGQ;ENSG00000167378:ENST00000300809:exon_44098961_44099676:IRGQ HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 44610798 A/T 1 12 7 19 5.33606452292974 3.88729569495765 1.44876882797208 A:T A T 10 0.555327956422522 0.645874384560469 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 44610843 C/T 1 14 6 20 6.22540861008469 3.33196773853513 2.89344087154956 T:C C T 10 0.555327956422522 0.261033291477746 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 12 9 21 5.33606452292974 4.9979516078027 0.338112915127039 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 44611420 A/G 1 13 7 20 5.78073656650721 3.88729569495765 1.89344087154956 A:G A G 10 0.555327956422522 0.501729600552412 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 10 22 32 4.44672043577478 12.2172150412955 -7.7704946055207 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00699295240170062 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 12 21 33 5.33606452292974 11.661887084873 -6.32582256194323 A:T A T 10 0.555327956422522 0.0343656255017199 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 13 15 28 5.78073656650721 8.32991934633783 -2.54918277983062 A:G A G 10 0.555327956422522 0.347681760793844 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 44792969 G/A 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 A:G G A 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000159917:ENST00000391957:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000433015:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000291182:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000359844:exon_44792291_44793353:ZNF235 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 44981318 G/A 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 44981525 G/A 1 7 12 19 3.11270430504235 6.66393547707026 -3.55123117202792 A:G G A 10 0.555327956422522 0.110901602972419 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 44981883 C/G 1 5 14 19 2.22336021788739 7.77459138991531 -5.55123117202792 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0183760951760472 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 45490570 A/G 1 19 15 34 8.44876882797208 8.32991934633783 0.118849481634253 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 45490618 G/A 1 31 24 55 13.7848333509018 13.3278709541405 0.456962396761291 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 34 30 64 15.1188494816343 16.6598386926757 -1.54098921104141 T:C T C 10 0.555327956422522 0.707683831748983 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 38 21 59 16.8975376559442 11.661887084873 5.2356505710712 A:C A C 10 0.555327956422522 0.19100801567642 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 46 20 66 20.454914004564 11.1065591284504 9.34835487611355 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0250822078793183 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 32 16 48 14.2295053944793 8.88524730276035 5.34425809171895 A:G G A 10 0.555327956422522 0.146112547120248 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 45923653 A/G 1 32 36 68 14.2295053944793 19.9918064312108 -5.76230103673149 A:G A G 10 0.555327956422522 0.179679504464696 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 46027125 G/A 1 124 139 263 55.1393334036073 77.1905859427306 -22.0512525391233 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0.00751362019396077 ENSG00000125753:ENST00000245932:exon_46027099_46027135:VASP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 46124517 C/T 1 28 19 47 12.4508172201694 10.5512311720279 1.89958604814147 T:C C T 10 0.555327956422522 0.6604821888971 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46124465_46124590:EML2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 46129999 C/A 1 20 28 48 8.89344087154956 15.5491827798306 -6.65574190828105 A:C:G C A 10 0.555327956422522 0.0592121200806577 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46129963_46130097:EML2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 46216642 G/T 1 9 17 26 4.0020483921973 9.44057525918287 -5.43852686698557 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0463758134411358 ENSG00000177051:ENST00000317683:exon_46213887_46216831:FBXO46 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 46269076 G/A 1 8 2 10 3.55737634861982 1.11065591284504 2.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 0.201545371859033 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 46269313 G/C 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 C:G G C 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 46319415 G/C 1 47 52 99 20.8995860481415 28.8770537339711 -7.97746768582967 C:G G C 10 0.555327956422522 0.128858554556893 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46319109_46319441:SYMPK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 46327053 C/T 1 43 36 79 19.1208978738316 19.9918064312108 -0.870908557379234 T:C C T 10 0.555327956422522 0.909971647098023 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46327025_46327133:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46327025_46327133:SYMPK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 46330809 G/A 1 47 51 98 20.8995860481415 28.3217257775486 -7.42213972940715 A:G G A 10 0.555327956422522 0.154399211020508 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46330768_46330881:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46330768_46330881:SYMPK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 46375779 C/T 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000170608:ENST00000302177:exon_46375333_46377054:FOXA3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 46376217 C/A 1 9 6 15 4.0020483921973 3.33196773853513 0.670080653662171 A:C C A 10 0.555327956422522 0.799910806218814 ENSG00000170608:ENST00000302177:exon_46375333_46377054:FOXA3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 46857015 C/T 1 61 45 106 27.1249946582262 24.9897580390135 2.13523661921267 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.696998995373935 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46857005_46857164:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46857005_46857246:PPP5C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 47124714 T/G 1 1 7 8 0.444672043577478 3.88729569495765 -3.44262365138018 T:G T G 10 0.555327956422522 0.0258462190222723 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 47569826 G/A 0 31 0 31 13.7848333509018 0 13.7848333509018 G G 10 0.555327956422522 2.14455794830087e-08 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47567449_47571126:ZC3H4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 47575039 A/G 1 20 19 39 8.89344087154956 10.5512311720279 -1.65779030047836 A:G A G 10 0.555327956422522 0.630873243834767 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47575035_47575378:ZC3H4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 47768128 G/C 1 20 15 35 8.89344087154956 8.32991934633783 0.563521525211732 C:G G C 10 0.555327956422522 0.867078000918724 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47768030_47768203:CCDC9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 47770015 A/C 1 19 18 37 8.44876882797208 9.9959032156054 -1.54713438763331 A:C A C 10 0.555327956422522 0.623331482289855 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 31 10 41 13.7848333509018 5.55327956422522 8.2315537866766 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0111495312100684 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 47858424 G/A 1 4 11 15 1.77868817430991 6.10860752064774 -4.32991934633783 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0349050371317493 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47858296_47858607:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47858296_47858607:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47858296_47858607:DHX34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 47865911 A/G 1 10 11 21 4.44672043577478 6.10860752064774 -1.66188708487296 A:G A G 10 0.555327956422522 0.514389688550212 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47865733_47865950:DHX34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 47876896 G/A 1 11 13 24 4.89139247935226 7.21926343349279 -2.32787095414053 A:G G A 10 0.555327956422522 0.412507168985383 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47876856_47876957:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47876856_47876957:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47876856_47876957:DHX34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 47879279 G/A 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47879181_47879354:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47879181_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47879181_47879354:DHX34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 47978671 G/A 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 48205725 T/C 1 11 6 17 4.89139247935226 3.33196773853513 1.55942474081713 T:C T C 10 0.555327956422522 0.477388500584111 ENSG00000063169:ENST00000396720:exon_48204585_48206534:GLTSCR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 48551546 A/T 1 7 1 8 3.11270430504235 0.555327956422522 2.55737634861982 A:T A T 10 0.555327956422522 0.0837859633971926 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48551104_48551645:PLA2G4C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 48558286 G/A 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 A:G G A 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48558135_48558306:PLA2G4C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 48601454 T/C 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 T:C T C 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48601396_48601516:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48601364_48601516:PLA2G4C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 48608598 C/G 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 C:G C G 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48608590_48608701:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48608590_48608701:PLA2G4C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 26 26 52 11.5614731330144 14.4385268669856 -2.87705373397114 C:G C G 10 0.555327956422522 0.485828284509982 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 48654553 G/T 1 24 18 42 10.6721290458595 9.9959032156054 0.676225830254078 T:C:G G T 10 0.555327956422522 0.87768344949826 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48654489_48654596:LIG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 48668830 G/A 1 25 20 45 11.116801089437 11.1065591284504 0.0102419609865123 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48668807_48668880:LIG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 48863386 C/T 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 T:C C T 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48863329_48863433:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48863329_48863433:TMEM143 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 48954395 C/T 1 8 22 30 3.55737634861982 12.2172150412955 -8.65983869267566 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00159536841134447 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48954291_48954488:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48954291_48954488:GRWD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 49376584 G/A 1 57 53 110 25.3463064839162 29.4323816903937 -4.08607520647742 A:G G A 10 0.555327956422522 0.444061118486095 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 11 2 13 4.89139247935226 1.11065591284504 3.78073656650721 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0478368011171907 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 49949589 A/T 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 A:T A T 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 49950298 C/T 1 54 51 105 24.0122903531838 28.3217257775486 -4.30943542436481 T:C C T 10 0.555327956422522 0.432448705197841 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 49950356 C/G 1 53 45 98 23.5676183096063 24.9897580390135 -1.42213972940715 C:G C G 10 0.555327956422522 0.839043560231929 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 80 53 133 35.5737634861982 29.4323816903937 6.14138179580458 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.296212678281101 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 79 50 129 35.1290914426208 27.7663978211261 7.36269362149466 T:G T G 10 0.555327956422522 0.214902913112469 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 49964977 C/G 1 17 1 18 7.55942474081713 0.555327956422522 7.0040967843946 C:G C G 10 0.555327956422522 0.000509965893580259 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 49965173 A/T 1 8 9 17 3.55737634861982 4.9979516078027 -1.44057525918287 A:T A T 10 0.555327956422522 0.626853565320545 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49965141_49965293:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 49967680 G/A 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 A:G G A 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967674_49967779:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967674_49967779:ALDH16A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 50183788 G/A 1 245 270 515 108.944650676482 149.938548234081 -40.9938975575988 A:G G A 10 0.555327956422522 0.000320802406328170 ENSG00000126457:ENST00000529284:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000532489:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000527382:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000528623:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000534465:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000391851:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000534280:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000351853:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000419451:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000449059:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000534676:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000454376:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000525616:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000524771:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000408976:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000529836:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000526224:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000527412:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000391849:exon_50183744_50183845:PRMT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 50310466 G/A 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50310126_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50310150_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50310154_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50310177_50310631:FUZ HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 17 22 39 7.55942474081713 12.2172150412955 -4.65779030047836 T:C T C 10 0.555327956422522 0.148270380292886 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 50387729 C/T 1 29 33 62 12.8954892637469 18.3258225619432 -5.43033329819636 T:C C T 10 0.555327956422522 0.200917871024585 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50387716_50387816:TBC1D17 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 50435747 T/C 1 229 120 349 101.829897979242 66.6393547707026 35.1905432085398 T:C T C 10 0.555327956422522 0.000155464432251617 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 50435998 C/T 1 214 116 330 95.1598173255803 64.4180429450125 30.7417743805677 T:C C T 10 0.555327956422522 0.000705076178243237 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 29 35 64 12.8954892637469 19.4364784747883 -6.54098921104141 A:G G A 10 0.555327956422522 0.103494926671385 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 51728641 A/G 1 2 9 11 0.889344087154956 4.9979516078027 -4.10860752064774 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0150596095234126 ENSG00000105383:ENST00000262262:exon_51728474_51728854:CD33 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 51850290 G/A 1 26 37 63 11.5614731330144 20.5471343876333 -8.98566125461888 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0303275811648683 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 52089982 C/G 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 C:G C G 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000105497:ENST00000262259:exon_52089880_52092993:ZNF175 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 52394954 T/C 1 10 4 14 4.44672043577478 2.22131182569009 2.22540861008469 T:C T C 10 0.555327956422522 0.288383222971717 ENSG00000198093:ENST00000354957:exon_52392489_52395150:ZNF649 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 52468587 G/T 1 8 1 9 3.55737634861982 0.555327956422522 3.0020483921973 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0495403730021064 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391795:exon_52468203_52468835:ZNF615 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 52469168 C/G 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 C:G C G 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 52471872 A/G 1 3 11 14 1.33401613073243 6.10860752064774 -4.77459138991531 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0135137734901899 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 52496149 C/T 1 8 10 18 3.55737634861982 5.55327956422522 -1.9959032156054 T:C C T 10 0.555327956422522 0.354494673636837 ENSG00000197619:ENST00000376716:exon_52494588_52498090:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000354939:exon_52494748_52498090:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391793:exon_52496133_52496567:ZNF615 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 52506985 T/C 1 8 1 9 3.55737634861982 0.555327956422522 3.0020483921973 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0495403730021064 ENSG00000197619:ENST00000376716:exon_52506950_52507153:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000354939:exon_52506950_52507153:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391793:exon_52506950_52507153:ZNF615 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 52519608 C/T 1 11 20 31 4.89139247935226 11.1065591284504 -6.21516664909818 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0294966063556148 ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 52520607 C/T 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:C C T 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000142556:ENST00000356322:exon_52520370_52520612:ZNF614;ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 52537576 T/G 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 T:G T G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000197619:ENST00000221315:exon_52536361_52538693:ZNF615 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 52619065 T/C 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000204611:ENST00000330123:exon_52617654_52620277:ZNF616 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 53268810 G/A 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 53269486 C/T 1 12 10 22 5.33606452292974 5.55327956422522 -0.217215041295483 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 53269614 G/A 1 14 10 24 6.22540861008469 5.55327956422522 0.672129045859473 A:G G A 10 0.555327956422522 0.839730194130565 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 53571306 T/C 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 T:C T C 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 53577419 G/C 1 9 10 19 4.0020483921973 5.55327956422522 -1.55123117202792 C:G G C 10 0.555327956422522 0.496869552202761 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000355147:exon_53577393_53577521:ZNF160 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 53911973 A/G 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 A:G A G 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000196417:ENST00000396408:exon_53910951_53915260:ZNF765 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 53959615 G/A 1 9 14 23 4.0020483921973 7.77459138991531 -3.77254299771801 A:G G A 10 0.555327956422522 0.141766408043743 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 53959804 T/C 1 10 12 22 4.44672043577478 6.66393547707026 -2.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.393799982731658 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 54962467 G/A 1 46 30 76 20.454914004564 16.6598386926757 3.79507531188833 A:G G A 10 0.555327956422522 0.420059744378941 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376514:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000443957:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54962467_54962559:LENG8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 54966579 C/G 1 33 35 68 14.6741774380568 19.4364784747883 -4.7623010367315 C:G C G 10 0.555327956422522 0.272585043544647 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 54968038 A/G 1 103 74 177 45.8012204884802 41.0942687752666 4.70695171321361 A:T:G A G 10 0.555327956422522 0.496753381237927 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54967815_54968100:LENG8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 54973280 C/G 1 10 15 25 4.44672043577478 8.32991934633783 -3.88319891056305 T:C:G C G 10 0.555327956422522 0.157828971143109 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 54974318 T/C 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55142739 A/C 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 A:C A C 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142713_55142757:LILRB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55142957 T/A 1 12 8 20 5.33606452292974 4.44262365138018 0.893440871549561 A:T T A 10 0.555327956422522 0.823148310222236 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 14 20 34 6.22540861008469 11.1065591284504 -4.88115051836575 T:C T C 10 0.555327956422522 0.119328286684192 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 22 18 40 9.78278495870452 9.9959032156054 -0.213118256900879 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55143491 G/T 1 25 23 48 11.116801089437 12.772542997718 -1.65574190828105 T:G G T 10 0.555327956422522 0.664615044642131 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 28 3 31 12.4508172201694 1.66598386926757 10.7848333509018 T:C C T 10 0.555327956422522 3.9112178430645e-05 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55568084 C/T 1 10 5 15 4.44672043577478 2.77663978211261 1.67008065366217 T:C C T 10 0.555327956422522 0.445339902559564 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55568085 G/T 1 10 5 15 4.44672043577478 2.77663978211261 1.67008065366217 T:G G T 10 0.555327956422522 0.445339902559564 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 14 11 25 6.22540861008469 6.10860752064774 0.11680108943695 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55738634 T/C 1 6 13 19 2.66803226146487 7.21926343349279 -4.55123117202792 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0395254330154768 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55738116_55738931:TMEM86B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55738746 G/A 1 2 7 9 0.889344087154956 3.88729569495765 -2.9979516078027 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0877066993700078 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55738116_55738931:TMEM86B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55739605 C/T 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 T:C C T 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55739559_55739805:TMEM86B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55739813 G/A 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 A:G G A 10 0.555327956422522 0.78392575562472 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55964720 G/A 1 92 76 168 40.909828009128 42.2049246881117 -1.29509667898369 A:G G A 10 0.555327956422522 0.876708570419439 ENSG00000063241:ENST00000438389:exon_55964345_55964755:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000085068:exon_55964345_55964755:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000425675:exon_55964345_55964755:ISOC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 6 12 18 2.66803226146487 6.66393547707026 -3.9959032156054 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0940345725776817 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55994413 C/T 1 9 9 18 4.0020483921973 4.9979516078027 -0.995903215605395 T:C C T 10 0.555327956422522 0.643952874691603 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 55995272 G/A 1 6 10 16 2.66803226146487 5.55327956422522 -2.88524730276035 A:G G A 10 0.555327956422522 0.207537445170925 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 56089353 C/T 1 19 22 41 8.44876882797208 12.2172150412955 -3.7684462133234 T:C C T 10 0.555327956422522 0.272032670141761 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 56114045 C/T 1 15 12 27 6.67008065366217 6.66393547707026 0.0061451765919065 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 30 27 57 13.3401613073243 14.9938548234081 -1.65369351608375 A:G G A 10 0.555327956422522 0.69053268551265 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 56162776 C/T 1 15 40 55 6.67008065366217 22.2131182569009 -15.5430376032387 T:C C T 10 0.555327956422522 3.03875836198314e-05 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 56180968 C/T 1 125 103 228 55.5840054471848 57.1987795115198 -1.61477406433501 T:C C T 10 0.555327956422522 0.841756398013462 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 57723007 G/C 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000083844:ENST00000263095:exon_57722722_57734212:ZNF264 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 57723013 G/A 1 10 5 15 4.44672043577478 2.77663978211261 1.67008065366217 A:G G A 10 0.555327956422522 0.445339902559564 ENSG00000083844:ENST00000263095:exon_57722722_57734212:ZNF264 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 57931553 C/T 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 T:C C T 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 57946924 G/C 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57946693_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57946697_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000415248:exon_57946711_57946961:ZNF749 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 58152361 T/A 1 14 14 28 6.22540861008469 7.77459138991531 -1.54918277983062 A:T T A 10 0.555327956422522 0.573526479524123 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 58152795 C/T 1 16 18 34 7.11475269723965 9.9959032156054 -2.88115051836575 T:C C T 10 0.555327956422522 0.388695221433277 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 58152817 G/C 1 15 19 34 6.67008065366217 10.5512311720279 -3.88115051836575 C:G G C 10 0.555327956422522 0.226744754730006 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 58153000 T/C 1 10 15 25 4.44672043577478 8.32991934633783 -3.88319891056305 T:C T C 10 0.555327956422522 0.157828971143109 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 58153009 C/T 1 11 11 22 4.89139247935226 6.10860752064774 -1.21721504129548 T:C C T 10 0.555327956422522 0.670344781787442 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 58153577 T/C 1 11 6 17 4.89139247935226 3.33196773853513 1.55942474081713 T:C T C 10 0.555327956422522 0.477388500584111 ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 58231807 A/G 1 5 8 13 2.22336021788739 4.44262365138018 -2.21926343349279 A:G A G 10 0.555327956422522 0.268109731741661 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 19 58453342 T/C 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58452206_58454015:ZNF256 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 13 12 25 5.78073656650721 6.66393547707026 -0.883198910563049 T:C C T 10 0.555327956422522 0.841067314696951 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 107 96 203 47.5799086627901 53.3114838165621 -5.73157515377196 A:G A G 10 0.555327956422522 0.437560133952209 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 3425729 C/T 1 20 16 36 8.89344087154956 8.88524730276035 0.00819356878920985 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3425652_3425741:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000457845:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000441983:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3425654_3425765:TTC15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 3504687 A/G 1 20 25 45 8.89344087154956 13.883198910563 -4.98975803901349 A:G A G 10 0.555327956422522 0.137010789034248 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3504585_3504764:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3504585_3504764:ADI1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 6990020 C/T 1 32 19 51 14.2295053944793 10.5512311720279 3.67827422245138 T:C C T 10 0.555327956422522 0.326479481966488 ENSG00000134326:ENST00000256722:exon_6988447_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000478738:exon_6988449_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000491738:exon_6990020_6990104:CMPK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 8871342 C/A 1 16 12 28 7.11475269723965 6.66393547707026 0.450817220169385 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 10059770 G/T 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 T:G G T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 15378808 C/G 1 12 19 31 5.33606452292974 10.5512311720279 -5.21516664909818 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0705072935874214 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15378592_15378810:NBAS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 15743344 T/C 1 3 10 13 1.33401613073243 5.55327956422522 -4.21926343349279 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0239466351830008 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15743316_15743399:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15743316_15743399:DDX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 17942682 T/A 1 6 9 15 2.66803226146487 4.9979516078027 -2.32991934633783 A:T T A 10 0.555327956422522 0.299710241961317 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17942663_17942849:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000524465:exon_17942663_17942849:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17942663_17942849:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000532257:exon_17942663_17942781:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000534669:exon_17942663_17942849:GEN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 17946274 C/G 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 C:G C G 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17946164_17946340:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17946164_17946340:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000534669:exon_17946164_17946411:GEN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 17961321 A/G 1 6 8 14 2.66803226146487 4.44262365138018 -1.77459138991531 A:G A G 10 0.555327956422522 0.423022312731772 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961245_17961388:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961245_17961388:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000528873:exon_17961245_17961388:GEN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 17962450 A/G 1 21 7 28 9.33811291512704 3.88729569495765 5.45081722016938 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0552248516291591 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 17963098 T/G 1 18 21 39 8.0040967843946 11.661887084873 -3.65779030047836 T:G T G 10 0.555327956422522 0.261448779310206 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 20101487 G/A 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000183891:ENST00000402414:exon_20101467_20101717:TTC32;ENSG00000183891:ENST00000333610:exon_20101467_20101747:TTC32 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 20240668 C/A 1 42 55 97 18.6762258302541 30.5430376032387 -11.8668117729846 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0183938389902128 ENSG00000068697:ENST00000175091:exon_20240652_20240772:LAPTM4A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 20818764 C/T 1 10 5 15 4.44672043577478 2.77663978211261 1.67008065366217 T:C C T 10 0.555327956422522 0.445339902559564 ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20817582_20819005:HS1BP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 20824498 C/T 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 T:C C T 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000415264:exon_20824492_20824533:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 20838222 C/T 1 10 4 14 4.44672043577478 2.22131182569009 2.22540861008469 T:C C T 10 0.555327956422522 0.288383222971717 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20838196_20838275:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 24439048 A/G 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 A:G A G 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24438918_24439101:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24438918_24439101:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24438918_24439101:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24438918_24439101:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24438918_24439101:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24438918_24439101:ITSN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 24477250 T/C 1 11 15 26 4.89139247935226 8.32991934633783 -3.43852686698557 T:C T C 10 0.555327956422522 0.235826270274551 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24477236_24477300:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24477236_24477300:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24477236_24477300:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24477236_24477300:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24477236_24477300:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24477236_24477300:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000406921:exon_24477236_24477300:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449230:exon_24477236_24477300:ITSN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 24524958 C/T 1 11 10 21 4.89139247935226 5.55327956422522 -0.661887084872961 T:C C T 10 0.555327956422522 0.828131296920228 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000406921:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449230:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000412011:exon_24524834_24524971:ITSN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 27293150 G/T 1 12 2 14 5.33606452292974 1.11065591284504 4.22540861008469 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0289917966881567 ENSG00000084693:ENST00000487078:exon_27292960_27293490:AGBL5;ENSG00000084693:ENST00000360131:exon_27292960_27293488:AGBL5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 27355991 G/T 1 44 35 79 19.565569917409 19.4364784747883 0.129091442620762 T:G G T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000138073:ENST00000468045:exon_27355985_27357497:PREB;ENSG00000138073:ENST00000260643:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000444452:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000406567:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000474802:exon_27355985_27356589:PREB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 27424636 G/A 1 14 16 30 6.22540861008469 8.88524730276035 -2.65983869267566 A:G G A 10 0.555327956422522 0.361419251986498 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 27435374 G/A 1 11 12 23 4.89139247935226 6.66393547707026 -1.77254299771801 A:G G A 10 0.555327956422522 0.531120817504268 ENSG00000138074:ENST00000428518:exon_27435331_27435390:SLC5A6;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27435238_27435475:C2orf28 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 9 14 23 4.0020483921973 7.77459138991531 -3.77254299771801 A:G A G 10 0.555327956422522 0.141766408043743 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 27462076 C/T 1 23 20 43 10.227457002282 11.1065591284504 -0.879102126168444 T:C C T 10 0.555327956422522 0.878299608285348 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27461986_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462020_27462100:CAD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 28 31 59 12.4508172201694 17.2151666490982 -4.7643494289288 A:G A G 10 0.555327956422522 0.238814044589868 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 27838058 C/A 1 8 15 23 3.55737634861982 8.32991934633783 -4.77254299771801 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0578021904179636 ENSG00000243943:ENST00000416005:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000379717:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000355467:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000505973:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27838035_27838136:ZNF512 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 29001691 A/G 1 46 41 87 20.454914004564 22.7684462133234 -2.31353220875941 A:G A G 10 0.555327956422522 0.666473252800843 ENSG00000213639:ENST00000455580:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000420282:exon_29001675_29001865:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000441461:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000427786:exon_29001675_29001797:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000358506:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395367:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000296122:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395366:exon_29001675_29001905:PPP1CB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 29092679 T/C 1 17 17 34 7.55942474081713 9.44057525918287 -1.88115051836575 T:C T C 10 0.555327956422522 0.605422040477597 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 29092850 G/T 1 14 21 35 6.22540861008469 11.661887084873 -5.43647847478827 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0875511705830525 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 29129418 A/G 1 28 25 53 12.4508172201694 13.883198910563 -1.43238169039367 A:G A G 10 0.555327956422522 0.78252863659632 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29129326_29129447:WDR43 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 29152456 A/G 1 52 57 109 23.1229462660289 31.6536935160838 -8.53074725005489 A:G A G 10 0.555327956422522 0.102252459386382 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29152445_29152576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000466067:exon_29152445_29152576:WDR43 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 73 51 124 32.4610591811559 28.3217257775486 4.13933340360727 T:C T C 10 0.555327956422522 0.471089286444106 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 32690189 A/G 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 A:G A G 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32690133_32690232:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32690133_32690232:BIRC6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 32693787 G/A 1 10 11 21 4.44672043577478 6.10860752064774 -1.66188708487296 A:G G A 10 0.555327956422522 0.514389688550212 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32693505_32693851:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32693505_32693851:BIRC6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 32770904 A/G 1 44 37 81 19.565569917409 20.5471343876333 -0.981564470224281 A:G A G 10 0.555327956422522 0.824161360489377 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32770710_32770927:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32770710_32770927:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32770710_32770927:BIRC6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 32983480 G/A 1 13 5 18 5.78073656650721 2.77663978211261 3.0040967843946 A:G G A 10 0.555327956422522 0.234861389233214 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 T:C C T 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 37076594 T/C 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 A:T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000115808:ENST00000263918:exon_37070783_37076768:STRN;ENSG00000115808:ENST00000379213:exon_37075472_37076768:STRN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 37230728 T/C 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 T:C T C 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37230685_37230829:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37230685_37230829:HEATR5B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 37230788 T/C 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 T:C T C 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37230685_37230829:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37230685_37230829:HEATR5B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 39008807 G/T 1 37 28 65 16.4528656123667 15.5491827798306 0.90368283253607 T:G G T 10 0.555327956422522 0.900872399720333 ENSG00000152147:ENST00000409011:exon_39008659_39009107:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000281950:exon_39008659_39009598:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000409566:exon_39008659_39009089:GEMIN6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 42396722 A/G 1 18 17 35 8.0040967843946 9.44057525918287 -1.43647847478827 A:G A G 10 0.555327956422522 0.734278463498667 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42396490_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42396490_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42396493_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000409040:exon_42396521_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000482660:exon_42396531_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42396601_42396776:EML4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 42515388 A/G 1 18 28 46 8.0040967843946 15.5491827798306 -7.54508599543601 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0265586384976599 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 42515437 A/G 1 21 27 48 9.33811291512704 14.9938548234081 -5.65574190828105 A:G A G 10 0.555327956422522 0.110847873905305 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 21 11 32 9.33811291512704 6.10860752064774 3.2295053944793 A:C C A 10 0.555327956422522 0.288515045544524 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 42990101 G/C 1 10 8 18 4.44672043577478 4.44262365138018 0.00409678439460492 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 42990336 T/G 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 T:G T G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 42990522 C/T 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 T:C C T 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 A:T T A 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 43797619 C/T 1 8 9 17 3.55737634861982 4.9979516078027 -1.44057525918287 T:C C T 10 0.555327956422522 0.626853565320545 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43797527_43797652:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43797527_43797652:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43797527_43797654:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000474159:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43797527_43797649:THADA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 43801712 A/G 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43801475_43801952:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43801475_43802166:THADA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 43804229 T/C 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 T:C T C 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43804161_43804373:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43804161_43804373:THADA;ENSG00000115970:ENST00000474159:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43804161_43804381:THADA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 44201376 T/C 1 76 77 153 33.7950753118883 42.7602526445342 -8.96517733264586 A:T:C:G T C 10 0.555327956422522 0.166483699095616 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44201289_44201434:LRPPRC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 44547574 G/A 1 14 14 28 6.22540861008469 7.77459138991531 -1.54918277983062 A:G G A 10 0.555327956422522 0.573526479524123 ENSG00000138079:ENST00000260649:exon_44547338_44548633:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409380:exon_44547338_44547960:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409740:exon_44547338_44547937:SLC3A1;ENSG00000138078:ENST00000425263:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000426481:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409957:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409411:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409936:exon_44545905_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000444696:exon_44547405_44547782:PREPL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 46313481 C/T 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000171132:ENST00000306156:exon_46313347_46313501:PRKCE;ENSG00000171132:ENST00000469753:exon_46313347_46313501:PRKCE;ENSG00000171132:ENST00000480633:exon_46313347_46313501:PRKCE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 48010488 G/A 1 15 12 27 6.67008065366217 6.66393547707026 0.0061451765919065 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48010267_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000493177:exon_48010309_48010632:MSH6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 48030838 A/T 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:T A T 10 0.555327956422522 1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 53992593 A/T 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:T A T 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53992514_53992686:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000446049:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000470916:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000480522:exon_53992514_53992698:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000489508:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000414369:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482134:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000459916:exon_53992514_53992722:ASB3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 54133744 T/C 1 9 12 21 4.0020483921973 6.66393547707026 -2.66188708487296 T:C T C 10 0.555327956422522 0.276109114103641 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54133735_54133830:PSME4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 54785900 C/T 1 64 42 106 28.4590107889586 23.3237741697459 5.13523661921267 T:C C T 10 0.555327956422522 0.329921665495906 ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54785531_54786024:SPTBN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 55253789 C/G 1 8 2 10 3.55737634861982 1.11065591284504 2.44672043577478 C:G C G 10 0.555327956422522 0.201545371859033 ENSG00000115310:ENST00000405240:exon_55252222_55254621:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000357376:exon_55252222_55254621:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000337526:exon_55252222_55254621:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000394611:exon_55252222_55254621:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000404909:exon_55252222_55254621:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000354474:exon_55252222_55254363:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000402434:exon_55252222_55254616:RTN4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 19 6 25 8.44876882797208 3.33196773853513 5.11680108943695 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0442424474389262 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 21 17 38 9.33811291512704 9.44057525918287 -0.102462344055835 T:G G T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 55771161 A/G 1 66 69 135 29.3483548761136 38.317628993154 -8.96927411704047 A:G A G 10 0.555327956422522 0.140674501368011 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 61 55 116 27.1249946582262 30.5430376032387 -3.41804294501255 T:C T C 10 0.555327956422522 0.575303465379393 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 55912120 T/C 1 11 9 20 4.89139247935226 4.9979516078027 -0.106559128450439 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000429805:exon_55912078_55912183:PNPT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 77 81 158 34.2397473554658 44.9815644702243 -10.7418171147585 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0927092135277055 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 61577435 T/C 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61577395_61577524:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61577395_61577524:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61577395_61577524:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61577395_61577524:USP34;ENSG00000115464:ENST00000453133:exon_61577395_61577524:USP34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 64327544 G/T 1 19 11 30 8.44876882797208 6.10860752064774 2.34016130732434 T:G G T 10 0.555327956422522 0.464289321890314 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 64327592 T/C 1 24 13 37 10.6721290458595 7.21926343349279 3.45286561236669 T:C T C 10 0.555327956422522 0.321143198310201 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 65298839 A/G 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 A:G A G 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000011523:ENST00000475851:exon_65298588_65298978:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 65299766 T/C 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 T:C T C 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 65315711 G/A 1 115 118 233 51.13728501141 65.5286988578576 -14.3914138464476 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0647320022734453 ENSG00000138069:ENST00000409784:exon_65313989_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000409892:exon_65313989_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000409751:exon_65315005_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000398529:exon_65315005_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000356214:exon_65315005_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000260638:exon_65315014_65315824:RAB1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 67630980 G/A 1 14 15 29 6.22540861008469 8.32991934633783 -2.10451073625314 A:G G A 10 0.555327956422522 0.459182512082066 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 67631831 G/A 1 25 18 43 11.116801089437 9.9959032156054 1.12089787383156 A:G G A 10 0.555327956422522 0.761359494764192 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 67632125 C/T 1 10 8 18 4.44672043577478 4.44262365138018 0.00409678439460492 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 69581631 G/A 1 13 17 30 5.78073656650721 9.44057525918287 -3.65983869267566 A:G G A 10 0.555327956422522 0.200611829751137 ENSG00000198380:ENST00000361060:exon_69581621_69581700:GFPT1;ENSG00000198380:ENST00000357308:exon_69581621_69581700:GFPT1;ENSG00000198380:ENST00000493759:exon_69581621_69581700:GFPT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 13 8 21 5.78073656650721 4.44262365138018 1.33811291512704 A:T A T 10 0.555327956422522 0.66298519208265 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 70033584 C/T 1 35 37 72 15.5635215252117 20.5471343876333 -4.98361286242158 T:C C T 10 0.555327956422522 0.238571881733821 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460439:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70033517_70033630:ANXA4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 71633389 C/T 1 19 13 32 8.44876882797208 7.21926343349279 1.2295053944793 T:C C T 10 0.555327956422522 0.724371704529355 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000494241:exon_71633258_71633392:ZNF638 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 34 48 82 15.1188494816343 26.6557419082811 -11.5368924266468 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0139939257939124 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 71654450 A/G 1 19 25 44 8.44876882797208 13.883198910563 -5.43443008259097 A:G A G 10 0.555327956422522 0.128356304232744 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71654413_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000492262:exon_71654425_71654544:ZNF638 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 71658541 C/T 1 25 27 52 11.116801089437 14.9938548234081 -3.87705373397114 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.328850770622475 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000472758:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000488126:exon_71658153_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000460310:exon_71658313_71658558:ZNF638 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 73461483 C/A 1 32 159 191 14.2295053944793 88.297145071181 -74.0676396767017 A:C C A 10 0.555327956422522 2.53350055255093e-28 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73461366_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73461397_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73461435_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73461448_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473786:exon_73461464_73461512:CCT7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 73478461 A/T 1 132 153 285 58.6967097522271 84.9651773326459 -26.2684675804188 A:T A T 10 0.555327956422522 0.00190629853963033 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 73675844 C/T 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C C T 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000377715:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000443750:exon_73675090_73681194:ALMS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 73717103 G/C 1 4 11 15 1.77868817430991 6.10860752064774 -4.32991934633783 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0349050371317493 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73716761_73718625:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73716761_73718625:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73716761_73717285:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73716761_73718625:ALMS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 73828538 G/A 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 A:G G A 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73828322_73828563:ALMS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 74761539 T/A 1 31 13 44 13.7848333509018 7.21926343349279 6.56556991740903 A:T T A 10 0.555327956422522 0.0491718320949344 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74761443_74761558:LOXL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 74763258 C/G 1 13 16 29 5.78073656650721 8.88524730276035 -3.10451073625314 C:G C G 10 0.555327956422522 0.266234224731931 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000481835:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000420535:exon_74763123_74763277:LOXL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 75113657 C/T 1 23 16 39 10.227457002282 8.88524730276035 1.34220969952164 T:C C T 10 0.555327956422522 0.748294746788754 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 75113789 C/G 1 21 19 40 9.33811291512704 10.5512311720279 -1.21311825690088 C:G C G 10 0.555327956422522 0.751440820706528 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 75115108 A/G 1 8 10 18 3.55737634861982 5.55327956422522 -1.9959032156054 A:G A G 10 0.555327956422522 0.354494673636837 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75115030_75115185:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75115030_75115185:HK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 75185856 G/T 1 28 31 59 12.4508172201694 17.2151666490982 -4.7643494289288 T:G G T 10 0.555327956422522 0.238814044589868 ENSG00000115350:ENST00000483063:exon_75185619_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000393918:exon_75185775_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000485527:exon_75185832_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000459636:exon_75185833_75186019:POLE4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 75899101 T/C 1 12 13 25 5.33606452292974 7.21926343349279 -1.88319891056305 T:C T C 10 0.555327956422522 0.547039280437458 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75899076_75899142:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75899076_75899142:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75899076_75899142:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000427862:exon_75899076_75899142:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75899076_75899142:C2orf3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 147 146 293 65.3667904058893 81.0778816376882 -15.7110912317989 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0683976063784543 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 196 149 345 87.1557205411857 82.7438655069558 4.41185503422992 A:T:C:G A G 10 0.555327956422522 0.664842624344229 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 166 137 303 73.8155592338614 76.0799300298855 -2.26437079602417 T:C C T 10 0.555327956422522 0.817232435098922 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 85818886 C/T 1 15 6 21 6.67008065366217 3.33196773853513 3.33811291512704 T:C C T 10 0.555327956422522 0.187868673759137 ENSG00000168899:ENST00000306384:exon_85818848_85818985:VAMP5;ENSG00000168899:ENST00000462451:exon_85818720_85818987:VAMP5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 86260871 A/C 1 14 9 23 6.22540861008469 4.9979516078027 1.22745700228199 A:C A C 10 0.555327956422522 0.678479253472011 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86260784_86260910:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86260784_86260910:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000496892:exon_86260784_86260910:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000492034:exon_86260784_86260910:POLR1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 87303060 C/G 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 C:G C G 10 0.555327956422522 0.605558868068935 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 88874891 C/A 1 18 24 42 8.0040967843946 13.3278709541405 -5.32377416974592 A:C C A 10 0.555327956422522 0.119927124185076 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000470706:exon_88874879_88874926:EIF2AK3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 88879131 T/C 1 5 11 16 2.22336021788739 6.10860752064774 -3.88524730276035 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0753333982593944 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000478003:exon_88879036_88879487:EIF2AK3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 88895123 T/C 1 8 16 24 3.55737634861982 8.88524730276035 -5.32787095414053 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0382967038854731 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88894987_88895181:EIF2AK3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 88913273 G/C 1 8 12 20 3.55737634861982 6.66393547707026 -3.10655912845044 C:G G C 10 0.555327956422522 0.181542604683008 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88913242_88913371:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88913242_88913371:EIF2AK3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 96798319 C/G 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000188886:ENST00000342380:exon_96798279_96798460:ASTL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 97527490 C/T 1 33 32 65 14.6741774380568 17.7704946055207 -3.09631716746393 T:C C T 10 0.555327956422522 0.455999483145975 ENSG00000168758:ENST00000305476:exon_97527474_97527631:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000474420:exon_97527474_97528184:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000482925:exon_97527474_97527631:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000467747:exon_97527474_97529065:SEMA4C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 98373691 G/A 1 18 16 34 8.0040967843946 8.88524730276035 -0.881150518365747 A:G G A 10 0.555327956422522 0.863350207608527 ENSG00000075568:ENST00000485245:exon_98372799_98373846:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000186436:exon_98372803_98373846:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000425805:exon_98372803_98373846:TMEM131 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 98408918 C/T 1 22 19 41 9.78278495870452 10.5512311720279 -0.768446213323401 T:C C T 10 0.555327956422522 0.875562949353059 ENSG00000075568:ENST00000186436:exon_98408849_98409447:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000425805:exon_98408849_98409447:TMEM131 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 105885961 T/C 1 16 11 27 7.11475269723965 6.10860752064774 1.00614517659191 T:C T C 10 0.555327956422522 0.846938067616076 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 105889349 G/A 1 20 10 30 8.89344087154956 5.55327956422522 3.34016130732434 A:G G A 10 0.555327956422522 0.271269845218948 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 110301875 G/C 1 13 12 25 5.78073656650721 6.66393547707026 -0.883198910563049 C:G G C 10 0.555327956422522 0.841067314696951 ENSG00000186522:ENST00000334001:exon_110300380_110301901:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000352314:exon_110300380_110301901:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000397712:exon_110300559_110301901:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000356688:exon_110300559_110301901:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000397714:exon_110300563_110301901:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000437928:exon_110301814_110301901:SEPT10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 111907691 T/C 1 9 9 18 4.0020483921973 4.9979516078027 -0.995903215605395 T:C T C 10 0.555327956422522 0.643952874691603 ENSG00000153094:ENST00000308659:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000357757:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000393253:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000393256:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000428038:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000433098:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000437029:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000452231:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000361493:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000431217:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000439718:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000422765:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000357682:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000452033:exon_111907526_111908532:BCL2L11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 113089267 T/C 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 T:C:G T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000188177:ENST00000409871:exon_113088582_113097634:ZC3H6;ENSG00000188177:ENST00000343936:exon_113088582_113097640:ZC3H6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 113308516 T/A 1 7 10 17 3.11270430504235 5.55327956422522 -2.44057525918287 A:T T A 10 0.555327956422522 0.329183052237539 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113308284_113308579:POLR1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 113309473 C/T 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113309352_113309556:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113309352_113309575:POLR1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 113496453 G/A 1 22 13 35 9.78278495870452 7.21926343349279 2.56352152521173 A:G G A 10 0.555327956422522 0.401605428146735 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113494184_113496625:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113495444_113496625:CKAP2L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 113498566 A/G 1 8 9 17 3.55737634861982 4.9979516078027 -1.44057525918287 A:G A G 10 0.555327956422522 0.626853565320545 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113498395_113498584:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113498395_113498584:CKAP2L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 98 68 166 43.5778602705928 37.7623010367315 5.81555923386135 C:G C G 10 0.555327956422522 0.390664596474090 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 118583940 C/T 1 20 23 43 8.89344087154956 12.772542997718 -3.87910212616844 T:C C T 10 0.555327956422522 0.282779147921419 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583845_118587042:DDX18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 127816695 C/T 1 33 37 70 14.6741774380568 20.5471343876333 -5.87295694957654 T:C C T 10 0.555327956422522 0.185592582332568 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127816587_127816731:BIN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 127821207 G/A 1 41 47 88 18.2315537866766 26.1004139518585 -7.86886016518193 A:G G A 10 0.555327956422522 0.107211293902353 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127821147_127821222:BIN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 128757995 A/C 1 10 13 23 4.44672043577478 7.21926343349279 -2.772542997718 A:C A C 10 0.555327956422522 0.295526802222298 ENSG00000136715:ENST00000259235:exon_128757881_128758028:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000357702:exon_128757881_128758028:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000259234:exon_128757881_128758028:SAP130 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 14 5 19 6.22540861008469 2.77663978211261 3.44876882797208 A:G G A 10 0.555327956422522 0.164530353380396 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 130925088 C/T 1 12 18 30 5.33606452292974 9.9959032156054 -4.65983869267566 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0991449163238243 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000473720:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439029:exon_130925031_130925163:SMPD4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 135893372 A/G 1 59 43 102 26.2356505710712 23.8791021261684 2.35654844490276 A:G A G 10 0.555327956422522 0.690673043688696 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 136393658 A/G 1 19 17 36 8.44876882797208 9.44057525918287 -0.99180643121079 A:G A G 10 0.555327956422522 0.740708520659872 ENSG00000048991:ENST00000422577:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000456040:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000486532:exon_136393658_136393753:R3HDM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 136511842 C/A 1 50 33 83 22.2336021788739 18.3258225619432 3.90777961693068 A:C C A 10 0.555327956422522 0.439840880057406 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136511109_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000470687:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136511722_136511847:UBXN4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 136598357 A/G 1 149 102 251 66.2561344930442 56.6434515550972 9.61268293794699 A:T:G A G 10 0.555327956422522 0.228124859832503 ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136597196_136598521:MCM6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 136623717 C/T 1 47 28 75 20.8995860481415 15.5491827798306 5.35040326831085 T:C C T 10 0.555327956422522 0.245509613397629 ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136623702_136623847:MCM6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 136624155 G/A 1 44 34 78 19.565569917409 18.8811505183657 0.684419399043286 A:G G A 10 0.555327956422522 0.909706736013773 ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136624133_136624298:MCM6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 136873084 G/A 1 147 167 314 65.3667904058893 92.7397687225612 -27.3729783166719 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00212608857373450 ENSG00000121966:ENST00000409817:exon_136871919_136873813:CXCR4;ENSG00000121966:ENST00000241393:exon_136871921_136873482:CXCR4;ENSG00000121966:ENST00000466288:exon_136872207_136873482:CXCR4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 149226932 A/G 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000204406:ENST00000407073:exon_149225910_149228030:MBD5;ENSG00000204406:ENST00000375752:exon_149225910_149228030:MBD5;ENSG00000204406:ENST00000453884:exon_149225910_149228068:MBD5;ENSG00000204406:ENST00000404807:exon_149225910_149228030:MBD5;ENSG00000204406:ENST00000416015:exon_149226294_149228030:MBD5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 152296641 G/T 1 9 4 13 4.0020483921973 2.22131182569009 1.78073656650721 T:G G T 10 0.555327956422522 0.408523981318449 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152296541_152296641:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152296541_152296641:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152296541_152296641:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152296541_152296641:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152296541_152296641:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000414861:exon_152296541_152296641:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152296541_152296641:RIF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 152302942 C/T 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 T:C C T 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152302940_152303089:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152302940_152303089:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152302940_152303089:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152302940_152303089:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152302940_152303089:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000414861:exon_152302940_152303089:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152302940_152303089:RIF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 152321090 C/G 1 26 17 43 11.5614731330144 9.44057525918287 2.12089787383156 C:G C G 10 0.555327956422522 0.543294340268406 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 152321272 C/T 1 19 12 31 8.44876882797208 6.66393547707026 1.78483335090182 T:C C T 10 0.555327956422522 0.590116426773325 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 160604452 C/T 1 65 64 129 28.9036828325361 35.5409892110414 -6.63730637850534 T:C C T 10 0.555327956422522 0.250162032800841 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 160605268 T/C 1 48 51 99 21.3442580917189 28.3217257775486 -6.97746768582968 T:C T C 10 0.555327956422522 0.188344898432625 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 160663678 T/C 1 5 9 14 2.22336021788739 4.9979516078027 -2.77459138991531 T:C T C 10 0.555327956422522 0.179216881393606 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 160673526 A/G 1 51 72 123 22.6782742224514 39.9836128624216 -17.3053386399702 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00194887914460129 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 160710922 T/C 1 43 35 78 19.1208978738316 19.4364784747883 -0.315580600956714 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 160711045 G/C 1 52 58 110 23.1229462660289 32.2090214725063 -9.08607520647741 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0846924392758012 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 160729005 C/T 1 32 36 68 14.2295053944793 19.9918064312108 -5.76230103673149 T:C C T 10 0.555327956422522 0.179679504464696 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160728330_160729104:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 160737621 C/T 1 48 47 95 21.3442580917189 26.1004139518585 -4.75615586013959 T:C C T 10 0.555327956422522 0.353310311344476 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 160738677 G/A 1 57 45 102 25.3463064839162 24.9897580390135 0.35654844490276 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 170678476 G/A 1 42 32 74 18.6762258302541 17.7704946055207 0.905731224733373 A:G G A 10 0.555327956422522 0.907043203405572 ENSG00000138382:ENST00000409837:exon_170678453_170678567:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000260953:exon_170678453_170678567:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000392640:exon_170678453_170678567:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000409965:exon_170678453_170678567:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000410097:exon_170678453_170678567:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000308099:exon_170678453_170678567:METTL5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 170917648 A/G 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 A:G A G 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000144357:ENST00000272793:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000442603:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000418381:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000421104:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000430321:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392632:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392631:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000439681:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000444475:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000474426:exon_170917589_170917696:UBR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 172216969 T/C 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 T:C T C 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000453846:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442541:exon_172216932_172217023:METTL8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 172291616 C/T 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 T:C C T 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000115827:ENST00000468592:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000375255:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000436317:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000490217:exon_172291593_172291696:DCAF17 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 175289238 T/G 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 T:G T G 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000144306:ENST00000437944:exon_175289203_175289377:SCRN3;ENSG00000144306:ENST00000456879:exon_175289203_175289377:SCRN3;ENSG00000144306:ENST00000490927:exon_175289203_175289298:SCRN3;ENSG00000144306:ENST00000272732:exon_175289203_175289377:SCRN3;ENSG00000144306:ENST00000409673:exon_175289203_175289377:SCRN3;ENSG00000144306:ENST00000475928:exon_175289203_175289377:SCRN3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 175436576 A/C 1 126 107 233 56.0286774907622 59.4200913372099 -3.39141384644762 A:C A C 10 0.555327956422522 0.692563821829252 ENSG00000115935:ENST00000392547:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000272746:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000359761:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392546:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409891:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000418906:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 175436940 G/A 1 207 207 414 92.0471130205379 114.952886979462 -22.9057739589241 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0259521259399248 ENSG00000115935:ENST00000392547:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392548:exon_175436873_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000272746:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000359761:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392546:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409891:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000418906:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 178482653 G/A 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000197557:ENST00000355689:exon_178479027_178483694:TTC30A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 179979930 T/C 1 3 9 12 1.33401613073243 4.9979516078027 -3.66393547707026 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0418446542055081 ENSG00000187231:ENST00000436925:exon_179979792_179979983:SESTD1;ENSG00000187231:ENST00000428443:exon_179979792_179979983:SESTD1;ENSG00000187231:ENST00000446758:exon_179979792_179979983:SESTD1;ENSG00000187231:ENST00000335289:exon_179979792_179979983:SESTD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 183593697 C/T 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000494462:exon_183593303_183593834:DNAJC10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 183622547 T/G 1 16 9 25 7.11475269723965 4.9979516078027 2.11680108943695 T:G T G 10 0.555327956422522 0.428150577551636 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183622419_183622552:DNAJC10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 10 17 27 4.44672043577478 9.44057525918287 -4.99385482340809 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0793657979175034 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 190323530 A/G 1 11 2 13 4.89139247935226 1.11065591284504 3.78073656650721 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0478368011171907 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190323479_190323598:WDR75 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 191301368 A/G 1 21 13 34 9.33811291512704 7.21926343349279 2.11884948163425 A:G A G 10 0.555327956422522 0.495256249707322 ENSG00000151690:ENST00000392328:exon_191300703_191302287:MFSD6;ENSG00000151690:ENST00000281416:exon_191300638_191302287:MFSD6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 192279327 T/C 0 10 1 11 4.44672043577478 0.555327956422522 3.89139247935226 A:T T A 10 0.555327956422522 0.0287031751756666 ENSG00000128641:ENST00000339514:exon_192279243_192279395:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000439065:exon_192279243_192279395:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000392318:exon_192279243_192279395:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000304164:exon_192279243_192279395:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000392316:exon_192279243_192279395:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000490069:exon_192279243_192279395:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000429318:exon_192279243_192279395:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000427152:exon_192279243_192279395:MYO1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 197004439 A/G 1 13 8 21 5.78073656650721 4.44262365138018 1.33811291512704 A:G A G 10 0.555327956422522 0.66298519208265 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197004344_197004523:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197004344_197004523:STK17B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 197004484 T/C 1 15 14 29 6.67008065366217 7.77459138991531 -1.10451073625314 T:C T C 10 0.555327956422522 0.711532833974462 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197004344_197004523:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197004344_197004523:STK17B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 197021372 T/A 1 30 33 63 13.3401613073243 18.3258225619432 -4.98566125461889 A:T T A 10 0.555327956422522 0.207991731778025 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000420683:exon_197021296_197021375:STK17B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 198570134 T/G 1 12 14 26 5.33606452292974 7.77459138991531 -2.43852686698557 T:G T G 10 0.555327956422522 0.430498156832276 ENSG00000152428:ENST00000282276:exon_198570087_198573109:MARS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 33 21 54 14.6741774380568 11.661887084873 3.01229035318381 C:G C G 10 0.555327956422522 0.493941610175192 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 201397724 G/A 1 11 7 18 4.89139247935226 3.88729569495765 1.0040967843946 A:G G A 10 0.555327956422522 0.813417267911682 ENSG00000163535:ENST00000418045:exon_201397697_201397831:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201397697_201397831:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201397697_201397831:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000409203:exon_201397697_201397831:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000460534:exon_201397697_201398098:SGOL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 202245244 A/G 1 13 6 19 5.78073656650721 3.33196773853513 2.44876882797208 A:G A G 10 0.555327956422522 0.356616392245917 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202241930_202245941:TRAK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 203139844 T/C 1 53 79 132 23.5676183096063 43.8709085573792 -20.3032902477729 T:C T C 10 0.555327956422522 0.000429148912325922 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000426814:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000488403:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000492740:exon_203139836_203140406:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000472050:exon_203139836_203139912:NOP58 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 203155936 A/C 1 48 61 109 21.3442580917189 33.8750053417738 -12.5307472500549 A:C A C 10 0.555327956422522 0.0202883932486579 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203155848_203155993:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203155848_203155993:NOP58 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 203421199 G/A 1 13 13 26 5.78073656650721 7.21926343349279 -1.43852686698557 A:G G A 10 0.555327956422522 0.693891745956565 ENSG00000204217:ENST00000374580:exon_203419975_203421254:BMPR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 26 24 50 11.5614731330144 13.3278709541405 -1.7663978211261 A:G A G 10 0.555327956422522 0.670282040426826 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 211319933 C/T 1 5 9 14 2.22336021788739 4.9979516078027 -2.77459138991531 T:C C T 10 0.555327956422522 0.179216881393606 ENSG00000115365:ENST00000443314:exon_211319831_211320038:LANCL1;ENSG00000115365:ENST00000450366:exon_211319831_211320038:LANCL1;ENSG00000115365:ENST00000233714:exon_211319831_211320038:LANCL1;ENSG00000115365:ENST00000441020:exon_211319831_211320038:LANCL1;ENSG00000115365:ENST00000431941:exon_211319831_211320038:LANCL1;ENSG00000115365:ENST00000419649:exon_211319831_211320038:LANCL1;ENSG00000115365:ENST00000448951:exon_211319831_211320038:LANCL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 215645464 C/G 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 C:G C G 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215645284_215646233:BARD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 216190020 C/G 1 61 61 122 27.1249946582262 33.8750053417738 -6.75001068354768 C:G C G 10 0.555327956422522 0.236550677393657 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000444305:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000488712:exon_216189903_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000427397:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000413174:exon_216189964_216190052:ATIC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 217293491 G/A 1 18 16 34 8.0040967843946 8.88524730276035 -0.881150518365747 A:G G A 10 0.555327956422522 0.863350207608527 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217293319_217293505:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217293319_217293505:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000427645:exon_217293319_217293502:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217293319_217293505:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000479008:exon_217293319_217293505:SMARCAL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 218940259 C/T 1 2 7 9 0.889344087154956 3.88729569495765 -2.9979516078027 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0877066993700078 ENSG00000188282:ENST00000457754:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000344321:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000374155:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000463872:exon_218939816_218940443:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000441828:exon_218939816_218940463:RUFY4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 219140282 G/A 1 19 21 40 8.44876882797208 11.661887084873 -3.21311825690088 A:G G A 10 0.555327956422522 0.341360637779387 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 21 17 38 9.33811291512704 9.44057525918287 -0.102462344055835 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 219146803 G/A 1 10 18 28 4.44672043577478 9.9959032156054 -5.54918277983061 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0376381075846462 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 219146868 T/C 1 49 27 76 21.7889301352964 14.9938548234081 6.79507531188833 T:C T C 10 0.555327956422522 0.133444706291189 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 219146882 G/C 1 54 25 79 24.0122903531838 13.883198910563 10.1290914426208 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0233375438567978 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 220045454 G/A 1 22 25 47 9.78278495870452 13.883198910563 -4.10041395185853 A:G G A 10 0.555327956422522 0.242748815640483 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443757:exon_220045392_220045473:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452293:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430747:exon_220045392_220045472:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045390_220045476:FAM134A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 220116737 C/T 1 204 264 468 90.7130968898055 146.606580495546 -55.8934836057403 T:C C T 10 0.555327956422522 2.75028823035407e-07 ENSG00000127824:ENST00000248437:exon_220116730_220116952:TUBA4A;ENSG00000127824:ENST00000392088:exon_220116730_220116952:TUBA4A;ENSG00000127824:ENST00000332858:exon_220116730_220116952:TUBA4A;ENSG00000127824:ENST00000427737:exon_220116730_220116952:TUBA4A;ENSG00000127824:ENST00000456818:exon_220116730_220116952:TUBA4A;ENSG00000127824:ENST00000447205:exon_220116730_220116952:TUBA4A;ENSG00000127824:ENST00000462806:exon_220116730_220116952:TUBA4A;ENSG00000127824:ENST00000475683:exon_220116261_220116952:TUBA4A;ENSG00000127824:ENST00000425551:exon_220116730_220116952:TUBA4A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 220250800 C/T 1 61 75 136 27.1249946582262 41.6495967316892 -14.524602073463 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0153844226368623 ENSG00000123992:ENST00000273075:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373972:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000523282:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373963:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373966:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000337010:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000457935:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000429013:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000521459:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000460963:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000322176:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000434339:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000430206:exon_220250704_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000520694:exon_220250760_220250820:DNPEP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 10 10 20 4.44672043577478 5.55327956422522 -1.10655912845044 T:C C T 10 0.555327956422522 0.657502601953682 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 13 14 27 5.78073656650721 7.77459138991531 -1.99385482340809 A:G G A 10 0.555327956422522 0.446307655179609 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 A:G G A 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 220406722 T/C 1 13 15 28 5.78073656650721 8.32991934633783 -2.54918277983062 T:C T C 10 0.555327956422522 0.347681760793844 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 224743373 C/T 1 20 27 47 8.89344087154956 14.9938548234081 -6.10041395185853 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0791336575527212 ENSG00000085449:ENST00000462702:exon_224743246_224743405:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224740064_224743447:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224740065_224743447:WDFY1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 230668858 T/C 1 18 26 44 8.0040967843946 14.4385268669856 -6.43443008259097 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0675188910707721 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000487178:exon_230668715_230668943:TRIP12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 230723777 G/C 1 60 70 130 26.6803226146487 38.8729569495765 -12.1926343349279 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0340813986146656 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000479037:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000409677:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000453485:exon_230723635_230723998:TRIP12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 47 56 103 20.8995860481415 31.0983655596612 -10.1987795115198 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0472864989195133 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 231258150 C/T 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231258129_231258176:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000496870:exon_231258129_231258176:SP140L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 231406070 G/A 1 18 14 32 8.0040967843946 7.77459138991531 0.229505394479297 A:T:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406016_231406087:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406016_231406087:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406016_231406087:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406016_231406087:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406016_231406087:SP100 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 231406680 T/C 1 11 11 22 4.89139247935226 6.10860752064774 -1.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.670344781787442 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406607_231406750:SP100 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 17 19 36 7.55942474081713 10.5512311720279 -2.99180643121079 A:G G A 10 0.555327956422522 0.320267909966196 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 49 13 62 21.7889301352964 7.21926343349279 14.5696667018036 T:C C T 10 0.555327956422522 0.000163635515170725 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 1 42 6 48 18.6762258302541 3.33196773853513 15.3442580917189 A:G G A 10 0.555327956422522 3.09069385819694e-06 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 232035429 G/A 1 56 56 112 24.9016344403388 31.0983655596612 -6.19673111932246 A:G G A 10 0.555327956422522 0.254420184389654 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000373635:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000491229:exon_232035116_232035435:PSMD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 232263127 G/A 1 17 14 31 7.55942474081713 7.77459138991531 -0.215166649098181 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000156966:ENST00000287590:exon_232262442_232265875:B3GNT7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 233201328 A/G 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 A:G A G 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_233201179_233201907:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_233201179_233201908:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_233200924_233201687:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_233201179_233201340:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000429283:exon_233199079_233201686:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000418143:exon_233201020_233201684:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000417808:exon_233200851_233201683:DIS3L2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 233599904 A/C 1 1 7 8 0.444672043577478 3.88729569495765 -3.44262365138018 A:C A C 10 0.555327956422522 0.0258462190222723 ENSG00000204120:ENST00000476995:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000427233:exon_233599865_233599947:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373566:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373563:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000428883:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409480:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000456491:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000484409:exon_233599865_233600161:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000492910:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409547:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000475359:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000488629:exon_233599865_233600298:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000490612:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000464402:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000421433:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000425040:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000430720:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000423659:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409196:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000488734:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409451:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000463554:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000440945:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000429187:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000482666:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000490229:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000483164:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000464805:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000489328:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000424038:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000414511:exon_233599858_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000452341:exon_233599858_233599948:GIGYF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 233659553 C/A 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000204120:ENST00000373566:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373563:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409480:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409547:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000423659:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409196:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409451:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000440945:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000414511:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000452341:exon_233659458_233659654:GIGYF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 234354320 C/T 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000077044:ENST00000264057:exon_234354269_234354408:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000409813:exon_234354269_234354408:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000490764:exon_234354269_234354408:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000430834:exon_234354269_234354408:DGKD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 234386134 A/G 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 A:G A G 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234384166_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234384172_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234384172_234386149:USP40 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 234394487 G/A 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 234749722 T/G 1 49 56 105 21.7889301352964 31.0983655596612 -9.30943542436481 T:C:G T G 10 0.555327956422522 0.0768434970489796 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 15 25 40 6.67008065366217 13.883198910563 -7.21311825690088 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0254501974151595 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 238668802 A/G 1 113 102 215 50.247940924255 56.6434515550972 -6.39551063084222 A:G A G 10 0.555327956422522 0.410318267099478 ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 202 194 396 89.8237528026506 107.733623545969 -17.9098707433187 A:G A G 10 0.555327956422522 0.076655542905049 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 302 268 570 134.290957160398 148.827892321236 -14.5369351608375 T:C:G C G 10 0.555327956422522 0.221912281080581 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 238990388 G/A 1 13 12 25 5.78073656650721 6.66393547707026 -0.883198910563049 A:G G A 10 0.555327956422522 0.841067314696951 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238990350_238990477:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000413463:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000443532:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000482031:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000431487:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238987206_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238990376_238990477:SCLY HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 T:C T C 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 239006879 C/T 1 11 9 20 4.89139247935226 4.9979516078027 -0.106559128450439 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 30 38 68 13.3401613073243 21.1024623440558 -7.76230103673149 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0668811209335351 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 240954110 A/G 1 1 7 8 0.444672043577478 3.88729569495765 -3.44262365138018 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0258462190222723 ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240951034_240954277:NDUFA10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 241513695 G/A 1 49 38 87 21.7889301352964 21.1024623440558 0.686467791240588 A:G G A 10 0.555327956422522 0.91444256492591 ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241513530_241513765:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241513192_241514045:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241513530_241516182:RNPEPL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 241517314 G/A 1 83 59 142 36.9077796169307 32.7643494289288 4.14343018800188 A:G G A 10 0.555327956422522 0.500481197981667 ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241517016_241518149:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241517016_241518144:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241517016_241518141:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000437406:exon_241517016_241518141:RNPEPL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 241536053 C/T 1 8 4 12 3.55737634861982 2.22131182569009 1.33606452292974 T:C C T 10 0.555327956422522 0.56621841747708 ENSG00000142330:ENST00000483602:exon_241535736_241536119:CAPN10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 6 10 16 2.66803226146487 5.55327956422522 -2.88524730276035 A:G G A 10 0.555327956422522 0.207537445170925 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 242046785 A/C 1 109 46 155 48.4692527499451 25.545085995436 22.9241667545091 A:T:C A C 10 0.555327956422522 0.000185847733879327 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000472072:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242046768_242046914:PASK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 242047750 A/G 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 A:G A G 10 0.555327956422522 0.554274589281642 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 242051777 G/A 1 109 24 133 48.4692527499451 13.3278709541405 35.1413817958046 A:G G A 10 0.555327956422522 2.05650252608642e-10 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000489256:exon_242051655_242052201:PASK;ENSG00000115687:ENST00000475666:exon_242051655_242051840:PASK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 242054403 G/A 1 11 6 17 4.89139247935226 3.33196773853513 1.55942474081713 A:G G A 10 0.555327956422522 0.477388500584111 ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242052722_242054592:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242053050_242054592:PASK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 242062162 C/T 1 22 16 38 9.78278495870452 8.88524730276035 0.897537655944165 T:C C T 10 0.555327956422522 0.870781297793979 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242062147_242062314:PASK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 242066156 C/T 1 36 32 68 16.0081935687892 17.7704946055207 -1.76230103673149 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.714880405702575 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 30 41 71 13.3401613073243 22.7684462133234 -9.42828490599906 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0309042128301304 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 242066789 A/G 1 25 26 51 11.116801089437 14.4385268669856 -3.32172577754862 A:G A G 10 0.555327956422522 0.398449939089232 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000459710:exon_242066401_242066866:PASK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 242075362 G/A 1 8 3 11 3.55737634861982 1.66598386926757 1.89139247935226 A:G G A 10 0.555327956422522 0.365636833821238 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242075291_242075454:PASK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 242082262 T/C 1 14 10 24 6.22540861008469 5.55327956422522 0.672129045859473 T:C T C 10 0.555327956422522 0.839730194130565 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000452907:exon_242082252_242082489:PASK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 242371101 C/T 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000006607:ENST00000264042:exon_242371094_242371189:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000373287:exon_242371094_242371189:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000471447:exon_242371094_242371189:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000485051:exon_242371094_242371189:FARP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 242380748 T/A 1 5 8 13 2.22336021788739 4.44262365138018 -2.21926343349279 A:T T A 10 0.555327956422522 0.268109731741661 ENSG00000006607:ENST00000264042:exon_242380719_242380971:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000373287:exon_242380719_242380971:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000413432:exon_242380719_242381167:FARP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 28 22 50 12.4508172201694 12.2172150412955 0.2336021788739 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 2 242793273 A/G 1 1 13 14 0.444672043577478 7.21926343349279 -6.77459138991531 A:G A G 10 0.555327956422522 0.000218449292400299 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 A:T T A 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 259818 G/A 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 A:G G A 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 8 2 10 3.55737634861982 1.11065591284504 2.44672043577478 C:G G C 10 0.555327956422522 0.201545371859033 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 278806 C/T 1 35 34 69 15.5635215252117 18.8811505183657 -3.31762899315402 T:C C T 10 0.555327956422522 0.467838853864305 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 44 51 95 19.565569917409 28.3217257775486 -8.75615586013959 T:C T C 10 0.555327956422522 0.079086441902178 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 27 18 45 12.0061451765919 9.9959032156054 2.01024196098651 T:C C T 10 0.555327956422522 0.653220891499285 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 60 85 145 26.6803226146487 47.2028762959144 -20.5225536812657 T:C C T 10 0.555327956422522 0.000774096858647912 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 66 51 117 29.3483548761136 28.3217257775486 1.02662909856493 T:G T G 10 0.555327956422522 0.925937923720177 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 57 46 103 25.3463064839162 25.545085995436 -0.198779511519763 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 2818801 T/C 1 5 11 16 2.22336021788739 6.10860752064774 -3.88524730276035 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0753333982593944 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 2840773 C/T 1 11 6 17 4.89139247935226 3.33196773853513 1.55942474081713 T:C C T 10 0.555327956422522 0.477388500584111 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2840700_2840797:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2840700_2840797:VPS16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 2996497 C/T 1 10 17 27 4.44672043577478 9.44057525918287 -4.99385482340809 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0793657979175034 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2996495_2996531:PTPRA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 3128675 T/C 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 T:C T C 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000215251:ENST00000380266:exon_3127165_3129906:FASTKD5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 3204084 G/A 1 25 23 48 11.116801089437 12.772542997718 -1.65574190828105 A:G G A 10 0.555327956422522 0.664615044642131 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3204012_3204504:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000399838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000461029:exon_3204012_3204095:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000472295:exon_3204012_3204516:ITPA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 3784110 C/T 1 39 41 80 17.3422096995216 22.7684462133234 -5.42623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 0.260479359624725 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3784051_3784184:CDC25B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 3838441 C/G 1 6 9 15 2.66803226146487 4.9979516078027 -2.32991934633783 C:G C G 10 0.555327956422522 0.299710241961317 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3838282_3838456:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000441852:exon_3838282_3838581:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3838282_3838456:MAVS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 5753579 C/T 1 10 10 20 4.44672043577478 5.55327956422522 -1.10655912845044 T:C C T 10 0.555327956422522 0.657502601953682 ENSG00000171984:ENST00000378979:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5753508_5753689:C20orf196 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 5933108 C/A 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 A:C C A 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5933070_5933174:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5933070_5933174:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5933070_5933174:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5933070_5933174:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5933070_5933174:MCM8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 5935875 G/A 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 A:G G A 10 0.555327956422522 0.150211231786478 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5935748_5935897:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5935748_5935897:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5935748_5935897:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5935748_5935897:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5935748_5935897:MCM8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 5937833 A/G 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5937772_5937875:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5937772_5937875:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5937772_5937875:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5937772_5937875:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5937772_5937875:MCM8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 5939214 A/C 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:C A C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5939174_5939372:MCM8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 5953833 A/G 1 1 7 8 0.444672043577478 3.88729569495765 -3.44262365138018 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0258462190222723 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5953702_5953842:MCM8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 5965583 T/A 1 13 10 23 5.78073656650721 5.55327956422522 0.227457002281995 A:T T A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5965427_5965646:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5965427_5965646:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5965427_5965646:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5965427_5965646:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5965427_5965646:MCM8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 36 45 81 16.0081935687892 24.9897580390135 -8.98156447022428 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0566702712027394 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 7980390 C/T 1 12 6 18 5.33606452292974 3.33196773853513 2.0040967843946 T:C C T 10 0.555327956422522 0.477948616778315 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000527925:exon_7980379_7980469:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000462384:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000530935:exon_7980379_7980507:TMX4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 10386013 C/A 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 A:C C A 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 10386059 G/A 1 10 12 22 4.44672043577478 6.66393547707026 -2.21721504129548 A:G G A 10 0.555327956422522 0.393799982731658 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 10393629 G/A 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 A:G G A 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10393178_10394162:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10393178_10394579:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10393178_10394579:MKKS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 10394046 G/A 1 2 6 8 0.889344087154956 3.33196773853513 -2.44262365138018 A:G G A 10 0.555327956422522 0.150542848470395 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10393178_10394162:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10393178_10394579:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10393178_10394579:MKKS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 10620386 A/G 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000101384:ENST00000254958:exon_10618332_10620603:JAG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 13695498 G/A 1 27 30 57 12.0061451765919 16.6598386926757 -4.65369351608375 A:G G A 10 0.555327956422522 0.231688627825925 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 13695607 T/G 1 25 27 52 11.116801089437 14.9938548234081 -3.87705373397114 T:G T G 10 0.555327956422522 0.328850770622475 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 15967719 T/C 1 7 16 23 3.11270430504235 8.88524730276035 -5.77254299771801 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0197369722085317 ENSG00000172264:ENST00000217246:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000310348:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000402914:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000378058:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000486914:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000407045:exon_15967711_15967803:MACROD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 16360515 C/T 1 10 2 12 4.44672043577478 1.11065591284504 3.33606452292974 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0782461275271357 ENSG00000089177:ENST00000354981:exon_16359450_16360808:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000355755:exon_16359450_16360808:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000358562:exon_16359450_16360808:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000378003:exon_16359450_16360808:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000408042:exon_16359450_16360808:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000377980:exon_16359450_16360808:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000251847:exon_16359450_16360808:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000450176:exon_16360395_16360808:KIF16B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 15 13 28 6.67008065366217 7.21926343349279 -0.549182779830615 A:G G A 10 0.555327956422522 0.851250752295518 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 17932210 C/T 1 50 69 119 22.2336021788739 38.317628993154 -16.0840268142801 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00404931771507575 ENSG00000089006:ENST00000377768:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000490175:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377759:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000483485:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377739:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000476648:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000431277:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000419004:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000494401:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000474883:exon_17932170_17932239:SNX5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 17943492 A/T 1 20 12 32 8.89344087154956 6.66393547707026 2.2295053944793 A:T A T 10 0.555327956422522 0.480113678066947 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 17950545 A/T 1 14 8 22 6.22540861008469 4.44262365138018 1.78278495870452 A:T A T 10 0.555327956422522 0.523473069933469 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17950444_17951013:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17950444_17950773:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377704:exon_17950444_17951013:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17950503_17950773:C20orf72 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 17968923 T/C 1 11 11 22 4.89139247935226 6.10860752064774 -1.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.670344781787442 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 18296043 G/A 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 A:G G A 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000125846:ENST00000377671:exon_18295716_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000396026:exon_18295716_18297638:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000401790:exon_18295713_18297637:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000402618:exon_18295716_18297460:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000316358:exon_18295713_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000462170:exon_18295713_18297640:ZNF133 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 18523019 G/A 1 39 50 89 17.3422096995216 27.7663978211261 -10.4241881216045 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.0323599024217522 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000422877:exon_18523012_18523046:SEC23B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 20006368 T/C 1 26 36 62 11.5614731330144 19.9918064312108 -8.43033329819636 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0400590514517393 ENSG00000173418:ENST00000334982:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000484480:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000310450:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000463154:exon_20006313_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000480550:exon_20006313_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000398602:exon_20006321_20006411:NAA20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 10 12 22 4.44672043577478 6.66393547707026 -2.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.393799982731658 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 21142523 C/G 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 C:G C G 10 0.555327956422522 0.739711191898725 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 21142813 T/C 1 14 7 21 6.22540861008469 3.88729569495765 2.33811291512704 T:C T C 10 0.555327956422522 0.382150972530821 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 21346280 G/A 1 39 35 74 17.3422096995216 19.4364784747883 -2.09426877526663 A:G G A 10 0.555327956422522 0.641300908175297 ENSG00000088930:ENST00000377191:exon_21346211_21346342:XRN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 23345069 C/T 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 T:C C T 10 0.555327956422522 0.605558868068935 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000424216:exon_23345000_23345166:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 23350790 C/T 1 9 19 28 4.0020483921973 10.5512311720279 -6.54918277983061 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0207240028110970 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23350728_23353700:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23350728_23353682:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000477239:exon_23350728_23351058:GZF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 24952147 G/A 1 22 31 53 9.78278495870452 17.2151666490982 -7.43238169039366 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0519927451328868 ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24952096_24952212:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24952096_24952212:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24952096_24952212:C20orf3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 24954339 G/A 1 8 13 21 3.55737634861982 7.21926343349279 -3.66188708487296 A:G G A 10 0.555327956422522 0.126067912845854 ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24954281_24954373:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24954281_24954373:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24954281_24954373:C20orf3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 25260976 C/G 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 C:G C G 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25260902_25261048:PYGB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 25657518 G/A 1 22 26 48 9.78278495870452 14.4385268669856 -4.65574190828105 A:G G A 10 0.555327956422522 0.192526491235171 ENSG00000130684:ENST00000376436:exon_25654851_25657673:ZNF337;ENSG00000130684:ENST00000252979:exon_25654851_25657673:ZNF337;ENSG00000130684:ENST00000376412:exon_25656306_25657673:ZNF337 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 30915461 T/C 1 16 13 29 7.11475269723965 7.21926343349279 -0.104510736253137 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000101350:ENST00000375712:exon_30915359_30915464:KIF3B;ENSG00000101350:ENST00000418717:exon_30915359_30915464:KIF3B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 31024274 T/C 1 36 45 81 16.0081935687892 24.9897580390135 -8.98156447022428 T:C:G T C 10 0.555327956422522 0.0566702712027394 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 31025163 A/G 1 9 6 15 4.0020483921973 3.33196773853513 0.670080653662171 A:G A G 10 0.555327956422522 0.799910806218814 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 32212690 C/T 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 T:C C T 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000078699:ENST00000375279:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000342704:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000346541:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397800:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000492345:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000359606:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397803:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000491618:exon_32212570_32212823:CBFA2T2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 9 15 24 4.0020483921973 8.32991934633783 -4.32787095414053 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0990620091275335 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 33000354 T/C 1 9 10 19 4.0020483921973 5.55327956422522 -1.55123117202792 T:C T C 10 0.555327956422522 0.496869552202761 ENSG00000078747:ENST00000374864:exon_33000321_33000445:ITCH;ENSG00000078747:ENST00000486883:exon_33000321_33000445:ITCH;ENSG00000078747:ENST00000262650:exon_33000321_33000445:ITCH HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 33338245 T/C 1 8 15 23 3.55737634861982 8.32991934633783 -4.77254299771801 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0578021904179636 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33337206_33338322:NCOA6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 33451148 G/A 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:G G A 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000131067:ENST00000356042:exon_33451116_33451351:GGT7;ENSG00000131067:ENST00000336431:exon_33451116_33451351:GGT7;ENSG00000131067:ENST00000253380:exon_33451116_33451351:GGT7;ENSG00000131067:ENST00000429091:exon_33451116_33451351:GGT7;ENSG00000131067:ENST00000457617:exon_33451116_33451351:GGT7;ENSG00000131067:ENST00000439668:exon_33451116_33451351:GGT7;ENSG00000131067:ENST00000427420:exon_33451116_33451351:GGT7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 33872311 G/C 1 17 13 30 7.55942474081713 7.21926343349279 0.340161307324341 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000242372:ENST00000440766:exon_33872184_33872326:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000374436:exon_33872184_33872518:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000462894:exon_33872184_33872505:EIF6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 4 14 18 1.77868817430991 7.77459138991531 -5.9959032156054 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00715866225129155 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 34081351 A/T 1 3 9 12 1.33401613073243 4.9979516078027 -3.66393547707026 A:T A T 10 0.555327956422522 0.0418446542055081 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34081256_34081399:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34081256_34081399:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34081256_34081399:CEP250 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 34090519 G/A 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 A:G G A 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425525:exon_34090218_34090632:CEP250 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 34099252 C/T 1 22 23 45 9.78278495870452 12.772542997718 -2.98975803901349 T:C C T 10 0.555327956422522 0.372989596784527 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34099192_34099804:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34099192_34099802:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34099192_34099802:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000422671:exon_34099192_34099469:CEP250 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 34218673 G/C 1 80 11 91 35.5737634861982 6.10860752064774 29.4651559655505 C:G G C 10 0.555327956422522 4.25367670299469e-11 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34218361_34218956:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34218663_34218717:CPNE1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 34219496 T/C 1 115 24 139 51.13728501141 13.3278709541405 37.8094140572694 T:C T C 10 0.555327956422522 1.51705105479306e-11 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34219481_34219500:CPNE1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 34243017 C/T 1 87 71 158 38.6864677912406 39.4282849059991 -0.741817114758469 T:C C T 10 0.555327956422522 0.93626500533673 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000431148:exon_34242815_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000435161:exon_34242843_34243266:RBM12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 34257566 C/T 1 16 11 27 7.11475269723965 6.10860752064774 1.00614517659191 T:C C T 10 0.555327956422522 0.846938067616076 ENSG00000244005:ENST00000374092:exon_34256610_34257607:NFS1;ENSG00000244005:ENST00000374085:exon_34256621_34257607:NFS1;ENSG00000244005:ENST00000480655:exon_34256886_34257607:NFS1;ENSG00000244005:ENST00000498084:exon_34256886_34257607:NFS1;ENSG00000244005:ENST00000397425:exon_34256905_34257607:NFS1;ENSG00000244005:ENST00000440385:exon_34256915_34257607:NFS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 34328784 T/G 1 98 96 194 43.5778602705928 53.3114838165621 -9.73362354596927 T:G T G 10 0.555327956422522 0.169988035392011 ENSG00000131051:ENST00000463004:exon_34326890_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000361162:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000253363:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000528062:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000407261:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000403542:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000338163:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000343294:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000429968:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000444878:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000374038:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000412738:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000427743:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000434927:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000455343:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000416108:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000442447:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000449489:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000433027:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000453310:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000416529:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000397370:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000463098:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000461849:exon_34328746_34328809:RBM39;ENSG00000131051:ENST00000493853:exon_34328380_34328809:RBM39 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 34502107 G/A 1 15 17 32 6.67008065366217 9.44057525918287 -2.7704946055207 A:G G A 10 0.555327956422522 0.375116209383114 ENSG00000025293:ENST00000374012:exon_34501955_34502119:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000439301:exon_34501955_34502119:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000373994:exon_34501955_34502119:PHF20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 35125340 C/T 1 51 55 106 22.6782742224514 30.5430376032387 -7.86476338078733 T:C C T 10 0.555327956422522 0.142394856173246 ENSG00000080845:ENST00000373913:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000373907:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000401952:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000339266:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000475894:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000482872:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000495241:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000491207:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000482037:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000340491:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000479220:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000489701:exon_35125108_35125469:DLGAP4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 39802851 G/A 1 19 11 30 8.44876882797208 6.10860752064774 2.34016130732434 A:G G A 10 0.555327956422522 0.464289321890314 ENSG00000124181:ENST00000244007:exon_39802764_39802951:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373271:exon_39802767_39802951:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373272:exon_39802764_39802951:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000461641:exon_39802767_39802952:PLCG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 40034097 A/G 1 10 7 17 4.44672043577478 3.88729569495765 0.559424740817127 A:G A G 10 0.555327956422522 0.813340797660957 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40030741_40034129:CHD6;ENSG00000124177:ENST00000480022:exon_40033163_40034129:CHD6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 40045231 G/C 1 11 7 18 4.89139247935226 3.88729569495765 1.0040967843946 C:G G C 10 0.555327956422522 0.813417267911682 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40045228_40045434:CHD6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 40049349 C/T 1 21 22 43 9.33811291512704 12.2172150412955 -2.87910212616845 T:C C T 10 0.555327956422522 0.443426847321452 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 40049586 T/C 1 22 16 38 9.78278495870452 8.88524730276035 0.897537655944165 T:C T C 10 0.555327956422522 0.870781297793979 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 40049873 T/C 1 17 10 27 7.55942474081713 5.55327956422522 2.00614517659191 T:C T C 10 0.555327956422522 0.562156482279236 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 42089511 T/C 1 156 176 332 69.3688387980866 97.7377203303639 -28.3688815322773 T:C:G T C 10 0.555327956422522 0.00194842442824879 ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42089343_42092245:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42089343_42092245:SRSF6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 42825929 C/T 1 64 55 119 28.4590107889586 30.5430376032387 -2.08402681428012 T:C C T 10 0.555327956422522 0.712939840248344 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 42826350 A/C 1 46 44 90 20.454914004564 24.434430082591 -3.97951607802698 A:C A C 10 0.555327956422522 0.398689157296562 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 42826379 C/T 1 42 38 80 18.6762258302541 21.1024623440558 -2.42623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 0.652989369742898 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 43251636 C/T 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000196839:ENST00000464097:exon_43251470_43251719:ADA;ENSG00000196839:ENST00000492931:exon_43251470_43251719:ADA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 43572217 T/C 1 23 36 59 10.227457002282 19.9918064312108 -9.7643494289288 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0124061359466769 ENSG00000025772:ENST00000372813:exon_43572094_43572220:TOMM34;ENSG00000025772:ENST00000372810:exon_43572094_43572220:TOMM34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 21 30 51 9.33811291512704 16.6598386926757 -7.32172577754862 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0477885646755809 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 44581348 G/A 1 16 18 34 7.11475269723965 9.9959032156054 -2.88115051836575 A:G G A 10 0.555327956422522 0.388695221433277 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44581237_44581348:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44581237_44581348:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44581237_44581348:ZNF335 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 44596207 C/G 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44595506_44596273:ZNF335 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 26 17 43 11.5614731330144 9.44057525918287 2.12089787383156 T:G T G 10 0.555327956422522 0.543294340268406 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 44693828 C/T 1 17 19 36 7.55942474081713 10.5512311720279 -2.99180643121079 T:C C T 10 0.555327956422522 0.320267909966196 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44693668_44693867:NCOA5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 44695817 C/T 1 14 10 24 6.22540861008469 5.55327956422522 0.672129045859473 T:C C T 10 0.555327956422522 0.839730194130565 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44695694_44695820:NCOA5;ENSG00000124160:ENST00000372291:exon_44695694_44695820:NCOA5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 44746982 T/C 1 97 99 196 43.1331882270154 54.9774676858297 -11.8442794588143 T:C T C 10 0.555327956422522 0.098149810719858 ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44746911_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44746955_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44746976_44747033:CD40 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 45318069 C/G 1 15 12 27 6.67008065366217 6.66393547707026 0.0061451765919065 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 45867852 A/G 1 28 24 52 12.4508172201694 13.3278709541405 -0.877053733971144 A:G A G 10 0.555327956422522 0.889218374767695 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45866054_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45867242_45867882:ZMYND8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 46268748 C/T 1 32 28 60 14.2295053944793 15.5491827798306 -1.31967738535132 T:C C T 10 0.555327956422522 0.795380305915561 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46268669_46268795:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46268669_46268795:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46268669_46268795:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46268669_46268795:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46268669_46268795:NCOA3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 46292301 C/T 1 5 9 14 2.22336021788739 4.9979516078027 -2.77459138991531 T:C C T 10 0.555327956422522 0.179216881393606 ENSG00000196562:ENST00000359930:exon_46292197_46292366:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000361612:exon_46292197_46292366:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000447361:exon_46292197_46292366:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000371978:exon_46292197_46292366:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000484875:exon_46292197_46292366:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000495544:exon_46292197_46292366:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000467815:exon_46292197_46292366:SULF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 46365571 A/G 1 1 11 12 0.444672043577478 6.10860752064774 -5.66393547707026 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00181567237233340 ENSG00000196562:ENST00000359930:exon_46365447_46365686:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000361612:exon_46365447_46365686:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000447361:exon_46365447_46365686:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000484875:exon_46365447_46365686:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000467815:exon_46365447_46365686:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000463221:exon_46365447_46365686:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000437955:exon_46365447_46365686:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000478766:exon_46365447_46365687:SULF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 47262549 C/T 1 43 43 86 19.1208978738316 23.8791021261684 -4.75820425233689 T:C C T 10 0.555327956422522 0.329293808099938 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47262389_47262595:PREX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 47307618 G/A 1 43 40 83 19.1208978738316 22.2131182569009 -3.09222038306932 A:G G A 10 0.555327956422522 0.509109431584431 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47307485_47307634:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47307485_47307634:PREX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 23 16 39 10.227457002282 8.88524730276035 1.34220969952164 A:G G A 10 0.555327956422522 0.748294746788754 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 48522392 G/A 1 25 20 45 11.116801089437 11.1065591284504 0.0102419609865123 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 48808011 C/T 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 T:C C T 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000172216:ENST00000303004:exon_48807376_48809212:CEBPB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 50803444 C/T 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 T:C C T 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 50803573 G/A 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 A:G G A 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 52192408 C/T 1 27 39 66 12.0061451765919 21.6577903004784 -9.65164512388645 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0184865954978046 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000437222:exon_52192266_52192566:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 52192637 T/C 1 37 23 60 16.4528656123667 12.772542997718 3.68032261464868 T:C T C 10 0.555327956422522 0.365385827635971 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 52193088 C/T 1 36 29 65 16.0081935687892 16.1045107362531 -0.0963171674639263 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 52193368 C/T 1 31 33 64 13.7848333509018 18.3258225619432 -4.54098921104141 T:C C T 10 0.555327956422522 0.260190779332048 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 52193698 G/A 1 18 19 37 8.0040967843946 10.5512311720279 -2.54713438763331 A:G G A 10 0.555327956422522 0.41275461605703 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 52198340 T/A 1 16 20 36 7.11475269723965 11.1065591284504 -3.99180643121079 A:T T A 10 0.555327956422522 0.184657826083378 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52198000_52199707:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52198000_52199636:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52198000_52199707:ZNF217 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 56189985 C/G 1 1 9 10 0.444672043577478 4.9979516078027 -4.55327956422522 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0068664951108094 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56189943_56190116:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000480037:exon_56189943_56190116:ZBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 57244493 G/A 1 38 34 72 16.8975376559442 18.8811505183657 -1.98361286242158 A:G G A 10 0.555327956422522 0.637597390955133 ENSG00000254995:ENST00000371138:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000435446:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000124222:ENST00000355957:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000312283:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000359617:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371141:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371132:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000358029:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000464640:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361830:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361770:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000468590:exon_57244358_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000438253:exon_57244347_57244509:STX16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 57268867 C/A 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 A:C C A 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57268793_57268978:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57268225_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57268235_57268978:NPEPL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 295 303 598 131.178252855356 168.264370796024 -37.0861179406681 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00263787822777731 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 60572663 C/A 1 14 14 28 6.22540861008469 7.77459138991531 -1.54918277983062 A:C C A 10 0.555327956422522 0.573526479524123 ENSG00000130699:ENST00000474089:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60572606_60572725:TAF4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 60963494 C/T 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 60968596 A/G 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:G A G 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60968496_60968661:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60968496_60968661:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60968496_60968661:CABLES2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 61468571 T/C 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 T:C T C 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466532:exon_61468274_61468617:COL9A3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 61542195 G/A 1 22 21 43 9.78278495870452 11.661887084873 -1.87910212616845 A:G G A 10 0.555327956422522 0.645850639619903 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370366:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000266071:exon_61542126_61542966:DIDO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 61870727 G/C 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 C:G G C 10 0.555327956422522 0.150211231786478 ENSG00000101197:ENST00000217169:exon_61870710_61870962:BIRC7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 62152819 G/A 1 4 14 18 1.77868817430991 7.77459138991531 -5.9959032156054 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00715866225129155 ENSG00000125534:ENST00000464438:exon_62152637_62152879:PPDPF HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 62196033 C/T 1 7 9 16 3.11270430504235 4.9979516078027 -1.88524730276035 T:C C T 10 0.555327956422522 0.451827358588768 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 62196182 G/C 1 15 21 36 6.67008065366217 11.661887084873 -4.99180643121079 C:G G C 10 0.555327956422522 0.13003425836145 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 62198236 G/A 1 12 13 25 5.33606452292974 7.21926343349279 -1.88319891056305 A:G G A 10 0.555327956422522 0.547039280437458 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 62200576 G/A 1 16 9 25 7.11475269723965 4.9979516078027 2.11680108943695 A:G G A 10 0.555327956422522 0.428150577551636 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 62203748 G/A 1 9 13 22 4.0020483921973 7.21926343349279 -3.21721504129548 A:G G A 10 0.555327956422522 0.199625660043352 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62203461_62204574:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62203461_62203808:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000479540:exon_62202038_62204574:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370082:exon_62203461_62204574:RP4-697K14.7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 62221766 C/T 1 14 14 28 6.22540861008469 7.77459138991531 -1.54918277983062 T:C C T 10 0.555327956422522 0.573526479524123 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000447518:exon_62221638_62221772:GMEB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 62320929 C/T 0 0 9 9 0 4.9979516078027 -4.9979516078027 T C T 10 0.555327956422522 0.00067976443209644 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62320855_62321001:RTEL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 62322288 T/C 1 2 9 11 0.889344087154956 4.9979516078027 -4.10860752064774 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0150596095234126 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62322158_62322300:RTEL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 62324289 C/T 1 10 3 13 4.44672043577478 1.66598386926757 2.78073656650721 T:C C T 10 0.555327956422522 0.164202722608268 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 62595169 A/G 1 9 10 19 4.0020483921973 5.55327956422522 -1.55123117202792 A:G A G 10 0.555327956422522 0.496869552202761 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62595142_62595266:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62595142_62595266:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62595142_62595266:ZNF512B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 62597694 T/G 1 10 11 21 4.44672043577478 6.10860752064774 -1.66188708487296 T:G T G 10 0.555327956422522 0.514389688550212 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62597494_62598134:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62597494_62598134:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62597494_62598134:ZNF512B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 62598772 G/T 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 T:G G T 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62598734_62598876:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62598734_62598876:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62598734_62598876:ZNF512B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 20 62607160 C/T 1 17 13 30 7.55942474081713 7.21926343349279 0.340161307324341 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000130590:ENST00000369886:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000498830:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000478694:exon_62607045_62607185:SAMD10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 19169218 G/C 1 28 16 44 12.4508172201694 8.88524730276035 3.56556991740903 C:G G C 10 0.555327956422522 0.293045980907275 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 26965148 G/A 1 31 30 61 13.7848333509018 16.6598386926757 -2.87500534177384 A:G G A 10 0.555327956422522 0.519882876612183 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 26965205 T/C 1 41 30 71 18.2315537866766 16.6598386926757 1.57171509400094 T:C T C 10 0.555327956422522 0.72218352701608 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 26969703 T/C 1 8 18 26 3.55737634861982 9.9959032156054 -6.43852686698557 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0162193051941255 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26969614_26969726:MRPL39 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 26976222 C/T 1 48 61 109 21.3442580917189 33.8750053417738 -12.5307472500549 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.0202883932486579 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 26976237 C/T 1 54 70 124 24.0122903531838 38.8729569495765 -14.8606665963927 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00856035565085208 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 30408670 A/T 1 77 48 125 34.2397473554658 26.6557419082811 7.58400544718475 A:T A T 10 0.555327956422522 0.178130635074161 ENSG00000156256:ENST00000399975:exon_30408592_30408695:USP16;ENSG00000156256:ENST00000399976:exon_30408592_30408695:USP16;ENSG00000156256:ENST00000334352:exon_30408592_30408695:USP16;ENSG00000156256:ENST00000474835:exon_30408592_30408695:USP16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 34614250 T/C 1 27 16 43 12.0061451765919 8.88524730276035 3.12089787383156 T:C T C 10 0.555327956422522 0.361306149656312 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 34619163 G/A 1 22 24 46 9.78278495870452 13.3278709541405 -3.54508599543601 A:G G A 10 0.555327956422522 0.302665007003409 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34619023_34619195:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34619023_34619195:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34619023_34619195:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34619023_34619195:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34619023_34619195:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34619023_34619195:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34619023_34619195:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34619023_34619195:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000413881:exon_34619023_34619195:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000443073:exon_34619023_34619195:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34619023_34619195:IFNAR2;ENSG00000249624:ENST00000433395:exon_34619079_34619195:AP000295.9;ENSG00000249624:ENST00000435704:exon_34619118_34619195:AP000295.9;ENSG00000249624:ENST00000451624:exon_34619157_34619195:AP000295.9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 34715699 G/C 1 23 12 35 10.227457002282 6.66393547707026 3.56352152521173 C:G G C 10 0.555327956422522 0.239216773998418 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34715574_34715728:IFNAR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 72 51 123 32.0163871375784 28.3217257775486 3.6946613600298 A:G A G 10 0.555327956422522 0.526387305674638 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 165 147 312 73.3708871902839 81.6332095941107 -8.26232240382684 A:G A G 10 0.555327956422522 0.362211229398901 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 35890409 C/T 1 10 5 15 4.44672043577478 2.77663978211261 1.67008065366217 T:C C T 10 0.555327956422522 0.445339902559564 ENSG00000159200:ENST00000487990:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000313806:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000489903:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381132:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000399272:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000481448:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000482533:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381135:exon_35888788_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000443408:exon_35888788_35890554:RCAN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 36080290 C/T 1 26 3 29 11.5614731330144 1.66598386926757 9.89548926374686 T:C C T 10 0.555327956422522 0.000110908955060438 ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36080242_36080367:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36080242_36080367:CLIC6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 38512956 A/G 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:G A G 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38512861_38512973:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38512861_38512973:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000450533:exon_38512861_38512973:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38512861_38512973:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38512861_38512973:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000481605:exon_38512861_38512973:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38512861_38512973:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38512861_38512973:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38512861_38512973:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38512861_38512973:TTC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 38525356 T/C 1 28 20 48 12.4508172201694 11.1065591284504 1.34425809171895 T:C T C 10 0.555327956422522 0.772218674347073 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000414818:exon_38525251_38525577:TTC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 16 15 31 7.11475269723965 8.32991934633783 -1.21516664909818 A:G G A 10 0.555327956422522 0.719325364600599 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 14 45 59 6.22540861008469 24.9897580390135 -18.7643494289288 T:C C T 10 0.555327956422522 1.06169808545185e-06 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 42812891 C/T 1 226 164 390 100.49588184851 91.0737848532936 9.42209699521644 T:C C T 10 0.555327956422522 0.359137016651255 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42812814_42812952:MX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 42817930 G/A 1 459 411 870 204.104468002062 228.239790089657 -24.1353220875941 A:G G A 10 0.555327956422522 0.101590284238707 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 42821113 T/C 1 316 334 650 140.516365770483 185.479537445122 -44.9631716746393 T:C T C 10 0.555327956422522 0.000436189580229139 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42821064_42821712:MX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 226 224 450 100.49588184851 124.393462238645 -23.8975803901349 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0256957122719165 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 43161022 C/T 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 T:C C T 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000183421:ENST00000332512:exon_43159529_43162157:RIPK4;ENSG00000183421:ENST00000352483:exon_43159545_43162157:RIPK4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 43161877 C/T 1 2 6 8 0.889344087154956 3.33196773853513 -2.44262365138018 T:C C T 10 0.555327956422522 0.150542848470395 ENSG00000183421:ENST00000332512:exon_43159529_43162157:RIPK4;ENSG00000183421:ENST00000352483:exon_43159545_43162157:RIPK4;ENSG00000183421:ENST00000330470:exon_43161640_43162157:RIPK4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 43162150 G/A 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 A:G G A 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000183421:ENST00000332512:exon_43159529_43162157:RIPK4;ENSG00000183421:ENST00000352483:exon_43159545_43162157:RIPK4;ENSG00000183421:ENST00000330470:exon_43161640_43162157:RIPK4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 43413553 T/G 1 10 6 16 4.44672043577478 3.33196773853513 1.11475269723965 T:G T G 10 0.555327956422522 0.624513862012014 ENSG00000173276:ENST00000398505:exon_43412602_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000310826:exon_43406940_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000416434:exon_43412602_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000398499:exon_43408746_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000398511:exon_43408746_43414217:ZNF295 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 43413651 T/C 1 14 7 21 6.22540861008469 3.88729569495765 2.33811291512704 T:C T C 10 0.555327956422522 0.382150972530821 ENSG00000173276:ENST00000398505:exon_43412602_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000310826:exon_43406940_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000416434:exon_43412602_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000398499:exon_43408746_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000398511:exon_43408746_43414217:ZNF295 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 33 11 44 14.6741774380568 6.10860752064774 8.56556991740903 T:G T G 10 0.555327956422522 0.00955143777577825 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 44323720 C/T 1 32 10 42 14.2295053944793 5.55327956422522 8.67622583025408 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00770289001488484 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 32 4 36 14.2295053944793 2.22131182569009 12.0081935687892 A:G G A 10 0.555327956422522 2.83230385685975e-05 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 44430325 T/C 1 8 3 11 3.55737634861982 1.66598386926757 1.89139247935226 T:C T C 10 0.555327956422522 0.365636833821238 ENSG00000160199:ENST00000291547:exon_44430163_44430334:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000432907:exon_44430163_44430334:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000480179:exon_44430163_44430334:PKNOX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 44846016 C/T 1 4 7 11 1.77868817430991 3.88729569495765 -2.10860752064774 T:C C T 10 0.555327956422522 0.234416927909769 ENSG00000142178:ENST00000270162:exon_44845903_44846072:SIK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 45096206 G/A 1 34 25 59 15.1188494816343 13.883198910563 1.2356505710712 A:G G A 10 0.555327956422522 0.794285671041272 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45096153_45096217:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45096153_45096217:RRP1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 45107518 A/G 1 28 19 47 12.4508172201694 10.5512311720279 1.89958604814147 A:G A G 10 0.555327956422522 0.6604821888971 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000470886:exon_45107397_45108121:RRP1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 45107562 T/C 1 22 31 53 9.78278495870452 17.2151666490982 -7.43238169039366 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0519927451328868 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000470886:exon_45107397_45108121:RRP1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 23 23 46 10.227457002282 12.772542997718 -2.54508599543601 T:C T C 10 0.555327956422522 0.46184947730117 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 45219524 T/C 1 27 30 57 12.0061451765919 16.6598386926757 -4.65369351608375 T:C T C 10 0.555327956422522 0.231688627825925 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 45220483 A/G 1 37 33 70 16.4528656123667 18.3258225619432 -1.87295694957654 A:G A G 10 0.555327956422522 0.718572418142477 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45220398_45220495:RRP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 45557227 G/A 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45557059_45557259:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000488392:exon_45557059_45557457:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000470545:exon_45557059_45557448:C21orf33 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 45648880 C/T 1 57 1 58 25.3463064839162 0.555327956422522 24.7909785274937 T:C C T 10 0.555327956422522 1.30367735725416e-13 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45642874_45648927:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400377:exon_45646717_45648927:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45646717_45649972:ICOSLG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 45656774 C/T 1 36 40 76 16.0081935687892 22.2131182569009 -6.20492468811167 T:C C T 10 0.555327956422522 0.166452880039350 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 45732116 C/T 1 102 108 210 45.3565484449028 59.9754192936324 -14.6188708487296 T:C C T 10 0.555327956422522 0.044120282876212 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000496824:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000491298:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45731988_45732177:PFKL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 46271452 C/T 1 50 47 97 22.2336021788739 26.1004139518585 -3.86681177298463 T:C C T 10 0.555327956422522 0.474766301943378 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 46313442 G/T 1 131 144 275 58.2520377086496 79.9672257248432 -21.7151880161935 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0090202410004569 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46313319_46313942:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46312832_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46313319_46313459:ITGB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 46950863 C/T 1 16 11 27 7.11475269723965 6.10860752064774 1.00614517659191 T:C C T 10 0.555327956422522 0.846938067616076 ENSG00000173638:ENST00000417954:exon_46950684_46950885:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46950684_46950885:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46950684_46950885:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46950684_46950885:SLC19A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 47614443 A/G 1 32 30 62 14.2295053944793 16.6598386926757 -2.43033329819636 A:G A G 10 0.555327956422522 0.609599371745769 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 25 30 55 11.116801089437 16.6598386926757 -5.54303760323871 A:C A C 10 0.555327956422522 0.137656286566486 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 47676711 G/A 1 27 39 66 12.0061451765919 21.6577903004784 -9.65164512388645 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.0184865954978046 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 47685939 A/G 1 14 19 33 6.22540861008469 10.5512311720279 -4.32582256194322 A:G A G 10 0.555327956422522 0.160689908592126 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685839_47686866:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685839_47686080:MCM3AP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 47705237 T/C 1 25 19 44 11.116801089437 10.5512311720279 0.565569917409034 T:C T C 10 0.555327956422522 0.880943123846544 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703982_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000426537:exon_47704919_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000495475:exon_47705205_47705308:MCM3AP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 47734659 G/A 1 9 12 21 4.0020483921973 6.66393547707026 -2.66188708487296 A:G G A 10 0.555327956422522 0.276109114103641 ENSG00000160298:ENST00000491666:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397683:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000417060:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397685:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397682:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000291691:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397680:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397679:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000423365:exon_47734630_47734963:C21orf58 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 47773103 C/A 1 3 9 12 1.33401613073243 4.9979516078027 -3.66393547707026 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0418446542055081 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47773018_47773240:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000337772:exon_47773018_47773240:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47773018_47773240:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000466474:exon_47773018_47773217:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000483844:exon_47773018_47773240:PCNT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 47811272 C/T 1 12 12 24 5.33606452292974 6.66393547707026 -1.32787095414053 T:C C T 10 0.555327956422522 0.682467369666187 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47811079_47811291:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47811079_47811291:PCNT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 47836653 C/T 1 12 5 17 5.33606452292974 2.77663978211261 2.55942474081713 T:C C T 10 0.555327956422522 0.233437199703189 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 47850484 G/C 1 8 14 22 3.55737634861982 7.77459138991531 -4.21721504129548 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0860332203503745 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47850421_47850571:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47850421_47850571:PCNT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 28 30 58 12.4508172201694 16.6598386926757 -4.20902147250628 A:G A G 10 0.555327956422522 0.291528326982408 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 47863757 A/C 1 10 8 18 4.44672043577478 4.44262365138018 0.00409678439460492 A:C A C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47863723_47863861:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47863723_47863861:PCNT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 47970581 G/A 1 2 6 8 0.889344087154956 3.33196773853513 -2.44262365138018 A:G G A 10 0.555327956422522 0.150542848470395 ENSG00000160305:ENST00000400274:exon_47970456_47970657:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000318711:exon_47970456_47970657:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000358985:exon_47970456_47970657:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000417564:exon_47970456_47970657:DIP2A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 21 47985655 C/T 1 5 8 13 2.22336021788739 4.44262365138018 -2.21926343349279 T:C C T 10 0.555327956422522 0.268109731741661 ENSG00000160305:ENST00000400274:exon_47985626_47985800:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000318711:exon_47985626_47985800:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000358985:exon_47985626_47985800:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000417564:exon_47985626_47985800:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000478105:exon_47985626_47985800:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000479654:exon_47985626_47985800:DIP2A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 17630486 C/A 1 23 13 36 10.227457002282 7.21926343349279 3.00819356878921 A:C C A 10 0.555327956422522 0.402098843489612 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000480451:exon_17630432_17630635:CECR5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 17662793 A/G 1 14 10 24 6.22540861008469 5.55327956422522 0.672129045859473 A:G A G 10 0.555327956422522 0.839730194130565 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17662710_17662912:CECR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 17669306 T/C 1 14 12 26 6.22540861008469 6.66393547707026 -0.438526866985572 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000469063:exon_17669229_17669617:CECR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 18111431 T/C 1 32 28 60 14.2295053944793 15.5491827798306 -1.31967738535132 T:C T C 10 0.555327956422522 0.795380305915561 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18111369_18111584:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18111369_18111513:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18111369_18111499:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000478963:exon_18111369_18111514:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000460085:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 18165995 T/G 1 17 19 36 7.55942474081713 10.5512311720279 -2.99180643121079 T:G T G 10 0.555327956422522 0.320267909966196 ENSG00000099968:ENST00000399781:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000464649:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000337612:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18165980_18166087:BCL2L13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 18209613 A/G 1 28 14 42 12.4508172201694 7.77459138991531 4.67622583025408 A:G A G 10 0.555327956422522 0.163888740884818 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 18209718 C/T 1 31 46 77 13.7848333509018 25.545085995436 -11.7602526445342 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00809577300043598 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 18220831 A/G 1 136 161 297 60.475397926537 89.407800984026 -28.932403057489 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00084844976455386 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399765:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000494097:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18220824_18220995:BID HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 19467717 C/T 1 8 1 9 3.55737634861982 0.555327956422522 3.0020483921973 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0495403730021064 ENSG00000093009:ENST00000407835:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000438587:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000455750:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000491520:exon_19467261_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000444382:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000437685:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000263201:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000483431:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000404724:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000435353:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000487669:exon_19467673_19467740:CDC45 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 19789541 A/C 1 33 23 56 14.6741774380568 12.772542997718 1.90163444033877 A:C A C 10 0.555327956422522 0.687278447743607 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000481086:exon_19789522_19789739:GNB1L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 19868218 A/G 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 A:G A G 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462330:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000487165:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000495655:exon_19868145_19868870:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000485358:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462843:exon_19868145_19868240:TXNRD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 40 53 93 17.7868817430991 29.4323816903937 -11.6454999472945 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0163233028403688 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 98 77 175 43.5778602705928 42.7602526445342 0.817607626058653 A:G G A 10 0.555327956422522 0.939438238297449 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 20303664 G/A 0 24 0 24 10.6721290458595 0 10.6721290458595 G G 10 0.555327956422522 8.50571616019602e-07 ENSG00000128185:ENST00000248879:exon_20303642_20303742:DGCR6L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 20800835 A/G 1 7 9 16 3.11270430504235 4.9979516078027 -1.88524730276035 A:G A G 10 0.555327956422522 0.451827358588768 ENSG00000099910:ENST00000429594:exon_20800730_20800907:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000328879:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000399308:exon_20800766_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000451094:exon_20800772_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000440659:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000417168:exon_20800771_20800963:KLHL22 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 20940085 G/A 1 34 31 65 15.1188494816343 17.2151666490982 -2.09631716746393 A:G G A 10 0.555327956422522 0.61930708858527 ENSG00000099917:ENST00000433831:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000437399:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000425759:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000292733:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000263205:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000406969:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000382974:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000492381:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000489651:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000473244:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000493216:exon_20937617_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000461076:exon_20939388_20940090:MED15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 21167787 G/A 1 18 7 25 8.0040967843946 3.88729569495765 4.11680108943695 A:G G A 10 0.555327956422522 0.109913495548130 ENSG00000241973:ENST00000255882:exon_21167646_21167794:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000437178:exon_21167646_21167794:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000485963:exon_21167646_21167794:PI4KA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 21213380 C/T 1 28 21 49 12.4508172201694 11.661887084873 0.788930135296422 T:C C T 10 0.555327956422522 0.886219150384339 ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 21224652 G/A 1 33 58 91 14.6741774380568 32.2090214725063 -17.5348440344495 A:G G A 10 0.555327956422522 0.000288075043643587 ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21224625_21224821:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21224625_21225329:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000439214:exon_21224625_21224821:SNAP29 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 23264785 C/A 1 8 1 9 3.55737634861982 0.555327956422522 3.0020483921973 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0495403730021064 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 23627369 A/G 1 14 20 34 6.22540861008469 11.1065591284504 -4.88115051836575 A:G A G 10 0.555327956422522 0.119328286684192 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000466076:exon_23627220_23627388:BCR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 24034288 A/G 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000159496:ENST00000441897:exon_24032961_24034396:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000290691:exon_24033048_24034396:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382833:exon_24033048_24034396:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382834:exon_24033048_24034396:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382831:exon_24033048_24034396:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000460003:exon_24033493_24034715:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000467354:exon_24033493_24034715:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000423392:exon_24033493_24034396:RGL4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 24035970 C/T 1 2 6 8 0.889344087154956 3.33196773853513 -2.44262365138018 T:C C T 10 0.555327956422522 0.150542848470395 ENSG00000159496:ENST00000441897:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000401461:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000290691:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382833:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382834:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382831:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000460003:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000467354:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000423392:exon_24035946_24036161:RGL4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 104 155 259 46.2458925320577 86.0758332454909 -39.8299407134332 A:G G A 10 0.555327956422522 8.92894177409589e-07 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 24179888 A/G 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 A:G A G 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000099958:ENST00000406855:exon_24179846_24180041:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000290730:exon_24179846_24179918:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000488272:exon_24179846_24179918:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24179846_24180041:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24179846_24180041:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464110:exon_24179846_24179918:DERL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 37 20 57 16.4528656123667 11.1065591284504 5.34630648391625 T:C T C 10 0.555327956422522 0.182582801206707 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 24964128 T/C 1 222 236 458 98.7171936742001 131.057397715715 -32.3402040415151 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00259089207633694 ENSG00000100028:ENST00000215829:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000457691:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000402849:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000404603:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000458544:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000448916:exon_24963952_24964144:SNRPD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 26853905 C/A 1 12 9 21 5.33606452292974 4.9979516078027 0.338112915127039 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26853825_26853933:HPS4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 26854441 G/A 1 13 17 30 5.78073656650721 9.44057525918287 -3.65983869267566 A:G G A 10 0.555327956422522 0.200611829751137 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26854411_26854543:HPS4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 26859942 C/T 1 15 24 39 6.67008065366217 13.3278709541405 -6.65779030047836 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0361368239681156 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26859883_26859981:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26859883_26860158:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 26862212 T/C 1 13 19 32 5.78073656650721 10.5512311720279 -4.7704946055207 T:C T C 10 0.555327956422522 0.109011061329792 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26861421_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26862192_26864589:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26861421_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000459918:exon_26862192_26862228:HPS4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 26884039 G/A 1 17 9 26 7.55942474081713 4.9979516078027 2.56147313301443 A:G G A 10 0.555327956422522 0.332317546529893 ENSG00000100104:ENST00000215917:exon_26883995_26884254:SRRD;ENSG00000100104:ENST00000477945:exon_26883948_26884254:SRRD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 26895337 G/A 1 20 18 38 8.89344087154956 9.9959032156054 -1.10246234405583 A:G G A 10 0.555327956422522 0.746082769898358 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26895070_26895348:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000481357:exon_26895070_26895357:TFIP11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 29621128 C/G 1 10 30 40 4.44672043577478 16.6598386926757 -12.2131182569009 C:G C G 10 0.555327956422522 0.000163813727726851 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429226:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000484039:exon_29621122_29621205:EMID1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 29630337 G/A 1 42 60 102 18.6762258302541 33.3196773853513 -14.6434515550972 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.00379148622795848 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000433143:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000487477:exon_29630294_29630338:EMID1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 58 51 109 25.7909785274937 28.3217257775486 -2.5307472500549 T:C C T 10 0.555327956422522 0.631190820809992 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 29755888 T/C 1 17 16 33 7.55942474081713 8.88524730276035 -1.32582256194322 T:C T C 10 0.555327956422522 0.726914463925943 ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000421126:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000473606:exon_29755662_29755948:AP1B1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 29908072 C/T 1 22 20 42 9.78278495870452 11.1065591284504 -1.32377416974592 T:C C T 10 0.555327956422522 0.756752546679991 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29908010_29908125:THOC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 29913272 C/T 1 14 6 20 6.22540861008469 3.33196773853513 2.89344087154956 T:C C T 10 0.555327956422522 0.261033291477746 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 29925221 C/T 1 4 10 14 1.77868817430991 5.55327956422522 -3.77459138991531 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0577678010140113 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29924926_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000484924:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000443089:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000492707:exon_29925151_29925228:THOC5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 29957570 G/A 1 50 53 103 22.2336021788739 29.4323816903937 -7.19877951151976 A:G G A 10 0.555327956422522 0.165462169019628 ENSG00000184117:ENST00000216121:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000437094:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000415100:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 62 51 113 27.5696667018036 28.3217257775486 -0.752059075744985 A:G A G 10 0.555327956422522 0.924692633014708 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 30198025 C/T 1 36 43 79 16.0081935687892 23.8791021261684 -7.87090855737923 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0889652724409437 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30197983_30198197:ASCC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 30221201 G/A 1 13 23 36 5.78073656650721 12.772542997718 -6.99180643121079 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0278002118611456 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000431535:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000495967:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000412689:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000465667:exon_30221075_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000463203:exon_30221076_30221347:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000495681:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000462454:exon_30221092_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000453160:exon_30221097_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000460313:exon_30221150_30221246:ASCC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 30689998 G/A 1 16 14 30 7.11475269723965 7.77459138991531 -0.65983869267566 A:G G A 10 0.555327956422522 0.85539905852902 ENSG00000248751:ENST00000330168:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434987:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434291:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000418047:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000447976:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30689974_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30689640_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000466666:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000437122:exon_30689910_30690099:TBC1D10A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 31013374 C/T 1 10 1 11 4.44672043577478 0.555327956422522 3.89139247935226 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0287031751756666 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31013317_31013482:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31013317_31013482:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31013317_31013482:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31013317_31013482:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000471659:exon_31013317_31013704:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000493542:exon_31013317_31013482:TCN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 31059823 T/C 0 0 9 9 0 4.9979516078027 -4.9979516078027 C T C 10 0.555327956422522 0.00067976443209644 ENSG00000167065:ENST00000404885:exon_31059391_31060067:DUSP18;ENSG00000167065:ENST00000407308:exon_31059391_31060067:DUSP18;ENSG00000167065:ENST00000377087:exon_31059000_31060067:DUSP18;ENSG00000167065:ENST00000334679:exon_31058018_31060067:DUSP18;ENSG00000167065:ENST00000342474:exon_31059502_31060067:DUSP18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 31328929 C/G 1 17 13 30 7.55942474081713 7.21926343349279 0.340161307324341 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31328876_31329017:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31328876_31329017:MORC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 13 11 24 5.78073656650721 6.10860752064774 -0.327870954140527 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 31342376 G/C 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000476152:exon_31342328_31342436:MORC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 31491295 G/C 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 C:G G C 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 31838085 G/A 1 20 29 49 8.89344087154956 16.1045107362531 -7.21106986470357 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0438812509281898 ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000495101:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000445424:exon_31837789_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000475437:exon_31838021_31838104:EIF4ENIF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 33670584 G/A 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 A:G G A 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000133424:ENST00000354992:exon_33668847_33670610:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000337431:exon_33668847_33670610:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000397394:exon_33669062_33670610:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000402320:exon_33669075_33670610:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000437602:exon_33670412_33670610:LARGE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 33700239 A/G 1 16 10 26 7.11475269723965 5.55327956422522 1.56147313301443 A:G A G 10 0.555327956422522 0.561847305125949 ENSG00000133424:ENST00000443693:exon_33700215_33700493:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000429788:exon_33700215_33700493:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000354992:exon_33700215_33700493:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000337431:exon_33700215_33700493:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000397394:exon_33700215_33700493:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000402320:exon_33700215_33700493:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000437602:exon_33700215_33700493:LARGE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 36537500 A/T 1 39 50 89 17.3422096995216 27.7663978211261 -10.4241881216045 A:T A T 10 0.555327956422522 0.0323599024217522 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 36537893 A/G 1 30 32 62 13.3401613073243 17.7704946055207 -4.43033329819636 A:G A G 10 0.555327956422522 0.306612234562664 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 36700175 A/G 1 91 109 200 40.4651559655505 60.5307472500549 -20.0655912845044 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00539036151280265 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36700041_36700201:MYH9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 37319293 C/T 1 26 31 57 11.5614731330144 17.2151666490982 -5.65369351608375 T:C C T 10 0.555327956422522 0.143497675571037 ENSG00000100368:ENST00000403662:exon_37319286_37319409:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000262825:exon_37319286_37319409:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000406230:exon_37319286_37319409:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000421539:exon_37319286_37319409:CSF2RB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 37329999 C/T 1 9 10 19 4.0020483921973 5.55327956422522 -1.55123117202792 T:C C T 10 0.555327956422522 0.496869552202761 ENSG00000100368:ENST00000403662:exon_37329874_37330036:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000262825:exon_37329874_37330036:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000406230:exon_37329874_37330036:CSF2RB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 37333794 A/G 1 25 21 46 11.116801089437 11.661887084873 -0.545085995436011 A:G A G 10 0.555327956422522 0.883074147030052 ENSG00000100368:ENST00000403662:exon_37333419_37336491:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000262825:exon_37333419_37336481:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000406230:exon_37333419_37334653:CSF2RB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 37425298 T/C 1 36 38 74 16.0081935687892 21.1024623440558 -5.09426877526662 T:C T C 10 0.555327956422522 0.243729975890296 ENSG00000128309:ENST00000401419:exon_37425257_37425842:MPST;ENSG00000128309:ENST00000397129:exon_37425257_37425862:MPST;ENSG00000128309:ENST00000404802:exon_37425257_37425835:MPST;ENSG00000128309:ENST00000341116:exon_37425257_37425860:MPST;ENSG00000128309:ENST00000429360:exon_37425257_37425863:MPST;ENSG00000128309:ENST00000404393:exon_37425257_37425837:MPST;ENSG00000128309:ENST00000485587:exon_37420233_37425853:MPST;ENSG00000128309:ENST00000397225:exon_37425257_37425862:MPST;ENSG00000128309:ENST00000452571:exon_37425257_37425555:MPST;ENSG00000128309:ENST00000446076:exon_37425248_37425318:MPST;ENSG00000128309:ENST00000437888:exon_37425248_37425555:MPST HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 37603021 G/A 1 2 15 17 0.889344087154956 8.32991934633783 -7.44057525918287 A:G G A 10 0.555327956422522 0.000288942689162642 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 37603051 C/T 1 2 19 21 0.889344087154956 10.5512311720279 -9.66188708487296 T:C C T 10 0.555327956422522 1.87335647750104e-05 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 37603390 C/T 1 3 11 14 1.33401613073243 6.10860752064774 -4.77459138991531 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0135137734901899 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 37637653 G/C 1 678 653 1331 301.48764554553 362.629155543907 -61.1415099983768 C:G G C 10 0.555327956422522 0.000839981436963257 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000469532:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000401529:exon_37637627_37637698:RAC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 38049843 G/A 1 26 24 50 11.5614731330144 13.3278709541405 -1.7663978211261 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.670282040426826 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38049786_38049880:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38049786_38049880:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38049786_38049880:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38049786_38049880:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38049786_38049880:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38049786_38049880:SH3BP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 13 12 25 5.78073656650721 6.66393547707026 -0.883198910563049 A:G A G 10 0.555327956422522 0.841067314696951 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 435 494 929 193.432338956203 274.332010472726 -80.8996715165229 A:T:C T C 10 0.555327956422522 1.19119933735815e-07 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 38322026 C/T 1 21 17 38 9.33811291512704 9.44057525918287 -0.102462344055835 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38321668_38322050:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38321668_38322050:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38321854_38322050:MICALL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 38323507 G/T 1 7 14 21 3.11270430504235 7.77459138991531 -4.66188708487296 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0482087998619483 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 38699004 C/T 1 32 37 69 14.2295053944793 20.5471343876333 -6.31762899315402 T:C C T 10 0.555327956422522 0.14582298391882 ENSG00000213923:ENST00000359867:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000396832:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000402865:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000400206:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000403904:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000438038:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000413574:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000405675:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000451964:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000398519:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000430335:exon_38698866_38699014:CSNK1E HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 39069181 T/C 1 9 11 20 4.0020483921973 6.10860752064774 -2.10655912845044 T:C T C 10 0.555327956422522 0.374427217398125 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 39134207 C/T 1 77 65 142 34.2397473554658 36.0963171674639 -1.85656981199812 T:C C T 10 0.555327956422522 0.800153577584932 ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39133956_39134304:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000489527:exon_39133956_39134300:GTPBP1;ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39133765_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134040_39134270:SUN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 39134715 T/C 1 63 47 110 28.0143387453811 26.1004139518585 1.91392479352259 T:C T C 10 0.555327956422522 0.773721185521241 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 39477566 A/G 1 90 90 180 40.020483921973 49.979516078027 -9.95903215605395 A:G A G 10 0.555327956422522 0.153971987465404 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39477476_39477692:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39477476_39478684:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39477476_39479219:APOBEC3G HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 T:G G T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 39709009 G/A 1 10 10 20 4.44672043577478 5.55327956422522 -1.10655912845044 A:G G A 10 0.555327956422522 0.657502601953682 ENSG00000100316:ENST00000473638:exon_39708889_39709315:RPL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 39711351 A/G 1 15 9 24 6.67008065366217 4.9979516078027 1.67212904585947 A:G A G 10 0.555327956422522 0.543438783557522 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 39814765 G/C 1 6 8 14 2.66803226146487 4.44262365138018 -1.77459138991531 C:G G C 10 0.555327956422522 0.423022312731772 ENSG00000100324:ENST00000216160:exon_39814737_39814850:TAB1;ENSG00000100324:ENST00000331454:exon_39814737_39814850:TAB1;ENSG00000100324:ENST00000464259:exon_39814644_39814850:TAB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 39815573 G/A 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 A:G G A 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000100324:ENST00000216160:exon_39815524_39815635:TAB1;ENSG00000100324:ENST00000331454:exon_39815524_39815635:TAB1;ENSG00000100324:ENST00000464259:exon_39815524_39815635:TAB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 39909802 C/T 1 30 26 56 13.3401613073243 14.4385268669856 -1.09836555966123 T:C C T 10 0.555327956422522 0.78916368036998 ENSG00000100335:ENST00000402881:exon_39909522_39910229:SMCR7L;ENSG00000100335:ENST00000216171:exon_39909522_39910229:SMCR7L;ENSG00000100335:ENST00000433117:exon_39909522_39912385:SMCR7L;ENSG00000100335:ENST00000325301:exon_39909522_39914137:SMCR7L;ENSG00000100335:ENST00000404569:exon_39909522_39912183:SMCR7L;ENSG00000100335:ENST00000428069:exon_39909522_39909871:SMCR7L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 300 301 601 133.401613073243 167.153714883179 -33.7521018099357 A:C A C 10 0.555327956422522 0.00593406793090861 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 40662394 C/G 1 19 8 27 8.44876882797208 4.44262365138018 4.00614517659191 C:G C G 10 0.555327956422522 0.174107580548536 ENSG00000100354:ENST00000454349:exon_40660692_40663040:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000400140:exon_40660692_40663040:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000429399:exon_40660692_40663040:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000445835:exon_40660692_40663040:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000335727:exon_40660692_40663040:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000446273:exon_40661007_40663040:TNRC6B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 42191442 C/T 1 12 11 23 5.33606452292974 6.10860752064774 -0.772542997718006 T:C C T 10 0.555327956422522 0.834806358038955 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000419798:exon_42191415_42191456:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000423900:exon_42191426_42191456:MEI1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 42269880 G/T 1 88 96 184 39.1311398348181 53.3114838165621 -14.180343981744 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0377610528780609 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42269802_42270023:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42269802_42270023:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42269802_42270023:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42269802_42270023:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000462539:exon_42269693_42270023:SREBF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 37 30 67 16.4528656123667 16.6598386926757 -0.206973080308973 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 42609148 T/C 1 41 26 67 18.2315537866766 14.4385268669856 3.79302691969103 T:C T C 10 0.555327956422522 0.390547640914768 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 43280395 G/A 1 52 44 96 23.1229462660289 24.434430082591 -1.31148381656211 A:G G A 10 0.555327956422522 0.837459493916147 ENSG00000100266:ENST00000496919:exon_43280392_43280567:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000473715:exon_43280392_43280567:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000263246:exon_43280392_43280567:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000337959:exon_43280392_43280567:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000407585:exon_43280392_43280567:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000403744:exon_43280392_43280567:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000402229:exon_43280392_43280567:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000436831:exon_43280392_43280567:PACSIN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 7 23 30 3.11270430504235 12.772542997718 -9.65983869267566 T:C:G G C 10 0.555327956422522 0.000638955485520786 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 43568444 G/A 1 12 10 22 5.33606452292974 5.55327956422522 -0.217215041295483 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43568409_43568560:TTLL12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 43568512 C/T 1 21 14 35 9.33811291512704 7.77459138991531 1.56352152521173 T:C C T 10 0.555327956422522 0.615320962333974 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43568409_43568560:TTLL12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 22 44489896 T/C 1 75 78 153 33.3504032683108 43.3155806009567 -9.96517733264587 T:C T C 10 0.555327956422522 0.121919285774653 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 4699936 G/C 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4699808_4699962:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4699808_4699962:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4699808_4699962:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4699808_4699962:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4699808_4699962:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4699808_4699962:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4699808_4699962:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4699808_4699962:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000477577:exon_4699808_4699962:ITPR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 4712413 G/A 1 8 3 11 3.55737634861982 1.66598386926757 1.89139247935226 A:G G A 10 0.555327956422522 0.365636833821238 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000477577:exon_4712413_4712610:ITPR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 5257577 A/G 1 75 56 131 33.3504032683108 31.0983655596612 2.25203770864962 A:G A G 10 0.555327956422522 0.725615702940905 ENSG00000134109:ENST00000419550:exon_5257514_5257807:EDEM1;ENSG00000134109:ENST00000256497:exon_5257514_5261642:EDEM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 8809222 C/T 1 13 13 26 5.78073656650721 7.21926343349279 -1.43852686698557 T:C C T 10 0.555327956422522 0.693891745956565 ENSG00000180914:ENST00000316793:exon_8808952_8810015:OXTR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 8809703 G/A 1 15 9 24 6.67008065366217 4.9979516078027 1.67212904585947 A:G G A 10 0.555327956422522 0.543438783557522 ENSG00000180914:ENST00000316793:exon_8808952_8810015:OXTR;ENSG00000180914:ENST00000449615:exon_8809598_8810015:OXTR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 23 19 42 10.227457002282 10.5512311720279 -0.323774169745922 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 10 12 22 4.44672043577478 6.66393547707026 -2.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.393799982731658 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 22 25 47 9.78278495870452 13.883198910563 -4.10041395185853 A:G G A 10 0.555327956422522 0.242748815640483 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 9506176 T/G 1 42 55 97 18.6762258302541 30.5430376032387 -11.8668117729846 A:T:G T G 10 0.555327956422522 0.0183938389902128 ENSG00000168137:ENST00000402198:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000402466:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000443339:exon_9506109_9506437:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000406341:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000407969:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000302463:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000493918:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000399686:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000413704:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000466242:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000488236:exon_9506109_9506638:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000421188:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000478961:exon_9506109_9506494:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000476740:exon_9506109_9506377:SETD5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 9974774 C/G 1 2 8 10 0.889344087154956 4.44262365138018 -3.55327956422522 C:G C G 10 0.555327956422522 0.028080868038134 ENSG00000163702:ENST00000383812:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000466046:exon_9974637_9975277:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000295981:exon_9974637_9975304:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000451231:exon_9974637_9975304:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000483582:exon_9974504_9975314:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000494365:exon_9974637_9975300:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000498214:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000403601:exon_9974637_9975305:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000416074:exon_9974637_9975304:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000451271:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000455057:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000413608:exon_9974637_9975300:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000461995:exon_9974637_9974832:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000497387:exon_9974637_9975304:IL17RC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 10354413 G/A 1 82 80 162 36.4631075733532 44.4262365138018 -7.96312894044856 A:G G A 10 0.555327956422522 0.235593082141742 ENSG00000157020:ENST00000397109:exon_10354263_10354414:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000337354:exon_10354263_10354414:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000350697:exon_10354263_10354414:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000479868:exon_10354263_10355655:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000343726:exon_10354263_10354414:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000397117:exon_10354263_10354414:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000383801:exon_10354263_10354414:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000416388:exon_10354263_10354414:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000477547:exon_10354263_10354414:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000438200:exon_10354263_10354414:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000482647:exon_10354263_10354518:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000397105:exon_10354263_10354414:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000431352:exon_10354330_10354414:SEC13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 11596348 C/T 1 12 8 20 5.33606452292974 4.44262365138018 0.893440871549561 T:C C T 10 0.555327956422522 0.823148310222236 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 11600101 G/T 1 15 10 25 6.67008065366217 5.55327956422522 1.11680108943695 T:G G T 10 0.555327956422522 0.692593351989186 ENSG00000144560:ENST00000273038:exon_11597544_11600301:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000413604:exon_11599543_11600301:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000451674:exon_11599817_11600301:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424529:exon_11599944_11600301:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000426568:exon_11599950_11600301:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11599950_11600301:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000404339:exon_11599963_11600301:VGLL4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 11887991 C/G 1 12 14 26 5.33606452292974 7.77459138991531 -2.43852686698557 C:G C G 10 0.555327956422522 0.430498156832276 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11887976_11888393:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11887976_11888246:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11887976_11888355:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11887976_11888253:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11887976_11888366:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11887976_11888359:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000494388:exon_11887976_11888338:C3orf31 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 12962074 G/A 1 53 36 89 23.5676183096063 19.9918064312108 3.57581187839554 A:G G A 10 0.555327956422522 0.457732527355876 ENSG00000144711:ENST00000273221:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000435445:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000450726:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000429247:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000452608:exon_12961930_12962096:IQSEC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 68 61 129 30.2376989632685 33.8750053417738 -3.63730637850534 T:C C T 10 0.555327956422522 0.535957326242911 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 47 47 94 20.8995860481415 26.1004139518585 -5.20082790371706 T:G G T 10 0.555327956422522 0.300033844728847 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 13367406 C/T 1 35 48 83 15.5635215252117 26.6557419082811 -11.0922203830693 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0151267993305701 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 59 36 95 26.2356505710712 19.9918064312108 6.24384413986041 A:G G A 10 0.555327956422522 0.215976829656066 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 13379400 C/T 1 61 42 103 27.1249946582262 23.3237741697459 3.80122048848024 T:C C T 10 0.555327956422522 0.488369153523519 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13379337_13379417:NUP210 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 13383540 A/G 1 108 96 204 48.0245807063676 53.3114838165621 -5.28690311019448 A:C:G A G 10 0.555327956422522 0.48134508117670 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13383496_13383623:NUP210 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 13395475 G/C 1 25 36 61 11.116801089437 19.9918064312108 -8.87500534177384 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0277988334105752 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 13395579 C/A 1 32 44 76 14.2295053944793 24.434430082591 -10.2049246881117 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0207466865400679 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 13407556 T/C 1 20 24 44 8.89344087154956 13.3278709541405 -4.43443008259097 T:C T C 10 0.555327956422522 0.224518747568463 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13407446_13407591:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13407446_13407591:NUP210 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 13421150 C/T 1 15 19 34 6.67008065366217 10.5512311720279 -3.88115051836575 T:C C T 10 0.555327956422522 0.226744754730006 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13421063_13421221:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13421063_13421221:NUP210 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 14174427 A/T 1 24 15 39 10.6721290458595 8.32991934633783 2.34220969952164 A:T A T 10 0.555327956422522 0.520690575426974 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14174366_14174435:TMEM43 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 14175262 T/C 1 26 16 42 11.5614731330144 8.88524730276035 2.67622583025408 T:C T C 10 0.555327956422522 0.440894103867154 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14175239_14175309:TMEM43 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 14187449 G/T 1 79 61 140 35.1290914426208 33.8750053417738 1.25408610084692 T:G G T 10 0.555327956422522 0.86519923941142 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14186647_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14186650_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14187229_14187659:XPC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 14199887 G/A 1 45 34 79 20.0102419609865 18.8811505183657 1.12909144262077 A:G G A 10 0.555327956422522 0.821862749119556 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 15115270 G/T 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 T:C:G G T 10 0.555327956422522 0.150211231786478 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15111580_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15115112_15116437:ZFYVE20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 15476011 C/G 1 13 15 28 5.78073656650721 8.32991934633783 -2.54918277983062 C:G C G 10 0.555327956422522 0.347681760793844 ENSG00000144597:ENST00000396842:exon_15475855_15476045:EAF1;ENSG00000144597:ENST00000432764:exon_15475855_15476045:EAF1;ENSG00000144597:ENST00000449565:exon_15475855_15476045:EAF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 16343340 T/C 1 15 14 29 6.67008065366217 7.77459138991531 -1.10451073625314 T:C T C 10 0.555327956422522 0.711532833974462 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16343133_16343375:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16343133_16343375:OXNAD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 17051328 T/C 1 9 9 18 4.0020483921973 4.9979516078027 -0.995903215605395 T:C T C 10 0.555327956422522 0.643952874691603 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 17051450 C/A 1 9 11 20 4.0020483921973 6.10860752064774 -2.10655912845044 A:C C A 10 0.555327956422522 0.374427217398125 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 19992432 G/T 1 15 14 29 6.67008065366217 7.77459138991531 -1.10451073625314 T:G G T 10 0.555327956422522 0.711532833974462 ENSG00000144566:ENST00000273047:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000443878:exon_19992298_19992436:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000412966:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000446547:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000422242:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000476544:exon_19992298_19992717:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000455772:exon_19992298_19992553:RAB5A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 33038747 C/G 1 28 19 47 12.4508172201694 10.5512311720279 1.89958604814147 C:G C G 10 0.555327956422522 0.6604821888971 ENSG00000170266:ENST00000399402:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33038221_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33038226_33038836:GLB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 33138549 G/A 1 13 7 20 5.78073656650721 3.88729569495765 1.89344087154956 A:G G A 10 0.555327956422522 0.501729600552412 ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33138503_33138722:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000482097:exon_33138503_33138610:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000485698:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000498537:exon_33138503_33138634:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000415454:exon_33138503_33138613:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000438227:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000440656:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000436768:exon_33138503_33138694:GLB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 33155782 G/A 1 43 34 77 19.1208978738316 18.8811505183657 0.239747355465809 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33155471_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33155531_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33155546_33156040:CRTAP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 33161898 C/T 1 22 27 49 9.78278495870452 14.9938548234081 -5.21106986470358 T:C C T 10 0.555327956422522 0.151070316195741 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000485310:exon_33161836_33161985:CRTAP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 33879770 G/A 1 15 12 27 6.67008065366217 6.66393547707026 0.0061451765919065 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33879696_33879819:PDCD6IP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 42 35 77 18.6762258302541 19.4364784747883 -0.760252644534194 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.908885191268183 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 42 43 85 18.6762258302541 23.8791021261684 -5.20287629591437 A:G A G 10 0.555327956422522 0.275797508941954 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 37053568 A/G 1 16 13 29 7.11475269723965 7.21926343349279 -0.104510736253137 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000076242:ENST00000231790:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000457004:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000432299:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000396438:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000456676:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000458205:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000455445:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000435176:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000441265:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000383761:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000421440:exon_37053532_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000447829:exon_37053533_37053590:MLH1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 37340341 G/A 1 27 9 36 12.0061451765919 4.9979516078027 7.00819356878921 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0189323198622146 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37340324_37340511:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000435830:exon_37340324_37340511:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37340324_37340511:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000450863:exon_37340324_37340511:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37340324_37340511:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37340324_37340511:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37340324_37340511:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37340324_37340511:GOLGA4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 37366459 C/A 1 27 27 54 12.0061451765919 14.9938548234081 -2.98770964681619 A:C C A 10 0.555327956422522 0.415371111688778 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 37368755 T/A 1 26 34 60 11.5614731330144 18.8811505183657 -7.31967738535132 A:T T A 10 0.555327956422522 0.0683785539008381 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 38047680 G/A 1 6 12 18 2.66803226146487 6.66393547707026 -3.9959032156054 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0940345725776817 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000488209:exon_38047672_38047695:VILL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 10 6 16 4.44672043577478 3.33196773853513 1.11475269723965 C:G G C 10 0.555327956422522 0.624513862012014 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 38170810 C/G 1 19 10 29 8.44876882797208 5.55327956422522 2.89548926374686 C:G C G 10 0.555327956422522 0.351058594008537 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000418880:exon_38170781_38170879:ACAA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 38565410 G/A 1 5 8 13 2.22336021788739 4.44262365138018 -2.21926343349279 A:G G A 10 0.555327956422522 0.268109731741661 ENSG00000157036:ENST00000412107:exon_38565392_38565904:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000436414:exon_38565392_38566359:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000287675:exon_38565392_38567442:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000358249:exon_38565392_38565436:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000431472:exon_38565392_38565908:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000447573:exon_38565392_38566309:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000422077:exon_38565392_38566190:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000454803:exon_38565392_38565894:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000438992:exon_38565392_38566059:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000457367:exon_38565392_38566612:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000450732:exon_38565392_38565551:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000474071:exon_38565392_38565436:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000483749:exon_38565392_38565737:EXOG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 39228795 C/G 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 C:G C G 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000168334:ENST00000396251:exon_39227580_39231016:XIRP1;ENSG00000168334:ENST00000340369:exon_39224706_39231016:XIRP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 39431081 G/A 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:G G A 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39430986_39431107:SLC25A38;ENSG00000144659:ENST00000431510:exon_39430986_39431107:SLC25A38 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 61 30 91 27.1249946582262 16.6598386926757 10.4651559655505 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0270495587648529 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 40498845 C/T 1 13 20 33 5.78073656650721 11.1065591284504 -5.32582256194322 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0787801500475162 ENSG00000188846:ENST00000338970:exon_40498783_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000465325:exon_40498794_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 40498920 A/T 1 25 2 27 11.116801089437 1.11065591284504 10.0061451765919 A:T A T 10 0.555327956422522 4.67659402334358e-05 ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000435633:exon_40498854_40499238:RPL14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 41280827 C/T 1 68 67 135 30.2376989632685 37.206973080309 -6.96927411704046 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.260166696368909 ENSG00000168036:ENST00000405570:exon_41280625_41280844:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396183:exon_41280625_41280845:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000349496:exon_41280625_41281936:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000447363:exon_41280625_41281936:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000453024:exon_41280625_41280845:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396190:exon_41280625_41281939:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396185:exon_41280625_41280845:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000471014:exon_41280624_41280845:CTNNB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 42236415 A/G 1 16 15 31 7.11475269723965 8.32991934633783 -1.21516664909818 A:G A G 10 0.555327956422522 0.719325364600599 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000484786:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000449246:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000427771:exon_42236296_42236433:TRAK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 42251263 C/T 1 16 15 31 7.11475269723965 8.32991934633783 -1.21516664909818 T:C C T 10 0.555327956422522 0.719325364600599 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 42251329 C/T 1 12 10 22 5.33606452292974 5.55327956422522 -0.217215041295483 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 18 24 42 8.0040967843946 13.3278709541405 -5.32377416974592 A:C:G A G 10 0.555327956422522 0.119927124185076 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 42610515 G/A 1 17 24 41 7.55942474081713 13.3278709541405 -5.7684462133234 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0834111646322127 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 43602803 C/T 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000160746:ENST00000292246:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000350459:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000396091:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000414522:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000451430:exon_43602712_43602894:ANO10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 44692564 C/G 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000169981:ENST00000396056:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000415571:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000432115:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000296092:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000399560:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000453164:exon_44692433_44692751:ZNF35 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 45779136 A/T 1 12 7 19 5.33606452292974 3.88729569495765 1.44876882797208 A:T A T 10 0.555327956422522 0.645874384560469 ENSG00000211456:ENST00000455997:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000418611:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000389061:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000441228:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000433336:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000464102:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000471207:exon_45778736_45779144:SACM1L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 46009414 C/T 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 T:C C T 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 46009487 G/A 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:G G A 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 47036756 C/G 1 63 58 121 28.0143387453811 32.2090214725063 -4.19468272712515 C:G C G 10 0.555327956422522 0.464942739075141 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000296147:exon_47036522_47037091:NBEAL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 193 182 375 85.8217044104533 101.069688068899 -15.2479836584457 A:C:G C G 10 0.555327956422522 0.119045055587065 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 47045846 C/T 1 110 95 205 48.9139247935226 52.7561558601396 -3.842231066617 T:C C T 10 0.555327956422522 0.62291423948459 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 52 65 117 23.1229462660289 36.0963171674639 -12.9733709014351 A:G G A 10 0.555327956422522 0.019653489974414 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 47162661 A/G 1 31 31 62 13.7848333509018 17.2151666490982 -3.43033329819636 A:T:G A G 10 0.555327956422522 0.443496921378228 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 47378060 A/C 1 24 10 34 10.6721290458595 5.55327956422522 5.11884948163425 A:C A C 10 0.555327956422522 0.0855901040834441 ENSG00000114648:ENST00000455924:exon_47378010_47378287:KLHL18;ENSG00000114648:ENST00000232766:exon_47378025_47378247:KLHL18;ENSG00000114648:ENST00000461084:exon_47378025_47380312:KLHL18;ENSG00000114648:ENST00000442272:exon_47378025_47378247:KLHL18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 47452118 G/A 1 11 7 18 4.89139247935226 3.88729569495765 1.0040967843946 A:G G A 10 0.555327956422522 0.813417267911682 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 16 24 40 7.11475269723965 13.3278709541405 -6.21311825690088 A:G G A 10 0.555327956422522 0.055961444375052 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 47459679 C/T 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 T:C C T 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000383739:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47459624_47459739:SCAP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 47460980 G/A 1 20 13 33 8.89344087154956 7.21926343349279 1.67417743805678 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.603041384471736 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47460818_47461194:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47460818_47461194:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47460818_47461194:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47460818_47461194:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000416208:exon_47460875_47461194:SCAP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 49719799 C/T 1 52 34 86 23.1229462660289 18.8811505183657 4.24179574766311 T:C C T 10 0.555327956422522 0.386496753364926 ENSG00000164062:ENST00000296456:exon_49719781_49719869:APEH;ENSG00000164062:ENST00000438011:exon_49719781_49719869:APEH;ENSG00000164062:ENST00000469362:exon_49719781_49719869:APEH HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 49738945 C/T 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:C C T 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000432042:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000494005:exon_49738924_49739041:RNF123 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 49751585 C/T 1 15 10 25 6.67008065366217 5.55327956422522 1.11680108943695 T:C C T 10 0.555327956422522 0.692593351989186 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000469978:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000444689:exon_49751523_49751607:RNF123 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 49758764 A/G 1 27 24 51 12.0061451765919 13.3278709541405 -1.32172577754862 A:G A G 10 0.555327956422522 0.778554121667431 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 49847623 A/G 1 10 10 20 4.44672043577478 5.55327956422522 -1.10655912845044 A:G A G 10 0.555327956422522 0.657502601953682 ENSG00000182179:ENST00000473992:exon_49847411_49847783:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000489826:exon_49847412_49847861:UBA7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 50326020 G/A 1 44 47 91 19.565569917409 26.1004139518585 -6.5348440344495 A:G G A 10 0.555327956422522 0.171826557200856 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000426499:exon_50326014_50326070:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000464258:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000486322:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000492387:exon_50325943_50326142:IFRD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 50327429 A/G 1 19 10 29 8.44876882797208 5.55327956422522 2.89548926374686 A:G A G 10 0.555327956422522 0.351058594008537 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50327360_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000414734:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000483071:exon_50327143_50327501:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000489569:exon_50327360_50327517:IFRD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 50334231 T/A 1 13 17 30 5.78073656650721 9.44057525918287 -3.65983869267566 A:T T A 10 0.555327956422522 0.200611829751137 ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 50355548 G/A 1 3 8 11 1.33401613073243 4.44262365138018 -3.10860752064774 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0718999345122269 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50355221_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50355227_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50355240_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50355243_50355970:HYAL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 50355730 T/G 1 12 8 20 5.33606452292974 4.44262365138018 0.893440871549561 T:G T G 10 0.555327956422522 0.823148310222236 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50355221_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50355227_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50355240_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50355243_50355970:HYAL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 1 10 10 20 4.44672043577478 5.55327956422522 -1.10655912845044 T:G T G 10 0.555327956422522 0.657502601953682 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 50645158 A/G 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000114737:ENST00000491847:exon_50643921_50645573:CISH;ENSG00000114737:ENST00000443053:exon_50643927_50645573:CISH;ENSG00000114737:ENST00000348721:exon_50643953_50645573:CISH HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 51430657 A/C 1 129 112 241 57.3626936214947 62.1967311193225 -4.8340374978278 A:C A C 10 0.555327956422522 0.559803845787656 ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 51737965 G/A 1 26 33 59 11.5614731330144 18.3258225619432 -6.7643494289288 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0882927279170919 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 43 37 80 19.1208978738316 20.5471343876333 -1.42623651380176 A:T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.822157109656556 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 52563337 G/A 1 55 33 88 24.4569623967613 18.3258225619432 6.13113983481806 A:G G A 10 0.555327956422522 0.199358241351594 ENSG00000168268:ENST00000307092:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000307076:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000422318:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000459839:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000492555:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000489316:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000471522:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000487779:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000490681:exon_52563166_52563350:NT5DC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 52720080 A/C 1 22 21 43 9.78278495870452 11.661887084873 -1.87910212616845 A:C A C 10 0.555327956422522 0.645850639619903 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 15 9 24 6.67008065366217 4.9979516078027 1.67212904585947 T:C C T 10 0.555327956422522 0.543438783557522 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 53125922 T/C 1 31 21 52 13.7848333509018 11.661887084873 2.12294626602886 T:C T C 10 0.555327956422522 0.579834100291356 ENSG00000163933:ENST00000296292:exon_53122499_53126086:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000394738:exon_53125681_53126086:RFT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 120 105 225 53.3606452292974 58.3094354243648 -4.94879019506745 A:G G A 10 0.555327956422522 0.546125804250339 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 53 66 119 23.5676183096063 36.6516451238865 -13.0840268142801 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0165119751815938 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 53262106 G/C 1 173 276 449 76.9282635389037 153.270515972616 -76.3422524337124 C:G G C 10 0.555327956422522 6.3936775200526e-13 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53262072_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53262072_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53262072_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53262072_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53262072_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53262072_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53262072_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53262072_53262165:TKT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 23 17 40 10.227457002282 9.44057525918287 0.786881743099121 A:C A C 10 0.555327956422522 0.874297431714736 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 53883722 C/G 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 C:G C G 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000494338:exon_53883682_53883822:IL17RB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 58104608 C/G 1 12 6 18 5.33606452292974 3.33196773853513 2.0040967843946 C:G C G 10 0.555327956422522 0.477948616778315 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58104599_58104716:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58104599_58104716:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58104599_58104716:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58104599_58104716:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58104599_58104716:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58104599_58104716:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58104599_58104716:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58104599_58104716:FLNB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 58109162 G/A 1 34 12 46 15.1188494816343 6.66393547707026 8.45491400456399 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0116883549011859 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58108820_58109417:FLNB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 53 35 88 23.5676183096063 19.4364784747883 4.13113983481806 T:C C T 10 0.555327956422522 0.392785355354002 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 58191266 C/T 1 1 8 9 0.444672043577478 4.44262365138018 -3.9979516078027 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0133428681828177 ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58191217_58191287:DNASE1L3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 58196639 C/T 0 10 0 10 4.44672043577478 0 4.44672043577478 C C 10 0.555327956422522 0.00309157318156107 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58196493_58196696:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58196493_58196950:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000463694:exon_58196493_58196647:DNASE1L3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 63967900 A/G 1 8 9 17 3.55737634861982 4.9979516078027 -1.44057525918287 A:G A G 10 0.555327956422522 0.626853565320545 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63967862_63968121:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63967862_63968121:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63967862_63968121:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63967862_63968121:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63967862_63968121:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000488239:exon_63967862_63968099:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000466529:exon_63967863_63968121:ATXN7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 63982082 G/A 1 7 11 18 3.11270430504235 6.10860752064774 -2.9959032156054 A:G G A 10 0.555327956422522 0.163703578976710 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000522345:exon_63981986_63982159:ATXN7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 64009102 G/T 1 100 79 179 44.4672043577478 43.8709085573792 0.596295800368566 T:G G T 10 0.555327956422522 0.940219733572181 ENSG00000163636:ENST00000295901:exon_64008951_64009236:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000476464:exon_64007994_64009113:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000492933:exon_64008951_64009148:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000482510:exon_64009068_64009134:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000475036:exon_64008727_64009154:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000497323:exon_64009068_64009134:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000478185:exon_64008951_64009132:PSMD6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 66431275 G/A 1 25 14 39 11.116801089437 7.77459138991531 3.34220969952164 A:G G A 10 0.555327956422522 0.334702054721937 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66431001_66431285:LRIG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 69096614 G/A 1 10 12 22 4.44672043577478 6.66393547707026 -2.21721504129548 A:G G A 10 0.555327956422522 0.393799982731658 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 69151152 C/A 1 51 54 105 22.6782742224514 29.9877096468162 -7.30943542436481 A:C C A 10 0.555327956422522 0.169139962353103 ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000435015:exon_69151060_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69151110_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000470936:exon_69150990_69151381:ARL6IP5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 73111973 A/G 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 A:G A G 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 73111998 C/T 1 2 6 8 0.889344087154956 3.33196773853513 -2.44262365138018 T:C C T 10 0.555327956422522 0.150542848470395 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 73114003 T/C 1 20 11 31 8.89344087154956 6.10860752064774 2.78483335090182 T:C T C 10 0.555327956422522 0.3684833918503 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000482242:exon_73114003_73114133:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000488810:exon_73114003_73114117:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 78700901 G/T 0 11 0 11 4.89139247935226 0 4.89139247935226 G G 10 0.555327956422522 0.00168338880649373 ENSG00000169855:ENST00000398414:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000398412:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000343019:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000436010:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000464233:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000495273:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000467549:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000498428:exon_78700882_78701079:ROBO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 78717343 C/T 0 16 0 16 7.11475269723965 0 7.11475269723965 C C 10 0.555327956422522 0.000130838913231159 ENSG00000169855:ENST00000398414:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000398412:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000343019:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000436010:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000464233:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000495273:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000467549:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000498428:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000484514:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000495961:exon_78717284_78717452:ROBO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 87276699 C/T 1 39 51 90 17.3422096995216 28.3217257775486 -10.979516078027 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0253769993878510 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87276421_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87276435_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87276452_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87276459_87276706:CHMP2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 87295049 T/C 1 25 32 57 11.116801089437 17.7704946055207 -6.65369351608375 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0835602425917244 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87294864_87295058:CHMP2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 87299075 A/C 1 11 10 21 4.89139247935226 5.55327956422522 -0.661887084872961 A:C A C 10 0.555327956422522 0.828131296920228 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87299025_87299127:CHMP2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 101283792 C/G 1 50 32 82 22.2336021788739 17.7704946055207 4.4631075733532 C:G C G 10 0.555327956422522 0.374205443659479 ENSG00000174173:ENST00000309922:exon_101283614_101285290:RG9MTD1;ENSG00000174173:ENST00000495642:exon_101283614_101284561:RG9MTD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 105260518 G/A 1 16 24 40 7.11475269723965 13.3278709541405 -6.21311825690088 A:G G A 10 0.555327956422522 0.055961444375052 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000481337:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105260477_105260609:ALCAM HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 112059768 C/G 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 C:G C G 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112059749_112059830:CD200 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 112063850 C/A 1 16 26 42 7.11475269723965 14.4385268669856 -7.32377416974592 A:C C A 10 0.555327956422522 0.028824563663687 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112063809_112064135:CD200 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 112066562 G/A 1 18 12 30 8.0040967843946 6.66393547707026 1.34016130732434 A:G G A 10 0.555327956422522 0.714800037991546 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112066410_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112066410_112066677:CD200 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 112184927 A/G 1 42 20 62 18.6762258302541 11.1065591284504 7.56966670180364 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0557616177990842 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 112185025 G/A 1 78 70 148 34.6844193990433 38.8729569495765 -4.18853755053325 A:G G A 10 0.555327956422522 0.508716408876745 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112184955_112185230:BTLA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 112256630 A/G 1 24 25 49 10.6721290458595 13.883198910563 -3.21106986470358 A:G A G 10 0.555327956422522 0.389814311107083 ENSG00000144848:ENST00000283290:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000402314:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000495756:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000467275:exon_112256378_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000496423:exon_112256582_112256737:ATG3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 112299732 A/G 1 19 16 35 8.44876882797208 8.88524730276035 -0.436478474788268 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000138459:ENST00000492406:exon_112299393_112300173:SLC35A5;ENSG00000138459:ENST00000460713:exon_112299393_112300173:SLC35A5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 112642568 C/G 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 C:G C G 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000163606:ENST00000471858:exon_112640056_112642646:CD200R1;ENSG00000163606:ENST00000308611:exon_112641537_112642646:CD200R1;ENSG00000163606:ENST00000295863:exon_112641835_112642646:CD200R1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 112642572 T/C 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 T:C T C 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000163606:ENST00000471858:exon_112640056_112642646:CD200R1;ENSG00000163606:ENST00000308611:exon_112641537_112642646:CD200R1;ENSG00000163606:ENST00000295863:exon_112641835_112642646:CD200R1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 119128398 G/A 1 19 14 33 8.44876882797208 7.77459138991531 0.674177438056775 A:G G A 10 0.555327956422522 0.862490050438795 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119128343_119128623:ARHGAP31 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 119222456 G/C 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 C:G G C 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000492164:exon_119222379_119222467:C3orf1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 119263518 G/C 1 50 36 86 22.2336021788739 19.9918064312108 2.24179574766311 C:G G C 10 0.555327956422522 0.665237737372238 ENSG00000121594:ENST00000264246:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383669:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383668:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000478182:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000463729:exon_119263190_119263714:CD80 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 119305169 G/A 1 30 28 58 13.3401613073243 15.5491827798306 -2.20902147250628 A:T:C:G G A 10 0.555327956422522 0.598268997181195 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119305132_119305210:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 119305379 T/A 1 21 22 43 9.33811291512704 12.2172150412955 -2.87910212616845 A:T T A 10 0.555327956422522 0.443426847321452 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 119327653 T/C 1 83 74 157 36.9077796169307 41.0942687752666 -4.18648915833595 T:C T C 10 0.555327956422522 0.521102289694287 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119327617_119327746:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119327617_119327794:PLA1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 119331874 C/T 1 61 65 126 27.1249946582262 36.0963171674639 -8.97132250923777 T:C C T 10 0.555327956422522 0.127200586438125 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 119331892 C/G 1 68 68 136 30.2376989632685 37.7623010367315 -7.52460207346299 C:G C G 10 0.555327956422522 0.19675230297768 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 121154974 T/C 1 14 6 20 6.22540861008469 3.33196773853513 2.89344087154956 T:C T C 10 0.555327956422522 0.261033291477746 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121154969_121155122:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121154969_121155122:POLQ HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 121208176 T/C 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 T:C T C 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121206149_121209255:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121206149_121209255:POLQ HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 121208833 G/C 1 4 11 15 1.77868817430991 6.10860752064774 -4.32991934633783 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0349050371317493 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121206149_121209255:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121206149_121209255:POLQ HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 122259640 T/C 1 67 68 135 29.793026919691 37.7623010367315 -7.96927411704047 T:C T C 10 0.555327956422522 0.193748872995916 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 122290579 C/T 1 15 16 31 6.67008065366217 8.88524730276035 -2.21516664909818 T:C C T 10 0.555327956422522 0.471945862571681 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122290525_122294050:DTX3L;ENSG00000163840:ENST00000383661:exon_122290525_122290594:DTX3L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 122418750 G/A 1 135 113 248 60.0307258829595 62.752059075745 -2.72133319278544 A:G G A 10 0.555327956422522 0.749545405261632 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122418237_122420482:PARP14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 122419083 C/A 1 72 64 136 32.0163871375784 35.5409892110414 -3.52460207346299 A:C C A 10 0.555327956422522 0.54710278473701 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122418237_122420482:PARP14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 122446642 C/T 1 5 15 20 2.22336021788739 8.32991934633783 -6.10655912845044 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00669247932999867 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 122459477 A/G 1 5 10 15 2.22336021788739 5.55327956422522 -3.32991934633783 A:G A G 10 0.555327956422522 0.117258617190494 ENSG00000169087:ENST00000383659:exon_122458846_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000471534:exon_122458850_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000306103:exon_122458850_122459722:HSPBAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 123634046 G/A 1 37 26 63 16.4528656123667 14.4385268669856 2.01433874538112 A:G G A 10 0.555327956422522 0.704045544538866 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123632300_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123632564_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123632572_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123632574_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123633166_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000483247:exon_123633509_123634136:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000419247:exon_123634046_123634136:CCDC14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 124515308 A/G 1 12 9 21 5.33606452292974 4.9979516078027 0.338112915127039 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 124515314 G/A 1 11 7 18 4.89139247935226 3.88729569495765 1.0040967843946 A:G G A 10 0.555327956422522 0.813417267911682 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 124515395 G/A 1 14 15 29 6.22540861008469 8.32991934633783 -2.10451073625314 A:G G A 10 0.555327956422522 0.459182512082066 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000474838:exon_124515387_124515664:ITGB5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 124515636 C/T 1 14 11 25 6.22540861008469 6.10860752064774 0.11680108943695 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000474838:exon_124515387_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000496703:exon_124515438_124515664:ITGB5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 124689451 C/T 1 17 19 36 7.55942474081713 10.5512311720279 -2.99180643121079 T:C C T 10 0.555327956422522 0.320267909966196 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124684554_124689645:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000487661:exon_124686321_124689645:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000480667:exon_124689265_124689645:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000482699:exon_124689397_124689645:HEG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 124728626 A/G 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 A:G A G 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124728549_124728668:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000488654:exon_124728359_124728668:HEG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 124731689 T/A 1 17 30 47 7.55942474081713 16.6598386926757 -9.10041395185853 A:T T A 10 0.555327956422522 0.0081699148286788 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 124732618 A/G 1 18 23 41 8.0040967843946 12.772542997718 -4.7684462133234 A:G A G 10 0.555327956422522 0.157329387783005 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124732316_124732834:HEG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 124738107 C/T 1 19 9 28 8.44876882797208 4.9979516078027 3.45081722016939 T:C C T 10 0.555327956422522 0.253687296893627 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124738106_124738340:HEG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 124739892 G/A 1 9 6 15 4.0020483921973 3.33196773853513 0.670080653662171 A:G G A 10 0.555327956422522 0.799910806218814 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124739636_124739974:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124739636_124739974:HEG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 124746049 A/G 1 32 10 42 14.2295053944793 5.55327956422522 8.67622583025408 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00770289001488484 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 124746182 C/A 1 15 5 20 6.67008065366217 2.77663978211261 3.89344087154956 A:C C A 10 0.555327956422522 0.113443509114618 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 124748226 G/A 1 12 5 17 5.33606452292974 2.77663978211261 2.55942474081713 A:G G A 10 0.555327956422522 0.233437199703189 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124748039_124748332:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124748039_124748332:HEG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 36 31 67 16.0081935687892 17.2151666490982 -1.20697308030897 T:C C T 10 0.555327956422522 0.806338054003419 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 126191011 G/A 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126190996_126191148:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000515545:exon_126190996_126191148:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126190996_126191148:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000336332:exon_126190996_126191148:ZXDC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 126194076 T/C 1 13 11 24 5.78073656650721 6.10860752064774 -0.327870954140527 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126193802_126194762:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126193802_126194708:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000336332:exon_126193802_126194708:ZXDC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 126708342 C/T 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000114554:ENST00000393409:exon_126707437_126708630:PLXNA1;ENSG00000114554:ENST00000251772:exon_126707502_126708630:PLXNA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 127295510 G/A 1 25 21 46 11.116801089437 11.661887084873 -0.545085995436011 A:G G A 10 0.555327956422522 0.883074147030052 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127295460_127295539:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127295460_127295539:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127295460_127295539:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127295460_127295539:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127295460_127295539:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127295460_127295539:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000490290:exon_127295460_127295539:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000469111:exon_127295460_127295539:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000490643:exon_127295459_127295539:TPRA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 127413881 T/C 1 40 54 94 17.7868817430991 29.9877096468162 -12.2008279037171 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0125743218713109 ENSG00000074416:ENST00000434178:exon_127413818_127414033:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000265052:exon_127413818_127414033:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000398104:exon_127413818_127414033:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000496306:exon_127413818_127414033:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000476682:exon_127413818_127414033:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000398101:exon_127413818_127414033:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000453507:exon_127413818_127414033:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000484451:exon_127413818_127414033:MGLL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 128890350 G/A 1 360 260 620 160.081935687892 144.385268669856 15.6966670180364 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0.210444461594028 ENSG00000169714:ENST00000502976:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000422453:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000451728:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000446936:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000307433:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000393290:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000500450:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000504813:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000441626:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000502372:exon_128889922_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000512338:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000507573:exon_128890095_128890614:CNBP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 128976396 T/C 1 31 43 74 13.7848333509018 23.8791021261684 -10.0942687752666 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0193710823673184 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 128984583 C/T 1 72 66 138 32.0163871375784 36.6516451238865 -4.63525798630803 T:C C T 10 0.555327956422522 0.441571649103067 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000513410:exon_128984392_128984635:COPG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 129023630 G/A 1 76 66 142 33.7950753118883 36.6516451238865 -2.85656981199812 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0.67306873822323 ENSG00000183624:ENST00000383463:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000417226:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000502878:exon_129023432_129024146:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000389735:exon_129023432_129024105:C3orf37 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 129286413 G/C 1 7 1 8 3.11270430504235 0.555327956422522 2.55737634861982 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0837859633971926 ENSG00000004399:ENST00000324093:exon_129286335_129286447:PLXND1;ENSG00000004399:ENST00000393239:exon_129286335_129286447:PLXND1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 130449248 G/A 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000196455:ENST00000356763:exon_130449152_130449286:PIK3R4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 130718472 G/A 1 45 58 103 20.0102419609865 32.2090214725063 -12.1987795115198 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0171786032464605 ENSG00000017260:ENST00000504381:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000505330:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507488:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000510168:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000508532:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000513801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504948:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000328560:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000533801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000428331:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000393221:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000422190:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000359644:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000347421:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504612:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000514654:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507194:exon_130718362_130718503:ATP2C1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 133329943 G/A 1 15 18 33 6.67008065366217 9.9959032156054 -3.32582256194322 A:G G A 10 0.555327956422522 0.293705287922686 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133329848_133329985:TOPBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 133342218 C/T 1 18 17 35 8.0040967843946 9.44057525918287 -1.43647847478827 T:C C T 10 0.555327956422522 0.734278463498667 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133342155_133342301:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133342155_133342301:TOPBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 133342223 C/T 1 21 17 38 9.33811291512704 9.44057525918287 -0.102462344055835 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133342155_133342301:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133342155_133342301:TOPBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 133368362 T/G 1 14 17 31 6.22540861008469 9.44057525918287 -3.21516664909818 T:G T G 10 0.555327956422522 0.279937122020371 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000511439:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000509162:exon_133368227_133368786:TOPBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 133941320 C/T 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 T:C C T 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000163785:ENST00000460933:exon_133941262_133941383:RYK;ENSG00000163785:ENST00000296084:exon_133941262_133941383:RYK;ENSG00000163785:ENST00000427044:exon_133941262_133941383:RYK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 134225969 T/C 1 9 21 30 4.0020483921973 11.661887084873 -7.65983869267566 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00553310261218803 ENSG00000182923:ENST00000332047:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000354446:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000511574:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000413794:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000438820:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000383229:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000504013:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000512894:exon_134225951_134226095:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134225951_134226128:CEP63 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 134670524 C/T 1 24 16 40 10.6721290458595 8.88524730276035 1.78688174309912 T:C C T 10 0.555327956422522 0.634893171030186 ENSG00000154928:ENST00000398015:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000482618:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000360935:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000425716:exon_134670213_134670560:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000488154:exon_134670213_134670560:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000474732:exon_134670213_134670604:EPHB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 138218994 T/C 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 T:C T C 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000114107:ENST00000264982:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000489254:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000484888:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000474781:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000459695:exon_138218952_138219022:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000481834:exon_138218726_138219066:CEP70 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 138244400 C/T 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 T:C C T 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000114107:ENST00000264982:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000489254:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000484888:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000474781:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000481834:exon_138244332_138244406:CEP70 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 138289221 C/T 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 T:C C T 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000114107:ENST00000264982:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000484888:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000474781:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000481834:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000468900:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000462419:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000478673:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000464035:exon_138289160_138289340:CEP70 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 140675469 C/T 1 1 9 10 0.444672043577478 4.9979516078027 -4.55327956422522 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0068664951108094 ENSG00000114120:ENST00000446041:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000502756:exon_140675369_140675911:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000393015:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000515813:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000507429:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000324194:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000502594:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000453248:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000513887:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000512023:exon_140675367_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000512506:exon_140675469_140675533:SLC25A36 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 141162128 C/G 1 76 62 138 33.7950753118883 34.4303332981964 -0.635257986308027 C:G C G 10 0.555327956422522 0.931877557857429 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 141162185 T/G 1 76 65 141 33.7950753118883 36.0963171674639 -2.3012418555756 T:G T G 10 0.555327956422522 0.734857765251563 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 141464146 G/A 1 83 84 167 36.9077796169307 46.6475483394918 -9.73976872256117 A:G G A 10 0.555327956422522 0.139087982593693 ENSG00000114125:ENST00000273480:exon_141464001_141466402:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000480908:exon_141464001_141464542:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000393000:exon_141464001_141464544:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000477012:exon_141464001_141464511:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000477393:exon_141464001_141464359:RNF7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 142123914 C/T 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 T:C C T 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000114127:ENST00000264951:exon_142123749_142123918:XRN1;ENSG00000114127:ENST00000498077:exon_142123749_142123915:XRN1;ENSG00000114127:ENST00000392981:exon_142123749_142123918:XRN1;ENSG00000114127:ENST00000472697:exon_142123749_142123918:XRN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 142731072 A/G 1 31 44 75 13.7848333509018 24.434430082591 -10.6495967316891 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0145738322227394 ENSG00000163714:ENST00000488497:exon_142731064_142731195:AC018450.1;ENSG00000163714:ENST00000473835:exon_142731064_142731195:AC018450.1;ENSG00000163714:ENST00000493782:exon_142731064_142731195:AC018450.1;ENSG00000163714:ENST00000429264:exon_142731064_142731195:AC018450.1;ENSG00000163714:ENST00000319822:exon_142731064_142731195:AC018450.1;ENSG00000163714:ENST00000397933:exon_142731064_142731195:AC018450.1;ENSG00000163714:ENST00000461591:exon_142731064_142731195:AC018450.1;ENSG00000163714:ENST00000469950:exon_142731064_142731195:AC018450.1;ENSG00000163714:ENST00000493598:exon_142731064_142731195:AC018450.1;ENSG00000163714:ENST00000463563:exon_142731064_142731195:AC018450.1;ENSG00000163714:ENST00000470400:exon_142731064_142731195:AC018450.1;ENSG00000163714:ENST00000465175:exon_142731064_142731195:AC018450.1;ENSG00000163714:ENST00000485374:exon_142731064_142731215:AC018450.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 145809661 C/T 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000152952:ENST00000282903:exon_145809587_145809688:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000360060:exon_145809587_145809688:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000494950:exon_145809587_145809688:PLOD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 39 0 39 17.3422096995216 0 17.3422096995216 G G 10 0.555327956422522 1.31631084428712e-10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 148727133 G/A 1 15 21 36 6.67008065366217 11.661887084873 -4.99180643121079 A:G G A 10 0.555327956422522 0.13003425836145 ENSG00000163754:ENST00000345003:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000296048:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000353986:exon_148727063_148727187:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000484197:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000461191:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000497528:exon_148727063_148727176:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000479119:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000469873:exon_148726668_148727189:GYG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 148759325 T/C 1 13 17 30 5.78073656650721 9.44057525918287 -3.65983869267566 T:C T C 10 0.555327956422522 0.200611829751137 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000467858:exon_148759277_148759467:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000471807:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000497427:exon_148759277_148759831:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000483382:exon_148759288_148759455:HLTF HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 148759964 T/C 1 19 27 46 8.44876882797208 14.9938548234081 -6.54508599543601 T:C T C 10 0.555327956422522 0.054892096407043 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148759953_148760077:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148759953_148760077:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148759953_148760077:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148759953_148760077:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000467858:exon_148759953_148760077:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000471807:exon_148759953_148760048:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000483382:exon_148759953_148760048:HLTF HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 148786085 T/C 1 13 12 25 5.78073656650721 6.66393547707026 -0.883198910563049 T:C T C 10 0.555327956422522 0.841067314696951 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392913:exon_148786027_148786122:HLTF HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 148863151 A/G 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 A:G A G 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148863141_148863333:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000462030:exon_148863141_148863333:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148863141_148863333:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000486530:exon_148863141_148863333:HPS3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 148872987 G/A 1 11 5 16 4.89139247935226 2.77663978211261 2.11475269723965 A:G G A 10 0.555327956422522 0.325169767810241 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148872894_148873002:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148872894_148873002:HPS3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 154018887 G/C 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 155571275 T/C 1 15 11 26 6.67008065366217 6.10860752064774 0.561473133014428 T:C T C 10 0.555327956422522 0.84687533574258 ENSG00000169359:ENST00000392845:exon_155571012_155572167:SLC33A1;ENSG00000169359:ENST00000359479:exon_155571012_155572218:SLC33A1;ENSG00000169359:ENST00000475842:exon_155571160_155571280:SLC33A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 155632314 A/G 1 65 70 135 28.9036828325361 38.8729569495765 -9.96927411704047 A:G A G 10 0.555327956422522 0.099524993117565 ENSG00000163655:ENST00000496455:exon_155632208_155632359:GMPS;ENSG00000163655:ENST00000295920:exon_155632208_155632359:GMPS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 156870816 A/G 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000163660:ENST00000464316:exon_156869966_156872455:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000474539:exon_156868071_156871617:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000467081:exon_156870529_156870945:CCNL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 158320597 T/C 1 14 15 29 6.22540861008469 8.32991934633783 -2.10451073625314 T:C T C 10 0.555327956422522 0.459182512082066 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 158320703 C/A 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 A:C C A 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 158366900 G/A 1 10 19 29 4.44672043577478 10.5512311720279 -6.10451073625314 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0251377380545549 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478251:exon_158366830_158368809:GFM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 11 13 24 4.89139247935226 7.21926343349279 -2.32787095414053 T:C T C 10 0.555327956422522 0.412507168985383 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 160156318 A/G 1 22 15 37 9.78278495870452 8.32991934633783 1.45286561236669 A:G A G 10 0.555327956422522 0.74140646380221 ENSG00000248710:ENST00000483754:exon_160156020_160156974:RP11-432B6.3;ENSG00000213186:ENST00000309784:exon_160153291_160156974:TRIM59 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 160156431 C/T 1 13 18 31 5.78073656650721 9.9959032156054 -4.21516664909818 T:C C T 10 0.555327956422522 0.148914132603621 ENSG00000248710:ENST00000483754:exon_160156020_160156974:RP11-432B6.3;ENSG00000213186:ENST00000309784:exon_160153291_160156974:TRIM59 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 160243765 G/A 1 2 12 14 0.889344087154956 6.66393547707026 -5.77459138991531 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00216105207299794 ENSG00000186432:ENST00000334256:exon_160243726_160243895:KPNA4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 170893070 G/A 1 6 17 23 2.66803226146487 9.44057525918287 -6.77254299771801 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0055554415227636 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000468757:exon_170893041_170893119:TNIK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 170946002 A/G 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170945954_170946010:TNIK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 19 18 37 8.44876882797208 9.9959032156054 -1.54713438763331 A:G G A 10 0.555327956422522 0.623331482289855 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 174951756 T/C 1 10 57 67 4.44672043577478 31.6536935160838 -27.206973080309 T:C T C 10 0.555327956422522 9.55928430166764e-12 ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 176756189 T/G 1 14 16 30 6.22540861008469 8.88524730276035 -2.65983869267566 T:G T G 10 0.555327956422522 0.361419251986498 ENSG00000177565:ENST00000430069:exon_176756101_176756222:TBL1XR1;ENSG00000177565:ENST00000457928:exon_176756101_176756222:TBL1XR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 178938939 A/T 1 10 13 23 4.44672043577478 7.21926343349279 -2.772542997718 A:T A T 10 0.555327956422522 0.295526802222298 ENSG00000121879:ENST00000263967:exon_178938774_178938945:PIK3CA;ENSG00000121879:ENST00000462255:exon_178938774_178938945:PIK3CA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 179306775 C/T 1 49 45 94 21.7889301352964 24.9897580390135 -3.20082790371707 T:C C T 10 0.555327956422522 0.534256169436274 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179306073_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179306243_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179306257_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179306619_179306783:MRPL47 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 179322385 A/C 1 46 34 80 20.454914004564 18.8811505183657 1.57376348619824 A:C A C 10 0.555327956422522 0.737444539448027 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179322315_179322442:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179322315_179322428:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179322315_179322434:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179322315_179322437:MRPL47 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 180326548 A/C 1 16 9 25 7.11475269723965 4.9979516078027 2.11680108943695 A:C A C 10 0.555327956422522 0.428150577551636 ENSG00000163728:ENST00000296015:exon_180326489_180326598:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000412756:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000465065:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000470669:exon_180326489_180327791:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000382584:exon_180326489_180326598:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000465625:exon_180326489_180326598:TTC14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 35 21 56 15.5635215252117 11.661887084873 3.90163444033877 T:C T C 10 0.555327956422522 0.346994570203494 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 95 81 176 42.2438441398604 44.9815644702243 -2.73772033036386 T:C C T 10 0.555327956422522 0.70477595478906 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 183442219 A/G 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:G A G 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183442207_183442319:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183442207_183442319:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000273660:exon_183442207_183442319:YEATS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 183476685 G/A 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183476650_183476753:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183476650_183476753:YEATS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 183508590 A/G 1 10 13 23 4.44672043577478 7.21926343349279 -2.772542997718 A:G A G 10 0.555327956422522 0.295526802222298 ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183508585_183508768:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183508585_183508768:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000432781:exon_183508585_183508768:YEATS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 183508714 G/A 1 10 7 17 4.44672043577478 3.88729569495765 0.559424740817127 A:G G A 10 0.555327956422522 0.813340797660957 ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183508585_183508768:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183508585_183508768:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000432781:exon_183508585_183508768:YEATS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 45 42 87 20.0102419609865 23.3237741697459 -3.31353220875941 C:G C G 10 0.555327956422522 0.517879497909315 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 183560195 A/G 1 13 11 24 5.78073656650721 6.10860752064774 -0.327870954140527 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 184039666 A/G 1 162 122 284 72.0368710595514 67.7500106835477 4.28686037600376 A:G A G 10 0.555327956422522 0.633143636717066 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000457456:exon_184039070_184039815:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 9 27 36 4.0020483921973 14.9938548234081 -10.9918064312108 A:C C A 10 0.555327956422522 0.000294069148493372 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 184429578 G/T 1 29 20 49 12.8954892637469 11.1065591284504 1.78893013529642 T:G G T 10 0.555327956422522 0.667619460958624 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 0 1196 12 1208 531.827764118664 6.66393547707026 525.163828641593 T:G G T 10 0.555327956422522 3.99260326915722e-282 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 186509517 G/A 1 49 26 75 21.7889301352964 14.4385268669856 7.35040326831085 A:G G A 10 0.555327956422522 0.103397197655473 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 187089031 C/A 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 A:C C A 10 0.555327956422522 0.605558868068935 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 105 70 175 46.6905645756352 38.8729569495765 7.81760762605865 T:C C T 10 0.555327956422522 0.25408249967686 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 191093053 T/C 1 11 23 34 4.89139247935226 12.772542997718 -7.88115051836575 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0087461320712436 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 191093175 T/A 1 12 23 35 5.33606452292974 12.772542997718 -7.43647847478827 A:T T A 10 0.555327956422522 0.0160526125378347 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 191093310 A/G 1 14 13 27 6.22540861008469 7.21926343349279 -0.993854823408094 A:G A G 10 0.555327956422522 0.703574709140118 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 193333490 C/T 1 26 25 51 11.5614731330144 13.883198910563 -2.32172577754862 T:C C T 10 0.555327956422522 0.57370515277947 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193333463_193333559:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193333463_193333559:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193333463_193333559:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193333463_193333559:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193333463_193333559:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193333463_193333559:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392437:exon_193333463_193333559:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000419435:exon_193333463_193333559:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392436:exon_193333463_193333559:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000487986:exon_193333463_193333559:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000434811:exon_193333463_193333559:OPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 193334991 G/A 1 4 11 15 1.77868817430991 6.10860752064774 -4.32991934633783 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0349050371317493 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000419435:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392436:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000487986:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000434811:exon_193334967_193335074:OPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 12 42 54 5.33606452292974 23.3237741697459 -17.9877096468162 T:C:G T C 10 0.555327956422522 7.50590250280134e-07 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 193385059 G/A 1 11 14 25 4.89139247935226 7.77459138991531 -2.88319891056305 A:G G A 10 0.555327956422522 0.3145412245025 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000445863:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000429164:exon_193384965_193385069:OPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 194126697 T/C 1 58 53 111 25.7909785274937 29.4323816903937 -3.64140316289994 T:C T C 10 0.555327956422522 0.504718482832366 ENSG00000133657:ENST00000439040:exon_194123401_194126845:ATP13A3;ENSG00000133657:ENST00000429136:exon_194123406_194126845:ATP13A3;ENSG00000133657:ENST00000256031:exon_194123409_194126845:ATP13A3;ENSG00000133657:ENST00000461660:exon_194124194_194126845:ATP13A3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 194369579 C/A 1 2 7 9 0.889344087154956 3.88729569495765 -2.9979516078027 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0877066993700078 ENSG00000041802:ENST00000460584:exon_194369410_194369748:LSG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 194369580 C/A 1 2 7 9 0.889344087154956 3.88729569495765 -2.9979516078027 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0877066993700078 ENSG00000041802:ENST00000460584:exon_194369410_194369748:LSG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 194373832 T/C 1 24 25 49 10.6721290458595 13.883198910563 -3.21106986470358 T:C T C 10 0.555327956422522 0.389814311107083 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 194373833 G/A 1 26 23 49 11.5614731330144 12.772542997718 -1.21106986470358 A:G G A 10 0.555327956422522 0.77457305657742 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 194387300 C/T 1 14 18 32 6.22540861008469 9.9959032156054 -3.7704946055207 T:C C T 10 0.555327956422522 0.213585949813489 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194387181_194387301:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000427461:exon_194387181_194387301:LSG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 194790434 C/G 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 C:G C G 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000173950:ENST00000310380:exon_194789008_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000437101:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000355729:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000458652:exon_194790020_194790677:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000460582:exon_194790322_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000473200:exon_194790360_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000429994:exon_194790406_194790840:C3orf21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 195595513 C/T 1 9 9 18 4.0020483921973 4.9979516078027 -0.995903215605395 T:C C T 10 0.555327956422522 0.643952874691603 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000495247:exon_195595404_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195595088_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195595094_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000481865:exon_195595096_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000424563:exon_195595227_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000478623:exon_195595377_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000411741:exon_195595459_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000489628:exon_195595501_195595580:TNK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 195965680 C/T 1 24 14 38 10.6721290458595 7.77459138991531 2.89753765594416 T:C C T 10 0.555327956422522 0.415285067204515 ENSG00000161217:ENST00000419333:exon_195965579_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000292823:exon_195961239_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000431016:exon_195965422_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000460827:exon_195965662_195965765:PCYT1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 196215549 C/T 1 10 10 20 4.44672043577478 5.55327956422522 -1.10655912845044 T:C C T 10 0.555327956422522 0.657502601953682 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196215478_196215554:RNF168 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 22 13 35 9.78278495870452 7.21926343349279 2.56352152521173 T:C T C 10 0.555327956422522 0.401605428146735 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 196612579 G/A 1 11 21 32 4.89139247935226 11.661887084873 -6.7704946055207 A:G G A 10 0.555327956422522 0.019867489356194 ENSG00000119231:ENST00000323460:exon_196612022_196613565:SENP5;ENSG00000119231:ENST00000445299:exon_196612022_196613565:SENP5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 196674879 A/G 0 0 10 10 0 5.55327956422522 -5.55327956422522 G A G 10 0.555327956422522 0.000302272239171608 ENSG00000119227:ENST00000412723:exon_196673214_196675556:PIGZ;ENSG00000119227:ENST00000413127:exon_196673608_196675444:PIGZ HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 196742277 C/T 1 18 15 33 8.0040967843946 8.32991934633783 -0.325822561943225 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196742236_196742387:MFI2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 196865242 C/T 1 11 21 32 4.89139247935226 11.661887084873 -6.7704946055207 T:C C T 10 0.555327956422522 0.019867489356194 ENSG00000075711:ENST00000346964:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000357674:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000381807:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000314062:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000359922:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419354:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000452595:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000422288:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000448528:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000443183:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392382:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000450955:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419227:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392381:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000471733:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000447466:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000477312:exon_196865093_196865262:DLG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 197495334 G/A 1 42 46 88 18.6762258302541 25.545085995436 -6.86886016518194 A:G G A 10 0.555327956422522 0.162926854927548 ENSG00000122068:ENST00000428738:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000494309:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000415708:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000241502:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000392374:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000412924:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000418169:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000426031:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000424384:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000428395:exon_197495306_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000463136:exon_197495310_197495458:FYTTD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 3 197579466 C/T 1 7 9 16 3.11270430504235 4.9979516078027 -1.88524730276035 T:C C T 10 0.555327956422522 0.451827358588768 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000481048:exon_197579199_197579491:LRCH3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 437831 C/T 1 16 12 28 7.11475269723965 6.66393547707026 0.450817220169385 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000182903:ENST00000338977:exon_433777_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000511833:exon_435484_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000500625:exon_435484_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000503157:exon_437736_438221:ZNF721 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 515489 G/A 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 A:G G A 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504187:exon_515449_515750:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503111:exon_515449_516631:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506402:exon_515449_515641:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000509768:exon_515449_516632:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506898:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000507493:exon_515449_515730:PIGG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 517376 T/C 1 2 9 11 0.889344087154956 4.9979516078027 -4.10860752064774 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0150596095234126 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 517461 T/C 1 4 10 14 1.77868817430991 5.55327956422522 -3.77459138991531 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0577678010140113 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 517622 C/T 1 3 9 12 1.33401613073243 4.9979516078027 -3.66393547707026 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0418446542055081 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_517621_517702:PIGG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 520853 G/A 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_520828_521329:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000510235:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_520739_521019:PIGG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 527677 T/C 1 9 3 12 4.0020483921973 1.66598386926757 2.33606452292974 T:C T C 10 0.555327956422522 0.247371341375508 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_524629_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_525903_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504879:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_527421_527770:PIGG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 533001 T/C 1 11 5 16 4.89139247935226 2.77663978211261 2.11475269723965 T:C T C 10 0.555327956422522 0.325169767810241 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_532942_533154:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_532942_533985:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000515237:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000505800:exon_532942_533312:PIGG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 A:G A G 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 673772 C/T 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:C C T 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000507804:exon_673703_673807:MYL5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 1244879 A/G 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 A:G A G 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 1244916 A/G 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 1330759 T/C 1 26 30 56 11.5614731330144 16.6598386926757 -5.09836555966123 T:C T C 10 0.555327956422522 0.180472409455814 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1330649_1330778:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512289:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000506530:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503162:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 1343405 T/C 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 T:C T C 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000163945:ENST00000511216:exon_1343312_1343642:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000296312:exon_1343312_1343642:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000389851:exon_1343312_1343642:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000507531:exon_1343312_1343642:KIAA1530 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 1374695 C/A 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:C C A 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000163945:ENST00000511216:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000389851:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000507531:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000511563:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000512728:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000503548:exon_1374668_1374776:KIAA1530 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 1374774 C/T 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C C T 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000163945:ENST00000511216:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000389851:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000507531:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000511563:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000512728:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000503548:exon_1374668_1374776:KIAA1530 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 1377615 A/G 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 A:G A G 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000163945:ENST00000511216:exon_1377554_1377728:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000389851:exon_1377554_1377728:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000507531:exon_1377554_1377728:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000511563:exon_1377554_1377728:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000512728:exon_1377554_1377728:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000503548:exon_1377554_1381837:KIAA1530 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 169 144 313 75.1495753645938 79.9672257248432 -4.81765036024937 A:G G A 10 0.555327956422522 0.608859610511015 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 15 16 31 6.67008065366217 8.88524730276035 -2.21516664909818 T:C C T 10 0.555327956422522 0.471945862571681 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 1818563 A/G 1 31 32 63 13.7848333509018 17.7704946055207 -3.98566125461888 A:G A G 10 0.555327956422522 0.314005042569906 ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1818454_1818641:LETM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 2341194 T/C 1 3 11 14 1.33401613073243 6.10860752064774 -4.77459138991531 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0135137734901899 ENSG00000159733:ENST00000505324:exon_2341180_2342812:ZFYVE28;ENSG00000159733:ENST00000290974:exon_2341180_2341382:ZFYVE28;ENSG00000159733:ENST00000511071:exon_2341180_2341382:ZFYVE28;ENSG00000159733:ENST00000515312:exon_2341180_2341382:ZFYVE28;ENSG00000159733:ENST00000515169:exon_2341180_2341382:ZFYVE28;ENSG00000159733:ENST00000509171:exon_2341180_2341382:ZFYVE28;ENSG00000159733:ENST00000503000:exon_2341180_2341382:ZFYVE28;ENSG00000159733:ENST00000342540:exon_2341180_2341382:ZFYVE28 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 2743999 A/G 1 104 102 206 46.2458925320577 56.6434515550972 -10.3975590230395 A:G A G 10 0.555327956422522 0.160746644400884 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 2826400 T/C 1 31 25 56 13.7848333509018 13.883198910563 -0.0983655596612305 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2826340_2826644:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2826340_2826641:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2826340_2826429:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2826340_2826828:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826392_2826486:SH3BP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 2952908 A/G 1 46 51 97 20.454914004564 28.3217257775486 -7.86681177298463 A:G A G 10 0.555327956422522 0.125072208192159 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2952841_2952972:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2952841_2952972:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2952841_2952972:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2952841_2952972:NOP14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 3514689 T/C 1 55 48 103 24.4569623967613 26.6557419082811 -2.19877951151976 T:C T C 10 0.555327956422522 0.692230049970521 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 59 54 113 26.2356505710712 29.9877096468162 -3.75205907574498 A:T:G A G 10 0.555327956422522 0.508070775119654 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 3517911 T/C 1 34 48 82 15.1188494816343 26.6557419082811 -11.5368924266468 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0139939257939124 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3517843_3517925:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3517843_3517925:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3517609_3517925:LRPAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 3526645 C/T 1 60 62 122 26.6803226146487 34.4303332981964 -7.75001068354768 T:C C T 10 0.555327956422522 0.171906422092389 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3526634_3526873:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3526634_3526778:LRPAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 4322570 G/A 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 A:G G A 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4322367_4323512:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4322367_4323125:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4322367_4323513:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4322367_4323513:ZBTB49 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 4322770 T/C 1 9 3 12 4.0020483921973 1.66598386926757 2.33606452292974 T:C T C 10 0.555327956422522 0.247371341375508 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4322367_4323512:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4322367_4323125:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4322367_4323513:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4322367_4323513:ZBTB49 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 6925237 C/G 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 C:G C G 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000132405:ENST00000444368:exon_6925100_6925498:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000448507:exon_6925100_6925838:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000340816:exon_6925100_6925838:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000446947:exon_6925100_6925838:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000409757:exon_6925100_6925838:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000427736:exon_6925100_6925286:TBC1D14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 28 23 51 12.4508172201694 12.772542997718 -0.321725777548622 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 8229774 C/T 1 31 36 67 13.7848333509018 19.9918064312108 -6.20697308030897 T:C C T 10 0.555327956422522 0.140502779106841 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 24 34 58 10.6721290458595 18.8811505183657 -8.20902147250627 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0342368514320951 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 1 24 34 58 10.6721290458595 18.8811505183657 -8.20902147250627 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0342368514320951 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 13601337 G/A 1 41 20 61 18.2315537866766 11.1065591284504 7.12499465822616 A:G G A 10 0.555327956422522 0.071690373149352 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 15835844 A/C 1 19 13 32 8.44876882797208 7.21926343349279 1.2295053944793 A:C A C 10 0.555327956422522 0.724371704529355 ENSG00000004468:ENST00000502843:exon_15835840_15835925:CD38;ENSG00000004468:ENST00000226279:exon_15835840_15835925:CD38;ENSG00000004468:ENST00000510674:exon_15835840_15835925:CD38 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 17503382 C/T 1 19 7 26 8.44876882797208 3.88729569495765 4.56147313301443 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0780579063446087 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 17586703 T/C 1 146 110 256 64.9221183623118 61.0860752064774 3.83604315583437 T:C:G T C 10 0.555327956422522 0.65998593958896 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000509583:exon_17586595_17587079:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508014:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000513105:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000504614:exon_17586595_17586759:LAP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 17818885 T/C 1 15 14 29 6.67008065366217 7.77459138991531 -1.10451073625314 T:C T C 10 0.555327956422522 0.711532833974462 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000509719:exon_17818855_17819076:NCAPG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 17829990 G/C 1 6 9 15 2.66803226146487 4.9979516078027 -2.32991934633783 C:G G C 10 0.555327956422522 0.299710241961317 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000510063:exon_17829901_17830011:NCAPG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 24578097 C/T 1 190 166 356 84.4876882797208 92.1844407661386 -7.69675248641782 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.42397349526781 ENSG00000109606:ENST00000336812:exon_24577866_24578301:DHX15;ENSG00000109606:ENST00000511553:exon_24578092_24578301:DHX15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 25419908 G/T 1 9 9 18 4.0020483921973 4.9979516078027 -0.995903215605395 T:G G T 10 0.555327956422522 0.643952874691603 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419777_25420120:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419777_25420111:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25419777_25420120:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 37836302 T/C 1 5 15 20 2.22336021788739 8.32991934633783 -6.10655912845044 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00669247932999867 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 37851856 A/C 0 0 20 20 0 11.1065591284504 -11.1065591284504 C A C 10 0.555327956422522 9.13685065738176e-08 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37851805_37851994:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37851805_37851994:PGM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 37903669 A/G 1 11 8 19 4.89139247935226 4.44262365138018 0.448768827972082 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 37904082 T/C 1 14 8 22 6.22540861008469 4.44262365138018 1.78278495870452 T:C T C 10 0.555327956422522 0.523473069933469 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 43 23 66 19.1208978738316 12.772542997718 6.34835487611355 T:G T G 10 0.555327956422522 0.136924583818264 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 38776303 T/C 1 37 24 61 16.4528656123667 13.3278709541405 3.12499465822616 T:C T C 10 0.555327956422522 0.442427193531578 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 45 30 75 20.0102419609865 16.6598386926757 3.35040326831085 T:G T G 10 0.555327956422522 0.486423737380245 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 48 30 78 21.3442580917189 16.6598386926757 4.68441939904329 A:T A T 10 0.555327956422522 0.306702688268893 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 57 41 98 25.3463064839162 22.7684462133234 2.57786027059285 T:G T G 10 0.555327956422522 0.613162591808943 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 38829832 T/C 1 16 6 22 7.11475269723965 3.33196773853513 3.78278495870452 T:C T C 10 0.555327956422522 0.133222794462454 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 38830012 G/C 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 17 1 18 7.55942474081713 0.555327956422522 7.0040967843946 A:G A G 10 0.555327956422522 0.000509965893580259 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 40138676 A/G 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 A:G A G 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000078177:ENST00000261435:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000381804:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000511480:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000513269:exon_40138564_40138702:N4BP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 47560002 C/A 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47559681_47560290:ATP10D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 47578971 G/A 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47578790_47578990:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47578790_47578990:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47578790_47578990:ATP10D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 54011603 C/T 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 54232110 G/A 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54231271_54232242:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54231271_54232228:SCFD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 54327235 T/C 1 7 1 8 3.11270430504235 0.555327956422522 2.55737634861982 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0837859633971926 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 17 11 28 7.55942474081713 6.10860752064774 1.45081722016938 T:C T C 10 0.555327956422522 0.704654895104891 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 57215677 G/A 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 A:G G A 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57215094_57216224:AASDH HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 57237683 G/A 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57237617_57237809:AASDH HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 57268328 T/C 1 6 9 15 2.66803226146487 4.9979516078027 -2.32991934633783 T:C T C 10 0.555327956422522 0.299710241961317 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57268275_57268347:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57268275_57268347:PPAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 57273840 C/G 1 23 18 41 10.227457002282 9.9959032156054 0.231553786676599 C:G C G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000510643:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507724:exon_57273816_57273882:PPAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 57361553 A/G 1 51 82 133 22.6782742224514 45.5368924266468 -22.8586182041954 A:G A G 10 0.555327956422522 7.66543634997653e-05 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57361523_57361560:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57361523_57361560:SRP72 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 37 47 84 16.4528656123667 26.1004139518585 -9.64754833949184 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0369938330577433 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 28 37 65 12.4508172201694 20.5471343876333 -8.09631716746393 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0461971826478515 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 100 81 181 44.4672043577478 44.9815644702243 -0.514360112476474 T:C C T 10 0.555327956422522 0.940531548894185 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 68497597 C/A 1 14 14 28 6.22540861008469 7.77459138991531 -1.54918277983062 A:C C A 10 0.555327956422522 0.573526479524123 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68497575_68497626:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000505673:exon_68497575_68497626:UBA6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 68534392 C/T 1 11 9 20 4.89139247935226 4.9979516078027 -0.106559128450439 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68534269_68534392:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000420827:exon_68534269_68534392:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000429659:exon_68534269_68534392:UBA6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 69203080 T/C 1 62 44 106 27.5696667018036 24.434430082591 3.13523661921267 T:C:G T C 10 0.555327956422522 0.559098249667834 ENSG00000083896:ENST00000344157:exon_69202745_69203168:YTHDC1;ENSG00000083896:ENST00000355665:exon_69202745_69203168:YTHDC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 73930552 G/A 1 10 7 17 4.44672043577478 3.88729569495765 0.559424740817127 A:G G A 10 0.555327956422522 0.813340797660957 ENSG00000163626:ENST00000295890:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000449739:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000520291:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000533586:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000507544:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000510031:exon_73930495_73930616:COX18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 73956736 G/A 1 30 38 68 13.3401613073243 21.1024623440558 -7.76230103673149 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0668811209335351 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 76720885 T/C 1 38 53 91 16.8975376559442 29.4323816903937 -12.5348440344495 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0109440287517750 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76720775_76720885:USO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 76730195 A/G 1 50 58 108 22.2336021788739 32.2090214725063 -9.97541929363237 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0653202480416701 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76730106_76730204:USO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 76878688 G/A 1 33 42 75 14.6741774380568 23.3237741697459 -8.64959673168915 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0483271892924481 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 76881233 G/T 1 22 22 44 9.78278495870452 12.2172150412955 -2.43443008259097 T:G G T 10 0.555327956422522 0.544489977307098 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76881219_76881345:SDAD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 14 10 24 6.22540861008469 5.55327956422522 0.672129045859473 T:C C T 10 0.555327956422522 0.839730194130565 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 84383810 C/T 1 8 9 17 3.55737634861982 4.9979516078027 -1.44057525918287 T:C C T 10 0.555327956422522 0.626853565320545 ENSG00000163322:ENST00000321945:exon_84382092_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000475656:exon_84382098_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000506553:exon_84383162_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000504777:exon_84383228_84384055:FAM175A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 89319296 T/C 1 12 9 21 5.33606452292974 4.9979516078027 0.338112915127039 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000138642:ENST00000511939:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000380265:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000438983:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000264346:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000506714:exon_89319260_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000515365:exon_89319294_89319361:HERC6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 90034686 A/G 1 9 21 30 4.0020483921973 11.661887084873 -7.65983869267566 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00553310261218803 ENSG00000180346:ENST00000317005:exon_90033968_90036050:TIGD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 95170839 G/A 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95170805_95170906:SMARCAD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 95173779 T/C 1 3 8 11 1.33401613073243 4.44262365138018 -3.10860752064774 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0718999345122269 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95173767_95174158:SMARCAD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 95197520 C/T 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95197490_95197625:SMARCAD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 95561459 A/G 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000163110:ENST00000437932:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000503974:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000514743:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000380176:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000506632:exon_95561427_95561601:PDLIM5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 100825046 C/T 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 T:C C T 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000164031:ENST00000442697:exon_100824883_100825055:DNAJB14;ENSG00000164031:ENST00000420137:exon_100824883_100825055:DNAJB14;ENSG00000164031:ENST00000471101:exon_100824883_100825055:DNAJB14;ENSG00000164031:ENST00000334223:exon_100824883_100825055:DNAJB14;ENSG00000164031:ENST00000455208:exon_100824883_100825055:DNAJB14;ENSG00000164031:ENST00000398991:exon_100824935_100825055:DNAJB14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 103225513 T/C 1 16 11 27 7.11475269723965 6.10860752064774 1.00614517659191 T:C T C 10 0.555327956422522 0.846938067616076 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512337:exon_103225474_103225645:SLC39A8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 103228734 C/T 1 11 5 16 4.89139247935226 2.77663978211261 2.11475269723965 T:C C T 10 0.555327956422522 0.325169767810241 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000510255:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512657:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000502903:exon_103228714_103228762:SLC39A8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 103236979 A/G 1 24 30 54 10.6721290458595 16.6598386926757 -5.98770964681619 A:G A G 10 0.555327956422522 0.131230808799670 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103236825_103236987:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103236825_103236987:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103236825_103236987:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000510255:exon_103236825_103236987:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000514000:exon_103236825_103236987:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512657:exon_103236825_103236987:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000502903:exon_103236825_103236987:SLC39A8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 10 12 22 4.44672043577478 6.66393547707026 -2.21721504129548 A:G A G 10 0.555327956422522 0.393799982731658 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 103611845 C/T 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 T:C C T 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103611753_103611928:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103611753_103611928:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103611753_103611928:MANBA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 104061993 C/G 1 41 23 64 18.2315537866766 12.772542997718 5.45901078895859 C:G C G 10 0.555327956422522 0.208184070831048 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 104062223 C/T 1 18 19 37 8.0040967843946 10.5512311720279 -2.54713438763331 T:C C T 10 0.555327956422522 0.41275461605703 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 104067200 G/C 1 25 18 43 11.116801089437 9.9959032156054 1.12089787383156 C:G G C 10 0.555327956422522 0.761359494764192 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066986_104067264:CENPE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 104082349 C/T 1 12 10 22 5.33606452292974 5.55327956422522 -0.217215041295483 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 106155185 C/G 1 7 1 8 3.11270430504235 0.555327956422522 2.55737634861982 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0837859633971926 ENSG00000168769:ENST00000305737:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000513237:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000265149:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000380013:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000394764:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000413648:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000514870:exon_106155054_106155429:TET2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 107249244 C/G 1 50 62 112 22.2336021788739 34.4303332981964 -12.1967311193225 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0223572947527821 ENSG00000164022:ENST00000510207:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000442366:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000358008:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394701:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000432345:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394699:exon_107249233_107249400:AIMP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 108641317 G/A 1 18 14 32 8.0040967843946 7.77459138991531 0.229505394479297 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 110384790 A/G 1 26 20 46 11.5614731330144 11.1065591284504 0.454914004563991 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000138802:ENST00000504968:exon_110384057_110384800:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000399100:exon_110384057_110384800:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000265175:exon_110384057_110384800:SEC24B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 101 92 193 44.9118764013253 51.090171990872 -6.17829558954674 A:T A T 10 0.555327956422522 0.385214340971585 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 15 18 33 6.67008065366217 9.9959032156054 -3.32582256194322 A:G G A 10 0.555327956422522 0.293705287922686 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 113352628 A/G 1 16 18 34 7.11475269723965 9.9959032156054 -2.88115051836575 A:G A G 10 0.555327956422522 0.388695221433277 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 113352769 G/A 1 17 13 30 7.55942474081713 7.21926343349279 0.340161307324341 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 113352899 G/A 1 15 21 36 6.67008065366217 11.661887084873 -4.99180643121079 A:G G A 10 0.555327956422522 0.13003425836145 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 113353285 T/C 1 18 16 34 8.0040967843946 8.88524730276035 -0.881150518365747 T:C T C 10 0.555327956422522 0.863350207608527 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 119736796 A/C 1 15 15 30 6.67008065366217 8.32991934633783 -1.65983869267566 A:C A C 10 0.555327956422522 0.584377790818652 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 122617745 G/A 1 61 51 112 27.1249946582262 28.3217257775486 -1.19673111932246 A:G G A 10 0.555327956422522 0.849459310476974 ENSG00000164111:ENST00000296511:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000512232:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000501272:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000506395:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000515017:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000511552:exon_122617736_122618130:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513428:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513523:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513728:exon_122617736_122617779:ANXA5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 123814308 C/T 1 5 8 13 2.22336021788739 4.44262365138018 -2.21926343349279 T:C C T 10 0.555327956422522 0.268109731741661 ENSG00000138685:ENST00000264498:exon_123813366_123819391:FGF2;ENSG00000138685:ENST00000394350:exon_123813366_123819376:FGF2;ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123813730_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123813801_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000510735:exon_123813805_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123813806_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000502270:exon_123813896_123814380:NUDT6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 125590478 T/C 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 T:C T C 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000151458:ENST00000504087:exon_125590139_125593689:ANKRD50;ENSG00000151458:ENST00000281131:exon_125590139_125593689:ANKRD50;ENSG00000151458:ENST00000515641:exon_125590139_125593689:ANKRD50 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 125591687 A/G 1 2 7 9 0.889344087154956 3.88729569495765 -2.9979516078027 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0877066993700078 ENSG00000151458:ENST00000504087:exon_125590139_125593689:ANKRD50;ENSG00000151458:ENST00000281131:exon_125590139_125593689:ANKRD50;ENSG00000151458:ENST00000515641:exon_125590139_125593689:ANKRD50 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 128814492 G/A 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 A:G G A 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814355_128814573:PLK4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 128949799 C/T 1 17 10 27 7.55942474081713 5.55327956422522 2.00614517659191 T:C C T 10 0.555327956422522 0.562156482279236 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 128949850 A/G 1 15 9 24 6.67008065366217 4.9979516078027 1.67212904585947 A:G A G 10 0.555327956422522 0.543438783557522 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 128949929 C/A 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 A:C C A 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 139964337 G/A 1 2 7 9 0.889344087154956 3.88729569495765 -2.9979516078027 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0877066993700078 ENSG00000151014:ENST00000280614:exon_139964228_139964497:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000504378:exon_139964228_139965045:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000515616:exon_139964226_139964497:CCRN4L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 139964455 C/T 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000151014:ENST00000280614:exon_139964228_139964497:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000504378:exon_139964228_139965045:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000515616:exon_139964226_139964497:CCRN4L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 49 63 112 21.7889301352964 34.9856612546189 -13.1967311193225 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0132950847331461 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 49 71 120 21.7889301352964 39.4282849059991 -17.6393547707026 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00126972892524538 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 146744641 T/A 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 A:T T A 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000151612:ENST00000508784:exon_146744574_146744677:ZNF827;ENSG00000151612:ENST00000513320:exon_146744574_146744677:ZNF827;ENSG00000151612:ENST00000379448:exon_146744574_146744677:ZNF827;ENSG00000151612:ENST00000281318:exon_146744574_146744677:ZNF827;ENSG00000151612:ENST00000440280:exon_146744574_146744677:ZNF827;ENSG00000151612:ENST00000509940:exon_146744574_146744677:ZNF827 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 148555353 T/C 1 13 7 20 5.78073656650721 3.88729569495765 1.89344087154956 T:C T C 10 0.555327956422522 0.501729600552412 ENSG00000164168:ENST00000296582:exon_148555320_148557872:TMEM184C;ENSG00000164168:ENST00000505999:exon_148555320_148555679:TMEM184C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 154478222 C/T 1 21 7 28 9.33811291512704 3.88729569495765 5.45081722016938 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0552248516291591 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000462540:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154478118_154478234:KIAA0922 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 154479430 T/C 1 20 10 30 8.89344087154956 5.55327956422522 3.34016130732434 T:C T C 10 0.555327956422522 0.271269845218948 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000462540:exon_154479410_154479923:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154479410_154479520:KIAA0922 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 154504740 G/A 1 8 13 21 3.55737634861982 7.21926343349279 -3.66188708487296 A:G G A 10 0.555327956422522 0.126067912845854 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154504716_154504824:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154504716_154504824:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154504716_154504824:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154504716_154504824:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154504716_154504824:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154504716_154504824:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000446129:exon_154504716_154504824:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000509565:exon_154504690_154504824:KIAA0922 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 154525458 C/T 1 77 97 174 34.2397473554658 53.8668117729846 -19.6270644175188 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00289905908273424 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154524954_154525534:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154524954_154525582:KIAA0922 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 155459194 A/T 1 21 30 51 9.33811291512704 16.6598386926757 -7.32172577754862 A:T A T 10 0.555327956422522 0.0477885646755809 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155459121_155459234:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000503251:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155459121_155459260:PLRG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 155461113 T/C 1 39 26 65 17.3422096995216 14.4385268669856 2.90368283253607 T:C T C 10 0.555327956422522 0.533195268794182 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000507125:exon_155461103_155461424:PLRG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 156651206 C/T 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 T:C C T 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000164116:ENST00000506455:exon_156651182_156651584:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000511108:exon_156651182_156651782:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000357469:exon_156651182_156651568:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000455639:exon_156651182_156651568:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000509901:exon_156651182_156651597:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000443668:exon_156651182_156653499:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000393832:exon_156651182_156653497:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000296518:exon_156651182_156653501:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000515201:exon_156651182_156651594:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000513574:exon_156651182_156651584:GUCY1A3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 156721198 C/T 1 68 45 113 30.2376989632685 24.9897580390135 5.24794092425502 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.344628761683996 ENSG00000061918:ENST00000505154:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000502959:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000505764:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000507146:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000264424:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000503520:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000513437:exon_156721029_156721226:GUCY1B3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 159791519 G/A 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000052795:ENST00000264433:exon_159791465_159791621:FNIP2;ENSG00000052795:ENST00000379346:exon_159791465_159791621:FNIP2;ENSG00000052795:ENST00000505130:exon_159791511_159791621:FNIP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 164415930 C/T 1 35 45 80 15.5635215252117 24.9897580390135 -9.42623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0422294274465972 ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164415613_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164415819_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164415840_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164415860_164415956:C4orf43 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 166009706 T/C 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000170088:ENST00000306480:exon_166009620_166009754:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000506087:exon_166009620_166009754:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000505095:exon_166009620_166009754:TMEM192 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 166231868 A/G 1 8 9 17 3.55737634861982 4.9979516078027 -1.44057525918287 A:G A G 10 0.555327956422522 0.626853565320545 ENSG00000109466:ENST00000226725:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000514860:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506824:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000421009:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506541:exon_166231705_166231904:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506761:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000509028:exon_166231705_166231902:KLHL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 169393881 G/A 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 A:G G A 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000181381:ENST00000511577:exon_169393847_169393960:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000260184:exon_169393847_169393960:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000505890:exon_169393847_169393960:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000505696:exon_169393847_169393960:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000514748:exon_169393847_169393960:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000515088:exon_169393847_169393960:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000513901:exon_169393847_169393960:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000512371:exon_169393847_169393960:DDX60L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 170037572 G/A 1 17 15 32 7.55942474081713 8.32991934633783 -0.770494605520703 A:G G A 10 0.555327956422522 0.859436806449628 ENSG00000154447:ENST00000284637:exon_170037420_170037781:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000511421:exon_170037420_170037781:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000508685:exon_170037420_170037781:SH3RF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 170038894 A/G 1 14 7 21 6.22540861008469 3.88729569495765 2.33811291512704 A:G A G 10 0.555327956422522 0.382150972530821 ENSG00000154447:ENST00000284637:exon_170038674_170038933:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000511421:exon_170038674_170038933:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000508685:exon_170038674_170038933:SH3RF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 170398454 T/C 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000137601:ENST00000439128:exon_170398275_170398503:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000379072:exon_170398275_170398503:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000511633:exon_170398275_170398503:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000510533:exon_170398275_170398503:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000507142:exon_170398275_170398503:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000512193:exon_170398275_170398503:NEK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 170634390 C/T 1 6 10 16 2.66803226146487 5.55327956422522 -2.88524730276035 T:C C T 10 0.555327956422522 0.207537445170925 ENSG00000109572:ENST00000504131:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000513761:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000347613:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000360642:exon_170634230_170634446:CLCN3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 6 23 29 2.66803226146487 12.772542997718 -10.1045107362531 A:G A G 10 0.555327956422522 0.000222833445233359 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 178274565 A/G 1 7 3 10 3.11270430504235 1.66598386926757 1.44672043577478 A:G A G 10 0.555327956422522 0.527797798104687 ENSG00000109674:ENST00000264596:exon_178274462_178274882:NEIL3;ENSG00000109674:ENST00000513321:exon_178274462_178275433:NEIL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 178274835 A/C 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 A:C A C 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000109674:ENST00000264596:exon_178274462_178274882:NEIL3;ENSG00000109674:ENST00000513321:exon_178274462_178275433:NEIL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 184366145 C/T 1 8 9 17 3.55737634861982 4.9979516078027 -1.44057525918287 T:C C T 10 0.555327956422522 0.626853565320545 ENSG00000168564:ENST00000504169:exon_184365744_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000302350:exon_184365788_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000510928:exon_184365850_184366222:CDKN2AIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 184600571 C/A 1 9 6 15 4.0020483921973 3.33196773853513 0.670080653662171 A:C C A 10 0.555327956422522 0.799910806218814 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184600506_184600639:C4orf41 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 185655171 C/T 1 12 5 17 5.33606452292974 2.77663978211261 2.55942474081713 T:C C T 10 0.555327956422522 0.233437199703189 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185655170_185655287:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185655170_185655284:MLF1IP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 185687863 A/G 1 14 15 29 6.22540861008469 8.32991934633783 -2.10451073625314 A:G A G 10 0.555327956422522 0.459182512082066 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687776_185687910:ACSL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 186097045 C/T 1 34 32 66 15.1188494816343 17.7704946055207 -2.65164512388645 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.537159979917104 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 75 75 150 33.3504032683108 41.6495967316892 -8.2991934633783 A:T:C T C 10 0.555327956422522 0.188683295765934 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 31 20 51 13.7848333509018 11.1065591284504 2.67827422245138 A:G G A 10 0.555327956422522 0.483824964775692 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 186320880 A/G 1 95 73 168 42.2438441398604 40.5389408188441 1.70490332101631 A:G A G 10 0.555327956422522 0.816196741429362 ENSG00000186352:ENST00000335174:exon_186320724_186320927:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511393:exon_186320724_186321782:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000506424:exon_186320724_186320897:ANKRD37;ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186320694_186321632:UFSP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 186320906 C/G 1 103 86 189 45.8012204884802 47.7582042523369 -1.95698376385665 A:C:G C G 10 0.555327956422522 0.770366270769588 ENSG00000186352:ENST00000335174:exon_186320724_186320927:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511393:exon_186320724_186321782:ANKRD37;ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186320694_186321632:UFSP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 4 186347055 G/A 0 0 8 8 0 4.44262365138018 -4.44262365138018 A G A 10 0.555327956422522 0.00152868713451737 ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186347020_186347133:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000264689:exon_186347020_186347139:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000510755:exon_186347020_186347123:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000502428:exon_186347020_186347084:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000505357:exon_186347020_186347132:UFSP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 231111 T/C 1 65 69 134 28.9036828325361 38.317628993154 -9.41394616061795 T:C T C 10 0.555327956422522 0.11736874577938 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_231058_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_231058_231115:SDHA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 311478 T/C 1 72 82 154 32.0163871375784 45.5368924266468 -13.5205052890684 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0346736616592540 ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_311408_311609:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_311408_312526:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507473:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000511482:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000512466:exon_308312_311517:PDCD6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 422955 C/G 1 5 9 14 2.22336021788739 4.9979516078027 -2.77459138991531 C:G C G 10 0.555327956422522 0.179216881393606 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000510910:exon_422492_422973:AHRR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 434981 G/C 1 24 16 40 10.6721290458595 8.88524730276035 1.78688174309912 C:G G C 10 0.555327956422522 0.634893171030186 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 58 44 102 25.7909785274937 24.434430082591 1.35654844490276 A:G G A 10 0.555327956422522 0.842303329482451 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 462465 C/A 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 A:C C A 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_462272_462644:EXOC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 475104 A/G 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000066230:ENST00000264938:exon_474998_475247:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000514375:exon_474998_475247:SLC9A3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 479905 A/C 1 11 11 22 4.89139247935226 6.10860752064774 -1.21721504129548 A:C A C 10 0.555327956422522 0.670344781787442 ENSG00000066230:ENST00000507407:exon_479752_480080:SLC9A3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 635660 C/T 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000112877:ENST00000264935:exon_635487_635699:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000444221:exon_635487_635699:CEP72 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 1057615 A/G 1 4 16 20 1.77868817430991 8.88524730276035 -7.10655912845044 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00238930598369905 ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000514994:exon_1057326_1057764:SLC12A7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 1063998 G/A 1 13 21 34 5.78073656650721 11.661887084873 -5.88115051836575 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0562620626821101 ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1063959_1064090:SLC12A7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 1065399 C/T 1 16 9 25 7.11475269723965 4.9979516078027 2.11680108943695 T:C C T 10 0.555327956422522 0.428150577551636 ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1065398_1065593:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1065398_1065593:SLC12A7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 1081702 A/G 1 5 8 13 2.22336021788739 4.44262365138018 -2.21926343349279 A:G A G 10 0.555327956422522 0.268109731741661 ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1081692_1081859:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000510943:exon_1081692_1081773:SLC12A7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 1081767 C/T 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 T:C C T 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1081692_1081859:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000510943:exon_1081692_1081773:SLC12A7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 1467004 A/G 1 24 53 77 10.6721290458595 29.4323816903937 -18.7602526445342 A:G A G 10 0.555327956422522 2.58656815374880e-05 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 22 14 36 9.78278495870452 7.77459138991531 2.00819356878921 T:C C T 10 0.555327956422522 0.615541397669078 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 7870973 A/G 1 15 6 21 6.67008065366217 3.33196773853513 3.33811291512704 A:G A G 10 0.555327956422522 0.187868673759137 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508047:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000503550:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000502550:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000506877:exon_7870883_7871030:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512217:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7870883_7871036:MTRR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 7878179 C/T 1 15 16 31 6.67008065366217 8.88524730276035 -2.21516664909818 T:C C T 10 0.555327956422522 0.471945862571681 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7878057_7878262:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514220:exon_7878057_7878348:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508890:exon_7878057_7878188:MTRR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 7878424 T/A 1 11 17 28 4.89139247935226 9.44057525918287 -4.54918277983062 A:T T A 10 0.555327956422522 0.0897900097121998 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 7889216 G/A 1 12 6 18 5.33606452292974 3.33196773853513 2.0040967843946 A:G G A 10 0.555327956422522 0.477948616778315 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7889208_7889276:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 7889304 C/T 1 11 5 16 4.89139247935226 2.77663978211261 2.11475269723965 T:C C T 10 0.555327956422522 0.325169767810241 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 7897319 G/A 1 17 24 41 7.55942474081713 13.3278709541405 -5.7684462133234 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0834111646322127 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 10227548 C/A 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10226442_10227759:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10226845_10227759:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10227068_10227759:FAM173B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 10239261 G/A 1 9 3 12 4.0020483921973 1.66598386926757 2.33606452292974 A:G G A 10 0.555327956422522 0.247371341375508 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 10239278 C/T 1 9 3 12 4.0020483921973 1.66598386926757 2.33606452292974 T:C C T 10 0.555327956422522 0.247371341375508 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 14368975 C/T 1 25 21 46 11.116801089437 11.661887084873 -0.545085995436011 T:C C T 10 0.555327956422522 0.883074147030052 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14368817_14369008:TRIO HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 14397238 T/C 1 9 15 24 4.0020483921973 8.32991934633783 -4.32787095414053 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0990620091275335 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000502490:exon_14397152_14397450:TRIO HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 31538692 A/C 1 14 7 21 6.22540861008469 3.88729569495765 2.33811291512704 A:C A C 10 0.555327956422522 0.382150972530821 ENSG00000082213:ENST00000325366:exon_31538367_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000355907:exon_31538367_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000510659:exon_31538591_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000513967:exon_31538591_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000517780:exon_31538367_31538793:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000511208:exon_31538588_31538791:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000504464:exon_31538591_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000510530:exon_31538280_31538796:C5orf22 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 32403346 C/T 1 21 21 42 9.33811291512704 11.661887084873 -2.32377416974592 T:C C T 10 0.555327956422522 0.535380009317526 ENSG00000056097:ENST00000265069:exon_32403211_32403502:ZFR;ENSG00000056097:ENST00000382126:exon_32403211_32403502:ZFR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 33462034 G/A 1 79 61 140 35.1290914426208 33.8750053417738 1.25408610084692 A:G G A 10 0.555327956422522 0.86519923941142 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33462011_33462111:TARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 33989518 C/T 1 7 12 19 3.11270430504235 6.66393547707026 -3.55123117202792 T:C C T 10 0.555327956422522 0.110901602972419 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33989216_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33988789_33989607:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 33998883 A/G 1 7 20 27 3.11270430504235 11.1065591284504 -7.99385482340809 A:T:G A G 10 0.555327956422522 0.00290260598307539 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33998746_33998887:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33998746_33998932:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33998746_33998932:C1QTNF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 34004707 C/T 1 3 10 13 1.33401613073243 5.55327956422522 -4.21926343349279 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0239466351830008 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_34004679_34004839:AMACR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 34008100 C/T 1 5 12 17 2.22336021788739 6.66393547707026 -4.44057525918287 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0476549732727157 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_34007878_34008213:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_34007878_34008133:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_34007878_34008209:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_34007878_34008189:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_34007878_34008133:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_34007878_34008133:AMACR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 36985303 A/G 1 41 33 74 18.2315537866766 18.3258225619432 -0.0942687752666274 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 37036492 C/T 1 12 13 25 5.33606452292974 7.21926343349279 -1.88319891056305 T:C C T 10 0.555327956422522 0.547039280437458 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_37036481_37036589:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_37036481_37036589:NIPBL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 37333727 A/G 1 8 10 18 3.55737634861982 5.55327956422522 -1.9959032156054 A:G A G 10 0.555327956422522 0.354494673636837 ENSG00000113569:ENST00000231498:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000381843:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000434056:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000513532:exon_37333565_37333735:NUP155 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 42800808 C/T 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 43453811 G/A 1 11 11 22 4.89139247935226 6.10860752064774 -1.21721504129548 A:G G A 10 0.555327956422522 0.670344781787442 ENSG00000151881:ENST00000500337:exon_43453760_43454145:C5orf28;ENSG00000151881:ENST00000397080:exon_43453760_43454145:C5orf28;ENSG00000151881:ENST00000512085:exon_43453760_43454145:C5orf28;ENSG00000151881:ENST00000506860:exon_43453760_43454145:C5orf28 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 43609343 C/T 1 18 22 40 8.0040967843946 12.2172150412955 -4.21311825690088 T:C C T 10 0.555327956422522 0.204048523382284 ENSG00000112992:ENST00000505678:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512422:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43609245_43609448:NNT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 43613046 A/G 1 32 51 83 14.2295053944793 28.3217257775486 -14.0922203830693 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0026392583261035 ENSG00000112992:ENST00000505678:exon_43613010_43613239:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512422:exon_43613010_43613239:NNT;ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43613010_43613239:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43613010_43613239:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43613010_43613239:NNT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 43653243 C/T 1 20 9 29 8.89344087154956 4.9979516078027 3.89548926374686 T:C C T 10 0.555327956422522 0.190477687227125 ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43653120_43653315:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43653120_43653315:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43653120_43653315:NNT;ENSG00000112992:ENST00000513390:exon_43653120_43653682:NNT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 44809162 G/C 1 32 39 71 14.2295053944793 21.6577903004784 -7.42828490599906 C:G G C 10 0.555327956422522 0.093889493893638 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 52397337 T/C 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000164172:ENST00000510818:exon_52397189_52397339:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000450852:exon_52397189_52397339:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000396954:exon_52397189_52397339:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000502402:exon_52396241_52397339:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000338412:exon_52397189_52397339:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000508922:exon_52397189_52397339:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000527216:exon_52397189_52397339:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000514553:exon_52396956_52397339:MOCS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 61690338 C/T 1 16 9 25 7.11475269723965 4.9979516078027 2.11680108943695 T:C C T 10 0.555327956422522 0.428150577551636 ENSG00000086189:ENST00000199320:exon_61690311_61690434:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000506390:exon_61690311_61690434:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000514911:exon_61690311_61690434:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000509182:exon_61690311_61690434:DIMT1L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 4 11 15 1.77868817430991 6.10860752064774 -4.32991934633783 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0349050371317493 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 23 24 47 10.227457002282 13.3278709541405 -3.10041395185853 C:G C G 10 0.555327956422522 0.3813122088619 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 65317181 C/T 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 T:C C T 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000416865:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65317150_65317213:ERBB2IP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 65350374 A/G 1 58 43 101 25.7909785274937 23.8791021261684 1.91187640132528 A:G A G 10 0.555327956422522 0.764163200286645 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 67522722 C/T 1 12 4 16 5.33606452292974 2.22131182569009 3.11475269723965 T:C C T 10 0.555327956422522 0.136543787545186 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67522118_67522837:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67522118_67522837:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000517412:exon_67522265_67522837:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67522462_67522837:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67522462_67522837:PIK3R1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 67588148 G/A 1 5 13 18 2.22336021788739 7.21926343349279 -4.9959032156054 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0297547757208393 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000523807:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000522084:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000320694:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000336483:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518292:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518813:exon_67586628_67588189:PIK3R1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 67589188 C/T 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 T:C C T 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000320694:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521409:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000336483:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518292:exon_67588929_67589220:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000517698:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518813:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000519025:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000523872:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000520550:exon_67589131_67589311:PIK3R1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 18 32 50 8.0040967843946 17.7704946055207 -9.7663978211261 T:G G T 10 0.555327956422522 0.00647925472249743 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 68524133 A/G 1 34 21 55 15.1188494816343 11.661887084873 3.45696239676129 A:G A G 10 0.555327956422522 0.415969200776244 ENSG00000134056:ENST00000256441:exon_68524027_68524214:MRPS36;ENSG00000134056:ENST00000507022:exon_68524027_68524214:MRPS36;ENSG00000134056:ENST00000512880:exon_68524027_68524214:MRPS36 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 22 10 32 9.78278495870452 5.55327956422522 4.2295053944793 T:C C T 10 0.555327956422522 0.155798600832097 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 70751818 T/G 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 T:G T G 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70751442_70751916:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70751442_70751916:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70751442_70751916:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70751442_70751916:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70751513_70751916:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70751616_70751916:BDP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 70800538 G/A 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70800448_70800578:BDP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 23 17 40 10.227457002282 9.44057525918287 0.786881743099121 A:G G A 10 0.555327956422522 0.874297431714736 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 70806573 G/A 1 21 22 43 9.33811291512704 12.2172150412955 -2.87910212616845 A:G G A 10 0.555327956422522 0.443426847321452 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 19 11 30 8.44876882797208 6.10860752064774 2.34016130732434 A:T T A 10 0.555327956422522 0.464289321890314 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 70806711 C/G 1 20 6 26 8.89344087154956 3.33196773853513 5.56147313301443 C:G C G 10 0.555327956422522 0.030067450712797 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 70806958 G/A 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 70809169 A/G 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 A:G A G 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70809012_70809234:BDP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 70840233 C/T 1 9 10 19 4.0020483921973 5.55327956422522 -1.55123117202792 T:C C T 10 0.555327956422522 0.496869552202761 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70840184_70840334:BDP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 70945075 A/G 1 27 22 49 12.0061451765919 12.2172150412955 -0.211069864703576 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000131844:ENST00000512218:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000323375:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000340941:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000509539:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000505435:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000508703:exon_70944924_70945080:MCCC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 72184098 C/T 1 24 19 43 10.6721290458595 10.5512311720279 0.120897873831556 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000083312:ENST00000337273:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000454282:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000415341:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000523768:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000396346:exon_72183954_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000447967:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000506351:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000519220:exon_72184065_72184130:TNPO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 72798845 A/G 1 459 468 927 204.104468002062 259.89348360574 -55.7890156036779 A:T:C:G A G 10 0.555327956422522 0.000241499955631586 ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 72874907 A/C 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 A:C A C 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000164338:ENST00000296792:exon_72874842_72874975:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000509005:exon_72874842_72874975:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000508491:exon_72874842_72874975:UTP15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 73985215 A/G 1 15 22 37 6.67008065366217 12.2172150412955 -5.54713438763331 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0705491956670771 ENSG00000049860:ENST00000511181:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000515528:exon_73985153_73985674:HEXB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 73992881 A/G 1 10 8 18 4.44672043577478 4.44262365138018 0.00409678439460492 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000049860:ENST00000511181:exon_73992821_73992931:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73992821_73992931:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73992821_73992931:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000510820:exon_73992821_73992931:HEXB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 95234350 A/G 1 24 10 34 10.6721290458595 5.55327956422522 5.11884948163425 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0855901040834441 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 95234377 C/T 1 28 14 42 12.4508172201694 7.77459138991531 4.67622583025408 T:C C T 10 0.555327956422522 0.163888740884818 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 95234392 A/C 1 29 8 37 12.8954892637469 4.44262365138018 8.45286561236669 A:C A C 10 0.555327956422522 0.00470822161086728 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 95236415 G/A 1 34 21 55 15.1188494816343 11.661887084873 3.45696239676129 A:G G A 10 0.555327956422522 0.415969200776244 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 95236459 C/T 1 14 12 26 6.22540861008469 6.66393547707026 -0.438526866985572 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 96118852 G/C 1 15 5 20 6.67008065366217 2.77663978211261 3.89344087154956 C:G G C 10 0.555327956422522 0.113443509114618 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96118755_96118939:ERAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 96121524 C/T 1 66 27 93 29.3483548761136 14.9938548234081 14.3545000527055 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00326064181642560 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96121343_96121675:ERAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 96124330 T/C 1 30 15 45 13.3401613073243 8.32991934633783 5.01024196098651 T:C T C 10 0.555327956422522 0.176341852604436 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96124234_96124388:ERAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 96126308 A/G 1 36 19 55 16.0081935687892 10.5512311720279 5.45696239676129 A:G A G 10 0.555327956422522 0.174349942609108 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96126215_96126329:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503311:exon_96126288_96126346:ERAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 96129512 A/G 1 22 11 33 9.78278495870452 6.10860752064774 3.67417743805677 A:G A G 10 0.555327956422522 0.22310524100548 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96129506_96129660:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96129506_96129660:ERAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 96130836 T/C 1 12 8 20 5.33606452292974 4.44262365138018 0.893440871549561 T:C T C 10 0.555327956422522 0.823148310222236 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96130745_96130865:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96130745_96130865:ERAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 96139250 C/G 1 34 19 53 15.1188494816343 10.5512311720279 4.56761830960634 C:G C G 10 0.555327956422522 0.216813859241840 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 7 10 17 3.11270430504235 5.55327956422522 -2.44057525918287 A:G G A 10 0.555327956422522 0.329183052237539 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 21 22 43 9.33811291512704 12.2172150412955 -2.87910212616845 T:C C T 10 0.555327956422522 0.443426847321452 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 96512865 T/A 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:T T A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 96512871 T/A 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:T T A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 C:G G C 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 98199204 C/T 1 6 9 15 2.66803226146487 4.9979516078027 -2.32991934633783 T:C C T 10 0.555327956422522 0.299710241961317 ENSG00000153922:ENST00000514344:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000284049:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000505657:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000511067:exon_98199112_98199290:CHD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 102345546 A/C 1 11 19 30 4.89139247935226 10.5512311720279 -5.65983869267566 A:C A C 10 0.555327956422522 0.0432984066200927 ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000346918:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379787:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379799:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000510006:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000515456:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504691:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504456:exon_102345455_102345570:PAM HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 102520400 A/C 1 13 18 31 5.78073656650721 9.9959032156054 -4.21516664909818 A:C A C 10 0.555327956422522 0.148914132603621 ENSG00000145725:ENST00000321521:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000358359:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000451606:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000513500:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000414217:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000509597:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000507966:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000511724:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000511022:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000510672:exon_102519944_102520445:PPIP5K2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 110456263 C/G 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 C:G C G 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456194_110456291:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456194_110456291:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456194_110456294:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456194_110456291:WDR36 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 110456704 A/T 1 6 13 19 2.66803226146487 7.21926343349279 -4.55123117202792 A:T A T 10 0.555327956422522 0.0395254330154768 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456697_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456694_110456839:WDR36 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 26 4 30 11.5614731330144 2.22131182569009 9.34016130732434 C:G G C 10 0.555327956422522 0.000372577778086382 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 112889370 G/C 1 3 15 18 1.33401613073243 8.32991934633783 -6.9959032156054 C:G G C 10 0.555327956422522 0.00124437180780587 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112889287_112889383:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000503857:exon_112889287_112889383:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000515883:exon_112889287_112889383:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112889287_112889383:YTHDC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 115428334 G/T 1 7 10 17 3.11270430504235 5.55327956422522 -2.44057525918287 T:G G T 10 0.555327956422522 0.329183052237539 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 115469773 C/T 1 9 9 18 4.0020483921973 4.9979516078027 -0.995903215605395 T:C C T 10 0.555327956422522 0.643952874691603 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115469765_115469875:COMMD10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 122881462 A/T 1 11 12 23 4.89139247935226 6.66393547707026 -1.77254299771801 A:T A T 10 0.555327956422522 0.531120817504268 ENSG00000151292:ENST00000395412:exon_122881111_122881535:CSNK1G3;ENSG00000151292:ENST00000457355:exon_122881111_122881535:CSNK1G3;ENSG00000151292:ENST00000345990:exon_122881111_122881535:CSNK1G3;ENSG00000151292:ENST00000395411:exon_122881111_122881535:CSNK1G3;ENSG00000151292:ENST00000508708:exon_122881111_122881650:CSNK1G3;ENSG00000151292:ENST00000521364:exon_122881109_122881535:CSNK1G3;ENSG00000151292:ENST00000510842:exon_122881111_122881535:CSNK1G3;ENSG00000151292:ENST00000361991:exon_122881328_122881535:CSNK1G3;ENSG00000151292:ENST00000360683:exon_122881328_122881535:CSNK1G3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 125911132 G/A 0 0 9 9 0 4.9979516078027 -4.9979516078027 A G A 10 0.555327956422522 0.00067976443209644 ENSG00000164904:ENST00000409134:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000447989:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000437170:exon_125911112_125911140:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000297542:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000503281:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000509459:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000416117:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000433026:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000413020:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000458249:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000511266:exon_125911129_125911156:ALDH7A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 125939409 C/T 1 53 40 93 23.5676183096063 22.2131182569009 1.35450005270546 T:C C T 10 0.555327956422522 0.834980339519244 ENSG00000164902:ENST00000297540:exon_125939262_125939875:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000514725:exon_125939266_125939756:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000456348:exon_125939262_125939534:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000505674:exon_125939253_125939875:PHAX HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 128430757 T/C 1 54 50 104 24.0122903531838 27.7663978211261 -3.75410746794228 T:C T C 10 0.555327956422522 0.490288287727149 ENSG00000066583:ENST00000506986:exon_128430529_128430768:ISOC1;ENSG00000066583:ENST00000173527:exon_128430444_128430768:ISOC1;ENSG00000066583:ENST00000513879:exon_128430530_128430768:ISOC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 130766662 T/C 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000158987:ENST00000509018:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000512611:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000507093:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000296859:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000358714:exon_130766547_130767042:RAPGEF6;ENSG00000217128:ENST00000514667:exon_130766552_130767042:FNIP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 132437531 C/T 1 88 61 149 39.1311398348181 33.8750053417738 5.25613449304422 T:C C T 10 0.555327956422522 0.410366869851266 ENSG00000170606:ENST00000304858:exon_132437451_132437570:HSPA4;ENSG00000170606:ENST00000514825:exon_132437288_132437570:HSPA4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 133316518 G/A 1 170 152 322 75.5942474081713 84.4098493762233 -8.81560196805206 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.340544321229538 ENSG00000213585:ENST00000265333:exon_133316420_133316647:VDAC1;ENSG00000213585:ENST00000395044:exon_133316420_133316647:VDAC1;ENSG00000213585:ENST00000395047:exon_133316420_133316647:VDAC1;ENSG00000213585:ENST00000492324:exon_133316420_133316708:VDAC1;ENSG00000213585:ENST00000425992:exon_133316419_133316647:VDAC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 133997171 C/T 1 25 19 44 11.116801089437 10.5512311720279 0.565569917409034 T:C C T 10 0.555327956422522 0.880943123846544 ENSG00000113615:ENST00000398844:exon_133996809_133997276:SEC24A;ENSG00000113615:ENST00000322887:exon_133996809_133997276:SEC24A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 134076812 G/A 1 46 43 89 20.454914004564 23.8791021261684 -3.42418812160446 A:G G A 10 0.555327956422522 0.522442045670678 ENSG00000164615:ENST00000297156:exon_134076753_134077213:CAMLG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 14 5 19 6.22540861008469 2.77663978211261 3.44876882797208 A:G G A 10 0.555327956422522 0.164530353380396 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 137717213 G/A 1 17 25 42 7.55942474081713 13.883198910563 -6.32377416974592 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0615458868244714 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000512928:exon_137717205_137717437:KDM3B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 138658476 T/C 1 395 339 734 175.645457213104 188.256177227235 -12.6107200141311 T:C T C 10 0.555327956422522 0.35333142827457 ENSG00000015479:ENST00000509990:exon_138658287_138658656:MATR3;ENSG00000015479:ENST00000445468:exon_138658287_138658656:MATR3;ENSG00000015479:ENST00000361059:exon_138658287_138658656:MATR3;ENSG00000015479:ENST00000504203:exon_138658287_138658656:MATR3;ENSG00000015479:ENST00000502929:exon_138658287_138658656:MATR3;ENSG00000015479:ENST00000394800:exon_138658287_138658656:MATR3;ENSG00000015479:ENST00000394805:exon_138658287_138658656:MATR3;ENSG00000015479:ENST00000502499:exon_138658287_138658656:MATR3;ENSG00000015479:ENST00000510056:exon_138658287_138658656:MATR3;ENSG00000015479:ENST00000503811:exon_138658287_138658656:MATR3;ENSG00000015479:ENST00000504643:exon_138658287_138658637:MATR3;ENSG00000015479:ENST00000337359:exon_138658454_138658656:MATR3;ENSG00000015479:ENST00000505625:exon_138658287_138658656:MATR3;ENSG00000015479:ENST00000502422:exon_138658287_138658656:MATR3;ENSG00000015479:ENST00000512040:exon_138658435_138658656:MATR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 13 8 21 5.78073656650721 4.44262365138018 1.33811291512704 A:G A G 10 0.555327956422522 0.66298519208265 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 139940302 G/A 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 A:G G A 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139940284_139940339:APBB3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 140857798 T/C 1 8 4 12 3.55737634861982 2.22131182569009 1.33606452292974 T:C T C 10 0.555327956422522 0.56621841747708 ENSG00000240184:ENST00000308177:exon_140855580_140858113:PCDHGC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 140903792 G/A 1 61 47 108 27.1249946582262 26.1004139518585 1.02458070636763 A:G G A 10 0.555327956422522 0.922927627324616 ENSG00000131504:ENST00000476339:exon_140903710_140904322:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000389054:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398557:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000520569:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398566:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398562:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000253811:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000448451:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000518047:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000468119:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000521457:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000389057:exon_140903710_140903796:DIAPH1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 141014494 T/C 1 40 49 89 17.7868817430991 27.2110698647036 -9.42418812160446 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0542960218346178 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141014378_141014731:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141014378_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141014460_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141014378_141014520:HDAC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 141025730 T/G 1 10 5 15 4.44672043577478 2.77663978211261 1.67008065366217 T:G T G 10 0.555327956422522 0.445339902559564 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141025654_141025758:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141025654_141025758:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141025654_141026289:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141025654_141025758:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000518499:exon_141025654_141025931:FCHSD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 145499996 C/T 1 41 33 74 18.2315537866766 18.3258225619432 -0.0942687752666274 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145499934_145500066:LARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 145508340 A/G 1 37 47 84 16.4528656123667 26.1004139518585 -9.64754833949184 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0369938330577433 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145508235_145508345:LARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 145519821 G/A 1 39 32 71 17.3422096995216 17.7704946055207 -0.42828490599906 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000512412:exon_145519767_145519824:LARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 145523105 G/A 1 26 23 49 11.5614731330144 12.772542997718 -1.21106986470358 A:G G A 10 0.555327956422522 0.77457305657742 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000514104:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000504323:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508667:exon_145522807_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000507095:exon_145523050_145523113:LARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 145539996 T/G 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 T:G T G 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145539937_145540049:LARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 149200043 T/C 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 T:C T C 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149199996_149200169:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149199996_149200169:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149199996_149200169:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149199996_149200169:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149199996_149200169:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149199996_149200169:PPARGC1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 149212430 G/A 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 A:G G A 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 149212510 C/A 1 13 4 17 5.78073656650721 2.22131182569009 3.55942474081713 A:C C A 10 0.555327956422522 0.092105841480131 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 149216256 C/T 1 10 18 28 4.44672043577478 9.9959032156054 -5.54918277983061 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0376381075846462 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149215826_149216636:PPARGC1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 149216304 C/T 1 11 9 20 4.89139247935226 4.9979516078027 -0.106559128450439 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149215826_149216636:PPARGC1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 149754991 C/T 1 30 24 54 13.3401613073243 13.3278709541405 0.012290353183813 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149754946_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149754180_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149754902_149755117:TCOF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 149755421 A/G 1 31 28 59 13.7848333509018 15.5491827798306 -1.7643494289288 A:G A G 10 0.555327956422522 0.694998475399664 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755284_149755472:TCOF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 149755744 G/C 1 32 45 77 14.2295053944793 24.9897580390135 -10.7602526445342 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0157144021745623 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755645_149755893:TCOF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 149759096 T/C 1 33 38 71 14.6741774380568 21.1024623440558 -6.42828490599906 T:C T C 10 0.555327956422522 0.151374157802237 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149759095_149760422:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506063:exon_149759095_149759207:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506767:exon_149759095_149759295:TCOF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 149825159 G/C 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 C:G G C 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000164587:ENST00000519855:exon_149824987_149825248:RPS14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 150410282 G/T 1 177 177 354 78.7069517132136 98.2930482867864 -19.5860965735728 T:C:G G T 10 0.555327956422522 0.0370671146267370 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150409506_150410308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150409506_150410308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150409510_150410308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150409517_150410308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522574:exon_150410045_150410308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150410053_150410308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150410142_150410308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150410142_150410308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150410180_150410308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150410250_150410308:TNIP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 159 206 365 70.702854928819 114.39755902304 -43.6947040942205 A:G A G 10 0.555327956422522 5.37380644760658e-06 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 150512740 G/A 1 197 180 377 87.6003925847632 99.959032156054 -12.3586395712908 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.213580544151008 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150512655_150512748:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150512655_150512748:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150512655_150512748:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517707:exon_150512655_150512884:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150512655_150512748:ANXA6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 155 144 299 68.9241667545091 79.9672257248432 -11.0430589703341 A:G G A 10 0.555327956422522 0.200971297537829 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 150632832 G/A 1 110 100 210 48.9139247935226 55.5327956422522 -6.61887084872961 A:G G A 10 0.555327956422522 0.367284229864534 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150632453_150632858:GM2A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 150639439 A/G 1 108 94 202 48.0245807063676 52.2008279037171 -4.17624719734943 A:G A G 10 0.555327956422522 0.571541600749818 ENSG00000196743:ENST00000523466:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000523004:exon_150639360_150639477:GM2A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 150647040 C/T 1 120 74 194 53.3606452292974 41.0942687752666 12.2663764540307 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0828632226622946 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 153372525 G/A 1 23 20 43 10.227457002282 11.1065591284504 -0.879102126168444 A:G G A 10 0.555327956422522 0.878299608285348 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153369688_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153371263_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153372059_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153372066_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518914:exon_153372248_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518946:exon_153372274_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153372515_153372670:FAM114A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 153413390 C/T 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153413351_153413426:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153413351_153413437:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522395:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518900:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000523705:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000519808:exon_153413377_153413443:FAM114A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 153429459 T/C 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 T:C T C 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000037749:ENST00000522782:exon_153429117_153429577:MFAP3;ENSG00000037749:ENST00000436816:exon_153429117_153429577:MFAP3;ENSG00000037749:ENST00000322602:exon_153429117_153429577:MFAP3;ENSG00000037749:ENST00000522177:exon_153429117_153429577:MFAP3;ENSG00000037749:ENST00000519928:exon_153429162_153429577:MFAP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 153432733 T/C 1 4 9 13 1.77868817430991 4.9979516078027 -3.21926343349279 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0940602799732446 ENSG00000037749:ENST00000439768:exon_153432480_153433612:MFAP3;ENSG00000037749:ENST00000436816:exon_153432480_153437014:MFAP3;ENSG00000037749:ENST00000322602:exon_153432480_153434593:MFAP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 153432970 C/T 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000037749:ENST00000439768:exon_153432480_153433612:MFAP3;ENSG00000037749:ENST00000436816:exon_153432480_153437014:MFAP3;ENSG00000037749:ENST00000322602:exon_153432480_153434593:MFAP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 153709273 A/G 1 22 23 45 9.78278495870452 12.772542997718 -2.98975803901349 A:G A G 10 0.555327956422522 0.372989596784527 ENSG00000164574:ENST00000425427:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000297107:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000520647:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377661:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000521781:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000519571:exon_153709132_153709298:GALNT10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 153796484 G/A 1 33 36 69 14.6741774380568 19.9918064312108 -5.31762899315402 A:G G A 10 0.555327956422522 0.225814430524402 ENSG00000164574:ENST00000297107:exon_153796374_153800544:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000520647:exon_153796374_153798572:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377661:exon_153796374_153798591:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000517958:exon_153796374_153798593:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000427235:exon_153796374_153799810:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377657:exon_153796374_153799810:GALNT10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 154291414 T/C 1 11 12 23 4.89139247935226 6.66393547707026 -1.77254299771801 T:C T C 10 0.555327956422522 0.531120817504268 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 54 78 132 24.0122903531838 43.3155806009567 -19.3032902477729 A:G A G 10 0.555327956422522 0.000826974489238033 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 158204425 A/G 1 4 13 17 1.77868817430991 7.21926343349279 -5.44057525918287 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0122609762671924 ENSG00000164330:ENST00000519890:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000519739:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000518836:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000313708:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000380654:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000517373:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000522192:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000523464:exon_158204421_158204547:EBF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 20 23 43 8.89344087154956 12.772542997718 -3.87910212616844 A:G A G 10 0.555327956422522 0.282779147921419 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 159912418 C/G 1 15 5 20 6.67008065366217 2.77663978211261 3.89344087154956 C:G C G 10 0.555327956422522 0.113443509114618 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 167937607 G/A 1 35 47 82 15.5635215252117 26.1004139518585 -10.5368924266468 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0256438891379669 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167937586_167937691:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167937586_167937691:RARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 169021610 C/T 1 21 22 43 9.33811291512704 12.2172150412955 -2.87910212616845 T:C C T 10 0.555327956422522 0.443426847321452 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021575_169021685:CCDC99 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 169028481 T/C 1 25 21 46 11.116801089437 11.661887084873 -0.545085995436011 T:C T C 10 0.555327956422522 0.883074147030052 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 169031150 T/C 1 27 24 51 12.0061451765919 13.3278709541405 -1.32172577754862 T:C T C 10 0.555327956422522 0.778554121667431 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 169031218 G/T 1 20 14 34 8.89344087154956 7.77459138991531 1.11884948163425 T:G G T 10 0.555327956422522 0.73341319325584 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 169129422 A/G 1 31 22 53 13.7848333509018 12.2172150412955 1.56761830960633 A:G A G 10 0.555327956422522 0.681482325200223 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 45 40 85 20.0102419609865 22.2131182569009 -2.20287629591436 A:C:G C G 10 0.555327956422522 0.663133334057868 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 56 56 112 24.9016344403388 31.0983655596612 -6.19673111932246 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.254420184389654 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 171481606 A/G 1 44 50 94 19.565569917409 27.7663978211261 -8.20082790371707 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0969034995175417 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 171523436 G/A 1 74 79 153 32.9057312247334 43.8709085573792 -10.9651773326459 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0872520238548079 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171523430_171523564:STK10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 173316729 G/A 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000113742:ENST00000265085:exon_173315283_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000326629:exon_173315331_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000520867:exon_173316343_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000334035:exon_173316343_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000519835:exon_173316534_173317861:CPEB4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 174937193 C/T 1 33 37 70 14.6741774380568 20.5471343876333 -5.87295694957654 T:C C T 10 0.555327956422522 0.185592582332568 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174937112_174937315:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502865:exon_174937112_174937210:SFXN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 174953743 G/A 1 32 47 79 14.2295053944793 26.1004139518585 -11.8709085573792 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00885577647831566 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174953641_174956745:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174953641_174953886:SFXN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 176081907 C/T 1 14 8 22 6.22540861008469 4.44262365138018 1.78278495870452 T:C C T 10 0.555327956422522 0.523473069933469 ENSG00000048140:ENST00000310032:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000405525:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000514705:exon_176079744_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000508164:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000504168:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000503045:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000515708:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000507471:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000414405:exon_176081380_176082021:TSPAN17 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 176382995 G/A 1 7 11 18 3.11270430504235 6.10860752064774 -2.9959032156054 A:G G A 10 0.555327956422522 0.163703578976710 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176382960_176383036:UIMC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 176830627 G/A 1 2 13 15 0.889344087154956 7.21926343349279 -6.32991934633783 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00111162449871957 ENSG00000131187:ENST00000502854:exon_176830482_176831091:F12;ENSG00000131187:ENST00000504406:exon_176830255_176830751:F12;ENSG00000131187:ENST00000510358:exon_176830482_176831473:F12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 176915143 C/T 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:C C T 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176914898_176915249:PDLIM7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 176916516 C/T 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 T:C C T 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 40 42 82 17.7868817430991 23.3237741697459 -5.5368924266468 A:G G A 10 0.555327956422522 0.223513803896284 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 176958397 G/A 1 10 4 14 4.44672043577478 2.22131182569009 2.22540861008469 A:G G A 10 0.555327956422522 0.288383222971717 ENSG00000146067:ENST00000510479:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000506955:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000329540:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000510163:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000524677:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000442143:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000443375:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000513502:exon_176958283_176958835:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000506064:exon_176958339_176958522:FAM193B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 177031348 T/C 1 13 12 25 5.78073656650721 6.66393547707026 -0.883198910563049 T:C T C 10 0.555327956422522 0.841067314696951 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000502420:exon_177031280_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000510761:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505468:exon_177031067_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000507061:exon_177031313_177031542:B4GALT7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 12 11 23 5.33606452292974 6.10860752064774 -0.772542997718006 T:C T C 10 0.555327956422522 0.834806358038955 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 1 2281 12 2293 1014.29693140023 6.66393547707026 1007.63299592316 T:C T C 10 0.555327956422522 0 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 178140090 C/T 1 8 12 20 3.55737634861982 6.66393547707026 -3.10655912845044 T:C C T 10 0.555327956422522 0.181542604683008 ENSG00000169131:ENST00000335815:exon_178138593_178140622:ZNF354A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 179193598 C/T 1 15 10 25 6.67008065366217 5.55327956422522 1.11680108943695 T:C C T 10 0.555327956422522 0.692593351989186 ENSG00000161021:ENST00000292599:exon_179192327_179193742:MAML1;ENSG00000161021:ENST00000376951:exon_179192327_179193742:MAML1;ENSG00000161021:ENST00000503050:exon_179192327_179193742:MAML1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 179201847 G/A 1 17 12 29 7.55942474081713 6.66393547707026 0.895489263746863 A:G G A 10 0.555327956422522 0.852446590248957 ENSG00000161021:ENST00000292599:exon_179200896_179204287:MAML1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 179260153 C/T 1 207 199 406 92.0471130205379 110.510263328082 -18.4631503075439 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0720933700954044 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 179260213 G/A 1 266 285 551 118.282763591609 158.268467580419 -39.9857039888096 A:G G A 10 0.555327956422522 0.000695324232207272 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 179264731 T/C 1 31 53 84 13.7848333509018 29.4323816903937 -15.6475483394918 T:C T C 10 0.555327956422522 0.000875416868271272 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179264266_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179264274_179264879:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179264277_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179264527_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179264693_179264811:C5orf45 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 179264915 G/T 1 13 19 32 5.78073656650721 10.5512311720279 -4.7704946055207 T:G G T 10 0.555327956422522 0.109011061329792 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000518950:exon_179264760_179265255:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 179280379 T/C 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C T C 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000161010:ENST00000403396:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522663:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518235:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520698:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520150:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519208:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523737:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520995:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000524068:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522157:exon_179280197_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523835:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519213:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519318:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000517338:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519398:exon_179280283_179280437:C5orf45 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 64 44 108 28.4590107889586 24.434430082591 4.02458070636763 T:G T G 10 0.555327956422522 0.498108432313252 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 43 57 100 19.1208978738316 31.6536935160838 -12.5327956422522 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0153111830160354 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 180218820 C/A 1 31 46 77 13.7848333509018 25.545085995436 -11.7602526445342 A:C C A 10 0.555327956422522 0.00809577300043598 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 180218831 G/A 1 26 32 58 11.5614731330144 17.7704946055207 -6.20902147250627 A:G G A 10 0.555327956422522 0.113055516830934 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 180219304 C/T 1 57 65 122 25.3463064839162 36.0963171674639 -10.7500106835477 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0555684522826841 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 180219537 G/A 1 51 50 101 22.6782742224514 27.7663978211261 -5.08812359867472 A:G G A 10 0.555327956422522 0.318076760819787 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000504671:exon_180219373_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000506889:exon_180219511_180220097:MGAT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 180669136 C/T 1 20 20 40 8.89344087154956 11.1065591284504 -2.21311825690088 T:C C T 10 0.555327956422522 0.526214098904355 ENSG00000204628:ENST00000513060:exon_180668492_180669345:GNB2L1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 180687212 C/T 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000183718:ENST00000327767:exon_180687002_180688119:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000510796:exon_180687002_180687258:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000503005:exon_180687002_180687325:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000514805:exon_180687002_180688082:TRIM52 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 5 180687308 G/C 1 15 17 32 6.67008065366217 9.44057525918287 -2.7704946055207 C:G G C 10 0.555327956422522 0.375116209383114 ENSG00000183718:ENST00000327767:exon_180687002_180688119:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000503005:exon_180687002_180687325:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000514805:exon_180687002_180688082:TRIM52 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 146 70 216 64.9221183623118 38.8729569495765 26.0491614127353 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00035139549529897 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 564145 A/G 1 11 6 17 4.89139247935226 3.33196773853513 1.55942474081713 A:G A G 10 0.555327956422522 0.477388500584111 ENSG00000112685:ENST00000230449:exon_564033_564154:EXOC2;ENSG00000112685:ENST00000448181:exon_564033_564154:EXOC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 599209 T/C 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000112685:ENST00000230449:exon_599080_599225:EXOC2;ENSG00000112685:ENST00000448181:exon_599080_599225:EXOC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 2766144 T/C 1 8 16 24 3.55737634861982 8.88524730276035 -5.32787095414053 T:C:G T C 10 0.555327956422522 0.0382967038854731 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2765648_2766678:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2765648_2766678:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000415856:exon_2765666_2766678:WRNIP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 33 42 75 14.6741774380568 23.3237741697459 -8.64959673168915 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0483271892924481 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 7229346 T/C 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 T:C T C 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000483150:exon_7229230_7230666:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7229230_7229883:RREB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 7229619 G/A 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000483150:exon_7229230_7230666:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7229230_7229883:RREB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 11185533 G/A 1 33 35 68 14.6741774380568 19.4364784747883 -4.7623010367315 A:G G A 10 0.555327956422522 0.272585043544647 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 11193860 G/A 1 17 12 29 7.55942474081713 6.66393547707026 0.895489263746863 A:G G A 10 0.555327956422522 0.852446590248957 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11193824_11193925:NEDD9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 11213832 T/C 1 22 20 42 9.78278495870452 11.1065591284504 -1.32377416974592 T:C T C 10 0.555327956422522 0.756752546679991 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 13365584 G/A 1 25 11 36 11.116801089437 6.10860752064774 5.00819356878921 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0967091907326827 ENSG00000145990:ENST00000379287:exon_13358062_13365894:GFOD1;ENSG00000145990:ENST00000379284:exon_13358062_13365894:GFOD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 13599303 C/T 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 T:C C T 10 0.555327956422522 0.150211231786478 ENSG00000124523:ENST00000379262:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000397350:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13599264_13599387:SIRT5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 13711279 A/G 1 10 10 20 4.44672043577478 5.55327956422522 -1.10655912845044 A:G A G 10 0.555327956422522 0.657502601953682 ENSG00000010017:ENST00000011619:exon_13711167_13711796:RANBP9;ENSG00000010017:ENST00000283152:exon_13711167_13711953:RANBP9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 13794147 C/T 1 13 11 24 5.78073656650721 6.10860752064774 -0.327870954140527 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13794126_13794179:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13794126_13794179:CCDC90A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 16306866 G/A 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 A:G G A 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 17688693 C/T 1 29 20 49 12.8954892637469 11.1065591284504 1.78893013529642 T:C C T 10 0.555327956422522 0.667619460958624 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17688627_17688849:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17688627_17688849:NUP153 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 21065449 C/T 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21065279_21065459:CDKAL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 21065450 A/G 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:G A G 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21065279_21065459:CDKAL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 21201493 G/A 1 9 14 23 4.0020483921973 7.77459138991531 -3.77254299771801 A:G G A 10 0.555327956422522 0.141766408043743 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000476517:exon_21201341_21201505:CDKAL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 24418348 G/A 1 8 12 20 3.55737634861982 6.66393547707026 -3.10655912845044 A:G G A 10 0.555327956422522 0.181542604683008 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418312_24418395:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418312_24418464:MRS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 24653376 G/A 1 26 21 47 11.5614731330144 11.661887084873 -0.100413951858533 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 25600968 G/A 1 9 10 19 4.0020483921973 5.55327956422522 -1.55123117202792 A:G G A 10 0.555327956422522 0.496869552202761 ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25600542_25600974:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25600542_25600974:LRRC16A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 26045737 C/G 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 C:G C G 10 0.555327956422522 0.605558868068935 ENSG00000196532:ENST00000360577:exon_26045612_26047022:HIST1H3C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 26056145 G/A 1 212 196 408 94.2704732384253 108.844279458814 -14.573806220389 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.148816471874789 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 26056604 G/A 1 146 138 284 64.9221183623118 76.635257986308 -11.7131396239962 A:G G A 10 0.555327956422522 0.169777098633253 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 26184102 G/A 1 9 17 26 4.0020483921973 9.44057525918287 -5.43852686698557 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0463758134411358 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 26393021 G/A 1 30 31 61 13.3401613073243 17.2151666490982 -3.87500534177384 A:G G A 10 0.555327956422522 0.367377166174333 ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 26410148 T/C 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:C T C 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000026950:ENST00000082468:exon_26410122_26410260:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000513047:exon_26410122_26410260:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000502361:exon_26410122_26410260:BTN3A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 26459791 C/T 1 9 4 13 4.0020483921973 2.22131182569009 1.78073656650721 T:C C T 10 0.555327956422522 0.408523981318449 ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26459709_26460056:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26459709_26460056:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000493173:exon_26459709_26460056:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26459709_26460056:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000265424:exon_26459709_26460056:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000469185:exon_26459709_26460056:BTN2A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 26468319 C/T 1 11 20 31 4.89139247935226 11.1065591284504 -6.21516664909818 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0294966063556148 ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26468176_26469830:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26468176_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26467947_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000265424:exon_26468176_26468635:BTN2A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 21 23 44 9.33811291512704 12.772542997718 -3.43443008259097 A:G A G 10 0.555327956422522 0.362904165769611 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 40 40 80 17.7868817430991 22.2131182569009 -4.42623651380175 A:G A G 10 0.555327956422522 0.368233186486957 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 26598798 G/A 1 74 65 139 32.9057312247334 36.0963171674639 -3.19058594273056 A:G G A 10 0.555327956422522 0.609107806906696 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598493_26600278:ABT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 27420588 G/A 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000096654:ENST00000211936:exon_27418522_27421039:ZNF184;ENSG00000096654:ENST00000377419:exon_27418599_27421039:ZNF184 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 27425185 C/A 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 A:C C A 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000096654:ENST00000211936:exon_27425062_27425188:ZNF184;ENSG00000096654:ENST00000377419:exon_27425062_27425188:ZNF184 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 28251716 T/A 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:T T A 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28251533_28251986:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28251553_28251986:PGBD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 28264717 C/T 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 T:C C T 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28264593_28264722:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28264593_28264722:PGBD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 29523670 C/A 1 85 42 127 37.7971237040856 23.3237741697459 14.4733495343397 A:C C A 10 0.555327956422522 0.00958357002807447 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 29523859 G/C 1 169 208 377 75.1495753645938 115.508214935885 -40.3586395712908 C:G G C 10 0.555327956422522 3.22189826793288e-05 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 29523872 A/G 1 152 212 364 67.5901506237767 117.729526761575 -50.139376137798 A:G A G 10 0.555327956422522 1.51558273430652e-07 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 29524003 A/G 1 140 225 365 62.2540861008469 124.948790195067 -62.6947040942205 A:G A G 10 0.555327956422522 6.08130768564669e-11 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 368 491 859 163.639312036512 272.666026603458 -109.026714566946 A:C:G G A 10 0.555327956422522 9.20138495919444e-14 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 29691713 A/C 1 24 14 38 10.6721290458595 7.77459138991531 2.89753765594416 A:C A C 10 0.555327956422522 0.415285067204515 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 29691744 C/G 1 15 18 33 6.67008065366217 9.9959032156054 -3.32582256194322 C:G C G 10 0.555327956422522 0.293705287922686 ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29691717_29692225:HLA-F HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 12 8 20 5.33606452292974 4.44262365138018 0.893440871549561 A:C A C 10 0.555327956422522 0.823148310222236 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 12 8 20 5.33606452292974 4.44262365138018 0.893440871549561 A:T A T 10 0.555327956422522 0.823148310222236 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 29695713 C/T 1 9 3 12 4.0020483921973 1.66598386926757 2.33606452292974 T:C C T 10 0.555327956422522 0.247371341375508 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 29695854 G/A 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29695734_29695883:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000475996:exon_29695734_29697128:HLA-F HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 29910801 C/A 1 451 1 452 200.547091653443 0.555327956422522 199.99176369702 A:C C A 10 0.555327956422522 1.95603369924042e-113 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 0 499 0 499 221.891349745162 0 221.891349745162 A A 10 0.555327956422522 3.70536594888427e-128 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 35 64 99 15.5635215252117 35.5409892110414 -19.9774676858297 A:T:G A G 10 0.555327956422522 6.61581424536574e-05 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 47 52 99 20.8995860481415 28.8770537339711 -7.97746768582967 A:C C A 10 0.555327956422522 0.128858554556893 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30164497 G/A 1 39 29 68 17.3422096995216 16.1045107362531 1.23769896326851 A:G G A 10 0.555327956422522 0.807974242118942 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30164313_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30164356_30164523:TRIM26 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30228379 A/G 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 A:G A G 10 0.555327956422522 0.739817826611437 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30229013 A/G 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:G A G 10 0.555327956422522 0.739711191898725 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30231071 G/A 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:G G A 10 0.555327956422522 1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30231108 G/T 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 T:G G T 10 0.555327956422522 1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30297529 T/C 1 7 12 19 3.11270430504235 6.66393547707026 -3.55123117202792 T:C T C 10 0.555327956422522 0.110901602972419 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000449040:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000428728:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000420746:exon_30297306_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30297359_30297547:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30297359_30297547:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30309508 T/C 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:C T C 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30309489_30311505:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30309489_30309673:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30309489_30309673:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30313340 G/C 1 69 90 159 30.682371006846 49.979516078027 -19.297145071181 C:G G C 10 0.555327956422522 0.00235249255560442 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 28 21 49 12.4508172201694 11.661887084873 0.788930135296422 T:G T G 10 0.555327956422522 0.886219150384339 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 28 21 49 12.4508172201694 11.661887084873 0.788930135296422 A:C C A 10 0.555327956422522 0.886219150384339 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30457283 G/T 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 T:G G T 10 0.555327956422522 0.150211231786478 ENSG00000204592:ENST00000427226:exon_30457231_30457372:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457231_30457372:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457244_30457372:HLA-E HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30457732 T/C 1 1003 851 1854 446.00605970821 472.584090915566 -26.5780312073558 T:C T C 10 0.555327956422522 0.215596268604926 ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30457289_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30457316_30457772:HLA-E HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 768 684 1452 341.508129467503 379.844322193005 -38.3361927255019 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0447420045201135 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 22 27 49 9.78278495870452 14.9938548234081 -5.21106986470358 A:G G A 10 0.555327956422522 0.151070316195741 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30529816 G/A 1 7 13 20 3.11270430504235 7.21926343349279 -4.10655912845044 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0737347832885448 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30527808_30529901:PRR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30530203 A/G 1 14 20 34 6.22540861008469 11.1065591284504 -4.88115051836575 A:G A G 10 0.555327956422522 0.119328286684192 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30530245 T/C 1 10 13 23 4.44672043577478 7.21926343349279 -2.772542997718 T:C T C 10 0.555327956422522 0.295526802222298 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30656398 T/C 1 51 43 94 22.6782742224514 23.8791021261684 -1.20082790371707 T:C T C 10 0.555327956422522 0.835912580183859 ENSG00000137404:ENST00000259953:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000470733:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000482141:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000462857:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376420:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000474864:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000444096:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000495946:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376421:exon_30655829_30656719:NRM HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30671452 T/C 1 33 46 79 14.6741774380568 25.545085995436 -10.8709085573792 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0169645322380703 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30671398_30671598:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30671195_30671858:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30671760 C/T 1 38 27 65 16.8975376559442 14.9938548234081 1.90368283253607 T:C C T 10 0.555327956422522 0.708593367424019 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30671195_30671858:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30671969 G/C 1 31 23 54 13.7848333509018 12.772542997718 1.01229035318381 C:G G C 10 0.555327956422522 0.891258773061341 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30672718 G/A 1 16 23 39 7.11475269723965 12.772542997718 -5.65779030047836 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0767743759468292 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30673113 G/T 1 27 27 54 12.0061451765919 14.9938548234081 -2.98770964681619 T:G G T 10 0.555327956422522 0.415371111688778 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30673422 A/G 1 26 20 46 11.5614731330144 11.1065591284504 0.454914004563991 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000492462:exon_30673359_30673875:MDC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30673489 G/C 1 26 30 56 11.5614731330144 16.6598386926757 -5.09836555966123 C:G G C 10 0.555327956422522 0.180472409455814 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000492462:exon_30673359_30673875:MDC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30676046 C/G 1 14 19 33 6.22540861008469 10.5512311720279 -4.32582256194322 C:G C G 10 0.555327956422522 0.160689908592126 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30675343_30676134:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30675343_30676134:MDC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30680562 G/A 1 25 18 43 11.116801089437 9.9959032156054 1.12089787383156 A:G G A 10 0.555327956422522 0.761359494764192 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30679651_30681131:MDC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30680608 C/T 1 31 20 51 13.7848333509018 11.1065591284504 2.67827422245138 T:C C T 10 0.555327956422522 0.483824964775692 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30679651_30681131:MDC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30691490 G/A 1 1827 1385 3212 812.415823616052 769.129219645193 43.2866039708593 A:T:C:G G A 10 0.555327956422522 0.126805788260707 ENSG00000196230:ENST00000327892:exon_30691117_30693203:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000422827:exon_30691488_30692174:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000444378:exon_30691434_30692174:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000330914:exon_30691117_30693203:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000396389:exon_30691117_30693203:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000396384:exon_30691117_30693203:TUBB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30695920 C/T 1 258 266 524 114.725387242989 147.717236408391 -32.9918491654015 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00423252704711042 ENSG00000137312:ENST00000376389:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000376385:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000456573:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000432446:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000422641:exon_30695513_30695922:FLOT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30697931 T/C 1 142 177 319 63.1434301880019 98.2930482867864 -35.1496180987845 T:C T C 10 0.555327956422522 9.55018920360044e-05 ENSG00000137312:ENST00000376389:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000376385:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000456573:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000432446:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000422641:exon_30697799_30697963:FLOT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30708944 T/A 1 9 4 13 4.0020483921973 2.22131182569009 1.78073656650721 A:T T A 10 0.555327956422522 0.408523981318449 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30709364 G/T 1 8 3 11 3.55737634861982 1.66598386926757 1.89139247935226 T:G G T 10 0.555327956422522 0.365636833821238 ENSG00000137312:ENST00000484168:exon_30708967_30709481:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000484693:exon_30709131_30709980:FLOT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30864829 T/C 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 T:C T C 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000514434:exon_30864791_30864918:DDR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30865204 A/C 1 10 6 16 4.44672043577478 3.33196773853513 1.11475269723965 A:C A C 10 0.555327956422522 0.624513862012014 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30865138_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30865156_30865374:DDR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 12 10 22 5.33606452292974 5.55327956422522 -0.217215041295483 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 12 8 20 5.33606452292974 4.44262365138018 0.893440871549561 A:C A C 10 0.555327956422522 0.823148310222236 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30882634 C/T 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30882781 G/T 1 15 13 28 6.67008065366217 7.21926343349279 -0.549182779830615 T:G G T 10 0.555327956422522 0.851250752295518 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30888169 G/A 1 12 10 22 5.33606452292974 5.55327956422522 -0.217215041295483 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30889389 T/C 1 18 14 32 8.0040967843946 7.77459138991531 0.229505394479297 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30889366_30889468:VARS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30890483 G/T 1 13 25 38 5.78073656650721 13.883198910563 -8.10246234405583 T:G G T 10 0.555327956422522 0.00891721557284758 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000477052:exon_30890360_30890551:VARS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30892322 C/T 1 7 14 21 3.11270430504235 7.77459138991531 -4.66188708487296 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0482087998619483 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30892131_30892341:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 12 11 23 5.33606452292974 6.10860752064774 -0.772542997718006 A:G G A 10 0.555327956422522 0.834806358038955 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 30893428 G/A 1 19 16 35 8.44876882797208 8.88524730276035 -0.436478474788268 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30893321_30893451:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893321_30893496:VARS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31110786 T/A 1 35 32 67 15.5635215252117 17.7704946055207 -2.20697308030897 A:T T A 10 0.555327956422522 0.623856024916973 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110740_31110911:CCHCR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 32 20 52 14.2295053944793 11.1065591284504 3.12294626602886 T:C T C 10 0.555327956422522 0.405893870756447 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31113030 A/G 1 35 32 67 15.5635215252117 17.7704946055207 -2.20697308030897 A:G A G 10 0.555327956422522 0.623856024916973 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 33 25 58 14.6741774380568 13.883198910563 0.790978527493726 A:G G A 10 0.555327956422522 0.895286785174961 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31116220 G/A 1 23 12 35 10.227457002282 6.66393547707026 3.56352152521173 A:G G A 10 0.555327956422522 0.239216773998418 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 30 15 45 13.3401613073243 8.32991934633783 5.01024196098651 C:G C G 10 0.555327956422522 0.176341852604436 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31122330 G/A 1 33 20 53 14.6741774380568 11.1065591284504 3.56761830960634 A:G G A 10 0.555327956422522 0.337406825494301 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 23 17 40 10.227457002282 9.44057525918287 0.786881743099121 A:G A G 10 0.555327956422522 0.874297431714736 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C 1 27 16 43 12.0061451765919 8.88524730276035 3.12089787383156 A:C A C 10 0.555327956422522 0.361306149656312 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 54 42 96 24.0122903531838 23.3237741697459 0.688516183437891 T:C T C 10 0.555327956422522 0.918503730541524 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 2510 1196 3706 1116.12682937947 664.172235881336 451.954593498134 A:T:C:G T C 10 0.555327956422522 7.37754136857434e-52 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 2713 821 3534 1206.3952542257 455.924252222891 750.471002002807 A:T:C:G C G 10 0.555327956422522 4.38205542238262e-152 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31237333 T/A 0 14 0 14 6.22540861008469 0 6.22540861008469 T T 10 0.555327956422522 0.000483722581978021 ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31237342 G/T 0 14 0 14 6.22540861008469 0 6.22540861008469 G G 10 0.555327956422522 0.000483722581978021 ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31239335 G/A 1 80 4 84 35.5737634861982 2.22131182569009 33.3524516605082 A:G G A 10 0.555327956422522 3.71870888956666e-16 ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31239378 T/G 1 2083 90 2173 926.251866771887 49.979516078027 876.27235069386 T:G T G 10 0.555327956422522 0 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31239430 C/T 1 2359 159 2518 1048.98135079927 88.297145071181 960.68420572809 T:C C T 10 0.555327956422522 4.94065645841247e-324 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 0 1360 1 1361 604.75397926537 0.555327956422522 604.198651308948 A:G G A 10 0.555327956422522 0 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31322470 C/G 1 67 56 123 29.793026919691 31.0983655596612 -1.30533863997021 C:G C G 10 0.555327956422522 0.856150847833687 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31431757 A/G 1 71 77 148 31.5717150940009 42.7602526445342 -11.1885375505333 A:T:G A G 10 0.555327956422522 0.0688345073583576 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31473561 A/G 1 12 9 21 5.33606452292974 4.9979516078027 0.338112915127039 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31473957 C/G 1 25 17 42 11.116801089437 9.44057525918287 1.67622583025408 C:G C G 10 0.555327956422522 0.64411754906678 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31474000 G/A 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 A:G G A 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31525448 C/T 1 14 14 28 6.22540861008469 7.77459138991531 -1.54918277983062 T:C C T 10 0.555327956422522 0.573526479524123 ENSG00000204498:ENST00000376146:exon_31525405_31525626:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376148:exon_31525405_31525626:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376145:exon_31525405_31525581:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000496233:exon_31525405_31525482:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000473655:exon_31525405_31525736:NFKBIL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 96 109 205 42.6885161834379 60.5307472500549 -17.842231066617 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0137518478819616 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31598489 A/G 1 40 35 75 17.7868817430991 19.4364784747883 -1.64959673168915 A:G A G 10 0.555327956422522 0.728289721688426 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598368_31598578:BAT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 285 292 577 126.731532419581 162.155763275376 -35.4242308557952 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00333442891550282 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 127 118 245 56.4733495343397 65.5286988578576 -9.05534932351788 T:C C T 10 0.555327956422522 0.247843533244087 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31627449 C/G 1 16 24 40 7.11475269723965 13.3278709541405 -6.21311825690088 C:G C G 10 0.555327956422522 0.055961444375052 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 46 37 83 20.454914004564 20.5471343876333 -0.0922203830693249 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 89 110 199 39.5758118783955 61.0860752064774 -21.5102633280819 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00264964826212521 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31639979 C/T 1 24 20 44 10.6721290458595 11.1065591284504 -0.434430082590966 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31655438 G/A 1 11 13 24 4.89139247935226 7.21926343349279 -2.32787095414053 A:G G A 10 0.555327956422522 0.412507168985383 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000468205:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000490209:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000474007:exon_31655352_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31655430_31655517:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31655419_31655517:XXbac-BPG32J3.20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31695043 A/G 1 6 16 22 2.66803226146487 8.88524730276035 -6.21721504129548 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0092388818981735 ENSG00000213722:ENST00000437288:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000469963:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375789:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000480913:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000483792:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375787:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375792:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000444662:exon_31694818_31695130:DDAH2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31695437 G/A 1 12 18 30 5.33606452292974 9.9959032156054 -4.65983869267566 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0991449163238243 ENSG00000213722:ENST00000469963:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375789:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000480913:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000483792:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375787:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375792:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000416410:exon_31695352_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000436437:exon_31695383_31695469:DDAH2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31696493 G/A 1 16 10 26 7.11475269723965 5.55327956422522 1.56147313301443 A:G G A 10 0.555327956422522 0.561847305125949 ENSG00000213722:ENST00000437288:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000469963:exon_31695950_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375789:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000480913:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000483792:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375787:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375792:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000444662:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000416410:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000436437:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000488119:exon_31695958_31696522:DDAH2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31731881 C/T 1 7 11 18 3.11270430504235 6.10860752064774 -2.9959032156054 T:C C T 10 0.555327956422522 0.163703578976710 ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000228727:ENST00000433778:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000415669:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000425424:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000494299:exon_31731397_31731936:C6orf26 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31748820 G/A 1 32 21 53 14.2295053944793 11.661887084873 2.56761830960633 A:G G A 10 0.555327956422522 0.493642527442102 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31807466 A/G 1 12 16 28 5.33606452292974 8.88524730276035 -3.54918277983062 A:G A G 10 0.555327956422522 0.187908971200259 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31807489 C/T 1 17 12 29 7.55942474081713 6.66393547707026 0.895489263746863 T:C C T 10 0.555327956422522 0.852446590248957 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31856212 C/T 1 25 27 52 11.116801089437 14.9938548234081 -3.87705373397114 T:C C T 10 0.555327956422522 0.328850770622475 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31856140_31856283:EHMT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31928306 A/G 1 14 21 35 6.22540861008469 11.661887084873 -5.43647847478827 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0875511705830525 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31928209_31928323:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31928209_31928323:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000488648:exon_31928209_31928323:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31928209_31928323:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000461073:exon_31928209_31928323:SKIV2L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31936679 C/T 1 33 25 58 14.6741774380568 13.883198910563 0.790978527493726 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.895286785174961 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000471818:exon_31936678_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 6 9 15 2.66803226146487 4.9979516078027 -2.32991934633783 A:G A G 10 0.555327956422522 0.299710241961317 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32149140 C/T 1 27 21 48 12.0061451765919 11.661887084873 0.344258091718945 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000204305:ENST00000469940:exon_32149128_32149412:AGER;ENSG00000204305:ENST00000473619:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375067:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000484849:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375076:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375065:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375070:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375069:exon_32149128_32149254:AGER HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32151734 G/A 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 A:G G A 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000204305:ENST00000375067:exon_32151658_32151764:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375055:exon_32151658_32151764:AGER;ENSG00000204305:ENST00000484849:exon_32151658_32152023:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375076:exon_32151658_32151764:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375065:exon_32151658_32151764:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375070:exon_32151658_32151764:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375069:exon_32151658_32151764:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375059:exon_32151658_32151764:AGER;ENSG00000204305:ENST00000438221:exon_32151658_32151764:AGER;ENSG00000204305:ENST00000450110:exon_32151658_32151764:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375056:exon_32151658_32151764:AGER HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32157639 C/T 1 16 13 29 7.11475269723965 7.21926343349279 -0.104510736253137 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000204304:ENST00000375050:exon_32157472_32157963:PBX2;ENSG00000204304:ENST00000478678:exon_32157472_32157719:PBX2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32159191 C/T 1 374 319 693 166.307344297977 177.149618098785 -10.8422738008077 T:C C T 10 0.555327956422522 0.422209731983677 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32158543_32159280:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32158543_32159280:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32158543_32159280:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32158543_32159280:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32158544_32159280:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000403803:exon_32158573_32159280:GPSM3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 600 528 1128 266.803226146487 293.213160991092 -26.4099348446048 A:T:C:G C A 10 0.555327956422522 0.119233455806617 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32605284 G/A 1 915 87 1002 406.874919873392 48.3135322087594 358.561387664633 A:G G A 10 0.555327956422522 7.15701206444213e-138 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32605295 C/T 1 943 112 1055 419.325737093562 62.1967311193225 357.129005974239 T:C C T 10 0.555327956422522 4.99637731734333e-127 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32605309 A/G 1 926 117 1043 411.766312352745 64.9733709014351 346.79294145131 A:C:G A G 10 0.555327956422522 1.80446690312086e-120 ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32627988 A/G 0 741 0 741 329.501984290911 0 329.501984290911 A A 10 0.555327956422522 5.45459132113062e-190 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399082:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000460185:exon_32627663_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32627884_32628026:HLA-DQB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32627991 C/T 1 742 1 743 329.946656334489 0.555327956422522 329.391328378066 T:C C T 10 0.555327956422522 1.57403038500115e-187 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399082:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000460185:exon_32627663_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32627884_32628026:HLA-DQB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32628001 T/C 1 606 2 608 269.471258407952 1.11065591284504 268.360602495107 T:C T C 10 0.555327956422522 6.72702436734271e-151 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399082:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000460185:exon_32627663_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32627884_32628026:HLA-DQB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32628070 T/C 0 15 0 15 6.67008065366217 0 6.67008065366217 T T 10 0.555327956422522 0.000251015038114268 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32629155 C/A 1 120 56 176 53.3606452292974 31.0983655596612 22.2622796696361 A:C C A 10 0.555327956422522 0.000798069430675919 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32629124_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32629685 G/A 1 1 8 9 0.444672043577478 4.44262365138018 -3.9979516078027 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0133428681828177 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32629124_32632844:HLA-DQB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 33 41 74 14.6741774380568 22.7684462133234 -8.09426877526663 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0617535044149583 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32797773 T/C 1 33 50 83 14.6741774380568 27.7663978211261 -13.0922203830693 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00542952707242611 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797707_32797866:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32805849 C/T 1 45 39 84 20.0102419609865 21.6577903004784 -1.64754833949184 T:C C T 10 0.555327956422522 0.742634268494538 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32805518_32806014:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32805518_32806014:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32805518_32806014:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32805518_32806010:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32805518_32806014:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32906586 C/T 1 62 65 127 27.5696667018036 36.0963171674639 -8.52665046566029 T:C C T 10 0.555327956422522 0.130009265733612 ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000248993:ENST00000429234:exon_32906461_32906742:XXbac-BPG181M17.5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32906652 T/A 1 67 56 123 29.793026919691 31.0983655596612 -1.30533863997021 A:T T A 10 0.555327956422522 0.856150847833687 ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000248993:ENST00000429234:exon_32906461_32906742:XXbac-BPG181M17.5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32906716 T/C 1 95 55 150 42.2438441398604 30.5430376032387 11.7008065366217 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0587306987472102 ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000248993:ENST00000429234:exon_32906461_32906742:XXbac-BPG181M17.5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32917411 C/T 1 193 211 404 85.8217044104533 117.174198805152 -31.3524943946989 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.0018824200911937 ENSG00000204257:ENST00000480785:exon_32917048_32917448:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32917388_32917564:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32917388_32918580:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000456800:exon_32917388_32917666:HLA-DMA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32917498 C/G 1 171 187 358 76.0389194517487 103.846327851012 -27.8074083992629 C:G C G 10 0.555327956422522 0.00340480074316809 ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32917388_32917564:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32917388_32918580:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000456800:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000422832:exon_32917434_32917666:HLA-DMA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32917544 C/T 1 176 132 308 78.2622796696361 73.3032902477729 4.95898942186322 T:C C T 10 0.555327956422522 0.605947197043795 ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32917388_32917564:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32917388_32918580:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000456800:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000422832:exon_32917434_32917666:HLA-DMA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 38 57 95 16.8975376559442 31.6536935160838 -14.7561558601396 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.00263604233788699 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32945625 C/T 1 156 146 302 69.3688387980866 81.0778816376882 -11.7090428396016 T:C C T 10 0.555327956422522 0.183075927957144 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000481259:exon_32945534_32945678:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945534_32945782:BRD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32948462 G/A 1 228 234 462 101.385225935665 129.94674180287 -28.5615158672052 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.00868284396113326 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000469132:exon_32948359_32949063:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482838:exon_32948359_32948543:BRD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32974934 G/A 1 44 23 67 19.565569917409 12.772542997718 6.79302691969103 A:G G A 10 0.555327956422522 0.109822346441731 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 32975869 G/A 1 36 23 59 16.0081935687892 12.772542997718 3.2356505710712 A:G G A 10 0.555327956422522 0.433616178282923 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975790_32975871:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975790_32976014:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975790_32975901:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000374813:exon_32975790_32975871:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000467465:exon_32975838_32976181:HLA-DOA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33036505 G/C 1 937 517 1454 416.657704832097 287.104553470444 129.553151361653 A:T:C:G G C 10 0.555327956422522 6.02653678176273e-12 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33036971 C/T 0 1202 0 1202 534.495796380129 0 534.495796380129 C C 10 0.555327956422522 9.4442922243254e-308 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33036977 G/A 0 1198 0 1198 532.717108205819 0 532.717108205819 G G 10 0.555327956422522 1.04898549288267e-306 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33036999 T/C 1 1314 3 1317 584.299065260806 1.66598386926757 582.633081391539 T:C:G T C 10 0.555327956422522 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33037061 G/C 1 1983 5 1988 881.784662414139 2.77663978211261 879.008022632026 A:T:C:G G C 10 0.555327956422522 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33037419 G/A 1 2062 19 2081 916.91375385676 10.5512311720279 906.362522684732 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33037424 T/C 1 2014 26 2040 895.569495765041 14.4385268669856 881.130968898055 T:C:G T C 10 0.555327956422522 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33037522 T/C 1 919 81 1000 408.653608047702 44.9815644702243 363.672043577478 T:C T C 10 0.555327956422522 4.9344871435846e-143 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33037579 A/T 1 675 2 677 300.153629414798 1.11065591284504 299.042973501953 A:T A T 10 0.555327956422522 2.18715267906014e-168 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33037639 G/A 1 1309 7 1316 582.075705042919 3.88729569495765 578.188409347961 A:T:G G A 10 0.555327956422522 2.24493548157346e-319 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33037640 C/T 1 1317 10 1327 585.633081391539 5.55327956422522 580.079801827313 T:C C T 10 0.555327956422522 7.86366482582292e-316 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 274 95 369 121.840139940229 52.7561558601396 69.0839840800894 T:C T C 10 0.555327956422522 1.18793482809841e-13 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 288 120 408 128.065548550314 66.6393547707026 61.426193779611 T:C C T 10 0.555327956422522 4.95422017100376e-10 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 307 97 404 136.514317378286 53.8668117729846 82.6475056053011 T:C T C 10 0.555327956422522 2.10214953044568e-17 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33162540 C/G 1 24 36 60 10.6721290458595 19.9918064312108 -9.31967738535132 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0188130311812128 ENSG00000204231:ENST00000374685:exon_33161365_33162606:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000374680:exon_33161365_33162606:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483281:exon_33161997_33162606:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483821:exon_33162441_33162606:RXRB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33169281 G/A 1 37 33 70 16.4528656123667 18.3258225619432 -1.87295694957654 A:G G A 10 0.555327956422522 0.718572418142477 ENSG00000112473:ENST00000374675:exon_33169019_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374677:exon_33168650_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000496894:exon_33168702_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000467504:exon_33169023_33169433:SLC39A7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33169895 C/G 1 63 38 101 28.0143387453811 21.1024623440558 6.91187640132528 C:G C G 10 0.555327956422522 0.192910984308028 ENSG00000112473:ENST00000444757:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374675:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374677:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000496894:exon_33169849_33169899:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000467504:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000445037:exon_33169849_33169902:SLC39A7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33170004 A/C 1 2 6 8 0.889344087154956 3.33196773853513 -2.44262365138018 A:C A C 10 0.555327956422522 0.150542848470395 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33179689 C/T 1 32 25 57 14.2295053944793 13.883198910563 0.346306483916248 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000204227:ENST00000374656:exon_33179506_33179779:RING1;ENSG00000204227:ENST00000478431:exon_33179506_33179779:RING1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33248412 A/C 1 5 9 14 2.22336021788739 4.9979516078027 -2.77459138991531 A:C A C 10 0.555327956422522 0.179216881393606 ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33248205_33248764:WDR46 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33281842 G/T 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 T:G G T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33281843 A/T 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 A:T A T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33287183 T/C 1 85 88 173 37.7971237040856 48.8688601651819 -11.0717364610963 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0927732200367694 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33287157_33287631:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33287157_33287631:DAXX HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 53 76 129 23.5676183096063 42.2049246881117 -18.6373063785053 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00133218576248486 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33636907 C/T 1 23 27 50 10.227457002282 14.9938548234081 -4.7663978211261 T:C C T 10 0.555327956422522 0.200588244921778 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33636751_33636933:ITPR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33638180 C/T 1 15 12 27 6.67008065366217 6.66393547707026 0.0061451765919065 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33638102_33638353:ITPR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33641379 T/C 1 24 22 46 10.6721290458595 12.2172150412955 -1.54508599543601 T:C T C 10 0.555327956422522 0.65899014290951 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33641368_33641497:ITPR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33651129 C/T 1 18 18 36 8.0040967843946 9.9959032156054 -1.99180643121079 T:C C T 10 0.555327956422522 0.507892993773159 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33650984_33651174:ITPR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 33653448 C/T 1 18 26 44 8.0040967843946 14.4385268669856 -6.43443008259097 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0675188910707721 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33653420_33653604:ITPR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 34214322 C/G 1 17 18 35 7.55942474081713 9.9959032156054 -2.43647847478827 C:G C G 10 0.555327956422522 0.496859186813131 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 34824636 A/G 1 8 4 12 3.55737634861982 2.22131182569009 1.33606452292974 A:G A G 10 0.555327956422522 0.56621841747708 ENSG00000065060:ENST00000452449:exon_34824567_34824706:UHRF1BP1;ENSG00000065060:ENST00000192788:exon_34824567_34824706:UHRF1BP1;ENSG00000065060:ENST00000399008:exon_34824567_34824706:UHRF1BP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 34855748 G/C 1 74 68 142 32.9057312247334 37.7623010367315 -4.85656981199812 C:G G C 10 0.555327956422522 0.447459880618173 ENSG00000064995:ENST00000361288:exon_34855564_34855866:TAF11;ENSG00000064995:ENST00000420584:exon_34855564_34855819:TAF11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 35260503 C/T 1 15 20 35 6.67008065366217 11.1065591284504 -4.43647847478827 T:C C T 10 0.555327956422522 0.17276317127097 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000417184:exon_35260331_35260504:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 35260530 C/T 1 17 20 37 7.55942474081713 11.1065591284504 -3.54713438763331 T:C C T 10 0.555327956422522 0.251085232136404 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 35565177 G/A 1 23 20 43 10.227457002282 11.1065591284504 -0.879102126168444 A:G G A 10 0.555327956422522 0.878299608285348 ENSG00000096060:ENST00000357266:exon_35565025_35565181:FKBP5;ENSG00000096060:ENST00000337746:exon_35565025_35565181:FKBP5;ENSG00000096060:ENST00000373875:exon_35565025_35565181:FKBP5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 35803192 C/A 1 21 20 41 9.33811291512704 11.1065591284504 -1.7684462133234 A:C C A 10 0.555327956422522 0.63839210748962 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 35803283 C/T 1 1 10 11 0.444672043577478 5.55327956422522 -5.10860752064774 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00352985127998045 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 36446975 G/C 1 9 19 28 4.0020483921973 10.5512311720279 -6.54918277983061 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0207240028110970 ENSG00000112078:ENST00000373731:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000481911:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000265344:exon_36446898_36447000:KCTD20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 36823657 C/T 1 38 19 57 16.8975376559442 10.5512311720279 6.34630648391625 T:C C T 10 0.555327956422522 0.109250450700998 ENSG00000137168:ENST00000373699:exon_36822603_36823809:PPIL1;ENSG00000137168:ENST00000483552:exon_36822603_36823809:PPIL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 7 11 18 3.11270430504235 6.10860752064774 -2.9959032156054 A:G A G 10 0.555327956422522 0.163703578976710 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 36936697 T/C 1 112 72 184 49.8032688806775 39.9836128624216 9.81965601825596 T:C T C 10 0.555327956422522 0.158714729823420 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36935918_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36936513_36936727:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36936513_36936725:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36936536_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36936688_36936750:MTCH1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 3 18 21 1.33401613073243 9.9959032156054 -8.66188708487296 A:G A G 10 0.555327956422522 0.000196634742187008 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 36937798 G/A 1 9 3 12 4.0020483921973 1.66598386926757 2.33606452292974 A:G G A 10 0.555327956422522 0.247371341375508 ENSG00000137409:ENST00000460219:exon_36937242_36937890:MTCH1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 36978834 A/G 1 2 7 9 0.889344087154956 3.88729569495765 -2.9979516078027 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0877066993700078 ENSG00000146192:ENST00000487975:exon_36978749_36979339:FGD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 36979583 C/T 1 31 28 59 13.7848333509018 15.5491827798306 -1.7643494289288 T:C C T 10 0.555327956422522 0.694998475399664 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36979482_36979630:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36979482_36979809:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36979482_36979630:FGD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 43 49 92 19.1208978738316 27.2110698647036 -8.09017199087202 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0938974765101127 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 38841101 G/A 1 1 7 8 0.444672043577478 3.88729569495765 -3.44262365138018 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0258462190222723 ENSG00000124721:ENST00000449981:exon_38841012_38841152:DNAH8;ENSG00000124721:ENST00000327475:exon_38841012_38841152:DNAH8;ENSG00000124721:ENST00000359357:exon_38841012_38841152:DNAH8;ENSG00000124721:ENST00000441566:exon_38841012_38841152:DNAH8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 41309552 T/C 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 T:C T C 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000096264:ENST00000373083:exon_41309532_41309667:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373089:exon_41309532_41309667:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373086:exon_41309532_41309667:NCR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 42185564 A/C 1 16 14 30 7.11475269723965 7.77459138991531 -0.65983869267566 A:C A C 10 0.555327956422522 0.85539905852902 ENSG00000048544:ENST00000053468:exon_42185540_42185603:MRPS10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 42906384 G/T 1 123 128 251 54.6946613600298 71.0819784220828 -16.387317062053 T:C:G G T 10 0.555327956422522 0.0419326648913953 ENSG00000137161:ENST00000372836:exon_42906306_42907025:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000394142:exon_42906306_42907007:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000336842:exon_42906306_42906445:CNPY3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 42932200 G/T 1 21 23 44 9.33811291512704 12.772542997718 -3.43443008259097 T:G G T 10 0.555327956422522 0.362904165769611 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 42932202 C/T 1 21 22 43 9.33811291512704 12.2172150412955 -2.87910212616845 T:C C T 10 0.555327956422522 0.443426847321452 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 42933526 C/T 1 30 15 45 13.3401613073243 8.32991934633783 5.01024196098651 T:C C T 10 0.555327956422522 0.176341852604436 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42933419_42933527:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42933419_42933527:PEX6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 43020188 G/A 1 9 10 19 4.0020483921973 5.55327956422522 -1.55123117202792 A:G G A 10 0.555327956422522 0.496869552202761 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43019947_43020534:CUL7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 43481121 C/T 1 38 39 77 16.8975376559442 21.6577903004784 -4.76025264453419 T:C C T 10 0.555327956422522 0.302549983212839 ENSG00000137207:ENST00000372422:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000510102:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000259737:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000504851:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000506469:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000490447:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000503972:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000514627:exon_43480807_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000460547:exon_43480204_43481371:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000455768:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000416380:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000372417:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000500090:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000488966:exon_43480952_43481189:YIPF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 43488836 C/T 1 7 9 16 3.11270430504235 4.9979516078027 -1.88524730276035 T:C C T 10 0.555327956422522 0.451827358588768 ENSG00000171453:ENST00000481352:exon_43488670_43489217:POLR1C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 43488894 G/T 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 T:G G T 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000171453:ENST00000481352:exon_43488670_43489217:POLR1C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 43492578 G/A 1 37 34 71 16.4528656123667 18.8811505183657 -2.42828490599906 A:G G A 10 0.555327956422522 0.63320192801284 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 27 31 58 12.0061451765919 17.2151666490982 -5.20902147250627 A:C A C 10 0.555327956422522 0.187038726791140 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 43581935 A/G 1 35 42 77 15.5635215252117 23.3237741697459 -7.76025264453419 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0852188205594263 ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43581397_43583397:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43581468_43583397:POLH HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 43590408 G/A 1 14 16 30 6.22540861008469 8.88524730276035 -2.65983869267566 A:G G A 10 0.555327956422522 0.361419251986498 ENSG00000172432:ENST00000307114:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000416243:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000393882:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000476510:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000478872:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000419497:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000432918:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000484748:exon_43590370_43590422:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000307126:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000372177:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000434548:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000435398:exon_43590370_43590541:GTPBP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 43608048 C/T 1 40 30 70 17.7868817430991 16.6598386926757 1.12704305042346 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.81110105761616 ENSG00000124688:ENST00000451025:exon_43607758_43608656:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000372173:exon_43607758_43608656:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000372171:exon_43607758_43608689:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000426254:exon_43607758_43608686:MAD2L1BP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 43968814 A/G 1 43 43 86 19.1208978738316 23.8791021261684 -4.75820425233689 A:G A G 10 0.555327956422522 0.329293808099938 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43968317_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43968754_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43968711_43968880:C6orf223 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 43970827 G/A 1 61 66 127 27.1249946582262 36.6516451238865 -9.52665046566029 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0905383068889863 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43970418_43972887:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43970418_43972877:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43970418_43972845:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43970418_43971142:C6orf223 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 46108916 C/G 1 9 6 15 4.0020483921973 3.33196773853513 0.670080653662171 C:G C G 10 0.555327956422522 0.799910806218814 ENSG00000001561:ENST00000321037:exon_46108789_46108959:ENPP4;ENSG00000001561:ENST00000371401:exon_46108789_46108959:ENPP4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 49412433 C/T 1 5 11 16 2.22336021788739 6.10860752064774 -3.88524730276035 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0753333982593944 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49412352_49412467:MUT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 49425591 T/C 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 T:C T C 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49425404_49425771:MUT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 49439805 G/A 1 14 5 19 6.22540861008469 2.77663978211261 3.44876882797208 A:G G A 10 0.555327956422522 0.164530353380396 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49439776_49439896:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49439776_49439896:CENPQ HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 52269046 C/G 1 10 10 20 4.44672043577478 5.55327956422522 -1.10655912845044 C:G C G 10 0.555327956422522 0.657502601953682 ENSG00000170915:ENST00000442253:exon_52267960_52272575:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000361841:exon_52267960_52272574:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000360726:exon_52267960_52272489:PAQR8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 56327849 C/T 1 6 10 16 2.66803226146487 5.55327956422522 -2.88524730276035 T:C C T 10 0.555327956422522 0.207537445170925 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56327844_56327954:DST HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 56351972 G/C 1 18 10 28 8.0040967843946 5.55327956422522 2.45081722016939 C:G G C 10 0.555327956422522 0.447757015649459 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000487754:exon_56351902_56352071:DST HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 56417282 C/T 1 18 16 34 8.0040967843946 8.88524730276035 -0.881150518365747 T:C C T 10 0.555327956422522 0.863350207608527 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56416982_56418453:DST HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 56417545 T/C 1 12 11 23 5.33606452292974 6.10860752064774 -0.772542997718006 T:C T C 10 0.555327956422522 0.834806358038955 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56416982_56418453:DST HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 56420538 C/T 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 T:C C T 10 0.555327956422522 0.150211231786478 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000520144:exon_56420406_56420638:DST HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 56462706 T/C 1 8 9 17 3.55737634861982 4.9979516078027 -1.44057525918287 T:C T C 10 0.555327956422522 0.626853565320545 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56462538_56462804:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56462538_56462804:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56462538_56462804:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56462538_56462804:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56462538_56462804:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56462538_56462804:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56462538_56462804:DST;ENSG00000151914:ENST00000518398:exon_56462538_56462804:DST HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 56463410 T/C 1 9 3 12 4.0020483921973 1.66598386926757 2.33606452292974 T:C T C 10 0.555327956422522 0.247371341375508 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56463274_56463507:DST HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 10 0 10 4.44672043577478 0 4.44672043577478 G G 10 0.555327956422522 0.00309157318156107 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 57246884 A/G 0 8 0 8 3.55737634861982 0 3.55737634861982 A A 10 0.555327956422522 0.0105734315433712 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 57393125 A/G 0 0 8 8 0 4.44262365138018 -4.44262365138018 G A G 10 0.555327956422522 0.00152868713451737 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 8 8 0 4.44262365138018 -4.44262365138018 A G A 10 0.555327956422522 0.00152868713451737 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 64421939 G/C 1 39 42 81 17.3422096995216 23.3237741697459 -5.98156447022428 T:C:G G C 10 0.555327956422522 0.182029664336285 ENSG00000118482:ENST00000515594:exon_64421482_64422259:PHF3;ENSG00000118482:ENST00000262043:exon_64421482_64425377:PHF3;ENSG00000118482:ENST00000509876:exon_64421482_64424350:PHF3;ENSG00000118482:ENST00000393387:exon_64421482_64424405:PHF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 71289188 C/T 1 11 14 25 4.89139247935226 7.77459138991531 -2.88319891056305 T:C C T 10 0.555327956422522 0.3145412245025 ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71289117_71289269:C6orf57 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 71377711 C/T 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 T:C C T 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000422334:exon_71377659_71377844:SMAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 12 10 22 5.33606452292974 5.55327956422522 -0.217215041295483 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 74190448 T/C 1 12 13 25 5.33606452292974 7.21926343349279 -1.88319891056305 T:C T C 10 0.555327956422522 0.547039280437458 ENSG00000135297:ENST00000498286:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415954:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000357845:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370305:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370308:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370300:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415228:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000462039:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000445187:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000520366:exon_74190398_74190485:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000487960:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000524046:exon_74190398_74190528:MTO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 74229792 A/G 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000156508:ENST00000316292:exon_74229606_74230741:EEF1A1;ENSG00000156508:ENST00000456206:exon_74229606_74230741:EEF1A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 74354175 C/T 1 7 1 8 3.11270430504235 0.555327956422522 2.55737634861982 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0837859633971926 ENSG00000119899:ENST00000355773:exon_74354130_74354326:SLC17A5;ENSG00000119899:ENST00000393019:exon_74354130_74354326:SLC17A5;ENSG00000119899:ENST00000481996:exon_74354130_74354186:SLC17A5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 74497009 A/G 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74496957_74497175:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74496957_74497175:CD109 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 74497152 G/A 1 6 11 17 2.66803226146487 6.10860752064774 -3.44057525918287 A:G G A 10 0.555327956422522 0.140894133470777 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74496957_74497175:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74496957_74497175:CD109 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 79656562 A/T 1 19 10 29 8.44876882797208 5.55327956422522 2.89548926374686 A:T A T 10 0.555327956422522 0.351058594008537 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 79656570 G/A 1 24 12 36 10.6721290458595 6.66393547707026 4.00819356878921 A:G G A 10 0.555327956422522 0.2400131411827 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 79675701 A/G 1 8 4 12 3.55737634861982 2.22131182569009 1.33606452292974 A:G A G 10 0.555327956422522 0.56621841747708 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79675662_79675773:PHIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 79692751 G/A 1 18 11 29 8.0040967843946 6.10860752064774 1.89548926374686 A:G G A 10 0.555327956422522 0.576502455223641 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79692603_79692834:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79692603_79692834:PHIP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 83949261 T/C 1 16 1 17 7.11475269723965 0.555327956422522 6.55942474081713 T:C T C 10 0.555327956422522 0.000907359583450224 ENSG00000065833:ENST00000369705:exon_83949258_83949355:ME1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 90042914 T/C 1 157 131 288 69.8135108416641 72.7479622913504 -2.93445144968632 T:C T C 10 0.555327956422522 0.766944683462887 ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90042805_90042924:UBE2J1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 90362783 A/C 1 10 14 24 4.44672043577478 7.77459138991531 -3.32787095414053 A:C A C 10 0.555327956422522 0.217768755345003 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90362711_90362874:MDN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 90405706 G/A 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 A:G G A 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90405324_90405711:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90405324_90405711:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90405324_90405711:MDN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 90577984 C/T 1 9 10 19 4.0020483921973 5.55327956422522 -1.55123117202792 T:C C T 10 0.555327956422522 0.496869552202761 ENSG00000118412:ENST00000237177:exon_90575672_90578801:CASP8AP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 96999725 C/T 1 15 22 37 6.67008065366217 12.2172150412955 -5.54713438763331 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0705491956670771 ENSG00000014123:ENST00000369278:exon_96999714_96999799:KIAA0776 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 24 30 54 10.6721290458595 16.6598386926757 -5.98770964681619 A:G A G 10 0.555327956422522 0.131230808799670 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 T:C T C 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 106536253 G/A 1 9 6 15 4.0020483921973 3.33196773853513 0.670080653662171 A:G G A 10 0.555327956422522 0.799910806218814 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106536076_106536324:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106536076_106536324:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106536076_106536324:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000424894:exon_106536076_106536324:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000489365:exon_106536229_106536324:PRDM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 106987370 A/C 1 25 13 38 11.116801089437 7.21926343349279 3.89753765594417 A:C A C 10 0.555327956422522 0.253327046612756 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106987278_106987404:AIM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 107088231 C/T 1 10 8 18 4.44672043577478 4.44262365138018 0.00409678439460492 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107088224_107088383:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000467262:exon_107088224_107088383:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107088224_107088383:QRSL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 107113715 G/A 1 17 14 31 7.55942474081713 7.77459138991531 -0.215166649098181 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 107391396 G/A 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 A:G G A 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000178409:ENST00000369042:exon_107386386_107392154:BEND3;ENSG00000178409:ENST00000429433:exon_107386401_107392154:BEND3;ENSG00000178409:ENST00000339644:exon_107389803_107392154:BEND3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 109802649 T/A 1 48 33 81 21.3442580917189 18.3258225619432 3.01843552977572 A:T T A 10 0.555327956422522 0.576435680898359 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109802278_109803257:ZBTB24 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 110501805 C/T 1 9 21 30 4.0020483921973 11.661887084873 -7.65983869267566 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00553310261218803 ENSG00000168438:ENST00000368932:exon_110501587_110501836:CDC40;ENSG00000168438:ENST00000368933:exon_110501578_110501836:CDC40;ENSG00000168438:ENST00000368930:exon_110501624_110501836:CDC40;ENSG00000168438:ENST00000307731:exon_110501624_110501836:CDC40;ENSG00000168438:ENST00000439165:exon_110501627_110501836:CDC40 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 111346806 C/T 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111346606_111347303:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111346606_111347231:RPF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 111346808 G/A 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111346606_111347303:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111346606_111347231:RPF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 126210395 T/G 1 17 19 36 7.55942474081713 10.5512311720279 -2.99180643121079 T:G T G 10 0.555327956422522 0.320267909966196 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000413085:exon_126210118_126211127:NCOA7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 127768472 G/A 1 6 14 20 2.66803226146487 7.77459138991531 -5.10655912845044 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0246812283603920 ENSG00000255330:ENST00000481848:exon_127767553_127768885:RP3-403A15.5;ENSG00000255330:ENST00000473298:exon_127767553_127768885:RP3-403A15.5;ENSG00000189367:ENST00000368281:exon_127767553_127768885:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000009606:exon_127767553_127768885:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000405702:exon_127767553_127768885:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000483725:exon_127767553_127768885:KIAA0408 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 127771452 T/G 1 5 9 14 2.22336021788739 4.9979516078027 -2.77459138991531 T:G T G 10 0.555327956422522 0.179216881393606 ENSG00000255330:ENST00000481848:exon_127771135_127771497:RP3-403A15.5;ENSG00000255330:ENST00000473298:exon_127771135_127771497:RP3-403A15.5;ENSG00000255330:ENST00000464495:exon_127771332_127771497:RP3-403A15.5;ENSG00000189367:ENST00000368281:exon_127771135_127772361:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000009606:exon_127771135_127771497:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000405702:exon_127771135_127771497:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000483725:exon_127771135_127771497:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000487331:exon_127771135_127771497:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000472335:exon_127771191_127771497:KIAA0408;ENSG00000214338:ENST00000368268:exon_127771330_127771497:C6orf174 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 127775166 T/C 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 T:C T C 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000255330:ENST00000481848:exon_127774992_127775246:RP3-403A15.5;ENSG00000255330:ENST00000473298:exon_127774992_127775246:RP3-403A15.5;ENSG00000255330:ENST00000464495:exon_127774992_127775232:RP3-403A15.5;ENSG00000255330:ENST00000474293:exon_127775015_127775246:RP3-403A15.5;ENSG00000189367:ENST00000009606:exon_127774992_127775246:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000405702:exon_127774992_127775246:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000483725:exon_127774992_127775246:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000487331:exon_127774992_127775246:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000472335:exon_127774992_127775387:KIAA0408;ENSG00000214338:ENST00000368268:exon_127774992_127775246:C6orf174 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 130031215 T/C 1 14 5 19 6.22540861008469 2.77663978211261 3.44876882797208 T:C T C 10 0.555327956422522 0.164530353380396 ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_130031169_130031370:ARHGAP18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 133072650 A/G 1 10 6 16 4.44672043577478 3.33196773853513 1.11475269723965 A:G A G 10 0.555327956422522 0.624513862012014 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 133077063 T/C 1 11 3 14 4.89139247935226 1.66598386926757 3.22540861008469 T:C T C 10 0.555327956422522 0.107343149248364 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525289:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532053:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000531279:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526157:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526192:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000524919:exon_133077021_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000530536:exon_133077053_133077174:VNN2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 986 504 1490 438.446634967393 279.885290036951 158.561344930442 A:G A G 10 0.555327956422522 6.98638583791076e-17 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 133136410 C/A 1 6 16 22 2.66803226146487 8.88524730276035 -6.21721504129548 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0092388818981735 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 8 11 19 3.55737634861982 6.10860752064774 -2.55123117202792 T:C T C 10 0.555327956422522 0.2564170773856 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 298 0 298 132.512268986088 0 132.512268986088 T T 10 0.555327956422522 8.09949908611255e-77 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 345 0 345 153.41185503423 0 153.41185503423 A A 10 0.555327956422522 9.60556202408482e-89 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 346 0 346 153.856527077807 0 153.856527077807 A A 10 0.555327956422522 5.14752975518123e-89 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 194 0 194 86.2663764540307 0 86.2663764540307 G G 10 0.555327956422522 4.51580309323716e-50 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 194 1 195 86.2663764540307 0.555327956422522 85.7110484976082 T:G T G 10 0.555327956422522 2.57619151915061e-48 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 137026266 T/G 1 10 25 35 4.44672043577478 13.883198910563 -9.43647847478827 T:G T G 10 0.555327956422522 0.00179145629263923 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137026248_137026271:MAP3K5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 137113137 G/A 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137112848_137113656:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137112848_137113656:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137112848_137113656:MAP3K5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 13 8 21 5.78073656650721 4.44262365138018 1.33811291512704 T:C T C 10 0.555327956422522 0.66298519208265 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 146125793 A/T 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 A:T A T 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000118496:ENST00000237281:exon_146125508_146127557:FBXO30 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 146234644 G/A 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:G G A 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000146414:ENST00000367507:exon_146234614_146234685:SHPRH;ENSG00000146414:ENST00000367505:exon_146234614_146234685:SHPRH;ENSG00000146414:ENST00000367503:exon_146234614_146234685:SHPRH;ENSG00000146414:ENST00000438092:exon_146234614_146234685:SHPRH;ENSG00000146414:ENST00000275233:exon_146234614_146234685:SHPRH;ENSG00000146414:ENST00000433355:exon_146234614_146234685:SHPRH HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 147680359 A/G 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 A:G A G 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000164506:ENST00000367479:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000179882:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000367481:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000321680:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000367480:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000367475:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000392291:exon_147680220_147680459:STXBP5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 149795522 G/A 1 10 1 11 4.44672043577478 0.555327956422522 3.89139247935226 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0287031751756666 ENSG00000178199:ENST00000416573:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000389942:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409806:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409948:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000462655:exon_149795375_149795749:ZC3H12D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 149795692 G/A 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 A:G G A 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000178199:ENST00000416573:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000389942:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409806:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409948:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000462655:exon_149795375_149795749:ZC3H12D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 150114745 G/A 1 38 45 83 16.8975376559442 24.9897580390135 -8.09222038306932 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0777787485163784 ENSG00000120265:ENST00000367384:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000484601:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367378:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000464889:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367380:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000486585:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000495487:exon_150114685_150114768:PCMT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 152443761 C/T 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 T:C C T 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000460912:exon_152443195_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152443528_152443811:SYNE1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 152464839 A/G 1 8 10 18 3.55737634861982 5.55327956422522 -1.9959032156054 A:G A G 10 0.555327956422522 0.354494673636837 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152464758_152468898:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152464758_152464900:SYNE1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 153296541 G/C 1 35 32 67 15.5635215252117 17.7704946055207 -2.20697308030897 C:G G C 10 0.555327956422522 0.623856024916973 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 153323594 C/T 1 19 9 28 8.44876882797208 4.9979516078027 3.45081722016939 T:C C T 10 0.555327956422522 0.253687296893627 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000482526:exon_153323562_153323671:MTRF1L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 155578010 G/A 1 21 24 45 9.33811291512704 13.3278709541405 -3.98975803901349 A:G G A 10 0.555327956422522 0.234586818523213 ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155577618_155578854:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000318981:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456144:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000367174:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000360366:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000529824:exon_155577618_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155577618_155579221:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528391:exon_155577594_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456877:exon_155577618_155578334:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000275246:exon_155577618_155578354:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155577618_155579216:TIAM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 155606325 C/T 1 9 13 22 4.0020483921973 7.21926343349279 -3.21721504129548 T:C C T 10 0.555327956422522 0.199625660043352 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000468889:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000495806:exon_155606292_155606333:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000489874:exon_155606292_155606411:TFB1M HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 159065758 C/G 1 8 10 18 3.55737634861982 5.55327956422522 -1.9959032156054 C:G C G 10 0.555327956422522 0.354494673636837 ENSG00000146425:ENST00000367089:exon_159065714_159065771:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159065714_159065770:DYNLT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 160468278 A/G 1 10 11 21 4.44672043577478 6.10860752064774 -1.66188708487296 A:G A G 10 0.555327956422522 0.514389688550212 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160468191_160468368:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160468191_160468368:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000479434:exon_160468191_160468368:IGF2R HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 160505207 A/G 1 58 30 88 25.7909785274937 16.6598386926757 9.13113983481806 A:G A G 10 0.555327956422522 0.053584857775487 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160504982_160505216:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160504982_160505216:IGF2R HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 160517481 C/T 1 60 50 110 26.6803226146487 27.7663978211261 -1.08607520647742 T:C C T 10 0.555327956422522 0.84830274847622 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 170110404 T/C 1 19 18 37 8.44876882797208 9.9959032156054 -1.54713438763331 T:C T C 10 0.555327956422522 0.623331482289855 ENSG00000130024:ENST00000339209:exon_170110332_170110487:PHF10;ENSG00000130024:ENST00000366780:exon_170110332_170110487:PHF10;ENSG00000130024:ENST00000445358:exon_170110332_170110487:PHF10;ENSG00000130024:ENST00000252308:exon_170110332_170110487:PHF10;ENSG00000130024:ENST00000480008:exon_170107124_170110487:PHF10;ENSG00000130024:ENST00000341591:exon_170110311_170110487:PHF10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 170181516 A/G 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 A:G A G 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170181426_170181680:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170181426_170181680:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170181426_170181680:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170181426_170181617:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170181426_170181617:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170181426_170181680:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170181426_170181612:C6orf70 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 170591923 T/G 1 2 6 8 0.889344087154956 3.33196773853513 -2.44262365138018 T:G T G 10 0.555327956422522 0.150542848470395 ENSG00000198719:ENST00000366756:exon_170591294_170591967:DLL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 170626943 T/C 1 10 13 23 4.44672043577478 7.21926343349279 -2.772542997718 T:C T C 10 0.555327956422522 0.295526802222298 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 170627586 G/T 1 38 19 57 16.8975376559442 10.5512311720279 6.34630648391625 T:G G T 10 0.555327956422522 0.109250450700998 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 170627614 T/C 1 38 13 51 16.8975376559442 7.21926343349279 9.67827422245138 T:C:G T C 10 0.555327956422522 0.00694920653200102 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 170627761 A/G 1 43 17 60 19.1208978738316 9.44057525918287 9.68032261464868 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0131172056999768 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 6 170628009 T/G 1 28 28 56 12.4508172201694 15.5491827798306 -3.09836555966123 T:G T G 10 0.555327956422522 0.422172312047089 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 552046 A/G 1 11 8 19 4.89139247935226 4.44262365138018 0.448768827972082 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000197461:ENST00000402802:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000344323:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000354513:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000482462:exon_551988_553104:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000400761:exon_551988_552092:PDGFA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 590148 G/A 1 11 11 22 4.89139247935226 6.10860752064774 -1.21721504129548 A:G G A 10 0.555327956422522 0.670344781787442 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 590199 A/G 1 19 7 26 8.44876882797208 3.88729569495765 4.56147313301443 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0780579063446087 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 590229 T/C 1 21 7 28 9.33811291512704 3.88729569495765 5.45081722016938 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0552248516291591 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 897508 C/G 1 10 9 19 4.44672043577478 4.9979516078027 -0.551231172027917 C:G C G 10 0.555327956422522 0.821029314638873 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000475971:exon_897465_897594:SUN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 899820 G/T 1 19 11 30 8.44876882797208 6.10860752064774 2.34016130732434 T:G G T 10 0.555327956422522 0.464289321890314 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_899765_900019:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_899765_900019:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_899765_900019:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_899765_900019:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_899765_900019:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_899765_900019:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_899765_900019:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_899765_900019:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_899765_900019:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_899765_900019:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_899765_900019:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_899765_900019:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_899765_900019:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000475971:exon_899765_900019:SUN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 912992 C/T 1 36 34 70 16.0081935687892 18.8811505183657 -2.87295694957654 T:C C T 10 0.555327956422522 0.547994555344404 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_912852_914537:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_912852_914536:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000475971:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000497943:exon_912852_914539:SUN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 1008966 C/T 1 10 15 25 4.44672043577478 8.32991934633783 -3.88319891056305 T:C C T 10 0.555327956422522 0.157828971143109 ENSG00000240230:ENST00000344111:exon_1005711_1009092:COX19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 1131356 T/C 1 12 4 16 5.33606452292974 2.22131182569009 3.11475269723965 T:C T C 10 0.555327956422522 0.136543787545186 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 1533513 A/G 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 A:G A G 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1533390_1533547:INTS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 1542697 G/A 1 26 16 42 11.5614731330144 8.88524730276035 2.67622583025408 A:G G A 10 0.555327956422522 0.440894103867154 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 1542814 T/C 1 28 18 46 12.4508172201694 9.9959032156054 2.45491400456399 T:C T C 10 0.555327956422522 0.553511992484837 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 9 11 20 4.0020483921973 6.10860752064774 -2.10655912845044 A:G G A 10 0.555327956422522 0.374427217398125 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 2297006 A/G 1 171 160 331 76.0389194517487 88.8524730276035 -12.8135535758548 A:G A G 10 0.555327956422522 0.166750515594427 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2297000_2297149:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000480807:exon_2297000_2297253:SNX8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 2303986 T/C 1 42 40 82 18.6762258302541 22.2131182569009 -3.5368924266468 T:C T C 10 0.555327956422522 0.438826928389604 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2303933_2304093:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000479689:exon_2303933_2304093:SNX8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 52 44 96 23.1229462660289 24.434430082591 -1.31148381656211 T:C T C 10 0.555327956422522 0.837459493916147 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 2578181 C/T 1 24 18 42 10.6721290458595 9.9959032156054 0.676225830254078 T:C C T 10 0.555327956422522 0.87768344949826 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 19 20 39 8.44876882797208 11.1065591284504 -2.65779030047836 T:C T C 10 0.555327956422522 0.422929473783178 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 2578246 C/T 1 19 20 39 8.44876882797208 11.1065591284504 -2.65779030047836 T:C C T 10 0.555327956422522 0.422929473783178 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 2578371 G/A 1 24 10 34 10.6721290458595 5.55327956422522 5.11884948163425 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0855901040834441 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 2582907 C/T 1 12 4 16 5.33606452292974 2.22131182569009 3.11475269723965 T:C C T 10 0.555327956422522 0.136543787545186 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2582838_2582957:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2582838_2582957:C7orf27 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 4780514 G/T 1 20 15 35 8.89344087154956 8.32991934633783 0.563521525211732 T:G G T 10 0.555327956422522 0.867078000918724 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000460979:exon_4780490_4780654:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4780469_4780619:KIAA0415 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 5104275 G/A 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 A:G G A 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 5104359 G/A 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 A:G G A 10 0.555327956422522 0.605558868068935 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 5105133 C/T 1 8 11 19 3.55737634861982 6.10860752064774 -2.55123117202792 T:C C T 10 0.555327956422522 0.2564170773856 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 5105208 C/T 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 5353457 G/A 1 44 45 89 19.565569917409 24.9897580390135 -5.42418812160446 A:G G A 10 0.555327956422522 0.286112039600159 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 26 21 47 11.5614731330144 11.661887084873 -0.100413951858533 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 5427517 G/A 1 25 21 46 11.116801089437 11.661887084873 -0.545085995436011 A:G G A 10 0.555327956422522 0.883074147030052 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5427303_5427660:TNRC18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 5541657 G/A 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 6026942 G/T 1 28 24 52 12.4508172201694 13.3278709541405 -0.877053733971144 T:G G T 10 0.555327956422522 0.889218374767695 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 6043386 G/A 1 10 3 13 4.44672043577478 1.66598386926757 2.78073656650721 A:G G A 10 0.555327956422522 0.164202722608268 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382321:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000413462:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000380416:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000415839:exon_6042941_6043689:PMS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 6066450 T/C 1 53 48 101 23.5676183096063 26.6557419082811 -3.08812359867472 T:C T C 10 0.555327956422522 0.54928066176438 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6066359_6066592:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000490523:exon_6066359_6066592:EIF2AK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 6189487 C/A 1 14 15 29 6.22540861008469 8.32991934633783 -2.10451073625314 A:C C A 10 0.555327956422522 0.459182512082066 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 8 14 22 3.55737634861982 7.77459138991531 -4.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0860332203503745 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 6370077 C/T 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 7 9 16 3.11270430504235 4.9979516078027 -1.88524730276035 A:G G A 10 0.555327956422522 0.451827358588768 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 6370575 C/T 1 15 11 26 6.67008065366217 6.10860752064774 0.561473133014428 T:C C T 10 0.555327956422522 0.84687533574258 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000524898:exon_6370426_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000530143:exon_6370459_6370866:C7orf70 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 6456302 C/T 1 8 2 10 3.55737634861982 1.11065591284504 2.44672043577478 T:C C T 10 0.555327956422522 0.201545371859033 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6456299_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000497308:exon_6456258_6456342:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000454738:exon_6455890_6456385:DAGLB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 6505901 T/C 1 168 173 341 74.7049033210163 96.0717364610963 -21.36683314008 A:T:C T C 10 0.555327956422522 0.0219924205191921 ENSG00000136240:ENST00000258739:exon_6505702_6505954:KDELR2;ENSG00000136240:ENST00000454368:exon_6505702_6505954:KDELR2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 6776956 A/G 1 5 9 14 2.22336021788739 4.9979516078027 -2.77459138991531 A:G A G 10 0.555327956422522 0.179216881393606 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 12727826 G/C 1 6 10 16 2.66803226146487 5.55327956422522 -2.88524730276035 C:G G C 10 0.555327956422522 0.207537445170925 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000439721:exon_12727791_12728031:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000399303:exon_12727722_12728432:ARL4A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 17379110 G/A 1 15 14 29 6.67008065366217 7.77459138991531 -1.10451073625314 A:G G A 10 0.555327956422522 0.711532833974462 ENSG00000106546:ENST00000242057:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000463496:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000401808:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000492120:exon_17378610_17379151:AHR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 20180717 C/G 1 11 10 21 4.89139247935226 5.55327956422522 -0.661887084872961 C:G C G 10 0.555327956422522 0.828131296920228 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20176020_20180781:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20180248_20180781:MACC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 20193979 T/G 1 23 14 37 10.227457002282 7.77459138991531 2.45286561236669 T:G T G 10 0.555327956422522 0.508922712642407 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20193816_20194004:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20193816_20194004:MACC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 20197911 C/T 1 12 20 32 5.33606452292974 11.1065591284504 -5.7704946055207 T:C C T 10 0.555327956422522 0.04951094379604 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 20198440 G/A 1 22 19 41 9.78278495870452 10.5512311720279 -0.768446213323401 A:G G A 10 0.555327956422522 0.875562949353059 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 20201458 G/A 1 8 15 23 3.55737634861982 8.32991934633783 -4.77254299771801 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0578021904179636 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20201371_20201493:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20201371_20201493:MACC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 23015831 T/C 1 6 9 15 2.66803226146487 4.9979516078027 -2.32991934633783 T:C T C 10 0.555327956422522 0.299710241961317 ENSG00000122591:ENST00000432176:exon_23015829_23015924:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000440481:exon_23015829_23015924:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000242158:exon_23015829_23015924:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000409923:exon_23015829_23015924:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000457703:exon_23015829_23015924:FAM126A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 24756951 C/T 1 24 23 47 10.6721290458595 12.772542997718 -2.10041395185853 T:C C T 10 0.555327956422522 0.559655419240777 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000446822:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24756088_24756993:DFNA5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 30634661 C/G 1 57 74 131 25.3463064839162 41.0942687752666 -15.7479622913504 C:G C G 10 0.555327956422522 0.00629601333487423 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 30825575 C/A 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 A:C C A 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000254959:ENST00000458257:exon_30825365_30825608:RP4-740D2.1;ENSG00000254959:ENST00000451002:exon_30825365_30825608:RP4-740D2.1;ENSG00000240583:ENST00000434909:exon_30825365_30825608:AQP1;ENSG00000106125:ENST00000265299:exon_30825365_30825608:FAM188B;ENSG00000106125:ENST00000381693:exon_30825365_30825608:FAM188B;ENSG00000106125:ENST00000494187:exon_30825365_30826260:FAM188B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 30831082 C/T 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000254959:ENST00000458257:exon_30830781_30831190:RP4-740D2.1;ENSG00000240583:ENST00000434909:exon_30830781_30831190:AQP1;ENSG00000106125:ENST00000265299:exon_30830781_30831190:FAM188B;ENSG00000106125:ENST00000381693:exon_30830781_30831190:FAM188B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 30831088 G/A 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000254959:ENST00000458257:exon_30830781_30831190:RP4-740D2.1;ENSG00000240583:ENST00000434909:exon_30830781_30831190:AQP1;ENSG00000106125:ENST00000265299:exon_30830781_30831190:FAM188B;ENSG00000106125:ENST00000381693:exon_30830781_30831190:FAM188B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 32613020 A/G 1 29 30 59 12.8954892637469 16.6598386926757 -3.7643494289288 A:G A G 10 0.555327956422522 0.359877835724353 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32612811_32613030:AVL9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 34979905 C/A 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 A:C C A 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000173852:ENST00000310974:exon_34979765_34979939:DPY19L1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 24 15 39 10.6721290458595 8.32991934633783 2.34220969952164 T:C C T 10 0.555327956422522 0.520690575426974 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 37960450 C/G 1 17 11 28 7.55942474081713 6.10860752064774 1.45081722016938 C:G C G 10 0.555327956422522 0.704654895104891 ENSG00000086289:ENST00000199448:exon_37960163_37960810:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000423717:exon_37960260_37960810:EPDR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 38393343 T/C 0 8 0 8 3.55737634861982 0 3.55737634861982 T T 10 0.555327956422522 0.0105734315433712 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 38393390 T/G 0 8 0 8 3.55737634861982 0 3.55737634861982 T T 10 0.555327956422522 0.0105734315433712 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 39991447 C/T 1 17 11 28 7.55942474081713 6.10860752064774 1.45081722016938 T:C C T 10 0.555327956422522 0.704654895104891 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_39989636_39991451:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000326351:exon_39989959_39991451:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_39990109_39991451:CDK13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 244 173 417 108.499978632905 96.0717364610963 12.4282421718083 A:G G A 10 0.555327956422522 0.236969161318005 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 43664280 A/G 1 80 68 148 35.5737634861982 37.7623010367315 -2.18853755053325 A:T:G A G 10 0.555327956422522 0.741119087429377 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43664117_43666385:STK17A;ENSG00000164543:ENST00000474211:exon_43664117_43664783:STK17A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 43688234 C/T 1 28 23 51 12.4508172201694 12.772542997718 -0.321725777548622 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000106603:ENST00000415076:exon_43688199_43688251:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000446330:exon_43688199_43688251:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000446564:exon_43688199_43688251:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000438444:exon_43688199_43688251:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000310564:exon_43688199_43688251:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000395879:exon_43688199_43689895:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000395880:exon_43688199_43688251:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000223336:exon_43688199_43688251:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000415798:exon_43688199_43688251:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000431651:exon_43688199_43688251:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000451651:exon_43688199_43688251:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000418140:exon_43688199_43688251:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000459713:exon_43688199_43688353:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000448704:exon_43686827_43688251:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000470156:exon_43688199_43688251:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000457939:exon_43688199_43688251:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000420441:exon_43687787_43688251:C7orf44 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 43810764 G/A 1 39 39 78 17.3422096995216 21.6577903004784 -4.31558060095671 A:G G A 10 0.555327956422522 0.362398902176416 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43810737_43810769:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43810737_43810769:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43810737_43810769:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43810734_43810769:BLVRA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 44153780 A/G 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 A:G A G 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000106624:ENST00000223357:exon_44153193_44154159:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000450684:exon_44153193_44154161:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000413907:exon_44153193_44154158:AEBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 44747499 G/A 1 83 58 141 36.9077796169307 32.2090214725063 4.6987581444244 A:G G A 10 0.555327956422522 0.446570445682888 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 44799842 C/T 1 35 37 72 15.5635215252117 20.5471343876333 -4.98361286242158 T:C C T 10 0.555327956422522 0.238571881733821 ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 45005795 G/A 1 114 112 226 50.6926129678325 62.1967311193225 -11.50411815149 A:G G A 10 0.555327956422522 0.124299404342968 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45005672_45006437:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45005672_45005879:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45005672_45006437:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45005672_45005879:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45005672_45005879:MYO1G HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 45009723 G/A 1 150 135 285 66.7008065366217 74.9692741170405 -8.26846758041877 A:G G A 10 0.555327956422522 0.340411655204645 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009639_45009753:MYO1G HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 45015107 G/A 1 129 144 273 57.3626936214947 79.9672257248432 -22.6045321033485 A:G G A 10 0.555327956422522 0.006120756060508 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45015075_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000435656:exon_45015083_45015248:MYO1G HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 45016621 C/T 1 81 76 157 36.0184355297757 42.2049246881117 -6.18648915833595 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.335712124116830 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000435656:exon_45016462_45016670:MYO1G HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 45113170 G/A 1 62 39 101 27.5696667018036 21.6577903004784 5.91187640132528 A:G G A 10 0.555327956422522 0.270802708819152 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 45143892 A/G 1 6 4 10 2.66803226146487 2.22131182569009 0.44672043577478 A:G A G 10 0.555327956422522 1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 45144494 T/C 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C T C 10 0.555327956422522 0.479662189097226 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 45148667 G/A 1 121 98 219 53.8053172728748 54.4221397294072 -0.616822456532319 A:G G A 10 0.555327956422522 0.945865748151226 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45148426_45148682:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 45148773 C/A 1 39 45 84 17.3422096995216 24.9897580390135 -7.64754833949184 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0999965824960273 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 48004962 C/T 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48003783_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48002885_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48004897_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48004763_48005035:HUS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 48016353 G/T 1 7 14 21 3.11270430504235 7.77459138991531 -4.66188708487296 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0482087998619483 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000442024:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432627:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000433977:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000446009:exon_48016327_48016434:HUS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 48017989 T/C 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C T C 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000136273:ENST00000468868:exon_48017857_48018190:HUS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 56136194 C/T 1 41 23 64 18.2315537866766 12.772542997718 5.45901078895859 T:C C T 10 0.555327956422522 0.208184070831048 ENSG00000129103:ENST00000395436:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000418349:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000434526:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395437:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000275607:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395435:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000420966:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413952:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000342190:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000436782:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000442826:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000437307:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413756:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000483327:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000423763:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000498777:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000438133:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000447501:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000451338:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000529457:exon_56136175_56136331:SUMF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 56174115 A/C 1 390 259 649 173.422096995216 143.829940713433 29.5921562817832 A:C A C 10 0.555327956422522 0.019771270899978 ENSG00000106153:ENST00000395422:exon_56174057_56174269:CHCHD2;ENSG00000106153:ENST00000473095:exon_56174057_56174124:CHCHD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 56174140 G/T 1 122 100 222 54.2499893164523 55.5327956422522 -1.28280632579987 T:G G T 10 0.555327956422522 0.89262703363844 ENSG00000106153:ENST00000395422:exon_56174057_56174269:CHCHD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 63981563 A/G 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 A:G A G 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000173041:ENST00000309683:exon_63980262_63982878:ZNF680 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 66774604 G/C 1 7 23 30 3.11270430504235 12.772542997718 -9.65983869267566 C:G G C 10 0.555327956422522 0.000638955485520786 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 70228020 G/T 1 3 23 26 1.33401613073243 12.772542997718 -11.4385268669856 T:G G T 10 0.555327956422522 4.18703012384594e-06 ENSG00000158321:ENST00000406775:exon_70227856_70228327:AUTS2;ENSG00000158321:ENST00000342771:exon_70227856_70228327:AUTS2;ENSG00000158321:ENST00000416482:exon_70227856_70228327:AUTS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 70228139 A/G 1 1 19 20 0.444672043577478 10.5512311720279 -10.1065591284504 A:G A G 10 0.555327956422522 2.37347671507761e-06 ENSG00000158321:ENST00000406775:exon_70227856_70228327:AUTS2;ENSG00000158321:ENST00000342771:exon_70227856_70228327:AUTS2;ENSG00000158321:ENST00000416482:exon_70227856_70228327:AUTS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 34 12 46 15.1188494816343 6.66393547707026 8.45491400456399 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0116883549011859 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 73753250 T/C 1 31 37 68 13.7848333509018 20.5471343876333 -6.7623010367315 T:C T C 10 0.555327956422522 0.112550907694391 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 75045959 C/G 1 19 33 52 8.44876882797208 18.3258225619432 -9.87705373397114 C:G C G 10 0.555327956422522 0.00749307665088232 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 75583325 A/G 1 10 17 27 4.44672043577478 9.44057525918287 -4.99385482340809 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0793657979175034 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000421059:exon_75583307_75583427:POR;ENSG00000127948:ENST00000471238:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000449920:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000418341:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75583307_75583498:POR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 75609677 A/G 1 28 23 51 12.4508172201694 12.772542997718 -0.321725777548622 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75609657_75609711:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75609657_75610056:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75609657_75609729:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75609657_75609789:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75609657_75610040:POR;ENSG00000127948:ENST00000426184:exon_75609657_75609757:POR;ENSG00000127948:ENST00000475509:exon_75609657_75609678:POR HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 75621571 G/T 1 25 76 101 11.116801089437 42.2049246881117 -31.0881235986747 T:G G T 10 0.555327956422522 5.30013277187946e-10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 15 5 20 6.67008065366217 2.77663978211261 3.89344087154956 A:T:C T C 10 0.555327956422522 0.113443509114618 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 14 13 27 6.22540861008469 7.21926343349279 -0.993854823408094 T:C T C 10 0.555327956422522 0.703574709140118 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 76058857 G/A 1 2 12 14 0.889344087154956 6.66393547707026 -5.77459138991531 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00216105207299794 ENSG00000188372:ENST00000336517:exon_76058832_76058950:ZP3;ENSG00000188372:ENST00000394857:exon_76058832_76058950:ZP3;ENSG00000188372:ENST00000416245:exon_76057955_76058950:ZP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 39 23 62 17.3422096995216 12.772542997718 4.56966670180364 T:C C T 10 0.555327956422522 0.253177320558439 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 76610095 C/T 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 T:C C T 10 0.555327956422522 0.739711191898725 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 77256713 A/G 1 55 37 92 24.4569623967613 20.5471343876333 3.90982800912798 A:G A G 10 0.555327956422522 0.463112348487273 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77256473_77256992:PTPN12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 86800351 A/G 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:G A G 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000135164:ENST00000331242:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000413276:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000447863:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000414194:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000394702:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000411766:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000425406:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000420131:exon_86800311_86800373:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000449088:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000430405:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000432937:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000394703:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000434534:exon_86800311_86800367:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000412139:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000425705:exon_86800311_86800405:DMTF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 86813831 C/G 1 6 10 16 2.66803226146487 5.55327956422522 -2.88524730276035 C:G C G 10 0.555327956422522 0.207537445170925 ENSG00000135164:ENST00000331242:exon_86813713_86813941:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000413276:exon_86813713_86813941:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000447863:exon_86813713_86813941:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000425406:exon_86813713_86813941:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000432937:exon_86813713_86813941:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000394703:exon_86813713_86813941:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000412139:exon_86813713_86813941:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000473521:exon_86813713_86813941:DMTF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 89982132 T/C 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000477972:exon_89982130_89982546:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89982130_89982323:GTPBP10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 23 19 42 10.227457002282 10.5512311720279 -0.323774169745922 T:G G T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 91632391 G/A 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 A:G G A 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 91691601 C/T 1 4 7 11 1.77868817430991 3.88729569495765 -2.10860752064774 T:C C T 10 0.555327956422522 0.234416927909769 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 91712698 A/G 1 21 9 30 9.33811291512704 4.9979516078027 4.34016130732434 A:C:G A G 10 0.555327956422522 0.141164510315933 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91712484_91713009:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91712484_91712969:AKAP9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 91713972 C/T 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 T:C C T 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 91715662 C/T 1 12 7 19 5.33606452292974 3.88729569495765 1.44876882797208 T:C C T 10 0.555327956422522 0.645874384560469 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91715542_91715730:AKAP9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 21 24 45 9.33811291512704 13.3278709541405 -3.98975803901349 A:C A C 10 0.555327956422522 0.234586818523213 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 62 80 142 27.5696667018036 44.4262365138018 -16.8565698119981 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00517910688348268 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 92028039 C/A 1 36 47 83 16.0081935687892 26.1004139518585 -10.0922203830693 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0273073251236971 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 95034775 G/C 1 16 12 28 7.11475269723965 6.66393547707026 0.450817220169385 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000105854:ENST00000455123:exon_95034179_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000355659:exon_95034185_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000433091:exon_95034192_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000222572:exon_95034209_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000483292:exon_95034590_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000446142:exon_95034651_95034800:PON2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 95041016 G/C 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 C:G G C 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000105854:ENST00000455123:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000355659:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000433091:exon_95040965_95041055:PON2;ENSG00000105854:ENST00000222572:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000446142:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000469926:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000491069:exon_95040963_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000490778:exon_95040994_95041091:PON2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 97863145 G/A 1 5 3 8 2.22336021788739 1.66598386926757 0.557376348619824 A:G G A 10 0.555327956422522 0.739711191898725 ENSG00000205356:ENST00000447648:exon_97862733_97863223:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000490842:exon_97862139_97863154:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000379795:exon_97862733_97863223:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000471397:exon_97862739_97863223:TECPR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 98559980 C/T 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 T:C C T 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000196367:ENST00000359863:exon_98559925_98560050:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000355540:exon_98559925_98560050:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000446306:exon_98559925_98560050:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000456197:exon_98559925_98560050:TRRAP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 99631790 A/G 1 12 12 24 5.33606452292974 6.66393547707026 -1.32787095414053 A:G A G 10 0.555327956422522 0.682467369666187 ENSG00000106261:ENST00000324306:exon_99630928_99636631:ZKSCAN1;ENSG00000106261:ENST00000426572:exon_99630928_99631894:ZKSCAN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 99654600 A/G 1 12 12 24 5.33606452292974 6.66393547707026 -1.32787095414053 A:G A G 10 0.555327956422522 0.682467369666187 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 99654689 G/A 1 8 9 17 3.55737634861982 4.9979516078027 -1.44057525918287 A:G G A 10 0.555327956422522 0.626853565320545 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99654630_99654872:ZSCAN21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 99669802 A/G 1 9 24 33 4.0020483921973 13.3278709541405 -9.32582256194322 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00131754002832052 ENSG00000166526:ENST00000303915:exon_99669105_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000424697:exon_99667597_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000299667:exon_99667611_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000487620:exon_99667800_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000412947:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000428683:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000449785:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000441298:exon_99669703_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000415068:exon_99669794_99669835:ZNF3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 99691740 G/A 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 A:G G A 10 0.555327956422522 0.150211231786478 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 129 136 265 57.3626936214947 75.524602073463 -18.1619084519683 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0260424523919399 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 31 23 54 13.7848333509018 12.772542997718 1.01229035318381 A:T:G A T 10 0.555327956422522 0.891258773061341 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 37 31 68 16.4528656123667 17.2151666490982 -0.762301036731493 A:G A G 10 0.555327956422522 0.903093129372532 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 99707712 A/G 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:G A G 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000106290:ENST00000487115:exon_99707700_99707897:TAF6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 100469276 G/A 1 15 8 23 6.67008065366217 4.44262365138018 2.22745700228199 A:G G A 10 0.555327956422522 0.40594380768443 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100469165_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100469165_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100469165_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100469165_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000488670:exon_100469165_100469343:TRIP6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 100731505 C/G 1 13 18 31 5.78073656650721 9.9959032156054 -4.21516664909818 C:G C G 10 0.555327956422522 0.148914132603621 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 100731829 T/C 1 43 37 80 19.1208978738316 20.5471343876333 -1.42623651380176 T:C T C 10 0.555327956422522 0.822157109656556 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 100850144 G/A 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 A:G G A 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100850060_100850185:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100850060_100850185:PLOD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 100850908 G/A 1 7 12 19 3.11270430504235 6.66393547707026 -3.55123117202792 A:G G A 10 0.555327956422522 0.110901602972419 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100850859_100851005:PLOD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 100853714 G/A 1 15 21 36 6.67008065366217 11.661887084873 -4.99180643121079 A:G G A 10 0.555327956422522 0.13003425836145 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000487563:exon_100853374_100853720:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000460132:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000440925:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000466881:exon_100853637_100853725:PLOD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 100855823 G/A 1 16 10 26 7.11475269723965 5.55327956422522 1.56147313301443 A:G G A 10 0.555327956422522 0.561847305125949 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478082:exon_100855811_100855936:PLOD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 100855877 G/A 1 29 15 44 12.8954892637469 8.32991934633783 4.56556991740903 A:G G A 10 0.555327956422522 0.175572924148133 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478082:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478264:exon_100855825_100855936:PLOD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 100855929 G/C 1 10 17 27 4.44672043577478 9.44057525918287 -4.99385482340809 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0793657979175034 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478082:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478264:exon_100855825_100855936:PLOD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 102087202 T/C 1 60 51 111 26.6803226146487 28.3217257775486 -1.64140316289994 T:C T C 10 0.555327956422522 0.775003511983229 ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 102114087 C/T 1 47 26 73 20.8995860481415 14.4385268669856 6.4610591811559 T:C C T 10 0.555327956422522 0.157142769962068 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 102114090 T/C 1 25 43 68 11.116801089437 23.8791021261684 -12.7623010367315 T:C T C 10 0.555327956422522 0.00213167296526944 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 102715804 C/T 1 11 20 31 4.89139247935226 11.1065591284504 -6.21516664909818 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0294966063556148 ENSG00000170632:ENST00000323716:exon_102715328_102715858:ARMC10;ENSG00000170632:ENST00000428183:exon_102715328_102715858:ARMC10;ENSG00000170632:ENST00000441711:exon_102715328_102715858:ARMC10;ENSG00000170632:ENST00000454559:exon_102715328_102715858:ARMC10;ENSG00000170632:ENST00000425331:exon_102715328_102715858:ARMC10;ENSG00000170632:ENST00000323735:exon_102715373_102715858:ARMC10;ENSG00000170632:ENST00000306450:exon_102715397_102715858:ARMC10;ENSG00000170632:ENST00000434153:exon_102715615_102715858:ARMC10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 105148903 T/C 1 14 12 26 6.22540861008469 6.66393547707026 -0.438526866985572 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000091127:ENST00000481939:exon_105148562_105148991:PUS7;ENSG00000091127:ENST00000356362:exon_105148562_105148967:PUS7;ENSG00000091127:ENST00000469408:exon_105148562_105148991:PUS7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 107002806 A/G 1 13 12 25 5.78073656650721 6.66393547707026 -0.883198910563049 A:G A G 10 0.555327956422522 0.841067314696951 ENSG00000164597:ENST00000347053:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000297135:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000393603:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000484237:exon_107002753_107002865:COG5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 107216836 G/A 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 A:G G A 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000471763:exon_107216811_107217636:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107216811_107217037:DUS4L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 24 18 42 10.6721290458595 9.9959032156054 0.676225830254078 T:C T C 10 0.555327956422522 0.87768344949826 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 31 31 62 13.7848333509018 17.2151666490982 -3.43033329819636 A:G G A 10 0.555327956422522 0.443496921378228 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 112096073 T/C 1 13 15 28 5.78073656650721 8.32991934633783 -2.54918277983062 T:C T C 10 0.555327956422522 0.347681760793844 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000443101:exon_112096057_112096128:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000429071:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000476927:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000440625:exon_112096057_112096141:IFRD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 116528240 C/T 1 29 25 54 12.8954892637469 13.883198910563 -0.987709646816187 T:C C T 10 0.555327956422522 0.786122279703696 ENSG00000198898:ENST00000464223:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000484325:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000449080:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000490693:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000461878:exon_116528181_116528753:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000417431:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000464669:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116528181_116528244:CAPZA2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 116557939 C/T 1 54 42 96 24.0122903531838 23.3237741697459 0.688516183437891 T:C C T 10 0.555327956422522 0.918503730541524 ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116557781_116559315:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116557781_116558242:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116557781_116559312:CAPZA2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 117824239 G/C 1 22 13 35 9.78278495870452 7.21926343349279 2.56352152521173 C:G G C 10 0.555327956422522 0.401605428146735 ENSG00000128534:ENST00000249299:exon_117824086_117824308:NAA38;ENSG00000128534:ENST00000424702:exon_117824198_117824308:NAA38;ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38;ENSG00000128534:ENST00000411938:exon_117824221_117824334:NAA38 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 124491951 T/C 1 12 10 22 5.33606452292974 5.55327956422522 -0.217215041295483 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000128513:ENST00000357628:exon_124491926_124492005:POT1;ENSG00000128513:ENST00000440969:exon_124491926_124492005:POT1;ENSG00000128513:ENST00000393329:exon_124491926_124492005:POT1;ENSG00000128513:ENST00000393326:exon_124491926_124492005:POT1;ENSG00000128513:ENST00000451720:exon_124491926_124492005:POT1;ENSG00000128513:ENST00000265391:exon_124491926_124492005:POT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 128409225 A/G 1 22 25 47 9.78278495870452 13.883198910563 -4.10041395185853 A:G A G 10 0.555327956422522 0.242748815640483 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128409117_128411528:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128409117_128409990:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000493278:exon_128409117_128409250:CALU HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 128607384 G/A 1 25 26 51 11.116801089437 14.4385268669856 -3.32172577754862 A:G G A 10 0.555327956422522 0.398449939089232 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 128641226 G/C 1 15 13 28 6.67008065366217 7.21926343349279 -0.549182779830615 C:G G C 10 0.555327956422522 0.851250752295518 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128641113_128641288:TNPO3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 129297332 T/G 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 T:G T G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000106459:ENST00000353868:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393232:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393231:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000454688:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000223190:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000311967:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393230:exon_129297183_129297414:NRF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 129330337 C/T 1 11 10 21 4.89139247935226 5.55327956422522 -0.661887084872961 T:C C T 10 0.555327956422522 0.828131296920228 ENSG00000106459:ENST00000353868:exon_129330246_129330386:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393232:exon_129330246_129330386:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393231:exon_129330246_129330386:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000454688:exon_129330246_129330386:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000223190:exon_129330246_129330386:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000311967:exon_129330246_129330386:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393230:exon_129330246_129330386:NRF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 133580447 G/A 1 14 19 33 6.22540861008469 10.5512311720279 -4.32582256194322 A:G G A 10 0.555327956422522 0.160689908592126 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000469115:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000482089:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000460346:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000472020:exon_133580352_133580488:EXOC4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 139026152 T/G 1 15 7 22 6.67008065366217 3.88729569495765 2.78278495870452 T:G T G 10 0.555327956422522 0.285994739228917 ENSG00000164898:ENST00000297534:exon_139025878_139026268:C7orf55 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 139102490 A/G 1 13 21 34 5.78073656650721 11.661887084873 -5.88115051836575 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0562620626821101 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 1 32 27 59 14.2295053944793 14.9938548234081 -0.764349428928796 A:G G A 10 0.555327956422522 0.896034534534726 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 69 0 69 30.682371006846 0 30.682371006846 T T 10 0.555327956422522 3.5106442573723e-18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 142991361 G/C 1 8 16 24 3.55737634861982 8.88524730276035 -5.32787095414053 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0382967038854731 ENSG00000106144:ENST00000310447:exon_142991323_142991417:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000392923:exon_142991323_142991417:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000493642:exon_142991323_142991417:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000481483:exon_142991323_142991574:CASP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 148851273 G/C 1 8 4 12 3.55737634861982 2.22131182569009 1.33606452292974 C:G G C 10 0.555327956422522 0.56621841747708 ENSG00000197024:ENST00000420008:exon_148851058_148851432:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000426851:exon_148851037_148851432:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000485111:exon_148851037_148851432:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000475153:exon_148851037_148851432:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000483892:exon_148851037_148851409:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000491174:exon_148851037_148851432:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000335901:exon_148851037_148851432:ZNF398 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 149129829 C/T 1 20 17 37 8.89344087154956 9.44057525918287 -0.547134387633312 T:C C T 10 0.555327956422522 0.869997748652473 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149128454_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149129360_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149128867_149130026:ZNF777 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 149152906 G/A 1 20 8 28 8.89344087154956 4.44262365138018 4.45081722016939 A:G G A 10 0.555327956422522 0.126756229357224 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 12 12 24 5.33606452292974 6.66393547707026 -1.32787095414053 T:C T C 10 0.555327956422522 0.682467369666187 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 11 14 25 4.89139247935226 7.77459138991531 -2.88319891056305 A:G A G 10 0.555327956422522 0.3145412245025 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 125 82 207 55.5840054471848 45.5368924266468 10.0471130205379 T:C T C 10 0.555327956422522 0.162651378965829 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 176 69 245 78.2622796696361 38.317628993154 39.9446506764821 A:G G A 10 0.555327956422522 2.11502124836611e-07 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 146 62 208 64.9221183623118 34.4303332981964 30.4917850641154 T:C C T 10 0.555327956422522 1.83491236437239e-05 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 149 176 325 66.2561344930442 97.7377203303639 -31.4815858373196 T:C T C 10 0.555327956422522 0.000521157473239329 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 150094851 A/G 1 17 16 33 7.55942474081713 8.88524730276035 -1.32582256194322 A:G A G 10 0.555327956422522 0.726914463925943 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 150324825 C/T 1 20 15 35 8.89344087154956 8.32991934633783 0.563521525211732 T:C C T 10 0.555327956422522 0.867078000918724 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 150325175 C/T 1 12 20 32 5.33606452292974 11.1065591284504 -5.7704946055207 T:C C T 10 0.555327956422522 0.04951094379604 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 28 27 55 12.4508172201694 14.9938548234081 -2.54303760323871 C:G G C 10 0.555327956422522 0.500500871846427 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 44 34 78 19.565569917409 18.8811505183657 0.684419399043286 A:G G A 10 0.555327956422522 0.909706736013773 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 150921950 A/G 1 35 26 61 15.5635215252117 14.4385268669856 1.12499465822616 A:G A G 10 0.555327956422522 0.798119108960228 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000468073:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000441774:exon_150921862_150922074:ABCF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 40 47 87 17.7868817430991 26.1004139518585 -8.31353220875941 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0839892469035537 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 38 52 90 16.8975376559442 28.8770537339711 -11.979516078027 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0142562444076888 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 151859288 G/T 1 23 25 48 10.227457002282 13.883198910563 -3.65574190828105 A:T:G G T 10 0.555327956422522 0.311204408143141 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000424877:exon_151859202_151860419:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151859202_151860911:MLL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 151873853 C/T 1 5 8 13 2.22336021788739 4.44262365138018 -2.21926343349279 T:C C T 10 0.555327956422522 0.268109731741661 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151873276_151875053:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151873276_151875095:MLL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 156979662 C/T 1 16 21 37 7.11475269723965 11.661887084873 -4.54713438763331 T:C C T 10 0.555327956422522 0.139568461922462 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_156979528_156979715:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_156979528_156979715:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000389103:exon_156979528_156979715:UBE3C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 157024038 A/G 1 20 16 36 8.89344087154956 8.88524730276035 0.00819356878920985 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000009335:ENST00000497368:exon_157023774_157024509:UBE3C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 158447855 T/G 1 13 16 29 5.78073656650721 8.88524730276035 -3.10451073625314 T:G T G 10 0.555327956422522 0.266234224731931 ENSG00000146918:ENST00000432615:exon_158447810_158447950:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000275830:exon_158447810_158447950:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000356309:exon_158447810_158447950:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409423:exon_158447810_158447950:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000441982:exon_158447810_158447950:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000467785:exon_158447810_158448147:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409339:exon_158447810_158447950:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000449727:exon_158447810_158447950:NCAPG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 158534216 T/C 1 43 52 95 19.1208978738316 28.8770537339711 -9.75615586013959 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0495709551096127 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158534214_158534339:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 10 8 18 4.44672043577478 4.44262365138018 0.00409678439460492 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 381410 A/G 1 13 12 25 5.78073656650721 6.66393547707026 -0.883198910563049 A:G A G 10 0.555327956422522 0.841067314696951 ENSG00000147364:ENST00000518240:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000524125:exon_381341_381444:FBXO25 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 6299654 T/C 1 9 11 20 4.0020483921973 6.10860752064774 -2.10655912845044 T:C T C 10 0.555327956422522 0.374427217398125 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6299588_6299677:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6299588_6299677:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6299588_6299677:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6299588_6299677:MCPH1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 6302183 G/C 1 21 13 34 9.33811291512704 7.21926343349279 2.11884948163425 C:G G C 10 0.555327956422522 0.495256249707322 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 6566351 C/G 1 30 18 48 13.3401613073243 9.9959032156054 3.34425809171895 C:G C G 10 0.555327956422522 0.384505541119117 ENSG00000155189:ENST00000285518:exon_6565878_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000523234:exon_6566187_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000518327:exon_6566214_6566408:AGPAT5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 8176221 C/T 1 11 4 15 4.89139247935226 2.22131182569009 2.67008065366217 T:C C T 10 0.555327956422522 0.199926509979624 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 8176554 C/T 1 10 14 24 4.44672043577478 7.77459138991531 -3.32787095414053 T:C C T 10 0.555327956422522 0.217768755345003 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 8234077 G/C 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 C:G G C 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 8234113 G/A 1 10 6 16 4.44672043577478 3.33196773853513 1.11475269723965 A:G G A 10 0.555327956422522 0.624513862012014 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 8234192 G/C 1 17 3 20 7.55942474081713 1.66598386926757 5.89344087154956 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0112462008212926 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 8234218 C/T 1 18 2 20 8.0040967843946 1.11065591284504 6.89344087154956 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00131252059969926 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 8234219 G/A 1 19 2 21 8.44876882797208 1.11065591284504 7.33811291512704 A:G G A 10 0.555327956422522 0.000778389785771228 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 8234714 C/T 1 14 11 25 6.22540861008469 6.10860752064774 0.11680108943695 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 8749695 G/C 1 30 23 53 13.3401613073243 12.772542997718 0.567618309606335 C:G G C 10 0.555327956422522 0.891214205866966 ENSG00000147324:ENST00000276282:exon_8747571_8751155:MFHAS1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 9414049 G/A 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000173273:ENST00000520408:exon_9413424_9414122:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000310430:exon_9413424_9414122:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000522110:exon_9413442_9416341:TNKS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 9564437 A/G 1 7 1 8 3.11270430504235 0.555327956422522 2.55737634861982 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0837859633971926 ENSG00000173273:ENST00000520408:exon_9564321_9564507:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000310430:exon_9564321_9564507:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000518281:exon_9564321_9564507:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000434877:exon_9564321_9564507:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000518027:exon_9564321_9564518:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000519392:exon_9564321_9564518:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000517989:exon_9564321_9564507:TNKS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 9564485 G/A 1 3 8 11 1.33401613073243 4.44262365138018 -3.10860752064774 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0718999345122269 ENSG00000173273:ENST00000520408:exon_9564321_9564507:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000310430:exon_9564321_9564507:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000518281:exon_9564321_9564507:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000434877:exon_9564321_9564507:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000518027:exon_9564321_9564518:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000519392:exon_9564321_9564518:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000517989:exon_9564321_9564507:TNKS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 9567700 C/A 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 A:C C A 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000173273:ENST00000520408:exon_9567652_9567919:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000310430:exon_9567652_9567730:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000518281:exon_9567652_9567730:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000434877:exon_9567652_9567919:TNKS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 9627791 A/G 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 A:G A G 10 0.555327956422522 1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 11418773 C/T 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 T:C C T 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 11643693 C/A 1 24 21 45 10.6721290458595 11.661887084873 -0.989758039013489 A:C C A 10 0.555327956422522 0.766666458115943 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 11667179 C/T 1 126 171 297 56.0286774907622 94.9610805482513 -38.932403057489 T:C:G C T 10 0.555327956422522 6.30456424560224e-06 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531733:exon_11667176_11667485:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531249:exon_11667176_11667448:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11666765_11667359:FDFT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 11683622 T/C 1 97 65 162 43.1331882270154 36.0963171674639 7.03687105955144 T:C T C 10 0.555327956422522 0.269808222596756 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528729:exon_11683509_11683724:FDFT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 11689119 G/C 1 200 239 439 88.9344087154956 132.723381584983 -43.7889728694871 C:G G C 10 0.555327956422522 2.82881573437241e-05 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11689027_11689176:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529521:exon_11689027_11689303:FDFT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 11704650 C/T 1 20 20 40 8.89344087154956 11.1065591284504 -2.21311825690088 T:C C T 10 0.555327956422522 0.526214098904355 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000420692:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526481:exon_11704615_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530624:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11704602_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530290:exon_11704626_11704677:CTSB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 11705589 A/G 1 30 46 76 13.3401613073243 25.545085995436 -12.2049246881117 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00543414705982306 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000420692:exon_11705576_11706212:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530624:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530290:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11705583_11705661:CTSB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 11710888 G/C 1 18 9 27 8.0040967843946 4.9979516078027 3.00614517659191 C:G G C 10 0.555327956422522 0.333068746152876 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11710838_11711023:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526645:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525315:exon_11710838_11710971:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530573:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532370:exon_11710838_11711328:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000505496:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524500:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531502:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527215:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532656:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534382:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000528965:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524654:exon_11710867_11710988:CTSB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 17125768 T/C 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000324815:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000519381:exon_17125767_17125782:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000518038:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17125767_17125881:VPS37A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 8 9 17 3.55737634861982 4.9979516078027 -1.44057525918287 T:C C T 10 0.555327956422522 0.626853565320545 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 17918934 A/G 1 85 97 182 37.7971237040856 53.8668117729846 -16.069688068899 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0170432620423866 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000521542:exon_17918886_17919383:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518746:exon_17918909_17918967:ASAH1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 19677915 G/A 1 9 6 15 4.0020483921973 3.33196773853513 0.670080653662171 A:G G A 10 0.555327956422522 0.799910806218814 ENSG00000104613:ENST00000397977:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000522114:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000523869:exon_19677890_19678029:INTS10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 21846586 G/C 1 19 13 32 8.44876882797208 7.21926343349279 1.2295053944793 C:G G C 10 0.555327956422522 0.724371704529355 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000518808:exon_21845859_21846594:XPO7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 38 29 67 16.8975376559442 16.1045107362531 0.79302691969103 A:G A G 10 0.555327956422522 0.902483138401395 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 21965372 C/T 1 24 10 34 10.6721290458595 5.55327956422522 5.11884948163425 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0855901040834441 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 21996020 G/A 1 25 19 44 11.116801089437 10.5512311720279 0.565569917409034 A:G G A 10 0.555327956422522 0.880943123846544 ENSG00000168476:ENST00000334530:exon_21995533_21996065:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000306306:exon_21995533_21996065:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000523293:exon_21995764_21996065:REEP4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 21997738 A/T 1 9 11 20 4.0020483921973 6.10860752064774 -2.10655912845044 A:T A T 10 0.555327956422522 0.374427217398125 ENSG00000168476:ENST00000334530:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000306306:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000523293:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000518664:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000519074:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000519875:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000521744:exon_21997719_21997761:REEP4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 22107986 A/G 1 37 44 81 16.4528656123667 24.434430082591 -7.98156447022428 A:G A G 10 0.555327956422522 0.092913052796138 ENSG00000168495:ENST00000306433:exon_22107909_22108680:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000397802:exon_22107909_22109485:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000518039:exon_22107909_22108409:POLR3D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 22262379 C/T 1 6 8 14 2.66803226146487 4.44262365138018 -1.77459138991531 T:C C T 10 0.555327956422522 0.423022312731772 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520644:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000524285:exon_22262209_22262490:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520832:exon_22262209_22262383:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000519960:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000522881:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517552:exon_22262030_22262493:SLC39A14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 22428708 A/G 1 16 9 25 7.11475269723965 4.9979516078027 2.11680108943695 A:G A G 10 0.555327956422522 0.428150577551636 ENSG00000120896:ENST00000240123:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000434297:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517535:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000428103:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523965:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000521554:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000443610:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523348:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517962:exon_22428457_22428734:SORBS3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 22442661 A/G 1 10 12 22 4.44672043577478 6.66393547707026 -2.21721504129548 A:C:G A G 10 0.555327956422522 0.393799982731658 ENSG00000120913:ENST00000456545:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000308354:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000397760:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000339162:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000381194:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000452226:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000397761:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000436754:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000426493:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000429812:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000409141:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000265810:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000409417:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000416159:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000448520:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000491330:exon_22442530_22442675:PDLIM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 22463623 C/T 1 34 30 64 15.1188494816343 16.6598386926757 -1.54098921104141 T:C C T 10 0.555327956422522 0.707683831748983 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523801:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521301:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521837:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523349:exon_22463598_22463689:KIAA1967 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 22471824 G/A 1 32 29 61 14.2295053944793 16.1045107362531 -1.87500534177384 A:G G A 10 0.555327956422522 0.699508804201353 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000522599:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521020:exon_22471398_22471827:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 22481449 A/G 1 21 31 52 9.33811291512704 17.2151666490982 -7.87705373397114 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0354613302806409 ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520489:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000399977:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519863:exon_22481428_22481562:BIN3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 22548790 G/T 1 10 16 26 4.44672043577478 8.88524730276035 -4.43852686698557 T:G G T 10 0.555327956422522 0.112681249078794 ENSG00000179388:ENST00000317216:exon_22545172_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000522910:exon_22547556_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000519492:exon_22547937_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000524088:exon_22547985_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000518773:exon_22548678_22548995:EGR3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 23104195 G/T 1 12 7 19 5.33606452292974 3.88729569495765 1.44876882797208 T:G G T 10 0.555327956422522 0.645874384560469 ENSG00000147457:ENST00000397677:exon_23103769_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000313219:exon_23103604_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519414:exon_23104150_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000517325:exon_23104155_23104337:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000442460:exon_23104157_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519984:exon_23104172_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519529:exon_23104172_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519503:exon_23104179_23104507:CHMP7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 23294761 T/C 1 18 22 40 8.0040967843946 12.2172150412955 -4.21311825690088 T:C T C 10 0.555327956422522 0.204048523382284 ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000520936:exon_23294547_23294771:ENTPD4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 23429329 T/C 1 15 15 30 6.67008065366217 8.32991934633783 -1.65983869267566 T:C T C 10 0.555327956422522 0.584377790818652 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 25222165 A/G 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 A:G A G 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000147459:ENST00000276440:exon_25222142_25222220:DOCK5;ENSG00000147459:ENST00000444569:exon_25222142_25222220:DOCK5;ENSG00000147459:ENST00000467709:exon_25222142_25222220:DOCK5;ENSG00000147459:ENST00000481728:exon_25222142_25222293:DOCK5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 25267622 A/G 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 A:G A G 10 0.555327956422522 0.605558868068935 ENSG00000147459:ENST00000276440:exon_25267615_25267718:DOCK5;ENSG00000147459:ENST00000467709:exon_25267615_25267718:DOCK5;ENSG00000147459:ENST00000521405:exon_25266948_25267718:DOCK5;ENSG00000147459:ENST00000479547:exon_25267513_25267718:DOCK5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 25287397 T/C 1 13 11 24 5.78073656650721 6.10860752064774 -0.327870954140527 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000104756:ENST00000221200:exon_25285366_25287489:KCTD9;ENSG00000104756:ENST00000519665:exon_25286778_25287489:KCTD9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 25364834 A/T 1 39 25 64 17.3422096995216 13.883198910563 3.45901078895859 A:T A T 10 0.555327956422522 0.450810083461726 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 25364960 A/G 1 35 28 63 15.5635215252117 15.5491827798306 0.0143387453811155 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 25365278 G/A 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 26510792 T/C 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000092964:ENST00000521913:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000311151:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000522745:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000523027:exon_26510748_26510913:DPYSL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 49 74 123 21.7889301352964 41.0942687752666 -19.3053386399702 A:C:G C G 10 0.555327956422522 0.000527398608803728 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 27634064 C/T 1 13 12 25 5.78073656650721 6.66393547707026 -0.883198910563049 T:C C T 10 0.555327956422522 0.841067314696951 ENSG00000171320:ENST00000523566:exon_27633879_27634387:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000305188:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000397418:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000522378:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000519637:exon_27633879_27634224:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000524293:exon_27633879_27637612:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000523910:exon_27634027_27634686:ESCO2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 25 19 44 11.116801089437 10.5512311720279 0.565569917409034 C:G C G 10 0.555327956422522 0.880943123846544 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 27679981 T/C 1 13 7 20 5.78073656650721 3.88729569495765 1.89344087154956 T:C T C 10 0.555327956422522 0.501729600552412 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000521226:exon_27679836_27680005:PBK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 36 27 63 16.0081935687892 14.9938548234081 1.01433874538112 C:G G C 10 0.555327956422522 0.899257575830217 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 28574803 G/A 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000012232:ENST00000523149:exon_28574756_28575724:EXTL3;ENSG00000012232:ENST00000220562:exon_28573102_28575724:EXTL3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 29197672 A/G 1 106 102 208 47.1352366192127 56.6434515550972 -9.50821493588457 A:G A G 10 0.555327956422522 0.185783568153778 ENSG00000120875:ENST00000240100:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000404690:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000462477:exon_29197615_29197760:DUSP4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 30924557 C/T 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30924549_30924698:WRN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 31024638 C/T 1 11 15 26 4.89139247935226 8.32991934633783 -3.43852686698557 T:C C T 10 0.555327956422522 0.235826270274551 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 31024654 T/C 1 15 9 24 6.67008065366217 4.9979516078027 1.67212904585947 T:C T C 10 0.555327956422522 0.543438783557522 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 15 10 25 6.67008065366217 5.55327956422522 1.11680108943695 T:C T C 10 0.555327956422522 0.692593351989186 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 25 19 44 11.116801089437 10.5512311720279 0.565569917409034 A:G A G 10 0.555327956422522 0.880943123846544 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 37730368 G/A 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37728796_37730697:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37728796_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 37963239 C/T 1 17 11 28 7.55942474081713 6.10860752064774 1.45081722016938 T:C C T 10 0.555327956422522 0.704654895104891 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37962760_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37963011_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517719:exon_37963018_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37963068_37963256:ASH2L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 37985897 A/G 1 13 12 25 5.78073656650721 6.66393547707026 -0.883198910563049 A:G A G 10 0.555327956422522 0.841067314696951 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000428278:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000521652:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000524247:exon_37985858_37985976:ASH2L HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 38677932 A/G 1 68 48 116 30.2376989632685 26.6557419082811 3.58195705498745 A:G A G 10 0.555327956422522 0.514891272336435 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38677850_38678153:TACC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 38684853 T/C 1 35 22 57 15.5635215252117 12.2172150412955 3.34630648391625 T:C T C 10 0.555327956422522 0.424789729709399 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521642:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521050:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38684686_38685585:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38684686_38684893:TACC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 38695996 T/C 1 42 31 73 18.6762258302541 17.2151666490982 1.4610591811559 T:C T C 10 0.555327956422522 0.814033342496971 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522752:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38695988_38696025:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38695988_38696028:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38695988_38696064:TACC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 41553928 C/G 1 2 6 8 0.889344087154956 3.33196773853513 -2.44262365138018 C:G C G 10 0.555327956422522 0.150542848470395 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41553881_41554105:ANK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 41585438 G/A 1 17 8 25 7.55942474081713 4.44262365138018 3.11680108943695 A:G G A 10 0.555327956422522 0.232942365111759 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41585426_41585524:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41585426_41585524:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41585426_41585524:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41585426_41585524:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41585426_41585524:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41585426_41585524:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41585426_41585524:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41585426_41585524:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41585426_41585524:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41585426_41585524:ANK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 52746153 C/T 1 7 4 11 3.11270430504235 2.22131182569009 0.891392479352258 T:C C T 10 0.555327956422522 0.764420046735623 ENSG00000168300:ENST00000360540:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519559:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000522514:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519554:exon_52746078_52746249:PCMTD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 53537316 A/G 1 8 5 13 3.55737634861982 2.77663978211261 0.780736566507215 A:G A G 10 0.555327956422522 0.78392575562472 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 53555069 A/G 1 12 17 29 5.33606452292974 9.44057525918287 -4.10451073625314 A:G A G 10 0.555327956422522 0.137511299610045 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 53586746 C/T 1 1 7 8 0.444672043577478 3.88729569495765 -3.44262365138018 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0258462190222723 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53586405_53586834:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53586405_53586834:RB1CC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 61655556 G/T 1 7 11 18 3.11270430504235 6.10860752064774 -2.9959032156054 T:G G T 10 0.555327956422522 0.163703578976710 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000453098:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000524602:exon_61653924_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000525508:exon_61653992_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000527825:exon_61655379_61655656:CHD7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 72966002 G/A 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000523582:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000262209:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 76468282 G/A 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 A:G G A 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000164749:ENST00000354370:exon_76468217_76468304:HNF4G;ENSG00000164749:ENST00000396423:exon_76468217_76468304:HNF4G HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 86126052 C/T 1 12 21 33 5.33606452292974 11.661887084873 -6.32582256194323 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0343656255017199 ENSG00000133740:ENST00000418930:exon_86125988_86126753:E2F5;ENSG00000133740:ENST00000256117:exon_86125988_86126751:E2F5;ENSG00000133740:ENST00000416274:exon_86125988_86126750:E2F5;ENSG00000133740:ENST00000519128:exon_86124392_86128536:E2F5;ENSG00000133740:ENST00000517476:exon_86125988_86126272:E2F5;ENSG00000133740:ENST00000521429:exon_86125988_86126725:E2F5;ENSG00000133740:ENST00000518234:exon_86125988_86126137:E2F5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 87497176 G/A 1 23 11 34 10.227457002282 6.10860752064774 4.11884948163425 A:G G A 10 0.555327956422522 0.170566255638556 ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 87519315 T/G 1 19 31 50 8.44876882797208 17.2151666490982 -8.7663978211261 T:G T G 10 0.555327956422522 0.0150444122742176 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523370:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000521045:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518772:exon_87519224_87519341:FAM82B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 87520894 C/A 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87520721_87520910:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87520721_87520904:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87520721_87520913:FAM82B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 87540872 G/A 1 15 21 36 6.67008065366217 11.661887084873 -4.99180643121079 A:G G A 10 0.555327956422522 0.13003425836145 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87540754_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523072:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523001:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517771:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523469:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000522240:exon_87540764_87540905:CPNE3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 87570665 A/C 1 51 31 82 22.6782742224514 17.2151666490982 5.4631075733532 A:C A C 10 0.555327956422522 0.266429958137886 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87570516_87573639:CPNE3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 90770315 C/T 1 39 36 75 17.3422096995216 19.9918064312108 -2.64959673168915 T:C C T 10 0.555327956422522 0.562518926811777 ENSG00000104312:ENST00000220751:exon_90769975_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000522965:exon_90770034_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000517696:exon_90770045_90770461:RIPK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 95419698 A/G 1 15 2 17 6.67008065366217 1.11065591284504 5.55942474081713 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00624518375731168 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95419667_95419948:RAD54B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 100899793 G/A 1 327 368 695 145.407758249835 204.360687963488 -58.9529297136528 A:G G A 10 0.555327956422522 7.67247945463679e-06 ENSG00000164919:ENST00000522934:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520517:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520468:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000297564:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520271:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000517682:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000524245:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000522940:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000518171:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000523016:exon_100899289_100899846:COX6C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 101206391 G/A 1 21 13 34 9.33811291512704 7.21926343349279 2.11884948163425 A:G G A 10 0.555327956422522 0.495256249707322 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101206340_101206496:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101206340_101206496:SPAG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 101206457 A/G 1 29 17 46 12.8954892637469 9.44057525918287 3.45491400456399 A:G A G 10 0.555327956422522 0.373716954822928 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101206340_101206496:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101206340_101206496:SPAG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 101206531 G/A 1 23 6 29 10.227457002282 3.33196773853513 6.89548926374686 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0136579666591236 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 101730345 A/G 1 1628 1581 3209 723.926086944134 877.973499104007 -154.047412159873 A:T:C:G A G 10 0.555327956422522 4.86017535655406e-08 ENSG00000070756:ENST00000318607:exon_101730315_101730508:PABPC1;ENSG00000070756:ENST00000347137:exon_101730315_101730508:PABPC1;ENSG00000070756:ENST00000519004:exon_101730315_101730508:PABPC1;ENSG00000070756:ENST00000517921:exon_101730001_101730508:PABPC1;ENSG00000070756:ENST00000518196:exon_101730315_101730508:PABPC1;ENSG00000070756:ENST00000521865:exon_101730315_101730508:PABPC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 101960857 C/T 1 272 709 981 120.950795853074 393.727521103568 -272.776725250494 T:C:G C T 10 0.555327956422522 2.19508274672265e-69 ENSG00000164924:ENST00000395957:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000395958:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000457309:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000395956:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000353245:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000517797:exon_101960824_101961014:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000395953:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000395948:exon_101960824_101960960:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000395951:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000419477:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000521607:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000480304:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000518736:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000517727:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000521328:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000418997:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000437293:exon_101960842_101961128:YWHAZ HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 103663912 T/G 1 45 54 99 20.0102419609865 29.9877096468162 -9.97746768582967 T:G T G 10 0.555327956422522 0.0541229315032553 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103663377_103664289:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103663377_103664289:KLF10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 103845372 G/A 1 49 32 81 21.7889301352964 17.7704946055207 4.01843552977572 A:G G A 10 0.555327956422522 0.434045257907665 ENSG00000155096:ENST00000337198:exon_103845284_103845446:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000347770:exon_103845284_103845446:AZIN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 104312432 A/G 1 9 4 13 4.0020483921973 2.22131182569009 1.78073656650721 A:G A G 10 0.555327956422522 0.408523981318449 ENSG00000164930:ENST00000522566:exon_104312184_104312512:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000522484:exon_104312184_104312512:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523933:exon_104312428_104312512:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523739:exon_104312428_104312512:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000358755:exon_104312184_104312512:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000519011:exon_104312184_104312512:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000521195:exon_104312182_104312512:FZD6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 33 23 56 14.6741774380568 12.772542997718 1.90163444033877 A:G A G 10 0.555327956422522 0.687278447743607 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 110302047 T/G 1 9 6 15 4.0020483921973 3.33196773853513 0.670080653662171 T:G T G 10 0.555327956422522 0.799910806218814 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 96 110 206 42.6885161834379 61.0860752064774 -18.3975590230395 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0114486215221799 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 120790304 T/C 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120790259_120790369:TAF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 120803637 C/G 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 C:G C G 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120803564_120803699:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000523904:exon_120803564_120803699:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000523734:exon_120803564_120804114:TAF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 120847188 T/C 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 T:C T C 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000136982:ENST00000313655:exon_120846216_120847241:DSCC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 123965019 C/G 1 26 27 53 11.5614731330144 14.9938548234081 -3.43238169039366 A:C:G C G 10 0.555327956422522 0.407179557092282 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 125463435 C/G 1 8 9 17 3.55737634861982 4.9979516078027 -1.44057525918287 C:G C G 10 0.555327956422522 0.626853565320545 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 131124559 T/C 1 8 10 18 3.55737634861982 5.55327956422522 -1.9959032156054 T:C T C 10 0.555327956422522 0.354494673636837 ENSG00000153317:ENST00000524124:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000357668:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000521075:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000518721:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000343135:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000519483:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000520189:exon_131124340_131124660:ASAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 134474148 C/T 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000008513:ENST00000319914:exon_134474118_134474237:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000395320:exon_134474118_134474237:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000399640:exon_134474118_134474237:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000521180:exon_134474118_134474237:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000522652:exon_134474118_134474237:ST3GAL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 135524797 G/T 1 58 49 107 25.7909785274937 27.2110698647036 -1.42009133720985 T:G G T 10 0.555327956422522 0.845863115229267 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135524718_135524844:ZFAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 135602581 A/G 1 9 7 16 4.0020483921973 3.88729569495765 0.114752697239648 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 135602590 C/T 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 135612745 A/G 1 12 4 16 5.33606452292974 2.22131182569009 3.11475269723965 A:G A G 10 0.555327956422522 0.136543787545186 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 141460918 C/T 1 7 11 18 3.11270430504235 6.10860752064774 -2.9959032156054 T:C C T 10 0.555327956422522 0.163703578976710 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141460889_141461029:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 141461062 G/A 1 9 12 21 4.0020483921973 6.66393547707026 -2.66188708487296 A:G G A 10 0.555327956422522 0.276109114103641 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 141461074 A/G 1 12 10 22 5.33606452292974 5.55327956422522 -0.217215041295483 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 141461116 C/T 1 10 5 15 4.44672043577478 2.77663978211261 1.67008065366217 T:C C T 10 0.555327956422522 0.445339902559564 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 141568622 G/A 1 12 11 23 5.33606452292974 6.10860752064774 -0.772542997718006 A:G G A 10 0.555327956422522 0.834806358038955 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141568584_141568671:EIF2C2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 142176321 C/T 1 29 17 46 12.8954892637469 9.44057525918287 3.45491400456399 T:C C T 10 0.555327956422522 0.373716954822928 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142176289_142176488:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142176289_142176488:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142176289_142176488:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142176289_142176488:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142176289_142176488:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521477:exon_142176289_142176332:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520482:exon_142176289_142176488:DENND3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 143425406 C/T 1 8 1 9 3.55737634861982 0.555327956422522 3.0020483921973 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0495403730021064 ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143425327_143425833:TSNARE1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 143436034 A/G 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 A:G A G 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000519651:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520462:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000518720:exon_143435998_143436124:TSNARE1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 143746050 C/T 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C C T 10 0.555327956422522 0.479662189097226 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 143746069 T/C 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 T:C T C 10 0.555327956422522 0.479662189097226 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144332082 T/C 1 6 2 8 2.66803226146487 1.11065591284504 1.55737634861982 T:C T C 10 0.555327956422522 0.312923734992564 ENSG00000181638:ENST00000520584:exon_144331860_144333510:ZFP41;ENSG00000181638:ENST00000330701:exon_144331860_144333510:ZFP41;ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144331860_144333510:ZFP41 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144358302 C/T 1 7 1 8 3.11270430504235 0.555327956422522 2.55737634861982 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0837859633971926 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000522479:exon_144358067_144358351:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000522033:exon_144358067_144358340:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 8 12 20 3.55737634861982 6.66393547707026 -3.10655912845044 A:G G A 10 0.555327956422522 0.181542604683008 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144392368 G/A 1 23 15 38 10.227457002282 8.32991934633783 1.89753765594416 A:G G A 10 0.555327956422522 0.625367432232606 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144392238_144392673:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144391892_144392387:TOP1MT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144403485 G/C 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 C:G G C 10 0.555327956422522 0.605558868068935 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144406705 C/T 1 7 12 19 3.11270430504235 6.66393547707026 -3.55123117202792 T:C C T 10 0.555327956422522 0.110901602972419 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144406655_144406799:TOP1MT HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144662182 G/A 1 249 234 483 110.723338850792 129.94674180287 -19.2234029520781 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.081891541836698 ENSG00000104529:ENST00000532400:exon_144662182_144662343:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144671244 C/G 1 10 3 13 4.44672043577478 1.66598386926757 2.78073656650721 C:G C G 10 0.555327956422522 0.164202722608268 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144671956 G/A 1 12 11 23 5.33606452292974 6.10860752064774 -0.772542997718006 A:G G A 10 0.555327956422522 0.834806358038955 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144681714 G/A 1 10 7 17 4.44672043577478 3.88729569495765 0.559424740817127 A:G G A 10 0.555327956422522 0.813340797660957 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144689146 C/T 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 T:C C T 10 0.555327956422522 0.198922593064512 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144732450 G/A 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 A:G G A 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000183309:ENST00000526926:exon_144732068_144734546:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000458270:exon_144732068_144734546:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000532796:exon_144731830_144736872:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000328466:exon_144731954_144733759:ZNF623 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144775871 C/A 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000181135:ENST00000525185:exon_144775841_144776000:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000534303:exon_144775841_144776009:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000528456:exon_144775841_144775942:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530574:exon_144775841_144775997:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531985:exon_144775841_144775893:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527293:exon_144775841_144775926:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531811:exon_144775841_144775918:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000525862:exon_144775841_144775873:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000526315:exon_144775841_144776129:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530341:exon_144775841_144775881:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531254:exon_144775841_144776199:ZNF707 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 9 5 14 4.0020483921973 2.77663978211261 1.22540861008469 A:C A C 10 0.555327956422522 0.597849528390556 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144874078 C/T 1 30 26 56 13.3401613073243 14.4385268669856 -1.09836555966123 T:C C T 10 0.555327956422522 0.78916368036998 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144874046_144874083:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144874046_144874083:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144874046_144874083:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144874046_144874083:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144874046_144874083:SCRIB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144885580 A/G 1 18 24 42 8.0040967843946 13.3278709541405 -5.32377416974592 A:G A G 10 0.555327956422522 0.119927124185076 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144885553_144885741:SCRIB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144886809 C/T 1 12 19 31 5.33606452292974 10.5512311720279 -5.21516664909818 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0705072935874214 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144886738_144886995:SCRIB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144889172 A/G 1 15 11 26 6.67008065366217 6.10860752064774 0.561473133014428 A:G A G 10 0.555327956422522 0.84687533574258 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000531942:exon_144889094_144889183:SCRIB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144894496 G/A 1 9 13 22 4.0020483921973 7.21926343349279 -3.21721504129548 A:G G A 10 0.555327956422522 0.199625660043352 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144894436_144894554:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144894436_144894554:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144894436_144894554:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144894436_144894554:SCRIB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144895669 G/A 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 A:G G A 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144895640_144895696:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144895640_144895696:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144895640_144895696:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144895640_144895696:SCRIB HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144990335 G/A 1 26 19 45 11.5614731330144 10.5512311720279 1.01024196098651 A:G G A 10 0.555327956422522 0.880991898881775 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 19 20 39 8.44876882797208 11.1065591284504 -2.65779030047836 A:G A G 10 0.555327956422522 0.422929473783178 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144991176 T/C 1 37 60 97 16.4528656123667 33.3196773853513 -16.8668117729846 T:C T C 10 0.555327956422522 0.000681814453789903 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144992103 T/C 1 19 22 41 8.44876882797208 12.2172150412955 -3.7684462133234 T:C T C 10 0.555327956422522 0.272032670141761 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144992361 T/C 1 11 18 29 4.89139247935226 9.9959032156054 -5.10451073625314 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0627746776963758 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144992862 A/G 1 27 20 47 12.0061451765919 11.1065591284504 0.899586048141469 A:G A G 10 0.555327956422522 0.883633241647726 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144992900 G/A 1 22 26 48 9.78278495870452 14.4385268669856 -4.65574190828105 A:G G A 10 0.555327956422522 0.192526491235171 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144993324 C/T 1 35 38 73 15.5635215252117 21.1024623440558 -5.5389408188441 T:C:G C T 10 0.555327956422522 0.197166064080750 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144993377 A/G 1 35 37 72 15.5635215252117 20.5471343876333 -4.98361286242158 A:C:G A G 10 0.555327956422522 0.238571881733821 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144995494 C/T 1 26 20 46 11.5614731330144 11.1065591284504 0.454914004563991 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144995736 G/A 1 21 22 43 9.33811291512704 12.2172150412955 -2.87910212616845 A:G G A 10 0.555327956422522 0.443426847321452 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144996029 A/G 1 15 18 33 6.67008065366217 9.9959032156054 -3.32582256194322 A:G A G 10 0.555327956422522 0.293705287922686 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144996408 T/G 1 27 21 48 12.0061451765919 11.661887084873 0.344258091718945 T:G T G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_144996100_144996563:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144997656 C/T 1 17 9 26 7.55942474081713 4.9979516078027 2.56147313301443 T:C C T 10 0.555327956422522 0.332317546529893 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144997927 G/A 1 10 13 23 4.44672043577478 7.21926343349279 -2.772542997718 A:G G A 10 0.555327956422522 0.295526802222298 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144998169 C/T 1 11 13 24 4.89139247935226 7.21926343349279 -2.32787095414053 T:C C T 10 0.555327956422522 0.412507168985383 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144998190 A/G 1 9 13 22 4.0020483921973 7.21926343349279 -3.21721504129548 A:G A G 10 0.555327956422522 0.199625660043352 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144999417 C/T 1 7 10 17 3.11270430504235 5.55327956422522 -2.44057525918287 T:C C T 10 0.555327956422522 0.329183052237539 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144999621 C/T 1 10 2 12 4.44672043577478 1.11065591284504 3.33606452292974 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0782461275271357 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144999642 A/C 1 13 4 17 5.78073656650721 2.22131182569009 3.55942474081713 A:C A C 10 0.555327956422522 0.092105841480131 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 144999684 A/G 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145001031 T/C 1 22 19 41 9.78278495870452 10.5512311720279 -0.768446213323401 T:C T C 10 0.555327956422522 0.875562949353059 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_145000952_145001050:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145001588 C/T 1 25 26 51 11.116801089437 14.4385268669856 -3.32172577754862 T:C C T 10 0.555327956422522 0.398449939089232 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145001784 A/G 1 19 19 38 8.44876882797208 10.5512311720279 -2.10246234405583 A:G A G 10 0.555327956422522 0.517033830009147 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145007187 G/A 1 15 11 26 6.67008065366217 6.10860752064774 0.561473133014428 A:G G A 10 0.555327956422522 0.84687533574258 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145006961_145007279:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145008560 A/G 1 13 8 21 5.78073656650721 4.44262365138018 1.33811291512704 A:G A G 10 0.555327956422522 0.66298519208265 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145008486_145008613:PLEC HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145058037 A/G 1 14 7 21 6.22540861008469 3.88729569495765 2.33811291512704 A:G A G 10 0.555327956422522 0.382150972530821 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058010_145058272:PARP10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 34 42 76 15.1188494816343 23.3237741697459 -8.20492468811167 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0647179776481826 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 59 55 114 26.2356505710712 30.5430376032387 -4.3073870321675 A:G G A 10 0.555327956422522 0.451213440070979 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145066853 C/T 1 13 3 16 5.78073656650721 1.66598386926757 4.11475269723965 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0443257801951099 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145154257 C/G 1 63 45 108 28.0143387453811 24.9897580390135 3.02458070636763 C:G C G 10 0.555327956422522 0.628513750748285 ENSG00000179526:ENST00000398712:exon_145154180_145154333:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000359551:exon_145154180_145154333:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000361077:exon_145154180_145154333:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000530216:exon_145154153_145154333:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000534242:exon_145154194_145154333:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000525275:exon_145154204_145154521:SHARPIN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 22 29 51 9.78278495870452 16.1045107362531 -6.32172577754862 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0902632476497996 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145665407 C/T 1 5 9 14 2.22336021788739 4.9979516078027 -2.77459138991531 T:C C T 10 0.555327956422522 0.179216881393606 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665404_145665456:NFKBIL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145665516 T/C 1 8 6 14 3.55737634861982 3.33196773853513 0.225408610084692 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665462_145665551:NFKBIL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145665761 G/A 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 A:G G A 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665734_145665812:NFKBIL2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145689915 G/A 1 11 7 18 4.89139247935226 3.88729569495765 1.0040967843946 A:G G A 10 0.555327956422522 0.813417267911682 ENSG00000187954:ENST00000438911:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000292543:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000403000:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000424149:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000306145:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000533764:exon_145689658_145689995:CYHR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145737444 G/C 1 26 13 39 11.5614731330144 7.21926343349279 4.34220969952164 C:G G C 10 0.555327956422522 0.197530044502360 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737294_145737450:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737294_145737450:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737294_145737450:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737294_145737450:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737285_145737450:RECQL4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145737636 A/G 1 21 14 35 9.33811291512704 7.77459138991531 1.56352152521173 A:G A G 10 0.555327956422522 0.615320962333974 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737527_145737707:RECQL4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 15 9 24 6.67008065366217 4.9979516078027 1.67212904585947 T:C C T 10 0.555327956422522 0.543438783557522 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 7 12 19 3.11270430504235 6.66393547707026 -3.55123117202792 C:G C G 10 0.555327956422522 0.110901602972419 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 17 9 26 7.55942474081713 4.9979516078027 2.56147313301443 A:G G A 10 0.555327956422522 0.332317546529893 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145742514 A/G 1 11 6 17 4.89139247935226 3.33196773853513 1.55942474081713 A:G A G 10 0.555327956422522 0.477388500584111 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534270:exon_145742217_145742574:RECQL4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145742879 T/C 1 11 3 14 4.89139247935226 1.66598386926757 3.22540861008469 T:C T C 10 0.555327956422522 0.107343149248364 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145742798_145742892:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145742798_145742892:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145742798_145742892:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145742798_145742892:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145742798_145742883:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145742798_145742937:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534270:exon_145742798_145742956:RECQL4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 145745182 T/C 1 9 15 24 4.0020483921973 8.32991934633783 -4.32787095414053 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0990620091275335 ENSG00000160959:ENST00000527730:exon_145745085_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000529022:exon_145744999_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000292524:exon_145744999_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000530854:exon_145745085_145745369:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000525766:exon_145744999_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000531310:exon_145744651_145745438:LRRC14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 146067054 G/A 1 33 17 50 14.6741774380568 9.44057525918287 5.2336021788739 A:G G A 10 0.555327956422522 0.155370143577845 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530776:exon_146066740_146067121:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 146156247 C/A 1 12 9 21 5.33606452292974 4.9979516078027 0.338112915127039 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 8 146171437 A/G 1 4 9 13 1.77868817430991 4.9979516078027 -3.21926343349279 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0940602799732446 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000532351:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000532811:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000527512:exon_146171299_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000527811:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000527427:exon_146169475_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000529378:exon_146171310_146171601:ZNF16 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 312104 G/A 1 12 9 21 5.33606452292974 4.9979516078027 0.338112915127039 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_311954_312941:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000474772:exon_311958_312166:DOCK8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 421032 C/G 1 14 9 23 6.22540861008469 4.9979516078027 1.22745700228199 C:G C G 10 0.555327956422522 0.678479253472011 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000493666:exon_420949_421078:DOCK8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 42 56 98 18.6762258302541 31.0983655596612 -12.4221397294072 C:G C G 10 0.555327956422522 0.0143203399305756 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 4576680 T/C 1 9 4 13 4.0020483921973 2.22131182569009 1.78073656650721 T:C T C 10 0.555327956422522 0.408523981318449 ENSG00000106688:ENST00000262352:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000381910:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000422398:exon_4576569_4576763:SLC1A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 4685008 C/T 1 3 7 10 1.33401613073243 3.88729569495765 -2.55327956422522 T:C C T 10 0.555327956422522 0.121065279657040 ENSG00000106993:ENST00000381858:exon_4684877_4685158:CDC37L1;ENSG00000106993:ENST00000381854:exon_4684877_4685158:CDC37L1;ENSG00000106993:ENST00000381845:exon_4684877_4685158:CDC37L1;ENSG00000106993:ENST00000479095:exon_4684877_4685475:CDC37L1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 5050706 C/T 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 T:C C T 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5050686_5050831:JAK2;ENSG00000096968:ENST00000472549:exon_5050686_5050831:JAK2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 5968416 A/G 1 24 23 47 10.6721290458595 12.772542997718 -2.10041395185853 A:G A G 10 0.555327956422522 0.559655419240777 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 28 19 47 12.4508172201694 10.5512311720279 1.89958604814147 A:G A G 10 0.555327956422522 0.6604821888971 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 6007500 G/A 1 4 8 12 1.77868817430991 4.44262365138018 -2.66393547707026 A:G G A 10 0.555327956422522 0.150211231786478 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_6007195_6008003:KIAA2026 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 7046901 C/G 1 9 3 12 4.0020483921973 1.66598386926757 2.33606452292974 C:G C G 10 0.555327956422522 0.247371341375508 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7046862_7046917:KDM4C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 7103816 C/T 1 5 5 10 2.22336021788739 2.77663978211261 -0.553279564225219 T:C C T 10 0.555327956422522 0.759189275590932 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000495890:exon_7103685_7104017:KDM4C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 7799606 C/A 1 56 46 102 24.9016344403388 25.545085995436 -0.643451555097243 A:C C A 10 0.555327956422522 0.920843686656853 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 7799653 G/T 1 60 67 127 26.6803226146487 37.206973080309 -10.5266504656603 T:G G T 10 0.555327956422522 0.0613197653524643 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 17394536 C/T 1 2 6 8 0.889344087154956 3.33196773853513 -2.44262365138018 T:C C T 10 0.555327956422522 0.150542848470395 ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17394532_17395067:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17394532_17395067:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17394532_17395067:CNTLN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 20764870 T/C 1 10 11 21 4.44672043577478 6.10860752064774 -1.66188708487296 T:C T C 10 0.555327956422522 0.514389688550212 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20764868_20765072:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20764868_20765072:KIAA1797 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 20953049 A/G 1 14 14 28 6.22540861008469 7.77459138991531 -1.54918277983062 A:G A G 10 0.555327956422522 0.573526479524123 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20952984_20953064:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20952984_20953064:KIAA1797 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 20988426 A/G 1 20 20 40 8.89344087154956 11.1065591284504 -2.21311825690088 A:G A G 10 0.555327956422522 0.526214098904355 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20988331_20988428:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20988331_20988428:KIAA1797 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 26892654 G/A 1 16 9 25 7.11475269723965 4.9979516078027 2.11680108943695 A:G G A 10 0.555327956422522 0.428150577551636 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26892411_26892802:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26892411_26892801:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26892257_26892785:C9orf82 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 26978259 A/G 1 13 3 16 5.78073656650721 1.66598386926757 4.11475269723965 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0443257801951099 ENSG00000096872:ENST00000519968:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517444:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000518614:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000429045:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517866:exon_26978126_26978261:IFT74 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 33113493 A/G 1 80 182 262 35.5737634861982 101.069688068899 -65.4959245827008 A:C:G A G 10 0.555327956422522 4.32213419660762e-16 ENSG00000086062:ENST00000379731:exon_33110635_33113584:B4GALT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 33290532 A/G 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000086102:ENST00000379540:exon_33290509_33290595:NFX1;ENSG00000086102:ENST00000379521:exon_33290510_33290595:NFX1;ENSG00000086102:ENST00000263220:exon_33290510_33290595:NFX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 33354876 C/T 1 11 5 16 4.89139247935226 2.77663978211261 2.11475269723965 T:C C T 10 0.555327956422522 0.325169767810241 ENSG00000086102:ENST00000379540:exon_33354849_33354890:NFX1;ENSG00000086102:ENST00000379521:exon_33354849_33354890:NFX1;ENSG00000086102:ENST00000263220:exon_33354849_33354890:NFX1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 33442952 G/A 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 A:G G A 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000165272:ENST00000297991:exon_33442850_33442968:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000493581:exon_33441154_33443890:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000494193:exon_33442883_33442968:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000494313:exon_33442850_33443107:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000343952:exon_33442850_33442968:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000463983:exon_33442850_33443456:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000473153:exon_33442850_33442968:AQP3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 33941759 T/C 1 12 10 22 5.33606452292974 5.55327956422522 -0.217215041295483 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379225:exon_33941647_33941860:UBAP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 34017106 C/T 1 12 11 23 5.33606452292974 6.10860752064774 -0.772542997718006 T:C C T 10 0.555327956422522 0.834806358038955 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000351580:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000412543:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000480885:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000459988:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000418786:exon_34017048_34017146:UBAP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 34242094 T/A 1 56 54 110 24.9016344403388 29.9877096468162 -5.08607520647742 A:T T A 10 0.555327956422522 0.338641915803173 ENSG00000165006:ENST00000297661:exon_34241183_34242106:UBAP1;ENSG00000165006:ENST00000379186:exon_34241183_34242106:UBAP1;ENSG00000165006:ENST00000359544:exon_34241183_34242106:UBAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 35060746 A/G 1 9 9 18 4.0020483921973 4.9979516078027 -0.995903215605395 A:G A G 10 0.555327956422522 0.643952874691603 ENSG00000165280:ENST00000480327:exon_35060310_35060920:VCP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 35092480 T/G 1 9 8 17 4.0020483921973 4.44262365138018 -0.440575259182873 T:G T G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000165282:ENST00000474436:exon_35088687_35093577:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000378617:exon_35091237_35092764:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000465745:exon_35091237_35094356:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000341666:exon_35091237_35092764:PIGO HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 35093457 C/T 1 7 9 16 3.11270430504235 4.9979516078027 -1.88524730276035 T:C C T 10 0.555327956422522 0.451827358588768 ENSG00000165282:ENST00000298004:exon_35093418_35093577:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000474436:exon_35088687_35093577:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000378617:exon_35093418_35093577:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000465745:exon_35091237_35094356:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000341666:exon_35093418_35093577:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000361778:exon_35093418_35093577:PIGO HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 35101522 G/A 1 143 173 316 63.5881022315794 96.0717364610963 -32.483634229517 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0.000279664159878684 ENSG00000165283:ENST00000356493:exon_35101423_35101557:STOML2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 35105257 G/A 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 A:G G A 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000005238:ENST00000378566:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35104118_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35104120_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35104139_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000479357:exon_35104827_35105371:KIAA1539 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 35618092 T/C 1 11 11 22 4.89139247935226 6.10860752064774 -1.21721504129548 T:C T C 10 0.555327956422522 0.670344781787442 ENSG00000137101:ENST00000396757:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000396759:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000259633:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000490239:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000463720:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000477364:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000378431:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000465754:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000470387:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000482121:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000378430:exon_35618011_35618118:CD72 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 35650458 G/A 1 9 14 23 4.0020483921973 7.77459138991531 -3.77254299771801 A:G G A 10 0.555327956422522 0.141766408043743 ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650354_35650467:SIT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 35705759 G/A 1 103 71 174 45.8012204884802 39.4282849059991 6.37293558248118 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.360195795830919 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35705747_35705848:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000486788:exon_35705747_35705848:TLN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 35712003 G/A 1 64 43 107 28.4590107889586 23.8791021261684 4.57990866279015 A:G G A 10 0.555327956422522 0.383317570814654 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35712002_35712121:TLN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 35749845 G/C 1 8 8 16 3.55737634861982 4.44262365138018 -0.885247302760352 C:G G C 10 0.555327956422522 0.802462003404914 ENSG00000107185:ENST00000456972:exon_35749734_35749868:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000378078:exon_35749734_35749868:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000496906:exon_35749734_35749868:RGP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 36191149 T/C 1 172 198 370 76.4835914953262 109.954935371659 -33.4713438763331 T:C T C 10 0.555327956422522 0.000539455596128937 ENSG00000122705:ENST00000433436:exon_36190892_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000345519:exon_36190920_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000464497:exon_36190928_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000470744:exon_36190929_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000242285:exon_36190934_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000396603:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000466396:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000462562:exon_36190990_36191270:CLTA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 21 10 31 9.33811291512704 5.55327956422522 3.78483335090182 T:C C T 10 0.555327956422522 0.206837442668999 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 38396065 G/T 1 49 34 83 21.7889301352964 18.8811505183657 2.90777961693068 T:G G T 10 0.555327956422522 0.58123954902559 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 74345072 A/C 1 4 7 11 1.77868817430991 3.88729569495765 -2.10860752064774 A:T:C A C 10 0.555327956422522 0.234416927909769 ENSG00000135048:ENST00000377066:exon_74344964_74345169:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000377044:exon_74344964_74345169:TMEM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 10 21 31 4.44672043577478 11.661887084873 -7.21516664909818 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0108242511713790 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 7 1 8 3.11270430504235 0.555327956422522 2.55737634861982 A:C A C 10 0.555327956422522 0.0837859633971926 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 77752510 C/T 1 10 17 27 4.44672043577478 9.44057525918287 -4.99385482340809 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0793657979175034 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77752454_77752532:OSTF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 15 16 31 6.67008065366217 8.88524730276035 -2.21516664909818 A:G A G 10 0.555327956422522 0.471945862571681 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 80851350 G/C 1 10 15 25 4.44672043577478 8.32991934633783 -3.88319891056305 C:G G C 10 0.555327956422522 0.157828971143109 ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000476652:exon_80851010_80851574:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80851011_80851519:CEP78 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 80919756 T/G 1 15 12 27 6.67008065366217 6.66393547707026 0.0061451765919065 T:G T G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80919651_80919856:PSAT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 88636887 G/A 1 12 12 24 5.33606452292974 6.66393547707026 -1.32787095414053 A:G G A 10 0.555327956422522 0.682467369666187 ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88636816_88637213:NAA35 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 88651370 T/C 1 3 20 23 1.33401613073243 11.1065591284504 -9.772542997718 T:C T C 10 0.555327956422522 5.69919494455426e-05 ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000464314:exon_88651263_88651728:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000257504:exon_88651263_88651422:GOLM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 88692336 C/T 1 18 3 21 8.0040967843946 1.66598386926757 6.33811291512704 T:C C T 10 0.555327956422522 0.00683161571934379 ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88692327_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88692327_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88692313_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000257504:exon_88692327_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000470762:exon_88692322_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000472919:exon_88692327_88692454:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000486130:exon_88692325_88692506:GOLM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 88694179 G/T 1 6 3 9 2.66803226146487 1.66598386926757 1.0020483921973 T:G G T 10 0.555327956422522 0.739817826611437 ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000470762:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000486130:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000466178:exon_88694107_88694256:GOLM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 88959938 C/T 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 T:C C T 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000083223:ENST00000277141:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375960:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375961:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375963:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000427388:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000432440:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000449875:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375947:exon_88959785_88960069:ZCCHC6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 93637015 C/T 1 31 26 57 13.7848333509018 14.4385268669856 -0.653693516083752 T:C C T 10 0.555327956422522 0.894438143068177 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93636954_93637131:SYK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 93639973 G/C 1 23 19 42 10.227457002282 10.5512311720279 -0.323774169745922 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 93640009 G/A 1 24 20 44 10.6721290458595 11.1065591284504 -0.434430082590966 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 93641175 C/T 1 17 15 32 7.55942474081713 8.32991934633783 -0.770494605520703 T:C C T 10 0.555327956422522 0.859436806449628 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 93641199 T/C 1 19 18 37 8.44876882797208 9.9959032156054 -1.54713438763331 T:C T C 10 0.555327956422522 0.623331482289855 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 94985637 T/C 1 100 73 173 44.4672043577478 40.5389408188441 3.9282635389037 A:T:C T C 10 0.555327956422522 0.592495697920814 ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_94985628_94985711:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000421189:exon_94985628_94985771:IARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 95005537 A/C 1 55 56 111 24.4569623967613 31.0983655596612 -6.64140316289994 A:C:G A C 10 0.555327956422522 0.215123582336795 ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_95005498_95005593:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_95005498_95005593:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_95005498_95005593:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_95005498_95005593:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_95005498_95005593:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_95005498_95005593:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375627:exon_95005498_95005593:IARS;ENSG00000196305:ENST00000473915:exon_95005498_95005731:IARS;ENSG00000196305:ENST00000449893:exon_95005498_95005593:IARS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 95063947 C/T 1 34 28 62 15.1188494816343 15.5491827798306 -0.430333298196363 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95063833_95064104:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95063833_95064104:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95063833_95064104:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95063833_95064104:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000477862:exon_95063861_95064104:NOL8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 95068046 C/T 1 27 30 57 12.0061451765919 16.6598386926757 -4.65369351608375 T:C C T 10 0.555327956422522 0.231688627825925 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000477862:exon_95068035_95068112:NOL8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 95072907 G/C 1 19 6 25 8.44876882797208 3.33196773853513 5.11680108943695 C:G G C 10 0.555327956422522 0.0442424474389262 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95072835_95072957:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95072835_95072957:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95072835_95072957:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95072835_95072957:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000434228:exon_95072835_95072957:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000432670:exon_95072835_95072957:NOL8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 95076665 C/G 1 38 40 78 16.8975376559442 22.2131182569009 -5.31558060095671 C:G C G 10 0.555327956422522 0.254701368752943 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95076549_95078420:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000434228:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000432670:exon_95076549_95077098:NOL8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 95077470 T/A 1 16 22 38 7.11475269723965 12.2172150412955 -5.10246234405584 A:T T A 10 0.555327956422522 0.104141902689037 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95076549_95078420:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000434228:exon_95076549_95078418:NOL8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 95077827 G/A 1 27 23 50 12.0061451765919 12.772542997718 -0.766397821126098 A:G G A 10 0.555327956422522 0.887168416612352 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95076549_95078420:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000434228:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000433029:exon_95077625_95078418:NOL8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 95375468 G/A 1 10 13 23 4.44672043577478 7.21926343349279 -2.772542997718 A:G G A 10 0.555327956422522 0.295526802222298 ENSG00000188312:ENST00000375587:exon_95375301_95382815:CENPP;ENSG00000188312:ENST00000375579:exon_95375301_95377446:CENPP;ENSG00000188312:ENST00000375576:exon_95375301_95377446:CENPP;ENSG00000127080:ENST00000287996:exon_95375466_95378339:IPPK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 95396712 G/A 1 7 9 16 3.11270430504235 4.9979516078027 -1.88524730276035 A:G G A 10 0.555327956422522 0.451827358588768 ENSG00000127080:ENST00000287996:exon_95396668_95396770:IPPK;ENSG00000127080:ENST00000375522:exon_95396668_95396770:IPPK HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 19 10 29 8.44876882797208 5.55327956422522 2.89548926374686 A:C C A 10 0.555327956422522 0.351058594008537 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 95838070 G/C 1 30 28 58 13.3401613073243 15.5491827798306 -2.20902147250628 C:G G C 10 0.555327956422522 0.598268997181195 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95838066_95838254:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95838066_95838254:SUSD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 95840093 C/T 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 T:C C T 10 0.555327956422522 0.391168946317987 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 95840256 A/G 1 24 45 69 10.6721290458595 24.9897580390135 -14.317628993154 A:G A G 10 0.555327956422522 0.000614305709490829 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000471462:exon_95840125_95840275:SUSD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 96209943 T/C 1 16 21 37 7.11475269723965 11.661887084873 -4.54713438763331 T:C T C 10 0.555327956422522 0.139568461922462 ENSG00000188938:ENST00000479094:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000423591:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375412:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375409:exon_96208783_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000523407:exon_96208807_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520403:exon_96208815_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520470:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483149:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483056:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000476484:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428152:exon_96209550_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428378:exon_96209917_96209979:FAM120AOS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 96415482 A/T 1 4 13 17 1.77868817430991 7.21926343349279 -5.44057525918287 A:T A T 10 0.555327956422522 0.0122609762671924 ENSG00000197724:ENST00000359246:exon_96415461_96415647:PHF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 98638306 C/T 1 11 5 16 4.89139247935226 2.77663978211261 2.11475269723965 T:C C T 10 0.555327956422522 0.325169767810241 ENSG00000182150:ENST00000375266:exon_98637900_98638366:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000405401:exon_98637900_98638366:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000288985:exon_98637983_98638366:C9orf102 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 98766861 G/T 1 4 6 10 1.77868817430991 3.33196773853513 -1.55327956422522 T:G G T 10 0.555327956422522 0.355948609276717 ENSG00000182150:ENST00000479391:exon_98766802_98767137:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000407474:exon_98766802_98766983:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000320486:exon_98766802_98766983:C9orf102 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 99581811 C/T 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000466833:exon_99581690_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000478850:exon_99581690_99582060:ZNF782 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 99581916 C/G 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 C:G C G 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000466833:exon_99581690_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000478850:exon_99581690_99582060:ZNF782 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 100388197 C/T 1 5 4 9 2.22336021788739 2.22131182569009 0.00204839219730246 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000136925:ENST00000375172:exon_100387963_100388279:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000341170:exon_100387963_100388279:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000375165:exon_100387963_100388279:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000354801:exon_100387963_100388279:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000375171:exon_100387963_100388279:TSTD2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 100420976 G/A 1 8 7 15 3.55737634861982 3.88729569495765 -0.32991934633783 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000136937:ENST00000375147:exon_100420922_100421025:NCBP1;ENSG00000136937:ENST00000375132:exon_100420922_100421025:NCBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 101980519 C/T 1 37 46 83 16.4528656123667 25.545085995436 -9.09222038306932 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0471182202804699 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101978708_101981118:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000319033:exon_101978708_101981118:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101979649_101981118:ALG2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 102888676 C/G 1 7 2 9 3.11270430504235 1.11065591284504 2.0020483921973 C:G C G 10 0.555327956422522 0.314861423474498 ENSG00000119509:ENST00000262457:exon_102888665_102888831:INVS;ENSG00000119509:ENST00000496467:exon_102888665_102888831:INVS;ENSG00000119509:ENST00000262456:exon_102888665_102888831:INVS;ENSG00000119509:ENST00000374921:exon_102888665_102888831:INVS;ENSG00000119509:ENST00000466647:exon_102888665_102888831:INVS;ENSG00000119509:ENST00000460636:exon_102888665_102888831:INVS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 103054951 T/C 1 8 2 10 3.55737634861982 1.11065591284504 2.44672043577478 T:C T C 10 0.555327956422522 0.201545371859033 ENSG00000119509:ENST00000262457:exon_103054608_103055325:INVS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 103064530 G/A 1 8 12 20 3.55737634861982 6.66393547707026 -3.10655912845044 A:G G A 10 0.555327956422522 0.181542604683008 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 104152790 G/C 1 81 53 134 36.0184355297757 29.4323816903937 6.58605383938206 C:G G C 10 0.555327956422522 0.259821859572268 ENSG00000136897:ENST00000374865:exon_104149915_104153132:MRPL50 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 104152846 G/A 1 81 61 142 36.0184355297757 33.8750053417738 2.14343018800188 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0.736286912774967 ENSG00000136897:ENST00000374865:exon_104149915_104153132:MRPL50 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 104297693 T/A 1 19 18 37 8.44876882797208 9.9959032156054 -1.54713438763331 A:T T A 10 0.555327956422522 0.623331482289855 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000478347:exon_104297680_104297798:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000488264:exon_104297680_104297729:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000374819:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000479306:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000481046:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000466817:exon_104297680_104297834:RNF20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 104302625 A/G 1 22 16 38 9.78278495870452 8.88524730276035 0.897537655944165 A:G A G 10 0.555327956422522 0.870781297793979 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000478347:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000488264:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000374819:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000479306:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000466817:exon_104302485_104302652:RNF20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 104324545 G/A 1 21 28 49 9.33811291512704 15.5491827798306 -6.21106986470358 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0845359141037232 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104324528_104325622:RNF20 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 21 18 39 9.33811291512704 9.9959032156054 -0.657790300478357 A:C:G G A 10 0.555327956422522 0.87279129294191 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 108147763 T/G 1 36 26 62 16.0081935687892 14.4385268669856 1.56966670180364 T:G T G 10 0.555327956422522 0.703910084509235 ENSG00000070214:ENST00000374723:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000470972:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374720:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374724:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000361080:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000343170:exon_108147703_108147783:SLC44A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 111641825 G/A 1 8 14 22 3.55737634861982 7.77459138991531 -4.21721504129548 A:G G A 10 0.555327956422522 0.0860332203503745 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 111651620 A/T 1 7 7 14 3.11270430504235 3.88729569495765 -0.774591389915308 A:T A T 10 0.555327956422522 0.790013880012186 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111651612_111651673:IKBKAP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 111688828 C/T 1 6 5 11 2.66803226146487 2.77663978211261 -0.108607520647741 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111688803_111688883:IKBKAP HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 112900785 A/G 1 25 62 87 11.116801089437 34.4303332981964 -23.3135322087594 A:G A G 10 0.555327956422522 6.64613014584219e-07 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 113006420 A/G 1 183 189 372 81.3749839746785 104.956983763857 -23.5819997891782 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0142179601102816 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 114359624 C/A 0 0 10 10 0 5.55327956422522 -5.55327956422522 A C A 10 0.555327956422522 0.000302272239171608 ENSG00000106853:ENST00000309195:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374324:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000407693:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000333580:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000238248:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000422125:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374313:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374308:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000485319:exon_114359597_114359693:PTGR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 114694486 A/G 1 24 7 31 10.6721290458595 3.88729569495765 6.78483335090182 A:G A G 10 0.555327956422522 0.017513128680101 ENSG00000148154:ENST00000374279:exon_114694450_114694639:UGCG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 115931692 A/G 1 26 19 45 11.5614731330144 10.5512311720279 1.01024196098651 A:G A G 10 0.555327956422522 0.880991898881775 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 13 27 40 5.78073656650721 14.9938548234081 -9.21311825690088 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00388796218584761 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 115950706 A/C 1 16 13 29 7.11475269723965 7.21926343349279 -0.104510736253137 A:C A C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950669_115950841:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115950669_115950771:FKBP15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 115962208 C/T 1 7 5 12 3.11270430504235 2.77663978211261 0.336064522929736 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115962094_115962243:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115962094_115962243:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115962094_115962243:FKBP15 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 116044998 A/G 1 32 21 53 14.2295053944793 11.661887084873 2.56761830960633 A:G A G 10 0.555327956422522 0.493642527442102 ENSG00000136875:ENST00000374199:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000374198:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000488937:exon_116044926_116045456:PRPF4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 116132334 C/T 1 5 7 12 2.22336021788739 3.88729569495765 -1.66393547707026 T:C C T 10 0.555327956422522 0.391168946317987 ENSG00000119411:ENST00000374183:exon_116131896_116133513:BSPRY;ENSG00000119411:ENST00000462085:exon_116131896_116133513:BSPRY HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 116346287 C/T 1 26 18 44 11.5614731330144 9.9959032156054 1.56556991740903 T:C C T 10 0.555327956422522 0.653043555958764 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 47 52 99 20.8995860481415 28.8770537339711 -7.97746768582967 A:G A G 10 0.555327956422522 0.128858554556893 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 37 31 68 16.4528656123667 17.2151666490982 -0.762301036731493 T:C C T 10 0.555327956422522 0.903093129372532 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 24 24 48 10.6721290458595 13.3278709541405 -2.65574190828105 A:G G A 10 0.555327956422522 0.469745292824653 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 123583192 A/G 1 7 8 15 3.11270430504235 4.44262365138018 -1.32991934633783 A:G A G 10 0.555327956422522 0.605558868068935 ENSG00000095261:ENST00000373920:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123583117_123583257:PSMD5 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 41 27 68 18.2315537866766 14.9938548234081 3.23769896326851 A:G A G 10 0.555327956422522 0.465597169550356 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 17 41 58 7.55942474081713 22.7684462133234 -15.2090214725063 T:C C T 10 0.555327956422522 9.01090791192387e-05 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 126520068 T/C 1 2 7 9 0.889344087154956 3.88729569495765 -2.9979516078027 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0877066993700078 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126519982_126520101:DENND1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 127177161 A/G 1 45 63 108 20.0102419609865 34.9856612546189 -14.9754192936324 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0047635859424234 ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 127623856 C/G 1 3 5 8 1.33401613073243 2.77663978211261 -1.44262365138018 C:G C G 10 0.555327956422522 0.479662189097226 ENSG00000136942:ENST00000487431:exon_127623698_127624215:RPL35 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 127915947 G/A 1 45 43 88 20.0102419609865 23.8791021261684 -3.86886016518193 A:G G A 10 0.555327956422522 0.453011693015981 ENSG00000119414:ENST00000373547:exon_127915812_127916021:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000373546:exon_127915812_127916021:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000415905:exon_127915812_127916021:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000451402:exon_127915812_127916021:PPP6C HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 128064673 T/G 1 5 11 16 2.22336021788739 6.10860752064774 -3.88524730276035 T:G T G 10 0.555327956422522 0.0753333982593944 ENSG00000165219:ENST00000497580:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394084:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000470056:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394105:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394104:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394101:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000265956:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000418009:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394083:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000495955:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000467750:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000297933:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000312123:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000431329:exon_128064489_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000436712:exon_128064586_128065105:GAPVD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 128692068 C/T 1 40 45 85 17.7868817430991 24.9897580390135 -7.20287629591436 T:C C T 10 0.555327956422522 0.126751398452385 ENSG00000167081:ENST00000373492:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373489:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000342287:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373487:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373483:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373482:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000447726:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000428092:exon_128691934_128692124:PBX3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 130164993 C/T 1 11 3 14 4.89139247935226 1.66598386926757 3.22540861008469 T:C C T 10 0.555327956422522 0.107343149248364 ENSG00000136856:ENST00000373371:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000451404:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000476835:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419917:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373354:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373360:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373355:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419132:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000439597:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000423934:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373350:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000430147:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000484617:exon_130164643_130165032:SLC2A8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 130191186 C/T 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:C C T 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130191111_130191199:ZNF79 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 130197414 A/G 1 7 1 8 3.11270430504235 0.555327956422522 2.55737634861982 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0837859633971926 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130197369_130197495:ZNF79 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 130206669 C/T 1 14 4 18 6.22540861008469 2.22131182569009 4.0040967843946 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0614923883244788 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 130210946 A/G 1 4 4 8 1.77868817430991 2.22131182569009 -0.442623651380176 A:G A G 10 0.555327956422522 1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 130219669 C/T 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 T:C C T 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000485704:exon_130219595_130219692:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130219595_130219672:LRSAM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 130242166 A/G 1 9 13 22 4.0020483921973 7.21926343349279 -3.21721504129548 A:G A G 10 0.555327956422522 0.199625660043352 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130242118_130242257:LRSAM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 130586688 G/A 1 9 3 12 4.0020483921973 1.66598386926757 2.33606452292974 A:G G A 10 0.555327956422522 0.247371341375508 ENSG00000106991:ENST00000373203:exon_130586583_130586725:ENG;ENSG00000106991:ENST00000344849:exon_130586583_130586725:ENG;ENSG00000106991:ENST00000480266:exon_130586583_130586725:ENG HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 51 41 92 22.6782742224514 22.7684462133234 -0.0901719908720224 C:G G C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 52 42 94 23.1229462660289 23.3237741697459 -0.200827903717066 A:G A G 10 0.555327956422522 1 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 130707081 A/G 1 6 7 13 2.66803226146487 3.88729569495765 -1.21926343349279 A:G A G 10 0.555327956422522 0.581542779849296 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000465821:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000373084:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000300434:exon_130707056_130707177:FAM102A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 130825784 T/G 1 11 19 30 4.89139247935226 10.5512311720279 -5.65983869267566 T:G T G 10 0.555327956422522 0.0432984066200927 ENSG00000171169:ENST00000373078:exon_130823512_130826179:NAIF1;ENSG00000171169:ENST00000470245:exon_130825653_130826021:NAIF1;ENSG00000171169:ENST00000488519:exon_130824269_130826179:NAIF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131296225 T/C 1 23 21 44 10.227457002282 11.661887084873 -1.43443008259097 T:C T C 10 0.555327956422522 0.761995935351521 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131296040_131296230:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131296040_131296230:GLE1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 23 32 55 10.227457002282 17.7704946055207 -7.54303760323871 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0425709161545429 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 66 73 139 29.3483548761136 40.5389408188441 -11.1905859427306 T:C C T 10 0.555327956422522 0.06042322162368 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 18 18 36 8.0040967843946 9.9959032156054 -1.99180643121079 A:G G A 10 0.555327956422522 0.507892993773159 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 18 14 32 8.0040967843946 7.77459138991531 0.229505394479297 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131403096 A/G 1 21 14 35 9.33811291512704 7.77459138991531 1.56352152521173 A:G A G 10 0.555327956422522 0.615320962333974 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131402970_131403218:WDR34 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131484063 G/A 1 32 26 58 14.2295053944793 14.4385268669856 -0.209021472506274 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000160446:ENST00000372663:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372672:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372667:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000467312:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372664:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000452105:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000406904:exon_131483947_131484096:ZDHHC12 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131515547 G/T 1 17 14 31 7.55942474081713 7.77459138991531 -0.215166649098181 T:G G T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131515443_131515879:ZER1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131565554 T/C 1 10 19 29 4.44672043577478 10.5512311720279 -6.10451073625314 T:C T C 10 0.555327956422522 0.0251377380545549 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131565529_131565739:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000466056:exon_131565529_131565727:TBC1D13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131570177 A/C 1 10 5 15 4.44672043577478 2.77663978211261 1.67008065366217 A:C A C 10 0.555327956422522 0.445339902559564 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131570093_131572711:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131570093_131572703:TBC1D13 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131584631 C/T 1 63 47 110 28.0143387453811 26.1004139518585 1.91392479352259 T:C C T 10 0.555327956422522 0.773721185521241 ENSG00000167136:ENST00000372642:exon_131584607_131584956:ENDOG;ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131585069 A/G 1 12 18 30 5.33606452292974 9.9959032156054 -4.65983869267566 A:G A G 10 0.555327956422522 0.0991449163238243 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 11 8 19 4.89139247935226 4.44262365138018 0.448768827972082 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131670043 C/T 1 3 9 12 1.33401613073243 4.9979516078027 -3.66393547707026 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0418446542055081 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131670112 C/T 1 9 10 19 4.0020483921973 5.55327956422522 -1.55123117202792 T:C C T 10 0.555327956422522 0.496869552202761 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131670919 T/C 1 14 7 21 6.22540861008469 3.88729569495765 2.33811291512704 T:C T C 10 0.555327956422522 0.382150972530821 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 65 54 119 28.9036828325361 29.9877096468162 -1.08402681428012 A:C A C 10 0.555327956422522 0.85405546170781 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131771505 C/T 1 13 11 24 5.78073656650721 6.10860752064774 -0.327870954140527 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000148341:ENST00000372564:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000479237:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372559:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372554:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000461811:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000417224:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000416629:exon_131771385_131771625:SH3GLB2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 131846957 T/C 1 5 6 11 2.22336021788739 3.33196773853513 -1.10860752064774 T:C T C 10 0.555327956422522 0.554274589281642 ENSG00000167130:ENST00000372546:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000406974:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000327812:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000412363:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000480255:exon_131846878_131847047:DOLPP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 132571193 C/T 1 6 6 12 2.66803226146487 3.33196773853513 -0.663935477070264 T:C C T 10 0.555327956422522 0.775730055964994 ENSG00000136816:ENST00000259339:exon_132571184_132571311:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000437263:exon_132571184_132571311:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000488169:exon_132571184_132571311:TOR1B HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 132580901 C/G 1 24 22 46 10.6721290458595 12.2172150412955 -1.54508599543601 C:G C G 10 0.555327956422522 0.65899014290951 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000474192:exon_132580632_132580926:TOR1A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 133578479 C/T 1 14 18 32 6.22540861008469 9.9959032156054 -3.7704946055207 T:C C T 10 0.555327956422522 0.213585949813489 ENSG00000130713:ENST00000372358:exon_133578440_133578568:EXOSC2;ENSG00000130713:ENST00000491115:exon_133578440_133578568:EXOSC2;ENSG00000130713:ENST00000430138:exon_133578440_133578568:EXOSC2;ENSG00000130713:ENST00000372352:exon_133578440_133578568:EXOSC2;ENSG00000130713:ENST00000372351:exon_133578440_133578568:EXOSC2;ENSG00000130713:ENST00000495699:exon_133578440_133578568:EXOSC2;ENSG00000130713:ENST00000467138:exon_133578440_133578568:EXOSC2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 133761001 A/G 1 15 13 28 6.67008065366217 7.21926343349279 -0.549182779830615 A:G A G 10 0.555327956422522 0.851250752295518 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 134497321 C/T 1 67 51 118 29.793026919691 28.3217257775486 1.4713011421424 T:C C T 10 0.555327956422522 0.853143521825615 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000419442:exon_134497183_134497385:RAPGEF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 135139826 T/C 1 41 42 83 18.2315537866766 23.3237741697459 -5.09222038306932 T:C T C 10 0.555327956422522 0.270917044165407 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 135277301 A/G 1 21 25 46 9.33811291512704 13.883198910563 -4.54508599543601 A:C:G A G 10 0.555327956422522 0.184752336213808 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 135277341 C/A 1 34 28 62 15.1188494816343 15.5491827798306 -0.430333298196363 A:C C A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 135781239 A/G 1 9 6 15 4.0020483921973 3.33196773853513 0.670080653662171 A:G A G 10 0.555327956422522 0.799910806218814 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135780968_135781526:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135780968_135781526:TSC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 135976976 C/T 1 17 15 32 7.55942474081713 8.32991934633783 -0.770494605520703 T:C C T 10 0.555327956422522 0.859436806449628 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135975883_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135976907_135977301:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135976686_135977526:RALGDS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 135985796 C/T 1 15 12 27 6.67008065366217 6.66393547707026 0.0061451765919065 T:C C T 10 0.555327956422522 1 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135985683_135985876:RALGDS HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 136199466 G/A 1 24 29 53 10.6721290458595 16.1045107362531 -5.43238169039366 A:G G A 10 0.555327956422522 0.166335409725073 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 136199503 G/A 1 21 19 40 9.33811291512704 10.5512311720279 -1.21311825690088 A:G G A 10 0.555327956422522 0.751440820706528 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 136213521 T/C 1 7 11 18 3.11270430504235 6.10860752064774 -2.9959032156054 T:C T C 10 0.555327956422522 0.163703578976710 ENSG00000148297:ENST00000491289:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000486395:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000343730:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000344469:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000476080:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000422801:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000371999:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000446777:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000494177:exon_136213395_136213548:MED22;ENSG00000148297:ENST00000457204:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000482295:exon_136213262_136213555:MED22 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 38 26 64 16.8975376559442 14.4385268669856 2.4590107889586 A:G A G 10 0.555327956422522 0.615326521125616 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 136907005 G/A 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 A:G G A 10 0.555327956422522 0.52319910466823 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136906882_136907073:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136906882_136907073:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136906882_136907073:BRD3 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 137711997 G/C 1 15 9 24 6.67008065366217 4.9979516078027 1.67212904585947 C:G G C 10 0.555327956422522 0.543438783557522 ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137711962_137712069:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137711962_137712069:COL5A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 137714027 T/C 1 5 8 13 2.22336021788739 4.44262365138018 -2.21926343349279 T:C T C 10 0.555327956422522 0.268109731741661 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 137726950 C/T 1 31 10 41 13.7848333509018 5.55327956422522 8.2315537866766 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0111495312100684 ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137726817_137727050:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137726817_137727050:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000371820:exon_137726817_137727050:COL5A1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 138395969 A/G 1 112 99 211 49.8032688806775 54.9774676858297 -5.17419880515214 A:G A G 10 0.555327956422522 0.488914641673586 ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138395388_138396519:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138395388_138396516:MRPS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 139137407 C/A 1 2 7 9 0.889344087154956 3.88729569495765 -2.9979516078027 A:C C A 10 0.555327956422522 0.0877066993700078 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139137322_139137687:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139137322_139137687:QSOX2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 139326304 G/A 1 7 6 13 3.11270430504235 3.33196773853513 -0.219263433492786 A:G G A 10 0.555327956422522 1 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139326276_139326437:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139326276_139326437:INPP5E HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 139371234 G/A 1 26 14 40 11.5614731330144 7.77459138991531 3.78688174309912 A:G G A 10 0.555327956422522 0.266632510667905 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 139371786 A/C 1 17 23 40 7.55942474081713 12.772542997718 -5.21311825690088 A:C A C 10 0.555327956422522 0.11184424593338 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 139391543 C/T 1 26 24 50 11.5614731330144 13.3278709541405 -1.7663978211261 T:C C T 10 0.555327956422522 0.670282040426826 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 139621326 G/A 1 4 5 9 1.77868817430991 2.77663978211261 -0.997951607802698 A:G G A 10 0.555327956422522 0.52319910466823 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 139757265 C/T 1 14 10 24 6.22540861008469 5.55327956422522 0.672129045859473 T:C C T 10 0.555327956422522 0.839730194130565 ENSG00000107223:ENST00000371648:exon_139756942_139757451:EDF1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 139973820 C/T 1 8 14 22 3.55737634861982 7.77459138991531 -4.21721504129548 T:C C T 10 0.555327956422522 0.0860332203503745 ENSG00000197355:ENST00000409858:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000360271:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 139996099 G/A 1 23 20 43 10.227457002282 11.1065591284504 -0.879102126168444 A:G G A 10 0.555327956422522 0.878299608285348 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_139995936_139996124:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000371587:exon_139995936_139997762:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_139995936_139996124:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_139996077_139996124:MAN1B1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 140002989 T/C 1 28 25 53 12.4508172201694 13.883198910563 -1.43238169039367 T:C T C 10 0.555327956422522 0.78252863659632 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140002840_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001983_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000475449:exon_140002983_140003529:MAN1B1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 148 162 310 65.8114624494667 89.9631289404486 -24.1516664909818 A:G G A 10 0.555327956422522 0.00605803775546651 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 140006425 C/G 1 139 96 235 61.8094140572694 53.3114838165621 8.49793024070733 T:C:G C G 10 0.555327956422522 0.293616994530206 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006393_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140006360_140006481:DPP7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 140008934 A/G 1 39 14 53 17.3422096995216 7.77459138991531 9.56761830960633 A:G A G 10 0.555327956422522 0.00832920152862723 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008915_140009165:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008915_140008944:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008915_140009170:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008915_140009178:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 140100224 A/G 1 12 7 19 5.33606452292974 3.88729569495765 1.44876882797208 A:G A G 10 0.555327956422522 0.645874384560469 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 140108857 T/C 1 13 9 22 5.78073656650721 4.9979516078027 0.782784958704517 T:C T C 10 0.555327956422522 0.831864543663915 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140108656_140108865:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140108656_140108865:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140108656_140108865:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140108656_140108865:NDOR1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 140167022 G/A 1 32 35 67 14.2295053944793 19.4364784747883 -5.20697308030897 A:G G A 10 0.555327956422522 0.219638908926081 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166959_140167067:COBRA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 140611436 T/C 1 40 36 76 17.7868817430991 19.9918064312108 -2.20492468811167 T:C T C 10 0.555327956422522 0.645111880539578 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 140638416 G/A 1 59 45 104 26.2356505710712 24.9897580390135 1.24589253205772 A:G G A 10 0.555327956422522 0.843970185894929 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 48 38 86 21.3442580917189 21.1024623440558 0.241795747663112 T:C T C 10 0.555327956422522 1 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 229542 G/A 1 18 20 38 8.0040967843946 11.1065591284504 -3.10246234405583 A:G G A 10 0.555327956422522 0.330727415667330 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 295069 A/G 0 0 26 26 0 14.4385268669856 -14.4385268669856 G A G 10 0.555327956422522 7.06375266743174e-10 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 1471138 G/T 1 3 6 9 1.33401613073243 3.33196773853513 -1.9979516078027 T:G G T 10 0.555327956422522 0.198922593064512 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 1506224 G/A 1 526 537 1063 233.897494921753 298.211112598894 -64.3136176771409 A:C:G G A 10 0.555327956422522 7.70275137661134e-05 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1506172_1506312:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1506204_1506312:SLC25A6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 2656261 A/G 1 57 113 170 25.3463064839162 62.752059075745 -37.4057525918287 A:G A G 10 0.555327956422522 1.04098386949059e-08 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381177:exon_2655922_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000417575:exon_2656071_2656297:CD99 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 2656283 A/T 1 85 150 235 37.7971237040856 83.2991934633783 -45.5020697592927 A:T A T 10 0.555327956422522 3.33114281114662e-09 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381177:exon_2655922_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000417575:exon_2656071_2656297:CD99 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 3592725 G/A 1 20 9 29 8.89344087154956 4.9979516078027 3.89548926374686 A:G G A 10 0.555327956422522 0.190477687227125 ENSG00000183943:ENST00000262848:exon_3592639_3592807:PRKX HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 6995417 C/T 1 14 17 31 6.22540861008469 9.44057525918287 -3.21516664909818 A:T:C C T 10 0.555327956422522 0.279937122020371 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000412827:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_6995261_6995490:HDHD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 6995438 C/T 1 29 28 57 12.8954892637469 15.5491827798306 -2.65369351608375 T:C C T 10 0.555327956422522 0.506846736590378 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000412827:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_6995261_6995490:HDHD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 7023678 G/A 1 47 45 92 20.8995860481415 24.9897580390135 -4.09017199087202 A:T:G G A 10 0.555327956422522 0.402850069215390 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000498474:exon_7023661_7023879:HDHD1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 13397397 C/T 0 140 0 140 62.2540861008469 0 62.2540861008469 C C 10 0.555327956422522 2.71185657159796e-36 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 15415583 C/T 0 27 0 27 12.0061451765919 0 12.0061451765919 C C 10 0.555327956422522 1.37623159764605e-07 ENSG00000087842:ENST00000380420:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000380421:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000492432:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000484433:exon_15415571_15415653:PIR HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 16778527 A/C 1 85 8 93 37.7971237040856 4.44262365138018 33.3545000527055 A:C A C 10 0.555327956422522 6.34749888083155e-14 ENSG00000169895:ENST00000380155:exon_16778355_16783459:SYAP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 16859628 G/A 1 51 9 60 22.6782742224514 4.9979516078027 17.6803226146487 A:G G A 10 0.555327956422522 1.57824333916398e-06 ENSG00000086712:ENST00000380122:exon_16859551_16862642:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000398155:exon_16859551_16860296:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000485153:exon_16859551_16862642:TXLNG HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 19587233 T/C 1 11 257 268 4.89139247935226 142.719284800588 -137.827892321236 T:C T C 10 0.555327956422522 5.87932352468049e-75 ENSG00000147010:ENST00000379702:exon_19587221_19587306:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000397821:exon_19587221_19587306:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000379716:exon_19587221_19587306:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000397804:exon_19587221_19587306:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000379698:exon_19587221_19587306:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000379726:exon_19587221_19587306:SH3KBP1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 21861434 A/G 0 0 17 17 0 9.44057525918287 -9.44057525918287 G A G 10 0.555327956422522 1.03914714184834e-06 ENSG00000012174:ENST00000379484:exon_21861288_21861436:MBTPS2;ENSG00000012174:ENST00000465888:exon_21861288_21861436:MBTPS2;ENSG00000012174:ENST00000365779:exon_21861288_21861436:MBTPS2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 38147170 C/T 0 8 0 8 3.55737634861982 0 3.55737634861982 C C 10 0.555327956422522 0.0105734315433712 ENSG00000156313:ENST00000309513:exon_38147114_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000339363:exon_38146347_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000338898:exon_38147114_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000482855:exon_38147114_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000318842:exon_38147114_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000342811:exon_38147114_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000378505:exon_38147114_38147294:RPGR HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 40573157 G/A 1 4 30 34 1.77868817430991 16.6598386926757 -14.8811505183657 A:G G A 10 0.555327956422522 1.93641429492622e-07 ENSG00000180182:ENST00000324817:exon_40573030_40573159:MED14;ENSG00000180182:ENST00000482034:exon_40573084_40573159:MED14;ENSG00000180182:ENST00000492219:exon_40573130_40573159:MED14 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 44929077 C/A 1 16 15 31 7.11475269723965 8.32991934633783 -1.21516664909818 A:C C A 10 0.555327956422522 0.719325364600599 ENSG00000147050:ENST00000382899:exon_44928824_44929602:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000334516:exon_44928824_44929602:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000377967:exon_44928824_44929602:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000414389:exon_44928824_44929602:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000433797:exon_44928824_44929602:KDM6A HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 47062534 G/A 1 24 121 145 10.6721290458595 67.1946827271252 -56.5225536812657 A:G G A 10 0.555327956422522 4.52467994352173e-22 ENSG00000130985:ENST00000377351:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000335972:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000424033:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000377271:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000490869:exon_47062533_47062613:UBA1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 47483800 G/A 0 13 0 13 5.78073656650721 0 5.78073656650721 G G 10 0.555327956422522 0.000935755410675861 ENSG00000126759:ENST00000478222:exon_47483612_47483839:CFP;ENSG00000126759:ENST00000396992:exon_47483613_47483839:CFP;ENSG00000126759:ENST00000247153:exon_47483625_47483839:CFP HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 48674638 G/A 0 19 0 19 8.44876882797208 0 8.44876882797208 G G 10 0.555327956422522 1.90910826542979e-05 ENSG00000094631:ENST00000444343:exon_48674548_48674676:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000334136:exon_48674548_48674676:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000376619:exon_48674548_48674676:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000477528:exon_48674548_48674676:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000436813:exon_48674548_48674676:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000486227:exon_48674548_48674676:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000465457:exon_48674548_48674676:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000495515:exon_48674597_48674676:HDAC6 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 48973428 C/T 0 0 39 39 0 21.6577903004784 -21.6577903004784 T C T 10 0.555327956422522 1.87738449360719e-14 ENSG00000068394:ENST00000156109:exon_48973384_48973516:GPKOW;ENSG00000068394:ENST00000327905:exon_48973384_48973431:GPKOW HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 53222280 T/C 1 47 51 98 20.8995860481415 28.3217257775486 -7.42213972940715 T:C T C 10 0.555327956422522 0.154399211020508 ENSG00000126012:ENST00000375401:exon_53221334_53222514:KDM5C;ENSG00000126012:ENST00000404049:exon_53221439_53222514:KDM5C;ENSG00000126012:ENST00000375379:exon_53222111_53222514:KDM5C;ENSG00000126012:ENST00000375383:exon_53222111_53222514:KDM5C HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 55479299 G/A 0 109 0 109 48.4692527499451 0 48.4692527499451 G G 10 0.555327956422522 1.78035112198053e-28 ENSG00000187601:ENST00000342972:exon_55478538_55479998:MAGEH1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 57475132 T/C 0 0 8 8 0 4.44262365138018 -4.44262365138018 C T C 10 0.555327956422522 0.00152868713451737 ENSG00000165591:ENST00000374900:exon_57474957_57475151:FAAH2;ENSG00000165591:ENST00000491179:exon_57475115_57475151:FAAH2;ENSG00000165591:ENST00000465623:exon_57474957_57475151:FAAH2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 57618870 G/A 0 12 0 12 5.33606452292974 0 5.33606452292974 G G 10 0.555327956422522 0.00091995938163399 ENSG00000198455:ENST00000374888:exon_57618269_57623906:ZXDB HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 65824292 G/A 0 0 8 8 0 4.44262365138018 -4.44262365138018 A G A 10 0.555327956422522 0.00152868713451737 ENSG00000131080:ENST00000374719:exon_65824263_65824348:EDA2R;ENSG00000131080:ENST00000396050:exon_65824263_65824348:EDA2R;ENSG00000131080:ENST00000448960:exon_65824263_65824348:EDA2R;ENSG00000131080:ENST00000253392:exon_65824263_65824348:EDA2R;ENSG00000131080:ENST00000456230:exon_65824263_65824348:EDA2R;ENSG00000131080:ENST00000450752:exon_65824263_65824348:EDA2R HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 69615675 G/A 0 18 0 18 8.0040967843946 0 8.0040967843946 G G 10 0.555327956422522 3.607780804312e-05 ENSG00000090889:ENST00000374388:exon_69615521_69615676:KIF4A;ENSG00000090889:ENST00000374403:exon_69615521_69615676:KIF4A HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 71416721 C/T 1 25 1 26 11.116801089437 0.555327956422522 10.5614731330144 T:C C T 10 0.555327956422522 8.93766451268252e-06 ENSG00000102309:ENST00000373662:exon_71416635_71416951:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000218432:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000423432:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000373669:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000475071:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000439980:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000496835:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000446576:exon_71416635_71417204:PIN4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 71549512 G/C 0 15 0 15 6.67008065366217 0 6.67008065366217 G G 10 0.555327956422522 0.000251015038114268 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71549366_71549559:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71549367_71549926:HDAC8 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 73041671 T/G 1 154 1 155 68.4794947109316 0.555327956422522 67.9241667545091 T:G T G 10 0.555327956422522 3.62754761043249e-38 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 76937963 G/C 1 1 52 53 0.444672043577478 28.8770537339711 -28.4323816903937 C:G G C 10 0.555327956422522 1.49076345152719e-17 ENSG00000085224:ENST00000373344:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000395603:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000480283:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000395605:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000343347:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000400862:exon_76937807_76938943:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000400861:exon_76937807_76938943:ATRX HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 77268381 C/T 0 0 14 14 0 7.77459138991531 -7.77459138991531 T C T 10 0.555327956422522 1.18183696210375e-05 ENSG00000165240:ENST00000395563:exon_77268376_77268609:ATP7A;ENSG00000165240:ENST00000341514:exon_77268376_77268609:ATP7A;ENSG00000165240:ENST00000400860:exon_77268376_77268609:ATP7A;ENSG00000165240:ENST00000355691:exon_77268376_77268609:ATP7A HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 77268502 G/C 0 0 13 13 0 7.21926343349279 -7.21926343349279 C G C 10 0.555327956422522 2.65777212481276e-05 ENSG00000165240:ENST00000395563:exon_77268376_77268609:ATP7A;ENSG00000165240:ENST00000341514:exon_77268376_77268609:ATP7A;ENSG00000165240:ENST00000400860:exon_77268376_77268609:ATP7A;ENSG00000165240:ENST00000355691:exon_77268376_77268609:ATP7A HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 78216024 A/C 1 208 7 215 92.4917850641154 3.88729569495765 88.6044893691578 A:C A C 10 0.555327956422522 1.19388561199626e-43 ENSG00000078589:ENST00000171757:exon_78216005_78217451:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000475374:exon_78216005_78216577:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000461541:exon_78216005_78216368:P2RY10 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 78426471 C/T 0 0 9 9 0 4.9979516078027 -4.9979516078027 T C T 10 0.555327956422522 0.00067976443209644 ENSG00000147138:ENST00000276077:exon_78426469_78427726:GPR174 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 78426488 T/C 0 0 13 13 0 7.21926343349279 -7.21926343349279 C T C 10 0.555327956422522 2.65777212481276e-05 ENSG00000147138:ENST00000276077:exon_78426469_78427726:GPR174 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 78426988 T/C 0 0 13 13 0 7.21926343349279 -7.21926343349279 C T C 10 0.555327956422522 2.65777212481276e-05 ENSG00000147138:ENST00000276077:exon_78426469_78427726:GPR174 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 100265552 T/A 0 0 10 10 0 5.55327956422522 -5.55327956422522 A T A 10 0.555327956422522 0.000302272239171608 ENSG00000188917:ENST00000490509:exon_100265374_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000372939:exon_100264339_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000372935:exon_100264531_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000372936:exon_100264531_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000338687:exon_100264548_100265696:TRMT2B HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 100608191 G/A 0 0 95 95 0 52.7561558601396 -52.7561558601396 A G A 10 0.555327956422522 3.66254947789099e-34 ENSG00000010671:ENST00000372880:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372869:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372855:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372859:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372860:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000395179:exon_100608182_100608203:BTK;ENSG00000010671:ENST00000308731:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000443591:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000470069:exon_100608031_100608339:BTK HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 102842041 T/C 1 2 299 301 0.889344087154956 166.043058970334 -165.153714883179 T:C T C 10 0.555327956422522 8.12799149725458e-102 ENSG00000133142:ENST00000372629:exon_102841577_102842446:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000414064:exon_102841578_102842653:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000468024:exon_102841577_102842446:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000472484:exon_102841577_102842657:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000415568:exon_102841582_102842430:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000472745:exon_102841577_102842622:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000494801:exon_102841582_102842454:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000452632:exon_102841878_102842251:TCEAL4 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 117521338 G/A 0 0 9 9 0 4.9979516078027 -4.9979516078027 A G A 10 0.555327956422522 0.00067976443209644 ENSG00000131725:ENST00000435384:exon_117521303_117521377:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000254029:exon_117521303_117521377:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371822:exon_117521303_117521377:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371825:exon_117521303_117521377:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000534809:exon_117521303_117521377:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000493448:exon_117521303_117521377:WDR44 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 117527020 C/T 0 14 0 14 6.22540861008469 0 6.22540861008469 C C 10 0.555327956422522 0.000483722581978021 ENSG00000131725:ENST00000435384:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000254029:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371822:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371825:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000534809:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000493448:exon_117526595_117527178:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000446173:exon_117526592_117527238:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371848:exon_117526711_117527234:WDR44 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 117528056 G/A 0 0 10 10 0 5.55327956422522 -5.55327956422522 A G A 10 0.555327956422522 0.000302272239171608 ENSG00000131725:ENST00000435384:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000254029:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371822:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371825:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000534809:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000446173:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371848:exon_117528018_117528148:WDR44 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 117731469 A/G 0 0 11 11 0 6.10860752064774 -6.10860752064774 T:G A G 10 0.555327956422522 0.000134412014309179 ENSG00000147251:ENST00000276204:exon_117731394_117731515:DOCK11;ENSG00000147251:ENST00000276202:exon_117731394_117731515:DOCK11 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 118893137 T/C 0 0 13 13 0 7.21926343349279 -7.21926343349279 C T C 10 0.555327956422522 2.65777212481276e-05 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 118893413 T/C 0 0 13 13 0 7.21926343349279 -7.21926343349279 C T C 10 0.555327956422522 2.65777212481276e-05 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 119590533 T/A 0 0 43 43 0 23.8791021261684 -23.8791021261684 A T A 10 0.555327956422522 7.34027839508526e-16 ENSG00000005893:ENST00000434600:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000200639:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371335:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371345:exon_119590506_119590624:LAMP2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 123034511 A/C 0 0 28 28 0 15.5491827798306 -15.5491827798306 C A C 10 0.555327956422522 1.39673860499461e-10 ENSG00000101966:ENST00000481776:exon_123034343_123034543:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000468691:exon_123034343_123034543:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000371199:exon_123034343_123034543:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000434753:exon_123034343_123034543:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000497640:exon_123034343_123034543:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000355640:exon_123034343_123034543:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000531762:exon_123034343_123034543:XIAP HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 123041043 A/G 0 19 0 19 8.44876882797208 0 8.44876882797208 A A 10 0.555327956422522 1.90910826542979e-05 ENSG00000101966:ENST00000468691:exon_123040838_123041101:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000371199:exon_123040838_123047829:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000434753:exon_123040838_123047829:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000355640:exon_123040838_123047815:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000531762:exon_123040838_123047815:XIAP HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 129283520 A/G 0 0 41 41 0 22.7684462133234 -22.7684462133234 G A G 10 0.555327956422522 3.71221293000454e-15 ENSG00000156709:ENST00000416073:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000527892:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000319908:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000287295:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000529877:exon_129283444_129283543:AIFM1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 134185997 T/A 0 0 27 27 0 14.9938548234081 -14.9938548234081 A T A 10 0.555327956422522 3.14105333395273e-10 ENSG00000203950:ENST00000518153:exon_134185947_134186120:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000370775:exon_134184962_134186205:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000520964:exon_134185947_134186226:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000522309:exon_134185947_134186171:FAM127B HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 134713861 C/T 0 33 0 33 14.6741774380568 0 14.6741774380568 C C 10 0.555327956422522 5.81872404127349e-09 ENSG00000165359:ENST00000370752:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000481908:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000356856:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000493637:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000494957:exon_134713810_134714087:DDX26B HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 149983351 C/T 0 20 0 20 8.89344087154956 0 8.89344087154956 C C 10 0.555327956422522 1.01536764622924e-05 ENSG00000102181:ENST00000370377:exon_149983335_149983409:CD99L2;ENSG00000102181:ENST00000346693:exon_149983335_149983409:CD99L2;ENSG00000102181:ENST00000438086:exon_149983335_149983409:CD99L2;ENSG00000102181:ENST00000437787:exon_149983335_149983409:CD99L2;ENSG00000102181:ENST00000355330:exon_149983335_149983409:CD99L2;ENSG00000102181:ENST00000419771:exon_149983335_149983409:CD99L2;ENSG00000102181:ENST00000418547:exon_149983335_149983409:CD99L2 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 153215746 G/A 1 1 91 92 0.444672043577478 50.5348440344495 -50.090171990872 A:G G A 10 0.555327956422522 4.82753199838145e-31 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153215694_153215994:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000444191:exon_153215694_153215994:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153215694_153215994:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153215694_153215994:HCFC1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 153278668 C/T 0 97 0 97 43.1331882270154 0 43.1331882270154 C C 10 0.555327956422522 1.81267630855563e-25 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393682:exon_153278494_153278794:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000444254:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000437278:exon_153278494_153278794:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393687:exon_153278494_153278794:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000429936:exon_153278494_153278794:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000443220:exon_153278494_153278884:IRAK1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 153579448 A/G 0 16 0 16 7.11475269723965 0 7.11475269723965 A A 10 0.555327956422522 0.000130838913231159 ENSG00000196924:ENST00000490936:exon_153578399_153580064:FLNA HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 153631033 G/T 0 0 51 51 0 28.3217257775486 -28.3217257775486 T G T 10 0.555327956422522 1.12209891463427e-18 ENSG00000013563:ENST00000393638:exon_153629579_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369809:exon_153629579_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000014935:exon_153630099_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369808:exon_153630099_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369807:exon_153630099_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000309585:exon_153630102_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000497242:exon_153630828_153631531:DNASE1L1 HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 153678182 G/T 1 1 22 23 0.444672043577478 12.2172150412955 -11.772542997718 T:G G T 10 0.555327956422522 2.38789999682464e-07 ENSG00000071859:ENST00000464419:exon_153678029_153678279:FAM50A HGDP00721_parsed_pileup.txt . X 154507173 T/G 0 10 0 10 4.44672043577478 0 4.44672043577478 T T 10 0.555327956422522 0.00309157318156107 ENSG00000155962:ENST00000369449:exon_154505500_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000422096:exon_154505526_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000360485:exon_154505526_154507353:CLIC2