INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 897307 C/T 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_897206_897427:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_897206_897427:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000455747:exon_897206_897652:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000463212:exon_897206_897858:KLHL17 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 1198757 G/A 1 24 39 63 10.9084399766941 21.2737850378721 -10.3653450611781 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0108887515469273 ENSG00000160087:ENST00000450390:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000347370:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000349431:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000339385:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000348298:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000400929:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000464036:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000360466:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000400930:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000473215:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000435198:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000509720:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000466752:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000503294:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000477894:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000471154:exon_1198726_1198949:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000422076:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000502382:exon_1198726_1198766:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000461142:exon_1198233_1198766:UBE2J2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 46 52 98 20.9078432886636 28.3650467171628 -7.4572034284992 C:G C G 10 0.545481667637747 0.155213512071895 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 1262966 C/T 1 5 9 14 2.27259166181127 4.90933500873972 -2.63674334692846 T:C C T 10 0.545481667637747 0.185033796786841 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 1263144 G/A 1 13 8 21 5.90873832070929 4.36385334110198 1.54488497960731 A:G G A 10 0.545481667637747 0.521566668167506 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 1342612 G/C 1 185 141 326 84.0858914870168 76.9129151369223 7.17297635009449 T:C:G G C 10 0.545481667637747 0.436622457140437 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 1421531 C/A 1 10 3 13 4.54518332362253 1.63644500291324 2.90873832070929 A:C C A 10 0.545481667637747 0.16204615807973 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 21 28 49 9.54488497960731 15.2734866938569 -5.7286017142496 T:C T C 10 0.545481667637747 0.114666398750904 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 1430985 C/T 1 32 23 55 14.5445866355921 12.5460783556682 1.99850827992392 T:C C T 10 0.545481667637747 0.684988864820291 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 56 55 111 25.4530266122862 30.0014917200761 -4.54846510778991 A:G A G 10 0.545481667637747 0.392579577702681 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 1558792 T/C 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 T:C T C 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1558769_1558862:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1558769_1559079:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000512004:exon_1558502_1558862:MIB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 1562437 C/G 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 C:G C G 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1562217_1562587:MIB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 1562536 G/A 1 16 20 36 7.27229331779605 10.9096333527549 -3.63734003495889 A:G G A 10 0.545481667637747 0.243963114769603 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1562217_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505370:exon_1562454_1562587:MIB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 1635505 G/A 1 10 17 27 4.54518332362253 9.2731883498417 -4.72800502621917 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0817264592715129 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000478901:exon_1635478_1635555:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 1635565 C/T 1 10 18 28 4.54518332362253 9.81867001747944 -5.27348669385691 A:T:C C T 10 0.545481667637747 0.0567424992356573 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 2441358 T/C 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 T:C T C 10 0.545481667637747 0.243356459282646 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2441232_2441369:PANK4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 77 107 184 34.9979115918935 58.3665384372389 -23.3686268453454 A:G A G 10 0.545481667637747 0.000627404570484096 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 3548136 T/C 1 7 12 19 3.18162832653577 6.54578001165296 -3.36415168511719 T:C T C 10 0.545481667637747 0.165823977917260 ENSG00000116213:ENST00000270708:exon_3548030_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378320:exon_3548030_3548221:WDR8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 6278414 A/G 1 12 8 20 5.45421998834704 4.36385334110198 1.09036664724506 A:G A G 10 0.545481667637747 0.660941894453713 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6278349_6278429:RNF207 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 6279370 G/C 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 C:G G C 10 0.545481667637747 0.527815080970101 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6279296_6281351:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6279296_6281359:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6279296_6280865:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6279296_6279403:RNF207 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 6313938 C/T 1 5 10 15 2.27259166181127 5.45481667637747 -3.1822250145662 T:C C T 10 0.545481667637747 0.12160675687954 ENSG00000158292:ENST00000377893:exon_6313778_6314207:GPR153 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 6314822 T/C 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 T:C T C 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000158292:ENST00000377893:exon_6314610_6315074:GPR153 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 6659505 G/A 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 A:G G A 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000162413:ENST00000377658:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000377663:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000467612:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000496707:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000463043:exon_6659107_6659512:KLHL21 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 24 19 43 10.9084399766941 10.3641516851172 0.54428829157688 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 6694574 G/A 1 18 26 44 8.18132998252056 14.1825233585814 -6.00119337606086 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0947187381000248 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 6705874 G/C 1 11 16 27 4.99970165598478 8.72770668220395 -3.72800502621917 C:G G C 10 0.545481667637747 0.177085561534340 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 6705944 C/T 1 11 12 23 4.99970165598478 6.54578001165296 -1.54607835566818 T:C C T 10 0.545481667637747 0.536843443422341 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6705931_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000349363:exon_6705931_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000473993:exon_6705936_6706038:DNAJC11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 9323910 G/A 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:G G A 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 9416418 G/A 1 1 8 9 0.454518332362253 4.36385334110198 -3.90933500873972 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0140456952017061 ENSG00000171621:ENST00000328089:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000450402:exon_9415802_9416556:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000357898:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000377399:exon_9415766_9416644:SPSB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 9781643 C/T 1 40 35 75 18.1807332944901 19.0918583673211 -0.911125072831023 A:T:C C T 10 0.545481667637747 0.907795420376526 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9781502_9781645:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9781502_9781645:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9781502_9781645:PIK3CD HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 9784423 C/T 1 69 49 118 31.3617649329955 26.7286017142496 4.63316321874586 T:C C T 10 0.545481667637747 0.406814153543463 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9784334_9784479:PIK3CD HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 9804693 C/T 1 17 12 29 7.7268116501583 6.54578001165296 1.18103163850534 T:C C T 10 0.545481667637747 0.712372034204297 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9804453_9804701:CLSTN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 9811541 A/G 1 20 18 38 9.09036664724506 9.81867001747944 -0.728303370234384 A:G A G 10 0.545481667637747 0.871215003267403 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9811531_9811639:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9811531_9811739:CLSTN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 10460485 T/C 1 61 79 140 27.7256182740974 43.093051743382 -15.3674334692846 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0106715801663869 ENSG00000142657:ENST00000491493:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000477958:exon_10460433_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000465632:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10460450_10460629:PGD HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 40 90 130 18.1807332944901 49.0933500873972 -30.9126167929071 T:C C T 10 0.545481667637747 7.2752933084416e-08 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 11087356 C/T 1 14 13 27 6.36325665307154 7.09126167929071 -0.728005026219168 T:C C T 10 0.545481667637747 0.847782191919342 ENSG00000009724:ENST00000400897:exon_11086580_11087705:MASP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 13 13 26 5.90873832070929 7.09126167929071 -1.18252335858142 A:G G A 10 0.545481667637747 0.696126980810445 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 11856378 G/A 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11856263_11856456:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11856263_11856456:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11856263_11856456:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11856263_11856456:MTHFR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 12 29 41 5.45421998834704 15.8189683614947 -10.3647483731476 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00143080552777726 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 12164437 C/T 1 18 11 29 8.18132998252056 6.00029834401522 2.18103163850534 T:C C T 10 0.545481667637747 0.460258162140569 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12164436_12164588:TNFRSF8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 12198297 T/C 1 33 40 73 14.9991049679544 21.8192667055099 -6.82016173755553 T:C T C 10 0.545481667637747 0.126250300743340 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 15755248 C/T 1 93 65 158 42.2702049096895 35.4563083964536 6.81389651323598 T:C C T 10 0.545481667637747 0.29928133201915 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 17736432 G/A 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 A:G G A 10 0.545481667637747 0.779228340946012 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 19499560 T/C 1 14 13 27 6.36325665307154 7.09126167929071 -0.728005026219168 T:C T C 10 0.545481667637747 0.847782191919342 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000419533:exon_19499358_19499587:UBR4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 19565344 C/G 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 C:G C G 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19565289_19565351:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19565289_19565348:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19565289_19565351:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375197:exon_19565289_19565348:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19565289_19565351:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000467423:exon_19565121_19566479:KIAA0090 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 19566881 C/T 1 8 11 19 3.63614665889802 6.00029834401522 -2.36415168511719 T:C C T 10 0.545481667637747 0.357710103923903 ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000467423:exon_19566791_19567198:KIAA0090 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 20020993 A/G 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000490234:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000494342:exon_20020985_20021044:TMCO4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 20020994 C/T 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000490234:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000494342:exon_20020985_20021044:TMCO4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 20977221 A/T 1 12 17 29 5.45421998834704 9.2731883498417 -3.81896836149466 A:T A T 10 0.545481667637747 0.191679709049513 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 20978832 T/C 1 269 258 527 122.265431405446 140.734270250539 -18.4688388450926 A:T:C T C 10 0.545481667637747 0.115235651502331 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20978270_20979021:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20978685_20979021:DDOST HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 104 60 164 47.2699065656743 32.7289000582648 14.5410065074095 A:C:G G A 10 0.545481667637747 0.0229798357714323 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 24077451 C/T 1 38 31 69 17.2716966297656 16.9099316967702 0.36176493299546 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 24180962 T/C 1 35 43 78 15.9081416326789 23.4557117084231 -7.54757007574426 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0891165402499104 ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24180850_24181050:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24180850_24181050:FUCA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 27 4 31 12.2719949737808 2.18192667055099 10.0900683032298 T:C T C 10 0.545481667637747 0.000190699221330373 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 29 7 36 13.1810316385053 3.81837167346423 9.36265996504111 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00210464309884440 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 24201094 G/C 1 17 4 21 7.7268116501583 2.18192667055099 5.54488497960731 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0155604230463135 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 24201109 C/T 1 15 3 18 6.8177749854338 1.63644500291324 5.18132998252055 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0163493059861476 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 11 9 20 4.99970165598478 4.90933500873972 0.0903666472450606 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 24201357 A/G 1 10 8 18 4.54518332362253 4.36385334110198 0.181329982520555 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 24201448 C/T 1 16 14 30 7.27229331779605 7.63674334692846 -0.364450029132409 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 12 11 23 5.45421998834704 6.00029834401522 -0.546078355668181 A:G G A 10 0.545481667637747 0.837030175057015 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 24201919 T/C 1 7 2 9 3.18162832653577 1.09096333527549 2.09066499126028 T:C T C 10 0.545481667637747 0.195909819758449 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 24201920 T/C 1 7 2 9 3.18162832653577 1.09096333527549 2.09066499126028 T:C T C 10 0.545481667637747 0.195909819758449 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 25554719 G/A 1 73 89 162 33.1798382624445 48.5478684197595 -15.368030157315 A:T:G G A 10 0.545481667637747 0.0177064226530951 ENSG00000117614:ENST00000236273:exon_25554609_25554726:SYF2;ENSG00000117614:ENST00000354361:exon_25554609_25554726:SYF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 25570081 T/C 1 118 129 247 53.6331632187459 70.3671351252694 -16.7339719065235 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0348971005123948 ENSG00000117616:ENST00000498238:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000243189:exon_25570041_25570124:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000473314:exon_25570041_25570715:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000417642:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000475766:exon_25570041_25570124:C1orf63 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 25889632 T/C 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 T:C T C 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000157978:ENST00000374338:exon_25889561_25889644:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000488127:exon_25889561_25889644:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000484476:exon_25889307_25889644:LDLRAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 26644537 C/A 1 918 963 1881 417.247829108548 525.29884593515 -108.051016826602 A:T:C C A 10 0.545481667637747 6.26676327382451e-07 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26644448_26644562:CD52;ENSG00000169442:ENST00000492808:exon_26644449_26644562:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26644449_26644562:CD52 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 12 16 28 5.45421998834704 8.72770668220395 -3.27348669385692 A:G G A 10 0.545481667637747 0.255806345342211 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 26883511 A/C 1 45 34 79 20.4533249563014 18.5463766996834 1.90694825661799 A:C A C 10 0.545481667637747 0.735017147086944 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000488985:exon_26883489_26883527:RPS6KA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 63 50 113 28.6346549388219 27.2740833818873 1.36057155693459 T:C T C 10 0.545481667637747 0.850342217547957 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 26900735 C/G 1 98 77 175 44.5427965715008 42.0020884081065 2.54070816339428 C:G C G 10 0.545481667637747 0.761506755654414 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 87 64 151 39.543094915516 34.9108267288158 4.63226818670021 T:G T G 10 0.545481667637747 0.463145290459321 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 29529699 T/C 1 16 4 20 7.27229331779605 2.18192667055099 5.09036664724506 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0243164073781052 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475773:exon_29529643_29529713:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463412:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000453185:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29529654_29529745:MECR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 29542637 A/G 1 24 13 37 10.9084399766941 7.09126167929071 3.81717829740336 A:G A G 10 0.545481667637747 0.248606432535613 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29542513_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29542549_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29542605_29542648:MECR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 31426815 A/G 1 25 16 41 11.3629583090563 8.72770668220395 2.63525162685237 A:C:G A G 10 0.545481667637747 0.436932819585099 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 59 68 127 26.8165816093729 37.0927533993668 -10.2761717899939 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0745443357997322 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 33245802 C/G 1 123 134 257 55.9057548805571 73.0945434634581 -17.188788582901 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0331464072519098 ENSG00000134684:ENST00000469100:exon_33245686_33245879:YARS;ENSG00000134684:ENST00000373477:exon_33245686_33245879:YARS;ENSG00000134684:ENST00000490826:exon_33244983_33246312:YARS;ENSG00000134684:ENST00000487404:exon_33245686_33245879:YARS;ENSG00000134684:ENST00000478828:exon_33245686_33245879:YARS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 21 14 35 9.54488497960731 7.63674334692846 1.90814163267886 A:G A G 10 0.545481667637747 0.611609620786406 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 35921764 G/C 1 10 16 26 4.54518332362253 8.72770668220395 -4.18252335858142 C:G G C 10 0.545481667637747 0.116095624224208 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000485551:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000335883:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000440579:exon_35921614_35921842:KIAA0319L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 36225948 T/C 1 14 7 21 6.36325665307154 3.81837167346423 2.54488497960731 T:C T C 10 0.545481667637747 0.283556941871978 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 36557619 G/A 1 31 15 46 14.0900683032298 8.1822250145662 5.90784328866364 A:G G A 10 0.545481667637747 0.102475059089078 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36557511_36557695:ADPRHL2;ENSG00000116863:ENST00000468594:exon_36557511_36557695:ADPRHL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 36807481 C/T 1 23 22 45 10.4539216443318 12.0005966880304 -1.54667504369861 T:C C T 10 0.545481667637747 0.656258473337138 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36805225_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36805225_36807574:STK40 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 37948780 A/C 1 15 16 31 6.8177749854338 8.72770668220395 -1.90993169677016 A:C A C 10 0.545481667637747 0.589243588768345 ENSG00000163874:ENST00000373087:exon_37948338_37949978:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000373082:exon_37948338_37949817:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000492829:exon_37948035_37949976:ZC3H12A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 16 13 29 7.27229331779605 7.09126167929071 0.181031638505338 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 40431685 C/T 1 19 20 39 8.63584831488281 10.9096333527549 -2.27378503787213 T:C C T 10 0.545481667637747 0.521371073133049 ENSG00000168389:ENST00000372811:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000450641:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000434861:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000420632:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000372809:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000525305:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000483824:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000412699:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000469745:exon_40431529_40431686:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000480630:exon_40431529_40431686:MFSD2A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 40773123 G/C 1 24 18 42 10.9084399766941 9.81867001747944 1.08976995921463 C:G G C 10 0.545481667637747 0.759357190163115 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 40773149 T/C 1 15 18 33 6.8177749854338 9.81867001747944 -3.00089503204565 T:C T C 10 0.545481667637747 0.300591355607069 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 40981251 G/A 1 12 17 29 5.45421998834704 9.2731883498417 -3.81896836149466 A:G G A 10 0.545481667637747 0.191679709049513 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 5 16 21 2.27259166181127 8.72770668220395 -6.45511502039269 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00699926557592017 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 43630156 A/C 1 222 220 442 100.90306978442 120.005966880304 -19.1028970958842 A:C:G A C 10 0.545481667637747 0.0696058273523587 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43629855_43630164:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000431635:exon_43629993_43630164:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43630017_43630164:EBNA1BP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 43853237 C/T 1 21 19 40 9.54488497960731 10.3641516851172 -0.819266705509879 T:C C T 10 0.545481667637747 0.874215754851831 ENSG00000159479:ENST00000290663:exon_43853174_43853318:MED8;ENSG00000159479:ENST00000362029:exon_43853174_43853318:MED8;ENSG00000159479:ENST00000372457:exon_43853174_43853318:MED8;ENSG00000159479:ENST00000372455:exon_43853174_43853300:MED8;ENSG00000159479:ENST00000473560:exon_43853174_43853318:MED8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 43919413 A/G 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 A:G A G 10 0.545481667637747 0.782586339670189 ENSG00000178922:ENST00000372434:exon_43919266_43919496:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372432:exon_43919266_43919634:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372427:exon_43917876_43919580:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372425:exon_43919266_43919464:HYI;ENSG00000178922:ENST00000486909:exon_43919266_43919519:HYI;ENSG00000178922:ENST00000469587:exon_43919266_43919479:HYI HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 44415415 C/T 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 T:C C T 10 0.545481667637747 0.152855532002609 ENSG00000117408:ENST00000372343:exon_44415089_44415825:IPO13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 44441533 A/G 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:C:G A G 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000117410:ENST00000532072:exon_44441509_44441845:ATP6V0B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 44447413 G/C 1 10 14 24 4.54518332362253 7.63674334692846 -3.09156002330593 C:G G C 10 0.545481667637747 0.223659279774392 ENSG00000117411:ENST00000372324:exon_44447361_44447596:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000497866:exon_44447361_44447595:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000434555:exon_44447405_44447596:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000356836:exon_44447361_44447596:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000309519:exon_44447361_44447596:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000485678:exon_44447361_44447596:B4GALT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 44451234 C/T 1 36 35 71 16.3626599650411 19.0918583673211 -2.72919840228003 T:C C T 10 0.545481667637747 0.552157473949243 ENSG00000117411:ENST00000372324:exon_44451189_44451293:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000434555:exon_44451189_44451293:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000356836:exon_44451189_44451293:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000309519:exon_44451189_44451293:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000481924:exon_44451189_44451878:B4GALT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 46500744 G/C 1 12 15 27 5.45421998834704 8.1822250145662 -2.72800502621917 C:G G C 10 0.545481667637747 0.336084534017515 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 46827283 A/G 1 25 18 43 11.3629583090563 9.81867001747944 1.54428829157688 A:C:G A G 10 0.545481667637747 0.650218906276211 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 47024454 G/A 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 A:G G A 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000079277:ENST00000342571:exon_47023090_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371946:exon_47023090_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371945:exon_47023091_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371949:exon_47023091_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000396306:exon_47023091_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371944:exon_47023091_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000341183:exon_47023091_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000524749:exon_47023905_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000528077:exon_47024065_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000428112:exon_47024371_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000532897:exon_47024428_47024472:MKNK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 47027240 T/C 0 11 0 11 4.99970165598478 0 4.99970165598478 T T 10 0.545481667637747 0.00144330453530437 ENSG00000079277:ENST00000342571:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371946:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371945:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371944:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000341183:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000528077:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000428112:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000532897:exon_47027150_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000530528:exon_47027149_47027314:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000531355:exon_47027154_47027345:MKNK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 47048928 G/A 1 9 4 13 4.09066499126028 2.18192667055099 1.90873832070929 A:C:G G A 10 0.545481667637747 0.405734407269743 ENSG00000079277:ENST00000342571:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371946:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371945:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371949:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000396306:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371944:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000341183:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000528077:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000428112:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000531355:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000532783:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000496619:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000528237:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000526513:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000484301:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000486716:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000480531:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000529170:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000531769:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000465783:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000474868:exon_47048900_47049001:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000532110:exon_47048900_47049001:MKNK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 7 11 18 3.18162832653577 6.00029834401522 -2.81867001747945 A:G A G 10 0.545481667637747 0.237085594735494 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 47767914 G/A 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000447475:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000413565:exon_47767906_47768018:STIL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 47799639 G/C 1 24 38 62 10.9084399766941 20.7283033702344 -9.81986339354031 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0148704468824094 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47799481_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000471289:exon_47799551_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47799586_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371870:exon_47799613_47799788:CMPK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 52264064 A/G 1 63 44 107 28.6346549388219 24.0011933760609 4.63346156276107 A:G A G 10 0.545481667637747 0.383803284267314 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52263921_52264083:NRD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 53676448 G/A 1 32 27 59 14.5445866355921 14.7280050262192 -0.183418390627072 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 53679229 A/G 1 28 29 57 12.7265133061431 15.8189683614947 -3.09245505535158 A:G A G 10 0.545481667637747 0.427331927866647 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53678936_53679869:CPT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 53681699 T/G 1 36 30 66 16.3626599650411 16.3644500291324 -0.00179006409129912 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000162384:ENST00000294360:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000483739:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000470385:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000478839:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000371480:exon_53681663_53681728:C1orf123 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 53716416 G/A 1 9 11 20 4.09066499126028 6.00029834401522 -1.90963335275494 A:G G A 10 0.545481667637747 0.501706253434889 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53716362_53716534:LRP8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 53732315 G/T 1 9 20 29 4.09066499126028 10.9096333527549 -6.81896836149466 T:G G T 10 0.545481667637747 0.0142221439166050 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000459674:exon_53732145_53734270:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000475501:exon_53732145_53732319:LRP8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 53792651 A/C 0 8 0 8 3.63614665889802 0 3.63614665889802 A A 10 0.545481667637747 0.0096600748165856 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000496580:exon_53792545_53792664:LRP8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 55188382 C/T 1 11 6 17 4.99970165598478 3.27289000582648 1.7268116501583 T:C C T 10 0.545481667637747 0.471137770776418 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55188348_55188472:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55188348_55188472:TTC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 62960101 A/G 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 A:G A G 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000116641:ENST00000371140:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000395441:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000251157:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000340370:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000454575:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000479983:exon_62959946_62960969:DOCK7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 63284830 G/A 1 13 15 28 5.90873832070929 8.1822250145662 -2.27348669385692 A:G G A 10 0.545481667637747 0.44954716189734 ENSG00000125703:ENST00000317868:exon_63284676_63285006:ATG4C;ENSG00000125703:ENST00000371120:exon_63284676_63285006:ATG4C;ENSG00000125703:ENST00000371118:exon_63284676_63284850:ATG4C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 63991267 T/C 1 7 12 19 3.18162832653577 6.54578001165296 -3.36415168511719 T:C T C 10 0.545481667637747 0.165823977917260 ENSG00000203965:ENST00000480886:exon_63991243_63991430:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000371088:exon_63991243_63991430:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000448122:exon_63991243_63991430:EFCAB7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 64117414 G/A 1 20 18 38 9.09036664724506 9.81867001747944 -0.728303370234384 A:G G A 10 0.545481667637747 0.871215003267403 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64117340_64117523:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64117340_64117523:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000483707:exon_64117026_64117523:PGM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 65310489 T/C 1 31 15 46 14.0900683032298 8.1822250145662 5.90784328866364 T:C T C 10 0.545481667637747 0.102475059089078 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65310437_65310572:JAK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 65311262 G/A 1 14 22 36 6.36325665307154 12.0005966880304 -5.63734003495889 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0661642395426111 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 70904800 G/T 1 40 52 92 18.1807332944901 28.3650467171628 -10.1843134226727 T:G G T 10 0.545481667637747 0.0361564994283901 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70904784_70905253:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70904784_70905252:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70904784_70904887:CTH;ENSG00000116761:ENST00000482383:exon_70904784_70904915:CTH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 74665493 G/A 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000254685:ENST00000467578:exon_74665348_74665529:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000524915:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000482102:exon_74665348_74665529:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370898:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000529485:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370894:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000534056:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000472069:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000116783:ENST00000370899:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000370895:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000534632:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000533006:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000370891:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000370893:exon_74665348_74665515:TNNI3K HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 84944989 A/G 1 55 35 90 24.9985082799239 19.0918583673211 5.90664991260277 A:G A G 10 0.545481667637747 0.244271512742775 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 84961108 G/A 1 40 49 89 18.1807332944901 26.7286017142496 -8.54786841975948 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0710912820378917 ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84961056_84961138:RPF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 85031576 G/T 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 T:G G T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000122432:ENST00000263717:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000361426:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000460286:exon_85031544_85031877:SPATA1;ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85031524_85031695:CTBS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 85113203 T/C 1 3 11 14 1.36355499708676 6.00029834401522 -4.63674334692846 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0151104593398819 ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85109390_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85109599_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85113022_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85113024_85113290:SSX2IP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 85724328 C/T 1 23 15 38 10.4539216443318 8.1822250145662 2.27169662976561 T:C C T 10 0.545481667637747 0.516781951791391 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 85742012 G/C 1 10 21 31 4.54518332362253 11.4551150203927 -6.90993169677016 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0176730843802818 ENSG00000142867:ENST00000394761:exon_85741979_85742480:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000370580:exon_85741979_85742773:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000271015:exon_85741979_85742479:BCL10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 14 20 34 6.36325665307154 10.9096333527549 -4.5463766996834 T:C T C 10 0.545481667637747 0.124232616500542 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 19 21 40 8.63584831488281 11.4551150203927 -2.81926670550988 T:C C T 10 0.545481667637747 0.428110736064814 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 86838158 C/T 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 T:C C T 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000524695:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000496592:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000479890:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000486557:exon_86838114_86838264:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86838114_86838223:ODF2L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 89352980 C/T 1 23 15 38 10.4539216443318 8.1822250145662 2.27169662976561 T:C C T 10 0.545481667637747 0.516781951791391 ENSG00000137947:ENST00000370500:exon_89352944_89353050:GTF2B;ENSG00000137947:ENST00000448623:exon_89352944_89353050:GTF2B;ENSG00000137947:ENST00000494819:exon_89352944_89353050:GTF2B;ENSG00000137947:ENST00000418217:exon_89352959_89353050:GTF2B;ENSG00000137947:ENST00000471296:exon_89352944_89353050:GTF2B;ENSG00000137947:ENST00000471471:exon_89352944_89353050:GTF2B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 89426902 G/A 1 33 24 57 14.9991049679544 13.0915600233059 1.90754494464842 A:G G A 10 0.545481667637747 0.690431019160232 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 89474818 A/G 1 12 1 13 5.45421998834704 0.545481667637747 4.90873832070929 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00903518436202255 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000461384:exon_89474527_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000445969:exon_89474618_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89474782_89474823:GBP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 89475135 C/T 1 11 2 13 4.99970165598478 1.09096333527549 3.90873832070929 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0470034688879142 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000461384:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000445969:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89475075_89475177:GBP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 89522646 G/C 1 14 5 19 6.36325665307154 2.72740833818873 3.63584831488281 C:G G C 10 0.545481667637747 0.109537367994142 ENSG00000117228:ENST00000422952:exon_89522537_89522728:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89522537_89522817:GBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 89579941 T/C 1 37 42 79 16.8171782974034 22.9102300407854 -6.09305174338201 T:C T C 10 0.545481667637747 0.176458598025202 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89579699_89579979:GBP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 89582690 G/C 1 26 33 59 11.8174766414186 18.0008950320457 -6.18341839062707 C:G G C 10 0.545481667637747 0.117116051374855 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 93306317 G/A 1 9 6 15 4.09066499126028 3.27289000582648 0.817774985433796 A:G G A 10 0.545481667637747 0.797861210956256 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 65 70 135 29.5436916035464 38.1837167346423 -8.64002513109584 A:G G A 10 0.545481667637747 0.142196338830766 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 93672723 A/C 1 12 4 16 5.45421998834704 2.18192667055099 3.27229331779605 A:C A C 10 0.545481667637747 0.132268379253018 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 93744055 G/A 1 11 5 16 4.99970165598478 2.72740833818873 2.27229331779605 A:G G A 10 0.545481667637747 0.319450493523029 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93744020_93744164:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93744020_93744270:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93744020_93744270:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93744020_93744287:CCDC18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 94343233 T/C 1 74 54 128 33.6343565948067 29.4560100524383 4.17834654236839 T:C T C 10 0.545481667637747 0.478701657320648 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94343029_94343439:DNTTIP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 100316589 A/G 1 12 1 13 5.45421998834704 0.545481667637747 4.90873832070929 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00903518436202255 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100316531_100316680:AGL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 100340787 G/A 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000477753:exon_100340710_100340812:AGL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 100358103 C/T 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100357988_100358163:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100357988_100358163:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100357988_100358163:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100357988_100358163:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100357988_100358163:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100357988_100358163:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100357988_100358163:AGL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 100575933 G/A 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000156876:ENST00000287482:exon_100575848_100576039:SASS6;ENSG00000156876:ENST00000462159:exon_100575848_100576039:SASS6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 109351501 A/G 1 9 16 25 4.09066499126028 8.72770668220395 -4.63704169094367 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0715909203080173 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109351405_109352148:STXBP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 109547295 G/T 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 T:G G T 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000085433:ENST00000400794:exon_109547214_109547340:WDR47;ENSG00000085433:ENST00000369962:exon_109547214_109547337:WDR47;ENSG00000085433:ENST00000361054:exon_109547214_109547337:WDR47;ENSG00000085433:ENST00000369965:exon_109547214_109547340:WDR47;ENSG00000085433:ENST00000357672:exon_109547214_109547337:WDR47;ENSG00000085433:ENST00000407372:exon_109547214_109547340:WDR47 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 110279701 C/T 1 19 13 32 8.63584831488281 7.09126167929071 1.5445866355921 T:C C T 10 0.545481667637747 0.600655390935048 ENSG00000134202:ENST00000256594:exon_110276554_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000361066:exon_110279124_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000486823:exon_110279552_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000476321:exon_110279597_110280189:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000488824:exon_110279598_110279791:GSTM3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 110466466 T/C 1 21 18 39 9.54488497960731 9.81867001747944 -0.27378503787213 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 27 18 45 12.2719949737808 9.81867001747944 2.45332495630139 A:C C A 10 0.545481667637747 0.549935916866795 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 110883569 A/T 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 A:T A T 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 111773568 G/C 1 5 9 14 2.27259166181127 4.90933500873972 -2.63674334692846 C:G G C 10 0.545481667637747 0.185033796786841 ENSG00000064886:ENST00000530597:exon_111773364_111773736:CHI3L2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/T 1 301 57 358 136.810018041038 31.0924550553516 105.717562985687 T:C C T 10 0.545481667637747 3.40890254785330e-32 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 113197203 A/G 1 100 74 174 45.4518332362253 40.3656434051933 5.08618983103203 A:G A G 10 0.545481667637747 0.447657393042296 ENSG00000116489:ENST00000263168:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000393426:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000498626:exon_113197087_113197293:CAPZA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 113236681 C/T 1 18 18 36 8.18132998252056 9.81867001747944 -1.63734003495889 T:C C T 10 0.545481667637747 0.618217725988323 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113236527_113236794:MOV10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 113237171 A/G 1 26 26 52 11.8174766414186 14.1825233585814 -2.36504671716284 A:G A G 10 0.545481667637747 0.57806548721543 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 113239382 G/A 1 23 27 50 10.4539216443318 14.7280050262192 -4.27408338188735 A:G G A 10 0.545481667637747 0.256439941547007 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113239361_113239468:MOV10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 34 25 59 15.4536233003166 13.6370416909437 1.81658160937293 T:C T C 10 0.545481667637747 0.69576291385753 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 113242299 C/A 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 A:C C A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113242080_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113242246_113242432:MOV10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 48 31 79 21.8168799533881 16.9099316967702 4.90694825661799 T:C C T 10 0.545481667637747 0.309409499126367 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 114948281 A/G 1 15 8 23 6.8177749854338 4.36385334110198 2.45392164433182 A:G A G 10 0.545481667637747 0.403122215406532 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000476908:exon_114946948_114948381:TRIM33 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 120285546 G/A 1 17 2 19 7.7268116501583 1.09096333527549 6.63584831488281 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00195780534407219 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120285430_120285667:PHGDH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 144916748 C/G 1 12 2 14 5.45421998834704 1.09096333527549 4.36325665307154 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0281573227603282 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144916705_144916749:PDE4DIP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 144917595 T/C 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 T:C T C 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144917499_144917636:PDE4DIP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 144918957 T/A 0 9 0 9 4.09066499126028 0 4.09066499126028 T T 10 0.545481667637747 0.00510371084910098 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000525886:exon_144918833_144919011:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144918833_144918991:PDE4DIP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 144922583 G/A 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 A:G G A 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144922519_144922638:PDE4DIP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 0 0 96 96 0 52.3662400932237 -52.3662400932237 A G A 10 0.545481667637747 1.33332136723404e-33 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 101 101 0 55.0936484314124 -55.0936484314124 C T C 10 0.545481667637747 2.58637719234135e-35 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 50 50 0 27.2740833818873 -27.2740833818873 T:C G T 10 0.545481667637747 7.54345369222855e-18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 58 58 0 31.6379367229893 -31.6379367229893 A C A 10 0.545481667637747 1.37398333502249e-20 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 117 0 117 53.1786448863836 0 53.1786448863836 G G 10 0.545481667637747 1.96842758236243e-31 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 87 87 0 47.456905084484 -47.456905084484 C T C 10 0.545481667637747 1.61054252999153e-30 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 118 118 0 64.3668367812541 -64.3668367812541 T C T 10 0.545481667637747 3.90001017046181e-41 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 145598272 G/A 1 8 2 10 3.63614665889802 1.09096333527549 2.54518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 0.123918791716156 ENSG00000186141:ENST00000334163:exon_145598244_145598295:POLR3C;ENSG00000186141:ENST00000369294:exon_145598244_145598295:POLR3C;ENSG00000186141:ENST00000489436:exon_145598244_145598295:POLR3C;ENSG00000186141:ENST00000471254:exon_145598256_145598295:POLR3C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 147096794 A/G 1 11 4 15 4.99970165598478 2.18192667055099 2.8177749854338 A:G A G 10 0.545481667637747 0.195724131043462 ENSG00000116128:ENST00000234739:exon_147095643_147098017:BCL9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 147119273 G/A 1 13 13 26 5.90873832070929 7.09126167929071 -1.18252335858142 A:G G A 10 0.545481667637747 0.696126980810445 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 149915754 G/A 1 8 13 21 3.63614665889802 7.09126167929071 -3.45511502039269 A:G G A 10 0.545481667637747 0.187332125989055 ENSG00000163113:ENST00000369135:exon_149912231_149916964:OTUD7B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 89 68 157 40.4521315802405 37.0927533993668 3.35937818087373 T:G G T 10 0.545481667637747 0.630907222879276 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 150727539 G/A 1 41 56 97 18.6352516268524 30.5469733877138 -11.9117217608615 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0185932788489844 ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150727477_150727626:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150727477_150727626:CTSS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 150808889 C/G 1 14 12 26 6.36325665307154 6.54578001165296 -0.182523358581421 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000143437:ENST00000358595:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000322733:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000342710:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000394700:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000368975:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000471844:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000354396:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000515192:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000505755:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000468970:exon_150808756_150808975:ARNT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 151209063 C/T 1 22 15 37 9.99940331196957 8.1822250145662 1.81717829740336 T:C C T 10 0.545481667637747 0.621972675148655 ENSG00000143398:ENST00000414290:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000464105:exon_151209034_151209223:PIP5K1A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 201 195 396 91.3581848048129 106.368925189361 -15.0107403845478 T:C T C 10 0.545481667637747 0.130408243262004 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 151271520 A/G 1 33 14 47 14.9991049679544 7.63674334692846 7.36236162102589 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0392545530955499 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151271284_151271549:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151271284_151271549:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151271284_151271549:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151271284_151271549:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151271284_151271549:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151271284_151271549:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000529142:exon_151271284_151271549:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151271284_151271549:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000469239:exon_151270901_151271549:PI4KB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 26 29 55 11.8174766414186 15.8189683614947 -4.00149172007608 A:G G A 10 0.545481667637747 0.282458859602687 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 151374025 T/C 1 230 258 488 104.539216443318 140.734270250539 -36.1950538072205 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00105309409197069 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151374018_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151374018_151374410:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000474100:exon_151373715_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000466425:exon_151374018_151374106:PSMB4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 39 33 72 17.7262149621279 18.0008950320457 -0.274680069917782 A:C A C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 151825991 G/T 1 3 9 12 1.36355499708676 4.90933500873972 -3.54578001165296 T:G G T 10 0.545481667637747 0.0457815358442577 ENSG00000196407:ENST00000368817:exon_151825919_151826173:THEM5;ENSG00000196407:ENST00000368818:exon_151825919_151826173:THEM5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 151867560 G/A 1 3 12 15 1.36355499708676 6.54578001165296 -5.1822250145662 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00850383908706819 ENSG00000159445:ENST00000368814:exon_151867484_151867670:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000471464:exon_151867484_151867670:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000344296:exon_151867484_151867670:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000489410:exon_151867306_151867670:THEM4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 153909069 G/C 1 13 10 23 5.90873832070929 5.45481667637747 0.45392164433182 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000477746:exon_153909018_153909118:DENND4B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 76 78 154 34.5433932595312 42.5475700757443 -8.00417681621303 A:G A G 10 0.545481667637747 0.196580303790687 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 153926078 T/C 1 22 19 41 9.99940331196957 10.3641516851172 -0.364748373147627 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 154245917 T/C 1 87 86 173 39.543094915516 46.9114234168462 -7.36832850133023 T:C T C 10 0.545481667637747 0.285164937448426 ENSG00000143575:ENST00000328703:exon_154245812_154246074:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000483970:exon_154245812_154246074:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000447768:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000531435:exon_154245812_154246437:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000477780:exon_154245812_154246437:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000453365:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000435087:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000471326:exon_154245344_154246074:HAX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 6 13 19 2.72710999417352 7.09126167929071 -4.36415168511719 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0629589987215586 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 155206202 A/C 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:C A C 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000177628:ENST00000368373:exon_155206036_155206260:GBA;ENSG00000177628:ENST00000327247:exon_155206036_155206260:GBA;ENSG00000177628:ENST00000402928:exon_155206036_155206260:GBA;ENSG00000177628:ENST00000427500:exon_155206036_155206260:GBA;ENSG00000177628:ENST00000428024:exon_155206036_155206260:GBA;ENSG00000177628:ENST00000478472:exon_155206036_155206250:GBA;ENSG00000177628:ENST00000491081:exon_155205973_155206260:GBA;ENSG00000177628:ENST00000497670:exon_155206187_155206260:GBA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 55 54 109 24.9985082799239 29.4560100524383 -4.45750177251442 T:C C T 10 0.545481667637747 0.441760164509166 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 155289545 T/G 1 2 10 12 0.909036664724506 5.45481667637747 -4.54578001165296 T:G T G 10 0.545481667637747 0.0162200812106925 ENSG00000160752:ENST00000492887:exon_155289402_155289676:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000489324:exon_155289446_155289719:FDPS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 155735012 T/C 1 14 13 27 6.36325665307154 7.09126167929071 -0.728005026219168 T:C T C 10 0.545481667637747 0.847782191919342 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 155829511 C/T 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000132718:ENST00000368324:exon_155829300_155829586:SYT11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 156202173 A/G 1 28 33 61 12.7265133061431 18.0008950320457 -5.27438172590257 A:C:G A G 10 0.545481667637747 0.198753249991828 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368279:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000466489:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368276:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000320139:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156202111_156202216:PMF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 156213921 C/T 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 T:C C T 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000160781:ENST00000292291:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000492619:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000360733:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000335852:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000356983:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368271:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000340183:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000491107:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368270:exon_156213214_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000468632:exon_156213214_156214194:PAQR6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 156233189 C/T 1 20 12 32 9.09036664724506 6.54578001165296 2.5445866355921 T:C C T 10 0.545481667637747 0.382163131763023 ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156233186_156233361:SMG5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 156263940 T/C 1 9 11 20 4.09066499126028 6.00029834401522 -1.90963335275494 T:C T C 10 0.545481667637747 0.501706253434889 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 156264000 G/A 1 8 22 30 3.63614665889802 12.0005966880304 -8.36445002913241 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00277562188916147 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 156280969 G/A 1 308 138 446 139.991646367574 75.2764701340091 64.7151762335648 A:G G A 10 0.545481667637747 4.83641996307058e-10 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156280741_156280986:CCT3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 156280971 G/A 1 311 143 454 141.355201364661 78.0038784721978 63.3513228924629 A:G G A 10 0.545481667637747 1.69794228751838e-09 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156280741_156280986:CCT3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 156616814 C/G 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 C:G C G 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000132692:ENST00000441358:exon_156616593_156616936:BCAN;ENSG00000132692:ENST00000329117:exon_156616593_156616967:BCAN;ENSG00000132692:ENST00000457777:exon_156616593_156616967:BCAN;ENSG00000132692:ENST00000479949:exon_156616593_156616967:BCAN;ENSG00000132692:ENST00000361588:exon_156616593_156616967:BCAN;ENSG00000132692:ENST00000255029:exon_156616593_156616954:BCAN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 156697056 T/C 1 33 37 70 14.9991049679544 20.1828217025966 -5.18371673464229 T:C T C 10 0.545481667637747 0.230947138277434 ENSG00000143319:ENST00000313146:exon_156696698_156698227:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000368219:exon_156696698_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000496538:exon_156696698_156697178:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000470713:exon_156697003_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000469074:exon_156697034_156697600:ISG20L2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 156706559 A/C,G 0 0 12 12 0 6.54578001165296 -6.54578001165296 C:G A C 10 0.545481667637747 7.77350451012197e-05 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 156760887 C/A 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 A:C C A 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156760859_156760954:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000454659:exon_156760859_156760954:PRCC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 156784982 T/C 1 3 6 9 1.36355499708676 3.27289000582648 -1.90933500873972 T:C T C 10 0.545481667637747 0.316116386178568 ENSG00000027869:ENST00000368199:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000368198:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000392306:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000486350:exon_156784829_156785203:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000495306:exon_156784290_156785013:SH2D2A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 156909695 G/A 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000132694:ENST00000368194:exon_156909340_156909702:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000413909:exon_156909340_156909702:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000487682:exon_156908210_156910217:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000361409:exon_156909340_156909702:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000315174:exon_156909340_156909702:ARHGEF11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 160062340 G/A 1 12 9 21 5.45421998834704 4.90933500873972 0.544884979607314 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 160062472 C/T 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062376_160062485:IGSF8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 160062727 A/G 1 9 4 13 4.09066499126028 2.18192667055099 1.90873832070929 A:G A G 10 0.545481667637747 0.405734407269743 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062714_160063121:IGSF8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 160616703 G/T 1 114 90 204 51.8150898892968 49.0933500873972 2.72173980189962 T:G G T 10 0.545481667637747 0.725553490614935 ENSG00000117090:ENST00000302035:exon_160616660_160617085:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000235739:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000497223:exon_160616660_160616869:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000392208:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000355199:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000494463:exon_160616660_160616811:SLAMF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 829 823 1652 376.795697528308 448.931412465866 -72.135714937558 A:T:G G A 10 0.545481667637747 0.000407772692817566 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 160793442 A/G 1 9 14 23 4.09066499126028 7.63674334692846 -3.54607835566818 A:G A G 10 0.545481667637747 0.147879044249785 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 160793560 A/G 1 12 16 28 5.45421998834704 8.72770668220395 -3.27348669385692 A:G A G 10 0.545481667637747 0.255806345342211 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 100 51 151 45.4518332362253 27.8195650495251 17.6322681867002 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00412347191302051 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 139 152 291 63.1780481983532 82.9132134809375 -19.7351652825844 A:T:G G A 10 0.545481667637747 0.0216091771563725 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 161721707 C/T 1 9 16 25 4.09066499126028 8.72770668220395 -4.63704169094367 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0715909203080173 ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 165667781 T/G 1 9 5 14 4.09066499126028 2.72740833818873 1.36325665307154 T:G T G 10 0.545481667637747 0.594821470841361 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165667615_165668100:ALDH9A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 166039898 C/G 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 C:G C G 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000188859:ENST00000435676:exon_166039069_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000456900:exon_166039072_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000441649:exon_166038749_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000354422:exon_166039256_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000338353:exon_166039257_166040000:FAM78B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 166827391 G/A 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166827356_166827518:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166827356_166827518:TADA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 169293721 G/A 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 A:G G A 10 0.545481667637747 0.782586339670189 ENSG00000143156:ENST00000367811:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000525440:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000528517:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000524967:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000485609:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000491225:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000527460:exon_169293631_169293738:NME7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 169345868 A/G 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 A:G A G 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000117475:ENST00000367808:exon_169345778_169346217:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000329281:exon_169345778_169346217:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000367807:exon_169345778_169346621:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000420531:exon_169345778_169346132:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000426663:exon_169345778_169346217:BLZF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 84 55 139 38.1795399184293 30.0014917200761 8.17804819835317 A:G A G 10 0.545481667637747 0.173449099931293 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 169821135 C/T 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 T:C C T 10 0.545481667637747 0.523901512697289 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 169823718 T/C 1 15 11 26 6.8177749854338 6.00029834401522 0.817476641418578 T:C T C 10 0.545481667637747 0.844971052281341 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 21 28 49 9.54488497960731 15.2734866938569 -5.7286017142496 T:C T C 10 0.545481667637747 0.114666398750904 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 171755182 G/A 1 20 16 36 9.09036664724506 8.72770668220395 0.362659965041109 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 171763549 C/T 1 20 14 34 9.09036664724506 7.63674334692846 1.4536233003166 T:C C T 10 0.545481667637747 0.731216270033085 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000466643:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000476386:exon_171763534_171763667:METTL13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 170 147 317 77.268116501583 80.1858051427488 -2.9176886411658 T:C C T 10 0.545481667637747 0.777998396235713 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 174188285 G/A 1 33 32 65 14.9991049679544 17.4554133644079 -2.45630839645355 A:G G A 10 0.545481667637747 0.618673058679908 ENSG00000152061:ENST00000357444:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367689:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174188263_174188433:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000457696:exon_174188263_174188433:RABGAP1L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 66 50 116 29.9982099359087 27.2740833818873 2.72412655402135 T:C C T 10 0.545481667637747 0.641859593315335 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 179312752 C/T 1 8 3 11 3.63614665889802 1.63644500291324 1.99970165598478 T:C C T 10 0.545481667637747 0.364801401986479 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179312725_179312770:SOAT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 179319541 C/G 1 11 12 23 4.99970165598478 6.54578001165296 -1.54607835566818 C:G C G 10 0.545481667637747 0.536843443422341 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179319431_179319566:SOAT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 179320578 A/G 1 21 28 49 9.54488497960731 15.2734866938569 -5.7286017142496 A:G A G 10 0.545481667637747 0.114666398750904 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179320452_179320597:SOAT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 181018236 A/G 1 16 18 34 7.27229331779605 9.81867001747944 -2.5463766996834 A:G A G 10 0.545481667637747 0.39437426025059 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181018188_181018833:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181018188_181018448:MR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 182354850 A/G 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:G A G 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182354834_182355022:GLUL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 182356399 A/G 1 26 43 69 11.8174766414186 23.4557117084231 -11.6382350670045 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00530033884241875 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000484996:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000475808:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000480604:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000462444:exon_182355910_182356427:GLUL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 183513646 G/A 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 A:G G A 10 0.545481667637747 0.735500840387382 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 183876182 C/T 1 12 4 16 5.45421998834704 2.18192667055099 3.27229331779605 T:C C T 10 0.545481667637747 0.132268379253018 ENSG00000143344:ENST00000304685:exon_183876146_183876235:RGL1;ENSG00000143344:ENST00000367531:exon_183876146_183876235:RGL1;ENSG00000143344:ENST00000360851:exon_183876146_183876235:RGL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 186289510 G/A 1 56 45 101 25.4530266122862 24.5466750436986 0.906351568587556 A:G G A 10 0.545481667637747 0.92050349968184 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186289444_186289550:TPR;ENSG00000047410:ENST00000467810:exon_186289444_186289550:TPR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 186363119 C/G 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 C:G C G 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000157181:ENST00000287859:exon_186363079_186363147:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000419367:exon_186363079_186363147:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000432021:exon_186363079_186363147:C1orf27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 198671653 A/G 1 16 15 31 7.27229331779605 8.1822250145662 -0.909931696770157 A:G A G 10 0.545481667637747 0.857266052198222 ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367367:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000391970:exon_198671516_198671659:PTPRC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 198721794 C/T 1 96 92 188 43.6337599067763 50.1843134226727 -6.55055351589643 T:C C T 10 0.545481667637747 0.341976501763497 ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000352140:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000348564:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367372:exon_198721723_198721901:PTPRC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 200534248 C/T 1 3 10 13 1.36355499708676 5.45481667637747 -4.09126167929071 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0265022743429481 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200534197_200534381:KIF14 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 200635550 T/C 1 13 16 29 5.90873832070929 8.72770668220395 -2.81896836149466 T:C T C 10 0.545481667637747 0.352077308499086 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 200635560 T/C 1 18 18 36 8.18132998252056 9.81867001747944 -1.63734003495889 T:C T C 10 0.545481667637747 0.618217725988323 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 17 18 35 7.7268116501583 9.81867001747944 -2.09185836732114 A:G A G 10 0.545481667637747 0.501053345348018 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 37 22 59 16.8171782974034 12.0005966880304 4.81658160937293 A:G G A 10 0.545481667637747 0.239791197919752 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 27 30 57 12.2719949737808 16.3644500291324 -4.09245505535158 A:G G A 10 0.545481667637747 0.289643783543210 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 202977809 G/A 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 A:G G A 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000163444:ENST00000367242:exon_202977771_202977938:TMEM183A;ENSG00000163444:ENST00000468449:exon_202977771_202977938:TMEM183A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 206652427 C/G 1 7 1 8 3.18162832653577 0.545481667637747 2.63614665889802 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0793996161569039 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206652286_206652476:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000462698:exon_206652286_206652476:IKBKE HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 206769047 T/C 1 10 5 15 4.54518332362253 2.72740833818873 1.8177749854338 T:C T C 10 0.545481667637747 0.44074713691162 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 209933331 A/G 1 7 14 21 3.18162832653577 7.63674334692846 -4.45511502039269 A:G A G 10 0.545481667637747 0.077082718790732 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 209933528 G/A 1 15 7 22 6.8177749854338 3.81837167346423 2.99940331196957 A:G G A 10 0.545481667637747 0.284226176487771 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 209933540 A/G 1 7 15 22 3.18162832653577 8.1822250145662 -5.00059668803043 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0514213814172012 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 209933660 G/C 1 10 11 21 4.54518332362253 6.00029834401522 -1.45511502039269 C:G G C 10 0.545481667637747 0.662266055550669 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933601_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 209936914 C/T 1 14 21 35 6.36325665307154 11.4551150203927 -5.09185836732114 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0912306213941213 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 12 8 20 5.45421998834704 4.36385334110198 1.09036664724506 T:C T C 10 0.545481667637747 0.660941894453713 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 39 39 78 17.7262149621279 21.2737850378721 -3.54757007574426 C:G C G 10 0.545481667637747 0.428325053622776 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 211451467 T/C 1 14 15 29 6.36325665307154 8.1822250145662 -1.81896836149466 T:C T C 10 0.545481667637747 0.577160759175787 ENSG00000117625:ENST00000533469:exon_211451459_211451565:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367006:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452325:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000435653:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452621:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000528926:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000419091:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000529572:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367005:exon_211451459_211451583:RCOR3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 212276276 A/G 1 14 15 29 6.36325665307154 8.1822250145662 -1.81896836149466 A:G A G 10 0.545481667637747 0.577160759175787 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212276184_212278348:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212276184_212278186:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212276184_212277936:DTL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 212515613 C/T 1 19 12 31 8.63584831488281 6.54578001165296 2.09006830322984 T:C C T 10 0.545481667637747 0.476931260537673 ENSG00000066027:ENST00000261461:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000498129:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000479259:exon_212515530_212515622:PPP2R5A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214492286 G/A 1 11 9 20 4.99970165598478 4.90933500873972 0.0903666472450606 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214492202_214492326:SMYD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214510115 T/G 1 30 37 67 13.6355499708676 20.1828217025966 -6.54727173172905 T:G T G 10 0.545481667637747 0.112189849779479 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214510047_214510473:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214510047_214510445:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000416415:exon_214510047_214510474:SMYD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214811244 C/G 1 7 12 19 3.18162832653577 6.54578001165296 -3.36415168511719 C:G C G 10 0.545481667637747 0.165823977917260 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214811209_214811344:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214813487 A/G 1 17 18 35 7.7268116501583 9.81867001747944 -2.09185836732114 A:G A G 10 0.545481667637747 0.501053345348018 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214813782 A/G 1 17 22 39 7.7268116501583 12.0005966880304 -4.27378503787213 A:G A G 10 0.545481667637747 0.198649262012410 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214813941 C/G 1 19 23 42 8.63584831488281 12.5460783556682 -3.91023004078537 T:C:G C G 10 0.545481667637747 0.277998047807719 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214814125 G/A 1 20 14 34 9.09036664724506 7.63674334692846 1.4536233003166 A:G G A 10 0.545481667637747 0.731216270033085 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214814582 G/A 1 10 9 19 4.54518332362253 4.90933500873972 -0.364151685117192 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214814733 T/G 1 12 10 22 5.45421998834704 5.45481667637747 -0.000596688030433334 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214814778 G/A 1 9 9 18 4.09066499126028 4.90933500873972 -0.818670017479445 A:G G A 10 0.545481667637747 0.814103892547842 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214814995 C/T 1 11 15 26 4.99970165598478 8.1822250145662 -3.18252335858142 T:C C T 10 0.545481667637747 0.239869675139145 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214815916 T/C 1 7 9 16 3.18162832653577 4.90933500873972 -1.72770668220395 T:C T C 10 0.545481667637747 0.4555478790811 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214816142 T/G 1 5 9 14 2.27259166181127 4.90933500873972 -2.63674334692846 T:G T G 10 0.545481667637747 0.185033796786841 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214816224 G/A 1 12 13 25 5.45421998834704 7.09126167929071 -1.63704169094367 A:G G A 10 0.545481667637747 0.550995061740953 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214816297 A/G 1 10 13 23 4.54518332362253 7.09126167929071 -2.54607835566818 A:C:G A G 10 0.545481667637747 0.302524544988392 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214818215 G/A 1 15 9 24 6.8177749854338 4.90933500873972 1.90843997669407 A:G G A 10 0.545481667637747 0.540106773962345 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214818223 T/A 1 14 8 22 6.36325665307154 4.36385334110198 1.99940331196957 A:T T A 10 0.545481667637747 0.521742512666216 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214818846 A/G 1 20 18 38 9.09036664724506 9.81867001747944 -0.728303370234384 A:G A G 10 0.545481667637747 0.871215003267403 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214818945 A/C 1 25 29 54 11.3629583090563 15.8189683614947 -4.45601005243834 A:C A C 10 0.545481667637747 0.274155460039748 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214819328 G/A 1 33 20 53 14.9991049679544 10.9096333527549 4.08947161519941 A:G G A 10 0.545481667637747 0.273136577255204 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214819587 A/G 1 44 36 80 19.9988066239391 19.6373400349589 0.361466588980242 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214819980 C/T 1 43 46 89 19.5442882915769 25.0921567113364 -5.54786841975948 T:C C T 10 0.545481667637747 0.243425941441338 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214820299 A/G 1 23 27 50 10.4539216443318 14.7280050262192 -4.27408338188735 A:G A G 10 0.545481667637747 0.256439941547007 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214820494 G/A 1 31 28 59 14.0900683032298 15.2734866938569 -1.18341839062707 A:G G A 10 0.545481667637747 0.794501131186994 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 214820524 T/C 1 37 36 73 16.8171782974034 19.6373400349589 -2.82016173755553 T:C T C 10 0.545481667637747 0.55727025589682 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 217804325 G/A 1 4 8 12 1.81807332944901 4.36385334110198 -2.54578001165296 A:G G A 10 0.545481667637747 0.157407748991045 ENSG00000092978:ENST00000366935:exon_217804258_217804424:GPATCH2;ENSG00000092978:ENST00000366934:exon_217804258_217804424:GPATCH2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 220146680 C/T 1 46 68 114 20.9078432886636 37.0927533993668 -16.1849101107032 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00253761773363309 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220146580_220146740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220146580_220146740:EPRS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 12 25 37 5.45421998834704 13.6370416909437 -8.18282170259664 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00787196349452697 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 226030079 A/G 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 A:C:G A G 10 0.545481667637747 0.523901512697289 ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226030067_226030175:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226030067_226030175:EPHX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 226040404 C/T 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 T:C C T 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226040365_226040470:TMEM63A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 226054333 G/A 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226054274_226054382:TMEM63A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 226055595 G/A 1 5 10 15 2.27259166181127 5.45481667637747 -3.1822250145662 A:G G A 10 0.545481667637747 0.12160675687954 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226055588_226055730:TMEM63A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 226108200 C/T 1 51 62 113 23.1804349504749 33.8198633935403 -10.6394284430654 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0473520127579641 ENSG00000143811:ENST00000343818:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000478402:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316940:exon_226107608_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316918:exon_226108155_226108313:PYCR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 226923264 G/A 1 9 12 21 4.09066499126028 6.54578001165296 -2.45511502039269 A:G G A 10 0.545481667637747 0.381254161766230 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 226923396 G/A 1 9 9 18 4.09066499126028 4.90933500873972 -0.818670017479445 A:G G A 10 0.545481667637747 0.814103892547842 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 226924196 C/T 1 18 15 33 8.18132998252056 8.1822250145662 -0.000895032045649558 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 226925167 G/A 1 4 10 14 1.81807332944901 5.45481667637747 -3.63674334692846 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0615052435608368 ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 227922918 A/C 1 14 15 29 6.36325665307154 8.1822250145662 -1.81896836149466 A:C A C 10 0.545481667637747 0.577160759175787 ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227922697_227923200:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227922713_227923112:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227922713_227923090:JMJD4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 25 14 39 11.3629583090563 7.63674334692846 3.72621496212787 A:G A G 10 0.545481667637747 0.262292856314734 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 227935762 G/A 1 19 6 25 8.63584831488281 3.27289000582648 5.36295830905633 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0426103477586695 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 228362682 G/A 1 3 8 11 1.36355499708676 4.36385334110198 -3.00029834401522 A:G G A 10 0.545481667637747 0.126273306068542 ENSG00000181873:ENST00000366711:exon_228362393_228362730:C1orf69;ENSG00000181873:ENST00000484749:exon_228362393_228362730:C1orf69 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 229730452 G/A 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 A:G G A 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229728858_229730841:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229728868_229730841:TAF5L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 229772932 A/G 1 8 8 16 3.63614665889802 4.36385334110198 -0.727706682203952 A:G A G 10 0.545481667637747 0.8039768822367 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 229773441 C/T 1 14 11 25 6.36325665307154 6.00029834401522 0.362958309056325 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 13 12 25 5.90873832070929 6.54578001165296 -0.637041690943674 A:G A G 10 0.545481667637747 0.842576598281257 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 231376806 G/C 1 21 16 37 9.54488497960731 8.72770668220395 0.817178297403363 C:G G C 10 0.545481667637747 0.869526951478906 ENSG00000143633:ENST00000366649:exon_231376770_231376913:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000318906:exon_231376770_231376916:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000366651:exon_231376770_231376924:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000366648:exon_231376770_231376924:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000451322:exon_231376770_231376836:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000421623:exon_231376770_231376924:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000471936:exon_231376770_231376933:C1orf131 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 231377081 C/T 1 10 6 16 4.54518332362253 3.27289000582648 1.27229331779605 T:C C T 10 0.545481667637747 0.620225311632925 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231376919_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000436239:exon_231376953_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231376956_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231376962_231377202:GNPAT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 231401902 G/A 1 16 23 39 7.27229331779605 12.5460783556682 -5.27378503787213 A:G G A 10 0.545481667637747 0.107501222001949 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000492459:exon_231401880_231401911:GNPAT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 233086456 T/C 1 15 31 46 6.8177749854338 16.9099316967702 -10.0921567113364 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00295930892662031 ENSG00000135778:ENST00000494689:exon_233086351_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233086360_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233086370_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000496662:exon_233086379_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233086386_233086490:C1orf57 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 234509972 A/G 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 A:G A G 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000168275:ENST00000366612:exon_234509447_234510135:C1orf31 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 234529519 C/T 1 60 6 66 27.2710999417352 3.27289000582648 23.9982099359087 T:C C T 10 0.545481667637747 1.83993798592834e-10 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 234529540 G/A 1 71 4 75 32.27080159772 2.18192667055099 30.088874927169 A:G G A 10 0.545481667637747 1.30347834494549e-14 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 79 5 84 35.906948256618 2.72740833818873 33.1795399184292 T:C C T 10 0.545481667637747 1.36777791770726e-15 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 88 11 99 39.9976132478783 6.00029834401522 33.997314903863 A:G G A 10 0.545481667637747 2.75712732405862e-13 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 234541801 A/G 1 46 36 82 20.9078432886636 19.6373400349589 1.27050325370475 A:G A G 10 0.545481667637747 0.824964247153249 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234541649_234541845:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234541649_234543701:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234541649_234542126:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000481183:exon_234541649_234541845:TARBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 234546245 C/T 1 11 9 20 4.99970165598478 4.90933500873972 0.0903666472450606 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234546191_234546277:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000481183:exon_234546191_234546277:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000463793:exon_234546150_234546277:TARBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 234569192 T/C 1 11 11 22 4.99970165598478 6.00029834401522 -1.00059668803043 T:C T C 10 0.545481667637747 0.67524038559697 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234569156_234569317:TARBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 234573025 T/C 1 12 12 24 5.45421998834704 6.54578001165296 -1.09156002330593 T:C T C 10 0.545481667637747 0.685991730875607 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234573021_234573118:TARBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 234582651 T/C 1 7 13 20 3.18162832653577 7.09126167929071 -3.90963335275494 T:C T C 10 0.545481667637747 0.113949941344795 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234582549_234582721:TARBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 234584231 C/T 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234584226_234584325:TARBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 234606998 A/G 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234606934_234607003:TARBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 234744250 G/A 1 91 76 167 41.361168244965 41.4566067404688 -0.0954384955037426 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 234744413 C/A 1 43 45 88 19.5442882915769 24.5466750436986 -5.00238675212173 A:C C A 10 0.545481667637747 0.286765654171384 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 235652513 T/C 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000162885:ENST00000366600:exon_235652473_235652573:B3GALNT2;ENSG00000162885:ENST00000366599:exon_235652473_235652573:B3GALNT2;ENSG00000162885:ENST00000313984:exon_235652473_235652573:B3GALNT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 22 8 30 9.99940331196957 4.36385334110198 5.63554997086759 A:T T A 10 0.545481667637747 0.0436157759212540 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 11 4 15 4.99970165598478 2.18192667055099 2.8177749854338 T:C T C 10 0.545481667637747 0.195724131043462 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 14 2 16 6.36325665307154 1.09096333527549 5.27229331779605 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00985170774699126 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236702209 C/T 1 12 4 16 5.45421998834704 2.18192667055099 3.27229331779605 T:C C T 10 0.545481667637747 0.132268379253018 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236702210 A/G 1 13 4 17 5.90873832070929 2.18192667055099 3.7268116501583 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0880868330094187 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 14 7 21 6.36325665307154 3.81837167346423 2.54488497960731 A:G G A 10 0.545481667637747 0.283556941871978 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 22 26 48 9.99940331196957 14.1825233585814 -4.18312004661185 T:C T C 10 0.545481667637747 0.247632782912701 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 24 28 52 10.9084399766941 15.2734866938569 -4.36504671716284 T:C C T 10 0.545481667637747 0.265287587211042 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 41 46 87 18.6352516268524 25.0921567113364 -6.45690508448399 T:C T C 10 0.545481667637747 0.19609929605681 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 33 39 72 14.9991049679544 21.2737850378721 -6.27468006991778 T:C T C 10 0.545481667637747 0.155586474752818 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 28 48 76 12.7265133061431 26.1831200466119 -13.4566067404688 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00252053275145592 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 35 26 61 15.9081416326789 14.1825233585814 1.72561827409744 A:G G A 10 0.545481667637747 0.700983556558899 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236740135 T/C 1 8 13 21 3.63614665889802 7.09126167929071 -3.45511502039269 T:C T C 10 0.545481667637747 0.187332125989055 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236740080_236740249:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236740080_236740249:HEATR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236746443 C/T 1 15 14 29 6.8177749854338 7.63674334692846 -0.818968361494663 T:C C T 10 0.545481667637747 0.852670497525973 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236746313_236746496:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236746313_236746496:HEATR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236748505 T/C 1 20 10 30 9.09036664724506 5.45481667637747 3.63554997086759 T:C T C 10 0.545481667637747 0.203056700745850 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236749649 T/C 1 7 9 16 3.18162832653577 4.90933500873972 -1.72770668220395 T:C T C 10 0.545481667637747 0.4555478790811 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236755837 C/T 1 11 10 21 4.99970165598478 5.45481667637747 -0.455115020392687 T:C C T 10 0.545481667637747 0.831123791313476 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236755823_236755933:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236755823_236755933:HEATR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 236758887 T/C 1 16 12 28 7.27229331779605 6.54578001165296 0.726513306143085 T:C T C 10 0.545481667637747 0.85098446461766 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236758840_236758973:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236758840_236758973:HEATR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 237048500 A/G 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237048421_237048519:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237048421_237048519:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237048421_237048519:MTR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 237054569 A/G 1 9 6 15 4.09066499126028 3.27289000582648 0.817774985433796 A:G A G 10 0.545481667637747 0.797861210956256 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237054433_237054629:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237054433_237054629:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237054433_237054629:MTR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 243419429 T/A 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:T T A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000054282:ENST00000448231:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000343783:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000391846:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000490065:exon_243419336_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243419358_243419542:SDCCAG8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 243579112 G/A 1 3 6 9 1.36355499708676 3.27289000582648 -1.90933500873972 A:G G A 10 0.545481667637747 0.316116386178568 ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000493334:exon_243579004_243579131:SDCCAG8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 245849729 G/A 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 A:G G A 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 245850506 G/C 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 C:G G C 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 245851289 G/T 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 T:G G T 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 245861571 C/T 1 9 4 13 4.09066499126028 2.18192667055099 1.90873832070929 T:C C T 10 0.545481667637747 0.405734407269743 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245861408_245861610:KIF26B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 1 249144610 G/A 1 29 29 58 13.1810316385053 15.8189683614947 -2.63793672298932 A:G G A 10 0.545481667637747 0.511580658365649 ENSG00000171163:ENST00000463519:exon_249144205_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000306601:exon_249144205_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000427146:exon_249144205_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366470:exon_249144205_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366471:exon_249144207_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000533927:exon_249144208_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000476503:exon_249144223_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366469:exon_249144239_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000477070:exon_249144241_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000482023:exon_249144244_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000412341:exon_249144244_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000451251:exon_249144265_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000315492:exon_249144265_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000470787:exon_249144481_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000462037:exon_249144576_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000474351:exon_249144583_249144715:ZNF692 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 54 50 104 24.5439899475617 27.2740833818873 -2.73009343432568 A:G G A 10 0.545481667637747 0.623038701753696 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 23 23 46 10.4539216443318 12.5460783556682 -2.09215671133636 A:G A G 10 0.545481667637747 0.556475636818224 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 5498724 G/A 1 8 8 16 3.63614665889802 4.36385334110198 -0.727706682203952 A:G G A 10 0.545481667637747 0.8039768822367 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 5498810 A/G 1 14 9 23 6.36325665307154 4.90933500873972 1.45392164433182 A:G A G 10 0.545481667637747 0.676547146622212 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 5790616 A/G 1 15 10 25 6.8177749854338 5.45481667637747 1.36295830905633 A:G A G 10 0.545481667637747 0.68954281062682 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5788794_5791990:C10orf18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 6002368 T/G 1 10 2 12 4.54518332362253 1.09096333527549 3.45421998834704 T:G T G 10 0.545481667637747 0.0775830896711619 ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 11805339 C/T 1 12 1 13 5.45421998834704 0.545481667637747 4.90873832070929 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00903518436202255 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000422887:exon_11805223_11805350:ECHDC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 11805354 A/G 0 14 0 14 6.36325665307154 0 6.36325665307154 A A 10 0.545481667637747 0.000222560078569451 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 11805357 G/A 0 14 0 14 6.36325665307154 0 6.36325665307154 G G 10 0.545481667637747 0.000222560078569451 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 12867598 C/G 1 13 9 22 5.90873832070929 4.90933500873972 0.999403311969568 C:G C G 10 0.545481667637747 0.831133867954711 ENSG00000183049:ENST00000378847:exon_12867572_12867689:CAMK1D;ENSG00000183049:ENST00000378845:exon_12867572_12868142:CAMK1D HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 13330402 T/C 1 6 12 18 2.72710999417352 6.54578001165296 -3.81867001747945 T:C T C 10 0.545481667637747 0.095953636396545 ENSG00000107537:ENST00000396913:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000453759:exon_13330360_13330541:PHYH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 13364914 C/G 1 19 20 39 8.63584831488281 10.9096333527549 -2.27378503787213 C:G C G 10 0.545481667637747 0.521371073133049 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13364835_13365047:SEPHS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 13 12 25 5.90873832070929 6.54578001165296 -0.637041690943674 T:C T C 10 0.545481667637747 0.842576598281257 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 18 22 40 8.18132998252056 12.0005966880304 -3.81926670550988 A:G A G 10 0.545481667637747 0.266713992682672 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 14976727 G/C 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 C:G G C 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000152457:ENST00000378289:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378275:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000449101:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000453695:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378246:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000357717:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378249:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000396817:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378255:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378254:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378258:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378278:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000418843:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378241:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000456122:exon_14976722_14976774:DCLRE1C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 17686334 C/T 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000136738:ENST00000377524:exon_17686124_17686378:STAM;ENSG00000136738:ENST00000460949:exon_17686124_17686378:STAM;ENSG00000136738:ENST00000445846:exon_17686207_17686378:STAM;ENSG00000136738:ENST00000377500:exon_17686207_17686378:STAM HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 24721946 A/C 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:C A C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24721924_24722122:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24721924_24722122:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24721924_24722122:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24721924_24722122:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24721924_24722122:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24721924_24722122:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24721924_24722122:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24721924_24722122:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24721924_24722122:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24721924_24722122:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24721924_24722122:KIAA1217 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 24908686 T/C 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 A:T:C T C 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000107863:ENST00000396432:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000320481:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000486374:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000376410:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000445703:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000446003:exon_24908402_24910298:ARHGAP21 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 25312895 C/A 1 3 7 10 1.36355499708676 3.81837167346423 -2.45481667637747 A:C C A 10 0.545481667637747 0.201970346156534 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 30728101 T/C 1 105 143 248 47.7244248980366 78.0038784721978 -30.2794535741612 T:C T C 10 0.545481667637747 0.000123618672190105 ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000415139:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375322:exon_30727845_30728371:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000413724:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30727751_30728203:MAP3K8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 31791311 G/A 1 13 13 26 5.90873832070929 7.09126167929071 -1.18252335858142 A:G G A 10 0.545481667637747 0.696126980810445 ENSG00000148516:ENST00000320985:exon_31791276_31791437:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000437844:exon_31791276_31791437:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000488625:exon_31791276_31791437:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000424869:exon_31791276_31791437:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000361642:exon_31791276_31791437:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000446923:exon_31791276_31791437:ZEB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 33209266 G/T 1 32 31 63 14.5445866355921 16.9099316967702 -2.36534506117806 T:G G T 10 0.545481667637747 0.613261915741647 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33209173_33209313:ITGB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 33211227 T/G 1 18 24 42 8.18132998252056 13.0915600233059 -4.91023004078537 T:G T G 10 0.545481667637747 0.162457895460962 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33211185_33211274:ITGB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 33217110 G/A 1 19 12 31 8.63584831488281 6.54578001165296 2.09006830322984 A:G G A 10 0.545481667637747 0.476931260537673 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000480226:exon_33217078_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000474568:exon_33217102_33217192:ITGB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 35302705 C/T 1 29 32 61 13.1810316385053 17.4554133644079 -4.27438172590256 T:C C T 10 0.545481667637747 0.30424690357479 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35302627_35302728:CUL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 35484949 T/G 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000095794:ENST00000488741:exon_35484793_35485070:CREM;ENSG00000095794:ENST00000474931:exon_35484830_35485027:CREM;ENSG00000095794:ENST00000468236:exon_35484837_35485027:CREM;ENSG00000095794:ENST00000344351:exon_35484845_35485070:CREM;ENSG00000095794:ENST00000490511:exon_35484937_35485027:CREM HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 35772402 G/A 1 27 31 58 12.2719949737808 16.9099316967702 -4.63793672298932 A:G G A 10 0.545481667637747 0.236917252130946 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000490012:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000493157:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000492478:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000470025:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35772158_35772406:CCNY HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 45878050 G/A 1 35 23 58 15.9081416326789 12.5460783556682 3.36206327701067 A:G G A 10 0.545481667637747 0.429600395511203 ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45877931_45878129:ALOX5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 45953767 A/G 1 16 9 25 7.27229331779605 4.90933500873972 2.36295830905633 A:G A G 10 0.545481667637747 0.423480855331424 ENSG00000165406:ENST00000453424:exon_45950035_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000319836:exon_45952817_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000395771:exon_45952817_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000395769:exon_45952954_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000476962:exon_45952959_45953991:MARCH8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 50679081 G/A 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50679021_50679166:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50679021_50679166:ERCC6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 50732280 C/T 1 9 6 15 4.09066499126028 3.27289000582648 0.817774985433796 T:C C T 10 0.545481667637747 0.797861210956256 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50732079_50732823:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000447839:exon_50732079_50732823:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000515869:exon_50732079_50732823:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000342592:exon_50732079_50732823:ERCC6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 A:G A G 10 0.545481667637747 0.527815080970101 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 58120988 C/A 1 51 33 84 23.1804349504749 18.0008950320457 5.17953991842925 A:C C A 10 0.545481667637747 0.274525348134956 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58120957_58121036:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58120957_58121020:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58120957_58121034:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58120957_58121023:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58120957_58121003:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58120957_58121027:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58120957_58121018:ZWINT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 61552692 G/T 1 13 11 24 5.90873832070929 6.00029834401522 -0.0915600233059273 T:G G T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552607_61552732:CCDC6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 61552774 C/T 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552735_61552869:CCDC6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 70101417 G/C 1 142 138 280 64.5416031954399 75.2764701340091 -10.7348669385692 C:G G C 10 0.545481667637747 0.207701474348100 ENSG00000096746:ENST00000469172:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000441000:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000265866:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000354695:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000481819:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000491200:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000490442:exon_70100931_70101608:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000478698:exon_70100931_70101608:HNRNPH3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 70225504 G/T 1 7 2 9 3.18162832653577 1.09096333527549 2.09066499126028 T:G G T 10 0.545481667637747 0.195909819758449 ENSG00000138346:ENST00000399180:exon_70225424_70225569:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000399179:exon_70225424_70225569:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000358410:exon_70225424_70225569:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000445821:exon_70225424_70225569:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000433594:exon_70225424_70225569:DNA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 70482238 G/A 1 11 15 26 4.99970165598478 8.1822250145662 -3.18252335858142 A:G G A 10 0.545481667637747 0.239869675139145 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70482212_70482334:CCAR1;ENSG00000060339:ENST00000494903:exon_70482212_70482334:CCAR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 70549579 G/A 1 60 54 114 27.2710999417352 29.4560100524383 -2.18491011070316 A:G G A 10 0.545481667637747 0.707306274817761 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70549467_70549672:CCAR1;ENSG00000060339:ENST00000480627:exon_70549467_70549629:CCAR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 70700944 A/G 1 36 33 69 16.3626599650411 18.0008950320457 -1.63823506700454 A:G A G 10 0.545481667637747 0.717929659427753 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 70863699 C/T 1 887 790 1677 403.157760805318 430.93051743382 -27.7727566285017 A:T:C C T 10 0.545481667637747 0.177452565983819 ENSG00000122862:ENST00000462445:exon_70863627_70864297:SRGN;ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70863627_70864567:SRGN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 71142420 G/A 1 36 33 69 16.3626599650411 18.0008950320457 -1.63823506700454 A:G G A 10 0.545481667637747 0.717929659427753 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 71874683 G/A 1 32 28 60 14.5445866355921 15.2734866938569 -0.728900058264818 A:G G A 10 0.545481667637747 0.897165329693736 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 71874734 G/A 1 23 24 47 10.4539216443318 13.0915600233059 -2.63763837897411 A:G G A 10 0.545481667637747 0.466307924509928 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 71874784 C/T 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 T:C C T 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 26 28 54 11.8174766414186 15.2734866938569 -3.45601005243834 T:C C T 10 0.545481667637747 0.412505555030716 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 71906150 T/C 1 7 2 9 3.18162832653577 1.09096333527549 2.09066499126028 T:C T C 10 0.545481667637747 0.195909819758449 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 72358577 G/A 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000180644:ENST00000373209:exon_72357104_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000441259:exon_72357105_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000318971:exon_72357105_72358937:PRF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 72643671 C/T 1 27 38 65 12.2719949737808 20.7283033702344 -8.45630839645355 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0454492327735007 ENSG00000166228:ENST00000299299:exon_72643267_72643805:PCBD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 73520632 A/C 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 A:C A C 10 0.545481667637747 0.527815080970101 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73520288_73520681:C10orf54 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 73521371 C/T 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73521355_73521701:C10orf54 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 76788860 C/T 1 24 25 49 10.9084399766941 13.6370416909437 -2.7286017142496 T:C C T 10 0.545481667637747 0.474554776339739 ENSG00000156650:ENST00000372725:exon_76788247_76792051:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372724:exon_76788247_76792050:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000287239:exon_76788247_76792380:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372714:exon_76788247_76790948:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372711:exon_76788247_76792380:MYST4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 76789077 G/A 1 13 23 36 5.90873832070929 12.5460783556682 -6.63734003495889 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0295264693753898 ENSG00000156650:ENST00000372725:exon_76788247_76792051:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372724:exon_76788247_76792050:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000287239:exon_76788247_76792380:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372714:exon_76788247_76790948:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372711:exon_76788247_76792380:MYST4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 67 61 128 30.452728268271 33.2743817259026 -2.82165345763161 A:G G A 10 0.545481667637747 0.657456025277722 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 81926718 A/G 1 58 64 122 26.3620632770107 34.9108267288158 -8.54876345180513 A:G A G 10 0.545481667637747 0.123063965467315 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 88930249 A/T 1 15 19 34 6.8177749854338 10.3641516851172 -3.5463766996834 A:T A T 10 0.545481667637747 0.232561835944529 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 90767482 A/G 1 68 47 115 30.9072466006332 25.6376383789741 5.2696082216591 A:G A G 10 0.545481667637747 0.349690322026876 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494410:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000460510:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000477270:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000466081:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000371857:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90767457_90767594:FAS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 91066769 C/A 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 A:C C A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 91470834 A/C 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 A:C A C 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000447580:exon_91470718_91470847:KIF20B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 91479211 G/T 1 16 17 33 7.27229331779605 9.2731883498417 -2.00089503204565 T:G G T 10 0.545481667637747 0.490545827853142 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91479176_91479463:KIF20B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 91497207 A/G 1 12 23 35 5.45421998834704 12.5460783556682 -7.09185836732114 A:T:G A G 10 0.545481667637747 0.0175265116944486 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 91522548 A/G 1 23 14 37 10.4539216443318 7.63674334692846 2.81717829740336 A:G A G 10 0.545481667637747 0.410682812854318 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91522395_91522592:KIF20B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 91528504 C/T 1 15 15 30 6.8177749854338 8.1822250145662 -1.36445002913241 T:C C T 10 0.545481667637747 0.71468425454372 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91528495_91528645:KIF20B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 96104665 T/G 1 19 26 45 8.63584831488281 14.1825233585814 -5.54667504369861 T:G T G 10 0.545481667637747 0.101611796226776 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96104610_96104690:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96104610_96104690:NOC3L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 96114835 G/A 1 21 15 36 9.54488497960731 8.1822250145662 1.36265996504111 A:G G A 10 0.545481667637747 0.738817375454975 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96114720_96114850:NOC3L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 96352265 A/G 1 19 18 37 8.63584831488281 9.81867001747944 -1.18282170259664 A:G A G 10 0.545481667637747 0.742767838498592 ENSG00000119969:ENST00000441434:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371327:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000464030:exon_96351986_96352271:HELLS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 96997670 A/G 1 488 495 983 221.804946192779 270.013425480685 -48.2084792879053 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00209837362054743 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 96997820 A/G 1 331 331 662 150.445568011906 180.554431988094 -30.1088639761885 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0191959689457558 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000492511:exon_96997697_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_96997767_96997868:PDLIM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 97440394 T/C 1 2 7 9 0.909036664724506 3.81837167346423 -2.90933500873972 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0890372070351746 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 97599537 G/C 1 148 141 289 67.2687131896135 76.9129151369223 -9.64420194730887 T:C:G G C 10 0.545481667637747 0.262055123279734 ENSG00000138185:ENST00000453258:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371206:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000481316:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371205:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371203:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000483213:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371207:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000490659:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000494070:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000461927:exon_97599057_97599565:ENTPD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 97607165 G/A 1 19 22 41 8.63584831488281 12.0005966880304 -3.36474837314763 A:G G A 10 0.545481667637747 0.347088605478900 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 97919011 A/G 1 11 9 20 4.99970165598478 4.90933500873972 0.0903666472450606 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 98287792 G/T 1 31 24 55 14.0900683032298 13.0915600233059 0.998508279923916 T:G G T 10 0.545481667637747 0.892461281179937 ENSG00000077147:ENST00000371142:exon_98287788_98287934:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000485093:exon_98287788_98287930:TM9SF3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 98369536 A/G 1 30 46 76 13.6355499708676 25.0921567113364 -11.4566067404688 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0107986544784475 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000467625:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98369469_98369624:PIK3AP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 98380137 T/C 1 46 56 102 20.9078432886636 30.5469733877138 -9.63913009905019 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0590186856809858 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98380109_98380168:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000461252:exon_98380109_98380191:PIK3AP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 48 38 86 21.8168799533881 20.7283033702344 1.08857658315376 T:C C T 10 0.545481667637747 0.829517477429344 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 98469507 C/A 1 9 15 24 4.09066499126028 8.1822250145662 -4.09156002330593 A:C C A 10 0.545481667637747 0.103711750518253 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 99006083 G/A 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000213390:ENST00000358531:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000492211:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000487035:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000371027:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000479633:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000316676:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000358308:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000355366:exon_99006029_99006094:ARHGAP19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 99116903 C/T 1 23 39 62 10.4539216443318 21.2737850378721 -10.8198633935403 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00701730955526158 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99116115_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000465394:exon_99116863_99116953:RRP12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 51 20 71 23.1804349504749 10.9096333527549 12.27080159772 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00393048034052889 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 99126249 G/A 1 24 49 73 10.9084399766941 26.7286017142496 -15.8201617375555 A:G G A 10 0.545481667637747 0.000228121240701596 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99126203_99126317:RRP12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 99141205 A/G 1 4 13 17 1.81807332944901 7.09126167929071 -5.2731883498417 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0132181654462577 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141143_99141240:RRP12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 99141484 C/T 1 7 14 21 3.18162832653577 7.63674334692846 -4.45511502039269 T:C C T 10 0.545481667637747 0.077082718790732 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141472_99141583:RRP12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 99155984 G/A 1 7 10 17 3.18162832653577 5.45481667637747 -2.2731883498417 A:G G A 10 0.545481667637747 0.332311875410834 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99155975_99156058:RRP12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 99227333 T/G 1 14 17 31 6.36325665307154 9.2731883498417 -2.90993169677016 T:G T G 10 0.545481667637747 0.367528049294024 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434392:exon_99227262_99227360:MMS19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 99410790 T/C 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 T:C T C 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000155252:ENST00000416867:exon_99410698_99410898:PI4K2A;ENSG00000155252:ENST00000370631:exon_99410698_99410898:PI4K2A;ENSG00000249967:ENST00000370649:exon_99410698_99410898:RP11-548K23.11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 99498234 G/A 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 A:G G A 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000155256:ENST00000393677:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370610:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370613:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000337540:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000497994:exon_99498234_99498406:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000356257:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000357540:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000453958:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000359980:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000462887:exon_99498234_99498602:ZFYVE27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 99504630 G/T 1 10 3 13 4.54518332362253 1.63644500291324 2.90873832070929 T:G G T 10 0.545481667637747 0.16204615807973 ENSG00000155256:ENST00000393677:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370610:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370613:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000337540:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000497994:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000356257:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000453958:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000359980:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000423811:exon_99504486_99504672:ZFYVE27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 100179851 T/C 1 12 15 27 5.45421998834704 8.1822250145662 -2.72800502621917 T:C T C 10 0.545481667637747 0.336084534017515 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000462743:exon_100179802_100180126:HPS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 100182285 T/C 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 T:C T C 10 0.545481667637747 0.527815080970101 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 100183570 G/C 1 9 14 23 4.09066499126028 7.63674334692846 -3.54607835566818 C:G G C 10 0.545481667637747 0.147879044249785 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000470095:exon_100183510_100183644:HPS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 100190920 G/A 1 13 13 26 5.90873832070929 7.09126167929071 -1.18252335858142 A:G G A 10 0.545481667637747 0.696126980810445 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100190888_100191039:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000414009:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100190888_100191048:HPS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 100190942 T/C 0 28 0 28 12.7265133061431 0 12.7265133061431 T T 10 0.545481667637747 5.15667187646696e-08 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100190888_100191039:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000414009:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100190888_100191048:HPS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 101639796 G/A 1 8 14 22 3.63614665889802 7.63674334692846 -4.00059668803043 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0916744188680922 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 101639877 A/C 1 7 13 20 3.18162832653577 7.09126167929071 -3.90963335275494 A:C A C 10 0.545481667637747 0.113949941344795 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 101645498 T/C 1 12 5 17 5.45421998834704 2.72740833818873 2.7268116501583 T:C T C 10 0.545481667637747 0.227151988982216 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101645444_101645623:DNMBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 101657880 G/A 1 12 3 15 5.45421998834704 1.63644500291324 3.8177749854338 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0670347185280012 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101657814_101658042:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101657843_101658042:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101657843_101658042:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101657843_101658042:DNMBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 101715899 G/A 1 10 6 16 4.54518332362253 3.27289000582648 1.27229331779605 A:G G A 10 0.545481667637747 0.620225311632925 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101714971_101716962:DNMBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 101995470 T/C 1 9 21 30 4.09066499126028 11.4551150203927 -7.36445002913241 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00923399106553629 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_101995424_101995521:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000468709:exon_101995424_101995521:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_101995424_101995521:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_101995424_101995521:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000482452:exon_101995424_101995521:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000478047:exon_101995424_101995521:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000370379:exon_101995424_101995521:CWF19L1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 102295836 C/G 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 C:G C G 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000166135:ENST00000299163:exon_102295616_102295892:HIF1AN;ENSG00000166135:ENST00000442724:exon_102295659_102295892:HIF1AN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 52 34 86 23.6349532828372 18.5463766996834 5.08857658315376 T:C C T 10 0.545481667637747 0.280969374451878 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 102750783 C/A 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:C C A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000107815:ENST00000476766:exon_102750626_102750811:C10orf2;ENSG00000107815:ENST00000370228:exon_102750626_102750811:C10orf2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 102762256 C/T 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000107816:ENST00000426584:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000489526:exon_102762254_102762934:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000429732:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000481129:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102759233_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000454422:exon_102762254_102762703:LZTS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 102766574 A/G 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 105758670 A/G 1 12 9 21 5.45421998834704 4.90933500873972 0.544884979607314 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105758657_105758729:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105758657_105758729:SLK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 105763026 C/T 1 14 13 27 6.36325665307154 7.09126167929071 -0.728005026219168 T:C C T 10 0.545481667637747 0.847782191919342 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 116602805 A/G 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 A:G A G 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000151553:ENST00000369248:exon_116602692_116602985:FAM160B1;ENSG00000151553:ENST00000369250:exon_116602692_116602985:FAM160B1;ENSG00000151553:ENST00000392942:exon_116602692_116602985:FAM160B1;ENSG00000151553:ENST00000455766:exon_116602692_116602985:FAM160B1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 120920588 T/C 1 6 15 21 2.72710999417352 8.1822250145662 -5.45511502039269 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0259947353194303 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 120933324 G/A 1 67 45 112 30.452728268271 24.5466750436986 5.90605322457234 A:T:G G A 10 0.545481667637747 0.296700188664497 ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000463322:exon_120933257_120933384:PRDX3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 121196335 G/A 1 27 15 42 12.2719949737808 8.1822250145662 4.08976995921463 A:G G A 10 0.545481667637747 0.218760850546111 ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121196163_121196353:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000369108:exon_121196163_121196353:GRK5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 121436362 A/G 1 7 1 8 3.18162832653577 0.545481667637747 2.63614665889802 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0793996161569039 ENSG00000151929:ENST00000369085:exon_121435976_121437331:BAG3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 121586827 A/G 1 3 7 10 1.36355499708676 3.81837167346423 -2.45481667637747 A:G A G 10 0.545481667637747 0.201970346156534 ENSG00000198825:ENST00000361976:exon_121586143_121588652:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369080:exon_121586143_121587837:INPP5F HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 121586882 A/G 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 A:G A G 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000198825:ENST00000361976:exon_121586143_121588652:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369080:exon_121586143_121587837:INPP5F HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 121671651 T/C 1 15 16 31 6.8177749854338 8.72770668220395 -1.90993169677016 T:C T C 10 0.545481667637747 0.589243588768345 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121671556_121671676:SEC23IP;ENSG00000107651:ENST00000446561:exon_121671556_121671676:SEC23IP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 121679013 A/G 1 15 12 27 6.8177749854338 6.54578001165296 0.271994973780831 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121678956_121679108:SEC23IP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 121685559 G/A 1 22 16 38 9.99940331196957 8.72770668220395 1.27169662976561 A:G G A 10 0.545481667637747 0.746021063688677 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121685548_121685739:SEC23IP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 121693246 A/G 1 40 33 73 18.1807332944901 18.0008950320457 0.17983826244447 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121693198_121693299:SEC23IP;ENSG00000107651:ENST00000475542:exon_121693198_121693282:SEC23IP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 122624679 G/A 1 7 11 18 3.18162832653577 6.00029834401522 -2.81867001747945 A:G G A 10 0.545481667637747 0.237085594735494 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000462529:exon_122624559_122624703:WDR11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 122645376 A/T 1 17 13 30 7.7268116501583 7.09126167929071 0.635549970867592 A:T A T 10 0.545481667637747 0.856505800488025 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122645326_122645450:WDR11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 122663585 G/A 1 27 35 62 12.2719949737808 19.0918583673211 -6.81986339354031 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0968716735322682 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122663559_122663654:WDR11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 123503187 T/C 1 7 13 20 3.18162832653577 7.09126167929071 -3.90963335275494 T:C T C 10 0.545481667637747 0.113949941344795 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123502626_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123502710_123503373:ATE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 123724863 G/A 1 46 34 80 20.9078432886636 18.5463766996834 2.36146658898024 A:G G A 10 0.545481667637747 0.653907610731912 ENSG00000107672:ENST00000369023:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000489266:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000468209:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000482078:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000369017:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000464321:exon_123724858_123724900:NSMCE4A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 124742895 G/C 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000496079:exon_124742806_124742986:PSTK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 126089434 G/A 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 A:G G A 10 0.545481667637747 0.152855532002609 ENSG00000065154:ENST00000368845:exon_126089409_126089553:OAT;ENSG00000065154:ENST00000471127:exon_126089409_126089553:OAT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 126311832 A/G 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 A:G A G 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000189319:ENST00000337318:exon_126307861_126312173:FAM53B;ENSG00000189319:ENST00000392754:exon_126307861_126312173:FAM53B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 134038812 G/A 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134038737_134039120:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368622:exon_134038737_134038840:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000298630:exon_134038737_134038840:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000462160:exon_134038737_134038840:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368625:exon_134038737_134038840:STK32C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 134161633 A/G 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 A:G A G 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000148814:ENST00000368615:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000392638:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000432555:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000344079:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368614:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000462656:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368613:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000356571:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368612:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000450442:exon_134161488_134161853:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368610:exon_134161488_134161860:LRRC27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 135369532 T/C 0 0 24 24 0 13.0915600233059 -13.0915600233059 C T C 10 0.545481667637747 6.04273723688866e-09 ENSG00000130649:ENST00000368520:exon_135368165_135374724:CYP2E1;ENSG00000171772:ENST00000303903:exon_135369485_135369551:SYCE1;ENSG00000171772:ENST00000432597:exon_135369485_135369551:SYCE1;ENSG00000171772:ENST00000479535:exon_135369485_135369551:SYCE1;ENSG00000171772:ENST00000368517:exon_135369485_135369551:SYCE1;ENSG00000171772:ENST00000343131:exon_135369485_135369551:SYCE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 135370633 C/T 0 0 23 23 0 12.5460783556682 -12.5460783556682 T C T 10 0.545481667637747 1.32948152068651e-08 ENSG00000130649:ENST00000368520:exon_135368165_135374724:CYP2E1;ENSG00000171772:ENST00000303903:exon_135370571_135370660:SYCE1;ENSG00000171772:ENST00000432597:exon_135370571_135370660:SYCE1;ENSG00000171772:ENST00000479535:exon_135370571_135370660:SYCE1;ENSG00000171772:ENST00000368517:exon_135370571_135370660:SYCE1;ENSG00000171772:ENST00000343131:exon_135370571_135370660:SYCE1;ENSG00000171772:ENST00000460441:exon_135370571_135370660:SYCE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 135370639 C/A 0 0 23 23 0 12.5460783556682 -12.5460783556682 A C A 10 0.545481667637747 1.32948152068651e-08 ENSG00000130649:ENST00000368520:exon_135368165_135374724:CYP2E1;ENSG00000171772:ENST00000303903:exon_135370571_135370660:SYCE1;ENSG00000171772:ENST00000432597:exon_135370571_135370660:SYCE1;ENSG00000171772:ENST00000479535:exon_135370571_135370660:SYCE1;ENSG00000171772:ENST00000368517:exon_135370571_135370660:SYCE1;ENSG00000171772:ENST00000343131:exon_135370571_135370660:SYCE1;ENSG00000171772:ENST00000460441:exon_135370571_135370660:SYCE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 10 135373591 C/T 0 0 8 8 0 4.36385334110198 -4.36385334110198 T C T 10 0.545481667637747 0.00182142476255671 ENSG00000130649:ENST00000368520:exon_135368165_135374724:CYP2E1;ENSG00000171772:ENST00000479535:exon_135372381_135373600:SYCE1;ENSG00000171772:ENST00000482127:exon_135373120_135373657:SYCE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 212408 C/T 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000177963:ENST00000530149:exon_210364_213780:RIC8A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 237087 A/G 1 34 22 56 15.4536233003166 12.0005966880304 3.45302661228617 A:G A G 10 0.545481667637747 0.42109999692412 ENSG00000185627:ENST00000532097:exon_236546_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000529372:exon_236966_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000534590:exon_236977_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000431206:exon_236977_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000528906:exon_236981_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000525665:exon_237000_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000527047:exon_237004_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000352303:exon_237026_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000382671:exon_237038_237144:PSMD13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 244197 T/C 1 53 17 70 24.0894716151994 9.2731883498417 14.8162832653577 T:C T C 10 0.545481667637747 0.000415355309999559 ENSG00000185627:ENST00000532097:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000529372:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000534590:exon_244041_244469:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000431206:exon_244041_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000528906:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000525665:exon_244041_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000527047:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000352303:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000382671:exon_244161_244216:PSMD13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 293215 C/T 1 14 35 49 6.36325665307154 19.0918583673211 -12.7286017142496 T:C C T 10 0.545481667637747 0.000276460523342926 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_292886_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_293068_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_293163_293727:ATHL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 22 20 42 9.99940331196957 10.9096333527549 -0.910230040785374 A:G A G 10 0.545481667637747 0.877111986995837 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 199 158 357 90.4491481400884 86.186103486764 4.26304465332433 A:G A G 10 0.545481667637747 0.670908387898906 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 587425 C/A 1 26 7 33 11.8174766414186 3.81837167346423 7.99910496795435 A:C C A 10 0.545481667637747 0.00485313237220065 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_587259_588497:PHRF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 840363 C/T 1 146 112 258 66.3596765248889 61.0939467754277 5.26572974946128 T:C C T 10 0.545481667637747 0.532179941824293 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 870446 G/A 1 15 26 41 6.8177749854338 14.1825233585814 -7.36474837314763 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0270707043407966 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 156 129 285 70.9048598485115 70.3671351252694 0.537724723242121 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 2424541 C/G 1 24 32 56 10.9084399766941 17.4554133644079 -6.54697338771383 C:G C G 10 0.545481667637747 0.082401663897716 ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 22 18 40 9.99940331196957 9.81867001747944 0.180733294490121 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 6340525 A/T 1 6 8 14 2.72710999417352 4.36385334110198 -1.63674334692846 A:T A T 10 0.545481667637747 0.428770074510924 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 6520015 G/T 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 T:G G T 10 0.545481667637747 0.152855532002609 ENSG00000179532:ENST00000473019:exon_6519953_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6519001_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000354685:exon_6518815_6520191:DNHD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 6532519 C/T 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6532503_6532659:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000354685:exon_6532503_6532659:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000472080:exon_6532503_6532659:DNHD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 6588228 G/A 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6588155_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525080:exon_6588155_6588582:DNHD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 6953858 A/G 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 A:G A G 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000149054:ENST00000527171:exon_6953325_6953903:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000278319:exon_6953325_6953903:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000299468:exon_6953325_6953903:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000529755:exon_6953325_6953903:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000414517:exon_6953325_6953903:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000529903:exon_6953417_6953903:ZNF215 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 7694013 T/G 1 19 19 38 8.63584831488281 10.3641516851172 -1.72830337023439 T:G T G 10 0.545481667637747 0.626589184197869 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7693979_7694686:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7693979_7694121:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000527542:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532920:exon_7693979_7694037:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000524608:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000436351:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000525307:exon_7693859_7694122:CYB5R2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 9321173 A/G 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:G A G 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000166471:ENST00000299596:exon_9321131_9321248:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000524543:exon_9321131_9321248:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000429086:exon_9321131_9321248:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000528080:exon_9321131_9321248:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000527813:exon_9321131_9321248:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000533723:exon_9321131_9321248:TMEM41B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 10515057 C/T 1 11 10 21 4.99970165598478 5.45481667637747 -0.455115020392687 T:C C T 10 0.545481667637747 0.831123791313476 ENSG00000133805:ENST00000256183:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000444303:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396554:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000534047:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396553:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529834:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000431080:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000528723:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529507:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000533116:exon_10514914_10515249:AMPD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 10517184 G/A 1 9 19 28 4.09066499126028 10.3641516851172 -6.27348669385692 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0216842964384243 ENSG00000133805:ENST00000256183:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000444303:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396554:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000534047:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396553:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529834:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000431080:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000528723:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529507:exon_10517117_10517280:AMPD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 11913585 G/T 1 12 10 22 5.45421998834704 5.45481667637747 -0.000596688030433334 T:G G T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11913515_11913653:USP47;ENSG00000170242:ENST00000525267:exon_11913537_11913653:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11913515_11913653:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11913515_11913653:USP47 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 13441126 A/G 1 7 18 25 3.18162832653577 9.81867001747944 -6.63704169094367 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00864739203202523 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13441040_13441292:BTBD10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 13443250 C/T 1 12 10 22 5.45421998834704 5.45481667637747 -0.000596688030433334 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13443189_13443362:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13443189_13443385:BTBD10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 14913575 G/A 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:G G A 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000186104:ENST00000334636:exon_14913527_14913798:CYP2R1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 18303704 G/A 1 15 17 32 6.8177749854338 9.2731883498417 -2.4554133644079 A:G G A 10 0.545481667637747 0.478253507539261 ENSG00000110756:ENST00000438420:exon_18303497_18303767:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000349215:exon_18303497_18303767:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000396253:exon_18303497_18303767:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000352460:exon_18303497_18303767:HPS5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 18319180 G/T 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 T:G G T 10 0.545481667637747 0.523901512697289 ENSG00000110756:ENST00000438420:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000349215:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000396253:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000352460:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000531848:exon_18319106_18319264:HPS5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 18505552 G/A 1 18 28 46 8.18132998252056 15.2734866938569 -7.09215671133636 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0385714450281189 ENSG00000074319:ENST00000357193:exon_18505417_18505619:TSG101;ENSG00000074319:ENST00000251968:exon_18505417_18505619:TSG101 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 18555901 C/G 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 C:G C G 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000151116:ENST00000396197:exon_18555877_18556000:UEVLD;ENSG00000151116:ENST00000379387:exon_18555877_18556000:UEVLD HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 18633897 T/C 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 27362359 T/G 1 5 9 14 2.27259166181127 4.90933500873972 -2.63674334692846 T:G T G 10 0.545481667637747 0.185033796786841 ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 33881043 G/A 1 62 66 128 28.1801366064597 36.0017900640913 -7.82165345763162 A:G G A 10 0.545481667637747 0.183020508670497 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 34482908 C/T 1 19 13 32 8.63584831488281 7.09126167929071 1.5445866355921 T:C C T 10 0.545481667637747 0.600655390935048 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34482798_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000530343:exon_34482280_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000525707:exon_34482750_34482936:CAT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 35 27 62 15.9081416326789 14.7280050262192 1.18013660645969 T:G T G 10 0.545481667637747 0.799764343060413 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 23 37 60 10.4539216443318 20.1828217025966 -9.72890005826482 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0134154080682882 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 15 16 31 6.8177749854338 8.72770668220395 -1.90993169677016 A:T:G G A 10 0.545481667637747 0.589243588768345 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 34938265 C/T 1 14 8 22 6.36325665307154 4.36385334110198 1.99940331196957 T:C C T 10 0.545481667637747 0.521742512666216 ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34938119_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34938179_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34938188_34938362:PDHX HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 34991727 T/C 1 10 12 22 4.54518332362253 6.54578001165296 -2.00059668803043 T:C T C 10 0.545481667637747 0.401468669837045 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34991686_34991833:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34991686_34991833:PDHX HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 35226155 A/G 1 15 7 22 6.8177749854338 3.81837167346423 2.99940331196957 A:G A G 10 0.545481667637747 0.284226176487771 ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531110:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534296:exon_35226059_35226456:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525241:exon_35226059_35226358:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526553:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534082:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528672:exon_35226059_35226187:CD44 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 35827958 A/G 1 13 18 31 5.90873832070929 9.81867001747944 -3.90993169677015 A:G A G 10 0.545481667637747 0.206175558984211 ENSG00000166326:ENST00000299413:exon_35827908_35829775:TRIM44;ENSG00000166326:ENST00000532066:exon_35827908_35828171:TRIM44 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 43472746 C/T 1 20 17 37 9.09036664724506 9.2731883498417 -0.182821702596637 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000052841:ENST00000039989:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525135:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525543:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000533554:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000418561:exon_43472730_43472815:TTC17 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 11 14 25 4.99970165598478 7.63674334692846 -2.63704169094367 T:G G T 10 0.545481667637747 0.319558675893505 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 21 26 47 9.54488497960731 14.1825233585814 -4.63763837897411 A:G A G 10 0.545481667637747 0.189049373285479 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 45975130 C/T 1 14 4 18 6.36325665307154 2.18192667055099 4.18132998252055 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0579373779093583 ENSG00000135365:ENST00000257821:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527401:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000323180:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000418153:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527753:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000534766:exon_45975078_45975166:PHF21A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 46332703 C/T 1 11 9 20 4.99970165598478 4.90933500873972 0.0903666472450606 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000157613:ENST00000529193:exon_46332583_46332740:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000446415:exon_46332583_46332740:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000288400:exon_46332583_46332740:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000527342:exon_46332465_46332740:CREB3L1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 46341946 C/T 0 31 0 31 14.0900683032298 0 14.0900683032298 C C 10 0.545481667637747 7.84638738970673e-09 ENSG00000157613:ENST00000529193:exon_46341815_46342079:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000446415:exon_46341815_46342080:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000288400:exon_46341815_46342080:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000530244:exon_46341815_46342079:CREB3L1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 46419348 G/A 1 14 10 24 6.36325665307154 5.45481667637747 0.908439976694073 A:G G A 10 0.545481667637747 0.838386676963374 ENSG00000110497:ENST00000314845:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000533727:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000534300:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000426438:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000314823:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000298834:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000452566:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000458649:exon_46417965_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000526545:exon_46418934_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000528950:exon_46419000_46419493:AMBRA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 57077464 T/C 1 23 10 33 10.4539216443318 5.45481667637747 4.99910496795435 T:C T C 10 0.545481667637747 0.114269878769504 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 57081197 G/C 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 C:G G C 10 0.545481667637747 0.527815080970101 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 57466111 C/T 1 28 25 53 12.7265133061431 13.6370416909437 -0.910528384800589 T:C C T 10 0.545481667637747 0.89046873383244 ENSG00000156599:ENST00000527985:exon_57466031_57466890:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000287169:exon_57466031_57466890:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000529480:exon_57466031_57466890:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000529447:exon_57466031_57466307:ZDHHC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 57509690 G/A 1 380 380 760 172.716966297656 207.283033702344 -34.5660674046877 A:C:G G A 10 0.545481667637747 0.0119630208914990 ENSG00000211450:ENST00000534355:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000533321:exon_57509281_57510529:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000388857:exon_57509589_57510129:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000528798:exon_57509589_57509699:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000534386:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000254732:ENST00000531074:exon_57509635_57509719:RP11-691N7.6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 58959633 G/A 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000110042:ENST00000532982:exon_58959571_58959723:DTX4;ENSG00000110042:ENST00000227451:exon_58959571_58959723:DTX4;ENSG00000110042:ENST00000531902:exon_58959571_58959724:DTX4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 60714062 T/C 1 65 4 69 29.5436916035464 2.18192667055099 27.3617649329955 T:C T C 10 0.545481667637747 4.03456506523775e-13 ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60714004_60714293:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60714004_60714241:SLC15A3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 61907716 G/A 1 12 15 27 5.45421998834704 8.1822250145662 -2.72800502621917 A:G G A 10 0.545481667637747 0.336084534017515 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61907706_61907757:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61907706_61907757:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61907706_61907757:INCENP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 62358931 T/G 1 10 14 24 4.54518332362253 7.63674334692846 -3.09156002330593 T:G T G 10 0.545481667637747 0.223659279774392 ENSG00000149016:ENST00000308436:exon_62358876_62359016:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000476907:exon_62358876_62359649:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000278279:exon_62358876_62358995:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000478537:exon_62358876_62358995:TUT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 63986992 C/T 0 10 0 10 4.54518332362253 0 4.54518332362253 C C 10 0.545481667637747 0.00270867480271896 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 63988045 G/A 0 0 164 164 0 89.4589934925905 -89.4589934925905 A G A 10 0.545481667637747 6.89335032050896e-57 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 64572018 T/C 1 22 22 44 9.99940331196957 12.0005966880304 -2.00119337606087 T:C T C 10 0.545481667637747 0.549117968411728 ENSG00000133895:ENST00000377316:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64571806_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64571847_64572288:MEN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 64799998 T/C 1 9 10 19 4.09066499126028 5.45481667637747 -1.36415168511719 T:C T C 10 0.545481667637747 0.646474994475887 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000525648:exon_64799903_64800023:SNX15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 64806270 C/T 1 14 9 23 6.36325665307154 4.90933500873972 1.45392164433182 T:C C T 10 0.545481667637747 0.676547146622212 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64802992_64806301:SNX15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 64807235 C/T 1 10 4 14 4.54518332362253 2.18192667055099 2.36325665307154 T:C C T 10 0.545481667637747 0.284675534132335 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64807158_64808042:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64807158_64808044:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64807158_64807264:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64807158_64808042:SNX15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 17 16 33 7.7268116501583 8.72770668220395 -1.00089503204565 T:C C T 10 0.545481667637747 0.730455650391869 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 64884052 G/A 1 4 9 13 1.81807332944901 4.90933500873972 -3.09126167929071 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0994104714946873 ENSG00000174276:ENST00000310597:exon_64883876_64885170:ZNHIT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 49 46 95 22.2713982857504 25.0921567113364 -2.82075842558596 T:C C T 10 0.545481667637747 0.606835203876894 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65064690 G/A 1 22 8 30 9.99940331196957 4.36385334110198 5.63554997086759 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0436157759212540 ENSG00000014138:ENST00000265465:exon_65064591_65066156:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000527618:exon_65064591_65065087:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000534785:exon_65064591_65065023:POLA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65161525 G/A 1 6 10 16 2.72710999417352 5.45481667637747 -2.72770668220395 A:G G A 10 0.545481667637747 0.211649836550054 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000526201:exon_65161512_65161570:FRMD8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65164357 C/T 1 13 6 19 5.90873832070929 3.27289000582648 2.63584831488281 T:C C T 10 0.545481667637747 0.256383122170611 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65164270_65164408:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000531151:exon_65164270_65164491:FRMD8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65269349 C/G 1 946 1088 2034 429.974342414691 593.484054389869 -163.509711975177 A:T:C:G C G 10 0.545481667637747 4.12905587657501e-13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65270183 C/T 1 1324 1194 2518 601.782272047623 651.30511115947 -49.5228391118469 T:C:G C T 10 0.545481667637747 0.0475984410292858 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65338944 T/G 1 44 31 75 19.9988066239391 16.9099316967702 3.08887492716898 T:G T G 10 0.545481667637747 0.489204815229557 ENSG00000173465:ENST00000309328:exon_65338862_65339241:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65338862_65339359:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000526877:exon_65338862_65339329:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000533115:exon_65338862_65339250:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527413:exon_65338862_65339239:SSSCA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 38 25 63 17.2716966297656 13.6370416909437 3.63465493882194 A:G G A 10 0.545481667637747 0.378387759949262 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 27 21 48 12.2719949737808 11.4551150203927 0.816879953388145 T:G T G 10 0.545481667637747 0.885200970200109 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 41 33 74 18.6352516268524 18.0008950320457 0.634356594806722 A:G G A 10 0.545481667637747 0.90759511605138 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65380916 G/A 1 21 16 37 9.54488497960731 8.72770668220395 0.817178297403363 A:G G A 10 0.545481667637747 0.869526951478906 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65380489_65381713:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524856:exon_65380489_65382853:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000527304:exon_65376103_65381707:MAP3K11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65384727 C/T 1 11 10 21 4.99970165598478 5.45481667637747 -0.455115020392687 T:C C T 10 0.545481667637747 0.831123791313476 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65384721_65384820:PCNXL3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65387378 T/A 1 6 16 22 2.72710999417352 8.72770668220395 -6.00059668803043 A:T T A 10 0.545481667637747 0.0164118062435037 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65387225_65387403:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000531045:exon_65387329_65387403:PCNXL3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65408937 C/T 1 36 36 72 16.3626599650411 19.6373400349589 -3.27468006991778 T:C C T 10 0.545481667637747 0.478346218506207 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65408300_65409071:SIPA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65487273 G/A 1 81 64 145 36.8159849213425 34.9108267288158 1.90515819252669 A:G G A 10 0.545481667637747 0.802606856875163 ENSG00000172922:ENST00000534482:exon_65487152_65487280:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000308418:exon_65485144_65487280:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000533698:exon_65487152_65487280:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000531596:exon_65487152_65487280:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000528220:exon_65486641_65487280:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000527610:exon_65487192_65487635:RNASEH2C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 977 1115 2092 444.064410717921 608.212059416088 -164.147648698167 A:T:G G A 10 0.545481667637747 7.40993773107926e-13 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65629932 T/C 1 16 7 23 7.27229331779605 3.81837167346423 3.45392164433182 T:C T C 10 0.545481667637747 0.208244249691514 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65629934 G/C 1 16 8 24 7.27229331779605 4.36385334110198 2.90843997669407 C:G G C 10 0.545481667637747 0.305970557304632 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 20 22 42 9.09036664724506 12.0005966880304 -2.91023004078537 T:C C T 10 0.545481667637747 0.438921692863405 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 23 22 45 10.4539216443318 12.0005966880304 -1.54667504369861 A:G G A 10 0.545481667637747 0.656258473337138 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 28 24 52 12.7265133061431 13.0915600233059 -0.365046717162842 T:G G T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 32 31 63 14.5445866355921 16.9099316967702 -2.36534506117806 A:G G A 10 0.545481667637747 0.613261915741647 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 36 43 79 16.3626599650411 23.4557117084231 -7.09305174338201 T:C C T 10 0.545481667637747 0.114607902063367 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 65735174 G/C 1 38 22 60 17.2716966297656 12.0005966880304 5.27109994173518 C:G G C 10 0.545481667637747 0.195343374700695 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65735150_65735292:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65735150_65735292:SART1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 66254085 G/T 1 17 18 35 7.7268116501583 9.81867001747944 -2.09185836732114 T:G G T 10 0.545481667637747 0.501053345348018 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531354:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532019:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526515:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533725:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66254011_66254148:DPP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 12 11 23 5.45421998834704 6.00029834401522 -0.546078355668181 A:G A G 10 0.545481667637747 0.837030175057015 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 66272237 G/A 1 31 28 59 14.0900683032298 15.2734866938569 -1.18341839062707 A:G G A 10 0.545481667637747 0.794501131186994 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 66276576 G/A 1 32 34 66 14.5445866355921 18.5463766996834 -4.0017900640913 A:G G A 10 0.545481667637747 0.325958373523972 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66276550_66277021:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66276550_66277128:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66276550_66277130:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66276550_66277130:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66276550_66276816:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66276550_66277127:DPP3;ENSG00000174483:ENST00000419755:exon_66276546_66276785:BBS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 66282095 G/A 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 A:G G A 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000174483:ENST00000419755:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000526760:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000533644:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000318312:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000527251:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000335157:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000533557:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000455748:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529955:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000526035:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000534730:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000532908:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529766:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000393994:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000524907:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000524705:exon_66281977_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000524458:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000533430:exon_66281940_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529953:exon_66282066_66282149:BBS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 67120530 C/G 1 110 110 220 49.9970165598478 60.0029834401522 -10.0059668803043 C:G C G 10 0.545481667637747 0.176487652264085 ENSG00000175482:ENST00000529704:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000533429:exon_67120162_67120549:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000530584:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000312419:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000532830:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000534515:exon_67119024_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000528087:exon_67119036_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000531239:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000524743:exon_67120459_67120631:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000525255:exon_67119995_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000529000:exon_67120364_67120582:POLD4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 67200677 T/A 1 38 47 85 17.2716966297656 25.6376383789741 -8.36594174920849 A:T T A 10 0.545481667637747 0.0808972739428895 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200597_67200687:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200597_67200687:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200597_67200686:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 43 41 84 19.5442882915769 22.3647483731476 -2.82046008157075 T:C C T 10 0.545481667637747 0.584244512085792 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 41 25 66 18.6352516268524 13.6370416909437 4.9982099359087 A:T:C C T 10 0.545481667637747 0.265806286591492 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 67205978 G/A 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763894627012578 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 67209515 C/T 1 21 13 34 9.54488497960731 7.09126167929071 2.4536233003166 T:C C T 10 0.545481667637747 0.491669588132129 ENSG00000172725:ENST00000393893:exon_67209437_67209559:CORO1B;ENSG00000172725:ENST00000341356:exon_67209437_67209559:CORO1B;ENSG00000172725:ENST00000393886:exon_67209437_67209559:CORO1B;ENSG00000172725:ENST00000453768:exon_67209437_67209559:CORO1B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 67209869 T/G 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 T:G T G 10 0.545481667637747 0.763908715137577 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 67351585 C/G 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 C:G C G 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 584 304 888 265.438706099556 165.826426961875 99.6122791376807 A:T:G A G 10 0.545481667637747 1.31074745792001e-11 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 67353970 T/C 1 1272 705 1977 578.147318764786 384.564575684612 193.582743080174 A:T:C:G T C 10 0.545481667637747 1.21569866494308e-18 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 11 8 19 4.99970165598478 4.36385334110198 0.635848314882807 T:C C T 10 0.545481667637747 0.82162549041289 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 68851414 T/C 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 T:C T C 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000162341:ENST00000294309:exon_68851413_68851484:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000356782:exon_68851413_68851484:TPCN2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 68855363 G/A 1 4 8 12 1.81807332944901 4.36385334110198 -2.54578001165296 A:G G A 10 0.545481667637747 0.157407748991045 ENSG00000162341:ENST00000294309:exon_68855343_68858072:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000442692:exon_68855343_68858072:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000356782:exon_68855343_68858072:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000450354:exon_68855343_68858072:TPCN2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 70185325 C/T 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 T:C C T 10 0.545481667637747 0.523901512697289 ENSG00000131626:ENST00000253925:exon_70185277_70185412:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000389547:exon_70185277_70185412:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000532504:exon_70185277_70185412:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526262:exon_70185277_70185417:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530798:exon_70185277_70185412:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526369:exon_70185277_70185412:PPFIA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 70200529 C/T 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 T:C C T 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000131626:ENST00000253925:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000389547:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000532504:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526262:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530798:exon_70200428_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526347:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530294:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526074:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000528750:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000533894:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530390:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000527612:exon_70200309_70200558:PPFIA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 70253475 C/T 1 8 12 20 3.63614665889802 6.54578001165296 -2.90963335275494 T:C C T 10 0.545481667637747 0.261277301714232 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000482755:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000527622:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000415461:exon_70253459_70253490:CTTN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 72408657 C/T 1 45 56 101 20.4533249563014 30.5469733877138 -10.0936484314124 A:T:C C T 10 0.545481667637747 0.0459021388348464 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408643_72408694:ARAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 72415329 G/A 1 26 11 37 11.8174766414186 6.00029834401522 5.81717829740336 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0683820285042286 ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000340247:exon_72415197_72415379:ARAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 90 74 164 40.9066499126028 40.3656434051933 0.541006507409499 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 75277757 C/G 1 6 12 18 2.72710999417352 6.54578001165296 -3.81867001747945 C:G C G 10 0.545481667637747 0.095953636396545 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 75279846 C/T 1 11 10 21 4.99970165598478 5.45481667637747 -0.455115020392687 T:C C T 10 0.545481667637747 0.831123791313476 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 17 21 38 7.7268116501583 11.4551150203927 -3.72830337023438 A:G G A 10 0.545481667637747 0.255359068809926 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 77412851 A/G 1 18 27 45 8.18132998252056 14.7280050262192 -6.54667504369861 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0527073307732933 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77411766_77414578:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000528095:exon_77412164_77413540:RSF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 T:C T C 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 82643760 G/T 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 T:G G T 10 0.545481667637747 0.523901512697289 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 82644904 G/A 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 A:G G A 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 85374993 C/T 1 14 8 22 6.36325665307154 4.36385334110198 1.99940331196957 T:C C T 10 0.545481667637747 0.521742512666216 ENSG00000137504:ENST00000490820:exon_85374568_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000528561:exon_85374568_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000260058:exon_85374859_85375697:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527529:exon_85374859_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000525639:exon_85374859_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000398294:exon_85374859_85375269:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527447:exon_85372110_85376146:CREBZF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 85692181 A/C 1 7 10 17 3.18162832653577 5.45481667637747 -2.2731883498417 A:C A C 10 0.545481667637747 0.332311875410834 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530692:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529760:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532603:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529016:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526961:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530542:exon_85692172_85692271:PICALM HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 85725937 C/T 1 11 10 21 4.99970165598478 5.45481667637747 -0.455115020392687 T:C C T 10 0.545481667637747 0.831123791313476 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000534412:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000531771:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000531558:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000531930:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532041:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000525162:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528256:exon_85725913_85726006:PICALM HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 23 27 50 10.4539216443318 14.7280050262192 -4.27408338188735 A:C:G C G 10 0.545481667637747 0.256439941547007 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 102196019 A/G 1 105 68 173 47.7244248980366 37.0927533993668 10.6316714986698 A:G A G 10 0.545481667637747 0.109185485834962 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102195187_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102192568_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102195192_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102195186_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102195694_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527309:exon_102195952_102196093:BIRC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 42 40 82 19.0897699592146 21.8192667055099 -2.72949674629525 A:G G A 10 0.545481667637747 0.580014177805616 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 102272884 C/T 1 76 47 123 34.5433932595312 25.6376383789741 8.90575488055712 T:C C T 10 0.545481667637747 0.123457363743908 ENSG00000152558:ENST00000361236:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000398136:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000532161:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000528969:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000529492:exon_102272475_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000525577:exon_102272656_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000531103:exon_102272765_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000526676:exon_102272830_102272937:TMEM123 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 C:G G C 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 107197640 T/C 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 T:C T C 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 107299623 A/C 1 20 11 31 9.09036664724506 6.00029834401522 3.09006830322984 A:C A C 10 0.545481667637747 0.284954488499266 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 107917087 A/G 1 10 6 16 4.54518332362253 3.27289000582648 1.27229331779605 A:G A G 10 0.545481667637747 0.620225311632925 ENSG00000166266:ENST00000299351:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000393094:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000526303:exon_107916997_107917220:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000531427:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000532782:exon_107916997_107917096:CUL5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 108043988 C/T 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000533535:exon_108041859_108044578:NPAT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 108143299 A/G 1 3 9 12 1.36355499708676 4.90933500873972 -3.54578001165296 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0457815358442577 ENSG00000149311:ENST00000527805:exon_108143259_108143334:ATM;ENSG00000149311:ENST00000278616:exon_108143259_108143334:ATM;ENSG00000149311:ENST00000299392:exon_108143259_108143334:ATM;ENSG00000149311:ENST00000452508:exon_108143259_108143334:ATM;ENSG00000149311:ENST00000532637:exon_108143259_108143334:ATM;ENSG00000149311:ENST00000533470:exon_108143259_108143334:ATM HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 111724133 C/T 1 12 9 21 5.45421998834704 4.90933500873972 0.544884979607314 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527714:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111724103_111724208:FDXACB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 111896324 C/T 1 15 10 25 6.8177749854338 5.45481667637747 1.36295830905633 T:C C T 10 0.545481667637747 0.68954281062682 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111896320_111896475:DLAT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 111916647 G/A 1 13 13 26 5.90873832070929 7.09126167929071 -1.18252335858142 A:G G A 10 0.545481667637747 0.696126980810445 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111916587_111916694:DLAT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 111959625 C/T 1 10 26 36 4.54518332362253 14.1825233585814 -9.63734003495889 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00132651651748060 ENSG00000204370:ENST00000375549:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000528182:exon_111959591_111959728:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000528021:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000526592:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000525291:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000530923:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000534010:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000255292:ENST00000531744:exon_111959591_111959735:AP002884.2;ENSG00000255292:ENST00000532699:exon_111959591_111959735:AP002884.2;ENSG00000255292:ENST00000525987:exon_111959591_111959735:AP002884.2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 113194168 A/C 1 19 12 31 8.63584831488281 6.54578001165296 2.09006830322984 A:C A C 10 0.545481667637747 0.476931260537673 ENSG00000149292:ENST00000529221:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000429951:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000442859:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000531164:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000529850:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000436332:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000314756:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000278593:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000504025:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000520742:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000525965:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000464224:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000494714:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000393020:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000455306:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000489064:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000527781:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000483239:exon_113194010_113194173:TTC12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 113237020 T/C 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000149292:ENST00000529221:exon_113236947_113237114:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000278593:exon_113236947_113237108:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000504025:exon_113236947_113237108:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000520742:exon_113236947_113237108:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000464224:exon_113236947_113237108:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000483239:exon_113236947_113237109:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000480233:exon_113236947_113237109:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000496311:exon_113236947_113237108:TTC12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 113679119 C/T 1 7 1 8 3.18162832653577 0.545481667637747 2.63614665889802 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0793996161569039 ENSG00000048028:ENST00000260188:exon_113679020_113679159:USP28;ENSG00000048028:ENST00000003302:exon_113679020_113679159:USP28 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 116631482 G/A 1 13 7 20 5.90873832070929 3.81837167346423 2.09036664724506 A:G G A 10 0.545481667637747 0.378879562360477 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116631451_116631668:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116631451_116631668:BUD13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 8 7 15 3.63614665889802 3.81837167346423 -0.182225014566205 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 116729196 T/C 1 8 9 17 3.63614665889802 4.90933500873972 -1.2731883498417 T:C T C 10 0.545481667637747 0.628894857051545 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 117100257 C/T 1 27 19 46 12.2719949737808 10.3641516851172 1.90784328866364 T:C C T 10 0.545481667637747 0.657641333184872 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117100093_117100572:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117100093_117100956:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000524507:exon_117100222_117100572:PCSK7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 117222592 G/A 1 11 10 21 4.99970165598478 5.45481667637747 -0.455115020392687 A:G G A 10 0.545481667637747 0.831123791313476 ENSG00000110274:ENST00000525734:exon_117222506_117222658:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533153:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000525416:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527324:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527609:exon_117222506_117222675:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533570:exon_117222506_117222676:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117222506_117222704:CEP164 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 117267884 A/G 1 17 10 27 7.7268116501583 5.45481667637747 2.27199497378083 A:G A G 10 0.545481667637747 0.442481195527858 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 117859209 G/A 1 5 14 19 2.27259166181127 7.63674334692846 -5.36415168511719 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0190715633866824 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000531365:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117857452_117859217:IL10RA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 117864047 A/G 1 9 12 21 4.09066499126028 6.54578001165296 -2.45511502039269 A:G A G 10 0.545481667637747 0.381254161766230 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534335:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117863723_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117863773_117864125:IL10RA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 24 27 51 10.9084399766941 14.7280050262192 -3.8195650495251 T:C C T 10 0.545481667637747 0.325417285585722 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 118886603 G/A 1 14 114 128 6.36325665307154 62.1849101107032 -55.8216534576316 A:G G A 10 0.545481667637747 3.87525713356602e-25 ENSG00000118181:ENST00000532567:exon_118886551_118886649:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527791:exon_118886551_118886649:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527673:exon_118886551_118886649:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000530602:exon_118886551_118886649:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527853:exon_118886551_118886649:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000236900:exon_118886551_118886649:RPS25 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 118886656 G/A 1 15 12 27 6.8177749854338 6.54578001165296 0.271994973780831 A:G G A 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 118889028 G/A 1 319 230 549 144.991348023559 125.460783556682 19.5305644668769 A:G G A 10 0.545481667637747 0.094819586569073 ENSG00000118181:ENST00000532567:exon_118888992_118889040:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527791:exon_118888992_118889388:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527673:exon_118888992_118889400:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000530602:exon_118888992_118889054:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527853:exon_118888072_118889401:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000236900:exon_118888992_118889052:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000524864:exon_118888992_118889376:RPS25 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 118890908 C/T 1 43 46 89 19.5442882915769 25.0921567113364 -5.54786841975948 T:C C T 10 0.545481667637747 0.243425941441338 ENSG00000196655:ENST00000533632:exon_118890860_118890963:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000447216:exon_118890860_118891459:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000528230:exon_118890860_118890963:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000531290:exon_118890860_118890963:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000359005:exon_118890860_118890963:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118890860_118890963:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000525079:exon_118890860_118890963:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533149:exon_118890102_118890963:TRAPPC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 19 12 31 8.63584831488281 6.54578001165296 2.09006830322984 T:C C T 10 0.545481667637747 0.476931260537673 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 118899102 A/G 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 A:G A G 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 118925935 G/A 1 60 41 101 27.2710999417352 22.3647483731476 4.90635156858755 A:G G A 10 0.545481667637747 0.36873363921409 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526571:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925897_118926130:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532421:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000533381:exon_118925735_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530467:exon_118925867_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000527038:exon_118925896_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529174:exon_118925914_118926051:HYOU1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 35 43 78 15.9081416326789 23.4557117084231 -7.54757007574426 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0891165402499104 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 119043656 C/T 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 T:C C T 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000160703:ENST00000482180:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000454811:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000449394:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000422249:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000474751:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000468765:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119043610_119043698:NLRX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 119045300 T/G 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000524562:exon_119045162_119045749:NLRX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 119045431 T/C 1 7 1 8 3.18162832653577 0.545481667637747 2.63614665889802 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0793996161569039 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000524562:exon_119045162_119045749:NLRX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 119205830 A/G 1 11 9 20 4.99970165598478 4.90933500873972 0.0903666472450606 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 120350819 A/G 1 12 8 20 5.45421998834704 4.36385334110198 1.09036664724506 A:G A G 10 0.545481667637747 0.660941894453713 ENSG00000196914:ENST00000397843:exon_120350669_120351139:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000356641:exon_120350669_120351139:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000532993:exon_120350669_120351139:ARHGEF12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 121367626 T/C 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 T:C T C 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121367578_121367758:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532451:exon_121367578_121367758:SORL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 121448090 T/G 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121447990_121448109:SORL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 121456962 C/T 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 T:C C T 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121456931_121457038:SORL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 121457022 C/T 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 T:C C T 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121456931_121457038:SORL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 121475922 T/A 1 24 13 37 10.9084399766941 7.09126167929071 3.81717829740336 A:T T A 10 0.545481667637747 0.248606432535613 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 1186 1297 2483 539.058742181632 707.489722926158 -168.430980744526 A:T:G A G 10 0.545481667637747 1.37180066049447e-11 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 1034 928 1962 469.97195566257 506.206987567829 -36.2350319052595 A:T:C:G T G 10 0.545481667637747 0.102625266685654 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 27 5 32 12.2719949737808 2.72740833818873 9.5445866355921 T:C T C 10 0.545481667637747 0.000552141075608483 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 20 16 36 9.09036664724506 8.72770668220395 0.362659965041109 A:T T A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 125351472 A/T 1 50 57 107 22.7259166181127 31.0924550553516 -8.36653843723893 A:T A T 10 0.545481667637747 0.120058216841041 ENSG00000149557:ENST00000527350:exon_125351430_125351493:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000278919:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000392709:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000533294:exon_125351430_125351652:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000532981:exon_125351430_125351529:FEZ1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 20 15 35 9.09036664724506 8.1822250145662 0.908141632678856 A:G A G 10 0.545481667637747 0.865672807484116 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 2 19 21 0.909036664724506 10.3641516851172 -9.45511502039269 A:C C A 10 0.545481667637747 2.41188019735239e-05 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 125766153 G/A 1 4 12 16 1.81807332944901 6.54578001165296 -4.72770668220395 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0223776060408316 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 125766204 G/C 0 11 0 11 4.99970165598478 0 4.99970165598478 G G 10 0.545481667637747 0.00144330453530437 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 125766207 C/T 0 11 0 11 4.99970165598478 0 4.99970165598478 C C 10 0.545481667637747 0.00144330453530437 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 125769536 G/T 1 20 7 27 9.09036664724506 3.81837167346423 5.27199497378083 T:G G T 10 0.545481667637747 0.0520558328028788 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 126081403 T/C 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126081345_126081587:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126081345_126081541:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126081345_126081524:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000532674:exon_126081345_126081587:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000532800:exon_126081345_126081525:RPUSD4;ENSG00000197798:ENST00000533050:exon_126081309_126081725:FAM118B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 126139100 T/C 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000110074:ENST00000533839:exon_126138950_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000263578:exon_126139028_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000534011:exon_126139030_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000442061:exon_126139041_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000529802:exon_126139052_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000526525:exon_126139066_126139310:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525083:exon_126139066_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525770:exon_126139066_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000527004:exon_126139085_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000526366:exon_126139087_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000524751:exon_126139089_126139310:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000532101:exon_126139096_126139186:FOXRED1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 126174038 C/T 1 30 42 72 13.6355499708676 22.9102300407854 -9.27468006991778 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0327274742970716 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 126201403 T/C 1 30 29 59 13.6355499708676 15.8189683614947 -2.18341839062707 T:C T C 10 0.545481667637747 0.602324844761245 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126201300_126201445:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000530860:exon_126201299_126201445:DCPS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 36 36 72 16.3626599650411 19.6373400349589 -3.27468006991778 T:C T C 10 0.545481667637747 0.478346218506207 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 129743722 G/A 1 8 1 9 3.63614665889802 0.545481667637747 3.09066499126028 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0461109865564625 ENSG00000170322:ENST00000304521:exon_129743640_129743910:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000446488:exon_129743640_129743910:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524794:exon_129743640_129743910:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524746:exon_129743640_129743910:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000531755:exon_129743640_129743910:NFRKB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 129746707 G/T 1 10 7 17 4.54518332362253 3.81837167346423 0.726811650158302 T:G G T 10 0.545481667637747 0.810670786245774 ENSG00000170322:ENST00000304521:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000446488:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524794:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524746:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000531755:exon_129746616_129746790:NFRKB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 129754668 T/C 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 T:C T C 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000170322:ENST00000304521:exon_129754640_129754741:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000446488:exon_129754640_129754741:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524794:exon_129754640_129754777:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524746:exon_129754640_129754741:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000531755:exon_129754640_129754777:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000530278:exon_129754639_129754777:NFRKB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 130003601 C/A 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 A:C C A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000084234:ENST00000533616:exon_130003524_130003623:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000528499:exon_130003524_130003623:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000263574:exon_130003524_130003623:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000345598:exon_130003524_130003623:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000338167:exon_130003524_130003623:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000278756:exon_130003524_130003623:APLP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 130130937 T/C 1 8 15 23 3.63614665889802 8.1822250145662 -4.54607835566818 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0619351832056806 ENSG00000196323:ENST00000528448:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000525842:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000338191:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000397753:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000454539:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000445008:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000357899:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000530205:exon_130130751_130131784:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000529982:exon_130130751_130131329:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000527478:exon_130130751_130131757:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000529348:exon_130130751_130131826:ZBTB44 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 130777886 G/A 1 9 10 19 4.09066499126028 5.45481667637747 -1.36415168511719 A:G G A 10 0.545481667637747 0.646474994475887 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130777848_130777978:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130777864_130778241:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130777848_130777978:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130777848_130777978:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130777848_130777978:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130777848_130777978:SNX19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 130784396 G/A 1 8 12 20 3.63614665889802 6.54578001165296 -2.90963335275494 A:G G A 10 0.545481667637747 0.261277301714232 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 130784488 A/G 1 10 12 22 4.54518332362253 6.54578001165296 -2.00059668803043 A:G A G 10 0.545481667637747 0.401468669837045 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 130785205 G/A 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.527815080970101 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 11 130785304 T/C 1 6 8 14 2.72710999417352 4.36385334110198 -1.63674334692846 T:C T C 10 0.545481667637747 0.428770074510924 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 406292 G/A 1 10 22 32 4.54518332362253 12.0005966880304 -7.4554133644079 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0117348110172979 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 427575 A/G 1 13 20 33 5.90873832070929 10.9096333527549 -5.00089503204565 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0835169883334138 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_427272_427627:KDM5A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 520947 A/C 1 2 9 11 0.909036664724506 4.90933500873972 -4.00029834401522 A:C A C 10 0.545481667637747 0.0289107038402345 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_520913_521144:CCDC77 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 939302 A/G 1 26 28 54 11.8174766414186 15.2734866938569 -3.45601005243834 A:G A G 10 0.545481667637747 0.412505555030716 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_939169_939326:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_939169_939326:WNK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 993930 C/T 1 28 59 87 12.7265133061431 32.1834183906271 -19.456905084484 T:C C T 10 0.545481667637747 3.31467460383686e-05 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 998365 G/T 1 24 18 42 10.9084399766941 9.81867001747944 1.08976995921463 T:G G T 10 0.545481667637747 0.759357190163115 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_998306_998389:WNK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 33 38 71 14.9991049679544 20.7283033702344 -5.72919840228004 A:G G A 10 0.545481667637747 0.190297276746052 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 3147203 C/T 1 3 6 9 1.36355499708676 3.27289000582648 -1.90933500873972 T:C C T 10 0.545481667637747 0.316116386178568 ENSG00000197905:ENST00000358409:exon_3147134_3147274:TEAD4;ENSG00000197905:ENST00000359864:exon_3147134_3147274:TEAD4;ENSG00000197905:ENST00000443986:exon_3147134_3147274:TEAD4;ENSG00000197905:ENST00000397122:exon_3147134_3147274:TEAD4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 3782647 A/T 1 3 7 10 1.36355499708676 3.81837167346423 -2.45481667637747 A:T A T 10 0.545481667637747 0.201970346156534 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3782612_3782758:EFCAB4B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 3782701 C/T 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3782612_3782758:EFCAB4B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 3788145 C/T 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 T:C C T 10 0.545481667637747 0.527815080970101 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3788081_3788264:EFCAB4B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 50 46 96 22.7259166181127 25.0921567113364 -2.36624009322371 A:G G A 10 0.545481667637747 0.682107852420898 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 4651052 A/G 1 18 7 25 8.18132998252056 3.81837167346423 4.36295830905633 A:G A G 10 0.545481667637747 0.106809904531783 ENSG00000111247:ENST00000321524:exon_4651050_4651099:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000352618:exon_4651050_4651099:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000228843:exon_4651050_4651099:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000442992:exon_4651050_4651099:RAD51AP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 4662210 T/C 1 9 9 18 4.09066499126028 4.90933500873972 -0.818670017479445 T:C T C 10 0.545481667637747 0.814103892547842 ENSG00000111247:ENST00000321524:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000352618:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000228843:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000442992:exon_4662149_4662313:RAD51AP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6495275 C/A 0 10 0 10 4.54518332362253 0 4.54518332362253 C C 10 0.545481667637747 0.00270867480271896 ENSG00000111321:ENST00000228918:exon_6495232_6495328:LTBR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6500105 T/G 0 16 0 16 7.27229331779605 0 7.27229331779605 T T 10 0.545481667637747 6.47620228351818e-05 ENSG00000111321:ENST00000228918:exon_6499826_6500733:LTBR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 16 11 27 7.27229331779605 6.00029834401522 1.27199497378083 A:G A G 10 0.545481667637747 0.701434925212117 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 14 14 28 6.36325665307154 7.63674334692846 -1.27348669385692 A:G A G 10 0.545481667637747 0.705678422974658 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 55 46 101 24.9985082799239 25.0921567113364 -0.0936484314124435 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 25 43 68 11.3629583090563 23.4557117084231 -12.0927533993668 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0033989152972817 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6639981 C/G 1 74 45 119 33.6343565948067 24.5466750436986 9.08768155110811 C:G C G 10 0.545481667637747 0.098100769220353 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6639857_6639983:NCAPD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6640519 G/A 1 112 70 182 50.9060532245723 38.1837167346423 12.7223364899301 A:T:G G A 10 0.545481667637747 0.0626775629574784 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6640493_6641120:NCAPD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6643991 C/G 1 5000 3000 8000 2272.59166181127 1636.44500291324 636.146658898024 A:T:C:G C G 10 0.545481667637747 7.02999659867388e-47 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000496049:exon_6643976_6644307:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6643976_6644157:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6643958_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6643985_6644027:GAPDH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 4647 2412 7059 2112.14669048739 1315.70178234225 796.444908145144 A:T:C:G T C 10 0.545481667637747 1.29268399592804e-82 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 4965 2965 7930 2256.68352017859 1617.35314454592 639.330375632666 A:T:C T C 10 0.545481667637747 1.03145592203832e-47 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6657538 T/G 1 7 1 8 3.18162832653577 0.545481667637747 2.63614665889802 T:G T G 10 0.545481667637747 0.0793996161569039 ENSG00000010295:ENST00000488007:exon_6657231_6657711:IFFO1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6690909 C/T 1 141 92 233 64.0870848630777 50.1843134226727 13.902771440405 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0754927866435726 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6690815_6690980:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6690815_6690980:CHD4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 30 20 50 13.6355499708676 10.9096333527549 2.72591661811265 A:G G A 10 0.545481667637747 0.479747848447848 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6858126 G/A 1 105 82 187 47.7244248980366 44.7294967462953 2.99492815174131 A:G G A 10 0.545481667637747 0.713610254074295 ENSG00000089693:ENST00000435120:exon_6857936_6858148:MLF2;ENSG00000089693:ENST00000203630:exon_6857936_6858148:MLF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6954875 C/T 1 1 7 8 0.454518332362253 3.81837167346423 -3.36385334110198 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0271476654586150 ENSG00000111664:ENST00000229264:exon_6954750_6954966:GNB3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 46 74 120 20.9078432886636 40.3656434051933 -19.4578001165296 A:T:G A G 10 0.545481667637747 0.000448997733085619 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 6965502 G/A 1 33 56 89 14.9991049679544 30.5469733877138 -15.5478684197595 A:C:G G A 10 0.545481667637747 0.00127345007202534 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965469_6965614:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965469_6965614:USP5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 4 9 13 1.81807332944901 4.90933500873972 -3.09126167929071 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0994104714946873 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 7046003 C/T 1 20 36 56 9.09036664724506 19.6373400349589 -10.5469733877138 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00672873732021701 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7044710_7046724:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7044710_7046724:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000229279:exon_7045754_7046724:ATN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 7090193 A/G 1 10 19 29 4.54518332362253 10.3641516851172 -5.81896836149466 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0388996764246589 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7090166_7090344:LPCAT3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 9822317 A/T 1 1 7 8 0.454518332362253 3.81837167346423 -3.36385334110198 A:T A T 10 0.545481667637747 0.0271476654586150 ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9822313_9822391:CLEC2D HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 9822387 C/G 1 90 42 132 40.9066499126028 22.9102300407854 17.9964198718174 C:G C G 10 0.545481667637747 0.00159404335048213 ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9822313_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9822324_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9822325_9822391:CLEC2D HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 10999780 C/T 1 3 9 12 1.36355499708676 4.90933500873972 -3.54578001165296 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0457815358442577 ENSG00000111215:ENST00000228811:exon_10999644_10999966:PRR4;ENSG00000111215:ENST00000431566:exon_10999640_10999909:PRR4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 12967127 C/T 1 71 36 107 32.27080159772 19.6373400349589 12.6334615627611 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0150321800372953 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000426619:exon_12967065_12967158:DDX47 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 14577892 A/T 1 44 30 74 19.9988066239391 16.3644500291324 3.63435659480672 A:T A T 10 0.545481667637747 0.416061608362403 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14576843_14578407:ATF7IP;ENSG00000171681:ENST00000396279:exon_14576850_14578391:ATF7IP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 14587301 A/G 1 24 33 57 10.9084399766941 18.0008950320457 -7.09245505535158 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0632297961666116 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14587271_14587357:ATF7IP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 14649196 A/G 1 25 10 35 11.3629583090563 5.45481667637747 5.90814163267886 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0604000116199886 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14649165_14649277:ATF7IP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 14976553 G/C 1 9 3 12 4.09066499126028 1.63644500291324 2.45421998834704 C:G G C 10 0.545481667637747 0.245735735487388 ENSG00000182993:ENST00000330828:exon_14975846_14977349:C12orf60 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 510 639 1149 231.804349504749 348.56278562052 -116.758436115771 T:C:G C G 10 0.545481667637747 5.41841619149753e-12 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 16050808 T/A 0 1 10 11 0.454518332362253 5.45481667637747 -5.00029834401522 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00370111192657596 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 16516994 G/A 1 235 92 327 106.811808105129 50.1843134226727 56.6274946824567 A:G G A 10 0.545481667637747 1.62205393063180e-10 ENSG00000008394:ENST00000010404:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396210:exon_16516729_16517342:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396209:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396207:exon_16516729_16517343:MGST1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 17 28 45 7.7268116501583 15.2734866938569 -7.54667504369861 T:G T G 10 0.545481667637747 0.0251688536648337 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 21623969 A/G 1 91 57 148 41.361168244965 31.0924550553516 10.2687131896135 A:C:G A G 10 0.545481667637747 0.0986910652938084 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21623903_21624032:RECQL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 52 73 125 23.6349532828372 39.8201617375555 -16.1852084547184 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00396371311749585 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 22826456 T/A 1 9 13 22 4.09066499126028 7.09126167929071 -3.00059668803043 A:T T A 10 0.545481667637747 0.207242496035041 ENSG00000139163:ENST00000381409:exon_22826434_22826594:ETNK1;ENSG00000139163:ENST00000266517:exon_22826434_22826594:ETNK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 146 96 242 66.3596765248889 52.3662400932237 13.9934364316652 T:C:G G C 10 0.545481667637747 0.0811404583941842 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 25362777 A/G 1 6 19 25 2.72710999417352 10.3641516851172 -7.63704169094367 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00231097764153293 ENSG00000133703:ENST00000311936:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000256078:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000406761:exon_25362729_25362845:KRAS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 27064232 C/T 1 32 78 110 14.5445866355921 42.5475700757443 -28.0029834401522 T:C C T 10 0.545481667637747 8.00299184782218e-08 ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27064111_27064250:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27064111_27064250:C12orf11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 27143508 G/A 1 21 29 50 9.54488497960731 15.8189683614947 -6.27408338188735 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0879678154313437 ENSG00000064115:ENST00000343028:exon_27143383_27143560:TM7SF3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 42481732 G/A 1 12 9 21 5.45421998834704 4.90933500873972 0.544884979607314 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000151233:ENST00000398675:exon_42475650_42481749:GXYLT1;ENSG00000151233:ENST00000280876:exon_42475650_42481749:GXYLT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 44148259 T/C 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 T:C T C 10 0.545481667637747 0.243356459282646 ENSG00000129317:ENST00000416848:exon_44148139_44149064:PUS7L;ENSG00000129317:ENST00000344862:exon_44148139_44149064:PUS7L;ENSG00000129317:ENST00000431332:exon_44148139_44149064:PUS7L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 44180295 G/A 1 10 14 24 4.54518332362253 7.63674334692846 -3.09156002330593 A:G G A 10 0.545481667637747 0.223659279774392 ENSG00000198001:ENST00000448290:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000431837:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000440781:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000356669:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000446056:exon_44180202_44180360:IRAK4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 48272895 A/G 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000111424:ENST00000395324:exon_48272751_48272898:VDR;ENSG00000111424:ENST00000229022:exon_48272751_48272898:VDR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 48539482 T/G 1 101 50 151 45.9063515685876 27.2740833818873 18.6322681867002 T:G T G 10 0.545481667637747 0.00240940231127103 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000312352:exon_48539347_48539488:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000443538:exon_48539347_48539887:PFKM HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 49065727 T/C 1 6 15 21 2.72710999417352 8.1822250145662 -5.45511502039269 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0259947353194303 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49065582_49065745:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49065582_49065745:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000357861:exon_49065582_49065745:C12orf41 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 49087656 G/C 1 15 10 25 6.8177749854338 5.45481667637747 1.36295830905633 C:G G C 10 0.545481667637747 0.68954281062682 ENSG00000129315:ENST00000261900:exon_49086752_49088219:CCNT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 32 35 67 14.5445866355921 19.0918583673211 -4.54727173172905 T:G T G 10 0.545481667637747 0.272005653028432 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 49424534 G/A 1 20 10 30 9.09036664724506 5.45481667637747 3.63554997086759 A:G G A 10 0.545481667637747 0.203056700745850 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49424384_49424551:MLL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 49919876 A/G 1 52 48 100 23.6349532828372 26.1831200466119 -2.5481667637747 A:G A G 10 0.545481667637747 0.617012521834825 ENSG00000123352:ENST00000321898:exon_49919727_49921207:SPATS2;ENSG00000123352:ENST00000447889:exon_49919727_49921207:SPATS2;ENSG00000123352:ENST00000395063:exon_49919727_49921207:SPATS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 50037071 G/A 1 9 31 40 4.09066499126028 16.9099316967702 -12.8192667055099 A:G G A 10 0.545481667637747 4.58659561060105e-05 ENSG00000110844:ENST00000261897:exon_50037006_50037180:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000419405:exon_50037006_50037180:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000380281:exon_50037006_50037180:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000341308:exon_50037006_50037180:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000395012:exon_50037006_50037180:PRPF40B;ENSG00000161791:ENST00000335154:exon_50031724_50039686:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000352151:exon_50031724_50039686:FMNL3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 50189602 A/G 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 50189807 C/A 1 13 8 21 5.90873832070929 4.36385334110198 1.54488497960731 A:C C A 10 0.545481667637747 0.521566668167506 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 50189834 T/G 1 11 7 18 4.99970165598478 3.81837167346423 1.18132998252055 T:G T G 10 0.545481667637747 0.641996695541785 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 50232169 A/T 1 13 13 26 5.90873832070929 7.09126167929071 -1.18252335858142 A:T A T 10 0.545481667637747 0.696126980810445 ENSG00000186666:ENST00000333924:exon_50231560_50232798:BCDIN3D HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 50529736 G/A 1 11 14 25 4.99970165598478 7.63674334692846 -2.63704169094367 A:G G A 10 0.545481667637747 0.319558675893505 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50529724_50529852:LASS5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 51089734 T/A 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 A:T T A 10 0.545481667637747 0.527815080970101 ENSG00000066084:ENST00000301180:exon_51089631_51089750:DIP2B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 51203371 C/T 1 20 25 45 9.09036664724506 13.6370416909437 -4.54667504369861 T:C C T 10 0.545481667637747 0.180913272368107 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51203239_51203372:ATF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 51386066 A/G 1 3 6 9 1.36355499708676 3.27289000582648 -1.90933500873972 A:G A G 10 0.545481667637747 0.316116386178568 ENSG00000110911:ENST00000262051:exon_51385973_51386122:SLC11A2;ENSG00000110911:ENST00000394904:exon_51385973_51386122:SLC11A2;ENSG00000110911:ENST00000262052:exon_51385973_51386122:SLC11A2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 51773557 G/A 1 9 5 14 4.09066499126028 2.72740833818873 1.36325665307154 A:G G A 10 0.545481667637747 0.594821470841361 ENSG00000139629:ENST00000356317:exon_51773075_51773668:GALNT6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 53433486 C/T 1 9 2 11 4.09066499126028 1.09096333527549 2.99970165598478 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0774939953200738 ENSG00000063046:ENST00000420463:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000416762:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000430205:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000262056:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000438209:exon_53433414_53433486:EIF4B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 53682986 C/T 1 5 10 15 2.27259166181127 5.45481667637747 -3.1822250145662 T:C C T 10 0.545481667637747 0.12160675687954 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682874_53683087:ESPL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 53708092 A/G 1 12 24 36 5.45421998834704 13.0915600233059 -7.63734003495889 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0118035427282257 ENSG00000094914:ENST00000394384:exon_53708082_53708225:AAAS;ENSG00000094914:ENST00000209873:exon_53708082_53708225:AAAS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 54575458 T/C 1 19 18 37 8.63584831488281 9.81867001747944 -1.18282170259664 T:C T C 10 0.545481667637747 0.742767838498592 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 27 47 74 12.2719949737808 25.6376383789741 -13.3656434051933 A:C:G A G 10 0.545481667637747 0.00221339599718745 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 56151291 T/C 1 88 58 146 39.9976132478783 31.6379367229893 8.35967652488894 T:C T C 10 0.545481667637747 0.183574969949878 ENSG00000205323:ENST00000444631:exon_56151167_56151337:SARNP;ENSG00000205323:ENST00000336133:exon_56151058_56151337:SARNP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 56397872 C/T 1 11 11 22 4.99970165598478 6.00029834401522 -1.00059668803043 T:C C T 10 0.545481667637747 0.67524038559697 ENSG00000139531:ENST00000266971:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394115:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000356124:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394109:exon_56397402_56399309:SUOX HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 56711371 C/T 1 40 15 55 18.1807332944901 8.1822250145662 9.99850827992392 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0066065085624844 ENSG00000135473:ENST00000425394:exon_56710718_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000379495:exon_56710721_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000257931:exon_56710721_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000440411:exon_56710721_56711427:PAN2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 56743044 G/A 1 26 51 77 11.8174766414186 27.8195650495251 -16.0020884081065 A:G G A 10 0.545481667637747 0.000326930322207715 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56742947_56743045:STAT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 31 31 62 14.0900683032298 16.9099316967702 -2.81986339354031 A:G G A 10 0.545481667637747 0.524293633475891 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 56815281 T/C 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 T:C T C 10 0.545481667637747 0.763908715137577 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 57870648 A/G 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:G A G 10 0.545481667637747 0.481553868568817 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 58335626 A/T 1 9 6 15 4.09066499126028 3.27289000582648 0.817774985433796 A:T A T 10 0.545481667637747 0.797861210956256 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58335360_58335671:XRCC6BP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 58345606 T/C 1 1 7 8 0.454518332362253 3.81837167346423 -3.36385334110198 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0271476654586150 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58345541_58345678:XRCC6BP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 21 23 44 9.54488497960731 12.5460783556682 -3.00119337606087 A:T T A 10 0.545481667637747 0.368587724804263 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 65146532 C/T 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 T:C C T 10 0.545481667637747 0.243356459282646 ENSG00000135677:ENST00000258145:exon_65146478_65146537:GNS;ENSG00000135677:ENST00000418919:exon_65146478_65146537:GNS;ENSG00000135677:ENST00000432885:exon_65146478_65146537:GNS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 26 23 49 11.8174766414186 12.5460783556682 -0.728601714249601 A:G A G 10 0.545481667637747 0.88635490575172 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 75900588 A/G 1 44 45 89 19.9988066239391 24.5466750436986 -4.54786841975948 A:G A G 10 0.545481667637747 0.34003082767529 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75900562_75900696:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75900562_75900696:KRR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 75902186 T/C 1 51 26 77 23.1804349504749 14.1825233585814 8.99791159189348 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0399209957268222 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75902054_75902226:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75902054_75902226:KRR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 76453966 G/A 1 816 469 1285 370.886959207598 255.830902122103 115.056057085495 A:C:G G A 10 0.545481667637747 8.74970530058276e-11 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76453918_76454059:NAP1L1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 76740515 G/T 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 T:G G T 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000179941:ENST00000393262:exon_76738254_76741567:BBS10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 80014907 A/T 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 A:T A T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000177425:ENST00000328827:exon_80014856_80014987:PAWR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 94543506 C/T 1 14 5 19 6.36325665307154 2.72740833818873 3.63584831488281 T:C C T 10 0.545481667637747 0.109537367994142 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94542748_94543809:PLXNC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 94694743 T/C 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 T:C T C 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94694686_94694833:PLXNC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 94772742 C/T 1 4 10 14 1.81807332944901 5.45481667637747 -3.63674334692846 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0615052435608368 ENSG00000173588:ENST00000339839:exon_94772567_94772818:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397809:exon_94772567_94772818:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397807:exon_94772567_94772818:CCDC41 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 100452564 G/T 1 18 6 24 8.18132998252056 3.27289000582648 4.90843997669407 T:G G T 10 0.545481667637747 0.062904669459089 ENSG00000111647:ENST00000279907:exon_100451807_100453311:UHRF1BP1L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 101732655 C/T 1 6 11 17 2.72710999417352 6.00029834401522 -3.2731883498417 T:C C T 10 0.545481667637747 0.143847339286626 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101732591_101732735:UTP20 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 102117589 C/T 1 13 16 29 5.90873832070929 8.72770668220395 -2.81896836149466 T:C C T 10 0.545481667637747 0.352077308499086 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102117500_102117625:CHPT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 102158763 T/C 1 26 17 43 11.8174766414186 9.2731883498417 2.54428829157688 T:C T C 10 0.545481667637747 0.449357998904098 ENSG00000111670:ENST00000299314:exon_102157980_102159082:GNPTAB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 102224436 C/T 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000111670:ENST00000299314:exon_102224337_102224632:GNPTAB;ENSG00000111670:ENST00000392919:exon_102224337_102224596:GNPTAB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 102455729 G/A 1 21 23 44 9.54488497960731 12.5460783556682 -3.00119337606087 A:G G A 10 0.545481667637747 0.368587724804263 ENSG00000120860:ENST00000240079:exon_102455690_102455899:CCDC53 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 104376693 G/A 1 8 36 44 3.63614665889802 19.6373400349589 -16.0011933760609 A:G G A 10 0.545481667637747 9.84125036399054e-07 ENSG00000139372:ENST00000392872:exon_104376577_104376712:TDG;ENSG00000139372:ENST00000266775:exon_104376577_104376712:TDG HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 104698582 A/G 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 A:G A G 10 0.545481667637747 0.243356459282646 ENSG00000255150:ENST00000527879:exon_104697517_104698980:EID3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 104709559 C/T 1 13 40 53 5.90873832070929 21.8192667055099 -15.9105283848006 T:C C T 10 0.545481667637747 1.14688406040120e-05 ENSG00000198431:ENST00000525566:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000429002:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526266:exon_104709555_104709604:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000503506:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526691:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531691:exon_104709555_104709679:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000388854:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526390:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531689:exon_104709555_104709610:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000529546:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526580:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000354940:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000524698:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527688:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000378070:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527335:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000397736:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000427956:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526950:exon_104709555_104709674:TXNRD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 105380143 G/A 1 13 2 15 5.90873832070929 1.09096333527549 4.8177749854338 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0167155600286377 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105380098_105380245:C12orf45 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 105380152 A/C 1 13 4 17 5.90873832070929 2.18192667055099 3.7268116501583 A:C A C 10 0.545481667637747 0.0880868330094187 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105380098_105380245:C12orf45 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 105433523 T/A 1 8 11 19 3.63614665889802 6.00029834401522 -2.36415168511719 A:T T A 10 0.545481667637747 0.357710103923903 ENSG00000136010:ENST00000258494:exon_105433491_105433584:ALDH1L2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 105434467 C/T 1 3 9 12 1.36355499708676 4.90933500873972 -3.54578001165296 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0457815358442577 ENSG00000136010:ENST00000258494:exon_105434385_105434472:ALDH1L2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 105583877 G/A 1 7 1 8 3.18162832653577 0.545481667637747 2.63614665889802 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0793996161569039 ENSG00000136044:ENST00000258530:exon_105583769_105583933:APPL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 106633601 G/A 1 35 16 51 15.9081416326789 8.72770668220395 7.1804349504749 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0487574514592708 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 108941679 G/A 1 20 10 30 9.09036664724506 5.45481667637747 3.63554997086759 A:C:G G A 10 0.545481667637747 0.203056700745850 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108941663_108941767:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108941663_108941767:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108941663_108941767:SART3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 109017898 C/T 1 12 23 35 5.45421998834704 12.5460783556682 -7.09185836732114 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0175265116944486 ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109017694_109018088:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 109937534 G/A 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:G G A 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000151148:ENST00000342494:exon_109937438_109937615:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000434735:exon_109937438_109937615:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000280774:exon_109937438_109937615:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000449510:exon_109937438_109937615:UBE3B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 79 51 130 35.906948256618 27.8195650495251 8.08738320709289 A:T A T 10 0.545481667637747 0.159708080506053 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 20 10 30 9.09036664724506 5.45481667637747 3.63554997086759 T:G G T 10 0.545481667637747 0.203056700745850 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 20 10 30 9.09036664724506 5.45481667637747 3.63554997086759 T:C C T 10 0.545481667637747 0.203056700745850 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 110937404 T/C 1 3 8 11 1.36355499708676 4.36385334110198 -3.00029834401522 T:C T C 10 0.545481667637747 0.126273306068542 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 110974890 T/C 1 27 13 40 12.2719949737808 7.09126167929071 5.18073329449012 T:C T C 10 0.545481667637747 0.113131688939334 ENSG00000196850:ENST00000354300:exon_110972237_110974900:PPTC7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 113386779 C/G 1 12 9 21 5.45421998834704 4.90933500873972 0.544884979607314 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113386666_113387010:OAS3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 113398919 G/A 1 14 18 32 6.36325665307154 9.81867001747944 -3.4554133644079 A:G G A 10 0.545481667637747 0.286679217980447 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113398876_113399051:OAS3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 113403684 C/T 1 13 12 25 5.90873832070929 6.54578001165296 -0.637041690943674 T:C C T 10 0.545481667637747 0.842576598281257 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113403549_113403834:OAS3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 113424893 C/G 1 55 87 142 24.9985082799239 47.456905084484 -22.4583968045601 C:G C G 10 0.545481667637747 0.000188192631600562 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 114261053 G/A 1 21 15 36 9.54488497960731 8.1822250145662 1.36265996504111 A:G G A 10 0.545481667637747 0.738817375454975 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114259863_114261126:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114261014_114261126:RBM19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 114377885 G/C 1 24 13 37 10.9084399766941 7.09126167929071 3.81717829740336 C:G G C 10 0.545481667637747 0.248606432535613 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 44 31 75 19.9988066239391 16.9099316967702 3.08887492716898 T:C T C 10 0.545481667637747 0.489204815229557 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 118597943 C/T 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 T:C C T 10 0.545481667637747 0.152855532002609 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 118682751 C/T 1 23 17 40 10.4539216443318 9.2731883498417 1.18073329449012 T:C:G C T 10 0.545481667637747 0.752858268417667 ENSG00000135090:ENST00000392533:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000359811:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000419821:exon_118682699_118682770:TAOK3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 120171995 T/C 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 T:C T C 10 0.545481667637747 0.782586339670189 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120171969_120172162:CIT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 120189879 A/G 1 10 3 13 4.54518332362253 1.63644500291324 2.90873832070929 A:G A G 10 0.545481667637747 0.16204615807973 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120189855_120190052:CIT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 120189888 T/C 1 10 2 12 4.54518332362253 1.09096333527549 3.45421998834704 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0775830896711619 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120189855_120190052:CIT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 120637199 G/A 1 1770 1621 3391 804.497448281188 884.225783240788 -79.7283349595999 A:T:G G A 10 0.545481667637747 0.00610540186245692 ENSG00000089157:ENST00000313104:exon_120637113_120637288:RPLP0;ENSG00000089157:ENST00000228306:exon_120637113_120637288:RPLP0;ENSG00000089157:ENST00000392514:exon_120637113_120637288:RPLP0 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 120884328 C/T 1 13 16 29 5.90873832070929 8.72770668220395 -2.81896836149466 T:C C T 10 0.545481667637747 0.352077308499086 ENSG00000111780:ENST00000229384:exon_120884284_120884364:GATC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 120966921 A/G 1 29 32 61 13.1810316385053 17.4554133644079 -4.27438172590256 A:G A G 10 0.545481667637747 0.30424690357479 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120966743_120966964:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120966743_120966953:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120966743_120966953:COQ5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 121018862 C/T 1 10 5 15 4.54518332362253 2.72740833818873 1.8177749854338 T:C C T 10 0.545481667637747 0.44074713691162 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 121131891 C/T 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 T:C C T 10 0.545481667637747 0.305240384071396 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 18 6 24 8.18132998252056 3.27289000582648 4.90843997669407 T:C T C 10 0.545481667637747 0.062904669459089 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 41 17 58 18.6352516268524 9.2731883498417 9.36206327701067 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0168889970134167 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 24 25 49 10.9084399766941 13.6370416909437 -2.7286017142496 T:C C T 10 0.545481667637747 0.474554776339739 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 29 12 41 13.1810316385053 6.54578001165296 6.63525162685237 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0413528882912976 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 121840634 T/C 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 T:C T C 10 0.545481667637747 0.152855532002609 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 121855611 G/A 1 27 51 78 12.2719949737808 27.8195650495251 -15.5475700757443 A:G G A 10 0.545481667637747 0.000557236243612248 ENSG00000170633:ENST00000361234:exon_121855307_121855714:RNF34;ENSG00000170633:ENST00000392465:exon_121855307_121855714:RNF34;ENSG00000170633:ENST00000354795:exon_121855307_121855714:RNF34;ENSG00000170633:ENST00000392464:exon_121855307_121855714:RNF34 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 21 20 41 9.54488497960731 10.9096333527549 -1.36474837314763 T:C C T 10 0.545481667637747 0.754320340488457 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 43 32 75 19.5442882915769 17.4554133644079 2.08887492716898 A:G G A 10 0.545481667637747 0.644892421946826 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 58 28 86 26.3620632770107 15.2734866938569 11.0885765831538 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0170535563813110 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 122186268 C/T 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 T:C C T 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000188735:ENST00000449592:exon_122186232_122186348:TMEM120B;ENSG00000188735:ENST00000342607:exon_122186232_122186348:TMEM120B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 122326812 T/C 1 13 29 42 5.90873832070929 15.8189683614947 -9.91023004078537 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00280999952339025 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122326646_122326900:PSMD9;ENSG00000110801:ENST00000340175:exon_122326646_122326900:PSMD9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 33 41 74 14.9991049679544 22.3647483731476 -7.36564340519328 A:G A G 10 0.545481667637747 0.101699505423495 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 122626381 G/A 1 7 2 9 3.18162832653577 1.09096333527549 2.09066499126028 A:G G A 10 0.545481667637747 0.195909819758449 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122626238_122628963:MLXIP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 31 33 64 14.0900683032298 18.0008950320457 -3.91082672881581 C:G G C 10 0.545481667637747 0.379771806071028 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 123467163 C/G 1 11 21 32 4.99970165598478 11.4551150203927 -6.4554133644079 A:C:G C G 10 0.545481667637747 0.0315263590798145 ENSG00000182196:ENST00000392435:exon_123467016_123467460:ARL6IP4;ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123467016_123467452:ARL6IP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 123950471 G/A 1 72 37 109 32.7253199300822 20.1828217025966 12.5424982274856 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0161362082893579 ENSG00000184209:ENST00000438124:exon_123950085_123950941:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000526639:exon_123950085_123951483:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000392420:exon_123950085_123950941:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000361485:exon_123950085_123950937:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000412157:exon_123950085_123950936:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000350887:exon_123950085_123950937:SNRNP35 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 124104049 A/G 1 51 24 75 23.1804349504749 13.0915600233059 10.088874927169 A:C:G A G 10 0.545481667637747 0.0202449289310736 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124103979_124104271:DDX55 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 124104686 G/A 1 52 33 85 23.6349532828372 18.0008950320457 5.63405825079151 A:G G A 10 0.545481667637747 0.232353882623213 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 124144395 A/G 1 28 16 44 12.7265133061431 8.72770668220395 3.99880662393913 A:T:G A G 10 0.545481667637747 0.289186598494007 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 124144793 T/C 1 23 20 43 10.4539216443318 10.9096333527549 -0.45571170842312 T:C T C 10 0.545481667637747 0.879898924773058 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144713_124145620:GTF2H3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 124156637 C/T 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 T:C C T 10 0.545481667637747 0.782586339670189 ENSG00000168778:ENST00000303372:exon_124156603_124156679:TCTN2;ENSG00000168778:ENST00000426174:exon_124156603_124156679:TCTN2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 124221796 G/A 1 23 20 43 10.4539216443318 10.9096333527549 -0.45571170842312 A:G G A 10 0.545481667637747 0.879898924773058 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124221606_124221818:ATP6V0A2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 124228414 A/G 1 17 10 27 7.7268116501583 5.45481667637747 2.27199497378083 A:G A G 10 0.545481667637747 0.442481195527858 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124228332_124228482:ATP6V0A2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 124821696 C/T 1 25 13 38 11.3629583090563 7.09126167929071 4.27169662976562 T:C C T 10 0.545481667637747 0.19327927706062 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000440187:exon_124821650_124821726:NCOR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 125398039 G/C 1 946 1555 2501 429.974342414691 848.223993176697 -418.249650762005 A:T:C:G G C 10 0.545481667637747 4.4071216135576e-63 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 125467158 C/T 1 11 17 28 4.99970165598478 9.2731883498417 -4.27348669385692 T:C C T 10 0.545481667637747 0.128737248500911 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125467057_125467169:DHX37 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 125561151 A/G 1 32 17 49 14.5445866355921 9.2731883498417 5.2713982857504 A:G A G 10 0.545481667637747 0.151666557651259 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000418937:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125561037_125561157:AACS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 125626785 G/C 1 29 35 64 13.1810316385053 19.0918583673211 -5.91082672881581 T:C:G G C 10 0.545481667637747 0.166913485347293 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125626638_125627871:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125626638_125627861:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125626638_125627861:AACS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 132400653 C/T 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000177169:ENST00000321867:exon_132400436_132400704:ULK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 15 12 27 6.8177749854338 6.54578001165296 0.271994973780831 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 133249339 T/C 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 T:C T C 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133249213_133249425:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133249213_133249425:POLE;ENSG00000177084:ENST00000376577:exon_133249213_133249425:POLE HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 133357412 T/C 1 15 29 44 6.8177749854338 15.8189683614947 -9.00119337606087 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00925649728805422 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133357384_133357500:GOLGA3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 133363006 G/A 1 20 20 40 9.09036664724506 10.9096333527549 -1.81926670550988 A:G G A 10 0.545481667637747 0.634717532478894 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133362925_133363141:GOLGA3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 133428242 G/A 1 12 19 31 5.45421998834704 10.3641516851172 -4.90993169677016 A:G G A 10 0.545481667637747 0.103137911347106 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133428204_133428323:CHFR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 17 15 32 7.7268116501583 8.1822250145662 -0.455413364407903 T:C T C 10 0.545481667637747 0.861584441110341 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 12 133778796 C/T 1 15 12 27 6.8177749854338 6.54578001165296 0.271994973780831 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133778730_133778955:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133778730_133781730:ZNF268 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 20567488 A/G 1 12 15 27 5.45421998834704 8.1822250145662 -2.72800502621917 A:G A G 10 0.545481667637747 0.336084534017515 ENSG00000121741:ENST00000382883:exon_20567203_20568059:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382869:exon_20567203_20568059:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000456228:exon_20567203_20568059:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000418722:exon_20567203_20568059:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382881:exon_20567203_20567704:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382874:exon_20567203_20568059:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382871:exon_20567203_20568059:ZMYM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 0 125 1 126 56.8147915452816 0.545481667637747 56.2693098776439 T:C T C 10 0.545481667637747 9.49672165644325e-32 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 25000617 C/G 1 66 51 117 29.9982099359087 27.8195650495251 2.1786448863836 C:G C G 10 0.545481667637747 0.711180784363285 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25000604_25000736:PARP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 25009297 G/T 1 33 24 57 14.9991049679544 13.0915600233059 1.90754494464842 T:G G T 10 0.545481667637747 0.690431019160232 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 25009441 C/G 1 26 12 38 11.8174766414186 6.54578001165296 5.27169662976562 C:G C G 10 0.545481667637747 0.103042906525820 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 25009485 C/G 1 12 21 33 5.45421998834704 11.4551150203927 -6.00089503204565 C:G C G 10 0.545481667637747 0.052794886859809 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 25052261 C/T 1 5 9 14 2.27259166181127 4.90933500873972 -2.63674334692846 T:C C T 10 0.545481667637747 0.185033796786841 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25052231_25052414:PARP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 25075859 C/T 1 10 6 16 4.54518332362253 3.27289000582648 1.27229331779605 T:C C T 10 0.545481667637747 0.620225311632925 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25075771_25075972:PARP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 25466955 T/C 1 14 11 25 6.36325665307154 6.00029834401522 0.362958309056325 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 25479541 A/C 1 10 13 23 4.54518332362253 7.09126167929071 -2.54607835566818 A:C A C 10 0.545481667637747 0.302524544988392 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 25486911 G/T 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 T:G G T 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25486720_25487229:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25486720_25487229:CENPJ HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 25487103 T/C 1 3 6 9 1.36355499708676 3.27289000582648 -1.90933500873972 T:C T C 10 0.545481667637747 0.316116386178568 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25486720_25487229:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25486720_25487229:CENPJ HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 25825889 T/C 1 11 8 19 4.99970165598478 4.36385334110198 0.635848314882807 T:C T C 10 0.545481667637747 0.82162549041289 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25825787_25825913:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25825787_25825913:MTMR6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 25876011 G/A 1 12 10 22 5.45421998834704 5.45481667637747 -0.000596688030433334 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25875662_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000481980:exon_25875694_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000490231:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000480187:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000460326:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000465068:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25875771_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000495460:exon_25875783_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25875785_25876018:NUPL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 25901165 C/G 1 18 11 29 8.18132998252056 6.00029834401522 2.18103163850534 C:G C G 10 0.545481667637747 0.460258162140569 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000394327:exon_25901054_25901172:NUPL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 30107067 G/C 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 C:G G C 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000139514:ENST00000380752:exon_30106961_30107119:SLC7A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 33703656 T/C 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 T:C T C 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33703066_33704426:STARD13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 20 19 39 9.09036664724506 10.3641516851172 -1.27378503787213 A:G G A 10 0.545481667637747 0.748640025630809 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 37 48 85 16.8171782974034 26.1831200466119 -9.36594174920849 A:G G A 10 0.545481667637747 0.049399987562177 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 39598616 G/A 1 13 12 25 5.90873832070929 6.54578001165296 -0.637041690943674 A:G G A 10 0.545481667637747 0.842576598281257 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000496138:exon_39598614_39598693:C13orf23 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 39603498 G/A 1 11 14 25 4.99970165598478 7.63674334692846 -2.63704169094367 A:G G A 10 0.545481667637747 0.319558675893505 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000436678:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000418503:exon_39603418_39603512:C13orf23 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 39622075 T/C 1 14 10 24 6.36325665307154 5.45481667637747 0.908439976694073 T:C T C 10 0.545481667637747 0.838386676963374 ENSG00000188811:ENST00000470258:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379600:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379599:exon_39621811_39624246:NHLRC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 41323397 C/T 1 38 41 79 17.2716966297656 22.3647483731476 -5.09305174338201 T:C C T 10 0.545481667637747 0.260177397122124 ENSG00000102738:ENST00000498078:exon_41323274_41323749:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41323274_41323417:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000461675:exon_41323274_41323417:MRPS31 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 41382711 A/T 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:T A T 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000102743:ENST00000443985:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000379523:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000426521:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000338625:exon_41382574_41382732:SLC25A15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 41834744 C/T 1 13 17 30 5.90873832070929 9.2731883498417 -3.36445002913241 T:C C T 10 0.545481667637747 0.271420658203315 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 21 30 51 9.54488497960731 16.3644500291324 -6.8195650495251 A:C A C 10 0.545481667637747 0.0668527832132588 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 44411432 A/G 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000151773:ENST00000444614:exon_44411379_44411565:CCDC122;ENSG00000151773:ENST00000379193:exon_44411416_44411565:CCDC122 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 0 35 0 35 15.9081416326789 0 15.9081416326789 G G 10 0.545481667637747 6.5722550380846e-10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 45964581 T/C 0 163 0 163 74.0864881750473 0 74.0864881750473 T T 10 0.545481667637747 1.54559742616461e-43 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 47354101 C/T 1 96 96 192 43.6337599067763 52.3662400932237 -8.73248018644742 T:C C T 10 0.545481667637747 0.218136948950680 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 50057097 G/A 1 11 6 17 4.99970165598478 3.27289000582648 1.7268116501583 A:G G A 10 0.545481667637747 0.471137770776418 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50056873_50057098:SETDB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 50057633 A/G 1 13 5 18 5.90873832070929 2.72740833818873 3.18132998252055 A:G A G 10 0.545481667637747 0.158872164572138 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50057600_50057699:SETDB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 50080847 A/G 1 16 27 43 7.27229331779605 14.7280050262192 -7.45571170842312 A:C:G A G 10 0.545481667637747 0.0308435546994426 ENSG00000136147:ENST00000482487:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000496623:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000467763:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000485919:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000442195:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50080771_50080892:PHF11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 97 71 168 44.0882782391385 38.72919840228 5.35907983685851 A:G G A 10 0.545481667637747 0.438757213496384 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 50108252 T/C 1 9 11 20 4.09066499126028 6.00029834401522 -1.90963335275494 T:C T C 10 0.545481667637747 0.501706253434889 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50106082_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50106090_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000471984:exon_50108054_50108398:RCBTB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 50123622 G/C 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 C:G G C 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50123594_50123784:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50123594_50123784:RCBTB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 50123649 G/A 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50123594_50123784:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50123594_50123784:RCBTB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 50134099 T/C 1 3 6 9 1.36355499708676 3.27289000582648 -1.90933500873972 T:C T C 10 0.545481667637747 0.316116386178568 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50134054_50134220:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50134054_50134220:RCBTB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 13 3 16 5.90873832070929 1.63644500291324 4.27229331779605 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0422836204844924 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 52598189 A/G 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 A:G A G 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52598142_52599073:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52598142_52599073:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000519151:exon_52598142_52599073:ALG11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 52603194 G/T 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 T:G G T 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 10 16 26 4.54518332362253 8.72770668220395 -4.18252335858142 T:C C T 10 0.545481667637747 0.116095624224208 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 53049267 T/C 1 27 27 54 12.2719949737808 14.7280050262192 -2.45601005243834 T:C T C 10 0.545481667637747 0.585057704278628 ENSG00000136108:ENST00000258607:exon_53049030_53050484:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378037:exon_53049030_53050485:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000490903:exon_53049030_53050484:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000459902:exon_53049030_53049277:CKAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 75876389 G/A 1 2 20 22 0.909036664724506 10.9096333527549 -10.0005966880304 A:G G A 10 0.545481667637747 1.21521947999172e-05 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000478591:exon_75876379_75876537:TBC1D4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 75884216 C/T 1 33 4 37 14.9991049679544 2.18192667055099 12.8171782974034 T:C C T 10 0.545481667637747 8.46165011066096e-06 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000493487:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000413735:exon_75884171_75884287:TBC1D4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 75884290 G/A 1 12 1 13 5.45421998834704 0.545481667637747 4.90873832070929 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00903518436202255 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 76423248 T/C 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 T:C T C 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76423112_76423428:LMO7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 92345579 C/T 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 T:C C T 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000179399:ENST00000377067:exon_92345441_92346135:GPC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 95275517 G/A 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 A:G G A 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000152749:ENST00000376958:exon_95275363_95275554:GPR180 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 95863008 C/A 1 4 9 13 1.81807332944901 4.90933500873972 -3.09126167929071 A:C C A 10 0.545481667637747 0.0994104714946873 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95862946_95863035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95862946_95863035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95862946_95863035:ABCC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 96293631 G/A 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 A:G G A 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000134874:ENST00000347108:exon_96293549_96294109:DZIP1;ENSG00000134874:ENST00000361156:exon_96293549_96294109:DZIP1;ENSG00000134874:ENST00000376825:exon_96293549_96294283:DZIP1;ENSG00000134874:ENST00000361396:exon_96293549_96294109:DZIP1;ENSG00000134874:ENST00000376829:exon_96293549_96294109:DZIP1;ENSG00000134874:ENST00000466569:exon_96293549_96294283:DZIP1;ENSG00000134874:ENST00000466027:exon_96293549_96294109:DZIP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 45 98 143 20.4533249563014 53.4572034284992 -33.0038784721978 T:C C T 10 0.545481667637747 2.97729023096592e-08 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 100888122 A/G 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000175198:ENST00000376285:exon_100888096_100888132:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376286:exon_100888096_100888132:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376279:exon_100888096_100888132:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376277:exon_100888096_100888132:PCCA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 103275386 T/C 1 20 19 39 9.09036664724506 10.3641516851172 -1.27378503787213 T:C T C 10 0.545481667637747 0.748640025630809 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103275227_103275390:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103275227_103275390:TPP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 103418728 A/G 1 30 19 49 13.6355499708676 10.3641516851172 3.2713982857504 A:G A G 10 0.545481667637747 0.390943960211222 ENSG00000151287:ENST00000376027:exon_103418340_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376019:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376022:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376021:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376032:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376029:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376031:exon_103418467_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000455589:exon_103418467_103418930:C13orf27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 59 44 103 26.8165816093729 24.0011933760609 2.81538823331206 C:G G C 10 0.545481667637747 0.621357707621968 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 111870037 T/C 1 16 19 35 7.27229331779605 10.3641516851172 -3.09185836732114 T:C T C 10 0.545481667637747 0.312384908362781 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000449979:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000491775:exon_111870026_111870147:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000469877:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000466143:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000467053:exon_111870026_111870212:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426768:exon_111870026_111870232:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111870026_111870227:ARHGEF7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 113508839 G/C 1 4 8 12 1.81807332944901 4.36385334110198 -2.54578001165296 C:G G C 10 0.545481667637747 0.157407748991045 ENSG00000068650:ENST00000487903:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375630:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375645:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000283558:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000431624:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000459908:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000418678:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000432166:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000489577:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000471555:exon_113508593_113508844:ATP11A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 113536132 T/C 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 T:C T C 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000068650:ENST00000487903:exon_113536127_113541482:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375630:exon_113536130_113541482:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000419631:exon_113536130_113538272:ATP11A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 24 27 51 10.9084399766941 14.7280050262192 -3.8195650495251 T:C C T 10 0.545481667637747 0.325417285585722 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 113909339 A/G 1 51 40 91 23.1804349504749 21.8192667055099 1.36116824496503 A:G A G 10 0.545481667637747 0.833517546690114 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 113964153 C/G 1 60 69 129 27.2710999417352 37.6382350670045 -10.3671351252694 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0766893448345188 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113963958_113964177:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113963958_113964177:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113963958_113964177:LAMP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 113973832 C/T 1 62 53 115 28.1801366064597 28.9105283848006 -0.730391778340902 T:C C T 10 0.545481667637747 0.925513502174935 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113973784_113973971:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113973784_113973971:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113973784_113973971:LAMP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 113975768 T/C 1 73 70 143 33.1798382624445 38.1837167346423 -5.00387847219782 T:C T C 10 0.545481667637747 0.402544604696411 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113974660_113975785:LAMP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 113975894 C/T 1 48 35 83 21.8168799533881 19.0918583673211 2.725021586067 T:C C T 10 0.545481667637747 0.58272903042508 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113975872_113976042:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113975872_113976042:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113975872_113977745:LAMP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 114150107 C/T 1 23 23 46 10.4539216443318 12.5460783556682 -2.09215671133636 T:C C T 10 0.545481667637747 0.556475636818224 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 114175038 G/A 1 4 10 14 1.81807332944901 5.45481667637747 -3.63674334692846 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0615052435608368 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 13 114780764 A/G 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:G A G 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114780685_114780808:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114780685_114780808:RASA3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 20770036 T/C 1 9 6 15 4.09066499126028 3.27289000582648 0.817774985433796 T:C T C 10 0.545481667637747 0.797861210956256 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20769992_20770124:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20769992_20770124:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20769992_20770124:TTC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 25 22 47 11.3629583090563 12.0005966880304 -0.637638378974108 T:C T C 10 0.545481667637747 0.884237404202915 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 45 40 85 20.4533249563014 21.8192667055099 -1.36594174920849 A:C A C 10 0.545481667637747 0.827746152667173 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 23 24 47 10.4539216443318 13.0915600233059 -2.63763837897411 C:G G C 10 0.545481667637747 0.466307924509928 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 20841707 C/T 1 12 12 24 5.45421998834704 6.54578001165296 -1.09156002330593 T:C C T 10 0.545481667637747 0.685991730875607 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20841666_20841742:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20841666_20841742:TEP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 20847202 A/G 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 A:G A G 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20847140_20847264:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20847140_20847264:TEP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 20852770 G/T 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 T:G G T 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20852759_20852872:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20852759_20852872:TEP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 22 12 34 9.99940331196957 6.54578001165296 3.4536233003166 T:C T C 10 0.545481667637747 0.301560616037186 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 215 195 410 97.7214414578844 106.368925189361 -8.64748373147626 A:T:C:G T G 10 0.545481667637747 0.39945030414949 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 20940515 C/T 1 44 27 71 19.9988066239391 14.7280050262192 5.27080159771996 T:C C T 10 0.545481667637747 0.233978640589785 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 20940606 G/A 1 67 21 88 30.452728268271 11.4551150203927 18.9976132478783 A:G G A 10 0.545481667637747 3.71892237952753e-05 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 20940626 C/T 1 72 29 101 32.7253199300822 15.8189683614947 16.9063515685876 A:T:C C T 10 0.545481667637747 0.000641742750364706 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 21250124 G/A 1 17 9 26 7.7268116501583 4.90933500873972 2.81747664141858 A:G G A 10 0.545481667637747 0.326568424395203 ENSG00000169413:ENST00000304677:exon_21249854_21250626:RNASE6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 95 75 170 43.179241574414 40.911125072831 2.26811650158302 T:C T C 10 0.545481667637747 0.758346386934216 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23020706 C/A 1 126 152 278 57.2693098776439 82.9132134809375 -25.6439036032937 A:C C A 10 0.545481667637747 0.00210646836696035 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23020919 C/T 1 157 116 273 71.3593781808737 63.2758734459786 8.08350473489507 T:C C T 10 0.545481667637747 0.331572215673084 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23020970 G/T 1 181 124 305 82.2678181575678 67.6397267870806 14.6280913704872 T:G G T 10 0.545481667637747 0.0955686813327118 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23021039 G/A 1 71 54 125 32.27080159772 29.4560100524383 2.81479154528163 A:G G A 10 0.545481667637747 0.653814730147145 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23044002 G/T 1 252 248 500 114.538619755288 135.279453574161 -20.7408338188735 A:T:G G T 10 0.545481667637747 0.0655575718016058 ENSG00000129562:ENST00000250498:exon_23043959_23044133:DAD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23282449 C/T 1 12 7 19 5.45421998834704 3.81837167346423 1.63584831488281 T:C C T 10 0.545481667637747 0.497845829751492 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000488800:exon_23282184_23282649:SLC7A7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 17 24 41 7.7268116501583 13.0915600233059 -5.36474837314763 C:G G C 10 0.545481667637747 0.115996377466619 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23374435 G/A 1 21 19 40 9.54488497960731 10.3641516851172 -0.819266705509879 A:G G A 10 0.545481667637747 0.874215754851831 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374303_23374455:RBM23 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23374862 C/T 1 28 17 45 12.7265133061431 9.2731883498417 3.45332495630139 T:C C T 10 0.545481667637747 0.369409164380547 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374815_23374868:RBM23 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23530738 G/A 1 51 45 96 23.1804349504749 24.5466750436986 -1.36624009322371 A:G G A 10 0.545481667637747 0.837749323355124 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23530507_23530831:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000473758:exon_23530507_23530831:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000338631:exon_23530507_23530831:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000357481:exon_23530507_23530831:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23530507_23530831:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000397341:exon_23530507_23530831:ACIN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23549285 G/A 1 39 29 68 17.7262149621279 15.8189683614947 1.90724660063321 A:G G A 10 0.545481667637747 0.715308951668287 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 33 16 49 14.9991049679544 8.72770668220395 6.2713982857504 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0847821176565051 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23549383 G/T 1 33 25 58 14.9991049679544 13.6370416909437 1.36206327701068 T:G G T 10 0.545481667637747 0.792508796934133 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23549785 T/C 1 75 92 167 34.088874927169 50.1843134226727 -16.0954384955037 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0128858962375196 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23745533 C/T 1 14 14 28 6.36325665307154 7.63674334692846 -1.27348669385692 T:C C T 10 0.545481667637747 0.705678422974658 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23944505 G/A 1 14 11 25 6.36325665307154 6.00029834401522 0.362958309056325 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 23944514 C/A 1 26 19 45 11.8174766414186 10.3641516851172 1.45332495630139 A:C C A 10 0.545481667637747 0.765116146805495 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24026493 A/G 1 11 14 25 4.99970165598478 7.63674334692846 -2.63704169094367 A:G A G 10 0.545481667637747 0.319558675893505 ENSG00000157306:ENST00000288014:exon_24025198_24026513:THTPA;ENSG00000157306:ENST00000404535:exon_24025952_24026513:THTPA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24033070 C/T 1 9 12 21 4.09066499126028 6.54578001165296 -2.45511502039269 T:C C T 10 0.545481667637747 0.381254161766230 ENSG00000213983:ENST00000465445:exon_24032925_24033430:AP1G2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24458162 G/C 1 6 8 14 2.72710999417352 4.36385334110198 -1.63674334692846 C:G G C 10 0.545481667637747 0.428770074510924 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 4 8 12 1.81807332944901 4.36385334110198 -2.54578001165296 A:T A T 10 0.545481667637747 0.157407748991045 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 22 14 36 9.99940331196957 7.63674334692846 2.36265996504111 A:G G A 10 0.545481667637747 0.504501807695613 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 13 10 23 5.90873832070929 5.45481667637747 0.45392164433182 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24617238 C/T 1 30 26 56 13.6355499708676 14.1825233585814 -0.54697338771383 T:C C T 10 0.545481667637747 0.894032826388861 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24617185_24617331:RNF31 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24629744 G/A 1 19 31 50 8.63584831488281 16.9099316967702 -8.27408338188735 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0224718568866661 ENSG00000092098:ENST00000382682:exon_24629729_24629870:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000491351:exon_24629729_24629869:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24629729_24629866:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000382687:exon_24629729_24629870:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000483895:exon_24629729_24629814:RNF31 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24642348 C/T 1 53 55 108 24.0894716151994 30.0014917200761 -5.91202010487667 T:C C T 10 0.545481667637747 0.287808380086346 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24642335_24642407:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24642335_24642407:REC8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24653523 G/C 1 25 35 60 11.3629583090563 19.0918583673211 -7.72890005826482 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0515337337520981 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653504_24653624:IPO4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 18 14 32 8.18132998252056 7.63674334692846 0.544586635592098 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24653965 C/T 1 12 19 31 5.45421998834704 10.3641516851172 -4.90993169677016 T:C C T 10 0.545481667637747 0.103137911347106 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24662177 C/T 1 14 18 32 6.36325665307154 9.81867001747944 -3.4554133644079 T:C C T 10 0.545481667637747 0.286679217980447 ENSG00000100926:ENST00000261789:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528669:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000529332:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000524835:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000396854:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000531406:exon_24661854_24662319:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528895:exon_24661919_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530563:exon_24661937_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530468:exon_24662049_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000525592:exon_24662094_24662475:TM9SF1;ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24661854_24662475:RP11-468E2.1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24707879 T/C 1 71 44 115 32.27080159772 24.0011933760609 8.2696082216591 T:C T C 10 0.545481667637747 0.134113981691528 ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24707452_24707984:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24707795_24708445:GMPR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24710921 T/C 1 26 14 40 11.8174766414186 7.63674334692846 4.18073329449012 T:C T C 10 0.545481667637747 0.206080689563089 ENSG00000092330:ENST00000267415:exon_24710881_24710982:TINF2;ENSG00000092330:ENST00000399423:exon_24710881_24710982:TINF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24805463 G/T 1 8 10 18 3.63614665889802 5.45481667637747 -1.81867001747945 T:G G T 10 0.545481667637747 0.479742344098255 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24805227_24805601:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24805228_24805601:RIPK3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24809024 G/A 1 1 9 10 0.454518332362253 4.90933500873972 -4.45481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00722455904266944 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24809013_24809204:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24809013_24809242:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000357715:exon_24809013_24809242:RIPK3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 13 8 21 5.90873832070929 4.36385334110198 1.54488497960731 A:C A C 10 0.545481667637747 0.521566668167506 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 24901433 C/T 1 22 24 46 9.99940331196957 13.0915600233059 -3.09215671133636 T:C C T 10 0.545481667637747 0.377437741297956 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 31381351 T/C 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 T:C T C 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000196792:ENST00000355683:exon_31381213_31381388:STRN3;ENSG00000196792:ENST00000357479:exon_31381213_31381388:STRN3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 31647241 G/A 1 10 6 16 4.54518332362253 3.27289000582648 1.27229331779605 A:G G A 10 0.545481667637747 0.620225311632925 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 34985645 G/A 1 45 42 87 20.4533249563014 22.9102300407854 -2.45690508448399 A:G G A 10 0.545481667637747 0.666976321051857 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 35222732 C/T 1 36 18 54 16.3626599650411 9.81867001747944 6.54398994756167 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0769322125600131 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35221938_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35221943_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35221943_35222910:BAZ1A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 25 21 46 11.3629583090563 11.4551150203927 -0.0921567113363597 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 35735967 A/G 1 10 22 32 4.54518332362253 12.0005966880304 -7.4554133644079 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0117348110172979 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35735933_35736081:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35735933_35736081:KIAA0391 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 35761675 C/G 1 97 106 203 44.0882782391385 57.8210567696012 -13.7327785304626 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0569672336790122 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 309 394 703 140.446164699936 214.919777049272 -74.4736123493361 A:G G A 10 0.545481667637747 1.88378514997507e-08 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 39556185 G/C 1 27 11 38 12.2719949737808 6.00029834401522 6.27169662976561 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0497113304008241 ENSG00000100934:ENST00000307712:exon_39556133_39556212:SEC23A;ENSG00000100934:ENST00000457395:exon_39556133_39556212:SEC23A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 39648629 C/T 1 189 206 395 85.9039648164658 112.369223533376 -26.4652587169101 A:T:C C T 10 0.545481667637747 0.00852573556737124 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39648528_39648666:PNN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 39650234 A/T 1 252 214 466 114.538619755288 116.733076874478 -2.19445711919008 A:T A T 10 0.545481667637747 0.852458765428774 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39649707_39652422:PNN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 39736680 T/C 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 T:C T C 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39736328_39736726:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39736328_39736726:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39736350_39736726:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39736618_39736726:CTAGE5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 39777676 G/C 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 C:G G C 10 0.545481667637747 0.152855532002609 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000382245:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39777653_39777791:CTAGE5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 45679562 A/C 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:C A C 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000129534:ENST00000469020:exon_45679314_45679731:C14orf106 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 45693249 A/G 1 25 37 62 11.3629583090563 20.1828217025966 -8.81986339354031 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0295461672214047 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45693121_45693949:C14orf106 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 45693605 A/G 1 20 21 41 9.09036664724506 11.4551150203927 -2.36474837314763 A:G A G 10 0.545481667637747 0.531152816001262 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45693121_45693949:C14orf106 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 45711594 T/C 1 19 12 31 8.63584831488281 6.54578001165296 2.09006830322984 T:C T C 10 0.545481667637747 0.476931260537673 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45711237_45711683:C14orf106 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 45711988 C/T 1 16 9 25 7.27229331779605 4.90933500873972 2.36295830905633 T:C C T 10 0.545481667637747 0.423480855331424 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45711964_45712077:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45711964_45712077:C14orf106 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 50065717 G/C 1 7 12 19 3.18162832653577 6.54578001165296 -3.36415168511719 C:G G C 10 0.545481667637747 0.165823977917260 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 50074122 T/A 1 15 7 22 6.8177749854338 3.81837167346423 2.99940331196957 A:T T A 10 0.545481667637747 0.284226176487771 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 50074520 C/T 1 23 19 42 10.4539216443318 10.3641516851172 0.0897699592146264 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 50085571 G/A 1 1067 1358 2425 484.971060630524 740.76410465206 -255.793044021536 A:T:G G A 10 0.545481667637747 2.56612024575933e-25 ENSG00000165502:ENST00000298289:exon_50085407_50085858:RPL36AL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 19 15 34 8.63584831488281 8.1822250145662 0.453623300316602 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 50100683 C/G 1 11 7 18 4.99970165598478 3.81837167346423 1.18132998252055 C:G C G 10 0.545481667637747 0.641996695541785 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 50583083 G/T 1 19 8 27 8.63584831488281 4.36385334110198 4.27199497378083 T:G G T 10 0.545481667637747 0.122054016327619 ENSG00000100483:ENST00000395859:exon_50583005_50583297:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000491402:exon_50583005_50583318:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000395860:exon_50583005_50583275:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000484763:exon_50582798_50583276:C14orf138 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 10 18 28 4.54518332362253 9.81867001747944 -5.27348669385691 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0567424992356573 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 50616878 G/A 1 9 4 13 4.09066499126028 2.18192667055099 1.90873832070929 A:G G A 10 0.545481667637747 0.405734407269743 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50616726_50616948:SOS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 51192659 G/A 1 14 24 38 6.36325665307154 13.0915600233059 -6.72830337023438 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0336229725029575 ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 51202311 G/C 1 49 41 90 22.2713982857504 22.3647483731476 -0.0933500873972299 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51202234_51202335:NIN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 74 81 155 33.6343565948067 44.1840150786575 -10.5496584838508 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0908181488941414 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 51224417 G/C 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 C:G G C 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 51224658 T/A 1 9 6 15 4.09066499126028 3.27289000582648 0.817774985433796 A:T T A 10 0.545481667637747 0.797861210956256 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 51225132 G/T 1 8 10 18 3.63614665889802 5.45481667637747 -1.81867001747945 T:G G T 10 0.545481667637747 0.479742344098255 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 51237701 A/G 1 38 19 57 17.2716966297656 10.3641516851172 6.90754494464842 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0829654378920764 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453401:exon_51237570_51237710:NIN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 53325090 C/T 1 2 7 9 0.909036664724506 3.81837167346423 -2.90933500873972 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0890372070351746 ENSG00000073712:ENST00000341590:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000395631:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000343279:exon_53323993_53325268:FERMT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 53619364 C/T 1 8 8 16 3.63614665889802 4.36385334110198 -0.727706682203952 T:C C T 10 0.545481667637747 0.8039768822367 ENSG00000100523:ENST00000357758:exon_53618979_53620000:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395606:exon_53618979_53619922:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000323669:exon_53618979_53619816:DDHD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 58831962 A/G 1 14 13 27 6.36325665307154 7.09126167929071 -0.728005026219168 A:G A G 10 0.545481667637747 0.847782191919342 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 60590988 A/G 1 14 6 20 6.36325665307154 3.27289000582648 3.09036664724506 A:G A G 10 0.545481667637747 0.184519017097887 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 61857969 A/G 1 11 11 22 4.99970165598478 6.00029834401522 -1.00059668803043 A:G A G 10 0.545481667637747 0.67524038559697 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61857943_61858006:PRKCH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 64519709 A/T 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 A:T A T 10 0.545481667637747 0.782586339670189 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 64612845 C/T 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 T:C C T 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64612786_64612941:SYNE2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 64612858 C/A 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 A:C C A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64612786_64612941:SYNE2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 64637147 C/A 1 11 12 23 4.99970165598478 6.54578001165296 -1.54607835566818 A:C C A 10 0.545481667637747 0.536843443422341 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64636946_64637180:SYNE2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 66096297 G/A 1 30 26 56 13.6355499708676 14.1825233585814 -0.54697338771383 A:G G A 10 0.545481667637747 0.894032826388861 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000358307:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394581:exon_66096210_66096324:FUT8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 68117421 T/C 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 T:C T C 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 68118132 C/T 1 62 101 163 28.1801366064597 55.0936484314124 -26.9135118249528 T:C C T 10 0.545481667637747 2.67002149247531e-05 ENSG00000081181:ENST00000261783:exon_68117432_68118437:ARG2;ENSG00000100568:ENST00000216456:exon_68117869_68118198:VTI1B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 68252852 A/T 1 3 7 10 1.36355499708676 3.81837167346423 -2.45481667637747 A:T A T 10 0.545481667637747 0.201970346156534 ENSG00000072121:ENST00000347230:exon_68252831_68252950:ZFYVE26;ENSG00000072121:ENST00000411699:exon_68252831_68252950:ZFYVE26 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 69352230 G/A 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000072110:ENST00000193403:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000438964:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000394419:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000376839:exon_69352142_69352292:ACTN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 71108942 G/A 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000133985:ENST00000256367:exon_71108504_71109252:TTC9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 71109153 C/G 1 12 11 23 5.45421998834704 6.00029834401522 -0.546078355668181 C:G C G 10 0.545481667637747 0.837030175057015 ENSG00000133985:ENST00000256367:exon_71108504_71109252:TTC9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 71137844 G/T 1 18 11 29 8.18132998252056 6.00029834401522 2.18103163850534 T:G G T 10 0.545481667637747 0.460258162140569 ENSG00000133985:ENST00000256367:exon_71137793_71142077:TTC9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 72945012 T/C 1 3 9 12 1.36355499708676 4.90933500873972 -3.54578001165296 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0457815358442577 ENSG00000182732:ENST00000402788:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000404301:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000343854:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000434263:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000453330:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000407322:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000406236:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000355512:exon_72944976_72945037:RGS6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 19 27 46 8.63584831488281 14.7280050262192 -6.09215671133636 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0766224530877039 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 74527349 C/T 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000119711:ENST00000350259:exon_74526891_74527449:ALDH6A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 74759006 C/T 1 10 12 22 4.54518332362253 6.54578001165296 -2.00059668803043 T:C C T 10 0.545481667637747 0.401468669837045 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74758990_74759079:ABCD4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 74759301 G/T 1 9 13 22 4.09066499126028 7.09126167929071 -3.00059668803043 T:C:G G T 10 0.545481667637747 0.207242496035041 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759254_74759345:ABCD4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 74759477 C/T 1 12 9 21 5.45421998834704 4.90933500873972 0.544884979607314 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759451_74759529:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759451_74759951:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759451_74759572:ABCD4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 74766352 A/G 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:G A G 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74766251_74766378:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74766251_74766378:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74766251_74766378:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000477803:exon_74766251_74766378:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000493427:exon_74765764_74766378:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000493752:exon_74765881_74766378:ABCD4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 77793207 G/A 1 11 6 17 4.99970165598478 3.27289000582648 1.7268116501583 A:G G A 10 0.545481667637747 0.471137770776418 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 77794283 T/C 1 16 7 23 7.27229331779605 3.81837167346423 3.45392164433182 T:C T C 10 0.545481667637747 0.208244249691514 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393741:exon_77794123_77794380:GSTZ1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 77926011 C/T 1 100 98 198 45.4518332362253 53.4572034284992 -8.0053701922739 T:C C T 10 0.545481667637747 0.254529506460467 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77925959_77926149:AHSA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 77928525 A/G 1 108 95 203 49.0879798951233 51.820758425586 -2.73277853046264 A:G A G 10 0.545481667637747 0.724766943938806 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77928503_77928585:AHSA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 77935520 G/A 1 120 118 238 54.5421998834704 64.3668367812541 -9.82463689778378 A:G G A 10 0.545481667637747 0.216193027697506 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77935420_77935807:AHSA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 78028803 A/G 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 A:G A G 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000100596:ENST00000216484:exon_78028739_78028832:SPTLC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 78174473 A/C 1 92 97 189 41.8156865773273 52.9117217608615 -11.0960351835342 A:C A C 10 0.545481667637747 0.108412687240117 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 88431898 C/T 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 T:C C T 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000054983:ENST00000261304:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393568:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393569:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000474294:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000445021:exon_88431849_88431973:GALC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 90429760 C/T 1 23 23 46 10.4539216443318 12.5460783556682 -2.09215671133636 T:C C T 10 0.545481667637747 0.556475636818224 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 90756760 A/T 1 9 1 10 4.09066499126028 0.545481667637747 3.54518332362253 A:T A T 10 0.545481667637747 0.0266590352665392 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90756565_90756951:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90756565_90756951:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90756565_90756951:C14orf102 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 90866346 C/T 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 T:C C T 10 0.545481667637747 0.305240384071396 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 426 325 751 193.62480958632 177.281541982268 16.343267604052 A:T:G T G 10 0.545481667637747 0.240993147627571 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 93263982 C/G 1 23 21 44 10.4539216443318 11.4551150203927 -1.00119337606087 C:G C G 10 0.545481667637747 0.764603325812675 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93263783_93264012:GOLGA5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 23 28 51 10.4539216443318 15.2734866938569 -4.8195650495251 A:G A G 10 0.545481667637747 0.205680980702786 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 93673655 G/A 1 11 10 21 4.99970165598478 5.45481667637747 -0.455115020392687 A:G G A 10 0.545481667637747 0.831123791313476 ENSG00000012963:ENST00000013070:exon_93673401_93673786:UBR7;ENSG00000012963:ENST00000416753:exon_93673401_93673786:UBR7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 102391577 G/C 1 15 12 27 6.8177749854338 6.54578001165296 0.271994973780831 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000078304:ENST00000328724:exon_102391478_102394022:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334743:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000350249:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334756:exon_102391478_102394075:PPP2R5C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 102453876 G/A 1 8 7 15 3.63614665889802 3.81837167346423 -0.182225014566205 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102453790_102453969:DYNC1H1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 102463407 A/G 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102463372_102463611:DYNC1H1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 102483120 A/G 1 14 5 19 6.36325665307154 2.72740833818873 3.63584831488281 A:G A G 10 0.545481667637747 0.109537367994142 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102483103_102483336:DYNC1H1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 102493761 A/G 1 32 22 54 14.5445866355921 12.0005966880304 2.54398994756166 A:G A G 10 0.545481667637747 0.498699287655162 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102493720_102493881:DYNC1H1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 102792386 T/C 1 7 2 9 3.18162832653577 1.09096333527549 2.09066499126028 T:C T C 10 0.545481667637747 0.195909819758449 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 102792631 G/A 1 6 10 16 2.72710999417352 5.45481667637747 -2.72770668220395 A:G G A 10 0.545481667637747 0.211649836550054 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 102798055 G/A 1 6 8 14 2.72710999417352 4.36385334110198 -1.63674334692846 A:G G A 10 0.545481667637747 0.428770074510924 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102797959_102798183:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102797959_102798183:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102797959_102798183:ZNF839 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 102815042 C/T 1 60 70 130 27.2710999417352 38.1837167346423 -10.9126167929071 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0639991034189621 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 102931603 A/T 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 A:T A T 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000196663:ENST00000359520:exon_102931478_102931626:TECPR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 103440473 G/C 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 C:G G C 10 0.545481667637747 0.243356459282646 ENSG00000198752:ENST00000361246:exon_103440353_103440486:CDC42BPB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 103986255 C/T 1 29 58 87 13.1810316385053 31.6379367229893 -18.456905084484 T:C C T 10 0.545481667637747 8.62453361870457e-05 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103985996_103986379:CKB;ENSG00000166165:ENST00000428256:exon_103985996_103986379:CKB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 104194196 C/G 1 3 6 9 1.36355499708676 3.27289000582648 -1.90933500873972 C:G C G 10 0.545481667637747 0.316116386178568 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104194083_104194251:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104194083_104194251:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000392675:exon_104193791_104194251:ZFYVE21 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 105393556 G/C 1 3 7 10 1.36355499708676 3.81837167346423 -2.45481667637747 C:G G C 10 0.545481667637747 0.201970346156534 ENSG00000166428:ENST00000392593:exon_105393478_105393567:PLD4;ENSG00000166428:ENST00000472901:exon_105393478_105393567:PLD4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 105477507 G/A 1 36 30 66 16.3626599650411 16.3644500291324 -0.00179006409129912 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 105477613 T/C 1 42 36 78 19.0897699592146 19.6373400349589 -0.547570075744261 T:C T C 10 0.545481667637747 0.909951321109231 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 45 65 110 20.4533249563014 35.4563083964536 -15.0029834401522 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00525558793908363 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 105518336 G/T 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 T:G G T 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000183484:ENST00000392585:exon_105515728_105518439:GPR132;ENSG00000183484:ENST00000329797:exon_105515739_105518439:GPR132 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 105716098 T/C 1 19 26 45 8.63584831488281 14.1825233585814 -5.54667504369861 T:C T C 10 0.545481667637747 0.101611796226776 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715977_105717421:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715977_105717430:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715977_105716298:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392553:exon_105715977_105716633:BTBD6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 105930406 G/A 1 38 40 78 17.2716966297656 21.8192667055099 -4.54757007574426 A:G G A 10 0.545481667637747 0.308358395610813 ENSG00000182979:ENST00000435036:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000490198:exon_105930369_105930484:MTA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 106174877 G/A 1 136 487 623 61.8144932012664 265.649572139583 -203.835078938316 A:T:G G A 10 0.545481667637747 2.24290421307070e-62 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 106329407 C/T 1 45 25 70 20.4533249563014 13.6370416909437 6.81628326535771 T:C C T 10 0.545481667637747 0.118443326047858 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 106757979 A/G 0 15 0 15 6.8177749854338 0 6.8177749854338 A A 10 0.545481667637747 0.00011994165868482 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 106758084 T/C 1 1406 1 1407 639.052775301328 0.545481667637747 638.50729363369 T:C T C 10 0.545481667637747 0 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 106791131 A/G 1 14 1 15 6.36325665307154 0.545481667637747 5.8177749854338 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00276308782218847 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 107170159 G/A 0 0 22 22 0 12.0005966880304 -12.0005966880304 A G A 10 0.545481667637747 2.92503387878074e-08 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 14 107170227 A/C 1 1 21 22 0.454518332362253 11.4551150203927 -11.0005966880304 A:C A C 10 0.545481667637747 8.01543761929568e-07 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 21937964 A/G 0 10 0 10 4.54518332362253 0 4.54518332362253 A A 10 0.545481667637747 0.00270867480271896 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 22939192 G/A 1 15 17 32 6.8177749854338 9.2731883498417 -2.4554133644079 A:G G A 10 0.545481667637747 0.478253507539261 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22939175_22939266:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22939175_22939266:CYFIP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 39 35 74 17.7262149621279 19.0918583673211 -1.36564340519327 T:C C T 10 0.545481667637747 0.815630927913872 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 23052632 T/C 1 5 11 16 2.27259166181127 6.00029834401522 -3.72770668220395 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0783621541065292 ENSG00000170113:ENST00000337435:exon_23052595_23052755:NIPA1;ENSG00000170113:ENST00000437912:exon_23052595_23052755:NIPA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 30337377 G/C 0 0 14 14 0 7.63674334692846 -7.63674334692846 C G C 10 0.545481667637747 1.60590431123540e-05 ENSG00000215315:ENST00000400005:exon_30336926_30337498:AC111152.1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 32929683 G/A 1 23 21 44 10.4539216443318 11.4551150203927 -1.00119337606087 A:G G A 10 0.545481667637747 0.764603325812675 ENSG00000198826:ENST00000361627:exon_32928458_32932150:ARHGAP11A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 24 14 38 10.9084399766941 7.63674334692846 3.27169662976562 A:G G A 10 0.545481667637747 0.330150172260751 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 34542872 C/G 1 9 9 18 4.09066499126028 4.90933500873972 -0.818670017479445 C:G C G 10 0.545481667637747 0.814103892547842 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34542832_34542930:SLC12A6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 34544468 C/T 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 T:C C T 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34544371_34544585:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34544371_34544585:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34544371_34544585:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34544371_34544585:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34544371_34544585:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34544371_34544585:SLC12A6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 34546704 G/A 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 A:G G A 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34546549_34546790:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34546549_34546790:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34546549_34546790:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34546549_34546790:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34546549_34546790:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34546549_34546790:SLC12A6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 35273620 C/T 1 15 15 30 6.8177749854338 8.1822250145662 -1.36445002913241 T:C C T 10 0.545481667637747 0.71468425454372 ENSG00000198146:ENST00000356321:exon_35270542_35275691:ZNF770 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 40589002 A/G 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 A:G A G 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40588959_40589109:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40588947_40589109:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40588947_40589109:PLCB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 40590134 G/A 1 9 9 18 4.09066499126028 4.90933500873972 -0.818670017479445 A:G G A 10 0.545481667637747 0.814103892547842 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40590078_40590160:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40590078_40590160:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40590078_40590160:PLCB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 42026764 C/T 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 T:C C T 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000174197:ENST00000389936:exon_42026720_42026792:MGA;ENSG00000174197:ENST00000219905:exon_42026720_42026792:MGA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 42041712 G/A 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 A:G G A 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000174197:ENST00000389936:exon_42041309_42042813:MGA;ENSG00000174197:ENST00000219905:exon_42041309_42042813:MGA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 42115747 G/C 1 2 7 9 0.909036664724506 3.81837167346423 -2.90933500873972 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0890372070351746 ENSG00000137802:ENST00000457542:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000512970:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000389931:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000221214:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000260357:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000505373:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000456763:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000505061:exon_42115645_42116259:MAPKBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 43662115 T/C 1 4 10 14 1.81807332944901 5.45481667637747 -3.63674334692846 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0615052435608368 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43661794_43662246:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43661794_43662258:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43661794_43662258:ZSCAN29 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 43678096 A/G 1 9 4 13 4.09066499126028 2.18192667055099 1.90873832070929 A:G A G 10 0.545481667637747 0.405734407269743 ENSG00000137822:ENST00000260383:exon_43677989_43678154:TUBGCP4;ENSG00000137822:ENST00000399460:exon_43677989_43678154:TUBGCP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 45047134 G/A 1 35 14 49 15.9081416326789 7.63674334692846 8.2713982857504 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0209394143751981 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 45047573 C/T 1 39 20 59 17.7262149621279 10.9096333527549 6.81658160937293 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0887238292255857 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 45695626 T/G 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 T:G T G 10 0.545481667637747 0.523901512697289 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 48720652 C/T 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 T:C C T 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000166147:ENST00000316623:exon_48720543_48720668:FBN1;ENSG00000166147:ENST00000389087:exon_48720543_48720668:FBN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 52254682 T/C 1 25 26 51 11.3629583090563 14.1825233585814 -2.81956504952509 T:C T C 10 0.545481667637747 0.482723853722245 ENSG00000166477:ENST00000299601:exon_52254586_52254690:LEO1;ENSG00000166477:ENST00000315141:exon_52254586_52254690:LEO1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 56387859 T/C 1 6 16 22 2.72710999417352 8.72770668220395 -6.00059668803043 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0164118062435037 ENSG00000181827:ENST00000422057:exon_56385831_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000423270:exon_56382732_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000317318:exon_56382732_56388818:RFX7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 56388033 T/C 1 12 19 31 5.45421998834704 10.3641516851172 -4.90993169677016 T:C T C 10 0.545481667637747 0.103137911347106 ENSG00000181827:ENST00000422057:exon_56385831_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000423270:exon_56382732_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000317318:exon_56382732_56388818:RFX7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 60639874 G/A 1 68 97 165 30.9072466006332 52.9117217608615 -22.0044751602282 A:G G A 10 0.545481667637747 0.000727682005806916 ENSG00000182718:ENST00000396024:exon_60639333_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000332680:exon_60639351_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000421017:exon_60639351_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000451270:exon_60639351_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000356292:exon_60639536_60639888:ANXA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 108 65 173 49.0879798951233 35.4563083964536 13.6316714986698 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0392391359759986 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 63433785 G/A 1 126 86 212 57.2693098776439 46.9114234168462 10.3578864607976 A:G G A 10 0.545481667637747 0.167739375255630 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 63597857 T/G 1 11 8 19 4.99970165598478 4.36385334110198 0.635848314882807 T:G T G 10 0.545481667637747 0.82162549041289 ENSG00000138613:ENST00000380343:exon_63597813_63601324:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000261879:exon_63597813_63601325:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000380340:exon_63597813_63598754:APH1B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 63918307 G/C 1 18 9 27 8.18132998252056 4.90933500873972 3.27199497378083 C:G G C 10 0.545481667637747 0.248024429023792 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63918184_63918353:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63918184_63918353:HERC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 63922752 T/A 1 14 12 26 6.36325665307154 6.54578001165296 -0.182523358581421 A:T T A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63922665_63922834:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63922665_63922834:HERC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 63932513 G/C 1 18 14 32 8.18132998252056 7.63674334692846 0.544586635592098 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63932351_63932644:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63932351_63932644:HERC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 63937209 C/G 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 C:G C G 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63937191_63937296:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63937191_63937296:HERC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 63954029 C/T 1 15 8 23 6.8177749854338 4.36385334110198 2.45392164433182 T:C C T 10 0.545481667637747 0.403122215406532 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63953952_63954220:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63953952_63954220:HERC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 63970456 T/C 1 14 10 24 6.36325665307154 5.45481667637747 0.908439976694073 T:C T C 10 0.545481667637747 0.838386676963374 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63970044_63970564:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63970044_63970564:HERC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 63988357 C/G 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63988323_63988538:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63988323_63988538:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000425434:exon_63988323_63988538:HERC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 64204128 G/T 1 3 8 11 1.36355499708676 4.36385334110198 -3.00029834401522 T:G G T 10 0.545481667637747 0.126273306068542 ENSG00000035664:ENST00000261891:exon_64204107_64204190:DAPK2;ENSG00000035664:ENST00000457488:exon_64204107_64204190:DAPK2;ENSG00000035664:ENST00000395790:exon_64204041_64204190:DAPK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 64455123 G/T 1 166 161 327 75.450043172134 87.8225484896773 -12.3725053175433 T:G G T 10 0.545481667637747 0.182561888974838 ENSG00000166794:ENST00000300026:exon_64455051_64455404:PPIB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 64508763 G/A 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 A:G G A 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000169118:ENST00000303052:exon_64508761_64508912:CSNK1G1;ENSG00000169118:ENST00000447727:exon_64508761_64508912:CSNK1G1;ENSG00000169118:ENST00000303032:exon_64508761_64508912:CSNK1G1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 64710827 T/C 1 13 13 26 5.90873832070929 7.09126167929071 -1.18252335858142 T:C T C 10 0.545481667637747 0.696126980810445 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64710740_64710927:TRIP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 64737225 G/A 1 9 18 27 4.09066499126028 9.81867001747944 -5.72800502621917 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0326964877481770 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64737205_64737307:TRIP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 64966526 C/T 1 9 15 24 4.09066499126028 8.1822250145662 -4.09156002330593 T:C C T 10 0.545481667637747 0.103711750518253 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64966115_64968455:ZNF609 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 66612927 C/T 1 3 14 17 1.36355499708676 7.63674334692846 -6.2731883498417 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00260836142171247 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000441424:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000524795:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66612909_66613070:DIS3L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 66618342 A/G 1 22 8 30 9.99940331196957 4.36385334110198 5.63554997086759 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0436157759212540 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66618169_66618702:DIS3L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 66625660 A/T 1 14 21 35 6.36325665307154 11.4551150203927 -5.09185836732114 A:T A T 10 0.545481667637747 0.0912306213941213 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66625342_66626236:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66625342_66626082:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66625342_66626066:DIS3L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 66629403 C/A 1 35 20 55 15.9081416326789 10.9096333527549 4.99850827992392 A:C C A 10 0.545481667637747 0.22264556219843 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66629052_66629519:TIPIN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 66793480 C/T 1 21 16 37 9.54488497960731 8.72770668220395 0.817178297403363 T:C C T 10 0.545481667637747 0.869526951478906 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 66793677 G/C 1 18 10 28 8.18132998252056 5.45481667637747 2.72651330614309 C:G G C 10 0.545481667637747 0.346086789444934 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 67528374 T/G 1 19 26 45 8.63584831488281 14.1825233585814 -5.54667504369861 T:G T G 10 0.545481667637747 0.101611796226776 ENSG00000103591:ENST00000261880:exon_67528317_67528406:AAGAB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 7 14 21 3.18162832653577 7.63674334692846 -4.45511502039269 T:C C T 10 0.545481667637747 0.077082718790732 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 9 18 27 4.09066499126028 9.81867001747944 -5.72800502621917 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0326964877481770 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 73027478 T/C 1 9 5 14 4.09066499126028 2.72740833818873 1.36325665307154 T:C T C 10 0.545481667637747 0.594821470841361 ENSG00000140463:ENST00000268057:exon_73027454_73027523:BBS4;ENSG00000140463:ENST00000395205:exon_73027454_73027523:BBS4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 73052840 T/C 1 17 11 28 7.7268116501583 6.00029834401522 1.72651330614308 T:C T C 10 0.545481667637747 0.572643391755575 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 73052845 A/G 1 17 12 29 7.7268116501583 6.54578001165296 1.18103163850534 A:G A G 10 0.545481667637747 0.712372034204297 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 74336633 T/C 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 T:C T C 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000140464:ENST00000418568:exon_74336562_74336640:PML;ENSG00000140464:ENST00000417341:exon_74336562_74340151:PML;ENSG00000140464:ENST00000436891:exon_74336562_74340151:PML;ENSG00000140464:ENST00000268058:exon_74336562_74339112:PML HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 74709975 G/A 1 98 79 177 44.5427965715008 43.093051743382 1.44974482811878 A:G G A 10 0.545481667637747 0.880076898249939 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74709932_74710016:SEMA7A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 74710305 G/A 1 91 70 161 41.361168244965 38.1837167346423 3.17745151032274 A:G G A 10 0.545481667637747 0.635597543155499 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74710218_74710310:SEMA7A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 74883851 T/G 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 T:G T G 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000179361:ENST00000382537:exon_74883492_74883918:ARID3B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 161 175 336 73.1774515103227 95.4592918366057 -22.281840326283 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0158509447667143 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 75130093 T/C 1 13 1 14 5.90873832070929 0.545481667637747 5.36325665307154 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00500613420070702 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75130092_75130139:ULK3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 75146366 G/T 1 34 24 58 15.4536233003166 13.0915600233059 2.36206327701068 T:G G T 10 0.545481667637747 0.598689140775304 ENSG00000140497:ENST00000268099:exon_75146362_75146460:SCAMP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 75188584 C/T 1 10 10 20 4.54518332362253 5.45481667637747 -0.909633352754939 T:C C T 10 0.545481667637747 0.82309086372065 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75188493_75188666:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75188493_75188666:MPI;ENSG00000178802:ENST00000379693:exon_75188493_75188842:MPI HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 75336729 A/G 1 9 9 18 4.09066499126028 4.90933500873972 -0.818670017479445 A:G A G 10 0.545481667637747 0.814103892547842 ENSG00000138621:ENST00000342932:exon_75336727_75336855:PPCDC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 75498744 G/C 1 34 32 66 15.4536233003166 17.4554133644079 -2.0017900640913 C:G G C 10 0.545481667637747 0.623533313313109 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 75499995 T/G 1 33 51 84 14.9991049679544 27.8195650495251 -12.8204600815707 T:G T G 10 0.545481667637747 0.00590016945914087 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 75632360 C/A 1 74 71 145 33.6343565948067 38.72919840228 -5.09484180747331 A:T:C C A 10 0.545481667637747 0.405297741270726 ENSG00000140365:ENST00000267935:exon_75632306_75632614:COMMD4;ENSG00000140365:ENST00000338995:exon_75632306_75632612:COMMD4;ENSG00000140365:ENST00000480484:exon_75632306_75632561:COMMD4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 75648650 C/T 1 35 55 90 15.9081416326789 30.0014917200761 -14.0933500873972 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00298530526093323 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75648642_75648790:MAN2C1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 75650836 G/A 1 45 53 98 20.4533249563014 28.9105283848006 -8.4572034284992 A:G G A 10 0.545481667637747 0.104108214428177 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75650803_75650959:MAN2C1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 75650972 G/A 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763894627012578 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 47 41 88 21.3623616210259 22.3647483731476 -1.00238675212173 T:G G T 10 0.545481667637747 0.831401998107881 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 78337303 C/T 1 7 9 16 3.18162832653577 4.90933500873972 -1.72770668220395 T:C C T 10 0.545481667637747 0.4555478790811 ENSG00000167202:ENST00000418039:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000409931:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000300584:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000420639:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000435468:exon_78337242_78337410:TBC1D2B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 78567853 G/T 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 T:G G T 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000140403:ENST00000394855:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000343789:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000394852:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000446172:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000493321:exon_78567339_78568070:DNAJA4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 79215311 A/C 1 8 8 16 3.63614665889802 4.36385334110198 -0.727706682203952 A:C A C 10 0.545481667637747 0.8039768822367 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 79217691 G/A 1 502 231 733 228.168202845851 126.00626522432 102.161937621531 A:T:C:G G A 10 0.545481667637747 1.50490958424579e-14 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000527715:exon_79217676_79219246:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534237:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79217676_79217782:CTSH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 79237247 C/G 1 198 172 370 89.9946298077261 93.8228468336925 -3.82821702596638 C:G C G 10 0.545481667637747 0.714867985528368 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79237233_79237433:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79237233_79237260:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79237233_79237256:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79237233_79237404:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79237233_79237388:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79237120_79237436:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79237233_79237388:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000530010:exon_79237233_79237340:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534268:exon_79236880_79237363:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528436:exon_79237233_79237384:CTSH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 95 104 199 43.179241574414 56.7300934343257 -13.5508518599116 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0548527039601656 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 81598225 C/A 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 A:C C A 10 0.545481667637747 0.735500840387382 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 81598269 T/G 1 89 65 154 40.4521315802405 35.4563083964536 4.99582318378697 T:G T G 10 0.545481667637747 0.466571515796374 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 81598416 G/A 1 53 63 116 24.0894716151994 34.3653450611781 -10.2758734459787 A:C:G G A 10 0.545481667637747 0.061992838680518 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 82443939 G/A 1 10 11 21 4.54518332362253 6.00029834401522 -1.45511502039269 A:G G A 10 0.545481667637747 0.662266055550669 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 82444663 T/C 1 13 12 25 5.90873832070929 6.54578001165296 -0.637041690943674 T:C T C 10 0.545481667637747 0.842576598281257 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 82456227 T/C 1 7 11 18 3.18162832653577 6.00029834401522 -2.81867001747945 T:C T C 10 0.545481667637747 0.237085594735494 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82456194_82456325:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82456194_82456325:EFTUD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 82512429 C/G 1 12 6 18 5.45421998834704 3.27289000582648 2.18132998252055 C:G C G 10 0.545481667637747 0.350676066108478 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82512419_82512570:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82512419_82512570:EFTUD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 83502065 A/C 1 5 9 14 2.27259166181127 4.90933500873972 -2.63674334692846 A:C A C 10 0.545481667637747 0.185033796786841 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83501981_83503613:WHAMM HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 83502066 C/G 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 C:G C G 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83501981_83503613:WHAMM HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 85188839 C/T 1 12 11 23 5.45421998834704 6.00029834401522 -0.546078355668181 T:C C T 10 0.545481667637747 0.837030175057015 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86122654 T/C 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86122779 T/C 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86122916 T/C 1 7 2 9 3.18162832653577 1.09096333527549 2.09066499126028 T:C T C 10 0.545481667637747 0.195909819758449 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86123019 C/T 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 T:C C T 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86123462 T/C 1 9 12 21 4.09066499126028 6.54578001165296 -2.45511502039269 T:C T C 10 0.545481667637747 0.381254161766230 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86123924 C/T 1 9 5 14 4.09066499126028 2.72740833818873 1.36325665307154 T:C C T 10 0.545481667637747 0.594821470841361 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86123988 G/A 1 9 2 11 4.09066499126028 1.09096333527549 2.99970165598478 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0774939953200738 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86124044 G/C 1 12 3 15 5.45421998834704 1.63644500291324 3.8177749854338 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0670347185280012 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86124483 C/G 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 C:G C G 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86124555 G/A 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 A:G G A 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86124946 T/C 1 2 11 13 0.909036664724506 6.00029834401522 -5.09126167929071 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0049344968896263 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86124968 G/A 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:G G A 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86125031 G/A 1 3 11 14 1.36355499708676 6.00029834401522 -4.63674334692846 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0151104593398819 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86125304 C/T 1 15 6 21 6.8177749854338 3.27289000582648 3.54488497960731 T:C C T 10 0.545481667637747 0.130974510766364 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 26 32 58 11.8174766414186 17.4554133644079 -5.63793672298932 T:C C T 10 0.545481667637747 0.147998274121349 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 86287867 G/A 1 29 23 52 13.1810316385053 12.5460783556682 0.634953282837158 A:G G A 10 0.545481667637747 0.890129759076656 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 89195526 A/G 1 207 118 325 94.0852947989864 64.3668367812541 29.7184580177322 A:G A G 10 0.545481667637747 0.000986847044682838 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 89804043 C/T 1 8 9 17 3.63614665889802 4.90933500873972 -1.2731883498417 T:C C T 10 0.545481667637747 0.628894857051545 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 19 12 31 8.63584831488281 6.54578001165296 2.09006830322984 C:G G C 10 0.545481667637747 0.476931260537673 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 37 32 69 16.8171782974034 17.4554133644079 -0.63823506700454 T:C T C 10 0.545481667637747 0.9041693659292 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 90170237 C/T 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90170187_90171250:C15orf42 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 90611818 C/A 1 9 11 20 4.09066499126028 6.00029834401522 -1.90963335275494 A:C C A 10 0.545481667637747 0.501706253434889 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90610342_90611827:ZNF710 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 90623052 T/C 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90622892_90625432:ZNF710 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 90771704 G/A 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 A:G G A 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 A:G G A 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 91449654 T/C 1 15 13 28 6.8177749854338 7.09126167929071 -0.273486693856915 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91449600_91449727:MAN2A2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 91449702 A/T 1 13 15 28 5.90873832070929 8.1822250145662 -2.27348669385692 A:T A T 10 0.545481667637747 0.44954716189734 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91449600_91449727:MAN2A2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 91454424 C/T 1 20 18 38 9.09036664724506 9.81867001747944 -0.728303370234384 T:C C T 10 0.545481667637747 0.871215003267403 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91454401_91454468:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91454401_91454468:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91454401_91454468:MAN2A2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 91474738 G/C 1 6 10 16 2.72710999417352 5.45481667637747 -2.72770668220395 C:G G C 10 0.545481667637747 0.211649836550054 ENSG00000184508:ENST00000330334:exon_91474155_91474786:HDDC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 99762052 A/G 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000103852:ENST00000459771:exon_99761946_99762069:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394132:exon_99761946_99762069:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000434186:exon_99761946_99762069:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394136:exon_99761946_99762069:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000262074:exon_99761946_99762069:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000427087:exon_99761946_99762069:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000421732:exon_99761946_99762069:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000413876:exon_99761946_99762069:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000494567:exon_99761946_99762069:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394135:exon_99761946_99762069:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394130:exon_99761946_99762069:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394129:exon_99761946_99762069:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000431450:exon_99761946_99762069:TTC23 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 15 101717680 G/T 1 13 8 21 5.90873832070929 4.36385334110198 1.54488497960731 T:G G T 10 0.545481667637747 0.521566668167506 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 97541 G/A 1 65 61 126 29.5436916035464 33.2743817259026 -3.73069012235612 A:G G A 10 0.545481667637747 0.531683530419337 ENSG00000161980:ENST00000293860:exon_96407_97557:POLR3K;ENSG00000161980:ENST00000481810:exon_97236_97557:POLR3K HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 129654 C/T 1 47 50 97 21.3623616210259 27.2740833818873 -5.91172176086145 T:C C T 10 0.545481667637747 0.261982351875113 ENSG00000103152:ENST00000436333:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397817:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000356432:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000428050:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000475280:exon_129424_129843:MPG;ENSG00000103152:ENST00000219431:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397818:exon_129424_129699:MPG HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 315008 A/G 1 11 20 31 4.99970165598478 10.9096333527549 -5.90993169677016 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0456130255550640 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_314810_316124:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_314810_316119:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_314810_316090:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000424016:exon_314810_315089:ITFG3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 99 81 180 44.997314903863 44.1840150786575 0.813299825205547 A:G A G 10 0.545481667637747 0.940399873485533 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 424277 G/A 1 18 18 36 8.18132998252056 9.81867001747944 -1.63734003495889 A:G G A 10 0.545481667637747 0.618217725988323 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 18 14 32 8.18132998252056 7.63674334692846 0.544586635592098 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 23 24 47 10.4539216443318 13.0915600233059 -2.63763837897411 A:G A G 10 0.545481667637747 0.466307924509928 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 2014283 A/G 1 81 29 110 36.8159849213425 15.8189683614947 20.9970165598478 A:G A G 10 0.545481667637747 4.83166606019042e-05 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533186:exon_2014277_2014357:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000532746:exon_2014277_2014368:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533872:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2013654_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000534461:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 2014591 C/T 1 798 209 1007 362.705629225078 114.005668536289 248.699960688789 A:T:C C T 10 0.545481667637747 4.1138322596641e-60 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 2111980 C/G 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2111872_2112009:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2111872_2112009:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2111872_2112009:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2111872_2112009:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2111872_2112009:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2111872_2112009:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000463601:exon_2111590_2112009:TSC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 2258767 G/A 1 54 35 89 24.5439899475617 19.0918583673211 5.45213158024052 A:G G A 10 0.545481667637747 0.287134892699087 ENSG00000167965:ENST00000382450:exon_2258760_2259398:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301724:exon_2258451_2259398:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000397124:exon_2258760_2259398:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301725:exon_2258760_2259397:MLST8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 2305693 G/A 1 34 62 96 15.4536233003166 33.8198633935403 -18.3662400932237 A:G G A 10 0.545481667637747 0.000195319326491171 ENSG00000205937:ENST00000320225:exon_2305586_2305727:RNPS1;ENSG00000205937:ENST00000397086:exon_2305586_2305727:RNPS1;ENSG00000205937:ENST00000301730:exon_2305586_2305727:RNPS1;ENSG00000167970:ENST00000454671:exon_2305586_2305729:AC009065.1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 2512523 G/A 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000162062:ENST00000361837:exon_2512416_2512527:C16orf59;ENSG00000162062:ENST00000483320:exon_2512416_2512527:C16orf59 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 2581031 C/T 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 T:C C T 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 2821573 C/T 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 T:C C T 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 3339435 G/C 1 16 13 29 7.27229331779605 7.09126167929071 0.181031638505338 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000006194:ENST00000219069:exon_3339393_3341460:ZNF263 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 3349328 C/T 1 3 7 10 1.36355499708676 3.81837167346423 -2.45481667637747 T:C C T 10 0.545481667637747 0.201970346156534 ENSG00000140993:ENST00000426381:exon_3349106_3350614:TIGD7;ENSG00000140993:ENST00000396862:exon_3348832_3352009:TIGD7;ENSG00000140993:ENST00000268674:exon_3348965_3350614:TIGD7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 3367229 T/C 1 10 13 23 4.54518332362253 7.09126167929071 -2.54607835566818 T:C T C 10 0.545481667637747 0.302524544988392 ENSG00000162086:ENST00000293995:exon_3367190_3368574:ZNF75A;ENSG00000162086:ENST00000498240:exon_3367190_3368574:ZNF75A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 3586230 C/T 1 13 16 29 5.90873832070929 8.72770668220395 -2.81896836149466 T:C C T 10 0.545481667637747 0.352077308499086 ENSG00000103351:ENST00000341633:exon_3586122_3586581:CLUAP1;ENSG00000103351:ENST00000417763:exon_3586122_3586581:CLUAP1;ENSG00000103351:ENST00000445795:exon_3586122_3587669:CLUAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 54 53 107 24.5439899475617 28.9105283848006 -4.36653843723893 C:G G C 10 0.545481667637747 0.437603681320528 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 4390358 G/T 1 12 8 20 5.45421998834704 4.36385334110198 1.09036664724506 T:G G T 10 0.545481667637747 0.660941894453713 ENSG00000217930:ENST00000318059:exon_4390252_4390406:PAM16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 4511868 G/C 1 37 43 80 16.8171782974034 23.4557117084231 -6.63853341101976 C:G G C 10 0.545481667637747 0.145168615346432 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4511695_4511960:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4511696_4511960:NMRAL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 9 3 12 4.09066499126028 1.63644500291324 2.45421998834704 T:C C T 10 0.545481667637747 0.245735735487388 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 4751045 C/T 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 T:C C T 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4750971_4751135:ANKS3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 4752134 A/G 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:G A G 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4752103_4752243:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4752103_4752243:ANKS3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 4802386 G/T 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 T:G G T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000103199:ENST00000219478:exon_4800815_4803059:ZNF500 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 4930100 C/T 1 6 14 20 2.72710999417352 7.63674334692846 -4.90963335275494 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0407141622416941 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4930084_4932361:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4930084_4932361:UBN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 8729124 G/A 1 4 8 12 1.81807332944901 4.36385334110198 -2.54578001165296 A:G G A 10 0.545481667637747 0.157407748991045 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 8953081 C/G 1 21 15 36 9.54488497960731 8.1822250145662 1.36265996504111 C:G C G 10 0.545481667637747 0.738817375454975 ENSG00000153048:ENST00000396593:exon_8953028_8953192:CARHSP1;ENSG00000153048:ENST00000311052:exon_8953028_8953192:CARHSP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 8999138 T/C 1 55 46 101 24.9985082799239 25.0921567113364 -0.0936484314124435 T:C:G T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000187555:ENST00000344836:exon_8999044_8999188:USP7;ENSG00000187555:ENST00000381886:exon_8999044_8999188:USP7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 10989219 C/G 1 27 27 54 12.2719949737808 14.7280050262192 -2.45601005243834 C:G C G 10 0.545481667637747 0.585057704278628 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_10989139_10989285:CIITA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 11000848 G/C 1 30 37 67 13.6355499708676 20.1828217025966 -6.54727173172905 C:G G C 10 0.545481667637747 0.112189849779479 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 11001770 G/T 1 28 17 45 12.7265133061431 9.2731883498417 3.45332495630139 T:G G T 10 0.545481667637747 0.369409164380547 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 11002904 G/A 1 35 19 54 15.9081416326789 10.3641516851172 5.54398994756166 A:G G A 10 0.545481667637747 0.135207833986948 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 11017058 G/A 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 A:G G A 10 0.545481667637747 0.782586339670189 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 11773662 C/G 1 70 76 146 31.8162832653577 41.4566067404688 -9.64032347511106 C:G C G 10 0.545481667637747 0.114639065409403 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 11873158 T/C 1 16 18 34 7.27229331779605 9.81867001747944 -2.5463766996834 T:C T C 10 0.545481667637747 0.39437426025059 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11873022_11873219:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11873022_11873219:ZC3H7A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 11876203 T/C 1 12 14 26 5.45421998834704 7.63674334692846 -2.18252335858142 T:C T C 10 0.545481667637747 0.434203864087606 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11876143_11876244:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11876143_11876408:ZC3H7A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 11933678 G/C 1 282 289 571 128.174169726155 157.644201947309 -29.4700322211535 A:C:G G C 10 0.545481667637747 0.0147251889995571 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11933552_11933842:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11933552_11933842:RSL1D1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 11940390 T/C 1 182 166 348 82.7223364899301 90.549956827866 -7.82762033793594 T:C T C 10 0.545481667637747 0.419503138766647 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11940358_11940459:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11940358_11940459:RSL1D1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 12061626 G/A 1 157 210 367 71.3593781808737 114.551150203927 -43.1917720230531 A:G G A 10 0.545481667637747 7.64373813262743e-06 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 14742400 T/G 1 38 23 61 17.2716966297656 12.5460783556682 4.72561827409743 T:G T G 10 0.545481667637747 0.248391693398525 ENSG00000103429:ENST00000261658:exon_14742245_14742449:BFAR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 15718591 G/A 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:G G A 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 15818141 A/C 1 12 16 28 5.45421998834704 8.72770668220395 -3.27348669385692 A:C A C 10 0.545481667637747 0.255806345342211 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 23 14 37 10.4539216443318 7.63674334692846 2.81717829740336 A:G G A 10 0.545481667637747 0.410682812854318 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 19547357 A/G 1 9 1 10 4.09066499126028 0.545481667637747 3.54518332362253 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0266590352665392 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 19547503 C/T 1 11 4 15 4.99970165598478 2.18192667055099 2.8177749854338 T:C C T 10 0.545481667637747 0.195724131043462 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 19548116 G/A 1 4 10 14 1.81807332944901 5.45481667637747 -3.63674334692846 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0615052435608368 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 19548290 G/A 1 12 3 15 5.45421998834704 1.63644500291324 3.8177749854338 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0670347185280012 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 19725561 G/A 1 22 27 49 9.99940331196957 14.7280050262192 -4.7286017142496 A:G G A 10 0.545481667637747 0.197312998284813 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 24166130 T/C 1 12 16 28 5.45421998834704 8.72770668220395 -3.27348669385692 T:C T C 10 0.545481667637747 0.255806345342211 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 24582299 C/G 1 52 40 92 23.6349532828372 21.8192667055099 1.81568657732728 C:G C G 10 0.545481667637747 0.753927010970503 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 65 58 123 29.5436916035464 31.6379367229893 -2.09424511944288 A:G A G 10 0.545481667637747 0.717958717516452 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 51 38 89 23.1804349504749 20.7283033702344 2.45213158024052 T:C T C 10 0.545481667637747 0.670570053325167 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 27472772 C/T 1 16 9 25 7.27229331779605 4.90933500873972 2.36295830905633 T:C C T 10 0.545481667637747 0.423480855331424 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27471935_27472883:GTF3C1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 27474910 A/G 1 14 15 29 6.36325665307154 8.1822250145662 -1.81896836149466 A:G A G 10 0.545481667637747 0.577160759175787 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27474862_27474913:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27474862_27474913:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27474862_27474913:GTF3C1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 28145165 T/A 1 25 31 56 11.3629583090563 16.9099316967702 -5.54697338771383 A:T T A 10 0.545481667637747 0.141986711080816 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28145162_28145254:XPO6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 28222690 G/A 1 25 22 47 11.3629583090563 12.0005966880304 -0.637638378974108 A:G G A 10 0.545481667637747 0.884237404202915 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28222687_28223190:XPO6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 28836706 G/A 1 54 35 89 24.5439899475617 19.0918583673211 5.45213158024052 A:G G A 10 0.545481667637747 0.287134892699087 ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28836687_28836723:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28836687_28836723:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28836687_28836723:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000359153:exon_28836687_28836723:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28836687_28836723:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28836687_28836723:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28836687_28836723:ATXN2L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 31088347 G/A 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:G G A 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000167395:ENST00000428260:exon_31087567_31088365:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 31088625 A/G 1 8 3 11 3.63614665889802 1.63644500291324 1.99970165598478 A:G A G 10 0.545481667637747 0.364801401986479 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 31090407 G/C 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 C:G G C 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 31091209 T/C 1 12 11 23 5.45421998834704 6.00029834401522 -0.546078355668181 T:C T C 10 0.545481667637747 0.837030175057015 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 31092075 G/A 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 31121793 G/A 1 21 18 39 9.54488497960731 9.81867001747944 -0.27378503787213 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000103507:ENST00000394951:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000219794:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394950:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000287507:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394952:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000441132:exon_31121722_31121801:BCKDK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 31374535 C/G 1 10 10 20 4.54518332362253 5.45481667637747 -0.909633352754939 C:G C G 10 0.545481667637747 0.82309086372065 ENSG00000140678:ENST00000268296:exon_31374486_31374695:ITGAX;ENSG00000140678:ENST00000394880:exon_31374486_31374695:ITGAX HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 31384648 C/T 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 T:C C T 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000140678:ENST00000268296:exon_31384570_31384711:ITGAX HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 46723598 T/C 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000091651:ENST00000219097:exon_46723558_46723682:ORC6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 50106594 T/C 1 7 12 19 3.18162832653577 6.54578001165296 -3.36415168511719 T:C T C 10 0.545481667637747 0.165823977917260 ENSG00000155393:ENST00000285767:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000483299:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000299192:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000405152:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000401635:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000456734:exon_50106516_50106625:HEATR3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 50785667 T/C 1 39 44 83 17.7262149621279 24.0011933760609 -6.274978413933 A:T:C T C 10 0.545481667637747 0.186057519145049 ENSG00000083799:ENST00000427738:exon_50785515_50785817:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000311559:exon_50785515_50785817:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000398568:exon_50785515_50785817:CYLD HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 56396486 C/T 1 53 55 108 24.0894716151994 30.0014917200761 -5.91202010487667 T:C C T 10 0.545481667637747 0.287808380086346 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 56545175 T/C 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 T:C T C 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000125124:ENST00000245157:exon_56545071_56545196:BBS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 56839439 C/T 1 8 15 23 3.63614665889802 8.1822250145662 -4.54607835566818 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0619351832056806 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56839416_56839544:NUP93 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 56855496 C/G 1 22 23 45 9.99940331196957 12.5460783556682 -2.54667504369861 C:G C G 10 0.545481667637747 0.458001602818798 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56855416_56855505:NUP93 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 8 8 16 3.63614665889802 4.36385334110198 -0.727706682203952 A:G G A 10 0.545481667637747 0.8039768822367 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57060340 T/C 1 19 21 40 8.63584831488281 11.4551150203927 -2.81926670550988 T:C T C 10 0.545481667637747 0.428110736064814 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57060353 T/C 1 22 22 44 9.99940331196957 12.0005966880304 -2.00119337606087 T:C T C 10 0.545481667637747 0.549117968411728 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57062177 T/A 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 A:T T A 10 0.545481667637747 0.779228340946012 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57068106 A/G 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 A:G A G 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57068080_57068163:NLRC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57068107 C/T 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 T:C C T 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57068080_57068163:NLRC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57071113 T/C 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 T:C T C 10 0.545481667637747 0.523901512697289 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57071107_57071196:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57071107_57071196:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57071107_57071196:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57071107_57071196:NLRC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57085465 C/T 1 13 12 25 5.90873832070929 6.54578001165296 -0.637041690943674 T:C C T 10 0.545481667637747 0.842576598281257 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57085450_57085533:NLRC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57091977 T/C 1 15 14 29 6.8177749854338 7.63674334692846 -0.818968361494663 T:C T C 10 0.545481667637747 0.852670497525973 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57091977_57092060:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57091977_57092060:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57091977_57092060:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57091977_57092060:NLRC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57101340 T/C 1 17 8 25 7.7268116501583 4.36385334110198 3.36295830905633 T:C T C 10 0.545481667637747 0.228487063060426 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57101299_57101382:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57101299_57101382:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57101299_57101382:NLRC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57101373 A/G 1 14 3 17 6.36325665307154 1.63644500291324 4.7268116501583 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0264033241055959 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57101299_57101382:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57101299_57101382:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57101299_57101382:NLRC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57111232 C/T 1 16 23 39 7.27229331779605 12.5460783556682 -5.27378503787213 T:C C T 10 0.545481667637747 0.107501222001949 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57111208_57111291:NLRC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57392733 A/C 1 312 301 613 141.809719697023 164.189981958962 -22.3802622619389 A:C A C 10 0.545481667637747 0.0742619260156917 ENSG00000102962:ENST00000219235:exon_57392684_57392801:CCL22 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57499902 T/C 1 32 29 61 14.5445866355921 15.8189683614947 -1.27438172590256 T:C T C 10 0.545481667637747 0.79753304015901 ENSG00000102978:ENST00000219252:exon_57499865_57499933:POLR2C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57595999 A/G 1 22 16 38 9.99940331196957 8.72770668220395 1.27169662976561 A:G A G 10 0.545481667637747 0.746021063688677 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57595968_57596069:GPR114 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 57784797 C/T 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 T:C C T 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57784739_57784839:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57784739_57784839:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57784739_57784839:KATNB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 58550484 G/A 1 17 7 24 7.7268116501583 3.81837167346423 3.90843997669407 A:G G A 10 0.545481667637747 0.150198498186465 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000418480:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000467320:exon_58550036_58550576:SETD6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 67691477 A/T 1 12 10 22 5.45421998834704 5.45481667637747 -0.000596688030433334 A:T A T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691433_67691587:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691435_67691587:ACD HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 67697633 C/T 1 3 16 19 1.36355499708676 8.72770668220395 -7.36415168511719 T:C C T 10 0.545481667637747 0.000773778273425791 ENSG00000124074:ENST00000243878:exon_67697560_67697723:C16orf48;ENSG00000124074:ENST00000414445:exon_67697560_67697723:C16orf48 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 67911517 T/C 1 17 24 41 7.7268116501583 13.0915600233059 -5.36474837314763 T:C T C 10 0.545481667637747 0.115996377466619 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 67964203 T/C 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 T:C T C 10 0.545481667637747 0.782586339670189 ENSG00000141086:ENST00000319955:exon_67964088_67964221:CTRL;ENSG00000141086:ENST00000432773:exon_67963848_67964221:CTRL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 119 108 227 54.0876815511081 58.9120201048767 -4.82433855376856 A:G A G 10 0.545481667637747 0.548769150416379 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 68055495 G/C 1 21 35 56 9.54488497960731 19.0918583673211 -9.54697338771383 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0149481205767418 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 68056703 G/A 1 17 15 32 7.7268116501583 8.1822250145662 -0.455413364407903 A:G G A 10 0.545481667637747 0.861584441110341 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 68088485 A/G 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 A:G A G 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000167264:ENST00000358896:exon_68088477_68088520:DUS2L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 68156591 T/A 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 A:T T A 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000072736:ENST00000379165:exon_68155890_68157024:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000349223:exon_68155890_68157024:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000346183:exon_68155890_68157024:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000329524:exon_68155890_68157024:NFATC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 68293320 T/C 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 T:C T C 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000103066:ENST00000219345:exon_68293049_68294965:PLA2G15;ENSG00000103066:ENST00000444212:exon_68293049_68294959:PLA2G15;ENSG00000103066:ENST00000413021:exon_68293049_68294959:PLA2G15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 68344696 C/T 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 T:C C T 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 68387373 C/T 1 7 1 8 3.18162832653577 0.545481667637747 2.63614665889802 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0793996161569039 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 23 12 35 10.4539216443318 6.54578001165296 3.90814163267886 T:C C T 10 0.545481667637747 0.234674771647419 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 68598007 A/G 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 A:G A G 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000184939:ENST00000398253:exon_68596947_68601039:ZFP90 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 23 24 47 10.4539216443318 13.0915600233059 -2.63763837897411 A:G G A 10 0.545481667637747 0.466307924509928 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 69782855 C/T 1 49 59 108 22.2713982857504 32.1834183906271 -9.91202010487667 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0659090615648513 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782821_69783021:NOB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 69963355 G/A 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 A:G G A 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69963351_69963432:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69963351_69963432:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69963351_69963432:WWP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 69970329 A/G 1 10 9 19 4.54518332362253 4.90933500873972 -0.364151685117192 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69970215_69970355:WWP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 69973825 G/A 1 12 16 28 5.45421998834704 8.72770668220395 -3.27348669385692 A:G G A 10 0.545481667637747 0.255806345342211 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973744_69975644:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973744_69975643:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973744_69975643:WWP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 70287177 A/G 1 102 87 189 46.3608699009498 47.456905084484 -1.09603518353418 A:G A G 10 0.545481667637747 0.884060943774314 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70287171_70287284:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70287171_70287284:AARS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 70546234 G/A 1 11 5 16 4.99970165598478 2.72740833818873 2.27229331779605 A:G G A 10 0.545481667637747 0.319450493523029 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70546142_70546321:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70546176_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70546222_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70546226_70546335:COG4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 70548297 G/A 1 10 4 14 4.54518332362253 2.18192667055099 2.36325665307154 A:G G A 10 0.545481667637747 0.284675534132335 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70548238_70548386:COG4;ENSG00000103051:ENST00000524584:exon_70548238_70548412:COG4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 26 32 58 11.8174766414186 17.4554133644079 -5.63793672298932 A:T A T 10 0.545481667637747 0.147998274121349 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 100 125 225 45.4518332362253 68.1852084547184 -22.7333752184931 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00254302164502675 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 70726795 C/A 1 11 14 25 4.99970165598478 7.63674334692846 -2.63704169094367 A:C C A 10 0.545481667637747 0.319558675893505 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70726724_70726874:VAC14 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 74664810 A/T 1 14 11 25 6.36325665307154 6.00029834401522 0.362958309056325 A:T A T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 74670458 C/T 1 12 7 19 5.45421998834704 3.81837167346423 1.63584831488281 T:C C T 10 0.545481667637747 0.497845829751492 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74670244_74670475:RFWD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 74706349 T/C 1 11 6 17 4.99970165598478 3.27289000582648 1.7268116501583 T:C T C 10 0.545481667637747 0.471137770776418 ENSG00000168404:ENST00000306247:exon_74705755_74706436:MLKL;ENSG00000168404:ENST00000308807:exon_74705755_74706436:MLKL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 75204282 C/A 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 A:C C A 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000184517:ENST00000332307:exon_75203151_75206129:ZFP1;ENSG00000184517:ENST00000464850:exon_75203151_75205898:ZFP1;ENSG00000184517:ENST00000393430:exon_75203151_75206114:ZFP1;ENSG00000184517:ENST00000378686:exon_75203151_75206129:ZFP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 77228971 C/T 1 8 12 20 3.63614665889802 6.54578001165296 -2.90963335275494 T:C C T 10 0.545481667637747 0.261277301714232 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 81819768 T/C 1 62 62 124 28.1801366064597 33.8198633935403 -5.63972678708062 T:C T C 10 0.545481667637747 0.322074712890792 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81819548_81819787:PLCG2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 84520254 A/G 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 A:G A G 10 0.545481667637747 0.243356459282646 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84520237_84520665:KIAA1609 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 84778690 C/T 1 63 2 65 28.6346549388219 1.09096333527549 27.5436916035464 T:C C T 10 0.545481667637747 1.28711958696810e-14 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 84778697 G/C 1 71 4 75 32.27080159772 2.18192667055099 30.088874927169 C:G G C 10 0.545481667637747 1.30347834494549e-14 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 39 60 99 17.7262149621279 32.7289000582648 -15.002685096137 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00322168635232268 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 16 21 37 7.27229331779605 11.4551150203927 -4.18282170259664 T:G T G 10 0.545481667637747 0.187982657653704 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 49 52 101 22.2713982857504 28.3650467171628 -6.09364843141244 A:G A G 10 0.545481667637747 0.231702173969316 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 84808824 C/G 1 13 19 32 5.90873832070929 10.3641516851172 -4.4554133644079 C:G C G 10 0.545481667637747 0.154475243091034 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84808766_84808831:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84808766_84808831:USP10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 85711860 C/T 1 49 39 88 22.2713982857504 21.2737850378721 0.997613247878267 T:C C T 10 0.545481667637747 0.914836547576105 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 85834818 G/A 1 578 648 1226 262.711596105382 353.47212062926 -90.7605245238778 A:T:C:G G A 10 0.545481667637747 2.32583029839636e-07 ENSG00000131143:ENST00000253452:exon_85834811_85834884:COX4I1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 18 9 27 8.18132998252056 4.90933500873972 3.27199497378083 A:G G A 10 0.545481667637747 0.248024429023792 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 88601360 C/T 1 10 9 19 4.54518332362253 4.90933500873972 -0.364151685117192 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000179588:ENST00000319555:exon_88599556_88601389:ZFPM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 4 10 14 1.81807332944901 5.45481667637747 -3.63674334692846 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0615052435608368 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 17 14 31 7.7268116501583 7.63674334692846 0.0900683032298444 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 88781125 T/C 1 18 20 38 8.18132998252056 10.9096333527549 -2.72830337023438 T:C T C 10 0.545481667637747 0.41707138879274 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 88870967 T/C 1 24 25 49 10.9084399766941 13.6370416909437 -2.7286017142496 T:C T C 10 0.545481667637747 0.474554776339739 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88870953_88871075:CDT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 88943533 C/T 1 10 9 19 4.54518332362253 4.90933500873972 -0.364151685117192 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000129993:ENST00000327483:exon_88941266_88943683:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268679:exon_88941266_88943683:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268683:exon_88941267_88943683:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000448839:exon_88941267_88943683:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000436887:exon_88941267_88943683:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000360302:exon_88941267_88943683:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000414270:exon_88943384_88943683:CBFA2T3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 89350038 G/A 1 31 24 55 14.0900683032298 13.0915600233059 0.998508279923916 A:G G A 10 0.545481667637747 0.892461281179937 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 89350178 G/A 1 50 35 85 22.7259166181127 19.0918583673211 3.63405825079151 A:G G A 10 0.545481667637747 0.44773036714921 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 89357603 G/A 1 5 10 15 2.27259166181127 5.45481667637747 -3.1822250145662 A:G G A 10 0.545481667637747 0.12160675687954 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 89644001 T/C 0 13 0 13 5.90873832070929 0 5.90873832070929 T T 10 0.545481667637747 0.000413898410899833 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89643947_89644129:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89643947_89644129:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000525982:exon_89643947_89644129:CPNE7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 89661807 C/T 1 18 7 25 8.18132998252056 3.81837167346423 4.36295830905633 T:C C T 10 0.545481667637747 0.106809904531783 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000529800:exon_89661775_89661831:CPNE7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 89662990 T/C 1 16 6 22 7.27229331779605 3.27289000582648 3.99940331196957 T:C T C 10 0.545481667637747 0.132095272636517 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 89663072 G/A 1 24 8 32 10.9084399766941 4.36385334110198 6.5445866355921 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0209622380413639 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 89760652 C/T 1 11 5 16 4.99970165598478 2.72740833818873 2.27229331779605 T:C C T 10 0.545481667637747 0.319450493523029 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 89790059 G/A 1 15 7 22 6.8177749854338 3.81837167346423 2.99940331196957 A:G G A 10 0.545481667637747 0.284226176487771 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89789668_89790117:ZNF276 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 89971316 G/T 1 6 10 16 2.72710999417352 5.45481667637747 -2.72770668220395 T:G G T 10 0.545481667637747 0.211649836550054 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 16 90097748 C/T 1 8 1 9 3.63614665889802 0.545481667637747 3.09066499126028 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0461109865564625 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90097707_90097904:GAS8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 961900 G/A 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:G G A 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 1371393 C/T 1 45 32 77 20.4533249563014 17.4554133644079 2.99791159189348 T:C C T 10 0.545481667637747 0.567497552887759 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1371282_1371417:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1371282_1371417:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1371282_1371417:MYO1C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 1377943 A/G 1 28 33 61 12.7265133061431 18.0008950320457 -5.27438172590257 A:G A G 10 0.545481667637747 0.198753249991828 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1377904_1377984:MYO1C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 1383893 G/A 1 33 46 79 14.9991049679544 25.0921567113364 -10.093051743382 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0239229493030881 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1383821_1383919:MYO1C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 1634104 C/T 1 7 10 17 3.18162832653577 5.45481667637747 -2.2731883498417 T:C C T 10 0.545481667637747 0.332311875410834 ENSG00000167716:ENST00000455636:exon_1634049_1634239:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1634049_1634239:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000492901:exon_1633674_1634131:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1634049_1634239:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1634049_1634239:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1634049_1634239:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1634049_1634239:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1634049_1634239:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000474958:exon_1634049_1634239:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000479966:exon_1633765_1634239:WDR81 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 1637302 A/G 1 6 11 17 2.72710999417352 6.00029834401522 -3.2731883498417 A:G A G 10 0.545481667637747 0.143847339286626 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 1639458 A/G 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 A:G A G 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1638866_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1639333_1639512:WDR81 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 1640793 C/T 1 8 7 15 3.63614665889802 3.81837167346423 -0.182225014566205 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 1782957 C/T 1 87 59 146 39.543094915516 32.1834183906271 7.35967652488895 T:C C T 10 0.545481667637747 0.244712359698615 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1782854_1782993:RPA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 1940232 A/G 1 15 13 28 6.8177749854338 7.09126167929071 -0.273486693856915 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1940129_1940250:DPH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 2202943 T/C 1 10 15 25 4.54518332362253 8.1822250145662 -3.63704169094367 T:C T C 10 0.545481667637747 0.162458691100737 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 2203025 T/G 1 13 9 22 5.90873832070929 4.90933500873972 0.999403311969568 T:G T G 10 0.545481667637747 0.831133867954711 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 2203167 T/G 1 13 10 23 5.90873832070929 5.45481667637747 0.45392164433182 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 2203175 C/G 1 12 14 26 5.45421998834704 7.63674334692846 -2.18252335858142 C:G C G 10 0.545481667637747 0.434203864087606 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 2236404 T/C 1 66 70 136 29.9982099359087 38.1837167346423 -8.18550679873359 T:C:G T C 10 0.545481667637747 0.168610985571179 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2236255_2236418:TSR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 13 17 30 5.90873832070929 9.2731883498417 -3.36445002913241 T:C T C 10 0.545481667637747 0.271420658203315 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 3910165 A/G 1 15 11 26 6.8177749854338 6.00029834401522 0.817476641418578 A:G A G 10 0.545481667637747 0.844971052281341 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3907739_3910264:ZZEF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 3953083 T/C 1 11 7 18 4.99970165598478 3.81837167346423 1.18132998252055 T:C T C 10 0.545481667637747 0.641996695541785 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3953002_3953153:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3953002_3953153:ZZEF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 3953102 A/G 1 12 9 21 5.45421998834704 4.90933500873972 0.544884979607314 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3953002_3953153:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3953002_3953153:ZZEF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 3966064 A/G 1 5 10 15 2.27259166181127 5.45481667637747 -3.1822250145662 A:G A G 10 0.545481667637747 0.12160675687954 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3966047_3966211:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3966047_3966211:ZZEF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 3979949 G/A 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3979931_3980053:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3979931_3980053:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000418156:exon_3979910_3980053:ZZEF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 4451453 C/T 1 26 26 52 11.8174766414186 14.1825233585814 -2.36504671716284 T:C C T 10 0.545481667637747 0.57806548721543 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4451438_4451605:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4451438_4451605:MYBBP1A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 4699552 G/A 1 37 28 65 16.8171782974034 15.2734866938569 1.54369160354645 A:G G A 10 0.545481667637747 0.711091319151225 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4699439_4699591:PSMB6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 85 103 188 38.6340582507915 56.1846117666879 -17.5505535158964 T:C:G C T 10 0.545481667637747 0.0125634550128383 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 4720469 C/T 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 T:C C T 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4720441_4720554:PLD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 4796274 T/C 1 11 9 20 4.99970165598478 4.90933500873972 0.0903666472450606 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4796274_4796362:MINK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 4796286 C/T 1 12 12 24 5.45421998834704 6.54578001165296 -1.09156002330593 T:C C T 10 0.545481667637747 0.685991730875607 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4796274_4796362:MINK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 4797305 G/A 1 20 23 43 9.09036664724506 12.5460783556682 -3.45571170842312 A:G G A 10 0.545481667637747 0.358342122591806 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4797283_4797388:MINK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 4856376 A/G 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 A:G A G 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000108515:ENST00000520221:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522798:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522301:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521811:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519602:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000441285:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000381335:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000323997:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000422083:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519834:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522249:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521659:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000518175:exon_4856346_4856404:ENO3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 4856580 T/C 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000108515:ENST00000520221:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522798:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522301:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521811:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519602:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000441285:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000381335:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000323997:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000422083:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519834:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522249:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000517627:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521659:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000518175:exon_4856567_4856636:ENO3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 4875566 T/C 1 10 11 21 4.54518332362253 6.00029834401522 -1.45511502039269 T:C T C 10 0.545481667637747 0.662266055550669 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 4883818 C/G 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 C:G C G 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4882979_4883916:CAMTA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5085857 C/T 1 2 8 10 0.909036664724506 4.36385334110198 -3.45481667637747 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0510474779497875 ENSG00000180626:ENST00000399604:exon_5082830_5087571:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000381752:exon_5083373_5086253:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000315777:exon_5085505_5086312:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000389222:exon_5085505_5086312:ZNF594 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5085893 C/T 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 T:C C T 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000180626:ENST00000399604:exon_5082830_5087571:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000381752:exon_5083373_5086253:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000315777:exon_5085505_5086312:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000389222:exon_5085505_5086312:ZNF594 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 82 54 136 37.2705032537047 29.4560100524383 7.81449320126641 A:G A G 10 0.545481667637747 0.196586096269407 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5126689 G/A 1 79 54 133 35.906948256618 29.4560100524383 6.45093820417965 A:G G A 10 0.545481667637747 0.296093875383047 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5264916 C/T 1 26 36 62 11.8174766414186 19.6373400349589 -7.81986339354031 A:T:C C T 10 0.545481667637747 0.0551461242381593 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5264503_5264970:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5264503_5264970:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5264503_5264970:RABEP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 50 43 93 22.7259166181127 23.4557117084231 -0.729795090310468 T:C T C 10 0.545481667637747 0.917230215700803 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5284698 A/G 1 37 20 57 16.8171782974034 10.9096333527549 5.90754494464842 A:G A G 10 0.545481667637747 0.142922889858996 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5284719 T/C 1 35 15 50 15.9081416326789 8.1822250145662 7.72591661811265 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0325393018893830 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5284770 G/A 1 19 25 44 8.63584831488281 13.6370416909437 -5.00119337606087 A:G G A 10 0.545481667637747 0.133308064079262 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 91 84 175 41.361168244965 45.8204600815707 -4.45929183660571 A:G A G 10 0.545481667637747 0.543793855294673 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 64 58 122 29.0891732711842 31.6379367229893 -2.54876345180513 T:C T C 10 0.545481667637747 0.650493214243531 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5294976 T/A 1 18 20 38 8.18132998252056 10.9096333527549 -2.72830337023438 A:T T A 10 0.545481667637747 0.41707138879274 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 21 23 44 9.54488497960731 12.5460783556682 -3.00119337606087 T:C C T 10 0.545481667637747 0.368587724804263 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 57 71 128 25.9075449446484 38.72919840228 -12.8216534576316 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0262020977671983 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 59 59 118 26.8165816093729 32.1834183906271 -5.36683678125414 C:G C G 10 0.545481667637747 0.355397523471481 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 5392161 C/T 1 21 17 38 9.54488497960731 9.2731883498417 0.271696629765616 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 6513329 G/A 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6513314_6513480:KIAA0753 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 6524298 T/A 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 A:T T A 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6524108_6524318:KIAA0753 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 6547766 G/C 1 20 19 39 9.09036664724506 10.3641516851172 -1.27378503787213 C:G G C 10 0.545481667637747 0.748640025630809 ENSG00000129235:ENST00000250101:exon_6546271_6547920:TXNDC17;ENSG00000108590:ENST00000225728:exon_6546635_6547979:MED31 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 6663753 A/G 1 15 9 24 6.8177749854338 4.90933500873972 1.90843997669407 A:G A G 10 0.545481667637747 0.540106773962345 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7124115 A/G 1 114 109 223 51.8150898892968 59.4575017725144 -7.64241188321758 A:G A G 10 0.545481667637747 0.313599123895447 ENSG00000072778:ENST00000356839:exon_7124085_7124149:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000322910:exon_7124085_7124149:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000350303:exon_7124085_7124149:ACADVL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 20 12 32 9.09036664724506 6.54578001165296 2.5445866355921 T:C C T 10 0.545481667637747 0.382163131763023 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 62 36 98 28.1801366064597 19.6373400349589 8.5427965715008 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0854459663067837 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7213137 G/C 1 21 14 35 9.54488497960731 7.63674334692846 1.90814163267886 C:G G C 10 0.545481667637747 0.611609620786406 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7216763 C/T 1 28 30 58 12.7265133061431 16.3644500291324 -3.63793672298933 T:C C T 10 0.545481667637747 0.357914717049397 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7216699_7216788:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7216699_7216788:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7216699_7216788:GPS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7217920 G/A 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 A:G G A 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7245371 A/G 1 67 57 124 30.452728268271 31.0924550553516 -0.639726787080626 A:G A G 10 0.545481667637747 0.928308328336342 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7245267_7245386:ACAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7293715 C/T 1 23 17 40 10.4539216443318 9.2731883498417 1.18073329449012 T:C C T 10 0.545481667637747 0.752858268417667 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7293055_7293760:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7293055_7293760:PLSCR3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7297452 A/G 1 9 9 18 4.09066499126028 4.90933500873972 -0.818670017479445 A:G A G 10 0.545481667637747 0.814103892547842 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7297423_7297590:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7297423_7297590:PLSCR3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7412403 T/C 1 37 31 68 16.8171782974034 16.9099316967702 -0.0927533993667922 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7412263_7412509:POLR2A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7477938 G/C 1 251 230 481 114.084101422926 125.460783556682 -11.3766821337563 A:C:G G C 10 0.545481667637747 0.313808935747816 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7477864_7477996:EIF4A1;ENSG00000161960:ENST00000380512:exon_7477864_7477996:EIF4A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7478498 G/A 1 339 325 664 154.081714670804 177.281541982268 -23.199827311464 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0730391385761812 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7478437_7478576:EIF4A1;ENSG00000161960:ENST00000380512:exon_7478437_7478720:EIF4A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7496411 G/A 1 22 11 33 9.99940331196957 6.00029834401522 3.99910496795435 A:G G A 10 0.545481667637747 0.220520820458291 ENSG00000129245:ENST00000250113:exon_7496302_7496499:FXR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7606722 C/G 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 C:G C G 10 0.545481667637747 0.523901512697289 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7750436 C/T 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 T:C C T 10 0.545481667637747 0.152855532002609 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750423_7750770:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750423_7750770:KDM6B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7751778 G/A 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 120 125 245 54.5421998834704 68.1852084547184 -13.643008571248 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0833559329027805 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7761512 C/A 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:C C A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000182224:ENST00000332439:exon_7761064_7761612:CYB5D1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7802454 A/C 1 14 9 23 6.36325665307154 4.90933500873972 1.45392164433182 A:C A C 10 0.545481667637747 0.676547146622212 ENSG00000170004:ENST00000380358:exon_7802329_7802520:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000403047:exon_7802329_7802520:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000358181:exon_7802329_7802520:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000330494:exon_7802329_7802520:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000412940:exon_7802329_7802520:CHD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 7850976 A/G 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7850889_7851040:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7850889_7851040:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7850889_7851040:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7850889_7851040:CNTROB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 8048169 T/C 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 T:C T C 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 8048283 G/A 1 11 18 29 4.99970165598478 9.81867001747944 -4.81896836149466 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0922668413903268 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 8053085 T/G 1 13 5 18 5.90873832070929 2.72740833818873 3.18132998252055 T:G T G 10 0.545481667637747 0.158872164572138 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000413754:exon_8053073_8053194:PER1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 8092694 T/G 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 T:G T G 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000196544:ENST00000389017:exon_8091652_8093564:C17orf59;ENSG00000196544:ENST00000357939:exon_8092385_8093056:C17orf59 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 8132763 T/C 1 27 22 49 12.2719949737808 12.0005966880304 0.271398285750397 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8132620_8132764:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8132620_8132764:C17orf68 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 8161149 C/T 1 11 11 22 4.99970165598478 6.00029834401522 -1.00059668803043 T:C C T 10 0.545481667637747 0.67524038559697 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8161125_8161256:PFAS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 8167600 T/C 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 T:C T C 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8167530_8167655:PFAS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 8168224 T/C 1 10 8 18 4.54518332362253 4.36385334110198 0.181329982520555 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8168213_8168443:PFAS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 8192922 C/T 1 21 15 36 9.54488497960731 8.1822250145662 1.36265996504111 T:C C T 10 0.545481667637747 0.738817375454975 ENSG00000125434:ENST00000312524:exon_8192892_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000396278:exon_8192892_8192961:SLC25A35 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 8416901 C/T 1 11 13 24 4.99970165598478 7.09126167929071 -2.09156002330593 T:C C T 10 0.545481667637747 0.41817747956773 ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8416856_8416987:MYH10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 8792003 C/T 1 15 7 22 6.8177749854338 3.81837167346423 2.99940331196957 T:C C T 10 0.545481667637747 0.284226176487771 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 8792029 A/G 1 20 11 31 9.09036664724506 6.00029834401522 3.09006830322984 A:G A G 10 0.545481667637747 0.284954488499266 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 8792093 G/A 1 17 5 22 7.7268116501583 2.72740833818873 4.99940331196957 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0335330995162524 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 8792171 T/C 1 11 9 20 4.99970165598478 4.90933500873972 0.0903666472450606 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 8792514 G/A 1 8 8 16 3.63614665889802 4.36385334110198 -0.727706682203952 A:G G A 10 0.545481667637747 0.8039768822367 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8792456_8792539:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8792456_8792539:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8792456_8792539:PIK3R5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 9395231 G/A 1 30 22 52 13.6355499708676 12.0005966880304 1.63495328283716 A:G G A 10 0.545481667637747 0.678470966109799 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9395146_9395238:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9395146_9395238:STX8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 15532208 G/A 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000221926:ENST00000336708:exon_15531274_15532512:TRIM16;ENSG00000221926:ENST00000416464:exon_15531274_15532512:TRIM16;ENSG00000221926:ENST00000402781:exon_15531281_15532512:TRIM16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 30 24 54 13.6355499708676 13.0915600233059 0.543989947561663 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 16326005 A/C 1 26 30 56 11.8174766414186 16.3644500291324 -4.54697338771383 A:C:G A C 10 0.545481667637747 0.229915508502025 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 16336992 C/G 1 23 43 66 10.4539216443318 23.4557117084231 -13.0017900640913 C:G C G 10 0.545481667637747 0.00178030447360495 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 16342813 T/C 1 24 25 49 10.9084399766941 13.6370416909437 -2.7286017142496 T:C T C 10 0.545481667637747 0.474554776339739 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 17 16 33 7.7268116501583 8.72770668220395 -1.00089503204565 T:C T C 10 0.545481667637747 0.730455650391869 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 16344601 G/C 1 18 15 33 8.18132998252056 8.1822250145662 -0.000895032045649558 C:G G C 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 16855878 C/T 1 41 44 85 18.6352516268524 24.0011933760609 -5.3659417492085 T:C C T 10 0.545481667637747 0.276108407108724 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16855760_16855897:TNFRSF13B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 47 40 87 21.3623616210259 21.8192667055099 -0.456905084483985 A:T:G G A 10 0.545481667637747 0.914831465671605 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 17409560 C/T 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000490392:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000484838:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000477595:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000482906:exon_17409541_17409615:PEMT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 54 63 117 24.5439899475617 34.3653450611781 -9.8213551136164 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0774632396061471 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 18219835 T/C 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 T:C T C 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 18220770 G/A 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 18221010 A/G 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 A:G A G 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 19812541 T/C 1 8 10 18 3.63614665889802 5.45481667637747 -1.81867001747945 T:C T C 10 0.545481667637747 0.479742344098255 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19812494_19812589:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19812494_19812589:AKAP10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 19861458 C/T 1 7 17 24 3.18162832653577 9.2731883498417 -6.09156002330593 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0138596406155271 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19861327_19861884:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19861327_19861884:AKAP10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 20107773 T/C 1 22 15 37 9.99940331196957 8.1822250145662 1.81717829740336 T:C T C 10 0.545481667637747 0.621972675148655 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 20108239 A/T 1 14 19 33 6.36325665307154 10.3641516851172 -4.00089503204565 A:T A T 10 0.545481667637747 0.166942100114116 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 24 15 39 10.9084399766941 8.1822250145662 2.72621496212787 T:C C T 10 0.545481667637747 0.424047742831371 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 20163529 A/G 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20163505_20163607:SPECC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 20924523 G/A 1 28 20 48 12.7265133061431 10.9096333527549 1.81687995338815 A:G G A 10 0.545481667637747 0.664808566110727 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000476111:exon_20924426_20924539:USP22 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 46 0 46 20.9078432886636 0 20.9078432886636 T T 10 0.545481667637747 1.05305136466865e-12 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 48 0 48 21.8168799533881 0 21.8168799533881 G G 10 0.545481667637747 2.93442940657165e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 53 0 53 24.0894716151994 0 24.0894716151994 G G 10 0.545481667637747 1.26549508141242e-14 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 55 0 55 24.9985082799239 0 24.9985082799239 C C 10 0.545481667637747 3.65634498681156e-15 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 21203964 C/G 0 50 0 50 22.7259166181127 0 22.7259166181127 C C 10 0.545481667637747 8.27950124164531e-14 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 28 0 28 12.7265133061431 0 12.7265133061431 C C 10 0.545481667637747 5.15667187646696e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 47 0 47 21.3623616210259 0 21.3623616210259 C C 10 0.545481667637747 5.54967806068356e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 38 0 38 17.2716966297656 0 17.2716966297656 C C 10 0.545481667637747 2.02239640037727e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 19 0 19 8.63584831488281 0 8.63584831488281 C C 10 0.545481667637747 1.73877311294817e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 26 0 26 11.8174766414186 0 11.8174766414186 C C 10 0.545481667637747 1.83513670272213e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 32 0 32 14.5445866355921 0 14.5445866355921 G G 10 0.545481667637747 4.2091166037189e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 71 0 71 32.27080159772 0 32.27080159772 G G 10 0.545481667637747 2.54569550655719e-19 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 26207386 G/T 0 9 0 9 4.09066499126028 0 4.09066499126028 G G 10 0.545481667637747 0.00510371084910098 ENSG00000232859:ENST00000460380:exon_26205386_26207392:C17orf108;ENSG00000232859:ENST00000379103:exon_26207300_26207392:C17orf108;ENSG00000232859:ENST00000508862:exon_26207300_26207392:C17orf108;ENSG00000232859:ENST00000379102:exon_26207300_26207392:C17orf108;ENSG00000232859:ENST00000503642:exon_26207217_26207392:C17orf108 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 26676135 C/T 1 69 75 144 31.3617649329955 40.911125072831 -9.54936013983556 T:C C T 10 0.545481667637747 0.112513965282362 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 26686416 G/A 1 8 11 19 3.63614665889802 6.00029834401522 -2.36415168511719 A:G G A 10 0.545481667637747 0.357710103923903 ENSG00000244045:ENST00000292114:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000509083:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000457710:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000483505:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000395404:exon_26686338_26686427:TMEM199 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 27009749 C/T 1 41 32 73 18.6352516268524 17.4554133644079 1.17983826244447 T:C C T 10 0.545481667637747 0.81502271630775 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27009745_27009874:SUPT6H;ENSG00000109111:ENST00000347486:exon_27009745_27009874:SUPT6H HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 27185827 C/T 1 53 49 102 24.0894716151994 26.7286017142496 -2.63913009905019 A:T:C C T 10 0.545481667637747 0.620003892941621 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27185594_27185842:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27185594_27185842:ERAL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 27208326 C/T 1 22 14 36 9.99940331196957 7.63674334692846 2.36265996504111 T:C C T 10 0.545481667637747 0.504501807695613 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27208210_27208393:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27208210_27208393:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394910:exon_27208210_27208393:FLOT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 13 16 29 5.90873832070929 8.72770668220395 -2.81896836149466 T:C C T 10 0.545481667637747 0.352077308499086 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 27424316 G/A 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533652:exon_27423915_27424371:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527686:exon_27424164_27424368:MYO18A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 27438469 G/A 1 11 16 27 4.99970165598478 8.72770668220395 -3.72800502621917 A:G G A 10 0.545481667637747 0.177085561534340 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27438442_27438601:MYO18A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 27441077 C/G 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 C:G C G 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533399:exon_27441029_27441286:MYO18A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 27530413 T/C 0 13 0 13 5.90873832070929 0 5.90873832070929 T T 10 0.545481667637747 0.000413898410899833 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 27835138 C/T 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 T:C C T 10 0.545481667637747 0.782586339670189 ENSG00000160551:ENST00000261716:exon_27834914_27835150:TAOK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 27889578 T/C 1 9 11 20 4.09066499126028 6.00029834401522 -1.90963335275494 T:C T C 10 0.545481667637747 0.501706253434889 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 27889986 T/C 1 8 3 11 3.63614665889802 1.63644500291324 1.99970165598478 T:C T C 10 0.545481667637747 0.364801401986479 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 27904711 G/A 1 11 10 21 4.99970165598478 5.45481667637747 -0.455115020392687 A:G G A 10 0.545481667637747 0.831123791313476 ENSG00000108262:ENST00000225394:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394868:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000473217:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394869:exon_27904663_27904760:GIT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 28576076 T/C 1 44 54 98 19.9988066239391 29.4560100524383 -9.45720342849921 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0673259996690083 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28575223_28576186:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28575223_28576186:BLMH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 28612448 G/C 1 19 31 50 8.63584831488281 16.9099316967702 -8.27408338188735 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0224718568866661 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28612406_28612498:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28612406_28612498:BLMH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 29653037 A/G 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000196712:ENST00000358273:exon_29652838_29653270:NF1;ENSG00000196712:ENST00000356175:exon_29652838_29653270:NF1;ENSG00000196712:ENST00000444181:exon_29652838_29653270:NF1;ENSG00000196712:ENST00000456735:exon_29652838_29653270:NF1;ENSG00000196712:ENST00000493220:exon_29652838_29653270:NF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 29857460 G/A 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 A:G G A 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000131242:ENST00000394744:exon_29857344_29857487:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000325874:exon_29857344_29857487:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000394742:exon_29857344_29857487:RAB11FIP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 33289046 G/C 1 8 16 24 3.63614665889802 8.72770668220395 -5.09156002330593 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0412084805916291 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 33768199 G/A 1 29 25 54 13.1810316385053 13.6370416909437 -0.456010052438335 A:G G A 10 0.545481667637747 0.892454864090402 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 33998802 G/C 1 16 16 32 7.27229331779605 8.72770668220395 -1.4554133644079 T:C:G G C 10 0.545481667637747 0.723184023134138 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 34856721 G/A 0 24 0 24 10.9084399766941 0 10.9084399766941 G G 10 0.545481667637747 6.61734029658387e-07 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34856670_34856799:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34856670_34856799:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34856670_34856799:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34856670_34856799:MYO19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 34964141 G/A 1 9 3 12 4.09066499126028 1.63644500291324 2.45421998834704 A:G G A 10 0.545481667637747 0.245735735487388 ENSG00000129282:ENST00000250156:exon_34964106_34964238:MRM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 35896123 T/C 1 14 7 21 6.36325665307154 3.81837167346423 2.54488497960731 T:C T C 10 0.545481667637747 0.283556941871978 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000508220:exon_35896081_35897580:SYNRG HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 35956391 G/C 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000378189:exon_35956270_35956391:SYNRG HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 25 17 42 11.3629583090563 9.2731883498417 2.08976995921463 A:G G A 10 0.545481667637747 0.539810244595978 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 36909061 A/G 1 124 98 222 56.3602732129194 53.4572034284992 2.90306978442017 A:G A G 10 0.545481667637747 0.736263251880165 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909003_36909082:PSMB3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 36909499 A/T 1 105 84 189 47.7244248980366 45.8204600815707 1.90396481646582 A:T A T 10 0.545481667637747 0.826657373753073 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909403_36909587:PSMB3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 36926731 T/G 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 36966701 G/T 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 T:G G T 10 0.545481667637747 0.782586339670189 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 37 38 75 16.8171782974034 20.7283033702344 -3.91112507283102 A:G A G 10 0.545481667637747 0.417191771084845 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 37814080 G/A 1 10 10 20 4.54518332362253 5.45481667637747 -0.909633352754939 A:G G A 10 0.545481667637747 0.82309086372065 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000484773:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000443521:exon_37814028_37814105:STARD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 39846018 C/T 1 39 27 66 17.7262149621279 14.7280050262192 2.9982099359087 T:C C T 10 0.545481667637747 0.536895354970826 ENSG00000173812:ENST00000462917:exon_39845137_39846441:EIF1;ENSG00000173812:ENST00000479972:exon_39845741_39846193:EIF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 40125864 G/A 1 29 16 45 13.1810316385053 8.72770668220395 4.45332495630139 A:G G A 10 0.545481667637747 0.230813272549084 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 40477064 C/G 1 89 80 169 40.4521315802405 43.6385334110198 -3.18640183077924 C:G C G 10 0.545481667637747 0.643449514724104 ENSG00000168610:ENST00000264657:exon_40476981_40477079:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000389272:exon_40476981_40477079:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000404395:exon_40476981_40477079:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000471989:exon_40476981_40477079:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000498330:exon_40476981_40477175:STAT3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 28 29 57 12.7265133061431 15.8189683614947 -3.09245505535158 A:C C A 10 0.545481667637747 0.427331927866647 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 55 54 109 24.9985082799239 29.4560100524383 -4.45750177251442 A:G A G 10 0.545481667637747 0.441760164509166 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 28 13 41 12.7265133061431 7.09126167929071 5.63525162685237 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0852954736087108 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 14 18 32 6.36325665307154 9.81867001747944 -3.4554133644079 A:G A G 10 0.545481667637747 0.286679217980447 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 40822678 C/T 1 14 13 27 6.36325665307154 7.09126167929071 -0.728005026219168 T:C C T 10 0.545481667637747 0.847782191919342 ENSG00000068137:ENST00000293349:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000412503:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000456950:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000445882:exon_40822591_40822723:PLEKHH3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 40835922 A/C 1 5 13 18 2.27259166181127 7.09126167929071 -4.81867001747944 A:C A C 10 0.545481667637747 0.0309693444433747 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40835839_40835940:CNTNAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 41605949 A/G 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:G A G 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000175832:ENST00000393664:exon_41605212_41606111:ETV4;ENSG00000175832:ENST00000319349:exon_41605212_41606111:ETV4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 42152103 G/A 1 13 8 21 5.90873832070929 4.36385334110198 1.54488497960731 A:G G A 10 0.545481667637747 0.521566668167506 ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 6 10 16 2.72710999417352 5.45481667637747 -2.72770668220395 C:G C G 10 0.545481667637747 0.211649836550054 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 42268255 G/C 1 15 10 25 6.8177749854338 5.45481667637747 1.36295830905633 C:G G C 10 0.545481667637747 0.68954281062682 ENSG00000168591:ENST00000357984:exon_42267869_42269098:TMUB2;ENSG00000168591:ENST00000319511:exon_42267869_42269098:TMUB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 42287700 G/A 1 84 68 152 38.1795399184293 37.0927533993668 1.08678651906246 A:G G A 10 0.545481667637747 0.871021893781712 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287686_42287841:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287686_42287841:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287686_42287841:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287686_42287841:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287686_42287841:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287686_42287841:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287686_42287841:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287686_42287841:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287686_42287841:UBTF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 44117135 C/T 1 4 11 15 1.81807332944901 6.00029834401522 -4.1822250145662 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0373845255059045 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44117068_44117250:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44117068_44117250:KIAA1267 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 44248499 G/C 1 13 14 27 5.90873832070929 7.63674334692846 -1.72800502621917 C:G G C 10 0.545481667637747 0.564423910665474 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 45266579 C/G 1 7 11 18 3.18162832653577 6.00029834401522 -2.81867001747945 C:G C G 10 0.545481667637747 0.237085594735494 ENSG00000004897:ENST00000066544:exon_45266512_45266632:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000446365:exon_45266512_45266665:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000441612:exon_45266512_45266624:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000525495:exon_45266512_45266764:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000533415:exon_45266512_45266617:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000527547:exon_45266512_45266590:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000526866:exon_45266512_45266630:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000532893:exon_45266512_45266627:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000528147:exon_45266512_45266618:CDC27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 45735975 G/A 1 75 78 153 34.088874927169 42.5475700757443 -8.45869514857528 A:G G A 10 0.545481667637747 0.193802088511389 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45735874_45736026:KPNB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 45750468 T/C 1 91 74 165 41.361168244965 40.3656434051933 0.995524839771754 T:C T C 10 0.545481667637747 0.937721991539575 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45750384_45750531:KPNB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 45915677 G/A 1 19 15 34 8.63584831488281 8.1822250145662 0.453623300316602 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45915636_45915816:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 45994044 C/T 1 14 16 30 6.36325665307154 8.72770668220395 -2.36445002913241 T:C C T 10 0.545481667637747 0.464222354403181 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 45994094 T/C 1 17 18 35 7.7268116501583 9.81867001747944 -2.09185836732114 T:C T C 10 0.545481667637747 0.501053345348018 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 45994154 G/A 1 12 17 29 5.45421998834704 9.2731883498417 -3.81896836149466 A:G G A 10 0.545481667637747 0.191679709049513 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 46002744 G/T 1 10 11 21 4.54518332362253 6.00029834401522 -1.45511502039269 T:G G T 10 0.545481667637747 0.662266055550669 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46002714_46002907:SP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 46020698 C/T 1 5 12 17 2.27259166181127 6.54578001165296 -4.2731883498417 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0496343269315444 ENSG00000108439:ENST00000225573:exon_46020672_46020796:PNPO;ENSG00000108439:ENST00000434554:exon_46020672_46020796:PNPO HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 47778793 C/T 1 26 24 50 11.8174766414186 13.0915600233059 -1.27408338188735 T:C C T 10 0.545481667637747 0.777010398967016 ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47778305_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47778649_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47778682_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47778683_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508749:exon_47778690_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507477:exon_47778690_47780373:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47778701_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47778701_47778872:SLC35B1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 47788755 G/A 1 24 19 43 10.9084399766941 10.3641516851172 0.54428829157688 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000121104:ENST00000240364:exon_47787694_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000513602:exon_47788357_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000503573:exon_47788707_47788917:FAM117A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 48226811 C/T 1 50 50 100 22.7259166181127 27.2740833818873 -4.5481667637747 T:C C T 10 0.545481667637747 0.367879484321215 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 48431032 G/A 1 4 12 16 1.81807332944901 6.54578001165296 -4.72770668220395 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0223776060408316 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000509778:exon_48430991_48431035:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 48431197 C/T 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 T:C C T 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 48432324 G/C 1 7 1 8 3.18162832653577 0.545481667637747 2.63614665889802 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0793996161569039 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48432215_48432417:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48432215_48432417:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48432215_48432417:XYLT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 48455985 A/T 1 7 10 17 3.18162832653577 5.45481667637747 -2.2731883498417 A:T A T 10 0.545481667637747 0.332311875410834 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511519:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48455956_48456042:EME1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 48456193 T/C 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48456135_48456256:EME1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 48629458 A/G 1 9 11 20 4.09066499126028 6.00029834401522 -1.90963335275494 A:G A G 10 0.545481667637747 0.501706253434889 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48629146_48629541:SPATA20 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 49077039 C/T 1 12 22 34 5.45421998834704 12.0005966880304 -6.5463766996834 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0257526729559668 ENSG00000008294:ENST00000262013:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357804:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000376407:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000510283:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000505279:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357122:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000514613:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000505173:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000513827:exon_49077022_49077078:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000515685:exon_49077022_49077078:SPAG9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 49350802 A/C 1 26 20 46 11.8174766414186 10.9096333527549 0.90784328866364 A:C A C 10 0.545481667637747 0.882601219104775 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49350723_49350811:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000508506:exon_49350723_49350811:UTP18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 55183203 T/C 1 18 21 39 8.18132998252056 11.4551150203927 -3.27378503787213 T:C T C 10 0.545481667637747 0.335663531029767 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 55183716 T/C 1 20 22 42 9.09036664724506 12.0005966880304 -2.91023004078537 T:C T C 10 0.545481667637747 0.438921692863405 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 56386118 A/G 0 0 10 10 0 5.45481667637747 -5.45481667637747 G A G 10 0.545481667637747 0.000376282521605541 ENSG00000005379:ENST00000355701:exon_56385902_56386741:BZRAP1;ENSG00000005379:ENST00000343736:exon_56385902_56386741:BZRAP1;ENSG00000005379:ENST00000268893:exon_56385902_56386741:BZRAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 56584205 A/C 1 16 10 26 7.27229331779605 5.45481667637747 1.81747664141858 A:C A C 10 0.545481667637747 0.557013656890898 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56584104_56584232:MTMR4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 56585872 G/C 1 9 9 18 4.09066499126028 4.90933500873972 -0.818670017479445 C:G G C 10 0.545481667637747 0.814103892547842 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56585829_56585925:MTMR4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 56769979 C/T 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 T:C C T 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000108384:ENST00000461271:exon_56769934_56770046:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000337432:exon_56769934_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487921:exon_56769937_56769993:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000476741:exon_56769963_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000475762:exon_56769963_56771011:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000486827:exon_56769967_56771172:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487525:exon_56769967_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000482007:exon_56769976_56770149:RAD51C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 57287454 A/G 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 A:G A G 10 0.545481667637747 0.523901512697289 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57287371_57289171:C17orf71 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 17 18 35 7.7268116501583 9.81867001747944 -2.09185836732114 A:G G A 10 0.545481667637747 0.501053345348018 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 57889066 G/A 1 14 15 29 6.36325665307154 8.1822250145662 -1.81896836149466 A:G G A 10 0.545481667637747 0.577160759175787 ENSG00000062716:ENST00000262291:exon_57889031_57889147:TMEM49 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 62476429 G/A 1 15 22 37 6.8177749854338 12.0005966880304 -5.18282170259664 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0992354948456433 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62476406_62476506:POLG2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 62492582 C/T 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 T:C C T 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62492525_62493169:POLG2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 62528179 A/G 1 8 9 17 3.63614665889802 4.90933500873972 -1.2731883498417 A:G A G 10 0.545481667637747 0.628894857051545 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 65822410 G/A 1 9 14 23 4.09066499126028 7.63674334692846 -3.54607835566818 A:G G A 10 0.545481667637747 0.147879044249785 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65821640_65822453:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65821652_65822453:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65821780_65822453:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65821780_65822453:BPTF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 65988049 T/C 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 T:C T C 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000186665:ENST00000449250:exon_65987218_65988219:C17orf58;ENSG00000186665:ENST00000334461:exon_65987218_65988219:C17orf58 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 126 130 256 57.2693098776439 70.9126167929071 -13.6433069152632 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0902835891118408 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 116 108 224 52.7241265540214 58.9120201048767 -6.18789355085532 A:T T A 10 0.545481667637747 0.421123810016099 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 66267650 T/G 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000108932:ENST00000327268:exon_66266980_66267795:SLC16A6;ENSG00000108932:ENST00000344066:exon_66267095_66267795:SLC16A6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 66267691 A/T 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 A:T A T 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000108932:ENST00000327268:exon_66266980_66267795:SLC16A6;ENSG00000108932:ENST00000344066:exon_66267095_66267795:SLC16A6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 66449122 G/A 1 14 5 19 6.36325665307154 2.72740833818873 3.63584831488281 A:G G A 10 0.545481667637747 0.109537367994142 ENSG00000070540:ENST00000262139:exon_66449051_66449133:WIPI1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 67267317 T/C 1 19 20 39 8.63584831488281 10.9096333527549 -2.27378503787213 T:C T C 10 0.545481667637747 0.521371073133049 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67267303_67267433:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67267303_67267430:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67267303_67267430:ABCA5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 67273882 C/A 1 20 15 35 9.09036664724506 8.1822250145662 0.908141632678856 A:C C A 10 0.545481667637747 0.865672807484116 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67273782_67273983:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67273782_67273983:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67273782_67273983:ABCA5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 67513003 C/A 1 8 9 17 3.63614665889802 4.90933500873972 -1.2731883498417 A:C C A 10 0.545481667637747 0.628894857051545 ENSG00000108984:ENST00000359094:exon_67512996_67513044:MAP2K6;ENSG00000108984:ENST00000435374:exon_67512996_67513044:MAP2K6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 71192663 G/A 1 9 2 11 4.09066499126028 1.09096333527549 2.99970165598478 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0774939953200738 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71192646_71192890:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71192646_71192890:COG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 71197439 C/T 1 21 11 32 9.54488497960731 6.00029834401522 3.5445866355921 T:C C T 10 0.545481667637747 0.219957089714407 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 71204440 C/T 1 60 60 120 27.2710999417352 32.7289000582648 -5.45780011652964 T:C C T 10 0.545481667637747 0.359360039706071 ENSG00000133193:ENST00000405159:exon_71203492_71205907:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000403627:exon_71203492_71205907:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000255557:exon_71203493_71205907:FAM104A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 71243508 C/T 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 T:C C T 10 0.545481667637747 0.523901512697289 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71243380_71245091:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71243380_71245091:C17orf80 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 35 45 80 15.9081416326789 24.5466750436986 -8.63853341101976 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0564827266824214 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 70 87 157 31.8162832653577 47.456905084484 -15.6406218191263 T:C T C 10 0.545481667637747 0.012918985499932 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 73127110 A/T 1 8 8 16 3.63614665889802 4.36385334110198 -0.727706682203952 A:T A T 10 0.545481667637747 0.8039768822367 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 73488794 C/T 1 14 7 21 6.36325665307154 3.81837167346423 2.54488497960731 T:C C T 10 0.545481667637747 0.283556941871978 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73488555_73488870:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73488555_73488870:KIAA0195 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 73518203 G/C 1 20 24 44 9.09036664724506 13.0915600233059 -4.00119337606087 C:G G C 10 0.545481667637747 0.230233603733121 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 73518284 G/C 1 13 7 20 5.90873832070929 3.81837167346423 2.09036664724506 C:G G C 10 0.545481667637747 0.378879562360477 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 73519413 C/T 1 9 6 15 4.09066499126028 3.27289000582648 0.817774985433796 T:C C T 10 0.545481667637747 0.797861210956256 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 74387284 C/T 1 9 19 28 4.09066499126028 10.3641516851172 -6.27348669385692 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0216842964384243 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74385614_74387694:UBE2O HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 74394934 G/A 1 12 8 20 5.45421998834704 4.36385334110198 1.09036664724506 A:G G A 10 0.545481667637747 0.660941894453713 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74394918_74395072:UBE2O HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 74467664 C/G 1 26 22 48 11.8174766414186 12.0005966880304 -0.183120046611855 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74466976_74468134:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74466976_74468134:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74466979_74468921:RHBDF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 74472998 G/A 1 8 7 15 3.63614665889802 3.81837167346423 -0.182225014566205 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74472912_74473106:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74472912_74473106:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74472912_74473106:RHBDF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 74475024 G/A 1 8 11 19 3.63614665889802 6.00029834401522 -2.36415168511719 A:G G A 10 0.545481667637747 0.357710103923903 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74474888_74475091:RHBDF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 76113954 G/A 1 104 69 173 47.2699065656743 37.6382350670045 9.63167149866977 A:G G A 10 0.545481667637747 0.147368747364897 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392466:exon_76113883_76114016:TMC6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 76120065 A/G 1 3 10 13 1.36355499708676 5.45481667637747 -4.09126167929071 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0265022743429481 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 76166939 C/G 1 249 220 469 113.175064758201 120.005966880304 -6.83090212210332 C:G C G 10 0.545481667637747 0.546724674362554 ENSG00000108639:ENST00000225777:exon_76166898_76167135:SYNGR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 76170830 C/T 1 27 36 63 12.2719949737808 19.6373400349589 -7.36534506117806 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0758511781740695 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76170160_76171031:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76170773_76171031:TK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 76178751 C/T 1 18 21 39 8.18132998252056 11.4551150203927 -3.27378503787213 T:C C T 10 0.545481667637747 0.335663531029767 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 76183043 A/G 1 20 16 36 9.09036664724506 8.72770668220395 0.362659965041109 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 76219591 G/A 1 54 37 91 24.5439899475617 20.1828217025966 4.36116824496503 A:G G A 10 0.545481667637747 0.400152165748768 ENSG00000089685:ENST00000374948:exon_76219546_76221715:BIRC5;ENSG00000089685:ENST00000301633:exon_76219546_76221715:BIRC5;ENSG00000089685:ENST00000350051:exon_76219546_76221715:BIRC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 11 15 26 4.99970165598478 8.1822250145662 -3.18252335858142 T:C C T 10 0.545481667637747 0.239869675139145 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 29 28 57 13.1810316385053 15.2734866938569 -2.09245505535158 A:G G A 10 0.545481667637747 0.596819086502937 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 20 22 42 9.09036664724506 12.0005966880304 -2.91023004078537 T:C T C 10 0.545481667637747 0.438921692863405 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 23 28 51 10.4539216443318 15.2734866938569 -4.8195650495251 A:T:G A G 10 0.545481667637747 0.205680980702786 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 76817090 C/T 1 6 10 16 2.72710999417352 5.45481667637747 -2.72770668220395 T:C C T 10 0.545481667637747 0.211649836550054 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76817073_76817143:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76817073_76817143:USP36 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 14 9 23 6.36325665307154 4.90933500873972 1.45392164433182 A:G G A 10 0.545481667637747 0.676547146622212 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 77081788 G/A 1 11 5 16 4.99970165598478 2.72740833818873 2.27229331779605 A:G G A 10 0.545481667637747 0.319450493523029 ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77081702_77081816:ENGASE HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 78082504 G/A 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 A:G G A 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78082496_78082627:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78082496_78082627:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78082496_78082627:GAA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 78084769 G/A 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78084740_78084824:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78084740_78084824:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78084740_78084824:GAA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 78091405 G/A 1 2 7 9 0.909036664724506 3.81837167346423 -2.90933500873972 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0890372070351746 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 78113832 G/A 1 27 22 49 12.2719949737808 12.0005966880304 0.271398285750397 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000141543:ENST00000269349:exon_78113807_78113939:EIF4A3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 78184393 C/T 1 6 13 19 2.72710999417352 7.09126167929071 -4.36415168511719 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0629589987215586 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 78261805 A/G 1 10 6 16 4.54518332362253 3.27289000582648 1.27229331779605 A:G A G 10 0.545481667637747 0.620225311632925 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78261614_78262162:RNF213 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 78341776 G/A 1 15 12 27 6.8177749854338 6.54578001165296 0.271994973780831 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78341761_78341943:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78341761_78341943:RNF213 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 78865546 T/C 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 T:C T C 10 0.545481667637747 0.523901512697289 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78865520_78865637:RPTOR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 78935197 C/T 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 T:C C T 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78935194_78935280:RPTOR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79478019 G/A 1 3475 2876 6351 1579.45120495883 1568.80527612616 10.6459288326689 A:T:C:G G A 10 0.545481667637747 0.791324372127927 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79478870 C/A 1 12 11 23 5.45421998834704 6.00029834401522 -0.546078355668181 A:C C A 10 0.545481667637747 0.837030175057015 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79478871 C/T 1 13 10 23 5.90873832070929 5.45481667637747 0.45392164433182 T:C C T 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 10 15 25 4.54518332362253 8.1822250145662 -3.63704169094367 A:G G A 10 0.545481667637747 0.162458691100737 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79526402 G/C 1 16 18 34 7.27229331779605 9.81867001747944 -2.5463766996834 C:G G C 10 0.545481667637747 0.39437426025059 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79523915_79526442:NPLOC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79571637 C/G 1 31 22 53 14.0900683032298 12.0005966880304 2.08947161519941 C:G C G 10 0.545481667637747 0.584438646149134 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79571574_79571753:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79571574_79571753:NPLOC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79632363 C/T 1 59 38 97 26.8165816093729 20.7283033702344 6.08827823913854 T:C C T 10 0.545481667637747 0.222750601186856 ENSG00000204237:ENST00000374741:exon_79632067_79632614:C17orf90 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79637367 C/G 1 26 7 33 11.8174766414186 3.81837167346423 7.99910496795435 C:G C G 10 0.545481667637747 0.00485313237220065 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79637255_79637483:CCDC137 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79639708 C/T 1 13 13 26 5.90873832070929 7.09126167929071 -1.18252335858142 T:C C T 10 0.545481667637747 0.696126980810445 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79653321 T/C 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 T:C T C 10 0.545481667637747 0.523901512697289 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79662067 A/G 1 23 19 42 10.4539216443318 10.3641516851172 0.0897699592146264 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79661954_79662097:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79661954_79662097:HGS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79663880 T/C 1 19 32 51 8.63584831488281 17.4554133644079 -8.8195650495251 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0161782014597270 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79663931 T/C 1 13 15 28 5.90873832070929 8.1822250145662 -2.27348669385692 T:C T C 10 0.545481667637747 0.44954716189734 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79668135 G/T 1 38 36 74 17.2716966297656 19.6373400349589 -2.36564340519327 T:G G T 10 0.545481667637747 0.640917325541949 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668075_79668161:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668075_79668161:HGS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79668552 C/T 1 40 34 74 18.1807332944901 18.5463766996834 -0.365643405193275 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668538_79669143:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668538_79669149:HGS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79671714 T/C 1 198 207 405 89.9946298077261 112.914705201014 -22.9200753932875 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0246309688626009 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79671663_79671746:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79671663_79671746:MRPL12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79803101 A/G 1 330 361 691 149.991049679543 196.918882017227 -46.9278323376832 A:G A G 10 0.545481667637747 0.000374869903116048 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000473021:exon_79803020_79803332:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79803043_79803106:P4HB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 79941544 G/T 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 T:G G T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79941430_79941544:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79941430_79941544:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79941430_79941544:ASPSCR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 80039634 C/T 1 69 73 142 31.3617649329955 39.8201617375555 -8.45839680456007 T:C C T 10 0.545481667637747 0.177353907020587 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80039477_80039719:FASN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 80373452 C/T 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 80401946 A/G 1 31 28 59 14.0900683032298 15.2734866938569 -1.18341839062707 A:G A G 10 0.545481667637747 0.794501131186994 ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80401498_80401980:C17orf62 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 80684442 G/A 1 13 21 34 5.90873832070929 11.4551150203927 -5.5463766996834 A:T:G G A 10 0.545481667637747 0.0597690043716893 ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80684356_80684478:FN3KRP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 80863857 T/C 1 4 12 16 1.81807332944901 6.54578001165296 -4.72770668220395 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0223776060408316 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80863812_80863929:TBCD HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 22 14 36 9.99940331196957 7.63674334692846 2.36265996504111 T:C T C 10 0.545481667637747 0.504501807695613 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00856_parsed_pileup.txt . 17 81006387 G/A 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_81006347_81006446:B3GNTL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 224131 G/A 1 19 12 31 8.63584831488281 6.54578001165296 2.09006830322984 A:G G A 10 0.545481667637747 0.476931260537673 ENSG00000079134:ENST00000261600:exon_224084_224179:THOC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 2595443 G/T 1 20 24 44 9.09036664724506 13.0915600233059 -4.00119337606087 T:G G T 10 0.545481667637747 0.230233603733121 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2595415_2595620:NDC80 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 2724930 A/T 1 10 5 15 4.54518332362253 2.72740833818873 1.8177749854338 A:T A T 10 0.545481667637747 0.44074713691162 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2724897_2724993:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2724897_2724993:SMCHD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 2740714 A/G 1 9 3 12 4.09066499126028 1.63644500291324 2.45421998834704 A:G A G 10 0.545481667637747 0.245735735487388 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2740701_2740819:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2740701_2740819:SMCHD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 2750477 A/G 1 22 13 35 9.99940331196957 7.09126167929071 2.90814163267886 A:G A G 10 0.545481667637747 0.396818936531709 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2750348_2750505:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2750348_2750505:SMCHD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 2763697 C/T 1 8 8 16 3.63614665889802 4.36385334110198 -0.727706682203952 T:C C T 10 0.545481667637747 0.8039768822367 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2763635_2763787:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2763635_2763787:SMCHD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 2909700 C/T 1 12 7 19 5.45421998834704 3.81837167346423 1.63584831488281 T:C C T 10 0.545481667637747 0.497845829751492 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2909689_2909817:EMILIN2;ENSG00000132205:ENST00000308080:exon_2909689_2909817:EMILIN2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 9117867 T/C 1 66 48 114 29.9982099359087 26.1831200466119 3.81508988929685 T:C T C 10 0.545481667637747 0.510862171409238 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9117385_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9117836_9117901:NDUFV2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 9254857 C/G 1 39 48 87 17.7262149621279 26.1831200466119 -8.45690508448399 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0843837562774066 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000359158:exon_9254209_9255428:ANKRD12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 9562042 C/T 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9561978_9562073:PPP4R1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 9936132 T/C 1 42 50 92 19.0897699592146 27.2740833818873 -8.18431342267272 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0940762964602305 ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9936107_9936210:VAPA;ENSG00000101558:ENST00000400000:exon_9936107_9936210:VAPA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 9944956 T/C 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9944921_9945055:VAPA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 9944960 A/G 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9944921_9945055:VAPA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 11886563 C/G 1 8 15 23 3.63614665889802 8.1822250145662 -4.54607835566818 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0619351832056806 ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11886498_11886620:MPPE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 12718593 A/G 1 57 52 109 25.9075449446484 28.3650467171628 -2.45750177251442 A:G A G 10 0.545481667637747 0.700621990936007 ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12718516_12718634:PSMG2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 19153494 C/T 1 15 13 28 6.8177749854338 7.09126167929071 -0.273486693856915 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 19444661 A/C 1 4 9 13 1.81807332944901 4.90933500873972 -3.09126167929071 A:C A C 10 0.545481667637747 0.0994104714946873 ENSG00000101752:ENST00000261537:exon_19444487_19450918:MIB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 21100240 C/T 1 7 11 18 3.18162832653577 6.00029834401522 -2.81867001747945 T:C C T 10 0.545481667637747 0.237085594735494 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 21109250 T/C 1 23 11 34 10.4539216443318 6.00029834401522 4.4536233003166 T:C T C 10 0.545481667637747 0.167436578700110 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 23854692 C/T 1 7 9 16 3.18162832653577 4.90933500873972 -1.72770668220395 T:C C T 10 0.545481667637747 0.4555478790811 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23854627_23854788:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23854627_23854788:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23854627_23854788:TAF4B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 23866349 G/A 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 A:G G A 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23865846_23866463:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23865846_23866463:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23865846_23866463:TAF4B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 23873463 T/C 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 T:C T C 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23873390_23873495:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23873390_23873495:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23873390_23873495:TAF4B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 29104698 C/T 1 9 17 26 4.09066499126028 9.2731883498417 -5.18252335858142 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0487046981211123 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29104666_29104851:DSG2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 29122799 G/A 1 10 9 19 4.54518332362253 4.90933500873972 -0.364151685117192 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29122483_29122815:DSG2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 29126670 T/C 1 16 25 41 7.27229331779605 13.6370416909437 -6.36474837314763 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0587481641125344 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 32822382 G/T 1 6 10 16 2.72710999417352 5.45481667637747 -2.72770668220395 T:G G T 10 0.545481667637747 0.211649836550054 ENSG00000186812:ENST00000330501:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000261333:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000355632:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000421371:exon_32822355_32822848:ZNF397 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 33048554 C/T 1 37 31 68 16.8171782974034 16.9099316967702 -0.0927533993667922 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000153391:ENST00000441607:exon_33048293_33048706:INO80C;ENSG00000153391:ENST00000334598:exon_33048297_33048706:INO80C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 33694120 G/A 1 6 8 14 2.72710999417352 4.36385334110198 -1.63674334692846 A:G G A 10 0.545481667637747 0.428770074510924 ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33694060_33694437:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33694060_33694437:SLC39A6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 11 11 22 4.99970165598478 6.00029834401522 -1.00059668803043 A:C A C 10 0.545481667637747 0.67524038559697 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 18 22 40 8.18132998252056 12.0005966880304 -3.81926670550988 A:G G A 10 0.545481667637747 0.266713992682672 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 46 35 81 20.9078432886636 19.0918583673211 1.81598492134249 T:C C T 10 0.545481667637747 0.738386430723698 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 39584412 T/C 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 T:C T C 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000078142:ENST00000262039:exon_39584320_39584505:PIK3C3;ENSG00000078142:ENST00000398870:exon_39584320_39584505:PIK3C3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 43565380 A/G 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 A:G A G 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 43565399 C/A 1 9 5 14 4.09066499126028 2.72740833818873 1.36325665307154 A:C C A 10 0.545481667637747 0.594821470841361 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 43568717 T/C 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 T:C T C 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43568668_43568725:PSTPIP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 43669618 T/C 1 314 268 582 142.718756361747 146.189086926916 -3.47033056516875 T:C T C 10 0.545481667637747 0.770980295689244 ENSG00000152234:ENST00000282050:exon_43669532_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000398752:exon_43669532_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000483666:exon_43669532_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000490226:exon_43669532_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000469552:exon_43669543_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000484856:exon_43669565_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000475026:exon_43669565_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000487439:exon_43669598_43669698:ATP5A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 43678225 T/C 1 82 97 179 37.2705032537047 52.9117217608615 -15.6412185071567 A:T:C T C 10 0.545481667637747 0.0199412253055759 ENSG00000152234:ENST00000282050:exon_43678138_43678245:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000398752:exon_43678138_43678319:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000483666:exon_43678138_43678261:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000484856:exon_43678138_43678245:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000475026:exon_43678138_43678239:ATP5A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 43702468 A/G 1 32 32 64 14.5445866355921 17.4554133644079 -2.91082672881581 A:G A G 10 0.545481667637747 0.530613755541967 ENSG00000152240:ENST00000282058:exon_43702433_43702556:HAUS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 46284587 T/C 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 T:C T C 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000134030:ENST00000256413:exon_46284290_46284776:KIAA0427;ENSG00000134030:ENST00000382998:exon_46284290_46284782:KIAA0427;ENSG00000134030:ENST00000435190:exon_46284290_46284776:KIAA0427;ENSG00000134030:ENST00000420275:exon_46284290_46284776:KIAA0427 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 46447817 G/C 1 8 10 18 3.63614665889802 5.45481667637747 -1.81867001747945 C:G G C 10 0.545481667637747 0.479742344098255 ENSG00000101665:ENST00000262158:exon_46446223_46448280:SMAD7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 46448129 G/A 1 7 11 18 3.18162832653577 6.00029834401522 -2.81867001747945 A:G G A 10 0.545481667637747 0.237085594735494 ENSG00000101665:ENST00000262158:exon_46446223_46448280:SMAD7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 47318626 T/C 1 27 37 64 12.2719949737808 20.1828217025966 -7.91082672881581 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0589329602981488 ENSG00000167315:ENST00000285093:exon_47318522_47318697:ACAA2;ENSG00000167315:ENST00000398549:exon_47318522_47318697:ACAA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 47809871 G/T 1 12 13 25 5.45421998834704 7.09126167929071 -1.63704169094367 T:G G T 10 0.545481667637747 0.550995061740953 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 47810251 C/G 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 C:G C G 10 0.545481667637747 0.363888885190466 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 47811667 C/G 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 C:G C G 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 32 30 62 14.5445866355921 16.3644500291324 -1.81986339354031 T:C T C 10 0.545481667637747 0.702517739461567 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 56202768 C/A 1 11 8 19 4.99970165598478 4.36385334110198 0.635848314882807 A:C C A 10 0.545481667637747 0.82162549041289 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 56203074 G/A 1 6 8 14 2.72710999417352 4.36385334110198 -1.63674334692846 A:T:G G A 10 0.545481667637747 0.428770074510924 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 56203120 C/T 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 T:C C T 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 56204644 T/G 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 T:G T G 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 56204671 A/T 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:T A T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 56204932 T/G 1 9 5 14 4.09066499126028 2.72740833818873 1.36325665307154 T:G T G 10 0.545481667637747 0.594821470841361 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 56204945 C/G 1 11 4 15 4.99970165598478 2.18192667055099 2.8177749854338 C:G C G 10 0.545481667637747 0.195724131043462 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 56204977 C/T 1 16 3 19 7.27229331779605 1.63644500291324 5.63584831488281 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0100532466385133 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 56204991 C/T 1 17 3 20 7.7268116501583 1.63644500291324 6.09036664724506 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00614587392952435 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 56205262 A/C 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 A:C A C 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 56205481 G/A 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 A:G G A 10 0.545481667637747 0.564612706784151 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 56819930 T/C 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 T:C T C 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 59780393 T/A 1 4 9 13 1.81807332944901 4.90933500873972 -3.09126167929071 A:T T A 10 0.545481667637747 0.0994104714946873 ENSG00000197563:ENST00000400334:exon_59780367_59780549:PIGN;ENSG00000197563:ENST00000357637:exon_59780367_59780549:PIGN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 59814324 G/C 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 C:G G C 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000197563:ENST00000400334:exon_59814204_59814334:PIGN;ENSG00000197563:ENST00000357637:exon_59814204_59814334:PIGN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 60985800 C/A 1 15 12 27 6.8177749854338 6.54578001165296 0.271994973780831 A:C C A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 60985879 T/C 1 34 36 70 15.4536233003166 19.6373400349589 -4.18371673464229 T:C T C 10 0.545481667637747 0.338128025706763 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 13 10 23 5.90873832070929 5.45481667637747 0.45392164433182 A:T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 61582751 T/G 1 66 66 132 29.9982099359087 36.0017900640913 -6.0035801281826 T:G T G 10 0.545481667637747 0.295832475577425 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 61585260 T/C 1 17 29 46 7.7268116501583 15.8189683614947 -8.09215671133636 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0178751996050512 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61585199_61585336:SERPINB10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 61587053 G/A 1 31 18 49 14.0900683032298 9.81867001747944 4.2713982857504 A:G G A 10 0.545481667637747 0.252122052433578 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 61602495 C/T 1 78 55 133 35.4524299242557 30.0014917200761 5.45093820417966 T:C C T 10 0.545481667637747 0.384021096015704 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61602072_61603345:SERPINB10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 61650865 G/A 1 24 12 36 10.9084399766941 6.54578001165296 4.36265996504111 A:G G A 10 0.545481667637747 0.180385887624087 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61650813_61650881:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61650813_61650955:SERPINB8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 45 62 107 20.4533249563014 33.8198633935403 -13.3665384372389 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0113021007330651 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 71928150 C/T 1 93 55 148 42.2702049096895 30.0014917200761 12.2687131896135 T:C:G C T 10 0.545481667637747 0.0473603103972661 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71928150_71928179:CYB5A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 71959075 G/A 1 60 35 95 27.2710999417352 19.0918583673211 8.17924157441404 A:G G A 10 0.545481667637747 0.099508951385113 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71958982_71959251:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71958982_71959170:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71958982_71959179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71958982_71959179:CYB5A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 18 12 30 8.18132998252056 6.54578001165296 1.63554997086759 A:G G A 10 0.545481667637747 0.58714780737981 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 18 77067000 T/G 1 3 8 11 1.36355499708676 4.36385334110198 -3.00029834401522 T:G T G 10 0.545481667637747 0.126273306068542 ENSG00000166377:ENST00000426216:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000359184:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000440332:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000307671:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000490210:exon_77066986_77067234:ATP9B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 313633 G/A 1 7 12 19 3.18162832653577 6.54578001165296 -3.36415168511719 A:G G A 10 0.545481667637747 0.165823977917260 ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_313492_313643:MIER2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 327900 G/A 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_327864_327989:MIER2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 334474 T/G 1 3 7 10 1.36355499708676 3.81837167346423 -2.45481667637747 T:G T G 10 0.545481667637747 0.201970346156534 ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_334400_334542:MIER2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 880066 G/A 1 7 11 18 3.18162832653577 6.00029834401522 -2.81867001747945 A:G G A 10 0.545481667637747 0.237085594735494 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 9 24 33 4.09066499126028 13.0915600233059 -9.00089503204565 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00239966603297877 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 28 26 54 12.7265133061431 14.1825233585814 -1.45601005243834 T:C C T 10 0.545481667637747 0.784921492259992 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 990819 G/A 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:G G A 10 0.545481667637747 0.740297003186309 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 16 14 30 7.27229331779605 7.63674334692846 -0.364450029132409 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 1271274 C/T 1 10 6 16 4.54518332362253 3.27289000582648 1.27229331779605 T:C C T 10 0.545481667637747 0.620225311632925 ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271139_1271364:CIRBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 1272040 T/C 1 338 325 663 153.627196338442 177.281541982268 -23.6543456438262 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0668329418204736 ENSG00000099622:ENST00000320936:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000413636:exon_1271980_1272442:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000444172:exon_1271980_1272442:CIRBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 1357082 T/C 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 T:C T C 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1357008_1357093:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1357008_1357093:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1357008_1357093:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1357063_1357093:MUM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 1360575 G/A 1 18 9 27 8.18132998252056 4.90933500873972 3.27199497378083 A:G G A 10 0.545481667637747 0.248024429023792 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1360135_1361031:MUM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 38 55 93 17.2716966297656 30.0014917200761 -12.7297950903105 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00903049683297264 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 1912986 C/T 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 T:C C T 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 36 35 71 16.3626599650411 19.0918583673211 -2.72919840228003 A:G A G 10 0.545481667637747 0.552157473949243 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 40 41 81 18.1807332944901 22.3647483731476 -4.18401507865751 A:G G A 10 0.545481667637747 0.373111341072123 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 2078221 G/C 1 58 67 125 26.3620632770107 36.547271731729 -10.1852084547184 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0724797767976954 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 51 45 96 23.1804349504749 24.5466750436986 -1.36624009322371 A:G A G 10 0.545481667637747 0.837749323355124 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 42 70 112 19.0897699592146 38.1837167346423 -19.0939467754277 T:C T C 10 0.545481667637747 0.000397614936336159 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 2138654 T/G 1 24 21 45 10.9084399766941 11.4551150203927 -0.546675043698613 T:G T G 10 0.545481667637747 0.882083753701345 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2138618_2138713:AP3D1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 2337468 G/A 1 5 16 21 2.27259166181127 8.72770668220395 -6.45511502039269 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00699926557592017 ENSG00000005206:ENST00000382189:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000432705:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2337442_2337624:AC004410.1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 11 15 26 4.99970165598478 8.1822250145662 -3.18252335858142 A:C C A 10 0.545481667637747 0.239869675139145 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 2759287 C/T 1 29 37 66 13.1810316385053 20.1828217025966 -7.0017900640913 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0851045374010957 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2759255_2759292:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2759255_2759292:SGTA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 16 28 44 7.27229331779605 15.2734866938569 -8.00119337606087 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0220495367011970 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 3186085 G/T 1 13 14 27 5.90873832070929 7.63674334692846 -1.72800502621917 T:G G T 10 0.545481667637747 0.564423910665474 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3185875_3186212:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3185875_3186212:NCLN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 33 37 70 14.9991049679544 20.1828217025966 -5.18371673464229 T:C T C 10 0.545481667637747 0.230947138277434 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 52 43 95 23.6349532828372 23.4557117084231 0.179241574414039 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 3752563 G/A 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 A:G G A 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752506_3752718:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752506_3752718:APBA3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 3762698 C/T 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 T:C C T 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3762665_3762816:MRPL54 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 4101062 G/T 1 29 27 56 13.1810316385053 14.7280050262192 -1.54697338771383 A:T:G G T 10 0.545481667637747 0.689401353244932 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4100962_4101141:MAP2K2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 4352959 A/G 1 6 11 17 2.72710999417352 6.00029834401522 -3.2731883498417 A:G A G 10 0.545481667637747 0.143847339286626 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 4409756 A/G 1 24 13 37 10.9084399766941 7.09126167929071 3.81717829740336 A:G A G 10 0.545481667637747 0.248606432535613 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 4454083 C/T 1 50 27 77 22.7259166181127 14.7280050262192 7.99791159189348 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0681728710443494 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 4457650 C/T 1 16 29 45 7.27229331779605 15.8189683614947 -8.54667504369861 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0156342078688297 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4457612_4457694:UBXN6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 4816719 G/A 1 17 21 38 7.7268116501583 11.4551150203927 -3.72830337023438 A:G G A 10 0.545481667637747 0.255359068809926 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 21 15 36 9.54488497960731 8.1822250145662 1.36265996504111 T:C T C 10 0.545481667637747 0.738817375454975 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 46 36 82 20.9078432886636 19.6373400349589 1.27050325370475 T:C T C 10 0.545481667637747 0.824964247153249 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 5914605 A/G 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 A:G A G 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 5914625 G/A 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 A:G G A 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 5917616 G/A 1 29 24 53 13.1810316385053 13.0915600233059 0.089471615199411 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000031823:ENST00000034275:exon_5916154_5917664:RANBP3;ENSG00000031823:ENST00000340578:exon_5916154_5917664:RANBP3;ENSG00000031823:ENST00000439268:exon_5916154_5917664:RANBP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 6535065 G/A 0 127 0 127 57.7238282100061 0 57.7238282100061 G G 10 0.545481667637747 3.93608014752458e-34 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 6535080 T/C 1 52 59 111 23.6349532828372 32.1834183906271 -8.54846510778991 T:C T C 10 0.545481667637747 0.105993222377650 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 6669934 G/A 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000125735:ENST00000245912:exon_6669862_6670169:TNFSF14 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 6731057 T/C 1 33 21 54 14.9991049679544 11.4551150203927 3.54398994756166 T:C T C 10 0.545481667637747 0.343117989768813 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 6755007 T/C 1 5 16 21 2.27259166181127 8.72770668220395 -6.45511502039269 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00699926557592017 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 7083761 A/G 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000130544:ENST00000439035:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000414706:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000252840:exon_7082889_7087979:ZNF557 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 7622226 G/A 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 A:G G A 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 7623700 G/A 1 4 8 12 1.81807332944901 4.36385334110198 -2.54578001165296 A:G G A 10 0.545481667637747 0.157407748991045 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 7687428 G/A 1 26 26 52 11.8174766414186 14.1825233585814 -2.36504671716284 A:G G A 10 0.545481667637747 0.57806548721543 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7687416_7687547:XAB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 7694393 G/A 1 12 14 26 5.45421998834704 7.63674334692846 -2.18252335858142 A:G G A 10 0.545481667637747 0.434203864087606 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7694363_7694439:XAB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 7712577 C/G 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 C:G C G 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 8376431 G/A 1 62 72 134 28.1801366064597 39.2746800699178 -11.0945434634581 A:G G A 10 0.545481667637747 0.056563879593751 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8376234_8376479:NDUFA7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 8486884 G/A 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 A:G G A 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8486607_8486900:MARCH2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 9721401 A/T 1 12 11 23 5.45421998834704 6.00029834401522 -0.546078355668181 A:T A T 10 0.545481667637747 0.837030175057015 ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 9922223 G/A 1 3 16 19 1.36355499708676 8.72770668220395 -7.36415168511719 A:G G A 10 0.545481667637747 0.000773778273425791 ENSG00000127452:ENST00000247977:exon_9920947_9922393:FBXL12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 9949152 G/A 1 97 99 196 44.0882782391385 54.002685096137 -9.9144068569984 A:C:G G A 10 0.545481667637747 0.172804443865062 ENSG00000127445:ENST00000247970:exon_9949112_9949324:PIN1;ENSG00000127445:ENST00000424497:exon_9949112_9949324:PIN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10204481 C/T 1 17 24 41 7.7268116501583 13.0915600233059 -5.36474837314763 T:C C T 10 0.545481667637747 0.115996377466619 ENSG00000130812:ENST00000253109:exon_10204369_10204556:ANGPTL6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 83 75 158 37.725021586067 40.911125072831 -3.18610348676402 C:G C G 10 0.545481667637747 0.632163826447237 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 26 32 58 11.8174766414186 17.4554133644079 -5.63793672298932 T:C C T 10 0.545481667637747 0.147998274121349 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10225342 C/T 1 47 21 68 21.3623616210259 11.4551150203927 9.90724660063321 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0200015516611345 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 180 168 348 81.8132998252055 91.6409201631415 -9.82762033793594 A:G A G 10 0.545481667637747 0.306475079005274 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10229297 C/A 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 A:C C A 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000130811:ENST00000453552:exon_10229275_10229403:EIF3G HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10267077 T/C 1 13 13 26 5.90873832070929 7.09126167929071 -1.18252335858142 T:C T C 10 0.545481667637747 0.696126980810445 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10267067_10267185:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10267067_10267185:DNMT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10334663 T/G 1 12 5 17 5.45421998834704 2.72740833818873 2.7268116501583 T:G T G 10 0.545481667637747 0.227151988982216 ENSG00000175898:ENST00000317726:exon_10332109_10335623:S1PR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10394792 G/A 1 57 48 105 25.9075449446484 26.1831200466119 -0.275575101963433 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10394709_10394996:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10394709_10394996:ICAM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10395683 A/G 1 89 55 144 40.4521315802405 30.0014917200761 10.4506398601644 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0938680542641225 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000444336:exon_10395605_10395685:ICAM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10426422 A/C 1 10 6 16 4.54518332362253 3.27289000582648 1.27229331779605 A:C A C 10 0.545481667637747 0.620225311632925 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10426381_10426471:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426062_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426007_10426435:FDX1L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 10 4 14 4.54518332362253 2.18192667055099 2.36325665307154 T:C T C 10 0.545481667637747 0.284675534132335 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10449392 A/G 1 155 133 288 70.4503415161492 72.5490617958204 -2.09872027967113 A:G A G 10 0.545481667637747 0.813113988485708 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 45 55 100 20.4533249563014 30.0014917200761 -9.5481667637747 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0569117254394875 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 25 34 59 11.3629583090563 18.5463766996834 -7.18341839062707 A:C C A 10 0.545481667637747 0.0672569842928383 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10568668 C/T 1 4 13 17 1.81807332944901 7.09126167929071 -5.2731883498417 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0132181654462577 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10568555_10568778:PDE4A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10599965 G/A 1 27 22 49 12.2719949737808 12.0005966880304 0.271398285750397 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10599868_10600044:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10599868_10600044:KEAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 18 14 32 8.18132998252056 7.63674334692846 0.544586635592098 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10668383 T/C 1 10 7 17 4.54518332362253 3.81837167346423 0.726811650158302 T:C T C 10 0.545481667637747 0.810670786245774 ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10668673 A/G 1 30 40 70 13.6355499708676 21.8192667055099 -8.18371673464229 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0547706551393934 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668648_10668736:KRI1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 35 13 48 15.9081416326789 7.09126167929071 8.81687995338815 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0129567847250215 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 20 28 48 9.09036664724506 15.2734866938569 -6.18312004661185 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0821838337063768 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 10676423 G/A 1 8 12 20 3.63614665889802 6.54578001165296 -2.90963335275494 A:G G A 10 0.545481667637747 0.261277301714232 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10676393_10676696:KRI1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 11224265 A/G 1 10 9 19 4.54518332362253 4.90933500873972 -0.364151685117192 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11224211_11224438:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11224211_11224438:LDLR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 11227602 C/T 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 T:C C T 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11227535_11227674:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11227535_11227674:LDLR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 11230881 T/C 1 12 11 23 5.45421998834704 6.00029834401522 -0.546078355668181 T:C T C 10 0.545481667637747 0.837030175057015 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11230768_11230909:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11230768_11230909:LDLR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 11319491 G/A 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:G G A 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11319362_11319505:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11319362_11319505:DOCK6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 11319636 G/A 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:G G A 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11319587_11319779:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11319587_11319779:DOCK6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 4 9 13 1.81807332944901 4.90933500873972 -3.09126167929071 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0994104714946873 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 11942615 A/C 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 A:C A C 10 0.545481667637747 0.782586339670189 ENSG00000171295:ENST00000304060:exon_11942183_11946016:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000427505:exon_11942183_11942798:ZNF440 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 11942771 G/A 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 A:G G A 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000171295:ENST00000304060:exon_11942183_11946016:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000427505:exon_11942183_11942798:ZNF440 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 12059699 T/G 1 12 22 34 5.45421998834704 12.0005966880304 -6.5463766996834 T:G T G 10 0.545481667637747 0.0257526729559668 ENSG00000196757:ENST00000254321:exon_12059091_12061578:ZNF700;ENSG00000196757:ENST00000482090:exon_12059091_12061588:ZNF700 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 12059838 G/A 1 12 17 29 5.45421998834704 9.2731883498417 -3.81896836149466 A:G G A 10 0.545481667637747 0.191679709049513 ENSG00000196757:ENST00000254321:exon_12059091_12061578:ZNF700;ENSG00000196757:ENST00000482090:exon_12059091_12061588:ZNF700 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 13264398 C/T 1 69 88 157 31.3617649329955 48.0023867521217 -16.6406218191263 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00811608392554965 ENSG00000160888:ENST00000292433:exon_13263758_13265716:IER2;ENSG00000160888:ENST00000393152:exon_13263893_13265716:IER2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 25 21 46 11.3629583090563 11.4551150203927 -0.0921567113363597 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 89 71 160 40.4521315802405 38.72919840228 1.72293317796048 T:C C T 10 0.545481667637747 0.812086736394071 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 280 239 519 127.265133061431 130.370118565422 -3.10498550399069 A:G A G 10 0.545481667637747 0.791546504617695 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 14030689 T/C 1 8 13 21 3.63614665889802 7.09126167929071 -3.45511502039269 T:C T C 10 0.545481667637747 0.187332125989055 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14030631_14030764:CC2D1A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 14040896 G/A 1 28 20 48 12.7265133061431 10.9096333527549 1.81687995338815 A:G G A 10 0.545481667637747 0.664808566110727 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14040891_14040967:CC2D1A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 14065488 A/G 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:G A G 10 0.545481667637747 0.481553868568817 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 14516704 G/C 1 31 29 60 14.0900683032298 15.8189683614947 -1.72890005826482 C:G G C 10 0.545481667637747 0.698171928393748 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14516560_14516751:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14516560_14516751:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14516560_14516751:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14516560_14516751:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14516560_14516751:CD97 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 14582468 G/A 1 59 47 106 26.8165816093729 25.6376383789741 1.17894323039882 A:G G A 10 0.545481667637747 0.845840905030774 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 1 11 6 17 4.99970165598478 3.27289000582648 1.7268116501583 T:C C T 10 0.545481667637747 0.471137770776418 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 14682804 G/C 1 51 50 101 23.1804349504749 27.2740833818873 -4.09364843141244 C:G G C 10 0.545481667637747 0.425483326543665 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14682701_14682886:NDUFB7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 14884751 G/A 1 73 8 81 33.1798382624445 4.36385334110198 28.8159849213425 A:G G A 10 0.545481667637747 4.95995251284455e-12 ENSG00000127507:ENST00000353005:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000353876:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392967:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000346057:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392965:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000315576:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000360222:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392964:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392962:exon_14884750_14884866:EMR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 14884841 G/A 1 53 5 58 24.0894716151994 2.72740833818873 21.3620632770107 A:G G A 10 0.545481667637747 2.00243824228927e-09 ENSG00000127507:ENST00000353005:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000353876:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392967:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000346057:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392965:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000315576:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000360222:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392964:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392962:exon_14884750_14884866:EMR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 14 14 28 6.36325665307154 7.63674334692846 -1.27348669385692 A:C C A 10 0.545481667637747 0.705678422974658 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 15233732 G/A 1 12 14 26 5.45421998834704 7.63674334692846 -2.18252335858142 A:G G A 10 0.545481667637747 0.434203864087606 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233703_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233703_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233703_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233703_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233703_15233841:ILVBL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 16633950 T/C 1 21 24 45 9.54488497960731 13.0915600233059 -3.54667504369861 T:C T C 10 0.545481667637747 0.298480649145751 ENSG00000085872:ENST00000198939:exon_16633863_16634101:CHERP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 16666101 G/C 1 15 13 28 6.8177749854338 7.09126167929071 -0.273486693856915 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000127526:ENST00000436494:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000409648:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000248069:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000421082:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000469055:exon_16665963_16666412:SLC35E1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 16790859 C/T 1 10 13 23 4.54518332362253 7.09126167929071 -2.54607835566818 T:C C T 10 0.545481667637747 0.302524544988392 ENSG00000072954:ENST00000187762:exon_16790795_16790951:TMEM38A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17160893 C/T 1 12 10 22 5.45421998834704 5.45481667637747 -0.000596688030433334 T:C:G C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17160573_17160986:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17160573_17160986:HAUS8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 57 38 95 25.9075449446484 20.7283033702344 5.17924157441404 T:C T C 10 0.545481667637747 0.304113638458274 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 102 84 186 46.3608699009498 45.8204600815707 0.540409819379065 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17337871 A/G 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 A:G A G 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17337882 C/G 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 C:G C G 10 0.545481667637747 0.527815080970101 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17339112 G/A 1 18 23 41 8.18132998252056 12.5460783556682 -4.36474837314763 A:G G A 10 0.545481667637747 0.209363873419243 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17339065_17339118:OCEL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17394124 T/G 1 13 3 16 5.90873832070929 1.63644500291324 4.27229331779605 T:G T G 10 0.545481667637747 0.0422836204844924 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394034_17394693:ANKLE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17394504 A/C 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 A:C A C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394034_17394693:ANKLE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17395003 A/G 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394898_17395075:ANKLE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17395055 C/G 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394898_17395075:ANKLE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17396549 T/C 1 12 4 16 5.45421998834704 2.18192667055099 3.27229331779605 T:C T C 10 0.545481667637747 0.132268379253018 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17396490_17396628:ANKLE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17412366 G/A 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.527815080970101 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17412399 G/A 1 3 6 9 1.36355499708676 3.27289000582648 -1.90933500873972 A:G G A 10 0.545481667637747 0.316116386178568 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17448961 A/C 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 A:C A C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17448817_17449064:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17448817_17449064:GTPBP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17450016 T/C 1 11 20 31 4.99970165598478 10.9096333527549 -5.90993169677016 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0456130255550640 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17451981 G/A 1 12 9 21 5.45421998834704 4.90933500873972 0.544884979607314 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17451853_17452131:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17451853_17452131:GTPBP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 57 52 109 25.9075449446484 28.3650467171628 -2.45750177251442 A:G A G 10 0.545481667637747 0.700621990936007 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17664090 C/T 1 6 13 19 2.72710999417352 7.09126167929071 -4.36415168511719 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0629589987215586 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 17670201 C/T 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 T:C C T 10 0.545481667637747 0.782586339670189 ENSG00000130309:ENST00000252599:exon_17670120_17670230:GLT25D1;ENSG00000130309:ENST00000379714:exon_17670120_17670230:GLT25D1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 18234441 C/T 1 6 8 14 2.72710999417352 4.36385334110198 -1.63674334692846 T:C C T 10 0.545481667637747 0.428770074510924 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18234390_18234465:MAST3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 18245512 C/T 1 8 12 20 3.63614665889802 6.54578001165296 -2.90963335275494 T:C C T 10 0.545481667637747 0.261277301714232 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18245389_18245521:MAST3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 18255359 G/A 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 A:G G A 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18255276_18255503:MAST3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 18257750 C/T 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18257691_18257827:MAST3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 18279638 T/C 1 8 12 20 3.63614665889802 6.54578001165296 -2.90963335275494 T:C T C 10 0.545481667637747 0.261277301714232 ENSG00000105647:ENST00000222254:exon_18279536_18279706:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000426902:exon_18279536_18279706:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000464016:exon_18279285_18279649:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000470732:exon_18279308_18279706:PIK3R2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 18288069 A/G 1 405 350 755 184.079924606712 190.918583673211 -6.83865906649896 A:G A G 10 0.545481667637747 0.63476478927359 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 18288642 A/G 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 A:G A G 10 0.545481667637747 0.304880148035765 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 18305824 C/T 1 21 16 37 9.54488497960731 8.72770668220395 0.817178297403363 T:C C T 10 0.545481667637747 0.869526951478906 ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18305768_18305896:MPV17L2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 19038998 G/A 1 45 62 107 20.4533249563014 33.8198633935403 -13.3665384372389 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0113021007330651 ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19038937_19039436:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19038937_19039438:DDX49 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 19243175 C/T 1 20 12 32 9.09036664724506 6.54578001165296 2.5445866355921 T:C C T 10 0.545481667637747 0.382163131763023 ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19243161_19243317:TMEM161A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 19737389 G/T 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 T:G G T 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19737352_19738093:LPAR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 21300124 T/C 0 0 8 8 0 4.36385334110198 -4.36385334110198 C T C 10 0.545481667637747 0.00182142476255671 ENSG00000160352:ENST00000343332:exon_21299613_21301019:ZNF714;ENSG00000160352:ENST00000291770:exon_21299613_21307879:ZNF714 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 21477379 C/T 1 4 8 12 1.81807332944901 4.36385334110198 -2.54578001165296 T:C C T 10 0.545481667637747 0.157407748991045 ENSG00000182141:ENST00000356929:exon_21473963_21477541:ZNF708 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 21910621 A/G 1 7 13 20 3.18162832653577 7.09126167929071 -3.90963335275494 A:G A G 10 0.545481667637747 0.113949941344795 ENSG00000197020:ENST00000358296:exon_21906844_21910791:ZNF100;ENSG00000197020:ENST00000445015:exon_21906844_21910791:ZNF100 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 23542697 G/C 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 23545250 A/G 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 A:G A G 10 0.545481667637747 0.152855532002609 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 33098632 G/C 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33098541_33098738:ANKRD27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 11 6 17 4.99970165598478 3.27289000582648 1.7268116501583 T:C C T 10 0.545481667637747 0.471137770776418 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 33110204 T/C 1 18 14 32 8.18132998252056 7.63674334692846 0.544586635592098 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33110166_33110285:ANKRD27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 33110259 G/A 1 10 11 21 4.54518332362253 6.00029834401522 -1.45511502039269 A:G G A 10 0.545481667637747 0.662266055550669 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33110166_33110285:ANKRD27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 33117666 T/C 1 8 9 17 3.63614665889802 4.90933500873972 -1.2731883498417 T:C T C 10 0.545481667637747 0.628894857051545 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33117618_33117733:ANKRD27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 34706531 A/G 1 96 77 173 43.6337599067763 42.0020884081065 1.63167149866977 A:G A G 10 0.545481667637747 0.819272950028182 ENSG00000105216:ENST00000324222:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000356258:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000433627:exon_34706501_34706566:LSM14A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 35828794 G/A 1 192 161 353 87.2675198135526 87.8225484896773 -0.555028676124678 A:G G A 10 0.545481667637747 0.957424844143242 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35828658_35828924:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35828658_35828924:CD22;ENSG00000012124:ENST00000270311:exon_35828658_35828924:CD22 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 36033460 C/T 1 3 8 11 1.36355499708676 4.36385334110198 -3.00029834401522 T:C C T 10 0.545481667637747 0.126273306068542 ENSG00000105679:ENST00000222286:exon_36033392_36033510:GAPDHS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 246 238 484 111.811509761114 129.824636897784 -18.0131271366695 T:C:G C T 10 0.545481667637747 0.100573877959623 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 36224705 A/G 1 10 11 21 4.54518332362253 6.00029834401522 -1.45511502039269 A:G A G 10 0.545481667637747 0.662266055550669 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 36230174 T/C 1 64 62 126 29.0891732711842 33.8198633935403 -4.73069012235612 T:C T C 10 0.545481667637747 0.421253606138113 ENSG00000126246:ENST00000246532:exon_36230153_36230527:TMEM149;ENSG00000126246:ENST00000344990:exon_36230153_36230527:TMEM149 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 36259415 G/A 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36259306_36260077:C19orf55;ENSG00000167595:ENST00000396908:exon_36259306_36259447:C19orf55 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 36268771 C/T 1 9 2 11 4.09066499126028 1.09096333527549 2.99970165598478 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0774939953200738 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36268726_36268810:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36268726_36268810:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36268726_36268810:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000221905:exon_36268726_36268810:ARHGAP33 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 36273534 G/A 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36273499_36273581:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36273499_36273581:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36273499_36273581:ARHGAP33 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 36275074 G/A 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:G G A 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36275074_36275219:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36275074_36275219:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36275074_36275219:ARHGAP33 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 36583684 A/G 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36583591_36583713:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36583591_36583713:WDR62 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 37005298 A/G 1 14 14 28 6.36325665307154 7.63674334692846 -1.27348669385692 A:G A G 10 0.545481667637747 0.705678422974658 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 37039069 A/C 1 14 5 19 6.36325665307154 2.72740833818873 3.63584831488281 A:C A C 10 0.545481667637747 0.109537367994142 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 37117302 A/G 1 7 2 9 3.18162832653577 1.09096333527549 2.09066499126028 A:G A G 10 0.545481667637747 0.195909819758449 ENSG00000161298:ENST00000423582:exon_37117032_37118894:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000292928:exon_37117032_37119499:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000441040:exon_37117035_37118452:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000439428:exon_37117032_37119469:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000435416:exon_37117035_37119172:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000455093:exon_37117032_37119498:ZNF382 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 37129806 G/A 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 A:G G A 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000197808:ENST00000360357:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396893:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396896:exon_37129686_37130439:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396892:exon_37129591_37129890:ZNF461 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 37209866 T/C 1 3 6 9 1.36355499708676 3.27289000582648 -1.90933500873972 T:C T C 10 0.545481667637747 0.316116386178568 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 37210805 C/T 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 T:C C T 10 0.545481667637747 0.243356459282646 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 22 15 37 9.99940331196957 8.1822250145662 1.81717829740336 T:G G T 10 0.545481667637747 0.621972675148655 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 38643539 C/T 1 9 4 13 4.09066499126028 2.18192667055099 1.90873832070929 T:C C T 10 0.545481667637747 0.405734407269743 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38643480_38643607:SIPA1L3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 38652993 C/T 1 12 14 26 5.45421998834704 7.63674334692846 -2.18252335858142 T:C C T 10 0.545481667637747 0.434203864087606 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38652893_38653011:SIPA1L3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 38673298 C/G 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38673159_38673380:SIPA1L3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 19 27 46 8.63584831488281 14.7280050262192 -6.09215671133636 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0766224530877039 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 38800176 G/A 1 20 25 45 9.09036664724506 13.6370416909437 -4.54667504369861 A:G G A 10 0.545481667637747 0.180913272368107 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 51 72 123 23.1804349504749 39.2746800699178 -16.0942451194429 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00372212745726103 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 39100594 G/A 1 52 48 100 23.6349532828372 26.1831200466119 -2.5481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.617012521834825 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39100549_39100665:MAP4K1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 39100688 G/A 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:G G A 10 0.545481667637747 0.740297003186309 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 106 78 184 48.1789432303988 42.5475700757443 5.63137315465456 T:C C T 10 0.545481667637747 0.416367266979791 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 39224413 A/G 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 A:G A G 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000182472:ENST00000328867:exon_39224343_39224421:CAPN12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 39307103 C/T 1 76 81 157 34.5433932595312 44.1840150786575 -9.64062181912627 T:C C T 10 0.545481667637747 0.128160636894703 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39307093_39307163:ECH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 39907036 C/T 1 13 6 19 5.90873832070929 3.27289000582648 2.63584831488281 T:C C T 10 0.545481667637747 0.256383122170611 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000451354:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39906988_39907054:PLEKHG2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 39913634 G/A 1 17 19 36 7.7268116501583 10.3641516851172 -2.63734003495889 A:G G A 10 0.545481667637747 0.405818572523694 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 39923952 G/A 1 3465 2688 6153 1574.90602163521 1466.25472261026 108.651299024943 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00546760045054627 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39923852_39924058:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39923852_39924058:RPS16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 39926509 A/C 1 2146 1935 4081 975.396341249395 1055.50702687904 -80.1106856296454 A:T:C:G A C 10 0.545481667637747 0.0119014285335349 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 39926521 G/A 1 2063 1887 3950 937.671319663328 1029.32390683243 -91.6525871691006 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00345504769519712 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 40030654 G/C 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 C:G G C 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 40030704 C/T 1 4 9 13 1.81807332944901 4.90933500873972 -3.09126167929071 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0994104714946873 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 40197924 T/C 1 22 20 42 9.99940331196957 10.9096333527549 -0.910230040785374 T:C T C 10 0.545481667637747 0.877111986995837 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40197818_40198028:LGALS14 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 40199914 C/G 1 36 35 71 16.3626599650411 19.0918583673211 -2.72919840228003 A:C:G C G 10 0.545481667637747 0.552157473949243 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40199837_40200087:LGALS14 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 51 45 96 23.1804349504749 24.5466750436986 -1.36624009322371 A:T:G A G 10 0.545481667637747 0.837749323355124 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 40739731 C/G 1 66 52 118 29.9982099359087 28.3650467171628 1.63316321874586 C:G C G 10 0.545481667637747 0.782279589905057 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000489375:exon_40739575_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000496089:exon_40739662_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000311278:exon_40739728_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000424901:exon_40739728_40739858:AKT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 40928944 A/G 1 10 5 15 4.54518332362253 2.72740833818873 1.8177749854338 A:G A G 10 0.545481667637747 0.44074713691162 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 40928968 A/G 1 11 7 18 4.99970165598478 3.81837167346423 1.18132998252055 A:G A G 10 0.545481667637747 0.641996695541785 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 19 27 46 8.63584831488281 14.7280050262192 -6.09215671133636 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0766224530877039 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 41096189 A/G 1 21 25 46 9.54488497960731 13.6370416909437 -4.09215671133636 A:G A G 10 0.545481667637747 0.238888870847996 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41096150_41096328:SHKBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 42703833 A/G 1 9 10 19 4.09066499126028 5.45481667637747 -1.36415168511719 A:G A G 10 0.545481667637747 0.646474994475887 ENSG00000160570:ENST00000403271:exon_42702752_42703981:DEDD2;ENSG00000160570:ENST00000336034:exon_42702752_42703981:DEDD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 42728836 T/C 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 T:C T C 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000167625:ENST00000301215:exon_42728539_42732353:ZNF526 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 42753283 G/A 1 42 36 78 19.0897699592146 19.6373400349589 -0.547570075744261 A:G G A 10 0.545481667637747 0.909951321109231 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 42753649 G/C 1 27 27 54 12.2719949737808 14.7280050262192 -2.45601005243834 C:G G C 10 0.545481667637747 0.585057704278628 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 42911769 G/A 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42911758_42911943:LIPE HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 44098963 C/G 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 C:G C G 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000167378:ENST00000422989:exon_44098961_44099492:IRGQ;ENSG00000167378:ENST00000300809:exon_44098961_44099676:IRGQ HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 44500701 C/T 1 12 5 17 5.45421998834704 2.72740833818873 2.7268116501583 T:C C T 10 0.545481667637747 0.227151988982216 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 44610665 A/G 1 11 11 22 4.99970165598478 6.00029834401522 -1.00059668803043 A:G A G 10 0.545481667637747 0.67524038559697 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 44610798 A/T 1 13 14 27 5.90873832070929 7.63674334692846 -1.72800502621917 A:T A T 10 0.545481667637747 0.564423910665474 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 16 22 38 7.27229331779605 12.0005966880304 -4.72830337023439 T:C T C 10 0.545481667637747 0.143014157172580 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 44611420 A/G 1 11 9 20 4.99970165598478 4.90933500873972 0.0903666472450606 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 17 7 24 7.7268116501583 3.81837167346423 3.90843997669407 A:G A G 10 0.545481667637747 0.150198498186465 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 17 8 25 7.7268116501583 4.36385334110198 3.36295830905633 A:T A T 10 0.545481667637747 0.228487063060426 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 28 16 44 12.7265133061431 8.72770668220395 3.99880662393913 A:G A G 10 0.545481667637747 0.289186598494007 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 44660967 A/G 1 4 9 13 1.81807332944901 4.90933500873972 -3.09126167929071 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0994104714946873 ENSG00000159905:ENST00000426739:exon_44660405_44664462:ZNF234;ENSG00000159905:ENST00000244316:exon_44660405_44664462:ZNF234 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 44739303 T/C 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 T:C T C 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 44739399 T/C 1 17 4 21 7.7268116501583 2.18192667055099 5.54488497960731 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0155604230463135 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 44792969 G/A 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 A:G G A 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000159917:ENST00000391957:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000433015:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000291182:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000359844:exon_44792291_44793353:ZNF235 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 29 36 65 13.1810316385053 19.6373400349589 -6.45630839645355 T:C T C 10 0.545481667637747 0.134389388162031 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 45490570 A/G 1 13 15 28 5.90873832070929 8.1822250145662 -2.27348669385692 A:G A G 10 0.545481667637747 0.44954716189734 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 29 12 41 13.1810316385053 6.54578001165296 6.63525162685237 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0413528882912976 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 45854919 T/G 1 10 8 18 4.54518332362253 4.36385334110198 0.181329982520555 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45854853_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45854853_45854979:ERCC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 45867259 C/T 1 17 13 30 7.7268116501583 7.09126167929071 0.635549970867592 T:C C T 10 0.545481667637747 0.856505800488025 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391940:exon_45867244_45867377:ERCC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 45868309 T/G 1 9 9 18 4.09066499126028 4.90933500873972 -0.818670017479445 T:C:G T G 10 0.545481667637747 0.814103892547842 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391940:exon_45868300_45868416:ERCC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 12 14 26 5.45421998834704 7.63674334692846 -2.18252335858142 A:C A C 10 0.545481667637747 0.434203864087606 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 19 14 33 8.63584831488281 7.63674334692846 0.99910496795435 A:G A G 10 0.545481667637747 0.861592700201063 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 18 8 26 8.18132998252056 4.36385334110198 3.81747664141858 A:G G A 10 0.545481667637747 0.168120564649063 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 13 16 29 5.90873832070929 8.72770668220395 -2.81896836149466 A:C C A 10 0.545481667637747 0.352077308499086 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 46124517 C/T 1 14 14 28 6.36325665307154 7.63674334692846 -1.27348669385692 T:C C T 10 0.545481667637747 0.705678422974658 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46124465_46124590:EML2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 46129999 C/A 1 8 21 29 3.63614665889802 11.4551150203927 -7.81896836149466 A:T:C C A 10 0.545481667637747 0.00446098543331499 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46129963_46130097:EML2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 46133251 C/T 1 26 3 29 11.8174766414186 1.63644500291324 10.1810316385053 T:C C T 10 0.545481667637747 9.75581285767293e-05 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 46133256 G/A 1 26 3 29 11.8174766414186 1.63644500291324 10.1810316385053 A:G G A 10 0.545481667637747 9.75581285767293e-05 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 46141845 T/C 1 10 12 22 4.54518332362253 6.54578001165296 -2.00059668803043 T:C T C 10 0.545481667637747 0.401468669837045 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46141763_46141892:EML2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 46289509 G/A 1 4 14 18 1.81807332944901 7.63674334692846 -5.81867001747945 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00771859118587067 ENSG00000185800:ENST00000270223:exon_46288852_46290129:DMWD;ENSG00000185800:ENST00000377735:exon_46288852_46290129:DMWD HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 46319415 G/C 1 45 33 78 20.4533249563014 18.0008950320457 2.45242992425574 C:G G C 10 0.545481667637747 0.649596101025337 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46319109_46319441:SYMPK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 46387792 G/C 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 47124714 T/G 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 47127324 C/G 1 1 7 8 0.454518332362253 3.81837167346423 -3.36385334110198 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0271476654586150 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47126715_47127494:PTGIR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 47258842 C/T 1 1 7 8 0.454518332362253 3.81837167346423 -3.36385334110198 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0271476654586150 ENSG00000181027:ENST00000391909:exon_47258669_47261832:FKRP;ENSG00000181027:ENST00000318584:exon_47258669_47261832:FKRP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 47291174 G/C 1 36 45 81 16.3626599650411 24.5466750436986 -8.1840150786575 C:G G C 10 0.545481667637747 0.074299265798765 ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47290657_47291851:SLC1A5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 47865947 G/A 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 A:G G A 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47865733_47865950:DHX34 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 47978671 G/A 0 10 0 10 4.54518332362253 0 4.54518332362253 G G 10 0.545481667637747 0.00270867480271896 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 96 125 221 43.6337599067763 68.1852084547184 -24.5514485479421 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00113753822831463 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 48647172 G/A 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 A:G G A 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48647140_48647220:LIG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 25 8 33 11.3629583090563 4.36385334110198 6.99910496795435 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0143674099597562 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 9 6 15 4.09066499126028 3.27289000582648 0.817774985433796 T:C C T 10 0.545481667637747 0.797861210956256 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 48733757 G/A 1 15 16 31 6.8177749854338 8.72770668220395 -1.90993169677016 A:G G A 10 0.545481667637747 0.589243588768345 ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523668:exon_48733695_48733904:CARD8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 48949286 G/T 1 28 27 55 12.7265133061431 14.7280050262192 -2.00149172007608 T:G G T 10 0.545481667637747 0.591305615312041 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48949062_48949449:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48949251_48949449:GRWD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 49339098 T/C 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 T:C T C 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000087076:ENST00000263278:exon_49339062_49339100:HSD17B14 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 49376582 G/A 1 38 58 96 17.2716966297656 31.6379367229893 -14.3662400932237 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00390755163578464 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 49377086 T/C 1 118 108 226 53.6331632187459 58.9120201048767 -5.27885688613082 T:C T C 10 0.545481667637747 0.504368193588369 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 49377242 G/C 1 158 141 299 71.813896513236 76.9129151369223 -5.09901862368635 A:C:G G C 10 0.545481667637747 0.561838959497498 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 49377319 A/G 1 113 140 253 51.3605715569346 76.3674334692846 -25.00686191235 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00192121127503195 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 49377436 G/C 1 103 107 210 46.8153882333121 58.3665384372389 -11.5511502039269 C:G G C 10 0.545481667637747 0.111435647663139 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 30 29 59 13.6355499708676 15.8189683614947 -2.18341839062707 A:G A G 10 0.545481667637747 0.602324844761245 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 42 56 98 19.0897699592146 30.5469733877138 -11.4572034284992 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0251472347524297 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 40 55 95 18.1807332944901 30.0014917200761 -11.820758425586 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0174534188378874 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 12 9 21 5.45421998834704 4.90933500873972 0.544884979607314 A:G A G 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 684 648 1332 310.890539335781 353.47212062926 -42.581581293479 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0193556921761745 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 49485548 G/A 1 15 13 28 6.8177749854338 7.09126167929071 -0.273486693856915 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 49513273 C/T 1 85 100 185 38.6340582507915 54.5481667637747 -15.9141085129832 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0218615518703294 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513230_49513323:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513230_49513428:RUVBL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 61 50 111 27.7256182740974 27.2740833818873 0.451534892210088 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 50310466 G/A 1 6 13 19 2.72710999417352 7.09126167929071 -4.36415168511719 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0629589987215586 ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50310126_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50310150_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50310154_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50310177_50310631:FUZ HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 50322482 C/G 1 20 12 32 9.09036664724506 6.54578001165296 2.5445866355921 C:G C G 10 0.545481667637747 0.382163131763023 ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312881:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50322429_50322553:MED25 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 50387750 G/C 1 41 28 69 18.6352516268524 15.2734866938569 3.36176493299546 C:G G C 10 0.545481667637747 0.468901963434377 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50387716_50387816:TBC1D17 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 50435998 C/T 1 295 148 443 134.082908046865 80.7312868103865 53.3516212364781 T:C C T 10 0.545481667637747 2.93449911224536e-07 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 22 13 35 9.99940331196957 7.09126167929071 2.90814163267886 A:G G A 10 0.545481667637747 0.396818936531709 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 50967686 G/A 1 1 14 15 0.454518332362253 7.63674334692846 -7.1822250145662 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00025134036294872 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50967603_50967789:MYBPC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 52376507 T/C 1 5 9 14 2.27259166181127 4.90933500873972 -2.63674334692846 T:C T C 10 0.545481667637747 0.185033796786841 ENSG00000161551:ENST00000301399:exon_52374535_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000440236:exon_52374555_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000420592:exon_52375252_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000451628:exon_52375710_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000342582:exon_52375785_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000458390:exon_52375803_52376959:ZNF577 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 52537576 T/G 1 8 1 9 3.63614665889802 0.545481667637747 3.09066499126028 T:G T G 10 0.545481667637747 0.0461109865564625 ENSG00000197619:ENST00000221315:exon_52536361_52538693:ZNF615 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 52793713 C/T 1 15 5 20 6.8177749854338 2.72740833818873 4.09036664724506 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0745910243039017 ENSG00000196214:ENST00000439461:exon_52793319_52795976:ZNF766;ENSG00000196214:ENST00000359102:exon_52793319_52795976:ZNF766 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 1 1 7 8 0.454518332362253 3.81837167346423 -3.36385334110198 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0271476654586150 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 53085659 C/T 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 T:C C T 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391786:exon_53085455_53085751:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 53085813 T/C 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 T:C T C 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 53086124 C/A 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 A:C C A 10 0.545481667637747 0.152855532002609 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 53911510 G/A 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:G G A 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000196417:ENST00000396408:exon_53910951_53915260:ZNF765 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 53958126 T/G 1 7 10 17 3.18162832653577 5.45481667637747 -2.2731883498417 T:G T G 10 0.545481667637747 0.332311875410834 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 53958263 G/A 1 12 6 18 5.45421998834704 3.27289000582648 2.18132998252055 A:G G A 10 0.545481667637747 0.350676066108478 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 53958798 G/T 1 8 7 15 3.63614665889802 3.81837167346423 -0.182225014566205 T:G G T 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 54080144 A/G 1 18 2 20 8.18132998252056 1.09096333527549 7.09036664724506 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00113502236838496 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 54677897 G/A 1 23 15 38 10.4539216443318 8.1822250145662 2.27169662976561 A:G G A 10 0.545481667637747 0.516781951791391 ENSG00000125505:ENST00000437868:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000245615:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000494142:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000431666:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000338624:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000449249:exon_54677768_54678125:MBOAT7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 54697079 C/T 1 18 18 36 8.18132998252056 9.81867001747944 -1.63734003495889 T:C C T 10 0.545481667637747 0.618217725988323 ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54697030_54697173:TSEN34 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 54705317 C/G 1 3 11 14 1.36355499708676 6.00029834401522 -4.63674334692846 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0151104593398819 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 54705340 C/G 1 3 10 13 1.36355499708676 5.45481667637747 -4.09126167929071 A:C:G C G 10 0.545481667637747 0.0265022743429481 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 55142739 A/C 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:C A C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142713_55142757:LILRB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 9 27 36 4.09066499126028 14.7280050262192 -10.6373400349589 T:C T C 10 0.545481667637747 0.000586415154844216 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 15 23 38 6.8177749854338 12.5460783556682 -5.72830337023439 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0728805352106327 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 55143491 G/T 1 19 26 45 8.63584831488281 14.1825233585814 -5.54667504369861 T:G G T 10 0.545481667637747 0.101611796226776 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 3 11 14 1.36355499708676 6.00029834401522 -4.63674334692846 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0151104593398819 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 A:G A G 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 55179364 A/G 1 14 14 28 6.36325665307154 7.63674334692846 -1.27348669385692 A:G A G 10 0.545481667637747 0.705678422974658 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55179324_55181810:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55179324_55179844:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55179324_55179855:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55179324_55179848:LILRB4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 55494881 C/G 1 11 2 13 4.99970165598478 1.09096333527549 3.90873832070929 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0470034688879142 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 55512232 C/A 1 11 1 12 4.99970165598478 0.545481667637747 4.45421998834704 A:C C A 10 0.545481667637747 0.0088305259647185 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 55512316 T/G 0 8 0 8 3.63614665889802 0 3.63614665889802 T T 10 0.545481667637747 0.0096600748165856 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 55559715 G/A 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55559697_55559909:RDH13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 55624113 G/A 1 12 10 22 5.45421998834704 5.45481667637747 -0.000596688030433334 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55624033_55624163:PPP1R12C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 56206102 G/A 1 23 26 49 10.4539216443318 14.1825233585814 -3.7286017142496 A:G G A 10 0.545481667637747 0.316431029480916 ENSG00000063245:ENST00000085079:exon_56206092_56206349:EPN1;ENSG00000063245:ENST00000270460:exon_56206092_56206349:EPN1;ENSG00000063245:ENST00000411543:exon_56206092_56206349:EPN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 57723007 G/C 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 C:G G C 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000083844:ENST00000263095:exon_57722722_57734212:ZNF264 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 57840547 A/G 1 6 8 14 2.72710999417352 4.36385334110198 -1.63674334692846 A:G A G 10 0.545481667637747 0.428770074510924 ENSG00000178229:ENST00000321545:exon_57839072_57842144:ZNF543 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 57946924 G/C 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 C:G G C 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57946693_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57946697_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000415248:exon_57946711_57946961:ZNF749 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 57956828 T/G 1 9 4 13 4.09066499126028 2.18192667055099 1.90873832070929 T:G T G 10 0.545481667637747 0.405734407269743 ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57954659_57957191:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57954659_57956853:ZNF749 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 58058536 A/G 1 10 6 16 4.54518332362253 3.27289000582648 1.27229331779605 A:G A G 10 0.545481667637747 0.620225311632925 ENSG00000251369:ENST00000506609:exon_58058343_58059361:ZNF550 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 58058739 T/C 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 T:C T C 10 0.545481667637747 0.523901512697289 ENSG00000251369:ENST00000506609:exon_58058343_58059361:ZNF550 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 58083467 C/T 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 T:C C T 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000083817:ENST00000196489:exon_58082935_58085069:ZNF416 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 58213952 C/A 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 A:C C A 10 0.545481667637747 0.782586339670189 ENSG00000249233:ENST00000512439:exon_58213003_58214156:ZNF154 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 58213969 T/G 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 T:G T G 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000249233:ENST00000512439:exon_58213003_58214156:ZNF154 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 58319906 C/G 1 19 9 28 8.63584831488281 4.90933500873972 3.72651330614308 C:G C G 10 0.545481667637747 0.185762714220775 ENSG00000178935:ENST00000391701:exon_58318450_58320471:ZNF552 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 58596449 C/T 1 8 1 9 3.63614665889802 0.545481667637747 3.09066499126028 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0461109865564625 ENSG00000176293:ENST00000515535:exon_58595587_58597677:ZNF135;ENSG00000121413:ENST00000240727:exon_58595210_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000433686:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000402070:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000421612:exon_58595212_58596743:ZSCAN18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 21 30 51 9.54488497960731 16.3644500291324 -6.8195650495251 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0668527832132588 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 58805783 C/T 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000083842:ENST00000196548:exon_58805464_58807254:ZNF8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 58806083 T/C 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000083842:ENST00000196548:exon_58805464_58807254:ZNF8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 58904396 G/A 1 1323 1357 2680 601.327753715261 740.218622984423 -138.890869269162 A:T:C:G G A 10 0.545481667637747 8.40296570578404e-08 ENSG00000083845:ENST00000196551:exon_58904343_58904552:RPS5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 59028585 G/A 1 9 3 12 4.09066499126028 1.63644500291324 2.45421998834704 A:G G A 10 0.545481667637747 0.245735735487388 ENSG00000119574:ENST00000354590:exon_59027762_59029040:ZBTB45 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 59058693 G/A 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 A:G G A 10 0.545481667637747 0.399015848289425 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 59061357 C/T 1 137 142 279 62.2690115336287 77.4583968045601 -15.1893852709314 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0713125539477577 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59061316_59061402:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59061316_59061402:TRIM28 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 59073613 A/G 1 17 7 24 7.7268116501583 3.81837167346423 3.90843997669407 A:G A G 10 0.545481667637747 0.150198498186465 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 19 59074429 C/T 1 8 9 17 3.63614665889802 4.90933500873972 -1.2731883498417 T:C C T 10 0.545481667637747 0.628894857051545 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 234197 C/T 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 T:C C T 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000035115:ENST00000403712:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000463865:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000403657:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000405430:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000473104:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000415006:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000356150:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000403658:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000468321:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000479739:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000451005:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000431160:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000488979:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000471948:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000481932:exon_234160_234231:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000488044:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000497051:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000475027:exon_234160_234272:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000454318:exon_234160_234272:SH3YL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 3391826 C/T 1 10 8 18 4.54518332362253 4.36385334110198 0.181329982520555 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 1 12 19 31 5.45421998834704 10.3641516851172 -4.90993169677016 T:C T C 10 0.545481667637747 0.103137911347106 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 3392295 A/G 1 22 24 46 9.99940331196957 13.0915600233059 -3.09215671133636 A:G A G 10 0.545481667637747 0.377437741297956 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 3425729 C/T 1 16 10 26 7.27229331779605 5.45481667637747 1.81747664141858 T:C C T 10 0.545481667637747 0.557013656890898 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3425652_3425741:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000457845:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000441983:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3425654_3425765:TTC15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 3428364 A/G 1 12 6 18 5.45421998834704 3.27289000582648 2.18132998252055 A:G A G 10 0.545481667637747 0.350676066108478 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3428296_3428434:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3428296_3428434:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3428296_3428434:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000457845:exon_3428296_3428434:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000441983:exon_3428296_3428434:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3428296_3428434:TTC15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 33 23 56 14.9991049679544 12.5460783556682 2.45302661228617 T:C C T 10 0.545481667637747 0.591933886776825 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 3504687 A/G 1 31 29 60 14.0900683032298 15.8189683614947 -1.72890005826482 A:G A G 10 0.545481667637747 0.698171928393748 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3504585_3504764:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3504585_3504764:ADI1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 6990020 C/T 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 T:C C T 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000134326:ENST00000256722:exon_6988447_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000478738:exon_6988449_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000491738:exon_6990020_6990104:CMPK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 10262920 T/G 1 50 66 116 22.7259166181127 36.0017900640913 -13.2758734459787 T:C:G T G 10 0.545481667637747 0.0151092217469494 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10262839_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10262866_10263184:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498343:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000463887:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10262879_10263024:RRM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 10712278 C/T 1 25 29 54 11.3629583090563 15.8189683614947 -4.45601005243834 T:C C T 10 0.545481667637747 0.274155460039748 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10710892_10712316:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10711781_10712316:NOL10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 15372562 C/T 1 8 8 16 3.63614665889802 4.36385334110198 -0.727706682203952 T:C C T 10 0.545481667637747 0.8039768822367 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15372546_15372635:NBAS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 15378808 C/G 1 11 15 26 4.99970165598478 8.1822250145662 -3.18252335858142 C:G C G 10 0.545481667637747 0.239869675139145 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15378592_15378810:NBAS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 15735648 T/C 1 27 22 49 12.2719949737808 12.0005966880304 0.271398285750397 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15735614_15735677:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15735614_15735677:DDX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 15747393 C/T 1 28 21 49 12.7265133061431 11.4551150203927 1.2713982857504 T:C C T 10 0.545481667637747 0.775192518121671 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15747299_15747437:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15747299_15747437:DDX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 20131079 T/C 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000118965:ENST00000345530:exon_20131030_20131170:WDR35;ENSG00000118965:ENST00000281405:exon_20131030_20131170:WDR35;ENSG00000118965:ENST00000416055:exon_20131030_20131170:WDR35;ENSG00000118965:ENST00000445063:exon_20131030_20131170:WDR35;ENSG00000118965:ENST00000414212:exon_20131030_20131170:WDR35 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 20234122 C/A 1 33 45 78 14.9991049679544 24.5466750436986 -9.54757007574426 A:C C A 10 0.545481667637747 0.0310741352361941 ENSG00000068697:ENST00000175091:exon_20234078_20234176:LAPTM4A;ENSG00000068697:ENST00000483117:exon_20234078_20234176:LAPTM4A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 20824559 C/T 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 20838318 G/A 1 7 1 8 3.18162832653577 0.545481667637747 2.63614665889802 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0793996161569039 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 24933809 G/A 1 15 13 28 6.8177749854338 7.09126167929071 -0.273486693856915 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24933800_24933980:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24933800_24933980:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24933800_24933980:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24933800_24933980:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24933800_24933980:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24933800_24933980:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000486198:exon_24933800_24934352:NCOA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 26590084 T/G 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 T:G T G 10 0.545481667637747 0.527815080970101 ENSG00000138018:ENST00000442141:exon_26590014_26590088:EPT1;ENSG00000138018:ENST00000407686:exon_26590014_26590088:EPT1;ENSG00000138018:ENST00000260585:exon_26590014_26590088:EPT1;ENSG00000138018:ENST00000447170:exon_26590014_26590088:EPT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 27260540 C/A 1 27 56 83 12.2719949737808 30.5469733877138 -18.274978413933 A:C C A 10 0.545481667637747 6.00856060681818e-05 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460904:exon_27260429_27260683:TMEM214 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 27429367 T/C 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27429351_27429402:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27429351_27429402:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27429351_27429402:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000412471:exon_27429351_27429402:SLC5A6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 27459364 T/C 1 8 14 22 3.63614665889802 7.63674334692846 -4.00059668803043 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0916744188680922 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27459152_27459391:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27459152_27459391:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27459152_27459391:CAD HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 27462076 C/T 1 20 19 39 9.09036664724506 10.3641516851172 -1.27378503787213 T:C C T 10 0.545481667637747 0.748640025630809 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27461986_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462020_27462100:CAD HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 27601917 G/T 1 16 14 30 7.27229331779605 7.63674334692846 -0.364450029132409 T:G G T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000163795:ENST00000323703:exon_27601334_27601921:ZNF513;ENSG00000163795:ENST00000407879:exon_27601334_27601921:ZNF513;ENSG00000163795:ENST00000426760:exon_27601751_27601921:ZNF513;ENSG00000163795:ENST00000436006:exon_27601598_27601921:ZNF513 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 27838058 C/A 1 5 15 20 2.27259166181127 8.1822250145662 -5.90963335275494 A:C C A 10 0.545481667637747 0.0116111943149808 ENSG00000243943:ENST00000416005:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000379717:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000355467:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000505973:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27838035_27838136:ZNF512 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 27887034 C/A 1 15 17 32 6.8177749854338 9.2731883498417 -2.4554133644079 A:C C A 10 0.545481667637747 0.478253507539261 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 29001691 A/G 1 26 38 64 11.8174766414186 20.7283033702344 -8.91082672881581 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0320949835965467 ENSG00000213639:ENST00000455580:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000420282:exon_29001675_29001865:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000441461:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000427786:exon_29001675_29001797:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000358506:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395367:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000296122:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395366:exon_29001675_29001905:PPP1CB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 29092679 T/C 1 11 19 30 4.99970165598478 10.3641516851172 -5.36445002913241 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0652662882408545 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 29092850 G/T 1 8 14 22 3.63614665889802 7.63674334692846 -4.00059668803043 T:G G T 10 0.545481667637747 0.0916744188680922 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 29152456 A/G 1 62 51 113 28.1801366064597 27.8195650495251 0.360571556934591 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29152445_29152576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000466067:exon_29152445_29152576:WDR43 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 32666411 T/C 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 T:C T C 10 0.545481667637747 0.152855532002609 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32666397_32666530:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32666397_32666530:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000444173:exon_32666397_32666503:BIRC6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 32689838 C/G 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 C:G C G 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32689577_32689891:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32689577_32689891:BIRC6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 32822957 G/A 1 20 18 38 9.09036664724506 9.81867001747944 -0.728303370234384 A:G G A 10 0.545481667637747 0.871215003267403 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32822818_32823035:BIRC6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 T:C C T 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 33759395 C/T 1 49 29 78 22.2713982857504 15.8189683614947 6.45242992425574 T:C C T 10 0.545481667637747 0.172081174262973 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33756792_33759467:RASGRP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 33764176 A/G 1 48 24 72 21.8168799533881 13.0915600233059 8.72531993008222 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0438720308051043 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33764164_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33764161_33764416:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33764161_33764390:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33764161_33765248:RASGRP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 36782886 G/A 1 7 1 8 3.18162832653577 0.545481667637747 2.63614665889802 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0793996161569039 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36782805_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000414288:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000475815:exon_36782826_36786398:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000441005:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000432869:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487919:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487282:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000484205:exon_36782432_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36782831_36782891:FEZ2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 37241050 G/A 1 8 11 19 3.63614665889802 6.00029834401522 -2.36415168511719 A:G G A 10 0.545481667637747 0.357710103923903 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37240984_37241163:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37240984_37241163:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000471051:exon_37240984_37241138:HEATR5B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 37304144 G/C 1 2 7 9 0.909036664724506 3.81837167346423 -2.90933500873972 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0890372070351746 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37304054_37304162:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37304054_37304162:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000424416:exon_37304054_37304162:HEATR5B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 37454767 A/G 1 45 36 81 20.4533249563014 19.6373400349589 0.815984921342498 A:G A G 10 0.545481667637747 0.911364946703472 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37454687_37456179:CEBPZ HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 37458668 G/A 1 31 35 66 14.0900683032298 19.0918583673211 -5.0017900640913 A:G G A 10 0.545481667637747 0.219293619668146 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 37471114 C/A 1 19 10 29 8.63584831488281 5.45481667637747 3.18103163850534 A:C C A 10 0.545481667637747 0.266845155834917 ENSG00000003509:ENST00000455230:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000414639:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37471054_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000336237:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000431821:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000483999:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000439218:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474257:exon_37471006_37471116:C2orf56 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 37494591 A/G 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 A:G A G 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000469275:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000452104:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000443977:exon_37494573_37494679:PRKD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 37505105 T/G 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 T:G T G 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37505009_37505132:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37505009_37505132:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000469275:exon_37505009_37506533:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000494667:exon_37505009_37505132:PRKD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 37506939 A/G 1 3 6 9 1.36355499708676 3.27289000582648 -1.90933500873972 A:G A G 10 0.545481667637747 0.316116386178568 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37506889_37507072:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37506889_37507072:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000494667:exon_37506889_37507072:PRKD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 38302390 G/C 1 4 8 12 1.81807332944901 4.36385334110198 -2.54578001165296 C:G G C 10 0.545481667637747 0.157407748991045 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38301489_38302532:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38301489_38302532:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000490576:exon_38302102_38302532:CYP1B1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 39025555 G/A 1 13 11 24 5.90873832070929 6.00029834401522 -0.0915600233059273 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39024871_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000423682:exon_39025515_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39024878_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39025110_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39025422_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000477981:exon_39025494_39025584:DHX57 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 39050141 A/C 1 11 6 17 4.99970165598478 3.27289000582648 1.7268116501583 A:C A C 10 0.545481667637747 0.471137770776418 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39050135_39050411:DHX57 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 44004010 T/C 1 9 11 20 4.09066499126028 6.00029834401522 -1.90963335275494 T:C T C 10 0.545481667637747 0.501706253434889 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000496980:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000406852:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000479242:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000398823:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000462426:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44003962_44004038:DYNC2LI1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 15 14 29 6.8177749854338 7.63674334692846 -0.818968361494663 T:C T C 10 0.545481667637747 0.852670497525973 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 44201376 T/C 1 74 79 153 33.6343565948067 43.093051743382 -9.45869514857529 T:C T C 10 0.545481667637747 0.143687773476053 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44201289_44201434:LRPPRC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 44547574 G/A 1 20 14 34 9.09036664724506 7.63674334692846 1.4536233003166 A:G G A 10 0.545481667637747 0.731216270033085 ENSG00000138079:ENST00000260649:exon_44547338_44548633:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409380:exon_44547338_44547960:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409740:exon_44547338_44547937:SLC3A1;ENSG00000138078:ENST00000425263:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000426481:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409957:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409411:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409936:exon_44545905_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000444696:exon_44547405_44547782:PREPL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 46986416 A/G 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:G A G 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000171150:ENST00000306503:exon_46985658_46990268:SOCS5;ENSG00000171150:ENST00000394861:exon_46985658_46989452:SOCS5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 47220622 G/A 1 12 13 25 5.45421998834704 7.09126167929071 -1.63704169094367 A:G G A 10 0.545481667637747 0.550995061740953 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000474321:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47220589_47220667:TTC7A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 17 23 40 7.7268116501583 12.5460783556682 -4.81926670550988 A:G A G 10 0.545481667637747 0.152670821940794 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 20 18 38 9.09036664724506 9.81867001747944 -0.728303370234384 A:T A T 10 0.545481667637747 0.871215003267403 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 54133744 T/C 1 10 19 29 4.54518332362253 10.3641516851172 -5.81896836149466 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0388996764246589 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54133735_54133830:PSME4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 54150237 A/G 1 13 5 18 5.90873832070929 2.72740833818873 3.18132998252055 A:G A G 10 0.545481667637747 0.158872164572138 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54150186_54150255:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54150186_54150255:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54150186_54150255:PSME4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 55201038 C/T 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000115310:ENST00000491592:exon_55200699_55201155:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000485749:exon_55200957_55201327:RTN4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 55277226 C/T 1 44 37 81 19.9988066239391 20.1828217025966 -0.184015078657506 T:C:G C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000115310:ENST00000337526:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000317610:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000357732:exon_55276881_55277680:RTN4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 55460001 C/T 1 24 50 74 10.9084399766941 27.2740833818873 -16.3656434051933 T:C C T 10 0.545481667637747 0.000154446868865993 ENSG00000143947:ENST00000402285:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000272317:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000449323:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000497083:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000404735:exon_55459814_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000463185:exon_55459944_55460505:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000471772:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000478196:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000494756:exon_55459830_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000495843:exon_55459931_55460008:RPS27A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 37 14 51 16.8171782974034 7.63674334692846 9.1804349504749 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0108589973189348 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 55481322 T/A 1 39 48 87 17.7262149621279 26.1831200466119 -8.45690508448399 A:T T A 10 0.545481667637747 0.0843837562774066 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55481177_55481337:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55481177_55481337:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55481177_55481337:MTIF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 35 33 68 15.9081416326789 18.0008950320457 -2.0927533993668 T:G G T 10 0.545481667637747 0.627860733880965 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 55559764 C/T 1 25 29 54 11.3629583090563 15.8189683614947 -4.45601005243834 T:C C T 10 0.545481667637747 0.274155460039748 ENSG00000115355:ENST00000336838:exon_55559702_55559829:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000263630:exon_55559702_55559829:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000436346:exon_55559702_55559829:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000413716:exon_55559702_55559829:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000422883:exon_55559702_55559829:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000426576:exon_55559702_55559829:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000468534:exon_55559551_55559829:CCDC88A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 33 33 66 14.9991049679544 18.0008950320457 -3.0017900640913 T:C T C 10 0.545481667637747 0.46145209131823 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 55883317 G/T 1 13 10 23 5.90873832070929 5.45481667637747 0.45392164433182 T:G G T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415489:exon_55883266_55883355:PNPT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 55912120 T/C 1 10 12 22 4.54518332362253 6.54578001165296 -2.00059668803043 T:C T C 10 0.545481667637747 0.401468669837045 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000429805:exon_55912078_55912183:PNPT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 60689441 T/C 1 8 3 11 3.63614665889802 1.63644500291324 1.99970165598478 T:C T C 10 0.545481667637747 0.364801401986479 ENSG00000119866:ENST00000356842:exon_60687817_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000359629:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000378117:exon_60688487_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000489516:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000492272:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000335712:exon_60684333_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000477659:exon_60686955_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000358510:exon_60687409_60689559:BCL11A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 61459626 C/T 1 12 8 20 5.45421998834704 4.36385334110198 1.09036664724506 T:C C T 10 0.545481667637747 0.660941894453713 ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61459587_61459667:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61459587_61459667:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61459587_61459667:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61459587_61459667:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61459587_61459667:USP34;ENSG00000115464:ENST00000463046:exon_61459587_61459667:USP34;ENSG00000115464:ENST00000453734:exon_61459587_61459667:USP34 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 64327544 G/T 1 41 32 73 18.6352516268524 17.4554133644079 1.17983826244447 T:G G T 10 0.545481667637747 0.81502271630775 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 64327592 T/C 1 16 15 31 7.27229331779605 8.1822250145662 -0.909931696770157 T:C T C 10 0.545481667637747 0.857266052198222 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 65495887 G/A 1 315 260 575 143.17327469411 141.825233585814 1.34804110829549 A:G G A 10 0.545481667637747 0.933271201089719 ENSG00000138071:ENST00000260641:exon_65495698_65498387:ACTR2;ENSG00000138071:ENST00000377982:exon_65495698_65497280:ACTR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 67630980 G/A 1 10 9 19 4.54518332362253 4.90933500873972 -0.364151685117192 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 67631831 G/A 1 29 17 46 13.1810316385053 9.2731883498417 3.90784328866364 A:G G A 10 0.545481667637747 0.300259540488475 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 67632125 C/T 1 9 10 19 4.09066499126028 5.45481667637747 -1.36415168511719 T:C C T 10 0.545481667637747 0.646474994475887 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 177 189 366 80.4497448281188 103.096035183534 -22.6462903554154 T:G G T 10 0.545481667637747 0.0181535807007446 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 265 148 413 120.447358075997 80.7312868103865 39.7160712656105 C:G G C 10 0.545481667637747 9.04788222261461e-05 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 68622990 T/C 1 294 172 466 133.628389714502 93.8228468336925 39.8055428808099 T:C T C 10 0.545481667637747 0.000230325502763623 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 101 88 189 45.9063515685876 48.0023867521217 -2.09603518353418 A:G G A 10 0.545481667637747 0.770552326284448 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 71221822 A/G 1 6 11 17 2.72710999417352 6.00029834401522 -3.2731883498417 A:G A G 10 0.545481667637747 0.143847339286626 ENSG00000144043:ENST00000453130:exon_71221818_71221879:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000272438:exon_71221818_71222075:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000433258:exon_71221818_71221962:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000466731:exon_71221771_71221834:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000489894:exon_71221818_71221933:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000473055:exon_71221818_71222003:TEX261 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 71305456 C/T 1 44 24 68 19.9988066239391 13.0915600233059 6.9072466006332 T:C C T 10 0.545481667637747 0.1128329086466 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71305448_71305484:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 71337203 C/T 1 38 26 64 17.2716966297656 14.1825233585814 3.08917327118419 T:C C T 10 0.545481667637747 0.454461380081613 ENSG00000124370:ENST00000413592:exon_71336814_71337252:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71336814_71337252:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000462609:exon_71336944_71337252:MCEE HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 71351487 G/A 1 25 18 43 11.3629583090563 9.81867001747944 1.54428829157688 A:G G A 10 0.545481667637747 0.650218906276211 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000494660:exon_71351477_71351673:MCEE HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 34 27 61 15.4536233003166 14.7280050262192 0.725618274097435 A:C A C 10 0.545481667637747 0.898173042348068 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 35 49 84 15.9081416326789 26.7286017142496 -10.8204600815707 A:T:G G T 10 0.545481667637747 0.0209788021874304 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 30 21 51 13.6355499708676 11.4551150203927 2.1804349504749 A:G G A 10 0.545481667637747 0.576183760718556 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 60 42 102 27.2710999417352 22.9102300407854 4.36086990094981 A:G G A 10 0.545481667637747 0.426782021280477 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 71377014 G/A 1 34 58 92 15.4536233003166 31.6379367229893 -16.1843134226727 A:G G A 10 0.545481667637747 0.000757970904418695 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 71591148 C/T 1 10 14 24 4.54518332362253 7.63674334692846 -3.09156002330593 T:C C T 10 0.545481667637747 0.223659279774392 ENSG00000075292:ENST00000494621:exon_71591084_71591382:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000466975:exon_71591084_71591382:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000410075:exon_71591084_71591382:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000466330:exon_71591084_71591382:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71591084_71591382:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71591084_71591382:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000377802:exon_71591084_71591382:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000464375:exon_71591084_71591382:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000475743:exon_71591084_71591382:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71591084_71591382:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71591084_71591382:ZNF638 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 73490412 A/G 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000163013:ENST00000295133:exon_73490341_73490436:FBXO41;ENSG00000163013:ENST00000521871:exon_73490341_73490436:FBXO41 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 73679280 A/G 1 3 7 10 1.36355499708676 3.81837167346423 -2.45481667637747 A:G A G 10 0.545481667637747 0.201970346156534 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000377715:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000443750:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73678824_73681194:ALMS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 73679990 T/A 1 2 7 9 0.909036664724506 3.81837167346423 -2.90933500873972 A:T T A 10 0.545481667637747 0.0890372070351746 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000377715:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000443750:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73678824_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73679852_73681194:ALMS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 20 38 58 9.09036664724506 20.7283033702344 -11.6379367229893 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00230888925595511 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 109 118 227 49.5424982274856 64.3668367812541 -14.8243385537686 A:T:C A T 10 0.545481667637747 0.0530890075170459 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 74300717 T/C 1 9 3 12 4.09066499126028 1.63644500291324 2.45421998834704 T:C T C 10 0.545481667637747 0.245735735487388 ENSG00000187605:ENST00000475405:exon_74300676_74300766:TET3;ENSG00000187605:ENST00000409262:exon_74300676_74300766:TET3;ENSG00000187605:ENST00000233310:exon_74300676_74300766:TET3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 74328439 G/C 1 9 1 10 4.09066499126028 0.545481667637747 3.54518332362253 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0266590352665392 ENSG00000187605:ENST00000409262:exon_74327520_74329698:TET3;ENSG00000187605:ENST00000233310:exon_74327520_74328640:TET3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 74657782 C/T 1 8 3 11 3.63614665889802 1.63644500291324 1.99970165598478 T:C C T 10 0.545481667637747 0.364801401986479 ENSG00000114993:ENST00000305557:exon_74657743_74657804:RTKN;ENSG00000114993:ENST00000272430:exon_74657743_74657804:RTKN;ENSG00000114993:ENST00000233330:exon_74657743_74657804:RTKN;ENSG00000114993:ENST00000393983:exon_74657743_74657804:RTKN;ENSG00000114993:ENST00000437544:exon_74657743_74657804:RTKN;ENSG00000114993:ENST00000469859:exon_74657743_74658056:RTKN;ENSG00000114993:ENST00000479256:exon_74657743_74657804:RTKN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 42 49 91 19.0897699592146 26.7286017142496 -7.63883175503497 A:G G A 10 0.545481667637747 0.114836830748367 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 46 46 92 20.9078432886636 25.0921567113364 -4.18431342267272 A:T:C C T 10 0.545481667637747 0.403221094029273 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 90 76 166 40.9066499126028 41.4566067404688 -0.549956827865998 A:C C A 10 0.545481667637747 0.938029989259154 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 74710491 C/T 1 17 23 40 7.7268116501583 12.5460783556682 -4.81926670550988 T:C C T 10 0.545481667637747 0.152670821940794 ENSG00000135637:ENST00000474681:exon_74710195_74710535:CCDC142;ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463704:exon_74710449_74710832:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74710449_74710690:TTC31 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 74761539 T/A 1 25 28 53 11.3629583090563 15.2734866938569 -3.91052838480059 A:T T A 10 0.545481667637747 0.334383049319745 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74761443_74761558:LOXL3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 75115108 A/G 1 9 13 22 4.09066499126028 7.09126167929071 -3.00059668803043 A:G A G 10 0.545481667637747 0.207242496035041 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75115030_75115185:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75115030_75115185:HK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 75882399 G/A 1 86 51 137 39.0885765831538 27.8195650495251 11.2690115336287 A:T:C:G G A 10 0.545481667637747 0.0588854205887396 ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75882190_75884986:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75882190_75882428:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000453233:exon_75882190_75882428:MRPL19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 75915035 C/T 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75914953_75915103:C2orf3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 75923413 T/C 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 T:C T C 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000442309:exon_75923378_75923441:C2orf3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 86371883 T/C 1 80 96 176 36.3614665889802 52.3662400932237 -16.0047735042435 T:C:G T C 10 0.545481667637747 0.0186958178740978 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86371063_86372004:IMMT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 86400824 G/A 1 60 52 112 27.2710999417352 28.3650467171628 -1.09394677542766 A:C:G G A 10 0.545481667637747 0.849940706218176 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86400773_86400885:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86400631_86400884:IMMT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 86433240 C/T 1 50 62 112 22.7259166181127 33.8198633935403 -11.0939467754277 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0369862424524909 ENSG00000132313:ENST00000254644:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000337109:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000409180:exon_86433229_86433418:MRPL35 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 86683642 A/G 1 9 9 18 4.09066499126028 4.90933500873972 -0.818670017479445 A:G A G 10 0.545481667637747 0.814103892547842 ENSG00000115548:ENST00000409556:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000312912:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000441719:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000409064:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000463013:exon_86683565_86683778:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000488971:exon_86683556_86683689:KDM3A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 86979093 G/A 1 15 5 20 6.8177749854338 2.72740833818873 4.09036664724506 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0745910243039017 ENSG00000153561:ENST00000283632:exon_86979019_86979153:RMND5A;ENSG00000153561:ENST00000466417:exon_86979019_86979153:RMND5A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 89156948 C/G 1 5320 2280 7600 2418.03752816719 1243.69820221406 1174.33932595312 A:T:C:G C G 10 0.545481667637747 5.34989390857482e-167 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 89160096 T/C 1 19 17 36 8.63584831488281 9.2731883498417 -0.637340034958891 T:C T C 10 0.545481667637747 0.86810856223121 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 89160371 G/C 1 12 19 31 5.45421998834704 10.3641516851172 -4.90993169677016 C:G G C 10 0.545481667637747 0.103137911347106 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 89160701 A/C 0 10 0 10 4.54518332362253 0 4.54518332362253 A A 10 0.545481667637747 0.00270867480271896 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 89160714 T/A 1 10 7 17 4.54518332362253 3.81837167346423 0.726811650158302 A:T T A 10 0.545481667637747 0.810670786245774 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 89161052 T/G 1 3152 19 3171 1432.64178360582 10.3641516851172 1422.2776319207 A:T:C:G T G 10 0.545481667637747 0 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 89161113 C/G 1 20 27 47 9.09036664724506 14.7280050262192 -5.63763837897411 C:G C G 10 0.545481667637747 0.108035376708810 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 89185520 C/T 1 15 5 20 6.8177749854338 2.72740833818873 4.09036664724506 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0745910243039017 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 96684975 C/T 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 T:C C T 10 0.545481667637747 0.523901512697289 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 96685307 G/A 1 3 7 10 1.36355499708676 3.81837167346423 -2.45481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.201970346156534 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 96789787 T/C 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000188886:ENST00000342380:exon_96789589_96790010:ASTL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 96944553 G/A 1 70 67 137 31.8162832653577 36.547271731729 -4.73098846637134 A:C:G G A 10 0.545481667637747 0.440508950347576 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000484372:exon_96944547_96944736:SNRNP200 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 97213229 G/T 1 45 38 83 20.4533249563014 20.7283033702344 -0.274978413932999 T:G G T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000196843:ENST00000359765:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000470579:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000357485:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000412735:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000467498:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000454558:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000497920:exon_97213127_97213254:ARID5A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 99978048 G/A 1 169 140 309 76.8135981692208 76.3674334692846 0.44616469993619 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99977611_99978283:EIF5B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 99995517 C/T 1 138 133 271 62.7235298659909 72.5490617958204 -9.82553192982943 T:C C T 10 0.545481667637747 0.246490428905488 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995482_99995589:EIF5B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 100019495 C/T 1 18 23 41 8.18132998252056 12.5460783556682 -4.36474837314763 T:C C T 10 0.545481667637747 0.209363873419243 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 100020945 C/T 1 22 23 45 9.99940331196957 12.5460783556682 -2.54667504369861 T:C C T 10 0.545481667637747 0.458001602818798 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100020907_100021140:REV1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 100058870 C/T 1 7 10 17 3.18162832653577 5.45481667637747 -2.2731883498417 T:C C T 10 0.545481667637747 0.332311875410834 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100058779_100058931:REV1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 101635538 C/T 1 42 8 50 19.0897699592146 4.36385334110198 14.7259166181127 T:C C T 10 0.545481667637747 2.18384696775985e-05 ENSG00000071082:ENST00000409028:exon_101635460_101636078:RPL31 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 101898412 G/C 1 17 16 33 7.7268116501583 8.72770668220395 -1.00089503204565 C:G G C 10 0.545481667637747 0.730455650391869 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000490553:exon_101897955_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000463726:exon_101898321_101898519:RNF149 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 105889349 G/A 1 11 9 20 4.99970165598478 4.90933500873972 0.0903666472450606 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 105897003 G/A 1 9 11 20 4.09066499126028 6.00029834401522 -1.90963335275494 A:G G A 10 0.545481667637747 0.501706253434889 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105896839_105897180:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105896839_105897180:TGFBRAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 109088275 G/A 1 23 13 36 10.4539216443318 7.09126167929071 3.36265996504111 A:G G A 10 0.545481667637747 0.316052667885887 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000409896:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000462897:exon_109088270_109088572:GCC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 113067636 C/T 1 6 8 14 2.72710999417352 4.36385334110198 -1.63674334692846 T:C C T 10 0.545481667637747 0.428770074510924 ENSG00000188177:ENST00000409871:exon_113067462_113067738:ZC3H6;ENSG00000188177:ENST00000343936:exon_113067462_113067738:ZC3H6;ENSG00000188177:ENST00000476511:exon_113067462_113067738:ZC3H6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 113346480 G/A 1 26 28 54 11.8174766414186 15.2734866938569 -3.45601005243834 A:G G A 10 0.545481667637747 0.412505555030716 ENSG00000125611:ENST00000324913:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000454841:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000409719:exon_113343777_113346852:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000469030:exon_113346443_113346617:CHCHD5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 113404708 G/A 1 9 18 27 4.09066499126028 9.81867001747944 -5.72800502621917 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0326964877481770 ENSG00000144136:ENST00000272542:exon_113404140_113404739:SLC20A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 113417057 G/A 1 73 6 79 33.1798382624445 3.27289000582648 29.906948256618 A:G G A 10 0.545481667637747 2.33526837750493e-13 ENSG00000144136:ENST00000272542:exon_113416781_113417339:SLC20A1;ENSG00000144136:ENST00000409095:exon_113416781_113417339:SLC20A1;ENSG00000144136:ENST00000490674:exon_113415940_113417339:SLC20A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 113940730 T/C 1 40 31 71 18.1807332944901 16.9099316967702 1.27080159771997 T:C T C 10 0.545481667637747 0.812206084599261 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 108 67 175 49.0879798951233 36.547271731729 12.5407081633943 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0580062267017119 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 120129886 G/A 1 1060 910 1970 481.789432303988 496.38831755035 -14.5988852463615 A:T:C:G G A 10 0.545481667637747 0.511826889316818 ENSG00000155368:ENST00000355857:exon_120129821_120130126:DBI;ENSG00000155368:ENST00000409094:exon_120129821_120130057:DBI;ENSG00000155368:ENST00000311521:exon_120129821_120130122:DBI;ENSG00000155368:ENST00000460901:exon_120129821_120130030:DBI;ENSG00000155368:ENST00000393103:exon_120129821_120129983:DBI;ENSG00000155368:ENST00000475783:exon_120129821_120130076:DBI HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 122106262 T/G 1 15 8 23 6.8177749854338 4.36385334110198 2.45392164433182 T:G T G 10 0.545481667637747 0.403122215406532 ENSG00000074054:ENST00000429969:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000442289:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000263710:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000455322:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000397587:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000376194:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000409078:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000452274:exon_122106088_122106294:CLASP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 122125373 G/T 1 17 12 29 7.7268116501583 6.54578001165296 1.18103163850534 T:G G T 10 0.545481667637747 0.712372034204297 ENSG00000074054:ENST00000429969:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000442289:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000263710:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000455322:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000397587:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000376194:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000409078:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000452274:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000472776:exon_122125164_122125407:CLASP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 145 153 298 65.9051581925267 83.4586951485753 -17.5535369560486 A:C A C 10 0.545481667637747 0.0418716421741385 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 127816695 C/T 1 19 17 36 8.63584831488281 9.2731883498417 -0.637340034958891 T:C C T 10 0.545481667637747 0.86810856223121 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127816587_127816731:BIN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 127821207 G/A 1 18 16 34 8.18132998252056 8.72770668220395 -0.546376699683396 A:G G A 10 0.545481667637747 0.864897162102258 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127821147_127821222:BIN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 15 18 33 6.8177749854338 9.81867001747944 -3.00089503204565 A:G A G 10 0.545481667637747 0.300591355607069 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 128047101 C/G 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000163161:ENST00000494464:exon_128046913_128047400:ERCC3;ENSG00000163161:ENST00000460485:exon_128046952_128047400:ERCC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 128608184 C/T 1 20 25 45 9.09036664724506 13.6370416909437 -4.54667504369861 T:C C T 10 0.545481667637747 0.180913272368107 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 128757658 G/C 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000136715:ENST00000259235:exon_128757630_128757720:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000357702:exon_128757630_128757720:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000259234:exon_128757630_128757720:SAP130 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 128934400 T/C 1 15 5 20 6.8177749854338 2.72740833818873 4.09036664724506 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0745910243039017 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128934388_128934472:UGGT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 128939799 C/T 1 8 11 19 3.63614665889802 6.00029834401522 -2.36415168511719 T:C C T 10 0.545481667637747 0.357710103923903 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 9 16 25 4.09066499126028 8.72770668220395 -4.63704169094367 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0715909203080173 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 135893372 A/G 1 40 36 76 18.1807332944901 19.6373400349589 -1.45660674046877 A:G A G 10 0.545481667637747 0.731621989584265 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 136107777 G/A 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 A:G G A 10 0.545481667637747 0.523901512697289 ENSG00000121988:ENST00000283060:exon_136107554_136107785:ZRANB3;ENSG00000121988:ENST00000401392:exon_136107554_136107785:ZRANB3;ENSG00000121988:ENST00000264159:exon_136107554_136107785:ZRANB3;ENSG00000121988:ENST00000403017:exon_136107554_136107785:ZRANB3;ENSG00000121988:ENST00000452187:exon_136107554_136107785:ZRANB3;ENSG00000121988:ENST00000397448:exon_136107554_136107785:ZRANB3;ENSG00000121988:ENST00000472452:exon_136107554_136107785:ZRANB3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 136393658 A/G 1 22 14 36 9.99940331196957 7.63674334692846 2.36265996504111 A:G A G 10 0.545481667637747 0.504501807695613 ENSG00000048991:ENST00000422577:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000456040:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000486532:exon_136393658_136393753:R3HDM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 136409574 A/C 1 13 13 26 5.90873832070929 7.09126167929071 -1.18252335858142 A:C A C 10 0.545481667637747 0.696126980810445 ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000429703:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000487294:exon_136409300_136409591:R3HDM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 136511817 A/G 1 32 29 61 14.5445866355921 15.8189683614947 -1.27438172590256 A:G A G 10 0.545481667637747 0.79753304015901 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136511109_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000470687:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136511722_136511847:UBXN4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 144194565 C/T 1 45 17 62 20.4533249563014 9.2731883498417 11.1801366064597 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0046931533329899 ENSG00000075884:ENST00000295095:exon_144194482_144194611:ARHGAP15;ENSG00000075884:ENST00000469117:exon_144194482_144194611:ARHGAP15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 148716428 T/C 1 10 12 22 4.54518332362253 6.54578001165296 -2.00059668803043 T:C T C 10 0.545481667637747 0.401468669837045 ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000461711:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148716161_148716435:ORC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 149447942 C/T 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 T:C C T 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000135999:ENST00000457184:exon_149447783_149447942:EPC2;ENSG00000135999:ENST00000258484:exon_149447783_149447942:EPC2;ENSG00000135999:ENST00000409654:exon_149447783_149447942:EPC2;ENSG00000135999:ENST00000397424:exon_149447783_149447942:EPC2;ENSG00000135999:ENST00000449013:exon_149447783_149447942:EPC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 150432976 C/T 1 105 117 222 47.7244248980366 63.8213551136164 -16.0969302155798 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0310795628037579 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150432951_150432992:MMADHC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 150438708 T/G 1 101 114 215 45.9063515685876 62.1849101107032 -16.2785585421156 T:C:G T G 10 0.545481667637747 0.0282722824509227 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150438641_150438785:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150438641_150438785:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150438641_150438785:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150438641_150438785:MMADHC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 152954912 T/C 1 1 8 9 0.454518332362253 4.36385334110198 -3.90933500873972 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0140456952017061 ENSG00000182389:ENST00000339254:exon_152954844_152954927:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000439467:exon_152954844_152954975:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000427385:exon_152954844_152954927:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000201943:exon_152954844_152954927:CACNB4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 160112881 G/T 1 7 15 22 3.18162832653577 8.1822250145662 -5.00059668803043 T:G G T 10 0.545481667637747 0.0514213814172012 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160112707_160112886:WDSUB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 160604379 C/T 1 45 43 88 20.4533249563014 23.4557117084231 -3.00238675212173 T:C:G C T 10 0.545481667637747 0.522916030341431 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 160604452 C/T 1 57 40 97 25.9075449446484 21.8192667055099 4.08827823913854 T:C C T 10 0.545481667637747 0.416752573519145 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 160604768 G/A 1 56 70 126 25.4530266122862 38.1837167346423 -12.7306901223561 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0251383260404947 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 160663678 T/C 1 6 12 18 2.72710999417352 6.54578001165296 -3.81867001747945 T:C T C 10 0.545481667637747 0.095953636396545 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 160673526 A/G 1 54 67 121 24.5439899475617 36.547271731729 -12.0032817841674 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0353199259167049 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 160737621 C/T 1 36 34 70 16.3626599650411 18.5463766996834 -2.18371673464229 T:C C T 10 0.545481667637747 0.632207266489053 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 160738677 G/A 1 43 22 65 19.5442882915769 12.0005966880304 7.54369160354645 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0625137793022189 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 160743040 T/A 1 30 35 65 13.6355499708676 19.0918583673211 -5.45630839645355 A:T T A 10 0.545481667637747 0.212610839137450 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160742931_160743041:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160742931_160743041:RP11-357L2.1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 104 100 204 47.2699065656743 54.5481667637747 -7.27826019810038 T:C C T 10 0.545481667637747 0.325153230504379 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 163137871 C/G 1 56 34 90 25.4530266122862 18.5463766996834 6.90664991260277 C:G C G 10 0.545481667637747 0.168563521299772 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 163137983 T/C 1 28 25 53 12.7265133061431 13.6370416909437 -0.910528384800589 T:C T C 10 0.545481667637747 0.89046873383244 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 169952233 T/C 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000073737:ENST00000419279:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000327239:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000357546:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000428522:exon_169952054_169952672:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000421653:exon_169952054_169952277:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000432060:exon_169952054_169952430:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000436483:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000412271:exon_169952054_169952677:DHRS9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 172291616 C/T 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000115827:ENST00000468592:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000375255:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000436317:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000490217:exon_172291593_172291696:DCAF17 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 172725301 A/G 1 13 3 16 5.90873832070929 1.63644500291324 4.27229331779605 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0422836204844924 ENSG00000115840:ENST00000422440:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000392592:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000263812:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000426896:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000475360:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000472748:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000484227:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000464063:exon_172725191_172725333:SLC25A12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 175213578 C/T 1 73 61 134 33.1798382624445 33.2743817259026 -0.0945434634580948 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000138433:ENST00000414336:exon_175212749_175213900:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000342016:exon_175212750_175213900:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000362053:exon_175212878_175213900:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000425101:exon_175213124_175213900:CIR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 182374534 A/G 1 10 25 35 4.54518332362253 13.6370416909437 -9.09185836732114 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00326843080409186 ENSG00000115232:ENST00000425522:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000490435:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000476824:exon_182374385_182374534:ITGA4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 182399097 T/C 1 27 19 46 12.2719949737808 10.3641516851172 1.90784328866364 T:C T C 10 0.545481667637747 0.657641333184872 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 182780126 G/A 1 12 24 36 5.45421998834704 13.0915600233059 -7.63734003495889 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0118035427282257 ENSG00000138434:ENST00000431877:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000320370:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000409001:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000261006:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000428267:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000454579:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000440623:exon_182779943_182781732:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000416081:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000491720:exon_182779943_182783402:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000409136:exon_182779943_182781154:SSFA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 190323530 A/G 1 15 10 25 6.8177749854338 5.45481667637747 1.36295830905633 A:G A G 10 0.545481667637747 0.68954281062682 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190323479_190323598:WDR75 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 190788123 G/T 0 511 0 511 232.258867837111 0 232.258867837111 G G 10 0.545481667637747 4.3932937064592e-135 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 191064753 C/T 1 7 19 26 3.18162832653577 10.3641516851172 -7.18252335858142 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00533672310501436 ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 191161622 T/C 1 13 18 31 5.90873832070929 9.81867001747944 -3.90993169677015 T:C T C 10 0.545481667637747 0.206175558984211 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000409934:exon_191161539_191161679:HIBCH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 191224981 G/T 1 12 6 18 5.45421998834704 3.27289000582648 2.18132998252055 T:G G T 10 0.545481667637747 0.350676066108478 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 191231503 G/A 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191231421_191231584:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191231421_191231621:INPP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 197010698 A/T 1 20 17 37 9.09036664724506 9.2731883498417 -0.182821702596637 A:T A T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197010635_197010779:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197010635_197010779:STK17B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 197021276 T/C 1 14 24 38 6.36325665307154 13.0915600233059 -6.72830337023438 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0336229725029575 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 98 99 197 44.5427965715008 54.002685096137 -9.45988852463616 T:C T C 10 0.545481667637747 0.197690157772983 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 103 96 199 46.8153882333121 52.3662400932237 -5.55085185991165 A:C:G A G 10 0.545481667637747 0.434478955862373 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 131 110 241 59.5419015394551 60.0029834401522 -0.461081900697017 T:C T C 10 0.545481667637747 0.94854749016711 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 198327314 G/A 1 5 11 16 2.27259166181127 6.00029834401522 -3.72770668220395 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0783621541065292 ENSG00000115520:ENST00000263960:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409398:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409010:exon_198327263_198327455:COQ10B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 266 262 528 120.901876408359 142.91619692109 -22.0143205127304 A:T:C T C 10 0.545481667637747 0.0546243926396736 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 129 140 269 58.6328648747306 76.3674334692846 -17.7345685945539 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0320367147979676 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 198571709 T/C 1 13 16 29 5.90873832070929 8.72770668220395 -2.81896836149466 T:C T C 10 0.545481667637747 0.352077308499086 ENSG00000152428:ENST00000282276:exon_198570087_198573109:MARS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 201397724 G/A 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000163535:ENST00000418045:exon_201397697_201397831:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201397697_201397831:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201397697_201397831:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000409203:exon_201397697_201397831:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000460534:exon_201397697_201398098:SGOL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 202626242 C/T 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 T:C C T 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000003393:ENST00000264276:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000457679:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000482891:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000482789:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000467448:exon_202624183_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000409666:exon_202625526_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000496244:exon_202626126_202626541:ALS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 207012483 A/G 1 18 23 41 8.18132998252056 12.5460783556682 -4.36474837314763 A:G A G 10 0.545481667637747 0.209363873419243 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000456284:exon_207012477_207012558:NDUFS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 214160817 G/A 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 A:G G A 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000144451:ENST00000331683:exon_214160788_214160834:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000406979:exon_214160764_214160834:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000432529:exon_214160788_214160834:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000420497:exon_214160788_214160834:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000440779:exon_214160788_214160834:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000452556:exon_214160788_214160852:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000272898:exon_214160788_214160834:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000447990:exon_214160788_214160834:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000414961:exon_214160788_214160834:SPAG16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 214182100 A/T 1 23 17 40 10.4539216443318 9.2731883498417 1.18073329449012 A:T A T 10 0.545481667637747 0.752858268417667 ENSG00000144451:ENST00000432529:exon_214181943_214182702:SPAG16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 215632255 C/T 0 10 0 10 4.54518332362253 0 4.54518332362253 C C 10 0.545481667637747 0.00270867480271896 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215632206_215632378:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215632206_215632378:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215632206_215632378:BARD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 215645464 C/G 1 11 6 17 4.99970165598478 3.27289000582648 1.7268116501583 C:G C G 10 0.545481667637747 0.471137770776418 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215645284_215646233:BARD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 217279768 G/A 1 12 17 29 5.45421998834704 9.2731883498417 -3.81896836149466 A:G G A 10 0.545481667637747 0.191679709049513 ENSG00000138375:ENST00000430374:exon_217279370_217279864:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217279370_217280238:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000444508:exon_217279370_217279818:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217279370_217280238:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000427645:exon_217279731_217280238:SMARCAL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 217285119 C/T 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 T:C C T 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217285022_217285255:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217285022_217285255:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000427645:exon_217285022_217285255:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217285022_217285255:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000412913:exon_217285022_217285255:SMARCAL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 218940259 C/T 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000188282:ENST00000457754:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000344321:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000374155:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000463872:exon_218939816_218940443:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000441828:exon_218939816_218940463:RUFY4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 219103580 A/G 1 2 7 9 0.909036664724506 3.81837167346423 -2.90933500873972 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0890372070351746 ENSG00000163466:ENST00000465395:exon_219103387_219103918:ARPC2;ENSG00000163466:ENST00000472753:exon_219103387_219103740:ARPC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 219130802 T/C 1 51 59 110 23.1804349504749 32.1834183906271 -9.00298344015216 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0857554757078801 ENSG00000127837:ENST00000248450:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000444053:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000475678:exon_219130302_219131310:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000420660:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000489767:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000422731:exon_219130778_219130804:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000465442:exon_219130787_219130870:AAMP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 14 21 35 6.36325665307154 11.4551150203927 -5.09185836732114 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0912306213941213 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 219146803 G/A 1 2 11 13 0.909036664724506 6.00029834401522 -5.09126167929071 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0049344968896263 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 219146868 T/C 1 21 10 31 9.54488497960731 5.45481667637747 4.09006830322984 T:C T C 10 0.545481667637747 0.152661512870057 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 219146882 G/C 1 21 12 33 9.54488497960731 6.54578001165296 2.99910496795435 C:G G C 10 0.545481667637747 0.382438779857024 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 220473355 G/A 1 9 5 14 4.09066499126028 2.72740833818873 1.36325665307154 A:G G A 10 0.545481667637747 0.594821470841361 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000426736:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000475396:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000473899:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220473305_220473510:STK11IP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 224743373 C/T 1 19 17 36 8.63584831488281 9.2731883498417 -0.637340034958891 T:C C T 10 0.545481667637747 0.86810856223121 ENSG00000085449:ENST00000462702:exon_224743246_224743405:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224740064_224743447:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224740065_224743447:WDFY1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 224765956 C/T 1 23 18 41 10.4539216443318 9.81867001747944 0.635251626852375 T:C C T 10 0.545481667637747 0.876630470577377 ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224765900_224766050:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224765900_224766050:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000429915:exon_224765900_224766050:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000483061:exon_224765572_224766050:WDFY1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 224866387 G/A 1 3 8 11 1.36355499708676 4.36385334110198 -3.00029834401522 A:G G A 10 0.545481667637747 0.126273306068542 ENSG00000135919:ENST00000409304:exon_224866359_224866639:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000258405:exon_224866359_224866639:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000409840:exon_224866359_224866639:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000447280:exon_224866359_224866639:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000457690:exon_224866359_224866639:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000432738:exon_224866359_224866639:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000489065:exon_224866269_224866639:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000454956:exon_224866358_224866639:SERPINE2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 225346646 T/C 1 76 70 146 34.5433932595312 38.1837167346423 -3.64032347511106 A:T:C T C 10 0.545481667637747 0.561436003686378 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225346609_225346795:CUL3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 225362478 C/T 1 64 76 140 29.0891732711842 41.4566067404688 -12.3674334692846 T:C C T 10 0.545481667637747 0.041343733790461 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000451538:exon_225362470_225362536:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000487558:exon_225362470_225362566:CUL3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 228398422 A/G 1 38 23 61 17.2716966297656 12.5460783556682 4.72561827409743 A:G A G 10 0.545481667637747 0.248391693398525 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228398265_228398474:AGFG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 228416712 A/G 1 25 32 57 11.3629583090563 17.4554133644079 -6.09245505535158 A:G A G 10 0.545481667637747 0.111678208607641 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000458212:exon_228416675_228416833:AGFG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 65 34 99 29.5436916035464 18.5463766996834 10.997314903863 A:T:G A G 10 0.545481667637747 0.0265813370313615 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 231072709 C/T 1 21 40 61 9.54488497960731 21.8192667055099 -12.2743817259026 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00185616534980885 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231072706_231072774:SP110 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 231077112 G/A 1 20 35 55 9.09036664724506 19.0918583673211 -10.0014917200761 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00944590345576418 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077111_231077145:SP110 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 231110582 C/T 1 13 12 25 5.90873832070929 6.54578001165296 -0.637041690943674 T:C C T 10 0.545481667637747 0.842576598281257 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392044:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231110578_231110655:SP140 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 231115790 G/A 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.527815080970101 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 231256812 A/G 1 20 14 34 9.09036664724506 7.63674334692846 1.4536233003166 A:G A G 10 0.545481667637747 0.731216270033085 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231256802_231256944:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000496870:exon_231256802_231256944:SP140L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 17 15 32 7.7268116501583 8.1822250145662 -0.455413364407903 T:C T C 10 0.545481667637747 0.861584441110341 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 98 116 214 44.5427965715008 63.2758734459786 -18.7330768744779 A:C:G G A 10 0.545481667637747 0.0109955575753140 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 231742138 G/A 1 73 80 153 33.1798382624445 43.6385334110198 -10.4586951485753 A:G G A 10 0.545481667637747 0.104141144681594 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231742115_231742265:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231742115_231742265:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000335005:exon_231742115_231742265:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231742115_231742265:ITM2C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 232035429 G/A 1 95 103 198 43.179241574414 56.1846117666879 -13.0053701922739 A:T:G G A 10 0.545481667637747 0.0741393708291133 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000373635:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000491229:exon_232035116_232035435:PSMD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 232072912 T/C 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000482392:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000440107:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232072840_232072965:ARMC9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 232196564 C/T 1 19 6 25 8.63584831488281 3.27289000582648 5.36295830905633 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0426103477586695 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 232196597 G/A 1 20 7 27 9.09036664724506 3.81837167346423 5.27199497378083 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0520558328028788 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 232320581 T/G 1 14 11 25 6.36325665307154 6.00029834401522 0.362958309056325 T:G T G 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 233599904 A/C 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 A:C A C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000204120:ENST00000476995:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000427233:exon_233599865_233599947:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373566:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373563:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000428883:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409480:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000456491:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000484409:exon_233599865_233600161:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000492910:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409547:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000475359:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000488629:exon_233599865_233600298:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000490612:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000464402:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000421433:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000425040:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000430720:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000423659:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409196:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000488734:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409451:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000463554:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000440945:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000429187:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000482666:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000490229:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000483164:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000464805:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000489328:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000424038:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000414511:exon_233599858_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000452341:exon_233599858_233599948:GIGYF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 234115337 G/A 1 9 20 29 4.09066499126028 10.9096333527549 -6.81896836149466 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0142221439166050 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 234386134 A/G 1 3 7 10 1.36355499708676 3.81837167346423 -2.45481667637747 A:G A G 10 0.545481667637747 0.201970346156534 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234384166_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234384172_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234384172_234386149:USP40 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 234394487 G/A 1 6 10 16 2.72710999417352 5.45481667637747 -2.72770668220395 A:G G A 10 0.545481667637747 0.211649836550054 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 234394569 A/G 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:G A G 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 234432017 A/G 1 2 11 13 0.909036664724506 6.00029834401522 -5.09126167929071 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0049344968896263 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234431816_234432135:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234431816_234432135:USP40;ENSG00000085982:ENST00000427112:exon_234431816_234432135:USP40 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 234449316 G/A 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234449308_234449412:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234449308_234449412:USP40;ENSG00000085982:ENST00000427112:exon_234449308_234449412:USP40 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 234749258 T/C 1 29 38 67 13.1810316385053 20.7283033702344 -7.54727173172905 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0666409985538112 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 234749354 G/A 1 25 17 42 11.3629583090563 9.2731883498417 2.08976995921463 A:G G A 10 0.545481667637747 0.539810244595978 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 234749780 G/C 1 35 31 66 15.9081416326789 16.9099316967702 -1.0017900640913 C:G G C 10 0.545481667637747 0.806156424375263 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 29 25 54 13.1810316385053 13.6370416909437 -0.456010052438335 C:G G C 10 0.545481667637747 0.892454864090402 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 9 3 12 4.09066499126028 1.63644500291324 2.45421998834704 T:C T C 10 0.545481667637747 0.245735735487388 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 238973039 C/T 1 13 4 17 5.90873832070929 2.18192667055099 3.7268116501583 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0880868330094187 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238972998_238973110:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449191:exon_238972998_238973110:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238972998_238973110:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238972998_238973110:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497256:exon_238972998_238973110:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238972998_238973110:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_238972998_238973110:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238972998_238973110:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000413463:exon_238972998_238973110:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000446202:exon_238972998_238973110:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238972998_238973110:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238972998_238973110:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000412508:exon_238972998_238973110:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000443532:exon_238972998_238973110:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000416757:exon_238972998_238973110:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000487197:exon_238972998_238973736:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480859:exon_238972998_238973110:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000482031:exon_238973001_238973110:SCLY HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 238990388 G/A 1 9 5 14 4.09066499126028 2.72740833818873 1.36325665307154 A:G G A 10 0.545481667637747 0.594821470841361 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238990350_238990477:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000413463:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000443532:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000482031:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000431487:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238987206_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238990376_238990477:SCLY HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 239006933 C/T 1 7 9 16 3.18162832653577 4.90933500873972 -1.72770668220395 T:C C T 10 0.545481667637747 0.4555478790811 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 239237953 G/T 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 T:G G T 10 0.545481667637747 0.523901512697289 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000409739:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 57 43 100 25.9075449446484 23.4557117084231 2.4518332362253 T:C T C 10 0.545481667637747 0.688181852429066 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 240961728 T/C 1 42 37 79 19.0897699592146 20.1828217025966 -1.09305174338201 T:C T C 10 0.545481667637747 0.821991522226385 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000407129:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000497536:exon_240961589_240961757:NDUFA10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 241513695 G/A 1 25 29 54 11.3629583090563 15.8189683614947 -4.45601005243834 A:G G A 10 0.545481667637747 0.274155460039748 ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241513530_241513765:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241513192_241514045:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241513530_241516182:RNPEPL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 241536053 C/T 1 3 7 10 1.36355499708676 3.81837167346423 -2.45481667637747 T:C C T 10 0.545481667637747 0.201970346156534 ENSG00000142330:ENST00000483602:exon_241535736_241536119:CAPN10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 10 9 19 4.54518332362253 4.90933500873972 -0.364151685117192 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 242075362 G/A 1 11 10 21 4.99970165598478 5.45481667637747 -0.455115020392687 A:G G A 10 0.545481667637747 0.831123791313476 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242075291_242075454:PASK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 242572846 A/G 1 38 36 74 17.2716966297656 19.6373400349589 -2.36564340519327 A:G A G 10 0.545481667637747 0.640917325541949 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 28 28 56 12.7265133061431 15.2734866938569 -2.54697338771383 T:C T C 10 0.545481667637747 0.505214501031278 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 28 35 63 12.7265133061431 19.0918583673211 -6.36534506117806 A:G A G 10 0.545481667637747 0.128482509471229 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 242793433 G/A 1 7 10 17 3.18162832653577 5.45481667637747 -2.2731883498417 A:G G A 10 0.545481667637747 0.332311875410834 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000343705:exon_242793385_242793449:PDCD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 2 242794356 C/T 0 8 0 8 3.63614665889802 0 3.63614665889802 C C 10 0.545481667637747 0.0096600748165856 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242794350_242794505:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242794350_242794505:PDCD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:T T A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 256763 G/C 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 C:G G C 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 257733 A/G 1 3 13 16 1.36355499708676 7.09126167929071 -5.72770668220395 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0047324583374105 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 6 12 18 2.72710999417352 6.54578001165296 -3.81867001747945 C:G G C 10 0.545481667637747 0.095953636396545 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 19 27 46 8.63584831488281 14.7280050262192 -6.09215671133636 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0766224530877039 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 73 60 133 33.1798382624445 32.7289000582648 0.45093820417965 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 26 22 48 11.8174766414186 12.0005966880304 -0.183120046611855 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 2097688 T/C 1 10 9 19 4.54518332362253 4.90933500873972 -0.364151685117192 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000125834:ENST00000381482:exon_2097312_2098061:STK35;ENSG00000125834:ENST00000246032:exon_2097312_2098061:STK35;ENSG00000125834:ENST00000493263:exon_2097312_2098061:STK35 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 2840929 G/A 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2840885_2841013:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2840885_2841013:VPS16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 2844911 C/T 1 18 13 31 8.18132998252056 7.09126167929071 1.09006830322985 T:C C T 10 0.545481667637747 0.72247651404882 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000458279:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380443:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000487461:exon_2844595_2844933:VPS16;ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2844830_2844933:PTPRA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 2945759 C/T 1 25 26 51 11.3629583090563 14.1825233585814 -2.81956504952509 T:C C T 10 0.545481667637747 0.482723853722245 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000455631:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000431048:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000418580:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000430705:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2945507_2945848:PTPRA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 2996497 C/T 1 15 14 29 6.8177749854338 7.63674334692846 -0.818968361494663 T:C C T 10 0.545481667637747 0.852670497525973 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2996495_2996531:PTPRA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 3008448 C/T 1 20 28 48 9.09036664724506 15.2734866938569 -6.18312004661185 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0821838337063768 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_3008353_3008487:PTPRA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 3018782 G/A 1 37 27 64 16.8171782974034 14.7280050262192 2.08917327118419 A:G G A 10 0.545481667637747 0.618203056429681 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_3018705_3019320:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_3018705_3019320:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_3018705_3019314:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_3018705_3019314:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_3018705_3019314:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_3018705_3019320:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_3018705_3019314:PTPRA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 3842984 C/T 1 9 9 18 4.09066499126028 4.90933500873972 -0.818670017479445 T:C C T 10 0.545481667637747 0.814103892547842 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3842901_3843060:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000416600:exon_3842901_3843060:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3842901_3843060:MAVS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 3870124 G/C 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 C:G G C 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000125779:ENST00000316562:exon_3869742_3870375:PANK2;ENSG00000125779:ENST00000336066:exon_3870036_3870375:PANK2;ENSG00000125779:ENST00000361370:exon_3870062_3870375:PANK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 5086872 T/C 1 24 27 51 10.9084399766941 14.7280050262192 -3.8195650495251 T:C T C 10 0.545481667637747 0.325417285585722 ENSG00000089063:ENST00000379283:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000342308:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379299:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000202834:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379286:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379279:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000492419:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379277:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379298:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379276:exon_5086834_5086956:C20orf30 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 5169799 C/T 1 2 8 10 0.909036664724506 4.36385334110198 -3.45481667637747 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0510474779497875 ENSG00000101290:ENST00000460006:exon_5169713_5169832:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000379062:exon_5169713_5169832:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000379070:exon_5169713_5169832:CDS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 35 22 57 15.9081416326789 12.0005966880304 3.90754494464842 T:C T C 10 0.545481667637747 0.352187090085509 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 35 22 57 15.9081416326789 12.0005966880304 3.90754494464842 T:C T C 10 0.545481667637747 0.352187090085509 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 10594363 G/A 1 21 1 22 9.54488497960731 0.545481667637747 8.99940331196957 A:G G A 10 0.545481667637747 4.18249200905044e-05 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 13763601 A/G 1 47 42 89 21.3623616210259 22.9102300407854 -1.54786841975948 A:G A G 10 0.545481667637747 0.750585531584818 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13763150_13763829:ESF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 17597482 G/A 1 25 22 47 11.3629583090563 12.0005966880304 -0.637638378974108 A:G G A 10 0.545481667637747 0.884237404202915 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17597377_17597484:RRBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 38 21 59 17.2716966297656 11.4551150203927 5.81658160937293 A:G G A 10 0.545481667637747 0.150334915363485 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 18513372 C/T 1 29 25 54 13.1810316385053 13.6370416909437 -0.456010052438335 T:C C T 10 0.545481667637747 0.892454864090402 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18513308_18513388:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18513308_18513388:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18513308_18513388:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18513308_18513388:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18513308_18513388:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18513308_18513388:SEC23B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 6 12 18 2.72710999417352 6.54578001165296 -3.81867001747945 T:C T C 10 0.545481667637747 0.095953636396545 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 20475809 G/A 1 3 8 11 1.36355499708676 4.36385334110198 -3.00029834401522 A:G G A 10 0.545481667637747 0.126273306068542 ENSG00000188559:ENST00000417022:exon_20475761_20475919:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000430436:exon_20475761_20475919:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000334388:exon_20475761_20475919:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000202677:exon_20475761_20475919:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000427175:exon_20475761_20475919:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000418184:exon_20475761_20475919:RALGAPA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 30659556 G/A 1 50 44 94 22.7259166181127 24.0011933760609 -1.27527675794822 A:G G A 10 0.545481667637747 0.836143867048192 ENSG00000101336:ENST00000375862:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000486475:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000262651:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000520553:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000518730:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000375852:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000470092:exon_30659465_30660392:HCK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 32212690 C/T 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 T:C C T 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000078699:ENST00000375279:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000342704:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000346541:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397800:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000492345:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000359606:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397803:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000491618:exon_32212570_32212823:CBFA2T2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 13 6 19 5.90873832070929 3.27289000582648 2.63584831488281 T:C C T 10 0.545481667637747 0.256383122170611 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 33509608 T/C 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000131069:ENST00000336325:exon_33509589_33509669:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000481284:exon_33509589_33509669:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000360596:exon_33509589_33509669:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000477932:exon_33509589_33509669:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000253382:exon_33509589_33509669:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000491533:exon_33509589_33509669:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000470315:exon_33509451_33509669:ACSS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 37055875 T/C 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 T:C T C 10 0.545481667637747 0.735500840387382 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 37394884 G/A 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 A:G G A 10 0.545481667637747 0.523901512697289 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37394881_37395020:ACTR5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 37396120 A/G 1 10 3 13 4.54518332362253 1.63644500291324 2.90873832070929 A:G A G 10 0.545481667637747 0.16204615807973 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37396107_37396239:ACTR5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 37400490 G/A 1 8 9 17 3.63614665889802 4.90933500873972 -1.2731883498417 A:G G A 10 0.545481667637747 0.628894857051545 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 37400506 C/T 0 18 0 18 8.18132998252056 0 8.18132998252056 C C 10 0.545481667637747 3.37737952660095e-05 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 37534665 C/T 1 21 22 43 9.54488497960731 12.0005966880304 -2.45571170842312 T:C C T 10 0.545481667637747 0.540674742921706 ENSG00000101445:ENST00000299824:exon_37534612_37534737:PPP1R16B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 37570725 C/T 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 T:C C T 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37570602_37570769:FAM83D HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 39797465 T/C 1 8 13 21 3.63614665889802 7.09126167929071 -3.45511502039269 T:C T C 10 0.545481667637747 0.187332125989055 ENSG00000124181:ENST00000244007:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373271:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373272:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000477870:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000483175:exon_39797396_39797510:PLCG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 40034097 A/G 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:G A G 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40030741_40034129:CHD6;ENSG00000124177:ENST00000480022:exon_40033163_40034129:CHD6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 40043913 C/T 1 11 5 16 4.99970165598478 2.72740833818873 2.27229331779605 T:C C T 10 0.545481667637747 0.319450493523029 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40043826_40044278:CHD6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 43252915 T/C 1 53 51 104 24.0894716151994 27.8195650495251 -3.73009343432568 T:C T C 10 0.545481667637747 0.491279886685004 ENSG00000196839:ENST00000372874:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000464097:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000492931:exon_43252843_43252970:ADA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 44047974 G/A 1 17 9 26 7.7268116501583 4.90933500873972 2.81747664141858 A:G G A 10 0.545481667637747 0.326568424395203 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44047935_44048035:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000455050:exon_44047935_44048035:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44047935_44048035:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44047874_44048035:PIGT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 44511257 G/A 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 44596545 G/A 1 16 6 22 7.27229331779605 3.27289000582648 3.99940331196957 A:G G A 10 0.545481667637747 0.132095272636517 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44596373_44597497:ZNF335 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 13 14 27 5.90873832070929 7.63674334692846 -1.72800502621917 T:G T G 10 0.545481667637747 0.564423910665474 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 44757524 C/G 1 144 133 277 65.4506398601644 72.5490617958204 -7.09842193565591 C:G C G 10 0.545481667637747 0.398786864836333 ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44757521_44758502:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44757521_44758502:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44756969_44758153:CD40;ENSG00000101017:ENST00000466205:exon_44757521_44757765:CD40;ENSG00000101017:ENST00000489304:exon_44757521_44758502:CD40;ENSG00000101017:ENST00000477696:exon_44757521_44757643:CD40 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 45315346 C/T 1 33 19 52 14.9991049679544 10.3641516851172 4.63495328283716 T:C C T 10 0.545481667637747 0.212325504289772 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 45315786 C/T 1 12 17 29 5.45421998834704 9.2731883498417 -3.81896836149466 T:C C T 10 0.545481667637747 0.191679709049513 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 47262549 C/T 1 43 43 86 19.5442882915769 23.4557117084231 -3.91142341684624 T:C C T 10 0.545481667637747 0.448674342099836 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47262389_47262595:PREX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 47307618 G/A 1 52 34 86 23.6349532828372 18.5463766996834 5.08857658315376 A:G G A 10 0.545481667637747 0.280969374451878 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47307485_47307634:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47307485_47307634:PREX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 47570114 G/A 1 8 13 21 3.63614665889802 7.09126167929071 -3.45511502039269 A:G G A 10 0.545481667637747 0.187332125989055 ENSG00000124198:ENST00000371917:exon_47570093_47570327:ARFGEF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 47704595 C/T 1 33 28 61 14.9991049679544 15.2734866938569 -0.274381725902565 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000124207:ENST00000449004:exon_47704546_47704643:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000396192:exon_47704546_47704643:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000417408:exon_47704546_47704643:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000262982:exon_47704546_47704643:CSE1L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 29 20 49 13.1810316385053 10.9096333527549 2.2713982857504 T:C:G C T 10 0.545481667637747 0.567685751286053 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 47865372 G/A 1 25 33 58 11.3629583090563 18.0008950320457 -6.63793672298933 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0870457075900576 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 26 32 58 11.8174766414186 17.4554133644079 -5.63793672298932 A:G G A 10 0.545481667637747 0.147998274121349 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 13 12 25 5.90873832070929 6.54578001165296 -0.637041690943674 C:G C G 10 0.545481667637747 0.842576598281257 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 47886684 G/A 1 16 20 36 7.27229331779605 10.9096333527549 -3.63734003495889 A:G G A 10 0.545481667637747 0.243963114769603 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47886479_47887760:ZNFX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 48259034 A/G 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000158470:ENST00000371711:exon_48259005_48259121:B4GALT5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 48522392 G/A 1 13 8 21 5.90873832070929 4.36385334110198 1.54488497960731 A:G G A 10 0.545481667637747 0.521566668167506 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 9 4 13 4.09066499126028 2.18192667055099 1.90873832070929 A:G G A 10 0.545481667637747 0.405734407269743 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 48523326 G/A 1 12 13 25 5.45421998834704 7.09126167929071 -1.63704169094367 A:G G A 10 0.545481667637747 0.550995061740953 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 48524827 A/G 1 10 8 18 4.54518332362253 4.36385334110198 0.181329982520555 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48524692_48525129:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48524692_48525129:SPATA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 49493171 G/A 1 55 51 106 24.9985082799239 27.8195650495251 -2.82105676960118 A:G G A 10 0.545481667637747 0.626111026747175 ENSG00000124243:ENST00000358791:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000262591:exon_49493023_49493713:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000371608:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000463943:exon_49493023_49493714:BCAS4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 49493195 A/G 1 62 46 108 28.1801366064597 25.0921567113364 3.08797989512333 A:G A G 10 0.545481667637747 0.563760354030176 ENSG00000124243:ENST00000358791:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000262591:exon_49493023_49493713:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000371608:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000463943:exon_49493023_49493714:BCAS4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 50092027 T/G 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 T:G T G 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000101096:ENST00000371564:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000396009:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000371567:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000414705:exon_50091995_50092197:NFATC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 52561494 T/C 1 22 9 31 9.99940331196957 4.90933500873972 5.09006830322984 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0726288543033952 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52561322_52561535:BCAS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 56190634 C/T 1 8 8 16 3.63614665889802 4.36385334110198 -0.727706682203952 T:C C T 10 0.545481667637747 0.8039768822367 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56190568_56193137:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000480037:exon_56190568_56191524:ZBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 57244493 G/A 1 37 20 57 16.8171782974034 10.9096333527549 5.90754494464842 A:G G A 10 0.545481667637747 0.142922889858996 ENSG00000254995:ENST00000371138:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000435446:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000124222:ENST00000355957:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000312283:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000359617:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371141:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371132:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000358029:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000464640:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361830:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361770:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000468590:exon_57244358_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000438253:exon_57244347_57244509:STX16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 57268867 C/A 1 11 8 19 4.99970165598478 4.36385334110198 0.635848314882807 A:C C A 10 0.545481667637747 0.82162549041289 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57268793_57268978:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57268225_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57268235_57268978:NPEPL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 57288422 T/C 1 12 7 19 5.45421998834704 3.81837167346423 1.63584831488281 T:C T C 10 0.545481667637747 0.497845829751492 ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57287877_57289149:NPEPL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 33 16 49 14.9991049679544 8.72770668220395 6.2713982857504 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0847821176565051 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 337 287 624 153.172678006079 156.553238612033 -3.38056060595409 T:C C T 10 0.545481667637747 0.809432294907291 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 57610059 C/A 1 55 74 129 24.9985082799239 40.3656434051933 -15.3671351252694 A:C C A 10 0.545481667637747 0.00778159573396102 ENSG00000101166:ENST00000355937:exon_57608200_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000371033:exon_57609689_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000463057:exon_57609964_57610181:SLMO2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 60572663 C/A 1 9 10 19 4.09066499126028 5.45481667637747 -1.36415168511719 A:C C A 10 0.545481667637747 0.646474994475887 ENSG00000130699:ENST00000474089:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60572606_60572725:TAF4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 60713332 A/G 1 184 159 343 83.6313731546546 86.7315851544018 -3.10021199974722 A:G A G 10 0.545481667637747 0.745174793680017 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 60881330 G/A 1 41 26 67 18.6352516268524 14.1825233585814 4.45272826827095 A:G G A 10 0.545481667637747 0.326484022522633 ENSG00000130706:ENST00000423787:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000370744:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000253003:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000462554:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000465805:exon_60881253_60881376:ADRM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 60963494 C/T 1 17 4 21 7.7268116501583 2.18192667055099 5.54488497960731 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0155604230463135 ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 61287939 C/T 1 10 3 13 4.54518332362253 1.63644500291324 2.90873832070929 T:C C T 10 0.545481667637747 0.16204615807973 ENSG00000101187:ENST00000370512:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000217159:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000497209:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000370507:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000342674:exon_61287807_61288563:SLCO4A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 61444939 G/C 1 39 20 59 17.7262149621279 10.9096333527549 6.81658160937293 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0887238292255857 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61444619_61445001:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61444619_61445001:OGFR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 61588159 A/G 1 28 29 57 12.7265133061431 15.8189683614947 -3.09245505535158 A:G A G 10 0.545481667637747 0.427331927866647 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000411611:exon_61588117_61588314:SLC17A9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 61588745 C/T 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 T:C C T 10 0.545481667637747 0.152855532002609 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 61595636 C/T 1 19 29 48 8.63584831488281 15.8189683614947 -7.18312004661185 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0422706255063331 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61595580_61595667:SLC17A9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 61910270 G/A 1 21 14 35 9.54488497960731 7.63674334692846 1.90814163267886 A:G G A 10 0.545481667637747 0.611609620786406 ENSG00000101199:ENST00000370283:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000353546:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000370275:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519604:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000520485:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519531:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000518601:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000522403:exon_61910251_61910347:ARFGAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 62191321 A/G 1 12 9 21 5.45421998834704 4.90933500873972 0.544884979607314 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 62191937 G/A 1 11 11 22 4.99970165598478 6.00029834401522 -1.00059668803043 A:G G A 10 0.545481667637747 0.67524038559697 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 62194103 A/G 1 15 7 22 6.8177749854338 3.81837167346423 2.99940331196957 A:G A G 10 0.545481667637747 0.284226176487771 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 62195087 A/G 1 8 11 19 3.63614665889802 6.00029834401522 -2.36415168511719 A:G A G 10 0.545481667637747 0.357710103923903 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 62196253 C/A 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 A:C C A 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 62197370 G/A 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 62198341 G/A 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 62198686 G/A 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 A:G G A 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 62200738 G/A 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 62200860 A/G 1 14 5 19 6.36325665307154 2.72740833818873 3.63584831488281 A:G A G 10 0.545481667637747 0.109537367994142 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 62200929 G/A 1 8 12 20 3.63614665889802 6.54578001165296 -2.90963335275494 A:G G A 10 0.545481667637747 0.261277301714232 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 62324280 C/T 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 T:C C T 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 62324289 C/T 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 T:C C T 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 62560701 C/T 1 21 22 43 9.54488497960731 12.0005966880304 -2.45571170842312 T:C C T 10 0.545481667637747 0.540674742921706 ENSG00000101152:ENST00000369911:exon_62560665_62560878:DNAJC5;ENSG00000101152:ENST00000360864:exon_62560665_62560878:DNAJC5;ENSG00000101152:ENST00000470551:exon_62560665_62560878:DNAJC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 20 62574006 A/G 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 A:G A G 10 0.545481667637747 0.735500840387382 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 46 38 84 20.9078432886636 20.7283033702344 0.179539918429253 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 19165722 T/C 1 19 10 29 8.63584831488281 5.45481667637747 3.18103163850534 T:C T C 10 0.545481667637747 0.266845155834917 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19161284_19165898:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19165121_19165895:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19165564_19165898:C21orf91 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 19169155 G/C 1 9 17 26 4.09066499126028 9.2731883498417 -5.18252335858142 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0487046981211123 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 19169218 G/C 1 31 18 49 14.0900683032298 9.81867001747944 4.2713982857504 C:G G C 10 0.545481667637747 0.252122052433578 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 30714776 T/C 1 10 12 22 4.54518332362253 6.54578001165296 -2.00059668803043 T:C T C 10 0.545481667637747 0.401468669837045 ENSG00000156273:ENST00000286800:exon_30714720_30718469:BACH1;ENSG00000156273:ENST00000399921:exon_30714720_30718469:BACH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 34128717 G/A 1 13 11 24 5.90873832070929 6.00029834401522 -0.0915600233059273 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000159086:ENST00000466846:exon_34127524_34129105:GCFC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 51 23 74 23.1804349504749 12.5460783556682 10.6343565948067 A:T:G T G 10 0.545481667637747 0.0139418163722840 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 34617213 T/C 1 1 10 11 0.454518332362253 5.45481667637747 -5.00029834401522 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00370111192657596 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 34652190 T/C 1 23 29 52 10.4539216443318 15.8189683614947 -5.36504671716284 T:C T C 10 0.545481667637747 0.163337467422083 ENSG00000249624:ENST00000433395:exon_34652057_34652223:AP000295.9;ENSG00000249624:ENST00000451624:exon_34652057_34652223:AP000295.9;ENSG00000249624:ENST00000432231:exon_34652057_34652223:AP000295.9;ENSG00000243646:ENST00000290200:exon_34652057_34652223:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000422891:exon_34652057_34652223:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000493295:exon_34652057_34652223:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000498371:exon_34652057_34652223:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000451065:exon_34652057_34652223:IL10RB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 34715699 G/C 1 20 10 30 9.09036664724506 5.45481667637747 3.63554997086759 C:G G C 10 0.545481667637747 0.203056700745850 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34715574_34715728:IFNAR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 34883618 T/C 1 31 22 53 14.0900683032298 12.0005966880304 2.08947161519941 T:C T C 10 0.545481667637747 0.584438646149134 ENSG00000159131:ENST00000414353:exon_34883559_34883664:GART;ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34883559_34883765:GART HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 34924243 T/C 1 58 55 113 26.3620632770107 30.0014917200761 -3.63942844306541 T:C T C 10 0.545481667637747 0.509401576253701 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 34925304 A/G 1 63 62 125 28.6346549388219 33.8198633935403 -5.18520845471837 A:G A G 10 0.545481667637747 0.369768016129977 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 34925689 G/A 1 60 76 136 27.2710999417352 41.4566067404688 -14.1855067987336 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0157936902307704 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 34925827 T/C 1 79 90 169 35.906948256618 49.0933500873972 -13.1864018307792 T:C T C 10 0.545481667637747 0.044559506662703 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 34926043 G/A 1 93 98 191 42.2702049096895 53.4572034284992 -11.1869985188097 A:G G A 10 0.545481667637747 0.110037579483110 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 97 107 204 44.0882782391385 58.3665384372389 -14.2782601981004 T:C C T 10 0.545481667637747 0.048856692400844 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 17 36 53 7.7268116501583 19.6373400349589 -11.9105283848006 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00129952514142787 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 38437951 T/G 1 29 27 56 13.1810316385053 14.7280050262192 -1.54697338771383 T:G T G 10 0.545481667637747 0.689401353244932 ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38435146_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38436448_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38437674_38438012:PIGP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 40191431 T/G 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 T:G T G 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 40191638 A/G 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 43221797 G/C 1 12 8 20 5.45421998834704 4.36385334110198 1.09036664724506 C:G G C 10 0.545481667637747 0.660941894453713 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000486812:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000470586:exon_43221154_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000465955:exon_43221788_43221882:PRDM15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 43239972 A/G 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:G A G 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000495217:exon_43239938_43240139:PRDM15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 43327793 C/T 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 T:C C T 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000157617:ENST00000299796:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000380486:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000329623:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000482084:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000482186:exon_43327769_43328911:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000467074:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000494352:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000419715:exon_43327769_43327893:C2CD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 43327856 A/G 1 3 9 12 1.36355499708676 4.90933500873972 -3.54578001165296 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0457815358442577 ENSG00000157617:ENST00000299796:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000380486:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000329623:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000482084:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000482186:exon_43327769_43328911:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000467074:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000494352:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000419715:exon_43327769_43327893:C2CD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 44270229 C/T 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44270151_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44269336_44270352:WDR4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 44273858 G/A 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 A:G G A 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44273679_44273862:WDR4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 12 8 20 5.45421998834704 4.36385334110198 1.09036664724506 C:G C G 10 0.545481667637747 0.660941894453713 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 27 11 38 12.2719949737808 6.00029834401522 6.27169662976561 T:G T G 10 0.545481667637747 0.0497113304008241 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 44323720 C/T 1 29 12 41 13.1810316385053 6.54578001165296 6.63525162685237 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0413528882912976 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 20 2 22 9.09036664724506 1.09096333527549 7.99940331196957 A:G G A 10 0.545481667637747 0.000379297076289919 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 44430325 T/C 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000160199:ENST00000291547:exon_44430163_44430334:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000432907:exon_44430163_44430334:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000480179:exon_44430163_44430334:PKNOX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 29 44 73 13.1810316385053 24.0011933760609 -10.8201617375555 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0131605681823837 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 45219524 T/C 1 30 39 69 13.6355499708676 21.2737850378721 -7.63823506700454 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0700927791217297 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 45220483 A/G 1 30 24 54 13.6355499708676 13.0915600233059 0.543989947561663 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45220398_45220495:RRP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 19 25 44 8.63584831488281 13.6370416909437 -5.00119337606087 A:G G A 10 0.545481667637747 0.133308064079262 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 45506819 T/C 1 10 8 18 4.54518332362253 4.36385334110198 0.181329982520555 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45506683_45506841:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45506683_45506841:TRAPPC10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 45522693 G/A 1 16 6 22 7.27229331779605 3.27289000582648 3.99940331196957 A:G G A 10 0.545481667637747 0.132095272636517 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45522659_45522853:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45522659_45522853:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000459741:exon_45522659_45522853:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000468864:exon_45522659_45522853:TRAPPC10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 45527291 G/A 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45527176_45527315:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000456705:exon_45527254_45527315:PWP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 45528919 G/A 1 9 3 12 4.09066499126028 1.63644500291324 2.45421998834704 A:G G A 10 0.545481667637747 0.245735735487388 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45528865_45528977:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000456705:exon_45528865_45528977:PWP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 18 14 32 8.18132998252056 7.63674334692846 0.544586635592098 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 28 15 43 12.7265133061431 8.1822250145662 4.54428829157688 A:G A G 10 0.545481667637747 0.171854981537491 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 45544594 T/C 1 46 25 71 20.9078432886636 13.6370416909437 7.27080159771996 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0950325908346085 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45544461_45544608:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45544461_45546000:PWP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 43 47 90 19.5442882915769 25.6376383789741 -6.09335008739723 T:C T C 10 0.545481667637747 0.20525662463278 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 45733867 A/T 1 55 69 124 24.9985082799239 37.6382350670045 -12.6397267870806 A:T A T 10 0.545481667637747 0.024129045910403 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45733796_45733904:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45733796_45733904:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000496824:exon_45733796_45733904:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45733796_45736222:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45733796_45733904:PFKL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 45750248 G/A 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 A:G G A 10 0.545481667637747 0.243356459282646 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 45751814 C/T 0 34 0 34 15.4536233003166 0 15.4536233003166 C C 10 0.545481667637747 1.21843073564551e-09 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45750346_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45751731_45751851:C21orf2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 46311813 A/G 1 30 30 60 13.6355499708676 16.3644500291324 -2.72890005826482 A:G A G 10 0.545481667637747 0.517945204967424 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46311724_46311911:ITGB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 46319069 T/C 1 27 24 51 12.2719949737808 13.0915600233059 -0.819565049525096 T:C T C 10 0.545481667637747 0.888432790595991 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46318982_46319077:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000320216:exon_46318982_46319077:ITGB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 46320313 C/T 1 55 48 103 24.9985082799239 26.1831200466119 -1.18461176668794 T:C C T 10 0.545481667637747 0.843471683599063 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000320216:exon_46320235_46320390:ITGB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 46951556 A/G 1 13 14 27 5.90873832070929 7.63674334692846 -1.72800502621917 A:G A G 10 0.545481667637747 0.564423910665474 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000477688:exon_46951332_46952062:SLC19A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 46957794 T/C 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000427839:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000443742:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000486303:exon_46957685_46957847:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000528477:exon_46957692_46957922:SLC19A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 25 38 63 11.3629583090563 20.7283033702344 -9.36534506117806 A:C A C 10 0.545481667637747 0.0221236649868569 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 47635627 C/G 1 19 25 44 8.63584831488281 13.6370416909437 -5.00119337606087 C:G C G 10 0.545481667637747 0.133308064079262 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47635599_47635707:LSS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 47676711 G/A 1 30 30 60 13.6355499708676 16.3644500291324 -2.72890005826482 A:G G A 10 0.545481667637747 0.517945204967424 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 47685939 A/G 1 21 20 41 9.54488497960731 10.9096333527549 -1.36474837314763 A:G A G 10 0.545481667637747 0.754320340488457 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685839_47686866:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685839_47686080:MCM3AP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 47697650 A/G 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 A:G A G 10 0.545481667637747 0.586892638954817 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 47703649 G/A 1 37 29 66 16.8171782974034 15.8189683614947 0.998209935908701 A:G G A 10 0.545481667637747 0.901755816772851 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703529_47703752:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47703529_47703752:MCM3AP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 47704896 G/A 1 13 13 26 5.90873832070929 7.09126167929071 -1.18252335858142 A:G G A 10 0.545481667637747 0.696126980810445 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703982_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47703982_47705236:MCM3AP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 47705237 T/C 1 22 13 35 9.99940331196957 7.09126167929071 2.90814163267886 T:C T C 10 0.545481667637747 0.396818936531709 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703982_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000426537:exon_47704919_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000495475:exon_47705205_47705308:MCM3AP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 21 47805773 T/C 1 16 10 26 7.27229331779605 5.45481667637747 1.81747664141858 T:C T C 10 0.545481667637747 0.557013656890898 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47805747_47805898:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47805747_47805898:PCNT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 17690409 G/A 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 A:G G A 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17690246_17690575:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17690246_17690779:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17690246_17690614:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000441548:exon_17690246_17690613:CECR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 18300768 G/A 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:G G A 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000093100:ENST00000252134:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000425874:exon_18300077_18301895:MICAL3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 18354766 C/T 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 T:C C T 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000429452:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000400561:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000444520:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000495076:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000414725:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000383094:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000207726:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000461307:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000462645:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000465886:exon_18354696_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000498345:exon_18354700_18354789:MICAL3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 18609642 C/T 1 44 22 66 19.9988066239391 12.0005966880304 7.9982099359087 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0487648983720486 ENSG00000215193:ENST00000474897:exon_18609121_18609801:PEX26;ENSG00000183785:ENST00000316027:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000330423:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000416740:exon_18609121_18609801:TUBA8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 19165216 G/A 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 A:G G A 10 0.545481667637747 0.782586339670189 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 19165478 A/G 1 42 32 74 19.0897699592146 17.4554133644079 1.63435659480673 A:G A G 10 0.545481667637747 0.727635903131278 ENSG00000100075:ENST00000215882:exon_19165455_19165554:SLC25A1;ENSG00000100075:ENST00000451283:exon_19165455_19165554:SLC25A1;ENSG00000100075:ENST00000470922:exon_19165240_19165554:SLC25A1;ENSG00000100075:ENST00000461267:exon_19165455_19165554:SLC25A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 19420109 T/C 1 26 19 45 11.8174766414186 10.3641516851172 1.45332495630139 T:C T C 10 0.545481667637747 0.765116146805495 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19419425_19420130:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19420102_19420382:MRPL40 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 77 76 153 34.9979115918935 41.4566067404688 -6.45869514857529 A:G G A 10 0.545481667637747 0.329972725198743 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 19789541 A/C 1 18 15 33 8.18132998252056 8.1822250145662 -0.000895032045649558 A:C A C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000481086:exon_19789522_19789739:GNB1L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 19839516 C/T 1 7 2 9 3.18162832653577 1.09096333527549 2.09066499126028 T:C C T 10 0.545481667637747 0.195909819758449 ENSG00000215012:ENST00000407472:exon_19833661_19840009:C22orf29;ENSG00000215012:ENST00000328554:exon_19833669_19840009:C22orf29;ENSG00000215012:ENST00000405640:exon_19833669_19840009:C22orf29;ENSG00000215012:ENST00000416337:exon_19839512_19840009:C22orf29 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 19950263 G/T 1 71 55 126 32.27080159772 30.0014917200761 2.26930987764388 T:G G T 10 0.545481667637747 0.72094061763772 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 20302276 A/T 1 16 18 34 7.27229331779605 9.81867001747944 -2.5463766996834 A:T A T 10 0.545481667637747 0.39437426025059 ENSG00000128185:ENST00000248879:exon_20301799_20302347:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000405465:exon_20301806_20302347:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000443409:exon_20301917_20302347:DGCR6L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 21982892 C/T 1 34 24 58 15.4536233003166 13.0915600233059 2.36206327701068 T:C C T 10 0.545481667637747 0.598689140775304 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 21984205 A/G 1 37 23 60 16.8171782974034 12.5460783556682 4.27109994173518 A:G A G 10 0.545481667637747 0.300711581793087 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21984140_21984301:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21984140_21984332:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21984140_21984327:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21984140_21984303:YDJC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 23627369 A/G 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000466076:exon_23627220_23627388:BCR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 24224655 G/A 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 A:G G A 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398359:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000407566:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000467660:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405286:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398363:exon_24224646_24224733:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000472526:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000473357:exon_24222596_24224833:SLC2A11;ENSG00000251357:ENST00000447957:exon_24224646_24224833:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000502845:exon_24224646_24224833:AP000350.10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 24224659 C/A 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 A:C C A 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398359:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000407566:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000467660:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405286:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398363:exon_24224646_24224733:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000472526:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000473357:exon_24222596_24224833:SLC2A11;ENSG00000251357:ENST00000447957:exon_24224646_24224833:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000502845:exon_24224646_24224833:AP000350.10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 24459438 T/C 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24459422_24459609:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24459422_24459609:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24459422_24459609:CABIN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 35 21 56 15.9081416326789 11.4551150203927 4.45302661228617 T:C T C 10 0.545481667637747 0.283025625530493 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 24921683 C/T 1 14 8 22 6.36325665307154 4.36385334110198 1.99940331196957 T:C C T 10 0.545481667637747 0.521742512666216 ENSG00000100024:ENST00000415388:exon_24921679_24922636:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000326010:exon_24921679_24922553:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000413389:exon_24921679_24922552:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000498140:exon_24921679_24924358:UPB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 24964128 T/C 1 346 308 654 157.26334299734 168.008353632426 -10.7450106350865 A:T:C T C 10 0.545481667637747 0.409694808505615 ENSG00000100028:ENST00000215829:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000457691:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000402849:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000404603:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000458544:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000448916:exon_24963952_24964144:SNRPD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 26860269 G/C 1 24 16 40 10.9084399766941 8.72770668220395 2.18073329449012 C:G G C 10 0.545481667637747 0.528541347452857 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26860210_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26860205_26860792:HPS4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 26 19 45 11.8174766414186 10.3641516851172 1.45332495630139 T:C C T 10 0.545481667637747 0.765116146805495 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 29755888 T/C 1 11 5 16 4.99970165598478 2.72740833818873 2.27229331779605 T:C T C 10 0.545481667637747 0.319450493523029 ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000421126:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000473606:exon_29755662_29755948:AP1B1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 29881828 C/T 1 3 6 9 1.36355499708676 3.27289000582648 -1.90933500873972 T:C C T 10 0.545481667637747 0.316116386178568 ENSG00000100285:ENST00000310624:exon_29881712_29881836:NEFH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 30198025 C/T 1 32 44 76 14.5445866355921 24.0011933760609 -9.45660674046877 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0374453390892695 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30197983_30198197:ASCC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 32871383 T/G 1 14 12 26 6.36325665307154 6.54578001165296 -0.182523358581421 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32871244_32871385:FBXO7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 35660875 G/T 1 12 17 29 5.45421998834704 9.2731883498417 -3.81896836149466 A:T:G G T 10 0.545481667637747 0.191679709049513 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 36684331 C/T 1 166 220 386 75.450043172134 120.005966880304 -44.5559237081703 T:C C T 10 0.545481667637747 6.30617664982983e-06 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 193 140 333 87.7220381459148 76.3674334692846 11.3546046766303 T:C T C 10 0.545481667637747 0.226065840030495 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 205 138 343 93.1762581342619 75.2764701340091 17.8997880002528 A:C C A 10 0.545481667637747 0.0575876024826458 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 36900812 C/T 1 7 1 8 3.18162832653577 0.545481667637747 2.63614665889802 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0793996161569039 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900562_36900813:FOXRED2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 36907001 T/C 1 16 7 23 7.27229331779605 3.81837167346423 3.45392164433182 T:C T C 10 0.545481667637747 0.208244249691514 ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36906897_36907047:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000478547:exon_36906903_36907215:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000462641:exon_36906915_36907047:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36906946_36907047:EIF3D HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 37271802 C/T 1 22 20 42 9.99940331196957 10.9096333527549 -0.910230040785374 T:C C T 10 0.545481667637747 0.877111986995837 ENSG00000100365:ENST00000447071:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37271695_37271825:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000439078:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 37273742 G/A 1 31 23 54 14.0900683032298 12.5460783556682 1.54398994756166 A:G G A 10 0.545481667637747 0.684981535141276 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 37407240 G/A 1 20 11 31 9.09036664724506 6.00029834401522 3.09006830322984 A:G G A 10 0.545481667637747 0.284954488499266 ENSG00000128311:ENST00000403892:exon_37406900_37407366:TST;ENSG00000128311:ENST00000249042:exon_37406900_37407366:TST HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 37602846 G/A 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 A:G G A 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 38046695 C/A 1 28 23 51 12.7265133061431 12.5460783556682 0.180434950474904 A:C C A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000466097:exon_38046549_38046785:SH3BP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 38051355 G/A 1 10 8 18 4.54518332362253 4.36385334110198 0.181329982520555 A:T:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 29 43 72 13.1810316385053 23.4557117084231 -10.2746800699178 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0175423023700763 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 38164106 C/T 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 T:C C T 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 7 9 16 3.18162832653577 4.90933500873972 -1.72770668220395 A:G A G 10 0.545481667637747 0.4555478790811 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 333 339 672 151.35460467663 184.918285329196 -33.5636806525659 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00945036126028683 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 38323507 G/T 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 T:G G T 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 39411696 C/T 1 83 67 150 37.725021586067 36.547271731729 1.17774985433795 T:C C T 10 0.545481667637747 0.870048667145405 ENSG00000244509:ENST00000396752:exon_39411600_39411756:APOBEC3C;ENSG00000244509:ENST00000361441:exon_39411600_39411756:APOBEC3C;ENSG00000244509:ENST00000396762:exon_39411600_39411756:APOBEC3C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 40803186 G/T 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 T:G G T 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000100359:ENST00000485962:exon_40803021_40803572:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000478085:exon_40802442_40804433:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000481408:exon_40803021_40803332:SGSM3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 40814636 C/T 1 10 8 18 4.54518332362253 4.36385334110198 0.181329982520555 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 41195082 G/A 1 22 16 38 9.99940331196957 8.72770668220395 1.27169662976561 A:G G A 10 0.545481667637747 0.746021063688677 ENSG00000100372:ENST00000263255:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000491545:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000435456:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000420970:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000458600:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000443810:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000412879:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000426396:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000434193:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000449676:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000434185:exon_41195027_41195087:SLC25A17 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 42912097 C/T 1 43 25 68 19.5442882915769 13.6370416909437 5.90724660063321 T:C C T 10 0.545481667637747 0.180127437548164 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 42912106 C/T 1 29 40 69 13.1810316385053 21.8192667055099 -8.63823506700454 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0399244033742842 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 18 6 24 8.18132998252056 3.27289000582648 4.90843997669407 C:G G C 10 0.545481667637747 0.062904669459089 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 43206950 A/C 1 15 21 36 6.8177749854338 11.4551150203927 -4.63734003495889 A:T:C A C 10 0.545481667637747 0.13352255184162 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43206819_43206950:ARFGAP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 43576904 G/A 1 15 19 34 6.8177749854338 10.3641516851172 -3.5463766996834 A:G G A 10 0.545481667637747 0.232561835944529 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000357017:exon_43576762_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43576748_43576946:TTLL12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 45577231 T/C 1 8 7 15 3.63614665889802 3.81837167346423 -0.182225014566205 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000093000:ENST00000347635:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000432759:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000425733:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000355253:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000407019:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000493456:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000396096:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000440908:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000422489:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000469163:exon_45577167_45577248:NUP50 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 67 49 116 30.452728268271 26.7286017142496 3.72412655402135 C:G G C 10 0.545481667637747 0.514878477805036 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 50658424 T/C 1 25 16 41 11.3629583090563 8.72770668220395 2.63525162685237 T:C T C 10 0.545481667637747 0.436932819585099 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 50664612 A/G 1 15 17 32 6.8177749854338 9.2731883498417 -2.4554133644079 A:G A G 10 0.545481667637747 0.478253507539261 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000473946:exon_50664479_50664620:TUBGCP6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 50699668 A/G 1 4 11 15 1.81807332944901 6.00029834401522 -4.1822250145662 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0373845255059045 ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50699596_50699737:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50699596_50700137:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50699596_50699725:MAPK12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 50704661 T/C 1 25 8 33 11.3629583090563 4.36385334110198 6.99910496795435 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0143674099597562 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704655_50704734:MAPK11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 22 50722165 C/T 0 17 0 17 7.7268116501583 0 7.7268116501583 C C 10 0.545481667637747 6.57893372584328e-05 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 3189279 A/G 1 20 25 45 9.09036664724506 13.6370416909437 -4.54667504369861 A:G A G 10 0.545481667637747 0.180913272368107 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3189134_3189387:TRNT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 4403837 A/G 1 9 2 11 4.09066499126028 1.09096333527549 2.99970165598478 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0774939953200738 ENSG00000144455:ENST00000272902:exon_4402830_4403938:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000383843:exon_4403450_4403938:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000458465:exon_4403479_4403938:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000405420:exon_4403793_4403938:SUMF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 4712413 G/A 1 11 5 16 4.99970165598478 2.72740833818873 2.27229331779605 A:G G A 10 0.545481667637747 0.319450493523029 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000477577:exon_4712413_4712610:ITPR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 5021403 C/T 1 71 79 150 32.27080159772 43.093051743382 -10.822250145662 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0848913590490344 ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5020801_5021483:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000457655:exon_5021097_5021483:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5021122_5021483:BHLHE40 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 5024771 T/C 1 78 92 170 35.4524299242557 50.1843134226727 -14.731883498417 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0253813462466334 ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5024521_5027008:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5024521_5024953:BHLHE40 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 8955389 C/T 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 T:C C T 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_8955328_8955404:RAD18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 9885615 G/C 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000156990:ENST00000433535:exon_9885574_9885698:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000383820:exon_9885574_9885700:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000287624:exon_9885574_9885678:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000424438:exon_9885409_9885626:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000427174:exon_9885574_9885670:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000484134:exon_9885574_9885700:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000418713:exon_9885574_9885686:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000472381:exon_9885149_9885702:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433972:exon_9885574_9885743:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433555:exon_9885574_9885660:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000451405:exon_9885409_9885679:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000460909:exon_9885574_9885700:RPUSD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 10276163 T/A 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 A:T T A 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000134070:ENST00000256458:exon_10276143_10276343:IRAK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 11643465 T/C 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 T:C T C 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000144560:ENST00000273038:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000413604:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000426568:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000404339:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000445411:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000418000:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000458499:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417206:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417466:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424709:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000419541:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000437722:exon_11643307_11643496:VGLL4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 11887991 C/G 1 9 12 21 4.09066499126028 6.54578001165296 -2.45511502039269 C:G C G 10 0.545481667637747 0.381254161766230 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11887976_11888393:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11887976_11888246:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11887976_11888355:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11887976_11888253:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11887976_11888366:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11887976_11888359:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000494388:exon_11887976_11888338:C3orf31 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 12544829 G/A 1 7 13 20 3.18162832653577 7.09126167929071 -3.90963335275494 A:G G A 10 0.545481667637747 0.113949941344795 ENSG00000154743:ENST00000446004:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000314571:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000454502:exon_12544761_12544968:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000402228:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000284995:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000473755:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000383797:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000444864:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000415684:exon_12544761_12545283:TSEN2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 12613866 T/C 1 37 34 71 16.8171782974034 18.5463766996834 -1.72919840228003 T:C T C 10 0.545481667637747 0.72136203804527 ENSG00000075975:ENST00000170447:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000411987:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000448482:exon_12613568_12613872:MKRN2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 25 20 45 11.3629583090563 10.9096333527549 0.453324956301387 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 30 17 47 13.6355499708676 9.2731883498417 4.36236162102589 T:G G T 10 0.545481667637747 0.241496007796083 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 13367406 C/T 1 36 28 64 16.3626599650411 15.2734866938569 1.0891732711842 T:C C T 10 0.545481667637747 0.803268377237755 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 31 26 57 14.0900683032298 14.1825233585814 -0.0924550553515768 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 13383540 A/G 1 54 41 95 24.5439899475617 22.3647483731476 2.17924157441404 A:G A G 10 0.545481667637747 0.681323608666125 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13383496_13383623:NUP210 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 13395475 G/C 1 17 8 25 7.7268116501583 4.36385334110198 3.36295830905633 C:G G C 10 0.545481667637747 0.228487063060426 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 13395579 C/A 1 19 21 40 8.63584831488281 11.4551150203927 -2.81926670550988 A:C C A 10 0.545481667637747 0.428110736064814 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 13407556 T/C 1 11 12 23 4.99970165598478 6.54578001165296 -1.54607835566818 T:C T C 10 0.545481667637747 0.536843443422341 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13407446_13407591:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13407446_13407591:NUP210 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 13421150 C/T 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13421063_13421221:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13421063_13421221:NUP210 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 14158009 A/G 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000163528:ENST00000295767:exon_14157926_14158024:CHCHD4;ENSG00000163528:ENST00000396914:exon_14157926_14158024:CHCHD4;ENSG00000163528:ENST00000420103:exon_14157926_14158024:CHCHD4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 15115478 C/T 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 T:C C T 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15111580_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15115112_15116437:ZFYVE20 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 15115872 A/G 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:G A G 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15111580_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15115112_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000418832:exon_15115869_15115958:ZFYVE20 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 15117125 G/A 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 A:G G A 10 0.545481667637747 0.152855532002609 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15117113_15117217:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15117113_15117217:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000418832:exon_15117113_15117217:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000435849:exon_15117113_15117217:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000426541:exon_15117113_15117217:ZFYVE20 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 17051450 C/A 1 28 24 52 12.7265133061431 13.0915600233059 -0.365046717162842 A:C C A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 17053499 A/G 1 23 18 41 10.4539216443318 9.81867001747944 0.635251626852375 A:G A G 10 0.545481667637747 0.876630470577377 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000419842:exon_17051986_17053652:PLCL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 19992432 G/T 1 14 7 21 6.36325665307154 3.81837167346423 2.54488497960731 T:G G T 10 0.545481667637747 0.283556941871978 ENSG00000144566:ENST00000273047:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000443878:exon_19992298_19992436:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000412966:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000446547:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000422242:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000476544:exon_19992298_19992717:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000455772:exon_19992298_19992553:RAB5A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 33138549 G/A 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33138503_33138722:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000482097:exon_33138503_33138610:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000485698:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000498537:exon_33138503_33138634:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000415454:exon_33138503_33138613:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000438227:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000440656:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000436768:exon_33138503_33138694:GLB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 33155782 G/A 1 10 16 26 4.54518332362253 8.72770668220395 -4.18252335858142 A:G G A 10 0.545481667637747 0.116095624224208 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33155471_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33155531_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33155546_33156040:CRTAP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 33161898 C/T 1 10 10 20 4.54518332362253 5.45481667637747 -0.909633352754939 T:C C T 10 0.545481667637747 0.82309086372065 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000485310:exon_33161836_33161985:CRTAP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 33174156 T/G 1 21 7 28 9.54488497960731 3.81837167346423 5.72651330614308 T:G T G 10 0.545481667637747 0.035764520204842 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 33174168 G/A 1 18 8 26 8.18132998252056 4.36385334110198 3.81747664141858 A:G G A 10 0.545481667637747 0.168120564649063 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 33434831 G/A 1 24 22 46 10.9084399766941 12.0005966880304 -1.09215671133636 A:G G A 10 0.545481667637747 0.768802260222528 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000492136:exon_33429830_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000466441:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000486388:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000464787:exon_33434804_33434946:UBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 33458266 T/C 1 8 17 25 3.63614665889802 9.2731883498417 -5.63704169094367 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0270381460681358 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000481761:exon_33458250_33458312:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000418410:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000456378:exon_33458250_33458326:UBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 33653540 T/A 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 A:T T A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000163539:ENST00000468888:exon_33653493_33653563:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000399362:exon_33653493_33653563:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000359576:exon_33653493_33653563:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000307312:exon_33653493_33653563:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000480013:exon_33653493_33653563:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000461133:exon_33653493_33653563:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000313350:exon_33653493_33653563:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000487200:exon_33653493_33653563:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000333778:exon_33653493_33653563:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000485378:exon_33653501_33653563:CLASP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 33877626 G/A 1 28 27 55 12.7265133061431 14.7280050262192 -2.00149172007608 A:G G A 10 0.545481667637747 0.591305615312041 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 38 36 74 17.2716966297656 19.6373400349589 -2.36564340519327 T:C C T 10 0.545481667637747 0.640917325541949 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 46 43 89 20.9078432886636 23.4557117084231 -2.54786841975948 A:G A G 10 0.545481667637747 0.59622205629213 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 37053568 A/G 1 14 19 33 6.36325665307154 10.3641516851172 -4.00089503204565 A:G A G 10 0.545481667637747 0.166942100114116 ENSG00000076242:ENST00000231790:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000457004:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000432299:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000396438:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000456676:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000458205:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000455445:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000435176:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000441265:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000383761:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000421440:exon_37053532_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000447829:exon_37053533_37053590:MLH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 37107470 G/A 1 6 10 16 2.72710999417352 5.45481667637747 -2.72770668220395 A:G G A 10 0.545481667637747 0.211649836550054 ENSG00000093167:ENST00000496479:exon_37107301_37110254:LRRFIP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 37365630 G/A 1 27 34 61 12.2719949737808 18.5463766996834 -6.27438172590256 A:G G A 10 0.545481667637747 0.122721068695757 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000429018:exon_37365079_37366450:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 37366459 C/A 1 42 41 83 19.0897699592146 22.3647483731476 -3.274978413933 A:C C A 10 0.545481667637747 0.508987852940812 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 37368755 T/A 1 43 44 87 19.5442882915769 24.0011933760609 -4.45690508448399 A:T T A 10 0.545481667637747 0.389202946543734 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 38168125 A/C 1 45 27 72 20.4533249563014 14.7280050262192 5.72531993008222 A:C A C 10 0.545481667637747 0.193710287863491 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000301810:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38167317_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000421218:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38167552_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38167942_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38167984_38168191:ACAA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 38271881 C/T 1 18 17 35 8.18132998252056 9.2731883498417 -1.09185836732114 T:C C T 10 0.545481667637747 0.736704595175774 ENSG00000172939:ENST00000446845:exon_38271856_38271921:OXSR1;ENSG00000172939:ENST00000311806:exon_38271856_38271921:OXSR1;ENSG00000172939:ENST00000426620:exon_38271856_38272184:OXSR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 39450065 C/T 1 20 17 37 9.09036664724506 9.2731883498417 -0.182821702596637 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000168028:ENST00000490490:exon_39449695_39450215:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39450028_39450215:RPSA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 39453160 G/A 1 92 106 198 41.8156865773273 57.8210567696012 -16.0053701922739 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0266952843871887 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000495394:exon_39451750_39453268:RPSA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 40498920 A/T 1 12 3 15 5.45421998834704 1.63644500291324 3.8177749854338 A:T A T 10 0.545481667637747 0.0670347185280012 ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000435633:exon_40498854_40499238:RPL14 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 42236415 A/G 1 17 16 33 7.7268116501583 8.72770668220395 -1.00089503204565 A:G A G 10 0.545481667637747 0.730455650391869 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000484786:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000449246:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000427771:exon_42236296_42236433:TRAK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 42251263 C/T 1 11 6 17 4.99970165598478 3.27289000582648 1.7268116501583 T:C C T 10 0.545481667637747 0.471137770776418 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 42251329 C/T 1 12 4 16 5.45421998834704 2.18192667055099 3.27229331779605 T:C C T 10 0.545481667637747 0.132268379253018 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 44692564 C/G 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000169981:ENST00000396056:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000415571:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000432115:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000296092:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000399560:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000453164:exon_44692433_44692751:ZNF35 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 8 11 19 3.63614665889802 6.00029834401522 -2.36415168511719 A:C C A 10 0.545481667637747 0.357710103923903 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 45436102 T/C 1 19 7 26 8.63584831488281 3.81837167346423 4.81747664141858 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0749938595115895 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45435925_45436179:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45435925_45436179:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45435925_45436179:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000431023:exon_45435925_45436179:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000430399:exon_45435925_45436179:LARS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 45530196 C/T 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45530189_45530304:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45530189_45530304:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45530189_45530304:LARS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 45779136 A/T 1 16 12 28 7.27229331779605 6.54578001165296 0.726513306143085 A:T A T 10 0.545481667637747 0.85098446461766 ENSG00000211456:ENST00000455997:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000418611:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000389061:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000441228:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000433336:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000464102:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000471207:exon_45778736_45779144:SACM1L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 31 36 67 14.0900683032298 19.6373400349589 -5.54727173172905 T:C:G T C 10 0.545481667637747 0.179194575248336 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 82 51 133 37.2705032537047 27.8195650495251 9.45093820417965 T:C C T 10 0.545481667637747 0.116719042198047 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 72 54 126 32.7253199300822 29.4560100524383 3.26930987764388 T:G G T 10 0.545481667637747 0.592047784007874 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 49141859 G/A 1 92 97 189 41.8156865773273 52.9117217608615 -11.0960351835342 A:G G A 10 0.545481667637747 0.108412687240117 ENSG00000172053:ENST00000306125:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000430182:exon_49141806_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000445471:exon_49141764_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000414533:exon_49141790_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000420147:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000464962:exon_49141757_49141944:QARS;ENSG00000172053:ENST00000452739:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000482261:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000470619:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000479495:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000418549:exon_49141806_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000417025:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000482438:exon_49141448_49141904:QARS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 50294275 C/T 1 128 162 290 58.1783465423684 88.368030157315 -30.1896836149466 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00039292881624917 ENSG00000114353:ENST00000422163:exon_50294155_50294284:GNAI2;ENSG00000114353:ENST00000446079:exon_50294155_50294284:GNAI2;ENSG00000114353:ENST00000491100:exon_50294155_50294284:GNAI2;ENSG00000114353:ENST00000313601:exon_50294155_50294284:GNAI2;ENSG00000114353:ENST00000441156:exon_50294155_50294284:GNAI2;ENSG00000114353:ENST00000440628:exon_50294155_50294284:GNAI2;ENSG00000114353:ENST00000451956:exon_50294155_50294284:GNAI2;ENSG00000114353:ENST00000490122:exon_50294155_50294284:GNAI2;ENSG00000114353:ENST00000266027:exon_50294155_50294284:GNAI2;ENSG00000114353:ENST00000492383:exon_50294155_50294284:GNAI2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 50326020 G/A 1 44 46 90 19.9988066239391 25.0921567113364 -5.09335008739723 A:G G A 10 0.545481667637747 0.291310545218238 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000426499:exon_50326014_50326070:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000464258:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000486322:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000492387:exon_50325943_50326142:IFRD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 50327429 A/G 1 20 18 38 9.09036664724506 9.81867001747944 -0.728303370234384 A:G A G 10 0.545481667637747 0.871215003267403 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50327360_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000414734:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000483071:exon_50327143_50327501:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000489569:exon_50327360_50327517:IFRD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 50334231 T/A 1 7 1 8 3.18162832653577 0.545481667637747 2.63614665889802 A:T T A 10 0.545481667637747 0.0793996161569039 ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 50336661 T/C 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 T:C T C 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000186792:ENST00000336307:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000415204:exon_50336644_50336832:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000513170:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000450982:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000066014:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50336644_50336847:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50336644_50336852:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50336644_50336831:NAT6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 50355730 T/G 1 6 10 16 2.72710999417352 5.45481667637747 -2.72770668220395 T:G T G 10 0.545481667637747 0.211649836550054 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50355221_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50355227_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50355240_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50355243_50355970:HYAL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 1 1 10 11 0.454518332362253 5.45481667637747 -5.00029834401522 T:G T G 10 0.545481667637747 0.00370111192657596 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 51430657 A/C 1 56 48 104 25.4530266122862 26.1831200466119 -0.730093434325685 A:C A C 10 0.545481667637747 0.921698563623488 ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 51737965 G/A 1 20 31 51 9.09036664724506 16.9099316967702 -7.81956504952509 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0341719668340858 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 80 62 142 36.3614665889802 33.8198633935403 2.54160319543993 T:C:G C T 10 0.545481667637747 0.736192833164791 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 52242103 G/A 1 70 79 149 31.8162832653577 43.093051743382 -11.2767684780243 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0701554159129721 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52242099_52242263:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52242099_52242263:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52242099_52242263:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52242099_52242263:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52242099_52242263:ALAS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 12 13 25 5.45421998834704 7.09126167929071 -1.63704169094367 T:C C T 10 0.545481667637747 0.550995061740953 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 52740657 C/T 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000114902:ENST00000474945:exon_52740159_52740719:SPCS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 53259854 T/C 1 209 199 408 94.9943314637109 108.550851859912 -13.5565203962008 T:C:G T C 10 0.545481667637747 0.179824486394204 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53258723_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53259767_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53259655_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53259675_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53259718_53259947:TKT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 53326142 G/A 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763894627012578 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 53856653 C/T 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 T:C C T 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53856518_53856669:CHDH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 53914093 G/A 1 10 11 21 4.54518332362253 6.00029834401522 -1.45511502039269 A:G G A 10 0.545481667637747 0.662266055550669 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53913966_53914099:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000498740:exon_53913966_53914136:ACTR8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 58109162 G/A 1 12 11 23 5.45421998834704 6.00029834401522 -0.546078355668181 A:G G A 10 0.545481667637747 0.837030175057015 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58108820_58109417:FLNB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 58112488 C/T 1 7 20 27 3.18162832653577 10.9096333527549 -7.72800502621917 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00326105779611682 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58112329_58112489:FLNB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 58118555 G/A 1 5 13 18 2.27259166181127 7.09126167929071 -4.81867001747944 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0309693444433747 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58117805_58118658:FLNB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 58154177 G/A 1 23 18 41 10.4539216443318 9.81867001747944 0.635251626852375 A:G G A 10 0.545481667637747 0.876630470577377 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 19 25 44 8.63584831488281 13.6370416909437 -5.00119337606087 T:C C T 10 0.545481667637747 0.133308064079262 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 58191242 C/G 1 8 14 22 3.63614665889802 7.63674334692846 -4.00059668803043 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0916744188680922 ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58191217_58191287:DNASE1L3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 58191266 C/T 1 14 8 22 6.36325665307154 4.36385334110198 1.99940331196957 T:C C T 10 0.545481667637747 0.521742512666216 ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58191217_58191287:DNASE1L3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 81754732 A/G 1 27 18 45 12.2719949737808 9.81867001747944 2.45332495630139 A:G A G 10 0.545481667637747 0.549935916866795 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81754595_81754764:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81754595_81754764:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81754595_81754764:GBE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 98304467 T/C 1 46 44 90 20.9078432886636 24.0011933760609 -3.09335008739723 T:C T C 10 0.545481667637747 0.526833748927178 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 98307630 C/T 1 22 28 50 9.99940331196957 15.2734866938569 -5.27408338188735 T:C C T 10 0.545481667637747 0.155596451205766 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 49 53 102 22.2713982857504 28.9105283848006 -6.63913009905019 A:G G A 10 0.545481667637747 0.196934706308394 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 101572495 C/T 1 19 19 38 8.63584831488281 10.3641516851172 -1.72830337023439 T:C C T 10 0.545481667637747 0.626589184197869 ENSG00000144802:ENST00000394054:exon_101571935_101572707:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000483180:exon_101571935_101572707:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000326151:exon_101572445_101572707:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000326172:exon_101571935_101572707:NFKBIZ HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 101576175 T/C 1 14 10 24 6.36325665307154 5.45481667637747 0.908439976694073 T:C T C 10 0.545481667637747 0.838386676963374 ENSG00000144802:ENST00000394054:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000483180:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000326151:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000326172:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000477601:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000495089:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000495719:exon_101576044_101576303:NFKBIZ HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 105422844 C/T 1 7 11 18 3.18162832653577 6.00029834401522 -2.81867001747945 T:C C T 10 0.545481667637747 0.237085594735494 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 105438957 T/G 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 105439026 G/A 1 9 2 11 4.09066499126028 1.09096333527549 2.99970165598478 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0774939953200738 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 112184927 A/G 1 36 49 85 16.3626599650411 26.7286017142496 -10.3659417492085 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0288712379131127 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 112188609 T/G 1 42 46 88 19.0897699592146 25.0921567113364 -6.00238675212173 T:G T G 10 0.545481667637747 0.201007039839530 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000496584:exon_112188603_112188651:BTLA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 112256630 A/G 1 47 33 80 21.3623616210259 18.0008950320457 3.36146658898024 A:G A G 10 0.545481667637747 0.501131533507588 ENSG00000144848:ENST00000283290:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000402314:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000495756:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000467275:exon_112256378_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000496423:exon_112256582_112256737:ATG3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 112299732 A/G 1 9 12 21 4.09066499126028 6.54578001165296 -2.45511502039269 A:G A G 10 0.545481667637747 0.381254161766230 ENSG00000138459:ENST00000492406:exon_112299393_112300173:SLC35A5;ENSG00000138459:ENST00000460713:exon_112299393_112300173:SLC35A5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 112727184 A/T 1 25 33 58 11.3629583090563 18.0008950320457 -6.63793672298933 A:T A T 10 0.545481667637747 0.0870457075900576 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 113286405 C/T 1 9 12 21 4.09066499126028 6.54578001165296 -2.45511502039269 T:C C T 10 0.545481667637747 0.381254161766230 ENSG00000072858:ENST00000264852:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000393830:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000491730:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000483946:exon_113286387_113286763:SIDT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 118931389 C/T 1 9 16 25 4.09066499126028 8.72770668220395 -4.63704169094367 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0715909203080173 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118930579_118931528:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118930587_118935191:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118930589_118931528:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118930589_118931528:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118930626_118931528:B4GALT4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 118945796 G/C 1 3 10 13 1.36355499708676 5.45481667637747 -4.09126167929071 C:G G C 10 0.545481667637747 0.0265022743429481 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000460321:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000491906:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118945733_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118945786_118945888:B4GALT4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 118948716 G/A 1 17 15 32 7.7268116501583 8.1822250145662 -0.455413364407903 A:G G A 10 0.545481667637747 0.861584441110341 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000471675:exon_118948694_118948900:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118948694_118949091:B4GALT4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 119013714 C/A 1 9 5 14 4.09066499126028 2.72740833818873 1.36325665307154 A:C C A 10 0.545481667637747 0.594821470841361 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119013220_119013851:ARHGAP31 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 119133183 G/A 1 17 15 32 7.7268116501583 8.1822250145662 -0.455413364407903 A:G G A 10 0.545481667637747 0.861584441110341 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 119196166 T/C 1 10 13 23 4.54518332362253 7.09126167929071 -2.54607835566818 T:C T C 10 0.545481667637747 0.302524544988392 ENSG00000163389:ENST00000295588:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000419577:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000497447:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000486607:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000476573:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000460339:exon_119196160_119196254:POGLUT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 119211294 A/G 1 21 18 39 9.54488497960731 9.81867001747944 -0.27378503787213 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000163389:ENST00000295588:exon_119211129_119213555:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000486607:exon_119211129_119211324:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000473648:exon_119211129_119211993:POGLUT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 121417434 T/G 1 23 19 42 10.4539216443318 10.3641516851172 0.0897699592146264 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000426235:exon_121415847_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000489400:exon_121415874_121417776:GOLGB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 124456742 G/C 1 38 41 79 17.2716966297656 22.3647483731476 -5.09305174338201 C:G G C 10 0.545481667637747 0.260177397122124 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124456639_124457086:UMPS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 124462808 C/T 1 46 24 70 20.9078432886636 13.0915600233059 7.81628326535771 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0712998127833456 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 124728626 A/G 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:G A G 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124728549_124728668:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000488654:exon_124728359_124728668:HEG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 124731689 T/A 1 11 9 20 4.99970165598478 4.90933500873972 0.0903666472450606 A:T T A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 124732618 A/G 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124732316_124732834:HEG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 124738107 C/T 1 7 10 17 3.18162832653577 5.45481667637747 -2.2731883498417 T:C C T 10 0.545481667637747 0.332311875410834 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124738106_124738340:HEG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 124739892 G/A 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 A:G G A 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124739636_124739974:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124739636_124739974:HEG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 124746049 A/G 1 3 9 12 1.36355499708676 4.90933500873972 -3.54578001165296 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0457815358442577 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 124746182 C/A 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:C C A 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 124746347 T/C 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 T:C T C 10 0.545481667637747 0.782586339670189 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 14 15 29 6.36325665307154 8.1822250145662 -1.81896836149466 T:C C T 10 0.545481667637747 0.577160759175787 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 125726048 G/C 1 20 12 32 9.09036664724506 6.54578001165296 2.5445866355921 C:G G C 10 0.545481667637747 0.382163131763023 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125725699_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125725916_125726068:SLC41A3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 126180820 G/A 1 15 7 22 6.8177749854338 3.81837167346423 2.99940331196957 A:G G A 10 0.545481667637747 0.284226176487771 ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126180378_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000515545:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000336332:exon_126179926_126181063:ZXDC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 127292333 G/A 1 24 32 56 10.9084399766941 17.4554133644079 -6.54697338771383 A:G G A 10 0.545481667637747 0.082401663897716 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 24 25 49 10.9084399766941 13.6370416909437 -2.7286017142496 T:C C T 10 0.545481667637747 0.474554776339739 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 127379270 C/T 1 12 5 17 5.45421998834704 2.72740833818873 2.7268116501583 T:C C T 10 0.545481667637747 0.227151988982216 ENSG00000114631:ENST00000342480:exon_127379221_127380002:PODXL2;ENSG00000114631:ENST00000302192:exon_127379221_127379876:PODXL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 127783698 A/T 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:T A T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000175792:ENST00000472125:exon_127783625_127784063:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000464873:exon_127783628_127784063:RUVBL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 127800071 A/G 1 79 84 163 35.906948256618 45.8204600815707 -9.91351182495276 A:G A G 10 0.545481667637747 0.134845729273687 ENSG00000175792:ENST00000322623:exon_127799803_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000417360:exon_127799807_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000478892:exon_127800025_127800252:RUVBL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 89 83 172 40.4521315802405 45.274978413933 -4.82284683369248 T:C C T 10 0.545481667637747 0.490962167017031 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 128614185 A/C 1 9 15 24 4.09066499126028 8.1822250145662 -4.09156002330593 A:C A C 10 0.545481667637747 0.103711750518253 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128614153_128614191:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 128890350 G/A 1 329 250 579 149.536531347181 136.370416909437 13.1661144377445 A:T:C:G G A 10 0.545481667637747 0.278116073967832 ENSG00000169714:ENST00000502976:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000422453:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000451728:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000446936:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000307433:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000393290:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000500450:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000504813:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000441626:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000502372:exon_128889922_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000512338:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000507573:exon_128890095_128890614:CNBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 128976396 T/C 1 16 33 49 7.27229331779605 18.0008950320457 -10.7286017142496 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00237252747041562 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 128976451 C/G 1 28 31 59 12.7265133061431 16.9099316967702 -4.18341839062707 C:G C G 10 0.545481667637747 0.296912620797675 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 129034758 A/G 1 26 29 55 11.8174766414186 15.8189683614947 -4.00149172007608 A:G A G 10 0.545481667637747 0.282458859602687 ENSG00000184897:ENST00000333762:exon_129033615_129035117:H1FX HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 133341988 T/C 1 24 28 52 10.9084399766941 15.2734866938569 -4.36504671716284 T:C T C 10 0.545481667637747 0.265287587211042 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133341935_133342037:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133341935_133342037:TOPBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 134670524 C/T 1 9 4 13 4.09066499126028 2.18192667055099 1.90873832070929 T:C C T 10 0.545481667637747 0.405734407269743 ENSG00000154928:ENST00000398015:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000482618:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000360935:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000425716:exon_134670213_134670560:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000488154:exon_134670213_134670560:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000474732:exon_134670213_134670604:EPHB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 137881265 T/A 1 5 11 16 2.27259166181127 6.00029834401522 -3.72770668220395 A:T T A 10 0.545481667637747 0.0783621541065292 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 145788467 T/C 0 0 11 11 0 6.00029834401522 -6.00029834401522 C T C 10 0.545481667637747 0.000171027304217214 ENSG00000152952:ENST00000282903:exon_145787227_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000461497:exon_145787227_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000360060:exon_145787231_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000494950:exon_145787968_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000495700:exon_145788028_145788659:PLOD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 19 0 19 8.63584831488281 0 8.63584831488281 G G 10 0.545481667637747 1.73877311294817e-05 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 148727133 G/A 1 10 13 23 4.54518332362253 7.09126167929071 -2.54607835566818 A:G G A 10 0.545481667637747 0.302524544988392 ENSG00000163754:ENST00000345003:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000296048:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000353986:exon_148727063_148727187:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000484197:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000461191:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000497528:exon_148727063_148727176:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000479119:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000469873:exon_148726668_148727189:GYG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 148759325 T/C 1 10 7 17 4.54518332362253 3.81837167346423 0.726811650158302 T:C T C 10 0.545481667637747 0.810670786245774 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000467858:exon_148759277_148759467:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000471807:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000497427:exon_148759277_148759831:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000483382:exon_148759288_148759455:HLTF HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 149459341 A/G 1 41 30 71 18.6352516268524 16.3644500291324 2.27080159771996 A:G A G 10 0.545481667637747 0.634590845553019 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 149459413 C/T 1 22 22 44 9.99940331196957 12.0005966880304 -2.00119337606087 T:C C T 10 0.545481667637747 0.549117968411728 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149459362_149459505:COMMD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 76 0 76 34.5433932595312 0 34.5433932595312 T T 10 0.545481667637747 1.10760285019085e-20 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 152554357 A/G 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 A:G A G 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000169860:ENST00000305097:exon_152553550_152554714:P2RY1;ENSG00000169860:ENST00000407427:exon_152553728_152554631:P2RY1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 158320597 T/C 1 5 9 14 2.27259166181127 4.90933500873972 -2.63674334692846 T:C T C 10 0.545481667637747 0.185033796786841 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 158366900 G/A 1 20 20 40 9.09036664724506 10.9096333527549 -1.81926670550988 A:G G A 10 0.545481667637747 0.634717532478894 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478251:exon_158366830_158368809:GFM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 14 10 24 6.36325665307154 5.45481667637747 0.908439976694073 T:C T C 10 0.545481667637747 0.838386676963374 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 43 51 94 19.5442882915769 27.8195650495251 -8.27527675794822 A:T:C C T 10 0.545481667637747 0.0973080014226037 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 170078232 C/T 1 6 11 17 2.72710999417352 6.00029834401522 -3.2731883498417 T:C C T 10 0.545481667637747 0.143847339286626 ENSG00000136603:ENST00000476188:exon_170078109_170078488:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000259119:exon_170077487_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000426052:exon_170078156_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000413427:exon_170077411_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000458537:exon_170077411_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000431185:exon_170078120_170079217:SKIL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 170893070 G/A 1 9 6 15 4.09066499126028 3.27289000582648 0.817774985433796 A:G G A 10 0.545481667637747 0.797861210956256 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000468757:exon_170893041_170893119:TNIK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 11 12 23 4.99970165598478 6.54578001165296 -1.54607835566818 A:G G A 10 0.545481667637747 0.536843443422341 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 178785549 G/A 1 34 26 60 15.4536233003166 14.1825233585814 1.27109994173518 A:G G A 10 0.545481667637747 0.796178040727884 ENSG00000172667:ENST00000311417:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000432729:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000441601:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000443441:exon_178785271_178785598:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000416402:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000414084:exon_178785271_178785597:ZMAT3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 178978078 T/G 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 T:G T G 10 0.545481667637747 0.152855532002609 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 179051170 A/G 1 31 37 68 14.0900683032298 20.1828217025966 -6.09275339936679 A:G A G 10 0.545481667637747 0.145213604557817 ENSG00000121864:ENST00000496856:exon_179051057_179052402:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000491818:exon_179051057_179051401:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000326361:exon_179051057_179053323:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466264:exon_179051057_179051617:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000484866:exon_179051057_179052400:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466663:exon_179051057_179051518:ZNF639 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 179306648 A/G 1 28 29 57 12.7265133061431 15.8189683614947 -3.09245505535158 A:G A G 10 0.545481667637747 0.427331927866647 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179306073_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179306243_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179306257_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179306619_179306783:MRPL47 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 179306775 C/T 1 66 60 126 29.9982099359087 32.7289000582648 -2.73069012235612 T:C C T 10 0.545481667637747 0.65509590799938 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179306073_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179306243_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179306257_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179306619_179306783:MRPL47 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 179322385 A/C 1 68 65 133 30.9072466006332 35.4563083964536 -4.54906179582034 A:T:C A C 10 0.545481667637747 0.434544663844608 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179322315_179322442:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179322315_179322428:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179322315_179322434:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179322315_179322437:MRPL47 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 180319981 G/T 1 7 1 8 3.18162832653577 0.545481667637747 2.63614665889802 T:G G T 10 0.545481667637747 0.0793996161569039 ENSG00000163728:ENST00000296015:exon_180319918_180320210:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000491380:exon_180319977_180320210:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000412756:exon_180319981_180320210:TTC14 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 180325487 T/C 1 6 11 17 2.72710999417352 6.00029834401522 -3.2731883498417 T:C T C 10 0.545481667637747 0.143847339286626 ENSG00000163728:ENST00000296015:exon_180325436_180325553:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000412756:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000465065:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000470669:exon_180325436_180326059:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000382584:exon_180325436_180325553:TTC14 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 182755209 T/G 1 20 20 40 9.09036664724506 10.9096333527549 -1.81926670550988 T:G T G 10 0.545481667637747 0.634717532478894 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182755202_182755222:MCCC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 182790249 G/A 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497959:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000490284:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000487634:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000486226:exon_182790215_182790275:MCCC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 182853554 G/A 1 57 55 112 25.9075449446484 30.0014917200761 -4.09394677542766 A:G G A 10 0.545481667637747 0.449051010921586 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 183904049 A/G 1 13 17 30 5.90873832070929 9.2731883498417 -3.36445002913241 A:G A G 10 0.545481667637747 0.271420658203315 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183903811_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000421340:exon_183903883_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000485921:exon_183903892_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000463685:exon_183903948_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000478288:exon_183903949_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183903962_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183903964_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000481116:exon_183903979_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000498136:exon_183903984_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466416:exon_183903987_183904068:ABCF3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 184039666 A/G 1 104 79 183 47.2699065656743 43.093051743382 4.17685482229231 A:G A G 10 0.545481667637747 0.553308154580205 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000457456:exon_184039070_184039815:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 11 3 14 4.99970165598478 1.63644500291324 3.36325665307154 A:C C A 10 0.545481667637747 0.104990031088893 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 185135338 T/A 0 1554 1 1555 706.321488490941 0.545481667637747 705.776006823303 T:C T C 10 0.545481667637747 0 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 1 1145 12 1157 520.42349055478 6.54578001165296 513.877710543127 A:T:C:G G T 10 0.545481667637747 3.99370333169013e-278 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 186509517 G/A 1 39 42 81 17.7262149621279 22.9102300407854 -5.1840150786575 A:G G A 10 0.545481667637747 0.265394046529305 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 186793423 C/T 1 102 70 172 46.3608699009498 38.1837167346423 8.17715316630752 T:C C T 10 0.545481667637747 0.221076693302770 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000457772:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186793350_186793640:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000470633:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000392479:exon_186793350_186796341:ST6GAL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 187088812 C/T 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 187088903 C/A 1 16 6 22 7.27229331779605 3.27289000582648 3.99940331196957 A:C C A 10 0.545481667637747 0.132095272636517 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 187089031 C/A 1 10 12 22 4.54518332362253 6.54578001165296 -2.00059668803043 A:C C A 10 0.545481667637747 0.401468669837045 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 189712010 G/A 1 21 12 33 9.54488497960731 6.54578001165296 2.99910496795435 A:G G A 10 0.545481667637747 0.382438779857024 ENSG00000090530:ENST00000319332:exon_189711883_189712072:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000427335:exon_189711883_189712072:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000444866:exon_189711883_189712072:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000426003:exon_189711883_189712072:LEPREL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 191093053 T/C 1 1 7 8 0.454518332362253 3.81837167346423 -3.36385334110198 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0271476654586150 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 191093080 A/G 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 A:G A G 10 0.545481667637747 0.152855532002609 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 191093175 T/A 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 A:T T A 10 0.545481667637747 0.152855532002609 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 191093310 A/G 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 191100561 C/A 1 48 52 100 21.8168799533881 28.3650467171628 -6.5481667637747 A:C C A 10 0.545481667637747 0.193151453264306 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191100535_191100614:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191100535_191100614:CCDC50 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 193855920 C/T 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 T:C C T 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000114315:ENST00000232424:exon_193855472_193856521:HES1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 194373832 T/C 1 25 19 44 11.3629583090563 10.3641516851172 0.998806623939133 T:C T C 10 0.545481667637747 0.879906091060462 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 194373833 G/A 1 26 18 44 11.8174766414186 9.81867001747944 1.99880662393914 A:G G A 10 0.545481667637747 0.650240685638277 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 194387300 C/T 1 14 15 29 6.36325665307154 8.1822250145662 -1.81896836149466 T:C C T 10 0.545481667637747 0.577160759175787 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194387181_194387301:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000427461:exon_194387181_194387301:LSG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 194408821 G/C 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 C:G G C 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000185112:ENST00000329759:exon_194406622_194409762:FAM43A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 195453064 T/G 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 T:G T G 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000498018:exon_195453052_195453443:MUC20 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 195591056 C/T 1 9 12 21 4.09066499126028 6.54578001165296 -2.45511502039269 T:C C T 10 0.545481667637747 0.381254161766230 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195590236_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195590236_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195590236_195591058:TNK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 195800811 C/T 1 90 99 189 40.9066499126028 54.002685096137 -13.0960351835342 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0577144286468774 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 196215549 C/T 1 19 3 22 8.63584831488281 1.63644500291324 6.99940331196957 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00226528022973579 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196215478_196215554:RNF168 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 196730759 G/A 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 A:G G A 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 197401952 T/C 1 10 7 17 4.54518332362253 3.81837167346423 0.726811650158302 T:C T C 10 0.545481667637747 0.810670786245774 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197398264_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197400891_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197401889_197402067:KIAA0226 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 197427557 A/G 1 22 27 49 9.99940331196957 14.7280050262192 -4.7286017142496 A:G A G 10 0.545481667637747 0.197312998284813 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000447048:exon_197427484_197427640:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 197432029 C/A 1 10 7 17 4.54518332362253 3.81837167346423 0.726811650158302 A:C C A 10 0.545481667637747 0.810670786245774 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000467303:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000474214:exon_197431963_197432046:KIAA0226 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 197432036 C/T 1 10 7 17 4.54518332362253 3.81837167346423 0.726811650158302 T:C C T 10 0.545481667637747 0.810670786245774 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000467303:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000474214:exon_197431963_197432046:KIAA0226 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 3 197597044 C/T 1 15 5 20 6.8177749854338 2.72740833818873 4.09036664724506 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0745910243039017 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197597031_197597047:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000471667:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000483442:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000473177:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000428136:exon_197597031_197597149:LRCH3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 843508 C/T 1 48 44 92 21.8168799533881 24.0011933760609 -2.18431342267272 T:C C T 10 0.545481667637747 0.676106150459011 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843064_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843065_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843096_843562:GAK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 843695 A/G 1 50 46 96 22.7259166181127 25.0921567113364 -2.36624009322371 A:G A G 10 0.545481667637747 0.682107852420898 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843680_844197:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843680_843856:GAK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 28 13 41 12.7265133061431 7.09126167929071 5.63525162685237 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0852954736087108 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 1244416 A/G 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 A:G A G 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 123 88 211 55.9057548805571 48.0023867521217 7.90336812843539 A:G G A 10 0.545481667637747 0.299815624308015 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 1729953 G/A 0 60 1 61 27.2710999417352 0.545481667637747 26.7256182740974 C:G G C 10 0.545481667637747 6.03192502011204e-15 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000467746:exon_1729435_1729959:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 14 10 24 6.36325665307154 5.45481667637747 0.908439976694073 T:C C T 10 0.545481667637747 0.838386676963374 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 1986542 C/T 1 12 12 24 5.45421998834704 6.54578001165296 -1.09156002330593 T:C C T 10 0.545481667637747 0.685991730875607 ENSG00000185049:ENST00000382882:exon_1986535_1986646:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000467661:exon_1986535_1986646:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000333877:exon_1986535_1986646:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000416258:exon_1986535_1986646:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000463820:exon_1986535_1986646:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000411638:exon_1986535_1986646:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000453740:exon_1986535_1986646:WHSC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 2906707 G/T 1 65 74 139 29.5436916035464 40.3656434051933 -10.8219518016468 T:C:G G T 10 0.545481667637747 0.0734248468972803 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2906491_2907448:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2906491_2906835:ADD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 59 49 108 26.8165816093729 26.7286017142496 0.0879798951233255 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 2934308 G/A 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:G G A 10 0.545481667637747 0.740297003186309 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 3213832 G/A 1 17 15 32 7.7268116501583 8.1822250145662 -0.455413364407903 A:G G A 10 0.545481667637747 0.861584441110341 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000509751:exon_3213639_3213869:HTT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 40 27 67 18.1807332944901 14.7280050262192 3.45272826827095 T:C T C 10 0.545481667637747 0.462033179141114 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 3227419 A/G 1 47 40 87 21.3623616210259 21.8192667055099 -0.456905084483985 A:G A G 10 0.545481667637747 0.914831465671605 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 36 37 73 16.3626599650411 20.1828217025966 -3.82016173755553 A:G G A 10 0.545481667637747 0.411110072576103 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 3234980 G/A 1 29 29 58 13.1810316385053 15.8189683614947 -2.63793672298932 A:G G A 10 0.545481667637747 0.511580658365649 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3234890_3235080:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3234890_3235080:HTT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 3514689 T/C 1 48 41 89 21.8168799533881 22.3647483731476 -0.547868419759482 T:C T C 10 0.545481667637747 0.915622365664333 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 3526645 C/T 1 45 50 95 20.4533249563014 27.2740833818873 -6.82075842558596 T:C C T 10 0.545481667637747 0.18038719122956 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3526634_3526873:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3526634_3526778:LRPAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 4543553 C/T 1 11 11 22 4.99970165598478 6.00029834401522 -1.00059668803043 T:C C T 10 0.545481667637747 0.67524038559697 ENSG00000168818:ENST00000505286:exon_4543524_4543737:STX18;ENSG00000168818:ENST00000306200:exon_4543524_4543755:STX18;ENSG00000168818:ENST00000512780:exon_4543524_4543758:STX18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 5812778 G/A 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:G G A 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5812680_5816032:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5812680_5815889:EVC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 6594947 A/C 1 2 7 9 0.909036664724506 3.81837167346423 -2.90933500873972 A:C A C 10 0.545481667637747 0.0890372070351746 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6594900_6595077:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6594900_6595011:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6594900_6595077:MAN2B2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 6606864 A/G 1 5 11 16 2.27259166181127 6.00029834401522 -3.72770668220395 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0783621541065292 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6606782_6607056:MAN2B2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 6612909 C/A 1 3 7 10 1.36355499708676 3.81837167346423 -2.45481667637747 A:C C A 10 0.545481667637747 0.201970346156534 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6612813_6613005:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6612813_6613005:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6612813_6613005:MAN2B2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 6616056 C/T 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 T:C C T 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6615945_6616082:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6615945_6616082:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6615945_6616082:MAN2B2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 8228948 T/C 1 8 8 16 3.63614665889802 4.36385334110198 -0.727706682203952 T:C T C 10 0.545481667637747 0.8039768822367 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000514274:exon_8228707_8229196:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508438:exon_8228688_8229000:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 8229005 C/T 0 11 0 11 4.99970165598478 0 4.99970165598478 C C 10 0.545481667637747 0.00144330453530437 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000514274:exon_8228707_8229196:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 14 9 23 6.36325665307154 4.90933500873972 1.45392164433182 A:G A G 10 0.545481667637747 0.676547146622212 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 8229774 C/T 1 12 7 19 5.45421998834704 3.81837167346423 1.63584831488281 T:C C T 10 0.545481667637747 0.497845829751492 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 11 14 25 4.99970165598478 7.63674334692846 -2.63704169094367 T:C T C 10 0.545481667637747 0.319558675893505 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 T:C T C 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 10669522 A/C 1 3 13 16 1.36355499708676 7.09126167929071 -5.72770668220395 A:C A C 10 0.545481667637747 0.0047324583374105 ENSG00000109684:ENST00000226951:exon_10669483_10669535:CLNK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 13604182 T/C 1 23 14 37 10.4539216443318 7.63674334692846 2.81717829740336 T:C T C 10 0.545481667637747 0.410682812854318 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 13604418 G/C 1 18 17 35 8.18132998252056 9.2731883498417 -1.09185836732114 C:G G C 10 0.545481667637747 0.736704595175774 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 13615174 G/A 1 20 18 38 9.09036664724506 9.81867001747944 -0.728303370234384 A:G G A 10 0.545481667637747 0.871215003267403 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000482713:exon_13615130_13615285:BOD1L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 17503433 C/T 1 16 14 30 7.27229331779605 7.63674334692846 -0.364450029132409 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 17818885 T/C 1 11 11 22 4.99970165598478 6.00029834401522 -1.00059668803043 T:C T C 10 0.545481667637747 0.67524038559697 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000509719:exon_17818855_17819076:NCAPG HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 25253995 C/T 1 30 16 46 13.6355499708676 8.72770668220395 4.90784328866364 T:C C T 10 0.545481667637747 0.182297714622472 ENSG00000038210:ENST00000512921:exon_25253943_25254097:PI4K2B;ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25253943_25254097:PI4K2B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 25363901 T/A 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 A:T T A 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000168228:ENST00000450254:exon_25363848_25363923:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000302874:exon_25363848_25363923:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000507760:exon_25363848_25363923:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000505412:exon_25363848_25363923:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000508058:exon_25363848_25363923:ZCCHC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 19 20 39 8.63584831488281 10.9096333527549 -2.27378503787213 T:C T C 10 0.545481667637747 0.521371073133049 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 38016395 T/G 1 3 9 12 1.36355499708676 4.90933500873972 -3.54578001165296 T:G T G 10 0.545481667637747 0.0457815358442577 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 38799710 T/C 1 12 10 22 5.45421998834704 5.45481667637747 -0.000596688030433334 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 39000305 A/G 1 11 7 18 4.99970165598478 3.81837167346423 1.18132998252055 A:G A G 10 0.545481667637747 0.641996695541785 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_39000260_39000529:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000372489:exon_39000243_39000529:TMEM156 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 39303925 A/G 1 18 35 53 8.18132998252056 19.0918583673211 -10.9105283848006 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00340023922325818 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39303898_39303996:RFC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 18 4 22 8.18132998252056 2.18192667055099 5.99940331196957 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00989075019963312 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 39466819 G/T 1 17 13 30 7.7268116501583 7.09126167929071 0.635549970867592 T:G G T 10 0.545481667637747 0.856505800488025 ENSG00000121897:ENST00000340169:exon_39466666_39466822:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000261434:exon_39466666_39466822:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000433013:exon_39466666_39466822:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000381846:exon_39466666_39466822:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000515061:exon_39466666_39466822:LIAS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 40123377 T/G 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 T:G T G 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000078177:ENST00000261435:exon_40121552_40123929:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000381804:exon_40121552_40123929:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000511480:exon_40121552_40123929:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000513269:exon_40121552_40123929:N4BP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 40428010 T/C 1 9 6 15 4.09066499126028 3.27289000582648 0.817774985433796 T:C T C 10 0.545481667637747 0.797861210956256 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40425272_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40425698_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40426355_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40427429_40428160:RBM47 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 41258970 A/G 1 22 20 42 9.99940331196957 10.9096333527549 -0.910230040785374 A:G A G 10 0.545481667637747 0.877111986995837 ENSG00000154277:ENST00000514924:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000503431:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000284440:exon_41258850_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381760:exon_41258925_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512419:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381762:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000505232:exon_41258949_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000504818:exon_41258950_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000508768:exon_41258957_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512788:exon_41258962_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000472501:exon_41258963_41259037:UCHL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 41258978 C/T 1 31 29 60 14.0900683032298 15.8189683614947 -1.72890005826482 T:C C T 10 0.545481667637747 0.698171928393748 ENSG00000154277:ENST00000514924:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000503431:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000284440:exon_41258850_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381760:exon_41258925_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512419:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381762:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000505232:exon_41258949_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000504818:exon_41258950_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000508768:exon_41258957_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512788:exon_41258962_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000472501:exon_41258963_41259037:UCHL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 42457545 G/A 1 13 12 25 5.90873832070929 6.54578001165296 -0.637041690943674 A:G G A 10 0.545481667637747 0.842576598281257 ENSG00000124406:ENST00000381668:exon_42457542_42457616:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000514372:exon_42457542_42457616:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000381662:exon_42457542_42457616:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000264449:exon_42457542_42457616:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000506602:exon_42457542_42457616:ATP8A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 53751932 C/T 1 5 9 14 2.27259166181127 4.90933500873972 -2.63674334692846 T:C C T 10 0.545481667637747 0.185033796786841 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_53751914_53752033:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_53751914_53752033:SCFD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 54011526 A/G 1 19 16 35 8.63584831488281 8.72770668220395 -0.0918583673211444 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 56291528 T/C 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 T:C T C 10 0.545481667637747 0.243356459282646 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 56766050 T/C 1 24 25 49 10.9084399766941 13.6370416909437 -2.7286017142496 T:C T C 10 0.545481667637747 0.474554776339739 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56765851_56766050:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56765851_56766050:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56765851_56766050:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56765851_56766050:EXOC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 57204777 A/C 1 13 7 20 5.90873832070929 3.81837167346423 2.09036664724506 A:C A C 10 0.545481667637747 0.378879562360477 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57204771_57204957:AASDH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 57211352 T/C 1 11 6 17 4.99970165598478 3.27289000582648 1.7268116501583 T:C T C 10 0.545481667637747 0.471137770776418 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57211293_57211456:AASDH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 57215677 G/A 1 11 3 14 4.99970165598478 1.63644500291324 3.36325665307154 A:G G A 10 0.545481667637747 0.104990031088893 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57215094_57216224:AASDH HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 57273840 C/G 1 11 15 26 4.99970165598478 8.1822250145662 -3.18252335858142 C:G C G 10 0.545481667637747 0.239869675139145 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000510643:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507724:exon_57273816_57273882:PPAT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 57333822 G/T 1 14 9 23 6.36325665307154 4.90933500873972 1.45392164433182 T:G G T 10 0.545481667637747 0.676547146622212 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57333081_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57333783_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000504757:exon_57333784_57333910:SRP72 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 68904558 C/T 0 8 0 8 3.63614665889802 0 3.63614665889802 C C 10 0.545481667637747 0.0096600748165856 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 69203080 T/C 1 45 43 88 20.4533249563014 23.4557117084231 -3.00238675212173 T:C T C 10 0.545481667637747 0.522916030341431 ENSG00000083896:ENST00000344157:exon_69202745_69203168:YTHDC1;ENSG00000083896:ENST00000355665:exon_69202745_69203168:YTHDC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 73942678 C/T 1 33 22 55 14.9991049679544 12.0005966880304 2.99850827992392 T:C C T 10 0.545481667637747 0.498774139551763 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 14 3 17 6.36325665307154 1.63644500291324 4.7268116501583 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0264033241055959 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 84383810 C/T 1 6 8 14 2.72710999417352 4.36385334110198 -1.63674334692846 T:C C T 10 0.545481667637747 0.428770074510924 ENSG00000163322:ENST00000321945:exon_84382092_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000475656:exon_84382098_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000506553:exon_84383162_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000504777:exon_84383228_84384055:FAM175A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 89319296 T/C 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 T:C T C 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000138642:ENST00000511939:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000380265:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000438983:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000264346:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000506714:exon_89319260_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000515365:exon_89319294_89319361:HERC6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 89397091 A/G 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 A:G A G 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000138646:ENST00000264350:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000508159:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000510223:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000502913:exon_89396992_89397181:HERC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 89625427 G/C 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 C:G G C 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000138641:ENST00000402738:exon_89625249_89625432:HERC3;ENSG00000138641:ENST00000264345:exon_89625249_89625432:HERC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 95186055 A/G 1 4 10 14 1.81807332944901 5.45481667637747 -3.63674334692846 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0615052435608368 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000506089:exon_95185679_95186057:SMARCAD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 95561459 A/G 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 A:G A G 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000163110:ENST00000437932:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000503974:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000514743:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000380176:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000506632:exon_95561427_95561601:PDLIM5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 103964529 A/C 1 7 9 16 3.18162832653577 4.90933500873972 -1.72770668220395 A:C A C 10 0.545481667637747 0.4555478790811 ENSG00000164038:ENST00000362026:exon_103964453_103964602:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000506288:exon_103964453_103964602:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000339611:exon_103964453_103964602:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000394785:exon_103964453_103964602:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000503103:exon_103964453_103964602:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000503230:exon_103964453_103964602:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000510976:exon_103964453_103964602:NHEDC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 104059542 G/A 1 11 25 36 4.99970165598478 13.6370416909437 -8.63734003495889 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00420406934175708 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104059508_104059606:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104059508_104059606:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104059508_104059609:CENPE HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 104061993 C/G 1 31 20 51 14.0900683032298 10.9096333527549 3.1804349504749 C:G C G 10 0.545481667637747 0.401399456956214 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 104062223 C/T 1 15 21 36 6.8177749854338 11.4551150203927 -4.63734003495889 T:C C T 10 0.545481667637747 0.13352255184162 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 104082349 C/T 1 12 13 25 5.45421998834704 7.09126167929071 -1.63704169094367 T:C C T 10 0.545481667637747 0.550995061740953 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 108641300 T/C 1 13 12 25 5.90873832070929 6.54578001165296 -0.637041690943674 T:C T C 10 0.545481667637747 0.842576598281257 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 108641317 G/A 1 11 10 21 4.99970165598478 5.45481667637747 -0.455115020392687 A:G G A 10 0.545481667637747 0.831123791313476 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 119200331 T/C 1 23 10 33 10.4539216443318 5.45481667637747 4.99910496795435 T:C T C 10 0.545481667637747 0.114269878769504 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 119736796 A/C 1 24 23 47 10.9084399766941 12.5460783556682 -1.63763837897411 A:C A C 10 0.545481667637747 0.662184348761034 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 122617745 G/A 1 54 37 91 24.5439899475617 20.1828217025966 4.36116824496503 A:G G A 10 0.545481667637747 0.400152165748768 ENSG00000164111:ENST00000296511:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000512232:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000501272:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000506395:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000515017:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000511552:exon_122617736_122618130:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513428:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513523:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513728:exon_122617736_122617779:ANXA5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 128814492 G/A 1 10 12 22 4.54518332362253 6.54578001165296 -2.00059668803043 A:G G A 10 0.545481667637747 0.401468669837045 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814355_128814573:PLK4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 128842761 G/A 1 5 9 14 2.27259166181127 4.90933500873972 -2.63674334692846 A:G G A 10 0.545481667637747 0.185033796786841 ENSG00000164073:ENST00000296468:exon_128842679_128842926:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000515130:exon_128842679_128842926:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000513559:exon_128842679_128842926:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000504126:exon_128842512_128842926:MFSD8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 128949799 C/T 1 14 10 24 6.36325665307154 5.45481667637747 0.908439976694073 T:C C T 10 0.545481667637747 0.838386676963374 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 128949850 A/G 1 14 11 25 6.36325665307154 6.00029834401522 0.362958309056325 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 128949929 C/A 1 15 6 21 6.8177749854338 3.27289000582648 3.54488497960731 A:C C A 10 0.545481667637747 0.130974510766364 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 129012638 A/G 1 23 23 46 10.4539216443318 12.5460783556682 -2.09215671133636 A:G A G 10 0.545481667637747 0.556475636818224 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000394288:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000432347:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129012502_129012667:LARP1B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 129043204 C/G 1 11 9 20 4.99970165598478 4.90933500873972 0.0903666472450606 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 129043286 C/T 1 6 13 19 2.72710999417352 7.09126167929071 -4.36415168511719 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0629589987215586 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507259:exon_129043272_129043343:LARP1B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 129100643 G/A 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 A:G G A 10 0.545481667637747 0.243356459282646 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129100561_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129100561_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129100561_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129100561_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507259:exon_129100561_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508648:exon_129100469_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000506199:exon_129100469_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000503725:exon_129100502_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000417169:exon_129100502_129100667:LARP1B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 38 35 73 17.2716966297656 19.0918583673211 -1.82016173755553 T:C T C 10 0.545481667637747 0.724793007290324 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 43 49 92 19.5442882915769 26.7286017142496 -7.18431342267272 T:C C T 10 0.545481667637747 0.143109483195401 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 154478222 C/T 1 9 11 20 4.09066499126028 6.00029834401522 -1.90963335275494 T:C C T 10 0.545481667637747 0.501706253434889 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000462540:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154478118_154478234:KIAA0922 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 154525138 A/G 1 69 74 143 31.3617649329955 40.3656434051933 -9.00387847219782 A:G A G 10 0.545481667637747 0.131642058678655 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154524954_154525534:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154524954_154525582:KIAA0922 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 154553833 A/G 1 13 5 18 5.90873832070929 2.72740833818873 3.18132998252055 A:G A G 10 0.545481667637747 0.158872164572138 ENSG00000121210:ENST00000478919:exon_154553516_154553990:KIAA0922 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 154553877 C/T 1 33 40 73 14.9991049679544 21.8192667055099 -6.82016173755553 T:C C T 10 0.545481667637747 0.126250300743340 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000478919:exon_154553516_154553990:KIAA0922 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 159790392 G/A 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 A:G G A 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000052795:ENST00000264433:exon_159789254_159790580:FNIP2;ENSG00000052795:ENST00000379346:exon_159789254_159790580:FNIP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 169928842 G/T 1 11 10 21 4.99970165598478 5.45481667637747 -0.455115020392687 T:G G T 10 0.545481667637747 0.831123791313476 ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 169931268 G/A 1 13 3 16 5.90873832070929 1.63644500291324 4.27229331779605 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0422836204844924 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 169931274 G/A 1 12 3 15 5.45421998834704 1.63644500291324 3.8177749854338 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0670347185280012 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 186085314 T/G 1 15 19 34 6.8177749854338 10.3641516851172 -3.5463766996834 T:G T G 10 0.545481667637747 0.232561835944529 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186085183_186085333:KIAA1430 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 186097045 C/T 1 33 23 56 14.9991049679544 12.5460783556682 2.45302661228617 T:C C T 10 0.545481667637747 0.591933886776825 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 29 35 64 13.1810316385053 19.0918583673211 -5.91082672881581 T:C T C 10 0.545481667637747 0.166913485347293 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 17 30 47 7.7268116501583 16.3644500291324 -8.63763837897411 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0125810972789362 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 186294198 C/T 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186294010_186294233:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186294010_186294233:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186294010_186294233:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186294010_186294233:LRP2BP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 4 186299260 A/G 1 13 17 30 5.90873832070929 9.2731883498417 -3.36445002913241 A:G A G 10 0.545481667637747 0.271420658203315 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 231111 T/C 1 82 80 162 37.2705032537047 43.6385334110198 -6.36803015731501 T:C T C 10 0.545481667637747 0.343852481904463 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_231058_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_231058_231115:SDHA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 311478 T/C 1 95 115 210 43.179241574414 62.7303917783409 -19.5511502039269 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00830253030021986 ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_311408_311609:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_311408_312526:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507473:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000511482:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000512466:exon_308312_311517:PDCD6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 422955 C/G 1 19 17 36 8.63584831488281 9.2731883498417 -0.637340034958891 C:G C G 10 0.545481667637747 0.86810856223121 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000510910:exon_422492_422973:AHRR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 432905 C/A 1 1 7 8 0.454518332362253 3.81837167346423 -3.36385334110198 A:C C A 10 0.545481667637747 0.0271476654586150 ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_432140_433062:AHRR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 434722 G/C 1 16 15 31 7.27229331779605 8.1822250145662 -0.909931696770157 C:G G C 10 0.545481667637747 0.857266052198222 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_433968_434972:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 442571 A/C 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:C A C 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 25 40 65 11.3629583090563 21.8192667055099 -10.4563083964536 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0121508562641473 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 475104 A/G 1 9 17 26 4.09066499126028 9.2731883498417 -5.18252335858142 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0487046981211123 ENSG00000066230:ENST00000264938:exon_474998_475247:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000514375:exon_474998_475247:SLC9A3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 479905 A/C 1 11 25 36 4.99970165598478 13.6370416909437 -8.63734003495889 A:C A C 10 0.545481667637747 0.00420406934175708 ENSG00000066230:ENST00000507407:exon_479752_480080:SLC9A3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 1063998 G/A 1 1 7 8 0.454518332362253 3.81837167346423 -3.36385334110198 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0271476654586150 ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1063959_1064090:SLC12A7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 1065399 C/T 1 8 2 10 3.63614665889802 1.09096333527549 2.54518332362253 T:C C T 10 0.545481667637747 0.123918791716156 ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1065398_1065593:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1065398_1065593:SLC12A7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 22 19 41 9.99940331196957 10.3641516851172 -0.364748373147627 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 5447607 A/G 1 11 3 14 4.99970165598478 1.63644500291324 3.36325665307154 A:G A G 10 0.545481667637747 0.104990031088893 ENSG00000164151:ENST00000512608:exon_5447540_5447622:KIAA0947;ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5447540_5447622:KIAA0947 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 5462607 A/G 1 16 13 29 7.27229331779605 7.09126167929071 0.181031638505338 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 5462620 G/A 1 13 15 28 5.90873832070929 8.1822250145662 -2.27348669385692 A:G G A 10 0.545481667637747 0.44954716189734 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 5489383 G/A 1 33 39 72 14.9991049679544 21.2737850378721 -6.27468006991778 A:G G A 10 0.545481667637747 0.155586474752818 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5489262_5490347:KIAA0947 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 6600064 G/T 1 93 112 205 42.2702049096895 61.0939467754277 -18.8237418657381 T:G G T 10 0.545481667637747 0.00932960891965139 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 6600150 G/A 1 124 112 236 56.3602732129194 61.0939467754277 -4.73367356250829 A:G G A 10 0.545481667637747 0.556597291296814 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6600143_6600345:NSUN2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 6605532 C/A 1 14 5 19 6.36325665307154 2.72740833818873 3.63584831488281 A:C C A 10 0.545481667637747 0.109537367994142 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 6633779 C/G 1 11 12 23 4.99970165598478 6.54578001165296 -1.54607835566818 C:G C G 10 0.545481667637747 0.536843443422341 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 6748659 T/C 1 12 12 24 5.45421998834704 6.54578001165296 -1.09156002330593 T:C T C 10 0.545481667637747 0.685991730875607 ENSG00000112941:ENST00000230859:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000511764:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000514697:exon_6748577_6748703:PAPD7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 7866967 G/C 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 C:G G C 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000511261:exon_7866759_7867502:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 7868030 T/C 1 3 6 9 1.36355499708676 3.27289000582648 -1.90933500873972 T:C T C 10 0.545481667637747 0.316116386178568 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000504695:exon_7867463_7868220:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507572:exon_7867603_7868145:FASTKD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 7878424 T/A 1 12 10 22 5.45421998834704 5.45481667637747 -0.000596688030433334 A:T T A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 7889216 G/A 1 14 11 25 6.36325665307154 6.00029834401522 0.362958309056325 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7889208_7889276:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 7889304 C/T 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 T:C C T 10 0.545481667637747 0.527815080970101 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 10227548 C/A 1 2 9 11 0.909036664724506 4.90933500873972 -4.00029834401522 A:C C A 10 0.545481667637747 0.0289107038402345 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10226442_10227759:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10226845_10227759:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10227068_10227759:FAM173B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 10239261 G/A 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 10239278 C/T 1 7 2 9 3.18162832653577 1.09096333527549 2.09066499126028 T:C C T 10 0.545481667637747 0.195909819758449 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 14420027 A/C 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 A:C A C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509354:exon_14419887_14420295:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512979:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000507714:exon_14419923_14420130:TRIO HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 14498727 G/A 1 7 14 21 3.18162832653577 7.63674334692846 -4.45511502039269 A:G G A 10 0.545481667637747 0.077082718790732 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000344135:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508343:exon_14498628_14499290:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508283:exon_14498625_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508717:exon_14498625_14498749:TRIO HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 16 12 28 7.27229331779605 6.54578001165296 0.726513306143085 A:G A G 10 0.545481667637747 0.85098446461766 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 31423007 T/C 1 9 16 25 4.09066499126028 8.72770668220395 -4.63704169094367 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0715909203080173 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31422894_31423428:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000510178:exon_31422894_31423051:DROSHA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 32400266 A/G 1 28 28 56 12.7265133061431 15.2734866938569 -2.54697338771383 A:G A G 10 0.545481667637747 0.505214501031278 ENSG00000056097:ENST00000265069:exon_32400112_32400308:ZFR;ENSG00000056097:ENST00000382126:exon_32400112_32400308:ZFR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 33989518 C/T 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 T:C:G C T 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33989216_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33988789_33989607:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 36985303 A/G 1 19 19 38 8.63584831488281 10.3641516851172 -1.72830337023439 A:G A G 10 0.545481667637747 0.626589184197869 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 37333727 A/G 1 13 5 18 5.90873832070929 2.72740833818873 3.18132998252055 A:G A G 10 0.545481667637747 0.158872164572138 ENSG00000113569:ENST00000231498:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000381843:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000434056:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000513532:exon_37333565_37333735:NUP155 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 43704542 C/G 1 62 48 110 28.1801366064597 26.1831200466119 1.99701655984783 C:G C G 10 0.545481667637747 0.774095028422773 ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43704357_43707507:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43704357_43705334:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43704357_43705595:NNT;ENSG00000112992:ENST00000503059:exon_43704357_43704846:NNT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 54603822 T/C 0 9 0 9 4.09066499126028 0 4.09066499126028 T T 10 0.545481667637747 0.00510371084910098 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54603588_54603975:SKIV2L2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 54960609 A/G 1 7 2 9 3.18162832653577 1.09096333527549 2.09066499126028 A:G A G 10 0.545481667637747 0.195909819758449 ENSG00000177058:ENST00000515159:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000505708:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000396865:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000318672:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000416547:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000515629:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000508124:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000512595:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000511233:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000512208:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000524154:exon_54960521_54960960:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000507447:exon_54960388_54960691:SLC38A9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 54960673 C/G 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 C:G C G 10 0.545481667637747 0.527815080970101 ENSG00000177058:ENST00000515159:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000505708:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000396865:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000318672:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000416547:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000515629:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000508124:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000512595:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000511233:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000512208:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000524154:exon_54960521_54960960:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000507447:exon_54960388_54960691:SLC38A9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 54960687 C/T 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 T:C C T 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000177058:ENST00000515159:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000505708:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000396865:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000318672:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000416547:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000515629:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000508124:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000512595:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000511233:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000512208:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000524154:exon_54960521_54960960:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000507447:exon_54960388_54960691:SLC38A9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 59895055 A/G 1 7 10 17 3.18162832653577 5.45481667637747 -2.2731883498417 A:G A G 10 0.545481667637747 0.332311875410834 ENSG00000035499:ENST00000265036:exon_59894902_59895087:DEPDC1B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 61694379 T/C 1 26 20 46 11.8174766414186 10.9096333527549 0.90784328866364 T:C T C 10 0.545481667637747 0.882601219104775 ENSG00000086189:ENST00000199320:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000506390:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000514911:exon_61694256_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000509182:exon_61694338_61694387:DIMT1L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 65108215 A/G 1 4 17 21 1.81807332944901 9.2731883498417 -7.45511502039269 A:G A G 10 0.545481667637747 0.00145567459101057 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000509935:exon_65108082_65108218:NLN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 68417643 C/T 1 6 11 17 2.72710999417352 6.00029834401522 -3.2731883498417 T:C C T 10 0.545481667637747 0.143847339286626 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68417580_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68417574_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000512367:exon_68417521_68417722:SLC30A5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 16 26 42 7.27229331779605 14.1825233585814 -6.91023004078537 A:T A T 10 0.545481667637747 0.042767845616875 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 68471247 G/A 1 49 38 87 22.2713982857504 20.7283033702344 1.54309491551601 A:G G A 10 0.545481667637747 0.82967224770488 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000505500:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000507798:exon_68471224_68471364:CCNB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 24 31 55 10.9084399766941 16.9099316967702 -6.00149172007608 T:C C T 10 0.545481667637747 0.106417830618377 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 68695940 T/G 1 22 23 45 9.99940331196957 12.5460783556682 -2.54667504369861 T:G T G 10 0.545481667637747 0.458001602818798 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000513214:exon_68695876_68695996:RAD17 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 70858342 A/G 1 8 17 25 3.63614665889802 9.2731883498417 -5.63704169094367 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0270381460681358 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70858101_70858347:BDP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 74877266 C/T 1 15 7 22 6.8177749854338 3.81837167346423 2.99940331196957 T:C C T 10 0.545481667637747 0.284226176487771 ENSG00000122008:ENST00000241436:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000352007:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000380481:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000425306:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000503479:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000506928:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000510815:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000515295:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508867:exon_74877034_74878790:POLK;ENSG00000122008:ENST00000514141:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000504026:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000511527:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000505975:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508526:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000509126:exon_74877034_74877273:POLK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 75003678 T/C 1 7 13 20 3.18162832653577 7.09126167929071 -3.90963335275494 T:C T C 10 0.545481667637747 0.113949941344795 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000507421:exon_75003309_75003700:POC5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 75884734 G/A 1 9 9 18 4.09066499126028 4.90933500873972 -0.818670017479445 A:G G A 10 0.545481667637747 0.814103892547842 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75884731_75884798:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75884731_75884798:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75884731_75884798:IQGAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 75906851 T/C 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000504254:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000513534:exon_75906845_75907008:IQGAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 75906923 C/G 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000504254:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000513534:exon_75906845_75907008:IQGAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 75932869 C/T 1 12 13 25 5.45421998834704 7.09126167929071 -1.63704169094367 T:C C T 10 0.545481667637747 0.550995061740953 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75932866_75932929:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000515505:exon_75932859_75932933:IQGAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 75932965 G/C 1 11 13 24 4.99970165598478 7.09126167929071 -2.09156002330593 C:G G C 10 0.545481667637747 0.41817747956773 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 75948650 A/G 1 6 10 16 2.72710999417352 5.45481667637747 -2.72770668220395 A:G A G 10 0.545481667637747 0.211649836550054 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75948575_75948658:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75948575_75948658:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75948575_75948658:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75948575_75948658:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75948575_75948658:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75948575_75948658:IQGAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 14 10 24 6.36325665307154 5.45481667637747 0.908439976694073 T:C T C 10 0.545481667637747 0.838386676963374 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 78596044 T/C 1 3 6 9 1.36355499708676 3.27289000582648 -1.90933500873972 A:T:C T C 10 0.545481667637747 0.316116386178568 ENSG00000152409:ENST00000282259:exon_78595976_78596141:JMY;ENSG00000152409:ENST00000396135:exon_78595976_78596141:JMY;ENSG00000152409:ENST00000396137:exon_78595976_78596141:JMY HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 80604430 C/T 1 25 41 66 11.3629583090563 22.3647483731476 -11.0017900640913 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00891840431357269 ENSG00000131732:ENST00000507402:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000254037:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000407610:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000506458:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000380199:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000438268:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000504502:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000505860:exon_80604226_80604530:ZCCHC9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 82648977 T/G 1 14 20 34 6.36325665307154 10.9096333527549 -4.5463766996834 T:G T G 10 0.545481667637747 0.124232616500542 ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82648950_82649577:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82648944_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82648950_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82648944_82649606:XRCC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 96031569 A/G 1 9 9 18 4.09066499126028 4.90933500873972 -0.818670017479445 A:G A G 10 0.545481667637747 0.814103892547842 ENSG00000153113:ENST00000505143:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511097:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515160:exon_96031540_96031998:CAST;ENSG00000153113:ENST00000507487:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000421689:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512620:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000514845:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000506811:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000514055:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96031489_96031611:CAST HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 96118852 G/C 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96118755_96118939:ERAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 96121524 C/T 1 13 2 15 5.90873832070929 1.09096333527549 4.8177749854338 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0167155600286377 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96121343_96121675:ERAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 96129512 A/G 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 A:G A G 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96129506_96129660:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96129506_96129660:ERAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 16 1 17 7.27229331779605 0.545481667637747 6.7268116501583 T:G G T 10 0.545481667637747 0.000835931572240152 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 1 18 4 22 8.18132998252056 2.18192667055099 5.99940331196957 A:T T A 10 0.545481667637747 0.00989075019963312 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 96237326 G/A 0 11 0 11 4.99970165598478 0 4.99970165598478 G G 10 0.545481667637747 0.00144330453530437 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96237210_96237385:ERAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 29 5 34 13.1810316385053 2.72740833818873 10.4536233003166 T:C C T 10 0.545481667637747 0.000209845244720866 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 39 10 49 17.7262149621279 5.45481667637747 12.2713982857504 T:C C T 10 0.545481667637747 0.000444223848910175 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 30 8 38 13.6355499708676 4.36385334110198 9.27169662976561 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00285673132024912 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 96350710 G/A 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 A:G G A 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000113441:ENST00000231368:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000489981:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000417755:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000379870:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000395770:exon_96350643_96350799:LNPEP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 96512865 T/A 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 A:T T A 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 96512871 T/A 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 A:T T A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 16 15 31 7.27229331779605 8.1822250145662 -0.909931696770157 C:G G C 10 0.545481667637747 0.857266052198222 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 108672946 C/T 1 21 17 38 9.54488497960731 9.2731883498417 0.271696629765616 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108670410_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108670411_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108670411_108673057:PJA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 108713970 C/T 1 26 15 41 11.8174766414186 8.1822250145662 3.63525162685237 T:C C T 10 0.545481667637747 0.275717628252466 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 108713982 T/C 1 39 13 52 17.7262149621279 7.09126167929071 10.6349532828372 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00314722074879022 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 108714298 T/C 1 43 40 83 19.5442882915769 21.8192667055099 -2.274978413933 T:C T C 10 0.545481667637747 0.659804466514136 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 108719151 G/A 1 22 16 38 9.99940331196957 8.72770668220395 1.27169662976561 A:G G A 10 0.545481667637747 0.746021063688677 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000511624:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000512822:exon_108719097_108719221:PJA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 21 14 35 9.54488497960731 7.63674334692846 1.90814163267886 C:G G C 10 0.545481667637747 0.611609620786406 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 112175770 G/A 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 112176325 G/A 1 4 9 13 1.81807332944901 4.90933500873972 -3.09126167929071 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0994104714946873 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 112176559 T/G 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 T:G T G 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 112176756 T/A 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 A:T T A 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 112177171 G/A 1 9 13 22 4.09066499126028 7.09126167929071 -3.00059668803043 A:G G A 10 0.545481667637747 0.207242496035041 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 13 5 18 5.90873832070929 2.72740833818873 3.18132998252055 T:C T C 10 0.545481667637747 0.158872164572138 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 112328377 A/G 1 8 2 10 3.63614665889802 1.09096333527549 2.54518332362253 A:G A G 10 0.545481667637747 0.123918791716156 ENSG00000172795:ENST00000515408:exon_112328369_112328467:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000513585:exon_112328369_112328467:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000389063:exon_112328369_112328467:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000512751:exon_112328369_112328467:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000502635:exon_112328369_112328467:DCP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 118691784 T/C 1 68 51 119 30.9072466006332 27.8195650495251 3.08768155110811 T:C T C 10 0.545481667637747 0.582224593900532 ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118690009_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118691718_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118691730_118691816:TNFAIP8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 11 17 28 4.99970165598478 9.2731883498417 -4.27348669385692 A:G A G 10 0.545481667637747 0.128737248500911 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 122682334 C/T 1 12 13 25 5.45421998834704 7.09126167929071 -1.63704169094367 T:C C T 10 0.545481667637747 0.550995061740953 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 122682348 A/G 1 10 10 20 4.54518332362253 5.45481667637747 -0.909633352754939 A:G A G 10 0.545481667637747 0.82309086372065 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 125939409 C/T 1 35 33 68 15.9081416326789 18.0008950320457 -2.0927533993668 T:C C T 10 0.545481667637747 0.627860733880965 ENSG00000164902:ENST00000297540:exon_125939262_125939875:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000514725:exon_125939266_125939756:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000456348:exon_125939262_125939534:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000505674:exon_125939253_125939875:PHAX HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 132334252 A/G 1 17 11 28 7.7268116501583 6.00029834401522 1.72651330614308 A:G A G 10 0.545481667637747 0.572643391755575 ENSG00000155329:ENST00000324170:exon_132332677_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000355372:exon_132332688_132334524:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509437:exon_132333792_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513848:exon_132333904_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513541:exon_132334100_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000508080:exon_132334105_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509008:exon_132334220_132334542:ZCCHC10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 134223593 A/G 1 31 31 62 14.0900683032298 16.9099316967702 -2.81986339354031 A:G A G 10 0.545481667637747 0.524293633475891 ENSG00000113621:ENST00000441965:exon_134223465_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000358387:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000506916:exon_134223391_134223752:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000507024:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508810:exon_134223385_134223870:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508779:exon_134223385_134223872:TXNDC15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 134364996 G/T 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 T:G G T 10 0.545481667637747 0.243356459282646 ENSG00000069011:ENST00000265340:exon_134363424_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000506438:exon_134364243_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000503586:exon_134364912_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000504936:exon_134364977_134365011:PITX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 137717213 G/A 1 18 7 25 8.18132998252056 3.81837167346423 4.36295830905633 A:G G A 10 0.545481667637747 0.106809904531783 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000512928:exon_137717205_137717437:KDM3B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 137892170 G/A 1 413 407 820 187.716071265611 222.011038728563 -34.2949674629525 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0170629993416203 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000524109:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000512328:exon_137892141_137892262:HSPA9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 137902339 T/C 1 107 156 263 48.6334615627611 85.0951401514885 -36.4616785887274 T:C T C 10 0.545481667637747 7.37241388092835e-06 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000501917:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000523929:exon_137902315_137902400:HSPA9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 11 5 16 4.99970165598478 2.72740833818873 2.27229331779605 A:G A G 10 0.545481667637747 0.319450493523029 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 139682663 G/C 1 12 15 27 5.45421998834704 8.1822250145662 -2.72800502621917 C:G G C 10 0.545481667637747 0.336084534017515 ENSG00000113068:ENST00000261813:exon_139682626_139682706:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000510217:exon_139682626_139682698:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000524074:exon_139682626_139682668:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000507185:exon_139682626_139682671:PFDN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 140044539 C/A 0 31 0 31 14.0900683032298 0 14.0900683032298 C C 10 0.545481667637747 7.84638738970673e-09 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140044261_140044688:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140044384_140044688:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140044453_140044688:WDR55 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 18 10 28 8.18132998252056 5.45481667637747 2.72651330614309 A:T:C C A 10 0.545481667637747 0.346086789444934 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 141019569 G/C 1 12 8 20 5.45421998834704 4.36385334110198 1.09036664724506 C:G G C 10 0.545481667637747 0.660941894453713 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 141019830 C/G 1 15 12 27 6.8177749854338 6.54578001165296 0.271994973780831 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 141029072 G/A 1 5 13 18 2.27259166181127 7.09126167929071 -4.81867001747944 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0309693444433747 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141028962_141029103:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141028962_141029106:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141028962_141029097:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141028962_141029097:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000519800:exon_141028962_141029097:FCHSD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 141391532 G/A 1 14 12 26 6.36325665307154 6.54578001165296 -0.182523358581421 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000113552:ENST00000513454:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000311337:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000500692:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000458112:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000508177:exon_141391477_141392359:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503794:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504139:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000505689:exon_141391414_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000510194:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503229:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000507107:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504424:exon_141391514_141391606:GNPDA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 143200053 C/T 1 18 6 24 8.18132998252056 3.27289000582648 4.90843997669407 T:C C T 10 0.545481667637747 0.062904669459089 ENSG00000158497:ENST00000289448:exon_143200045_143200284:HMHB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 145499996 C/T 1 52 40 92 23.6349532828372 21.8192667055099 1.81568657732728 T:C C T 10 0.545481667637747 0.753927010970503 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145499934_145500066:LARS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 145508340 A/G 1 29 42 71 13.1810316385053 22.9102300407854 -9.72919840228003 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0232325558702243 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145508235_145508345:LARS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 145519821 G/A 1 45 49 94 20.4533249563014 26.7286017142496 -6.27527675794822 A:G G A 10 0.545481667637747 0.214088614452101 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000512412:exon_145519767_145519824:LARS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 145523105 G/A 1 32 33 65 14.5445866355921 18.0008950320457 -3.45630839645355 A:G G A 10 0.545481667637747 0.455126250157139 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000514104:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000504323:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508667:exon_145522807_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000507095:exon_145523050_145523113:LARS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 145539996 T/G 1 15 19 34 6.8177749854338 10.3641516851172 -3.5463766996834 T:G T G 10 0.545481667637747 0.232561835944529 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145539937_145540049:LARS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 145543972 G/A 1 10 6 16 4.54518332362253 3.27289000582648 1.27229331779605 A:G G A 10 0.545481667637747 0.620225311632925 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000505223:exon_145543961_145544034:LARS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 149216256 C/T 1 8 8 16 3.63614665889802 4.36385334110198 -0.727706682203952 T:C C T 10 0.545481667637747 0.8039768822367 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149215826_149216636:PPARGC1B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 149216304 C/T 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 T:C C T 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149215826_149216636:PPARGC1B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 149907533 T/G 1 13 4 17 5.90873832070929 2.18192667055099 3.7268116501583 T:G T G 10 0.545481667637747 0.0880868330094187 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149907366_149907860:NDST1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 149907602 A/G 1 9 4 13 4.09066499126028 2.18192667055099 1.90873832070929 A:G A G 10 0.545481667637747 0.405734407269743 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149907366_149907860:NDST1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 150483095 A/G 1 6 8 14 2.72710999417352 4.36385334110198 -1.63674334692846 A:G A G 10 0.545481667637747 0.428770074510924 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 300 297 597 136.355499708676 162.008055288411 -25.6525555797349 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0360796689492211 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 168 148 316 76.3590798368585 80.7312868103865 -4.37220697352804 A:G G A 10 0.545481667637747 0.651415637228007 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 151043103 G/C 1 24 25 49 10.9084399766941 13.6370416909437 -2.7286017142496 C:G G C 10 0.545481667637747 0.474554776339739 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151040657_151043160:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000520687:exon_151042049_151043160:SPARC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 154275786 G/A 1 9 17 26 4.09066499126028 9.2731883498417 -5.18252335858142 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0487046981211123 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154275652_154275903:GEMIN5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 154282235 T/C 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154282099_154282236:GEMIN5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 154291409 C/T 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 154300940 A/C 1 3 10 13 1.36355499708676 5.45481667637747 -4.09126167929071 A:C A C 10 0.545481667637747 0.0265022743429481 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154300903_154300985:GEMIN5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 154306972 T/C 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 T:C T C 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154306945_154307110:GEMIN5;ENSG00000082516:ENST00000523355:exon_154306946_154307110:GEMIN5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 154346259 A/G 1 91 67 158 41.361168244965 36.547271731729 4.81389651323598 A:G A G 10 0.545481667637747 0.472541128280375 ENSG00000082515:ENST00000523037:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000265229:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000439747:exon_154346246_154346526:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000522038:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000342738:exon_154346246_154346528:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000519059:exon_154346246_154346453:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000520040:exon_154346246_154346505:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000518364:exon_154346246_154346531:MRPL22 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 156936364 T/C 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 T:C T C 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000135074:ENST00000517951:exon_156936309_156936475:ADAM19;ENSG00000135074:ENST00000257527:exon_156936309_156936475:ADAM19;ENSG00000135074:ENST00000394020:exon_156936309_156936475:ADAM19;ENSG00000135074:ENST00000517905:exon_156936309_156936475:ADAM19;ENSG00000135074:ENST00000432888:exon_156936309_156936475:ADAM19;ENSG00000135074:ENST00000430702:exon_156936309_156936475:ADAM19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 157164962 T/C 1 23 15 38 10.4539216443318 8.1822250145662 2.27169662976561 T:C T C 10 0.545481667637747 0.516781951791391 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157164918_157165002:THG1L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 167937607 G/A 1 51 67 118 23.1804349504749 36.547271731729 -13.3668367812541 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0159298480537571 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167937586_167937691:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167937586_167937691:RARS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 42 38 80 19.0897699592146 20.7283033702344 -1.63853341101976 C:G C G 10 0.545481667637747 0.737131711672181 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 57 57 114 25.9075449446484 31.0924550553516 -5.18491011070316 T:C:G C T 10 0.545481667637747 0.347680649913629 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 171481606 A/G 1 63 48 111 28.6346549388219 26.1831200466119 2.45153489221009 A:G A G 10 0.545481667637747 0.703242708909085 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 171520790 G/C 1 62 66 128 28.1801366064597 36.0017900640913 -7.82165345763162 C:G G C 10 0.545481667637747 0.183020508670497 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171520416_171520964:STK10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 171533629 A/G 1 41 23 64 18.6352516268524 12.5460783556682 6.08917327118419 A:G A G 10 0.545481667637747 0.133527114298072 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 171533656 C/T 1 36 18 54 16.3626599650411 9.81867001747944 6.54398994756167 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0769322125600131 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 171533782 T/C 1 22 31 53 9.99940331196957 16.9099316967702 -6.91052838480059 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0720182797737085 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519710:exon_171533666_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171533714_171534038:STK10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 174936038 A/G 1 42 28 70 19.0897699592146 15.2734866938569 3.81628326535771 A:G A G 10 0.545481667637747 0.401630701756968 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174936035_174936205:SFXN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 5 10 15 2.27259166181127 5.45481667637747 -3.1822250145662 T:G G T 10 0.545481667637747 0.12160675687954 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 30 32 62 13.6355499708676 17.4554133644079 -3.81986339354031 A:G G A 10 0.545481667637747 0.372468601968138 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 176915143 C/T 1 17 14 31 7.7268116501583 7.63674334692846 0.0900683032298444 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176914898_176915249:PDLIM7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 176931594 G/C 1 57 48 105 25.9075449446484 26.1831200466119 -0.275575101963433 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176930751_176931661:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000501403:exon_176930785_176931661:DOK3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 176931706 G/C 1 14 15 29 6.36325665307154 8.1822250145662 -1.81896836149466 C:G G C 10 0.545481667637747 0.577160759175787 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 176936882 C/T 1 10 8 18 4.54518332362253 4.36385334110198 0.181329982520555 T:C C T 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 52 56 108 23.6349532828372 30.5469733877138 -6.91202010487667 A:G G A 10 0.545481667637747 0.208890016325604 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 177031348 T/C 1 10 14 24 4.54518332362253 7.63674334692846 -3.09156002330593 T:C T C 10 0.545481667637747 0.223659279774392 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000502420:exon_177031280_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000510761:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505468:exon_177031067_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000507061:exon_177031313_177031542:B4GALT7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 16 8 24 7.27229331779605 4.36385334110198 2.90843997669407 T:C T C 10 0.545481667637747 0.305970557304632 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 0 1057 0 1057 480.425877306901 0 480.425877306901 T T 10 0.545481667637747 7.58764248422161e-279 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 178310446 C/T 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178309710_178312029:ZNF354B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 56 58 114 25.4530266122862 31.6379367229893 -6.18491011070315 A:G A G 10 0.545481667637747 0.259669980510116 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 180651231 G/A 1 18 18 36 8.18132998252056 9.81867001747944 -1.63734003495889 A:G G A 10 0.545481667637747 0.618217725988323 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000451234:exon_180651000_180651293:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 5 180665065 G/C 1 20 15 35 9.09036664724506 8.1822250145662 0.908141632678856 C:G G C 10 0.545481667637747 0.865672807484116 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 115 72 187 52.2696082216591 39.2746800699178 12.9949281517413 A:G G A 10 0.545481667637747 0.056590060256174 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 397290 T/C 1 8 11 19 3.63614665889802 6.00029834401522 -2.36415168511719 T:C T C 10 0.545481667637747 0.357710103923903 ENSG00000137265:ENST00000495137:exon_397108_397546:IRF4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 564145 A/G 1 14 11 25 6.36325665307154 6.00029834401522 0.362958309056325 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000112685:ENST00000230449:exon_564033_564154:EXOC2;ENSG00000112685:ENST00000448181:exon_564033_564154:EXOC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 2955802 T/C 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 T:C T C 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000124570:ENST00000380524:exon_2955758_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380520:exon_2955758_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000335686:exon_2955758_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380529:exon_2955758_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380539:exon_2955758_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380546:exon_2955758_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380500:exon_2955792_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000316782:exon_2955758_2955904:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000440670:exon_2955791_2955904:SERPINB6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 3010390 C/T 1 18 2 20 8.18132998252056 1.09096333527549 7.09036664724506 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00113502236838496 ENSG00000124588:ENST00000426637:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380441:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380454:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3010259_3010423:NQO2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 3015790 A/G 1 8 1 9 3.63614665889802 0.545481667637747 3.09066499126028 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0461109865564625 ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3015764_3015877:NQO2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 4998963 A/G 1 3 13 16 1.36355499708676 7.09126167929071 -5.72770668220395 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0047324583374105 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 6318795 C/A 1 8 1 9 3.63614665889802 0.545481667637747 3.09066499126028 A:C C A 10 0.545481667637747 0.0461109865564625 ENSG00000124491:ENST00000264870:exon_6318768_6318915:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000441301:exon_6318768_6318915:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000379960:exon_6318768_6318915:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000414279:exon_6318768_6318915:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000431222:exon_6318768_6318915:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000451619:exon_6318768_6318915:F13A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 7904845 G/T 1 108 75 183 49.0879798951233 40.911125072831 8.17685482229231 T:G G T 10 0.545481667637747 0.235487704990169 ENSG00000239264:ENST00000379757:exon_7904807_7904956:TXNDC5;ENSG00000239264:ENST00000473453:exon_7904807_7904956:TXNDC5;ENSG00000188428:ENST00000439343:exon_7904807_7904956:MUTED HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 8413890 A/G 1 11 11 22 4.99970165598478 6.00029834401522 -1.00059668803043 A:G A G 10 0.545481667637747 0.67524038559697 ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8413301_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8413303_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8413303_8413932:SLC35B3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 12122773 T/C 1 7 11 18 3.18162832653577 6.00029834401522 -2.81867001747945 T:C T C 10 0.545481667637747 0.237085594735494 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 12124587 C/G 1 2 9 11 0.909036664724506 4.90933500873972 -4.00029834401522 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0289107038402345 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 12163575 G/A 1 15 8 23 6.8177749854338 4.36385334110198 2.45392164433182 A:G G A 10 0.545481667637747 0.403122215406532 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12163516_12165232:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000399469:exon_12163516_12164808:HIVEP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 13599306 C/T 1 7 1 8 3.18162832653577 0.545481667637747 2.63614665889802 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0793996161569039 ENSG00000124523:ENST00000379262:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000397350:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13599264_13599387:SIRT5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 16145325 A/G 1 12 14 26 5.45421998834704 7.63674334692846 -2.18252335858142 A:G A G 10 0.545481667637747 0.434203864087606 ENSG00000007944:ENST00000356840:exon_16145128_16145548:MYLIP;ENSG00000007944:ENST00000349606:exon_16145128_16145548:MYLIP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 16306751 G/A 1 16 21 37 7.27229331779605 11.4551150203927 -4.18282170259664 A:G G A 10 0.545481667637747 0.187982657653704 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 16328068 T/C 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 T:C T C 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16326625_16328574:ATXN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 18256625 A/G 1 114 111 225 51.8150898892968 60.5484651077899 -8.73337521849307 A:G A G 10 0.545481667637747 0.255287386051803 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18256592_18256670:DEK;ENSG00000124795:ENST00000503715:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18256604_18256686:DEK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 20212469 G/A 1 2 7 9 0.909036664724506 3.81837167346423 -2.90933500873972 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0890372070351746 ENSG00000172197:ENST00000324607:exon_20212367_20212630:MBOAT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 24653273 G/C 1 26 19 45 11.8174766414186 10.3641516851172 1.45332495630139 C:G G C 10 0.545481667637747 0.765116146805495 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 24666739 C/T 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 T:C C T 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24666347_24666819:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000480495:exon_24666215_24666839:TDP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 24780892 A/C 1 15 19 34 6.8177749854338 10.3641516851172 -3.5463766996834 A:C A C 10 0.545481667637747 0.232561835944529 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24780891_24780968:GMNN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 24848372 C/T 1 13 13 26 5.90873832070929 7.09126167929071 -1.18252335858142 T:C C T 10 0.545481667637747 0.696126980810445 ENSG00000111913:ENST00000259698:exon_24848253_24848382:FAM65B;ENSG00000111913:ENST00000378023:exon_24848253_24848382:FAM65B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 26056549 A/G 1 30 32 62 13.6355499708676 17.4554133644079 -3.81986339354031 A:G A G 10 0.545481667637747 0.372468601968138 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 26056604 G/A 1 68 82 150 30.9072466006332 44.7294967462953 -13.822250145662 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0265990186377945 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 26104217 T/C 1 49 145 194 22.2713982857504 79.0948418074733 -56.8234435217229 T:C:G T C 10 0.545481667637747 1.60792744346576e-16 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 26104448 A/G 1 80 139 219 36.3614665889802 75.8219518016468 -39.4604852126666 A:G A G 10 0.545481667637747 9.26593599469686e-08 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 26184102 G/A 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 26285560 A/G 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 A:G A G 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 26285683 T/C 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 21 26 47 9.54488497960731 14.1825233585814 -4.63763837897411 A:G A G 10 0.545481667637747 0.189049373285479 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 26598170 A/G 1 34 30 64 15.4536233003166 16.3644500291324 -0.910826728815806 A:G A G 10 0.545481667637747 0.90024337544442 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 34 27 61 15.4536233003166 14.7280050262192 0.725618274097435 A:G A G 10 0.545481667637747 0.898173042348068 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 26598798 G/A 1 42 36 78 19.0897699592146 19.6373400349589 -0.547570075744261 A:G G A 10 0.545481667637747 0.909951321109231 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598493_26600278:ABT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 28094660 A/T 0 8 0 8 3.63614665889802 0 3.63614665889802 A A 10 0.545481667637747 0.0096600748165856 ENSG00000196812:ENST00000340487:exon_28094561_28094699:ZSCAN16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 28244577 C/T 1 13 7 20 5.90873832070929 3.81837167346423 2.09036664724506 A:T:C C T 10 0.545481667637747 0.378879562360477 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 0 429 0 429 194.988364583407 0 194.988364583407 A A 10 0.545481667637747 1.28829757787375e-113 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30030057 G/A 1 51 48 99 23.1804349504749 26.1831200466119 -3.00268509613695 A:G G A 10 0.545481667637747 0.546732742318291 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30026676_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30030001_30030110:ZNRD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 42 34 76 19.0897699592146 18.5463766996834 0.543393259531232 A:T:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 28 28 56 12.7265133061431 15.2734866938569 -2.54697338771383 A:C C A 10 0.545481667637747 0.505214501031278 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 32 43 75 14.5445866355921 23.4557117084231 -8.91112507283102 T:C T C 10 0.545481667637747 0.048026683945454 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30864829 T/C 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000514434:exon_30864791_30864918:DDR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30865204 A/C 1 7 12 19 3.18162832653577 6.54578001165296 -3.36415168511719 A:C A C 10 0.545481667637747 0.165823977917260 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30865138_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30865156_30865374:DDR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 T:C C T 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 16 8 24 7.27229331779605 4.36385334110198 2.90843997669407 A:C A C 10 0.545481667637747 0.305970557304632 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30882634 C/T 1 12 12 24 5.45421998834704 6.54578001165296 -1.09156002330593 T:C C T 10 0.545481667637747 0.685991730875607 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30882781 G/T 1 11 14 25 4.99970165598478 7.63674334692846 -2.63704169094367 T:G G T 10 0.545481667637747 0.319558675893505 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30887972 C/T 1 10 13 23 4.54518332362253 7.09126167929071 -2.54607835566818 T:C C T 10 0.545481667637747 0.302524544988392 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30887988 C/T 1 14 9 23 6.36325665307154 4.90933500873972 1.45392164433182 T:C C T 10 0.545481667637747 0.676547146622212 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30888169 G/A 1 14 5 19 6.36325665307154 2.72740833818873 3.63584831488281 A:G G A 10 0.545481667637747 0.109537367994142 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30889389 T/C 1 22 14 36 9.99940331196957 7.63674334692846 2.36265996504111 T:C T C 10 0.545481667637747 0.504501807695613 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30889366_30889468:VARS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30890483 G/T 1 19 14 33 8.63584831488281 7.63674334692846 0.99910496795435 T:G G T 10 0.545481667637747 0.861592700201063 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000477052:exon_30890360_30890551:VARS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30892322 C/T 1 7 13 20 3.18162832653577 7.09126167929071 -3.90963335275494 T:C C T 10 0.545481667637747 0.113949941344795 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30892131_30892341:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 22 9 31 9.99940331196957 4.90933500873972 5.09006830322984 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0726288543033952 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 30893428 G/A 1 8 13 21 3.63614665889802 7.09126167929071 -3.45511502039269 A:G G A 10 0.545481667637747 0.187332125989055 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30893321_30893451:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893321_30893496:VARS2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31110391 G/C 1 28 45 73 12.7265133061431 24.5466750436986 -11.8201617375555 C:G G C 10 0.545481667637747 0.00655180913338074 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 15 24 39 6.8177749854338 13.0915600233059 -6.27378503787213 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0529297051309523 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31112484 C/T 1 14 17 31 6.36325665307154 9.2731883498417 -2.90993169677016 T:C C T 10 0.545481667637747 0.367528049294024 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112406_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31113030 A/G 1 14 21 35 6.36325665307154 11.4551150203927 -5.09185836732114 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0912306213941213 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 9 21 30 4.09066499126028 11.4551150203927 -7.36445002913241 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00923399106553629 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31116210 G/A 1 4 8 12 1.81807332944901 4.36385334110198 -2.54578001165296 A:G G A 10 0.545481667637747 0.157407748991045 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 3 10 13 1.36355499708676 5.45481667637747 -4.09126167929071 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0265022743429481 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 15 23 38 6.8177749854338 12.5460783556682 -5.72830337023439 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0728805352106327 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31118898 A/T 1 9 18 27 4.09066499126028 9.81867001747944 -5.72800502621917 A:T A T 10 0.545481667637747 0.0326964877481770 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118732_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31118644_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31118662_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31118752_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31118847_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31118869_31118899:CCHCR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 11 10 21 4.99970165598478 5.45481667637747 -0.455115020392687 A:G A G 10 0.545481667637747 0.831123791313476 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C 1 12 10 22 5.45421998834704 5.45481667637747 -0.000596688030433334 A:C A C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31129707 C/T 1 20 13 33 9.09036664724506 7.09126167929071 1.99910496795435 T:C C T 10 0.545481667637747 0.600713000589755 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 14 26 40 6.36325665307154 14.1825233585814 -7.81926670550988 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0163975924309811 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31239335 G/A 0 25 0 25 11.3629583090563 0 11.3629583090563 G G 10 0.545481667637747 3.47878160086669e-07 ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31239376 C/T 0 26 0 26 11.8174766414186 0 11.8174766414186 C C 10 0.545481667637747 1.83513670272213e-07 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31239378 T/G 0 26 0 26 11.8174766414186 0 11.8174766414186 T T 10 0.545481667637747 1.83513670272213e-07 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 3 34 37 1.36355499708676 18.5463766996834 -17.1828217025966 T:C C T 10 0.545481667637747 3.2643675318787e-09 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31239430 C/T 1 34 6 40 15.4536233003166 3.27289000582648 12.1807332944901 T:C C T 10 0.545481667637747 8.388330424392e-05 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31239501 G/T 1 17 20 37 7.7268116501583 10.9096333527549 -3.18282170259664 T:G G T 10 0.545481667637747 0.324086893701699 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31239518 C/T 1 18 19 37 8.18132998252056 10.3641516851172 -2.18282170259664 T:C C T 10 0.545481667637747 0.511334437758605 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31431820 C/T 1 62 55 117 28.1801366064597 30.0014917200761 -1.8213551136164 T:C C T 10 0.545481667637747 0.78082798911378 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31473546 A/G 1 11 22 33 4.99970165598478 12.0005966880304 -7.00089503204565 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0215697899756606 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31477681 A/G 1 7 13 20 3.18162832653577 7.09126167929071 -3.90963335275494 A:G A G 10 0.545481667637747 0.113949941344795 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31477559_31478901:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31477559_31478901:MICB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31506624 T/C 1 114 107 221 51.8150898892968 58.3665384372389 -6.55144854794208 T:C T C 10 0.545481667637747 0.380662930281709 ENSG00000254870:ENST00000376185:exon_31506540_31506632:XXbac-BPG296P20.16;ENSG00000198563:ENST00000376177:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000462256:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000458640:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000396172:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376174:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000525098:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000417556:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000449461:exon_31506540_31506716:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376163:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000436533:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000481456:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000427214:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000453105:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000428098:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000419338:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000456662:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000428450:exon_31506540_31506716:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000449757:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000456976:exon_31506596_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000418897:exon_31506608_31506632:BAT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 31599360 A/G 1 60 62 122 27.2710999417352 33.8198633935403 -6.54876345180513 A:T:G A G 10 0.545481667637747 0.238532684705428 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598916_31599597:BAT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 32782387 G/A 1 11 6 17 4.99970165598478 3.27289000582648 1.7268116501583 A:G G A 10 0.545481667637747 0.471137770776418 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 32796793 G/A 1 33 15 48 14.9991049679544 8.1822250145662 6.81687995338815 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0587044946189228 ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32793192_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32796683_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32796721_32796811:TAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 45 57 102 20.4533249563014 31.0924550553516 -10.6391300990502 A:C C A 10 0.545481667637747 0.0368169852658365 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 32818678 G/A 1 10 9 19 4.54518332362253 4.90933500873972 -0.364151685117192 A:G G A 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 32826233 A/G 1 180 173 353 81.8132998252055 94.3683285013302 -12.5550286761247 A:G A G 10 0.545481667637747 0.181867219444848 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32826141_32826677:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000395333:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32826141_32826499:PSMB9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 160 149 309 72.7229331779605 81.2767684780243 -8.55383530006381 A:C:G G A 10 0.545481667637747 0.332033029723825 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 28 30 58 12.7265133061431 16.3644500291324 -3.63793672298933 A:G G A 10 0.545481667637747 0.357914717049397 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 32 21 53 14.5445866355921 11.4551150203927 3.08947161519941 A:G G A 10 0.545481667637747 0.411642782630799 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 124 127 251 56.3602732129194 69.2761717899939 -12.9158985770745 T:C T C 10 0.545481667637747 0.112898040030704 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 32974551 G/T 1 57 63 120 25.9075449446484 34.3653450611781 -8.45780011652964 A:T:C:G G T 10 0.545481667637747 0.142139604362141 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32971955_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32971959_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32973372_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974384_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974523_32974618:HLA-DOA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 32974934 G/A 1 47 24 71 21.3623616210259 13.0915600233059 8.27080159771997 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0561073647950492 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 32975257 C/T 1 48 30 78 21.8168799533881 16.3644500291324 5.45242992425574 T:C C T 10 0.545481667637747 0.255447227191996 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 32975869 G/A 1 49 29 78 22.2713982857504 15.8189683614947 6.45242992425574 A:G G A 10 0.545481667637747 0.172081174262973 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975790_32975871:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975790_32976014:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975790_32975901:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000374813:exon_32975790_32975871:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000467465:exon_32975838_32976181:HLA-DOA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 11 6 17 4.99970165598478 3.27289000582648 1.7268116501583 A:G G A 10 0.545481667637747 0.471137770776418 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 33272712 C/A 1 9 16 25 4.09066499126028 8.72770668220395 -4.63704169094367 A:C C A 10 0.545481667637747 0.0715909203080173 ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 60 62 122 27.2710999417352 33.8198633935403 -6.54876345180513 C:G G C 10 0.545481667637747 0.238532684705428 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 33281842 G/T 1 12 7 19 5.45421998834704 3.81837167346423 1.63584831488281 T:G G T 10 0.545481667637747 0.497845829751492 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 33281843 A/T 1 11 7 18 4.99970165598478 3.81837167346423 1.18132998252055 A:T A T 10 0.545481667637747 0.641996695541785 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 33283766 T/C 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 54 44 98 24.5439899475617 24.0011933760609 0.542796571500794 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 33359716 G/C 1 11 8 19 4.99970165598478 4.36385334110198 0.635848314882807 C:G G C 10 0.545481667637747 0.82162549041289 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000450504:exon_33359638_33359774:KIFC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 33636907 C/T 1 13 12 25 5.90873832070929 6.54578001165296 -0.637041690943674 T:C C T 10 0.545481667637747 0.842576598281257 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33636751_33636933:ITPR3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 33641379 T/C 1 15 3 18 6.8177749854338 1.63644500291324 5.18132998252055 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0163493059861476 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33641368_33641497:ITPR3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 33643558 G/A 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33643468_33643633:ITPR3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 33653448 C/T 1 15 10 25 6.8177749854338 5.45481667637747 1.36295830905633 T:C C T 10 0.545481667637747 0.68954281062682 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33653420_33653604:ITPR3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 33659472 C/G 1 12 13 25 5.45421998834704 7.09126167929071 -1.63704169094367 C:G C G 10 0.545481667637747 0.550995061740953 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 33665458 T/C 1 58 71 129 26.3620632770107 38.72919840228 -12.3671351252694 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0335035368413054 ENSG00000137288:ENST00000374231:exon_33665345_33665527:C6orf125;ENSG00000137288:ENST00000374214:exon_33665345_33665527:C6orf125 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 35803192 C/A 1 12 17 29 5.45421998834704 9.2731883498417 -3.81896836149466 A:C C A 10 0.545481667637747 0.191679709049513 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 35803283 C/T 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 T:C C T 10 0.545481667637747 0.740297003186309 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 36098410 A/C 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 A:C A C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000156711:ENST00000476951:exon_36098396_36098478:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000373761:exon_36098098_36098478:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000211287:exon_36098098_36098478:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000373770:exon_36098262_36098478:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000373766:exon_36098262_36098478:MAPK13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 36339136 G/A 1 10 13 23 4.54518332362253 7.09126167929071 -2.54607835566818 A:G G A 10 0.545481667637747 0.302524544988392 ENSG00000010030:ENST00000339796:exon_36339107_36339337:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000340181:exon_36339107_36339337:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373738:exon_36339107_36339337:ETV7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 36437849 G/T 1 27 14 41 12.2719949737808 7.63674334692846 4.63525162685237 T:G G T 10 0.545481667637747 0.160237053393128 ENSG00000112078:ENST00000373731:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000483557:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000498267:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000481911:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000449081:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000265344:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000460983:exon_36437829_36438034:KCTD20 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 36446975 G/C 1 13 15 28 5.90873832070929 8.1822250145662 -2.27348669385692 C:G G C 10 0.545481667637747 0.44954716189734 ENSG00000112078:ENST00000373731:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000481911:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000265344:exon_36446898_36447000:KCTD20 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 36713263 A/G 1 4 8 12 1.81807332944901 4.36385334110198 -2.54578001165296 A:G A G 10 0.545481667637747 0.157407748991045 ENSG00000124772:ENST00000459703:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000244751:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000493411:exon_36713164_36713292:CPNE5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 36823737 G/T 1 25 16 41 11.3629583090563 8.72770668220395 2.63525162685237 T:G G T 10 0.545481667637747 0.436932819585099 ENSG00000137168:ENST00000373699:exon_36822603_36823809:PPIL1;ENSG00000137168:ENST00000483552:exon_36822603_36823809:PPIL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 36824399 C/T 1 20 16 36 9.09036664724506 8.72770668220395 0.362659965041109 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000137168:ENST00000373699:exon_36824362_36824430:PPIL1;ENSG00000137168:ENST00000483552:exon_36824362_36824430:PPIL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 36936697 T/C 1 125 69 194 56.8147915452816 37.6382350670045 19.1765564782771 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00604047266255123 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36935918_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36936513_36936727:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36936513_36936725:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36936536_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36936688_36936750:MTCH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 36937798 G/A 1 16 4 20 7.27229331779605 2.18192667055099 5.09036664724506 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0243164073781052 ENSG00000137409:ENST00000460219:exon_36937242_36937890:MTCH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 36990029 G/C 1 11 8 19 4.99970165598478 4.36385334110198 0.635848314882807 C:G G C 10 0.545481667637747 0.82162549041289 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36990015_36990146:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36990015_36990146:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36990015_36990146:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36990015_36990146:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36990015_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36990015_36990062:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36989318_36990146:FGD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 36993615 C/T 1 23 16 39 10.4539216443318 8.72770668220395 1.72621496212787 T:C:G C T 10 0.545481667637747 0.631839252739854 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36993568_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36993568_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36993568_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36993568_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36990015_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36993568_36993714:FGD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 37252210 C/T 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 T:C C T 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000065491:ENST00000373491:exon_37252112_37252240:TBC1D22B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 38084384 G/A 1 44 37 81 19.9988066239391 20.1828217025966 -0.184015078657506 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000156639:ENST00000287218:exon_38084348_38084515:ZFAND3;ENSG00000156639:ENST00000373391:exon_38084348_38084515:ZFAND3;ENSG00000156639:ENST00000474522:exon_38084348_38084452:ZFAND3;ENSG00000156639:ENST00000373389:exon_38084348_38084515:ZFAND3;ENSG00000156639:ENST00000440482:exon_38084348_38084515:ZFAND3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 38650588 T/A 1 59 60 119 26.8165816093729 32.7289000582648 -5.91231844889189 A:T T A 10 0.545481667637747 0.311276316366537 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 56 44 100 25.4530266122862 24.0011933760609 1.4518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 0.840979955922355 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 34 36 70 15.4536233003166 19.6373400349589 -4.18371673464229 A:C A C 10 0.545481667637747 0.338128025706763 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 41903783 G/A 1 32 36 68 14.5445866355921 19.6373400349589 -5.09275339936679 A:G G A 10 0.545481667637747 0.225060568241808 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 42185564 A/C 1 26 21 47 11.8174766414186 11.4551150203927 0.362361621025894 A:C A C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000048544:ENST00000053468:exon_42185540_42185603:MRPS10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 42992808 T/C 1 29 29 58 13.1810316385053 15.8189683614947 -2.63793672298932 T:C T C 10 0.545481667637747 0.511580658365649 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 42992825 C/G 1 28 31 59 12.7265133061431 16.9099316967702 -4.18341839062707 C:G C G 10 0.545481667637747 0.296912620797675 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 42995211 A/G 1 92 74 166 41.8156865773273 40.3656434051933 1.450043172134 A:G A G 10 0.545481667637747 0.876202641535289 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42995098_42995215:RRP36 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 43008298 C/T 1 21 19 40 9.54488497960731 10.3641516851172 -0.819266705509879 T:C C T 10 0.545481667637747 0.874215754851831 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43008268_43008484:CUL7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 43020188 G/A 1 12 4 16 5.45421998834704 2.18192667055099 3.27229331779605 A:G G A 10 0.545481667637747 0.132268379253018 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43019947_43020534:CUL7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 43184132 A/C 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:C A C 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000112659:ENST00000252050:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000515773:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000354495:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000372647:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000508656:exon_43183896_43184241:CUL9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 43738977 C/T 1 12 12 24 5.45421998834704 6.54578001165296 -1.09156002330593 T:C C T 10 0.545481667637747 0.685991730875607 ENSG00000112715:ENST00000476772:exon_43737921_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000426830:exon_43737948_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372067:exon_43737950_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000532514:exon_43737950_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372064:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000425836:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372055:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000324450:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000413642:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000482630:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000417285:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000531362:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000530947:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000531781:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372077:exon_43738519_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000519767:exon_43738530_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000520948:exon_43738820_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000518538:exon_43738890_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000523950:exon_43738946_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000523873:exon_43738946_43739049:VEGFA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 44219710 A/C 1 6 24 30 2.72710999417352 13.0915600233059 -10.3644500291324 A:C A C 10 0.545481667637747 0.000150827357097560 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 44222718 G/C 1 49 38 87 22.2713982857504 20.7283033702344 1.54309491551601 C:G G C 10 0.545481667637747 0.82967224770488 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222443_44222810:SLC35B2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 44360533 G/A 1 20 13 33 9.09036664724506 7.09126167929071 1.99910496795435 A:G G A 10 0.545481667637747 0.600713000589755 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44360404_44360565:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44360404_44360565:CDC5L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 44371714 C/T 1 30 43 73 13.6355499708676 23.4557117084231 -9.82016173755553 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0250401409762412 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 44413463 T/A 1 39 29 68 17.7262149621279 15.8189683614947 1.90724660063321 A:T:C T A 10 0.545481667637747 0.715308951668287 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44413392_44413604:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44413392_44413604:CDC5L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 46107752 C/G 1 8 11 19 3.63614665889802 6.00029834401522 -2.36415168511719 C:G C G 10 0.545481667637747 0.357710103923903 ENSG00000001561:ENST00000321037:exon_46107288_46108146:ENPP4;ENSG00000001561:ENST00000371401:exon_46107287_46108146:ENPP4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 49403301 C/T 1 15 12 27 6.8177749854338 6.54578001165296 0.271994973780831 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 49419305 A/C 1 7 16 23 3.18162832653577 8.72770668220395 -5.54607835566818 A:C A C 10 0.545481667637747 0.0219480939668005 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49419179_49419427:MUT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 53159090 G/T 1 33 15 48 14.9991049679544 8.1822250145662 6.81687995338815 T:G G T 10 0.545481667637747 0.0587044946189228 ENSG00000012660:ENST00000370913:exon_53158886_53159289:ELOVL5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 57393112 T/C 1 3 8 11 1.36355499708676 4.36385334110198 -3.00029834401522 T:C T C 10 0.545481667637747 0.126273306068542 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 57393125 A/G 0 0 10 10 0 5.45481667637747 -5.45481667637747 G A G 10 0.545481667637747 0.000376282521605541 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 12 12 0 6.54578001165296 -6.54578001165296 A G A 10 0.545481667637747 7.77350451012197e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 10 10 0 5.45481667637747 -5.45481667637747 G T G 10 0.545481667637747 0.000376282521605541 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 9 0 9 4.09066499126028 0 4.09066499126028 C C 10 0.545481667637747 0.00510371084910098 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 9 9 0 4.90933500873972 -4.90933500873972 C T C 10 0.545481667637747 0.000827870945600588 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 70407465 A/T 1 12 11 23 5.45421998834704 6.00029834401522 -0.546078355668181 A:T A T 10 0.545481667637747 0.837030175057015 ENSG00000168216:ENST00000370577:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000370570:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000472827:exon_70407455_70407533:LMBRD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 71377711 C/T 1 9 4 13 4.09066499126028 2.18192667055099 1.90873832070929 T:C C T 10 0.545481667637747 0.405734407269743 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000422334:exon_71377659_71377844:SMAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 6 10 16 2.72710999417352 5.45481667637747 -2.72770668220395 T:C C T 10 0.545481667637747 0.211649836550054 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 10 8 18 4.54518332362253 4.36385334110198 0.181329982520555 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 74138503 G/A 1 19 18 37 8.63584831488281 9.81867001747944 -1.18282170259664 A:G G A 10 0.545481667637747 0.742767838498592 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74138432_74138534:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74138432_74138534:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74138432_74138534:C6orf150 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 22 16 38 9.99940331196957 8.72770668220395 1.27169662976561 T:C C T 10 0.545481667637747 0.746021063688677 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 83881740 T/C 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83881639_83881778:PGM3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 83949261 T/C 1 8 16 24 3.63614665889802 8.72770668220395 -5.09156002330593 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0412084805916291 ENSG00000065833:ENST00000369705:exon_83949258_83949355:ME1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 90347511 T/C 1 49 36 85 22.2713982857504 19.6373400349589 2.63405825079151 T:C:G T C 10 0.545481667637747 0.587753261788239 ENSG00000083099:ENST00000520897:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000412237:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523793:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520441:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523377:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000517396:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000524153:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520318:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000521961:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523075:exon_90347461_90347601:LYRM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 90348407 G/T 1 21 30 51 9.54488497960731 16.3644500291324 -6.8195650495251 T:G G T 10 0.545481667637747 0.0668527832132588 ENSG00000083099:ENST00000412237:exon_90348391_90348453:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520441:exon_90348391_90348453:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523377:exon_90348391_90348472:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520318:exon_90348391_90348468:LYRM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 90362783 A/C 1 10 9 19 4.54518332362253 4.90933500873972 -0.364151685117192 A:C:G A C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90362711_90362874:MDN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 90371202 G/A 1 19 16 35 8.63584831488281 8.72770668220395 -0.0918583673211444 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90371150_90371297:MDN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 90374283 A/G 1 23 19 42 10.4539216443318 10.3641516851172 0.0897699592146264 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90374206_90374347:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90374206_90374347:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90374206_90374347:MDN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 90384274 T/C 1 4 9 13 1.81807332944901 4.90933500873972 -3.09126167929071 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0994104714946873 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90383823_90384308:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90383823_90384308:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90383823_90384308:MDN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 90390443 C/A 1 2 7 9 0.909036664724506 3.81837167346423 -2.90933500873972 A:C C A 10 0.545481667637747 0.0890372070351746 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90390308_90390470:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90390308_90390470:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90390308_90390470:MDN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 90402482 G/A 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 A:G G A 10 0.545481667637747 0.782586339670189 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90402162_90402867:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90402162_90402872:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90402162_90402867:MDN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 90408589 A/G 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 A:G A G 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90408584_90408754:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90408584_90408754:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90408584_90408754:MDN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 96053922 T/A 1 6 17 23 2.72710999417352 9.2731883498417 -6.54607835566818 A:T T A 10 0.545481667637747 0.0102604253827857 ENSG00000172469:ENST00000358812:exon_96053624_96057333:MANEA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 54 51 105 24.5439899475617 27.8195650495251 -3.27557510196343 A:G A G 10 0.545481667637747 0.557000588110963 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 100957344 T/C 1 41 38 79 18.6352516268524 20.7283033702344 -2.09305174338201 T:C T C 10 0.545481667637747 0.65269509163337 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100956070_100957409:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000518006:exon_100957094_100957409:ASCC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 100966006 C/T 1 20 20 40 9.09036664724506 10.9096333527549 -1.81926670550988 T:C C T 10 0.545481667637747 0.634717532478894 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100965867_100966018:ASCC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 101094554 A/G 1 9 7 16 4.09066499126028 3.81837167346423 0.272293317796049 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101094491_101094645:ASCC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 101166095 G/A 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101165951_101166127:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324696:exon_101165951_101166127:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000522650:exon_101165951_101166127:ASCC3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 106547372 C/G 1 17 13 30 7.7268116501583 7.09126167929071 0.635549970867592 A:C:G C G 10 0.545481667637747 0.856505800488025 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000450060:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000481163:exon_106547175_106547584:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106547175_106547427:PRDM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 106555025 G/A 1 19 19 38 8.63584831488281 10.3641516851172 -1.72830337023439 A:G G A 10 0.545481667637747 0.626589184197869 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106554786_106555383:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106554786_106557813:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106554786_106557814:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106554786_106556965:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106554786_106557814:PRDM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 109762332 C/T 1 4 9 13 1.81807332944901 4.90933500873972 -3.09126167929071 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0994104714946873 ENSG00000185250:ENST00000440797:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000521072:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000368958:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109761966_109762374:SMPD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 12 13 25 5.45421998834704 7.09126167929071 -1.63704169094367 T:C:G G T 10 0.545481667637747 0.550995061740953 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 51 9 60 23.1804349504749 4.90933500873972 18.2710999417352 T:G G T 10 0.545481667637747 7.78368818037593e-07 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 49 9 58 22.2713982857504 4.90933500873972 17.3620632770107 T:C C T 10 0.545481667637747 2.01291280997639e-06 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 59 37 96 26.8165816093729 20.1828217025966 6.63375990677629 A:G G A 10 0.545481667637747 0.183808707269409 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 109770869 G/A 1 60 49 109 27.2710999417352 26.7286017142496 0.542498227485577 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000433205:exon_109770860_109770986:MICAL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 109775436 T/C 1 30 28 58 13.6355499708676 15.2734866938569 -1.63793672298933 T:C T C 10 0.545481667637747 0.693796649246338 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 12 11 23 5.45421998834704 6.00029834401522 -0.546078355668181 T:C T C 10 0.545481667637747 0.837030175057015 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 109802651 C/T 1 28 26 54 12.7265133061431 14.1825233585814 -1.45601005243834 T:C C T 10 0.545481667637747 0.784921492259992 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109802278_109803257:ZBTB24 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 110064928 A/T 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 A:T A T 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000112367:ENST00000368944:exon_110064878_110064975:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110064878_110064975:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110064878_110064975:FIG4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 110107517 T/C 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110107505_110107652:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110107505_110107652:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000419951:exon_110107209_110107652:FIG4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 23 16 39 10.4539216443318 8.72770668220395 1.72621496212787 A:G G A 10 0.545481667637747 0.631839252739854 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 116574455 G/A 1 21 30 51 9.54488497960731 16.3644500291324 -6.8195650495251 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0668527832132588 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 116575116 G/T 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 T:G G T 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 116600774 C/G 1 27 32 59 12.2719949737808 17.4554133644079 -5.18341839062707 C:G C G 10 0.545481667637747 0.191981396781335 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 116600810 G/A 1 25 22 47 11.3629583090563 12.0005966880304 -0.637638378974108 A:G G A 10 0.545481667637747 0.884237404202915 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 116784850 C/G 1 16 26 42 7.27229331779605 14.1825233585814 -6.91023004078537 C:G C G 10 0.545481667637747 0.042767845616875 ENSG00000188820:ENST00000368606:exon_116784446_116784931:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000532607:exon_116784446_116784931:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000368605:exon_116784446_116784934:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000368604:exon_116784446_116784931:FAM26F HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 116973182 T/C 1 8 9 17 3.63614665889802 4.90933500873972 -1.2731883498417 T:C T C 10 0.545481667637747 0.628894857051545 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 13 0 13 5.90873832070929 0 5.90873832070929 C C 10 0.545481667637747 0.000413898410899833 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 119510941 C/A 1 7 16 23 3.18162832653577 8.72770668220395 -5.54607835566818 A:C C A 10 0.545481667637747 0.0219480939668005 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119510829_119511048:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119510829_119511048:MAN1A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 126210575 G/A 1 16 8 24 7.27229331779605 4.36385334110198 2.90843997669407 A:G G A 10 0.545481667637747 0.305970557304632 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000413085:exon_126210118_126211127:NCOA7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 126329574 A/C 0 20 0 20 9.09036664724506 0 9.09036664724506 A A 10 0.545481667637747 8.98013890723783e-06 ENSG00000066651:ENST00000334379:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000450358:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000368333:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000461129:exon_126329538_126329626:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000479748:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000368332:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000481529:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000468097:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000453993:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000466316:exon_126329538_126329618:TRMT11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 130374102 C/A 1 8 2 10 3.63614665889802 1.09096333527549 2.54518332362253 A:C C A 10 0.545481667637747 0.123918791716156 ENSG00000198945:ENST00000529410:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000533560:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000361794:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000528385:exon_130374004_130374125:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000368139:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000526019:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000368136:exon_130374004_130374136:L3MBTL3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 130761798 T/C 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000164484:ENST00000296978:exon_130761552_130764208:TMEM200A;ENSG00000164484:ENST00000392429:exon_130761552_130764206:TMEM200A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 130761957 A/G 0 8 0 8 3.63614665889802 0 3.63614665889802 A A 10 0.545481667637747 0.0096600748165856 ENSG00000164484:ENST00000296978:exon_130761552_130764208:TMEM200A;ENSG00000164484:ENST00000392429:exon_130761552_130764206:TMEM200A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 131190838 G/A 1 25 25 50 11.3629583090563 13.6370416909437 -2.27408338188735 A:G G A 10 0.545481667637747 0.57096418327652 ENSG00000079819:ENST00000337057:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000257986:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000368128:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527411:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000524581:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000529208:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527423:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000456097:exon_131190799_131191266:EPB41L2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 135287533 A/G 1 29 36 65 13.1810316385053 19.6373400349589 -6.45630839645355 A:G A G 10 0.545481667637747 0.134389388162031 ENSG00000112339:ENST00000367837:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000445176:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367824:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527005:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527578:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000415177:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367826:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000533274:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000526100:exon_135287467_135287611:HBS1L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 135606755 C/G 1 9 10 19 4.09066499126028 5.45481667637747 -1.36415168511719 C:G C G 10 0.545481667637747 0.646474994475887 ENSG00000135541:ENST00000367800:exon_135604670_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367801:exon_135605110_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000457866:exon_135605124_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000475846:exon_135606034_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000498558:exon_135606323_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367799:exon_135606430_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000527681:exon_135606433_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000265602:exon_135606434_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000487135:exon_135606519_135606785:AHI1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 136554628 G/A 1 19 18 37 8.63584831488281 9.81867001747944 -1.18282170259664 A:G G A 10 0.545481667637747 0.742767838498592 ENSG00000146410:ENST00000451457:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000367784:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000420702:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000275229:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000532282:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000532958:exon_136554282_136554637:FAM54A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 230 1 231 104.539216443318 0.545481667637747 103.99373477568 A:T T A 10 0.545481667637747 5.6825280984064e-59 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 273 0 273 124.083504734895 0 124.083504734895 A A 10 0.545481667637747 2.22730114661556e-72 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 275 0 275 124.99254139962 0 124.99254139962 A A 10 0.545481667637747 6.02225199108146e-73 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 102 0 102 46.3608699009498 0 46.3608699009498 G G 10 0.545481667637747 1.52488569212487e-27 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 111 0 111 50.4515348922101 0 50.4515348922101 T T 10 0.545481667637747 9.29188192702108e-30 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 136944063 A/G 1 11 14 25 4.99970165598478 7.63674334692846 -2.63704169094367 A:G A G 10 0.545481667637747 0.319558675893505 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136943986_136944119:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136943986_136944119:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136943986_136944119:MAP3K5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 136977568 T/C 1 9 4 13 4.09066499126028 2.18192667055099 1.90873832070929 T:C T C 10 0.545481667637747 0.405734407269743 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136977445_136977598:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136977445_136977598:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136977445_136977598:MAP3K5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 137519588 A/C 1 74 85 159 33.6343565948067 46.3659417492085 -12.7315851544018 A:C A C 10 0.545481667637747 0.0463693154944039 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 138195991 A/G 1 118 93 211 53.6331632187459 50.7297950903105 2.90336812843539 A:G A G 10 0.545481667637747 0.729744283374394 ENSG00000118503:ENST00000420009:exon_138195982_138196172:TNFAIP3;ENSG00000118503:ENST00000237289:exon_138195982_138196172:TNFAIP3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 138413333 G/C 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 C:G G C 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000112378:ENST00000421351:exon_138411923_138413405:PERP;ENSG00000112378:ENST00000265603:exon_138411926_138413405:PERP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 143074700 T/C 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000010818:ENST00000367604:exon_143072604_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000367603:exon_143072605_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000012134:exon_143072606_143075068:HIVEP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 143784092 A/G 1 10 9 19 4.54518332362253 4.90933500873972 -0.364151685117192 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000034693:ENST00000344281:exon_143784053_143784134:PEX3;ENSG00000034693:ENST00000367592:exon_143784053_143784134:PEX3;ENSG00000034693:ENST00000367591:exon_143784053_143784134:PEX3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 143816859 C/T 1 30 41 71 13.6355499708676 22.3647483731476 -8.72919840228004 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0424869174372793 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143815949_143816984:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143816614_143816984:FUCA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 149700491 G/A 1 29 29 58 13.1810316385053 15.8189683614947 -2.63793672298932 A:G G A 10 0.545481667637747 0.511580658365649 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 149730846 G/A 1 27 15 42 12.2719949737808 8.1822250145662 4.08976995921463 A:G G A 10 0.545481667637747 0.218760850546111 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149730713_149732748:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149730713_149732749:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149730713_149732652:TAB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 20 24 44 9.09036664724506 13.0915600233059 -4.00119337606087 T:C C T 10 0.545481667637747 0.230233603733121 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 16 10 26 7.27229331779605 5.45481667637747 1.81747664141858 C:G G C 10 0.545481667637747 0.557013656890898 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 152469188 C/G 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000472563:exon_152469018_152469513:SYNE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 152469331 C/T 1 3 6 9 1.36355499708676 3.27289000582648 -1.90933500873972 T:C C T 10 0.545481667637747 0.316116386178568 ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000472563:exon_152469018_152469513:SYNE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 153296541 G/C 1 15 21 36 6.8177749854338 11.4551150203927 -4.63734003495889 C:G G C 10 0.545481667637747 0.13352255184162 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 153323594 C/T 1 15 10 25 6.8177749854338 5.45481667637747 1.36295830905633 T:C C T 10 0.545481667637747 0.68954281062682 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000482526:exon_153323562_153323671:MTRF1L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 155141313 C/T 1 17 11 28 7.7268116501583 6.00029834401522 1.72651330614308 T:C C T 10 0.545481667637747 0.572643391755575 ENSG00000213079:ENST00000367178:exon_155141311_155141467:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000367186:exon_155141311_155141467:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000417268:exon_155141311_155141467:RBM16 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 157739931 T/C 1 15 15 30 6.8177749854338 8.1822250145662 -1.36445002913241 T:C T C 10 0.545481667637747 0.71468425454372 ENSG00000215712:ENST00000400788:exon_157739814_157739951:C6orf35;ENSG00000215712:ENST00000367144:exon_157739299_157739951:C6orf35 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 159065758 C/G 1 7 17 24 3.18162832653577 9.2731883498417 -6.09156002330593 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0138596406155271 ENSG00000146425:ENST00000367089:exon_159065714_159065771:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159065714_159065770:DYNLT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 159398633 T/C 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000130363:ENST00000367069:exon_159397312_159398880:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000449822:exon_159397866_159398880:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000252655:exon_159398268_159398880:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000297262:exon_159398268_159398880:RSPH3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 68 75 143 30.9072466006332 40.911125072831 -10.0038784721978 A:T:C:G G A 10 0.545481667637747 0.093833823303746 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 160453978 A/G 1 11 11 22 4.99970165598478 6.00029834401522 -1.00059668803043 A:G A G 10 0.545481667637747 0.67524038559697 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160453974_160454139:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160453974_160454139:IGF2R HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 160464289 G/A 1 11 11 22 4.99970165598478 6.00029834401522 -1.00059668803043 A:G G A 10 0.545481667637747 0.67524038559697 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160464180_160464320:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160464180_160464320:IGF2R HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 161507618 C/T 1 7 13 20 3.18162832653577 7.09126167929071 -3.90963335275494 T:C C T 10 0.545481667637747 0.113949941344795 ENSG00000085511:ENST00000366920:exon_161507616_161507699:MAP3K4;ENSG00000085511:ENST00000392142:exon_161507616_161507699:MAP3K4;ENSG00000085511:ENST00000348824:exon_161507616_161507699:MAP3K4;ENSG00000085511:ENST00000366919:exon_161507616_161507699:MAP3K4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 161557662 G/A 1 8 2 10 3.63614665889802 1.09096333527549 2.54518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 0.123918791716156 ENSG00000026652:ENST00000320285:exon_161551057_161557666:AGPAT4;ENSG00000026652:ENST00000457520:exon_161557107_161557666:AGPAT4;ENSG00000026652:ENST00000366911:exon_161557107_161557666:AGPAT4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 166736362 C/T 1 108 132 240 49.0879798951233 72.0035801281826 -22.9156002330593 A:T:C C T 10 0.545481667637747 0.00345670610317607 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 166739646 T/C 1 29 45 74 13.1810316385053 24.5466750436986 -11.3656434051933 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00981246893036718 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000494682:exon_166739361_166739655:SFT2D1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 168343838 T/C 1 10 1 11 4.54518332362253 0.545481667637747 3.99970165598478 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0153623774768648 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168343809_168343871:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000507679:exon_168343809_168343874:MLLT4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 168349011 C/T 1 12 11 23 5.45421998834704 6.00029834401522 -0.546078355668181 T:C C T 10 0.545481667637747 0.837030175057015 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000509296:exon_168348709_168349158:MLLT4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 168370548 A/C 1 21 19 40 9.54488497960731 10.3641516851172 -0.819266705509879 A:T:C A C 10 0.545481667637747 0.874215754851831 ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168370462_168370770:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168370462_168372702:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168370462_168372702:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168370462_168372702:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168370462_168372703:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168370462_168370615:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000507704:exon_168370462_168370705:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000485634:exon_168370462_168370647:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000515794:exon_168370462_168370988:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511503:exon_168370462_168370968:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000486649:exon_168370462_168370583:MLLT4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 6 170068180 A/G 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 A:G A G 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170068078_170068191:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170068078_170068281:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170068078_170068281:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000496752:exon_170068078_170068191:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000474869:exon_170068157_170068281:WDR27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 550467 G/A 1 9 12 21 4.09066499126028 6.54578001165296 -2.45511502039269 A:G G A 10 0.545481667637747 0.381254161766230 ENSG00000197461:ENST00000402802:exon_550446_550633:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000344323:exon_550446_550633:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000354513:exon_550446_550633:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000482462:exon_550446_550633:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000400761:exon_550446_550633:PDGFA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 552046 A/G 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000197461:ENST00000402802:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000344323:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000354513:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000482462:exon_551988_553104:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000400761:exon_551988_552092:PDGFA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 618938 A/G 1 14 15 29 6.36325665307154 8.1822250145662 -1.81896836149466 A:G A G 10 0.545481667637747 0.577160759175787 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_618893_619014:PRKAR1B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 810219 T/C 1 9 10 19 4.09066499126028 5.45481667637747 -1.36415168511719 T:C T C 10 0.545481667637747 0.646474994475887 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 881668 C/T 1 19 10 29 8.63584831488281 5.45481667637747 3.18103163850534 T:C C T 10 0.545481667637747 0.266845155834917 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000427969:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450538:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000407944:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457378:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000435699:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000439679:exon_881583_881723:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457598:exon_881583_881672:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000340926:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000403868:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000467483:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000469755:exon_881583_881710:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450881:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000493681:exon_881453_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000477950:exon_881549_881767:SUN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 889169 A/G 1 15 7 22 6.8177749854338 3.81837167346423 2.99940331196957 A:G A G 10 0.545481667637747 0.284226176487771 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000407944:exon_889157_889326:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000340926:exon_889157_890404:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000419312:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_889157_889240:SUN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 897492 A/G 1 16 10 26 7.27229331779605 5.45481667637747 1.81747664141858 A:G A G 10 0.545481667637747 0.557013656890898 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000475971:exon_897465_897594:SUN1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 930689 C/T 1 49 31 80 22.2713982857504 16.9099316967702 5.36146658898024 T:C C T 10 0.545481667637747 0.26175580281656 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 940181 C/T 1 13 15 28 5.90873832070929 8.1822250145662 -2.27348669385692 T:C C T 10 0.545481667637747 0.44954716189734 ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000495809:exon_940170_941036:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000437486:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000454383:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453823:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_940170_940253:COX19 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 1097952 C/T 1 1 7 8 0.454518332362253 3.81837167346423 -3.36385334110198 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0271476654586150 ENSG00000164849:ENST00000444847:exon_1097128_1098097:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000397095:exon_1097128_1098894:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000297468:exon_1097141_1098897:GPR146 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 1132153 G/A 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 A:G G A 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 1132456 C/T 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 1132505 G/A 1 8 8 16 3.63614665889802 4.36385334110198 -0.727706682203952 A:G G A 10 0.545481667637747 0.8039768822367 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 1192797 C/A 1 24 17 41 10.9084399766941 9.2731883498417 1.63525162685237 A:T:C C A 10 0.545481667637747 0.64124397566331 ENSG00000178381:ENST00000401903:exon_1192709_1192860:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000316495:exon_1192543_1192860:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000397083:exon_1192543_1192877:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1192544_1192860:ZFAND2A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 1195215 A/C 1 17 17 34 7.7268116501583 9.2731883498417 -1.5463766996834 A:C A C 10 0.545481667637747 0.609610413780762 ENSG00000178381:ENST00000401903:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000316495:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000397083:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1195089_1195313:ZFAND2A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 1938001 G/A 1 32 32 64 14.5445866355921 17.4554133644079 -2.91082672881581 A:G G A 10 0.545481667637747 0.530613755541967 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1937848_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1937836_1938026:MAD1L1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 1976457 C/T 1 26 25 51 11.8174766414186 13.6370416909437 -1.81956504952509 T:C C T 10 0.545481667637747 0.673783713039537 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 28 9 37 12.7265133061431 4.90933500873972 7.81717829740336 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0122637389428409 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 2290522 C/T 1 59 48 107 26.8165816093729 26.1831200466119 0.633461562761074 T:C C T 10 0.545481667637747 0.922968859373013 ENSG00000106268:ENST00000356714:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397049:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000447457:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397047:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397046:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397048:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000449983:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000343985:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000339737:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000431585:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000487426:exon_2290464_2290781:NUDT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 2472555 C/T 1 19 14 33 8.63584831488281 7.63674334692846 0.99910496795435 T:C C T 10 0.545481667637747 0.861592700201063 ENSG00000136213:ENST00000258711:exon_2472198_2474242:CHST12;ENSG00000136213:ENST00000432336:exon_2472198_2473010:CHST12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 2472707 G/C 1 17 18 35 7.7268116501583 9.81867001747944 -2.09185836732114 C:G G C 10 0.545481667637747 0.501053345348018 ENSG00000136213:ENST00000258711:exon_2472198_2474242:CHST12;ENSG00000136213:ENST00000432336:exon_2472198_2473010:CHST12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 2577691 C/G 1 14 9 23 6.36325665307154 4.90933500873972 1.45392164433182 C:G C G 10 0.545481667637747 0.676547146622212 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 30 27 57 13.6355499708676 14.7280050262192 -1.09245505535158 T:C T C 10 0.545481667637747 0.791447779844186 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 6 16 22 2.72710999417352 8.72770668220395 -6.00059668803043 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0164118062435037 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 2578238 C/T 1 5 16 21 2.27259166181127 8.72770668220395 -6.45511502039269 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00699926557592017 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 2578246 C/T 1 17 6 23 7.7268116501583 3.27289000582648 4.45392164433182 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0917659595928374 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 2583165 G/A 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 2583328 C/T 1 18 11 29 8.18132998252056 6.00029834401522 2.18103163850534 T:C C T 10 0.545481667637747 0.460258162140569 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2583224_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2583224_2583596:C7orf27 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 2951824 A/G 1 37 33 70 16.8171782974034 18.0008950320457 -1.18371673464229 A:C:G A G 10 0.545481667637747 0.810894677474147 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2951806_2951930:CARD11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 2959172 G/A 1 24 19 43 10.9084399766941 10.3641516851172 0.54428829157688 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2959006_2959246:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2959006_2959246:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2959114_2959246:CARD11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 2962293 C/G 1 13 13 26 5.90873832070929 7.09126167929071 -1.18252335858142 C:G C G 10 0.545481667637747 0.696126980810445 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2962268_2962394:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2962268_2962674:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2962268_2962394:CARD11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 5353061 C/T 1 16 7 23 7.27229331779605 3.81837167346423 3.45392164433182 T:C C T 10 0.545481667637747 0.208244249691514 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 5353253 G/T 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 T:G G T 10 0.545481667637747 0.782586339670189 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 5353344 G/A 1 11 5 16 4.99970165598478 2.72740833818873 2.27229331779605 A:G G A 10 0.545481667637747 0.319450493523029 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 5363981 G/A 1 9 14 23 4.09066499126028 7.63674334692846 -3.54607835566818 A:G G A 10 0.545481667637747 0.147879044249785 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5363845_5363986:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5363845_5363986:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000455076:exon_5363853_5363986:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000497663:exon_5363878_5363986:TNRC18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 5391702 C/G 1 15 15 30 6.8177749854338 8.1822250145662 -1.36445002913241 C:G C G 10 0.545481667637747 0.71468425454372 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5390919_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5391633_5391725:TNRC18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 5530954 G/A 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:G G A 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5530862_5531080:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5530862_5531080:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000297035:exon_5530862_5531080:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000458142:exon_5530862_5531080:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5530862_5531080:FBXL18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 5541009 C/A 0 9 0 9 4.09066499126028 0 4.09066499126028 C C 10 0.545481667637747 0.00510371084910098 ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000458142:exon_5540119_5541550:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 5541657 G/A 1 12 1 13 5.45421998834704 0.545481667637747 4.90873832070929 A:G G A 10 0.545481667637747 0.00903518436202255 ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 5568366 A/G 1 83 85 168 37.725021586067 46.3659417492085 -8.64092016314149 A:G A G 10 0.545481667637747 0.188268424227763 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 54 37 91 24.5439899475617 20.1828217025966 4.36116824496503 A:G G A 10 0.545481667637747 0.400152165748768 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 15 12 27 6.8177749854338 6.54578001165296 0.271994973780831 A:C:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 6449496 T/C 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 T:C T C 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6448757_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6448760_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6448761_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6449148_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6449231_6449666:DAGLB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 6621277 G/A 1 30 26 56 13.6355499708676 14.1825233585814 -0.54697338771383 A:G G A 10 0.545481667637747 0.894032826388861 ENSG00000136247:ENST00000405731:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396707:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396713:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000335965:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000493944:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396709:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000474097:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000483589:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396706:exon_6621238_6621311:ZDHHC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 6777218 T/C 1 12 13 25 5.45421998834704 7.09126167929071 -1.63704169094367 T:C T C 10 0.545481667637747 0.550995061740953 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 8008970 C/G 1 4 11 15 1.81807332944901 6.00029834401522 -4.1822250145662 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0373845255059045 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8008423_8009438:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8008425_8009438:GLCCI1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 12727826 G/C 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000439721:exon_12727791_12728031:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000399303:exon_12727722_12728432:ARL4A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 17379110 G/A 1 21 13 34 9.54488497960731 7.09126167929071 2.4536233003166 A:G G A 10 0.545481667637747 0.491669588132129 ENSG00000106546:ENST00000242057:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000463496:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000401808:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000492120:exon_17378610_17379151:AHR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 20180717 C/G 1 15 6 21 6.8177749854338 3.27289000582648 3.54488497960731 C:G C G 10 0.545481667637747 0.130974510766364 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20176020_20180781:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20180248_20180781:MACC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 20198440 G/A 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 A:G G A 10 0.545481667637747 0.782586339670189 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 24756951 C/T 1 14 44 58 6.36325665307154 24.0011933760609 -17.6379367229893 T:C C T 10 0.545481667637747 3.80495373239631e-06 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000446822:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24756088_24756993:DFNA5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 30830823 A/G 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 A:G A G 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000254959:ENST00000458257:exon_30830781_30831190:RP4-740D2.1;ENSG00000240583:ENST00000434909:exon_30830781_30831190:AQP1;ENSG00000106125:ENST00000265299:exon_30830781_30831190:FAM188B;ENSG00000106125:ENST00000381693:exon_30830781_30831190:FAM188B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 33060946 A/G 1 14 9 23 6.36325665307154 4.90933500873972 1.45392164433182 A:G A G 10 0.545481667637747 0.676547146622212 ENSG00000122643:ENST00000456458:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000381626:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000396152:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000242210:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000405342:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409467:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409787:exon_33060884_33060969:NT5C3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 43916727 T/G 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 43917013 G/A 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 43917274 A/G 1 8 13 21 3.63614665889802 7.09126167929071 -3.45511502039269 A:G A G 10 0.545481667637747 0.187332125989055 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 44153780 A/G 1 8 12 20 3.63614665889802 6.54578001165296 -2.90963335275494 A:G A G 10 0.545481667637747 0.261277301714232 ENSG00000106624:ENST00000223357:exon_44153193_44154159:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000450684:exon_44153193_44154161:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000413907:exon_44153193_44154158:AEBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 44606098 C/T 1 31 41 72 14.0900683032298 22.3647483731476 -8.27468006991778 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0579110808019484 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000479602:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000448192:exon_44605737_44606123:DDX56 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 44612229 G/A 1 36 30 66 16.3626599650411 16.3644500291324 -0.00179006409129912 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44612162_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44612173_44612343:DDX56 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 44620836 C/A 1 45 33 78 20.4533249563014 18.0008950320457 2.45242992425574 A:C C A 10 0.545481667637747 0.649596101025337 ENSG00000158604:ENST00000457408:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000419520:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000481238:exon_44619496_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000477639:exon_44619503_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000444131:exon_44620692_44620838:TMED4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 44800176 G/T 1 40 66 106 18.1807332944901 36.0017900640913 -17.8210567696012 T:G G T 10 0.545481667637747 0.000588258182309854 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 44836314 A/G 1 23 28 51 10.4539216443318 15.2734866938569 -4.8195650495251 A:G A G 10 0.545481667637747 0.205680980702786 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 A:G G A 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 45004063 T/C 1 141 104 245 64.0870848630777 56.7300934343257 7.356991428752 T:C T C 10 0.545481667637747 0.36925391392605 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45004014_45004118:MYO1G HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 45008963 C/T 1 16 13 29 7.27229331779605 7.09126167929071 0.181031638505338 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45008519_45009082:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45008122_45009082:MYO1G HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 140 93 233 63.6325665307154 50.7297950903105 12.902771440405 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0998651710577524 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 45009341 A/G 1 149 99 248 67.7232315219757 54.002685096137 13.7205464258388 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0851228846578672 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 45009723 G/A 1 130 111 241 59.0873832070929 60.5484651077899 -1.46108190069702 A:C:G G A 10 0.545481667637747 0.846493657142349 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009639_45009753:MYO1G HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 45104131 G/A 1 38 33 71 17.2716966297656 18.0008950320457 -0.729198402280037 A:G G A 10 0.545481667637747 0.905381136080224 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000478582:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000482714:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000492883:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000472223:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000476594:exon_45104062_45104221:CCM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 45115581 G/A 1 70 76 146 31.8162832653577 41.4566067404688 -9.64032347511106 A:G G A 10 0.545481667637747 0.114639065409403 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45115376_45115951:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45115376_45116066:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45115376_45116013:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45115376_45116050:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45115376_45116068:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45115376_45116030:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45115376_45116052:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45115376_45116036:CCM2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 45139892 G/A 1 38 44 82 17.2716966297656 24.0011933760609 -6.72949674629525 A:G G A 10 0.545481667637747 0.14961592812377 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 45139919 A/C 1 39 43 82 17.7262149621279 23.4557117084231 -5.72949674629525 A:C A C 10 0.545481667637747 0.222991468402389 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 45144494 T/C 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 T:C T C 10 0.545481667637747 0.527815080970101 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 55459563 A/G 1 7 9 16 3.18162832653577 4.90933500873972 -1.72770668220395 A:G A G 10 0.545481667637747 0.4555478790811 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 55540707 G/A 1 7 25 32 3.18162832653577 13.6370416909437 -10.4554133644079 A:G G A 10 0.545481667637747 0.000246769197053993 ENSG00000154978:ENST00000285279:exon_55538306_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428648:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000433959:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428097:exon_55539630_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000418904:exon_55539896_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000454227:exon_55540402_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000453256:exon_55540447_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000427700:exon_55540470_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000455023:exon_55540578_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000414113:exon_55540610_55540738:VOPP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 55840888 A/C 0 0 20 20 0 10.9096333527549 -10.9096333527549 C A C 10 0.545481667637747 1.41588536065824e-07 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 249 233 482 113.175064758201 127.097228559595 -13.922163801394 T:C:G T C 10 0.545481667637747 0.216815315762872 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 63981559 T/C 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 T:C T C 10 0.545481667637747 0.243356459282646 ENSG00000173041:ENST00000309683:exon_63980262_63982878:ZNF680 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 64169019 G/A 1 11 7 18 4.99970165598478 3.81837167346423 1.18132998252055 A:G G A 10 0.545481667637747 0.641996695541785 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 64169061 G/A 1 8 8 16 3.63614665889802 4.36385334110198 -0.727706682203952 A:G G A 10 0.545481667637747 0.8039768822367 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 24 23 47 10.9084399766941 12.5460783556682 -1.63763837897411 A:C C A 10 0.545481667637747 0.662184348761034 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 72300332 G/A 1 9 10 19 4.09066499126028 5.45481667637747 -1.36415168511719 A:G G A 10 0.545481667637747 0.646474994475887 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 29 17 46 13.1810316385053 9.2731883498417 3.90784328866364 T:C C T 10 0.545481667637747 0.300259540488475 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 32 33 65 14.5445866355921 18.0008950320457 -3.45630839645355 T:C C T 10 0.545481667637747 0.455126250157139 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 73097948 G/C 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 73731906 C/T 1 9 10 19 4.09066499126028 5.45481667637747 -1.36415168511719 T:C C T 10 0.545481667637747 0.646474994475887 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73731810_73731997:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73731810_73731997:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73731877_73731997:CLIP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 73753250 T/C 1 18 11 29 8.18132998252056 6.00029834401522 2.18103163850534 T:C T C 10 0.545481667637747 0.460258162140569 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 73790958 C/T 1 34 25 59 15.4536233003166 13.6370416909437 1.81658160937293 T:C C T 10 0.545481667637747 0.69576291385753 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73790217_73791152:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73790217_73791152:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73790217_73791152:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000487091:exon_73790400_73791152:CLIP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 75511134 A/G 1 2 7 9 0.909036664724506 3.81837167346423 -2.90933500873972 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0890372070351746 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 75609677 A/G 1 27 22 49 12.2719949737808 12.0005966880304 0.271398285750397 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75609657_75609711:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75609657_75610056:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75609657_75609729:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75609657_75609789:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75609657_75610040:POR;ENSG00000127948:ENST00000426184:exon_75609657_75609757:POR;ENSG00000127948:ENST00000475509:exon_75609657_75609678:POR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 22 3 25 9.99940331196957 1.63644500291324 8.36295830905632 T:C T C 10 0.545481667637747 0.000494304828127873 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 75633160 C/T 1 16 14 30 7.27229331779605 7.63674334692846 -0.364450029132409 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000430497:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000454618:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000492053:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75633057_75633173:STYXL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 18 27 45 8.18132998252056 14.7280050262192 -6.54667504369861 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0527073307732933 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 75677504 C/T 1 153 155 308 69.5413048514247 84.5496584838508 -15.0083536324261 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0863920952271942 ENSG00000146701:ENST00000461263:exon_75677369_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000315758:exon_75677385_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000443006:exon_75677403_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000461665:exon_75677454_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000490105:exon_75677479_75677840:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000432020:exon_75677479_75677544:MDH2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 6 17 23 2.72710999417352 9.2731883498417 -6.54607835566818 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0102604253827857 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 76991935 C/T 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 T:C C T 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000186088:ENST00000257626:exon_76991900_76991977:PION;ENSG00000186088:ENST00000455630:exon_76991900_76991977:PION;ENSG00000186088:ENST00000334003:exon_76991900_76991977:PION HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 91699497 G/A 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91699344_91699520:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91699344_91699520:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91699344_91699520:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91699344_91699520:AKAP9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 91763513 G/A 1 32 17 49 14.5445866355921 9.2731883498417 5.2713982857504 A:G G A 10 0.545481667637747 0.151666557651259 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91763487_91763844:CYP51A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 92733766 C/A 1 11 2 13 4.99970165598478 1.09096333527549 3.90873832070929 A:C C A 10 0.545481667637747 0.0470034688879142 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 92734983 A/G 1 10 15 25 4.54518332362253 8.1822250145662 -3.63704169094367 A:G A G 10 0.545481667637747 0.162458691100737 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 92760738 T/G 1 42 33 75 19.0897699592146 18.0008950320457 1.08887492716898 T:G T G 10 0.545481667637747 0.817796033759837 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92760530_92761298:SAMD9L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 92762681 A/G 1 20 23 43 9.09036664724506 12.5460783556682 -3.45571170842312 A:G A G 10 0.545481667637747 0.358342122591806 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 93551428 C/T 1 10 12 22 4.54518332362253 6.54578001165296 -2.00059668803043 T:C C T 10 0.545481667637747 0.401468669837045 ENSG00000127920:ENST00000248564:exon_93551011_93551545:GNG11 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 95034775 G/C 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 C:G G C 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000105854:ENST00000455123:exon_95034179_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000355659:exon_95034185_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000433091:exon_95034192_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000222572:exon_95034209_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000483292:exon_95034590_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000446142:exon_95034651_95034800:PON2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 95800820 T/C 1 12 4 16 5.45421998834704 2.18192667055099 3.27229331779605 T:C T C 10 0.545481667637747 0.132268379253018 ENSG00000004864:ENST00000265631:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000416240:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000490072:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000484495:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000492869:exon_95800784_95800836:SLC25A13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 97847040 G/A 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000205356:ENST00000447648:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000490842:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000463402:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000379795:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000485716:exon_97847004_97847150:TECPR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 4 10 14 1.81807332944901 5.45481667637747 -3.63674334692846 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0615052435608368 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 126 79 205 57.2693098776439 43.093051743382 14.1762581342619 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0495062103202388 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 99752566 G/A 1 18 16 34 8.18132998252056 8.72770668220395 -0.546376699683396 A:G G A 10 0.545481667637747 0.864897162102258 ENSG00000146826:ENST00000394035:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000457641:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419037:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000316937:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000448720:exon_99752047_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000456769:exon_99752047_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000470260:exon_99752098_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419841:exon_99752447_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000275726:exon_99752489_99752758:C7orf43 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 99817859 A/G 1 14 14 28 6.36325665307154 7.63674334692846 -1.27348669385692 A:G A G 10 0.545481667637747 0.705678422974658 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99817737_99818296:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99817737_99818087:PVRIG HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 99821685 C/T 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 T:C C T 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000160844:ENST00000436886:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000292369:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000435519:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000328453:exon_99821505_99821698:GATS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 99926612 C/T 1 24 22 46 10.9084399766941 12.0005966880304 -1.09215671133636 T:C C T 10 0.545481667637747 0.768802260222528 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 100285476 C/T 1 16 14 30 7.27229331779605 7.63674334692846 -0.364450029132409 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100285411_100285506:GIGYF1;ENSG00000146830:ENST00000471340:exon_100285411_100285506:GIGYF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 100468090 G/C 1 3 15 18 1.36355499708676 8.1822250145662 -6.81867001747945 C:G G C 10 0.545481667637747 0.00142574195678334 ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 100732488 G/A 1 10 10 20 4.54518332362253 5.45481667637747 -0.909633352754939 A:G G A 10 0.545481667637747 0.82309086372065 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 101837149 G/A 1 7 10 17 3.18162832653577 5.45481667637747 -2.2731883498417 A:G G A 10 0.545481667637747 0.332311875410834 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000360264:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000425244:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000393824:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000338990:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000292535:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000412016:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000415720:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000436903:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000431850:exon_101837122_101837170:CUX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 102087202 T/C 1 31 28 59 14.0900683032298 15.2734866938569 -1.18341839062707 T:C T C 10 0.545481667637747 0.794501131186994 ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 1 16 6 22 7.27229331779605 3.27289000582648 3.99940331196957 A:G G A 10 0.545481667637747 0.132095272636517 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 102114087 C/T 1 84 13 97 38.1795399184293 7.09126167929071 31.0882782391385 T:C C T 10 0.545481667637747 2.36036871443761e-11 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 102952123 G/T 1 112 88 200 50.9060532245723 48.0023867521217 2.9036664724506 T:C:G G T 10 0.545481667637747 0.72271700132202 ENSG00000105819:ENST00000249269:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000428154:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000420236:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000444457:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000453466:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000469560:exon_102951025_102952343:PMPCB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 104717517 C/T 1 38 40 78 17.2716966297656 21.8192667055099 -4.54757007574426 T:C C T 10 0.545481667637747 0.308358395610813 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000478990:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000476671:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000482560:exon_104717410_104717640:MLL5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 105148593 G/A 1 12 6 18 5.45421998834704 3.27289000582648 2.18132998252055 A:G G A 10 0.545481667637747 0.350676066108478 ENSG00000091127:ENST00000481939:exon_105148562_105148991:PUS7;ENSG00000091127:ENST00000356362:exon_105148562_105148967:PUS7;ENSG00000091127:ENST00000469408:exon_105148562_105148991:PUS7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 105752691 G/A 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 A:G G A 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000008282:ENST00000455385:exon_105752586_105752777:SYPL1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 19 14 33 8.63584831488281 7.63674334692846 0.99910496795435 T:C T C 10 0.545481667637747 0.861592700201063 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 35 16 51 15.9081416326789 8.72770668220395 7.1804349504749 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0487574514592708 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 44 40 84 19.9988066239391 21.8192667055099 -1.82046008157075 C:G G C 10 0.545481667637747 0.742714547456025 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 116528240 C/T 1 37 28 65 16.8171782974034 15.2734866938569 1.54369160354645 A:T:C C T 10 0.545481667637747 0.711091319151225 ENSG00000198898:ENST00000464223:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000484325:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000449080:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000490693:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000461878:exon_116528181_116528753:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000417431:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000464669:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116528181_116528244:CAPZA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 116557939 C/T 1 70 58 128 31.8162832653577 31.6379367229893 0.178346542368388 A:T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116557781_116559315:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116557781_116558242:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116557781_116559312:CAPZA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 A:G G A 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 127224286 A/G 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 A:G A G 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127224205_127225661:GCC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 127721507 T/C 1 104 126 230 47.2699065656743 68.7306901223561 -21.4607835566818 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00531061724594969 ENSG00000197157:ENST00000438400:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000354725:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000486037:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000470463:exon_127721412_127721553:SND1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 129297332 T/G 1 7 8 15 3.18162832653577 4.36385334110198 -1.1822250145662 T:G T G 10 0.545481667637747 0.609177701589922 ENSG00000106459:ENST00000353868:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393232:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393231:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000454688:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000223190:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000311967:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393230:exon_129297183_129297414:NRF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 12 14 26 5.45421998834704 7.63674334692846 -2.18252335858142 T:C T C 10 0.545481667637747 0.434203864087606 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 129821552 T/C 1 13 7 20 5.90873832070929 3.81837167346423 2.09036664724506 T:C T C 10 0.545481667637747 0.378879562360477 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129821463_129821559:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129821463_129821559:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129821463_129821559:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129821463_129821559:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000467599:exon_129821463_129821897:TMEM209 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 130144943 G/C 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 C:G G C 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000106484:ENST00000341441:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000416162:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000378576:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000393187:exon_130144780_130146127:MEST;ENSG00000106484:ENST00000223215:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000437945:exon_130144780_130145194:MEST;ENSG00000106484:ENST00000463263:exon_130144780_130145139:MEST HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 131347009 T/C 0 384 0 384 174.535039627105 0 174.535039627105 T T 10 0.545481667637747 8.85905211544544e-102 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 133979545 A/T 1 9 1 10 4.09066499126028 0.545481667637747 3.54518332362253 A:T A T 10 0.545481667637747 0.0266590352665392 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 1 11 1 12 4.99970165598478 0.545481667637747 4.45421998834704 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0088305259647185 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 133979578 A/G 0 10 0 10 4.54518332362253 0 4.54518332362253 A A 10 0.545481667637747 0.00270867480271896 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 134849213 G/A 1 25 13 38 11.3629583090563 7.09126167929071 4.27169662976562 A:C:G G A 10 0.545481667637747 0.19327927706062 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 134849577 A/C 1 16 16 32 7.27229331779605 8.72770668220395 -1.4554133644079 A:C A C 10 0.545481667637747 0.723184023134138 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 137600690 C/T 1 17 9 26 7.7268116501583 4.90933500873972 2.81747664141858 T:C C T 10 0.545481667637747 0.326568424395203 ENSG00000182158:ENST00000330387:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000456390:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000452463:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000458726:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000417785:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000420629:exon_137600583_137600758:CREB3L2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 138740037 G/C 1 10 12 22 4.54518332362253 6.54578001165296 -2.00059668803043 C:G G C 10 0.545481667637747 0.401468669837045 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138739951_138740041:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138739951_138740041:ZC3HAV1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 138761034 G/C 1 18 11 29 8.18132998252056 6.00029834401522 2.18103163850534 C:G G C 10 0.545481667637747 0.460258162140569 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000460845:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 138764233 C/T 1 7 11 18 3.18162832653577 6.00029834401522 -2.81867001747945 T:C C T 10 0.545481667637747 0.237085594735494 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 139415775 G/C 1 10 9 19 4.54518332362253 4.90933500873972 -0.364151685117192 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 139415943 G/A 1 17 18 35 7.7268116501583 9.81867001747944 -2.09185836732114 A:G G A 10 0.545481667637747 0.501053345348018 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 14 17 31 6.36325665307154 9.2731883498417 -2.90993169677016 A:G G A 10 0.545481667637747 0.367528049294024 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 11 12 23 4.99970165598478 6.54578001165296 -1.54607835566818 T:C C T 10 0.545481667637747 0.536843443422341 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 13 13 26 5.90873832070929 7.09126167929071 -1.18252335858142 A:G G A 10 0.545481667637747 0.696126980810445 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 1 70 39 109 31.8162832653577 21.2737850378721 10.5424982274856 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0436570715539869 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 73 56 129 33.1798382624445 30.5469733877138 2.63286487473064 T:C T C 10 0.545481667637747 0.659443527367482 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 148506396 A/C 1 5 13 18 2.27259166181127 7.09126167929071 -4.81867001747944 A:C A C 10 0.545481667637747 0.0309693444433747 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 149152906 G/A 1 9 14 23 4.09066499126028 7.63674334692846 -3.54607835566818 A:G G A 10 0.545481667637747 0.147879044249785 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 149317062 C/T 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 T:C C T 10 0.545481667637747 0.304880148035765 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150093701 A/C 0 0 17 17 0 9.2731883498417 -9.2731883498417 C A C 10 0.545481667637747 1.50790464051815e-06 ENSG00000196456:ENST00000478789:exon_150093601_150094003:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000490973:exon_150093601_150094067:ZNF775 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150171710 T/C 1 5 4 9 2.27259166181127 2.18192667055099 0.0906649912602773 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150171100_150171726:GIMAP8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150217089 G/A 1 12 1 13 5.45421998834704 0.545481667637747 4.90873832070929 A:T:G G A 10 0.545481667637747 0.00903518436202255 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150217335 G/T 1 2 7 9 0.909036664724506 3.81837167346423 -2.90933500873972 T:G G T 10 0.545481667637747 0.0890372070351746 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150324825 C/T 1 26 15 41 11.8174766414186 8.1822250145662 3.63525162685237 T:C C T 10 0.545481667637747 0.275717628252466 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150389593 T/C 1 40 44 84 18.1807332944901 24.0011933760609 -5.82046008157075 T:C T C 10 0.545481667637747 0.228176630302408 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 22 27 49 9.99940331196957 14.7280050262192 -4.7286017142496 C:G G C 10 0.545481667637747 0.197312998284813 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150389856 A/G 1 39 32 71 17.7262149621279 17.4554133644079 0.270801597719966 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150418045 G/A 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 13 18 31 5.90873832070929 9.81867001747944 -3.90993169677015 T:C C T 10 0.545481667637747 0.206175558984211 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 20 36 56 9.09036664724506 19.6373400349589 -10.5469733877138 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00672873732021701 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150761314 G/A 1 8 9 17 3.63614665889802 4.90933500873972 -1.2731883498417 A:G G A 10 0.545481667637747 0.628894857051545 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000488420:exon_150761289_150761448:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761289_150761454:SLC4A2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150761680 C/A 1 16 3 19 7.27229331779605 1.63644500291324 5.63584831488281 A:C C A 10 0.545481667637747 0.0100532466385133 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761613_150761831:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761613_150761778:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761613_150761847:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761613_150761854:SLC4A2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150763655 T/A 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 A:T T A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150763604_150763848:SLC4A2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 15 16 31 6.8177749854338 8.72770668220395 -1.90993169677016 A:G G A 10 0.545481667637747 0.589243588768345 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150773165 C/T 1 29 21 50 13.1810316385053 11.4551150203927 1.72591661811265 T:C C T 10 0.545481667637747 0.671749267619066 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000469467:exon_150773070_150773273:SLC4A2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150774308 G/A 1 46 48 94 20.9078432886636 26.1831200466119 -5.27527675794822 A:G G A 10 0.545481667637747 0.300687208672686 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150774245_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150774000_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150774000_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150774188_150774488:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150774000_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150774000_150775179:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000459800:exon_150774188_150774599:FASTK HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150779288 G/A 1 34 41 75 15.4536233003166 22.3647483731476 -6.91112507283102 A:G G A 10 0.545481667637747 0.131216828592279 ENSG00000164897:ENST00000297533:exon_150779262_150779680:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000392818:exon_150779262_150779680:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000462940:exon_150779262_150779995:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000482202:exon_150779262_150779680:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000476627:exon_150779262_150779680:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000488752:exon_150779262_150779680:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000492838:exon_150779262_150779680:TMUB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150905143 C/T 1 2 12 14 0.909036664724506 6.54578001165296 -5.63674334692846 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00259721898742587 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150904923_150905193:ABCF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150912750 G/T 1 40 48 88 18.1807332944901 26.1831200466119 -8.00238675212173 T:G G T 10 0.545481667637747 0.087962281423563 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150912690_150912818:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150912690_150912818:ABCF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150912786 T/C 1 32 48 80 14.5445866355921 26.1831200466119 -11.6385334110198 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00969913677558339 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150912690_150912818:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150912690_150912818:ABCF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 53 44 97 24.0894716151994 24.0011933760609 0.0882782391385426 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 45 36 81 20.4533249563014 19.6373400349589 0.815984921342498 C:G C G 10 0.545481667637747 0.911364946703472 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 44 38 82 19.9988066239391 20.7283033702344 -0.729496746295254 C:G C G 10 0.545481667637747 0.911897748265896 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 150935430 G/C 1 34 28 62 15.4536233003166 15.2734866938569 0.180136606459689 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 151064064 C/T 1 24 14 38 10.9084399766941 7.63674334692846 3.27169662976562 T:C C T 10 0.545481667637747 0.330150172260751 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000480907:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000497987:exon_151064025_151064211:NUB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 151074296 A/G 1 23 36 59 10.4539216443318 19.6373400349589 -9.18341839062707 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0183528652522142 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000460712:exon_151074133_151074367:NUB1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 151874498 C/T 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151873276_151875053:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151873276_151875095:MLL3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 155503920 A/T 1 8 5 13 3.63614665889802 2.72740833818873 0.908738320709289 A:T A T 10 0.545481667637747 0.782586339670189 ENSG00000184863:ENST00000401878:exon_155503897_155504149:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000307403:exon_155503897_155504149:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000440108:exon_155503867_155504149:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000392761:exon_155503897_155504149:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000486747:exon_155503897_155504149:RBM33 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 156761818 G/A 1 16 10 26 7.27229331779605 5.45481667637747 1.81747664141858 A:G G A 10 0.545481667637747 0.557013656890898 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 19 21 40 8.63584831488281 11.4551150203927 -2.81926670550988 C:G G C 10 0.545481667637747 0.428110736064814 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 19 23 42 8.63584831488281 12.5460783556682 -3.91023004078537 A:G G A 10 0.545481667637747 0.277998047807719 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 49 26 75 22.2713982857504 14.1825233585814 8.08887492716898 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0640020995734459 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 158526880 G/A 1 16 26 42 7.27229331779605 14.1825233585814 -6.91023004078537 A:G G A 10 0.545481667637747 0.042767845616875 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158523686_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158526140_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158526302_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158526304_158526943:ESYT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 158528233 A/G 1 20 22 42 9.09036664724506 12.0005966880304 -2.91023004078537 A:G A G 10 0.545481667637747 0.438921692863405 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 158534372 G/A 1 24 28 52 10.9084399766941 15.2734866938569 -4.36504671716284 A:G G A 10 0.545481667637747 0.265287587211042 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 158534381 G/C 1 23 26 49 10.4539216443318 14.1825233585814 -3.7286017142496 C:G G C 10 0.545481667637747 0.316431029480916 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 158536267 T/C 1 18 13 31 8.18132998252056 7.09126167929071 1.09006830322985 T:C T C 10 0.545481667637747 0.72247651404882 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 158536334 G/A 1 16 10 26 7.27229331779605 5.45481667637747 1.81747664141858 A:G G A 10 0.545481667637747 0.557013656890898 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 7 158536345 A/G 1 17 10 27 7.7268116501583 5.45481667637747 2.27199497378083 A:G A G 10 0.545481667637747 0.442481195527858 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 1905132 G/A 1 1 7 8 0.454518332362253 3.81837167346423 -3.36385334110198 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0271476654586150 ENSG00000104728:ENST00000349830:exon_1904915_1906799:ARHGEF10;ENSG00000104728:ENST00000520359:exon_1904915_1906807:ARHGEF10;ENSG00000104728:ENST00000518288:exon_1904915_1906807:ARHGEF10;ENSG00000104728:ENST00000398564:exon_1904915_1906799:ARHGEF10;ENSG00000104728:ENST00000262112:exon_1904915_1906799:ARHGEF10;ENSG00000104728:ENST00000522435:exon_1904915_1906805:ARHGEF10;ENSG00000104728:ENST00000521927:exon_1904915_1905371:ARHGEF10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 6303025 G/A 1 23 22 45 10.4539216443318 12.0005966880304 -1.54667504369861 A:T:G G A 10 0.545481667637747 0.656258473337138 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 6478986 C/T 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 T:C C T 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 A:C C A 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 8234077 G/C 1 9 3 12 4.09066499126028 1.63644500291324 2.45421998834704 C:G G C 10 0.545481667637747 0.245735735487388 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 8234192 G/C 0 9 0 9 4.09066499126028 0 4.09066499126028 G G 10 0.545481667637747 0.00510371084910098 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 8234218 C/T 1 8 1 9 3.63614665889802 0.545481667637747 3.09066499126028 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0461109865564625 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 8234219 G/A 1 8 1 9 3.63614665889802 0.545481667637747 3.09066499126028 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0461109865564625 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 8234714 C/T 1 13 9 22 5.90873832070929 4.90933500873972 0.999403311969568 T:C C T 10 0.545481667637747 0.831133867954711 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 10623240 T/C 1 44 32 76 19.9988066239391 17.4554133644079 2.54339325953123 T:C T C 10 0.545481667637747 0.567472700296727 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 11162496 A/C 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 A:C A C 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000104643:ENST00000221086:exon_11162350_11162523:MTMR9;ENSG00000104643:ENST00000530200:exon_11162350_11162523:MTMR9;ENSG00000104643:ENST00000526292:exon_11162350_11162523:MTMR9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 11637276 G/A 1 11 4 15 4.99970165598478 2.18192667055099 2.8177749854338 A:G G A 10 0.545481667637747 0.195724131043462 ENSG00000154328:ENST00000530433:exon_11637107_11637461:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11637254_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11637107_11637459:NEIL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 11643553 G/T 1 7 7 14 3.18162832653577 3.81837167346423 -0.636743346928458 T:G G T 10 0.545481667637747 0.79245845949312 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528113:exon_11643472_11643606:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 11643803 C/T 1 18 5 23 8.18132998252056 2.72740833818873 5.45392164433182 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0338817099084827 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 11667179 C/T 1 156 163 319 70.9048598485115 88.9135118249527 -18.0086519764413 T:C C T 10 0.545481667637747 0.048919643930931 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531733:exon_11667176_11667485:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531249:exon_11667176_11667448:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11666765_11667359:FDFT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 11689119 G/C 1 200 202 402 90.9036664724506 110.187296862825 -19.2836303903743 T:C:G G C 10 0.545481667637747 0.0569456695961169 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11689027_11689176:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529521:exon_11689027_11689303:FDFT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 11706581 T/G 1 15 9 24 6.8177749854338 4.90933500873972 1.90843997669407 T:G T G 10 0.545481667637747 0.540106773962345 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11706555_11707087:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11706570_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11706571_11706673:CTSB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 11710888 G/C 1 12 10 22 5.45421998834704 5.45481667637747 -0.000596688030433334 C:G G C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11710838_11711023:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526645:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525315:exon_11710838_11710971:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530573:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532370:exon_11710838_11711328:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000505496:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524500:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531502:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527215:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532656:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534382:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000528965:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524654:exon_11710867_11710988:CTSB HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 17125768 T/C 1 3 7 10 1.36355499708676 3.81837167346423 -2.45481667637747 T:C T C 10 0.545481667637747 0.201970346156534 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000324815:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000519381:exon_17125767_17125782:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000518038:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17125767_17125881:VPS37A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 19677915 G/A 1 14 6 20 6.36325665307154 3.27289000582648 3.09036664724506 A:G G A 10 0.545481667637747 0.184519017097887 ENSG00000104613:ENST00000397977:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000522114:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000523869:exon_19677890_19678029:INTS10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 21766881 A/C 1 8 16 24 3.63614665889802 8.72770668220395 -5.09156002330593 A:C A C 10 0.545481667637747 0.0412084805916291 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 21846586 G/C 1 10 11 21 4.54518332362253 6.00029834401522 -1.45511502039269 C:G G C 10 0.545481667637747 0.662266055550669 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000518808:exon_21845859_21846594:XPO7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 26 38 64 11.8174766414186 20.7283033702344 -8.91082672881581 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0320949835965467 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 22262379 C/T 1 10 6 16 4.54518332362253 3.27289000582648 1.27229331779605 T:C C T 10 0.545481667637747 0.620225311632925 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520644:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000524285:exon_22262209_22262490:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520832:exon_22262209_22262383:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000519960:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000522881:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517552:exon_22262030_22262493:SLC39A14 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 22273687 T/C 1 12 8 20 5.45421998834704 4.36385334110198 1.09036664724506 T:C T C 10 0.545481667637747 0.660941894453713 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517370:exon_22273586_22273782:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000518348:exon_22273586_22273793:SLC39A14 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 22526559 G/A 1 15 14 29 6.8177749854338 7.63674334692846 -0.818968361494663 A:G G A 10 0.545481667637747 0.852670497525973 ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22526557_22526633:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22526557_22526626:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22526557_22526592:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000522687:exon_22526557_22526638:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520292:exon_22526557_22526635:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000518366:exon_22526557_22526604:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000522268:exon_22526557_22526661:BIN3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 22548790 G/T 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 T:G G T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000179388:ENST00000317216:exon_22545172_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000522910:exon_22547556_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000519492:exon_22547937_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000524088:exon_22547985_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000518773:exon_22548678_22548995:EGR3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 66 52 118 29.9982099359087 28.3650467171628 1.63316321874586 C:G G C 10 0.545481667637747 0.782279589905057 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 23294761 T/C 1 11 13 24 4.99970165598478 7.09126167929071 -2.09156002330593 T:C T C 10 0.545481667637747 0.41817747956773 ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000520936:exon_23294547_23294771:ENTPD4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 25287397 T/C 1 12 7 19 5.45421998834704 3.81837167346423 1.63584831488281 T:C T C 10 0.545481667637747 0.497845829751492 ENSG00000104756:ENST00000221200:exon_25285366_25287489:KCTD9;ENSG00000104756:ENST00000519665:exon_25286778_25287489:KCTD9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 25364331 G/A 1 19 19 38 8.63584831488281 10.3641516851172 -1.72830337023439 A:G G A 10 0.545481667637747 0.626589184197869 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 25364834 A/T 1 10 19 29 4.54518332362253 10.3641516851172 -5.81896836149466 A:T A T 10 0.545481667637747 0.0388996764246589 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 25364960 A/G 1 12 18 30 5.45421998834704 9.81867001747944 -4.36445002913241 A:G A G 10 0.545481667637747 0.141554640853993 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 25365278 G/A 1 10 6 16 4.54518332362253 3.27289000582648 1.27229331779605 A:G G A 10 0.545481667637747 0.620225311632925 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 26221331 T/C 1 18 12 30 8.18132998252056 6.54578001165296 1.63554997086759 T:C T C 10 0.545481667637747 0.58714780737981 ENSG00000221914:ENST00000380737:exon_26221237_26221406:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000524169:exon_26221237_26221406:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000315985:exon_26221237_26221406:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000518215:exon_26221237_26221406:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000518890:exon_26221237_26221406:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000517754:exon_26220200_26221406:PPP2R2A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 4 6 10 1.81807332944901 3.27289000582648 -1.45481667637747 A:C A C 10 0.545481667637747 0.527815080970101 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 30973957 G/T 1 11 3 14 4.99970165598478 1.63644500291324 3.36325665307154 T:G G T 10 0.545481667637747 0.104990031088893 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30973870_30974044:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30973870_30974044:WRN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 30999280 G/T 1 16 8 24 7.27229331779605 4.36385334110198 2.90843997669407 T:G G T 10 0.545481667637747 0.305970557304632 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30999197_30999291:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30999197_30999291:WRN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 31024638 C/T 1 18 26 44 8.18132998252056 14.1825233585814 -6.00119337606086 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0947187381000248 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 33246538 A/G 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:C:G A G 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 33246591 G/C 1 5 3 8 2.27259166181127 1.63644500291324 0.636146658898024 C:G G C 10 0.545481667637747 0.735500840387382 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 25 25 50 11.3629583090563 13.6370416909437 -2.27408338188735 A:G A G 10 0.545481667637747 0.57096418327652 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 37963239 C/T 1 25 18 43 11.3629583090563 9.81867001747944 1.54428829157688 T:C C T 10 0.545481667637747 0.650218906276211 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37962760_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37963011_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517719:exon_37963018_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37963068_37963256:ASH2L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 37985897 A/G 1 12 16 28 5.45421998834704 8.72770668220395 -3.27348669385692 A:G A G 10 0.545481667637747 0.255806345342211 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000428278:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000521652:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000524247:exon_37985858_37985976:ASH2L HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 38095662 C/T 1 12 12 24 5.45421998834704 6.54578001165296 -1.09156002330593 T:C C T 10 0.545481667637747 0.685991730875607 ENSG00000085788:ENST00000397166:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000519857:exon_38095607_38096576:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000526237:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000532222:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000520272:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000319246:exon_38095607_38095727:DDHD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 38458707 C/T 0 9 0 9 4.09066499126028 0 4.09066499126028 C C 10 0.545481667637747 0.00510371084910098 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 41791283 G/A 1 13 10 23 5.90873832070929 5.45481667637747 0.45392164433182 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000083168:ENST00000265713:exon_41786997_41792385:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000406337:exon_41786997_41792385:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000396930:exon_41786997_41792385:MYST3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 41906095 A/G 1 3 6 9 1.36355499708676 3.27289000582648 -1.90933500873972 A:G A G 10 0.545481667637747 0.316116386178568 ENSG00000083168:ENST00000265713:exon_41905896_41906820:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000406337:exon_41905896_41906820:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000396930:exon_41905896_41906820:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000485568:exon_41905896_41906820:MYST3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 48710955 A/G 1 39 28 67 17.7262149621279 15.2734866938569 2.45272826827095 A:G A G 10 0.545481667637747 0.624035449206916 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48710798_48710958:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48710798_48710958:AC103686.1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 52746153 C/T 1 5 13 18 2.27259166181127 7.09126167929071 -4.81867001747944 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0309693444433747 ENSG00000168300:ENST00000360540:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519559:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000522514:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519554:exon_52746078_52746249:PCMTD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 53537316 A/G 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 A:G A G 10 0.545481667637747 0.243356459282646 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 53555069 A/G 1 16 18 34 7.27229331779605 9.81867001747944 -2.5463766996834 A:G A G 10 0.545481667637747 0.39437426025059 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 56686224 T/C 1 15 13 28 6.8177749854338 7.09126167929071 -0.273486693856915 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56685701_56686278:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56686029_56686278:TGS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 56708701 T/C 1 22 13 35 9.99940331196957 7.09126167929071 2.90814163267886 T:C T C 10 0.545481667637747 0.396818936531709 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56708537_56708711:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56708537_56708711:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000519494:exon_56708537_56708711:TGS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 56711713 A/G 1 15 14 29 6.8177749854338 7.63674334692846 -0.818968361494663 A:G A G 10 0.545481667637747 0.852670497525973 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56711473_56711779:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56711473_56711779:TGS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 56723557 T/G 1 4 8 12 1.81807332944901 4.36385334110198 -2.54578001165296 T:G T G 10 0.545481667637747 0.157407748991045 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56723440_56723656:TGS1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 25 29 54 11.3629583090563 15.8189683614947 -4.45601005243834 T:C T C 10 0.545481667637747 0.274155460039748 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 67577178 G/A 1 10 5 15 4.54518332362253 2.72740833818873 1.8177749854338 A:G G A 10 0.545481667637747 0.44074713691162 ENSG00000175073:ENST00000310421:exon_67576484_67579452:VCPIP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 68204202 C/A 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 A:C C A 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000066777:ENST00000262215:exon_68204082_68204358:ARFGEF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 68208815 T/C 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000066777:ENST00000262215:exon_68208666_68208845:ARFGEF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 74204653 A/T 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:T A T 10 0.545481667637747 1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 74527996 C/T 1 2 11 13 0.909036664724506 6.00029834401522 -5.09126167929071 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0049344968896263 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 74893452 A/G 1 60 64 124 27.2710999417352 34.9108267288158 -7.63972678708063 A:G A G 10 0.545481667637747 0.176741036419806 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74893390_74893601:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000519551:exon_74893390_74893716:TMEM70 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 106 80 186 48.1789432303988 43.6385334110198 4.54040981937906 A:G A G 10 0.545481667637747 0.508789888323122 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 59 56 115 26.8165816093729 30.5469733877138 -3.7303917783409 C:G C G 10 0.545481667637747 0.512722951191555 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 77896263 C/T 1 37 48 85 16.8171782974034 26.1831200466119 -9.36594174920849 T:C C T 10 0.545481667637747 0.049399987562177 ENSG00000164751:ENST00000357039:exon_77892494_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000419564:exon_77892496_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000520103:exon_77895170_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000522527:exon_77895193_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000518986:exon_77895876_77896431:PEX2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 41 38 79 18.6352516268524 20.7283033702344 -2.09305174338201 A:G A G 10 0.545481667637747 0.65269509163337 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 94746698 G/T 1 7 11 18 3.18162832653577 6.00029834401522 -2.81867001747945 T:G G T 10 0.545481667637747 0.237085594735494 ENSG00000183808:ENST00000399300:exon_94741584_94748666:RBM12B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 17 17 34 7.7268116501583 9.2731883498417 -1.5463766996834 T:C T C 10 0.545481667637747 0.609610413780762 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 25 22 47 11.3629583090563 12.0005966880304 -0.637638378974108 T:C C T 10 0.545481667637747 0.884237404202915 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 95893915 T/C 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 T:C T C 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95892346_95893974:INTS8;ENSG00000175305:ENST00000520509:exon_95891998_95893973:CCNE2;ENSG00000175305:ENST00000308108:exon_95892455_95893973:CCNE2;ENSG00000175305:ENST00000396133:exon_95893842_95893997:CCNE2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 101206391 G/A 1 12 12 24 5.45421998834704 6.54578001165296 -1.09156002330593 A:G G A 10 0.545481667637747 0.685991730875607 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101206340_101206496:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101206340_101206496:SPAG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 101206531 G/A 1 28 13 41 12.7265133061431 7.09126167929071 5.63525162685237 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0852954736087108 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 103307434 G/A 1 29 34 63 13.1810316385053 18.5463766996834 -5.36534506117806 A:G G A 10 0.545481667637747 0.205634519565343 ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103307432_103307558:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103307432_103307558:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103307432_103307558:UBR5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 103663912 T/G 1 22 16 38 9.99940331196957 8.72770668220395 1.27169662976561 T:G T G 10 0.545481667637747 0.746021063688677 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103663377_103664289:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103663377_103664289:KLF10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 104343607 C/A 1 18 10 28 8.18132998252056 5.45481667637747 2.72651330614309 A:C C A 10 0.545481667637747 0.346086789444934 ENSG00000164930:ENST00000522566:exon_104343569_104345045:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000522484:exon_104343569_104345094:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523739:exon_104343569_104344222:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000358755:exon_104343569_104345087:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000519011:exon_104343569_104344120:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000521195:exon_104343569_104344014:FZD6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 107754473 G/A 1 8 11 19 3.63614665889802 6.00029834401522 -2.36415168511719 A:G G A 10 0.545481667637747 0.357710103923903 ENSG00000164830:ENST00000445937:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000452423:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000442977:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000531443:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000517566:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000435082:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000336821:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000312046:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000519415:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000449762:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000297447:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000521592:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000521864:exon_107754450_107754712:OXR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 109215368 T/C 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 T:C T C 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000104408:ENST00000523674:exon_109215212_109215575:EIF3E HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 117768048 G/C 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 C:G G C 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000147677:ENST00000521861:exon_117767905_117768060:EIF3H;ENSG00000147677:ENST00000518995:exon_117767905_117768061:EIF3H;ENSG00000147677:ENST00000522800:exon_117767905_117768068:EIF3H;ENSG00000147677:ENST00000518034:exon_117767905_117768062:EIF3H;ENSG00000147677:ENST00000517974:exon_117767905_117768062:EIF3H;ENSG00000147677:ENST00000519046:exon_117767905_117768062:EIF3H HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 76 70 146 34.5433932595312 38.1837167346423 -3.64032347511106 A:G A G 10 0.545481667637747 0.561436003686378 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 120790304 T/C 1 8 3 11 3.63614665889802 1.63644500291324 1.99970165598478 T:C T C 10 0.545481667637747 0.364801401986479 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120790259_120790369:TAF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 120803637 C/G 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 C:G C G 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120803564_120803699:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000523904:exon_120803564_120803699:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000523734:exon_120803564_120804114:TAF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 120847188 T/C 1 8 6 14 3.63614665889802 3.27289000582648 0.363256653071542 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000136982:ENST00000313655:exon_120846216_120847241:DSCC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 123964431 G/A 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 123964953 C/T 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 125498086 A/G 1 15 11 26 6.8177749854338 6.00029834401522 0.817476641418578 A:G A G 10 0.545481667637747 0.844971052281341 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139;ENSG00000170881:ENST00000517684:exon_125498072_125498475:RNF139 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 126071664 T/C 1 9 8 17 4.09066499126028 4.36385334110198 -0.273188349841698 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000164961:ENST00000318410:exon_126071618_126071784:KIAA0196;ENSG00000164961:ENST00000517845:exon_126071618_126071784:KIAA0196;ENSG00000164961:ENST00000377985:exon_126071618_126071784:KIAA0196;ENSG00000164961:ENST00000523273:exon_126071618_126071784:KIAA0196 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 132982824 A/G 1 18 26 44 8.18132998252056 14.1825233585814 -6.00119337606086 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0947187381000248 ENSG00000132294:ENST00000254624:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000407309:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000377917:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000334503:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000519656:exon_132982723_132982890:EFR3A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 132999936 A/G 1 14 12 26 6.36325665307154 6.54578001165296 -0.182523358581421 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000132294:ENST00000254624:exon_132999822_132999949:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000407309:exon_132999822_132999949:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000377917:exon_132999873_132999949:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000334503:exon_132999822_132999949:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000519656:exon_132999822_132999949:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000519920:exon_132999822_132999949:EFR3A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 140744387 G/A 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 A:G G A 10 0.545481667637747 0.243356459282646 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521667:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000522504:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521700:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000519482:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000524162:exon_140744336_140744445:TRAPPC9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 141310644 G/A 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 A:G G A 10 0.545481667637747 0.243356459282646 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521167:exon_141310568_141310713:TRAPPC9 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 142154291 G/A 1 9 17 26 4.09066499126028 9.2731883498417 -5.18252335858142 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0487046981211123 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523058:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523015:exon_142154013_142154358:DENND3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 142161032 A/C 1 13 16 29 5.90873832070929 8.72770668220395 -2.81896836149466 A:C A C 10 0.545481667637747 0.352077308499086 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142160933_142161052:DENND3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 142161873 C/T 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 T:C C T 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142161718_142161936:DENND3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 142161888 G/A 1 10 8 18 4.54518332362253 4.36385334110198 0.181329982520555 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142161718_142161936:DENND3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 142170884 C/T 1 13 11 24 5.90873832070929 6.00029834401522 -0.0915600233059273 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521477:exon_142170731_142170886:DENND3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 143808951 C/T 1 3 8 11 1.36355499708676 4.36385334110198 -3.00029834401522 T:C C T 10 0.545481667637747 0.126273306068542 ENSG00000130193:ENST00000336138:exon_143808621_143809277:C8orf55;ENSG00000130193:ENST00000443814:exon_143808765_143809118:C8orf55 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144775871 C/A 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 A:C C A 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000181135:ENST00000525185:exon_144775841_144776000:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000534303:exon_144775841_144776009:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000528456:exon_144775841_144775942:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530574:exon_144775841_144775997:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531985:exon_144775841_144775893:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527293:exon_144775841_144775926:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531811:exon_144775841_144775918:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000525862:exon_144775841_144775873:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000526315:exon_144775841_144776129:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530341:exon_144775841_144775881:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531254:exon_144775841_144776199:ZNF707 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144990335 G/A 1 10 7 17 4.54518332362253 3.81837167346423 0.726811650158302 A:G G A 10 0.545481667637747 0.810670786245774 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 13 9 22 5.90873832070929 4.90933500873972 0.999403311969568 A:G A G 10 0.545481667637747 0.831133867954711 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144990846 G/A 1 39 27 66 17.7262149621279 14.7280050262192 2.9982099359087 A:G G A 10 0.545481667637747 0.536895354970826 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144990879 G/A 1 29 42 71 13.1810316385053 22.9102300407854 -9.72919840228003 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0232325558702243 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144991176 T/C 1 35 19 54 15.9081416326789 10.3641516851172 5.54398994756166 T:C T C 10 0.545481667637747 0.135207833986948 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144992103 T/C 1 12 13 25 5.45421998834704 7.09126167929071 -1.63704169094367 T:C T C 10 0.545481667637747 0.550995061740953 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144992361 T/C 1 8 9 17 3.63614665889802 4.90933500873972 -1.2731883498417 T:C T C 10 0.545481667637747 0.628894857051545 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144992862 A/G 1 14 15 29 6.36325665307154 8.1822250145662 -1.81896836149466 A:C:G A G 10 0.545481667637747 0.577160759175787 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144993324 C/T 1 27 12 39 12.2719949737808 6.54578001165296 5.72621496212787 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0766951793380548 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144993377 A/G 1 23 7 30 10.4539216443318 3.81837167346423 6.63554997086759 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0164374089809595 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144995494 C/T 1 20 7 27 9.09036664724506 3.81837167346423 5.27199497378083 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0520558328028788 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144995736 G/A 1 20 18 38 9.09036664724506 9.81867001747944 -0.728303370234384 A:G G A 10 0.545481667637747 0.871215003267403 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144996029 A/G 1 19 10 29 8.63584831488281 5.45481667637747 3.18103163850534 A:G A G 10 0.545481667637747 0.266845155834917 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144996408 T/G 1 21 18 39 9.54488497960731 9.81867001747944 -0.27378503787213 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_144996100_144996563:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144997656 C/T 1 9 5 14 4.09066499126028 2.72740833818873 1.36325665307154 T:C C T 10 0.545481667637747 0.594821470841361 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144998169 C/T 1 16 9 25 7.27229331779605 4.90933500873972 2.36295830905633 T:C C T 10 0.545481667637747 0.423480855331424 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144998190 A/G 1 15 10 25 6.8177749854338 5.45481667637747 1.36295830905633 A:G A G 10 0.545481667637747 0.68954281062682 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144999417 C/T 1 10 9 19 4.54518332362253 4.90933500873972 -0.364151685117192 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144999621 C/T 1 6 9 15 2.72710999417352 4.90933500873972 -2.1822250145662 T:C C T 10 0.545481667637747 0.304880148035765 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 144999684 A/G 1 9 10 19 4.09066499126028 5.45481667637747 -1.36415168511719 A:G A G 10 0.545481667637747 0.646474994475887 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 145001031 T/C 1 16 12 28 7.27229331779605 6.54578001165296 0.726513306143085 T:C T C 10 0.545481667637747 0.85098446461766 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_145000952_145001050:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 145001588 C/T 1 14 14 28 6.36325665307154 7.63674334692846 -1.27348669385692 T:C C T 10 0.545481667637747 0.705678422974658 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 145008560 A/G 1 14 10 24 6.36325665307154 5.45481667637747 0.908439976694073 A:G A G 10 0.545481667637747 0.838386676963374 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145008486_145008613:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 145011204 A/G 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:G A G 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000526416:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527816:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528131:exon_145011147_145011239:PLEC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 145689915 G/A 0 8 0 8 3.63614665889802 0 3.63614665889802 G G 10 0.545481667637747 0.0096600748165856 ENSG00000187954:ENST00000438911:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000292543:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000403000:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000424149:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000306145:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000533764:exon_145689658_145689995:CYHR1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 145692385 C/T 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000167702:ENST00000301332:exon_145692342_145692493:KIFC2;ENSG00000167702:ENST00000301331:exon_145692342_145692493:KIFC2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 145737636 A/G 1 25 18 43 11.3629583090563 9.81867001747944 1.54428829157688 A:G A G 10 0.545481667637747 0.650218906276211 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737527_145737707:RECQL4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 19 6 25 8.63584831488281 3.27289000582648 5.36295830905633 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0426103477586695 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 145740376 G/A 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 A:G G A 10 0.545481667637747 0.481553868568817 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145740320_145740456:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145740320_145740456:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145740320_145740456:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145740320_145740456:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532846:exon_145740320_145740426:RECQL4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 6 12 18 2.72710999417352 6.54578001165296 -3.81867001747945 C:G C G 10 0.545481667637747 0.095953636396545 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 9 12 21 4.09066499126028 6.54578001165296 -2.45511502039269 A:G G A 10 0.545481667637747 0.381254161766230 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 145742879 T/C 1 8 2 10 3.63614665889802 1.09096333527549 2.54518332362253 T:C T C 10 0.545481667637747 0.123918791716156 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145742798_145742892:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145742798_145742892:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145742798_145742892:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145742798_145742892:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145742798_145742883:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145742798_145742937:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534270:exon_145742798_145742956:RECQL4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 145745182 T/C 1 10 8 18 4.54518332362253 4.36385334110198 0.181329982520555 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000160959:ENST00000527730:exon_145745085_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000529022:exon_145744999_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000292524:exon_145744999_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000530854:exon_145745085_145745369:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000525766:exon_145744999_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000531310:exon_145744651_145745438:LRRC14 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 145947776 G/A 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000198169:ENST00000292562:exon_145946514_145948767:ZNF251 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 8 146067054 G/A 1 7 13 20 3.18162832653577 7.09126167929071 -3.90963335275494 A:G G A 10 0.545481667637747 0.113949941344795 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530776:exon_146066740_146067121:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 334337 A/G 1 10 15 25 4.54518332362253 8.1822250145662 -3.63704169094367 A:G A G 10 0.545481667637747 0.162458691100737 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_334225_334384:DOCK8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 399255 G/A 1 15 15 30 6.8177749854338 8.1822250145662 -1.36445002913241 A:G G A 10 0.545481667637747 0.71468425454372 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_399146_399259:DOCK8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 421032 C/G 1 10 19 29 4.54518332362253 10.3641516851172 -5.81896836149466 C:G C G 10 0.545481667637747 0.0388996764246589 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000493666:exon_420949_421078:DOCK8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 439352 A/G 1 9 14 23 4.09066499126028 7.63674334692846 -3.54607835566818 A:G A G 10 0.545481667637747 0.147879044249785 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_439245_439388:DOCK8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 2029199 G/A 1 29 52 81 13.1810316385053 28.3650467171628 -15.1840150786575 A:G G A 10 0.545481667637747 0.000759423241825827 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000457226:exon_2028987_2029221:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2029006_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2029019_2029247:SMARCA2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 53 45 98 24.0894716151994 24.5466750436986 -0.457203428499202 A:G G A 10 0.545481667637747 0.919676706425353 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 53 43 96 24.0894716151994 23.4557117084231 0.633759906776291 C:G C G 10 0.545481667637747 0.918725742921335 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 4564432 G/A 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 A:G G A 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000106688:ENST00000262352:exon_4564344_4564458:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000381910:exon_4564344_4564458:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000490167:exon_4564344_4564458:SLC1A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 4741097 C/A 1 24 14 38 10.9084399766941 7.63674334692846 3.27169662976562 A:C C A 10 0.545481667637747 0.330150172260751 ENSG00000147853:ENST00000381809:exon_4740937_4741318:AK3;ENSG00000147853:ENST00000447596:exon_4740937_4741227:AK3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 5050706 C/T 1 2 8 10 0.909036664724506 4.36385334110198 -3.45481667637747 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0510474779497875 ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5050686_5050831:JAK2;ENSG00000096968:ENST00000472549:exon_5050686_5050831:JAK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 5081780 G/A 1 7 5 12 3.18162832653577 2.72740833818873 0.454219988347036 A:C:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5081725_5081861:JAK2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 5467801 C/T 1 7 2 9 3.18162832653577 1.09096333527549 2.09066499126028 T:C C T 10 0.545481667637747 0.195909819758449 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 5774225 T/G 1 28 25 53 12.7265133061431 13.6370416909437 -0.910528384800589 A:T:G T G 10 0.545481667637747 0.89046873383244 ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5773958_5776552:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5773958_5774298:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5773958_5776557:KIAA1432 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 5968416 A/G 1 21 22 43 9.54488497960731 12.0005966880304 -2.45571170842312 A:G A G 10 0.545481667637747 0.540674742921706 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 13 24 37 5.90873832070929 13.0915600233059 -7.18282170259664 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0204131583745355 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 6506038 C/T 1 24 16 40 10.9084399766941 8.72770668220395 2.18073329449012 T:C C T 10 0.545481667637747 0.528541347452857 ENSG00000147854:ENST00000468435:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000276893:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000485617:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000492853:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000481243:exon_6506033_6506112:UHRF2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 6595046 C/T 1 10 11 21 4.54518332362253 6.00029834401522 -1.45511502039269 T:C C T 10 0.545481667637747 0.662266055550669 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6595014_6595119:GLDC;ENSG00000178445:ENST00000463305:exon_6595014_6595119:GLDC HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 6984172 G/A 1 17 11 28 7.7268116501583 6.00029834401522 1.72651330614308 A:G G A 10 0.545481667637747 0.572643391755575 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 19341045 A/G 1 6 5 11 2.72710999417352 2.72740833818873 -0.000298344015216667 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000137145:ENST00000380437:exon_19340990_19341112:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000307015:exon_19340990_19341112:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000453857:exon_19340990_19341112:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380432:exon_19340990_19341112:DENND4C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 19376255 A/C 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:C A C 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 19376258 G/C 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 C:G G C 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 20764870 T/C 1 12 4 16 5.45421998834704 2.18192667055099 3.27229331779605 T:C T C 10 0.545481667637747 0.132268379253018 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20764868_20765072:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20764868_20765072:KIAA1797 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 20885204 A/G 1 9 11 20 4.09066499126028 6.00029834401522 -1.90963335275494 A:G A G 10 0.545481667637747 0.501706253434889 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20885108_20885229:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20885108_20885229:KIAA1797 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 20988426 A/G 1 16 23 39 7.27229331779605 12.5460783556682 -5.27378503787213 A:G A G 10 0.545481667637747 0.107501222001949 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20988331_20988428:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20988331_20988428:KIAA1797 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 21816758 G/A 1 9 3 12 4.09066499126028 1.63644500291324 2.45421998834704 A:G G A 10 0.545481667637747 0.245735735487388 ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000404796:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000460874:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21816713_21816771:MTAP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 26884871 A/C 1 13 7 20 5.90873832070929 3.81837167346423 2.09036664724506 A:C A C 10 0.545481667637747 0.378879562360477 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26884808_26884883:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26884808_26884900:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000495958:exon_26884808_26884883:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000517946:exon_26884808_26884883:C9orf82 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 27556780 G/A 1 5 5 10 2.27259166181127 2.72740833818873 -0.45481667637747 A:G G A 10 0.545481667637747 0.763894627012578 ENSG00000147894:ENST00000380003:exon_27556559_27556794:C9orf72;ENSG00000147894:ENST00000488117:exon_27556559_27556794:C9orf72 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 33290532 A/G 1 6 2 8 2.72710999417352 1.09096333527549 1.63614665889802 A:G A G 10 0.545481667637747 0.305240384071396 ENSG00000086102:ENST00000379540:exon_33290509_33290595:NFX1;ENSG00000086102:ENST00000379521:exon_33290510_33290595:NFX1;ENSG00000086102:ENST00000263220:exon_33290510_33290595:NFX1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 33675817 A/T 0 281 1 282 127.719651393793 0.545481667637747 127.174169726155 A:C:G A C 10 0.545481667637747 1.99647226157927e-72 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 34256539 A/G 1 7 1 8 3.18162832653577 0.545481667637747 2.63614665889802 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0793996161569039 ENSG00000186638:ENST00000443226:exon_34256221_34256740:KIF24;ENSG00000186638:ENST00000402558:exon_34255733_34257979:KIF24;ENSG00000186638:ENST00000379174:exon_34255733_34257979:KIF24;ENSG00000186638:ENST00000379166:exon_34255733_34257979:KIF24;ENSG00000186638:ENST00000345050:exon_34255733_34257979:KIF24;ENSG00000186638:ENST00000403891:exon_34255733_34257979:KIF24;ENSG00000186638:ENST00000420188:exon_34256220_34257979:KIF24 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 34647802 G/C 1 7 9 16 3.18162832653577 4.90933500873972 -1.72770668220395 C:G G C 10 0.545481667637747 0.4555478790811 ENSG00000213930:ENST00000472111:exon_34647489_34647958:GALT;ENSG00000213930:ENST00000487381:exon_34647654_34647958:GALT;ENSG00000213930:ENST00000468099:exon_34647086_34647953:GALT;ENSG00000213930:ENST00000485531:exon_34647086_34648168:GALT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 34649442 A/G 1 16 16 32 7.27229331779605 8.72770668220395 -1.4554133644079 A:G A G 10 0.545481667637747 0.723184023134138 ENSG00000213930:ENST00000378842:exon_34649407_34649561:GALT;ENSG00000213930:ENST00000450095:exon_34649407_34649561:GALT;ENSG00000213930:ENST00000489643:exon_34648995_34650279:GALT;ENSG00000213930:ENST00000488412:exon_34649174_34649561:GALT HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 35092069 A/C 1 9 3 12 4.09066499126028 1.63644500291324 2.45421998834704 A:C A C 10 0.545481667637747 0.245735735487388 ENSG00000165282:ENST00000474436:exon_35088687_35093577:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000378617:exon_35091237_35092764:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000465745:exon_35091237_35094356:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000341666:exon_35091237_35092764:PIGO HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 37429814 A/G 1 120 116 236 54.5421998834704 63.2758734459786 -8.73367356250829 A:G A G 10 0.545481667637747 0.266665442488678 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000377824:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000491488:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000497693:exon_37427703_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000480596:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000438860:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000494290:exon_37428992_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000482603:exon_37429783_37429833:GRHPR HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 28 19 47 12.7265133061431 10.3641516851172 2.36236162102589 T:G G T 10 0.545481667637747 0.558938265217256 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 29 25 54 13.1810316385053 13.6370416909437 -0.456010052438335 T:C C T 10 0.545481667637747 0.892454864090402 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 34 25 59 15.4536233003166 13.6370416909437 1.81658160937293 T:C T C 10 0.545481667637747 0.69576291385753 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 36 22 58 16.3626599650411 12.0005966880304 4.36206327701068 A:G G A 10 0.545481667637747 0.291882284765161 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 37537557 G/A 1 6 7 13 2.72710999417352 3.81837167346423 -1.09126167929071 A:G G A 10 0.545481667637747 0.586892638954817 ENSG00000147912:ENST00000276960:exon_37537107_37537940:FBXO10;ENSG00000147912:ENST00000432825:exon_37537107_37537940:FBXO10 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 1 27 4 31 12.2719949737808 2.18192667055099 10.0900683032298 A:G G A 10 0.545481667637747 0.000190699221330373 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 11 11 22 4.99970165598478 6.00029834401522 -1.00059668803043 T:C C T 10 0.545481667637747 0.67524038559697 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 26 18 44 11.8174766414186 9.81867001747944 1.99880662393914 T:C C T 10 0.545481667637747 0.650240685638277 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 22 17 39 9.99940331196957 9.2731883498417 0.726214962127868 A:G G A 10 0.545481667637747 0.87317385911228 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 12 12 24 5.45421998834704 6.54578001165296 -1.09156002330593 T:C C T 10 0.545481667637747 0.685991730875607 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 77752510 C/T 1 29 38 67 13.1810316385053 20.7283033702344 -7.54727173172905 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0666409985538112 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77752454_77752532:OSTF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 77761642 T/C 1 40 29 69 18.1807332944901 15.8189683614947 2.36176493299546 T:C T C 10 0.545481667637747 0.629343014413858 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77761599_77762181:OSTF1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 27 19 46 12.2719949737808 10.3641516851172 1.90784328866364 A:G A G 10 0.545481667637747 0.657641333184872 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 80851350 G/C 1 6 3 9 2.72710999417352 1.63644500291324 1.09066499126028 C:G G C 10 0.545481667637747 0.523901512697289 ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000476652:exon_80851010_80851574:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80851011_80851519:CEP78 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 88593275 C/A 1 15 12 27 6.8177749854338 6.54578001165296 0.271994973780831 A:C C A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88593182_88593296:NAA35;ENSG00000135040:ENST00000376040:exon_88593182_88593296:NAA35 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 88959938 C/T 1 4 11 15 1.81807332944901 6.00029834401522 -4.1822250145662 T:C:G C T 10 0.545481667637747 0.0373845255059045 ENSG00000083223:ENST00000277141:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375960:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375961:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375963:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000427388:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000432440:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000449875:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375947:exon_88959785_88960069:ZCCHC6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 90321583 C/T 1 6 20 26 2.72710999417352 10.9096333527549 -8.18252335858142 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00135930077861606 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 92003679 C/T 1 17 26 43 7.7268116501583 14.1825233585814 -6.45571170842312 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0648632467029849 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92003551_92003707:SEMA4D HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 92006275 G/A 1 10 14 24 4.54518332362253 7.63674334692846 -3.09156002330593 A:G G A 10 0.545481667637747 0.223659279774392 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92006179_92006330:SEMA4D HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 95782667 C/T 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 T:C C T 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95782599_95782706:FGD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 100367810 G/A 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 A:G G A 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000136925:ENST00000375172:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000341170:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000375165:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000354801:exon_100367765_100367923:TSTD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 100367813 A/G 1 7 3 10 3.18162832653577 1.63644500291324 1.54518332362253 A:G A G 10 0.545481667637747 0.363888885190466 ENSG00000136925:ENST00000375172:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000341170:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000375165:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000354801:exon_100367765_100367923:TSTD2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 100420976 G/A 1 14 6 20 6.36325665307154 3.27289000582648 3.09036664724506 A:G G A 10 0.545481667637747 0.184519017097887 ENSG00000136937:ENST00000375147:exon_100420922_100421025:NCBP1;ENSG00000136937:ENST00000375132:exon_100420922_100421025:NCBP1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 10 8 18 4.54518332362253 4.36385334110198 0.181329982520555 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 100819192 C/T 1 37 32 69 16.8171782974034 17.4554133644079 -0.63823506700454 T:C C T 10 0.545481667637747 0.9041693659292 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 110084328 C/T 1 49 54 103 22.2713982857504 29.4560100524383 -7.18461176668794 T:C C T 10 0.545481667637747 0.166403601126986 ENSG00000119318:ENST00000416373:exon_110084264_110084399:RAD23B;ENSG00000119318:ENST00000358015:exon_110084264_110084399:RAD23B HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 111641806 G/A 1 12 17 29 5.45421998834704 9.2731883498417 -3.81896836149466 A:G G A 10 0.545481667637747 0.191679709049513 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 111659439 T/C 1 7 16 23 3.18162832653577 8.72770668220395 -5.54607835566818 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0219480939668005 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111659428_111659565:IKBKAP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 111659483 T/G 1 8 13 21 3.63614665889802 7.09126167929071 -3.45511502039269 T:G T G 10 0.545481667637747 0.187332125989055 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111659428_111659565:IKBKAP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 111660851 C/T 1 4 10 14 1.81807332944901 5.45481667637747 -3.63674334692846 A:T:C C T 10 0.545481667637747 0.0615052435608368 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111660782_111660861:IKBKAP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 111679872 G/A 1 11 6 17 4.99970165598478 3.27289000582648 1.7268116501583 A:G G A 10 0.545481667637747 0.471137770776418 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111679827_111679950:IKBKAP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 77 58 135 34.9979115918935 31.6379367229893 3.35997486890416 T:C T C 10 0.545481667637747 0.604411685412676 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 114982481 G/A 1 54 81 135 24.5439899475617 44.1840150786575 -19.6400251310958 A:G G A 10 0.545481667637747 0.000723304826575647 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 83 59 142 37.725021586067 32.1834183906271 5.54160319543993 T:C C T 10 0.545481667637747 0.355631541466838 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 115931692 A/G 1 23 12 35 10.4539216443318 6.54578001165296 3.90814163267886 A:G A G 10 0.545481667637747 0.234674771647419 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 117109051 T/G 1 46 45 91 20.9078432886636 24.5466750436986 -3.63883175503497 T:G T G 10 0.545481667637747 0.462424647410713 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117108949_117109054:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117108949_117109064:AKNA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 117126860 T/C 1 29 27 56 13.1810316385053 14.7280050262192 -1.54697338771383 T:C T C 10 0.545481667637747 0.689401353244932 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117126840_117126899:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117126840_117126899:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117126840_117126899:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117126840_117126899:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117126840_117126899:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117126840_117126899:AKNA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 119187839 C/T 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 T:C C T 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000148219:ENST00000288520:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000341734:exon_119187507_119187905:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373986:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000361209:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000313400:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373996:exon_119187507_119188367:ASTN2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 119461275 G/A 1 13 5 18 5.90873832070929 2.72740833818873 3.18132998252055 A:G G A 10 0.545481667637747 0.158872164572138 ENSG00000119401:ENST00000394497:exon_119459944_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000450136:exon_119459941_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000373983:exon_119459935_119463579:TRIM32 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 123201733 T/C 1 17 20 37 7.7268116501583 10.9096333527549 -3.18282170259664 T:C T C 10 0.545481667637747 0.324086893701699 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 123605126 T/C 1 19 7 26 8.63584831488281 3.81837167346423 4.81747664141858 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0749938595115895 ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123605015_123605200:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123605015_123605190:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000435107:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000476949:exon_123605015_123605189:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000471789:exon_123605015_123605160:PSMD5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 124065224 G/A 1 12 6 18 5.45421998834704 3.27289000582648 2.18132998252055 A:G G A 10 0.545481667637747 0.350676066108478 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000432226:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449773:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477863:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000456109:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000475428:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477104:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124065189_124065343:GSN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 124094800 T/C 1 18 4 22 8.18132998252056 2.18192667055099 5.99940331196957 T:C T C 10 0.545481667637747 0.00989075019963312 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124094712_124095121:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373806:exon_124094712_124094940:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373805:exon_124094712_124095016:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477553:exon_124094712_124094867:GSN HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 28 44 72 12.7265133061431 24.0011933760609 -11.2746800699178 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0089064360822048 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 125652757 G/A 1 3 9 12 1.36355499708676 4.90933500873972 -3.54578001165296 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0457815358442577 ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125652591_125652829:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000478216:exon_125652449_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000471874:exon_125652450_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125652517_125652824:RC3H2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 125673051 T/G 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 T:G T G 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000186130:ENST00000373659:exon_125670335_125674360:ZBTB6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 125920376 G/A 1 21 28 49 9.54488497960731 15.2734866938569 -5.7286017142496 A:G G A 10 0.545481667637747 0.114666398750904 ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125920291_125920402:STRBP HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 126520068 T/C 1 8 15 23 3.63614665889802 8.1822250145662 -4.54607835566818 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0619351832056806 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126519982_126520101:DENND1A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 127177161 A/G 1 71 83 154 32.27080159772 45.274978413933 -13.004176816213 A:C:G A G 10 0.545481667637747 0.0427224018328591 ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 127643456 T/C 1 3 9 12 1.36355499708676 4.90933500873972 -3.54578001165296 T:C T C 10 0.545481667637747 0.0457815358442577 ENSG00000136935:ENST00000373555:exon_127643450_127643536:GOLGA1;ENSG00000136935:ENST00000475407:exon_127643450_127643536:GOLGA1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 127915947 G/A 1 51 51 102 23.1804349504749 27.8195650495251 -4.63913009905019 A:G G A 10 0.545481667637747 0.371949186287719 ENSG00000119414:ENST00000373547:exon_127915812_127916021:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000373546:exon_127915812_127916021:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000415905:exon_127915812_127916021:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000451402:exon_127915812_127916021:PPP6C HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 128064673 T/G 1 13 10 23 5.90873832070929 5.45481667637747 0.45392164433182 T:G T G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000165219:ENST00000497580:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394084:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000470056:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394105:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394104:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394101:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000265956:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000418009:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394083:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000495955:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000467750:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000297933:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000312123:exon_128064262_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000431329:exon_128064489_128065105:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000436712:exon_128064586_128065105:GAPVD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 128069703 C/A 1 5 7 12 2.27259166181127 3.81837167346423 -1.54578001165296 A:C C A 10 0.545481667637747 0.399015848289425 ENSG00000165219:ENST00000497580:exon_128069692_128069826:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394084:exon_128069692_128069826:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000470056:exon_128069692_128069826:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394105:exon_128069692_128069826:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394104:exon_128069692_128069826:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394101:exon_128069692_128069826:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000265956:exon_128069692_128069826:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000418009:exon_128069692_128069826:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394083:exon_128069692_128069826:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000495955:exon_128069692_128069826:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000467750:exon_128069692_128069826:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000297933:exon_128069692_128069826:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000312123:exon_128069692_128069826:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000431329:exon_128069692_128069826:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000436712:exon_128069692_128069826:GAPVD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 128692068 C/T 1 39 22 61 17.7262149621279 12.0005966880304 5.72561827409744 T:C C T 10 0.545481667637747 0.157853656321732 ENSG00000167081:ENST00000373492:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373489:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000342287:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373487:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373483:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373482:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000447726:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000428092:exon_128691934_128692124:PBX3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 129595667 C/T 1 5 8 13 2.27259166181127 4.36385334110198 -2.09126167929071 T:C C T 10 0.545481667637747 0.275257667619234 ENSG00000169155:ENST00000449886:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373464:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373457:exon_129593688_129599382:ZBTB43 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 129595895 T/C 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 T:C T C 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000169155:ENST00000449886:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373464:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373457:exon_129593688_129599382:ZBTB43 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 130206669 C/T 1 9 4 13 4.09066499126028 2.18192667055099 1.90873832070929 T:C C T 10 0.545481667637747 0.405734407269743 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 130219669 C/T 1 8 1 9 3.63614665889802 0.545481667637747 3.09066499126028 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0461109865564625 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000485704:exon_130219595_130219692:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130219595_130219672:LRSAM1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 130476383 G/A 1 11 3 14 4.99970165598478 1.63644500291324 3.36325665307154 A:G G A 10 0.545481667637747 0.104990031088893 ENSG00000160401:ENST00000464092:exon_130476113_130478281:C9orf117;ENSG00000187024:ENST00000423807:exon_130475772_130476561:PTRH1;ENSG00000187024:ENST00000419060:exon_130475789_130476561:PTRH1;ENSG00000187024:ENST00000456267:exon_130476251_130476468:PTRH1;ENSG00000187024:ENST00000414832:exon_130476347_130476561:PTRH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 131287573 G/A 1 14 9 23 6.36325665307154 4.90933500873972 1.45392164433182 A:G G A 10 0.545481667637747 0.676547146622212 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131287471_131287702:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131287471_131287702:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000494417:exon_131287471_131287702:GLE1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 131515547 G/T 1 6 6 12 2.72710999417352 3.27289000582648 -0.545780011652964 T:G G T 10 0.545481667637747 0.779228340946012 ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131515443_131515879:ZER1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 131565554 T/C 1 13 6 19 5.90873832070929 3.27289000582648 2.63584831488281 T:C T C 10 0.545481667637747 0.256383122170611 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131565529_131565739:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000466056:exon_131565529_131565727:TBC1D13 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 131585069 A/G 1 6 8 14 2.72710999417352 4.36385334110198 -1.63674334692846 A:G A G 10 0.545481667637747 0.428770074510924 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 A:G G A 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 17 17 34 7.7268116501583 9.2731883498417 -1.5463766996834 C:G G C 10 0.545481667637747 0.609610413780762 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 131735495 C/T 1 23 12 35 10.4539216443318 6.54578001165296 3.90814163267886 T:C C T 10 0.545481667637747 0.234674771647419 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131735439_131735528:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000411887:exon_131735439_131735528:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131735439_131735528:NUP188 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 132580901 C/G 1 44 31 75 19.9988066239391 16.9099316967702 3.08887492716898 C:G C G 10 0.545481667637747 0.489204815229557 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000474192:exon_132580632_132580926:TOR1A HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 134349105 G/A 1 17 15 32 7.7268116501583 8.1822250145662 -0.455413364407903 A:G G A 10 0.545481667637747 0.861584441110341 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134348895_134349111:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134348895_134349111:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134348895_134349111:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134348895_134349111:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134348895_134349111:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000456307:exon_134348981_134349111:BAT2L1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 134351343 C/T 1 32 14 46 14.5445866355921 7.63674334692846 6.90784328866364 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0531151267989383 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134351317_134351922:BAT2L1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 135554566 G/A 1 15 8 23 6.8177749854338 4.36385334110198 2.45392164433182 A:G G A 10 0.545481667637747 0.403122215406532 ENSG00000125484:ENST00000372146:exon_135553364_135555190:GTF3C4;ENSG00000125484:ENST00000483873:exon_135554265_135554697:GTF3C4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 135772717 G/A 1 18 14 32 8.18132998252056 7.63674334692846 0.544586635592098 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135772571_135772732:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135772571_135772732:TSC1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 29 37 66 13.1810316385053 20.1828217025966 -7.0017900640913 A:G G A 10 0.545481667637747 0.0851045374010957 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 135982088 A/C 1 13 12 25 5.90873832070929 6.54578001165296 -0.637041690943674 A:C A C 10 0.545481667637747 0.842576598281257 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000424572:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000460587:exon_135982032_135982135:RALGDS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 135983504 T/C 1 12 15 27 5.45421998834704 8.1822250145662 -2.72800502621917 T:C T C 10 0.545481667637747 0.336084534017515 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135983375_135983793:RALGDS HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 136029045 G/A 1 4 4 8 1.81807332944901 2.18192667055099 -0.363853341101976 A:G G A 10 0.545481667637747 1 ENSG00000148288:ENST00000372040:exon_136028340_136029648:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000372043:exon_136028340_136029629:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000470431:exon_136028340_136030699:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000472281:exon_136028340_136030699:GBGT1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 136650966 C/T 1 17 20 37 7.7268116501583 10.9096333527549 -3.18282170259664 T:C C T 10 0.545481667637747 0.324086893701699 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136650898_136651007:VAV2 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 137005023 C/T 1 15 18 33 6.8177749854338 9.81867001747944 -3.00089503204565 T:C C T 10 0.545481667637747 0.300591355607069 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 137734163 C/T 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 T:C C T 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137734003_137736686:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137734003_137734174:COL5A1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139270975 C/T 1 3 5 8 1.36355499708676 2.72740833818873 -1.36385334110198 T:C C T 10 0.545481667637747 0.481553868568817 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139273402 C/T 1 16 17 33 7.27229331779605 9.2731883498417 -2.00089503204565 T:C C T 10 0.545481667637747 0.490545827853142 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139298580 C/T 1 20 12 32 9.09036664724506 6.54578001165296 2.5445866355921 T:C C T 10 0.545481667637747 0.382163131763023 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139299637 C/T 1 30 13 43 13.6355499708676 7.09126167929071 6.54428829157688 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0472411183520991 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139299543_139299800:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139299570_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139299570_139299654:SDCCAG3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139306467 C/T 1 50 48 98 22.7259166181127 26.1831200466119 -3.4572034284992 T:C C T 10 0.545481667637747 0.542988971482391 ENSG00000165688:ENST00000371720:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000446975:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139306449_139306651:PMPCA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139311471 C/T 1 46 52 98 20.9078432886636 28.3650467171628 -7.4572034284992 T:C C T 10 0.545481667637747 0.155213512071895 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139324737 C/A 1 14 18 32 6.36325665307154 9.81867001747944 -3.4554133644079 A:C C A 10 0.545481667637747 0.286679217980447 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139324729_139324865:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139324729_139324865:INPP5E HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139324740 C/T 1 18 11 29 8.18132998252056 6.00029834401522 2.18103163850534 T:C C T 10 0.545481667637747 0.460258162140569 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139324729_139324865:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139324729_139324865:INPP5E HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139326304 G/A 1 4 7 11 1.81807332944901 3.81837167346423 -2.00029834401522 A:G G A 10 0.545481667637747 0.243356459282646 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139326276_139326437:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139326276_139326437:INPP5E HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139328551 T/C 1 2 6 8 0.909036664724506 3.27289000582648 -2.36385334110198 T:C T C 10 0.545481667637747 0.152855532002609 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139328489_139328586:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139328489_139328586:INPP5E HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139391338 C/T 1 5 6 11 2.27259166181127 3.27289000582648 -1.00029834401522 T:C C T 10 0.545481667637747 0.56152261820193 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139399320 C/T 1 7 6 13 3.18162832653577 3.27289000582648 -0.0912616792907106 T:C C T 10 0.545481667637747 1 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139399125_139399556:NOTCH1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139620695 C/T 1 10 4 14 4.54518332362253 2.18192667055099 2.36325665307154 T:C C T 10 0.545481667637747 0.284675534132335 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139621120 A/G 1 18 16 34 8.18132998252056 8.72770668220395 -0.546376699683396 A:G A G 10 0.545481667637747 0.864897162102258 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139621168 G/A 1 14 17 31 6.36325665307154 9.2731883498417 -2.90993169677016 A:G G A 10 0.545481667637747 0.367528049294024 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139726239 A/G 1 56 48 104 25.4530266122862 26.1831200466119 -0.730093434325685 A:G A G 10 0.545481667637747 0.921698563623488 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000425121:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000466096:exon_139726173_139726822:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139726173_139726313:C9orf86 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 139973820 C/T 1 7 4 11 3.18162832653577 2.18192667055099 0.999701655984783 T:C C T 10 0.545481667637747 0.763908715137577 ENSG00000197355:ENST00000409858:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000360271:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 140001879 C/T 1 18 16 34 8.18132998252056 8.72770668220395 -0.546376699683396 T:C C T 10 0.545481667637747 0.864897162102258 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140001702_140001899:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140001702_140001899:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001702_140001899:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140001702_140001899:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000475449:exon_140001741_140001899:MAN1B1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 140262426 C/T 1 8 4 12 3.63614665889802 2.18192667055099 1.45421998834704 T:C C T 10 0.545481667637747 0.564612706784151 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140262017_140262441:EXD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . 9 140267490 G/A 1 4 5 9 1.81807332944901 2.72740833818873 -0.909335008739723 A:G G A 10 0.545481667637747 0.740297003186309 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140267357_140267524:EXD3 HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 200860 T/C 1 13 14 27 5.90873832070929 7.63674334692846 -1.72800502621917 T:C T C 10 0.545481667637747 0.564423910665474 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000445062:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000429181:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000443019:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_200401_200981:PLCXD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 207362 C/T 1 14 8 22 6.36325665307154 4.36385334110198 1.99940331196957 T:C C T 10 0.545481667637747 0.521742512666216 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_207315_207459:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_207315_207424:PLCXD1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 299362 A/G 1 11 14 25 4.99970165598478 7.63674334692846 -2.63704169094367 A:G A G 10 0.545481667637747 0.319558675893505 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 299591 A/G 1 6 14 20 2.72710999417352 7.63674334692846 -4.90963335275494 A:G A G 10 0.545481667637747 0.0407141622416941 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 322161 A/G 1 6 4 10 2.72710999417352 2.18192667055099 0.54518332362253 A:G A G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000496630:exon_322140_322251:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000381625:exon_322140_322325:PPP2R3B HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 1024 935 1959 465.426772338947 510.025359241293 -44.5985869023463 A:C:G G A 10 0.545481667637747 0.0434772903480681 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 51 64 115 23.1804349504749 34.9108267288158 -11.7303917783409 T:C C T 10 0.545481667637747 0.0310673501483676 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 40 31 71 18.1807332944901 16.9099316967702 1.27080159771997 T:C C T 10 0.545481667637747 0.812206084599261 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 2139186 C/T 1 12 12 24 5.45421998834704 6.54578001165296 -1.09156002330593 T:C C T 10 0.545481667637747 0.685991730875607 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 2139200 T/C 1 14 11 25 6.36325665307154 6.00029834401522 0.362958309056325 T:C T C 10 0.545481667637747 1 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 2161129 C/G 1 15 12 27 6.8177749854338 6.54578001165296 0.271994973780831 C:G C G 10 0.545481667637747 1 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2161103_2161271:DHRSX HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 2407207 G/A 1 14 16 30 6.36325665307154 8.72770668220395 -2.36445002913241 A:G G A 10 0.545481667637747 0.464222354403181 ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 2408437 G/A 1 18 17 35 8.18132998252056 9.2731883498417 -1.09185836732114 A:G G A 10 0.545481667637747 0.736704595175774 ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000461691:exon_2407946_2408813:ZBED1 HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 2632482 C/T 1 50 71 121 22.7259166181127 38.72919840228 -16.0032817841674 T:C C T 10 0.545481667637747 0.00445798680484034 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99 HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 2656261 A/G 1 56 44 100 25.4530266122862 24.0011933760609 1.4518332362253 A:G A G 10 0.545481667637747 0.840979955922355 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381177:exon_2655922_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000417575:exon_2656071_2656297:CD99 HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 2656283 A/T 1 76 57 133 34.5433932595312 31.0924550553516 3.45093820417965 A:T A T 10 0.545481667637747 0.601575047919723 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381177:exon_2655922_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000417575:exon_2656071_2656297:CD99 HGDP00856_parsed_pileup.txt . X 70470347 C/T 0 0 21 21 0 11.4551150203927 -11.4551150203927 T C T 10 0.545481667637747 6.4354585294251e-08 ENSG00000147130:ENST00000373998:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000314425:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000353904:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000412202:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000431634:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000373988:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000373984:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000489332:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000373982:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000373981:exon_70470282_70470576:ZMYM3