INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 990380 C/T 0 59 0 59 28.2769562659345 0 28.2769562659345 C C 10 0.52072955481467 2.83466993476034e-17 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_990204_991496:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_990204_991492:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000461111:exon_990204_991492:AGRN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 1249157 G/A 1 94 69 163 45.051421847421 35.9303392822122 9.12108256520879 A:G G A 10 0.52072955481467 0.158771037562866 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1249112_1250550:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1249112_1249485:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1249112_1249205:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000461514:exon_1249112_1249160:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531377:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527383:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531292:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000467408:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1249125_1249301:CPSF3L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 58 58 116 27.7976858207491 30.2023141792509 -2.40462835850172 C:G C G 10 0.52072955481467 0.710308111899508 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 1262966 C/T 1 36 27 63 17.2537360266719 14.0596979799961 3.19403804667579 T:C C T 10 0.52072955481467 0.451059761130848 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 1263144 G/A 1 16 21 37 7.66832712296528 10.9353206511081 -3.26699352814279 A:G G A 10 0.52072955481467 0.32482658498311 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 1342612 G/C 1 169 200 369 80.9967052363208 104.145910962934 -23.1492057266132 T:C:G G C 10 0.52072955481467 0.0165062740874799 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 1421531 C/A 1 23 15 38 11.0232202392626 7.81094332222005 3.21227691704254 A:C C A 10 0.52072955481467 0.332370199874861 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 27 28 55 12.9403020200039 14.5804275348108 -1.64012551480685 T:C T C 10 0.52072955481467 0.687196889659917 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 1430985 C/T 1 41 33 74 19.6500882525985 17.1840753088841 2.46601294371442 T:C C T 10 0.52072955481467 0.641975931718005 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 76 95 171 36.4245538340851 49.4693077073936 -13.0447538733086 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0468244379928034 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 1551927 T/C 1 11 12 23 5.27197489703863 6.24875465777604 -0.97677976073741 T:C T C 10 0.52072955481467 0.835284067578657 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000477990:exon_1551888_1554590:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514363:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000502470:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507082:exon_1551888_1553278:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000463492:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000510793:exon_1551654_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1551690_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1551691_1551994:MIB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 1558792 T/C 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 T:C T C 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1558769_1558862:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000512004:exon_1558502_1558862:MIB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 1635565 C/T 1 13 7 20 6.23051578740929 3.64510688370269 2.5854089037066 T:C C T 10 0.52072955481467 0.271400284316410 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 16 12 28 7.66832712296528 6.24875465777604 1.41957246518924 T:C C T 10 0.52072955481467 0.706167957724672 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 86 107 193 41.2172582859384 55.7180623651697 -14.5008040792313 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0433919741304643 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 3551792 G/A 1 13 13 26 6.23051578740929 6.76948421259071 -0.53896842518142 A:G G A 10 0.52072955481467 0.84709817230133 ENSG00000116213:ENST00000270708:exon_3551724_3551858:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3551724_3551858:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3551724_3551858:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000471223:exon_3548450_3553662:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000497940:exon_3551724_3551858:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000469643:exon_3551724_3552014:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000494884:exon_3551724_3551997:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000465916:exon_3551724_3551858:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000419924:exon_3551724_3551858:WDR8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 3638674 C/T 1 12 5 17 5.75124534222396 2.60364777407335 3.14759756815061 T:C C T 10 0.52072955481467 0.149297422970946 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3638585_3638771:TP73 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 3659742 C/T 1 15 9 24 7.18905667777995 4.68656599333203 2.50249068444792 T:C C T 10 0.52072955481467 0.414445820205225 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 3800242 A/G 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 A:G A G 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000169598:ENST00000378209:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000491998:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000430539:exon_3800071_3801984:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000468793:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000477548:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000339350:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000378206:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000475969:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000448632:exon_3800071_3800305:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000461150:exon_3800071_3800364:DFFB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 60 64 124 28.7562267111198 33.3266915081389 -4.57046479701908 A:G A G 10 0.52072955481467 0.419949622725043 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 6649277 T/C 1 14 15 29 6.70978623259462 7.81094332222005 -1.10115708962543 T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.713495169021185 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 6659445 C/T 1 14 16 30 6.70978623259462 8.33167287703472 -1.6218866444401 T:C C T 10 0.52072955481467 0.587501156256487 ENSG00000162413:ENST00000377658:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000377663:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000467612:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000496707:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000463043:exon_6659107_6659512:KLHL21 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 6705874 G/C 1 12 17 29 5.75124534222396 8.85240243184939 -3.10115708962543 C:G G C 10 0.52072955481467 0.269403872469277 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 7909737 C/T 0 0 8 8 0 4.16583643851736 -4.16583643851736 T C T 10 0.52072955481467 0.00278384587959875 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000400910:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000361696:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7909700_7909743:UTS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 8044992 G/A 1 204 156 360 97.7711708178073 81.2338105510885 16.5373602667188 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0819470329329298 ENSG00000116288:ENST00000493373:exon_8044954_8045112:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000338639:exon_8044954_8045339:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000493678:exon_8044954_8045565:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000377493:exon_8044954_8045341:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000377491:exon_8044954_8045310:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000377488:exon_8044954_8045171:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000469225:exon_8044924_8045342:PARK7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 9307033 G/A 1 9 5 14 4.31343400666797 2.60364777407335 1.70978623259462 A:G G A 10 0.52072955481467 0.429598343746981 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9307025_9307142:H6PD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 9307138 T/C 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9307025_9307142:H6PD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 9323910 G/A 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 9781643 C/T 1 65 36 101 31.1525789370464 18.7462639733281 12.4063149637183 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0164231204929651 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9781502_9781645:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9781502_9781645:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9781502_9781645:PIK3CD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 9784423 C/T 1 45 34 79 21.5671700333398 17.7048048636988 3.86236516964107 T:C C T 10 0.52072955481467 0.431022854915593 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9784334_9784479:PIK3CD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 9804693 C/T 1 41 41 82 19.6500882525985 21.3499117474015 -1.69982349480294 T:C C T 10 0.52072955481467 0.740911342803576 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9804453_9804701:CLSTN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 9811541 A/G 1 26 15 41 12.4610315748186 7.81094332222005 4.65008825259853 A:G A G 10 0.52072955481467 0.161283807581287 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9811531_9811639:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9811531_9811739:CLSTN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 11303328 G/A 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11303171_11303357:MTOR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 12 13 25 5.75124534222396 6.76948421259071 -1.01823887036675 A:G G A 10 0.52072955481467 0.694646743266974 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 12198297 T/C 1 62 70 132 29.7147676014905 36.4510688370269 -6.73630123553643 A:T:C T C 10 0.52072955481467 0.25780597338207 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 12569090 T/C 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 T:C T C 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000048707:ENST00000358136:exon_12568947_12572099:VPS13D;ENSG00000048707:ENST00000356315:exon_12568947_12572099:VPS13D;ENSG00000048707:ENST00000011700:exon_12568947_12570415:VPS13D;ENSG00000048707:ENST00000496628:exon_12568947_12572099:VPS13D;ENSG00000048707:ENST00000471923:exon_12568947_12572099:VPS13D HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 14143003 A/G 1 3 8 11 1.43781133555599 4.16583643851736 -2.72802510296137 A:G A G 10 0.52072955481467 0.132783549738221 ENSG00000116731:ENST00000376048:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000503842:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000505823:exon_14142922_14143065:PRDM2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 16056364 G/A 1 35 42 77 16.7744655814866 21.8706413022161 -5.09617572072959 A:G G A 10 0.52072955481467 0.255785599894618 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16056340_16056424:PLEKHM2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 16255644 C/T 1 14 9 23 6.70978623259462 4.68656599333203 2.02322023926259 T:C C T 10 0.52072955481467 0.414185612013738 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN;ENSG00000065526:ENST00000375753:exon_16254586_16255713:SPEN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 16260916 C/T 1 18 21 39 8.62686801333594 10.9353206511081 -2.30845263777213 T:C C T 10 0.52072955481467 0.522666332291258 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 16262404 C/T 1 18 9 27 8.62686801333594 4.68656599333203 3.94030202000391 T:C C T 10 0.52072955481467 0.176641317007219 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 16271260 G/A 1 25 16 41 11.9817611296333 8.33167287703472 3.65008825259853 A:G G A 10 0.52072955481467 0.27678671333685 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16271192_16271334:ZBTB17 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 16641899 C/T 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 T:C C T 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16641664_16641930:FBXO42 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 47 39 86 22.5257109237105 20.3084526377721 2.21725828593839 A:G G A 10 0.52072955481467 0.666870818928258 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 17740062 T/C 1 46 55 101 22.0464404785252 28.6401255148068 -6.59368503628167 T:C T C 10 0.52072955481467 0.196585617243619 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17740033_17740213:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17740033_17740213:RCC2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 20977000 A/C 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 A:C A C 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 20977221 A/T 1 12 8 20 5.75124534222396 4.16583643851736 1.5854089037066 A:T A T 10 0.52072955481467 0.510829655044723 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 20978832 T/C 1 254 215 469 121.734693077074 111.956854285154 9.77783879191978 T:C T C 10 0.52072955481467 0.380026795258193 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20978270_20979021:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20978685_20979021:DDOST HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 22149935 T/C 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000187942:ENST00000344642:exon_22148695_22151714:LDLRAD2;ENSG00000142798:ENST00000486901:exon_22148738_22149981:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000374695:exon_22148738_22149981:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000457597:exon_22148738_22149981:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000481644:exon_22149794_22149981:HSPG2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 22852904 G/A 1 8 10 18 3.83416356148264 5.2072955481467 -1.37313198666406 A:G G A 10 0.52072955481467 0.638802194234348 ENSG00000184677:ENST00000374651:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000404138:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000375647:exon_22852695_22857647:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000374649:exon_22852695_22857647:ZBTB40 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 23419261 G/A 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 23419374 G/T 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 T:G G T 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 23419383 C/T 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 T:C C T 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 24077399 C/T 1 25 25 50 11.9817611296333 13.0182388703667 -1.0364777407335 T:C C T 10 0.52072955481467 0.779128855228348 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000487554:exon_24077335_24077434:TCEB3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 37 31 68 17.7330064718572 16.1426161992548 1.59039027260244 T:C C T 10 0.52072955481467 0.717524703833257 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 24134721 T/C 1 16 13 29 7.66832712296528 6.76948421259071 0.898842910374571 T:C T C 10 0.52072955481467 0.853126532704154 ENSG00000117305:ENST00000374490:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000436439:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000374487:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000235958:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000496907:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000374483:exon_24134625_24134813:HMGCL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 24180962 T/C 1 41 30 71 19.6500882525985 15.6218866444401 4.02820160815843 T:C T C 10 0.52072955481467 0.345256221576593 ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24180850_24181050:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24180850_24181050:FUCA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 24194748 G/C 1 20 5 25 9.5854089037066 2.60364777407335 6.98176112963325 C:G G C 10 0.52072955481467 0.00485314377670073 ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24194388_24194784:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24194501_24194776:FUCA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 24201162 G/A 1 19 26 45 9.10613845852127 13.5389684251814 -4.43282996666015 A:G G A 10 0.52072955481467 0.232347018162802 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 25889632 T/C 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000157978:ENST00000374338:exon_25889561_25889644:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000488127:exon_25889561_25889644:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000484476:exon_25889307_25889644:LDLRAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 25890189 A/G 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000157978:ENST00000374338:exon_25890152_25890282:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000488127:exon_25890152_25891698:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000484476:exon_25890152_25890282:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000474283:exon_25890125_25890282:LDLRAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 26644537 C/A 1 607 680 1287 290.917160227495 354.096097273976 -63.1789370464803 A:T:C C A 10 0.52072955481467 0.000436421653857559 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26644448_26644562:CD52;ENSG00000169442:ENST00000492808:exon_26644449_26644562:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26644449_26644562:CD52 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 26883511 A/C 1 56 51 107 26.8391449303785 26.5572072955482 0.281937634830314 A:C A C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000488985:exon_26883489_26883527:RPS6KA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 26900735 C/G 1 86 103 189 41.2172582859384 53.635144145911 -12.4178858599726 A:C:G C G 10 0.52072955481467 0.0803405889777615 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 28206588 T/C 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 T:C T C 10 0.52072955481467 1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 62 35 97 29.7147676014905 18.2255344185134 11.489233182977 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0195676007305854 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 52 27 79 24.9220631496372 14.0596979799961 10.8623651696411 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0175203672204832 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 53 24 77 25.4013335948225 12.4975093155521 12.9038242792704 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00405167286049721 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 29313973 G/A 1 15 11 26 7.18905667777995 5.72802510296137 1.46103157481858 A:T:G G A 10 0.52072955481467 0.695544738359801 ENSG00000159023:ENST00000343067:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398863:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398861:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000356093:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398865:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000358989:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000482464:exon_29313960_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373800:exon_29313960_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000349460:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000347529:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373798:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373797:exon_29313943_29314417:EPB41 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 105 86 191 50.3233967444597 44.7827417140616 5.54065503039804 T:G T G 10 0.52072955481467 0.426842873755443 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 29529699 T/C 1 17 11 28 8.14759756815061 5.72802510296137 2.41957246518924 T:C T C 10 0.52072955481467 0.450243949257095 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475773:exon_29529643_29529713:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463412:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000453185:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29529654_29529745:MECR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 29542637 A/G 1 16 9 25 7.66832712296528 4.68656599333203 2.98176112963325 A:G A G 10 0.52072955481467 0.317005341446711 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29542513_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29542549_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29542605_29542648:MECR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 80 91 171 38.3416356148264 47.386389488135 -9.04475387330857 A:G A G 10 0.52072955481467 0.169114594563768 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 33099637 A/G 1 31 23 54 14.8573838007452 11.9767797607374 2.88060404000782 A:G A G 10 0.52072955481467 0.496539785206376 ENSG00000176261:ENST00000468695:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373506:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473294:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000478041:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000436661:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000498691:exon_33099552_33099662:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373501:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000476493:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000465588:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000483138:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000479075:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473383:exon_33099552_33100123:ZBTB8OS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 33402515 C/T 1 20 19 39 9.5854089037066 9.89386154147873 -0.308452637772129 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000116514:ENST00000373456:exon_33402046_33402860:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000401899:exon_33402050_33402860:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000356990:exon_33402055_33402910:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000405457:exon_33402057_33402910:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000235150:exon_33402269_33402860:RNF19B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 33402542 G/C 1 24 23 47 11.5024906844479 11.9767797607374 -0.474289076289489 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000116514:ENST00000373456:exon_33402046_33402860:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000401899:exon_33402050_33402860:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000356990:exon_33402055_33402910:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000405457:exon_33402057_33402910:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000235150:exon_33402269_33402860:RNF19B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 14 17 31 6.70978623259462 8.85240243184939 -2.14261619925477 A:G A G 10 0.52072955481467 0.475988624180078 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 36225948 T/C 1 6 12 18 2.87562267111198 6.24875465777604 -3.37313198666406 T:C T C 10 0.52072955481467 0.155728897636768 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 36316571 A/C 0 0 8 8 0 4.16583643851736 -4.16583643851736 C A C 10 0.52072955481467 0.00278384587959875 ENSG00000134698:ENST00000373210:exon_36316455_36316654:EIF2C4;ENSG00000134698:ENST00000397882:exon_36316455_36316654:EIF2C4;ENSG00000134698:ENST00000488778:exon_36316455_36316796:EIF2C4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 36359669 A/G 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000092847:ENST00000373206:exon_36359638_36359772:EIF2C1;ENSG00000092847:ENST00000373204:exon_36359638_36359772:EIF2C1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 36557619 G/A 1 29 27 56 13.8988429103746 14.0596979799961 -0.160855069621519 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36557511_36557695:ADPRHL2;ENSG00000116863:ENST00000468594:exon_36557511_36557695:ADPRHL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 36558967 C/T 1 45 31 76 21.5671700333398 16.1426161992548 5.42455383408508 T:C C T 10 0.52072955481467 0.250874547250009 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36558698_36559533:ADPRHL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 36638206 G/A 1 55 44 99 26.3598744851932 22.9121004118455 3.44777407334767 A:G G A 10 0.52072955481467 0.546406031622812 ENSG00000116871:ENST00000429533:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000462118:exon_36637569_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36638070_36638228:MAP7D1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 38148765 A/G 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 A:G A G 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000116922:ENST00000358011:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000494120:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000464178:exon_38148408_38148832:C1orf109 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 38327982 G/T 1 15 16 31 7.18905667777995 8.33167287703472 -1.14261619925477 T:G G T 10 0.52072955481467 0.721790765566653 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 38338795 A/G 1 23 15 38 11.0232202392626 7.81094332222005 3.21227691704254 A:G A G 10 0.52072955481467 0.332370199874861 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 38449910 T/C 1 26 25 51 12.4610315748186 13.0182388703667 -0.557207295548169 T:C T C 10 0.52072955481467 0.88948472920142 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000489537:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000461869:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000470585:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000462258:exon_38449790_38449932:SF3A3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 11 15 26 5.27197489703863 7.81094332222005 -2.53896842518142 T:C C T 10 0.52072955481467 0.333843435098941 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 39835817 A/G 1 9 5 14 4.31343400666797 2.60364777407335 1.70978623259462 A:G A G 10 0.52072955481467 0.429598343746981 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000476350:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39835702_39835858:MACF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 39908506 G/A 1 14 31 45 6.70978623259462 16.1426161992548 -9.43282996666015 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00658381695038018 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39908386_39908583:MACF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 18 29 47 8.62686801333594 15.1011570896254 -6.47428907628949 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0786834278672316 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 39951415 G/A 1 31 53 84 14.8573838007452 27.5986664051775 -12.7412826044323 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00609811852307918 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39951210_39952652:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39951210_39952659:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39951210_39952659:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39951210_39952789:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39951210_39952659:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39951210_39952659:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000360115:exon_39951210_39952659:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000446276:exon_39951210_39952659:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000442046:exon_39951210_39952659:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000496360:exon_39950273_39951889:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000497807:exon_39950273_39952659:MACF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 40315888 A/T 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 A:T A T 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000469476:exon_40315795_40315933:TRIT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 40705726 A/T 1 5 13 18 2.39635222592665 6.76948421259071 -4.37313198666406 A:T A T 10 0.52072955481467 0.0565168815780058 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 40981251 G/A 1 11 8 19 5.27197489703863 4.16583643851736 1.10613845852127 A:G G A 10 0.52072955481467 0.653020003043937 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 13 14 27 6.23051578740929 7.29021376740538 -1.05969797999609 T:C C T 10 0.52072955481467 0.70448341958002 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 41493811 C/T 1 22 10 32 10.5439497940773 5.2072955481467 5.33665424593056 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0756787799142798 ENSG00000010803:ENST00000372597:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372596:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000337495:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372595:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000326197:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361191:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361705:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397174:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397171:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000456518:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000402904:exon_41492877_41493991:SCMH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 41976497 G/A 1 30 24 54 14.3781133555599 12.4975093155521 1.88060404000782 A:G G A 10 0.52072955481467 0.683441288722091 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 41979156 A/G 1 8 11 19 3.83416356148264 5.72802510296137 -1.89386154147873 A:G A G 10 0.52072955481467 0.492400577054298 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 42654473 T/C 1 10 5 15 4.7927044518533 2.60364777407335 2.18905667777995 T:C T C 10 0.52072955481467 0.308037122491406 ENSG00000198815:ENST00000372573:exon_42654408_42654599:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000372572:exon_42654408_42654599:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000372571:exon_42654408_42655480:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000361346:exon_42654408_42654599:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000361776:exon_42654408_42654599:FOXJ3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 43212869 A/T 1 7 2 9 3.35489311629731 1.04145910962934 2.31343400666797 A:T A T 10 0.52072955481467 0.183068589600402 ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43212046_43213083:LEPRE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 43395635 C/T 1 47 43 90 22.5257109237105 22.3913708570308 0.134340066679705 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43395544_43395646:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43395544_43395706:SLC2A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 43396414 G/A 1 27 26 53 12.9403020200039 13.5389684251814 -0.598666405177509 A:G G A 10 0.52072955481467 0.891408372688376 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000475162:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43396297_43396611:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43395990_43396537:SLC2A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 43408966 G/A 1 40 22 62 19.1708178074132 11.4560502059227 7.71476760149046 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0563164753309268 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000415851:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43408897_43408992:SLC2A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 43825644 T/C 1 29 23 52 13.8988429103746 11.9767797607374 1.92206314963716 T:C T C 10 0.52072955481467 0.677654136132061 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000478882:exon_43825438_43825768:CDC20 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 43906896 A/G 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000198198:ENST00000372442:exon_43906885_43907051:KIAA0467 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 43917637 G/A 1 11 6 17 5.27197489703863 3.12437732888802 2.14759756815061 A:G G A 10 0.52072955481467 0.339416350374528 ENSG00000198198:ENST00000372442:exon_43916008_43918304:KIAA0467;ENSG00000198198:ENST00000460536:exon_43916008_43918321:KIAA0467;ENSG00000178922:ENST00000372433:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372434:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000470662:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000487366:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372430:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372432:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372427:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372425:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000403034:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372426:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000486909:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000496142:exon_43917606_43917890:HYI HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 44137257 C/A 1 6 8 14 2.87562267111198 4.16583643851736 -1.29021376740538 A:C C A 10 0.52072955481467 0.596274656681649 ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44137176_44137546:KDM4A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 44463204 C/T 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000196517:ENST00000372310:exon_44462155_44463411:SLC6A9;ENSG00000196517:ENST00000475075:exon_44463115_44463411:SLC6A9;ENSG00000196517:ENST00000360584:exon_44463200_44463411:SLC6A9;ENSG00000196517:ENST00000357730:exon_44463200_44463411:SLC6A9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 11 5 16 5.27197489703863 2.60364777407335 2.66832712296528 A:G A G 10 0.52072955481467 0.216398220878093 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 47799639 G/C 1 58 42 100 27.7976858207491 21.8706413022161 5.927044518533 C:G G C 10 0.52072955481467 0.270906709171554 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47799481_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000471289:exon_47799551_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47799586_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371870:exon_47799613_47799788:CMPK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 51826853 T/C 1 69 61 130 33.0696607177878 31.7645028436949 1.3051578740929 T:C T C 10 0.52072955481467 0.860821773766068 ENSG00000085832:ENST00000371730:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51826843_51827027:EPS15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 52266242 G/A 1 30 30 60 14.3781133555599 15.6218866444401 -1.2437732888802 A:G G A 10 0.52072955481467 0.796710516997506 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52266228_52266355:NRD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 52266350 C/T 1 29 33 62 13.8988429103746 17.1840753088841 -3.28523239850954 T:C C T 10 0.52072955481467 0.446505185873475 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52266228_52266355:NRD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 52290984 T/G 1 23 25 48 11.0232202392626 13.0182388703667 -1.99501863110416 T:G T G 10 0.52072955481467 0.567626612652638 ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000473805:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000475715:exon_52290969_52291054:NRD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 52301849 G/A 1 36 22 58 17.2537360266719 11.4560502059227 5.79768582074914 A:G G A 10 0.52072955481467 0.148263367897089 ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52301803_52301884:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52301803_52301884:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52301803_52301884:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52301803_52301884:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000475715:exon_52301803_52301884:NRD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 52498370 C/T 1 15 21 36 7.18905667777995 10.9353206511081 -3.74626397332812 T:C C T 10 0.52072955481467 0.244102359180986 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 52498861 A/T 1 29 26 55 13.8988429103746 13.5389684251814 0.359874485193151 A:T A T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 52851608 G/A 1 11 4 15 5.27197489703863 2.08291821925868 3.18905667777995 A:G G A 10 0.52072955481467 0.123192206125781 ENSG00000085840:ENST00000371568:exon_52851524_52851621:ORC1;ENSG00000085840:ENST00000371566:exon_52851524_52851621:ORC1;ENSG00000085840:ENST00000476332:exon_52851524_52851621:ORC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 52882406 A/G 1 27 37 64 12.9403020200039 19.2669935281428 -6.32669150813888 A:G A G 10 0.52072955481467 0.132988776605181 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52882320_52883992:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52882320_52882694:PRPF38A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 52991638 C/T 1 7 12 19 3.35489311629731 6.24875465777604 -2.89386154147873 T:C C T 10 0.52072955481467 0.250829533252171 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 54511432 T/A 1 22 21 43 10.5439497940773 10.9353206511081 -0.391370857030809 A:T T A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000116209:ENST00000371348:exon_54511365_54511459:TMEM59;ENSG00000116209:ENST00000234831:exon_54511365_54511459:TMEM59;ENSG00000116209:ENST00000371341:exon_54511365_54511459:TMEM59;ENSG00000116209:ENST00000371338:exon_54511365_54511459:TMEM59;ENSG00000116209:ENST00000420738:exon_54511365_54511459:TMEM59;ENSG00000116209:ENST00000440019:exon_54511365_54511459:TMEM59;ENSG00000116209:ENST00000452421:exon_54511365_54511459:TMEM59;ENSG00000116209:ENST00000371337:exon_54511159_54511459:TMEM59 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 50 54 104 23.9635222592665 28.1193959599922 -4.15587370072568 C:G G C 10 0.52072955481467 0.433462523905345 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 112 88 200 53.678289860757 45.824200823691 7.854089037066 C:G C G 10 0.52072955481467 0.288525623639048 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 54683925 G/A 1 44 40 84 21.0878995881545 20.8291821925868 0.258717395567722 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 64097432 C/T 1 26 16 42 12.4610315748186 8.33167287703472 4.12935869778386 T:C C T 10 0.52072955481467 0.219366019333381 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64097328_64097453:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64097328_64097453:PGM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 65311214 G/C 1 36 16 52 17.2537360266719 8.33167287703472 8.92206314963716 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0174479479587632 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 65321250 G/A 1 34 37 71 16.2951951363012 19.2669935281428 -2.97179839184157 A:G G A 10 0.52072955481467 0.552887122541888 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65321192_65321381:JAK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 65335095 T/C 1 16 11 27 7.66832712296528 5.72802510296137 1.94030202000391 T:C T C 10 0.52072955481467 0.5644014761963 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65334994_65335157:JAK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 67861520 C/A 1 7 1 8 3.35489311629731 0.52072955481467 2.83416356148264 A:C C A 10 0.52072955481467 0.0721941130810857 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67861230_67862583:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67861230_67862583:IL12RB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 70904800 G/T 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 T:G G T 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70904784_70905253:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70904784_70905252:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70904784_70904887:CTH;ENSG00000116761:ENST00000482383:exon_70904784_70904915:CTH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 74665493 G/A 1 1 8 9 0.47927044518533 4.16583643851736 -3.68656599333203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0171960976249239 ENSG00000254685:ENST00000467578:exon_74665348_74665529:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000524915:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000482102:exon_74665348_74665529:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370898:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000529485:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370894:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000534056:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000472069:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000116783:ENST00000370899:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000370895:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000534632:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000533006:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000370891:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000370893:exon_74665348_74665515:TNNI3K HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 76227022 A/G 1 78 71 149 37.3830947244557 36.9717983918416 0.411296332614178 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76226807_76227300:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000481374:exon_76226807_76227055:ACADM HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 76255658 A/G 1 6 11 17 2.87562267111198 5.72802510296137 -2.85240243184939 A:G A G 10 0.52072955481467 0.224918141362531 ENSG00000137955:ENST00000496055:exon_76253182_76256202:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000319942:exon_76255637_76255742:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000370824:exon_76255637_76255742:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000473406:exon_76255637_76255742:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000485459:exon_76255637_76255959:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000370826:exon_76255637_76255798:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000462042:exon_76255637_76255681:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000470201:exon_76255637_76255742:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000471759:exon_76255637_76255742:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000491266:exon_76255637_76255742:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000461653:exon_76254844_76256202:RABGGTB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 76257892 A/T 1 30 31 61 14.3781133555599 16.1426161992548 -1.76450284369487 A:T A T 10 0.52072955481467 0.701419533851801 ENSG00000137955:ENST00000496055:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000319942:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000370824:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000485459:exon_76257866_76257939:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000470201:exon_76257866_76257971:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000471759:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000491266:exon_76257866_76257987:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000461653:exon_76257866_76257935:RABGGTB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 85113229 A/G 1 7 6 13 3.35489311629731 3.12437732888802 0.23051578740929 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85109390_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85109599_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85113022_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85113024_85113290:SSX2IP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 87190040 T/C 1 33 33 66 15.8159246911159 17.1840753088841 -1.36815061776822 T:C T C 10 0.52072955481467 0.805677328043137 ENSG00000097033:ENST00000212369:exon_87189996_87190088:SH3GLB1;ENSG00000097033:ENST00000482504:exon_87189996_87190088:SH3GLB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 89426902 G/A 1 16 10 26 7.66832712296528 5.2072955481467 2.46103157481858 A:G G A 10 0.52072955481467 0.433118121558513 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 89478868 G/A 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89478868_89479007:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89478868_89479110:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89478868_89479110:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89478868_89479110:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000235878:exon_89478868_89479110:GBP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 89522646 G/C 1 15 4 19 7.18905667777995 2.08291821925868 5.10613845852127 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0211299863203083 ENSG00000117228:ENST00000422952:exon_89522537_89522728:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89522537_89522817:GBP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 89525966 T/C 1 7 15 22 3.35489311629731 7.81094332222005 -4.45605020592274 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0855250585282075 ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89525880_89526007:GBP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 18 23 41 8.62686801333594 11.9767797607374 -3.34991174740147 A:G G A 10 0.52072955481467 0.348892228743102 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 93646207 T/C 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 T:C T C 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93645611_93646285:TMED5;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 93826178 A/T 1 23 15 38 11.0232202392626 7.81094332222005 3.21227691704254 A:T A T 10 0.52072955481467 0.332370199874861 ENSG00000117505:ENST00000370272:exon_93826050_93828149:DR1;ENSG00000117505:ENST00000370267:exon_93826050_93826725:DR1;ENSG00000117505:ENST00000481583:exon_93826050_93826492:DR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 94037267 T/C 1 15 8 23 7.18905667777995 4.16583643851736 3.02322023926259 T:C T C 10 0.52072955481467 0.219045420855692 ENSG00000137936:ENST00000370247:exon_94037227_94037398:BCAR3;ENSG00000137936:ENST00000260502:exon_94037227_94037398:BCAR3;ENSG00000137936:ENST00000370244:exon_94037227_94037398:BCAR3;ENSG00000137936:ENST00000370243:exon_94037227_94037398:BCAR3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 95368998 T/C 1 13 10 23 6.23051578740929 5.2072955481467 1.02322023926259 T:C T C 10 0.52072955481467 0.683682381961274 ENSG00000117519:ENST00000370206:exon_95368959_95369080:CNN3;ENSG00000117519:ENST00000394202:exon_95368959_95369080:CNN3;ENSG00000117519:ENST00000415017:exon_95368959_95369080:CNN3;ENSG00000117519:ENST00000474409:exon_95368959_95369080:CNN3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 110466466 T/C 1 20 26 46 9.5854089037066 13.5389684251814 -3.95355952147482 A:T:C T C 10 0.52072955481467 0.301593551546022 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 110466555 G/A 1 16 19 35 7.66832712296528 9.89386154147873 -2.22553441851345 A:G G A 10 0.52072955481467 0.500775716406867 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 10 11 21 4.7927044518533 5.72802510296137 -0.93532065110807 A:C C A 10 0.52072955481467 0.827826563650395 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 110581321 G/A 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 A:G G A 10 0.52072955481467 0.806303597637586 ENSG00000143093:ENST00000369796:exon_110581305_110581379:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000369795:exon_110581305_110581379:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000369794:exon_110581305_110581379:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000485775:exon_110581305_110581379:FAM40A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 110766466 G/A 1 4 9 13 1.91708178074132 4.68656599333203 -2.76948421259071 A:G G A 10 0.52072955481467 0.166029130373969 ENSG00000116396:ENST00000489935:exon_110765586_110766705:KCNC4;ENSG00000116396:ENST00000469655:exon_110765586_110766522:KCNC4;ENSG00000116396:ENST00000438661:exon_110765586_110766522:KCNC4;ENSG00000116396:ENST00000369787:exon_110765586_110766522:KCNC4;ENSG00000116396:ENST00000413138:exon_110765586_110766522:KCNC4;ENSG00000116396:ENST00000459877:exon_110762338_110768800:KCNC4;ENSG00000116396:ENST00000463629:exon_110766460_110766522:KCNC4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 528 415 943 253.054795057854 216.102765248088 36.9520298097662 T:C:G C T 10 0.52072955481467 0.0173016906881829 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 111726869 G/A 1 14 2 16 6.70978623259462 1.04145910962934 5.66832712296528 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0046710172713039 ENSG00000134255:ENST00000498239:exon_111726813_111727430:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000357172:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000478042:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000473474:exon_111726813_111726953:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000467362:exon_111726813_111727722:CEPT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 113197203 A/G 1 63 56 119 30.1940380466758 29.1608550696215 1.03318297705427 A:G A G 10 0.52072955481467 0.855076727863885 ENSG00000116489:ENST00000263168:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000393426:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000498626:exon_113197087_113197293:CAPZA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 113236681 C/T 1 20 27 47 9.5854089037066 14.0596979799961 -4.47428907628949 T:C C T 10 0.52072955481467 0.242549844617963 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113236527_113236794:MOV10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 113237171 A/G 1 27 20 47 12.9403020200039 10.4145910962934 2.52571092371051 A:G A G 10 0.52072955481467 0.47034240445371 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 113239382 G/A 1 23 20 43 11.0232202392626 10.4145910962934 0.608629142969191 A:G G A 10 0.52072955481467 0.879856912389644 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113239361_113239468:MOV10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 27 24 51 12.9403020200039 12.4975093155521 0.442792704451831 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 35 39 74 16.7744655814866 20.3084526377721 -3.53398705628558 T:C C T 10 0.52072955481467 0.41811582257548 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 114301335 C/T 1 10 12 22 4.7927044518533 6.24875465777604 -1.45605020592274 T:C C T 10 0.52072955481467 0.670595760110997 ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114301281_114301470:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000446739:exon_114301281_114301780:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000493212:exon_114301281_114302111:PHTF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 114448197 A/G 1 8 8 16 3.83416356148264 4.16583643851736 -0.33167287703472 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114447763_114448397:DCLRE1B;ENSG00000118655:ENST00000466480:exon_114448031_114448397:DCLRE1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 114448389 C/T 1 16 8 24 7.66832712296528 4.16583643851736 3.50249068444792 T:C C T 10 0.52072955481467 0.219527027886609 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114447763_114448397:DCLRE1B;ENSG00000118655:ENST00000466480:exon_114448031_114448397:DCLRE1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 114973429 T/C 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 T:C T C 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114973420_114973534:TRIM33 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 115280605 A/C 1 142 143 285 68.0564032163169 74.4643263384978 -6.40792312218095 A:C:G A C 10 0.52072955481467 0.476898248424043 ENSG00000009307:ENST00000339438:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000438362:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000358528:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369533:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000261443:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000530886:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369530:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000534699:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000529046:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000525132:exon_115280584_115280693:CSDE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 118165973 C/T 1 2 6 8 0.95854089037066 3.12437732888802 -2.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 0.164210754421108 ENSG00000183508:ENST00000369448:exon_118165464_118170994:FAM46C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 118166096 C/T 1 2 9 11 0.95854089037066 4.68656599333203 -3.72802510296137 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0323592930418307 ENSG00000183508:ENST00000369448:exon_118165464_118170994:FAM46C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 119575687 C/T 1 17 14 31 8.14759756815061 7.29021376740538 0.857383800745231 T:C C T 10 0.52072955481467 0.857960893951531 ENSG00000116874:ENST00000369426:exon_119573839_119576011:WARS2;ENSG00000116874:ENST00000235521:exon_119573844_119575982:WARS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 119575818 C/G 1 8 14 22 3.83416356148264 7.29021376740538 -3.45605020592274 C:G C G 10 0.52072955481467 0.199452613384147 ENSG00000116874:ENST00000369426:exon_119573839_119576011:WARS2;ENSG00000116874:ENST00000235521:exon_119573844_119575982:WARS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 120458004 A/T 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 A:T A T 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000134250:ENST00000256646:exon_120454176_120459317:NOTCH2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 144930940 T/C 1 7 2 9 3.35489311629731 1.04145910962934 2.31343400666797 T:C T C 10 0.52072955481467 0.183068589600402 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 144931087 T/C 1 7 1 8 3.35489311629731 0.52072955481467 2.83416356148264 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0721941130810857 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 144931330 C/T 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 1 29 28 57 13.8988429103746 14.5804275348108 -0.681584624436189 A:G G A 10 0.52072955481467 0.89501069508708 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 52 52 0 27.0779368503628 -27.0779368503628 C T C 10 0.52072955481467 2.45580411143576e-17 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 1 1 48 49 0.47927044518533 24.9950186311042 -24.5157481859188 T:G G T 10 0.52072955481467 1.20993283061521e-14 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 43 43 0 22.3913708570308 -22.3913708570308 A C A 10 0.52072955481467 1.84063588849094e-14 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 83 0 83 39.7794469503824 0 39.7794469503824 G G 10 0.52072955481467 3.29232532460661e-24 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 61 61 0 31.7645028436949 -31.7645028436949 C T C 10 0.52072955481467 3.27657081525742e-20 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 67 67 0 34.8888801725829 -34.8888801725829 T C T 10 0.52072955481467 3.971032574829e-22 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 149915754 G/A 1 15 6 21 7.18905667777995 3.12437732888802 4.06467934889193 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0836954361100518 ENSG00000163113:ENST00000369135:exon_149912231_149916964:OTUD7B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 149939279 G/A 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000163113:ENST00000369135:exon_149939219_149939446:OTUD7B;ENSG00000163113:ENST00000417191:exon_149939219_149939446:OTUD7B;ENSG00000163113:ENST00000479905:exon_149939219_149939312:OTUD7B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 51 62 113 24.4427927044518 32.2852323985095 -7.8424396940577 T:G G T 10 0.52072955481467 0.15772404855976 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 150239478 T/G 1 118 148 266 56.5539125318689 77.0679741125712 -20.5140615807022 T:G T G 10 0.52072955481467 0.0139490767260824 ENSG00000117362:ENST00000414276:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000452164:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000433443:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000369109:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000360244:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000461320:exon_150239475_150239654:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000236017:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000486308:exon_150239356_150239878:APH1A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 150418796 C/T 1 14 9 23 6.70978623259462 4.68656599333203 2.02322023926259 T:C C T 10 0.52072955481467 0.414185612013738 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150418702_150418877:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150418702_150418877:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150418702_150418877:RPRD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 150460348 C/T 1 15 18 33 7.18905667777995 9.37313198666406 -2.18407530888411 T:C C T 10 0.52072955481467 0.488782681892328 ENSG00000143374:ENST00000369054:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369064:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000438568:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369052:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369053:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369051:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000479372:exon_150460334_150461108:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000467982:exon_150460346_150460530:TARS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 150808889 C/G 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000143437:ENST00000358595:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000322733:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000342710:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000394700:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000368975:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000471844:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000354396:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000515192:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000505755:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000468970:exon_150808756_150808975:ARNT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 150999737 A/G 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 A:G A G 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000143363:ENST00000467771:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000462440:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000475722:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000450884:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_150999709_150999803:PRUNE HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 151021185 C/G 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 C:G C G 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000143443:ENST00000368926:exon_151020216_151021328:C1orf56;ENSG00000143443:ENST00000433087:exon_151021010_151021328:C1orf56;ENSG00000143443:ENST00000465135:exon_151021045_151021328:C1orf56;ENSG00000143443:ENST00000473308:exon_151021139_151021328:C1orf56 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 151131536 C/G 1 10 6 16 4.7927044518533 3.12437732888802 1.66832712296528 C:G C G 10 0.52072955481467 0.460768625180263 ENSG00000163154:ENST00000368910:exon_151131142_151132225:TNFAIP8L2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 151141485 G/C 1 52 44 96 24.9220631496372 22.9121004118455 2.00996273779168 C:G G C 10 0.52072955481467 0.759447908936846 ENSG00000163156:ENST00000368905:exon_151141462_151142773:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000368902:exon_151141462_151141614:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000497147:exon_151141462_151141587:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000459799:exon_151141462_151141609:SCNM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 151215011 A/G 1 27 45 72 12.9403020200039 23.4328299666602 -10.4925279466562 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0176998346248178 ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000489625:exon_151214914_151215043:PIP5K1A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 151262645 C/T 1 19 32 51 9.10613845852127 16.6633457540694 -7.55720729554817 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0359880904156116 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151262598_151262710:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151262598_151262710:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151262598_151262710:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151262598_151262710:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000426871:exon_151262598_151262710:ZNF687 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 33 24 57 15.8159246911159 12.4975093155521 3.31841537556381 A:G G A 10 0.52072955481467 0.427273355159016 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 151318733 C/T 1 68 59 127 32.5903902726024 30.7230437340655 1.86734653853691 T:C C T 10 0.52072955481467 0.79010440834659 ENSG00000143390:ENST00000290524:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000368870:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452671:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452513:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000392746:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000422595:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000450506:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000458484:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000421986:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000430227:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000435314:exon_151318691_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000478564:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000412774:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000437327:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000436271:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000494217:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000479681:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000444392:exon_151318681_151318809:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452456:exon_151318681_151318809:RFX5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 151372138 G/A 1 142 170 312 68.0564032163169 88.5240243184939 -20.467621102177 A:C:G G A 10 0.52072955481467 0.0232685839841884 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 27 20 47 12.9403020200039 10.4145910962934 2.52571092371051 A:C A C 10 0.52072955481467 0.47034240445371 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 151747970 A/G 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 A:G A G 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000182134:ENST00000525790:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368827:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368825:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000440583:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368824:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368823:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368822:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000458431:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000526413:exon_151747868_151748019:TDRKH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 153516358 G/A 1 23 50 73 11.0232202392626 26.0364777407335 -15.0132575014709 A:G G A 10 0.52072955481467 0.000580946099867042 ENSG00000196154:ENST00000368715:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000481009:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000354332:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000468373:exon_153516089_153516415:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368716:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368714:exon_153516097_153516399:S100A4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 153631198 T/C 1 9 5 14 4.31343400666797 2.60364777407335 1.70978623259462 T:C T C 10 0.52072955481467 0.429598343746981 ENSG00000143553:ENST00000368685:exon_153631130_153631362:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000474959:exon_153631188_153631660:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000462880:exon_153631190_153631362:SNAPIN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 153745128 G/C 1 57 30 87 27.3184153755638 15.6218866444401 11.6965287311237 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0132974164815908 ENSG00000143624:ENST00000318967:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000428986:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000456435:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000435409:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000481797:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000512605:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000476843:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000503133:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368670:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368669:exon_153744816_153745187:INTS3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 153784567 G/C 1 11 21 32 5.27197489703863 10.9353206511081 -5.66334575406944 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0516397127802673 ENSG00000143614:ENST00000368655:exon_153784498_153784608:GATAD2B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 153909069 G/C 1 10 12 22 4.7927044518533 6.24875465777604 -1.45605020592274 C:G G C 10 0.52072955481467 0.670595760110997 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000477746:exon_153909018_153909118:DENND4B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 153914500 G/A 1 18 19 37 8.62686801333594 9.89386154147873 -1.26699352814279 A:G G A 10 0.52072955481467 0.743209181591739 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153914345_153914589:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153914345_153914589:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000483561:exon_153914345_153914720:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000472932:exon_153914405_153914589:DENND4B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 153916856 C/G 1 17 16 33 8.14759756815061 8.33167287703472 -0.184075308884109 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153916534_153916873:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153916534_153916873:DENND4B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 98 73 171 46.9685036281623 38.0132575014709 8.95524612669143 A:G A G 10 0.52072955481467 0.193074027397783 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 153926078 T/C 1 23 21 44 11.0232202392626 10.9353206511081 0.0878995881545208 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 153941514 C/T 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 T:C C T 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000143578:ENST00000449724:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368607:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000271889:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000461688:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368601:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368603:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368600:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000479010:exon_153941406_153941787:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000492729:exon_153941406_153941931:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000473340:exon_153940998_153941830:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000431292:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000405694:exon_153941406_153941652:CREB3L4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 154316434 C/T 1 15 8 23 7.18905667777995 4.16583643851736 3.02322023926259 T:C C T 10 0.52072955481467 0.219045420855692 ENSG00000143515:ENST00000368489:exon_154316369_154316533:ATP8B2;ENSG00000143515:ENST00000341831:exon_154316369_154316533:ATP8B2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 154317153 C/T 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000143515:ENST00000368489:exon_154317117_154317261:ATP8B2;ENSG00000143515:ENST00000341831:exon_154317117_154317261:ATP8B2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 154320942 A/G 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000143515:ENST00000368489:exon_154320884_154321014:ATP8B2;ENSG00000143515:ENST00000341831:exon_154320884_154321014:ATP8B2;ENSG00000143515:ENST00000505882:exon_154320884_154321014:ATP8B2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 154561925 C/T 1 56 58 114 26.8391449303785 30.2023141792509 -3.36316924887238 A:T:C C T 10 0.52072955481467 0.574106220595377 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154561845_154561938:ADAR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 154573967 T/C 1 127 137 264 60.8673465385369 71.3399490096098 -10.4726024710729 T:C T C 10 0.52072955481467 0.217883823469619 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000463920:exon_154572653_154574724:ADAR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 24 21 45 11.5024906844479 10.9353206511081 0.567170033339851 C:G C G 10 0.52072955481467 0.88267073819837 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 154744852 A/G 1 17 21 38 8.14759756815061 10.9353206511081 -2.78772308295746 A:G A G 10 0.52072955481467 0.41821411726343 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 154904840 T/C 1 42 48 90 20.1293586977839 24.9950186311042 -4.8656599333203 T:C T C 10 0.52072955481467 0.342567217791884 ENSG00000163344:ENST00000368467:exon_154904828_154904891:PMVK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 154917569 T/A 1 48 44 92 23.0049813688958 22.9121004118455 0.0928809570503617 A:T T A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154916552_154917593:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154916556_154917593:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154916918_154917593:PBXIP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 24 26 50 11.5024906844479 13.5389684251814 -2.0364777407335 T:C:G C T 10 0.52072955481467 0.574733557508779 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 154931603 G/A 1 29 20 49 13.8988429103746 10.4145910962934 3.48425181408117 A:G G A 10 0.52072955481467 0.391207580467612 ENSG00000163348:ENST00000368457:exon_154929502_154932322:PYGO2;ENSG00000163348:ENST00000368456:exon_154931216_154932322:PYGO2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 154987526 C/T 1 24 27 51 11.5024906844479 14.0596979799961 -2.55720729554817 T:C C T 10 0.52072955481467 0.486913223504623 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000487542:exon_154987131_154987785:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154986924_154988290:ZBTB7B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 154988957 A/G 1 35 25 60 16.7744655814866 13.0182388703667 3.7562267111198 A:G A G 10 0.52072955481467 0.366944330974419 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154988696_154989457:ZBTB7B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 156146218 C/T 1 53 64 117 25.4013335948225 33.3266915081389 -7.92535791331639 T:C C T 10 0.52072955481467 0.164906778047166 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000484155:exon_156146196_156146447:SEMA4A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 156446903 T/C 1 11 18 29 5.27197489703863 9.37313198666406 -4.10115708962543 T:C T C 10 0.52072955481467 0.139923168664175 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000353795:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000340875:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000454816:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000493077:exon_156446721_156446994:MEF2D HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 25 19 44 11.9817611296333 9.89386154147873 2.08789958815452 A:G G A 10 0.52072955481467 0.549986734138911 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 29 28 57 13.8988429103746 14.5804275348108 -0.681584624436189 A:G G A 10 0.52072955481467 0.89501069508708 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 156616814 C/G 1 6 12 18 2.87562267111198 6.24875465777604 -3.37313198666406 C:G C G 10 0.52072955481467 0.155728897636768 ENSG00000132692:ENST00000441358:exon_156616593_156616936:BCAN;ENSG00000132692:ENST00000329117:exon_156616593_156616967:BCAN;ENSG00000132692:ENST00000457777:exon_156616593_156616967:BCAN;ENSG00000132692:ENST00000479949:exon_156616593_156616967:BCAN;ENSG00000132692:ENST00000361588:exon_156616593_156616967:BCAN;ENSG00000132692:ENST00000255029:exon_156616593_156616954:BCAN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 156706559 A/C,G 0 0 11 11 0 5.72802510296137 -5.72802510296137 C:G A G 10 0.52072955481467 0.000306469410891868 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 156737969 C/T 1 31 32 63 14.8573838007452 16.6633457540694 -1.80596195332421 T:C C T 10 0.52072955481467 0.705807666311002 ENSG00000143294:ENST00000353233:exon_156737274_156738031:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000271526:exon_156737292_156738031:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156737346_156738031:PRCC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 156909695 G/A 1 10 2 12 4.7927044518533 1.04145910962934 3.75124534222396 A:G G A 10 0.52072955481467 0.040517956655805 ENSG00000132694:ENST00000368194:exon_156909340_156909702:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000413909:exon_156909340_156909702:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000487682:exon_156908210_156910217:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000361409:exon_156909340_156909702:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000315174:exon_156909340_156909702:ARHGEF11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 160000711 C/T 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000143315:ENST00000368090:exon_159997462_160001783:PIGM HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 160208439 C/T 1 26 29 55 12.4610315748186 15.1011570896254 -2.64012551480685 T:C C T 10 0.52072955481467 0.50199058740513 ENSG00000132716:ENST00000368073:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000326837:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000368074:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000461888:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000466253:exon_160208397_160208775:DCAF8;ENSG00000162735:ENST00000527349:exon_160208397_160208537:PEX19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 160208472 T/C 1 29 30 59 13.8988429103746 15.6218866444401 -1.72304373406553 T:C T C 10 0.52072955481467 0.696862572479534 ENSG00000132716:ENST00000368073:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000326837:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000368074:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000461888:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000466253:exon_160208397_160208775:DCAF8;ENSG00000162735:ENST00000527349:exon_160208397_160208537:PEX19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 160249362 A/G 1 33 29 62 15.8159246911159 15.1011570896254 0.714767601490461 A:G A G 10 0.52072955481467 0.899289376471809 ENSG00000162735:ENST00000368072:exon_160246602_160249424:PEX19;ENSG00000162735:ENST00000472750:exon_160246657_160249424:PEX19;ENSG00000162735:ENST00000429425:exon_160248271_160249424:PEX19;ENSG00000162735:ENST00000532508:exon_160249086_160249424:PEX19;ENSG00000162735:ENST00000495624:exon_160249185_160249635:PEX19;ENSG00000162735:ENST00000462644:exon_160249274_160249424:PEX19;ENSG00000162735:ENST00000532643:exon_160249283_160249424:PEX19;ENSG00000162735:ENST00000440949:exon_160249341_160249424:PEX19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 160302298 T/C 1 42 40 82 20.1293586977839 20.8291821925868 -0.699823494802938 T:C T C 10 0.52072955481467 0.912246202929366 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160302238_160302347:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160302238_160302347:COPA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 160305044 C/T 1 25 27 52 11.9817611296333 14.0596979799961 -2.07793685036284 T:C C T 10 0.52072955481467 0.581553855774598 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160305032_160305112:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160305032_160305112:COPA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 160321065 A/G 1 13 9 22 6.23051578740929 4.68656599333203 1.54394979407726 A:G A G 10 0.52072955481467 0.53135812068658 ENSG00000162736:ENST00000368067:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000294785:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368063:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000392212:exon_160321012_160321162:NCSTN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 160321499 C/T 1 34 14 48 16.2951951363012 7.29021376740538 9.00498136889584 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00924468801297055 ENSG00000162736:ENST00000368067:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000294785:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368063:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000392212:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000459963:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000424645:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000424754:exon_160321486_160321595:NCSTN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 160322763 A/G 1 14 20 34 6.70978623259462 10.4145910962934 -3.70480486369878 A:G A G 10 0.52072955481467 0.231281092475669 ENSG00000162736:ENST00000368065:exon_160322677_160322781:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000294785:exon_160322677_160322781:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368063:exon_160322677_160322781:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000421914:exon_160322677_160322781:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000392212:exon_160322677_160322781:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000459963:exon_160322677_160322781:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000424645:exon_160322677_160322781:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000424754:exon_160322677_160322781:NCSTN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 160461060 C/T 1 24 21 45 11.5024906844479 10.9353206511081 0.567170033339851 T:C C T 10 0.52072955481467 0.88267073819837 ENSG00000162739:ENST00000368059:exon_160460915_160461178:SLAMF6;ENSG00000162739:ENST00000368057:exon_160460915_160461178:SLAMF6;ENSG00000162739:ENST00000368055:exon_160460915_160461178:SLAMF6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 160654758 C/G 1 979 710 1689 469.205765836438 369.717983918416 99.4877819180224 T:C:G C G 10 0.52072955481467 1.22879748371249e-06 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 1016 533 1549 486.938772308295 277.548852716219 209.389919592076 A:C:G G A 10 0.52072955481467 6.19207777988194e-27 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 161721707 C/T 1 5 12 17 2.39635222592665 6.24875465777604 -3.85240243184939 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0870960062083928 ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 163313539 C/T 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 T:C C T 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163313523_163313613:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000531529:exon_163313523_163313605:NUF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 166818566 A/G 1 28 34 62 13.4195724651892 17.7048048636988 -4.28523239850954 A:G A G 10 0.52072955481467 0.309828427609089 ENSG00000143157:ENST00000367876:exon_166818175_166819660:POGK;ENSG00000143157:ENST00000367875:exon_166818175_166823710:POGK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 27 17 44 12.9403020200039 8.85240243184939 4.08789958815452 T:C T C 10 0.52072955481467 0.23079428601772 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 14 18 32 6.70978623259462 9.37313198666406 -2.66334575406944 A:G A G 10 0.52072955481467 0.379705859397668 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 21 19 40 10.0646793488919 9.89386154147873 0.170817807413201 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 172411496 A/G 1 5 15 20 2.39635222592665 7.81094332222005 -5.4145910962934 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0228276833667751 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 172411768 T/C 1 11 9 20 5.27197489703863 4.68656599333203 0.5854089037066 T:C T C 10 0.52072955481467 0.826808206154088 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 179051300 T/C 1 56 46 102 26.8391449303785 23.9535595214748 2.88558540890366 T:C T C 10 0.52072955481467 0.620586796509666 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179050512_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000367625:exon_179051205_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179051213_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179051221_179051522:TOR3A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 179310262 C/T 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 179320578 A/G 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179320452_179320597:SOAT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 180166008 C/T 1 12 6 18 5.75124534222396 3.12437732888802 2.62686801333594 T:C C T 10 0.52072955481467 0.245162799745609 ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180165397_180173165:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000443059:exon_180165817_180166025:QSOX1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 180471278 G/A 1 60 58 118 28.7562267111198 30.2023141792509 -1.44608746813106 A:G G A 10 0.52072955481467 0.853900868038624 ENSG00000135847:ENST00000367595:exon_180471180_180472089:ACBD6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 182354850 A/G 1 2 6 8 0.95854089037066 3.12437732888802 -2.16583643851736 A:G A G 10 0.52072955481467 0.164210754421108 ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182354834_182355022:GLUL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 182356399 A/G 1 44 67 111 21.0878995881545 34.8888801725829 -13.8009805844284 A:T:G A G 10 0.52072955481467 0.0100663995037214 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000484996:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000475808:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000480604:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000462444:exon_182355910_182356427:GLUL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 182844020 C/T 1 16 11 27 7.66832712296528 5.72802510296137 1.94030202000391 T:C C T 10 0.52072955481467 0.5644014761963 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182843989_182844089:DHX9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 182845346 C/T 1 30 27 57 14.3781133555599 14.0596979799961 0.318415375563811 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182845185_182845398:DHX9;ENSG00000135829:ENST00000490519:exon_182845264_182845398:DHX9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 183105705 G/A 1 22 8 30 10.5439497940773 4.16583643851736 6.3781133555599 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0267298368552666 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 186289510 G/A 1 68 59 127 32.5903902726024 30.7230437340655 1.86734653853691 A:G G A 10 0.52072955481467 0.79010440834659 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186289444_186289550:TPR;ENSG00000047410:ENST00000467810:exon_186289444_186289550:TPR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 198721794 C/T 1 52 35 87 24.9220631496372 18.2255344185134 6.69652873112371 T:C C T 10 0.52072955481467 0.163588683820255 ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000352140:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000348564:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367372:exon_198721723_198721901:PTPRC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 200635550 T/C 1 12 15 27 5.75124534222396 7.81094332222005 -2.05969797999609 T:C T C 10 0.52072955481467 0.447615619311931 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 200635560 T/C 1 14 15 29 6.70978623259462 7.81094332222005 -1.10115708962543 T:C T C 10 0.52072955481467 0.713495169021185 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 14 15 29 6.70978623259462 7.81094332222005 -1.10115708962543 A:T A T 10 0.52072955481467 0.713495169021185 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 202935911 T/C 1 16 4 20 7.66832712296528 2.08291821925868 5.5854089037066 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0132289346087372 ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000473599:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000478009:exon_202935877_202936026:CYB5R1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 202977809 G/A 1 2 7 9 0.95854089037066 3.64510688370269 -2.68656599333203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0972167926377697 ENSG00000163444:ENST00000367242:exon_202977771_202977938:TMEM183A;ENSG00000163444:ENST00000468449:exon_202977771_202977938:TMEM183A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 206665052 C/T 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000462698:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000162888:ENST00000367119:exon_206664449_206666409:C1orf147 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 206669465 C/T 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 T:C C T 10 0.52072955481467 0.806303597637586 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206669445_206670223:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000462698:exon_206669445_206670220:IKBKE HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 206711610 G/A 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000136653:ENST00000355294:exon_206711501_206711622:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367117:exon_206711501_206711622:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000338603:exon_206711501_206711622:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367118:exon_206711501_206711622:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000435226:exon_206711501_206711622:RASSF5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 209933331 A/G 1 22 20 42 10.5439497940773 10.4145910962934 0.129358697783861 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 209933528 G/A 1 30 39 69 14.3781133555599 20.3084526377721 -5.93033928221223 A:G G A 10 0.52072955481467 0.184691039374566 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 209933540 A/G 1 44 34 78 21.0878995881545 17.7048048636988 3.38309472445574 A:G A G 10 0.52072955481467 0.49698732326674 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 209933660 G/C 1 33 30 63 15.8159246911159 15.6218866444401 0.194038046675791 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933601_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 209936914 C/T 1 21 18 39 10.0646793488919 9.37313198666406 0.691547362227871 T:C C T 10 0.52072955481467 0.873630371447354 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 42 42 84 20.1293586977839 21.8706413022161 -1.74128260443228 C:G C G 10 0.52072955481467 0.743762970273784 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 87 78 165 41.6965287311237 40.6169052755443 1.07962345557946 T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.87651311823224 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214492286 G/A 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 A:G G A 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214492202_214492326:SMYD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214510115 T/G 1 21 28 49 10.0646793488919 14.5804275348108 -4.51574818591883 T:G T G 10 0.52072955481467 0.201798030841650 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214510047_214510473:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214510047_214510445:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000416415:exon_214510047_214510474:SMYD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214811244 C/G 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214811209_214811344:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214813487 A/G 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 A:G A G 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214813782 A/G 1 11 7 18 5.27197489703863 3.64510688370269 1.62686801333594 A:G A G 10 0.52072955481467 0.487529072791399 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214813941 C/G 1 15 8 23 7.18905667777995 4.16583643851736 3.02322023926259 C:G C G 10 0.52072955481467 0.219045420855692 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214814125 G/A 1 11 8 19 5.27197489703863 4.16583643851736 1.10613845852127 A:G G A 10 0.52072955481467 0.653020003043937 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214814582 G/A 1 11 1 12 5.27197489703863 0.52072955481467 4.75124534222396 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0068497648993244 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214814733 T/G 1 13 5 18 6.23051578740929 2.60364777407335 3.62686801333594 T:G T G 10 0.52072955481467 0.101364734583614 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214814778 G/A 1 13 1 14 6.23051578740929 0.52072955481467 5.70978623259462 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00204361869370968 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214814995 C/T 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 T:C C T 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214815916 T/C 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 T:C T C 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214816142 T/G 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 T:G T G 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214816224 G/A 1 10 2 12 4.7927044518533 1.04145910962934 3.75124534222396 A:G G A 10 0.52072955481467 0.040517956655805 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214816297 A/G 1 19 13 32 9.10613845852127 6.76948421259071 2.33665424593056 A:G A G 10 0.52072955481467 0.480625933616023 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214818215 G/A 1 13 13 26 6.23051578740929 6.76948421259071 -0.53896842518142 A:G G A 10 0.52072955481467 0.84709817230133 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214818223 T/A 1 13 13 26 6.23051578740929 6.76948421259071 -0.53896842518142 A:T T A 10 0.52072955481467 0.84709817230133 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214818846 A/G 1 14 16 30 6.70978623259462 8.33167287703472 -1.6218866444401 A:G A G 10 0.52072955481467 0.587501156256487 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214818945 A/C 1 15 17 32 7.18905667777995 8.85240243184939 -1.66334575406944 A:C A C 10 0.52072955481467 0.598565100829255 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214819328 G/A 1 36 47 83 17.2537360266719 24.4742890762895 -7.22055304961761 A:G G A 10 0.52072955481467 0.124213764377341 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214819587 A/G 1 20 25 45 9.5854089037066 13.0182388703667 -3.43282996666015 A:G A G 10 0.52072955481467 0.37093488579249 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214819980 C/T 1 20 23 43 9.5854089037066 11.9767797607374 -2.39137085703081 T:C C T 10 0.52072955481467 0.542181636891993 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214820299 A/G 1 10 9 19 4.7927044518533 4.68656599333203 0.10613845852127 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214820494 G/A 1 18 16 34 8.62686801333594 8.33167287703472 0.295195136301221 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 214820524 T/C 1 18 23 41 8.62686801333594 11.9767797607374 -3.34991174740147 T:C T C 10 0.52072955481467 0.348892228743102 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 37 23 60 17.7330064718572 11.9767797607374 5.7562267111198 T:C C T 10 0.52072955481467 0.155510041199716 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 220921945 G/C 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 C:G G C 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000117791:ENST00000469583:exon_220921567_220922145:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220921611_220922145:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220921676_220922145:MOSC2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 32 26 58 15.3366542459306 13.5389684251814 1.79768582074914 T:C T C 10 0.52072955481467 0.694241419321361 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 26 26 52 12.4610315748186 13.5389684251814 -1.07793685036284 T:C T C 10 0.52072955481467 0.78295334612617 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 223905532 G/A 1 19 14 33 9.10613845852127 7.29021376740538 1.81592469111589 A:G G A 10 0.52072955481467 0.60279298858228 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223905464_223905533:CAPN2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 223933079 C/T 1 18 17 35 8.62686801333594 8.85240243184939 -0.225534418513449 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223933008_223933141:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223933008_223933141:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223933008_223933141:CAPN2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 223934720 G/A 1 27 24 51 12.9403020200039 12.4975093155521 0.442792704451831 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223934699_223934765:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223934699_223934867:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223934699_223934867:CAPN2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 223954080 A/C 1 11 13 24 5.27197489703863 6.76948421259071 -1.49750931555208 A:C A C 10 0.52072955481467 0.548584049171421 ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000433674:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000474026:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000487223:exon_223954069_223954133:CAPN2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 226923938 A/C 1 11 14 25 5.27197489703863 7.29021376740538 -2.01823887036675 A:C A C 10 0.52072955481467 0.431806214148498 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 226924642 C/T 1 8 12 20 3.83416356148264 6.24875465777604 -2.4145910962934 T:C C T 10 0.52072955481467 0.371430851394435 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 226925111 C/T 1 12 14 26 5.75124534222396 7.29021376740538 -1.53896842518142 T:C C T 10 0.52072955481467 0.562641904116243 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 227920061 T/G 1 48 34 82 23.0049813688958 17.7048048636988 5.30017650519706 T:G T G 10 0.52072955481467 0.269466265928968 ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 227935762 G/A 1 14 22 36 6.70978623259462 11.4560502059227 -4.74626397332812 A:G G A 10 0.52072955481467 0.133495943590918 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 228335125 C/T 1 196 184 380 93.9370072563247 95.8142380858993 -1.8772308295746 T:C C T 10 0.52072955481467 0.877619310875946 ENSG00000143774:ENST00000366730:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000462807:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485838:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000312726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000492871:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366728:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366727:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000453943:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366723:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366729:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000391865:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366722:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498092:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000435153:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366721:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000460224:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000472939:exon_228335107_228335146:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000412265:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366719:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366720:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366718:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366715:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470040:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366716:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485168:exon_228335107_228335188:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000478725:exon_228335107_228335260:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000420445:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000495999:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000486668:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000464858:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470155:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000481341:exon_228335111_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498115:exon_228335107_228335400:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470740:exon_228335107_228335239:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000465025:exon_228335125_228335245:GUK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 228582643 C/T 1 23 30 53 11.0232202392626 15.6218866444401 -4.59866640517751 T:C C T 10 0.52072955481467 0.218248582076723 ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228581377_228582953:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000493030:exon_228581817_228582714:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228582157_228582953:TRIM11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 228588680 A/C 1 7 11 18 3.35489311629731 5.72802510296137 -2.37313198666406 A:C A C 10 0.52072955481467 0.346420367518563 ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228588665_228588895:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228588640_228588892:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000366699:exon_228588665_228588895:TRIM11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 230415148 G/A 1 37 46 83 17.7330064718572 23.9535595214748 -6.22055304961761 A:G G A 10 0.52072955481467 0.187855892343621 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 230415244 T/C 1 64 59 123 30.6733084918611 30.7230437340655 -0.0497352422044059 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:T T A 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 234509972 A/G 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:G A G 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000168275:ENST00000366612:exon_234509447_234510135:C1orf31 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 234529519 C/T 1 24 13 37 11.5024906844479 6.76948421259071 4.73300647185721 T:C C T 10 0.52072955481467 0.139186775038917 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 234529540 G/A 1 22 6 28 10.5439497940773 3.12437732888802 7.41957246518924 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00694096674884343 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 21 20 41 10.0646793488919 10.4145910962934 -0.349911747401469 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 25 28 53 11.9817611296333 14.5804275348108 -2.59866640517751 T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.494590467476528 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 236740135 T/C 1 8 7 15 3.83416356148264 3.64510688370269 0.18905667777995 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236740080_236740249:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236740080_236740249:HEATR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 236767330 A/G 1 10 11 21 4.7927044518533 5.72802510296137 -0.93532065110807 A:G A G 10 0.52072955481467 0.827826563650395 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366579:exon_236767254_236767427:HEATR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 242042301 G/A 1 4 16 20 1.91708178074132 8.33167287703472 -6.4145910962934 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00575736211969442 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 244218067 G/A 1 16 5 21 7.66832712296528 2.60364777407335 5.06467934889193 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0292882235930097 ENSG00000179456:ENST00000366538:exon_244217090_244220774:ZNF238;ENSG00000179456:ENST00000358704:exon_244217090_244220778:ZNF238 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 245849729 G/A 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 245850506 G/C 1 10 7 17 4.7927044518533 3.64510688370269 1.14759756815061 C:G G C 10 0.52072955481467 0.634129017759885 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 245851289 G/T 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 T:G G T 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 245861571 C/T 1 3 8 11 1.43781133555599 4.16583643851736 -2.72802510296137 T:C C T 10 0.52072955481467 0.132783549738221 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245861408_245861610:KIF26B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 246810464 G/C 1 13 8 21 6.23051578740929 4.16583643851736 2.06467934889193 C:G G C 10 0.52072955481467 0.391931055698548 ENSG00000162852:ENST00000483271:exon_246810441_246811537:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366513:exon_246810441_246811339:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366512:exon_246810441_246811545:CNST HGDP00855_parsed_pileup.txt . 1 247006051 G/C 1 7 11 18 3.35489311629731 5.72802510296137 -2.37313198666406 C:G G C 10 0.52072955481467 0.346420367518563 ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000498601:exon_247005996_247006078:AHCTF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 54 47 101 25.8806040400078 24.4742890762895 1.40631496371833 A:G G A 10 0.52072955481467 0.842287412112904 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 6150677 C/A 1 50 37 87 23.9635222592665 19.2669935281428 4.69652873112371 A:C C A 10 0.52072955481467 0.335334553050443 ENSG00000134453:ENST00000372795:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000418869:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000379888:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000429138:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000437845:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000432931:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000446108:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000418631:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000447032:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000481147:exon_6150451_6150705:RBM17 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 10 8 18 4.7927044518533 4.16583643851736 0.62686801333594 A:G A G 10 0.52072955481467 0.817378948970493 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 11 14 25 5.27197489703863 7.29021376740538 -2.01823887036675 A:T A T 10 0.52072955481467 0.431806214148498 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 12 16 28 5.75124534222396 8.33167287703472 -2.58042753481076 T:C C T 10 0.52072955481467 0.350079965528076 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 11505175 A/G 1 15 6 21 7.18905667777995 3.12437732888802 4.06467934889193 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0836954361100518 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 12131218 C/T 1 18 6 24 8.62686801333594 3.12437732888802 5.50249068444792 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0254072188637344 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000415935:exon_12131174_12131254:DHTKD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 12149939 C/T 1 19 13 32 9.10613845852127 6.76948421259071 2.33665424593056 T:C C T 10 0.52072955481467 0.480625933616023 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12149908_12150014:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12149908_12150014:DHTKD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 23 25 48 11.0232202392626 13.0182388703667 -1.99501863110416 T:C T C 10 0.52072955481467 0.567626612652638 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 12292348 G/T 1 99 87 186 47.4477740733477 45.3034712688763 2.14430280447139 T:G G T 10 0.52072955481467 0.76953619276831 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 13633835 A/G 1 7 1 8 3.35489311629731 0.52072955481467 2.83416356148264 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0721941130810857 ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13633768_13633888:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000320054:exon_13633768_13633888:PRPF18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 11 9 20 5.27197489703863 4.68656599333203 0.5854089037066 A:G A G 10 0.52072955481467 0.826808206154088 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 21827796 G/A 1 9 9 18 4.31343400666797 4.68656599333203 -0.37313198666406 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000078403:ENST00000377100:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377072:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000307729:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377091:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000471315:exon_21827762_21827893:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000446906:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000495130:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377059:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000396529:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000476557:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000430455:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000462999:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000480415:exon_21827762_21827841:MLLT10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 24908686 T/C 1 11 5 16 5.27197489703863 2.60364777407335 2.66832712296528 T:C T C 10 0.52072955481467 0.216398220878093 ENSG00000107863:ENST00000396432:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000320481:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000486374:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000376410:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000445703:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000446003:exon_24908402_24910298:ARHGAP21 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 26998637 T/G 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 T:G T G 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000148459:ENST00000376215:exon_26998567_26998697:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000376203:exon_26998567_26998697:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000396343:exon_26998567_26998697:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000473224:exon_26998567_26998697:PDSS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 27389314 C/T 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27389014_27389405:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27389014_27389427:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27389014_27389427:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27389014_27389421:ANKRD26 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 23 18 41 11.0232202392626 9.37313198666406 1.65008825259853 A:G G A 10 0.52072955481467 0.64186927009697 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 27437964 T/C 1 41 63 104 19.6500882525985 32.8059619533242 -13.1558737007257 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0105757829707391 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000493741:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27437835_27437969:YME1L1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 27444328 C/A 0 11 0 11 5.27197489703863 0 5.27197489703863 C C 10 0.52072955481467 0.00106983837970180 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27443753_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27444299_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27444299_27444541:MASTL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 27459670 C/T 1 6 9 15 2.87562267111198 4.68656599333203 -1.81094332222005 T:C C T 10 0.52072955481467 0.44117550699482 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 33209266 G/T 1 9 18 27 4.31343400666797 9.37313198666406 -5.05969797999609 T:G G T 10 0.52072955481467 0.0556408222394603 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33209173_33209313:ITGB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 33211227 T/G 1 9 3 12 4.31343400666797 1.56218866444401 2.75124534222396 T:G T G 10 0.52072955481467 0.150146977653864 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33211185_33211274:ITGB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 33217110 G/A 1 17 5 22 8.14759756815061 2.60364777407335 5.54394979407726 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0189359180007504 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000480226:exon_33217078_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000474568:exon_33217102_33217192:ITGB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 34620220 C/T 1 11 16 27 5.27197489703863 8.33167287703472 -3.05969797999609 T:C C T 10 0.52072955481467 0.253772919953493 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000466092:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34620045_34620272:PARD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 35302705 C/T 1 14 10 24 6.70978623259462 5.2072955481467 1.50249068444792 T:C C T 10 0.52072955481467 0.683763897335876 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35302627_35302728:CUL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 35772402 G/A 1 17 9 26 8.14759756815061 4.68656599333203 3.46103157481858 A:G G A 10 0.52072955481467 0.238474281795361 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000490012:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000493157:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000492478:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000470025:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35772158_35772406:CCNY HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 35858090 A/G 1 19 29 48 9.10613845852127 15.1011570896254 -5.99501863110416 A:G A G 10 0.52072955481467 0.111086347947446 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35857982_35860852:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35857982_35860852:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000339497:exon_35857982_35860840:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35857982_35860840:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35857982_35860840:CCNY HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 43287148 G/A 1 10 10 20 4.7927044518533 5.2072955481467 -0.4145910962934 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43287075_43287217:BMS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 43678796 C/T 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 T:C C T 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000169826:ENST00000374466:exon_43678698_43680756:CSGALNACT2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 45878050 G/A 1 22 36 58 10.5439497940773 18.7462639733281 -8.20231417925086 A:G G A 10 0.52072955481467 0.035180345339617 ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45877931_45878129:ALOX5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 45938491 C/T 1 27 18 45 12.9403020200039 9.37313198666406 3.56717003333985 T:C C T 10 0.52072955481467 0.300497646391797 ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45938486_45938664:ALOX5;ENSG00000012779:ENST00000493336:exon_45938061_45938664:ALOX5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 46222724 C/G 1 12 14 26 5.75124534222396 7.29021376740538 -1.53896842518142 C:G C G 10 0.52072955481467 0.562641904116243 ENSG00000172661:ENST00000374362:exon_46222667_46222768:FAM21C;ENSG00000172661:ENST00000336378:exon_46222667_46222768:FAM21C;ENSG00000172661:ENST00000399588:exon_46222684_46222768:FAM21C;ENSG00000172661:ENST00000359860:exon_46222684_46222768:FAM21C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 51827763 A/G 1 19 10 29 9.10613845852127 5.2072955481467 3.89884291037457 A:G A G 10 0.52072955481467 0.192782293977604 ENSG00000099290:ENST00000434114:exon_51827684_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000282633:exon_51827721_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000351071:exon_51827721_51827768:FAM21A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 61665886 C/A 1 18 4 22 8.62686801333594 2.08291821925868 6.54394979407726 A:C C A 10 0.52072955481467 0.00505584468362303 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61665880_61666414:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61665880_61666818:CCDC6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 70101417 G/C 1 81 90 171 38.8209060600117 46.8656599333203 -8.04475387330857 C:G G C 10 0.52072955481467 0.221681425593605 ENSG00000096746:ENST00000469172:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000441000:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000265866:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000354695:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000481819:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000491200:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000490442:exon_70100931_70101608:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000478698:exon_70100931_70101608:HNRNPH3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 70482238 G/A 1 20 14 34 9.5854089037066 7.29021376740538 2.29519513630122 A:G G A 10 0.52072955481467 0.494188680133003 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70482212_70482334:CCAR1;ENSG00000060339:ENST00000494903:exon_70482212_70482334:CCAR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 70549579 G/A 1 7 10 17 3.35489311629731 5.2072955481467 -1.85240243184939 A:G G A 10 0.52072955481467 0.468528473543755 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70549467_70549672:CCAR1;ENSG00000060339:ENST00000480627:exon_70549467_70549629:CCAR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 645 701 1346 309.129437144538 365.031417925084 -55.9019807805458 A:T:G G A 10 0.52072955481467 0.00244897653943347 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 70863699 C/T 1 1241 892 2133 594.774622474995 464.490762894686 130.283859580309 T:C C T 10 0.52072955481467 1.68807639012358e-08 ENSG00000122862:ENST00000462445:exon_70863627_70864297:SRGN;ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70863627_70864567:SRGN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 73520632 A/C 1 4 7 11 1.91708178074132 3.64510688370269 -1.72802510296137 A:C A C 10 0.52072955481467 0.371924081118385 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73520288_73520681:C10orf54 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 79760818 A/G 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 A:G A G 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000148606:ENST00000372371:exon_79760734_79760852:POLR3A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 79762028 G/A 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.347970315516692 ENSG00000148606:ENST00000372371:exon_79761955_79762066:POLR3A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 108 92 200 51.7612080800156 47.9071190429496 3.854089037066 A:G G A 10 0.52072955481467 0.620522327860384 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 81926718 A/G 1 99 110 209 47.4477740733477 57.2802510296137 -9.83247695626602 A:G A G 10 0.52072955481467 0.18835657192996 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 8 8 16 3.83416356148264 4.16583643851736 -0.33167287703472 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 88203068 T/C 1 8 9 17 3.83416356148264 4.68656599333203 -0.85240243184939 T:C T C 10 0.52072955481467 0.809480166298499 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000484070:exon_88203032_88203789:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372075:exon_88203032_88203120:WAPAL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 C:G C G 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 91007360 T/G 1 11 6 17 5.27197489703863 3.12437732888802 2.14759756815061 T:G T G 10 0.52072955481467 0.339416350374528 ENSG00000107798:ENST00000336233:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000371829:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000456827:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000425287:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000428800:exon_91007295_91007588:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000282673:exon_91007295_91007406:LIPA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 91497207 A/G 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 A:G A G 10 0.52072955481467 0.806303597637586 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 91522548 A/G 1 17 13 30 8.14759756815061 6.76948421259071 1.3781133555599 A:G A G 10 0.52072955481467 0.715813234813189 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91522395_91522592:KIF20B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 91528504 C/T 1 7 4 11 3.35489311629731 2.08291821925868 1.27197489703863 T:C C T 10 0.52072955481467 0.552692319562948 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91528495_91528645:KIF20B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 93608142 G/A 1 11 2 13 5.27197489703863 1.04145910962934 4.23051578740929 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0239073326021939 ENSG00000107854:ENST00000371627:exon_93608140_93608392:TNKS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 19 25 44 9.10613845852127 13.0182388703667 -3.91210041184548 A:T A T 10 0.52072955481467 0.290912709188041 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 96997670 A/G 1 701 774 1475 335.968582074916 403.044675426555 -67.0760933516382 A:T:G A G 10 0.52072955481467 0.000477351432731619 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 96997820 A/G 1 447 547 994 214.233888997843 284.839066483624 -70.605177485782 A:G A G 10 0.52072955481467 8.53124913789368e-06 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000492511:exon_96997697_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_96997767_96997868:PDLIM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 97023630 T/C 1 418 312 730 200.335046087468 162.467621102177 37.8674249852909 A:T:C T C 10 0.52072955481467 0.00543035686115967 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_97023621_97023820:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_97023621_97023820:PDLIM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 97599537 G/C 1 91 86 177 43.613610511865 44.7827417140616 -1.16913120219658 C:G G C 10 0.52072955481467 0.88058622005873 ENSG00000138185:ENST00000453258:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371206:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000481316:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371205:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371203:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000483213:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371207:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000490659:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000494070:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000461927:exon_97599057_97599565:ENTPD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 97919011 A/G 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 A:G A G 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 98287792 G/T 1 18 16 34 8.62686801333594 8.33167287703472 0.295195136301221 T:G G T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000077147:ENST00000371142:exon_98287788_98287934:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000485093:exon_98287788_98287930:TM9SF3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 98369536 A/G 1 53 64 117 25.4013335948225 33.3266915081389 -7.92535791331639 A:G A G 10 0.52072955481467 0.164906778047166 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000467625:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98369469_98369624:PIK3AP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 98380137 T/C 1 69 65 134 33.0696607177878 33.8474210629536 -0.777760345165781 T:C T C 10 0.52072955481467 0.931183859201953 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98380109_98380168:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000461252:exon_98380109_98380191:PIK3AP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 54 45 99 25.8806040400078 23.4328299666602 2.44777407334767 T:C C T 10 0.52072955481467 0.687659931430223 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 98469507 C/A 1 37 18 55 17.7330064718572 9.37313198666406 8.35987448519315 A:C C A 10 0.52072955481467 0.0299839014117210 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 99205731 A/G 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 A:G A G 10 0.52072955481467 0.806303597637586 ENSG00000171311:ENST00000464440:exon_99205712_99205751:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370902:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370886:exon_99205712_99205743:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370885:exon_99205712_99205750:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370884:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000485122:exon_99205712_99205742:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000476234:exon_99205712_99205763:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000489158:exon_99205712_99205763:EXOSC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 99219885 G/A 1 25 25 50 11.9817611296333 13.0182388703667 -1.0364777407335 A:G G A 10 0.52072955481467 0.779128855228348 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 99220707 C/T 1 10 19 29 4.7927044518533 9.89386154147873 -5.10115708962543 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0641932125587867 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 99410790 T/C 1 8 7 15 3.83416356148264 3.64510688370269 0.18905667777995 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000155252:ENST00000416867:exon_99410698_99410898:PI4K2A;ENSG00000155252:ENST00000370631:exon_99410698_99410898:PI4K2A;ENSG00000249967:ENST00000370649:exon_99410698_99410898:RP11-548K23.11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 99498234 G/A 1 9 11 20 4.31343400666797 5.72802510296137 -1.4145910962934 A:G G A 10 0.52072955481467 0.655741219933051 ENSG00000155256:ENST00000393677:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370610:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370613:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000337540:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000497994:exon_99498234_99498406:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000356257:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000357540:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000453958:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000359980:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000462887:exon_99498234_99498602:ZFYVE27 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 99504630 G/T 1 6 9 15 2.87562267111198 4.68656599333203 -1.81094332222005 T:G G T 10 0.52072955481467 0.44117550699482 ENSG00000155256:ENST00000393677:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370610:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370613:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000337540:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000497994:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000356257:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000453958:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000359980:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000423811:exon_99504486_99504672:ZFYVE27 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 101157438 G/C 1 35 35 70 16.7744655814866 18.2255344185134 -1.4510688370269 C:G G C 10 0.52072955481467 0.811126060712367 ENSG00000120053:ENST00000370508:exon_101156627_101157443:GOT1;ENSG00000120053:ENST00000489349:exon_101157222_101157443:GOT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 101502968 A/G 1 14 21 35 6.70978623259462 10.9353206511081 -4.22553441851345 A:G A G 10 0.52072955481467 0.176839633688286 ENSG00000119929:ENST00000493385:exon_101502910_101503080:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370476:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000471520:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370472:exon_101502910_101503119:CUTC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 103285900 C/T 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 T:C C T 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000166167:ENST00000370187:exon_103285770_103285956:BTRC;ENSG00000166167:ENST00000393441:exon_103285770_103285956:BTRC;ENSG00000166167:ENST00000408038:exon_103285770_103285956:BTRC;ENSG00000166167:ENST00000465182:exon_103285770_103285951:BTRC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 103339142 G/A 1 26 30 56 12.4610315748186 15.6218866444401 -3.16085506962152 A:G G A 10 0.52072955481467 0.424251649243372 ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103338639_103339310:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103338641_103339574:POLL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 103340144 A/G 1 15 20 35 7.18905667777995 10.4145910962934 -3.22553441851345 A:G A G 10 0.52072955481467 0.311944692649197 ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103340005_103341982:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000415897:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000485369:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000429502:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000470140:exon_103340009_103340173:POLL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 105372696 G/A 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 105762591 G/A 1 18 15 33 8.62686801333594 7.81094332222005 0.815924691115891 A:G G A 10 0.52072955481467 0.862375479002996 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 112266771 C/T 1 52 26 78 24.9220631496372 13.5389684251814 11.3830947244557 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0121800045991118 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 115489152 C/G 1 20 17 37 9.5854089037066 8.85240243184939 0.733006471857211 C:G C G 10 0.52072955481467 0.870166960031672 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 115489167 G/A 1 20 13 33 9.5854089037066 6.76948421259071 2.81592469111589 A:G G A 10 0.52072955481467 0.385153960404695 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 120446114 A/G 1 1 9 10 0.47927044518533 4.68656599333203 -4.2072955481467 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00905306247383101 ENSG00000151893:ENST00000369156:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000369151:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000493518:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000490610:exon_120446110_120446293:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000489169:exon_120446110_120446153:C10orf46 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 120920588 T/C 1 12 8 20 5.75124534222396 4.16583643851736 1.5854089037066 T:C T C 10 0.52072955481467 0.510829655044723 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 121196335 G/A 1 15 13 28 7.18905667777995 6.76948421259071 0.419572465189241 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121196163_121196353:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000369108:exon_121196163_121196353:GRK5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 121436068 T/G 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 T:G T G 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000151929:ENST00000369085:exon_121435976_121437331:BAG3;ENSG00000151929:ENST00000450186:exon_121435979_121436219:BAG3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 122624679 G/A 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 A:G G A 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000462529:exon_122624559_122624703:WDR11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 122645376 A/T 1 11 11 22 5.27197489703863 5.72802510296137 -0.45605020592274 A:T A T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122645326_122645450:WDR11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 122663585 G/A 1 14 8 22 6.70978623259462 4.16583643851736 2.54394979407726 A:G G A 10 0.52072955481467 0.295404626091449 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122663559_122663654:WDR11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 122665459 C/G 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 C:G C G 10 0.52072955481467 0.806303597637586 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122665388_122666367:WDR11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 123549691 T/G 1 6 10 16 2.87562267111198 5.2072955481467 -2.33167287703472 T:G T G 10 0.52072955481467 0.318493089377623 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000485281:exon_123549684_123549741:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000470613:exon_123549378_123549804:ATE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 126089434 G/A 1 16 9 25 7.66832712296528 4.68656599333203 2.98176112963325 A:G G A 10 0.52072955481467 0.317005341446711 ENSG00000065154:ENST00000368845:exon_126089409_126089553:OAT;ENSG00000065154:ENST00000471127:exon_126089409_126089553:OAT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 133 128 261 63.7429692096489 66.6533830162778 -2.91041380662887 T:C T C 10 0.52072955481467 0.75682115962708 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 150 152 302 71.8905667777995 79.1508923318298 -7.26032555403033 C:G G C 10 0.52072955481467 0.42026649487025 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 129900858 C/T 1 91 95 186 43.613610511865 49.4693077073936 -5.85569719552861 T:C C T 10 0.52072955481467 0.419675096086384 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 129901501 G/C 1 113 123 236 54.1575603059423 64.0497352422044 -9.89217493626212 C:G G C 10 0.52072955481467 0.215718487645145 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 129901747 C/T 1 94 111 205 45.051421847421 57.8009805844284 -12.7495587370073 T:C:G C T 10 0.52072955481467 0.080469134230763 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 152 134 286 72.8491076681702 69.7777603451658 3.07134732300439 A:C:G G A 10 0.52072955481467 0.722961474480986 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 117 79 196 56.0746420866836 41.1376348303589 14.9370072563247 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0378860245530494 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 129903465 A/G 1 97 89 186 46.489233182977 46.3449303785056 0.14430280447138 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 129903802 A/G 1 100 93 193 47.927044518533 48.4278485977643 -0.500804079231308 A:G A G 10 0.52072955481467 0.94272747458019 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 129904560 C/T 1 82 76 158 39.3001765051971 39.5754461659149 -0.275269660717861 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 129905896 T/A 1 73 66 139 34.9867424985291 34.3681506177682 0.618591880760867 A:T T A 10 0.52072955481467 0.932543950307103 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 129906980 C/T 1 75 49 124 35.9452833888998 25.5157481859188 10.4295352029809 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0718316720760351 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 133761285 G/A 1 34 34 68 16.2951951363012 17.7048048636988 -1.40960972739756 A:G G A 10 0.52072955481467 0.808450367305566 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000470416:exon_133761034_133761295:PPP2R2D HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 135076523 C/A 1 96 75 171 46.0099627377917 39.0547166111002 6.95524612669143 A:C C A 10 0.52072955481467 0.319762765757295 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 135076596 T/C 1 58 51 109 27.7976858207491 26.5572072955482 1.24047852520097 T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.848279937188273 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 135082346 A/G 1 21 22 43 10.0646793488919 11.4560502059227 -1.39137085703081 A:G A G 10 0.52072955481467 0.760671850446137 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 135085321 C/T 1 27 23 50 12.9403020200039 11.9767797607374 0.963522259266501 T:C C T 10 0.52072955481467 0.887642089834428 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 135085426 A/G 1 53 47 100 25.4013335948225 24.4742890762895 0.927044518533002 A:G A G 10 0.52072955481467 0.920355933001748 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 135087521 G/A 1 20 10 30 9.5854089037066 5.2072955481467 4.3781133555599 A:G G A 10 0.52072955481467 0.142966838766859 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 135097434 A/G 1 28 27 55 13.4195724651892 14.0596979799961 -0.640125514806849 A:G A G 10 0.52072955481467 0.89324841776031 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135097386_135097506:TUBGCP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 135098672 G/A 1 17 32 49 8.14759756815061 16.6633457540694 -8.51574818591883 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0211775859766510 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135098589_135098717:TUBGCP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 135112940 C/T 1 34 24 58 16.2951951363012 12.4975093155521 3.79768582074914 T:C C T 10 0.52072955481467 0.358504624456297 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000487796:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135112939_135113107:TUBGCP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 10 135122507 G/A 1 13 9 22 6.23051578740929 4.68656599333203 1.54394979407726 A:G G A 10 0.52072955481467 0.53135812068658 ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135122327_135122644:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135122327_135122638:TUBGCP2;ENSG00000198546:ENST00000361518:exon_135121979_135122600:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000359035:exon_135122445_135122600:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000482153:exon_135122453_135122600:ZNF511 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 236091 G/A 1 9 8 17 4.31343400666797 4.16583643851736 0.14759756815061 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_236048_236431:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_236048_236354:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_236048_236352:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_236048_236330:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525237:exon_236048_236326:SIRT3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 27 16 43 12.9403020200039 8.33167287703472 4.60862914296919 A:G A G 10 0.52072955481467 0.171998140479118 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 244 291 535 116.941988625221 151.532300451069 -34.5903118258485 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00281615911717690 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 320772 A/G 1 11 1 12 5.27197489703863 0.52072955481467 4.75124534222396 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0068497648993244 ENSG00000142089:ENST00000399808:exon_320565_321050:IFITM3;ENSG00000142089:ENST00000526811:exon_320565_320772:IFITM3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 2016659 T/C 0 8 0 8 3.83416356148264 0 3.83416356148264 T T 10 0.52072955481467 0.00819011697530837 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 2016662 T/C 0 9 0 9 4.31343400666797 0 4.31343400666797 T T 10 0.52072955481467 0.00414942019491893 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 3028140 G/A 1 48 60 108 23.0049813688958 31.2437732888802 -8.23879191998436 A:G G A 10 0.52072955481467 0.123395023459091 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000484484:exon_3028109_3028240:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000466442:exon_3028109_3030127:CARS;ENSG00000110619:ENST00000470221:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3028109_3028189:CARS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 6588228 G/A 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 A:G G A 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6588155_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525080:exon_6588155_6588582:DNHD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 6622218 G/A 1 10 5 15 4.7927044518533 2.60364777407335 2.18905667777995 A:G G A 10 0.52072955481467 0.308037122491406 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622156_6622285:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000526352:exon_6622156_6622534:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 6622714 G/A 1 19 28 47 9.10613845852127 14.5804275348108 -5.47428907628949 A:G G A 10 0.52072955481467 0.143517569827338 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 10521764 T/C 1 18 19 37 8.62686801333594 9.89386154147873 -1.26699352814279 T:C T C 10 0.52072955481467 0.743209181591739 ENSG00000133805:ENST00000256183:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000444303:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396554:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000534047:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396553:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529834:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000431080:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000528723:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529507:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000530864:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529744:exon_10521732_10521796:AMPD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 10555589 A/G 1 7 8 15 3.35489311629731 4.16583643851736 -0.81094332222005 A:G A G 10 0.52072955481467 0.797925780414529 ENSG00000110315:ENST00000265981:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000528665:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000533412:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000530156:exon_10555563_10555752:RNF141 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 11292700 G/C 1 9 9 18 4.31343400666797 4.68656599333203 -0.37313198666406 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 11964292 G/A 1 26 25 51 12.4610315748186 13.0182388703667 -0.557207295548169 A:G G A 10 0.52072955481467 0.88948472920142 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11963882_11964659:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11963882_11964659:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11963882_11964659:USP47;ENSG00000170242:ENST00000525078:exon_11963882_11964696:USP47 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 17095967 T/A 1 89 78 167 42.6550696214944 40.6169052755443 2.03816434595011 A:T:C T A 10 0.52072955481467 0.757475766156660 ENSG00000110700:ENST00000531008:exon_17095936_17096013:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000531908:exon_17095936_17096013:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000228140:exon_17095936_17096013:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000526895:exon_17095936_17096013:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000525634:exon_17095936_17096013:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000525828:exon_17095940_17096013:RPS13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 17111272 A/G 1 14 6 20 6.70978623259462 3.12437732888802 3.5854089037066 A:C:G A G 10 0.52072955481467 0.121539458049168 ENSG00000011405:ENST00000265970:exon_17108119_17111467:PIK3C2A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 33065394 C/T 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000176148:ENST00000532687:exon_33065296_33065658:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33065301_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528898:exon_33065296_33065482:TCP11L1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 33112141 A/G 1 14 14 28 6.70978623259462 7.29021376740538 -0.580427534810759 A:G A G 10 0.52072955481467 0.852057573756229 ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33112078_33112273:CSTF3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 33881043 G/A 1 44 29 73 21.0878995881545 15.1011570896254 5.98674249852909 A:G G A 10 0.52072955481467 0.197220929942700 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 35201842 C/T 1 364 286 650 174.45444204746 148.928652676996 25.5257893704645 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0453349154331116 ENSG00000026508:ENST00000263398:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000360158:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000449691:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528086:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433892:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000434472:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000352818:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000442151:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525211:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526669:exon_35201821_35201876:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526000:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000279452:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000527889:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531118:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528455:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531873:exon_35201826_35201954:CD44 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 43876698 C/T 1 62 15 77 29.7147676014905 7.81094332222005 21.9038242792704 T:C C T 10 0.52072955481467 2.73317670262032e-07 ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 28 34 62 13.4195724651892 17.7048048636988 -4.28523239850954 A:G A G 10 0.52072955481467 0.309828427609089 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 45975130 C/T 1 16 8 24 7.66832712296528 4.16583643851736 3.50249068444792 T:C C T 10 0.52072955481467 0.219527027886609 ENSG00000135365:ENST00000257821:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527401:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000323180:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000418153:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527753:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000534766:exon_45975078_45975166:PHF21A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 47270255 C/T 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000134575:ENST00000256997:exon_47270227_47270457:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000529444:exon_47270227_47270353:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000534448:exon_47270227_47270367:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000527256:exon_47270227_47270370:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000531004:exon_47270227_47270365:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000531547:exon_47270227_47270365:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000529663:exon_47270227_47270391:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000530453:exon_47270227_47270356:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000444355:exon_47270227_47270367:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000529788:exon_47270227_47270365:ACP2;ENSG00000025434:ENST00000495866:exon_47270190_47270415:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000527464:exon_47270190_47270415:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000529540:exon_47270231_47270415:NR1H3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 47303275 T/C 1 10 8 18 4.7927044518533 4.16583643851736 0.62686801333594 T:C T C 10 0.52072955481467 0.817378948970493 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000489415:exon_47303126_47303304:MADD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 47306585 G/A 1 13 8 21 6.23051578740929 4.16583643851736 2.06467934889193 A:G G A 10 0.52072955481467 0.391931055698548 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000524530:exon_47306497_47306616:MADD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 47311023 A/C 1 12 10 22 5.75124534222396 5.2072955481467 0.54394979407726 A:C A C 10 0.52072955481467 0.834964721023274 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47310942_47311044:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47310942_47311044:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47310942_47311044:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47310942_47311044:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47310942_47311044:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47310942_47311044:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47310942_47311044:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47310942_47311044:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47310942_47311044:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47310942_47311044:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47310942_47311044:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47310942_47311044:MADD;ENSG00000110514:ENST00000524530:exon_47310942_47311044:MADD;ENSG00000110514:ENST00000524686:exon_47310942_47311044:MADD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 47640429 G/C 1 34 32 66 16.2951951363012 16.6633457540694 -0.368150617768219 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000109919:ENST00000302503:exon_47638868_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000534074:exon_47640256_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000531669:exon_47640262_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000525649:exon_47640391_47640471:MTCH2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 57080882 C/T 1 6 11 17 2.87562267111198 5.72802510296137 -2.85240243184939 T:C C T 10 0.52072955481467 0.224918141362531 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 57509690 G/A 1 241 250 491 115.504177289665 130.182388703667 -14.678211414003 A:G G A 10 0.52072955481467 0.190359835365285 ENSG00000211450:ENST00000534355:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000533321:exon_57509281_57510529:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000388857:exon_57509589_57510129:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000528798:exon_57509589_57509699:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000534386:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000254732:ENST00000531074:exon_57509635_57509719:RP11-691N7.6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 58959633 G/A 1 8 14 22 3.83416356148264 7.29021376740538 -3.45605020592274 A:G G A 10 0.52072955481467 0.199452613384147 ENSG00000110042:ENST00000532982:exon_58959571_58959723:DTX4;ENSG00000110042:ENST00000227451:exon_58959571_58959723:DTX4;ENSG00000110042:ENST00000531902:exon_58959571_58959724:DTX4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 60610056 G/C 1 44 55 99 21.0878995881545 28.6401255148068 -7.55222592665233 C:G G C 10 0.52072955481467 0.132453126813700 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 60610065 G/A 1 46 40 86 22.0464404785252 20.8291821925868 1.21725828593838 A:G G A 10 0.52072955481467 0.829617964186974 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 182 118 300 87.2272210237301 61.4460874681311 25.781133555599 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00314957394119535 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 60673868 T/C 1 69 81 150 33.0696607177878 42.1790939399883 -9.1094332222005 T:C T C 10 0.52072955481467 0.141831370638793 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60673836_60674056:PRPF19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 60701136 C/G 1 1 14 15 0.47927044518533 7.29021376740538 -6.81094332222005 C:G C G 10 0.52072955481467 0.000335830005056366 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60701014_60701216:TMEM132A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 60703777 G/A 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 60704213 C/T 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 60899767 A/G 1 12 10 22 5.75124534222396 5.2072955481467 0.54394979407726 A:G A G 10 0.52072955481467 0.834964721023274 ENSG00000167987:ENST00000301765:exon_60897730_60900011:VPS37C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 61165280 G/A 1 12 6 18 5.75124534222396 3.12437732888802 2.62686801333594 A:G G A 10 0.52072955481467 0.245162799745609 ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165246_61165447:TMEM216;ENSG00000187049:ENST00000398979:exon_61165246_61165447:TMEM216 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 61179285 G/A 1 30 19 49 14.3781133555599 9.89386154147873 4.48425181408117 A:G G A 10 0.52072955481467 0.252467845594794 ENSG00000149532:ENST00000340437:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000394888:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000439958:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000477890:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000448745:exon_61179241_61179409:CPSF7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 61914369 C/T 1 11 12 23 5.27197489703863 6.24875465777604 -0.97677976073741 T:C C T 10 0.52072955481467 0.835284067578657 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61914130_61914374:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61914130_61914374:INCENP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 62293948 G/A 1 8 10 18 3.83416356148264 5.2072955481467 -1.37313198666406 A:G G A 10 0.52072955481467 0.638802194234348 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 62458275 T/C 1 39 39 78 18.6915473622279 20.3084526377721 -1.61690527554426 A:T:C T C 10 0.52072955481467 0.734977891226413 ENSG00000168000:ENST00000405837:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000433053:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000403734:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000470529:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000278893:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000360796:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000463679:exon_62458259_62458814:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000403550:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000407022:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000301781:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000421906:exon_62458259_62458339:BSCL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 62496519 T/C 1 31 46 77 14.8573838007452 23.9535595214748 -9.09617572072959 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0402536389254695 ENSG00000162222:ENST00000530625:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000294161:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62496011_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62496295_62496558:TTC9C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 62505764 C/T 1 17 19 36 8.14759756815061 9.89386154147873 -1.74626397332812 T:C C T 10 0.52072955481467 0.618468395501587 ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62505760_62506108:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62505760_62506075:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532276:exon_62505760_62505962:TTC9C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 62564009 T/C 1 47 42 89 22.5257109237105 21.8706413022161 0.655069621494373 T:C T C 10 0.52072955481467 0.915839702029536 ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533048:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000530875:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533440:exon_62563932_62564035:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531872:exon_62563932_62564039:NXF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 63585804 C/A 1 48 33 81 23.0049813688958 17.1840753088841 5.82090606001173 A:C C A 10 0.52072955481467 0.221403192084580 ENSG00000168005:ENST00000294244:exon_63585688_63585837:C11orf84 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 63713317 G/A 1 2 12 14 0.95854089037066 6.24875465777604 -5.29021376740538 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00566799789247379 ENSG00000110583:ENST00000377793:exon_63713312_63713407:NAA40;ENSG00000110583:ENST00000338447:exon_63713312_63713407:NAA40;ENSG00000110583:ENST00000456907:exon_63713306_63713347:NAA40 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 63767186 A/G 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 A:G A G 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000133315:ENST00000255681:exon_63767114_63767235:MACROD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64026144 G/A 1 12 8 20 5.75124534222396 4.16583643851736 1.5854089037066 A:G G A 10 0.52072955481467 0.510829655044723 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64025945_64026185:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64025945_64026185:PLCB3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64034911 G/A 1 7 11 18 3.35489311629731 5.72802510296137 -2.37313198666406 A:G G A 10 0.52072955481467 0.346420367518563 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64034825_64035394:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64034825_64035394:PLCB3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64085002 G/A 1 102 98 200 48.8855854089037 51.0314963718377 -2.145910962934 A:G G A 10 0.52072955481467 0.777435333041756 ENSG00000173113:ENST00000308774:exon_64084921_64085033:TRMT112 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64109118 T/G 1 20 21 41 9.5854089037066 10.9353206511081 -1.34991174740147 T:G T G 10 0.52072955481467 0.755213277513956 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64109208 G/C 1 24 39 63 11.5024906844479 20.3084526377721 -8.80596195332421 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0314642170270348 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64111928 T/C 1 52 48 100 24.9220631496372 24.9950186311042 -0.0729554814669982 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64124515 T/C 1 100 81 181 47.927044518533 42.1790939399883 5.74795057854473 T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.413612691031516 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64124511_64125006:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64124511_64124958:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64124511_64124997:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64124511_64125002:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64122666_64125000:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64124511_64124842:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000472524:exon_64124511_64125003:CCDC88B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64138805 T/C 1 18 17 35 8.62686801333594 8.85240243184939 -0.225534418513449 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64138755_64138813:RPS6KA4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64138905 T/G 1 11 17 28 5.27197489703863 8.85240243184939 -3.58042753481076 T:G T G 10 0.52072955481467 0.189855934010188 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64572018 T/C 1 32 46 78 15.3366542459306 23.9535595214748 -8.61690527554426 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0542709692426744 ENSG00000133895:ENST00000377316:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64571806_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64571847_64572288:MEN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64680819 G/A 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64680738_64680867:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64680738_64680873:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64680738_64680873:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000227459:exon_64680738_64680873:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000461701:exon_64680738_64681972:ATG2A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64799998 T/C 1 15 18 33 7.18905667777995 9.37313198666406 -2.18407530888411 T:C T C 10 0.52072955481467 0.488782681892328 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000525648:exon_64799903_64800023:SNX15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64877197 C/T 1 196 148 344 93.9370072563247 77.0679741125712 16.8690331437535 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0748243418283526 ENSG00000149823:ENST00000279281:exon_64877177_64877395:C11orf2;ENSG00000149823:ENST00000527646:exon_64877177_64877395:C11orf2;ENSG00000149823:ENST00000531146:exon_64877177_64877329:C11orf2;ENSG00000149823:ENST00000533827:exon_64877177_64877395:C11orf2;ENSG00000149823:ENST00000534591:exon_64877177_64878075:C11orf2;ENSG00000149823:ENST00000526856:exon_64877177_64877395:C11orf2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64880743 C/T 1 13 10 23 6.23051578740929 5.2072955481467 1.02322023926259 T:C C T 10 0.52072955481467 0.683682381961274 ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000524986:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64880283_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000345348:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529414:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000524690:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530892:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531029:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527851:exon_64880211_64881066:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534667:exon_64880686_64880886:TM7SF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64893365 T/A 1 33 36 69 15.8159246911159 18.7462639733281 -2.93033928221223 A:T:G T A 10 0.52072955481467 0.54722202617951 ENSG00000149792:ENST00000524482:exon_64893198_64894828:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000528529:exon_64893198_64893774:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000534078:exon_64893198_64893476:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000526319:exon_64893198_64893414:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000279242:exon_64893198_64894843:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000533943:exon_64893198_64893650:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000532671:exon_64893198_64894835:MRPL49 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 84 69 153 40.2587173955677 35.9303392822122 4.32837811335549 T:C C T 10 0.52072955481467 0.517755443659563 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 65161525 G/A 1 11 15 26 5.27197489703863 7.81094332222005 -2.53896842518142 A:G G A 10 0.52072955481467 0.333843435098941 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000526201:exon_65161512_65161570:FRMD8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 65164357 C/T 1 9 12 21 4.31343400666797 6.24875465777604 -1.93532065110807 T:C C T 10 0.52072955481467 0.513471758577479 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65164270_65164408:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000531151:exon_65164270_65164491:FRMD8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 65168281 C/T 1 18 16 34 8.62686801333594 8.33167287703472 0.295195136301221 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65168195_65168338:FRMD8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 65269349 C/G 1 130 183 313 62.3051578740929 95.2935085310846 -32.9883506569917 A:C:G C G 10 0.52072955481467 0.000224712673381164 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 65338944 T/G 1 72 73 145 34.5074720533438 38.0132575014709 -3.50578544812715 T:G T G 10 0.52072955481467 0.562058064949124 ENSG00000173465:ENST00000309328:exon_65338862_65339241:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65338862_65339359:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000526877:exon_65338862_65339329:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000533115:exon_65338862_65339250:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527413:exon_65338862_65339239:SSSCA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 44 41 85 21.0878995881545 21.3499117474015 -0.26201215924695 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 27 47 74 12.9403020200039 24.4742890762895 -11.5339870562856 T:G T G 10 0.52072955481467 0.0074289400954418 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 46 33 79 22.0464404785252 17.1840753088841 4.86236516964107 A:G G A 10 0.52072955481467 0.311116295433363 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 65367031 C/T 1 67 65 132 32.1111198274171 33.8474210629536 -1.73630123553644 T:C C T 10 0.52072955481467 0.794128522266537 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000532507:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000530153:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524848:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000534432:exon_65366922_65367239:MAP3K11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 65380916 G/A 1 30 28 58 14.3781133555599 14.5804275348108 -0.202314179250859 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65380489_65381713:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524856:exon_65380489_65382853:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000527304:exon_65376103_65381707:MAP3K11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 65384727 C/T 1 17 13 30 8.14759756815061 6.76948421259071 1.3781133555599 T:C C T 10 0.52072955481467 0.715813234813189 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65384721_65384820:PCNXL3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 65387012 C/T 1 21 16 37 10.0646793488919 8.33167287703472 1.73300647185721 T:C C T 10 0.52072955481467 0.623713104808598 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65387008_65387131:PCNXL3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 65387378 T/A 1 9 9 18 4.31343400666797 4.68656599333203 -0.37313198666406 A:T T A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65387225_65387403:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000531045:exon_65387329_65387403:PCNXL3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 67034266 C/A 1 35 24 59 16.7744655814866 12.4975093155521 4.27695626593447 A:C C A 10 0.52072955481467 0.298087720961676 ENSG00000173020:ENST00000308595:exon_67033881_67034283:ADRBK1;ENSG00000173020:ENST00000526285:exon_67033952_67034283:ADRBK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 67120530 C/G 1 192 195 387 92.0199254755834 101.542263188861 -9.52233771327728 C:G C G 10 0.52072955481467 0.334259483736472 ENSG00000175482:ENST00000529704:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000533429:exon_67120162_67120549:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000530584:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000312419:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000532830:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000534515:exon_67119024_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000528087:exon_67119036_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000531239:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000524743:exon_67120459_67120631:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000525255:exon_67119995_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000529000:exon_67120364_67120582:POLD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 67164791 T/C 1 12 9 21 5.75124534222396 4.68656599333203 1.06467934889193 T:C T C 10 0.52072955481467 0.669361120839622 ENSG00000172613:ENST00000307980:exon_67164650_67164857:RAD9A;ENSG00000172613:ENST00000529100:exon_67164650_67164861:RAD9A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 67165015 T/C 1 20 22 42 9.5854089037066 11.4560502059227 -1.87064130221614 T:C T C 10 0.52072955481467 0.643866969057701 ENSG00000172613:ENST00000307980:exon_67164935_67165880:RAD9A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 67171736 C/T 1 31 28 59 14.8573838007452 14.5804275348108 0.276956265934471 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67171662_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67171600_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67171658_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67171660_67171825:TBC1D10C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 76 64 140 36.4245538340851 33.3266915081389 3.0978623259462 T:C C T 10 0.52072955481467 0.612840634342264 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 49 39 88 23.4842518140812 20.3084526377721 3.17579917630904 T:C C T 10 0.52072955481467 0.523411841468682 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 67205978 G/A 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:G G A 10 0.52072955481467 0.728437659058648 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 67209515 C/T 1 30 18 48 14.3781133555599 9.37313198666406 5.00498136889584 T:C C T 10 0.52072955481467 0.193020736077068 ENSG00000172725:ENST00000393893:exon_67209437_67209559:CORO1B;ENSG00000172725:ENST00000341356:exon_67209437_67209559:CORO1B;ENSG00000172725:ENST00000393886:exon_67209437_67209559:CORO1B;ENSG00000172725:ENST00000453768:exon_67209437_67209559:CORO1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 67209869 T/G 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 T:G T G 10 0.52072955481467 0.728437659058648 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 67351585 C/G 1 10 8 18 4.7927044518533 4.16583643851736 0.62686801333594 C:G C G 10 0.52072955481467 0.817378948970493 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 820 480 1300 393.001765051971 249.950186311042 143.051578740929 A:C:G A G 10 0.52072955481467 1.57136496001135e-15 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 67353970 T/C 1 1117 707 1824 535.345087272014 368.155795253972 167.189292018042 T:C:G T C 10 0.52072955481467 3.51011290320362e-15 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 21 13 34 10.0646793488919 6.76948421259071 3.29519513630122 T:C C T 10 0.52072955481467 0.304385840178127 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 67812467 C/T 1 66 61 127 31.6318493822318 31.7645028436949 -0.132653461463089 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000110719:ENST00000265686:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000532635:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000525724:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000528981:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000533005:exon_67812425_67812569:TCIRG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 68030015 C/T 1 46 51 97 22.0464404785252 26.5572072955482 -4.51076681702299 T:C C T 10 0.52072955481467 0.362693724299102 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 68030173 C/A 1 33 26 59 15.8159246911159 13.5389684251814 2.27695626593447 A:C C A 10 0.52072955481467 0.603322273326783 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 70118489 G/A 1 2 7 9 0.95854089037066 3.64510688370269 -2.68656599333203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0972167926377697 ENSG00000131626:ENST00000253925:exon_70118279_70118542:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000389547:exon_70118279_70118542:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000532504:exon_70118279_70118542:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530746:exon_70118279_70118542:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000532024:exon_70118013_70118542:PPFIA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 70221160 A/G 1 8 7 15 3.83416356148264 3.64510688370269 0.18905667777995 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000131626:ENST00000253925:exon_70221024_70221199:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000389547:exon_70221024_70221199:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000532504:exon_70221024_70221199:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526262:exon_70221024_70221199:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530548:exon_70221024_70221199:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000531657:exon_70221024_70221199:PPFIA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 44 59 103 21.0878995881545 30.7230437340655 -9.63514414591101 A:G G A 10 0.52072955481467 0.061122789123532 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 71155171 C/T 1 35 49 84 16.7744655814866 25.5157481859188 -8.74128260443228 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0631765376460535 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 19 17 36 9.10613845852127 8.85240243184939 0.253736026671881 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 72397200 C/T 1 29 43 72 13.8988429103746 22.3913708570308 -8.49252794665624 T:C C T 10 0.52072955481467 0.058367904455259 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72397087_72397236:ARAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 72415329 G/A 1 26 15 41 12.4610315748186 7.81094332222005 4.65008825259853 A:G G A 10 0.52072955481467 0.161283807581287 ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000340247:exon_72415197_72415379:ARAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 72535805 T/C 1 9 10 19 4.31343400666797 5.2072955481467 -0.89386154147873 T:C T C 10 0.52072955481467 0.819317260655474 ENSG00000168010:ENST00000321297:exon_72535779_72535887:ATG16L2;ENSG00000168010:ENST00000435507:exon_72535779_72535887:ATG16L2;ENSG00000168010:ENST00000439504:exon_72533893_72535887:ATG16L2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 73106327 C/T 1 25 24 49 11.9817611296333 12.4975093155521 -0.515748185918829 T:C C T 10 0.52072955481467 0.887471056433241 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73106132_73106330:RELT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 118 117 235 56.5539125318689 60.9253579133164 -4.37144538144744 A:G G A 10 0.52072955481467 0.601584253045443 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 73796917 C/T 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000168014:ENST00000334126:exon_73796663_73796931:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313663:exon_73796663_73796931:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313681:exon_73796663_73796931:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000289350:exon_73796663_73796931:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000414160:exon_73796663_73796931:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000442398:exon_73796663_73796931:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000415191:exon_73796663_73796931:C2CD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 75160575 G/A 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000158555:ENST00000526177:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000527820:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533784:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000529721:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000336898:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533805:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000376282:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443415:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443276:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000527322:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533911:exon_75160562_75160655:GDPD5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 75277757 C/G 1 3 14 17 1.43781133555599 7.29021376740538 -5.85240243184939 C:G C G 10 0.52072955481467 0.00591487166080978 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 75279846 C/T 1 10 13 23 4.7927044518533 6.76948421259071 -1.97677976073741 T:C C T 10 0.52072955481467 0.532250778549921 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 10 18 28 4.7927044518533 9.37313198666406 -4.58042753481076 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0909379654239063 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 77378388 T/C 1 21 19 40 10.0646793488919 9.89386154147873 0.170817807413201 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 77378505 A/G 1 18 14 32 8.62686801333594 7.29021376740538 1.33665424593056 A:G A G 10 0.52072955481467 0.724623430309991 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 77409568 T/C 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 T:C T C 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531026:exon_77409532_77409573:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531768:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000532556:exon_77409532_77409738:RSF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 77790655 G/C 1 81 40 121 38.8209060600117 20.8291821925868 17.9917238674249 C:G G C 10 0.52072955481467 0.00101358083795945 ENSG00000151366:ENST00000528251:exon_77790625_77790890:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000530054:exon_77790625_77790911:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000281031:exon_77790625_77791265:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000527806:exon_77790625_77790887:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000534029:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000525085:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000528164:exon_77790625_77790907:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000324742:exon_77790625_77790931:NDUFC2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 77920563 G/T 1 2 7 9 0.95854089037066 3.64510688370269 -2.68656599333203 T:G G T 10 0.52072955481467 0.0972167926377697 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530521:exon_77920494_77920597:USP35 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 77920863 C/A 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 A:C C A 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 77920930 A/G 1 7 8 15 3.35489311629731 4.16583643851736 -0.81094332222005 A:G A G 10 0.52072955481467 0.797925780414529 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 77924870 C/T 1 5 12 17 2.39635222592665 6.24875465777604 -3.85240243184939 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0870960062083928 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77924692_77925072:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77924692_77925184:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77924692_77925757:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77924692_77925465:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77924692_77925753:USP35 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 77930345 T/C 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 T:C T C 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000033327:ENST00000304401:exon_77926342_77930461:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000340149:exon_77926343_77930461:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000361507:exon_77926343_77930461:GAB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 77936166 A/G 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 A:G A G 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000033327:ENST00000304401:exon_77936154_77936248:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000340149:exon_77936154_77936248:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000361507:exon_77936154_77936248:GAB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 77937800 G/A 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 A:G G A 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000033327:ENST00000304401:exon_77937511_77938097:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000340149:exon_77937511_77938097:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000361507:exon_77937511_77938097:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000528329:exon_77937666_77938097:GAB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 78277277 A/G 1 2 8 10 0.95854089037066 4.16583643851736 -3.2072955481467 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0565144613350746 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000525345:exon_78277178_78277313:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78277178_78277318:NARS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 78279790 T/G 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 T:G T G 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000526709:exon_78279761_78279798:NARS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 82535963 C/T 1 19 19 38 9.10613845852127 9.89386154147873 -0.787723082957459 T:C:G C T 10 0.52072955481467 0.87154498790441 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82534544_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532767:exon_82535409_82542480:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82535410_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82535415_82536164:PRCP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 85374993 C/T 1 15 12 27 7.18905667777995 6.24875465777604 0.94030202000391 T:C:G C T 10 0.52072955481467 0.8478003207822 ENSG00000137504:ENST00000490820:exon_85374568_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000528561:exon_85374568_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000260058:exon_85374859_85375697:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527529:exon_85374859_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000525639:exon_85374859_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000398294:exon_85374859_85375269:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527447:exon_85372110_85376146:CREBZF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 8 14 22 3.83416356148264 7.29021376740538 -3.45605020592274 C:G C G 10 0.52072955481467 0.199452613384147 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 96116444 T/C 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 T:C T C 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96113701_96116637:CCDC82 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 C:G G C 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 107299623 A/C 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:C A C 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 107992346 G/C 1 13 10 23 6.23051578740929 5.2072955481467 1.02322023926259 C:G G C 10 0.52072955481467 0.683682381961274 ENSG00000075239:ENST00000265838:exon_107992243_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000524833:exon_107992294_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000299355:exon_107992294_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000531813:exon_107992311_107992405:ACAT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 111724133 C/T 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527714:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111724103_111724208:FDXACB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 111896324 C/T 1 15 19 34 7.18905667777995 9.89386154147873 -2.70480486369878 T:C C T 10 0.52072955481467 0.393262168513200 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111896320_111896475:DLAT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 111908162 T/C 1 29 29 58 13.8988429103746 15.1011570896254 -1.20231417925086 T:C T C 10 0.52072955481467 0.793481554935362 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111907997_111908184:DLAT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 114320725 G/A 1 8 2 10 3.83416356148264 1.04145910962934 2.7927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.112396421350563 ENSG00000076043:ENST00000265881:exon_114320568_114320998:REXO2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 30 20 50 14.3781133555599 10.4145910962934 3.9635222592665 T:C C T 10 0.52072955481467 0.321861906900029 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 117063003 G/A 1 13 18 31 6.23051578740929 9.37313198666406 -3.14261619925477 A:G G A 10 0.52072955481467 0.284278075165481 ENSG00000149577:ENST00000324225:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000278951:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000529441:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000431081:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000529484:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000525065:exon_117062970_117063078:SIDT2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 18 39 57 8.62686801333594 20.3084526377721 -11.6815846244362 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00211755993241274 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 117282800 G/T 1 17 13 30 8.14759756815061 6.76948421259071 1.3781133555599 T:G G T 10 0.52072955481467 0.715813234813189 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117282788_117283984:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117282788_117283984:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117282788_117283059:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117282788_117283982:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000528706:exon_117282788_117283055:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533433:exon_117282788_117283546:CEP164 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 117859209 G/A 1 11 9 20 5.27197489703863 4.68656599333203 0.5854089037066 A:G G A 10 0.52072955481467 0.826808206154088 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000531365:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117857452_117859217:IL10RA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 117864047 A/G 1 17 9 26 8.14759756815061 4.68656599333203 3.46103157481858 A:G A G 10 0.52072955481467 0.238474281795361 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534335:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117863723_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117863773_117864125:IL10RA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 118919206 T/C 1 169 145 314 80.9967052363208 75.5057854481271 5.49091978819364 T:C T C 10 0.52072955481467 0.572268421157124 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531682:exon_118919069_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919184_118919275:HYOU1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 118940957 C/G 1 27 22 49 12.9403020200039 11.4560502059227 1.48425181408117 C:G C G 10 0.52072955481467 0.775270562441899 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 118949331 C/T 1 16 13 29 7.66832712296528 6.76948421259071 0.898842910374571 T:C C T 10 0.52072955481467 0.853126532704154 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 32 35 67 15.3366542459306 18.2255344185134 -2.88888017258289 A:G A G 10 0.52072955481467 0.541378591700862 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 118955716 A/C 1 5 8 13 2.39635222592665 4.16583643851736 -1.76948421259071 A:C A C 10 0.52072955481467 0.409410722535207 ENSG00000149397:ENST00000278715:exon_118955587_118955776:HMBS;ENSG00000149397:ENST00000442944:exon_118955624_118955776:HMBS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 120350819 A/G 1 7 14 21 3.35489311629731 7.29021376740538 -3.93532065110807 A:G A G 10 0.52072955481467 0.124425931676223 ENSG00000196914:ENST00000397843:exon_120350669_120351139:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000356641:exon_120350669_120351139:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000532993:exon_120350669_120351139:ARHGEF12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 121448090 T/G 1 7 17 24 3.35489311629731 8.85240243184939 -5.49750931555208 T:G T G 10 0.52072955481467 0.0387535911546428 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121447990_121448109:SORL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 121475922 T/A 1 10 18 28 4.7927044518533 9.37313198666406 -4.58042753481076 A:T T A 10 0.52072955481467 0.0909379654239063 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 122653801 C/T 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000154127:ENST00000284273:exon_122653761_122653930:UBASH3B;ENSG00000154127:ENST00000530917:exon_122653761_122653930:UBASH3B;ENSG00000154127:ENST00000529998:exon_122653761_122653930:UBASH3B;ENSG00000154127:ENST00000526493:exon_122653072_122653930:UBASH3B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 124955032 T/C 1 5 8 13 2.39635222592665 4.16583643851736 -1.76948421259071 T:C T C 10 0.52072955481467 0.409410722535207 ENSG00000134955:ENST00000403796:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000407458:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000298280:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000526405:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000308074:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000525837:exon_124954962_124955035:SLC37A2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 23 18 41 11.0232202392626 9.37313198666406 1.65008825259853 C:G C G 10 0.52072955481467 0.64186927009697 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 7 9 16 3.35489311629731 4.68656599333203 -1.33167287703472 A:C C A 10 0.52072955481467 0.61923512047445 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 125769354 T/C 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 T:C T C 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 126074192 A/G 1 19 17 36 9.10613845852127 8.85240243184939 0.253736026671881 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000530903:exon_126074126_126074223:RPUSD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 126081403 T/C 1 11 9 20 5.27197489703863 4.68656599333203 0.5854089037066 T:C T C 10 0.52072955481467 0.826808206154088 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126081345_126081587:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126081345_126081541:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126081345_126081524:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000532674:exon_126081345_126081587:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000532800:exon_126081345_126081525:RPUSD4;ENSG00000197798:ENST00000533050:exon_126081309_126081725:FAM118B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 126138755 G/A 0 27 0 27 12.9403020200039 0 12.9403020200039 G G 10 0.52072955481467 2.46866464690100e-08 ENSG00000182934:ENST00000332118:exon_126138583_126138854:SRPR;ENSG00000182934:ENST00000532259:exon_126138583_126138877:SRPR;ENSG00000182934:ENST00000528744:exon_126138583_126138815:SRPR;ENSG00000182934:ENST00000530680:exon_126138583_126138762:SRPR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 126174164 C/T 1 44 54 98 21.0878995881545 28.1193959599922 -7.03149637183766 T:C C T 10 0.52072955481467 0.158396144533264 ENSG00000255062:ENST00000524964:exon_126174103_126174213:RP11-712L6.5;ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 128675292 T/A 1 13 19 32 6.23051578740929 9.89386154147873 -3.66334575406944 A:T T A 10 0.52072955481467 0.217975641066748 ENSG00000151702:ENST00000525560:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000344954:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000429175:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000527786:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000534087:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000281428:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000528790:exon_128673771_128677134:FLI1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 129754644 A/G 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 A:G A G 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000170322:ENST00000304521:exon_129754640_129754741:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000446488:exon_129754640_129754741:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524794:exon_129754640_129754777:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524746:exon_129754640_129754741:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000531755:exon_129754640_129754777:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000530278:exon_129754639_129754777:NFRKB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 130750642 A/C 1 2 8 10 0.95854089037066 4.16583643851736 -3.2072955481467 A:C A C 10 0.52072955481467 0.0565144613350746 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000527116:exon_130750517_130751036:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000426933:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530330:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130750517_130750701:SNX19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 130776524 T/C 1 14 17 31 6.70978623259462 8.85240243184939 -2.14261619925477 T:C T C 10 0.52072955481467 0.475988624180078 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130776520_130776616:SNX19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 130776613 A/G 1 14 9 23 6.70978623259462 4.68656599333203 2.02322023926259 A:G A G 10 0.52072955481467 0.414185612013738 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130776520_130776616:SNX19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 130780015 C/T 1 8 10 18 3.83416356148264 5.2072955481467 -1.37313198666406 T:C C T 10 0.52072955481467 0.638802194234348 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130779913_130780032:SNX19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 130784754 C/G 1 9 3 12 4.31343400666797 1.56218866444401 2.75124534222396 C:G C G 10 0.52072955481467 0.150146977653864 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 11 130784971 C/G 1 11 2 13 5.27197489703863 1.04145910962934 4.23051578740929 C:G C G 10 0.52072955481467 0.0239073326021939 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 990912 A/C 1 69 48 117 33.0696607177878 24.9950186311042 8.07464208668361 A:C A C 10 0.52072955481467 0.139668946840225 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_990858_990955:WNK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 993930 C/T 1 42 52 94 20.1293586977839 27.0779368503628 -6.94857815257898 T:C C T 10 0.52072955481467 0.179303301980419 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 994014 C/T 1 48 58 106 23.0049813688958 30.2023141792509 -7.19733281035502 T:C C T 10 0.52072955481467 0.173940749622280 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 35 37 72 16.7744655814866 19.2669935281428 -2.49252794665624 A:G A G 10 0.52072955481467 0.558258590612477 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 2973615 T/C 1 14 8 22 6.70978623259462 4.16583643851736 2.54394979407726 T:C T C 10 0.52072955481467 0.295404626091449 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 3046802 A/G 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 A:G A G 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000078246:ENST00000228245:exon_3046797_3046895:TULP3;ENSG00000078246:ENST00000448120:exon_3046797_3046895:TULP3;ENSG00000078246:ENST00000397132:exon_3046797_3046895:TULP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 3806147 T/C 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 T:C T C 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3805938_3806201:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3805938_3806201:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3805938_3806201:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3805938_3806201:EFCAB4B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 4388084 C/G 1 49 35 84 23.4842518140812 18.2255344185134 5.25871739556772 C:G C G 10 0.52072955481467 0.275469013382085 ENSG00000118971:ENST00000261254:exon_4387926_4388085:CCND2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 6560573 G/T 1 285 165 450 136.592076877819 85.9203765444205 50.6717003333985 T:G G T 10 0.52072955481467 1.71806262476645e-06 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6560434_6560884:CD27 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 6562768 G/C 1 20 8 28 9.5854089037066 4.16583643851736 5.41957246518924 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0566918972782301 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 71 57 128 34.0282016081584 29.6815846244362 4.34661698372224 T:C C T 10 0.52072955481467 0.479465963706057 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 6639981 C/G 1 77 77 154 36.9038242792704 40.0961757207296 -3.19235144145918 C:G C G 10 0.52072955481467 0.628962761972531 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6639857_6639983:NCAPD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 6640519 G/A 1 94 132 226 45.051421847421 68.7363012355364 -23.6848793881154 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00171446899301604 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6640493_6641120:NCAPD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 6643991 C/G 1 3891 4106 7997 1864.84130221612 2138.11555206903 -273.274249852916 A:T:C:G C G 10 0.52072955481467 9.78632833299077e-10 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000496049:exon_6643976_6644307:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6643976_6644157:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6643958_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6643985_6644027:GAPDH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 4006 3629 7635 1919.95740341243 1889.72755442244 30.2298489899947 A:T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.491931528342469 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 3929 4093 8022 1883.05357913316 2131.34606785644 -248.292488723283 A:T:C:G T C 10 0.52072955481467 2.95470279146545e-08 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 6657538 T/G 1 2 6 8 0.95854089037066 3.12437732888802 -2.16583643851736 T:G T G 10 0.52072955481467 0.164210754421108 ENSG00000010295:ENST00000488007:exon_6657231_6657711:IFFO1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 6690909 C/T 1 88 124 212 42.175799176309 64.5704647970191 -22.39466562071 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00241534593589027 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6690815_6690980:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6690815_6690980:CHD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 6760367 C/T 1 9 11 20 4.31343400666797 5.72802510296137 -1.4145910962934 T:C C T 10 0.52072955481467 0.655741219933051 ENSG00000111653:ENST00000341550:exon_6759446_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000444704:exon_6759705_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000396807:exon_6759757_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000437127:exon_6759757_6760392:ING4;ENSG00000111653:ENST00000435449:exon_6759757_6760392:ING4;ENSG00000111653:ENST00000446105:exon_6759792_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000486287:exon_6759957_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000484795:exon_6759990_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000482489:exon_6760131_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000469749:exon_6760178_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000472002:exon_6760180_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000488381:exon_6760262_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000495771:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000493144:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000472810:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000466221:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000423703:exon_6760361_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000412586:exon_6760361_6760400:ING4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 47 50 97 22.5257109237105 26.0364777407335 -3.51076681702299 A:C:G A G 10 0.52072955481467 0.47906878976843 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 6965502 G/A 1 48 41 89 23.0049813688958 21.3499117474015 1.65506962149437 A:G G A 10 0.52072955481467 0.751200751724928 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965469_6965614:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965469_6965614:USP5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 7022085 T/A 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:T T A 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 A:G A G 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 7046003 C/T 1 37 29 66 17.7330064718572 15.1011570896254 2.63184938223178 T:C C T 10 0.52072955481467 0.540054205306205 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7044710_7046724:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7044710_7046724:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000229279:exon_7045754_7046724:ATN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 7055860 T/C 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 T:C T C 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000111679:ENST00000399448:exon_7055740_7055902:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000416215:exon_7055754_7055902:PTPN6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 7090193 A/G 1 18 15 33 8.62686801333594 7.81094332222005 0.815924691115891 A:G A G 10 0.52072955481467 0.862375479002996 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7090166_7090344:LPCAT3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 7249598 T/C 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000139178:ENST00000266542:exon_7247153_7249759:C1RL;ENSG00000139178:ENST00000396661:exon_7249181_7249759:C1RL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 7280807 C/T 1 6 9 15 2.87562267111198 4.68656599333203 -1.81094332222005 T:C C T 10 0.52072955481467 0.44117550699482 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 10854718 G/A 1 108 192 300 51.7612080800156 99.9800745244166 -48.218866444401 A:G G A 10 0.52072955481467 2.32059555877371e-08 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10854559_10854733:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10854559_10854733:CSDA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 12967127 C/T 1 46 20 66 22.0464404785252 10.4145910962934 11.6318493822318 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00437335808061182 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000426619:exon_12967065_12967158:DDX47 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 14577892 A/T 1 8 1 9 3.83416356148264 0.52072955481467 3.31343400666797 A:T A T 10 0.52072955481467 0.0405156912184239 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14576843_14578407:ATF7IP;ENSG00000171681:ENST00000396279:exon_14576850_14578391:ATF7IP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 14587301 A/G 1 13 12 25 6.23051578740929 6.24875465777604 -0.0182388703667495 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14587271_14587357:ATF7IP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 14649196 A/G 1 32 33 65 15.3366542459306 17.1840753088841 -1.84742106295355 A:G A G 10 0.52072955481467 0.710037133115538 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14649165_14649277:ATF7IP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 19626205 T/C 1 9 18 27 4.31343400666797 9.37313198666406 -5.05969797999609 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0556408222394603 ENSG00000139154:ENST00000398864:exon_19626182_19626289:AEBP2;ENSG00000139154:ENST00000266508:exon_19626182_19626289:AEBP2;ENSG00000139154:ENST00000435841:exon_19626182_19626289:AEBP2;ENSG00000139154:ENST00000360995:exon_19626182_19626289:AEBP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 25242595 C/G 1 61 57 118 29.2354971563051 29.6815846244362 -0.446087468131061 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242548_25242611:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242548_25242611:LRMP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 87 91 178 41.6965287311237 47.386389488135 -5.68986075701125 C:G G C 10 0.52072955481467 0.409786093666887 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 26809316 G/A 1 8 10 18 3.83416356148264 5.2072955481467 -1.37313198666406 A:G G A 10 0.52072955481467 0.638802194234348 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26809230_26809481:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26809230_26809481:ITPR2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 26810816 T/G 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 T:G T G 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26810640_26810825:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26810640_26810825:ITPR2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 27863859 C/T 1 20 20 40 9.5854089037066 10.4145910962934 -0.829182192586799 T:C C T 10 0.52072955481467 0.874658284917496 ENSG00000061794:ENST00000081029:exon_27863729_27863888:MRPS35;ENSG00000061794:ENST00000321446:exon_27863777_27863888:MRPS35 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 31604928 G/C 1 11 11 22 5.27197489703863 5.72802510296137 -0.45605020592274 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 31605044 G/T 1 13 12 25 6.23051578740929 6.24875465777604 -0.0182388703667495 T:G G T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 31648826 C/T 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31648744_31648853:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31648744_31648853:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31648744_31648853:DENND5B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 32134815 G/A 1 11 9 20 5.27197489703863 4.68656599333203 0.5854089037066 A:G G A 10 0.52072955481467 0.826808206154088 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 32481093 G/C 1 10 10 20 4.7927044518533 5.2072955481467 -0.4145910962934 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000151746:ENST00000457150:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000281474:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000395758:exon_32480395_32481489:BICD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 44180295 G/A 1 2 8 10 0.95854089037066 4.16583643851736 -3.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0565144613350746 ENSG00000198001:ENST00000448290:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000431837:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000440781:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000356669:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000446056:exon_44180202_44180360:IRAK4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 46321514 A/T 1 16 10 26 7.66832712296528 5.2072955481467 2.46103157481858 A:T A T 10 0.52072955481467 0.433118121558513 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 48272895 A/G 1 10 5 15 4.7927044518533 2.60364777407335 2.18905667777995 A:G A G 10 0.52072955481467 0.308037122491406 ENSG00000111424:ENST00000395324:exon_48272751_48272898:VDR;ENSG00000111424:ENST00000229022:exon_48272751_48272898:VDR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 10 8 18 4.7927044518533 4.16583643851736 0.62686801333594 T:C C T 10 0.52072955481467 0.817378948970493 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 48539482 T/G 1 62 70 132 29.7147676014905 36.4510688370269 -6.73630123553643 T:G T G 10 0.52072955481467 0.25780597338207 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000312352:exon_48539347_48539488:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000443538:exon_48539347_48539887:PFKM HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 49255798 G/C 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000172602:ENST00000309739:exon_49255792_49255901:RND1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 49424534 G/A 1 14 14 28 6.70978623259462 7.29021376740538 -0.580427534810759 A:G G A 10 0.52072955481467 0.852057573756229 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49424384_49424551:MLL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 50848132 T/A 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 A:T T A 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000161813:ENST00000429001:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000398464:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000398473:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000293618:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000522085:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000518444:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000441650:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000518561:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000520064:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000347328:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000521120:exon_50848097_50848745:LARP4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 51112586 T/C 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 T:C T C 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000066084:ENST00000301180:exon_51112492_51112601:DIP2B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 51442944 G/A 1 18 16 34 8.62686801333594 8.33167287703472 0.295195136301221 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000050426:ENST00000262055:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000418425:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000448283:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380135:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380123:exon_51442817_51442968:LETMD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 54575458 T/C 1 14 8 22 6.70978623259462 4.16583643851736 2.54394979407726 T:C T C 10 0.52072955481467 0.295404626091449 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 22 21 43 10.5439497940773 10.9353206511081 -0.391370857030809 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 54675113 G/A 1 9 6 15 4.31343400666797 3.12437732888802 1.18905667777995 A:G G A 10 0.52072955481467 0.611940175630342 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 54676905 G/A 1 13 7 20 6.23051578740929 3.64510688370269 2.5854089037066 A:G G A 10 0.52072955481467 0.271400284316410 ENSG00000135486:ENST00000340913:exon_54676863_54677018:HNRNPA1;ENSG00000135486:ENST00000420780:exon_54676863_54677022:HNRNPA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 55806134 T/C 0 17 0 17 8.14759756815061 0 8.14759756815061 T T 10 0.52072955481467 1.89340112623079e-05 ENSG00000179899:ENST00000326184:exon_55805506_55808295:PHC1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 57106660 A/T 1 1829 1739 3568 876.585644243969 905.548695822711 -28.9630515787425 A:T:C:G A T 10 0.52072955481467 0.339542457068611 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57106570_57106692:NACA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 2232 2225 4457 1069.73163365366 1158.62325946264 -88.8916258089841 A:T:C:G A G 10 0.52072955481467 0.00795868094398992 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 57133140 T/G 1 11 11 22 5.27197489703863 5.72802510296137 -0.45605020592274 T:G T G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57133078_57133147:PRIM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 57870648 A/G 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 A:G A G 10 0.52072955481467 0.767073670700831 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 12 8 20 5.75124534222396 4.16583643851736 1.5854089037066 A:T T A 10 0.52072955481467 0.510829655044723 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 68052178 G/T 1 20 14 34 9.5854089037066 7.29021376740538 2.29519513630122 T:G G T 10 0.52072955481467 0.494188680133003 ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 45 33 78 21.5671700333398 17.1840753088841 4.38309472445574 A:G G A 10 0.52072955481467 0.364928417054248 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 72013832 A/G 1 8 8 16 3.83416356148264 4.16583643851736 -0.33167287703472 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72013706_72013904:ZFC3H1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 72164395 C/T 1 15 12 27 7.18905667777995 6.24875465777604 0.94030202000391 T:C C T 10 0.52072955481467 0.8478003207822 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 75900588 A/G 1 11 5 16 5.27197489703863 2.60364777407335 2.66832712296528 A:G A G 10 0.52072955481467 0.216398220878093 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75900562_75900696:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75900562_75900696:KRR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 19 16 35 9.10613845852127 8.33167287703472 0.774465581486551 C:G C G 10 0.52072955481467 0.866428368314304 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 2 8 10 0.95854089037066 4.16583643851736 -3.2072955481467 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0565144613350746 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 94972290 C/T 1 16 13 29 7.66832712296528 6.76948421259071 0.898842910374571 T:C C T 10 0.52072955481467 0.853126532704154 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94972170_94972305:TMCC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 94975799 G/A 1 15 20 35 7.18905667777995 10.4145910962934 -3.22553441851345 A:G G A 10 0.52072955481467 0.311944692649197 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 94976084 T/C 1 17 25 42 8.14759756815061 13.0182388703667 -4.87064130221614 T:C T C 10 0.52072955481467 0.164075854588464 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 94976159 T/C 1 16 18 34 7.66832712296528 9.37313198666406 -1.70480486369878 T:C T C 10 0.52072955481467 0.608859073396323 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 98928103 C/T 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 T:C C T 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000120802:ENST00000266732:exon_98926601_98928321:TMPO HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 99007623 C/T 1 10 8 18 4.7927044518533 4.16583643851736 0.62686801333594 T:C C T 10 0.52072955481467 0.817378948970493 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 102455729 G/A 1 14 17 31 6.70978623259462 8.85240243184939 -2.14261619925477 A:G G A 10 0.52072955481467 0.475988624180078 ENSG00000120860:ENST00000240079:exon_102455690_102455899:CCDC53 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 104327979 C/T 1 397 365 762 190.270366738576 190.066287507355 0.204079231221499 A:T:C:G C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000166598:ENST00000299767:exon_104327734_104328065:HSP90B1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 105433523 T/A 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 A:T T A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000136010:ENST00000258494:exon_105433491_105433584:ALDH1L2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 109017898 C/T 1 48 31 79 23.0049813688958 16.1426161992548 6.86236516964107 T:C C T 10 0.52072955481467 0.142954830193226 ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109017694_109018088:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 112191641 G/A 1 12 6 18 5.75124534222396 3.12437732888802 2.62686801333594 A:G G A 10 0.52072955481467 0.245162799745609 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000512792:exon_112191511_112191719:ACAD10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 112230413 G/A 1 16 11 27 7.66832712296528 5.72802510296137 1.94030202000391 A:G G A 10 0.52072955481467 0.5644014761963 ENSG00000111275:ENST00000261733:exon_112230402_112230586:ALDH2;ENSG00000111275:ENST00000416293:exon_112230402_112230586:ALDH2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 112460147 T/G 1 177 176 353 84.8308687978034 91.6484016473819 -6.8175328495785 T:C:G T G 10 0.52072955481467 0.488733754120634 ENSG00000089248:ENST00000261735:exon_112459954_112461024:ERP29;ENSG00000089248:ENST00000455836:exon_112459954_112461024:ERP29 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 112580071 C/T 1 11 21 32 5.27197489703863 10.9353206511081 -5.66334575406944 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0516397127802673 ENSG00000135148:ENST00000257604:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000412615:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000432758:exon_112579893_112580099:TRAFD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 10 15 25 4.7927044518533 7.81094332222005 -3.01823887036675 T:C C T 10 0.52072955481467 0.237337229008743 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 21 18 39 10.0646793488919 9.37313198666406 0.691547362227871 T:C T C 10 0.52072955481467 0.873630371447354 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 120884328 C/T 1 10 10 20 4.7927044518533 5.2072955481467 -0.4145910962934 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000111780:ENST00000229384:exon_120884284_120884364:GATC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 120966921 A/G 1 9 16 25 4.31343400666797 8.33167287703472 -4.01823887036675 A:G A G 10 0.52072955481467 0.114026931073522 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120966743_120966964:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120966743_120966953:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120966743_120966953:COQ5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 121018862 C/T 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 0.492394667760678 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 22 32 54 10.5439497940773 16.6633457540694 -6.11939595999218 A:G G A 10 0.52072955481467 0.103117281666921 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 30 30 60 14.3781133555599 15.6218866444401 -1.2437732888802 C:G G C 10 0.52072955481467 0.796710516997506 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 17 9 26 8.14759756815061 4.68656599333203 3.46103157481858 T:C T C 10 0.52072955481467 0.238474281795361 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 121666646 A/G 1 24 21 45 11.5024906844479 10.9353206511081 0.567170033339851 A:G A G 10 0.52072955481467 0.88267073819837 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121666528_121666669:P2RX4;ENSG00000135124:ENST00000359949:exon_121666528_121666669:P2RX4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 121691096 G/A 1 20 18 38 9.5854089037066 9.37313198666406 0.212276917042541 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121691076_121691275:CAMKK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 42 45 87 20.1293586977839 23.4328299666602 -3.30347126887629 T:C C T 10 0.52072955481467 0.520233983433465 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 60 61 121 28.7562267111198 31.7645028436949 -3.00827613257507 A:G G A 10 0.52072955481467 0.586682238885077 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 48 68 116 23.0049813688958 35.4096097273976 -12.4046283585017 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0253340633074943 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 75 81 156 35.9452833888998 42.1790939399883 -6.23381055108852 T:C T C 10 0.52072955481467 0.336665054433444 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 122186268 C/T 1 7 2 9 3.35489311629731 1.04145910962934 2.31343400666797 T:C C T 10 0.52072955481467 0.183068589600402 ENSG00000188735:ENST00000449592:exon_122186232_122186348:TMEM120B;ENSG00000188735:ENST00000342607:exon_122186232_122186348:TMEM120B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 122186317 G/A 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.347970315516692 ENSG00000188735:ENST00000449592:exon_122186232_122186348:TMEM120B;ENSG00000188735:ENST00000342607:exon_122186232_122186348:TMEM120B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 30 37 67 14.3781133555599 19.2669935281428 -4.88888017258289 A:G A G 10 0.52072955481467 0.271145816174993 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 122617989 A/G 1 2 9 11 0.95854089037066 4.68656599333203 -3.72802510296137 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0323592930418307 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122617982_122618077:MLXIP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 122618131 A/G 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 A:G A G 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122618129_122618689:MLXIP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 122626381 G/A 1 11 4 15 5.27197489703863 2.08291821925868 3.18905667777995 A:G G A 10 0.52072955481467 0.123192206125781 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122626238_122628963:MLXIP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 11 9 20 5.27197489703863 4.68656599333203 0.5854089037066 T:C C T 10 0.52072955481467 0.826808206154088 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 123645803 G/A 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 123799974 A/G 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 123806219 C/T 1 11 7 18 5.27197489703863 3.64510688370269 1.62686801333594 T:C C T 10 0.52072955481467 0.487529072791399 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123806082_123806279:SBNO1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 123810873 G/A 1 8 11 19 3.83416356148264 5.72802510296137 -1.89386154147873 A:G G A 10 0.52072955481467 0.492400577054298 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123810699_123810881:SBNO1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 124826462 C/T 1 52 31 83 24.9220631496372 16.1426161992548 8.77944695038239 T:C C T 10 0.52072955481467 0.061459312264894 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 124856660 T/A 1 42 39 81 20.1293586977839 20.3084526377721 -0.179093939988267 A:T T A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 125298877 G/A 1 59 35 94 28.2769562659345 18.2255344185134 10.051421847421 A:G G A 10 0.52072955481467 0.039199466367156 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125298748_125298951:SCARB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 125434580 C/T 1 20 35 55 9.5854089037066 18.2255344185134 -8.64012551480685 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0215949649364406 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434532_125434605:DHX37 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 125434716 G/A 1 20 23 43 9.5854089037066 11.9767797607374 -2.39137085703081 A:G G A 10 0.52072955481467 0.542181636891993 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434695_125434789:DHX37 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 125437019 T/C 1 31 20 51 14.8573838007452 10.4145910962934 4.44279270445183 T:C T C 10 0.52072955481467 0.262109355477484 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125436944_125437116:DHX37 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 125438516 T/C 1 29 14 43 13.8988429103746 7.29021376740538 6.60862914296919 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0475028061093485 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 125438523 C/T 1 25 15 40 11.9817611296333 7.81094332222005 4.1708178074132 T:C C T 10 0.52072955481467 0.207572100041063 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 125441359 T/C 1 33 34 67 15.8159246911159 17.7048048636988 -1.88888017258289 T:C T C 10 0.52072955481467 0.714117281942563 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 125448960 C/T 1 34 25 59 16.2951951363012 13.0182388703667 3.27695626593447 T:C C T 10 0.52072955481467 0.435482777253743 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 125467158 C/T 1 31 18 49 14.8573838007452 9.37313198666406 5.48425181408117 T:C C T 10 0.52072955481467 0.152054676421141 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125467057_125467169:DHX37 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 125587278 G/A 1 9 12 21 4.31343400666797 6.24875465777604 -1.93532065110807 A:G G A 10 0.52072955481467 0.513471758577479 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125587225_125587339:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125587225_125587339:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125587225_125587339:AACS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 125626685 C/T 1 22 32 54 10.5439497940773 16.6633457540694 -6.11939595999218 T:C C T 10 0.52072955481467 0.103117281666921 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125626638_125627871:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125626638_125627861:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125626638_125627861:AACS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 132508389 A/G 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132508322_132508486:EP400 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 132625960 G/A 1 22 32 54 10.5439497940773 16.6633457540694 -6.11939595999218 A:G G A 10 0.52072955481467 0.103117281666921 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132625820_132625965:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132625820_132625965:DDX51 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 22 27 49 10.5439497940773 14.0596979799961 -3.51574818591883 A:G G A 10 0.52072955481467 0.321254153252864 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 22 24 46 10.5439497940773 12.4975093155521 -1.95355952147482 T:C T C 10 0.52072955481467 0.658468619483023 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 133212582 G/A 1 12 8 20 5.75124534222396 4.16583643851736 1.5854089037066 A:G G A 10 0.52072955481467 0.510829655044723 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133212478_133212610:POLE HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 133219831 T/C 1 22 12 34 10.5439497940773 6.24875465777604 4.29519513630122 T:C T C 10 0.52072955481467 0.169930919837473 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133219810_133219916:POLE HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 133236000 C/T 1 15 7 22 7.18905667777995 3.64510688370269 3.54394979407726 T:C C T 10 0.52072955481467 0.141126288119375 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133235881_133236095:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133235881_133236095:POLE;ENSG00000177084:ENST00000376577:exon_133235881_133236095:POLE HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 133294371 A/G 1 62 50 112 29.7147676014905 26.0364777407335 3.67828986075696 A:G A G 10 0.52072955481467 0.509016210115319 ENSG00000176894:ENST00000454808:exon_133294296_133294384:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000317555:exon_133294296_133294384:PGAM5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 12 133331459 G/C 1 31 32 63 14.8573838007452 16.6633457540694 -1.80596195332421 C:G G C 10 0.52072955481467 0.705807666311002 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 19271676 A/T 0 35 0 35 16.7744655814866 0 16.7744655814866 A A 10 0.52072955481467 1.27234244085827e-10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 0 279 4 283 133.716454206707 2.08291821925868 131.633535987448 T:C T C 10 0.52072955481467 1.94403722419892e-72 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 21742311 C/T 0 29 0 29 13.8988429103746 0 13.8988429103746 C C 10 0.52072955481467 6.59554448105615e-09 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21742127_21742538:SKA3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 23906983 G/C 1 4 10 14 1.91708178074132 5.2072955481467 -3.29021376740538 C:G G C 10 0.52072955481467 0.107382582617767 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 23908034 A/G 1 3 8 11 1.43781133555599 4.16583643851736 -2.72802510296137 A:G A G 10 0.52072955481467 0.132783549738221 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 23929095 T/C 1 9 10 19 4.31343400666797 5.2072955481467 -0.89386154147873 T:C T C 10 0.52072955481467 0.819317260655474 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000423156:exon_23928658_23929622:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 23930055 A/T 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 A:T A T 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 25466955 T/C 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 25479541 A/C 1 8 7 15 3.83416356148264 3.64510688370269 0.18905667777995 A:C A C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 25486911 G/T 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 T:G G T 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25486720_25487229:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25486720_25487229:CENPJ HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 25876011 G/A 1 9 24 33 4.31343400666797 12.4975093155521 -8.18407530888411 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00485058067105893 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25875662_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000481980:exon_25875694_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000490231:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000480187:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000460326:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000465068:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25875771_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000495460:exon_25875783_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25875785_25876018:NUPL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 25901165 C/G 1 6 10 16 2.87562267111198 5.2072955481467 -2.33167287703472 C:G C G 10 0.52072955481467 0.318493089377623 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000394327:exon_25901054_25901172:NUPL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 26789638 T/C 1 31 25 56 14.8573838007452 13.0182388703667 1.83914493037848 T:C T C 10 0.52072955481467 0.688963758077531 ENSG00000127870:ENST00000468480:exon_26789611_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000498039:exon_26789276_26789729:RNF6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 26793644 T/C 1 19 12 31 9.10613845852127 6.24875465777604 2.85738380074523 T:C T C 10 0.52072955481467 0.369822219527132 ENSG00000127870:ENST00000468480:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000498039:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000476347:exon_26793433_26793804:RNF6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 28009920 G/C 1 12 11 23 5.75124534222396 5.72802510296137 0.0232202392625904 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 28866635 T/G 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 T:G T G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000152520:ENST00000380958:exon_28866519_28866676:PAN3;ENSG00000152520:ENST00000399613:exon_28866519_28869472:PAN3;ENSG00000152520:ENST00000399620:exon_28866519_28866659:PAN3;ENSG00000152520:ENST00000282391:exon_28866519_28869472:PAN3;ENSG00000152520:ENST00000380972:exon_28866519_28866859:PAN3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 30107067 G/C 1 12 18 30 5.75124534222396 9.37313198666406 -3.6218866444401 C:G G C 10 0.52072955481467 0.204170935491037 ENSG00000139514:ENST00000380752:exon_30106961_30107119:SLC7A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 31735675 G/T 1 22 28 50 10.5439497940773 14.5804275348108 -4.0364777407335 T:G G T 10 0.52072955481467 0.261150545214535 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31735613_31736064:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31735613_31736064:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31735613_31736064:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31735613_31736117:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31735613_31735761:HSPH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 34395390 A/T 1 18 16 34 8.62686801333594 8.33167287703472 0.295195136301221 A:T A T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000133119:ENST00000380071:exon_34395269_34395406:RFC3;ENSG00000133119:ENST00000434425:exon_34395269_34395406:RFC3;ENSG00000133119:ENST00000399354:exon_34395269_34395406:RFC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 39598616 G/A 1 8 11 19 3.83416356148264 5.72802510296137 -1.89386154147873 A:G G A 10 0.52072955481467 0.492400577054298 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000496138:exon_39598614_39598693:C13orf23 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 39603498 G/A 1 9 2 11 4.31343400666797 1.04145910962934 3.27197489703863 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0679252119053198 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000436678:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000418503:exon_39603418_39603512:C13orf23 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 41382711 A/T 1 2 7 9 0.95854089037066 3.64510688370269 -2.68656599333203 A:T A T 10 0.52072955481467 0.0972167926377697 ENSG00000102743:ENST00000443985:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000379523:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000426521:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000338625:exon_41382574_41382732:SLC25A15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 41515286 T/A 1 31 37 68 14.8573838007452 19.2669935281428 -4.40960972739756 A:T T A 10 0.52072955481467 0.331682339189715 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41515057_41515506:ELF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 41517985 A/G 1 42 66 108 20.1293586977839 34.3681506177682 -14.2387919199844 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0068170597320532 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41517978_41518061:ELF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 41533052 T/C 1 15 13 28 7.18905667777995 6.76948421259071 0.419572465189241 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41532972_41533152:ELF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 41834744 C/T 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 43462352 T/C 1 8 18 26 3.83416356148264 9.37313198666406 -5.53896842518142 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0317712262234647 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 43469157 G/A 1 15 5 20 7.18905667777995 2.60364777407335 4.5854089037066 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0448331414550217 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 43469211 G/A 1 15 4 19 7.18905667777995 2.08291821925868 5.10613845852127 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0211299863203083 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 46577297 T/C 1 33 23 56 15.8159246911159 11.9767797607374 3.83914493037848 T:C T C 10 0.52072955481467 0.349790968094918 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000470308:exon_46577274_46577471:ZC3H13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 20 38 58 9.5854089037066 19.7877230829575 -10.2023141792509 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00825077666653532 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 47127813 C/T 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 T:C C T 10 0.52072955481467 0.806303597637586 ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47127303_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47127303_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000443945:exon_47127305_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47127335_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47127395_47127838:LRCH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 48619942 G/A 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000136159:ENST00000258662:exon_48619796_48621282:NUDT15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 50056926 G/A 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50056873_50057098:SETDB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 44 26 70 21.0878995881545 13.5389684251814 7.5489311629731 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0736568755538248 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 50204880 G/A 1 14 4 18 6.70978623259462 2.08291821925868 4.62686801333594 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0334234205605602 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 10 15 25 4.7927044518533 7.81094332222005 -3.01823887036675 T:C T C 10 0.52072955481467 0.237337229008743 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 75884290 G/A 1 14 9 23 6.70978623259462 4.68656599333203 2.02322023926259 A:G G A 10 0.52072955481467 0.414185612013738 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 75887003 T/C 1 16 10 26 7.66832712296528 5.2072955481467 2.46103157481858 T:C T C 10 0.52072955481467 0.433118121558513 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75886874_75887034:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75886874_75887034:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75886874_75887034:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75886874_75887034:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000493487:exon_75886874_75887034:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000413735:exon_75886874_75887034:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000488955:exon_75886918_75887034:TBC1D4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 76055820 G/C 1 6 16 22 2.87562267111198 8.33167287703472 -5.45605020592274 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0304645623805761 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_76055406_76056250:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_76055406_76056250:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_76055406_76056250:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_76055406_76056250:TBC1D4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 76409436 A/G 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 A:G A G 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76409288_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000485987:exon_76409288_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000524651:exon_76409288_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000525107:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000525914:exon_76409369_76409475:LMO7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 79940811 T/C 1 16 12 28 7.66832712296528 6.24875465777604 1.41957246518924 T:C T C 10 0.52072955481467 0.706167957724672 ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000461008:exon_79940768_79940845:RBM26 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 95858978 T/C 1 7 4 11 3.35489311629731 2.08291821925868 1.27197489703863 T:C T C 10 0.52072955481467 0.552692319562948 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95858786_95859035:ABCC4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 95858996 T/C 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 T:C T C 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95858786_95859035:ABCC4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 25 37 62 11.9817611296333 19.2669935281428 -7.28523239850954 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0747370638897425 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 100511247 G/A 1 10 4 14 4.7927044518533 2.08291821925868 2.70978623259462 A:G G A 10 0.52072955481467 0.184807178247656 ENSG00000125246:ENST00000376360:exon_100511115_100511303:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000376355:exon_100511115_100511303:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000444838:exon_100511115_100511303:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000323941:exon_100511115_100511303:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000376354:exon_100511115_100511303:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000339105:exon_100511115_100511303:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000416504:exon_100511115_100511303:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000443887:exon_100511115_100511303:CLYBL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 101287340 C/T 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 T:C C T 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000496511:exon_101287319_101287449:TMTC4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 101287404 G/A 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000496511:exon_101287319_101287449:TMTC4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 11 10 21 5.27197489703863 5.2072955481467 0.0646793488919304 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 111279817 A/G 1 11 8 19 5.27197489703863 4.16583643851736 1.10613845852127 A:G A G 10 0.52072955481467 0.653020003043937 ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111279786_111279899:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000424185:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000397191:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000439607:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111279786_111279894:CARKD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 26 30 56 12.4610315748186 15.6218866444401 -3.16085506962152 A:G G A 10 0.52072955481467 0.424251649243372 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 28 22 50 13.4195724651892 11.4560502059227 1.9635222592665 T:C T C 10 0.52072955481467 0.671580093817857 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 111870037 T/C 1 22 15 37 10.5439497940773 7.81094332222005 2.73300647185721 T:C T C 10 0.52072955481467 0.413063314099052 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000449979:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000491775:exon_111870026_111870147:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000469877:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000466143:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000467053:exon_111870026_111870212:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426768:exon_111870026_111870232:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111870026_111870227:ARHGEF7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 113527967 G/A 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000068650:ENST00000487903:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375630:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375645:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000283558:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000471555:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000419631:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000495930:exon_113527746_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000493489:exon_113527817_113527990:ATP11A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 113536132 T/C 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 T:C T C 10 0.52072955481467 0.806303597637586 ENSG00000068650:ENST00000487903:exon_113536127_113541482:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375630:exon_113536130_113541482:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000419631:exon_113536130_113538272:ATP11A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 113975754 C/T 1 66 75 141 31.6318493822318 39.0547166111002 -7.42286722886847 T:C C T 10 0.52072955481467 0.237909242705392 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113974660_113975785:LAMP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 114150107 C/T 1 16 19 35 7.66832712296528 9.89386154147873 -2.22553441851345 T:C C T 10 0.52072955481467 0.500775716406867 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 114175038 G/A 1 18 8 26 8.62686801333594 4.16583643851736 4.46103157481858 A:G G A 10 0.52072955481467 0.114679729645551 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 114780764 A/G 1 11 9 20 5.27197489703863 4.68656599333203 0.5854089037066 A:G A G 10 0.52072955481467 0.826808206154088 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114780685_114780808:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114780685_114780808:RASA3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 115002305 G/A 1 27 24 51 12.9403020200039 12.4975093155521 0.442792704451831 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115002277_115002371:CDC16 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 115004914 C/T 1 20 12 32 9.5854089037066 6.24875465777604 3.33665424593056 T:C C T 10 0.52072955481467 0.289248223803459 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 115004935 T/C 1 27 23 50 12.9403020200039 11.9767797607374 0.963522259266501 T:C T C 10 0.52072955481467 0.887642089834428 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 115009384 G/A 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 A:G G A 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115009331_115009464:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115009331_115009464:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115009331_115009464:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115009331_115009464:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115009331_115009464:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115009331_115009464:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115009331_115009464:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115009331_115009464:CDC16 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 115030714 T/C 1 25 37 62 11.9817611296333 19.2669935281428 -7.28523239850954 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0747370638897425 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000461716:exon_115030368_115030715:CDC16 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 115090019 G/A 1 25 23 48 11.9817611296333 11.9767797607374 0.00498136889584089 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 115090136 T/C 1 38 38 76 18.2122769170425 19.7877230829575 -1.57544616591492 T:C T C 10 0.52072955481467 0.731889310111429 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 115090193 G/A 1 37 39 76 17.7330064718572 20.3084526377721 -2.57544616591492 A:G G A 10 0.52072955481467 0.567908544021717 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 115090931 C/T 1 23 18 41 11.0232202392626 9.37313198666406 1.65008825259853 T:C C T 10 0.52072955481467 0.64186927009697 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 13 115091399 T/C 1 20 17 37 9.5854089037066 8.85240243184939 0.733006471857211 T:C T C 10 0.52072955481467 0.870166960031672 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 20847202 A/G 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G A G 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20847140_20847264:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20847140_20847264:TEP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 20850093 C/T 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 T:C C T 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20850072_20850222:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20850072_20850222:TEP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 20850156 C/G 1 9 6 15 4.31343400666797 3.12437732888802 1.18905667777995 C:G C G 10 0.52072955481467 0.611940175630342 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20850072_20850222:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20850072_20850222:TEP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 8 21 29 3.83416356148264 10.9353206511081 -7.10115708962543 T:C T C 10 0.52072955481467 0.00895874067840682 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 258 240 498 123.651774857815 124.975093155521 -1.32331829770565 T:G T G 10 0.52072955481467 0.928544949492875 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 20940515 C/T 1 29 9 38 13.8988429103746 4.68656599333203 9.21227691704254 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00302894046836688 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 20940606 G/A 1 58 29 87 27.7976858207491 15.1011570896254 12.6965287311237 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00705523195566163 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 20940626 C/T 1 64 27 91 30.6733084918611 14.0596979799961 16.613610511865 T:C C T 10 0.52072955481467 0.000481954957623326 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 24458162 G/C 1 5 9 14 2.39635222592665 4.68656599333203 -2.29021376740538 C:G G C 10 0.52072955481467 0.287077835461110 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 24617238 C/T 1 32 19 51 15.3366542459306 9.89386154147873 5.44279270445183 T:C C T 10 0.52072955481467 0.160479960992447 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24617185_24617331:RNF31 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 24649669 C/T 1 46 50 96 22.0464404785252 26.0364777407335 -3.99003726220832 T:C C T 10 0.52072955481467 0.416314436725431 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24649425_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24649432_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24649432_24649778:IPO4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 24653523 G/C 1 46 30 76 22.0464404785252 15.6218866444401 6.42455383408508 C:G G C 10 0.52072955481467 0.167961093687904 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653504_24653624:IPO4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 29 20 49 13.8988429103746 10.4145910962934 3.48425181408117 A:G G A 10 0.52072955481467 0.391207580467612 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 40 39 79 19.1708178074132 20.3084526377721 -1.13763483035893 T:C T C 10 0.52072955481467 0.822506213829374 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 83 72 155 39.7794469503824 37.4925279466562 2.28691900372615 T:C C T 10 0.52072955481467 0.748071029104493 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 24760808 C/T 1 26 12 38 12.4610315748186 6.24875465777604 6.21227691704254 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0509131357844707 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 24771285 G/A 1 10 15 25 4.7927044518533 7.81094332222005 -3.01823887036675 A:G G A 10 0.52072955481467 0.237337229008743 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24771171_24771312:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24771171_24771312:C14orf21 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 24773387 T/C 1 22 21 43 10.5439497940773 10.9353206511081 -0.391370857030809 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24773247_24773483:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24773247_24773394:C14orf21 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 14 15 29 6.70978623259462 7.81094332222005 -1.10115708962543 A:C A C 10 0.52072955481467 0.713495169021185 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 31099738 A/G 1 2 6 8 0.95854089037066 3.12437732888802 -2.16583643851736 A:G A G 10 0.52072955481467 0.164210754421108 ENSG00000092108:ENST00000311943:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000463622:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000458591:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000484733:exon_31099683_31099771:SCFD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 31582526 T/C 1 20 17 37 9.5854089037066 8.85240243184939 0.733006471857211 T:C T C 10 0.52072955481467 0.870166960031672 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31582483_31582690:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31582483_31582690:HECTD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 35222732 C/T 1 13 6 19 6.23051578740929 3.12437732888802 3.10613845852127 T:C C T 10 0.52072955481467 0.173990747242703 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35221938_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35221943_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35221943_35222910:BAZ1A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 35735967 A/G 1 24 22 46 11.5024906844479 11.4560502059227 0.0464404785251809 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35735933_35736081:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35735933_35736081:KIAA0391 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 242 257 499 115.98344773485 133.82749558737 -17.8440478525203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.116787291703166 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 35873770 G/A 1 210 187 397 100.646793488919 97.3764267503433 3.27036673857602 A:C:G G A 10 0.52072955481467 0.763232635671102 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35873624_35873952:NFKBIA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 45606287 C/T 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000187790:ENST00000267430:exon_45606272_45606444:FANCM HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 45696037 T/G 1 13 3 16 6.23051578740929 1.56218866444401 4.66832712296528 T:G T G 10 0.52072955481467 0.0229985249854673 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45695946_45696039:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45696029_45696039:C14orf106 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 45711594 T/C 1 12 4 16 5.75124534222396 2.08291821925868 3.66832712296528 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0808258357838215 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45711237_45711683:C14orf106 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 50272806 G/C 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50272739_50272851:SDCCAG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 50583083 G/T 1 13 8 21 6.23051578740929 4.16583643851736 2.06467934889193 T:G G T 10 0.52072955481467 0.391931055698548 ENSG00000100483:ENST00000395859:exon_50583005_50583297:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000491402:exon_50583005_50583318:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000395860:exon_50583005_50583275:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000484763:exon_50582798_50583276:C14orf138 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 20 23 43 9.5854089037066 11.9767797607374 -2.39137085703081 T:C C T 10 0.52072955481467 0.542181636891993 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 50616878 G/A 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50616726_50616948:SOS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 51192659 G/A 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 51202311 G/C 1 28 22 50 13.4195724651892 11.4560502059227 1.9635222592665 C:G G C 10 0.52072955481467 0.671580093817857 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51202234_51202335:NIN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 57 55 112 27.3184153755638 28.6401255148068 -1.32171013924304 T:C C T 10 0.52072955481467 0.850151775432203 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 51223789 C/T 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 T:C C T 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 51224374 T/G 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 T:G T G 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 51224658 T/A 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 A:T T A 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 51225132 G/T 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 T:G G T 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 51716188 T/G 1 20 13 33 9.5854089037066 6.76948421259071 2.81592469111589 T:G T G 10 0.52072955481467 0.385153960404695 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716186_51716287:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716186_51716287:TMX1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 51716467 G/A 1 29 17 46 13.8988429103746 8.85240243184939 5.04644047852518 A:G G A 10 0.52072955481467 0.142845737616133 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716411_51716483:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716411_51716483:TMX1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 55310492 G/A 1 7 10 17 3.35489311629731 5.2072955481467 -1.85240243184939 A:G G A 10 0.52072955481467 0.468528473543755 ENSG00000131979:ENST00000254299:exon_55308735_55310861:GCH1;ENSG00000131979:ENST00000491895:exon_55309096_55310861:GCH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 55531358 C/T 1 40 48 88 19.1708178074132 24.9950186311042 -5.82420082369096 T:C C T 10 0.52072955481467 0.240673189118587 ENSG00000168175:ENST00000395468:exon_55531334_55536912:MAPK1IP1L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 37 45 82 17.7330064718572 23.4328299666602 -5.69982349480294 A:C A C 10 0.52072955481467 0.224789454763673 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 55643908 A/G 1 19 20 39 9.10613845852127 10.4145910962934 -1.30845263777213 A:G A G 10 0.52072955481467 0.749405489103177 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 55655692 C/T 1 12 18 30 5.75124534222396 9.37313198666406 -3.6218866444401 T:C C T 10 0.52072955481467 0.204170935491037 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55655660_55655898:DLGAP5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 55817708 T/C 1 4 10 14 1.91708178074132 5.2072955481467 -3.29021376740538 T:C T C 10 0.52072955481467 0.107382582617767 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 55818517 T/A 1 16 14 30 7.66832712296528 7.29021376740538 0.378113355559901 A:T T A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 55818706 T/C 1 11 9 20 5.27197489703863 4.68656599333203 0.5854089037066 T:C T C 10 0.52072955481467 0.826808206154088 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 55819219 G/T 1 17 16 33 8.14759756815061 8.33167287703472 -0.184075308884109 T:G G T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 58831962 A/G 1 11 7 18 5.27197489703863 3.64510688370269 1.62686801333594 A:G A G 10 0.52072955481467 0.487529072791399 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 59950690 A/C 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 A:C A C 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59950527_59951086:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000481608:exon_59950398_59950724:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000527981:exon_59950398_59951126:C14orf149 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 59951278 T/C 1 3 8 11 1.43781133555599 4.16583643851736 -2.72802510296137 T:C T C 10 0.52072955481467 0.132783549738221 ENSG00000050130:ENST00000425728:exon_59951161_59951311:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000261247:exon_59951161_59951311:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000442454:exon_59951244_59951311:JKAMP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 64656855 T/C 1 7 4 11 3.35489311629731 2.08291821925868 1.27197489703863 T:C T C 10 0.52072955481467 0.552692319562948 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64656789_64656955:SYNE2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 64988830 C/A 1 16 13 29 7.66832712296528 6.76948421259071 0.898842910374571 A:C C A 10 0.52072955481467 0.853126532704154 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 66096297 G/A 1 20 19 39 9.5854089037066 9.89386154147873 -0.308452637772129 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000358307:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394581:exon_66096210_66096324:FUT8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 71444788 G/A 1 5 12 17 2.39635222592665 6.24875465777604 -3.85240243184939 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0870960062083928 ENSG00000100731:ENST00000238570:exon_71443659_71445365:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000304743:exon_71443659_71445365:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000439984:exon_71443659_71445365:PCNX HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 73440864 C/T 1 2 11 13 0.95854089037066 5.72802510296137 -4.76948421259071 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0102303466309106 ENSG00000165861:ENST00000394207:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73440788_73440901:ZFYVE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 73491270 C/T 1 10 4 14 4.7927044518533 2.08291821925868 2.70978623259462 T:C C T 10 0.52072955481467 0.184807178247656 ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73490734_73491650:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73490734_73491650:ZFYVE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 45 35 80 21.5671700333398 18.2255344185134 3.3416356148264 T:C T C 10 0.52072955481467 0.502546947825307 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 74196686 T/C 1 21 24 45 10.0646793488919 12.4975093155521 -2.43282996666015 T:C T C 10 0.52072955481467 0.551177525292509 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74196343_74196688:C14orf43 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 74203940 C/T 1 9 15 24 4.31343400666797 7.81094332222005 -3.49750931555208 T:C C T 10 0.52072955481467 0.159684989292766 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74203701_74204000:C14orf43 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 75279395 T/A 1 19 22 41 9.10613845852127 11.4560502059227 -2.34991174740147 A:T T A 10 0.52072955481467 0.532693470798802 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 75359670 G/A 1 42 40 82 20.1293586977839 20.8291821925868 -0.699823494802938 A:G G A 10 0.52072955481467 0.912246202929366 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75359537_75359689:DLST HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 75367807 C/T 1 43 40 83 20.6086291429692 20.8291821925868 -0.220553049617607 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75367769_75367936:DLST HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 27 21 48 12.9403020200039 10.9353206511081 2.00498136889584 A:G A G 10 0.52072955481467 0.665194262654053 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 77492891 G/A 1 35 36 71 16.7744655814866 18.7462639733281 -1.97179839184157 A:G G A 10 0.52072955481467 0.721863403619614 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 77793207 G/A 1 8 12 20 3.83416356148264 6.24875465777604 -2.4145910962934 A:G G A 10 0.52072955481467 0.371430851394435 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 78174473 A/C 1 31 49 80 14.8573838007452 25.5157481859188 -10.6583643851736 A:C A C 10 0.52072955481467 0.0185990238063015 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 88477882 A/C 1 14 14 28 6.70978623259462 7.29021376740538 -0.580427534810759 A:C A C 10 0.52072955481467 0.852057573756229 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 91681888 G/A 1 19 16 35 9.10613845852127 8.33167287703472 0.774465581486551 A:G G A 10 0.52072955481467 0.866428368314304 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91681749_91682137:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91681749_91681900:C14orf159 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 91760522 C/T 1 17 9 26 8.14759756815061 4.68656599333203 3.46103157481858 T:C C T 10 0.52072955481467 0.238474281795361 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91760517_91760662:CCDC88C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 91772121 G/A 1 10 18 28 4.7927044518533 9.37313198666406 -4.58042753481076 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0909379654239063 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91772109_91772270:CCDC88C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 91773568 T/C 1 17 10 27 8.14759756815061 5.2072955481467 2.94030202000391 T:C T C 10 0.52072955481467 0.335877161640575 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91773382_91773570:CCDC88C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 93107590 C/T 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 T:C C T 10 0.52072955481467 0.347970315516692 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93107583_93107674:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93107583_93107674:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93107583_93107674:RIN3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 93170993 C/T 1 250 273 523 119.817611296333 142.159168464405 -22.3415571680724 T:C C T 10 0.52072955481467 0.054069430192139 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 93180727 A/G 1 112 131 243 53.678289860757 68.2155716807218 -14.5372818199648 A:C:G A G 10 0.52072955481467 0.0628573212972882 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93180721_93180796:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93180721_93180796:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93180721_93180796:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93180721_93180796:LGMN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 93199080 C/T 1 100 95 195 47.927044518533 49.4693077073936 -1.54226318886064 T:C C T 10 0.52072955481467 0.830148412816239 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93198994_93199160:LGMN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 93263982 C/G 1 14 19 33 6.70978623259462 9.89386154147873 -3.18407530888411 C:G C G 10 0.52072955481467 0.298443052627376 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93263783_93264012:GOLGA5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 13 10 23 6.23051578740929 5.2072955481467 1.02322023926259 A:G A G 10 0.52072955481467 0.683682381961274 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 94405871 G/C 1 15 11 26 7.18905667777995 5.72802510296137 1.46103157481858 C:G G C 10 0.52072955481467 0.695544738359801 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94405454_94406018:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94405454_94406018:ASB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 94417421 G/A 1 11 11 22 5.27197489703863 5.72802510296137 -0.45605020592274 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 94417541 A/G 1 22 12 34 10.5439497940773 6.24875465777604 4.29519513630122 A:G A G 10 0.52072955481467 0.169930919837473 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 94417586 G/A 1 23 15 38 11.0232202392626 7.81094332222005 3.21227691704254 A:G G A 10 0.52072955481467 0.332370199874861 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 95884323 G/A 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95883831_95884363:C14orf49 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 96768380 T/G 1 1 9 10 0.47927044518533 4.68656599333203 -4.2072955481467 T:G T G 10 0.52072955481467 0.00905306247383101 ENSG00000066739:ENST00000359933:exon_96768344_96768445:ATG2B;ENSG00000066739:ENST00000261834:exon_96768344_96768445:ATG2B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 96771959 A/G 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 A:G A G 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000066739:ENST00000359933:exon_96771926_96772152:ATG2B;ENSG00000066739:ENST00000261834:exon_96771926_96772152:ATG2B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 99967186 A/T 1 14 18 32 6.70978623259462 9.37313198666406 -2.66334575406944 A:T A T 10 0.52072955481467 0.379705859397668 ENSG00000090061:ENST00000389879:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000216279:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000411691:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000380246:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000437596:exon_99967103_99967208:CCNK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 100563943 G/A 1 97 125 222 46.489233182977 65.0911943518337 -18.6019611688567 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0129075576574631 ENSG00000196405:ENST00000402714:exon_100563818_100563995:EVL;ENSG00000196405:ENST00000392920:exon_100563818_100563995:EVL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 100743954 C/G 1 18 27 45 8.62686801333594 14.0596979799961 -5.43282996666015 C:G C G 10 0.52072955481467 0.134877410536729 ENSG00000100811:ENST00000262238:exon_100743755_100749129:YY1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 100759046 C/A 1 12 6 18 5.75124534222396 3.12437732888802 2.62686801333594 A:C C A 10 0.52072955481467 0.245162799745609 ENSG00000197119:ENST00000359232:exon_100757448_100759369:SLC25A29;ENSG00000197119:ENST00000392908:exon_100757448_100759369:SLC25A29 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 103342049 T/C 1 28 41 69 13.4195724651892 21.3499117474015 -7.93033928221223 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0699718924082884 ENSG00000131323:ENST00000392745:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000347662:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000351691:exon_103341961_103342065:TRAF3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 103440473 G/C 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 C:G G C 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000198752:ENST00000361246:exon_103440353_103440486:CDC42BPB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 103593950 C/G 1 11 26 37 5.27197489703863 13.5389684251814 -8.26699352814279 C:G C G 10 0.52072955481467 0.00781911574965727 ENSG00000185215:ENST00000333007:exon_103593342_103593966:TNFAIP2;ENSG00000185215:ENST00000451723:exon_103593342_103593966:TNFAIP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 103601609 A/T 1 6 15 21 2.87562267111198 7.81094332222005 -4.93532065110807 A:T A T 10 0.52072955481467 0.0467824561794380 ENSG00000185215:ENST00000333007:exon_103601556_103603776:TNFAIP2;ENSG00000185215:ENST00000451723:exon_103601556_103601688:TNFAIP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 103986255 C/T 1 8 8 16 3.83416356148264 4.16583643851736 -0.33167287703472 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103985996_103986379:CKB;ENSG00000166165:ENST00000428256:exon_103985996_103986379:CKB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 103988180 G/T 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 T:G G T 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103988155_103988287:CKB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 16 14 30 7.66832712296528 7.29021376740538 0.378113355559901 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 73 68 141 34.9867424985291 35.4096097273976 -0.422867228868469 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 105716034 C/T 1 23 15 38 11.0232202392626 7.81094332222005 3.21227691704254 T:C C T 10 0.52072955481467 0.332370199874861 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715977_105717421:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715977_105717430:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715977_105716298:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392553:exon_105715977_105716633:BTBD6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 106307418 G/A 1 118 105 223 56.5539125318689 54.6766032555403 1.8773092763286 A:T:G G A 10 0.52072955481467 0.84073082465453 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 106321913 G/A 1 207 118 325 99.2089821533633 61.4460874681311 37.7628946852323 A:T:C:G G A 10 0.52072955481467 2.90028604792427e-05 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 106330067 C/G 1 134 10 144 64.2222396548342 5.2072955481467 59.0149441066875 A:C:G C G 10 0.52072955481467 9.17664558032171e-27 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 106330841 G/C 0 52 0 52 24.9220631496372 0 24.9220631496372 G G 10 0.52072955481467 3.24788837292716e-15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 14 106791131 A/G 0 0 9 9 0 4.68656599333203 -4.68656599333203 G A G 10 0.52072955481467 0.00133421505404264 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 21937964 A/G 0 12 0 12 5.75124534222396 0 5.75124534222396 A A 10 0.52072955481467 0.000544390514281559 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 22960868 G/C 1 23 24 47 11.0232202392626 12.4975093155521 -1.47428907628949 C:G G C 10 0.52072955481467 0.770672818089637 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22960793_22960889:CYFIP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 31 33 64 14.8573838007452 17.1840753088841 -2.32669150813888 T:C C T 10 0.52072955481467 0.61738255719535 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 32929683 G/A 1 11 8 19 5.27197489703863 4.16583643851736 1.10613845852127 A:G G A 10 0.52072955481467 0.653020003043937 ENSG00000198826:ENST00000361627:exon_32928458_32932150:ARHGAP11A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 35273620 C/T 1 10 12 22 4.7927044518533 6.24875465777604 -1.45605020592274 T:C C T 10 0.52072955481467 0.670595760110997 ENSG00000198146:ENST00000356321:exon_35270542_35275691:ZNF770 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 40675502 C/G 1 9 15 24 4.31343400666797 7.81094332222005 -3.49750931555208 C:G C G 10 0.52072955481467 0.159684989292766 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40675429_40675523:C15orf23 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 40750740 A/G 1 12 14 26 5.75124534222396 7.29021376740538 -1.53896842518142 A:G A G 10 0.52072955481467 0.562641904116243 ENSG00000140320:ENST00000416165:exon_40750650_40752095:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000339351:exon_40750650_40752095:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000442618:exon_40750650_40752095:BAHD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 40751555 C/A 1 29 12 41 13.8988429103746 6.24875465777604 7.65008825259853 A:C C A 10 0.52072955481467 0.0185805895673526 ENSG00000140320:ENST00000416165:exon_40750650_40752095:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000339351:exon_40750650_40752095:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000442618:exon_40750650_40752095:BAHD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 42717091 G/T 1 10 4 14 4.7927044518533 2.08291821925868 2.70978623259462 T:G G T 10 0.52072955481467 0.184807178247656 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42717032_42717223:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42717032_42717223:ZFP106 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 43699592 C/T 1 4 8 12 1.91708178074132 4.16583643851736 -2.24875465777604 T:C C T 10 0.52072955481467 0.251467937811103 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43699407_43699768:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43699412_43699768:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000476454:exon_43699412_43699768:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43699412_43699768:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43699412_43699768:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43699412_43699768:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43699412_43699768:TP53BP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 48626647 A/G 1 100 106 206 47.927044518533 55.197332810355 -7.27028829182202 A:T:G A G 10 0.52072955481467 0.329159944088768 ENSG00000128951:ENST00000331200:exon_48626614_48626705:DUT;ENSG00000128951:ENST00000450740:exon_48626614_48626705:DUT;ENSG00000128951:ENST00000249783:exon_48626614_48626705:DUT;ENSG00000128951:ENST00000455976:exon_48626614_48626705:DUT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 21 14 35 10.0646793488919 7.29021376740538 2.77446558148655 A:G A G 10 0.52072955481467 0.399537055090493 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 52901638 T/C 1 8 10 18 3.83416356148264 5.2072955481467 -1.37313198666406 T:C T C 10 0.52072955481467 0.638802194234348 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 52901977 G/A 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 A:G G A 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 56386514 T/A 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 A:T T A 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000181827:ENST00000422057:exon_56385831_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000423270:exon_56382732_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000317318:exon_56382732_56388818:RFX7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 59963488 A/G 1 11 8 19 5.27197489703863 4.16583643851736 1.10613845852127 A:G A G 10 0.52072955481467 0.653020003043937 ENSG00000140299:ENST00000267859:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000415213:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000409352:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000439052:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000448414:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000464390:exon_59963380_59963513:BNIP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 11 10 21 5.27197489703863 5.2072955481467 0.0646793488919304 T:G T G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 60741684 C/G 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 C:G C G 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60741047_60742040:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60741047_60742040:NARG2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 63433785 G/A 1 35 27 62 16.7744655814866 14.0596979799961 2.71476760149046 A:G G A 10 0.52072955481467 0.526633573593665 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 11 14 25 5.27197489703863 7.29021376740538 -2.01823887036675 A:G G A 10 0.52072955481467 0.431806214148498 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 63597857 T/G 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 T:G T G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000138613:ENST00000380343:exon_63597813_63601324:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000261879:exon_63597813_63601325:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000380340:exon_63597813_63598754:APH1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 63918307 G/C 1 9 6 15 4.31343400666797 3.12437732888802 1.18905667777995 C:G G C 10 0.52072955481467 0.611940175630342 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63918184_63918353:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63918184_63918353:HERC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 63922752 T/A 1 9 5 14 4.31343400666797 2.60364777407335 1.70978623259462 A:T T A 10 0.52072955481467 0.429598343746981 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63922665_63922834:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63922665_63922834:HERC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 63932513 G/C 1 14 9 23 6.70978623259462 4.68656599333203 2.02322023926259 C:G G C 10 0.52072955481467 0.414185612013738 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63932351_63932644:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63932351_63932644:HERC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 63954029 C/T 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 T:C C T 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63953952_63954220:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63953952_63954220:HERC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 65110492 G/A 1 6 8 14 2.87562267111198 4.16583643851736 -1.29021376740538 A:G G A 10 0.52072955481467 0.596274656681649 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65110456_65110543:PIF1;ENSG00000140451:ENST00000333425:exon_65110456_65110543:PIF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 65916527 A/T 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:T A T 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000074621:ENST00000399033:exon_65916293_65918308:SLC24A1;ENSG00000074621:ENST00000339868:exon_65916293_65918308:SLC24A1;ENSG00000074621:ENST00000261892:exon_65916293_65918308:SLC24A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 66618342 A/G 1 15 4 19 7.18905667777995 2.08291821925868 5.10613845852127 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0211299863203083 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66618169_66618702:DIS3L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 67528374 T/G 1 15 11 26 7.18905667777995 5.72802510296137 1.46103157481858 T:G T G 10 0.52072955481467 0.695544738359801 ENSG00000103591:ENST00000261880:exon_67528317_67528406:AAGAB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 69728949 A/G 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 A:G A G 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728903_69729061:KIF23 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 69732736 C/T 1 17 10 27 8.14759756815061 5.2072955481467 2.94030202000391 T:C C T 10 0.52072955481467 0.335877161640575 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69732647_69732826:KIF23 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 23 22 45 11.0232202392626 11.4560502059227 -0.432829966660149 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 12 22 34 5.75124534222396 11.4560502059227 -5.70480486369878 T:C C T 10 0.52072955481467 0.058745856269239 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 72191110 T/C 1 5 9 14 2.39635222592665 4.68656599333203 -2.29021376740538 T:C T C 10 0.52072955481467 0.287077835461110 ENSG00000066933:ENST00000356056:exon_72189802_72191373:MYO9A;ENSG00000066933:ENST00000424560:exon_72189802_72191373:MYO9A;ENSG00000066933:ENST00000446448:exon_72189802_72191373:MYO9A;ENSG00000066933:ENST00000444904:exon_72189802_72191373:MYO9A;ENSG00000066933:ENST00000261864:exon_72189802_72191373:MYO9A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 73052840 T/C 1 13 7 20 6.23051578740929 3.64510688370269 2.5854089037066 T:C T C 10 0.52072955481467 0.271400284316410 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 73052845 A/G 1 16 9 25 7.66832712296528 4.68656599333203 2.98176112963325 A:G A G 10 0.52072955481467 0.317005341446711 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 310 275 585 148.573838007452 143.200627574034 5.37321043341805 A:T:C C T 10 0.52072955481467 0.679074783643652 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 75131661 A/G 1 16 15 31 7.66832712296528 7.81094332222005 -0.142616199254769 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75131609_75131714:ULK3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 75146366 G/T 1 74 61 135 35.4660129437144 31.7645028436949 3.70151010001955 T:G G T 10 0.52072955481467 0.547273553501086 ENSG00000140497:ENST00000268099:exon_75146362_75146460:SCAMP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 75188584 C/T 1 23 11 34 11.0232202392626 5.72802510296137 5.29519513630122 T:C:G C T 10 0.52072955481467 0.0853520544698787 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75188493_75188666:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75188493_75188666:MPI;ENSG00000178802:ENST00000379693:exon_75188493_75188842:MPI HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 75189930 A/G 1 44 31 75 21.0878995881545 16.1426161992548 4.94528338889975 A:G A G 10 0.52072955481467 0.298302555437356 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189853_75191798:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189853_75190569:MPI HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 75498974 A/G 1 95 51 146 45.5306922926064 26.5572072955482 18.9734849970582 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00161079522979592 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 75632360 C/A 1 95 69 164 45.5306922926064 35.9303392822122 9.60035301039412 A:C C A 10 0.52072955481467 0.138111095044349 ENSG00000140365:ENST00000267935:exon_75632306_75632614:COMMD4;ENSG00000140365:ENST00000338995:exon_75632306_75632612:COMMD4;ENSG00000140365:ENST00000480484:exon_75632306_75632561:COMMD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 75641392 C/G 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 C:G C G 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000140398:ENST00000355059:exon_75641225_75641680:NEIL1;ENSG00000140398:ENST00000336572:exon_75641247_75641463:NEIL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 75652604 C/T 1 14 12 26 6.70978623259462 6.24875465777604 0.46103157481858 T:C C T 10 0.52072955481467 1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 75658926 G/T 1 8 11 19 3.83416356148264 5.72802510296137 -1.89386154147873 T:G G T 10 0.52072955481467 0.492400577054298 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75658863_75658933:MAN2C1;ENSG00000140400:ENST00000421803:exon_75658863_75658933:MAN2C1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 74 81 155 35.4660129437144 42.1790939399883 -6.71308099627385 T:G G T 10 0.52072955481467 0.29642729918767 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 77472871 G/A 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000173517:ENST00000312493:exon_77471132_77474382:AC087465.1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 79606186 G/A 1 61 84 145 29.2354971563051 43.7412826044323 -14.5057854481271 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0196340523870012 ENSG00000166557:ENST00000299705:exon_79606099_79606347:TMED3;ENSG00000166557:ENST00000424155:exon_79606099_79606347:TMED3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 15 53 68 7.18905667777995 27.5986664051775 -20.4096097273976 T:C T C 10 0.52072955481467 5.75895900526692e-07 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 143 115 258 68.5356736615022 59.883898803687 8.65177485781514 A:C A C 10 0.52072955481467 0.289939047537204 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 112 109 221 53.678289860757 56.759521474799 -3.08123161404207 A:T:C C T 10 0.52072955481467 0.686769869987388 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 81294774 G/C 1 11 17 28 5.27197489703863 8.85240243184939 -3.58042753481076 C:G G C 10 0.52072955481467 0.189855934010188 ENSG00000140406:ENST00000267984:exon_81293295_81296342:MESDC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 82422814 C/T 1 10 9 19 4.7927044518533 4.68656599333203 0.10613845852127 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82422561_82422902:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82422561_82422902:EFTUD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 86123462 T/C 1 7 6 13 3.35489311629731 3.12437732888802 0.23051578740929 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 86124044 G/C 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 86286787 C/T 1 26 40 66 12.4610315748186 20.8291821925868 -8.36815061776822 T:C:G C T 10 0.52072955481467 0.0480052287037452 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86286723_86287056:AKAP13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 86287867 G/A 1 51 31 82 24.4427927044518 16.1426161992548 8.30017650519707 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0766329223315689 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 86287910 C/T 1 34 33 67 16.2951951363012 17.1840753088841 -0.888880172582891 T:C C T 10 0.52072955481467 0.90282527751782 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 89169858 A/G 1 35 49 84 16.7744655814866 25.5157481859188 -8.74128260443228 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0631765376460535 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 89172558 G/C 1 12 12 24 5.75124534222396 6.24875465777604 -0.49750931555208 C:G G C 10 0.52072955481467 0.841650853857263 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89172457_89172657:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89172457_89172657:AEN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 89804043 C/T 1 13 4 17 6.23051578740929 2.08291821925868 4.14759756815061 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0522960077891863 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 17 12 29 8.14759756815061 6.24875465777604 1.89884291037457 C:G G C 10 0.52072955481467 0.578315378656019 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 34 39 73 16.2951951363012 20.3084526377721 -4.01325750147091 T:C T C 10 0.52072955481467 0.3516922981743 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 89860786 A/C 1 1 7 8 0.47927044518533 3.64510688370269 -3.16583643851736 A:C A C 10 0.52072955481467 0.0323874083396119 ENSG00000140521:ENST00000526671:exon_89860607_89861059:POLG HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 90168693 T/A 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:T T A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 90168873 T/C 1 13 7 20 6.23051578740929 3.64510688370269 2.5854089037066 T:C T C 10 0.52072955481467 0.271400284316410 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 90611818 C/A 1 18 17 35 8.62686801333594 8.85240243184939 -0.225534418513449 A:C C A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90610342_90611827:ZNF710 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 90623052 T/C 1 10 10 20 4.7927044518533 5.2072955481467 -0.4145910962934 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90622892_90625432:ZNF710 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 90628537 G/A 1 163 133 296 78.1210825652088 69.2570307903511 8.86405177485769 A:G G A 10 0.52072955481467 0.322761160690208 ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90628507_90628619:IDH2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 90764219 G/A 1 2 7 9 0.95854089037066 3.64510688370269 -2.68656599333203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0972167926377697 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90764214_90764325:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000379122:exon_90764214_90764325:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90764214_90764325:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90764214_90764325:SEMA4B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 90768320 C/T 1 11 3 14 5.27197489703863 1.56218866444401 3.70978623259462 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0603185136025827 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000379122:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90768200_90768410:SEMA4B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 91449654 T/C 1 8 10 18 3.83416356148264 5.2072955481467 -1.37313198666406 T:C T C 10 0.52072955481467 0.638802194234348 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91449600_91449727:MAN2A2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 91449702 A/T 1 8 15 23 3.83416356148264 7.81094332222005 -3.97677976073741 A:T A T 10 0.52072955481467 0.142432345936036 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91449600_91449727:MAN2A2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 91474738 G/C 1 7 10 17 3.35489311629731 5.2072955481467 -1.85240243184939 C:G G C 10 0.52072955481467 0.468528473543755 ENSG00000184508:ENST00000330334:exon_91474155_91474786:HDDC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 91478544 A/C 1 14 3 17 6.70978623259462 1.56218866444401 5.14759756815061 A:C A C 10 0.52072955481467 0.0139839148920153 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91478174_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000495068:exon_91478515_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000497152:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91478516_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000439771:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000486253:exon_91478540_91478605:UNC45A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 91499986 G/T 1 17 4 21 8.14759756815061 2.08291821925868 6.06467934889193 T:G G T 10 0.52072955481467 0.00821040680115198 ENSG00000166965:ENST00000394258:exon_91499842_91500130:RCCD1;ENSG00000166965:ENST00000300233:exon_91499840_91500130:RCCD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 91525197 C/T 1 33 29 62 15.8159246911159 15.1011570896254 0.714767601490461 T:C C T 10 0.52072955481467 0.899289376471809 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 8 13 21 3.83416356148264 6.76948421259071 -2.93532065110807 A:G G A 10 0.52072955481467 0.274671777521875 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 101566298 C/T 1 9 10 19 4.31343400666797 5.2072955481467 -0.89386154147873 T:C C T 10 0.52072955481467 0.819317260655474 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101566170_101566342:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101566170_101566342:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101566170_101566342:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101566170_101566342:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101566170_101566342:LRRK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 101592081 T/A 1 15 23 38 7.18905667777995 11.9767797607374 -4.78772308295746 A:T T A 10 0.52072955481467 0.143854343078633 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101591916_101592165:LRRK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 101717680 G/T 1 10 5 15 4.7927044518533 2.60364777407335 2.18905667777995 T:G G T 10 0.52072955481467 0.308037122491406 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 102191919 G/C 1 9 5 14 4.31343400666797 2.60364777407335 1.70978623259462 C:G G C 10 0.52072955481467 0.429598343746981 ENSG00000184277:ENST00000333202:exon_102191899_102191976:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000453041:exon_102191899_102191976:TM2D3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 102224341 G/A 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102224278_102224440:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102224278_102224440:TARSL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 102264304 G/C 1 12 6 18 5.75124534222396 3.12437732888802 2.62686801333594 C:G G C 10 0.52072955481467 0.245162799745609 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102264294_102264807:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102264294_102264645:TARSL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 15 102264476 C/A 1 9 14 23 4.31343400666797 7.29021376740538 -2.97677976073741 A:C C A 10 0.52072955481467 0.296663371072281 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102264294_102264807:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102264294_102264645:TARSL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 85 83 168 40.737987840753 43.2205530496176 -2.48256520886456 A:G A G 10 0.52072955481467 0.700390813724407 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 420220 G/A 1 103 2 105 49.364855854089 1.04145910962934 48.3233967444597 A:G G A 10 0.52072955481467 1.02855869795625e-26 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 111 88 199 53.1990194155716 45.824200823691 7.37481859188068 A:G G A 10 0.52072955481467 0.320666446195241 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 179 149 328 85.7894096881741 77.5887036673858 8.20070602078825 T:C C T 10 0.52072955481467 0.376895861466204 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 39 47 86 18.6915473622279 24.4742890762895 -5.78274171406161 A:G A G 10 0.52072955481467 0.235435470959616 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 624114 A/G 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G A G 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000007541:ENST00000409527:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000409439:exon_624066_624592:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000422307:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000439574:exon_624066_624409:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000470411:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000420990:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000443147:exon_624066_624763:PIGQ HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 624713 C/T 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 T:C C T 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000007541:ENST00000409527:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000422307:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000470411:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000420990:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000443147:exon_624066_624763:PIGQ HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 633125 T/C 1 11 11 22 5.27197489703863 5.72802510296137 -0.45605020592274 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 633353 T/C 1 17 23 40 8.14759756815061 11.9767797607374 -3.8291821925868 T:C T C 10 0.52072955481467 0.268363886567792 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 633354 G/A 1 17 21 38 8.14759756815061 10.9353206511081 -2.78772308295746 A:G G A 10 0.52072955481467 0.41821411726343 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 677629 T/C 1 8 7 15 3.83416356148264 3.64510688370269 0.18905667777995 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000197562:ENST00000248139:exon_677342_679272:RAB40C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 706534 G/A 1 2 6 8 0.95854089037066 3.12437732888802 -2.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 0.164210754421108 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_706302_706537:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000420061:exon_706302_706537:WDR90 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 708275 C/A 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 A:C C A 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_708183_708344:WDR90 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 716273 T/C 1 16 1 17 7.66832712296528 0.52072955481467 7.14759756815061 T:C T C 10 0.52072955481467 0.000325674425511367 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_716220_716350:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_716220_716350:WDR90 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 716287 C/A 1 15 2 17 7.18905667777995 1.04145910962934 6.14759756815061 A:C C A 10 0.52072955481467 0.00267539635258004 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_716220_716350:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_716220_716350:WDR90 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 717544 G/C 1 11 8 19 5.27197489703863 4.16583643851736 1.10613845852127 C:G G C 10 0.52072955481467 0.653020003043937 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 718514 C/G 1 67 55 122 32.1111198274171 28.6401255148068 3.47099431261027 C:G C G 10 0.52072955481467 0.586855627971152 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_718488_718569:RHOT2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 719592 G/A 1 45 46 91 21.5671700333398 23.9535595214748 -2.38638948813497 A:G G A 10 0.52072955481467 0.675016065881583 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_719553_719606:RHOT2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 720152 T/C 1 52 57 109 24.9220631496372 29.6815846244362 -4.75952147479903 T:C T C 10 0.52072955481467 0.388789202047118 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720123_720175:RHOT2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 720960 C/T 1 57 29 86 27.3184153755638 15.1011570896254 12.2172582859384 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00929869597486424 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720892_721000:RHOT2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 720986 G/A 1 27 35 62 12.9403020200039 18.2255344185134 -5.28523239850954 A:G G A 10 0.52072955481467 0.203939380359977 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720892_721000:RHOT2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 735921 T/C 1 8 15 23 3.83416356148264 7.81094332222005 -3.97677976073741 T:C T C 10 0.52072955481467 0.142432345936036 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_735869_735990:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_735869_735990:WDR24 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 775480 C/T 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 T:C C T 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_775413_775580:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000485091:exon_775413_775580:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000293889:exon_775413_775580:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_775413_775580:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000345165:exon_775413_775580:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_775413_775580:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_775446_775580:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000460023:exon_775446_775580:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000439619:exon_775413_775580:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000423653:exon_775413_775580:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000471861:exon_775413_775580:CCDC78 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 845754 C/T 1 14 10 24 6.70978623259462 5.2072955481467 1.50249068444792 T:C C T 10 0.52072955481467 0.683763897335876 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 845797 G/C 1 15 8 23 7.18905667777995 4.16583643851736 3.02322023926259 C:G G C 10 0.52072955481467 0.219045420855692 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 846798 C/T 1 7 4 11 3.35489311629731 2.08291821925868 1.27197489703863 T:C C T 10 0.52072955481467 0.552692319562948 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_846615_846861:CHTF18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 904551 G/C 1 5 8 13 2.39635222592665 4.16583643851736 -1.76948421259071 C:G G C 10 0.52072955481467 0.409410722535207 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_903638_904706:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_903638_904706:LMF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 1364365 A/G 1 269 239 508 128.923749754854 124.454363600706 4.46938615414766 A:C:G A G 10 0.52072955481467 0.722444409573999 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000443007:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000473256:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000402301:exon_1364294_1364377:UBE2I HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 1374818 A/G 1 154 150 304 73.8076485585408 78.1094332222005 -4.30178466365967 A:G A G 10 0.52072955481467 0.646212180119759 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1374731_1375351:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1374731_1375215:UBE2I HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 1544301 G/C 1 21 7 28 10.0646793488919 3.64510688370269 6.41957246518924 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0215081545755281 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 1544302 A/G 1 20 7 27 9.5854089037066 3.64510688370269 5.94030202000391 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0321531240468568 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 1545448 A/G 1 13 11 24 6.23051578740929 5.72802510296137 0.50249068444792 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1545347_1545624:TELO2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 2014283 A/G 1 306 209 515 146.656756226711 108.832476956266 37.824279270445 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00092326618758017 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533186:exon_2014277_2014357:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000532746:exon_2014277_2014368:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533872:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2013654_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000534461:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 2014424 C/G 1 13 19 32 6.23051578740929 9.89386154147873 -3.66334575406944 C:G C G 10 0.52072955481467 0.217975641066748 ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 2258767 G/A 1 78 89 167 37.3830947244557 46.3449303785056 -8.96183565404989 A:G G A 10 0.52072955481467 0.187804198572529 ENSG00000167965:ENST00000382450:exon_2258760_2259398:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301724:exon_2258451_2259398:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000397124:exon_2258760_2259398:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301725:exon_2258760_2259397:MLST8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 2512523 G/A 1 9 3 12 4.31343400666797 1.56218866444401 2.75124534222396 A:G G A 10 0.52072955481467 0.150146977653864 ENSG00000162062:ENST00000361837:exon_2512416_2512527:C16orf59;ENSG00000162062:ENST00000483320:exon_2512416_2512527:C16orf59 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 T:G G T 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 3073240 G/T 1 38 60 98 18.2122769170425 31.2437732888802 -13.0314963718377 T:G G T 10 0.52072955481467 0.00856987605749824 ENSG00000103145:ENST00000354679:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000396916:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000248089:exon_3073234_3073362:HCFC1R1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 30 36 66 14.3781133555599 18.7462639733281 -4.36815061776822 T:C T C 10 0.52072955481467 0.324567014705455 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 4511752 T/C 1 44 23 67 21.0878995881545 11.9767797607374 9.11111982741711 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0276490527078594 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4511695_4511960:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4511696_4511960:NMRAL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 4524155 C/G 1 28 3 31 13.4195724651892 1.56218866444401 11.8573838007452 C:G C G 10 0.52072955481467 1.27343786015452e-05 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4524094_4524167:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4524094_4524167:NMRAL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 4556911 G/A 1 51 44 95 24.4427927044518 22.9121004118455 1.53069229260635 A:C:G G A 10 0.52072955481467 0.759398579349172 ENSG00000103415:ENST00000406590:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000458134:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000219700:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000398595:exon_4556896_4557013:HMOX2;ENSG00000103415:ENST00000414777:exon_4556896_4557013:HMOX2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 5075542 G/A 1 4 11 15 1.91708178074132 5.72802510296137 -3.81094332222005 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0682141035611568 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 5075633 G/A 1 9 5 14 4.31343400666797 2.60364777407335 1.70978623259462 A:G G A 10 0.52072955481467 0.429598343746981 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 5083483 T/C 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 T:C T C 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5083274_5083729:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5083274_5083729:NAGPA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 5128001 C/T 1 13 16 29 6.23051578740929 8.33167287703472 -2.10115708962543 T:C C T 10 0.52072955481467 0.462301755728773 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5127908_5128018:ALG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 5128817 G/A 1 9 9 18 4.31343400666797 4.68656599333203 -0.37313198666406 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5128758_5128879:ALG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 5139186 G/C 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 C:G G C 10 0.52072955481467 0.806303597637586 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 5139217 C/G 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 5140541 G/C 1 10 9 19 4.7927044518533 4.68656599333203 0.10613845852127 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5140433_5140566:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5140433_5140566:FAM86A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 5140561 C/T 1 9 9 18 4.31343400666797 4.68656599333203 -0.37313198666406 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5140433_5140566:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5140433_5140566:FAM86A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 8722629 G/C 1 9 18 27 4.31343400666797 9.37313198666406 -5.05969797999609 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0556408222394603 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 8953081 C/G 1 37 31 68 17.7330064718572 16.1426161992548 1.59039027260244 C:G C G 10 0.52072955481467 0.717524703833257 ENSG00000153048:ENST00000396593:exon_8953028_8953192:CARHSP1;ENSG00000153048:ENST00000311052:exon_8953028_8953192:CARHSP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 8999138 T/C 1 46 33 79 22.0464404785252 17.1840753088841 4.86236516964107 T:C T C 10 0.52072955481467 0.311116295433363 ENSG00000187555:ENST00000344836:exon_8999044_8999188:USP7;ENSG00000187555:ENST00000381886:exon_8999044_8999188:USP7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 10524957 G/T 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 T:G G T 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10524468_10525312:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10524468_10525312:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10524452_10525312:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10524452_10525312:ATF7IP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 10575824 C/A 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 A:C C A 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10575693_10577494:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10575693_10577494:ATF7IP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 37 37 74 17.7330064718572 19.2669935281428 -1.53398705628558 A:G A G 10 0.52072955481467 0.728714674670938 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 10989219 C/G 1 21 29 50 10.0646793488919 15.1011570896254 -5.0364777407335 C:G C G 10 0.52072955481467 0.15972357889411 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_10989139_10989285:CIITA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 12061626 G/A 1 87 81 168 41.6965287311237 42.1790939399883 -0.482565208864557 A:T:G G A 10 0.52072955481467 0.938660071319714 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 12061674 G/A 1 57 53 110 27.3184153755638 27.5986664051775 -0.280251029613702 A:C:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 12162969 A/G 1 5 9 14 2.39635222592665 4.68656599333203 -2.29021376740538 A:G A G 10 0.52072955481467 0.287077835461110 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12162914_12162989:SNX29;ENSG00000048471:ENST00000323433:exon_12162914_12162989:SNX29 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 12662420 C/T 1 16 3 19 7.66832712296528 1.56218866444401 6.10613845852127 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00504304617394946 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12662363_12668145:SNX29 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 12758966 T/C 1 19 13 32 9.10613845852127 6.76948421259071 2.33665424593056 T:C T C 10 0.52072955481467 0.480625933616023 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12756937_12758972:CPPED1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 15818141 A/C 1 16 23 39 7.66832712296528 11.9767797607374 -4.30845263777213 A:C A C 10 0.52072955481467 0.199958679651087 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 23 38 61 11.0232202392626 19.7877230829575 -8.76450284369487 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0288565530982573 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 16162019 T/C 1 16 15 31 7.66832712296528 7.81094332222005 -0.142616199254769 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16162013_16162159:ABCC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 16228242 G/A 1 16 14 30 7.66832712296528 7.29021376740538 0.378113355559901 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16228207_16228365:ABCC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 19547503 C/T 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 T:C C T 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 19680546 T/C 1 6 11 17 2.87562267111198 5.72802510296137 -2.85240243184939 T:C T C 10 0.52072955481467 0.224918141362531 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 22237118 A/G 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22236975_22237296:EEF2K HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 22237273 C/G 1 13 6 19 6.23051578740929 3.12437732888802 3.10613845852127 C:G C G 10 0.52072955481467 0.173990747242703 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22236975_22237296:EEF2K HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 22262514 C/A 1 4 8 12 1.91708178074132 4.16583643851736 -2.24875465777604 A:C C A 10 0.52072955481467 0.251467937811103 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22262472_22262643:EEF2K HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 23403744 A/G 1 12 14 26 5.75124534222396 7.29021376740538 -1.53896842518142 A:G A G 10 0.52072955481467 0.562641904116243 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23403701_23403844:COG7;ENSG00000168434:ENST00000429391:exon_23403701_23403844:COG7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 23409440 G/A 1 11 15 26 5.27197489703863 7.81094332222005 -2.53896842518142 A:G G A 10 0.52072955481467 0.333843435098941 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23409367_23409450:COG7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 23489711 C/G 1 29 42 71 13.8988429103746 21.8706413022161 -7.97179839184157 C:G C G 10 0.52072955481467 0.0740550424059392 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23489689_23489822:GGA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 23563501 C/T 1 13 9 22 6.23051578740929 4.68656599333203 1.54394979407726 T:C C T 10 0.52072955481467 0.53135812068658 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23563470_23563625:EARS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 23672560 A/T 1 13 10 23 6.23051578740929 5.2072955481467 1.02322023926259 A:T A T 10 0.52072955481467 0.683682381961274 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23672491_23672602:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23672491_23672563:DCTN5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 23701458 G/A 1 66 61 127 31.6318493822318 31.7645028436949 -0.132653461463089 A:C:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 24166130 T/C 1 40 23 63 19.1708178074132 11.9767797607374 7.19403804667579 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0775517504380056 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 24582299 C/G 1 21 19 40 10.0646793488919 9.89386154147873 0.170817807413201 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 57 47 104 27.3184153755638 24.4742890762895 2.84412629927432 A:G A G 10 0.52072955481467 0.624046793576449 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 24788645 T/A 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 A:T T A 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24788569_24788679:TNRC6A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 24801737 G/A 1 10 7 17 4.7927044518533 3.64510688370269 1.14759756815061 A:G G A 10 0.52072955481467 0.634129017759885 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 24802325 C/T 1 3 15 18 1.43781133555599 7.81094332222005 -6.37313198666406 T:C C T 10 0.52072955481467 0.003387623267809 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 24834233 C/T 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834195_24834334:TNRC6A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 24835168 G/A 1 9 10 19 4.31343400666797 5.2072955481467 -0.89386154147873 A:G G A 10 0.52072955481467 0.819317260655474 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834753_24836196:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834753_24837545:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834753_24836090:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834753_24836107:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834753_24836107:TNRC6A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 27472772 C/T 1 22 26 48 10.5439497940773 13.5389684251814 -2.99501863110416 T:C C T 10 0.52072955481467 0.390987987137181 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27471935_27472883:GTF3C1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 27474910 A/G 1 13 20 33 6.23051578740929 10.4145910962934 -4.18407530888411 A:G A G 10 0.52072955481467 0.164822979060702 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27474862_27474913:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27474862_27474913:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27474862_27474913:GTF3C1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 28145165 T/A 1 29 25 54 13.8988429103746 13.0182388703667 0.880604040007821 A:T T A 10 0.52072955481467 0.891907041980298 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28145162_28145254:XPO6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 28222690 G/A 1 13 18 31 6.23051578740929 9.37313198666406 -3.14261619925477 A:G G A 10 0.52072955481467 0.284278075165481 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28222687_28223190:XPO6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 28602991 A/G 1 9 8 17 4.31343400666797 4.16583643851736 0.14759756815061 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 28920039 C/A 1 17 15 32 8.14759756815061 7.81094332222005 0.336654245930561 A:C C A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28919930_28920085:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28919930_28920085:RABEP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 29675928 C/T 1 142 119 261 68.0564032163169 61.9668170229457 6.08958619337114 T:C C T 10 0.52072955481467 0.457920565514378 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 29994922 C/T 1 12 7 19 5.75124534222396 3.64510688370269 2.10613845852127 T:C C T 10 0.52072955481467 0.367172032607735 ENSG00000149930:ENST00000416441:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000279394:exon_29994824_29994985:TAOK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 8 7 15 3.83416356148264 3.64510688370269 0.18905667777995 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 30081476 C/T 1 2867 2731 5598 1374.06836634634 1422.11241419886 -48.0440478525225 T:C:G C T 10 0.52072955481467 0.1991041164747 ENSG00000149925:ENST00000395248:exon_30081438_30081741:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000338110:exon_30081438_30081734:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000436540:exon_30081438_30081734:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000412304:exon_30081438_30081734:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000395240:exon_30081438_30081741:ALDOA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 30094660 G/A 1 3 8 11 1.43781133555599 4.16583643851736 -2.72802510296137 A:G G A 10 0.52072955481467 0.132783549738221 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 30410091 G/A 1 11 10 21 5.27197489703863 5.2072955481467 0.0646793488919304 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 31075175 G/A 0 28 0 28 13.4195724651892 0 13.4195724651892 G G 10 0.52072955481467 1.27565978897763e-08 ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31075134_31075802:ZNF668 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 31505253 G/A 1 25 36 61 11.9817611296333 18.7462639733281 -6.76450284369487 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0955195620881934 ENSG00000140688:ENST00000327237:exon_31505187_31505257:C16orf58;ENSG00000140688:ENST00000452223:exon_31505187_31505257:C16orf58;ENSG00000140688:ENST00000430477:exon_31505187_31505257:C16orf58 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 56396486 C/T 1 58 55 113 27.7976858207491 28.6401255148068 -0.842439694057706 T:C C T 10 0.52072955481467 0.925067209361768 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 56839439 C/T 1 20 19 39 9.5854089037066 9.89386154147873 -0.308452637772129 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56839416_56839544:NUP93 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 57017319 G/A 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57017238_57017323:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57017238_57017323:CETP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 57071113 T/C 1 10 7 17 4.7927044518533 3.64510688370269 1.14759756815061 T:C T C 10 0.52072955481467 0.634129017759885 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57071107_57071196:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57071107_57071196:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57071107_57071196:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57071107_57071196:NLRC5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 57080528 C/A 1 12 4 16 5.75124534222396 2.08291821925868 3.66832712296528 A:C C A 10 0.52072955481467 0.0808258357838215 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57080464_57080553:NLRC5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 57392733 A/C 1 145 110 255 69.4942145518729 57.2802510296137 12.2139635222592 A:C A C 10 0.52072955481467 0.132619112751477 ENSG00000102962:ENST00000219235:exon_57392684_57392801:CCL22 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 57595999 A/G 1 20 15 35 9.5854089037066 7.81094332222005 1.77446558148655 A:G A G 10 0.52072955481467 0.613641602768592 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57595968_57596069:GPR114 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 57601792 C/T 1 48 31 79 23.0049813688958 16.1426161992548 6.86236516964107 T:C C T 10 0.52072955481467 0.142954830193226 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 57784797 C/T 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57784739_57784839:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57784739_57784839:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57784739_57784839:KATNB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 67214416 C/T 1 8 1 9 3.83416356148264 0.52072955481467 3.31343400666797 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0405156912184239 ENSG00000196123:ENST00000290881:exon_67213944_67214569:KIAA0895L;ENSG00000196123:ENST00000394016:exon_67213944_67214569:KIAA0895L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 67691668 A/G 1 39 27 66 18.6915473622279 14.0596979799961 4.63184938223178 A:G A G 10 0.52072955481467 0.269492695858739 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691665_67691756:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691665_67691756:ACD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 67763698 C/T 1 10 12 22 4.7927044518533 6.24875465777604 -1.45605020592274 T:C C T 10 0.52072955481467 0.670595760110997 ENSG00000141084:ENST00000317506:exon_67763583_67763731:RANBP10;ENSG00000141084:ENST00000448631:exon_67763583_67763731:RANBP10;ENSG00000141084:ENST00000411657:exon_67763583_67763731:RANBP10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 67865937 T/C 1 34 31 65 16.2951951363012 16.1426161992548 0.152578937046453 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000102901:ENST00000219172:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000440851:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000436104:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000445712:exon_67865915_67866011:CENPT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 68112725 C/T 1 23 13 36 11.0232202392626 6.76948421259071 4.25373602667188 T:C C T 10 0.52072955481467 0.182857638763797 ENSG00000167264:ENST00000358896:exon_68112652_68113223:DUS2L;ENSG00000167264:ENST00000432752:exon_68112652_68113218:DUS2L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 29 22 51 13.8988429103746 11.4560502059227 2.44279270445183 T:C C T 10 0.52072955481467 0.575601966284486 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 68893953 T/C 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 T:C T C 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000103047:ENST00000261778:exon_68893787_68894427:TMCO7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 69008037 C/T 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000103047:ENST00000261778:exon_69007931_69008071:TMCO7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 69201050 C/T 1 46 41 87 22.0464404785252 21.3499117474015 0.69652873112371 T:C C T 10 0.52072955481467 0.914833657449328 ENSG00000141076:ENST00000314423:exon_69200978_69201088:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000352319:exon_69200978_69201088:CIRH1A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 69354963 A/G 1 66 67 133 31.6318493822318 34.8888801725829 -3.25703079035111 A:G A G 10 0.52072955481467 0.603005753957236 ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 69373414 T/C 1 10 6 16 4.7927044518533 3.12437732888802 1.66832712296528 T:C T C 10 0.52072955481467 0.460768625180263 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69373079_69373513:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69373079_69373460:COG8;ENSG00000132603:ENST00000254940:exon_69373343_69373788:NIP7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 69973825 G/A 1 32 30 62 15.3366542459306 15.6218866444401 -0.285232398509539 A:T:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973744_69975644:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973744_69975643:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973744_69975643:WWP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 70164334 A/G 0 10 0 10 4.7927044518533 0 4.7927044518533 A A 10 0.52072955481467 0.00210541036264447 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70164326_70164447:PDPR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 70190401 C/T 1 6 11 17 2.87562267111198 5.72802510296137 -2.85240243184939 T:C C T 10 0.52072955481467 0.224918141362531 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70190378_70195205:PDPR;ENSG00000090857:ENST00000205055:exon_70190378_70190765:PDPR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 70303580 G/A 1 52 52 104 24.9220631496372 27.0779368503628 -2.15587370072568 A:G G A 10 0.52072955481467 0.695418902316408 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 70395387 C/T 1 22 21 43 10.5439497940773 10.9353206511081 -0.391370857030809 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000168872:ENST00000302243:exon_70395321_70395413:DDX19A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 24 21 45 11.5024906844479 10.9353206511081 0.567170033339851 T:C C T 10 0.52072955481467 0.88267073819837 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 70546234 G/A 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 A:G G A 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70546142_70546321:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70546176_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70546222_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70546226_70546335:COG4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 25 27 52 11.9817611296333 14.0596979799961 -2.07793685036284 A:T A T 10 0.52072955481467 0.581553855774598 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 60 56 116 28.7562267111198 29.1608550696215 -0.404628358501718 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 71318577 T/C 1 8 3 11 3.83416356148264 1.56218866444401 2.27197489703863 T:C T C 10 0.52072955481467 0.230986313204545 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 71319646 G/A 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 72137943 C/T 1 39 22 61 18.6915473622279 11.4560502059227 7.23549715630513 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0725827588859369 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137845_72138030:DHX38 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 72822296 G/A 1 12 3 15 5.75124534222396 1.56218866444401 4.18905667777995 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0374553526850559 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72816784_72822747:ZFHX3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 72829630 A/G 1 9 1 10 4.31343400666797 0.52072955481467 3.7927044518533 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0225455086853891 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72827154_72832613:ZFHX3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 74339364 G/A 1 208 161 369 99.6882525985486 83.8374583251619 15.8507942733868 A:G G A 10 0.52072955481467 0.106186812054139 ENSG00000103035:ENST00000219313:exon_74339187_74344205:PSMD7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 8 0 8 3.83416356148264 0 3.83416356148264 C C 10 0.52072955481467 0.00819011697530837 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 74490556 G/A 1 22 24 46 10.5439497940773 12.4975093155521 -1.95355952147482 A:G G A 10 0.52072955481467 0.658468619483023 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74490547_74490653:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74490547_74490653:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74490547_74490653:GLG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 74664743 T/C 1 10 7 17 4.7927044518533 3.64510688370269 1.14759756815061 T:C T C 10 0.52072955481467 0.634129017759885 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 74664810 A/T 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:T A T 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 74670458 C/T 1 17 10 27 8.14759756815061 5.2072955481467 2.94030202000391 T:C C T 10 0.52072955481467 0.335877161640575 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74670244_74670475:RFWD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 74671866 G/A 1 14 9 23 6.70978623259462 4.68656599333203 2.02322023926259 A:G G A 10 0.52072955481467 0.414185612013738 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74671754_74671868:RFWD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 74706349 T/C 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 T:C T C 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000168404:ENST00000306247:exon_74705755_74706436:MLKL;ENSG00000168404:ENST00000308807:exon_74705755_74706436:MLKL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 74937998 T/C 1 19 11 30 9.10613845852127 5.72802510296137 3.3781133555599 T:C T C 10 0.52072955481467 0.273263162366694 ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_74937845_74937998:WDR59;ENSG00000103091:ENST00000205064:exon_74937845_74938045:WDR59 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 81010073 C/T 1 43 28 71 20.6086291429692 14.5804275348108 6.02820160815843 T:C C T 10 0.52072955481467 0.156222071028524 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 81061827 G/A 1 12 4 16 5.75124534222396 2.08291821925868 3.66832712296528 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0808258357838215 ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000439957:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000393335:exon_81061776_81061902:CENPN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 22 9 31 10.5439497940773 4.68656599333203 5.85738380074523 A:C C A 10 0.52072955481467 0.0464850442379125 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 84213114 C/T 1 20 21 41 9.5854089037066 10.9353206511081 -1.34991174740147 T:C C T 10 0.52072955481467 0.755213277513956 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 28 19 47 13.4195724651892 9.89386154147873 3.52571092371051 A:T A T 10 0.52072955481467 0.311670332811952 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 84215390 T/C 1 26 8 34 12.4610315748186 4.16583643851736 8.29519513630122 T:C T C 10 0.52072955481467 0.00528690430590937 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84215352_84215664:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84215352_84215469:TAF1C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 84516309 G/A 1 10 9 19 4.7927044518533 4.68656599333203 0.10613845852127 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84516198_84516316:KIAA1609 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 84520292 C/T 1 7 4 11 3.35489311629731 2.08291821925868 1.27197489703863 T:C C T 10 0.52072955481467 0.552692319562948 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84520237_84520665:KIAA1609 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 115 100 215 55.116101196313 52.072955481467 3.04314571484596 A:C:G A G 10 0.52072955481467 0.682867044902786 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 66 95 161 31.6318493822318 49.4693077073936 -17.8374583251619 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00562163281141701 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 35 45 80 16.7744655814866 23.4328299666602 -6.6583643851736 T:G T G 10 0.52072955481467 0.146422167006607 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 32 63 95 15.3366542459306 32.8059619533242 -17.4693077073936 A:G A G 10 0.52072955481467 0.000420902701081779 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 85015541 G/A 1 9 11 20 4.31343400666797 5.72802510296137 -1.4145910962934 A:G G A 10 0.52072955481467 0.655741219933051 ENSG00000153786:ENST00000313732:exon_85015476_85015600:ZDHHC7;ENSG00000153786:ENST00000344861:exon_85015476_85015600:ZDHHC7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 85694968 C/T 1 19 11 30 9.10613845852127 5.72802510296137 3.3781133555599 T:C C T 10 0.52072955481467 0.273263162366694 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85694752_85695371:KIAA0182 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 85706047 A/C 1 9 13 22 4.31343400666797 6.76948421259071 -2.45605020592274 A:C A C 10 0.52072955481467 0.393983016021626 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85706011_85706960:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85706011_85706499:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85706011_85706102:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000471070:exon_85706011_85706254:KIAA0182 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 85954801 G/A 1 146 101 247 69.9734849970582 52.5936850362817 17.3797999607765 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0301784041622688 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85954712_85956197:IRF8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 86565882 G/C 1 6 11 17 2.87562267111198 5.72802510296137 -2.85240243184939 C:G G C 10 0.52072955481467 0.224918141362531 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 86566039 C/T 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 T:C C T 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 86566042 G/A 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 86575737 C/T 1 4 7 11 1.91708178074132 3.64510688370269 -1.72802510296137 T:C C T 10 0.52072955481467 0.371924081118385 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86575707_86575819:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86575707_86575819:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86575707_86575819:MTHFSD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 A:G G A 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 88713501 A/G 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 A:G A G 10 0.52072955481467 0.210816219015888 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 88779032 G/C 1 25 24 49 11.9817611296333 12.4975093155521 -0.515748185918829 C:G G C 10 0.52072955481467 0.887471056433241 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779030_88779313:CTU2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 15 29 44 7.18905667777995 15.1011570896254 -7.91210041184548 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0225748746333161 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 38 34 72 18.2122769170425 17.7048048636988 0.507472053343761 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 88872511 T/C 1 80 56 136 38.3416356148264 29.1608550696215 9.18078054520488 T:C T C 10 0.52072955481467 0.122649205635891 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872429_88872529:CDT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 89293501 G/A 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 89350038 G/A 1 32 24 56 15.3366542459306 12.4975093155521 2.83914493037848 A:G G A 10 0.52072955481467 0.504515161991656 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 89350178 G/A 1 35 38 73 16.7744655814866 19.7877230829575 -3.01325750147091 A:G G A 10 0.52072955481467 0.485032720351331 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 89644001 T/C 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89643947_89644129:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89643947_89644129:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000525982:exon_89643947_89644129:CPNE7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 89764190 C/T 1 7 1 8 3.35489311629731 0.52072955481467 2.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0721941130810857 ENSG00000158792:ENST00000289805:exon_89762751_89764713:SPATA2L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 16 89836323 C/T 1 11 15 26 5.27197489703863 7.81094332222005 -2.53896842518142 T:C C T 10 0.52072955481467 0.333843435098941 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89836245_89836432:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89836245_89836432:FANCA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 16 20 36 7.66832712296528 10.4145910962934 -2.74626397332812 A:G G A 10 0.52072955481467 0.406077322827484 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 526907 G/T 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 T:G G T 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_526773_526914:VPS53 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 1371393 C/T 1 101 84 185 48.4063149637183 43.7412826044323 4.66503235928605 T:C C T 10 0.52072955481467 0.508480358540945 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1371282_1371417:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1371282_1371417:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1371282_1371417:MYO1C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 1377943 A/G 1 62 50 112 29.7147676014905 26.0364777407335 3.67828986075696 A:G A G 10 0.52072955481467 0.509016210115319 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1377904_1377984:MYO1C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 1383893 G/A 1 40 50 90 19.1708178074132 26.0364777407335 -6.8656599333203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.170022575880784 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1383821_1383919:MYO1C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 1680002 T/C 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 T:C T C 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000132386:ENST00000254722:exon_1679826_1680036:SERPINF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 1684643 C/T 1 6 13 19 2.87562267111198 6.76948421259071 -3.89386154147873 T:C C T 10 0.52072955481467 0.105925620736623 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1682829_1684733:SMYD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 1686410 T/C 1 9 3 12 4.31343400666797 1.56218866444401 2.75124534222396 T:C T C 10 0.52072955481467 0.150146977653864 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1686329_1686452:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1684986_1686452:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000476292:exon_1686404_1686452:SMYD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 1690752 G/A 1 8 7 15 3.83416356148264 3.64510688370269 0.18905667777995 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1690716_1690898:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1690716_1690898:SMYD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 1782957 C/T 1 64 64 128 30.6733084918611 33.3266915081389 -2.65338301627776 T:C C T 10 0.52072955481467 0.658957750093049 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1782854_1782993:RPA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 1940232 A/G 1 29 11 40 13.8988429103746 5.72802510296137 8.1708178074132 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0107806275023180 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1940129_1940250:DPH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 1943880 C/G 1 12 13 25 5.75124534222396 6.76948421259071 -1.01823887036675 C:G C G 10 0.52072955481467 0.694646743266974 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1943799_1943899:DPH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 2091765 C/T 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 T:C C T 10 0.52072955481467 0.347970315516692 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2091693_2091809:SMG6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 2186100 C/T 1 3 10 13 1.43781133555599 5.2072955481467 -3.76948421259071 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0497304815614789 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2185941_2186153:SMG6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 2203025 T/G 1 7 11 18 3.35489311629731 5.72802510296137 -2.37313198666406 T:G T G 10 0.52072955481467 0.346420367518563 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 2203175 C/G 1 9 8 17 4.31343400666797 4.16583643851736 0.14759756815061 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 2203453 A/G 1 16 20 36 7.66832712296528 10.4145910962934 -2.74626397332812 A:G A G 10 0.52072955481467 0.406077322827484 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 2298615 T/C 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 T:C T C 10 0.52072955481467 0.347970315516692 ENSG00000070444:ENST00000174618:exon_2298169_2298748:MNT;ENSG00000070444:ENST00000404961:exon_2298169_2298748:MNT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 46 52 98 22.0464404785252 27.0779368503628 -5.03149637183766 A:G G A 10 0.52072955481467 0.314038151908493 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 3526637 C/T 1 14 7 21 6.70978623259462 3.64510688370269 3.06467934889193 T:C C T 10 0.52072955481467 0.197227501927402 ENSG00000197417:ENST00000225519:exon_3526633_3526785:SHPK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 3563963 C/G 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 3564068 G/A 1 8 1 9 3.83416356148264 0.52072955481467 3.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0405156912184239 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 3564073 A/G 1 9 1 10 4.31343400666797 0.52072955481467 3.7927044518533 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0225455086853891 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 3564084 T/C 0 8 0 8 3.83416356148264 0 3.83416356148264 T T 10 0.52072955481467 0.00819011697530837 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 3568012 A/G 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 A:G A G 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3567973_3568092:TAX1BP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 3577146 C/T 1 56 61 117 26.8391449303785 31.7645028436949 -4.92535791331639 T:C C T 10 0.52072955481467 0.405108110669188 ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3576521_3577171:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000345901:exon_3576524_3577171:P2RX5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 41 50 91 19.6500882525985 26.0364777407335 -6.38638948813497 T:C T C 10 0.52072955481467 0.207886236772676 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 3844787 C/G 1 54 40 94 25.8806040400078 20.8291821925868 5.05142184742102 C:G C G 10 0.52072955481467 0.304095222806395 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3844730_3844948:ATP2A3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 3845927 A/G 1 48 34 82 23.0049813688958 17.7048048636988 5.30017650519706 A:G A G 10 0.52072955481467 0.269466265928968 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3845900_3846025:ATP2A3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 3846802 A/G 1 16 22 38 7.66832712296528 11.4560502059227 -3.78772308295746 A:G A G 10 0.52072955481467 0.256456984157809 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3846685_3846816:ATP2A3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 3848013 A/C 1 21 23 44 10.0646793488919 11.9767797607374 -1.91210041184548 A:C A C 10 0.52072955481467 0.651371499155847 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3847998_3848100:ATP2A3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 3910165 A/G 1 11 11 22 5.27197489703863 5.72802510296137 -0.45605020592274 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3907739_3910264:ZZEF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 3947644 T/C 1 6 14 20 2.87562267111198 7.29021376740538 -4.4145910962934 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0709058537292896 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3947518_3947668:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3947518_3947668:ZZEF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 3968064 A/C 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 A:C A C 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3967655_3968123:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3967655_3968123:ZZEF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 4585821 G/A 1 27 31 58 12.9403020200039 16.1426161992548 -3.20231417925086 A:G G A 10 0.52072955481467 0.431904829293632 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4585797_4585868:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4585797_4585868:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4585797_4585868:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4585797_4585868:PELP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 4699552 G/A 1 21 18 39 10.0646793488919 9.37313198666406 0.691547362227871 A:G G A 10 0.52072955481467 0.873630371447354 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4699439_4699591:PSMB6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 101 86 187 48.4063149637183 44.7827417140616 3.62357324965672 T:C:G C T 10 0.52072955481467 0.609135330701134 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 4796274 T/C 1 34 18 52 16.2951951363012 9.37313198666406 6.92206314963716 A:T:C T C 10 0.52072955481467 0.0702091580965656 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4796274_4796362:MINK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 4796286 C/T 1 35 21 56 16.7744655814866 10.9353206511081 5.83914493037848 T:C C T 10 0.52072955481467 0.140943999959325 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4796274_4796362:MINK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 4797305 G/A 1 27 28 55 12.9403020200039 14.5804275348108 -1.64012551480685 A:G G A 10 0.52072955481467 0.687196889659917 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4797283_4797388:MINK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 4856376 A/G 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 A:G A G 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000108515:ENST00000520221:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522798:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522301:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521811:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519602:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000441285:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000381335:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000323997:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000422083:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519834:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522249:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521659:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000518175:exon_4856346_4856404:ENO3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 4856580 T/C 1 5 10 15 2.39635222592665 5.2072955481467 -2.81094332222005 T:C T C 10 0.52072955481467 0.196715161243913 ENSG00000108515:ENST00000520221:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522798:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522301:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521811:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519602:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000441285:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000381335:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000323997:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000422083:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519834:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522249:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000517627:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521659:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000518175:exon_4856567_4856636:ENO3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 4858732 C/T 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 T:C C T 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000108515:ENST00000519602:exon_4858702_4858883:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000441285:exon_4858702_4858899:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000381335:exon_4858702_4858899:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000323997:exon_4858702_4858899:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000422083:exon_4858702_4858899:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521659:exon_4858702_4859157:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519584:exon_4858702_4858899:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000518175:exon_4858702_4858899:ENO3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 4875566 T/C 1 17 10 27 8.14759756815061 5.2072955481467 2.94030202000391 T:C T C 10 0.52072955481467 0.335877161640575 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 4883818 C/G 1 6 12 18 2.87562267111198 6.24875465777604 -3.37313198666406 C:G C G 10 0.52072955481467 0.155728897636768 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4882979_4883916:CAMTA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 84 48 132 40.2587173955677 24.9950186311042 15.2636987644636 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00875564080712749 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5126689 G/A 1 82 44 126 39.3001765051971 22.9121004118455 16.3880760933516 A:C:G G A 10 0.52072955481467 0.00414651161928235 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 40 36 76 19.1708178074132 18.7462639733281 0.424553834085081 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5284698 A/G 1 29 24 53 13.8988429103746 12.4975093155521 1.40133359482249 A:C:G A G 10 0.52072955481467 0.78377438123074 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5284719 T/C 1 24 19 43 11.5024906844479 9.89386154147873 1.60862914296919 T:C T C 10 0.52072955481467 0.650094237647782 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5284770 G/A 1 32 27 59 15.3366542459306 14.0596979799961 1.27695626593447 A:G G A 10 0.52072955481467 0.795068533155472 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 42 23 65 20.1293586977839 11.9767797607374 8.15257893704645 A:G A G 10 0.52072955481467 0.046957711072265 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 38 17 55 18.2122769170425 8.85240243184939 9.35987448519315 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0144188284176320 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5294976 T/A 1 27 29 56 12.9403020200039 15.1011570896254 -2.16085506962152 A:T T A 10 0.52072955481467 0.594406133513865 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 17 12 29 8.14759756815061 6.24875465777604 1.89884291037457 T:C C T 10 0.52072955481467 0.578315378656019 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 42 32 74 20.1293586977839 16.6633457540694 3.46601294371442 T:C C T 10 0.52072955481467 0.485412682824854 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 39 36 75 18.6915473622279 18.7462639733281 -0.0547166111002468 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5347576 G/A 1 14 16 30 6.70978623259462 8.33167287703472 -1.6218866444401 A:G G A 10 0.52072955481467 0.587501156256487 ENSG00000005100:ENST00000225296:exon_5344232_5347833:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000457531:exon_5345596_5347833:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000433302:exon_5345596_5347833:DHX33 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5425076 A/G 1 13 9 22 6.23051578740929 4.68656599333203 1.54394979407726 A:G A G 10 0.52072955481467 0.53135812068658 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 13 10 23 6.23051578740929 5.2072955481467 1.02322023926259 T:C T C 10 0.52072955481467 0.683682381961274 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5436263 C/T 1 5 9 14 2.39635222592665 4.68656599333203 -2.29021376740538 A:T:C C T 10 0.52072955481467 0.287077835461110 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5436142_5436304:NLRP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 5485367 A/T 1 23 22 45 11.0232202392626 11.4560502059227 -0.432829966660149 A:T A T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5485179_5485382:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5485179_5485382:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5485179_5485382:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5485179_5485382:NLRP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 6900362 C/T 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 T:C C T 10 0.52072955481467 0.56880209104754 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 6919093 T/C 1 130 114 244 62.3051578740929 59.3631692488724 2.94198862522052 T:C T C 10 0.52072955481467 0.748776102524884 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6919093_6919194:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6919093_6919194:C17orf49 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 6941625 C/T 1 4 9 13 1.91708178074132 4.68656599333203 -2.76948421259071 T:C C T 10 0.52072955481467 0.166029130373969 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 6943266 G/A 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6943082_6943438:SLC16A13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 6946287 T/C 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 T:C T C 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6946249_6946392:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6946249_6946392:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6946249_6946392:SLC16A11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 31 21 52 14.8573838007452 10.9353206511081 3.92206314963716 T:C T C 10 0.52072955481467 0.331484873471674 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 30 28 58 14.3781133555599 14.5804275348108 -0.202314179250859 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7133162 G/A 1 33 22 55 15.8159246911159 11.4560502059227 4.35987448519315 A:C:G G A 10 0.52072955481467 0.280598101101481 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 170 98 268 81.4759756815061 51.0314963718377 30.4444793096684 A:G G A 10 0.52072955481467 0.000185391243447881 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7154582 T/C 1 141 97 238 67.5771327711315 50.510766817023 17.0663659541085 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0274191255797879 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7224921 C/G 1 18 13 31 8.62686801333594 6.76948421259071 1.85738380074523 C:G C G 10 0.52072955481467 0.591060437395048 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7224879_7225106:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7224879_7225106:NEURL4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7230845 G/T 1 5 8 13 2.39635222592665 4.16583643851736 -1.76948421259071 T:G G T 10 0.52072955481467 0.409410722535207 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7230759_7231203:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7230759_7231203:NEURL4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7245371 A/G 1 40 47 87 19.1708178074132 24.4742890762895 -5.30347126887629 A:G A G 10 0.52072955481467 0.283561446792673 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7245267_7245386:ACAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7251605 G/C 1 10 6 16 4.7927044518533 3.12437732888802 1.66832712296528 C:G G C 10 0.52072955481467 0.460768625180263 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7592560 C/T 1 15 12 27 7.18905667777995 6.24875465777604 0.94030202000391 T:C C T 10 0.52072955481467 0.8478003207822 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7592542_7592640:WRAP53 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7606722 C/G 1 5 8 13 2.39635222592665 4.16583643851736 -1.76948421259071 C:G C G 10 0.52072955481467 0.409410722535207 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7750232 T/C 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 T:C T C 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750137_7750334:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750137_7750334:KDM6B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7750436 C/T 1 11 13 24 5.27197489703863 6.76948421259071 -1.49750931555208 T:C C T 10 0.52072955481467 0.548584049171421 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750423_7750770:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750423_7750770:KDM6B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7751778 G/A 1 12 18 30 5.75124534222396 9.37313198666406 -3.6218866444401 A:G G A 10 0.52072955481467 0.204170935491037 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 97 104 201 46.489233182977 54.1558737007257 -7.66664051774867 A:G G A 10 0.52072955481467 0.290100299316706 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 38 33 71 18.2122769170425 17.1840753088841 1.02820160815843 A:G A G 10 0.52072955481467 0.813671983712961 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 7761512 C/A 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 A:C C A 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000182224:ENST00000332439:exon_7761064_7761612:CYB5D1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 8048169 T/C 1 13 16 29 6.23051578740929 8.33167287703472 -2.10115708962543 T:C T C 10 0.52072955481467 0.462301755728773 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 8048283 G/A 1 20 21 41 9.5854089037066 10.9353206511081 -1.34991174740147 A:G G A 10 0.52072955481467 0.755213277513956 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 8053085 T/G 1 18 17 35 8.62686801333594 8.85240243184939 -0.225534418513449 T:G T G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000413754:exon_8053073_8053194:PER1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 8092694 T/G 1 23 9 32 11.0232202392626 4.68656599333203 6.33665424593056 T:G T G 10 0.52072955481467 0.0323378049376255 ENSG00000196544:ENST00000389017:exon_8091652_8093564:C17orf59;ENSG00000196544:ENST00000357939:exon_8092385_8093056:C17orf59 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 8108281 G/A 1 82 33 115 39.3001765051971 17.1840753088841 22.1161011963129 A:G G A 10 0.52072955481467 3.3198953586737e-05 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 8132763 T/C 1 23 23 46 11.0232202392626 11.9767797607374 -0.953559521474819 T:C T C 10 0.52072955481467 0.882897772659332 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8132620_8132764:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8132620_8132764:C17orf68 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 8157310 C/T 1 14 16 30 6.70978623259462 8.33167287703472 -1.6218866444401 T:C C T 10 0.52072955481467 0.587501156256487 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8157177_8157397:PFAS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 8167600 T/C 1 8 12 20 3.83416356148264 6.24875465777604 -2.4145910962934 T:C T C 10 0.52072955481467 0.371430851394435 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8167530_8167655:PFAS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 8168224 T/C 1 21 17 38 10.0646793488919 8.85240243184939 1.21227691704254 T:C T C 10 0.52072955481467 0.747094710173641 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8168213_8168443:PFAS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 8192922 C/T 1 21 14 35 10.0646793488919 7.29021376740538 2.77446558148655 T:C C T 10 0.52072955481467 0.399537055090493 ENSG00000125434:ENST00000312524:exon_8192892_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000396278:exon_8192892_8192961:SLC25A35 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 8281059 A/C 1 6 8 14 2.87562267111198 4.16583643851736 -1.29021376740538 A:C A C 10 0.52072955481467 0.596274656681649 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 8792029 A/G 1 35 25 60 16.7744655814866 13.0182388703667 3.7562267111198 A:G A G 10 0.52072955481467 0.366944330974419 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 8792514 G/A 1 15 9 24 7.18905667777995 4.68656599333203 2.50249068444792 A:G G A 10 0.52072955481467 0.414445820205225 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8792456_8792539:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8792456_8792539:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8792456_8792539:PIK3R5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 14005439 G/A 1 12 9 21 5.75124534222396 4.68656599333203 1.06467934889193 A:G G A 10 0.52072955481467 0.669361120839622 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_14005435_14005559:COX10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 16343026 C/T 1 11 16 27 5.27197489703863 8.33167287703472 -3.05969797999609 T:C C T 10 0.52072955481467 0.253772919953493 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 17163741 G/A 1 39 27 66 18.6915473622279 14.0596979799961 4.63184938223178 A:G G A 10 0.52072955481467 0.269492695858739 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17163615_17163788:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000471414:exon_17163615_17164010:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17163616_17163788:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17163688_17163788:COPS3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 25 23 48 11.9817611296333 11.9767797607374 0.00498136889584089 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 17394611 G/A 1 19 19 38 9.10613845852127 9.89386154147873 -0.787723082957459 A:G G A 10 0.52072955481467 0.87154498790441 ENSG00000141026:ENST00000268711:exon_17394593_17396535:MED9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 17948475 G/A 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 A:G G A 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000141034:ENST00000268719:exon_17948461_17948520:C17orf39;ENSG00000141034:ENST00000376345:exon_17948461_17948520:C17orf39 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 18167397 G/T 1 7 8 15 3.35489311629731 4.16583643851736 -0.81094332222005 T:G G T 10 0.52072955481467 0.797925780414529 ENSG00000177427:ENST00000323019:exon_18167024_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395704:exon_18167098_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395706:exon_18167024_18169095:SMCR7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 18167505 T/C 1 2 7 9 0.95854089037066 3.64510688370269 -2.68656599333203 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0972167926377697 ENSG00000177427:ENST00000323019:exon_18167024_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395704:exon_18167098_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395706:exon_18167024_18169095:SMCR7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 18220770 G/A 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 A:G G A 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 18221144 G/A 1 8 9 17 3.83416356148264 4.68656599333203 -0.85240243184939 A:G G A 10 0.52072955481467 0.809480166298499 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 18575055 G/A 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 33 36 69 15.8159246911159 18.7462639733281 -2.93033928221223 A:G A G 10 0.52072955481467 0.54722202617951 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 20107773 T/C 1 12 22 34 5.75124534222396 11.4560502059227 -5.70480486369878 T:C T C 10 0.52072955481467 0.058745856269239 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 20108239 A/T 1 26 25 51 12.4610315748186 13.0182388703667 -0.557207295548169 A:T A T 10 0.52072955481467 0.88948472920142 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 18 16 34 8.62686801333594 8.33167287703472 0.295195136301221 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 20163529 A/G 1 7 4 11 3.35489311629731 2.08291821925868 1.27197489703863 A:G A G 10 0.52072955481467 0.552692319562948 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20163505_20163607:SPECC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 61 0 61 29.2354971563051 0 29.2354971563051 T T 10 0.52072955481467 7.3726494926366e-18 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 54 0 54 25.8806040400078 0 25.8806040400078 G G 10 0.52072955481467 8.34410859165327e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 57 1 58 27.3184153755638 0.52072955481467 26.7976858207491 A:C C A 10 0.52072955481467 2.59035323016063e-15 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 30 0 30 14.3781133555599 0 14.3781133555599 C C 10 0.52072955481467 3.4118767029665e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 57 0 57 27.3184153755638 0 27.3184153755638 C C 10 0.52072955481467 1.09371040481171e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 46 1 47 22.0464404785252 0.52072955481467 21.5257109237105 A:C C A 10 0.52072955481467 3.41197464915293e-12 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 45 0 45 21.5671700333398 0 21.5671700333398 C C 10 0.52072955481467 1.81055617677368e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 50 0 50 23.9635222592665 0 23.9635222592665 C C 10 0.52072955481467 1.26853663576984e-14 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 54 0 54 25.8806040400078 0 25.8806040400078 G G 10 0.52072955481467 8.34410859165327e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 77 0 77 36.9038242792704 0 36.9038242792704 G G 10 0.52072955481467 1.72554957834624e-22 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 25931745 C/T 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 T:C C T 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25931706_25931754:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25931706_25931754:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25931706_25931754:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398988:exon_25931706_25931754:KSR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 33 33 66 15.8159246911159 17.1840753088841 -1.36815061776822 A:G G A 10 0.52072955481467 0.805677328043137 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 46 20 66 22.0464404785252 10.4145910962934 11.6318493822318 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00437335808061182 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 26676135 C/T 1 74 89 163 35.4660129437144 46.3449303785056 -10.8789174347912 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0994706984461254 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 27009749 C/T 1 53 52 105 25.4013335948225 27.0779368503628 -1.67660325554035 T:C C T 10 0.52072955481467 0.770058871910068 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27009745_27009874:SUPT6H;ENSG00000109111:ENST00000347486:exon_27009745_27009874:SUPT6H HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 27014396 C/T 1 44 38 82 21.0878995881545 19.7877230829575 1.30017650519706 T:C C T 10 0.52072955481467 0.825421600648066 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 27014483 C/A 1 39 47 86 18.6915473622279 24.4742890762895 -5.78274171406161 A:C C A 10 0.52072955481467 0.235435470959616 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 27185827 C/T 1 65 76 141 31.1525789370464 39.5754461659149 -8.42286722886847 T:C C T 10 0.52072955481467 0.177283190482259 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27185594_27185842:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27185594_27185842:ERAL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 27424316 G/A 1 11 6 17 5.27197489703863 3.12437732888802 2.14759756815061 A:G G A 10 0.52072955481467 0.339416350374528 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533652:exon_27423915_27424371:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527686:exon_27424164_27424368:MYO18A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 27438469 G/A 1 16 21 37 7.66832712296528 10.9353206511081 -3.26699352814279 A:G G A 10 0.52072955481467 0.32482658498311 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27438442_27438601:MYO18A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 27441077 C/G 1 11 9 20 5.27197489703863 4.68656599333203 0.5854089037066 C:G C G 10 0.52072955481467 0.826808206154088 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533399:exon_27441029_27441286:MYO18A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 27613677 G/A 1 9 10 19 4.31343400666797 5.2072955481467 -0.89386154147873 A:G G A 10 0.52072955481467 0.819317260655474 ENSG00000108256:ENST00000225388:exon_27613010_27614734:NUFIP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 27869968 G/A 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 A:G G A 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000160551:ENST00000261716:exon_27869579_27871502:TAOK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 28576076 T/C 1 40 24 64 19.1708178074132 12.4975093155521 6.67330849186112 T:C T C 10 0.52072955481467 0.104300043616209 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28575223_28576186:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28575223_28576186:BLMH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 28612448 G/C 1 18 25 43 8.62686801333594 13.0182388703667 -4.39137085703081 T:C:G G C 10 0.52072955481467 0.221851712159764 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28612406_28612498:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28612406_28612498:BLMH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 29096006 C/T 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.292441655168790 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 29111368 A/G 1 10 13 23 4.7927044518533 6.76948421259071 -1.97677976073741 A:G A G 10 0.52072955481467 0.532250778549921 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 29553485 G/A 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000196712:ENST00000358273:exon_29553453_29553702:NF1;ENSG00000196712:ENST00000356175:exon_29553453_29553702:NF1;ENSG00000196712:ENST00000444181:exon_29553453_29553702:NF1;ENSG00000196712:ENST00000495910:exon_29553453_29553702:NF1;ENSG00000196712:ENST00000456735:exon_29553453_29553702:NF1;ENSG00000196712:ENST00000493220:exon_29553453_29553702:NF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 17 33 50 8.14759756815061 17.1840753088841 -9.0364777407335 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0108653786102307 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 33433487 C/T 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000185379:ENST00000345365:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000474236:exon_33433405_33433490:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000360276:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000335858:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000394589:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000489139:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000345766:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000460118:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000494406:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000418935:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000415064:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000339934:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000486323:exon_33433460_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000467861:exon_33433460_33433500:RAD51L3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 33446607 C/G 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 C:G C G 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000185379:ENST00000345365:exon_33446551_33446888:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000360276:exon_33446551_33446888:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000335858:exon_33446551_33446888:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000394589:exon_33446551_33446888:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000489139:exon_33446551_33446738:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000345766:exon_33446551_33446738:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000460118:exon_33446551_33446735:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000418935:exon_33446551_33446748:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000339934:exon_33446551_33446888:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000357906:exon_33446551_33446888:RAD51L3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 33998802 G/C 1 20 19 39 9.5854089037066 9.89386154147873 -0.308452637772129 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 34416537 G/A 1 258 162 420 123.651774857815 84.3581878799765 39.2935869778386 A:G G A 10 0.52072955481467 0.000133803397340548 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 35310422 G/A 1 156 152 308 74.7661894489115 79.1508923318298 -4.38470288291835 A:G G A 10 0.52072955481467 0.648310985308725 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35310186_35310596:AATF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 35346641 T/C 1 40 31 71 19.1708178074132 16.1426161992548 3.02820160815843 T:C T C 10 0.52072955481467 0.479255963893725 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35346546_35346710:AATF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 35376351 C/T 1 52 46 98 24.9220631496372 23.9535595214748 0.968503628162342 T:C C T 10 0.52072955481467 0.919541869076953 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35376304_35376371:AATF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 35896123 T/C 1 15 16 31 7.18905667777995 8.33167287703472 -1.14261619925477 T:C T C 10 0.52072955481467 0.721790765566653 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000508220:exon_35896081_35897580:SYNRG HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 35956391 G/C 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 C:G G C 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000378189:exon_35956270_35956391:SYNRG HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 36909499 A/T 1 98 68 166 46.9685036281623 35.4096097273976 11.5588939007648 A:T A T 10 0.52072955481467 0.0743453853242314 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909403_36909587:PSMB3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 36926731 T/G 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 T:G T G 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 36926767 G/A 1 13 7 20 6.23051578740929 3.64510688370269 2.5854089037066 A:G G A 10 0.52072955481467 0.271400284316410 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 61 58 119 29.2354971563051 30.2023141792509 -0.96681702294573 A:G A G 10 0.52072955481467 0.926948742047266 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 37334243 G/A 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:G G A 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000067191:ENST00000394303:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000344140:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000394310:exon_37334237_37334332:CACNB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 37627525 A/G 1 12 14 26 5.75124534222396 7.29021376740538 -1.53896842518142 A:G A G 10 0.52072955481467 0.562641904116243 ENSG00000167258:ENST00000300647:exon_37627135_37628016:CDK12;ENSG00000167258:ENST00000430627:exon_37627132_37628016:CDK12;ENSG00000167258:ENST00000447079:exon_37627132_37628016:CDK12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 37922259 G/A 1 23 25 48 11.0232202392626 13.0182388703667 -1.99501863110416 A:G G A 10 0.52072955481467 0.567626612652638 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37913968_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_37921198_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439167:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000394189:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377952:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000351680:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346243:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37922043_37922746:IKZF3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 38711222 T/C 1 120 62 182 57.5124534222396 32.2852323985095 25.2272210237301 T:C T C 10 0.52072955481467 0.000191389087342149 ENSG00000126353:ENST00000246657:exon_38710021_38712070:CCR7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 38990834 G/C 1 7 9 16 3.35489311629731 4.68656599333203 -1.33167287703472 C:G G C 10 0.52072955481467 0.61923512047445 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 8 12 20 3.83416356148264 6.24875465777604 -2.4145910962934 A:T T A 10 0.52072955481467 0.371430851394435 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 39983808 G/C 1 43 4 47 20.6086291429692 2.08291821925868 18.5257109237105 C:G G C 10 0.52072955481467 9.3076819446788e-09 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 39983820 G/A 1 46 3 49 22.0464404785252 1.56218866444401 20.4842518140812 A:G G A 10 0.52072955481467 2.71772497594222e-10 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 39983849 G/C 1 60 12 72 28.7562267111198 6.24875465777604 22.5074720533438 C:G G C 10 0.52072955481467 4.048153821481e-08 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 40125864 G/A 1 48 42 90 23.0049813688958 21.8706413022161 1.1343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 0.833575736604761 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 40142302 T/C 1 45 51 96 21.5671700333398 26.5572072955482 -4.99003726220832 A:T:C T C 10 0.52072955481467 0.309480723916362 ENSG00000168259:ENST00000457167:exon_40142282_40142400:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000426588:exon_40142282_40142400:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000316603:exon_40142282_40142400:DNAJC7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 40257163 T/C 1 13 6 19 6.23051578740929 3.12437732888802 3.10613845852127 T:C T C 10 0.52072955481467 0.173990747242703 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 49 44 93 23.4842518140812 22.9121004118455 0.57215140223569 A:C C A 10 0.52072955481467 0.917767516154146 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 28 36 64 13.4195724651892 18.7462639733281 -5.32669150813888 A:G A G 10 0.52072955481467 0.210955535631090 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 40722029 A/G 1 39 40 79 18.6915473622279 20.8291821925868 -2.13763483035893 A:G A G 10 0.52072955481467 0.653642104558189 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40722000_40722201:MLX HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 7 6 13 3.35489311629731 3.12437732888802 0.23051578740929 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 17 14 31 8.14759756815061 7.29021376740538 0.857383800745231 A:G A G 10 0.52072955481467 0.857960893951531 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 40822678 C/T 1 14 24 38 6.70978623259462 12.4975093155521 -5.78772308295746 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0733991870094423 ENSG00000068137:ENST00000293349:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000412503:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000456950:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000445882:exon_40822591_40822723:PLEKHH3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 42398052 A/G 1 125 82 207 59.9088056481663 42.6998234948029 17.2089821533633 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0178893700237796 ENSG00000013306:ENST00000225308:exon_42397990_42398099:SLC25A39;ENSG00000013306:ENST00000377095:exon_42397990_42398099:SLC25A39 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 42398757 C/A 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 A:C C A 10 0.52072955481467 0.326815943641994 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 36 39 75 17.2537360266719 20.3084526377721 -3.05471661110025 C:G G C 10 0.52072955481467 0.490413922353287 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 43003484 T/C 1 21 15 36 10.0646793488919 7.81094332222005 2.25373602667188 T:C T C 10 0.52072955481467 0.506830356128462 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43003360_43003554:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43003448_43003554:KIF18B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 43010064 G/A 1 14 8 22 6.70978623259462 4.16583643851736 2.54394979407726 A:G G A 10 0.52072955481467 0.295404626091449 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43010041_43010141:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43010041_43010141:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000376982:exon_43010041_43010141:KIF18B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 89 85 174 42.6550696214944 44.262012159247 -1.60694253775258 T:C C T 10 0.52072955481467 0.82029971548598 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 86 89 175 41.2172582859384 46.3449303785056 -5.12767209256724 A:G G A 10 0.52072955481467 0.450048420120929 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 44248737 A/G 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G A G 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 45735975 G/A 1 51 54 105 24.4427927044518 28.1193959599922 -3.67660325554035 A:G G A 10 0.52072955481467 0.495104486682524 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45735874_45736026:KPNB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 45750468 T/C 1 81 88 169 38.8209060600117 45.824200823691 -7.00329476367923 T:C T C 10 0.52072955481467 0.282395940769088 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45750384_45750531:KPNB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 14 11 25 6.70978623259462 5.72802510296137 0.98176112963325 T:C C T 10 0.52072955481467 0.841891529653028 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 45915395 T/C 1 7 8 15 3.35489311629731 4.16583643851736 -0.81094332222005 T:C T C 10 0.52072955481467 0.797925780414529 ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 46000406 T/C 1 19 15 34 9.10613845852127 7.81094332222005 1.29519513630122 T:C T C 10 0.52072955481467 0.732713753067144 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46000328_46000640:SP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 46020698 C/T 1 8 10 18 3.83416356148264 5.2072955481467 -1.37313198666406 T:C C T 10 0.52072955481467 0.638802194234348 ENSG00000108439:ENST00000225573:exon_46020672_46020796:PNPO;ENSG00000108439:ENST00000434554:exon_46020672_46020796:PNPO HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 46926615 G/A 1 49 58 107 23.4842518140812 30.2023141792509 -6.71806236516969 A:G G A 10 0.52072955481467 0.208874423663403 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509415:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000505071:exon_46926614_46926631:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000502761:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46926614_46926739:CALCOCO2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 46973071 G/C 1 100 53 153 47.927044518533 27.5986664051775 20.3283781133555 C:G G C 10 0.52072955481467 0.00114139983150635 ENSG00000159199:ENST00000355938:exon_46973017_46973233:ATP5G1;ENSG00000159199:ENST00000513347:exon_46973017_46973230:ATP5G1;ENSG00000159199:ENST00000503641:exon_46973017_46973233:ATP5G1;ENSG00000159199:ENST00000393366:exon_46973017_46973231:ATP5G1;ENSG00000159199:ENST00000506855:exon_46973017_46973233:ATP5G1;ENSG00000159199:ENST00000513781:exon_46973017_46973223:ATP5G1;ENSG00000159199:ENST00000502964:exon_46973017_46973233:ATP5G1;ENSG00000159199:ENST00000515060:exon_46973017_46973233:ATP5G1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 47021314 C/T 1 30 25 55 14.3781133555599 13.0182388703667 1.35987448519315 T:C C T 10 0.52072955481467 0.787718165681325 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47021287_47021337:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47021287_47021337:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47021287_47021337:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000507302:exon_47021287_47021337:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514929:exon_47021287_47021337:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510558:exon_47021287_47021337:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000512243:exon_47021287_47021337:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515174:exon_47021287_47021501:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510195:exon_47021287_47021337:SNF8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 48174908 C/T 1 9 6 15 4.31343400666797 3.12437732888802 1.18905667777995 T:C C T 10 0.52072955481467 0.611940175630342 ENSG00000005882:ENST00000007708:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000508030:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000503176:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000503614:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000442211:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000508960:exon_48174787_48175160:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000505897:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000505440:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000512238:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000515040:exon_48174877_48174928:PDK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 48433958 T/C 1 9 8 17 4.31343400666797 4.16583643851736 0.14759756815061 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48433872_48434134:XYLT2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 48539035 T/C 1 22 15 37 10.5439497940773 7.81094332222005 2.73300647185721 T:C T C 10 0.52072955481467 0.413063314099052 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539018_48539047:ACSF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 48557326 G/A 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 A:G G A 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 48557348 T/C 1 9 6 15 4.31343400666797 3.12437732888802 1.18905667777995 T:C T C 10 0.52072955481467 0.611940175630342 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 48559559 A/G 1 18 6 24 8.62686801333594 3.12437732888802 5.50249068444792 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0254072188637344 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000515221:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000451010:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000504284:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000506211:exon_48559458_48559817:RSAD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 49077039 C/T 1 10 6 16 4.7927044518533 3.12437732888802 1.66832712296528 T:C C T 10 0.52072955481467 0.460768625180263 ENSG00000008294:ENST00000262013:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357804:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000376407:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000510283:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000505279:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357122:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000514613:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000505173:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000513827:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000515685:exon_49077022_49077078:SPAG9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 49350802 A/C 1 11 5 16 5.27197489703863 2.60364777407335 2.66832712296528 A:C:G A C 10 0.52072955481467 0.216398220878093 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49350723_49350811:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000508506:exon_49350723_49350811:UTP18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 61805747 G/A 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000125695:ENST00000336174:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375840:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000447001:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000392950:exon_61805718_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375841:exon_61805694_61805773:STRADA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 61901197 T/A 1 26 56 82 12.4610315748186 29.1608550696215 -16.6998234948029 A:T T A 10 0.52072955481467 0.000230947329774641 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901177_61901312:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901177_61901312:FTSJ3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 61903445 G/C 1 18 23 41 8.62686801333594 11.9767797607374 -3.34991174740147 C:G G C 10 0.52072955481467 0.348892228743102 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903416_61903495:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903416_61903495:FTSJ3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 61908271 C/T 1 132 123 255 63.2636987644636 64.0497352422044 -0.786036477740844 T:C C T 10 0.52072955481467 0.95005507450271 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908169_61908295:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908169_61908295:PSMC5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 62290699 G/A 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 A:G G A 10 0.52072955481467 0.806303597637586 ENSG00000136478:ENST00000258991:exon_62289934_62291602:TEX2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 65988049 T/C 1 7 1 8 3.35489311629731 0.52072955481467 2.83416356148264 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0721941130810857 ENSG00000186665:ENST00000449250:exon_65987218_65988219:C17orf58;ENSG00000186665:ENST00000334461:exon_65987218_65988219:C17orf58 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 109 104 213 52.240478525201 54.1558737007257 -1.91539517552471 A:G A G 10 0.52072955481467 0.837065482076384 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 67515558 C/T 1 17 20 37 8.14759756815061 10.4145910962934 -2.26699352814279 T:C C T 10 0.52072955481467 0.512047217834505 ENSG00000108984:ENST00000359094:exon_67515454_67515573:MAP2K6;ENSG00000108984:ENST00000435374:exon_67515454_67515573:MAP2K6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 70120551 A/C 1 13 4 17 6.23051578740929 2.08291821925868 4.14759756815061 A:T:C A C 10 0.52072955481467 0.0522960077891863 ENSG00000125398:ENST00000245479:exon_70119684_70122561:SOX9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 72758210 C/T 1 27 36 63 12.9403020200039 18.7462639733281 -5.80596195332421 T:C C T 10 0.52072955481467 0.165375300195822 ENSG00000109062:ENST00000262613:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1;ENSG00000109062:ENST00000413388:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 72769739 A/G 1 10 10 20 4.7927044518533 5.2072955481467 -0.4145910962934 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72769715_72769827:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72769715_72769824:NAT9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 72771766 C/G 1 6 8 14 2.87562267111198 4.16583643851736 -1.29021376740538 C:G C G 10 0.52072955481467 0.596274656681649 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72771761_72771846:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72771761_72771846:NAT9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 73125173 A/G 1 8 9 17 3.83416356148264 4.68656599333203 -0.85240243184939 A:G A G 10 0.52072955481467 0.809480166298499 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 73127110 A/T 1 6 16 22 2.87562267111198 8.33167287703472 -5.45605020592274 A:T A T 10 0.52072955481467 0.0304645623805761 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 8 16 24 3.83416356148264 8.33167287703472 -4.49750931555208 C:G G C 10 0.52072955481467 0.100165006005282 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 73627539 T/C 1 15 11 26 7.18905667777995 5.72802510296137 1.46103157481858 T:C T C 10 0.52072955481467 0.695544738359801 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73627530_73627748:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73627530_73627748:RECQL5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 73830426 C/T 0 94 0 94 45.051421847421 0 45.051421847421 C C 10 0.52072955481467 2.39632354910452e-27 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73830406_73830612:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73830406_73830612:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73830406_73830612:UNC13D HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 74057198 A/G 1 22 19 41 10.5439497940773 9.89386154147873 0.650088252598531 A:G A G 10 0.52072955481467 0.876851211844837 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74057191_74057300:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000304220:exon_74057186_74057300:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74057191_74057300:SRP68 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 74077797 C/T 1 29 50 79 13.8988429103746 26.0364777407335 -12.1376348303589 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00672399191683099 ENSG00000186919:ENST00000334586:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000425015:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000441571:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000421794:exon_74077681_74077836:ZACN;ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 74079710 G/C 1 42 44 86 20.1293586977839 22.9121004118455 -2.78274171406162 C:G G C 10 0.52072955481467 0.590051809527239 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000467929:exon_74079600_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000467586:exon_74079658_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000405575:exon_74079659_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000335146:exon_74079659_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000357231:exon_74079659_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000351709:exon_74079659_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000425372:exon_74079659_74079831:EXOC7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 74387284 C/T 1 20 31 51 9.5854089037066 16.1426161992548 -6.55720729554817 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0695773353867093 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74385614_74387694:UBE2O HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 74394934 G/A 1 22 20 42 10.5439497940773 10.4145910962934 0.129358697783861 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74394918_74395072:UBE2O HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 74467664 C/G 1 40 20 60 19.1708178074132 10.4145910962934 8.7562267111198 C:G C G 10 0.52072955481467 0.0274852434657629 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74466976_74468134:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74466976_74468134:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74466979_74468921:RHBDF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 74472998 G/A 1 20 20 40 9.5854089037066 10.4145910962934 -0.829182192586799 A:G G A 10 0.52072955481467 0.874658284917496 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74472912_74473106:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74472912_74473106:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74472912_74473106:RHBDF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 74475024 G/A 1 33 29 62 15.8159246911159 15.1011570896254 0.714767601490461 A:G G A 10 0.52072955481467 0.899289376471809 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74474888_74475091:RHBDF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 55 41 96 26.3598744851932 21.3499117474015 5.00996273779168 T:C C T 10 0.52072955481467 0.357980542217157 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 20 19 39 9.5854089037066 9.89386154147873 -0.308452637772129 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 76993546 A/G 1 21 7 28 10.0646793488919 3.64510688370269 6.41957246518924 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0215081545755281 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76993074_76994045:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76993074_76993726:CANT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 77768654 C/A 1 10 4 14 4.7927044518533 2.08291821925868 2.70978623259462 A:C C A 10 0.52072955481467 0.184807178247656 ENSG00000141570:ENST00000269385:exon_77765931_77769357:CBX8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 78078709 T/C 1 9 12 21 4.31343400666797 6.24875465777604 -1.93532065110807 T:C T C 10 0.52072955481467 0.513471758577479 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78078354_78078931:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78078354_78078931:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78078354_78078931:GAA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 78079597 A/G 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 A:G A G 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78079548_78079693:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78079548_78079693:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78079548_78079693:GAA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 78079669 G/A 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78079548_78079693:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78079548_78079693:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78079548_78079693:GAA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 78082504 G/A 1 5 11 16 2.39635222592665 5.72802510296137 -3.33167287703472 A:G G A 10 0.52072955481467 0.132080205864997 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78082496_78082627:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78082496_78082627:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78082496_78082627:GAA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 78084769 G/A 1 11 7 18 5.27197489703863 3.64510688370269 1.62686801333594 A:G G A 10 0.52072955481467 0.487529072791399 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78084740_78084824:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78084740_78084824:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78084740_78084824:GAA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 78091405 G/A 1 12 13 25 5.75124534222396 6.76948421259071 -1.01823887036675 A:G G A 10 0.52072955481467 0.694646743266974 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 78113832 G/A 1 49 40 89 23.4842518140812 20.8291821925868 2.65506962149437 A:G G A 10 0.52072955481467 0.597134325644937 ENSG00000141543:ENST00000269349:exon_78113807_78113939:EIF4A3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 78293189 A/T 0 10 0 10 4.7927044518533 0 4.7927044518533 A A 10 0.52072955481467 0.00210541036264447 ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78292990_78295258:RNF213 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 78896529 C/T 1 8 9 17 3.83416356148264 4.68656599333203 -0.85240243184939 T:C C T 10 0.52072955481467 0.809480166298499 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78896524_78896627:RPTOR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 79220224 G/C 1 60 37 97 28.7562267111198 19.2669935281428 9.48923318297701 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0668134998058496 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 79225330 C/A 1 35 27 62 16.7744655814866 14.0596979799961 2.71476760149046 A:C C A 10 0.52072955481467 0.526633573593665 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225293_79225412:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 79226264 T/C 1 55 46 101 26.3598744851932 23.9535595214748 2.40631496371833 T:C T C 10 0.52072955481467 0.690646827629468 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 79244802 T/C 1 26 27 53 12.4610315748186 14.0596979799961 -1.59866640517751 T:C T C 10 0.52072955481467 0.682062911234245 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79244718_79244824:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79244718_79244824:SLC38A10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 79478019 G/A 1 3901 4069 7970 1869.63400666797 2118.84855854089 -249.21455187292 A:T:C:G G A 10 0.52072955481467 2.34345664269071e-08 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 79478870 C/A 1 26 9 35 12.4610315748186 4.68656599333203 7.77446558148655 A:C C A 10 0.52072955481467 0.0102729985633038 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 79478871 C/T 1 25 10 35 11.9817611296333 5.2072955481467 6.77446558148655 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0268034244454399 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 79478916 G/T 1 23 4 27 11.0232202392626 2.08291821925868 8.94030202000391 T:G G T 10 0.52072955481467 0.000407129838603177 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 79526402 G/C 1 32 23 55 15.3366542459306 11.9767797607374 3.35987448519315 C:G G C 10 0.52072955481467 0.418760646948822 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79523915_79526442:NPLOC4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 79803101 A/G 1 620 553 1173 297.147676014905 287.963443812512 9.18423220239214 A:G A G 10 0.52072955481467 0.598967148863677 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000473021:exon_79803020_79803332:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79803043_79803106:P4HB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 79803433 G/A 1 10 8 18 4.7927044518533 4.16583643851736 0.62686801333594 A:T:C:G G A 10 0.52072955481467 0.817378948970493 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 79805134 G/A 1 399 410 809 191.228907628947 213.499117474015 -22.270209845068 A:G G A 10 0.52072955481467 0.121545769698953 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79805119_79805203:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79805119_79805206:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000478034:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000472244:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000484286:exon_79805119_79805724:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000477607:exon_79805119_79805223:P4HB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 79845968 C/T 1 57 35 92 27.3184153755638 18.2255344185134 9.09288095705036 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0606705179516786 ENSG00000183684:ENST00000505490:exon_79845717_79846021:THOC4;ENSG00000183684:ENST00000331204:exon_79845721_79846021:THOC4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 79954544 T/A 1 24 18 42 11.5024906844479 9.37313198666406 2.12935869778386 A:T T A 10 0.52072955481467 0.54016050626039 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79954296_79954722:ASPSCR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 79991603 C/T 1 9 6 15 4.31343400666797 3.12437732888802 1.18905667777995 T:C C T 10 0.52072955481467 0.611940175630342 ENSG00000169750:ENST00000306897:exon_79991575_79992077:RAC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 80017902 C/T 1 59 76 135 28.2769562659345 39.5754461659149 -11.2984898999804 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0578340740605832 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80017824_80017969:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80017824_80017969:DUS1L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 80020812 C/T 1 62 65 127 29.7147676014905 33.8474210629536 -4.13265346146309 T:C C T 10 0.52072955481467 0.478388393681638 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80020737_80020849:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80020737_80020820:DUS1L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 80046944 A/G 1 104 114 218 49.8441262992743 59.3631692488724 -9.51904294959806 A:G A G 10 0.52072955481467 0.198566361993570 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80046845_80047048:FASN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 80585094 C/T 1 17 5 22 8.14759756815061 2.60364777407335 5.54394979407726 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0189359180007504 ENSG00000141580:ENST00000392325:exon_80585080_80585167:WDR45L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 80684432 A/G 1 14 18 32 6.70978623259462 9.37313198666406 -2.66334575406944 A:G A G 10 0.52072955481467 0.379705859397668 ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80684356_80684478:FN3KRP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 80684442 G/A 1 20 14 34 9.5854089037066 7.29021376740538 2.29519513630122 A:G G A 10 0.52072955481467 0.494188680133003 ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80684356_80684478:FN3KRP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 80863857 T/C 1 5 9 14 2.39635222592665 4.68656599333203 -2.29021376740538 T:C T C 10 0.52072955481467 0.287077835461110 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80863812_80863929:TBCD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 32 44 76 15.3366542459306 22.9121004118455 -7.57544616591492 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0858625059951336 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 16 21 37 7.66832712296528 10.9353206511081 -3.26699352814279 A:G G A 10 0.52072955481467 0.32482658498311 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 204602 G/C 1 7 10 17 3.35489311629731 5.2072955481467 -1.85240243184939 C:G G C 10 0.52072955481467 0.468528473543755 ENSG00000101557:ENST00000400266:exon_204564_204692:USP14;ENSG00000101557:ENST00000261601:exon_204564_204692:USP14;ENSG00000101557:ENST00000383589:exon_204564_204692:USP14 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 674320 A/G 1 10 24 34 4.7927044518533 12.4975093155521 -7.70480486369878 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00943409245993339 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_674161_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_673859_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_673861_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_674038_674406:ENOSF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 2724930 A/T 1 5 8 13 2.39635222592665 4.16583643851736 -1.76948421259071 A:T A T 10 0.52072955481467 0.409410722535207 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2724897_2724993:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2724897_2724993:SMCHD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 2750477 A/G 1 5 9 14 2.39635222592665 4.68656599333203 -2.29021376740538 A:G A G 10 0.52072955481467 0.287077835461110 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2750348_2750505:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2750348_2750505:SMCHD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 2763697 C/T 1 9 5 14 4.31343400666797 2.60364777407335 1.70978623259462 T:C C T 10 0.52072955481467 0.429598343746981 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2763635_2763787:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2763635_2763787:SMCHD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 2920288 G/A 1 14 10 24 6.70978623259462 5.2072955481467 1.50249068444792 A:G G A 10 0.52072955481467 0.683763897335876 ENSG00000101577:ENST00000261596:exon_2916992_2920435:LPIN2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 9117867 T/C 1 29 25 54 13.8988429103746 13.0182388703667 0.880604040007821 A:T:C T C 10 0.52072955481467 0.891907041980298 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9117385_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9117836_9117901:NDUFV2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 9255718 G/A 1 8 12 20 3.83416356148264 6.24875465777604 -2.4145910962934 A:G G A 10 0.52072955481467 0.371430851394435 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000400020:exon_9255630_9255795:ANKRD12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 20 26 46 9.5854089037066 13.5389684251814 -3.95355952147482 A:G A G 10 0.52072955481467 0.301593551546022 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 11886563 C/G 1 13 7 20 6.23051578740929 3.64510688370269 2.5854089037066 C:G C G 10 0.52072955481467 0.271400284316410 ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11886498_11886620:MPPE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 48 61 109 23.0049813688958 31.7645028436949 -8.75952147479903 C:G C G 10 0.52072955481467 0.103084599478905 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 29 23 52 13.8988429103746 11.9767797607374 1.92206314963716 T:C T C 10 0.52072955481467 0.677654136132061 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 43 25 68 20.6086291429692 13.0182388703667 7.59039027260244 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0692427362843724 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 12718593 A/G 1 25 24 49 11.9817611296333 12.4975093155521 -0.515748185918829 A:G A G 10 0.52072955481467 0.887471056433241 ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12718516_12718634:PSMG2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 28 31 59 13.4195724651892 16.1426161992548 -2.72304373406553 A:C C A 10 0.52072955481467 0.516021266657557 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 13056333 C/T 1 16 9 25 7.66832712296528 4.68656599333203 2.98176112963325 T:C C T 10 0.52072955481467 0.317005341446711 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13055779_13056697:CEP192 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 13068132 T/C 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 T:C T C 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13068093_13068236:CEP192 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 13095609 T/C 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13095502_13095680:CEP192 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 6 10 16 2.87562267111198 5.2072955481467 -2.33167287703472 T:G G T 10 0.52072955481467 0.318493089377623 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 19154143 G/A 1 7 12 19 3.35489311629731 6.24875465777604 -2.89386154147873 A:G G A 10 0.52072955481467 0.250829533252171 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 29410772 A/G 1 10 16 26 4.7927044518533 8.33167287703472 -3.53896842518142 A:G A G 10 0.52072955481467 0.175025807748805 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29409136_29410952:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29409137_29410952:TRAPPC8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 14 10 24 6.70978623259462 5.2072955481467 1.50249068444792 T:C T C 10 0.52072955481467 0.683763897335876 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 33694120 G/A 1 10 9 19 4.7927044518533 4.68656599333203 0.10613845852127 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33694060_33694437:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33694060_33694437:SLC39A6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 2 7 9 0.95854089037066 3.64510688370269 -2.68656599333203 A:C A C 10 0.52072955481467 0.0972167926377697 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 9 9 18 4.31343400666797 4.68656599333203 -0.37313198666406 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 21 24 45 10.0646793488919 12.4975093155521 -2.43282996666015 T:C C T 10 0.52072955481467 0.551177525292509 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 39617703 C/A 1 9 1 10 4.31343400666797 0.52072955481467 3.7927044518533 A:C C A 10 0.52072955481467 0.0225455086853891 ENSG00000078142:ENST00000262039:exon_39617656_39617784:PIK3C3;ENSG00000078142:ENST00000398870:exon_39617656_39617784:PIK3C3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 43669618 T/C 1 233 264 497 111.670013728182 137.472602471073 -25.802588742891 A:T:C T C 10 0.52072955481467 0.0219720776067934 ENSG00000152234:ENST00000282050:exon_43669532_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000398752:exon_43669532_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000483666:exon_43669532_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000490226:exon_43669532_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000469552:exon_43669543_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000484856:exon_43669565_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000475026:exon_43669565_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000487439:exon_43669598_43669698:ATP5A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 43678173 C/T 1 114 144 258 54.6368307511276 74.9850558933125 -20.3482251421849 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0125573116659946 ENSG00000152234:ENST00000282050:exon_43678138_43678245:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000398752:exon_43678138_43678319:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000483666:exon_43678138_43678261:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000484856:exon_43678138_43678245:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000475026:exon_43678138_43678239:ATP5A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 47803354 C/T 1 26 30 56 12.4610315748186 15.6218866444401 -3.16085506962152 T:C C T 10 0.52072955481467 0.424251649243372 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803202_47803368:MBD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 51820805 G/A 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 55221648 T/C 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 T:C T C 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55221492_55221656:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55221492_55221656:FECH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 55226383 G/C 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 C:G G C 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55226377_55226475:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55226377_55226475:FECH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 55247336 C/A 1 8 13 21 3.83416356148264 6.76948421259071 -2.93532065110807 A:C C A 10 0.52072955481467 0.274671777521875 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55247305_55247431:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55247287_55247431:FECH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 55268866 C/T 1 34 23 57 16.2951951363012 11.9767797607374 4.31841537556381 T:C C T 10 0.52072955481467 0.289463312562943 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 9 2 11 4.31343400666797 1.04145910962934 3.27197489703863 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0679252119053198 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 10 4 14 4.7927044518533 2.08291821925868 2.70978623259462 A:G A G 10 0.52072955481467 0.184807178247656 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 12 7 19 5.75124534222396 3.64510688370269 2.10613845852127 T:G G T 10 0.52072955481467 0.367172032607735 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 T:G T G 10 0.52072955481467 0.806303597637586 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 13 8 21 6.23051578740929 4.16583643851736 2.06467934889193 A:C A C 10 0.52072955481467 0.391931055698548 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 56204489 C/G 1 5 8 13 2.39635222592665 4.16583643851736 -1.76948421259071 C:G C G 10 0.52072955481467 0.409410722535207 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 56204747 G/A 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 60985879 T/C 1 68 40 108 32.5903902726024 20.8291821925868 11.7612080800156 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0264356857184871 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 T:C C T 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 61647069 G/A 1 4 8 12 1.91708178074132 4.16583643851736 -2.24875465777604 A:G G A 10 0.52072955481467 0.251467937811103 ENSG00000221887:ENST00000481726:exon_61647035_61647172:HMSD;ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000448851:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61647042_61647172:SERPINB8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 55 31 86 26.3598744851932 16.1426161992548 10.2172582859384 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0305756942382214 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 63 56 119 30.1940380466758 29.1608550696215 1.03318297705427 T:C T C 10 0.52072955481467 0.855076727863885 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 41 36 77 19.6500882525985 18.7462639733281 0.90382427927041 T:C T C 10 0.52072955481467 0.9093209018721 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 18 15 33 8.62686801333594 7.81094332222005 0.815924691115891 A:G G A 10 0.52072955481467 0.862375479002996 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 77067000 T/G 1 10 5 15 4.7927044518533 2.60364777407335 2.18905667777995 T:G T G 10 0.52072955481467 0.308037122491406 ENSG00000166377:ENST00000426216:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000359184:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000440332:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000307671:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000490210:exon_77066986_77067234:ATP9B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 77227476 A/G 1 25 25 50 11.9817611296333 13.0182388703667 -1.0364777407335 A:G A G 10 0.52072955481467 0.779128855228348 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77227450_77227582:NFATC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 77246406 T/G 1 9 13 22 4.31343400666797 6.76948421259071 -2.45605020592274 T:G T G 10 0.52072955481467 0.393983016021626 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 77246444 C/T 1 11 8 19 5.27197489703863 4.16583643851736 1.10613845852127 T:C C T 10 0.52072955481467 0.653020003043937 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 18 77473086 G/A 1 4 9 13 1.91708178074132 4.68656599333203 -2.76948421259071 A:G G A 10 0.52072955481467 0.166029130373969 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77472972_77473138:CTDP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 316 241 557 151.449460678564 125.495822710335 25.9536379682288 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0304653759384160 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 582583 G/T 1 3 134 137 1.43781133555599 69.7777603451658 -68.3399490096098 T:G G T 10 0.52072955481467 1.10271529526054e-38 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 651587 C/T 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 T:C C T 10 0.52072955481467 1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 651832 C/T 1 69 76 145 33.0696607177878 39.5754461659149 -6.50578544812715 T:C C T 10 0.52072955481467 0.281402120147953 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_651611_651855:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_651611_651855:RNF126 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 880066 G/A 1 18 13 31 8.62686801333594 6.76948421259071 1.85738380074523 A:G G A 10 0.52072955481467 0.591060437395048 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 60 51 111 28.7562267111198 26.5572072955482 2.19901941557163 A:G A G 10 0.52072955481467 0.704655808915278 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 120 88 208 57.5124534222396 45.824200823691 11.6882525985486 A:G A G 10 0.52072955481467 0.110577190476913 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1036444 G/A 1 221 207 428 105.918768385958 107.791017846637 -1.87224946067876 A:G G A 10 0.52072955481467 0.884631986331577 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1049305 C/A 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 A:C C A 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1049265_1049436:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1049265_1049436:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1049265_1049436:ABCA7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 54 31 85 25.8806040400078 16.1426161992548 9.73798784075305 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0388150386103664 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 55 30 85 26.3598744851932 15.6218866444401 10.7379878407531 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0222552364798779 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 32 34 66 15.3366542459306 17.7048048636988 -2.36815061776822 T:C C T 10 0.52072955481467 0.622633499260239 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1095352 C/G 1 17 11 28 8.14759756815061 5.72802510296137 2.41957246518924 C:G C G 10 0.52072955481467 0.450243949257095 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1095355 C/T 1 13 7 20 6.23051578740929 3.64510688370269 2.5854089037066 T:C C T 10 0.52072955481467 0.271400284316410 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1110829 G/A 1 22 12 34 10.5439497940773 6.24875465777604 4.29519513630122 A:G G A 10 0.52072955481467 0.169930919837473 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1110711_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1110744_1110887:SBNO2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1113701 G/A 1 19 10 29 9.10613845852127 5.2072955481467 3.89884291037457 A:G G A 10 0.52072955481467 0.192782293977604 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1113534_1113703:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1113534_1113703:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1113534_1113703:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1113534_1113703:SBNO2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1119019 C/T 1 10 12 22 4.7927044518533 6.24875465777604 -1.45605020592274 T:C C T 10 0.52072955481467 0.670595760110997 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1119010_1119163:SBNO2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1357082 T/C 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 T:C T C 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1357008_1357093:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1357008_1357093:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1357008_1357093:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1357063_1357093:MUM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1360575 G/A 1 15 13 28 7.18905667777995 6.76948421259071 0.419572465189241 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1360135_1361031:MUM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 43 40 83 20.6086291429692 20.8291821925868 -0.220553049617607 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1622116 G/A 1 128 108 236 61.3466169837222 56.2387919199844 5.10782506373788 A:G G A 10 0.52072955481467 0.51540442365788 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1622053_1622222:TCF3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 94 90 184 45.051421847421 46.8656599333203 -1.81423808589928 A:G A G 10 0.52072955481467 0.82494275027299 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 134 99 233 64.2222396548342 51.5522259266523 12.6700137281819 A:G G A 10 0.52072955481467 0.101285889810466 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 2040979 T/C 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 T:C T C 10 0.52072955481467 0.806303597637586 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 2138654 T/G 1 36 30 66 17.2537360266719 15.6218866444401 1.63184938223178 T:C:G T G 10 0.52072955481467 0.713235671055516 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2138618_2138713:AP3D1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 2226676 G/A 1 44 23 67 21.0878995881545 11.9767797607374 9.11111982741711 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0276490527078594 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 2252712 A/C 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 A:C A C 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000167476:ENST00000300961:exon_2252252_2252795:JSRP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 2337468 G/A 1 14 9 23 6.70978623259462 4.68656599333203 2.02322023926259 A:G G A 10 0.52072955481467 0.414185612013738 ENSG00000005206:ENST00000382189:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000432705:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2337442_2337624:AC004410.1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 22 22 44 10.5439497940773 11.4560502059227 -0.912100411845479 A:C C A 10 0.52072955481467 0.880316065777494 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 3186085 G/T 1 15 15 30 7.18905667777995 7.81094332222005 -0.621886644440099 T:G G T 10 0.52072955481467 0.856597458926775 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3185875_3186212:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3185875_3186212:NCLN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 3198817 G/A 1 31 28 59 14.8573838007452 14.5804275348108 0.276956265934471 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3198815_3198895:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3198815_3198895:NCLN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 37 35 72 17.7330064718572 18.2255344185134 -0.492527946656239 T:C T C 10 0.52072955481467 0.906821117299167 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 58 47 105 27.7976858207491 24.4742890762895 3.32339674445965 A:G A G 10 0.52072955481467 0.558337750097126 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 3534842 G/A 1 22 22 44 10.5439497940773 11.4560502059227 -0.912100411845479 A:G G A 10 0.52072955481467 0.880316065777494 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3534793_3536755:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3534793_3538325:FZR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 3542983 C/T 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 0.492394667760678 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 3544971 C/T 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.728437659058648 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 3548231 A/G 1 27 26 53 12.9403020200039 13.5389684251814 -0.598666405177509 A:G A G 10 0.52072955481467 0.891408372688376 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3548121_3548265:C19orf28 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 3762698 C/T 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3762665_3762816:MRPL54 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 3767265 C/T 1 97 122 219 46.489233182977 63.5290056873897 -17.0397725044127 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0215344686507795 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3767259_3767562:MRPL54 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4028783 C/T 1 21 15 36 10.0646793488919 7.81094332222005 2.25373602667188 T:C C T 10 0.52072955481467 0.506830356128462 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4028718_4028846:PIAS4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 310 344 654 148.573838007452 179.130966856246 -30.5571288487942 A:T:C:G G A 10 0.52072955481467 0.0169764428888513 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 316 316 632 151.449460678564 164.550539321436 -13.1010786428714 A:G A G 10 0.52072955481467 0.300838228054173 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 13 24 37 6.23051578740929 12.4975093155521 -6.26699352814279 T:C T C 10 0.52072955481467 0.047539044308923 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 17 27 44 8.14759756815061 14.0596979799961 -5.91210041184548 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0959599924440788 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4362691 G/C 1 33 39 72 15.8159246911159 20.3084526377721 -4.49252794665624 C:G G C 10 0.52072955481467 0.291630658631294 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4362609_4362733:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4362609_4362733:SH3GL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4409756 A/G 1 24 32 56 11.5024906844479 16.6633457540694 -5.16085506962152 A:G A G 10 0.52072955481467 0.182274011956643 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4454083 C/T 1 60 39 99 28.7562267111198 20.3084526377721 8.44777407334767 T:C C T 10 0.52072955481467 0.107066951732621 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4457650 C/T 1 29 32 61 13.8988429103746 16.6633457540694 -2.76450284369487 T:C C T 10 0.52072955481467 0.522679996772269 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4457612_4457694:UBXN6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4493708 A/G 1 38 44 82 18.2122769170425 22.9121004118455 -4.69982349480294 A:G A G 10 0.52072955481467 0.320837494610577 ENSG00000167674:ENST00000429822:exon_4493700_4493859:AC011498.1;ENSG00000167674:ENST00000301284:exon_4493700_4493859:AC011498.1;ENSG00000167674:ENST00000398364:exon_4493700_4493859:AC011498.1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4702065 G/A 1 11 19 30 5.27197489703863 9.89386154147873 -4.6218866444401 A:C:G G A 10 0.52072955481467 0.101678875578326 ENSG00000142002:ENST00000357909:exon_4702039_4702167:DPP9;ENSG00000142002:ENST00000381797:exon_4702039_4702167:DPP9;ENSG00000142002:ENST00000262960:exon_4702039_4702167:DPP9;ENSG00000142002:ENST00000262959:exon_4702039_4702167:DPP9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4847868 G/A 1 52 22 74 24.9220631496372 11.4560502059227 13.4660129437144 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00161339838324949 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 26 41 67 12.4610315748186 21.3499117474015 -8.88888017258289 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0369307102890122 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 54 49 103 25.8806040400078 25.5157481859188 0.36485585408899 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4910889 G/T 1 12 4 16 5.75124534222396 2.08291821925868 3.66832712296528 T:G G T 10 0.52072955481467 0.0808258357838215 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4910888_4911050:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4910566_4911050:UHRF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 4910924 C/T 1 10 8 18 4.7927044518533 4.16583643851736 0.62686801333594 T:C C T 10 0.52072955481467 0.817378948970493 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4910888_4911050:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4910566_4911050:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4910898_4911050:UHRF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 5041178 T/C 1 10 16 26 4.7927044518533 8.33167287703472 -3.53896842518142 T:C T C 10 0.52072955481467 0.175025807748805 ENSG00000127663:ENST00000159111:exon_5041148_5041262:KDM4B;ENSG00000127663:ENST00000381759:exon_5041148_5041262:KDM4B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 5110794 A/G 1 9 11 20 4.31343400666797 5.72802510296137 -1.4145910962934 A:G A G 10 0.52072955481467 0.655741219933051 ENSG00000127663:ENST00000159111:exon_5110633_5110829:KDM4B;ENSG00000127663:ENST00000381759:exon_5110633_5110829:KDM4B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 5206775 A/G 1 16 8 24 7.66832712296528 4.16583643851736 3.50249068444792 A:G A G 10 0.52072955481467 0.219527027886609 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5205519_5206853:PTPRS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 67 66 133 32.1111198274171 34.3681506177682 -2.25703079035111 A:G G A 10 0.52072955481467 0.728822893542909 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 5915022 C/T 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 T:C C T 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914951_5915157:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914951_5915157:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914951_5915076:CAPS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 34 29 63 16.2951951363012 15.1011570896254 1.19403804667579 T:G G T 10 0.52072955481467 0.8017892780571 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 6750397 C/T 1 69 89 158 33.0696607177878 46.3449303785056 -13.2752696607179 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0382270839478008 ENSG00000125733:ENST00000313285:exon_6750303_6750442:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000394404:exon_6750303_6750442:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000481339:exon_6750303_6750442:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000313244:exon_6750303_6750442:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000475024:exon_6750303_6750644:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000420690:exon_6750303_6750442:TRIP10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 6755007 T/C 1 10 10 20 4.7927044518533 5.2072955481467 -0.4145910962934 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 7125297 G/A 1 11 13 24 5.27197489703863 6.76948421259071 -1.49750931555208 A:G G A 10 0.52072955481467 0.548584049171421 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7125294_7125538:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7125294_7125538:INSR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 7528734 A/G 1 27 18 45 12.9403020200039 9.37313198666406 3.56717003333985 A:G A G 10 0.52072955481467 0.300497646391797 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7528704_7528841:ARHGEF18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 7533767 T/G 1 23 14 37 11.0232202392626 7.29021376740538 3.73300647185721 T:G T G 10 0.52072955481467 0.251076482988679 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 7533850 A/G 1 27 16 43 12.9403020200039 8.33167287703472 4.60862914296919 A:G A G 10 0.52072955481467 0.171998140479118 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 7687428 G/A 1 62 43 105 29.7147676014905 22.3913708570308 7.32339674445965 A:G G A 10 0.52072955481467 0.171470927018325 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7687416_7687547:XAB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 7975586 C/T 1 28 26 54 13.4195724651892 13.5389684251814 -0.119395959992179 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000076984:ENST00000397981:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397983:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000468058:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397979:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000425613:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000494348:exon_7975145_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000465324:exon_7975581_7975620:MAP2K7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 9721401 A/T 1 10 1 11 4.7927044518533 0.52072955481467 4.27197489703863 A:T A T 10 0.52072955481467 0.0124611301920712 ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 10887840 G/C 1 68 58 126 32.5903902726024 30.2023141792509 2.38807609335158 C:G G C 10 0.52072955481467 0.721578505852037 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10887794_10887892:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10887794_10887892:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10887794_10887892:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10887794_10887892:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10887794_10887892:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10887794_10887892:DNM2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 11598483 T/C 1 9 6 15 4.31343400666797 3.12437732888802 1.18905667777995 T:C T C 10 0.52072955481467 0.611940175630342 ENSG00000161914:ENST00000293771:exon_11598107_11598718:ZNF653 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 12763007 G/A 1 173 167 340 82.9137870170621 86.9618356540499 -4.0480486369878 A:G G A 10 0.52072955481467 0.664527523136088 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12762967_12763084:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12762967_12763084:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12762967_12763084:MAN2B1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 36 31 67 17.2537360266719 16.1426161992548 1.11111982741711 A:G G A 10 0.52072955481467 0.80796686888264 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 13008607 G/T 1 19 15 34 9.10613845852127 7.81094332222005 1.29519513630122 T:G G T 10 0.52072955481467 0.732713753067144 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008517_13008677:GCDH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 13054781 G/T 1 499 611 1110 239.15595214748 318.165757991763 -79.0098058442837 T:C:G G T 10 0.52072955481467 2.3139968334402e-06 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 13264549 C/T 1 153 135 288 73.3283781133555 70.2984898999805 3.02988821337505 T:C C T 10 0.52072955481467 0.723954131757407 ENSG00000160888:ENST00000292433:exon_13263758_13265716:IER2;ENSG00000160888:ENST00000393152:exon_13263893_13265716:IER2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 13910539 G/A 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000132003:ENST00000254323:exon_13910534_13910735:ZSWIM4;ENSG00000132003:ENST00000440752:exon_13910534_13910735:ZSWIM4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 14161636 C/T 1 14 7 21 6.70978623259462 3.64510688370269 3.06467934889193 T:C C T 10 0.52072955481467 0.197227501927402 ENSG00000104998:ENST00000263379:exon_14161570_14161695:IL27RA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 14231256 T/C 1 84 83 167 40.2587173955677 43.2205530496176 -2.96183565404989 T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.698698147480123 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 14492265 T/C 1 8 8 16 3.83416356148264 4.16583643851736 -0.33167287703472 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 14492272 T/C 1 7 16 23 3.35489311629731 8.33167287703472 -4.97677976073741 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0579491872491973 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 14574959 G/A 1 193 162 355 92.4991959207687 84.3581878799765 8.14100804079216 A:G G A 10 0.52072955481467 0.395772631090544 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14574872_14574965:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14574872_14574965:PKN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 14580328 A/G 1 108 141 249 51.7612080800156 73.4228672288685 -21.6616591488528 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00632792670793884 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 20 11 31 9.5854089037066 5.72802510296137 3.85738380074523 A:G G A 10 0.52072955481467 0.208278517993137 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 14682804 G/C 1 85 78 163 40.737987840753 40.6169052755443 0.121082565208795 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14682701_14682886:NDUFB7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 38 25 63 18.2122769170425 13.0182388703667 5.19403804667579 A:G G A 10 0.52072955481467 0.208413255453617 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 33 22 55 15.8159246911159 11.4560502059227 4.35987448519315 A:T:G G A 10 0.52072955481467 0.280598101101481 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 15229993 A/G 1 21 16 37 10.0646793488919 8.33167287703472 1.73300647185721 A:G A G 10 0.52072955481467 0.623713104808598 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 16259623 C/T 1 20 26 46 9.5854089037066 13.5389684251814 -3.95355952147482 T:C C T 10 0.52072955481467 0.301593551546022 ENSG00000196684:ENST00000253680:exon_16259534_16259685:HSH2D;ENSG00000196684:ENST00000397372:exon_16259534_16259685:HSH2D HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 16631322 T/C 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000105072:ENST00000221671:exon_16630905_16632163:C19orf44 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 16666101 G/C 1 22 22 44 10.5439497940773 11.4560502059227 -0.912100411845479 C:G G C 10 0.52072955481467 0.880316065777494 ENSG00000127526:ENST00000436494:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000409648:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000248069:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000421082:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000469055:exon_16665963_16666412:SLC35E1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 16974541 G/A 1 4 10 14 1.91708178074132 5.2072955481467 -3.29021376740538 A:G G A 10 0.52072955481467 0.107382582617767 ENSG00000127511:ENST00000379803:exon_16974491_16974607:SIN3B;ENSG00000127511:ENST00000248054:exon_16974491_16974607:SIN3B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 16976289 T/C 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000127511:ENST00000379803:exon_16976221_16976459:SIN3B;ENSG00000127511:ENST00000248054:exon_16976221_16976459:SIN3B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 8 12 20 3.83416356148264 6.24875465777604 -2.4145910962934 T:C C T 10 0.52072955481467 0.371430851394435 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17173588 G/A 1 8 9 17 3.83416356148264 4.68656599333203 -0.85240243184939 A:G G A 10 0.52072955481467 0.809480166298499 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17173508_17173589:HAUS8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 83 94 177 39.7794469503824 48.948578152579 -9.16913120219658 T:C T C 10 0.52072955481467 0.176034951746975 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17306074 G/A 1 85 73 158 40.737987840753 38.0132575014709 2.72473033928214 A:G G A 10 0.52072955481467 0.690993893630906 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 98 71 169 46.9685036281623 36.9717983918416 9.99670523632077 T:C C T 10 0.52072955481467 0.143297166588149 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 71 102 173 34.0282016081584 53.1144145910963 -19.0862129829379 T:C T C 10 0.52072955481467 0.00379041938249807 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 69 62 131 33.0696607177878 32.2852323985095 0.784428319278234 A:G A G 10 0.52072955481467 0.930420397297765 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17321487 A/G 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 A:G A G 10 0.52072955481467 1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17337871 A/G 1 6 12 18 2.87562267111198 6.24875465777604 -3.37313198666406 A:G A G 10 0.52072955481467 0.155728897636768 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17337882 C/G 1 8 12 20 3.83416356148264 6.24875465777604 -2.4145910962934 C:G C G 10 0.52072955481467 0.371430851394435 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17339112 G/A 1 17 17 34 8.14759756815061 8.85240243184939 -0.704804863698779 A:G G A 10 0.52072955481467 0.864632483960446 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17339065_17339118:OCEL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17451981 G/A 1 18 18 36 8.62686801333594 9.37313198666406 -0.746263973328119 A:G G A 10 0.52072955481467 0.8682121543722 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17451853_17452131:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17451853_17452131:GTPBP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17631821 G/A 1 91 99 190 43.613610511865 51.5522259266523 -7.93861541478729 A:G G A 10 0.52072955481467 0.276059789006758 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17631753_17632095:PGLS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17660300 G/A 1 17 14 31 8.14759756815061 7.29021376740538 0.857383800745231 A:G G A 10 0.52072955481467 0.857960893951531 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17660253_17660494:FAM129C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17837425 C/G 1 29 27 56 13.8988429103746 14.0596979799961 -0.160855069621519 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17837981 A/G 1 26 29 55 12.4610315748186 15.1011570896254 -2.64012551480685 A:G A G 10 0.52072955481467 0.50199058740513 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17885270 A/G 1 8 12 20 3.83416356148264 6.24875465777604 -2.4145910962934 A:G A G 10 0.52072955481467 0.371430851394435 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17885203_17885287:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17885203_17885287:FCHO1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17885880 C/T 1 23 13 36 11.0232202392626 6.76948421259071 4.25373602667188 T:C C T 10 0.52072955481467 0.182857638763797 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17885865_17885889:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17885865_17885889:FCHO1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 17886940 G/A 1 15 12 27 7.18905667777995 6.24875465777604 0.94030202000391 A:G G A 10 0.52072955481467 0.8478003207822 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17886792_17886970:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17886792_17886970:FCHO1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 18170384 G/A 1 11 7 18 5.27197489703863 3.64510688370269 1.62686801333594 A:G G A 10 0.52072955481467 0.487529072791399 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 18180451 A/G 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G A G 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18180356_18180523:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18180356_18180523:IL12RB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 18186575 G/A 1 10 6 16 4.7927044518533 3.12437732888802 1.66832712296528 A:G G A 10 0.52072955481467 0.460768625180263 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 18186618 T/C 1 7 12 19 3.35489311629731 6.24875465777604 -2.89386154147873 T:C T C 10 0.52072955481467 0.250829533252171 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 18234441 C/T 1 14 10 24 6.70978623259462 5.2072955481467 1.50249068444792 T:C C T 10 0.52072955481467 0.683763897335876 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18234390_18234465:MAST3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 18245512 C/T 1 6 16 22 2.87562267111198 8.33167287703472 -5.45605020592274 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0304645623805761 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18245389_18245521:MAST3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 18255359 G/A 1 14 13 27 6.70978623259462 6.76948421259071 -0.0596979799960895 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18255276_18255503:MAST3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 18257750 C/T 1 15 13 28 7.18905667777995 6.76948421259071 0.419572465189241 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18257691_18257827:MAST3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 18288004 A/G 1 269 220 489 128.923749754854 114.560502059227 14.3632476956264 A:G A G 10 0.52072955481467 0.205042880141783 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 18288069 A/G 1 551 497 1048 264.078015297117 258.802588742891 5.27542655422587 A:T:G A G 10 0.52072955481467 0.757238304512606 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 19136541 C/T 1 33 21 54 15.8159246911159 10.9353206511081 4.88060404000782 T:C C T 10 0.52072955481467 0.220213127625147 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 19230868 A/G 1 23 25 48 11.0232202392626 13.0182388703667 -1.99501863110416 A:G A G 10 0.52072955481467 0.567626612652638 ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19230429_19230992:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19230429_19230992:TMEM161A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 19449686 G/T 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 T:G G T 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000129933:ENST00000392313:exon_19449654_19449748:MAU2;ENSG00000129933:ENST00000262815:exon_19449654_19449748:MAU2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 62 61 123 29.7147676014905 31.7645028436949 -2.04973524220441 A:G G A 10 0.52072955481467 0.719084110346118 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 19735043 G/A 1 17 14 31 8.14759756815061 7.29021376740538 0.857383800745231 A:G G A 10 0.52072955481467 0.857960893951531 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19734468_19735378:LPAR2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 19740729 C/G 1 118 86 204 56.5539125318689 44.7827417140616 11.7711708178073 T:C:G C G 10 0.52072955481467 0.106980335012683 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 19790159 A/C 1 10 11 21 4.7927044518533 5.72802510296137 -0.93532065110807 A:C A C 10 0.52072955481467 0.827826563650395 ENSG00000181896:ENST00000318110:exon_19789990_19791412:ZNF101;ENSG00000181896:ENST00000415440:exon_19789990_19791412:ZNF101 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 33096786 G/A 1 15 10 25 7.18905667777995 5.2072955481467 1.98176112963325 A:G G A 10 0.52072955481467 0.549126451072817 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 19 17 36 9.10613845852127 8.85240243184939 0.253736026671881 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 9 10 19 4.31343400666797 5.2072955481467 -0.89386154147873 T:C C T 10 0.52072955481467 0.819317260655474 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 33117666 T/C 1 9 12 21 4.31343400666797 6.24875465777604 -1.93532065110807 T:C T C 10 0.52072955481467 0.513471758577479 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33117618_33117733:ANKRD27 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 33467413 C/T 1 16 7 23 7.66832712296528 3.64510688370269 4.02322023926259 T:C C T 10 0.52072955481467 0.099569417326673 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 33600764 T/C 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 T:C T C 10 0.52072955481467 0.347970315516692 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33600623_33600922:GPATCH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 33602757 C/T 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33602630_33602808:GPATCH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 34890878 C/T 1 1051 1020 2071 503.713237889782 531.144145910963 -27.4309080211816 T:C C T 10 0.52072955481467 0.234977045255453 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34890806_34891210:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34890806_34891236:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34890806_34891210:GPI HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 35450229 C/T 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000180884:ENST00000404801:exon_35447258_35450475:ZNF792;ENSG00000180884:ENST00000407202:exon_35447258_35450475:ZNF792 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 35501051 T/C 1 43 63 106 20.6086291429692 32.8059619533242 -12.197332810355 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0194488953298548 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35500996_35501099:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35500996_35501099:GRAMD1A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 35510102 G/C 1 65 91 156 31.1525789370464 47.386389488135 -16.2338105510885 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0101938097643270 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 105 110 215 50.3233967444597 57.2802510296137 -6.95685428515404 T:C:G T G 10 0.52072955481467 0.374930028529482 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 170 144 314 81.4759756815061 74.9850558933125 6.49091978819362 A:G A G 10 0.52072955481467 0.49797327001407 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 35770056 G/A 1 13 13 26 6.23051578740929 6.76948421259071 -0.53896842518142 A:G G A 10 0.52072955481467 0.84709817230133 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 232 257 489 111.190743282997 133.82749558737 -22.6367523043736 A:C:G A G 10 0.52072955481467 0.0416832662896488 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 35843086 G/A 1 9 6 15 4.31343400666797 3.12437732888802 1.18905667777995 A:G G A 10 0.52072955481467 0.611940175630342 ENSG00000126266:ENST00000246553:exon_35842455_35843357:FFAR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 236 191 427 113.107825063738 99.459344969602 13.6484800941359 T:C C T 10 0.52072955481467 0.191167939492601 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 36430465 A/C 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 A:C A C 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000126243:ENST00000246529:exon_36430312_36431742:LRFN3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 36430798 A/G 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 A:G A G 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000126243:ENST00000246529:exon_36430312_36431742:LRFN3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 36435564 G/A 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 A:G G A 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000126243:ENST00000246529:exon_36435450_36436084:LRFN3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 A:C A C 10 0.52072955481467 0.347970315516692 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 37004938 T/C 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 T:C T C 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 37005298 A/G 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 37129806 G/A 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000197808:ENST00000360357:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396893:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396896:exon_37129686_37130439:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396892:exon_37129591_37129890:ZNF461 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 37209866 T/C 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 T:C T C 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 38643539 C/T 1 11 10 21 5.27197489703863 5.2072955481467 0.0646793488919304 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38643480_38643607:SIPA1L3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 34 54 88 16.2951951363012 28.1193959599922 -11.824200823691 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0137525702144559 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 37 73 110 17.7330064718572 38.0132575014709 -20.2802510296137 T:C C T 10 0.52072955481467 0.000117321420463335 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 38817486 T/C 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 T:C T C 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000099337:ENST00000263372:exon_38817233_38817628:KCNK6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 38817876 G/A 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000099337:ENST00000263372:exon_38817820_38819640:KCNK6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 38896244 C/A 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 A:C C A 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38896159_38896275:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38896159_38896275:FAM98C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 38899548 G/A 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38899391_38899728:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38899391_38899728:FAM98C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 129 119 248 61.8258874289076 61.9668170229457 -0.140929594038155 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 39100594 G/A 1 122 97 219 58.4709943126103 50.510766817023 7.96022749558727 A:G G A 10 0.52072955481467 0.310361438126745 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39100549_39100665:MAP4K1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 39100688 G/A 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 A:G G A 10 0.52072955481467 0.767073670700831 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 39191323 C/T 1 74 62 136 35.4660129437144 32.2852323985095 3.18078054520488 T:C C T 10 0.52072955481467 0.607362102470954 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39191240_39191354:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39191240_39191354:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39191240_39191344:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39191240_39191354:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39191240_39191354:ACTN4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 39308190 C/T 1 201 159 360 96.3333594822513 82.7959992155325 13.5373602667188 T:C C T 10 0.52072955481467 0.154780999963538 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39308091_39308215:ECH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 39322087 T/G 1 157 128 285 75.2454598940968 66.6533830162778 8.59207687781905 A:T:G T G 10 0.52072955481467 0.314123397147274 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 39329517 C/T 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 T:C C T 10 0.52072955481467 1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 39360720 G/A 1 16 14 30 7.66832712296528 7.29021376740538 0.378113355559901 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000187994:ENST00000340740:exon_39360583_39360900:RINL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 39907036 C/T 1 13 8 21 6.23051578740929 4.16583643851736 2.06467934889193 T:C C T 10 0.52072955481467 0.391931055698548 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000451354:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39906988_39907054:PLEKHG2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 39908574 C/T 1 13 17 30 6.23051578740929 8.85240243184939 -2.6218866444401 T:C C T 10 0.52072955481467 0.365338055729386 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000478523:exon_39908485_39908745:PLEKHG2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 97 86 183 46.489233182977 44.7827417140616 1.7064914689154 A:C:G A G 10 0.52072955481467 0.824607695662719 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 40872540 C/T 1 48 48 96 23.0049813688958 24.9950186311042 -1.99003726220832 T:C C T 10 0.52072955481467 0.68454351899998 ENSG00000105223:ENST00000392032:exon_40872517_40872591:PLD3;ENSG00000105223:ENST00000409419:exon_40872517_40872591:PLD3;ENSG00000105223:ENST00000409587:exon_40872517_40872591:PLD3;ENSG00000105223:ENST00000356508:exon_40872517_40872591:PLD3;ENSG00000105223:ENST00000409735:exon_40872517_40872591:PLD3;ENSG00000105223:ENST00000409281:exon_40872517_40872591:PLD3;ENSG00000105223:ENST00000493006:exon_40872517_40872591:PLD3;ENSG00000105223:ENST00000359274:exon_40872517_40872591:PLD3;ENSG00000105223:ENST00000464586:exon_40872517_40872551:PLD3;ENSG00000105223:ENST00000485448:exon_40872517_40873751:PLD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 40883933 G/A 1 88 75 163 42.175799176309 39.0547166111002 3.12108256520879 A:G G A 10 0.52072955481467 0.638883176086357 ENSG00000105223:ENST00000409419:exon_40883893_40884382:PLD3;ENSG00000105223:ENST00000409587:exon_40883893_40884390:PLD3;ENSG00000105223:ENST00000356508:exon_40883893_40884390:PLD3;ENSG00000105223:ENST00000409735:exon_40883893_40884390:PLD3;ENSG00000105223:ENST00000409281:exon_40883893_40884390:PLD3;ENSG00000105223:ENST00000488311:exon_40883893_40884034:PLD3;ENSG00000105223:ENST00000486134:exon_40883893_40884130:PLD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 40928944 A/G 1 8 15 23 3.83416356148264 7.81094332222005 -3.97677976073741 A:G A G 10 0.52072955481467 0.142432345936036 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 40928968 A/G 1 9 17 26 4.31343400666797 8.85240243184939 -4.53896842518142 A:G A G 10 0.52072955481467 0.08021119942859 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 19 11 30 9.10613845852127 5.72802510296137 3.3781133555599 T:C T C 10 0.52072955481467 0.273263162366694 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 T:C T C 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 23 23 46 11.0232202392626 11.9767797607374 -0.953559521474819 A:G G A 10 0.52072955481467 0.882897772659332 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 82 105 187 39.3001765051971 54.6766032555403 -15.3764267503433 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0278746794674027 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 79 121 200 37.8623651696411 63.0082761325751 -25.145910962934 A:G A G 10 0.52072955481467 0.000385890512711216 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 41939297 C/G 1 14 19 33 6.70978623259462 9.89386154147873 -3.18407530888411 C:G C G 10 0.52072955481467 0.298443052627376 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 16 17 33 7.66832712296528 8.85240243184939 -1.18407530888411 T:C T C 10 0.52072955481467 0.729460209285984 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 44660967 A/G 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000159905:ENST00000426739:exon_44660405_44664462:ZNF234;ENSG00000159905:ENST00000244316:exon_44660405_44664462:ZNF234 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 44679167 A/G 1 9 6 15 4.31343400666797 3.12437732888802 1.18905667777995 A:G A G 10 0.52072955481467 0.611940175630342 ENSG00000167380:ENST00000413984:exon_44679137_44679582:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000300823:exon_44679137_44679582:ZNF226 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 44739303 T/C 1 10 5 15 4.7927044518533 2.60364777407335 2.18905667777995 T:C T C 10 0.52072955481467 0.308037122491406 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 44739399 T/C 1 13 11 24 6.23051578740929 5.72802510296137 0.50249068444792 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 64 53 117 30.6733084918611 27.5986664051775 3.07464208668361 T:C T C 10 0.52072955481467 0.580235758267196 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 45396144 C/T 1 47 51 98 22.5257109237105 26.5572072955482 -4.03149637183765 T:C C T 10 0.52072955481467 0.420694536049957 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45396094_45396186:TOMM40 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 45571285 C/T 1 31 23 54 14.8573838007452 11.9767797607374 2.88060404000782 T:C C T 10 0.52072955481467 0.496539785206376 ENSG00000104859:ENST00000221455:exon_45571273_45571312:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391953:exon_45571273_45571312:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391952:exon_45571273_45571316:CLASRP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 46124517 C/T 1 30 29 59 14.3781133555599 15.1011570896254 -0.723043734065529 T:C C T 10 0.52072955481467 0.896700500710258 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46124465_46124590:EML2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 46129999 C/A 1 24 22 46 11.5024906844479 11.4560502059227 0.0464404785251809 A:C C A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46129963_46130097:EML2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 46269076 G/A 1 8 10 18 3.83416356148264 5.2072955481467 -1.37313198666406 A:G G A 10 0.52072955481467 0.638802194234348 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 46269313 G/C 1 6 8 14 2.87562267111198 4.16583643851736 -1.29021376740538 C:G G C 10 0.52072955481467 0.596274656681649 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 46387503 T/C 1 23 21 44 11.0232202392626 10.9353206511081 0.0878995881545208 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 29 20 49 13.8988429103746 10.4145910962934 3.48425181408117 A:C:G C G 10 0.52072955481467 0.391207580467612 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 46857015 C/T 1 44 34 78 21.0878995881545 17.7048048636988 3.38309472445574 T:C C T 10 0.52072955481467 0.49698732326674 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46857005_46857164:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46857005_46857246:PPP5C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 47585517 G/C 1 15 11 26 7.18905667777995 5.72802510296137 1.46103157481858 C:G G C 10 0.52072955481467 0.695544738359801 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47585441_47585552:ZC3H4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 47588325 G/A 1 25 11 36 11.9817611296333 5.72802510296137 6.25373602667188 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0444808132388112 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47588313_47588452:ZC3H4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 47858424 G/A 1 16 9 25 7.66832712296528 4.68656599333203 2.98176112963325 A:G G A 10 0.52072955481467 0.317005341446711 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47858296_47858607:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47858296_47858607:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47858296_47858607:DHX34 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 47865911 A/G 1 11 14 25 5.27197489703863 7.29021376740538 -2.01823887036675 A:G A G 10 0.52072955481467 0.431806214148498 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47865733_47865950:DHX34 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 47865947 G/A 1 14 12 26 6.70978623259462 6.24875465777604 0.46103157481858 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47865733_47865950:DHX34 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 47879279 G/A 1 5 10 15 2.39635222592665 5.2072955481467 -2.81094332222005 A:G G A 10 0.52072955481467 0.196715161243913 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47879181_47879354:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47879181_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47879181_47879354:DHX34 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 47885310 C/T 1 19 15 34 9.10613845852127 7.81094332222005 1.29519513630122 T:C C T 10 0.52072955481467 0.732713753067144 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47885237_47885961:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47885237_47885961:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47885237_47885949:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47885237_47885536:DHX34 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 47978671 G/A 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 47978739 C/T 1 10 8 18 4.7927044518533 4.16583643851736 0.62686801333594 T:C C T 10 0.52072955481467 0.817378948970493 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 48205725 T/C 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 T:C T C 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000063169:ENST00000396720:exon_48204585_48206534:GLTSCR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 48248864 C/A 1 696 622 1318 333.57222984899 323.893783094725 9.678446754265 A:T:C C A 10 0.52072955481467 0.600495041942416 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 226 273 499 108.315120611885 142.159168464405 -33.8440478525203 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00265154350056322 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 48260277 C/T 1 307 188 495 147.136026671896 97.8971563051579 49.2388703667384 T:C C T 10 0.52072955481467 9.77570484311025e-06 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48260256_48260314:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48260256_48260314:GLTSCR2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 48602948 T/C 0 0 9 9 0 4.68656599333203 -4.68656599333203 C T C 10 0.52072955481467 0.00133421505404264 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48602928_48603117:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48602928_48603117:PLA2G4C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 23 36 59 11.0232202392626 18.7462639733281 -7.72304373406553 C:G C G 10 0.52072955481467 0.0503405875112393 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 48622427 A/G 1 22 40 62 10.5439497940773 20.8291821925868 -10.2852323985095 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0105677800289197 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48622394_48622447:LIG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 48654553 G/T 1 26 29 55 12.4610315748186 15.1011570896254 -2.64012551480685 T:G G T 10 0.52072955481467 0.50199058740513 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48654489_48654596:LIG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 14 9 23 6.70978623259462 4.68656599333203 2.02322023926259 T:C T C 10 0.52072955481467 0.414185612013738 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 48954421 G/A 1 28 20 48 13.4195724651892 10.4145910962934 3.00498136889584 A:G G A 10 0.52072955481467 0.470493764292766 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48954291_48954488:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48954291_48954488:GRWD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 735 923 1658 352.263777211218 480.63337909394 -128.369601882723 T:C T C 10 0.52072955481467 2.90693352633952e-10 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 49950298 C/T 1 53 39 92 25.4013335948225 20.3084526377721 5.09288095705036 T:C C T 10 0.52072955481467 0.298549419864658 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 49950356 C/G 1 50 37 87 23.9635222592665 19.2669935281428 4.69652873112371 C:G C G 10 0.52072955481467 0.335334553050443 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 63 52 115 30.1940380466758 27.0779368503628 3.11610119631295 T:C C T 10 0.52072955481467 0.576753452115514 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 61 49 110 29.2354971563051 25.5157481859188 3.7197489703863 T:G T G 10 0.52072955481467 0.505001869892062 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 50097784 T/C 1 6 9 15 2.87562267111198 4.68656599333203 -1.81094332222005 T:C T C 10 0.52072955481467 0.44117550699482 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50097711_50097872:PRR12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 50098423 G/A 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 A:C:G G A 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50097954_50101270:PRR12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 50100295 A/G 1 11 5 16 5.27197489703863 2.60364777407335 2.66832712296528 A:G A G 10 0.52072955481467 0.216398220878093 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50097954_50101270:PRR12;ENSG00000126464:ENST00000314734:exon_50100116_50101270:PRR12;ENSG00000126464:ENST00000246798:exon_50100116_50101270:PRR12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 50157946 T/C 1 49 57 106 23.4842518140812 29.6815846244362 -6.19733281035502 T:C T C 10 0.52072955481467 0.244015911422636 ENSG00000126461:ENST00000360565:exon_50157909_50158127:SCAF1;ENSG00000126461:ENST00000447618:exon_50157909_50158127:SCAF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 79 73 152 37.8623651696411 38.0132575014709 -0.150892331829837 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 50358133 T/G 1 56 59 115 26.8391449303785 30.7230437340655 -3.88389880368705 T:G T G 10 0.52072955481467 0.513800149844855 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 50360989 A/G 1 47 39 86 22.5257109237105 20.3084526377721 2.21725828593839 A:G A G 10 0.52072955481467 0.666870818928258 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50360950_50361039:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50360950_50361039:PTOV1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 32 32 64 15.3366542459306 16.6633457540694 -1.32669150813888 T:C T C 10 0.52072955481467 0.802800854618928 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 50412417 G/A 1 94 97 191 45.051421847421 50.510766817023 -5.45934496960196 A:G G A 10 0.52072955481467 0.469039457174288 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 50436371 G/A 1 462 199 661 221.422945675622 103.625181408119 117.797764267503 A:G G A 10 0.52072955481467 1.56762686369584e-20 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 50905042 G/A 1 15 15 30 7.18905667777995 7.81094332222005 -0.621886644440099 A:G G A 10 0.52072955481467 0.856597458926775 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 50905074 G/A 1 21 15 36 10.0646793488919 7.81094332222005 2.25373602667188 A:G G A 10 0.52072955481467 0.506830356128462 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 52471872 A/G 1 1 7 8 0.47927044518533 3.64510688370269 -3.16583643851736 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0323874083396119 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 52793713 C/T 1 12 13 25 5.75124534222396 6.76948421259071 -1.01823887036675 T:C C T 10 0.52072955481467 0.694646743266974 ENSG00000196214:ENST00000439461:exon_52793319_52795976:ZNF766;ENSG00000196214:ENST00000359102:exon_52793319_52795976:ZNF766 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 53577419 G/C 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 C:G G C 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000355147:exon_53577393_53577521:ZNF160 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 54656709 A/T 1 28 19 47 13.4195724651892 9.89386154147873 3.52571092371051 A:T A T 10 0.52072955481467 0.311670332811952 ENSG00000088038:ENST00000221232:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000358389:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000411507:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000445408:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000482247:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000406403:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000447684:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000457463:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000496327:exon_54656604_54656736:CNOT3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 54677897 G/A 1 21 30 51 10.0646793488919 15.6218866444401 -5.55720729554817 A:G G A 10 0.52072955481467 0.125161458621701 ENSG00000125505:ENST00000437868:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000245615:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000494142:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000431666:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000338624:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000449249:exon_54677768_54678125:MBOAT7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 54696167 C/A 1 16 16 32 7.66832712296528 8.33167287703472 -0.663345754069439 A:C C A 10 0.52072955481467 0.860773721489143 ENSG00000170892:ENST00000455798:exon_54695967_54696206:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000456872:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54695967_54696224:TSEN34 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 25 41 66 11.9817611296333 21.3499117474015 -9.36815061776822 T:G T G 10 0.52072955481467 0.0259233586427455 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 55568084 C/T 1 9 8 17 4.31343400666797 4.16583643851736 0.14759756815061 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 55568085 G/T 1 8 9 17 3.83416356148264 4.68656599333203 -0.85240243184939 T:G G T 10 0.52072955481467 0.809480166298499 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 17 14 31 8.14759756815061 7.29021376740538 0.857383800745231 T:C T C 10 0.52072955481467 0.857960893951531 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 55624113 G/A 1 11 11 22 5.27197489703863 5.72802510296137 -0.45605020592274 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55624033_55624163:PPP1R12C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 55756980 A/G 1 75 63 138 35.9452833888998 32.8059619533242 3.13932143557555 A:G A G 10 0.52072955481467 0.610121204844538 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55756860_55757046:PPP6R1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 10 10 20 4.7927044518533 5.2072955481467 -0.4145910962934 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 55995272 G/A 1 10 11 21 4.7927044518533 5.72802510296137 -0.93532065110807 A:G G A 10 0.52072955481467 0.827826563650395 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 57132968 G/A 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 58058735 G/A 1 2 6 8 0.95854089037066 3.12437732888802 -2.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 0.164210754421108 ENSG00000251369:ENST00000506609:exon_58058343_58059361:ZNF550 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 58319906 C/G 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000178935:ENST00000391701:exon_58318450_58320471:ZNF552 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 58724380 G/A 1 45 43 88 21.5671700333398 22.3913708570308 -0.824200823690958 A:G G A 10 0.52072955481467 0.915159139468234 ENSG00000171606:ENST00000326804:exon_58723527_58724927:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000424679:exon_58723527_58724509:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000345813:exon_58723527_58724509:ZNF274 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 58755366 G/A 1 10 7 17 4.7927044518533 3.64510688370269 1.14759756815061 A:G G A 10 0.52072955481467 0.634129017759885 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58755331_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58755328_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000333581:exon_58755328_58755422:ZNF544 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 58772579 C/G 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 C:G C G 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 27 20 47 12.9403020200039 10.4145910962934 2.52571092371051 A:G A G 10 0.52072955481467 0.47034240445371 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 58806083 T/C 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 T:C T C 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000083842:ENST00000196548:exon_58805464_58807254:ZNF8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 58904396 G/A 1 2700 2895 5595 1294.03020200039 1507.51206118847 -213.481859188078 A:T:C:G G A 10 0.52072955481467 1.1793113203253e-08 ENSG00000083845:ENST00000196551:exon_58904343_58904552:RPS5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 59059729 G/A 1 268 249 517 128.444479309668 129.661659148853 -1.21717983918438 A:T:G G A 10 0.52072955481467 0.929878132144982 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59059661_59059775:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59059661_59059775:TRIM28 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 59061357 C/T 1 282 284 566 135.154265542263 147.887193567366 -12.7329280251032 T:C C T 10 0.52072955481467 0.293024418042039 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59061316_59061402:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59061316_59061402:TRIM28 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 59073613 A/G 1 20 7 27 9.5854089037066 3.64510688370269 5.94030202000391 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0321531240468568 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 59074429 C/T 1 18 9 27 8.62686801333594 4.68656599333203 3.94030202000391 T:C C T 10 0.52072955481467 0.176641317007219 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 19 59074653 T/C 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 T:C T C 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 3391826 C/T 1 44 35 79 21.0878995881545 18.2255344185134 2.86236516964107 T:C C T 10 0.52072955481467 0.573932546634548 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 3392295 A/G 1 48 42 90 23.0049813688958 21.8706413022161 1.1343400666797 A:G A G 10 0.52072955481467 0.833575736604761 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 26 10 36 12.4610315748186 5.2072955481467 7.25373602667188 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0185960003091623 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 39 28 67 18.6915473622279 14.5804275348108 4.11111982741711 T:C C T 10 0.52072955481467 0.330350780128967 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 8870862 T/C 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 T:C T C 10 0.52072955481467 0.806303597637586 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 15735648 T/C 1 14 13 27 6.70978623259462 6.76948421259071 -0.0596979799960895 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15735614_15735677:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15735614_15735677:DDX1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 20234122 C/A 1 30 20 50 14.3781133555599 10.4145910962934 3.9635222592665 A:C C A 10 0.52072955481467 0.321861906900029 ENSG00000068697:ENST00000175091:exon_20234078_20234176:LAPTM4A;ENSG00000068697:ENST00000483117:exon_20234078_20234176:LAPTM4A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 20240668 C/A 1 18 14 32 8.62686801333594 7.29021376740538 1.33665424593056 A:C C A 10 0.52072955481467 0.724623430309991 ENSG00000068697:ENST00000175091:exon_20240652_20240772:LAPTM4A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 27260469 G/A 1 65 49 114 31.1525789370464 25.5157481859188 5.63683075112762 A:G G A 10 0.52072955481467 0.30366121249471 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000475258:exon_27260429_27260532:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460904:exon_27260429_27260683:TMEM214 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 27355991 G/T 1 59 49 108 28.2769562659345 25.5157481859188 2.76120808001564 T:G G T 10 0.52072955481467 0.630757788948239 ENSG00000138073:ENST00000468045:exon_27355985_27357497:PREB;ENSG00000138073:ENST00000260643:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000444452:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000406567:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000474802:exon_27355985_27356589:PREB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 27424636 G/A 1 30 24 54 14.3781133555599 12.4975093155521 1.88060404000782 A:G G A 10 0.52072955481467 0.683441288722091 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 27429367 T/C 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 T:C T C 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27429351_27429402:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27429351_27429402:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27429351_27429402:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000412471:exon_27429351_27429402:SLC5A6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 27435374 G/A 1 25 19 44 11.9817611296333 9.89386154147873 2.08789958815452 A:G G A 10 0.52072955481467 0.549986734138911 ENSG00000138074:ENST00000428518:exon_27435331_27435390:SLC5A6;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27435238_27435475:C2orf28 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 9 15 24 4.31343400666797 7.81094332222005 -3.49750931555208 A:G A G 10 0.52072955481467 0.159684989292766 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 27462076 C/T 1 33 33 66 15.8159246911159 17.1840753088841 -1.36815061776822 T:C C T 10 0.52072955481467 0.805677328043137 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27461986_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462020_27462100:CAD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 34 20 54 16.2951951363012 10.4145910962934 5.88060404000782 A:G A G 10 0.52072955481467 0.133558182725525 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 32666411 T/C 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 T:C T C 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32666397_32666530:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32666397_32666530:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000444173:exon_32666397_32666503:BIRC6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 32822957 G/A 1 20 21 41 9.5854089037066 10.9353206511081 -1.34991174740147 A:G G A 10 0.52072955481467 0.755213277513956 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32822818_32823035:BIRC6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 13 4 17 6.23051578740929 2.08291821925868 4.14759756815061 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0522960077891863 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 33759395 C/T 1 43 41 84 20.6086291429692 21.3499117474015 -0.741282604432278 T:C C T 10 0.52072955481467 0.913243204187445 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33756792_33759467:RASGRP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 33764176 A/G 1 37 40 77 17.7330064718572 20.8291821925868 -3.09617572072959 A:G A G 10 0.52072955481467 0.49567073098975 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33764164_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33764161_33764416:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33764161_33764390:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33764161_33765248:RASGRP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 36810586 T/C 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 T:C T C 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36810496_36810612:FEZ2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 29 16 45 13.8988429103746 8.33167287703472 5.56717003333985 A:G G A 10 0.52072955481467 0.102578665125485 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 37458668 G/A 1 21 21 42 10.0646793488919 10.9353206511081 -0.870641302216139 A:G G A 10 0.52072955481467 0.877575319429811 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 37458711 G/A 1 14 9 23 6.70978623259462 4.68656599333203 2.02322023926259 A:G G A 10 0.52072955481467 0.414185612013738 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 37471114 C/A 1 5 8 13 2.39635222592665 4.16583643851736 -1.76948421259071 A:C C A 10 0.52072955481467 0.409410722535207 ENSG00000003509:ENST00000455230:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000414639:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37471054_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000336237:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000431821:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000483999:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000439218:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474257:exon_37471006_37471116:C2orf56 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 37506939 A/G 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 A:G A G 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37506889_37507072:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37506889_37507072:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000494667:exon_37506889_37507072:PRKD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 38604351 A/G 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38604285_38604404:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38604285_38604427:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38604285_38604432:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38604285_38604403:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38604285_38604398:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000456736:exon_38604285_38604404:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000474535:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000472097:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000451483:exon_38604285_38604421:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000416222:exon_38604285_38604415:ATL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 39025555 G/A 1 8 11 19 3.83416356148264 5.72802510296137 -1.89386154147873 A:G G A 10 0.52072955481467 0.492400577054298 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39024871_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000423682:exon_39025515_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39024878_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39025110_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39025422_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000477981:exon_39025494_39025584:DHX57 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 39050141 A/C 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 A:C A C 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39050135_39050411:DHX57 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 39082344 T/C 1 11 5 16 5.27197489703863 2.60364777407335 2.66832712296528 T:C T C 10 0.52072955481467 0.216398220878093 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39082199_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39081196_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39082199_39082417:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000474104:exon_39080187_39082394:DHX57 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 A:C C A 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 42990101 G/C 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 C:G G C 10 0.52072955481467 0.347970315516692 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 42990522 C/T 1 2 7 9 0.95854089037066 3.64510688370269 -2.68656599333203 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0972167926377697 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 8 3 11 3.83416356148264 1.56218866444401 2.27197489703863 A:T T A 10 0.52072955481467 0.230986313204545 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 47301029 A/G 1 20 27 47 9.5854089037066 14.0596979799961 -4.47428907628949 A:G A G 10 0.52072955481467 0.242549844617963 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47300841_47301187:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47300841_47302463:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47300841_47301062:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47300841_47303276:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47300841_47302696:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47300841_47302463:TTC7A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 53955850 C/T 1 8 9 17 3.83416356148264 4.68656599333203 -0.85240243184939 T:C C T 10 0.52072955481467 0.809480166298499 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406687:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000394717:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000498475:exon_53955849_53955984:ASB3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 54035447 A/G 1 18 16 34 8.62686801333594 8.33167287703472 0.295195136301221 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 17 16 33 8.14759756815061 8.33167287703472 -0.184075308884109 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 4 7 11 1.91708178074132 3.64510688370269 -1.72802510296137 A:T A T 10 0.52072955481467 0.371924081118385 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 54127041 C/T 1 8 12 20 3.83416356148264 6.24875465777604 -2.4145910962934 T:C C T 10 0.52072955481467 0.371430851394435 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54127018_54127154:PSME4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 54133744 T/C 1 10 9 19 4.7927044518533 4.68656599333203 0.10613845852127 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54133735_54133830:PSME4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 54858439 C/T 1 73 79 152 34.9867424985291 41.1376348303589 -6.15089233182984 T:C C T 10 0.52072955481467 0.330701229529994 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 54858511 C/T 1 86 109 195 41.2172582859384 56.759521474799 -15.5422631888606 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0263815594438477 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 54882291 C/A 1 52 24 76 24.9220631496372 12.4975093155521 12.4245538340851 A:C C A 10 0.52072955481467 0.00550465428782193 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54882207_54882345:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54882207_54882345:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54882207_54882345:SPTBN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 38 62 100 18.2122769170425 32.2852323985095 -14.072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00500584551161326 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 55460001 C/T 1 14 26 40 6.70978623259462 13.5389684251814 -6.8291821925868 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0386266639287921 ENSG00000143947:ENST00000402285:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000272317:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000449323:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000497083:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000404735:exon_55459814_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000463185:exon_55459944_55460505:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000471772:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000478196:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000494756:exon_55459830_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000495843:exon_55459931_55460008:RPS27A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 T:C C T 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 20 23 43 9.5854089037066 11.9767797607374 -2.39137085703081 T:G G T 10 0.52072955481467 0.542181636891993 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 55559764 C/T 1 4 9 13 1.91708178074132 4.68656599333203 -2.76948421259071 T:C C T 10 0.52072955481467 0.166029130373969 ENSG00000115355:ENST00000336838:exon_55559702_55559829:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000263630:exon_55559702_55559829:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000436346:exon_55559702_55559829:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000413716:exon_55559702_55559829:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000422883:exon_55559702_55559829:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000426576:exon_55559702_55559829:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000468534:exon_55559551_55559829:CCDC88A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 52 45 97 24.9220631496372 23.4328299666602 1.48923318297701 T:C T C 10 0.52072955481467 0.839079442478197 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 55912120 T/C 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 T:C T C 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000429805:exon_55912078_55912183:PNPT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 14 13 27 6.70978623259462 6.76948421259071 -0.0596979799960895 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 8 10 18 3.83416356148264 5.2072955481467 -1.37313198666406 A:G A G 10 0.52072955481467 0.638802194234348 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 60689441 T/C 1 2 9 11 0.95854089037066 4.68656599333203 -3.72802510296137 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0323592930418307 ENSG00000119866:ENST00000356842:exon_60687817_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000359629:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000378117:exon_60688487_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000489516:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000492272:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000335712:exon_60684333_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000477659:exon_60686955_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000358510:exon_60687409_60689559:BCL11A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 61412677 C/G 1 19 26 45 9.10613845852127 13.5389684251814 -4.43282996666015 C:G C G 10 0.52072955481467 0.232347018162802 ENSG00000173209:ENST00000357022:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000489653:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000394457:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000493628:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000430934:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000389584:exon_61412643_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000471542:exon_61412637_61413632:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000487904:exon_61412637_61412881:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000484217:exon_61412637_61413632:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000409615:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000410073:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000491217:exon_61412661_61412753:AHSA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 64327544 G/T 1 14 8 22 6.70978623259462 4.16583643851736 2.54394979407726 T:G G T 10 0.52072955481467 0.295404626091449 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 64327592 T/C 1 14 7 21 6.70978623259462 3.64510688370269 3.06467934889193 T:C T C 10 0.52072955481467 0.197227501927402 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 65298839 A/G 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 A:G A G 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000011523:ENST00000475851:exon_65298588_65298978:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 65299766 T/C 1 10 10 20 4.7927044518533 5.2072955481467 -0.4145910962934 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 65315711 G/A 1 81 87 168 38.8209060600117 45.3034712688763 -6.48256520886456 A:G G A 10 0.52072955481467 0.354159376612449 ENSG00000138069:ENST00000409784:exon_65313989_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000409892:exon_65313989_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000409751:exon_65315005_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000398529:exon_65315005_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000356214:exon_65315005_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000260638:exon_65315014_65315824:RAB1A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 67631831 G/A 1 7 11 18 3.35489311629731 5.72802510296137 -2.37313198666406 A:G G A 10 0.52072955481467 0.346420367518563 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 20 30 50 9.5854089037066 15.6218866444401 -6.0364777407335 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0911652709672552 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 68592496 C/T 1 143 141 284 68.5356736615022 73.4228672288685 -4.88719356736628 T:C C T 10 0.52072955481467 0.593088087495503 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68592305_68592525:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68592322_68592525:PLEK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 119 97 216 57.0331829770543 50.510766817023 6.52241616003128 T:G G T 10 0.52072955481467 0.377108499655869 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 10 5 15 4.7927044518533 2.60364777407335 2.18905667777995 A:T A T 10 0.52072955481467 0.308037122491406 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 71297695 T/C 1 66 26 92 31.6318493822318 13.5389684251814 18.0928809570504 T:C T C 10 0.52072955481467 0.000147968766274055 ENSG00000124357:ENST00000497690:exon_71297632_71297749:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000434004:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000531934:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000465105:exon_71297632_71298149:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000480411:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71295780_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000533981:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71296108_71298957:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000464638:exon_71297430_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000428360:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524736:exon_71297643_71297716:NAGK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 71305456 C/T 1 86 31 117 41.2172582859384 16.1426161992548 25.0746420866836 T:C C T 10 0.52072955481467 2.71404600971594e-06 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71305448_71305484:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 71337203 C/T 1 8 12 20 3.83416356148264 6.24875465777604 -2.4145910962934 T:C C T 10 0.52072955481467 0.371430851394435 ENSG00000124370:ENST00000413592:exon_71336814_71337252:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71336814_71337252:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000462609:exon_71336944_71337252:MCEE HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 71351403 C/A 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 A:C C A 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 71351487 G/A 1 5 8 13 2.39635222592665 4.16583643851736 -1.76948421259071 A:G G A 10 0.52072955481467 0.409410722535207 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000494660:exon_71351477_71351673:MCEE HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 71360282 G/A 1 37 36 73 17.7330064718572 18.7462639733281 -1.01325750147091 A:G G A 10 0.52072955481467 0.816035056701793 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 71377014 G/A 1 17 9 26 8.14759756815061 4.68656599333203 3.46103157481858 A:G G A 10 0.52072955481467 0.238474281795361 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 71633389 C/T 1 4 7 11 1.91708178074132 3.64510688370269 -1.72802510296137 T:C C T 10 0.52072955481467 0.371924081118385 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000494241:exon_71633258_71633392:ZNF638 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 73829372 C/T 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 T:C C T 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73829312_73829495:ALMS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 74057995 T/C 1 25 27 52 11.9817611296333 14.0596979799961 -2.07793685036284 T:C T C 10 0.52072955481467 0.581553855774598 ENSG00000124356:ENST00000339566:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000409707:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000452725:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000432295:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000424659:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394073:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394070:exon_74057972_74058186:STAMBP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 47 52 99 22.5257109237105 27.0779368503628 -4.55222592665233 A:T A T 10 0.52072955481467 0.367183617099572 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 74274415 C/T 1 5 10 15 2.39635222592665 5.2072955481467 -2.81094332222005 T:C C T 10 0.52072955481467 0.196715161243913 ENSG00000187605:ENST00000305799:exon_74273405_74275538:TET3;ENSG00000187605:ENST00000409262:exon_74273450_74275538:TET3;ENSG00000187605:ENST00000233310:exon_74273450_74275538:TET3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 74687628 C/T 1 32 48 80 15.3366542459306 24.9950186311042 -9.6583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0333926628585920 ENSG00000115274:ENST00000452361:exon_74687348_74688011:INO80B;ENSG00000115274:ENST00000441673:exon_74687348_74687973:INO80B;ENSG00000239779:ENST00000233615:exon_74687348_74688018:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000393972:exon_74687348_74688018:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000470536:exon_74687348_74687744:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000484744:exon_74687348_74688010:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000409737:exon_74687348_74687983:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000494741:exon_74687348_74687823:WBP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 75882399 G/A 1 19 16 35 9.10613845852127 8.33167287703472 0.774465581486551 A:G G A 10 0.52072955481467 0.866428368314304 ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75882190_75884986:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75882190_75882428:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000453233:exon_75882190_75882428:MRPL19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 86259443 C/T 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86259395_86259505:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86259395_86259505:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000496892:exon_86259395_86259505:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000492034:exon_86259395_86259505:POLR1A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 86346119 A/G 1 15 13 28 7.18905667777995 6.76948421259071 0.419572465189241 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86346044_86346167:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000465560:exon_86346044_86346167:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000483925:exon_86346044_86346304:PTCD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 86433240 C/T 1 20 49 69 9.5854089037066 25.5157481859188 -15.9303392822122 T:C C T 10 0.52072955481467 0.000147210056308826 ENSG00000132313:ENST00000254644:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000337109:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000409180:exon_86433229_86433418:MRPL35 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 86683642 A/G 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:G A G 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000115548:ENST00000409556:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000312912:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000441719:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000409064:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000463013:exon_86683565_86683778:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000488971:exon_86683556_86683689:KDM3A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 86691250 G/A 1 11 9 20 5.27197489703863 4.68656599333203 0.5854089037066 A:G G A 10 0.52072955481467 0.826808206154088 ENSG00000115548:ENST00000409556:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000312912:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000441719:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000409064:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000488971:exon_86691176_86691339:KDM3A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 89160046 A/G 0 18 0 18 8.62686801333594 0 8.62686801333594 A A 10 0.52072955481467 9.7055097956503e-06 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 89160739 T/C 1 173 77 250 82.9137870170621 40.0961757207296 42.8176112963325 A:T:C:G T A 10 0.52072955481467 4.08562537313143e-08 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 89161000 T/C 1 14 7 21 6.70978623259462 3.64510688370269 3.06467934889193 T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.197227501927402 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 89161073 A/C 1 14 6 20 6.70978623259462 3.12437732888802 3.5854089037066 A:C A C 10 0.52072955481467 0.121539458049168 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 89161090 T/C 1 14 7 21 6.70978623259462 3.64510688370269 3.06467934889193 T:C T C 10 0.52072955481467 0.197227501927402 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 95773955 A/G 1 27 30 57 12.9403020200039 15.6218866444401 -2.68158462443619 A:G A G 10 0.52072955481467 0.509129318444239 ENSG00000144029:ENST00000272418:exon_95773920_95774153:MRPS5;ENSG00000144029:ENST00000345084:exon_95773920_95774153:MRPS5;ENSG00000144029:ENST00000475895:exon_95773920_95774153:MRPS5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 96684975 C/T 1 12 6 18 5.75124534222396 3.12437732888802 2.62686801333594 T:C C T 10 0.52072955481467 0.245162799745609 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 96685307 G/A 1 8 3 11 3.83416356148264 1.56218866444401 2.27197489703863 A:G G A 10 0.52072955481467 0.230986313204545 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 96688990 C/T 1 13 3 16 6.23051578740929 1.56218866444401 4.66832712296528 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0229985249854673 ENSG00000186281:ENST00000335448:exon_96688706_96689040:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000484440:exon_96688706_96689188:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000482704:exon_96688854_96689748:GPAT2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 96795608 T/G 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 T:G T G 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000188886:ENST00000342380:exon_96795563_96795717:ASTL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 96795714 G/A 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000188886:ENST00000342380:exon_96795563_96795717:ASTL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 96952833 A/G 1 78 79 157 37.3830947244557 41.1376348303589 -3.75454010590318 A:G A G 10 0.52072955481467 0.576454271524118 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96952744_96952898:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000480615:exon_96952744_96952898:SNRNP200 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 96993757 C/T 1 18 16 34 8.62686801333594 8.33167287703472 0.295195136301221 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 96993884 A/G 1 14 14 28 6.70978623259462 7.29021376740538 -0.580427534810759 A:G A G 10 0.52072955481467 0.852057573756229 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 97020049 T/C 1 10 20 30 4.7927044518533 10.4145910962934 -5.6218866444401 T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.0447395862451019 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000477409:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97019921_97020126:NCAPH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 97030247 T/C 1 19 18 37 9.10613845852127 9.37313198666406 -0.266993528142789 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435349:exon_97030218_97030329:NCAPH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 97526787 T/A 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 A:T T A 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000168758:ENST00000305476:exon_97525453_97527192:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000474420:exon_97525473_97527386:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000482925:exon_97525479_97527192:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000467747:exon_97525485_97527192:SEMA4C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 97526788 C/A 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 A:C C A 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000168758:ENST00000305476:exon_97525453_97527192:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000474420:exon_97525473_97527386:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000482925:exon_97525479_97527192:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000467747:exon_97525485_97527192:SEMA4C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 1 9 10 0.47927044518533 4.68656599333203 -4.2072955481467 T:C T C 10 0.52072955481467 0.00905306247383101 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 99787009 C/T 1 10 14 24 4.7927044518533 7.29021376740538 -2.49750931555208 T:C C T 10 0.52072955481467 0.316530133475197 ENSG00000158411:ENST00000487588:exon_99787000_99787115:MITD1;ENSG00000158411:ENST00000422537:exon_99787000_99787097:MITD1;ENSG00000158411:ENST00000464685:exon_99787000_99787115:MITD1;ENSG00000158411:ENST00000289359:exon_99787000_99787115:MITD1;ENSG00000158411:ENST00000483721:exon_99787000_99787368:MITD1;ENSG00000158411:ENST00000409107:exon_99787000_99787115:MITD1;ENSG00000158411:ENST00000466880:exon_99786998_99787115:MITD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 99978048 G/A 1 146 108 254 69.9734849970582 56.2387919199844 13.7346930770738 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0899448325959047 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99977611_99978283:EIF5B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 27 37 64 12.9403020200039 19.2669935281428 -6.32669150813888 T:C T C 10 0.52072955481467 0.132988776605181 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 8 10 18 3.83416356148264 5.2072955481467 -1.37313198666406 A:G A G 10 0.52072955481467 0.638802194234348 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 16 7 23 7.66832712296528 3.64510688370269 4.02322023926259 A:G A G 10 0.52072955481467 0.099569417326673 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 101925026 T/C 1 4 10 14 1.91708178074132 5.2072955481467 -3.29021376740538 T:C T C 10 0.52072955481467 0.107382582617767 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101924591_101925163:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101924591_101925158:RNF149 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 105889349 G/A 1 13 10 23 6.23051578740929 5.2072955481467 1.02322023926259 A:G G A 10 0.52072955481467 0.683682381961274 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 105897003 G/A 1 16 12 28 7.66832712296528 6.24875465777604 1.41957246518924 A:G G A 10 0.52072955481467 0.706167957724672 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105896839_105897180:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105896839_105897180:TGFBRAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 105924510 A/G 1 12 15 27 5.75124534222396 7.81094332222005 -2.05969797999609 A:G A G 10 0.52072955481467 0.447615619311931 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105924071_105924775:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105924071_105924778:TGFBRAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 109088275 G/A 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 A:G G A 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000409896:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000462897:exon_109088270_109088572:GCC2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 111907691 T/C 1 6 15 21 2.87562267111198 7.81094332222005 -4.93532065110807 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0467824561794380 ENSG00000153094:ENST00000308659:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000357757:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000393253:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000393256:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000428038:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000433098:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000437029:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000452231:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000361493:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000431217:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000439718:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000422765:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000357682:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000452033:exon_111907526_111908532:BCL2L11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 113308516 T/A 1 3 8 11 1.43781133555599 4.16583643851736 -2.72802510296137 A:T T A 10 0.52072955481467 0.132783549738221 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113308284_113308579:POLR1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 113309473 C/T 1 8 3 11 3.83416356148264 1.56218866444401 2.27197489703863 T:C C T 10 0.52072955481467 0.230986313204545 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113309352_113309556:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113309352_113309575:POLR1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 113498566 A/G 1 5 8 13 2.39635222592665 4.16583643851736 -1.76948421259071 A:G A G 10 0.52072955481467 0.409410722535207 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113498395_113498584:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113498395_113498584:CKAP2L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 113537223 C/A 1 12 6 18 5.75124534222396 3.12437732888802 2.62686801333594 A:C C A 10 0.52072955481467 0.245162799745609 ENSG00000115008:ENST00000263339:exon_113537073_113537243:IL1A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 71 58 129 34.0282016081584 30.2023141792509 3.82588742890757 T:C T C 10 0.52072955481467 0.537732973511111 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 39 38 77 18.6915473622279 19.7877230829575 -1.09617572072959 C:G G C 10 0.52072955481467 0.820409667769268 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 41 46 87 19.6500882525985 23.9535595214748 -4.30347126887629 A:G A G 10 0.52072955481467 0.391134416988714 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 113955443 C/A 1 36 38 74 17.2537360266719 19.7877230829575 -2.53398705628558 A:C C A 10 0.52072955481467 0.563144652475769 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113955324_113955490:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113955327_113955490:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113955327_113955490:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113955324_113955490:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000487574:exon_113955327_113955766:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409378:exon_113955327_113955490:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000460725:exon_113954772_113955490:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000465592:exon_113955327_113955490:PSD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 113956371 G/C 1 68 43 111 32.5903902726024 22.3913708570308 10.1990194155716 C:G G C 10 0.52072955481467 0.057345289399124 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000460725:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000465592:exon_113956317_113956407:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000464559:exon_113956135_113956803:PSD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 45 41 86 21.5671700333398 21.3499117474015 0.217258285938378 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 11 4 15 5.27197489703863 2.08291821925868 3.18905667777995 T:C T C 10 0.52072955481467 0.123192206125781 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 4 14 18 1.91708178074132 7.29021376740538 -5.37313198666406 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0160207778231823 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 122106262 T/G 1 14 16 30 6.70978623259462 8.33167287703472 -1.6218866444401 T:G T G 10 0.52072955481467 0.587501156256487 ENSG00000074054:ENST00000429969:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000442289:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000263710:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000455322:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000397587:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000376194:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000409078:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000452274:exon_122106088_122106294:CLASP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 122216419 A/G 0 0 8 8 0 4.16583643851736 -4.16583643851736 G A G 10 0.52072955481467 0.00278384587959875 ENSG00000074054:ENST00000429969:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000263710:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000455322:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000397587:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000376194:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000409078:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000452274:exon_122216416_122216551:CLASP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 261 248 509 125.089586193371 129.140929594038 -4.05134340066701 A:T:C A C 10 0.52072955481467 0.722895281737183 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 127821207 G/A 1 39 49 88 18.6915473622279 25.5157481859188 -6.82420082369096 A:G G A 10 0.52072955481467 0.165344996875776 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127821147_127821222:BIN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 9 34 43 4.31343400666797 17.7048048636988 -13.3913708570308 A:G A G 10 0.52072955481467 4.30123062329069e-05 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 128608184 C/T 1 25 26 51 11.9817611296333 13.5389684251814 -1.55720729554817 T:C C T 10 0.52072955481467 0.676709354006684 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 128757995 A/C 1 9 6 15 4.31343400666797 3.12437732888802 1.18905667777995 A:T:C A C 10 0.52072955481467 0.611940175630342 ENSG00000136715:ENST00000259235:exon_128757881_128758028:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000357702:exon_128757881_128758028:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000259234:exon_128757881_128758028:SAP130 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 128934400 T/C 1 9 13 22 4.31343400666797 6.76948421259071 -2.45605020592274 T:C T C 10 0.52072955481467 0.393983016021626 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128934388_128934472:UGGT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 13 14 27 6.23051578740929 7.29021376740538 -1.05969797999609 A:G G A 10 0.52072955481467 0.70448341958002 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 136409574 A/C 1 29 19 48 13.8988429103746 9.89386154147873 4.00498136889584 A:C A C 10 0.52072955481467 0.311903913202396 ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000429703:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000487294:exon_136409300_136409591:R3HDM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 136511842 C/A 1 23 13 36 11.0232202392626 6.76948421259071 4.25373602667188 A:C C A 10 0.52072955481467 0.182857638763797 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136511109_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000470687:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136511722_136511847:UBXN4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 136598357 A/G 1 53 70 123 25.4013335948225 36.4510688370269 -11.0497352422044 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0474123441718171 ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136597196_136598521:MCM6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 150432976 C/T 1 64 44 108 30.6733084918611 22.9121004118455 7.76120808001564 T:C C T 10 0.52072955481467 0.148677132896640 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150432951_150432992:MMADHC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 152320118 G/A 1 6 10 16 2.87562267111198 5.2072955481467 -2.33167287703472 A:G G A 10 0.52072955481467 0.318493089377623 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 152321595 C/T 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 152322095 A/T 1 18 21 39 8.62686801333594 10.9353206511081 -2.30845263777213 A:T A T 10 0.52072955481467 0.522666332291258 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 160604452 C/T 1 18 25 43 8.62686801333594 13.0182388703667 -4.39137085703081 T:C C T 10 0.52072955481467 0.221851712159764 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 160605268 T/C 1 46 29 75 22.0464404785252 15.1011570896254 6.94528338889975 T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.132486478581381 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 160673526 A/G 1 13 25 38 6.23051578740929 13.0182388703667 -6.78772308295746 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0338738975836856 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 24 20 44 11.5024906844479 10.4145910962934 1.08789958815452 T:C C T 10 0.52072955481467 0.765154003607581 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 163137871 C/G 1 21 15 36 10.0646793488919 7.81094332222005 2.25373602667188 C:G C G 10 0.52072955481467 0.506830356128462 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 163137983 T/C 1 14 25 39 6.70978623259462 13.0182388703667 -6.30845263777213 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0535236322874138 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 166797646 C/T 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000123607:ENST00000243344:exon_166797537_166797694:TTC21B;ENSG00000123607:ENST00000464374:exon_166797537_166797694:TTC21B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 170402752 T/C 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 T:C T C 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 170403030 T/C 1 14 14 28 6.70978623259462 7.29021376740538 -0.580427534810759 T:C T C 10 0.52072955481467 0.852057573756229 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 78 78 156 37.3830947244557 40.6169052755443 -3.23381055108851 A:T T A 10 0.52072955481467 0.63106752800351 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 21 19 40 10.0646793488919 9.89386154147873 0.170817807413201 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 174131392 T/C 1 8 9 17 3.83416356148264 4.68656599333203 -0.85240243184939 T:C T C 10 0.52072955481467 0.809480166298499 ENSG00000091436:ENST00000409176:exon_174130778_174131511:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000375213:exon_174130778_174132738:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000431503:exon_174130778_174131478:AC013461.1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 178416968 G/A 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000196659:ENST00000408939:exon_178414973_178417742:TTC30B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 179396162 C/G 1 2 6 8 0.95854089037066 3.12437732888802 -2.16583643851736 C:G C G 10 0.52072955481467 0.164210754421108 ENSG00000155657:ENST00000473181:exon_179394968_179400576:TTN;ENSG00000155657:ENST00000460472:exon_179394968_179400576:TTN;ENSG00000155657:ENST00000359218:exon_179394968_179400576:TTN;ENSG00000155657:ENST00000356127:exon_179394968_179400576:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342175:exon_179394968_179400576:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342992:exon_179394968_179400576:TTN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 190323530 A/G 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G A G 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190323479_190323598:WDR75 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 191224927 C/T 1 10 3 13 4.7927044518533 1.56218866444401 3.23051578740929 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0958867035011751 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 191224981 G/T 1 9 1 10 4.31343400666797 0.52072955481467 3.7927044518533 T:G G T 10 0.52072955481467 0.0225455086853891 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 197021276 T/C 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 T:C T C 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 198001319 A/G 1 6 19 25 2.87562267111198 9.89386154147873 -7.01823887036675 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00786562429720965 ENSG00000065413:ENST00000282272:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000328737:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000450567:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000337207:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409153:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409919:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000447713:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000443014:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000463879:exon_197998695_198001386:ANKRD44 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 78 54 132 37.3830947244557 28.1193959599922 9.26369876446357 T:C T C 10 0.52072955481467 0.116852102584614 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 63 56 119 30.1940380466758 29.1608550696215 1.03318297705427 A:G A G 10 0.52072955481467 0.855076727863885 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 70 84 154 33.5489311629731 43.7412826044323 -10.1923514414592 T:C T C 10 0.52072955481467 0.106856362130886 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 257 211 468 123.17250441263 109.873936065895 13.2985683467345 A:T:C T C 10 0.52072955481467 0.229073115762178 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 201371768 G/T 1 6 10 16 2.87562267111198 5.2072955481467 -2.33167287703472 T:G G T 10 0.52072955481467 0.318493089377623 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000468413:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000478816:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000458583:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000447556:exon_201371580_201371814:KCTD18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 201437214 A/G 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 201437334 T/C 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 202245244 A/G 1 3 8 11 1.43781133555599 4.16583643851736 -2.72802510296137 A:G A G 10 0.52072955481467 0.132783549738221 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202241930_202245941:TRAK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 202252539 G/A 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 A:G G A 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202252426_202252724:TRAK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 203139844 T/C 1 45 72 117 21.5671700333398 37.4925279466562 -15.9253579133164 T:C T C 10 0.52072955481467 0.00393951688618959 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000426814:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000488403:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000492740:exon_203139836_203140406:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000472050:exon_203139836_203139912:NOP58 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 203155936 A/C 1 57 58 115 27.3184153755638 30.2023141792509 -2.88389880368705 A:C A C 10 0.52072955481467 0.640992512084562 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203155848_203155993:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203155848_203155993:NOP58 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 203162132 T/C 1 71 75 146 34.0282016081584 39.0547166111002 -5.02651500294181 T:C T C 10 0.52072955481467 0.408916892657958 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203162102_203162236:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203162102_203162236:NOP58 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 207006676 T/C 1 26 30 56 12.4610315748186 15.6218866444401 -3.16085506962152 T:C T C 10 0.52072955481467 0.424251649243372 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207006665_207006793:NDUFS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 207008763 C/A 1 24 20 44 11.5024906844479 10.4145910962934 1.08789958815452 A:C C A 10 0.52072955481467 0.765154003607581 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 207025444 T/C 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 T:C T C 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000114942:ENST00000479587:exon_207025312_207025841:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000460760:exon_207025312_207025914:EEF1B2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 25 23 48 11.9817611296333 11.9767797607374 0.00498136889584089 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 219146803 G/A 1 9 18 27 4.31343400666797 9.37313198666406 -5.05969797999609 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0556408222394603 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 219267781 C/T 1 66 62 128 31.6318493822318 32.2852323985095 -0.653383016277754 T:C C T 10 0.52072955481467 0.929669255691229 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219267734_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219267758_219267850:CTDSP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 219508372 A/T 1 13 12 25 6.23051578740929 6.24875465777604 -0.0182388703667495 A:T A T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 219508988 T/C 1 9 16 25 4.31343400666797 8.33167287703472 -4.01823887036675 T:C T C 10 0.52072955481467 0.114026931073522 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 219509618 C/A 1 15 6 21 7.18905667777995 3.12437732888802 4.06467934889193 A:C C A 10 0.52072955481467 0.0836954361100518 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 219602499 G/C 1 7 6 13 3.35489311629731 3.12437732888802 0.23051578740929 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000135912:ENST00000415717:exon_219602302_219602702:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219602302_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000437755:exon_219602302_219602922:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219602302_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000424644:exon_219602302_219602701:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219602297_219603886:TTLL4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 219602819 G/A 1 6 11 17 2.87562267111198 5.72802510296137 -2.85240243184939 A:G G A 10 0.52072955481467 0.224918141362531 ENSG00000135912:ENST00000457313:exon_219602631_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219602302_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000437755:exon_219602302_219602922:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219602302_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219602297_219603886:TTLL4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 219610433 A/G 1 9 18 27 4.31343400666797 9.37313198666406 -5.05969797999609 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0556408222394603 ENSG00000135912:ENST00000457313:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000417196:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000461181:exon_219610110_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000494428:exon_219610276_219610524:TTLL4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 10 11 21 4.7927044518533 5.72802510296137 -0.93532065110807 A:G G A 10 0.52072955481467 0.827826563650395 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 220046488 G/A 1 43 37 80 20.6086291429692 19.2669935281428 1.3416356148264 A:G G A 10 0.52072955481467 0.82322614213628 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220046362_220046497:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046362_220046497:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046362_220046497:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046362_220046497:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046400_220046497:FAM134A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 220047174 G/A 1 38 36 74 18.2122769170425 18.7462639733281 -0.533987056285579 A:G G A 10 0.52072955481467 0.907969389506314 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220047136_220047351:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 220404347 C/G 1 21 27 48 10.0646793488919 14.0596979799961 -3.99501863110416 C:G C G 10 0.52072955481467 0.252329158367922 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 225346646 T/C 1 79 76 155 37.8623651696411 39.5754461659149 -1.71308099627385 T:C T C 10 0.52072955481467 0.809686532004678 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225346609_225346795:CUL3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 225362478 C/T 1 41 48 89 19.6500882525985 24.9950186311042 -5.34493037850563 T:C C T 10 0.52072955481467 0.288895160029071 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000451538:exon_225362470_225362536:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000487558:exon_225362470_225362566:CUL3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 38 33 71 18.2122769170425 17.1840753088841 1.02820160815843 A:C:G A G 10 0.52072955481467 0.813671983712961 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 231077112 G/A 1 68 58 126 32.5903902726024 30.2023141792509 2.38807609335158 A:C:G G A 10 0.52072955481467 0.721578505852037 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077111_231077145:SP110 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 231248261 C/T 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231248225_231248290:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231248225_231248290:SP140L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 28 27 55 13.4195724651892 14.0596979799961 -0.640125514806849 A:G G A 10 0.52072955481467 0.89324841776031 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 92 27 119 44.0928809570504 14.0596979799961 30.0331829770543 T:C C T 10 0.52072955481467 1.88016301820869e-08 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 1 90 1 91 43.1343400666797 0.52072955481467 42.613610511865 A:G G A 10 0.52072955481467 2.75718777110733e-24 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 233201328 A/G 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 A:G A G 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_233201179_233201907:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_233201179_233201908:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_233200924_233201687:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_233201179_233201340:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000429283:exon_233199079_233201686:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000418143:exon_233201020_233201684:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000417808:exon_233200851_233201683:DIS3L2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 233599904 A/C 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 A:C A C 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000204120:ENST00000476995:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000427233:exon_233599865_233599947:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373566:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373563:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000428883:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409480:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000456491:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000484409:exon_233599865_233600161:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000492910:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409547:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000475359:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000488629:exon_233599865_233600298:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000490612:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000464402:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000421433:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000425040:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000430720:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000423659:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409196:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000488734:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409451:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000463554:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000440945:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000429187:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000482666:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000490229:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000483164:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000464805:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000489328:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000424038:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000414511:exon_233599858_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000452341:exon_233599858_233599948:GIGYF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 233659553 C/A 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 A:C C A 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000204120:ENST00000373566:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373563:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409480:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409547:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000423659:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409196:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409451:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000440945:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000414511:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000452341:exon_233659458_233659654:GIGYF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 233925166 G/A 1 46 27 73 22.0464404785252 14.0596979799961 7.98674249852909 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0781768354260771 ENSG00000168918:ENST00000422935:exon_233924677_233925322:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000451407:exon_233925062_233925322:INPP5D HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 234749258 T/C 1 27 20 47 12.9403020200039 10.4145910962934 2.52571092371051 T:C T C 10 0.52072955481467 0.47034240445371 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 234749354 G/A 1 25 19 44 11.9817611296333 9.89386154147873 2.08789958815452 A:G G A 10 0.52072955481467 0.549986734138911 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 234749780 G/C 1 23 34 57 11.0232202392626 17.7048048636988 -6.68158462443619 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0850319819629549 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 235404862 C/G 1 19 4 23 9.10613845852127 2.08291821925868 7.02322023926259 C:G C G 10 0.52072955481467 0.00309126105998718 ENSG00000188042:ENST00000390645:exon_235401685_235405697:ARL4C;ENSG00000188042:ENST00000339728:exon_235404656_235405244:ARL4C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 238668802 A/G 1 58 51 109 27.7976858207491 26.5572072955482 1.24047852520097 A:G A G 10 0.52072955481467 0.848279937188273 ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 89 81 170 42.6550696214944 42.1790939399883 0.4759756815061 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 120 107 227 57.5124534222396 55.7180623651697 1.79439105706992 A:C:G C G 10 0.52072955481467 0.842162220921933 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 37 37 74 17.7330064718572 19.2669935281428 -1.53398705628558 T:C T C 10 0.52072955481467 0.728714674670938 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 241463461 T/C 1 6 9 15 2.87562267111198 4.68656599333203 -1.81094332222005 T:C T C 10 0.52072955481467 0.44117550699482 ENSG00000144504:ENST00000373318:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000272972:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000361678:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000391987:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000403283:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000401804:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000373320:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405523:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405002:exon_241461355_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000480230:exon_241461356_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000484526:exon_241461356_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000459901:exon_241462675_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000496300:exon_241463240_241463798:ANKMY1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 241517314 G/A 1 93 52 145 44.5721514022357 27.0779368503628 17.4942145518729 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00358083276806457 ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241517016_241518149:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241517016_241518144:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241517016_241518141:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000437406:exon_241517016_241518141:RNPEPL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 7 12 19 3.35489311629731 6.24875465777604 -2.89386154147873 A:G G A 10 0.52072955481467 0.250829533252171 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 242046785 A/C 1 96 66 162 46.0099627377917 34.3681506177682 11.6418121200235 A:C A C 10 0.52072955481467 0.0706244900744425 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000472072:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242046768_242046914:PASK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 242051777 G/A 1 56 24 80 26.8391449303785 12.4975093155521 14.3416356148264 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00156491125899651 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000489256:exon_242051655_242052201:PASK;ENSG00000115687:ENST00000475666:exon_242051655_242051840:PASK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 242054403 G/A 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242052722_242054592:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242053050_242054592:PASK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 242062162 C/T 1 18 21 39 8.62686801333594 10.9353206511081 -2.30845263777213 T:C C T 10 0.52072955481467 0.522666332291258 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242062147_242062314:PASK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 242066156 C/T 1 31 30 61 14.8573838007452 15.6218866444401 -0.764502843694869 T:C C T 10 0.52072955481467 0.898322654029636 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 41 43 84 19.6500882525985 22.3913708570308 -2.74128260443228 T:C T C 10 0.52072955481467 0.585832742087495 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 242066789 A/G 1 16 27 43 7.66832712296528 14.0596979799961 -6.39137085703081 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0659112651102053 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000459710:exon_242066401_242066866:PASK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 242075362 G/A 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 A:G G A 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242075291_242075454:PASK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 242082262 T/C 1 9 13 22 4.31343400666797 6.76948421259071 -2.45605020592274 T:C T C 10 0.52072955481467 0.393983016021626 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000452907:exon_242082252_242082489:PASK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 242380748 T/A 1 9 5 14 4.31343400666797 2.60364777407335 1.70978623259462 A:T T A 10 0.52072955481467 0.429598343746981 ENSG00000006607:ENST00000264042:exon_242380719_242380971:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000373287:exon_242380719_242380971:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000413432:exon_242380719_242381167:FARP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 25 29 54 11.9817611296333 15.1011570896254 -3.11939595999218 A:G A G 10 0.52072955481467 0.416346908966056 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 242690745 C/T 1 13 10 23 6.23051578740929 5.2072955481467 1.02322023926259 T:C C T 10 0.52072955481467 0.683682381961274 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 242793273 A/G 1 11 9 20 5.27197489703863 4.68656599333203 0.5854089037066 A:G A G 10 0.52072955481467 0.826808206154088 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 2 242793433 G/A 1 5 9 14 2.39635222592665 4.68656599333203 -2.29021376740538 A:G G A 10 0.52072955481467 0.287077835461110 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000343705:exon_242793385_242793449:PDCD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 8 10 18 3.83416356148264 5.2072955481467 -1.37313198666406 A:T T A 10 0.52072955481467 0.638802194234348 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 257733 A/G 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 A:G A G 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 259818 G/A 1 7 10 17 3.35489311629731 5.2072955481467 -1.85240243184939 A:G G A 10 0.52072955481467 0.468528473543755 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 8 12 20 3.83416356148264 6.24875465777604 -2.4145910962934 C:G G C 10 0.52072955481467 0.371430851394435 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 32 27 59 15.3366542459306 14.0596979799961 1.27695626593447 T:C T C 10 0.52072955481467 0.795068533155472 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 372097 G/A 1 39 17 56 18.6915473622279 8.85240243184939 9.83914493037848 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0104388740121639 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 47 58 105 22.5257109237105 30.2023141792509 -7.67660325554035 T:C C T 10 0.52072955481467 0.143295662305760 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 1293247 C/T 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 T:C C T 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000125775:ENST00000381812:exon_1293231_1293406:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000381808:exon_1293231_1293406:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000360779:exon_1293231_1293406:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000339987:exon_1293231_1293406:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000245974:exon_1293231_1293406:SDCBP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 2635212 A/G 1 140 92 232 67.0978623259462 47.9071190429496 19.1907432829966 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0124218457616613 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000496775:exon_2634880_2635221:NOP56 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 2638492 G/A 1 10 18 28 4.7927044518533 9.37313198666406 -4.58042753481076 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0909379654239063 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 384 379 763 184.039850951167 197.35650127476 -13.3166503235932 A:T:C T C 10 0.52072955481467 0.346196814666597 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 3784110 C/T 1 18 23 41 8.62686801333594 11.9767797607374 -3.34991174740147 T:C:G C T 10 0.52072955481467 0.348892228743102 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3784051_3784184:CDC25B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 3842984 C/T 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 T:C C T 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3842901_3843060:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000416600:exon_3842901_3843060:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3842901_3843060:MAVS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 4854682 A/G 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 A:G A G 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000089057:ENST00000379333:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000338244:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000379324:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000424750:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000437886:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000423430:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000468355:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000496331:exon_4854523_4854738:SLC23A2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 36 23 59 17.2537360266719 11.9767797607374 5.27695626593447 T:C T C 10 0.52072955481467 0.192952910130451 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 36 23 59 17.2537360266719 11.9767797607374 5.27695626593447 T:C T C 10 0.52072955481467 0.192952910130451 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 7980390 C/T 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 T:C C T 10 0.52072955481467 0.347970315516692 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000527925:exon_7980379_7980469:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000462384:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000530935:exon_7980379_7980507:TMX4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 10594363 G/A 0 32 0 32 15.3366542459306 0 15.3366542459306 G G 10 0.52072955481467 9.14321740378935e-10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 13763601 A/G 1 16 13 29 7.66832712296528 6.76948421259071 0.898842910374571 A:G A G 10 0.52072955481467 0.853126532704154 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13763150_13763829:ESF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 17 22 39 8.14759756815061 11.4560502059227 -3.30845263777213 A:C C A 10 0.52072955481467 0.337129691685971 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 23 19 42 11.0232202392626 9.89386154147873 1.12935869778386 A:G G A 10 0.52072955481467 0.759532170383494 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 18131563 T/C 1 7 4 11 3.35489311629731 2.08291821925868 1.27197489703863 T:C T C 10 0.52072955481467 0.552692319562948 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18131465_18131586:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18131465_18131586:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18131465_18131586:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18131465_18131586:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18131465_18131586:CSRP2BP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 18143355 C/T 1 12 11 23 5.75124534222396 5.72802510296137 0.0232202392625904 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18143021_18143589:CSRP2BP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 18462421 A/G 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000132664:ENST00000377603:exon_18462263_18462454:POLR3F;ENSG00000132664:ENST00000462997:exon_18462263_18462454:POLR3F HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 18523002 C/G 1 70 41 111 33.5489311629731 21.3499117474015 12.1990194155716 C:G C G 10 0.52072955481467 0.0223808123308924 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18522940_18523046:SEC23B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 23345844 A/C 1 7 11 18 3.35489311629731 5.72802510296137 -2.37313198666406 A:C A C 10 0.52072955481467 0.346420367518563 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 25193953 G/A 1 10 10 20 4.7927044518533 5.2072955481467 -0.4145910962934 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000197586:ENST00000354989:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000525986:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000439162:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433417:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25193899_25194012:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000447877:exon_25193899_25194042:ENTPD6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 25260931 A/G 1 14 16 30 6.70978623259462 8.33167287703472 -1.6218866444401 A:G A G 10 0.52072955481467 0.587501156256487 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25260902_25261048:PYGB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 25264814 T/C 1 8 11 19 3.83416356148264 5.72802510296137 -1.89386154147873 T:C T C 10 0.52072955481467 0.492400577054298 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25264740_25264887:PYGB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 25276297 G/A 1 30 22 52 14.3781133555599 11.4560502059227 2.92206314963716 A:G G A 10 0.52072955481467 0.488227755711358 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000428458:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000471359:exon_25276240_25276306:PYGB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 25282944 A/G 1 17 21 38 8.14759756815061 10.9353206511081 -2.78772308295746 A:G A G 10 0.52072955481467 0.41821411726343 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 25288632 G/A 1 27 20 47 12.9403020200039 10.4145910962934 2.52571092371051 A:G G A 10 0.52072955481467 0.47034240445371 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000491682:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000481556:exon_25288602_25288681:ABHD12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 25398790 G/A 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000101003:ENST00000429262:exon_25398741_25398831:GINS1;ENSG00000101003:ENST00000262460:exon_25398741_25398831:GINS1;ENSG00000101003:ENST00000484893:exon_25398741_25398831:GINS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 31023500 C/T 1 48 40 88 23.0049813688958 20.8291821925868 2.17579917630904 T:C C T 10 0.52072955481467 0.670621098778191 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 31024034 G/A 1 31 32 63 14.8573838007452 16.6633457540694 -1.80596195332421 A:G G A 10 0.52072955481467 0.705807666311002 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 31024207 C/T 1 34 38 72 16.2951951363012 19.7877230829575 -3.49252794665624 T:C C T 10 0.52072955481467 0.41229550930857 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 31024274 T/C 1 57 36 93 27.3184153755638 18.7462639733281 8.57215140223569 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0782822340805069 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 31025163 A/G 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 A:G A G 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 132 106 238 63.2636987644636 55.197332810355 8.06636595410854 T:C C T 10 0.52072955481467 0.300059708087472 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 31981849 T/C 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 T:C T C 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 32212690 C/T 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000078699:ENST00000375279:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000342704:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000346541:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397800:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000492345:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000359606:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397803:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000491618:exon_32212570_32212823:CBFA2T2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 32264533 C/A 1 26 20 46 12.4610315748186 10.4145910962934 2.04644047852518 A:C C A 10 0.52072955481467 0.559270829244767 ENSG00000101412:ENST00000343380:exon_32263489_32264785:E2F1;ENSG00000101412:ENST00000402461:exon_32263489_32264785:E2F1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 10 5 15 4.7927044518533 2.60364777407335 2.18905667777995 T:C C T 10 0.52072955481467 0.308037122491406 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 33591006 G/A 1 37 29 66 17.7330064718572 15.1011570896254 2.63184938223178 A:G G A 10 0.52072955481467 0.540054205306205 ENSG00000100991:ENST00000252015:exon_33590207_33591086:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000451813:exon_33590215_33591086:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000432634:exon_33590215_33591086:TRPC4AP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 12 15 27 5.75124534222396 7.81094332222005 -2.05969797999609 T:C C T 10 0.52072955481467 0.447615619311931 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 34090519 G/A 1 14 14 28 6.70978623259462 7.29021376740538 -0.580427534810759 A:G G A 10 0.52072955481467 0.852057573756229 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425525:exon_34090218_34090632:CEP250 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 34144746 A/G 1 232 198 430 111.190743282997 103.104451853305 8.08629142969191 A:T:G A G 10 0.52072955481467 0.440394388209626 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 35128751 G/A 1 72 56 128 34.5074720533438 29.1608550696215 5.34661698372224 A:G G A 10 0.52072955481467 0.376629526478492 ENSG00000080845:ENST00000373913:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000373907:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000401952:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000339266:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000475894:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000482872:exon_35128602_35128763:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000495241:exon_35128602_35129000:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000340491:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000489701:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000479951:exon_35128602_35128930:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000478910:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000483381:exon_35128742_35128821:DLGAP4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 36770588 C/T 1 7 6 13 3.35489311629731 3.12437732888802 0.23051578740929 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000198959:ENST00000361475:exon_36770466_36770601:TGM2;ENSG00000198959:ENST00000485572:exon_36770466_36770601:TGM2;ENSG00000198959:ENST00000468262:exon_36770466_36770601:TGM2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 37534665 C/T 1 30 27 57 14.3781133555599 14.0596979799961 0.318415375563811 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000101445:ENST00000299824:exon_37534612_37534737:PPP1R16B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 37555116 G/C 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37554955_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37555069_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37555086_37555451:FAM83D HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 37570725 C/T 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 T:C C T 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37570602_37570769:FAM83D HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 37667182 C/T 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 T:C C T 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37667142_37668363:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000449559:exon_37667142_37667289:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000493450:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000482619:exon_37667142_37667279:DHX35 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 39797465 T/C 1 8 8 16 3.83416356148264 4.16583643851736 -0.33167287703472 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000124181:ENST00000244007:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373271:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373272:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000477870:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000483175:exon_39797396_39797510:PLCG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 40045231 G/C 1 9 9 18 4.31343400666797 4.68656599333203 -0.37313198666406 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40045228_40045434:CHD6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 40049586 T/C 1 14 5 19 6.70978623259462 2.60364777407335 4.10613845852127 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0678450364332657 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 40049873 T/C 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 T:C T C 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 40050314 G/A 1 3 10 13 1.43781133555599 5.2072955481467 -3.76948421259071 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0497304815614789 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 42328639 T/C 1 99 64 163 47.4477740733477 33.3266915081389 14.1210825652088 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0281132821755941 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42328397_42328684:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42328397_42328684:MYBL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 43547677 T/G 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 T:G T G 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000101104:ENST00000217074:exon_43547547_43547686:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43547547_43547686:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43547547_43547686:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43547547_43547686:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43547547_43547686:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000481196:exon_43547635_43547686:PABPC1L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 43566787 A/G 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 A:G A G 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000476056:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217075:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000479873:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372826:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000474208:exon_43566743_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000489068:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372822:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000482486:exon_43566484_43566832:PABPC1L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 23 31 54 11.0232202392626 16.1426161992548 -5.11939595999218 A:G G A 10 0.52072955481467 0.174851821934990 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 44596207 C/G 1 14 8 22 6.70978623259462 4.16583643851736 2.54394979407726 C:G C G 10 0.52072955481467 0.295404626091449 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44595506_44596273:ZNF335 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 44596545 G/A 1 12 18 30 5.75124534222396 9.37313198666406 -3.6218866444401 A:G G A 10 0.52072955481467 0.204170935491037 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44596373_44597497:ZNF335 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 19 28 47 9.10613845852127 14.5804275348108 -5.47428907628949 T:G T G 10 0.52072955481467 0.143517569827338 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 44746982 T/C 1 25 29 54 11.9817611296333 15.1011570896254 -3.11939595999218 T:C T C 10 0.52072955481467 0.416346908966056 ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44746911_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44746955_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44746976_44747033:CD40 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 45853037 A/G 1 13 15 28 6.23051578740929 7.81094332222005 -1.58042753481076 A:G A G 10 0.52072955481467 0.575566601943921 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45852970_45853209:ZMYND8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 45867852 A/G 1 15 12 27 7.18905667777995 6.24875465777604 0.94030202000391 A:G A G 10 0.52072955481467 0.8478003207822 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45866054_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45867242_45867882:ZMYND8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 47249077 C/T 1 67 70 137 32.1111198274171 36.4510688370269 -4.33994900960978 T:C C T 10 0.52072955481467 0.49419663602824 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47248815_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47248815_47249177:PREX1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 47626847 T/C 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000124198:ENST00000371917:exon_47626769_47626941:ARFGEF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 47685320 G/C 1 10 13 23 4.7927044518533 6.76948421259071 -1.97677976073741 C:G G C 10 0.52072955481467 0.532250778549921 ENSG00000124207:ENST00000396192:exon_47685252_47685359:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000417408:exon_47685252_47685359:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000262982:exon_47685252_47685359:CSE1L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 47841660 G/T 1 29 22 51 13.8988429103746 11.4560502059227 2.44279270445183 T:G G T 10 0.52072955481467 0.575601966284486 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000462328:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000493252:exon_47841650_47841736:DDX27 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 47865784 C/T 1 31 25 56 14.8573838007452 13.0182388703667 1.83914493037848 T:C C T 10 0.52072955481467 0.688963758077531 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 47874005 A/G 1 15 14 29 7.18905667777995 7.29021376740538 -0.101157089625429 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47873954_47874201:ZNFX1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 24 12 36 11.5024906844479 6.24875465777604 5.25373602667188 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0950628223685324 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 26 12 38 12.4610315748186 6.24875465777604 6.21227691704254 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0509131357844707 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 48524827 A/G 1 12 5 17 5.75124534222396 2.60364777407335 3.14759756815061 A:G A G 10 0.52072955481467 0.149297422970946 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48524692_48525129:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48524692_48525129:SPATA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 49196284 C/T 1 100 93 193 47.927044518533 48.4278485977643 -0.500804079231308 T:C C T 10 0.52072955481467 0.94272747458019 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49196240_49196463:PTPN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 50769183 G/A 1 16 26 42 7.66832712296528 13.5389684251814 -5.87064130221614 A:G G A 10 0.52072955481467 0.088400683717967 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 50769379 C/T 1 7 21 28 3.35489311629731 10.9353206511081 -7.58042753481076 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00428027460075183 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 50769549 A/G 1 10 15 25 4.7927044518533 7.81094332222005 -3.01823887036675 A:G A G 10 0.52072955481467 0.237337229008743 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 50803444 C/T 1 13 10 23 6.23051578740929 5.2072955481467 1.02322023926259 T:C:G C T 10 0.52072955481467 0.683682381961274 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 50803573 G/A 1 15 12 27 7.18905667777995 6.24875465777604 0.94030202000391 A:G G A 10 0.52072955481467 0.8478003207822 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 52192637 T/C 1 20 9 29 9.5854089037066 4.68656599333203 4.89884291037457 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0929090545941862 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 52193088 C/T 1 23 27 50 11.0232202392626 14.0596979799961 -3.0364777407335 T:C C T 10 0.52072955481467 0.399729435952489 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 56190634 C/T 1 10 6 16 4.7927044518533 3.12437732888802 1.66832712296528 T:C C T 10 0.52072955481467 0.460768625180263 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56190568_56193137:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000480037:exon_56190568_56191524:ZBP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 57564070 C/T 1 26 30 56 12.4610315748186 15.6218866444401 -3.16085506962152 T:C C T 10 0.52072955481467 0.424251649243372 ENSG00000101158:ENST00000344018:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000482747:exon_57563969_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000460601:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000477741:exon_57563969_57564076:TH1L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 57565943 G/C 1 4 8 12 1.91708178074132 4.16583643851736 -2.24875465777604 C:G G C 10 0.52072955481467 0.251467937811103 ENSG00000101158:ENST00000478389:exon_57565150_57567075:TH1L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 97 97 194 46.489233182977 50.510766817023 -4.02153363404598 A:G A G 10 0.52072955481467 0.566343671465488 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 60704972 G/A 1 16 31 47 7.66832712296528 16.1426161992548 -8.47428907628949 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0185273568066975 ENSG00000149657:ENST00000279068:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000440110:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000444156:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000400318:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000479741:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000279069:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000370906:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000361670:exon_60704841_60705008:LSM14B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 60963494 C/T 1 13 6 19 6.23051578740929 3.12437732888802 3.10613845852127 T:C C T 10 0.52072955481467 0.173990747242703 ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 60966318 G/T 1 14 15 29 6.70978623259462 7.81094332222005 -1.10115708962543 T:G G T 10 0.52072955481467 0.713495169021185 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60966305_60966509:CABLES2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 61287939 C/T 1 16 3 19 7.66832712296528 1.56218866444401 6.10613845852127 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00504304617394946 ENSG00000101187:ENST00000370512:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000217159:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000497209:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000370507:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000342674:exon_61287807_61288563:SLCO4A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 61468571 T/C 0 0 11 11 0 5.72802510296137 -5.72802510296137 C T C 10 0.52072955481467 0.000306469410891868 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466532:exon_61468274_61468617:COL9A3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 62191321 A/G 1 20 20 40 9.5854089037066 10.4145910962934 -0.829182192586799 A:G A G 10 0.52072955481467 0.874658284917496 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 62191937 G/A 1 14 14 28 6.70978623259462 7.29021376740538 -0.580427534810759 A:T:G G A 10 0.52072955481467 0.852057573756229 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 62194103 A/G 1 18 13 31 8.62686801333594 6.76948421259071 1.85738380074523 A:G A G 10 0.52072955481467 0.591060437395048 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 62194128 G/A 1 13 10 23 6.23051578740929 5.2072955481467 1.02322023926259 A:G G A 10 0.52072955481467 0.683682381961274 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 62195087 A/G 1 17 12 29 8.14759756815061 6.24875465777604 1.89884291037457 A:G A G 10 0.52072955481467 0.578315378656019 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 62196253 C/A 1 10 11 21 4.7927044518533 5.72802510296137 -0.93532065110807 A:C C A 10 0.52072955481467 0.827826563650395 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 62324280 C/T 1 10 7 17 4.7927044518533 3.64510688370269 1.14759756815061 T:C C T 10 0.52072955481467 0.634129017759885 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 62326110 A/C 1 6 8 14 2.87562267111198 4.16583643851736 -1.29021376740538 A:C A C 10 0.52072955481467 0.596274656681649 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62326094_62326331:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62326094_62326327:RTEL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 62331989 T/G 1 33 19 52 15.8159246911159 9.89386154147873 5.92206314963716 T:G T G 10 0.52072955481467 0.126113527687633 ENSG00000101246:ENST00000359715:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000440854:exon_62329996_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000485858:exon_62331954_62332129:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000217224:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000324228:exon_62331954_62332054:ARFRP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 58 43 101 27.7976858207491 22.3913708570308 5.40631496371833 T:G G T 10 0.52072955481467 0.319418313531395 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP00855_parsed_pileup.txt . 20 62560701 C/T 1 28 27 55 13.4195724651892 14.0596979799961 -0.640125514806849 T:C C T 10 0.52072955481467 0.89324841776031 ENSG00000101152:ENST00000369911:exon_62560665_62560878:DNAJC5;ENSG00000101152:ENST00000360864:exon_62560665_62560878:DNAJC5;ENSG00000101152:ENST00000470551:exon_62560665_62560878:DNAJC5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 15 11 26 7.18905667777995 5.72802510296137 1.46103157481858 C:G G C 10 0.52072955481467 0.695544738359801 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 19169155 G/C 1 7 8 15 3.35489311629731 4.16583643851736 -0.81094332222005 C:G G C 10 0.52072955481467 0.797925780414529 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 19169218 G/C 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 C:G G C 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 26976222 C/T 1 51 40 91 24.4427927044518 20.8291821925868 3.61361051186503 T:C C T 10 0.52072955481467 0.464472806294989 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 26976237 C/T 1 57 43 100 27.3184153755638 22.3913708570308 4.927044518533 T:C:G C T 10 0.52072955481467 0.367860428293246 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 30714776 T/C 1 8 10 18 3.83416356148264 5.2072955481467 -1.37313198666406 T:C T C 10 0.52072955481467 0.638802194234348 ENSG00000156273:ENST00000286800:exon_30714720_30718469:BACH1;ENSG00000156273:ENST00000399921:exon_30714720_30718469:BACH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 11 23 34 5.27197489703863 11.9767797607374 -6.70480486369878 T:G T G 10 0.52072955481467 0.0250234412030001 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 34652190 T/C 1 21 25 46 10.0646793488919 13.0182388703667 -2.95355952147482 T:C T C 10 0.52072955481467 0.461015315127632 ENSG00000249624:ENST00000433395:exon_34652057_34652223:AP000295.9;ENSG00000249624:ENST00000451624:exon_34652057_34652223:AP000295.9;ENSG00000249624:ENST00000432231:exon_34652057_34652223:AP000295.9;ENSG00000243646:ENST00000290200:exon_34652057_34652223:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000422891:exon_34652057_34652223:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000493295:exon_34652057_34652223:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000498371:exon_34652057_34652223:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000451065:exon_34652057_34652223:IL10RB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 59 56 115 28.2769562659345 29.1608550696215 -0.883898803687046 A:G A G 10 0.52072955481467 0.925706035388294 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 37420650 G/A 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:G G A 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000185917:ENST00000399215:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399212:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000332131:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399205:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399208:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399201:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399207:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000414900:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000424303:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000429161:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000485865:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000446166:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000442559:exon_37420620_37420694:SETD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 37442632 G/C 1 23 35 58 11.0232202392626 18.2255344185134 -7.20231417925086 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0656993932919569 ENSG00000159228:ENST00000466328:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000439427:exon_37442313_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000399191:exon_37442333_37442702:CBR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 37444973 C/T 1 42 56 98 20.1293586977839 29.1608550696215 -9.03149637183766 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0694958382796472 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 40191431 T/G 1 11 8 19 5.27197489703863 4.16583643851736 1.10613845852127 T:G T G 10 0.52072955481467 0.653020003043937 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 43221826 T/C 1 15 14 29 7.18905667777995 7.29021376740538 -0.101157089625429 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000486812:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000470586:exon_43221154_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000465955:exon_43221788_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000477633:exon_43221817_43221882:PRDM15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 44430325 T/C 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000160199:ENST00000291547:exon_44430163_44430334:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000432907:exon_44430163_44430334:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000480179:exon_44430163_44430334:PKNOX1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 45168884 G/A 1 38 31 69 18.2122769170425 16.1426161992548 2.06966071778777 A:G G A 10 0.52072955481467 0.632145842656172 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398085:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45168876_45168961:PDXK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 45379560 G/A 1 26 13 39 12.4610315748186 6.76948421259071 5.69154736222787 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0780228421217414 ENSG00000160216:ENST00000291572:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000438598:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000448287:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398061:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000327505:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000445582:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398063:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398058:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000457068:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000448845:exon_45379515_45379677:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000422850:exon_45379515_45379740:AGPAT3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 17 21 38 8.14759756815061 10.9353206511081 -2.78772308295746 A:G G A 10 0.52072955481467 0.41821411726343 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 45506819 T/C 1 21 16 37 10.0646793488919 8.33167287703472 1.73300647185721 T:C T C 10 0.52072955481467 0.623713104808598 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45506683_45506841:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45506683_45506841:TRAPPC10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 45528919 G/A 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45528865_45528977:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000456705:exon_45528865_45528977:PWP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 17 17 34 8.14759756815061 8.85240243184939 -0.704804863698779 T:C T C 10 0.52072955481467 0.864632483960446 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 32 36 68 15.3366542459306 18.7462639733281 -3.40960972739756 A:G A G 10 0.52072955481467 0.466804870280468 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 45544594 T/C 1 24 27 51 11.5024906844479 14.0596979799961 -2.55720729554817 T:C T C 10 0.52072955481467 0.486913223504623 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45544461_45544608:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45544461_45546000:PWP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 26 33 59 12.4610315748186 17.1840753088841 -4.72304373406553 T:C T C 10 0.52072955481467 0.241795445432849 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 45732116 C/T 1 97 82 179 46.489233182977 42.6998234948029 3.78940968817407 T:C C T 10 0.52072955481467 0.60085591591132 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000496824:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000491298:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45731988_45732177:PFKL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 45750145 T/C 1 36 41 77 17.2537360266719 21.3499117474015 -4.09617572072959 T:C T C 10 0.52072955481467 0.363492351310903 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 46311813 A/G 1 58 41 99 27.7976858207491 21.3499117474015 6.44777407334767 A:G A G 10 0.52072955481467 0.227259343177047 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46311724_46311911:ITGB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 46319069 T/C 1 56 53 109 26.8391449303785 27.5986664051775 -0.75952147479903 T:C T C 10 0.52072955481467 0.923752842198875 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000320216:exon_46318982_46319077:ITGB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 46320313 C/T 1 96 95 191 46.0099627377917 49.4693077073936 -3.45934496960196 T:C C T 10 0.52072955481467 0.66402526764045 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000320216:exon_46320235_46320390:ITGB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 46927489 A/G 1 6 13 19 2.87562267111198 6.76948421259071 -3.89386154147873 A:G A G 10 0.52072955481467 0.105925620736623 ENSG00000182871:ENST00000400337:exon_46927475_46927507:COL18A1;ENSG00000182871:ENST00000400347:exon_46927475_46927507:COL18A1;ENSG00000182871:ENST00000355480:exon_46927475_46927507:COL18A1;ENSG00000182871:ENST00000359759:exon_46927475_46927507:COL18A1;ENSG00000182871:ENST00000342220:exon_46927475_46927507:COL18A1;ENSG00000182871:ENST00000473212:exon_46925933_46927507:COL18A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 46951556 A/G 1 14 19 33 6.70978623259462 9.89386154147873 -3.18407530888411 A:G A G 10 0.52072955481467 0.298443052627376 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000477688:exon_46951332_46952062:SLC19A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 47614443 A/G 1 31 35 66 14.8573838007452 18.2255344185134 -3.36815061776822 A:G A G 10 0.52072955481467 0.460238249688516 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 30 31 61 14.3781133555599 16.1426161992548 -1.76450284369487 A:C A C 10 0.52072955481467 0.701419533851801 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 47676711 G/A 1 32 34 66 15.3366542459306 17.7048048636988 -2.36815061776822 A:G G A 10 0.52072955481467 0.622633499260239 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 47685939 A/G 1 19 26 45 9.10613845852127 13.5389684251814 -4.43282996666015 A:G A G 10 0.52072955481467 0.232347018162802 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685839_47686866:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685839_47686080:MCM3AP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 47705237 T/C 1 16 12 28 7.66832712296528 6.24875465777604 1.41957246518924 T:C T C 10 0.52072955481467 0.706167957724672 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703982_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000426537:exon_47704919_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000495475:exon_47705205_47705308:MCM3AP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 47777063 G/A 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.347970315516692 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47776889_47777106:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000337772:exon_47776889_47777106:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47776889_47777106:PCNT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 47783796 T/C 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 T:C T C 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47783395_47783849:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47783395_47783849:PCNT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 47786524 A/G 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47786499_47787054:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47786499_47787054:PCNT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 47786817 C/G 1 6 9 15 2.87562267111198 4.68656599333203 -1.81094332222005 C:G C G 10 0.52072955481467 0.44117550699482 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47786499_47787054:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47786499_47787054:PCNT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 47808679 C/T 1 8 9 17 3.83416356148264 4.68656599333203 -0.85240243184939 T:C C T 10 0.52072955481467 0.809480166298499 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47808657_47808799:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47808657_47808799:PCNT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 21 47821588 A/G 1 2 6 8 0.95854089037066 3.12437732888802 -2.16583643851736 A:G A G 10 0.52072955481467 0.164210754421108 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47821465_47821635:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47821465_47821635:PCNT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 17589297 G/A 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 17590599 C/T 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 T:C C T 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 17690430 C/G 1 9 9 18 4.31343400666797 4.68656599333203 -0.37313198666406 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17690246_17690575:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17690246_17690779:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17690246_17690614:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000441548:exon_17690246_17690613:CECR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 18354766 C/T 1 10 7 17 4.7927044518533 3.64510688370269 1.14759756815061 T:C C T 10 0.52072955481467 0.634129017759885 ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000429452:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000400561:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000444520:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000495076:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000414725:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000383094:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000207726:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000461307:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000462645:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000465886:exon_18354696_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000498345:exon_18354700_18354789:MICAL3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 19026613 A/G 1 12 11 23 5.75124534222396 5.72802510296137 0.0232202392625904 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000070413:ENST00000263196:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000389262:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000467659:exon_19025350_19026634:DGCR2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 19028643 C/T 1 18 15 33 8.62686801333594 7.81094332222005 0.815924691115891 T:C C T 10 0.52072955481467 0.862375479002996 ENSG00000070413:ENST00000263196:exon_19028571_19028807:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000389262:exon_19028571_19028807:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000467659:exon_19028571_19029472:DGCR2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 19121721 C/T 1 28 21 49 13.4195724651892 10.9353206511081 2.48425181408117 T:C C T 10 0.52072955481467 0.567853026717871 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19117792_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19121450_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19121481_19121988:DGCR14 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 19124866 G/A 1 16 10 26 7.66832712296528 5.2072955481467 2.46103157481858 A:G G A 10 0.52072955481467 0.433118121558513 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19124836_19124945:DGCR14 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 19132061 C/T 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19132019_19132197:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19132019_19132197:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19131570_19132146:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000469466:exon_19131637_19132172:DGCR14 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 19789541 A/C 1 20 20 40 9.5854089037066 10.4145910962934 -0.829182192586799 A:C A C 10 0.52072955481467 0.874658284917496 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000481086:exon_19789522_19789739:GNB1L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 20102750 C/T 1 7 8 15 3.35489311629731 4.16583643851736 -0.81094332222005 T:C C T 10 0.52072955481467 0.797925780414529 ENSG00000099899:ENST00000471040:exon_20102488_20102962:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000463710:exon_20102488_20102915:TRMT2A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 21167787 G/A 1 6 9 15 2.87562267111198 4.68656599333203 -1.81094332222005 A:G G A 10 0.52072955481467 0.44117550699482 ENSG00000241973:ENST00000255882:exon_21167646_21167794:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000437178:exon_21167646_21167794:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000485963:exon_21167646_21167794:PI4KA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 21213380 C/T 1 24 17 41 11.5024906844479 8.85240243184939 2.65008825259853 T:C C T 10 0.52072955481467 0.437857236813471 ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 21213416 A/G 1 36 22 58 17.2537360266719 11.4560502059227 5.79768582074914 A:G A G 10 0.52072955481467 0.148263367897089 ENSG00000241973:ENST00000449120:exon_21213411_21213705:PI4KA;ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 21337325 G/A 1 10 8 18 4.7927044518533 4.16583643851736 0.62686801333594 A:G G A 10 0.52072955481467 0.817378948970493 ENSG00000099949:ENST00000479606:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000215739:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000414985:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000389355:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000493460:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000443265:exon_21337316_21337378:LZTR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 21982892 C/T 1 88 76 164 42.175799176309 39.5754461659149 2.60035301039412 T:C C T 10 0.52072955481467 0.696709174117307 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 21984205 A/G 1 64 63 127 30.6733084918611 32.8059619533242 -2.13265346146309 A:G A G 10 0.52072955481467 0.723060650771528 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21984140_21984301:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21984140_21984332:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21984140_21984327:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21984140_21984303:YDJC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 22277571 A/C 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 A:C A C 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000100034:ENST00000406981:exon_22273793_22277844:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000263212:exon_22273793_22277844:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000407142:exon_22273800_22277844:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000496143:exon_22277498_22277844:PPM1F HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 23627369 A/G 1 11 22 33 5.27197489703863 11.4560502059227 -6.18407530888411 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0361460942384450 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000466076:exon_23627220_23627388:BCR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 24237221 C/G 1 12 19 31 5.75124534222396 9.89386154147873 -4.14261619925477 C:G C G 10 0.52072955481467 0.152512052952858 ENSG00000240972:ENST00000465752:exon_24236959_24237414:MIF;ENSG00000218537:ENST00000406213:exon_24236613_24237719:AP000350.4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 24717518 G/A 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 A:G G A 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000100014:ENST00000398280:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000437398:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000421374:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000314328:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000440893:exon_24717256_24717656:SPECC1L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 34 26 60 16.2951951363012 13.5389684251814 2.7562267111198 T:C T C 10 0.52072955481467 0.519542709262601 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 24964128 T/C 1 197 143 340 94.41627770151 74.4643263384978 19.9519513630122 A:T:C T C 10 0.52072955481467 0.0341163399150261 ENSG00000100028:ENST00000215829:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000457691:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000402849:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000404603:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000458544:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000448916:exon_24963952_24964144:SNRPD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 26853905 C/A 1 15 12 27 7.18905667777995 6.24875465777604 0.94030202000391 A:C C A 10 0.52072955481467 0.8478003207822 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26853825_26853933:HPS4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 26854441 G/A 1 12 10 22 5.75124534222396 5.2072955481467 0.54394979407726 A:G G A 10 0.52072955481467 0.834964721023274 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26854411_26854543:HPS4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 26859942 C/T 1 10 14 24 4.7927044518533 7.29021376740538 -2.49750931555208 T:C C T 10 0.52072955481467 0.316530133475197 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26859883_26859981:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26859883_26860158:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 26862212 T/C 1 8 11 19 3.83416356148264 5.72802510296137 -1.89386154147873 T:C T C 10 0.52072955481467 0.492400577054298 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26861421_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26862192_26864589:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26861421_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000459918:exon_26862192_26862228:HPS4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 30975861 C/T 1 31 65 96 14.8573838007452 33.8474210629536 -18.9900372622083 T:C C T 10 0.52072955481467 0.000130755553769415 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30975738_30975910:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30974824_30976061:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30975738_30975922:PES1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 30987861 G/C 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 C:G G C 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 30987864 C/T 1 6 8 14 2.87562267111198 4.16583643851736 -1.29021376740538 T:C C T 10 0.52072955481467 0.596274656681649 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 31491295 G/C 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 32352791 G/A 1 157 185 342 75.2454598940968 96.3349676407139 -21.0895077466171 A:G G A 10 0.52072955481467 0.023028626123279 ENSG00000128245:ENST00000248975:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000397492:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000471374:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000427094:exon_32352126_32353589:YWHAH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 42 50 92 20.1293586977839 26.0364777407335 -5.90711904294964 T:C C T 10 0.52072955481467 0.250977682058741 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 32875190 G/A 1 51 34 85 24.4427927044518 17.7048048636988 6.73798784075305 A:G G A 10 0.52072955481467 0.158474031564166 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000444207:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000465418:exon_32874968_32875218:FBXO7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 32887150 C/T 1 47 34 81 22.5257109237105 17.7048048636988 4.82090606001173 T:C C T 10 0.52072955481467 0.317342549452976 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32883732_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32887073_32887168:FBXO7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 34022284 G/A 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000133424:ENST00000452586:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000354992:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000337431:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000397394:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000402320:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000437602:exon_34022228_34022310:LARGE HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 13 28 41 6.23051578740929 14.5804275348108 -8.34991174740147 T:G T G 10 0.52072955481467 0.0115615851105632 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 19 24 43 9.10613845852127 12.4975093155521 -3.39137085703081 C:G G C 10 0.52072955481467 0.36014967926019 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 36537500 A/T 1 34 34 68 16.2951951363012 17.7048048636988 -1.40960972739756 A:T A T 10 0.52072955481467 0.808450367305566 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 36537893 A/G 1 31 22 53 14.8573838007452 11.4560502059227 3.40133359482249 A:G A G 10 0.52072955481467 0.409925917447595 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 36661998 G/A 1 43 28 71 20.6086291429692 14.5804275348108 6.02820160815843 A:G G A 10 0.52072955481467 0.156222071028524 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 36684331 C/T 1 216 229 445 103.522416160031 119.247068052559 -15.7246518925281 T:C C T 10 0.52072955481467 0.141386630133859 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 207 152 359 99.2089821533633 79.1508923318298 20.0580898215335 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0346485314479305 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 209 133 342 100.167523043734 69.2570307903511 30.9104922533829 A:C C A 10 0.52072955481467 0.000934999499553611 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 36900271 T/C 1 13 7 20 6.23051578740929 3.64510688370269 2.5854089037066 T:C T C 10 0.52072955481467 0.271400284316410 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900145_36900414:FOXRED2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 36900806 A/G 1 14 7 21 6.70978623259462 3.64510688370269 3.06467934889193 A:G A G 10 0.52072955481467 0.197227501927402 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900562_36900813:FOXRED2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 37699377 T/C 1 15 11 26 7.18905667777995 5.72802510296137 1.46103157481858 T:C T C 10 0.52072955481467 0.695544738359801 ENSG00000100055:ENST00000248901:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000422721:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000443914:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000417357:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000462927:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000427572:exon_37699295_37699443:CYTH4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 38046695 C/A 1 39 32 71 18.6915473622279 16.6633457540694 2.02820160815843 A:C C A 10 0.52072955481467 0.637291346748276 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000466097:exon_38046549_38046785:SH3BP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 38051355 G/A 1 21 14 35 10.0646793488919 7.29021376740538 2.77446558148655 A:C:G G A 10 0.52072955481467 0.399537055090493 ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 32 32 64 15.3366542459306 16.6633457540694 -1.32669150813888 T:C C T 10 0.52072955481467 0.802800854618928 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 38087269 C/T 1 28 21 49 13.4195724651892 10.9353206511081 2.48425181408117 T:C C T 10 0.52072955481467 0.567853026717871 ENSG00000100101:ENST00000493862:exon_38087181_38087431:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000359114:exon_38087181_38089483:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000438329:exon_38087181_38087431:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38087181_38087431:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000484650:exon_38087181_38087472:NOL12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 38164106 C/T 1 17 14 31 8.14759756815061 7.29021376740538 0.857383800745231 T:C C T 10 0.52072955481467 0.857960893951531 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 38204089 C/T 1 10 9 19 4.7927044518533 4.68656599333203 0.10613845852127 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38203912_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38203919_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000445195:exon_38203923_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000415371:exon_38203930_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000478203:exon_38203941_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000426858:exon_38203945_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000451984:exon_38204021_38204170:GCAT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 21 13 34 10.0646793488919 6.76948421259071 3.29519513630122 A:G A G 10 0.52072955481467 0.304385840178127 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 724 724 1448 346.991802314179 377.008197685821 -30.0163953716421 T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.114621936852292 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 38323507 G/T 1 13 24 37 6.23051578740929 12.4975093155521 -6.26699352814279 T:G G T 10 0.52072955481467 0.047539044308923 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 4 12 16 1.91708178074132 6.24875465777604 -4.33167287703472 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0426542052864454 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 11 4 15 5.27197489703863 2.08291821925868 3.18905667777995 A:G G A 10 0.52072955481467 0.123192206125781 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 13 14 27 6.23051578740929 7.29021376740538 -1.05969797999609 A:C C A 10 0.52072955481467 0.70448341958002 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 18 8 26 8.62686801333594 4.16583643851736 4.46103157481858 T:C T C 10 0.52072955481467 0.114679729645551 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 19 3 22 9.10613845852127 1.56218866444401 7.54394979407726 T:G G T 10 0.52072955481467 0.00103955549398343 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 21 11 32 10.0646793488919 5.72802510296137 4.33665424593056 C:G G C 10 0.52072955481467 0.156629381530112 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 8 9 17 3.83416356148264 4.68656599333203 -0.85240243184939 C:G G C 10 0.52072955481467 0.809480166298499 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 39497452 A/G 0 8 0 8 3.83416356148264 0 3.83416356148264 A A 10 0.52072955481467 0.00819011697530837 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 39497454 G/C 1 9 1 10 4.31343400666797 0.52072955481467 3.7927044518533 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0225455086853891 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 25 6 31 11.9817611296333 3.12437732888802 8.85738380074523 C:G G C 10 0.52072955481467 0.00174111595708027 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 39709009 G/A 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 A:G G A 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000100316:ENST00000473638:exon_39708889_39709315:RPL3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 39709605 G/A 1 12 8 20 5.75124534222396 4.16583643851736 1.5854089037066 A:G G A 10 0.52072955481467 0.510829655044723 ENSG00000100316:ENST00000464182:exon_39709196_39709710:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000467105:exon_39709196_39710213:RPL3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 39711351 A/G 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 A:G A G 10 0.52072955481467 0.806303597637586 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 41605776 G/C 1 19 21 40 9.10613845852127 10.9353206511081 -1.8291821925868 C:G G C 10 0.52072955481467 0.635914069230674 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000489136:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000453659:exon_41605700_41606012:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000449635:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41605700_41605937:L3MBTL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 41610024 G/A 1 15 12 27 7.18905667777995 6.24875465777604 0.94030202000391 A:G G A 10 0.52072955481467 0.8478003207822 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41609855_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000489136:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41609897_41610030:L3MBTL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 41613188 C/T 1 16 15 31 7.66832712296528 7.81094332222005 -0.142616199254769 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41613127_41615540:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000449635:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41613127_41613206:L3MBTL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 41783659 C/T 1 2 6 8 0.95854089037066 3.12437732888802 -2.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 0.164210754421108 ENSG00000167074:ENST00000406644:exon_41783355_41783672:TEF;ENSG00000167074:ENST00000433913:exon_41783355_41783672:TEF;ENSG00000167074:ENST00000266304:exon_41783355_41783672:TEF;ENSG00000167074:ENST00000524489:exon_41783355_41783672:TEF;ENSG00000167074:ENST00000417325:exon_41783340_41783672:TEF;ENSG00000167074:ENST00000413942:exon_41783355_41783672:TEF HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 41833116 C/T 1 21 14 35 10.0646793488919 7.29021376740538 2.77446558148655 T:C C T 10 0.52072955481467 0.399537055090493 ENSG00000183864:ENST00000327492:exon_41829496_41833411:TOB2;ENSG00000183864:ENST00000434408:exon_41833046_41833411:TOB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 42059828 C/T 1 347 260 607 166.30684447931 135.389684251814 30.9171602274953 T:C:G C T 10 0.52072955481467 0.0131465949696805 ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 42073134 C/T 1 3 18 21 1.43781133555599 9.37313198666406 -7.93532065110807 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00060937396697926 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 42076330 G/A 1 110 87 197 52.7197489703863 45.3034712688763 7.41627770151002 A:G G A 10 0.52072955481467 0.318172917136557 ENSG00000100138:ENST00000355257:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000215956:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000401959:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000463675:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000402458:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000488571:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000469028:exon_42076250_42076368:NHP2L1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 42177317 A/G 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 A:G A G 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42177288_42177398:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42177288_42177398:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000300398:exon_42177288_42177398:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000419798:exon_42177288_42177398:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000462246:exon_42177288_42177398:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000473736:exon_42177288_42177367:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000462450:exon_42177288_42177398:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000498456:exon_42177288_42177398:MEI1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 42177816 C/A 1 26 22 48 12.4610315748186 11.4560502059227 1.00498136889584 A:C C A 10 0.52072955481467 0.885335420642288 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000300398:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000419798:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000462450:exon_42177689_42177828:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000498456:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42177355_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42177403_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42177450_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000403492:exon_42177739_42177849:MEI1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 42191540 C/T 1 55 24 79 26.3598744851932 12.4975093155521 13.8623651696411 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00215993952680961 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42191415_42191546:MEI1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 43575935 C/T 1 53 59 112 25.4013335948225 30.7230437340655 -5.32171013924304 T:C C T 10 0.52072955481467 0.344559166515783 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43575847_43576006:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43575847_43576006:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43575847_43576006:TTLL12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 44489896 T/C 1 79 103 182 37.8623651696411 53.635144145911 -15.7727789762699 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0212839039054611 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 44594584 C/G 1 58 55 113 27.7976858207491 28.6401255148068 -0.842439694057706 C:G C G 10 0.52072955481467 0.925067209361768 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000472551:exon_44594501_44594602:PARVG HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 149 123 272 71.4112963326142 64.0497352422044 7.36156109040977 A:C A C 10 0.52072955481467 0.395667225503794 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 45723807 G/C 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 C:G G C 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000427777:exon_45723723_45723841:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 45723842 G/A 1 3 8 11 1.43781133555599 4.16583643851736 -2.72802510296137 A:G G A 10 0.52072955481467 0.132783549738221 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 45723854 C/G 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 C:G C G 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 45728370 G/A 1 10 5 15 4.7927044518533 2.60364777407335 2.18905667777995 A:G G A 10 0.52072955481467 0.308037122491406 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 47083010 T/C 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 T:C T C 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 47083012 T/A 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 A:T T A 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 47085924 G/A 1 12 8 20 5.75124534222396 4.16583643851736 1.5854089037066 A:G G A 10 0.52072955481467 0.510829655044723 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47085889_47086097:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47085889_47086097:CERK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 73 61 134 34.9867424985291 31.7645028436949 3.22223965483422 C:G G C 10 0.52072955481467 0.604562394256434 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50646936 G/C 1 7 2 9 3.35489311629731 1.04145910962934 2.31343400666797 C:G G C 10 0.52072955481467 0.183068589600402 ENSG00000073169:ENST00000492092:exon_50646917_50647145:RP3-402G11.5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50658424 T/C 1 23 18 41 11.0232202392626 9.37313198666406 1.65008825259853 T:C T C 10 0.52072955481467 0.64186927009697 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50664612 A/G 1 14 17 31 6.70978623259462 8.85240243184939 -2.14261619925477 A:G A G 10 0.52072955481467 0.475988624180078 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000473946:exon_50664479_50664620:TUBGCP6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50696678 G/A 1 19 11 30 9.10613845852127 5.72802510296137 3.3781133555599 A:G G A 10 0.52072955481467 0.273263162366694 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000492218:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50696672_50696730:MAPK12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 50 59 109 23.9635222592665 30.7230437340655 -6.75952147479903 A:G G A 10 0.52072955481467 0.212927154954514 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 54 35 89 25.8806040400078 18.2255344185134 7.65506962149437 A:G A G 10 0.52072955481467 0.111992023331692 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50722134 T/C 1 17 20 37 8.14759756815061 10.4145910962934 -2.26699352814279 T:C T C 10 0.52072955481467 0.512047217834505 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50722408 T/C 1 17 12 29 8.14759756815061 6.24875465777604 1.89884291037457 T:C T C 10 0.52072955481467 0.578315378656019 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722262_50722419:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722262_50722419:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722262_50722419:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722262_50722419:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722262_50722419:PLXNB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50751529 G/C 1 59 56 115 28.2769562659345 29.1608550696215 -0.883898803687046 T:C:G G C 10 0.52072955481467 0.925706035388294 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50751428_50751537:FAM116B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 72 48 120 34.5074720533438 24.9950186311042 9.5124534222396 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0833639621900088 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50878196 G/A 1 16 17 33 7.66832712296528 8.85240243184939 -1.18407530888411 A:G G A 10 0.52072955481467 0.729460209285984 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50878182_50878478:PPP6R2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 86 84 170 41.2172582859384 43.7412826044323 -2.52402431849389 A:G A G 10 0.52072955481467 0.701930862671021 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50895020 C/T 1 43 43 86 20.6086291429692 22.3913708570308 -1.78274171406161 T:C C T 10 0.52072955481467 0.746542076559039 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000476293:exon_50895018_50895102:SBF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50901009 C/T 1 45 28 73 21.5671700333398 14.5804275348108 6.98674249852909 T:C C T 10 0.52072955481467 0.127224405228931 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000356279:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50900988_50901146:SBF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 24 27 51 11.5024906844479 14.0596979799961 -2.55720729554817 A:G G A 10 0.52072955481467 0.486913223504623 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50987287 A/G 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:G A G 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50988062 G/T 1 5 12 17 2.39635222592665 6.24875465777604 -3.85240243184939 T:G G T 10 0.52072955481467 0.0870960062083928 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 50988193 A/G 1 4 11 15 1.91708178074132 5.72802510296137 -3.81094332222005 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0682141035611568 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 51009953 C/T 1 29 17 46 13.8988429103746 8.85240243184939 5.04644047852518 T:C C T 10 0.52072955481467 0.142845737616133 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000497224:exon_51009587_51009968:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51009804_51009968:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51009804_51009962:CTA-384D8.32 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 51011376 G/C 1 11 9 20 5.27197489703863 4.68656599333203 0.5854089037066 C:G G C 10 0.52072955481467 0.826808206154088 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000475238:exon_51011304_51011529:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 22 51064039 G/C 1 21 24 45 10.0646793488919 12.4975093155521 -2.43282996666015 C:G G C 10 0.52072955481467 0.551177525292509 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064007_51064109:ARSA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 3189279 A/G 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 A:G A G 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3189134_3189387:TRNT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 9005085 T/C 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000415439:exon_9005019_9005115:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000495087:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000418463:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000421052:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000413832:exon_9005019_9005277:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000469793:exon_9005019_9005127:RAD18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 10 11 21 4.7927044518533 5.72802510296137 -0.93532065110807 T:C T C 10 0.52072955481467 0.827826563650395 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 6 13 19 2.87562267111198 6.76948421259071 -3.89386154147873 T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.105925620736623 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 27 21 48 12.9403020200039 10.9353206511081 2.00498136889584 A:G G A 10 0.52072955481467 0.665194262654053 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 14 11 25 6.70978623259462 5.72802510296137 0.98176112963325 C:G C G 10 0.52072955481467 0.841891529653028 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 9822187 G/A 1 31 26 57 14.8573838007452 13.5389684251814 1.31841537556381 A:G G A 10 0.52072955481467 0.791478194167244 ENSG00000171148:ENST00000301964:exon_9821544_9822233:TADA3;ENSG00000171148:ENST00000492103:exon_9821651_9822233:TADA3;ENSG00000171148:ENST00000440161:exon_9821940_9822233:TADA3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 55 60 115 26.3598744851932 31.2437732888802 -4.88389880368705 T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.401105623390886 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 10251340 C/G 1 10 4 14 4.7927044518533 2.08291821925868 2.70978623259462 C:G C G 10 0.52072955481467 0.184807178247656 ENSG00000134070:ENST00000256458:exon_10251273_10251376:IRAK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 10264480 C/G 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 C:G C G 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000134070:ENST00000256458:exon_10264320_10264515:IRAK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 10302172 G/A 1 42 42 84 20.1293586977839 21.8706413022161 -1.74128260443228 A:G G A 10 0.52072955481467 0.743762970273784 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 10311939 C/T 1 40 22 62 19.1708178074132 11.4560502059227 7.71476760149046 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0563164753309268 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 10312507 A/G 1 30 33 63 14.3781133555599 17.1840753088841 -2.80596195332421 A:G A G 10 0.52072955481467 0.529118114388023 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 11596302 T/C 1 11 16 27 5.27197489703863 8.33167287703472 -3.05969797999609 T:C T C 10 0.52072955481467 0.253772919953493 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 12881757 C/T 1 24 16 40 11.5024906844479 8.33167287703472 3.1708178074132 T:C C T 10 0.52072955481467 0.345330723446821 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 14174427 A/T 1 16 18 34 7.66832712296528 9.37313198666406 -1.70480486369878 A:T A T 10 0.52072955481467 0.608859073396323 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14174366_14174435:TMEM43 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 14199887 G/A 1 28 17 45 13.4195724651892 8.85240243184939 4.56717003333985 A:G G A 10 0.52072955481467 0.182478392983933 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 14220023 G/C 1 10 13 23 4.7927044518533 6.76948421259071 -1.97677976073741 C:G G C 10 0.52072955481467 0.532250778549921 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14219966_14220283:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14219966_14220172:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14219966_14220101:XPC;ENSG00000154767:ENST00000511155:exon_14219984_14220121:XPC;ENSG00000170860:ENST00000306024:exon_14219858_14220381:LSM3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 14523295 C/T 1 7 1 8 3.35489311629731 0.52072955481467 2.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0721941130810857 ENSG00000131389:ENST00000454876:exon_14523179_14523349:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000458124:exon_14523179_14523349:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000360861:exon_14523179_14523349:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000451687:exon_14523179_14523349:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000452151:exon_14523179_14523349:SLC6A6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 17 11 28 8.14759756815061 5.72802510296137 2.41957246518924 A:G G A 10 0.52072955481467 0.450243949257095 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 15476011 C/G 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 C:G C G 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000144597:ENST00000396842:exon_15475855_15476045:EAF1;ENSG00000144597:ENST00000432764:exon_15475855_15476045:EAF1;ENSG00000144597:ENST00000449565:exon_15475855_15476045:EAF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 17051450 C/A 1 10 7 17 4.7927044518533 3.64510688370269 1.14759756815061 A:C C A 10 0.52072955481467 0.634129017759885 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 17053499 A/G 1 13 18 31 6.23051578740929 9.37313198666406 -3.14261619925477 A:G A G 10 0.52072955481467 0.284278075165481 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000419842:exon_17051986_17053652:PLCL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 23934772 G/A 1 10 10 20 4.7927044518533 5.2072955481467 -0.4145910962934 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000197885:ENST00000388759:exon_23933151_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000443659:exon_23933552_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000421515:exon_23933555_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000425478:exon_23933572_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000418853:exon_23933574_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000437230:exon_23933588_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000412028:exon_23933798_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000415901:exon_23933801_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000416026:exon_23934556_23934828:NKIRAS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 33155782 G/A 1 17 29 46 8.14759756815061 15.1011570896254 -6.95355952147482 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0538895445807697 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33155471_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33155531_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33155546_33156040:CRTAP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 33161898 C/T 1 7 8 15 3.35489311629731 4.16583643851736 -0.81094332222005 T:C C T 10 0.52072955481467 0.797925780414529 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000485310:exon_33161836_33161985:CRTAP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 37357030 C/T 1 6 10 16 2.87562267111198 5.2072955481467 -2.33167287703472 T:C C T 10 0.52072955481467 0.318493089377623 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37356911_37357089:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000435830:exon_37356911_37357089:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37356911_37357089:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37356911_37357089:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37356911_37357089:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37356911_37357089:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37356911_37357089:GOLGA4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 38170810 C/G 1 12 17 29 5.75124534222396 8.85240243184939 -3.10115708962543 C:G C G 10 0.52072955481467 0.269403872469277 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000418880:exon_38170781_38170879:ACAA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 A:C C A 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 44 43 87 21.0878995881545 22.3913708570308 -1.30347126887629 C:G G C 10 0.52072955481467 0.830346434636114 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 45530196 C/T 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45530189_45530304:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45530189_45530304:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45530189_45530304:LARS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 46008790 G/A 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 A:G G A 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 47454399 G/A,C 0 0 62 62 0 32.2852323985095 -32.2852323985095 A:C G A 10 0.52072955481467 1.57036355330967e-20 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47454196_47454925:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47454196_47454931:PTPN23 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 39 23 62 18.6915473622279 11.9767797607374 6.71476760149046 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0985629276480134 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 47957563 G/C 1 69 67 136 33.0696607177878 34.8888801725829 -1.81921945479512 C:G G C 10 0.52072955481467 0.797005621475094 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 50368091 T/C 1 21 16 37 10.0646793488919 8.33167287703472 1.73300647185721 T:C T C 10 0.52072955481467 0.623713104808598 ENSG00000068028:ENST00000362008:exon_50367217_50368158:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000327761:exon_50367219_50368158:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395126:exon_50367219_50368158:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000357043:exon_50367219_50368158:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395117:exon_50367219_50368158:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000359365:exon_50367219_50368158:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000482447:exon_50367219_50368158:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395129:exon_50367219_50368158:RASSF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 51980258 C/T 0 14 0 14 6.70978623259462 0 6.70978623259462 C C 10 0.52072955481467 0.000141526948255473 ENSG00000041880:ENST00000417220:exon_51980182_51980359:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000408970:exon_51980182_51980359:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000431474:exon_51980182_51980359:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000447362:exon_51980182_51980359:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000398755:exon_51980182_51980359:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000471971:exon_51980182_51980359:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000475782:exon_51980182_51980277:PARP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 154 123 277 73.8076485585408 64.0497352422044 9.75791331633641 A:G G A 10 0.52072955481467 0.253389197426783 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 77 75 152 36.9038242792704 39.0547166111002 -2.15089233182984 T:C C T 10 0.52072955481467 0.745861252124635 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 14 4 18 6.70978623259462 2.08291821925868 4.62686801333594 A:C A C 10 0.52072955481467 0.0334234205605602 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 53856653 C/T 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53856518_53856669:CHDH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 53914093 G/A 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 A:G G A 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53913966_53914099:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000498740:exon_53913966_53914136:ACTR8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 53925849 C/T 1 14 15 29 6.70978623259462 7.81094332222005 -1.10115708962543 T:C C T 10 0.52072955481467 0.713495169021185 ENSG00000113811:ENST00000495461:exon_53925797_53926015:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000488746:exon_53925797_53925892:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000487571:exon_53925797_53925882:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000485414:exon_53925797_53925912:RP11-884K10.5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 56835761 G/A 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56835731_56835995:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56835731_56835977:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000495373:exon_56835731_56835977:ARHGEF3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 T:C C T 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 66430811 T/G 1 5 9 14 2.39635222592665 4.68656599333203 -2.29021376740538 T:G T G 10 0.52072955481467 0.287077835461110 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66430649_66430913:LRIG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 69096614 G/A 1 13 3 16 6.23051578740929 1.56218866444401 4.66832712296528 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0229985249854673 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 69151152 C/A 1 39 37 76 18.6915473622279 19.2669935281428 -0.575446165914919 A:C C A 10 0.52072955481467 0.909084581442228 ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000435015:exon_69151060_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69151110_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000470936:exon_69150990_69151381:ARL6IP5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 75471341 G/A 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 75472209 C/T 1 7 8 15 3.35489311629731 4.16583643851736 -0.81094332222005 T:C C T 10 0.52072955481467 0.797925780414529 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 97686391 G/A 1 16 22 38 7.66832712296528 11.4560502059227 -3.78772308295746 A:G G A 10 0.52072955481467 0.256456984157809 ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97686006_97686476:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97686006_97686476:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97686006_97686476:MINA;ENSG00000170854:ENST00000514314:exon_97686006_97686467:MINA;ENSG00000170854:ENST00000330299:exon_97686006_97686476:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506099:exon_97686101_97686476:MINA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 98250862 C/A 1 40 56 96 19.1708178074132 29.1608550696215 -9.99003726220832 A:C C A 10 0.52072955481467 0.0517065439061632 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 98250986 C/T 1 84 78 162 40.2587173955677 40.6169052755443 -0.358187879976533 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 101404761 A/G 1 19 89 108 9.10613845852127 46.3449303785056 -37.2387919199844 A:G A G 10 0.52072955481467 2.00966486511336e-13 ENSG00000114391:ENST00000464595:exon_101404662_101404772:RPL24;ENSG00000114391:ENST00000394077:exon_101404662_101404772:RPL24;ENSG00000114391:ENST00000495401:exon_101404662_101404772:RPL24;ENSG00000114391:ENST00000469605:exon_101404662_101404772:RPL24 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 105266274 T/C 1 12 12 24 5.75124534222396 6.24875465777604 -0.49750931555208 T:C T C 10 0.52072955481467 0.841650853857263 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000389927:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000465413:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000491388:exon_105266234_105266371:ALCAM HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 16 11 27 7.66832712296528 5.72802510296137 1.94030202000391 A:T:G A G 10 0.52072955481467 0.5644014761963 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 105422844 C/T 1 6 18 24 2.87562267111198 9.37313198666406 -6.49750931555208 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0124790761307531 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 105438957 T/G 1 16 10 26 7.66832712296528 5.2072955481467 2.46103157481858 T:G T G 10 0.52072955481467 0.433118121558513 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 105439026 G/A 1 8 9 17 3.83416356148264 4.68656599333203 -0.85240243184939 A:G G A 10 0.52072955481467 0.809480166298499 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 111842431 T/C 1 222 209 431 106.398038831143 108.832476956266 -2.43443812512275 A:T:C T C 10 0.52072955481467 0.847114474340103 ENSG00000174500:ENST00000308910:exon_111839688_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000438451:exon_111839692_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000484193:exon_111841943_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000470085:exon_111842072_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000495418:exon_111842152_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000460387:exon_111842302_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000383684:exon_111842302_111842622:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000488580:exon_111842408_111842619:GCET2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 112063850 C/A 1 5 11 16 2.39635222592665 5.72802510296137 -3.33167287703472 A:C C A 10 0.52072955481467 0.132080205864997 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112063809_112064135:CD200 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 112185025 G/A 1 40 46 86 19.1708178074132 23.9535595214748 -4.78274171406162 A:G G A 10 0.52072955481467 0.331876381884703 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112184955_112185230:BTLA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 112188609 T/G 1 52 41 93 24.9220631496372 21.3499117474015 3.57215140223569 T:G T G 10 0.52072955481467 0.469617242309459 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000496584:exon_112188603_112188651:BTLA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 122288210 G/A 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122287336_122288871:DTX3L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 29 34 63 13.8988429103746 17.7048048636988 -3.80596195332421 A:G A G 10 0.52072955481467 0.378040626716134 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 122354792 G/A 1 23 36 59 11.0232202392626 18.7462639733281 -7.72304373406553 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0503405875112393 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 124692689 C/T 1 14 4 18 6.70978623259462 2.08291821925868 4.62686801333594 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0334234205605602 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124692575_124692749:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000487661:exon_124692575_124692749:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000482699:exon_124692575_124692751:HEG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 124731689 T/A 1 8 11 19 3.83416356148264 5.72802510296137 -1.89386154147873 A:T T A 10 0.52072955481467 0.492400577054298 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 124732618 A/G 1 14 10 24 6.70978623259462 5.2072955481467 1.50249068444792 A:G A G 10 0.52072955481467 0.683763897335876 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124732316_124732834:HEG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 124802881 A/G 1 98 65 163 46.9685036281623 33.8474210629536 13.1210825652088 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0415417585838524 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 124802888 C/T 1 100 77 177 47.927044518533 40.0961757207296 7.83086879780341 T:C C T 10 0.52072955481467 0.259249572273309 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 18 19 37 8.62686801333594 9.89386154147873 -1.26699352814279 T:C C T 10 0.52072955481467 0.743209181591739 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 125249340 G/A 1 19 7 26 9.10613845852127 3.64510688370269 5.46103157481858 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0475397388387747 ENSG00000144909:ENST00000296220:exon_125247702_125249424:OSBPL11;ENSG00000144909:ENST00000393455:exon_125247713_125249424:OSBPL11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 126180820 G/A 1 17 15 32 8.14759756815061 7.81094332222005 0.336654245930561 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126180378_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000515545:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000336332:exon_126179926_126181063:ZXDC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 127379270 C/T 1 9 18 27 4.31343400666797 9.37313198666406 -5.05969797999609 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0556408222394603 ENSG00000114631:ENST00000342480:exon_127379221_127380002:PODXL2;ENSG00000114631:ENST00000302192:exon_127379221_127379876:PODXL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 127800071 A/G 1 35 49 84 16.7744655814866 25.5157481859188 -8.74128260443228 A:C:G A G 10 0.52072955481467 0.0631765376460535 ENSG00000175792:ENST00000322623:exon_127799803_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000417360:exon_127799807_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000478892:exon_127800025_127800252:RUVBL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 127872506 C/T 1 17 20 37 8.14759756815061 10.4145910962934 -2.26699352814279 T:C C T 10 0.52072955481467 0.512047217834505 ENSG00000175792:ENST00000464873:exon_127872046_127872757:RUVBL1;ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_127872297_127872666:EEFSEC;ENSG00000132394:ENST00000483457:exon_127872344_127872666:EEFSEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 127983495 T/C 1 12 17 29 5.75124534222396 8.85240243184939 -3.10115708962543 T:C T C 10 0.52072955481467 0.269403872469277 ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_127983460_127983624:EEFSEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 128344786 G/A 1 99 95 194 47.4477740733477 49.4693077073936 -2.02153363404597 A:G G A 10 0.52072955481467 0.774344585309646 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344717_128344855:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344717_128344855:RPN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 104 114 218 49.8441262992743 59.3631692488724 -9.51904294959806 T:C C T 10 0.52072955481467 0.198566361993570 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 128614185 A/C 1 16 14 30 7.66832712296528 7.29021376740538 0.378113355559901 A:C A C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128614153_128614191:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 128621444 G/A 1 9 2 11 4.31343400666797 1.04145910962934 3.27197489703863 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0679252119053198 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128621396_128621471:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128621396_128621471:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128621396_128621471:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128621396_128621471:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128621396_128621471:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128621396_128621475:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128621396_128621471:ACAD9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 11 12 23 5.27197489703863 6.24875465777604 -0.97677976073741 T:C C T 10 0.52072955481467 0.835284067578657 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 129155451 C/T 1 41 40 81 19.6500882525985 20.8291821925868 -1.17909393998827 T:C C T 10 0.52072955481467 0.824545770778029 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 131102053 A/G 1 19 26 45 9.10613845852127 13.5389684251814 -4.43282996666015 A:G A G 10 0.52072955481467 0.232347018162802 ENSG00000198585:ENST00000521288:exon_131102006_131107674:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000502852:exon_131100890_131102283:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000359850:exon_131102006_131107674:NUDT16 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 132277866 G/A 1 5 9 14 2.39635222592665 4.68656599333203 -2.29021376740538 A:G G A 10 0.52072955481467 0.287077835461110 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132276988_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000485198:exon_132277316_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132277668_132277929:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132276986_132277929:NPHP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 132338346 T/G 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 T:G T G 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000507705:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000487024:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000481970:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132338312_132338389:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132338312_132338389:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132338312_132338389:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132338312_132338389:NPHP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 148872987 G/A 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148872894_148873002:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148872894_148873002:HPS3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 13 17 30 6.23051578740929 8.85240243184939 -2.6218866444401 T:C C T 10 0.52072955481467 0.365338055729386 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 84 1 85 40.2587173955677 0.52072955481467 39.737987840753 A:T T A 10 0.52072955481467 6.77508432695432e-23 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 158362441 T/C 1 8 9 17 3.83416356148264 4.68656599333203 -0.85240243184939 T:C T C 10 0.52072955481467 0.809480166298499 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158362067_158362504:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158362317_158362504:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158362317_158362504:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158362317_158362504:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158362317_158362504:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158362386_158362504:GFM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 158366900 G/A 1 21 16 37 10.0646793488919 8.33167287703472 1.73300647185721 A:G G A 10 0.52072955481467 0.623713104808598 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478251:exon_158366830_158368809:GFM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 8 10 18 3.83416356148264 5.2072955481467 -1.37313198666406 T:C T C 10 0.52072955481467 0.638802194234348 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 160956548 A/G 1 6 13 19 2.87562267111198 6.76948421259071 -3.89386154147873 A:G A G 10 0.52072955481467 0.105925620736623 ENSG00000169251:ENST00000351193:exon_160956518_160956614:NMD3;ENSG00000169251:ENST00000472947:exon_160956518_160956614:NMD3;ENSG00000169251:ENST00000460469:exon_160956518_160956614:NMD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 169492101 C/T 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000085274:ENST00000349841:exon_169492053_169492349:MYNN;ENSG00000085274:ENST00000356716:exon_169492053_169492349:MYNN;ENSG00000085274:ENST00000392733:exon_169492053_169492349:MYNN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 170893070 G/A 1 12 13 25 5.75124534222396 6.76948421259071 -1.01823887036675 A:G G A 10 0.52072955481467 0.694646743266974 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000468757:exon_170893041_170893119:TNIK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 22 18 40 10.5439497940773 9.37313198666406 1.1708178074132 A:G G A 10 0.52072955481467 0.753527828648834 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 179306775 C/T 1 27 26 53 12.9403020200039 13.5389684251814 -0.598666405177509 T:C C T 10 0.52072955481467 0.891408372688376 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179306073_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179306243_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179306257_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179306619_179306783:MRPL47 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 179322385 A/C 1 14 17 31 6.70978623259462 8.85240243184939 -2.14261619925477 A:C A C 10 0.52072955481467 0.475988624180078 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179322315_179322442:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179322315_179322428:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179322315_179322434:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179322315_179322437:MRPL47 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 55 59 114 26.3598744851932 30.7230437340655 -4.36316924887237 T:C T C 10 0.52072955481467 0.453566687082256 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 25 17 42 11.9817611296333 8.85240243184939 3.12935869778386 A:C C A 10 0.52072955481467 0.357671464852489 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 186502665 C/T 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 T:C C T 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000156976:ENST00000465222:exon_186502221_186502831:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000491473:exon_186502218_186502733:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000486805:exon_186502353_186502830:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000485101:exon_186502353_186503840:EIF4A2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 187088656 C/T 1 8 1 9 3.83416356148264 0.52072955481467 3.31343400666797 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0405156912184239 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 187088903 C/A 1 3 10 13 1.43781133555599 5.2072955481467 -3.76948421259071 A:C C A 10 0.52072955481467 0.0497304815614789 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 187089031 C/A 1 4 9 13 1.91708178074132 4.68656599333203 -2.76948421259071 A:C C A 10 0.52072955481467 0.166029130373969 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 193334991 G/A 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000419435:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392436:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000487986:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000434811:exon_193334967_193335074:OPA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 18 19 37 8.62686801333594 9.89386154147873 -1.26699352814279 A:T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.743209181591739 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 195452951 G/C 0 12 0 12 5.75124534222396 0 5.75124534222396 G G 10 0.52072955481467 0.000544390514281559 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 195453064 T/G 1 7 4 11 3.35489311629731 2.08291821925868 1.27197489703863 A:T:G T G 10 0.52072955481467 0.552692319562948 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000498018:exon_195453052_195453443:MUC20 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 195477791 G/A 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000145113:ENST00000308466:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000448861:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000339251:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000415455:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000392407:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000349607:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000346145:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000478156:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000463781:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000333177:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000405167:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000479406:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000466475:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000475231:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000477086:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000480843:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000470451:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000462323:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000477756:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000392409:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000464234:exon_195477760_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000467235:exon_195476727_195477983:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000469992:exon_195477478_195477983:MUC4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 195594950 G/A 1 23 24 47 11.0232202392626 12.4975093155521 -1.47428907628949 A:G G A 10 0.52072955481467 0.770672818089637 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 195615376 A/G 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:G A G 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000316664:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000438207:exon_195615297_195615455:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000468819:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000447060:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000433111:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000427576:exon_195615297_195615477:TNK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 195800811 C/T 1 84 88 172 40.2587173955677 45.824200823691 -5.56548342812324 T:C C T 10 0.52072955481467 0.402235012864308 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 196199204 G/T 1 15 25 40 7.18905667777995 13.0182388703667 -5.8291821925868 T:G G T 10 0.52072955481467 0.0808719055034555 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 T:C T C 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 196386964 C/G 1 36 27 63 17.2537360266719 14.0596979799961 3.19403804667579 C:G C G 10 0.52072955481467 0.451059761130848 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 196454939 C/T 1 16 8 24 7.66832712296528 4.16583643851736 3.50249068444792 T:C C T 10 0.52072955481467 0.219527027886609 ENSG00000163964:ENST00000426755:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000421265:exon_196454794_196455222:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000451319:exon_196454794_196454981:PIGX HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 196534706 T/C 1 23 25 48 11.0232202392626 13.0182388703667 -1.99501863110416 T:C T C 10 0.52072955481467 0.567626612652638 ENSG00000180370:ENST00000327134:exon_196534653_196534785:PAK2;ENSG00000180370:ENST00000488224:exon_196534653_196534785:PAK2;ENSG00000180370:ENST00000481344:exon_196534653_196534915:PAK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 196730759 G/A 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 A:G G A 10 0.52072955481467 0.784083035222644 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 3 197566254 T/C 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000494069:exon_197566192_197566268:LRCH3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 755129 C/T 1 5 10 15 2.39635222592665 5.2072955481467 -2.81094332222005 T:C C T 10 0.52072955481467 0.196715161243913 ENSG00000185619:ENST00000362003:exon_755067_755204:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000505655:exon_755067_755204:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000521023:exon_755067_755204:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000470161:exon_755067_755204:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000430644:exon_755067_755204:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000440452:exon_755067_755204:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000488032:exon_755067_755152:PCGF3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 843720 T/C 1 58 55 113 27.7976858207491 28.6401255148068 -0.842439694057706 T:C T C 10 0.52072955481467 0.925067209361768 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843680_844197:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843680_843856:GAK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 858924 G/A 1 43 36 79 20.6086291429692 18.7462639733281 1.86236516964107 A:G G A 10 0.52072955481467 0.735901410572621 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_858910_859032:GAK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 1729953 G/A 1 106 74 180 50.802667189645 38.5339870562856 12.2686801333594 A:G G A 10 0.52072955481467 0.073264636979116 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000467746:exon_1729435_1729959:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 1729988 G/A 1 109 79 188 52.240478525201 41.1376348303589 11.102843694842 A:G G A 10 0.52072955481467 0.108651590936266 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 74 66 140 35.4660129437144 34.3681506177682 1.0978623259462 A:G A G 10 0.52072955481467 0.866073252064241 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 1732978 G/A 1 28 37 65 13.4195724651892 19.2669935281428 -5.84742106295355 A:G G A 10 0.52072955481467 0.171880691855019 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1732899_1733028:TACC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 38 41 79 18.2122769170425 21.3499117474015 -3.13763483035893 A:G G A 10 0.52072955481467 0.500807451441306 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 4864876 C/T 1 15 9 24 7.18905667777995 4.68656599333203 2.50249068444792 T:C C T 10 0.52072955481467 0.414445820205225 ENSG00000163132:ENST00000382723:exon_4864428_4865663:MSX1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 5812778 G/A 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 A:G G A 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5812680_5816032:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5812680_5815889:EVC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 6302707 C/T 1 6 8 14 2.87562267111198 4.16583643851736 -1.29021376740538 T:C C T 10 0.52072955481467 0.596274656681649 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 6303022 C/T 1 4 13 17 1.91708178074132 6.76948421259071 -4.85240243184939 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0263028820474456 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 6303354 G/A 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 6303955 G/A 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 6304087 A/G 1 7 4 11 3.35489311629731 2.08291821925868 1.27197489703863 A:G A G 10 0.52072955481467 0.552692319562948 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 6304242 T/C 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 T:C T C 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 6616056 C/T 1 11 5 16 5.27197489703863 2.60364777407335 2.66832712296528 T:C C T 10 0.52072955481467 0.216398220878093 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6615945_6616082:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6615945_6616082:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6615945_6616082:MAN2B2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 8228948 T/C 1 9 5 14 4.31343400666797 2.60364777407335 1.70978623259462 T:C T C 10 0.52072955481467 0.429598343746981 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000514274:exon_8228707_8229196:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508438:exon_8228688_8229000:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 9 21 30 4.31343400666797 10.9353206511081 -6.6218866444401 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0172350077893729 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 8229774 C/T 1 7 15 22 3.35489311629731 7.81094332222005 -4.45605020592274 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0855250585282075 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 16 13 29 7.66832712296528 6.76948421259071 0.898842910374571 T:C T C 10 0.52072955481467 0.853126532704154 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 1 8 21 29 3.83416356148264 10.9353206511081 -7.10115708962543 T:C T C 10 0.52072955481467 0.00895874067840682 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 13604207 A/G 1 16 20 36 7.66832712296528 10.4145910962934 -2.74626397332812 A:G A G 10 0.52072955481467 0.406077322827484 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 17503433 C/T 1 25 7 32 11.9817611296333 3.64510688370269 8.33665424593056 A:T:C C T 10 0.52072955481467 0.00391799685834368 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 T:C T C 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 37836302 T/C 1 11 22 33 5.27197489703863 11.4560502059227 -6.18407530888411 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0361460942384450 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 37903669 A/G 1 7 10 17 3.35489311629731 5.2072955481467 -1.85240243184939 A:G A G 10 0.52072955481467 0.468528473543755 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 37903756 T/C 1 11 13 24 5.27197489703863 6.76948421259071 -1.49750931555208 T:C T C 10 0.52072955481467 0.548584049171421 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 37904082 T/C 1 1 11 12 0.47927044518533 5.72802510296137 -5.24875465777604 A:T:C T C 10 0.52072955481467 0.00245944267305800 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 38016395 T/G 1 16 30 46 7.66832712296528 15.6218866444401 -7.95355952147482 T:G T G 10 0.52072955481467 0.0257865234380585 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 38138856 G/A 1 57 58 115 27.3184153755638 30.2023141792509 -2.88389880368705 A:G G A 10 0.52072955481467 0.640992512084562 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38138756_38139240:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38138756_38140794:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38138756_38139240:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38138756_38139364:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000401554:exon_38138756_38139165:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000407365:exon_38138756_38140796:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000406664:exon_38138756_38139248:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000405444:exon_38138756_38139023:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000492180:exon_38138756_38138870:TBC1D1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 7 8 15 3.35489311629731 4.16583643851736 -0.81094332222005 T:C T C 10 0.52072955481467 0.797925780414529 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 39122697 C/T 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 T:C C T 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39122630_39123829:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39122630_39123828:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39122630_39122825:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39122630_39123826:KLHL5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 25 19 44 11.9817611296333 9.89386154147873 2.08789958815452 T:C T C 10 0.52072955481467 0.549986734138911 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 39303925 A/G 1 16 22 38 7.66832712296528 11.4560502059227 -3.78772308295746 A:G A G 10 0.52072955481467 0.256456984157809 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39303898_39303996:RFC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 12 14 26 5.75124534222396 7.29021376740538 -1.53896842518142 A:G A G 10 0.52072955481467 0.562641904116243 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 40428010 T/C 1 10 4 14 4.7927044518533 2.08291821925868 2.70978623259462 T:C T C 10 0.52072955481467 0.184807178247656 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40425272_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40425698_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40426355_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40427429_40428160:RBM47 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 40438576 A/G 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40438458_40438664:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40438458_40438902:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40438458_40438664:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40438458_40438664:RBM47 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 40440215 T/C 1 27 15 42 12.9403020200039 7.81094332222005 5.12935869778386 T:C T C 10 0.52072955481467 0.123999510179659 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40439788_40440814:RBM47 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 40440854 G/C 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 C:G G C 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000515053:exon_40440259_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000513473:exon_40440332_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000505414:exon_40440435_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514782:exon_40440499_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000507180:exon_40440540_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000511598:exon_40440570_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000511902:exon_40440732_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000505220:exon_40440733_40440941:RBM47 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 47560015 A/G 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:G A G 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47559681_47560290:ATP10D HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 47560163 C/A 1 8 2 10 3.83416356148264 1.04145910962934 2.7927044518533 A:C C A 10 0.52072955481467 0.112396421350563 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47559681_47560290:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47560098_47560290:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47560105_47560290:ATP10D HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 48147309 T/C 1 12 17 29 5.75124534222396 8.85240243184939 -3.10115708962543 T:C T C 10 0.52072955481467 0.269403872469277 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000511471:exon_48147095_48147312:TEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 48172266 G/A 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48172265_48172393:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48172262_48172395:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48172265_48172393:TEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 9 5 14 4.31343400666797 2.60364777407335 1.70978623259462 T:C T C 10 0.52072955481467 0.429598343746981 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 57268328 T/C 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 T:C T C 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57268275_57268347:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57268275_57268347:PPAT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 57333822 G/T 1 9 11 20 4.31343400666797 5.72802510296137 -1.4145910962934 T:G G T 10 0.52072955481467 0.655741219933051 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57333081_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57333783_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000504757:exon_57333784_57333910:SRP72 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 57361553 A/G 1 36 62 98 17.2537360266719 32.2852323985095 -15.0314963718377 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00316176898773536 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57361523_57361560:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57361523_57361560:SRP72 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 57797414 C/T 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 57798174 C/G 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 C:G C G 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 57798189 G/A 1 7 6 13 3.35489311629731 3.12437732888802 0.23051578740929 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 57830663 T/C 1 28 23 51 13.4195724651892 11.9767797607374 1.44279270445183 T:C T C 10 0.52072955481467 0.779631084926117 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57830572_57830692:C4orf14 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 57843295 C/A 1 30 23 53 14.3781133555599 11.9767797607374 2.40133359482249 A:C C A 10 0.52072955481467 0.582998453444184 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57842608_57844989:C4orf14 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 68904558 C/T 0 9 0 9 4.31343400666797 0 4.31343400666797 C C 10 0.52072955481467 0.00414942019491893 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 75937971 C/T 1 1 10 11 0.47927044518533 5.2072955481467 -4.72802510296137 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00473262313205509 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 75938179 G/A 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 76720885 T/C 1 20 23 43 9.5854089037066 11.9767797607374 -2.39137085703081 T:C T C 10 0.52072955481467 0.542181636891993 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76720775_76720885:USO1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 59 48 107 28.2769562659345 24.9950186311042 3.28193763483031 A:G G A 10 0.52072955481467 0.562161788911354 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 79786856 G/A 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000138756:ENST00000389010:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502871:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000335016:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000264889:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000505725:exon_79786711_79786927:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502613:exon_79786711_79786874:BMP2K HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 79800080 G/A 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000138756:ENST00000389010:exon_79799888_79800589:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502871:exon_79799888_79801123:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000264889:exon_79799888_79800083:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000507670:exon_79799888_79800586:BMP2K HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 79832509 A/C 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 A:C A C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000138756:ENST00000335016:exon_79831764_79833339:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502613:exon_79831764_79837526:BMP2K;ENSG00000163291:ENST00000511594:exon_79831992_79833217:PAQR3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 95186055 A/G 1 7 6 13 3.35489311629731 3.12437732888802 0.23051578740929 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000506089:exon_95185679_95186057:SMARCAD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 95561459 A/G 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 A:G A G 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000163110:ENST00000437932:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000503974:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000514743:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000380176:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000506632:exon_95561427_95561601:PDLIM5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 104061537 C/T 1 12 11 23 5.75124534222396 5.72802510296137 0.0232202392625904 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061413_104061571:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061413_104061571:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061413_104061571:CENPE HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 108575989 G/A 1 11 9 20 5.27197489703863 4.68656599333203 0.5854089037066 A:G G A 10 0.52072955481467 0.826808206154088 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108575851_108576056:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108575851_108576056:PAPSS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 108641317 G/A 1 7 6 13 3.35489311629731 3.12437732888802 0.23051578740929 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 108969883 G/A 1 19 5 24 9.10613845852127 2.60364777407335 6.50249068444792 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00770205468370471 ENSG00000138795:ENST00000265165:exon_108968701_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000379951:exon_108968701_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000503879:exon_108968729_108969930:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000504426:exon_108968748_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000505379:exon_108969325_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000514444:exon_108969456_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000505297:exon_108969510_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000510135:exon_108969533_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000438313:exon_108969573_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000507470:exon_108969683_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000509428:exon_108969753_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000512407:exon_108969791_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000510624:exon_108969795_108969907:LEF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 110384078 A/C 1 10 8 18 4.7927044518533 4.16583643851736 0.62686801333594 A:C A C 10 0.52072955481467 0.817378948970493 ENSG00000138802:ENST00000504968:exon_110384057_110384800:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000399100:exon_110384057_110384800:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000265175:exon_110384057_110384800:SEC24B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 4 11 15 1.91708178074132 5.72802510296137 -3.81094332222005 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0682141035611568 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 113352628 A/G 1 11 13 24 5.27197489703863 6.76948421259071 -1.49750931555208 A:G A G 10 0.52072955481467 0.548584049171421 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 113352899 G/A 1 15 9 24 7.18905667777995 4.68656599333203 2.50249068444792 A:G G A 10 0.52072955481467 0.414445820205225 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 113353285 T/C 1 15 17 32 7.18905667777995 8.85240243184939 -1.66334575406944 T:C T C 10 0.52072955481467 0.598565100829255 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 128949799 C/T 1 7 6 13 3.35489311629731 3.12437732888802 0.23051578740929 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 128949850 A/G 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 A:G A G 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 129208649 C/T 1 23 27 50 11.0232202392626 14.0596979799961 -3.0364777407335 T:C C T 10 0.52072955481467 0.399729435952489 ENSG00000164040:ENST00000520121:exon_129208528_129209984:PGRMC2;ENSG00000164040:ENST00000296425:exon_129208528_129209984:PGRMC2;ENSG00000164040:ENST00000332709:exon_129208524_129208678:PGRMC2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 130023759 A/T 1 14 6 20 6.70978623259462 3.12437732888802 3.5854089037066 A:T A T 10 0.52072955481467 0.121539458049168 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502360:exon_130023757_130024192:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508622:exon_130023757_130023946:C4orf33 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 140262145 A/G 1 9 12 21 4.31343400666797 6.24875465777604 -1.93532065110807 A:G A G 10 0.52072955481467 0.513471758577479 ENSG00000164134:ENST00000296543:exon_140262066_140262223:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000398947:exon_140262066_140262223:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000482087:exon_140262066_140262227:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000480277:exon_140262066_140262223:NAA15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 154478222 C/T 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000462540:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154478118_154478234:KIAA0922 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 154525138 A/G 1 48 48 96 23.0049813688958 24.9950186311042 -1.99003726220832 A:G A G 10 0.52072955481467 0.68454351899998 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154524954_154525534:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154524954_154525582:KIAA0922 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 154525458 C/T 1 57 37 94 27.3184153755638 19.2669935281428 8.05142184742102 T:C C T 10 0.52072955481467 0.099541365663846 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154524954_154525534:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154524954_154525582:KIAA0922 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 154553877 C/T 1 28 38 66 13.4195724651892 19.7877230829575 -6.36815061776822 T:C C T 10 0.52072955481467 0.138906722045310 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000478919:exon_154553516_154553990:KIAA0922 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 169928842 G/T 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 T:G G T 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 184426387 C/T 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000168556:ENST00000302327:exon_184426147_184426520:ING2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 184600601 A/G 1 11 7 18 5.27197489703863 3.64510688370269 1.62686801333594 A:G A G 10 0.52072955481467 0.487529072791399 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184600506_184600639:C4orf41 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 57 96 153 27.3184153755638 49.9900372622083 -22.6716218866445 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00025382933001327 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 185655171 C/T 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 T:C C T 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185655170_185655287:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185655170_185655284:MLF1IP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 185687129 G/A 1 15 21 36 7.18905667777995 10.9353206511081 -3.74626397332812 A:G G A 10 0.52072955481467 0.244102359180986 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000503407:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687045_185687140:ACSL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 185687863 A/G 1 10 9 19 4.7927044518533 4.68656599333203 0.10613845852127 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687776_185687910:ACSL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 186097045 C/T 1 24 28 52 11.5024906844479 14.5804275348108 -3.07793685036284 T:C C T 10 0.52072955481467 0.408177483166984 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 28 38 66 13.4195724651892 19.7877230829575 -6.36815061776822 T:C T C 10 0.52072955481467 0.138906722045310 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 20 12 32 9.5854089037066 6.24875465777604 3.33665424593056 A:G G A 10 0.52072955481467 0.289248223803459 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 205565 G/A 1 9 12 21 4.31343400666797 6.24875465777604 -1.93532065110807 A:G G A 10 0.52072955481467 0.513471758577479 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 226160 A/C 1 80 97 177 38.3416356148264 50.510766817023 -12.1691312021966 A:C A C 10 0.52072955481467 0.0710481994143989 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_225748_226162:SDHA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 228362 T/C 1 61 63 124 29.2354971563051 32.8059619533242 -3.57046479701908 T:C T C 10 0.52072955481467 0.530533752444553 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_227724_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_228300_228448:SDHA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 233734 C/G 1 93 112 205 44.5721514022357 58.321710139243 -13.7495587370073 C:G C G 10 0.52072955481467 0.0590034032301163 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_233718_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_233592_233744:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_233592_234253:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_233592_234253:SDHA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 256472 G/A 1 124 82 206 59.4295352029809 42.6998234948029 16.729711708178 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0212349893287011 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 256509 G/A 1 88 72 160 42.175799176309 37.4925279466562 4.6832712296528 A:T:G G A 10 0.52072955481467 0.477115108119677 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 311478 T/C 1 128 124 252 61.3466169837222 64.5704647970191 -3.22384781329683 T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.70544127966579 ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_311408_311609:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_311408_312526:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507473:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000511482:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000512466:exon_308312_311517:PDCD6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 422955 C/G 1 17 12 29 8.14759756815061 6.24875465777604 1.89884291037457 C:G C G 10 0.52072955481467 0.578315378656019 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000510910:exon_422492_422973:AHRR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 442790 G/A 1 7 10 17 3.35489311629731 5.2072955481467 -1.85240243184939 A:G G A 10 0.52072955481467 0.468528473543755 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 453834 T/G 1 53 57 110 25.4013335948225 29.6815846244362 -4.2802510296137 T:G T G 10 0.52072955481467 0.445694899084683 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 474974 C/T 1 5 8 13 2.39635222592665 4.16583643851736 -1.76948421259071 T:C C T 10 0.52072955481467 0.409410722535207 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 1467004 A/G 1 53 76 129 25.4013335948225 39.5754461659149 -14.1741125710924 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0134757932444310 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 1479678 G/C 1 7 2 9 3.35489311629731 1.04145910962934 2.31343400666797 C:G G C 10 0.52072955481467 0.183068589600402 ENSG00000153395:ENST00000513757:exon_1479591_1479790:LPCAT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 62 37 99 29.7147676014905 19.2669935281428 10.4477740733477 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0436993439681324 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 5462148 G/A 1 11 3 14 5.27197489703863 1.56218866444401 3.70978623259462 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0603185136025827 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 14420027 A/C 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 A:C A C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509354:exon_14419887_14420295:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512979:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000507714:exon_14419923_14420130:TRIO HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 14741984 T/C 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 T:C T C 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000154122:ENST00000284268:exon_14741936_14742031:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000503939:exon_14741936_14742031:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000515517:exon_14741566_14742031:ANKH HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 33462034 G/A 1 52 52 104 24.9220631496372 27.0779368503628 -2.15587370072568 A:G G A 10 0.52072955481467 0.695418902316408 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33462011_33462111:TARS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 43297144 A/G 1 26 28 54 12.4610315748186 14.5804275348108 -2.11939595999218 A:G A G 10 0.52072955481467 0.588105785438613 ENSG00000112972:ENST00000325110:exon_43297104_43297268:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000433297:exon_43297104_43297268:HMGCS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 44809162 G/C 1 35 36 71 16.7744655814866 18.7462639733281 -1.97179839184157 C:G G C 10 0.52072955481467 0.721863403619614 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 52942197 A/G 1 26 29 55 12.4610315748186 15.1011570896254 -2.64012551480685 A:G A G 10 0.52072955481467 0.50199058740513 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506765:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000509443:exon_52942025_52942235:NDUFS4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 64881936 A/G 1 11 8 19 5.27197489703863 4.16583643851736 1.10613845852127 A:C:G A G 10 0.52072955481467 0.653020003043937 ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000513773:exon_64881826_64882008:PPWD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 65350374 A/G 1 28 40 68 13.4195724651892 20.8291821925868 -7.40960972739756 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0886087539053468 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 66478626 T/C 1 20 22 42 9.5854089037066 11.4560502059227 -1.87064130221614 T:C T C 10 0.52072955481467 0.643866969057701 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 66480374 G/C 1 11 4 15 5.27197489703863 2.08291821925868 3.18905667777995 C:G G C 10 0.52072955481467 0.123192206125781 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180;ENSG00000134061:ENST00000515027:exon_66480350_66480413:CD180 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 28 19 47 13.4195724651892 9.89386154147873 3.52571092371051 T:G G T 10 0.52072955481467 0.311670332811952 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 68471247 G/A 1 35 25 60 16.7744655814866 13.0182388703667 3.7562267111198 A:G G A 10 0.52072955481467 0.366944330974419 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000505500:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000507798:exon_68471224_68471364:CCNB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 68695940 T/G 1 19 25 44 9.10613845852127 13.0182388703667 -3.91210041184548 T:G T G 10 0.52072955481467 0.290912709188041 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000513214:exon_68695876_68695996:RAD17 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 71519675 G/A 1 41 47 88 19.6500882525985 24.4742890762895 -4.82420082369096 A:G G A 10 0.52072955481467 0.33726445899663 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71519630_71519677:MRPS27 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 73985215 A/G 1 16 12 28 7.66832712296528 6.24875465777604 1.41957246518924 A:G A G 10 0.52072955481467 0.706167957724672 ENSG00000049860:ENST00000511181:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000515528:exon_73985153_73985674:HEXB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 74046464 C/T 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 T:C C T 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000345239:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509430:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000427854:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509097:exon_74046404_74046492:GFM2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 74063154 C/G 1 44 56 100 21.0878995881545 29.1608550696215 -8.072955481467 C:G C G 10 0.52072955481467 0.110109416201675 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74062763_74063196:GFM2;ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74062817_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74063073_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74063088_74063188:NSA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 74069863 A/G 1 76 69 145 36.4245538340851 35.9303392822122 0.494214551872851 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74069693_74069885:NSA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 74656175 G/A 1 24 24 48 11.5024906844479 12.4975093155521 -0.995018631104159 A:G G A 10 0.52072955481467 0.775126855237466 ENSG00000113161:ENST00000511206:exon_74656113_74656583:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000287936:exon_74656113_74657929:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000343975:exon_74656113_74657248:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000429286:exon_74656113_74657924:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000509085:exon_74656113_74656307:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000511986:exon_74656113_74656306:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000512053:exon_74656113_74656354:HMGCR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 74877266 C/T 1 9 10 19 4.31343400666797 5.2072955481467 -0.89386154147873 T:C C T 10 0.52072955481467 0.819317260655474 ENSG00000122008:ENST00000241436:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000352007:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000380481:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000425306:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000503479:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000506928:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000510815:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000515295:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508867:exon_74877034_74878790:POLK;ENSG00000122008:ENST00000514141:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000504026:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000511527:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000505975:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508526:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000509126:exon_74877034_74877273:POLK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 7 11 18 3.35489311629731 5.72802510296137 -2.37313198666406 T:C T C 10 0.52072955481467 0.346420367518563 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 76359024 C/A 1 12 11 23 5.75124534222396 5.72802510296137 0.0232202392625904 A:C C A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76358877_76361059:AGGF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 76734084 C/T 1 10 21 31 4.7927044518533 10.9353206511081 -6.14261619925477 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0308107865096397 ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000502528:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511630:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507654:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511791:exon_76734083_76734186:WDR41 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 78181423 C/T 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 T:C C T 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000113273:ENST00000264914:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000341088:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000396151:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000521800:exon_78181407_78181653:ARSB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 79950512 A/G 1 8 7 15 3.83416356148264 3.64510688370269 0.18905667777995 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000228716:ENST00000439211:exon_79950223_79950802:DHFR;ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_79950467_79950783:MSH3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 82500734 G/T 1 17 5 22 8.14759756815061 2.60364777407335 5.54394979407726 T:G G T 10 0.52072955481467 0.0189359180007504 ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000514538:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000509268:exon_82500634_82500740:XRCC4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96121524 C/T 1 29 28 57 13.8988429103746 14.5804275348108 -0.681584624436189 T:C C T 10 0.52072955481467 0.89501069508708 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96121343_96121675:ERAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96124330 T/C 1 21 11 32 10.0646793488919 5.72802510296137 4.33665424593056 T:C T C 10 0.52072955481467 0.156629381530112 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96124234_96124388:ERAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96126308 A/G 1 12 15 27 5.75124534222396 7.81094332222005 -2.05969797999609 A:G A G 10 0.52072955481467 0.447615619311931 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96126215_96126329:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503311:exon_96126288_96126346:ERAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96127833 G/A 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 A:G G A 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96127764_96127895:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96127764_96127895:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503311:exon_96127764_96127895:ERAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96129512 A/G 1 16 3 19 7.66832712296528 1.56218866444401 6.10613845852127 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00504304617394946 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96129506_96129660:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96129506_96129660:ERAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96139250 C/G 1 47 11 58 22.5257109237105 5.72802510296137 16.7976858207491 C:G C G 10 0.52072955481467 8.09935492102876e-06 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96139595 G/A 1 31 25 56 14.8573838007452 13.0182388703667 1.83914493037848 A:G G A 10 0.52072955481467 0.688963758077531 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 22 1 23 10.5439497940773 0.52072955481467 10.0232202392626 T:G G T 10 0.52072955481467 7.89694688783647e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 1 22 3 25 10.5439497940773 1.56218866444401 8.98176112963325 A:T T A 10 0.52072955481467 0.00020489166715722 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96237326 G/A 1 14 3 17 6.70978623259462 1.56218866444401 5.14759756815061 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0139839148920153 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96237210_96237385:ERAP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 26 1 27 12.4610315748186 0.52072955481467 11.9403020200039 T:C C T 10 0.52072955481467 6.48810905717726e-07 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 38 2 40 18.2122769170425 1.04145910962934 17.1708178074132 T:C C T 10 0.52072955481467 5.50632035896015e-09 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 28 2 30 13.4195724651892 1.04145910962934 12.3781133555599 T:C C T 10 0.52072955481467 1.39408465936991e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 A:G G A 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 12 15 27 5.75124534222396 7.81094332222005 -2.05969797999609 T:C C T 10 0.52072955481467 0.447615619311931 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96512865 T/A 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 A:T T A 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 102483699 A/T 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 A:T A T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000145725:ENST00000321521:exon_102483635_102483736:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000507921:exon_102483635_102483736:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000358359:exon_102483635_102483736:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000451606:exon_102483635_102483736:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000513500:exon_102483635_102483736:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000414217:exon_102483635_102483736:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000507310:exon_102483635_102483736:PPIP5K2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 108672946 C/T 1 14 6 20 6.70978623259462 3.12437732888802 3.5854089037066 T:C C T 10 0.52072955481467 0.121539458049168 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108670410_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108670411_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108670411_108673057:PJA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 28 26 54 13.4195724651892 13.5389684251814 -0.119395959992179 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 112917278 T/G 1 2 6 8 0.95854089037066 3.12437732888802 -2.16583643851736 T:G T G 10 0.52072955481467 0.164210754421108 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112917114_112917406:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112917114_112917406:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112916963_112920176:YTHDC2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 12 9 21 5.75124534222396 4.68656599333203 1.06467934889193 A:T T A 10 0.52072955481467 0.669361120839622 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 115428334 G/T 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 T:G G T 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 115469773 C/T 1 12 4 16 5.75124534222396 2.08291821925868 3.66832712296528 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0808258357838215 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115469765_115469875:COMMD10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 118691784 T/C 1 48 28 76 23.0049813688958 14.5804275348108 8.42455383408508 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0655485721450965 ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118690009_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118691718_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118691730_118691816:TNFAIP8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 118728953 G/C 1 69 68 137 33.0696607177878 35.4096097273976 -2.33994900960979 C:G G C 10 0.52072955481467 0.732535187593703 ENSG00000145779:ENST00000274456:exon_118728511_118729089:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000513374:exon_118728511_118729438:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504642:exon_118728511_118729141:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118728511_118730294:TNFAIP8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 14 8 22 6.70978623259462 4.16583643851736 2.54394979407726 A:G A G 10 0.52072955481467 0.295404626091449 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 121355795 C/A 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 A:C C A 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 122682348 A/G 1 10 8 18 4.7927044518533 4.16583643851736 0.62686801333594 A:G A G 10 0.52072955481467 0.817378948970493 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 122685727 C/G 1 8 9 17 3.83416356148264 4.68656599333203 -0.85240243184939 C:G C G 10 0.52072955481467 0.809480166298499 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122685638_122685783:CEP120 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 122727026 G/A 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 A:G G A 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000395431:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000503049:exon_122726603_122727031:CEP120 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 123985368 C/T 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000168916:ENST00000504926:exon_123985303_123985390:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000306315:exon_123985303_123985390:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000395398:exon_123985303_123985390:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000505686:exon_123985303_123985390:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000503896:exon_123985303_123985390:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000509799:exon_123985303_123985390:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000513986:exon_123985303_123985390:ZNF608 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 132094205 G/A 1 17 20 37 8.14759756815061 10.4145910962934 -2.26699352814279 A:G G A 10 0.52072955481467 0.512047217834505 ENSG00000164402:ENST00000296873:exon_132091697_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000412572:exon_132091697_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000448933:exon_132091697_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378706:exon_132092025_132094699:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378699:exon_132093835_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378701:exon_132093836_132094248:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000458488:exon_132093892_132094248:SEPT8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 137904675 C/T 1 108 140 248 51.7612080800156 72.9021376740538 -21.1409295940381 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00754940491360554 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137904614_137904738:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137904614_137904738:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000504902:exon_137904614_137904738:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507115:exon_137904614_137904738:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000505110:exon_137904655_137904738:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000504810:exon_137904657_137904738:HSPA9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 139574050 G/A 1 37 51 88 17.7330064718572 26.5572072955482 -8.82420082369096 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0693045565782042 ENSG00000120306:ENST00000261811:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000509589:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000504227:exon_139574031_139574237:C5orf32 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 139682663 G/C 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 C:G G C 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000113068:ENST00000261813:exon_139682626_139682706:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000510217:exon_139682626_139682698:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000524074:exon_139682626_139682668:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000507185:exon_139682626_139682671:PFDN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 139908177 A/C 1 42 29 71 20.1293586977839 15.1011570896254 5.02820160815843 A:C A C 10 0.52072955481467 0.237765193567596 ENSG00000131503:ENST00000360839:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000422011:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000253810:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000310356:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000297183:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000431508:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000433049:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000435794:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000432301:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000254996:ENST00000532219:exon_139907769_139909381:ANKHD1-EIF4EBP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 140041960 T/G 1 12 9 21 5.75124534222396 4.68656599333203 1.06467934889193 T:G T G 10 0.52072955481467 0.669361120839622 ENSG00000113141:ENST00000417647:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000261812:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000515592:exon_140041764_140042064:IK;ENSG00000113141:ENST00000518969:exon_140041887_140042012:IK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 140048209 T/C 1 14 13 27 6.70978623259462 6.76948421259071 -0.0596979799960895 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 140048707 A/G 1 7 18 25 3.35489311629731 9.37313198666406 -6.01823887036675 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0256076639301518 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048664_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048664_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048476_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048664_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048664_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511364:exon_140048664_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000520764:exon_140048664_140048833:WDR55 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 141016383 C/A 1 13 16 29 6.23051578740929 8.33167287703472 -2.10115708962543 A:C C A 10 0.52072955481467 0.462301755728773 ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141016303_141016437:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141016303_141016409:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523088:exon_141016303_141016400:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000519474:exon_141016303_141016405:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141016303_141016392:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000492506:exon_141016303_141016410:HDAC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 141026182 G/T 1 11 11 22 5.27197489703863 5.72802510296137 -0.45605020592274 T:G G T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141026170_141026289:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141026170_141026289:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141025654_141026289:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141026170_141026289:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141026170_141026289:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522763:exon_141026075_141026289:FCHSD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 149212430 G/A 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 149212471 G/A 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 149216256 C/T 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 T:C C T 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149215826_149216636:PPARGC1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 149216304 C/T 1 10 3 13 4.7927044518533 1.56218866444401 3.23051578740929 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0958867035011751 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149215826_149216636:PPARGC1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 149374932 T/C 1 4 8 12 1.91708178074132 4.16583643851736 -2.24875465777604 T:C T C 10 0.52072955481467 0.251467937811103 ENSG00000164296:ENST00000296736:exon_149372681_149375992:TIGD6;ENSG00000164296:ENST00000515406:exon_149374291_149375992:TIGD6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 149375110 C/T 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000164296:ENST00000296736:exon_149372681_149375992:TIGD6;ENSG00000164296:ENST00000515406:exon_149374291_149375992:TIGD6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 149776232 C/T 1 41 47 88 19.6500882525985 24.4742890762895 -4.82420082369096 T:C C T 10 0.52072955481467 0.33726445899663 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149775845_149776405:TCOF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 209 223 432 100.167523043734 116.122690723671 -15.9551676799374 A:G G A 10 0.52072955481467 0.135406508374569 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 150565008 C/T 1 62 41 103 29.7147676014905 21.3499117474015 8.36485585408899 T:C C T 10 0.52072955481467 0.114288860803086 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 150584981 C/G 1 34 31 65 16.2951951363012 16.1426161992548 0.152578937046453 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150584961_150585036:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150584961_150585038:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150584961_150585036:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000421260:exon_150584961_150585036:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150584961_150585036:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150584961_150585036:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522179:exon_150584961_150585036:CCDC69 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 150632782 A/G 1 38 37 75 18.2122769170425 19.2669935281428 -1.05471661110025 A:G A G 10 0.52072955481467 0.818253532061428 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150632453_150632858:GM2A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 151043103 G/C 1 11 7 18 5.27197489703863 3.64510688370269 1.62686801333594 C:G G C 10 0.52072955481467 0.487529072791399 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151040657_151043160:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000520687:exon_151042049_151043160:SPARC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 156753257 C/T 1 25 25 50 11.9817611296333 13.0182388703667 -1.0364777407335 T:C C T 10 0.52072955481467 0.779128855228348 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520960:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000518555:exon_156752608_156753275:CYFIP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 162902516 T/C 1 22 14 36 10.5439497940773 7.29021376740538 3.25373602667188 T:C T C 10 0.52072955481467 0.318740065925166 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162902464_162902678:HMMR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 167937607 G/A 1 31 58 89 14.8573838007452 30.2023141792509 -15.3449303785056 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00133685008394474 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167937586_167937691:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167937586_167937691:RARS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 169267784 G/A 1 58 42 100 27.7976858207491 21.8706413022161 5.927044518533 A:C:G G A 10 0.52072955481467 0.270906709171554 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520836:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520181:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519628:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169267761_169267856:DOCK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 59 63 122 28.2769562659345 32.8059619533242 -4.52900568738973 C:G C G 10 0.52072955481467 0.416459253138727 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 65 57 122 31.1525789370464 29.6815846244362 1.47099431261026 T:C C T 10 0.52072955481467 0.856289314089167 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 171326960 C/T 1 11 15 26 5.27197489703863 7.81094332222005 -2.53896842518142 T:C C T 10 0.52072955481467 0.333843435098941 ENSG00000072803:ENST00000296933:exon_171326918_171327104:FBXW11;ENSG00000072803:ENST00000265094:exon_171326918_171327104:FBXW11;ENSG00000072803:ENST00000393802:exon_171326918_171327104:FBXW11;ENSG00000072803:ENST00000523843:exon_171326918_171327104:FBXW11;ENSG00000072803:ENST00000522891:exon_171326918_171327104:FBXW11;ENSG00000072803:ENST00000519693:exon_171326937_171327104:FBXW11;ENSG00000072803:ENST00000517395:exon_171326951_171327104:FBXW11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 171481606 A/G 1 49 46 95 23.4842518140812 23.9535595214748 -0.46930770739365 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 171520790 G/C 1 80 71 151 38.3416356148264 36.9717983918416 1.36983722298483 C:G G C 10 0.52072955481467 0.870706532816298 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171520416_171520964:STK10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 171533629 A/G 1 61 67 128 29.2354971563051 34.8888801725829 -5.65338301627776 A:G A G 10 0.52072955481467 0.331351012413373 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 171533656 C/T 1 64 52 116 30.6733084918611 27.0779368503628 3.59537164149828 T:C C T 10 0.52072955481467 0.516837569087144 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 171533782 T/C 1 41 56 97 19.6500882525985 29.1608550696215 -9.51076681702299 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0541530742932791 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519710:exon_171533666_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171533714_171534038:STK10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 175772208 C/T 1 11 9 20 5.27197489703863 4.68656599333203 0.5854089037066 T:C C T 10 0.52072955481467 0.826808206154088 ENSG00000170085:ENST00000345702:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000430704:exon_175772186_175772569:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000443967:exon_175772186_175772994:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000341199:exon_175772186_175772992:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000420396:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000332772:exon_175772186_175772992:C5orf25 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 1 1851 2 1853 887.129594038046 1.04145910962934 886.088134928416 A:T:C T C 10 0.52072955481467 0 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 177547336 G/A 1 8 18 26 3.83416356148264 9.37313198666406 -5.53896842518142 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0317712262234647 ENSG00000145911:ENST00000274605:exon_177547179_177547700:N4BP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 179195867 G/A 1 8 17 25 3.83416356148264 8.85240243184939 -5.01823887036675 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0473259467471381 ENSG00000161021:ENST00000292599:exon_179195851_179196090:MAML1;ENSG00000161021:ENST00000376951:exon_179195851_179196090:MAML1;ENSG00000161021:ENST00000503050:exon_179195851_179196090:MAML1;ENSG00000161021:ENST00000507385:exon_179195853_179196090:MAML1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 179201540 C/G 1 18 10 28 8.62686801333594 5.2072955481467 3.41957246518924 C:G C G 10 0.52072955481467 0.256362319911248 ENSG00000161021:ENST00000292599:exon_179200896_179204287:MAML1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 5 179263515 G/A 1 206 186 392 98.729711708178 96.8556971955286 1.87401451264937 A:G G A 10 0.52072955481467 0.879498286800385 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179263436_179264252:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179263436_179264252:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179263471_179264218:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179263436_179264255:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000403396:exon_179261436_179264204:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522663:exon_179262133_179264204:C5orf45 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 31 20 51 14.8573838007452 10.4145910962934 4.44279270445183 A:C:G G A 10 0.52072955481467 0.262109355477484 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 397290 T/C 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000137265:ENST00000495137:exon_397108_397546:IRF4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 16 17 33 7.66832712296528 8.85240243184939 -1.18407530888411 A:T:G G A 10 0.52072955481467 0.729460209285984 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 5431340 A/G 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 A:G A G 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000445533:exon_5431274_5431405:FARS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 12120445 A/G 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 A:G A G 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000095951:ENST00000487103:exon_12120123_12120455:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 12120588 C/T 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 T:C C T 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 12122174 A/G 1 9 10 19 4.31343400666797 5.2072955481467 -0.89386154147873 A:G A G 10 0.52072955481467 0.819317260655474 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 12124587 C/G 1 4 7 11 1.91708178074132 3.64510688370269 -1.72802510296137 C:G C G 10 0.52072955481467 0.371924081118385 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 12124855 G/A 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 A:G G A 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 12163575 G/A 1 21 6 27 10.0646793488919 3.12437732888802 6.94030202000391 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0108281489477362 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12163516_12165232:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000399469:exon_12163516_12164808:HIVEP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 13599306 C/T 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000124523:ENST00000379262:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000397350:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13599264_13599387:SIRT5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 13612078 A/G 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 A:G A G 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13612022_13612524:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13612022_13612520:SIRT5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 13711279 A/G 1 23 16 39 11.0232202392626 8.33167287703472 2.69154736222787 A:G A G 10 0.52072955481467 0.425813158373115 ENSG00000010017:ENST00000011619:exon_13711167_13711796:RANBP9;ENSG00000010017:ENST00000283152:exon_13711167_13711953:RANBP9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 16143261 A/G 1 11 15 26 5.27197489703863 7.81094332222005 -2.53896842518142 A:G A G 10 0.52072955481467 0.333843435098941 ENSG00000007944:ENST00000356840:exon_16143251_16143448:MYLIP;ENSG00000007944:ENST00000349606:exon_16143251_16143448:MYLIP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 16306751 G/A 1 10 6 16 4.7927044518533 3.12437732888802 1.66832712296528 A:G G A 10 0.52072955481467 0.460768625180263 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 16306866 G/A 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 A:G G A 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 16327330 T/C 1 9 6 15 4.31343400666797 3.12437732888802 1.18905667777995 T:C T C 10 0.52072955481467 0.611940175630342 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16326625_16328574:ATXN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 17665479 G/C 1 12 7 19 5.75124534222396 3.64510688370269 2.10613845852127 C:G G C 10 0.52072955481467 0.367172032607735 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17665470_17665616:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17665470_17665616:NUP153 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 17675246 T/C 1 16 10 26 7.66832712296528 5.2072955481467 2.46103157481858 T:C T C 10 0.52072955481467 0.433118121558513 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17675136_17675264:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17675136_17675264:NUP153 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 17688693 C/T 1 14 5 19 6.70978623259462 2.60364777407335 4.10613845852127 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0678450364332657 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17688627_17688849:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17688627_17688849:NUP153 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 18161563 G/A 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000165097:ENST00000388870:exon_18161558_18161685:KDM1B;ENSG00000165097:ENST00000397244:exon_18161558_18161685:KDM1B;ENSG00000165097:ENST00000297792:exon_18161558_18161685:KDM1B;ENSG00000165097:ENST00000388869:exon_18161558_18161685:KDM1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 18212794 A/T 1 8 7 15 3.83416356148264 3.64510688370269 0.18905667777995 A:T A T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000165097:ENST00000388870:exon_18212719_18212835:KDM1B;ENSG00000165097:ENST00000397244:exon_18212719_18212835:KDM1B;ENSG00000165097:ENST00000297792:exon_18212719_18212835:KDM1B;ENSG00000165097:ENST00000388869:exon_18212719_18212835:KDM1B;ENSG00000165097:ENST00000449850:exon_18212719_18212835:KDM1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 18237661 C/T 1 67 51 118 32.1111198274171 26.5572072955482 5.55391253186895 T:C C T 10 0.52072955481467 0.312544066550206 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000507591:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000512145:exon_18237281_18237747:DEK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 18256625 A/G 1 26 43 69 12.4610315748186 22.3913708570308 -9.93033928221223 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0213996422039411 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18256592_18256670:DEK;ENSG00000124795:ENST00000503715:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18256604_18256686:DEK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 18264180 G/C 1 73 50 123 34.9867424985291 26.0364777407335 8.95026475779559 C:G G C 10 0.52072955481467 0.124660925649525 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18264074_18264439:DEK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 18264210 G/A 1 46 69 115 22.0464404785252 35.9303392822122 -13.883898803687 A:C:G G A 10 0.52072955481467 0.0114376235363612 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18264074_18264439:DEK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 18264658 G/A 1 45 40 85 21.5671700333398 20.8291821925868 0.73798784075305 A:G G A 10 0.52072955481467 0.913797627002084 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264616_18265054:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264616_18264799:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264616_18264766:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264616_18264772:DEK;ENSG00000124795:ENST00000503715:exon_18264616_18264772:DEK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 21201493 G/A 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 A:G G A 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000476517:exon_21201341_21201505:CDKAL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 24653215 C/T 1 34 26 60 16.2951951363012 13.5389684251814 2.7562267111198 T:C C T 10 0.52072955481467 0.519542709262601 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 24653273 G/C 1 15 9 24 7.18905667777995 4.68656599333203 2.50249068444792 C:G G C 10 0.52072955481467 0.414445820205225 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 24666739 C/T 1 5 10 15 2.39635222592665 5.2072955481467 -2.81094332222005 T:C C T 10 0.52072955481467 0.196715161243913 ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24666347_24666819:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000480495:exon_24666215_24666839:TDP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 29910801 C/A 0 1702 1 1703 815.718297705432 0.52072955481467 815.197568150617 T:C C T 10 0.52072955481467 0 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 0 925 0 925 443.32516179643 0 443.32516179643 A A 10 0.52072955481467 9.92236610746633e-263 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 32811645 A/G 1 199 243 442 95.3748185918807 126.537281819965 -31.1624632280841 A:C:G A G 10 0.52072955481467 0.00313694152830755 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 32811730 G/T 1 144 110 254 69.0149441066875 57.2802510296137 11.7346930770738 A:T:G G T 10 0.52072955481467 0.148720138376593 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 178 165 343 85.3101392429887 85.9203765444205 -0.610237301431809 T:C T C 10 0.52072955481467 0.956946748987546 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 102 98 200 48.8855854089037 51.0314963718377 -2.145910962934 T:C T C 10 0.52072955481467 0.777435333041756 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 32826233 A/G 1 220 196 416 105.439497940773 102.062992743675 3.37650519709729 A:G A G 10 0.52072955481467 0.768494688230515 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32826141_32826677:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000395333:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32826141_32826499:PSMB9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 223 203 426 106.877309276329 105.708099627378 1.16920964895058 A:G G A 10 0.52072955481467 0.922798863787459 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 49 49 98 23.4842518140812 25.5157481859188 -2.03149637183766 A:G G A 10 0.52072955481467 0.687339649296421 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 13 13 26 6.23051578740929 6.76948421259071 -0.53896842518142 A:G G A 10 0.52072955481467 0.84709817230133 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 99 145 244 47.4477740733477 75.5057854481271 -28.0580113747795 T:C T C 10 0.52072955481467 0.000403062725730271 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 12 8 20 5.75124534222396 4.16583643851736 1.5854089037066 A:G G A 10 0.52072955481467 0.510829655044723 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 6 9 15 2.87562267111198 4.68656599333203 -1.81094332222005 A:G G A 10 0.52072955481467 0.44117550699482 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 33272712 C/A 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 A:C C A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 159 124 283 76.2040007844675 64.5704647970191 11.6335359874484 A:C:G G C 10 0.52072955481467 0.171505713718511 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 33281842 G/T 1 10 2 12 4.7927044518533 1.04145910962934 3.75124534222396 T:G G T 10 0.52072955481467 0.040517956655805 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 33281843 A/T 1 9 2 11 4.31343400666797 1.04145910962934 3.27197489703863 A:T A T 10 0.52072955481467 0.0679252119053198 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 33283766 T/C 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 73 76 149 34.9867424985291 39.5754461659149 -4.58870366738583 A:G A G 10 0.52072955481467 0.461597591346659 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 33359716 G/C 1 27 21 48 12.9403020200039 10.9353206511081 2.00498136889584 C:G G C 10 0.52072955481467 0.665194262654053 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000450504:exon_33359638_33359774:KIFC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 33643558 G/A 0 17 0 17 8.14759756815061 0 8.14759756815061 G G 10 0.52072955481467 1.89340112623079e-05 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33643468_33643633:ITPR3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 33665458 T/C 1 37 46 83 17.7330064718572 23.9535595214748 -6.22055304961761 T:C T C 10 0.52072955481467 0.187855892343621 ENSG00000137288:ENST00000374231:exon_33665345_33665527:C6orf125;ENSG00000137288:ENST00000374214:exon_33665345_33665527:C6orf125 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 34214322 C/G 1 19 21 40 9.10613845852127 10.9353206511081 -1.8291821925868 C:G C G 10 0.52072955481467 0.635914069230674 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 35610590 A/G 1 14 16 30 6.70978623259462 8.33167287703472 -1.6218866444401 A:G A G 10 0.52072955481467 0.587501156256487 ENSG00000096060:ENST00000357266:exon_35610497_35610620:FKBP5;ENSG00000096060:ENST00000337746:exon_35610497_35610620:FKBP5;ENSG00000096060:ENST00000373875:exon_35610520_35610597:FKBP5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 35803192 C/A 1 20 23 43 9.5854089037066 11.9767797607374 -2.39137085703081 A:C C A 10 0.52072955481467 0.542181636891993 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 36355372 T/C 1 8 9 17 3.83416356148264 4.68656599333203 -0.85240243184939 T:C T C 10 0.52072955481467 0.809480166298499 ENSG00000010030:ENST00000339796:exon_36355313_36356164:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000340181:exon_36355313_36355560:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373737:exon_36355313_36355560:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373738:exon_36355313_36356164:ETV7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 36446975 G/C 1 11 11 22 5.27197489703863 5.72802510296137 -0.45605020592274 C:G G C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000112078:ENST00000373731:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000481911:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000265344:exon_36446898_36447000:KCTD20 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 36990029 G/C 1 19 14 33 9.10613845852127 7.29021376740538 1.81592469111589 C:G G C 10 0.52072955481467 0.60279298858228 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36990015_36990146:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36990015_36990146:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36990015_36990146:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36990015_36990146:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36990015_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36990015_36990062:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36989318_36990146:FGD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 36993615 C/T 1 24 20 44 11.5024906844479 10.4145910962934 1.08789958815452 T:C C T 10 0.52072955481467 0.765154003607581 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36993568_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36993568_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36993568_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36993568_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36990015_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36993568_36993714:FGD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 37252210 C/T 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000065491:ENST00000373491:exon_37252112_37252240:TBC1D22B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 37349033 G/A 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 38650628 T/G 1 67 81 148 32.1111198274171 42.1790939399883 -10.0679741125712 T:G T G 10 0.52072955481467 0.100409106227150 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 60 40 100 28.7562267111198 20.8291821925868 7.927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.132920363610693 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 93 81 174 44.5721514022357 42.1790939399883 2.39305746224742 T:C C T 10 0.52072955481467 0.761652271480532 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 41658566 C/T 1 93 88 181 44.5721514022357 45.824200823691 -1.25204942145527 T:C C T 10 0.52072955481467 0.8818416678694 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658401_41658655:TFEB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 37 52 89 17.7330064718572 27.0779368503628 -9.34493037850563 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0557056855918083 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 42 32 74 20.1293586977839 16.6633457540694 3.46601294371442 A:C A C 10 0.52072955481467 0.485412682824854 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 41903783 G/A 1 42 32 74 20.1293586977839 16.6633457540694 3.46601294371442 A:G G A 10 0.52072955481467 0.485412682824854 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 42044945 G/A 1 7 2 9 3.35489311629731 1.04145910962934 2.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 0.183068589600402 ENSG00000137413:ENST00000456846:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000494547:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000372982:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000530512:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000320973:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000372977:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000465926:exon_42044838_42044977:TAF8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 42185564 A/C 1 11 11 22 5.27197489703863 5.72802510296137 -0.45605020592274 A:C A C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000048544:ENST00000053468:exon_42185540_42185603:MRPS10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 42992808 T/C 1 23 10 33 11.0232202392626 5.2072955481467 5.81592469111589 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0541064916291489 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 42992825 C/G 1 20 10 30 9.5854089037066 5.2072955481467 4.3781133555599 C:G C G 10 0.52072955481467 0.142966838766859 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 42995211 A/G 1 73 96 169 34.9867424985291 49.9900372622083 -15.0032947636792 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0252779155254199 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42995098_42995215:RRP36 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 43008298 C/T 1 22 21 43 10.5439497940773 10.9353206511081 -0.391370857030809 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43008268_43008484:CUL7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 43020188 G/A 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43019947_43020534:CUL7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 43152573 A/G 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:G A G 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000112659:ENST00000252050:exon_43152040_43152643:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000515773:exon_43152040_43152643:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000451399:exon_43152040_43152643:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000354495:exon_43152040_43152643:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000372647:exon_43152040_43152643:CUL9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 43406501 C/T 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000124574:ENST00000372515:exon_43406362_43406533:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000372530:exon_43406362_43406533:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000244533:exon_43406362_43406533:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000463024:exon_43405672_43406533:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000469856:exon_43406449_43406533:ABCC10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 43490502 G/A 0 58 0 58 27.7976858207491 0 27.7976858207491 G G 10 0.52072955481467 5.56558680766561e-17 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43490069_43491743:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43490072_43491743:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43490075_43491743:XPO5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 43492578 G/A 1 50 56 106 23.9635222592665 29.1608550696215 -5.19733281035502 A:G G A 10 0.52072955481467 0.331770693482516 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 29 24 53 13.8988429103746 12.4975093155521 1.40133359482249 A:C A C 10 0.52072955481467 0.78377438123074 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 44115169 G/A 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 A:G G A 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000137216:ENST00000259746:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000323267:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000534326:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000456124:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371915:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371893:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000497371:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000525873:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000533121:exon_44115114_44115237:TMEM63B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 44219710 A/C 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 A:C A C 10 0.52072955481467 0.767073670700831 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 51 47 98 24.4427927044518 24.4742890762895 -0.0314963718376546 T:G G T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 56327951 G/A 1 21 5 26 10.0646793488919 2.60364777407335 7.46103157481858 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00303622206935900 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56327844_56327954:DST HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 8 0 8 3.83416356148264 0 3.83416356148264 G G 10 0.52072955481467 0.00819011697530837 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 70407465 A/T 1 10 10 20 4.7927044518533 5.2072955481467 -0.4145910962934 A:T A T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000168216:ENST00000370577:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000370570:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000472827:exon_70407455_70407533:LMBRD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 71289189 A/G 1 8 10 18 3.83416356148264 5.2072955481467 -1.37313198666406 A:G A G 10 0.52072955481467 0.638802194234348 ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71289117_71289269:C6orf57 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 71377711 C/T 1 6 8 14 2.87562267111198 4.16583643851736 -1.29021376740538 T:C C T 10 0.52072955481467 0.596274656681649 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000422334:exon_71377659_71377844:SMAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 21 12 33 10.0646793488919 6.24875465777604 3.81592469111589 T:C C T 10 0.52072955481467 0.223144570927670 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 79595097 A/G 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G A G 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000146243:ENST00000369940:exon_79595095_79595160:IRAK1BP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 79656562 A/T 1 7 1 8 3.35489311629731 0.52072955481467 2.83416356148264 A:T A T 10 0.52072955481467 0.0721941130810857 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 79657391 G/A 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79657340_79657492:PHIP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 A:G A G 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 83075914 G/A 0 8 0 8 3.83416356148264 0 3.83416356148264 G G 10 0.52072955481467 0.00819011697530837 ENSG00000146242:ENST00000369750:exon_83074340_83080545:TPBG HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 87969674 T/C 1 7 10 17 3.35489311629731 5.2072955481467 -1.85240243184939 T:C T C 10 0.52072955481467 0.468528473543755 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 89793894 G/C 1 33 38 71 15.8159246911159 19.7877230829575 -3.97179839184157 C:G G C 10 0.52072955481467 0.405891499989052 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 90039670 G/C 1 255 238 493 122.213963522259 123.933634045891 -1.7196705236323 C:G G C 10 0.52072955481467 0.89247736887476 ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90039279_90039676:UBE2J1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 90408742 C/T 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90408584_90408754:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90408584_90408754:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90408584_90408754:MDN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 91226208 G/A 1 15 11 26 7.18905667777995 5.72802510296137 1.46103157481858 A:G G A 10 0.52072955481467 0.695544738359801 ENSG00000135341:ENST00000369332:exon_91223292_91226400:MAP3K7;ENSG00000135341:ENST00000369329:exon_91223292_91226400:MAP3K7;ENSG00000135341:ENST00000369325:exon_91223292_91226400:MAP3K7;ENSG00000135341:ENST00000369327:exon_91223292_91226400:MAP3K7;ENSG00000135341:ENST00000479630:exon_91225353_91226400:MAP3K7;ENSG00000135341:ENST00000450832:exon_91225353_91226400:MAP3K7;ENSG00000135341:ENST00000369320:exon_91225402_91226400:MAP3K7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 96999725 C/T 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 T:C C T 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000014123:ENST00000369278:exon_96999714_96999799:KIAA0776 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 15 8 23 7.18905667777995 4.16583643851736 3.02322023926259 A:G A G 10 0.52072955481467 0.219045420855692 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 38 34 72 18.2122769170425 17.7048048636988 0.507472053343761 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 106547372 C/G 1 6 25 31 2.87562267111198 13.0182388703667 -10.1426161992548 C:G C G 10 0.52072955481467 0.000233800543034235 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000450060:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000481163:exon_106547175_106547584:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106547175_106547427:PRDM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 106555025 G/A 1 27 18 45 12.9403020200039 9.37313198666406 3.56717003333985 A:G G A 10 0.52072955481467 0.300497646391797 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106554786_106555383:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106554786_106557813:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106554786_106557814:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106554786_106556965:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106554786_106557814:PRDM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 107076783 A/T 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 A:T A T 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 107113715 G/A 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.347970315516692 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 108233929 G/A 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000025796:ENST00000369002:exon_108233920_108233978:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000423697:exon_108233920_108233978:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000429168:exon_108233920_108233978:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000484803:exon_108233920_108233978:SEC63 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 109766471 T/A 1 94 95 189 45.051421847421 49.4693077073936 -4.41788585997262 A:T T A 10 0.52072955481467 0.560418246582679 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000335266:exon_109766400_109766493:MICAL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 109773731 C/T 1 37 21 58 17.7330064718572 10.9353206511081 6.79768582074914 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0871251829060897 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109773714_109773818:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109773714_109773818:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109773714_109773818:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109773714_109773818:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000483856:exon_109773714_109773734:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109773714_109773818:MICAL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 11 9 20 5.27197489703863 4.68656599333203 0.5854089037066 A:G G A 10 0.52072955481467 0.826808206154088 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 119510941 C/A 1 20 19 39 9.5854089037066 9.89386154147873 -0.308452637772129 A:C C A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119510829_119511048:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119510829_119511048:MAN1A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 119669877 C/T 1 17 17 34 8.14759756815061 8.85240243184939 -0.704804863698779 T:C C T 10 0.52072955481467 0.864632483960446 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119669628_119670452:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119669628_119670452:MAN1A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 126210395 T/G 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 T:G T G 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000413085:exon_126210118_126211127:NCOA7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 126249914 T/G 1 9 9 18 4.31343400666797 4.68656599333203 -0.37313198666406 T:G T G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000368353:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000438495:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000444128:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000229634:exon_126249782_126252266:NCOA7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 130761798 T/C 1 7 4 11 3.35489311629731 2.08291821925868 1.27197489703863 T:C T C 10 0.52072955481467 0.552692319562948 ENSG00000164484:ENST00000296978:exon_130761552_130764208:TMEM200A;ENSG00000164484:ENST00000392429:exon_130761552_130764206:TMEM200A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 149 0 149 71.4112963326142 0 71.4112963326142 T T 10 0.52072955481467 6.29571174416598e-43 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 161 0 161 77.1625416748381 0 77.1625416748381 A A 10 0.52072955481467 2.4266243214194e-46 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 161 0 161 77.1625416748381 0 77.1625416748381 A A 10 0.52072955481467 2.4266243214194e-46 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 136597377 C/T 0 133 0 133 63.7429692096489 0 63.7429692096489 C C 10 0.52072955481467 2.38477533278561e-38 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 84 1 85 40.2587173955677 0.52072955481467 39.737987840753 A:G G A 10 0.52072955481467 6.77508432695432e-23 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 93 0 93 44.5721514022357 0 44.5721514022357 T T 10 0.52072955481467 4.61587846554708e-27 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 136977568 T/C 1 2 7 9 0.95854089037066 3.64510688370269 -2.68656599333203 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0972167926377697 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136977445_136977598:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136977445_136977598:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136977445_136977598:MAP3K5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 137026266 T/G 1 11 10 21 5.27197489703863 5.2072955481467 0.0646793488919304 T:G T G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137026248_137026271:MAP3K5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 137113137 G/A 1 8 6 14 3.83416356148264 3.12437732888802 0.70978623259462 A:G G A 10 0.52072955481467 0.793034760336182 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137112848_137113656:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137112848_137113656:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137112848_137113656:MAP3K5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 139695061 G/T 1 14 14 28 6.70978623259462 7.29021376740538 -0.580427534810759 T:G G T 10 0.52072955481467 0.852057573756229 ENSG00000164442:ENST00000367651:exon_139693393_139695089:CITED2;ENSG00000164442:ENST00000392312:exon_139694608_139695081:CITED2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 2 9 11 0.95854089037066 4.68656599333203 -3.72802510296137 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0323592930418307 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 143784092 A/G 1 7 13 20 3.35489311629731 6.76948421259071 -3.4145910962934 A:G A G 10 0.52072955481467 0.178195702938796 ENSG00000034693:ENST00000344281:exon_143784053_143784134:PEX3;ENSG00000034693:ENST00000367592:exon_143784053_143784134:PEX3;ENSG00000034693:ENST00000367591:exon_143784053_143784134:PEX3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 143816859 C/T 1 9 9 18 4.31343400666797 4.68656599333203 -0.37313198666406 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143815949_143816984:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143816614_143816984:FUCA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 149700491 G/A 1 20 16 36 9.5854089037066 8.33167287703472 1.25373602667188 A:G G A 10 0.52072955481467 0.740178283607933 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 149730846 G/A 1 14 19 33 6.70978623259462 9.89386154147873 -3.18407530888411 A:G G A 10 0.52072955481467 0.298443052627376 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149730713_149732748:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149730713_149732749:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149730713_149732652:TAB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 151336739 C/G 1 11 5 16 5.27197489703863 2.60364777407335 2.66832712296528 C:G C G 10 0.52072955481467 0.216398220878093 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336652_151336829:MTHFD1L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 152443761 C/T 1 7 14 21 3.35489311629731 7.29021376740538 -3.93532065110807 T:C C T 10 0.52072955481467 0.124425931676223 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000460912:exon_152443195_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152443528_152443811:SYNE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 152464839 A/G 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152464758_152468898:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152464758_152464900:SYNE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 152469188 C/G 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 C:G C G 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000472563:exon_152469018_152469513:SYNE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 152469331 C/T 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000472563:exon_152469018_152469513:SYNE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 155141313 C/T 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000213079:ENST00000367178:exon_155141311_155141467:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000367186:exon_155141311_155141467:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000417268:exon_155141311_155141467:RBM16 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 155574099 T/C 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 T:C T C 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000318981:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456144:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000367174:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000360366:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000529824:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528391:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456877:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000275246:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155574082_155574187:TIAM2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 157739931 T/C 1 7 12 19 3.35489311629731 6.24875465777604 -2.89386154147873 T:C T C 10 0.52072955481467 0.250829533252171 ENSG00000215712:ENST00000400788:exon_157739814_157739951:C6orf35;ENSG00000215712:ENST00000367144:exon_157739299_157739951:C6orf35 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 14 21 35 6.70978623259462 10.9353206511081 -4.22553441851345 A:G A G 10 0.52072955481467 0.176839633688286 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 51 66 117 24.4427927044518 34.3681506177682 -9.92535791331639 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0783170851473949 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 49 30 79 23.4842518140812 15.6218866444401 7.86236516964107 T:C:G C T 10 0.52072955481467 0.0907243168878658 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 160453978 A/G 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 A:G A G 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160453974_160454139:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160453974_160454139:IGF2R HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 160464289 G/A 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 A:G G A 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160464180_160464320:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160464180_160464320:IGF2R HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 160468278 A/G 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G A G 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160468191_160468368:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160468191_160468368:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000479434:exon_160468191_160468368:IGF2R HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 166580188 G/A 1 2 6 8 0.95854089037066 3.12437732888802 -2.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 0.164210754421108 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166580080_166580344:T HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 166721211 G/T 1 3 10 13 1.43781133555599 5.2072955481467 -3.76948421259071 T:G G T 10 0.52072955481467 0.0497304815614789 ENSG00000176381:ENST00000322583:exon_166719168_166721871:PRR18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 166721224 C/G 1 3 14 17 1.43781133555599 7.29021376740538 -5.85240243184939 C:G C G 10 0.52072955481467 0.00591487166080978 ENSG00000176381:ENST00000322583:exon_166719168_166721871:PRR18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 166736362 C/T 1 20 15 35 9.5854089037066 7.81094332222005 1.77446558148655 T:C C T 10 0.52072955481467 0.613641602768592 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 168349011 C/T 1 10 6 16 4.7927044518533 3.12437732888802 1.66832712296528 T:C C T 10 0.52072955481467 0.460768625180263 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000509296:exon_168348709_168349158:MLLT4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 170105719 C/T 1 7 14 21 3.35489311629731 7.29021376740538 -3.93532065110807 T:C C T 10 0.52072955481467 0.124425931676223 ENSG00000185127:ENST00000332290:exon_170102257_170106401:C6orf120;ENSG00000130024:ENST00000339209:exon_170105712_170105820:PHF10;ENSG00000130024:ENST00000366780:exon_170105712_170105820:PHF10;ENSG00000130024:ENST00000445358:exon_170105712_170105820:PHF10;ENSG00000130024:ENST00000252308:exon_170105712_170105820:PHF10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 134 92 226 64.2222396548342 47.9071190429496 16.3151206118846 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0329518722048427 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 T:C T C 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 1131356 T/C 1 11 13 24 5.27197489703863 6.76948421259071 -1.49750931555208 T:C T C 10 0.52072955481467 0.548584049171421 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 1533513 A/G 1 20 18 38 9.5854089037066 9.37313198666406 0.212276917042541 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1533390_1533547:INTS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 1542697 G/A 1 21 13 34 10.0646793488919 6.76948421259071 3.29519513630122 A:G G A 10 0.52072955481467 0.304385840178127 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 1542814 T/C 1 19 14 33 9.10613845852127 7.29021376740538 1.81592469111589 T:C T C 10 0.52072955481467 0.60279298858228 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 20 17 37 9.5854089037066 8.85240243184939 0.733006471857211 A:G G A 10 0.52072955481467 0.870166960031672 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 2297006 A/G 1 105 109 214 50.3233967444597 56.759521474799 -6.43612473033938 A:C:G A G 10 0.52072955481467 0.411710267539186 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2297000_2297149:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000480807:exon_2297000_2297253:SNX8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 2303986 T/C 1 43 48 91 20.6086291429692 24.9950186311042 -4.38638948813497 T:C T C 10 0.52072955481467 0.40150238414744 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2303933_2304093:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000479689:exon_2303933_2304093:SNX8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 2771106 G/C 1 45 38 83 21.5671700333398 19.7877230829575 1.77944695038239 C:G G C 10 0.52072955481467 0.742290927769851 ENSG00000146535:ENST00000275364:exon_2767746_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000407904:exon_2768195_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000491117:exon_2768195_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000407653:exon_2768200_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000496740:exon_2769458_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000396960:exon_2769458_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000471281:exon_2770657_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000485329:exon_2770985_2771384:GNA12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 30 33 63 14.3781133555599 17.1840753088841 -2.80596195332421 T:C T C 10 0.52072955481467 0.529118114388023 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 2976800 C/T 1 41 24 65 19.6500882525985 12.4975093155521 7.15257893704645 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0825611721819895 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2976671_2976868:CARD11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 5105208 C/T 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 T:C C T 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 5347749 G/A 1 31 24 55 14.8573838007452 12.4975093155521 2.35987448519315 A:G G A 10 0.52072955481467 0.590068677084358 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 5347914 G/A 1 23 14 37 11.0232202392626 7.29021376740538 3.73300647185721 A:G G A 10 0.52072955481467 0.251076482988679 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 5399044 C/G 1 28 33 61 13.4195724651892 17.1840753088841 -3.76450284369487 C:G C G 10 0.52072955481467 0.37059844851539 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5399029_5399200:TNRC18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 13 16 29 6.23051578740929 8.33167287703472 -2.10115708962543 C:G G C 10 0.52072955481467 0.462301755728773 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 5427950 G/A 1 11 13 24 5.27197489703863 6.76948421259071 -1.49750931555208 A:G G A 10 0.52072955481467 0.548584049171421 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 5540769 A/C 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:C A C 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000458142:exon_5540119_5541550:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 5567545 A/G 1 7 10 17 3.35489311629731 5.2072955481467 -1.85240243184939 A:G A G 10 0.52072955481467 0.468528473543755 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 5568366 A/G 1 32 32 64 15.3366542459306 16.6633457540694 -1.32669150813888 A:C:G A G 10 0.52072955481467 0.802800854618928 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 29 42 71 13.8988429103746 21.8706413022161 -7.97179839184157 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0740550424059392 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 5632828 C/T 1 533 1 534 255.451147283781 0.52072955481467 254.930417728966 T:C C T 10 0.52072955481467 2.60829217836011e-149 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5632454_5633399:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5632454_5633399:FSCN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 6026988 G/A 1 39 25 64 18.6915473622279 13.0182388703667 5.67330849186112 A:G G A 10 0.52072955481467 0.169766024246658 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 6036980 G/C 1 4 5 9 1.91708178074132 2.60364777407335 -0.68656599333203 C:G G C 10 0.52072955481467 0.745461033574925 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6036957_6037054:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6036957_6037054:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382321:exon_6036957_6037054:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6036957_6037054:PMS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 6063283 C/T 1 40 44 84 19.1708178074132 22.9121004118455 -3.74128260443228 T:C C T 10 0.52072955481467 0.4454412769933 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6062934_6063465:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6062934_6063326:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6062934_6063378:AIMP2;ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6061881_6064432:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000422786:exon_6062807_6063377:EIF2AK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 14 20 34 6.70978623259462 10.4145910962934 -3.70480486369878 T:C T C 10 0.52072955481467 0.231281092475669 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 6193464 T/G 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 T:G T G 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193387_6193513:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 6193521 G/C 1 10 7 17 4.7927044518533 3.64510688370269 1.14759756815061 C:G G C 10 0.52072955481467 0.634129017759885 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193518_6193612:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 6194274 T/C 1 8 18 26 3.83416356148264 9.37313198666406 -5.53896842518142 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0317712262234647 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 18 7 25 8.62686801333594 3.64510688370269 4.98176112963325 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0694547921866217 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 6370194 C/T 1 25 12 37 11.9817611296333 6.24875465777604 5.73300647185721 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0699276835355337 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 6370305 C/G 1 15 14 29 7.18905667777995 7.29021376740538 -0.101157089625429 C:G C G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 6370406 C/T 1 10 8 18 4.7927044518533 4.16583643851736 0.62686801333594 T:C C T 10 0.52072955481467 0.817378948970493 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 6621277 G/A 1 11 18 29 5.27197489703863 9.37313198666406 -4.10115708962543 A:G G A 10 0.52072955481467 0.139923168664175 ENSG00000136247:ENST00000405731:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396707:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396713:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000335965:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000493944:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396709:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000474097:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000483589:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396706:exon_6621238_6621311:ZDHHC4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 6647738 T/C 1 17 13 30 8.14759756815061 6.76948421259071 1.3781133555599 T:C T C 10 0.52072955481467 0.715813234813189 ENSG00000146576:ENST00000344417:exon_6647591_6648357:C7orf26;ENSG00000146576:ENST00000359073:exon_6647591_6648355:C7orf26 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 17379110 G/A 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000106546:ENST00000242057:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000463496:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000401808:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000492120:exon_17378610_17379151:AHR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 21469700 A/G 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:G A G 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000105866:ENST00000222584:exon_21468907_21470461:SP4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 23240263 G/A 1 12 16 28 5.75124534222396 8.33167287703472 -2.58042753481076 A:G G A 10 0.52072955481467 0.350079965528076 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23239787_23240628:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23239787_23240574:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23239787_23240625:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23239787_23240324:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23239787_23240586:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23239787_23240630:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000489145:exon_23239787_23240443:NUPL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 23357321 C/T 1 13 7 20 6.23051578740929 3.64510688370269 2.5854089037066 T:C C T 10 0.52072955481467 0.271400284316410 ENSG00000136231:ENST00000258729:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000421467:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000417854:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000435131:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000498363:exon_23357258_23357452:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000467592:exon_23357312_23357332:IGF2BP3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 24703298 G/A 1 6 9 15 2.87562267111198 4.68656599333203 -1.81094332222005 A:G G A 10 0.52072955481467 0.44117550699482 ENSG00000105926:ENST00000222644:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409761:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000396475:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000430180:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409253:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000472674:exon_24703093_24703340:MPP6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 24738802 A/T 1 31 65 96 14.8573838007452 33.8474210629536 -18.9900372622083 A:T A T 10 0.52072955481467 0.000130755553769415 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24737972_24738878:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24737974_24738878:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24737975_24738878:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24738000_24738878:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24738614_24738878:DFNA5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 24742436 T/C 1 44 100 144 21.0878995881545 52.072955481467 -30.9850558933125 T:C T C 10 0.52072955481467 2.42040760732565e-07 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 24756951 C/T 1 65 28 93 31.1525789370464 14.5804275348108 16.5721514022357 T:C C T 10 0.52072955481467 0.000562544432823349 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000446822:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24756088_24756993:DFNA5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 24758753 C/T 1 45 26 71 21.5671700333398 13.5389684251814 8.02820160815843 T:C C T 10 0.52072955481467 0.058148046050488 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 24758818 G/T 1 52 32 84 24.9220631496372 16.6633457540694 8.25871739556772 T:G G T 10 0.52072955481467 0.0803944467787645 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 24854765 G/A 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000070882:ENST00000313367:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000353930:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000352860:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409863:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396431:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409452:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409759:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409555:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396429:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409069:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000486214:exon_24854732_24854822:OSBPL3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 26411468 A/G 1 10 8 18 4.7927044518533 4.16583643851736 0.62686801333594 A:G A G 10 0.52072955481467 0.817378948970493 ENSG00000086300:ENST00000416246:exon_26411441_26411642:SNX10;ENSG00000086300:ENST00000338523:exon_26411441_26411653:SNX10;ENSG00000086300:ENST00000396376:exon_26411441_26411653:SNX10;ENSG00000086300:ENST00000409367:exon_26411441_26411653:SNX10;ENSG00000086300:ENST00000446848:exon_26411441_26411653:SNX10;ENSG00000086300:ENST00000409838:exon_26411441_26411653:SNX10;ENSG00000086300:ENST00000462993:exon_26411441_26411653:SNX10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 30634661 C/G 1 65 81 146 31.1525789370464 42.1790939399883 -11.0265150029418 C:G C G 10 0.52072955481467 0.0689019434967904 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 32529936 G/C 1 16 12 28 7.66832712296528 6.24875465777604 1.41957246518924 C:G G C 10 0.52072955481467 0.706167957724672 ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 32598630 T/A 1 5 5 10 2.39635222592665 2.60364777407335 -0.2072955481467 A:T T A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 32598656 C/T 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 T:C C T 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 32623477 C/G 1 10 7 17 4.7927044518533 3.64510688370269 1.14759756815061 C:G C G 10 0.52072955481467 0.634129017759885 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32623404_32628333:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32623404_32625778:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32623404_32623519:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32623404_32628323:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000470500:exon_32623404_32623779:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000467779:exon_32623404_32623818:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000497020:exon_32623404_32623714:AVL9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 32909182 G/A 1 13 9 22 6.23051578740929 4.68656599333203 1.54394979407726 A:G G A 10 0.52072955481467 0.53135812068658 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 36438709 C/G 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 C:G C G 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36438688_36439002:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36438688_36439002:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000424865:exon_36438688_36439002:ANLN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 39745855 A/G 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000006451:ENST00000005257:exon_39745722_39747723:RALA;ENSG00000006451:ENST00000468201:exon_39745722_39745990:RALA;ENSG00000006451:ENST00000434466:exon_39745722_39745907:RALA;ENSG00000006451:ENST00000466491:exon_39745722_39745901:RALA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 134 122 256 64.2222396548342 63.5290056873897 0.693233967444485 A:G G A 10 0.52072955481467 0.950179638784345 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 44005528 C/T 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 T:C C T 10 0.52072955481467 1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 44099664 T/C 1 137 148 285 65.6600509903902 77.0679741125712 -11.4079231221809 T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.192064731806819 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 44112873 G/T 1 22 18 40 10.5439497940773 9.37313198666406 1.1708178074132 T:G G T 10 0.52072955481467 0.753527828648834 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 44800176 G/T 1 67 59 126 32.1111198274171 30.7230437340655 1.38807609335159 T:G G T 10 0.52072955481467 0.85859476367783 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 44836314 A/G 1 19 17 36 9.10613845852127 8.85240243184939 0.253736026671881 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 15 2 17 7.18905667777995 1.04145910962934 6.14759756815061 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00267539635258004 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 48004962 C/T 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 T:C C T 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48003783_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48002885_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48004897_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48004763_48005035:HUS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 56125757 A/G 1 75 70 145 35.9452833888998 36.4510688370269 -0.505785448127142 A:G A G 10 0.52072955481467 0.933999732298373 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56125686_56125796:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56125686_56125796:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56125686_56125796:CCT6A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 56136194 C/T 1 27 12 39 12.9403020200039 6.24875465777604 6.69154736222787 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0367116686289722 ENSG00000129103:ENST00000395436:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000418349:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000434526:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395437:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000275607:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395435:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000420966:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413952:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000342190:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000436782:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000442826:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000437307:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413756:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000483327:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000423763:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000498777:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000438133:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000447501:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000451338:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000529457:exon_56136175_56136331:SUMF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 56174115 A/C 1 275 218 493 131.799372425966 113.519042949598 18.2803294763677 A:C:G A C 10 0.52072955481467 0.104615356687549 ENSG00000106153:ENST00000395422:exon_56174057_56174269:CHCHD2;ENSG00000106153:ENST00000473095:exon_56174057_56174124:CHCHD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 56174140 G/T 1 94 79 173 45.051421847421 41.1376348303589 3.9137870170621 T:G G T 10 0.52072955481467 0.594444715349618 ENSG00000106153:ENST00000395422:exon_56174057_56174269:CHCHD2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 64452738 G/A 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:G G A 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000213462:ENST00000394323:exon_64451187_64453792:ERV3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 64863392 C/T 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 T:C C T 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 6 4 10 2.87562267111198 2.08291821925868 0.7927044518533 A:G A G 10 0.52072955481467 0.756013992488881 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 65425894 A/G 1 40 60 100 19.1708178074132 31.2437732888802 -12.072955481467 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0163022542737161 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65425671_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65425688_65426050:GUSB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 65429359 G/A 1 30 22 52 14.3781133555599 11.4560502059227 2.92206314963716 A:G G A 10 0.52072955481467 0.488227755711358 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000461622:exon_65429133_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000462371:exon_65429317_65429445:GUSB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 65439879 G/C 1 7 2 9 3.35489311629731 1.04145910962934 2.31343400666797 C:G G C 10 0.52072955481467 0.183068589600402 ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65439282_65441147:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000489482:exon_65439513_65439993:GUSB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 65842221 A/G 1 7 6 13 3.35489311629731 3.12437732888802 0.23051578740929 A:G A G 10 0.52072955481467 1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 65842545 T/C 1 9 8 17 4.31343400666797 4.16583643851736 0.14759756815061 T:C T C 10 0.52072955481467 1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 66774604 G/C 1 3 14 17 1.43781133555599 7.29021376740538 -5.85240243184939 C:G G C 10 0.52072955481467 0.00591487166080978 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 72300332 G/A 1 13 6 19 6.23051578740929 3.12437732888802 3.10613845852127 A:G G A 10 0.52072955481467 0.173990747242703 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 28 23 51 13.4195724651892 11.9767797607374 1.44279270445183 T:C C T 10 0.52072955481467 0.779631084926117 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 73097238 G/A 1 34 30 64 16.2951951363012 15.6218866444401 0.673308491861121 A:G G A 10 0.52072955481467 0.900936640840065 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 73097720 G/C 1 11 22 33 5.27197489703863 11.4560502059227 -6.18407530888411 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0361460942384450 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 73535599 G/A 1 85 73 158 40.737987840753 38.0132575014709 2.72473033928214 A:G G A 10 0.52072955481467 0.690993893630906 ENSG00000106683:ENST00000418310:exon_73535469_73536855:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000336180:exon_73535469_73536855:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000435201:exon_73535469_73535631:LIMK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 73753250 T/C 1 31 21 52 14.8573838007452 10.9353206511081 3.92206314963716 T:C T C 10 0.52072955481467 0.331484873471674 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 76609944 T/C 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 T:C T C 10 0.52072955481467 0.347970315516692 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 76828953 C/T 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000127951:ENST00000248598:exon_76828498_76829143:FGL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 77256407 A/G 1 17 16 33 8.14759756815061 8.33167287703472 -0.184075308884109 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 86800351 A/G 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 A:G A G 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000135164:ENST00000331242:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000413276:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000447863:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000414194:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000394702:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000411766:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000425406:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000420131:exon_86800311_86800373:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000449088:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000430405:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000432937:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000394703:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000434534:exon_86800311_86800367:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000412139:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000425705:exon_86800311_86800405:DMTF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 87835811 T/C 1 15 20 35 7.18905667777995 10.4145910962934 -3.22553441851345 T:C T C 10 0.52072955481467 0.311944692649197 ENSG00000075142:ENST00000265729:exon_87834433_87835819:SRI;ENSG00000075142:ENST00000419179:exon_87834973_87835819:SRI;ENSG00000075142:ENST00000472930:exon_87835601_87835819:SRI;ENSG00000075142:ENST00000490437:exon_87835753_87835819:SRI;ENSG00000075142:ENST00000394641:exon_87835771_87835819:SRI HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 92166194 G/A 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000127993:ENST00000265732:exon_92166165_92166848:C7orf64;ENSG00000127993:ENST00000481551:exon_92163716_92167319:C7orf64 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 92762681 A/G 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 92764982 C/T 1 10 6 16 4.7927044518533 3.12437732888802 1.66832712296528 T:C C T 10 0.52072955481467 0.460768625180263 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 94292993 C/G 1 1 28 29 0.47927044518533 14.5804275348108 -14.1011570896254 C:G C G 10 0.52072955481467 2.37852478882516e-08 ENSG00000242265:ENST00000482108:exon_94292646_94299007:PEG10;ENSG00000242265:ENST00000488574:exon_94292646_94295010:PEG10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 97488569 A/T 1 32 40 72 15.3366542459306 20.8291821925868 -5.49252794665624 A:T A T 10 0.52072955481467 0.197197535100760 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000442734:exon_97488554_97488710:ASNS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 97863145 G/A 1 9 5 14 4.31343400666797 2.60364777407335 1.70978623259462 A:G G A 10 0.52072955481467 0.429598343746981 ENSG00000205356:ENST00000447648:exon_97862733_97863223:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000490842:exon_97862139_97863154:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000379795:exon_97862733_97863223:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000471397:exon_97862739_97863223:TECPR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 97873994 G/A 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 A:G G A 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000205356:ENST00000447648:exon_97873883_97874005:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000379795:exon_97873883_97874005:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000472845:exon_97873883_97874005:TECPR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 24 22 46 11.5024906844479 11.4560502059227 0.0464404785251809 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 98552879 C/T 1 6 10 16 2.87562267111198 5.2072955481467 -2.33167287703472 T:C C T 10 0.52072955481467 0.318493089377623 ENSG00000196367:ENST00000359863:exon_98552721_98552927:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000355540:exon_98552721_98552927:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000446306:exon_98552721_98552927:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000456197:exon_98552721_98552927:TRRAP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 98650051 G/C 1 4 10 14 1.91708178074132 5.2072955481467 -3.29021376740538 C:G G C 10 0.52072955481467 0.107382582617767 ENSG00000198742:ENST00000361368:exon_98649828_98650069:SMURF1;ENSG00000198742:ENST00000361125:exon_98649828_98650069:SMURF1;ENSG00000198742:ENST00000394240:exon_98649828_98650069:SMURF1;ENSG00000198742:ENST00000480055:exon_98649835_98650069:SMURF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 98984341 A/G 1 152 176 328 72.8491076681702 91.6484016473819 -18.7992939792118 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0407702875833444 ENSG00000241685:ENST00000441989:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000432884:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000508211:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000130429:ENST00000443222:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000414376:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000252725:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484600:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000455009:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484375:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000418347:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000417330:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000431816:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000427217:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000458033:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451682:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451694:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000474880:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000445924:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000432343:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000493403:exon_98984308_98984412:ARPC1B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 99500899 T/C 1 16 7 23 7.66832712296528 3.64510688370269 4.02322023926259 T:C T C 10 0.52072955481467 0.099569417326673 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 99500911 A/G 1 16 7 23 7.66832712296528 3.64510688370269 4.02322023926259 A:G A G 10 0.52072955481467 0.099569417326673 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 99654600 A/G 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 99654689 G/A 1 9 6 15 4.31343400666797 3.12437732888802 1.18905667777995 A:G G A 10 0.52072955481467 0.611940175630342 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99654630_99654872:ZSCAN21 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 99669802 A/G 1 9 10 19 4.31343400666797 5.2072955481467 -0.89386154147873 A:G A G 10 0.52072955481467 0.819317260655474 ENSG00000166526:ENST00000303915:exon_99669105_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000424697:exon_99667597_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000299667:exon_99667611_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000487620:exon_99667800_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000412947:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000428683:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000449785:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000441298:exon_99669703_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000415068:exon_99669794_99669835:ZNF3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 99691740 G/A 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 A:G G A 10 0.52072955481467 1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 130 125 255 62.3051578740929 65.0911943518337 -2.78603647774085 A:G G A 10 0.52072955481467 0.754130917660177 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 16 13 29 7.66832712296528 6.76948421259071 0.898842910374571 A:T A T 10 0.52072955481467 0.853126532704154 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 20 12 32 9.5854089037066 6.24875465777604 3.33665424593056 A:G A G 10 0.52072955481467 0.289248223803459 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 53 34 87 25.4013335948225 17.7048048636988 7.69652873112371 A:G G A 10 0.52072955481467 0.107719881863956 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 99926612 C/T 1 23 24 47 11.0232202392626 12.4975093155521 -1.47428907628949 T:C C T 10 0.52072955481467 0.770672818089637 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 100285476 C/T 1 18 16 34 8.62686801333594 8.33167287703472 0.295195136301221 T:C:G C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100285411_100285506:GIGYF1;ENSG00000146830:ENST00000471340:exon_100285411_100285506:GIGYF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 100861452 T/C 1 5 4 9 2.39635222592665 2.08291821925868 0.31343400666797 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100860949_100861498:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000461205:exon_100861447_100861498:ZNHIT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 100875772 T/G 1 21 14 35 10.0646793488919 7.29021376740538 2.77446558148655 T:G T G 10 0.52072955481467 0.399537055090493 ENSG00000106404:ENST00000308344:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000401528:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000305064:exon_100875374_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000433833:exon_100875686_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000414035:exon_100875769_100875796:CLDN15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 101916647 A/G 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 A:G A G 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101916637_101916764:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101916637_101916764:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101916637_101916764:CUX1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 101917521 G/A 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101917445_101917581:CUX1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 102760511 A/C 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 A:C A C 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000161048:ENST00000455523:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000341533:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000417955:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000422589:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000465647:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000427257:exon_102760024_102760670:NAPEPLD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 102949484 G/A 1 37 42 79 17.7330064718572 21.8706413022161 -4.13763483035893 A:G G A 10 0.52072955481467 0.369227823984727 ENSG00000105819:ENST00000249269:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000428154:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000420236:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000456433:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000443722:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000444457:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000498530:exon_102949399_102949706:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000453466:exon_102949399_102949542:PMPCB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 106513011 C/T 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000105851:ENST00000440650:exon_106512982_106513047:PIK3CG;ENSG00000105851:ENST00000496166:exon_106512982_106513047:PIK3CG;ENSG00000105851:ENST00000473541:exon_106512982_106513047:PIK3CG;ENSG00000105851:ENST00000359195:exon_106512982_106513047:PIK3CG HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 107002806 A/G 1 6 6 12 2.87562267111198 3.12437732888802 -0.24875465777604 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000164597:ENST00000347053:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000297135:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000393603:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000484237:exon_107002753_107002865:COG5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 13 9 22 6.23051578740929 4.68656599333203 1.54394979407726 A:G G A 10 0.52072955481467 0.53135812068658 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 117824239 G/C 1 12 13 25 5.75124534222396 6.76948421259071 -1.01823887036675 C:G G C 10 0.52072955481467 0.694646743266974 ENSG00000128534:ENST00000249299:exon_117824086_117824308:NAA38;ENSG00000128534:ENST00000424702:exon_117824198_117824308:NAA38;ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38;ENSG00000128534:ENST00000411938:exon_117824221_117824334:NAA38 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 128034629 C/T 1 44 24 68 21.0878995881545 12.4975093155521 8.59039027260244 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0392255184144918 ENSG00000106348:ENST00000469328:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000484496:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000419067:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000338791:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000496200:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000354269:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000348127:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000378717:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000416064:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000343214:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000470772:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000480861:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000460045:exon_128034510_128035052:IMPDH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 128108916 T/C 1 1 7 8 0.47927044518533 3.64510688370269 -3.16583643851736 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0323874083396119 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 128388648 G/A 1 13 16 29 6.23051578740929 8.33167287703472 -2.10115708962543 A:G G A 10 0.52072955481467 0.462301755728773 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128388627_128388858:CALU HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 129297332 T/G 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 T:G T G 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000106459:ENST00000353868:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393232:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393231:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000454688:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000223190:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000311967:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393230:exon_129297183_129297414:NRF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 135291624 T/C 1 19 17 36 9.10613845852127 8.85240243184939 0.253736026671881 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135291499_135291663:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000472132:exon_135291499_135291663:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000463247:exon_135291619_135291663:NUP205 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 138761034 G/C 1 13 9 22 6.23051578740929 4.68656599333203 1.54394979407726 C:G G C 10 0.52072955481467 0.53135812068658 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000460845:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 138764233 C/T 1 9 11 20 4.31343400666797 5.72802510296137 -1.4145910962934 T:C C T 10 0.52072955481467 0.655741219933051 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 139026152 T/G 1 17 11 28 8.14759756815061 5.72802510296137 2.41957246518924 T:C:G T G 10 0.52072955481467 0.450243949257095 ENSG00000164898:ENST00000297534:exon_139025878_139026268:C7orf55 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 139102490 A/G 1 9 6 15 4.31343400666797 3.12437732888802 1.18905667777995 A:G A G 10 0.52072955481467 0.611940175630342 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 139415943 G/A 1 18 31 49 8.62686801333594 16.1426161992548 -7.51574818591883 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0326528391637093 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 11 8 19 5.27197489703863 4.16583643851736 1.10613845852127 A:G G A 10 0.52072955481467 0.653020003043937 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 9 14 23 4.31343400666797 7.29021376740538 -2.97677976073741 T:C C T 10 0.52072955481467 0.296663371072281 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 7 6 13 3.35489311629731 3.12437732888802 0.23051578740929 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 0 0 316 316 0 164.550539321436 -164.550539321436 A G A 10 0.52072955481467 1.15740386069563e-101 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 297 140 437 142.343322220043 72.9021376740538 69.4411845459892 T:C T C 10 0.52072955481467 1.94806577079341e-11 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 142988726 G/A 1 2 8 10 0.95854089037066 4.16583643851736 -3.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0565144613350746 ENSG00000106144:ENST00000310447:exon_142988633_142988783:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000392923:exon_142988633_142988783:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000392925:exon_142988633_142988783:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000350623:exon_142988633_142988783:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000493642:exon_142988633_142988783:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000481483:exon_142988711_142988783:CASP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 142991361 G/C 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 C:G G C 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000106144:ENST00000310447:exon_142991323_142991417:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000392923:exon_142991323_142991417:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000493642:exon_142991323_142991417:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000481483:exon_142991323_142991574:CASP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 148851213 G/A 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000197024:ENST00000420008:exon_148851058_148851432:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000426851:exon_148851037_148851432:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000485111:exon_148851037_148851432:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000475153:exon_148851037_148851432:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000483892:exon_148851037_148851409:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000491174:exon_148851037_148851432:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000335901:exon_148851037_148851432:ZNF398 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 149559273 C/T 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 T:C C T 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000106479:ENST00000223210:exon_149557472_149559583:ZNF862 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 150325175 C/T 1 30 31 61 14.3781133555599 16.1426161992548 -1.76450284369487 T:C C T 10 0.52072955481467 0.701419533851801 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 150417677 G/A 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 A:G G A 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 150761314 G/A 1 15 17 32 7.18905667777995 8.85240243184939 -1.66334575406944 A:G G A 10 0.52072955481467 0.598565100829255 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000488420:exon_150761289_150761448:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761289_150761454:SLC4A2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 150761680 C/A 1 22 13 35 10.5439497940773 6.76948421259071 3.77446558148655 A:C C A 10 0.52072955481467 0.237402047115918 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761613_150761831:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761613_150761778:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761613_150761847:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761613_150761854:SLC4A2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 18 18 36 8.62686801333594 9.37313198666406 -0.746263973328119 A:G G A 10 0.52072955481467 0.8682121543722 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 150773165 C/T 1 39 22 61 18.6915473622279 11.4560502059227 7.23549715630513 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0725827588859369 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000469467:exon_150773070_150773273:SLC4A2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 150774308 G/A 1 52 48 100 24.9220631496372 24.9950186311042 -0.0729554814669982 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150774245_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150774000_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150774000_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150774188_150774488:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150774000_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150774000_150775179:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000459800:exon_150774188_150774599:FASTK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 61 60 121 29.2354971563051 31.2437732888802 -2.00827613257507 A:G G A 10 0.52072955481467 0.717053798694798 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 55 74 129 26.3598744851932 38.5339870562856 -12.1741125710924 C:G C G 10 0.52072955481467 0.0343481727569088 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 38 43 81 18.2122769170425 22.3913708570308 -4.17909393998827 C:G C G 10 0.52072955481467 0.374857152770136 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 151853090 G/A 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 A:G G A 10 0.52072955481467 0.806303597637586 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151852995_151853142:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151852995_151853142:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151852995_151853142:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000424877:exon_151852995_151853142:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151852995_151853142:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000418061:exon_151852995_151853142:MLL3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 9 5 14 4.31343400666797 2.60364777407335 1.70978623259462 C:G G C 10 0.52072955481467 0.429598343746981 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 12 5 17 5.75124534222396 2.60364777407335 3.14759756815061 A:G G A 10 0.52072955481467 0.149297422970946 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 16 13 29 7.66832712296528 6.76948421259071 0.898842910374571 T:C T C 10 0.52072955481467 0.853126532704154 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 158526880 G/A 1 32 16 48 15.3366542459306 8.33167287703472 7.00498136889584 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0440898222307596 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158523686_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158526140_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158526302_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158526304_158526943:ESYT2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 8 13 21 3.83416356148264 6.76948421259071 -2.93532065110807 A:G A G 10 0.52072955481467 0.274671777521875 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 1728557 C/G 1 3 5 8 1.43781133555599 2.60364777407335 -1.16583643851736 C:G C G 10 0.52072955481467 0.492394667760678 ENSG00000182372:ENST00000331222:exon_1728416_1734738:CLN8;ENSG00000182372:ENST00000519254:exon_1728416_1728938:CLN8;ENSG00000182372:ENST00000523237:exon_1728416_1728932:CLN8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 6302686 C/T 1 15 15 30 7.18905667777995 7.81094332222005 -0.621886644440099 T:C C T 10 0.52072955481467 0.856597458926775 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 9414049 G/A 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000173273:ENST00000520408:exon_9413424_9414122:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000310430:exon_9413424_9414122:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000522110:exon_9413442_9416341:TNKS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 10285810 T/C 1 10 3 13 4.7927044518533 1.56218866444401 3.23051578740929 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0958867035011751 ENSG00000175806:ENST00000317173:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000527408:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000441698:exon_10285658_10285875:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000528246:exon_10285658_10286395:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000425987:exon_10285658_10286399:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000382490:exon_10285658_10286399:MSRA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 10623240 T/C 1 45 52 97 21.5671700333398 27.0779368503628 -5.51076681702299 T:C T C 10 0.52072955481467 0.265773485148280 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 10623254 C/A 1 47 35 82 22.5257109237105 18.2255344185134 4.30017650519707 A:C C A 10 0.52072955481467 0.377230310583933 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 11667179 C/T 1 211 181 392 101.126063934105 94.2520494214553 6.87401451264937 T:C C T 10 0.52072955481467 0.511170631076234 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531733:exon_11667176_11667485:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531249:exon_11667176_11667448:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11666765_11667359:FDFT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 17067520 A/G 1 7 4 11 3.35489311629731 2.08291821925868 1.27197489703863 A:G A G 10 0.52072955481467 0.552692319562948 ENSG00000104219:ENST00000262096:exon_17067441_17067567:ZDHHC2;ENSG00000104219:ENST00000517334:exon_17067441_17067694:ZDHHC2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 10 5 15 4.7927044518533 2.60364777407335 2.18905667777995 T:C C T 10 0.52072955481467 0.308037122491406 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 17796382 A/G 1 22 28 50 10.5439497940773 14.5804275348108 -4.0364777407335 A:G A G 10 0.52072955481467 0.261150545214535 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 17796383 C/T 1 21 29 50 10.0646793488919 15.1011570896254 -5.0364777407335 T:C C T 10 0.52072955481467 0.15972357889411 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 17814915 A/G 1 17 20 37 8.14759756815061 10.4145910962934 -2.26699352814279 A:G A G 10 0.52072955481467 0.512047217834505 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17814773_17814930:PCM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 30 12 42 14.3781133555599 6.24875465777604 8.12935869778386 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0130546805763461 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 32 11 43 15.3366542459306 5.72802510296137 9.60862914296919 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00342598046469695 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 19677915 G/A 1 7 9 16 3.35489311629731 4.68656599333203 -1.33167287703472 A:G G A 10 0.52072955481467 0.61923512047445 ENSG00000104613:ENST00000397977:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000522114:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000523869:exon_19677890_19678029:INTS10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 21837672 T/C 1 7 6 13 3.35489311629731 3.12437732888802 0.23051578740929 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21837595_21837714:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21837595_21837714:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21837595_21837714:XPO7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 22106638 C/T 1 13 21 34 6.23051578740929 10.9353206511081 -4.70480486369878 T:C C T 10 0.52072955481467 0.122995810594521 ENSG00000168495:ENST00000306433:exon_22106557_22106822:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000397802:exon_22106557_22106822:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000517789:exon_22106557_22106822:POLR3D HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 22442661 A/G 1 4 7 11 1.91708178074132 3.64510688370269 -1.72802510296137 A:G A G 10 0.52072955481467 0.371924081118385 ENSG00000120913:ENST00000456545:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000308354:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000397760:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000339162:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000381194:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000452226:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000397761:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000436754:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000426493:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000429812:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000409141:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000265810:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000409417:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000416159:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000448520:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000491330:exon_22442530_22442675:PDLIM2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 24 36 60 11.5024906844479 18.7462639733281 -7.2437732888802 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0701924061300322 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 23104195 G/T 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 T:G G T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000147457:ENST00000397677:exon_23103769_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000313219:exon_23103604_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519414:exon_23104150_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000517325:exon_23104155_23104337:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000442460:exon_23104157_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519984:exon_23104172_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519529:exon_23104172_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519503:exon_23104179_23104507:CHMP7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 23291835 T/C 1 6 11 17 2.87562267111198 5.72802510296137 -2.85240243184939 T:C T C 10 0.52072955481467 0.224918141362531 ENSG00000197217:ENST00000518471:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000521321:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522255:exon_23291830_23292251:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23291606_23291991:ENTPD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 23294761 T/C 1 13 18 31 6.23051578740929 9.37313198666406 -3.14261619925477 T:C T C 10 0.52072955481467 0.284278075165481 ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000520936:exon_23294547_23294771:ENTPD4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 23429329 T/C 1 10 13 23 4.7927044518533 6.76948421259071 -1.97677976073741 T:C T C 10 0.52072955481467 0.532250778549921 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 25364331 G/A 1 10 10 20 4.7927044518533 5.2072955481467 -0.4145910962934 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 26240646 A/G 1 15 25 40 7.18905667777995 13.0182388703667 -5.8291821925868 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0808719055034555 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 4 10 14 1.91708178074132 5.2072955481467 -3.29021376740538 C:G C G 10 0.52072955481467 0.107382582617767 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 24 38 62 11.5024906844479 19.7877230829575 -8.28523239850954 T:C:G G C 10 0.52072955481467 0.041431501423773 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 28384712 A/G 1 5 9 14 2.39635222592665 4.68656599333203 -2.29021376740538 A:G A G 10 0.52072955481467 0.287077835461110 ENSG00000104290:ENST00000240093:exon_28384664_28385681:FZD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 29005093 A/G 1 3 7 10 1.43781133555599 3.64510688370269 -2.2072955481467 A:G A G 10 0.52072955481467 0.210816219015888 ENSG00000197892:ENST00000524189:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000357808:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000355514:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000404075:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000522355:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000521515:exon_29004909_29005119:KIF13B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 33246538 A/G 1 4 4 8 1.91708178074132 2.08291821925868 -0.16583643851736 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 33246591 G/C 1 10 7 17 4.7927044518533 3.64510688370269 1.14759756815061 C:G G C 10 0.52072955481467 0.634129017759885 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 33246685 G/A 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 A:G G A 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 32 23 55 15.3366542459306 11.9767797607374 3.35987448519315 A:G A G 10 0.52072955481467 0.418760646948822 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 37730368 G/A 1 5 7 12 2.39635222592665 3.64510688370269 -1.24875465777604 A:G G A 10 0.52072955481467 0.56880209104754 ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37728796_37730697:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37728796_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 37963239 C/T 1 26 9 35 12.4610315748186 4.68656599333203 7.77446558148655 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0102729985633038 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37962760_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37963011_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517719:exon_37963018_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37963068_37963256:ASH2L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 37985897 A/G 1 18 10 28 8.62686801333594 5.2072955481467 3.41957246518924 A:G A G 10 0.52072955481467 0.256362319911248 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000428278:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000521652:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000524247:exon_37985858_37985976:ASH2L HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 48701786 A/T 1 25 24 49 11.9817611296333 12.4975093155521 -0.515748185918829 A:T A T 10 0.52072955481467 0.887471056433241 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48701712_48701799:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48701712_48701799:AC103686.1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 12 16 28 5.75124534222396 8.33167287703472 -2.58042753481076 T:C T C 10 0.52072955481467 0.350079965528076 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 67341481 C/T 1 44 46 90 21.0878995881545 23.9535595214748 -2.8656599333203 T:C C T 10 0.52072955481467 0.598202186616604 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 67341938 G/T 1 24 37 61 11.5024906844479 19.2669935281428 -7.76450284369487 T:G G T 10 0.52072955481467 0.0541409230355113 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 74893452 A/G 1 21 19 40 10.0646793488919 9.89386154147873 0.170817807413201 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74893390_74893601:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000519551:exon_74893390_74893716:TMEM70 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 22 20 42 10.5439497940773 10.4145910962934 0.129358697783861 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 8 12 20 3.83416356148264 6.24875465777604 -2.4145910962934 C:G C G 10 0.52072955481467 0.371430851394435 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 90770315 C/T 1 28 29 57 13.4195724651892 15.1011570896254 -1.68158462443619 T:C C T 10 0.52072955481467 0.692125714753518 ENSG00000104312:ENST00000220751:exon_90769975_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000522965:exon_90770034_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000517696:exon_90770045_90770461:RIPK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 4 16 20 1.91708178074132 8.33167287703472 -6.4145910962934 T:C T C 10 0.52072955481467 0.00575736211969442 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 7 12 19 3.35489311629731 6.24875465777604 -2.89386154147873 C:G C G 10 0.52072955481467 0.250829533252171 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 90995019 C/T 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 T:C C T 10 0.52072955481467 0.806303597637586 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000519426:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000523444:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517337:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000494804:exon_90994632_90995083:NBN HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 94746698 G/T 1 9 10 19 4.31343400666797 5.2072955481467 -0.89386154147873 T:G G T 10 0.52072955481467 0.819317260655474 ENSG00000183808:ENST00000399300:exon_94741584_94748666:RBM12B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 95518762 C/T 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 T:C C T 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95518728_95518945:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95518728_95518945:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95518728_95518945:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000521080:exon_95518728_95518945:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95518728_95518945:KIAA1429 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 98289714 G/C 1 2 12 14 0.95854089037066 6.24875465777604 -5.29021376740538 C:G G C 10 0.52072955481467 0.00566799789247379 ENSG00000180543:ENST00000322128:exon_98285717_98290176:TSPYL5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 103663912 T/G 1 57 51 108 27.3184153755638 26.5572072955482 0.761208080015642 T:G T G 10 0.52072955481467 0.923429798530036 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103663377_103664289:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103663377_103664289:KLF10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 103851052 T/C 1 21 34 55 10.0646793488919 17.7048048636988 -7.64012551480685 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0429787439279802 ENSG00000155096:ENST00000337198:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000347770:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000521536:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000522311:exon_103850972_103851144:AZIN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 110301998 T/C 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 81 112 193 38.8209060600117 58.321710139243 -19.5008040792313 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00604319370311712 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 123966085 G/A 1 14 9 23 6.70978623259462 4.68656599333203 2.02322023926259 A:G G A 10 0.52072955481467 0.414185612013738 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 123966159 G/C 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 C:G G C 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 124027628 T/C 1 65 53 118 31.1525789370464 27.5986664051775 3.55391253186894 T:C T C 10 0.52072955481467 0.52064840167142 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 A:T T A 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 T:C C T 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 125463250 T/C 1 6 8 14 2.87562267111198 4.16583643851736 -1.29021376740538 T:C T C 10 0.52072955481467 0.596274656681649 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 125463435 C/G 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 C:G C G 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 125498547 C/T 1 12 15 27 5.75124534222396 7.81094332222005 -2.05969797999609 T:C C T 10 0.52072955481467 0.447615619311931 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 125499363 G/A 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 A:G G A 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 125528135 G/A 1 10 14 24 4.7927044518533 7.29021376740538 -2.49750931555208 A:G G A 10 0.52072955481467 0.316530133475197 ENSG00000147687:ENST00000276692:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523214:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519548:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522810:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000517678:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519776:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521546:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521973:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520321:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522310:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519232:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520938:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523888:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523152:exon_125528128_125528271:TATDN1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 131124559 T/C 1 14 19 33 6.70978623259462 9.89386154147873 -3.18407530888411 T:C T C 10 0.52072955481467 0.298443052627376 ENSG00000153317:ENST00000524124:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000357668:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000521075:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000518721:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000343135:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000519483:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000520189:exon_131124340_131124660:ASAP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 132982824 A/G 1 12 14 26 5.75124534222396 7.29021376740538 -1.53896842518142 A:G A G 10 0.52072955481467 0.562641904116243 ENSG00000132294:ENST00000254624:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000407309:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000377917:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000334503:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000519656:exon_132982723_132982890:EFR3A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 141461062 G/A 1 9 6 15 4.31343400666797 3.12437732888802 1.18905667777995 A:G G A 10 0.52072955481467 0.611940175630342 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 141461185 A/G 1 11 10 21 5.27197489703863 5.2072955481467 0.0646793488919304 A:G A G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 141461266 A/G 1 10 13 23 4.7927044518533 6.76948421259071 -1.97677976073741 A:G A G 10 0.52072955481467 0.532250778549921 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 141551407 G/A 1 10 5 15 4.7927044518533 2.60364777407335 2.18905667777995 A:G G A 10 0.52072955481467 0.308037122491406 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000520412:exon_141551263_141551556:EIF2C2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 141559358 G/A 1 5 8 13 2.39635222592665 4.16583643851736 -1.76948421259071 A:G G A 10 0.52072955481467 0.409410722535207 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141559213_141559397:EIF2C2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 141566311 C/T 1 6 12 18 2.87562267111198 6.24875465777604 -3.37313198666406 T:C C T 10 0.52072955481467 0.155728897636768 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000521325:exon_141566266_141566337:EIF2C2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 141568622 G/A 1 16 13 29 7.66832712296528 6.76948421259071 0.898842910374571 A:G G A 10 0.52072955481467 0.853126532704154 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141568584_141568671:EIF2C2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 141716284 G/A 1 12 9 21 5.75124534222396 4.68656599333203 1.06467934889193 A:G G A 10 0.52072955481467 0.669361120839622 ENSG00000169398:ENST00000522684:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000519654:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000519465:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000517887:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000521059:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000395218:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000354438:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000395214:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000395221:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000523539:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000340930:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000519993:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000519419:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000524202:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000430260:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000521986:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000522424:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000521562:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000521250:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000523388:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000521981:exon_141716218_141716304:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000521029:exon_141716256_141716304:PTK2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 142154291 G/A 1 23 22 45 11.0232202392626 11.4560502059227 -0.432829966660149 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523058:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523015:exon_142154013_142154358:DENND3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 142161032 A/C 1 22 10 32 10.5439497940773 5.2072955481467 5.33665424593056 A:C A C 10 0.52072955481467 0.0756787799142798 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142160933_142161052:DENND3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 142161873 C/T 1 23 15 38 11.0232202392626 7.81094332222005 3.21227691704254 T:C C T 10 0.52072955481467 0.332370199874861 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142161718_142161936:DENND3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 142161888 G/A 1 25 18 43 11.9817611296333 9.37313198666406 2.60862914296919 A:G G A 10 0.52072955481467 0.44925780943465 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142161718_142161936:DENND3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 142170884 C/T 1 20 11 31 9.5854089037066 5.72802510296137 3.85738380074523 T:C C T 10 0.52072955481467 0.208278517993137 ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521477:exon_142170731_142170886:DENND3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 143396446 C/T 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 T:C C T 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143396364_143396450:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143396364_143396453:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143396364_143396453:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143396364_143396450:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000519651:exon_143396364_143396450:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000518928:exon_143396364_143396453:TSNARE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 143413136 C/T 1 11 3 14 5.27197489703863 1.56218866444401 3.70978623259462 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0603185136025827 ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000519651:exon_143413115_143413192:TSNARE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 143436034 A/G 1 7 1 8 3.35489311629731 0.52072955481467 2.83416356148264 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0721941130810857 ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000519651:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520462:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000518720:exon_143435998_143436124:TSNARE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 14 14 28 6.70978623259462 7.29021376740538 -0.580427534810759 A:G G A 10 0.52072955481467 0.852057573756229 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144392368 G/A 1 41 33 74 19.6500882525985 17.1840753088841 2.46601294371442 A:T:G G A 10 0.52072955481467 0.641975931718005 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144392238_144392673:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144391892_144392387:TOP1MT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144403449 G/A 1 14 16 30 6.70978623259462 8.33167287703472 -1.6218866444401 A:G G A 10 0.52072955481467 0.587501156256487 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144413416 G/A 1 7 8 15 3.35489311629731 4.16583643851736 -0.81094332222005 A:G G A 10 0.52072955481467 0.797925780414529 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523417:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518007:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518760:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000520950:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522043:exon_144413394_144413509:TOP1MT HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144620342 T/C 1 19 26 45 9.10613845852127 13.5389684251814 -4.43282996666015 T:C T C 10 0.52072955481467 0.232347018162802 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144620855 C/A 1 22 16 38 10.5439497940773 8.33167287703472 2.21227691704254 A:C C A 10 0.52072955481467 0.51865110132053 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144621084 T/G 1 14 6 20 6.70978623259462 3.12437732888802 3.5854089037066 T:G T G 10 0.52072955481467 0.121539458049168 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144623574 T/C 1 11 10 21 5.27197489703863 5.2072955481467 0.0646793488919304 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144623546_144623623:ZC3H3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144650925 A/T 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 A:T A T 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000204839:ENST00000533210:exon_144649956_144650927:C8orf73;ENSG00000204839:ENST00000524906:exon_144650722_144651024:C8orf73;ENSG00000204839:ENST00000534459:exon_144650722_144651057:C8orf73;ENSG00000204839:ENST00000533083:exon_144650722_144651013:C8orf73;ENSG00000204839:ENST00000532862:exon_144650722_144651030:C8orf73 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144775871 C/A 1 8 9 17 3.83416356148264 4.68656599333203 -0.85240243184939 A:C C A 10 0.52072955481467 0.809480166298499 ENSG00000181135:ENST00000525185:exon_144775841_144776000:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000534303:exon_144775841_144776009:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000528456:exon_144775841_144775942:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530574:exon_144775841_144775997:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531985:exon_144775841_144775893:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527293:exon_144775841_144775926:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531811:exon_144775841_144775918:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000525862:exon_144775841_144775873:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000526315:exon_144775841_144776129:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530341:exon_144775841_144775881:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531254:exon_144775841_144776199:ZNF707 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 11 8 19 5.27197489703863 4.16583643851736 1.10613845852127 A:C A C 10 0.52072955481467 0.653020003043937 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144808747 G/A 1 6 10 16 2.87562267111198 5.2072955481467 -2.33167287703472 A:G G A 10 0.52072955481467 0.318493089377623 ENSG00000180921:ENST00000388913:exon_144806103_144810893:FAM83H;ENSG00000180921:ENST00000395103:exon_144807621_144810810:FAM83H HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144877654 T/G 1 23 21 44 11.0232202392626 10.9353206511081 0.0878995881545208 T:G T G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144877590_144877700:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144877590_144877700:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144877590_144877700:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144877590_144877700:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144877590_144877700:SCRIB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144893084 G/A 1 27 28 55 12.9403020200039 14.5804275348108 -1.64012551480685 A:G G A 10 0.52072955481467 0.687196889659917 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144893076_144893242:SCRIB HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 28 20 48 13.4195724651892 10.4145910962934 3.00498136889584 A:G A G 10 0.52072955481467 0.470493764292766 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144991176 T/C 1 67 45 112 32.1111198274171 23.4328299666602 8.67828986075696 T:C T C 10 0.52072955481467 0.108142448293651 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144992103 T/C 1 37 33 70 17.7330064718572 17.1840753088841 0.548931162973098 T:C T C 10 0.52072955481467 0.905487876888373 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144992361 T/C 1 26 15 41 12.4610315748186 7.81094332222005 4.65008825259853 T:C T C 10 0.52072955481467 0.161283807581287 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144992862 A/G 1 30 20 50 14.3781133555599 10.4145910962934 3.9635222592665 A:G A G 10 0.52072955481467 0.321861906900029 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144993324 C/T 1 54 35 89 25.8806040400078 18.2255344185134 7.65506962149437 T:C C T 10 0.52072955481467 0.111992023331692 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144993377 A/G 1 35 29 64 16.7744655814866 15.1011570896254 1.67330849186112 A:G A G 10 0.52072955481467 0.708775401912957 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144995494 C/T 1 24 20 44 11.5024906844479 10.4145910962934 1.08789958815452 T:C C T 10 0.52072955481467 0.765154003607581 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144995736 G/A 1 26 18 44 12.4610315748186 9.37313198666406 3.08789958815452 A:G G A 10 0.52072955481467 0.369437879421467 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144996029 A/G 1 23 10 33 11.0232202392626 5.2072955481467 5.81592469111589 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0541064916291489 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144996111 C/T 1 19 12 31 9.10613845852127 6.24875465777604 2.85738380074523 T:C C T 10 0.52072955481467 0.369822219527132 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_144996100_144996563:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144996408 T/G 1 22 20 42 10.5439497940773 10.4145910962934 0.129358697783861 T:G T G 10 0.52072955481467 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_144996100_144996563:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144997523 G/A 0 28 0 28 13.4195724651892 0 13.4195724651892 G G 10 0.52072955481467 1.27565978897763e-08 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144997656 C/T 1 16 12 28 7.66832712296528 6.24875465777604 1.41957246518924 T:C C T 10 0.52072955481467 0.706167957724672 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144997783 G/A 1 14 21 35 6.70978623259462 10.9353206511081 -4.22553441851345 A:G G A 10 0.52072955481467 0.176839633688286 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144998169 C/T 1 9 3 12 4.31343400666797 1.56218866444401 2.75124534222396 T:C C T 10 0.52072955481467 0.150146977653864 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144998190 A/G 1 9 4 13 4.31343400666797 2.08291821925868 2.23051578740929 A:G A G 10 0.52072955481467 0.272232594497415 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144998514 C/T 1 14 10 24 6.70978623259462 5.2072955481467 1.50249068444792 T:C C T 10 0.52072955481467 0.683763897335876 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144999621 C/T 1 13 2 15 6.23051578740929 1.04145910962934 5.18905667777995 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00810742496770954 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144999642 A/C 1 13 4 17 6.23051578740929 2.08291821925868 4.14759756815061 A:C A C 10 0.52072955481467 0.0522960077891863 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 144999684 A/G 1 18 8 26 8.62686801333594 4.16583643851736 4.46103157481858 A:G A G 10 0.52072955481467 0.114679729645551 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145001031 T/C 1 23 17 40 11.0232202392626 8.85240243184939 2.1708178074132 T:C T C 10 0.52072955481467 0.529736574205869 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_145000952_145001050:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145001588 C/T 1 25 17 42 11.9817611296333 8.85240243184939 3.12935869778386 T:C C T 10 0.52072955481467 0.357671464852489 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145001784 A/G 1 18 13 31 8.62686801333594 6.76948421259071 1.85738380074523 A:G A G 10 0.52072955481467 0.591060437395048 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145007187 G/A 1 12 6 18 5.75124534222396 3.12437732888802 2.62686801333594 A:G G A 10 0.52072955481467 0.245162799745609 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145006961_145007279:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145008560 A/G 1 9 6 15 4.31343400666797 3.12437732888802 1.18905667777995 A:G A G 10 0.52072955481467 0.611940175630342 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145008486_145008613:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145011204 A/G 1 6 3 9 2.87562267111198 1.56218866444401 1.31343400666797 A:G A G 10 0.52072955481467 0.511187786305567 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000526416:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527816:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528131:exon_145011147_145011239:PLEC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145058037 A/G 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 A:G A G 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058010_145058272:PARP10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 34 38 72 16.2951951363012 19.7877230829575 -3.49252794665624 A:G A G 10 0.52072955481467 0.41229550930857 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 34 35 69 16.2951951363012 18.2255344185134 -1.93033928221223 A:G G A 10 0.52072955481467 0.718056723843859 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145535881 C/A 1 61 75 136 29.2354971563051 39.0547166111002 -9.81921945479512 A:C C A 10 0.52072955481467 0.102776108772175 ENSG00000185122:ENST00000328245:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000528838:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000400779:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000415363:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000400780:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000532338:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000527328:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000530661:exon_145535828_145535930:HSF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145617910 A/G 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 A:G A G 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000173137:ENST00000526231:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000529654:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000308860:exon_145617660_145617912:ADCK5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 46 35 81 22.0464404785252 18.2255344185134 3.82090606001173 A:G G A 10 0.52072955481467 0.436929127167650 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145649177 G/T 1 105 106 211 50.3233967444597 55.197332810355 -4.87393606589537 T:G G T 10 0.52072955481467 0.535323832506163 ENSG00000160948:ENST00000529182:exon_145649000_145649515:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526977:exon_145649000_145650434:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526054:exon_145649000_145649305:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000292510:exon_145649000_145649305:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000377348:exon_145649000_145649515:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526204:exon_145649003_145649305:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530983:exon_145649004_145649305:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000528142:exon_145649005_145649515:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530836:exon_145649014_145649305:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530804:exon_145649035_145649305:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000527797:exon_145649055_145649305:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000532861:exon_145649132_145649305:VPS28 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145661675 G/A 1 13 9 22 6.23051578740929 4.68656599333203 1.54394979407726 A:G G A 10 0.52072955481467 0.53135812068658 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145661041_145661801:NFKBIL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145662172 G/T 1 8 13 21 3.83416356148264 6.76948421259071 -2.93532065110807 T:G G T 10 0.52072955481467 0.274671777521875 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145662140_145662303:NFKBIL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145665407 C/T 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665404_145665456:NFKBIL2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145736101 G/A 1 14 10 24 6.70978623259462 5.2072955481467 1.50249068444792 A:G G A 10 0.52072955481467 0.683763897335876 ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145735981_145736105:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145735981_145736286:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000526749:exon_145735743_145736197:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000534427:exon_145735629_145736286:MFSD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145737490 G/A 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 A:G G A 10 0.52072955481467 0.347970315516692 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 14 12 26 6.70978623259462 6.24875465777604 0.46103157481858 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145741178 C/T 1 12 8 20 5.75124534222396 4.16583643851736 1.5854089037066 T:C C T 10 0.52072955481467 0.510829655044723 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741148_145741274:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741148_145741274:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741148_145741274:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741148_145741274:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532846:exon_145741148_145741277:RECQL4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 17 14 31 8.14759756815061 7.29021376740538 0.857383800745231 A:G G A 10 0.52072955481467 0.857960893951531 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145746099 C/T 1 11 17 28 5.27197489703863 8.85240243184939 -3.58042753481076 T:C C T 10 0.52072955481467 0.189855934010188 ENSG00000160959:ENST00000527730:exon_145745622_145746195:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000529022:exon_145745622_145746206:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000292524:exon_145745622_145746206:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000531310:exon_145745626_145746206:LRRC14 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145754187 C/G 1 40 14 54 19.1708178074132 7.29021376740538 11.8806040400078 C:G C G 10 0.52072955481467 0.00148437839790527 ENSG00000213563:ENST00000524821:exon_145754145_145754516:C8orf82;ENSG00000213563:ENST00000313465:exon_145754145_145754476:C8orf82;ENSG00000213563:ENST00000534680:exon_145754145_145754516:C8orf82;ENSG00000213563:ENST00000527462:exon_145754145_145754446:C8orf82 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 145999080 G/A 1 6 9 15 2.87562267111198 4.68656599333203 -1.81094332222005 A:G G A 10 0.52072955481467 0.44117550699482 ENSG00000196378:ENST00000527190:exon_145997611_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000343459:exon_145998499_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000429371:exon_145998499_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000527740:exon_145998505_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000449516:exon_145998508_145999990:ZNF34 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 146015749 C/T 1 4246 3703 7949 2034.98231025691 1928.26154147872 106.720768778188 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0167946271235909 ENSG00000161016:ENST00000534781:exon_146015740_146016257:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000531975:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000529163:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000526668:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000528296:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000394920:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000527914:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000262584:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000528957:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000534813:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000529920:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000533397:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000532702:exon_146015740_146015855:RPL8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 146017171 A/G 1 4088 3814 7902 1959.25757991763 1986.06252206315 -26.8049421455223 A:T:C:G A G 10 0.52072955481467 0.550690693503726 ENSG00000161016:ENST00000531975:exon_146017158_146017257:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000526668:exon_146017158_146017344:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000394920:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000262584:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000444860:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000528957:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000534813:exon_146017158_146017197:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000529920:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000533397:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000532702:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000525232:exon_146016498_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000531767:exon_146016892_146017257:RPL8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 146067125 C/T 1 9 10 19 4.31343400666797 5.2072955481467 -0.89386154147873 T:C C T 10 0.52072955481467 0.819317260655474 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 8 146068322 C/T 1 9 11 20 4.31343400666797 5.72802510296137 -1.4145910962934 T:C C T 10 0.52072955481467 0.655741219933051 ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 334337 A/G 1 12 9 21 5.75124534222396 4.68656599333203 1.06467934889193 A:G A G 10 0.52072955481467 0.669361120839622 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_334225_334384:DOCK8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 421032 C/G 1 13 18 31 6.23051578740929 9.37313198666406 -3.14261619925477 C:G C G 10 0.52072955481467 0.284278075165481 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000493666:exon_420949_421078:DOCK8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 439352 A/G 1 30 16 46 14.3781133555599 8.33167287703472 6.04644047852518 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0780968931134298 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_439245_439388:DOCK8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 2029018 G/A 1 57 40 97 27.3184153755638 20.8291821925868 6.48923318297701 A:G G A 10 0.52072955481467 0.222479647151356 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000457226:exon_2028987_2029221:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2029006_2029247:SMARCA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 2039973 C/T 1 2 9 11 0.95854089037066 4.68656599333203 -3.72802510296137 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0323592930418307 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 2039983 A/C 1 3 9 12 1.43781133555599 4.68656599333203 -3.24875465777604 A:C A C 10 0.52072955481467 0.0819642025853453 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 2073292 A/G 1 44 28 72 21.0878995881545 14.5804275348108 6.50747205334376 A:G A G 10 0.52072955481467 0.127196048777079 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2073212_2073342:SMARCA2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 2820046 G/C 1 18 4 22 8.62686801333594 2.08291821925868 6.54394979407726 C:G G C 10 0.52072955481467 0.00505584468362303 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2820018_2820098:KIAA0020 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 4576680 T/C 1 17 6 23 8.14759756815061 3.12437732888802 5.02322023926259 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0382240394381922 ENSG00000106688:ENST00000262352:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000381910:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000422398:exon_4576569_4576763:SLC1A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 5988505 C/A 1 13 6 19 6.23051578740929 3.12437732888802 3.10613845852127 A:C C A 10 0.52072955481467 0.173990747242703 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5988345_5988545:KIAA2026 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 6506038 C/T 1 14 6 20 6.70978623259462 3.12437732888802 3.5854089037066 T:C C T 10 0.52072955481467 0.121539458049168 ENSG00000147854:ENST00000468435:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000276893:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000485617:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000492853:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000481243:exon_6506033_6506112:UHRF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 6595046 C/T 1 9 5 14 4.31343400666797 2.60364777407335 1.70978623259462 T:C C T 10 0.52072955481467 0.429598343746981 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6595014_6595119:GLDC;ENSG00000178445:ENST00000463305:exon_6595014_6595119:GLDC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 6645251 C/T 1 5 11 16 2.39635222592665 5.72802510296137 -3.33167287703472 T:C C T 10 0.52072955481467 0.132080205864997 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6645245_6645650:GLDC HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 6984172 G/A 1 22 7 29 10.5439497940773 3.64510688370269 6.89884291037457 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0142416752782914 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 6984236 G/A 1 9 19 28 4.31343400666797 9.89386154147873 -5.58042753481076 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0380973581511144 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 7046901 C/G 1 6 11 17 2.87562267111198 5.72802510296137 -2.85240243184939 C:G C G 10 0.52072955481467 0.224918141362531 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7046862_7046917:KDM4C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 7046917 A/G 1 10 5 15 4.7927044518533 2.60364777407335 2.18905667777995 A:G A G 10 0.52072955481467 0.308037122491406 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7046862_7046917:KDM4C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 7103816 C/T 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 T:C C T 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000495890:exon_7103685_7104017:KDM4C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 22 4 26 10.5439497940773 2.08291821925868 8.46103157481858 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00068119144781037 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 21816758 G/A 1 15 8 23 7.18905667777995 4.16583643851736 3.02322023926259 A:C:G G A 10 0.52072955481467 0.219045420855692 ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000404796:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000460874:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21816713_21816771:MTAP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 26892654 G/A 1 9 9 18 4.31343400666797 4.68656599333203 -0.37313198666406 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26892411_26892802:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26892411_26892801:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26892257_26892785:C9orf82 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 32552462 C/G 1 13 10 23 6.23051578740929 5.2072955481467 1.02322023926259 C:G C G 10 0.52072955481467 0.683682381961274 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32552432_32552551:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32552432_32552551:TOPORS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 33971740 A/G 1 17 9 26 8.14759756815061 4.68656599333203 3.46103157481858 A:G A G 10 0.52072955481467 0.238474281795361 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33971649_33971752:UBAP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 17 10 27 8.14759756815061 5.2072955481467 2.94030202000391 A:T:C C T 10 0.52072955481467 0.335877161640575 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 34635679 G/A 1 56 37 93 26.8391449303785 19.2669935281428 7.57215140223569 A:G G A 10 0.52072955481467 0.120543225075411 ENSG00000147955:ENST00000277010:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000378892:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000353468:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000476705:exon_34635392_34635805:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000442847:exon_34634720_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000360710:exon_34634720_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000477726:exon_34635480_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000461426:exon_34635494_34635855:SIGMAR1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 35105257 G/A 1 10 8 18 4.7927044518533 4.16583643851736 0.62686801333594 A:G G A 10 0.52072955481467 0.817378948970493 ENSG00000005238:ENST00000378566:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35104118_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35104120_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35104139_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000479357:exon_35104827_35105371:KIAA1539 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 37429814 A/G 1 88 132 220 42.175799176309 68.7363012355364 -26.5605020592274 A:G A G 10 0.52072955481467 0.000424713919528187 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000377824:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000491488:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000497693:exon_37427703_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000480596:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000438860:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000494290:exon_37428992_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000482603:exon_37429783_37429833:GRHPR HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 42 30 72 20.1293586977839 15.6218866444401 4.50747205334376 T:G G T 10 0.52072955481467 0.34543168958997 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 39 35 74 18.6915473622279 18.2255344185134 0.466012943714425 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 38 40 78 18.2122769170425 20.8291821925868 -2.61690527554426 T:C T C 10 0.52072955481467 0.572554933603148 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 70 51 121 33.5489311629731 26.5572072955482 6.99172386742494 A:G G A 10 0.52072955481467 0.236748634746440 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 37537557 G/A 1 13 13 26 6.23051578740929 6.76948421259071 -0.53896842518142 A:G G A 10 0.52072955481467 0.84709817230133 ENSG00000147912:ENST00000276960:exon_37537107_37537940:FBXO10;ENSG00000147912:ENST00000432825:exon_37537107_37537940:FBXO10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 11 4 15 5.27197489703863 2.08291821925868 3.18905667777995 T:C C T 10 0.52072955481467 0.123192206125781 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 1 20 4 24 9.5854089037066 2.08291821925868 7.50249068444792 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00187789431690361 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 11 4 15 5.27197489703863 2.08291821925868 3.18905667777995 T:C C T 10 0.52072955481467 0.123192206125781 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 38396271 G/A 1 38 25 63 18.2122769170425 13.0182388703667 5.19403804667579 A:G G A 10 0.52072955481467 0.208413255453617 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 38397215 C/T 1 43 33 76 20.6086291429692 17.1840753088841 3.42455383408508 T:C C T 10 0.52072955481467 0.491278147474666 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 29 35 64 13.8988429103746 18.2255344185134 -4.32669150813888 T:C C T 10 0.52072955481467 0.317284191334388 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 23 36 59 11.0232202392626 18.7462639733281 -7.72304373406553 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0503405875112393 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 5 8 13 2.39635222592665 4.16583643851736 -1.76948421259071 T:C C T 10 0.52072955481467 0.409410722535207 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 77752510 C/T 1 19 13 32 9.10613845852127 6.76948421259071 2.33665424593056 T:C C T 10 0.52072955481467 0.480625933616023 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77752454_77752532:OSTF1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 92003679 C/T 1 28 24 52 13.4195724651892 12.4975093155521 0.922063149637161 T:C C T 10 0.52072955481467 0.88982925768634 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92003551_92003707:SEMA4D HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 95009747 C/T 1 59 80 139 28.2769562659345 41.6583643851736 -13.3814081192391 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0269786201923092 ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000449893:exon_95009659_95009833:IARS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 96209943 T/C 1 3 15 18 1.43781133555599 7.81094332222005 -6.37313198666406 T:C T C 10 0.52072955481467 0.003387623267809 ENSG00000188938:ENST00000479094:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000423591:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375412:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375409:exon_96208783_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000523407:exon_96208807_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520403:exon_96208815_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520470:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483149:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483056:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000476484:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428152:exon_96209550_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428378:exon_96209917_96209979:FAM120AOS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 96238578 C/T 1 38 40 78 18.2122769170425 20.8291821925868 -2.61690527554426 T:C C T 10 0.52072955481467 0.572554933603148 ENSG00000048828:ENST00000437660:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000375389:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000277165:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000340893:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000333936:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000446420:exon_96238538_96238620:FAM120A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 97062981 C/T 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 T:C C T 10 0.52072955481467 0.347970315516692 ENSG00000175787:ENST00000395395:exon_97062097_97063736:ZNF169;ENSG00000175787:ENST00000340911:exon_97061730_97063736:ZNF169 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 100420976 G/A 1 5 3 8 2.39635222592665 1.56218866444401 0.83416356148264 A:G G A 10 0.52072955481467 0.728437659058648 ENSG00000136937:ENST00000375147:exon_100420922_100421025:NCBP1;ENSG00000136937:ENST00000375132:exon_100420922_100421025:NCBP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 T:C C T 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 100819070 T/G 1 15 10 25 7.18905667777995 5.2072955481467 1.98176112963325 T:G T G 10 0.52072955481467 0.549126451072817 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 100823084 T/C 1 65 60 125 31.1525789370464 31.2437732888802 -0.0911943518337495 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 100823135 G/C 1 69 50 119 33.0696607177878 26.0364777407335 7.03318297705427 C:G G C 10 0.52072955481467 0.200483845353517 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 104309445 T/C 1 12 25 37 5.75124534222396 13.0182388703667 -7.26699352814279 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0204028625449797 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104309419_104309496:RNF20 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 106864399 A/G 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 A:G A G 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106864241_106864474:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000440179:exon_106864241_106864474:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106864241_106864474:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106864241_106864474:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106864241_106864474:SMC2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 108147763 T/G 1 7 11 18 3.35489311629731 5.72802510296137 -2.37313198666406 T:G T G 10 0.52072955481467 0.346420367518563 ENSG00000070214:ENST00000374723:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000470972:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374720:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374724:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000361080:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000343170:exon_108147703_108147783:SLC44A1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 111641825 G/A 1 11 21 32 5.27197489703863 10.9353206511081 -5.66334575406944 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0516397127802673 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 111651620 A/T 1 10 5 15 4.7927044518533 2.60364777407335 2.18905667777995 A:T A T 10 0.52072955481467 0.308037122491406 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111651612_111651673:IKBKAP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 111656228 T/A 1 3 6 9 1.43781133555599 3.12437732888802 -1.68656599333203 A:T T A 10 0.52072955481467 0.326815943641994 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111656223_111656346:IKBKAP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 111688828 C/T 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111688803_111688883:IKBKAP HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 112900199 T/C 1 39 34 73 18.6915473622279 17.7048048636988 0.986742498529093 T:C T C 10 0.52072955481467 0.906856412132721 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 112900785 A/G 1 55 63 118 26.3598744851932 32.8059619533242 -6.44608746813105 A:G A G 10 0.52072955481467 0.268821674857029 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 22 33 55 10.5439497940773 17.1840753088841 -6.64012551480685 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0798346424078765 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 114190337 G/A 1 8 4 12 3.83416356148264 2.08291821925868 1.75124534222396 A:G G A 10 0.52072955481467 0.392664984305907 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114190322_114190441:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114190322_114190441:KIAA0368 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 114195587 G/A 1 19 31 50 9.10613845852127 16.1426161992548 -7.0364777407335 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0484127769594304 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114195513_114195652:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114195513_114195652:KIAA0368 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 114694486 A/G 1 11 22 33 5.27197489703863 11.4560502059227 -6.18407530888411 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0361460942384450 ENSG00000148154:ENST00000374279:exon_114694450_114694639:UGCG HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 51 33 84 24.4427927044518 17.1840753088841 7.25871739556772 T:C T C 10 0.52072955481467 0.126347794982347 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 60 43 103 28.7562267111198 22.3913708570308 6.36485585408899 T:C C T 10 0.52072955481467 0.236689719937295 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 115941046 T/C 1 11 17 28 5.27197489703863 8.85240243184939 -3.58042753481076 T:C T C 10 0.52072955481467 0.189855934010188 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115940910_115941081:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115940910_115941081:FKBP15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 115950706 A/C 1 16 15 31 7.66832712296528 7.81094332222005 -0.142616199254769 A:C A C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950669_115950841:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115950669_115950771:FKBP15 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 116044998 A/G 1 14 20 34 6.70978623259462 10.4145910962934 -3.70480486369878 A:G A G 10 0.52072955481467 0.231281092475669 ENSG00000136875:ENST00000374199:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000374198:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000488937:exon_116044926_116045456:PRPF4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 25 30 55 11.9817611296333 15.6218866444401 -3.64012551480685 T:C C T 10 0.52072955481467 0.346987708170193 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 116152891 A/G 1 6 18 24 2.87562267111198 9.37313198666406 -6.49750931555208 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0124790761307531 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116152873_116153213:ALAD HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 117108971 C/T 1 55 49 104 26.3598744851932 25.5157481859188 0.844126299274322 T:C C T 10 0.52072955481467 0.92192795116353 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117108949_117109054:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117108949_117109064:AKNA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 117110112 T/C 1 55 61 116 26.3598744851932 31.7645028436949 -5.40462835850172 T:C:G T C 10 0.52072955481467 0.352848527224302 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000491133:exon_117110053_117110180:AKNA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 117110180 G/A 1 66 64 130 31.6318493822318 33.3266915081389 -1.6948421259071 A:G G A 10 0.52072955481467 0.792659396673332 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000491133:exon_117110053_117110180:AKNA HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 119461275 G/A 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 A:G G A 10 0.52072955481467 1 ENSG00000119401:ENST00000394497:exon_119459944_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000450136:exon_119459941_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000373983:exon_119459935_119463579:TRIM32 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 123201733 T/C 1 19 14 33 9.10613845852127 7.29021376740538 1.81592469111589 T:C T C 10 0.52072955481467 0.60279298858228 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 123605126 T/C 1 6 14 20 2.87562267111198 7.29021376740538 -4.4145910962934 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0709058537292896 ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123605015_123605200:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123605015_123605190:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000435107:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000476949:exon_123605015_123605189:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000471789:exon_123605015_123605160:PSMD5 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 126520068 T/C 1 6 5 11 2.87562267111198 2.60364777407335 0.27197489703863 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126519982_126520101:DENND1A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 127643456 T/C 1 4 6 10 1.91708178074132 3.12437732888802 -1.2072955481467 T:C T C 10 0.52072955481467 0.535104054706355 ENSG00000136935:ENST00000373555:exon_127643450_127643536:GOLGA1;ENSG00000136935:ENST00000475407:exon_127643450_127643536:GOLGA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 127661645 G/A 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 A:G G A 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000136935:ENST00000373555:exon_127661608_127661757:GOLGA1;ENSG00000136935:ENST00000475407:exon_127661608_127661757:GOLGA1;ENSG00000136935:ENST00000485337:exon_127661608_127661712:GOLGA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 130164993 C/T 1 8 2 10 3.83416356148264 1.04145910962934 2.7927044518533 T:C C T 10 0.52072955481467 0.112396421350563 ENSG00000136856:ENST00000373371:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000451404:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000476835:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419917:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373354:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373360:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373355:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419132:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000439597:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000423934:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373350:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000430147:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000484617:exon_130164643_130165032:SLC2A8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 130206669 C/T 1 7 7 14 3.35489311629731 3.64510688370269 -0.29021376740538 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 130219669 C/T 1 9 7 16 4.31343400666797 3.64510688370269 0.66832712296528 T:C C T 10 0.52072955481467 0.806303597637586 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000485704:exon_130219595_130219692:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130219595_130219672:LRSAM1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 130476383 G/A 1 7 9 16 3.35489311629731 4.68656599333203 -1.33167287703472 A:G G A 10 0.52072955481467 0.61923512047445 ENSG00000160401:ENST00000464092:exon_130476113_130478281:C9orf117;ENSG00000187024:ENST00000423807:exon_130475772_130476561:PTRH1;ENSG00000187024:ENST00000419060:exon_130475789_130476561:PTRH1;ENSG00000187024:ENST00000456267:exon_130476251_130476468:PTRH1;ENSG00000187024:ENST00000414832:exon_130476347_130476561:PTRH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 63 62 125 30.1940380466758 32.2852323985095 -2.09119435183374 A:C A C 10 0.52072955481467 0.721086223643815 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 131771505 C/T 1 24 15 39 11.5024906844479 7.81094332222005 3.69154736222787 T:C C T 10 0.52072955481467 0.264195344066534 ENSG00000148341:ENST00000372564:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000479237:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372559:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372554:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000461811:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000417224:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000416629:exon_131771385_131771625:SH3GLB2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 131804785 T/C 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 T:C T C 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000148343:ENST00000474534:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000439290:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000445183:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000358369:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000413435:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000421332:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000406926:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000277475:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000450073:exon_131804583_131804785:FAM73B HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 131897131 G/A 1 19 9 28 9.10613845852127 4.68656599333203 4.41957246518924 A:G G A 10 0.52072955481467 0.128969279004675 ENSG00000119383:ENST00000358994:exon_131897074_131897173:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000455292:exon_131897074_131897173:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000393370:exon_131897074_131897173:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000524946:exon_131897074_131897173:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000337738:exon_131897074_131897173:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000348141:exon_131897074_131897173:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000405725:exon_131897074_131897173:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000357197:exon_131897074_131897173:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000452489:exon_131897074_131897173:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000445241:exon_131897074_131897173:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000355007:exon_131897074_131897173:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000417728:exon_131897074_131897173:PPP2R4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 12 23 35 5.75124534222396 11.9767797607374 -6.22553441851345 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0417349059470892 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 134371165 C/T 1 74 61 135 35.4660129437144 31.7645028436949 3.70151010001955 T:C C T 10 0.52072955481467 0.547273553501086 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134371127_134375558:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000320547:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000465931:exon_134371127_134375584:BAT2L1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 134386744 T/C 1 8 5 13 3.83416356148264 2.60364777407335 1.23051578740929 T:C T C 10 0.52072955481467 0.585356807999496 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134386724_134386855:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 134386781 G/A 1 6 9 15 2.87562267111198 4.68656599333203 -1.81094332222005 A:G G A 10 0.52072955481467 0.44117550699482 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134386724_134386855:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 134387488 T/C 1 7 11 18 3.35489311629731 5.72802510296137 -2.37313198666406 T:C T C 10 0.52072955481467 0.346420367518563 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134387428_134387514:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134387279_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 134401335 C/T 1 19 13 32 9.10613845852127 6.76948421259071 2.33665424593056 T:C C T 10 0.52072955481467 0.480625933616023 ENSG00000130717:ENST00000372215:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372208:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000491309:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372211:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372210:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000484876:exon_134401316_134401546:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000494584:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000459858:exon_134401332_134401364:UCK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 135521303 C/T 1 4 7 11 1.91708178074132 3.64510688370269 -1.72802510296137 T:C C T 10 0.52072955481467 0.371924081118385 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000310532:exon_135521282_135521458:DDX31 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 135771793 G/A 1 10 1 11 4.7927044518533 0.52072955481467 4.27197489703863 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0124611301920712 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135766735_135772141:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135766736_135772141:TSC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 135781205 T/C 1 4 7 11 1.91708178074132 3.64510688370269 -1.72802510296137 T:C T C 10 0.52072955481467 0.371924081118385 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135780968_135781526:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135780968_135781526:TSC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 135974079 G/C 1 36 31 67 17.2537360266719 16.1426161992548 1.11111982741711 C:G G C 10 0.52072955481467 0.80796686888264 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 49 31 80 23.4842518140812 16.1426161992548 7.3416356148264 A:G G A 10 0.52072955481467 0.116893737057131 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 136199466 G/A 1 40 31 71 19.1708178074132 16.1426161992548 3.02820160815843 A:G G A 10 0.52072955481467 0.479255963893725 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 136199503 G/A 1 30 29 59 14.3781133555599 15.1011570896254 -0.723043734065529 A:G G A 10 0.52072955481467 0.896700500710258 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 136213521 T/C 1 8 8 16 3.83416356148264 4.16583643851736 -0.33167287703472 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000148297:ENST00000491289:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000486395:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000343730:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000344469:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000476080:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000422801:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000371999:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000446777:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000494177:exon_136213395_136213548:MED22;ENSG00000148297:ENST00000457204:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000482295:exon_136213262_136213555:MED22 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 36 27 63 17.2537360266719 14.0596979799961 3.19403804667579 A:G A G 10 0.52072955481467 0.451059761130848 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 136643908 G/A 1 10 13 23 4.7927044518533 6.76948421259071 -1.97677976073741 A:G G A 10 0.52072955481467 0.532250778549921 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136643884_136644011:VAV2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 136650966 C/T 1 19 23 42 9.10613845852127 11.9767797607374 -2.87064130221614 T:C C T 10 0.52072955481467 0.440671141871519 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136650898_136651007:VAV2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 138395624 C/T 1 140 138 278 67.0978623259462 71.8606785644245 -4.76281623847825 T:C C T 10 0.52072955481467 0.589232239159402 ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138395388_138396519:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138395388_138396516:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000488610:exon_138395388_138395806:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000485333:exon_138395388_138395822:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000472852:exon_138395388_138395801:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000453385:exon_138395388_138395856:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000472946:exon_138395388_138395832:MRPS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 138830184 C/T 1 23 13 36 11.0232202392626 6.76948421259071 4.25373602667188 T:C C T 10 0.52072955481467 0.182857638763797 ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138830068_138830206:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000489050:exon_138830068_138830206:UBAC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 139368684 G/A 1 29 20 49 13.8988429103746 10.4145910962934 3.48425181408117 A:G G A 10 0.52072955481467 0.391207580467612 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000404925:exon_139368501_139368938:SEC16A HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 139621168 G/A 1 13 12 25 6.23051578740929 6.24875465777604 -0.0182388703667495 A:G G A 10 0.52072955481467 1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 139973820 C/T 1 8 2 10 3.83416356148264 1.04145910962934 2.7927044518533 T:C C T 10 0.52072955481467 0.112396421350563 ENSG00000197355:ENST00000409858:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000360271:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 140002989 T/C 1 46 32 78 22.0464404785252 16.6633457540694 5.38309472445574 T:C T C 10 0.52072955481467 0.257170483780919 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140002840_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001983_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000475449:exon_140002983_140003529:MAN1B1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 211 157 368 101.126063934105 81.7545401059032 19.3715238282014 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0472831602571544 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 140006425 C/G 1 224 165 389 107.356579721514 85.9203765444205 21.4362031770934 T:C:G C G 10 0.52072955481467 0.0329317209459712 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006393_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140006360_140006481:DPP7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 140008750 G/C 1 73 77 150 34.9867424985291 40.0961757207296 -5.1094332222005 C:G G C 10 0.52072955481467 0.414772672493064 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008695_140008830:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 140167022 G/A 1 45 43 88 21.5671700333398 22.3913708570308 -0.824200823690958 A:G G A 10 0.52072955481467 0.915159139468234 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166959_140167067:COBRA1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 140262426 C/T 1 7 5 12 3.35489311629731 2.60364777407335 0.75124534222396 T:C C T 10 0.52072955481467 0.776730588922806 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140262017_140262441:EXD3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 140611436 T/C 1 37 32 69 17.7330064718572 16.6633457540694 1.06966071778777 T:C T C 10 0.52072955481467 0.810874581995028 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 140638416 G/A 1 47 46 93 22.5257109237105 23.9535595214748 -1.42784859776431 A:G G A 10 0.52072955481467 0.83571509110986 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 43 39 82 20.6086291429692 20.3084526377721 0.300176505197065 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 200860 T/C 1 6 8 14 2.87562267111198 4.16583643851736 -1.29021376740538 T:C T C 10 0.52072955481467 0.596274656681649 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000445062:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000429181:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000443019:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_200401_200981:PLCXD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 207362 C/T 1 8 26 34 3.83416356148264 13.5389684251814 -9.70480486369878 T:C C T 10 0.52072955481467 0.000897273212020885 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_207315_207459:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_207315_207424:PLCXD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 299362 A/G 1 12 15 27 5.75124534222396 7.81094332222005 -2.05969797999609 A:G A G 10 0.52072955481467 0.447615619311931 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 299591 A/G 1 9 12 21 4.31343400666797 6.24875465777604 -1.93532065110807 A:G A G 10 0.52072955481467 0.513471758577479 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 322161 A/G 1 4 8 12 1.91708178074132 4.16583643851736 -2.24875465777604 A:G A G 10 0.52072955481467 0.251467937811103 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000496630:exon_322140_322251:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000381625:exon_322140_322325:PPP2R3B HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 1467404 A/C 1 5 6 11 2.39635222592665 3.12437732888802 -0.72802510296137 A:C A C 10 0.52072955481467 0.767073670700831 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1467324_1467438:IL3RA HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 1497644 G/C 1 18 13 31 8.62686801333594 6.76948421259071 1.85738380074523 C:G G C 10 0.52072955481467 0.591060437395048 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1497552_1497657:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1497552_1497657:IL3RA HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 1537002 C/G 1 78 50 128 37.3830947244557 26.0364777407335 11.3466169837222 A:C:G C G 10 0.52072955481467 0.0512812966577919 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 70 47 117 33.5489311629731 24.4742890762895 9.07464208668362 T:C C T 10 0.52072955481467 0.096424541456487 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 1537953 C/T 1 37 44 81 17.7330064718572 22.9121004118455 -5.17909393998827 T:C C T 10 0.52072955481467 0.267120165367589 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 1540706 A/G 1 51 67 118 24.4427927044518 34.8888801725829 -10.4460874681311 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0649233685611113 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1540551_1540735:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1540551_1540735:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1540551_1540735:ASMTL HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 1546792 G/A 1 77 65 142 36.9038242792704 33.8474210629536 3.05640321631686 A:G G A 10 0.52072955481467 0.615521297211108 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 1546842 A/G 1 88 89 177 42.175799176309 46.3449303785056 -4.16913120219659 A:G A G 10 0.52072955481467 0.54784650395777 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 1546876 A/G 1 104 81 185 49.8441262992743 42.1790939399883 7.66503235928605 A:G A G 10 0.52072955481467 0.270270310471322 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 73 43 116 34.9867424985291 22.3913708570308 12.5953716414983 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0200968279329662 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 2139200 T/C 1 10 10 20 4.7927044518533 5.2072955481467 -0.4145910962934 T:C T C 10 0.52072955481467 1 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 2632482 C/T 1 92 101 193 44.0928809570504 52.5936850362817 -8.50080407923131 T:C C T 10 0.52072955481467 0.221717254661175 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 2644302 C/T 1 90 71 161 43.1343400666797 36.9717983918416 6.16254167483813 T:C C T 10 0.52072955481467 0.344639004691881 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482293:exon_2644301_2644404:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482405:exon_2644301_2644414:CD99 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 3592725 G/A 1 18 11 29 8.62686801333594 5.72802510296137 2.89884291037457 A:G G A 10 0.52072955481467 0.353436764303422 ENSG00000183943:ENST00000262848:exon_3592639_3592807:PRKX HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 6995315 C/T 1 24 22 46 11.5024906844479 11.4560502059227 0.0464404785251809 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000412827:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_6995261_6995490:HDHD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 6995417 C/T 1 22 20 42 10.5439497940773 10.4145910962934 0.129358697783861 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000412827:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_6995261_6995490:HDHD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 6995438 C/T 1 25 23 48 11.9817611296333 11.9767797607374 0.00498136889584089 T:C C T 10 0.52072955481467 1 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000412827:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_6995261_6995490:HDHD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 7023678 G/A 1 34 30 64 16.2951951363012 15.6218866444401 0.673308491861121 A:G G A 10 0.52072955481467 0.900936640840065 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000498474:exon_7023661_7023879:HDHD1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 12809661 G/A 1 31 37 68 14.8573838007452 19.2669935281428 -4.40960972739756 A:G G A 10 0.52072955481467 0.331682339189715 ENSG00000101911:ENST00000380663:exon_12809474_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000380668:exon_12809489_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000398491:exon_12809525_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000489404:exon_12809607_12809738:PRPS2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 16859628 G/A 1 22 16 38 10.5439497940773 8.33167287703472 2.21227691704254 A:G G A 10 0.52072955481467 0.51865110132053 ENSG00000086712:ENST00000380122:exon_16859551_16862642:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000398155:exon_16859551_16860296:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000485153:exon_16859551_16862642:TXLNG HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 24075862 A/G 1 43 35 78 20.6086291429692 18.2255344185134 2.38309472445574 A:G A G 10 0.52072955481467 0.6507680880971 ENSG00000130741:ENST00000253039:exon_24075750_24075871:EIF2S3;ENSG00000130741:ENST00000423068:exon_24075750_24075871:EIF2S3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 24806547 C/T 0 1105 0 1105 529.59384192979 0 529.59384192979 C C 10 0.52072955481467 1.12655510911629e-313 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 40460040 T/C 1 8 20 28 3.83416356148264 10.4145910962934 -6.58042753481076 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0138117535310474 ENSG00000182220:ENST00000378438:exon_40460014_40460133:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000486558:exon_40460014_40460133:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000447485:exon_40460014_40460128:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000423649:exon_40460014_40460133:ATP6AP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 46618321 C/G 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 C:G C G 10 0.52072955481467 0.347970315516692 ENSG00000065923:ENST00000328306:exon_46618140_46618490:SLC9A7 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 47444985 T/C 1 87 27 114 41.6965287311237 14.0596979799961 27.6368307511276 T:C T C 10 0.52072955481467 1.45778779005726e-07 ENSG00000102265:ENST00000218388:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377018:exon_47444335_47445482:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000456754:exon_47444604_47445422:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377017:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377013:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000445623:exon_47444741_47445066:TIMP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 47445940 C/T 1 40 186 226 19.1708178074132 96.8556971955286 -77.6848793881154 T:C C T 10 0.52072955481467 1.63705816231085e-26 ENSG00000102265:ENST00000218388:exon_47445920_47446188:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377017:exon_47445920_47446188:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377013:exon_47445920_47446187:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000445623:exon_47445920_47446188:TIMP1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 48682972 A/G 1 26 43 69 12.4610315748186 22.3913708570308 -9.93033928221223 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0213996422039411 ENSG00000094631:ENST00000444343:exon_48682954_48683380:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000334136:exon_48682954_48683386:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000376619:exon_48682954_48683386:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000477528:exon_48682954_48683392:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000486227:exon_48682954_48683386:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000488543:exon_48682954_48683386:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000430858:exon_48682954_48683386:HDAC6 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 48888074 T/C 1 33 19 52 15.8159246911159 9.89386154147873 5.92206314963716 T:C T C 10 0.52072955481467 0.126113527687633 ENSG00000068323:ENST00000315869:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000493583:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000478476:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000336239:exon_48887729_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000495940:exon_48888024_48888110:TFE3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 49035732 C/T 1 19 5 24 9.10613845852127 2.60364777407335 6.50249068444792 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00770205468370471 ENSG00000012211:ENST00000376317:exon_49035600_49035737:PRICKLE3;ENSG00000012211:ENST00000453382:exon_49035600_49035737:PRICKLE3;ENSG00000012211:ENST00000432913:exon_49035600_49035737:PRICKLE3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 53641647 T/C 1 7 17 24 3.35489311629731 8.85240243184939 -5.49750931555208 T:C T C 10 0.52072955481467 0.0387535911546428 ENSG00000086758:ENST00000342160:exon_53641495_53641706:HUWE1;ENSG00000086758:ENST00000262854:exon_53641495_53641706:HUWE1;ENSG00000086758:ENST00000276009:exon_53641495_53641706:HUWE1;ENSG00000086758:ENST00000375220:exon_53641495_53641706:HUWE1;ENSG00000086758:ENST00000218328:exon_53641495_53641706:HUWE1;ENSG00000086758:ENST00000396323:exon_53641495_53641706:HUWE1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 54836361 A/G 1 49 78 127 23.4842518140812 40.6169052755443 -17.1326534614631 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00246252805156969 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 54836505 A/G 1 23 44 67 11.0232202392626 22.9121004118455 -11.8888801725829 A:G A G 10 0.52072955481467 0.00457258825204526 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 54837340 C/T 1 28 73 101 13.4195724651892 38.0132575014709 -24.5936850362817 T:C C T 10 0.52072955481467 1.09184343058859e-06 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54837254_54837563:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54837254_54837562:MAGED2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 54838077 C/T 1 11 25 36 5.27197489703863 13.0182388703667 -7.74626397332812 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0116317000391713 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54838007_54838077:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000487482:exon_54837965_54838086:MAGED2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 55479299 G/A 1 45 21 66 21.5671700333398 10.9353206511081 10.6318493822318 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00940645416881395 ENSG00000187601:ENST00000342972:exon_55478538_55479998:MAGEH1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 71416721 C/T 1 6 2 8 2.87562267111198 1.04145910962934 1.83416356148264 T:C C T 10 0.52072955481467 0.292441655168790 ENSG00000102309:ENST00000373662:exon_71416635_71416951:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000218432:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000423432:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000373669:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000475071:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000439980:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000496835:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000446576:exon_71416635_71417204:PIN4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 71493691 C/T 1 1664 2556 4220 797.506020788389 1330.9847421063 -533.478721317907 A:T:C C T 10 0.52072955481467 6.54758511635913e-61 ENSG00000198034:ENST00000316084:exon_71493651_71493822:RPS4X;ENSG00000198034:ENST00000486733:exon_71493651_71495000:RPS4X HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 71791912 C/T 1 8 3 11 3.83416356148264 1.56218866444401 2.27197489703863 T:C C T 10 0.52072955481467 0.230986313204545 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373568:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000436675:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000415409:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000440442:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000412342:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373571:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000439122:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373560:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373559:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373561:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000478743:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000421523:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373556:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373554:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000340176:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000444609:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000486704:exon_71791796_71791959:HDAC8 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 73043817 T/C 1 15 36 51 7.18905667777995 18.7462639733281 -11.5572072955482 T:C T C 10 0.52072955481467 0.00118090449600018 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 73045809 T/C 1 31 20 51 14.8573838007452 10.4145910962934 4.44279270445183 T:C T C 10 0.52072955481467 0.262109355477484 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 73062463 G/T 1 10 16 26 4.7927044518533 8.33167287703472 -3.53896842518142 T:G G T 10 0.52072955481467 0.175025807748805 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 73066439 T/C 1 1 13 14 0.47927044518533 6.76948421259071 -6.29021376740538 T:C T C 10 0.52072955481467 0.000654729365917171 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 118893137 T/C 1 6 7 13 2.87562267111198 3.64510688370269 -0.76948421259071 T:C T C 10 0.52072955481467 0.784083035222644 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 118893413 T/C 1 4 9 13 1.91708178074132 4.68656599333203 -2.76948421259071 T:C T C 10 0.52072955481467 0.166029130373969 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 123019832 A/G 1 7 3 10 3.35489311629731 1.56218866444401 1.7927044518533 A:G A G 10 0.52072955481467 0.347970315516692 ENSG00000101966:ENST00000430625:exon_123019481_123019980:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000371199:exon_123019481_123020389:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000434753:exon_123019481_123020389:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000355640:exon_123019481_123020389:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000531762:exon_123019481_123020389:XIAP HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 129058882 T/C 1 61 40 101 29.2354971563051 20.8291821925868 8.40631496371833 T:C T C 10 0.52072955481467 0.110674116826250 ENSG00000156697:ENST00000425117:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000371051:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000394422:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000427972:exon_129058771_129058886:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000371042:exon_129058771_129059171:UTP14A HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 129201179 C/T 1 27 11 38 12.9403020200039 5.72802510296137 7.21227691704254 T:C C T 10 0.52072955481467 0.0222842656498169 ENSG00000102034:ENST00000335997:exon_129198849_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000455513:exon_129198849_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000308167:exon_129198903_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000527455:exon_129198903_129201500:ELF4 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 135310785 T/C 1 31 24 55 14.8573838007452 12.4975093155521 2.35987448519315 T:C T C 10 0.52072955481467 0.590068677084358 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000495432:exon_135310782_135311154:MAP7D3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 135313034 T/G 1 12 3 15 5.75124534222396 1.56218866444401 4.18905667777995 T:G T G 10 0.52072955481467 0.0374553526850559 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000477124:exon_135312998_135313314:MAP7D3 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153195393 G/A 1 19 31 50 9.10613845852127 16.1426161992548 -7.0364777407335 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0484127769594304 ENSG00000102030:ENST00000464845:exon_153194695_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000482485:exon_153195280_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370015:exon_153195367_153195760:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000393712:exon_153195374_153195756:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370009:exon_153195377_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000466877:exon_153195379_153195676:NAA10 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153218365 C/A 1 19 24 43 9.10613845852127 12.4975093155521 -3.39137085703081 A:C C A 10 0.52072955481467 0.36014967926019 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153217965_153218409:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000444191:exon_153217965_153218409:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153217965_153218541:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153217965_153218409:HCFC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153219665 C/T 1 16 33 49 7.66832712296528 17.1840753088841 -9.51574818591883 T:C C T 10 0.52072955481467 0.00933512223851916 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153219517_153220993:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153219517_153220993:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153219517_153220993:HCFC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153220360 A/G 1 12 41 53 5.75124534222396 21.3499117474015 -15.5986664051775 A:G A G 10 0.52072955481467 2.20657638265327e-05 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153219517_153220993:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153219517_153220993:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153219517_153220993:HCFC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153221657 T/C 1 9 27 36 4.31343400666797 14.0596979799961 -9.74626397332812 T:C T C 10 0.52072955481467 0.00126162791417082 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153221642_153221862:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153221642_153221862:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153221642_153221862:HCFC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153222835 G/C 1 17 36 53 8.14759756815061 18.7462639733281 -10.5986664051775 C:G G C 10 0.52072955481467 0.00373050049581508 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153222765_153222984:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153222765_153222984:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153222765_153222984:HCFC1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153248248 G/A 1 2 9 11 0.95854089037066 4.68656599333203 -3.72802510296137 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0323592930418307 ENSG00000177854:ENST00000369982:exon_153247301_153248646:TMEM187 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153278829 G/A 1 67 40 107 32.1111198274171 20.8291821925868 11.2819376348303 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0329362365704412 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000444254:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000443220:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000467236:exon_153278787_153278884:IRAK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153284192 A/G 1 52 29 81 24.9220631496372 15.1011570896254 9.82090606001173 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0340827440453218 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393682:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393687:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000429936:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000463031:exon_153284050_153284396:IRAK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153284483 G/A 1 67 44 111 32.1111198274171 22.9121004118455 9.19901941557163 A:G G A 10 0.52072955481467 0.0873353485672436 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393682:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000444230:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393687:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000429936:exon_153284426_153284529:IRAK1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153296046 G/A 1 11 28 39 5.27197489703863 14.5804275348108 -9.30845263777213 A:G G A 10 0.52072955481467 0.00344392488510126 ENSG00000169057:ENST00000303391:exon_153287024_153296901:MECP2;ENSG00000169057:ENST00000453960:exon_153295685_153296901:MECP2 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153579448 A/G 1 10 3 13 4.7927044518533 1.56218866444401 3.23051578740929 A:G A G 10 0.52072955481467 0.0958867035011751 ENSG00000196924:ENST00000490936:exon_153578399_153580064:FLNA HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153581932 A/G 1 185 144 329 88.6650323592861 74.9850558933125 13.6799764659736 A:G A G 10 0.52072955481467 0.136397596697163 ENSG00000196924:ENST00000420627:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000360319:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369854:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369863:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369852:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000422373:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000428077:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369850:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000490936:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000344736:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000415241:exon_153581922_153581966:FLNA HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153596102 C/T 1 121 59 180 57.9917238674249 30.7230437340655 27.2686801333594 T:C C T 10 0.52072955481467 4.97247237540127e-05 ENSG00000196924:ENST00000420627:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000360319:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369854:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369863:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369852:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000422373:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000428077:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369850:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000344736:exon_153596009_153596106:FLNA HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153633359 G/C 1 11 24 35 5.27197489703863 12.4975093155521 -7.22553441851345 C:G G C 10 0.52072955481467 0.0171443367852326 ENSG00000013563:ENST00000393638:exon_153633336_153633424:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369809:exon_153633336_153633424:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000014935:exon_153633336_153633424:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369808:exon_153633336_153633424:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369807:exon_153633336_153633424:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000309585:exon_153633336_153633424:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000451865:exon_153633336_153633424:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000424626:exon_153633336_153633424:DNASE1L1 HGDP00855_parsed_pileup.txt . X 153633953 T/C 1 8 10 18 3.83416356148264 5.2072955481467 -1.37313198666406 T:C T C 10 0.52072955481467 0.638802194234348 ENSG00000013563:ENST00000393638:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369809:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000014935:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369808:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369807:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000309585:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000451865:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000412184:exon_153633775_153633959:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000424626:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000432135:exon_153633830_153633996:DNASE1L1