INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 900505 G/C 1 13 11 24 6.05034299985822 5.88047900011997 0.169863999738255 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_900343_901095:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_900343_901095:KLHL17 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 949608 G/A 1 1534 2064 3598 713.94047398327 1103.39169602251 -389.45122203924 A:T:G G A 10 0.534589000010906 1.21253988935284e-38 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 984302 T/C 1 13 16 29 6.05034299985822 8.5534240001745 -2.50308100031627 T:C T C 10 0.534589000010906 0.359545966755733 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_984247_984439:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_984247_984439:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000492947:exon_983909_984439:AGRN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 1390875 C/T 0 28 0 28 13.0315079996946 0 13.0315079996946 C C 10 0.534589000010906 4.08399156522524e-08 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000475091:exon_1390840_1390899:ATAD3C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 1430985 C/T 1 54 55 109 25.1321939994111 29.4023950005998 -4.27020100118876 T:C C T 10 0.534589000010906 0.442908673542125 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 84 107 191 39.0945239990839 57.2010230011669 -18.1064990020831 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00898683472109454 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 1551927 T/C 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 T:C T C 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000477990:exon_1551888_1554590:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514363:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000502470:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507082:exon_1551888_1553278:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000463492:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000510793:exon_1551654_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1551690_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1551691_1551994:MIB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 48 24 72 22.3397279994765 12.8301360002617 9.50959199921476 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0249948234174673 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 1686040 G/T 1 21 43 64 9.77363099977097 22.987327000469 -13.213696000698 T:G G T 10 0.534589000010906 0.00101708718298984 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000469045:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000480499:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497747:exon_1685983_1686305:NADK;ENSG00000008130:ENST00000477235:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000489538:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497615:exon_1685983_1686335:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497186:exon_1685983_1686137:NADK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 7909737 C/T 0 0 29 29 0 15.5030810003163 -15.5030810003163 T C T 10 0.534589000010906 2.32949973319805e-10 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000400910:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000361696:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7909700_7909743:UTS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 9107759 T/C 1 20 7 27 9.30821999978188 3.74212300007634 5.56609699970554 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0341948678425046 ENSG00000142583:ENST00000377424:exon_9107669_9107793:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000377414:exon_9107669_9107793:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000474145:exon_9107669_9107793:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000484798:exon_9107669_9107793:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000479813:exon_9107669_9107793:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000486632:exon_9107669_9107793:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000461296:exon_9107669_9107788:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000487835:exon_9107669_9107793:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000464985:exon_9107670_9107793:SLC2A5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 9324213 C/T 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 T:C C T 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 9324571 T/C 1 8 3 11 3.72328799991275 1.60376700003272 2.11952099988003 T:C T C 10 0.534589000010906 0.238841320527235 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 9324670 A/G 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 A:G A G 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 17 9 26 7.9119869998146 4.81130100009815 3.10068599971644 A:G G A 10 0.534589000010906 0.243968304911115 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 13 9 22 6.05034299985822 4.81130100009815 1.23904199976007 A:G A G 10 0.534589000010906 0.672470686731093 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 16 26 42 7.4465759998255 13.8993140002836 -6.45273800045805 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0621618267203255 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 43 37 80 20.012672999531 19.7797930004035 0.232879999127519 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 15894288 C/T 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 0.529760851175976 ENSG00000116138:ENST00000375847:exon_15894273_15898228:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000475133:exon_15894273_15898228:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000483270:exon_15894273_15894730:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000490811:exon_15894273_15894556:DNAJC16 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 16056364 G/A 1 21 20 41 9.77363099977097 10.6917800002181 -0.918149000447148 A:G G A 10 0.534589000010906 0.875862115158315 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16056340_16056424:PLEKHM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 17314702 C/T 1 18 11 29 8.37739799980369 5.88047900011997 2.49691899968372 T:C C T 10 0.534589000010906 0.457180957633404 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314633_17314729:ATP13A2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 19422060 G/A 1 14 13 27 6.51575399984732 6.94965700014178 -0.433903000294463 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000467272:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000483922:exon_19422039_19422416:UBR4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 19584004 G/A 1 49 69 118 22.8051389994656 36.8866410007525 -14.0815020012869 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00974044461379605 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 19585207 G/A 1 150 138 288 69.8116499983641 73.773282001505 -3.96163200314095 A:G G A 10 0.534589000010906 0.679334106771267 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19585175_19586622:MRTO4;ENSG00000053372:ENST00000479559:exon_19585175_19585233:MRTO4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 20977221 A/T 1 15 15 30 6.98116499983641 8.01883500016359 -1.03767000032718 A:T A T 10 0.534589000010906 0.718295138743325 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 20978832 T/C 1 306 328 634 142.415765996663 175.345192003577 -32.9294260069144 A:T:C T C 10 0.534589000010906 0.00961066146511182 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20978270_20979021:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20978685_20979021:DDOST HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 96 98 194 44.679455998953 52.3897220010688 -7.71026600211577 A:G G A 10 0.534589000010906 0.280675686070768 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 22149935 T/C 1 7 10 17 3.25787699992366 5.34589000010906 -2.0880130001854 T:C T C 10 0.534589000010906 0.339484157804598 ENSG00000187942:ENST00000344642:exon_22148695_22151714:LDLRAD2;ENSG00000142798:ENST00000486901:exon_22148738_22149981:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000374695:exon_22148738_22149981:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000457597:exon_22148738_22149981:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000481644:exon_22149794_22149981:HSPG2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 22852904 G/A 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000184677:ENST00000374651:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000404138:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000375647:exon_22852695_22857647:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000374649:exon_22852695_22857647:ZBTB40 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 23418153 C/T 0 9 0 9 4.18869899990185 0 4.18869899990185 C C 10 0.534589000010906 0.00459053241595814 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 23419261 G/A 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:G G A 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 23419855 T/C 1 6 8 14 2.79246599993456 4.27671200008725 -1.48424600015268 T:C T C 10 0.534589000010906 0.437971150157616 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 23885498 T/C 1 159 125 284 74.0003489982659 66.8236250013633 7.17672399690268 T:C T C 10 0.534589000010906 0.405436622682455 ENSG00000117318:ENST00000374561:exon_23885426_23885510:ID3;ENSG00000117318:ENST00000463312:exon_23885426_23885566:ID3;ENSG00000117318:ENST00000486541:exon_23884936_23885510:ID3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 23885599 T/C 1 1 7 8 0.465410999989094 3.74212300007634 -3.27671200008725 T:C T C 10 0.534589000010906 0.029100529378057 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 34 24 58 15.8239739996292 12.8301360002617 2.99383799936745 T:C C T 10 0.534589000010906 0.510834559517571 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 24180962 T/C 1 16 6 22 7.4465759998255 3.20753400006544 4.23904199976007 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0869907781611442 ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24180850_24181050:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24180850_24181050:FUCA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 37 10 47 17.2202069995965 5.34589000010906 11.8743169994874 T:C T C 10 0.534589000010906 0.000601771077686591 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 40 14 54 18.6164399995638 7.48424600015268 11.1321939994111 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0024437601959535 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 24201094 G/C 1 24 27 51 11.1698639997383 14.4339030002945 -3.26403900055621 C:G G C 10 0.534589000010906 0.400719178000423 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 24201109 C/T 1 30 23 53 13.9623299996728 12.2955470002508 1.66678299942198 T:C C T 10 0.534589000010906 0.681469234855748 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 25 14 39 11.6352749997273 7.48424600015268 4.15102899957466 A:G A G 10 0.534589000010906 0.201572301274183 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 24201357 A/G 1 17 11 28 7.9119869998146 5.88047900011997 2.03150799969463 A:G A G 10 0.534589000010906 0.457094536572337 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 24201448 C/T 1 30 16 46 13.9623299996728 8.5534240001745 5.40890599949832 T:C C T 10 0.534589000010906 0.138733340148781 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 17 18 35 7.9119869998146 9.62260200019631 -1.71061500038171 A:G G A 10 0.534589000010906 0.613212152222237 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 24201919 T/C 1 21 13 34 9.77363099977097 6.94965700014178 2.82397399962919 T:C T C 10 0.534589000010906 0.391503232273528 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 24201920 T/C 1 21 14 35 9.77363099977097 7.48424600015268 2.28938499961829 T:C T C 10 0.534589000010906 0.499913952744214 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 25889632 T/C 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000157978:ENST00000374338:exon_25889561_25889644:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000488127:exon_25889561_25889644:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000484476:exon_25889307_25889644:LDLRAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 25890189 A/G 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000157978:ENST00000374338:exon_25890152_25890282:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000488127:exon_25890152_25891698:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000484476:exon_25890152_25890282:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000474283:exon_25890125_25890282:LDLRAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 26610891 A/C 1 17 17 34 7.9119869998146 9.0880130001854 -1.1760260003708 A:C A C 10 0.534589000010906 0.732812837731546 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26610853_26612032:UBXN11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 26644537 C/A 1 1492 1356 2848 694.393211983728 724.902684014789 -30.5094720310605 A:C C A 10 0.534589000010906 0.251955476224889 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26644448_26644562:CD52;ENSG00000169442:ENST00000492808:exon_26644449_26644562:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26644449_26644562:CD52 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 721 630 1351 335.561330992137 336.791070006871 -1.22973901473409 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.956508265231774 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 729 622 1351 339.28461899205 332.514358006784 6.77026098526596 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.722980375664839 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 7 12 19 3.25787699992366 6.41506800013087 -3.15719100020722 A:G G A 10 0.534589000010906 0.170892403910016 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 26883511 A/C 1 21 10 31 9.77363099977097 5.34589000010906 4.42774099966191 A:C A C 10 0.534589000010906 0.148782810912363 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000488985:exon_26883489_26883527:RPS6KA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 17 32 49 7.9119869998146 17.106848000349 -9.1948610005344 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0095914836350599 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 26900735 C/G 1 54 44 98 25.1321939994111 23.5219160004799 1.61027799893121 C:G C G 10 0.534589000010906 0.762321567340293 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 28206588 T/C 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 T:C T C 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 28562676 A/G 1 417 441 858 194.076386995452 235.75374900481 -41.6773620093574 A:C:G A G 10 0.534589000010906 0.00449192514016088 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28562620_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000417632:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000335514:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000468425:exon_28562653_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562665_28562781:ATPIF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 28564252 A/G 1 11 15 26 5.11952099988003 8.01883500016359 -2.89931400028356 A:G A G 10 0.534589000010906 0.325953144749333 ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 28564279 A/G 1 24 15 39 11.1698639997383 8.01883500016359 3.15102899957466 A:G A G 10 0.534589000010906 0.339042124161351 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28564272_28564616:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 31426815 A/G 1 34 22 56 15.8239739996292 11.7609580002399 4.06301599938926 A:G A G 10 0.534589000010906 0.287408492033131 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 32557486 A/G 1 13 14 27 6.05034299985822 7.48424600015268 -1.43390300029446 A:G A G 10 0.534589000010906 0.700429126790904 ENSG00000121775:ENST00000487305:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000336294:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000456834:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373633:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373634:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000441402:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000472503:exon_32557276_32557610:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000468135:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000427288:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000476968:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000498613:exon_32557276_32557612:TMEM39B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 32672908 T/G 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 T:G T G 10 0.534589000010906 0.156883047615629 ENSG00000160051:ENST00000291358:exon_32672841_32674288:IQCC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 32672932 G/A 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000160051:ENST00000291358:exon_32672841_32674288:IQCC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 32696628 A/C 1 1 8 9 0.465410999989094 4.27671200008725 -3.81130100009815 A:C A C 10 0.534589000010906 0.0151819886668037 ENSG00000084623:ENST00000474371:exon_32696528_32696655:EIF3I HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 32740366 G/A 1 81 52 133 37.6982909991166 27.7986280005671 9.89966299854949 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.098327320540787 ENSG00000182866:ENST00000336890:exon_32740338_32740419:LCK;ENSG00000182866:ENST00000482949:exon_32740338_32740684:LCK;ENSG00000182866:ENST00000495610:exon_32740338_32740419:LCK;ENSG00000182866:ENST00000355928:exon_32740338_32740856:LCK;ENSG00000182866:ENST00000476457:exon_32740338_32740419:LCK;ENSG00000182866:ENST00000469765:exon_32740338_32740419:LCK;ENSG00000182866:ENST00000398345:exon_32740338_32740419:LCK;ENSG00000182866:ENST00000373564:exon_32740338_32740684:LCK;ENSG00000182866:ENST00000461712:exon_32740338_32740679:LCK;ENSG00000182866:ENST00000373562:exon_32740338_32740419:LCK;ENSG00000182866:ENST00000477031:exon_32740338_32740603:LCK;ENSG00000182866:ENST00000373557:exon_32740338_32740419:LCK;ENSG00000182866:ENST00000333070:exon_32740338_32740419:LCK;ENSG00000182866:ENST00000436824:exon_32740338_32740419:LCK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 33099637 A/G 1 48 25 73 22.3397279994765 13.3647250002727 8.97500299920386 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0453461745333141 ENSG00000176261:ENST00000468695:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373506:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473294:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000478041:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000436661:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000498691:exon_33099552_33099662:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373501:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000476493:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000465588:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000483138:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000479075:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473383:exon_33099552_33100123:ZBTB8OS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 33409693 G/A 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 A:G G A 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000116514:ENST00000373456:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000401899:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000356990:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000405457:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000235150:exon_33409620_33409760:RNF19B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 38148765 A/G 1 14 7 21 6.51575399984732 3.74212300007634 2.77363099977097 A:G A G 10 0.534589000010906 0.276590217785206 ENSG00000116922:ENST00000358011:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000494120:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000464178:exon_38148408_38148832:C1orf109 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 39854066 A/G 1 6 9 15 2.79246599993456 4.81130100009815 -2.01883500016359 A:G A G 10 0.534589000010906 0.313814139216668 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39852859_39854330:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39852859_39854330:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39852859_39854330:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39852859_39854330:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39852859_39854330:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39852859_39854330:MACF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 40363054 G/C 1 9 13 22 4.18869899990185 6.94965700014178 -2.76095800023993 C:G G C 10 0.534589000010906 0.287120525503420 ENSG00000116990:ENST00000397332:exon_40361098_40363642:MYCL1;ENSG00000116990:ENST00000334282:exon_40361105_40363642:MYCL1;ENSG00000116990:ENST00000372816:exon_40362899_40363642:MYCL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 40431602 G/A 1 5 12 17 2.32705499994547 6.41506800013087 -4.0880130001854 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0535258720090529 ENSG00000168389:ENST00000372811:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000450641:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000434861:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000420632:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000372809:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000525305:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000483824:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000412699:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000469745:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000480630:exon_40431529_40431686:MFSD2A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 40768344 C/T 1 28 24 52 13.0315079996946 12.8301360002617 0.201371999432885 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000466267:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000427563:exon_40768293_40768481:COL9A2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 40961449 T/C 1 12 7 19 5.58493199986913 3.74212300007634 1.84280899979278 T:C T C 10 0.534589000010906 0.492933071348704 ENSG00000187815:ENST00000372706:exon_40960593_40962015:ZNF642;ENSG00000187815:ENST00000372705:exon_40960593_40961960:ZNF642 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 40981230 G/A 1 19 25 44 8.84280899979279 13.3647250002727 -4.52191600047987 A:G G A 10 0.534589000010906 0.177359294183873 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 41013015 C/T 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000117010:ENST00000372699:exon_41012234_41013841:ZNF684;ENSG00000117010:ENST00000493756:exon_41012234_41013457:ZNF684 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 12 6 18 5.58493199986913 3.20753400006544 2.37739799980369 T:C C T 10 0.534589000010906 0.34614898565578 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 41493811 C/T 1 8 18 26 3.72328799991275 9.62260200019631 -5.89931400028356 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0287356442755983 ENSG00000010803:ENST00000372597:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372596:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000337495:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372595:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000326197:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361191:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361705:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397174:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397171:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000456518:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000402904:exon_41492877_41493991:SCMH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 42045747 T/C 1 9 11 20 4.18869899990185 5.88047900011997 -1.69178000021812 T:C T C 10 0.534589000010906 0.505607767076301 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_42045408_42050989:HIVEP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 42047782 A/T 1 8 2 10 3.72328799991275 1.06917800002181 2.65410999989094 A:T A T 10 0.534589000010906 0.117787000476102 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_42045408_42050989:HIVEP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 42922623 T/G 1 14 10 24 6.51575399984732 5.34589000010906 1.16986399973826 T:G T G 10 0.534589000010906 0.686499461842995 ENSG00000127125:ENST00000372560:exon_42922210_42922744:PPCS;ENSG00000127125:ENST00000472013:exon_42922215_42923021:PPCS;ENSG00000127125:ENST00000435501:exon_42922215_42922744:PPCS;ENSG00000127125:ENST00000372561:exon_42922230_42922744:PPCS;ENSG00000127125:ENST00000471420:exon_42922472_42922744:PPCS;ENSG00000127125:ENST00000466871:exon_42922614_42922744:PPCS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 43408966 G/A 1 7 9 16 3.25787699992366 4.81130100009815 -1.5534240001745 A:G G A 10 0.534589000010906 0.462907821628628 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000415851:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43408897_43408992:SLC2A1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 43825644 T/C 1 30 15 45 13.9623299996728 8.01883500016359 5.94349499950923 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0991977403805154 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000478882:exon_43825438_43825768:CDC20 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 43917637 G/A 1 20 28 48 9.30821999978188 14.9684920003054 -5.66027200052349 A:G G A 10 0.534589000010906 0.112206174593263 ENSG00000198198:ENST00000372442:exon_43916008_43918304:KIAA0467;ENSG00000198198:ENST00000460536:exon_43916008_43918321:KIAA0467;ENSG00000178922:ENST00000372433:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372434:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000470662:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000487366:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372430:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372432:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372427:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372425:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000403034:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372426:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000486909:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000496142:exon_43917606_43917890:HYI HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 43919413 A/G 0 0 26 26 0 13.8993140002836 -13.8993140002836 G A G 10 0.534589000010906 2.31074878937358e-09 ENSG00000178922:ENST00000372434:exon_43919266_43919496:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372432:exon_43919266_43919634:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372427:exon_43917876_43919580:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372425:exon_43919266_43919464:HYI;ENSG00000178922:ENST00000486909:exon_43919266_43919519:HYI;ENSG00000178922:ENST00000469587:exon_43919266_43919479:HYI HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 44071221 G/A 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000142949:ENST00000359947:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000438120:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372413:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372414:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372412:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000422171:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000412568:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000429895:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000414879:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372407:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000496447:exon_44071200_44071293:PTPRF HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 44086831 C/T 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:C C T 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000142949:ENST00000359947:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000438120:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372413:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372414:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372412:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000422171:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000412568:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000429895:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000414879:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372407:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000496447:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000477970:exon_44086768_44086903:PTPRF HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 44137257 C/A 1 13 5 18 6.05034299985822 2.67294500005453 3.37739799980369 A:C C A 10 0.534589000010906 0.155238770669501 ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44137176_44137546:KDM4A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 45224901 G/A 1 15 25 40 6.98116499983641 13.3647250002727 -6.38356000043624 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0559839531778444 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45224878_45225020:KIF2C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 46660295 T/C 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000085998:ENST00000371984:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371992:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000396420:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371986:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000477114:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000497439:exon_46660254_46660323:POMGNT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 11 12 23 5.11952099988003 6.41506800013087 -1.29554700025084 A:G A G 10 0.534589000010906 0.677644254347807 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 17 21 38 7.9119869998146 11.226369000229 -3.31438200041443 A:G A G 10 0.534589000010906 0.329957108100267 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 53712727 C/T 1 11 18 29 5.11952099988003 9.62260200019631 -4.50308100031628 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0977801092175839 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53711217_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53712628_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53712225_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53712240_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53712240_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53712630_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53712690_53712728:LRP8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 55319902 A/G 1 24 39 63 11.1698639997383 20.8489710004253 -9.67910700068708 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0161568556834453 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 58992957 T/A 1 10 22 32 4.65410999989094 11.7609580002399 -7.10684800034899 A:T T A 10 0.534589000010906 0.0129214179938467 ENSG00000173406:ENST00000485760:exon_58992933_58993007:DAB1;ENSG00000162600:ENST00000467509:exon_58992933_58993007:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58992933_58993007:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58992933_58993007:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58992933_58993007:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000476933:exon_58992933_58993007:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_58992933_58993007:OMA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 62579907 C/T 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 63284830 G/A 1 13 9 22 6.05034299985822 4.81130100009815 1.23904199976007 A:G G A 10 0.534589000010906 0.672470686731093 ENSG00000125703:ENST00000317868:exon_63284676_63285006:ATG4C;ENSG00000125703:ENST00000371120:exon_63284676_63285006:ATG4C;ENSG00000125703:ENST00000371118:exon_63284676_63284850:ATG4C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 64114301 T/C 1 13 17 30 6.05034299985822 9.0880130001854 -3.03767000032718 T:C T C 10 0.534589000010906 0.27812385936588 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64114188_64114323:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64114188_64114323:PGM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 65310489 T/C 1 12 3 15 5.58493199986913 1.60376700003272 3.98116499983641 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0663369253246265 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65310437_65310572:JAK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 65311262 G/A 1 11 8 19 5.11952099988003 4.27671200008725 0.842808999792785 A:G G A 10 0.534589000010906 0.819574245361162 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 68960349 T/C 1 8 2 10 3.72328799991275 1.06917800002181 2.65410999989094 T:C T C 10 0.534589000010906 0.117787000476102 ENSG00000024526:ENST00000456315:exon_68960113_68960378:DEPDC1;ENSG00000024526:ENST00000370966:exon_68960113_68960378:DEPDC1;ENSG00000024526:ENST00000370962:exon_68960113_68960378:DEPDC1;ENSG00000024526:ENST00000370964:exon_68960113_68960378:DEPDC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 70654835 G/C 1 2 8 10 0.930821999978188 4.27671200008725 -3.34589000010906 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0527671529214564 ENSG00000066557:ENST00000370952:exon_70654775_70654956:LRRC40 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 70904800 G/T 1 21 13 34 9.77363099977097 6.94965700014178 2.82397399962919 T:G G T 10 0.534589000010906 0.391503232273528 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70904784_70905253:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70904784_70905252:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70904784_70904887:CTH;ENSG00000116761:ENST00000482383:exon_70904784_70904915:CTH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 74648408 C/T 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000162620:ENST00000395089:exon_74648222_74648545:LRRIQ3;ENSG00000162620:ENST00000354431:exon_74648222_74648545:LRRIQ3;ENSG00000162620:ENST00000415760:exon_74648222_74648545:LRRIQ3;ENSG00000162620:ENST00000388972:exon_74648222_74648545:LRRIQ3;ENSG00000162620:ENST00000370911:exon_74648222_74648545:LRRIQ3;ENSG00000162620:ENST00000463724:exon_74645907_74649368:LRRIQ3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 74670172 A/G 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 A:G A G 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000254685:ENST00000467578:exon_74670075_74670277:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000482102:exon_74670075_74670175:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370898:exon_74670075_74672918:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000472069:exon_74670075_74670261:FPGT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 76257892 A/T 1 45 39 84 20.9434949995092 20.8489710004253 0.09452399908389 A:T A T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000137955:ENST00000496055:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000319942:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000370824:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000485459:exon_76257866_76257939:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000470201:exon_76257866_76257971:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000471759:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000491266:exon_76257866_76257987:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000461653:exon_76257866_76257935:RABGGTB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 78098403 T/C 1 8 12 20 3.72328799991275 6.41506800013087 -2.69178000021812 T:C T C 10 0.534589000010906 0.265898160963149 ENSG00000036549:ENST00000370801:exon_78097535_78099090:ZZZ3;ENSG00000036549:ENST00000476275:exon_78097535_78098561:ZZZ3;ENSG00000036549:ENST00000420374:exon_78097535_78099090:ZZZ3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 85724328 C/T 1 18 21 39 8.37739799980369 11.226369000229 -2.84897100042534 T:C C T 10 0.534589000010906 0.422955267397017 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 85742012 G/C 1 18 13 31 8.37739799980369 6.94965700014178 1.42774099966191 C:G G C 10 0.534589000010906 0.719634139084765 ENSG00000142867:ENST00000394761:exon_85741979_85742480:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000370580:exon_85741979_85742773:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000271015:exon_85741979_85742479:BCL10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 86847955 G/A 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000480440:exon_86847625_86848041:ODF2L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 89237556 C/T 0 8 0 8 3.72328799991275 0 3.72328799991275 C C 10 0.534589000010906 0.00887189752631728 ENSG00000065243:ENST00000370521:exon_89237346_89237562:PKN2;ENSG00000065243:ENST00000316005:exon_89237346_89237562:PKN2;ENSG00000065243:ENST00000370505:exon_89237346_89237562:PKN2;ENSG00000065243:ENST00000370513:exon_89237346_89237562:PKN2;ENSG00000065243:ENST00000436111:exon_89237346_89237562:PKN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 89426902 G/A 1 26 24 50 12.1006859997164 12.8301360002617 -0.729450000545302 A:G G A 10 0.534589000010906 0.887699691641646 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 89522646 G/C 1 11 2 13 5.11952099988003 1.06917800002181 4.05034299985822 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0265185322124304 ENSG00000117228:ENST00000422952:exon_89522537_89522728:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89522537_89522817:GBP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 90179532 A/G 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 A:G A G 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000171488:ENST00000370454:exon_90178268_90185092:LRRC8C;ENSG00000171488:ENST00000529501:exon_90178268_90185092:LRRC8C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 93306317 G/A 1 13 13 26 6.05034299985822 6.94965700014178 -0.899314000283557 A:G G A 10 0.534589000010906 0.84469204921112 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 93306355 A/C 1 13 10 23 6.05034299985822 5.34589000010906 0.704452999749162 A:C A C 10 0.534589000010906 0.836527371779212 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 93646300 C/T 1 5 7 12 2.32705499994547 3.74212300007634 -1.41506800013087 T:C C T 10 0.534589000010906 0.565015885912817 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000448243:exon_93646273_93646409:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 93646433 T/C 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 T:C T C 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 93826178 A/T 1 26 25 51 12.1006859997164 13.3647250002727 -1.26403900055621 A:T A T 10 0.534589000010906 0.779586606565027 ENSG00000117505:ENST00000370272:exon_93826050_93828149:DR1;ENSG00000117505:ENST00000370267:exon_93826050_93826725:DR1;ENSG00000117505:ENST00000481583:exon_93826050_93826492:DR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 42 35 77 19.5472619995419 18.7106150003817 0.836646999160234 A:G A G 10 0.534589000010906 0.909240543679975 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 94342564 C/A 1 183 129 312 85.1702129980042 68.9619810014069 16.2082319965973 A:C C A 10 0.534589000010906 0.0693473555781172 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 94343023 A/G 1 130 136 266 60.5034299985822 72.7041040014832 -12.200674002901 A:G A G 10 0.534589000010906 0.140296832798811 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 94344716 C/T 1 35 19 54 16.2893849996183 10.1571910002072 6.13219399941107 T:C C T 10 0.534589000010906 0.102518816009108 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94344633_94344762:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94344633_94344718:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94344104_94345474:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94344633_94344720:DNTTIP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 100361925 G/A 1 3 9 12 1.39623299996728 4.81130100009815 -3.41506800013087 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0784465209153547 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100361842_100361944:AGL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 101705191 C/T 1 8 4 12 3.72328799991275 2.13835600004362 1.58493199986913 T:C C T 10 0.534589000010906 0.401454124777931 ENSG00000170989:ENST00000305352:exon_101704378_101707074:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000424264:exon_101704378_101705491:S1PR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 109351501 A/G 1 31 20 51 14.4277409996619 10.6917800002181 3.73596099944379 A:G A G 10 0.534589000010906 0.327432269345011 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109351405_109352148:STXBP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 110466338 C/A 1 16 17 33 7.4465759998255 9.0880130001854 -1.6414370003599 A:C C A 10 0.534589000010906 0.603642096692231 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 110466466 T/C 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 T:C T C 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 110466555 G/A 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 A:G G A 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 A:C C A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 110581321 G/A 1 6 12 18 2.79246599993456 6.41506800013087 -3.62260200019631 A:G G A 10 0.534589000010906 0.100748004668825 ENSG00000143093:ENST00000369796:exon_110581305_110581379:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000369795:exon_110581305_110581379:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000369794:exon_110581305_110581379:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000485775:exon_110581305_110581379:FAM40A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 110883569 A/T 1 11 5 16 5.11952099988003 2.67294500005453 2.4465759998255 A:T A T 10 0.534589000010906 0.316657798068879 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 110888948 G/A 1 62 54 116 28.8554819993238 28.8678060005889 -0.0123240012650996 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110888930_110889299:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110888930_110889299:RBM15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 582 469 1051 270.869201993653 250.722241005115 20.1469609885377 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.216260561868253 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 111726869 G/A 1 107 77 184 49.7989769988331 41.1633530008398 8.63562399799329 A:G G A 10 0.534589000010906 0.209617811736241 ENSG00000134255:ENST00000498239:exon_111726813_111727430:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000357172:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000478042:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000473474:exon_111726813_111726953:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000467362:exon_111726813_111727722:CEPT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 112308953 T/C 1 44 30 74 20.4780839995201 16.0376700003272 4.44041399919295 T:C T C 10 0.534589000010906 0.351387901906217 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 112308972 G/A 1 45 34 79 20.9434949995092 18.1760260003708 2.76746899913842 A:G G A 10 0.534589000010906 0.573774950022519 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 113197203 A/G 1 30 20 50 13.9623299996728 10.6917800002181 3.2705499994547 A:G A G 10 0.534589000010906 0.396471196309824 ENSG00000116489:ENST00000263168:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000393426:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000498626:exon_113197087_113197293:CAPZA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 113236681 C/T 1 14 17 31 6.51575399984732 9.0880130001854 -2.57225900033809 T:C C T 10 0.534589000010906 0.373247092552356 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113236527_113236794:MOV10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 113237171 A/G 1 21 16 37 9.77363099977097 8.5534240001745 1.22020699959648 A:G A G 10 0.534589000010906 0.743525615581831 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 113239382 G/A 1 44 45 89 20.4780839995201 24.0565050004908 -3.57842100097064 A:G G A 10 0.534589000010906 0.458756957900750 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113239361_113239468:MOV10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 40 37 77 18.6164399995638 19.7797930004035 -1.16335300083976 A:T:C T C 10 0.534589000010906 0.819883566120428 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 92 78 170 42.8178119989966 41.6979420008507 1.11986999814597 T:C C T 10 0.534589000010906 0.878100268649682 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 113456546 A/T 1 72 59 131 33.5095919992148 31.5407510006435 1.96884099857131 A:T A T 10 0.534589000010906 0.792882445470753 ENSG00000155380:ENST00000369626:exon_113454469_113456787:SLC16A1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 114397608 T/C 1 11 8 19 5.11952099988003 4.27671200008725 0.842808999792785 T:C T C 10 0.534589000010906 0.819574245361162 ENSG00000134242:ENST00000359785:exon_114397529_114397671:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000528414:exon_114397529_114397671:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000420377:exon_114397529_114397671:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000484147:exon_114397529_114397671:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000354605:exon_114397529_114397671:PTPN22 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 117626781 G/A 1 10 12 22 4.65410999989094 6.41506800013087 -1.76095800023993 A:G G A 10 0.534589000010906 0.524043562584602 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117626640_117626790:TTF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 144930940 T/C 0 8 0 8 3.72328799991275 0 3.72328799991275 T T 10 0.534589000010906 0.00887189752631728 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 144931330 C/T 0 8 0 8 3.72328799991275 0 3.72328799991275 C C 10 0.534589000010906 0.00887189752631728 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 0 0 43 43 0 22.987327000469 -22.987327000469 A G A 10 0.534589000010906 5.2116552051287e-15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 53 53 0 28.333217000578 -28.333217000578 C T C 10 0.534589000010906 2.48508994401847e-18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 32 32 0 17.106848000349 -17.106848000349 T G T 10 0.534589000010906 2.34840283458112e-11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 38 38 0 20.3143820004144 -20.3143820004144 A C A 10 0.534589000010906 2.38667045887047e-13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 75 0 75 34.905824999182 0 34.905824999182 G G 10 0.534589000010906 4.45362744388504e-21 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 49 49 0 26.1948610005344 -26.1948610005344 C:G T C 10 0.534589000010906 5.29658001461145e-17 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 87 87 0 46.5092430009488 -46.5092430009488 T C T 10 0.534589000010906 1.2641191053917e-29 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 146740502 C/G 1 13 9 22 6.05034299985822 4.81130100009815 1.23904199976007 C:G C G 10 0.534589000010906 0.672470686731093 ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146740441_146740537:CHD1L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 149858575 G/A 1 7 8 15 3.25787699992366 4.27671200008725 -1.01883500016359 A:G G A 10 0.534589000010906 0.615581524507087 ENSG00000184260:ENST00000331380:exon_149858525_149858961:HIST2H2AC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 68 54 122 31.6479479992584 28.8678060005889 2.78014199866946 A:T:G G T 10 0.534589000010906 0.650513278694363 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 150444026 G/A 1 10 22 32 4.65410999989094 11.7609580002399 -7.10684800034899 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0129214179938467 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 151006539 C/A 1 8 10 18 3.72328799991275 5.34589000010906 -1.62260200019631 A:C C A 10 0.534589000010906 0.485331297542652 ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_151006282_151007683:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_151006282_151006589:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_151006282_151008187:PRUNE HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 151026815 C/T 1 12 3 15 5.58493199986913 1.60376700003272 3.98116499983641 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0663369253246265 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 151209063 C/T 1 17 7 24 7.9119869998146 3.74212300007634 4.16986399973825 T:C C T 10 0.534589000010906 0.102874824022524 ENSG00000143398:ENST00000414290:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000464105:exon_151209034_151209223:PIP5K1A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 216 235 451 100.528775997644 125.628415002563 -25.0996390049186 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0182686681834612 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 23 19 42 10.7044529997492 10.1571910002072 0.547261999541947 A:G G A 10 0.534589000010906 0.87867221204653 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 151374025 T/C 1 257 268 525 119.610626997197 143.269852002923 -23.6592250057257 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0397587252364536 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151374018_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151374018_151374410:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000474100:exon_151373715_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000466425:exon_151374018_151374106:PSMB4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 42 48 90 19.5472619995419 25.6602720005235 -6.11301000098155 A:C A C 10 0.534589000010906 0.205945539114966 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 151735545 A/G 1 42 40 82 19.5472619995419 21.3835600004362 -1.8362980008943 A:G A G 10 0.534589000010906 0.740150598172662 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151735426_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000478926:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000486707:exon_151735431_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000481777:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000461182:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000462783:exon_151735093_151735622:MRPL9;ENSG00000143450:ENST00000418982:exon_151735445_151735643:OAZ3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 151825991 G/T 1 7 1 8 3.25787699992366 0.534589000010906 2.72328799991275 T:G G T 10 0.534589000010906 0.0755591978202379 ENSG00000196407:ENST00000368817:exon_151825919_151826173:THEM5;ENSG00000196407:ENST00000368818:exon_151825919_151826173:THEM5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 153517172 T/C 1 134 164 298 62.3650739985386 87.6725960017886 -25.30752200325 T:C T C 10 0.534589000010906 0.00363499541193553 ENSG00000196154:ENST00000368715:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000481009:exon_153517130_153517573:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000354332:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000468373:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368716:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368714:exon_153517130_153517285:S100A4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 153909069 G/C 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 C:G G C 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000477746:exon_153909018_153909118:DENND4B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 138 105 243 64.226717998495 56.1318450011451 8.09487299734983 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.304260780264615 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 153926078 T/C 1 17 21 38 7.9119869998146 11.226369000229 -3.31438200041443 T:C T C 10 0.534589000010906 0.329957108100267 ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 154245917 T/C 1 55 45 100 25.5976049994002 24.0565050004908 1.5410999989094 T:C T C 10 0.534589000010906 0.764908474140585 ENSG00000143575:ENST00000328703:exon_154245812_154246074:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000483970:exon_154245812_154246074:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000447768:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000531435:exon_154245812_154246437:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000477780:exon_154245812_154246437:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000453365:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000435087:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000471326:exon_154245344_154246074:HAX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 154317153 C/T 1 7 6 13 3.25787699992366 3.20753400006544 0.0503429998582212 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000143515:ENST00000368489:exon_154317117_154317261:ATP8B2;ENSG00000143515:ENST00000341831:exon_154317117_154317261:ATP8B2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 C:G C G 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 18 16 34 8.37739799980369 8.5534240001745 -0.176026000370806 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 156107534 C/T 1 13 17 30 6.05034299985822 9.0880130001854 -3.03767000032718 T:C C T 10 0.534589000010906 0.27812385936588 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156107499_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156107445_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156107445_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000498722:exon_156107445_156107952:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000506981:exon_156107253_156107534:LMNA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 156146218 C/T 1 25 19 44 11.6352749997273 10.1571910002072 1.47808399952013 T:C C T 10 0.534589000010906 0.762907380746898 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000484155:exon_156146196_156146447:SEMA4A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 156206121 G/A 1 56 46 102 26.0630159993893 24.5910940005017 1.47192199888758 A:G G A 10 0.534589000010906 0.842782983413226 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368273:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156206079_156206274:PMF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 156233189 C/T 1 18 9 27 8.37739799980369 4.81130100009815 3.56609699970554 T:C C T 10 0.534589000010906 0.182295568819292 ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156233186_156233361:SMG5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 156263940 T/C 1 8 10 18 3.72328799991275 5.34589000010906 -1.62260200019631 T:C T C 10 0.534589000010906 0.485331297542652 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 156264000 G/A 1 22 32 54 10.2390419997601 17.106848000349 -6.86780600058893 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0753802048082498 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 156280969 G/A 1 406 183 589 188.956865995572 97.8297870019958 91.1270789935763 A:G G A 10 0.534589000010906 2.54645039395788e-14 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156280741_156280986:CCT3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 156280971 G/A 1 406 186 592 188.956865995572 99.4335540020285 89.5233119935436 A:G G A 10 0.534589000010906 7.96830622393167e-14 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156280741_156280986:CCT3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 156446903 T/C 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 T:C T C 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000353795:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000340875:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000454816:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000493077:exon_156446721_156446994:MEF2D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 8 10 18 3.72328799991275 5.34589000010906 -1.62260200019631 A:G G A 10 0.534589000010906 0.485331297542652 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 13 11 24 6.05034299985822 5.88047900011997 0.169863999738255 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 156566196 C/A 1 54 54 108 25.1321939994111 28.8678060005889 -3.73561200117785 A:C C A 10 0.534589000010906 0.500169086000005 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000415314:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000494414:exon_156565873_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000497287:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000463513:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000498641:exon_156566179_156566297:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000529520:exon_156565873_156566294:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000473910:exon_156565873_156567913:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000531129:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000474904:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000498756:exon_156566086_156566270:GPATCH4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 156760887 C/A 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 A:C C A 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156760859_156760954:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000454659:exon_156760859_156760954:PRCC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 36 43 79 16.7547959996074 22.987327000469 -6.23253100086158 A:G A G 10 0.534589000010906 0.176267362535627 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 158819003 G/A 1 136 109 245 63.2958959985168 58.2702010011888 5.02569499732802 A:G G A 10 0.534589000010906 0.564451987192502 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158818980_158819294:MNDA;ENSG00000163563:ENST00000438394:exon_158818980_158819296:MNDA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 159752046 A/T 1 22 19 41 10.2390419997601 10.1571910002072 0.0818509995528522 A:T A T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000158716:ENST00000368109:exon_159751943_159752333:DUSP23;ENSG00000158716:ENST00000368108:exon_159751943_159752333:DUSP23;ENSG00000158716:ENST00000368107:exon_159751943_159752333:DUSP23 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 160275507 A/G 1 45 59 104 20.9434949995092 31.5407510006435 -10.5972560011342 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0391448711000065 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160275478_160275563:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160275478_160275563:COPA;ENSG00000122218:ENST00000481522:exon_160275478_160275714:COPA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 958 951 1909 445.863737989552 508.394139010372 -62.5304010208196 A:T:C:G G A 10 0.534589000010906 0.00443080638930408 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 160990876 C/A 0 10 0 10 4.65410999989094 0 4.65410999989094 C C 10 0.534589000010906 0.00238317236301322 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 160990878 C/T 0 10 0 10 4.65410999989094 0 4.65410999989094 C C 10 0.534589000010906 0.00238317236301322 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 161183516 C/T 1 87 72 159 40.4907569990512 38.4904080007852 2.00034899826593 T:C C T 10 0.534589000010906 0.811596614021153 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161183439_161184086:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000492153:exon_161183439_161183522:NDUFS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 97 74 171 45.1448669989421 39.559586000807 5.58528099813507 A:G A G 10 0.534589000010906 0.400249585045726 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 161721707 C/T 1 11 14 25 5.11952099988003 7.48424600015268 -2.36472500027265 T:C C T 10 0.534589000010906 0.423628611134497 ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 163297322 A/C 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 A:C A C 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000143228:ENST00000534289:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000450453:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000442820:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000490881:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000487578:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163297278_163297352:NUF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 163313539 C/T 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163313523_163313613:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000531529:exon_163313523_163313605:NUF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 165667781 T/G 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 T:G T G 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165667615_165668100:ALDH9A1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 52 61 113 24.2013719994329 32.6099290006653 -8.40855700123238 A:G G A 10 0.534589000010906 0.131035429791728 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 167973976 C/T 1 25 24 49 11.6352749997273 12.8301360002617 -1.1948610005344 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.775568337806118 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000470721:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_167973771_167974031:DCAF6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 169676486 A/G 1 17 17 34 7.9119869998146 9.0880130001854 -1.1760260003708 A:G A G 10 0.534589000010906 0.732812837731546 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169676483_169676590:SELL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 48 56 104 22.3397279994765 29.9369840006107 -7.59725600113423 A:G A G 10 0.534589000010906 0.14117986257668 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 169823660 C/T 1 23 14 37 10.7044529997492 7.48424600015268 3.22020699959648 T:C C T 10 0.534589000010906 0.325226488321981 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 171509327 G/A 1 91 106 197 42.3524009990075 56.666434001156 -14.3140330021485 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0453401397988257 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 171511039 C/G 1 50 53 103 23.2705499994547 28.333217000578 -5.06266700112332 C:G C G 10 0.534589000010906 0.324919434400385 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171509400_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171510969_171511368:BAT2L2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 171514731 C/G 1 17 20 37 7.9119869998146 10.6917800002181 -2.77979300040352 C:G C G 10 0.534589000010906 0.411249951697163 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171514618_171514826:BAT2L2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 171556165 G/C 1 30 39 69 13.9623299996728 20.8489710004253 -6.88664100075252 A:C:G G C 10 0.534589000010906 0.116165932393582 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171556142_171556360:BAT2L2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 51 41 92 23.7359609994438 21.9181490004471 1.81781199899665 T:C T C 10 0.534589000010906 0.754317792970745 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 34 27 61 15.8239739996292 14.4339030002945 1.39007099933473 A:G A G 10 0.534589000010906 0.797807128783475 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 17 32 49 7.9119869998146 17.106848000349 -9.1948610005344 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0095914836350599 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 161 186 347 74.9311709982441 99.4335540020285 -24.5023830037844 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0096954546035694 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 80 75 155 37.2328799991275 40.094175000818 -2.86129500169044 T:C C T 10 0.534589000010906 0.68743620673012 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 179319541 C/G 1 10 3 13 4.65410999989094 1.60376700003272 3.05034299985822 C:G C G 10 0.534589000010906 0.102317208684754 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179319431_179319566:SOAT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 180159654 C/T 1 8 2 10 3.72328799991275 1.06917800002181 2.65410999989094 T:C C T 10 0.534589000010906 0.117787000476102 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180159568_180159715:QSOX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 180159657 C/T 1 9 2 11 4.18869899990185 1.06917800002181 3.11952099988003 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0723916304569276 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180159568_180159715:QSOX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 180953853 A/G 1 9 8 17 4.18869899990185 4.27671200008725 -0.0880130001854029 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000135823:ENST00000258301:exon_180953813_180953907:STX6;ENSG00000135823:ENST00000469135:exon_180953813_180953907:STX6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 181018236 A/G 1 13 10 23 6.05034299985822 5.34589000010906 0.704452999749162 A:G A G 10 0.534589000010906 0.836527371779212 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181018188_181018833:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181018188_181018448:MR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 182356399 A/G 1 20 30 50 9.30821999978188 16.0376700003272 -6.7294500005453 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0650734803508949 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000484996:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000475808:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000480604:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000462444:exon_182355910_182356427:GLUL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 183105705 G/A 1 9 7 16 4.18869899990185 3.74212300007634 0.446575999825503 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 186289510 G/A 1 68 68 136 31.6479479992584 36.3520520007416 -4.70410400148322 A:G G A 10 0.534589000010906 0.439763111368154 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186289444_186289550:TPR;ENSG00000047410:ENST00000467810:exon_186289444_186289550:TPR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 192545099 G/A 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:G G A 10 0.534589000010906 0.741882642224914 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 192780268 T/C 1 18 32 50 8.37739799980369 17.106848000349 -8.7294500005453 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0154847819251757 ENSG00000116741:ENST00000235382:exon_192780111_192780277:RGS2;ENSG00000116741:ENST00000464302:exon_192780111_192780369:RGS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 192780657 C/T 1 21 31 52 9.77363099977097 16.5722590003381 -6.79862800056711 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.070160489381763 ENSG00000116741:ENST00000235382:exon_192780532_192781403:RGS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 200522566 G/C 1 20 14 34 9.30821999978188 7.48424600015268 1.8239739996292 C:G G C 10 0.534589000010906 0.607616730533381 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200520628_200522895:KIF14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 200534248 C/T 1 10 8 18 4.65410999989094 4.27671200008725 0.377397999803692 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200534197_200534381:KIF14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 23 32 55 10.7044529997492 17.106848000349 -6.40239500059983 A:G A G 10 0.534589000010906 0.1040472814487 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 12 11 23 5.58493199986913 5.88047900011997 -0.295547000250839 A:T A T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 201934578 G/A 1 31 44 75 14.4277409996619 23.5219160004799 -9.09417500081795 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.0374025308416491 ENSG00000134375:ENST00000367287:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000478378:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000482943:exon_201934561_201934671:TIMM17A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 202104616 T/A 1 11 8 19 5.11952099988003 4.27671200008725 0.842808999792785 A:T T A 10 0.534589000010906 0.819574245361162 ENSG00000143862:ENST00000272217:exon_202104587_202104654:ARL8A;ENSG00000143862:ENST00000491358:exon_202104587_202104736:ARL8A;ENSG00000143862:ENST00000486225:exon_202104587_202104928:ARL8A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 202119546 C/G 1 30 16 46 13.9623299996728 8.5534240001745 5.40890599949832 C:G C G 10 0.534589000010906 0.138733340148781 ENSG00000143851:ENST00000309017:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000367279:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000308986:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000495688:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000462815:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000496197:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000480836:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000477554:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000492977:exon_202118979_202119552:PTPN7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 203818973 C/A 1 33 46 79 15.3585629996401 24.5910940005017 -9.23253100086158 A:C C A 10 0.534589000010906 0.0420783572923689 ENSG00000058673:ENST00000367214:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367212:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000332127:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000495527:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367210:exon_203818839_203819154:ZC3H11A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 209933331 A/G 1 21 14 35 9.77363099977097 7.48424600015268 2.28938499961829 A:G A G 10 0.534589000010906 0.499913952744214 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 209933528 G/A 1 13 18 31 6.05034299985822 9.62260200019631 -3.57225900033809 A:G G A 10 0.534589000010906 0.211837916082521 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 209933540 A/G 1 19 12 31 8.84280899979279 6.41506800013087 2.42774099966191 A:G A G 10 0.534589000010906 0.47233262636417 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 209933660 G/C 1 18 16 34 8.37739799980369 8.5534240001745 -0.176026000370806 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933601_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 209936914 C/T 1 18 15 33 8.37739799980369 8.01883500016359 0.3585629996401 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 A:T:C T C 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 42 38 80 19.5472619995419 20.3143820004144 -0.767120000872485 C:G C G 10 0.534589000010906 0.91094449377668 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 43 49 92 20.012672999531 26.1948610005344 -6.18218800100335 T:C T C 10 0.534589000010906 0.210469860203906 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 211840498 T/C 1 17 10 27 7.9119869998146 5.34589000010906 2.56609699970554 T:C T C 10 0.534589000010906 0.342373022205262 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000489633:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211839772_211840573:NEK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 212515613 C/T 1 9 6 15 4.18869899990185 3.20753400006544 0.981164999836409 T:C C T 10 0.534589000010906 0.796967668188066 ENSG00000066027:ENST00000261461:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000498129:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000479259:exon_212515530_212515622:PPP2R5A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 212788567 C/T 1 13 11 24 6.05034299985822 5.88047900011997 0.169863999738255 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000162772:ENST00000366981:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366987:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000426071:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000391902:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000341491:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000465155:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366985:exon_212788494_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000464547:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366983:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000336937:exon_212788490_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366984:exon_212788490_212788603:ATF3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 213414543 A/G 1 9 7 16 4.18869899990185 3.74212300007634 0.446575999825503 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000136643:ENST00000366960:exon_213414045_213415640:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000366959:exon_213414045_213415640:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000490299:exon_213414045_213415640:RPS6KC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 214510115 T/G 1 43 35 78 20.012672999531 18.7106150003817 1.30205799914933 T:G T G 10 0.534589000010906 0.820845839011519 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214510047_214510473:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214510047_214510445:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000416415:exon_214510047_214510474:SMYD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 17 14 31 7.9119869998146 7.48424600015268 0.427740999661912 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 23 24 47 10.7044529997492 12.8301360002617 -2.12568300051258 T:C T C 10 0.534589000010906 0.561062064368195 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 223905532 G/A 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:G G A 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223905464_223905533:CAPN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 223933079 C/T 1 5 7 12 2.32705499994547 3.74212300007634 -1.41506800013087 T:C C T 10 0.534589000010906 0.565015885912817 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223933008_223933141:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223933008_223933141:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223933008_223933141:CAPN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 223934720 G/A 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 A:G G A 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223934699_223934765:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223934699_223934867:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223934699_223934867:CAPN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 225607144 C/T 1 19 17 36 8.84280899979279 9.0880130001854 -0.245204000392617 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225606965_225607154:LBR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 225609884 A/G 1 12 21 33 5.58493199986913 11.226369000229 -5.6414370003599 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.0552550907450538 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225609779_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225609779_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225609813_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225609779_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000488632:exon_225609779_225610129:LBR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 225611661 C/T 1 26 23 49 12.1006859997164 12.2955470002508 -0.194861000534395 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000421383:exon_225611623_225611791:LBR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 226019633 T/C 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000143819:ENST00000445856:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000448202:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000467015:exon_226019480_226019864:EPHX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 10 10 20 4.65410999989094 5.34589000010906 -0.69178000021812 T:G T G 10 0.534589000010906 0.824629775002564 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 226555302 A/G 1 99 91 190 46.0756889989203 48.6475990009925 -2.57191000207214 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.716697873204854 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226555181_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226555181_226555309:PARP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 226570840 T/C 1 150 136 286 69.8116499983641 72.7041040014832 -2.89245400311913 T:C T C 10 0.534589000010906 0.767018298424696 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 122 113 235 56.7801419986695 60.4085570012324 -3.62841500256292 A:G A G 10 0.534589000010906 0.647562614063705 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 80 90 170 37.2328799991275 48.1130100009815 -10.880130001854 A:G G A 10 0.534589000010906 0.106194882050006 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 226595647 C/G 1 31 41 72 14.4277409996619 21.9181490004471 -7.49040800078524 C:G C G 10 0.534589000010906 0.097465077700694 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226595511_226595774:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226595511_226595776:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226595511_226595717:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226595511_226595683:PARP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 226923938 A/C 1 29 14 43 13.4969189996837 7.48424600015268 6.01267299953104 A:C A C 10 0.534589000010906 0.0683352560887066 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 226924642 C/T 1 17 15 32 7.9119869998146 8.01883500016359 -0.106848000348994 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 227172290 C/T 1 10 4 14 4.65410999989094 2.13835600004362 2.51575399984732 T:C C T 10 0.534589000010906 0.194114354160929 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227172249_227172356:ADCK3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 227174210 T/C 1 35 23 58 16.2893849996183 12.2955470002508 3.99383799936745 T:C T C 10 0.534589000010906 0.356988488718115 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 19 23 42 8.84280899979279 12.2955470002508 -3.45273800045805 A:C:G A G 10 0.534589000010906 0.353538941026806 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 227935762 G/A 1 25 19 44 11.6352749997273 10.1571910002072 1.47808399952013 A:G G A 10 0.534589000010906 0.762907380746898 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 228295582 T/C 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 T:C T C 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000162910:ENST00000465268:exon_228295369_228295976:MRPL55 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 228588680 A/C 1 9 14 23 4.18869899990185 7.48424600015268 -3.29554700025084 A:C A C 10 0.534589000010906 0.210289302298530 ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228588665_228588895:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228588640_228588892:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000366699:exon_228588665_228588895:TRIM11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 18 20 38 8.37739799980369 10.6917800002181 -2.31438200041443 A:G A G 10 0.534589000010906 0.516482161923489 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 234744413 C/A 0 228 0 228 106.113707997513 0 106.113707997513 C C 10 0.534589000010906 1.26428265695783e-62 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 236141174 T/C 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 T:C T C 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236139130_236141288:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236139130_236141288:NID1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 236144951 A/G 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 A:G A G 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236144911_236145082:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236144911_236145082:NID1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 37 24 61 17.2202069995965 12.8301360002617 4.39007099933473 A:G G A 10 0.534589000010906 0.304779112707586 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 10 7 17 4.65410999989094 3.74212300007634 0.911986999814598 T:C T C 10 0.534589000010906 0.809164893348427 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 236723074 G/C 1 18 13 31 8.37739799980369 6.94965700014178 1.42774099966191 C:G G C 10 0.534589000010906 0.719634139084765 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 236723108 C/T 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 T:C C T 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 236737983 A/G 1 17 17 34 7.9119869998146 9.0880130001854 -1.1760260003708 A:G A G 10 0.534589000010906 0.732812837731546 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236737961_236738203:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000490339:exon_236737961_236738075:HEATR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 236746443 C/T 1 10 5 15 4.65410999989094 2.67294500005453 1.98116499983641 T:C C T 10 0.534589000010906 0.438822405676019 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236746313_236746496:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236746313_236746496:HEATR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 236748505 T/C 1 8 8 16 3.72328799991275 4.27671200008725 -0.553424000174497 T:C T C 10 0.534589000010906 0.807042042252045 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 236749730 C/T 1 10 2 12 4.65410999989094 1.06917800002181 3.58493199986913 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0440105344752742 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 236755837 C/T 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 T:C C T 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236755823_236755933:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236755823_236755933:HEATR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 236755856 T/C 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 T:C T C 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236755823_236755933:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236755823_236755933:HEATR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 236758887 T/C 1 5 9 14 2.32705499994547 4.81130100009815 -2.48424600015268 T:C T C 10 0.534589000010906 0.283670203474933 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236758840_236758973:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236758840_236758973:HEATR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 242035382 C/T 1 17 20 37 7.9119869998146 10.6917800002181 -2.77979300040352 T:C C T 10 0.534589000010906 0.411249951697163 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242035334_242035580:EXO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 242042301 G/A 1 24 13 37 11.1698639997383 6.94965700014178 4.22020699959648 A:G G A 10 0.534589000010906 0.188740822052331 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 242048674 C/T 1 14 9 23 6.51575399984732 4.81130100009815 1.70445299974916 T:C C T 10 0.534589000010906 0.535325651889601 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518741:exon_242048659_242048809:EXO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 245850506 G/C 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 C:G G C 10 0.534589000010906 0.298446592097252 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 1 246922390 A/G 1 38 29 67 17.6856179995856 15.5030810003163 2.1825369992693 A:G A G 10 0.534589000010906 0.625824869414162 ENSG00000143653:ENST00000366510:exon_246922336_246922453:SCCPDH;ENSG00000143653:ENST00000366509:exon_246922336_246922453:SCCPDH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 5781628 T/G 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 T:G T G 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5781581_5782460:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000380270:exon_5781581_5781776:C10orf18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 5781969 A/T 1 10 3 13 4.65410999989094 1.60376700003272 3.05034299985822 A:T A T 10 0.534589000010906 0.102317208684754 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5781581_5782460:C10orf18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 5788608 G/C 1 12 4 16 5.58493199986913 2.13835600004362 3.4465759998255 C:G G C 10 0.534589000010906 0.130326098972588 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 5791578 G/T 1 16 16 32 7.4465759998255 8.5534240001745 -1.10684800034899 T:G G T 10 0.534589000010906 0.725761441333252 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5788794_5791990:C10orf18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 5855225 G/A 1 47 53 100 21.8743169994874 28.333217000578 -6.4589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 0.228848351939248 ENSG00000057608:ENST00000380191:exon_5855177_5855512:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000435969:exon_5855177_5855512:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380153:exon_5855177_5855512:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380181:exon_5855177_5855374:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380132:exon_5855177_5855374:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000456041:exon_5855177_5855350:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000418688:exon_5855177_5855392:GDI2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 5 13 18 2.32705499994547 6.94965700014178 -4.62260200019631 A:T A T 10 0.534589000010906 0.0336404123788179 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 11505175 A/G 1 6 9 15 2.79246599993456 4.81130100009815 -2.01883500016359 A:G A G 10 0.534589000010906 0.313814139216668 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 12131081 T/G 1 12 5 17 5.58493199986913 2.67294500005453 2.9119869998146 T:G T G 10 0.534589000010906 0.223771329291868 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 12143105 C/G 1 7 6 13 3.25787699992366 3.20753400006544 0.0503429998582212 C:G C G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12143041_12143180:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12143041_12143180:DHTKD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 69 79 148 32.1133589992475 42.2325310008616 -10.1191720016141 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0996891917138692 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 110 88 198 51.1952099988003 47.0438320009597 4.1513779978406 A:G A G 10 0.534589000010906 0.569416249836413 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 12867598 C/G 1 15 11 26 6.98116499983641 5.88047900011997 1.10068599971644 C:G C G 10 0.534589000010906 0.699080776375629 ENSG00000183049:ENST00000378847:exon_12867572_12867689:CAMK1D;ENSG00000183049:ENST00000378845:exon_12867572_12868142:CAMK1D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 13364914 C/G 1 23 35 58 10.7044529997492 18.7106150003817 -8.00616200063255 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0473901958673676 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13364835_13365047:SEPHS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 11 10 21 5.11952099988003 5.34589000010906 -0.226369000229027 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 13701373 C/T 1 6 9 15 2.79246599993456 4.81130100009815 -2.01883500016359 T:C C T 10 0.534589000010906 0.313814139216668 ENSG00000151474:ENST00000358621:exon_13701323_13701490:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378502:exon_13701323_13701490:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000357447:exon_13701323_13701490:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378503:exon_13701323_13701490:FRMD4A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 15145842 G/T 1 45 73 118 20.9434949995092 39.0249970007961 -18.0815020012869 T:G G T 10 0.534589000010906 0.00114555822165161 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 21827796 G/A 1 13 8 21 6.05034299985822 4.27671200008725 1.77363099977097 A:G G A 10 0.534589000010906 0.515314898478003 ENSG00000078403:ENST00000377100:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377072:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000307729:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377091:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000471315:exon_21827762_21827893:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000446906:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000495130:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377059:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000396529:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000476557:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000430455:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000462999:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000480415:exon_21827762_21827841:MLLT10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 22048330 C/T 1 43 36 79 20.012672999531 19.2452040003926 0.767468999138423 T:C C T 10 0.534589000010906 0.910459559410953 ENSG00000136770:ENST00000376980:exon_22048099_22048547:DNAJC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 30728101 T/C 1 141 207 348 65.6229509984622 110.659923002258 -45.0369720037953 T:C T C 10 0.534589000010906 1.53190602472903e-06 ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000415139:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375322:exon_30727845_30728371:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000413724:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30727751_30728203:MAP3K8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 34620220 C/T 1 19 19 38 8.84280899979279 10.1571910002072 -1.31438200041443 T:C C T 10 0.534589000010906 0.745799595822869 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000466092:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34620045_34620272:PARD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 35772402 G/A 1 18 12 30 8.37739799980369 6.41506800013087 1.96232999967282 A:G G A 10 0.534589000010906 0.583860625026523 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000490012:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000493157:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000492478:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000470025:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35772158_35772406:CCNY HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 38344700 C/G 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 C:G C G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 38407519 A/G 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 A:G A G 10 0.534589000010906 0.592941099997918 ENSG00000075407:ENST00000361085:exon_38406318_38411511:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000351773:exon_38406318_38412276:ZNF37A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 43287148 G/A 1 13 15 28 6.05034299985822 8.01883500016359 -1.96849200030537 A:G G A 10 0.534589000010906 0.570640261191915 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43287075_43287217:BMS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 43292647 A/G 1 33 42 75 15.3585629996401 22.4527380004581 -7.09417500081795 A:C:G A G 10 0.534589000010906 0.106001948821803 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43291922_43292679:BMS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 43678796 C/T 1 6 8 14 2.79246599993456 4.27671200008725 -1.48424600015268 T:C C T 10 0.534589000010906 0.437971150157616 ENSG00000169826:ENST00000374466:exon_43678698_43680756:CSGALNACT2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 169 185 354 78.6544589981569 98.8989650020176 -20.2445060038607 A:T T A 10 0.534589000010906 0.0330089595968502 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 45953767 A/G 1 8 2 10 3.72328799991275 1.06917800002181 2.65410999989094 A:G A G 10 0.534589000010906 0.117787000476102 ENSG00000165406:ENST00000453424:exon_45950035_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000319836:exon_45952817_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000395771:exon_45952817_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000395769:exon_45952954_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000476962:exon_45952959_45953991:MARCH8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 46143958 T/G 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 T:G T G 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000172671:ENST00000374366:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374376:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000344646:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374371:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374370:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000465407:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000495747:exon_46143867_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000497028:exon_46143923_46143982:ANUBL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 58120988 C/A 1 58 28 86 26.9938379993675 14.9684920003054 12.0253459990621 A:C C A 10 0.534589000010906 0.00938884004959965 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58120957_58121036:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58120957_58121020:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58120957_58121034:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58120957_58121023:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58120957_58121003:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58120957_58121027:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58120957_58121018:ZWINT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 59956041 C/T 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000151151:ENST00000373935:exon_59951278_59956459:IPMK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 61552692 G/T 1 8 11 19 3.72328799991275 5.88047900011997 -2.15719100020721 T:G G T 10 0.534589000010906 0.363088485682007 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552607_61552732:CCDC6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 64564892 G/T 1 13 8 21 6.05034299985822 4.27671200008725 1.77363099977097 T:G G T 10 0.534589000010906 0.515314898478003 ENSG00000181915:ENST00000373783:exon_64564516_64568238:ADO HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 64564934 C/G 1 20 2 22 9.30821999978188 1.06917800002181 8.23904199976007 C:G C G 10 0.534589000010906 0.000334014534153856 ENSG00000181915:ENST00000373783:exon_64564516_64568238:ADO HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 20 19 39 9.30821999978188 10.1571910002072 -0.848971000425335 A:G G A 10 0.534589000010906 0.872831334711128 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 64974380 G/C 1 9 6 15 4.18869899990185 3.20753400006544 0.981164999836409 C:G G C 10 0.534589000010906 0.796967668188066 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 69571336 G/A 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:G G A 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000108176:ENST00000225171:exon_69571282_69571421:DNAJC12;ENSG00000108176:ENST00000483798:exon_69571282_69571421:DNAJC12;ENSG00000108176:ENST00000480963:exon_69571282_69571421:DNAJC12;ENSG00000108176:ENST00000339758:exon_69570966_69571421:DNAJC12;ENSG00000108176:ENST00000480180:exon_69571286_69571421:DNAJC12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 70700944 A/G 1 71 57 128 33.0441809992257 30.4715730006216 2.57260799860403 A:G A G 10 0.534589000010906 0.658986438222213 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 70733266 T/G 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:G T G 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 456 322 778 212.227415995027 172.137658003512 40.0897579915151 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.00402269690015108 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 71874683 G/A 1 37 35 72 17.2202069995965 18.7106150003817 -1.49040800078523 A:G G A 10 0.534589000010906 0.724966950158671 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 71874734 G/A 1 18 16 34 8.37739799980369 8.5534240001745 -0.176026000370806 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 71874784 C/T 1 10 8 18 4.65410999989094 4.27671200008725 0.377397999803692 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 24 23 47 11.1698639997383 12.2955470002508 -1.12568300051258 T:C C T 10 0.534589000010906 0.77141261178773 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 71906150 T/C 1 8 10 18 3.72328799991275 5.34589000010906 -1.62260200019631 T:C T C 10 0.534589000010906 0.485331297542652 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 30 40 70 13.9623299996728 21.3835600004362 -7.42123000076342 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0928107408287673 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 72289778 C/T 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 T:C C T 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000107719:ENST00000263563:exon_72289645_72289824:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000373214:exon_72289645_72289824:KIAA1274 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 72643671 C/T 1 27 50 77 12.5660969997055 26.7294500005453 -14.1633530008398 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00129720913865147 ENSG00000166228:ENST00000299299:exon_72643267_72643805:PCBD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 73520632 A/C 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 A:C A C 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73520288_73520681:C10orf54 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 73577267 G/A 1 3 8 11 1.39623299996728 4.27671200008725 -2.88047900011997 A:G G A 10 0.534589000010906 0.127884495538899 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 74114536 C/G 1 13 18 31 6.05034299985822 9.62260200019631 -3.57225900033809 C:G C G 10 0.534589000010906 0.211837916082521 ENSG00000148719:ENST00000394903:exon_74114523_74114907:DNAJB12;ENSG00000148719:ENST00000338820:exon_74114523_74114907:DNAJB12;ENSG00000148719:ENST00000444643:exon_74114523_74114988:DNAJB12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 74834651 T/C 1 11 8 19 5.11952099988003 4.27671200008725 0.842808999792785 T:C T C 10 0.534589000010906 0.819574245361162 ENSG00000122884:ENST00000307116:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000394890:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000412021:exon_74834566_74834679:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000440381:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000263556:exon_74834566_74834673:P4HA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 74894375 T/C 1 82 52 134 38.1637019991057 27.7986280005671 10.3650739985386 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0829885367202675 ENSG00000122882:ENST00000494307:exon_74894361_74894512:ECD;ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74893414_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74894283_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74894283_74894571:ECD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 74896664 T/C 1 24 32 56 11.1698639997383 17.106848000349 -5.93698400061074 T:C T C 10 0.534589000010906 0.139962066123658 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74896462_74896676:ECD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 74897816 C/T 1 19 18 37 8.84280899979279 9.62260200019631 -0.779793000403524 T:C C T 10 0.534589000010906 0.86963318737537 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74897761_74897828:ECD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 74899111 A/G 1 16 15 31 7.4465759998255 8.01883500016359 -0.572259000338088 A:G A G 10 0.534589000010906 0.858876862828474 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74899067_74899253:ECD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 74899134 C/G 1 18 15 33 8.37739799980369 8.01883500016359 0.3585629996401 C:G C G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74899067_74899253:ECD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 74916173 T/A 1 20 14 34 9.30821999978188 7.48424600015268 1.8239739996292 A:T T A 10 0.534589000010906 0.607616730533381 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000484976:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000453402:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74916033_74916211:ECD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 74923562 C/T 1 11 9 20 5.11952099988003 4.81130100009815 0.308219999781879 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74923491_74923708:ECD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 75006804 A/G 1 19 21 40 8.84280899979279 11.226369000229 -2.38356000043624 A:G A G 10 0.534589000010906 0.526778577056088 ENSG00000213551:ENST00000372950:exon_75006768_75008620:DNAJC9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 75148116 A/G 1 41 49 90 19.0818509995529 26.1948610005344 -7.11301000098154 A:G A G 10 0.534589000010906 0.139884963074308 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000492380:exon_75148070_75148172:ANXA7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 75406912 G/T 1 8 3 11 3.72328799991275 1.60376700003272 2.11952099988003 T:G G T 10 0.534589000010906 0.238841320527235 ENSG00000166317:ENST00000372873:exon_75404639_75408637:SYNPO2L;ENSG00000166317:ENST00000394810:exon_75404639_75408637:SYNPO2L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 75407649 A/C 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 A:C A C 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000166317:ENST00000372873:exon_75404639_75408637:SYNPO2L;ENSG00000166317:ENST00000394810:exon_75404639_75408637:SYNPO2L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 75936611 C/T 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 T:C C T 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_75936444_75936644:ADK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 81066034 C/T 1 5 8 13 2.32705499994547 4.27671200008725 -1.94965700014178 T:C C T 10 0.534589000010906 0.405475359831307 ENSG00000108175:ENST00000334512:exon_81065857_81066101:ZMIZ1;ENSG00000108175:ENST00000360331:exon_81065857_81066101:ZMIZ1;ENSG00000108175:ENST00000446377:exon_81065975_81066101:ZMIZ1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 67 44 111 31.1825369992693 23.5219160004799 7.66062099878943 A:C:G G A 10 0.534589000010906 0.154125720605773 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 86131003 T/C 1 4 8 12 1.86164399995638 4.27671200008725 -2.41506800013087 T:C T C 10 0.534589000010906 0.246532544157622 ENSG00000107771:ENST00000359979:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86130770_86132225:FAM190B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 86131059 A/G 1 2 10 12 0.930821999978188 5.34589000010906 -4.41506800013087 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0167573406364211 ENSG00000107771:ENST00000359979:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86130770_86132225:FAM190B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 T:C T C 10 0.534589000010906 0.529760851175976 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 5 7 12 2.32705499994547 3.74212300007634 -1.41506800013087 C:G C G 10 0.534589000010906 0.565015885912817 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 91066460 T/A 1 21 24 45 9.77363099977097 12.8301360002617 -3.05650500049077 A:T:G T A 10 0.534589000010906 0.373823916263529 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 91162677 C/T 1 28 11 39 13.0315079996946 5.88047900011997 7.15102899957466 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0241417745121563 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 91178000 C/T 1 23 18 41 10.7044529997492 9.62260200019631 1.08185099955285 T:C C T 10 0.534589000010906 0.756980786078456 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 91404448 C/G 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 C:G C G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000152782:ENST00000307534:exon_91404357_91405215:PANK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 11 16 27 5.11952099988003 8.5534240001745 -3.43390300029446 A:G G A 10 0.534589000010906 0.246684909438815 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 91497207 A/G 1 34 35 69 15.8239739996292 18.7106150003817 -2.88664100075252 A:G A G 10 0.534589000010906 0.546647291175749 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 38 42 80 17.6856179995856 22.4527380004581 -4.76712000087248 A:T T A 10 0.534589000010906 0.313665480459822 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 20 18 38 9.30821999978188 9.62260200019631 -0.31438200041443 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 36 39 75 16.7547959996074 20.8489710004253 -4.09417500081796 A:G A G 10 0.534589000010906 0.356392834100926 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 8 11 19 3.72328799991275 5.88047900011997 -2.15719100020721 A:G A G 10 0.534589000010906 0.363088485682007 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 93608142 G/A 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:G G A 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000107854:ENST00000371627:exon_93608140_93608392:TNKS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 95276742 G/C 1 33 32 65 15.3585629996401 17.106848000349 -1.74828500070889 C:G G C 10 0.534589000010906 0.709862438076848 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 22 15 37 10.2390419997601 8.01883500016359 2.22020699959648 C:G G C 10 0.534589000010906 0.512515268374475 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 25 16 41 11.6352749997273 8.5534240001745 3.08185099955285 A:G A G 10 0.534589000010906 0.352303772989377 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 95459817 C/T 1 24 17 41 11.1698639997383 9.0880130001854 2.08185099955285 T:C C T 10 0.534589000010906 0.535691814402222 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95459787_95459863:FRA10AC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 6 11 17 2.79246599993456 5.88047900011997 -3.0880130001854 A:C A C 10 0.534589000010906 0.150155070613150 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 97023630 T/C 1 348 268 616 161.963027996205 143.269852002923 18.6931759932819 T:C T C 10 0.534589000010906 0.135144020693305 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_97023621_97023820:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_97023621_97023820:PDLIM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 97919011 A/G 1 13 11 24 6.05034299985822 5.88047900011997 0.169863999738255 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 99116903 C/T 1 26 74 100 12.1006859997164 39.559586000807 -27.4589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 3.03035670111868e-08 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99116115_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000465394:exon_99116863_99116953:RRP12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 50 35 85 23.2705499994547 18.7106150003817 4.55993499907299 T:C C T 10 0.534589000010906 0.330279516692564 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 99126249 G/A 1 41 30 71 19.0818509995529 16.0376700003272 3.04418099922567 A:G G A 10 0.534589000010906 0.478528291226649 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99126203_99126317:RRP12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 99141205 A/G 1 6 8 14 2.79246599993456 4.27671200008725 -1.48424600015268 A:G A G 10 0.534589000010906 0.437971150157616 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141143_99141240:RRP12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 99141484 C/T 1 2 9 11 0.930821999978188 4.81130100009815 -3.88047900011997 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0299085362195834 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141472_99141583:RRP12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 99155984 G/A 1 7 10 17 3.25787699992366 5.34589000010906 -2.0880130001854 A:G G A 10 0.534589000010906 0.339484157804598 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99155975_99156058:RRP12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 99504630 G/T 1 12 5 17 5.58493199986913 2.67294500005453 2.9119869998146 T:G G T 10 0.534589000010906 0.223771329291868 ENSG00000155256:ENST00000393677:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370610:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370613:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000337540:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000497994:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000356257:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000453958:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000359980:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000423811:exon_99504486_99504672:ZFYVE27 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 99969568 A/G 1 6 9 15 2.79246599993456 4.81130100009815 -2.01883500016359 A:G A G 10 0.534589000010906 0.313814139216668 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 100190920 G/A 1 18 25 43 8.37739799980369 13.3647250002727 -4.98732700046896 A:G G A 10 0.534589000010906 0.168143294360701 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100190888_100191039:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000414009:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100190888_100191048:HPS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 101166544 C/T 1 30 26 56 13.9623299996728 13.8993140002836 0.0630159993892629 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000120053:ENST00000370508:exon_101166483_101166606:GOT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 101502968 A/G 1 24 28 52 11.1698639997383 14.9684920003054 -3.79862800056712 A:G A G 10 0.534589000010906 0.331153738522708 ENSG00000119929:ENST00000493385:exon_101502910_101503080:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370476:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000471520:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370472:exon_101502910_101503119:CUTC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 101978852 G/C 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000213341:ENST00000370397:exon_101978765_101978889:CHUK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 102738766 T/C 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 T:C T C 10 0.534589000010906 0.189086525758904 ENSG00000055950:ENST00000318325:exon_102737578_102739129:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000370241:exon_102738486_102738768:MRPL43;ENSG00000095539:ENST00000519649:exon_102738606_102738775:SEMA4G;ENSG00000095539:ENST00000521006:exon_102738606_102738775:SEMA4G;ENSG00000095539:ENST00000457585:exon_102738606_102738775:SEMA4G;ENSG00000095539:ENST00000370250:exon_102738606_102738775:SEMA4G;ENSG00000095539:ENST00000517724:exon_102738606_102738775:SEMA4G;ENSG00000095539:ENST00000210633:exon_102738606_102738775:SEMA4G HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 123 70 193 57.2455529986586 37.4212300007634 19.8243229978951 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00476967468143519 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 102750783 C/A 1 7 6 13 3.25787699992366 3.20753400006544 0.0503429998582212 A:C C A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000107815:ENST00000476766:exon_102750626_102750811:C10orf2;ENSG00000107815:ENST00000370228:exon_102750626_102750811:C10orf2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 102766574 A/G 1 41 24 65 19.0818509995529 12.8301360002617 6.25171499929111 A:G A G 10 0.534589000010906 0.135881325861502 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 103899871 A/G 1 19 31 50 8.84280899979279 16.5722590003381 -7.7294500005453 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0330036825552365 ENSG00000148840:ENST00000278070:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000413464:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000412852:exon_103898857_103901761:PPRC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 103908080 G/A 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 A:G G A 10 0.534589000010906 0.485270004264881 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 104140350 G/A 1 21 19 40 9.77363099977097 10.1571910002072 -0.383560000436242 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104140263_104140443:GBF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 104436641 C/T 1 22 23 45 10.2390419997601 12.2955470002508 -2.05650500049077 T:C C T 10 0.534589000010906 0.553500523516736 ENSG00000138175:ENST00000260746:exon_104436315_104436698:ARL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 104573017 G/T 1 9 13 22 4.18869899990185 6.94965700014178 -2.76095800023993 T:G G T 10 0.534589000010906 0.287120525503420 ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 105362104 G/A 1 10 9 19 4.65410999989094 4.81130100009815 -0.157191000207215 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 111651541 G/A 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000108039:ENST00000502895:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000502935:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369683:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369680:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000322238:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369661:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369659:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000403138:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000430337:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000423625:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000443078:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000506777:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000505255:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000490740:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000451592:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000502595:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000508275:exon_111651480_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000475123:exon_111651337_111651584:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000504664:exon_111651478_111651584:XPNPEP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 112266771 C/T 1 52 31 83 24.2013719994329 16.5722590003381 7.6291129990948 T:C C T 10 0.534589000010906 0.099413199221641 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 115489152 C/G 1 15 15 30 6.98116499983641 8.01883500016359 -1.03767000032718 C:G C G 10 0.534589000010906 0.718295138743325 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 115489167 G/A 1 13 10 23 6.05034299985822 5.34589000010906 0.704452999749162 A:G G A 10 0.534589000010906 0.836527371779212 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 116207642 C/T 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000099204:ENST00000336585:exon_116207639_116207779:ABLIM1;ENSG00000099204:ENST00000369252:exon_116207639_116207779:ABLIM1;ENSG00000099204:ENST00000392955:exon_116207639_116207779:ABLIM1;ENSG00000099204:ENST00000392952:exon_116207639_116207779:ABLIM1;ENSG00000099204:ENST00000369257:exon_116207639_116207779:ABLIM1;ENSG00000099204:ENST00000369267:exon_116207639_116207779:ABLIM1;ENSG00000099204:ENST00000533213:exon_116207639_116207779:ABLIM1;ENSG00000099204:ENST00000214870:exon_116207639_116207779:ABLIM1;ENSG00000099204:ENST00000369265:exon_116207639_116207785:ABLIM1;ENSG00000099204:ENST00000369262:exon_116207639_116207779:ABLIM1;ENSG00000099204:ENST00000369260:exon_116207639_116207779:ABLIM1;ENSG00000099204:ENST00000369263:exon_116207639_116207779:ABLIM1;ENSG00000099204:ENST00000369266:exon_116207639_116207779:ABLIM1;ENSG00000099204:ENST00000369256:exon_116207639_116207779:ABLIM1;ENSG00000099204:ENST00000277895:exon_116207639_116207779:ABLIM1;ENSG00000099204:ENST00000369253:exon_116207639_116207779:ABLIM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 116719543 G/A 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 A:G G A 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000165832:ENST00000298746:exon_116719485_116719566:TRUB1;ENSG00000165832:ENST00000485065:exon_116719485_116719759:TRUB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 120920588 T/C 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 T:C T C 10 0.534589000010906 0.156883047615629 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 120933324 G/A 1 47 26 73 21.8743169994874 13.8993140002836 7.97500299920386 A:G G A 10 0.534589000010906 0.077712812341717 ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000463322:exon_120933257_120933384:PRDX3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 121586882 A/G 1 4 8 12 1.86164399995638 4.27671200008725 -2.41506800013087 A:G A G 10 0.534589000010906 0.246532544157622 ENSG00000198825:ENST00000361976:exon_121586143_121588652:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369080:exon_121586143_121587837:INPP5F HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 121679013 A/G 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 A:G A G 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121678956_121679108:SEC23IP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 123503187 T/C 1 9 8 17 4.18869899990185 4.27671200008725 -0.0880130001854029 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123502626_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123502710_123503373:ATE1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 123673339 T/C 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 T:C T C 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000455628:exon_123673305_123673408:ATE1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 123724863 G/A 1 32 20 52 14.893151999651 10.6917800002181 4.20137199943289 A:G G A 10 0.534589000010906 0.267809319270634 ENSG00000107672:ENST00000369023:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000489266:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000468209:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000482078:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000369017:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000464321:exon_123724858_123724900:NSMCE4A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 A:G G A 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 124742792 G/A 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 126089434 G/A 1 6 11 17 2.79246599993456 5.88047900011997 -3.0880130001854 A:G G A 10 0.534589000010906 0.150155070613150 ENSG00000065154:ENST00000368845:exon_126089409_126089553:OAT;ENSG00000065154:ENST00000471127:exon_126089409_126089553:OAT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 33 20 53 15.3585629996401 10.6917800002181 4.66678299942198 T:C T C 10 0.534589000010906 0.217013634235036 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 10 133769482 G/C 0 0 142 142 0 75.9116380015487 -75.9116380015487 C G C 10 0.534589000010906 6.80461243311915e-48 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 290816 A/G 1 6 10 16 2.79246599993456 5.34589000010906 -2.5534240001745 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.219453370200368 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 290891 T/C 1 11 9 20 5.11952099988003 4.81130100009815 0.308219999781879 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 290918 G/A 1 13 9 22 6.05034299985822 4.81130100009815 1.23904199976007 A:G G A 10 0.534589000010906 0.672470686731093 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 293188 T/C 1 26 50 76 12.1006859997164 26.7294500005453 -14.6287640008289 T:C T C 10 0.534589000010906 0.00079824631848105 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_292886_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_293068_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_293163_293727:ATHL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 36 51 87 16.7547959996074 27.2640390005562 -10.5092430009488 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0310041321117777 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 275 378 653 127.988024997001 202.074642004122 -74.0866170071217 A:G A G 10 0.534589000010906 7.06609802535324e-09 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 488609 G/T 1 10 15 25 4.65410999989094 8.01883500016359 -3.36472500027265 T:G G T 10 0.534589000010906 0.228865227218520 ENSG00000174915:ENST00000308020:exon_488529_488647:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000526878:exon_488529_488647:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000527325:exon_488529_488647:PTDSS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 490035 C/T 1 16 17 33 7.4465759998255 9.0880130001854 -1.6414370003599 T:C C T 10 0.534589000010906 0.603642096692231 ENSG00000174915:ENST00000308020:exon_489883_490068:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000526878:exon_489883_490068:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000531411:exon_489883_490068:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000530029:exon_489791_490068:PTDSS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 494662 G/A 1 178 128 306 82.8431579980587 68.427392001396 14.4157659966628 A:G G A 10 0.534589000010906 0.108468759480048 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494512_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494513_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494513_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494515_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494515_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494516_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494523_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494546_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494548_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494552_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494561_494778:RNH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 494942 G/C 1 152 109 261 70.7424719983423 58.2702010011888 12.4722709971535 C:G G C 10 0.534589000010906 0.136301628272744 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 534242 A/G 1 20 16 36 9.30821999978188 8.5534240001745 0.754795999607383 A:G A G 10 0.534589000010906 0.868181823114154 ENSG00000174775:ENST00000397594:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000397596:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000493230:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000451590:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000417302:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000311189:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000468682:exon_534212_534375:HRAS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 562437 G/A 1 28 17 45 13.0315079996946 9.0880130001854 3.94349499950923 A:G G A 10 0.534589000010906 0.295613948073502 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_562385_562776:RASSF7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 563257 G/A 0 31 0 31 14.4277409996619 0 14.4277409996619 G G 10 0.534589000010906 5.55075131370475e-09 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563189_563478:RASSF7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 587425 C/A 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 A:C C A 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_587259_588497:PHRF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 607175 G/A 1 14 16 30 6.51575399984732 8.5534240001745 -2.03767000032718 A:G G A 10 0.534589000010906 0.470259628180765 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 609068 G/A 1 20 12 32 9.30821999978188 6.41506800013087 2.89315199965101 A:G G A 10 0.534589000010906 0.376435613149687 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 609353 G/A 1 44 34 78 20.4780839995201 18.1760260003708 2.30205799914933 A:G G A 10 0.534589000010906 0.650549954036195 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 610724 C/T 1 20 19 39 9.30821999978188 10.1571910002072 -0.848971000425335 T:C C T 10 0.534589000010906 0.872831334711128 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_610501_610761:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_610667_610735:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_610667_610761:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_610501_610761:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_610501_610761:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_610501_610761:PHRF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 612967 A/G 1 9 8 17 4.18869899990185 4.27671200008725 -0.0880130001854029 A:G A G 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 613165 G/C 1 12 5 17 5.58493199986913 2.67294500005453 2.9119869998146 C:G G C 10 0.534589000010906 0.223771329291868 ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 613192 A/G 1 10 3 13 4.65410999989094 1.60376700003272 3.05034299985822 A:G A G 10 0.534589000010906 0.102317208684754 ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 613208 T/C 1 176 163 339 81.9123359980805 87.1380070017777 -5.22567100369714 T:C T C 10 0.534589000010906 0.586340102396782 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 613297 T/G 1 151 280 431 70.2770609983532 149.684920003054 -79.4078590047005 T:G T G 10 0.534589000010906 1.77886617281396e-14 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 614318 T/C 1 86 95 181 40.0253459990621 50.7859550010361 -10.760609001974 T:C T C 10 0.534589000010906 0.117633531260535 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614203_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000525750:exon_613785_614397:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614009_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614090_614399:IRF7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 823827 G/A 1 55 47 102 25.5976049994002 25.1256830005126 0.471921998887584 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_823694_823855:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_823527_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_823694_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000526083:exon_823648_823855:PNPLA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 840363 C/T 1 138 115 253 64.226717998495 61.4777350012542 2.74898299724077 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.752907350959726 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 870446 G/A 1 28 36 64 13.0315079996946 19.2452040003926 -6.21369600069799 A:G G A 10 0.534589000010906 0.132977866119019 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 1309956 C/T 1 10 9 19 4.65410999989094 4.81130100009815 -0.157191000207215 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000078902:ENST00000317204:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527886:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000525159:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000263646:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000382211:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530506:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530541:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000528719:exon_1309866_1310006:TOLLIP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 1902768 G/A 1 191 239 430 88.8935009979169 127.766771002607 -38.8732700046896 A:G G A 10 0.534589000010906 0.000191111721122059 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000421485:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000446808:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381775:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381758:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000405957:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000451814:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000457279:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000429923:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000406638:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000418975:exon_1902662_1902782:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000417766:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381768:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000472974:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000432093:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000485341:exon_1902662_1902826:LSP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 326 263 589 151.723985996445 140.596907002868 11.1270789935764 A:G G A 10 0.534589000010906 0.363793459108014 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 40 31 71 18.6164399995638 16.5722590003381 2.04418099922567 C:G G C 10 0.534589000010906 0.636746351476178 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 5655988 T/C 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000491385:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5655861_5656091:TRIM34 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 58 57 115 26.9938379993675 30.4715730006216 -3.47773500125419 A:C C A 10 0.534589000010906 0.514852944355832 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 5688940 C/T 1 2 13 15 0.930821999978188 6.94965700014178 -6.01883500016359 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00280245990455275 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5688919_5688941:TRIM5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 11 9 20 5.11952099988003 4.81130100009815 0.308219999781879 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 5701281 G/A 1 25 16 41 11.6352749997273 8.5534240001745 3.08185099955285 A:G G A 10 0.534589000010906 0.352303772989377 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 5701409 G/C 1 26 17 43 12.1006859997164 9.0880130001854 3.01267299953104 C:G G C 10 0.534589000010906 0.445057618908604 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 109 82 191 50.7297989988112 43.8362980008943 6.89350099791695 T:C T C 10 0.534589000010906 0.34583616797383 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 124 104 228 57.7109639986476 55.5972560011342 2.11370799751342 A:G G A 10 0.534589000010906 0.790976983590694 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 6239344 G/A 1 10 4 14 4.65410999989094 2.13835600004362 2.51575399984732 A:G G A 10 0.534589000010906 0.194114354160929 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6237800_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000532797:exon_6239035_6239380:FAM160A2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 6340525 A/T 1 1 11 12 0.465410999989094 5.88047900011997 -5.41506800013087 A:T A T 10 0.534589000010906 0.00207174314531138 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 6432427 G/A 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 A:G G A 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000166313:ENST00000299402:exon_6431857_6432591:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000389907:exon_6431857_6432591:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000311051:exon_6431857_6432591:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000389906:exon_6431857_6432591:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000534416:exon_6432402_6432591:APBB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 49 46 95 22.8051389994656 24.5910940005017 -1.78595500103607 T:C C T 10 0.534589000010906 0.758022735383308 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 93 72 165 43.2832229989857 38.4904080007852 4.7928149982005 A:G G A 10 0.534589000010906 0.482878548005904 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 6631016 C/T 1 93 85 178 43.2832229989857 45.440065000927 -2.15684200194128 T:C C T 10 0.534589000010906 0.764114081915817 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630955_6631046:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 6632450 C/T 1 260 218 478 121.006859997164 116.540402002378 4.46645799478691 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.713821117669577 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000299424:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000527248:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000531760:exon_6632419_6632534:TAF10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 6636106 T/A 1 59 34 93 27.4592489993565 18.1760260003708 9.28322299898574 A:T T A 10 0.534589000010906 0.0610054218509517 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000429085:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000524611:exon_6636097_6636222:TPP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 6638569 G/A 1 33 24 57 15.3585629996401 12.8301360002617 2.52842699937836 A:G G A 10 0.534589000010906 0.595749209157065 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6638532_6638646:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000524788:exon_6638206_6638592:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000528571:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000428886:exon_6638221_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000534644:exon_6638532_6638659:TPP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 6643976 C/T 1 4 8 12 1.86164399995638 4.27671200008725 -2.41506800013087 T:C C T 10 0.534589000010906 0.246532544157622 ENSG00000166341:ENST00000299441:exon_6642556_6645621:DCHS1;ENSG00000166341:ENST00000442153:exon_6642562_6645621:DCHS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 8008934 C/T 1 449 471 920 208.969538995103 251.791419005137 -42.8218800100335 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0049460343619637 ENSG00000175390:ENST00000533626:exon_8008445_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000449102:exon_8008855_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000309828:exon_8008867_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000531329:exon_8008884_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000528653:exon_8008903_8009263:EIF3F HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 9537904 G/C 1 14 13 27 6.51575399984732 6.94965700014178 -0.433903000294463 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000166478:ENST00000396604:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396602:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000530463:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396597:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000299606:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000447186:exon_9537748_9537909:ZNF143 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 9754221 C/T 1 36 28 64 16.7547959996074 14.9684920003054 1.78630399930201 T:C C T 10 0.534589000010906 0.707833771544174 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9754076_9754257:SWAP70 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 9769483 C/T 1 31 47 78 14.4277409996619 25.1256830005126 -10.6979420008507 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0169037740711130 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 9769562 C/G 1 55 49 104 25.5976049994002 26.1948610005344 -0.597256001134227 C:G C G 10 0.534589000010906 0.921963433432994 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 13441126 A/G 1 4 11 15 1.86164399995638 5.88047900011997 -4.01883500016359 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0413471963302241 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13441040_13441292:BTBD10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 13443250 C/T 1 4 10 14 1.86164399995638 5.34589000010906 -3.48424600015268 T:C C T 10 0.534589000010906 0.104581828814314 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13443189_13443362:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13443189_13443385:BTBD10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 17098991 T/C 1 1847 1 1848 859.614116979857 0.534589000010906 859.079527979846 T:C T C 10 0.534589000010906 0 ENSG00000110700:ENST00000228140:exon_17098976_17099024:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000526895:exon_17098976_17099020:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000525634:exon_17098976_17099024:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000525828:exon_17098976_17099215:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000533969:exon_17098976_17099024:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000527571:exon_17098976_17099214:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000534329:exon_17098976_17099024:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000528074:exon_17098502_17099024:RPS13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 17351683 C/G 1 22 15 37 10.2390419997601 8.01883500016359 2.22020699959648 C:G C G 10 0.534589000010906 0.512515268374475 ENSG00000070081:ENST00000532658:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000533773:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000405119:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000323688:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000529010:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000458064:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000527580:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000531242:exon_17351674_17351844:NUCB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 4 9 13 1.86164399995638 4.81130100009815 -2.94965700014178 T:C C T 10 0.534589000010906 0.162146782239777 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 18319180 G/T 1 7 1 8 3.25787699992366 0.534589000010906 2.72328799991275 T:G G T 10 0.534589000010906 0.0755591978202379 ENSG00000110756:ENST00000438420:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000349215:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000396253:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000352460:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000531848:exon_18319106_18319264:HPS5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 18505552 G/A 1 24 23 47 11.1698639997383 12.2955470002508 -1.12568300051258 A:G G A 10 0.534589000010906 0.77141261178773 ENSG00000074319:ENST00000357193:exon_18505417_18505619:TSG101;ENSG00000074319:ENST00000251968:exon_18505417_18505619:TSG101 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 20404613 T/G 1 53 33 86 24.666782999422 17.6414370003599 7.02534599906208 T:G T G 10 0.534589000010906 0.131820683670622 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 20404757 T/C 1 50 52 102 23.2705499994547 27.7986280005671 -4.52807800111242 T:C T C 10 0.534589000010906 0.373656331467552 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 22647261 G/A 1 14 21 35 6.51575399984732 11.226369000229 -4.71061500038171 A:G G A 10 0.534589000010906 0.127799241921893 ENSG00000183161:ENST00000327470:exon_22644079_22647387:FANCF;ENSG00000148935:ENST00000528582:exon_22647188_22647359:GAS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 33880896 T/A 1 43 51 94 20.012672999531 27.2640390005562 -7.25136600102516 A:T T A 10 0.534589000010906 0.147859870208569 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 52 35 87 24.2013719994329 18.7106150003817 5.49075699905118 T:C T C 10 0.534589000010906 0.282449812470401 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 33886294 A/G 1 9 8 17 4.18869899990185 4.27671200008725 -0.0880130001854029 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33886148_33886475:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33886148_33886697:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33886148_33886363:LMO2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 44 19 63 20.4780839995201 10.1571910002072 10.3208929993129 T:C:G T G 10 0.534589000010906 0.0109920294415167 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 10 25 35 4.65410999989094 13.3647250002727 -8.71061500038171 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00358529861159387 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 20 15 35 9.30821999978188 8.01883500016359 1.28938499961829 A:G G A 10 0.534589000010906 0.736114007655199 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 34938265 C/T 1 5 7 12 2.32705499994547 3.74212300007634 -1.41506800013087 T:C C T 10 0.534589000010906 0.565015885912817 ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34938119_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34938179_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34938188_34938362:PDHX HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 34991727 T/C 1 8 8 16 3.72328799991275 4.27671200008725 -0.553424000174497 T:C T C 10 0.534589000010906 0.807042042252045 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34991686_34991833:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34991686_34991833:PDHX HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 35201842 C/T 1 211 171 382 98.2017209976988 91.4147190018649 6.78700199583389 T:C C T 10 0.534589000010906 0.505123002041694 ENSG00000026508:ENST00000263398:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000360158:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000449691:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528086:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433892:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000434472:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000352818:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000442151:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525211:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526669:exon_35201821_35201876:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526000:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000279452:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000527889:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531118:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528455:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531873:exon_35201826_35201954:CD44 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 35223158 T/C 1 2 7 9 0.930821999978188 3.74212300007634 -2.81130100009815 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0917858367386368 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 35226155 A/G 1 7 20 27 3.25787699992366 10.6917800002181 -7.43390300029446 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00585105189062213 ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531110:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534296:exon_35226059_35226456:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525241:exon_35226059_35226358:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526553:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534082:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528672:exon_35226059_35226187:CD44 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 35641312 G/A 1 25 19 44 11.6352749997273 10.1571910002072 1.47808399952013 A:G G A 10 0.534589000010906 0.762907380746898 ENSG00000179431:ENST00000317811:exon_35639735_35642419:FJX1;ENSG00000179431:ENST00000532914:exon_35641236_35641609:FJX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 35827958 A/G 1 20 24 44 9.30821999978188 12.8301360002617 -3.52191600047987 A:G A G 10 0.534589000010906 0.294586000695374 ENSG00000166326:ENST00000299413:exon_35827908_35829775:TRIM44;ENSG00000166326:ENST00000532066:exon_35827908_35828171:TRIM44 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 43776481 C/T 1 7 1 8 3.25787699992366 0.534589000010906 2.72328799991275 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0755591978202379 ENSG00000149084:ENST00000395700:exon_43776423_43777086:HSD17B12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 43876698 C/T 1 82 24 106 38.1637019991057 12.8301360002617 25.333565998844 A:T:C:G C T 10 0.534589000010906 4.41109351406981e-07 ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 43913604 G/A 1 15 13 28 6.98116499983641 6.94965700014178 0.0315079996946315 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43913591_43913679:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529366:exon_43913591_43913679:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530754:exon_43913591_43913679:ALKBH3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 43940602 C/G 1 25 39 64 11.6352749997273 20.8489710004253 -9.21369600069799 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0237722133738782 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 33 19 52 15.3585629996401 10.1571910002072 5.20137199943289 T:G G T 10 0.534589000010906 0.165451500120164 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 44101118 C/T 1 11 14 25 5.11952099988003 7.48424600015268 -2.36472500027265 T:C C T 10 0.534589000010906 0.423628611134497 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44101081_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44101081_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44101081_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000531940:exon_44101081_44101157:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44098873_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000532122:exon_44100888_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000531190:exon_44100888_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527557:exon_44101079_44101170:ACCS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 44104981 C/T 1 8 18 26 3.72328799991275 9.62260200019631 -5.89931400028356 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0287356442755983 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 26 32 58 12.1006859997164 17.106848000349 -5.00616200063255 A:G A G 10 0.534589000010906 0.19114129733589 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 45937303 A/G 1 20 21 41 9.30821999978188 11.226369000229 -1.91814900044715 A:G A G 10 0.534589000010906 0.639189413952457 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45937254_45937387:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45937254_45937387:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45937254_45937387:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000525192:exon_45937254_45937387:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000525229:exon_45937254_45937387:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000528674:exon_45937254_45937387:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000529030:exon_45937254_45937387:PEX16 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 45975130 C/T 1 14 16 30 6.51575399984732 8.5534240001745 -2.03767000032718 T:C C T 10 0.534589000010906 0.470259628180765 ENSG00000135365:ENST00000257821:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527401:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000323180:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000418153:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527753:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000534766:exon_45975078_45975166:PHF21A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 46387868 A/G 1 10 3 13 4.65410999989094 1.60376700003272 3.05034299985822 A:G A G 10 0.534589000010906 0.102317208684754 ENSG00000149091:ENST00000525434:exon_46387794_46388076:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000454345:exon_46387794_46388534:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000318201:exon_46387807_46388534:DGKZ HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 46403649 G/A 1 15 10 25 6.98116499983641 5.34589000010906 1.63527499972735 A:G G A 10 0.534589000010906 0.553361397131065 ENSG00000110492:ENST00000405308:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000441869:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000490240:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000405994:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000359803:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000533952:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395569:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395566:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000481047:exon_46403261_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000405098:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000430827:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000489525:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000407067:exon_46403303_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395565:exon_46403607_46403683:MDK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 47182985 G/A 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 A:G G A 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000149179:ENST00000395460:exon_47182678_47183798:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000532031:exon_47181656_47183796:C11orf49 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 47303275 T/C 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000489415:exon_47303126_47303304:MADD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 47306585 G/A 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000524530:exon_47306497_47306616:MADD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 47640429 G/C 1 54 64 118 25.1321939994111 34.213696000698 -9.08150200128691 C:G G C 10 0.534589000010906 0.097273936964581 ENSG00000109919:ENST00000302503:exon_47638868_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000534074:exon_47640256_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000531669:exon_47640262_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000525649:exon_47640391_47640471:MTCH2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 57076820 T/G 1 34 29 63 15.8239739996292 15.5030810003163 0.320892999312919 T:G T G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 57077464 T/C 1 25 18 43 11.6352749997273 9.62260200019631 2.01267299953104 T:C T C 10 0.534589000010906 0.647044752750656 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 57081197 G/C 1 6 14 20 2.79246599993456 7.48424600015268 -4.69178000021812 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0431004774055677 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 58318619 C/G 1 46 48 94 21.4089059994983 25.6602720005235 -4.25136600102517 C:G C G 10 0.534589000010906 0.408789135135962 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58318538_58318705:LPXN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 58378424 A/G 1 4 16 20 1.86164399995638 8.5534240001745 -6.69178000021812 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00296312731174006 ENSG00000186660:ENST00000316059:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000186660:ENST00000389918:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000255073:ENST00000389919:exon_58378423_58378527:AP001350.3;ENSG00000255073:ENST00000422974:exon_58378423_58378527:AP001350.3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 58919813 A/G 1 34 32 66 15.8239739996292 17.106848000349 -1.2828740007198 A:G A G 10 0.534589000010906 0.80550244026644 ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 58940278 G/T 1 7 9 16 3.25787699992366 4.81130100009815 -1.5534240001745 T:G G T 10 0.534589000010906 0.462907821628628 ENSG00000110042:ENST00000227451:exon_58939965_58940279:DTX4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 60184191 G/A 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 A:G G A 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000166928:ENST00000531787:exon_60182910_60185161:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000300187:exon_60182910_60185161:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000395005:exon_60182910_60185161:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000530662:exon_60182910_60185158:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000527841:exon_60182910_60185158:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000525397:exon_60182910_60185036:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000531783:exon_60182910_60185161:MS4A14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 60609972 A/G 1 64 61 125 29.786303999302 32.6099290006653 -2.82362500136325 A:G A G 10 0.534589000010906 0.654223433454563 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 60610056 G/C 1 60 48 108 27.9246599993456 25.6602720005235 2.26438799882215 C:G G C 10 0.534589000010906 0.700194257446517 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 61895741 A/G 1 9 11 20 4.18869899990185 5.88047900011997 -1.69178000021812 A:G A G 10 0.534589000010906 0.505607767076301 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61895623_61895773:INCENP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 61897359 C/T 1 18 18 36 8.37739799980369 9.62260200019631 -1.24520400039262 T:C C T 10 0.534589000010906 0.739482103379621 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 61907716 G/A 1 19 24 43 8.84280899979279 12.8301360002617 -3.98732700046896 A:G G A 10 0.534589000010906 0.226193822184689 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61907706_61907757:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61907706_61907757:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61907706_61907757:INCENP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 62334908 G/C 1 1257 759 2016 585.021626986291 405.753051008278 179.268575978013 A:T:C:G G C 10 0.534589000010906 9.2792385641064e-16 ENSG00000254772:ENST00000329251:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000525340:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000378019:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000524420:exon_62334871_62335000:EEF1G HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 62365665 G/A 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000149480:ENST00000526844:exon_62365581_62365862:MTA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 62378660 G/A 1 21 17 38 9.77363099977097 9.0880130001854 0.68561799958557 A:G G A 10 0.534589000010906 0.871910130672068 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 62378801 T/C 1 23 18 41 10.7044529997492 9.62260200019631 1.08185099955285 T:C:G T C 10 0.534589000010906 0.756980786078456 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 63672479 G/A 1 17 13 30 7.9119869998146 6.94965700014178 0.962329999672819 A:G G A 10 0.534589000010906 0.85523438102995 ENSG00000072518:ENST00000508192:exon_63672258_63672515:MARK2;ENSG00000072518:ENST00000502399:exon_63672264_63672515:MARK2;ENSG00000072518:ENST00000350490:exon_63672258_63672515:MARK2;ENSG00000072518:ENST00000509502:exon_63672264_63672515:MARK2;ENSG00000072518:ENST00000315032:exon_63672258_63672515:MARK2;ENSG00000072518:ENST00000377809:exon_63672258_63672515:MARK2;ENSG00000072518:ENST00000402010:exon_63672258_63672515:MARK2;ENSG00000072518:ENST00000361128:exon_63672258_63672515:MARK2;ENSG00000072518:ENST00000377810:exon_63672258_63672515:MARK2;ENSG00000072518:ENST00000413835:exon_63672258_63672515:MARK2;ENSG00000072518:ENST00000425897:exon_63672258_63672515:MARK2;ENSG00000072518:ENST00000513765:exon_63672264_63672515:MARK2;ENSG00000072518:ENST00000408948:exon_63672258_63672515:MARK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 63987339 C/T 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:C C T 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 63988045 G/A 1 135 168 303 62.8304849985277 89.8109520018322 -26.9804670033045 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00222074259998097 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 64026144 G/A 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64025945_64026185:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64025945_64026185:PLCB3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 64109118 T/G 1 12 4 16 5.58493199986913 2.13835600004362 3.4465759998255 T:G T G 10 0.534589000010906 0.130326098972588 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 64109208 G/C 1 14 19 33 6.51575399984732 10.1571910002072 -3.6414370003599 C:G G C 10 0.534589000010906 0.224604451059302 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 64111928 T/C 1 27 32 59 12.5660969997055 17.106848000349 -4.54075100064346 T:C T C 10 0.534589000010906 0.243031701409990 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 64124515 T/C 1 107 93 200 49.7989769988331 49.7167770010143 0.0821999978187904 A:T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64124511_64125006:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64124511_64124958:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64124511_64124997:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64124511_64125002:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64122666_64125000:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64124511_64124842:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000472524:exon_64124511_64125003:CCDC88B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 64138805 T/C 1 31 27 58 14.4277409996619 14.4339030002945 -0.00616200063254979 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64138755_64138813:RPS6KA4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 64572018 T/C 1 30 45 75 13.9623299996728 24.0565050004908 -10.094175000818 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0206330053608206 ENSG00000133895:ENST00000377316:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64571806_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64571847_64572288:MEN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 141 145 286 65.6229509984622 77.5154050015814 -11.8924540031191 T:C T C 10 0.534589000010906 0.172709428946725 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 64898226 C/T 1 44 39 83 20.4780839995201 20.8489710004253 -0.370887000905203 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000162298:ENST00000294256:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000377190:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000307289:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000449943:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526060:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000434219:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526121:exon_64898200_64898273:SYVN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 46 42 88 21.4089059994983 22.4527380004581 -1.04383200095973 T:C C T 10 0.534589000010906 0.831591991388527 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65161129 C/T 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000528854:exon_65161044_65161226:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65161044_65161145:FRMD8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65161525 G/A 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 A:G G A 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000526201:exon_65161512_65161570:FRMD8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65164357 C/T 1 7 8 15 3.25787699992366 4.27671200008725 -1.01883500016359 T:C C T 10 0.534589000010906 0.615581524507087 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65164270_65164408:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000531151:exon_65164270_65164491:FRMD8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65293819 G/A 1 50 39 89 23.2705499994547 20.8489710004253 2.42157899902936 A:G G A 10 0.534589000010906 0.671146623493485 ENSG00000142186:ENST00000270176:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000525364:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000420247:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000533862:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527630:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000349495:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000279270:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000417543:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000524944:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527009:exon_65293595_65293821:SCYL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 24 36 60 11.1698639997383 19.2452040003926 -8.07534000065436 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0387644257230064 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 18 21 39 8.37739799980369 11.226369000229 -2.84897100042534 T:G T G 10 0.534589000010906 0.422955267397017 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 35 30 65 16.2893849996183 16.0376700003272 0.251714999291107 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65384727 C/T 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 T:C C T 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65384721_65384820:PCNXL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65386206 C/G 1 15 5 20 6.98116499983641 2.67294500005453 4.30821999978188 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0712795860430289 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65385411_65386538:PCNXL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65387012 C/T 1 10 12 22 4.65410999989094 6.41506800013087 -1.76095800023993 T:C C T 10 0.534589000010906 0.524043562584602 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65387008_65387131:PCNXL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65546857 A/C 1 19 15 34 8.84280899979279 8.01883500016359 0.823973999629194 A:C A C 10 0.534589000010906 0.864184099905938 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65547333 G/A 1 11 18 29 5.11952099988003 9.62260200019631 -4.50308100031628 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0977801092175839 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 1620 1818 3438 753.965819982332 971.882802019827 -217.916982037495 A:T:G G A 10 0.534589000010906 1.09234046627173e-13 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65629932 T/C 1 19 7 26 8.84280899979279 3.74212300007634 5.10068599971644 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0498866353028037 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65629934 G/C 1 17 7 24 7.9119869998146 3.74212300007634 4.16986399973825 C:G G C 10 0.534589000010906 0.102874824022524 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 29 13 42 13.4969189996837 6.94965700014178 6.54726199954195 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0450414774408262 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 38 32 70 17.6856179995856 17.106848000349 0.578769999236577 A:G G A 10 0.534589000010906 0.905303835324234 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 43 30 73 20.012672999531 16.0376700003272 3.97500299920386 T:G G T 10 0.534589000010906 0.411708438875764 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 29 27 56 13.4969189996837 14.4339030002945 -0.936984000610737 A:G G A 10 0.534589000010906 0.893599684023243 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 59 75 134 27.4592489993565 40.094175000818 -12.6349260014614 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0303823754492705 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65735174 G/C 1 46 30 76 21.4089059994983 16.0376700003272 5.37123599917114 C:G G C 10 0.534589000010906 0.250316455013524 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65735150_65735292:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65735150_65735292:SART1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 65826704 G/A 1 187 158 345 87.0318569979606 84.4650620017232 2.56679499623742 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.787594111045041 ENSG00000087365:ENST00000528302:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000322535:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000355456:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000529994:exon_65826672_65826809:SF3B2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 66031660 C/T 1 22 19 41 10.2390419997601 10.1571910002072 0.0818509995528522 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66031517_66031690:KLC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 66105194 G/A 1 68 71 139 31.6479479992584 37.9558190007743 -6.30787100151594 A:G G A 10 0.534589000010906 0.307784623477302 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66104804_66105278:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66104840_66105360:BRMS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 66276576 G/A 1 36 44 80 16.7547959996074 23.5219160004799 -6.76712000087248 A:G G A 10 0.534589000010906 0.145157381233850 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66276550_66277021:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66276550_66277128:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66276550_66277130:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66276550_66277130:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66276550_66276816:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66276550_66277127:DPP3;ENSG00000174483:ENST00000419755:exon_66276546_66276785:BBS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 66612999 C/T 1 33 18 51 15.3585629996401 9.62260200019631 5.73596099944379 T:C C T 10 0.534589000010906 0.122819775659848 ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66612637_66613997:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000309657:exon_66612971_66613033:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000524849:exon_66612971_66613033:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000525356:exon_66612971_66613033:RCE1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 67068530 C/T 1 25 20 45 11.6352749997273 10.6917800002181 0.943494999509229 T:C C T 10 0.534589000010906 0.881474380728673 ENSG00000172932:ENST00000447274:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000511455:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000308440:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000514166:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000512231:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000513750:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000507915:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000506119:exon_67068461_67068599:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000515828:exon_67068247_67068618:ANKRD13D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 67068859 T/C 1 28 27 55 13.0315079996946 14.4339030002945 -1.40239500059983 T:C T C 10 0.534589000010906 0.787232658296689 ENSG00000172932:ENST00000447274:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000511455:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000308440:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000514166:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000512231:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000513750:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000507915:exon_67068753_67069294:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000515828:exon_67068753_67068869:ANKRD13D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 67164791 T/C 1 13 4 17 6.05034299985822 2.13835600004362 3.9119869998146 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0860483604965006 ENSG00000172613:ENST00000307980:exon_67164650_67164857:RAD9A;ENSG00000172613:ENST00000529100:exon_67164650_67164861:RAD9A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 67166337 G/A 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 0.529760851175976 ENSG00000172531:ENST00000532279:exon_67166193_67166634:PPP1CA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 67171736 C/T 1 22 24 46 10.2390419997601 12.8301360002617 -2.59109400050168 T:C C T 10 0.534589000010906 0.463097485658083 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67171662_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67171600_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67171658_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67171660_67171825:TBC1D10C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 67172911 C/T 1 44 27 71 20.4780839995201 14.4339030002945 6.04418099922567 T:C C T 10 0.534589000010906 0.155456592573965 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67172870_67172977:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67172870_67172977:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67172870_67172977:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67172870_67172977:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000533745:exon_67172870_67172977:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529132:exon_67172870_67172977:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000526474:exon_67172719_67172977:TBC1D10C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 73 48 121 33.9750029992039 25.6602720005235 8.31473099868037 T:C C T 10 0.534589000010906 0.144767731134425 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 53 37 90 24.666782999422 19.7797930004035 4.88698999901846 T:C C T 10 0.534589000010906 0.341866593642385 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 67351585 C/G 1 10 9 19 4.65410999989094 4.81130100009815 -0.157191000207215 C:G C G 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 67352256 C/A 1 13 9 22 6.05034299985822 4.81130100009815 1.23904199976007 A:C C A 10 0.534589000010906 0.672470686731093 ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000489040:exon_67352156_67352535:GSTP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 1984 1815 3799 923.375423978362 970.279035019794 -46.9036110414321 A:T:C:G A G 10 0.534589000010906 0.130401998619419 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 24 15 39 11.1698639997383 8.01883500016359 3.15102899957466 T:C C T 10 0.534589000010906 0.339042124161351 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 67816463 G/C 1 64 29 93 29.786303999302 15.5030810003163 14.2832229989857 T:C:G G C 10 0.534589000010906 0.00339848535960954 ENSG00000110719:ENST00000265686:exon_67816346_67816464:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000532635:exon_67816346_67816464:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000525724:exon_67816346_67816464:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000533005:exon_67816346_67816464:TCIRG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 68704028 C/T 1 7 18 25 3.25787699992366 9.62260200019631 -6.36472500027265 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0146215782960437 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 A:C:G G C 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 71185479 T/C 1 11 8 19 5.11952099988003 4.27671200008725 0.842808999792785 T:C T C 10 0.534589000010906 0.819574245361162 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 71185518 T/C 1 9 10 19 4.18869899990185 5.34589000010906 -1.15719100020721 T:C T C 10 0.534589000010906 0.650010996424856 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 72408055 G/C 1 50 45 95 23.2705499994547 24.0565050004908 -0.785955001036076 C:G G C 10 0.534589000010906 0.918212248142995 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72407594_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408028_72408240:ARAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 72408657 C/T 1 32 46 78 14.893151999651 24.5910940005017 -9.69794200085067 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0308275946064731 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408643_72408694:ARAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 72700079 C/A 1 14 9 23 6.51575399984732 4.81130100009815 1.70445299974916 A:C C A 10 0.534589000010906 0.535325651889601 ENSG00000137478:ENST00000311172:exon_72700009_72700142:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000409418:exon_72700009_72700142:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000409314:exon_72700009_72700142:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000432043:exon_72700009_72700142:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000458644:exon_72700009_72700142:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000409853:exon_72700009_72700142:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000422375:exon_72700046_72700142:FCHSD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 73120653 A/G 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000054965:ENST00000064778:exon_73120532_73120706:FAM168A;ENSG00000054965:ENST00000356467:exon_73120532_73120706:FAM168A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 73620537 C/G 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 C:G C G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73620444_73620638:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73620444_73620638:PAAF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 73689474 G/A 1 86 65 151 40.0253459990621 34.7482850007089 5.27706099835319 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.415117581492129 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73689298_73689522:UCP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 73915481 T/C 1 8 3 11 3.72328799991275 1.60376700003272 2.11952099988003 T:C T C 10 0.534589000010906 0.238841320527235 ENSG00000214517:ENST00000398427:exon_73915398_73915490:PPME1;ENSG00000214517:ENST00000328257:exon_73915398_73915490:PPME1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 74546905 G/A 1 2 12 14 0.930821999978188 6.41506800013087 -5.48424600015268 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00512162111311059 ENSG00000166439:ENST00000299563:exon_74546591_74553458:RNF169 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 75277628 A/G 1 23 28 51 10.7044529997492 14.9684920003054 -4.26403900055621 A:G A G 10 0.534589000010906 0.262141452698135 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526242:exon_75277512_75277726:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277395_75277700:SERPINH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 75277757 C/G 1 16 16 32 7.4465759998255 8.5534240001745 -1.10684800034899 C:G C G 10 0.534589000010906 0.725761441333252 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 75279846 C/T 1 31 23 54 14.4277409996619 12.2955470002508 2.13219399941107 T:C C T 10 0.534589000010906 0.587922272765463 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 43 41 84 20.012672999531 21.9181490004471 -1.90547600091611 A:G G A 10 0.534589000010906 0.743067207643521 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 27 15 42 12.5660969997055 8.01883500016359 4.54726199954195 T:C T C 10 0.534589000010906 0.167495467529491 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 77924870 C/T 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 T:C C T 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77924692_77925072:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77924692_77925184:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77924692_77925757:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77924692_77925465:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77924692_77925753:USP35 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 78279790 T/G 1 9 8 17 4.18869899990185 4.27671200008725 -0.0880130001854029 T:G T G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000526709:exon_78279761_78279798:NARS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 82535963 C/T 1 50 82 132 23.2705499994547 43.8362980008943 -20.5657480014396 T:C C T 10 0.534589000010906 0.000439029514226497 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82534544_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532767:exon_82535409_82542480:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82535410_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82535415_82536164:PRCP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 82643760 G/T 1 7 8 15 3.25787699992366 4.27671200008725 -1.01883500016359 T:G G T 10 0.534589000010906 0.615581524507087 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 82644904 G/A 1 11 6 17 5.11952099988003 3.20753400006544 1.9119869998146 A:G G A 10 0.534589000010906 0.467664186074611 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 85374993 C/T 1 14 22 36 6.51575399984732 11.7609580002399 -5.24520400039262 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0945747783400786 ENSG00000137504:ENST00000490820:exon_85374568_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000528561:exon_85374568_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000260058:exon_85374859_85375697:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527529:exon_85374859_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000525639:exon_85374859_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000398294:exon_85374859_85375269:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527447:exon_85372110_85376146:CREBZF HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 85692181 A/C 1 7 13 20 3.25787699992366 6.94965700014178 -3.69178000021812 A:C A C 10 0.534589000010906 0.117777156244559 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530692:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529760:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532603:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529016:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526961:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530542:exon_85692172_85692271:PICALM HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 7 9 16 3.25787699992366 4.81130100009815 -1.5534240001745 T:C C T 10 0.534589000010906 0.462907821628628 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 88027209 T/C 1 222 232 454 103.321241997579 124.02464800253 -20.7034060049513 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0537275218389675 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 88027393 A/C 1 178 169 347 82.8431579980587 90.3455410018431 -7.50238300378439 A:C A C 10 0.534589000010906 0.420197319831885 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 95512060 A/G 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 A:G A G 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000077458:ENST00000358780:exon_95511986_95512121:FAM76B;ENSG00000077458:ENST00000398187:exon_95511986_95512121:FAM76B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 86 75 161 40.0253459990621 40.094175000818 -0.0688290017558728 A:C:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 95580926 G/A 1 9 16 25 4.18869899990185 8.5534240001745 -4.36472500027265 A:G G A 10 0.534589000010906 0.107346258595778 ENSG00000087053:ENST00000346299:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000393223:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000409459:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000352297:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000444541:exon_95580878_95581063:MTMR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 95712897 G/T 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 T:G G T 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95709762_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95711440_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95712112_95713127:MAML2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 72 86 158 33.5095919992148 45.9746540009379 -12.4650620017232 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0552869339163933 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 102272884 C/T 1 36 39 75 16.7547959996074 20.8489710004253 -4.09417500081796 T:C C T 10 0.534589000010906 0.356392834100926 ENSG00000152558:ENST00000361236:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000398136:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000532161:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000528969:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000529492:exon_102272475_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000525577:exon_102272656_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000531103:exon_102272765_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000526676:exon_102272830_102272937:TMEM123 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 110327745 C/T 1 18 17 35 8.37739799980369 9.0880130001854 -0.710615000381711 T:C C T 10 0.534589000010906 0.86625268328472 ENSG00000137714:ENST00000260270:exon_110327642_110327771:FDX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 19 19 38 8.84280899979279 10.1571910002072 -1.31438200041443 T:C C T 10 0.534589000010906 0.745799595822869 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 116633862 G/A 1 11 9 20 5.11952099988003 4.81130100009815 0.308219999781879 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 116655600 G/A 1 36 25 61 16.7547959996074 13.3647250002727 3.39007099933473 A:G G A 10 0.534589000010906 0.441801275356927 ENSG00000109917:ENST00000429220:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000444935:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000227322:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000449430:exon_116655575_116655637:ZNF259 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 116728630 G/C 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 0 48 0 48 22.3397279994765 0 22.3397279994765 A A 10 0.534589000010906 9.44853181558031e-14 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 117096652 G/A 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117096647_117096737:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117095417_117097592:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117096647_117096737:PCSK7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 117097952 C/T 1 10 8 18 4.65410999989094 4.27671200008725 0.377397999803692 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117097873_117098038:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117097873_117098038:PCSK7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 118919206 T/C 1 72 53 125 33.5095919992148 28.333217000578 5.17637499863674 T:C T C 10 0.534589000010906 0.370940018270621 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531682:exon_118919069_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919184_118919275:HYOU1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 119205830 A/G 1 13 10 23 6.05034299985822 5.34589000010906 0.704452999749162 A:G A G 10 0.534589000010906 0.836527371779212 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 120099658 A/G 1 7 11 18 3.25787699992366 5.88047900011997 -2.62260200019631 A:G A G 10 0.534589000010906 0.243363535954427 ENSG00000184232:ENST00000328965:exon_120099577_120101001:OAF;ENSG00000184232:ENST00000531220:exon_120099577_120099949:OAF HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 121475922 T/A 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:T T A 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 122646967 G/A 1 9 3 12 4.18869899990185 1.60376700003272 2.58493199986913 A:G G A 10 0.534589000010906 0.157534918401888 ENSG00000154127:ENST00000284273:exon_122646927_122646980:UBASH3B;ENSG00000154127:ENST00000526386:exon_122646927_122646980:UBASH3B;ENSG00000154127:ENST00000530917:exon_122646927_122646980:UBASH3B;ENSG00000154127:ENST00000533451:exon_122646342_122646980:UBASH3B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 122665437 A/G 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 0.529760851175976 ENSG00000154127:ENST00000284273:exon_122665410_122665542:UBASH3B;ENSG00000154127:ENST00000526493:exon_122665410_122665504:UBASH3B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 123596703 A/C 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:C A C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000166261:ENST00000336139:exon_123594885_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000530393:exon_123595488_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000529691:exon_123595488_123597699:ZNF202 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 41 58 99 19.0818509995529 31.0061620006325 -11.9243110010797 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0200520175747301 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 10 10 20 4.65410999989094 5.34589000010906 -0.69178000021812 A:C C A 10 0.534589000010906 0.824629775002564 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 125769354 T/C 1 26 10 36 12.1006859997164 5.34589000010906 6.75479599960738 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0288819413980233 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 129746707 G/T 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 T:G G T 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000170322:ENST00000304521:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000446488:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524794:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524746:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000531755:exon_129746616_129746790:NFRKB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 11 134047243 T/C 1 10 13 23 4.65410999989094 6.94965700014178 -2.29554700025084 T:C T C 10 0.534589000010906 0.404969031814226 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134047114_134047970:NCAPD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 520947 A/C 1 5 9 14 2.32705499994547 4.81130100009815 -2.48424600015268 A:C A C 10 0.534589000010906 0.283670203474933 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_520913_521144:CCDC77 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 674540 T/C 1 21 5 26 9.77363099977097 2.67294500005453 7.10068599971644 T:C T C 10 0.534589000010906 0.00528359015241178 ENSG00000171840:ENST00000305108:exon_674383_674567:NINJ2;ENSG00000171840:ENST00000397265:exon_674383_674567:NINJ2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 1863449 A/T 1 13 29 42 6.05034299985822 15.5030810003163 -9.45273800045805 A:T A T 10 0.534589000010906 0.0047616264196367 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1863424_1863680:ADIPOR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 107 44 151 49.7989769988331 23.5219160004799 26.2770609983532 A:T:G A G 10 0.534589000010906 1.83929940029322e-05 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 87 36 123 40.4907569990512 19.2452040003926 21.2455529986586 A:G G A 10 0.534589000010906 0.000127409515228949 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 24 18 42 11.1698639997383 9.62260200019631 1.54726199954194 A:G A G 10 0.534589000010906 0.646830707540118 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 39 22 61 18.1510289995747 11.7609580002399 6.39007099933473 A:G A G 10 0.534589000010906 0.122983517743379 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6571279 T/C 1 7 48 55 3.25787699992366 25.6602720005235 -22.4023950005998 T:C T C 10 0.534589000010906 5.63783983736745e-10 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6571200_6571484:TAPBPL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 74 23 97 34.440413999193 12.2955470002508 22.1448669989421 A:G A G 10 0.534589000010906 5.21661265601297e-06 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 64 106 170 29.786303999302 56.666434001156 -26.880130001854 T:C C T 10 0.534589000010906 4.07551862139234e-05 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6639981 C/G 1 159 78 237 74.0003489982659 41.6979420008507 32.3024069974153 C:G C G 10 0.534589000010906 2.76556731853270e-05 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6639857_6639983:NCAPD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6640519 G/A 1 361 208 569 168.013370996063 111.194512002268 56.8188589937945 A:G G A 10 0.534589000010906 1.56431695392484e-06 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6640493_6641120:NCAPD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6643991 C/G 1 5526 2451 7977 2571.86118593973 1310.27763902673 1261.583546913 A:T:C:G C G 10 0.534589000010906 3.64822718599927e-182 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000496049:exon_6643976_6644307:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6643976_6644157:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6643958_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6643985_6644027:GAPDH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 5284 2318 7602 2459.23172394237 1239.17730202528 1220.05442191709 A:T:C:G T C 10 0.534589000010906 5.43144236807109e-179 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 5404 2434 7838 2515.08104394106 1301.18962602655 1213.89141791452 A:T:C T C 10 0.534589000010906 1.62828932341797e-171 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6657538 T/G 1 7 1 8 3.25787699992366 0.534589000010906 2.72328799991275 T:G T G 10 0.534589000010906 0.0755591978202379 ENSG00000010295:ENST00000488007:exon_6657231_6657711:IFFO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6690909 C/T 1 226 133 359 105.182885997535 71.1003370014505 34.0825489960847 T:C C T 10 0.534589000010906 0.000311175501250129 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6690815_6690980:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6690815_6690980:CHD4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 77 45 122 35.8366469991602 24.0565050004908 11.7801419986695 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0365498118571739 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6858126 G/A 1 311 108 419 144.742820996608 57.7356120011778 87.0072089954304 A:G G A 10 0.534589000010906 3.27385887355187e-18 ENSG00000089693:ENST00000435120:exon_6857936_6858148:MLF2;ENSG00000089693:ENST00000203630:exon_6857936_6858148:MLF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6954812 C/T 1 5 11 16 2.32705499994547 5.88047900011997 -3.5534240001745 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0838041199296228 ENSG00000111664:ENST00000229264:exon_6954750_6954966:GNB3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6979199 G/A 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 A:G G A 10 0.534589000010906 0.189086525758904 ENSG00000111669:ENST00000474253:exon_6979181_6979300:TPI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6980442 G/A 1 11 26 37 5.11952099988003 13.8993140002836 -8.77979300040352 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00457567520462762 ENSG00000111671:ENST00000523102:exon_6980099_6980483:SPSB2;ENSG00000111671:ENST00000524270:exon_6980099_6980483:SPSB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 6980482 C/T 1 9 40 49 4.18869899990185 21.3835600004362 -17.1948610005344 T:C C T 10 0.534589000010906 8.03063412197077e-07 ENSG00000111671:ENST00000523102:exon_6980099_6980483:SPSB2;ENSG00000111671:ENST00000524270:exon_6980099_6980483:SPSB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 7014766 T/C 1 6 22 28 2.79246599993456 11.7609580002399 -8.96849200030537 T:C T C 10 0.534589000010906 0.000897126633153377 ENSG00000010626:ENST00000433346:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000449039:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000457146:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000486401:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000431207:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000415834:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7014749_7014923:LRRC23 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 7015707 G/T 1 9 25 34 4.18869899990185 13.3647250002727 -9.17602600037081 T:G G T 10 0.534589000010906 0.00172734920100461 ENSG00000010626:ENST00000433346:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000457146:exon_7015573_7015782:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000486401:exon_7015573_7015919:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000431207:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7015573_7015826:LRRC23 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 7022085 T/A 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:T T A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 7022135 C/T 1 9 7 16 4.18869899990185 3.74212300007634 0.446575999825503 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 24 13 37 11.1698639997383 6.94965700014178 4.22020699959648 A:G A G 10 0.534589000010906 0.188740822052331 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 7044943 G/A 1 33 79 112 15.3585629996401 42.2325310008616 -26.8739680012215 A:G G A 10 0.534589000010906 3.33943122531118e-07 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7044710_7046724:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7044710_7046724:ATN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 7045160 G/C 1 64 28 92 29.786303999302 14.9684920003054 14.8178119989966 C:G G C 10 0.534589000010906 0.00226300285323472 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7044710_7046724:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7044710_7046724:ATN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 7592035 G/T 1 40 1 41 18.6164399995638 0.534589000010906 18.0818509995529 T:G G T 10 0.534589000010906 2.86259958734984e-10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 9094548 A/G 1 21 6 27 9.77363099977097 3.20753400006544 6.56609699970554 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0116955419948584 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 14577892 A/T 1 22 8 30 10.2390419997601 4.27671200008725 5.96232999967282 A:T A T 10 0.534589000010906 0.0422542417448784 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14576843_14578407:ATF7IP;ENSG00000171681:ENST00000396279:exon_14576850_14578391:ATF7IP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 14587301 A/G 1 10 32 42 4.65410999989094 17.106848000349 -12.4527380004581 A:G A G 10 0.534589000010906 0.000137310558466783 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14587271_14587357:ATF7IP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 14649196 A/G 1 32 20 52 14.893151999651 10.6917800002181 4.20137199943289 A:G A G 10 0.534589000010906 0.267809319270634 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14649165_14649277:ATF7IP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 14924028 A/G 1 2 7 9 0.930821999978188 3.74212300007634 -2.81130100009815 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0917858367386368 ENSG00000197837:ENST00000358064:exon_14923613_14924065:HIST4H4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 14927538 G/T 1 94 73 167 43.7486339989748 39.0249970007961 4.72363699817869 T:G G T 10 0.534589000010906 0.4857039974208 ENSG00000111332:ENST00000389078:exon_14927349_14927957:H2AFJ;ENSG00000111332:ENST00000228929:exon_14927405_14927759:H2AFJ HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 14976553 G/C 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000182993:ENST00000330828:exon_14975846_14977349:C12orf60 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 2041 935 2976 949.903850977741 499.840715010197 450.063135967544 A:T:C:G C G 10 0.534589000010906 3.36443677063551e-63 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 16516994 G/A 1 184 292 476 85.6356239979933 156.099988003185 -70.4643640051913 A:G G A 10 0.534589000010906 9.62543491405494e-11 ENSG00000008394:ENST00000010404:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396210:exon_16516729_16517342:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396209:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396207:exon_16516729_16517343:MGST1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 19626205 T/C 1 23 21 44 10.7044529997492 11.226369000229 -0.521916000479866 T:C T C 10 0.534589000010906 0.881154601714937 ENSG00000139154:ENST00000398864:exon_19626182_19626289:AEBP2;ENSG00000139154:ENST00000266508:exon_19626182_19626289:AEBP2;ENSG00000139154:ENST00000435841:exon_19626182_19626289:AEBP2;ENSG00000139154:ENST00000360995:exon_19626182_19626289:AEBP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 21621533 G/A 1 13 35 48 6.05034299985822 18.7106150003817 -12.6602720005235 A:G G A 10 0.534589000010906 0.000246888340510753 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 23 47 70 10.7044529997492 25.1256830005126 -14.4212300007634 T:G T G 10 0.534589000010906 0.00068603227737919 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 21623969 A/G 1 107 54 161 49.7989769988331 28.8678060005889 20.9311709982441 A:G A G 10 0.534589000010906 0.000880499024442515 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21623903_21624032:RECQL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 25362777 A/G 1 2 10 12 0.930821999978188 5.34589000010906 -4.41506800013087 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0167573406364211 ENSG00000133703:ENST00000311936:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000256078:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000406761:exon_25362729_25362845:KRAS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 27064232 C/T 1 53 27 80 24.666782999422 14.4339030002945 10.2328799991275 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0245957501126830 ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27064111_27064250:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27064111_27064250:C12orf11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 28605426 G/A 1 29 60 89 13.4969189996837 32.0753400006544 -18.5784210009706 A:G G A 10 0.534589000010906 0.000105731391482963 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28605411_28605587:CCDC91 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 29486745 T/C 1 12 13 25 5.58493199986913 6.94965700014178 -1.36472500027265 T:C T C 10 0.534589000010906 0.689551323254237 ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29486565_29487005:FAR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 29521193 A/G 1 3 15 18 1.39623299996728 8.01883500016359 -6.62260200019631 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00174471102604526 ENSG00000087502:ENST00000360150:exon_29521174_29521220:ERGIC2;ENSG00000087502:ENST00000201023:exon_29521174_29521220:ERGIC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 31944691 A/C 0 31 0 31 14.4277409996619 0 14.4277409996619 A A 10 0.534589000010906 5.55075131370475e-09 ENSG00000188375:ENST00000340398:exon_31944119_31945175:H3F3C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 32134240 C/T 1 32 17 49 14.893151999651 9.0880130001854 5.8051389994656 T:C C T 10 0.534589000010906 0.114885522880872 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 32134926 G/A 1 16 21 37 7.4465759998255 11.226369000229 -3.77979300040352 A:G G A 10 0.534589000010906 0.249367416803454 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 32481093 G/C 1 8 32 40 3.72328799991275 17.106848000349 -13.3835600004362 T:C:G G C 10 0.534589000010906 2.02565983576058e-05 ENSG00000151746:ENST00000457150:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000281474:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000395758:exon_32480395_32481489:BICD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 42481732 G/A 1 2 8 10 0.930821999978188 4.27671200008725 -3.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0527671529214564 ENSG00000151233:ENST00000398675:exon_42475650_42481749:GXYLT1;ENSG00000151233:ENST00000280876:exon_42475650_42481749:GXYLT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 46321514 A/T 1 39 48 87 18.1510289995747 25.6602720005235 -7.50924300094883 A:T A T 10 0.534589000010906 0.108329951850839 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 48185449 G/A 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000061273:ENST00000080059:exon_48185369_48185489:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000354334:exon_48185369_48185489:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000470668:exon_48185369_48185489:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000459625:exon_48185369_48185489:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000419356:exon_48185369_48185489:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000310824:exon_48185369_48185489:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000380610:exon_48185369_48185489:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000477203:exon_48185369_48185489:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000488927:exon_48185369_48185489:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000477937:exon_48185369_48185489:HDAC7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 17 17 34 7.9119869998146 9.0880130001854 -1.1760260003708 T:C C T 10 0.534589000010906 0.732812837731546 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 48477422 A/G 1 5 9 14 2.32705499994547 4.81130100009815 -2.48424600015268 A:G A G 10 0.534589000010906 0.283670203474933 ENSG00000079387:ENST00000004980:exon_48477374_48477545:SENP1;ENSG00000079387:ENST00000448372:exon_48477374_48477545:SENP1;ENSG00000079387:ENST00000339976:exon_48477374_48477545:SENP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 48526712 G/A 1 9 23 32 4.18869899990185 12.2955470002508 -8.10684800034899 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00433843367827794 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48526651_48526840:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48526651_48526840:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48526651_48526840:PFKM HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 42 17 59 19.5472619995419 9.0880130001854 10.4592489993565 T:G G T 10 0.534589000010906 0.00606887034705291 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 49086963 G/A 1 8 4 12 3.72328799991275 2.13835600004362 1.58493199986913 A:G G A 10 0.534589000010906 0.401454124777931 ENSG00000129315:ENST00000261900:exon_49086752_49088219:CCNT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 50189602 A/G 1 24 12 36 11.1698639997383 6.41506800013087 4.75479599960738 A:G A G 10 0.534589000010906 0.13294662285611 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 50189807 C/A 1 25 15 40 11.6352749997273 8.01883500016359 3.61643999956376 A:C C A 10 0.534589000010906 0.270927261847930 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 50189834 T/G 1 27 14 41 12.5660969997055 7.48424600015268 5.08185099955285 T:G T G 10 0.534589000010906 0.119642823581058 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 50190653 C/T 1 23 8 31 10.7044529997492 4.27671200008725 6.42774099966191 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0290644565058481 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 50190667 A/T 1 24 10 34 11.1698639997383 5.34589000010906 5.82397399962919 A:T A T 10 0.534589000010906 0.0574198082318187 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 50232169 A/T 1 15 12 27 6.98116499983641 6.41506800013087 0.566096999705537 A:T A T 10 0.534589000010906 0.84987578658165 ENSG00000186666:ENST00000333924:exon_50231560_50232798:BCDIN3D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 50236848 T/C 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 T:C T C 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000186666:ENST00000333924:exon_50236637_50236875:BCDIN3D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 50529736 G/A 1 29 15 44 13.4969189996837 8.01883500016359 5.47808399952013 A:G G A 10 0.534589000010906 0.129808750784030 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50529724_50529852:LASS5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 50537815 A/G 1 17 11 28 7.9119869998146 5.88047900011997 2.03150799969463 A:G A G 10 0.534589000010906 0.457094536572337 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50537735_50537840:LASS5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 51442944 G/A 1 24 10 34 11.1698639997383 5.34589000010906 5.82397399962919 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0574198082318187 ENSG00000050426:ENST00000262055:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000418425:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000448283:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380135:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380123:exon_51442817_51442968:LETMD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 51771040 T/C 1 12 4 16 5.58493199986913 2.13835600004362 3.4465759998255 T:C T C 10 0.534589000010906 0.130326098972588 ENSG00000139629:ENST00000356317:exon_51770979_51771151:GALNT6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 52639302 G/C 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 C:G G C 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000135480:ENST00000331817:exon_52639196_52639416:KRT7;ENSG00000135480:ENST00000422319:exon_52639196_52639416:KRT7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 53581376 C/T 1 6 8 14 2.79246599993456 4.27671200008725 -1.48424600015268 T:C C T 10 0.534589000010906 0.437971150157616 ENSG00000139651:ENST00000416904:exon_53581285_53584654:ZNF740;ENSG00000139651:ENST00000267122:exon_53581285_53584654:ZNF740 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 53586536 C/T 1 260 69 329 121.006859997164 36.8866410007525 84.1202189964119 T:C:G C T 10 0.534589000010906 6.56259963283831e-22 ENSG00000139626:ENST00000422257:exon_53586475_53586694:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000267082:exon_53586475_53586694:ITGB7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 45 85 130 20.9434949995092 45.440065000927 -24.4965700014178 T:C T C 10 0.534589000010906 1.99186760711364e-05 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 53670545 C/A 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:C C A 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53670404_53670643:ESPL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 53671005 G/A 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 A:G G A 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53670867_53671011:ESPL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 53682042 T/A 1 26 21 47 12.1006859997164 11.226369000229 0.874316999487416 A:T T A 10 0.534589000010906 0.884079059755605 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53681756_53682125:ESPL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 53682986 C/T 1 10 27 37 4.65410999989094 14.4339030002945 -9.77979300040352 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00146083647018430 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682874_53683087:ESPL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 54109733 A/G 1 11 17 28 5.11952099988003 9.0880130001854 -3.96849200030537 A:G A G 10 0.534589000010906 0.183844291494137 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 64 41 105 29.786303999302 21.9181490004471 7.86815499885487 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.142058299109786 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 54675113 G/A 1 7 6 13 3.25787699992366 3.20753400006544 0.0503429998582212 A:G G A 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 54970454 T/C 1 1 9 10 0.465410999989094 4.81130100009815 -4.34589000010906 T:C T C 10 0.534589000010906 0.00786026152417633 ENSG00000123360:ENST00000243052:exon_54970355_54970485:PDE1B;ENSG00000123360:ENST00000394277:exon_54970355_54970485:PDE1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 55355033 C/T 1 37 24 61 17.2202069995965 12.8301360002617 4.39007099933473 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.304779112707586 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55354989_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 56711371 C/T 1 27 27 54 12.5660969997055 14.4339030002945 -1.86780600058892 T:C C T 10 0.534589000010906 0.682869505124349 ENSG00000135473:ENST00000425394:exon_56710718_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000379495:exon_56710721_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000257931:exon_56710721_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000440411:exon_56710721_56711427:PAN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 57499408 G/A 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 A:G G A 10 0.534589000010906 0.759738684806709 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 57619362 G/A 1 13 8 21 6.05034299985822 4.27671200008725 1.77363099977097 A:G G A 10 0.534589000010906 0.515314898478003 ENSG00000182379:ENST00000349394:exon_57618661_57620229:NXPH4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 57649840 C/T 1 22 7 29 10.2390419997601 3.74212300007634 6.49691899968373 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0156390613474562 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57649773_57649857:R3HDM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 57869582 T/C 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 T:C T C 10 0.534589000010906 0.592941099997918 ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57869559_57869714:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57869559_57869714:ARHGAP9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 34 49 83 15.8239739996292 26.1948610005344 -10.3708870009052 A:C A C 10 0.534589000010906 0.0272410194240371 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 57911000 T/A 1 15 4 19 6.98116499983641 2.13835600004362 4.84280899979279 A:T T A 10 0.534589000010906 0.0359770464172895 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 57926791 T/G 1 75 106 181 34.905824999182 56.666434001156 -21.760609001974 T:G T G 10 0.534589000010906 0.00130885393874406 ENSG00000175203:ENST00000434715:exon_57926767_57926805:DCTN2;ENSG00000175203:ENST00000354743:exon_57926767_57926805:DCTN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 39 17 56 18.1510289995747 9.0880130001854 9.06301599938926 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0157541221312268 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 64803798 A/C 1 7 12 19 3.25787699992366 6.41506800013087 -3.15719100020722 A:C A C 10 0.534589000010906 0.170892403910016 ENSG00000184575:ENST00000332707:exon_64803742_64803875:XPOT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 65146532 C/T 1 8 4 12 3.72328799991275 2.13835600004362 1.58493199986913 T:C C T 10 0.534589000010906 0.401454124777931 ENSG00000135677:ENST00000258145:exon_65146478_65146537:GNS;ENSG00000135677:ENST00000418919:exon_65146478_65146537:GNS;ENSG00000135677:ENST00000432885:exon_65146478_65146537:GNS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 65632318 T/G 1 1 10 11 0.465410999989094 5.34589000010906 -4.88047900011997 T:G T G 10 0.534589000010906 0.0040450386649354 ENSG00000174106:ENST00000308330:exon_65632282_65632361:LEMD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 196 84 280 91.2205559978624 44.9054760009161 46.3150799969463 A:C:G G A 10 0.534589000010906 1.93087704594452e-08 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 69042495 A/G 1 2 17 19 0.930821999978188 9.0880130001854 -8.15719100020721 A:G A G 10 0.534589000010906 0.000128168053936044 ENSG00000127314:ENST00000460800:exon_69042479_69042561:RAP1B;ENSG00000127314:ENST00000485252:exon_69042479_69042561:RAP1B;ENSG00000127314:ENST00000450214:exon_69042479_69042561:RAP1B;ENSG00000127314:ENST00000456697:exon_69042479_69042561:RAP1B;ENSG00000127314:ENST00000250559:exon_69042479_69042561:RAP1B;ENSG00000127314:ENST00000393436:exon_69042479_69042561:RAP1B;ENSG00000127314:ENST00000425247:exon_69042479_69042561:RAP1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 51 146 197 23.7359609994438 78.0499940015923 -54.3140330021485 A:G G A 10 0.534589000010906 4.57225913887999e-15 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 70195439 A/G 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 A:G A G 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000127328:ENST00000247833:exon_70195389_70195501:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000483530:exon_70195389_70195501:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000362025:exon_70195389_70195501:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000325555:exon_70195389_70195501:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000378809:exon_70195389_70195501:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000325596:exon_70195389_70195501:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000526994:exon_70195389_70195501:RAB3IP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 72307616 A/G 1 10 5 15 4.65410999989094 2.67294500005453 1.98116499983641 A:G A G 10 0.534589000010906 0.438822405676019 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 75884254 C/T 1 9 14 23 4.18869899990185 7.48424600015268 -3.29554700025084 T:C C T 10 0.534589000010906 0.210289302298530 ENSG00000139278:ENST00000266659:exon_75884186_75884298:GLIPR1;ENSG00000139278:ENST00000456650:exon_75884186_75884298:GLIPR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 39 52 91 18.1510289995747 27.7986280005671 -9.64759900099245 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0459115424253311 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 80203620 T/G 1 12 29 41 5.58493199986913 15.5030810003163 -9.91814900044715 T:G T G 10 0.534589000010906 0.00250777522659314 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80203575_80203790:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80203575_80203790:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80203575_80203790:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80203575_80203790:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80203575_80203790:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80203575_80203790:PPP1R12A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 7 22 29 3.25787699992366 11.7609580002399 -8.50308100031627 C:G G C 10 0.534589000010906 0.00226174450343842 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 93196422 T/G 1 9 5 14 4.18869899990185 2.67294500005453 1.51575399984732 T:G T G 10 0.534589000010906 0.593864451936242 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93196180_93196510:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93196180_93196510:EEA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 93202801 C/T 1 7 11 18 3.25787699992366 5.88047900011997 -2.62260200019631 T:C C T 10 0.534589000010906 0.243363535954427 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93202793_93202932:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93202793_93202932:EEA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 94673277 G/A 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 A:G G A 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94673248_94673425:PLXNC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 94761701 T/C 1 17 12 29 7.9119869998146 6.41506800013087 1.49691899968372 T:C T C 10 0.534589000010906 0.710418220209128 ENSG00000173588:ENST00000339839:exon_94761570_94761719:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397809:exon_94761570_94761719:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397807:exon_94761570_94761719:CCDC41 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 100452564 G/T 1 26 11 37 12.1006859997164 5.88047900011997 6.22020699959648 T:G G T 10 0.534589000010906 0.0473714007546196 ENSG00000111647:ENST00000279907:exon_100451807_100453311:UHRF1BP1L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 104327979 C/T 1 328 617 945 152.654807996423 329.841413006729 -177.186605010306 T:C C T 10 0.534589000010906 5.14207793716934e-31 ENSG00000166598:ENST00000299767:exon_104327734_104328065:HSP90B1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 104341015 T/C 1 8 8 16 3.72328799991275 4.27671200008725 -0.553424000174497 T:C T C 10 0.534589000010906 0.807042042252045 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 104341398 T/A 1 9 2 11 4.18869899990185 1.06917800002181 3.11952099988003 A:T T A 10 0.534589000010906 0.0723916304569276 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 104698582 A/G 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 A:G A G 10 0.534589000010906 0.156883047615629 ENSG00000255150:ENST00000527879:exon_104697517_104698980:EID3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 105583877 G/A 1 14 3 17 6.51575399984732 1.60376700003272 4.9119869998146 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0256203520107063 ENSG00000136044:ENST00000258530:exon_105583769_105583933:APPL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 106633569 C/T 1 12 38 50 5.58493199986913 20.3143820004144 -14.7294500005453 T:C:G C T 10 0.534589000010906 2.69072019418138e-05 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 106838340 T/C 1 9 11 20 4.18869899990185 5.88047900011997 -1.69178000021812 T:C T C 10 0.534589000010906 0.505607767076301 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106838241_106838368:POLR3B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 106903321 T/C 1 11 25 36 5.11952099988003 13.3647250002727 -8.24520400039262 T:C T C 10 0.534589000010906 0.00695237329388627 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106903198_106903974:POLR3B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 109182049 T/C 1 1 8 9 0.465410999989094 4.27671200008725 -3.81130100009815 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0151819886668037 ENSG00000084112:ENST00000326495:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000360239:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000303438:exon_109180971_109183020:SSH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 131 58 189 60.9688409985713 31.0061620006325 29.9626789979388 A:T A T 10 0.534589000010906 1.05536263177372e-05 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 23 12 35 10.7044529997492 6.41506800013087 4.28938499961829 T:G G T 10 0.534589000010906 0.175651385675006 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 24 12 36 11.1698639997383 6.41506800013087 4.75479599960738 T:C C T 10 0.534589000010906 0.13294662285611 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 111993712 C/T 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000204842:ENST00000377617:exon_111993687_111993723:ATXN2;ENSG00000204842:ENST00000389153:exon_111993687_111993723:ATXN2;ENSG00000204842:ENST00000483311:exon_111993687_111993723:ATXN2;ENSG00000204842:ENST00000392645:exon_111993687_111993723:ATXN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 112191641 G/A 1 14 3 17 6.51575399984732 1.60376700003272 4.9119869998146 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0256203520107063 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000512792:exon_112191511_112191719:ACAD10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 112460147 T/G 1 517 224 741 240.617486994362 119.747936002443 120.869550991919 T:G T G 10 0.534589000010906 1.71292070474733e-19 ENSG00000089248:ENST00000261735:exon_112459954_112461024:ERP29;ENSG00000089248:ENST00000455836:exon_112459954_112461024:ERP29 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 112477055 T/C 1 13 2 15 6.05034299985822 1.06917800002181 4.98116499983641 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0094264980296512 ENSG00000111300:ENST00000261745:exon_112477033_112477143:NAA25 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 113398919 G/A 1 6 18 24 2.79246599993456 9.62260200019631 -6.83013600026175 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00671538610067119 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113398876_113399051:OAS3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 113875765 C/A 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 A:C C A 10 0.534589000010906 0.189086525758904 ENSG00000139410:ENST00000345635:exon_113875691_113876080:SDSL;ENSG00000139410:ENST00000403593:exon_113875691_113876080:SDSL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 114261053 G/A 1 5 13 18 2.32705499994547 6.94965700014178 -4.62260200019631 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0336404123788179 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114259863_114261126:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114261014_114261126:RBM19 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 11 7 18 5.11952099988003 3.74212300007634 1.37739799980369 T:C C T 10 0.534589000010906 0.63873345646322 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 114377885 G/C 1 4 11 15 1.86164399995638 5.88047900011997 -4.01883500016359 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0413471963302241 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 120589160 A/G 1 11 31 42 5.11952099988003 16.5722590003381 -11.4527380004581 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.000504445992339444 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 120637199 G/A 1 1958 4874 6832 911.274737978646 2605.58678605316 -1694.31204807451 A:T:C:G G A 10 0.534589000010906 0 ENSG00000089157:ENST00000313104:exon_120637113_120637288:RPLP0;ENSG00000089157:ENST00000228306:exon_120637113_120637288:RPLP0;ENSG00000089157:ENST00000392514:exon_120637113_120637288:RPLP0 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 120661977 T/C 1 10 23 33 4.65410999989094 12.2955470002508 -7.6414370003599 T:C T C 10 0.534589000010906 0.00850780032367277 ENSG00000089159:ENST00000424649:exon_120661954_120662180:PXN;ENSG00000089159:ENST00000228307:exon_120661954_120662180:PXN;ENSG00000089159:ENST00000267257:exon_120661954_120662180:PXN;ENSG00000089159:ENST00000458477:exon_120661954_120662180:PXN;ENSG00000089159:ENST00000323871:exon_120661954_120662183:PXN;ENSG00000089159:ENST00000440827:exon_120661954_120662180:PXN;ENSG00000089159:ENST00000331257:exon_120661954_120662180:PXN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 121017171 A/G 1 113 157 270 52.5914429987676 83.9304730017122 -31.3390300029446 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.000147231106457774 ENSG00000167272:ENST00000357500:exon_121016849_121017215:POP5;ENSG00000167272:ENST00000341039:exon_121016849_121017215:POP5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 121018862 C/T 1 2 10 12 0.930821999978188 5.34589000010906 -4.41506800013087 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0167573406364211 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 18 10 28 8.37739799980369 5.34589000010906 3.03150799969463 T:C T C 10 0.534589000010906 0.263416888742408 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 34 29 63 15.8239739996292 15.5030810003163 0.320892999312919 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 42 21 63 19.5472619995419 11.226369000229 8.32089299931292 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0426309712844567 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 41 33 74 19.0818509995529 17.6414370003599 1.44041399919295 C:G G C 10 0.534589000010906 0.815955406028815 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 108 271 379 50.2643879988222 144.873619002956 -94.6092310041334 A:T:C T C 10 0.534589000010906 1.26658049007002e-22 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 122326812 T/C 1 17 44 61 7.9119869998146 23.5219160004799 -15.6099290006653 T:C T C 10 0.534589000010906 8.4736288178986e-05 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122326646_122326900:PSMD9;ENSG00000110801:ENST00000340175:exon_122326646_122326900:PSMD9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 41 92 133 19.0818509995529 49.1821880010034 -30.1003370014505 A:G A G 10 0.534589000010906 1.85371928298498e-07 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 122617989 A/G 1 10 3 13 4.65410999989094 1.60376700003272 3.05034299985822 A:G A G 10 0.534589000010906 0.102317208684754 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122617982_122618077:MLXIP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 122618131 A/G 1 11 7 18 5.11952099988003 3.74212300007634 1.37739799980369 A:G A G 10 0.534589000010906 0.63873345646322 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122618129_122618689:MLXIP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 122626381 G/A 1 8 4 12 3.72328799991275 2.13835600004362 1.58493199986913 A:G G A 10 0.534589000010906 0.401454124777931 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122626238_122628963:MLXIP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 18 45 63 8.37739799980369 24.0565050004908 -15.6791070006871 C:G G C 10 0.534589000010906 7.3026546736169e-05 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 122991478 C/G 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 C:G C G 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000111011:ENST00000531389:exon_122991425_122991800:RSRC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 37 13 50 17.2202069995965 6.94965700014178 10.2705499994547 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00414043162131619 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 123645803 G/A 1 9 3 12 4.18869899990185 1.60376700003272 2.58493199986913 A:G G A 10 0.534589000010906 0.157534918401888 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 123799974 A/G 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 A:G A G 10 0.534589000010906 0.298446592097252 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 123806219 C/T 1 17 32 49 7.9119869998146 17.106848000349 -9.1948610005344 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0095914836350599 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123806082_123806279:SBNO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 123810873 G/A 1 21 21 42 9.77363099977097 11.226369000229 -1.45273800045806 A:G G A 10 0.534589000010906 0.757488064034296 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123810699_123810881:SBNO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 123825559 C/T 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123825535_123825635:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123825535_123825635:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123825535_123825635:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123825535_123825635:SBNO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 123950471 G/A 1 237 75 312 110.302406997415 40.094175000818 70.2082319965973 A:G G A 10 0.534589000010906 3.69756169446905e-16 ENSG00000184209:ENST00000438124:exon_123950085_123950941:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000526639:exon_123950085_123951483:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000392420:exon_123950085_123950941:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000361485:exon_123950085_123950937:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000412157:exon_123950085_123950936:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000350887:exon_123950085_123950937:SNRNP35 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 124102871 T/C 0 8 0 8 3.72328799991275 0 3.72328799991275 T T 10 0.534589000010906 0.00887189752631728 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 124102889 C/G 0 11 0 11 5.11952099988003 0 5.11952099988003 C C 10 0.534589000010906 0.00124103136705642 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 124102920 T/C 1 10 1 11 4.65410999989094 0.534589000010906 4.11952099988003 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0138045823225813 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 124104049 A/G 1 56 24 80 26.0630159993893 12.8301360002617 13.2328799991275 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00334062739819661 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124103979_124104271:DDX55 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 124104686 G/A 1 116 64 180 53.9876759987349 34.213696000698 19.7739799980369 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00346298029172311 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 124144395 A/G 1 30 16 46 13.9623299996728 8.5534240001745 5.40890599949832 A:G A G 10 0.534589000010906 0.138733340148781 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 124144793 T/C 1 44 36 80 20.4780839995201 19.2452040003926 1.23287999912752 T:C T C 10 0.534589000010906 0.823211639052444 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144713_124145620:GTF2H3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 124156637 C/T 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000168778:ENST00000303372:exon_124156603_124156679:TCTN2;ENSG00000168778:ENST00000426174:exon_124156603_124156679:TCTN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 124221796 G/A 1 18 15 33 8.37739799980369 8.01883500016359 0.3585629996401 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124221606_124221818:ATP6V0A2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 124821696 C/T 1 56 102 158 26.0630159993893 54.5280780011124 -28.4650620017232 T:C C T 10 0.534589000010906 6.50099756448423e-06 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000440187:exon_124821650_124821726:NCOR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 124826462 C/T 1 19 34 53 8.84280899979279 18.1760260003708 -9.33321700057802 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0125838805728229 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 124957627 C/T 1 27 11 38 12.5660969997055 5.88047900011997 6.68561799958557 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0339635792137391 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000420698:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000448008:exon_124957498_124957677:NCOR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 124979789 T/G 1 9 5 14 4.18869899990185 2.67294500005453 1.51575399984732 T:G T G 10 0.534589000010906 0.593864451936242 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124979693_124979798:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000420698:exon_124979693_124979914:NCOR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 125298877 G/A 1 27 49 76 12.5660969997055 26.1948610005344 -13.6287640008289 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00182007935601889 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125298748_125298951:SCARB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 125434716 G/A 1 14 28 42 6.51575399984732 14.9684920003054 -8.45273800045806 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0123992704369775 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434695_125434789:DHX37 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 125448960 C/T 1 10 24 34 4.65410999989094 12.8301360002617 -8.17602600037081 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00554790473968588 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 125591727 C/T 0 19 1 20 8.84280899979279 0.534589000010906 8.30821999978188 A:C C A 10 0.534589000010906 0.000129359136151335 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125591667_125591814:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125591667_125591814:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125591667_125591814:AACS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 125603252 C/T 1 5 13 18 2.32705499994547 6.94965700014178 -4.62260200019631 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0336404123788179 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125603187_125603311:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125603187_125603311:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125603187_125603311:AACS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 125626785 G/C 1 25 75 100 11.6352749997273 40.094175000818 -28.4589000010906 C:G G C 10 0.534589000010906 8.66991161126983e-09 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125626638_125627871:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125626638_125627861:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125626638_125627861:AACS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 132416780 C/A 1 13 28 41 6.05034299985822 14.9684920003054 -8.91814900044715 A:C C A 10 0.534589000010906 0.00705620553132586 ENSG00000177192:ENST00000443358:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000440818:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000376649:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000322060:exon_132416720_132416857:PUS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 132625960 G/A 1 28 21 49 13.0315079996946 11.226369000229 1.8051389994656 A:G G A 10 0.534589000010906 0.66858074355079 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132625820_132625965:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132625820_132625965:DDX51 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 45 17 62 20.9434949995092 9.0880130001854 11.8554819993238 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00308656035965226 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 11 28 39 5.11952099988003 14.9684920003054 -9.84897100042534 T:C T C 10 0.534589000010906 0.00193456151079969 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 12 133732636 G/A 1 5 8 13 2.32705499994547 4.27671200008725 -1.94965700014178 A:G G A 10 0.534589000010906 0.405475359831307 ENSG00000090612:ENST00000248211:exon_133732089_133736047:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000426665:exon_133732089_133733554:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000402932:exon_133732533_133733497:ZNF268 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 20567488 A/G 1 11 13 24 5.11952099988003 6.94965700014178 -1.83013600026174 A:G A G 10 0.534589000010906 0.540892890072247 ENSG00000121741:ENST00000382883:exon_20567203_20568059:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382869:exon_20567203_20568059:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000456228:exon_20567203_20568059:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000418722:exon_20567203_20568059:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382881:exon_20567203_20567704:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382874:exon_20567203_20568059:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382871:exon_20567203_20568059:ZMYM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 23905711 A/G 1 25 31 56 11.6352749997273 16.5722590003381 -4.93698400061074 A:G A G 10 0.534589000010906 0.227701619752903 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 23907909 A/G 1 6 13 19 2.79246599993456 6.94965700014178 -4.15719100020721 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0664194041354686 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 23908034 A/G 1 5 11 16 2.32705499994547 5.88047900011997 -3.5534240001745 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0838041199296228 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 23909162 A/G 1 18 11 29 8.37739799980369 5.88047900011997 2.49691899968372 A:G A G 10 0.534589000010906 0.457180957633404 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 23911820 A/G 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 A:G A G 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 25000617 C/G 1 93 96 189 43.2832229989857 51.320544001047 -8.03732100206125 C:G C G 10 0.534589000010906 0.244269636132259 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25000604_25000736:PARP4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 25009297 G/T 1 79 85 164 36.7674689991384 45.440065000927 -8.67259600178859 T:G G T 10 0.534589000010906 0.183649884912591 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 25009441 C/G 1 51 49 100 23.7359609994438 26.1948610005344 -2.4589000010906 C:G C G 10 0.534589000010906 0.688654751834388 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 25009485 C/G 1 41 43 84 19.0818509995529 22.987327000469 -3.90547600091611 C:G C G 10 0.534589000010906 0.444149489406258 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 25052261 C/T 1 6 12 18 2.79246599993456 6.41506800013087 -3.62260200019631 T:C C T 10 0.534589000010906 0.100748004668825 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25052231_25052414:PARP4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 25075859 C/T 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 T:C C T 10 0.534589000010906 0.592941099997918 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25075771_25075972:PARP4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 25876011 G/A 1 4 8 12 1.86164399995638 4.27671200008725 -2.41506800013087 A:G G A 10 0.534589000010906 0.246532544157622 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25875662_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000481980:exon_25875694_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000490231:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000480187:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000460326:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000465068:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25875771_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000495460:exon_25875783_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25875785_25876018:NUPL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 26788114 A/G 1 55 53 108 25.5976049994002 28.333217000578 -2.73561200117785 A:G A G 10 0.534589000010906 0.630149632797406 ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 28009031 G/C 1 174 162 336 80.9815139981023 86.6034180017668 -5.62190400366444 C:G G C 10 0.534589000010906 0.547830927730695 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 28197436 C/T 1 162 134 296 75.3965819982332 71.6349260014614 3.76165599677181 T:C C T 10 0.534589000010906 0.68360643299613 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 28239940 G/C 1 115 78 193 53.5222649987458 41.6979420008507 11.8243229978951 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0968584692458738 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 153 123 276 71.2078829983314 65.7544470013414 5.45343599698992 A:G G A 10 0.534589000010906 0.546351956721666 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 30107067 G/C 1 7 9 16 3.25787699992366 4.81130100009815 -1.5534240001745 C:G G C 10 0.534589000010906 0.462907821628628 ENSG00000139514:ENST00000380752:exon_30106961_30107119:SLC7A1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 31725260 A/G 1 14 16 30 6.51575399984732 8.5534240001745 -2.03767000032718 A:G A G 10 0.534589000010906 0.470259628180765 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31725084_31725328:HSPH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 31729729 A/G 1 14 12 26 6.51575399984732 6.41506800013087 0.100685999716442 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000439123:exon_31729651_31729791:HSPH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 41323397 C/T 1 15 18 33 6.98116499983641 9.62260200019631 -2.6414370003599 T:C C T 10 0.534589000010906 0.386417985090157 ENSG00000102738:ENST00000498078:exon_41323274_41323749:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41323274_41323417:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000461675:exon_41323274_41323417:MRPS31 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 41331026 C/G 1 30 22 52 13.9623299996728 11.7609580002399 2.20137199943289 T:C:G C G 10 0.534589000010906 0.58019459929345 ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41331009_41331149:MRPS31 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 41515286 T/A 1 27 26 53 12.5660969997055 13.8993140002836 -1.33321700057802 A:T T A 10 0.534589000010906 0.783472875037343 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41515057_41515506:ELF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 41517985 A/G 1 16 16 32 7.4465759998255 8.5534240001745 -1.10684800034899 A:G A G 10 0.534589000010906 0.725761441333252 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41517978_41518061:ELF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 41533052 T/C 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:C T C 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41532972_41533152:ELF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 43462352 T/C 1 60 54 114 27.9246599993456 28.8678060005889 -0.943146001243285 T:C T C 10 0.534589000010906 0.925256020044398 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 46541673 T/A 1 23 25 48 10.7044529997492 13.3647250002727 -2.66027200052349 A:T T A 10 0.534589000010906 0.471573474354599 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46541639_46542163:ZC3H13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 46562935 A/G 1 38 30 68 17.6856179995856 16.0376700003272 1.64794799925839 A:G A G 10 0.534589000010906 0.716823081014213 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46562922_46563232:ZC3H13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 12 30 42 5.58493199986913 16.0376700003272 -10.4527380004581 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00164113374655830 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 48528684 T/C 1 18 23 41 8.37739799980369 12.2955470002508 -3.91814900044715 T:C T C 10 0.534589000010906 0.273044441286071 ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48528531_48528692:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378645:exon_48528531_48528692:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378642:exon_48528531_48528692:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000331052:exon_48528531_48528692:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000467222:exon_48528275_48528689:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000434484:exon_48528531_48528692:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000433022:exon_48528588_48528692:SUCLA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 48619856 G/A 1 9 13 22 4.18869899990185 6.94965700014178 -2.76095800023993 A:G G A 10 0.534589000010906 0.287120525503420 ENSG00000136159:ENST00000258662:exon_48619796_48621282:NUDT15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 48619942 G/A 1 14 7 21 6.51575399984732 3.74212300007634 2.77363099977097 A:G G A 10 0.534589000010906 0.276590217785206 ENSG00000136159:ENST00000258662:exon_48619796_48621282:NUDT15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 50050620 A/G 1 10 8 18 4.65410999989094 4.27671200008725 0.377397999803692 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50050612_50051175:SETDB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 50057633 A/G 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 A:G A G 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50057600_50057699:SETDB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 50080847 A/G 1 15 13 28 6.98116499983641 6.94965700014178 0.0315079996946315 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000136147:ENST00000482487:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000496623:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000467763:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000485919:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000442195:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50080771_50080892:PHF11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 101 90 191 47.0065109988985 48.1130100009815 -1.10649900208305 A:C:G G A 10 0.534589000010906 0.884864565852904 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 50108252 T/C 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 T:C T C 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50106082_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50106090_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000471984:exon_50108054_50108398:RCBTB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 9 11 20 4.18869899990185 5.88047900011997 -1.69178000021812 T:C T C 10 0.534589000010906 0.505607767076301 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 50283819 T/C 1 24 15 39 11.1698639997383 8.01883500016359 3.15102899957466 T:C T C 10 0.534589000010906 0.339042124161351 ENSG00000102753:ENST00000261667:exon_50283708_50283836:KPNA3;ENSG00000102753:ENST00000457886:exon_50283708_50283836:KPNA3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 52343391 C/T 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 T:C C T 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000102796:ENST00000444610:exon_52343292_52343429:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000218981:exon_52342131_52343429:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000469957:exon_52343292_52343429:DHRS12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 52365354 G/T 1 7 1 8 3.25787699992366 0.534589000010906 2.72328799991275 T:G G T 10 0.534589000010906 0.0755591978202379 ENSG00000102796:ENST00000444610:exon_52365301_52365393:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000218981:exon_52365301_52365393:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000280056:exon_52365301_52365393:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000490949:exon_52365301_52365393:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000497151:exon_52365301_52365393:DHRS12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 52598189 A/G 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52598142_52599073:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52598142_52599073:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000519151:exon_52598142_52599073:ALG11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 8 10 18 3.72328799991275 5.34589000010906 -1.62260200019631 T:C C T 10 0.534589000010906 0.485331297542652 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 53049267 T/C 1 34 36 70 15.8239739996292 19.2452040003926 -3.42123000076342 T:C T C 10 0.534589000010906 0.472513779211991 ENSG00000136108:ENST00000258607:exon_53049030_53050484:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378037:exon_53049030_53050485:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000490903:exon_53049030_53050484:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000459902:exon_53049030_53049277:CKAP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 76423248 T/C 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76423112_76423428:LMO7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 79932548 T/C 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 T:C T C 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79932409_79932568:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79932409_79932568:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79932409_79932568:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79932409_79932568:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79932409_79932568:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79932409_79932568:RBM26 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 95273447 G/A 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:G G A 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000152749:ENST00000376958:exon_95273332_95273489:GPR180 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 95863008 C/A 1 9 4 13 4.18869899990185 2.13835600004362 2.05034299985822 A:C C A 10 0.534589000010906 0.281774765265439 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95862946_95863035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95862946_95863035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95862946_95863035:ABCC4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 57 45 102 26.5284269993784 24.0565050004908 2.47192199888758 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.691581580498526 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 99948097 A/G 1 158 173 331 73.5349379982768 92.4838970018867 -18.9489590036099 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0413325405165367 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 100211649 G/C 1 16 21 37 7.4465759998255 11.226369000229 -3.77979300040352 C:G G C 10 0.534589000010906 0.249367416803454 ENSG00000125304:ENST00000376387:exon_100211617_100211788:TM9SF2;ENSG00000125304:ENST00000419976:exon_100211617_100211788:TM9SF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 101287404 G/A 1 10 1 11 4.65410999989094 0.534589000010906 4.11952099988003 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0138045823225813 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000496511:exon_101287319_101287449:TMTC4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 103328660 A/G 1 56 51 107 26.0630159993893 27.2640390005562 -1.20102300116694 A:G A G 10 0.534589000010906 0.846634594171454 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000466153:exon_103328646_103328765:TPP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 7 10 17 3.25787699992366 5.34589000010906 -2.0880130001854 A:T:C T C 10 0.534589000010906 0.339484157804598 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 111176519 G/T 1 9 20 29 4.18869899990185 10.6917800002181 -6.50308100031627 T:G G T 10 0.534589000010906 0.0237592142489094 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 38 31 69 17.6856179995856 16.5722590003381 1.11335899924748 A:G G A 10 0.534589000010906 0.810449230593296 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 43 34 77 20.012672999531 18.1760260003708 1.83664699916024 A:G A G 10 0.534589000010906 0.732326612300748 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 25 33 58 11.6352749997273 17.6414370003599 -6.00616200063255 T:C T C 10 0.534589000010906 0.116439967259935 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 111340342 G/A 1 32 33 65 14.893151999651 17.6414370003599 -2.74828500070889 A:G G A 10 0.534589000010906 0.535099759716054 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111340294_111340365:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000465145:exon_111340294_111340365:CARS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 23 17 40 10.7044529997492 9.0880130001854 1.61643999956376 T:C C T 10 0.534589000010906 0.637891733652776 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 113909339 A/G 1 29 31 60 13.4969189996837 16.5722590003381 -3.07534000065436 A:G A G 10 0.534589000010906 0.440129102807527 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 113975754 C/T 1 47 57 104 21.8743169994874 30.4715730006216 -8.59725600113423 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0952671209054614 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113974660_113975785:LAMP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 114150107 C/T 1 12 19 31 5.58493199986913 10.1571910002072 -4.57225900033809 T:C C T 10 0.534589000010906 0.107696074729923 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 114157846 G/A 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 A:G G A 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114157811_114157903:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114157811_114157903:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114157811_114157903:TMCO3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 114175038 G/A 1 4 8 12 1.86164399995638 4.27671200008725 -2.41506800013087 A:G G A 10 0.534589000010906 0.246532544157622 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 114507965 C/T 1 13 2 15 6.05034299985822 1.06917800002181 4.98116499983641 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0094264980296512 ENSG00000184497:ENST00000375353:exon_114507858_114508001:FAM70B;ENSG00000184497:ENST00000467169:exon_114507858_114508001:FAM70B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 114514771 C/A 1 9 1 10 4.18869899990185 0.534589000010906 3.65410999989094 A:C C A 10 0.534589000010906 0.0244567728924624 ENSG00000184497:ENST00000375353:exon_114514709_114514899:FAM70B;ENSG00000184497:ENST00000467169:exon_114514709_114514926:FAM70B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 115037613 G/A 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 A:G G A 10 0.534589000010906 0.156883047615629 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 13 115090318 G/C 1 35 40 75 16.2893849996183 21.3835600004362 -5.09417500081795 C:G G C 10 0.534589000010906 0.248784387473341 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 20784431 G/A 1 178 139 317 82.8431579980587 74.3078710015159 8.53528699654279 A:G G A 10 0.534589000010906 0.33925189685554 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20784386_20784731:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 38 35 73 17.6856179995856 18.7106150003817 -1.02499700079614 A:C A C 10 0.534589000010906 0.815643728244484 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 4 9 13 1.86164399995638 4.81130100009815 -2.94965700014178 C:G G C 10 0.534589000010906 0.162146782239777 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 21861787 C/G 1 28 25 53 13.0315079996946 13.3647250002727 -0.333217000578021 C:G C G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000100888:ENST00000430710:exon_21861635_21862354:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000399982:exon_21861635_21862354:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000262707:exon_21861635_21862354:CHD8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 22932160 A/T 1 10 8 18 4.65410999989094 4.27671200008725 0.377397999803692 A:T A T 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 23299135 G/T 1 60 50 110 27.9246599993456 26.7294500005453 1.19520999880034 T:G G T 10 0.534589000010906 0.848828566443705 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 23746269 C/G 1 7 10 17 3.25787699992366 5.34589000010906 -2.0880130001854 C:G C G 10 0.534589000010906 0.339484157804598 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 23777099 G/A 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 A:G G A 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000129473:ENST00000250405:exon_23776969_23777408:BCL2L2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 23944514 C/A 1 19 35 54 8.84280899979279 18.7106150003817 -9.86780600058893 A:C:G C A 10 0.534589000010906 0.00898367944639595 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24458162 G/C 0 0 16 16 0 8.5534240001745 -8.5534240001745 C G C 10 0.534589000010906 4.84603222707105e-06 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 19 10 29 8.84280899979279 5.34589000010906 3.49691899968373 A:G G A 10 0.534589000010906 0.263763626258807 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 10 9 19 4.65410999989094 4.81130100009815 -0.157191000207215 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 393 350 743 182.906522995714 187.106150003817 -4.19962700810316 T:C T C 10 0.534589000010906 0.768673691368606 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24641838 C/T 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 T:C C T 10 0.534589000010906 0.319511032376371 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24642348 C/T 1 33 30 63 15.3585629996401 16.0376700003272 -0.679107000687081 T:C C T 10 0.534589000010906 0.899890156085493 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24642335_24642407:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24642335_24642407:REC8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24647814 T/C 1 28 35 63 13.0315079996946 18.7106150003817 -5.67910700068708 T:C T C 10 0.534589000010906 0.165528119182476 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647812_24647878:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647812_24647878:REC8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24653965 C/T 1 10 8 18 4.65410999989094 4.27671200008725 0.377397999803692 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 23 20 43 10.7044529997492 10.6917800002181 0.0126729995310413 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24760808 C/T 1 25 19 44 11.6352749997273 10.1571910002072 1.47808399952013 T:C C T 10 0.534589000010906 0.762907380746898 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24761805 A/C 1 10 2 12 4.65410999989094 1.06917800002181 3.58493199986913 A:C A C 10 0.534589000010906 0.0440105344752742 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24771285 G/A 1 10 2 12 4.65410999989094 1.06917800002181 3.58493199986913 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0440105344752742 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24771171_24771312:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24771171_24771312:C14orf21 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24773387 T/C 1 15 10 25 6.98116499983641 5.34589000010906 1.63527499972735 T:C T C 10 0.534589000010906 0.553361397131065 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24773247_24773483:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24773247_24773394:C14orf21 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24839083 G/C 1 7 20 27 3.25787699992366 10.6917800002181 -7.43390300029446 C:G G C 10 0.534589000010906 0.00585105189062213 ENSG00000100968:ENST00000440487:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000424781:exon_24838705_24839800:NFATC4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24839165 C/T 1 24 35 59 11.1698639997383 18.7106150003817 -7.54075100064346 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0510860920609526 ENSG00000100968:ENST00000440487:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000424781:exon_24838705_24839800:NFATC4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24843620 T/C 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24843532_24843672:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24843532_24843672:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24843532_24843672:NFATC4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24845841 T/C 1 26 29 55 12.1006859997164 15.5030810003163 -3.40239500059983 T:C T C 10 0.534589000010906 0.417703751638093 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 10 15 25 4.65410999989094 8.01883500016359 -3.36472500027265 A:C A C 10 0.534589000010906 0.228865227218520 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24906515 C/T 1 29 11 40 13.4969189996837 5.88047900011997 7.61643999956376 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0170230004781166 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24906534 G/A 1 28 10 38 13.0315079996946 5.34589000010906 7.68561799958557 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0140239351434692 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24909281 C/T 1 80 99 179 37.2328799991275 52.9243110010797 -15.6914310019522 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0201002749101389 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24909362 T/C 1 108 132 240 50.2643879988222 70.5657480014396 -20.3013600026175 T:C:G T C 10 0.534589000010906 0.0095387254507313 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24909475 C/G 1 69 87 156 32.1133589992475 46.5092430009488 -14.3958840017013 A:C:G C G 10 0.534589000010906 0.0243442017410289 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24909629 C/A 1 108 79 187 50.2643879988222 42.2325310008616 8.03185699796057 A:C C A 10 0.534589000010906 0.241973399383397 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24909731 C/T 1 42 39 81 19.5472619995419 20.8489710004253 -1.30170900088339 T:C C T 10 0.534589000010906 0.824009395641471 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24910846 C/T 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 T:C C T 10 0.534589000010906 0.741882642224914 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24910973 T/G 1 27 22 49 12.5660969997055 11.7609580002399 0.805138999465605 T:G T G 10 0.534589000010906 0.886563011000463 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24910974 T/A 1 27 22 49 12.5660969997055 11.7609580002399 0.805138999465605 A:T T A 10 0.534589000010906 0.886563011000463 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 24911452 T/C 1 14 20 34 6.51575399984732 10.6917800002181 -4.1760260003708 T:C T C 10 0.534589000010906 0.170548663863318 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24911384_24911466:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24911384_24911466:SDR39U1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 31099738 A/G 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000092108:ENST00000311943:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000463622:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000458591:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000484733:exon_31099683_31099771:SCFD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 35222732 C/T 1 55 30 85 25.5976049994002 16.0376700003272 9.55993499907299 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0390535630569111 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35221938_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35221943_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35221943_35222910:BAZ1A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 35735967 A/G 1 19 9 28 8.84280899979279 4.81130100009815 4.03150799969463 A:G A G 10 0.534589000010906 0.134486044001291 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35735933_35736081:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35735933_35736081:KIAA0391 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 846 981 1827 393.737705990774 524.431809010699 -130.694103019925 A:T:G G A 10 0.534589000010906 1.01322164681750e-09 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 35873770 G/A 1 200 187 387 93.0821999978188 99.9681430020394 -6.88594300422064 A:G G A 10 0.534589000010906 0.507771347435748 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35873624_35873952:NFKBIA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 39556185 G/C 1 11 15 26 5.11952099988003 8.01883500016359 -2.89931400028356 C:G G C 10 0.534589000010906 0.325953144749333 ENSG00000100934:ENST00000307712:exon_39556133_39556212:SEC23A;ENSG00000100934:ENST00000457395:exon_39556133_39556212:SEC23A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 39644498 G/A 1 22 12 34 10.2390419997601 6.41506800013087 3.82397399962919 A:G G A 10 0.534589000010906 0.229370851498472 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39644425_39644596:PNN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 39650234 A/T 1 262 239 501 121.937681997143 127.766771002607 -5.82908900546393 A:T A T 10 0.534589000010906 0.622348187609701 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39649707_39652422:PNN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 39736680 T/C 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 T:C T C 10 0.534589000010906 0.156883047615629 ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39736328_39736726:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39736328_39736726:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39736350_39736726:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39736618_39736726:CTAGE5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 12 17 29 5.58493199986913 9.0880130001854 -3.50308100031627 A:G G A 10 0.534589000010906 0.198836235703780 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 39871017 T/C 1 6 14 20 2.79246599993456 7.48424600015268 -4.69178000021812 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0431004774055677 ENSG00000165355:ENST00000298097:exon_39870380_39871065:FBXO33 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 45693224 C/T 1 31 24 55 14.4277409996619 12.8301360002617 1.59760499940017 T:C C T 10 0.534589000010906 0.687529942938485 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45693121_45693949:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000469020:exon_45693121_45693248:C14orf106 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 50065717 G/C 1 17 19 36 7.9119869998146 10.1571910002072 -2.24520400039262 C:G G C 10 0.534589000010906 0.50571419534925 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 50074122 T/A 1 16 19 35 7.4465759998255 10.1571910002072 -2.71061500038171 A:T T A 10 0.534589000010906 0.399078377925196 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 50074520 C/T 1 44 37 81 20.4780839995201 19.7797930004035 0.698290999116612 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.911651568718938 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 50085571 G/A 1 1959 2417 4376 911.740148978635 1292.10161302636 -380.361464047725 A:T:C:G G A 10 0.534589000010906 1.32253366162610e-30 ENSG00000165502:ENST00000298289:exon_50085407_50085858:RPL36AL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 34 37 71 15.8239739996292 19.7797930004035 -3.95581900077433 T:C T C 10 0.534589000010906 0.405162358883269 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 50583083 G/T 1 12 4 16 5.58493199986913 2.13835600004362 3.4465759998255 T:G G T 10 0.534589000010906 0.130326098972588 ENSG00000100483:ENST00000395859:exon_50583005_50583297:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000491402:exon_50583005_50583318:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000395860:exon_50583005_50583275:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000484763:exon_50582798_50583276:C14orf138 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 20 17 37 9.30821999978188 9.0880130001854 0.220206999596478 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 50769717 G/A 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 A:G G A 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000087299:ENST00000261699:exon_50769620_50769735:L2HGDH;ENSG00000087299:ENST00000267436:exon_50769620_50769735:L2HGDH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 50778816 A/C 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:C A C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000087299:ENST00000261699:exon_50778729_50778886:L2HGDH;ENSG00000087299:ENST00000267436:exon_50778729_50778947:L2HGDH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 51202311 G/C 1 26 12 38 12.1006859997164 6.41506800013087 5.68561799958557 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0737448870724525 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51202234_51202335:NIN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 53325090 C/T 1 32 20 52 14.893151999651 10.6917800002181 4.20137199943289 T:C C T 10 0.534589000010906 0.267809319270634 ENSG00000073712:ENST00000341590:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000395631:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000343279:exon_53323993_53325268:FERMT2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 53417158 G/C 1 8 3 11 3.72328799991275 1.60376700003272 2.11952099988003 C:G G C 10 0.534589000010906 0.238841320527235 ENSG00000073712:ENST00000341590:exon_53417130_53417295:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000395631:exon_53417130_53417295:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000343279:exon_53417130_53417295:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000399304:exon_53417130_53417295:FERMT2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 57699393 C/T 1 14 14 28 6.51575399984732 7.48424600015268 -0.968492000305369 T:C C T 10 0.534589000010906 0.710379181771136 ENSG00000070367:ENST00000340918:exon_57699385_57699467:EXOC5;ENSG00000070367:ENST00000413566:exon_57699385_57699467:EXOC5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 59939727 T/C 1 19 5 24 8.84280899979279 2.67294500005453 6.16986399973826 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0130248631872869 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59939335_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000463432:exon_59939579_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000532049:exon_59939583_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000478430:exon_59939585_59939808:C14orf149 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 59950690 A/C 1 9 7 16 4.18869899990185 3.74212300007634 0.446575999825503 A:C A C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59950527_59951086:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000481608:exon_59950398_59950724:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000527981:exon_59950398_59951126:C14orf149 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 59951278 T/C 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 T:C T C 10 0.534589000010906 0.529760851175976 ENSG00000050130:ENST00000425728:exon_59951161_59951311:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000261247:exon_59951161_59951311:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000442454:exon_59951244_59951311:JKAMP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 64908845 G/A 1 50 63 113 23.2705499994547 33.6791070006871 -10.4085570012324 A:G G A 10 0.534589000010906 0.058856608941777 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64908772_64908883:MTHFD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 64988279 A/G 1 34 22 56 15.8239739996292 11.7609580002399 4.06301599938926 A:G A G 10 0.534589000010906 0.287408492033131 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 64988830 C/A 1 62 60 122 28.8554819993238 32.0753400006544 -3.21985800133054 A:C C A 10 0.534589000010906 0.586642366700031 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 64988924 T/C 1 52 51 103 24.2013719994329 27.2640390005562 -3.06266700112332 T:C T C 10 0.534589000010906 0.554914953213401 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 66096297 G/A 1 17 6 23 7.9119869998146 3.20753400006544 4.70445299974916 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0594421597906508 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000358307:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394581:exon_66096210_66096324:FUT8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 70839635 C/A 1 21 19 40 9.77363099977097 10.1571910002072 -0.383560000436242 A:C C A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000213463:ENST00000256366:exon_70833217_70839848:SYNJ2BP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 71137844 G/T 1 12 8 20 5.58493199986913 4.27671200008725 1.30821999978188 T:G G T 10 0.534589000010906 0.656685513222068 ENSG00000133985:ENST00000256367:exon_71137793_71142077:TTC9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 74036370 G/T 1 31 17 48 14.4277409996619 9.0880130001854 5.33972799947651 T:G G T 10 0.534589000010906 0.147659910971723 ENSG00000119673:ENST00000238651:exon_74035772_74036587:ACOT2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 74206481 T/C 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 75359670 G/A 1 18 22 40 8.37739799980369 11.7609580002399 -3.38356000043624 A:G G A 10 0.534589000010906 0.341934716221639 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75359537_75359689:DLST HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 21 23 44 9.77363099977097 12.2955470002508 -2.52191600047987 A:G A G 10 0.534589000010906 0.454405830121413 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 5 11 16 2.32705499994547 5.88047900011997 -3.5534240001745 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0838041199296228 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 77492891 G/A 1 40 31 71 18.6164399995638 16.5722590003381 2.04418099922567 A:G G A 10 0.534589000010906 0.636746351476178 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 77793207 G/A 1 15 6 21 6.98116499983641 3.20753400006544 3.77363099977097 A:G G A 10 0.534589000010906 0.125707234511992 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 77926011 C/T 1 79 97 176 36.7674689991384 51.8551330010579 -15.0876640019195 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.0234328213600953 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77925959_77926149:AHSA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 77928525 A/G 1 106 113 219 49.333565998844 60.4085570012324 -11.0749910023884 A:G A G 10 0.534589000010906 0.136610656396920 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77928503_77928585:AHSA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 77935520 G/A 1 167 160 327 77.7236369981787 85.534240001745 -7.81060300356627 A:G G A 10 0.534589000010906 0.405805877226566 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77935420_77935807:AHSA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 78174473 A/C 1 55 47 102 25.5976049994002 25.1256830005126 0.471921998887584 A:C A C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 88477882 A/C 1 22 24 46 10.2390419997601 12.8301360002617 -2.59109400050168 A:C A C 10 0.534589000010906 0.463097485658083 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 90429749 A/G 1 32 38 70 14.893151999651 20.3143820004144 -5.42123000076342 A:G A G 10 0.534589000010906 0.230680638859932 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 90451530 T/C 1 36 32 68 16.7547959996074 17.106848000349 -0.352052000741612 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90451476_90451554:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90451476_90451554:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90451476_90451554:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90451476_90451554:TDP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 13 12 25 6.05034299985822 6.41506800013087 -0.364725000272651 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 91773568 T/C 1 2 8 10 0.930821999978188 4.27671200008725 -3.34589000010906 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0527671529214564 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91773382_91773570:CCDC88C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 19 19 38 8.84280899979279 10.1571910002072 -1.31438200041443 T:C C T 10 0.534589000010906 0.745799595822869 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 93118674 G/A 1 22 23 45 10.2390419997601 12.2955470002508 -2.05650500049077 A:G G A 10 0.534589000010906 0.553500523516736 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 93118823 C/T 1 17 17 34 7.9119869998146 9.0880130001854 -1.1760260003708 T:C C T 10 0.534589000010906 0.732812837731546 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 93119407 C/T 1 25 15 40 11.6352749997273 8.01883500016359 3.61643999956376 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.270927261847930 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 93142887 G/A 1 10 4 14 4.65410999989094 2.13835600004362 2.51575399984732 A:G G A 10 0.534589000010906 0.194114354160929 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93142820_93142951:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93142820_93142951:RIN3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 93170993 C/T 1 117 36 153 54.453086998724 19.2452040003926 35.2078829983314 T:C C T 10 0.534589000010906 4.95167722540937e-09 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 93263982 C/G 1 25 24 49 11.6352749997273 12.8301360002617 -1.1948610005344 C:G C G 10 0.534589000010906 0.775568337806118 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93263783_93264012:GOLGA5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 7 12 19 3.25787699992366 6.41506800013087 -3.15719100020722 A:G A G 10 0.534589000010906 0.170892403910016 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 93649552 A/G 1 39 49 88 18.1510289995747 26.1948610005344 -8.04383200095973 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0882389547789736 ENSG00000165943:ENST00000298894:exon_93648542_93650707:MOAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 94417421 G/A 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 94528836 C/T 1 123 109 232 57.2455529986586 58.2702010011888 -1.0246480025302 T:C C T 10 0.534589000010906 0.895494348673163 ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94528443_94528967:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94528443_94528967:DDX24 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 95884323 G/A 1 7 1 8 3.25787699992366 0.534589000010906 2.72328799991275 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0755591978202379 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95883831_95884363:C14orf49 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 97299853 A/G 1 30 41 71 13.9623299996728 21.9181490004471 -7.95581900077433 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0736116291398224 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97299804_97299968:VRK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 97321689 C/T 1 53 38 91 24.666782999422 20.3143820004144 4.35240099900755 T:C C T 10 0.534589000010906 0.400987504493717 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97321561_97321693:VRK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 99967186 A/T 1 34 23 57 15.8239739996292 12.2955470002508 3.52842699937836 A:T A T 10 0.534589000010906 0.356934380839290 ENSG00000090061:ENST00000389879:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000216279:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000411691:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000380246:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000437596:exon_99967103_99967208:CCNK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 100759046 C/A 1 22 2 24 10.2390419997601 1.06917800002181 9.16986399973825 A:C C A 10 0.534589000010906 0.00010550008707608 ENSG00000197119:ENST00000359232:exon_100757448_100759369:SLC25A29;ENSG00000197119:ENST00000392908:exon_100757448_100759369:SLC25A29 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 102391585 G/C 1 13 12 25 6.05034299985822 6.41506800013087 -0.364725000272651 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000078304:ENST00000328724:exon_102391478_102394022:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334743:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000350249:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334756:exon_102391478_102394075:PPP2R5C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 104029378 C/G 0 28 0 28 13.0315079996946 0 13.0315079996946 C C 10 0.534589000010906 4.08399156522524e-08 ENSG00000126214:ENST00000409074:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000472726:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000247618:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104029300_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000440963:exon_104029302_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000458117:exon_104029316_104029461:C14orf153 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 104029449 G/A 1 20 27 47 9.30821999978188 14.4339030002945 -5.12568300051258 A:G G A 10 0.534589000010906 0.145159875669988 ENSG00000126214:ENST00000409074:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000472726:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000247618:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104029300_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000440963:exon_104029302_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000458117:exon_104029316_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000489117:exon_104029390_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000495778:exon_104029414_104029461:C14orf153 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 17 23 40 7.9119869998146 12.2955470002508 -4.38356000043624 T:C C T 10 0.534589000010906 0.204468860758716 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 105173653 C/T 1 31 28 59 14.4277409996619 14.9684920003054 -0.540751000643457 T:C C T 10 0.534589000010906 0.896937891713827 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105173590_105174339:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105173590_105174339:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105173590_105174339:INF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 105179194 T/C 1 15 20 35 6.98116499983641 10.6917800002181 -3.71061500038171 T:C T C 10 0.534589000010906 0.237118321869173 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000480763:exon_105179170_105179270:INF2;ENSG00000203485:ENST00000477497:exon_105179050_105179329:INF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 105180565 T/C 1 47 46 93 21.8743169994874 24.5910940005017 -2.71677700101426 T:C T C 10 0.534589000010906 0.603985548856711 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 105180706 A/C 1 34 31 65 15.8239739996292 16.5722590003381 -0.748285000708892 A:C A C 10 0.534589000010906 0.90131810569111 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 71 78 149 33.0441809992257 41.6979420008507 -8.653761001625 A:G G A 10 0.534589000010906 0.163107919799606 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 14 105930406 G/A 1 34 28 62 15.8239739996292 14.9684920003054 0.855481999323825 A:G G A 10 0.534589000010906 0.89893631404705 ENSG00000182979:ENST00000435036:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000490198:exon_105930369_105930484:MTA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 30337377 G/C 0 0 13 13 0 6.94965700014178 -6.94965700014178 C G C 10 0.534589000010906 4.80702484846248e-05 ENSG00000215315:ENST00000400005:exon_30336926_30337498:AC111152.1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 31197564 G/A 1 9 5 14 4.18869899990185 2.67294500005453 1.51575399984732 A:G G A 10 0.534589000010906 0.593864451936242 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31196715_31198100:FAN1;ENSG00000198690:ENST00000441675:exon_31196715_31198100:FAN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 32929624 A/G 1 34 20 54 15.8239739996292 10.6917800002181 5.13219399941107 A:G A G 10 0.534589000010906 0.174288384044005 ENSG00000198826:ENST00000361627:exon_32928458_32932150:ARHGAP11A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 9 8 17 4.18869899990185 4.27671200008725 -0.0880130001854029 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 34634124 C/G 1 383 7 390 178.252412995823 3.74212300007634 174.510289995747 C:G C G 10 0.534589000010906 1.15751628393470e-92 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 34634138 G/A 1 396 40 436 184.302755995681 21.3835600004362 162.919195995245 A:G G A 10 0.534589000010906 9.89134797651544e-65 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 34634139 T/C 1 389 42 431 181.044878995758 22.4527380004581 158.5921409953 T:C:G T C 10 0.534589000010906 9.45142216361685e-62 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 35273620 C/T 1 12 12 24 5.58493199986913 6.41506800013087 -0.830136000261746 T:C C T 10 0.534589000010906 0.83866338058516 ENSG00000198146:ENST00000356321:exon_35270542_35275691:ZNF770 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 40265799 A/G 1 11 8 19 5.11952099988003 4.27671200008725 0.842808999792785 A:G A G 10 0.534589000010906 0.819574245361162 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40265793_40265950:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40265793_40265950:EIF2AK4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 40313141 C/T 1 15 17 32 6.98116499983641 9.0880130001854 -2.10684800034899 T:C C T 10 0.534589000010906 0.482636180272191 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40313100_40313228:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40313100_40313228:EIF2AK4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 40327290 A/G 1 89 69 158 41.4215789990294 36.8866410007525 4.53493799827685 A:C:G A G 10 0.534589000010906 0.474407232584374 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 93 79 172 43.2832229989857 42.2325310008616 1.05069199812416 A:G G A 10 0.534589000010906 0.878889009497197 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 40328665 G/A 1 801 793 1594 372.794210991264 423.929077008649 -51.1348660173842 A:T:C:G G A 10 0.534589000010906 0.010432718752696 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40327891_40328701:SRP14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 40512901 A/C 1 101 76 177 47.0065109988985 40.6287640008289 6.37774699806963 A:C A C 10 0.534589000010906 0.366076835070917 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40512765_40513335:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40512765_40513335:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40512765_40513378:BUB1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 40581543 T/C 1 9 10 19 4.18869899990185 5.34589000010906 -1.15719100020721 T:C T C 10 0.534589000010906 0.650010996424856 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40581473_40581559:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40581473_40581559:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40581473_40581559:PLCB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 40590134 G/A 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 A:G G A 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40590078_40590160:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40590078_40590160:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40590078_40590160:PLCB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 52 18 70 24.2013719994329 9.62260200019631 14.5787699992366 A:G A G 10 0.534589000010906 0.000442797468460675 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 53 17 70 24.666782999422 9.0880130001854 15.5787699992366 A:C C A 10 0.534589000010906 0.000166136742643379 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 41672384 A/G 1 126 120 246 58.6417859986258 64.1506800013087 -5.50889400268289 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.48287950156291 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450592:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41672291_41673245:NUSAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 41689166 C/A 1 33 13 46 15.3585629996401 6.94965700014178 8.40890599949832 A:C C A 10 0.534589000010906 0.0170779339005706 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 41689232 C/T 1 30 16 46 13.9623299996728 8.5534240001745 5.40890599949832 T:C C T 10 0.534589000010906 0.138733340148781 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 41819460 C/G 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 C:G C G 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41819365_41819499:RPAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 42235316 C/T 1 26 23 49 12.1006859997164 12.2955470002508 -0.194861000534395 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42235265_42235362:EHD4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 42452928 C/T 1 22 18 40 10.2390419997601 9.62260200019631 0.616439999563758 T:C C T 10 0.534589000010906 0.875398535411848 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42450899_42453027:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42450900_42453027:VPS39 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 42453963 T/C 1 26 12 38 12.1006859997164 6.41506800013087 5.68561799958557 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0737448870724525 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42453880_42453971:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42453880_42453971:VPS39 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 42553173 A/C 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 A:C A C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000103978:ENST00000389834:exon_42553156_42553200:TMEM87A;ENSG00000103978:ENST00000448392:exon_42553156_42553200:TMEM87A;ENSG00000103978:ENST00000307216:exon_42553156_42553200:TMEM87A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 42579984 G/A 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:G G A 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42579889_42580016:GANC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 42631928 T/C 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:C T C 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42631867_42632110:GANC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 42820589 G/A 1 27 35 62 12.5660969997055 18.7106150003817 -6.14451800067617 A:G G A 10 0.534589000010906 0.127397425205062 ENSG00000092531:ENST00000249647:exon_42820460_42820618:SNAP23 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 43661802 T/C 1 12 3 15 5.58493199986913 1.60376700003272 3.98116499983641 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0663369253246265 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43661794_43662246:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43661794_43662258:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43661794_43662258:ZSCAN29 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 43696014 G/C 1 23 16 39 10.7044529997492 8.5534240001745 2.15102899957466 C:G G C 10 0.534589000010906 0.524420620718488 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 43724646 T/G 1 9 15 24 4.18869899990185 8.01883500016359 -3.83013600026175 T:G T G 10 0.534589000010906 0.151422991853702 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43724392_43724875:TP53BP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 43748304 A/G 1 20 9 29 9.30821999978188 4.81130100009815 4.49691899968373 A:G A G 10 0.534589000010906 0.135069159960843 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43748090_43748529:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000480860:exon_43748090_43748350:TP53BP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 65 138 203 30.2517149992911 73.773282001505 -43.5215670022139 T:C C T 10 0.534589000010906 8.46662980223074e-10 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 44053617 C/T 1 1 8 9 0.465410999989094 4.27671200008725 -3.81130100009815 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0151819886668037 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 44061802 C/T 1 54 83 137 25.1321939994111 44.3708870009052 -19.2386930014941 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.00108338149132384 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44061716_44061844:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44061716_44061844:PDIA3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 44069069 G/C 1 5 9 14 2.32705499994547 4.81130100009815 -2.48424600015268 C:G G C 10 0.534589000010906 0.283670203474933 ENSG00000128886:ENST00000319359:exon_44068968_44069741:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000486851:exon_44068968_44069164:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000433927:exon_44068968_44069162:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000497700:exon_44068968_44069166:ELL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 78 87 165 36.3020579991493 46.5092430009488 -10.2071850017995 T:C T C 10 0.534589000010906 0.118682075298620 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 44102010 A/C 1 40 38 78 18.6164399995638 20.3143820004144 -1.69794200085067 A:C A C 10 0.534589000010906 0.734194628135955 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 44615174 G/C 1 18 22 40 8.37739799980369 11.7609580002399 -3.38356000043624 C:G G C 10 0.534589000010906 0.341934716221639 ENSG00000166734:ENST00000299957:exon_44615163_44615217:CASC4;ENSG00000166734:ENST00000416522:exon_44615163_44615217:CASC4;ENSG00000166734:ENST00000360824:exon_44615163_44615217:CASC4;ENSG00000166734:ENST00000345795:exon_44615163_44615217:CASC4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 45654327 A/G 1 140 94 234 65.1575399984732 50.2513660010252 14.906173997448 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0571693710866079 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45653324_45654419:GATM HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 45661678 T/A 1 75 48 123 34.905824999182 25.6602720005235 9.24555299865855 A:T T A 10 0.534589000010906 0.103744293272458 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45661524_45661719:GATM HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 45694579 C/T 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 T:C C T 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 45694610 C/T 1 9 13 22 4.18869899990185 6.94965700014178 -2.76095800023993 T:C C T 10 0.534589000010906 0.287120525503420 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 45695695 G/A 1 10 17 27 4.65410999989094 9.0880130001854 -4.43390300029446 A:G G A 10 0.534589000010906 0.121233873388390 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 50769520 G/A 1 16 10 26 7.4465759998255 5.34589000010906 2.10068599971644 A:G G A 10 0.534589000010906 0.438652940292951 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50769473_50769696:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50769473_50769696:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50769473_50769696:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50769473_50769696:USP8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 50773787 A/G 1 23 22 45 10.7044529997492 11.7609580002399 -1.05650500049077 A:G A G 10 0.534589000010906 0.76711418400348 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50773678_50774262:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50773678_50774262:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50773678_50774262:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50773678_50774262:USP8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 50789423 G/A 1 28 18 46 13.0315079996946 9.62260200019631 3.40890599949832 A:G G A 10 0.534589000010906 0.375676182042755 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000419830:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000396440:exon_50789286_50789428:USP8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 50867082 G/A 1 11 13 24 5.11952099988003 6.94965700014178 -1.83013600026174 A:G G A 10 0.534589000010906 0.540892890072247 ENSG00000092439:ENST00000313478:exon_50867049_50867332:TRPM7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 50888568 A/G 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 A:G A G 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000092439:ENST00000313478:exon_50888452_50888578:TRPM7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 50897114 A/G 1 5 11 16 2.32705499994547 5.88047900011997 -3.5534240001745 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0838041199296228 ENSG00000092439:ENST00000313478:exon_50897063_50897341:TRPM7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 54919047 A/G 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000137766:ENST00000260323:exon_54919026_54920806:UNC13C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 59368167 G/A 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 A:G G A 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59368153_59368414:RNF111 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 60639874 G/A 1 98 144 242 45.6102779989312 76.9808160015705 -31.3705380026393 A:T:G G A 10 0.534589000010906 5.98116006983455e-05 ENSG00000182718:ENST00000396024:exon_60639333_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000332680:exon_60639351_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000421017:exon_60639351_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000451270:exon_60639351_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000356292:exon_60639536_60639888:ANXA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 57 42 99 26.5284269993784 22.4527380004581 4.0756889989203 T:G T G 10 0.534589000010906 0.422313710426604 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 63419699 A/C 1 32 20 52 14.893151999651 10.6917800002181 4.20137199943289 A:C A C 10 0.534589000010906 0.267809319270634 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63419552_63419888:LACTB;ENSG00000103642:ENST00000413507:exon_63419552_63419888:LACTB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 10 2 12 4.65410999989094 1.06917800002181 3.58493199986913 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0440105344752742 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 21 8 29 9.77363099977097 4.27671200008725 5.49691899968372 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0421156313407721 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 64455123 G/T 1 72 100 172 33.5095919992148 53.4589000010906 -19.9493080018758 T:G G T 10 0.534589000010906 0.00277132502480604 ENSG00000166794:ENST00000300026:exon_64455051_64455404:PPIB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 64710827 T/C 1 13 7 20 6.05034299985822 3.74212300007634 2.30821999978188 T:C T C 10 0.534589000010906 0.372688141283748 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64710740_64710927:TRIP4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 64962630 A/C 1 10 10 20 4.65410999989094 5.34589000010906 -0.69178000021812 A:C:G A C 10 0.534589000010906 0.824629775002564 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64962545_64962632:ZNF609 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 64966526 C/T 1 18 19 37 8.37739799980369 10.1571910002072 -1.77979300040352 T:C C T 10 0.534589000010906 0.622304005317116 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64966115_64968455:ZNF609 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 65108479 T/C 1 21 20 41 9.77363099977097 10.6917800002181 -0.918149000447148 T:C T C 10 0.534589000010906 0.875862115158315 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 65108504 A/T 1 23 36 59 10.7044529997492 19.2452040003926 -8.54075100064346 A:T A T 10 0.534589000010906 0.0268706148540407 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 65153690 G/A 1 7 8 15 3.25787699992366 4.27671200008725 -1.01883500016359 A:G G A 10 0.534589000010906 0.615581524507087 ENSG00000249240:ENST00000502574:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000249240:ENST00000437723:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65153676_65153774:PLEKHO2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 65157482 C/T 1 17 15 32 7.9119869998146 8.01883500016359 -0.106848000348994 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65157098_65160206:PLEKHO2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 65255894 G/A 1 146 143 289 67.9500059984077 76.4462270015596 -8.49622100315185 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.316923341163929 ENSG00000090487:ENST00000204566:exon_65255362_65256077:SPG21;ENSG00000090487:ENST00000416889:exon_65255364_65256077:SPG21;ENSG00000090487:ENST00000433215:exon_65255364_65256077:SPG21 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 66612965 T/C 1 8 3 11 3.72328799991275 1.60376700003272 2.11952099988003 T:C T C 10 0.534589000010906 0.238841320527235 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000441424:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000524795:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66612909_66613070:DIS3L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 66641732 G/C 1 11 15 26 5.11952099988003 8.01883500016359 -2.89931400028356 T:C:G G C 10 0.534589000010906 0.325953144749333 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66641653_66641775:TIPIN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 66793795 G/A 1 266 526 792 123.799325997099 281.193814005737 -157.394488008638 A:T:C:G G A 10 0.534589000010906 2.95810818041357e-29 ENSG00000174444:ENST00000307961:exon_66793713_66793842:RPL4;ENSG00000174444:ENST00000432669:exon_66793713_66793842:RPL4;ENSG00000174444:ENST00000436058:exon_66793713_66793842:RPL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 67528374 T/G 1 14 7 21 6.51575399984732 3.74212300007634 2.77363099977097 T:G T G 10 0.534589000010906 0.276590217785206 ENSG00000103591:ENST00000261880:exon_67528317_67528406:AAGAB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 72502150 C/T 1 647 566 1213 301.120916992944 302.577374006173 -1.456457013229 T:C C T 10 0.534589000010906 0.954100038491665 ENSG00000067225:ENST00000319622:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000335181:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000419739:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000449901:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000438234:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000434220:exon_72502014_72502187:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000389093:exon_72502014_72502200:PKM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 73027478 T/C 0 9 0 9 4.18869899990185 0 4.18869899990185 T T 10 0.534589000010906 0.00459053241595814 ENSG00000140463:ENST00000268057:exon_73027454_73027523:BBS4;ENSG00000140463:ENST00000395205:exon_73027454_73027523:BBS4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 74276414 A/G 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74275547_74276471:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000359750:exon_74275561_74276471:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74275561_74276471:STOML1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 58 28 86 26.9938379993675 14.9684920003054 12.0253459990621 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00938884004959965 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 66 31 97 30.7171259992802 16.5722590003381 14.1448669989421 T:G G T 10 0.534589000010906 0.00420225757812803 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 69 82 151 32.1133589992475 43.8362980008943 -11.7229390016468 A:T T A 10 0.534589000010906 0.0605385641186903 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 78301401 C/T 1 5 7 12 2.32705499994547 3.74212300007634 -1.41506800013087 T:C C T 10 0.534589000010906 0.565015885912817 ENSG00000167202:ENST00000418039:exon_78301339_78301456:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000409931:exon_78301339_78301456:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000300584:exon_78301339_78301456:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000420639:exon_78301339_78301456:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000472786:exon_78301339_78301456:TBC1D2B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 79215311 A/C 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:C A C 10 0.534589000010906 0.731759291541082 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 79217691 G/A 1 331 157 488 154.05104099639 83.9304730017122 70.1205679946779 A:T:G G A 10 0.534589000010906 1.20910826043012e-10 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000527715:exon_79217676_79219246:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534237:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79217676_79217782:CTSH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 79606191 C/T 1 40 54 94 18.6164399995638 28.8678060005889 -10.2513660010252 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0383749136776756 ENSG00000166557:ENST00000299705:exon_79606099_79606347:TMED3;ENSG00000166557:ENST00000424155:exon_79606099_79606347:TMED3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 96 89 185 44.679455998953 47.5784210009706 -2.89896500201762 A:G A G 10 0.534589000010906 0.712627023590694 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 81598269 T/G 1 91 52 143 42.3524009990075 27.7986280005671 14.5537729984404 T:G T G 10 0.534589000010906 0.0150096571156779 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 81598416 G/A 1 69 66 135 32.1133589992475 35.2828740007198 -3.16951500147232 A:G G A 10 0.534589000010906 0.605350007304723 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 85188775 G/A 1 27 12 39 12.5660969997055 6.41506800013087 6.15102899957466 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0541191773984591 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 85188839 C/T 1 20 23 43 9.30821999978188 12.2955470002508 -2.98732700046896 T:C C T 10 0.534589000010906 0.364482205091434 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 85333953 A/G 1 15 9 24 6.98116499983641 4.81130100009815 2.16986399973826 A:G A G 10 0.534589000010906 0.418609856680633 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85333936_85334114:ZNF592 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 85341859 G/A 1 19 12 31 8.84280899979279 6.41506800013087 2.42774099966191 A:G G A 10 0.534589000010906 0.47233262636417 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85341819_85342106:ZNF592 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 86278309 G/A 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 A:G G A 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86278223_86278381:AKAP13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 86286787 C/T 1 11 9 20 5.11952099988003 4.81130100009815 0.308219999781879 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86286723_86287056:AKAP13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 86287910 C/T 1 12 15 27 5.58493199986913 8.01883500016359 -2.43390300029446 T:C C T 10 0.534589000010906 0.440986457681888 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 89172525 G/A 1 19 14 33 8.84280899979279 7.48424600015268 1.3585629996401 A:G G A 10 0.534589000010906 0.728172693915283 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89172457_89172657:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89172457_89172657:AEN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 165 186 351 76.7928149982005 99.4335540020285 -22.640739003828 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0160250808752788 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 89867424 C/T 1 13 14 27 6.05034299985822 7.48424600015268 -1.43390300029446 T:C C T 10 0.534589000010906 0.700429126790904 ENSG00000140521:ENST00000268124:exon_89867338_89867458:POLG;ENSG00000140521:ENST00000442287:exon_89867338_89867458:POLG;ENSG00000140521:ENST00000532584:exon_89867338_89867458:POLG;ENSG00000140521:ENST00000526314:exon_89867338_89867458:POLG;ENSG00000140521:ENST00000526573:exon_89867338_89867458:POLG;ENSG00000140521:ENST00000533857:exon_89867338_89867522:POLG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 90167658 G/A 1 9 8 17 4.18869899990185 4.27671200008725 -0.0880130001854029 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 90611818 C/A 1 3 13 16 1.39623299996728 6.94965700014178 -5.5534240001745 A:C C A 10 0.534589000010906 0.00968514670275872 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90610342_90611827:ZNF710 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 90771704 G/A 1 13 13 26 6.05034299985822 6.94965700014178 -0.899314000283557 A:G G A 10 0.534589000010906 0.84469204921112 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 91010776 T/C 1 9 16 25 4.18869899990185 8.5534240001745 -4.36472500027265 T:C T C 10 0.534589000010906 0.107346258595778 ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91010682_91010824:IQGAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 91485698 G/C 1 13 14 27 6.05034299985822 7.48424600015268 -1.43390300029446 C:G G C 10 0.534589000010906 0.700429126790904 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91485667_91485835:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91485667_91485835:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91485667_91485835:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91485667_91485978:UNC45A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 91543010 T/C 1 19 7 26 8.84280899979279 3.74212300007634 5.10068599971644 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0498866353028037 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91542907_91543023:VPS33B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 100246936 T/C 1 10 1 11 4.65410999989094 0.534589000010906 4.11952099988003 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0138045823225813 ENSG00000068305:ENST00000354410:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000346108:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000449277:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000338042:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000453228:exon_100246934_100247060:MEF2A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 18 21 39 8.37739799980369 11.226369000229 -2.84897100042534 A:G G A 10 0.534589000010906 0.422955267397017 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 101110096 T/C 1 22 22 44 10.2390419997601 11.7609580002399 -1.52191600047987 T:C T C 10 0.534589000010906 0.653699059282048 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 101464915 T/C 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 T:C T C 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 101591923 A/G 1 3 8 11 1.39623299996728 4.27671200008725 -2.88047900011997 A:G A G 10 0.534589000010906 0.127884495538899 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101591916_101592165:LRRK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 101595257 G/A 1 8 1 9 3.72328799991275 0.534589000010906 3.18869899990185 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0431228184091904 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101595151_101595428:LRRK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 101598200 G/A 1 8 8 16 3.72328799991275 4.27671200008725 -0.553424000174497 A:G G A 10 0.534589000010906 0.807042042252045 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 101598314 C/T 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 T:C C T 10 0.534589000010906 0.592941099997918 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 101606261 C/T 1 16 18 34 7.4465759998255 9.62260200019631 -2.17602600037081 T:C C T 10 0.534589000010906 0.494443161884986 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 15 101718927 G/A 1 7 9 16 3.25787699992366 4.81130100009815 -1.5534240001745 A:G G A 10 0.534589000010906 0.462907821628628 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 97541 G/A 1 116 166 282 53.9876759987349 88.7417740018104 -34.7540980030755 A:G G A 10 0.534589000010906 3.57022176505816e-05 ENSG00000161980:ENST00000293860:exon_96407_97557:POLR3K;ENSG00000161980:ENST00000481810:exon_97236_97557:POLR3K HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 137 110 247 63.7613069985059 58.8047900011997 4.95651699730621 A:G A G 10 0.534589000010906 0.566049937336197 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 424277 G/A 1 23 12 35 10.7044529997492 6.41506800013087 4.28938499961829 A:G G A 10 0.534589000010906 0.175651385675006 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 46 28 74 21.4089059994983 14.9684920003054 6.44041399919295 T:C T C 10 0.534589000010906 0.161615726095315 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 33 13 46 15.3585629996401 6.94965700014178 8.40890599949832 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0170779339005706 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 29 10 39 13.4969189996837 5.34589000010906 8.15102899957466 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0096586149643378 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 601326 C/T 1 22 19 41 10.2390419997601 10.1571910002072 0.0818509995528522 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_601302_601427:SOLH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 601632 T/C 1 19 20 39 8.84280899979279 10.6917800002181 -1.84897100042534 T:C T C 10 0.534589000010906 0.630952369844217 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_601512_601664:SOLH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 44 31 75 20.4780839995201 16.5722590003381 3.90582499918205 A:G A G 10 0.534589000010906 0.418167067223362 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 630902 C/G 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 C:G C G 10 0.534589000010906 0.298446592097252 ENSG00000007541:ENST00000409527:exon_630858_630972:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_630858_630972:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_630858_630972:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000420990:exon_630858_630972:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000443147:exon_630858_630972:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_630183_630972:PIGQ HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 677629 T/C 1 12 8 20 5.58493199986913 4.27671200008725 1.30821999978188 T:C T C 10 0.534589000010906 0.656685513222068 ENSG00000197562:ENST00000248139:exon_677342_679272:RAB40C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 840599 C/T 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_840531_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_840525_842367:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_840525_840805:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_840525_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_840525_842347:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_840525_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_840525_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_840525_840671:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000426047:exon_840525_840666:CHTF18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 841175 C/T 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 T:C C T 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_840525_842367:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_840525_842347:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000426047:exon_841161_841370:CHTF18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 845819 A/G 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 A:G A G 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 847743 C/T 1 22 30 52 10.2390419997601 16.0376700003272 -5.79862800056712 T:C C T 10 0.534589000010906 0.125967157237215 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847694_847751:CHTF18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 847936 C/T 1 15 15 30 6.98116499983641 8.01883500016359 -1.03767000032718 T:C C T 10 0.534589000010906 0.718295138743325 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847839_847975:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847839_848063:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847839_848072:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847839_847975:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847839_848074:CHTF18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 848013 G/A 1 28 16 44 13.0315079996946 8.5534240001745 4.47808399952013 A:G G A 10 0.534589000010906 0.226313018732406 ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847839_848063:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847839_848072:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847839_848074:CHTF18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 1364365 A/G 1 213 200 413 99.132542997677 106.917800002181 -7.78525700450419 A:G A G 10 0.534589000010906 0.459491560372378 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000443007:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000473256:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000402301:exon_1364294_1364377:UBE2I HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 1374818 A/G 1 283 268 551 131.711312996914 143.269852002923 -11.5585390060092 A:G A G 10 0.534589000010906 0.326317445235742 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1374731_1375351:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1374731_1375215:UBE2I HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 1503879 T/A 1 13 17 30 6.05034299985822 9.0880130001854 -3.03767000032718 A:T T A 10 0.534589000010906 0.27812385936588 ENSG00000103249:ENST00000448525:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000428756:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000262318:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000382745:exon_1503835_1503895:CLCN7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 1547477 T/C 1 5 8 13 2.32705499994547 4.27671200008725 -1.94965700014178 T:C T C 10 0.534589000010906 0.405475359831307 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1547362_1547509:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1547362_1547509:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1547362_1547509:TELO2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 1552761 C/T 1 22 13 35 10.2390419997601 6.94965700014178 3.28938499961829 T:C C T 10 0.534589000010906 0.310824265016004 ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1552314_1553003:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1552646_1552762:TELO2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 27 29 56 12.5660969997055 15.5030810003163 -2.93698400061074 A:G A G 10 0.534589000010906 0.503382989325272 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 1657284 C/G 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 C:G C G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000187535:ENST00000397417:exon_1657121_1657298:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000426508:exon_1657121_1657298:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000458658:exon_1657121_1657300:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000361339:exon_1657121_1657300:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000439987:exon_1657121_1657300:IFT140 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 2014283 A/G 1 373 24 397 173.598302995932 12.8301360002617 160.76816699567 A:G A G 10 0.534589000010906 1.27532853657664e-71 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533186:exon_2014277_2014357:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000532746:exon_2014277_2014368:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533872:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2013654_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000534461:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 2014424 C/G 1 11 21 32 5.11952099988003 11.226369000229 -6.10684800034899 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0337083025912769 ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 38 45 83 17.6856179995856 24.0565050004908 -6.3708870009052 A:G A G 10 0.534589000010906 0.186527612272247 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 2222286 C/T 1 29 27 56 13.4969189996837 14.4339030002945 -0.936984000610737 T:C C T 10 0.534589000010906 0.893599684023243 ENSG00000131653:ENST00000326181:exon_2222192_2222375:TRAF7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 2285357 C/T 1 34 45 79 15.8239739996292 24.0565050004908 -8.23253100086158 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0710026130512292 ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2285217_2285743:E4F1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 2880299 C/A 1 5 16 21 2.32705499994547 8.5534240001745 -6.22636900022903 A:C C A 10 0.534589000010906 0.00770497279789231 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2880170_2880329:ZG16B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 20 31 51 9.30821999978188 16.5722590003381 -7.26403900055621 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0488632734498324 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 110 91 201 51.1952099988003 48.6475990009925 2.54761099780789 C:G G C 10 0.534589000010906 0.724415586519722 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 4390358 G/T 1 22 18 40 10.2390419997601 9.62260200019631 0.616439999563758 T:G G T 10 0.534589000010906 0.875398535411848 ENSG00000217930:ENST00000318059:exon_4390252_4390406:PAM16 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 33 30 63 15.3585629996401 16.0376700003272 -0.679107000687081 T:C T C 10 0.534589000010906 0.899890156085493 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 4511752 T/C 1 89 39 128 41.4215789990294 20.8489710004253 20.572607998604 T:C T C 10 0.534589000010906 0.000255049908067072 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4511695_4511960:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4511696_4511960:NMRAL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 4513708 C/T 1 30 67 97 13.9623299996728 35.8174630007307 -21.8551330010579 T:C C T 10 0.534589000010906 9.04652634733751e-06 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4513661_4513851:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4513661_4513851:NMRAL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 4524155 C/G 1 23 9 32 10.7044529997492 4.81130100009815 5.89315199965101 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0496635850803187 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4524094_4524167:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4524094_4524167:NMRAL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 4556911 G/A 1 41 39 80 19.0818509995529 20.8489710004253 -1.76712000087248 A:G G A 10 0.534589000010906 0.73719287486119 ENSG00000103415:ENST00000406590:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000458134:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000219700:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000398595:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000414777:exon_4556896_4557013:HMOX2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 6 9 15 2.79246599993456 4.81130100009815 -2.01883500016359 T:C C T 10 0.534589000010906 0.313814139216668 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 4751045 C/T 1 8 1 9 3.72328799991275 0.534589000010906 3.18869899990185 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0431228184091904 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4750971_4751135:ANKS3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 4752134 A/G 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 A:G A G 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4752103_4752243:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4752103_4752243:ANKS3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 4815602 T/C 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000103199:ENST00000219478:exon_4815566_4816077:ZNF500 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 4855279 A/G 1 60 61 121 27.9246599993456 32.6099290006653 -4.68526900131963 A:G A G 10 0.534589000010906 0.412875415519184 ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4853204_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000436648:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4855102_4855311:GLYR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 5075542 G/A 1 16 7 23 7.4465759998255 3.74212300007634 3.70445299974916 A:G G A 10 0.534589000010906 0.145094012769066 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 5075633 G/A 1 12 4 16 5.58493199986913 2.13835600004362 3.4465759998255 A:G G A 10 0.534589000010906 0.130326098972588 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 5083483 T/C 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 T:C T C 10 0.534589000010906 0.156883047615629 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5083274_5083729:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5083274_5083729:NAGPA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 5128001 C/T 1 12 9 21 5.58493199986913 4.81130100009815 0.773630999770972 T:C C T 10 0.534589000010906 0.828599613252825 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5127908_5128018:ALG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 5139186 G/C 1 11 6 17 5.11952099988003 3.20753400006544 1.9119869998146 C:G G C 10 0.534589000010906 0.467664186074611 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 5139217 C/G 1 12 5 17 5.58493199986913 2.67294500005453 2.9119869998146 C:G C G 10 0.534589000010906 0.223771329291868 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 5140541 G/C 1 4 9 13 1.86164399995638 4.81130100009815 -2.94965700014178 C:G G C 10 0.534589000010906 0.162146782239777 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5140433_5140566:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5140433_5140566:FAM86A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 10575824 C/A 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 A:C C A 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10575693_10577494:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10575693_10577494:ATF7IP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 10989219 C/G 1 11 6 17 5.11952099988003 3.20753400006544 1.9119869998146 C:G C G 10 0.534589000010906 0.467664186074611 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_10989139_10989285:CIITA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 11000848 G/C 1 33 22 55 15.3585629996401 11.7609580002399 3.59760499940017 C:G G C 10 0.534589000010906 0.347346963810807 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 11001770 G/T 1 34 36 70 15.8239739996292 19.2452040003926 -3.42123000076342 T:G G T 10 0.534589000010906 0.472513779211991 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 11002904 G/A 1 24 12 36 11.1698639997383 6.41506800013087 4.75479599960738 A:G G A 10 0.534589000010906 0.13294662285611 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 11016045 C/T 1 16 21 37 7.4465759998255 11.226369000229 -3.77979300040352 T:C C T 10 0.534589000010906 0.249367416803454 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11016024_11016107:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11016024_11016107:CIITA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 11017058 G/A 1 11 4 15 5.11952099988003 2.13835600004362 2.98116499983641 A:G G A 10 0.534589000010906 0.194125209391915 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 11647492 T/C 1 61 54 115 28.3900709993347 28.8678060005889 -0.477735001254192 T:C T C 10 0.534589000010906 0.925885635602426 ENSG00000189067:ENST00000339430:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000413364:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000381810:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000405528:exon_11647389_11647545:LITAF HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 12061674 G/A 1 120 61 181 55.8493199986913 32.6099290006653 23.239390998026 A:G G A 10 0.534589000010906 0.000573501394325074 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 12096886 G/A 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 A:G G A 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000140660:ENST00000268271:exon_12096848_12096900:RUNDC2A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 12758966 T/C 1 11 9 20 5.11952099988003 4.81130100009815 0.308219999781879 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12756937_12758972:CPPED1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 14742400 T/G 1 25 29 54 11.6352749997273 15.5030810003163 -3.86780600058893 T:G T G 10 0.534589000010906 0.33992040050421 ENSG00000103429:ENST00000261658:exon_14742245_14742449:BFAR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 14758836 C/T 1 11 8 19 5.11952099988003 4.27671200008725 0.842808999792785 T:C C T 10 0.534589000010906 0.819574245361162 ENSG00000103429:ENST00000261658:exon_14758726_14758928:BFAR;ENSG00000103429:ENST00000426842:exon_14758726_14758928:BFAR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 12 5 17 5.58493199986913 2.67294500005453 2.9119869998146 A:C C A 10 0.534589000010906 0.223771329291868 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 15098047 C/G 1 13 3 16 6.05034299985822 1.60376700003272 4.4465759998255 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0414802081249136 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15098044_15098190:PDXDC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 15129970 A/G 1 26 48 74 12.1006859997164 25.6602720005235 -13.559586000807 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00222017973409948 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 15131962 A/G 1 45 28 73 20.9434949995092 14.9684920003054 5.97500299920386 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.196535368388322 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 15131974 G/T 1 44 26 70 20.4780839995201 13.8993140002836 6.57876999923658 T:G G T 10 0.534589000010906 0.120660420107771 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 15133889 T/G 1 22 20 42 10.2390419997601 10.6917800002181 -0.452738000458053 T:G T G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 15961351 T/C 1 24 1 25 11.1698639997383 0.534589000010906 10.6352749997273 T:C T C 10 0.534589000010906 5.72487984997496e-06 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 15961356 C/T 1 24 1 25 11.1698639997383 0.534589000010906 10.6352749997273 T:C C T 10 0.534589000010906 5.72487984997496e-06 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 15961369 G/A 0 28 0 28 13.0315079996946 0 13.0315079996946 G G 10 0.534589000010906 4.08399156522524e-08 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 18861335 A/G 1 4 8 12 1.86164399995638 4.27671200008725 -2.41506800013087 A:G A G 10 0.534589000010906 0.246532544157622 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18861271_18861448:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18861271_18861448:SMG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 19547357 A/G 0 0 11 11 0 5.88047900011997 -5.88047900011997 G A G 10 0.534589000010906 0.000221923391012186 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 19547503 C/T 1 6 8 14 2.79246599993456 4.27671200008725 -1.48424600015268 T:C C T 10 0.534589000010906 0.437971150157616 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 21272591 G/C 1 1 8 9 0.465410999989094 4.27671200008725 -3.81130100009815 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0151819886668037 ENSG00000103316:ENST00000219599:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000396023:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000415987:exon_21272575_21272659:CRYM HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 22262514 C/A 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 A:C C A 10 0.534589000010906 0.298446592097252 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22262472_22262643:EEF2K HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 23079353 T/C 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 T:C T C 10 0.534589000010906 0.592941099997918 ENSG00000103404:ENST00000219689:exon_23072727_23080937:USP31;ENSG00000103404:ENST00000381162:exon_23079303_23079901:USP31 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 23672560 A/T 1 9 5 14 4.18869899990185 2.67294500005453 1.51575399984732 A:T A T 10 0.534589000010906 0.593864451936242 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23672491_23672602:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23672491_23672563:DCTN5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 23701458 G/A 1 80 57 137 37.2328799991275 30.4715730006216 6.76130699850588 A:G G A 10 0.534589000010906 0.265962492164170 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 23847575 C/A 1 11 10 21 5.11952099988003 5.34589000010906 -0.226369000229027 A:C C A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_23847322_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_23847345_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000498058:exon_23847403_23847669:PRKCB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 24788645 T/A 1 14 5 19 6.51575399984732 2.67294500005453 3.84280899979279 A:T T A 10 0.534589000010906 0.105953198279502 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24788569_24788679:TNRC6A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 24801737 G/A 1 12 9 21 5.58493199986913 4.81130100009815 0.773630999770972 A:G G A 10 0.534589000010906 0.828599613252825 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 24802325 C/T 1 11 8 19 5.11952099988003 4.27671200008725 0.842808999792785 T:C C T 10 0.534589000010906 0.819574245361162 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 24834233 C/T 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 T:C C T 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834195_24834334:TNRC6A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 24835168 G/A 1 22 10 32 10.2390419997601 5.34589000010906 4.89315199965101 A:C:G G A 10 0.534589000010906 0.109581380667217 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834753_24836196:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834753_24837545:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834753_24836090:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834753_24836107:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834753_24836107:TNRC6A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 29 32 61 13.4969189996837 17.106848000349 -3.60992900066527 T:C T C 10 0.534589000010906 0.371175926908841 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 27363901 G/A 1 8 4 12 3.72328799991275 2.13835600004362 1.58493199986913 A:G G A 10 0.534589000010906 0.401454124777931 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27363861_27364017:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27363861_27364017:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27363861_27364017:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27363861_27364017:IL4R HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 27373872 A/C 1 41 25 66 19.0818509995529 13.3647250002727 5.7171259992802 A:C A C 10 0.534589000010906 0.175390059497723 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 27373915 G/T 1 37 12 49 17.2202069995965 6.41506800013087 10.8051389994656 T:G G T 10 0.534589000010906 0.00229140690133374 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 27373964 T/C 1 42 23 65 19.5472619995419 12.2955470002508 7.25171499929111 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0815195196168655 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 27373972 T/C 1 45 24 69 20.9434949995092 12.8301360002617 8.11335899924748 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0537100232192642 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 27374180 T/C 1 37 30 67 17.2202069995965 16.0376700003272 1.1825369992693 T:C T C 10 0.534589000010906 0.80743084437921 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 27374400 A/G 1 34 23 57 15.8239739996292 12.2955470002508 3.52842699937836 A:G A G 10 0.534589000010906 0.356934380839290 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 28993369 C/T 1 13 16 29 6.05034299985822 8.5534240001745 -2.50308100031627 T:C C T 10 0.534589000010906 0.359545966755733 ENSG00000169682:ENST00000311008:exon_28993222_28993377:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000452515:exon_28993222_28993377:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000323081:exon_28993222_28993377:SPNS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 31075175 G/A 1 19 15 34 8.84280899979279 8.01883500016359 0.823973999629194 A:G G A 10 0.534589000010906 0.864184099905938 ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31075134_31075802:ZNF668 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 31088347 G/A 1 10 4 14 4.65410999989094 2.13835600004362 2.51575399984732 A:G G A 10 0.534589000010906 0.194114354160929 ENSG00000167395:ENST00000428260:exon_31087567_31088365:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 31088625 A/G 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:G A G 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 31090407 G/C 1 12 2 14 5.58493199986913 1.06917800002181 4.51575399984732 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0158603999537431 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 31091209 T/C 1 19 14 33 8.84280899979279 7.48424600015268 1.3585629996401 T:C T C 10 0.534589000010906 0.728172693915283 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 31092075 G/A 1 14 14 28 6.51575399984732 7.48424600015268 -0.968492000305369 A:G G A 10 0.534589000010906 0.710379181771136 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 31121793 G/A 1 29 29 58 13.4969189996837 15.5030810003163 -2.00616200063255 A:G G A 10 0.534589000010906 0.601603473828192 ENSG00000103507:ENST00000394951:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000219794:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394950:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000287507:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394952:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000441132:exon_31121722_31121801:BCKDK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 31193942 C/A 1 372 358 730 173.132891995943 191.382862003904 -18.2499700079614 A:C C A 10 0.534589000010906 0.181700373194305 ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 31336719 G/A 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:G G A 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000169896:ENST00000287497:exon_31336584_31336725:ITGAM HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 31374535 C/G 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 C:G C G 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000140678:ENST00000268296:exon_31374486_31374695:ITGAX;ENSG00000140678:ENST00000394880:exon_31374486_31374695:ITGAX HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 31384648 C/T 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 T:C C T 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000140678:ENST00000268296:exon_31384570_31384711:ITGAX HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 46642286 G/A 1 10 8 18 4.65410999989094 4.27671200008725 0.377397999803692 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000171241:ENST00000303383:exon_46642209_46642301:SHCBP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 56545175 T/C 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:C T C 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000125124:ENST00000245157:exon_56545071_56545196:BBS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 56855496 C/G 1 18 23 41 8.37739799980369 12.2955470002508 -3.91814900044715 C:G C G 10 0.534589000010906 0.273044441286071 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56855416_56855505:NUP93 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 57015091 G/C 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 C:G G C 10 0.534589000010906 0.298446592097252 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57015070_57015137:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57015070_57015137:CETP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 57017319 G/A 1 14 9 23 6.51575399984732 4.81130100009815 1.70445299974916 A:G G A 10 0.534589000010906 0.535325651889601 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57017238_57017323:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57017238_57017323:CETP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 57085465 C/T 1 8 8 16 3.72328799991275 4.27671200008725 -0.553424000174497 T:C C T 10 0.534589000010906 0.807042042252045 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57085450_57085533:NLRC5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 57595999 A/G 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 A:G A G 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57595968_57596069:GPR114 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 57601792 C/T 1 16 9 25 7.4465759998255 4.81130100009815 2.63527499972735 T:C C T 10 0.534589000010906 0.322000273897906 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 57787027 C/T 1 25 22 47 11.6352749997273 11.7609580002399 -0.125683000512584 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786989_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786989_57787179:KATNB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 57787906 C/T 1 14 17 31 6.51575399984732 9.0880130001854 -2.57225900033809 T:C C T 10 0.534589000010906 0.373247092552356 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57787857_57787907:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57787857_57787907:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57787857_57787907:KATNB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 58030634 C/T 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000166188:ENST00000299237:exon_58028573_58032426:ZNF319 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 58549932 T/C 1 15 7 22 6.98116499983641 3.74212300007634 3.23904199976007 T:C T C 10 0.534589000010906 0.201853762836156 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58549857_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58549857_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58549695_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58549857_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000470003:exon_58549857_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000492050:exon_58549857_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000468223:exon_58549434_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58549857_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000418480:exon_58549857_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58549695_58550001:SETD6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 58552921 G/A 1 20 17 37 9.30821999978188 9.0880130001854 0.220206999596478 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 58575489 G/A 1 50 34 84 23.2705499994547 18.1760260003708 5.09452399908389 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.276068701381555 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58575405_58575524:CNOT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 58587737 C/T 1 16 15 31 7.4465759998255 8.01883500016359 -0.572259000338088 T:C C T 10 0.534589000010906 0.858876862828474 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58587686_58587764:CNOT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 58616984 T/C 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 T:C T C 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58616960_58617086:CNOT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 67696365 G/A 1 12 8 20 5.58493199986913 4.27671200008725 1.30821999978188 A:G G A 10 0.534589000010906 0.656685513222068 ENSG00000102981:ENST00000458121:exon_67695799_67696680:PARD6A;ENSG00000102981:ENST00000219255:exon_67695796_67696677:PARD6A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 67709955 A/G 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000141098:ENST00000268797:exon_67708436_67709956:GFOD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 67911517 T/C 1 17 28 45 7.9119869998146 14.9684920003054 -7.05650500049077 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0370279634742211 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 67969531 A/G 1 131 107 238 60.9688409985713 57.2010230011669 3.76781799740436 A:G A G 10 0.534589000010906 0.649511967980233 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969485_67969600:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969452_67969600:PSMB10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 222 195 417 103.321241997579 104.244855002127 -0.923613004547803 A:G A G 10 0.534589000010906 0.960857322564369 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 67973953 G/A 1 9 8 17 4.18869899990185 4.27671200008725 -0.0880130001854029 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000213398:ENST00000264005:exon_67973653_67974381:LCAT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 68021468 G/C 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000167261:ENST00000322384:exon_68021296_68021663:DPEP2;ENSG00000167261:ENST00000268795:exon_68021296_68021663:DPEP2;ENSG00000167261:ENST00000393847:exon_68021297_68021663:DPEP2;ENSG00000167261:ENST00000412757:exon_68021300_68021663:DPEP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 68072004 A/G 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 A:G A G 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000167264:ENST00000358896:exon_68071909_68072052:DUS2L;ENSG00000167264:ENST00000432752:exon_68071909_68072052:DUS2L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 68156591 T/A 1 13 11 24 6.05034299985822 5.88047900011997 0.169863999738255 A:T T A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000072736:ENST00000379165:exon_68155890_68157024:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000349223:exon_68155890_68157024:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000346183:exon_68155890_68157024:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000329524:exon_68155890_68157024:NFATC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 68293320 T/C 1 13 2 15 6.05034299985822 1.06917800002181 4.98116499983641 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0094264980296512 ENSG00000103066:ENST00000219345:exon_68293049_68294965:PLA2G15;ENSG00000103066:ENST00000444212:exon_68293049_68294959:PLA2G15;ENSG00000103066:ENST00000413021:exon_68293049_68294959:PLA2G15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 68344696 C/T 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 68390697 C/T 1 22 24 46 10.2390419997601 12.8301360002617 -2.59109400050168 T:C C T 10 0.534589000010906 0.463097485658083 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68390604_68390700:PRMT7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 68598007 A/G 1 10 3 13 4.65410999989094 1.60376700003272 3.05034299985822 A:G A G 10 0.534589000010906 0.102317208684754 ENSG00000184939:ENST00000398253:exon_68596947_68601039:ZFP90 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 69963355 G/A 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:G G A 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69963351_69963432:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69963351_69963432:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69963351_69963432:WWP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 69967897 T/C 1 13 9 22 6.05034299985822 4.81130100009815 1.23904199976007 T:C T C 10 0.534589000010906 0.672470686731093 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69967873_69968032:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69967873_69968032:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69967873_69968032:WWP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 69970329 A/G 1 13 5 18 6.05034299985822 2.67294500005453 3.37739799980369 A:G A G 10 0.534589000010906 0.155238770669501 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69970215_69970355:WWP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 69973825 G/A 1 17 15 32 7.9119869998146 8.01883500016359 -0.106848000348994 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973744_69975644:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973744_69975643:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973744_69975643:WWP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 70287177 A/G 1 152 110 262 70.7424719983423 58.8047900011997 11.9376819971426 A:G A G 10 0.534589000010906 0.154222298407613 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70287171_70287284:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70287171_70287284:AARS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 70546234 G/A 1 9 5 14 4.18869899990185 2.67294500005453 1.51575399984732 A:G G A 10 0.534589000010906 0.593864451936242 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70546142_70546321:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70546176_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70546222_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70546226_70546335:COG4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 70548297 G/A 1 8 3 11 3.72328799991275 1.60376700003272 2.11952099988003 A:G G A 10 0.534589000010906 0.238841320527235 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70548238_70548386:COG4;ENSG00000103051:ENST00000524584:exon_70548238_70548412:COG4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 25 14 39 11.6352749997273 7.48424600015268 4.15102899957466 A:T A T 10 0.534589000010906 0.201572301274183 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 97 76 173 45.1448669989421 40.6287640008289 4.51610299811325 T:C C T 10 0.534589000010906 0.542188510643948 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 70726795 C/A 1 9 9 18 4.18869899990185 4.81130100009815 -0.622602000196309 A:C C A 10 0.534589000010906 0.81636697210269 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70726724_70726874:VAC14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 72828403 A/G 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:G A G 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72827154_72832613:ZFHX3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 72829630 A/G 1 7 10 17 3.25787699992366 5.34589000010906 -2.0880130001854 A:G A G 10 0.534589000010906 0.339484157804598 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72827154_72832613:ZFHX3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 75269534 C/T 1 13 15 28 6.05034299985822 8.01883500016359 -1.96849200030537 T:C C T 10 0.534589000010906 0.570640261191915 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 77228866 T/C 1 13 5 18 6.05034299985822 2.67294500005453 3.37739799980369 T:C T C 10 0.534589000010906 0.155238770669501 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 81953195 G/A 1 28 32 60 13.0315079996946 17.106848000349 -4.07534000065436 A:G G A 10 0.534589000010906 0.303097682007859 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81953089_81953269:PLCG2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84088026 T/C 1 29 24 53 13.4969189996837 12.8301360002617 0.666782999421979 T:C T C 10 0.534589000010906 0.89120364089182 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84088047 C/T 1 27 30 57 12.5660969997055 16.0376700003272 -3.47157300062164 T:C C T 10 0.534589000010906 0.425917134878986 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84100173 C/T 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84100094_84100218:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84100094_84100218:MBTPS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84115393 G/A 1 14 4 18 6.51575399984732 2.13835600004362 4.37739799980369 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0559940525767233 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84115352_84115513:MBTPS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84127418 C/T 1 5 8 13 2.32705499994547 4.27671200008725 -1.94965700014178 T:C C T 10 0.534589000010906 0.405475359831307 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84127316_84127426:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84127316_84127426:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84127316_84127426:MBTPS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 32 25 57 14.893151999651 13.3647250002727 1.52842699937836 A:C C A 10 0.534589000010906 0.79087142371729 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84213114 C/T 1 37 20 57 17.2202069995965 10.6917800002181 6.52842699937836 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0858880717188049 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 14 11 25 6.51575399984732 5.88047900011997 0.635274999727349 A:T A T 10 0.534589000010906 0.843567005465164 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84215390 T/C 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84215352_84215664:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84215352_84215469:TAF1C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84230500 A/C 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 A:C A C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000140955:ENST00000315906:exon_84230476_84230772:ADAD2;ENSG00000140955:ENST00000268624:exon_84230476_84230772:ADAD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84691044 C/T 1 15 25 40 6.98116499983641 13.3647250002727 -6.38356000043624 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0559839531778444 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84690477_84691550:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84690477_84691519:KLHL36 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84695214 C/T 1 5 10 15 2.32705499994547 5.34589000010906 -3.01883500016359 T:C C T 10 0.534589000010906 0.128857341400782 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84695361 G/A 1 15 11 26 6.98116499983641 5.88047900011997 1.10068599971644 A:G G A 10 0.534589000010906 0.699080776375629 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 114 125 239 53.0568539987567 66.8236250013633 -13.7667710026065 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0799197788979076 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 85 74 159 39.559934999073 39.559586000807 0.000348998265941702 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 45 49 94 20.9434949995092 26.1948610005344 -5.25136600102517 T:G T G 10 0.534589000010906 0.301677802522682 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 28 51 79 13.0315079996946 27.2640390005562 -14.2325310008616 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.00147845245138535 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 85694968 C/T 1 9 6 15 4.18869899990185 3.20753400006544 0.981164999836409 T:C C T 10 0.534589000010906 0.796967668188066 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85694752_85695371:KIAA0182 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 85706047 A/C 1 25 30 55 11.6352749997273 16.0376700003272 -4.40239500059983 A:C A C 10 0.534589000010906 0.279536737587406 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85706011_85706960:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85706011_85706499:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85706011_85706102:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000471070:exon_85706011_85706254:KIAA0182 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 85948098 G/A 1 70 66 136 32.5787699992366 35.2828740007198 -2.70410400148322 A:G G A 10 0.534589000010906 0.667831635904805 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85948079_85948126:IRF8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 86565882 G/C 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 C:G G C 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 87446053 G/A 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 A:G G A 10 0.534589000010906 0.189086525758904 ENSG00000140948:ENST00000268616:exon_87445122_87446582:ZCCHC14;ENSG00000140948:ENST00000412336:exon_87445027_87446582:ZCCHC14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 12 16 28 5.58493199986913 8.5534240001745 -2.96849200030537 A:G G A 10 0.534589000010906 0.343734499573097 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 88052146 C/T 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 T:C C T 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88052034_88052273:BANP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 88599023 A/G 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 0.529760851175976 ENSG00000179588:ENST00000319555:exon_88599022_88599117:ZFPM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 88872511 T/C 1 84 71 155 39.0945239990839 37.9558190007743 1.13870499830956 T:C T C 10 0.534589000010906 0.872391779720687 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872429_88872529:CDT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 89350038 G/A 1 59 56 115 27.4592489993565 29.9369840006107 -2.4777350012542 A:G G A 10 0.534589000010906 0.641814362397674 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 89350178 G/A 1 79 58 137 36.7674689991384 31.0061620006325 5.76130699850587 A:G G A 10 0.534589000010906 0.346685515622227 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 89644001 T/C 1 9 11 20 4.18869899990185 5.88047900011997 -1.69178000021812 T:C T C 10 0.534589000010906 0.505607767076301 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89643947_89644129:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89643947_89644129:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000525982:exon_89643947_89644129:CPNE7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 89661807 C/T 1 27 15 42 12.5660969997055 8.01883500016359 4.54726199954195 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.167495467529491 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000529800:exon_89661775_89661831:CPNE7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 89662990 T/C 1 52 41 93 24.2013719994329 21.9181490004471 2.28322299898574 T:C T C 10 0.534589000010906 0.67820435736154 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 89663072 G/A 1 73 58 131 33.9750029992039 31.0061620006325 2.96884099857131 A:G G A 10 0.534589000010906 0.661639135285503 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 89804275 C/T 1 48 32 80 22.3397279994765 17.106848000349 5.23287999912752 T:C C T 10 0.534589000010906 0.263265686319029 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804214_89804313:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804214_89804313:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804214_89804313:ZNF276;ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89803959_89805116:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89803959_89805116:FANCA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 16 89845402 C/T 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 T:C C T 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89845351_89845411:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89845351_89845411:FANCA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 7 11 18 3.25787699992366 5.88047900011997 -2.62260200019631 A:G G A 10 0.534589000010906 0.243363535954427 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 505129 A/C 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 A:C A C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_505035_505136:VPS53 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 82 84 166 38.1637019991057 44.9054760009161 -6.74177400181041 T:C C T 10 0.534589000010906 0.312130846369259 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 650206 C/T 1 44 54 98 20.4780839995201 28.8678060005889 -8.38972200106879 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.104796152760419 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 27 44 71 12.5660969997055 23.5219160004799 -10.9558190007743 T:G G T 10 0.534589000010906 0.0119474394330714 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 1371393 C/T 1 87 60 147 40.4907569990512 32.0753400006544 8.41541699839681 T:C C T 10 0.534589000010906 0.185760215316712 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1371282_1371417:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1371282_1371417:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1371282_1371417:MYO1C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 32 42 74 14.893151999651 22.4527380004581 -7.55958600080705 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0813761515414073 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 1377914 C/A 1 43 34 77 20.012672999531 18.1760260003708 1.83664699916024 A:C C A 10 0.534589000010906 0.732326612300748 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1377904_1377984:MYO1C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 1377943 A/G 1 36 23 59 16.7547959996074 12.2955470002508 4.45924899935654 A:G A G 10 0.534589000010906 0.296482904061942 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1377904_1377984:MYO1C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 1383893 G/A 1 42 28 70 19.5472619995419 14.9684920003054 4.57876999923658 A:G G A 10 0.534589000010906 0.283507254154521 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1383821_1383919:MYO1C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 1637074 A/G 1 16 17 33 7.4465759998255 9.0880130001854 -1.6414370003599 A:G A G 10 0.534589000010906 0.603642096692231 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 1637302 A/G 1 15 14 29 6.98116499983641 7.48424600015268 -0.503081000316275 A:G A G 10 0.534589000010906 0.85484380718489 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 1640793 C/T 1 14 16 30 6.51575399984732 8.5534240001745 -2.03767000032718 T:C C T 10 0.534589000010906 0.470259628180765 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 1680002 T/C 1 10 12 22 4.65410999989094 6.41506800013087 -1.76095800023993 T:C T C 10 0.534589000010906 0.524043562584602 ENSG00000132386:ENST00000254722:exon_1679826_1680036:SERPINF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 1686410 T/C 1 2 8 10 0.930821999978188 4.27671200008725 -3.34589000010906 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0527671529214564 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1686329_1686452:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1684986_1686452:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000476292:exon_1686404_1686452:SMYD4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 1703543 G/C 1 10 10 20 4.65410999989094 5.34589000010906 -0.69178000021812 C:G G C 10 0.534589000010906 0.824629775002564 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1703151_1704099:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000495309:exon_1703510_1704011:SMYD4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 1782957 C/T 1 76 58 134 35.3712359991711 31.0061620006325 4.36507399853859 T:C C T 10 0.534589000010906 0.488776813052385 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1782854_1782993:RPA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 1943880 C/G 1 10 4 14 4.65410999989094 2.13835600004362 2.51575399984732 C:G C G 10 0.534589000010906 0.194114354160929 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1943799_1943899:DPH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 2091765 C/T 1 7 6 13 3.25787699992366 3.20753400006544 0.0503429998582212 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2091693_2091809:SMG6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 2585113 C/T 1 29 32 61 13.4969189996837 17.106848000349 -3.60992900066527 T:C C T 10 0.534589000010906 0.371175926908841 ENSG00000007168:ENST00000397195:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000451360:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000006951:exon_2585023_2585201:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000397193:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 44 40 84 20.4780839995201 21.3835600004362 -0.905476000916106 A:G G A 10 0.534589000010906 0.913000460031098 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 2600186 G/A 1 64 44 108 29.786303999302 23.5219160004799 6.26438799882215 A:G G A 10 0.534589000010906 0.247521695926620 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2600013_2600236:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2600013_2600236:KIAA0664 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 3563963 C/G 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 C:G C G 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 3839685 G/A 1 31 18 49 14.4277409996619 9.62260200019631 4.8051389994656 A:G G A 10 0.534589000010906 0.19777597911001 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3839561_3839763:ATP2A3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 3840928 A/G 1 48 36 84 22.3397279994765 19.2452040003926 3.09452399908389 A:G A G 10 0.534589000010906 0.513815361928005 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3840710_3840930:ATP2A3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 3845927 A/G 1 27 20 47 12.5660969997055 10.6917800002181 1.87431699948742 A:G A G 10 0.534589000010906 0.661716636656004 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3845900_3846025:ATP2A3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 3846802 A/G 1 10 5 15 4.65410999989094 2.67294500005453 1.98116499983641 A:G A G 10 0.534589000010906 0.438822405676019 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3846685_3846816:ATP2A3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 3848013 A/C 1 16 8 24 7.4465759998255 4.27671200008725 3.16986399973826 A:C A C 10 0.534589000010906 0.223463869283253 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3847998_3848100:ATP2A3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 3910165 A/G 1 13 10 23 6.05034299985822 5.34589000010906 0.704452999749162 A:G A G 10 0.534589000010906 0.836527371779212 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3907739_3910264:ZZEF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 3953083 T/C 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 T:C T C 10 0.534589000010906 0.189086525758904 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3953002_3953153:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3953002_3953153:ZZEF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 3953102 A/G 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 A:G A G 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3953002_3953153:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3953002_3953153:ZZEF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 4446457 G/A 1 46 66 112 21.4089059994983 35.2828740007198 -13.8739680012215 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0102611559609166 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4446208_4446460:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4446208_4446460:MYBBP1A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 4577849 C/G 1 84 93 177 39.0945239990839 49.7167770010143 -10.6222530019304 C:G C G 10 0.534589000010906 0.113901177152130 ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4577805_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4577805_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4577805_4577964:PELP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 4722785 G/A 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 A:G G A 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4722724_4722877:PLD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 4722876 G/A 1 2 7 9 0.930821999978188 3.74212300007634 -2.81130100009815 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0917858367386368 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4722724_4722877:PLD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 4797305 G/A 1 16 15 31 7.4465759998255 8.01883500016359 -0.572259000338088 A:G G A 10 0.534589000010906 0.858876862828474 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4797283_4797388:MINK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 4856376 A/G 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000108515:ENST00000520221:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522798:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522301:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521811:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519602:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000441285:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000381335:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000323997:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000422083:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519834:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522249:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521659:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000518175:exon_4856346_4856404:ENO3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 4875628 A/G 1 5 10 15 2.32705499994547 5.34589000010906 -3.01883500016359 A:G A G 10 0.534589000010906 0.128857341400782 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 4926882 A/G 1 34 22 56 15.8239739996292 11.7609580002399 4.06301599938926 A:G A G 10 0.534589000010906 0.287408492033131 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5085857 C/T 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 T:C C T 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000180626:ENST00000399604:exon_5082830_5087571:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000381752:exon_5083373_5086253:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000315777:exon_5085505_5086312:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000389222:exon_5085505_5086312:ZNF594 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5085893 C/T 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 T:C C T 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000180626:ENST00000399604:exon_5082830_5087571:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000381752:exon_5083373_5086253:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000315777:exon_5085505_5086312:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000389222:exon_5085505_5086312:ZNF594 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 26 19 45 12.1006859997164 10.1571910002072 1.94349499950923 A:G A G 10 0.534589000010906 0.65454554395575 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5126689 G/A 1 31 16 47 14.4277409996619 8.5534240001745 5.87431699948742 A:G G A 10 0.534589000010906 0.107005013818601 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 30 20 50 13.9623299996728 10.6917800002181 3.2705499994547 T:C T C 10 0.534589000010906 0.396471196309824 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5284698 A/G 1 16 12 28 7.4465759998255 6.41506800013087 1.03150799969463 A:G A G 10 0.534589000010906 0.85019112749302 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5284719 T/C 1 21 17 38 9.77363099977097 9.0880130001854 0.68561799958557 T:C T C 10 0.534589000010906 0.871910130672068 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5284770 G/A 1 52 24 76 24.2013719994329 12.8301360002617 11.3712359991711 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0109394036537804 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 91 108 199 42.3524009990075 57.7356120011778 -15.3832110021703 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0327958766638992 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 68 65 133 31.6479479992584 34.7482850007089 -3.1003370014505 T:C T C 10 0.534589000010906 0.602911020752137 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5294976 T/A 1 42 24 66 19.5472619995419 12.8301360002617 6.7171259992802 A:T T A 10 0.534589000010906 0.108890547973186 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 34 17 51 15.8239739996292 9.0880130001854 6.73596099944379 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0677134529904536 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5308411 A/G 1 29 13 42 13.4969189996837 6.94965700014178 6.54726199954195 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0450414774408262 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 81 92 173 37.6982909991166 49.1821880010034 -11.4838970018867 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0933214751079264 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 86 97 183 40.0253459990621 51.8551330010579 -11.8297870019958 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0881461640705098 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5347576 G/A 1 9 9 18 4.18869899990185 4.81130100009815 -0.622602000196309 A:G G A 10 0.534589000010906 0.81636697210269 ENSG00000005100:ENST00000225296:exon_5344232_5347833:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000457531:exon_5345596_5347833:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000433302:exon_5345596_5347833:DHX33 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5425076 A/G 1 13 6 19 6.05034299985822 3.20753400006544 2.84280899979279 A:G A G 10 0.534589000010906 0.25120097657608 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 14 7 21 6.51575399984732 3.74212300007634 2.77363099977097 T:C T C 10 0.534589000010906 0.276590217785206 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5485367 A/T 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 A:T A T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5485179_5485382:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5485179_5485382:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5485179_5485382:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5485179_5485382:NLRP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 5487164 C/G 1 4 8 12 1.86164399995638 4.27671200008725 -2.41506800013087 T:C:G C G 10 0.534589000010906 0.246532544157622 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5487007_5487832:NLRP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 6941625 C/T 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 T:C C T 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 6943266 G/A 1 9 7 16 4.18869899990185 3.74212300007634 0.446575999825503 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6943082_6943438:SLC16A13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 6945087 G/T 1 13 12 25 6.05034299985822 6.41506800013087 -0.364725000272651 T:G G T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6944949_6945227:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6944949_6945227:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6944949_6945227:SLC16A11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 6946287 T/C 1 24 26 50 11.1698639997383 13.8993140002836 -2.7294500005453 T:C T C 10 0.534589000010906 0.479836118157417 ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6946249_6946392:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6946249_6946392:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6946249_6946392:SLC16A11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 6946330 C/T 1 12 17 29 5.58493199986913 9.0880130001854 -3.50308100031627 T:C C T 10 0.534589000010906 0.198836235703780 ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6946249_6946392:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6946249_6946392:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6946249_6946392:SLC16A11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7127696 G/A 1 196 236 432 91.2205559978624 126.163004002574 -34.9424480047114 A:C:G G A 10 0.534589000010906 0.000856252201187107 ENSG00000072778:ENST00000356839:exon_7127640_7127712:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000322910:exon_7127640_7127712:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000350303:exon_7127640_7127712:ACADVL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 19 20 39 8.84280899979279 10.6917800002181 -1.84897100042534 T:C T C 10 0.534589000010906 0.630952369844217 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7133162 G/A 1 17 22 39 7.9119869998146 11.7609580002399 -3.84897100042534 A:G G A 10 0.534589000010906 0.261344115635340 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7144146 C/A 1 348 403 751 161.963027996205 215.439367004395 -53.4763390081905 A:T:C C A 10 0.534589000010906 0.000103126519288660 ENSG00000170296:ENST00000302386:exon_7143333_7144238:GABARAP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7216540 G/A 1 60 72 132 27.9246599993456 38.4904080007852 -10.5657480014396 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0673097703025686 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7216531_7216610:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7216531_7216610:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7216531_7216610:GPS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7217463 T/C 1 53 20 73 24.666782999422 10.6917800002181 13.9750029992039 T:C T C 10 0.534589000010906 0.000945726040548772 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7217399_7217478:GPS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7224736 T/G 1 16 7 23 7.4465759998255 3.74212300007634 3.70445299974916 T:G T G 10 0.534589000010906 0.145094012769066 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7224680_7224778:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7224680_7224778:NEURL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7224921 C/G 1 9 13 22 4.18869899990185 6.94965700014178 -2.76095800023993 C:G C G 10 0.534589000010906 0.287120525503420 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7224879_7225106:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7224879_7225106:NEURL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7256760 C/T 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 T:C C T 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000213859:ENST00000333751:exon_7255208_7258258:KCTD11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7366651 C/G 1 7 12 19 3.25787699992366 6.41506800013087 -3.15719100020722 C:G C G 10 0.534589000010906 0.170892403910016 ENSG00000174282:ENST00000311403:exon_7362685_7367209:ZBTB4;ENSG00000174282:ENST00000380599:exon_7362688_7367209:ZBTB4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7405937 C/T 1 18 16 34 8.37739799980369 8.5534240001745 -0.176026000370806 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7405837_7406020:POLR2A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7412403 T/C 1 41 27 68 19.0818509995529 14.4339030002945 4.64794799925839 T:C T C 10 0.534589000010906 0.275792323654624 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7412263_7412509:POLR2A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7460685 G/A 1 28 30 58 13.0315079996946 16.0376700003272 -3.00616200063255 A:G G A 10 0.534589000010906 0.433377433253994 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7462969 A/G 1 20 9 29 9.30821999978188 4.81130100009815 4.49691899968373 A:G A G 10 0.534589000010906 0.135069159960843 ENSG00000239697:ENST00000518220:exon_7462941_7463019:TNFSF12;ENSG00000248871:ENST00000293826:exon_7462941_7463019:TNFSF12-TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462941_7463019:TNFSF13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7477938 G/C 1 269 209 478 125.195558997066 111.729101002279 13.4664579947869 C:G G C 10 0.534589000010906 0.233203739605311 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7477864_7477996:EIF4A1;ENSG00000161960:ENST00000380512:exon_7477864_7477996:EIF4A1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7530147 G/C 1 10 4 14 4.65410999989094 2.13835600004362 2.51575399984732 C:G G C 10 0.534589000010906 0.194114354160929 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7530271 C/T 1 28 30 58 13.0315079996946 16.0376700003272 -3.00616200063255 T:C C T 10 0.534589000010906 0.433377433253994 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7530261_7530362:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7530261_7530362:SAT2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7750436 C/T 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 T:C C T 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750423_7750770:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750423_7750770:KDM6B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7750903 T/C 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7751778 G/A 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7754460 C/A 1 10 7 17 4.65410999989094 3.74212300007634 0.911986999814598 A:C C A 10 0.534589000010906 0.809164893348427 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7754339_7754544:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7754339_7754544:KDM6B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 148 140 288 68.8808279983859 74.8424600015268 -5.96163200314093 A:G G A 10 0.534589000010906 0.515930140574056 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7843053 C/T 1 25 19 44 11.6352749997273 10.1571910002072 1.47808399952013 T:C C T 10 0.534589000010906 0.762907380746898 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000419170:exon_7842831_7843067:CNTROB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7847955 C/A 1 27 20 47 12.5660969997055 10.6917800002181 1.87431699948742 A:C C A 10 0.534589000010906 0.661716636656004 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7847794_7847956:CNTROB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 7849087 C/G 1 20 18 38 9.30821999978188 9.62260200019631 -0.31438200041443 C:G C G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7849046_7849304:CNTROB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 8046772 C/G 1 17 7 24 7.9119869998146 3.74212300007634 4.16986399973825 C:G C G 10 0.534589000010906 0.102874824022524 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8046584_8047194:PER1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 8053085 T/G 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:G T G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000413754:exon_8053073_8053194:PER1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 8064083 T/G 1 46 52 98 21.4089059994983 27.7986280005671 -6.38972200106879 T:G T G 10 0.534589000010906 0.224218388458457 ENSG00000220205:ENST00000316509:exon_8062467_8064189:VAMP2;ENSG00000220205:ENST00000404970:exon_8063724_8064842:VAMP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 8076778 C/T 1 3 8 11 1.39623299996728 4.27671200008725 -2.88047900011997 T:C C T 10 0.534589000010906 0.127884495538899 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 8108331 A/G 1 121 72 193 56.3147309986804 38.4904080007852 17.8243229978951 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0113775376247457 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 124 73 197 57.7109639986476 39.0249970007961 18.6859669978515 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00811303046880361 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 8132763 T/C 1 16 9 25 7.4465759998255 4.81130100009815 2.63527499972735 T:C T C 10 0.534589000010906 0.322000273897906 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8132620_8132764:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8132620_8132764:C17orf68 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 8161149 C/T 1 4 8 12 1.86164399995638 4.27671200008725 -2.41506800013087 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.246532544157622 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8161125_8161256:PFAS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 8167600 T/C 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 T:C T C 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8167530_8167655:PFAS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 8192922 C/T 1 33 16 49 15.3585629996401 8.5534240001745 6.8051389994656 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0619245549709524 ENSG00000125434:ENST00000312524:exon_8192892_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000396278:exon_8192892_8192961:SLC25A35 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 8281059 A/C 1 27 15 42 12.5660969997055 8.01883500016359 4.54726199954195 A:C A C 10 0.534589000010906 0.167495467529491 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 8402669 C/T 1 16 11 27 7.4465759998255 5.88047900011997 1.56609699970554 T:C C T 10 0.534589000010906 0.569731599740806 ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8402588_8402794:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8402588_8402794:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8402588_8402794:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8402588_8402794:MYH10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 8416901 C/T 1 12 11 23 5.58493199986913 5.88047900011997 -0.295547000250839 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8416856_8416987:MYH10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 12899963 T/C 1 20 18 38 9.30821999978188 9.62260200019631 -0.31438200041443 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 12915009 G/A 1 10 7 17 4.65410999989094 3.74212300007634 0.911986999814598 A:G G A 10 0.534589000010906 0.809164893348427 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12914980_12915099:ELAC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 14005439 G/A 1 7 6 13 3.25787699992366 3.20753400006544 0.0503429998582212 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_14005435_14005559:COX10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 15611495 T/C 1 7 6 13 3.25787699992366 3.20753400006544 0.0503429998582212 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 16852027 T/G 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:G T G 10 0.534589000010906 0.731759291541082 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 17046024 C/A 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 A:C C A 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17045941_17046079:MPRIP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 17062241 C/G 1 5 16 21 2.32705499994547 8.5534240001745 -6.22636900022903 C:G C G 10 0.534589000010906 0.00770497279789231 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000423885:exon_17061811_17062316:MPRIP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 17250159 C/T 1 10 4 14 4.65410999989094 2.13835600004362 2.51575399984732 T:C C T 10 0.534589000010906 0.194114354160929 ENSG00000205309:ENST00000446264:exon_17250127_17250977:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000478373:exon_17250119_17250977:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000379552:exon_17250119_17250975:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000389022:exon_17250119_17250975:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000470418:exon_17250119_17250172:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000483704:exon_17250119_17250977:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000480529:exon_17250119_17250466:NT5M HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 17394611 G/A 1 24 22 46 11.1698639997383 11.7609580002399 -0.591094000501679 A:G G A 10 0.534589000010906 0.883413014201246 ENSG00000141026:ENST00000268711:exon_17394593_17396535:MED9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 17696531 G/C 1 2 9 11 0.930821999978188 4.81130100009815 -3.88047900011997 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0299085362195834 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17696263_17696878:RAI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 17696755 C/A 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 A:C C A 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17696263_17696878:RAI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 17707105 T/C 1 16 14 30 7.4465759998255 7.48424600015268 -0.0376700003271813 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17707070_17707163:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17707070_17707355:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17707070_17707433:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17707070_17707355:RAI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 17750907 G/A 1 6 9 15 2.79246599993456 4.81130100009815 -2.01883500016359 A:G G A 10 0.534589000010906 0.313814139216668 ENSG00000175662:ENST00000379504:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000318094:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000478943:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000395739:exon_17750663_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000486413:exon_17750866_17751097:TOM1L2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 17948475 G/A 1 1 8 9 0.465410999989094 4.27671200008725 -3.81130100009815 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0151819886668037 ENSG00000141034:ENST00000268719:exon_17948461_17948520:C17orf39;ENSG00000141034:ENST00000376345:exon_17948461_17948520:C17orf39 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 17997209 G/A 1 9 5 14 4.18869899990185 2.67294500005453 1.51575399984732 A:G G A 10 0.534589000010906 0.593864451936242 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000473213:exon_17997127_17997594:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000496428:exon_17997127_17997282:DRG2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 18111721 C/T 1 65 65 130 30.2517149992911 34.7482850007089 -4.49657000141778 T:C C T 10 0.534589000010906 0.4305166700787 ENSG00000091542:ENST00000399138:exon_18111533_18113268:ALKBH5;ENSG00000091542:ENST00000490106:exon_18111533_18113268:ALKBH5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 18167684 G/A 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 A:G G A 10 0.534589000010906 0.592941099997918 ENSG00000177427:ENST00000323019:exon_18167024_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395704:exon_18167098_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395706:exon_18167024_18169095:SMCR7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 18193941 G/A 1 11 10 21 5.11952099988003 5.34589000010906 -0.226369000229027 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18193871_18194000:TOP3A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 18220674 C/T 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 18226177 G/T 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 T:G G T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18225931_18226517:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18225931_18226384:SMCR8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 18232096 G/A 1 22 23 45 10.2390419997601 12.2955470002508 -2.05650500049077 A:G G A 10 0.534589000010906 0.553500523516736 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 19284990 C/A 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 A:C C A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000166484:ENST00000308406:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000299612:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000490660:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395604:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000412231:exon_19283921_19285124:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395602:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000457323:exon_19281842_19285779:MAPK7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 20107773 T/C 1 13 18 31 6.05034299985822 9.62260200019631 -3.57225900033809 T:C T C 10 0.534589000010906 0.211837916082521 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 20108239 A/T 1 16 12 28 7.4465759998255 6.41506800013087 1.03150799969463 A:T A T 10 0.534589000010906 0.85019112749302 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 22 16 38 10.2390419997601 8.5534240001745 1.68561799958557 T:C C T 10 0.534589000010906 0.628415893633615 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 29 0 29 13.4969189996837 0 13.4969189996837 T T 10 0.534589000010906 2.09519037258903e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 28 0 28 13.0315079996946 0 13.0315079996946 T T 10 0.534589000010906 4.08399156522524e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 28 0 28 13.0315079996946 0 13.0315079996946 G G 10 0.534589000010906 4.08399156522524e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 29 0 29 13.4969189996837 0 13.4969189996837 G G 10 0.534589000010906 2.09519037258903e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 32 0 32 14.893151999651 0 14.893151999651 C C 10 0.534589000010906 2.86656094920722e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 21203964 C/G 0 27 0 27 12.5660969997055 0 12.5660969997055 C C 10 0.534589000010906 7.97747293179349e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 21 0 21 9.77363099977097 0 9.77363099977097 C C 10 0.534589000010906 2.04858593031777e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 31 0 31 14.4277409996619 0 14.4277409996619 C C 10 0.534589000010906 5.55075131370475e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 14 0 14 6.51575399984732 0 6.51575399984732 C C 10 0.534589000010906 0.000178069426267112 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 13 0 13 6.05034299985822 0 6.05034299985822 C C 10 0.534589000010906 0.000339316427973881 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 18 0 18 8.37739799980369 0 8.37739799980369 C C 10 0.534589000010906 1.37659736439671e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 18 0 18 8.37739799980369 0 8.37739799980369 G G 10 0.534589000010906 1.37659736439671e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 53 0 53 24.666782999422 0 24.666782999422 G G 10 0.534589000010906 4.00022975215455e-15 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 25909816 C/T 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 T:C C T 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 25909850 G/T 1 10 6 16 4.65410999989094 3.20753400006544 1.4465759998255 T:G G T 10 0.534589000010906 0.618055081094626 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 209 153 362 97.2708989977206 81.7921170016686 15.478781996052 A:G G A 10 0.534589000010906 0.113855100647681 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 21 46 67 9.77363099977097 24.5910940005017 -14.8174630007307 A:G G A 10 0.534589000010906 0.000322697088627112 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 25974442 G/A 1 235 175 410 109.371584997437 93.5530750019086 15.8185099955285 A:G G A 10 0.534589000010906 0.124828157527082 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25974296_25974458:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25974296_25974458:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25974296_25974458:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25974296_25974458:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000481514:exon_25974296_25974458:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000486774:exon_25974056_25974458:LGALS9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 26676135 C/T 1 128 112 240 59.572607998604 59.8739680012215 -0.30136000261745 T:C C T 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 27005639 A/T 1 13 13 26 6.05034299985822 6.94965700014178 -0.899314000283557 A:T A T 10 0.534589000010906 0.84469204921112 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27005563_27005652:SUPT6H;ENSG00000109111:ENST00000347486:exon_27005563_27005652:SUPT6H HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 27009749 C/T 1 29 31 60 13.4969189996837 16.5722590003381 -3.07534000065436 T:C C T 10 0.534589000010906 0.440129102807527 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27009745_27009874:SUPT6H;ENSG00000109111:ENST00000347486:exon_27009745_27009874:SUPT6H HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 27075423 C/T 1 131 113 244 60.9688409985713 60.4085570012324 0.560283997338928 T:C C T 10 0.534589000010906 0.948944579132294 ENSG00000076604:ENST00000461195:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262395:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000473421:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000469529:exon_27075280_27075441:TRAF4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 27185827 C/T 1 51 45 96 23.7359609994438 24.0565050004908 -0.320544001046979 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27185594_27185842:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27185594_27185842:ERAL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 27208326 C/T 1 9 12 21 4.18869899990185 6.41506800013087 -2.22636900022903 T:C C T 10 0.534589000010906 0.384849165712211 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27208210_27208393:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27208210_27208393:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394910:exon_27208210_27208393:FLOT2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 27240116 G/C 1 18 17 35 8.37739799980369 9.0880130001854 -0.710615000381711 C:G G C 10 0.534589000010906 0.86625268328472 ENSG00000109118:ENST00000332830:exon_27239500_27240295:PHF12;ENSG00000109118:ENST00000378879:exon_27239500_27240295:PHF12;ENSG00000109118:ENST00000268756:exon_27239162_27240295:PHF12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 8 15 23 3.72328799991275 8.01883500016359 -4.29554700025084 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0934974114630953 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 27424316 G/A 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 A:G G A 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533652:exon_27423915_27424371:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527686:exon_27424164_27424368:MYO18A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 27438469 G/A 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27438442_27438601:MYO18A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 27441077 C/G 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 C:G C G 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533399:exon_27441029_27441286:MYO18A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 27530413 T/C 0 23 0 23 10.7044529997492 0 10.7044529997492 T T 10 0.534589000010906 5.78135501734028e-07 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 27613677 G/A 1 19 15 34 8.84280899979279 8.01883500016359 0.823973999629194 A:G G A 10 0.534589000010906 0.864184099905938 ENSG00000108256:ENST00000225388:exon_27613010_27614734:NUFIP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 27904711 G/A 1 15 14 29 6.98116499983641 7.48424600015268 -0.503081000316275 A:G G A 10 0.534589000010906 0.85484380718489 ENSG00000108262:ENST00000225394:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394868:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000473217:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394869:exon_27904663_27904760:GIT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 28511978 G/A 1 127 123 250 59.1071969986149 65.7544470013414 -6.64725000272652 A:G G A 10 0.534589000010906 0.410291610123858 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 28576076 T/C 1 44 46 90 20.4780839995201 24.5910940005017 -4.11301000098154 T:C T C 10 0.534589000010906 0.399428233630942 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28575223_28576186:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28575223_28576186:BLMH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 28612448 G/C 1 22 14 36 10.2390419997601 7.48424600015268 2.75479599960738 C:G G C 10 0.534589000010906 0.405804289066246 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28612406_28612498:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28612406_28612498:BLMH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 29161503 A/G 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 A:G A G 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 30214331 T/A 1 14 21 35 6.51575399984732 11.226369000229 -4.71061500038171 A:T T A 10 0.534589000010906 0.127799241921893 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30214255_30214332:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000477128:exon_30214255_30215240:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30214255_30214332:UTP6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 19 18 37 8.84280899979279 9.62260200019631 -0.779793000403524 T:C T C 10 0.534589000010906 0.86963318737537 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 30533970 A/G 1 2 9 11 0.930821999978188 4.81130100009815 -3.88047900011997 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0299085362195834 ENSG00000126858:ENST00000333942:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000394692:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000358365:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000354266:exon_30533929_30534048:RHOT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 33749546 A/G 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:G A G 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 33749919 A/C 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 A:C A C 10 0.534589000010906 0.298446592097252 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000447040:exon_33749664_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000445092:exon_33749840_33750087:SLFN12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 33772658 G/T 1 10 13 23 4.65410999989094 6.94965700014178 -2.29554700025084 T:G G T 10 0.534589000010906 0.404969031814226 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33772392_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33771634_33773029:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000524511:exon_33772381_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000531588:exon_33772467_33772712:SLFN13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 34416537 G/A 1 354 298 652 164.755493996139 159.30752200325 5.44797199288925 A:G G A 10 0.534589000010906 0.694673726085303 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 34432663 A/G 1 93 53 146 43.2832229989857 28.333217000578 14.9500059984077 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0158423502449128 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 34432664 T/A 1 93 53 146 43.2832229989857 28.333217000578 14.9500059984077 A:T T A 10 0.534589000010906 0.0158423502449128 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 A:G G A 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 25 32 57 11.6352749997273 17.106848000349 -5.47157300062164 A:G G A 10 0.534589000010906 0.183779175355583 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 35896123 T/C 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 T:C T C 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000508220:exon_35896081_35897580:SYNRG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 35902225 C/G 1 29 18 47 13.4969189996837 9.62260200019631 3.87431699948742 C:G C G 10 0.534589000010906 0.306487288090517 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 35937637 T/C 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 T:C T C 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000378189:exon_35937478_35937711:SYNRG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 12 18 30 5.58493199986913 9.62260200019631 -4.03767000032718 T:C T C 10 0.534589000010906 0.147392324053680 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 36926731 T/G 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 T:G T G 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 36926767 G/A 1 10 6 16 4.65410999989094 3.20753400006544 1.4465759998255 A:G G A 10 0.534589000010906 0.618055081094626 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 30 29 59 13.9623299996728 15.5030810003163 -1.54075100064346 A:G A G 10 0.534589000010906 0.697537250273704 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 37818554 C/T 1 20 21 41 9.30821999978188 11.226369000229 -1.91814900044715 T:C C T 10 0.534589000010906 0.639189413952457 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37818504_37818597:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37818504_37818597:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37818504_37818597:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000481171:exon_37818504_37819737:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000471896:exon_37818504_37818597:STARD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 38068621 T/C 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 T:C T C 10 0.534589000010906 0.189086525758904 ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000464556:exon_38068579_38068750:GSDMB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 21 19 40 9.77363099977097 10.1571910002072 -0.383560000436242 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 38457151 G/A 1 18 13 31 8.37739799980369 6.94965700014178 1.42774099966191 A:G G A 10 0.534589000010906 0.719634139084765 ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38457080_38457282:CDC6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 38990834 G/C 1 21 40 61 9.77363099977097 21.3835600004362 -11.6099290006653 C:G G C 10 0.534589000010906 0.00304215660053523 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 2 7 9 0.930821999978188 3.74212300007634 -2.81130100009815 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0917858367386368 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 41234470 A/G 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000487825:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461574:exon_41234421_41234592:BRCA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 41244000 T/C 1 4 10 14 1.86164399995638 5.34589000010906 -3.48424600015268 T:C T C 10 0.534589000010906 0.104581828814314 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 41244435 T/C 1 11 16 27 5.11952099988003 8.5534240001745 -3.43390300029446 T:C T C 10 0.534589000010906 0.246684909438815 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 41244936 G/A 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:G G A 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 41245237 A/G 1 5 9 14 2.32705499994547 4.81130100009815 -2.48424600015268 A:G A G 10 0.534589000010906 0.283670203474933 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 12 7 19 5.58493199986913 3.74212300007634 1.84280899979278 A:G G A 10 0.534589000010906 0.492933071348704 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 41291953 C/G 1 16 4 20 7.4465759998255 2.13835600004362 5.30821999978188 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0228601800517913 ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41291833_41292300:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41291833_41292350:NBR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 30 30 60 13.9623299996728 16.0376700003272 -2.07534000065436 T:C:G G C 10 0.534589000010906 0.606925494025643 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 43003484 T/C 1 18 18 36 8.37739799980369 9.62260200019631 -1.24520400039262 T:C T C 10 0.534589000010906 0.739482103379621 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43003360_43003554:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43003448_43003554:KIF18B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 43010064 G/A 1 12 9 21 5.58493199986913 4.81130100009815 0.773630999770972 A:G G A 10 0.534589000010906 0.828599613252825 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43010041_43010141:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43010041_43010141:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000376982:exon_43010041_43010141:KIF18B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 43111558 G/A 1 17 26 43 7.9119869998146 13.8993140002836 -5.98732700046896 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0914853188681239 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 43171138 C/G 1 22 17 39 10.2390419997601 9.0880130001854 1.15102899957466 C:G C G 10 0.534589000010906 0.750464864567812 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43171053_43171171:NMT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 45 70 115 20.9434949995092 37.4212300007634 -16.4777350012542 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00262500417060562 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 131 120 251 60.9688409985713 64.1506800013087 -3.18183900273742 A:G G A 10 0.534589000010906 0.70448472427921 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 45198343 C/T 1 29 20 49 13.4969189996837 10.6917800002181 2.8051389994656 T:C C T 10 0.534589000010906 0.475264900760456 ENSG00000004897:ENST00000066544:exon_45195069_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000446365:exon_45195310_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000441612:exon_45196583_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000525495:exon_45197352_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000531206:exon_45197621_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000533415:exon_45198137_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000527547:exon_45198246_45198383:CDC27 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 45214685 T/C 1 7 10 17 3.25787699992366 5.34589000010906 -2.0880130001854 T:C T C 10 0.534589000010906 0.339484157804598 ENSG00000004897:ENST00000066544:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000441612:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000525495:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000531206:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000533415:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000527547:exon_45214518_45214726:CDC27 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 46627747 C/T 1 10 5 15 4.65410999989094 2.67294500005453 1.98116499983641 T:C C T 10 0.534589000010906 0.438822405676019 ENSG00000120093:ENST00000470495:exon_46626232_46628543:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000472863:exon_46627174_46628543:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000311626:exon_46627247_46628543:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000498678:exon_46627368_46628543:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000490677:exon_46627619_46628540:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000460160:exon_46627629_46628543:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000489475:exon_46627630_46628543:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000476342:exon_46627696_46628543:HOXB3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 46688256 T/C 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000120087:ENST00000239165:exon_46687881_46688379:HOXB7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 47293906 G/A 1 53 36 89 24.666782999422 19.2452040003926 5.42157899902936 A:G G A 10 0.534589000010906 0.288036079704558 ENSG00000108798:ENST00000225941:exon_47293893_47294060:ABI3;ENSG00000108798:ENST00000419580:exon_47293893_47294042:ABI3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 47778793 C/T 1 13 7 20 6.05034299985822 3.74212300007634 2.30821999978188 T:C C T 10 0.534589000010906 0.372688141283748 ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47778305_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47778649_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47778682_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47778683_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508749:exon_47778690_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507477:exon_47778690_47780373:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47778701_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47778701_47778872:SLC35B1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 47788755 G/A 1 32 18 50 14.893151999651 9.62260200019631 5.2705499994547 A:G G A 10 0.534589000010906 0.156571003422777 ENSG00000121104:ENST00000240364:exon_47787694_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000513602:exon_47788357_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000503573:exon_47788707_47788917:FAM117A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 48431197 C/T 1 13 5 18 6.05034299985822 2.67294500005453 3.37739799980369 T:C C T 10 0.534589000010906 0.155238770669501 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 48455985 A/T 1 9 2 11 4.18869899990185 1.06917800002181 3.11952099988003 A:T A T 10 0.534589000010906 0.0723916304569276 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511519:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48455956_48456042:EME1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 48539035 T/C 1 20 9 29 9.30821999978188 4.81130100009815 4.49691899968373 T:C T C 10 0.534589000010906 0.135069159960843 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539018_48539047:ACSF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 48557326 G/A 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 A:G G A 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 48557348 T/C 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 T:C T C 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 48559559 A/G 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000515221:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000451010:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000504284:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000506211:exon_48559458_48559817:RSAD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 48628160 A/G 1 10 10 20 4.65410999989094 5.34589000010906 -0.69178000021812 A:G A G 10 0.534589000010906 0.824629775002564 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48627897_48628252:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48628069_48628163:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511347:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505656:exon_48628069_48628212:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508528:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000513618:exon_48627761_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628095_48628278:SPATA20 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 48628470 T/A 1 9 5 14 4.18869899990185 2.67294500005453 1.51575399984732 A:T T A 10 0.534589000010906 0.593864451936242 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628359_48628583:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628359_48628745:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628359_48628551:SPATA20 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 48633043 G/A 1 27 33 60 12.5660969997055 17.6414370003599 -5.07534000065436 A:G G A 10 0.534589000010906 0.197714109850137 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48632853_48633211:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48632853_48633211:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48632853_48633211:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48632853_48633137:SPATA20 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 54978794 G/A 1 12 18 30 5.58493199986913 9.62260200019631 -4.03767000032718 A:G G A 10 0.534589000010906 0.147392324053680 ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54978780_54978939:TRIM25 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 55028170 C/T 1 18 17 35 8.37739799980369 9.0880130001854 -0.710615000381711 T:C C T 10 0.534589000010906 0.86625268328472 ENSG00000121058:ENST00000240316:exon_55027250_55028357:COIL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 57287454 A/G 1 10 7 17 4.65410999989094 3.74212300007634 0.911986999814598 A:G A G 10 0.534589000010906 0.809164893348427 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57287371_57289171:C17orf71 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 36 42 78 16.7547959996074 22.4527380004581 -5.69794200085067 A:G G A 10 0.534589000010906 0.212528731271953 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 61843368 C/A 1 17 20 37 7.9119869998146 10.6917800002181 -2.77979300040352 A:C C A 10 0.534589000010906 0.411249951697163 ENSG00000108588:ENST00000225726:exon_61843272_61843554:CCDC47;ENSG00000108588:ENST00000403162:exon_61843272_61843554:CCDC47 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 62006857 G/T 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:G G T 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 62290699 G/A 1 10 9 19 4.65410999989094 4.81130100009815 -0.157191000207215 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000136478:ENST00000258991:exon_62289934_62291602:TEX2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 62476429 G/A 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 A:G G A 10 0.534589000010906 0.592941099997918 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62476406_62476506:POLG2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 62481801 A/G 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G A G 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 62492582 C/T 1 3 10 13 1.39623299996728 5.34589000010906 -3.94965700014178 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0473534851625257 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62492525_62493169:POLG2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 62528179 A/G 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 65739627 A/G 1 45 64 109 20.9434949995092 34.213696000698 -13.2702010011888 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0123070966797079 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65739595_65739702:NOL11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 66038392 C/G 1 112 106 218 52.1260319987785 56.666434001156 -4.54040200237752 C:G C G 10 0.534589000010906 0.54196554954388 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66038201_66038469:KPNA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 60 46 106 27.9246599993456 24.5910940005017 3.33356599884396 A:G A G 10 0.534589000010906 0.559595300947955 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 71192663 G/A 1 10 11 21 4.65410999989094 5.88047900011997 -1.22636900022903 A:G G A 10 0.534589000010906 0.664535375129959 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71192646_71192890:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71192646_71192890:COG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 71196809 A/G 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71196705_71196915:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71196705_71196915:COG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 28 33 61 13.0315079996946 17.6414370003599 -4.60992900066527 A:G G A 10 0.534589000010906 0.249966277990836 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 71232687 T/C 1 11 13 24 5.11952099988003 6.94965700014178 -1.83013600026174 T:C T C 10 0.534589000010906 0.540892890072247 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 71232807 T/C 1 9 5 14 4.18869899990185 2.67294500005453 1.51575399984732 T:C T C 10 0.534589000010906 0.593864451936242 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 19 11 30 8.84280899979279 5.88047900011997 2.96232999967282 C:G G C 10 0.534589000010906 0.360536373270145 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 71239087 G/T 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:G G T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71239035_71239142:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71239035_71239142:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71239035_71239142:C17orf80 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 72758210 C/T 1 16 29 45 7.4465759998255 15.5030810003163 -8.05650500049077 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0169465439762069 ENSG00000109062:ENST00000262613:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1;ENSG00000109062:ENST00000413388:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 72769739 A/G 1 7 6 13 3.25787699992366 3.20753400006544 0.0503429998582212 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72769715_72769827:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72769715_72769824:NAT9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 72771766 C/G 1 6 9 15 2.79246599993456 4.81130100009815 -2.01883500016359 C:G C G 10 0.534589000010906 0.313814139216668 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72771761_72771846:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72771761_72771846:NAT9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 47 42 89 21.8743169994874 22.4527380004581 -0.578421000970639 T:C C T 10 0.534589000010906 0.915740508963432 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 73125173 A/G 1 10 13 23 4.65410999989094 6.94965700014178 -2.29554700025084 A:G A G 10 0.534589000010906 0.404969031814226 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 12 13 25 5.58493199986913 6.94965700014178 -1.36472500027265 C:G G C 10 0.534589000010906 0.689551323254237 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 73488794 C/T 1 14 8 22 6.51575399984732 4.27671200008725 2.23904199976007 T:C C T 10 0.534589000010906 0.396720668612636 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73488555_73488870:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73488555_73488870:KIAA0195 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 73512884 T/G 1 11 4 15 5.11952099988003 2.13835600004362 2.98116499983641 T:G T G 10 0.534589000010906 0.194125209391915 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73512827_73512991:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73512827_73512991:TSEN54 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 73513289 C/G 1 16 21 37 7.4465759998255 11.226369000229 -3.77979300040352 C:G C G 10 0.534589000010906 0.249367416803454 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73513242_73513325:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73513242_73513325:TSEN54 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 73625286 G/A 1 18 20 38 8.37739799980369 10.6917800002181 -2.31438200041443 A:G G A 10 0.534589000010906 0.516482161923489 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 73627539 T/C 1 9 2 11 4.18869899990185 1.06917800002181 3.11952099988003 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0723916304569276 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73627530_73627748:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73627530_73627748:RECQL5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 73819525 C/T 1 2 14 16 0.930821999978188 7.48424600015268 -6.5534240001745 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00152545639440241 ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73819346_73819603:UNK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 73827205 T/C 1 22 24 46 10.2390419997601 12.8301360002617 -2.59109400050168 T:C T C 10 0.534589000010906 0.463097485658083 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73827203_73827250:UNC13D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 73836162 C/G 1 14 21 35 6.51575399984732 11.226369000229 -4.71061500038171 C:G C G 10 0.534589000010906 0.127799241921893 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73836099_73836191:UNC13D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 73886888 A/G 1 11 14 25 5.11952099988003 7.48424600015268 -2.36472500027265 A:G A G 10 0.534589000010906 0.423628611134497 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73885041_73887428:TRIM65 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 73888354 G/A 1 7 10 17 3.25787699992366 5.34589000010906 -2.0880130001854 A:G G A 10 0.534589000010906 0.339484157804598 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73888348_73888581:TRIM65 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 73900688 T/C 1 52 39 91 24.2013719994329 20.8489710004253 3.35240099900755 T:C T C 10 0.534589000010906 0.528892030796732 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477736:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493104:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493383:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000461602:exon_73900307_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000464758:exon_73900303_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000410030:exon_73900621_73900800:MRPL38 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 73949540 G/C 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 C:G G C 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000161533:ENST00000293217:exon_73949532_73949701:ACOX1;ENSG00000161533:ENST00000301608:exon_73949532_73949701:ACOX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 74152366 A/G 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 A:G A G 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000141576:ENST00000269391:exon_74152291_74152402:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000319945:exon_74152291_74152402:RNF157 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 75085434 G/A 1 7 11 18 3.25787699992366 5.88047900011997 -2.62260200019631 A:G G A 10 0.534589000010906 0.243363535954427 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 75494746 A/C,G 0 1 130 131 0.465410999989094 69.4965700014178 -69.0311590014287 A:G A G 10 0.534589000010906 4.64442183188809e-42 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 75494780 A/T 1 161 103 264 74.9311709982441 55.0626670011233 19.8685039971208 A:T:C A T 10 0.534589000010906 0.0159717805635884 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 76121004 G/A 1 41 50 91 19.0818509995529 26.7294500005453 -7.64759900099245 A:G G A 10 0.534589000010906 0.115441766995956 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120970_76121066:TMC6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 76130575 A/T 1 9 9 18 4.18869899990185 4.81130100009815 -0.622602000196309 A:T A T 10 0.534589000010906 0.81636697210269 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130475_76130645:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130537_76130645:TMC8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 76131070 G/A 1 17 12 29 7.9119869998146 6.41506800013087 1.49691899968372 A:G G A 10 0.534589000010906 0.710418220209128 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130951_76131090:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130951_76131090:TMC8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 76134828 C/A 1 10 7 17 4.65410999989094 3.74212300007634 0.911986999814598 A:C C A 10 0.534589000010906 0.809164893348427 ENSG00000167895:ENST00000301627:exon_76134690_76134885:TMC8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 76170951 G/A 1 110 120 230 51.1952099988003 64.1506800013087 -12.9554700025084 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.0982414474941897 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76170160_76171031:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76170773_76171031:TK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 76993546 A/G 1 14 10 24 6.51575399984732 5.34589000010906 1.16986399973826 A:G A G 10 0.534589000010906 0.686499461842995 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76993074_76994045:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76993074_76993726:CANT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 77073566 G/A 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 A:G G A 10 0.534589000010906 0.298446592097252 ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77073512_77073579:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77073512_77073579:ENGASE HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 77081788 G/A 1 7 8 15 3.25787699992366 4.27671200008725 -1.01883500016359 A:G G A 10 0.534589000010906 0.615581524507087 ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77081702_77081816:ENGASE HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 78084769 G/A 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 A:G G A 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78084740_78084824:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78084740_78084824:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78084740_78084824:GAA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 78091405 G/A 1 9 28 37 4.18869899990185 14.9684920003054 -10.7797930004035 A:G G A 10 0.534589000010906 0.000409333436231089 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 78113832 G/A 1 33 43 76 15.3585629996401 22.987327000469 -7.62876400082886 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0850244982250518 ENSG00000141543:ENST00000269349:exon_78113807_78113939:EIF4A3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 78184679 C/T 1 9 9 18 4.18869899990185 4.81130100009815 -0.622602000196309 T:C C T 10 0.534589000010906 0.81636697210269 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 78337058 G/C 1 7 12 19 3.25787699992366 6.41506800013087 -3.15719100020722 C:G G C 10 0.534589000010906 0.170892403910016 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78336902_78337114:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78336902_78337114:RNF213 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 78346531 C/A 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 A:C C A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78346321_78346534:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78346321_78346534:RNF213 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 78350223 C/T 1 12 13 25 5.58493199986913 6.94965700014178 -1.36472500027265 T:C C T 10 0.534589000010906 0.689551323254237 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78350101_78350343:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78350101_78350343:RNF213 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 78865546 T/C 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 T:C T C 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78865520_78865637:RPTOR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 78865630 A/G 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 A:G A G 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78865520_78865637:RPTOR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79173184 T/C 1 8 10 18 3.72328799991275 5.34589000010906 -1.62260200019631 T:C T C 10 0.534589000010906 0.485331297542652 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79173181_79173349:AZI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79173224 T/C 1 6 11 17 2.79246599993456 5.88047900011997 -3.0880130001854 T:C T C 10 0.534589000010906 0.150155070613150 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79173181_79173349:AZI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79174221 T/C 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79174129_79174246:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79174129_79174246:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79174129_79174246:AZI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79202956 T/C 1 20 18 38 9.30821999978188 9.62260200019631 -0.31438200041443 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79205736 G/A 1 7 9 16 3.25787699992366 4.81130100009815 -1.5534240001745 A:G G A 10 0.534589000010906 0.462907821628628 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79205647_79205821:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79205647_79205821:C17orf56 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79220224 G/C 1 41 41 82 19.0818509995529 21.9181490004471 -2.8362980008943 C:G G C 10 0.534589000010906 0.58036011224187 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79225330 C/A 1 20 22 42 9.30821999978188 11.7609580002399 -2.45273800045805 A:C C A 10 0.534589000010906 0.536633256829306 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225293_79225412:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79226264 T/C 1 44 33 77 20.4780839995201 17.6414370003599 2.83664699916023 T:C T C 10 0.534589000010906 0.568544689897189 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79244802 T/C 1 12 6 18 5.58493199986913 3.20753400006544 2.37739799980369 T:C T C 10 0.534589000010906 0.34614898565578 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79244718_79244824:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79244718_79244824:SLC38A10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79478019 G/A 1 3766 4168 7934 1752.73782595893 2228.16695204546 -475.429126086528 A:T:C:G G A 10 0.534589000010906 1.25020412819690e-26 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79478870 C/A 1 37 15 52 17.2202069995965 8.01883500016359 9.20137199943289 A:C C A 10 0.534589000010906 0.0118206535499148 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79478871 C/T 1 38 15 53 17.6856179995856 8.01883500016359 9.66678299942198 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00846772987725863 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79478916 G/T 1 23 9 32 10.7044529997492 4.81130100009815 5.89315199965101 T:G G T 10 0.534589000010906 0.0496635850803187 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79479115 C/T 1 3910 4079 7989 1819.75700995736 2180.58853104449 -360.831521087128 T:C:G C T 10 0.534589000010906 6.48378766541671e-16 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79478929_79479168:ACTG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79511135 A/G 1 23 16 39 10.7044529997492 8.5534240001745 2.15102899957466 A:G A G 10 0.534589000010906 0.524420620718488 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79511030_79511146:C17orf70 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79514028 C/G 1 14 8 22 6.51575399984732 4.27671200008725 2.23904199976007 C:G C G 10 0.534589000010906 0.396720668612636 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79513935_79514112:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79663981 C/T 1 54 43 97 25.1321939994111 22.987327000469 2.14486699894212 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.685062514561153 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79663956_79664028:HGS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79803433 G/A 1 4 8 12 1.86164399995638 4.27671200008725 -2.41506800013087 A:C:G G A 10 0.534589000010906 0.246532544157622 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79805134 G/A 1 176 126 302 81.9123359980805 67.3582140013742 14.5541219967064 A:G G A 10 0.534589000010906 0.09464762634455 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79805119_79805203:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79805119_79805206:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000478034:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000472244:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000484286:exon_79805119_79805724:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000477607:exon_79805119_79805223:P4HB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79845968 C/T 1 125 85 210 58.1763749986367 45.440065000927 12.7363099977097 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0837125388900618 ENSG00000183684:ENST00000505490:exon_79845717_79846021:THOC4;ENSG00000183684:ENST00000331204:exon_79845721_79846021:THOC4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79890818 C/T 1 125 185 310 58.1763749986367 98.8989650020176 -40.7225900033809 T:C C T 10 0.534589000010906 3.65673095294481e-06 ENSG00000183010:ENST00000337943:exon_79890269_79890839:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000432920:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000405481:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000329875:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000403172:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000402252:exon_79890756_79890839:PYCR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79941544 G/T 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 T:G G T 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79941430_79941544:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79941430_79941544:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79941430_79941544:ASPSCR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 79993919 C/T 1 64 64 128 29.786303999302 34.213696000698 -4.42739200139597 T:C C T 10 0.534589000010906 0.478598509494348 ENSG00000169738:ENST00000306869:exon_79993757_79993939:DCXR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 80006957 A/C 1 17 16 33 7.9119869998146 8.5534240001745 -0.641437000359899 A:C A C 10 0.534589000010906 0.862673282858281 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 80007887 A/G 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 80007897 G/T 1 10 15 25 4.65410999989094 8.01883500016359 -3.36472500027265 T:G G T 10 0.534589000010906 0.228865227218520 ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 80008392 G/T 1 11 17 28 5.11952099988003 9.0880130001854 -3.96849200030537 T:G G T 10 0.534589000010906 0.183844291494137 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80008278_80008431:RFNG;ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 80017902 C/T 1 59 69 128 27.4592489993565 36.8866410007525 -9.42739200139598 T:C C T 10 0.534589000010906 0.110414963034856 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80017824_80017969:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80017824_80017969:DUS1L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 80020812 C/T 1 44 36 80 20.4780839995201 19.2452040003926 1.23287999912752 T:C C T 10 0.534589000010906 0.823211639052444 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80020737_80020849:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80020737_80020820:DUS1L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 80195738 G/A 1 69 52 121 32.1133589992475 27.7986280005671 4.31473099868037 A:G G A 10 0.534589000010906 0.466468722538718 ENSG00000141526:ENST00000392341:exon_80195014_80195769:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392339:exon_80195014_80195769:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392340:exon_80195014_80195769:SLC16A3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 23 25 48 10.7044529997492 13.3647250002727 -2.66027200052349 A:G G A 10 0.534589000010906 0.471573474354599 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 80373452 C/T 1 5 8 13 2.32705499994547 4.27671200008725 -1.94965700014178 T:C C T 10 0.534589000010906 0.405475359831307 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 80377690 T/G 1 5 7 12 2.32705499994547 3.74212300007634 -1.41506800013087 T:G T G 10 0.534589000010906 0.565015885912817 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80377625_80377759:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80377665_80377759:HEXDC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 80401946 A/G 1 56 45 101 26.0630159993893 24.0565050004908 2.00651099889849 A:G A G 10 0.534589000010906 0.764939971131019 ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80401498_80401980:C17orf62 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 80684432 A/G 1 19 18 37 8.84280899979279 9.62260200019631 -0.779793000403524 A:G A G 10 0.534589000010906 0.86963318737537 ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80684356_80684478:FN3KRP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 20 20 40 9.30821999978188 10.6917800002181 -1.38356000043624 A:G G A 10 0.534589000010906 0.751793136121849 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 166819 T/C 0 26 0 26 12.1006859997164 0 12.1006859997164 T T 10 0.534589000010906 1.56144677378860e-07 ENSG00000101557:ENST00000400266:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000261601:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000383589:exon_166787_166819:USP14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 691266 A/G 1 4 13 17 1.86164399995638 6.94965700014178 -5.0880130001854 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0149470426139560 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_691204_691276:ENOSF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 693828 A/C 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 A:C A C 10 0.534589000010906 0.592941099997918 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 2885118 C/T 1 11 4 15 5.11952099988003 2.13835600004362 2.98116499983641 T:C C T 10 0.534589000010906 0.194125209391915 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2884962_2885137:EMILIN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 2891847 C/T 1 26 3 29 12.1006859997164 1.60376700003272 10.4969189996837 T:C C T 10 0.534589000010906 4.6628228845997e-05 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2890559_2892484:EMILIN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 3879217 G/T 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 T:G G T 10 0.534589000010906 0.529760851175976 ENSG00000170579:ENST00000315677:exon_3879112_3880135:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000498188:exon_3879112_3880076:DLGAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 9117867 T/C 1 96 68 164 44.679455998953 36.3520520007416 8.32740399821141 T:C T C 10 0.534589000010906 0.210491802936673 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9117385_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9117836_9117901:NDUFV2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 148 99 247 68.8808279983859 52.9243110010797 15.9565169973062 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0477965619330802 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 9562042 C/T 1 8 8 16 3.72328799991275 4.27671200008725 -0.553424000174497 T:C C T 10 0.534589000010906 0.807042042252045 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9561978_9562073:PPP4R1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 10681711 C/T 1 7 14 21 3.25787699992366 7.48424600015268 -4.22636900022903 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0798051995578241 ENSG00000154864:ENST00000503781:exon_10681658_10681750:FAM38B;ENSG00000154864:ENST00000285141:exon_10681658_10681750:FAM38B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 11999115 T/C 1 9 5 14 4.18869899990185 2.67294500005453 1.51575399984732 T:C T C 10 0.534589000010906 0.593864451936242 ENSG00000141401:ENST00000269159:exon_11999053_11999186:IMPA2;ENSG00000141401:ENST00000383376:exon_11999053_11999186:IMPA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 12325958 G/A 1 111 103 214 51.6606209987894 55.0626670011233 -3.40204600233389 A:G G A 10 0.534589000010906 0.681080475600952 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12325066_12326568:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12325172_12326129:TUBB6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 131 102 233 60.9688409985713 54.5280780011124 6.4407629974589 C:G C G 10 0.534589000010906 0.430766698845789 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 21 26 47 9.77363099977097 13.8993140002836 -4.12568300051258 T:C T C 10 0.534589000010906 0.244339192603155 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 44 15 59 20.4780839995201 8.01883500016359 12.4592489993565 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00101463186718286 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 12698983 C/T 1 10 7 17 4.65410999989094 3.74212300007634 0.911986999814598 T:C C T 10 0.534589000010906 0.809164893348427 ENSG00000101624:ENST00000262127:exon_12698978_12699202:CEP76;ENSG00000101624:ENST00000438851:exon_12698978_12699202:CEP76 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 47 59 106 21.8743169994874 31.5407510006435 -9.66643400115604 A:C C A 10 0.534589000010906 0.0643971434351525 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 13056333 C/T 1 5 13 18 2.32705499994547 6.94965700014178 -4.62260200019631 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0336404123788179 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13055779_13056697:CEP192 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 13068132 T/C 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 T:C T C 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13068093_13068236:CEP192 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:G G T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 19154143 G/A 1 15 7 22 6.98116499983641 3.74212300007634 3.23904199976007 A:G G A 10 0.534589000010906 0.201853762836156 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 29104698 C/T 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 T:C C T 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29104666_29104851:DSG2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 29122799 G/A 1 24 20 44 11.1698639997383 10.6917800002181 0.478083999520134 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29122483_29122815:DSG2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 32834095 T/C 1 12 10 22 5.58493199986913 5.34589000010906 0.239041999760067 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000186814:ENST00000333206:exon_32832819_32834345:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000420878:exon_32833423_32834187:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000360932:exon_32833423_32834285:ZSCAN30 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 32834186 T/G 1 8 2 10 3.72328799991275 1.06917800002181 2.65410999989094 T:G T G 10 0.534589000010906 0.117787000476102 ENSG00000186814:ENST00000333206:exon_32832819_32834345:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000420878:exon_32833423_32834187:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000360932:exon_32833423_32834285:ZSCAN30 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 19 16 35 8.84280899979279 8.5534240001745 0.289384999618289 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 33702162 G/A 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33702015_33702233:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33702015_33702233:SLC39A6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 43565380 A/G 1 12 6 18 5.58493199986913 3.20753400006544 2.37739799980369 A:G A G 10 0.534589000010906 0.34614898565578 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 43565399 C/A 1 10 9 19 4.65410999989094 4.81130100009815 -0.157191000207215 A:T:C C A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 43568717 T/C 1 13 11 24 6.05034299985822 5.88047900011997 0.169863999738255 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43568668_43568725:PSTPIP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 48458717 T/A 1 21 17 38 9.77363099977097 9.0880130001854 0.68561799958557 A:T T A 10 0.534589000010906 0.871910130672068 ENSG00000082212:ENST00000321341:exon_48458628_48458730:ME2;ENSG00000082212:ENST00000382927:exon_48458628_48458730:ME2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 51820805 G/A 1 15 8 23 6.98116499983641 4.27671200008725 2.70445299974916 A:G G A 10 0.534589000010906 0.300128883020768 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 20 19 39 9.30821999978188 10.1571910002072 -0.848971000425335 T:C T C 10 0.534589000010906 0.872831334711128 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 56202768 C/A 1 5 10 15 2.32705499994547 5.34589000010906 -3.01883500016359 A:C C A 10 0.534589000010906 0.128857341400782 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 56203074 G/A 1 1 8 9 0.465410999989094 4.27671200008725 -3.81130100009815 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0151819886668037 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 56205262 A/C 1 3 9 12 1.39623299996728 4.81130100009815 -3.41506800013087 A:C A C 10 0.534589000010906 0.0784465209153547 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 56586371 A/G 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 A:G A G 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000074657:ENST00000336078:exon_56585503_56587865:ZNF532 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 57000469 T/A 1 17 16 33 7.9119869998146 8.5534240001745 -0.641437000359899 A:T T A 10 0.534589000010906 0.862673282858281 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57000323_57000476:LMAN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 60985879 T/C 1 54 47 101 25.1321939994111 25.1256830005126 0.00651099889849149 A:T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 15 16 31 6.98116499983641 8.5534240001745 -1.57225900033809 T:C C T 10 0.534589000010906 0.593556772946765 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 61582751 T/G 1 6 29 35 2.79246599993456 15.5030810003163 -12.7106150003817 T:G T G 10 0.534589000010906 1.20558064432125e-05 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 61582867 A/G 1 4 30 34 1.86164399995638 16.0376700003272 -14.1760260003708 A:G A G 10 0.534589000010906 7.1865393945523e-07 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 61585260 T/C 1 7 16 23 3.25787699992366 8.5534240001745 -5.29554700025084 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0350385771662904 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61585199_61585336:SERPINB10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 61587067 C/T 1 11 29 40 5.11952099988003 15.5030810003163 -10.3835600004362 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00124407131093430 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 61600384 C/T 1 6 48 54 2.79246599993456 25.6602720005235 -22.8678060005889 T:C C T 10 0.534589000010906 1.12585189528776e-10 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61600282_61600437:SERPINB10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 61650865 G/A 1 7 6 13 3.25787699992366 3.20753400006544 0.0503429998582212 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61650813_61650881:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61650813_61650955:SERPINB8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 22 4 26 10.2390419997601 2.13835600004362 8.10068599971644 T:C T C 10 0.534589000010906 0.00127114935532981 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 67534642 C/T 1 7 9 16 3.25787699992366 4.81130100009815 -1.5534240001745 T:C C T 10 0.534589000010906 0.462907821628628 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67534593_67534647:CD226 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 71920855 G/A 1 54 51 105 25.1321939994111 27.2640390005562 -2.13184500114513 A:G G A 10 0.534589000010906 0.696387708304864 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71920531_71920900:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71920628_71920900:CYB5A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 71928150 C/T 1 91 60 151 42.3524009990075 32.0753400006544 10.2770609983532 T:C C T 10 0.534589000010906 0.102703356770340 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71928150_71928179:CYB5A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 71959075 G/A 1 34 29 63 15.8239739996292 15.5030810003163 0.320892999312919 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71958982_71959251:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71958982_71959170:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71958982_71959179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71958982_71959179:CYB5A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 55 36 91 25.5976049994002 19.2452040003926 6.35240099900755 A:G G A 10 0.534589000010906 0.207341286415396 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 57 41 98 26.5284269993784 21.9181490004471 4.61027799893121 T:C T C 10 0.534589000010906 0.36388085074568 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 30 21 51 13.9623299996728 11.226369000229 2.73596099944379 T:C T C 10 0.534589000010906 0.484628676451642 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 72998004 T/C 1 1 7 8 0.465410999989094 3.74212300007634 -3.27671200008725 T:C T C 10 0.534589000010906 0.029100529378057 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 72998211 C/G 1 5 9 14 2.32705499994547 4.81130100009815 -2.48424600015268 C:G C G 10 0.534589000010906 0.283670203474933 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 72998886 T/C 1 11 12 23 5.11952099988003 6.41506800013087 -1.29554700025084 T:C T C 10 0.534589000010906 0.677644254347807 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 72999359 T/C 1 12 8 20 5.58493199986913 4.27671200008725 1.30821999978188 T:C T C 10 0.534589000010906 0.656685513222068 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 77170477 C/A 1 10 17 27 4.65410999989094 9.0880130001854 -4.43390300029446 A:C C A 10 0.534589000010906 0.121233873388390 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 77227476 A/G 1 25 28 53 11.6352749997273 14.9684920003054 -3.33321700057802 A:G A G 10 0.534589000010906 0.409305255624458 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77227450_77227582:NFATC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 77246406 T/G 1 7 14 21 3.25787699992366 7.48424600015268 -4.22636900022903 T:G T G 10 0.534589000010906 0.0798051995578241 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 18 77246444 C/T 1 12 8 20 5.58493199986913 4.27671200008725 1.30821999978188 T:C C T 10 0.534589000010906 0.656685513222068 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 313633 G/A 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 A:G G A 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_313492_313643:MIER2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 617614 G/A 1 40 47 87 18.6164399995638 25.1256830005126 -6.50924300094882 A:G G A 10 0.534589000010906 0.164219832206794 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_617570_617655:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_617570_617655:POLRMT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 15 7 22 6.98116499983641 3.74212300007634 3.23904199976007 C:G G C 10 0.534589000010906 0.201853762836156 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 621063 A/G 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:G A G 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 621070 G/A 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 622336 T/G 1 19 14 33 8.84280899979279 7.48424600015268 1.3585629996401 T:G T G 10 0.534589000010906 0.728172693915283 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_622149_622373:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_622149_622373:POLRMT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 629846 G/A 1 32 19 51 14.893151999651 10.1571910002072 4.73596099944379 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.207452924112523 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_629540_630168:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_629540_630168:POLRMT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 804396 C/T 1 161 158 319 74.9311709982441 84.4650620017232 -9.53389100347903 T:C C T 10 0.534589000010906 0.286845155727408 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 804642 C/T 1 147 145 292 68.4154169983968 77.5154050015814 -9.09998800318456 T:C C T 10 0.534589000010906 0.291470184910956 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 880066 G/A 1 11 8 19 5.11952099988003 4.27671200008725 0.842808999792785 A:G G A 10 0.534589000010906 0.819574245361162 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 47 59 106 21.8743169994874 31.5407510006435 -9.66643400115604 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.0643971434351525 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 984533 T/C 1 38 37 75 17.6856179995856 19.7797930004035 -2.09417500081795 T:C T C 10 0.534589000010906 0.644889610012263 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 991968 T/C 1 60 60 120 27.9246599993456 32.0753400006544 -4.15068000130873 T:C T C 10 0.534589000010906 0.465045527656498 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991955_992121:WDR18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 77 74 151 35.8366469991602 39.559586000807 -3.72293900164681 A:G A G 10 0.534589000010906 0.568438611117312 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1036444 G/A 1 253 202 455 117.748982997241 107.986978002203 9.76200499503776 A:G G A 10 0.534589000010906 0.372087913491321 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1055191 G/A 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 A:G G A 10 0.534589000010906 0.189086525758904 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1055096_1055350:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1055096_1055350:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1055096_1055350:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000530092:exon_1055096_1055350:ABCA7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1056065 A/G 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1056065_1056242:ABCA7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 27 20 47 12.5660969997055 10.6917800002181 1.87431699948742 T:C T C 10 0.534589000010906 0.661716636656004 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 28 20 48 13.0315079996946 10.6917800002181 2.33972799947651 A:G G A 10 0.534589000010906 0.563817178033223 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 40 60 100 18.6164399995638 32.0753400006544 -13.4589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0088233337885367 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1095352 C/G 1 10 12 22 4.65410999989094 6.41506800013087 -1.76095800023993 C:G C G 10 0.534589000010906 0.524043562584602 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1095355 C/T 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 T:C C T 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1106477 G/C 1 12 10 22 5.58493199986913 5.34589000010906 0.239041999760067 C:G G C 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1110829 G/A 1 20 24 44 9.30821999978188 12.8301360002617 -3.52191600047987 A:G G A 10 0.534589000010906 0.294586000695374 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1110711_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1110744_1110887:SBNO2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1271274 C/T 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 T:C C T 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271139_1271364:CIRBP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1271529 C/T 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 0.204502714830273 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1272040 T/C 1 688 641 1329 320.202767992497 342.671549006991 -22.4687810144941 A:T:C:G T C 10 0.534589000010906 0.226322053838396 ENSG00000099622:ENST00000320936:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000413636:exon_1271980_1272442:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000444172:exon_1271980_1272442:CIRBP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 52 48 100 24.2013719994329 25.6602720005235 -1.4589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 0.841229872093544 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1397443 G/A 1 91 45 136 42.3524009990075 24.0565050004908 18.2958959985168 A:C:G G A 10 0.534589000010906 0.00186827801289872 ENSG00000130005:ENST00000252288:exon_1397089_1397498:GAMT;ENSG00000130005:ENST00000455182:exon_1397092_1397498:GAMT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1611856 G/A 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 0.529760851175976 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1619333 G/A 1 64 19 83 29.786303999302 10.1571910002072 19.6291129990948 A:G G A 10 0.534589000010906 1.24539430201432e-05 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 134 120 254 62.3650739985386 64.1506800013087 -1.78560600277014 A:G A G 10 0.534589000010906 0.85042073421601 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 34 22 56 15.8239739996292 11.7609580002399 4.06301599938926 A:G A G 10 0.534589000010906 0.287408492033131 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 2099250 G/A 1 9 8 17 4.18869899990185 4.27671200008725 -0.0880130001854029 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098435_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098435_2099592:IZUMO4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 20 20 40 9.30821999978188 10.6917800002181 -1.38356000043624 A:C C A 10 0.534589000010906 0.751793136121849 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 2732741 G/A 1 64 68 132 29.786303999302 36.3520520007416 -6.56574800143959 A:G G A 10 0.534589000010906 0.257852932987093 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 64 71 135 29.786303999302 37.9558190007743 -8.16951500147231 T:C T C 10 0.534589000010906 0.167869790656623 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 30 27 57 13.9623299996728 14.4339030002945 -0.471573000621643 A:C:G A C 10 0.534589000010906 0.895413387239517 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 2917287 C/A 1 9 11 20 4.18869899990185 5.88047900011997 -1.69178000021812 A:C C A 10 0.534589000010906 0.505607767076301 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 2917689 C/T 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 T:C C T 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 3162909 C/T 1 16 24 40 7.4465759998255 12.8301360002617 -5.38356000043624 T:C C T 10 0.534589000010906 0.1120485386908 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3162791_3163766:GNA15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 3186085 G/T 1 9 6 15 4.18869899990185 3.20753400006544 0.981164999836409 T:G G T 10 0.534589000010906 0.796967668188066 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3185875_3186212:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3185875_3186212:NCLN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 53 40 93 24.666782999422 21.3835600004362 3.28322299898574 A:T:C T C 10 0.534589000010906 0.533607507119314 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 96 68 164 44.679455998953 36.3520520007416 8.32740399821141 A:G A G 10 0.534589000010906 0.210491802936673 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 3778310 G/A 1 75 90 165 34.905824999182 48.1130100009815 -13.2071850017995 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0423687053778218 ENSG00000007264:ENST00000315548:exon_3777968_3778420:MATK;ENSG00000007264:ENST00000395045:exon_3777968_3778420:MATK;ENSG00000007264:ENST00000310132:exon_3777968_3778420:MATK;ENSG00000007264:ENST00000395040:exon_3777968_3778420:MATK;ENSG00000007264:ENST00000420907:exon_3777968_3778420:MATK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 4101062 G/T 1 27 22 49 12.5660969997055 11.7609580002399 0.805138999465605 T:G G T 10 0.534589000010906 0.886563011000463 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4100962_4101141:MAP2K2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 4180836 C/T 1 8 12 20 3.72328799991275 6.41506800013087 -2.69178000021812 T:C C T 10 0.534589000010906 0.265898160963149 ENSG00000077463:ENST00000337491:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000305232:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000269860:exon_4180779_4180906:SIRT6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 4292597 C/T 0 21 0 21 9.77363099977097 0 9.77363099977097 C C 10 0.534589000010906 2.04858593031777e-06 ENSG00000167664:ENST00000442193:exon_4292237_4292882:TMIGD2;ENSG00000167664:ENST00000301272:exon_4292237_4292882:TMIGD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 4292841 C/G 1 2 16 18 0.930821999978188 8.5534240001745 -7.62260200019631 C:G C G 10 0.534589000010906 0.000446635780949361 ENSG00000167664:ENST00000442193:exon_4292237_4292882:TMIGD2;ENSG00000167664:ENST00000301272:exon_4292237_4292882:TMIGD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 4362691 G/C 1 19 22 41 8.84280899979279 11.7609580002399 -2.91814900044715 C:G G C 10 0.534589000010906 0.434217034310714 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4362609_4362733:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4362609_4362733:SH3GL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 4409756 A/G 1 32 34 66 14.893151999651 18.1760260003708 -3.2828740007198 A:G A G 10 0.534589000010906 0.459843872832268 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 4454083 C/T 1 32 28 60 14.893151999651 14.9684920003054 -0.0753400006543625 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 4457650 C/T 1 6 12 18 2.79246599993456 6.41506800013087 -3.62260200019631 T:C C T 10 0.534589000010906 0.100748004668825 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4457612_4457694:UBXN6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 4538599 G/A 1 12 5 17 5.58493199986913 2.67294500005453 2.9119869998146 A:G G A 10 0.534589000010906 0.223771329291868 ENSG00000171236:ENST00000306390:exon_4537227_4538963:LRG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 4816719 G/A 1 30 33 63 13.9623299996728 17.6414370003599 -3.67910700068708 A:G G A 10 0.534589000010906 0.378132598938835 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 36 35 71 16.7547959996074 18.7106150003817 -1.95581900077433 T:C T C 10 0.534589000010906 0.721449347156186 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 5110794 A/G 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000127663:ENST00000159111:exon_5110633_5110829:KDM4B;ENSG00000127663:ENST00000381759:exon_5110633_5110829:KDM4B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 5212060 G/A 1 13 16 29 6.05034299985822 8.5534240001745 -2.50308100031627 A:G G A 10 0.534589000010906 0.359545966755733 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5211976_5212261:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5211976_5212261:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5211976_5212261:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5211976_5212261:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5211976_5212261:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5211976_5212261:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5211976_5212261:PTPRS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 5212380 C/T 1 19 15 34 8.84280899979279 8.01883500016359 0.823973999629194 T:C C T 10 0.534589000010906 0.864184099905938 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5212348_5212502:PTPRS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 5212482 G/A 1 20 6 26 9.30821999978188 3.20753400006544 6.10068599971644 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0177966545555558 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5212348_5212502:PTPRS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 19 15 34 8.84280899979279 8.01883500016359 0.823973999629194 A:G G A 10 0.534589000010906 0.864184099905938 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 5789565 T/C 1 22 16 38 10.2390419997601 8.5534240001745 1.68561799958557 T:C T C 10 0.534589000010906 0.628415893633615 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 6374813 T/C 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 T:C T C 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 35 39 74 16.2893849996183 20.8489710004253 -4.55958600080705 A:G A G 10 0.534589000010906 0.2965259633375 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 6535080 T/C 1 99 135 234 46.0756889989203 72.1695150014723 -26.093826002552 T:C T C 10 0.534589000010906 0.000795477340302477 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 885 759 1644 411.888734990348 405.753051008278 6.13568398207047 A:T:C:G G A 10 0.534589000010906 0.766773381308853 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 6731057 T/C 1 32 33 65 14.893151999651 17.6414370003599 -2.74828500070889 T:C T C 10 0.534589000010906 0.535099759716054 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 6755007 T/C 1 13 17 30 6.05034299985822 9.0880130001854 -3.03767000032718 T:C T C 10 0.534589000010906 0.27812385936588 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 7083761 A/G 1 4 9 13 1.86164399995638 4.81130100009815 -2.94965700014178 A:G A G 10 0.534589000010906 0.162146782239777 ENSG00000130544:ENST00000439035:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000414706:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000252840:exon_7082889_7087979:ZNF557 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 7125297 G/A 1 14 10 24 6.51575399984732 5.34589000010906 1.16986399973826 A:G G A 10 0.534589000010906 0.686499461842995 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7125294_7125538:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7125294_7125538:INSR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 39 51 90 18.1510289995747 27.2640390005562 -9.11301000098154 A:C:G A G 10 0.534589000010906 0.0574357775679878 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 7763703 A/G 1 401 550 951 186.629810995627 294.023950005998 -107.394139010372 A:T:G A G 10 0.534589000010906 3.59015201454881e-12 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763627_7763740:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763627_7763740:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763627_7763740:FCER2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 7913974 T/C 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 T:C T C 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000142459:ENST00000270530:exon_7913807_7914031:EVI5L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 7986638 C/G 1 9 10 19 4.18869899990185 5.34589000010906 -1.15719100020721 C:G C G 10 0.534589000010906 0.650010996424856 ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7986590_7986658:SNAPC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 8122767 T/C 1 12 6 18 5.58493199986913 3.20753400006544 2.37739799980369 T:C T C 10 0.534589000010906 0.34614898565578 ENSG00000131142:ENST00000253451:exon_8122688_8122804:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000405803:exon_8122685_8122804:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000390669:exon_8122685_8122804:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000458625:exon_8122685_8122804:CCL25 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 8326866 C/T 1 50 51 101 23.2705499994547 27.2640390005562 -3.99348900110151 T:C C T 10 0.534589000010906 0.427144123470133 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 87 83 170 40.4907569990512 44.3708870009052 -3.88013000185403 A:C:G G A 10 0.534589000010906 0.590624854274122 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 8326944 G/A 1 66 66 132 30.7171259992802 35.2828740007198 -4.5657480014396 A:G G A 10 0.534589000010906 0.433581102300705 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 8326999 C/T 1 32 22 54 14.893151999651 11.7609580002399 3.13219399941107 T:C C T 10 0.534589000010906 0.416027719834033 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 8615058 C/T 1 5 8 13 2.32705499994547 4.27671200008725 -1.94965700014178 T:C C T 10 0.534589000010906 0.405475359831307 ENSG00000142347:ENST00000446661:exon_8615050_8615240:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000305795:exon_8615050_8615240:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000338257:exon_8615044_8615240:MYO1F HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 9267292 G/A 1 9 3 12 4.18869899990185 1.60376700003272 2.58493199986913 A:G G A 10 0.534589000010906 0.157534918401888 ENSG00000130803:ENST00000419608:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9267288_9267424:ZNF317 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 9271969 C/A 1 23 23 46 10.7044529997492 12.2955470002508 -1.59109400050168 A:C C A 10 0.534589000010906 0.659908763281336 ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9270790_9274089:ZNF317 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 9452868 G/A 1 10 9 19 4.65410999989094 4.81130100009815 -0.157191000207215 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000188321:ENST00000317221:exon_9452371_9453744:ZNF559;ENSG00000188321:ENST00000393883:exon_9452371_9454519:ZNF559 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 9452879 C/A 1 14 11 25 6.51575399984732 5.88047900011997 0.635274999727349 A:C C A 10 0.534589000010906 0.843567005465164 ENSG00000188321:ENST00000317221:exon_9452371_9453744:ZNF559;ENSG00000188321:ENST00000393883:exon_9452371_9454519:ZNF559 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 9492370 A/T 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 A:T A T 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000188629:ENST00000446085:exon_9491344_9492453:ZNF177;ENSG00000188629:ENST00000343499:exon_9491824_9492864:ZNF177;ENSG00000188629:ENST00000434737:exon_9491824_9492864:ZNF177 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 9524272 T/C 1 56 28 84 26.0630159993893 14.9684920003054 11.0945239990839 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0159628504902428 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524224_9525396:ZNF266 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 9721401 A/T 1 24 15 39 11.1698639997383 8.01883500016359 3.15102899957466 A:T A T 10 0.534589000010906 0.339042124161351 ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 9949152 G/A 0 284 0 284 132.176723996903 0 132.176723996903 G G 10 0.534589000010906 1.05567974289225e-77 ENSG00000127445:ENST00000247970:exon_9949112_9949324:PIN1;ENSG00000127445:ENST00000424497:exon_9949112_9949324:PIN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 89 85 174 41.4215789990294 45.440065000927 -4.01848600189765 C:G C G 10 0.534589000010906 0.544293972911925 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 10221111 T/C 1 8 12 20 3.72328799991275 6.41506800013087 -2.69178000021812 T:C T C 10 0.534589000010906 0.265898160963149 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 9 19 28 4.18869899990185 10.1571910002072 -5.96849200030537 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0352555502551958 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 57 64 121 26.5284269993784 34.213696000698 -7.68526900131963 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.172038975676792 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 10224548 G/A 1 68 52 120 31.6479479992584 27.7986280005671 3.84931999869127 A:G G A 10 0.534589000010906 0.522213693476021 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 372 404 776 173.132891995943 215.973956004406 -42.8410640084631 A:C:G A G 10 0.534589000010906 0.00220605137612279 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 190 223 413 88.4280899979279 119.213347002432 -30.7852570045042 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00259038244468534 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 10291181 T/C 1 13 15 28 6.05034299985822 8.01883500016359 -1.96849200030537 T:C T C 10 0.534589000010906 0.570640261191915 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10291026_10291245:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10291026_10291245:DNMT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 10395683 A/G 1 130 88 218 60.5034299985822 47.0438320009597 13.4595979976225 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0772956259447959 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000444336:exon_10395605_10395685:ICAM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 10449392 A/G 1 178 185 363 82.8431579980587 98.8989650020176 -16.0558070039589 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0924730831234634 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 17 34 51 7.9119869998146 18.1760260003708 -10.2640390005562 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00464567094216369 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 23 29 52 10.7044529997492 15.5030810003163 -4.79862800056711 A:C C A 10 0.534589000010906 0.211090721651267 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 10568668 C/T 1 5 8 13 2.32705499994547 4.27671200008725 -1.94965700014178 T:C C T 10 0.534589000010906 0.405475359831307 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10568555_10568778:PDE4A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 10599965 G/A 1 24 20 44 11.1698639997383 10.6917800002181 0.478083999520134 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10599868_10600044:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10599868_10600044:KEAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 11144046 C/T 1 48 38 86 22.3397279994765 20.3143820004144 2.02534599906208 T:C C T 10 0.534589000010906 0.745942336010817 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11143966_11144193:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11143966_11144193:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11143966_11144193:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11143966_11144193:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11143966_11144193:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11143966_11144193:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11143966_11144193:SMARCA4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 11303554 A/G 1 12 1 13 5.58493199986913 0.534589000010906 5.05034299985822 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00435336637924491 ENSG00000197256:ENST00000355150:exon_11303507_11304718:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000432929:exon_11303507_11304718:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000439675:exon_11303507_11304718:KANK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 11303943 A/G 1 7 1 8 3.25787699992366 0.534589000010906 2.72328799991275 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0755591978202379 ENSG00000197256:ENST00000355150:exon_11303507_11304718:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000432929:exon_11303507_11304718:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000439675:exon_11303507_11304718:KANK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 11304498 C/T 1 8 3 11 3.72328799991275 1.60376700003272 2.11952099988003 T:C C T 10 0.534589000010906 0.238841320527235 ENSG00000197256:ENST00000355150:exon_11303507_11304718:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000432929:exon_11303507_11304718:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000439675:exon_11303507_11304718:KANK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 11319636 G/A 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 0.529760851175976 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11319587_11319779:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11319587_11319779:DOCK6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 11598240 G/A 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000161914:ENST00000293771:exon_11598107_11598718:ZNF653 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 11979164 T/C 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 T:C T C 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000171291:ENST00000455282:exon_11978121_11980297:ZNF439;ENSG00000171291:ENST00000304030:exon_11978121_11980306:ZNF439 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 12542653 T/G 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 T:G T G 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000180855:ENST00000301547:exon_12540521_12542794:ZNF443;ENSG00000180855:ENST00000411622:exon_12541336_12542794:ZNF443;ENSG00000180855:ENST00000436821:exon_12542383_12542794:ZNF443 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 13220676 G/A 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:G G A 10 0.534589000010906 0.741882642224914 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 13264549 C/T 1 190 207 397 88.4280899979279 110.659923002258 -22.2318330043297 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.0267952302538508 ENSG00000160888:ENST00000292433:exon_13263758_13265716:IER2;ENSG00000160888:ENST00000393152:exon_13263893_13265716:IER2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 18 23 41 8.37739799980369 12.2955470002508 -3.91814900044715 A:G A G 10 0.534589000010906 0.273044441286071 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 238 186 424 110.767817997404 99.4335540020285 11.3342639953758 T:C C T 10 0.534589000010906 0.284242466353521 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 13885437 C/A 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 A:C C A 10 0.534589000010906 0.764524730244108 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 704 725 1429 327.649343992322 387.577025007907 -59.9276810155847 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.00159352391725900 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 14231243 C/T 1 134 84 218 62.3650739985386 44.9054760009161 17.4595979976225 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0207678063021991 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 14231325 C/G 1 108 70 178 50.2643879988222 37.4212300007634 12.8431579980587 T:C:G C G 10 0.534589000010906 0.0600937484934552 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 14231330 A/G 1 104 71 175 48.4027439988658 37.9558190007743 10.4469249980914 A:G A G 10 0.534589000010906 0.129423858153701 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 14492265 T/C 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 T:C T C 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 14492272 T/C 1 12 6 18 5.58493199986913 3.20753400006544 2.37739799980369 T:C T C 10 0.534589000010906 0.34614898565578 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 14580328 A/G 1 185 170 355 86.1010349979824 90.880130001854 -4.77909500387165 A:G A G 10 0.534589000010906 0.632197530410103 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 14589378 C/T 1 6 10 16 2.79246599993456 5.34589000010906 -2.5534240001745 T:C C T 10 0.534589000010906 0.219453370200368 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14588574_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14588574_14589379:GIPC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 27 31 58 12.5660969997055 16.5722590003381 -4.00616200063255 A:G G A 10 0.534589000010906 0.295980325170233 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 14682804 G/C 1 64 57 121 29.786303999302 30.4715730006216 -0.685269001319629 C:G G C 10 0.534589000010906 0.927534139492055 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14682701_14682886:NDUFB7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 14705363 T/C 1 2 9 11 0.930821999978188 4.81130100009815 -3.88047900011997 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0299085362195834 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 15465960 G/A 1 30 34 64 13.9623299996728 18.1760260003708 -4.21369600069798 A:G G A 10 0.534589000010906 0.317192547254798 ENSG00000105127:ENST00000269701:exon_15464341_15466181:AKAP8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 15480979 G/A 1 15 15 30 6.98116499983641 8.01883500016359 -1.03767000032718 A:G G A 10 0.534589000010906 0.718295138743325 ENSG00000105127:ENST00000269701:exon_15480957_15480990:AKAP8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 20 20 40 9.30821999978188 10.6917800002181 -1.38356000043624 T:C C T 10 0.534589000010906 0.751793136121849 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 17160893 C/T 1 27 14 41 12.5660969997055 7.48424600015268 5.08185099955285 T:C C T 10 0.534589000010906 0.119642823581058 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17160573_17160986:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17160573_17160986:HAUS8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 17173588 G/A 1 7 8 15 3.25787699992366 4.27671200008725 -1.01883500016359 A:G G A 10 0.534589000010906 0.615581524507087 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17173508_17173589:HAUS8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 17337555 C/A 1 14 11 25 6.51575399984732 5.88047900011997 0.635274999727349 A:C C A 10 0.534589000010906 0.843567005465164 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 17337871 A/G 1 16 9 25 7.4465759998255 4.81130100009815 2.63527499972735 A:G A G 10 0.534589000010906 0.322000273897906 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 17337882 C/G 1 12 7 19 5.58493199986913 3.74212300007634 1.84280899979278 C:G C G 10 0.534589000010906 0.492933071348704 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 17339112 G/A 1 19 31 50 8.84280899979279 16.5722590003381 -7.7294500005453 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0330036825552365 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17339065_17339118:OCEL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 17351535 G/A 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 0.529760851175976 ENSG00000160113:ENST00000291442:exon_17351480_17351574:NR2F6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 17664090 C/T 1 9 36 45 4.18869899990185 19.2452040003926 -15.0565050004908 T:C C T 10 0.534589000010906 6.83111940509479e-06 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 17664418 G/A 1 11 4 15 5.11952099988003 2.13835600004362 2.98116499983641 A:G G A 10 0.534589000010906 0.194125209391915 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17664122_17664647:FAM129C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 18538742 A/C 1 10 7 17 4.65410999989094 3.74212300007634 0.911986999814598 A:C A C 10 0.534589000010906 0.809164893348427 ENSG00000130511:ENST00000348495:exon_18538708_18538792:SSBP4;ENSG00000130511:ENST00000270061:exon_18538708_18538792:SSBP4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 18545786 G/T 1 53 52 105 24.666782999422 27.7986280005671 -3.13184500114513 T:G G T 10 0.534589000010906 0.558296463893812 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18545625_18545927:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18545625_18545927:ISYNA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 18546678 T/C 1 49 50 99 22.8051389994656 26.7294500005453 -3.9243110010797 T:C T C 10 0.534589000010906 0.480878554162699 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18546567_18546731:ISYNA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 18679379 C/G 1 68 62 130 31.6479479992584 33.1445180006762 -1.49657000141778 C:G C G 10 0.534589000010906 0.792781087769766 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 1 79 1 80 36.7674689991384 0.534589000010906 36.2328799991275 A:T:C C A 10 0.534589000010906 2.00246117402286e-20 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 18685964 G/T 1 2952 2832 5784 1373.89327196781 1513.95604803089 -140.062776063081 A:T:C:G G T 10 0.534589000010906 0.000235083242386234 ENSG00000221983:ENST00000430157:exon_18685867_18688269:UBA52;ENSG00000221983:ENST00000442744:exon_18685867_18688269:UBA52 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 18775077 C/T 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 T:C C T 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000167487:ENST00000431920:exon_18775071_18775253:KLHL26;ENSG00000167487:ENST00000300976:exon_18775071_18775253:KLHL26 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 19136541 C/T 1 60 38 98 27.9246599993456 20.3143820004144 7.61027799893121 T:C C T 10 0.534589000010906 0.129608433867126 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 19230868 A/G 1 24 36 60 11.1698639997383 19.2452040003926 -8.07534000065436 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0387644257230064 ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19230429_19230992:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19230429_19230992:TMEM161A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 19257410 G/A 0 177 0 177 82.3777469980696 0 82.3777469980696 G G 10 0.534589000010906 7.68854798364085e-49 ENSG00000213999:ENST00000162023:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000409224:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000424583:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000410050:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000414036:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000444486:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000421262:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000409447:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000064489:ENST00000502742:exon_19257364_19257457:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000354191:exon_19257364_19257457:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000514819:exon_19257364_19257457:AC002126.6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 20003109 A/G 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 A:G A G 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000355095:exon_20003002_20003556:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000427401:exon_20003035_20003166:ZNF90 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 20003576 C/G 1 13 7 20 6.05034299985822 3.74212300007634 2.30821999978188 C:G C G 10 0.534589000010906 0.372688141283748 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 21300462 A/G 1 17 17 34 7.9119869998146 9.0880130001854 -1.1760260003708 A:G A G 10 0.534589000010906 0.732812837731546 ENSG00000160352:ENST00000343332:exon_21299613_21301019:ZNF714;ENSG00000160352:ENST00000291770:exon_21299613_21307879:ZNF714 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 21719401 T/C 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 23542697 G/C 1 25 20 45 11.6352749997273 10.6917800002181 0.943494999509229 C:G G C 10 0.534589000010906 0.881474380728673 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 23837145 A/G 1 10 10 20 4.65410999989094 5.34589000010906 -0.69178000021812 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.824629775002564 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 30165639 C/T 1 23 19 42 10.7044529997492 10.1571910002072 0.547261999541947 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.87867221204653 ENSG00000166289:ENST00000299373:exon_30164731_30166364:PLEKHF1;ENSG00000166289:ENST00000436066:exon_30164731_30166364:PLEKHF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 8 11 19 3.72328799991275 5.88047900011997 -2.15719100020721 A:G G A 10 0.534589000010906 0.363088485682007 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 30314666 C/T 1 16 17 33 7.4465759998255 9.0880130001854 -1.6414370003599 T:C C T 10 0.534589000010906 0.603642096692231 ENSG00000105173:ENST00000262643:exon_30314562_30315216:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000357943:exon_30314562_30315216:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000444983:exon_30314562_30315216:CCNE1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33096786 G/A 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 16 16 32 7.4465759998255 8.5534240001745 -1.10684800034899 T:C C T 10 0.534589000010906 0.725761441333252 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 13 7 20 6.05034299985822 3.74212300007634 2.30821999978188 T:C C T 10 0.534589000010906 0.372688141283748 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33183352 G/C 1 16 14 30 7.4465759998255 7.48424600015268 -0.0376700003271813 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33444707 C/T 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 T:C C T 10 0.534589000010906 0.156883047615629 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000427840:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000415324:exon_33444521_33444707:CCDC123 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33464993 G/A 1 11 3 14 5.11952099988003 1.60376700003272 3.51575399984732 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0655983504942837 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33464966_33465118:C19orf40 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 14 8 22 6.51575399984732 4.27671200008725 2.23904199976007 A:G G A 10 0.534589000010906 0.396720668612636 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33467515 T/C 1 8 12 20 3.72328799991275 6.41506800013087 -2.69178000021812 T:C T C 10 0.534589000010906 0.265898160963149 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33467576 G/A 1 13 10 23 6.05034299985822 5.34589000010906 0.704452999749162 A:G G A 10 0.534589000010906 0.836527371779212 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33470874 A/G 1 3 10 13 1.39623299996728 5.34589000010906 -3.94965700014178 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0473534851625257 ENSG00000131941:ENST00000254260:exon_33469499_33471162:RHPN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33579128 T/C 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33579040_33579174:GPATCH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33600764 T/C 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 T:C T C 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33600623_33600922:GPATCH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33605300 A/G 1 17 4 21 7.9119869998146 2.13835600004362 5.77363099977097 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0143845817680363 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33608733 C/A 1 2 16 18 0.930821999978188 8.5534240001745 -7.62260200019631 A:C C A 10 0.534589000010906 0.000446635780949361 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33608731_33608947:GPATCH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33617508 G/A 1 7 11 18 3.25787699992366 5.88047900011997 -2.62260200019631 A:G G A 10 0.534589000010906 0.243363535954427 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33617494_33617639:GPATCH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 33617583 C/T 1 12 13 25 5.58493199986913 6.94965700014178 -1.36472500027265 T:C C T 10 0.534589000010906 0.689551323254237 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33617494_33617639:GPATCH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 34842488 T/C 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 T:C T C 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000166398:ENST00000299505:exon_34842419_34842497:KIAA0355 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 34868642 A/G 1 273 287 560 127.057202997023 153.42704300313 -26.3698400061074 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0275402982455672 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34868640_34868786:GPI HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 34884857 C/A 1 286 234 520 133.107545996881 125.093826002552 8.01371999432887 A:C:G C A 10 0.534589000010906 0.509693727543331 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34884819_34884971:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34884819_34884971:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34884819_34884971:GPI HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 34959979 A/G 1 250 259 509 116.352749997273 138.458551002825 -22.1058010055512 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0506297936242699 ENSG00000126261:ENST00000246548:exon_34959945_34960795:UBA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 35231840 A/G 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:G A G 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000197841:ENST00000392232:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000448715:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000425140:exon_35231516_35233774:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000492450:exon_35231516_35233091:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000459757:exon_35231516_35233091:ZNF181 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 35232677 G/A 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 A:G G A 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000197841:ENST00000392232:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000448715:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000425140:exon_35231516_35233774:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000492450:exon_35231516_35233091:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000459757:exon_35231516_35233091:ZNF181 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 47 89 136 21.8743169994874 47.5784210009706 -25.7041040014832 A:G A G 10 0.534589000010906 9.90972808083005e-06 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 36530343 C/T 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000161277:ENST00000292894:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000392182:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000522483:exon_36530225_36530620:THAP8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 10 10 20 4.65410999989094 5.34589000010906 -0.69178000021812 A:C A C 10 0.534589000010906 0.824629775002564 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 36940760 G/T 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:G G T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000186017:ENST00000434377:exon_36936021_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000454319:exon_36936021_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000493391:exon_36937923_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000392170:exon_36938531_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000424129:exon_36938584_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000358744:exon_36938584_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000452939:exon_36940435_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000427002:exon_36940666_36940903:ZNF566 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 37004938 T/C 1 9 7 16 4.18869899990185 3.74212300007634 0.446575999825503 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 37038092 T/C 1 6 14 20 2.79246599993456 7.48424600015268 -4.69178000021812 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0431004774055677 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 37129768 A/G 1 9 8 17 4.18869899990185 4.27671200008725 -0.0880130001854029 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000197808:ENST00000360357:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396893:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396896:exon_37129686_37130439:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396892:exon_37129591_37129890:ZNF461 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 37130718 G/T 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 T:G G T 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000197808:ENST00000360357:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396893:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396892:exon_37130614_37130945:ZNF461 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 37210805 C/T 1 9 3 12 4.18869899990185 1.60376700003272 2.58493199986913 T:C C T 10 0.534589000010906 0.157534918401888 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 37310679 C/A 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 A:C C A 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000197863:ENST00000356725:exon_37309224_37311016:ZNF790 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 37310886 G/A 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:G G A 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000197863:ENST00000356725:exon_37309224_37311016:ZNF790;ENSG00000197863:ENST00000528994:exon_37310709_37311016:ZNF790;ENSG00000197863:ENST00000525288:exon_37310839_37311016:ZNF790 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 37618208 A/G 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000197050:ENST00000304239:exon_37618030_37619304:ZNF420;ENSG00000197050:ENST00000337995:exon_37618030_37620662:ZNF420 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 37853366 G/C 1 18 7 25 8.37739799980369 3.74212300007634 4.63527499972735 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0720418033802358 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853011_37853489:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 37853375 T/C 1 15 7 22 6.98116499983641 3.74212300007634 3.23904199976007 T:C T C 10 0.534589000010906 0.201853762836156 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853011_37853489:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 38643539 C/T 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 T:C C T 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38643480_38643607:SIPA1L3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 47 46 93 21.8743169994874 24.5910940005017 -2.71677700101426 T:C C T 10 0.534589000010906 0.603985548856711 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 38800176 G/A 1 43 45 88 20.012672999531 24.0565050004908 -4.04383200095973 A:G G A 10 0.534589000010906 0.394738280197335 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 38872778 C/T 1 133 96 229 61.8996629985495 51.320544001047 10.5791189975025 T:C C T 10 0.534589000010906 0.164758070578082 ENSG00000099341:ENST00000215071:exon_38872757_38872868:PSMD8;ENSG00000099341:ENST00000404323:exon_38872757_38872868:PSMD8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 38893856 G/C 1 5 7 12 2.32705499994547 3.74212300007634 -1.41506800013087 C:G G C 10 0.534589000010906 0.565015885912817 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38893775_38893858:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38893775_38893858:FAM98C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 39416887 C/T 1 13 21 34 6.05034299985822 11.226369000229 -5.17602600037081 T:C C T 10 0.534589000010906 0.086020077971915 ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39416845_39416940:FBXO17 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 39880929 C/T 1 42 27 69 19.5472619995419 14.4339030002945 5.11335899924748 T:C C T 10 0.534589000010906 0.229484231293006 ENSG00000006712:ENST00000221265:exon_39880900_39880929:PAF1;ENSG00000006712:ENST00000416728:exon_39880900_39880929:PAF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 39888390 G/C 1 36 55 91 16.7547959996074 29.4023950005998 -12.6475990009925 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0084823750233709 ENSG00000063322:ENST00000315588:exon_39888097_39891201:MED29;ENSG00000063322:ENST00000435462:exon_39888167_39888397:MED29 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 39907036 C/T 1 10 7 17 4.65410999989094 3.74212300007634 0.911986999814598 T:C C T 10 0.534589000010906 0.809164893348427 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000451354:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39906988_39907054:PLEKHG2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 39908574 C/T 1 8 11 19 3.72328799991275 5.88047900011997 -2.15719100020721 T:C C T 10 0.534589000010906 0.363088485682007 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000478523:exon_39908485_39908745:PLEKHG2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 40719076 T/C 1 10 4 14 4.65410999989094 2.13835600004362 2.51575399984732 T:C T C 10 0.534589000010906 0.194114354160929 ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40718983_40719095:MAP3K10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 88 73 161 40.9561679990403 39.0249970007961 1.93117099824413 A:G A G 10 0.534589000010906 0.812769122212427 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 41129842 C/T 0 21 0 21 9.77363099977097 0 9.77363099977097 C C 10 0.534589000010906 2.04858593031777e-06 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41129841_41129987:LTBP4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 T:C T C 10 0.534589000010906 0.298446592097252 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 34 50 84 15.8239739996292 26.7294500005453 -10.9054760009161 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0211110728547598 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 42471050 G/C 1 20 4 24 9.30821999978188 2.13835600004362 7.16986399973826 C:G G C 10 0.534589000010906 0.00341768075624556 ENSG00000105409:ENST00000302102:exon_42470734_42471117:ATP1A3;ENSG00000105409:ENST00000441343:exon_42470734_42471492:ATP1A3;ENSG00000105409:ENST00000473840:exon_42470751_42471117:ATP1A3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 43013363 A/G 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000079385:ENST00000161559:exon_43011458_43013380:CEACAM1;ENSG00000079385:ENST00000352591:exon_43011458_43013380:CEACAM1;ENSG00000079385:ENST00000351134:exon_43011458_43013380:CEACAM1;ENSG00000079385:ENST00000358394:exon_43011458_43013380:CEACAM1;ENSG00000079385:ENST00000378065:exon_43011458_43013380:CEACAM1;ENSG00000079385:ENST00000403444:exon_43011466_43013380:CEACAM1;ENSG00000079385:ENST00000403461:exon_43013244_43013380:CEACAM1;ENSG00000079385:ENST00000488639:exon_43013252_43013380:CEACAM1;ENSG00000079385:ENST00000465051:exon_43013256_43013380:CEACAM1;ENSG00000079385:ENST00000308072:exon_43013274_43013380:CEACAM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 44153100 A/G 1 18 22 40 8.37739799980369 11.7609580002399 -3.38356000043624 A:G A G 10 0.534589000010906 0.341934716221639 ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44152732_44153295:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44152732_44153295:PLAUR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 44740260 T/C 1 15 17 32 6.98116499983641 9.0880130001854 -2.10684800034899 T:C T C 10 0.534589000010906 0.482636180272191 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 93 101 194 43.2832229989857 53.9934890011015 -10.7102660021158 T:C T C 10 0.534589000010906 0.130803386446773 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 45396144 C/T 1 74 62 136 34.440413999193 33.1445180006762 1.29589599851678 T:C C T 10 0.534589000010906 0.863700542698904 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45396094_45396186:TOMM40 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 45422446 A/T 1 14 2 16 6.51575399984732 1.06917800002181 5.4465759998255 A:T A T 10 0.534589000010906 0.00557247115706583 ENSG00000130208:ENST00000252491:exon_45422430_45422606:APOC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 45476422 T/C 1 9 11 20 4.18869899990185 5.88047900011997 -1.69178000021812 T:C T C 10 0.534589000010906 0.505607767076301 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45476344_45476467:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45476344_45476467:CLPTM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 28 19 47 13.0315079996946 10.1571910002072 2.87431699948742 T:C T C 10 0.534589000010906 0.465561196449487 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 46024584 T/G 1 136 112 248 63.2958959985168 59.8739680012215 3.4219279972953 T:G T G 10 0.534589000010906 0.702632414353741 ENSG00000125753:ENST00000245932:exon_46024580_46024664:VASP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 46275976 G/C 1 21 15 36 9.77363099977097 8.01883500016359 1.75479599960738 C:G G C 10 0.534589000010906 0.618346161055637 ENSG00000104936:ENST00000458663:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000447742:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000291270:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000377750:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000342805:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000343373:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000348168:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000354227:exon_46275899_46276010:DMPK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 46341824 C/T 1 30 29 59 13.9623299996728 15.5030810003163 -1.54075100064346 T:C C T 10 0.534589000010906 0.697537250273704 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46341719_46341873:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46341719_46341873:SYMPK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 46352122 A/G 1 26 8 34 12.1006859997164 4.27671200008725 7.8239739996292 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0089382090117974 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46352008_46352134:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46352008_46352134:SYMPK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 46857015 C/T 1 56 43 99 26.0630159993893 22.987327000469 3.0756889989203 T:C C T 10 0.534589000010906 0.547418882995539 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46857005_46857164:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46857005_46857246:PPP5C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 46888132 G/A 1 47 37 84 21.8743169994874 19.7797930004035 2.09452399908389 A:G G A 10 0.534589000010906 0.663456488106901 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46888061_46888166:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46888061_46888166:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46888061_46888166:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46888061_46888166:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000487483:exon_46888061_46888166:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000486994:exon_46888061_46888166:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000467502:exon_46888061_46888166:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000493347:exon_46888061_46888166:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000491003:exon_46888061_46888166:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000492109:exon_46887634_46888166:PPP5C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 92 72 164 42.8178119989966 38.4904080007852 4.32740399821141 A:G G A 10 0.534589000010906 0.531517664813515 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 47588325 G/A 1 11 11 22 5.11952099988003 5.88047900011997 -0.760958000239933 A:G G A 10 0.534589000010906 0.832013937520133 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47588313_47588452:ZC3H4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 47978671 G/A 1 10 12 22 4.65410999989094 6.41506800013087 -1.76095800023993 A:G G A 10 0.534589000010906 0.524043562584602 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 47980153 G/A 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47980060_47980195:KPTN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 48248864 C/A 1 792 744 1536 368.605511991362 397.734216008114 -29.1287040167517 A:C:G C A 10 0.534589000010906 0.137995204949995 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 273 316 589 127.057202997023 168.930124003446 -41.8729210064237 A:C:G A G 10 0.534589000010906 0.000597311865658753 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 48260277 C/T 1 336 203 539 156.378095996336 108.521567002214 47.8565289941216 T:C C T 10 0.534589000010906 3.29728636859369e-05 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48260256_48260314:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48260256_48260314:GLTSCR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 48654553 G/T 1 16 21 37 7.4465759998255 11.226369000229 -3.77979300040352 T:G G T 10 0.534589000010906 0.249367416803454 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48654489_48654596:LIG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 48668830 G/A 1 16 21 37 7.4465759998255 11.226369000229 -3.77979300040352 A:G G A 10 0.534589000010906 0.249367416803454 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48668807_48668880:LIG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 T:C C T 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 48836673 G/T 1 10 3 13 4.65410999989094 1.60376700003272 3.05034299985822 T:G G T 10 0.534589000010906 0.102317208684754 ENSG00000161558:ENST00000435956:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000377431:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48835613_48836690:TMEM143 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 A:G A G 10 0.534589000010906 0.780814438460418 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 1836 2139 3975 854.494595979977 1143.48587102333 -288.991275043351 T:C:G T C 10 0.534589000010906 4.59819444026205e-20 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 49497155 A/G 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 A:G A G 10 0.534589000010906 0.485270004264881 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 49840500 C/A 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 A:C C A 10 0.534589000010906 0.189086525758904 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 50310466 G/A 1 12 10 22 5.58493199986913 5.34589000010906 0.239041999760067 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50310126_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50310150_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50310154_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50310177_50310631:FUZ HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 50322482 C/G 1 25 19 44 11.6352749997273 10.1571910002072 1.47808399952013 C:G C G 10 0.534589000010906 0.762907380746898 ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312881:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50322429_50322553:MED25 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 11 6 17 5.11952099988003 3.20753400006544 1.9119869998146 T:C T C 10 0.534589000010906 0.467664186074611 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 50387750 G/C 1 21 22 43 9.77363099977097 11.7609580002399 -1.98732700046896 C:G G C 10 0.534589000010906 0.545718959386356 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50387716_50387816:TBC1D17 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 50393269 A/G 1 129 410 539 60.0380189985931 219.181490004471 -159.143471005878 A:T:G A G 10 0.534589000010906 3.12666964994356e-44 ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 50435747 T/C 1 377 86 463 175.459946995888 45.9746540009379 129.48529299495 T:C T C 10 0.534589000010906 2.86503123625915e-36 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 50436371 G/A 1 906 328 1234 421.662365990119 175.345192003577 246.317173986542 A:T:C:G G A 10 0.534589000010906 6.45735541456499e-47 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 50863023 A/G 0 0 13 13 0 6.94965700014178 -6.94965700014178 G A G 10 0.534589000010906 4.80702484846248e-05 ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50862997_50863119:NAPSA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 267 330 597 124.264736997088 176.414370003599 -52.1496330065109 T:C:G C T 10 0.534589000010906 2.27817763437143e-05 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 240 297 537 111.698639997383 158.772933003239 -47.0742930058565 A:C:G G A 10 0.534589000010906 5.52060340418124e-05 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 165 154 319 76.7928149982005 82.3267060016795 -5.53389100347903 A:T:C:G T C 10 0.534589000010906 0.537547139414573 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 51850304 G/A 1 87 59 146 40.4907569990512 31.5407510006435 8.95000599840771 A:G G A 10 0.534589000010906 0.158230291802730 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 52537576 T/G 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 T:G T G 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000197619:ENST00000221315:exon_52536361_52538693:ZNF615 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 52887437 A/C 1 1 18 19 0.465410999989094 9.62260200019631 -9.15719100020721 A:C A C 10 0.534589000010906 1.79483884944087e-05 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 1 2 17 19 0.930821999978188 9.0880130001854 -8.15719100020721 T:C T C 10 0.534589000010906 0.000128168053936044 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 53116476 G/A 1 52 64 116 24.2013719994329 34.213696000698 -10.0123240012651 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0633244402172294 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53115620_53116929:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53115620_53116929:ZNF83 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 53571306 T/C 1 25 25 50 11.6352749997273 13.3647250002727 -1.7294500005453 T:C T C 10 0.534589000010906 0.671752386433554 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 53572494 G/T 1 9 11 20 4.18869899990185 5.88047900011997 -1.69178000021812 T:G G T 10 0.534589000010906 0.505607767076301 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 54080067 T/C 1 1 8 9 0.465410999989094 4.27671200008725 -3.81130100009815 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0151819886668037 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514374:exon_54079951_54080113:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000509047:exon_54079951_54080074:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511567:exon_54079951_54080129:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513265:exon_54079951_54080107:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000502616:exon_54079951_54080071:ZNF331 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 54080144 A/G 0 0 10 10 0 5.34589000010906 -5.34589000010906 G A G 10 0.534589000010906 0.000476833145364821 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 54677897 G/A 1 45 34 79 20.9434949995092 18.1760260003708 2.76746899913842 A:G G A 10 0.534589000010906 0.573774950022519 ENSG00000125505:ENST00000437868:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000245615:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000494142:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000431666:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000338624:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000449249:exon_54677768_54678125:MBOAT7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 54697079 C/T 1 57 67 124 26.5284269993784 35.8174630007307 -9.28903600135235 T:C C T 10 0.534589000010906 0.105016026337447 ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54697030_54697173:TSEN34 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 27 42 69 12.5660969997055 22.4527380004581 -9.88664100075252 T:G T G 10 0.534589000010906 0.0212413269861643 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 54962467 G/A 1 11 11 22 5.11952099988003 5.88047900011997 -0.760958000239933 A:G G A 10 0.534589000010906 0.832013937520133 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376514:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000443957:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54962467_54962559:LENG8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 54965860 G/A 1 17 18 35 7.9119869998146 9.62260200019631 -1.71061500038171 A:G G A 10 0.534589000010906 0.613212152222237 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54965609_54965861:LENG8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 54966579 C/G 1 11 19 30 5.11952099988003 10.1571910002072 -5.03767000032718 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0694515651240427 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 54974318 T/C 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 T:C T C 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 55086775 C/T 1 11 1 12 5.11952099988003 0.534589000010906 4.58493199986913 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00776339189204268 ENSG00000239998:ENST00000439534:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251377:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391738:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251376:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391737:exon_55086723_55087019:LILRA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 24 23 47 11.1698639997383 12.2955470002508 -1.12568300051258 T:C T C 10 0.534589000010906 0.77141261178773 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 25 26 51 11.6352749997273 13.8993140002836 -2.26403900055621 T:C T C 10 0.534589000010906 0.575543255672886 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 55143491 G/T 1 34 26 60 15.8239739996292 13.8993140002836 1.92465999934564 T:G G T 10 0.534589000010906 0.698299901303493 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 13 7 20 6.05034299985822 3.74212300007634 2.30821999978188 T:C C T 10 0.534589000010906 0.372688141283748 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 14 2 16 6.51575399984732 1.06917800002181 5.4465759998255 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00557247115706583 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 55559715 G/A 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 A:G G A 10 0.534589000010906 0.189086525758904 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55559697_55559909:RDH13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 55568084 C/T 1 9 6 15 4.18869899990185 3.20753400006544 0.981164999836409 T:C C T 10 0.534589000010906 0.796967668188066 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 55568085 G/T 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 T:G G T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 55603909 G/A 0 95 0 95 44.2140449989639 0 44.2140449989639 G G 10 0.534589000010906 2.05221618265168e-26 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55603810_55603912:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55603810_55603912:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55603810_55603912:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55603810_55603912:PPP1R12C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 55739605 C/T 1 8 3 11 3.72328799991275 1.60376700003272 2.11952099988003 T:C C T 10 0.534589000010906 0.238841320527235 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55739559_55739805:TMEM86B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 55964720 G/A 1 88 75 163 40.9561679990403 40.094175000818 0.861992998222313 A:G G A 10 0.534589000010906 0.937473327195486 ENSG00000063241:ENST00000438389:exon_55964345_55964755:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000085068:exon_55964345_55964755:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000425675:exon_55964345_55964755:ISOC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 15 11 26 6.98116499983641 5.88047900011997 1.10068599971644 T:C C T 10 0.534589000010906 0.699080776375629 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 56104136 T/C 1 7 16 23 3.25787699992366 8.5534240001745 -5.29554700025084 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0350385771662904 ENSG00000179943:ENST00000221665:exon_56102738_56105012:FIZ1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 56935117 C/G 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 C:G C G 10 0.534589000010906 0.156883047615629 ENSG00000198440:ENST00000291598:exon_56934260_56936400:ZNF583 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 56935527 A/G 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 A:G A G 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000198440:ENST00000291598:exon_56934260_56936400:ZNF583 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 57132968 G/A 1 11 8 19 5.11952099988003 4.27671200008725 0.842808999792785 A:G G A 10 0.534589000010906 0.819574245361162 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 58004346 G/C 1 8 2 10 3.72328799991275 1.06917800002181 2.65410999989094 C:G G C 10 0.534589000010906 0.117787000476102 ENSG00000105136:ENST00000524372:exon_58004224_58004367:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000427558:exon_58004224_58005153:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000354197:exon_58004224_58005151:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000424930:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000426954:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000284020:exon_58004278_58004600:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000442920:exon_58004224_58005588:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000523439:exon_58004224_58005621:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000517598:exon_58004224_58005255:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000347466:exon_58004224_58006032:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000415379:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000521754:exon_58004224_58004423:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000221735:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000521137:exon_58004224_58004544:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000522346:exon_58004224_58006033:ZNF419 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 58083467 C/T 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 T:C C T 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000083817:ENST00000196489:exon_58082935_58085069:ZNF416 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 58213693 C/T 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 T:C C T 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000249233:ENST00000512439:exon_58213003_58214156:ZNF154 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 58724380 G/A 1 78 72 150 36.3020579991493 38.4904080007852 -2.18835000163591 A:G G A 10 0.534589000010906 0.743755086913693 ENSG00000171606:ENST00000326804:exon_58723527_58724927:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000424679:exon_58723527_58724509:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000345813:exon_58723527_58724509:ZNF274 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 58755366 G/A 1 9 6 15 4.18869899990185 3.20753400006544 0.981164999836409 A:G G A 10 0.534589000010906 0.796967668188066 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58755331_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58755328_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000333581:exon_58755328_58755422:ZNF544 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 58772579 C/G 1 17 10 27 7.9119869998146 5.34589000010906 2.56609699970554 C:G C G 10 0.534589000010906 0.342373022205262 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 59010593 A/G 1 2 7 9 0.930821999978188 3.74212300007634 -2.81130100009815 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.0917858367386368 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 59061357 C/T 1 472 446 918 219.673991994852 238.426694004864 -18.7527020100117 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.220940619823446 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59061316_59061402:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59061316_59061402:TRIM28 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 59073613 A/G 1 20 17 37 9.30821999978188 9.0880130001854 0.220206999596478 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 59074429 C/T 1 6 13 19 2.79246599993456 6.94965700014178 -4.15719100020721 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0664194041354686 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 19 59074653 T/C 1 8 12 20 3.72328799991275 6.41506800013087 -2.69178000021812 T:C T C 10 0.534589000010906 0.265898160963149 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 1 44 34 78 20.4780839995201 18.1760260003708 2.30205799914933 T:C T C 10 0.534589000010906 0.650549954036195 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 3392295 A/G 1 28 21 49 13.0315079996946 11.226369000229 1.8051389994656 A:G A G 10 0.534589000010906 0.66858074355079 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 3425729 C/T 1 18 22 40 8.37739799980369 11.7609580002399 -3.38356000043624 T:C C T 10 0.534589000010906 0.341934716221639 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3425652_3425741:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000457845:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000441983:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3425654_3425765:TTC15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 3428364 A/G 1 13 6 19 6.05034299985822 3.20753400006544 2.84280899979279 A:G A G 10 0.534589000010906 0.25120097657608 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3428296_3428434:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3428296_3428434:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3428296_3428434:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000457845:exon_3428296_3428434:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000441983:exon_3428296_3428434:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3428296_3428434:TTC15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 8871342 C/A 1 8 10 18 3.72328799991275 5.34589000010906 -1.62260200019631 A:C C A 10 0.534589000010906 0.485331297542652 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 9628284 A/C 1 71 80 151 33.0441809992257 42.7671200008725 -9.72293900164681 A:C A C 10 0.534589000010906 0.121231505827683 ENSG00000134330:ENST00000482918:exon_9628276_9628573:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000497473:exon_9628276_9628940:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000470914:exon_9628276_9629871:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000492223:exon_9628276_9628586:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000481367:exon_9628276_9628521:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000351760:exon_9628276_9628591:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000481688:exon_9628276_9628443:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000489468:exon_9628276_9628366:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000487850:exon_9628276_9628624:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000484826:exon_9628276_9628751:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000490621:exon_9628274_9628521:IAH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 10059770 G/T 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 T:G G T 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 10059844 C/T 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 T:C C T 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 10580967 G/A 1 394 373 767 183.371933995703 199.401697004068 -16.0297630083649 A:T:C:G G A 10 0.534589000010906 0.247004322392969 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10580094_10580994:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10580727_10580994:ODC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 10712278 C/T 1 42 23 65 19.5472619995419 12.2955470002508 7.25171499929111 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0815195196168655 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10710892_10712316:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10711781_10712316:NOL10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 10784491 A/G 1 18 10 28 8.37739799980369 5.34589000010906 3.03150799969463 A:G A G 10 0.534589000010906 0.263416888742408 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000431319:exon_10784446_10784498:NOL10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 10908893 A/G 1 8 2 10 3.72328799991275 1.06917800002181 2.65410999989094 A:G A G 10 0.534589000010906 0.117787000476102 ENSG00000143882:ENST00000272238:exon_10908845_10908936:ATP6V1C2;ENSG00000143882:ENST00000381661:exon_10908845_10908936:ATP6V1C2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 15372562 C/T 1 7 8 15 3.25787699992366 4.27671200008725 -1.01883500016359 T:C C T 10 0.534589000010906 0.615581524507087 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15372546_15372635:NBAS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 15378808 C/G 1 20 29 49 9.30821999978188 15.5030810003163 -6.1948610005344 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0858634698688924 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15378592_15378810:NBAS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 15747393 C/T 1 19 25 44 8.84280899979279 13.3647250002727 -4.52191600047987 T:C C T 10 0.534589000010906 0.177359294183873 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15747299_15747437:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15747299_15747437:DDX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 20234122 C/A 1 61 79 140 28.3900709993347 42.2325310008616 -13.8424600015268 A:C C A 10 0.534589000010906 0.0218966174608520 ENSG00000068697:ENST00000175091:exon_20234078_20234176:LAPTM4A;ENSG00000068697:ENST00000483117:exon_20234078_20234176:LAPTM4A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 20824559 C/T 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 T:C C T 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 24929851 A/T 0 8 0 8 3.72328799991275 0 3.72328799991275 A A 10 0.534589000010906 0.00887189752631728 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24929437_24930757:NCOA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 25064193 G/A 1 8 15 23 3.72328799991275 8.01883500016359 -4.29554700025084 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0934974114630953 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 27293150 G/T 1 11 5 16 5.11952099988003 2.67294500005453 2.4465759998255 T:G G T 10 0.534589000010906 0.316657798068879 ENSG00000084693:ENST00000487078:exon_27292960_27293490:AGBL5;ENSG00000084693:ENST00000360131:exon_27292960_27293488:AGBL5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 27355991 G/T 1 41 36 77 19.0818509995529 19.2452040003926 -0.163353000839766 T:G G T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000138073:ENST00000468045:exon_27355985_27357497:PREB;ENSG00000138073:ENST00000260643:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000444452:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000406567:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000474802:exon_27355985_27356589:PREB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 27424636 G/A 1 29 23 52 13.4969189996837 12.2955470002508 1.20137199943289 A:G G A 10 0.534589000010906 0.782217096467268 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 11 12 23 5.11952099988003 6.41506800013087 -1.29554700025084 A:G A G 10 0.534589000010906 0.677644254347807 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 27462076 C/T 1 33 22 55 15.3585629996401 11.7609580002399 3.59760499940017 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.347346963810807 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27461986_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462020_27462100:CAD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 25 29 54 11.6352749997273 15.5030810003163 -3.86780600058893 A:G A G 10 0.534589000010906 0.33992040050421 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 27887034 C/A 1 23 28 51 10.7044529997492 14.9684920003054 -4.26403900055621 A:C C A 10 0.534589000010906 0.262141452698135 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 58 53 111 26.9938379993675 28.333217000578 -1.33937900121057 T:C T C 10 0.534589000010906 0.849233790126203 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 32822957 G/A 1 14 13 27 6.51575399984732 6.94965700014178 -0.433903000294463 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32822818_32823035:BIRC6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 33759395 C/T 1 25 20 45 11.6352749997273 10.6917800002181 0.943494999509229 T:C C T 10 0.534589000010906 0.881474380728673 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33756792_33759467:RASGRP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 33764176 A/G 1 10 7 17 4.65410999989094 3.74212300007634 0.911986999814598 A:G A G 10 0.534589000010906 0.809164893348427 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33764164_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33764161_33764416:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33764161_33764390:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33764161_33765248:RASGRP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 36782886 G/A 1 12 4 16 5.58493199986913 2.13835600004362 3.4465759998255 A:G G A 10 0.534589000010906 0.130326098972588 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36782805_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000414288:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000475815:exon_36782826_36786398:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000441005:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000432869:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487919:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487282:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000484205:exon_36782432_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36782831_36782891:FEZ2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 39025555 G/A 1 14 15 29 6.51575399984732 8.01883500016359 -1.50308100031628 A:G G A 10 0.534589000010906 0.58291728377747 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39024871_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000423682:exon_39025515_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39024878_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39025110_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39025422_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000477981:exon_39025494_39025584:DHX57 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 39050141 A/C 1 18 17 35 8.37739799980369 9.0880130001854 -0.710615000381711 A:C A C 10 0.534589000010906 0.86625268328472 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39050135_39050411:DHX57 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 42515388 A/G 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 A:G A G 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 4 14 18 1.86164399995638 7.48424600015268 -5.62260200019631 A:C C A 10 0.534589000010906 0.00881066971311052 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 42990101 G/C 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 C:G G C 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 42990522 C/T 1 1 8 9 0.465410999989094 4.27671200008725 -3.81130100009815 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0151819886668037 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 8 2 10 3.72328799991275 1.06917800002181 2.65410999989094 A:T T A 10 0.534589000010906 0.117787000476102 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 44004010 T/C 1 4 9 13 1.86164399995638 4.81130100009815 -2.94965700014178 T:C T C 10 0.534589000010906 0.162146782239777 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000496980:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000406852:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000479242:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000398823:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000462426:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44003962_44004038:DYNC2LI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 12 15 27 5.58493199986913 8.01883500016359 -2.43390300029446 T:C T C 10 0.534589000010906 0.440986457681888 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 44201376 T/C 1 62 61 123 28.8554819993238 32.6099290006653 -3.75444700134144 T:C T C 10 0.534589000010906 0.527417127672378 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44201289_44201434:LRPPRC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 44209439 C/T 1 21 16 37 9.77363099977097 8.5534240001745 1.22020699959648 T:C C T 10 0.534589000010906 0.743525615581831 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44209377_44209573:LRPPRC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 44209477 C/T 1 7 11 18 3.25787699992366 5.88047900011997 -2.62260200019631 T:C C T 10 0.534589000010906 0.243363535954427 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44209377_44209573:LRPPRC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 45640374 C/A 1 7 9 16 3.25787699992366 4.81130100009815 -1.5534240001745 A:C C A 10 0.534589000010906 0.462907821628628 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 45645512 C/T 1 6 11 17 2.79246599993456 5.88047900011997 -3.0880130001854 T:C C T 10 0.534589000010906 0.150155070613150 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45645504_45645680:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45645504_45645680:SRBD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 46839477 T/C 1 2 9 11 0.930821999978188 4.81130100009815 -3.88047900011997 A:T:C T C 10 0.534589000010906 0.0299085362195834 ENSG00000151665:ENST00000281382:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000306465:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000412717:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000495933:exon_46839367_46839483:PIGF HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 46986416 A/G 1 7 6 13 3.25787699992366 3.20753400006544 0.0503429998582212 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000171150:ENST00000306503:exon_46985658_46990268:SOCS5;ENSG00000171150:ENST00000394861:exon_46985658_46989452:SOCS5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 12 13 25 5.58493199986913 6.94965700014178 -1.36472500027265 A:G G A 10 0.534589000010906 0.689551323254237 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 54127041 C/T 1 10 6 16 4.65410999989094 3.20753400006544 1.4465759998255 T:C C T 10 0.534589000010906 0.618055081094626 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54127018_54127154:PSME4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 54150237 A/G 0 8 0 8 3.72328799991275 0 3.72328799991275 A A 10 0.534589000010906 0.00887189752631728 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54150186_54150255:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54150186_54150255:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54150186_54150255:PSME4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 54858439 C/T 1 43 37 80 20.012672999531 19.7797930004035 0.232879999127519 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 54858511 C/T 1 53 27 80 24.666782999422 14.4339030002945 10.2328799991275 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0245957501126830 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 54882291 C/A 1 30 29 59 13.9623299996728 15.5030810003163 -1.54075100064346 A:C C A 10 0.534589000010906 0.697537250273704 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54882207_54882345:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54882207_54882345:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54882207_54882345:SPTBN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 20 13 33 9.30821999978188 6.94965700014178 2.3585629996401 A:G G A 10 0.534589000010906 0.486546433298847 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 55277226 C/T 1 110 66 176 51.1952099988003 35.2828740007198 15.9123359980805 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.0189100110637921 ENSG00000115310:ENST00000337526:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000317610:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000357732:exon_55276881_55277680:RTN4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 55481322 T/A 1 38 25 63 17.6856179995856 13.3647250002727 4.32089299931292 A:T T A 10 0.534589000010906 0.31295461121653 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55481177_55481337:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55481177_55481337:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55481177_55481337:MTIF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 55771161 A/G 1 29 28 57 13.4969189996837 14.9684920003054 -1.47157300062164 A:G A G 10 0.534589000010906 0.693264001794915 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 60773242 C/T 1 18 15 33 8.37739799980369 8.01883500016359 0.3585629996401 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000119866:ENST00000356842:exon_60773106_60773435:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000359629:exon_60773106_60773435:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000378117:exon_60773106_60773435:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000489516:exon_60773106_60773435:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000335712:exon_60773106_60773435:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000358510:exon_60773106_60773435:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000409351:exon_60773106_60773435:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000489183:exon_60773106_60773315:BCL11A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 61412677 C/G 1 31 34 65 14.4277409996619 18.1760260003708 -3.74828500070889 C:G C G 10 0.534589000010906 0.385012644966641 ENSG00000173209:ENST00000357022:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000489653:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000394457:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000493628:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000430934:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000389584:exon_61412643_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000471542:exon_61412637_61413632:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000487904:exon_61412637_61412881:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000484217:exon_61412637_61413632:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000409615:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000410073:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000491217:exon_61412661_61412753:AHSA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 61413723 A/G 1 3 8 11 1.39623299996728 4.27671200008725 -2.88047900011997 A:G A G 10 0.534589000010906 0.127884495538899 ENSG00000173209:ENST00000491217:exon_61413581_61413910:AHSA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 6 18 24 2.79246599993456 9.62260200019631 -6.83013600026175 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00671538610067119 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 61647901 A/G 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 A:G A G 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000453133:exon_61647881_61647968:USP34 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 63176139 A/C 1 8 4 12 3.72328799991275 2.13835600004362 1.58493199986913 A:C A C 10 0.534589000010906 0.401454124777931 ENSG00000115504:ENST00000405015:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000431489:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000263991:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000354487:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000405289:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000454124:exon_63176068_63176297:EHBP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 64124722 C/A 1 8 3 11 3.72328799991275 1.60376700003272 2.11952099988003 A:C C A 10 0.534589000010906 0.238841320527235 ENSG00000143952:ENST00000354504:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000272322:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000409558:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000416400:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000394400:exon_64124630_64124724:VPS54 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 65540905 C/G 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 C:G C G 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000198369:ENST00000356388:exon_65537985_65541303:SPRED2;ENSG00000198369:ENST00000443619:exon_65540127_65541303:SPRED2;ENSG00000198369:ENST00000452315:exon_65540639_65541303:SPRED2;ENSG00000198369:ENST00000421087:exon_65540837_65541303:SPRED2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 68364478 T/C 1 9 3 12 4.18869899990185 1.60376700003272 2.58493199986913 T:C T C 10 0.534589000010906 0.157534918401888 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68364431_68364565:PPP3R1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 68385097 A/G 1 21 37 58 9.77363099977097 19.7797930004035 -10.0061620006325 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0117196137116597 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68384928_68385254:PPP3R1;ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68384976_68385273:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68385049_68385273:PNO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 73746923 C/T 1 2 8 10 0.930821999978188 4.27671200008725 -3.34589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0527671529214564 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73746902_73747143:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73746902_73747143:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73746902_73747143:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73746902_73747143:ALMS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 73784477 T/A 0 11 0 11 5.11952099988003 0 5.11952099988003 T T 10 0.534589000010906 0.00124103136705642 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73784347_73784481:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73784347_73784481:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73784347_73784481:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73784347_73784481:ALMS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 84 81 165 39.0945239990839 43.3017090008834 -4.2071850017995 A:T A T 10 0.534589000010906 0.532901057998567 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 74763258 C/G 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 C:G C G 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000481835:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000420535:exon_74763123_74763277:LOXL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 75113789 C/G 1 17 11 28 7.9119869998146 5.88047900011997 2.03150799969463 C:G C G 10 0.534589000010906 0.457094536572337 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 75882399 G/A 1 130 61 191 60.5034299985822 32.6099290006653 27.8935009979169 A:C:G G A 10 0.534589000010906 4.47672112411098e-05 ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75882190_75884986:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75882190_75882428:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000453233:exon_75882190_75882428:MRPL19 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 75915035 C/T 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75914953_75915103:C2orf3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 75923413 T/C 1 10 8 18 4.65410999989094 4.27671200008725 0.377397999803692 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000442309:exon_75923378_75923441:C2orf3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 99193496 C/T 1 10 3 13 4.65410999989094 1.60376700003272 3.05034299985822 T:C C T 10 0.534589000010906 0.102317208684754 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409463:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000498026:exon_99193452_99193606:INPP4A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 14 20 34 6.51575399984732 10.6917800002181 -4.1760260003708 T:C T C 10 0.534589000010906 0.170548663863318 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 20 40 60 9.30821999978188 21.3835600004362 -12.0753400006544 T:C T C 10 0.534589000010906 0.00260419988265537 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 32 27 59 14.893151999651 14.4339030002945 0.459248999356545 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 99995517 C/T 1 135 168 303 62.8304849985277 89.8109520018322 -26.9804670033045 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00222074259998097 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995482_99995589:EIF5B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 43 56 99 20.012672999531 29.9369840006107 -9.9243110010797 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0550769107801813 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 18 27 45 8.37739799980369 14.4339030002945 -6.05650500049077 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0743204900397469 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 100020945 C/T 1 18 18 36 8.37739799980369 9.62260200019631 -1.24520400039262 T:C C T 10 0.534589000010906 0.739482103379621 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100020907_100021140:REV1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 T:C T C 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 17 12 29 7.9119869998146 6.41506800013087 1.49691899968372 A:G A G 10 0.534589000010906 0.710418220209128 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 100058870 C/T 1 3 8 11 1.39623299996728 4.27671200008725 -2.88047900011997 T:C C T 10 0.534589000010906 0.127884495538899 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100058779_100058931:REV1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 101635538 C/T 1 97 12 109 45.1448669989421 6.41506800013087 38.7297989988112 T:C C T 10 0.534589000010906 3.07120647221607e-15 ENSG00000071082:ENST00000409028:exon_101635460_101636078:RPL31 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 101925026 T/C 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 T:C T C 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101924591_101925163:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101924591_101925158:RNF149 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 105885961 T/C 1 19 14 33 8.84280899979279 7.48424600015268 1.3585629996401 T:C T C 10 0.534589000010906 0.728172693915283 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 105915128 G/A 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:G G A 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105914968_105915162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105914968_105915162:TGFBRAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 105977776 G/A 1 11 1 12 5.11952099988003 0.534589000010906 4.58493199986913 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00776339189204268 ENSG00000115641:ENST00000409177:exon_105974169_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000344213:exon_105977269_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393353:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000530340:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393352:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000322142:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000336660:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000358129:exon_105977287_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000409807:exon_105977314_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000408995:exon_105977318_105977891:FHL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 109087563 C/G 1 16 13 29 7.4465759998255 6.94965700014178 0.496918999683725 C:G C G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000409896:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109086107_109088572:GCC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 110373197 G/A 0 8 0 8 3.72328799991275 0 3.72328799991275 G G 10 0.534589000010906 0.00887189752631728 ENSG00000198142:ENST00000356454:exon_110371911_110376563:ANKRD57 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 113089267 T/C 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 T:C T C 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000188177:ENST00000409871:exon_113088582_113097634:ZC3H6;ENSG00000188177:ENST00000343936:exon_113088582_113097640:ZC3H6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 42 33 75 19.5472619995419 17.6414370003599 1.90582499918204 A:T:C T C 10 0.534589000010906 0.728777221175584 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 113940730 T/C 1 48 26 74 22.3397279994765 13.8993140002836 8.44041399919295 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0615389633209355 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 35 29 64 16.2893849996183 15.5030810003163 0.786303999302014 C:G G C 10 0.534589000010906 0.900603258527992 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 27 18 45 12.5660969997055 9.62260200019631 2.94349499950923 A:G A G 10 0.534589000010906 0.455498725254974 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 19 10 29 8.84280899979279 5.34589000010906 3.49691899968373 T:C T C 10 0.534589000010906 0.263763626258807 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 21 25 46 9.77363099977097 13.3647250002727 -3.59109400050168 T:C T C 10 0.534589000010906 0.303945006850555 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 122125373 G/T 1 6 9 15 2.79246599993456 4.81130100009815 -2.01883500016359 T:G G T 10 0.534589000010906 0.313814139216668 ENSG00000074054:ENST00000429969:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000442289:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000263710:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000455322:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000397587:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000376194:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000409078:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000452274:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000472776:exon_122125164_122125407:CLASP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 382 356 738 177.787001995834 190.313684003883 -12.5266820080487 A:C A C 10 0.534589000010906 0.356552414462991 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 127821207 G/A 1 51 39 90 23.7359609994438 20.8489710004253 2.88698999901846 A:G G A 10 0.534589000010906 0.597696438150501 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127821147_127821222:BIN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 15 34 49 6.98116499983641 18.1760260003708 -11.1948610005344 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00146762654985464 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 128396807 A/G 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000072163:ENST00000426981:exon_128395956_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000469300:exon_128396000_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000494613:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409286:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409754:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000476932:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000324938:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000484252:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000466410:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409455:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000410109:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409808:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000410011:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000324864:exon_128396005_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000355119:exon_128396005_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000342067:exon_128396005_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000410038:exon_128396045_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000413578:exon_128396558_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409254:exon_128396772_128397003:LIMS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 128934400 T/C 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:C T C 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128934388_128934472:UGGT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 130925088 C/T 1 8 15 23 3.72328799991275 8.01883500016359 -4.29554700025084 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0934974114630953 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000473720:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439029:exon_130925031_130925163:SMPD4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 143959722 A/G 1 33 37 70 15.3585629996401 19.7797930004035 -4.42123000076342 A:G A G 10 0.534589000010906 0.337907253112526 ENSG00000075884:ENST00000409869:exon_143959703_143959771:ARHGAP15;ENSG00000075884:ENST00000295095:exon_143959703_143959771:ARHGAP15;ENSG00000075884:ENST00000460776:exon_143959703_143959771:ARHGAP15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 150071216 T/A 1 89 63 152 41.4215789990294 33.6791070006871 7.74247199834228 A:T T A 10 0.534589000010906 0.222958134611262 ENSG00000150556:ENST00000409642:exon_150071060_150071776:LYPD6B;ENSG00000150556:ENST00000409876:exon_150071060_150071770:LYPD6B;ENSG00000150556:ENST00000409029:exon_150071060_150071776:LYPD6B;ENSG00000150556:ENST00000498249:exon_150071060_150071776:LYPD6B;ENSG00000150556:ENST00000280115:exon_150071060_150071772:LYPD6B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 150432976 C/T 1 96 89 185 44.679455998953 47.5784210009706 -2.89896500201762 T:C C T 10 0.534589000010906 0.712627023590694 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150432951_150432992:MMADHC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 152135415 C/T 1 49 44 93 22.8051389994656 23.5219160004799 -0.716777001014261 T:C C T 10 0.534589000010906 0.917395633956053 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152135342_152135504:NMI;ENSG00000123609:ENST00000491771:exon_152133769_152135504:NMI HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 26 32 58 12.1006859997164 17.106848000349 -5.00616200063255 T:C T C 10 0.534589000010906 0.19114129733589 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 152139416 G/A 1 69 66 135 32.1133589992475 35.2828740007198 -3.16951500147232 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.605350007304723 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000491771:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000414946:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000477072:exon_152139285_152139468:NMI HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 152311570 G/A 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:G G A 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000414861:exon_152311409_152311624:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152311409_152311673:RIF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 152314385 G/A 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 A:G G A 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152314275_152314477:RIF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 152320118 G/A 1 31 13 44 14.4277409996619 6.94965700014178 7.47808399952013 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0238770383159362 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 152322095 A/T 1 41 36 77 19.0818509995529 19.2452040003926 -0.163353000839766 A:T A T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 152331418 C/G 1 14 18 32 6.51575399984732 9.62260200019631 -3.10684800034899 C:G C G 10 0.534589000010906 0.29168355485208 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152331371_152332136:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152331371_152332419:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152331371_152333863:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152331371_152331733:RIF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 152698480 C/T 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000182389:ENST00000360283:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000339254:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000439467:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000397327:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000427385:exon_152698417_152698602:CACNB4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 160710922 T/C 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 T:C T C 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 160711045 G/C 1 11 11 22 5.11952099988003 5.88047900011997 -0.760958000239933 C:G G C 10 0.534589000010906 0.832013937520133 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 160743040 T/A 1 3 8 11 1.39623299996728 4.27671200008725 -2.88047900011997 A:T T A 10 0.534589000010906 0.127884495538899 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160742931_160743041:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160742931_160743041:RP11-357L2.1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 163137871 C/G 1 28 34 62 13.0315079996946 18.1760260003708 -5.14451800067617 C:G C G 10 0.534589000010906 0.204303403852532 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 163137983 T/C 1 18 24 42 8.37739799980369 12.8301360002617 -4.45273800045806 T:C T C 10 0.534589000010906 0.215476689036162 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 163208893 T/G 1 18 27 45 8.37739799980369 14.4339030002945 -6.05650500049077 T:G T G 10 0.534589000010906 0.0743204900397469 ENSG00000115271:ENST00000473240:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000446271:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000429691:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000437150:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000481161:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000453113:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000487445:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000479199:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000233612:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000421131:exon_163208848_163208917:GCA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 47 51 98 21.8743169994874 27.2640390005562 -5.38972200106879 A:G G A 10 0.534589000010906 0.311322785529854 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 174131392 T/C 1 7 13 20 3.25787699992366 6.94965700014178 -3.69178000021812 T:C T C 10 0.534589000010906 0.117777156244559 ENSG00000091436:ENST00000409176:exon_174130778_174131511:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000375213:exon_174130778_174132738:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000431503:exon_174130778_174131478:AC013461.1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 175260355 G/T 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 T:G G T 10 0.534589000010906 0.592941099997918 ENSG00000138433:ENST00000414336:exon_175260279_175260429:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000342016:exon_175260279_175260443:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000362053:exon_175260279_175260397:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000425101:exon_175260279_175260412:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000461454:exon_175260279_175260434:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000472169:exon_175260279_175260437:CIR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 175436940 G/A 1 119 136 255 55.3839089987022 72.7041040014832 -17.320195002781 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0326688149918700 ENSG00000115935:ENST00000392547:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392548:exon_175436873_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000272746:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000359761:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392546:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409891:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000418906:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 179403593 G/A 1 10 7 17 4.65410999989094 3.74212300007634 0.911986999814598 A:G G A 10 0.534589000010906 0.809164893348427 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 179404786 A/T 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 A:T A T 10 0.534589000010906 0.298446592097252 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 179406191 C/T 1 13 8 21 6.05034299985822 4.27671200008725 1.77363099977097 T:C C T 10 0.534589000010906 0.515314898478003 ENSG00000155657:ENST00000473181:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000460472:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000359218:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000356127:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342175:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342992:exon_179406009_179406311:TTN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 180810202 C/T 1 58 56 114 26.9938379993675 29.9369840006107 -2.94314600124329 T:C C T 10 0.534589000010906 0.638964287494579 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 180810358 C/T 1 46 39 85 21.4089059994983 20.8489710004253 0.559934999072986 T:C C T 10 0.534589000010906 0.913957596347025 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000404136:exon_180810348_180810442:CWC22 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 182399097 T/C 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 182780126 G/A 1 7 8 15 3.25787699992366 4.27671200008725 -1.01883500016359 A:G G A 10 0.534589000010906 0.615581524507087 ENSG00000138434:ENST00000431877:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000320370:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000409001:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000261006:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000428267:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000454579:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000440623:exon_182779943_182781732:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000416081:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000491720:exon_182779943_182783402:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000409136:exon_182779943_182781154:SSFA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 185802243 C/A 0 0 10 10 0 5.34589000010906 -5.34589000010906 A C A 10 0.534589000010906 0.000476833145364821 ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 191064753 C/T 1 3 8 11 1.39623299996728 4.27671200008725 -2.88047900011997 T:C C T 10 0.534589000010906 0.127884495538899 ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 197004439 A/G 1 22 13 35 10.2390419997601 6.94965700014178 3.28938499961829 A:G A G 10 0.534589000010906 0.310824265016004 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197004344_197004523:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197004344_197004523:STK17B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 197021276 T/C 1 12 7 19 5.58493199986913 3.74212300007634 1.84280899979278 T:C T C 10 0.534589000010906 0.492933071348704 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 197021372 T/A 1 33 26 59 15.3585629996401 13.8993140002836 1.45924899935654 A:T T A 10 0.534589000010906 0.794394519670799 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000420683:exon_197021296_197021375:STK17B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 116 116 232 53.9876759987349 62.0123240012651 -8.0246480025302 T:C T C 10 0.534589000010906 0.293189711254438 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 67 65 132 31.1825369992693 34.7482850007089 -3.56574800143959 A:G A G 10 0.534589000010906 0.542531794910782 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 44 39 83 20.4780839995201 20.8489710004253 -0.370887000905203 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 198327314 G/A 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000115520:ENST00000263960:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409398:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409010:exon_198327263_198327455:COQ10B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 222 227 449 103.321241997579 121.351703002476 -18.0304610048968 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0887624652738149 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 68 67 135 31.6479479992584 35.8174630007307 -4.16951500147232 A:G A G 10 0.534589000010906 0.49080013029537 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 198365788 C/T 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000115541:ENST00000463841:exon_198365606_198365962:HSPE1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 198571709 T/C 1 22 21 43 10.2390419997601 11.226369000229 -0.98732700046896 A:T:C T C 10 0.534589000010906 0.762668245420617 ENSG00000152428:ENST00000282276:exon_198570087_198573109:MARS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 201736068 A/G 1 98 84 182 45.6102779989312 44.9054760009161 0.7048019980151 A:G A G 10 0.534589000010906 0.940866636520008 ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 203139844 T/C 1 72 89 161 33.5095919992148 47.5784210009706 -14.0688290017559 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0270470639465345 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000426814:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000488403:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000492740:exon_203139836_203140406:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000472050:exon_203139836_203139912:NOP58 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 203155936 A/C 1 70 75 145 32.5787699992366 40.094175000818 -7.51540500158138 A:C A C 10 0.534589000010906 0.213018737991683 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203155848_203155993:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203155848_203155993:NOP58 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 203421199 G/A 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000204217:ENST00000374580:exon_203419975_203421254:BMPR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 207652764 G/A 1 13 6 19 6.05034299985822 3.20753400006544 2.84280899979279 A:G G A 10 0.534589000010906 0.25120097657608 ENSG00000118246:ENST00000236980:exon_207652661_207652879:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000402774:exon_207652661_207652879:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000403094:exon_207652661_207652879:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000487777:exon_207652661_207652879:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000471788:exon_207652661_207652879:FASTKD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 215645464 C/G 1 10 4 14 4.65410999989094 2.13835600004362 2.51575399984732 C:G C G 10 0.534589000010906 0.194114354160929 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215645284_215646233:BARD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 219508372 A/T 1 12 10 22 5.58493199986913 5.34589000010906 0.239041999760067 A:T:C A T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 219508988 T/C 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 219509618 C/A 1 7 9 16 3.25787699992366 4.81130100009815 -1.5534240001745 A:C C A 10 0.534589000010906 0.462907821628628 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 219525953 T/C 1 18 20 38 8.37739799980369 10.6917800002181 -2.31438200041443 T:C T C 10 0.534589000010906 0.516482161923489 ENSG00000074582:ENST00000430322:exon_219525662_219526030:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000456050:exon_219525662_219526030:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219525662_219526030:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000416304:exon_219525662_219526030:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219525662_219526030:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219525662_219526030:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000423377:exon_219525662_219526030:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219525662_219526030:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219525662_219526030:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219525662_219526030:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219525662_219526030:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000493376:exon_219525590_219526030:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000471576:exon_219525787_219526243:BCS1L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 219526634 G/A 1 19 29 48 8.84280899979279 15.5030810003163 -6.66027200052349 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0601300423990354 ENSG00000074582:ENST00000430322:exon_219526482_219526639:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000456050:exon_219526482_219526639:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000443791:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000471576:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219526389_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219526574_219526676:BCS1L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 219602499 G/C 1 5 9 14 2.32705499994547 4.81130100009815 -2.48424600015268 C:G G C 10 0.534589000010906 0.283670203474933 ENSG00000135912:ENST00000415717:exon_219602302_219602702:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219602302_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000437755:exon_219602302_219602922:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219602302_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000424644:exon_219602302_219602701:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219602297_219603886:TTLL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 219602819 G/A 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000135912:ENST00000457313:exon_219602631_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219602302_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000437755:exon_219602302_219602922:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219602302_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219602297_219603886:TTLL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 219610433 A/G 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 0.529760851175976 ENSG00000135912:ENST00000457313:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000417196:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000461181:exon_219610110_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000494428:exon_219610276_219610524:TTLL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 220037666 A/G 1 84 60 144 39.0945239990839 32.0753400006544 7.01918399842953 A:G A G 10 0.534589000010906 0.243750536905696 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 220037756 A/G 1 83 72 155 38.6291129990948 38.4904080007852 0.138704998309564 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 220040330 A/G 1 45 56 101 20.9434949995092 29.9369840006107 -8.99348900110151 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0894510515261645 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000451647:exon_220040313_220040394:C2orf24 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 220046975 C/A 1 33 35 68 15.3585629996401 18.7106150003817 -3.35205200074161 A:C C A 10 0.534589000010906 0.466227093736490 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 220047173 A/T 1 51 46 97 23.7359609994438 24.5910940005017 -0.855133001057883 A:T A T 10 0.534589000010906 0.919021068428582 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220047136_220047351:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 220047393 C/T 1 56 48 104 26.0630159993893 25.6602720005235 0.40274399886577 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 220079136 A/G 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 A:G A G 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000115657:ENST00000265316:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000497882:exon_220078843_220080607:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000295750:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000439002:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000427013:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000448398:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000494639:exon_220079111_220079405:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000496984:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000492953:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000417678:exon_220079111_220079220:ABCB6;ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220079111_220079220:ATG9A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 220115026 C/T 1 60 51 111 27.9246599993456 27.2640390005562 0.660620998789433 T:C C T 10 0.534589000010906 0.924446397525532 ENSG00000115661:ENST00000409638:exon_220113143_220115059:STK16;ENSG00000127824:ENST00000248437:exon_220114433_220116045:TUBA4A;ENSG00000127824:ENST00000392088:exon_220114433_220116045:TUBA4A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 220473355 G/A 1 3 11 14 1.39623299996728 5.88047900011997 -4.48424600015268 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0282018025011262 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000426736:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000475396:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000473899:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220473305_220473510:STK11IP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 224743373 C/T 1 8 12 20 3.72328799991275 6.41506800013087 -2.69178000021812 T:C C T 10 0.534589000010906 0.265898160963149 ENSG00000085449:ENST00000462702:exon_224743246_224743405:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224740064_224743447:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224740065_224743447:WDFY1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 228197238 G/A 1 72 45 117 33.5095919992148 24.0565050004908 9.45308699872399 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0948827671085567 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000530359:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000531278:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000452930:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000470090:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000534203:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436791:exon_228197135_228197304:MFF HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 228398422 A/G 1 30 22 52 13.9623299996728 11.7609580002399 2.20137199943289 A:G A G 10 0.534589000010906 0.58019459929345 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228398265_228398474:AGFG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 228416712 A/G 1 21 28 49 9.77363099977097 14.9684920003054 -5.1948610005344 A:G A G 10 0.534589000010906 0.152857790989944 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000458212:exon_228416675_228416833:AGFG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 230632268 G/A 1 156 128 284 72.6041159982987 68.427392001396 4.17672399690268 A:G G A 10 0.534589000010906 0.634556966056827 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230631930_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230632157_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230632157_230632466:TRIP12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 231077112 G/A 1 72 61 133 33.5095919992148 32.6099290006653 0.899662998549495 A:G G A 10 0.534589000010906 0.93079723212868 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077111_231077145:SP110 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 231256812 A/G 1 9 7 16 4.18869899990185 3.74212300007634 0.446575999825503 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231256802_231256944:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000496870:exon_231256802_231256944:SP140L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 44 28 72 20.4780839995201 14.9684920003054 5.50959199921476 A:G G A 10 0.534589000010906 0.237248623813750 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 149 30 179 69.346238998375 16.0376700003272 53.3085689980478 T:C C T 10 0.534589000010906 6.30816705844693e-17 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 1 138 1 139 64.226717998495 0.534589000010906 63.6921289984841 A:G G A 10 0.534589000010906 3.35878489968109e-36 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 232035429 G/A 1 63 73 136 29.3208929993129 39.0249970007961 -9.70410400148322 A:G G A 10 0.534589000010906 0.102514537824692 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000373635:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000491229:exon_232035116_232035435:PSMD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 232263127 G/A 1 11 8 19 5.11952099988003 4.27671200008725 0.842808999792785 A:G G A 10 0.534589000010906 0.819574245361162 ENSG00000156966:ENST00000287590:exon_232262442_232265875:B3GNT7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 234113057 G/A 1 42 36 78 19.5472619995419 19.2452040003926 0.302057999149326 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 234113301 C/T 1 51 38 89 23.7359609994438 20.3143820004144 3.42157899902936 T:C C T 10 0.534589000010906 0.524121338473171 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000491070:exon_234113288_234113760:INPP5D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 234371351 G/A 1 7 11 18 3.25787699992366 5.88047900011997 -2.62260200019631 A:G G A 10 0.534589000010906 0.243363535954427 ENSG00000077044:ENST00000264057:exon_234371289_234371381:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000409813:exon_234371289_234371381:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000430834:exon_234371289_234371381:DGKD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 35 46 81 16.2893849996183 24.5910940005017 -8.30170900088339 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0743701090013093 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 16 21 37 7.4465759998255 11.226369000229 -3.77979300040352 T:C T C 10 0.534589000010906 0.249367416803454 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 234761225 C/T 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234761211_234761266:HJURP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 238668802 A/G 1 49 43 92 22.8051389994656 22.987327000469 -0.182188001003354 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 108 105 213 50.2643879988222 56.1318450011451 -5.86745700232298 A:G A G 10 0.534589000010906 0.450058599845995 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 195 170 365 90.7551449978733 90.880130001854 -0.124985003980697 C:G C G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 239079542 A/G 1 7 9 16 3.25787699992366 4.81130100009815 -1.5534240001745 A:G A G 10 0.534589000010906 0.462907821628628 ENSG00000132323:ENST00000450411:exon_239079049_239079665:ILKAP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 239306268 A/C 1 8 2 10 3.72328799991275 1.06917800002181 2.65410999989094 A:C A C 10 0.534589000010906 0.117787000476102 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239306100_239306320:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239306100_239306320:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239306100_239306320:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000462122:exon_239306100_239306321:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000483951:exon_239306063_239306320:TRAF3IP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 239344412 C/T 1 9 6 15 4.18869899990185 3.20753400006544 0.981164999836409 T:C C T 10 0.534589000010906 0.796967668188066 ENSG00000065802:ENST00000463352:exon_239344352_239344654:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000264607:exon_239344352_239344654:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000469885:exon_239344352_239344522:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000438264:exon_239344352_239344654:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000491653:exon_239344352_239344654:ASB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 242046785 A/C 1 96 74 170 44.679455998953 39.559586000807 5.11986999814597 A:C A C 10 0.534589000010906 0.442992294126693 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000472072:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242046768_242046914:PASK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 242051777 G/A 1 43 27 70 20.012672999531 14.4339030002945 5.57876999923658 A:G G A 10 0.534589000010906 0.189551855756423 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000489256:exon_242051655_242052201:PASK;ENSG00000115687:ENST00000475666:exon_242051655_242051840:PASK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 242062162 C/T 1 19 20 39 8.84280899979279 10.6917800002181 -1.84897100042534 T:C C T 10 0.534589000010906 0.630952369844217 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242062147_242062314:PASK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 242066156 C/T 1 22 41 63 10.2390419997601 21.9181490004471 -11.6791070006871 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00349635829832067 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 26 37 63 12.1006859997164 19.7797930004035 -7.67910700068708 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0581676187521219 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 242066789 A/G 1 26 28 54 12.1006859997164 14.9684920003054 -2.86780600058893 A:G A G 10 0.534589000010906 0.495736225650852 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000459710:exon_242066401_242066866:PASK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 242573211 T/C 1 78 80 158 36.3020579991493 42.7671200008725 -6.46506200172315 T:C T C 10 0.534589000010906 0.338605466979803 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 39 43 82 18.1510289995747 22.987327000469 -4.8362980008943 A:G A G 10 0.534589000010906 0.319352056155836 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 9 7 16 4.18869899990185 3.74212300007634 0.446575999825503 A:T T A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 257733 A/G 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 A:G A G 10 0.534589000010906 0.592941099997918 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 259818 G/A 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 C:G G C 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 278806 C/T 1 28 45 73 13.0315079996946 24.0565050004908 -11.0249970007961 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0131917691349127 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 73 54 127 33.9750029992039 28.8678060005889 5.10719699861493 T:C T C 10 0.534589000010906 0.375122889271842 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 48 70 118 22.3397279994765 37.4212300007634 -15.0815020012869 T:G T G 10 0.534589000010906 0.00558826565462074 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 34 37 71 15.8239739996292 19.7797930004035 -3.95581900077433 A:G A G 10 0.534589000010906 0.405162358883269 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 39 25 64 18.1510289995747 13.3647250002727 4.78630399930201 T:C C T 10 0.534589000010906 0.260092213244229 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 2635212 A/G 1 104 127 231 48.4027439988658 67.8928030013851 -19.4900590025193 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0120381070692912 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000496775:exon_2634880_2635221:NOP56 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 204 194 398 94.9438439977752 103.710266002116 -8.7664220043406 A:T:C T C 10 0.534589000010906 0.39313327015386 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 2638492 G/A 1 47 34 81 21.8743169994874 18.1760260003708 3.69829099911661 A:G G A 10 0.534589000010906 0.437012958084858 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 691 637 1328 321.599000992464 340.533193006947 -18.9341920144832 A:T:C:G T C 10 0.534589000010906 0.308792779158263 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 2818801 T/C 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 T:C T C 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 2945759 C/T 1 18 39 57 8.37739799980369 20.8489710004253 -12.4715730006216 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00123459533469097 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000455631:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000431048:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000418580:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000430705:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2945507_2945848:PTPRA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 2996497 C/T 1 13 10 23 6.05034299985822 5.34589000010906 0.704452999749162 T:C C T 10 0.534589000010906 0.836527371779212 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2996495_2996531:PTPRA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 3193978 G/A 1 19 28 47 8.84280899979279 14.9684920003054 -6.12568300051258 A:C:G G A 10 0.534589000010906 0.0800255663316875 ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193965_3194072:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3193902_3194029:ITPA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 3204084 G/A 1 90 77 167 41.8869899990185 41.1633530008398 0.723636998178691 A:G G A 10 0.534589000010906 0.938273310179679 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3204012_3204504:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000399838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000461029:exon_3204012_3204095:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000472295:exon_3204012_3204516:ITPA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 4680251 A/G 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000171867:ENST00000420824:exon_4679862_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000455665:exon_4679862_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000379440:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000531860:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000430350:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000525336:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000424424:exon_4679862_4680613:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000444805:exon_4680216_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000379436:exon_4679857_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000457586:exon_4679857_4680517:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000431433:exon_4679857_4680516:PRNP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 5753579 C/T 1 14 21 35 6.51575399984732 11.226369000229 -4.71061500038171 T:C C T 10 0.534589000010906 0.127799241921893 ENSG00000171984:ENST00000378979:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5753508_5753689:C20orf196 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 17 11 28 7.9119869998146 5.88047900011997 2.03150799969463 T:C C T 10 0.534589000010906 0.457094536572337 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 10620275 G/A 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 0.529760851175976 ENSG00000101384:ENST00000254958:exon_10618332_10620603:JAG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 11903654 G/A 1 13 6 19 6.05034299985822 3.20753400006544 2.84280899979279 A:G G A 10 0.534589000010906 0.25120097657608 ENSG00000132640:ENST00000449734:exon_11903282_11907257:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000254977:exon_11903282_11907257:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000407832:exon_11903282_11907243:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000399006:exon_11903282_11907257:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000405977:exon_11903282_11907257:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000449299:exon_11903282_11903658:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000378226:exon_11903282_11907243:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000453685:exon_11903282_11905859:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000471120:exon_11903282_11903683:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000473180:exon_11903282_11903778:BTBD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 13695498 G/A 1 59 61 120 27.4592489993565 32.6099290006653 -5.15068000130873 A:G G A 10 0.534589000010906 0.361052497855637 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 13695607 T/G 1 36 35 71 16.7547959996074 18.7106150003817 -1.95581900077433 T:G T G 10 0.534589000010906 0.721449347156186 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 13779113 T/C 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 T:C:G T C 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000101247:ENST00000378106:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000378081:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000463598:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000485738:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000477732:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000475968:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000481249:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000476536:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000464269:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000479716:exon_13779107_13779146:C20orf7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 18142564 A/G 1 5 9 14 2.32705499994547 4.81130100009815 -2.48424600015268 A:G A G 10 0.534589000010906 0.283670203474933 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18142464_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18142467_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18142464_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18142464_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18142467_18142883:CSRP2BP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 18462421 A/G 1 6 9 15 2.79246599993456 4.81130100009815 -2.01883500016359 A:G A G 10 0.534589000010906 0.313814139216668 ENSG00000132664:ENST00000377603:exon_18462263_18462454:POLR3F;ENSG00000132664:ENST00000462997:exon_18462263_18462454:POLR3F HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 18523002 C/G 1 28 24 52 13.0315079996946 12.8301360002617 0.201371999432885 C:G C G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18522940_18523046:SEC23B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 20006368 T/C 1 28 32 60 13.0315079996946 17.106848000349 -4.07534000065436 T:C T C 10 0.534589000010906 0.303097682007859 ENSG00000173418:ENST00000334982:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000484480:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000310450:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000463154:exon_20006313_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000480550:exon_20006313_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000398602:exon_20006321_20006411:NAA20 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 9 4 13 4.18869899990185 2.13835600004362 2.05034299985822 T:C T C 10 0.534589000010906 0.281774765265439 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 20585894 C/T 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 T:C C T 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000188559:ENST00000430436:exon_20585819_20586056:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000334388:exon_20585819_20586056:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000202677:exon_20585819_20586056:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000418184:exon_20585819_20586056:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000495793:exon_20585819_20586056:RALGAPA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 21142813 T/C 1 12 8 20 5.58493199986913 4.27671200008725 1.30821999978188 T:C T C 10 0.534589000010906 0.656685513222068 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 23345844 A/C 1 7 6 13 3.25787699992366 3.20753400006544 0.0503429998582212 A:C A C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 31023500 C/T 1 34 16 50 15.8239739996292 8.5534240001745 7.2705499994547 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0465044231487212 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 31024034 G/A 1 34 27 61 15.8239739996292 14.4339030002945 1.39007099933473 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.797807128783475 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 31024207 C/T 1 40 33 73 18.6164399995638 17.6414370003599 0.975002999203859 T:C C T 10 0.534589000010906 0.906718471339053 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 31024274 T/C 1 39 49 88 18.1510289995747 26.1948610005344 -8.04383200095973 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0882389547789736 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 31025163 A/G 1 19 13 32 8.84280899979279 6.94965700014178 1.89315199965101 A:G A G 10 0.534589000010906 0.596151250735722 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 31427602 G/A 1 64 61 125 29.786303999302 32.6099290006653 -2.82362500136325 A:G G A 10 0.534589000010906 0.654223433454563 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 74 81 155 34.440413999193 43.3017090008834 -8.86129500169044 T:C C T 10 0.534589000010906 0.17095862830537 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 31981849 T/C 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 T:C T C 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 32264533 C/A 1 46 34 80 21.4089059994983 18.1760260003708 3.23287999912752 A:C C A 10 0.534589000010906 0.502492710968631 ENSG00000101412:ENST00000343380:exon_32263489_32264785:E2F1;ENSG00000101412:ENST00000402461:exon_32263489_32264785:E2F1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 15 7 22 6.98116499983641 3.74212300007634 3.23904199976007 T:C C T 10 0.534589000010906 0.201853762836156 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 34090519 G/A 1 16 14 30 7.4465759998255 7.48424600015268 -0.0376700003271813 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425525:exon_34090218_34090632:CEP250 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 35865054 C/T 1 127 91 218 59.1071969986149 48.6475990009925 10.4595979976225 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.174388494683174 ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000437329:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000470352:exon_35864983_35865112:RPN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 37536456 C/T 1 13 9 22 6.05034299985822 4.81130100009815 1.23904199976007 T:C C T 10 0.534589000010906 0.672470686731093 ENSG00000101445:ENST00000299824:exon_37536449_37536578:PPP1R16B;ENSG00000101445:ENST00000373331:exon_37536449_37536578:PPP1R16B;ENSG00000101445:ENST00000438192:exon_37536449_37536578:PPP1R16B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 37555116 G/C 1 4 11 15 1.86164399995638 5.88047900011997 -4.01883500016359 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0413471963302241 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37554955_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37555069_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37555086_37555451:FAM83D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 37667182 C/T 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 T:C C T 10 0.534589000010906 0.592941099997918 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37667142_37668363:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000449559:exon_37667142_37667289:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000493450:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000482619:exon_37667142_37667279:DHX35 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 42088708 G/A 1 110 94 204 51.1952099988003 50.2513660010252 0.943843997775168 A:C:G G A 10 0.534589000010906 0.944075639402894 ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42088673_42088881:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42088673_42088881:SRSF6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 42225114 G/A 1 16 4 20 7.4465759998255 2.13835600004362 5.30821999978188 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0228601800517913 ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000436476:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000486243:exon_42225075_42225162:IFT52 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 42826379 C/T 1 65 52 117 30.2517149992911 27.7986280005671 2.45308699872399 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.71106830611153 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 44047974 G/A 1 17 14 31 7.9119869998146 7.48424600015268 0.427740999661912 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44047935_44048035:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000455050:exon_44047935_44048035:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44047935_44048035:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44047874_44048035:PIGT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 27 13 40 12.5660969997055 6.94965700014178 5.61643999956376 A:G G A 10 0.534589000010906 0.08221398516996 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 44596207 C/G 1 2 10 12 0.930821999978188 5.34589000010906 -4.41506800013087 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0167573406364211 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44595506_44596273:ZNF335 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 44596545 G/A 1 2 8 10 0.930821999978188 4.27671200008725 -3.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0527671529214564 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44596373_44597497:ZNF335 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 44642406 G/C 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000100985:ENST00000372330:exon_44642296_44642435:MMP9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 25 29 54 11.6352749997273 15.5030810003163 -3.86780600058893 T:G T G 10 0.534589000010906 0.33992040050421 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 44757524 C/G 1 196 173 369 91.2205559978624 92.4838970018867 -1.26334100402433 C:G C G 10 0.534589000010906 0.916915611932569 ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44757521_44758502:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44757521_44758502:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44756969_44758153:CD40;ENSG00000101017:ENST00000466205:exon_44757521_44757765:CD40;ENSG00000101017:ENST00000489304:exon_44757521_44758502:CD40;ENSG00000101017:ENST00000477696:exon_44757521_44757643:CD40 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 45315346 C/T 1 30 27 57 13.9623299996728 14.4339030002945 -0.471573000621643 A:T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.895413387239517 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 45318042 G/A 1 20 19 39 9.30821999978188 10.1571910002072 -0.848971000425335 A:G G A 10 0.534589000010906 0.872831334711128 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 45318069 C/G 1 23 21 44 10.7044529997492 11.226369000229 -0.521916000479866 C:G C G 10 0.534589000010906 0.881154601714937 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 47253043 G/A 1 33 21 54 15.3585629996401 11.226369000229 4.13219399941107 A:G G A 10 0.534589000010906 0.277705180163414 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47253001_47253221:PREX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 47307618 G/A 1 16 18 34 7.4465759998255 9.62260200019631 -2.17602600037081 A:G G A 10 0.534589000010906 0.494443161884986 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47307485_47307634:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47307485_47307634:PREX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 23 18 41 10.7044529997492 9.62260200019631 1.08185099955285 T:C C T 10 0.534589000010906 0.756980786078456 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 47865372 G/A 1 16 15 31 7.4465759998255 8.01883500016359 -0.572259000338088 A:G G A 10 0.534589000010906 0.858876862828474 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 12 8 20 5.58493199986913 4.27671200008725 1.30821999978188 A:G G A 10 0.534589000010906 0.656685513222068 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 6 9 15 2.79246599993456 4.81130100009815 -2.01883500016359 C:G C G 10 0.534589000010906 0.313814139216668 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 47886684 G/A 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 A:G G A 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47886479_47887760:ZNFX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 23 16 39 10.7044529997492 8.5534240001745 2.15102899957466 A:G G A 10 0.534589000010906 0.524420620718488 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 48522392 G/A 1 21 32 53 9.77363099977097 17.106848000349 -7.33321700057802 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0531310853854201 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 49196284 C/T 1 35 34 69 16.2893849996183 18.1760260003708 -1.88664100075252 T:C C T 10 0.534589000010906 0.71766772783466 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49196240_49196463:PTPN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 49493171 G/A 1 63 57 120 29.3208929993129 30.4715730006216 -1.15068000130872 A:G G A 10 0.534589000010906 0.855120687147868 ENSG00000124243:ENST00000358791:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000262591:exon_49493023_49493713:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000371608:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000463943:exon_49493023_49493714:BCAS4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 49493195 A/G 1 56 63 119 26.0630159993893 33.6791070006871 -7.61609100129782 A:G A G 10 0.534589000010906 0.168811655416968 ENSG00000124243:ENST00000358791:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000262591:exon_49493023_49493713:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000371608:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000463943:exon_49493023_49493714:BCAS4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 49575026 C/A 1 26 23 49 12.1006859997164 12.2955470002508 -0.194861000534395 A:C C A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000000419:ENST00000371588:exon_49574900_49575087:DPM1;ENSG00000000419:ENST00000466152:exon_49574900_49575087:DPM1;ENSG00000000419:ENST00000371582:exon_49574900_49575092:DPM1;ENSG00000000419:ENST00000449701:exon_49574900_49575087:DPM1;ENSG00000000419:ENST00000371583:exon_49574900_49575087:DPM1;ENSG00000000419:ENST00000371584:exon_49574900_49575058:DPM1;ENSG00000000419:ENST00000413082:exon_49574900_49575069:DPM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 50769183 G/A 1 17 9 26 7.9119869998146 4.81130100009815 3.10068599971644 A:G G A 10 0.534589000010906 0.243968304911115 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 50769379 C/T 1 18 15 33 8.37739799980369 8.01883500016359 0.3585629996401 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 50769549 A/G 1 15 13 28 6.98116499983641 6.94965700014178 0.0315079996946315 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 52192408 C/T 1 24 21 45 11.1698639997383 11.226369000229 -0.0565050004907732 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000437222:exon_52192266_52192566:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 52193368 C/T 1 17 21 38 7.9119869998146 11.226369000229 -3.31438200041443 T:C C T 10 0.534589000010906 0.329957108100267 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 52193660 G/A 1 13 12 25 6.05034299985822 6.41506800013087 -0.364725000272651 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 52193698 G/A 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 A:G G A 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 52198340 T/A 1 15 15 30 6.98116499983641 8.01883500016359 -1.03767000032718 A:T:G T A 10 0.534589000010906 0.718295138743325 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52198000_52199707:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52198000_52199636:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52198000_52199707:ZNF217 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 52570229 T/C 0 0 11 11 0 5.88047900011997 -5.88047900011997 C T C 10 0.534589000010906 0.000221923391012186 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52569971_52570234:BCAS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 338 350 688 157.308917996314 187.106150003817 -29.7972320075033 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.0240992399403171 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 174 170 344 80.9815139981023 90.880130001854 -9.89861600375168 A:G A G 10 0.534589000010906 0.304490003508039 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 57572839 G/T 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 T:G G T 10 0.534589000010906 0.633804450498163 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 57610059 C/A 1 90 102 192 41.8869899990185 54.5280780011124 -12.641088002094 A:C C A 10 0.534589000010906 0.0706259547305187 ENSG00000101166:ENST00000355937:exon_57608200_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000371033:exon_57609689_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000463057:exon_57609964_57610181:SLMO2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 60572663 C/A 1 7 8 15 3.25787699992366 4.27671200008725 -1.01883500016359 A:C C A 10 0.534589000010906 0.615581524507087 ENSG00000130699:ENST00000474089:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60572606_60572725:TAF4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 60768497 C/T 1 24 17 41 11.1698639997383 9.0880130001854 2.08185099955285 T:C C T 10 0.534589000010906 0.535691814402222 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466933:exon_60768472_60769109:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60768472_60768680:GTPBP5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 60966318 G/T 1 10 10 20 4.65410999989094 5.34589000010906 -0.69178000021812 T:G G T 10 0.534589000010906 0.824629775002564 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60966305_60966509:CABLES2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 61287939 C/T 1 8 10 18 3.72328799991275 5.34589000010906 -1.62260200019631 T:C C T 10 0.534589000010906 0.485331297542652 ENSG00000101187:ENST00000370512:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000217159:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000497209:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000370507:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000342674:exon_61287807_61288563:SLCO4A1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 61440971 G/A 1 12 16 28 5.58493199986913 8.5534240001745 -2.96849200030537 A:G G A 10 0.534589000010906 0.343734499573097 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000450048:exon_61440937_61441015:OGFR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 61443870 C/G 1 81 77 158 37.6982909991166 41.1633530008398 -3.46506200172315 C:G C G 10 0.534589000010906 0.632444731825009 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 61472073 C/A 1 33 26 59 15.3585629996401 13.8993140002836 1.45924899935654 A:C C A 10 0.534589000010906 0.794394519670799 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61471894_61472496:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61471894_61472511:COL9A3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 61490752 T/C 1 10 14 24 4.65410999989094 7.48424600015268 -2.83013600026174 T:C T C 10 0.534589000010906 0.307110312407199 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61490716_61490878:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61490716_61490878:TCFL5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 61512080 A/C 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 A:C A C 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61509090_61513766:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61509095_61513766:DIDO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 61512358 G/A 1 3 9 12 1.39623299996728 4.81130100009815 -3.41506800013087 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0784465209153547 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61509090_61513766:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61509095_61513766:DIDO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 61513649 G/T 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:G G T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61509090_61513766:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61509095_61513766:DIDO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 61528074 T/C 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 T:C T C 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61527883_61528348:DIDO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 61588159 A/G 1 17 11 28 7.9119869998146 5.88047900011997 2.03150799969463 A:G A G 10 0.534589000010906 0.457094536572337 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000411611:exon_61588117_61588314:SLC17A9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 61595636 C/T 1 13 8 21 6.05034299985822 4.27671200008725 1.77363099977097 T:C C T 10 0.534589000010906 0.515314898478003 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61595580_61595667:SLC17A9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 61907468 A/G 1 6 8 14 2.79246599993456 4.27671200008725 -1.48424600015268 A:G A G 10 0.534589000010906 0.437971150157616 ENSG00000101199:ENST00000523114:exon_61907443_61907552:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000522959:exon_61907443_61907552:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000370283:exon_61907443_61907552:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000353546:exon_61907443_61907552:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000370275:exon_61907443_61907552:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000520485:exon_61907443_61907552:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000524192:exon_61907443_61907552:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519531:exon_61907443_61907552:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000522403:exon_61907443_61907552:ARFGAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 61910270 G/A 1 16 9 25 7.4465759998255 4.81130100009815 2.63527499972735 A:G G A 10 0.534589000010906 0.322000273897906 ENSG00000101199:ENST00000370283:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000353546:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000370275:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519604:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000520485:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519531:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000518601:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000522403:exon_61910251_61910347:ARFGAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62152819 G/A 1 3 10 13 1.39623299996728 5.34589000010906 -3.94965700014178 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0473534851625257 ENSG00000125534:ENST00000464438:exon_62152637_62152879:PPDPF HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62191321 A/G 1 15 18 33 6.98116499983641 9.62260200019631 -2.6414370003599 A:G A G 10 0.534589000010906 0.386417985090157 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62191937 G/A 1 10 16 26 4.65410999989094 8.5534240001745 -3.89931400028356 A:G G A 10 0.534589000010906 0.167820466191829 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62194128 G/A 1 8 11 19 3.72328799991275 5.88047900011997 -2.15719100020721 A:G G A 10 0.534589000010906 0.363088485682007 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62195087 A/G 1 14 10 24 6.51575399984732 5.34589000010906 1.16986399973826 A:G A G 10 0.534589000010906 0.686499461842995 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62197370 G/A 1 7 8 15 3.25787699992366 4.27671200008725 -1.01883500016359 A:G G A 10 0.534589000010906 0.615581524507087 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62324289 C/T 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 T:C C T 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62332025 C/T 1 44 56 100 20.4780839995201 29.9369840006107 -9.4589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0706511568112125 ENSG00000101246:ENST00000359715:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000440854:exon_62329996_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000485858:exon_62331954_62332129:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000217224:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000324228:exon_62331954_62332054:ARFRP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62372706 G/A 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62372605_62372832:SLC2A4RG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62372814 G/A 1 27 22 49 12.5660969997055 11.7609580002399 0.805138999465605 A:G G A 10 0.534589000010906 0.886563011000463 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62372723_62372832:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000474248:exon_62372723_62372832:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62372723_62372832:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62372605_62372832:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62372757_62372832:SLC2A4RG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62374096 C/T 1 88 68 156 40.9561679990403 36.3520520007416 4.60411599829866 T:C C T 10 0.534589000010906 0.471243641629774 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62374052_62374143:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62374052_62374143:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62374052_62374143:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000496425:exon_62373881_62374143:SLC2A4RG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62378349 C/T 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 T:C C T 10 0.534589000010906 0.189086525758904 ENSG00000130584:ENST00000245663:exon_62375019_62378654:ZBTB46;ENSG00000130584:ENST00000302995:exon_62378225_62378654:ZBTB46;ENSG00000130584:ENST00000395104:exon_62375878_62378654:ZBTB46 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62378364 C/T 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 T:C C T 10 0.534589000010906 0.189086525758904 ENSG00000130584:ENST00000245663:exon_62375019_62378654:ZBTB46;ENSG00000130584:ENST00000302995:exon_62378225_62378654:ZBTB46;ENSG00000130584:ENST00000395104:exon_62375878_62378654:ZBTB46 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62577613 T/C 1 4 11 15 1.86164399995638 5.88047900011997 -4.01883500016359 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0413471963302241 ENSG00000198276:ENST00000354216:exon_62577514_62577620:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000369892:exon_62577514_62577620:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000369908:exon_62577514_62577620:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000358711:exon_62577514_62577620:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000492660:exon_62577158_62577620:UCKL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62595547 C/T 1 5 8 13 2.32705499994547 4.27671200008725 -1.94965700014178 T:C C T 10 0.534589000010906 0.405475359831307 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62595424_62595570:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62595424_62595570:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62595424_62595570:ZNF512B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62595990 T/C 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62595843_62596069:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62595843_62596069:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62595843_62596069:ZNF512B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62607160 C/T 1 7 19 26 3.25787699992366 10.1571910002072 -6.89931400028356 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00929345953017304 ENSG00000130590:ENST00000369886:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000498830:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000478694:exon_62607045_62607185:SAMD10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 20 62664365 C/T 1 68 65 133 31.6479479992584 34.7482850007089 -3.1003370014505 T:C C T 10 0.534589000010906 0.602911020752137 ENSG00000101161:ENST00000266079:exon_62664194_62664453:PRPF6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 17203785 A/T 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 A:T A T 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000155313:ENST00000285681:exon_17203720_17203948:USP25;ENSG00000155313:ENST00000285679:exon_17203720_17203948:USP25;ENSG00000155313:ENST00000400183:exon_17203720_17203948:USP25;ENSG00000155313:ENST00000453553:exon_17203720_17203948:USP25 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 26976222 C/T 1 61 49 110 28.3900709993347 26.1948610005344 2.19520999880034 T:C C T 10 0.534589000010906 0.703007439005075 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 26976237 C/T 1 69 59 128 32.1133589992475 31.5407510006435 0.572607998604024 T:C C T 10 0.534589000010906 0.929678650466315 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 34614250 T/C 1 18 12 30 8.37739799980369 6.41506800013087 1.96232999967282 T:C T C 10 0.534589000010906 0.583860625026523 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 18 7 25 8.37739799980369 3.74212300007634 4.63527499972735 A:T:G T G 10 0.534589000010906 0.0720418033802358 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 34640788 A/G 1 17 16 33 7.9119869998146 8.5534240001745 -0.641437000359899 A:G A G 10 0.534589000010906 0.862673282858281 ENSG00000249624:ENST00000433395:exon_34640699_34640822:AP000295.9;ENSG00000243646:ENST00000290200:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000422891:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000493295:exon_34640233_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000498371:exon_34640587_34640822:IL10RB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 34925304 A/G 1 54 55 109 25.1321939994111 29.4023950005998 -4.27020100118876 A:G A G 10 0.534589000010906 0.442908673542125 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 34926043 G/A 1 78 131 209 36.3020579991493 70.0311590014287 -33.7291010022794 A:G G A 10 0.534589000010906 2.95101642061735e-06 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 149 155 304 69.346238998375 82.8612950016904 -13.5150560033154 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.121011813156436 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 10 29 39 4.65410999989094 15.5030810003163 -10.8489710004253 T:C T C 10 0.534589000010906 0.000578024428188303 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 34950566 T/C 1 77 76 153 35.8366469991602 40.6287640008289 -4.79211700166862 T:C T C 10 0.534589000010906 0.466083723884307 ENSG00000159147:ENST00000453626:exon_34949842_34950750:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000457359:exon_34949867_34950750:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000303071:exon_34950211_34950750:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000413267:exon_34950213_34950750:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000417871:exon_34950223_34950750:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000460557:exon_34950230_34950750:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000444517:exon_34950248_34950750:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000442660:exon_34950248_34950750:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000437395:exon_34950507_34950750:DONSON;ENSG00000159147:ENST00000432378:exon_34950548_34950750:DONSON HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 35890409 C/T 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 T:C C T 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000159200:ENST00000487990:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000313806:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000489903:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381132:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000399272:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000481448:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000482533:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381135:exon_35888788_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000443408:exon_35888788_35890554:RCAN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 37507769 C/T 1 7 1 8 3.25787699992366 0.534589000010906 2.72328799991275 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0755591978202379 ENSG00000159231:ENST00000290354:exon_37507210_37507779:CBR3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 38437951 T/G 1 22 19 41 10.2390419997601 10.1571910002072 0.0818509995528522 T:G T G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38435146_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38436448_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38437674_38438012:PIGP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 38525356 T/C 1 19 7 26 8.84280899979279 3.74212300007634 5.10068599971644 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0498866353028037 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000414818:exon_38525251_38525577:TTC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 38538021 A/G 1 28 43 71 13.0315079996946 22.987327000469 -9.95581900077433 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0231320654558765 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38537852_38538053:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38537852_38538067:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38537852_38538067:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000487711:exon_38537852_38538067:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000472398:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000469939:exon_38537852_38538067:TTC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 22 40 62 10.2390419997601 21.3835600004362 -11.1445180006762 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00492898977780601 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 22 33 55 10.2390419997601 17.6414370003599 -7.40239500059983 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0575463690503406 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 40670460 G/C 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000185658:ENST00000333229:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000342449:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380804:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380800:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380783:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000341322:exon_40668363_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000470108:exon_40670016_40670508:BRWD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 182 176 358 84.7048019980151 94.0876640019195 -9.38286200390436 A:G A G 10 0.534589000010906 0.340310545055837 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 45168884 G/A 1 18 23 41 8.37739799980369 12.2955470002508 -3.91814900044715 A:G G A 10 0.534589000010906 0.273044441286071 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398085:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45168876_45168961:PDXK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 45173472 G/A 1 80 1 81 37.2328799991275 0.534589000010906 36.6982909991166 A:G G A 10 0.534589000010906 1.04372831295944e-20 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45173464_45173535:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45173464_45173475:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45173464_45173535:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000461123:exon_45173464_45173600:PDXK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 45379560 G/A 1 15 20 35 6.98116499983641 10.6917800002181 -3.71061500038171 A:G G A 10 0.534589000010906 0.237118321869173 ENSG00000160216:ENST00000291572:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000438598:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000448287:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398061:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000327505:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000445582:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398063:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398058:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000457068:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000448845:exon_45379515_45379677:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000422850:exon_45379515_45379740:AGPAT3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 17 15 32 7.9119869998146 8.01883500016359 -0.106848000348994 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 45506819 T/C 1 7 6 13 3.25787699992366 3.20753400006544 0.0503429998582212 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45506683_45506841:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45506683_45506841:TRAPPC10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 45528919 G/A 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 A:G G A 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45528865_45528977:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000456705:exon_45528865_45528977:PWP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 14 7 21 6.51575399984732 3.74212300007634 2.77363099977097 A:T:C T C 10 0.534589000010906 0.276590217785206 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 24 20 44 11.1698639997383 10.6917800002181 0.478083999520134 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 45544594 T/C 1 29 20 49 13.4969189996837 10.6917800002181 2.8051389994656 T:C T C 10 0.534589000010906 0.475264900760456 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45544461_45544608:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45544461_45546000:PWP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 39 36 75 18.1510289995747 19.2452040003926 -1.09417500081796 T:C T C 10 0.534589000010906 0.817777502570584 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 45750168 A/G 1 51 43 94 23.7359609994438 22.987327000469 0.748633998974835 A:G A G 10 0.534589000010906 0.917867541436955 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 45750248 G/A 1 7 10 17 3.25787699992366 5.34589000010906 -2.0880130001854 A:G G A 10 0.534589000010906 0.339484157804598 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 45833916 C/T 0 0 12 12 0 6.41506800013087 -6.41506800013087 T C T 10 0.534589000010906 0.000103285587331952 ENSG00000142185:ENST00000300482:exon_45833774_45833957:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000397928:exon_45833774_45833957:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000397932:exon_45833774_45833957:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000300481:exon_45833774_45833957:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000498430:exon_45833774_45833957:TRPM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 46311813 A/G 1 18 10 28 8.37739799980369 5.34589000010906 3.03150799969463 A:G A G 10 0.534589000010906 0.263416888742408 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46311724_46311911:ITGB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 47614443 A/G 1 14 11 25 6.51575399984732 5.88047900011997 0.635274999727349 A:G A G 10 0.534589000010906 0.843567005465164 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 11 6 17 5.11952099988003 3.20753400006544 1.9119869998146 A:C A C 10 0.534589000010906 0.467664186074611 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 47614553 G/A 1 10 4 14 4.65410999989094 2.13835600004362 2.51575399984732 A:G G A 10 0.534589000010906 0.194114354160929 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 47676837 C/T 1 22 13 35 10.2390419997601 6.94965700014178 3.28938499961829 T:C C T 10 0.534589000010906 0.310824265016004 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 47734659 G/A 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 A:G G A 10 0.534589000010906 0.298446592097252 ENSG00000160298:ENST00000491666:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397683:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000417060:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397685:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397682:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000291691:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397680:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397679:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000423365:exon_47734630_47734963:C21orf58 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 47831509 A/G 1 11 13 24 5.11952099988003 6.94965700014178 -1.83013600026174 A:G A G 10 0.534589000010906 0.540892890072247 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47831103_47831981:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47831103_47831981:PCNT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 47836403 T/C 1 18 17 35 8.37739799980369 9.0880130001854 -0.710615000381711 T:C T C 10 0.534589000010906 0.86625268328472 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 47836750 T/C 1 2 7 9 0.930821999978188 3.74212300007634 -2.81130100009815 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0917858367386368 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 47850484 G/C 1 6 12 18 2.79246599993456 6.41506800013087 -3.62260200019631 C:G G C 10 0.534589000010906 0.100748004668825 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47850421_47850571:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47850421_47850571:PCNT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 22 21 43 10.2390419997601 11.226369000229 -0.98732700046896 A:G A G 10 0.534589000010906 0.762668245420617 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 17669306 T/C 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 T:C T C 10 0.534589000010906 0.592941099997918 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000469063:exon_17669229_17669617:CECR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 18209613 A/G 1 32 29 61 14.893151999651 15.5030810003163 -0.609929000665268 A:G A G 10 0.534589000010906 0.89843015297044 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 19026613 A/G 1 9 8 17 4.18869899990185 4.27671200008725 -0.0880130001854029 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000070413:ENST00000263196:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000389262:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000467659:exon_19025350_19026634:DGCR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 20761193 C/T 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:C C T 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000185252:ENST00000400451:exon_20759667_20761968:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000403682:exon_20759667_20761697:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000357502:exon_20759667_20761971:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000493734:exon_20759667_20761970:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000356671:exon_20759667_20762752:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000437275:exon_20759667_20762745:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000405993:exon_20759667_20761258:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000476678:exon_20759667_20761683:ZNF74 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 20941012 C/T 1 42 53 95 19.5472619995419 28.333217000578 -8.78595500103608 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0801439697347645 ENSG00000099917:ENST00000433831:exon_20940855_20941906:MED15;ENSG00000099917:ENST00000437399:exon_20940855_20941904:MED15;ENSG00000099917:ENST00000425759:exon_20940855_20941918:MED15;ENSG00000099917:ENST00000292733:exon_20940855_20941919:MED15;ENSG00000099917:ENST00000263205:exon_20940855_20941906:MED15;ENSG00000099917:ENST00000406969:exon_20940855_20941904:MED15;ENSG00000099917:ENST00000382974:exon_20940855_20941154:MED15;ENSG00000099917:ENST00000492381:exon_20940855_20941904:MED15;ENSG00000099917:ENST00000489651:exon_20940855_20941904:MED15;ENSG00000099917:ENST00000473244:exon_20940855_20941919:MED15;ENSG00000099917:ENST00000493216:exon_20940855_20941904:MED15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 22330082 T/C 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:C T C 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22330012_22330087:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449517:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000424393:exon_22330012_22330116:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437929:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000430142:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000489581:exon_22330012_22330168:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000456075:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449704:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000442653:exon_22330012_22330341:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437103:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000434517:exon_22330018_22330179:TOP3B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 22764411 T/C 1 1 647 648 0.465410999989094 345.879083007056 -345.413672007067 A:T:C T C 10 0.534589000010906 4.27057679595342e-213 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 22764436 C/A 1 3 604 607 1.39623299996728 322.891756006587 -321.49552300662 A:C C A 10 0.534589000010906 1.34441834353167e-194 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 22764518 A/C 1 1 96 97 0.465410999989094 51.320544001047 -50.8551330010579 A:C A C 10 0.534589000010906 6.77625964795732e-31 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 23523630 C/A 1 9 7 16 4.18869899990185 3.74212300007634 0.446575999825503 A:C C A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23522397_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23522552_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23522552_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23523071_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23523071_23524426:BCR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 23627369 A/G 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000466076:exon_23627220_23627388:BCR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 24034288 A/G 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 A:G A G 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000159496:ENST00000441897:exon_24032961_24034396:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000290691:exon_24033048_24034396:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382833:exon_24033048_24034396:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382834:exon_24033048_24034396:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382831:exon_24033048_24034396:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000460003:exon_24033493_24034715:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000467354:exon_24033493_24034715:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000423392:exon_24033493_24034396:RGL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 24237221 C/G 1 35 47 82 16.2893849996183 25.1256830005126 -8.8362980008943 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0593670219529674 ENSG00000240972:ENST00000465752:exon_24236959_24237414:MIF;ENSG00000218537:ENST00000406213:exon_24236613_24237719:AP000350.4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 24717518 G/A 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 A:G G A 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000100014:ENST00000398280:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000437398:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000421374:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000314328:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000440893:exon_24717256_24717656:SPECC1L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 26884039 G/A 1 12 16 28 5.58493199986913 8.5534240001745 -2.96849200030537 A:G G A 10 0.534589000010906 0.343734499573097 ENSG00000100104:ENST00000215917:exon_26883995_26884254:SRRD;ENSG00000100104:ENST00000477945:exon_26883948_26884254:SRRD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 26895337 G/A 1 25 27 52 11.6352749997273 14.4339030002945 -2.79862800056711 A:G G A 10 0.534589000010906 0.487888918097824 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26895070_26895348:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000481357:exon_26895070_26895357:TFIP11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 29654882 T/C 1 30 21 51 13.9623299996728 11.226369000229 2.73596099944379 T:C T C 10 0.534589000010906 0.484628676451642 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29654806_29655586:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29654806_29655586:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29654806_29655586:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29654806_29655586:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29654806_29655586:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29654806_29655586:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29654806_29655586:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29654806_29655586:EMID1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 79 103 182 36.7674689991384 55.0626670011233 -18.2951980019849 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00734737418815324 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 30198025 C/T 1 35 39 74 16.2893849996183 20.8489710004253 -4.55958600080705 T:C C T 10 0.534589000010906 0.2965259633375 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30197983_30198197:ASCC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 30416151 T/C 1 10 11 21 4.65410999989094 5.88047900011997 -1.22636900022903 T:C T C 10 0.534589000010906 0.664535375129959 ENSG00000100330:ENST00000401950:exon_30415469_30416873:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000333027:exon_30415469_30416873:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000323630:exon_30415469_30416873:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000351488:exon_30415469_30416873:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000406629:exon_30415469_30416873:MTMR3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 30975861 C/T 1 87 73 160 40.4907569990512 39.0249970007961 1.46575999825503 T:C C T 10 0.534589000010906 0.874137982257935 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30975738_30975910:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30974824_30976061:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30975738_30975922:PES1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 30987864 C/T 1 14 3 17 6.51575399984732 1.60376700003272 4.9119869998146 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0256203520107063 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 31022537 C/A 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 A:C C A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31022447_31023265:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31022447_31023033:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31022447_31022992:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31022447_31023047:TCN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 32009884 C/T 1 8 8 16 3.72328799991275 4.27671200008725 -0.553424000174497 T:C C T 10 0.534589000010906 0.807042042252045 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 32784051 T/C 1 122 97 219 56.7801419986695 51.8551330010579 4.92500899761158 T:C T C 10 0.534589000010906 0.542246402468086 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32783569_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32783588_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000451746:exon_32783588_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32783588_32784086:C22orf28 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 40 41 81 18.6164399995638 21.9181490004471 -3.30170900088339 T:C C T 10 0.534589000010906 0.504503336985014 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 32875190 G/A 1 72 55 127 33.5095919992148 29.4023950005998 4.10719699861493 A:G G A 10 0.534589000010906 0.478093468294106 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000444207:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000465418:exon_32874968_32875218:FBXO7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 32887150 C/T 1 53 48 101 24.666782999422 25.6602720005235 -0.993489001101512 T:C C T 10 0.534589000010906 0.842692019450298 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32883732_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32887073_32887168:FBXO7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 35660875 G/T 1 16 21 37 7.4465759998255 11.226369000229 -3.77979300040352 T:G G T 10 0.534589000010906 0.249367416803454 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 36900271 T/C 1 5 12 17 2.32705499994547 6.41506800013087 -4.0880130001854 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0535258720090529 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900145_36900414:FOXRED2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 36900806 A/G 1 10 14 24 4.65410999989094 7.48424600015268 -2.83013600026174 A:G A G 10 0.534589000010906 0.307110312407199 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900562_36900813:FOXRED2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 37524619 G/T 1 24 21 45 11.1698639997383 11.226369000229 -0.0565050004907732 T:G G T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37524133_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37524562_37524888:IL2RB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 37531436 G/A 1 8 10 18 3.72328799991275 5.34589000010906 -1.62260200019631 A:G G A 10 0.534589000010906 0.485331297542652 ENSG00000100385:ENST00000447922:exon_37531368_37531448:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37531368_37531482:IL2RB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 38051355 G/A 0 29 1 30 13.4969189996837 0.534589000010906 12.9623299996728 C:G G C 10 0.534589000010906 2.53937501612410e-07 ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 38151170 G/A 1 13 10 23 6.05034299985822 5.34589000010906 0.704452999749162 A:G G A 10 0.534589000010906 0.836527371779212 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38151108_38151197:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000407319:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000428075:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000413051:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000418339:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000452519:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000417857:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000331103:exon_38151108_38151517:TRIOBP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 615 605 1220 286.227764993293 323.426345006598 -37.1985800133053 A:T:C:G T C 10 0.534589000010906 0.033681842596616 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 9 9 18 4.18869899990185 4.81130100009815 -0.622602000196309 A:C C A 10 0.534589000010906 0.81636697210269 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 8 8 16 3.72328799991275 4.27671200008725 -0.553424000174497 T:C T C 10 0.534589000010906 0.807042042252045 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 9 7 16 4.18869899990185 3.74212300007634 0.446575999825503 T:G G T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 27 14 41 12.5660969997055 7.48424600015268 5.08185099955285 C:G G C 10 0.534589000010906 0.119642823581058 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 11 3 14 5.11952099988003 1.60376700003272 3.51575399984732 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0655983504942837 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 39497452 A/G 0 9 0 9 4.18869899990185 0 4.18869899990185 A A 10 0.534589000010906 0.00459053241595814 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 39497454 G/C 0 10 0 10 4.65410999989094 0 4.65410999989094 G G 10 0.534589000010906 0.00238317236301322 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 23 25 48 10.7044529997492 13.3647250002727 -2.66027200052349 C:G G C 10 0.534589000010906 0.471573474354599 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 39709009 G/A 1 10 8 18 4.65410999989094 4.27671200008725 0.377397999803692 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000100316:ENST00000473638:exon_39708889_39709315:RPL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 39711351 A/G 1 7 10 17 3.25787699992366 5.34589000010906 -2.0880130001854 A:G A G 10 0.534589000010906 0.339484157804598 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 41605776 G/C 1 25 11 36 11.6352749997273 5.88047900011997 5.75479599960738 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0654644824635756 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000489136:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000453659:exon_41605700_41606012:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000449635:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41605700_41605937:L3MBTL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 41610024 G/A 1 14 15 29 6.51575399984732 8.01883500016359 -1.50308100031628 A:G G A 10 0.534589000010906 0.58291728377747 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41609855_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000489136:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41609897_41610030:L3MBTL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 41613188 C/T 1 4 13 17 1.86164399995638 6.94965700014178 -5.0880130001854 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0149470426139560 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41613127_41615540:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000449635:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41613127_41613206:L3MBTL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 41833116 C/T 1 8 14 22 3.72328799991275 7.48424600015268 -3.76095800023993 T:C C T 10 0.534589000010906 0.134711925154703 ENSG00000183864:ENST00000327492:exon_41829496_41833411:TOB2;ENSG00000183864:ENST00000434408:exon_41833046_41833411:TOB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 42059828 C/T 1 534 463 997 248.529473994176 247.51470700505 1.01476698912668 A:T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.974676410776093 ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 42073134 C/T 1 8 173 181 3.72328799991275 92.4838970018867 -88.760609001974 T:C C T 10 0.534589000010906 6.76260143704443e-47 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 42076330 G/A 1 156 253 409 72.6041159982987 135.251017002759 -62.6469010044606 A:T:G G A 10 0.534589000010906 5.94951565155619e-10 ENSG00000100138:ENST00000355257:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000215956:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000401959:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000463675:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000402458:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000488571:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000469028:exon_42076250_42076368:NHP2L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 42177816 C/A 1 12 18 30 5.58493199986913 9.62260200019631 -4.03767000032718 A:C C A 10 0.534589000010906 0.147392324053680 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000300398:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000419798:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000462450:exon_42177689_42177828:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000498456:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42177355_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42177403_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42177450_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000403492:exon_42177739_42177849:MEI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 42191540 C/T 1 9 5 14 4.18869899990185 2.67294500005453 1.51575399984732 T:C C T 10 0.534589000010906 0.593864451936242 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42191415_42191546:MEI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 42336172 G/A 1 13 10 23 6.05034299985822 5.34589000010906 0.704452999749162 A:G G A 10 0.534589000010906 0.836527371779212 ENSG00000100162:ENST00000472374:exon_42336143_42336223:CENPM HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 42341308 A/G 1 19 36 55 8.84280899979279 19.2452040003926 -10.4023950005998 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00636752238580405 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42340925_42341308:CENPM HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 13 24 37 6.05034299985822 12.8301360002617 -6.77979300040352 T:C C T 10 0.534589000010906 0.031276597122774 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 42486723 G/A 1 223 120 343 103.786652997568 64.1506800013087 39.6359729962592 A:G G A 10 0.534589000010906 1.75993704589593e-05 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 24 33 57 11.1698639997383 17.6414370003599 -6.47157300062165 T:C C T 10 0.534589000010906 0.110290998333783 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 39 35 74 18.1510289995747 18.7106150003817 -0.559586000807048 T:C C T 10 0.534589000010906 0.907745533616263 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 48 28 76 22.3397279994765 14.9684920003054 7.37123599917114 C:G G C 10 0.534589000010906 0.106991086131652 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 43089849 T/C 1 26 22 48 12.1006859997164 11.7609580002399 0.33972799947651 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 43576904 G/A 1 23 23 46 10.7044529997492 12.2955470002508 -1.59109400050168 A:G G A 10 0.534589000010906 0.659908763281336 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000357017:exon_43576762_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43576748_43576946:TTLL12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 110 145 255 51.1952099988003 77.5154050015814 -26.320195002781 A:C A C 10 0.534589000010906 0.00106487166504738 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 45577231 T/C 1 6 18 24 2.79246599993456 9.62260200019631 -6.83013600026175 T:C T C 10 0.534589000010906 0.00671538610067119 ENSG00000093000:ENST00000347635:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000432759:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000425733:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000355253:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000407019:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000493456:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000396096:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000440908:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000422489:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000469163:exon_45577167_45577248:NUP50 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 45723807 G/C 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 C:G G C 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000427777:exon_45723723_45723841:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 45723842 G/A 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 A:G G A 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 45723854 C/G 1 7 1 8 3.25787699992366 0.534589000010906 2.72328799991275 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0755591978202379 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 45728370 G/A 1 10 9 19 4.65410999989094 4.81130100009815 -0.157191000207215 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 47083010 T/C 1 26 10 36 12.1006859997164 5.34589000010906 6.75479599960738 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0288819413980233 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 47083012 T/A 1 26 10 36 12.1006859997164 5.34589000010906 6.75479599960738 A:T T A 10 0.534589000010906 0.0288819413980233 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 47087670 G/A 1 11 8 19 5.11952099988003 4.27671200008725 0.842808999792785 A:G G A 10 0.534589000010906 0.819574245361162 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47087469_47087674:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47087469_47087674:CERK;ENSG00000100422:ENST00000471929:exon_47087469_47087674:CERK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 50356302 C/T 1 23 12 35 10.7044529997492 6.41506800013087 4.28938499961829 T:C C T 10 0.534589000010906 0.175651385675006 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 50356555 T/C 1 19 8 27 8.84280899979279 4.27671200008725 4.56609699970554 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0849616341801765 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 126 143 269 58.6417859986258 76.4462270015596 -17.8044410029337 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0322916389716914 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 165 130 295 76.7928149982005 69.4965700014178 7.29624499678272 A:C:G G C 10 0.534589000010906 0.414099795217067 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 50646936 G/C 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000073169:ENST00000492092:exon_50646917_50647145:RP3-402G11.5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 50658424 T/C 1 22 18 40 10.2390419997601 9.62260200019631 0.616439999563758 T:C T C 10 0.534589000010906 0.875398535411848 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 50664612 A/G 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000473946:exon_50664479_50664620:TUBGCP6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 50684708 G/A 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G G A 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 50696678 G/A 1 21 11 32 9.77363099977097 5.88047900011997 3.89315199965101 A:G G A 10 0.534589000010906 0.214635404866943 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000492218:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50696672_50696730:MAPK12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 29 29 58 13.4969189996837 15.5030810003163 -2.00616200063255 A:G G A 10 0.534589000010906 0.601603473828192 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 29 31 60 13.4969189996837 16.5722590003381 -3.07534000065436 A:G A G 10 0.534589000010906 0.440129102807527 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 50719293 G/A 1 17 22 39 7.9119869998146 11.7609580002399 -3.84897100042534 A:G G A 10 0.534589000010906 0.261344115635340 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 50903659 G/A 1 12 8 20 5.58493199986913 4.27671200008725 1.30821999978188 A:G G A 10 0.534589000010906 0.656685513222068 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50903644_50903757:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50903644_50903757:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50903644_50903757:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000356279:exon_50903644_50903757:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50903644_50903757:SBF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 22 50956469 A/G 1 37 42 79 17.2202069995965 22.4527380004581 -5.23253100086158 A:G A G 10 0.534589000010906 0.260007905448997 ENSG00000025770:ENST00000420993:exon_50956402_50956481:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000425199:exon_50956402_50956481:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000361482:exon_50956402_50956481:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000380768:exon_50956402_50956481:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000395698:exon_50956402_50956481:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000395701:exon_50956402_50956481:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000518394:exon_50956402_50956481:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000523045:exon_50956402_50956481:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000453005:exon_50956402_50956475:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000418794:exon_50956402_50956487:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000299821:exon_50956402_50956481:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000520939:exon_50956402_50956481:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000496227:exon_50956402_50956481:NCAPH2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 3189279 A/G 1 23 24 47 10.7044529997492 12.8301360002617 -2.12568300051258 A:G A G 10 0.534589000010906 0.561062064368195 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3189134_3189387:TRNT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 8955389 C/T 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 T:C C T 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_8955328_8955404:RAD18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 9005078 C/T 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 T:C C T 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000415439:exon_9005019_9005115:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000495087:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000418463:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000421052:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000413832:exon_9005019_9005277:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000469793:exon_9005019_9005127:RAD18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 9005085 T/C 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 T:C T C 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000415439:exon_9005019_9005115:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000495087:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000418463:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000421052:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000413832:exon_9005019_9005277:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000469793:exon_9005019_9005127:RAD18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 9 13 22 4.18869899990185 6.94965700014178 -2.76095800023993 T:C T C 10 0.534589000010906 0.287120525503420 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 12 2 14 5.58493199986913 1.06917800002181 4.51575399984732 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0158603999537431 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 26 12 38 12.1006859997164 6.41506800013087 5.68561799958557 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0737448870724525 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 9425944 G/C 1 16 27 43 7.4465759998255 14.4339030002945 -6.98732700046896 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0456108240166209 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 9426224 G/A 1 45 28 73 20.9434949995092 14.9684920003054 5.97500299920386 A:G G A 10 0.534589000010906 0.196535368388322 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9426208_9427386:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9426208_9428475:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9426208_9426344:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9426208_9426554:THUMPD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 C:G C G 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 9870857 G/A 1 29 26 55 13.4969189996837 13.8993140002836 -0.402395000599832 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000431204:exon_9870644_9870936:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9870644_9871019:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 9871030 T/G 1 40 28 68 18.6164399995638 14.9684920003054 3.64794799925839 T:G T G 10 0.534589000010906 0.396967060086109 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 9988028 G/A 1 44 52 96 20.4780839995201 27.7986280005671 -7.32054400104698 A:G G A 10 0.534589000010906 0.151920166085499 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9987769_9989685:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9987226_9989685:PRRT3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 10011449 G/A 1 39 29 68 18.1510289995747 15.5030810003163 2.64794799925839 A:G G A 10 0.534589000010906 0.545363693142746 ENSG00000125037:ENST00000245046:exon_10011403_10011485:TMEM111;ENSG00000125037:ENST00000487465:exon_10010328_10011485:TMEM111;ENSG00000125037:ENST00000497557:exon_10011413_10011485:TMEM111 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 11643465 T/C 1 16 6 22 7.4465759998255 3.20753400006544 4.23904199976007 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0869907781611442 ENSG00000144560:ENST00000273038:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000413604:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000426568:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000404339:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000445411:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000418000:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000458499:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417206:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417466:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424709:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000419541:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000437722:exon_11643307_11643496:VGLL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 11871215 T/C 1 16 9 25 7.4465759998255 4.81130100009815 2.63527499972735 T:C T C 10 0.534589000010906 0.322000273897906 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11871188_11871338:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11871188_11871338:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11871188_11871338:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11871188_11871338:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000460246:exon_11871188_11871384:C3orf31 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 12613866 T/C 1 24 27 51 11.1698639997383 14.4339030002945 -3.26403900055621 T:C T C 10 0.534589000010906 0.400719178000423 ENSG00000075975:ENST00000170447:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000411987:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000448482:exon_12613568_12613872:MKRN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 12962074 G/A 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000144711:ENST00000273221:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000435445:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000450726:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000429247:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000452608:exon_12961930_12962096:IQSEC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 12977568 C/T 1 13 13 26 6.05034299985822 6.94965700014178 -0.899314000283557 T:C C T 10 0.534589000010906 0.84469204921112 ENSG00000144711:ENST00000273221:exon_12976948_12978197:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000435445:exon_12976948_12978197:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000450726:exon_12976948_12978197:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000429247:exon_12976948_12978197:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000452608:exon_12976948_12978197:IQSEC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 92 72 164 42.8178119989966 38.4904080007852 4.32740399821141 T:C C T 10 0.534589000010906 0.531517664813515 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 36 37 73 16.7547959996074 19.7797930004035 -3.02499700079614 T:G G T 10 0.534589000010906 0.484105875465863 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 13367406 C/T 1 38 57 95 17.6856179995856 30.4715730006216 -12.7859550010361 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0098662871760915 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 43 39 82 20.012672999531 20.8489710004253 -0.836298000894296 A:G G A 10 0.534589000010906 0.911980269055723 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 13379400 C/T 1 21 11 32 9.77363099977097 5.88047900011997 3.89315199965101 T:C C T 10 0.534589000010906 0.214635404866943 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13379337_13379417:NUP210 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 13383540 A/G 1 47 31 78 21.8743169994874 16.5722590003381 5.30205799914933 A:G A G 10 0.534589000010906 0.25680776491456 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13383496_13383623:NUP210 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 13395475 G/C 1 14 6 20 6.51575399984732 3.20753400006544 3.30821999978188 C:G G C 10 0.534589000010906 0.179108698464351 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 13395579 C/A 1 13 7 20 6.05034299985822 3.74212300007634 2.30821999978188 A:C C A 10 0.534589000010906 0.372688141283748 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 13407556 T/C 1 11 10 21 5.11952099988003 5.34589000010906 -0.226369000229027 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13407446_13407591:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13407446_13407591:NUP210 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 14 22 36 6.51575399984732 11.7609580002399 -5.24520400039262 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0945747783400786 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 15115270 G/T 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 T:G G T 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15111580_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15115112_15116437:ZFYVE20 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 39 14 53 18.1510289995747 7.48424600015268 10.666782999422 C:G C G 10 0.534589000010906 0.00351483756371412 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 158 128 286 73.5349379982768 68.427392001396 5.10754599688087 T:C T C 10 0.534589000010906 0.553931244372761 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 109 88 197 50.7297989988112 47.0438320009597 3.68596699785151 A:C A C 10 0.534589000010906 0.617664288785466 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 17051328 T/C 1 12 10 22 5.58493199986913 5.34589000010906 0.239041999760067 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 17208267 T/C 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000131374:ENST00000450163:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000437885:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000253692:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000429383:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000414318:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000446818:exon_17208259_17208420:TBC1D5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 37033491 C/A 1 13 11 24 6.05034299985822 5.88047900011997 0.169863999738255 A:C C A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000178567:ENST00000322716:exon_37027357_37034795:EPM2AIP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 5 10 15 2.32705499994547 5.34589000010906 -3.01883500016359 C:G G C 10 0.534589000010906 0.128857341400782 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 38170810 C/G 1 25 29 54 11.6352749997273 15.5030810003163 -3.86780600058893 C:G C G 10 0.534589000010906 0.33992040050421 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000418880:exon_38170781_38170879:ACAA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 39184959 C/T 1 17 7 24 7.9119869998146 3.74212300007634 4.16986399973825 T:C C T 10 0.534589000010906 0.102874824022524 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 39185077 G/A 1 15 12 27 6.98116499983641 6.41506800013087 0.566096999705537 A:G G A 10 0.534589000010906 0.84987578658165 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 39186728 C/T 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 T:C C T 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39186488_39186747:CSRNP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 39188182 C/T 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39187969_39188218:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39188154_39188213:CSRNP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 39431081 G/A 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 A:G G A 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39430986_39431107:SLC25A38;ENSG00000144659:ENST00000431510:exon_39430986_39431107:SLC25A38 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 170 77 247 79.119869998146 41.1633530008398 37.9565169973062 T:C T C 10 0.534589000010906 1.05054416456387e-06 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 39450065 C/T 1 10 9 19 4.65410999989094 4.81130100009815 -0.157191000207215 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000168028:ENST00000490490:exon_39449695_39450215:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39450028_39450215:RPSA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 39453160 G/A 1 140 169 309 65.1575399984732 90.3455410018431 -25.18800100337 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.00431434155098768 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000495394:exon_39451750_39453268:RPSA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 40498845 C/T 1 26 19 45 12.1006859997164 10.1571910002072 1.94349499950923 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.65454554395575 ENSG00000188846:ENST00000338970:exon_40498783_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000465325:exon_40498794_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 15 9 24 6.98116499983641 4.81130100009815 2.16986399973826 A:G A G 10 0.534589000010906 0.418609856680633 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 42610515 G/A 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 A:G G A 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 44692564 C/G 1 5 7 12 2.32705499994547 3.74212300007634 -1.41506800013087 C:G C G 10 0.534589000010906 0.565015885912817 ENSG00000169981:ENST00000396056:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000415571:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000432115:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000296092:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000399560:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000453164:exon_44692433_44692751:ZNF35 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 A:C C A 10 0.534589000010906 0.189086525758904 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 36 43 79 16.7547959996074 22.987327000469 -6.23253100086158 C:G G C 10 0.534589000010906 0.176267362535627 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 47043238 C/T 1 11 11 22 5.11952099988003 5.88047900011997 -0.760958000239933 T:C C T 10 0.534589000010906 0.832013937520133 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000475689:exon_47043179_47043316:NBEAL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 56 40 96 26.0630159993893 21.3835600004362 4.67945599895302 C:G C G 10 0.534589000010906 0.358431679678779 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 47049193 A/G 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 A:G A G 10 0.534589000010906 0.764524730244108 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 39 43 82 18.1510289995747 22.987327000469 -4.8362980008943 A:G G A 10 0.534589000010906 0.319352056155836 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 47162886 C/T 1 24 21 45 11.1698639997383 11.226369000229 -0.0565050004907732 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 47385241 C/T 1 14 12 26 6.51575399984732 6.41506800013087 0.100685999716442 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000114648:ENST00000232766:exon_47385045_47388306:KLHL18;ENSG00000114648:ENST00000442272:exon_47385045_47386067:KLHL18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 47448825 G/A 1 18 9 27 8.37739799980369 4.81130100009815 3.56609699970554 A:G G A 10 0.534589000010906 0.182295568819292 ENSG00000076201:ENST00000456408:exon_47448799_47448857:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47448799_47448857:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47448799_47448857:PTPN23 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 25 24 49 11.6352749997273 12.8301360002617 -1.1948610005344 A:G G A 10 0.534589000010906 0.775568337806118 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 23 22 45 10.7044529997492 11.7609580002399 -1.05650500049077 T:C T C 10 0.534589000010906 0.76711418400348 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 48474249 A/G 1 22 31 53 10.2390419997601 16.5722590003381 -6.33321700057802 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.0978868052495303 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 117 86 203 54.453086998724 45.9746540009379 8.47843299778608 T:C C T 10 0.534589000010906 0.260254892450169 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 49751585 C/T 1 11 5 16 5.11952099988003 2.67294500005453 2.4465759998255 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.316657798068879 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000469978:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000444689:exon_49751523_49751607:RNF123 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 49758764 A/G 1 30 23 53 13.9623299996728 12.2955470002508 1.66678299942198 A:G A G 10 0.534589000010906 0.681469234855748 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 49847623 A/G 1 12 7 19 5.58493199986913 3.74212300007634 1.84280899979278 A:G A G 10 0.534589000010906 0.492933071348704 ENSG00000182179:ENST00000473992:exon_49847411_49847783:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000489826:exon_49847412_49847861:UBA7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 49949071 A/G 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000164077:ENST00000296473:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000419032:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000417270:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000484985:exon_49948965_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000483022:exon_49949054_49949444:MON1A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 50097113 A/G 1 67 44 111 31.1825369992693 23.5219160004799 7.66062099878943 A:C:G A G 10 0.534589000010906 0.154125720605773 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50097082_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50097082_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50097082_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50097082_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000441115:exon_50097082_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50097082_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50097082_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000434592:exon_50097065_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000478026:exon_50096776_50097179:RBM6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 50103917 G/A 1 50 57 107 23.2705499994547 30.4715730006216 -7.20102300116694 A:G G A 10 0.534589000010906 0.175254732735963 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000434592:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50103825_50103935:RBM6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 50114515 C/T 1 20 20 40 9.30821999978188 10.6917800002181 -1.38356000043624 T:C C T 10 0.534589000010906 0.751793136121849 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50114441_50114682:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50114441_50114683:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50114441_50114680:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50114441_50114682:RBM6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 50144951 T/C 1 11 13 24 5.11952099988003 6.94965700014178 -1.83013600026174 T:C T C 10 0.534589000010906 0.540892890072247 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000395174:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000496179:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000474818:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000494360:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000441812:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000489437:exon_50144914_50145002:RBM5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 50153356 T/C 1 50 55 105 23.2705499994547 29.4023950005998 -6.13184500114513 T:C T C 10 0.534589000010906 0.241389252735154 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475128:exon_50153339_50153376:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475590:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000492430:exon_50153339_50153613:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000479275:exon_50153339_50153664:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464988:exon_50153339_50153413:RBM5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 50327429 A/G 1 37 32 69 17.2202069995965 17.106848000349 0.113358999247485 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50327360_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000414734:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000483071:exon_50327143_50327501:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000489569:exon_50327360_50327517:IFRD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 50369546 C/A 1 34 22 56 15.8239739996292 11.7609580002399 4.06301599938926 A:C C A 10 0.534589000010906 0.287408492033131 ENSG00000068028:ENST00000362008:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000327761:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395126:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000357043:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395117:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000359365:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395129:exon_50369481_50369597:RASSF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 T:G T G 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 51430657 A/C 1 127 109 236 59.1071969986149 58.2702010011888 0.836995997426172 A:C A C 10 0.534589000010906 0.948009582087976 ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 51737965 G/A 1 56 61 117 26.0630159993893 32.6099290006653 -6.54691300127601 A:G G A 10 0.534589000010906 0.229662083997103 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 51 40 91 23.7359609994438 21.3835600004362 2.35240099900755 T:C C T 10 0.534589000010906 0.674700529396626 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 52242103 G/A 1 66 64 130 30.7171259992802 34.213696000698 -3.49657000141778 A:G G A 10 0.534589000010906 0.539838324759065 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52242099_52242263:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52242099_52242263:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52242099_52242263:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52242099_52242263:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52242099_52242263:ALAS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 23 31 54 10.7044529997492 16.5722590003381 -5.86780600058892 T:C C T 10 0.534589000010906 0.13294154692271 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 52526535 G/A 1 66 48 114 30.7171259992802 25.6602720005235 5.05685399875671 A:G G A 10 0.534589000010906 0.349706855585768 ENSG00000010322:ENST00000479054:exon_52525888_52527084:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000433196:exon_52525888_52527087:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000345716:exon_52525888_52527087:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000489895:exon_52525888_52527084:NISCH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 52729960 C/T 1 77 61 138 35.8366469991602 32.6099290006653 3.22671799849497 T:C C T 10 0.534589000010906 0.609305381494745 ENSG00000016864:ENST00000478968:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000394783:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000266014:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000407584:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000491606:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000481643:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000394786:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000484163:exon_52729206_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000463827:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000344678:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000480080:exon_52729256_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000344383:exon_52729809_52730056:GLT8D1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 53259854 T/C 1 215 228 443 100.063364997655 121.886292002487 -21.8229270048314 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0404812280770005 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53258723_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53259767_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53259655_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53259675_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53259718_53259947:TKT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 53326142 G/A 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 A:G G A 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 53856653 C/T 1 14 8 22 6.51575399984732 4.27671200008725 2.23904199976007 T:C C T 10 0.534589000010906 0.396720668612636 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53856518_53856669:CHDH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 53857917 T/G 1 7 10 17 3.25787699992366 5.34589000010906 -2.0880130001854 T:G T G 10 0.534589000010906 0.339484157804598 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53857333_53858094:CHDH;ENSG00000016391:ENST00000481668:exon_53857571_53858094:CHDH;ENSG00000016391:ENST00000467802:exon_53857658_53858094:CHDH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 53883722 C/G 1 6 8 14 2.79246599993456 4.27671200008725 -1.48424600015268 C:G C G 10 0.534589000010906 0.437971150157616 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000494338:exon_53883682_53883822:IL17RB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 53899276 C/T 1 41 44 85 19.0818509995529 23.5219160004799 -4.44006500092701 T:C C T 10 0.534589000010906 0.384530509811802 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53898773_53899827:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53898773_53899615:IL17RB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 53925849 C/T 1 27 24 51 12.5660969997055 12.8301360002617 -0.264039000556208 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000113811:ENST00000495461:exon_53925797_53926015:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000488746:exon_53925797_53925892:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000487571:exon_53925797_53925882:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000485414:exon_53925797_53925912:RP11-884K10.5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 58107156 G/A 1 9 10 19 4.18869899990185 5.34589000010906 -1.15719100020721 A:G G A 10 0.534589000010906 0.650010996424856 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58106968_58107230:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58106968_58107230:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58106968_58107230:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58106968_58107230:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58106968_58107230:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58106968_58107230:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58106968_58107230:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58106968_58107230:FLNB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 58109162 G/A 1 22 20 42 10.2390419997601 10.6917800002181 -0.452738000458053 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58108820_58109417:FLNB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 58112440 A/G 1 17 11 28 7.9119869998146 5.88047900011997 2.03150799969463 A:G A G 10 0.534589000010906 0.457094536572337 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58112329_58112489:FLNB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 58112488 C/T 1 28 24 52 13.0315079996946 12.8301360002617 0.201371999432885 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58112329_58112489:FLNB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 58118555 G/A 1 26 21 47 12.1006859997164 11.226369000229 0.874316999487416 A:G G A 10 0.534589000010906 0.884079059755605 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58117805_58118658:FLNB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 57 57 114 26.5284269993784 30.4715730006216 -3.94314600124329 T:C C T 10 0.534589000010906 0.51124081874652 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 58414382 C/T 1 9 7 16 4.18869899990185 3.74212300007634 0.446575999825503 T:C C T 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 59908126 A/G 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:G A G 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000189283:ENST00000492590:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000476844:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000466788:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000468189:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000341848:exon_59908072_59908140:FHIT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 9 7 16 4.18869899990185 3.74212300007634 0.446575999825503 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 66430877 G/C 1 6 15 21 2.79246599993456 8.01883500016359 -5.22636900022903 C:G G C 10 0.534589000010906 0.027572661612133 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66430649_66430913:LRIG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 73111973 A/G 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 A:G A G 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 73111998 C/T 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 T:C C T 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 75471295 C/T 1 8 4 12 3.72328799991275 2.13835600004362 1.58493199986913 T:C C T 10 0.534589000010906 0.401454124777931 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 75471341 G/A 1 9 5 14 4.18869899990185 2.67294500005453 1.51575399984732 A:G G A 10 0.534589000010906 0.593864451936242 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 75472209 C/T 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 T:C C T 10 0.534589000010906 0.298446592097252 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 88189580 T/G 1 1 9 10 0.465410999989094 4.81130100009815 -4.34589000010906 T:G T G 10 0.534589000010906 0.00786026152417633 ENSG00000175105:ENST00000309495:exon_88188254_88190198:ZNF654 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 98304467 T/C 1 17 26 43 7.9119869998146 13.8993140002836 -5.98732700046896 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0914853188681239 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 98307630 C/T 1 10 1 11 4.65410999989094 0.534589000010906 4.11952099988003 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0138045823225813 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 99886662 G/A 1 23 13 36 10.7044529997492 6.94965700014178 3.75479599960738 A:G G A 10 0.534589000010906 0.243661160357124 ENSG00000184220:ENST00000421999:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000491299:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000489081:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000478909:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000497345:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000479555:exon_99886582_99886684:C3orf26 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 48 42 90 22.3397279994765 22.4527380004581 -0.113010000981546 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 108298260 C/T 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 T:C C T 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000163507:ENST00000491772:exon_108298128_108298273:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000295746:exon_108298128_108298273:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000481530:exon_108298128_108298273:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000487834:exon_108298128_108298273:KIAA1524 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 112059768 C/G 1 5 9 14 2.32705499994547 4.81130100009815 -2.48424600015268 C:G C G 10 0.534589000010906 0.283670203474933 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112059749_112059830:CD200 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 112066656 T/G 1 17 19 36 7.9119869998146 10.1571910002072 -2.24520400039262 T:G T G 10 0.534589000010906 0.50571419534925 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112066410_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112066410_112066677:CD200 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 112185025 G/A 1 61 77 138 28.3900709993347 41.1633530008398 -12.773282001505 A:G G A 10 0.534589000010906 0.03267665412862 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112184955_112185230:BTLA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 112188609 T/G 1 50 63 113 23.2705499994547 33.6791070006871 -10.4085570012324 T:G T G 10 0.534589000010906 0.058856608941777 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000496584:exon_112188603_112188651:BTLA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 112727184 A/T 1 20 14 34 9.30821999978188 7.48424600015268 1.8239739996292 A:T:G A T 10 0.534589000010906 0.607616730533381 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 118948716 G/A 1 24 22 46 11.1698639997383 11.7609580002399 -0.591094000501679 A:G G A 10 0.534589000010906 0.883413014201246 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000471675:exon_118948694_118948900:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118948694_118949091:B4GALT4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 119133183 G/A 1 18 2 20 8.37739799980369 1.06917800002181 7.30821999978188 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00104551790125341 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 119196166 T/C 1 1 10 11 0.465410999989094 5.34589000010906 -4.88047900011997 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0040450386649354 ENSG00000163389:ENST00000295588:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000419577:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000497447:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000486607:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000476573:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000460339:exon_119196160_119196254:POGLUT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 119211294 A/G 1 8 13 21 3.72328799991275 6.94965700014178 -3.22636900022903 A:G A G 10 0.534589000010906 0.190957094599046 ENSG00000163389:ENST00000295588:exon_119211129_119213555:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000486607:exon_119211129_119211324:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000473648:exon_119211129_119211993:POGLUT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 121712051 A/C 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:C A C 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 121712805 G/C 1 7 1 8 3.25787699992366 0.534589000010906 2.72328799991275 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0755591978202379 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000383663:exon_121712627_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 122133830 T/G 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 T:G T G 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000196981:ENST00000330689:exon_122130715_122134882:WDR5B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 48 29 77 22.3397279994765 15.5030810003163 6.83664699916023 T:C T C 10 0.534589000010906 0.137316862464195 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 29 25 54 13.4969189996837 13.3647250002727 0.132193999411074 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 122288210 G/A 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 A:G G A 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122287336_122288871:DTX3L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 122418750 G/A 1 30 14 44 13.9623299996728 7.48424600015268 6.47808399952013 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0685333493018317 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122418237_122420482:PARP14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 122419083 C/A 1 21 12 33 9.77363099977097 6.41506800013087 3.3585629996401 A:C C A 10 0.534589000010906 0.295801979493019 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122418237_122420482:PARP14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 122446642 C/T 1 2 9 11 0.930821999978188 4.81130100009815 -3.88047900011997 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0299085362195834 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 122459477 A/G 1 19 15 34 8.84280899979279 8.01883500016359 0.823973999629194 A:G A G 10 0.534589000010906 0.864184099905938 ENSG00000169087:ENST00000383659:exon_122458846_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000471534:exon_122458850_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000306103:exon_122458850_122459722:HSPBAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 122864436 G/A 1 11 8 19 5.11952099988003 4.27671200008725 0.842808999792785 A:G G A 10 0.534589000010906 0.819574245361162 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 124456742 G/C 1 65 41 106 30.2517149992911 21.9181490004471 8.33356599884396 C:G G C 10 0.534589000010906 0.119072002565690 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124456639_124457086:UMPS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 124462808 C/T 1 61 47 108 28.3900709993347 25.1256830005126 3.26438799882215 T:C C T 10 0.534589000010906 0.563478688878874 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 124692689 C/T 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 T:C C T 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124692575_124692749:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000487661:exon_124692575_124692749:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000482699:exon_124692575_124692751:HEG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 124731689 T/A 0 0 9 9 0 4.81130100009815 -4.81130100009815 A T A 10 0.534589000010906 0.00102454206148113 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 124738107 C/T 1 8 2 10 3.72328799991275 1.06917800002181 2.65410999989094 T:C C T 10 0.534589000010906 0.117787000476102 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124738106_124738340:HEG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 124802677 A/G 1 55 72 127 25.5976049994002 38.4904080007852 -12.8928030013851 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.0258141383767271 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 124802881 A/G 1 41 35 76 19.0818509995529 18.7106150003817 0.371235999171141 A:C:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 124802888 C/T 1 46 42 88 21.4089059994983 22.4527380004581 -1.04383200095973 T:C C T 10 0.534589000010906 0.831591991388527 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 124826408 T/C 1 26 21 47 12.1006859997164 11.226369000229 0.874316999487416 T:C T C 10 0.534589000010906 0.884079059755605 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124826325_124826615:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124826325_124826475:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124826321_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000461616:exon_124826325_124826421:SLC12A8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 124829057 A/G 1 10 9 19 4.65410999989094 4.81130100009815 -0.157191000207215 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000485954:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479231:exon_124829033_124829562:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465777:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000495105:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000485849:exon_124829033_124829179:SLC12A8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 125249340 G/A 1 10 11 21 4.65410999989094 5.88047900011997 -1.22636900022903 A:G G A 10 0.534589000010906 0.664535375129959 ENSG00000144909:ENST00000296220:exon_125247702_125249424:OSBPL11;ENSG00000144909:ENST00000393455:exon_125247713_125249424:OSBPL11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 125266387 G/A 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 A:G G A 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000144909:ENST00000296220:exon_125266250_125266436:OSBPL11;ENSG00000144909:ENST00000393455:exon_125266250_125266436:OSBPL11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 125726048 G/C 1 22 12 34 10.2390419997601 6.41506800013087 3.82397399962919 C:G G C 10 0.534589000010906 0.229370851498472 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125725699_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125725916_125726068:SLC41A3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 126180820 G/A 1 23 10 33 10.7044529997492 5.34589000010906 5.3585629996401 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0797601118735542 ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126180378_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000515545:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000336332:exon_126179926_126181063:ZXDC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 126180912 C/T 1 7 13 20 3.25787699992366 6.94965700014178 -3.69178000021812 T:C C T 10 0.534589000010906 0.117777156244559 ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126180378_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000515545:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000336332:exon_126179926_126181063:ZXDC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 127339943 C/T 1 133 135 268 61.8996629985495 72.1695150014723 -10.2698520029228 T:C C T 10 0.534589000010906 0.220797390752866 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127339916_127340071:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127339916_127340071:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127339916_127340071:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127339916_127340071:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468414:exon_127339916_127340071:MCM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 110 79 189 51.1952099988003 42.2325310008616 8.96267899793876 T:C C T 10 0.534589000010906 0.215048499269889 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 128614185 A/C 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 A:C A C 10 0.534589000010906 0.529760851175976 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128614153_128614191:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 128890350 G/A 1 344 336 680 160.101383996248 179.621904003664 -19.5205200074161 A:G G A 10 0.534589000010906 0.134022780447349 ENSG00000169714:ENST00000502976:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000422453:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000451728:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000446936:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000307433:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000393290:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000500450:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000504813:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000441626:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000502372:exon_128889922_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000512338:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000507573:exon_128890095_128890614:CNBP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 128976396 T/C 1 36 20 56 16.7547959996074 10.6917800002181 6.06301599938926 T:C T C 10 0.534589000010906 0.109606079381092 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 128976451 C/G 1 28 17 45 13.0315079996946 9.0880130001854 3.94349499950923 C:G C G 10 0.534589000010906 0.295613948073502 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 129034758 A/G 1 76 101 177 35.3712359991711 53.9934890011015 -18.6222530019304 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00525743507387166 ENSG00000184897:ENST00000333762:exon_129033615_129035117:H1FX HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 132277907 G/A 1 19 5 24 8.84280899979279 2.67294500005453 6.16986399973826 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0130248631872869 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132276988_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000485198:exon_132277316_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132277668_132277929:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132276986_132277929:NPHP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 19 12 31 8.84280899979279 6.41506800013087 2.42774099966191 A:G G A 10 0.534589000010906 0.47233262636417 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 137881265 T/A 1 13 16 29 6.05034299985822 8.5534240001745 -2.50308100031627 A:T T A 10 0.534589000010906 0.359545966755733 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 140695307 C/A 1 31 34 65 14.4277409996619 18.1760260003708 -3.74828500070889 A:C C A 10 0.534589000010906 0.385012644966641 ENSG00000114120:ENST00000446041:exon_140695105_140698775:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000324194:exon_140695102_140695492:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000502594:exon_140695102_140695325:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000453248:exon_140695102_140695323:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000511757:exon_140695102_140695489:SLC25A36 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 142168331 C/T 1 15 18 33 6.98116499983641 9.62260200019631 -2.6414370003599 T:C C T 10 0.534589000010906 0.386417985090157 ENSG00000175054:ENST00000504521:exon_142168077_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515810:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142168080_142172075:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142168080_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515107:exon_142168160_142168444:ATR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 42 0 42 19.5472619995419 0 19.5472619995419 G G 10 0.534589000010906 4.32575704977318e-12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 148786108 C/T 1 10 8 18 4.65410999989094 4.27671200008725 0.377397999803692 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392913:exon_148786027_148786122:HLTF HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 148872987 G/A 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 A:G G A 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148872894_148873002:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148872894_148873002:HPS3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 148881673 C/T 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 T:C C T 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148881629_148881736:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148881629_148881736:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460822:exon_148881629_148881736:HPS3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 154 0 154 71.6732939983205 0 71.6732939983205 T T 10 0.534589000010906 2.28158389218866e-42 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 31 21 52 14.4277409996619 11.226369000229 3.20137199943288 C:G C G 10 0.534589000010906 0.40639789765689 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 155560259 C/T 1 7 6 13 3.25787699992366 3.20753400006544 0.0503429998582212 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000169359:ENST00000392845:exon_155560221_155560408:SLC33A1;ENSG00000169359:ENST00000359479:exon_155560221_155560408:SLC33A1;ENSG00000169359:ENST00000496772:exon_155560221_155560394:SLC33A1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 158320597 T/C 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 T:C T C 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 158366900 G/A 1 16 22 38 7.4465759998255 11.7609580002399 -4.31438200041443 A:G G A 10 0.534589000010906 0.193300941450225 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478251:exon_158366830_158368809:GFM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 6 14 20 2.79246599993456 7.48424600015268 -4.69178000021812 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0431004774055677 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 54 38 92 25.1321939994111 20.3143820004144 4.81781199899665 T:C C T 10 0.534589000010906 0.347422722961324 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 182755209 T/G 1 32 26 58 14.893151999651 13.8993140002836 0.99383799936745 T:G T G 10 0.534589000010906 0.895437256231146 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182755202_182755222:MCCC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 33 38 71 15.3585629996401 20.3143820004144 -4.95581900077433 T:C T C 10 0.534589000010906 0.284239524218677 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 66 68 134 30.7171259992802 36.3520520007416 -5.63492600146141 T:C C T 10 0.534589000010906 0.341687873195869 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 44 52 96 20.4780839995201 27.7986280005671 -7.32054400104698 C:G C G 10 0.534589000010906 0.151920166085499 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 183560195 A/G 1 19 25 44 8.84280899979279 13.3647250002727 -4.52191600047987 A:G A G 10 0.534589000010906 0.177359294183873 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 183960412 A/G 1 57 43 100 26.5284269993784 22.987327000469 3.5410999989094 A:G A G 10 0.534589000010906 0.48514216076517 ENSG00000214160:ENST00000411922:exon_183960089_183960464:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000397676:exon_183960122_183960464:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000445626:exon_183960213_183960464:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000458439:exon_183960213_183960464:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000418734:exon_183960213_183960464:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000485912:exon_183960247_183960464:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000455059:exon_183960257_183960464:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000446569:exon_183960362_183960464:ALG3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 184026652 C/T 1 109 104 213 50.7297989988112 55.5972560011342 -4.86745700232299 T:C C T 10 0.534589000010906 0.536612418325869 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184026496_184026842:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184026496_184026788:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184026496_184026836:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000358216:exon_184026650_184026682:PSMD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 184039666 A/G 1 116 132 248 53.9876759987349 70.5657480014396 -16.5780720027047 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0357555500890966 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000457456:exon_184039070_184039815:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 186301703 A/G 1 47 55 102 21.8743169994874 29.4023950005998 -7.52807800111242 A:G A G 10 0.534589000010906 0.137804302111957 ENSG00000090520:ENST00000439351:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000265028:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000495390:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000418776:exon_186301654_186301765:DNAJB11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 186509517 G/A 1 108 94 202 50.2643879988222 50.2513660010252 0.013021997796983 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 186793423 C/T 1 77 59 136 35.8366469991602 31.5407510006435 4.29589599851678 T:C C T 10 0.534589000010906 0.492163105292875 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000457772:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186793350_186793640:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000470633:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000392479:exon_186793350_186796341:ST6GAL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 192516430 C/T 1 14 2 16 6.51575399984732 1.06917800002181 5.4465759998255 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00557247115706583 ENSG00000180611:ENST00000392452:exon_192514604_192517439:C3orf59;ENSG00000180611:ENST00000315470:exon_192514607_192517439:C3orf59 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 193334991 G/A 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 A:G G A 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000419435:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392436:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000487986:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000434811:exon_193334967_193335074:OPA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 13 27 40 6.05034299985822 14.4339030002945 -8.38356000043624 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0103743402619893 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 195452951 G/C 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 C:G G C 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 195599180 C/T 1 3 9 12 1.39623299996728 4.81130100009815 -3.41506800013087 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0784465209153547 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195599147_195599253:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000481865:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000424563:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000478623:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000411741:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000489628:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000478715:exon_195599147_195599274:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000468680:exon_195599147_195599677:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000316664:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000486523:exon_195599151_195599341:TNK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 195778972 C/T 1 33 66 99 15.3585629996401 35.2828740007198 -19.9243110010797 T:C C T 10 0.534589000010906 7.02116635154354e-05 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195776155_195779055:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195776155_195779055:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195776347_195779055:TFRC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 195975139 A/C 1 2 11 13 0.930821999978188 5.88047900011997 -4.94965700014178 A:T:C A C 10 0.534589000010906 0.00930031863621162 ENSG00000161217:ENST00000441879:exon_195975078_195975194:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000419333:exon_195975078_195975194:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000292823:exon_195975078_195975194:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000431016:exon_195975078_195975194:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000411591:exon_195975078_195975194:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000430755:exon_195975078_195975194:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000416798:exon_195975078_195975194:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000473978:exon_195974238_195975194:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000488235:exon_195975078_195975144:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000460677:exon_195974238_195975194:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000444822:exon_195975078_195975194:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000412869:exon_195975078_195975194:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000438634:exon_195975078_195975194:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000491544:exon_195975078_195975194:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000443555:exon_195975078_195975194:PCYT1A;ENSG00000213123:ENST00000431391:exon_195975101_195975194:TCTEX1D2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 196199204 G/T 1 53 47 100 24.666782999422 25.1256830005126 -0.458900001090605 T:G G T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 196210590 A/G 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 196210808 T/C 1 7 1 8 3.25787699992366 0.534589000010906 2.72328799991275 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0755591978202379 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 22 14 36 10.2390419997601 7.48424600015268 2.75479599960738 T:C T C 10 0.534589000010906 0.405804289066246 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 196386644 C/T 1 37 26 63 17.2202069995965 13.8993140002836 3.32089299931292 T:C C T 10 0.534589000010906 0.449479387950434 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 196460680 C/T 1 22 20 42 10.2390419997601 10.6917800002181 -0.452738000458053 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196460630_196462878:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196460630_196462855:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196460630_196460773:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196460630_196460911:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196460630_196461160:PIGX HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 196613075 C/T 1 10 13 23 4.65410999989094 6.94965700014178 -2.29554700025084 T:C C T 10 0.534589000010906 0.404969031814226 ENSG00000119231:ENST00000323460:exon_196612022_196613565:SENP5;ENSG00000119231:ENST00000445299:exon_196612022_196613565:SENP5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 196663878 C/A 1 153 163 316 71.2078829983314 87.1380070017777 -15.9301240034463 A:C C A 10 0.534589000010906 0.0802942084044176 ENSG00000114503:ENST00000447325:exon_196662277_196663953:NCBP2;ENSG00000114503:ENST00000321256:exon_196662278_196663953:NCBP2;ENSG00000114503:ENST00000463783:exon_196662278_196666303:NCBP2;ENSG00000114503:ENST00000428425:exon_196662280_196663953:NCBP2;ENSG00000114503:ENST00000427641:exon_196662305_196663953:NCBP2;ENSG00000114503:ENST00000452404:exon_196663648_196663953:NCBP2;ENSG00000114503:ENST00000468923:exon_196663704_196664519:NCBP2;ENSG00000114503:ENST00000422610:exon_196663797_196663953:NCBP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 196730759 G/A 1 5 10 15 2.32705499994547 5.34589000010906 -3.01883500016359 A:G G A 10 0.534589000010906 0.128857341400782 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 196743130 T/C 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196743060_196743240:MFI2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 3 196746629 T/C 1 15 4 19 6.98116499983641 2.13835600004362 4.84280899979279 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0359770464172895 ENSG00000163975:ENST00000296351:exon_196745824_196746672:MFI2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 86798 C/T 1 13 3 16 6.05034299985822 1.60376700003272 4.4465759998255 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0414802081249136 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 87113 T/C 1 9 2 11 4.18869899990185 1.06917800002181 3.11952099988003 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0723916304569276 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 155713 A/G 1 2 8 10 0.930821999978188 4.27671200008725 -3.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0527671529214564 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 843508 C/T 1 90 57 147 41.8869899990185 30.4715730006216 11.4154169983968 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0685846862983009 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843064_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843065_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843096_843562:GAK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 843695 A/G 1 79 68 147 36.7674689991384 36.3520520007416 0.415416998396815 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843680_844197:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843680_843856:GAK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 19 26 45 8.84280899979279 13.8993140002836 -5.05650500049077 A:G A G 10 0.534589000010906 0.137500608377384 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 941518 C/T 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 T:C C T 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000507319:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505734:exon_941497_942377:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504744:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513682:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504505:exon_941497_941942:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514546:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504850:exon_941497_942298:TMEM175 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 946226 T/C 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 T:C T C 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515492:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504180:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000506669:exon_946199_946238:TMEM175 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 1165130 G/T 1 9 7 16 4.18869899990185 3.74212300007634 0.446575999825503 T:G G T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000159674:ENST00000290902:exon_1165051_1165274:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000431380:exon_1165051_1165274:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000507466:exon_1165051_1165413:SPON2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 110 138 248 51.1952099988003 73.773282001505 -22.5780720027047 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0041573483235797 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 14 21 35 6.51575399984732 11.226369000229 -4.71061500038171 T:C C T 10 0.534589000010906 0.127799241921893 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 2822467 G/T 1 10 3 13 4.65410999989094 1.60376700003272 3.05034299985822 T:G G T 10 0.534589000010906 0.102317208684754 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 2826912 C/G 1 8 4 12 3.72328799991275 2.13835600004362 1.58493199986913 C:G C G 10 0.534589000010906 0.401454124777931 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2826853_2826947:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2826478_2826923:SH3BP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 13 12 25 6.05034299985822 6.41506800013087 -0.364725000272651 T:G T G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 2933271 G/A 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 A:G G A 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000109736:ENST00000508276:exon_2933102_2933663:MFSD10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 33 28 61 15.3585629996401 14.9684920003054 0.390070999334732 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 55 62 117 25.5976049994002 33.1445180006762 -7.546913001276 A:G A G 10 0.534589000010906 0.165627213688177 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 3162056 C/T 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 T:C C T 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3162009_3162119:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3162009_3162119:HTT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 3213832 G/A 1 9 13 22 4.18869899990185 6.94965700014178 -2.76095800023993 A:G G A 10 0.534589000010906 0.287120525503420 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000509751:exon_3213639_3213869:HTT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 23 19 42 10.7044529997492 10.1571910002072 0.547261999541947 T:C T C 10 0.534589000010906 0.87867221204653 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 3227419 A/G 1 32 19 51 14.893151999651 10.1571910002072 4.73596099944379 A:G A G 10 0.534589000010906 0.207452924112523 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 3234980 G/A 1 12 7 19 5.58493199986913 3.74212300007634 1.84280899979278 A:G G A 10 0.534589000010906 0.492933071348704 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3234890_3235080:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3234890_3235080:HTT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 6302707 C/T 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 T:C C T 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 6303022 C/T 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 T:C C T 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 6303354 G/A 1 5 14 19 2.32705499994547 7.48424600015268 -5.15719100020721 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0208403668812872 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 6303955 G/A 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 A:G G A 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 6304087 A/G 1 8 4 12 3.72328799991275 2.13835600004362 1.58493199986913 A:G A G 10 0.534589000010906 0.401454124777931 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 6304242 T/C 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 6600012 A/G 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6599925_6600081:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6599925_6600081:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6599925_6600081:MAN2B2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 6606864 A/G 1 8 10 18 3.72328799991275 5.34589000010906 -1.62260200019631 A:G A G 10 0.534589000010906 0.485331297542652 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6606782_6607056:MAN2B2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 6616056 C/T 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 T:C C T 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6615945_6616082:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6615945_6616082:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6615945_6616082:MAN2B2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 6864690 T/C 1 9 14 23 4.18869899990185 7.48424600015268 -3.29554700025084 T:C T C 10 0.534589000010906 0.210289302298530 ENSG00000170871:ENST00000425103:exon_6862628_6865910:KIAA0232;ENSG00000170871:ENST00000307659:exon_6862628_6865910:KIAA0232 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 8228948 T/C 1 6 11 17 2.79246599993456 5.88047900011997 -3.0880130001854 T:C T C 10 0.534589000010906 0.150155070613150 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000514274:exon_8228707_8229196:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508438:exon_8228688_8229000:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 15 15 30 6.98116499983641 8.01883500016359 -1.03767000032718 A:G A G 10 0.534589000010906 0.718295138743325 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 8229774 C/T 1 13 10 23 6.05034299985822 5.34589000010906 0.704452999749162 T:C C T 10 0.534589000010906 0.836527371779212 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 11 11 22 5.11952099988003 5.88047900011997 -0.760958000239933 T:C T C 10 0.534589000010906 0.832013937520133 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 1 3 10 13 1.39623299996728 5.34589000010906 -3.94965700014178 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0473534851625257 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 10446906 A/G 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:G A G 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 10447168 C/G 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 C:G C G 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 17581449 C/T 1 43 44 87 20.012672999531 23.5219160004799 -3.50924300094882 T:C C T 10 0.534589000010906 0.454288275549764 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17581447_17581562:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508497:exon_17581447_17581562:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000512397:exon_17581447_17581562:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000509583:exon_17581447_17581562:LAP3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 17818885 T/C 1 13 9 22 6.05034299985822 4.81130100009815 1.23904199976007 T:C T C 10 0.534589000010906 0.672470686731093 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000509719:exon_17818855_17819076:NCAPG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 28 17 45 13.0315079996946 9.0880130001854 3.94349499950923 T:C T C 10 0.534589000010906 0.295613948073502 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 36069805 G/A 1 8 10 18 3.72328799991275 5.34589000010906 -1.62260200019631 A:G G A 10 0.534589000010906 0.485331297542652 ENSG00000047365:ENST00000303965:exon_36067620_36069900:ARAP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 37903669 A/G 1 4 10 14 1.86164399995638 5.34589000010906 -3.48424600015268 A:G A G 10 0.534589000010906 0.104581828814314 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 37903756 T/C 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 37904082 T/C 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 T:C T C 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 39000305 A/G 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_39000260_39000529:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000372489:exon_39000243_39000529:TMEM156 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 30 29 59 13.9623299996728 15.5030810003163 -1.54075100064346 T:C:G T C 10 0.534589000010906 0.697537250273704 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 40138676 A/G 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 A:G A G 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000078177:ENST00000261435:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000381804:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000511480:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000513269:exon_40138564_40138702:N4BP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 40428010 T/C 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40425272_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40425698_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40426355_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40427429_40428160:RBM47 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 44682465 T/C 1 16 4 20 7.4465759998255 2.13835600004362 5.30821999978188 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0228601800517913 ENSG00000151806:ENST00000281543:exon_44682458_44682569:GUF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 53751932 C/T 1 23 9 32 10.7044529997492 4.81130100009815 5.89315199965101 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0496635850803187 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_53751914_53752033:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_53751914_53752033:SCFD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 54011526 A/G 1 10 13 23 4.65410999989094 6.94965700014178 -2.29554700025084 A:G A G 10 0.534589000010906 0.404969031814226 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 54232110 G/A 1 9 8 17 4.18869899990185 4.27671200008725 -0.0880130001854029 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54231271_54232242:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54231271_54232228:SCFD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 54327235 T/C 1 12 14 26 5.58493199986913 7.48424600015268 -1.89931400028356 T:C T C 10 0.534589000010906 0.556366621174457 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 54327584 A/G 1 13 17 30 6.05034299985822 9.0880130001854 -3.03767000032718 A:G A G 10 0.534589000010906 0.27812385936588 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 56291528 T/C 1 9 9 18 4.18869899990185 4.81130100009815 -0.622602000196309 T:C T C 10 0.534589000010906 0.81636697210269 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 57301681 G/A 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57301516_57301781:PPAT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 57344588 A/G 1 23 24 47 10.7044529997492 12.8301360002617 -2.12568300051258 A:G A G 10 0.534589000010906 0.561062064368195 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57344545_57344669:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000505314:exon_57344545_57344669:SRP72 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 57796900 G/A 1 12 14 26 5.58493199986913 7.48424600015268 -1.89931400028356 A:G G A 10 0.534589000010906 0.556366621174457 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 57798174 C/G 1 10 11 21 4.65410999989094 5.88047900011997 -1.22636900022903 C:G C G 10 0.534589000010906 0.664535375129959 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 57830663 T/C 1 32 33 65 14.893151999651 17.6414370003599 -2.74828500070889 T:C T C 10 0.534589000010906 0.535099759716054 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57830572_57830692:C4orf14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 57843295 C/A 1 25 17 42 11.6352749997273 9.0880130001854 2.54726199954195 A:C C A 10 0.534589000010906 0.444674407068755 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57842608_57844989:C4orf14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 67 59 126 31.1825369992693 31.5407510006435 -0.358214001374161 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 43 37 80 20.012672999531 19.7797930004035 0.232879999127519 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 89 85 174 41.4215789990294 45.440065000927 -4.01848600189765 T:C C T 10 0.534589000010906 0.544293972911925 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 71702024 T/C 1 52 43 95 24.2013719994329 22.987327000469 1.21404499896393 T:C T C 10 0.534589000010906 0.837514287725616 ENSG00000132463:ENST00000254799:exon_71701875_71702031:GRSF1;ENSG00000132463:ENST00000439371:exon_71701875_71702031:GRSF1;ENSG00000132463:ENST00000505068:exon_71701875_71702031:GRSF1;ENSG00000132463:ENST00000499044:exon_71701875_71702031:GRSF1;ENSG00000132463:ENST00000502323:exon_71701875_71702031:GRSF1;ENSG00000132463:ENST00000514161:exon_71701875_71702031:GRSF1;ENSG00000132463:ENST00000508091:exon_71701875_71702031:GRSF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 30 35 65 13.9623299996728 18.7106150003817 -4.74828500070889 A:G G A 10 0.534589000010906 0.263773447043946 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 77039193 A/T 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:T A T 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000138750:ENST00000508604:exon_77038817_77039347:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77039099_77039347:NUP54 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 77053834 T/C 1 50 29 79 23.2705499994547 15.5030810003163 7.76746899913842 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0905139765398768 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514313:exon_77053473_77053872:NUP54 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 77055474 A/G 1 11 19 30 5.11952099988003 10.1571910002072 -5.03767000032718 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0694515651240427 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77055329_77055515:NUP54 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 77057501 A/G 1 13 9 22 6.05034299985822 4.81130100009815 1.23904199976007 A:G A G 10 0.534589000010906 0.672470686731093 ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77057341_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77057474_77057565:NUP54 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 77065580 T/C 1 9 13 22 4.18869899990185 6.94965700014178 -2.76095800023993 T:C T C 10 0.534589000010906 0.287120525503420 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508583:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514901:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510569:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510884:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000513352:exon_77065543_77065626:NUP54 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 77675925 G/A 1 9 1 10 4.18869899990185 0.534589000010906 3.65410999989094 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0244567728924624 ENSG00000138771:ENST00000296043:exon_77675464_77676345:SHROOM3;ENSG00000138771:ENST00000264907:exon_77675464_77676345:SHROOM3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 83795806 T/C 1 4 11 15 1.86164399995638 5.88047900011997 -4.01883500016359 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0413471963302241 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000436790:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503058:exon_83795764_83795904:SEC31A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 12 18 30 5.58493199986913 9.62260200019631 -4.03767000032718 T:C C T 10 0.534589000010906 0.147392324053680 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 84380955 G/T 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:G G T 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 84383810 C/T 1 9 3 12 4.18869899990185 1.60376700003272 2.58493199986913 T:C C T 10 0.534589000010906 0.157534918401888 ENSG00000163322:ENST00000321945:exon_84382092_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000475656:exon_84382098_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000506553:exon_84383162_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000504777:exon_84383228_84384055:FAM175A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 87968580 C/T 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 T:C C T 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000172493:ENST00000504956:exon_87967847_87969201:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000507468:exon_87967847_87968746:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000395146:exon_87967847_87968746:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000395142:exon_87967847_87968746:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000503477:exon_87967847_87968746:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000307808:exon_87967847_87968746:AFF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 88293887 G/A 1 7 15 22 3.25787699992366 8.01883500016359 -4.76095800023993 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0532500340847999 ENSG00000198189:ENST00000358290:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000507518:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000502576:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000507286:exon_88293861_88293967:HSD17B11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 89625427 G/C 0 0 8 8 0 4.27671200008725 -4.27671200008725 C G C 10 0.534589000010906 0.00220137053379731 ENSG00000138641:ENST00000402738:exon_89625249_89625432:HERC3;ENSG00000138641:ENST00000264345:exon_89625249_89625432:HERC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 90034686 A/G 1 5 8 13 2.32705499994547 4.27671200008725 -1.94965700014178 A:G A G 10 0.534589000010906 0.405475359831307 ENSG00000180346:ENST00000317005:exon_90033968_90036050:TIGD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 90035549 A/G 1 8 14 22 3.72328799991275 7.48424600015268 -3.76095800023993 A:G A G 10 0.534589000010906 0.134711925154703 ENSG00000180346:ENST00000317005:exon_90033968_90036050:TIGD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 95186055 A/G 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 A:G A G 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000506089:exon_95185679_95186057:SMARCAD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 103225513 T/C 1 17 11 28 7.9119869998146 5.88047900011997 2.03150799969463 T:C T C 10 0.534589000010906 0.457094536572337 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512337:exon_103225474_103225645:SLC39A8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 103228734 C/T 1 6 9 15 2.79246599993456 4.81130100009815 -2.01883500016359 T:C C T 10 0.534589000010906 0.313814139216668 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000510255:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512657:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000502903:exon_103228714_103228762:SLC39A8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 104061551 T/G 1 28 33 61 13.0315079996946 17.6414370003599 -4.60992900066527 T:G T G 10 0.534589000010906 0.249966277990836 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061413_104061571:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061413_104061571:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061413_104061571:CENPE HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 108575989 G/A 1 10 6 16 4.65410999989094 3.20753400006544 1.4465759998255 A:G G A 10 0.534589000010906 0.618055081094626 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108575851_108576056:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108575851_108576056:PAPSS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 108581223 A/G 1 12 20 32 5.58493199986913 10.6917800002181 -5.10684800034899 A:G A G 10 0.534589000010906 0.077632991998878 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108581115_108581228:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108581115_108581228:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000502431:exon_108581116_108581228:PAPSS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 110603784 T/C 1 26 22 48 12.1006859997164 11.7609580002399 0.33972799947651 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 146 107 253 67.9500059984077 57.2010230011669 10.7489829972408 A:T A T 10 0.534589000010906 0.185827062214218 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 119200331 T/C 1 17 14 31 7.9119869998146 7.48424600015268 0.427740999661912 A:T:C:G T C 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 128723042 T/C 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 T:C T C 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000164070:ENST00000508776:exon_128722940_128723073:HSPA4L;ENSG00000164070:ENST00000296464:exon_128722940_128723073:HSPA4L;ENSG00000164070:ENST00000508549:exon_128722940_128723073:HSPA4L;ENSG00000164070:ENST00000505726:exon_128722940_128723073:HSPA4L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 128748465 C/T 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 T:C C T 10 0.534589000010906 0.298446592097252 ENSG00000164070:ENST00000508776:exon_128748460_128748579:HSPA4L;ENSG00000164070:ENST00000296464:exon_128748460_128748579:HSPA4L;ENSG00000164070:ENST00000505726:exon_128748460_128748579:HSPA4L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 128807219 T/A 1 24 18 42 11.1698639997383 9.62260200019631 1.54726199954194 A:T T A 10 0.534589000010906 0.646830707540118 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128806863_128807781:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128806863_128807883:PLK4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 128814964 G/T 1 6 10 16 2.79246599993456 5.34589000010906 -2.5534240001745 T:G G T 10 0.534589000010906 0.219453370200368 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000508113:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814889_128815036:PLK4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 129012638 A/G 1 14 18 32 6.51575399984732 9.62260200019631 -3.10684800034899 A:G A G 10 0.534589000010906 0.29168355485208 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000394288:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000432347:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129012502_129012667:LARP1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 129043204 C/G 1 5 14 19 2.32705499994547 7.48424600015268 -5.15719100020721 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0208403668812872 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 129043286 C/T 1 9 9 18 4.18869899990185 4.81130100009815 -0.622602000196309 T:C C T 10 0.534589000010906 0.81636697210269 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507259:exon_129043272_129043343:LARP1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 129792857 G/A 1 13 7 20 6.05034299985822 3.74212300007634 2.30821999978188 A:G G A 10 0.534589000010906 0.372688141283748 ENSG00000077684:ENST00000226319:exon_129792510_129796379:PHF17;ENSG00000077684:ENST00000452328:exon_129792510_129796379:PHF17;ENSG00000077684:ENST00000512960:exon_129792510_129793489:PHF17 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 130030644 C/T 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 130032843 A/G 1 17 5 22 7.9119869998146 2.67294500005453 5.23904199976007 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0310922550633381 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130032841_130034487:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130032841_130033842:C4orf33 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 152609784 C/T 1 7 8 15 3.25787699992366 4.27671200008725 -1.01883500016359 T:C C T 10 0.534589000010906 0.615581524507087 ENSG00000059691:ENST00000263985:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515812:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515564:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000503160:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000510720:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000513504:exon_152609782_152609915:PET112L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 156617994 G/A 1 8 8 16 3.72328799991275 4.27671200008725 -0.553424000174497 A:G G A 10 0.534589000010906 0.807042042252045 ENSG00000164116:ENST00000506455:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000511108:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000357469:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000512983:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000511507:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000515602:exon_156617908_156618001:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000455639:exon_156617958_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000509901:exon_156617908_156618212:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000443668:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000296518:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000515201:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000513574:exon_156617908_156618274:GUCY1A3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 159601676 C/T 1 13 7 20 6.05034299985822 3.74212300007634 2.30821999978188 T:C C T 10 0.534589000010906 0.372688141283748 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000436096:exon_159601619_159601759:ETFDH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 164415930 C/T 1 69 61 130 32.1133589992475 32.6099290006653 -0.496570001417787 T:C C T 10 0.534589000010906 0.930222859963654 ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164415613_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164415819_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164415840_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164415860_164415956:C4orf43 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 30 50 80 13.9623299996728 26.7294500005453 -12.7671200008725 A:T:C:G A C 10 0.534589000010906 0.00485567229646624 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 59 58 117 27.4592489993565 31.0061620006325 -3.54691300127601 T:C T C 10 0.534589000010906 0.517983189395025 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 169176996 G/A 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 A:G G A 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169176862_169177020:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000505393:exon_169176862_169177020:DDX60 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 169197297 C/T 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 T:C C T 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169197166_169197332:DDX60 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 178231071 G/A 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 A:G G A 10 0.534589000010906 0.156883047615629 ENSG00000109674:ENST00000264596:exon_178230990_178231263:NEIL3;ENSG00000109674:ENST00000513321:exon_178231057_178231263:NEIL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 178274835 A/C 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:C A C 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000109674:ENST00000264596:exon_178274462_178274882:NEIL3;ENSG00000109674:ENST00000513321:exon_178274462_178275433:NEIL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 59 50 109 27.4592489993565 26.7294500005453 0.729798998811241 T:C C T 10 0.534589000010906 0.923697598616269 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 4 186379735 T/C 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 T:C T C 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 434722 G/C 1 27 10 37 12.5660969997055 5.34589000010906 7.22020699959648 C:G G C 10 0.534589000010906 0.020208051215854 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_433968_434972:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 434981 G/C 1 9 12 21 4.18869899990185 6.41506800013087 -2.22636900022903 C:G G C 10 0.534589000010906 0.384849165712211 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 442571 A/C 1 10 10 20 4.65410999989094 5.34589000010906 -0.69178000021812 A:C A C 10 0.534589000010906 0.824629775002564 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 479905 A/C 1 14 24 38 6.51575399984732 12.8301360002617 -6.31438200041443 A:C A C 10 0.534589000010906 0.0500243413381889 ENSG00000066230:ENST00000507407:exon_479752_480080:SLC9A3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 1057615 A/G 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000514994:exon_1057326_1057764:SLC12A7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 38 52 90 17.6856179995856 27.7986280005671 -10.1130100009815 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.0346526366095909 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 1467004 A/G 1 24 26 50 11.1698639997383 13.8993140002836 -2.7294500005453 A:G A G 10 0.534589000010906 0.479836118157417 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 5461103 G/A 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 5462607 A/G 1 14 9 23 6.51575399984732 4.81130100009815 1.70445299974916 A:G A G 10 0.534589000010906 0.535325651889601 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 5462620 G/A 1 11 11 22 5.11952099988003 5.88047900011997 -0.760958000239933 A:G G A 10 0.534589000010906 0.832013937520133 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 5489383 G/A 1 33 41 74 15.3585629996401 21.9181490004471 -6.55958600080705 A:G G A 10 0.534589000010906 0.131193793069129 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5489262_5490347:KIAA0947 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 6600150 G/A 1 199 156 355 92.6167889978297 83.3958840017013 9.22090499612835 A:G G A 10 0.534589000010906 0.338505324492626 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6600143_6600345:NSUN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 6604787 C/T 1 36 52 88 16.7547959996074 27.7986280005671 -11.0438320009597 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.0188565284219962 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604718_6604995:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6604718_6604821:NSUN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 6605532 C/A 1 10 10 20 4.65410999989094 5.34589000010906 -0.69178000021812 A:C C A 10 0.534589000010906 0.824629775002564 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 6623354 C/T 1 32 24 56 14.893151999651 12.8301360002617 2.06301599938926 T:C C T 10 0.534589000010906 0.595366790253859 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6623327_6623398:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6623327_6623398:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6623327_6623398:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505264:exon_6623327_6623398:NSUN2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 6633779 C/G 1 10 12 22 4.65410999989094 6.41506800013087 -1.76095800023993 C:G C G 10 0.534589000010906 0.524043562584602 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 7866821 T/C 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 T:C T C 10 0.534589000010906 0.592941099997918 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000511261:exon_7866759_7867502:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 7866967 G/C 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000511261:exon_7866759_7867502:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 7868030 T/C 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 T:C T C 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000504695:exon_7867463_7868220:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507572:exon_7867603_7868145:FASTKD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 7878424 T/A 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 A:T T A 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 7889216 G/A 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 A:G G A 10 0.534589000010906 0.592941099997918 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7889208_7889276:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 7889304 C/T 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 T:C C T 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 14741984 T/C 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 T:C T C 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000154122:ENST00000284268:exon_14741936_14742031:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000503939:exon_14741936_14742031:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000515517:exon_14741566_14742031:ANKH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 33989518 C/T 1 14 4 18 6.51575399984732 2.13835600004362 4.37739799980369 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0559940525767233 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33989216_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33988789_33989607:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 34008100 C/T 1 6 8 14 2.79246599993456 4.27671200008725 -1.48424600015268 T:C C T 10 0.534589000010906 0.437971150157616 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_34007878_34008213:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_34007878_34008133:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_34007878_34008209:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_34007878_34008189:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_34007878_34008133:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_34007878_34008133:AMACR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 36171780 A/G 1 12 18 30 5.58493199986913 9.62260200019631 -4.03767000032718 A:G A G 10 0.534589000010906 0.147392324053680 ENSG00000145604:ENST00000274254:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000274255:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000308927:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000509692:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000513151:exon_36171705_36171835:SKP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 42800808 C/T 1 28 26 54 13.0315079996946 13.8993140002836 -0.867806000588926 T:C C T 10 0.534589000010906 0.891699579713607 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 43039793 T/C 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 T:C T C 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 43297144 A/G 1 30 21 51 13.9623299996728 11.226369000229 2.73596099944379 A:G A G 10 0.534589000010906 0.484628676451642 ENSG00000112972:ENST00000325110:exon_43297104_43297268:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000433297:exon_43297104_43297268:HMGCS1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 44809162 G/C 1 55 52 107 25.5976049994002 27.7986280005671 -2.20102300116694 C:G G C 10 0.534589000010906 0.698861902491104 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 56178217 A/C 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 A:C A C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000095015:ENST00000399503:exon_56177397_56178693:MAP3K1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 27 21 48 12.5660969997055 11.226369000229 1.33972799947651 A:G G A 10 0.534589000010906 0.773000593890766 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 64881936 A/G 1 25 14 39 11.6352749997273 7.48424600015268 4.15102899957466 A:G A G 10 0.534589000010906 0.201572301274183 ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000513773:exon_64881826_64882008:PPWD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 65108215 A/G 1 25 12 37 11.6352749997273 6.41506800013087 5.22020699959648 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0995259003658365 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000509935:exon_65108082_65108218:NLN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 66478626 T/C 1 26 37 63 12.1006859997164 19.7797930004035 -7.67910700068708 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0581676187521219 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 66478729 A/G 1 8 16 24 3.72328799991275 8.5534240001745 -4.83013600026174 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0639341527338834 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 66480374 G/C 1 9 4 13 4.18869899990185 2.13835600004362 2.05034299985822 C:G G C 10 0.534589000010906 0.281774765265439 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180;ENSG00000134061:ENST00000515027:exon_66480350_66480413:CD180 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 67588148 G/A 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 A:C:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000523807:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000522084:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000320694:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000336483:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518292:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518813:exon_67586628_67588189:PIK3R1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 67593433 G/A 1 17 15 32 7.9119869998146 8.01883500016359 -0.106848000348994 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67593240_67597649:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67593240_67594581:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67593240_67597647:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67593240_67597649:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000320694:exon_67593240_67594411:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000336483:exon_67593240_67594411:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518813:exon_67593240_67594433:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000523872:exon_67593240_67594584:PIK3R1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 68417643 C/T 1 5 7 12 2.32705499994547 3.74212300007634 -1.41506800013087 T:C C T 10 0.534589000010906 0.565015885912817 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68417580_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68417574_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000512367:exon_68417521_68417722:SLC30A5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 27 22 49 12.5660969997055 11.7609580002399 0.805138999465605 A:T A T 10 0.534589000010906 0.886563011000463 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 68471247 G/A 1 99 71 170 46.0756889989203 37.9558190007743 8.11986999814598 A:G G A 10 0.534589000010906 0.219402905550165 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000505500:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000507798:exon_68471224_68471364:CCNB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 70800475 C/T 0 10 0 10 4.65410999989094 0 4.65410999989094 C C 10 0.534589000010906 0.00238317236301322 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70800448_70800578:BDP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 15 4 19 6.98116499983641 2.13835600004362 4.84280899979279 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0359770464172895 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 12 8 20 5.58493199986913 4.27671200008725 1.30821999978188 A:T T A 10 0.534589000010906 0.656685513222068 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 70858194 C/T 1 12 5 17 5.58493199986913 2.67294500005453 2.9119869998146 T:C C T 10 0.534589000010906 0.223771329291868 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70858101_70858347:BDP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 70858342 A/G 1 11 12 23 5.11952099988003 6.41506800013087 -1.29554700025084 A:G A G 10 0.534589000010906 0.677644254347807 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70858101_70858347:BDP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 72874907 A/C 1 19 11 30 8.84280899979279 5.88047900011997 2.96232999967282 A:C A C 10 0.534589000010906 0.360536373270145 ENSG00000164338:ENST00000296792:exon_72874842_72874975:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000509005:exon_72874842_72874975:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000508491:exon_72874842_72874975:UTP15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 73985215 A/G 1 22 20 42 10.2390419997601 10.6917800002181 -0.452738000458053 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000049860:ENST00000511181:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000515528:exon_73985153_73985674:HEXB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 74656175 G/A 1 38 38 76 17.6856179995856 20.3143820004144 -2.62876400082886 A:G G A 10 0.534589000010906 0.566812655968175 ENSG00000113161:ENST00000511206:exon_74656113_74656583:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000287936:exon_74656113_74657929:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000343975:exon_74656113_74657248:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000429286:exon_74656113_74657924:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000509085:exon_74656113_74656307:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000511986:exon_74656113_74656306:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000512053:exon_74656113_74656354:HMGCR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 74981153 G/A 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 A:G G A 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_74981032_74981309:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_74981032_74981309:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_74981032_74981309:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_74981032_74981309:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_74981032_74981309:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_74981032_74981309:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503521:exon_74981032_74981193:POC5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 74998598 G/A 1 15 10 25 6.98116499983641 5.34589000010906 1.63527499972735 A:G G A 10 0.534589000010906 0.553361397131065 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_74998430_74998657:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_74998440_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_74998495_74998635:POC5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 75003678 T/C 1 3 11 14 1.39623299996728 5.88047900011997 -4.48424600015268 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0282018025011262 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000507421:exon_75003309_75003700:POC5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 75906851 T/C 1 4 10 14 1.86164399995638 5.34589000010906 -3.48424600015268 T:C T C 10 0.534589000010906 0.104581828814314 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000504254:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000513534:exon_75906845_75907008:IQGAP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 75932869 C/T 1 4 10 14 1.86164399995638 5.34589000010906 -3.48424600015268 T:C C T 10 0.534589000010906 0.104581828814314 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75932866_75932929:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000515505:exon_75932859_75932933:IQGAP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 75932965 G/C 1 8 8 16 3.72328799991275 4.27671200008725 -0.553424000174497 C:G G C 10 0.534589000010906 0.807042042252045 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 27 22 49 12.5660969997055 11.7609580002399 0.805138999465605 T:C T C 10 0.534589000010906 0.886563011000463 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 76359024 C/A 1 25 14 39 11.6352749997273 7.48424600015268 4.15102899957466 A:C C A 10 0.534589000010906 0.201572301274183 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76358877_76361059:AGGF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 77298682 C/T 1 68 58 126 31.6479479992584 31.0061620006325 0.641785998625839 T:C C T 10 0.534589000010906 0.929062315683376 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77296349_77298879:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77298150_77298879:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000522901:exon_77298162_77298901:AP3B1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 80604430 C/T 1 28 12 40 13.0315079996946 6.41506800013087 6.61643999956376 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0393606952949278 ENSG00000131732:ENST00000507402:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000254037:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000407610:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000506458:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000380199:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000438268:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000504502:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000505860:exon_80604226_80604530:ZCCHC9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 95234350 A/G 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 96031569 A/G 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 A:G A G 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000153113:ENST00000505143:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511097:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515160:exon_96031540_96031998:CAST;ENSG00000153113:ENST00000507487:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000421689:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512620:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000514845:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000506811:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000514055:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96031489_96031611:CAST HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 96127833 G/A 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 A:G G A 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96127764_96127895:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96127764_96127895:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503311:exon_96127764_96127895:ERAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 96139250 C/G 1 9 5 14 4.18869899990185 2.67294500005453 1.51575399984732 T:C:G C G 10 0.534589000010906 0.593864451936242 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 13 1 14 6.05034299985822 0.534589000010906 5.51575399984732 T:G G T 10 0.534589000010906 0.00243552745016188 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 1 10 1 11 4.65410999989094 0.534589000010906 4.11952099988003 A:T T A 10 0.534589000010906 0.0138045823225813 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 26 3 29 12.1006859997164 1.60376700003272 10.4969189996837 T:C C T 10 0.534589000010906 4.6628228845997e-05 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 42 3 45 19.5472619995419 1.60376700003272 17.9434949995092 T:C C T 10 0.534589000010906 8.93142204850068e-09 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 96248496 T/C 1 5 48 53 2.32705499994547 25.6602720005235 -23.333217000578 T:C T C 10 0.534589000010906 1.98174747603421e-11 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96248341_96248502:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96248341_96248502:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96248341_96248502:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96248341_96248502:ERAP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 30 3 33 13.9623299996728 1.60376700003272 12.3585629996401 T:C C T 10 0.534589000010906 5.14251092175808e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 10 6 16 4.65410999989094 3.20753400006544 1.4465759998255 A:G G A 10 0.534589000010906 0.618055081094626 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 29 27 56 13.4969189996837 14.4339030002945 -0.936984000610737 T:C C T 10 0.534589000010906 0.893599684023243 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 96512865 T/A 1 12 2 14 5.58493199986913 1.06917800002181 4.51575399984732 A:T T A 10 0.534589000010906 0.0158603999537431 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 96512871 T/A 1 10 1 11 4.65410999989094 0.534589000010906 4.11952099988003 A:T T A 10 0.534589000010906 0.0138045823225813 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 7 8 15 3.25787699992366 4.27671200008725 -1.01883500016359 C:G G C 10 0.534589000010906 0.615581524507087 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 108672946 C/T 1 18 14 32 8.37739799980369 7.48424600015268 0.893151999651006 T:C C T 10 0.534589000010906 0.859882111162457 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108670410_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108670411_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108670411_108673057:PJA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 108713970 C/T 1 15 7 22 6.98116499983641 3.74212300007634 3.23904199976007 T:C C T 10 0.534589000010906 0.201853762836156 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 108713982 T/C 1 15 8 23 6.98116499983641 4.27671200008725 2.70445299974916 T:C T C 10 0.534589000010906 0.300128883020768 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 108714298 T/C 1 37 35 72 17.2202069995965 18.7106150003817 -1.49040800078523 T:C T C 10 0.534589000010906 0.724966950158671 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 108719151 G/A 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 A:G G A 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000511624:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000512822:exon_108719097_108719221:PJA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 110439509 A/G 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 A:G A G 10 0.534589000010906 0.156883047615629 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505303:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000504122:exon_110439485_110439559:WDR36 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 110456704 A/T 1 6 13 19 2.79246599993456 6.94965700014178 -4.15719100020721 A:T A T 10 0.534589000010906 0.0664194041354686 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456697_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456694_110456839:WDR36 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 14 23 37 6.51575399984732 12.2955470002508 -5.77979300040352 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0691664147030057 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 112889374 G/A 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 A:G G A 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112889287_112889383:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000503857:exon_112889287_112889383:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000515883:exon_112889287_112889383:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112889287_112889383:YTHDC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 112917278 T/G 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 T:G T G 10 0.534589000010906 0.298446592097252 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112917114_112917406:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112917114_112917406:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112916963_112920176:YTHDC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 13 20 33 6.05034299985822 10.6917800002181 -4.6414370003599 A:T T A 10 0.534589000010906 0.117715537265185 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 114961396 C/A 1 17 8 25 7.9119869998146 4.27671200008725 3.63527499972735 A:C C A 10 0.534589000010906 0.163981935985442 ENSG00000251201:ENST00000282382:exon_114961298_114961858:TMED7-TICAM2;ENSG00000251201:ENST00000408996:exon_114961298_114961870:TMED7-TICAM2;ENSG00000251201:ENST00000333314:exon_114961298_114961711:TMED7-TICAM2;ENSG00000134970:ENST00000456936:exon_114961298_114961870:TMED7;ENSG00000134970:ENST00000508420:exon_114961298_114961679:TMED7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 115822585 C/T 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000092421:ENST00000343348:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000257414:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000282394:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000510263:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000503402:exon_115822445_115822925:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000510024:exon_115822337_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000502996:exon_115822445_115822662:SEMA6A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 121309893 T/C 1 10 4 14 4.65410999989094 2.13835600004362 2.51575399984732 T:C T C 10 0.534589000010906 0.194114354160929 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121309891_121309979:SRFBP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 121356189 T/A 1 25 18 43 11.6352749997273 9.62260200019631 2.01267299953104 A:T T A 10 0.534589000010906 0.647044752750656 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 122682348 A/G 1 23 12 35 10.7044529997492 6.41506800013087 4.28938499961829 A:G A G 10 0.534589000010906 0.175651385675006 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 122718736 G/C 1 8 10 18 3.72328799991275 5.34589000010906 -1.62260200019631 C:G G C 10 0.534589000010906 0.485331297542652 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122718713_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122718719_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122718680_122718776:CEP120 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 122727026 G/A 1 9 6 15 4.18869899990185 3.20753400006544 0.981164999836409 A:G G A 10 0.534589000010906 0.796967668188066 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000395431:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000503049:exon_122726603_122727031:CEP120 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 131007957 A/G 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 A:T:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000217128:ENST00000307968:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000307954:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000510461:exon_131007198_131008617:FNIP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 131008194 T/C 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 T:C T C 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000217128:ENST00000307968:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000307954:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000510461:exon_131007198_131008617:FNIP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 131008484 C/T 0 8 0 8 3.72328799991275 0 3.72328799991275 C C 10 0.534589000010906 0.00887189752631728 ENSG00000217128:ENST00000307968:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000307954:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000510461:exon_131007198_131008617:FNIP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 20 29 49 9.30821999978188 15.5030810003163 -6.1948610005344 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0858634698688924 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 133887780 G/A 1 9 6 15 4.18869899990185 3.20753400006544 0.981164999836409 A:G G A 10 0.534589000010906 0.796967668188066 ENSG00000043143:ENST00000512386:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000282605:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000361895:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000432594:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000413974:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000433412:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000458562:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000448712:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000402835:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000395003:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000431355:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000453515:exon_133887742_133887899:PHF15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 134076812 G/A 1 45 43 88 20.9434949995092 22.987327000469 -2.04383200095973 A:G G A 10 0.534589000010906 0.670572819430167 ENSG00000164615:ENST00000297156:exon_134076753_134077213:CAMLG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 134223593 A/G 1 34 25 59 15.8239739996292 13.3647250002727 2.45924899935654 A:G A G 10 0.534589000010906 0.602106592778036 ENSG00000113621:ENST00000441965:exon_134223465_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000358387:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000506916:exon_134223391_134223752:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000507024:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508810:exon_134223385_134223870:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508779:exon_134223385_134223872:TXNDC15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 137717213 G/A 1 9 10 19 4.18869899990185 5.34589000010906 -1.15719100020721 A:G G A 10 0.534589000010906 0.650010996424856 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000512928:exon_137717205_137717437:KDM3B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 137892170 G/A 1 395 372 767 183.837344995692 198.867108004057 -15.0297630083649 A:G G A 10 0.534589000010906 0.277793947174761 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000524109:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000512328:exon_137892141_137892262:HSPA9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 137902339 T/C 1 108 158 266 50.2643879988222 84.4650620017232 -34.200674002901 T:C T C 10 0.534589000010906 2.73562873360158e-05 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000501917:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000523929:exon_137902315_137902400:HSPA9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 139574050 G/A 1 37 28 65 17.2202069995965 14.9684920003054 2.25171499929111 A:G G A 10 0.534589000010906 0.620138977091616 ENSG00000120306:ENST00000261811:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000509589:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000504227:exon_139574031_139574237:C5orf32 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 139680027 A/G 1 49 91 140 22.8051389994656 48.6475990009925 -25.8424600015268 A:G A G 10 0.534589000010906 1.29604544316014e-05 ENSG00000113068:ENST00000261813:exon_139680001_139680167:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000514611:exon_139680001_139680168:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000524074:exon_139680001_139680167:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000507185:exon_139680001_139680167:PFDN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 139936760 G/T 1 46 36 82 21.4089059994983 19.2452040003926 2.1637019991057 T:G G T 10 0.534589000010906 0.65923917853747 ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 139940233 G/A 1 9 3 12 4.18869899990185 1.60376700003272 2.58493199986913 A:G G A 10 0.534589000010906 0.157534918401888 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 139941228 A/G 1 11 8 19 5.11952099988003 4.27671200008725 0.842808999792785 A:G A G 10 0.534589000010906 0.819574245361162 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000358580:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139941172_139941307:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139941172_139941307:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511201:exon_139941172_139941292:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139941172_139941434:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000506289:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000508496:exon_139941172_139941310:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511463:exon_139941228_139941580:APBB3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 140021482 C/T 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000113119:ENST00000394671:exon_140021455_140021638:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000513002:exon_140021455_140021650:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000511410:exon_140021250_140021970:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000514449:exon_140021455_140021638:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000505086:exon_140021455_140021922:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000252100:exon_140021455_140021638:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000510336:exon_140021455_140021638:TMCO6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 140023238 C/G 1 8 8 16 3.72328799991275 4.27671200008725 -0.553424000174497 C:G C G 10 0.534589000010906 0.807042042252045 ENSG00000113119:ENST00000394671:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000252100:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000510336:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000509605:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000515265:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000509269:exon_140022948_140023260:TMCO6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 140048209 T/C 1 7 7 14 3.25787699992366 3.74212300007634 -0.484246000152685 T:C T C 10 0.534589000010906 0.796419892279177 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 140048544 C/T 1 12 11 23 5.58493199986913 5.88047900011997 -0.295547000250839 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048476_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511364:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000520764:exon_140048506_140048575:WDR55 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 140856265 G/C 1 19 16 35 8.84280899979279 8.5534240001745 0.289384999618289 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000240184:ENST00000308177:exon_140855580_140858113:PCDHGC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 140857798 T/C 1 19 10 29 8.84280899979279 5.34589000010906 3.49691899968373 T:C T C 10 0.534589000010906 0.263763626258807 ENSG00000240184:ENST00000308177:exon_140855580_140858113:PCDHGC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 141016383 C/A 1 22 16 38 10.2390419997601 8.5534240001745 1.68561799958557 A:C C A 10 0.534589000010906 0.628415893633615 ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141016303_141016437:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141016303_141016409:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523088:exon_141016303_141016400:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000519474:exon_141016303_141016405:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141016303_141016392:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000492506:exon_141016303_141016410:HDAC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 9 9 18 4.18869899990185 4.81130100009815 -0.622602000196309 A:C C A 10 0.534589000010906 0.81636697210269 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 141019569 G/C 1 17 15 32 7.9119869998146 8.01883500016359 -0.106848000348994 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 141019830 C/G 1 25 25 50 11.6352749997273 13.3647250002727 -1.7294500005453 C:G C G 10 0.534589000010906 0.671752386433554 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 141029072 G/A 1 6 8 14 2.79246599993456 4.27671200008725 -1.48424600015268 A:G G A 10 0.534589000010906 0.437971150157616 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141028962_141029103:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141028962_141029106:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141028962_141029097:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141028962_141029097:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000519800:exon_141028962_141029097:FCHSD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 141391532 G/A 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000113552:ENST00000513454:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000311337:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000500692:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000458112:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000508177:exon_141391477_141392359:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503794:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504139:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000505689:exon_141391414_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000510194:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503229:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000507107:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504424:exon_141391514_141391606:GNPDA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 141515332 C/T 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 T:C C T 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000131507:ENST00000253814:exon_141515295_141515382:NDFIP1;ENSG00000131507:ENST00000505614:exon_141515295_141515382:NDFIP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 147805120 T/C 1 10 7 17 4.65410999989094 3.74212300007634 0.911986999814598 T:C T C 10 0.534589000010906 0.809164893348427 ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000514832:exon_147805085_147805264:FBXO38 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 148747902 G/C 1 13 18 31 6.05034299985822 9.62260200019631 -3.57225900033809 C:G G C 10 0.534589000010906 0.211837916082521 ENSG00000145882:ENST00000274569:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000511945:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000505669:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000503240:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000514349:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000507621:exon_148747556_148749216:PCYOX1L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 149212471 G/A 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 A:G G A 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 149216256 C/T 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 T:C C T 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149215826_149216636:PPARGC1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 149216304 C/T 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149215826_149216636:PPARGC1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 149374932 T/C 1 5 7 12 2.32705499994547 3.74212300007634 -1.41506800013087 T:C T C 10 0.534589000010906 0.565015885912817 ENSG00000164296:ENST00000296736:exon_149372681_149375992:TIGD6;ENSG00000164296:ENST00000515406:exon_149374291_149375992:TIGD6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 149776232 C/T 1 62 48 110 28.8554819993238 25.6602720005235 3.19520999880033 T:C C T 10 0.534589000010906 0.567329355635616 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149775845_149776405:TCOF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 149907533 T/G 1 8 1 9 3.72328799991275 0.534589000010906 3.18869899990185 T:G T G 10 0.534589000010906 0.0431228184091904 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149907366_149907860:NDST1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 149907602 A/G 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149907366_149907860:NDST1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 150276152 C/T 0 0 9 9 0 4.81130100009815 -4.81130100009815 T C T 10 0.534589000010906 0.00102454206148113 ENSG00000145908:ENST00000427179:exon_150273961_150277746:ZNF300;ENSG00000145908:ENST00000394226:exon_150273961_150276531:ZNF300;ENSG00000145908:ENST00000446148:exon_150273964_150276535:ZNF300;ENSG00000145908:ENST00000274599:exon_150273964_150276535:ZNF300 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 150276288 A/C 0 0 10 10 0 5.34589000010906 -5.34589000010906 C A C 10 0.534589000010906 0.000476833145364821 ENSG00000145908:ENST00000427179:exon_150273961_150277746:ZNF300;ENSG00000145908:ENST00000394226:exon_150273961_150276531:ZNF300;ENSG00000145908:ENST00000446148:exon_150273964_150276535:ZNF300;ENSG00000145908:ENST00000274599:exon_150273964_150276535:ZNF300 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 100 87 187 46.5410999989094 46.5092430009488 0.031856997960567 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 150647012 A/G 1 120 89 209 55.8493199986913 47.5784210009706 8.27089899772064 A:G A G 10 0.534589000010906 0.26749636566324 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 157158553 C/T 1 19 12 31 8.84280899979279 6.41506800013087 2.42774099966191 T:C C T 10 0.534589000010906 0.47233262636417 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157158205_157158639:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157158428_157158639:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157158428_157158639:THG1L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 157164962 T/C 1 19 21 40 8.84280899979279 11.226369000229 -2.38356000043624 A:T:C T C 10 0.534589000010906 0.526778577056088 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157164918_157165002:THG1L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 159840935 T/A 1 37 19 56 17.2202069995965 10.1571910002072 7.06301599938926 A:T T A 10 0.534589000010906 0.0615015190981383 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159840906_159840986:SLU7;ENSG00000164609:ENST00000521826:exon_159840906_159840986:SLU7;ENSG00000164609:ENST00000521190:exon_159840809_159840986:SLU7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 162902516 T/C 1 16 28 44 7.4465759998255 14.9684920003054 -7.52191600047987 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0331578346976297 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162902464_162902678:HMMR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 169129422 A/G 1 20 19 39 9.30821999978188 10.1571910002072 -0.848971000425335 A:G A G 10 0.534589000010906 0.872831334711128 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 169267784 G/A 1 27 26 53 12.5660969997055 13.8993140002836 -1.33321700057802 A:G G A 10 0.534589000010906 0.783472875037343 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520836:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520181:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519628:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169267761_169267856:DOCK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 171533629 A/G 1 34 24 58 15.8239739996292 12.8301360002617 2.99383799936745 A:G A G 10 0.534589000010906 0.510834559517571 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 171533656 C/T 1 28 19 47 13.0315079996946 10.1571910002072 2.87431699948742 T:C C T 10 0.534589000010906 0.465561196449487 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 171533782 T/C 1 23 22 45 10.7044529997492 11.7609580002399 -1.05650500049077 T:C T C 10 0.534589000010906 0.76711418400348 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519710:exon_171533666_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171533714_171534038:STK10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 174936038 A/G 1 28 10 38 13.0315079996946 5.34589000010906 7.68561799958557 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0140239351434692 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174936035_174936205:SFXN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 175772208 C/T 1 14 20 34 6.51575399984732 10.6917800002181 -4.1760260003708 T:C C T 10 0.534589000010906 0.170548663863318 ENSG00000170085:ENST00000345702:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000430704:exon_175772186_175772569:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000443967:exon_175772186_175772994:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000341199:exon_175772186_175772992:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000420396:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000332772:exon_175772186_175772992:C5orf25 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 T:G G T 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 18 13 31 8.37739799980369 6.94965700014178 1.42774099966191 A:G G A 10 0.534589000010906 0.719634139084765 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 176915143 C/T 1 24 8 32 11.1698639997383 4.27671200008725 6.89315199965101 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0197939874896055 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176914898_176915249:PDLIM7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 176931463 C/T 1 89 100 189 41.4215789990294 53.4589000010906 -12.0373210020612 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.0805416673498862 ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176930751_176931661:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000501403:exon_176930785_176931661:DOK3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 176931706 G/C 1 17 13 30 7.9119869998146 6.94965700014178 0.962329999672819 C:G G C 10 0.534589000010906 0.85523438102995 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 176936546 A/C 1 41 27 68 19.0818509995529 14.4339030002945 4.64794799925839 A:C:G A C 10 0.534589000010906 0.275792323654624 ENSG00000146094:ENST00000312943:exon_176936476_176936576:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000415534:exon_176936476_176936576:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000377112:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000501403:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510380:exon_176936476_176936576:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000506493:exon_176936476_176936576:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000502885:exon_176936476_176936585:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510898:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000509310:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000502380:exon_176935785_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000512660:exon_176936167_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510389:exon_176936503_176936658:DOK3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 178140090 C/T 1 12 18 30 5.58493199986913 9.62260200019631 -4.03767000032718 T:C C T 10 0.534589000010906 0.147392324053680 ENSG00000169131:ENST00000335815:exon_178138593_178140622:ZNF354A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 179045142 G/A 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 A:G G A 10 0.534589000010906 0.156883047615629 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 75 67 142 34.905824999182 35.8174630007307 -0.91163800154866 T:G T G 10 0.534589000010906 0.933002622248301 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 179498658 G/T 1 20 13 33 9.30821999978188 6.94965700014178 2.3585629996401 T:G G T 10 0.534589000010906 0.486546433298847 ENSG00000113269:ENST00000522208:exon_179498456_179498721:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000521389:exon_179498456_179499118:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000393383:exon_179498456_179499118:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000261947:exon_179498456_179499101:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000520911:exon_179498456_179499113:RNF130 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 72 71 143 33.5095919992148 37.9558190007743 -4.44622700155956 A:G A G 10 0.534589000010906 0.502613243042285 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 180651231 G/A 1 16 13 29 7.4465759998255 6.94965700014178 0.496918999683725 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000451234:exon_180651000_180651293:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 5 180665065 G/C 1 13 11 24 6.05034299985822 5.88047900011997 0.169863999738255 C:G G C 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 127 126 253 59.1071969986149 67.3582140013742 -8.25101700275923 A:G G A 10 0.534589000010906 0.313488288400459 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 2783744 G/A 1 5 18 23 2.32705499994547 9.62260200019631 -7.29554700025084 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00273225117718386 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2783640_2783795:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2783640_2783795:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000415856:exon_2783640_2783784:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2783640_2783795:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2783640_2783795:WRNIP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 67 61 128 31.1825369992693 32.6099290006653 -1.42739200139597 A:G A G 10 0.534589000010906 0.859440554362736 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 4133855 C/T 1 13 21 34 6.05034299985822 11.226369000229 -5.17602600037081 T:C C T 10 0.534589000010906 0.086020077971915 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4133783_4134016:PECI;ENSG00000198721:ENST00000495548:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000489086:exon_4133783_4133935:PECI HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 7231770 A/G 1 3 11 14 1.39623299996728 5.88047900011997 -4.48424600015268 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0282018025011262 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7230073_7232140:RREB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 11723636 C/T 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:C C T 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000111863:ENST00000505099:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000414691:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000514824:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000513651:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000512139:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000229583:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000503285:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000379413:exon_11723582_11723733:C6orf105 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 12124587 C/G 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 C:G C G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 12163575 G/A 1 5 8 13 2.32705499994547 4.27671200008725 -1.94965700014178 A:G G A 10 0.534589000010906 0.405475359831307 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12163516_12165232:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000399469:exon_12163516_12164808:HIVEP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 13599306 C/T 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:C C T 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000124523:ENST00000379262:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000397350:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13599264_13599387:SIRT5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 13612078 A/G 1 22 15 37 10.2390419997601 8.01883500016359 2.22020699959648 A:G A G 10 0.534589000010906 0.512515268374475 ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13612022_13612524:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13612022_13612520:SIRT5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 13711279 A/G 1 2 7 9 0.930821999978188 3.74212300007634 -2.81130100009815 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0917858367386368 ENSG00000010017:ENST00000011619:exon_13711167_13711796:RANBP9;ENSG00000010017:ENST00000283152:exon_13711167_13711953:RANBP9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 17665479 G/C 1 14 9 23 6.51575399984732 4.81130100009815 1.70445299974916 C:G G C 10 0.534589000010906 0.535325651889601 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17665470_17665616:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17665470_17665616:NUP153 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 17675246 T/C 1 12 10 22 5.58493199986913 5.34589000010906 0.239041999760067 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17675136_17675264:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17675136_17675264:NUP153 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 18264180 G/C 1 40 43 83 18.6164399995638 22.987327000469 -4.3708870009052 C:G G C 10 0.534589000010906 0.378966518749229 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18264074_18264439:DEK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 24875993 C/G 1 11 4 15 5.11952099988003 2.13835600004362 2.98116499983641 C:G C G 10 0.534589000010906 0.194125209391915 ENSG00000111913:ENST00000259698:exon_24875919_24876045:FAM65B;ENSG00000111913:ENST00000378023:exon_24875919_24876045:FAM65B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 17 21 38 7.9119869998146 11.226369000229 -3.31438200041443 T:C T C 10 0.534589000010906 0.329957108100267 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 26370660 G/A 1 9 18 27 4.18869899990185 9.62260200019631 -5.43390300029446 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0517384585692059 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 26393021 G/A 1 19 13 32 8.84280899979279 6.94965700014178 1.89315199965101 A:G G A 10 0.534589000010906 0.596151250735722 ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 200 334 534 93.0821999978188 178.552726003643 -85.4705260058238 A:T:G G A 10 0.534589000010906 1.43238052201269e-13 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 29691713 A/C 1 10 22 32 4.65410999989094 11.7609580002399 -7.10684800034899 A:C A C 10 0.534589000010906 0.0129214179938467 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 29691744 C/G 1 8 23 31 3.72328799991275 12.2955470002508 -8.57225900033809 C:G C G 10 0.534589000010906 0.00324318027384225 ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29691717_29692225:HLA-F HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 11 7 18 5.11952099988003 3.74212300007634 1.37739799980369 T:C C T 10 0.534589000010906 0.63873345646322 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 4 10 14 1.86164399995638 5.34589000010906 -3.48424600015268 A:C A C 10 0.534589000010906 0.104581828814314 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 4 9 13 1.86164399995638 4.81130100009815 -2.94965700014178 A:T A T 10 0.534589000010906 0.162146782239777 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 29910402 G/A 1 559 30 589 260.164748993904 16.0376700003272 244.127078993576 A:G G A 10 0.534589000010906 3.19164199566938e-112 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29910325_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910326_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910329_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910331_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910331_29910403:HLA-A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 29910801 C/A 1 884 1 885 411.423323990359 0.534589000010906 410.888734990348 A:C C A 10 0.534589000010906 2.81097994352412e-238 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 29911360 A/G 1 4 17 21 1.86164399995638 9.0880130001854 -7.22636900022903 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00169442437870503 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 29912297 A/G 1 250 116 366 116.352749997273 62.0123240012651 54.3404259960084 A:G A G 10 0.534589000010906 8.8854463541743e-09 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 0 589 0 589 274.127078993576 0 274.127078993576 A A 10 0.534589000010906 8.83612858852615e-161 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 29912386 G/C 1 291 122 413 135.434600996826 65.2198580013305 70.2147429954958 C:G G C 10 0.534589000010906 2.18087422336118e-12 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 26 67 93 12.1006859997164 35.8174630007307 -23.7167770010143 A:G A G 10 0.534589000010906 1.03396384271603e-06 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 34 48 82 15.8239739996292 25.6602720005235 -9.8362980008943 A:C C A 10 0.534589000010906 0.0349412061513477 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 33 25 58 15.3585629996401 13.3647250002727 1.99383799936745 T:C T C 10 0.534589000010906 0.693313520391501 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30229457 C/T 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:C C T 10 0.534589000010906 0.731759291541082 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30229463 G/A 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:G G A 10 0.534589000010906 0.731759291541082 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30231071 G/A 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 A:G G A 10 0.534589000010906 0.592941099997918 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30231108 G/T 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 T:G G T 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30297529 T/C 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 T:C T C 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000449040:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000428728:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000420746:exon_30297306_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30297359_30297547:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30297359_30297547:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30313268 G/A 1 27 39 66 12.5660969997055 20.8489710004253 -8.2828740007198 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0478790375629733 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 35 21 56 16.2893849996183 11.226369000229 5.06301599938926 T:G T G 10 0.534589000010906 0.183070508660311 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 35 21 56 16.2893849996183 11.226369000229 5.06301599938926 A:C C A 10 0.534589000010906 0.183070508660311 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30457732 T/C 1 744 638 1382 346.265783991886 341.067782006958 5.19800198492783 T:C T C 10 0.534589000010906 0.787480991916842 ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30457289_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30457316_30457772:HLA-E HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 483 447 930 224.793512994732 238.961283004875 -14.1677700101426 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.357487953875285 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 19 25 44 8.84280899979279 13.3647250002727 -4.52191600047987 A:G G A 10 0.534589000010906 0.177359294183873 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30530245 T/C 1 13 9 22 6.05034299985822 4.81130100009815 1.23904199976007 T:C T C 10 0.534589000010906 0.672470686731093 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30656509 G/A 1 92 85 177 42.8178119989966 45.440065000927 -2.62225300193037 A:G G A 10 0.534589000010906 0.706865261819792 ENSG00000137404:ENST00000259953:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000470733:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000482141:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000462857:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376420:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000474864:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000444096:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000495946:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376421:exon_30655829_30656719:NRM HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30672326 T/C 1 25 18 43 11.6352749997273 9.62260200019631 2.01267299953104 T:C T C 10 0.534589000010906 0.647044752750656 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30672342 A/G 1 36 16 52 16.7547959996074 8.5534240001745 8.20137199943288 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0256150733658948 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 30865204 A/C 1 11 3 14 5.11952099988003 1.60376700003272 3.51575399984732 A:C A C 10 0.534589000010906 0.0655983504942837 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30865138_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30865156_30865374:DDR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 14 33 47 6.51575399984732 17.6414370003599 -11.1256830005126 T:C T C 10 0.534589000010906 0.00118315498528424 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31113030 A/G 1 22 15 37 10.2390419997601 8.01883500016359 2.22020699959648 A:G A G 10 0.534589000010906 0.512515268374475 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 21 13 34 9.77363099977097 6.94965700014178 2.82397399962919 A:G G A 10 0.534589000010906 0.391503232273528 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31118511 T/G 1 18 9 27 8.37739799980369 4.81130100009815 3.56609699970554 T:G T G 10 0.534589000010906 0.182295568819292 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 22 13 35 10.2390419997601 6.94965700014178 3.28938499961829 C:G C G 10 0.534589000010906 0.310824265016004 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 23 22 45 10.7044529997492 11.7609580002399 -1.05650500049077 C:G G C 10 0.534589000010906 0.76711418400348 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31124849 C/T 1 19 14 33 8.84280899979279 7.48424600015268 1.3585629996401 T:C C T 10 0.534589000010906 0.728172693915283 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000480060:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000475684:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 14 17 31 6.51575399984732 9.0880130001854 -2.57225900033809 A:G A G 10 0.534589000010906 0.373247092552356 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C 1 24 21 45 11.1698639997383 11.226369000229 -0.0565050004907732 A:C A C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 49 56 105 22.8051389994656 29.9369840006107 -7.13184500114513 A:T:C:G T C 10 0.534589000010906 0.171559819172004 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 1540 514 2054 716.732939983205 274.778746005606 441.954193977599 T:C T C 10 0.534589000010906 9.88117004721745e-90 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 1399 307 1706 651.109988984742 164.118823003348 486.991165981394 A:T:C:G C G 10 0.534589000010906 3.00412617872912e-135 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31238068 C/T 1 974 10 984 453.310313989378 5.34589000010906 447.964423989268 T:C C T 10 0.534589000010906 1.44431018568372e-245 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237987_31238199:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31237991_31238108:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31237998_31238262:HLA-C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31239335 G/A 0 33 0 33 15.3585629996401 0 15.3585629996401 G G 10 0.534589000010906 1.48364798067557e-09 ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31239378 T/G 1 625 7 632 290.881874993184 3.74212300007634 287.139751993107 T:G T G 10 0.534589000010906 5.36599550852040e-157 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31239430 C/T 1 332 34 366 154.516451996379 18.1760260003708 136.340425996008 T:C C T 10 0.534589000010906 4.50012477405877e-54 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 1 607 5 612 282.50447699338 2.67294500005453 279.831531993325 T:G G T 10 0.534589000010906 1.33777938994033e-155 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31322340 G/A 1 31 21 52 14.4277409996619 11.226369000229 3.20137199943288 A:G G A 10 0.534589000010906 0.40639789765689 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31322888 A/G 1 2064 1705 3769 960.60830397749 911.474245018595 49.1340589588951 A:T:C:G A G 10 0.534589000010906 0.109583817743898 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 1604 876 2480 746.519243982507 468.299964009554 278.219279972953 A:T:C:G C T 10 0.534589000010906 1.32046529992241e-29 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31323203 A/G 1 1581 1793 3374 735.814790982758 958.518077019555 -222.703286036797 A:T:C:G A G 10 0.534589000010906 1.68929692196418e-14 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 139 128 267 64.6921289984841 68.427392001396 -3.73526300291191 A:C C A 10 0.534589000010906 0.667820903530392 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 126 97 223 58.6417859986258 51.8551330010579 6.78665299756796 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.383146848045482 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31604010 C/G 1 200 184 384 93.0821999978188 98.3643760020067 -5.28217600418792 A:C:G C G 10 0.534589000010906 0.60909688508138 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 33 21 54 15.3585629996401 11.226369000229 4.13219399941107 C:G G C 10 0.534589000010906 0.277705180163414 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 40 61 101 18.6164399995638 32.6099290006653 -13.9934890011015 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00678479924857788 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31627449 C/G 1 18 19 37 8.37739799980369 10.1571910002072 -1.77979300040352 C:G C G 10 0.534589000010906 0.622304005317116 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 34 35 69 15.8239739996292 18.7106150003817 -2.88664100075252 T:C C T 10 0.534589000010906 0.546647291175749 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 116 129 245 53.9876759987349 68.9619810014069 -14.974305002672 A:T:C T C 10 0.534589000010906 0.0630628097908656 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 4 8 12 1.86164399995638 4.27671200008725 -2.41506800013087 A:G A G 10 0.534589000010906 0.246532544157622 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31731881 C/T 1 21 14 35 9.77363099977097 7.48424600015268 2.28938499961829 T:C C T 10 0.534589000010906 0.499913952744214 ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000228727:ENST00000433778:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000415669:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000425424:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000494299:exon_31731397_31731936:C6orf26 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31748820 G/A 1 45 46 91 20.9434949995092 24.5910940005017 -3.64759900099245 A:G G A 10 0.534589000010906 0.463214961827113 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31807489 C/T 1 63 40 103 29.3208929993129 21.3835600004362 7.93733299887668 T:C C T 10 0.534589000010906 0.138113259027492 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 31929014 A/C 1 5 9 14 2.32705499994547 4.81130100009815 -2.48424600015268 A:C A C 10 0.534589000010906 0.283670203474933 ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31928973_31929163:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31928818_31929452:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31928973_31929163:SKIV2L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32088854 G/C 1 48 30 78 22.3397279994765 16.0376700003272 6.30205799914933 C:G G C 10 0.534589000010906 0.173295238910176 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32088766_32088901:ATF6B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 2411 2556 4967 1122.10592097371 1366.40948402788 -244.30356305417 A:C C A 10 0.534589000010906 4.14867785290569e-12 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32410941 T/C 1 8 11 19 3.72328799991275 5.88047900011997 -2.15719100020721 T:C T C 10 0.534589000010906 0.363088485682007 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 2233 2148 4381 1039.26276297565 1148.29717202343 -109.034409047779 A:T:C A C 10 0.534589000010906 0.00101271914951235 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32411523 T/C 1 10 5 15 4.65410999989094 2.67294500005453 1.98116499983641 T:C T C 10 0.534589000010906 0.438822405676019 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 4112 3796 7908 1913.77003195515 2029.2998440414 -115.529812086245 A:T:G T G 10 0.534589000010906 0.00952088203662258 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32411726 G/A 1 9 8 17 4.18869899990185 4.27671200008725 -0.0880130001854029 A:G G A 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32605295 C/T 0 25 0 25 11.6352749997273 0 11.6352749997273 C C 10 0.534589000010906 3.06210739882288e-07 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 46 62 108 21.4089059994983 33.1445180006762 -11.7356120011778 A:C C A 10 0.534589000010906 0.0262892117334932 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32800412 C/T 1 74 62 136 34.440413999193 33.1445180006762 1.29589599851678 T:C C T 10 0.534589000010906 0.863700542698904 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800404_32800510:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800404_32800601:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32811645 A/G 1 122 165 287 56.7801419986695 88.2071850017995 -31.42704300313 A:G A G 10 0.534589000010906 0.000232230334699705 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 132 115 247 61.4342519985604 61.4777350012542 -0.0434830026937902 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 79 77 156 36.7674689991384 41.1633530008398 -4.39588400170134 T:C T C 10 0.534589000010906 0.52099805578897 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 141 117 258 65.6229509984622 62.546913001276 3.07603799718624 A:G G A 10 0.534589000010906 0.708604139175164 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 154 150 304 71.6732939983205 80.1883500016359 -8.51505600331544 A:G G A 10 0.534589000010906 0.329075037460204 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 33 40 73 15.3585629996401 21.3835600004362 -6.02499700079614 A:G G A 10 0.534589000010906 0.161160657460457 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 26 34 60 12.1006859997164 18.1760260003708 -6.07534000065436 A:G G A 10 0.534589000010906 0.121882337814474 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 146 167 313 67.9500059984077 89.2763630018213 -21.3263570034136 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0172173271001917 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 33631640 C/T 1 4 8 12 1.86164399995638 4.27671200008725 -2.41506800013087 T:C C T 10 0.534589000010906 0.246532544157622 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33631515_33631657:ITPR3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 33636907 C/T 1 5 7 12 2.32705499994547 3.74212300007634 -1.41506800013087 T:C C T 10 0.534589000010906 0.565015885912817 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33636751_33636933:ITPR3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 33638180 C/T 1 13 5 18 6.05034299985822 2.67294500005453 3.37739799980369 T:C C T 10 0.534589000010906 0.155238770669501 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33638102_33638353:ITPR3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 33641379 T/C 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 T:C T C 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33641368_33641497:ITPR3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 33653448 C/T 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33653420_33653604:ITPR3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 33740592 C/T 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 35803192 C/A 1 29 27 56 13.4969189996837 14.4339030002945 -0.936984000610737 A:C C A 10 0.534589000010906 0.893599684023243 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 35803283 C/T 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 0.529760851175976 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 36446975 G/C 1 3 8 11 1.39623299996728 4.27671200008725 -2.88047900011997 C:G G C 10 0.534589000010906 0.127884495538899 ENSG00000112078:ENST00000373731:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000481911:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000265344:exon_36446898_36447000:KCTD20 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 118 127 245 54.9184979987131 67.8928030013851 -12.974305002672 A:C C A 10 0.534589000010906 0.109180278197681 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 36653597 C/T 1 145 120 265 67.4845949984186 64.1506800013087 3.3339149971099 T:C C T 10 0.534589000010906 0.711939423068646 ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36653528_36655116:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36653528_36653701:CDKN1A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 36976637 G/C 1 13 11 24 6.05034299985822 5.88047900011997 0.169863999738255 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000146192:ENST00000489356:exon_36976610_36977807:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000497659:exon_36976610_36976857:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487975:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36976610_36976841:FGD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 T:C C T 10 0.534589000010906 0.189086525758904 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 36995222 G/A 1 14 10 24 6.51575399984732 5.34589000010906 1.16986399973826 A:G G A 10 0.534589000010906 0.686499461842995 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36995205_36996845:FGD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 37349033 G/A 1 10 10 20 4.65410999989094 5.34589000010906 -0.69178000021812 A:G G A 10 0.534589000010906 0.824629775002564 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 38650628 T/G 1 70 55 125 32.5787699992366 29.4023950005998 3.17637499863675 T:C:G T G 10 0.534589000010906 0.591537412401712 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 41162518 T/C 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 T:C T C 10 0.534589000010906 0.298446592097252 ENSG00000112195:ENST00000373108:exon_41162163_41162571:TREML2;ENSG00000112195:ENST00000483722:exon_41162163_41162571:TREML2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 97 110 207 45.1448669989421 58.8047900011997 -13.6599230022575 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0599867390653236 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 59 63 122 27.4592489993565 33.6791070006871 -6.21985800133054 T:C C T 10 0.534589000010906 0.276602114591309 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 42933526 C/T 1 6 16 22 2.79246599993456 8.5534240001745 -5.76095800023993 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0174136957058825 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42933419_42933527:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42933419_42933527:PEX6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 43307861 G/A 1 25 23 48 11.6352749997273 12.2955470002508 -0.66027200052349 A:G G A 10 0.534589000010906 0.885593736260476 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 23 18 41 10.7044529997492 9.62260200019631 1.08185099955285 A:C A C 10 0.534589000010906 0.756980786078456 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 43738977 C/T 1 16 16 32 7.4465759998255 8.5534240001745 -1.10684800034899 T:C C T 10 0.534589000010906 0.725761441333252 ENSG00000112715:ENST00000476772:exon_43737921_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000426830:exon_43737948_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372067:exon_43737950_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000532514:exon_43737950_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372064:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000425836:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372055:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000324450:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000413642:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000482630:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000417285:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000531362:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000530947:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000531781:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372077:exon_43738519_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000519767:exon_43738530_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000520948:exon_43738820_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000518538:exon_43738890_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000523950:exon_43738946_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000523873:exon_43738946_43739049:VEGFA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 150 127 277 69.8116499983641 67.8928030013851 1.91884699697903 T:C:G G T 10 0.534589000010906 0.856668876493312 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 44360533 G/A 1 8 11 19 3.72328799991275 5.88047900011997 -2.15719100020721 A:G G A 10 0.534589000010906 0.363088485682007 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44360404_44360565:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44360404_44360565:CDC5L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 46107752 C/G 1 11 6 17 5.11952099988003 3.20753400006544 1.9119869998146 C:G C G 10 0.534589000010906 0.467664186074611 ENSG00000001561:ENST00000321037:exon_46107288_46108146:ENPP4;ENSG00000001561:ENST00000371401:exon_46107287_46108146:ENPP4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 49403301 C/T 1 12 2 14 5.58493199986913 1.06917800002181 4.51575399984732 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0158603999537431 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 49426989 G/A 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 A:G G A 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49426795_49427218:MUT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 56327849 C/T 1 9 5 14 4.18869899990185 2.67294500005453 1.51575399984732 T:C C T 10 0.534589000010906 0.593864451936242 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56327844_56327954:DST HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 9 0 9 4.18869899990185 0 4.18869899990185 G G 10 0.534589000010906 0.00459053241595814 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 9 9 0 4.81130100009815 -4.81130100009815 A G A 10 0.534589000010906 0.00102454206148113 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 11 11 0 5.88047900011997 -5.88047900011997 G T G 10 0.534589000010906 0.000221923391012186 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 57512678 G/A 0 0 14 14 0 7.48424600015268 -7.48424600015268 A G A 10 0.534589000010906 2.23724224169534e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 70407465 A/T 1 29 18 47 13.4969189996837 9.62260200019631 3.87431699948742 A:T A T 10 0.534589000010906 0.306487288090517 ENSG00000168216:ENST00000370577:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000370570:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000472827:exon_70407455_70407533:LMBRD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 16 10 26 7.4465759998255 5.34589000010906 2.10068599971644 T:C C T 10 0.534589000010906 0.438652940292951 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 74138503 G/A 1 14 17 31 6.51575399984732 9.0880130001854 -2.57225900033809 A:G G A 10 0.534589000010906 0.373247092552356 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74138432_74138534:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74138432_74138534:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74138432_74138534:C6orf150 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 74190448 T/C 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 T:C T C 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000135297:ENST00000498286:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415954:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000357845:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370305:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370308:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370300:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415228:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000462039:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000445187:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000520366:exon_74190398_74190485:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000487960:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000524046:exon_74190398_74190528:MTO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 74229792 A/G 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000156508:ENST00000316292:exon_74229606_74230741:EEF1A1;ENSG00000156508:ENST00000456206:exon_74229606_74230741:EEF1A1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 74497152 G/A 1 1 8 9 0.465410999989094 4.27671200008725 -3.81130100009815 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0151819886668037 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74496957_74497175:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74496957_74497175:CD109 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 74521947 C/T 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74521928_74521993:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74521928_74521993:CD109 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 79595097 A/G 1 6 10 16 2.79246599993456 5.34589000010906 -2.5534240001745 A:G A G 10 0.534589000010906 0.219453370200368 ENSG00000146243:ENST00000369940:exon_79595095_79595160:IRAK1BP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 79656562 A/T 1 8 2 10 3.72328799991275 1.06917800002181 2.65410999989094 A:T A T 10 0.534589000010906 0.117787000476102 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 79656570 G/A 1 11 5 16 5.11952099988003 2.67294500005453 2.4465759998255 A:G G A 10 0.534589000010906 0.316657798068879 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 79675701 A/G 1 8 8 16 3.72328799991275 4.27671200008725 -0.553424000174497 A:G A G 10 0.534589000010906 0.807042042252045 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79675662_79675773:PHIP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 79692751 G/A 1 5 18 23 2.32705499994547 9.62260200019631 -7.29554700025084 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00273225117718386 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79692603_79692834:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79692603_79692834:PHIP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 83949261 T/C 1 2 7 9 0.930821999978188 3.74212300007634 -2.81130100009815 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0917858367386368 ENSG00000065833:ENST00000369705:exon_83949258_83949355:ME1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 89793894 G/C 1 226 218 444 105.182885997535 116.540402002378 -11.3575160048423 C:G G C 10 0.534589000010906 0.295314108307819 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 90039670 G/C 1 94 94 188 43.7486339989748 50.2513660010252 -6.50273200205034 C:G G C 10 0.534589000010906 0.34307904000577 ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90039279_90039676:UBE2J1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 90348407 G/T 1 23 27 50 10.7044529997492 14.4339030002945 -3.7294500005453 T:G G T 10 0.534589000010906 0.322233651534751 ENSG00000083099:ENST00000412237:exon_90348391_90348453:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520441:exon_90348391_90348453:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523377:exon_90348391_90348472:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520318:exon_90348391_90348468:LYRM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 90383870 G/A 1 5 7 12 2.32705499994547 3.74212300007634 -1.41506800013087 A:G G A 10 0.534589000010906 0.565015885912817 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90383823_90384308:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90383823_90384308:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90383823_90384308:MDN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 99956560 T/C 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:C T C 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000123552:ENST00000392738:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000500704:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000496518:exon_99956486_99956657:USP45;ENSG00000123552:ENST00000327681:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369233:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000506871:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000329966:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000472914:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000430949:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369232:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369231:exon_99956486_99956658:USP45 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 100957344 T/C 1 29 20 49 13.4969189996837 10.6917800002181 2.8051389994656 T:C T C 10 0.534589000010906 0.475264900760456 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100956070_100957409:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000518006:exon_100957094_100957409:ASCC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 100964147 G/C 1 9 2 11 4.18869899990185 1.06917800002181 3.11952099988003 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0723916304569276 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100964056_100964203:ASCC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 100966006 C/T 1 15 12 27 6.98116499983641 6.41506800013087 0.566096999705537 T:C C T 10 0.534589000010906 0.84987578658165 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100965867_100966018:ASCC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 101296389 G/A 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 A:G G A 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324696:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000522650:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000468245:exon_101295880_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324723:exon_101296296_101296583:ASCC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 63 65 128 29.3208929993129 34.7482850007089 -5.42739200139597 T:C C T 10 0.534589000010906 0.375694151940701 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 107076783 A/T 1 9 5 14 4.18869899990185 2.67294500005453 1.51575399984732 A:T A T 10 0.534589000010906 0.593864451936242 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 107113715 G/A 1 39 23 62 18.1510289995747 12.2955470002508 5.85548199932382 A:G G A 10 0.534589000010906 0.161191486166893 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 109770869 G/A 1 24 22 46 11.1698639997383 11.7609580002399 -0.591094000501679 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.883413014201246 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000433205:exon_109770860_109770986:MICAL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 109802651 C/T 1 56 65 121 26.0630159993893 34.7482850007089 -8.68526900131963 T:C C T 10 0.534589000010906 0.121563247229371 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109802278_109803257:ZBTB24 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 17 2 19 7.9119869998146 1.06917800002181 6.84280899979279 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00183909878621060 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 110146475 C/T 1 3 15 18 1.39623299996728 8.01883500016359 -6.62260200019631 T:C C T 10 0.534589000010906 0.00174471102604526 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 111346806 C/T 1 12 13 25 5.58493199986913 6.94965700014178 -1.36472500027265 T:C C T 10 0.534589000010906 0.689551323254237 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111346606_111347303:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111346606_111347231:RPF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 111346808 G/A 1 12 13 25 5.58493199986913 6.94965700014178 -1.36472500027265 A:G G A 10 0.534589000010906 0.689551323254237 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111346606_111347303:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111346606_111347231:RPF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 111587266 T/C 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 T:C T C 10 0.534589000010906 0.298446592097252 ENSG00000173214:ENST00000368847:exon_111587079_111592370:KIAA1919 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 111695073 C/T 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 T:C C T 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 111695887 G/A 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 116574455 G/A 1 15 12 27 6.98116499983641 6.41506800013087 0.566096999705537 A:G G A 10 0.534589000010906 0.84987578658165 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 116575116 G/T 1 11 12 23 5.11952099988003 6.41506800013087 -1.29554700025084 T:G G T 10 0.534589000010906 0.677644254347807 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 116599665 T/C 1 28 39 67 13.0315079996946 20.8489710004253 -7.81746300073071 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0656878906539376 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 116600774 C/G 1 41 37 78 19.0818509995529 19.7797930004035 -0.69794200085067 C:G C G 10 0.534589000010906 0.909893272722352 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 116600810 G/A 1 27 23 50 12.5660969997055 12.2955470002508 0.270549999454699 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 116784850 C/G 1 33 35 68 15.3585629996401 18.7106150003817 -3.35205200074161 C:G C G 10 0.534589000010906 0.466227093736490 ENSG00000188820:ENST00000368606:exon_116784446_116784931:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000532607:exon_116784446_116784931:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000368605:exon_116784446_116784934:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000368604:exon_116784446_116784931:FAM26F HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 3665 0 3665 1705.73131496003 0 1705.73131496003 C C 10 0.534589000010906 4.94065645841247e-324 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 126210395 T/G 1 9 6 15 4.18869899990185 3.20753400006544 0.981164999836409 T:G T G 10 0.534589000010906 0.796967668188066 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000413085:exon_126210118_126211127:NCOA7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 130031215 T/C 1 5 11 16 2.32705499994547 5.88047900011997 -3.5534240001745 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0838041199296228 ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_130031169_130031370:ARHGAP18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 130374102 C/A 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 A:C C A 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000198945:ENST00000529410:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000533560:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000361794:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000528385:exon_130374004_130374125:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000368139:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000526019:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000368136:exon_130374004_130374136:L3MBTL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 136554628 G/A 1 30 23 53 13.9623299996728 12.2955470002508 1.66678299942198 A:G G A 10 0.534589000010906 0.681469234855748 ENSG00000146410:ENST00000451457:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000367784:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000420702:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000275229:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000532282:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000532958:exon_136554282_136554637:FAM54A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 199 0 199 92.6167889978297 0 92.6167889978297 T T 10 0.534589000010906 9.01264448811152e-55 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 215 1 216 100.063364997655 0.534589000010906 99.5287759976443 A:G A G 10 0.534589000010906 3.95792684579145e-57 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 215 1 216 100.063364997655 0.534589000010906 99.5287759976443 A:G A G 10 0.534589000010906 3.95792684579145e-57 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 143 0 143 66.5537729984404 0 66.5537729984404 G G 10 0.534589000010906 1.37338314525658e-39 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 168 0 168 78.1890479981678 0 78.1890479981678 T T 10 0.534589000010906 2.36851231766442e-46 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 136944063 A/G 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 0.529760851175976 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136943986_136944119:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136943986_136944119:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136943986_136944119:MAP3K5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 138413269 A/G 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 A:G A G 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000112378:ENST00000421351:exon_138411923_138413405:PERP;ENSG00000112378:ENST00000265603:exon_138411926_138413405:PERP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 138413333 G/C 1 21 5 26 9.77363099977097 2.67294500005453 7.10068599971644 C:G G C 10 0.534589000010906 0.00528359015241178 ENSG00000112378:ENST00000421351:exon_138411923_138413405:PERP;ENSG00000112378:ENST00000265603:exon_138411926_138413405:PERP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 138734029 A/C 1 62 2 64 28.8554819993238 1.06917800002181 27.786303999302 A:C A C 10 0.534589000010906 6.85833250869034e-15 ENSG00000051620:ENST00000448741:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000058691:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000367697:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000453452:exon_138734017_138734291:HEBP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 4 9 13 1.86164399995638 4.81130100009815 -2.94965700014178 T:C T C 10 0.534589000010906 0.162146782239777 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 143816859 C/T 1 7 18 25 3.25787699992366 9.62260200019631 -6.36472500027265 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0146215782960437 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143815949_143816984:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143816614_143816984:FUCA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 25 18 43 11.6352749997273 9.62260200019631 2.01267299953104 C:G G C 10 0.534589000010906 0.647044752750656 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 152469188 C/G 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 C:G C G 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000472563:exon_152469018_152469513:SYNE1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 157405930 G/A 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 A:G G A 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000049618:ENST00000350026:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000346085:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000367148:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000275248:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000354354:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000414678:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000319584:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000452544:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000493658:exon_157405900_157406039:ARID1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 12 10 22 5.58493199986913 5.34589000010906 0.239041999760067 A:T T A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 159188128 A/G 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G A G 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 168348981 G/A 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000509296:exon_168348709_168349158:MLLT4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 170626943 T/C 1 11 7 18 5.11952099988003 3.74212300007634 1.37739799980369 T:C T C 10 0.534589000010906 0.63873345646322 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 170627614 T/C 1 36 17 53 16.7547959996074 9.0880130001854 7.66678299942198 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0386232846471748 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 170627651 G/A 1 17 27 44 7.9119869998146 14.4339030002945 -6.52191600047987 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0507159432232249 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 170627761 A/G 1 34 29 63 15.8239739996292 15.5030810003163 0.320892999312919 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 170628009 T/G 1 32 18 50 14.893151999651 9.62260200019631 5.2705499994547 T:G T G 10 0.534589000010906 0.156571003422777 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 170844456 G/A 1 177 203 380 82.3777469980696 108.521567002214 -26.1438200041443 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00746671644459557 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170844205_170844493:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000462957:exon_170844310_170844493:PSMB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 148 100 248 68.8808279983859 53.4589000010906 15.4219279972953 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0559758344546939 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 9 14 23 4.18869899990185 7.48424600015268 -3.29554700025084 T:C T C 10 0.534589000010906 0.210289302298530 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 810219 T/C 1 12 9 21 5.58493199986913 4.81130100009815 0.773630999770972 T:C T C 10 0.534589000010906 0.828599613252825 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 814788 G/A 1 21 13 34 9.77363099977097 6.94965700014178 2.82397399962919 A:G G A 10 0.534589000010906 0.391503232273528 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 881668 C/T 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 T:C C T 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000427969:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450538:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000407944:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457378:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000435699:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000439679:exon_881583_881723:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457598:exon_881583_881672:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000340926:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000403868:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000467483:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000469755:exon_881583_881710:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450881:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000493681:exon_881453_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000477950:exon_881549_881767:SUN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 889169 A/G 1 4 8 12 1.86164399995638 4.27671200008725 -2.41506800013087 A:G A G 10 0.534589000010906 0.246532544157622 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000407944:exon_889157_889326:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000340926:exon_889157_890404:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000419312:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_889157_889240:SUN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 930689 C/T 1 49 56 105 22.8051389994656 29.9369840006107 -7.13184500114513 T:C C T 10 0.534589000010906 0.171559819172004 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 931954 C/T 1 36 34 70 16.7547959996074 18.1760260003708 -1.42123000076342 T:C C T 10 0.534589000010906 0.810844234119323 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_931915_932055:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_931915_932111:GET4;ENSG00000239857:ENST00000464468:exon_931937_932055:GET4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 940181 C/T 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 T:C C T 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000495809:exon_940170_941036:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000437486:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000454383:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453823:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_940170_940253:COX19 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 943868 G/A 1 11 7 18 5.11952099988003 3.74212300007634 1.37739799980369 A:G G A 10 0.534589000010906 0.63873345646322 ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000437486:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000454383:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453823:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000481406:exon_943594_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000463358:exon_943789_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000477906:exon_943824_943909:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_943763_943909:COX19 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 1097952 C/T 1 6 5 11 2.79246599993456 2.67294500005453 0.119520999880034 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000164849:ENST00000444847:exon_1097128_1098097:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000397095:exon_1097128_1098894:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000297468:exon_1097141_1098897:GPR146 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 1131411 C/T 1 10 11 21 4.65410999989094 5.88047900011997 -1.22636900022903 T:C C T 10 0.534589000010906 0.664535375129959 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 1132456 C/T 1 13 5 18 6.05034299985822 2.67294500005453 3.37739799980369 T:C C T 10 0.534589000010906 0.155238770669501 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 1132505 G/A 1 12 10 22 5.58493199986913 5.34589000010906 0.239041999760067 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 1192797 C/A 1 25 6 31 11.6352749997273 3.20753400006544 8.42774099966191 A:C C A 10 0.534589000010906 0.00203700681988983 ENSG00000178381:ENST00000401903:exon_1192709_1192860:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000316495:exon_1192543_1192860:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000397083:exon_1192543_1192877:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1192544_1192860:ZFAND2A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 1195215 A/C 1 10 5 15 4.65410999989094 2.67294500005453 1.98116499983641 A:C A C 10 0.534589000010906 0.438822405676019 ENSG00000178381:ENST00000401903:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000316495:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000397083:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1195089_1195313:ZFAND2A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 1976457 C/T 1 11 10 21 5.11952099988003 5.34589000010906 -0.226369000229027 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 20 19 39 9.30821999978188 10.1571910002072 -0.848971000425335 A:G G A 10 0.534589000010906 0.872831334711128 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 2297006 A/G 1 81 98 179 37.6982909991166 52.3897220010688 -14.6914310019522 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0297095163559894 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2297000_2297149:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000480807:exon_2297000_2297253:SNX8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 2303986 T/C 1 28 16 44 13.0315079996946 8.5534240001745 4.47808399952013 T:C T C 10 0.534589000010906 0.226313018732406 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2303933_2304093:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000479689:exon_2303933_2304093:SNX8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 2472707 G/C 1 37 44 81 17.2202069995965 23.5219160004799 -6.30170900088339 C:G G C 10 0.534589000010906 0.181381714110536 ENSG00000136213:ENST00000258711:exon_2472198_2474242:CHST12;ENSG00000136213:ENST00000432336:exon_2472198_2473010:CHST12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 2577691 C/G 1 47 26 73 21.8743169994874 13.8993140002836 7.97500299920386 C:G C G 10 0.534589000010906 0.077712812341717 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 70 45 115 32.5787699992366 24.0565050004908 8.5222649987458 A:T:C T C 10 0.534589000010906 0.11311153798132 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 29 31 60 13.4969189996837 16.5722590003381 -3.07534000065436 T:C T C 10 0.534589000010906 0.440129102807527 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 2578238 C/T 1 29 31 60 13.4969189996837 16.5722590003381 -3.07534000065436 T:C C T 10 0.534589000010906 0.440129102807527 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 2583165 G/A 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 A:G G A 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 2583328 C/T 1 37 44 81 17.2202069995965 23.5219160004799 -6.30170900088339 T:C C T 10 0.534589000010906 0.181381714110536 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2583224_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2583224_2583596:C7orf27 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 2946461 T/C 1 54 67 121 25.1321939994111 35.8174630007307 -10.6852690013196 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0556300701229825 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 2954962 G/A 1 28 23 51 13.0315079996946 12.2955470002508 0.735960999443792 A:G G A 10 0.534589000010906 0.88893517752419 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2954871_2955006:CARD11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 22 6 28 10.2390419997601 3.20753400006544 7.03150799969463 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0076285975906149 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 4780514 G/T 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 T:G G T 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000460979:exon_4780490_4780654:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4780469_4780619:KIAA0415 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 5104833 C/T 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 5347721 G/A 0 30 0 30 13.9623299996728 0 13.9623299996728 G G 10 0.534589000010906 1.07722753189744e-08 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 5353253 G/T 1 28 4 32 13.0315079996946 2.13835600004362 10.893151999651 T:G G T 10 0.534589000010906 5.93003173233168e-05 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 5353344 G/A 1 19 6 25 8.84280899979279 3.20753400006544 5.63527499972735 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0268569951305857 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 7 15 22 3.25787699992366 8.01883500016359 -4.76095800023993 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0532500340847999 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 5417609 G/A 1 6 2 8 2.79246599993456 1.06917800002181 1.72328799991275 A:G G A 10 0.534589000010906 0.298446592097252 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5417553_5417655:TNRC18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 5541657 G/A 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:G G A 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 5568366 A/G 1 90 97 187 41.8869899990185 51.8551330010579 -9.96814300203943 A:G A G 10 0.534589000010906 0.163515231840819 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 38 49 87 17.6856179995856 26.1948610005344 -8.50924300094882 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0686402073291674 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 5643145 T/C 1 154 151 305 71.6732939983205 80.7229390016468 -9.04964500332633 T:C T C 10 0.534589000010906 0.302104388765837 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000444748:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000447103:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000405801:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5643127_5643248:FSCN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 5645116 T/C 1 327 420 747 152.189396996434 224.527380004581 -72.3379830081468 A:T:C T C 10 0.534589000010906 1.19330794127131e-07 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5644903_5646286:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5644903_5646285:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5644903_5646285:FSCN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 6026988 G/A 1 20 23 43 9.30821999978188 12.2955470002508 -2.98732700046896 A:G G A 10 0.534589000010906 0.364482205091434 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 6063283 C/T 1 98 104 202 45.6102779989312 55.5972560011342 -9.98697800220302 T:C C T 10 0.534589000010906 0.180083654516653 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6062934_6063465:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6062934_6063326:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6062934_6063378:AIMP2;ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6061881_6064432:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000422786:exon_6062807_6063377:EIF2AK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 17 16 33 7.9119869998146 8.5534240001745 -0.641437000359899 T:C T C 10 0.534589000010906 0.862673282858281 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 6193464 T/G 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 T:G T G 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193387_6193513:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 21 17 38 9.77363099977097 9.0880130001854 0.68561799958557 A:G G A 10 0.534589000010906 0.871910130672068 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 6370194 C/T 1 22 16 38 10.2390419997601 8.5534240001745 1.68561799958557 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.628415893633615 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 6370305 C/G 1 13 15 28 6.05034299985822 8.01883500016359 -1.96849200030537 C:G C G 10 0.534589000010906 0.570640261191915 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 6370406 C/T 1 10 13 23 4.65410999989094 6.94965700014178 -2.29554700025084 T:C C T 10 0.534589000010906 0.404969031814226 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 6621277 G/A 1 23 18 41 10.7044529997492 9.62260200019631 1.08185099955285 A:G G A 10 0.534589000010906 0.756980786078456 ENSG00000136247:ENST00000405731:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396707:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396713:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000335965:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000493944:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396709:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000474097:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000483589:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396706:exon_6621238_6621311:ZDHHC4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 6776956 A/G 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 A:G A G 10 0.534589000010906 0.517166724773948 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 8008970 C/G 1 3 7 10 1.39623299996728 3.74212300007634 -2.34589000010906 C:G C G 10 0.534589000010906 0.204502714830273 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8008423_8009438:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8008425_8009438:GLCCI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 8125964 C/T 1 14 14 28 6.51575399984732 7.48424600015268 -0.968492000305369 T:C C T 10 0.534589000010906 0.710379181771136 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8125823_8126968:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8125823_8128710:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000489405:exon_8125823_8126569:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000482540:exon_8125823_8128707:GLCCI1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 12727826 G/C 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 C:G G C 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000439721:exon_12727791_12728031:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000399303:exon_12727722_12728432:ARL4A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 25181912 T/C 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 T:C T C 10 0.534589000010906 0.156883047615629 ENSG00000153790:ENST00000409280:exon_25181860_25181951:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000283905:exon_25181860_25181951:C7orf31 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 30673415 A/C 1 297 272 569 138.227066996761 145.408208002966 -7.18114100620554 A:C A C 10 0.534589000010906 0.556470056952114 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30673351_30673649:GARS;ENSG00000106105:ENST00000485784:exon_30673351_30673527:GARS;ENSG00000106105:ENST00000496643:exon_30673351_30673649:GARS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 32909182 G/A 1 13 20 33 6.05034299985822 10.6917800002181 -4.6414370003599 A:G G A 10 0.534589000010906 0.117715537265185 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 36438709 C/G 1 8 6 14 3.72328799991275 3.20753400006544 0.515753999847315 C:G C G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36438688_36439002:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36438688_36439002:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000424865:exon_36438688_36439002:ANLN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 36492212 C/T 1 9 5 14 4.18869899990185 2.67294500005453 1.51575399984732 T:C C T 10 0.534589000010906 0.593864451936242 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36492086_36493400:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36492086_36493400:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000491782:exon_36492086_36493264:ANLN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 5 14 19 2.32705499994547 7.48424600015268 -5.15719100020721 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0208403668812872 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 38796570 G/A 1 6 18 24 2.79246599993456 9.62260200019631 -6.83013600026175 A:G G A 10 0.534589000010906 0.00671538610067119 ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38796438_38796582:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38796438_38796582:VPS41 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 263 219 482 122.403092997132 117.074991002388 5.32810199474329 A:T:C:G G A 10 0.534589000010906 0.64807290861412 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 44612229 G/A 1 33 28 61 15.3585629996401 14.9684920003054 0.390070999334732 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44612162_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44612173_44612343:DDX56 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 44620836 C/A 1 47 39 86 21.8743169994874 20.8489710004253 1.02534599906208 A:C C A 10 0.534589000010906 0.914005005709684 ENSG00000158604:ENST00000457408:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000419520:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000481238:exon_44619496_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000477639:exon_44619503_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000444131:exon_44620692_44620838:TMED4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 44800176 G/T 1 44 51 95 20.4780839995201 27.2640390005562 -6.78595500103607 T:G G T 10 0.534589000010906 0.181292133996968 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 26 13 39 12.1006859997164 6.94965700014178 5.15102899957466 A:G G A 10 0.534589000010906 0.10956194371503 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 45014806 G/A 1 64 43 107 29.786303999302 22.987327000469 6.79897699883306 A:G G A 10 0.534589000010906 0.207941199715186 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45014773_45014826:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45014773_45014826:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45014773_45014814:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45014773_45014826:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45011714_45014826:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45014773_45014826:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000435656:exon_45014698_45014826:MYO1G HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 55840888 A/C 0 0 21 21 0 11.226369000229 -11.226369000229 C A C 10 0.534589000010906 1.05820428566368e-07 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 176 243 419 81.9123359980805 129.90512700265 -47.9927910045696 T:C T C 10 0.534589000010906 3.00340374560483e-06 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 56136194 C/T 1 33 27 60 15.3585629996401 14.4339030002945 0.924659999345639 T:C C T 10 0.534589000010906 0.897215202403318 ENSG00000129103:ENST00000395436:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000418349:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000434526:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395437:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000275607:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395435:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000420966:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413952:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000342190:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000436782:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000442826:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000437307:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413756:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000483327:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000423763:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000498777:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000438133:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000447501:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000451338:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000529457:exon_56136175_56136331:SUMF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 56174115 A/C 1 899 567 1466 418.404488990195 303.111963006184 115.292525984012 A:C A C 10 0.534589000010906 1.36807057830486e-09 ENSG00000106153:ENST00000395422:exon_56174057_56174269:CHCHD2;ENSG00000106153:ENST00000473095:exon_56174057_56174124:CHCHD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 56174140 G/T 1 375 252 627 174.52912499591 134.716428002748 39.8126969931619 T:C:G G T 10 0.534589000010906 0.00154420961144122 ENSG00000106153:ENST00000395422:exon_56174057_56174269:CHCHD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 63981559 T/C 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 T:C T C 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000173041:ENST00000309683:exon_63980262_63982878:ZNF680 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 64169019 G/A 1 10 14 24 4.65410999989094 7.48424600015268 -2.83013600026174 A:G G A 10 0.534589000010906 0.307110312407199 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 64169061 G/A 1 10 10 20 4.65410999989094 5.34589000010906 -0.69178000021812 A:G G A 10 0.534589000010906 0.824629775002564 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 64389067 G/A 1 6 11 17 2.79246599993456 5.88047900011997 -3.0880130001854 A:G G A 10 0.534589000010906 0.150155070613150 ENSG00000198039:ENST00000527278:exon_64388032_64389502:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000476120:exon_64388032_64389635:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000319636:exon_64388032_64389416:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000395375:exon_64388032_64391344:ZNF273 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 66463938 G/A 0 9 0 9 4.18869899990185 0 4.18869899990185 G G 10 0.534589000010906 0.00459053241595814 ENSG00000198874:ENST00000359626:exon_66463804_66463941:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000442959:exon_66463804_66463941:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000475392:exon_66463804_66463941:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000361660:exon_66463804_66463941:TYW1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 20 19 39 9.30821999978188 10.1571910002072 -0.848971000425335 A:C C A 10 0.534589000010906 0.872831334711128 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 51 63 114 23.7359609994438 33.6791070006871 -9.94314600124329 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0740058415691329 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 73097238 G/A 1 39 37 76 18.1510289995747 19.7797930004035 -1.62876400082886 A:G G A 10 0.534589000010906 0.731156714140724 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 73097948 G/C 1 27 38 65 12.5660969997055 20.3143820004144 -7.74828500070889 A:C:G G C 10 0.534589000010906 0.0618750105668728 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 73151644 A/G 1 8 14 22 3.72328799991275 7.48424600015268 -3.76095800023993 A:G A G 10 0.534589000010906 0.134711925154703 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 73638035 A/G 1 4 10 14 1.86164399995638 5.34589000010906 -3.48424600015268 A:G A G 10 0.534589000010906 0.104581828814314 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 73731906 C/T 1 13 12 25 6.05034299985822 6.41506800013087 -0.364725000272651 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73731810_73731997:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73731810_73731997:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73731877_73731997:CLIP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 73753250 T/C 1 22 21 43 10.2390419997601 11.226369000229 -0.98732700046896 T:C T C 10 0.534589000010906 0.762668245420617 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 73814702 C/A 1 32 35 67 14.893151999651 18.7106150003817 -3.8174630007307 A:C C A 10 0.534589000010906 0.39181264942694 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73814700_73814885:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73814700_73814885:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73814700_73814885:CLIP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 73944185 T/C 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:C T C 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000006704:ENST00000265755:exon_73944064_73944247:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000455841:exon_73944064_73944247:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000424337:exon_73944064_73944247:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000476977:exon_73944064_73944247:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000489094:exon_73944064_73944247:GTF2IRD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 73969541 A/G 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000006704:ENST00000265755:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000455841:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000424337:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000476977:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000489094:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000470715:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 75609677 A/G 1 16 20 36 7.4465759998255 10.6917800002181 -3.24520400039262 A:G A G 10 0.534589000010906 0.317595143253115 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75609657_75609711:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75609657_75610056:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75609657_75609729:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75609657_75609789:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75609657_75610040:POR;ENSG00000127948:ENST00000426184:exon_75609657_75609757:POR;ENSG00000127948:ENST00000475509:exon_75609657_75609678:POR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 75614953 T/C 1 63 48 111 29.3208929993129 25.6602720005235 3.66062099878943 T:C T C 10 0.534589000010906 0.506626696794203 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 15 10 25 6.98116499983641 5.34589000010906 1.63527499972735 T:C T C 10 0.534589000010906 0.553361397131065 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 75633160 C/T 1 21 13 34 9.77363099977097 6.94965700014178 2.82397399962919 T:C C T 10 0.534589000010906 0.391503232273528 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000430497:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000454618:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000492053:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75633057_75633173:STYXL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 76608143 C/T 1 7 1 8 3.25787699992366 0.534589000010906 2.72328799991275 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0755591978202379 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 76610095 C/T 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:C C T 10 0.534589000010906 0.731759291541082 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 77256713 A/G 1 56 42 98 26.0630159993893 22.4527380004581 3.61027799893121 A:G A G 10 0.534589000010906 0.480201705203178 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77256473_77256992:PTPN12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 55 43 98 25.5976049994002 22.987327000469 2.61027799893121 A:G G A 10 0.534589000010906 0.614161884151061 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 89982132 T/C 1 9 15 24 4.18869899990185 8.01883500016359 -3.83013600026175 T:C T C 10 0.534589000010906 0.151422991853702 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000477972:exon_89982130_89982546:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89982130_89982323:GTPBP10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 35 45 80 16.2893849996183 24.0565050004908 -7.76712000087248 T:G G T 10 0.534589000010906 0.0925544678417137 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 91641928 A/G 1 6 7 13 2.79246599993456 3.74212300007634 -0.949657000141779 A:G A G 10 0.534589000010906 0.782390789702348 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91641743_91641956:AKAP9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 91691601 C/T 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 T:C C T 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 91712698 A/G 1 15 9 24 6.98116499983641 4.81130100009815 2.16986399973826 A:G A G 10 0.534589000010906 0.418609856680633 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91712484_91713009:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91712484_91712969:AKAP9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 91713972 C/T 1 5 8 13 2.32705499994547 4.27671200008725 -1.94965700014178 T:C C T 10 0.534589000010906 0.405475359831307 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 91715662 C/T 1 3 9 12 1.39623299996728 4.81130100009815 -3.41506800013087 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0784465209153547 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91715542_91715730:AKAP9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 21 24 45 9.77363099977097 12.8301360002617 -3.05650500049077 A:C A C 10 0.534589000010906 0.373823916263529 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 55 43 98 25.5976049994002 22.987327000469 2.61027799893121 A:G A G 10 0.534589000010906 0.614161884151061 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 T:C T C 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 92027537 C/G 1 20 19 39 9.30821999978188 10.1571910002072 -0.848971000425335 C:G C G 10 0.534589000010906 0.872831334711128 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 92027906 C/A 1 28 24 52 13.0315079996946 12.8301360002617 0.201371999432885 A:C C A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 92734034 T/G 1 14 11 25 6.51575399984732 5.88047900011997 0.635274999727349 T:C:G T G 10 0.534589000010906 0.843567005465164 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 97823125 G/A 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 A:G G A 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000164715:ENST00000297293:exon_97820926_97823884:LMTK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 32 20 52 14.893151999651 10.6917800002181 4.20137199943289 T:C C T 10 0.534589000010906 0.267809319270634 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 19 11 30 8.84280899979279 5.88047900011997 2.96232999967282 T:C C T 10 0.534589000010906 0.360536373270145 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 99500899 T/C 1 13 7 20 6.05034299985822 3.74212300007634 2.30821999978188 T:C T C 10 0.534589000010906 0.372688141283748 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 99500911 A/G 1 12 8 20 5.58493199986913 4.27671200008725 1.30821999978188 A:G A G 10 0.534589000010906 0.656685513222068 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 99654689 G/A 1 6 3 9 2.79246599993456 1.60376700003272 1.18869899990185 A:G G A 10 0.534589000010906 0.517166724773948 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99654630_99654872:ZSCAN21 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 99669802 A/G 1 17 9 26 7.9119869998146 4.81130100009815 3.10068599971644 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.243968304911115 ENSG00000166526:ENST00000303915:exon_99669105_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000424697:exon_99667597_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000299667:exon_99667611_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000487620:exon_99667800_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000412947:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000428683:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000449785:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000441298:exon_99669703_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000415068:exon_99669794_99669835:ZNF3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 99691740 G/A 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 A:G G A 10 0.534589000010906 0.529760851175976 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 297 285 582 138.227066996761 152.357865003108 -14.1307980063473 A:G G A 10 0.534589000010906 0.244831704282258 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 38 24 62 17.6856179995856 12.8301360002617 4.85548199932382 A:T A T 10 0.534589000010906 0.252112482456149 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 38 29 67 17.6856179995856 15.5030810003163 2.1825369992693 A:G A G 10 0.534589000010906 0.625824869414162 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 141 102 243 65.6229509984622 54.5280780011124 11.0948729973498 A:G G A 10 0.534589000010906 0.157610085333873 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 A:G A G 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 99757612 G/A 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000197093:ENST00000426974:exon_99756866_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000413800:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000495882:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000360039:exon_99756868_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000423751:exon_99757269_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000411994:exon_99757439_99758582:GAL3ST4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 99758136 T/G 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 T:G T G 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000197093:ENST00000426974:exon_99756866_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000413800:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000495882:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000360039:exon_99756868_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000423751:exon_99757269_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000411994:exon_99757439_99758582:GAL3ST4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 99926612 C/T 1 24 31 55 11.1698639997383 16.5722590003381 -5.40239500059983 T:C C T 10 0.534589000010906 0.176052335241239 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 100486086 A/T 1 23 13 36 10.7044529997492 6.94965700014178 3.75479599960738 A:T A T 10 0.534589000010906 0.243661160357124 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 101916647 A/G 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101916637_101916764:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101916637_101916764:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101916637_101916764:CUX1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 102949484 G/A 1 49 54 103 22.8051389994656 28.8678060005889 -6.06266700112332 A:G G A 10 0.534589000010906 0.237367723789312 ENSG00000105819:ENST00000249269:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000428154:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000420236:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000456433:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000443722:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000444457:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000498530:exon_102949399_102949706:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000453466:exon_102949399_102949542:PMPCB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 104717517 C/T 1 25 21 46 11.6352749997273 11.226369000229 0.408905999498321 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000478990:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000476671:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000482560:exon_104717410_104717640:MLL5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 106826381 C/T 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000105856:ENST00000468410:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000222574:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000485846:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000463202:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000417005:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000498408:exon_106826246_106826387:HBP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 106897237 A/C 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 A:C A C 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000164597:ENST00000297135:exon_106897177_106897239:COG5;ENSG00000164597:ENST00000393603:exon_106897177_106897239:COG5;ENSG00000164597:ENST00000468350:exon_106897177_106897239:COG5;ENSG00000164597:ENST00000462342:exon_106897177_106897239:COG5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 16 18 34 7.4465759998255 9.62260200019631 -2.17602600037081 T:C T C 10 0.534589000010906 0.494443161884986 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 19 10 29 8.84280899979279 5.34589000010906 3.49691899968373 A:G G A 10 0.534589000010906 0.263763626258807 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 16 13 29 7.4465759998255 6.94965700014178 0.496918999683725 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 127224286 A/G 1 4 12 16 1.86164399995638 6.41506800013087 -4.5534240001745 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0250380736834845 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127224205_127225661:GCC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 127721507 T/C 1 63 47 110 29.3208929993129 25.1256830005126 4.19520999880034 T:C T C 10 0.534589000010906 0.445566991522822 ENSG00000197157:ENST00000438400:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000354725:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000486037:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000470463:exon_127721412_127721553:SND1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 134849213 G/A 1 21 6 27 9.77363099977097 3.20753400006544 6.56609699970554 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0116955419948584 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 134849577 A/C 1 18 16 34 8.37739799980369 8.5534240001745 -0.176026000370806 A:C A C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 135329690 T/C 1 37 42 79 17.2202069995965 22.4527380004581 -5.23253100086158 T:C T C 10 0.534589000010906 0.260007905448997 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 15 8 23 6.98116499983641 4.27671200008725 2.70445299974916 A:G G A 10 0.534589000010906 0.300128883020768 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 14 8 22 6.51575399984732 4.27671200008725 2.23904199976007 A:G G A 10 0.534589000010906 0.396720668612636 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 138738204 G/A 1 8 7 15 3.72328799991275 3.74212300007634 -0.0188350001635906 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138738197_138738327:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138738197_138738327:ZC3HAV1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 138761034 G/C 1 9 21 30 4.18869899990185 11.226369000229 -7.03767000032718 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0158498557723233 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000460845:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 138764233 C/T 1 13 7 20 6.05034299985822 3.74212300007634 2.30821999978188 T:C C T 10 0.534589000010906 0.372688141283748 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 139026152 T/G 1 16 13 29 7.4465759998255 6.94965700014178 0.496918999683725 T:G T G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000164898:ENST00000297534:exon_139025878_139026268:C7orf55 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 139102490 A/G 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 A:G A G 10 0.534589000010906 0.633804450498163 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 139415775 G/C 1 12 13 25 5.58493199986913 6.94965700014178 -1.36472500027265 C:G G C 10 0.534589000010906 0.689551323254237 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 141364712 G/A 1 14 10 24 6.51575399984732 5.34589000010906 1.16986399973826 A:G G A 10 0.534589000010906 0.686499461842995 ENSG00000127359:ENST00000297761:exon_141364704_141364854:KIAA1147;ENSG00000127359:ENST00000482493:exon_141364704_141364854:KIAA1147 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 142494307 T/C 1 8 4 12 3.72328799991275 2.13835600004362 1.58493199986913 T:C T C 10 0.534589000010906 0.401454124777931 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 142495126 G/A 1 14 13 27 6.51575399984732 6.94965700014178 -0.433903000294463 A:G G A 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 142495127 G/T 1 14 13 27 6.51575399984732 6.94965700014178 -0.433903000294463 T:G G T 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 142495156 T/G 1 19 19 38 8.84280899979279 10.1571910002072 -1.31438200041443 T:G T G 10 0.534589000010906 0.745799595822869 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 1 169 158 327 78.6544589981569 84.4650620017232 -5.81060300356627 A:G G A 10 0.534589000010906 0.542145077038075 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 406 0 406 188.956865995572 0 188.956865995572 T T 10 0.534589000010906 4.03494656525027e-111 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 142965233 T/A 1 62 86 148 28.8554819993238 45.9746540009379 -17.1191720016141 A:T T A 10 0.534589000010906 0.0050291114715006 ENSG00000197448:ENST00000409500:exon_142965184_142965277:GSTK1;ENSG00000197448:ENST00000443571:exon_142965184_142965277:GSTK1;ENSG00000197448:ENST00000358406:exon_142965184_142965277:GSTK1;ENSG00000197448:ENST00000479303:exon_142965184_142965277:GSTK1;ENSG00000197448:ENST00000473649:exon_142965184_142965277:GSTK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 150027763 A/G 1 9 10 19 4.18869899990185 5.34589000010906 -1.15719100020721 A:G A G 10 0.534589000010906 0.650010996424856 ENSG00000188707:ENST00000343855:exon_150027401_150029808:C7orf29 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 150028098 A/G 1 29 32 61 13.4969189996837 17.106848000349 -3.60992900066527 A:G A G 10 0.534589000010906 0.371175926908841 ENSG00000188707:ENST00000343855:exon_150027401_150029808:C7orf29 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 74 49 123 34.440413999193 26.1948610005344 8.24555299865856 T:C T C 10 0.534589000010906 0.148299664187546 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 122 55 177 56.7801419986695 29.4023950005998 27.3777469980696 A:T:G G A 10 0.534589000010906 3.08987177251881e-05 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 101 45 146 47.0065109988985 24.0565050004908 22.9500059984077 T:C C T 10 0.534589000010906 0.000124244185244605 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 104 119 223 48.4027439988658 63.6160910012978 -15.213347002432 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0439593238289916 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 150171710 T/C 1 5 10 15 2.32705499994547 5.34589000010906 -3.01883500016359 T:C T C 10 0.534589000010906 0.128857341400782 ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150171100_150171726:GIMAP8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 150324825 C/T 1 6 13 19 2.79246599993456 6.94965700014178 -4.15719100020721 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0664194041354686 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 150325175 C/T 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 T:C C T 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 31 24 55 14.4277409996619 12.8301360002617 1.59760499940017 C:G G C 10 0.534589000010906 0.687529942938485 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 150389856 A/G 1 25 30 55 11.6352749997273 16.0376700003272 -4.40239500059983 A:G A G 10 0.534589000010906 0.279536737587406 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 150417677 G/A 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 151873853 C/T 1 2 8 10 0.930821999978188 4.27671200008725 -3.34589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0527671529214564 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151873276_151875053:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151873276_151875095:MLL3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 154738409 T/C 1 18 19 37 8.37739799980369 10.1571910002072 -1.77979300040352 T:C T C 10 0.534589000010906 0.622304005317116 ENSG00000214106:ENST00000411526:exon_154738350_154738546:AC093726.6;ENSG00000214106:ENST00000449486:exon_154738303_154738501:AC093726.6;ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000464717:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154738389_154738523:PAXIP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 155531080 A/G 1 7 3 10 3.25787699992366 1.60376700003272 1.65410999989094 A:G A G 10 0.534589000010906 0.355452084752108 ENSG00000184863:ENST00000401878:exon_155530754_155531097:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000307403:exon_155530754_155532720:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000392761:exon_155530754_155531097:RBM33 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 20 21 41 9.30821999978188 11.226369000229 -1.91814900044715 T:C T C 10 0.534589000010906 0.639189413952457 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 9 10 19 4.18869899990185 5.34589000010906 -1.15719100020721 A:G A G 10 0.534589000010906 0.650010996424856 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 6303025 G/A 1 33 22 55 15.3585629996401 11.7609580002399 3.59760499940017 A:G G A 10 0.534589000010906 0.347346963810807 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 6612711 T/A 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 A:T T A 10 0.534589000010906 0.189086525758904 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 6612712 C/G 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 C:G C G 10 0.534589000010906 0.189086525758904 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 8234077 G/C 1 9 9 18 4.18869899990185 4.81130100009815 -0.622602000196309 C:G G C 10 0.534589000010906 0.81636697210269 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 8234192 G/C 1 9 1 10 4.18869899990185 0.534589000010906 3.65410999989094 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0244567728924624 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 8234218 C/T 1 13 2 15 6.05034299985822 1.06917800002181 4.98116499983641 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0094264980296512 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 8234219 G/A 1 13 2 15 6.05034299985822 1.06917800002181 4.98116499983641 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0094264980296512 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 8234714 C/T 1 13 9 22 6.05034299985822 4.81130100009815 1.23904199976007 T:C C T 10 0.534589000010906 0.672470686731093 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 9413646 C/T 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 T:C C T 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000173273:ENST00000520408:exon_9413424_9414122:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000310430:exon_9413424_9414122:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000522110:exon_9413442_9416341:TNKS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 10285810 T/C 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000175806:ENST00000317173:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000527408:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000441698:exon_10285658_10285875:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000528246:exon_10285658_10286395:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000425987:exon_10285658_10286399:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000382490:exon_10285658_10286399:MSRA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 11418773 C/T 1 7 1 8 3.25787699992366 0.534589000010906 2.72328799991275 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0755591978202379 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 11667179 C/T 1 89 83 172 41.4215789990294 44.3708870009052 -2.94930800187583 T:C C T 10 0.534589000010906 0.702458002183194 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531733:exon_11667176_11667485:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531249:exon_11667176_11667448:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11666765_11667359:FDFT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 11689119 G/C 1 231 213 444 107.509940997481 113.867457002323 -6.35751600484227 A:C:G G C 10 0.534589000010906 0.568162445458342 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11689027_11689176:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529521:exon_11689027_11689303:FDFT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 11706581 T/G 1 3 5 8 1.39623299996728 2.67294500005453 -1.27671200008725 T:G T G 10 0.534589000010906 0.485270004264881 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11706555_11707087:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11706570_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11706571_11706673:CTSB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 11710888 G/C 1 17 9 26 7.9119869998146 4.81130100009815 3.10068599971644 C:G G C 10 0.534589000010906 0.243968304911115 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11710838_11711023:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526645:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525315:exon_11710838_11710971:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530573:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532370:exon_11710838_11711328:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000505496:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524500:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531502:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527215:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532656:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534382:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000528965:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524654:exon_11710867_11710988:CTSB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 3 6 9 1.39623299996728 3.20753400006544 -1.81130100009815 T:C C T 10 0.534589000010906 0.319511032376371 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 17915126 C/T 1 57 65 122 26.5284269993784 34.7482850007089 -8.21985800133053 T:C C T 10 0.534589000010906 0.146660446269353 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17913925_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17913934_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17913935_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17913961_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17914707_17915132:ASAH1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 21766881 A/C 1 45 49 94 20.9434949995092 26.1948610005344 -5.25136600102517 A:C A C 10 0.534589000010906 0.301677802522682 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 21846586 G/C 1 2 8 10 0.930821999978188 4.27671200008725 -3.34589000010906 C:G G C 10 0.534589000010906 0.0527671529214564 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000518808:exon_21845859_21846594:XPO7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 16 34 50 7.4465759998255 18.1760260003708 -10.7294500005453 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00266582993995753 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 22442661 A/G 0 0 9 9 0 4.81130100009815 -4.81130100009815 G A G 10 0.534589000010906 0.00102454206148113 ENSG00000120913:ENST00000456545:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000308354:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000397760:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000339162:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000381194:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000452226:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000397761:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000436754:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000426493:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000429812:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000409141:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000265810:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000409417:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000416159:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000448520:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000491330:exon_22442530_22442675:PDLIM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 23292985 A/G 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 A:G A G 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000197217:ENST00000518471:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000521321:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522913:exon_23292905_23292990:ENTPD4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 23294761 T/C 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 T:C T C 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000520936:exon_23294547_23294771:ENTPD4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 25287397 T/C 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 T:C T C 10 0.534589000010906 0.366323804837261 ENSG00000104756:ENST00000221200:exon_25285366_25287489:KCTD9;ENSG00000104756:ENST00000519665:exon_25286778_25287489:KCTD9 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 25364331 G/A 1 57 40 97 26.5284269993784 21.3835600004362 5.14486699894212 A:G G A 10 0.534589000010906 0.310190202555170 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 25364834 A/T 1 28 35 63 13.0315079996946 18.7106150003817 -5.67910700068708 A:T A T 10 0.534589000010906 0.165528119182476 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 25364960 A/G 1 45 46 91 20.9434949995092 24.5910940005017 -3.64759900099245 A:G A G 10 0.534589000010906 0.463214961827113 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 25365278 G/A 1 22 18 40 10.2390419997601 9.62260200019631 0.616439999563758 A:G G A 10 0.534589000010906 0.875398535411848 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 26441477 G/A 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000092964:ENST00000521913:exon_26441315_26441499:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000493789:exon_26441315_26441481:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000311151:exon_26441315_26441499:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000522745:exon_26441315_26441499:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000523027:exon_26441315_26441499:DPYSL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 43 30 73 20.012672999531 16.0376700003272 3.97500299920386 A:G A G 10 0.534589000010906 0.411708438875764 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 25 10 35 11.6352749997273 5.34589000010906 6.28938499961829 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0409169600224728 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 20 11 31 9.30821999978188 5.88047900011997 3.42774099966191 A:G G A 10 0.534589000010906 0.280125992347043 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 40 29 69 18.6164399995638 15.5030810003163 3.11335899924748 A:G A G 10 0.534589000010906 0.471506997147465 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 45 45 90 20.9434949995092 24.0565050004908 -3.11301000098155 T:C C T 10 0.534589000010906 0.527493434167704 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 67 50 117 31.1825369992693 26.7294500005453 4.45308699872399 A:C:G C G 10 0.534589000010906 0.458650388251349 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 71 68 139 33.0441809992257 36.3520520007416 -3.30787100151593 A:C A C 10 0.534589000010906 0.61024533603818 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 6 16 22 2.79246599993456 8.5534240001745 -5.76095800023993 A:C A C 10 0.534589000010906 0.0174136957058825 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 24 31 55 11.1698639997383 16.5722590003381 -5.40239500059983 C:G C G 10 0.534589000010906 0.176052335241239 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 23 22 45 10.7044529997492 11.7609580002399 -1.05650500049077 C:G G C 10 0.534589000010906 0.76711418400348 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 28384712 A/G 1 18 13 31 8.37739799980369 6.94965700014178 1.42774099966191 A:G A G 10 0.534589000010906 0.719634139084765 ENSG00000104290:ENST00000240093:exon_28384664_28385681:FZD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 15 10 25 6.98116499983641 5.34589000010906 1.63527499972735 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.553361397131065 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 16 12 28 7.4465759998255 6.41506800013087 1.03150799969463 T:C T C 10 0.534589000010906 0.85019112749302 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 22 13 35 10.2390419997601 6.94965700014178 3.28938499961829 A:G A G 10 0.534589000010906 0.310824265016004 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 37963239 C/T 1 15 14 29 6.98116499983641 7.48424600015268 -0.503081000316275 T:C C T 10 0.534589000010906 0.85484380718489 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37962760_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37963011_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517719:exon_37963018_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37963068_37963256:ASH2L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 37985897 A/G 1 13 16 29 6.05034299985822 8.5534240001745 -2.50308100031627 A:G A G 10 0.534589000010906 0.359545966755733 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000428278:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000521652:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000524247:exon_37985858_37985976:ASH2L HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 42213073 G/A 1 14 14 28 6.51575399984732 7.48424600015268 -0.968492000305369 A:G G A 10 0.534589000010906 0.710379181771136 ENSG00000070501:ENST00000532157:exon_42213034_42213085:POLB;ENSG00000070501:ENST00000523032:exon_42213034_42213085:POLB;ENSG00000070501:ENST00000265421:exon_42213034_42213085:POLB;ENSG00000070501:ENST00000520008:exon_42213034_42213085:POLB;ENSG00000070501:ENST00000518925:exon_42213034_42213085:POLB;ENSG00000070501:ENST00000522610:exon_42213034_42213085:POLB;ENSG00000070501:ENST00000519771:exon_42213034_42213085:POLB;ENSG00000070501:ENST00000524208:exon_42213034_42213085:POLB;ENSG00000070501:ENST00000521290:exon_42213034_42213085:POLB;ENSG00000070501:ENST00000519524:exon_42212977_42213085:POLB HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 43054644 G/A 1 11 11 22 5.11952099988003 5.88047900011997 -0.760958000239933 A:G G A 10 0.534589000010906 0.832013937520133 ENSG00000165102:ENST00000458501:exon_43054531_43055093:HGSNAT;ENSG00000165102:ENST00000379644:exon_43054531_43057998:HGSNAT;ENSG00000165102:ENST00000521576:exon_43054531_43055698:HGSNAT;ENSG00000165102:ENST00000297798:exon_43054531_43055093:HGSNAT;ENSG00000165102:ENST00000519705:exon_43054531_43055001:HGSNAT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 52746153 C/T 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:C C T 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000168300:ENST00000360540:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519559:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000522514:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519554:exon_52746078_52746249:PCMTD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 57129962 A/G 1 67 72 139 31.1825369992693 38.4904080007852 -7.30787100151594 A:G A G 10 0.534589000010906 0.234004787819289 ENSG00000170791:ENST00000521831:exon_57129890_57130097:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000355315:exon_57129890_57131172:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000303759:exon_57129890_57131174:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000396727:exon_57129890_57131174:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000523532:exon_57129890_57129971:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000523667:exon_57129890_57129988:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000521982:exon_57129890_57130000:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000522166:exon_57129890_57130024:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000518488:exon_57129890_57130028:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000518801:exon_57129890_57131178:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000523975:exon_57129890_57131357:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000396723:exon_57129890_57131083:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000523061:exon_57129890_57130272:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000521524:exon_57129890_57130248:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000396728:exon_57129890_57131174:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000519367:exon_57129890_57130028:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000518944:exon_57129890_57130149:CHCHD7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 63951237 C/T 1 16 10 26 7.4465759998255 5.34589000010906 2.10068599971644 T:C C T 10 0.534589000010906 0.438652940292951 ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63951219_63951730:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000517622:exon_63951219_63951268:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518966:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000523788:exon_63951219_63951361:GGH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 63951312 A/G 1 10 8 18 4.65410999989094 4.27671200008725 0.377397999803692 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63951219_63951730:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518966:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000523788:exon_63951219_63951361:GGH HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 11 18 29 5.11952099988003 9.62260200019631 -4.50308100031628 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0977801092175839 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 67576683 T/C 1 2 9 11 0.930821999978188 4.81130100009815 -3.88047900011997 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0299085362195834 ENSG00000175073:ENST00000310421:exon_67576484_67579452:VCPIP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 74495062 C/T 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 T:C C T 10 0.534589000010906 1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 75276649 A/G 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000104381:ENST00000220822:exon_75276220_75279111:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000434412:exon_75276220_75276839:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000522568:exon_75276220_75276976:GDAP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 81897435 A/G 0 11 0 11 5.11952099988003 0 5.11952099988003 A A 10 0.534589000010906 0.00124103136705642 ENSG00000076641:ENST00000220597:exon_81897011_81897612:PAG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 22 20 42 10.2390419997601 10.6917800002181 -0.452738000458053 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 95272605 G/C 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 C:G G C 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000164949:ENST00000396194:exon_95272401_95272740:GEM;ENSG00000164949:ENST00000297596:exon_95272401_95272740:GEM;ENSG00000164949:ENST00000523660:exon_95272044_95272740:GEM;ENSG00000164949:ENST00000521817:exon_95272231_95272740:GEM;ENSG00000164949:ENST00000523433:exon_95272451_95272740:GEM HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 95419698 A/G 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 A:G A G 10 0.534589000010906 0.592941099997918 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95419667_95419948:RAD54B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 95541302 A/G 1 10 8 18 4.65410999989094 4.27671200008725 0.377397999803692 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95541298_95541570:KIAA1429 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 T:C T C 10 0.534589000010906 0.156883047615629 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 22 29 51 10.2390419997601 15.5030810003163 -5.26403900055621 T:C C T 10 0.534589000010906 0.160580707429357 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 98289986 C/T 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 T:C C T 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000180543:ENST00000322128:exon_98285717_98290176:TSPYL5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 98788033 G/C 1 10 13 23 4.65410999989094 6.94965700014178 -2.29554700025084 C:G G C 10 0.534589000010906 0.404969031814226 ENSG00000104341:ENST00000445593:exon_98787285_98788336:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000220781:exon_98787285_98788336:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000378722:exon_98787935_98788336:LAPTM4B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 99057150 C/A 1 14 25 39 6.51575399984732 13.3647250002727 -6.84897100042534 A:C C A 10 0.534589000010906 0.0358025488752026 ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057055_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99056661_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 99057526 G/A 1 19 18 37 8.84280899979279 9.62260200019631 -0.779793000403524 A:G G A 10 0.534589000010906 0.86963318737537 ENSG00000156482:ENST00000517489:exon_99057171_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 99168383 T/C 1 9 7 16 4.18869899990185 3.74212300007634 0.446575999825503 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000517435:exon_99168186_99168640:POP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 101206391 G/A 1 10 6 16 4.65410999989094 3.20753400006544 1.4465759998255 A:G G A 10 0.534589000010906 0.618055081094626 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101206340_101206496:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101206340_101206496:SPAG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 101206531 G/A 1 6 11 17 2.79246599993456 5.88047900011997 -3.0880130001854 A:G G A 10 0.534589000010906 0.150155070613150 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 24 25 49 11.1698639997383 13.3647250002727 -2.1948610005344 A:G G A 10 0.534589000010906 0.568407863350002 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 103663912 T/G 1 92 96 188 42.8178119989966 51.320544001047 -8.50273200205034 T:G T G 10 0.534589000010906 0.214945819399111 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103663377_103664289:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103663377_103664289:KLF10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 104343607 C/A 1 1 10 11 0.465410999989094 5.34589000010906 -4.88047900011997 A:C C A 10 0.534589000010906 0.0040450386649354 ENSG00000164930:ENST00000522566:exon_104343569_104345045:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000522484:exon_104343569_104345094:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523739:exon_104343569_104344222:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000358755:exon_104343569_104345087:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000519011:exon_104343569_104344120:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000521195:exon_104343569_104344014:FZD6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 20 20 40 9.30821999978188 10.6917800002181 -1.38356000043624 A:G A G 10 0.534589000010906 0.751793136121849 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 110283256 T/C 1 12 11 23 5.58493199986913 5.88047900011997 -0.295547000250839 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110283234_110283359:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110283234_110283359:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110283234_110283359:NUDCD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 110283353 T/G 1 16 12 28 7.4465759998255 6.41506800013087 1.03150799969463 T:G T G 10 0.534589000010906 0.85019112749302 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110283234_110283359:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110283234_110283359:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110283234_110283359:NUDCD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 110301998 T/C 1 22 20 42 10.2390419997601 10.6917800002181 -0.452738000458053 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 110302047 T/G 1 12 10 22 5.58493199986913 5.34589000010906 0.239041999760067 T:G T G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 117783975 C/T 1 49 56 105 22.8051389994656 29.9369840006107 -7.13184500114513 T:C C T 10 0.534589000010906 0.171559819172004 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 50 34 84 23.2705499994547 18.1760260003708 5.09452399908389 A:G A G 10 0.534589000010906 0.276068701381555 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 120744349 T/C 1 23 18 41 10.7044529997492 9.62260200019631 1.08185099955285 T:C T C 10 0.534589000010906 0.756980786078456 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120743015_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000529653:exon_120744055_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000526969:exon_120744302_120744426:TAF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 120744399 C/T 1 27 13 40 12.5660969997055 6.94965700014178 5.61643999956376 T:C C T 10 0.534589000010906 0.08221398516996 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120743015_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000529653:exon_120744055_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000526969:exon_120744302_120744426:TAF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 121528385 T/C 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000172167:ENST00000305949:exon_121528165_121528431:MTBP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 123964431 G/A 1 16 12 28 7.4465759998255 6.41506800013087 1.03150799969463 A:G G A 10 0.534589000010906 0.85019112749302 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 123964953 C/T 1 9 12 21 4.18869899990185 6.41506800013087 -2.22636900022903 T:C C T 10 0.534589000010906 0.384849165712211 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 124142489 T/C 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518866:exon_124142438_124142573:WDR67 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 124448736 A/G 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 A:G A G 10 0.534589000010906 0.189086525758904 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 A:T T A 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 11 6 17 5.11952099988003 3.20753400006544 1.9119869998146 T:C C T 10 0.534589000010906 0.467664186074611 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 125463435 C/G 1 16 14 30 7.4465759998255 7.48424600015268 -0.0376700003271813 C:G C G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 125463544 T/C 1 12 18 30 5.58493199986913 9.62260200019631 -4.03767000032718 T:C T C 10 0.534589000010906 0.147392324053680 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 125499363 G/A 1 51 40 91 23.7359609994438 21.3835600004362 2.35240099900755 A:G G A 10 0.534589000010906 0.674700529396626 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 125528135 G/A 1 24 18 42 11.1698639997383 9.62260200019631 1.54726199954194 A:G G A 10 0.534589000010906 0.646830707540118 ENSG00000147687:ENST00000276692:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523214:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519548:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522810:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000517678:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519776:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521546:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521973:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520321:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522310:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519232:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520938:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523888:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523152:exon_125528128_125528271:TATDN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 132982824 A/G 1 11 7 18 5.11952099988003 3.74212300007634 1.37739799980369 A:G A G 10 0.534589000010906 0.63873345646322 ENSG00000132294:ENST00000254624:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000407309:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000377917:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000334503:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000519656:exon_132982723_132982890:EFR3A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 135602581 A/G 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 A:G A G 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 135612745 A/G 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 142161032 A/C 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:C A C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142160933_142161052:DENND3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 142161873 C/T 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 T:C C T 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142161718_142161936:DENND3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 142161888 G/A 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 A:G G A 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142161718_142161936:DENND3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 14 5 19 6.51575399984732 2.67294500005453 3.84280899979279 A:G G A 10 0.534589000010906 0.105953198279502 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 142204293 C/T 1 18 11 29 8.37739799980369 5.88047900011997 2.49691899968372 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.457180957633404 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 11 22 33 5.11952099988003 11.7609580002399 -6.6414370003599 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0230712933537221 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 142204351 A/G 1 14 10 24 6.51575399984732 5.34589000010906 1.16986399973826 A:G A G 10 0.534589000010906 0.686499461842995 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 142228909 G/A 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:G G A 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000022567:ENST00000519067:exon_142228110_142229128:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000517878:exon_142228110_142229128:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000024061:exon_142228110_142229128:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000433583:exon_142228110_142229128:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000425766:exon_142228110_142229128:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000520137:exon_142228873_142229128:SLC45A4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 143436034 A/G 1 4 4 8 1.86164399995638 2.13835600004362 -0.276712000087248 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000519651:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520462:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000518720:exon_143435998_143436124:TSNARE1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 143740324 G/A 1 10 10 20 4.65410999989094 5.34589000010906 -0.69178000021812 A:G G A 10 0.534589000010906 0.824629775002564 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 22 22 44 10.2390419997601 11.7609580002399 -1.52191600047987 T:C T C 10 0.534589000010906 0.653699059282048 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144620342 T/C 1 23 25 48 10.7044529997492 13.3647250002727 -2.66027200052349 T:C T C 10 0.534589000010906 0.471573474354599 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144620871 A/G 1 12 19 31 5.58493199986913 10.1571910002072 -4.57225900033809 A:G A G 10 0.534589000010906 0.107696074729923 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144621035 G/A 1 15 4 19 6.98116499983641 2.13835600004362 4.84280899979279 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0359770464172895 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144621084 T/G 1 20 10 30 9.30821999978188 5.34589000010906 3.96232999967282 T:G T G 10 0.534589000010906 0.199456527238873 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144621091 A/T 1 19 12 31 8.84280899979279 6.41506800013087 2.42774099966191 A:T A T 10 0.534589000010906 0.47233262636417 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144643169 C/T 1 9 4 13 4.18869899990185 2.13835600004362 2.05034299985822 T:C C T 10 0.534589000010906 0.281774765265439 ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526051:exon_144643031_144643593:GSDMD HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 1 1 15 16 0.465410999989094 8.01883500016359 -7.5534240001745 A:G G A 10 0.534589000010906 0.000138403390779916 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 669 658 1327 311.359958992704 351.759562007176 -40.3996030144723 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.0276742333979576 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144671244 C/A 1 8 8 16 3.72328799991275 4.27671200008725 -0.553424000174497 A:C C A 10 0.534589000010906 0.807042042252045 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144671922 G/A 1 8 11 19 3.72328799991275 5.88047900011997 -2.15719100020721 A:G G A 10 0.534589000010906 0.363088485682007 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144681777 G/T 1 16 14 30 7.4465759998255 7.48424600015268 -0.0376700003271813 T:G G T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144687092 T/C 1 37 30 67 17.2202069995965 16.0376700003272 1.1825369992693 T:C T C 10 0.534589000010906 0.80743084437921 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144687077_144687127:PYCRL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144689146 C/T 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 6 13 19 2.79246599993456 6.94965700014178 -4.15719100020721 A:C A C 10 0.534589000010906 0.0664194041354686 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144990879 G/A 1 63 55 118 29.3208929993129 29.4023950005998 -0.0815020012869105 A:T:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 144996831 G/A 1 16 7 23 7.4465759998255 3.74212300007634 3.70445299974916 A:G G A 10 0.534589000010906 0.145094012769066 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 145140590 C/T 1 90 75 165 41.8869899990185 40.094175000818 1.7928149982005 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.815113202291396 ENSG00000197858:ENST00000355091:exon_145140476_145140646:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000361036:exon_145140476_145140646:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000529638:exon_145140476_145140646:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000530796:exon_145140192_145140646:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000534072:exon_145140476_145141087:GPAA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 145665516 T/C 1 11 11 22 5.11952099988003 5.88047900011997 -0.760958000239933 T:C T C 10 0.534589000010906 0.832013937520133 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665462_145665551:NFKBIL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 145665761 G/A 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 A:G G A 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665734_145665812:NFKBIL2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 145689915 G/A 1 12 8 20 5.58493199986913 4.27671200008725 1.30821999978188 A:C:G G A 10 0.534589000010906 0.656685513222068 ENSG00000187954:ENST00000438911:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000292543:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000403000:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000424149:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000306145:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000533764:exon_145689658_145689995:CYHR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 145693720 A/G 1 9 1 10 4.18869899990185 0.534589000010906 3.65410999989094 A:G A G 10 0.534589000010906 0.0244567728924624 ENSG00000167702:ENST00000301332:exon_145693712_145693789:KIFC2;ENSG00000167702:ENST00000301331:exon_145693712_145693789:KIFC2;ENSG00000167702:ENST00000529644:exon_145693712_145693822:KIFC2;ENSG00000167702:ENST00000533114:exon_145693242_145693809:KIFC2;ENSG00000167702:ENST00000528415:exon_145693712_145693789:KIFC2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 145737514 G/A 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 A:G G A 10 0.534589000010906 0.731759291541082 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 145737636 A/G 1 31 22 53 14.4277409996619 11.7609580002399 2.66678299942198 A:G A G 10 0.534589000010906 0.493670316776132 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737527_145737707:RECQL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 20 21 41 9.30821999978188 11.226369000229 -1.91814900044715 T:C C T 10 0.534589000010906 0.639189413952457 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 16 14 30 7.4465759998255 7.48424600015268 -0.0376700003271813 C:G C G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 14 15 29 6.51575399984732 8.01883500016359 -1.50308100031628 A:G G A 10 0.534589000010906 0.58291728377747 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 145742514 A/G 1 8 4 12 3.72328799991275 2.13835600004362 1.58493199986913 A:G A G 10 0.534589000010906 0.401454124777931 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534270:exon_145742217_145742574:RECQL4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 145745182 T/C 1 12 17 29 5.58493199986913 9.0880130001854 -3.50308100031627 T:C T C 10 0.534589000010906 0.198836235703780 ENSG00000160959:ENST00000527730:exon_145745085_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000529022:exon_145744999_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000292524:exon_145744999_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000530854:exon_145745085_145745369:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000525766:exon_145744999_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000531310:exon_145744651_145745438:LRRC14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 146156247 C/A 1 6 10 16 2.79246599993456 5.34589000010906 -2.5534240001745 A:C C A 10 0.534589000010906 0.219453370200368 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 146157339 T/C 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 8 146171437 A/G 1 4 8 12 1.86164399995638 4.27671200008725 -2.41506800013087 A:G A G 10 0.534589000010906 0.246532544157622 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000532351:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000532811:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000527512:exon_146171299_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000527811:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000527427:exon_146169475_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000529378:exon_146171310_146171601:ZNF16 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 312124 T/C 1 2 8 10 0.930821999978188 4.27671200008725 -3.34589000010906 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0527671529214564 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_311954_312941:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000474772:exon_311958_312166:DOCK8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 399255 G/A 1 8 12 20 3.72328799991275 6.41506800013087 -2.69178000021812 A:G G A 10 0.534589000010906 0.265898160963149 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_399146_399259:DOCK8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 2058453 C/A 1 35 44 79 16.2893849996183 23.5219160004799 -7.23253100086158 A:C C A 10 0.534589000010906 0.114409618229694 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2058291_2058464:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2058291_2058464:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2058291_2058464:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2058291_2058464:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2058291_2058464:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2058291_2058464:SMARCA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 2073292 A/G 1 21 21 42 9.77363099977097 11.226369000229 -1.45273800045806 A:G A G 10 0.534589000010906 0.757488064034296 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2073212_2073342:SMARCA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 2820046 G/C 1 15 13 28 6.98116499983641 6.94965700014178 0.0315079996946315 C:G G C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2820018_2820098:KIAA0020 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 4685008 C/T 1 10 4 14 4.65410999989094 2.13835600004362 2.51575399984732 T:C C T 10 0.534589000010906 0.194114354160929 ENSG00000106993:ENST00000381858:exon_4684877_4685158:CDC37L1;ENSG00000106993:ENST00000381854:exon_4684877_4685158:CDC37L1;ENSG00000106993:ENST00000381845:exon_4684877_4685158:CDC37L1;ENSG00000106993:ENST00000479095:exon_4684877_4685475:CDC37L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 45 43 88 20.9434949995092 22.987327000469 -2.04383200095973 A:G A G 10 0.534589000010906 0.670572819430167 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 20 14 34 9.30821999978188 7.48424600015268 1.8239739996292 A:G A G 10 0.534589000010906 0.607616730533381 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 6012734 A/C 1 28 20 48 13.0315079996946 10.6917800002181 2.33972799947651 A:C A C 10 0.534589000010906 0.563817178033223 ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 7799606 C/A 1 85 68 153 39.559934999073 36.3520520007416 3.20788299833138 A:C C A 10 0.534589000010906 0.627414648792456 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 7799653 G/T 1 117 95 212 54.453086998724 50.7859550010361 3.66713199768792 T:G G T 10 0.534589000010906 0.630397419606041 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 15459821 A/C 1 19 14 33 8.84280899979279 7.48424600015268 1.3585629996401 A:C A C 10 0.534589000010906 0.728172693915283 ENSG00000164975:ENST00000380821:exon_15459717_15464132:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000467062:exon_15459717_15460311:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000380807:exon_15459717_15460311:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000490969:exon_15459717_15460311:SNAPC3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 15591372 T/A 1 7 1 8 3.25787699992366 0.534589000010906 2.72328799991275 A:T T A 10 0.534589000010906 0.0755591978202379 ENSG00000164989:ENST00000297641:exon_15591364_15591554:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380689:exon_15591364_15591554:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380701:exon_15591364_15591554:C9orf93 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 15784560 A/G 1 6 4 10 2.79246599993456 2.13835600004362 0.654109999890939 A:G A G 10 0.534589000010906 0.759738684806709 ENSG00000164989:ENST00000297641:exon_15784507_15784692:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380689:exon_15784507_15784692:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380701:exon_15784507_15784692:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000359391:exon_15784507_15784692:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000449575:exon_15784507_15784692:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000432954:exon_15784507_15784692:C9orf93 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 19376255 A/C 1 4 14 18 1.86164399995638 7.48424600015268 -5.62260200019631 A:C A C 10 0.534589000010906 0.00881066971311052 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 19376258 G/C 1 4 16 20 1.86164399995638 8.5534240001745 -6.69178000021812 C:G G C 10 0.534589000010906 0.00296312731174006 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 20988426 A/G 1 12 28 40 5.58493199986913 14.9684920003054 -9.38356000043624 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00380509375997304 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20988331_20988428:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20988331_20988428:KIAA1797 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 21029330 T/C 1 2 7 9 0.930821999978188 3.74212300007634 -2.81130100009815 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0917858367386368 ENSG00000188921:ENST00000495827:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000513293:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000521505:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000531631:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000380233:exon_21029294_21029397:PTPLAD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 26892654 G/A 1 11 2 13 5.11952099988003 1.06917800002181 4.05034299985822 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0265185322124304 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26892411_26892802:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26892411_26892801:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26892257_26892785:C9orf82 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 32450187 T/C 1 9 8 17 4.18869899990185 4.27671200008725 -0.0880130001854029 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 32459450 T/G 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 T:G T G 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32459369_32459512:DDX58 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 32552462 C/G 1 27 37 64 12.5660969997055 19.7797930004035 -7.21369600069798 C:G C G 10 0.534589000010906 0.0793509374145518 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32552432_32552551:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32552432_32552551:TOPORS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 10 15 25 4.65410999989094 8.01883500016359 -3.36472500027265 T:C C T 10 0.534589000010906 0.228865227218520 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 35105257 G/A 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 A:G G A 10 0.534589000010906 1 ENSG00000005238:ENST00000378566:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35104118_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35104120_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35104139_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000479357:exon_35104827_35105371:KIAA1539 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 35606884 G/A 1 8 5 13 3.72328799991275 2.67294500005453 1.05034299985822 A:G G A 10 0.534589000010906 0.592941099997918 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35606834_35606980:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35606834_35606980:TESK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 36162418 G/A 1 10 3 13 4.65410999989094 1.60376700003272 3.05034299985822 A:G G A 10 0.534589000010906 0.102317208684754 ENSG00000122694:ENST00000396613:exon_36162359_36163887:GLIPR2;ENSG00000122694:ENST00000377949:exon_36162359_36163887:GLIPR2;ENSG00000122694:ENST00000377959:exon_36162359_36162907:GLIPR2;ENSG00000122694:ENST00000377960:exon_36162359_36163910:GLIPR2;ENSG00000122694:ENST00000474050:exon_36162359_36163899:GLIPR2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 31 15 46 14.4277409996619 8.01883500016359 6.40890599949832 T:G G T 10 0.534589000010906 0.0750749667987139 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 23 13 36 10.7044529997492 6.94965700014178 3.75479599960738 T:C C T 10 0.534589000010906 0.243661160357124 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 27 15 42 12.5660969997055 8.01883500016359 4.54726199954195 T:C T C 10 0.534589000010906 0.167495467529491 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 89 54 143 41.4215789990294 28.8678060005889 12.5537729984404 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0362283106635599 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 37537557 G/A 1 8 13 21 3.72328799991275 6.94965700014178 -3.22636900022903 A:G G A 10 0.534589000010906 0.190957094599046 ENSG00000147912:ENST00000276960:exon_37537107_37537940:FBXO10;ENSG00000147912:ENST00000432825:exon_37537107_37537940:FBXO10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 38395928 C/T 1 17 13 30 7.9119869998146 6.94965700014178 0.962329999672819 T:C C T 10 0.534589000010906 0.85523438102995 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 38396002 C/T 1 23 19 42 10.7044529997492 10.1571910002072 0.547261999541947 T:C C T 10 0.534589000010906 0.87867221204653 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 38396271 G/A 1 22 18 40 10.2390419997601 9.62260200019631 0.616439999563758 A:G G A 10 0.534589000010906 0.875398535411848 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 71843023 C/A 1 18 18 36 8.37739799980369 9.62260200019631 -1.24520400039262 A:C C A 10 0.534589000010906 0.739482103379621 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71842897_71843030:TJP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 80912115 G/C 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 C:G G C 10 0.534589000010906 0.156883047615629 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80911992_80912186:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80912059_80912186:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80912059_80912186:PSAT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 88636887 G/A 1 8 20 28 3.72328799991275 10.6917800002181 -6.96849200030537 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0123425880620307 ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88636816_88637213:NAA35 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 88694179 G/T 1 5 4 9 2.32705499994547 2.13835600004362 0.188698999901846 T:G G T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000470762:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000486130:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000466178:exon_88694107_88694256:GOLM1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 90321583 C/T 1 28 20 48 13.0315079996946 10.6917800002181 2.33972799947651 T:C C T 10 0.534589000010906 0.563817178033223 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 92003679 C/T 1 16 13 29 7.4465759998255 6.94965700014178 0.496918999683725 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92003551_92003707:SEMA4D HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 95015749 A/C 1 4 7 11 1.86164399995638 3.74212300007634 -1.88047900011997 A:C A C 10 0.534589000010906 0.366323804837261 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 95018903 A/G 1 9 7 16 4.18869899990185 3.74212300007634 0.446575999825503 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000196305:ENST00000472894:exon_95018639_95019082:IARS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 95068046 C/T 1 39 38 77 18.1510289995747 20.3143820004144 -2.16335300083977 T:C C T 10 0.534589000010906 0.6487833492517 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000477862:exon_95068035_95068112:NOL8 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 96209943 T/C 1 24 25 49 11.1698639997383 13.3647250002727 -2.1948610005344 T:C T C 10 0.534589000010906 0.568407863350002 ENSG00000188938:ENST00000479094:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000423591:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375412:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375409:exon_96208783_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000523407:exon_96208807_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520403:exon_96208815_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520470:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483149:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483056:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000476484:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428152:exon_96209550_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428378:exon_96209917_96209979:FAM120AOS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 96238578 C/T 1 34 24 58 15.8239739996292 12.8301360002617 2.99383799936745 T:C:G C T 10 0.534589000010906 0.510834559517571 ENSG00000048828:ENST00000437660:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000375389:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000277165:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000340893:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000333936:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000446420:exon_96238538_96238620:FAM120A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 100459578 T/C 1 15 17 32 6.98116499983641 9.0880130001854 -2.10684800034899 T:C T C 10 0.534589000010906 0.482636180272191 ENSG00000136936:ENST00000375128:exon_100459403_100459639:XPA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 9 4 13 4.18869899990185 2.13835600004362 2.05034299985822 T:C C T 10 0.534589000010906 0.281774765265439 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 100767307 A/C 1 279 266 545 129.849668996957 142.200674002901 -12.3510050059438 A:T:C A C 10 0.534589000010906 0.302790415918916 ENSG00000136938:ENST00000447173:exon_100767246_100767435:ANP32B;ENSG00000136938:ENST00000339399:exon_100767246_100767435:ANP32B;ENSG00000136938:ENST00000473205:exon_100767217_100767417:ANP32B;ENSG00000136938:ENST00000486769:exon_100767246_100767580:ANP32B HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 100823084 T/C 1 46 39 85 21.4089059994983 20.8489710004253 0.559934999072986 T:C T C 10 0.534589000010906 0.913957596347025 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 108147763 T/G 1 19 14 33 8.84280899979279 7.48424600015268 1.3585629996401 A:T:G T G 10 0.534589000010906 0.728172693915283 ENSG00000070214:ENST00000374723:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000470972:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374720:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374724:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000361080:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000343170:exon_108147703_108147783:SLC44A1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 111641806 G/A 1 9 6 15 4.18869899990185 3.20753400006544 0.981164999836409 A:G G A 10 0.534589000010906 0.796967668188066 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 111659439 T/C 1 11 7 18 5.11952099988003 3.74212300007634 1.37739799980369 T:C T C 10 0.534589000010906 0.63873345646322 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111659428_111659565:IKBKAP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 111659483 T/G 1 10 4 14 4.65410999989094 2.13835600004362 2.51575399984732 T:G T G 10 0.534589000010906 0.194114354160929 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111659428_111659565:IKBKAP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 111660851 C/T 1 5 12 17 2.32705499994547 6.41506800013087 -4.0880130001854 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0535258720090529 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111660782_111660861:IKBKAP HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 111727670 C/G 1 27 25 52 12.5660969997055 13.3647250002727 -0.798628000567113 C:G C G 10 0.534589000010906 0.889733939858785 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111727658_111727808:CTNNAL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 111755008 C/T 1 10 5 15 4.65410999989094 2.67294500005453 1.98116499983641 T:C C T 10 0.534589000010906 0.438822405676019 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374593:exon_111754912_111755099:CTNNAL1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 112900199 T/C 1 20 29 49 9.30821999978188 15.5030810003163 -6.1948610005344 T:C T C 10 0.534589000010906 0.0858634698688924 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 112900785 A/G 1 22 29 51 10.2390419997601 15.5030810003163 -5.26403900055621 A:G A G 10 0.534589000010906 0.160580707429357 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 114694486 A/G 1 21 18 39 9.77363099977097 9.62260200019631 0.151028999574663 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000148154:ENST00000374279:exon_114694450_114694639:UGCG HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 16 28 44 7.4465759998255 14.9684920003054 -7.52191600047987 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0331578346976297 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 115968797 C/T 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 T:C C T 10 0.534589000010906 0.156883047615629 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115968789_115968858:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115968789_115968858:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115968789_115968858:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000493847:exon_115968291_115968858:FKBP15 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 44 43 87 20.4780839995201 22.987327000469 -2.50924300094882 A:G A G 10 0.534589000010906 0.5930748032196 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 18 21 39 8.37739799980369 11.226369000229 -2.84897100042534 T:C C T 10 0.534589000010906 0.422955267397017 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 16 16 32 7.4465759998255 8.5534240001745 -1.10684800034899 A:G G A 10 0.534589000010906 0.725761441333252 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 126144553 C/T 1 16 15 31 7.4465759998255 8.01883500016359 -0.572259000338088 T:C C T 10 0.534589000010906 0.858876862828474 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126141933_126144904:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126141933_126144904:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126141933_126144904:DENND1A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 126520068 T/C 1 7 5 12 3.25787699992366 2.67294500005453 0.584931999869128 T:C T C 10 0.534589000010906 0.780814438460418 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126519982_126520101:DENND1A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 127623856 C/G 1 7 4 11 3.25787699992366 2.13835600004362 1.11952099988003 C:G C G 10 0.534589000010906 0.559520922145634 ENSG00000136942:ENST00000487431:exon_127623698_127624215:RPL35 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 127915947 G/A 1 44 34 78 20.4780839995201 18.1760260003708 2.30205799914933 A:G G A 10 0.534589000010906 0.650549954036195 ENSG00000119414:ENST00000373547:exon_127915812_127916021:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000373546:exon_127915812_127916021:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000415905:exon_127915812_127916021:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000451402:exon_127915812_127916021:PPP6C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 128064673 T/G 1 7 2 9 3.25787699992366 1.06917800002181 2.18869899990185 T:G T G 10 0.534589000010906 0.189086525758904 ENSG00000165219:ENST00000497580:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394084:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000470056:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394105:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394104:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394101:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000265956:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000418009:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394083:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000495955:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000467750:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000297933:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000312123:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000431329:exon_128064489_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000436712:exon_128064586_128065105:GAPVD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 128692068 C/T 1 12 5 17 5.58493199986913 2.67294500005453 2.9119869998146 T:C C T 10 0.534589000010906 0.223771329291868 ENSG00000167081:ENST00000373492:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373489:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000342287:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373487:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373483:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373482:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000447726:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000428092:exon_128691934_128692124:PBX3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 129595667 C/T 1 2 7 9 0.930821999978188 3.74212300007634 -2.81130100009815 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0917858367386368 ENSG00000169155:ENST00000449886:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373464:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373457:exon_129593688_129599382:ZBTB43 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 8 9 17 3.72328799991275 4.81130100009815 -1.0880130001854 A:G G A 10 0.534589000010906 0.633804450498163 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 130630233 G/T 1 9 9 18 4.18869899990185 4.81130100009815 -0.622602000196309 T:G G T 10 0.534589000010906 0.81636697210269 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130628759_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630118_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630169_130630355:AK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 53 50 103 24.666782999422 26.7294500005453 -2.06266700112332 C:G G C 10 0.534589000010906 0.693905951005823 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 55 55 110 25.5976049994002 29.4023950005998 -3.80479000119966 A:G A G 10 0.534589000010906 0.503867537901286 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 130707081 A/G 1 12 10 22 5.58493199986913 5.34589000010906 0.239041999760067 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000465821:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000373084:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000300434:exon_130707056_130707177:FAM102A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 131088076 G/A 1 14 6 20 6.51575399984732 3.20753400006544 3.30821999978188 A:G G A 10 0.534589000010906 0.179108698464351 ENSG00000167113:ENST00000300452:exon_131088058_131088160:COQ4;ENSG00000167113:ENST00000372875:exon_131088058_131088679:COQ4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 131122794 G/A 1 17 13 30 7.9119869998146 6.94965700014178 0.962329999672819 A:G G A 10 0.534589000010906 0.85523438102995 ENSG00000167114:ENST00000339595:exon_131122613_131123501:SLC27A4;ENSG00000167114:ENST00000372870:exon_131122613_131123496:SLC27A4;ENSG00000167114:ENST00000300456:exon_131122613_131123502:SLC27A4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 131222921 G/A 1 18 5 23 8.37739799980369 2.67294500005453 5.70445299974916 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0202143956591613 ENSG00000136811:ENST00000469582:exon_131222792_131222945:ODF2;ENSG00000136811:ENST00000444993:exon_131222829_131222945:ODF2;ENSG00000136811:ENST00000351030:exon_131222829_131222945:ODF2;ENSG00000136811:ENST00000393527:exon_131222829_131222945:ODF2;ENSG00000136811:ENST00000448249:exon_131222829_131222945:ODF2;ENSG00000136811:ENST00000372807:exon_131222792_131222945:ODF2;ENSG00000136811:ENST00000421776:exon_131222792_131222945:ODF2;ENSG00000136811:ENST00000303890:exon_131222829_131222945:ODF2;ENSG00000136811:ENST00000444119:exon_131222792_131222945:ODF2;ENSG00000136811:ENST00000494663:exon_131222904_131222945:ODF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 131379998 C/A 1 52 42 94 24.2013719994329 22.4527380004581 1.74863399897483 A:C C A 10 0.534589000010906 0.757026640788295 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 131451876 G/T 1 248 244 492 115.421927997295 130.439716002661 -15.0177880053658 T:G G T 10 0.534589000010906 0.175502377481128 ENSG00000119335:ENST00000322030:exon_131451505_131451934:SET;ENSG00000119335:ENST00000494141:exon_131451554_131451934:SET HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 61 51 112 28.3900709993347 27.2640390005562 1.12603199877853 A:C A C 10 0.534589000010906 0.85029737396544 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 131849036 C/T 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000167130:ENST00000372546:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000406974:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000327812:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000412363:exon_131848988_131849077:DOLPP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 132580901 C/G 1 42 35 77 19.5472619995419 18.7106150003817 0.836646999160234 C:G C G 10 0.534589000010906 0.909240543679975 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000474192:exon_132580632_132580926:TOR1A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 132638424 C/T 1 12 5 17 5.58493199986913 2.67294500005453 2.9119869998146 T:C C T 10 0.534589000010906 0.223771329291868 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000496927:exon_132638409_132638517:USP20 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 132720770 A/G 1 65 61 126 30.2517149992911 32.6099290006653 -2.35821400137416 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.72114182699435 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 134346315 T/C 1 14 14 28 6.51575399984732 7.48424600015268 -0.968492000305369 T:C T C 10 0.534589000010906 0.710379181771136 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134346175_134346370:BAT2L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 134350231 C/T 1 23 33 56 10.7044529997492 17.6414370003599 -6.93698400061074 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0807217358801048 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000456307:exon_134349841_134350234:BAT2L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 134350323 C/G 1 24 18 42 11.1698639997383 9.62260200019631 1.54726199954194 C:G C G 10 0.534589000010906 0.646830707540118 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 134350458 C/T 1 24 21 45 11.1698639997383 11.226369000229 -0.0565050004907732 T:C C T 10 0.534589000010906 1 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 134351065 G/T 1 29 18 47 13.4969189996837 9.62260200019631 3.87431699948742 T:G G T 10 0.534589000010906 0.306487288090517 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 134351500 C/T 1 15 19 34 6.98116499983641 10.1571910002072 -3.1760260003708 A:T:C C T 10 0.534589000010906 0.304839552367912 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134351317_134351922:BAT2L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 134358108 A/G 1 19 11 30 8.84280899979279 5.88047900011997 2.96232999967282 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.360536373270145 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134358097_134358294:BAT2L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 134371165 C/T 1 47 46 93 21.8743169994874 24.5910940005017 -2.71677700101426 T:C C T 10 0.534589000010906 0.603985548856711 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134371127_134375558:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000320547:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000465931:exon_134371127_134375584:BAT2L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 134386744 T/C 1 7 6 13 3.25787699992366 3.20753400006544 0.0503429998582212 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134386724_134386855:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 134387488 T/C 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134387428_134387514:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134387279_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 134401335 C/T 1 18 13 31 8.37739799980369 6.94965700014178 1.42774099966191 T:C C T 10 0.534589000010906 0.719634139084765 ENSG00000130717:ENST00000372215:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372208:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000491309:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372211:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372210:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000484876:exon_134401316_134401546:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000494584:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000459858:exon_134401332_134401364:UCK1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 134497321 C/T 1 16 24 40 7.4465759998255 12.8301360002617 -5.38356000043624 T:C C T 10 0.534589000010906 0.1120485386908 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000419442:exon_134497183_134497385:RAPGEF1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 135554566 G/A 1 19 27 46 8.84280899979279 14.4339030002945 -5.59109400050168 A:G G A 10 0.534589000010906 0.105446170519312 ENSG00000125484:ENST00000372146:exon_135553364_135555190:GTF3C4;ENSG00000125484:ENST00000483873:exon_135554265_135554697:GTF3C4 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 135772717 G/A 1 2 9 11 0.930821999978188 4.81130100009815 -3.88047900011997 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0299085362195834 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135772571_135772732:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135772571_135772732:TSC1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 28 27 55 13.0315079996946 14.4339030002945 -1.40239500059983 A:G G A 10 0.534589000010906 0.787232658296689 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 135985796 C/T 1 4 6 10 1.86164399995638 3.20753400006544 -1.34589000010906 T:C C T 10 0.534589000010906 0.529760851175976 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135985683_135985876:RALGDS HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 136650966 C/T 1 14 6 20 6.51575399984732 3.20753400006544 3.30821999978188 T:C C T 10 0.534589000010906 0.179108698464351 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136650898_136651007:VAV2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 136913568 G/A 1 13 9 22 6.05034299985822 4.81130100009815 1.23904199976007 A:G G A 10 0.534589000010906 0.672470686731093 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000494743:exon_136913124_136913576:BRD3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 137005023 C/T 1 12 12 24 5.58493199986913 6.41506800013087 -0.830136000261746 T:C C T 10 0.534589000010906 0.83866338058516 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 139100805 T/C 1 8 13 21 3.72328799991275 6.94965700014178 -3.22636900022903 T:C T C 10 0.534589000010906 0.190957094599046 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139098179_139101121:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139098185_139101121:QSOX2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 139110654 C/T 1 5 3 8 2.32705499994547 1.60376700003272 0.723287999912752 T:C C T 10 0.534589000010906 0.731759291541082 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139110525_139110654:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139110525_139110654:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000455222:exon_139110525_139110654:QSOX2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 139369015 G/A 1 11 14 25 5.11952099988003 7.48424600015268 -2.36472500027265 A:G G A 10 0.534589000010906 0.423628611134497 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 139837171 A/G 0 23 0 23 10.7044529997492 0 10.7044529997492 A A 10 0.534589000010906 5.78135501734028e-07 ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139836999_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000433269:exon_139836999_139837178:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000480818:exon_139836999_139837395:FBXW5 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 139943112 A/G 1 5 9 14 2.32705499994547 4.81130100009815 -2.48424600015268 A:G A G 10 0.534589000010906 0.283670203474933 ENSG00000054179:ENST00000355097:exon_139942550_139943312:ENTPD2;ENSG00000054179:ENST00000460614:exon_139942559_139943312:ENTPD2;ENSG00000054179:ENST00000312665:exon_139943049_139943312:ENTPD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 139945363 G/A 1 4 5 9 1.86164399995638 2.67294500005453 -0.811301000098154 A:G G A 10 0.534589000010906 0.741882642224914 ENSG00000054179:ENST00000355097:exon_139945354_139945581:ENTPD2;ENSG00000054179:ENST00000312665:exon_139945354_139945581:ENTPD2;ENSG00000054179:ENST00000469106:exon_139945354_139945581:ENTPD2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 139973820 C/T 1 5 6 11 2.32705499994547 3.20753400006544 -0.880479000119966 T:C C T 10 0.534589000010906 0.764524730244108 ENSG00000197355:ENST00000409858:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000360271:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 140002989 T/C 1 39 38 77 18.1510289995747 20.3143820004144 -2.16335300083977 T:C T C 10 0.534589000010906 0.6487833492517 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140002840_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001983_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000475449:exon_140002983_140003529:MAN1B1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 362 322 684 168.478781996052 172.137658003512 -3.65887600745972 A:T:G G A 10 0.534589000010906 0.788552842380926 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 140006425 C/G 1 231 182 413 107.509940997481 97.2951980019849 10.2147429954958 C:G C G 10 0.534589000010906 0.324113260377283 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006393_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140006360_140006481:DPP7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 140008750 G/C 1 60 49 109 27.9246599993456 26.1948610005344 1.72979899881124 C:G G C 10 0.534589000010906 0.773844244376634 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008695_140008830:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00854_parsed_pileup.txt . 9 140166597 G/A 1 47 28 75 21.8743169994874 14.9684920003054 6.90582499918205 A:G G A 10 0.534589000010906 0.131953912792336 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166533_140166674:COBRA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 200860 T/C 1 10 10 20 4.65410999989094 5.34589000010906 -0.69178000021812 T:C T C 10 0.534589000010906 0.824629775002564 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000445062:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000429181:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000443019:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_200401_200981:PLCXD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 207362 C/T 1 6 8 14 2.79246599993456 4.27671200008725 -1.48424600015268 T:C C T 10 0.534589000010906 0.437971150157616 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_207315_207459:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_207315_207424:PLCXD1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 295069 A/G 1 16 5 21 7.4465759998255 2.67294500005453 4.77363099977097 A:T:G A G 10 0.534589000010906 0.047344478590988 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 295097 C/T 1 15 5 20 6.98116499983641 2.67294500005453 4.30821999978188 T:C C T 10 0.534589000010906 0.0712795860430289 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 6 6 12 2.79246599993456 3.20753400006544 -0.415068000130873 T:C T C 10 0.534589000010906 1 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 14 7 21 6.51575399984732 3.74212300007634 2.77363099977097 A:G A G 10 0.534589000010906 0.276590217785206 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 299360 G/A 1 12 3 15 5.58493199986913 1.60376700003272 3.98116499983641 A:G G A 10 0.534589000010906 0.0663369253246265 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 299362 A/G 1 11 1 12 5.11952099988003 0.534589000010906 4.58493199986913 A:G A G 10 0.534589000010906 0.00776339189204268 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 299591 A/G 1 5 5 10 2.32705499994547 2.67294500005453 -0.34589000010906 A:G A G 10 0.534589000010906 1 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 1686 1688 3374 784.682945981612 902.386232018409 -117.703286036797 A:T:G G A 10 0.534589000010906 4.98149162154265e-05 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 94 86 180 43.7486339989748 45.9746540009379 -2.22602000196309 T:C C T 10 0.534589000010906 0.765289467625452 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 27 25 52 12.5660969997055 13.3647250002727 -0.798628000567113 T:C C T 10 0.534589000010906 0.889733939858785 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 15415583 C/T 0 10 0 10 4.65410999989094 0 4.65410999989094 C C 10 0.534589000010906 0.00238317236301322 ENSG00000087842:ENST00000380420:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000380421:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000492432:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000484433:exon_15415571_15415653:PIR HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 16859628 G/A 1 3 8 11 1.39623299996728 4.27671200008725 -2.88047900011997 A:G G A 10 0.534589000010906 0.127884495538899 ENSG00000086712:ENST00000380122:exon_16859551_16862642:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000398155:exon_16859551_16860296:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000485153:exon_16859551_16862642:TXLNG HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 18938161 G/T 1 3 10 13 1.39623299996728 5.34589000010906 -3.94965700014178 T:G G T 10 0.534589000010906 0.0473534851625257 ENSG00000044446:ENST00000379942:exon_18938150_18938319:PHKA2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 24075862 A/G 1 17 68 85 7.9119869998146 36.3520520007416 -28.440065000927 A:G A G 10 0.534589000010906 4.81304066653063e-10 ENSG00000130741:ENST00000253039:exon_24075750_24075871:EIF2S3;ENSG00000130741:ENST00000423068:exon_24075750_24075871:EIF2S3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 40460040 T/C 0 46 0 46 21.4089059994983 0 21.4089059994983 T T 10 0.534589000010906 3.36548465776132e-13 ENSG00000182220:ENST00000378438:exon_40460014_40460133:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000486558:exon_40460014_40460133:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000447485:exon_40460014_40460128:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000423649:exon_40460014_40460133:ATP6AP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 47062534 G/A 1 14 140 154 6.51575399984732 74.8424600015268 -68.3267060016795 A:G G A 10 0.534589000010906 1.50843997301220e-31 ENSG00000130985:ENST00000377351:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000335972:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000424033:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000377271:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000490869:exon_47062533_47062613:UBA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 47085673 C/T 1 2 6 8 0.930821999978188 3.20753400006544 -2.27671200008725 T:C C T 10 0.534589000010906 0.156883047615629 ENSG00000102225:ENST00000522234:exon_47085364_47085977:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000428400:exon_47085364_47086102:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000523699:exon_47085495_47085801:CDK16 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 47487015 C/T 0 74 0 74 34.440413999193 0 34.440413999193 C C 10 0.534589000010906 8.43251766103819e-21 ENSG00000126759:ENST00000396992:exon_47486870_47487040:CFP;ENSG00000126759:ENST00000247153:exon_47486870_47487040:CFP;ENSG00000126759:ENST00000485991:exon_47486870_47487040:CFP;ENSG00000126759:ENST00000377005:exon_47486870_47487040:CFP;ENSG00000126759:ENST00000469388:exon_47486870_47487040:CFP HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 48682972 A/G 1 87 2 89 40.4907569990512 1.06917800002181 39.4215789990294 A:G A G 10 0.534589000010906 2.13430016718966e-21 ENSG00000094631:ENST00000444343:exon_48682954_48683380:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000334136:exon_48682954_48683386:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000376619:exon_48682954_48683386:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000477528:exon_48682954_48683392:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000486227:exon_48682954_48683386:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000488543:exon_48682954_48683386:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000430858:exon_48682954_48683386:HDAC6 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 48888074 T/C 0 0 32 32 0 17.106848000349 -17.106848000349 C T C 10 0.534589000010906 2.34840283458112e-11 ENSG00000068323:ENST00000315869:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000493583:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000478476:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000336239:exon_48887729_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000495940:exon_48888024_48888110:TFE3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 49032208 G/A 0 0 57 57 0 30.4715730006216 -30.4715730006216 A G A 10 0.534589000010906 1.16597351740654e-19 ENSG00000012211:ENST00000376317:exon_49031151_49032614:PRICKLE3;ENSG00000012211:ENST00000453382:exon_49031970_49032614:PRICKLE3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 49103224 G/A 0 26 0 26 12.1006859997164 0 12.1006859997164 G G 10 0.534589000010906 1.56144677378860e-07 ENSG00000101997:ENST00000376227:exon_49103192_49103386:CCDC22 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 54836361 A/G 1 3 107 110 1.39623299996728 57.2010230011669 -55.8047900011997 A:G A G 10 0.534589000010906 9.709913071736e-32 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 54836505 A/G 1 1 81 82 0.465410999989094 43.3017090008834 -42.8362980008943 A:G A G 10 0.534589000010906 5.51046963345041e-26 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 54837340 C/T 1 1 73 74 0.465410999989094 39.0249970007961 -38.559586000807 T:C C T 10 0.534589000010906 2.26155051335033e-23 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54837254_54837563:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54837254_54837562:MAGED2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 54838077 C/T 1 1 28 29 0.465410999989094 14.9684920003054 -14.5030810003163 T:C C T 10 0.534589000010906 7.9926340063209e-09 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54838007_54838077:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000487482:exon_54837965_54838086:MAGED2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 68381912 G/A 1 1 34 35 0.465410999989094 18.1760260003708 -17.7106150003817 A:G G A 10 0.534589000010906 9.75448831979035e-11 ENSG00000181191:ENST00000374584:exon_68380697_68382224:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000374583:exon_68380697_68383388:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000361478:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000396010:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000374571:exon_68380734_68382983:PJA1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 73043817 T/C 1 6 319 325 2.79246599993456 170.533891003479 -167.741425003544 T:C T C 10 0.534589000010906 4.06393130697517e-96 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 73045740 A/C 0 0 73 73 0 39.0249970007961 -39.0249970007961 C A C 10 0.534589000010906 5.65034524126348e-25 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 73045809 T/C 0 51 0 51 23.7359609994438 0 23.7359609994438 T T 10 0.534589000010906 1.41428071273068e-14 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 76937963 G/C 1 103 2 105 47.9373329988767 1.06917800002181 46.8681549988549 C:G G C 10 0.534589000010906 1.68811278970417e-25 ENSG00000085224:ENST00000373344:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000395603:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000480283:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000395605:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000343347:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000400862:exon_76937807_76938943:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000400861:exon_76937807_76938943:ATRX HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 77528317 G/A 0 0 10 10 0 5.34589000010906 -5.34589000010906 A G A 10 0.534589000010906 0.000476833145364821 ENSG00000173198:ENST00000373304:exon_77526961_77529270:CYSLTR1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 78216024 A/C 1 101 7 108 47.0065109988985 3.74212300007634 43.2643879988222 A:C A C 10 0.534589000010906 7.04859585317841e-20 ENSG00000078589:ENST00000171757:exon_78216005_78217451:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000475374:exon_78216005_78216577:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000461541:exon_78216005_78216368:P2RY10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 100076562 C/A 0 27 0 27 12.5660969997055 0 12.5660969997055 C C 10 0.534589000010906 7.97747293179349e-08 ENSG00000101811:ENST00000372972:exon_100076516_100076594:CSTF2;ENSG00000101811:ENST00000415585:exon_100076516_100076594:CSTF2;ENSG00000101811:ENST00000458320:exon_100076516_100076594:CSTF2;ENSG00000101811:ENST00000486615:exon_100076516_100076594:CSTF2;ENSG00000101811:ENST00000475126:exon_100076516_100076594:CSTF2;ENSG00000101811:ENST00000413437:exon_100076516_100076594:CSTF2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 117527020 C/T 0 0 12 12 0 6.41506800013087 -6.41506800013087 T C T 10 0.534589000010906 0.000103285587331952 ENSG00000131725:ENST00000435384:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000254029:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371822:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371825:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000534809:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000493448:exon_117526595_117527178:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000446173:exon_117526592_117527238:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371848:exon_117526711_117527234:WDR44 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 117819773 A/C 1 2 42 44 0.930821999978188 22.4527380004581 -21.5219160004799 A:C A C 10 0.534589000010906 4.23106708731517e-12 ENSG00000147251:ENST00000276204:exon_117819651_117820126:DOCK11;ENSG00000147251:ENST00000276202:exon_117819651_117820110:DOCK11 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 119590533 T/A 1 25 1 26 11.6352749997273 0.534589000010906 11.1006859997164 A:T T A 10 0.534589000010906 3.06702386815979e-06 ENSG00000005893:ENST00000434600:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000200639:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371335:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371345:exon_119590506_119590624:LAMP2 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 119760629 A/T 1 2 79 81 0.930821999978188 42.2325310008616 -41.3017090008834 A:T:G A T 10 0.534589000010906 5.43413334465165e-24 ENSG00000171155:ENST00000304661:exon_119759648_119761026:C1GALT1C1;ENSG00000171155:ENST00000371313:exon_119759786_119761026:C1GALT1C1 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 129058882 T/C 1 4 74 78 1.86164399995638 39.559586000807 -37.6979420008507 T:C T C 10 0.534589000010906 3.27194462580339e-20 ENSG00000156697:ENST00000425117:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000371051:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000394422:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000427972:exon_129058771_129058886:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000371042:exon_129058771_129059171:UTP14A HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 134185997 T/A 1 2 47 49 0.930821999978188 25.1256830005126 -24.1948610005344 A:T T A 10 0.534589000010906 1.32310372715959e-13 ENSG00000203950:ENST00000518153:exon_134185947_134186120:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000370775:exon_134184962_134186205:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000520964:exon_134185947_134186226:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000522309:exon_134185947_134186171:FAM127B HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 135310785 T/C 0 0 45 45 0 24.0565050004908 -24.0565050004908 C T C 10 0.534589000010906 1.12888307800311e-15 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000495432:exon_135310782_135311154:MAP7D3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 135313034 T/G 0 0 19 19 0 10.1571910002072 -10.1571910002072 G T G 10 0.534589000010906 4.88535613734605e-07 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000477124:exon_135312998_135313314:MAP7D3 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 153595205 T/C 1 77 1 78 35.8366469991602 0.534589000010906 35.3020579991493 T:C T C 10 0.534589000010906 7.41644946021556e-20 ENSG00000196924:ENST00000420627:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000360319:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369854:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369863:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369852:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000422373:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000428077:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369850:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000344736:exon_153595100_153595218:FLNA HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 153596066 G/A 1 108 2 110 50.2643879988222 1.06917800002181 49.1952099988003 A:G G A 10 0.534589000010906 7.1068518501232e-27 ENSG00000196924:ENST00000420627:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000360319:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369854:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369863:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369852:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000422373:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000428077:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369850:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000344736:exon_153596009_153596106:FLNA HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 153626892 T/A 1 17 1 18 7.9119869998146 0.534589000010906 7.37739799980369 A:T T A 10 0.534589000010906 0.000234742217201495 ENSG00000147403:ENST00000479366:exon_153626838_153626960:RPL10 HGDP00854_parsed_pileup.txt . X 154507173 T/G 1 58 1 59 26.9938379993675 0.534589000010906 26.4592489993565 T:G T G 10 0.534589000010906 6.00438350353803e-15 ENSG00000155962:ENST00000369449:exon_154505500_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000422096:exon_154505526_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000360485:exon_154505526_154507353:CLIC2