INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1190685 G/A 1 115 142 257 56.4924410223956 72.244116302781 -15.7516752803854 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0530146986804022 ENSG00000160087:ENST00000450390:exon_1189289_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000347370:exon_1189294_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000349431:exon_1189850_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000339385:exon_1190304_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000348298:exon_1190304_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000400929:exon_1190365_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000464036:exon_1190428_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000360466:exon_1190544_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000400930:exon_1190558_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000467339:exon_1190644_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000473215:exon_1190648_1190867:UBE2J2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1246390 C/G 1 23 25 48 11.2984882044791 12.7190345603488 -1.42054635586965 C:G C G 10 0.508761382413951 0.773204188173692 ENSG00000169972:ENST00000379031:exon_1246289_1246451:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000470520:exon_1246289_1246408:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000467712:exon_1246289_1246449:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000493657:exon_1245416_1246451:PUSL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 53 32 85 26.0356467320606 16.2803642372464 9.75528249481417 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0389274935673647 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1262966 C/T 1 25 26 51 12.2809654396512 13.2277959427627 -0.946830503111499 T:C C T 10 0.508761382413951 0.88881134853671 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1263144 G/A 1 19 12 31 9.33353373413493 6.10513658896741 3.22839714516752 A:G G A 10 0.508761382413951 0.283338682080454 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1277833 G/A 1 12 5 17 5.89486341103259 2.54380691206975 3.35105649896283 A:G G A 10 0.508761382413951 0.144506573427302 ENSG00000107404:ENST00000378891:exon_1277743_1277864:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000378888:exon_1277743_1277864:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000345100:exon_1277743_1277864:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000263743:exon_1277743_1277864:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000472445:exon_1277743_1277864:DVL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1309185 T/C 1 192 161 353 94.3178145765214 81.9105825686461 12.4072320078753 T:C:G T C 10 0.508761382413951 0.201351755518711 ENSG00000175756:ENST00000338370:exon_1309110_1309282:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000338338:exon_1309110_1309282:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000321751:exon_1309112_1309282:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000470457:exon_1309116_1309282:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000378853:exon_1309117_1309282:AURKAIP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1341185 A/G 1 3 13 16 1.47371585275815 6.61389797138136 -5.14018211862322 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0114213996535228 ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1340489_1341266:MRPL20 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1390875 C/T 0 38 0 38 18.6670674682699 0 18.6670674682699 C C 10 0.508761382413951 8.89772293033867e-12 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000475091:exon_1390840_1390899:ATAD3C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1403814 C/T 1 17 18 35 8.35105649896283 9.15770488345112 -0.806648384488284 T:C C T 10 0.508761382413951 0.866325022719942 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1403764_1405538:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1403764_1405538:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000484537:exon_1403764_1404043:ATAD3C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1404001 G/T 1 9 11 20 4.42114755827444 5.59637520655346 -1.17522764827902 T:G G T 10 0.508761382413951 0.658959055107234 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1403764_1405538:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1403764_1405538:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000484537:exon_1403764_1404043:ATAD3C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1404016 G/A 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 A:G G A 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1403764_1405538:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1403764_1405538:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000484537:exon_1403764_1404043:ATAD3C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1430985 C/T 1 28 46 74 13.7546812924094 23.4030235910417 -9.64834229863237 T:C C T 10 0.508761382413951 0.027027384864764 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1562536 G/A 1 16 13 29 7.85981788137678 6.61389797138136 1.24591990999542 A:G G A 10 0.508761382413951 0.712310635717891 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1562217_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505370:exon_1562454_1562587:MIB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1635004 T/C 1 22 18 40 10.8072495868931 9.15770488345112 1.64954470344196 T:C T C 10 0.508761382413951 0.63791205833107 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1634915_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000467737:exon_1634915_1635011:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000478901:exon_1634527_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1634915_1635063:CDK11A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 1635749 C/A 1 14 10 24 6.87734064620469 5.08761382413951 1.78972682206518 A:C C A 10 0.508761382413951 0.542761494383684 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1635662_1635994:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635662_1636041:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000495016:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635662_1636094:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000489300:exon_1635682_1635783:CDK11A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 2441358 T/C 1 11 4 15 5.40362479344654 2.0350455296558 3.36857926379074 T:C T C 10 0.508761382413951 0.119313325605239 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2441232_2441369:PANK4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 2452569 T/C 1 12 9 21 5.89486341103259 4.57885244172556 1.31601096930703 T:C T C 10 0.508761382413951 0.664655217869201 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000486396:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502770:exon_2452540_2453380:PANK4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 3548832 G/C 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000116213:ENST00000270708:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378320:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000471223:exon_3548450_3553662:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000424367:exon_3548777_3548902:WDR8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 3659742 C/T 1 11 9 20 5.40362479344654 4.57885244172556 0.824772351720981 T:C C T 10 0.508761382413951 0.824343209360058 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 3701663 T/C 1 7 10 17 3.43867032310234 5.08761382413951 -1.64894350103717 T:C T C 10 0.508761382413951 0.473990855338058 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3701651_3701767:LRRC47 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 3703710 G/A 1 46 33 79 22.5969764089583 16.7891256196604 5.80785078929787 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.215991925418715 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3703413_3703874:LRRC47 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 3761479 C/T 1 1 8 9 0.491238617586049 4.07009105931161 -3.57885244172556 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0194768002639544 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494951:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378223:exon_3761471_3761547:KIAA0562 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 3807258 G/C 1 53 42 95 26.0356467320606 21.3679780613859 4.66766867067466 C:G G C 10 0.508761382413951 0.356960485816172 ENSG00000198912:ENST00000361605:exon_3807133_3807621:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000474140:exon_3807133_3809560:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000486765:exon_3807133_3807621:C1orf174 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 3807450 C/A 1 29 32 61 14.2459199099954 16.2803642372464 -2.03444432725101 A:C C A 10 0.508761382413951 0.611294472164227 ENSG00000198912:ENST00000361605:exon_3807133_3807621:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000474140:exon_3807133_3809560:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000486765:exon_3807133_3807621:C1orf174 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 113 110 223 55.5099637872235 55.9637520655346 -0.453788278311066 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 7887579 C/G 1 2 13 15 0.982477235172098 6.61389797138136 -5.63142073620926 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0036366919302714 ENSG00000049246:ENST00000377532:exon_7887178_7887875:PER3;ENSG00000049246:ENST00000361923:exon_7887178_7887875:PER3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 7887605 G/A 1 10 1 11 4.91238617586049 0.508761382413951 4.40362479344654 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0118508059115006 ENSG00000049246:ENST00000377532:exon_7887178_7887875:PER3;ENSG00000049246:ENST00000361923:exon_7887178_7887875:PER3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 7909737 C/T 1 39 29 68 19.1583060858559 14.7540800900046 4.40422599585133 T:C C T 10 0.508761382413951 0.332093908643717 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000400910:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000361696:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7909700_7909743:UTS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 9129620 C/T 1 21 19 40 10.316010969307 9.66646626586507 0.649544703441961 T:C C T 10 0.508761382413951 0.875396965359485 ENSG00000142583:ENST00000377424:exon_9129563_9129775:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000456780:exon_9129563_9129887:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000377414:exon_9129563_9129663:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000474145:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000484798:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000479813:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000486632:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000487835:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000464985:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000473209:exon_9129563_9129653:SLC2A5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 9188876 T/C 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 T:C T C 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000180758:ENST00000377411:exon_9188704_9189229:GPR157;ENSG00000180758:ENST00000414642:exon_9188704_9189183:GPR157 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 9307033 G/A 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 A:G G A 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9307025_9307142:H6PD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 9307138 T/C 1 9 1 10 4.42114755827444 0.508761382413951 3.91238617586049 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0216733970401453 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9307025_9307142:H6PD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 9323910 G/A 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 9324571 T/C 1 9 3 12 4.42114755827444 1.52628414724185 2.89486341103259 T:C T C 10 0.508761382413951 0.146738110644472 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 9324670 A/G 1 11 9 20 5.40362479344654 4.57885244172556 0.824772351720981 A:G A G 10 0.508761382413951 0.824343209360058 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 11087524 G/A 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000009724:ENST00000400897:exon_11086580_11087705:MASP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 11114940 G/T 1 333 288 621 163.582459656154 146.523278135218 17.0591815209364 T:G G T 10 0.508761382413951 0.172607410663376 ENSG00000116649:ENST00000475189:exon_11114641_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000376957:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000489073:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 11115061 G/A 1 373 295 668 183.232004359596 150.084607812116 33.1473965474808 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0106225710892940 ENSG00000116649:ENST00000475189:exon_11115019_11115261:SRM;ENSG00000116649:ENST00000376957:exon_11115019_11115141:SRM;ENSG00000116649:ENST00000489073:exon_11115019_11115141:SRM;ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 11134043 C/T 1 21 13 34 10.316010969307 6.61389797138136 3.70211299792567 T:C C T 10 0.508761382413951 0.231916072753655 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11133991_11134065:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11133991_11134065:EXOSC10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 11137629 T/C 1 9 2 11 4.42114755827444 1.0175227648279 3.40362479344654 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0658750571190468 ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11136899_11137708:EXOSC10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 11158105 C/T 1 16 13 29 7.85981788137678 6.61389797138136 1.24591990999542 T:C C T 10 0.508761382413951 0.712310635717891 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11158077_11158213:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11158077_11158213:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000460196:exon_11158077_11158213:EXOSC10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 11272468 C/G 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 C:G C G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11272369_11272531:MTOR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 25 10 35 12.2809654396512 5.08761382413951 7.19335161551172 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0172494360243121 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 16 7 23 7.85981788137678 3.56132967689766 4.29848820447913 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0942882498496864 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 5 12 17 2.45619308793025 6.10513658896741 -3.64894350103717 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0912733858423377 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 12082334 A/T 1 14 29 43 6.87734064620469 14.7540800900046 -7.87673944379989 A:T A T 10 0.508761382413951 0.0211389275187165 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082279_12082499:MIIP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 12082461 C/T 1 11 17 28 5.40362479344654 8.64894350103717 -3.24531870759063 T:C C T 10 0.508761382413951 0.258527448393057 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082279_12082499:MIIP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 19 19 38 9.33353373413493 9.66646626586507 -0.332932531730137 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 12090137 C/T 1 39 37 76 19.1583060858559 18.8241711493162 0.334134936539726 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12090085_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12090085_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12090085_12090181:MIIP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 12164437 C/T 1 9 12 21 4.42114755827444 6.10513658896741 -1.68398903069297 T:C C T 10 0.508761382413951 0.517408343711901 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12164436_12164588:TNFRSF8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 26 33 59 12.7722040572373 16.7891256196604 -4.01692156242311 A:G G A 10 0.508761382413951 0.301235758132591 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 36 36 72 17.6845902330978 18.3154097669022 -0.63081953380447 A:G A G 10 0.508761382413951 0.906612873901584 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 15844615 A/G 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 A:G A G 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000132906:ENST00000333868:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000348549:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375890:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375874:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000400777:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000447522:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000474305:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000440484:exon_15844605_15844890:CASP9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 15850613 G/A 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 A:G G A 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000132906:ENST00000333868:exon_15850564_15850790:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000348549:exon_15850564_15850716:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375890:exon_15850564_15850790:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375874:exon_15850564_15850790:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000400777:exon_15850564_15850721:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000474305:exon_15850564_15850687:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000440484:exon_15850564_15850712:CASP9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 15909850 C/G 1 9 10 19 4.42114755827444 5.08761382413951 -0.666466265865068 C:G C G 10 0.508761382413951 0.821210319840976 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 16262411 C/T 1 18 12 30 8.84229511654888 6.10513658896741 2.73715852758147 T:C C T 10 0.508761382413951 0.363817218311101 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 16525056 G/T 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 T:G G T 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000142632:ENST00000478117:exon_16524349_16525239:ARHGEF19;ENSG00000142632:ENST00000270747:exon_16524599_16525239:ARHGEF19;ENSG00000142632:ENST00000421561:exon_16524599_16525139:ARHGEF19 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 16641899 C/T 1 8 12 20 3.92990894068839 6.10513658896741 -2.17522764827902 T:C C T 10 0.508761382413951 0.376308412261741 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16641664_16641930:FBXO42 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 17752089 C/T 1 20 11 31 9.82477235172098 5.59637520655346 4.22839714516752 T:C C T 10 0.508761382413951 0.151548626044045 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17752037_17752180:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17752037_17752180:RCC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 19499560 T/C 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000419533:exon_19499358_19499587:UBR4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 19566881 C/T 1 9 8 17 4.42114755827444 4.07009105931161 0.351056498962834 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000467423:exon_19566791_19567198:KIAA0090 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 20020993 A/G 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 A:G A G 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000490234:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000494342:exon_20020985_20021044:TMCO4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 20020994 C/T 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 T:C C T 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000490234:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000494342:exon_20020985_20021044:TMCO4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 20072082 C/T 1 2 7 9 0.982477235172098 3.56132967689766 -2.57885244172556 T:C C T 10 0.508761382413951 0.103646439844753 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20072025_20072144:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20072025_20072144:TMCO4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 20977221 A/T 1 21 6 27 10.316010969307 3.05256829448371 7.26344267482332 A:T A T 10 0.508761382413951 0.00612431343469327 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 20978832 T/C 1 382 391 773 187.653151917871 198.925700523855 -11.2725486059841 T:C T C 10 0.508761382413951 0.428783505527996 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20978270_20979021:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20978685_20979021:DDOST HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 152 165 317 74.6682698730795 83.9456280983019 -9.27735822522246 A:C:G G A 10 0.508761382413951 0.312092359202523 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 23399824 T/C 1 25 26 51 12.2809654396512 13.2277959427627 -0.946830503111499 T:C T C 10 0.508761382413951 0.88881134853671 ENSG00000004487:ENST00000356634:exon_23399785_23399896:KDM1A;ENSG00000004487:ENST00000400181:exon_23399785_23399896:KDM1A;ENSG00000004487:ENST00000465864:exon_23399767_23399896:KDM1A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 23419261 G/A 1 11 4 15 5.40362479344654 2.0350455296558 3.36857926379074 A:G G A 10 0.508761382413951 0.119313325605239 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 23419855 T/C 1 11 7 18 5.40362479344654 3.56132967689766 1.84229511654888 T:C T C 10 0.508761382413951 0.481911196747905 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 26582091 G/A 1 17 15 32 8.35105649896283 7.63142073620926 0.719635762753569 A:G G A 10 0.508761382413951 0.860736024832152 ENSG00000130695:ENST00000476272:exon_26581662_26582356:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000252992:exon_26581662_26582356:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000451429:exon_26581662_26582356:CCDC21 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 26608782 C/T 0 10 0 10 4.91238617586049 0 4.91238617586049 C C 10 0.508761382413951 0.00198015025857764 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26607819_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26608772_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26608773_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26608773_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26608775_26608846:UBXN11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 26610891 A/C 1 10 10 20 4.91238617586049 5.08761382413951 -0.175227648279019 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26610853_26612032:UBXN11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 26644537 C/A 1 2017 1724 3741 990.828291671061 877.104623281651 113.723668389409 A:C C A 10 0.508761382413951 0.00020493040730028 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26644448_26644562:CD52;ENSG00000169442:ENST00000492808:exon_26644449_26644562:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26644449_26644562:CD52 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 972 829 1801 477.48393629364 421.763186021165 55.7207502724743 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00888442346749769 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 960 822 1782 471.589072882607 418.201856344268 53.3872165383394 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0120045493436486 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 20 8 28 9.82477235172098 4.07009105931161 5.75468129240937 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0364811161388974 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 26883511 A/C 1 35 25 60 17.1933516155117 12.7190345603488 4.47431705516294 A:C A C 10 0.508761382413951 0.301609621418647 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000488985:exon_26883489_26883527:RPS6KA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 24 25 49 11.7897268220652 12.7190345603488 -0.929307738283597 T:C T C 10 0.508761382413951 0.886596358619732 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 27124278 C/G 1 16 11 27 7.85981788137678 5.59637520655346 2.26344267482332 C:G C G 10 0.508761382413951 0.443974308913854 ENSG00000060642:ENST00000472757:exon_27124054_27124298:PIGV;ENSG00000060642:ENST00000078527:exon_27124054_27124889:PIGV;ENSG00000060642:ENST00000374145:exon_27124054_27124884:PIGV;ENSG00000060642:ENST00000449950:exon_27124054_27124884:PIGV HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 27608747 C/T 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 T:C C T 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000142784:ENST00000319394:exon_27608730_27608776:WDTC1;ENSG00000142784:ENST00000432579:exon_27608730_27608776:WDTC1;ENSG00000142784:ENST00000361771:exon_27608730_27608776:WDTC1;ENSG00000142784:ENST00000447062:exon_27608730_27608776:WDTC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 63 35 98 30.9480329079211 17.8066483844883 13.1413845234328 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0084465258203406 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 70 26 96 34.3867032310234 13.2277959427627 21.1589072882607 T:C T C 10 0.508761382413951 1.37119133511963e-05 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 79 31 110 38.8078507892979 15.7716028548325 23.0362479344654 A:G A G 10 0.508761382413951 9.13688852644487e-06 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 127 103 230 62.3873044334282 52.4024223886369 9.98488204479128 T:G T G 10 0.508761382413951 0.210107859083682 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 29542637 A/G 1 20 10 30 9.82477235172098 5.08761382413951 4.73715852758147 A:G A G 10 0.508761382413951 0.100283488182554 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29542513_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29542549_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29542605_29542648:MECR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 31426815 A/G 1 29 30 59 14.2459199099954 15.2628414724185 -1.01692156242311 A:G A G 10 0.508761382413951 0.796321729221659 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 31898234 T/C 1 11 5 16 5.40362479344654 2.54380691206975 2.85981788137678 T:C T C 10 0.508761382413951 0.211238572184989 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31898177_31898256:SERINC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 31905946 C/T 0 16 0 16 7.85981788137678 0 7.85981788137678 C C 10 0.508761382413951 3.16472623419428e-05 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31905814_31906032:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31905814_31906032:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31905814_31906032:SERINC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 66 68 134 32.4217487606792 34.5957740041487 -2.17402524346943 A:G A G 10 0.508761382413951 0.730175588115668 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 33245802 C/G 1 64 50 114 31.4392715255071 25.4380691206975 6.00120240480959 C:G C G 10 0.508761382413951 0.302802856931225 ENSG00000134684:ENST00000469100:exon_33245686_33245879:YARS;ENSG00000134684:ENST00000373477:exon_33245686_33245879:YARS;ENSG00000134684:ENST00000490826:exon_33244983_33246312:YARS;ENSG00000134684:ENST00000487404:exon_33245686_33245879:YARS;ENSG00000134684:ENST00000478828:exon_33245686_33245879:YARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 35919979 A/G 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 A:G A G 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000485551:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000335883:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000440579:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000467109:exon_35919963_35920237:KIAA0319L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 36638146 G/A 1 18 19 37 8.84229511654888 9.66646626586507 -0.824171149316186 A:G G A 10 0.508761382413951 0.869882749699634 ENSG00000116871:ENST00000429533:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000462118:exon_36637569_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36638070_36638228:MAP7D1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 36638206 G/A 1 28 29 57 13.7546812924094 14.7540800900046 -0.999398797595205 A:G G A 10 0.508761382413951 0.793040323309054 ENSG00000116871:ENST00000429533:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000462118:exon_36637569_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36638070_36638228:MAP7D1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 10 22 32 4.91238617586049 11.1927504131069 -6.28036423724643 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0327744341158133 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 39801815 A/C 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 39908506 G/A 1 9 12 21 4.42114755827444 6.10513658896741 -1.68398903069297 A:G G A 10 0.508761382413951 0.517408343711901 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39908386_39908583:MACF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 10 8 18 4.91238617586049 4.07009105931161 0.842295116548883 C:G G C 10 0.508761382413951 0.815041324056156 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 40737589 T/C 1 9 13 22 4.42114755827444 6.61389797138136 -2.19275041310692 T:C T C 10 0.508761382413951 0.398108590862778 ENSG00000084073:ENST00000372759:exon_40737566_40737707:ZMPSTE24 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 40773149 T/C 1 8 6 14 3.92990894068839 3.05256829448371 0.877340646204686 T:C T C 10 0.508761382413951 0.79097715531601 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 40928731 G/A 1 8 9 17 3.92990894068839 4.57885244172556 -0.648943501037166 A:G G A 10 0.508761382413951 0.811742532730089 ENSG00000187801:ENST00000469416:exon_40928093_40929386:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000484445:exon_40928093_40929352:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000411995:exon_40928093_40929390:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000361584:exon_40928093_40929388:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000431552:exon_40928093_40929261:ZNF643 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 40961449 T/C 1 19 12 31 9.33353373413493 6.10513658896741 3.22839714516752 T:C T C 10 0.508761382413951 0.283338682080454 ENSG00000187815:ENST00000372706:exon_40960593_40962015:ZNF642;ENSG00000187815:ENST00000372705:exon_40960593_40961960:ZNF642 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 40981230 G/A 1 16 18 34 7.85981788137678 9.15770488345112 -1.29788700207433 A:G G A 10 0.508761382413951 0.732701821127198 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 40981251 G/A 1 18 14 32 8.84229511654888 7.12265935379531 1.71963576275357 A:G G A 10 0.508761382413951 0.598431040951595 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 41013015 C/T 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000117010:ENST00000372699:exon_41012234_41013841:ZNF684;ENSG00000117010:ENST00000493756:exon_41012234_41013457:ZNF684 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 8 7 15 3.92990894068839 3.56132967689766 0.368579263790735 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 41979156 A/G 1 9 9 18 4.42114755827444 4.57885244172556 -0.157704883451117 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 42045747 T/C 1 26 15 41 12.7722040572373 7.63142073620926 5.14078332102801 A:T:C T C 10 0.508761382413951 0.119576956898043 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_42045408_42050989:HIVEP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 42047208 C/G 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 C:G C G 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_42045408_42050989:HIVEP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 19 23 42 9.33353373413493 11.7015117955209 -2.36797806138594 T:C T C 10 0.508761382413951 0.537854046973192 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 45797505 C/G 1 16 8 24 7.85981788137678 4.07009105931161 3.78972682206518 C:G C G 10 0.508761382413951 0.153096477627005 ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45797333_45797544:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45797333_45797755:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000412971:exon_45797406_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000462388:exon_45797419_45797758:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000466231:exon_45797442_45797521:MUTYH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 45806768 T/G 1 14 11 25 6.87734064620469 5.59637520655346 1.28096543965123 T:G T G 10 0.508761382413951 0.691178115075758 ENSG00000132773:ENST00000372090:exon_45806745_45806887:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000477731:exon_45806745_45806887:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000471337:exon_45806745_45806887:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000495703:exon_45806745_45806887:TOE1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 25 28 53 12.2809654396512 14.2453187075906 -1.9643532679394 A:G A G 10 0.508761382413951 0.680648228895746 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 46818502 A/G 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:G A G 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 23 26 49 11.2984882044791 13.2277959427627 -1.9293077382836 A:G A G 10 0.508761382413951 0.66868427616436 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 47767914 G/A 1 7 1 8 3.43867032310234 0.508761382413951 2.92990894068839 A:G G A 10 0.508761382413951 0.070648384509694 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000447475:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000413565:exon_47767906_47768018:STIL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 47834209 G/T 1 39 55 94 19.1583060858559 27.9818760327673 -8.82356994691139 T:G G T 10 0.508761382413951 0.079129527371425 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47834141_47834287:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47834141_47834287:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47834141_47834287:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371870:exon_47834141_47834287:CMPK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 52264064 A/G 1 26 26 52 12.7722040572373 13.2277959427627 -0.45559188552545 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52263921_52264083:NRD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 46 43 89 22.5969764089583 21.8767394437999 0.720236965158364 C:G G C 10 0.508761382413951 0.915804605151437 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 181 129 310 88.9141897830749 65.6302183313997 23.2839714516752 A:C:G C G 10 0.508761382413951 0.00888523871864893 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 54683925 G/A 1 66 50 116 32.4217487606792 25.4380691206975 6.98367963998169 A:G G A 10 0.508761382413951 0.227206417212514 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 55182300 T/A 1 12 4 16 5.89486341103259 2.0350455296558 3.85981788137678 A:T T A 10 0.508761382413951 0.0775291226144439 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000486621:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55182273_55182390:TTC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 55317954 G/A 1 59 62 121 28.9830784375769 31.543205709665 -2.56012727208807 A:G G A 10 0.508761382413951 0.650568525029434 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55315306_55318059:DHCR24;ENSG00000116133:ENST00000436604:exon_55317876_55318059:DHCR24 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 64117414 G/A 1 15 10 25 7.36857926379074 5.08761382413951 2.28096543965123 A:G G A 10 0.508761382413951 0.426148435268484 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64117340_64117523:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64117340_64117523:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000483707:exon_64117026_64117523:PGM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 65311214 G/C 1 18 12 30 8.84229511654888 6.10513658896741 2.73715852758147 C:G G C 10 0.508761382413951 0.363817218311101 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 65311262 G/A 1 14 22 36 6.87734064620469 11.1927504131069 -4.31540976690223 A:G G A 10 0.508761382413951 0.182386388153018 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 65321250 G/A 1 26 17 43 12.7722040572373 8.64894350103717 4.12326055620011 A:G G A 10 0.508761382413951 0.225106130763604 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65321192_65321381:JAK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 65335095 T/C 1 9 13 22 4.42114755827444 6.61389797138136 -2.19275041310692 T:C T C 10 0.508761382413951 0.398108590862778 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65334994_65335157:JAK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 70904800 G/T 1 19 18 37 9.33353373413493 9.15770488345112 0.175828850683814 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70904784_70905253:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70904784_70905252:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70904784_70904887:CTH;ENSG00000116761:ENST00000482383:exon_70904784_70904915:CTH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 74670172 A/G 1 6 9 15 2.94743170551629 4.57885244172556 -1.63142073620926 A:G A G 10 0.508761382413951 0.447467080617159 ENSG00000254685:ENST00000467578:exon_74670075_74670277:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000482102:exon_74670075_74670175:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370898:exon_74670075_74672918:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000472069:exon_74670075_74670261:FPGT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 74671519 A/G 1 7 1 8 3.43867032310234 0.508761382413951 2.92990894068839 A:G A G 10 0.508761382413951 0.070648384509694 ENSG00000254685:ENST00000370898:exon_74670075_74672918:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370894:exon_74670892_74671890:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000534056:exon_74670903_74671907:FPGT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 75172001 T/A 1 80 66 146 39.2990894068839 33.5782512393208 5.72083816756316 A:T T A 10 0.508761382413951 0.363139683186212 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000492102:exon_75171172_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75171174_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75171656_75172141:CRYZ HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 36 20 56 17.6845902330978 10.175227648279 7.50936258481875 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0458571094175403 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 29 18 47 14.2459199099954 9.15770488345112 5.0882150265443 A:G A G 10 0.508761382413951 0.146752977004384 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 76257892 A/T 1 77 67 144 37.8253735541258 34.0870126217347 3.73836093239106 A:T A T 10 0.508761382413951 0.560154948186849 ENSG00000137955:ENST00000496055:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000319942:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000370824:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000485459:exon_76257866_76257939:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000470201:exon_76257866_76257971:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000471759:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000491266:exon_76257866_76257987:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000461653:exon_76257866_76257935:RABGGTB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 79115905 T/C 1 197 136 333 96.7740076644517 69.1915480082973 27.5824596561543 T:C T C 10 0.508761382413951 0.00254714194465708 ENSG00000137965:ENST00000370747:exon_79115871_79116337:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000467790:exon_79115871_79116337:IFI44 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 85031630 G/A 1 6 9 15 2.94743170551629 4.57885244172556 -1.63142073620926 A:G G A 10 0.508761382413951 0.447467080617159 ENSG00000122432:ENST00000263717:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000361426:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000460286:exon_85031544_85031877:SPATA1;ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85031524_85031695:CTBS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 85039955 G/A 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85039922_85040163:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85039922_85040147:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85039599_85040104:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85039599_85040113:CTBS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 85113229 A/G 1 10 9 19 4.91238617586049 4.57885244172556 0.333533734134932 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85109390_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85109599_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85113022_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85113024_85113290:SSX2IP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 85742012 G/C 1 17 23 40 8.35105649896283 11.7015117955209 -3.35045529655804 T:C:G G C 10 0.508761382413951 0.3433331296259 ENSG00000142867:ENST00000394761:exon_85741979_85742480:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000370580:exon_85741979_85742773:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000271015:exon_85741979_85742479:BCL10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 4 8 12 1.9649544703442 4.07009105931161 -2.10513658896741 T:C T C 10 0.508761382413951 0.259199063292902 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 T:C C T 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 86847955 G/A 1 10 4 14 4.91238617586049 2.0350455296558 2.87734064620469 A:G G A 10 0.508761382413951 0.180503112624562 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000480440:exon_86847625_86848041:ODF2L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 90179532 A/G 1 9 4 13 4.42114755827444 2.0350455296558 2.38610202861864 A:G A G 10 0.508761382413951 0.267810029003266 ENSG00000171488:ENST00000370454:exon_90178268_90185092:LRRC8C;ENSG00000171488:ENST00000529501:exon_90178268_90185092:LRRC8C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 93306317 G/A 1 13 6 19 6.38610202861864 3.05256829448371 3.33353373413493 A:G G A 10 0.508761382413951 0.168307374643700 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 93691985 G/A 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93691890_93692006:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93691890_93692006:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93691890_93692006:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93691890_93692006:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93691890_93692006:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93691890_93692006:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000421014:exon_93691890_93692006:CCDC18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 94342564 C/A 1 191 186 377 93.8265759589354 94.6296171289949 -0.803041170059515 A:T:C C A 10 0.508761382413951 0.95893548182814 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 94343023 A/G 1 155 160 315 76.1419857258376 81.4018211862322 -5.25983546039456 A:T:G A G 10 0.508761382413951 0.573279855176674 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 94344716 C/T 1 45 45 90 22.1057377913722 22.8942622086278 -0.788524417255587 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.916191676242523 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94344633_94344762:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94344633_94344718:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94344104_94345474:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94344633_94344720:DNTTIP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 95709939 T/G 1 13 19 32 6.38610202861864 9.66646626586507 -3.28036423724643 T:G T G 10 0.508761382413951 0.290034548011674 ENSG00000122481:ENST00000370202:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000263893:exon_95709767_95710271:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000429514:exon_95709767_95710207:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000492639:exon_95709767_95709967:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000495272:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000419345:exon_95709767_95710271:RWDD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 100316589 A/G 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 A:G A G 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100316531_100316680:AGL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 100336361 C/T 1 2 6 8 0.982477235172098 3.05256829448371 -2.07009105931161 T:C C T 10 0.508761382413951 0.172493759593104 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100336314_100336425:AGL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 100340787 G/A 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 A:C:G G A 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000477753:exon_100340710_100340812:AGL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 100361925 G/A 1 12 5 17 5.89486341103259 2.54380691206975 3.35105649896283 A:G G A 10 0.508761382413951 0.144506573427302 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100361842_100361944:AGL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 109351501 A/G 1 12 26 38 5.89486341103259 13.2277959427627 -7.33293253173014 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0220609072666738 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109351405_109352148:STXBP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 109486101 T/C 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 T:C T C 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000473062:exon_109486097_109486149:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000482889:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109486097_109486237:CLCC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 110170896 T/C 1 17 19 36 8.35105649896283 9.66646626586507 -1.31540976690223 T:C T C 10 0.508761382413951 0.739808852412005 ENSG00000116337:ENST00000526301:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000529299:exon_110170705_110171157:AMPD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 110171705 A/C 1 2 6 8 0.982477235172098 3.05256829448371 -2.07009105931161 A:C A C 10 0.508761382413951 0.172493759593104 ENSG00000116337:ENST00000467071:exon_110171336_110171857:AMPD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 110466338 C/A 1 27 17 44 13.2634426748233 8.64894350103717 4.61449917378616 A:C C A 10 0.508761382413951 0.177078703892883 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 110888948 G/A 1 45 40 85 22.1057377913722 20.350455296558 1.75528249481417 A:G G A 10 0.508761382413951 0.74543193044579 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110888930_110889299:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110888930_110889299:RBM15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 1047 971 2018 514.326832612593 494.007302323946 20.3195302886469 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.373182685382396 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 111726869 G/A 1 110 88 198 54.0362479344654 44.7710016524277 9.26524628203771 A:G G A 10 0.508761382413951 0.200895320303703 ENSG00000134255:ENST00000498239:exon_111726813_111727430:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000357172:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000478042:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000473474:exon_111726813_111726953:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000467362:exon_111726813_111727722:CEPT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 111773568 G/C 0 0 8 8 0 4.07009105931161 -4.07009105931161 C G C 10 0.508761382413951 0.00339109537265815 ENSG00000064886:ENST00000530597:exon_111773364_111773736:CHI3L2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 113197203 A/G 1 42 44 86 20.6320219386141 22.3855008262138 -1.75347888759978 A:G A G 10 0.508761382413951 0.746816561179307 ENSG00000116489:ENST00000263168:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000393426:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000498626:exon_113197087_113197293:CAPZA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 113236681 C/T 1 11 6 17 5.40362479344654 3.05256829448371 2.35105649896283 T:C C T 10 0.508761382413951 0.333580569907415 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113236527_113236794:MOV10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 113237171 A/G 1 10 9 19 4.91238617586049 4.57885244172556 0.333533734134932 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 113239382 G/A 1 23 31 54 11.2984882044791 15.7716028548325 -4.47311465035335 A:G G A 10 0.508761382413951 0.276115487522537 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113239361_113239468:MOV10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 20 21 41 9.82477235172098 10.683989030693 -0.85921667897199 T:C T C 10 0.508761382413951 0.87623230007505 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 36 23 59 17.6845902330978 11.7015117955209 5.98307843757689 T:C C T 10 0.508761382413951 0.151459597041772 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 114948281 A/G 1 20 15 35 9.82477235172098 7.63142073620926 2.19335161551172 A:G A G 10 0.508761382413951 0.501876804247675 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000476908:exon_114946948_114948381:TRIM33 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 116206423 G/A 1 8 2 10 3.92990894068839 1.0175227648279 2.91238617586049 A:G G A 10 0.508761382413951 0.109914731512069 ENSG00000173218:ENST00000355485:exon_116206282_116206889:VANGL1;ENSG00000173218:ENST00000369510:exon_116206282_116206889:VANGL1;ENSG00000173218:ENST00000310260:exon_116206282_116206889:VANGL1;ENSG00000173218:ENST00000369509:exon_116206282_116206889:VANGL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 116931628 C/A 1 246 213 459 120.844699926168 108.366174454172 12.4785254719965 A:C C A 10 0.508761382413951 0.26252445206758 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000445896:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000491156:exon_116931524_116931641:ATP1A1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 116947051 G/A 1 287 270 557 140.985483247196 137.365573251767 3.61990999542931 A:C:G G A 10 0.508761382413951 0.766891121134181 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116947038_116947394:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116947038_116947396:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116947038_116947396:ATP1A1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 118165691 C/T 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 T:C C T 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000183508:ENST00000369448:exon_118165464_118170994:FAM46C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 120285546 G/A 1 20 18 38 9.82477235172098 9.15770488345112 0.667067468269863 A:G G A 10 0.508761382413951 0.8721627636767 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120285430_120285667:PHGDH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 144909956 G/A 1 1 7 8 0.491238617586049 3.56132967689766 -3.07009105931161 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0359761797629569 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144909869_144909960:PDE4DIP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 1 7 1 8 3.43867032310234 0.508761382413951 2.92990894068839 T:C C T 10 0.508761382413951 0.070648384509694 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 144931330 C/T 1 7 1 8 3.43867032310234 0.508761382413951 2.92990894068839 T:C C T 10 0.508761382413951 0.070648384509694 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 0 0 57 57 0 28.9993987975952 -28.9993987975952 A G A 10 0.508761382413951 2.53321779537438e-18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 56 56 0 28.4906374151813 -28.4906374151813 C T C 10 0.508761382413951 5.15679693062942e-18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 40 40 0 20.350455296558 -20.350455296558 T G T 10 0.508761382413951 4.48435536523704e-13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 30 30 0 15.2628414724185 -15.2628414724185 A C A 10 0.508761382413951 5.47993006314402e-10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 116 0 116 56.9836796399817 0 56.9836796399817 G G 10 0.508761382413951 9.18386584603982e-35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 72 72 0 36.6308195338045 -36.6308195338045 C T C 10 0.508761382413951 5.9300729799195e-23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 1 1 159 160 0.491238617586049 80.8930598038182 -80.4018211862322 T:C C T 10 0.508761382413951 6.74147118232006e-48 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 149858575 G/A 1 16 18 34 7.85981788137678 9.15770488345112 -1.29788700207433 A:G G A 10 0.508761382413951 0.732701821127198 ENSG00000184260:ENST00000331380:exon_149858525_149858961:HIST2H2AC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 149915754 G/A 1 15 5 20 7.36857926379074 2.54380691206975 4.82477235172098 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0420027631184402 ENSG00000163113:ENST00000369135:exon_149912231_149916964:OTUD7B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 150239478 T/G 1 165 193 358 81.0543719016981 98.1909468058925 -17.1365749041944 T:C:G T G 10 0.508761382413951 0.0723620904900236 ENSG00000117362:ENST00000414276:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000452164:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000433443:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000369109:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000360244:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000461320:exon_150239475_150239654:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000236017:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000486308:exon_150239356_150239878:APH1A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 150418796 C/T 1 10 17 27 4.91238617586049 8.64894350103717 -3.73655732517668 T:C C T 10 0.508761382413951 0.178990411250083 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150418702_150418877:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150418702_150418877:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150418702_150418877:RPRD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 150460348 C/T 1 28 33 61 13.7546812924094 16.7891256196604 -3.03444432725101 T:C C T 10 0.508761382413951 0.445671791651679 ENSG00000143374:ENST00000369054:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369064:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000438568:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369052:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369053:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369051:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000479372:exon_150460334_150461108:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000467982:exon_150460346_150460530:TARS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 37 30 67 18.1758288506838 15.2628414724185 2.91298737826529 C:G C G 10 0.508761382413951 0.541671920253819 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 155145392 G/A 1 13 4 17 6.38610202861864 2.0350455296558 4.35105649896283 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0496218514424198 ENSG00000163463:ENST00000487350:exon_155145214_155145714:KRTCAP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 88 71 159 43.2289983475723 36.1220581513905 7.1069401961818 T:C C T 10 0.508761382413951 0.267704928549472 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 155289545 T/G 1 2 11 13 0.982477235172098 5.59637520655346 -4.61389797138136 T:G T G 10 0.508761382413951 0.0115925075570033 ENSG00000160752:ENST00000492887:exon_155289402_155289676:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000489324:exon_155289446_155289719:FDPS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 156206121 G/A 1 50 37 87 24.5619308793025 18.8241711493162 5.73775972998627 A:G G A 10 0.508761382413951 0.238795460607368 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368273:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156206079_156206274:PMF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 156233189 C/T 1 25 18 43 12.2809654396512 9.15770488345112 3.12326055620011 T:C C T 10 0.508761382413951 0.363555909641122 ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156233186_156233361:SMG5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 156262945 G/C 1 21 39 60 10.316010969307 19.8416939141441 -9.52568294483706 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0142325980423696 ENSG00000163472:ENST00000485135:exon_156262518_156262976:TMEM79;ENSG00000198715:ENST00000461597:exon_156262677_156263000:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000482579:exon_156262479_156263000:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156262479_156263000:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000481050:exon_156262486_156263000:C1orf85 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 156263940 T/C 1 15 9 24 7.36857926379074 4.57885244172556 2.78972682206518 T:C T C 10 0.508761382413951 0.309249018183124 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 156264000 G/A 1 25 25 50 12.2809654396512 12.7190345603488 -0.438069120697548 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 156280969 G/A 1 376 190 566 184.705720212354 96.6646626586507 88.0410575537038 A:G G A 10 0.508761382413951 8.84208869411738e-14 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156280741_156280986:CCT3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 156280971 G/A 1 384 197 581 188.635629153043 100.225992335548 88.4096368174945 A:C:G G A 10 0.508761382413951 1.39286357343449e-13 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156280741_156280986:CCT3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 156697056 T/C 1 118 95 213 57.9661568751538 48.3323313293253 9.63382554582844 T:C T C 10 0.508761382413951 0.193348261305432 ENSG00000143319:ENST00000313146:exon_156696698_156698227:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000368219:exon_156696698_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000496538:exon_156696698_156697178:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000470713:exon_156697003_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000469074:exon_156697034_156697600:ISG20L2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 156713623 C/T 1 156 189 345 76.6332243434236 96.1559012762367 -19.5226769328131 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0358240195888307 ENSG00000143321:ENST00000357325:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000368209:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000465180:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000482651:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000477306:exon_156713099_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000368206:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000469145:exon_156713501_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000471377:exon_156713595_156713670:HDGF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 18 19 37 8.84229511654888 9.66646626586507 -0.824171149316186 A:G A G 10 0.508761382413951 0.869882749699634 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 152 137 289 74.6682698730795 69.7003093907113 4.96796048236817 A:G A G 10 0.508761382413951 0.596544118596478 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 159043196 C/T 1 30 18 48 14.7371585275815 9.15770488345112 5.57945364413035 T:C C T 10 0.508761382413951 0.114033074351846 ENSG00000163568:ENST00000368130:exon_159043028_159043309:AIM2;ENSG00000163568:ENST00000411768:exon_159043028_159043309:AIM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 160000435 A/T 1 10 5 15 4.91238617586049 2.54380691206975 2.36857926379074 A:T A T 10 0.508761382413951 0.302882686663208 ENSG00000143315:ENST00000368090:exon_159997462_160001783:PIGM HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 160062340 G/A 1 19 17 36 9.33353373413493 8.64894350103717 0.684590233097765 A:G G A 10 0.508761382413951 0.868667377910195 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 160062472 C/T 1 14 24 38 6.87734064620469 12.2102731779348 -5.33293253173014 T:C C T 10 0.508761382413951 0.103966381011793 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062376_160062485:IGSF8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 160062727 A/G 1 9 17 26 4.42114755827444 8.64894350103717 -4.22779594276273 A:G A G 10 0.508761382413951 0.116984532347771 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062714_160063121:IGSF8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 21 6 27 10.316010969307 3.05256829448371 7.26344267482332 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00612431343469327 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 161013121 C/T 1 30 31 61 14.7371585275815 15.7716028548325 -1.03444432725101 T:C C T 10 0.508761382413951 0.799455933308295 ENSG00000158773:ENST00000368020:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368021:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000442467:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000435396:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368019:exon_161013058_161013149:USF1;ENSG00000158773:ENST00000473969:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000531842:exon_161013058_161013132:USF1;ENSG00000158773:ENST00000496363:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000491629:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000534633:exon_161013043_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000529476:exon_161013058_161013150:USF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 161019040 G/C 1 149 134 283 73.1945540203213 68.1740252434694 5.02052877685188 A:C:G G C 10 0.508761382413951 0.552899447082168 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 161020997 C/T 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 T:C C T 10 0.508761382413951 0.289666844678132 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 161681661 C/G 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 C:G C G 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 159 121 280 78.1069401961818 61.5601272720881 16.5468129240937 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0486935657328197 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 368 449 817 180.775811271666 228.433860703864 -47.6580494321979 A:G G A 10 0.508761382413951 0.000879531228363577 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 161696782 G/C 1 5 7 12 2.45619308793025 3.56132967689766 -1.10513658896741 C:G G C 10 0.508761382413951 0.574941367903584 ENSG00000162746:ENST00000367948:exon_161696493_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367946:exon_161696638_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367945:exon_161696638_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000336830:exon_161696597_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367944:exon_161696597_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000392158:exon_161696493_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000495397:exon_161695691_161696783:FCRLB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 163297322 A/C 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 A:C A C 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000143228:ENST00000534289:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000450453:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000442820:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000490881:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000487578:exon_163297278_163297352:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163297278_163297352:NUF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 163313539 C/T 1 9 5 14 4.42114755827444 2.54380691206975 1.87734064620469 T:C C T 10 0.508761382413951 0.424962478484933 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163313523_163313613:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000531529:exon_163313523_163313605:NUF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 169762807 T/G 1 27 42 69 13.2634426748233 21.3679780613859 -8.10453538656262 T:G T G 10 0.508761382413951 0.0543629565793767 ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000454472:exon_169762283_169763038:C1orf156 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 169821135 C/T 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 T:C C T 10 0.508761382413951 0.344505314881063 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 171509327 G/A 1 86 67 153 42.2465211124002 34.0870126217347 8.1595084906655 A:G G A 10 0.508761382413951 0.196292089886063 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 171511039 C/G 1 83 60 143 40.7728052596421 30.5256829448371 10.247122314805 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0943294320850731 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171509400_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171510969_171511368:BAT2L2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 171514731 C/G 1 25 20 45 12.2809654396512 10.175227648279 2.10573779137221 C:G C G 10 0.508761382413951 0.554242561106102 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171514618_171514826:BAT2L2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 171556165 G/C 1 44 44 88 21.6144991737862 22.3855008262138 -0.771001652427685 C:G G C 10 0.508761382413951 0.915265844137828 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171556142_171556360:BAT2L2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 48 42 90 23.5794536441304 21.3679780613859 2.21147558274441 T:C T C 10 0.508761382413951 0.674079401318637 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 29 26 55 14.2459199099954 13.2277959427627 1.0181239672327 A:G A G 10 0.508761382413951 0.789459156913444 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 24 23 47 11.7897268220652 11.7015117955209 0.0882150265443045 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 79 55 134 38.8078507892979 27.9818760327673 10.8259747565306 T:C C T 10 0.508761382413951 0.069341848627329 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 179320578 A/G 1 14 28 42 6.87734064620469 14.2453187075906 -7.36797806138594 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0296411774940718 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179320452_179320597:SOAT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 182354850 A/G 1 8 4 12 3.92990894068839 2.0350455296558 1.89486341103259 A:G A G 10 0.508761382413951 0.388585368391447 ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182354834_182355022:GLUL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 182356399 A/G 1 31 32 63 15.2283971451675 16.2803642372464 -1.05196709207891 A:G A G 10 0.508761382413951 0.8024536443897 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000484996:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000475808:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000480604:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000462444:exon_182355910_182356427:GLUL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 184663537 A/C 1 12 5 17 5.89486341103259 2.54380691206975 3.35105649896283 A:C A C 10 0.508761382413951 0.144506573427302 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184663178_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184659637_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184663197_184663606:EDEM3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 184801065 T/C 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000461167:exon_184800981_184801096:FAM129A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 192780268 T/C 1 8 18 26 3.92990894068839 9.15770488345112 -5.22779594276273 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0490487434630172 ENSG00000116741:ENST00000235382:exon_192780111_192780277:RGS2;ENSG00000116741:ENST00000464302:exon_192780111_192780369:RGS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 192780657 C/T 1 17 19 36 8.35105649896283 9.66646626586507 -1.31540976690223 T:C C T 10 0.508761382413951 0.739808852412005 ENSG00000116741:ENST00000235382:exon_192780532_192781403:RGS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 27 27 54 13.2634426748233 13.7365573251767 -0.473114650353352 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 12 25 37 5.89486341103259 12.7190345603488 -6.82417114931619 A:T A T 10 0.508761382413951 0.0314424986506813 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 41 29 70 20.140783321028 14.7540800900046 5.38670323102343 A:G G A 10 0.508761382413951 0.231880869745622 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 202104616 T/A 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 A:T T A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000143862:ENST00000272217:exon_202104587_202104654:ARL8A;ENSG00000143862:ENST00000491358:exon_202104587_202104736:ARL8A;ENSG00000143862:ENST00000486225:exon_202104587_202104928:ARL8A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 202119546 C/G 1 18 17 35 8.84229511654888 8.64894350103717 0.193351615511716 C:G C G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000143851:ENST00000309017:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000367279:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000308986:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000495688:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000462815:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000496197:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000480836:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000477554:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000492977:exon_202118979_202119552:PTPN7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 202888947 T/C 1 9 8 17 4.42114755827444 4.07009105931161 0.351056498962834 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000117153:ENST00000367261:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000435533:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367260:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367258:exon_202888883_202889036:KLHL12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 202935911 T/C 1 13 10 23 6.38610202861864 5.08761382413951 1.29848820447913 T:C T C 10 0.508761382413951 0.678726593550885 ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000473599:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000478009:exon_202935877_202936026:CYB5R1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 206652427 C/G 1 2 6 8 0.982477235172098 3.05256829448371 -2.07009105931161 C:G C G 10 0.508761382413951 0.172493759593104 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206652286_206652476:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000462698:exon_206652286_206652476:IKBKE HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 206757807 C/T 1 50 44 94 24.5619308793025 22.3855008262138 2.17643005308861 T:C C T 10 0.508761382413951 0.680805805299013 ENSG00000136653:ENST00000355294:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367117:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000338603:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367118:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000435226:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000304534:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000491368:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000481486:exon_206757807_206758627:RASSF5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 206772753 A/G 1 3 8 11 1.47371585275815 4.07009105931161 -2.59637520655346 A:G A G 10 0.508761382413951 0.139557898450825 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 209933331 A/G 1 34 17 51 16.7021129979257 8.64894350103717 8.0531694968885 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0251916156539557 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 209933540 A/G 1 32 23 55 15.7196357627536 11.7015117955209 4.0181239672327 A:G A G 10 0.508761382413951 0.284671748892002 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 209936914 C/T 1 21 18 39 10.316010969307 9.15770488345112 1.15830608585591 T:C C T 10 0.508761382413951 0.750717389169567 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 T:C:G T C 10 0.508761382413951 0.770813353200887 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 53 45 98 26.0356467320606 22.8942622086278 3.14138452343281 C:G C G 10 0.508761382413951 0.545708971630795 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 210004199 C/G 1 2 6 8 0.982477235172098 3.05256829448371 -2.07009105931161 C:G C G 10 0.508761382413951 0.172493759593104 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210004148_210004388:C1orf107 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 210006603 C/T 1 7 2 9 3.43867032310234 1.0175227648279 2.42114755827444 T:C C T 10 0.508761382413951 0.180291906522768 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210006530_210006703:C1orf107 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 210012436 C/T 1 12 12 24 5.89486341103259 6.10513658896741 -0.210273177934823 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210012254_210012473:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210012254_210012473:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210012254_210012473:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210012254_210012473:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210012254_210012473:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000457820:exon_210012150_210012473:C1orf107 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 211451467 T/C 1 14 8 22 6.87734064620469 4.07009105931161 2.80724958689308 T:C T C 10 0.508761382413951 0.287915846699909 ENSG00000117625:ENST00000533469:exon_211451459_211451565:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367006:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452325:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000435653:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452621:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000528926:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000419091:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000529572:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367005:exon_211451459_211451583:RCOR3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 35 33 68 17.1933516155117 16.7891256196604 0.404225995851334 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 211848807 A/C 1 10 7 17 4.91238617586049 3.56132967689766 1.35105649896283 A:C A C 10 0.508761382413951 0.629969031107128 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211848726_211848960:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211848726_211848899:NEK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 212515613 C/T 1 20 9 29 9.82477235172098 4.57885244172556 5.24591990999542 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0625744282787756 ENSG00000066027:ENST00000261461:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000498129:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000479259:exon_212515530_212515622:PPP2R5A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 214510115 T/G 1 27 37 64 13.2634426748233 18.8241711493162 -5.56072847449286 T:G T G 10 0.508761382413951 0.171113882321500 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214510047_214510473:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214510047_214510445:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000416415:exon_214510047_214510474:SMYD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 214814059 T/G 1 30 36 66 14.7371585275815 18.3154097669022 -3.57825123932076 T:G T G 10 0.508761382413951 0.391439430213979 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 214816224 G/A 1 27 15 42 13.2634426748233 7.63142073620926 5.63202193861406 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0904755046686021 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 214818223 T/A 1 48 60 108 23.5794536441304 30.5256829448371 -6.9462293007067 A:T T A 10 0.508761382413951 0.210715766563248 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 18 13 31 8.84229511654888 6.61389797138136 2.22839714516752 T:C C T 10 0.508761382413951 0.475249037707381 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 222802376 A/G 1 14 6 20 6.87734064620469 3.05256829448371 3.82477235172098 A:G A G 10 0.508761382413951 0.116430409892464 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 222802803 T/G 1 13 12 25 6.38610202861864 6.10513658896741 0.280965439651226 T:G T G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 223905532 G/A 1 15 9 24 7.36857926379074 4.57885244172556 2.78972682206518 A:G G A 10 0.508761382413951 0.309249018183124 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223905464_223905533:CAPN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 223933079 C/T 1 13 24 37 6.38610202861864 12.2102731779348 -5.82417114931619 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0695284868049253 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223933008_223933141:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223933008_223933141:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223933008_223933141:CAPN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 223934720 G/A 1 23 20 43 11.2984882044791 10.175227648279 1.12326055620011 A:G G A 10 0.508761382413951 0.762329329640337 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223934699_223934765:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223934699_223934867:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223934699_223934867:CAPN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 226055595 G/A 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 A:G G A 10 0.508761382413951 0.770813353200887 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226055588_226055730:TMEM63A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 226108200 C/T 1 70 62 132 34.3867032310234 31.543205709665 2.84349752135847 T:C C T 10 0.508761382413951 0.663665931232923 ENSG00000143811:ENST00000343818:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000478402:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316940:exon_226107608_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316918:exon_226108155_226108313:PYCR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 227077809 C/T 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000460775:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000472139:exon_227077736_227077834:PSEN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 229594003 C/T 1 7 2 9 3.43867032310234 1.0175227648279 2.42114755827444 T:C C T 10 0.508761382413951 0.180291906522768 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229593908_229594043:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229593908_229594043:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229593908_229594043:NUP133 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 229622162 A/G 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229622118_229622275:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229622118_229622275:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229622118_229622275:NUP133 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 229623338 T/C 1 10 7 17 4.91238617586049 3.56132967689766 1.35105649896283 T:C T C 10 0.508761382413951 0.629969031107128 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229623213_229623360:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229623213_229623360:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229623213_229623360:NUP133 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 229631734 T/C 1 8 6 14 3.92990894068839 3.05256829448371 0.877340646204686 T:C T C 10 0.508761382413951 0.79097715531601 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229631639_229631794:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229631639_229631794:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229631639_229631794:NUP133 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 229635521 A/G 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 A:G A G 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229635431_229635565:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229635431_229635565:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229635431_229635565:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366678:exon_229635431_229635565:NUP133 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 229683264 G/A 1 12 9 21 5.89486341103259 4.57885244172556 1.31601096930703 A:G G A 10 0.508761382413951 0.664655217869201 ENSG00000135776:ENST00000344517:exon_229683246_229683448:ABCB10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 229730452 G/A 1 12 17 29 5.89486341103259 8.64894350103717 -2.75408009000458 A:G G A 10 0.508761382413951 0.355226164704238 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229728858_229730841:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229728868_229730841:TAF5L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 229738170 T/G 1 22 36 58 10.8072495868931 18.3154097669022 -7.50816018000916 T:G T G 10 0.508761382413951 0.0498305099172185 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 229738236 G/A 1 29 31 60 14.2459199099954 15.7716028548325 -1.52568294483706 A:C:G G A 10 0.508761382413951 0.700884845111227 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 229772693 T/G 1 22 17 39 10.8072495868931 8.64894350103717 2.15830608585591 T:G T G 10 0.508761382413951 0.524898886777943 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 229790048 A/G 1 13 3 16 6.38610202861864 1.52628414724185 4.85981788137678 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0215780226457102 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229789996_229790135:URB2;ENSG00000135763:ENST00000434387:exon_229789996_229790135:URB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 230384937 T/C 1 13 23 36 6.38610202861864 11.7015117955209 -5.31540976690223 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0947879037481661 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230384930_230385017:GALNT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 230415148 G/A 1 46 48 94 22.5969764089583 24.4205463558696 -1.82356994691139 A:G G A 10 0.508761382413951 0.757292824746767 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 231377081 C/T 1 10 10 20 4.91238617586049 5.08761382413951 -0.175227648279019 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231376919_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000436239:exon_231376953_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231376956_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231376962_231377202:GNPAT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 231401902 G/A 1 18 14 32 8.84229511654888 7.12265935379531 1.71963576275357 A:G G A 10 0.508761382413951 0.598431040951595 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000492459:exon_231401880_231401911:GNPAT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 231488524 C/T 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 T:C C T 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000010072:ENST00000391858:exon_231487050_231488878:C1orf124;ENSG00000010072:ENST00000295050:exon_231488356_231490769:C1orf124 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 29 24 53 14.2459199099954 12.2102731779348 2.0356467320606 T:C C T 10 0.508761382413951 0.586202734668809 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 37 30 67 18.1758288506838 15.2628414724185 2.91298737826529 A:G G A 10 0.508761382413951 0.541671920253819 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 17 2 19 8.35105649896283 1.0175227648279 7.33353373413493 A:T T A 10 0.508761382413951 0.000752529696947172 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 19 1 20 9.33353373413493 0.508761382413951 8.82477235172098 T:C T C 10 0.508761382413951 4.19573038932612e-05 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 0 19 0 19 9.33353373413493 0 9.33353373413493 C C 10 0.508761382413951 4.01638524577167e-06 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236702209 C/T 1 15 1 16 7.36857926379074 0.508761382413951 6.85981788137678 T:C C T 10 0.508761382413951 0.000533463720748227 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236702210 A/G 1 14 2 16 6.87734064620469 1.0175227648279 5.85981788137678 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00426766297702038 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 10 3 13 4.91238617586049 1.52628414724185 3.38610202861864 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0929283691516743 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 15 15 30 7.36857926379074 7.63142073620926 -0.262841472418529 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 26 30 56 12.7722040572373 15.2628414724185 -2.49063741518125 T:C T C 10 0.508761382413951 0.593330008303876 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 12 17 29 5.89486341103259 8.64894350103717 -2.75408009000458 T:C C T 10 0.508761382413951 0.355226164704238 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 33 24 57 16.2108743803396 12.2102731779348 4.00060120240479 T:C T C 10 0.508761382413951 0.353878090747161 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 49 40 89 24.0706922617164 20.350455296558 3.72023696515836 T:C T C 10 0.508761382413951 0.459042471050891 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 51 48 99 25.0531694968885 24.4205463558696 0.632623141018854 A:G A G 10 0.508761382413951 0.920225631268088 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 43 41 84 21.1232605562001 20.859216678972 0.264043877228119 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 19 7 26 9.33353373413493 3.56132967689766 5.77220405723727 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0295890675812559 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236746443 C/T 1 12 8 20 5.89486341103259 4.07009105931161 1.82477235172098 T:C C T 10 0.508761382413951 0.504771039081216 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236746313_236746496:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236746313_236746496:HEATR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236748505 T/C 1 17 14 31 8.35105649896283 7.12265935379531 1.22839714516752 T:C T C 10 0.508761382413951 0.721386502145606 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236749649 T/C 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236755837 C/T 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 T:C C T 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236755823_236755933:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236755823_236755933:HEATR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236758887 T/C 1 14 12 26 6.87734064620469 6.10513658896741 0.772204057237275 T:C T C 10 0.508761382413951 0.845636468998877 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236758840_236758973:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236758840_236758973:HEATR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 236767330 A/G 1 6 9 15 2.94743170551629 4.57885244172556 -1.63142073620926 A:G A G 10 0.508761382413951 0.447467080617159 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366579:exon_236767254_236767427:HEATR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 237054569 A/G 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237054433_237054629:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237054433_237054629:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237054433_237054629:MTR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 237058828 C/T 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000470570:exon_237057641_237058850:MTR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 241798631 C/T 1 9 15 24 4.42114755827444 7.63142073620926 -3.21027317793482 T:C C T 10 0.508761382413951 0.222993356359584 ENSG00000203668:ENST00000366553:exon_241792155_241799232:CHML HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 242030151 A/G 1 8 10 18 3.92990894068839 5.08761382413951 -1.15770488345112 A:G A G 10 0.508761382413951 0.642640691319775 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242030132_242030357:EXO1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 242035382 C/T 1 10 11 21 4.91238617586049 5.59637520655346 -0.68398903069297 T:C C T 10 0.508761382413951 0.82938952505783 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242035334_242035580:EXO1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 242042301 G/A 1 17 16 33 8.35105649896283 8.14018211862322 0.210874380339618 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 243579112 G/A 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 A:G G A 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000493334:exon_243579004_243579131:SDCCAG8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 245849729 G/A 1 10 22 32 4.91238617586049 11.1927504131069 -6.28036423724643 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0327744341158133 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 245850506 G/C 1 13 28 41 6.38610202861864 14.2453187075906 -7.85921667897199 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0181431668752133 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 245851289 G/T 1 19 11 30 9.33353373413493 5.59637520655346 3.73715852758147 T:G G T 10 0.508761382413951 0.202564131606526 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 247006051 G/C 1 32 18 50 15.7196357627536 9.15770488345112 6.56193087930245 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0669580415989149 ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000498601:exon_247005996_247006078:AHCTF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 1 247320258 A/G 1 8 5 13 3.92990894068839 2.54380691206975 1.38610202861864 A:G A G 10 0.508761382413951 0.581825911412537 ENSG00000196418:ENST00000366499:exon_247319191_247321268:ZNF124;ENSG00000196418:ENST00000340684:exon_247319191_247320519:ZNF124;ENSG00000196418:ENST00000491848:exon_247320219_247320519:ZNF124 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 294953 A/G 1 10 12 22 4.91238617586049 6.10513658896741 -1.19275041310692 A:G A G 10 0.508761382413951 0.673245720296639 ENSG00000015171:ENST00000509513:exon_294843_295201:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000397962:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000381607:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000309776:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000381604:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000381602:exon_294843_295201:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000397959:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000381591:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000403354:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000402736:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000381584:exon_294843_295028:ZMYND11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 3172050 C/T 1 86 90 176 42.2465211124002 45.7885244172556 -3.54200330485537 T:C C T 10 0.508761382413951 0.598655695546546 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 5782022 C/A 1 32 27 59 15.7196357627536 13.7365573251767 1.98307843757689 A:C C A 10 0.508761382413951 0.696434551434237 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5781581_5782460:C10orf18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 5784151 A/G 1 8 15 23 3.92990894068839 7.63142073620926 -3.70151179552087 A:G A G 10 0.508761382413951 0.145808138014843 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5784060_5784489:C10orf18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 5808086 G/A 1 439 426 865 215.653753120276 216.732348908343 -1.07859578806759 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.945802191649646 ENSG00000057608:ENST00000380191:exon_5807186_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000435969:exon_5807186_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380131:exon_5807187_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380153:exon_5807187_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000479928:exon_5807192_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000447751:exon_5807812_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380181:exon_5807917_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380132:exon_5807917_5808115:GDI2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 A:T A T 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 11505175 A/G 1 18 13 31 8.84229511654888 6.61389797138136 2.22839714516752 A:G A G 10 0.508761382413951 0.475249037707381 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 11805339 C/T 0 10 0 10 4.91238617586049 0 4.91238617586049 C C 10 0.508761382413951 0.00198015025857764 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000422887:exon_11805223_11805350:ECHDC3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 11805354 A/G 1 11 1 12 5.40362479344654 0.508761382413951 4.89486341103259 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00643682590501964 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 11805357 G/A 1 13 1 14 6.38610202861864 0.508761382413951 5.87734064620469 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00186865419939791 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 12131081 T/G 1 12 8 20 5.89486341103259 4.07009105931161 1.82477235172098 T:G T G 10 0.508761382413951 0.504771039081216 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 12143105 C/G 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 C:G C G 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12143041_12143180:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12143041_12143180:DHTKD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 80 102 182 39.2990894068839 51.893661006223 -12.5945715993391 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0640110974363788 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 12867598 C/G 1 16 14 30 7.85981788137678 7.12265935379531 0.737158527581471 C:G C G 10 0.508761382413951 0.856199484978377 ENSG00000183049:ENST00000378847:exon_12867572_12867689:CAMK1D;ENSG00000183049:ENST00000378845:exon_12867572_12868142:CAMK1D HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 16547058 A/G 1 13 7 20 6.38610202861864 3.56132967689766 2.82477235172098 A:G A G 10 0.508761382413951 0.264650309181708 ENSG00000165983:ENST00000343656:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000378000:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000298942:exon_16547019_16547159:PTER HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 16796919 C/A 1 19 18 37 9.33353373413493 9.15770488345112 0.175828850683814 A:T:C C A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16796870_16796988:RSU1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 21827796 G/A 1 15 6 21 7.36857926379074 3.05256829448371 4.31601096930703 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0793074128043104 ENSG00000078403:ENST00000377100:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377072:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000307729:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377091:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000471315:exon_21827762_21827893:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000446906:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000495130:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377059:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000396529:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000476557:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000430455:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000462999:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000480415:exon_21827762_21827841:MLLT10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 24908686 T/C 1 17 11 28 8.35105649896283 5.59637520655346 2.75468129240937 T:C T C 10 0.508761382413951 0.347013425966047 ENSG00000107863:ENST00000396432:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000320481:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000486374:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000376410:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000445703:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000446003:exon_24908402_24910298:ARHGAP21 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 27303605 A/T 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 A:T A T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000107890:ENST00000445828:exon_27303423_27303608:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27303423_27303640:ANKRD26 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 27389314 C/T 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 T:C C T 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27389014_27389405:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27389014_27389427:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27389014_27389427:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27389014_27389421:ANKRD26 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 35 41 76 17.1933516155117 20.859216678972 -3.66586506346027 A:G G A 10 0.508761382413951 0.423419364903456 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 27437964 T/C 1 78 89 167 38.3166121717118 45.2797630348416 -6.96315086312981 T:C T C 10 0.508761382413951 0.314359731808985 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000493741:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27437835_27437969:YME1L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 27444328 C/A 0 16 0 16 7.85981788137678 0 7.85981788137678 C C 10 0.508761382413951 3.16472623419428e-05 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27443753_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27444299_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27444299_27444541:MASTL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 27459670 C/T 1 38 44 82 18.6670674682699 22.3855008262138 -3.71843335794398 T:C C T 10 0.508761382413951 0.440470867797659 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 22 17 39 10.8072495868931 8.64894350103717 2.15830608585591 T:C T C 10 0.508761382413951 0.524898886777943 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 20 23 43 9.82477235172098 11.7015117955209 -1.87673944379989 T:C T C 10 0.508761382413951 0.64798810832134 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 27508758 T/C 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 T:C T C 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000426079:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000412279:exon_27508652_27508786:ACBD5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 31134214 A/G 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 A:G A G 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000183621:ENST00000331737:exon_31133563_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000361310:exon_31133563_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000413025:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000436087:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000442986:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000452305:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000444692:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000430896:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000375311:exon_31133710_31134502:ZNF438 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 38344700 C/G 1 24 14 38 11.7897268220652 7.12265935379531 4.66706746826986 C:G C G 10 0.508761382413951 0.145638039411868 ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 38404188 G/C 1 12 6 18 5.89486341103259 3.05256829448371 2.84229511654888 C:G G C 10 0.508761382413951 0.239188352827104 ENSG00000075407:ENST00000361085:exon_38404123_38404218:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000351773:exon_38404123_38404218:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000479469:exon_38404123_38404313:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000463776:exon_38404123_38404250:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000477790:exon_38404123_38404621:ZNF37A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 38407519 A/G 1 19 16 35 9.33353373413493 8.14018211862322 1.19335161551172 A:G A G 10 0.508761382413951 0.73725408039855 ENSG00000075407:ENST00000361085:exon_38406318_38411511:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000351773:exon_38406318_38412276:ZNF37A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 43089965 G/A 1 8 5 13 3.92990894068839 2.54380691206975 1.38610202861864 A:G G A 10 0.508761382413951 0.581825911412537 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 43281089 T/C 1 11 13 24 5.40362479344654 6.61389797138136 -1.21027317793482 T:C T C 10 0.508761382413951 0.685890504791539 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43280930_43281120:BMS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 43292647 A/G 1 35 38 73 17.1933516155117 19.3329325317301 -2.13958091621842 A:G A G 10 0.508761382413951 0.641048159731933 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43291922_43292679:BMS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 240 243 483 117.897268220652 123.62901592659 -5.73174770593832 A:T T A 10 0.508761382413951 0.616801115651195 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 44052903 A/C 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 A:C A C 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000196793:ENST00000306006:exon_44051792_44053619:ZNF239;ENSG00000196793:ENST00000374446:exon_44051792_44053619:ZNF239;ENSG00000196793:ENST00000339962:exon_44051795_44053619:ZNF239;ENSG00000196793:ENST00000426961:exon_44051795_44053619:ZNF239 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 44053013 G/C 1 8 3 11 3.92990894068839 1.52628414724185 2.40362479344654 C:G G C 10 0.508761382413951 0.227353863226797 ENSG00000196793:ENST00000306006:exon_44051792_44053619:ZNF239;ENSG00000196793:ENST00000374446:exon_44051792_44053619:ZNF239;ENSG00000196793:ENST00000339962:exon_44051795_44053619:ZNF239;ENSG00000196793:ENST00000426961:exon_44051795_44053619:ZNF239;ENSG00000196793:ENST00000491188:exon_44052977_44053619:ZNF239 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 45953767 A/G 1 24 19 43 11.7897268220652 9.66646626586507 2.12326055620011 A:G A G 10 0.508761382413951 0.545059070699706 ENSG00000165406:ENST00000453424:exon_45950035_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000319836:exon_45952817_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000395771:exon_45952817_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000395769:exon_45952954_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000476962:exon_45952959_45953991:MARCH8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 46143958 T/G 1 9 7 16 4.42114755827444 3.56132967689766 0.859817881376784 T:G T G 10 0.508761382413951 0.804101251762597 ENSG00000172671:ENST00000374366:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374376:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000344646:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374371:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374370:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000465407:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000495747:exon_46143867_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000497028:exon_46143923_46143982:ANUBL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 46222724 C/G 1 7 9 16 3.43867032310234 4.57885244172556 -1.14018211862322 C:G C G 10 0.508761382413951 0.623757634359657 ENSG00000172661:ENST00000374362:exon_46222667_46222768:FAM21C;ENSG00000172661:ENST00000336378:exon_46222667_46222768:FAM21C;ENSG00000172661:ENST00000399588:exon_46222684_46222768:FAM21C;ENSG00000172661:ENST00000359860:exon_46222684_46222768:FAM21C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 50678369 T/C 1 11 10 21 5.40362479344654 5.08761382413951 0.31601096930703 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 50678717 T/C 1 10 6 16 4.91238617586049 3.05256829448371 1.85981788137678 T:C T C 10 0.508761382413951 0.455622877460238 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 62553763 A/G 1 5 13 18 2.45619308793025 6.61389797138136 -4.15770488345112 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0596661589652089 ENSG00000170312:ENST00000395284:exon_62553635_62554610:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000316629:exon_62553635_62554601:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000448257:exon_62553635_62554586:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000373809:exon_62553635_62554610:CDK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 20 15 35 9.82477235172098 7.63142073620926 2.19335161551172 A:G G A 10 0.508761382413951 0.501876804247675 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 64974380 G/C 1 11 11 22 5.40362479344654 5.59637520655346 -0.192750413106921 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 70105560 G/A 1 6 6 12 2.94743170551629 3.05256829448371 -0.105136588967412 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000204130:ENST00000466493:exon_70105459_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000466187:exon_70103183_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000388768:exon_70103266_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000265865:exon_70104902_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000473398:exon_70105490_70105668:RUFY2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 70225504 G/T 1 7 2 9 3.43867032310234 1.0175227648279 2.42114755827444 T:G G T 10 0.508761382413951 0.180291906522768 ENSG00000138346:ENST00000399180:exon_70225424_70225569:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000399179:exon_70225424_70225569:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000358410:exon_70225424_70225569:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000445821:exon_70225424_70225569:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000433594:exon_70225424_70225569:DNA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 70227964 C/T 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 T:C C T 10 0.508761382413951 0.335736887982477 ENSG00000138346:ENST00000399180:exon_70227880_70228063:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000399179:exon_70227880_70228063:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000358410:exon_70227880_70228063:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000445821:exon_70227880_70228063:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000433594:exon_70227880_70228063:DNA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 70482238 G/A 1 15 13 28 7.36857926379074 6.61389797138136 0.754681292409373 A:G G A 10 0.508761382413951 0.851195156405806 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70482212_70482334:CCAR1;ENSG00000060339:ENST00000494903:exon_70482212_70482334:CCAR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 70549579 G/A 1 20 13 33 9.82477235172098 6.61389797138136 3.21087438033962 A:G G A 10 0.508761382413951 0.298661263457526 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70549467_70549672:CCAR1;ENSG00000060339:ENST00000480627:exon_70549467_70549629:CCAR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 70700944 A/G 1 67 66 133 32.9129873782653 33.5782512393208 -0.665263861055479 A:G A G 10 0.508761382413951 0.931043401137991 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 70733266 T/G 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 T:G T G 10 0.508761382413951 0.542216324022944 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 70863699 C/T 1 1560 1898 3458 766.332243434236 965.629103821679 -199.296860387442 A:T:C:G C T 10 0.508761382413951 1.23444793127203e-11 ENSG00000122862:ENST00000462445:exon_70863627_70864297:SRGN;ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70863627_70864567:SRGN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 71874683 G/A 1 51 46 97 25.0531694968885 23.4030235910417 1.65014590584676 A:G G A 10 0.508761382413951 0.761425417388471 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 71874734 G/A 1 26 17 43 12.7722040572373 8.64894350103717 4.12326055620011 A:G G A 10 0.508761382413951 0.225106130763604 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 71874784 C/T 1 11 6 17 5.40362479344654 3.05256829448371 2.35105649896283 T:C C T 10 0.508761382413951 0.333580569907415 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 17 39 56 8.35105649896283 19.8416939141441 -11.4906374151813 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00292334645543365 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 74096396 C/T 1 15 12 27 7.36857926379074 6.10513658896741 1.26344267482332 T:C C T 10 0.508761382413951 0.702298904497837 ENSG00000148719:ENST00000394903:exon_74096282_74096454:DNAJB12;ENSG00000148719:ENST00000338820:exon_74096282_74096454:DNAJB12;ENSG00000148719:ENST00000444643:exon_74096282_74096454:DNAJB12;ENSG00000148719:ENST00000461919:exon_74096282_74096454:DNAJB12;ENSG00000148719:ENST00000463786:exon_74096282_74096454:DNAJB12;ENSG00000148719:ENST00000473051:exon_74096282_74096623:DNAJB12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 74834651 T/C 1 19 14 33 9.33353373413493 7.12265935379531 2.21087438033962 T:C T C 10 0.508761382413951 0.489070201574934 ENSG00000122884:ENST00000307116:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000394890:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000412021:exon_74834566_74834679:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000440381:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000263556:exon_74834566_74834673:P4HA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 74894375 T/C 1 60 60 120 29.4743170551629 30.5256829448371 -1.05136588967412 T:C T C 10 0.508761382413951 0.855666207868912 ENSG00000122882:ENST00000494307:exon_74894361_74894512:ECD;ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74893414_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74894283_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74894283_74894571:ECD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 74896664 T/C 1 30 40 70 14.7371585275815 20.350455296558 -5.61329676897657 T:C T C 10 0.508761382413951 0.190001562064668 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74896462_74896676:ECD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 74897816 C/T 1 28 27 55 13.7546812924094 13.7365573251767 0.0181239672326967 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74897761_74897828:ECD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 74899111 A/G 1 29 20 49 14.2459199099954 10.175227648279 4.0706922617164 A:G A G 10 0.508761382413951 0.256440797497237 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74899067_74899253:ECD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 74899134 C/G 1 28 23 51 13.7546812924094 11.7015117955209 2.0531694968885 C:G C G 10 0.508761382413951 0.578844625686923 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74899067_74899253:ECD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 74916173 T/A 1 16 17 33 7.85981788137678 8.64894350103717 -0.789125619660382 A:T T A 10 0.508761382413951 0.862463507447866 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000484976:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000453402:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74916033_74916211:ECD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 74923562 C/T 1 20 16 36 9.82477235172098 8.14018211862322 1.68459023309777 T:C C T 10 0.508761382413951 0.619673761572343 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74923491_74923708:ECD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 75006804 A/G 1 14 8 22 6.87734064620469 4.07009105931161 2.80724958689308 A:G A G 10 0.508761382413951 0.287915846699909 ENSG00000213551:ENST00000372950:exon_75006768_75008620:DNAJC9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 75148116 A/G 1 36 30 66 17.6845902330978 15.2628414724185 2.42174876067924 A:G A G 10 0.508761382413951 0.622827302867839 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000492380:exon_75148070_75148172:ANXA7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 75533448 A/G 1 8 15 23 3.92990894068839 7.63142073620926 -3.70151179552087 A:G A G 10 0.508761382413951 0.145808138014843 ENSG00000196968:ENST00000372841:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000394790:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000465695:exon_75532952_75534881:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000489264:exon_75533363_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000462704:exon_75533396_75533573:FUT11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 79739975 C/T 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 T:C C T 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000148606:ENST00000480092:exon_79739899_79740031:POLR3A;ENSG00000148606:ENST00000372371:exon_79739899_79740031:POLR3A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 77 67 144 37.8253735541258 34.0870126217347 3.73836093239106 A:G G A 10 0.508761382413951 0.560154948186849 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 81926718 A/G 1 70 66 136 34.3867032310234 33.5782512393208 0.808451991702668 A:G A G 10 0.508761382413951 0.931737118179877 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 86131003 T/C 1 6 10 16 2.94743170551629 5.08761382413951 -2.14018211862322 T:C T C 10 0.508761382413951 0.324879272681718 ENSG00000107771:ENST00000359979:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86130770_86132225:FAM190B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 86131059 A/G 1 8 6 14 3.92990894068839 3.05256829448371 0.877340646204686 A:G A G 10 0.508761382413951 0.79097715531601 ENSG00000107771:ENST00000359979:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86130770_86132225:FAM190B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 7 9 16 3.43867032310234 4.57885244172556 -1.14018211862322 T:C T C 10 0.508761382413951 0.623757634359657 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 88730312 T/C 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000148671:ENST00000372013:exon_88730233_88730672:C10orf116;ENSG00000148671:ENST00000372012:exon_88730233_88730487:C10orf116 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 90767482 A/G 1 33 45 78 16.2108743803396 22.8942622086278 -6.68338782828818 A:G A G 10 0.508761382413951 0.141485710046606 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494410:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000460510:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000477270:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000466081:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000371857:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90767457_90767594:FAS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 91066460 T/A 1 19 21 40 9.33353373413493 10.683989030693 -1.35045529655804 A:T T A 10 0.508761382413951 0.752494397021214 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 91066769 C/A 1 15 12 27 7.36857926379074 6.10513658896741 1.26344267482332 A:C C A 10 0.508761382413951 0.702298904497837 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 91162677 C/T 1 29 18 47 14.2459199099954 9.15770488345112 5.0882150265443 T:C C T 10 0.508761382413951 0.146752977004384 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 91178000 C/T 1 34 18 52 16.7021129979257 9.15770488345112 7.54440811447455 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0379699425791876 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 93608142 G/A 1 13 10 23 6.38610202861864 5.08761382413951 1.29848820447913 A:G G A 10 0.508761382413951 0.678726593550885 ENSG00000107854:ENST00000371627:exon_93608140_93608392:TNKS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 95459817 C/T 1 42 27 69 20.6320219386141 13.7365573251767 6.89546461343738 T:C C T 10 0.508761382413951 0.117000678402820 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95459787_95459863:FRA10AC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 96104665 T/G 1 16 13 29 7.85981788137678 6.61389797138136 1.24591990999542 T:G T G 10 0.508761382413951 0.712310635717891 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96104610_96104690:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96104610_96104690:NOC3L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 96114835 G/A 1 17 9 26 8.35105649896283 4.57885244172556 3.77220405723727 A:G G A 10 0.508761382413951 0.170337716294649 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96114720_96114850:NOC3L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 96352265 A/G 1 18 16 34 8.84229511654888 8.14018211862322 0.702112997925667 A:G A G 10 0.508761382413951 0.864873527062112 ENSG00000119969:ENST00000441434:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371327:exon_96352152_96352271:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000464030:exon_96351986_96352271:HELLS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 97447373 A/T 1 29 18 47 14.2459199099954 9.15770488345112 5.0882150265443 A:T A T 10 0.508761382413951 0.146752977004384 ENSG00000119977:ENST00000265993:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000343162:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371217:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000480852:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000443432:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371209:exon_97447349_97447476:TCTN3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 97919011 A/G 1 22 20 42 10.8072495868931 10.175227648279 0.632021938614059 A:G A G 10 0.508761382413951 0.878401052374126 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 42 46 88 20.6320219386141 23.4030235910417 -2.77100165242769 A:G A G 10 0.508761382413951 0.594638065177616 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 98287792 G/T 1 51 50 101 25.0531694968885 25.4380691206975 -0.384899623809048 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000077147:ENST00000371142:exon_98287788_98287934:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000485093:exon_98287788_98287930:TM9SF3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 98369536 A/G 1 23 38 61 11.2984882044791 19.3329325317301 -8.03444432725101 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0410478007796557 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000467625:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98369469_98369624:PIK3AP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 98380137 T/C 1 48 48 96 23.5794536441304 24.4205463558696 -0.841092711739293 T:C T C 10 0.508761382413951 0.918803267346913 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98380109_98380168:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000461252:exon_98380109_98380191:PIK3AP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 35 31 66 17.1933516155117 15.7716028548325 1.42174876067924 T:C C T 10 0.508761382413951 0.80578547683811 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 98469693 C/T 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 T:C C T 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 98741293 A/G 1 7 2 9 3.43867032310234 1.0175227648279 2.42114755827444 A:G A G 10 0.508761382413951 0.180291906522768 ENSG00000155640:ENST00000286067:exon_98741041_98745582:C10orf12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 99227333 T/G 1 7 10 17 3.43867032310234 5.08761382413951 -1.64894350103717 T:G T G 10 0.508761382413951 0.473990855338058 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434392:exon_99227262_99227360:MMS19 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 99969568 A/G 1 11 15 26 5.40362479344654 7.63142073620926 -2.22779594276273 A:G A G 10 0.508761382413951 0.435788589890287 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 100179851 T/C 1 5 14 19 2.45619308793025 7.12265935379531 -4.66646626586507 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0384390649292403 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000462743:exon_100179802_100180126:HPS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 100183570 G/C 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 C:G G C 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000470095:exon_100183510_100183644:HPS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 101639796 G/A 1 26 14 40 12.7722040572373 7.12265935379531 5.64954470344196 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0825442331888902 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 101639877 A/C 1 30 12 42 14.7371585275815 6.10513658896741 8.63202193861406 A:C A C 10 0.508761382413951 0.00831131767133911 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 101645498 T/C 1 8 1 9 3.92990894068839 0.508761382413951 3.42114755827444 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0393216639345302 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101645444_101645623:DNMBP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 101715899 G/A 1 10 8 18 4.91238617586049 4.07009105931161 0.842295116548883 A:G G A 10 0.508761382413951 0.815041324056156 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101714971_101716962:DNMBP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 102684380 C/A 1 4 7 11 1.9649544703442 3.56132967689766 -1.59637520655346 A:C C A 10 0.508761382413951 0.379976164789140 ENSG00000119906:ENST00000238961:exon_102683732_102684729:FAM178A;ENSG00000119906:ENST00000370271:exon_102683732_102684729:FAM178A;ENSG00000119906:ENST00000370269:exon_102683732_102684729:FAM178A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 102738766 T/C 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 T:C T C 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000055950:ENST00000318325:exon_102737578_102739129:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000370241:exon_102738486_102738768:MRPL43;ENSG00000095539:ENST00000519649:exon_102738606_102738775:SEMA4G;ENSG00000095539:ENST00000521006:exon_102738606_102738775:SEMA4G;ENSG00000095539:ENST00000457585:exon_102738606_102738775:SEMA4G;ENSG00000095539:ENST00000370250:exon_102738606_102738775:SEMA4G;ENSG00000095539:ENST00000517724:exon_102738606_102738775:SEMA4G;ENSG00000095539:ENST00000210633:exon_102738606_102738775:SEMA4G HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 120 65 185 58.9486341103259 33.0694898569068 25.8791442534191 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.000161588366479967 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 102766574 A/G 1 12 22 34 5.89486341103259 11.1927504131069 -5.29788700207433 A:G A G 10 0.508761382413951 0.085555193048057 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 103339142 G/A 1 33 37 70 16.2108743803396 18.8241711493162 -2.61329676897657 A:G G A 10 0.508761382413951 0.551972221399675 ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103338639_103339310:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103338641_103339574:POLL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 103340144 A/G 1 11 9 20 5.40362479344654 4.57885244172556 0.824772351720981 A:G A G 10 0.508761382413951 0.824343209360058 ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103340005_103341982:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000415897:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000485369:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000429502:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000470140:exon_103340009_103340173:POLL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 103344589 T/G 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 T:G T G 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000426919:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000454524:exon_103344368_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000413344:exon_103344444_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000461587:exon_103344551_103344676:POLL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 105362104 G/A 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 105882765 A/G 1 8 4 12 3.92990894068839 2.0350455296558 1.89486341103259 A:G A G 10 0.508761382413951 0.388585368391447 ENSG00000156384:ENST00000369729:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000463224:exon_105882723_105883121:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000369727:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000336358:exon_105882524_105882844:C10orf78 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 106074604 G/A 1 9 5 14 4.42114755827444 2.54380691206975 1.87734064620469 A:G G A 10 0.508761382413951 0.424962478484933 ENSG00000148841:ENST00000337478:exon_106071894_106075822:ITPRIP;ENSG00000148841:ENST00000278071:exon_106071901_106075822:ITPRIP;ENSG00000148841:ENST00000358187:exon_106071902_106075822:ITPRIP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 112262561 G/C 1 33 48 81 16.2108743803396 24.4205463558696 -8.20967197553003 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0753564492900514 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112262479_112262627:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112262479_112262627:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112262505_112262627:DUSP5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 115609137 C/T 1 24 26 50 11.7897268220652 13.2277959427627 -1.43806912069755 T:C C T 10 0.508761382413951 0.777630824420953 ENSG00000198924:ENST00000369305:exon_115608739_115610403:DCLRE1A;ENSG00000198924:ENST00000361384:exon_115608739_115610403:DCLRE1A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 119133968 G/C 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119133867_119134978:PDZD8;ENSG00000165650:ENST00000489491:exon_119133867_119133992:PDZD8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 119134058 T/C 1 9 4 13 4.42114755827444 2.0350455296558 2.38610202861864 T:C T C 10 0.508761382413951 0.267810029003266 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119133867_119134978:PDZD8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 119768551 C/T 1 8 4 12 3.92990894068839 2.0350455296558 1.89486341103259 T:C C T 10 0.508761382413951 0.388585368391447 ENSG00000107560:ENST00000355624:exon_119764427_119768736:RAB11FIP2;ENSG00000107560:ENST00000369199:exon_119764429_119768736:RAB11FIP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 120920588 T/C 1 13 9 22 6.38610202861864 4.57885244172556 1.80724958689308 T:C T C 10 0.508761382413951 0.524885322520688 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 121196335 G/A 1 18 22 40 8.84229511654888 11.1927504131069 -2.35045529655804 A:G G A 10 0.508761382413951 0.527982744560903 ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121196163_121196353:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000369108:exon_121196163_121196353:GRK5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 121586882 A/G 1 12 8 20 5.89486341103259 4.07009105931161 1.82477235172098 A:G A G 10 0.508761382413951 0.504771039081216 ENSG00000198825:ENST00000361976:exon_121586143_121588652:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369080:exon_121586143_121587837:INPP5F HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 121679013 A/G 1 16 8 24 7.85981788137678 4.07009105931161 3.78972682206518 A:G A G 10 0.508761382413951 0.153096477627005 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121678956_121679108:SEC23IP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 9 4 13 4.42114755827444 2.0350455296558 2.38610202861864 A:G G A 10 0.508761382413951 0.267810029003266 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 124742792 G/A 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 124742895 G/C 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000496079:exon_124742806_124742986:PSTK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 126089434 G/A 1 54 26 80 26.5268853496466 13.2277959427627 13.2990894068839 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00340935716557091 ENSG00000065154:ENST00000368845:exon_126089409_126089553:OAT;ENSG00000065154:ENST00000471127:exon_126089409_126089553:OAT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 126311832 A/G 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000189319:ENST00000337318:exon_126307861_126312173:FAM53B;ENSG00000189319:ENST00000392754:exon_126307861_126312173:FAM53B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 126670356 G/A 1 13 17 30 6.38610202861864 8.64894350103717 -2.26284147241853 A:G G A 10 0.508761382413951 0.467323702180597 ENSG00000019995:ENST00000359653:exon_126670278_126670398:ZRANB1;ENSG00000019995:ENST00000471421:exon_126669980_126670398:ZRANB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 154 160 314 75.6507471082516 81.4018211862322 -5.7510740779806 T:C T C 10 0.508761382413951 0.53490917674508 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 133 161 294 65.3347361389445 81.9105825686461 -16.5758464297016 T:C:G G C 10 0.508761382413951 0.0543557290500202 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 129900858 C/T 1 144 125 269 70.7383609323911 63.5951728017439 7.14318813064719 T:C C T 10 0.508761382413951 0.393761211797447 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 129901501 G/C 1 126 142 268 61.8960658158422 72.244116302781 -10.3480504869389 C:G G C 10 0.508761382413951 0.221756802055404 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 129901747 C/T 1 125 126 251 61.4048271982561 64.1039341841578 -2.69910698590169 T:C C T 10 0.508761382413951 0.752506248244591 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 166 175 341 81.5456105192841 89.0332419224414 -7.48763140315728 A:G G A 10 0.508761382413951 0.44834352818655 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 169 182 351 83.0193263720423 92.5945715993391 -9.57524522729679 T:C T C 10 0.508761382413951 0.310919983939840 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 129903465 A/G 1 156 142 298 76.6332243434236 72.244116302781 4.38910804064261 A:G A G 10 0.508761382413951 0.643111735033346 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 129903802 A/G 1 109 114 223 53.5450093168793 57.9987975951904 -4.45378827831107 A:G A G 10 0.508761382413951 0.592199725035638 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 129904560 C/T 1 107 95 202 52.5625320817072 48.3323313293253 4.2302007523819 T:C C T 10 0.508761382413951 0.573859870556481 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 129905896 T/A 1 78 63 141 38.3166121717118 32.0519670920789 6.26464507963291 A:T:C T A 10 0.508761382413951 0.312536916319973 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 129906928 G/A 1 71 79 150 34.8779418486095 40.1921492107021 -5.31420736209265 A:G G A 10 0.508761382413951 0.414431876171508 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 129906980 C/T 1 57 63 120 28.0006012024048 32.0519670920789 -4.05136588967412 T:C C T 10 0.508761382413951 0.466730951148515 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 131506192 C/T 1 29 23 52 14.2459199099954 11.7015117955209 2.54440811447455 T:C C T 10 0.508761382413951 0.491932864353585 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 131506283 C/T 1 19 20 39 9.33353373413493 10.175227648279 -0.841693914144088 T:C C T 10 0.508761382413951 0.87317463430215 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 135076523 C/A 1 93 76 169 45.6851914355026 38.6658650634603 7.01932637204229 A:C C A 10 0.508761382413951 0.282747998111775 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 135076596 T/C 1 55 55 110 27.0181239672327 27.9818760327673 -0.963752065534607 T:C T C 10 0.508761382413951 0.924086732978867 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 135082346 A/G 1 8 12 20 3.92990894068839 6.10513658896741 -2.17522764827902 A:G A G 10 0.508761382413951 0.376308412261741 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 135085321 C/T 1 12 10 22 5.89486341103259 5.08761382413951 0.807249586893079 T:C C T 10 0.508761382413951 0.832379092287417 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 135085426 A/G 1 30 39 69 14.7371585275815 19.8416939141441 -5.10453538656262 A:G A G 10 0.508761382413951 0.230387592528685 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 135087521 G/A 1 13 10 23 6.38610202861864 5.08761382413951 1.29848820447913 A:G G A 10 0.508761382413951 0.678726593550885 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 135089035 A/G 1 9 6 15 4.42114755827444 3.05256829448371 1.36857926379074 A:G A G 10 0.508761382413951 0.60808216621752 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 135097434 A/G 1 26 19 45 12.7722040572373 9.66646626586507 3.10573779137221 A:G A G 10 0.508761382413951 0.374609604410792 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135097386_135097506:TUBGCP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 135098672 G/A 1 22 22 44 10.8072495868931 11.1927504131069 -0.385500826213843 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135098589_135098717:TUBGCP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 10 135112940 C/T 1 19 21 40 9.33353373413493 10.683989030693 -1.35045529655804 T:C C T 10 0.508761382413951 0.752494397021214 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000487796:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135112939_135113107:TUBGCP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 236091 G/A 1 4 9 13 1.9649544703442 4.57885244172556 -2.61389797138136 A:G G A 10 0.508761382413951 0.172726937801510 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_236048_236431:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_236048_236354:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_236048_236352:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_236048_236330:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525237:exon_236048_236326:SIRT3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 290816 A/G 1 15 16 31 7.36857926379074 8.14018211862322 -0.77160285483248 A:G A G 10 0.508761382413951 0.858252211672412 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 290891 T/C 1 8 12 20 3.92990894068839 6.10513658896741 -2.17522764827902 T:C T C 10 0.508761382413951 0.376308412261741 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 290918 G/A 1 4 14 18 1.9649544703442 7.12265935379531 -5.15770488345112 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0174653498021898 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 293188 T/C 1 26 46 72 12.7722040572373 23.4030235910417 -10.6308195338045 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0131296056243978 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_292886_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_293068_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_293163_293727:ATHL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 77 60 137 37.8253735541258 30.5256829448371 7.29969060928872 A:G A G 10 0.508761382413951 0.231751180890916 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 319 401 720 156.70511900995 204.013314347994 -47.3081953380447 A:G A G 10 0.508761382413951 0.000451756267701892 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 1902768 G/A 1 159 145 304 78.1069401961818 73.7704004500229 4.33653974615891 A:G G A 10 0.508761382413951 0.646439978471286 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000421485:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000446808:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381775:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381758:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000405957:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000451814:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000457279:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000429923:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000406638:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000418975:exon_1902662_1902782:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000417766:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381768:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000472974:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000432093:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000485341:exon_1902662_1902826:LSP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 271 238 509 133.125665365819 121.08520901452 12.040456351299 A:G G A 10 0.508761382413951 0.287752903120560 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 2424541 C/G 1 43 62 105 21.1232605562001 31.543205709665 -10.4199451534649 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0504363710258146 ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 3028140 G/A 1 20 23 43 9.82477235172098 11.7015117955209 -1.87673944379989 A:G G A 10 0.508761382413951 0.64798810832134 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000484484:exon_3028109_3028240:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000466442:exon_3028109_3030127:CARS;ENSG00000110619:ENST00000470221:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3028109_3028189:CARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 41 39 80 20.140783321028 19.8416939141441 0.299089406883922 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 4103524 A/G 1 10 9 19 4.91238617586049 4.57885244172556 0.333533734134932 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533343:exon_4103435_4103581:STIM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 29 36 65 14.2459199099954 18.3154097669022 -4.06948985690681 A:C C A 10 0.508761382413951 0.323680767446304 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 121 86 207 59.4398727279119 43.7534788875998 15.6863938403121 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0310708627023952 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 4626704 C/T 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 T:C C T 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000167333:ENST00000300747:exon_4626309_4626791:TRIM68;ENSG00000167333:ENST00000531101:exon_4626309_4626791:TRIM68;ENSG00000167333:ENST00000532108:exon_4626309_4626791:TRIM68;ENSG00000167333:ENST00000533021:exon_4626309_4626791:TRIM68 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 5655988 T/C 1 13 6 19 6.38610202861864 3.05256829448371 3.33353373413493 T:C T C 10 0.508761382413951 0.168307374643700 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000491385:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5655861_5656091:TRIM34 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 46 36 82 22.5969764089583 18.3154097669022 4.28156664205602 A:C C A 10 0.508761382413951 0.377619595805511 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 5688940 C/T 1 14 5 19 6.87734064620469 2.54380691206975 4.33353373413493 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0643310571506474 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5688919_5688941:TRIM5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 5701409 G/C 1 26 18 44 12.7722040572373 9.15770488345112 3.61449917378616 C:G G C 10 0.508761382413951 0.294479080687978 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 6588553 C/T 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 T:C C T 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6588155_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525080:exon_6588155_6588582:DNHD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 6631016 C/T 1 146 109 255 71.7208381675632 55.4549906831207 16.2658474844425 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0449238623473861 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630955_6631046:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 6632450 C/T 1 199 179 378 97.7564848996238 91.0682874520972 6.68819744752653 T:C C T 10 0.508761382413951 0.503936715397341 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000299424:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000527248:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000531760:exon_6632419_6632534:TAF10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 6632857 A/T 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 A:T A T 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632619_6633179:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000532344:exon_6632632_6633049:TAF10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 6703334 A/G 1 248 237 485 121.82717716134 120.576447632106 1.25072952923378 A:G A G 10 0.508761382413951 0.927660360502489 ENSG00000158042:ENST00000288937:exon_6702013_6703633:MRPL17;ENSG00000158042:ENST00000529958:exon_6703182_6703633:MRPL17 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 7686584 A/T 1 44 14 58 21.6144991737862 7.12265935379531 14.4918398199908 A:T A T 10 0.508761382413951 0.000114522144746453 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 8707083 G/A 1 18 15 33 8.84229511654888 7.63142073620926 1.21087438033962 A:G G A 10 0.508761382413951 0.729664048203589 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 8707233 C/T 1 840 838 1678 412.640438772281 426.342038462891 -13.7015996906097 T:C C T 10 0.508761382413951 0.509805081065767 ENSG00000166441:ENST00000314138:exon_8707225_8711419:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000524496:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000534599:exon_8707225_8707392:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000532359:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530022:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000526562:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000525981:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530913:exon_8707225_8707395:RPL27A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 8933064 G/A 1 20 45 65 9.82477235172098 22.8942622086278 -13.0694898569068 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00117425360233042 ENSG00000166452:ENST00000299576:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309377:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309357:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000426510:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529876:exon_8932736_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000525005:exon_8932739_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000524577:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534506:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000396648:exon_8932885_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534147:exon_8932990_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529942:exon_8933012_8933218:C11orf17 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 11292700 G/C 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 11354346 T/C 1 4 7 11 1.9649544703442 3.56132967689766 -1.59637520655346 T:C T C 10 0.508761382413951 0.379976164789140 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11354241_11354378:GALNTL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 13441126 A/G 1 6 13 19 2.94743170551629 6.61389797138136 -3.66646626586507 A:G A G 10 0.508761382413951 0.109973528080042 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13441040_13441292:BTBD10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 13443250 C/T 1 5 8 13 2.45619308793025 4.07009105931161 -1.61389797138136 T:C C T 10 0.508761382413951 0.416571082319480 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13443189_13443362:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13443189_13443385:BTBD10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 12 14 26 5.89486341103259 7.12265935379531 -1.22779594276273 T:C C T 10 0.508761382413951 0.697185970897261 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 18309464 G/A 1 12 18 30 5.89486341103259 9.15770488345112 -3.26284147241853 A:G G A 10 0.508761382413951 0.274744112838359 ENSG00000110756:ENST00000438420:exon_18309440_18309560:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000349215:exon_18309440_18309560:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000396253:exon_18309440_18309560:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000352460:exon_18309440_18309560:HPS5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 18327684 G/T 1 16 12 28 7.85981788137678 6.10513658896741 1.75468129240937 T:G G T 10 0.508761382413951 0.573255486177598 ENSG00000110756:ENST00000438420:exon_18327682_18327894:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000349215:exon_18327682_18327894:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000396253:exon_18327682_18327894:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000352460:exon_18327682_18327894:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000531848:exon_18327682_18327894:HPS5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 18357419 A/G 1 18 17 35 8.84229511654888 8.64894350103717 0.193351615511716 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000110768:ENST00000453096:exon_18357301_18357493:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000531757:exon_18357301_18357451:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000418116:exon_18357301_18357493:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000525831:exon_18357301_18357431:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000265963:exon_18357301_18357493:GTF2H1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 18422487 C/A 1 361 397 758 177.337140948564 201.978268818339 -24.6411278697748 A:C:G C A 10 0.508761382413951 0.0751003033041912 ENSG00000134333:ENST00000422447:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000396222:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000379412:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000445376:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000227157:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000478970:exon_18422384_18422517:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000486690:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000460405:exon_18422384_18422557:LDHA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 18555901 C/G 1 5 10 15 2.45619308793025 5.08761382413951 -2.63142073620926 C:G C G 10 0.508761382413951 0.203076095656838 ENSG00000151116:ENST00000396197:exon_18555877_18556000:UEVLD;ENSG00000151116:ENST00000379387:exon_18555877_18556000:UEVLD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 18633971 G/A 1 16 6 22 7.85981788137678 3.05256829448371 4.80724958689308 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0532657349158644 ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 28057957 T/C 1 17 25 42 8.35105649896283 12.7190345603488 -4.36797806138594 T:C T C 10 0.508761382413951 0.21687221529882 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 18 44 62 8.84229511654888 22.3855008262138 -13.543205709665 T:C T C 10 0.508761382413951 0.000550087468832577 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 33065394 C/T 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 T:C C T 10 0.508761382413951 0.335736887982477 ENSG00000176148:ENST00000532687:exon_33065296_33065658:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33065301_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528898:exon_33065296_33065482:TCP11L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 33076191 T/C 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 T:C T C 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33076139_33076271:TCP11L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 33106616 C/T 1 24 25 49 11.7897268220652 12.7190345603488 -0.929307738283597 T:C C T 10 0.508761382413951 0.886596358619732 ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33106496_33106666:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33106496_33106744:TCP11L1;ENSG00000176102:ENST00000528865:exon_33106578_33106835:CSTF3;ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33106130_33106835:CSTF3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 34460541 T/C 1 11 8 19 5.40362479344654 4.07009105931161 1.33353373413493 T:C T C 10 0.508761382413951 0.648578515706695 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34460472_34460626:CAT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 23 10 33 11.2984882044791 5.08761382413951 6.21087438033962 T:G T G 10 0.508761382413951 0.035996371845262 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 16 17 33 7.85981788137678 8.64894350103717 -0.789125619660382 T:C C T 10 0.508761382413951 0.862463507447866 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 6 9 15 2.94743170551629 4.57885244172556 -1.63142073620926 A:G G A 10 0.508761382413951 0.447467080617159 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 34991727 T/C 1 19 12 31 9.33353373413493 6.10513658896741 3.22839714516752 T:C T C 10 0.508761382413951 0.283338682080454 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34991686_34991833:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34991686_34991833:PDHX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 43472746 C/T 1 10 10 20 4.91238617586049 5.08761382413951 -0.175227648279019 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000052841:ENST00000039989:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525135:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525543:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000533554:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000418561:exon_43472730_43472815:TTC17 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 43876698 C/T 1 86 45 131 42.2465211124002 22.8942622086278 19.3522589037724 T:C C T 10 0.508761382413951 0.000832887695430484 ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 42 49 91 20.6320219386141 24.9293077382836 -4.29728579966954 T:G G T 10 0.508761382413951 0.402135640759942 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 44636833 G/A 1 87 117 204 42.7377597299863 59.5250817424323 -16.787322012446 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0206761140748570 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 253 257 510 124.28337024927 130.751675280385 -6.46830503111499 A:G A G 10 0.508761382413951 0.595150694370702 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 45832514 C/T 1 14 17 31 6.87734064620469 8.64894350103717 -1.77160285483248 T:C C T 10 0.508761382413951 0.591853548885225 ENSG00000181830:ENST00000442528:exon_45832327_45833109:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000456334:exon_45832327_45834561:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000530670:exon_45832327_45832642:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000314134:exon_45832327_45834566:SLC35C1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 57080882 C/T 1 16 6 22 7.85981788137678 3.05256829448371 4.80724958689308 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0532657349158644 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 58978258 T/C 1 47 16 63 23.0882150265443 8.14018211862322 14.9480329079211 T:C:G T C 10 0.508761382413951 0.000200002804420647 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 107 78 185 52.5625320817072 39.6833878282882 12.8791442534191 A:C:G G A 10 0.508761382413951 0.0657664355205567 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 60673868 T/C 1 50 49 99 24.5619308793025 24.9293077382836 -0.367376858981146 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60673836_60674056:PRPF19 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 60703777 G/A 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 A:G G A 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 60704213 C/T 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 T:C C T 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 61633182 C/T 1 87 72 159 42.7377597299863 36.6308195338045 6.1069401961818 T:C C T 10 0.508761382413951 0.342186064625011 ENSG00000134824:ENST00000257261:exon_61633110_61634826:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000522056:exon_61633110_61633429:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000278840:exon_61633110_61634826:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000523235:exon_61633110_61634819:FADS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 61724292 C/T 1 1 9 10 0.491238617586049 4.57885244172556 -4.08761382413951 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0104552856236359 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 61895741 A/G 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 A:G A G 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61895623_61895773:INCENP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 61897359 C/T 1 23 19 42 11.2984882044791 9.66646626586507 1.63202193861406 T:C C T 10 0.508761382413951 0.646115005090698 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 61908440 T/C 1 13 14 27 6.38610202861864 7.12265935379531 -0.736557325176676 T:C T C 10 0.508761382413951 0.84854117910617 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61908385_61908516:INCENP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 61913196 G/T 1 35 28 63 17.1933516155117 14.2453187075906 2.94803290792109 T:G G T 10 0.508761382413951 0.52905705086798 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61913101_61913223:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61913101_61913223:INCENP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 62287695 C/T 1 37 40 77 18.1758288506838 20.350455296558 -2.17462644587422 T:C C T 10 0.508761382413951 0.649589321796698 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 62296023 C/A 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 A:C C A 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 62529349 C/G 1 92 81 173 45.1939528179165 41.20967197553 3.98428084238648 C:G C G 10 0.508761382413951 0.594661698752796 ENSG00000168002:ENST00000301788:exon_62529267_62529376:POLR2G;ENSG00000168002:ENST00000533442:exon_62529267_62529376:POLR2G;ENSG00000168002:ENST00000525455:exon_62529267_62529376:POLR2G;ENSG00000168002:ENST00000524819:exon_62529267_62529656:POLR2G;ENSG00000168002:ENST00000531944:exon_62529267_62530338:POLR2G;ENSG00000168002:ENST00000527435:exon_62529109_62529376:POLR2G;ENSG00000168002:ENST00000531996:exon_62529267_62529376:POLR2G HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 62623837 C/A 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:C C A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000168003:ENST00000377891:exon_62623518_62623853:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377892:exon_62623518_62623853:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377889:exon_62623518_62623853:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377890:exon_62623574_62623853:SLC3A2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 64109208 G/C 0 50 1 51 24.5619308793025 0.508761382413951 24.0531694968885 T:G G T 10 0.508761382413951 6.38147275546104e-14 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 64680819 G/A 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 A:G G A 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64680738_64680867:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64680738_64680873:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64680738_64680873:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000227459:exon_64680738_64680873:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000461701:exon_64680738_64681972:ATG2A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 64799998 T/C 1 8 10 18 3.92990894068839 5.08761382413951 -1.15770488345112 T:C T C 10 0.508761382413951 0.642640691319775 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000525648:exon_64799903_64800023:SNX15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 64806270 C/T 1 12 5 17 5.89486341103259 2.54380691206975 3.35105649896283 T:C C T 10 0.508761382413951 0.144506573427302 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64802992_64806301:SNX15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 64807235 C/T 1 25 20 45 12.2809654396512 10.175227648279 2.10573779137221 T:C C T 10 0.508761382413951 0.554242561106102 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64807158_64808042:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64807158_64808044:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64807158_64807264:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64807158_64808042:SNX15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 64812857 G/A 0 11 0 11 5.40362479344654 0 5.40362479344654 G G 10 0.508761382413951 0.00099308469328535 ENSG00000168060:ENST00000358658:exon_64812295_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355369:exon_64812297_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000339885:exon_64812297_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526799:exon_64812698_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529274:exon_64812708_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528977:exon_64812708_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000340252:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355721:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000356632:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526516:exon_64812776_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000532802:exon_64812785_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530995:exon_64812823_64812929:NAALADL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 64813827 G/A 0 12 0 12 5.89486341103259 0 5.89486341103259 G G 10 0.508761382413951 0.000498199128582232 ENSG00000168060:ENST00000532450:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000358658:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355369:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000339885:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526799:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529274:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528977:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000340252:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355721:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000356632:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526516:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530995:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000533842:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000534568:exon_64813661_64813843:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000533340:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000531746:exon_64812946_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528884:exon_64813661_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000531174:exon_64813471_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529685:exon_64813661_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000453486:exon_64813608_64813834:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530139:exon_64813732_64813834:NAALADL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 20 20 40 9.82477235172098 10.175227648279 -0.350455296558039 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 64884052 G/A 1 15 8 23 7.36857926379074 4.07009105931161 3.29848820447913 A:G G A 10 0.508761382413951 0.211653680335550 ENSG00000174276:ENST00000310597:exon_64883876_64885170:ZNHIT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 65 65 130 31.9305101430932 33.0694898569068 -1.13897971381363 T:C C T 10 0.508761382413951 0.861083144223429 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 65266169 A/G 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 A:G A G 10 0.508761382413951 0.335736887982477 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 65269349 C/G 1 439 505 944 215.653753120276 256.924498119045 -41.2707449987697 A:T:C:G C G 10 0.508761382413951 0.0075761007834307 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 65338944 T/G 1 84 95 179 41.2640438772281 48.3323313293253 -7.06828745209722 T:G T G 10 0.508761382413951 0.296256582272634 ENSG00000173465:ENST00000309328:exon_65338862_65339241:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65338862_65339359:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000526877:exon_65338862_65339329:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000533115:exon_65338862_65339250:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527413:exon_65338862_65339239:SSSCA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 46 57 103 22.5969764089583 28.9993987975952 -6.40242238863695 A:C:G G A 10 0.508761382413951 0.236907662143362 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 41 33 74 20.140783321028 16.7891256196604 3.35165770136763 T:G T G 10 0.508761382413951 0.485977544564292 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 39 36 75 19.1583060858559 18.3154097669022 0.842896318953677 A:G G A 10 0.508761382413951 0.908227159873769 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 65380916 G/A 1 44 30 74 21.6144991737862 15.2628414724185 6.35165770136763 A:G G A 10 0.508761382413951 0.162776331061994 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65380489_65381713:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524856:exon_65380489_65382853:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000527304:exon_65376103_65381707:MAP3K11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 65384727 C/T 1 6 9 15 2.94743170551629 4.57885244172556 -1.63142073620926 T:C C T 10 0.508761382413951 0.447467080617159 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65384721_65384820:PCNXL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 65387012 C/T 1 16 15 31 7.85981788137678 7.63142073620926 0.22839714516752 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65387008_65387131:PCNXL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 65387378 T/A 1 18 4 22 8.84229511654888 2.0350455296558 6.80724958689308 A:T T A 10 0.508761382413951 0.00446916307978311 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65387225_65387403:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000531045:exon_65387329_65387403:PCNXL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 65632769 G/C 1 62 51 113 30.456794290335 25.9468305031115 4.50996378722354 C:G G C 10 0.508761382413951 0.399273934050432 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632691_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632691_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632691_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632691_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632691_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632586_65633115:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530282:exon_65632691_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533519:exon_65632639_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529742:exon_65632691_65632794:MUS81 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 66288810 G/T 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 T:G G T 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000174483:ENST00000419755:exon_66288741_66288847:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000526760:exon_66288741_66288847:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000533644:exon_66288741_66288847:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000318312:exon_66288741_66288847:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000335157:exon_66288741_66288847:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000533557:exon_66288741_66288847:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000525809:exon_66288741_66288847:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000455748:exon_66288741_66288847:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529955:exon_66288741_66288847:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000526035:exon_66288741_66288847:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000532908:exon_66288741_66288847:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529766:exon_66288741_66288847:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000524458:exon_66288741_66288847:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000533430:exon_66288741_66289083:BBS1;ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66288108_66288937:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66288553_66288937:ZDHHC24 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 67816463 G/C 1 77 50 127 37.8253735541258 25.4380691206975 12.3873044334282 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0327949158733520 ENSG00000110719:ENST00000265686:exon_67816346_67816464:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000532635:exon_67816346_67816464:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000525724:exon_67816346_67816464:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000533005:exon_67816346_67816464:TCIRG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 68030311 G/A 1 38 39 77 18.6670674682699 19.8416939141441 -1.17462644587422 A:G G A 10 0.508761382413951 0.820322429228294 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000533310:exon_68030199_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 68705674 C/A 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 A:C C A 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68705650_68705822:IGHMBP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 71146841 G/A 1 60 56 116 29.4743170551629 28.4906374151813 0.983679639981688 A:G G A 10 0.508761382413951 0.926067176408004 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 71152461 A/G 1 91 61 152 44.7027142003305 31.034444327251 13.6682698730795 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0283918679996633 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71152406_71152486:DHCR7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 71155153 A/G 1 31 24 55 15.2283971451675 12.2102731779348 3.0181239672327 A:G A G 10 0.508761382413951 0.42268646690346 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71155039_71155165:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 71185479 T/C 1 8 12 20 3.92990894068839 6.10513658896741 -2.17522764827902 T:C T C 10 0.508761382413951 0.376308412261741 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 71185518 T/C 1 5 11 16 2.45619308793025 5.59637520655346 -3.14018211862322 T:C T C 10 0.508761382413951 0.137380042418554 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 71941212 A/G 1 18 19 37 8.84229511654888 9.66646626586507 -0.824171149316186 A:G A G 10 0.508761382413951 0.869882749699634 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71941165_71941315:INPPL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 72408055 G/C 1 42 36 78 20.6320219386141 18.3154097669022 2.31661217171182 C:G G C 10 0.508761382413951 0.651150563534697 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72407594_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408028_72408240:ARAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 73785326 T/C 1 2 7 9 0.982477235172098 3.56132967689766 -2.57885244172556 T:C T C 10 0.508761382413951 0.103646439844753 ENSG00000168014:ENST00000334126:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313663:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313681:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000289350:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000414160:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000442398:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000415191:exon_73785298_73785645:C2CD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 75110589 A/G 1 438 378 816 215.162514502689 192.311802552473 22.850711950216 A:G A G 10 0.508761382413951 0.115093131441266 ENSG00000149273:ENST00000531188:exon_75110530_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000529173:exon_75110559_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000531810:exon_75110561_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000528439:exon_75110562_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530164:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530689:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530721:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000405680:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000422465:exon_75110564_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000278572:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000532872:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000534440:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527446:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000526608:exon_75110581_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527273:exon_75110586_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000524851:exon_75110587_75110621:RPS3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 75277757 C/G 1 4 15 19 1.9649544703442 7.63142073620926 -5.66646626586507 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0106132033167678 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 75279846 C/T 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 T:C C T 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 16 15 31 7.85981788137678 7.63142073620926 0.22839714516752 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 76255454 T/G 1 9 2 11 4.42114755827444 1.0175227648279 3.40362479344654 T:G T G 10 0.508761382413951 0.0658750571190468 ENSG00000158636:ENST00000524490:exon_76255303_76255866:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000343878:exon_76255303_76255866:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000334736:exon_76255303_76255866:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000393457:exon_76255303_76255866:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000524767:exon_76255303_76255866:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000533248:exon_76255303_76255866:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525919:exon_76255303_76255866:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525038:exon_76255303_76255866:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000529032:exon_76255303_76255866:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000531641:exon_76255303_76255912:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000534573:exon_76255303_76255527:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000532719:exon_76255303_76255866:C11orf30 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 77412851 A/G 1 17 30 47 8.35105649896283 15.2628414724185 -6.9117849734557 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0568092302628191 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77411766_77414578:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000528095:exon_77412164_77413540:RSF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 T:C T C 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 77790655 G/C 1 118 73 191 57.9661568751538 37.1395809162184 20.8265759589354 C:G G C 10 0.508761382413951 0.00291454100824747 ENSG00000151366:ENST00000528251:exon_77790625_77790890:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000530054:exon_77790625_77790911:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000281031:exon_77790625_77791265:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000527806:exon_77790625_77790887:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000534029:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000525085:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000528164:exon_77790625_77790907:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000324742:exon_77790625_77790931:NDUFC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 77825320 T/C 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532306:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532440:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000524925:exon_77825312_77825422:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000529139:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525755:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000530454:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525870:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532050:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000527099:exon_77825312_77825438:ALG8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 77920563 G/T 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 T:G G T 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530521:exon_77920494_77920597:USP35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 77920863 C/A 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 A:C C A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 77920930 A/G 1 2 7 9 0.982477235172098 3.56132967689766 -2.57885244172556 A:G A G 10 0.508761382413951 0.103646439844753 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 77924870 C/T 1 5 7 12 2.45619308793025 3.56132967689766 -1.10513658896741 T:C C T 10 0.508761382413951 0.574941367903584 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77924692_77925072:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77924692_77925184:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77924692_77925757:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77924692_77925465:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77924692_77925753:USP35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 77961419 C/A 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 A:C C A 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000033327:ENST00000304401:exon_77961203_77961446:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000340149:exon_77961203_77961446:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000361507:exon_77961203_77961446:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000528886:exon_77961317_77961446:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000530915:exon_77961403_77961446:GAB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 85374993 C/T 1 16 18 34 7.85981788137678 9.15770488345112 -1.29788700207433 T:C C T 10 0.508761382413951 0.732701821127198 ENSG00000137504:ENST00000490820:exon_85374568_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000528561:exon_85374568_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000260058:exon_85374859_85375697:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527529:exon_85374859_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000525639:exon_85374859_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000398294:exon_85374859_85375269:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527447:exon_85372110_85376146:CREBZF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 88027209 T/C 1 210 257 467 103.16010969307 130.751675280385 -27.5915655873151 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0108943474002741 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 88027393 A/C 1 154 179 333 75.6507471082516 91.0682874520972 -15.4175403438457 A:C A C 10 0.508761382413951 0.0999948081706363 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 93464175 A/C 1 31 29 60 15.2283971451675 14.7540800900046 0.474317055162942 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 93480545 T/C 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000182919:ENST00000528288:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000331239:exon_93480468_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000533585:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000528099:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000354421:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000527003:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000531650:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000530279:exon_93480468_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000527363:exon_93480468_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000526335:exon_93479651_93480614:C11orf54 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 44 40 84 21.6144991737862 20.350455296558 1.26404387722812 C:G C G 10 0.508761382413951 0.82763669016361 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 94862577 G/T 1 23 37 60 11.2984882044791 18.8241711493162 -7.52568294483706 T:C:G G T 10 0.508761382413951 0.0536690454256835 ENSG00000149218:ENST00000278505:exon_94861541_94865815:ENDOD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 95512060 A/G 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 A:G A G 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000077458:ENST00000358780:exon_95511986_95512121:FAM76B;ENSG00000077458:ENST00000398187:exon_95511986_95512121:FAM76B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 95712897 G/T 1 10 10 20 4.91238617586049 5.08761382413951 -0.175227648279019 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95709762_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95711440_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95712112_95713127:MAML2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 100863319 A/C 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 A:C A C 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000170647:ENST00000303130:exon_100862811_100864663:TMEM133 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 100863354 C/A 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 A:C C A 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000170647:ENST00000303130:exon_100862811_100864663:TMEM133 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 107917087 A/G 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000166266:ENST00000299351:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000393094:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000526303:exon_107916997_107917220:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000531427:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000532782:exon_107916997_107917096:CUL5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 108009660 C/A 1 24 35 59 11.7897268220652 17.8066483844883 -6.01692156242311 A:C C A 10 0.508761382413951 0.120325911998488 ENSG00000075239:ENST00000265838:exon_108009625_108009768:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000531813:exon_108009625_108009768:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000528370:exon_108009625_108009891:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000534773:exon_108009447_108009768:ACAT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 108043988 C/T 1 16 20 36 7.85981788137678 10.175227648279 -2.31540976690223 T:C C T 10 0.508761382413951 0.506237025660026 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000533535:exon_108041859_108044578:NPAT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 111636992 G/T 1 2 6 8 0.982477235172098 3.05256829448371 -2.07009105931161 T:G G T 10 0.508761382413951 0.172493759593104 ENSG00000137713:ENST00000311129:exon_111636972_111637106:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000412902:exon_111636972_111637169:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000426998:exon_111636972_111637110:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000527614:exon_111636972_111637151:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000427203:exon_111636972_111637169:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000534521:exon_111636972_111637092:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000341980:exon_111636972_111637092:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000393055:exon_111636972_111637106:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000534500:exon_111636972_111637091:PPP2R1B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 113194168 A/C 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000149292:ENST00000529221:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000429951:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000442859:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000531164:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000529850:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000436332:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000314756:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000278593:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000504025:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000520742:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000525965:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000464224:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000494714:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000393020:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000455306:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000489064:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000527781:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000483239:exon_113194010_113194173:TTC12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 116633608 G/T 1 21 26 47 10.316010969307 13.2277959427627 -2.9117849734557 T:G G T 10 0.508761382413951 0.466250994234346 ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 20 25 45 9.82477235172098 12.7190345603488 -2.89426220862779 T:C C T 10 0.508761382413951 0.456576191637768 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 117691386 G/A 1 9 3 12 4.42114755827444 1.52628414724185 2.89486341103259 A:G G A 10 0.508761382413951 0.146738110644472 ENSG00000137731:ENST00000532119:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000528014:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000292079:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000260287:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000534383:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000533281:exon_117691275_117691411:FXYD2;ENSG00000254844:ENST00000531850:exon_117691176_117691436:RP11-728F11.3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 117859209 G/A 1 8 11 19 3.92990894068839 5.59637520655346 -1.66646626586507 A:G G A 10 0.508761382413951 0.497078070201239 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000531365:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117857452_117859217:IL10RA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 118267133 A/C 1 22 23 45 10.8072495868931 11.7015117955209 -0.894262208627794 A:C A C 10 0.508761382413951 0.881747306266209 ENSG00000110344:ENST00000252108:exon_118267029_118269922:UBE4A;ENSG00000110344:ENST00000431736:exon_118267029_118269003:UBE4A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 121393684 G/A 1 9 5 14 4.42114755827444 2.54380691206975 1.87734064620469 A:G G A 10 0.508761382413951 0.424962478484933 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121393625_121393698:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532451:exon_121393625_121393698:SORL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 121475922 T/A 1 9 10 19 4.42114755827444 5.08761382413951 -0.666466265865068 A:T T A 10 0.508761382413951 0.821210319840976 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 2436 2770 5206 1196.65727243962 1409.26902928664 -212.611756847029 A:T:C:G A G 10 0.508761382413951 3.77279962509769e-09 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 38 30 68 18.6670674682699 15.2628414724185 3.40422599585133 A:G A G 10 0.508761382413951 0.467192075496405 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 70 69 139 34.3867032310234 35.1045353865626 -0.717832155539185 A:G G A 10 0.508761382413951 0.93250765014424 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 34 51 85 16.7021129979257 25.9468305031115 -9.24471750518583 T:C:G C G 10 0.508761382413951 0.0505792524512064 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 125769354 T/C 1 14 17 31 6.87734064620469 8.64894350103717 -1.77160285483248 T:C T C 10 0.508761382413951 0.591853548885225 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 130776524 T/C 1 10 15 25 4.91238617586049 7.63142073620926 -2.71903456034877 T:C T C 10 0.508761382413951 0.32021815508557 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130776520_130776616:SNX19 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 130784754 C/G 1 15 10 25 7.36857926379074 5.08761382413951 2.28096543965123 C:G C G 10 0.508761382413951 0.426148435268484 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 11 130784971 C/G 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 C:G C G 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 520947 A/C 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_520913_521144:CCDC77 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 547683 T/C 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 T:C T C 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_547501_547720:CCDC77 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 863505 A/C 1 11 5 16 5.40362479344654 2.54380691206975 2.85981788137678 A:C A C 10 0.508761382413951 0.211238572184989 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 863517 G/A 1 6 13 19 2.94743170551629 6.61389797138136 -3.66646626586507 A:G G A 10 0.508761382413951 0.109973528080042 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 993930 C/T 1 70 64 134 34.3867032310234 32.5607284744929 1.82597475653057 T:C C T 10 0.508761382413951 0.795696907463417 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 998338 A/G 1 13 13 26 6.38610202861864 6.61389797138136 -0.227795942762725 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_998306_998389:WNK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 51 48 99 25.0531694968885 24.4205463558696 0.632623141018854 A:G G A 10 0.508761382413951 0.920225631268088 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 4388084 C/G 1 53 55 108 26.0356467320606 27.9818760327673 -1.9462293007067 C:G C G 10 0.508761382413951 0.772962718820946 ENSG00000118971:ENST00000261254:exon_4387926_4388085:CCND2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 20 19 39 9.82477235172098 9.66646626586507 0.158306085855912 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 38 41 79 18.6670674682699 20.859216678972 -2.19214921070213 A:G A G 10 0.508761382413951 0.653645335524392 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 37 22 59 18.1758288506838 11.1927504131069 6.98307843757689 A:T:G A G 10 0.508761382413951 0.0896595591488605 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 6634818 G/A 1 23 23 46 11.2984882044791 11.7015117955209 -0.403023591041745 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6634749_6634882:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6634749_6634882:NCAPD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 44 45 89 21.6144991737862 22.8942622086278 -1.27976303484164 T:C C T 10 0.508761382413951 0.832397159534121 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 6639981 C/G 1 65 73 138 31.9305101430932 37.1395809162184 -5.20907077312523 C:G C G 10 0.508761382413951 0.395187621466772 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6639857_6639983:NCAPD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 6640519 G/A 1 150 218 368 73.6857926379074 110.909981366241 -37.224188728334 A:C:G G A 10 0.508761382413951 0.00010957078517605 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6640493_6641120:NCAPD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 6954812 C/T 1 8 6 14 3.92990894068839 3.05256829448371 0.877340646204686 T:C C T 10 0.508761382413951 0.79097715531601 ENSG00000111664:ENST00000229264:exon_6954750_6954966:GNB3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 44 36 80 21.6144991737862 18.3154097669022 3.29908940688392 A:G A G 10 0.508761382413951 0.502983119724395 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 6979199 G/A 1 8 2 10 3.92990894068839 1.0175227648279 2.91238617586049 A:G G A 10 0.508761382413951 0.109914731512069 ENSG00000111669:ENST00000474253:exon_6979181_6979300:TPI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 6980442 G/A 1 7 9 16 3.43867032310234 4.57885244172556 -1.14018211862322 A:G G A 10 0.508761382413951 0.623757634359657 ENSG00000111671:ENST00000523102:exon_6980099_6980483:SPSB2;ENSG00000111671:ENST00000524270:exon_6980099_6980483:SPSB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 6980482 C/T 1 8 9 17 3.92990894068839 4.57885244172556 -0.648943501037166 T:C C T 10 0.508761382413951 0.811742532730089 ENSG00000111671:ENST00000523102:exon_6980099_6980483:SPSB2;ENSG00000111671:ENST00000524270:exon_6980099_6980483:SPSB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 7014766 T/C 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 T:C T C 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000010626:ENST00000433346:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000449039:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000457146:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000486401:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000431207:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000415834:exon_7014749_7014923:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7014749_7014923:LRRC23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 7015707 G/T 1 4 10 14 1.9649544703442 5.08761382413951 -3.12265935379531 T:G G T 10 0.508761382413951 0.112778665730966 ENSG00000010626:ENST00000433346:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000457146:exon_7015573_7015782:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000486401:exon_7015573_7015919:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000431207:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7015573_7015826:LRRC23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 7044943 G/A 1 47 46 93 23.0882150265443 23.4030235910417 -0.31480856449744 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7044710_7046724:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7044710_7046724:ATN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 7249598 T/C 1 5 8 13 2.45619308793025 4.07009105931161 -1.61389797138136 T:C T C 10 0.508761382413951 0.416571082319480 ENSG00000139178:ENST00000266542:exon_7247153_7249759:C1RL;ENSG00000139178:ENST00000396661:exon_7249181_7249759:C1RL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 8074192 G/A 1 34 19 53 16.7021129979257 9.66646626586507 7.0356467320606 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0553723431591926 ENSG00000059804:ENST00000075120:exon_8071826_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000486749:exon_8071827_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000469295:exon_8073667_8074227:SLC2A3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 9833524 C/G 1 45 46 91 22.1057377913722 23.4030235910417 -1.29728579966954 C:G C G 10 0.508761382413951 0.834190068616573 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 9833628 C/T 1 136 116 252 66.8084519917027 59.0163203600183 7.79213163168436 T:C C T 10 0.508761382413951 0.344823125862049 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 1113 1108 2221 546.748581373273 563.707611714658 -16.9590303413851 T:C:G C G 10 0.508761382413951 0.483726395330004 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 16516994 G/A 1 73 160 233 35.8604190837816 81.4018211862322 -45.5414021024506 A:G G A 10 0.508761382413951 2.34011571509382e-09 ENSG00000008394:ENST00000010404:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396210:exon_16516729_16517342:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396209:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396207:exon_16516729_16517343:MGST1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 41 39 80 20.140783321028 19.8416939141441 0.299089406883922 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 22602796 A/G 1 17 32 49 8.35105649896283 16.2803642372464 -7.9293077382836 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0310709040797196 ENSG00000111731:ENST00000333957:exon_22601541_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000446597:exon_22602479_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000396028:exon_22602479_22602825:KIAA0528 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 25242595 C/G 1 71 47 118 34.8779418486095 23.9117849734557 10.9661568751538 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0527155303428887 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242548_25242611:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242548_25242611:LRMP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 127 121 248 62.3873044334282 61.5601272720881 0.82717716134016 A:C:G G C 10 0.508761382413951 0.94939095615008 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 27521255 C/T 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 T:C C T 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000029153:ENST00000261178:exon_27521195_27521345:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000266503:exon_27521195_27521345:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000311001:exon_27521195_27521345:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000457040:exon_27521195_27521345:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000395901:exon_27521195_27521345:ARNTL2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 29486745 T/C 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29486565_29487005:FAR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 31604928 G/C 1 38 37 75 18.6670674682699 18.8241711493162 -0.157103681046323 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 31605044 G/T 1 33 51 84 16.2108743803396 25.9468305031115 -9.73595612277188 T:G G T 10 0.508761382413951 0.0378315023616587 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 31648826 C/T 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 T:C C T 10 0.508761382413951 0.770813353200887 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31648744_31648853:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31648744_31648853:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31648744_31648853:DENND5B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 32134815 G/A 1 25 38 63 12.2809654396512 19.3329325317301 -7.05196709207891 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0787904755566701 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 32134943 A/G 1 34 43 77 16.7021129979257 21.8767394437999 -5.17462644587422 A:G A G 10 0.508761382413951 0.255495615260079 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 39695445 G/A 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 A:G G A 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000139116:ENST00000341813:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000395670:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361418:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361961:exon_39695282_39695481:KIF21A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 42554505 A/G 1 24 24 48 11.7897268220652 12.2102731779348 -0.420546355869647 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000015153:ENST00000327791:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000380790:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000442791:exon_42552837_42554628:YAF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 44148259 T/C 1 2 7 9 0.982477235172098 3.56132967689766 -2.57885244172556 T:C T C 10 0.508761382413951 0.103646439844753 ENSG00000129317:ENST00000416848:exon_44148139_44149064:PUS7L;ENSG00000129317:ENST00000344862:exon_44148139_44149064:PUS7L;ENSG00000129317:ENST00000431332:exon_44148139_44149064:PUS7L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 44180295 G/A 1 19 31 50 9.33353373413493 15.7716028548325 -6.43806912069755 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0886747817391203 ENSG00000198001:ENST00000448290:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000431837:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000440781:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000356669:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000446056:exon_44180202_44180360:IRAK4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 46320421 G/A 1 86 85 171 42.2465211124002 43.2447175051858 -0.998196392785616 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.878823080050015 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 46321514 A/T 1 60 55 115 29.4743170551629 27.9818760327673 1.49244102239564 A:T A T 10 0.508761382413951 0.852133623517991 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 48238757 A/G 1 7 9 16 3.43867032310234 4.57885244172556 -1.14018211862322 A:G A G 10 0.508761382413951 0.623757634359657 ENSG00000111424:ENST00000395324:exon_48235322_48238788:VDR;ENSG00000111424:ENST00000229022:exon_48235322_48238788:VDR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 23 13 36 11.2984882044791 6.61389797138136 4.68459023309777 T:C C T 10 0.508761382413951 0.134634213050837 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 48539482 T/G 1 89 82 171 43.7202369651584 41.718433357944 2.00180360721438 T:G T G 10 0.508761382413951 0.818601474020058 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000312352:exon_48539347_48539488:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000443538:exon_48539347_48539887:PFKM HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 48737245 A/C 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 A:C A C 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000167528:ENST00000301042:exon_48733911_48737510:ZNF641;ENSG00000167528:ENST00000448928:exon_48733911_48737510:ZNF641 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 33 21 54 16.2108743803396 10.683989030693 5.52688534964665 T:G G T 10 0.508761382413951 0.136890705016616 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 49086963 G/A 1 6 10 16 2.94743170551629 5.08761382413951 -2.14018211862322 A:G G A 10 0.508761382413951 0.324879272681718 ENSG00000129315:ENST00000261900:exon_49086752_49088219:CCNT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 50236848 T/C 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000186666:ENST00000333924:exon_50236637_50236875:BCDIN3D HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 50537815 A/G 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50537735_50537840:LASS5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 50616197 T/C 1 37 39 76 18.1758288506838 19.8416939141441 -1.66586506346027 T:C T C 10 0.508761382413951 0.731683997699513 ENSG00000050405:ENST00000394943:exon_50615804_50616268:LIMA1;ENSG00000050405:ENST00000341247:exon_50615804_50616268:LIMA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 54110197 A/G 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54110044_54110199:CALCOCO1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 54575458 T/C 1 22 20 42 10.8072495868931 10.175227648279 0.632021938614059 T:C T C 10 0.508761382413951 0.878401052374126 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 54905815 C/G 1 23 26 49 11.2984882044791 13.2277959427627 -1.9293077382836 C:G C G 10 0.508761382413951 0.66868427616436 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54905733_54905889:NCKAP1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 55355033 C/T 1 25 25 50 12.2809654396512 12.7190345603488 -0.438069120697548 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55354989_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 55368245 G/A 1 7 12 19 3.43867032310234 6.10513658896741 -2.66646626586507 A:G G A 10 0.508761382413951 0.256095565288392 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55368184_55368342:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 55368368 G/A 1 19 14 33 9.33353373413493 7.12265935379531 2.21087438033962 A:G G A 10 0.508761382413951 0.489070201574934 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 56151291 T/C 1 29 25 54 14.2459199099954 12.7190345603488 1.52688534964665 T:C T C 10 0.508761382413951 0.685975762819668 ENSG00000205323:ENST00000444631:exon_56151167_56151337:SARNP;ENSG00000205323:ENST00000336133:exon_56151058_56151337:SARNP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 56636975 C/G 0 18 0 18 8.84229511654888 0 8.84229511654888 C C 10 0.508761382413951 7.99001513299551e-06 ENSG00000139645:ENST00000267116:exon_56631591_56637176:ANKRD52;ENSG00000139645:ENST00000417002:exon_56636517_56637176:ANKRD52;ENSG00000139645:ENST00000425794:exon_56636517_56637176:ANKRD52 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 56711371 C/T 1 26 18 44 12.7722040572373 9.15770488345112 3.61449917378616 T:C C T 10 0.508761382413951 0.294479080687978 ENSG00000135473:ENST00000425394:exon_56710718_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000379495:exon_56710721_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000257931:exon_56710721_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000440411:exon_56710721_56711427:PAN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 56743044 G/A 1 15 23 38 7.36857926379074 11.7015117955209 -4.33293253173014 A:G G A 10 0.508761382413951 0.194274954755678 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56742947_56743045:STAT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 27 29 56 13.2634426748233 14.7540800900046 -1.49063741518125 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.789528244137533 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 56825382 C/T 1 9 13 22 4.42114755827444 6.61389797138136 -2.19275041310692 T:C C T 10 0.508761382413951 0.398108590862778 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56825255_56825388:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56825255_56825388:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56825255_56825388:TIMELESS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 56865338 A/G 1 8 7 15 3.92990894068839 3.56132967689766 0.368579263790735 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000135423:ENST00000479952:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000390288:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000311966:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000424141:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000486433:exon_56864738_56865427:GLS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 57146069 T/G 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 T:G T G 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57145980_57146146:PRIM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 57625550 G/T 1 188 220 408 92.3528601061772 111.927504131069 -19.574644024892 T:C:G G T 10 0.508761382413951 0.0535535460182428 ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57625496_57625696:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57625496_57625696:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57625496_57625696:SHMT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 57637593 G/A 1 21 25 46 10.316010969307 12.7190345603488 -2.40302359104174 A:G G A 10 0.508761382413951 0.555909633342578 ENSG00000185482:ENST00000332782:exon_57637242_57637693:STAC3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 29 22 51 14.2459199099954 11.1927504131069 3.0531694968885 A:T T A 10 0.508761382413951 0.404754488123582 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 65146532 C/T 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000135677:ENST00000258145:exon_65146478_65146537:GNS;ENSG00000135677:ENST00000418919:exon_65146478_65146537:GNS;ENSG00000135677:ENST00000432885:exon_65146478_65146537:GNS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 106 86 192 52.0712934641212 43.7534788875998 8.31781457652141 A:G G A 10 0.508761382413951 0.24824528317918 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 68708761 C/T 1 11 17 28 5.40362479344654 8.64894350103717 -3.24531870759063 T:C C T 10 0.508761382413951 0.258527448393057 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68708728_68709045:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68708728_68709045:MDM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 68709892 C/T 1 8 13 21 3.92990894068839 6.61389797138136 -2.68398903069297 T:C C T 10 0.508761382413951 0.279281497621514 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68709858_68710033:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68709858_68710033:MDM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 68720627 G/A 1 7 10 17 3.43867032310234 5.08761382413951 -1.64894350103717 A:G G A 10 0.508761382413951 0.473990855338058 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68720437_68720801:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68720437_68720801:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000430606:exon_68718787_68720801:MDM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 68724951 G/T 1 8 4 12 3.92990894068839 2.0350455296558 1.89486341103259 T:G G T 10 0.508761382413951 0.388585368391447 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68724887_68725001:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68724887_68725001:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000430606:exon_68724887_68725001:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000393543:exon_68724887_68725001:MDM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 69085801 C/T 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 T:C C T 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69085748_69085892:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69085748_69085892:NUP107 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 69090684 A/G 1 9 9 18 4.42114755827444 4.57885244172556 -0.157704883451117 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69090599_69090702:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69090599_69090702:NUP107 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 72164395 C/T 1 30 28 58 14.7371585275815 14.2453187075906 0.491839819990844 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 26 35 61 12.7722040572373 17.8066483844883 -5.03444432725101 C:G C G 10 0.508761382413951 0.203105330071440 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 94243853 C/T 1 12 9 21 5.89486341103259 4.57885244172556 1.31601096930703 T:C C T 10 0.508761382413951 0.664655217869201 ENSG00000169372:ENST00000332896:exon_94243746_94244527:CRADD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 94631496 C/T 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94631440_94631579:PLXNC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 94673277 G/A 1 9 2 11 4.42114755827444 1.0175227648279 3.40362479344654 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0658750571190468 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94673248_94673425:PLXNC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 94761701 T/C 1 10 7 17 4.91238617586049 3.56132967689766 1.35105649896283 T:C T C 10 0.508761382413951 0.629969031107128 ENSG00000173588:ENST00000339839:exon_94761570_94761719:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397809:exon_94761570_94761719:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397807:exon_94761570_94761719:CCDC41 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 94972290 C/T 1 19 11 30 9.33353373413493 5.59637520655346 3.73715852758147 T:C C T 10 0.508761382413951 0.202564131606526 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94972170_94972305:TMCC3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 94975799 G/A 1 17 14 31 8.35105649896283 7.12265935379531 1.22839714516752 A:G G A 10 0.508761382413951 0.721386502145606 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 94976084 T/C 1 22 19 41 10.8072495868931 9.66646626586507 1.14078332102801 T:C T C 10 0.508761382413951 0.756727408558997 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 94976159 T/C 1 25 14 39 12.2809654396512 7.12265935379531 5.15830608585591 T:C T C 10 0.508761382413951 0.110234604636184 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 100452564 G/T 1 18 18 36 8.84229511654888 9.15770488345112 -0.315409766902235 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000111647:ENST00000279907:exon_100451807_100453311:UHRF1BP1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 102455729 G/A 1 28 20 48 13.7546812924094 10.175227648279 3.57945364413035 A:G G A 10 0.508761382413951 0.315896780165955 ENSG00000120860:ENST00000240079:exon_102455690_102455899:CCDC53 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 104327979 C/T 1 633 616 1249 310.954044931969 313.397011566994 -2.44296663502473 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.909878441768107 ENSG00000166598:ENST00000299767:exon_104327734_104328065:HSP90B1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 104376693 G/A 1 8 27 35 3.92990894068839 13.7365573251767 -9.80664838448828 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00103053056356057 ENSG00000139372:ENST00000392872:exon_104376577_104376712:TDG;ENSG00000139372:ENST00000266775:exon_104376577_104376712:TDG HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 104709559 C/T 1 17 12 29 8.35105649896283 6.10513658896741 2.24591990999542 T:C C T 10 0.508761382413951 0.460273177176109 ENSG00000198431:ENST00000525566:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000429002:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526266:exon_104709555_104709604:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000503506:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526691:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531691:exon_104709555_104709679:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000388854:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526390:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531689:exon_104709555_104709610:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000529546:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526580:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000354940:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000524698:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527688:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000378070:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527335:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000397736:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000427956:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526950:exon_104709555_104709674:TXNRD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 106903321 T/C 1 11 9 20 5.40362479344654 4.57885244172556 0.824772351720981 T:C T C 10 0.508761382413951 0.824343209360058 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106903198_106903974:POLR3B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 107360943 G/A 1 23 21 44 11.2984882044791 10.683989030693 0.614499173786157 A:G G A 10 0.508761382413951 0.88120115288746 ENSG00000151135:ENST00000280756:exon_107360889_107360958:C12orf23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 112191641 G/A 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 A:G G A 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000512792:exon_112191511_112191719:ACAD10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 112460147 T/G 1 230 204 434 112.984882044791 103.787322012446 9.19756003234528 T:G T G 10 0.508761382413951 0.38773184859196 ENSG00000089248:ENST00000261735:exon_112459954_112461024:ERP29;ENSG00000089248:ENST00000455836:exon_112459954_112461024:ERP29 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 112477055 T/C 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 T:C T C 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000111300:ENST00000261745:exon_112477033_112477143:NAA25 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 113386779 C/G 1 23 16 39 11.2984882044791 8.14018211862322 3.15830608585591 C:G C G 10 0.508761382413951 0.339684591138642 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113386666_113387010:OAS3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 113398919 G/A 1 22 23 45 10.8072495868931 11.7015117955209 -0.894262208627794 A:G G A 10 0.508761382413951 0.881747306266209 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113398876_113399051:OAS3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 113403684 C/T 1 7 13 20 3.43867032310234 6.61389797138136 -3.17522764827902 T:C C T 10 0.508761382413951 0.182776485911971 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113403549_113403834:OAS3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 113424893 C/G 1 74 61 135 36.3516577013676 31.034444327251 5.31721337411662 T:C:G C G 10 0.508761382413951 0.389680883654306 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 113596736 G/A 1 97 88 185 47.6501459058468 44.7710016524277 2.87914425341907 A:G G A 10 0.508761382413951 0.713280943700066 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113594986_113596917:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113594986_113596914:DDX54 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 113623241 C/G 1 29 37 66 14.2459199099954 18.8241711493162 -4.57825123932076 C:G C G 10 0.508761382413951 0.270246785683912 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113623083_113623284:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113623083_113623284:DDX54 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 114261053 G/A 1 11 9 20 5.40362479344654 4.57885244172556 0.824772351720981 A:G G A 10 0.508761382413951 0.824343209360058 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114259863_114261126:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114261014_114261126:RBM19 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 13 8 21 6.38610202861864 4.07009105931161 2.31601096930703 T:C C T 10 0.508761382413951 0.384857904990228 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 132416780 C/A 1 30 13 43 14.7371585275815 6.61389797138136 8.12326055620011 A:C C A 10 0.508761382413951 0.0143331153955932 ENSG00000177192:ENST00000443358:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000440818:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000376649:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000322060:exon_132416720_132416857:PUS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 132508389 A/G 1 8 4 12 3.92990894068839 2.0350455296558 1.89486341103259 A:G A G 10 0.508761382413951 0.388585368391447 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132508322_132508486:EP400 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 132625960 G/A 1 22 19 41 10.8072495868931 9.66646626586507 1.14078332102801 A:G G A 10 0.508761382413951 0.756727408558997 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132625820_132625965:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132625820_132625965:DDX51 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 21 24 45 10.316010969307 12.2102731779348 -1.89426220862779 A:G G A 10 0.508761382413951 0.655302540475603 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 14 18 32 6.87734064620469 9.15770488345112 -2.28036423724643 T:C T C 10 0.508761382413951 0.481273059851305 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 133378440 C/T 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 T:C C T 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133378353_133378555:GOLGA3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 38 20 58 18.6670674682699 10.175227648279 8.49183981999084 A:T:C T C 10 0.508761382413951 0.0347049689294311 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 133732624 C/T 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 A:T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000090612:ENST00000248211:exon_133732089_133736047:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000426665:exon_133732089_133733554:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000402932:exon_133732533_133733497:ZNF268 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 12 133778796 C/T 1 18 10 28 8.84229511654888 5.08761382413951 3.75468129240937 T:C C T 10 0.508761382413951 0.186823243553659 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133778730_133778955:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133778730_133781730:ZNF268 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 1 391 4 395 192.074299476145 2.0350455296558 190.039253946489 T:C:G T C 10 0.508761382413951 1.46029476300762e-107 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 24243204 G/A 1 18 5 23 8.84229511654888 2.54380691206975 6.29848820447913 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0108886055088929 ENSG00000127863:ENST00000248484:exon_24242831_24243236:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000403372:exon_24242831_24243263:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382258:exon_24242831_24243412:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382263:exon_24242831_24243236:TNFRSF19 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 25000617 C/G 1 70 77 147 34.3867032310234 39.1746264458742 -4.78792321485079 C:G C G 10 0.508761382413951 0.458204721870791 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25000604_25000736:PARP4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 25009297 G/T 1 103 61 164 50.5975776113631 31.034444327251 19.563133284112 T:G G T 10 0.508761382413951 0.00227098067664571 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 25009441 C/G 1 57 52 109 28.0006012024048 26.4555918855255 1.54500931687934 C:G C G 10 0.508761382413951 0.774829082546028 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 25009485 C/G 1 43 32 75 21.1232605562001 16.2803642372464 4.84289631895368 A:C:G C G 10 0.508761382413951 0.298929440058967 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 25052261 C/T 1 11 11 22 5.40362479344654 5.59637520655346 -0.192750413106921 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25052231_25052414:PARP4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 25075859 C/T 1 8 10 18 3.92990894068839 5.08761382413951 -1.15770488345112 T:C C T 10 0.508761382413951 0.642640691319775 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25075771_25075972:PARP4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 25480295 C/T 1 12 24 36 5.89486341103259 12.2102731779348 -6.31540976690223 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0443691620103385 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 25825889 T/C 1 14 10 24 6.87734064620469 5.08761382413951 1.78972682206518 T:C T C 10 0.508761382413951 0.542761494383684 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25825787_25825913:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25825787_25825913:MTMR6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 25831888 T/C 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 T:C T C 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25831874_25831983:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25831874_25831983:MTMR6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 25876011 G/A 1 9 16 25 4.42114755827444 8.14018211862322 -3.71903456034877 A:G G A 10 0.508761382413951 0.162748026974591 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25875662_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000481980:exon_25875694_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000490231:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000480187:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000460326:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000465068:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25875771_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000495460:exon_25875783_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25875785_25876018:NUPL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 25901165 C/G 1 5 14 19 2.45619308793025 7.12265935379531 -4.66646626586507 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0384390649292403 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000394327:exon_25901054_25901172:NUPL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 33017043 T/C 1 7 10 17 3.43867032310234 5.08761382413951 -1.64894350103717 T:C T C 10 0.508761382413951 0.473990855338058 ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33016525_33017553:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 33017869 T/C 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 T:C T C 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33017792_33018267:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000505213:exon_33017834_33018263:N4BP2L2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 33232435 A/G 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000083642:ENST00000315596:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000482955:exon_33232376_33232486:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000400481:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000421084:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000456898:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000498550:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000450460:exon_33232376_33232462:PDS5B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 33703656 T/C 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 T:C T C 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33703066_33704426:STARD13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 39598616 G/A 1 9 1 10 4.42114755827444 0.508761382413951 3.91238617586049 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0216733970401453 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000496138:exon_39598614_39598693:C13orf23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 39603498 G/A 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 A:G G A 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000436678:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000418503:exon_39603418_39603512:C13orf23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 39622075 T/C 1 17 12 29 8.35105649896283 6.10513658896741 2.24591990999542 T:C T C 10 0.508761382413951 0.460273177176109 ENSG00000188811:ENST00000470258:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379600:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379599:exon_39621811_39624246:NHLRC3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 40229957 T/A 1 2 6 8 0.982477235172098 3.05256829448371 -2.07009105931161 A:T T A 10 0.508761382413951 0.172493759593104 ENSG00000133103:ENST00000255468:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000416691:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000422759:exon_40229799_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000455146:exon_40229814_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000356576:exon_40229881_40230016:COG6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 41323397 C/T 1 28 31 59 13.7546812924094 15.7716028548325 -2.01692156242311 T:C C T 10 0.508761382413951 0.605606705543115 ENSG00000102738:ENST00000498078:exon_41323274_41323749:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41323274_41323417:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000461675:exon_41323274_41323417:MRPS31 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 41331026 C/G 1 56 41 97 27.5093625848187 20.859216678972 6.65014590584676 C:G C G 10 0.508761382413951 0.187642835494062 ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41331009_41331149:MRPS31 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 41515286 T/A 1 57 64 121 28.0006012024048 32.5607284744929 -4.56012727208807 A:T T A 10 0.508761382413951 0.414733725541465 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41515057_41515506:ELF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 41517985 A/G 1 25 49 74 12.2809654396512 24.9293077382836 -12.6483422986324 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00349003295483085 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41517978_41518061:ELF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 41533052 T/C 1 22 31 53 10.8072495868931 15.7716028548325 -4.9643532679394 T:C T C 10 0.508761382413951 0.215944311603585 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41532972_41533152:ELF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 42032572 T/C 1 9 7 16 4.42114755827444 3.56132967689766 0.859817881376784 T:C T C 10 0.508761382413951 0.804101251762597 ENSG00000102760:ENST00000379359:exon_42032421_42032606:C13orf15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 42267090 A/G 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000102763:ENST00000251030:exon_42266998_42267108:KIAA0564;ENSG00000102763:ENST00000379310:exon_42266998_42267108:KIAA0564;ENSG00000102763:ENST00000478987:exon_42266998_42267108:KIAA0564 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 42442546 A/G 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 A:G A G 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000102763:ENST00000251030:exon_42442482_42442613:KIAA0564;ENSG00000102763:ENST00000379310:exon_42442482_42442613:KIAA0564;ENSG00000102763:ENST00000281496:exon_42442482_42442613:KIAA0564;ENSG00000102763:ENST00000398857:exon_42442482_42442613:KIAA0564 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 43148565 T/C 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 T:C T C 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000120659:ENST00000239849:exon_43148289_43148658:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000398795:exon_43148291_43148658:TNFSF11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 43462607 G/A 1 53 37 90 26.0356467320606 18.8241711493162 7.21147558274441 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.140272307713228 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 0 74 0 74 36.3516577013676 0 36.3516577013676 G G 10 0.508761382413951 2.05756164324224e-22 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 45563464 G/C 1 6 12 18 2.94743170551629 6.10513658896741 -3.15770488345112 C:G G C 10 0.508761382413951 0.160737760390294 ENSG00000083635:ENST00000379161:exon_45563160_45563618:NUFIP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 46067593 G/A 1 5 7 12 2.45619308793025 3.56132967689766 -1.10513658896741 A:G G A 10 0.508761382413951 0.574941367903584 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46067482_46067621:COG3;ENSG00000136152:ENST00000465942:exon_46067482_46067621:COG3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 46541673 T/A 1 21 36 57 10.316010969307 18.3154097669022 -7.99939879759521 A:T T A 10 0.508761382413951 0.0459509256689125 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46541639_46542163:ZC3H13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 46562935 A/G 1 26 37 63 12.7722040572373 18.8241711493162 -6.05196709207891 A:G A G 10 0.508761382413951 0.132296936114495 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46562922_46563232:ZC3H13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 46701678 G/A 1 1581 1755 3336 776.648254403544 892.876226136484 -116.22797173294 A:T:C:G G A 10 0.508761382413951 5.85305616497739e-05 ENSG00000136167:ENST00000323076:exon_46700061_46701858:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000435666:exon_46700061_46701858:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000398576:exon_46700096_46701858:LCP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 50066042 G/A 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 A:G G A 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50065868_50066306:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50065868_50066297:SETDB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 12 16 28 5.89486341103259 8.14018211862322 -2.24531870759063 T:C T C 10 0.508761382413951 0.452217834143186 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 51530496 A/G 1 16 20 36 7.85981788137678 10.175227648279 -2.31540976690223 A:C:G A G 10 0.508761382413951 0.506237025660026 ENSG00000136104:ENST00000336617:exon_51530494_51530866:RNASEH2B;ENSG00000136104:ENST00000465541:exon_51530494_51530638:RNASEH2B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 51530530 G/T 1 19 8 27 9.33353373413493 4.07009105931161 5.26344267482332 T:G G T 10 0.508761382413951 0.0532045534453499 ENSG00000136104:ENST00000336617:exon_51530494_51530866:RNASEH2B;ENSG00000136104:ENST00000465541:exon_51530494_51530638:RNASEH2B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 52343391 C/T 1 7 1 8 3.43867032310234 0.508761382413951 2.92990894068839 T:C C T 10 0.508761382413951 0.070648384509694 ENSG00000102796:ENST00000444610:exon_52343292_52343429:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000218981:exon_52342131_52343429:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000469957:exon_52343292_52343429:DHRS12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 73352420 T/A 1 12 12 24 5.89486341103259 6.10513658896741 -0.210273177934823 A:T T A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73352325_73352518:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73352325_73352518:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73352325_73352518:DIS3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 77459684 C/T 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 T:C C T 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000178695:ENST00000377474:exon_77454312_77460525:KCTD12;ENSG00000178695:ENST00000317765:exon_77459280_77460540:KCTD12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 77632470 C/T 1 12 11 23 5.89486341103259 5.59637520655346 0.298488204479128 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77632353_77632541:MYCBP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 95273447 G/A 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 A:G G A 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000152749:ENST00000376958:exon_95273332_95273489:GPR180 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 95714976 C/T 1 16 9 25 7.85981788137678 4.57885244172556 3.28096543965123 T:C C T 10 0.508761382413951 0.231316073459551 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95714958_95715113:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95714958_95715113:ABCC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 95727780 T/C 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 T:C T C 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95727686_95727805:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95727686_95727805:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000467685:exon_95727686_95728273:ABCC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 95863008 C/A 1 5 8 13 2.45619308793025 4.07009105931161 -1.61389797138136 A:C:G C A 10 0.508761382413951 0.416571082319480 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95862946_95863035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95862946_95863035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95862946_95863035:ABCC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 103418728 A/G 1 13 28 41 6.38610202861864 14.2453187075906 -7.85921667897199 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0181431668752133 ENSG00000151287:ENST00000376027:exon_103418340_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376019:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376022:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376021:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376032:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376029:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376031:exon_103418467_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000455589:exon_103418467_103418930:C13orf27 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 65 73 138 31.9305101430932 37.1395809162184 -5.20907077312523 C:G G C 10 0.508761382413951 0.395187621466772 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 113527967 G/A 1 5 7 12 2.45619308793025 3.56132967689766 -1.10513658896741 A:G G A 10 0.508761382413951 0.574941367903584 ENSG00000068650:ENST00000487903:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375630:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375645:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000283558:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000471555:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000419631:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000495930:exon_113527746_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000493489:exon_113527817_113527990:ATP11A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 114157846 G/A 1 5 11 16 2.45619308793025 5.59637520655346 -3.14018211862322 A:G G A 10 0.508761382413951 0.137380042418554 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114157811_114157903:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114157811_114157903:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114157811_114157903:TMCO3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 13 114175038 G/A 1 12 4 16 5.89486341103259 2.0350455296558 3.85981788137678 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0775291226144439 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 20770036 T/C 1 10 7 17 4.91238617586049 3.56132967689766 1.35105649896283 T:C T C 10 0.508761382413951 0.629969031107128 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20769992_20770124:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20769992_20770124:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20769992_20770124:TTC5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 33 24 57 16.2108743803396 12.2102731779348 4.00060120240479 T:C T C 10 0.508761382413951 0.353878090747161 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 30 35 65 14.7371585275815 17.8066483844883 -3.06948985690681 A:C A C 10 0.508761382413951 0.459412279658642 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 5 9 14 2.45619308793025 4.57885244172556 -2.12265935379531 C:G G C 10 0.508761382413951 0.294178716907209 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 20841707 C/T 1 5 8 13 2.45619308793025 4.07009105931161 -1.61389797138136 T:C C T 10 0.508761382413951 0.416571082319480 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20841666_20841742:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20841666_20841742:TEP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 14 14 28 6.87734064620469 7.12265935379531 -0.245318707590627 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 20920340 A/G 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 A:G A G 10 0.508761382413951 0.219001271230579 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 21928338 C/T 1 42 20 62 20.6320219386141 10.175227648279 10.456794290335 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0104785309767911 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 21928383 T/C 1 29 4 33 14.2459199099954 2.0350455296558 12.2108743803396 T:C T C 10 0.508761382413951 1.19592355785109e-05 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 21928397 A/G 0 22 0 22 10.8072495868931 0 10.8072495868931 A A 10 0.508761382413951 5.10988106685346e-07 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 21928398 T/C 0 23 0 23 11.2984882044791 0 11.2984882044791 T T 10 0.508761382413951 2.57139378126959e-07 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 21945415 A/G 1 5 9 14 2.45619308793025 4.57885244172556 -2.12265935379531 A:G A G 10 0.508761382413951 0.294178716907209 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21945281_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21945335_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21945341_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21945362_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000447695:exon_21945383_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000457430:exon_21945383_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000494242:exon_21945392_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455138:exon_21945397_21945443:TOX4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 54 47 101 26.5268853496466 23.9117849734557 2.61510037619095 A:T:C T C 10 0.508761382413951 0.620056439915615 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 79 61 140 38.8078507892979 31.034444327251 7.77340646204686 A:G G A 10 0.508761382413951 0.205006499205276 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 37 67 104 18.1758288506838 34.0870126217347 -15.9111837710509 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00221107515603439 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 236 231 467 115.932313750308 117.523879337623 -1.5915655873151 A:T:C T C 10 0.508761382413951 0.889667015577994 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 23020921 G/C 1 213 149 362 104.633825545828 75.8054459796787 28.8283795661497 C:G G C 10 0.508761382413951 0.00268679699730383 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 23240328 T/A 1 487 420 907 239.233206764406 213.679780613859 25.5534261505465 A:T T A 10 0.508761382413951 0.0904113467013865 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 23282110 A/G 1 9 24 33 4.42114755827444 12.2102731779348 -7.78912561966038 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00818522857777151 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23282109_23282416:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 23282449 C/T 1 8 35 43 3.92990894068839 17.8066483844883 -13.8767394437999 T:C C T 10 0.508761382413951 2.03195193470404e-05 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000488800:exon_23282184_23282649:SLC7A7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 23374435 G/A 1 37 34 71 18.1758288506838 17.2978870020743 0.877941848609481 A:G G A 10 0.508761382413951 0.905671680032913 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374303_23374455:RBM23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 23374862 C/T 1 26 31 57 12.7722040572373 15.7716028548325 -2.99939879759521 T:C C T 10 0.508761382413951 0.430886459059924 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374815_23374868:RBM23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 68 71 139 33.4042259958513 36.1220581513905 -2.71783215553918 A:G A G 10 0.508761382413951 0.671935504296694 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 23549785 T/C 1 83 96 179 40.7728052596421 48.8410927117393 -8.06828745209722 T:C T C 10 0.508761382413951 0.232523965776009 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 23745172 T/C 1 32 30 62 15.7196357627536 15.2628414724185 0.45679429033504 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 23944505 G/A 1 23 18 41 11.2984882044791 9.15770488345112 2.14078332102801 A:G G A 10 0.508761382413951 0.535298801316041 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 23944514 C/A 1 41 34 75 20.140783321028 17.2978870020743 2.84289631895368 A:C C A 10 0.508761382413951 0.564220700795861 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24026493 A/G 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000157306:ENST00000288014:exon_24025198_24026513:THTPA;ENSG00000157306:ENST00000404535:exon_24025952_24026513:THTPA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24033070 C/T 1 8 3 11 3.92990894068839 1.52628414724185 2.40362479344654 T:C C T 10 0.508761382413951 0.227353863226797 ENSG00000213983:ENST00000465445:exon_24032925_24033430:AP1G2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24458162 G/C 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 A:T A T 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24568317 G/A 1 14 15 29 6.87734064620469 7.63142073620926 -0.754080090004578 A:G G A 10 0.508761382413951 0.853634761322044 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24568258_24568445:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24568258_24568445:PCK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 282 335 617 138.529290159266 170.435063108674 -31.9057729494077 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0111343571443235 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24662177 C/T 1 32 28 60 15.7196357627536 14.2453187075906 1.47431705516294 T:C C T 10 0.508761382413951 0.796495156798099 ENSG00000100926:ENST00000261789:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528669:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000529332:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000524835:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000396854:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000531406:exon_24661854_24662319:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528895:exon_24661919_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530563:exon_24661937_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530468:exon_24662049_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000525592:exon_24662094_24662475:TM9SF1;ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24661854_24662475:RP11-468E2.1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 75 58 133 36.8428963189537 29.5081601800092 7.33473613894452 T:C C T 10 0.508761382413951 0.224759187002114 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24702789 C/T 1 70 66 136 34.3867032310234 33.5782512393208 0.808451991702668 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.931737118179877 ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24702685_24702804:GMPR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24707879 T/C 1 96 93 189 47.1589072882607 47.3148085644974 -0.155901276236733 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24707452_24707984:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24707795_24708445:GMPR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24710921 T/C 1 41 37 78 20.140783321028 18.8241711493162 1.31661217171182 T:C T C 10 0.508761382413951 0.821166990607552 ENSG00000092330:ENST00000267415:exon_24710881_24710982:TINF2;ENSG00000092330:ENST00000399423:exon_24710881_24710982:TINF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 29 29 58 14.2459199099954 14.7540800900046 -0.508160180009156 A:G G A 10 0.508761382413951 0.896489390304002 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 15 17 32 7.36857926379074 8.64894350103717 -1.28036423724643 T:C T C 10 0.508761382413951 0.72498863519702 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24760764 G/A 1 21 4 25 10.316010969307 2.0350455296558 8.28096543965123 A:C:G G A 10 0.508761382413951 0.000949600059955875 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24771256 T/C 1 7 14 21 3.43867032310234 7.12265935379531 -3.68398903069297 T:C T C 10 0.508761382413951 0.128195044803432 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24771171_24771312:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24771171_24771312:C14orf21 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24784911 T/C 1 12 10 22 5.89486341103259 5.08761382413951 0.807249586893079 T:C T C 10 0.508761382413951 0.832379092287417 ENSG00000213903:ENST00000345363:exon_24784843_24786152:LTB4R;ENSG00000213903:ENST00000396789:exon_24784843_24787061:LTB4R;ENSG00000213903:ENST00000396782:exon_24784843_24787242:LTB4R HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24839083 G/C 1 9 8 17 4.42114755827444 4.07009105931161 0.351056498962834 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000100968:ENST00000440487:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000424781:exon_24838705_24839800:NFATC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24845841 T/C 1 13 16 29 6.38610202861864 8.14018211862322 -1.75408009000458 T:C T C 10 0.508761382413951 0.579672735950497 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24897948 G/T 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 T:G G T 10 0.508761382413951 0.726898178327146 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 20 13 33 9.82477235172098 6.61389797138136 3.21087438033962 A:C A C 10 0.508761382413951 0.298661263457526 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 31578762 C/T 1 17 22 39 8.35105649896283 11.1927504131069 -2.84169391414409 T:C C T 10 0.508761382413951 0.424197945472347 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 31582526 T/C 1 23 31 54 11.2984882044791 15.7716028548325 -4.47311465035335 T:C T C 10 0.508761382413951 0.276115487522537 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31582483_31582690:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31582483_31582690:HECTD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 31583173 G/A 1 10 5 15 4.91238617586049 2.54380691206975 2.36857926379074 A:G G A 10 0.508761382413951 0.302882686663208 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31583083_31583265:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31583083_31583265:HECTD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 31598248 A/G 1 31 30 61 15.2283971451675 15.2628414724185 -0.0344443272510091 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31597818_31598654:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31597818_31598654:HECTD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 31619392 T/C 1 17 13 30 8.35105649896283 6.61389797138136 1.73715852758147 T:C T C 10 0.508761382413951 0.586407892614967 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31619205_31619427:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31619205_31619427:HECTD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 25 16 41 12.2809654396512 8.14018211862322 4.14078332102801 T:C T C 10 0.508761382413951 0.213898140616510 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 35592538 C/G 1 39 53 92 19.1583060858559 26.9643532679394 -7.80604718208349 C:G C G 10 0.508761382413951 0.117609548758858 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 35761675 C/G 1 56 42 98 27.5093625848187 21.3679780613859 6.14138452343281 C:G C G 10 0.508761382413951 0.226437781683875 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 701 751 1452 344.35827092782 382.079798192877 -37.7215272650568 A:T:C:G G A 10 0.508761382413951 0.0489929864279317 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 50065717 G/C 1 12 11 23 5.89486341103259 5.59637520655346 0.298488204479128 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 50074122 T/A 1 25 14 39 12.2809654396512 7.12265935379531 5.15830608585591 A:T T A 10 0.508761382413951 0.110234604636184 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 50074520 C/T 1 49 45 94 24.0706922617164 22.8942622086278 1.17643005308861 T:C C T 10 0.508761382413951 0.837058198384786 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 50085571 G/A 1 1739 1971 3710 854.263955982139 1002.7686847379 -148.504728755758 A:T:C:G G A 10 0.508761382413951 1.15700683327447e-06 ENSG00000165502:ENST00000298289:exon_50085407_50085858:RPL36AL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 30 39 69 14.7371585275815 19.8416939141441 -5.10453538656262 T:C T C 10 0.508761382413951 0.230387592528685 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 50459574 A/G 1 10 17 27 4.91238617586049 8.64894350103717 -3.73655732517668 A:G A G 10 0.508761382413951 0.178990411250083 ENSG00000214900:ENST00000399206:exon_50459496_50459591:C14orf182;ENSG00000214900:ENST00000530176:exon_50459496_50459591:C14orf182;ENSG00000214900:ENST00000533506:exon_50459496_50459591:C14orf182;ENSG00000214900:ENST00000528300:exon_50459496_50459591:C14orf182;ENSG00000214900:ENST00000529902:exon_50459496_50459591:C14orf182 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 50583083 G/T 1 6 9 15 2.94743170551629 4.57885244172556 -1.63142073620926 T:G G T 10 0.508761382413951 0.447467080617159 ENSG00000100483:ENST00000395859:exon_50583005_50583297:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000491402:exon_50583005_50583318:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000395860:exon_50583005_50583275:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000484763:exon_50582798_50583276:C14orf138 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 23 32 55 11.2984882044791 16.2803642372464 -4.9818760327673 T:C C T 10 0.508761382413951 0.224527447190756 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 50769717 G/A 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 A:G G A 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000087299:ENST00000261699:exon_50769620_50769735:L2HGDH;ENSG00000087299:ENST00000267436:exon_50769620_50769735:L2HGDH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 50799126 G/C 1 2 6 8 0.982477235172098 3.05256829448371 -2.07009105931161 C:G G C 10 0.508761382413951 0.172493759593104 ENSG00000100490:ENST00000395834:exon_50798980_50799150:CDKL1;ENSG00000100490:ENST00000534267:exon_50798644_50799150:CDKL1;ENSG00000100490:ENST00000216378:exon_50798645_50799410:CDKL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 51192659 G/A 1 8 12 20 3.92990894068839 6.10513658896741 -2.17522764827902 A:G G A 10 0.508761382413951 0.376308412261741 ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 51202311 G/C 1 20 39 59 9.82477235172098 19.8416939141441 -10.0169215624231 C:G G C 10 0.508761382413951 0.009213284811122 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51202234_51202335:NIN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 58 57 115 28.4918398199908 28.9993987975952 -0.507558977604361 T:C C T 10 0.508761382413951 0.926046001743506 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 51223789 C/T 1 18 9 27 8.84229511654888 4.57885244172556 4.26344267482332 T:C C T 10 0.508761382413951 0.123621607685646 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 51224374 T/G 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 T:G T G 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 51225132 G/T 1 8 5 13 3.92990894068839 2.54380691206975 1.38610202861864 T:G G T 10 0.508761382413951 0.581825911412537 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 51716188 T/G 1 56 58 114 27.5093625848187 29.5081601800092 -1.99879759519041 T:G T G 10 0.508761382413951 0.709245720837031 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716186_51716287:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716186_51716287:TMX1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 51716467 G/A 1 88 89 177 43.2289983475723 45.2797630348416 -2.05076468726932 A:G G A 10 0.508761382413951 0.764239676319507 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716411_51716483:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716411_51716483:TMX1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 53325090 C/T 1 6 13 19 2.94743170551629 6.61389797138136 -3.66646626586507 T:C C T 10 0.508761382413951 0.109973528080042 ENSG00000073712:ENST00000341590:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000395631:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000343279:exon_53323993_53325268:FERMT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 55531358 C/T 1 88 113 201 43.2289983475723 57.4900362127765 -14.2610378652041 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.0480974309622027 ENSG00000168175:ENST00000395468:exon_55531334_55536912:MAPK1IP1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 56096731 A/G 1 20 17 37 9.82477235172098 8.64894350103717 1.17582885068381 A:G A G 10 0.508761382413951 0.744246999088275 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56096675_56096815:KTN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 56146357 G/A 1 41 48 89 20.140783321028 24.4205463558696 -4.27976303484164 A:G G A 10 0.508761382413951 0.396978985422347 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56146283_56146403:KTN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 64612845 C/T 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 T:C C T 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64612786_64612941:SYNE2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 64656855 T/C 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 T:C T C 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64656789_64656955:SYNE2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 64988830 C/A 1 72 87 159 35.3691804661955 44.2622402700137 -8.8930598038182 A:C:G C A 10 0.508761382413951 0.177404700687898 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 68060574 G/A 1 3 8 11 1.47371585275815 4.07009105931161 -2.59637520655346 A:G G A 10 0.508761382413951 0.139557898450825 ENSG00000100564:ENST00000216452:exon_68060460_68060669:PIGH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 68066949 G/A 1 10 1 11 4.91238617586049 0.508761382413951 4.40362479344654 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0118508059115006 ENSG00000100564:ENST00000216452:exon_68066741_68067017:PIGH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 68249499 C/T 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 T:C C T 10 0.508761382413951 0.770813353200887 ENSG00000072121:ENST00000347230:exon_68249497_68250242:ZFYVE26;ENSG00000072121:ENST00000411699:exon_68249497_68250242:ZFYVE26 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 68257485 C/T 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 T:C C T 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000072121:ENST00000347230:exon_68257289_68257490:ZFYVE26;ENSG00000072121:ENST00000411699:exon_68257289_68257490:ZFYVE26 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 68264867 A/G 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000072121:ENST00000347230:exon_68264731_68265339:ZFYVE26;ENSG00000072121:ENST00000411699:exon_68264731_68265339:ZFYVE26 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 70633700 G/A 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 A:G G A 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000100678:ENST00000381269:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000356921:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000494208:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000357887:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000358407:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000534137:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000528359:exon_70633356_70635201:SLC8A3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 73422350 T/G 1 15 12 27 7.36857926379074 6.10513658896741 1.26344267482332 T:G T G 10 0.508761382413951 0.702298904497837 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73422231_73422404:DCAF4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 45 38 83 22.1057377913722 19.3329325317301 2.77280525964207 T:C T C 10 0.508761382413951 0.58383909282436 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 74196686 T/C 1 26 33 59 12.7722040572373 16.7891256196604 -4.01692156242311 T:C T C 10 0.508761382413951 0.301235758132591 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74196343_74196688:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74196343_74196688:C14orf43 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 74206481 T/C 1 16 24 40 7.85981788137678 12.2102731779348 -4.35045529655804 T:C T C 10 0.508761382413951 0.205766923687008 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 74388908 T/C 1 9 8 17 4.42114755827444 4.07009105931161 0.351056498962834 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000119725:ENST00000334521:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000458102:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000442160:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000398139:exon_74388769_74388909:ZNF410 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 74424938 T/C 1 12 8 20 5.89486341103259 4.07009105931161 1.82477235172098 T:C T C 10 0.508761382413951 0.504771039081216 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74424850_74424980:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74424850_74424980:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74424850_74424980:COQ6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 21 31 52 10.316010969307 15.7716028548325 -5.45559188552545 A:G G A 10 0.508761382413951 0.164861820874975 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 75279395 T/A 1 15 6 21 7.36857926379074 3.05256829448371 4.31601096930703 A:T T A 10 0.508761382413951 0.0793074128043104 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 75359670 G/A 1 26 27 53 12.7722040572373 13.7365573251767 -0.964353267939401 A:G G A 10 0.508761382413951 0.890903905586243 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75359537_75359689:DLST HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 75360066 C/T 1 26 31 57 12.7722040572373 15.7716028548325 -2.99939879759521 T:C C T 10 0.508761382413951 0.430886459059924 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75360051_75360127:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75360051_75360127:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75360051_75360127:DLST HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 75367807 C/T 1 25 28 53 12.2809654396512 14.2453187075906 -1.9643532679394 T:C:G C T 10 0.508761382413951 0.680648228895746 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75367769_75367936:DLST HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 75483812 T/C 1 4 11 15 1.9649544703442 5.59637520655346 -3.63142073620926 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0723284393895949 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75480467_75483904:MLH3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 75513828 G/A 1 13 9 22 6.38610202861864 4.57885244172556 1.80724958689308 A:G G A 10 0.508761382413951 0.524885322520688 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 75568434 G/A 1 14 9 23 6.87734064620469 4.57885244172556 2.29848820447913 A:G G A 10 0.508761382413951 0.406545883266691 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75568360_75568468:NEK9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 75574087 C/T 1 18 10 28 8.84229511654888 5.08761382413951 3.75468129240937 T:C C T 10 0.508761382413951 0.186823243553659 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75574046_75574190:NEK9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 75590822 G/A 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75590749_75590926:NEK9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 75590846 A/T 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 A:T A T 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75590749_75590926:NEK9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 7 9 16 3.43867032310234 4.57885244172556 -1.14018211862322 A:G A G 10 0.508761382413951 0.623757634359657 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 88431898 C/T 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 T:C C T 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000054983:ENST00000261304:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393568:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393569:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000474294:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000445021:exon_88431849_88431973:GALC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 90429760 C/T 1 36 47 83 17.6845902330978 23.9117849734557 -6.22719474035793 T:C C T 10 0.508761382413951 0.188162397738156 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 92549586 G/A 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92549470_92549602:ATXN3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 265 199 464 130.178233660303 101.243515100376 28.9347185599268 T:G T G 10 0.508761382413951 0.00806343097627488 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 93170993 C/T 1 145 224 369 71.2295995499771 113.962549660725 -42.7329501107479 T:C C T 10 0.508761382413951 8.90898877923209e-06 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 93199080 C/T 1 66 28 94 32.4217487606792 14.2453187075906 18.1764300530886 T:C C T 10 0.508761382413951 0.000176105578689684 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93198994_93199160:LGMN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 93263982 C/G 1 41 38 79 20.140783321028 19.3329325317301 0.807850789297873 C:G C G 10 0.508761382413951 0.910591118869892 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93263783_93264012:GOLGA5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 7 22 29 3.43867032310234 11.1927504131069 -7.75408009000458 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00464135519326581 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 100759046 C/A 1 10 10 20 4.91238617586049 5.08761382413951 -0.175227648279019 A:C C A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000197119:ENST00000359232:exon_100757448_100759369:SLC25A29;ENSG00000197119:ENST00000392908:exon_100757448_100759369:SLC25A29 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 117 101 218 57.4749182575677 51.384899623809 6.09001863375869 A:G G A 10 0.508761382413951 0.417097052148429 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 100847707 A/G 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100847247_100848083:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100847247_100848083:WDR25 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 102391577 G/C 1 15 14 29 7.36857926379074 7.12265935379531 0.245919909995422 A:C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000078304:ENST00000328724:exon_102391478_102394022:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334743:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000350249:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334756:exon_102391478_102394075:PPP2R5C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 102463407 A/G 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 A:G A G 10 0.508761382413951 0.770813353200887 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102463372_102463611:DYNC1H1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 102493761 A/G 1 33 23 56 16.2108743803396 11.7015117955209 4.50936258481875 A:G A G 10 0.508761382413951 0.232805533219463 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102493720_102493881:DYNC1H1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 102514227 T/C 1 8 19 27 3.92990894068839 9.66646626586507 -5.73655732517668 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0332300364557628 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 102549873 G/A 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:G G A 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 365 423 788 179.302095418908 215.206064761101 -35.9039693421934 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0113726392776810 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 102808330 C/T 1 13 18 31 6.38610202861864 9.15770488345112 -2.77160285483248 T:C C T 10 0.508761382413951 0.370907451161819 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 102814945 G/A 1 77 102 179 37.8253735541258 51.893661006223 -14.0682874520972 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0364392071880225 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 102815042 C/T 1 95 103 198 46.6676686706747 52.4024223886369 -5.73475371796229 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.434684509727158 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 102901201 A/G 1 9 5 14 4.42114755827444 2.54380691206975 1.87734064620469 A:G A G 10 0.508761382413951 0.424962478484933 ENSG00000196663:ENST00000359520:exon_102900572_102901548:TECPR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 103342049 T/C 1 27 35 62 13.2634426748233 17.8066483844883 -4.54320570966496 T:C T C 10 0.508761382413951 0.255898166336644 ENSG00000131323:ENST00000392745:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000347662:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000351691:exon_103341961_103342065:TRAF3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 103986255 C/T 1 15 43 58 7.36857926379074 21.8767394437999 -14.5081601800092 T:C C T 10 0.508761382413951 0.000177156831389629 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103985996_103986379:CKB;ENSG00000166165:ENST00000428256:exon_103985996_103986379:CKB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 103988180 G/T 1 6 6 12 2.94743170551629 3.05256829448371 -0.105136588967412 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103988155_103988287:CKB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 104029449 G/A 1 34 28 62 16.7021129979257 14.2453187075906 2.45679429033504 A:G G A 10 0.508761382413951 0.611794225221805 ENSG00000126214:ENST00000409074:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000472726:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000247618:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104029300_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000440963:exon_104029302_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000458117:exon_104029316_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000489117:exon_104029390_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000495778:exon_104029414_104029461:C14orf153 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 104194196 C/G 1 4 8 12 1.9649544703442 4.07009105931161 -2.10513658896741 C:G C G 10 0.508761382413951 0.259199063292902 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104194083_104194251:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104194083_104194251:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000392675:exon_104193791_104194251:ZFYVE21 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 27 45 72 13.2634426748233 22.8942622086278 -9.63081953380447 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0250122763780028 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 105715515 C/T 1 18 6 24 8.84229511654888 3.05256829448371 5.78972682206518 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0231442517322602 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715494_105715584:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715494_105715584:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715241_105715584:BTBD6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 105716034 C/T 1 46 25 71 22.5969764089583 12.7190345603488 9.87794184860948 T:C C T 10 0.508761382413951 0.023486332684169 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715977_105717421:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715977_105717430:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715977_105716298:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392553:exon_105715977_105716633:BTBD6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 106329380 A/G 0 62 0 62 30.456794290335 0 30.456794290335 A A 10 0.508761382413951 7.09080733409475e-19 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 106330079 T/C 0 20 0 20 9.82477235172098 0 9.82477235172098 T T 10 0.508761382413951 2.01949479064064e-06 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 106733593 G/A 1 1 16 17 0.491238617586049 8.14018211862322 -7.64894350103717 A:G G A 10 0.508761382413951 0.000115358167876657 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 14 106791131 A/G 1 26 1 27 12.7722040572373 0.508761382413951 12.2634426748233 A:G A G 10 0.508761382413951 4.56270505142137e-07 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 21937964 A/G 0 13 0 13 6.38610202861864 0 6.38610202861864 A A 10 0.508761382413951 0.000250004186251157 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 23000272 A/G 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 A:G A G 10 0.508761382413951 0.726898178327146 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 53 54 107 26.0356467320606 27.4731146503534 -1.43746791829275 T:C C T 10 0.508761382413951 0.846786842709916 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 31197564 G/A 1 20 6 26 9.82477235172098 3.05256829448371 6.77220405723727 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00962985942514858 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31196715_31198100:FAN1;ENSG00000198690:ENST00000441675:exon_31196715_31198100:FAN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 31229420 T/C 1 5 10 15 2.45619308793025 5.08761382413951 -2.63142073620926 T:C T C 10 0.508761382413951 0.203076095656838 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31229322_31229462:FAN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 1 11 1 12 5.40362479344654 0.508761382413951 4.89486341103259 A:T A T 10 0.508761382413951 0.00643682590501964 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 56388033 T/C 1 18 20 38 8.84229511654888 10.175227648279 -1.33293253173014 T:C T C 10 0.508761382413951 0.74638536261314 ENSG00000181827:ENST00000422057:exon_56385831_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000423270:exon_56382732_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000317318:exon_56382732_56388818:RFX7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 59205723 A/G 1 34 38 72 16.7021129979257 19.3329325317301 -2.63081953380447 A:G A G 10 0.508761382413951 0.557357744529351 ENSG00000137776:ENST00000380516:exon_59205698_59205895:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000249736:exon_59205698_59205895:SLTM HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 59963488 A/G 1 15 14 29 7.36857926379074 7.12265935379531 0.245919909995422 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000140299:ENST00000267859:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000415213:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000409352:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000439052:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000448414:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000464390:exon_59963380_59963513:BNIP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 60639874 G/A 1 97 142 239 47.6501459058468 72.244116302781 -24.5939703969343 A:T:C:G G A 10 0.508761382413951 0.00149691580028789 ENSG00000182718:ENST00000396024:exon_60639333_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000332680:exon_60639351_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000421017:exon_60639351_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000451270:exon_60639351_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000356292:exon_60639536_60639888:ANXA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 61 50 111 29.965555672749 25.4380691206975 4.52748655205144 T:G T G 10 0.508761382413951 0.394948090582803 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 60734697 A/G 1 8 3 11 3.92990894068839 1.52628414724185 2.40362479344654 A:G A G 10 0.508761382413951 0.227353863226797 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60734615_60734744:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60734615_60734744:NARG2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 86 79 165 42.2465211124002 40.1921492107021 2.05437190169809 A:G G A 10 0.508761382413951 0.756158184639585 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 7 11 18 3.43867032310234 5.59637520655346 -2.15770488345112 A:G G A 10 0.508761382413951 0.352056460206795 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 63918307 G/C 1 1 7 8 0.491238617586049 3.56132967689766 -3.07009105931161 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0359761797629569 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63918184_63918353:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63918184_63918353:HERC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 63922752 T/A 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 A:T T A 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63922665_63922834:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63922665_63922834:HERC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 63932513 G/C 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 C:G G C 10 0.508761382413951 0.770813353200887 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63932351_63932644:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63932351_63932644:HERC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 63954029 C/T 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 T:C C T 10 0.508761382413951 0.335736887982477 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63953952_63954220:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63953952_63954220:HERC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 63970456 T/C 1 8 2 10 3.92990894068839 1.0175227648279 2.91238617586049 T:C T C 10 0.508761382413951 0.109914731512069 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63970044_63970564:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63970044_63970564:HERC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 65157482 C/T 1 25 28 53 12.2809654396512 14.2453187075906 -1.9643532679394 T:C C T 10 0.508761382413951 0.680648228895746 ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65157098_65160206:PLEKHO2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 66625660 A/T 1 34 34 68 16.7021129979257 17.2978870020743 -0.595774004148666 A:T A T 10 0.508761382413951 0.904018630479207 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66625342_66626236:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66625342_66626082:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66625342_66626066:DIS3L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 66629403 C/A 1 24 29 53 11.7897268220652 14.7540800900046 -2.9643532679394 A:C C A 10 0.508761382413951 0.492530731620175 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66629052_66629519:TIPIN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 66679684 A/G 1 82 94 176 40.281566642056 47.8235699469114 -7.54200330485537 A:G A G 10 0.508761382413951 0.259169424575477 ENSG00000169032:ENST00000307102:exon_66679155_66679765:MAP2K1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 66793480 C/T 1 16 16 32 7.85981788137678 8.14018211862322 -0.280364237246431 T:C C T 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 69238272 G/T 0 10 0 10 4.91238617586049 0 4.91238617586049 G G 10 0.508761382413951 0.00198015025857764 ENSG00000137808:ENST00000310673:exon_69237938_69239150:SPESP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 69709748 C/A 1 3 9 12 1.47371585275815 4.57885244172556 -3.10513658896741 A:C C A 10 0.508761382413951 0.0871818487647519 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69709722_69709850:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69709722_69709850:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69709722_69709850:KIF23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 69728949 A/G 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 A:G A G 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728903_69729061:KIF23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 69732736 C/T 1 10 15 25 4.91238617586049 7.63142073620926 -2.71903456034877 T:C C T 10 0.508761382413951 0.32021815508557 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69732647_69732826:KIF23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 12 12 24 5.89486341103259 6.10513658896741 -0.210273177934823 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 14 19 33 6.87734064620469 9.66646626586507 -2.78912561966038 T:C C T 10 0.508761382413951 0.385544935151851 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 86 76 162 42.2465211124002 38.6658650634603 3.58065604893994 A:T:C T C 10 0.508761382413951 0.583264233828567 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 275 265 540 135.090619836163 134.821766339697 0.268853496466477 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 75130093 T/C 0 18 0 18 8.84229511654888 0 8.84229511654888 T T 10 0.508761382413951 7.99001513299551e-06 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75130092_75130139:ULK3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 75146366 G/T 1 25 19 44 12.2809654396512 9.66646626586507 2.61449917378616 T:G G T 10 0.508761382413951 0.454446474053152 ENSG00000140497:ENST00000268099:exon_75146362_75146460:SCAMP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 75188584 C/T 1 16 9 25 7.85981788137678 4.57885244172556 3.28096543965123 T:C C T 10 0.508761382413951 0.231316073459551 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75188493_75188666:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75188493_75188666:MPI;ENSG00000178802:ENST00000379693:exon_75188493_75188842:MPI HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 75195059 G/A 1 25 21 46 12.2809654396512 10.683989030693 1.59697640895826 A:G G A 10 0.508761382413951 0.661003187953271 ENSG00000178761:ENST00000357635:exon_75192329_75195127:C15orf17 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 75336729 A/G 1 14 7 21 6.87734064620469 3.56132967689766 3.31601096930703 A:G A G 10 0.508761382413951 0.190676404068772 ENSG00000138621:ENST00000342932:exon_75336727_75336855:PPCDC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 75498744 G/C 1 78 72 150 38.3166121717118 36.6308195338045 1.68579263790735 C:G G C 10 0.508761382413951 0.806828992735367 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 75499995 T/G 1 86 103 189 42.2465211124002 52.4024223886369 -10.1559012762367 A:T:G T G 10 0.508761382413951 0.145966293325344 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 75632360 C/A 1 52 73 125 25.5444081144745 37.1395809162184 -11.5951728017439 A:C C A 10 0.508761382413951 0.0397401890561958 ENSG00000140365:ENST00000267935:exon_75632306_75632614:COMMD4;ENSG00000140365:ENST00000338995:exon_75632306_75632612:COMMD4;ENSG00000140365:ENST00000480484:exon_75632306_75632561:COMMD4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 122 96 218 59.931111345498 48.8410927117393 11.0900186337587 T:G G T 10 0.508761382413951 0.136585654513767 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 78441769 T/C 1 14 19 33 6.87734064620469 9.66646626586507 -2.78912561966038 T:C T C 10 0.508761382413951 0.385544935151851 ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78441663_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78441719_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000379576:exon_78441720_78441772:IDH3A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 79217691 G/A 1 150 148 298 73.6857926379074 75.2966845972647 -1.61089195935739 A:G G A 10 0.508761382413951 0.862182710584298 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000527715:exon_79217676_79219246:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534237:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79217676_79217782:CTSH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 79224747 C/T 1 64 37 101 31.4392715255071 18.8241711493162 12.615100376191 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.0127111170584421 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 79606191 C/T 1 65 79 144 31.9305101430932 40.1921492107021 -8.26163906760894 T:C C T 10 0.508761382413951 0.182494421859796 ENSG00000166557:ENST00000299705:exon_79606099_79606347:TMED3;ENSG00000166557:ENST00000424155:exon_79606099_79606347:TMED3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 113 126 239 55.5099637872235 64.1039341841578 -8.59397039693428 A:G A G 10 0.508761382413951 0.272025574452251 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 81598269 T/G 1 84 79 163 41.2640438772281 40.1921492107021 1.07189466652599 T:G T G 10 0.508761382413951 0.875849702970818 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 81598416 G/A 1 58 72 130 28.4918398199908 36.6308195338045 -8.13897971381363 A:G G A 10 0.508761382413951 0.161032058317473 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 82443824 C/T 1 23 25 48 11.2984882044791 12.7190345603488 -1.42054635586965 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.773204188173692 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 83499766 G/A 1 10 9 19 4.91238617586049 4.57885244172556 0.333533734134932 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83499351_83499831:WHAMM;ENSG00000156232:ENST00000234505:exon_83499351_83499831:WHAMM HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 83735926 C/G 1 49 48 97 24.0706922617164 24.4205463558696 -0.349854094153244 C:G C G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000064726:ENST00000261721:exon_83735503_83736106:BTBD1;ENSG00000064726:ENST00000379403:exon_83735503_83736106:BTBD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 85188839 C/T 1 16 16 32 7.85981788137678 8.14018211862322 -0.280364237246431 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 86122779 T/C 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 T:C T C 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 86122916 T/C 1 13 10 23 6.38610202861864 5.08761382413951 1.29848820447913 T:C T C 10 0.508761382413951 0.678726593550885 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 86123019 C/T 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 86123833 T/C 1 8 8 16 3.92990894068839 4.07009105931161 -0.140182118623216 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 86123924 C/T 1 14 2 16 6.87734064620469 1.0175227648279 5.85981788137678 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00426766297702038 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 86123988 G/A 1 13 2 15 6.38610202861864 1.0175227648279 5.36857926379074 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00751335541489972 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 86124483 C/G 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 C:G C G 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 86124555 G/A 1 8 9 17 3.92990894068839 4.57885244172556 -0.648943501037166 A:G G A 10 0.508761382413951 0.811742532730089 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 86125031 G/A 1 8 3 11 3.92990894068839 1.52628414724185 2.40362479344654 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.227353863226797 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 22 11 33 10.8072495868931 5.59637520655346 5.21087438033962 T:C C T 10 0.508761382413951 0.081665497424099 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 86286787 C/T 1 31 39 70 15.2283971451675 19.8416939141441 -4.61329676897657 T:C C T 10 0.508761382413951 0.283897715220899 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86286723_86287056:AKAP13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 86287910 C/T 1 25 41 66 12.2809654396512 20.859216678972 -8.57825123932076 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0365910223342792 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 89169858 A/G 1 31 23 54 15.2283971451675 11.7015117955209 3.52688534964665 A:G A G 10 0.508761382413951 0.344896353115183 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 89172558 G/C 1 5 20 25 2.45619308793025 10.175227648279 -7.71903456034877 C:G G C 10 0.508761382413951 0.00216232000459235 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89172457_89172657:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89172457_89172657:AEN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 417 386 803 204.846503533382 196.381893611785 8.46460992159737 A:G A G 10 0.508761382413951 0.572296971931909 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 89195526 A/G 1 237 200 437 116.423552367894 101.75227648279 14.6712758851034 A:G A G 10 0.508761382413951 0.165436819534579 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 89804043 C/T 1 11 16 27 5.40362479344654 8.14018211862322 -2.73655732517668 T:C C T 10 0.508761382413951 0.338377400229792 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 24 24 48 11.7897268220652 12.2102731779348 -0.420546355869647 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 30 40 70 14.7371585275815 20.350455296558 -5.61329676897657 T:C T C 10 0.508761382413951 0.190001562064668 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 90128966 C/T 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90128939_90129173:C15orf42 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 90167382 G/C 1 7 12 19 3.43867032310234 6.10513658896741 -2.66646626586507 C:G G C 10 0.508761382413951 0.256095565288392 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 90167658 G/A 1 9 10 19 4.42114755827444 5.08761382413951 -0.666466265865068 A:G G A 10 0.508761382413951 0.821210319840976 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 90168108 C/T 1 11 13 24 5.40362479344654 6.61389797138136 -1.21027317793482 T:C C T 10 0.508761382413951 0.685890504791539 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 90226947 C/A 1 2 8 10 0.982477235172098 4.07009105931161 -3.08761382413951 A:C C A 10 0.508761382413951 0.0611719145334834 ENSG00000166821:ENST00000300056:exon_90224762_90227179:PEX11A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 90623052 T/C 1 19 10 29 9.33353373413493 5.08761382413951 4.24591990999542 T:C T C 10 0.508761382413951 0.137786390771344 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90622892_90625432:ZNF710 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 90768320 C/T 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 T:C C T 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000379122:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90768200_90768410:SEMA4B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 90771750 T/G 1 16 15 31 7.85981788137678 7.63142073620926 0.22839714516752 T:G T G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 90969432 G/A 1 16 12 28 7.85981788137678 6.10513658896741 1.75468129240937 A:G G A 10 0.508761382413951 0.573255486177598 ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_90969342_90969498:IQGAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 91341522 C/T 1 25 11 36 12.2809654396512 5.59637520655346 6.68459023309777 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0296906446009239 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91341420_91341567:BLM HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 91424574 G/C 1 46 50 96 22.5969764089583 25.4380691206975 -2.84109271173929 A:C:G G C 10 0.508761382413951 0.610181438079734 ENSG00000140564:ENST00000268171:exon_91424516_91426688:FURIN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 91449654 T/C 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 T:C T C 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91449600_91449727:MAN2A2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 91449702 A/T 1 8 10 18 3.92990894068839 5.08761382413951 -1.15770488345112 A:T A T 10 0.508761382413951 0.642640691319775 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91449600_91449727:MAN2A2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 91474738 G/C 0 0 8 8 0 4.07009105931161 -4.07009105931161 C G C 10 0.508761382413951 0.00339109537265815 ENSG00000184508:ENST00000330334:exon_91474155_91474786:HDDC3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 91478544 A/C 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91478174_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000495068:exon_91478515_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000497152:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91478516_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000439771:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000486253:exon_91478540_91478605:UNC45A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 91485698 G/C 1 13 15 28 6.38610202861864 7.63142073620926 -1.24531870759063 C:G G C 10 0.508761382413951 0.707356544758575 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91485667_91485835:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91485667_91485835:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91485667_91485835:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91485667_91485978:UNC45A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 91499986 G/T 1 10 5 15 4.91238617586049 2.54380691206975 2.36857926379074 T:G G T 10 0.508761382413951 0.302882686663208 ENSG00000166965:ENST00000394258:exon_91499842_91500130:RCCD1;ENSG00000166965:ENST00000300233:exon_91499840_91500130:RCCD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 91525197 C/T 1 48 46 94 23.5794536441304 23.4030235910417 0.176430053088609 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 91543010 T/C 1 16 19 35 7.85981788137678 9.66646626586507 -1.80664838448828 A:T:C T C 10 0.508761382413951 0.613383812295341 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91542907_91543023:VPS33B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 99678145 G/A 1 5 8 13 2.45619308793025 4.07009105931161 -1.61389797138136 A:G G A 10 0.508761382413951 0.416571082319480 ENSG00000103852:ENST00000459771:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394132:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000434186:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394136:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000262074:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000427087:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000421732:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000413876:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000494567:exon_99676611_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394135:exon_99677781_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000480371:exon_99677845_99678332:TTC23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 101113862 C/T 1 10 12 22 4.91238617586049 6.10513658896741 -1.19275041310692 T:C C T 10 0.508761382413951 0.673245720296639 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 101591923 A/G 1 14 9 23 6.87734064620469 4.57885244172556 2.29848820447913 A:G A G 10 0.508761382413951 0.406545883266691 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101591916_101592165:LRRK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 101592081 T/A 1 10 8 18 4.91238617586049 4.07009105931161 0.842295116548883 A:T T A 10 0.508761382413951 0.815041324056156 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101591916_101592165:LRRK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 101595257 G/A 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 A:G G A 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101595151_101595428:LRRK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 101598200 G/A 1 18 5 23 8.84229511654888 2.54380691206975 6.29848820447913 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0108886055088929 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 101598314 C/T 1 8 7 15 3.92990894068839 3.56132967689766 0.368579263790735 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 101606261 C/T 1 18 30 48 8.84229511654888 15.2628414724185 -6.42054635586965 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0822206428799055 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 101717680 G/T 1 41 37 78 20.140783321028 18.8241711493162 1.31661217171182 T:G G T 10 0.508761382413951 0.821166990607552 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 15 102191919 G/C 1 14 5 19 6.87734064620469 2.54380691206975 4.33353373413493 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0643310571506474 ENSG00000184277:ENST00000333202:exon_102191899_102191976:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000453041:exon_102191899_102191976:TM2D3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 304514 C/T 1 15 16 31 7.36857926379074 8.14018211862322 -0.77160285483248 T:C C T 10 0.508761382413951 0.858252211672412 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000419173:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000426695:exon_304328_304564:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000438220:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000447499:exon_304380_304673:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000453430:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000449945:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420046:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420500:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000417499:exon_304328_304618:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000496874:exon_304121_304680:ITFG3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 315008 A/G 1 26 33 59 12.7722040572373 16.7891256196604 -4.01692156242311 A:G A G 10 0.508761382413951 0.301235758132591 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_314810_316124:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_314810_316119:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_314810_316090:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000424016:exon_314810_315089:ITFG3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 396264 A/G 1 18 16 34 8.84229511654888 8.14018211862322 0.702112997925667 A:G A G 10 0.508761382413951 0.864873527062112 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_396148_396322:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_396148_396444:AXIN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 396804 G/A 1 14 20 34 6.87734064620469 10.175227648279 -3.29788700207433 A:G G A 10 0.508761382413951 0.304473117869320 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_396148_397106:AXIN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 397044 G/T 1 9 8 17 4.42114755827444 4.07009105931161 0.351056498962834 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_396148_397106:AXIN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 95 94 189 46.6676686706747 47.8235699469114 -1.15590127623673 A:G A G 10 0.508761382413951 0.884501426370016 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 420079 C/T 1 42 43 85 20.6320219386141 21.8767394437999 -1.24471750518583 T:C C T 10 0.508761382413951 0.82863691818685 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 426536 C/T 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 T:C C T 10 0.508761382413951 0.726898178327146 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 427435 G/T 1 30 29 59 14.7371585275815 14.7540800900046 -0.0169215624231072 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 32 28 60 15.7196357627536 14.2453187075906 1.47431705516294 T:C T C 10 0.508761382413951 0.796495156798099 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 148 110 258 72.7033154027353 55.9637520655346 16.7395633372007 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.039792272947306 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 602672 C/T 1 39 34 73 19.1583060858559 17.2978870020743 1.86041908378158 T:C C T 10 0.508761382413951 0.725881289211269 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602605_602771:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_602605_602771:SOLH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 46 38 84 22.5969764089583 19.3329325317301 3.26404387722812 A:G A G 10 0.508761382413951 0.513463500479674 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 839084 A/C 1 7 10 17 3.43867032310234 5.08761382413951 -1.64894350103717 A:C A C 10 0.508761382413951 0.473990855338058 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_838931_839125:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_838931_839085:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_838931_839125:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_838928_839125:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_838931_839125:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_838931_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_838931_839125:CHTF18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 839269 G/A 1 4 11 15 1.9649544703442 5.59637520655346 -3.63142073620926 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0723284393895949 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_839210_839362:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_838931_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_839214_839360:CHTF18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 845742 G/A 1 24 15 39 11.7897268220652 7.63142073620926 4.15830608585591 A:G G A 10 0.508761382413951 0.202283535052964 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 845819 A/G 1 6 9 15 2.94743170551629 4.57885244172556 -1.63142073620926 A:G A G 10 0.508761382413951 0.447467080617159 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 847743 C/T 1 21 18 39 10.316010969307 9.15770488345112 1.15830608585591 T:C C T 10 0.508761382413951 0.750717389169567 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847694_847751:CHTF18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 847879 G/A 1 10 13 23 4.91238617586049 6.61389797138136 -1.70151179552087 A:G G A 10 0.508761382413951 0.535488052826954 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847839_847975:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847839_848063:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847839_848072:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847839_847975:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847839_848074:CHTF18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 1552761 C/T 1 18 10 28 8.84229511654888 5.08761382413951 3.75468129240937 T:C C T 10 0.508761382413951 0.186823243553659 ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1552314_1553003:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1552646_1552762:TELO2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 27 21 48 13.2634426748233 10.683989030693 2.57945364413035 A:G A G 10 0.508761382413951 0.474155549743457 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 1814440 A/G 1 23 19 42 11.2984882044791 9.66646626586507 1.63202193861406 A:G A G 10 0.508761382413951 0.646115005090698 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 1823444 C/G 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 C:G C G 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000197774:ENST00000454910:exon_1823229_1823475:EME2;ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1823229_1823475:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1823327_1823475:EME2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 1836796 C/A 1 27 18 45 13.2634426748233 9.15770488345112 4.10573779137221 A:C C A 10 0.508761382413951 0.235922159505921 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 1838640 T/C 1 82 86 168 40.281566642056 43.7534788875998 -3.47191224554376 T:C T C 10 0.508761382413951 0.643510004761162 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 1877494 T/C 1 17 40 57 8.35105649896283 20.350455296558 -11.9993987975952 T:C T C 10 0.508761382413951 0.00202813024977313 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 1877558 G/A 1 39 56 95 19.1583060858559 28.4906374151813 -9.33233132932534 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0643328929333165 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 1877706 A/C 1 25 48 73 12.2809654396512 24.4205463558696 -12.1395809162184 A:C A C 10 0.508761382413951 0.00478572585658833 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2014424 C/G 1 8 24 32 3.92990894068839 12.2102731779348 -8.28036423724643 C:G C G 10 0.508761382413951 0.00404629118863736 ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2014591 C/T 1 2203 1493 3696 1082.19867454207 759.580743944029 322.617930598037 A:T:C:G C T 10 0.508761382413951 1.98167445299544e-26 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 30 33 63 14.7371585275815 16.7891256196604 -2.05196709207891 A:C A C 10 0.508761382413951 0.616750639063722 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2025604 G/C 1 34 34 68 16.7021129979257 17.2978870020743 -0.595774004148666 A:C:G G C 10 0.508761382413951 0.904018630479207 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2025678 C/A 1 21 25 46 10.316010969307 12.7190345603488 -2.40302359104174 A:C C A 10 0.508761382413951 0.555909633342578 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 35 33 68 17.1933516155117 16.7891256196604 0.404225995851334 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2036048 T/C 1 54 45 99 26.5268853496466 22.8942622086278 3.63262314101885 T:C T C 10 0.508761382413951 0.48308846679413 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 44 51 95 21.6144991737862 25.9468305031115 -4.33233132932534 A:G A G 10 0.508761382413951 0.412091331199495 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2049728 C/T 1 66 57 123 32.4217487606792 28.9993987975952 3.42234996308403 T:C C T 10 0.508761382413951 0.588674721222152 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2049849 T/C 1 89 56 145 43.7202369651584 28.4906374151813 15.2295995499771 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0125270943083311 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2050192 G/T 1 43 39 82 21.1232605562001 19.8416939141441 1.28156664205602 T:G G T 10 0.508761382413951 0.82555619048195 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2257105 C/G 1 45 37 82 22.1057377913722 18.8241711493162 3.28156664205602 C:G C G 10 0.508761382413951 0.508303180075847 ENSG00000167965:ENST00000382450:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301724:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000397124:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301725:exon_2257036_2257111:MLST8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2260278 C/T 1 7 2 9 3.43867032310234 1.0175227648279 2.42114755827444 T:C C T 10 0.508761382413951 0.180291906522768 ENSG00000182685:ENST00000328540:exon_2260127_2260282:C16orf79 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2812647 C/T 1 117 117 234 57.4749182575677 59.5250817424323 -2.05016348486453 T:C C T 10 0.508761382413951 0.794086766301161 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 183 193 376 89.896667018247 98.1909468058925 -8.29427978764556 A:G A G 10 0.508761382413951 0.409353793918468 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 192 219 411 94.3178145765214 111.418742748655 -17.1009281721338 A:C C A 10 0.508761382413951 0.0936062893846027 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2814162 G/A 1 229 224 453 112.493643427205 113.962549660725 -1.46890623351979 A:C:G G A 10 0.508761382413951 0.92513676063916 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 2867450 G/C 1 2 22 24 0.982477235172098 11.1927504131069 -10.2102731779348 C:G G C 10 0.508761382413951 1.47388455464471e-05 ENSG00000007038:ENST00000455114:exon_2867431_2867457:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000450020:exon_2867431_2867457:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000005995:exon_2867431_2867457:PRSS21 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 3106994 A/T 1 2 6 8 0.982477235172098 3.05256829448371 -2.07009105931161 A:T A T 10 0.508761382413951 0.172493759593104 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 3170188 C/T 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 3339435 G/C 1 15 15 30 7.36857926379074 7.63142073620926 -0.262841472418529 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000006194:ENST00000219069:exon_3339393_3341460:ZNF263 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 3367229 T/C 1 24 10 34 11.7897268220652 5.08761382413951 6.70211299792567 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0250390549761083 ENSG00000162086:ENST00000293995:exon_3367190_3368574:ZNF75A;ENSG00000162086:ENST00000498240:exon_3367190_3368574:ZNF75A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 25 27 52 12.2809654396512 13.7365573251767 -1.45559188552545 C:G C G 10 0.508761382413951 0.781812955742105 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 3639771 G/T 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 T:G G T 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 3639827 G/A 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 A:G G A 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 65 70 135 31.9305101430932 35.6132967689766 -3.68278662588338 T:C:G G C 10 0.508761382413951 0.547530248029104 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 5139186 G/C 1 7 10 17 3.43867032310234 5.08761382413951 -1.64894350103717 C:G G C 10 0.508761382413951 0.473990855338058 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 5139217 C/G 1 4 10 14 1.9649544703442 5.08761382413951 -3.12265935379531 C:G C G 10 0.508761382413951 0.112778665730966 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 5140541 G/C 1 12 11 23 5.89486341103259 5.59637520655346 0.298488204479128 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5140433_5140566:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5140433_5140566:FAM86A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 5140561 C/T 1 12 10 22 5.89486341103259 5.08761382413951 0.807249586893079 T:C C T 10 0.508761382413951 0.832379092287417 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5140433_5140566:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5140433_5140566:FAM86A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 8999138 T/C 1 36 34 70 17.6845902330978 17.2978870020743 0.386703231023432 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000187555:ENST00000344836:exon_8999044_8999188:USP7;ENSG00000187555:ENST00000381886:exon_8999044_8999188:USP7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 11000848 G/C 1 32 21 53 15.7196357627536 10.683989030693 5.0356467320606 C:G G C 10 0.508761382413951 0.172441786235126 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 11001770 G/T 1 18 30 48 8.84229511654888 15.2628414724185 -6.42054635586965 T:G G T 10 0.508761382413951 0.0822206428799055 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 11002904 G/A 1 16 14 30 7.85981788137678 7.12265935379531 0.737158527581471 A:G G A 10 0.508761382413951 0.856199484978377 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 11016045 C/T 1 9 12 21 4.42114755827444 6.10513658896741 -1.68398903069297 T:C C T 10 0.508761382413951 0.517408343711901 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11016024_11016107:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11016024_11016107:CIITA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 11647492 T/C 1 78 79 157 38.3166121717118 40.1921492107021 -1.8755370389903 T:C T C 10 0.508761382413951 0.810871986726914 ENSG00000189067:ENST00000339430:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000413364:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000381810:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000405528:exon_11647389_11647545:LITAF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 11773662 C/G 1 87 86 173 42.7377597299863 43.7534788875998 -1.01571915761352 C:G C G 10 0.508761382413951 0.87949224305371 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 11852354 A/C 1 15 14 29 7.36857926379074 7.12265935379531 0.245919909995422 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11852287_11852395:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11852287_11852395:ZC3H7A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 11940390 T/C 1 521 505 1026 255.935319762332 256.924498119045 -0.989178356713666 T:C T C 10 0.508761382413951 0.975092665019788 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11940358_11940459:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11940358_11940459:RSL1D1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 52 65 117 25.5444081144745 33.0694898569068 -7.52508174243226 C:G G C 10 0.508761382413951 0.166787065392923 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 12009304 C/A 1 18 13 31 8.84229511654888 6.61389797138136 2.22839714516752 A:C C A 10 0.508761382413951 0.475249037707381 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_12009226_12009762:GSPT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 12897578 G/T 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12897564_12897744:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12897564_12897744:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12897564_12897728:CPPED1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 14742400 T/G 1 35 35 70 17.1933516155117 17.8066483844883 -0.613296768976568 T:G T G 10 0.508761382413951 0.905341570521038 ENSG00000103429:ENST00000261658:exon_14742245_14742449:BFAR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 15818141 A/C 1 23 28 51 11.2984882044791 14.2453187075906 -2.9468305031115 A:C A C 10 0.508761382413951 0.48419188484887 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 21 42 63 10.316010969307 21.3679780613859 -11.0519670920789 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00546568693293791 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 15961351 T/C 1 31 7 38 15.2283971451675 3.56132967689766 11.6670674682699 T:C T C 10 0.508761382413951 0.000126326645226877 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 15961356 C/T 1 34 5 39 16.7021129979257 2.54380691206975 14.1583060858559 T:C C T 10 0.508761382413951 2.74133409959834e-06 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 15961369 G/A 1 39 3 42 19.1583060858559 1.52628414724185 17.6320219386141 A:G G A 10 0.508761382413951 6.7568027975087e-09 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 16138322 T/C 1 15 5 20 7.36857926379074 2.54380691206975 4.82477235172098 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0420027631184402 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16138307_16138537:ABCC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 16139714 T/C 1 14 8 22 6.87734064620469 4.07009105931161 2.80724958689308 T:C T C 10 0.508761382413951 0.287915846699909 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16139693_16139870:ABCC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 18839362 T/C 1 9 7 16 4.42114755827444 3.56132967689766 0.859817881376784 T:C T C 10 0.508761382413951 0.804101251762597 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18839353_18839490:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18839353_18839493:SMG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 18840881 G/A 1 23 18 41 11.2984882044791 9.15770488345112 2.14078332102801 A:G G A 10 0.508761382413951 0.535298801316041 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18840608_18841077:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18840608_18841077:SMG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 18847416 G/A 1 11 16 27 5.40362479344654 8.14018211862322 -2.73655732517668 A:G G A 10 0.508761382413951 0.338377400229792 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18847255_18847534:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18847255_18847534:SMG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 9 3 12 4.42114755827444 1.52628414724185 2.89486341103259 T:C C T 10 0.508761382413951 0.146738110644472 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 19548116 G/A 1 10 19 29 4.91238617586049 9.66646626586507 -4.75408009000458 A:G G A 10 0.508761382413951 0.094297852833404 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 19548152 T/C 1 23 8 31 11.2984882044791 4.07009105931161 7.22839714516752 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0110380372825092 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 19548290 G/A 1 13 20 33 6.38610202861864 10.175227648279 -3.78912561966038 A:G G A 10 0.508761382413951 0.223608612785843 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 20748331 C/A 1 45 32 77 22.1057377913722 16.2803642372464 5.82537355412578 A:C C A 10 0.508761382413951 0.210032100679376 ENSG00000066654:ENST00000381337:exon_20748182_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000396083:exon_20744991_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000431224:exon_20746723_20748608:THUMPD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 22237118 A/G 1 9 7 16 4.42114755827444 3.56132967689766 0.859817881376784 A:G A G 10 0.508761382413951 0.804101251762597 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22236975_22237296:EEF2K HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 22237273 C/G 1 6 9 15 2.94743170551629 4.57885244172556 -1.63142073620926 C:G C G 10 0.508761382413951 0.447467080617159 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22236975_22237296:EEF2K HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 23360199 T/C 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 T:C T C 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000168447:ENST00000343070:exon_23359913_23360231:SCNN1B;ENSG00000168447:ENST00000307331:exon_23359913_23360231:SCNN1B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 23489711 C/G 1 33 29 62 16.2108743803396 14.7540800900046 1.45679429033504 C:G C G 10 0.508761382413951 0.799734602454058 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23489689_23489822:GGA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 23535680 A/C 1 17 31 48 8.35105649896283 15.7716028548325 -7.42054635586965 A:C A C 10 0.508761382413951 0.0422000704200145 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23533335_23535775:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23534832_23535775:EARS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 23536684 T/C 1 12 14 26 5.89486341103259 7.12265935379531 -1.22779594276273 T:C T C 10 0.508761382413951 0.697185970897261 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23536448_23536700:EARS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 23546561 G/C 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 C:G G C 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23546209_23546681:EARS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 23563501 C/T 1 5 9 14 2.45619308793025 4.57885244172556 -2.12265935379531 T:C C T 10 0.508761382413951 0.294178716907209 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23563470_23563625:EARS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 23701538 A/G 1 122 112 234 59.931111345498 56.9812748303625 2.94983651513547 A:G A G 10 0.508761382413951 0.743821970528132 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 23847575 C/A 1 88 112 200 43.2289983475723 56.9812748303625 -13.7522764827902 A:C:G C A 10 0.508761382413951 0.0560815677974991 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_23847322_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_23847345_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000498058:exon_23847403_23847669:PRKCB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 24166130 T/C 1 19 21 40 9.33353373413493 10.683989030693 -1.35045529655804 T:C T C 10 0.508761382413951 0.752494397021214 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 24202458 C/T 1 50 31 81 24.5619308793025 15.7716028548325 8.79032802446997 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0584666351847388 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000466124:exon_24202411_24202909:PRKCB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 24582299 C/G 1 68 69 137 33.4042259958513 35.1045353865626 -1.70030939071128 C:G C G 10 0.508761382413951 0.798040252360809 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 123 92 215 60.422349963084 46.8060471820835 13.6163027810005 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0656412603482416 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 25255506 C/T 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 T:C C T 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000155592:ENST00000328086:exon_25255106_25255597:ZKSCAN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 25258035 A/G 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000155592:ENST00000328086:exon_25258028_25258711:ZKSCAN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 29 28 57 14.2459199099954 14.2453187075906 0.000601202404794776 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 34 33 67 16.7021129979257 16.7891256196604 -0.0870126217347149 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 27356203 A/G 1 15 12 27 7.36857926379074 6.10513658896741 1.26344267482332 A:G A G 10 0.508761382413951 0.702298904497837 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27356190_27356341:IL4R HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 27357927 C/T 1 9 10 19 4.42114755827444 5.08761382413951 -0.666466265865068 T:C C T 10 0.508761382413951 0.821210319840976 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27357788_27357939:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27357788_27357939:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27357788_27357939:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27357788_27357939:IL4R HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 27373980 C/T 1 46 48 94 22.5969764089583 24.4205463558696 -1.82356994691139 T:C C T 10 0.508761382413951 0.757292824746767 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 27374180 T/C 1 59 54 113 28.9830784375769 27.4731146503534 1.50996378722354 A:T:C T C 10 0.508761382413951 0.778837782763761 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 27374927 T/G 1 37 32 69 18.1758288506838 16.2803642372464 1.89546461343738 T:G T G 10 0.508761382413951 0.718329164014680 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 27375157 T/C 1 42 35 77 20.6320219386141 17.8066483844883 2.82537355412578 T:C T C 10 0.508761382413951 0.569374014026581 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 28506428 C/T 1 9 2 11 4.42114755827444 1.0175227648279 3.40362479344654 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0658750571190468 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28506420_28507410:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28506420_28507410:AC138894.1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 28603012 A/G 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 A:G A G 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 28846866 G/A 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 A:G G A 10 0.508761382413951 0.754283830150561 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 28847246 T/C 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 A:T:C T C 10 0.508761382413951 0.335736887982477 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 28883241 A/G 1 10 6 16 4.91238617586049 3.05256829448371 1.85981788137678 A:G A G 10 0.508761382413951 0.455622877460238 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 28944396 C/G 1 55 62 117 27.0181239672327 31.543205709665 -4.52508174243226 C:G C G 10 0.508761382413951 0.40716735613229 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944232_28944435:CD19 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 29706444 C/T 1 78 72 150 38.3166121717118 36.6308195338045 1.68579263790735 T:C C T 10 0.508761382413951 0.806828992735367 ENSG00000103485:ENST00000449759:exon_29705985_29706465:QPRT;ENSG00000103485:ENST00000395384:exon_29705985_29706520:QPRT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 30081476 C/T 1 3410 3236 6646 1675.12368596843 1646.35183349155 28.771852476882 A:T:C:G C T 10 0.508761382413951 0.484376822738671 ENSG00000149925:ENST00000395248:exon_30081438_30081741:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000338110:exon_30081438_30081734:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000436540:exon_30081438_30081734:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000412304:exon_30081438_30081734:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000395240:exon_30081438_30081741:ALDOA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 30106716 C/A 1 9 15 24 4.42114755827444 7.63142073620926 -3.21027317793482 A:C C A 10 0.508761382413951 0.222993356359584 ENSG00000090238:ENST00000398841:exon_30106573_30107521:YPEL3;ENSG00000090238:ENST00000398838:exon_30106573_30106755:YPEL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 30366003 G/A 1 40 40 80 19.649544703442 20.350455296558 -0.700910593116078 A:G G A 10 0.508761382413951 0.911243344460803 ENSG00000169217:ENST00000305596:exon_30365925_30366028:CD2BP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 30393147 C/A 1 102 72 174 50.106338993777 36.6308195338045 13.4755194599725 A:C C A 10 0.508761382413951 0.0483714615250312 ENSG00000180096:ENST00000321367:exon_30393081_30393204:SEPT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 31075175 G/A 1 10 8 18 4.91238617586049 4.07009105931161 0.842295116548883 A:G G A 10 0.508761382413951 0.815041324056156 ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31075134_31075802:ZNF668 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 31088347 G/A 1 8 5 13 3.92990894068839 2.54380691206975 1.38610202861864 A:G G A 10 0.508761382413951 0.581825911412537 ENSG00000167395:ENST00000428260:exon_31087567_31088365:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 31088625 A/G 1 10 4 14 4.91238617586049 2.0350455296558 2.87734064620469 A:G A G 10 0.508761382413951 0.180503112624562 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 31090407 G/C 1 3 12 15 1.47371585275815 6.10513658896741 -4.63142073620926 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0193455095688636 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 31091209 T/C 1 17 11 28 8.35105649896283 5.59637520655346 2.75468129240937 T:C T C 10 0.508761382413951 0.347013425966047 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 31092075 G/A 1 18 15 33 8.84229511654888 7.63142073620926 1.21087438033962 A:G G A 10 0.508761382413951 0.729664048203589 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 31121793 G/A 1 44 50 94 21.6144991737862 25.4380691206975 -3.82356994691139 A:G G A 10 0.508761382413951 0.470692337789552 ENSG00000103507:ENST00000394951:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000219794:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394950:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000287507:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394952:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000441132:exon_31121722_31121801:BCKDK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 31193942 C/A 1 240 224 464 117.897268220652 113.962549660725 3.93471855992675 A:C C A 10 0.508761382413951 0.745213753464112 ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 53338163 A/G 1 6 14 20 2.94743170551629 7.12265935379531 -4.17522764827902 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0740332550078218 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53337632_53338537:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53337632_53338537:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53337632_53338537:CHD9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 53341748 T/G 1 3 8 11 1.47371585275815 4.07009105931161 -2.59637520655346 T:G T G 10 0.508761382413951 0.139557898450825 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53341593_53341817:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53341593_53341817:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53341593_53341865:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53341593_53341865:CHD9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 53358439 A/G 1 28 21 49 13.7546812924094 10.683989030693 3.0706922617164 A:G A G 10 0.508761382413951 0.395171423724248 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53357932_53358807:CHD9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 56485554 C/G 1 14 15 29 6.87734064620469 7.63142073620926 -0.754080090004578 C:G C G 10 0.508761382413951 0.853634761322044 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56485407_56485678:OGFOD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 56839439 C/T 1 14 9 23 6.87734064620469 4.57885244172556 2.29848820447913 T:C C T 10 0.508761382413951 0.406545883266691 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56839416_56839544:NUP93 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 57060340 T/C 1 9 22 31 4.42114755827444 11.1927504131069 -6.77160285483248 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0184777198144654 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 57060353 T/C 1 8 21 29 3.92990894068839 10.683989030693 -6.75408009000458 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0147434696507444 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 57085465 C/T 1 9 8 17 4.42114755827444 4.07009105931161 0.351056498962834 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57085450_57085533:NLRC5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 57449687 G/A 1 6 10 16 2.94743170551629 5.08761382413951 -2.14018211862322 A:G G A 10 0.508761382413951 0.324879272681718 ENSG00000102970:ENST00000219244:exon_57449677_57449974:CCL17;ENSG00000102970:ENST00000454860:exon_57449677_57449974:CCL17 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 57595999 A/G 1 9 16 25 4.42114755827444 8.14018211862322 -3.71903456034877 A:G A G 10 0.508761382413951 0.162748026974591 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57595968_57596069:GPR114 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 57601792 C/T 1 26 28 54 12.7722040572373 14.2453187075906 -1.47311465035335 T:C C T 10 0.508761382413951 0.785772374016051 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 57786711 C/T 1 14 10 24 6.87734064620469 5.08761382413951 1.78972682206518 T:C C T 10 0.508761382413951 0.542761494383684 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786690_57786840:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786690_57786840:KATNB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 58552921 G/A 1 18 16 34 8.84229511654888 8.14018211862322 0.702112997925667 A:G G A 10 0.508761382413951 0.864873527062112 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 58579274 C/T 1 93 92 185 45.6851914355026 46.8060471820835 -1.12085574658093 T:C C T 10 0.508761382413951 0.88330324548103 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58579265_58579395:CNOT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 58616984 T/C 1 26 28 54 12.7722040572373 14.2453187075906 -1.47311465035335 T:C T C 10 0.508761382413951 0.785772374016051 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58616960_58617086:CNOT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 58743454 A/C 1 66 55 121 32.4217487606792 27.9818760327673 4.43987272791193 A:C A C 10 0.508761382413951 0.467171590617173 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000494627:exon_58742953_58743471:GOT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 58750604 G/A 1 40 43 83 19.649544703442 21.8767394437999 -2.22719474035793 A:G G A 10 0.508761382413951 0.661366635520884 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58750567_58750717:GOT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 58757668 A/C 1 26 13 39 12.7722040572373 6.61389797138136 6.15830608585591 A:C A C 10 0.508761382413951 0.0546684576377571 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 58757683 A/G 1 22 11 33 10.8072495868931 5.59637520655346 5.21087438033962 A:G A G 10 0.508761382413951 0.081665497424099 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 66638804 G/A 1 5 7 12 2.45619308793025 3.56132967689766 -1.10513658896741 A:G G A 10 0.508761382413951 0.574941367903584 ENSG00000140931:ENST00000424011:exon_66638634_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000360086:exon_66638634_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000361909:exon_66638634_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000394108:exon_66638567_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000332807:exon_66638635_66638832:CMTM3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 67214416 C/T 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 T:C C T 10 0.508761382413951 0.335736887982477 ENSG00000196123:ENST00000290881:exon_67213944_67214569:KIAA0895L;ENSG00000196123:ENST00000394016:exon_67213944_67214569:KIAA0895L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 68344696 C/T 1 3 10 13 1.47371585275815 5.08761382413951 -3.61389797138136 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0535384651887407 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 12 8 20 5.89486341103259 4.07009105931161 1.82477235172098 T:C C T 10 0.508761382413951 0.504771039081216 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 69971066 C/T 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 T:C C T 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69971021_69971141:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69971021_69971141:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69971021_69971141:WWP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 70190401 C/T 1 15 2 17 7.36857926379074 1.0175227648279 6.35105649896283 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00240734384779847 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70190378_70195205:PDPR;ENSG00000090857:ENST00000205055:exon_70190378_70190765:PDPR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 70302201 C/G 1 37 39 76 18.1758288506838 19.8416939141441 -1.66586506346027 C:G C G 10 0.508761382413951 0.731683997699513 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70302174_70302282:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70302174_70302282:AARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 70726795 C/A 1 11 9 20 5.40362479344654 4.57885244172556 0.824772351720981 A:C C A 10 0.508761382413951 0.824343209360058 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70726724_70726874:VAC14 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 71318577 T/C 1 26 24 50 12.7722040572373 12.2102731779348 0.561930879302452 T:C T C 10 0.508761382413951 0.888583503958265 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 71319539 C/T 1 28 19 47 13.7546812924094 9.66646626586507 4.0882150265443 T:C C T 10 0.508761382413951 0.246361755683395 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 71319646 G/A 1 26 19 45 12.7722040572373 9.66646626586507 3.10573779137221 A:G G A 10 0.508761382413951 0.374609604410792 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 71682796 T/C 1 8 1 9 3.92990894068839 0.508761382413951 3.42114755827444 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0393216639345302 ENSG00000040199:ENST00000393524:exon_71678852_71683947:PHLPP2;ENSG00000040199:ENST00000356272:exon_71678852_71683947:PHLPP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 71773190 G/T 1 14 15 29 6.87734064620469 7.63142073620926 -0.754080090004578 T:G G T 10 0.508761382413951 0.853634761322044 ENSG00000166747:ENST00000299980:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000423132:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000393512:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000425422:exon_71773137_71773244:AP1G1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 71823206 C/A 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 A:C C A 10 0.508761382413951 0.335736887982477 ENSG00000166747:ENST00000299980:exon_71823182_71823385:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000423132:exon_71823182_71823385:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000393512:exon_71823182_71823385:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000433195:exon_71823182_71823385:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000425422:exon_71823182_71823385:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000450149:exon_71823182_71823385:AP1G1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 71950450 C/T 1 5 18 23 2.45619308793025 9.15770488345112 -6.70151179552087 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00586877375085142 ENSG00000182149:ENST00000378799:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000378798:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000439924:exon_71950365_71950511:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000424485:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000329908:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000456820:exon_71950365_71950545:KIAA0174 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 72042682 A/C 1 17 11 28 8.35105649896283 5.59637520655346 2.75468129240937 A:C A C 10 0.508761382413951 0.347013425966047 ENSG00000102967:ENST00000219240:exon_72042643_72042684:DHODH;ENSG00000102967:ENST00000378782:exon_72042643_72042684:DHODH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 72130203 C/G 1 22 25 47 10.8072495868931 12.7190345603488 -1.9117849734557 C:G C G 10 0.508761382413951 0.662187762538901 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 72130815 C/A 1 17 26 43 8.35105649896283 13.2277959427627 -4.87673944379989 A:C C A 10 0.508761382413951 0.169413306172653 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 72135014 T/C 1 16 9 25 7.85981788137678 4.57885244172556 3.28096543965123 T:C T C 10 0.508761382413951 0.231316073459551 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 72137561 G/A 1 25 23 48 12.2809654396512 11.7015117955209 0.579453644130353 A:G G A 10 0.508761382413951 0.886274778895971 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 72139184 C/A 1 38 46 84 18.6670674682699 23.4030235910417 -4.73595612277188 A:C C A 10 0.508761382413951 0.326824058607498 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72139131_72139247:DHX38 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 74519807 T/C 1 22 20 42 10.8072495868931 10.175227648279 0.632021938614059 T:C T C 10 0.508761382413951 0.878401052374126 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74519694_74519815:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74519694_74519815:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74519694_74519815:GLG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 75263661 G/A 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 A:G G A 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75262929_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75262929_75263921:BCAR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 75269534 C/T 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 81010026 C/A 1 102 81 183 50.106338993777 41.20967197553 8.89666701824697 A:C C A 10 0.508761382413951 0.208739136208543 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 28 20 48 13.7546812924094 10.175227648279 3.57945364413035 A:C C A 10 0.508761382413951 0.315896780165955 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 84213114 C/T 1 38 25 63 18.6670674682699 12.7190345603488 5.94803290792109 T:C C T 10 0.508761382413951 0.165251878707772 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 19 21 40 9.33353373413493 10.683989030693 -1.35045529655804 A:T A T 10 0.508761382413951 0.752494397021214 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 84215314 T/C 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 T:C T C 10 0.508761382413951 0.344505314881063 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 84215390 T/C 1 20 11 31 9.82477235172098 5.59637520655346 4.22839714516752 T:C T C 10 0.508761382413951 0.151548626044045 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84215352_84215664:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84215352_84215469:TAF1C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 84516309 G/A 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84516198_84516316:KIAA1609 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 84520292 C/T 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 T:C C T 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84520237_84520665:KIAA1609 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 84778690 C/T 1 153 13 166 75.1595084906655 6.61389797138136 68.5456105192841 A:T:C C T 10 0.508761382413951 1.80370453777382e-30 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 84778697 G/C 1 151 11 162 74.1770312554934 5.59637520655346 68.5806560489399 C:G G C 10 0.508761382413951 8.20772140757074e-32 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 62 104 166 30.456794290335 52.9111837710509 -22.4543894807159 T:C C T 10 0.508761382413951 0.000594433186326312 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 49 60 109 24.0706922617164 30.5256829448371 -6.45499068312066 T:G T G 10 0.508761382413951 0.250222524533798 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 39 46 85 19.1583060858559 23.4030235910417 -4.24471750518583 A:G A G 10 0.508761382413951 0.386284356504681 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 84808824 C/G 1 28 55 83 13.7546812924094 27.9818760327673 -14.2271947403579 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0019720777247442 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84808766_84808831:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84808766_84808831:USP10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 85694968 C/T 1 21 14 35 10.316010969307 7.12265935379531 3.19335161551172 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.31311258462459 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85694752_85695371:KIAA0182 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 85706047 A/C 1 25 29 54 12.2809654396512 14.7540800900046 -2.47311465035335 A:C A C 10 0.508761382413951 0.586582703405955 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85706011_85706960:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85706011_85706499:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85706011_85706102:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000471070:exon_85706011_85706254:KIAA0182 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 85711860 C/T 1 101 105 206 49.615100376191 53.4199451534649 -3.8048447772739 T:C C T 10 0.508761382413951 0.625924417457471 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 85954801 G/A 1 212 233 445 104.142586928242 118.541402102451 -14.3988151742082 A:G G A 10 0.508761382413951 0.184289200319967 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85954712_85956197:IRF8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 10 14 24 4.91238617586049 7.12265935379531 -2.21027317793482 A:G G A 10 0.508761382413951 0.417834229251689 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 88643557 G/A 1 25 19 44 12.2809654396512 9.66646626586507 2.61449917378616 A:G G A 10 0.508761382413951 0.454446474053152 ENSG00000158545:ENST00000301011:exon_88643518_88644134:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000452588:exon_88643518_88644134:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000289509:exon_88643518_88644134:ZC3H18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 88779032 G/C 1 25 28 53 12.2809654396512 14.2453187075906 -1.9643532679394 C:G G C 10 0.508761382413951 0.680648228895746 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779030_88779313:CTU2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 19 18 37 9.33353373413493 9.15770488345112 0.175828850683814 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 29 27 56 14.2459199099954 13.7365573251767 0.509362584818746 A:G A G 10 0.508761382413951 0.894761901454081 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 32 58 90 15.7196357627536 29.5081601800092 -13.7885244172556 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00420393420237584 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 88874632 C/G 1 48 78 126 23.5794536441304 39.6833878282882 -16.1039341841578 A:C:G C G 10 0.508761382413951 0.00427467037120535 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 88884466 C/T 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 T:C C T 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000141012:ENST00000268695:exon_88884415_88884532:GALNS;ENSG00000141012:ENST00000439266:exon_88884415_88884532:GALNS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 89764019 G/A 1 8 10 18 3.92990894068839 5.08761382413951 -1.15770488345112 A:G G A 10 0.508761382413951 0.642640691319775 ENSG00000158792:ENST00000289805:exon_89762751_89764713:SPATA2L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 90075226 C/T 1 13 5 18 6.38610202861864 2.54380691206975 3.84229511654888 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0971656837274008 ENSG00000003249:ENST00000304733:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000002501:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000392973:exon_90075192_90075332:DBNDD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 16 90075301 G/A 1 7 2 9 3.43867032310234 1.0175227648279 2.42114755827444 A:G G A 10 0.508761382413951 0.180291906522768 ENSG00000003249:ENST00000304733:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000002501:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000392973:exon_90075192_90075332:DBNDD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 16 15 31 7.85981788137678 7.63142073620926 0.22839714516752 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 617869 G/A 1 5 7 12 2.45619308793025 3.56132967689766 -1.10513658896741 A:G G A 10 0.508761382413951 0.574941367903584 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_617863_618096:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_617863_618096:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_617863_618096:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_617863_618096:VPS53 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 86 83 169 42.2465211124002 42.2271947403579 0.0193263720422863 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 648498 C/T 1 66 66 132 32.4217487606792 33.5782512393208 -1.15650247864153 T:C C T 10 0.508761382413951 0.862098970376458 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 97 137 234 47.6501459058468 69.7003093907113 -22.0501634848645 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00398970047567886 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 72 72 144 35.3691804661955 36.6308195338045 -1.26163906760894 C:G G C 10 0.508761382413951 0.867782231524007 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 649935 G/C 1 54 42 96 26.5268853496466 21.3679780613859 5.15890728826071 C:G G C 10 0.508761382413951 0.308557309584761 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 650206 C/T 1 62 55 117 30.456794290335 27.9818760327673 2.47491825756774 T:C C T 10 0.508761382413951 0.711665989130275 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 46 43 89 22.5969764089583 21.8767394437999 0.720236965158364 T:G G T 10 0.508761382413951 0.915804605151437 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 1639458 A/G 1 2 6 8 0.982477235172098 3.05256829448371 -2.07009105931161 A:G A G 10 0.508761382413951 0.172493759593104 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1638866_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1639333_1639512:WDR81 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 1640709 C/T 1 9 17 26 4.42114755827444 8.64894350103717 -4.22779594276273 T:C C T 10 0.508761382413951 0.116984532347771 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 1640793 C/T 1 17 9 26 8.35105649896283 4.57885244172556 3.77220405723727 T:C C T 10 0.508761382413951 0.170337716294649 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 2186100 C/T 1 2 10 12 0.982477235172098 5.08761382413951 -4.10513658896741 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0204165055162834 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2185941_2186153:SMG6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 2202943 T/C 1 30 24 54 14.7371585275815 12.2102731779348 2.52688534964665 T:C T C 10 0.508761382413951 0.500191503504275 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 2203167 T/G 1 20 19 39 9.82477235172098 9.66646626586507 0.158306085855912 T:G T G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 2203453 A/G 1 29 22 51 14.2459199099954 11.1927504131069 3.0531694968885 A:G A G 10 0.508761382413951 0.404754488123582 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 2585113 C/T 1 51 38 89 25.0531694968885 19.3329325317301 5.72023696515836 T:C C T 10 0.508761382413951 0.24424684890455 ENSG00000007168:ENST00000397195:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000451360:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000006951:exon_2585023_2585201:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000397193:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 37 38 75 18.1758288506838 19.3329325317301 -1.15710368104632 T:C T C 10 0.508761382413951 0.818054905518237 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 3839685 G/A 1 21 32 53 10.316010969307 16.2803642372464 -5.9643532679394 A:G G A 10 0.508761382413951 0.129979482416561 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3839561_3839763:ATP2A3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 3840928 A/G 1 54 51 105 26.5268853496466 25.9468305031115 0.580054846535148 A:G A G 10 0.508761382413951 0.922576680216528 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3840710_3840930:ATP2A3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 3854040 C/T 1 18 14 32 8.84229511654888 7.12265935379531 1.71963576275357 T:C C T 10 0.508761382413951 0.598431040951595 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3853987_3854067:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3853987_3854067:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3853987_3854067:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3853987_3854067:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3853987_3854067:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3853987_3854067:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3853987_3854067:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3853987_3854067:ATP2A3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 4699552 G/A 1 17 22 39 8.35105649896283 11.1927504131069 -2.84169391414409 A:G G A 10 0.508761382413951 0.424197945472347 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4699439_4699591:PSMB6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 85 124 209 41.7552824948142 63.0864114193299 -21.3311289245158 T:C:G C T 10 0.508761382413951 0.00357483660952838 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 5347576 G/A 1 20 15 35 9.82477235172098 7.63142073620926 2.19335161551172 A:G G A 10 0.508761382413951 0.501876804247675 ENSG00000005100:ENST00000225296:exon_5344232_5347833:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000457531:exon_5345596_5347833:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000433302:exon_5345596_5347833:DHX33 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 5425076 A/G 1 16 13 29 7.85981788137678 6.61389797138136 1.24591990999542 A:G A G 10 0.508761382413951 0.712310635717891 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 16 13 29 7.85981788137678 6.61389797138136 1.24591990999542 T:C T C 10 0.508761382413951 0.712310635717891 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 5436263 C/T 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 T:C C T 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5436142_5436304:NLRP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 5485367 A/T 1 10 10 20 4.91238617586049 5.08761382413951 -0.175227648279019 A:T A T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5485179_5485382:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5485179_5485382:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5485179_5485382:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5485179_5485382:NLRP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 6353679 A/C 0 23 0 23 11.2984882044791 0 11.2984882044791 A A 10 0.508761382413951 2.57139378126959e-07 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 6663895 C/G 1 11 10 21 5.40362479344654 5.08761382413951 0.31601096930703 C:G C G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 6919093 T/C 1 81 79 160 39.79032802447 40.1921492107021 -0.401821186232155 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6919093_6919194:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6919093_6919194:C17orf49 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 6920257 C/T 1 133 103 236 65.3347361389445 52.4024223886369 12.9323137503076 T:C:G C T 10 0.508761382413951 0.103419788497437 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6920229_6920333:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000455303:exon_6920229_6920333:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6920229_6920333:C17orf49 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7154582 T/C 1 99 119 218 48.6326231410189 60.5426045072602 -11.9099813662413 T:C:G T C 10 0.508761382413951 0.119059040465951 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7224921 C/G 1 16 13 29 7.85981788137678 6.61389797138136 1.24591990999542 C:G C G 10 0.508761382413951 0.712310635717891 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7224879_7225106:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7224879_7225106:NEURL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7230845 G/T 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 T:G G T 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7230759_7231203:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7230759_7231203:NEURL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7245371 A/G 1 27 23 50 13.2634426748233 11.7015117955209 1.56193087930245 A:G A G 10 0.508761382413951 0.67418939372333 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7245267_7245386:ACAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7251605 G/C 1 3 8 11 1.47371585275815 4.07009105931161 -2.59637520655346 C:G G C 10 0.508761382413951 0.139557898450825 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7366651 C/G 1 21 12 33 10.316010969307 6.10513658896741 4.21087438033962 C:G C G 10 0.508761382413951 0.164884756427116 ENSG00000174282:ENST00000311403:exon_7362685_7367209:ZBTB4;ENSG00000174282:ENST00000380599:exon_7362688_7367209:ZBTB4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7405937 C/T 1 5 8 13 2.45619308793025 4.07009105931161 -1.61389797138136 T:C C T 10 0.508761382413951 0.416571082319480 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7405837_7406020:POLR2A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7412403 T/C 1 37 19 56 18.1758288506838 9.66646626586507 8.50936258481875 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0233832373471199 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7412263_7412509:POLR2A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7530147 G/C 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 C:G G C 10 0.508761382413951 0.344505314881063 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7530271 C/T 1 44 45 89 21.6144991737862 22.8942622086278 -1.27976303484164 T:C C T 10 0.508761382413951 0.832397159534121 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7530261_7530362:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7530261_7530362:SAT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7750232 T/C 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 T:C T C 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750137_7750334:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750137_7750334:KDM6B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7750436 C/T 1 5 11 16 2.45619308793025 5.59637520655346 -3.14018211862322 T:C C T 10 0.508761382413951 0.137380042418554 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750423_7750770:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750423_7750770:KDM6B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7751778 G/A 1 10 7 17 4.91238617586049 3.56132967689766 1.35105649896283 A:G G A 10 0.508761382413951 0.629969031107128 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 83 76 159 40.7728052596421 38.6658650634603 2.1069401961818 A:G G A 10 0.508761382413951 0.751639495725488 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 36 44 80 17.6845902330978 22.3855008262138 -4.70091059311608 A:G A G 10 0.508761382413951 0.315268934896853 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 7802454 A/C 1 11 2 13 5.40362479344654 1.0175227648279 4.38610202861864 A:C A C 10 0.508761382413951 0.0227184069815744 ENSG00000170004:ENST00000380358:exon_7802329_7802520:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000403047:exon_7802329_7802520:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000358181:exon_7802329_7802520:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000330494:exon_7802329_7802520:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000412940:exon_7802329_7802520:CHD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 8132247 A/C 1 7 1 8 3.43867032310234 0.508761382413951 2.92990894068839 A:C A C 10 0.508761382413951 0.070648384509694 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 8132763 T/C 1 22 26 48 10.8072495868931 13.2277959427627 -2.42054635586965 T:C T C 10 0.508761382413951 0.564196326847116 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8132620_8132764:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8132620_8132764:C17orf68 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 8135061 T/C 1 16 15 31 7.85981788137678 7.63142073620926 0.22839714516752 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8135044_8135133:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8135044_8135133:C17orf68 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 8135446 G/A 1 12 20 32 5.89486341103259 10.175227648279 -4.28036423724643 A:G G A 10 0.508761382413951 0.157397557837097 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8135221_8135545:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8135221_8135545:C17orf68 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 8167600 T/C 1 11 3 14 5.40362479344654 1.52628414724185 3.87734064620469 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0578984717625192 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8167530_8167655:PFAS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 8168224 T/C 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 T:C T C 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8168213_8168443:PFAS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 8192922 C/T 1 26 38 64 12.7722040572373 19.3329325317301 -6.56072847449286 T:C C T 10 0.508761382413951 0.105458287132767 ENSG00000125434:ENST00000312524:exon_8192892_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000396278:exon_8192892_8192961:SLC25A35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 8792003 C/T 1 25 18 43 12.2809654396512 9.15770488345112 3.12326055620011 T:C C T 10 0.508761382413951 0.363555909641122 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 8792029 A/G 1 19 17 36 9.33353373413493 8.64894350103717 0.684590233097765 A:G A G 10 0.508761382413951 0.868667377910195 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 8792093 G/A 1 12 6 18 5.89486341103259 3.05256829448371 2.84229511654888 A:G G A 10 0.508761382413951 0.239188352827104 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 8792171 T/C 1 10 3 13 4.91238617586049 1.52628414724185 3.38610202861864 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0929283691516743 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 8792514 G/A 1 15 8 23 7.36857926379074 4.07009105931161 3.29848820447913 A:G G A 10 0.508761382413951 0.211653680335550 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8792456_8792539:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8792456_8792539:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8792456_8792539:PIK3R5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 42 30 72 20.6320219386141 15.2628414724185 5.36918046619553 A:G A G 10 0.508761382413951 0.238556414208104 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 12899902 C/T 1 28 31 59 13.7546812924094 15.7716028548325 -2.01692156242311 T:C C T 10 0.508761382413951 0.605606705543115 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 12899963 T/C 1 19 25 44 9.33353373413493 12.7190345603488 -3.38550082621384 T:C T C 10 0.508761382413951 0.366083560867370 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 12915009 G/A 1 9 10 19 4.42114755827444 5.08761382413951 -0.666466265865068 A:G G A 10 0.508761382413951 0.821210319840976 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12914980_12915099:ELAC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 20 16 36 9.82477235172098 8.14018211862322 1.68459023309777 A:G A G 10 0.508761382413951 0.619673761572343 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 16326005 A/C 1 19 21 40 9.33353373413493 10.683989030693 -1.35045529655804 A:C A C 10 0.508761382413951 0.752494397021214 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 16336992 C/G 1 9 12 21 4.42114755827444 6.10513658896741 -1.68398903069297 C:G C G 10 0.508761382413951 0.517408343711901 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 16342813 T/C 1 28 35 63 13.7546812924094 17.8066483844883 -4.05196709207891 T:C T C 10 0.508761382413951 0.316417820824042 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 16342833 T/C 1 33 28 61 16.2108743803396 14.2453187075906 1.96555567274899 T:C T C 10 0.508761382413951 0.701210014441723 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 16344601 G/C 1 29 28 57 14.2459199099954 14.2453187075906 0.000601202404794776 C:G G C 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 16852027 T/G 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 T:G T G 10 0.508761382413951 0.344505314881063 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 16855878 C/T 1 33 53 86 16.2108743803396 26.9643532679394 -10.7534788875998 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0231691074789945 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16855760_16855897:TNFRSF13B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 17046024 C/A 1 7 10 17 3.43867032310234 5.08761382413951 -1.64894350103717 A:C C A 10 0.508761382413951 0.473990855338058 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17045941_17046079:MPRIP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 17062241 C/G 1 12 24 36 5.89486341103259 12.2102731779348 -6.31540976690223 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0443691620103385 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000423885:exon_17061811_17062316:MPRIP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 71 63 134 34.8779418486095 32.0519670920789 2.82597475653057 A:G G A 10 0.508761382413951 0.66605670930111 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 17394611 G/A 1 33 30 63 16.2108743803396 15.2628414724185 0.948032907921089 A:G G A 10 0.508761382413951 0.899870196684743 ENSG00000141026:ENST00000268711:exon_17394593_17396535:MED9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 17696531 G/C 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 C:G G C 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17696263_17696878:RAI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 17696755 C/A 1 7 9 16 3.43867032310234 4.57885244172556 -1.14018211862322 A:C C A 10 0.508761382413951 0.623757634359657 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17696263_17696878:RAI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 17698254 G/A 1 9 5 14 4.42114755827444 2.54380691206975 1.87734064620469 A:G G A 10 0.508761382413951 0.424962478484933 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17697562_17700505:RAI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 17707105 T/C 1 9 8 17 4.42114755827444 4.07009105931161 0.351056498962834 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17707070_17707163:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17707070_17707355:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17707070_17707433:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17707070_17707355:RAI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 85 82 167 41.7552824948142 41.718433357944 0.0368491368701882 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 18193941 G/A 1 15 10 25 7.36857926379074 5.08761382413951 2.28096543965123 A:G G A 10 0.508761382413951 0.426148435268484 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18193871_18194000:TOP3A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 18219742 G/A 1 15 7 22 7.36857926379074 3.56132967689766 3.80724958689308 A:G G A 10 0.508761382413951 0.135111008279552 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 18219835 T/C 1 14 11 25 6.87734064620469 5.59637520655346 1.28096543965123 T:C T C 10 0.508761382413951 0.691178115075758 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 18220674 C/T 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 T:C C T 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 18221010 A/G 1 9 9 18 4.42114755827444 4.57885244172556 -0.157704883451117 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 18221134 C/T 1 7 10 17 3.43867032310234 5.08761382413951 -1.64894350103717 T:C C T 10 0.508761382413951 0.473990855338058 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 18226177 G/T 1 13 10 23 6.38610202861864 5.08761382413951 1.29848820447913 T:G G T 10 0.508761382413951 0.678726593550885 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18225931_18226517:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18225931_18226384:SMCR8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 18232096 G/A 1 16 34 50 7.85981788137678 17.2978870020743 -9.43806912069755 A:G G A 10 0.508761382413951 0.010176543149025 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 33 35 68 16.2108743803396 17.8066483844883 -1.59577400414867 A:G A G 10 0.508761382413951 0.717495976348783 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 19284990 C/A 1 9 15 24 4.42114755827444 7.63142073620926 -3.21027317793482 A:C C A 10 0.508761382413951 0.222993356359584 ENSG00000166484:ENST00000308406:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000299612:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000490660:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395604:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000412231:exon_19283921_19285124:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395602:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000457323:exon_19281842_19285779:MAPK7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 19812541 T/C 1 15 11 26 7.36857926379074 5.59637520655346 1.77220405723727 T:C T C 10 0.508761382413951 0.558785240284514 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19812494_19812589:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19812494_19812589:AKAP10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 19861458 C/T 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 T:C C T 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19861327_19861884:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19861327_19861884:AKAP10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 20107773 T/C 1 20 19 39 9.82477235172098 9.66646626586507 0.158306085855912 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 20108239 A/T 1 21 32 53 10.316010969307 16.2803642372464 -5.9643532679394 A:T A T 10 0.508761382413951 0.129979482416561 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 17 17 34 8.35105649896283 8.64894350103717 -0.297887002074333 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 20924523 G/A 1 14 10 24 6.87734064620469 5.08761382413951 1.78972682206518 A:G G A 10 0.508761382413951 0.542761494383684 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000476111:exon_20924426_20924539:USP22 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 22 0 22 10.8072495868931 0 10.8072495868931 T T 10 0.508761382413951 5.10988106685346e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 26 0 26 12.7722040572373 0 12.7722040572373 G G 10 0.508761382413951 3.28185112341515e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 26 1 27 12.7722040572373 0.508761382413951 12.2634426748233 A:C C A 10 0.508761382413951 4.56270505142137e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 13 0 13 6.38610202861864 0 6.38610202861864 C C 10 0.508761382413951 0.000250004186251157 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 42 0 42 20.6320219386141 0 20.6320219386141 C C 10 0.508761382413951 5.79836142646538e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 28 0 28 13.7546812924094 0 13.7546812924094 C C 10 0.508761382413951 8.32978748401765e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 20 0 20 9.82477235172098 0 9.82477235172098 C C 10 0.508761382413951 2.01949479064064e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 26 0 26 12.7722040572373 0 12.7722040572373 C C 10 0.508761382413951 3.28185112341515e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 29 0 29 14.2459199099954 0 14.2459199099954 G G 10 0.508761382413951 4.19808248151786e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 57 0 57 28.0006012024048 0 28.0006012024048 G G 10 0.508761382413951 2.12101656918458e-17 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 25628820 T/C 1 42 34 76 20.6320219386141 17.2978870020743 3.33413493653973 T:C T C 10 0.508761382413951 0.491829640728801 ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000427287:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25628814_25628982:WSB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 25909816 C/T 1 10 10 20 4.91238617586049 5.08761382413951 -0.175227648279019 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 25909850 G/T 1 9 7 16 4.42114755827444 3.56132967689766 0.859817881376784 T:G G T 10 0.508761382413951 0.804101251762597 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 25932609 C/T 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398988:exon_25932460_25932839:KSR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 114 82 196 56.0012024048096 41.718433357944 14.2827690468656 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0452920876043971 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 8 5 13 3.92990894068839 2.54380691206975 1.38610202861864 A:G G A 10 0.508761382413951 0.581825911412537 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 27009749 C/T 1 43 52 95 21.1232605562001 26.4555918855255 -5.33233132932534 T:C C T 10 0.508761382413951 0.305076741001805 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27009745_27009874:SUPT6H;ENSG00000109111:ENST00000347486:exon_27009745_27009874:SUPT6H HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 27068978 G/A 1 29 27 56 14.2459199099954 13.7365573251767 0.509362584818746 A:G G A 10 0.508761382413951 0.894761901454081 ENSG00000160602:ENST00000268766:exon_27068977_27069784:NEK8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 27075423 C/T 1 158 137 295 77.6157015785957 69.7003093907113 7.91539218788446 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.382467223721361 ENSG00000076604:ENST00000461195:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262395:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000473421:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000469529:exon_27075280_27075441:TRAF4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 27085564 A/G 1 15 11 26 7.36857926379074 5.59637520655346 1.77220405723727 A:G A G 10 0.508761382413951 0.558785240284514 ENSG00000173065:ENST00000452648:exon_27082996_27086894:C17orf63;ENSG00000173065:ENST00000341217:exon_27082996_27086894:C17orf63 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 27185827 C/T 1 61 50 111 29.965555672749 25.4380691206975 4.52748655205144 T:C C T 10 0.508761382413951 0.394948090582803 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27185594_27185842:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27185594_27185842:ERAL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 27228198 G/A 1 4 8 12 1.9649544703442 4.07009105931161 -2.10513658896741 A:G G A 10 0.508761382413951 0.259199063292902 ENSG00000167536:ENST00000378895:exon_27228008_27228319:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000394901:exon_27228008_27228319:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000426464:exon_27228008_27228319:DHRS13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 15 13 28 7.36857926379074 6.61389797138136 0.754681292409373 T:C C T 10 0.508761382413951 0.851195156405806 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 27438469 G/A 1 5 10 15 2.45619308793025 5.08761382413951 -2.63142073620926 A:G G A 10 0.508761382413951 0.203076095656838 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27438442_27438601:MYO18A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 27441077 C/G 0 0 9 9 0 4.57885244172556 -4.57885244172556 G C G 10 0.508761382413951 0.00166583700296704 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533399:exon_27441029_27441286:MYO18A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 27613677 G/A 1 27 34 61 13.2634426748233 17.2978870020743 -4.03444432725101 A:G G A 10 0.508761382413951 0.30893938790199 ENSG00000108256:ENST00000225388:exon_27613010_27614734:NUFIP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 27869968 G/A 1 7 10 17 3.43867032310234 5.08761382413951 -1.64894350103717 A:G G A 10 0.508761382413951 0.473990855338058 ENSG00000160551:ENST00000261716:exon_27869579_27871502:TAOK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 27889578 T/C 1 23 15 38 11.2984882044791 7.63142073620926 3.66706746826986 T:C T C 10 0.508761382413951 0.258653199088114 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 73 137 210 35.8604190837816 69.7003093907113 -33.8398903069297 A:G G A 10 0.508761382413951 3.14898721167291e-06 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 30183857 T/C 1 9 21 30 4.42114755827444 10.683989030693 -6.26284147241853 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0273523908345903 ENSG00000172301:ENST00000302362:exon_30183818_30183884:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000378634:exon_30183818_30183884:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000496655:exon_30183818_30183884:C17orf79 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 30228656 G/A 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30228555_30228731:UTP6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 33433487 C/T 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000185379:ENST00000345365:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000474236:exon_33433405_33433490:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000360276:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000335858:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000394589:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000489139:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000345766:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000460118:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000494406:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000418935:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000415064:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000339934:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000486323:exon_33433460_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000467861:exon_33433460_33433500:RAD51L3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 33998802 G/C 1 10 14 24 4.91238617586049 7.12265935379531 -2.21027317793482 C:G G C 10 0.508761382413951 0.417834229251689 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 35937637 T/C 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 T:C T C 10 0.508761382413951 0.335736887982477 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000378189:exon_35937478_35937711:SYNRG HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 16 17 33 7.85981788137678 8.64894350103717 -0.789125619660382 T:C T C 10 0.508761382413951 0.862463507447866 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 10 14 24 4.91238617586049 7.12265935379531 -2.21027317793482 T:C C T 10 0.508761382413951 0.417834229251689 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 36873149 C/T 1 22 24 46 10.8072495868931 12.2102731779348 -1.40302359104174 T:C C T 10 0.508761382413951 0.768508146193936 ENSG00000108292:ENST00000325718:exon_36872620_36873234:MLLT6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 36909061 A/G 1 177 142 319 86.9492353127307 72.244116302781 14.7051190099496 A:G A G 10 0.508761382413951 0.104431327213352 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909003_36909082:PSMB3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 36909499 A/T 1 73 72 145 35.8604190837816 36.6308195338045 -0.77040045002289 A:T A T 10 0.508761382413951 0.933887445872712 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909403_36909587:PSMB3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 37054772 C/T 0 97 0 97 47.6501459058468 0 47.6501459058468 C C 10 0.508761382413951 3.51667298336908e-29 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37054665_37054772:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37054665_37054772:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37054665_37054772:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000443937:exon_37054665_37055078:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37054665_37054772:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37054665_37054772:LASP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 25 15 40 12.2809654396512 7.63142073620926 4.64954470344196 A:G A G 10 0.508761382413951 0.156385223715006 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 38990834 G/C 1 23 33 56 11.2984882044791 16.7891256196604 -5.49063741518125 C:G G C 10 0.508761382413951 0.180879791026751 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 26 28 54 12.7722040572373 14.2453187075906 -1.47311465035335 A:T T A 10 0.508761382413951 0.785772374016051 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 39925925 A/G 1 50 57 107 24.5619308793025 28.9993987975952 -4.43746791829275 A:G A G 10 0.508761382413951 0.43939552565835 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000449889:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437187:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000420370:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000424457:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437369:exon_39925878_39925929:JUP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 40477064 C/G 1 55 64 119 27.0181239672327 32.5607284744929 -5.54260450726017 C:G C G 10 0.508761382413951 0.31485549619074 ENSG00000168610:ENST00000264657:exon_40476981_40477079:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000389272:exon_40476981_40477079:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000404395:exon_40476981_40477079:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000471989:exon_40476981_40477079:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000498330:exon_40476981_40477175:STAT3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 42 47 89 20.6320219386141 23.9117849734557 -3.27976303484164 A:C C A 10 0.508761382413951 0.525369243712772 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 70 68 138 34.3867032310234 34.5957740041487 -0.209070773125234 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 40722029 A/G 1 30 33 63 14.7371585275815 16.7891256196604 -2.05196709207891 A:G A G 10 0.508761382413951 0.616750639063722 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40722000_40722201:MLX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 40725379 A/T 1 21 15 36 10.316010969307 7.63142073620926 2.68459023309777 A:T A T 10 0.508761382413951 0.407639238387941 ENSG00000131470:ENST00000253789:exon_40725329_40725382:PSMC3IP;ENSG00000131470:ENST00000393795:exon_40725329_40725382:PSMC3IP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 13 7 20 6.38610202861864 3.56132967689766 2.82477235172098 A:G G A 10 0.508761382413951 0.264650309181708 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 17 10 27 8.35105649896283 5.08761382413951 3.26344267482332 A:G A G 10 0.508761382413951 0.249755100929954 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 40822678 C/T 1 12 19 31 5.89486341103259 9.66646626586507 -3.77160285483248 T:C C T 10 0.508761382413951 0.209400490261365 ENSG00000068137:ENST00000293349:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000412503:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000456950:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000445882:exon_40822591_40822723:PLEKHH3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 40835922 A/C 1 1 7 8 0.491238617586049 3.56132967689766 -3.07009105931161 A:C A C 10 0.508761382413951 0.0359761797629569 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40835839_40835940:CNTNAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 40926695 A/T 1 69 51 120 33.8954646134374 25.9468305031115 7.94863411032588 A:T:G A T 10 0.508761382413951 0.170600271214589 ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40926664_40926717:VPS25 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 41174025 A/C 1 21 12 33 10.316010969307 6.10513658896741 4.21087438033962 A:C A C 10 0.508761382413951 0.164884756427116 ENSG00000108828:ENST00000355653:exon_41173953_41174459:VAT1;ENSG00000108828:ENST00000315674:exon_41173953_41174397:VAT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 T:C T C 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 41234470 A/G 1 9 7 16 4.42114755827444 3.56132967689766 0.859817881376784 A:G A G 10 0.508761382413951 0.804101251762597 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000487825:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461574:exon_41234421_41234592:BRCA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 41244000 T/C 1 17 16 33 8.35105649896283 8.14018211862322 0.210874380339618 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 41244435 T/C 1 16 11 27 7.85981788137678 5.59637520655346 2.26344267482332 T:C T C 10 0.508761382413951 0.443974308913854 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 41244936 G/A 1 19 14 33 9.33353373413493 7.12265935379531 2.21087438033962 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.489070201574934 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 41245237 A/G 1 10 3 13 4.91238617586049 1.52628414724185 3.38610202861864 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0929283691516743 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 10 15 25 4.91238617586049 7.63142073620926 -2.71903456034877 A:G G A 10 0.508761382413951 0.32021815508557 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 41291953 C/G 1 11 1 12 5.40362479344654 0.508761382413951 4.89486341103259 C:G C G 10 0.508761382413951 0.00643682590501964 ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41291833_41292300:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41291833_41292350:NBR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 42156188 C/T 1 16 25 41 7.85981788137678 12.7190345603488 -4.85921667897199 T:C C T 10 0.508761382413951 0.159360401664448 ENSG00000108840:ENST00000336057:exon_42156163_42156247:HDAC5;ENSG00000108840:ENST00000393622:exon_42156163_42156247:HDAC5;ENSG00000108840:ENST00000225983:exon_42156163_42156247:HDAC5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 42268255 G/C 1 14 17 31 6.87734064620469 8.64894350103717 -1.77160285483248 C:G G C 10 0.508761382413951 0.591853548885225 ENSG00000168591:ENST00000357984:exon_42267869_42269098:TMUB2;ENSG00000168591:ENST00000319511:exon_42267869_42269098:TMUB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 149 163 312 73.1945540203213 82.928105333474 -9.7335513131527 T:C C T 10 0.508761382413951 0.282194303095768 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 43111558 G/A 1 13 6 19 6.38610202861864 3.05256829448371 3.33353373413493 A:G G A 10 0.508761382413951 0.168307374643700 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 54 51 105 26.5268853496466 25.9468305031115 0.580054846535148 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.922576680216528 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 133 138 271 65.3347361389445 70.2090707731252 -4.87433463418071 A:G G A 10 0.508761382413951 0.584639408661704 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 44109474 G/A 1 8 4 12 3.92990894068839 2.0350455296558 1.89486341103259 A:G G A 10 0.508761382413951 0.388585368391447 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44109413_44109665:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44109413_44109665:KIAA1267 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 44248499 G/C 1 17 19 36 8.35105649896283 9.66646626586507 -1.31540976690223 C:G G C 10 0.508761382413951 0.739808852412005 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 45885687 A/G 1 12 12 24 5.89486341103259 6.10513658896741 -0.210273177934823 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 45915788 T/C 1 41 25 66 20.140783321028 12.7190345603488 7.42174876067924 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0840695257425147 ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45915636_45915816:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 45994044 C/T 1 22 21 43 10.8072495868931 10.683989030693 0.123260556200108 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 45994094 T/C 1 29 27 56 14.2459199099954 13.7365573251767 0.509362584818746 T:C T C 10 0.508761382413951 0.894761901454081 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 45994154 G/A 1 32 21 53 15.7196357627536 10.683989030693 5.0356467320606 A:G G A 10 0.508761382413951 0.172441786235126 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 46002744 G/T 1 10 14 24 4.91238617586049 7.12265935379531 -2.21027317793482 T:G G T 10 0.508761382413951 0.417834229251689 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46002714_46002907:SP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 46020698 C/T 1 2 11 13 0.982477235172098 5.59637520655346 -4.61389797138136 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0115925075570033 ENSG00000108439:ENST00000225573:exon_46020672_46020796:PNPO;ENSG00000108439:ENST00000434554:exon_46020672_46020796:PNPO HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 46474118 G/T 1 6 17 23 2.94743170551629 8.64894350103717 -5.70151179552087 T:G G T 10 0.508761382413951 0.0207775686511518 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46474042_46474147:SKAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 46688256 T/C 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 T:C T C 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000120087:ENST00000239165:exon_46687881_46688379:HOXB7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 47293906 G/A 1 33 31 64 16.2108743803396 15.7716028548325 0.439271525507138 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000108798:ENST00000225941:exon_47293893_47294060:ABI3;ENSG00000108798:ENST00000419580:exon_47293893_47294042:ABI3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 47778793 C/T 1 8 15 23 3.92990894068839 7.63142073620926 -3.70151179552087 T:C C T 10 0.508761382413951 0.145808138014843 ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47778305_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47778649_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47778682_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47778683_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508749:exon_47778690_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507477:exon_47778690_47780373:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47778701_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47778701_47778872:SLC35B1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 47788755 G/A 1 35 31 66 17.1933516155117 15.7716028548325 1.42174876067924 A:G G A 10 0.508761382413951 0.80578547683811 ENSG00000121104:ENST00000240364:exon_47787694_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000513602:exon_47788357_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000503573:exon_47788707_47788917:FAM117A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 48226811 C/T 1 77 56 133 37.8253735541258 28.4906374151813 9.33473613894452 T:C:G C T 10 0.508761382413951 0.118337875597347 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 48539035 T/C 1 12 11 23 5.89486341103259 5.59637520655346 0.298488204479128 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539018_48539047:ACSF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 48557326 G/A 1 8 5 13 3.92990894068839 2.54380691206975 1.38610202861864 A:G G A 10 0.508761382413951 0.581825911412537 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 48557348 T/C 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 48559559 A/G 1 5 7 12 2.45619308793025 3.56132967689766 -1.10513658896741 A:G A G 10 0.508761382413951 0.574941367903584 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000515221:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000451010:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000504284:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000506211:exon_48559458_48559817:RSAD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 48628160 A/G 1 14 18 32 6.87734064620469 9.15770488345112 -2.28036423724643 A:G A G 10 0.508761382413951 0.481273059851305 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48627897_48628252:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48628069_48628163:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511347:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505656:exon_48628069_48628212:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508528:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000513618:exon_48627761_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628095_48628278:SPATA20 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 48628470 T/A 1 9 4 13 4.42114755827444 2.0350455296558 2.38610202861864 A:T T A 10 0.508761382413951 0.267810029003266 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628359_48628583:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628359_48628745:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628359_48628551:SPATA20 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 48633043 G/A 1 28 48 76 13.7546812924094 24.4205463558696 -10.6658650634603 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0157516840296461 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48632853_48633211:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48632853_48633211:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48632853_48633211:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48632853_48633137:SPATA20 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 55027850 T/C 1 25 31 56 12.2809654396512 15.7716028548325 -3.49063741518125 T:C T C 10 0.508761382413951 0.422870119853089 ENSG00000121058:ENST00000240316:exon_55027250_55028357:COIL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 55079471 T/C 1 30 32 62 14.7371585275815 16.2803642372464 -1.54320570966496 T:C T C 10 0.508761382413951 0.705302217121313 ENSG00000121064:ENST00000262288:exon_55079379_55079542:SCPEP1;ENSG00000121064:ENST00000393142:exon_55079379_55079542:SCPEP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 55183203 T/C 1 32 40 72 15.7196357627536 20.350455296558 -4.63081953380447 T:C T C 10 0.508761382413951 0.290476036686708 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 55183716 T/C 1 25 27 52 12.2809654396512 13.7365573251767 -1.45559188552545 T:C T C 10 0.508761382413951 0.781812955742105 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 55752400 C/T 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 T:C C T 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000153944:ENST00000284073:exon_55752333_55752487:MSI2;ENSG00000153944:ENST00000416426:exon_55752279_55752487:MSI2;ENSG00000153944:ENST00000442934:exon_55752333_55752487:MSI2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 56584508 T/C 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 T:C T C 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56584484_56584680:MTMR4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 56769979 C/T 1 8 9 17 3.92990894068839 4.57885244172556 -0.648943501037166 T:C C T 10 0.508761382413951 0.811742532730089 ENSG00000108384:ENST00000461271:exon_56769934_56770046:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000337432:exon_56769934_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487921:exon_56769937_56769993:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000476741:exon_56769963_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000475762:exon_56769963_56771011:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000486827:exon_56769967_56771172:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487525:exon_56769967_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000482007:exon_56769976_56770149:RAD51C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 57287454 A/G 1 2 9 11 0.982477235172098 4.57885244172556 -3.59637520655346 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0355658246260987 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57287371_57289171:C17orf71 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 27 48 75 13.2634426748233 24.4205463558696 -11.1571036810463 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0108380930101231 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 57963537 A/G 1 2 8 10 0.982477235172098 4.07009105931161 -3.08761382413951 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0611719145334834 ENSG00000108423:ENST00000325752:exon_57963444_57963591:TUBD1;ENSG00000108423:ENST00000340993:exon_57963444_57963591:TUBD1;ENSG00000108423:ENST00000394239:exon_57963444_57963591:TUBD1;ENSG00000108423:ENST00000376094:exon_57963444_57963591:TUBD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 58031412 A/G 1 12 11 23 5.89486341103259 5.59637520655346 0.298488204479128 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000189050:ENST00000305783:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000482446:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000343124:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000442346:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000466544:exon_58031406_58031507:RNFT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 60040329 C/T 1 11 13 24 5.40362479344654 6.61389797138136 -1.21027317793482 T:C C T 10 0.508761382413951 0.685890504791539 ENSG00000108510:ENST00000262436:exon_60040113_60040332:MED13;ENSG00000108510:ENST00000397786:exon_60040113_60040332:MED13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 61805747 G/A 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 A:G G A 10 0.508761382413951 0.770813353200887 ENSG00000125695:ENST00000336174:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375840:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000447001:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000392950:exon_61805718_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375841:exon_61805694_61805773:STRADA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 61901197 T/A 1 52 53 105 25.5444081144745 26.9643532679394 -1.41994515346485 A:T T A 10 0.508761382413951 0.845361442784164 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901177_61901312:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901177_61901312:FTSJ3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 61903445 G/C 1 16 15 31 7.85981788137678 7.63142073620926 0.22839714516752 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903416_61903495:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903416_61903495:FTSJ3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 61908271 C/T 1 175 155 330 85.9667580775586 78.8580142741624 7.10874380339618 T:C C T 10 0.508761382413951 0.441315622908223 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908169_61908295:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908169_61908295:PSMC5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 240 224 464 117.897268220652 113.962549660725 3.93471855992675 T:C C T 10 0.508761382413951 0.745213753464112 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 109 81 190 53.5450093168793 41.20967197553 12.3353373413493 A:G A G 10 0.508761382413951 0.081426283440182 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 62479069 A/C 1 9 10 19 4.42114755827444 5.08761382413951 -0.666466265865068 A:C A C 10 0.508761382413951 0.821210319840976 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62479036_62479116:POLG2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 63049698 T/C 1 9 9 18 4.42114755827444 4.57885244172556 -0.157704883451117 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000120063:ENST00000439174:exon_63049620_63049846:GNA13;ENSG00000120063:ENST00000239138:exon_63049620_63049846:GNA13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 65988049 T/C 1 11 10 21 5.40362479344654 5.08761382413951 0.31601096930703 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000186665:ENST00000449250:exon_65987218_65988219:C17orf58;ENSG00000186665:ENST00000334461:exon_65987218_65988219:C17orf58 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 168 187 355 82.5280877544562 95.1383785114088 -12.6102907569526 A:G A G 10 0.508761382413951 0.184777317512505 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 66 53 119 32.4217487606792 26.9643532679394 5.45739549273983 A:T T A 10 0.508761382413951 0.359303251545677 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 66267691 A/T 1 10 11 21 4.91238617586049 5.59637520655346 -0.68398903069297 A:T A T 10 0.508761382413951 0.82938952505783 ENSG00000108932:ENST00000327268:exon_66266980_66267795:SLC16A6;ENSG00000108932:ENST00000344066:exon_66267095_66267795:SLC16A6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 67101718 C/T 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000154262:ENST00000284425:exon_67101603_67101769:ABCA6;ENSG00000154262:ENST00000446604:exon_67101603_67101769:ABCA6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 67267317 T/C 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 T:C T C 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67267303_67267433:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67267303_67267430:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67267303_67267430:ABCA5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 67304447 C/T 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 T:C C T 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67304421_67304509:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67304421_67304509:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67304421_67304509:ABCA5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 70120551 A/C 1 11 24 35 5.40362479344654 12.2102731779348 -6.80664838448828 A:T:C A C 10 0.508761382413951 0.0268665950807958 ENSG00000125398:ENST00000245479:exon_70119684_70122561:SOX9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 71027833 A/G 1 8 2 10 3.92990894068839 1.0175227648279 2.91238617586049 A:G A G 10 0.508761382413951 0.109914731512069 ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_71027695_71027853:SLC39A11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 71196809 A/G 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 A:G A G 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71196705_71196915:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71196705_71196915:COG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 26 27 53 12.7722040572373 13.7365573251767 -0.964353267939401 A:G G A 10 0.508761382413951 0.890903905586243 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 71204440 C/T 1 79 76 155 38.8078507892979 38.6658650634603 0.1419857258376 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000133193:ENST00000405159:exon_71203492_71205907:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000403627:exon_71203492_71205907:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000255557:exon_71203493_71205907:FAM104A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 71232687 T/C 1 25 16 41 12.2809654396512 8.14018211862322 4.14078332102801 T:C T C 10 0.508761382413951 0.213898140616510 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 71232807 T/C 1 18 12 30 8.84229511654888 6.10513658896741 2.73715852758147 T:C T C 10 0.508761382413951 0.363817218311101 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 28 15 43 13.7546812924094 7.63142073620926 6.12326055620011 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0677722391008957 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 71233130 A/G 1 8 5 13 3.92990894068839 2.54380691206975 1.38610202861864 A:G A G 10 0.508761382413951 0.581825911412537 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 71238433 G/A 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71238383_71238490:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71238383_71238490:C17orf80 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 71239087 G/T 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71239035_71239142:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71239035_71239142:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71239035_71239142:C17orf80 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 71243508 C/T 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 T:C C T 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71243380_71245091:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71243380_71245091:C17orf80 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 72768970 G/A 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 A:G G A 10 0.508761382413951 0.289666844678132 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 42 42 84 20.6320219386141 21.3679780613859 -0.735956122771881 T:C C T 10 0.508761382413951 0.913322003711902 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 50 47 97 24.5619308793025 23.9117849734557 0.650145905846756 T:C T C 10 0.508761382413951 0.919395080041716 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 9 14 23 4.42114755827444 7.12265935379531 -2.70151179552087 C:G G C 10 0.508761382413951 0.300583067488647 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 73127683 T/C 1 22 27 49 10.8072495868931 13.7365573251767 -2.9293077382836 T:C T C 10 0.508761382413951 0.475443417674915 ENSG00000125458:ENST00000245552:exon_73127629_73127877:NT5C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 73269676 C/T 1 60 59 119 29.4743170551629 30.0169215624231 -0.542604507260165 T:C C T 10 0.508761382413951 0.927244836293695 ENSG00000125454:ENST00000375261:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73269062_73269720:SLC25A19 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 73488794 C/T 1 20 21 41 9.82477235172098 10.683989030693 -0.85921667897199 T:C C T 10 0.508761382413951 0.87623230007505 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73488555_73488870:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73488555_73488870:KIAA0195 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 73489567 C/G 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 C:G C G 10 0.508761382413951 0.749901411398711 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 73513677 A/C 1 8 6 14 3.92990894068839 3.05256829448371 0.877340646204686 A:C A C 10 0.508761382413951 0.79097715531601 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73513638_73513736:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73513638_73513736:TSEN54 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 73518284 G/C 1 29 20 49 14.2459199099954 10.175227648279 4.0706922617164 C:G G C 10 0.508761382413951 0.256440797497237 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 73520359 C/G 1 38 20 58 18.6670674682699 10.175227648279 8.49183981999084 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0347049689294311 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73520343_73520820:TSEN54 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 73870612 C/T 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 T:C C T 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000132481:ENST00000254816:exon_73870247_73871204:TRIM47 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 33 17 50 16.2108743803396 8.64894350103717 7.56193087930245 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0341711767229199 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 74 67 141 36.3516577013676 34.0870126217347 2.26464507963291 C:G G C 10 0.508761382413951 0.736530413631093 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 74077797 C/T 1 55 38 93 27.0181239672327 19.3329325317301 7.68519143550256 T:C C T 10 0.508761382413951 0.120117155306533 ENSG00000186919:ENST00000334586:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000425015:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000441571:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000421794:exon_74077681_74077836:ZACN;ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 75085434 G/A 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 A:G G A 10 0.508761382413951 0.770813353200887 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 76219663 A/G 1 82 81 163 40.281566642056 41.20967197553 -0.928105333474008 A:G A G 10 0.508761382413951 0.937594066576435 ENSG00000089685:ENST00000374948:exon_76219546_76221715:BIRC5;ENSG00000089685:ENST00000301633:exon_76219546_76221715:BIRC5;ENSG00000089685:ENST00000350051:exon_76219546_76221715:BIRC5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 16 9 25 7.85981788137678 4.57885244172556 3.28096543965123 T:C C T 10 0.508761382413951 0.231316073459551 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 76420085 T/C 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 T:C T C 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000187775:ENST00000442057:exon_76419778_76420234:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76419778_76420234:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76419783_76420234:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000374939:exon_76419783_76420234:DNAH17 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 27 31 58 13.2634426748233 15.7716028548325 -2.50816018000916 A:G G A 10 0.508761382413951 0.515152677438335 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 76993546 A/G 1 16 30 46 7.85981788137678 15.2628414724185 -7.40302359104174 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0378837331242655 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76993074_76994045:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76993074_76993726:CANT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 77073566 G/A 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 A:G G A 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77073512_77073579:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77073512_77073579:ENGASE HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 77076440 G/T 1 9 1 10 4.42114755827444 0.508761382413951 3.91238617586049 T:G G T 10 0.508761382413951 0.0216733970401453 ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77076289_77076446:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77076289_77076446:ENGASE HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 78293189 A/T 1 7 1 8 3.43867032310234 0.508761382413951 2.92990894068839 A:T A T 10 0.508761382413951 0.070648384509694 ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78292990_78295258:RNF213 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 78319136 G/A 1 11 23 34 5.40362479344654 11.7015117955209 -6.29788700207433 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0384635357008189 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 78319380 G/C 1 13 11 24 6.38610202861864 5.59637520655346 0.789726822065177 C:G G C 10 0.508761382413951 0.839412619839394 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 78341776 G/A 1 13 10 23 6.38610202861864 5.08761382413951 1.29848820447913 A:G G A 10 0.508761382413951 0.678726593550885 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78341761_78341943:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78341761_78341943:RNF213 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 78354661 C/T 1 14 9 23 6.87734064620469 4.57885244172556 2.29848820447913 T:C C T 10 0.508761382413951 0.406545883266691 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78354631_78354787:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78354631_78354787:RNF213 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 78865546 T/C 1 9 3 12 4.42114755827444 1.52628414724185 2.89486341103259 T:C T C 10 0.508761382413951 0.146738110644472 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78865520_78865637:RPTOR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 79478139 G/A 1 313 19 332 153.757687304433 9.66646626586507 144.091221038568 A:G G A 10 0.508761382413951 8.71823636760302e-68 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 79479399 G/A 1 12 11 23 5.89486341103259 5.59637520655346 0.298488204479128 A:G G A 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 25 27 52 12.2809654396512 13.7365573251767 -1.45559188552545 A:G G A 10 0.508761382413951 0.781812955742105 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 79803101 A/G 1 613 674 1287 301.129272580248 342.905171747003 -41.7758991667549 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0206447174208062 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000473021:exon_79803020_79803332:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79803043_79803106:P4HB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 79890818 C/T 1 180 183 363 88.4229511654888 93.103332981753 -4.6803818162642 T:C C T 10 0.508761382413951 0.636845887748966 ENSG00000183010:ENST00000337943:exon_79890269_79890839:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000432920:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000405481:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000329875:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000403172:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000402252:exon_79890756_79890839:PYCR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 79993919 C/T 1 49 51 100 24.0706922617164 25.9468305031115 -1.8761382413951 T:C C T 10 0.508761382413951 0.76437852472343 ENSG00000169738:ENST00000306869:exon_79993757_79993939:DCXR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 80014883 C/T 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 T:C C T 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80014505_80015346:GPS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 80037191 A/G 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 A:G A G 10 0.508761382413951 0.500623361388982 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 80585094 C/T 1 9 5 14 4.42114755827444 2.54380691206975 1.87734064620469 T:C C T 10 0.508761382413951 0.424962478484933 ENSG00000141580:ENST00000392325:exon_80585080_80585167:WDR45L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 80684432 A/G 1 17 22 39 8.35105649896283 11.1927504131069 -2.84169391414409 A:G A G 10 0.508761382413951 0.424197945472347 ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80684356_80684478:FN3KRP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 80684442 G/A 1 34 19 53 16.7021129979257 9.66646626586507 7.0356467320606 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0553723431591926 ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80684356_80684478:FN3KRP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 14 11 25 6.87734064620469 5.59637520655346 1.28096543965123 T:C T C 10 0.508761382413951 0.691178115075758 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 11 16 27 5.40362479344654 8.14018211862322 -2.73655732517668 A:G G A 10 0.508761382413951 0.338377400229792 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 17 81006387 G/A 1 3 9 12 1.47371585275815 4.57885244172556 -3.10513658896741 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0871818487647519 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_81006347_81006446:B3GNTL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 658064 G/C 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000176912:ENST00000323813:exon_657842_658340:C18orf56 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 662247 A/G 1 52 48 100 25.5444081144745 24.4205463558696 1.1238617586049 A:G A G 10 0.508761382413951 0.84204287501136 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_662146_662320:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_662146_662320:TYMS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 248 255 503 121.82717716134 129.734152515557 -7.90697535421734 T:C:G C T 10 0.508761382413951 0.50359832554777 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 674320 A/G 1 50 41 91 24.5619308793025 20.859216678972 3.70271420033046 A:T:G A G 10 0.508761382413951 0.464104406025535 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_674161_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_673859_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_673861_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_674038_674406:ENOSF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 691266 A/G 1 4 9 13 1.9649544703442 4.57885244172556 -2.61389797138136 A:G A G 10 0.508761382413951 0.172726937801510 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_691204_691276:ENOSF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 693828 A/C 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 A:C A C 10 0.508761382413951 0.726898178327146 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 2595443 G/T 1 21 18 39 10.316010969307 9.15770488345112 1.15830608585591 T:G G T 10 0.508761382413951 0.750717389169567 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2595415_2595620:NDC80 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 2724930 A/T 1 6 6 12 2.94743170551629 3.05256829448371 -0.105136588967412 A:T A T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2724897_2724993:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2724897_2724993:SMCHD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 2750477 A/G 1 23 11 34 11.2984882044791 5.59637520655346 5.70211299792567 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0589071252989471 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2750348_2750505:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2750348_2750505:SMCHD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 2763697 C/T 1 6 10 16 2.94743170551629 5.08761382413951 -2.14018211862322 T:C C T 10 0.508761382413951 0.324879272681718 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2763635_2763787:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2763635_2763787:SMCHD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 2891847 C/T 1 1 10 11 0.491238617586049 5.08761382413951 -4.59637520655346 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00557272985192978 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2890559_2892484:EMILIN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 9255718 G/A 1 88 90 178 43.2289983475723 45.7885244172556 -2.55952606968327 A:G G A 10 0.508761382413951 0.708487170481825 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000400020:exon_9255630_9255795:ANKRD12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 9535817 C/T 1 49 31 80 24.0706922617164 15.7716028548325 8.29908940688392 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0732209179893382 ENSG00000017797:ENST00000019317:exon_9535669_9538112:RALBP1;ENSG00000017797:ENST00000383432:exon_9535669_9538105:RALBP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 9562042 C/T 1 12 14 26 5.89486341103259 7.12265935379531 -1.22779594276273 T:C C T 10 0.508761382413951 0.697185970897261 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9561978_9562073:PPP4R1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 11999115 T/C 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000141401:ENST00000269159:exon_11999053_11999186:IMPA2;ENSG00000141401:ENST00000383376:exon_11999053_11999186:IMPA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 12308793 G/C 1 18 71 89 8.84229511654888 36.1220581513905 -27.2797630348416 C:G G C 10 0.508761382413951 3.47797244668705e-09 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12308686_12308794:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12308686_12308794:TUBB6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 103 135 238 50.5975776113631 68.6827866258834 -18.0852090145203 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0195937163662164 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 26 18 44 12.7722040572373 9.15770488345112 3.61449917378616 T:C T C 10 0.508761382413951 0.294479080687978 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 21 30 51 10.316010969307 15.2628414724185 -4.9468305031115 T:C C T 10 0.508761382413951 0.207126802744976 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 84 61 145 41.2640438772281 31.034444327251 10.2295995499771 A:C C A 10 0.508761382413951 0.0966817131779692 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 13056333 C/T 1 26 12 38 12.7722040572373 6.10513658896741 6.66706746826986 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0345762311184375 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13055779_13056697:CEP192 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 13068132 T/C 1 14 7 21 6.87734064620469 3.56132967689766 3.31601096930703 T:C T C 10 0.508761382413951 0.190676404068772 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13068093_13068236:CEP192 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 13069782 C/T 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 T:C C T 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000507254:exon_13069749_13069855:CEP192 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 T:G G T 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 14105016 C/A 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 A:C C A 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000175322:ENST00000309305:exon_14104724_14106408:ZNF519 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 23854692 C/T 1 13 4 17 6.38610202861864 2.0350455296558 4.35105649896283 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0496218514424198 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23854627_23854788:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23854627_23854788:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23854627_23854788:TAF4B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 23866349 G/A 1 12 14 26 5.89486341103259 7.12265935379531 -1.22779594276273 A:G G A 10 0.508761382413951 0.697185970897261 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23865846_23866463:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23865846_23866463:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23865846_23866463:TAF4B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 23873463 T/C 1 11 8 19 5.40362479344654 4.07009105931161 1.33353373413493 T:C T C 10 0.508761382413951 0.648578515706695 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23873390_23873495:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23873390_23873495:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23873390_23873495:TAF4B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 29104698 C/T 1 10 15 25 4.91238617586049 7.63142073620926 -2.71903456034877 T:C C T 10 0.508761382413951 0.32021815508557 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29104666_29104851:DSG2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 29122799 G/A 1 13 22 35 6.38610202861864 11.1927504131069 -4.80664838448828 A:G G A 10 0.508761382413951 0.127747139091646 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29122483_29122815:DSG2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 29126670 T/C 1 33 47 80 16.2108743803396 23.9117849734557 -7.70091059311608 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0935954943576571 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 25 23 48 12.2809654396512 11.7015117955209 0.579453644130353 T:C T C 10 0.508761382413951 0.886274778895971 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 33694120 G/A 1 17 12 29 8.35105649896283 6.10513658896741 2.24591990999542 A:G G A 10 0.508761382413951 0.460273177176109 ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33694060_33694437:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33694060_33694437:SLC39A6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 2 13 15 0.982477235172098 6.61389797138136 -5.63142073620926 A:C A C 10 0.508761382413951 0.0036366919302714 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 13 18 31 6.38610202861864 9.15770488345112 -2.77160285483248 A:G G A 10 0.508761382413951 0.370907451161819 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 25 31 56 12.2809654396512 15.7716028548325 -3.49063741518125 T:C C T 10 0.508761382413951 0.422870119853089 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 34310668 C/T 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34310609_34310767:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34310609_34310767:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34310609_34310767:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34310609_34310767:FHOD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 34378445 G/A 1 45 50 95 22.1057377913722 25.4380691206975 -3.33233132932534 A:G G A 10 0.508761382413951 0.538548886207219 ENSG00000134779:ENST00000334295:exon_34378412_34378572:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000383056:exon_34378412_34378572:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000415958:exon_34378385_34378572:C18orf10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 43669618 T/C 1 283 287 570 139.020528776852 146.014516752804 -6.99398797595205 T:C T C 10 0.508761382413951 0.557930012698765 ENSG00000152234:ENST00000282050:exon_43669532_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000398752:exon_43669532_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000483666:exon_43669532_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000490226:exon_43669532_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000469552:exon_43669543_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000484856:exon_43669565_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000475026:exon_43669565_43669698:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000487439:exon_43669598_43669698:ATP5A1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 47017820 A/G 1 11 18 29 5.40362479344654 9.15770488345112 -3.75408009000458 A:G A G 10 0.508761382413951 0.194535966290898 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 47318626 T/C 1 25 38 63 12.2809654396512 19.3329325317301 -7.05196709207891 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0787904755566701 ENSG00000167315:ENST00000285093:exon_47318522_47318697:ACAA2;ENSG00000167315:ENST00000398549:exon_47318522_47318697:ACAA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 47803354 C/T 1 21 34 55 10.316010969307 17.2978870020743 -6.9818760327673 T:C C T 10 0.508761382413951 0.078621575961214 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803202_47803368:MBD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 47911594 G/T 1 8 4 12 3.92990894068839 2.0350455296558 1.89486341103259 T:G G T 10 0.508761382413951 0.388585368391447 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47911586_47911723:SKA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 47911631 A/G 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 A:G A G 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47911586_47911723:SKA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 47918536 C/T 1 19 15 34 9.33353373413493 7.63142073620926 1.70211299792567 T:C C T 10 0.508761382413951 0.60947784477379 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000488454:exon_47918469_47918621:SKA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 14 22 36 6.87734064620469 11.1927504131069 -4.31540976690223 A:C A C 10 0.508761382413951 0.182386388153018 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 29 22 51 14.2459199099954 11.1927504131069 3.0531694968885 T:C T C 10 0.508761382413951 0.404754488123582 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 55247336 C/A 1 4 10 14 1.9649544703442 5.08761382413951 -3.12265935379531 A:C C A 10 0.508761382413951 0.112778665730966 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55247305_55247431:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55247287_55247431:FECH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 55268866 C/T 1 105 84 189 51.5800548465351 42.7359561227719 8.84409872376327 T:C C T 10 0.508761382413951 0.216195295812834 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 56202982 A/T 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 A:T A T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 36 16 52 17.6845902330978 8.14018211862322 9.54440811447455 C:G G C 10 0.508761382413951 0.00827330783932831 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 34 16 50 16.7021129979257 8.14018211862322 8.56193087930245 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0161256449380705 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 14 12 26 6.87734064620469 6.10513658896741 0.772204057237275 T:G G T 10 0.508761382413951 0.845636468998877 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 7 12 19 3.43867032310234 6.10513658896741 -2.66646626586507 T:G T G 10 0.508761382413951 0.256095565288392 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 15 11 26 7.36857926379074 5.59637520655346 1.77220405723727 A:C A C 10 0.508761382413951 0.558785240284514 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 56204489 C/G 1 11 26 37 5.40362479344654 13.2277959427627 -7.82417114931619 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0127253372555558 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 56204644 T/G 1 18 13 31 8.84229511654888 6.61389797138136 2.22839714516752 T:G T G 10 0.508761382413951 0.475249037707381 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 56204747 G/A 1 16 21 37 7.85981788137678 10.683989030693 -2.82417114931619 A:G G A 10 0.508761382413951 0.412103055806027 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 60231851 A/G 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 A:G A G 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60231804_60231868:ZCCHC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 60241732 C/T 1 15 22 37 7.36857926379074 11.1927504131069 -3.82417114931619 T:C C T 10 0.508761382413951 0.250175627777529 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60241290_60242783:ZCCHC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 61647069 G/A 1 4 15 19 1.9649544703442 7.63142073620926 -5.66646626586507 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0106132033167678 ENSG00000221887:ENST00000481726:exon_61647035_61647172:HMSD;ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000448851:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61647042_61647172:SERPINB8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 61650865 G/A 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 A:G G A 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61650813_61650881:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61650813_61650955:SERPINB8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 61654463 A/G 1 17 40 57 8.35105649896283 20.350455296558 -11.9993987975952 A:C:G A G 10 0.508761382413951 0.00202813024977313 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 49 80 129 24.0706922617164 40.7009105931161 -16.6302183313997 T:C T C 10 0.508761382413951 0.00357559483628767 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 71928150 C/T 1 87 41 128 42.7377597299863 20.859216678972 21.8785430510143 T:C C T 10 0.508761382413951 0.000125289114482089 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71928150_71928179:CYB5A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 71959075 G/A 1 25 18 43 12.2809654396512 9.15770488345112 3.12326055620011 A:G G A 10 0.508761382413951 0.363555909641122 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71958982_71959251:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71958982_71959170:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71958982_71959179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71958982_71959179:CYB5A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 63 40 103 30.9480329079211 20.350455296558 10.5975776113631 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0385820030371334 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 62 63 125 30.456794290335 32.0519670920789 -1.59517280174387 T:C T C 10 0.508761382413951 0.789059720191284 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 21 26 47 10.316010969307 13.2277959427627 -2.9117849734557 T:C T C 10 0.508761382413951 0.466250994234346 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 33 17 50 16.2108743803396 8.64894350103717 7.56193087930245 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0341711767229199 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 77170477 C/A 1 12 15 27 5.89486341103259 7.63142073620926 -1.73655732517668 A:C C A 10 0.508761382413951 0.566352319356245 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 77227476 A/G 1 26 20 46 12.7722040572373 10.175227648279 2.59697640895826 A:G A G 10 0.508761382413951 0.464563634554479 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77227450_77227582:NFATC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 77246444 C/T 1 13 4 17 6.38610202861864 2.0350455296558 4.35105649896283 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0496218514424198 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 18 77703341 G/A 1 36 23 59 17.6845902330978 11.7015117955209 5.98307843757689 A:G G A 10 0.508761382413951 0.151459597041772 ENSG00000122490:ENST00000397778:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000409073:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000466449:exon_77703329_77704324:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000351365:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000357575:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000474967:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000494607:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000478144:exon_77703329_77703462:PQLC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 313633 G/A 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_313492_313643:MIER2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 327900 G/A 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 A:G G A 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_327864_327989:MIER2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 227 183 410 111.511166192033 93.103332981753 18.4078332102801 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0752567409127538 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 900951 A/G 1 36 20 56 17.6845902330978 10.175227648279 7.50936258481875 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0458571094175403 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_900829_900952:C19orf22 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 901507 A/G 1 31 19 50 15.2283971451675 9.66646626586507 5.56193087930245 A:G A G 10 0.508761382413951 0.121746312172199 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_901422_901546:C19orf22 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 929753 A/G 1 30 18 48 14.7371585275815 9.15770488345112 5.57945364413035 A:G A G 10 0.508761382413951 0.114033074351846 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_929262_929896:ARID3A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 20 23 43 9.82477235172098 11.7015117955209 -1.87673944379989 T:C C T 10 0.508761382413951 0.64798810832134 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 33 23 56 16.2108743803396 11.7015117955209 4.50936258481875 T:C C T 10 0.508761382413951 0.232805533219463 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 1278861 C/T 1 107 101 208 52.5625320817072 51.384899623809 1.1776324578982 T:C C T 10 0.508761382413951 0.889848518612497 ENSG00000228300:ENST00000409293:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000492647:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000513897:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000518332:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000530634:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000469144:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000485191:exon_1278776_1279221:C19orf24;ENSG00000226593:ENST00000416408:exon_1278776_1279242:AC004258.1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 1622116 G/A 1 114 125 239 56.0012024048096 63.5951728017439 -7.59397039693428 A:G G A 10 0.508761382413951 0.332495273928964 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1622053_1622222:TCF3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 1978491 C/T 1 37 38 75 18.1758288506838 19.3329325317301 -1.15710368104632 T:C C T 10 0.508761382413951 0.818054905518237 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1978441_1978510:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1978441_1978510:CSNK1G2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 113 76 189 55.5099637872235 38.6658650634603 16.8440987237633 A:C:G A G 10 0.508761382413951 0.0161591904896379 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 41 34 75 20.140783321028 17.2978870020743 2.84289631895368 A:T:G A G 10 0.508761382413951 0.564220700795861 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2041032 T/C 1 5 19 24 2.45619308793025 9.66646626586507 -7.21027317793482 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0035774155183165 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2042040 G/A 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 A:G G A 10 0.508761382413951 0.749901411398711 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2098015 T/C 1 5 9 14 2.45619308793025 4.57885244172556 -2.12265935379531 T:C T C 10 0.508761382413951 0.294178716907209 ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 48 41 89 23.5794536441304 20.859216678972 2.72023696515836 A:G G A 10 0.508761382413951 0.596987995569362 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2115383 C/T 1 46 33 79 22.5969764089583 16.7891256196604 5.80785078929787 T:C C T 10 0.508761382413951 0.215991925418715 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2115218_2115417:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2115218_2115417:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2115330_2115417:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2115218_2115417:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2115218_2115417:AP3D1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2138654 T/G 1 25 16 41 12.2809654396512 8.14018211862322 4.14078332102801 T:G T G 10 0.508761382413951 0.213898140616510 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2138618_2138713:AP3D1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2223327 G/A 1 28 39 67 13.7546812924094 19.8416939141441 -6.08701262173471 A:C:G G A 10 0.508761382413951 0.144024858362622 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000440640:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2223280_2223485:DOT1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2226676 G/A 1 48 61 109 23.5794536441304 31.034444327251 -7.45499068312066 A:G G A 10 0.508761382413951 0.179617284414386 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2226772 G/C 1 70 60 130 34.3867032310234 30.5256829448371 3.86102028618637 C:G G C 10 0.508761382413951 0.539490705324953 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2248020 G/A 1 101 82 183 49.615100376191 41.718433357944 7.89666701824697 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.267441828394822 ENSG00000104897:ENST00000221494:exon_2247766_2248677:SF3A2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2248152 T/C 1 161 113 274 79.0894174313539 57.4900362127765 21.5993812185774 T:C T C 10 0.508761382413951 0.00932770088296733 ENSG00000104897:ENST00000221494:exon_2247766_2248677:SF3A2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2252990 C/G 0 8 0 8 3.92990894068839 0 3.92990894068839 C C 10 0.508761382413951 0.00787971815871171 ENSG00000167476:ENST00000300961:exon_2252911_2253002:JSRP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 15 22 37 7.36857926379074 11.1927504131069 -3.82417114931619 A:C C A 10 0.508761382413951 0.250175627777529 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2732741 G/A 1 40 48 88 19.649544703442 24.4205463558696 -4.77100165242769 A:G G A 10 0.508761382413951 0.337868069247469 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 38 50 88 18.6670674682699 25.4380691206975 -6.77100165242769 T:C T C 10 0.508761382413951 0.165866318742946 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 27 33 60 13.2634426748233 16.7891256196604 -3.52568294483706 A:C A C 10 0.508761382413951 0.369692927160232 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 29 23 52 14.2459199099954 11.7015117955209 2.54440811447455 T:G G T 10 0.508761382413951 0.491932864353585 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 2917287 C/A 1 5 8 13 2.45619308793025 4.07009105931161 -1.61389797138136 A:C C A 10 0.508761382413951 0.416571082319480 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 3179081 G/A 1 47 75 122 23.0882150265443 38.1571036810463 -15.068888654502 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00653558752549431 ENSG00000125910:ENST00000246115:exon_3178766_3180329:S1PR4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 3611972 G/A 1 17 24 41 8.35105649896283 12.2102731779348 -3.85921667897199 A:G G A 10 0.508761382413951 0.274490115892508 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3610626_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3611925_3612411:C19orf29;ENSG00000226800:ENST00000447295:exon_3611729_3612412:C19orf29OS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 3653525 C/T 1 10 9 19 4.91238617586049 4.57885244172556 0.333533734134932 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3653288_3653587:PIP5K1C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 3752563 G/A 1 16 17 33 7.85981788137678 8.64894350103717 -0.789125619660382 A:G G A 10 0.508761382413951 0.862463507447866 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752506_3752718:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752506_3752718:APBA3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 3762698 C/T 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3762665_3762816:MRPL54 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 407 368 775 199.934117357522 187.224188728334 12.709928629188 A:G G A 10 0.508761382413951 0.369216468565567 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 432 394 826 212.215082797173 200.451984671097 11.7630981260765 A:G A G 10 0.508761382413951 0.423565369935501 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 8 15 23 3.92990894068839 7.63142073620926 -3.70151179552087 T:C T C 10 0.508761382413951 0.145808138014843 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 8 11 19 3.92990894068839 5.59637520655346 -1.66646626586507 T:C C T 10 0.508761382413951 0.497078070201239 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 4362691 G/C 1 16 13 29 7.85981788137678 6.61389797138136 1.24591990999542 C:G G C 10 0.508761382413951 0.712310635717891 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4362609_4362733:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4362609_4362733:SH3GL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 4409756 A/G 1 38 19 57 18.6670674682699 9.66646626586507 9.00060120240479 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0172801328915384 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 4454083 C/T 1 37 32 69 18.1758288506838 16.2803642372464 1.89546461343738 T:C C T 10 0.508761382413951 0.718329164014680 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 4457650 C/T 1 19 19 38 9.33353373413493 9.66646626586507 -0.332932531730137 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4457612_4457694:UBXN6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 4702065 G/A 1 4 7 11 1.9649544703442 3.56132967689766 -1.59637520655346 A:G G A 10 0.508761382413951 0.379976164789140 ENSG00000142002:ENST00000357909:exon_4702039_4702167:DPP9;ENSG00000142002:ENST00000381797:exon_4702039_4702167:DPP9;ENSG00000142002:ENST00000262960:exon_4702039_4702167:DPP9;ENSG00000142002:ENST00000262959:exon_4702039_4702167:DPP9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 5590291 G/T 1 30 40 70 14.7371585275815 20.350455296558 -5.61329676897657 T:G G T 10 0.508761382413951 0.190001562064668 ENSG00000130254:ENST00000252542:exon_5590289_5590419:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000434962:exon_5590289_5590419:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000394625:exon_5590289_5590419:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000415313:exon_5590289_5590419:SAFB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 5616266 C/T 1 18 14 32 8.84229511654888 7.12265935379531 1.71963576275357 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.598431040951595 ENSG00000130254:ENST00000252542:exon_5616143_5616346:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000434962:exon_5616123_5616346:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000394625:exon_5616109_5616346:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000415313:exon_5616143_5616346:SAFB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 5654449 G/A 1 79 66 145 38.8078507892979 33.5782512393208 5.22959954997711 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.406791789890287 ENSG00000160633:ENST00000433404:exon_5654379_5654467:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000292123:exon_5654379_5654467:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000454510:exon_5654379_5654467:SAFB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 5692192 C/T 1 150 163 313 73.6857926379074 82.928105333474 -9.24231269556665 T:C C T 10 0.508761382413951 0.309071233567679 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5691845_5692219:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5691846_5692219:LONP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 5696101 C/T 1 49 46 95 24.0706922617164 23.4030235910417 0.667668670674658 T:C C T 10 0.508761382413951 0.918539089133749 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 6535080 T/C 1 77 92 169 37.8253735541258 46.8060471820835 -8.98067362795771 T:C T C 10 0.508761382413951 0.190756089353894 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 6755007 T/C 1 20 15 35 9.82477235172098 7.63142073620926 2.19335161551172 T:C T C 10 0.508761382413951 0.501876804247675 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 7141775 G/A 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 A:G G A 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7141688_7141827:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7141688_7141827:INSR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 7163140 T/G 1 13 11 24 6.38610202861864 5.59637520655346 0.789726822065177 T:G T G 10 0.508761382413951 0.839412619839394 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 7163154 G/A 1 13 11 24 6.38610202861864 5.59637520655346 0.789726822065177 A:G G A 10 0.508761382413951 0.839412619839394 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 7166376 C/T 1 17 13 30 8.35105649896283 6.61389797138136 1.73715852758147 T:C C T 10 0.508761382413951 0.586407892614967 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 7166388 G/A 1 8 18 26 3.92990894068839 9.15770488345112 -5.22779594276273 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0490487434630172 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 7184518 G/A 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7184327_7184648:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7184327_7184648:INSR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 7524846 C/T 1 12 4 16 5.89486341103259 2.0350455296558 3.85981788137678 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0775291226144439 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7524789_7524880:ARHGEF18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 7524855 C/T 1 11 4 15 5.40362479344654 2.0350455296558 3.36857926379074 T:C C T 10 0.508761382413951 0.119313325605239 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7524789_7524880:ARHGEF18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 7605566 C/T 1 19 26 45 9.33353373413493 13.2277959427627 -3.89426220862779 T:C C T 10 0.508761382413951 0.296801769641811 ENSG00000032444:ENST00000221249:exon_7605516_7605596:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000414982:exon_7605516_7605596:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000450331:exon_7605516_7605596:PNPLA6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 7687428 G/A 1 39 25 64 19.1583060858559 12.7190345603488 6.43927152550714 A:G G A 10 0.508761382413951 0.132972054765388 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7687416_7687547:XAB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 63 49 112 30.9480329079211 24.9293077382836 6.01872516963749 T:C T C 10 0.508761382413951 0.258674609075408 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 50 46 96 24.5619308793025 23.4030235910417 1.15890728826071 A:G A G 10 0.508761382413951 0.838769776864437 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 7916620 A/G 1 7 12 19 3.43867032310234 6.10513658896741 -2.66646626586507 A:G A G 10 0.508761382413951 0.256095565288392 ENSG00000142459:ENST00000270530:exon_7916567_7916656:EVI5L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 8376431 G/A 1 51 37 88 25.0531694968885 18.8241711493162 6.22899834757231 A:G G A 10 0.508761382413951 0.201263195737504 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8376234_8376479:NDUFA7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 8615058 C/T 1 12 6 18 5.89486341103259 3.05256829448371 2.84229511654888 T:C C T 10 0.508761382413951 0.239188352827104 ENSG00000142347:ENST00000446661:exon_8615050_8615240:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000305795:exon_8615050_8615240:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000338257:exon_8615044_8615240:MYO1F HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 9267319 G/T 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000130803:ENST00000419608:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9267288_9267424:ZNF317 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 9524045 G/C 1 33 38 71 16.2108743803396 19.3329325317301 -3.12205815139052 C:G G C 10 0.508761382413951 0.478312500579591 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 10204230 G/A 1 21 26 47 10.316010969307 13.2277959427627 -2.9117849734557 A:G G A 10 0.508761382413951 0.466250994234346 ENSG00000130812:ENST00000253109:exon_10204025_10204295:ANGPTL6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 10205618 G/A 1 6 9 15 2.94743170551629 4.57885244172556 -1.63142073620926 A:G G A 10 0.508761382413951 0.447467080617159 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 10224454 C/T 1 65 64 129 31.9305101430932 32.5607284744929 -0.630218331399675 T:C C T 10 0.508761382413951 0.930015900296008 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000471843:exon_10224309_10224510:P2RY11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 10394792 G/A 1 42 36 78 20.6320219386141 18.3154097669022 2.31661217171182 A:G G A 10 0.508761382413951 0.651150563534697 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10394709_10394996:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10394709_10394996:ICAM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 10395683 A/G 1 104 113 217 51.0888162289491 57.4900362127765 -6.40121998382736 A:G A G 10 0.508761382413951 0.415319641689594 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000444336:exon_10395605_10395685:ICAM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 10449392 A/G 1 301 275 576 147.862823893401 139.909380163837 7.95344372956424 A:T:G A G 10 0.508761382413951 0.531948483983745 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 24 22 46 11.7897268220652 11.1927504131069 0.596976408958255 A:C C A 10 0.508761382413951 0.883819420408773 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 10568668 C/T 1 3 11 14 1.47371585275815 5.59637520655346 -4.12265935379531 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0323929383164566 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10568555_10568778:PDE4A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 10599965 G/A 1 17 31 48 8.35105649896283 15.7716028548325 -7.42054635586965 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0422000704200145 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10599868_10600044:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10599868_10600044:KEAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 23 21 44 11.2984882044791 10.683989030693 0.614499173786157 C:G G C 10 0.508761382413951 0.88120115288746 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 10668383 T/C 1 5 7 12 2.45619308793025 3.56132967689766 -1.10513658896741 T:C T C 10 0.508761382413951 0.574941367903584 ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 31 26 57 15.2283971451675 13.2277959427627 2.00060120240479 A:C:G C G 10 0.508761382413951 0.691428943009619 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 22 20 42 10.8072495868931 10.175227648279 0.632021938614059 T:C C T 10 0.508761382413951 0.878401052374126 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 10676423 G/A 1 4 8 12 1.9649544703442 4.07009105931161 -2.10513658896741 A:G G A 10 0.508761382413951 0.259199063292902 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10676393_10676696:KRI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 11215999 C/T 1 19 24 43 9.33353373413493 12.2102731779348 -2.87673944379989 T:C C T 10 0.508761382413951 0.446375871838340 ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11215896_11216276:LDLR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 11227602 C/T 1 5 10 15 2.45619308793025 5.08761382413951 -2.63142073620926 T:C C T 10 0.508761382413951 0.203076095656838 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11227535_11227674:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11227535_11227674:LDLR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 11230881 T/C 1 21 13 34 10.316010969307 6.61389797138136 3.70211299792567 T:C T C 10 0.508761382413951 0.231916072753655 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11230768_11230909:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11230768_11230909:LDLR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 11942362 A/G 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 A:G A G 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000171295:ENST00000304060:exon_11942183_11946016:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000457526:exon_11942183_11942516:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000427505:exon_11942183_11942798:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000414255:exon_11942183_11942493:ZNF440 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 11942615 A/C 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 A:C A C 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000171295:ENST00000304060:exon_11942183_11946016:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000427505:exon_11942183_11942798:ZNF440 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 11979164 T/C 1 4 7 11 1.9649544703442 3.56132967689766 -1.59637520655346 T:C T C 10 0.508761382413951 0.379976164789140 ENSG00000171291:ENST00000455282:exon_11978121_11980297:ZNF439;ENSG00000171291:ENST00000304030:exon_11978121_11980306:ZNF439 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 13035006 G/A 1 95 105 200 46.6676686706747 53.4199451534649 -6.75227648279019 A:G G A 10 0.508761382413951 0.358208762685104 ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13034965_13035079:FARSA;ENSG00000179115:ENST00000423140:exon_13034965_13035079:FARSA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 0 0 16 16 0 8.14018211862322 -8.14018211862322 T C T 10 0.508761382413951 1.14995278264635e-05 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 16238279 C/T 1 34 37 71 16.7021129979257 18.8241711493162 -2.12205815139052 T:C C T 10 0.508761382413951 0.636545702751867 ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16238247_16238336:RAB8A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 16974541 G/A 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000127511:ENST00000379803:exon_16974491_16974607:SIN3B;ENSG00000127511:ENST00000248054:exon_16974491_16974607:SIN3B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17160720 G/A 1 15 26 41 7.36857926379074 13.2277959427627 -5.85921667897199 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0848181067091321 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17160573_17160986:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17160573_17160986:HAUS8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17163661 C/T 1 19 18 37 9.33353373413493 9.15770488345112 0.175828850683814 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17163635_17163776:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17163635_17163776:HAUS8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 T:C C T 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 77 72 149 37.8253735541258 36.6308195338045 1.19455402032131 A:T:C T C 10 0.508761382413951 0.87007309234127 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 150 113 263 73.6857926379074 57.4900362127765 16.1957564251309 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0483869407611727 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 54 45 99 26.5268853496466 22.8942622086278 3.63262314101885 T:C C T 10 0.508761382413951 0.48308846679413 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 46 49 95 22.5969764089583 24.9293077382836 -2.33233132932534 T:C T C 10 0.508761382413951 0.681855795411045 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 20 29 49 9.82477235172098 14.7540800900046 -4.9293077382836 A:G A G 10 0.508761382413951 0.198069215388993 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17337871 A/G 1 13 12 25 6.38610202861864 6.10513658896741 0.280965439651226 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17337882 C/G 1 8 12 20 3.92990894068839 6.10513658896741 -2.17522764827902 C:G C G 10 0.508761382413951 0.376308412261741 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17339112 G/A 1 21 17 38 10.316010969307 8.64894350103717 1.66706746826986 A:G G A 10 0.508761382413951 0.629122810958692 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17339065_17339118:OCEL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17393530 T/A 1 12 2 14 5.89486341103259 1.0175227648279 4.87734064620469 A:T T A 10 0.508761382413951 0.0131238438594985 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17393465_17393570:ANKLE1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17394124 T/G 1 17 14 31 8.35105649896283 7.12265935379531 1.22839714516752 T:G T G 10 0.508761382413951 0.721386502145606 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394034_17394693:ANKLE1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17394504 A/C 1 17 16 33 8.35105649896283 8.14018211862322 0.210874380339618 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394034_17394693:ANKLE1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17395003 A/G 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 A:G A G 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394898_17395075:ANKLE1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17395055 C/G 1 12 4 16 5.89486341103259 2.0350455296558 3.85981788137678 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0775291226144439 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394898_17395075:ANKLE1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17396549 T/C 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 T:C T C 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17396490_17396628:ANKLE1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17412366 G/A 1 12 6 18 5.89486341103259 3.05256829448371 2.84229511654888 A:G G A 10 0.508761382413951 0.239188352827104 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17412399 G/A 1 9 6 15 4.42114755827444 3.05256829448371 1.36857926379074 A:G G A 10 0.508761382413951 0.60808216621752 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17448961 A/C 1 24 21 45 11.7897268220652 10.683989030693 1.10573779137221 A:C A C 10 0.508761382413951 0.767567473040684 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17448817_17449064:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17448817_17449064:GTPBP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17450016 T/C 1 11 17 28 5.40362479344654 8.64894350103717 -3.24531870759063 T:C T C 10 0.508761382413951 0.258527448393057 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 17451981 G/A 1 18 14 32 8.84229511654888 7.12265935379531 1.71963576275357 A:G G A 10 0.508761382413951 0.598431040951595 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17451853_17452131:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17451853_17452131:GTPBP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 18555643 G/A 1 12 16 28 5.89486341103259 8.14018211862322 -2.24531870759063 A:G G A 10 0.508761382413951 0.452217834143186 ENSG00000105656:ENST00000262809:exon_18553475_18555678:ELL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 73 39 112 35.8604190837816 19.8416939141441 16.0187251696375 T:C T C 10 0.508761382413951 0.00243618224123542 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 19049198 G/A 1 12 5 17 5.89486341103259 2.54380691206975 3.35105649896283 A:G G A 10 0.508761382413951 0.144506573427302 ENSG00000051128:ENST00000221222:exon_19049162_19049293:HOMER3;ENSG00000051128:ENST00000433218:exon_19049162_19049293:HOMER3;ENSG00000051128:ENST00000355887:exon_19049162_19049293:HOMER3;ENSG00000051128:ENST00000392351:exon_19049162_19049293:HOMER3;ENSG00000051128:ENST00000357832:exon_19049162_19049293:HOMER3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 19136454 G/A 1 63 49 112 30.9480329079211 24.9293077382836 6.01872516963749 A:G G A 10 0.508761382413951 0.258674609075408 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 19243175 C/T 1 14 17 31 6.87734064620469 8.64894350103717 -1.77160285483248 T:C C T 10 0.508761382413951 0.591853548885225 ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19243161_19243317:TMEM161A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 19416742 G/A 1 11 10 21 5.40362479344654 5.08761382413951 0.31601096930703 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19416658_19416885:SUGP1;ENSG00000105705:ENST00000334782:exon_19416658_19416885:SUGP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 19735043 G/A 1 30 24 54 14.7371585275815 12.2102731779348 2.52688534964665 A:G G A 10 0.508761382413951 0.500191503504275 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19734468_19735378:LPAR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 19740729 C/G 1 134 122 256 65.8259747565306 62.068888654502 3.75708610202855 A:C:G C G 10 0.508761382413951 0.661939975424521 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 19790159 A/C 1 17 16 33 8.35105649896283 8.14018211862322 0.210874380339618 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000181896:ENST00000318110:exon_19789990_19791412:ZNF101;ENSG00000181896:ENST00000415440:exon_19789990_19791412:ZNF101 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 19822443 A/G 1 2 10 12 0.982477235172098 5.08761382413951 -4.10513658896741 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0204165055162834 ENSG00000105708:ENST00000344099:exon_19821282_19823898:ZNF14 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 21719401 T/C 1 4 8 12 1.9649544703442 4.07009105931161 -2.10513658896741 T:C T C 10 0.508761382413951 0.259199063292902 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 23542697 G/C 1 17 5 22 8.35105649896283 2.54380691206975 5.80724958689308 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0172615913671775 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 23837145 A/G 1 6 15 21 2.94743170551629 7.63142073620926 -4.68398903069297 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0491093636229696 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 33096786 G/A 1 14 5 19 6.87734064620469 2.54380691206975 4.33353373413493 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0643310571506474 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 21 13 34 10.316010969307 6.61389797138136 3.70211299792567 T:C C T 10 0.508761382413951 0.231916072753655 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 8 5 13 3.92990894068839 2.54380691206975 1.38610202861864 T:C C T 10 0.508761382413951 0.581825911412537 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 33117666 T/C 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 T:C T C 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33117618_33117733:ANKRD27 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 33183352 G/C 1 19 6 25 9.33353373413493 3.05256829448371 6.28096543965123 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0150034923902544 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 33467576 G/A 1 12 8 20 5.89486341103259 4.07009105931161 1.82477235172098 A:G G A 10 0.508761382413951 0.504771039081216 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 33470874 A/G 1 6 11 17 2.94743170551629 5.59637520655346 -2.64894350103717 A:G A G 10 0.508761382413951 0.230781110739111 ENSG00000131941:ENST00000254260:exon_33469499_33471162:RHPN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 33600764 T/C 1 3 9 12 1.47371585275815 4.57885244172556 -3.10513658896741 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0871818487647519 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33600623_33600922:GPATCH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 33605300 A/G 1 9 2 11 4.42114755827444 1.0175227648279 3.40362479344654 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0658750571190468 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 33878198 A/G 1 15 15 30 7.36857926379074 7.63142073620926 -0.262841472418529 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33877865_33878387:PEPD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 35434512 T/C 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 T:C T C 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000168661:ENST00000303586:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000439785:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000426813:exon_35434127_35436074:ZNF30 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 35435006 G/A 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 A:G G A 10 0.508761382413951 0.770813353200887 ENSG00000168661:ENST00000303586:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000439785:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000426813:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000342559:exon_35434996_35435724:ZNF30 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 35435069 A/G 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 A:G A G 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000168661:ENST00000303586:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000439785:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000426813:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000342559:exon_35434996_35435724:ZNF30 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 35435589 C/T 1 8 3 11 3.92990894068839 1.52628414724185 2.40362479344654 T:C C T 10 0.508761382413951 0.227353863226797 ENSG00000168661:ENST00000303586:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000439785:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000426813:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000342559:exon_35434996_35435724:ZNF30 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 35501051 T/C 1 37 36 73 18.1758288506838 18.3154097669022 -0.139580916218421 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35500996_35501099:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35500996_35501099:GRAMD1A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 60 60 120 29.4743170551629 30.5256829448371 -1.05136588967412 A:T:G T G 10 0.508761382413951 0.855666207868912 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 97 90 187 47.6501459058468 45.7885244172556 1.86162148859117 A:G A G 10 0.508761382413951 0.82643881650878 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 35741456 T/C 1 12 11 23 5.89486341103259 5.59637520655346 0.298488204479128 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 35757427 G/A 1 14 18 32 6.87734064620469 9.15770488345112 -2.28036423724643 A:G G A 10 0.508761382413951 0.481273059851305 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35757262_35757435:LSR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 35770056 G/A 1 30 6 36 14.7371585275815 3.05256829448371 11.6845902330978 A:G G A 10 0.508761382413951 7.56723985558551e-05 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 320 278 598 157.196357627536 141.435664311078 15.7606933164573 A:C:G A G 10 0.508761382413951 0.204892599322743 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 36033460 C/T 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000105679:ENST00000222286:exon_36033392_36033510:GAPDHS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 39 68 107 19.1583060858559 34.5957740041487 -15.4374679182928 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00352801048767451 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 36205695 G/T 1 101 101 202 49.615100376191 51.384899623809 -1.7697992476181 T:G G T 10 0.508761382413951 0.832945228058217 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36205529_36206409:ZBTB32 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 36224705 A/G 1 17 15 32 8.35105649896283 7.63142073620926 0.719635762753569 A:G A G 10 0.508761382413951 0.860736024832152 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 36230174 T/C 1 118 72 190 57.9661568751538 36.6308195338045 21.3353373413493 T:C T C 10 0.508761382413951 0.00222786190676249 ENSG00000126246:ENST00000246532:exon_36230153_36230527:TMEM149;ENSG00000126246:ENST00000344990:exon_36230153_36230527:TMEM149 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 36273308 G/A 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36273275_36273419:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36273275_36273419:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36273275_36273419:ARHGAP33 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 36273534 G/A 1 9 4 13 4.42114755827444 2.0350455296558 2.38610202861864 A:G G A 10 0.508761382413951 0.267810029003266 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36273499_36273581:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36273499_36273581:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36273499_36273581:ARHGAP33 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 36275074 G/A 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36275074_36275219:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36275074_36275219:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36275074_36275219:ARHGAP33 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 A:C A C 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 37004938 T/C 1 6 11 17 2.94743170551629 5.59637520655346 -2.64894350103717 T:C:G T C 10 0.508761382413951 0.230781110739111 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 37005998 A/G 1 21 18 39 10.316010969307 9.15770488345112 1.15830608585591 A:G A G 10 0.508761382413951 0.750717389169567 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 37039069 A/C 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 37117302 A/G 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000161298:ENST00000423582:exon_37117032_37118894:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000292928:exon_37117032_37119499:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000441040:exon_37117035_37118452:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000439428:exon_37117032_37119469:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000435416:exon_37117035_37119172:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000455093:exon_37117032_37119498:ZNF382 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 37210805 C/T 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 37310344 T/C 1 2 8 10 0.982477235172098 4.07009105931161 -3.08761382413951 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0611719145334834 ENSG00000197863:ENST00000356725:exon_37309224_37311016:ZNF790 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 37441111 C/T 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 T:C C T 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000198453:ENST00000333987:exon_37440414_37441990:ZNF568;ENSG00000198453:ENST00000415168:exon_37440414_37443645:ZNF568 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 22 26 48 10.8072495868931 13.2277959427627 -2.42054635586965 T:G G T 10 0.508761382413951 0.564196326847116 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 38189616 T/C 1 3 13 16 1.47371585275815 6.61389797138136 -5.14018211862322 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0114213996535228 ENSG00000198182:ENST00000355202:exon_38187276_38190796:ZNF607 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 33 30 63 16.2108743803396 15.2628414724185 0.948032907921089 T:C C T 10 0.508761382413951 0.899870196684743 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 38800176 G/A 1 32 27 59 15.7196357627536 13.7365573251767 1.98307843757689 A:G G A 10 0.508761382413951 0.696434551434237 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 38893856 G/C 1 15 10 25 7.36857926379074 5.08761382413951 2.28096543965123 C:G G C 10 0.508761382413951 0.426148435268484 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38893775_38893858:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38893775_38893858:FAM98C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 38894102 G/A 1 8 8 16 3.92990894068839 4.07009105931161 -0.140182118623216 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38893978_38894126:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38893978_38894126:FAM98C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 38896244 C/A 1 11 12 23 5.40362479344654 6.10513658896741 -0.701511795520872 A:C C A 10 0.508761382413951 0.836548497602108 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38896159_38896275:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38896159_38896275:FAM98C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 38899548 G/A 1 2 7 9 0.982477235172098 3.56132967689766 -2.57885244172556 A:G G A 10 0.508761382413951 0.103646439844753 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38899391_38899728:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38899391_38899728:FAM98C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 109 91 200 53.5450093168793 46.2972857996695 7.24772351720981 T:C:G T C 10 0.508761382413951 0.322451859885019 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 39100594 G/A 1 54 100 154 26.5268853496466 50.8761382413951 -24.3492528917484 A:G G A 10 0.508761382413951 9.73827096633974e-05 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39100549_39100665:MAP4K1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 39307103 C/T 1 136 106 242 66.8084519917027 53.9287065358788 12.8797454558239 T:C C T 10 0.508761382413951 0.107837552791254 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39307093_39307163:ECH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 39322087 T/G 1 95 132 227 46.6676686706747 67.1565024786415 -20.4888338079669 T:G T G 10 0.508761382413951 0.00778503912993989 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 39907036 C/T 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000451354:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39906988_39907054:PLEKHG2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 39908574 C/T 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 T:C C T 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000478523:exon_39908485_39908745:PLEKHG2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 39955515 C/T 1 65 68 133 31.9305101430932 34.5957740041487 -2.66526386105548 T:C C T 10 0.508761382413951 0.665227618519964 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39955438_39955689:SUPT5H HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 40541903 C/T 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 T:C C T 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000128000:ENST00000434248:exon_40534167_40542533:ZNF780B;ENSG00000128000:ENST00000221355:exon_40539486_40542533:ZNF780B;ENSG00000128000:ENST00000412146:exon_40540228_40542533:ZNF780B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 40719410 C/T 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 T:C C T 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 40719497 A/G 1 9 9 18 4.42114755827444 4.57885244172556 -0.157704883451117 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40719424_40720128:MAP3K10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 40928944 A/G 1 26 24 50 12.7722040572373 12.2102731779348 0.561930879302452 A:G A G 10 0.508761382413951 0.888583503958265 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 40928968 A/G 1 24 23 47 11.7897268220652 11.7015117955209 0.0882150265443045 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 25 20 45 12.2809654396512 10.175227648279 2.10573779137221 T:C T C 10 0.508761382413951 0.554242561106102 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 41822457 C/T 1 40 30 70 19.649544703442 15.2628414724185 4.38670323102343 T:C C T 10 0.508761382413951 0.339161478731843 ENSG00000142039:ENST00000269967:exon_41822289_41822744:CCDC97 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 42911769 G/A 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 A:G G A 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42911758_42911943:LIPE HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44103251 C/A 1 14 6 20 6.87734064620469 3.05256829448371 3.82477235172098 A:C C A 10 0.508761382413951 0.116430409892464 ENSG00000124444:ENST00000391965:exon_44102983_44104156:ZNF576;ENSG00000124444:ENST00000525771:exon_44102983_44104522:ZNF576;ENSG00000124444:ENST00000533118:exon_44102983_44103646:ZNF576;ENSG00000124444:ENST00000528387:exon_44102983_44103677:ZNF576;ENSG00000124444:ENST00000529930:exon_44102983_44103566:ZNF576;ENSG00000124444:ENST00000336564:exon_44102983_44105309:ZNF576 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44377669 G/A 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 A:G G A 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000176222:ENST00000324394:exon_44376519_44378229:ZNF404 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44418680 G/C 1 20 15 35 9.82477235172098 7.63142073620926 2.19335161551172 C:G G C 10 0.508761382413951 0.501876804247675 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44418776 G/A 1 19 13 32 9.33353373413493 6.61389797138136 2.71963576275357 A:G G A 10 0.508761382413951 0.379440812961881 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44418824 C/T 1 21 12 33 10.316010969307 6.10513658896741 4.21087438033962 T:C C T 10 0.508761382413951 0.164884756427116 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44501518 G/A 1 10 5 15 4.91238617586049 2.54380691206975 2.36857926379074 A:G G A 10 0.508761382413951 0.302882686663208 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44515074 C/A 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 A:C C A 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44515352 T/G 1 6 12 18 2.94743170551629 6.10513658896741 -3.15770488345112 T:G T G 10 0.508761382413951 0.160737760390294 ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44515341_44515400:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44515514 C/A 1 8 8 16 3.92990894068839 4.07009105931161 -0.140182118623216 A:C C A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44610665 A/G 1 7 11 18 3.43867032310234 5.59637520655346 -2.15770488345112 A:G A G 10 0.508761382413951 0.352056460206795 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44610798 A/T 1 15 17 32 7.36857926379074 8.64894350103717 -1.28036423724643 A:T A T 10 0.508761382413951 0.72498863519702 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44611162 G/T 1 20 9 29 9.82477235172098 4.57885244172556 5.24591990999542 T:G G T 10 0.508761382413951 0.0625744282787756 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 12 18 30 5.89486341103259 9.15770488345112 -3.26284147241853 T:C T C 10 0.508761382413951 0.274744112838359 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44660967 A/G 1 10 6 16 4.91238617586049 3.05256829448371 1.85981788137678 A:G A G 10 0.508761382413951 0.455622877460238 ENSG00000159905:ENST00000426739:exon_44660405_44664462:ZNF234;ENSG00000159905:ENST00000244316:exon_44660405_44664462:ZNF234 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44680489 G/A 1 5 11 16 2.45619308793025 5.59637520655346 -3.14018211862322 A:G G A 10 0.508761382413951 0.137380042418554 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44732658 C/G 1 5 7 12 2.45619308793025 3.56132967689766 -1.10513658896741 C:G C G 10 0.508761382413951 0.574941367903584 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44732599_44732725:ZNF227 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44739303 T/C 1 21 19 40 10.316010969307 9.66646626586507 0.649544703441961 T:C T C 10 0.508761382413951 0.875396965359485 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44740602 G/A 1 19 16 35 9.33353373413493 8.14018211862322 1.19335161551172 A:G G A 10 0.508761382413951 0.73725408039855 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44981516 C/T 1 10 9 19 4.91238617586049 4.57885244172556 0.333533734134932 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 44981883 C/G 1 14 12 26 6.87734064620469 6.10513658896741 0.772204057237275 C:G C G 10 0.508761382413951 0.845636468998877 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 45476422 T/C 1 12 15 27 5.89486341103259 7.63142073620926 -1.73655732517668 T:C T C 10 0.508761382413951 0.566352319356245 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45476344_45476467:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45476344_45476467:CLPTM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 45490570 A/G 1 8 10 18 3.92990894068839 5.08761382413951 -1.15770488345112 A:G A G 10 0.508761382413951 0.642640691319775 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 45868309 T/G 1 5 9 14 2.45619308793025 4.57885244172556 -2.12265935379531 T:G T G 10 0.508761382413951 0.294178716907209 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391940:exon_45868300_45868416:ERCC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 30 27 57 14.7371585275815 13.7365573251767 1.00060120240479 A:C A C 10 0.508761382413951 0.894764083157457 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 67 43 110 32.9129873782653 21.8767394437999 11.0362479344654 A:T:G A G 10 0.508761382413951 0.0361461510919697 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 48 40 88 23.5794536441304 20.350455296558 3.22899834757231 A:G G A 10 0.508761382413951 0.523335653948859 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 43 32 75 21.1232605562001 16.2803642372464 4.84289631895368 A:C C A 10 0.508761382413951 0.298929440058967 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 46024584 T/G 1 145 128 273 71.2295995499771 65.1214569489857 6.10814260099139 T:G T G 10 0.508761382413951 0.468186351155851 ENSG00000125753:ENST00000245932:exon_46024580_46024664:VASP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 46857015 C/T 1 50 54 104 24.5619308793025 27.4731146503534 -2.9111837710509 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.624133110562514 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46857005_46857164:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46857005_46857246:PPP5C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 122 123 245 59.931111345498 62.577650036916 -2.64653869141799 A:G G A 10 0.508761382413951 0.749665995349491 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 48248864 C/A 1 615 618 1233 302.11174981542 314.414534331822 -12.3027845164016 A:C C A 10 0.508761382413951 0.494274191207374 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 218 279 497 107.090018633759 141.944425693492 -34.8544070597336 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00193721157092451 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 48260277 C/T 1 221 126 347 108.563734486517 64.1039341841578 44.459800302359 T:C C T 10 0.508761382413951 1.60550976735634e-06 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48260256_48260314:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48260256_48260314:GLTSCR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 14 15 29 6.87734064620469 7.63142073620926 -0.754080090004578 C:G C G 10 0.508761382413951 0.853634761322044 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 48668830 G/A 1 6 16 22 2.94743170551629 8.14018211862322 -5.19275041310692 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0321407832002721 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48668807_48668880:LIG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 20 13 33 9.82477235172098 6.61389797138136 3.21087438033962 T:C T C 10 0.508761382413951 0.298661263457526 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 48836673 G/T 1 11 11 22 5.40362479344654 5.59637520655346 -0.192750413106921 T:C:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000161558:ENST00000435956:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000377431:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48835613_48836690:TMEM143 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 48863386 C/T 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 T:C C T 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48863329_48863433:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48863329_48863433:TMEM143 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 49377221 G/A 1 176 189 365 86.4579966951446 96.1559012762367 -9.6979045810921 A:G G A 10 0.508761382413951 0.320136538691297 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 49458262 C/T 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 T:C C T 10 0.508761382413951 0.335736887982477 ENSG00000087088:ENST00000502487:exon_49458072_49458856:BAX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G A G 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 1787 2196 3983 877.84340962627 1117.23999578104 -239.396586154767 T:C:G T C 10 0.508761382413951 3.35479207291765e-14 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 49513273 C/T 1 66 68 134 32.4217487606792 34.5957740041487 -2.17402524346943 T:C C T 10 0.508761382413951 0.730175588115668 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513230_49513323:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513230_49513428:RUVBL2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 50059050 C/T 1 23 28 51 11.2984882044791 14.2453187075906 -2.9468305031115 T:C C T 10 0.508761382413951 0.48419188484887 ENSG00000142546:ENST00000339093:exon_50058970_50059079:NOSIP;ENSG00000142546:ENST00000391853:exon_50058970_50059079:NOSIP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 75 81 156 36.8428963189537 41.20967197553 -4.36677565657635 C:G C G 10 0.508761382413951 0.521992375722085 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 50310466 G/A 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 A:G G A 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50310126_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50310150_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50310154_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50310177_50310631:FUZ HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 50322482 C/G 1 7 14 21 3.43867032310234 7.12265935379531 -3.68398903069297 C:G C G 10 0.508761382413951 0.128195044803432 ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312881:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50322429_50322553:MED25 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 23 18 41 11.2984882044791 9.15770488345112 2.14078332102801 T:C T C 10 0.508761382413951 0.535298801316041 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 50385545 G/A 1 20 35 55 9.82477235172098 17.8066483844883 -7.9818760327673 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0420963232063295 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50385499_50385657:TBC1D17 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 50387750 G/C 1 21 30 51 10.316010969307 15.2628414724185 -4.9468305031115 C:G G C 10 0.508761382413951 0.207126802744976 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50387716_50387816:TBC1D17 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 50393269 A/G 1 256 254 510 125.757086102029 129.225391133144 -3.46830503111499 A:G A G 10 0.508761382413951 0.790482367150644 ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 50905042 G/A 1 12 16 28 5.89486341103259 8.14018211862322 -2.24531870759063 A:G G A 10 0.508761382413951 0.452217834143186 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 50905074 G/A 1 16 16 32 7.85981788137678 8.14018211862322 -0.280364237246431 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 50967640 G/A 1 4 12 16 1.9649544703442 6.10513658896741 -4.14018211862322 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0456569950629327 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50967603_50967789:MYBPC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 50983930 C/T 1 41 38 79 20.140783321028 19.3329325317301 0.807850789297873 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.910591118869892 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 51228634 G/A 0 8 0 8 3.92990894068839 0 3.92990894068839 G G 10 0.508761382413951 0.00787971815871171 ENSG00000105472:ENST00000250340:exon_51228279_51228979:CLEC11A;ENSG00000105472:ENST00000445043:exon_51228230_51228657:CLEC11A;ENSG00000105472:ENST00000445858:exon_51228573_51228975:CLEC11A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 117 114 231 57.4749182575677 57.9987975951904 -0.523879337622674 T:C T C 10 0.508761382413951 0.947650464685078 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 62 57 119 30.456794290335 28.9993987975952 1.45739549273983 C:G C G 10 0.508761382413951 0.854614173486137 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 67 70 137 32.9129873782653 35.6132967689766 -2.70030939071128 A:G A G 10 0.508761382413951 0.669741696146199 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 51850290 G/A 1 52 44 96 25.5444081144745 22.3855008262138 3.15890728826071 A:G G A 10 0.508761382413951 0.541474357935067 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 52393984 C/T 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 T:C C T 10 0.508761382413951 0.335736887982477 ENSG00000198093:ENST00000354957:exon_52392489_52395150:ZNF649 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 52496149 C/T 1 9 8 17 4.42114755827444 4.07009105931161 0.351056498962834 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000197619:ENST00000376716:exon_52494588_52498090:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000354939:exon_52494748_52498090:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391793:exon_52496133_52496567:ZNF615 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 52519608 C/T 1 23 22 45 11.2984882044791 11.1927504131069 0.105737791372206 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 52520607 C/T 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000142556:ENST00000356322:exon_52520370_52520612:ZNF614;ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 52537576 T/G 1 9 6 15 4.42114755827444 3.05256829448371 1.36857926379074 T:G T G 10 0.508761382413951 0.60808216621752 ENSG00000197619:ENST00000221315:exon_52536361_52538693:ZNF615 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 52658510 T/C 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000196267:ENST00000322146:exon_52658125_52660793:ZNF836;ENSG00000196267:ENST00000457013:exon_52658125_52660793:ZNF836 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 52887437 A/C 1 4 16 20 1.9649544703442 8.14018211862322 -6.17522764827902 A:C A C 10 0.508761382413951 0.00638357951782834 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 1 3 8 11 1.47371585275815 4.07009105931161 -2.59637520655346 T:C T C 10 0.508761382413951 0.139557898450825 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53085659 C/T 1 12 9 21 5.89486341103259 4.57885244172556 1.31601096930703 T:C C T 10 0.508761382413951 0.664655217869201 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391786:exon_53085455_53085751:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53085813 T/C 1 8 4 12 3.92990894068839 2.0350455296558 1.89486341103259 T:C T C 10 0.508761382413951 0.388585368391447 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53086124 C/A 1 11 10 21 5.40362479344654 5.08761382413951 0.31601096930703 A:C C A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53116476 G/A 1 56 36 92 27.5093625848187 18.3154097669022 9.19395281791651 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0604599239201638 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53115620_53116929:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53115620_53116929:ZNF83 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53208161 A/C 1 4 8 12 1.9649544703442 4.07009105931161 -2.10513658896741 A:C A C 10 0.508761382413951 0.259199063292902 ENSG00000213020:ENST00000319783:exon_53207472_53210117:ZNF611 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53209381 A/G 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 A:G A G 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000213020:ENST00000319783:exon_53207472_53210117:ZNF611 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53209399 G/T 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 T:G G T 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000213020:ENST00000319783:exon_53207472_53210117:ZNF611 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53302942 C/T 1 10 5 15 4.91238617586049 2.54380691206975 2.36857926379074 T:C C T 10 0.508761382413951 0.302882686663208 ENSG00000198538:ENST00000360272:exon_53300659_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000438150:exon_53300661_53304940:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000457749:exon_53300662_53304955:ZNF28 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53303527 A/G 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 A:G A G 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000198538:ENST00000360272:exon_53300659_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000438150:exon_53300661_53304940:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000457749:exon_53300662_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000391783:exon_53303301_53304955:ZNF28 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53344701 A/G 1 13 5 18 6.38610202861864 2.54380691206975 3.84229511654888 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0971656837274008 ENSG00000204604:ENST00000243639:exon_53341786_53345404:ZNF468;ENSG00000204604:ENST00000396409:exon_53343932_53345404:ZNF468 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53344919 T/G 1 14 6 20 6.87734064620469 3.05256829448371 3.82477235172098 T:G T G 10 0.508761382413951 0.116430409892464 ENSG00000204604:ENST00000243639:exon_53341786_53345404:ZNF468;ENSG00000204604:ENST00000396409:exon_53343932_53345404:ZNF468 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53345321 T/G 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 T:G T G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000204604:ENST00000243639:exon_53341786_53345404:ZNF468;ENSG00000204604:ENST00000396409:exon_53343932_53345404:ZNF468 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53384185 C/T 1 1 7 8 0.491238617586049 3.56132967689766 -3.07009105931161 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0359761797629569 ENSG00000182986:ENST00000331416:exon_53379425_53385236:ZNF320;ENSG00000182986:ENST00000391781:exon_53383849_53385236:ZNF320 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53409976 T/C 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C T C 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53453777 C/T 1 9 8 17 4.42114755827444 4.07009105931161 0.351056498962834 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53454543 G/A 1 15 9 24 7.36857926379074 4.57885244172556 2.78972682206518 A:G G A 10 0.508761382413951 0.309249018183124 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53454789 A/T 1 11 2 13 5.40362479344654 1.0175227648279 4.38610202861864 A:T A T 10 0.508761382413951 0.0227184069815744 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53577419 G/C 1 16 10 26 7.85981788137678 5.08761382413951 2.77220405723727 C:G G C 10 0.508761382413951 0.328881444923395 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000355147:exon_53577393_53577521:ZNF160 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53645291 T/C 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 T:C T C 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000197937:ENST00000334197:exon_53642648_53645809:ZNF347;ENSG00000197937:ENST00000452676:exon_53643171_53645809:ZNF347;ENSG00000197937:ENST00000391778:exon_53643171_53645809:ZNF347 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53958126 T/G 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 T:G T G 10 0.508761382413951 0.800607341092145 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53958263 G/A 1 11 14 25 5.40362479344654 7.12265935379531 -1.71903456034877 A:G G A 10 0.508761382413951 0.55170289457065 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53958798 G/T 1 18 16 34 8.84229511654888 8.14018211862322 0.702112997925667 T:G G T 10 0.508761382413951 0.864873527062112 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53993988 A/T 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 A:T A T 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000198346:ENST00000396403:exon_53993629_53999509:ZNF813;ENSG00000198346:ENST00000468450:exon_53993629_53994020:ZNF813 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 53994178 G/A 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 A:G G A 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000198346:ENST00000396403:exon_53993629_53999509:ZNF813 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 54080144 A/G 0 21 0 21 10.316010969307 0 10.316010969307 A A 10 0.508761382413951 1.01570678424625e-06 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55174498 T/C 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 T:C T C 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174124_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174407_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174447_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174450_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174472_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174479_55174519:LILRB4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55175009 G/T 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 T:G G T 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174990_55175025:LILRB4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 T:C C T 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 A:G A G 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55179387 C/A 1 5 7 12 2.45619308793025 3.56132967689766 -1.10513658896741 A:C C A 10 0.508761382413951 0.574941367903584 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55179324_55181810:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55179324_55179844:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55179324_55179855:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55179324_55179848:LILRB4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55493651 C/T 1 17 6 23 8.35105649896283 3.05256829448371 5.29848820447913 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0353183846323172 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55494632 A/G 1 26 3 29 12.7722040572373 1.52628414724185 11.2459199099954 A:G A G 10 0.508761382413951 1.64441335788922e-05 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55494740 T/C 1 32 2 34 15.7196357627536 1.0175227648279 14.7021129979257 T:C T C 10 0.508761382413951 7.8866358101102e-08 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55494881 C/G 1 5 28 33 2.45619308793025 14.2453187075906 -11.7891256196604 C:G C G 10 0.508761382413951 3.03298772894958e-05 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55512137 C/A 1 11 52 63 5.40362479344654 26.4555918855255 -21.0519670920789 A:C C A 10 0.508761382413951 7.5913536473098e-08 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55512232 C/A 1 5 17 22 2.45619308793025 8.64894350103717 -6.19275041310692 A:C C A 10 0.508761382413951 0.0095397710397106 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55512316 T/G 1 7 18 25 3.43867032310234 9.15770488345112 -5.71903456034877 T:G T G 10 0.508761382413951 0.026772452822341 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55568084 C/T 1 9 3 12 4.42114755827444 1.52628414724185 2.89486341103259 T:C C T 10 0.508761382413951 0.146738110644472 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55568085 G/T 1 9 3 12 4.42114755827444 1.52628414724185 2.89486341103259 T:G G T 10 0.508761382413951 0.146738110644472 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55756980 A/G 1 83 83 166 40.7728052596421 42.2271947403579 -1.45438948071586 A:G A G 10 0.508761382413951 0.876683535027512 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55756860_55757046:PPP6R1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 15 9 24 7.36857926379074 4.57885244172556 2.78972682206518 T:C C T 10 0.508761382413951 0.309249018183124 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55995272 G/A 1 15 17 32 7.36857926379074 8.64894350103717 -1.28036423724643 A:G G A 10 0.508761382413951 0.72498863519702 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 55998317 C/A 1 28 25 53 13.7546812924094 12.7190345603488 1.0356467320606 A:C C A 10 0.508761382413951 0.785565299991673 ENSG00000090971:ENST00000205194:exon_55997775_55998935:NAT14 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 57132968 G/A 1 8 10 18 3.92990894068839 5.08761382413951 -1.15770488345112 A:G G A 10 0.508761382413951 0.642640691319775 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 58058739 T/C 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000251369:ENST00000506609:exon_58058343_58059361:ZNF550 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 58117223 T/A 1 9 6 15 4.42114755827444 3.05256829448371 1.36857926379074 A:T T A 10 0.508761382413951 0.60808216621752 ENSG00000183647:ENST00000332854:exon_58117054_58119637:ZNF530 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 58199291 C/T 1 10 5 15 4.91238617586049 2.54380691206975 2.36857926379074 T:C C T 10 0.508761382413951 0.302882686663208 ENSG00000204519:ENST00000356715:exon_58197849_58201167:ZNF551;ENSG00000204519:ENST00000282296:exon_58197849_58201167:ZNF551;ENSG00000204519:ENST00000359821:exon_58198706_58199560:ZNF551 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 58233008 G/A 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231855_58233065:ZNF671 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 58319906 C/G 1 12 27 39 5.89486341103259 13.7365573251767 -7.84169391414409 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0153328872994043 ENSG00000178935:ENST00000391701:exon_58318450_58320471:ZNF552 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 58453342 T/C 1 19 15 34 9.33353373413493 7.63142073620926 1.70211299792567 T:C T C 10 0.508761382413951 0.60947784477379 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58452206_58454015:ZNF256 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 58904396 G/A 1 1832 1845 3677 899.949147417642 938.66475055374 -38.7156031360977 A:T:C:G G A 10 0.508761382413951 0.204090516981124 ENSG00000083845:ENST00000196551:exon_58904343_58904552:RPS5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 59010593 A/G 1 6 6 12 2.94743170551629 3.05256829448371 -0.105136588967412 A:G A G 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 59059729 G/A 1 212 198 410 104.142586928242 100.734753717962 3.4078332102801 A:G G A 10 0.508761382413951 0.76700506079986 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59059661_59059775:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59059661_59059775:TRIM28 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 59061357 C/T 1 304 338 642 149.336539746159 171.961347255915 -22.6248075097565 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0757334037665632 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59061316_59061402:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59061316_59061402:TRIM28 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 59073613 A/G 1 9 25 34 4.42114755827444 12.7190345603488 -8.29788700207433 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00537372830439313 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 59074429 C/T 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 59074653 T/C 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 T:C T C 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 19 59082368 C/T 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59082361_59082796:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59082361_59082796:MZF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 8870862 T/C 1 26 27 53 12.7722040572373 13.7365573251767 -0.964353267939401 T:C T C 10 0.508761382413951 0.890903905586243 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 20133254 C/A 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:C C A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000118965:ENST00000345530:exon_20133162_20133272:WDR35;ENSG00000118965:ENST00000281405:exon_20133162_20133272:WDR35;ENSG00000118965:ENST00000414212:exon_20133162_20133272:WDR35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 20403949 C/T 1 12 10 22 5.89486341103259 5.08761382413951 0.807249586893079 T:C C T 10 0.508761382413951 0.832379092287417 ENSG00000115884:ENST00000254351:exon_20403574_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000381150:exon_20403574_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000403076:exon_20403723_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000482879:exon_20403763_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000429035:exon_20403579_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000447124:exon_20403913_20404052:SDC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 20824498 C/T 1 8 6 14 3.92990894068839 3.05256829448371 0.877340646204686 T:C C T 10 0.508761382413951 0.79097715531601 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000415264:exon_20824492_20824533:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 20838222 C/T 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20838196_20838275:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 24929851 A/T 1 34 28 62 16.7021129979257 14.2453187075906 2.45679429033504 A:T A T 10 0.508761382413951 0.611794225221805 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24929437_24930757:NCOA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 25064157 G/C 1 22 16 38 10.8072495868931 8.14018211862322 2.66706746826986 C:G G C 10 0.508761382413951 0.420419027699363 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 25064193 G/A 1 13 15 28 6.38610202861864 7.63142073620926 -1.24531870759063 A:G G A 10 0.508761382413951 0.707356544758575 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 25469502 C/T 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000119772:ENST00000264709:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380746:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000321117:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380756:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000402667:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000434249:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000474807:exon_25469489_25469645:DNMT3A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 26590084 T/G 1 1 7 8 0.491238617586049 3.56132967689766 -3.07009105931161 T:G T G 10 0.508761382413951 0.0359761797629569 ENSG00000138018:ENST00000442141:exon_26590014_26590088:EPT1;ENSG00000138018:ENST00000407686:exon_26590014_26590088:EPT1;ENSG00000138018:ENST00000260585:exon_26590014_26590088:EPT1;ENSG00000138018:ENST00000447170:exon_26590014_26590088:EPT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 27424636 G/A 1 23 32 55 11.2984882044791 16.2803642372464 -4.9818760327673 A:G G A 10 0.508761382413951 0.224527447190756 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 27429367 T/C 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 T:C T C 10 0.508761382413951 0.770813353200887 ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27429351_27429402:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27429351_27429402:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27429351_27429402:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000412471:exon_27429351_27429402:SLC5A6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 27435374 G/A 1 10 12 22 4.91238617586049 6.10513658896741 -1.19275041310692 A:G G A 10 0.508761382413951 0.673245720296639 ENSG00000138074:ENST00000428518:exon_27435331_27435390:SLC5A6;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27435238_27435475:C2orf28 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 17 7 24 8.35105649896283 3.56132967689766 4.78972682206518 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0648841359610272 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 27462076 C/T 1 17 34 51 8.35105649896283 17.2978870020743 -8.9468305031115 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0164243300377675 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27461986_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462020_27462100:CAD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 21 19 40 10.316010969307 9.66646626586507 0.649544703441961 A:G A G 10 0.508761382413951 0.875396965359485 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 27589810 T/C 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 T:C T C 10 0.508761382413951 0.770813353200887 ENSG00000115211:ENST00000475582:exon_27588425_27591600:EIF2B4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 29073265 G/A 1 29 36 65 14.2459199099954 18.3154097669022 -4.06948985690681 A:G G A 10 0.508761382413951 0.323680767446304 ENSG00000163806:ENST00000379579:exon_29072716_29073477:SPDYA;ENSG00000163806:ENST00000334056:exon_29072716_29073477:SPDYA;ENSG00000163806:ENST00000439646:exon_29072716_29073300:SPDYA;ENSG00000171103:ENST00000419999:exon_29073194_29073271:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29073194_29073271:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29073194_29073271:TRMT61B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 29129418 A/G 1 24 17 41 11.7897268220652 8.64894350103717 3.14078332102801 A:G A G 10 0.508761382413951 0.351930335862342 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29129326_29129447:WDR43 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 29135468 C/G 1 21 11 32 10.316010969307 5.59637520655346 4.71963576275357 C:G C G 10 0.508761382413951 0.111927046152469 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29135456_29135576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29135456_29135576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29135456_29135576:WDR43 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 29169612 T/C 1 140 138 278 68.7734064620469 70.2090707731252 -1.43566431107837 T:C T C 10 0.508761382413951 0.904536855013181 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29169466_29171088:WDR43 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 33759395 C/T 1 66 62 128 32.4217487606792 31.543205709665 0.878543051014276 T:C C T 10 0.508761382413951 0.929621587465395 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33756792_33759467:RASGRP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 33764176 A/G 1 30 34 64 14.7371585275815 17.2978870020743 -2.56072847449286 A:G A G 10 0.508761382413951 0.534608789192952 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33764164_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33764161_33764416:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33764161_33764390:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33764161_33765248:RASGRP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 37241050 G/A 1 6 6 12 2.94743170551629 3.05256829448371 -0.105136588967412 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37240984_37241163:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37240984_37241163:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000471051:exon_37240984_37241138:HEATR5B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 37454767 A/G 1 132 124 256 64.8434975213585 63.0864114193299 1.75708610202855 A:T:G A G 10 0.508761382413951 0.851364936231777 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37454687_37456179:CEBPZ HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 37458668 G/A 1 22 22 44 10.8072495868931 11.1927504131069 -0.385500826213843 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 37471114 C/A 1 14 6 20 6.87734064620469 3.05256829448371 3.82477235172098 A:C C A 10 0.508761382413951 0.116430409892464 ENSG00000003509:ENST00000455230:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000414639:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37471054_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000336237:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000431821:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000483999:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000439218:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474257:exon_37471006_37471116:C2orf56 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 37494591 A/G 1 9 6 15 4.42114755827444 3.05256829448371 1.36857926379074 A:G A G 10 0.508761382413951 0.60808216621752 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000469275:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000452104:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000443977:exon_37494573_37494679:PRKD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 37505105 T/G 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 T:G T G 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37505009_37505132:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37505009_37505132:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000469275:exon_37505009_37506533:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000494667:exon_37505009_37505132:PRKD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 43452183 A/G 1 26 21 47 12.7722040572373 10.683989030693 2.0882150265443 A:G A G 10 0.508761382413951 0.562903858847693 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 43519977 C/T 1 17 14 31 8.35105649896283 7.12265935379531 1.22839714516752 T:C C T 10 0.508761382413951 0.721386502145606 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485018:exon_43519973_43520205:THADA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 43520175 G/A 1 7 1 8 3.43867032310234 0.508761382413951 2.92990894068839 A:G G A 10 0.508761382413951 0.070648384509694 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485018:exon_43519973_43520205:THADA;ENSG00000115970:ENST00000486735:exon_43520131_43520352:THADA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 44201376 T/C 1 89 98 187 43.7202369651584 49.8586154765672 -6.13837851140883 T:C:G T C 10 0.508761382413951 0.380818759910276 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44201289_44201434:LRPPRC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 44547574 G/A 1 22 21 43 10.8072495868931 10.683989030693 0.123260556200108 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000138079:ENST00000260649:exon_44547338_44548633:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409380:exon_44547338_44547960:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409740:exon_44547338_44547937:SLC3A1;ENSG00000138078:ENST00000425263:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000426481:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409957:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409411:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409936:exon_44545905_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000444696:exon_44547405_44547782:PREPL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 45640374 C/A 1 5 14 19 2.45619308793025 7.12265935379531 -4.66646626586507 A:C C A 10 0.508761382413951 0.0384390649292403 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 45645512 C/T 1 9 15 24 4.42114755827444 7.63142073620926 -3.21027317793482 T:C C T 10 0.508761382413951 0.222993356359584 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45645504_45645680:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45645504_45645680:SRBD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 46839477 T/C 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 T:C:G T C 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000151665:ENST00000281382:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000306465:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000412717:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000495933:exon_46839367_46839483:PIGF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 47220622 G/A 1 6 14 20 2.94743170551629 7.12265935379531 -4.17522764827902 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0740332550078218 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000474321:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47220589_47220667:TTC7A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 47251469 G/C 1 4 8 12 1.9649544703442 4.07009105931161 -2.10513658896741 C:G G C 10 0.508761382413951 0.259199063292902 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000440051:exon_47251426_47251498:TTC7A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 47301029 A/G 1 22 36 58 10.8072495868931 18.3154097669022 -7.50816018000916 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0498305099172185 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47300841_47301187:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47300841_47302463:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47300841_47301062:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47300841_47303276:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47300841_47302696:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47300841_47302463:TTC7A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 53955850 C/T 1 3 10 13 1.47371585275815 5.08761382413951 -3.61389797138136 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0535384651887407 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406687:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000394717:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000498475:exon_53955849_53955984:ASB3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 54035447 A/G 1 34 30 64 16.7021129979257 15.2628414724185 1.43927152550714 A:G A G 10 0.508761382413951 0.802827798045576 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 15 18 33 7.36857926379074 9.15770488345112 -1.78912561966038 A:G A G 10 0.508761382413951 0.603048493918855 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 A:T A T 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 10 13 23 4.91238617586049 6.61389797138136 -1.70151179552087 A:G G A 10 0.508761382413951 0.535488052826954 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 54127041 C/T 1 15 14 29 7.36857926379074 7.12265935379531 0.245919909995422 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54127018_54127154:PSME4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 54133744 T/C 1 22 20 42 10.8072495868931 10.175227648279 0.632021938614059 T:C T C 10 0.508761382413951 0.878401052374126 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54133735_54133830:PSME4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 54858511 C/T 1 129 101 230 63.3697816686003 51.384899623809 11.9848820447913 T:C C T 10 0.508761382413951 0.129135531826081 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 55277226 C/T 1 133 80 213 65.3347361389445 40.7009105931161 24.6338255458284 T:C C T 10 0.508761382413951 0.000757321083154349 ENSG00000115310:ENST00000337526:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000317610:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000357732:exon_55276881_55277680:RTN4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 55481322 T/A 1 45 49 94 22.1057377913722 24.9293077382836 -2.82356994691139 A:T T A 10 0.508761382413951 0.606456219828237 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55481177_55481337:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55481177_55481337:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55481177_55481337:MTIF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 61412677 C/G 1 26 27 53 12.7722040572373 13.7365573251767 -0.964353267939401 A:C:G C G 10 0.508761382413951 0.890903905586243 ENSG00000173209:ENST00000357022:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000489653:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000394457:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000493628:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000430934:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000389584:exon_61412643_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000471542:exon_61412637_61413632:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000487904:exon_61412637_61412881:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000484217:exon_61412637_61413632:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000409615:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000410073:exon_61412637_61412753:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000491217:exon_61412661_61412753:AHSA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 61413723 A/G 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 A:G A G 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000173209:ENST00000491217:exon_61413581_61413910:AHSA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 4 13 17 1.9649544703442 6.61389797138136 -4.64894350103717 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0284172183308144 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 61577435 T/C 1 10 4 14 4.91238617586049 2.0350455296558 2.87734064620469 T:C T C 10 0.508761382413951 0.180503112624562 ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61577395_61577524:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61577395_61577524:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61577395_61577524:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61577395_61577524:USP34;ENSG00000115464:ENST00000453133:exon_61577395_61577524:USP34 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 61647901 A/G 1 7 10 17 3.43867032310234 5.08761382413951 -1.64894350103717 A:G A G 10 0.508761382413951 0.473990855338058 ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000453133:exon_61647881_61647968:USP34 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 64327544 G/T 1 16 30 46 7.85981788137678 15.2628414724185 -7.40302359104174 T:G G T 10 0.508761382413951 0.0378837331242655 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 64327592 T/C 1 16 22 38 7.85981788137678 11.1927504131069 -3.33293253173014 T:C T C 10 0.508761382413951 0.331062693453351 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 65540905 C/G 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 C:G C G 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000198369:ENST00000356388:exon_65537985_65541303:SPRED2;ENSG00000198369:ENST00000443619:exon_65540127_65541303:SPRED2;ENSG00000198369:ENST00000452315:exon_65540639_65541303:SPRED2;ENSG00000198369:ENST00000421087:exon_65540837_65541303:SPRED2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 67630980 G/A 1 32 18 50 15.7196357627536 9.15770488345112 6.56193087930245 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0669580415989149 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 67631831 G/A 1 56 36 92 27.5093625848187 18.3154097669022 9.19395281791651 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0604599239201638 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 67632125 C/T 1 48 23 71 23.5794536441304 11.7015117955209 11.8779418486095 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00594965888611125 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 68364478 T/C 1 8 5 13 3.92990894068839 2.54380691206975 1.38610202861864 T:C T C 10 0.508761382413951 0.581825911412537 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68364431_68364565:PPP3R1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 27 34 61 13.2634426748233 17.2978870020743 -4.03444432725101 A:G A G 10 0.508761382413951 0.30893938790199 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 68415767 G/A 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 A:G G A 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000234310:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409752:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409377:exon_68415646_68415822:PPP3R1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 68592496 C/T 1 225 221 446 110.528688956861 112.436265513483 -1.90757655662213 T:C C T 10 0.508761382413951 0.887044137437238 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68592305_68592525:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68592322_68592525:PLEK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 51 30 81 25.0531694968885 15.2628414724185 9.79032802446997 A:C:G G A 10 0.508761382413951 0.0342740055193048 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 467 356 823 229.408434412685 181.119052139367 48.2893822733184 T:C:G G C 10 0.508761382413951 0.000807958822981717 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 A:T A T 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 70037739 C/G 1 11 9 20 5.40362479344654 4.57885244172556 0.824772351720981 C:G C G 10 0.508761382413951 0.824343209360058 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70035038_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000409920:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70037726_70037752:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000487351:exon_70037726_70037857:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000468815:exon_70037726_70038034:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000472124:exon_70037726_70037805:ANXA4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 70071305 T/C 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 T:C T C 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000087338:ENST00000282570:exon_70071263_70071328:GMCL1;ENSG00000087338:ENST00000471404:exon_70071263_70071328:GMCL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 70402903 T/G 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 T:G T G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000115998:ENST00000264434:exon_70402805_70402909:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000420306:exon_70402805_70402909:C2orf42 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 70408938 A/G 1 8 6 14 3.92990894068839 3.05256829448371 0.877340646204686 A:G A G 10 0.508761382413951 0.79097715531601 ENSG00000115998:ENST00000264434:exon_70408295_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000420306:exon_70408295_70409127:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000447804:exon_70408612_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000417865:exon_70408641_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000419381:exon_70408735_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000470096:exon_70408762_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000457952:exon_70408782_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000428010:exon_70408938_70409129:C2orf42 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 99 136 235 48.6326231410189 69.1915480082973 -20.5589248672785 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00744765881158289 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 71221822 A/G 1 10 4 14 4.91238617586049 2.0350455296558 2.87734064620469 A:G A G 10 0.508761382413951 0.180503112624562 ENSG00000144043:ENST00000453130:exon_71221818_71221879:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000272438:exon_71221818_71222075:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000433258:exon_71221818_71221962:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000466731:exon_71221771_71221834:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000489894:exon_71221818_71221933:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000473055:exon_71221818_71222003:TEX261 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 71351403 C/A 1 16 17 33 7.85981788137678 8.64894350103717 -0.789125619660382 A:C C A 10 0.508761382413951 0.862463507447866 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 62 50 112 30.456794290335 25.4380691206975 5.01872516963749 A:C A C 10 0.508761382413951 0.346713050940746 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 71360282 G/A 1 92 96 188 45.1939528179165 48.8410927117393 -3.64713989382278 A:G G A 10 0.508761382413951 0.610196144648251 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 114 78 192 56.0012024048096 39.6833878282882 16.3178145765214 T:G G T 10 0.508761382413951 0.0207009171824881 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 41 25 66 20.140783321028 12.7190345603488 7.42174876067924 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0840695257425147 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 43 26 69 21.1232605562001 13.2277959427627 7.89546461343738 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0702211706781317 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 71417134 C/T 1 2 6 8 0.982477235172098 3.05256829448371 -2.07009105931161 T:C C T 10 0.508761382413951 0.172493759593104 ENSG00000124374:ENST00000244221:exon_71416975_71417151:PAIP2B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 71633389 C/T 1 15 8 23 7.36857926379074 4.07009105931161 3.29848820447913 T:C C T 10 0.508761382413951 0.211653680335550 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000494241:exon_71633258_71633392:ZNF638 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 73677898 G/C 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 C:G G C 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000377715:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000443750:exon_73675090_73681194:ALMS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 73678301 A/C 1 2 9 11 0.982477235172098 4.57885244172556 -3.59637520655346 A:C A C 10 0.508761382413951 0.0355658246260987 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000377715:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000443750:exon_73675090_73681194:ALMS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 73679440 G/A 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 A:G G A 10 0.508761382413951 0.335736887982477 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000377715:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000443750:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73678824_73681194:ALMS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 73679990 T/A 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 A:T T A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000377715:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000443750:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73678824_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73679852_73681194:ALMS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 73680508 G/C 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 C:G G C 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000377715:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000443750:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73678824_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73679852_73681194:ALMS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 73717656 A/G 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 A:G A G 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73716761_73718625:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73716761_73718625:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73716761_73718625:ALMS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 27 48 75 13.2634426748233 24.4205463558696 -11.1571036810463 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0108380930101231 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 74057995 T/C 1 22 27 49 10.8072495868931 13.7365573251767 -2.9293077382836 T:C T C 10 0.508761382413951 0.475443417674915 ENSG00000124356:ENST00000339566:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000409707:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000452725:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000432295:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000424659:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394073:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394070:exon_74057972_74058186:STAMBP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 61 52 113 29.965555672749 26.4555918855255 3.50996378722354 A:T A T 10 0.508761382413951 0.512172185499803 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 39 39 78 19.1583060858559 19.8416939141441 -0.683387828288176 A:G G A 10 0.508761382413951 0.91014842890924 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 44 32 76 21.6144991737862 16.2803642372464 5.33413493653973 T:C C T 10 0.508761382413951 0.251483017574356 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 417 297 714 204.846503533382 151.102130576943 53.744372956439 A:C C A 10 0.508761382413951 6.0323109378421e-05 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 74710491 C/T 1 20 20 40 9.82477235172098 10.175227648279 -0.350455296558039 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000135637:ENST00000474681:exon_74710195_74710535:CCDC142;ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463704:exon_74710449_74710832:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74710449_74710690:TTC31 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 74763258 C/G 1 3 14 17 1.47371585275815 7.12265935379531 -5.64894350103717 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0066745766452395 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000481835:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000420535:exon_74763123_74763277:LOXL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 75101454 T/C 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 T:C T C 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75101393_75101576:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75101393_75101576:HK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 75113789 C/G 1 22 20 42 10.8072495868931 10.175227648279 0.632021938614059 C:G C G 10 0.508761382413951 0.878401052374126 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 75115108 A/G 1 10 11 21 4.91238617586049 5.59637520655346 -0.68398903069297 A:G A G 10 0.508761382413951 0.82938952505783 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75115030_75115185:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75115030_75115185:HK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 85570480 A/G 0 43 0 43 21.1232605562001 0 21.1232605562001 A A 10 0.508761382413951 2.93102022170789e-13 ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85569079_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85569079_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85569211_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85569211_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85569805_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000438611:exon_85570114_85570504:RETSAT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 86255766 G/A 1 6 6 12 2.94743170551629 3.05256829448371 -0.105136588967412 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86255717_86255834:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86255717_86255834:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000471427:exon_86255717_86255922:POLR1A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 86269163 C/T 1 11 2 13 5.40362479344654 1.0175227648279 4.38610202861864 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0227184069815744 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86269012_86269226:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86269012_86269226:POLR1A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 86315741 C/T 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 T:C C T 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000486964:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000424089:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409024:exon_86315689_86315792:POLR1A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 86346119 A/G 1 9 23 32 4.42114755827444 11.7015117955209 -7.28036423724643 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0123567414294609 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86346044_86346167:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000465560:exon_86346044_86346167:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000483925:exon_86346044_86346304:PTCD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 86371883 T/C 1 162 112 274 79.5806560489399 56.9812748303625 22.5993812185774 T:C T C 10 0.508761382413951 0.00650272674104912 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86371063_86372004:IMMT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 86385668 T/C 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 86433240 C/T 1 61 94 155 29.965555672749 47.8235699469114 -17.8580142741624 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0047811135408199 ENSG00000132313:ENST00000254644:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000337109:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000409180:exon_86433229_86433418:MRPL35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 89160080 G/C 1 425 24 449 208.776412474071 12.2102731779348 196.566139296136 C:G G C 10 0.508761382413951 5.67024078938139e-93 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 89160464 C/G 1 15 2 17 7.36857926379074 1.0175227648279 6.35105649896283 C:G C G 10 0.508761382413951 0.00240734384779847 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 89185519 G/C 1 69 4 73 33.8954646134374 2.0350455296558 31.8604190837816 C:G G C 10 0.508761382413951 4.16589729904257e-16 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 96521726 G/A 1 8 3 11 3.92990894068839 1.52628414724185 2.40362479344654 A:G G A 10 0.508761382413951 0.227353863226797 ENSG00000174501:ENST00000456556:exon_96521014_96521928:AC073995.2;ENSG00000174501:ENST00000420871:exon_96521014_96521928:AC073995.2;ENSG00000174501:ENST00000419039:exon_96521014_96521928:AC073995.2;ENSG00000174501:ENST00000488721:exon_96521014_96521928:AC073995.2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 96684975 C/T 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 T:C C T 10 0.508761382413951 0.726898178327146 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 96685307 G/A 1 4 8 12 1.9649544703442 4.07009105931161 -2.10513658896741 A:G G A 10 0.508761382413951 0.259199063292902 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 96688990 C/T 1 10 7 17 4.91238617586049 3.56132967689766 1.35105649896283 T:C C T 10 0.508761382413951 0.629969031107128 ENSG00000186281:ENST00000335448:exon_96688706_96689040:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000484440:exon_96688706_96689188:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000482704:exon_96688854_96689748:GPAT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 96795608 T/G 1 5 7 12 2.45619308793025 3.56132967689766 -1.10513658896741 T:G T G 10 0.508761382413951 0.574941367903584 ENSG00000188886:ENST00000342380:exon_96795563_96795717:ASTL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 97526787 T/A 1 5 10 15 2.45619308793025 5.08761382413951 -2.63142073620926 A:T T A 10 0.508761382413951 0.203076095656838 ENSG00000168758:ENST00000305476:exon_97525453_97527192:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000474420:exon_97525473_97527386:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000482925:exon_97525479_97527192:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000467747:exon_97525485_97527192:SEMA4C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 97526788 C/A 1 5 10 15 2.45619308793025 5.08761382413951 -2.63142073620926 A:C C A 10 0.508761382413951 0.203076095656838 ENSG00000168758:ENST00000305476:exon_97525453_97527192:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000474420:exon_97525473_97527386:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000482925:exon_97525479_97527192:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000467747:exon_97525485_97527192:SEMA4C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 105885961 T/C 1 25 17 42 12.2809654396512 8.64894350103717 3.63202193861406 T:C T C 10 0.508761382413951 0.283061852154193 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 105889349 G/A 1 18 12 30 8.84229511654888 6.10513658896741 2.73715852758147 A:G G A 10 0.508761382413951 0.363817218311101 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 105915128 G/A 1 6 10 16 2.94743170551629 5.08761382413951 -2.14018211862322 A:G G A 10 0.508761382413951 0.324879272681718 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105914968_105915162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105914968_105915162:TGFBRAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 105924510 A/G 1 15 13 28 7.36857926379074 6.61389797138136 0.754681292409373 A:G A G 10 0.508761382413951 0.851195156405806 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105924071_105924775:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105924071_105924778:TGFBRAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 110373197 G/A 1 8 3 11 3.92990894068839 1.52628414724185 2.40362479344654 A:G G A 10 0.508761382413951 0.227353863226797 ENSG00000198142:ENST00000356454:exon_110371911_110376563:ANKRD57 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 16 7 23 7.85981788137678 3.56132967689766 4.29848820447913 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0942882498496864 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 13 15 28 6.38610202861864 7.63142073620926 -1.24531870759063 T:C T C 10 0.508761382413951 0.707356544758575 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 120129886 G/A 1 398 346 744 195.512969799248 176.031438315227 19.4815314840205 A:G G A 10 0.508761382413951 0.163466574321400 ENSG00000155368:ENST00000355857:exon_120129821_120130126:DBI;ENSG00000155368:ENST00000409094:exon_120129821_120130057:DBI;ENSG00000155368:ENST00000311521:exon_120129821_120130122:DBI;ENSG00000155368:ENST00000460901:exon_120129821_120130030:DBI;ENSG00000155368:ENST00000393103:exon_120129821_120129983:DBI;ENSG00000155368:ENST00000475783:exon_120129821_120130076:DBI HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 130912767 G/A 1 7 16 23 3.43867032310234 8.14018211862322 -4.70151179552087 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0601911044527136 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000491128:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000482171:exon_130911850_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000453750:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000457039:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000449159:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000461187:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130912669_130912832:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130912669_130912832:SMPD4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 130925088 C/T 1 11 19 30 5.40362479344654 9.66646626586507 -4.26284147241853 T:C C T 10 0.508761382413951 0.144300724540693 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000473720:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439029:exon_130925031_130925163:SMPD4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 132258593 A/G 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:G A G 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 132277686 C/T 1 14 7 21 6.87734064620469 3.56132967689766 3.31601096930703 T:C C T 10 0.508761382413951 0.190676404068772 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 132290399 G/A 1 8 1 9 3.92990894068839 0.508761382413951 3.42114755827444 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0393216639345302 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 135712078 G/T 1 25 19 44 12.2809654396512 9.66646626586507 2.61449917378616 T:G G T 10 0.508761382413951 0.454446474053152 ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135712051_135712369:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135712051_135714587:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452521:exon_135712051_135712408:CCNT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 143798189 A/G 1 72 88 160 35.3691804661955 44.7710016524277 -9.40182118623216 A:G A G 10 0.508761382413951 0.154492537768237 ENSG00000115919:ENST00000264170:exon_143797997_143798227:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000409512:exon_143797997_143798227:KYNU HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 152135415 C/T 1 65 40 105 31.9305101430932 20.350455296558 11.5800548465351 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0247812121067747 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152135342_152135504:NMI;ENSG00000123609:ENST00000491771:exon_152133769_152135504:NMI HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 17 28 45 8.35105649896283 14.2453187075906 -5.89426220862779 T:C T C 10 0.508761382413951 0.100095042767986 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 152139416 G/A 1 46 43 89 22.5969764089583 21.8767394437999 0.720236965158364 A:G G A 10 0.508761382413951 0.915804605151437 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000491771:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000414946:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000477072:exon_152139285_152139468:NMI HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 152311570 G/A 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 A:G G A 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000414861:exon_152311409_152311624:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152311409_152311673:RIF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 152320118 G/A 1 29 35 64 14.2459199099954 17.8066483844883 -3.56072847449286 A:G G A 10 0.508761382413951 0.384425955017786 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 152322095 A/T 1 59 46 105 28.9830784375769 23.4030235910417 5.58005484653515 A:T A T 10 0.508761382413951 0.284579397475061 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 152331418 C/G 1 27 35 62 13.2634426748233 17.8066483844883 -4.54320570966496 C:G C G 10 0.508761382413951 0.255898166336644 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152331371_152332136:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152331371_152332419:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152331371_152333863:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152331371_152331733:RIF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 160710922 T/C 1 23 16 39 11.2984882044791 8.14018211862322 3.15830608585591 T:C T C 10 0.508761382413951 0.339684591138642 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 160711045 G/C 1 33 35 68 16.2108743803396 17.8066483844883 -1.59577400414867 C:G G C 10 0.508761382413951 0.717495976348783 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 160729005 C/T 1 9 13 22 4.42114755827444 6.61389797138136 -2.19275041310692 T:C C T 10 0.508761382413951 0.398108590862778 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160728330_160729104:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 160737621 C/T 1 20 28 48 9.82477235172098 14.2453187075906 -4.42054635586965 T:C C T 10 0.508761382413951 0.24799373612998 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 160738677 G/A 1 27 26 53 13.2634426748233 13.2277959427627 0.0356467320605987 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 162091932 G/A 1 31 38 69 15.2283971451675 19.3329325317301 -4.10453538656262 A:G G A 10 0.508761382413951 0.337596761552429 ENSG00000136560:ENST00000259075:exon_162091853_162092698:TANK;ENSG00000136560:ENST00000392749:exon_162091853_162092683:TANK;ENSG00000136560:ENST00000405852:exon_162091853_162092732:TANK;ENSG00000136560:ENST00000437623:exon_162091853_162092677:TANK;ENSG00000136560:ENST00000439442:exon_162091853_162092159:TANK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 143 98 241 70.247122314805 49.8586154765672 20.3885068382378 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00982639754211834 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 163137871 C/G 1 23 20 43 11.2984882044791 10.175227648279 1.12326055620011 C:G C G 10 0.508761382413951 0.762329329640337 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 163137983 T/C 1 22 28 50 10.8072495868931 14.2453187075906 -3.43806912069755 T:C T C 10 0.508761382413951 0.396370013116307 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 172291616 C/T 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 T:C C T 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000115827:ENST00000468592:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000375255:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000436317:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000490217:exon_172291593_172291696:DCAF17 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 175260355 G/T 1 9 4 13 4.42114755827444 2.0350455296558 2.38610202861864 T:G G T 10 0.508761382413951 0.267810029003266 ENSG00000138433:ENST00000414336:exon_175260279_175260429:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000342016:exon_175260279_175260443:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000362053:exon_175260279_175260397:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000425101:exon_175260279_175260412:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000461454:exon_175260279_175260434:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000472169:exon_175260279_175260437:CIR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 179403593 G/A 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 A:G G A 10 0.508761382413951 0.219001271230579 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 179403750 C/T 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 T:C C T 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000155657:ENST00000473181:exon_179403673_179403978:TTN;ENSG00000155657:ENST00000460472:exon_179403673_179403978:TTN;ENSG00000155657:ENST00000359218:exon_179403673_179403978:TTN;ENSG00000155657:ENST00000356127:exon_179403673_179403978:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342175:exon_179403673_179403978:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342992:exon_179403673_179403978:TTN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 179404786 A/T 1 5 7 12 2.45619308793025 3.56132967689766 -1.10513658896741 A:T A T 10 0.508761382413951 0.574941367903584 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 179406191 C/T 1 4 10 14 1.9649544703442 5.08761382413951 -3.12265935379531 T:C C T 10 0.508761382413951 0.112778665730966 ENSG00000155657:ENST00000473181:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000460472:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000359218:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000356127:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342175:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342992:exon_179406009_179406311:TTN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 179444939 C/T 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 T:C C T 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000155657:ENST00000473181:exon_179444666_179444956:TTN;ENSG00000155657:ENST00000460472:exon_179444666_179444956:TTN;ENSG00000155657:ENST00000359218:exon_179444666_179444956:TTN;ENSG00000155657:ENST00000356127:exon_179444666_179444956:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342175:exon_179444666_179444956:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342992:exon_179444666_179444956:TTN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 179481400 C/T 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 T:C C T 10 0.508761382413951 0.219001271230579 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 180810202 C/T 1 61 64 125 29.965555672749 32.5607284744929 -2.59517280174387 T:C C T 10 0.508761382413951 0.65565368674374 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 180810264 A/T 1 46 73 119 22.5969764089583 37.1395809162184 -14.5426045072602 A:T A T 10 0.508761382413951 0.00780600501382199 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 184025875 G/T 1 47 36 83 23.0882150265443 18.3154097669022 4.77280525964207 T:G G T 10 0.508761382413951 0.323788982999592 ENSG00000163002:ENST00000409798:exon_184025782_184026166:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000295119:exon_184025782_184026408:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000374930:exon_184025782_184025972:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000479162:exon_184024216_184026408:NUP35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 184025876 A/T 1 46 36 82 22.5969764089583 18.3154097669022 4.28156664205602 A:T A T 10 0.508761382413951 0.377619595805511 ENSG00000163002:ENST00000409798:exon_184025782_184026166:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000295119:exon_184025782_184026408:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000374930:exon_184025782_184025972:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000479162:exon_184024216_184026408:NUP35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 191301700 G/A 1 37 38 75 18.1758288506838 19.3329325317301 -1.15710368104632 A:G G A 10 0.508761382413951 0.818054905518237 ENSG00000151690:ENST00000392328:exon_191300703_191302287:MFSD6;ENSG00000151690:ENST00000281416:exon_191300638_191302287:MFSD6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 93 94 187 45.6851914355026 47.8235699469114 -2.13837851140883 T:C T C 10 0.508761382413951 0.770251937528824 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 56 74 130 27.5093625848187 37.6483422986324 -10.1389797138136 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0795686101561421 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 62 71 133 30.456794290335 36.1220581513905 -5.66526386105548 T:C T C 10 0.508761382413951 0.340912556696469 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 191 188 379 93.8265759589354 95.6471398938228 -1.82056393488742 T:C T C 10 0.508761382413951 0.877557320173414 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 63 72 135 30.9480329079211 36.6308195338045 -5.68278662588338 A:G A G 10 0.508761382413951 0.344426334398306 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 201736068 A/G 1 108 115 223 53.0537706992933 58.5075589776044 -5.45378827831107 A:G A G 10 0.508761382413951 0.503110233277577 ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 202245244 A/G 1 22 16 38 10.8072495868931 8.14018211862322 2.66706746826986 A:G A G 10 0.508761382413951 0.420419027699363 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202241930_202245941:TRAK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 202252539 G/A 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 A:G G A 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202252426_202252724:TRAK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 202626242 C/T 1 8 4 12 3.92990894068839 2.0350455296558 1.89486341103259 T:C C T 10 0.508761382413951 0.388585368391447 ENSG00000003393:ENST00000264276:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000457679:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000482891:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000482789:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000467448:exon_202624183_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000409666:exon_202625526_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000496244:exon_202626126_202626541:ALS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 207008763 C/A 1 39 29 68 19.1583060858559 14.7540800900046 4.40422599585133 A:C C A 10 0.508761382413951 0.332093908643717 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 207025444 T/C 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 T:C T C 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000114942:ENST00000479587:exon_207025312_207025841:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000460760:exon_207025312_207025914:EEF1B2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 207169731 G/A 1 10 6 16 4.91238617586049 3.05256829448371 1.85981788137678 A:G G A 10 0.508761382413951 0.455622877460238 ENSG00000204186:ENST00000374423:exon_207169441_207179148:ZDBF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 207174316 T/C 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 T:C T C 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000204186:ENST00000374423:exon_207169441_207179148:ZDBF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 207459467 C/T 1 4 15 19 1.9649544703442 7.63142073620926 -5.66646626586507 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0106132033167678 ENSG00000114948:ENST00000264377:exon_207459461_207459629:ADAM23;ENSG00000114948:ENST00000374415:exon_207459461_207459629:ADAM23;ENSG00000114948:ENST00000374416:exon_207459461_207459629:ADAM23;ENSG00000114948:ENST00000431817:exon_207459461_207459629:ADAM23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 216190020 C/G 1 52 59 111 25.5444081144745 30.0169215624231 -4.47251344794856 C:G C G 10 0.508761382413951 0.447739271526256 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000444305:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000488712:exon_216189903_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000427397:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000413174:exon_216189964_216190052:ATIC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 216908679 C/T 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 T:C C T 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216908627_216908738:PECR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 217279768 G/A 1 27 23 50 13.2634426748233 11.7015117955209 1.56193087930245 A:G G A 10 0.508761382413951 0.67418939372333 ENSG00000138375:ENST00000430374:exon_217279370_217279864:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217279370_217280238:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000444508:exon_217279370_217279818:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217279370_217280238:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000427645:exon_217279731_217280238:SMARCAL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 217285119 C/T 1 8 8 16 3.92990894068839 4.07009105931161 -0.140182118623216 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217285022_217285255:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217285022_217285255:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000427645:exon_217285022_217285255:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217285022_217285255:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000412913:exon_217285022_217285255:SMARCAL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 219130802 T/C 1 35 45 80 17.1933516155117 22.8942622086278 -5.70091059311608 T:C T C 10 0.508761382413951 0.219446804470874 ENSG00000127837:ENST00000248450:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000444053:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000475678:exon_219130302_219131310:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000420660:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000489767:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000422731:exon_219130778_219130804:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000465442:exon_219130787_219130870:AAMP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 31 24 55 15.2283971451675 12.2102731779348 3.0181239672327 C:G G C 10 0.508761382413951 0.42268646690346 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 219146803 G/A 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 A:G G A 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 219266423 C/A 1 28 24 52 13.7546812924094 12.2102731779348 1.54440811447455 A:C C A 10 0.508761382413951 0.680241680575819 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000494067:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000496785:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000431127:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219265890_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219266287_219266435:CTDSP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 219267781 C/T 1 56 53 109 27.5093625848187 26.9643532679394 0.545009316879344 T:C C T 10 0.508761382413951 0.924037563667903 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219267734_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219267758_219267850:CTDSP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 219507070 C/T 1 32 5 37 15.7196357627536 2.54380691206975 13.1758288506838 T:C C T 10 0.508761382413951 8.2496186179856e-06 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 219508372 A/T 1 12 12 24 5.89486341103259 6.10513658896741 -0.210273177934823 A:T A T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 219508988 T/C 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 219509618 C/A 1 7 9 16 3.43867032310234 4.57885244172556 -1.14018211862322 A:C C A 10 0.508761382413951 0.623757634359657 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 219513548 G/A 1 11 11 22 5.40362479344654 5.59637520655346 -0.192750413106921 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219513358_219514182:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219513358_219514182:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219513358_219514182:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219513358_219514182:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219513358_219514182:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219513358_219514182:ZNF142 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 219602499 G/C 1 8 12 20 3.92990894068839 6.10513658896741 -2.17522764827902 C:G G C 10 0.508761382413951 0.376308412261741 ENSG00000135912:ENST00000415717:exon_219602302_219602702:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219602302_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000437755:exon_219602302_219602922:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219602302_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000424644:exon_219602302_219602701:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219602297_219603886:TTLL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 219602819 G/A 1 7 12 19 3.43867032310234 6.10513658896741 -2.66646626586507 A:G G A 10 0.508761382413951 0.256095565288392 ENSG00000135912:ENST00000457313:exon_219602631_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219602302_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000437755:exon_219602302_219602922:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219602302_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219602297_219603886:TTLL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 219610433 A/G 1 7 9 16 3.43867032310234 4.57885244172556 -1.14018211862322 A:G A G 10 0.508761382413951 0.623757634359657 ENSG00000135912:ENST00000457313:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000417196:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000461181:exon_219610110_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000494428:exon_219610276_219610524:TTLL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 220037666 A/G 1 84 80 164 41.2640438772281 40.7009105931161 0.563133284112041 A:G A G 10 0.508761382413951 0.937930647751579 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 220037756 A/G 1 115 73 188 56.4924410223956 37.1395809162184 19.3528601061772 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00544157540239106 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 220040330 A/G 1 29 26 55 14.2459199099954 13.2277959427627 1.0181239672327 A:G A G 10 0.508761382413951 0.789459156913444 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000451647:exon_220040313_220040394:C2orf24 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 220046975 C/A 1 37 47 84 18.1758288506838 23.9117849734557 -5.73595612277188 A:C C A 10 0.508761382413951 0.230538846661034 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 220047173 A/T 1 42 52 94 20.6320219386141 26.4555918855255 -5.82356994691139 A:T A T 10 0.508761382413951 0.256665615793531 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220047136_220047351:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 220047393 C/T 1 59 67 126 28.9830784375769 34.0870126217347 -5.10393418415782 T:C C T 10 0.508761382413951 0.374141656425747 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 220083279 C/T 1 10 7 17 4.91238617586049 3.56132967689766 1.35105649896283 T:C C T 10 0.508761382413951 0.629969031107128 ENSG00000115657:ENST00000265316:exon_220082847_220083712:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000439002:exon_220082847_220083673:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000427013:exon_220083177_220083395:ABCB6;ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220082847_220085174:ATG9A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 220087441 T/C 1 12 15 27 5.89486341103259 7.63142073620926 -1.73655732517668 T:C T C 10 0.508761382413951 0.566352319356245 ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220087367_220087460:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000429920:exon_220087367_220087615:ATG9A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 220100201 C/G 1 31 23 54 15.2283971451675 11.7015117955209 3.52688534964665 C:G C G 10 0.508761382413951 0.344896353115183 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220100196_220100307:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220100196_220100307:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220100196_220100307:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220100196_220100307:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220098855_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220098855_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220100196_220100307:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000483188:exon_220099873_220100307:ANKZF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 220251022 G/A 1 38 39 77 18.6670674682699 19.8416939141441 -1.17462644587422 A:G G A 10 0.508761382413951 0.820322429228294 ENSG00000123992:ENST00000273075:exon_220251008_220251133:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373972:exon_220251008_220251133:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000523282:exon_220251008_220251133:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373963:exon_220251008_220251133:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373966:exon_220251008_220251133:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000337010:exon_220251008_220251133:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000457935:exon_220251008_220251133:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000429013:exon_220251008_220251133:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000521459:exon_220251008_220251133:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000460963:exon_220251008_220251133:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000322176:exon_220251008_220251133:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000434339:exon_220251008_220251133:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000430206:exon_220251008_220251133:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000520694:exon_220251008_220251133:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000523527:exon_220250926_220251133:DNPEP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 50 29 79 24.5619308793025 14.7540800900046 9.80785078929787 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0320126794876283 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 45 21 66 22.1057377913722 10.683989030693 11.4217487606792 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00632153186481572 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 26 11 37 12.7722040572373 5.59637520655346 7.17582885068381 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0207707298420692 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 220405321 T/C 1 27 12 39 13.2634426748233 6.10513658896741 7.15830608585591 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0245301178587776 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 220406722 T/C 1 41 14 55 20.140783321028 7.12265935379531 13.0181239672327 A:T:C T C 10 0.508761382413951 0.000395355706616417 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 224765956 C/T 1 13 18 31 6.38610202861864 9.15770488345112 -2.77160285483248 T:C C T 10 0.508761382413951 0.370907451161819 ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224765900_224766050:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224765900_224766050:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000429915:exon_224765900_224766050:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000483061:exon_224765572_224766050:WDFY1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 225346646 T/C 1 86 95 181 42.2465211124002 48.3323313293253 -6.08581021692513 T:C T C 10 0.508761382413951 0.373267653836130 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225346609_225346795:CUL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 225362478 C/T 1 83 48 131 40.7728052596421 24.4205463558696 16.3522589037724 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00498663111784206 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000451538:exon_225362470_225362536:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000487558:exon_225362470_225362566:CUL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C T C 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 61 42 103 29.965555672749 21.3679780613859 8.59757761136305 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0944315329837613 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 231406680 T/C 1 21 15 36 10.316010969307 7.63142073620926 2.68459023309777 T:C T C 10 0.508761382413951 0.407639238387941 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406607_231406750:SP100 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 42 36 78 20.6320219386141 18.3154097669022 2.31661217171182 T:C C T 10 0.508761382413951 0.651150563534697 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 232035429 G/A 1 70 46 116 34.3867032310234 23.4030235910417 10.9836796399817 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0506943153042818 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000373635:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000491229:exon_232035116_232035435:PSMD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 232072912 T/C 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 T:C T C 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000482392:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000440107:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232072840_232072965:ARMC9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 232576594 G/A 1 62 10 72 30.456794290335 5.08761382413951 25.3691804661955 A:G G A 10 0.508761382413951 6.49568862043684e-10 ENSG00000187514:ENST00000481928:exon_232576058_232576693:PTMA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 234113057 G/A 1 78 83 161 38.3166121717118 42.2271947403579 -3.91058256864611 A:G G A 10 0.508761382413951 0.58128017720812 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 234113301 C/T 1 69 63 132 33.8954646134374 32.0519670920789 1.84349752135847 T:C:G C T 10 0.508761382413951 0.794174197538708 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000491070:exon_234113288_234113760:INPP5D HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 50 45 95 24.5619308793025 22.8942622086278 1.66766867067466 T:C:G G C 10 0.508761382413951 0.758960724756648 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 29 31 60 14.2459199099954 15.7716028548325 -1.52568294483706 T:C T C 10 0.508761382413951 0.700884845111227 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 239006879 C/T 1 5 10 15 2.45619308793025 5.08761382413951 -2.63142073620926 T:C C T 10 0.508761382413951 0.203076095656838 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 239155053 C/T 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 T:C C T 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000132326:ENST00000254657:exon_239152679_239155165:PER2;ENSG00000132326:ENST00000254658:exon_239152679_239155165:PER2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 241513695 G/A 1 21 26 47 10.316010969307 13.2277959427627 -2.9117849734557 A:G G A 10 0.508761382413951 0.466250994234346 ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241513530_241513765:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241513192_241514045:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241513530_241516182:RNPEPL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 241517314 G/A 1 73 50 123 35.8604190837816 25.4380691206975 10.422349963084 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0708851505648759 ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241517016_241518149:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241517016_241518144:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241517016_241518141:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000437406:exon_241517016_241518141:RNPEPL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 241536053 C/T 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 T:C C T 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000142330:ENST00000483602:exon_241535736_241536119:CAPN10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 3 8 11 1.47371585275815 4.07009105931161 -2.59637520655346 A:G G A 10 0.508761382413951 0.139557898450825 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 242075362 G/A 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242075291_242075454:PASK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 242439595 G/A 1 51 54 105 25.0531694968885 27.4731146503534 -2.41994515346485 A:G G A 10 0.508761382413951 0.69645115553384 ENSG00000115694:ENST00000316586:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000403346:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000401869:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405883:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405585:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000423004:exon_242439588_242439659:STK25;ENSG00000115694:ENST00000461760:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000450497:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000442307:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000424537:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000413760:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000429279:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000436402:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000492127:exon_242438822_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000479442:exon_242439318_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000496159:exon_242439462_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000440109:exon_242439558_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000435225:exon_242439587_242439696:STK25 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 22 20 42 10.8072495868931 10.175227648279 0.632021938614059 T:C T C 10 0.508761382413951 0.878401052374126 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 31 19 50 15.2283971451675 9.66646626586507 5.56193087930245 A:G A G 10 0.508761382413951 0.121746312172199 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 242674682 C/G 1 8 6 14 3.92990894068839 3.05256829448371 0.877340646204686 C:G C G 10 0.508761382413951 0.79097715531601 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000342518:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000463932:exon_242674547_242674931:D2HGDH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 242690675 G/A 1 7 1 8 3.43867032310234 0.508761382413951 2.92990894068839 A:G G A 10 0.508761382413951 0.070648384509694 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 242690770 T/C 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 2 242793433 G/A 1 12 11 23 5.89486341103259 5.59637520655346 0.298488204479128 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000343705:exon_242793385_242793449:PDCD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 4 8 12 1.9649544703442 4.07009105931161 -2.10513658896741 C:G G C 10 0.508761382413951 0.259199063292902 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 371972 T/C 1 11 20 31 5.40362479344654 10.175227648279 -4.77160285483248 T:C T C 10 0.508761382413951 0.105603260183457 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 372097 G/A 1 14 13 27 6.87734064620469 6.61389797138136 0.263442674823324 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 62 61 123 30.456794290335 31.034444327251 -0.577650036915969 T:C C T 10 0.508761382413951 0.928390084993632 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 428553 T/C 1 8 2 10 3.92990894068839 1.0175227648279 2.91238617586049 T:C T C 10 0.508761382413951 0.109914731512069 ENSG00000125875:ENST00000461304:exon_428533_428718:TBC1D20;ENSG00000125875:ENST00000354200:exon_428533_428718:TBC1D20;ENSG00000125875:ENST00000494633:exon_428533_428718:TBC1D20;ENSG00000125875:ENST00000246077:exon_428533_428718:TBC1D20 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 41 31 72 20.140783321028 15.7716028548325 4.36918046619553 T:C C T 10 0.508761382413951 0.346027101919336 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 2097688 T/C 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 T:C T C 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000125834:ENST00000381482:exon_2097312_2098061:STK35;ENSG00000125834:ENST00000246032:exon_2097312_2098061:STK35;ENSG00000125834:ENST00000493263:exon_2097312_2098061:STK35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 2633936 T/C 1 67 53 120 32.9129873782653 26.9643532679394 5.94863411032588 T:C T C 10 0.508761382413951 0.315254796238883 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000470143:exon_2633925_2634466:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2633925_2634039:NOP56 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 171 158 329 84.0018036072144 80.3842984214043 3.61750518581013 T:C T C 10 0.508761382413951 0.699836913532281 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 2967430 G/A 1 23 14 37 11.2984882044791 7.12265935379531 4.17582885068381 A:G G A 10 0.508761382413951 0.190249286652492 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000455631:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000418580:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000430705:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2967411_2967495:PTPRA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 3016351 A/G 1 13 17 30 6.38610202861864 8.64894350103717 -2.26284147241853 A:G A G 10 0.508761382413951 0.467323702180597 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_3016231_3016356:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_3016231_3016356:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_3016231_3016356:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_3016231_3016356:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_3016231_3016356:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_3016231_3016356:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_3016231_3016356:PTPRA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 3204084 G/A 1 74 83 157 36.3516577013676 42.2271947403579 -5.8755370389903 A:G G A 10 0.508761382413951 0.380071321336273 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3204012_3204504:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000399838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000461029:exon_3204012_3204095:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000472295:exon_3204012_3204516:ITPA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 3783764 C/T 1 11 8 19 5.40362479344654 4.07009105931161 1.33353373413493 T:C C T 10 0.508761382413951 0.648578515706695 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3783755_3783853:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3783755_3783853:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3783755_3783853:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3783755_3783853:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3783755_3783853:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3783755_3783853:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000480816:exon_3783755_3783853:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000468979:exon_3783755_3783822:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000495915:exon_3783755_3783853:CDC25B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 3784110 C/T 1 16 16 32 7.85981788137678 8.14018211862322 -0.280364237246431 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3784051_3784184:CDC25B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 3838441 C/G 1 9 7 16 4.42114755827444 3.56132967689766 0.859817881376784 C:G C G 10 0.508761382413951 0.804101251762597 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3838282_3838456:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000441852:exon_3838282_3838581:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3838282_3838456:MAVS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 3844929 C/T 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 T:C C T 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3844903_3845435:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000416600:exon_3844903_3845435:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3844903_3845435:MAVS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 4680251 A/G 1 30 31 61 14.7371585275815 15.7716028548325 -1.03444432725101 A:G A G 10 0.508761382413951 0.799455933308295 ENSG00000171867:ENST00000420824:exon_4679862_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000455665:exon_4679862_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000379440:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000531860:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000430350:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000525336:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000424424:exon_4679862_4680613:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000444805:exon_4680216_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000379436:exon_4679857_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000457586:exon_4679857_4680517:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000431433:exon_4679857_4680516:PRNP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 5169799 C/T 1 13 4 17 6.38610202861864 2.0350455296558 4.35105649896283 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0496218514424198 ENSG00000101290:ENST00000460006:exon_5169713_5169832:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000379062:exon_5169713_5169832:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000379070:exon_5169713_5169832:CDS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 16 10 26 7.85981788137678 5.08761382413951 2.77220405723727 T:C T C 10 0.508761382413951 0.328881444923395 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 5844121 C/T 1 19 15 34 9.33353373413493 7.63142073620926 1.70211299792567 T:C C T 10 0.508761382413951 0.60947784477379 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 37 31 68 18.1758288506838 15.7716028548325 2.40422599585133 T:C T C 10 0.508761382413951 0.62801233138454 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 35 29 64 17.1933516155117 14.7540800900046 2.43927152550714 T:C T C 10 0.508761382413951 0.617426419452736 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 5924828 A/G 1 13 10 23 6.38610202861864 5.08761382413951 1.29848820447913 A:G A G 10 0.508761382413951 0.678726593550885 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000493972:exon_5924808_5924899:TRMT6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 5974265 A/G 1 10 5 15 4.91238617586049 2.54380691206975 2.36857926379074 A:G A G 10 0.508761382413951 0.302882686663208 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5974152_5974341:MCM8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 38 69 107 18.6670674682699 35.1045353865626 -16.4374679182928 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00183959960994387 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 10620275 G/A 1 7 11 18 3.43867032310234 5.59637520655346 -2.15770488345112 A:G G A 10 0.508761382413951 0.352056460206795 ENSG00000101384:ENST00000254958:exon_10618332_10620603:JAG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 10620386 A/G 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000101384:ENST00000254958:exon_10618332_10620603:JAG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 13695498 G/A 1 45 44 89 22.1057377913722 22.3855008262138 -0.279763034841636 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 13695607 T/G 1 19 16 35 9.33353373413493 8.14018211862322 1.19335161551172 T:G T G 10 0.508761382413951 0.73725408039855 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 13763601 A/G 1 53 55 108 26.0356467320606 27.9818760327673 -1.9462293007067 A:G A G 10 0.508761382413951 0.772962718820946 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13763150_13763829:ESF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 17932210 C/T 1 106 123 229 52.0712934641212 62.577650036916 -10.5063565727948 T:C C T 10 0.508761382413951 0.165904265471155 ENSG00000089006:ENST00000377768:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000490175:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377759:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000483485:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377739:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000476648:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000431277:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000419004:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000494401:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000474883:exon_17932170_17932239:SNX5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 18142564 A/G 1 2 7 9 0.982477235172098 3.56132967689766 -2.57885244172556 A:G A G 10 0.508761382413951 0.103646439844753 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18142464_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18142467_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18142464_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18142464_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18142467_18142883:CSRP2BP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 18143355 C/T 1 18 13 31 8.84229511654888 6.61389797138136 2.22839714516752 T:C C T 10 0.508761382413951 0.475249037707381 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18143021_18143589:CSRP2BP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 18462413 C/T 1 10 11 21 4.91238617586049 5.59637520655346 -0.68398903069297 T:C C T 10 0.508761382413951 0.82938952505783 ENSG00000132664:ENST00000377603:exon_18462263_18462454:POLR3F;ENSG00000132664:ENST00000462997:exon_18462263_18462454:POLR3F HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 18462421 A/G 1 12 11 23 5.89486341103259 5.59637520655346 0.298488204479128 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000132664:ENST00000377603:exon_18462263_18462454:POLR3F;ENSG00000132664:ENST00000462997:exon_18462263_18462454:POLR3F HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 18541378 C/T 1 113 114 227 55.5099637872235 57.9987975951904 -2.48883380796687 T:C C T 10 0.508761382413951 0.790671314314163 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18541295_18542048:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18541295_18542048:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18541295_18542059:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18541295_18541766:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18541295_18542059:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18541295_18542059:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000422877:exon_18541295_18541477:SEC23B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 11 10 21 5.40362479344654 5.08761382413951 0.31601096930703 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 20493550 T/C 1 2 9 11 0.982477235172098 4.57885244172556 -3.59637520655346 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0355658246260987 ENSG00000188559:ENST00000430436:exon_20493157_20493928:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000334388:exon_20493157_20493928:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000202677:exon_20493157_20493928:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000418184:exon_20493157_20493928:RALGAPA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 21227151 A/G 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 A:G A G 10 0.508761382413951 0.549520355276029 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 24952147 G/A 1 13 12 25 6.38610202861864 6.10513658896741 0.280965439651226 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24952096_24952212:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24952096_24952212:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24952096_24952212:C20orf3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 25038484 G/T 1 19 26 45 9.33353373413493 13.2277959427627 -3.89426220862779 T:G G T 10 0.508761382413951 0.296801769641811 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_25038405_25038818:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376726:exon_25038405_25039616:ACSS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 25398790 G/A 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000101003:ENST00000429262:exon_25398741_25398831:GINS1;ENSG00000101003:ENST00000262460:exon_25398741_25398831:GINS1;ENSG00000101003:ENST00000484893:exon_25398741_25398831:GINS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 31427602 G/A 1 81 91 172 39.79032802447 46.2972857996695 -6.50695777519957 A:G G A 10 0.508761382413951 0.322832192141422 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 31981849 T/C 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 33591006 G/A 1 44 42 86 21.6144991737862 21.3679780613859 0.246521112400217 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000100991:ENST00000252015:exon_33590207_33591086:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000451813:exon_33590215_33591086:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000432634:exon_33590215_33591086:TRPC4AP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 3 9 12 1.47371585275815 4.57885244172556 -3.10513658896741 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0871818487647519 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 34090519 G/A 1 22 20 42 10.8072495868931 10.175227648279 0.632021938614059 A:G G A 10 0.508761382413951 0.878401052374126 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425525:exon_34090218_34090632:CEP250 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 35865054 C/T 1 87 113 200 42.7377597299863 57.4900362127765 -14.7522764827902 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0401328928870303 ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000437329:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000470352:exon_35864983_35865112:RPN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 36770588 C/T 1 9 7 16 4.42114755827444 3.56132967689766 0.859817881376784 T:C C T 10 0.508761382413951 0.804101251762597 ENSG00000198959:ENST00000361475:exon_36770466_36770601:TGM2;ENSG00000198959:ENST00000485572:exon_36770466_36770601:TGM2;ENSG00000198959:ENST00000468262:exon_36770466_36770601:TGM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 37534665 C/T 1 13 9 22 6.38610202861864 4.57885244172556 1.80724958689308 T:C C T 10 0.508761382413951 0.524885322520688 ENSG00000101445:ENST00000299824:exon_37534612_37534737:PPP1R16B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 37536456 C/T 1 37 31 68 18.1758288506838 15.7716028548325 2.40422599585133 T:C C T 10 0.508761382413951 0.62801233138454 ENSG00000101445:ENST00000299824:exon_37536449_37536578:PPP1R16B;ENSG00000101445:ENST00000373331:exon_37536449_37536578:PPP1R16B;ENSG00000101445:ENST00000438192:exon_37536449_37536578:PPP1R16B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 37536564 C/T 1 20 23 43 9.82477235172098 11.7015117955209 -1.87673944379989 T:C C T 10 0.508761382413951 0.64798810832134 ENSG00000101445:ENST00000299824:exon_37536449_37536578:PPP1R16B;ENSG00000101445:ENST00000373331:exon_37536449_37536578:PPP1R16B;ENSG00000101445:ENST00000438192:exon_37536449_37536578:PPP1R16B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 37555116 G/C 1 14 7 21 6.87734064620469 3.56132967689766 3.31601096930703 C:G G C 10 0.508761382413951 0.190676404068772 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37554955_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37555069_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37555086_37555451:FAM83D HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 37570725 C/T 1 9 1 10 4.42114755827444 0.508761382413951 3.91238617586049 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0216733970401453 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37570602_37570769:FAM83D HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 37667182 C/T 1 11 5 16 5.40362479344654 2.54380691206975 2.85981788137678 T:C C T 10 0.508761382413951 0.211238572184989 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37667142_37668363:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000449559:exon_37667142_37667289:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000493450:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000482619:exon_37667142_37667279:DHX35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 44512350 G/A 1 12 14 26 5.89486341103259 7.12265935379531 -1.22779594276273 A:G G A 10 0.508761382413951 0.697185970897261 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 44596207 C/G 1 4 13 17 1.9649544703442 6.61389797138136 -4.64894350103717 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0284172183308144 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44595506_44596273:ZNF335 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 44596545 G/A 1 11 13 24 5.40362479344654 6.61389797138136 -1.21027317793482 A:G G A 10 0.508761382413951 0.685890504791539 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44596373_44597497:ZNF335 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 35 36 71 17.1933516155117 18.3154097669022 -1.12205815139052 T:G T G 10 0.508761382413951 0.813259320731333 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 44757524 C/G 1 188 188 376 92.3528601061772 95.6471398938228 -3.29427978764556 C:G C G 10 0.508761382413951 0.757056998993929 ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44757521_44758502:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44757521_44758502:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44756969_44758153:CD40;ENSG00000101017:ENST00000466205:exon_44757521_44757765:CD40;ENSG00000101017:ENST00000489304:exon_44757521_44758502:CD40;ENSG00000101017:ENST00000477696:exon_44757521_44757643:CD40 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 45315346 C/T 1 32 21 53 15.7196357627536 10.683989030693 5.0356467320606 T:C C T 10 0.508761382413951 0.172441786235126 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 47262549 C/T 1 55 47 102 27.0181239672327 23.9117849734557 3.106338993777 T:C C T 10 0.508761382413951 0.553853944269148 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47262389_47262595:PREX1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 47307618 G/A 1 33 26 59 16.2108743803396 13.2277959427627 2.98307843757689 A:G G A 10 0.508761382413951 0.515382221202956 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47307485_47307634:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47307485_47307634:PREX1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 47626847 T/C 1 8 3 11 3.92990894068839 1.52628414724185 2.40362479344654 T:C T C 10 0.508761382413951 0.227353863226797 ENSG00000124198:ENST00000371917:exon_47626769_47626941:ARFGEF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 47685320 G/C 1 12 6 18 5.89486341103259 3.05256829448371 2.84229511654888 C:G G C 10 0.508761382413951 0.239188352827104 ENSG00000124207:ENST00000396192:exon_47685252_47685359:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000417408:exon_47685252_47685359:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000262982:exon_47685252_47685359:CSE1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 47841660 G/T 1 9 10 19 4.42114755827444 5.08761382413951 -0.666466265865068 T:G G T 10 0.508761382413951 0.821210319840976 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000462328:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000493252:exon_47841650_47841736:DDX27 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 47865784 C/T 1 34 61 95 16.7021129979257 31.034444327251 -14.3323313293253 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00385322213119331 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 47874005 A/G 1 14 7 21 6.87734064620469 3.56132967689766 3.31601096930703 A:G A G 10 0.508761382413951 0.190676404068772 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47873954_47874201:ZNFX1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 47888247 C/T 1 20 8 28 9.82477235172098 4.07009105931161 5.75468129240937 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0364811161388974 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47886479_47888287:ZNFX1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 48746189 C/T 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000240849:ENST00000522930:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371650:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371656:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371652:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000453505:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371658:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000124208:ENST00000341698:exon_48746083_48746227:TMEM189-UBE2V1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 49195061 A/G 1 12 8 20 5.89486341103259 4.07009105931161 1.82477235172098 A:G A G 10 0.508761382413951 0.504771039081216 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49194957_49195166:PTPN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 50092193 T/C 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 T:C T C 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000101096:ENST00000371564:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000396009:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000371567:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000414705:exon_50091995_50092197:NFATC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 50769183 G/A 1 15 15 30 7.36857926379074 7.63142073620926 -0.262841472418529 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 50769379 C/T 1 22 11 33 10.8072495868931 5.59637520655346 5.21087438033962 T:C C T 10 0.508761382413951 0.081665497424099 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 50769549 A/G 1 21 10 31 10.316010969307 5.08761382413951 5.22839714516752 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0720876623587349 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 54961541 A/T 1 34 31 65 16.7021129979257 15.7716028548325 0.930510143093187 A:T A T 10 0.508761382413951 0.90141759367423 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 56179808 T/C 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 T:C T C 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56178906_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56179111_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56179803_56179825:ZBP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 57244493 G/A 1 11 17 28 5.40362479344654 8.64894350103717 -3.24531870759063 A:G G A 10 0.508761382413951 0.258527448393057 ENSG00000254995:ENST00000371138:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000435446:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000124222:ENST00000355957:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000312283:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000359617:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371141:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371132:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000358029:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000464640:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361830:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361770:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000468590:exon_57244358_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000438253:exon_57244347_57244509:STX16 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 57268867 C/A 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 A:C C A 10 0.508761382413951 0.335736887982477 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57268793_57268978:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57268225_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57268235_57268978:NPEPL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 57564070 C/T 1 13 17 30 6.38610202861864 8.64894350103717 -2.26284147241853 T:C C T 10 0.508761382413951 0.467323702180597 ENSG00000101158:ENST00000344018:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000482747:exon_57563969_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000460601:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000477741:exon_57563969_57564076:TH1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 57565943 G/C 1 9 9 18 4.42114755827444 4.57885244172556 -0.157704883451117 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000101158:ENST00000478389:exon_57565150_57567075:TH1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 122 100 222 59.931111345498 50.8761382413951 9.05497310410288 A:G A G 10 0.508761382413951 0.227711063651859 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 57572614 T/C 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 T:C T C 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000101160:ENST00000488395:exon_57572447_57572808:CTSZ HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 60704972 G/A 1 10 5 15 4.91238617586049 2.54380691206975 2.36857926379074 A:G G A 10 0.508761382413951 0.302882686663208 ENSG00000149657:ENST00000279068:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000440110:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000444156:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000400318:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000479741:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000279069:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000370906:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000361670:exon_60704841_60705008:LSM14B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 60770931 A/G 1 12 10 22 5.89486341103259 5.08761382413951 0.807249586893079 A:G A G 10 0.508761382413951 0.832379092287417 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000472005:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466099:exon_60770858_60771005:GTPBP5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 60963494 C/T 1 12 3 15 5.89486341103259 1.52628414724185 4.36857926379074 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0355657976378936 ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 60966318 G/T 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60966305_60966509:CABLES2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 61467800 A/G 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 A:G A G 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000092758:ENST00000472880:exon_61467273_61468011:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000469802:exon_61467539_61467884:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61467771_61467884:COL9A3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 61468571 T/C 1 7 14 21 3.43867032310234 7.12265935379531 -3.68398903069297 T:C T C 10 0.508761382413951 0.128195044803432 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466532:exon_61468274_61468617:COL9A3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 61526180 C/T 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 T:C C T 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61526162_61526266:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61526162_61526266:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000461792:exon_61526162_61526266:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61526162_61526266:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61526162_61526266:DIDO1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 61528306 A/G 1 10 7 17 4.91238617586049 3.56132967689766 1.35105649896283 A:G A G 10 0.508761382413951 0.629969031107128 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61527883_61528348:DIDO1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 61598772 A/G 1 29 33 62 14.2459199099954 16.7891256196604 -2.54320570966496 A:G A G 10 0.508761382413951 0.528375859146654 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61598055_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000483113:exon_61598689_61599949:SLC17A9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 62152819 G/A 1 8 15 23 3.92990894068839 7.63142073620926 -3.70151179552087 A:G G A 10 0.508761382413951 0.145808138014843 ENSG00000125534:ENST00000464438:exon_62152637_62152879:PPDPF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 62191321 A/G 1 10 14 24 4.91238617586049 7.12265935379531 -2.21027317793482 A:G A G 10 0.508761382413951 0.417834229251689 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 62191937 G/A 1 14 10 24 6.87734064620469 5.08761382413951 1.78972682206518 A:G G A 10 0.508761382413951 0.542761494383684 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 62194030 G/C 1 8 12 20 3.92990894068839 6.10513658896741 -2.17522764827902 C:G G C 10 0.508761382413951 0.376308412261741 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 62194103 A/G 1 3 11 14 1.47371585275815 5.59637520655346 -4.12265935379531 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0323929383164566 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 62194128 G/A 1 8 8 16 3.92990894068839 4.07009105931161 -0.140182118623216 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 62195087 A/G 1 10 14 24 4.91238617586049 7.12265935379531 -2.21027317793482 A:G A G 10 0.508761382413951 0.417834229251689 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 62196253 C/A 1 12 14 26 5.89486341103259 7.12265935379531 -1.22779594276273 A:C C A 10 0.508761382413951 0.697185970897261 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 62197370 G/A 1 13 8 21 6.38610202861864 4.07009105931161 2.31601096930703 A:G G A 10 0.508761382413951 0.384857904990228 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 62198686 G/A 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 A:G G A 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 62198713 G/A 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 62200738 G/A 1 6 10 16 2.94743170551629 5.08761382413951 -2.14018211862322 A:G G A 10 0.508761382413951 0.324879272681718 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 62200860 A/G 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 A:G A G 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 62200929 G/A 1 2 6 8 0.982477235172098 3.05256829448371 -2.07009105931161 A:G G A 10 0.508761382413951 0.172493759593104 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 20 62324289 C/T 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 17203785 A/T 1 8 8 16 3.92990894068839 4.07009105931161 -0.140182118623216 A:T A T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000155313:ENST00000285681:exon_17203720_17203948:USP25;ENSG00000155313:ENST00000285679:exon_17203720_17203948:USP25;ENSG00000155313:ENST00000400183:exon_17203720_17203948:USP25;ENSG00000155313:ENST00000453553:exon_17203720_17203948:USP25 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 17236650 G/A 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 A:G G A 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000155313:ENST00000285681:exon_17236587_17236765:USP25;ENSG00000155313:ENST00000285679:exon_17236587_17236765:USP25;ENSG00000155313:ENST00000400183:exon_17236587_17236765:USP25;ENSG00000155313:ENST00000449491:exon_17236587_17236765:USP25 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 19169155 G/C 1 33 35 68 16.2108743803396 17.8066483844883 -1.59577400414867 C:G G C 10 0.508761382413951 0.717495976348783 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 19169218 G/C 1 53 42 95 26.0356467320606 21.3679780613859 4.66766867067466 T:C:G G C 10 0.508761382413951 0.356960485816172 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 26976222 C/T 1 60 52 112 29.4743170551629 26.4555918855255 3.01872516963749 T:C C T 10 0.508761382413951 0.572524325086528 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 26976237 C/T 1 74 64 138 36.3516577013676 32.5607284744929 3.79092922687477 T:C C T 10 0.508761382413951 0.551622094945075 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 27056250 A/G 1 7 2 9 3.43867032310234 1.0175227648279 2.42114755827444 A:G A G 10 0.508761382413951 0.180291906522768 ENSG00000154721:ENST00000480456:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000400533:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000400532:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000400537:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000400535:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000425221:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000312957:exon_27056195_27056260:JAM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 30339120 C/A 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:C C A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000198862:ENST00000389194:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000361371:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000446611:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000389195:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000452100:exon_30338692_30339501:LTN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 30339234 T/C 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 T:C T C 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000198862:ENST00000389194:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000361371:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000446611:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000389195:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000452100:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000483326:exon_30339217_30339501:LTN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 34128717 G/A 1 8 5 13 3.92990894068839 2.54380691206975 1.38610202861864 A:G G A 10 0.508761382413951 0.581825911412537 ENSG00000159086:ENST00000466846:exon_34127524_34129105:GCFC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 26 26 52 12.7722040572373 13.2277959427627 -0.45559188552545 T:G T G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 34640788 A/G 1 37 36 73 18.1758288506838 18.3154097669022 -0.139580916218421 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000249624:ENST00000433395:exon_34640699_34640822:AP000295.9;ENSG00000243646:ENST00000290200:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000422891:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000493295:exon_34640233_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000498371:exon_34640587_34640822:IL10RB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 34889816 T/C 1 30 23 53 14.7371585275815 11.7015117955209 3.0356467320606 T:C T C 10 0.508761382413951 0.413916419954781 ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34889664_34889915:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34889664_34889915:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34889664_34889915:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34889664_34889915:GART HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 146 148 294 71.7208381675632 75.2966845972647 -3.57584642970158 A:T:G A G 10 0.508761382413951 0.683468256632493 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 35890409 C/T 1 8 5 13 3.92990894068839 2.54380691206975 1.38610202861864 T:C C T 10 0.508761382413951 0.581825911412537 ENSG00000159200:ENST00000487990:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000313806:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000489903:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381132:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000399272:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000481448:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000482533:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381135:exon_35888788_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000443408:exon_35888788_35890554:RCAN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 38437951 T/G 1 49 23 72 24.0706922617164 11.7015117955209 12.3691804661955 T:G T G 10 0.508761382413951 0.00434955714029637 ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38435146_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38436448_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38437674_38438012:PIGP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 11 20 31 5.40362479344654 10.175227648279 -4.77160285483248 A:G G A 10 0.508761382413951 0.105603260183457 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 105 133 238 51.5800548465351 67.6652638610555 -16.0852090145203 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0380872019710586 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 43221826 T/C 1 14 17 31 6.87734064620469 8.64894350103717 -1.77160285483248 T:C T C 10 0.508761382413951 0.591853548885225 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000486812:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000470586:exon_43221154_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000465955:exon_43221788_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000477633:exon_43221817_43221882:PRDM15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 43938586 A/G 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000160190:ENST00000419522:exon_43938387_43938620:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000398341:exon_43938387_43938620:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000471277:exon_43938387_43938620:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000352133:exon_43938387_43938620:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000398343:exon_43938387_43938620:SLC37A1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 11 5 16 5.40362479344654 2.54380691206975 2.85981788137678 C:G C G 10 0.508761382413951 0.211238572184989 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 44323461 G/A 1 37 32 69 18.1758288506838 16.2803642372464 1.89546461343738 A:G G A 10 0.508761382413951 0.718329164014680 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 37 51 88 18.1758288506838 25.9468305031115 -7.77100165242769 T:G T G 10 0.508761382413951 0.109660613152291 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 44 38 82 21.6144991737862 19.3329325317301 2.28156664205602 A:G G A 10 0.508761382413951 0.659302766352613 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 44427658 G/T 1 2 6 8 0.982477235172098 3.05256829448371 -2.07009105931161 T:G G T 10 0.508761382413951 0.172493759593104 ENSG00000160194:ENST00000456957:exon_44427601_44427677:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000418336:exon_44427601_44427676:NDUFV3;ENSG00000160199:ENST00000291547:exon_44427601_44427728:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000432907:exon_44427601_44427728:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000480179:exon_44427601_44427728:PKNOX1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 45379560 G/A 1 9 15 24 4.42114755827444 7.63142073620926 -3.21027317793482 A:G G A 10 0.508761382413951 0.222993356359584 ENSG00000160216:ENST00000291572:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000438598:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000448287:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398061:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000327505:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000445582:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398063:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398058:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000457068:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000448845:exon_45379515_45379677:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000422850:exon_45379515_45379740:AGPAT3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 22 20 42 10.8072495868931 10.175227648279 0.632021938614059 A:G G A 10 0.508761382413951 0.878401052374126 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 45506819 T/C 1 11 11 22 5.40362479344654 5.59637520655346 -0.192750413106921 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45506683_45506841:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45506683_45506841:TRAPPC10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 18 9 27 8.84229511654888 4.57885244172556 4.26344267482332 T:C T C 10 0.508761382413951 0.123621607685646 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 27 21 48 13.2634426748233 10.683989030693 2.57945364413035 A:G A G 10 0.508761382413951 0.474155549743457 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 45544594 T/C 1 25 21 46 12.2809654396512 10.683989030693 1.59697640895826 T:C T C 10 0.508761382413951 0.661003187953271 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45544461_45544608:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45544461_45546000:PWP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 45732116 C/T 1 67 60 127 32.9129873782653 30.5256829448371 2.38730443342823 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.722807189883955 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000496824:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000491298:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45731988_45732177:PFKL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 45750145 T/C 1 36 43 79 17.6845902330978 21.8767394437999 -4.19214921070213 T:C T C 10 0.508761382413951 0.369210339872886 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 45759045 C/T 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 T:C C T 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45759001_45759285:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45759001_45759285:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45759001_45759276:C21orf2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 46387078 G/T 1 12 4 16 5.89486341103259 2.0350455296558 3.85981788137678 T:G G T 10 0.508761382413951 0.0775291226144439 ENSG00000160256:ENST00000291634:exon_46386949_46387096:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000397826:exon_46386949_46387096:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000458015:exon_46386949_46387096:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000479127:exon_46386949_46387096:C21orf70 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 46396659 G/C 1 15 11 26 7.36857926379074 5.59637520655346 1.77220405723727 C:G G C 10 0.508761382413951 0.558785240284514 ENSG00000160256:ENST00000291634:exon_46396595_46396904:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000397826:exon_46396595_46396904:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000479127:exon_46396595_46396888:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000485207:exon_46396595_46396888:C21orf70 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 46951556 A/G 1 20 26 46 9.82477235172098 13.2277959427627 -3.40302359104174 A:G A G 10 0.508761382413951 0.376652544219139 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000477688:exon_46951332_46952062:SLC19A1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 21 46957794 T/C 1 10 5 15 4.91238617586049 2.54380691206975 2.36857926379074 T:C T C 10 0.508761382413951 0.302882686663208 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000427839:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000443742:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000486303:exon_46957685_46957847:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000528477:exon_46957692_46957922:SLC19A1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 17589297 G/A 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 A:G G A 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 17589794 C/A 1 6 6 12 2.94743170551629 3.05256829448371 -0.105136588967412 A:C C A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 17669306 T/C 1 10 8 18 4.91238617586049 4.07009105931161 0.842295116548883 T:C T C 10 0.508761382413951 0.815041324056156 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000469063:exon_17669229_17669617:CECR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 17690430 C/G 1 9 13 22 4.42114755827444 6.61389797138136 -2.19275041310692 C:G C G 10 0.508761382413951 0.398108590862778 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17690246_17690575:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17690246_17690779:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17690246_17690614:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000441548:exon_17690246_17690613:CECR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 19420109 T/C 1 17 13 30 8.35105649896283 6.61389797138136 1.73715852758147 T:C T C 10 0.508761382413951 0.586407892614967 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19419425_19420130:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19420102_19420382:MRPL40 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 98 100 198 48.1413845234328 50.8761382413951 -2.73475371796229 A:G G A 10 0.508761382413951 0.722573452406104 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 41 29 70 20.140783321028 14.7540800900046 5.38670323102343 T:C C T 10 0.508761382413951 0.231880869745622 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 84 81 165 41.2640438772281 41.20967197553 0.0543719016980901 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 20102750 C/T 1 10 6 16 4.91238617586049 3.05256829448371 1.85981788137678 T:C C T 10 0.508761382413951 0.455622877460238 ENSG00000099899:ENST00000471040:exon_20102488_20102962:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000463710:exon_20102488_20102915:TRMT2A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 20113777 T/C 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 T:C T C 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 20307256 G/A 1 37 14 51 18.1758288506838 7.12265935379531 11.0531694968885 A:G G A 10 0.508761382413951 0.001913914894583 ENSG00000128185:ENST00000248879:exon_20307162_20307322:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000405465:exon_20307162_20307309:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000443409:exon_20307162_20307322:DGCR6L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 20761063 G/A 1 8 9 17 3.92990894068839 4.57885244172556 -0.648943501037166 A:G G A 10 0.508761382413951 0.811742532730089 ENSG00000185252:ENST00000400451:exon_20759667_20761968:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000403682:exon_20759667_20761697:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000357502:exon_20759667_20761971:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000493734:exon_20759667_20761970:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000356671:exon_20759667_20762752:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000437275:exon_20759667_20762745:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000405993:exon_20759667_20761258:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000476678:exon_20759667_20761683:ZNF74 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 21982892 C/T 1 56 49 105 27.5093625848187 24.9293077382836 2.58005484653515 T:C C T 10 0.508761382413951 0.626942626702699 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 21984205 A/G 1 91 84 175 44.7027142003305 42.7359561227719 1.96675807755858 A:T:G A G 10 0.508761382413951 0.820652535267523 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21984140_21984301:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21984140_21984332:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21984140_21984327:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21984140_21984303:YDJC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 1 31 15 46 15.2283971451675 7.63142073620926 7.59697640895826 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0269368303833611 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 22277571 A/C 1 5 8 13 2.45619308793025 4.07009105931161 -1.61389797138136 A:C A C 10 0.508761382413951 0.416571082319480 ENSG00000100034:ENST00000406981:exon_22273793_22277844:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000263212:exon_22273793_22277844:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000407142:exon_22273800_22277844:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000496143:exon_22277498_22277844:PPM1F HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 23223278 A/T 1 11 1 12 5.40362479344654 0.508761382413951 4.89486341103259 A:T A T 10 0.508761382413951 0.00643682590501964 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 23627238 C/A 1 13 16 29 6.38610202861864 8.14018211862322 -1.75408009000458 A:C C A 10 0.508761382413951 0.579672735950497 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000427791:exon_23627220_23627301:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000466076:exon_23627220_23627388:BCR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 23631801 T/C 1 2 7 9 0.982477235172098 3.56132967689766 -2.57885244172556 T:C T C 10 0.508761382413951 0.103646439844753 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23631704_23633318:BCR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 23632547 A/G 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 A:G A G 10 0.508761382413951 0.335736887982477 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23632526_23632600:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23632526_23632600:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23632526_23632600:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23632526_23632600:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23632526_23632600:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23632526_23632600:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23632526_23632600:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23631704_23633318:BCR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 24036563 G/A 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 A:G G A 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000159496:ENST00000441897:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000401461:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000290691:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382833:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382834:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382831:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000460003:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000467354:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000423392:exon_24036534_24036637:RGL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 24086107 A/G 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 A:G A G 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000187792:ENST00000341976:exon_24083769_24087406:ZNF70 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 24717518 G/A 1 9 8 17 4.42114755827444 4.07009105931161 0.351056498962834 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000100014:ENST00000398280:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000437398:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000421374:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000314328:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000440893:exon_24717256_24717656:SPECC1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 47 47 94 23.0882150265443 23.9117849734557 -0.823569946911391 T:C T C 10 0.508761382413951 0.917958987029501 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 29196306 G/A 1 149 153 302 73.1945540203213 77.8404915093345 -4.64593748901319 A:G G A 10 0.508761382413951 0.604837671218494 ENSG00000100219:ENST00000216037:exon_29196286_29196585:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000403532:exon_29196286_29196546:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000344347:exon_29196286_29196544:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000415306:exon_29196286_29196535:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000482720:exon_29196286_29196557:XBP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 29659960 C/T 1 9 14 23 4.42114755827444 7.12265935379531 -2.70151179552087 T:C C T 10 0.508761382413951 0.300583067488647 ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000496342:exon_29659824_29660390:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000414672:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000406335:exon_29659946_29660207:RHBDD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 28 41 69 13.7546812924094 20.859216678972 -7.10453538656262 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0926148602946641 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 29755888 T/C 1 12 24 36 5.89486341103259 12.2102731779348 -6.31540976690223 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0443691620103385 ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000421126:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000473606:exon_29755662_29755948:AP1B1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 29881828 C/T 1 3 8 11 1.47371585275815 4.07009105931161 -2.59637520655346 T:C C T 10 0.508761382413951 0.139557898450825 ENSG00000100285:ENST00000310624:exon_29881712_29881836:NEFH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 29886043 A/C 1 2 37 39 0.982477235172098 18.8241711493162 -17.8416939141441 A:C A C 10 0.508761382413951 9.01782262841382e-10 ENSG00000100285:ENST00000310624:exon_29884838_29887379:NEFH;ENSG00000100285:ENST00000328842:exon_29886042_29886692:NEFH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 29913272 C/T 1 9 6 15 4.42114755827444 3.05256829448371 1.36857926379074 T:C C T 10 0.508761382413951 0.60808216621752 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 67 79 146 32.9129873782653 40.1921492107021 -7.27916183243684 A:G A G 10 0.508761382413951 0.246738089729145 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 30975861 C/T 1 94 80 174 46.1764300530886 40.7009105931161 5.47551945997253 T:C C T 10 0.508761382413951 0.448421720199844 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30975738_30975910:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30974824_30976061:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30975738_30975922:PES1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 31491295 G/C 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 31679110 G/C 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 C:G G C 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000100100:ENST00000215912:exon_31677579_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000480654:exon_31677580_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000416925:exon_31677599_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000441972:exon_31677599_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000493034:exon_31677665_31679274:PIK3IP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 31741067 G/A 1 22 26 48 10.8072495868931 13.2277959427627 -2.42054635586965 A:G G A 10 0.508761382413951 0.564196326847116 ENSG00000100105:ENST00000266269:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000405309:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000351933:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000440325:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000215919:exon_31740318_31741762:PATZ1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 31971282 T/C 1 8 4 12 3.92990894068839 2.0350455296558 1.89486341103259 T:C T C 10 0.508761382413951 0.388585368391447 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476010:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000484806:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31971217_31971378:SFI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 32007137 C/T 1 15 18 33 7.36857926379074 9.15770488345112 -1.78912561966038 T:C C T 10 0.508761382413951 0.603048493918855 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000466991:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000491973:exon_32007129_32007289:SFI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 19 10 29 9.33353373413493 5.08761382413951 4.24591990999542 T:C T C 10 0.508761382413951 0.137786390771344 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 32784051 T/C 1 97 103 200 47.6501459058468 52.4024223886369 -4.75227648279019 T:C T C 10 0.508761382413951 0.524796978114635 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32783569_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32783588_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000451746:exon_32783588_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32783588_32784086:C22orf28 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 48 37 85 23.5794536441304 18.8241711493162 4.75528249481417 T:C C T 10 0.508761382413951 0.329640271888724 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 32871365 G/A 1 28 25 53 13.7546812924094 12.7190345603488 1.0356467320606 A:G G A 10 0.508761382413951 0.785565299991673 ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32871244_32871385:FBXO7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 34022284 G/A 1 5 7 12 2.45619308793025 3.56132967689766 -1.10513658896741 A:G G A 10 0.508761382413951 0.574941367903584 ENSG00000133424:ENST00000452586:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000354992:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000337431:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000397394:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000402320:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000437602:exon_34022228_34022310:LARGE HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 13 10 23 6.38610202861864 5.08761382413951 1.29848820447913 T:G T G 10 0.508761382413951 0.678726593550885 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 18 14 32 8.84229511654888 7.12265935379531 1.71963576275357 C:G G C 10 0.508761382413951 0.598431040951595 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 36537500 A/T 1 38 49 87 18.6670674682699 24.9293077382836 -6.26224027001373 A:T A T 10 0.508761382413951 0.198473809089780 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 36537893 A/G 1 56 60 116 27.5093625848187 30.5256829448371 -3.01632036001831 A:G A G 10 0.508761382413951 0.579078347562446 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 36900812 C/T 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 T:C C T 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900562_36900813:FOXRED2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 37325833 C/T 1 12 15 27 5.89486341103259 7.63142073620926 -1.73655732517668 T:C C T 10 0.508761382413951 0.566352319356245 ENSG00000100368:ENST00000403662:exon_37325681_37325849:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000262825:exon_37325681_37325849:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000406230:exon_37325681_37325849:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000421539:exon_37325681_37325849:CSF2RB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 37333794 A/G 1 23 10 33 11.2984882044791 5.08761382413951 6.21087438033962 A:G A G 10 0.508761382413951 0.035996371845262 ENSG00000100368:ENST00000403662:exon_37333419_37336491:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000262825:exon_37333419_37336481:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000406230:exon_37333419_37334653:CSF2RB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 37524619 G/T 1 81 80 161 39.79032802447 40.7009105931161 -0.910582568646106 T:G G T 10 0.508761382413951 0.937210835438492 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37524133_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37524562_37524888:IL2RB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 37531436 G/A 1 14 18 32 6.87734064620469 9.15770488345112 -2.28036423724643 A:G G A 10 0.508761382413951 0.481273059851305 ENSG00000100385:ENST00000447922:exon_37531368_37531448:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37531368_37531482:IL2RB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 37603745 G/A 1 9 4 13 4.42114755827444 2.0350455296558 2.38610202861864 A:G G A 10 0.508761382413951 0.267810029003266 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 38164106 C/T 1 14 15 29 6.87734064620469 7.63142073620926 -0.754080090004578 T:C C T 10 0.508761382413951 0.853634761322044 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 38205989 T/C 1 1 13 14 0.491238617586049 6.61389797138136 -6.12265935379531 T:C T C 10 0.508761382413951 0.000816439560497767 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38205956_38206164:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000445195:exon_38205956_38206164:GCAT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 17 7 24 8.35105649896283 3.56132967689766 4.78972682206518 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0648841359610272 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 686 714 1400 336.98969166403 363.255627043561 -26.2659353795314 T:C T C 10 0.508761382413951 0.164546148372858 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 38323507 G/T 1 11 9 20 5.40362479344654 4.57885244172556 0.824772351720981 T:G G T 10 0.508761382413951 0.824343209360058 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 16 8 24 7.85981788137678 4.07009105931161 3.78972682206518 T:C C T 10 0.508761382413951 0.153096477627005 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 14 6 20 6.87734064620469 3.05256829448371 3.82477235172098 A:G G A 10 0.508761382413951 0.116430409892464 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 12 10 22 5.89486341103259 5.08761382413951 0.807249586893079 A:C C A 10 0.508761382413951 0.832379092287417 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 11 7 18 5.40362479344654 3.56132967689766 1.84229511654888 T:C T C 10 0.508761382413951 0.481911196747905 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 10 4 14 4.91238617586049 2.0350455296558 2.87734064620469 T:G G T 10 0.508761382413951 0.180503112624562 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 34 8 42 16.7021129979257 4.07009105931161 12.6320219386141 C:G G C 10 0.508761382413951 7.58659355490699e-05 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 10 2 12 4.91238617586049 1.0175227648279 3.89486341103259 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0389207059439051 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 39497452 A/G 0 15 0 15 7.36857926379074 0 7.36857926379074 A A 10 0.508761382413951 6.30107909923356e-05 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 39497454 G/C 0 15 0 15 7.36857926379074 0 7.36857926379074 G G 10 0.508761382413951 6.30107909923356e-05 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 36 10 46 17.6845902330978 5.08761382413951 12.5969764089583 C:G G C 10 0.508761382413951 0.000172627451335681 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 39709009 G/A 1 7 14 21 3.43867032310234 7.12265935379531 -3.68398903069297 A:G G A 10 0.508761382413951 0.128195044803432 ENSG00000100316:ENST00000473638:exon_39708889_39709315:RPL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 39711351 A/G 1 15 13 28 7.36857926379074 6.61389797138136 0.754681292409373 A:G A G 10 0.508761382413951 0.851195156405806 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 39715140 C/T 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 T:C C T 10 0.508761382413951 0.219001271230579 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 416 429 845 204.355264915796 218.258633055585 -13.9033681397886 A:C A C 10 0.508761382413951 0.352920008836908 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 41548008 A/G 1 8 6 14 3.92990894068839 3.05256829448371 0.877340646204686 A:G A G 10 0.508761382413951 0.79097715531601 ENSG00000100393:ENST00000263253:exon_41547837_41548016:EP300 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 41833116 C/T 1 17 21 38 8.35105649896283 10.683989030693 -2.33293253173014 T:C C T 10 0.508761382413951 0.517467993667923 ENSG00000183864:ENST00000327492:exon_41829496_41833411:TOB2;ENSG00000183864:ENST00000434408:exon_41833046_41833411:TOB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 42071204 G/A 1 4 12 16 1.9649544703442 6.10513658896741 -4.14018211862322 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0456569950629327 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 42073134 C/T 1 14 119 133 6.87734064620469 60.5426045072602 -53.6652638610555 T:C C T 10 0.508761382413951 7.51471262440388e-23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 32 30 62 15.7196357627536 15.2628414724185 0.45679429033504 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 42912097 C/T 1 100 37 137 49.1238617586049 18.8241711493162 30.2996906092887 T:C C T 10 0.508761382413951 1.88326491676293e-07 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 13 20 33 6.38610202861864 10.175227648279 -3.78912561966038 T:C C T 10 0.508761382413951 0.223608612785843 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 8 18 26 3.92990894068839 9.15770488345112 -5.22779594276273 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0490487434630172 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 43089849 T/C 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 T:C T C 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 55 44 99 27.0181239672327 22.3855008262138 4.63262314101885 C:G G C 10 0.508761382413951 0.367065728858184 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 43575935 C/T 1 37 44 81 18.1758288506838 22.3855008262138 -4.20967197553003 T:C C T 10 0.508761382413951 0.375046753444255 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43575847_43576006:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43575847_43576006:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43575847_43576006:TTLL12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 44368204 A/G 1 21 24 45 10.316010969307 12.2102731779348 -1.89426220862779 A:G A G 10 0.508761382413951 0.655302540475603 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 44379822 T/C 1 19 15 34 9.33353373413493 7.63142073620926 1.70211299792567 T:C T C 10 0.508761382413951 0.60947784477379 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 44379838 A/G 1 23 18 41 11.2984882044791 9.15770488345112 2.14078332102801 A:G A G 10 0.508761382413951 0.535298801316041 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 44386281 C/T 1 44 47 91 21.6144991737862 23.9117849734557 -2.29728579966954 T:C C T 10 0.508761382413951 0.6754278064693 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000494795:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000465768:exon_44386208_44386286:SAMM50 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 73 69 142 35.8604190837816 35.1045353865626 0.755883697218962 A:C A C 10 0.508761382413951 0.93321029051966 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 45577231 T/C 1 14 19 33 6.87734064620469 9.66646626586507 -2.78912561966038 T:C T C 10 0.508761382413951 0.385544935151851 ENSG00000093000:ENST00000347635:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000432759:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000425733:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000355253:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000407019:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000493456:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000396096:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000440908:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000422489:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000469163:exon_45577167_45577248:NUP50 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 47083010 T/C 1 26 20 46 12.7722040572373 10.175227648279 2.59697640895826 T:C T C 10 0.508761382413951 0.464563634554479 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 47083012 T/A 1 30 22 52 14.7371585275815 11.1927504131069 3.54440811447455 A:T T A 10 0.508761382413951 0.335613017320477 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 47085924 G/A 1 15 10 25 7.36857926379074 5.08761382413951 2.28096543965123 A:G G A 10 0.508761382413951 0.426148435268484 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47085889_47086097:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47085889_47086097:CERK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 47087670 G/A 1 10 9 19 4.91238617586049 4.57885244172556 0.333533734134932 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47087469_47087674:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47087469_47087674:CERK;ENSG00000100422:ENST00000471929:exon_47087469_47087674:CERK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50354819 C/A 1 91 117 208 44.7027142003305 59.5250817424323 -14.8223675421018 A:C C A 10 0.508761382413951 0.0441220782613573 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50354773_50354882:PIM3;ENSG00000198355:ENST00000467480:exon_50354416_50354882:PIM3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50356302 C/T 1 13 10 23 6.38610202861864 5.08761382413951 1.29848820447913 T:C C T 10 0.508761382413951 0.678726593550885 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50356555 T/C 1 14 13 27 6.87734064620469 6.61389797138136 0.263442674823324 T:C T C 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 157 164 321 77.1244629610097 83.436866715888 -6.31240375487826 T:C T C 10 0.508761382413951 0.503083563639009 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50632779 C/T 1 34 28 62 16.7021129979257 14.2453187075906 2.45679429033504 T:C C T 10 0.508761382413951 0.611794225221805 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50632769_50632935:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50632769_50632935:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50632769_50632935:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50632769_50632935:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50632769_50632935:TRABD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50659094 C/T 1 21 20 41 10.316010969307 10.175227648279 0.14078332102801 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50684296 T/C 1 8 11 19 3.92990894068839 5.59637520655346 -1.66646626586507 T:C T C 10 0.508761382413951 0.497078070201239 ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50699668 A/G 1 11 4 15 5.40362479344654 2.0350455296558 3.36857926379074 A:G A G 10 0.508761382413951 0.119313325605239 ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50699596_50699737:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50699596_50700137:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50699596_50699725:MAPK12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50704661 T/C 1 18 7 25 8.84229511654888 3.56132967689766 5.28096543965123 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0440776328974178 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704655_50704734:MAPK11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50719293 G/A 1 13 30 43 6.38610202861864 15.2628414724185 -8.87673944379989 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00876852825069859 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50722134 T/C 1 4 12 16 1.9649544703442 6.10513658896741 -4.14018211862322 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0456569950629327 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 69 53 122 33.8954646134374 26.9643532679394 6.93111134549798 T:C C T 10 0.508761382413951 0.239057850667187 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50878196 G/A 1 13 17 30 6.38610202861864 8.64894350103717 -2.26284147241853 A:G G A 10 0.508761382413951 0.467323702180597 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50878182_50878478:PPP6R2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 92 73 165 45.1939528179165 37.1395809162184 8.05437190169809 A:G A G 10 0.508761382413951 0.213837690953739 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50893658 G/A 1 38 44 82 18.6670674682699 22.3855008262138 -3.71843335794398 A:G G A 10 0.508761382413951 0.440470867797659 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50893653_50893838:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50893653_50893838:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50893653_50893838:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50893653_50893806:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50893653_50893838:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50893653_50893838:SBF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50895020 C/T 1 18 12 30 8.84229511654888 6.10513658896741 2.73715852758147 T:C:G C T 10 0.508761382413951 0.363817218311101 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000476293:exon_50895018_50895102:SBF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50901009 C/T 1 16 16 32 7.85981788137678 8.14018211862322 -0.280364237246431 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000356279:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50900988_50901146:SBF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 137 122 259 67.2996906092887 62.068888654502 5.2308019547867 T:G T G 10 0.508761382413951 0.534616381691773 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 60 56 116 29.4743170551629 28.4906374151813 0.983679639981688 T:C:G C G 10 0.508761382413951 0.926067176408004 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50964236 G/A 1 159 139 298 78.1069401961818 70.7178321555392 7.38910804064261 A:C:G G A 10 0.508761382413951 0.417383480499672 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50987287 A/G 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 A:G A G 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50988062 G/T 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 T:G G T 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 50988193 A/G 1 10 1 11 4.91238617586049 0.508761382413951 4.40362479344654 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0118508059115006 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 51009953 C/T 1 14 17 31 6.87734064620469 8.64894350103717 -1.77160285483248 T:C C T 10 0.508761382413951 0.591853548885225 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000497224:exon_51009587_51009968:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51009804_51009968:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51009804_51009962:CTA-384D8.32 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 51011376 G/C 1 11 4 15 5.40362479344654 2.0350455296558 3.36857926379074 C:G G C 10 0.508761382413951 0.119313325605239 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000475238:exon_51011304_51011529:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 51018579 A/G 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 A:G A G 10 0.508761382413951 0.508416720988862 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 51064039 G/C 1 23 21 44 11.2984882044791 10.683989030693 0.614499173786157 C:G G C 10 0.508761382413951 0.88120115288746 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064007_51064109:ARSA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 22 51064416 T/C 1 22 15 37 10.8072495868931 7.63142073620926 3.17582885068381 T:C T C 10 0.508761382413951 0.32676512692443 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064364_51064491:ARSA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 4403837 A/G 0 10 0 10 4.91238617586049 0 4.91238617586049 A A 10 0.508761382413951 0.00198015025857764 ENSG00000144455:ENST00000272902:exon_4402830_4403938:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000383843:exon_4403450_4403938:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000458465:exon_4403479_4403938:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000405420:exon_4403793_4403938:SUMF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 4752034 G/A 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 A:G G A 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4752009_4752157:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4752009_4752157:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4752009_4752157:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4752009_4752157:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4752009_4752157:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4752009_4752157:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4752009_4752157:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4752009_4752157:ITPR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 4842231 C/T 1 9 6 15 4.42114755827444 3.05256829448371 1.36857926379074 T:C C T 10 0.508761382413951 0.60808216621752 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000467545:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000490572:exon_4842109_4842284:ITPR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 4856180 T/C 1 10 2 12 4.91238617586049 1.0175227648279 3.89486341103259 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0389207059439051 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 4856234 G/A 1 11 3 14 5.40362479344654 1.52628414724185 3.87734064620469 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0578984717625192 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 8809214 G/A 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000180914:ENST00000316793:exon_8808952_8810015:OXTR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 8955389 C/T 1 8 3 11 3.92990894068839 1.52628414724185 2.40362479344654 T:C C T 10 0.508761382413951 0.227353863226797 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_8955328_8955404:RAD18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 9005078 C/T 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 T:C C T 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000415439:exon_9005019_9005115:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000495087:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000418463:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000421052:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000413832:exon_9005019_9005277:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000469793:exon_9005019_9005127:RAD18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 9005085 T/C 1 8 6 14 3.92990894068839 3.05256829448371 0.877340646204686 T:C T C 10 0.508761382413951 0.79097715531601 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000415439:exon_9005019_9005115:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000495087:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000418463:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000421052:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000413832:exon_9005019_9005277:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000469793:exon_9005019_9005127:RAD18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 23 15 38 11.2984882044791 7.63142073620926 3.66706746826986 T:C T C 10 0.508761382413951 0.258653199088114 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 T:C T C 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 30 23 53 14.7371585275815 11.7015117955209 3.0356467320606 A:G G A 10 0.508761382413951 0.413916419954781 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 9425944 G/C 1 31 32 63 15.2283971451675 16.2803642372464 -1.05196709207891 C:G G C 10 0.508761382413951 0.8024536443897 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 9426224 G/A 1 32 46 78 15.7196357627536 23.4030235910417 -7.68338782828818 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0895589559155442 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9426208_9427386:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9426208_9428475:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9426208_9426344:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9426208_9426554:THUMPD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 81 91 172 39.79032802447 46.2972857996695 -6.50695777519957 T:C T C 10 0.508761382413951 0.322832192141422 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 10302045 C/T 1 42 38 80 20.6320219386141 19.3329325317301 1.29908940688392 T:C C T 10 0.508761382413951 0.823401154128263 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 10302056 A/G 1 40 36 76 19.649544703442 18.3154097669022 1.33413493653973 A:G A G 10 0.508761382413951 0.818848703183988 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 10302172 G/A 1 49 55 104 24.0706922617164 27.9818760327673 -3.9111837710509 A:G G A 10 0.508761382413951 0.492633004603051 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 11596302 T/C 1 10 6 16 4.91238617586049 3.05256829448371 1.85981788137678 T:C T C 10 0.508761382413951 0.455622877460238 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 11596348 C/T 1 7 9 16 3.43867032310234 4.57885244172556 -1.14018211862322 T:C C T 10 0.508761382413951 0.623757634359657 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 11643465 T/C 1 10 13 23 4.91238617586049 6.61389797138136 -1.70151179552087 T:C T C 10 0.508761382413951 0.535488052826954 ENSG00000144560:ENST00000273038:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000413604:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000426568:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000404339:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000445411:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000418000:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000458499:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417206:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417466:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424709:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000419541:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000437722:exon_11643307_11643496:VGLL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 11684957 C/T 1 9 20 29 4.42114755827444 10.175227648279 -5.75408009000458 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0400545286939346 ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11684911_11685398:VGLL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 12881757 C/T 1 25 19 44 12.2809654396512 9.66646626586507 2.61449917378616 T:C C T 10 0.508761382413951 0.454446474053152 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 12 14 26 5.89486341103259 7.12265935379531 -1.22779594276273 A:G G A 10 0.508761382413951 0.697185970897261 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 15737689 G/A 1 15 5 20 7.36857926379074 2.54380691206975 4.82477235172098 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0420027631184402 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15737641_15737738:ANKRD28 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 15737698 T/C 1 17 7 24 8.35105649896283 3.56132967689766 4.78972682206518 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0648841359610272 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15737641_15737738:ANKRD28 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 32 27 59 15.7196357627536 13.7365573251767 1.98307843757689 C:G C G 10 0.508761382413951 0.696434551434237 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 147 164 311 72.2120767851492 83.436866715888 -11.2247899307388 T:C T C 10 0.508761382413951 0.212289935084589 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 111 122 233 54.5274865520514 62.068888654502 -7.54140210245058 A:C A C 10 0.508761382413951 0.326545869216515 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 17051450 C/A 1 36 25 61 17.6845902330978 12.7190345603488 4.96555567274899 A:C C A 10 0.508761382413951 0.248934855884806 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 20189472 C/A 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 A:C C A 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000114166:ENST00000263754:exon_20189455_20189491:KAT2B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 20216519 T/A 1 20 21 41 9.82477235172098 10.683989030693 -0.85921667897199 A:T T A 10 0.508761382413951 0.87623230007505 ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000383774:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000443724:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000456624:exon_20216214_20216547:SGOL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 23848835 A/C 1 45 39 84 22.1057377913722 19.8416939141441 2.26404387722812 A:C A C 10 0.508761382413951 0.663177422031208 ENSG00000170142:ENST00000306627:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000484048:exon_23848728_23849379:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000346855:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000495141:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000481622:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000442670:exon_23848580_23848912:UBE2E1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 23934772 G/A 1 14 21 35 6.87734064620469 10.683989030693 -3.80664838448828 A:G G A 10 0.508761382413951 0.237189769070946 ENSG00000197885:ENST00000388759:exon_23933151_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000443659:exon_23933552_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000421515:exon_23933555_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000425478:exon_23933572_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000418853:exon_23933574_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000437230:exon_23933588_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000412028:exon_23933798_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000415901:exon_23933801_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000416026:exon_23934556_23934828:NKIRAS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 27442336 G/A 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 A:G G A 10 0.508761382413951 0.770813353200887 ENSG00000033867:ENST00000419036:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000295736:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000428386:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000425128:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000349751:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000435667:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000388777:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000454389:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000440156:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000457377:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000438530:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437179:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000446700:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000455077:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000445684:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437266:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000428179:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000475120:exon_27442255_27442535:SLC4A7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 33155782 G/A 1 26 24 50 12.7722040572373 12.2102731779348 0.561930879302452 A:G G A 10 0.508761382413951 0.888583503958265 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33155471_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33155531_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33155546_33156040:CRTAP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 33161898 C/T 1 10 7 17 4.91238617586049 3.56132967689766 1.35105649896283 T:C C T 10 0.508761382413951 0.629969031107128 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000485310:exon_33161836_33161985:CRTAP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 33877626 G/A 1 24 25 49 11.7897268220652 12.7190345603488 -0.929307738283597 A:G G A 10 0.508761382413951 0.886596358619732 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 30 32 62 14.7371585275815 16.2803642372464 -1.54320570966496 T:C C T 10 0.508761382413951 0.705302217121313 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 89 86 175 43.7202369651584 43.7534788875998 -0.0332419224414195 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 38170810 C/G 1 9 9 18 4.42114755827444 4.57885244172556 -0.157704883451117 C:G C G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000418880:exon_38170781_38170879:ACAA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 39111140 C/A 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 A:C C A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000114742:ENST00000302313:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000413099:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000396258:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000418020:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000433841:exon_39111134_39111181:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000420940:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000441361:exon_39111134_39111235:WDR48 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 39184959 C/T 1 28 39 67 13.7546812924094 19.8416939141441 -6.08701262173471 T:C C T 10 0.508761382413951 0.144024858362622 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 39185077 G/A 1 60 28 88 29.4743170551629 14.2453187075906 15.2289983475723 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00126888566501463 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 39186728 C/T 1 19 22 41 9.33353373413493 11.1927504131069 -1.85921667897199 T:C C T 10 0.508761382413951 0.640197803860353 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39186488_39186747:CSRNP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 39188182 C/T 1 14 15 29 6.87734064620469 7.63142073620926 -0.754080090004578 T:C C T 10 0.508761382413951 0.853634761322044 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39187969_39188218:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39188154_39188213:CSRNP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 40498845 C/T 1 18 12 30 8.84229511654888 6.10513658896741 2.73715852758147 T:C C T 10 0.508761382413951 0.363817218311101 ENSG00000188846:ENST00000338970:exon_40498783_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000465325:exon_40498794_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 42251263 C/T 1 16 11 27 7.85981788137678 5.59637520655346 2.26344267482332 T:C C T 10 0.508761382413951 0.443974308913854 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 42251329 C/T 1 9 7 16 4.42114755827444 3.56132967689766 0.859817881376784 T:C C T 10 0.508761382413951 0.804101251762597 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 42265166 T/C 1 25 33 58 12.2809654396512 16.7891256196604 -4.50816018000916 T:C T C 10 0.508761382413951 0.24080398875398 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42264434_42267381:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42264434_42267260:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42264434_42267381:TRAK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 42680000 C/T 1 25 27 52 12.2809654396512 13.7365573251767 -1.45559188552545 T:C C T 10 0.508761382413951 0.781812955742105 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 44692564 C/G 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 C:G C G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000169981:ENST00000396056:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000415571:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000432115:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000296092:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000399560:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000453164:exon_44692433_44692751:ZNF35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 44775962 A/G 1 8 2 10 3.92990894068839 1.0175227648279 2.91238617586049 A:G A G 10 0.508761382413951 0.109914731512069 ENSG00000186446:ENST00000396048:exon_44775689_44778575:ZNF501;ENSG00000186446:ENST00000302420:exon_44775689_44777036:ZNF501;ENSG00000186446:ENST00000332489:exon_44775914_44776301:ZNF501 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 45779136 A/T 1 13 11 24 6.38610202861864 5.59637520655346 0.789726822065177 A:T A T 10 0.508761382413951 0.839412619839394 ENSG00000211456:ENST00000455997:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000418611:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000389061:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000441228:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000433336:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000464102:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000471207:exon_45778736_45779144:SACM1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 47041851 C/A 1 29 21 50 14.2459199099954 10.683989030693 3.56193087930245 A:C C A 10 0.508761382413951 0.325954471439164 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47041686_47041894:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47041379_47041894:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47041379_47041894:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47041686_47041894:NBEAL2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 47043238 C/T 1 12 27 39 5.89486341103259 13.7365573251767 -7.84169391414409 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0153328872994043 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000475689:exon_47043179_47043316:NBEAL2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 55 52 107 27.0181239672327 26.4555918855255 0.562532081707246 C:G C G 10 0.508761382413951 0.923317115310567 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 47049193 A/G 1 3 8 11 1.47371585275815 4.07009105931161 -2.59637520655346 A:G A G 10 0.508761382413951 0.139557898450825 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 55 57 112 27.0181239672327 28.9993987975952 -1.98127483036251 A:G G A 10 0.508761382413951 0.776931601973587 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 47162886 C/T 1 59 33 92 28.9830784375769 16.7891256196604 12.1939528179165 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0120777271135125 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 47448825 G/A 1 19 17 36 9.33353373413493 8.64894350103717 0.684590233097765 A:G G A 10 0.508761382413951 0.868667377910195 ENSG00000076201:ENST00000456408:exon_47448799_47448857:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47448799_47448857:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47448799_47448857:PTPN23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 26 19 45 12.7722040572373 9.66646626586507 3.10573779137221 A:G G A 10 0.508761382413951 0.374609604410792 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 47459679 C/T 1 8 13 21 3.92990894068839 6.61389797138136 -2.68398903069297 T:C C T 10 0.508761382413951 0.279281497621514 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000383739:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47459624_47459739:SCAP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 62 50 112 30.456794290335 25.4380691206975 5.01872516963749 T:C T C 10 0.508761382413951 0.346713050940746 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 48474249 A/G 1 20 33 53 9.82477235172098 16.7891256196604 -6.9643532679394 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0731162500508906 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 124 89 213 60.9135885806701 45.2797630348416 15.6338255458284 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0336096545693762 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 49723107 C/T 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 T:C C T 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49723029_49723165:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49723029_49723165:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49723029_49723914:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49723029_49723914:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49723029_49723262:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49723029_49723914:MST1;ENSG00000173531:ENST00000481930:exon_49723029_49723218:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484269:exon_49723029_49723165:MST1;ENSG00000173531:ENST00000498021:exon_49723029_49723307:MST1;ENSG00000173531:ENST00000497359:exon_49723029_49724299:MST1;ENSG00000173531:ENST00000480268:exon_49723029_49723165:MST1;ENSG00000173531:ENST00000494809:exon_49723029_49723165:MST1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 49738945 C/T 1 4 9 13 1.9649544703442 4.57885244172556 -2.61389797138136 T:C C T 10 0.508761382413951 0.172726937801510 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000432042:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000494005:exon_49738924_49739041:RNF123 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 49751585 C/T 1 12 6 18 5.89486341103259 3.05256829448371 2.84229511654888 T:C C T 10 0.508761382413951 0.239188352827104 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000469978:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000444689:exon_49751523_49751607:RNF123 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 49758764 A/G 1 23 28 51 11.2984882044791 14.2453187075906 -2.9468305031115 A:G A G 10 0.508761382413951 0.48419188484887 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 49847623 A/G 1 11 9 20 5.40362479344654 4.57885244172556 0.824772351720981 A:G A G 10 0.508761382413951 0.824343209360058 ENSG00000182179:ENST00000473992:exon_49847411_49847783:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000489826:exon_49847412_49847861:UBA7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 50097113 A/G 1 54 45 99 26.5268853496466 22.8942622086278 3.63262314101885 A:G A G 10 0.508761382413951 0.48308846679413 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50097082_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50097082_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50097082_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50097082_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000441115:exon_50097082_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50097082_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50097082_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000434592:exon_50097065_50097179:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000478026:exon_50096776_50097179:RBM6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 50114515 C/T 1 25 8 33 12.2809654396512 4.07009105931161 8.21087438033962 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00475072284879711 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50114441_50114682:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50114441_50114683:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50114441_50114680:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50114441_50114682:RBM6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 50144951 T/C 1 11 14 25 5.40362479344654 7.12265935379531 -1.71903456034877 T:C T C 10 0.508761382413951 0.55170289457065 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000395174:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000496179:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000474818:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000494360:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000441812:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000489437:exon_50144914_50145002:RBM5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 50153356 T/C 1 48 42 90 23.5794536441304 21.3679780613859 2.21147558274441 T:C T C 10 0.508761382413951 0.674079401318637 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475128:exon_50153339_50153376:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475590:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000492430:exon_50153339_50153613:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000479275:exon_50153339_50153664:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464988:exon_50153339_50153413:RBM5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 50326020 G/A 1 92 92 184 45.1939528179165 46.8060471820835 -1.61209436416698 A:G G A 10 0.508761382413951 0.825281918691971 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000426499:exon_50326014_50326070:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000464258:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000486322:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000492387:exon_50325943_50326142:IFRD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 50327429 A/G 1 40 47 87 19.649544703442 23.9117849734557 -4.26224027001373 A:G A G 10 0.508761382413951 0.391696885277827 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50327360_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000414734:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000483071:exon_50327143_50327501:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000489569:exon_50327360_50327517:IFRD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 50334231 T/A 1 21 22 43 10.316010969307 11.1927504131069 -0.876739443799892 A:T T A 10 0.508761382413951 0.879082341188569 ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 50336661 T/C 1 4 7 11 1.9649544703442 3.56132967689766 -1.59637520655346 T:C T C 10 0.508761382413951 0.379976164789140 ENSG00000186792:ENST00000336307:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000415204:exon_50336644_50336832:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000513170:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000450982:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000066014:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50336644_50336847:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50336644_50336852:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50336644_50336831:NAT6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 50355730 T/G 1 23 24 47 11.2984882044791 12.2102731779348 -0.911784973455696 T:G T G 10 0.508761382413951 0.884246456780131 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50355221_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50355227_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50355240_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50355243_50355970:HYAL2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 50369546 C/A 1 24 23 47 11.7897268220652 11.7015117955209 0.0882150265443045 A:C C A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000068028:ENST00000362008:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000327761:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395126:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000357043:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395117:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000359365:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395129:exon_50369481_50369597:RASSF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 50378176 T/G 1 7 12 19 3.43867032310234 6.10513658896741 -2.66646626586507 T:G T G 10 0.508761382413951 0.256095565288392 ENSG00000068028:ENST00000362008:exon_50377987_50378367:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000357043:exon_50377987_50378272:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395117:exon_50377987_50378272:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000359365:exon_50377987_50378343:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000482447:exon_50377987_50378343:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395129:exon_50377987_50378272:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000478619:exon_50377987_50378411:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000488024:exon_50377987_50378261:RASSF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 51430657 A/C 1 178 139 317 87.4404739303167 70.7178321555392 16.7226417747775 A:C A C 10 0.508761382413951 0.0637325792284993 ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 51733446 C/T 1 37 26 63 18.1758288506838 13.2277959427627 4.94803290792109 T:C C T 10 0.508761382413951 0.256645949134877 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51733422_51733590:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51733422_51733590:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51733422_51733590:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51733422_51733590:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51733422_51733590:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51733422_51733590:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000493444:exon_51733422_51733590:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457927:exon_51733422_51733588:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000444233:exon_51733422_51733591:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51733422_51733590:TEX264 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 51737965 G/A 1 63 60 123 30.9480329079211 30.5256829448371 0.422349963084031 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 52088110 G/A 1 19 19 38 9.33353373413493 9.66646626586507 -0.332932531730137 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000164086:ENST00000495880:exon_52087956_52088390:DUSP7;ENSG00000164086:ENST00000296483:exon_52087956_52088390:DUSP7;ENSG00000164086:ENST00000451414:exon_52087956_52088390:DUSP7;ENSG00000164086:ENST00000469623:exon_52085648_52088390:DUSP7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 59 44 103 28.9830784375769 22.3855008262138 6.59757761136305 T:C C T 10 0.508761382413951 0.201363191574706 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 30 24 54 14.7371585275815 12.2102731779348 2.52688534964665 T:C C T 10 0.508761382413951 0.500191503504275 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 52283001 C/G 0 42 0 42 20.6320219386141 0 20.6320219386141 C C 10 0.508761382413951 5.79836142646538e-13 ENSG00000164088:ENST00000457454:exon_52282972_52283079:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000467471:exon_52282972_52283079:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000296487:exon_52282972_52283079:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000409502:exon_52282972_52283079:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000323588:exon_52282972_52283079:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000489606:exon_52282972_52283079:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000482724:exon_52282972_52283079:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000443681:exon_52282977_52283079:PPM1M HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 53267155 G/A 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53266776_53267290:TKT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 53326142 G/A 1 7 9 16 3.43867032310234 4.57885244172556 -1.14018211862322 A:G G A 10 0.508761382413951 0.623757634359657 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 56667480 C/T 1 52 56 108 25.5444081144745 28.4906374151813 -2.9462293007067 T:C C T 10 0.508761382413951 0.630594115852296 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56667072_56668000:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56667072_56667871:C3orf63 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 57542173 C/T 1 14 11 25 6.87734064620469 5.59637520655346 1.28096543965123 T:C C T 10 0.508761382413951 0.691178115075758 ENSG00000174840:ENST00000487257:exon_57542003_57543414:PDE12;ENSG00000174840:ENST00000311180:exon_57542004_57543414:PDE12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 57882601 C/T 1 13 5 18 6.38610202861864 2.54380691206975 3.84229511654888 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0971656837274008 ENSG00000163681:ENST00000295951:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000295952:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416870:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000383718:exon_57882600_57887872:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000428312:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000449503:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416658:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000442599:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000459654:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000472546:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000417128:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000438794:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000495364:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000494088:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000461354:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000466255:exon_57882600_57882659:SLMAP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 58109162 G/A 1 13 13 26 6.38610202861864 6.61389797138136 -0.227795942762725 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58108820_58109417:FLNB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 58112488 C/T 1 18 10 28 8.84229511654888 5.08761382413951 3.75468129240937 T:C C T 10 0.508761382413951 0.186823243553659 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58112329_58112489:FLNB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 58118555 G/A 1 14 16 30 6.87734064620469 8.14018211862322 -1.26284147241853 A:G G A 10 0.508761382413951 0.71657764528998 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58117805_58118658:FLNB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 58154177 G/A 1 24 29 53 11.7897268220652 14.7540800900046 -2.9643532679394 A:G G A 10 0.508761382413951 0.492530731620175 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 19 15 34 9.33353373413493 7.63142073620926 1.70211299792567 T:C C T 10 0.508761382413951 0.60947784477379 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 58395863 A/G 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383715:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000484288:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000459676:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000495557:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000493474:exon_58395817_58395886:PXK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 58410554 C/T 1 16 12 28 7.85981788137678 6.10513658896741 1.75468129240937 T:C C T 10 0.508761382413951 0.573255486177598 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58410479_58411748:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58410479_58411746:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58410479_58411601:PXK;ENSG00000168297:ENST00000493474:exon_58410479_58410902:PXK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 58416535 C/T 1 32 35 67 15.7196357627536 17.8066483844883 -2.08701262173471 T:C C T 10 0.508761382413951 0.627028018471651 ENSG00000168291:ENST00000302746:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000383714:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000469364:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000479945:exon_58416384_58417520:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000474765:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000461692:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000480626:exon_58416384_58416669:PDHB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 73114003 T/C 1 44 49 93 21.6144991737862 24.9293077382836 -3.31480856449744 T:C T C 10 0.508761382413951 0.534272221312452 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000482242:exon_73114003_73114133:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000488810:exon_73114003_73114117:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 81698130 T/C 1 16 8 24 7.85981788137678 4.07009105931161 3.78972682206518 T:C T C 10 0.508761382413951 0.153096477627005 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 98250862 C/A 1 208 203 411 102.177632457898 103.278560630032 -1.10092817213385 A:C C A 10 0.508761382413951 0.921475717706743 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 98250986 C/T 1 190 184 374 93.3353373413493 93.612094364167 -0.276757022817662 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 100287764 T/C 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 T:C T C 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000181458:ENST00000323523:exon_100287666_100287811:TMEM45A;ENSG00000181458:ENST00000403410:exon_100287666_100287811:TMEM45A;ENSG00000181458:ENST00000485260:exon_100287666_100287811:TMEM45A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 101576175 T/C 1 6 6 12 2.94743170551629 3.05256829448371 -0.105136588967412 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000144802:ENST00000394054:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000483180:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000326151:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000326172:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000477601:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000495089:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000495719:exon_101576044_101576303:NFKBIZ HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 105422844 C/T 1 13 19 32 6.38610202861864 9.66646626586507 -3.28036423724643 T:C C T 10 0.508761382413951 0.290034548011674 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 105438957 T/G 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 T:G T G 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 105439026 G/A 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 A:G G A 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 112185025 G/A 1 111 107 218 54.5274865520514 54.4374679182928 0.0900186337586888 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112184955_112185230:BTLA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 112188609 T/G 1 108 119 227 53.0537706992933 60.5426045072602 -7.48883380796687 T:G T G 10 0.508761382413951 0.352729977595603 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000496584:exon_112188603_112188651:BTLA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 118948716 G/A 1 34 24 58 16.7021129979257 12.2102731779348 4.49183981999084 A:G G A 10 0.508761382413951 0.293381744254851 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000471675:exon_118948694_118948900:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118948694_118949091:B4GALT4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 119133183 G/A 1 27 27 54 13.2634426748233 13.7365573251767 -0.473114650353352 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 119133554 G/A 1 27 18 45 13.2634426748233 9.15770488345112 4.10573779137221 A:G G A 10 0.508761382413951 0.235922159505921 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 120 110 230 58.9486341103259 55.9637520655346 2.98488204479128 T:C T C 10 0.508761382413951 0.741677896525868 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 121361787 G/A 1 130 118 248 63.8610202861864 60.0338431248462 3.82717716134016 A:G G A 10 0.508761382413951 0.6568033335872 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121361774_121363030:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121361774_121361828:HCLS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 121435621 T/C 1 9 6 15 4.42114755827444 3.05256829448371 1.36857926379074 T:C T C 10 0.508761382413951 0.60808216621752 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000426235:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000489400:exon_121435584_121435986:GOLGB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 121435624 C/T 1 11 6 17 5.40362479344654 3.05256829448371 2.35105649896283 T:C C T 10 0.508761382413951 0.333580569907415 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000426235:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000489400:exon_121435584_121435986:GOLGB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 30 33 63 14.7371585275815 16.7891256196604 -2.05196709207891 T:C C T 10 0.508761382413951 0.616750639063722 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 121526204 G/A 1 8 15 23 3.92990894068839 7.63142073620926 -3.70151179552087 A:G G A 10 0.508761382413951 0.145808138014843 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000460108:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000498104:exon_121526191_121526290:IQCB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 121563355 T/C 1 20 24 44 9.82477235172098 12.2102731779348 -2.38550082621384 T:C T C 10 0.508761382413951 0.547144790662794 ENSG00000145088:ENST00000490434:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000273668:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000451944:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000490477:exon_121563300_121563394:EAF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 121712805 G/C 1 13 13 26 6.38610202861864 6.61389797138136 -0.227795942762725 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000383663:exon_121712627_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 121838319 G/A 1 117 85 202 57.4749182575677 43.2447175051858 14.2302007523819 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0486860854918063 ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121838285_121838921:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121838285_121839175:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121838285_121839982:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121838285_121838667:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121838285_121838440:CD86 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 38 47 85 18.6670674682699 23.9117849734557 -5.24471750518583 T:C T C 10 0.508761382413951 0.278629908786088 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 122288210 G/A 1 18 19 37 8.84229511654888 9.66646626586507 -0.824171149316186 A:G G A 10 0.508761382413951 0.869882749699634 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122287336_122288871:DTX3L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 65 25 90 31.9305101430932 12.7190345603488 19.2114755827444 A:G A G 10 0.508761382413951 4.90880242161507e-05 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 122354792 G/A 1 69 23 92 33.8954646134374 11.7015117955209 22.1939528179165 A:G G A 10 0.508761382413951 2.98085963609744e-06 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 122864436 G/A 1 10 10 20 4.91238617586049 5.08761382413951 -0.175227648279019 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 123665902 T/G 1 18 24 42 8.84229511654888 12.2102731779348 -3.36797806138594 T:G T G 10 0.508761382413951 0.354991185398280 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000426152:exon_123665651_123665904:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000435910:exon_123665860_123666166:CCDC14 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 124627024 T/G 1 9 9 18 4.42114755827444 4.57885244172556 -0.157704883451117 T:G T G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000173702:ENST00000311075:exon_124626994_124627195:MUC13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 124731689 T/A 1 16 14 30 7.85981788137678 7.12265935379531 0.737158527581471 A:T T A 10 0.508761382413951 0.856199484978377 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 124732618 A/G 1 15 8 23 7.36857926379074 4.07009105931161 3.29848820447913 A:G A G 10 0.508761382413951 0.211653680335550 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124732316_124732834:HEG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 124738107 C/T 1 23 13 36 11.2984882044791 6.61389797138136 4.68459023309777 T:C C T 10 0.508761382413951 0.134634213050837 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124738106_124738340:HEG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 124739892 G/A 1 10 7 17 4.91238617586049 3.56132967689766 1.35105649896283 A:G G A 10 0.508761382413951 0.629969031107128 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124739636_124739974:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124739636_124739974:HEG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 124746049 A/G 1 18 18 36 8.84229511654888 9.15770488345112 -0.315409766902235 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 124746182 C/A 1 11 5 16 5.40362479344654 2.54380691206975 2.85981788137678 A:C C A 10 0.508761382413951 0.211238572184989 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 124746347 T/C 1 9 18 27 4.42114755827444 9.15770488345112 -4.73655732517668 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0829055482541467 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 124748226 G/A 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:C:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124748039_124748332:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124748039_124748332:HEG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 36 42 78 17.6845902330978 21.3679780613859 -3.68338782828818 T:C C T 10 0.508761382413951 0.429264713925188 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 128344786 G/A 1 99 71 170 48.6326231410189 36.1220581513905 12.5105649896283 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0555104968769922 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344717_128344855:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344717_128344855:RPN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 128987440 C/T 1 34 31 65 16.7021129979257 15.7716028548325 0.930510143093187 T:C C T 10 0.508761382413951 0.90141759367423 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128987338_128987463:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128987338_128987463:COPG HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 129155451 C/T 1 128 119 247 62.8785430510143 60.5426045072602 2.33593854375411 T:C C T 10 0.508761382413951 0.799178052762605 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 131102053 A/G 1 23 29 52 11.2984882044791 14.7540800900046 -3.45559188552545 A:G A G 10 0.508761382413951 0.405584785648138 ENSG00000198585:ENST00000521288:exon_131102006_131107674:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000502852:exon_131100890_131102283:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000359850:exon_131102006_131107674:NUDT16 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 132218623 G/T 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000138246:ENST00000260818:exon_132218578_132218652:DNAJC13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 132257069 G/A 1 29 10 39 14.2459199099954 5.08761382413951 9.15830608585591 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00356420226435073 ENSG00000138246:ENST00000260818:exon_132257020_132257876:DNAJC13;ENSG00000138246:ENST00000509279:exon_132257020_132257352:DNAJC13 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 132277866 G/A 1 15 14 29 7.36857926379074 7.12265935379531 0.245919909995422 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132276988_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000485198:exon_132277316_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132277668_132277929:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132276986_132277929:NPHP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 132277907 G/A 1 15 8 23 7.36857926379074 4.07009105931161 3.29848820447913 A:G G A 10 0.508761382413951 0.211653680335550 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132276988_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000485198:exon_132277316_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132277668_132277929:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132276986_132277929:NPHP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 133342218 C/T 1 15 27 42 7.36857926379074 13.7365573251767 -6.36797806138594 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0629671213991337 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133342155_133342301:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133342155_133342301:TOPBP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 134225969 T/C 1 19 7 26 9.33353373413493 3.56132967689766 5.77220405723727 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0295890675812559 ENSG00000182923:ENST00000332047:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000354446:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000511574:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000413794:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000438820:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000383229:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000504013:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000512894:exon_134225951_134226095:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134225951_134226128:CEP63 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 134278270 C/T 1 9 2 11 4.42114755827444 1.0175227648279 3.40362479344654 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0658750571190468 ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134277992_134278271:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134277992_134278271:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134277992_134278271:CEP63 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 134670524 C/T 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 T:C C T 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000154928:ENST00000398015:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000482618:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000360935:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000425716:exon_134670213_134670560:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000488154:exon_134670213_134670560:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000474732:exon_134670213_134670604:EPHB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 19 15 34 9.33353373413493 7.63142073620926 1.70211299792567 A:G G A 10 0.508761382413951 0.60947784477379 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 137881265 T/A 1 11 16 27 5.40362479344654 8.14018211862322 -2.73655732517668 A:T T A 10 0.508761382413951 0.338377400229792 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 49 0 49 24.0706922617164 0 24.0706922617164 G G 10 0.508761382413951 4.90797338742585e-15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 148786108 C/T 1 11 6 17 5.40362479344654 3.05256829448371 2.35105649896283 T:C C T 10 0.508761382413951 0.333580569907415 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392913:exon_148786027_148786122:HLTF HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 148872987 G/A 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 A:G G A 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148872894_148873002:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148872894_148873002:HPS3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 148881673 C/T 1 7 2 9 3.43867032310234 1.0175227648279 2.42114755827444 T:C C T 10 0.508761382413951 0.180291906522768 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148881629_148881736:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148881629_148881736:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460822:exon_148881629_148881736:HPS3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 149459413 C/T 1 46 51 97 22.5969764089583 25.9468305031115 -3.34985409415324 T:C C T 10 0.508761382413951 0.542715653635525 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149459362_149459505:COMMD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 48 41 89 23.5794536441304 20.859216678972 2.72023696515836 C:G C G 10 0.508761382413951 0.596987995569362 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 169513320 A/T 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 A:T A T 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000171757:ENST00000446859:exon_169513273_169513399:LRRC34;ENSG00000171757:ENST00000316515:exon_169513273_169513399:LRRC34;ENSG00000171757:ENST00000522596:exon_169511261_169514157:LRRC34;ENSG00000171757:ENST00000522830:exon_169513273_169513399:LRRC34;ENSG00000171757:ENST00000522526:exon_169513273_169513399:LRRC34;ENSG00000171757:ENST00000522329:exon_169513273_169513399:LRRC34 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 169854381 T/A 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:T T A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000173889:ENST00000494943:exon_169854207_169854453:PHC3;ENSG00000173889:ENST00000495893:exon_169854207_169854453:PHC3;ENSG00000173889:ENST00000413540:exon_169854207_169854453:PHC3;ENSG00000173889:ENST00000467570:exon_169854207_169854453:PHC3;ENSG00000173889:ENST00000497171:exon_169854207_169854458:PHC3;ENSG00000173889:ENST00000479467:exon_169854154_169854453:PHC3;ENSG00000173889:ENST00000466189:exon_169854322_169854453:PHC3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 170893070 G/A 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 A:G G A 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000468757:exon_170893041_170893119:TNIK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 170946002 A/G 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170945954_170946010:TNIK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 174951756 T/C 1 13 62 75 6.38610202861864 31.543205709665 -25.1571036810463 T:C:G T C 10 0.508761382413951 2.13524925728954e-09 ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 178560581 A/C 1 3 8 11 1.47371585275815 4.07009105931161 -2.59637520655346 A:C A C 10 0.508761382413951 0.139557898450825 ENSG00000197584:ENST00000420517:exon_178560441_178560929:KCNMB2;ENSG00000197584:ENST00000452583:exon_178560441_178560929:KCNMB2;ENSG00000197584:ENST00000432997:exon_178560441_178562217:KCNMB2;ENSG00000197584:ENST00000358316:exon_178560441_178562205:KCNMB2;ENSG00000197584:ENST00000457763:exon_178560441_178560725:KCNMB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 179298999 C/T 1 57 70 127 28.0006012024048 35.6132967689766 -7.61269556657177 T:C C T 10 0.508761382413951 0.183906033044019 ENSG00000136518:ENST00000429709:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000450518:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000392662:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000259034:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000484312:exon_179298952_179299008:ACTL6A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 180325487 T/C 1 6 6 12 2.94743170551629 3.05256829448371 -0.105136588967412 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000163728:ENST00000296015:exon_180325436_180325553:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000412756:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000465065:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000470669:exon_180325436_180326059:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000382584:exon_180325436_180325553:TTC14 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 182681740 C/T 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 T:C C T 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000043093:ENST00000292782:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000469954:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000492563:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000497606:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000460412:exon_182681719_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000487822:exon_182681736_182681837:DCUN1D1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 182755209 T/G 1 31 24 55 15.2283971451675 12.2102731779348 3.0181239672327 T:G T G 10 0.508761382413951 0.42268646690346 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182755202_182755222:MCCC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 183368216 A/T 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 A:T A T 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000114796:ENST00000242810:exon_183368084_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000493074:exon_183368084_183368526:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000437402:exon_183368084_183368326:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000454495:exon_183368084_183368495:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000473045:exon_183368084_183368363:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000468101:exon_183368084_183368378:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000427201:exon_183368084_183368485:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000482138:exon_183368084_183368546:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000454652:exon_183368084_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000468001:exon_183368084_183368521:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000476808:exon_183368145_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000242809:exon_183368145_183368777:KLHL24 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 183442219 A/G 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183442207_183442319:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183442207_183442319:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000273660:exon_183442207_183442319:YEATS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 183508590 A/G 1 10 5 15 4.91238617586049 2.54380691206975 2.36857926379074 A:G A G 10 0.508761382413951 0.302882686663208 ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183508585_183508768:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183508585_183508768:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000432781:exon_183508585_183508768:YEATS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 183508714 G/A 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183508585_183508768:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183508585_183508768:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000432781:exon_183508585_183508768:YEATS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 48 51 99 23.5794536441304 25.9468305031115 -2.36737685898115 C:G C G 10 0.508761382413951 0.687931348664311 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 183560195 A/G 1 14 14 28 6.87734064620469 7.12265935379531 -0.245318707590627 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 183861243 A/G 1 24 45 69 11.7897268220652 22.8942622086278 -11.1045353865626 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0079157982902152 ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000465218:exon_183860840_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 183976241 A/G 1 19 27 46 9.33353373413493 13.7365573251767 -4.40302359104174 A:G A G 10 0.508761382413951 0.237972026509203 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 17 16 33 8.35105649896283 8.14018211862322 0.210874380339618 A:C C A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 185331165 C/A 1 10 6 16 4.91238617586049 3.05256829448371 1.85981788137678 A:C C A 10 0.508761382413951 0.455622877460238 ENSG00000163904:ENST00000296257:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000427465:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000437107:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000413407:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000473760:exon_185331133_185331299:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000478001:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000476011:exon_185331133_185331432:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000444509:exon_185331143_185331196:SENP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 186509517 G/A 1 91 80 171 44.7027142003305 40.7009105931161 4.00180360721438 A:G G A 10 0.508761382413951 0.59251341521725 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 186793423 C/T 1 191 153 344 93.8265759589354 77.8404915093345 15.9860844496009 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0944472751670987 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000457772:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186793350_186793640:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000470633:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000392479:exon_186793350_186796341:ST6GAL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 191100561 C/A 1 37 50 87 18.1758288506838 25.4380691206975 -7.26224027001373 A:C C A 10 0.508761382413951 0.133338425859928 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191100535_191100614:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191100535_191100614:CCDC50 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 192516430 C/T 1 11 37 48 5.40362479344654 18.8241711493162 -13.4205463558696 T:C C T 10 0.508761382413951 0.000119651420794155 ENSG00000180611:ENST00000392452:exon_192514604_192517439:C3orf59;ENSG00000180611:ENST00000315470:exon_192514607_192517439:C3orf59 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 194369579 C/A 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 A:T:C C A 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000041802:ENST00000460584:exon_194369410_194369748:LSG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 194369580 C/A 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 A:C C A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000041802:ENST00000460584:exon_194369410_194369748:LSG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 194408704 A/G 1 15 19 34 7.36857926379074 9.66646626586507 -2.29788700207433 A:G A G 10 0.508761382413951 0.494205131577877 ENSG00000185112:ENST00000329759:exon_194406622_194409762:FAM43A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 194790434 C/G 1 9 13 22 4.42114755827444 6.61389797138136 -2.19275041310692 C:G C G 10 0.508761382413951 0.398108590862778 ENSG00000173950:ENST00000310380:exon_194789008_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000437101:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000355729:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000458652:exon_194790020_194790677:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000460582:exon_194790322_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000473200:exon_194790360_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000429994:exon_194790406_194790840:C3orf21 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 195452951 G/C 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 C:G G C 10 0.508761382413951 0.770813353200887 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 195453064 T/G 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 T:G T G 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000498018:exon_195453052_195453443:MUC20 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 195453244 G/A 0 8 0 8 3.92990894068839 0 3.92990894068839 G G 10 0.508761382413951 0.00787971815871171 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000498018:exon_195453052_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000423938:exon_195453241_195453443:MUC20 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 195474159 G/A 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000145113:ENST00000308466:exon_195473636_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000448861:exon_195473636_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000339251:exon_195473636_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000415455:exon_195473636_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000392407:exon_195473636_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000349607:exon_195473636_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000346145:exon_195473636_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000478156:exon_195473636_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000463781:exon_195473636_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000333177:exon_195473636_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000405167:exon_195473640_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000479406:exon_195473929_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000466475:exon_195473929_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000475231:exon_195473929_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000477086:exon_195473929_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000480843:exon_195473929_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000470451:exon_195473929_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000462323:exon_195473929_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000477756:exon_195473929_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000392409:exon_195473929_195474251:MUC4;ENSG00000145113:ENST00000464234:exon_195474044_195474251:MUC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 195591056 C/T 1 12 17 29 5.89486341103259 8.64894350103717 -2.75408009000458 T:C C T 10 0.508761382413951 0.355226164704238 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195590236_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195590236_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195590236_195591058:TNK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 195800811 C/T 1 97 136 233 47.6501459058468 69.1915480082973 -21.5414021024506 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00481642832336461 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 196199204 G/T 1 30 55 85 14.7371585275815 27.9818760327673 -13.2447175051858 T:G G T 10 0.508761382413951 0.00457713030917093 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 196454939 C/T 1 10 23 33 4.91238617586049 11.7015117955209 -6.78912561966038 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0225322379594873 ENSG00000163964:ENST00000426755:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000421265:exon_196454794_196455222:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000451319:exon_196454794_196454981:PIGX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 196613317 T/G 1 16 8 24 7.85981788137678 4.07009105931161 3.78972682206518 T:G T G 10 0.508761382413951 0.153096477627005 ENSG00000119231:ENST00000323460:exon_196612022_196613565:SENP5;ENSG00000119231:ENST00000445299:exon_196612022_196613565:SENP5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 3 196730759 G/A 1 12 11 23 5.89486341103259 5.59637520655346 0.298488204479128 A:T:G G A 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 843498 G/A 1 77 60 137 37.8253735541258 30.5256829448371 7.29969060928872 A:G G A 10 0.508761382413951 0.231751180890916 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843064_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843065_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843096_843562:GAK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 843508 C/T 1 64 75 139 31.4392715255071 38.1571036810463 -6.71783215553918 T:C C T 10 0.508761382413951 0.270575746955268 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843064_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843065_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843096_843562:GAK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 843695 A/G 1 69 73 142 33.8954646134374 37.1395809162184 -3.24411630278104 A:G A G 10 0.508761382413951 0.615014042940902 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843680_844197:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843680_843856:GAK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 13 16 29 6.38610202861864 8.14018211862322 -1.75408009000458 A:G A G 10 0.508761382413951 0.579672735950497 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 941518 C/T 1 16 7 23 7.85981788137678 3.56132967689766 4.29848820447913 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0942882498496864 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000507319:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505734:exon_941497_942377:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504744:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513682:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504505:exon_941497_941942:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514546:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504850:exon_941497_942298:TMEM175 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 1244879 A/G 1 17 13 30 8.35105649896283 6.61389797138136 1.73715852758147 A:G A G 10 0.508761382413951 0.586407892614967 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 2822467 G/T 1 9 16 25 4.42114755827444 8.14018211862322 -3.71903456034877 T:G G T 10 0.508761382413951 0.162748026974591 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 2826912 C/G 1 11 12 23 5.40362479344654 6.10513658896741 -0.701511795520872 C:G C G 10 0.508761382413951 0.836548497602108 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2826853_2826947:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2826478_2826923:SH3BP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 21 12 33 10.316010969307 6.10513658896741 4.21087438033962 T:G T G 10 0.508761382413951 0.164884756427116 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 3162056 C/T 1 11 16 27 5.40362479344654 8.14018211862322 -2.73655732517668 T:C C T 10 0.508761382413951 0.338377400229792 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3162009_3162119:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3162009_3162119:HTT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 3213832 G/A 1 14 13 27 6.87734064620469 6.61389797138136 0.263442674823324 A:C:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000509751:exon_3213639_3213869:HTT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 32 26 58 15.7196357627536 13.2277959427627 2.49183981999084 T:C T C 10 0.508761382413951 0.599765905958629 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 3227419 A/G 1 23 26 49 11.2984882044791 13.2277959427627 -1.9293077382836 A:G A G 10 0.508761382413951 0.66868427616436 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 3234980 G/A 1 11 12 23 5.40362479344654 6.10513658896741 -0.701511795520872 A:G G A 10 0.508761382413951 0.836548497602108 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3234890_3235080:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3234890_3235080:HTT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 3514689 T/C 1 97 62 159 47.6501459058468 31.543205709665 16.1069401961818 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0110615028069236 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 3526645 C/T 1 47 31 78 23.0882150265443 15.7716028548325 7.31661217171182 T:C C T 10 0.508761382413951 0.112602716856211 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3526634_3526873:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3526634_3526778:LRPAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 4322570 G/A 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4322367_4323512:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4322367_4323125:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4322367_4323513:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4322367_4323513:ZBTB49 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 4322665 T/C 1 7 9 16 3.43867032310234 4.57885244172556 -1.14018211862322 T:C T C 10 0.508761382413951 0.623757634359657 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4322367_4323512:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4322367_4323125:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4322367_4323513:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4322367_4323513:ZBTB49 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 4322770 T/C 1 8 11 19 3.92990894068839 5.59637520655346 -1.66646626586507 T:C T C 10 0.508761382413951 0.497078070201239 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4322367_4323512:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4322367_4323125:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4322367_4323513:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4322367_4323513:ZBTB49 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 5830393 C/T 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 T:C C T 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5830246_5830772:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000324989:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000397890:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000511535:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000512574:exon_5830216_5830395:CRMP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 6594947 A/C 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 A:C A C 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6594900_6595077:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6594900_6595011:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6594900_6595077:MAN2B2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 6600012 A/G 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 A:G A G 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6599925_6600081:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6599925_6600081:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6599925_6600081:MAN2B2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 6606864 A/G 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 A:G A G 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6606782_6607056:MAN2B2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 6616056 C/T 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6615945_6616082:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6615945_6616082:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6615945_6616082:MAN2B2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 6864690 T/C 1 15 22 37 7.36857926379074 11.1927504131069 -3.82417114931619 T:C T C 10 0.508761382413951 0.250175627777529 ENSG00000170871:ENST00000425103:exon_6862628_6865910:KIAA0232;ENSG00000170871:ENST00000307659:exon_6862628_6865910:KIAA0232 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 8228948 T/C 1 2 10 12 0.982477235172098 5.08761382413951 -4.10513658896741 T:C:G T C 10 0.508761382413951 0.0204165055162834 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000514274:exon_8228707_8229196:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508438:exon_8228688_8229000:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 14 18 32 6.87734064620469 9.15770488345112 -2.28036423724643 A:G A G 10 0.508761382413951 0.481273059851305 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 8229774 C/T 1 13 15 28 6.38610202861864 7.63142073620926 -1.24531870759063 T:C C T 10 0.508761382413951 0.707356544758575 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 8 17 25 3.92990894068839 8.64894350103717 -4.71903456034877 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0715023564848257 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 1 10 15 25 4.91238617586049 7.63142073620926 -2.71903456034877 T:C T C 10 0.508761382413951 0.32021815508557 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 17503433 C/T 1 8 16 24 3.92990894068839 8.14018211862322 -4.21027317793482 T:C C T 10 0.508761382413951 0.102846973921686 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 17818885 T/C 1 11 16 27 5.40362479344654 8.14018211862322 -2.73655732517668 T:C T C 10 0.508761382413951 0.338377400229792 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000509719:exon_17818855_17819076:NCAPG HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 17829990 G/C 1 13 14 27 6.38610202861864 7.12265935379531 -0.736557325176676 C:G G C 10 0.508761382413951 0.84854117910617 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000510063:exon_17829901_17830011:NCAPG HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 25253995 C/T 1 48 48 96 23.5794536441304 24.4205463558696 -0.841092711739293 T:C C T 10 0.508761382413951 0.918803267346913 ENSG00000038210:ENST00000512921:exon_25253943_25254097:PI4K2B;ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25253943_25254097:PI4K2B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 37903669 A/G 1 11 18 29 5.40362479344654 9.15770488345112 -3.75408009000458 A:G A G 10 0.508761382413951 0.194535966290898 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 37903756 T/C 1 18 12 30 8.84229511654888 6.10513658896741 2.73715852758147 T:C T C 10 0.508761382413951 0.363817218311101 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 37904082 T/C 1 17 25 42 8.35105649896283 12.7190345603488 -4.36797806138594 T:C:G T C 10 0.508761382413951 0.21687221529882 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 38016395 T/G 1 16 23 39 7.85981788137678 11.7015117955209 -3.84169391414409 T:G T G 10 0.508761382413951 0.262598459251714 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 38138856 G/A 1 50 55 105 24.5619308793025 27.9818760327673 -3.41994515346485 A:G G A 10 0.508761382413951 0.558372373754348 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38138756_38139240:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38138756_38140794:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38138756_38139240:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38138756_38139364:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000401554:exon_38138756_38139165:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000407365:exon_38138756_38140796:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000406664:exon_38138756_38139248:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000405444:exon_38138756_38139023:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000492180:exon_38138756_38138870:TBC1D1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 38800268 G/A 1 8 14 22 3.92990894068839 7.12265935379531 -3.19275041310692 A:G G A 10 0.508761382413951 0.203509391186301 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000505940:exon_38799970_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000515861:exon_38800182_38800519:TLR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 38829815 A/G 1 9 9 18 4.42114755827444 4.57885244172556 -0.157704883451117 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 15 20 35 7.36857926379074 10.175227648279 -2.80664838448828 T:C T C 10 0.508761382413951 0.399245770637396 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 39122697 C/T 1 10 26 36 4.91238617586049 13.2277959427627 -8.31540976690223 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00690623780094174 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39122630_39123829:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39122630_39123828:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39122630_39122825:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39122630_39123826:KLHL5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 40 53 93 19.649544703442 26.9643532679394 -7.31480856449744 T:C:G T C 10 0.508761382413951 0.146404499116722 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 40138676 A/G 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000078177:ENST00000261435:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000381804:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000511480:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000513269:exon_40138564_40138702:N4BP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 41015823 G/A 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 A:G G A 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000163697:ENST00000295974:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513140:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513611:exon_41015600_41016402:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000508593:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000316212:exon_41015600_41016419:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000506352:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000509475:exon_41015600_41016402:APBB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 41258970 A/G 1 11 8 19 5.40362479344654 4.07009105931161 1.33353373413493 A:G A G 10 0.508761382413951 0.648578515706695 ENSG00000154277:ENST00000514924:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000503431:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000284440:exon_41258850_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381760:exon_41258925_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512419:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381762:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000505232:exon_41258949_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000504818:exon_41258950_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000508768:exon_41258957_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512788:exon_41258962_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000472501:exon_41258963_41259037:UCHL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 41258978 C/T 1 13 17 30 6.38610202861864 8.64894350103717 -2.26284147241853 T:C C T 10 0.508761382413951 0.467323702180597 ENSG00000154277:ENST00000514924:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000503431:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000284440:exon_41258850_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381760:exon_41258925_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512419:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381762:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000505232:exon_41258949_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000504818:exon_41258950_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000508768:exon_41258957_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512788:exon_41258962_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000472501:exon_41258963_41259037:UCHL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 42003671 A/G 1 18 11 29 8.84229511654888 5.59637520655346 3.24591990999542 A:G A G 10 0.508761382413951 0.267065366288356 ENSG00000014824:ENST00000264451:exon_42003633_42003797:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000513699:exon_42003633_42003797:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000510460:exon_42003633_42003797:SLC30A9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 47560015 A/G 1 5 8 13 2.45619308793025 4.07009105931161 -1.61389797138136 A:G A G 10 0.508761382413951 0.416571082319480 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47559681_47560290:ATP10D HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 47560163 C/A 1 10 5 15 4.91238617586049 2.54380691206975 2.36857926379074 A:C C A 10 0.508761382413951 0.302882686663208 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47559681_47560290:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47560098_47560290:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47560105_47560290:ATP10D HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 47593283 G/C 1 7 11 18 3.43867032310234 5.59637520655346 -2.15770488345112 C:G G C 10 0.508761382413951 0.352056460206795 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47593059_47595503:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47593059_47595503:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47593059_47594892:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000505277:exon_47593059_47593312:ATP10D HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 56291528 T/C 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 T:C T C 10 0.508761382413951 0.749901411398711 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 56766050 T/C 1 24 19 43 11.7897268220652 9.66646626586507 2.12326055620011 T:C T C 10 0.508761382413951 0.545059070699706 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56765851_56766050:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56765851_56766050:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56765851_56766050:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56765851_56766050:EXOC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 57204777 A/C 1 12 12 24 5.89486341103259 6.10513658896741 -0.210273177934823 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57204771_57204957:AASDH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 57215677 G/A 1 10 14 24 4.91238617586049 7.12265935379531 -2.21027317793482 A:G G A 10 0.508761382413951 0.417834229251689 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57215094_57216224:AASDH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 57237683 G/A 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57237617_57237809:AASDH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 57273840 C/G 1 31 27 58 15.2283971451675 13.7365573251767 1.49183981999084 C:G C G 10 0.508761382413951 0.793097497683742 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000510643:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507724:exon_57273816_57273882:PPAT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 57333822 G/T 1 30 12 42 14.7371585275815 6.10513658896741 8.63202193861406 T:G G T 10 0.508761382413951 0.00831131767133911 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57333081_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57333783_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000504757:exon_57333784_57333910:SRP72 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 57344588 A/G 1 47 31 78 23.0882150265443 15.7716028548325 7.31661217171182 A:G A G 10 0.508761382413951 0.112602716856211 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57344545_57344669:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000505314:exon_57344545_57344669:SRP72 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 57777190 G/T 1 9 7 16 4.42114755827444 3.56132967689766 0.859817881376784 T:G G T 10 0.508761382413951 0.804101251762597 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57776796_57777702:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57776805_57777710:REST HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 68497597 C/A 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 A:C C A 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68497575_68497626:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000505673:exon_68497575_68497626:UBA6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 68534392 C/T 1 4 9 13 1.9649544703442 4.57885244172556 -2.61389797138136 T:C C T 10 0.508761382413951 0.172726937801510 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68534269_68534392:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000420827:exon_68534269_68534392:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000429659:exon_68534269_68534392:UBA6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 68904558 C/T 0 10 0 10 4.91238617586049 0 4.91238617586049 C C 10 0.508761382413951 0.00198015025857764 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 73942678 C/T 1 45 34 79 22.1057377913722 17.2978870020743 4.80785078929787 T:C C T 10 0.508761382413951 0.311660723579524 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 76836137 A/G 1 3 8 11 1.47371585275815 4.07009105931161 -2.59637520655346 A:G A G 10 0.508761382413951 0.139557898450825 ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76836021_76836138:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000513045:exon_76836021_76836138:NAAA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 76857309 C/T 1 10 14 24 4.91238617586049 7.12265935379531 -2.21027317793482 T:C C T 10 0.508761382413951 0.417834229251689 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000399490:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507187:exon_76856352_76857388:NAAA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 76857388 C/T 1 15 13 28 7.36857926379074 6.61389797138136 0.754681292409373 T:C C T 10 0.508761382413951 0.851195156405806 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000399490:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507187:exon_76856352_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507940:exon_76857317_76857388:NAAA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 76878688 G/A 1 50 30 80 24.5619308793025 15.2628414724185 9.29908940688392 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0436685057952469 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 77055474 A/G 1 25 25 50 12.2809654396512 12.7190345603488 -0.438069120697548 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77055329_77055515:NUP54 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 77057501 A/G 1 19 18 37 9.33353373413493 9.15770488345112 0.175828850683814 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77057341_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77057474_77057565:NUP54 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 77065580 T/C 1 16 20 36 7.85981788137678 10.175227648279 -2.31540976690223 T:C T C 10 0.508761382413951 0.506237025660026 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508583:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514901:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510569:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510884:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000513352:exon_77065543_77065626:NUP54 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 78079772 G/A 1 11 8 19 5.40362479344654 4.07009105931161 1.33353373413493 A:G G A 10 0.508761382413951 0.648578515706695 ENSG00000138764:ENST00000316355:exon_78079686_78079823:CCNG2;ENSG00000138764:ENST00000354403:exon_78079686_78079823:CCNG2;ENSG00000138764:ENST00000502280:exon_78079686_78079823:CCNG2;ENSG00000138764:ENST00000497512:exon_78079686_78079823:CCNG2;ENSG00000138764:ENST00000395640:exon_78079450_78079823:CCNG2;ENSG00000138764:ENST00000512918:exon_78079686_78079823:CCNG2;ENSG00000138764:ENST00000509972:exon_78079579_78079823:CCNG2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 79103006 C/T 0 243 0 243 119.37098407341 0 119.37098407341 C C 10 0.508761382413951 5.06233682111218e-72 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 83795806 T/C 1 12 10 22 5.89486341103259 5.08761382413951 0.807249586893079 T:C T C 10 0.508761382413951 0.832379092287417 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000436790:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503058:exon_83795764_83795904:SEC31A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 89361323 C/T 1 6 10 16 2.94743170551629 5.08761382413951 -2.14018211862322 T:C C T 10 0.508761382413951 0.324879272681718 ENSG00000138642:ENST00000511939:exon_89361300_89361402:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000380265:exon_89361300_89361402:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000438983:exon_89361300_89361402:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000264346:exon_89361300_89361402:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000506842:exon_89361300_89361792:HERC6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 89625427 G/C 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 C:G G C 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000138641:ENST00000402738:exon_89625249_89625432:HERC3;ENSG00000138641:ENST00000264345:exon_89625249_89625432:HERC3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 95186055 A/G 1 6 14 20 2.94743170551629 7.12265935379531 -4.17522764827902 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0740332550078218 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000506089:exon_95185679_95186057:SMARCAD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 95496882 C/T 1 9 7 16 4.42114755827444 3.56132967689766 0.859817881376784 T:C C T 10 0.508761382413951 0.804101251762597 ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95496767_95497185:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000510099:exon_95496767_95497089:PDLIM5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 95561459 A/G 1 3 9 12 1.47371585275815 4.57885244172556 -3.10513658896741 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0871818487647519 ENSG00000163110:ENST00000437932:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000503974:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000514743:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000380176:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000506632:exon_95561427_95561601:PDLIM5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 104061537 C/T 1 27 18 45 13.2634426748233 9.15770488345112 4.10573779137221 T:C C T 10 0.508761382413951 0.235922159505921 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061413_104061571:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061413_104061571:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061413_104061571:CENPE HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 106155185 C/G 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 C:G C G 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000168769:ENST00000305737:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000513237:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000265149:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000380013:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000394764:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000413648:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000514870:exon_106155054_106155429:TET2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 108641300 T/C 1 8 13 21 3.92990894068839 6.61389797138136 -2.68398903069297 T:C T C 10 0.508761382413951 0.279281497621514 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 110603784 T/C 1 33 31 64 16.2108743803396 15.7716028548325 0.439271525507138 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 113351822 G/A 1 4 9 13 1.9649544703442 4.57885244172556 -2.61389797138136 A:G G A 10 0.508761382413951 0.172726937801510 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 16 18 34 7.85981788137678 9.15770488345112 -1.29788700207433 A:G G A 10 0.508761382413951 0.732701821127198 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 113352628 A/G 1 19 23 42 9.33353373413493 11.7015117955209 -2.36797806138594 A:G A G 10 0.508761382413951 0.537854046973192 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 113352899 G/A 1 16 13 29 7.85981788137678 6.61389797138136 1.24591990999542 A:G G A 10 0.508761382413951 0.712310635717891 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 113353285 T/C 1 16 9 25 7.85981788137678 4.57885244172556 3.28096543965123 T:C T C 10 0.508761382413951 0.231316073459551 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 128723042 T/C 1 4 7 11 1.9649544703442 3.56132967689766 -1.59637520655346 T:C T C 10 0.508761382413951 0.379976164789140 ENSG00000164070:ENST00000508776:exon_128722940_128723073:HSPA4L;ENSG00000164070:ENST00000296464:exon_128722940_128723073:HSPA4L;ENSG00000164070:ENST00000508549:exon_128722940_128723073:HSPA4L;ENSG00000164070:ENST00000505726:exon_128722940_128723073:HSPA4L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 128807219 T/A 1 35 32 67 17.1933516155117 16.2803642372464 0.912987378265285 A:T T A 10 0.508761382413951 0.902897159265033 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128806863_128807781:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128806863_128807883:PLK4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 128814964 G/T 1 27 16 43 13.2634426748233 8.14018211862322 5.12326055620011 T:G G T 10 0.508761382413951 0.128787265314107 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000508113:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814889_128815036:PLK4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 129012638 A/G 1 12 4 16 5.89486341103259 2.0350455296558 3.85981788137678 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0775291226144439 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000394288:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000432347:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129012502_129012667:LARP1B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 129043204 C/G 1 10 11 21 4.91238617586049 5.59637520655346 -0.68398903069297 C:G C G 10 0.508761382413951 0.82938952505783 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 129043286 C/T 1 13 7 20 6.38610202861864 3.56132967689766 2.82477235172098 T:C C T 10 0.508761382413951 0.264650309181708 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507259:exon_129043272_129043343:LARP1B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 130023759 A/T 1 18 12 30 8.84229511654888 6.10513658896741 2.73715852758147 A:T A T 10 0.508761382413951 0.363817218311101 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502360:exon_130023757_130024192:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508622:exon_130023757_130023946:C4orf33 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 130030652 A/G 1 14 9 23 6.87734064620469 4.57885244172556 2.29848820447913 A:G A G 10 0.508761382413951 0.406545883266691 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 140297539 A/G 1 21 28 49 10.316010969307 14.2453187075906 -3.9293077382836 A:G A G 10 0.508761382413951 0.317339362932641 ENSG00000164134:ENST00000296543:exon_140297519_140297627:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000398947:exon_140297519_140297627:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000496716:exon_140297531_140297627:NAA15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 147215092 T/C 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 T:C T C 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000120519:ENST00000432059:exon_147215082_147215247:SLC10A7;ENSG00000120519:ENST00000335472:exon_147215082_147215247:SLC10A7;ENSG00000120519:ENST00000264986:exon_147215082_147215247:SLC10A7;ENSG00000120519:ENST00000507030:exon_147215082_147215247:SLC10A7;ENSG00000120519:ENST00000394062:exon_147215082_147215247:SLC10A7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 152609784 C/T 1 11 15 26 5.40362479344654 7.63142073620926 -2.22779594276273 T:C C T 10 0.508761382413951 0.435788589890287 ENSG00000059691:ENST00000263985:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515812:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515564:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000503160:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000510720:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000513504:exon_152609782_152609915:PET112L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 154513627 A/G 1 21 17 38 10.316010969307 8.64894350103717 1.66706746826986 A:G A G 10 0.508761382413951 0.629122810958692 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 154513722 C/T 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 T:C C T 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 154514965 T/C 1 9 8 17 4.42114755827444 4.07009105931161 0.351056498962834 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154514951_154515023:KIAA0922 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 154525458 C/T 1 87 116 203 42.7377597299863 59.0163203600183 -16.278560630032 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0245181642684007 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154524954_154525534:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154524954_154525582:KIAA0922 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 159601676 C/T 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 T:C C T 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000436096:exon_159601619_159601759:ETFDH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 159627872 A/C 1 1 7 8 0.491238617586049 3.56132967689766 -3.07009105931161 A:C A C 10 0.508761382413951 0.0359761797629569 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159627781_159628002:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159627781_159628002:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000307738:exon_159627781_159628002:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000506422:exon_159627781_159628002:ETFDH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 166021811 G/C 1 18 19 37 8.84229511654888 9.66646626586507 -0.824171149316186 T:C:G G C 10 0.508761382413951 0.869882749699634 ENSG00000170088:ENST00000306480:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000506087:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000505095:exon_166021780_166022044:TMEM192 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 166231868 A/G 1 8 11 19 3.92990894068839 5.59637520655346 -1.66646626586507 A:G A G 10 0.508761382413951 0.497078070201239 ENSG00000109466:ENST00000226725:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000514860:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506824:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000421009:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506541:exon_166231705_166231904:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506761:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000509028:exon_166231705_166231902:KLHL2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 169158531 T/C 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 T:C T C 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169158437_169158578:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000507815:exon_169158437_169158639:DDX60 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 169928842 G/T 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 169931268 G/A 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 A:G G A 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 169931274 G/A 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 A:G G A 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 174292472 G/T 1 31 23 54 15.2283971451675 11.7015117955209 3.52688534964665 T:G G T 10 0.508761382413951 0.344896353115183 ENSG00000164105:ENST00000296504:exon_174292094_174292648:SAP30 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 175237408 T/C 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 T:C T C 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000164118:ENST00000503780:exon_175237317_175237441:KIAA1712;ENSG00000164118:ENST00000457424:exon_175237317_175237441:KIAA1712;ENSG00000164118:ENST00000396791:exon_175237317_175237441:KIAA1712;ENSG00000164118:ENST00000426172:exon_175237317_175237441:KIAA1712;ENSG00000164118:ENST00000296519:exon_175237317_175237441:KIAA1712;ENSG00000164118:ENST00000508483:exon_175237317_175237837:KIAA1712 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 183815688 A/G 1 33 43 76 16.2108743803396 21.8767394437999 -5.66586506346027 A:G A G 10 0.508761382413951 0.2079682826091 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 57 77 134 28.0006012024048 39.1746264458742 -11.1740252434694 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0573225018902534 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 186379735 T/C 1 5 7 12 2.45619308793025 3.56132967689766 -1.10513658896741 T:C T C 10 0.508761382413951 0.574941367903584 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 186379899 G/C 1 12 4 16 5.89486341103259 2.0350455296558 3.85981788137678 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0775291226144439 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 186380243 A/C 1 8 7 15 3.92990894068839 3.56132967689766 0.368579263790735 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 186380295 A/G 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 4 186380846 A/T 1 4 8 12 1.9649544703442 4.07009105931161 -2.10513658896741 A:T A T 10 0.508761382413951 0.259199063292902 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 231111 T/C 1 57 45 102 28.0006012024048 22.8942622086278 5.106338993777 A:T:C T C 10 0.508761382413951 0.323551219935672 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_231058_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_231058_231115:SDHA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 311478 T/C 1 116 107 223 56.9836796399817 54.4374679182928 2.54621172168893 T:C T C 10 0.508761382413951 0.738285132372319 ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_311408_311609:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_311408_312526:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507473:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000511482:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000512466:exon_308312_311517:PDCD6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 422955 C/G 1 10 4 14 4.91238617586049 2.0350455296558 2.87734064620469 C:G C G 10 0.508761382413951 0.180503112624562 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000510910:exon_422492_422973:AHRR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 434722 G/C 1 23 19 42 11.2984882044791 9.66646626586507 1.63202193861406 C:G G C 10 0.508761382413951 0.646115005090698 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_433968_434972:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 434998 C/T 1 14 17 31 6.87734064620469 8.64894350103717 -1.77160285483248 T:C C T 10 0.508761382413951 0.591853548885225 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 442571 A/C 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 A:C A C 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 31 38 69 15.2283971451675 19.3329325317301 -4.10453538656262 A:G G A 10 0.508761382413951 0.337596761552429 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 474974 C/T 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:C C T 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 476353 C/T 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 T:C C T 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000066230:ENST00000264938:exon_476317_476493:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000514375:exon_476317_476493:SLC9A3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 477479 C/T 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 T:C C T 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000066230:ENST00000264938:exon_477447_477559:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000514375:exon_477447_477559:SLC9A3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 1467004 A/G 1 39 47 86 19.1583060858559 23.9117849734557 -4.75347888759978 A:G A G 10 0.508761382413951 0.332407773456793 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 5462148 G/A 1 34 32 66 16.7021129979257 16.2803642372464 0.421748760679236 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 5462607 A/G 1 28 22 50 13.7546812924094 11.1927504131069 2.56193087930245 A:G A G 10 0.508761382413951 0.483265726632539 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 5462620 G/A 1 21 18 39 10.316010969307 9.15770488345112 1.15830608585591 A:G G A 10 0.508761382413951 0.750717389169567 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 5489383 G/A 1 23 22 45 11.2984882044791 11.1927504131069 0.105737791372206 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5489262_5490347:KIAA0947 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 6604787 C/T 1 53 52 105 26.0356467320606 26.4555918855255 -0.419945153464852 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604718_6604995:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6604718_6604821:NSUN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 6633779 C/G 1 14 6 20 6.87734064620469 3.05256829448371 3.82477235172098 C:G C G 10 0.508761382413951 0.116430409892464 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 6651970 A/G 1 8 6 14 3.92990894068839 3.05256829448371 0.877340646204686 A:G A G 10 0.508761382413951 0.79097715531601 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 6652009 G/A 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 A:G G A 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 6656210 G/A 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 A:G G A 10 0.508761382413951 0.335736887982477 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6656191_6656292:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6656191_6656292:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6656191_6656292:SRD5A1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 6748659 T/C 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 T:C T C 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000112941:ENST00000230859:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000511764:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000514697:exon_6748577_6748703:PAPD7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 7878424 T/A 1 13 10 23 6.38610202861864 5.08761382413951 1.29848820447913 A:T T A 10 0.508761382413951 0.678726593550885 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 10239261 G/A 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 14420027 A/C 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509354:exon_14419887_14420295:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512979:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000507714:exon_14419923_14420130:TRIO HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 14741984 T/C 1 10 3 13 4.91238617586049 1.52628414724185 3.38610202861864 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0929283691516743 ENSG00000154122:ENST00000284268:exon_14741936_14742031:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000503939:exon_14741936_14742031:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000515517:exon_14741566_14742031:ANKH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 A:G A G 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 31423007 T/C 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 T:C T C 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31422894_31423428:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000510178:exon_31422894_31423051:DROSHA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 32400266 A/G 1 20 23 43 9.82477235172098 11.7015117955209 -1.87673944379989 A:G A G 10 0.508761382413951 0.64798810832134 ENSG00000056097:ENST00000265069:exon_32400112_32400308:ZFR;ENSG00000056097:ENST00000382126:exon_32400112_32400308:ZFR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 33461043 A/G 1 124 127 251 60.9135885806701 64.6126955665718 -3.69910698590169 A:G A G 10 0.508761382413951 0.658862381877043 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33461007_33461169:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33461007_33461169:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33461007_33461169:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33461007_33461169:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33461007_33461169:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33461007_33461169:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33461007_33461169:TARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 33989518 C/T 1 16 9 25 7.85981788137678 4.57885244172556 3.28096543965123 T:C C T 10 0.508761382413951 0.231316073459551 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33989216_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33988789_33989607:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 34004707 C/T 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 T:C C T 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_34004679_34004839:AMACR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 34008100 C/T 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_34007878_34008213:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_34007878_34008133:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_34007878_34008209:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_34007878_34008189:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_34007878_34008133:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_34007878_34008133:AMACR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 36104138 T/C 1 9 5 14 4.42114755827444 2.54380691206975 1.87734064620469 T:C T C 10 0.508761382413951 0.424962478484933 ENSG00000164187:ENST00000296603:exon_36098514_36104208:LMBRD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 42800808 C/T 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 T:C C T 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 43039793 T/C 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 T:C T C 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 43040023 T/G 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 T:G T G 10 0.508761382413951 0.335736887982477 ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 43609343 C/T 1 11 9 20 5.40362479344654 4.57885244172556 0.824772351720981 T:C C T 10 0.508761382413951 0.824343209360058 ENSG00000112992:ENST00000505678:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512422:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43609245_43609448:NNT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 7 10 17 3.43867032310234 5.08761382413951 -1.64894350103717 C:G G C 10 0.508761382413951 0.473990855338058 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 52942197 A/G 1 19 28 47 9.33353373413493 14.2453187075906 -4.9117849734557 A:G A G 10 0.508761382413951 0.188766660342517 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506765:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000509443:exon_52942025_52942235:NDUFS4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 61694379 T/C 1 17 33 50 8.35105649896283 16.7891256196604 -8.43806912069755 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0226827711962929 ENSG00000086189:ENST00000199320:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000506390:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000514911:exon_61694256_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000509182:exon_61694338_61694387:DIMT1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 61772535 G/T 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 T:G G T 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000086200:ENST00000424533:exon_61772510_61772580:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000325324:exon_61772510_61772580:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000409296:exon_61772510_61772580:IPO11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 64881936 A/G 1 10 10 20 4.91238617586049 5.08761382413951 -0.175227648279019 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000513773:exon_64881826_64882008:PPWD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 65108215 A/G 1 30 36 66 14.7371585275815 18.3154097669022 -3.57825123932076 A:G A G 10 0.508761382413951 0.391439430213979 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000509935:exon_65108082_65108218:NLN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 65350374 A/G 1 56 53 109 27.5093625848187 26.9643532679394 0.545009316879344 A:G A G 10 0.508761382413951 0.924037563667903 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 65350481 C/T 1 67 64 131 32.9129873782653 32.5607284744929 0.352258903772423 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511671:exon_65350461_65350779:ERBB2IP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 67588148 G/A 1 7 2 9 3.43867032310234 1.0175227648279 2.42114755827444 A:G G A 10 0.508761382413951 0.180291906522768 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000523807:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000522084:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000320694:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000336483:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518292:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518813:exon_67586628_67588189:PIK3R1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 68417643 C/T 1 15 6 21 7.36857926379074 3.05256829448371 4.31601096930703 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0793074128043104 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68417580_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68417574_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000512367:exon_68417521_68417722:SLC30A5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 26 29 55 12.7722040572373 14.7540800900046 -1.9818760327673 A:T A T 10 0.508761382413951 0.686174003039512 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 26 36 62 12.7722040572373 18.3154097669022 -5.54320570966496 T:G G T 10 0.508761382413951 0.164612030373892 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 68471247 G/A 1 121 75 196 59.4398727279119 38.1571036810463 21.2827690468656 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00261593388095298 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000505500:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000507798:exon_68471224_68471364:CCNB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 70858342 A/G 1 13 16 29 6.38610202861864 8.14018211862322 -1.75408009000458 A:G A G 10 0.508761382413951 0.579672735950497 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70858101_70858347:BDP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 75932869 C/T 1 8 3 11 3.92990894068839 1.52628414724185 2.40362479344654 T:C C T 10 0.508761382413951 0.227353863226797 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75932866_75932929:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000515505:exon_75932859_75932933:IQGAP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 75932965 G/C 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 C:G G C 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 77684726 G/A 1 9 5 14 4.42114755827444 2.54380691206975 1.87734064620469 A:G G A 10 0.508761382413951 0.424962478484933 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 82500734 G/T 1 15 17 32 7.36857926379074 8.64894350103717 -1.28036423724643 A:T:G G T 10 0.508761382413951 0.72498863519702 ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000514538:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000509268:exon_82500634_82500740:XRCC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 88 87 175 43.2289983475723 44.2622402700137 -1.03324192244142 A:G A G 10 0.508761382413951 0.880151283687562 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 108672946 C/T 1 25 41 66 12.2809654396512 20.859216678972 -8.57825123932076 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0365910223342792 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108670410_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108670411_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108670411_108673057:PJA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 108713970 C/T 1 26 18 44 12.7722040572373 9.15770488345112 3.61449917378616 T:C C T 10 0.508761382413951 0.294479080687978 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 108713982 T/C 1 35 21 56 17.1933516155117 10.683989030693 6.50936258481875 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0840383364850114 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 108714298 T/C 1 90 79 169 44.2114755827444 40.1921492107021 4.01932637204229 T:C T C 10 0.508761382413951 0.539506625293014 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 108719151 G/A 1 17 14 31 8.35105649896283 7.12265935379531 1.22839714516752 A:G G A 10 0.508761382413951 0.721386502145606 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000511624:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000512822:exon_108719097_108719221:PJA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 109181682 A/T 1 6 3 9 2.94743170551629 1.52628414724185 1.42114755827444 A:T A T 10 0.508761382413951 0.508416720988862 ENSG00000112893:ENST00000261483:exon_109181566_109181707:MAN2A1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 15 22 37 7.36857926379074 11.1927504131069 -3.82417114931619 C:G G C 10 0.508761382413951 0.250175627777529 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 115428334 G/T 1 9 7 16 4.42114755827444 3.56132967689766 0.859817881376784 T:G G T 10 0.508761382413951 0.804101251762597 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 115469773 C/T 1 14 10 24 6.87734064620469 5.08761382413951 1.78972682206518 T:C C T 10 0.508761382413951 0.542761494383684 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115469765_115469875:COMMD10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 118485716 A/G 1 10 6 16 4.91238617586049 3.05256829448371 1.85981788137678 A:G A G 10 0.508761382413951 0.455622877460238 ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118484434_118486116:DMXL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 118691784 T/C 1 136 80 216 66.8084519917027 40.7009105931161 26.1075413985866 A:T:C T C 10 0.508761382413951 0.000384777385392391 ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118690009_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118691718_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118691730_118691816:TNFAIP8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 A:G A G 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 122682334 C/T 1 12 19 31 5.89486341103259 9.66646626586507 -3.77160285483248 T:C C T 10 0.508761382413951 0.209400490261365 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 122685727 C/G 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 C:G C G 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122685638_122685783:CEP120 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 122718736 G/C 1 9 5 14 4.42114755827444 2.54380691206975 1.87734064620469 C:G G C 10 0.508761382413951 0.424962478484933 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122718713_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122718719_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122718680_122718776:CEP120 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 122727026 G/A 1 11 10 21 5.40362479344654 5.08761382413951 0.31601096930703 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000395431:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000503049:exon_122726603_122727031:CEP120 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 123983915 G/T 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 T:G G T 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000168916:ENST00000504926:exon_123982372_123984826:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000306315:exon_123982372_123984826:ZNF608 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 130766662 T/C 1 7 13 20 3.43867032310234 6.61389797138136 -3.17522764827902 T:C T C 10 0.508761382413951 0.182776485911971 ENSG00000158987:ENST00000509018:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000512611:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000507093:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000296859:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000358714:exon_130766547_130767042:RAPGEF6;ENSG00000217128:ENST00000514667:exon_130766552_130767042:FNIP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 131008194 T/C 1 8 12 20 3.92990894068839 6.10513658896741 -2.17522764827902 T:C T C 10 0.508761382413951 0.376308412261741 ENSG00000217128:ENST00000307968:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000307954:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000510461:exon_131007198_131008617:FNIP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 35 30 65 17.1933516155117 15.2628414724185 1.93051014309319 T:C T C 10 0.508761382413951 0.710137483500005 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 133887780 G/A 1 11 7 18 5.40362479344654 3.56132967689766 1.84229511654888 A:G G A 10 0.508761382413951 0.481911196747905 ENSG00000043143:ENST00000512386:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000282605:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000361895:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000432594:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000413974:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000433412:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000458562:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000448712:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000402835:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000395003:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000431355:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000453515:exon_133887742_133887899:PHF15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 134364518 C/G 1 10 18 28 4.91238617586049 9.15770488345112 -4.24531870759063 C:G C G 10 0.508761382413951 0.130819601457352 ENSG00000069011:ENST00000265340:exon_134363424_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000506438:exon_134364243_134365011:PITX1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 137517132 G/A 1 12 12 24 5.89486341103259 6.10513658896741 -0.210273177934823 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000112984:ENST00000513276:exon_137517111_137517200:KIF20A;ENSG00000112984:ENST00000394894:exon_137517111_137517200:KIF20A;ENSG00000112984:ENST00000508792:exon_137517111_137517137:KIF20A;ENSG00000112984:ENST00000511638:exon_137517111_137517200:KIF20A;ENSG00000112984:ENST00000503417:exon_137517111_137517200:KIF20A;ENSG00000112984:ENST00000504621:exon_137517111_137517200:KIF20A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 137892170 G/A 1 423 395 818 207.793935238899 200.960746053511 6.83318918538811 A:G G A 10 0.508761382413951 0.649444986274847 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000524109:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000512328:exon_137892141_137892262:HSPA9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 137902339 T/C 1 122 178 300 59.931111345498 90.5595260696833 -30.6284147241853 T:C T C 10 0.508761382413951 0.000415714739315935 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000501917:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000523929:exon_137902315_137902400:HSPA9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 11 6 17 5.40362479344654 3.05256829448371 2.35105649896283 A:G A G 10 0.508761382413951 0.333580569907415 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 139682663 G/C 1 8 13 21 3.92990894068839 6.61389797138136 -2.68398903069297 C:G G C 10 0.508761382413951 0.279281497621514 ENSG00000113068:ENST00000261813:exon_139682626_139682706:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000510217:exon_139682626_139682698:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000524074:exon_139682626_139682668:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000507185:exon_139682626_139682671:PFDN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 139938237 C/T 1 16 17 33 7.85981788137678 8.64894350103717 -0.789125619660382 T:C C T 10 0.508761382413951 0.862463507447866 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139937853_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000358580:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139937979_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139938170_139938406:APBB3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 140057535 G/A 1 34 35 69 16.7021129979257 17.8066483844883 -1.10453538656262 A:G G A 10 0.508761382413951 0.810719804637207 ENSG00000170445:ENST00000504156:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000457527:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000431330:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000504366:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000307633:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000448240:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000438307:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000415192:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512655:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000506579:exon_140057240_140058712:HARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 141391532 G/A 1 10 6 16 4.91238617586049 3.05256829448371 1.85981788137678 A:G G A 10 0.508761382413951 0.455622877460238 ENSG00000113552:ENST00000513454:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000311337:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000500692:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000458112:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000508177:exon_141391477_141392359:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503794:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504139:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000505689:exon_141391414_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000510194:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503229:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000507107:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504424:exon_141391514_141391606:GNPDA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 145499996 C/T 1 56 54 110 27.5093625848187 27.4731146503534 0.0362479344653934 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145499934_145500066:LARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 145508340 A/G 1 32 28 60 15.7196357627536 14.2453187075906 1.47431705516294 A:G A G 10 0.508761382413951 0.796495156798099 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145508235_145508345:LARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 145519821 G/A 1 44 59 103 21.6144991737862 30.0169215624231 -8.40242238863695 A:G G A 10 0.508761382413951 0.114477135463629 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000512412:exon_145519767_145519824:LARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 145523105 G/A 1 39 39 78 19.1583060858559 19.8416939141441 -0.683387828288176 A:G G A 10 0.508761382413951 0.91014842890924 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000514104:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000504323:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508667:exon_145522807_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000507095:exon_145523050_145523113:LARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 145539996 T/G 1 19 18 37 9.33353373413493 9.15770488345112 0.175828850683814 T:G T G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145539937_145540049:LARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 145543972 G/A 1 3 9 12 1.47371585275815 4.57885244172556 -3.10513658896741 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0871818487647519 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000505223:exon_145543961_145544034:LARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 147778631 A/G 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 A:G A G 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147778562_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000503613:exon_147778562_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147778562_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147778562_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000508326:exon_147778562_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000509411:exon_147778562_147779100:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147778562_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000521160:exon_147778578_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000509699:exon_147778562_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000502629:exon_147778560_147778695:FBXO38 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 147805120 T/C 1 11 7 18 5.40362479344654 3.56132967689766 1.84229511654888 T:C T C 10 0.508761382413951 0.481911196747905 ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000514832:exon_147805085_147805264:FBXO38 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 149216256 C/T 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 T:C C T 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149215826_149216636:PPARGC1B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 149919739 G/C 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 C:G G C 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149919644_149919826:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149919644_149919826:NDST1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 105 142 247 51.5800548465351 72.244116302781 -20.6640614562459 A:T:G A G 10 0.508761382413951 0.0090077816676968 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 91 90 181 44.7027142003305 45.7885244172556 -1.08581021692513 A:G G A 10 0.508761382413951 0.882070168909431 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 154173442 C/T 1 63 51 114 30.9480329079211 25.9468305031115 5.00120240480959 T:C C T 10 0.508761382413951 0.39930050336571 ENSG00000155506:ENST00000336314:exon_154173360_154173560:LARP1;ENSG00000155506:ENST00000285894:exon_154173360_154173560:LARP1;ENSG00000155506:ENST00000377643:exon_154173360_154173560:LARP1;ENSG00000155506:ENST00000518297:exon_154173360_154173560:LARP1;ENSG00000155506:ENST00000521577:exon_154173360_154173560:LARP1;ENSG00000155506:ENST00000524248:exon_154173360_154173560:LARP1;ENSG00000155506:ENST00000518194:exon_154173360_154173482:LARP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 156820032 T/C 1 75 71 146 36.8428963189537 36.1220581513905 0.720838167563159 T:C T C 10 0.508761382413951 0.93414378061934 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156819841_156820241:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156819841_156820232:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156819841_156822606:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156819841_156820215:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156819841_156820215:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156819841_156820231:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156819841_156822603:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156819841_156822606:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156819841_156820237:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156819841_156822606:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156819841_156820232:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523383:exon_156819841_156820241:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519663:exon_156819841_156820241:CYFIP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 158204425 A/G 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000164330:ENST00000519890:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000519739:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000518836:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000313708:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000380654:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000517373:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000522192:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000523464:exon_158204421_158204547:EBF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 6 15 21 2.94743170551629 7.63142073620926 -4.68398903069297 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0491093636229696 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 159840935 T/A 1 38 28 66 18.6670674682699 14.2453187075906 4.42174876067924 A:T T A 10 0.508761382413951 0.324815055475985 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159840906_159840986:SLU7;ENSG00000164609:ENST00000521826:exon_159840906_159840986:SLU7;ENSG00000164609:ENST00000521190:exon_159840809_159840986:SLU7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 162909687 G/A 1 22 19 41 10.8072495868931 9.66646626586507 1.14078332102801 A:G G A 10 0.508761382413951 0.756727408558997 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162909648_162909794:HMMR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 162909716 C/T 1 33 20 53 16.2108743803396 10.175227648279 6.0356467320606 T:C C T 10 0.508761382413951 0.101101587397389 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162909648_162909794:HMMR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 169021610 C/T 1 26 33 59 12.7722040572373 16.7891256196604 -4.01692156242311 T:C C T 10 0.508761382413951 0.301235758132591 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021575_169021685:CCDC99 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 169028481 T/C 1 24 31 55 11.7897268220652 15.7716028548325 -3.9818760327673 T:C T C 10 0.508761382413951 0.345256052188640 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 169031150 T/C 1 49 60 109 24.0706922617164 30.5256829448371 -6.45499068312066 T:C T C 10 0.508761382413951 0.250222524533798 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 169031218 G/T 1 39 39 78 19.1583060858559 19.8416939141441 -0.683387828288176 T:G G T 10 0.508761382413951 0.91014842890924 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 169435713 A/C 1 31 32 63 15.2283971451675 16.2803642372464 -1.05196709207891 A:C A C 10 0.508761382413951 0.8024536443897 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169435692_169435750:DOCK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 29 30 59 14.2459199099954 15.2628414724185 -1.01692156242311 C:G C G 10 0.508761382413951 0.796321729221659 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 48 38 86 23.5794536441304 19.3329325317301 4.24652111240022 T:C C T 10 0.508761382413951 0.389118572976969 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 175772208 C/T 1 15 19 34 7.36857926379074 9.66646626586507 -2.29788700207433 T:C C T 10 0.508761382413951 0.494205131577877 ENSG00000170085:ENST00000345702:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000430704:exon_175772186_175772569:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000443967:exon_175772186_175772994:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000341199:exon_175772186_175772992:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000420396:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000332772:exon_175772186_175772992:C5orf25 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 176636882 C/T 1 13 15 28 6.38610202861864 7.63142073620926 -1.24531870759063 T:C C T 10 0.508761382413951 0.707356544758575 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 176637149 G/A 1 14 19 33 6.87734064620469 9.66646626586507 -2.78912561966038 A:G G A 10 0.508761382413951 0.385544935151851 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 176637240 G/T 1 15 10 25 7.36857926379074 5.08761382413951 2.28096543965123 T:G G T 10 0.508761382413951 0.426148435268484 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 176637576 T/C 1 18 14 32 8.84229511654888 7.12265935379531 1.71963576275357 T:C T C 10 0.508761382413951 0.598431040951595 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 176721198 T/C 1 22 16 38 10.8072495868931 8.14018211862322 2.66706746826986 T:C T C 10 0.508761382413951 0.420419027699363 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 176733116 A/G 1 219 177 396 107.581257251345 90.0507646872693 17.5304925640754 A:G A G 10 0.508761382413951 0.078763718213494 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000511309:exon_176732872_176733148:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510797:exon_176733099_176733154:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503853:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510701:exon_176733099_176733164:PRELID1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 176733616 T/C 1 273 231 504 134.108142600991 117.523879337623 16.5842632633687 T:C T C 10 0.508761382413951 0.141717721575303 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733423_176733960:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733423_176733670:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733456_176733950:PRELID1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 94 98 192 46.1764300530886 49.8586154765672 -3.68218542347859 C:G G C 10 0.508761382413951 0.613846102613523 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 29 32 61 14.2459199099954 16.2803642372464 -2.03444432725101 A:G A G 10 0.508761382413951 0.611294472164227 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 46 31 77 22.5969764089583 15.7716028548325 6.82537355412578 T:C T C 10 0.508761382413951 0.138229548742746 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 176894756 C/T 1 19 21 40 9.33353373413493 10.683989030693 -1.35045529655804 T:C C T 10 0.508761382413951 0.752494397021214 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176894482_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000477391:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000506117:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000514833:exon_176894744_176894818:DBN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 176916516 C/T 1 28 12 40 13.7546812924094 6.10513658896741 7.64954470344196 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0172461182932664 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 176931706 G/C 1 18 12 30 8.84229511654888 6.10513658896741 2.73715852758147 C:G G C 10 0.508761382413951 0.363817218311101 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 176936590 T/C 1 45 35 80 22.1057377913722 17.8066483844883 4.29908940688392 T:C T C 10 0.508761382413951 0.371640095201377 ENSG00000146094:ENST00000377112:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000501403:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510898:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000509310:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000502380:exon_176935785_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000512660:exon_176936167_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510389:exon_176936503_176936658:DOK3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 176936819 C/G 1 18 10 28 8.84229511654888 5.08761382413951 3.75468129240937 C:G C G 10 0.508761382413951 0.186823243553659 ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176936803_176936858:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510380:exon_176936803_176936847:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000506493:exon_176936759_176936830:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000502885:exon_176936759_176936827:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510898:exon_176936759_176936853:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000512660:exon_176936759_176936827:DOK3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 177031348 T/C 1 8 11 19 3.92990894068839 5.59637520655346 -1.66646626586507 T:C T C 10 0.508761382413951 0.497078070201239 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000502420:exon_177031280_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000510761:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505468:exon_177031067_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000507061:exon_177031313_177031542:B4GALT7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 12 10 22 5.89486341103259 5.08761382413951 0.807249586893079 T:C T C 10 0.508761382413951 0.832379092287417 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 177547336 G/A 1 8 11 19 3.92990894068839 5.59637520655346 -1.66646626586507 A:G G A 10 0.508761382413951 0.497078070201239 ENSG00000145911:ENST00000274605:exon_177547179_177547700:N4BP3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 178140090 C/T 1 12 28 40 5.89486341103259 14.2453187075906 -8.35045529655804 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0105615529593142 ENSG00000169131:ENST00000335815:exon_178138593_178140622:ZNF354A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 180660447 G/C 1 9 4 13 4.42114755827444 2.0350455296558 2.38610202861864 C:G G C 10 0.508761382413951 0.267810029003266 ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180660413_180660763:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180657744_180662803:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515834:exon_180659659_180660524:TRIM41 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 5 180661980 T/C 1 24 25 49 11.7897268220652 12.7190345603488 -0.929307738283597 T:C T C 10 0.508761382413951 0.886596358619732 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180661932_180661995:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180661174_180662809:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180661174_180662806:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180661932_180661995:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180657744_180662803:TRIM41 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 175 129 304 85.9667580775586 65.6302183313997 20.3365397461589 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0216282029159981 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 1742794 A/G 1 16 11 27 7.85981788137678 5.59637520655346 2.26344267482332 A:G A G 10 0.508761382413951 0.443974308913854 ENSG00000112699:ENST00000530927:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380815:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380805:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000531690:exon_1742702_1742820:GMDS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 13 26 39 6.38610202861864 13.2277959427627 -6.84169391414409 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0362244264750109 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 82 71 153 40.281566642056 36.1220581513905 4.1595084906655 A:G A G 10 0.508761382413951 0.518517119760164 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 35 35 70 17.1933516155117 17.8066483844883 -0.613296768976568 A:G G A 10 0.508761382413951 0.905341570521038 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 4998963 A/G 1 8 15 23 3.92990894068839 7.63142073620926 -3.70151179552087 A:G A G 10 0.508761382413951 0.145808138014843 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 5260936 A/C 1 40 47 87 19.649544703442 23.9117849734557 -4.26224027001373 A:C A C 10 0.508761382413951 0.391696885277827 ENSG00000214113:ENST00000468929:exon_5260881_5260975:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000330636:exon_5260881_5261172:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000464010:exon_5260881_5260966:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000480566:exon_5260881_5260975:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000455814:exon_5260881_5260954:LYRM4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 7230680 G/T 1 11 6 17 5.40362479344654 3.05256829448371 2.35105649896283 T:G G T 10 0.508761382413951 0.333580569907415 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7230073_7232140:RREB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 7247248 T/C 1 14 14 28 6.87734064620469 7.12265935379531 -0.245318707590627 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7247244_7247454:RREB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 7884652 C/T 1 137 143 280 67.2996906092887 72.752877685195 -5.45318707590627 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.550117188364367 ENSG00000239264:ENST00000379757:exon_7884592_7884721:TXNDC5;ENSG00000239264:ENST00000460138:exon_7884592_7884721:TXNDC5;ENSG00000239264:ENST00000473453:exon_7884592_7884721:TXNDC5;ENSG00000239264:ENST00000475802:exon_7884592_7884721:TXNDC5;ENSG00000188428:ENST00000439343:exon_7884592_7884721:MUTED HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 10702799 G/A 1 27 16 43 13.2634426748233 8.14018211862322 5.12326055620011 A:G G A 10 0.508761382413951 0.128787265314107 ENSG00000111845:ENST00000379568:exon_10702798_10702872:PAK1IP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 12120445 A/G 1 8 3 11 3.92990894068839 1.52628414724185 2.40362479344654 A:G A G 10 0.508761382413951 0.227353863226797 ENSG00000095951:ENST00000487103:exon_12120123_12120455:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 12120588 C/T 1 9 15 24 4.42114755827444 7.63142073620926 -3.21027317793482 T:C C T 10 0.508761382413951 0.222993356359584 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 12122174 A/G 1 13 13 26 6.38610202861864 6.61389797138136 -0.227795942762725 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 12124587 C/G 1 17 16 33 8.35105649896283 8.14018211862322 0.210874380339618 C:G C G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 12124855 G/A 1 11 18 29 5.40362479344654 9.15770488345112 -3.75408009000458 A:G G A 10 0.508761382413951 0.194535966290898 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 12163575 G/A 1 13 8 21 6.38610202861864 4.07009105931161 2.31601096930703 A:G G A 10 0.508761382413951 0.384857904990228 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12163516_12165232:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000399469:exon_12163516_12164808:HIVEP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 13711279 A/G 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 A:G A G 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000010017:ENST00000011619:exon_13711167_13711796:RANBP9;ENSG00000010017:ENST00000283152:exon_13711167_13711953:RANBP9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 13814340 T/C 1 28 20 48 13.7546812924094 10.175227648279 3.57945364413035 T:C T C 10 0.508761382413951 0.315896780165955 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13814247_13814800:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13814247_13814800:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000359495:exon_13814247_13814789:CCDC90A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 15496662 C/T 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 T:C C T 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000008083:ENST00000341776:exon_15496363_15497401:JARID2;ENSG00000008083:ENST00000397311:exon_15496363_15497401:JARID2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 16306751 G/A 1 28 29 57 13.7546812924094 14.7540800900046 -0.999398797595205 A:G G A 10 0.508761382413951 0.793040323309054 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 16328068 T/C 1 14 12 26 6.87734064620469 6.10513658896741 0.772204057237275 T:C T C 10 0.508761382413951 0.845636468998877 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16326625_16328574:ATXN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 17600619 A/G 1 4 7 11 1.9649544703442 3.56132967689766 -1.59637520655346 A:G A G 10 0.508761382413951 0.379976164789140 ENSG00000137414:ENST00000259963:exon_17600586_17601352:FAM8A1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 17665479 G/C 1 35 20 55 17.1933516155117 10.175227648279 7.0181239672327 C:G G C 10 0.508761382413951 0.060175069567842 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17665470_17665616:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17665470_17665616:NUP153 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 17675246 T/C 1 26 19 45 12.7722040572373 9.66646626586507 3.10573779137221 T:C T C 10 0.508761382413951 0.374609604410792 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17675136_17675264:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17675136_17675264:NUP153 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 18237661 C/T 1 56 55 111 27.5093625848187 27.9818760327673 -0.472513447948558 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000507591:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000512145:exon_18237281_18237747:DEK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 18256625 A/G 1 59 53 112 28.9830784375769 26.9643532679394 2.01872516963749 A:G A G 10 0.508761382413951 0.706788575362277 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18256592_18256670:DEK;ENSG00000124795:ENST00000503715:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18256604_18256686:DEK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 18264210 G/A 1 43 31 74 21.1232605562001 15.7716028548325 5.35165770136763 A:G G A 10 0.508761382413951 0.245089257993439 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18264074_18264439:DEK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 18264658 G/A 1 37 23 60 18.1758288506838 11.7015117955209 6.47431705516294 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.120563672571379 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264616_18265054:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264616_18264799:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264616_18264766:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264616_18264772:DEK;ENSG00000124795:ENST00000503715:exon_18264616_18264772:DEK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 24653215 C/T 1 43 59 102 21.1232605562001 30.0169215624231 -8.893661006223 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0918589491905932 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 24653273 G/C 1 28 28 56 13.7546812924094 14.2453187075906 -0.490637415181254 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 24666739 C/T 1 1 7 8 0.491238617586049 3.56132967689766 -3.07009105931161 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0359761797629569 ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24666347_24666819:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000480495:exon_24666215_24666839:TDP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 26045737 C/G 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 C:G C G 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000196532:ENST00000360577:exon_26045612_26047022:HIST1H3C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 26045929 T/C 1 9 7 16 4.42114755827444 3.56132967689766 0.859817881376784 T:C T C 10 0.508761382413951 0.804101251762597 ENSG00000196532:ENST00000360577:exon_26045612_26047022:HIST1H3C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 26056549 A/G 1 230 227 457 112.984882044791 115.488833807967 -2.50395176317559 A:T:G A G 10 0.508761382413951 0.815262261447021 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 26056604 G/A 1 582 545 1127 285.900875435081 277.274953415603 8.62592201947729 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.612638415999768 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 26104217 T/C 1 62 87 149 30.456794290335 44.2622402700137 -13.8054459796787 T:C:G T C 10 0.508761382413951 0.0266961614547222 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 26104448 A/G 1 79 93 172 38.8078507892979 47.3148085644974 -8.50695777519957 A:G A G 10 0.508761382413951 0.19592107221926 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 26124430 C/T 1 25 27 52 12.2809654396512 13.7365573251767 -1.45559188552545 T:C C T 10 0.508761382413951 0.781812955742105 ENSG00000180573:ENST00000377791:exon_26124373_26124969:HIST1H2AC;ENSG00000180573:ENST00000314088:exon_26124418_26124977:HIST1H2AC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 26184102 G/A 1 4 11 15 1.9649544703442 5.59637520655346 -3.63142073620926 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0723284393895949 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 26285560 A/G 1 10 2 12 4.91238617586049 1.0175227648279 3.89486341103259 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0389207059439051 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 26285683 T/C 1 12 8 20 5.89486341103259 4.07009105931161 1.82477235172098 T:C T C 10 0.508761382413951 0.504771039081216 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 22 18 40 10.8072495868931 9.15770488345112 1.64954470344196 A:G A G 10 0.508761382413951 0.63791205833107 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 42 41 83 20.6320219386141 20.859216678972 -0.22719474035793 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 28269663 A/G 1 9 6 15 4.42114755827444 3.05256829448371 1.36857926379074 A:G A G 10 0.508761382413951 0.60808216621752 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 28270047 C/G 1 12 3 15 5.89486341103259 1.52628414724185 4.36857926379074 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0355657976378936 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 28891423 G/A 1 60 42 102 29.4743170551629 21.3679780613859 8.106338993777 A:G G A 10 0.508761382413951 0.113746919011988 ENSG00000204713:ENST00000377199:exon_28890990_28891766:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000377194:exon_28890990_28891765:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000481474:exon_28890990_28891690:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000444898:exon_28890990_28891768:TRIM27 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 29910801 C/A 1 941 1 942 462.255539148472 0.508761382413951 461.746777766058 A:C C A 10 0.508761382413951 5.72149551491626e-274 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 29911003 G/A 0 0 9 9 0 4.57885244172556 -4.57885244172556 A:C G A 10 0.508761382413951 0.00166583700296704 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 30030057 G/A 1 62 67 129 30.456794290335 34.0870126217347 -3.63021833139967 A:G G A 10 0.508761382413951 0.538612338510548 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30026676_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30030001_30030110:ZNRD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 30164467 C/A 1 33 26 59 16.2108743803396 13.2277959427627 2.98307843757689 A:C C A 10 0.508761382413951 0.515382221202956 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30164313_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30164356_30164523:TRIM26 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 30457732 T/C 1 1201 1138 2339 589.977579720845 578.970453187076 11.0071265337688 A:T:C T C 10 0.508761382413951 0.66409347939771 ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30457289_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30457316_30457772:HLA-E HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 737 866 1603 362.042861160918 440.587357170482 -78.5444960095634 A:T:C:G G A 10 0.508761382413951 8.72054021855778e-05 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 30460232 C/T 1 10 5 15 4.91238617586049 2.54380691206975 2.36857926379074 T:C C T 10 0.508761382413951 0.302882686663208 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 30638831 T/A 1 26 28 54 12.7722040572373 14.2453187075906 -1.47311465035335 A:T T A 10 0.508761382413951 0.785772374016051 ENSG00000204560:ENST00000376442:exon_30638813_30639051:DHX16;ENSG00000204560:ENST00000415603:exon_30638813_30639051:DHX16 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 2 32 34 0.982477235172098 16.2803642372464 -15.2978870020743 A:G G A 10 0.508761382413951 2.39122325696800e-08 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31515489 C/A 1 1 20 21 0.491238617586049 10.175227648279 -9.68398903069297 A:C C A 10 0.508761382413951 8.17027525052524e-06 ENSG00000204498:ENST00000376148:exon_31515358_31515528:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376145:exon_31515390_31515528:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000496233:exon_31515417_31515528:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000473655:exon_31515438_31515528:NFKBIL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 167 220 387 82.0368491368702 111.927504131069 -29.890654994199 A:C C A 10 0.508761382413951 0.00265967973635219 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 126 109 235 61.8960658158422 55.4549906831207 6.44107513272152 A:G G A 10 0.508761382413951 0.433758544406718 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31604010 C/G 1 150 152 302 73.6857926379074 77.3317301269205 -3.64593748901319 A:C:G C G 10 0.508761382413951 0.687349310490781 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 21 9 30 10.316010969307 4.57885244172556 5.73715852758147 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0437198983268862 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 51 51 102 25.0531694968885 25.9468305031115 -0.893661006222999 A:G A G 10 0.508761382413951 0.921193475341578 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31627449 C/G 1 21 28 49 10.316010969307 14.2453187075906 -3.9293077382836 C:G C G 10 0.508761382413951 0.317339362932641 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 19 28 47 9.33353373413493 14.2453187075906 -4.9117849734557 T:C C T 10 0.508761382413951 0.188766660342517 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 80 97 177 39.2990894068839 49.3498540941532 -10.0507646872693 T:C T C 10 0.508761382413951 0.133350814540628 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 8 8 16 3.92990894068839 4.07009105931161 -0.140182118623216 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31731881 C/T 1 15 7 22 7.36857926379074 3.56132967689766 3.80724958689308 T:C C T 10 0.508761382413951 0.135111008279552 ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000228727:ENST00000433778:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000415669:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000425424:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000494299:exon_31731397_31731936:C6orf26 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31748820 G/A 1 62 51 113 30.456794290335 25.9468305031115 4.50996378722354 A:G G A 10 0.508761382413951 0.399273934050432 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31762843 G/C 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 C:G G C 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31762844 G/T 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 T:G G T 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31777946 C/T 1 4 9 13 1.9649544703442 4.57885244172556 -2.61389797138136 T:C C T 10 0.508761382413951 0.172726937801510 ENSG00000204390:ENST00000375654:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000417199:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000375653:exon_31777824_31779230:HSPA1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31807489 C/T 1 25 13 38 12.2809654396512 6.61389797138136 5.66706746826986 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0746152796371923 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 31929014 A/C 1 8 13 21 3.92990894068839 6.61389797138136 -2.68398903069297 A:C A C 10 0.508761382413951 0.279281497621514 ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31928973_31929163:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31928818_31929452:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31928973_31929163:SKIV2L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 32977315 A/G 1 27 23 50 13.2634426748233 11.7015117955209 1.56193087930245 A:G A G 10 0.508761382413951 0.67418939372333 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32977232_32977389:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32977232_32977389:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32977232_32977337:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32977232_32977337:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000374813:exon_32977232_32977356:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000467465:exon_32977232_32977359:HLA-DOA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 33163451 G/A 1 33 33 66 16.2108743803396 16.7891256196604 -0.578251239320764 A:G G A 10 0.508761382413951 0.90264044684166 ENSG00000204231:ENST00000374685:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000374680:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483281:exon_33163347_33163479:RXRB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 33256471 T/C 1 97 81 178 47.6501459058468 41.20967197553 6.44047393031673 T:C T C 10 0.508761382413951 0.368413440376137 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256341_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256391_33256471:WDR46 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 33272712 C/A 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:C C A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 119 119 238 58.4573954927398 60.5426045072602 -2.08520901452033 C:G G C 10 0.508761382413951 0.79572950906127 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 33281842 G/T 1 12 5 17 5.89486341103259 2.54380691206975 3.35105649896283 T:G G T 10 0.508761382413951 0.144506573427302 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 33281843 A/T 1 11 4 15 5.40362479344654 2.0350455296558 3.36857926379074 A:T A T 10 0.508761382413951 0.119313325605239 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 33283766 T/C 1 18 8 26 8.84229511654888 4.07009105931161 4.77220405723727 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0766769048587819 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 61 75 136 29.965555672749 38.1571036810463 -8.19154800829733 A:G A G 10 0.508761382413951 0.170356920123293 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 33359716 G/C 1 32 27 59 15.7196357627536 13.7365573251767 1.98307843757689 C:G G C 10 0.508761382413951 0.696434551434237 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000450504:exon_33359638_33359774:KIFC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 33422976 T/G 1 4 10 14 1.9649544703442 5.08761382413951 -3.12265935379531 T:G T G 10 0.508761382413951 0.112778665730966 ENSG00000213588:ENST00000395064:exon_33422807_33425325:ZBTB9;ENSG00000213588:ENST00000487326:exon_33422807_33424094:ZBTB9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 33636907 C/T 1 7 12 19 3.43867032310234 6.10513658896741 -2.66646626586507 T:C C T 10 0.508761382413951 0.256095565288392 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33636751_33636933:ITPR3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 33638180 C/T 1 6 11 17 2.94743170551629 5.59637520655346 -2.64894350103717 T:C C T 10 0.508761382413951 0.230781110739111 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33638102_33638353:ITPR3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 33641379 T/C 1 12 6 18 5.89486341103259 3.05256829448371 2.84229511654888 T:C T C 10 0.508761382413951 0.239188352827104 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33641368_33641497:ITPR3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 35610590 A/G 1 9 19 28 4.42114755827444 9.66646626586507 -5.24531870759063 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0579825749632398 ENSG00000096060:ENST00000357266:exon_35610497_35610620:FKBP5;ENSG00000096060:ENST00000337746:exon_35610497_35610620:FKBP5;ENSG00000096060:ENST00000373875:exon_35610520_35610597:FKBP5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 36446975 G/C 1 20 17 37 9.82477235172098 8.64894350103717 1.17582885068381 C:G G C 10 0.508761382413951 0.744246999088275 ENSG00000112078:ENST00000373731:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000481911:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000265344:exon_36446898_36447000:KCTD20 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 112 124 236 55.0187251696375 63.0864114193299 -8.06768624969243 A:T:C C A 10 0.508761382413951 0.298295181568442 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 36653597 C/T 1 135 162 297 66.3172133741166 82.4193439510601 -16.1021305769434 T:C:G C T 10 0.508761382413951 0.0633971536174047 ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36653528_36655116:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36653528_36653701:CDKN1A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 11 10 21 5.40362479344654 5.08761382413951 0.31601096930703 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 36976637 G/C 1 19 25 44 9.33353373413493 12.7190345603488 -3.38550082621384 C:G G C 10 0.508761382413951 0.366083560867370 ENSG00000146192:ENST00000489356:exon_36976610_36977807:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000497659:exon_36976610_36976857:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487975:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36976610_36976841:FGD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 0 0 14 14 0 7.12265935379531 -7.12265935379531 T C T 10 0.508761382413951 4.7653522351876e-05 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 36995222 G/A 1 14 5 19 6.87734064620469 2.54380691206975 4.33353373413493 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0643310571506474 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36995205_36996845:FGD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 37349033 G/A 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 0 79 1 80 38.8078507892979 0.508761382413951 38.2990894068839 T:G G T 10 0.508761382413951 2.76630524712827e-22 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 41038845 C/T 1 2 8 10 0.982477235172098 4.07009105931161 -3.08761382413951 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0611719145334834 ENSG00000124596:ENST00000469104:exon_41038564_41039015:C6orf130;ENSG00000124596:ENST00000471367:exon_41038780_41039015:C6orf130 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 144 122 266 70.7383609323911 62.068888654502 8.66947227788904 T:C C T 10 0.508761382413951 0.297578917786385 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 124 119 243 60.9135885806701 60.5426045072602 0.370984073409915 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 30 30 60 14.7371585275815 15.2628414724185 -0.525682944837058 A:C A C 10 0.508761382413951 0.898132634111214 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 41903783 G/A 1 30 30 60 14.7371585275815 15.2628414724185 -0.525682944837058 A:G G A 10 0.508761382413951 0.898132634111214 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 42185564 A/C 1 22 12 34 10.8072495868931 6.10513658896741 4.70211299792567 A:C A C 10 0.508761382413951 0.123389179653544 ENSG00000048544:ENST00000053468:exon_42185540_42185603:MRPS10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 42532102 C/T 1 12 10 22 5.89486341103259 5.08761382413951 0.807249586893079 T:C C T 10 0.508761382413951 0.832379092287417 ENSG00000024048:ENST00000372903:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372883:exon_42532058_42532135:UBR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 42658949 T/A 1 12 5 17 5.89486341103259 2.54380691206975 3.35105649896283 A:T T A 10 0.508761382413951 0.144506573427302 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42658770_42661242:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42658770_42661242:UBR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 42933526 C/T 1 8 12 20 3.92990894068839 6.10513658896741 -2.17522764827902 T:C C T 10 0.508761382413951 0.376308412261741 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42933419_42933527:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42933419_42933527:PEX6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 42992808 T/C 1 19 20 39 9.33353373413493 10.175227648279 -0.841693914144088 T:C T C 10 0.508761382413951 0.87317463430215 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 42992825 C/G 1 16 18 34 7.85981788137678 9.15770488345112 -1.29788700207433 C:G C G 10 0.508761382413951 0.732701821127198 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 42995211 A/G 1 84 89 173 41.2640438772281 45.2797630348416 -4.01571915761352 A:G A G 10 0.508761382413951 0.544152763948965 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42995098_42995215:RRP36 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 43016263 G/A 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 A:G G A 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43016070_43016307:CUL7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 43308552 A/T 1 21 10 31 10.316010969307 5.08761382413951 5.22839714516752 A:T A T 10 0.508761382413951 0.0720876623587349 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43308528_43308646:ZNF318 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 44081718 G/A 1 276 236 512 135.58185845375 120.067686249692 15.5141722040571 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.170953902838825 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 44117607 C/T 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 T:C C T 10 0.508761382413951 0.770813353200887 ENSG00000137216:ENST00000259746:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000323267:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371915:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371893:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000533121:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000482966:exon_44117596_44117702:TMEM63B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 120 102 222 58.9486341103259 51.893661006223 7.05497310410288 T:G G T 10 0.508761382413951 0.34824447566631 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 44223308 G/A 1 72 64 136 35.3691804661955 32.5607284744929 2.80845199170267 A:G G A 10 0.508761382413951 0.668400096021456 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 44360533 G/A 1 22 19 41 10.8072495868931 9.66646626586507 1.14078332102801 A:G G A 10 0.508761382413951 0.756727408558997 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44360404_44360565:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44360404_44360565:CDC5L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 44371714 C/T 1 31 22 53 15.2283971451675 11.1927504131069 4.0356467320606 T:C C T 10 0.508761382413951 0.275580408634175 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 44413463 T/A 1 28 26 54 13.7546812924094 13.2277959427627 0.526885349646648 A:T T A 10 0.508761382413951 0.892815570792296 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44413392_44413604:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44413392_44413604:CDC5L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 46107752 C/G 1 18 11 29 8.84229511654888 5.59637520655346 3.24591990999542 C:G C G 10 0.508761382413951 0.267065366288356 ENSG00000001561:ENST00000321037:exon_46107288_46108146:ENPP4;ENSG00000001561:ENST00000371401:exon_46107287_46108146:ENPP4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 49403301 C/T 1 16 6 22 7.85981788137678 3.05256829448371 4.80724958689308 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0532657349158644 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 12 0 12 5.89486341103259 0 5.89486341103259 G G 10 0.508761382413951 0.000498199128582232 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 57246847 C/T 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 T:C C T 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 70407465 A/T 1 28 42 70 13.7546812924094 21.3679780613859 -7.61329676897657 A:T A T 10 0.508761382413951 0.0734316486367522 ENSG00000168216:ENST00000370577:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000370570:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000472827:exon_70407455_70407533:LMBRD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 71236216 C/T 1 9 6 15 4.42114755827444 3.05256829448371 1.36857926379074 T:C C T 10 0.508761382413951 0.60808216621752 ENSG00000082269:ENST00000418814:exon_71234046_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000370479:exon_71234634_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505769:exon_71235567_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000457062:exon_71234634_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000361499:exon_71234634_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000194672:exon_71234634_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505868:exon_71234046_71236401:FAM135A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 71269632 G/A 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000082269:ENST00000418814:exon_71269419_71270877:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000370479:exon_71269419_71270875:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505769:exon_71269419_71270735:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000457062:exon_71269419_71270727:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000361499:exon_71269419_71270362:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000194672:exon_71269419_71270874:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000442251:exon_71269419_71270873:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505675:exon_71269419_71270874:FAM135A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 71289189 A/G 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 A:G A G 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71289117_71289269:C6orf57 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 74161503 A/G 1 9 10 19 4.42114755827444 5.08761382413951 -0.666466265865068 A:G A G 10 0.508761382413951 0.821210319840976 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74161248_74161982:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74161248_74161999:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74161248_74161999:C6orf150 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 74161801 G/T 1 17 13 30 8.35105649896283 6.61389797138136 1.73715852758147 T:G G T 10 0.508761382413951 0.586407892614967 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74161248_74161982:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74161248_74161999:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74161248_74161999:C6orf150 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 83075914 G/A 1 12 13 25 5.89486341103259 6.61389797138136 -0.719034560348774 A:G G A 10 0.508761382413951 0.84288335090626 ENSG00000146242:ENST00000369750:exon_83074340_83080545:TPBG HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 99883515 G/C 1 8 5 13 3.92990894068839 2.54380691206975 1.38610202861864 C:G G C 10 0.508761382413951 0.581825911412537 ENSG00000123552:ENST00000392738:exon_99880190_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000500704:exon_99880255_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000496518:exon_99880312_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000327681:exon_99880315_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369233:exon_99883420_99883722:USP45 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 99893878 T/C 1 7 2 9 3.43867032310234 1.0175227648279 2.42114755827444 T:C T C 10 0.508761382413951 0.180291906522768 ENSG00000123552:ENST00000392738:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000500704:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000496518:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000327681:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369233:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000513344:exon_99893838_99894339:USP45 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 99894086 C/G 1 9 12 21 4.42114755827444 6.10513658896741 -1.68398903069297 C:G C G 10 0.508761382413951 0.517408343711901 ENSG00000123552:ENST00000392738:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000500704:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000496518:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000327681:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369233:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000513344:exon_99893838_99894339:USP45 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 107076696 G/A 1 10 15 25 4.91238617586049 7.63142073620926 -2.71903456034877 A:G G A 10 0.508761382413951 0.32021815508557 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 107077550 G/A 1 10 4 14 4.91238617586049 2.0350455296558 2.87734064620469 A:G G A 10 0.508761382413951 0.180503112624562 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107077453_107077580:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000467262:exon_107077474_107077580:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107077489_107077580:QRSL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 108214694 C/T 1 23 17 40 11.2984882044791 8.64894350103717 2.64954470344196 T:C C T 10 0.508761382413951 0.432433564598113 ENSG00000025796:ENST00000369002:exon_108214686_108214859:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000437345:exon_108214686_108214859:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000423697:exon_108214687_108214782:SEC63 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 265 0 265 130.178233660303 0 130.178233660303 T T 10 0.508761382413951 1.72654052585691e-78 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 306 0 306 150.319016981331 0 150.319016981331 A A 10 0.508761382413951 1.57163501525546e-90 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 310 0 310 152.283971451675 0 152.283971451675 A A 10 0.508761382413951 2.07869525522261e-91 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 311 0 311 152.775210069261 0 152.775210069261 G G 10 0.508761382413951 1.04273225770038e-91 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 382 1 383 187.653151917871 0.508761382413951 187.144390535457 A:T T A 10 0.508761382413951 1.51957169977565e-110 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 136944063 A/G 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136943986_136944119:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136943986_136944119:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136943986_136944119:MAP3K5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 139487836 T/C 1 8 4 12 3.92990894068839 2.0350455296558 1.89486341103259 T:C T C 10 0.508761382413951 0.388585368391447 ENSG00000112406:ENST00000367658:exon_139487421_139488461:HECA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 143074700 T/C 1 9 16 25 4.42114755827444 8.14018211862322 -3.71903456034877 T:C T C 10 0.508761382413951 0.162748026974591 ENSG00000010818:ENST00000367604:exon_143072604_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000367603:exon_143072605_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000012134:exon_143072606_143075068:HIVEP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 6 10 16 2.94743170551629 5.08761382413951 -2.14018211862322 T:C T C 10 0.508761382413951 0.324879272681718 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 143784092 A/G 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000034693:ENST00000344281:exon_143784053_143784134:PEX3;ENSG00000034693:ENST00000367592:exon_143784053_143784134:PEX3;ENSG00000034693:ENST00000367591:exon_143784053_143784134:PEX3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 143823112 G/A 1 12 20 32 5.89486341103259 10.175227648279 -4.28036423724643 A:G G A 10 0.508761382413951 0.157397557837097 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000451668:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000438118:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000367585:exon_143823082_143823259:FUCA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 143823157 T/C 1 9 10 19 4.42114755827444 5.08761382413951 -0.666466265865068 T:C T C 10 0.508761382413951 0.821210319840976 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000451668:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000438118:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000367585:exon_143823082_143823259:FUCA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 149700491 G/A 1 43 46 89 21.1232605562001 23.4030235910417 -2.27976303484164 A:G G A 10 0.508761382413951 0.672070699854267 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 149730846 G/A 1 48 28 76 23.5794536441304 14.2453187075906 9.33413493653973 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0383476433023204 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149730713_149732748:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149730713_149732749:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149730713_149732652:TAB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 149795692 G/A 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 A:G G A 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000178199:ENST00000416573:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000389942:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409806:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409948:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000462655:exon_149795375_149795749:ZC3H12D HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 44 52 96 21.6144991737862 26.4555918855255 -4.84109271173929 T:C C T 10 0.508761382413951 0.358555587010829 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 31 26 57 15.2283971451675 13.2277959427627 2.00060120240479 C:G G C 10 0.508761382413951 0.691428943009619 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 152443593 G/A 1 3 13 16 1.47371585275815 6.61389797138136 -5.14018211862322 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0114213996535228 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000460912:exon_152443195_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152443528_152443811:SYNE1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 153296370 G/A 1 82 75 157 40.281566642056 38.1571036810463 2.1244629610097 A:G G A 10 0.508761382413951 0.750080322983298 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 153323594 C/T 1 12 2 14 5.89486341103259 1.0175227648279 4.87734064620469 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0131238438594985 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000482526:exon_153323562_153323671:MTRF1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 153323806 A/G 1 12 4 16 5.89486341103259 2.0350455296558 3.85981788137678 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0775291226144439 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 153603472 C/T 0 1402 0 1402 688.716541855641 0 688.716541855641 C C 10 0.508761382413951 0 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 157405930 G/A 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 A:G G A 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000049618:ENST00000350026:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000346085:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000367148:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000275248:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000354354:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000414678:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000319584:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000452544:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000493658:exon_157405900_157406039:ARID1B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 157488298 G/A 1 13 4 17 6.38610202861864 2.0350455296558 4.35105649896283 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0496218514424198 ENSG00000049618:ENST00000350026:exon_157488174_157488319:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000346085:exon_157488174_157488319:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000367148:exon_157488174_157488319:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000275248:exon_157488174_157488319:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000354354:exon_157488174_157488319:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000414678:exon_157488174_157488319:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000319584:exon_157488174_157488319:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000478761:exon_157488174_157488319:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000400790:exon_157488174_157488319:ARID1B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 10 13 23 4.91238617586049 6.61389797138136 -1.70151179552087 A:G A G 10 0.508761382413951 0.535488052826954 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 160174456 T/G 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:G T G 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 82 116 198 40.281566642056 59.0163203600183 -18.7347537179623 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00842749479356808 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 39 34 73 19.1583060858559 17.2978870020743 1.86041908378158 T:C C T 10 0.508761382413951 0.725881289211269 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 44 48 92 21.6144991737862 24.4205463558696 -2.80604718208349 A:G G A 10 0.508761382413951 0.602627255860534 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 167352104 C/A 1 8 4 12 3.92990894068839 2.0350455296558 1.89486341103259 A:C C A 10 0.508761382413951 0.388585368391447 ENSG00000026297:ENST00000358165:exon_167352084_167352496:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000477674:exon_167351486_167352475:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000310843:exon_167352100_167352141:RNASET2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 168348981 G/A 1 3 9 12 1.47371585275815 4.57885244172556 -3.10513658896741 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0871818487647519 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000509296:exon_168348709_168349158:MLLT4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 168370548 A/C 1 17 11 28 8.35105649896283 5.59637520655346 2.75468129240937 A:C A C 10 0.508761382413951 0.347013425966047 ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168370462_168370770:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168370462_168372702:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168370462_168372702:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168370462_168372702:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168370462_168372703:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168370462_168370615:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000507704:exon_168370462_168370705:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000485634:exon_168370462_168370647:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000515794:exon_168370462_168370988:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511503:exon_168370462_168370968:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000486649:exon_168370462_168370583:MLLT4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 170162537 C/T 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 T:C C T 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170162525_170162627:C6orf70 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 170862266 G/A 1 67 46 113 32.9129873782653 23.4030235910417 9.50996378722354 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0745943806922193 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 72 83 155 35.3691804661955 42.2271947403579 -6.8580142741624 C:G G C 10 0.508761382413951 0.296419609171393 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 170866147 C/T 1 29 23 52 14.2459199099954 11.7015117955209 2.54440811447455 T:C C T 10 0.508761382413951 0.491932864353585 ENSG00000112592:ENST00000421512:exon_170865970_170866171:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170865970_170866171:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170865970_170866171:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170865967_170866171:TBP;ENSG00000112592:ENST00000423353:exon_170865967_170866171:TBP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 T:C T C 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 13 13 26 6.38610202861864 6.61389797138136 -0.227795942762725 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 810219 T/C 1 15 15 30 7.36857926379074 7.63142073620926 -0.262841472418529 A:T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 814676 G/T 1 12 10 22 5.89486341103259 5.08761382413951 0.807249586893079 T:G G T 10 0.508761382413951 0.832379092287417 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 1131356 T/C 1 16 14 30 7.85981788137678 7.12265935379531 0.737158527581471 T:C T C 10 0.508761382413951 0.856199484978377 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 1131394 G/A 1 18 15 33 8.84229511654888 7.63142073620926 1.21087438033962 A:G G A 10 0.508761382413951 0.729664048203589 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 1132153 G/A 1 9 15 24 4.42114755827444 7.63142073620926 -3.21027317793482 A:G G A 10 0.508761382413951 0.222993356359584 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 1533513 A/G 1 9 7 16 4.42114755827444 3.56132967689766 0.859817881376784 A:G A G 10 0.508761382413951 0.804101251762597 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1533390_1533547:INTS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 1542697 G/A 1 15 9 24 7.36857926379074 4.57885244172556 2.78972682206518 A:G G A 10 0.508761382413951 0.309249018183124 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 1542814 T/C 1 20 15 35 9.82477235172098 7.63142073620926 2.19335161551172 T:C T C 10 0.508761382413951 0.501876804247675 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 1607451 C/T 1 62 64 126 30.456794290335 32.5607284744929 -2.10393418415782 T:C C T 10 0.508761382413951 0.722327269529643 ENSG00000157778:ENST00000288607:exon_1606966_1607486:PSMG3;ENSG00000157778:ENST00000404674:exon_1606987_1607486:PSMG3;ENSG00000157778:ENST00000252329:exon_1607249_1607486:PSMG3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 59 42 101 28.9830784375769 21.3679780613859 7.61510037619095 T:C T C 10 0.508761382413951 0.136261841038997 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 2578181 C/T 1 27 21 48 13.2634426748233 10.683989030693 2.57945364413035 T:C C T 10 0.508761382413951 0.474155549743457 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 21 19 40 10.316010969307 9.66646626586507 0.649544703441961 T:C T C 10 0.508761382413951 0.875396965359485 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 2578246 C/T 1 15 17 32 7.36857926379074 8.64894350103717 -1.28036423724643 T:C C T 10 0.508761382413951 0.72498863519702 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 2578371 G/A 1 27 22 49 13.2634426748233 11.1927504131069 2.0706922617164 A:G G A 10 0.508761382413951 0.571090613494304 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 2582907 C/T 1 10 4 14 4.91238617586049 2.0350455296558 2.87734064620469 T:C C T 10 0.508761382413951 0.180503112624562 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2582838_2582957:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2582838_2582957:C7orf27 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 2951824 A/G 1 34 42 76 16.7021129979257 21.3679780613859 -4.66586506346027 A:G A G 10 0.508761382413951 0.303166079584911 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2951806_2951930:CARD11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 28 19 47 13.7546812924094 9.66646626586507 4.0882150265443 T:C T C 10 0.508761382413951 0.246361755683395 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 2959172 G/A 1 45 24 69 22.1057377913722 12.2102731779348 9.89546461343738 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0215034991040906 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2959006_2959246:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2959006_2959246:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2959114_2959246:CARD11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 2962293 C/G 1 50 22 72 24.5619308793025 11.1927504131069 13.3691804661955 C:G C G 10 0.508761382413951 0.00196997834877490 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2962268_2962394:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2962268_2962674:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2962268_2962394:CARD11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 2969680 G/A 1 23 17 40 11.2984882044791 8.64894350103717 2.64954470344196 A:G G A 10 0.508761382413951 0.432433564598113 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2969626_2969708:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2969626_2969694:CARD11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 2976767 G/A 1 23 13 36 11.2984882044791 6.61389797138136 4.68459023309777 A:G G A 10 0.508761382413951 0.134634213050837 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2976671_2976868:CARD11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 4780514 G/T 1 7 1 8 3.43867032310234 0.508761382413951 2.92990894068839 T:G G T 10 0.508761382413951 0.070648384509694 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000460979:exon_4780490_4780654:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4780469_4780619:KIAA0415 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 5347749 G/A 1 15 23 38 7.36857926379074 11.7015117955209 -4.33293253173014 A:G G A 10 0.508761382413951 0.194274954755678 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 12 23 35 5.89486341103259 11.7015117955209 -5.80664838448828 C:G G C 10 0.508761382413951 0.061955004568678 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 5427517 G/A 1 8 7 15 3.92990894068839 3.56132967689766 0.368579263790735 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5427303_5427660:TNRC18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 5540769 A/C 1 4 8 12 1.9649544703442 4.07009105931161 -2.10513658896741 A:C A C 10 0.508761382413951 0.259199063292902 ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000458142:exon_5540119_5541550:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 5541657 G/A 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 5568366 A/G 1 61 88 149 29.965555672749 44.7710016524277 -14.8054459796787 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0172626151418810 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 49 40 89 24.0706922617164 20.350455296558 3.72023696515836 A:G G A 10 0.508761382413951 0.459042471050891 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 6026988 G/A 1 16 23 39 7.85981788137678 11.7015117955209 -3.84169391414409 A:G G A 10 0.508761382413951 0.262598459251714 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 6063283 C/T 1 133 102 235 65.3347361389445 51.893661006223 13.4410751327215 T:C C T 10 0.508761382413951 0.089621978530148 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6062934_6063465:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6062934_6063326:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6062934_6063378:AIMP2;ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6061881_6064432:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000422786:exon_6062807_6063377:EIF2AK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 28 26 54 13.7546812924094 13.2277959427627 0.526885349646648 T:C T C 10 0.508761382413951 0.892815570792296 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 6193464 T/G 1 3 9 12 1.47371585275815 4.57885244172556 -3.10513658896741 T:G T G 10 0.508761382413951 0.0871818487647519 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193387_6193513:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 6193521 G/C 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193518_6193612:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 6194274 T/C 1 18 17 35 8.84229511654888 8.64894350103717 0.193351615511716 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 6370077 C/T 1 27 16 43 13.2634426748233 8.14018211862322 5.12326055620011 T:C C T 10 0.508761382413951 0.128787265314107 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 6370575 C/T 1 14 18 32 6.87734064620469 9.15770488345112 -2.28036423724643 T:C C T 10 0.508761382413951 0.481273059851305 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000524898:exon_6370426_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000530143:exon_6370459_6370866:C7orf70 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 8008970 C/G 1 18 14 32 8.84229511654888 7.12265935379531 1.71963576275357 C:G C G 10 0.508761382413951 0.598431040951595 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8008423_8009438:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8008425_8009438:GLCCI1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 18705964 C/T 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000048052:ENST00000417496:exon_18705836_18706546:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000461159:exon_18705836_18706099:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000405010:exon_18705836_18708466:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000406451:exon_18705836_18706099:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000428307:exon_18705836_18706728:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000406072:exon_18705836_18708466:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000401921:exon_18705836_18706099:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000523867:exon_18705836_18706099:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000432645:exon_18705836_18706099:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000441542:exon_18705836_18706099:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000262069:exon_18705836_18706099:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000456174:exon_18705836_18706523:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000524023:exon_18705836_18706602:HDAC9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 20198440 G/A 1 15 17 32 7.36857926379074 8.64894350103717 -1.28036423724643 A:G G A 10 0.508761382413951 0.72498863519702 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 21469504 C/G 1 4 8 12 1.9649544703442 4.07009105931161 -2.10513658896741 C:G C G 10 0.508761382413951 0.259199063292902 ENSG00000105866:ENST00000222584:exon_21468907_21470461:SP4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 23015831 T/C 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 T:C T C 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000122591:ENST00000432176:exon_23015829_23015924:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000440481:exon_23015829_23015924:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000242158:exon_23015829_23015924:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000409923:exon_23015829_23015924:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000457703:exon_23015829_23015924:FAM126A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 23235483 A/G 1 16 15 31 7.85981788137678 7.63142073620926 0.22839714516752 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000487595:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000486136:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23234022_23235534:NUPL2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 23239133 C/T 1 46 31 77 22.5969764089583 15.7716028548325 6.82537355412578 T:C C T 10 0.508761382413951 0.138229548742746 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000489145:exon_23239043_23239161:NUPL2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 25181912 T/C 1 2 6 8 0.982477235172098 3.05256829448371 -2.07009105931161 T:C T C 10 0.508761382413951 0.172493759593104 ENSG00000153790:ENST00000409280:exon_25181860_25181951:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000283905:exon_25181860_25181951:C7orf31 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 26224612 G/C 1 36 29 65 17.6845902330978 14.7540800900046 2.93051014309319 C:G G C 10 0.508761382413951 0.535488301432224 ENSG00000050344:ENST00000056233:exon_26224153_26226745:NFE2L3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 35709842 C/T 1 10 9 19 4.91238617586049 4.57885244172556 0.333533734134932 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000122557:ENST00000396081:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000311350:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000413517:exon_35709825_35709938:HERPUD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 36438709 C/G 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 C:G C G 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36438688_36439002:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36438688_36439002:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000424865:exon_36438688_36439002:ANLN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 36492212 C/T 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36492086_36493400:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36492086_36493400:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000491782:exon_36492086_36493264:ANLN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 265 217 482 130.178233660303 110.401219983827 19.7770136764756 A:G G A 10 0.508761382413951 0.075572827055106 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 45005795 G/A 1 109 110 219 53.5450093168793 55.9637520655346 -2.41874274865526 A:G G A 10 0.508761382413951 0.786985194276355 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45005672_45006437:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45005672_45005879:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45005672_45006437:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45005672_45005879:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45005672_45005879:MYO1G HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 45008963 C/T 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45008519_45009082:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45008122_45009082:MYO1G HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 141 89 230 69.2646450796329 45.2797630348416 23.9848820447913 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00152859746996196 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 45009723 G/A 1 212 176 388 104.142586928242 89.5420033048554 14.600583623387 A:G G A 10 0.508761382413951 0.141123168854572 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009639_45009753:MYO1G HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 45015107 G/A 1 104 82 186 51.0888162289491 41.718433357944 9.37038287100512 A:G G A 10 0.508761382413951 0.186764346058405 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45015075_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000435656:exon_45015083_45015248:MYO1G HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 45016621 C/T 1 64 65 129 31.4392715255071 33.0694898569068 -1.63021833139967 T:C C T 10 0.508761382413951 0.792177234856845 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000435656:exon_45016462_45016670:MYO1G HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 45113121 G/A 1 18 16 34 8.84229511654888 8.14018211862322 0.702112997925667 A:G G A 10 0.508761382413951 0.864873527062112 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000470837:exon_45113059_45113161:CCM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 45148857 G/C 1 131 124 255 64.3522589037724 63.0864114193299 1.2658474844425 T:C:G G C 10 0.508761382413951 0.90039227413119 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45148822_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 48004962 C/T 1 8 4 12 3.92990894068839 2.0350455296558 1.89486341103259 T:C C T 10 0.508761382413951 0.388585368391447 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48003783_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48002885_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48004897_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48004763_48005035:HUS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 48017965 C/T 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 T:C C T 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000136273:ENST00000468868:exon_48017857_48018190:HUS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 50467767 C/A 1 24 18 42 11.7897268220652 9.15770488345112 2.63202193861406 A:C C A 10 0.508761382413951 0.443754980806542 ENSG00000185811:ENST00000331340:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000359197:exon_50467616_50470223:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000343574:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000346667:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000349824:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000357364:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000438033:exon_50467616_50468574:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000439701:exon_50467616_50470264:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000471793:exon_50467616_50468325:IKZF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 55468867 G/A 1 14 10 24 6.87734064620469 5.08761382413951 1.78972682206518 A:G G A 10 0.508761382413951 0.542761494383684 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55468867_55469013:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55468867_55469013:LANCL2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 63981563 A/G 1 13 11 24 6.38610202861864 5.59637520655346 0.789726822065177 A:T:G A G 10 0.508761382413951 0.839412619839394 ENSG00000173041:ENST00000309683:exon_63980262_63982878:ZNF680 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 64168806 T/C 1 12 13 25 5.89486341103259 6.61389797138136 -0.719034560348774 A:T:C T C 10 0.508761382413951 0.84288335090626 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 64291976 G/A 1 1 11 12 0.491238617586049 5.59637520655346 -5.10513658896741 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00295241573596456 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 64291987 G/A 1 13 4 17 6.38610202861864 2.0350455296558 4.35105649896283 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0496218514424198 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 65220603 G/T 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 T:G G T 10 0.508761382413951 0.219001271230579 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 75609677 A/G 1 11 11 22 5.40362479344654 5.59637520655346 -0.192750413106921 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75609657_75609711:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75609657_75610056:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75609657_75609729:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75609657_75609789:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75609657_75610040:POR;ENSG00000127948:ENST00000426184:exon_75609657_75609757:POR;ENSG00000127948:ENST00000475509:exon_75609657_75609678:POR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 75614953 T/C 1 31 25 56 15.2283971451675 12.7190345603488 2.50936258481875 T:C T C 10 0.508761382413951 0.508072573992404 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 75615006 C/T 1 24 19 43 11.7897268220652 9.66646626586507 2.12326055620011 T:C C T 10 0.508761382413951 0.545059070699706 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 13 5 18 6.38610202861864 2.54380691206975 3.84229511654888 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0971656837274008 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 75959188 G/A 1 165 148 313 81.0543719016981 75.2966845972647 5.75768730443335 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.534269198169839 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 17 19 36 8.35105649896283 9.66646626586507 -1.31540976690223 T:C C T 10 0.508761382413951 0.739808852412005 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 77256407 A/G 1 60 67 127 29.4743170551629 34.0870126217347 -4.61269556657177 A:G A G 10 0.508761382413951 0.425604044151272 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 77326110 T/C 1 22 21 43 10.8072495868931 10.683989030693 0.123260556200108 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000187257:ENST00000334955:exon_77325760_77326372:RSBN1L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 33 32 65 16.2108743803396 16.2803642372464 -0.069489856906813 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 91691601 C/T 1 4 7 11 1.9649544703442 3.56132967689766 -1.59637520655346 T:C C T 10 0.508761382413951 0.379976164789140 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 91712698 A/G 1 8 22 30 3.92990894068839 11.1927504131069 -7.26284147241853 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00966986731075329 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91712484_91713009:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91712484_91712969:AKAP9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 91713972 C/T 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 T:C C T 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 91715662 C/T 1 3 8 11 1.47371585275815 4.07009105931161 -2.59637520655346 T:C C T 10 0.508761382413951 0.139557898450825 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91715542_91715730:AKAP9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 16 16 32 7.85981788137678 8.14018211862322 -0.280364237246431 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 120 114 234 58.9486341103259 57.9987975951904 0.949836515135473 A:G A G 10 0.508761382413951 0.947889879071336 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 15 8 23 7.36857926379074 4.07009105931161 3.29848820447913 T:C T C 10 0.508761382413951 0.211653680335550 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 92027537 C/G 1 32 18 50 15.7196357627536 9.15770488345112 6.56193087930245 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0669580415989149 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 92027906 C/A 1 54 51 105 26.5268853496466 25.9468305031115 0.580054846535148 A:C C A 10 0.508761382413951 0.922576680216528 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 92166194 G/A 1 16 20 36 7.85981788137678 10.175227648279 -2.31540976690223 A:G G A 10 0.508761382413951 0.506237025660026 ENSG00000127993:ENST00000265732:exon_92166165_92166848:C7orf64;ENSG00000127993:ENST00000481551:exon_92163716_92167319:C7orf64 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 92462572 G/A 0 24 0 24 11.7897268220652 0 11.7897268220652 G G 10 0.508761382413951 1.29431575833612e-07 ENSG00000105810:ENST00000265734:exon_92462405_92463004:CDK6;ENSG00000105810:ENST00000424848:exon_92462405_92463004:CDK6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 92734451 A/G 1 22 32 54 10.8072495868931 16.2803642372464 -5.47311465035335 A:G A G 10 0.508761382413951 0.172952783231279 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 52 49 101 25.5444081144745 24.9293077382836 0.615100376190952 A:G G A 10 0.508761382413951 0.92103198728364 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 92762681 A/G 1 23 37 60 11.2984882044791 18.8241711493162 -7.52568294483706 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0536690454256835 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 92764982 C/T 1 48 41 89 23.5794536441304 20.859216678972 2.72023696515836 T:C C T 10 0.508761382413951 0.596987995569362 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 92985252 T/C 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92985203_92985390:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000443443:exon_92985203_92985498:CCDC132 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 94173803 T/C 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 T:C T C 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000127995:ENST00000297273:exon_94173723_94173842:CASD1;ENSG00000127995:ENST00000265739:exon_94173723_94173842:CASD1;ENSG00000127995:ENST00000394380:exon_94173723_94173842:CASD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 95034775 G/C 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 C:G G C 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000105854:ENST00000455123:exon_95034179_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000355659:exon_95034185_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000433091:exon_95034192_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000222572:exon_95034209_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000483292:exon_95034590_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000446142:exon_95034651_95034800:PON2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 97481771 C/T 1 286 254 540 140.49424462961 129.225391133144 11.2688534964665 T:C C T 10 0.508761382413951 0.343811068188661 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97481440_97481780:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97481443_97481780:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97481443_97481780:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97481443_97481780:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97481443_97481780:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97481458_97481780:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97481464_97481780:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97481516_97481780:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000487714:exon_97481626_97481780:ASNS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 97488569 A/T 1 56 60 116 27.5093625848187 30.5256829448371 -3.01632036001831 A:T A T 10 0.508761382413951 0.579078347562446 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000442734:exon_97488554_97488710:ASNS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 97823629 A/G 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 A:G A G 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000164715:ENST00000297293:exon_97820926_97823884:LMTK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 97847040 G/A 1 6 9 15 2.94743170551629 4.57885244172556 -1.63142073620926 A:G G A 10 0.508761382413951 0.447467080617159 ENSG00000205356:ENST00000447648:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000490842:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000463402:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000379795:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000485716:exon_97847004_97847150:TECPR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 97863145 G/A 1 8 2 10 3.92990894068839 1.0175227648279 2.91238617586049 A:G G A 10 0.508761382413951 0.109914731512069 ENSG00000205356:ENST00000447648:exon_97862733_97863223:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000490842:exon_97862139_97863154:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000379795:exon_97862733_97863223:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000471397:exon_97862739_97863223:TECPR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 T:C C T 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 98552879 C/T 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000196367:ENST00000359863:exon_98552721_98552927:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000355540:exon_98552721_98552927:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000446306:exon_98552721_98552927:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000456197:exon_98552721_98552927:TRRAP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 98992071 C/T 0 0 18 18 0 9.15770488345112 -9.15770488345112 T C T 10 0.508761382413951 2.77501292045420e-06 ENSG00000130429:ENST00000491294:exon_98991652_98992420:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000463078:exon_98991966_98992424:ARPC1B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 99032458 C/T 1 8 7 15 3.92990894068839 3.56132967689766 0.368579263790735 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000485746:exon_99032413_99032642:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430982:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430029:exon_99032433_99032891:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99032413_99032891:RP5-900K19.1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 99047978 T/C 1 9 10 19 4.42114755827444 5.08761382413951 -0.666466265865068 T:C T C 10 0.508761382413951 0.821210319840976 ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99047948_99047994:CPSF4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 99081730 A/G 1 4 8 12 1.9649544703442 4.07009105931161 -2.10513658896741 A:G A G 10 0.508761382413951 0.259199063292902 ENSG00000198556:ENST00000331410:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481472:exon_99081653_99081769:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000448667:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000447047:exon_99081653_99081787:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481108:exon_99081278_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000494186:exon_99081653_99081766:ZNF789 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 99217424 G/A 1 4 9 13 1.9649544703442 4.57885244172556 -2.61389797138136 A:G G A 10 0.508761382413951 0.172726937801510 ENSG00000197037:ENST00000481424:exon_99217184_99219197:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394152:exon_99217184_99217616:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394150:exon_99217184_99217620:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000431485:exon_99217184_99217439:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000334715:exon_99217173_99217616:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000262941:exon_99217173_99217616:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394151:exon_99217230_99217620:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000466948:exon_99217288_99217616:ZNF498 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 99227172 A/G 1 4 12 16 1.9649544703442 6.10513658896741 -4.14018211862322 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0456569950629327 ENSG00000197037:ENST00000481424:exon_99226814_99230022:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394152:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394150:exon_99226814_99228527:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000334715:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000262941:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394151:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000485586:exon_99226814_99229994:ZNF498 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 102110065 C/A 1 33 24 57 16.2108743803396 12.2102731779348 4.00060120240479 A:C C A 10 0.508761382413951 0.353878090747161 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102110021_102110093:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110021_102110093:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102110021_102110093:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102110036_102110093:LRWD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 102952123 G/T 1 130 147 277 63.8610202861864 74.7879232148508 -10.9269029286644 T:G G T 10 0.508761382413951 0.206897543561568 ENSG00000105819:ENST00000249269:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000428154:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000420236:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000444457:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000453466:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000469560:exon_102951025_102952343:PMPCB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 116528240 C/T 1 22 20 42 10.8072495868931 10.175227648279 0.632021938614059 T:C C T 10 0.508761382413951 0.878401052374126 ENSG00000198898:ENST00000464223:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000484325:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000449080:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000490693:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000461878:exon_116528181_116528753:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000417431:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000464669:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116528181_116528244:CAPZA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 116557939 C/T 1 106 104 210 52.0712934641212 52.9111837710509 -0.839890306929703 T:C C T 10 0.508761382413951 0.945009726252792 ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116557781_116559315:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116557781_116558242:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116557781_116559312:CAPZA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 117825681 A/G 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 A:G A G 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 14 22 36 6.87734064620469 11.1927504131069 -4.31540976690223 A:G G A 10 0.508761382413951 0.182386388153018 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 127224286 A/G 1 8 10 18 3.92990894068839 5.08761382413951 -1.15770488345112 A:G A G 10 0.508761382413951 0.642640691319775 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127224205_127225661:GCC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 127225253 T/C 1 11 5 16 5.40362479344654 2.54380691206975 2.85981788137678 T:C T C 10 0.508761382413951 0.211238572184989 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127224205_127225661:GCC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 127721507 T/C 1 62 68 130 30.456794290335 34.5957740041487 -4.13897971381363 T:C T C 10 0.508761382413951 0.4838166298967 ENSG00000197157:ENST00000438400:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000354725:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000486037:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000470463:exon_127721412_127721553:SND1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 128038555 C/G 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 C:G C G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000106348:ENST00000469328:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000484496:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000419067:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000338791:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000496200:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000354269:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000348127:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000378717:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000416064:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000343214:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000470772:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000480861:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000497868:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000468842:exon_128038544_128038667:IMPDH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 129297332 T/G 1 10 6 16 4.91238617586049 3.05256829448371 1.85981788137678 T:G T G 10 0.508761382413951 0.455622877460238 ENSG00000106459:ENST00000353868:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393232:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393231:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000454688:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000223190:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000311967:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393230:exon_129297183_129297414:NRF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 134849213 G/A 1 29 31 60 14.2459199099954 15.7716028548325 -1.52568294483706 A:G G A 10 0.508761382413951 0.700884845111227 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 134849577 A/C 1 31 25 56 15.2283971451675 12.7190345603488 2.50936258481875 A:C A C 10 0.508761382413951 0.508072573992404 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 15 17 32 7.36857926379074 8.64894350103717 -1.28036423724643 A:G G A 10 0.508761382413951 0.72498863519702 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 8 16 24 3.92990894068839 8.14018211862322 -4.21027317793482 A:G G A 10 0.508761382413951 0.102846973921686 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 138740037 G/C 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138739951_138740041:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138739951_138740041:ZC3HAV1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 139415943 G/A 1 30 34 64 14.7371585275815 17.2978870020743 -2.56072847449286 A:G G A 10 0.508761382413951 0.534608789192952 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 30 38 68 14.7371585275815 19.3329325317301 -4.59577400414867 A:G G A 10 0.508761382413951 0.277156529949188 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 21 24 45 10.316010969307 12.2102731779348 -1.89426220862779 T:C C T 10 0.508761382413951 0.655302540475603 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 5 14 19 2.45619308793025 7.12265935379531 -4.66646626586507 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0384390649292403 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 141364712 G/A 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 A:G G A 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000127359:ENST00000297761:exon_141364704_141364854:KIAA1147;ENSG00000127359:ENST00000482493:exon_141364704_141364854:KIAA1147 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 1 76 74 150 37.3341349365397 37.6483422986324 -0.314207362092645 A:G G A 10 0.508761382413951 1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 103 101 204 50.5975776113631 51.384899623809 -0.787322012445998 A:T:C T C 10 0.508761382413951 0.944219380469737 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 143884103 G/A 1 32 21 53 15.7196357627536 10.683989030693 5.0356467320606 A:G G A 10 0.508761382413951 0.172441786235126 ENSG00000213214:ENST00000378115:exon_143883176_143885488:ARHGEF35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 148506396 A/C 1 4 12 16 1.9649544703442 6.10513658896741 -4.14018211862322 A:C A C 10 0.508761382413951 0.0456569950629327 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 148516766 T/C 1 23 29 52 11.2984882044791 14.7540800900046 -3.45559188552545 T:C T C 10 0.508761382413951 0.405584785648138 ENSG00000106462:ENST00000492143:exon_148516688_148516779:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000478654:exon_148516688_148516779:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000320356:exon_148516688_148516779:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000460911:exon_148516688_148516779:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000350995:exon_148516688_148516779:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000476773:exon_148516688_148516779:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000483967:exon_148516688_148516779:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000498186:exon_148516688_148516779:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000483012:exon_148516688_148516779:EZH2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 149152906 G/A 1 16 18 34 7.85981788137678 9.15770488345112 -1.29788700207433 A:G G A 10 0.508761382413951 0.732701821127198 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150094851 A/G 1 10 20 30 4.91238617586049 10.175227648279 -5.26284147241853 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0670955551618526 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150094853 G/A 1 20 10 30 9.82477235172098 5.08761382413951 4.73715852758147 A:G G A 10 0.508761382413951 0.100283488182554 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150217248 A/G 1 29 19 48 14.2459199099954 9.66646626586507 4.57945364413035 A:G A G 10 0.508761382413951 0.196693881052995 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150217309 C/T 1 38 19 57 18.6670674682699 9.66646626586507 9.00060120240479 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0172801328915384 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150325175 C/T 1 15 11 26 7.36857926379074 5.59637520655346 1.77220405723727 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.558785240284514 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150389593 T/C 1 37 64 101 18.1758288506838 32.5607284744929 -14.384899623809 T:C T C 10 0.508761382413951 0.00508550567273023 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150389856 A/G 1 54 77 131 26.5268853496466 39.1746264458742 -12.6477410962276 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0288456954321976 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150418045 G/A 1 3 8 11 1.47371585275815 4.07009105931161 -2.59637520655346 A:G G A 10 0.508761382413951 0.139557898450825 ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 24 20 44 11.7897268220652 10.175227648279 1.61449917378616 T:C C T 10 0.508761382413951 0.653794186675572 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 39 26 65 19.1583060858559 13.2277959427627 5.93051014309319 T:C C T 10 0.508761382413951 0.171982531170906 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150761697 G/T 1 14 13 27 6.87734064620469 6.61389797138136 0.263442674823324 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761613_150761831:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761613_150761778:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761613_150761847:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761613_150761854:SLC4A2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150761698 C/T 1 14 13 27 6.87734064620469 6.61389797138136 0.263442674823324 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761613_150761831:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761613_150761778:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761613_150761847:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761613_150761854:SLC4A2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 41 43 84 20.140783321028 21.8767394437999 -1.73595612277188 A:G G A 10 0.508761382413951 0.743987511372304 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 62 43 105 30.456794290335 21.8767394437999 8.58005484653515 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0977239509572002 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 74 69 143 36.3516577013676 35.1045353865626 1.24712231480501 C:G C G 10 0.508761382413951 0.867354912186696 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 150935407 C/T 1 41 45 86 20.140783321028 22.8942622086278 -2.75347888759978 T:C C T 10 0.508761382413951 0.590466966556734 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 151064064 C/T 1 22 13 35 10.8072495868931 6.61389797138136 4.19335161551172 T:C C T 10 0.508761382413951 0.177785064839699 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000480907:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000497987:exon_151064025_151064211:NUB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 151074296 A/G 1 38 28 66 18.6670674682699 14.2453187075906 4.42174876067924 A:G A G 10 0.508761382413951 0.324815055475985 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000460712:exon_151074133_151074367:NUB1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 151873853 C/T 1 9 16 25 4.42114755827444 8.14018211862322 -3.71903456034877 T:C C T 10 0.508761382413951 0.162748026974591 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151873276_151875053:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151873276_151875095:MLL3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 156469096 C/T 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 T:C C T 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000105982:ENST00000311822:exon_156468989_156469824:RNF32 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 156469179 C/T 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 T:C C T 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000105982:ENST00000317955:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000405335:exon_156469113_156469789:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000311822:exon_156468989_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392747:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000343665:exon_156469113_156469818:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392743:exon_156469113_156469818:RNF32 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 156469190 A/G 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 A:G A G 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000105982:ENST00000317955:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000405335:exon_156469113_156469789:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000311822:exon_156468989_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392747:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000343665:exon_156469113_156469818:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392743:exon_156469113_156469818:RNF32 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 156742749 G/A 1 20 19 39 9.82477235172098 9.66646626586507 0.158306085855912 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 156742796 A/C 1 16 18 34 7.85981788137678 9.15770488345112 -1.29788700207433 A:C A C 10 0.508761382413951 0.732701821127198 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 156742965 G/C 1 16 24 40 7.85981788137678 12.2102731779348 -4.35045529655804 C:G G C 10 0.508761382413951 0.205766923687008 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 156761818 G/A 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 A:G G A 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 10 15 25 4.91238617586049 7.63142073620926 -2.71903456034877 C:G G C 10 0.508761382413951 0.32021815508557 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 10 17 27 4.91238617586049 8.64894350103717 -3.73655732517668 A:G G A 10 0.508761382413951 0.178990411250083 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 156979662 C/T 1 11 17 28 5.40362479344654 8.64894350103717 -3.24531870759063 T:C C T 10 0.508761382413951 0.258527448393057 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_156979528_156979715:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_156979528_156979715:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000389103:exon_156979528_156979715:UBE3C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 33 35 68 16.2108743803396 17.8066483844883 -1.59577400414867 T:C T C 10 0.508761382413951 0.717495976348783 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 157024038 A/G 1 13 33 46 6.38610202861864 16.7891256196604 -10.4030235910417 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00277511236914771 ENSG00000009335:ENST00000497368:exon_157023774_157024509:UBE3C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 158526880 G/A 1 44 45 89 21.6144991737862 22.8942622086278 -1.27976303484164 A:T:C:G G A 10 0.508761382413951 0.832397159534121 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158523686_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158526140_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158526302_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158526304_158526943:ESYT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 158528233 A/G 1 27 18 45 13.2634426748233 9.15770488345112 4.10573779137221 A:G A G 10 0.508761382413951 0.235922159505921 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 158534372 G/A 1 41 37 78 20.140783321028 18.8241711493162 1.31661217171182 A:G G A 10 0.508761382413951 0.821166990607552 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 158534381 G/C 1 36 39 75 17.6845902330978 19.8416939141441 -2.15710368104632 C:G G C 10 0.508761382413951 0.645393030896258 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 158536267 T/C 1 32 21 53 15.7196357627536 10.683989030693 5.0356467320606 T:C T C 10 0.508761382413951 0.172441786235126 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 158536334 G/A 1 23 17 40 11.2984882044791 8.64894350103717 2.64954470344196 A:G G A 10 0.508761382413951 0.432433564598113 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 158536345 A/G 1 23 21 44 11.2984882044791 10.683989030693 0.614499173786157 A:G A G 10 0.508761382413951 0.88120115288746 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 3 10 13 1.47371585275815 5.08761382413951 -3.61389797138136 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0535384651887407 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 1728557 C/G 1 4 9 13 1.9649544703442 4.57885244172556 -2.61389797138136 C:G C G 10 0.508761382413951 0.172726937801510 ENSG00000182372:ENST00000331222:exon_1728416_1734738:CLN8;ENSG00000182372:ENST00000519254:exon_1728416_1728938:CLN8;ENSG00000182372:ENST00000523237:exon_1728416_1728932:CLN8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 6303025 G/A 1 33 43 76 16.2108743803396 21.8767394437999 -5.66586506346027 A:G G A 10 0.508761382413951 0.2079682826091 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 11689119 G/C 1 322 274 596 158.178834862708 139.400618781423 18.7782160812852 A:C:G G C 10 0.508761382413951 0.129561835661122 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11689027_11689176:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529521:exon_11689027_11689303:FDFT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 11706581 T/G 1 8 8 16 3.92990894068839 4.07009105931161 -0.140182118623216 T:G T G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11706555_11707087:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11706570_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11706571_11706673:CTSB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 11710888 G/C 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 C:G G C 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11710838_11711023:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526645:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525315:exon_11710838_11710971:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530573:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532370:exon_11710838_11711328:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000505496:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524500:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531502:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527215:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532656:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534382:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000528965:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524654:exon_11710867_11710988:CTSB HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 17796382 A/G 1 23 21 44 11.2984882044791 10.683989030693 0.614499173786157 A:G A G 10 0.508761382413951 0.88120115288746 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 17796383 C/T 1 23 20 43 11.2984882044791 10.175227648279 1.12326055620011 T:C C T 10 0.508761382413951 0.762329329640337 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 17814915 A/G 1 28 20 48 13.7546812924094 10.175227648279 3.57945364413035 A:G A G 10 0.508761382413951 0.315896780165955 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17814773_17814930:PCM1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 67 51 118 32.9129873782653 25.9468305031115 6.96615687515379 T:C T C 10 0.508761382413951 0.231205108001193 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 33 18 51 16.2108743803396 9.15770488345112 7.0531694968885 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0506337053493543 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 19677915 G/A 1 6 5 11 2.94743170551629 2.54380691206975 0.403624793446539 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000104613:ENST00000397977:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000522114:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000523869:exon_19677890_19678029:INTS10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 21766881 A/C 1 44 19 63 21.6144991737862 9.66646626586507 11.9480329079211 A:C A C 10 0.508761382413951 0.00341312281770133 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 21837672 T/C 1 2 9 11 0.982477235172098 4.57885244172556 -3.59637520655346 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0355658246260987 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21837595_21837714:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21837595_21837714:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21837595_21837714:XPO7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 22107986 A/G 1 33 29 62 16.2108743803396 14.7540800900046 1.45679429033504 A:G A G 10 0.508761382413951 0.799734602454058 ENSG00000168495:ENST00000306433:exon_22107909_22108680:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000397802:exon_22107909_22109485:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000518039:exon_22107909_22108409:POLR3D HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 22262321 T/C 1 10 5 15 4.91238617586049 2.54380691206975 2.36857926379074 T:C T C 10 0.508761382413951 0.302882686663208 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520644:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000524285:exon_22262209_22262490:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520832:exon_22262209_22262383:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000519960:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000522881:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517552:exon_22262030_22262493:SLC39A14 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 22273687 T/C 1 21 15 36 10.316010969307 7.63142073620926 2.68459023309777 T:C T C 10 0.508761382413951 0.407639238387941 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517370:exon_22273586_22273782:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000518348:exon_22273586_22273793:SLC39A14 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 22463623 C/T 1 15 24 39 7.36857926379074 12.2102731779348 -4.84169391414409 T:C C T 10 0.508761382413951 0.149059642604040 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523801:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521301:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521837:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523349:exon_22463598_22463689:KIAA1967 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 22471824 G/A 1 37 41 78 18.1758288506838 20.859216678972 -2.68338782828818 A:G G A 10 0.508761382413951 0.572460277259196 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000522599:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521020:exon_22471398_22471827:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 22481449 A/G 1 28 30 58 13.7546812924094 15.2628414724185 -1.50816018000916 A:G A G 10 0.508761382413951 0.696269078337955 ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520489:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000399977:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519863:exon_22481428_22481562:BIN3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 22526559 G/A 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22526557_22526633:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22526557_22526626:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22526557_22526592:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000522687:exon_22526557_22526638:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520292:exon_22526557_22526635:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000518366:exon_22526557_22526604:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000522268:exon_22526557_22526661:BIN3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 56 53 109 27.5093625848187 26.9643532679394 0.545009316879344 C:G G C 10 0.508761382413951 0.924037563667903 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 22900701 G/A 1 24 24 48 11.7897268220652 12.2102731779348 -0.420546355869647 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519910:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519028:exon_22900417_22900756:TNFRSF10B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 23104195 G/T 1 7 13 20 3.43867032310234 6.61389797138136 -3.17522764827902 T:G G T 10 0.508761382413951 0.182776485911971 ENSG00000147457:ENST00000397677:exon_23103769_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000313219:exon_23103604_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519414:exon_23104150_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000517325:exon_23104155_23104337:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000442460:exon_23104157_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519984:exon_23104172_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519529:exon_23104172_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519503:exon_23104179_23104507:CHMP7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 25287397 T/C 1 12 12 24 5.89486341103259 6.10513658896741 -0.210273177934823 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000104756:ENST00000221200:exon_25285366_25287489:KCTD9;ENSG00000104756:ENST00000519665:exon_25286778_25287489:KCTD9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 25364834 A/T 1 28 47 75 13.7546812924094 23.9117849734557 -10.1571036810463 A:T A T 10 0.508761382413951 0.0206992932955433 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 25364960 A/G 1 42 42 84 20.6320219386141 21.3679780613859 -0.735956122771881 A:G A G 10 0.508761382413951 0.913322003711902 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 25365278 G/A 1 14 16 30 6.87734064620469 8.14018211862322 -1.26284147241853 A:G G A 10 0.508761382413951 0.71657764528998 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 26221331 T/C 1 9 14 23 4.42114755827444 7.12265935379531 -2.70151179552087 T:C T C 10 0.508761382413951 0.300583067488647 ENSG00000221914:ENST00000380737:exon_26221237_26221406:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000524169:exon_26221237_26221406:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000315985:exon_26221237_26221406:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000518215:exon_26221237_26221406:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000518890:exon_26221237_26221406:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000517754:exon_26220200_26221406:PPP2R2A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 26240646 A/G 1 9 17 26 4.42114755827444 8.64894350103717 -4.22779594276273 A:G A G 10 0.508761382413951 0.116984532347771 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 27880826 C/T 1 5 3 8 2.45619308793025 1.52628414724185 0.929908940688392 T:C C T 10 0.508761382413951 0.726898178327146 ENSG00000189233:ENST00000413272:exon_27879481_27880979:C8orf80 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 28 31 59 13.7546812924094 15.7716028548325 -2.01692156242311 T:C:G G C 10 0.508761382413951 0.605606705543115 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 28304769 C/T 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 T:C C T 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000380254:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000346498:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000518734:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000520481:exon_28304480_28304790:FBXO16 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 28384712 A/G 1 18 30 48 8.84229511654888 15.2628414724185 -6.42054635586965 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0822206428799055 ENSG00000104290:ENST00000240093:exon_28384664_28385681:FZD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 64 58 122 31.4392715255071 29.5081601800092 1.93111134549798 A:G A G 10 0.508761382413951 0.786046069268999 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 37730368 G/A 1 5 7 12 2.45619308793025 3.56132967689766 -1.10513658896741 A:G G A 10 0.508761382413951 0.574941367903584 ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37728796_37730697:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37728796_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 38095662 C/T 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000085788:ENST00000397166:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000519857:exon_38095607_38096576:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000526237:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000532222:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000520272:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000319246:exon_38095607_38095727:DDHD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 48710955 A/G 1 24 23 47 11.7897268220652 11.7015117955209 0.0882150265443045 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48710798_48710958:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48710798_48710958:AC103686.1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 63951237 C/T 1 12 7 19 5.89486341103259 3.56132967689766 2.33353373413493 T:C C T 10 0.508761382413951 0.360698601141511 ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63951219_63951730:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000517622:exon_63951219_63951268:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518966:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000523788:exon_63951219_63951361:GGH HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 66517549 T/C 1 23 30 53 11.2984882044791 15.2628414724185 -3.9643532679394 T:C T C 10 0.508761382413951 0.336305750014063 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66517498_66517572:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000528721:exon_66517498_66517572:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000458464:exon_66517498_66517572:ARMC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 32 27 59 15.7196357627536 13.7365573251767 1.98307843757689 T:C T C 10 0.508761382413951 0.696434551434237 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 67341378 G/A 1 68 45 113 33.4042259958513 22.8942622086278 10.5099637872235 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0486402836133258 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 67342077 G/A 1 68 44 112 33.4042259958513 22.3855008262138 11.0187251696375 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0379130174821932 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 67592152 T/C 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000104205:ENST00000520044:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000104205:ENST00000519289:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000213865:ENST00000521113:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000519561:exon_67591956_67593393:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000390159:exon_67591956_67593235:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000396609:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000518860:exon_67591774_67592259:C8orf44 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 68007670 A/T 1 11 6 17 5.40362479344654 3.05256829448371 2.35105649896283 A:T A T 10 0.508761382413951 0.333580569907415 ENSG00000104218:ENST00000262210:exon_68007528_68007967:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000389042:exon_68007528_68007967:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000412460:exon_68007528_68007967:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519163:exon_68007528_68007967:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519668:exon_68007528_68007967:CSPP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 68200276 T/C 1 13 16 29 6.38610202861864 8.14018211862322 -1.75408009000458 T:C T C 10 0.508761382413951 0.579672735950497 ENSG00000066777:ENST00000262215:exon_68200190_68200300:ARFGEF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 71550832 T/C 1 8 7 15 3.92990894068839 3.56132967689766 0.368579263790735 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000147592:ENST00000522447:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000276590:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000517601:exon_71550786_71550864:LACTB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 74888616 G/C 1 21 31 52 10.316010969307 15.7716028548325 -5.45559188552545 C:G G C 10 0.508761382413951 0.164861820874975 ENSG00000175606:ENST00000523794:exon_74888540_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74888430_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74888442_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74888444_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517614:exon_74888454_74888726:TMEM70 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 145 140 285 71.2295995499771 71.2265935379531 0.00300601202397388 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 82 90 172 40.281566642056 45.7885244172556 -5.50695777519957 C:G C G 10 0.508761382413951 0.402902140756579 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 75274141 T/G 1 9 3 12 4.42114755827444 1.52628414724185 2.89486341103259 T:G T G 10 0.508761382413951 0.146738110644472 ENSG00000104381:ENST00000521096:exon_75274119_75274213:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000520797:exon_75274119_75274213:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000220822:exon_75274119_75274213:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000434412:exon_75274119_75274213:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000524366:exon_75274119_75274213:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000522568:exon_75274119_75274213:GDAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 81897435 A/G 1 9 9 18 4.42114755827444 4.57885244172556 -0.157704883451117 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000076641:ENST00000220597:exon_81897011_81897612:PAG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 81905397 A/G 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000076641:ENST00000220597:exon_81905338_81905542:PAG1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 87497176 G/A 1 11 15 26 5.40362479344654 7.63142073620926 -2.22779594276273 A:G G A 10 0.508761382413951 0.435788589890287 ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 87520894 C/A 1 6 13 19 2.94743170551629 6.61389797138136 -3.66646626586507 A:C C A 10 0.508761382413951 0.109973528080042 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87520721_87520910:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87520721_87520904:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87520721_87520913:FAM82B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 21 17 38 10.316010969307 8.64894350103717 1.66706746826986 T:C T C 10 0.508761382413951 0.629122810958692 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 34 18 52 16.7021129979257 9.15770488345112 7.54440811447455 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0379699425791876 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 90995019 C/T 1 10 8 18 4.91238617586049 4.07009105931161 0.842295116548883 T:C C T 10 0.508761382413951 0.815041324056156 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000519426:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000523444:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517337:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000494804:exon_90994632_90995083:NBN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 95419698 A/G 1 10 12 22 4.91238617586049 6.10513658896741 -1.19275041310692 A:G A G 10 0.508761382413951 0.673245720296639 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95419667_95419948:RAD54B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 95531419 T/C 1 41 30 71 20.140783321028 15.2628414724185 4.87794184860948 T:C T C 10 0.508761382413951 0.28554962172931 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95531213_95531704:KIAA1429 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 95538468 T/C 1 42 31 73 20.6320219386141 15.7716028548325 4.86041908378158 T:C T C 10 0.508761382413951 0.292323574522402 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95538451_95538530:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95538451_95539591:KIAA1429 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 95541302 A/G 1 32 28 60 15.7196357627536 14.2453187075906 1.47431705516294 A:G A G 10 0.508761382413951 0.796495156798099 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95541298_95541570:KIAA1429 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 95893915 T/C 1 9 2 11 4.42114755827444 1.0175227648279 3.40362479344654 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0658750571190468 ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95892346_95893974:INTS8;ENSG00000175305:ENST00000520509:exon_95891998_95893973:CCNE2;ENSG00000175305:ENST00000308108:exon_95892455_95893973:CCNE2;ENSG00000175305:ENST00000396133:exon_95893842_95893997:CCNE2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 99152322 A/C 1 11 13 24 5.40362479344654 6.61389797138136 -1.21027317793482 A:C A C 10 0.508761382413951 0.685890504791539 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99152306_99152417:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99152306_99152417:POP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 100182333 G/C 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000132549:ENST00000355155:exon_100182267_100182391:VPS13B;ENSG00000132549:ENST00000496144:exon_100182267_100182391:VPS13B;ENSG00000132549:ENST00000357162:exon_100182267_100182391:VPS13B;ENSG00000132549:ENST00000358544:exon_100182267_100182391:VPS13B;ENSG00000132549:ENST00000395996:exon_100182267_100182391:VPS13B;ENSG00000132549:ENST00000521932:exon_100182267_100182391:VPS13B HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 103663814 G/A 1 76 52 128 37.3341349365397 26.4555918855255 10.8785430510143 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0630277392498828 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103663377_103664289:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103663377_103664289:KLF10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 107754473 G/A 1 5 10 15 2.45619308793025 5.08761382413951 -2.63142073620926 A:G G A 10 0.508761382413951 0.203076095656838 ENSG00000164830:ENST00000445937:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000452423:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000442977:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000531443:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000517566:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000435082:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000336821:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000312046:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000519415:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000449762:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000297447:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000521592:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000521864:exon_107754450_107754712:OXR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 110301998 T/C 1 34 35 69 16.7021129979257 17.8066483844883 -1.10453538656262 T:C T C 10 0.508761382413951 0.810719804637207 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 59 57 116 28.9830784375769 28.9993987975952 -0.0163203600183124 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 120790304 T/C 1 4 13 17 1.9649544703442 6.61389797138136 -4.64894350103717 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0284172183308144 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120790259_120790369:TAF2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 120847188 T/C 1 15 16 31 7.36857926379074 8.14018211862322 -0.77160285483248 T:C T C 10 0.508761382413951 0.858252211672412 ENSG00000136982:ENST00000313655:exon_120846216_120847241:DSCC1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 123964431 G/A 1 12 13 25 5.89486341103259 6.61389797138136 -0.719034560348774 A:G G A 10 0.508761382413951 0.84288335090626 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 123964953 C/T 1 14 15 29 6.87734064620469 7.63142073620926 -0.754080090004578 T:C C T 10 0.508761382413951 0.853634761322044 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 123966085 G/A 1 14 20 34 6.87734064620469 10.175227648279 -3.29788700207433 A:G G A 10 0.508761382413951 0.304473117869320 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 123966159 G/C 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 C:G G C 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 135524797 G/T 1 43 35 78 21.1232605562001 17.8066483844883 3.31661217171182 T:G G T 10 0.508761382413951 0.49749493974549 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135524718_135524844:ZFAT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 141263015 G/A 1 12 8 20 5.89486341103259 4.07009105931161 1.82477235172098 A:G G A 10 0.508761382413951 0.504771039081216 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521667:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520532:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000518839:exon_141262876_141263028:TRAPPC9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 143381810 T/C 1 2 6 8 0.982477235172098 3.05256829448371 -2.07009105931161 T:C T C 10 0.508761382413951 0.172493759593104 ENSG00000171045:ENST00000518928:exon_143381477_143382005:TSNARE1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144732450 G/A 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 A:G G A 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000183309:ENST00000526926:exon_144732068_144734546:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000458270:exon_144732068_144734546:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000532796:exon_144731830_144736872:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000328466:exon_144731954_144733759:ZNF623 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144775871 C/A 1 6 4 10 2.94743170551629 2.0350455296558 0.91238617586049 A:C C A 10 0.508761382413951 0.754283830150561 ENSG00000181135:ENST00000525185:exon_144775841_144776000:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000534303:exon_144775841_144776009:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000528456:exon_144775841_144775942:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530574:exon_144775841_144775997:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531985:exon_144775841_144775893:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527293:exon_144775841_144775926:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531811:exon_144775841_144775918:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000525862:exon_144775841_144775873:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000526315:exon_144775841_144776129:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530341:exon_144775841_144775881:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531254:exon_144775841_144776199:ZNF707 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 8 7 15 3.92990894068839 3.56132967689766 0.368579263790735 A:C A C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144808747 G/A 1 7 6 13 3.43867032310234 3.05256829448371 0.386102028618637 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000180921:ENST00000388913:exon_144806103_144810893:FAM83H;ENSG00000180921:ENST00000395103:exon_144807621_144810810:FAM83H HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 22 19 41 10.8072495868931 9.66646626586507 1.14078332102801 A:G A G 10 0.508761382413951 0.756727408558997 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144990879 G/A 1 34 44 78 16.7021129979257 22.3855008262138 -5.68338782828818 A:G G A 10 0.508761382413951 0.213756613682255 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144991176 T/C 1 52 27 79 25.5444081144745 13.7365573251767 11.8078507892979 T:C T C 10 0.508761382413951 0.00927088320502366 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144992103 T/C 1 26 12 38 12.7722040572373 6.10513658896741 6.66706746826986 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0345762311184375 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144992361 T/C 1 20 19 39 9.82477235172098 9.66646626586507 0.158306085855912 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144992862 A/G 1 27 17 44 13.2634426748233 8.64894350103717 4.61449917378616 A:G A G 10 0.508761382413951 0.177078703892883 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144993324 C/T 1 34 32 66 16.7021129979257 16.2803642372464 0.421748760679236 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144993377 A/G 1 28 23 51 13.7546812924094 11.7015117955209 2.0531694968885 A:G A G 10 0.508761382413951 0.578844625686923 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144995494 C/T 1 22 20 42 10.8072495868931 10.175227648279 0.632021938614059 T:C C T 10 0.508761382413951 0.878401052374126 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144995736 G/A 1 10 16 26 4.91238617586049 8.14018211862322 -3.22779594276273 A:G G A 10 0.508761382413951 0.241304936772191 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144996029 A/G 1 15 13 28 7.36857926379074 6.61389797138136 0.754681292409373 A:G A G 10 0.508761382413951 0.851195156405806 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144996408 T/G 1 22 16 38 10.8072495868931 8.14018211862322 2.66706746826986 T:G T G 10 0.508761382413951 0.420419027699363 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_144996100_144996563:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144997656 C/T 1 15 17 32 7.36857926379074 8.64894350103717 -1.28036423724643 T:C C T 10 0.508761382413951 0.72498863519702 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144998169 C/T 1 17 7 24 8.35105649896283 3.56132967689766 4.78972682206518 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0648841359610272 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144998190 A/G 1 18 8 26 8.84229511654888 4.07009105931161 4.77220405723727 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0766769048587819 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144999621 C/T 1 14 5 19 6.87734064620469 2.54380691206975 4.33353373413493 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0643310571506474 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 144999642 A/C 1 16 10 26 7.85981788137678 5.08761382413951 2.77220405723727 A:C A C 10 0.508761382413951 0.328881444923395 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145001031 T/C 1 11 9 20 5.40362479344654 4.57885244172556 0.824772351720981 T:C T C 10 0.508761382413951 0.824343209360058 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_145000952_145001050:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145001588 C/T 1 16 21 37 7.85981788137678 10.683989030693 -2.82417114931619 A:T:C C T 10 0.508761382413951 0.412103055806027 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145001784 A/G 1 13 15 28 6.38610202861864 7.63142073620926 -1.24531870759063 A:G A G 10 0.508761382413951 0.707356544758575 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145007187 G/A 1 11 6 17 5.40362479344654 3.05256829448371 2.35105649896283 A:G G A 10 0.508761382413951 0.333580569907415 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145006961_145007279:PLEC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145661675 G/A 1 17 10 27 8.35105649896283 5.08761382413951 3.26344267482332 A:G G A 10 0.508761382413951 0.249755100929954 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145661041_145661801:NFKBIL2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145665761 G/A 1 4 11 15 1.9649544703442 5.59637520655346 -3.63142073620926 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0723284393895949 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665734_145665812:NFKBIL2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145689915 G/A 1 17 8 25 8.35105649896283 4.07009105931161 4.28096543965123 A:G G A 10 0.508761382413951 0.109097954971197 ENSG00000187954:ENST00000438911:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000292543:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000403000:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000424149:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000306145:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000533764:exon_145689658_145689995:CYHR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145692385 C/T 1 2 10 12 0.982477235172098 5.08761382413951 -4.10513658896741 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0204165055162834 ENSG00000167702:ENST00000301332:exon_145692342_145692493:KIFC2;ENSG00000167702:ENST00000301331:exon_145692342_145692493:KIFC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145693720 A/G 1 10 13 23 4.91238617586049 6.61389797138136 -1.70151179552087 A:G A G 10 0.508761382413951 0.535488052826954 ENSG00000167702:ENST00000301332:exon_145693712_145693789:KIFC2;ENSG00000167702:ENST00000301331:exon_145693712_145693789:KIFC2;ENSG00000167702:ENST00000529644:exon_145693712_145693822:KIFC2;ENSG00000167702:ENST00000533114:exon_145693242_145693809:KIFC2;ENSG00000167702:ENST00000528415:exon_145693712_145693789:KIFC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145737636 A/G 1 19 16 35 9.33353373413493 8.14018211862322 1.19335161551172 A:G A G 10 0.508761382413951 0.73725408039855 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737527_145737707:RECQL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145740376 G/A 1 12 16 28 5.89486341103259 8.14018211862322 -2.24531870759063 A:T:C:G G A 10 0.508761382413951 0.452217834143186 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145740320_145740456:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145740320_145740456:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145740320_145740456:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145740320_145740456:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532846:exon_145740320_145740426:RECQL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 29 18 47 14.2459199099954 9.15770488345112 5.0882150265443 C:G C G 10 0.508761382413951 0.146752977004384 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 29 25 54 14.2459199099954 12.7190345603488 1.52688534964665 A:G G A 10 0.508761382413951 0.685975762819668 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145742514 A/G 1 5 9 14 2.45619308793025 4.57885244172556 -2.12265935379531 A:G A G 10 0.508761382413951 0.294178716907209 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534270:exon_145742217_145742574:RECQL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145742879 T/C 1 8 6 14 3.92990894068839 3.05256829448371 0.877340646204686 T:C T C 10 0.508761382413951 0.79097715531601 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145742798_145742892:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145742798_145742892:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145742798_145742892:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145742798_145742892:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145742798_145742883:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145742798_145742937:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534270:exon_145742798_145742956:RECQL4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145745182 T/C 1 9 11 20 4.42114755827444 5.59637520655346 -1.17522764827902 T:C T C 10 0.508761382413951 0.658959055107234 ENSG00000160959:ENST00000527730:exon_145745085_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000529022:exon_145744999_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000292524:exon_145744999_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000530854:exon_145745085_145745369:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000525766:exon_145744999_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000531310:exon_145744651_145745438:LRRC14 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145753442 A/G 1 73 70 143 35.8604190837816 35.6132967689766 0.247122314805011 A:G A G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000213563:ENST00000524821:exon_145753408_145753456:C8orf82;ENSG00000213563:ENST00000313465:exon_145751603_145753456:C8orf82;ENSG00000213563:ENST00000534680:exon_145753408_145753456:C8orf82;ENSG00000213563:ENST00000532827:exon_145753408_145753456:C8orf82 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 145947776 G/A 1 7 5 12 3.43867032310234 2.54380691206975 0.894863411032588 A:G G A 10 0.508761382413951 0.774829336914443 ENSG00000198169:ENST00000292562:exon_145946514_145948767:ZNF251 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 8 146067054 G/A 1 15 21 36 7.36857926379074 10.683989030693 -3.31540976690223 A:G G A 10 0.508761382413951 0.318128312893990 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530776:exon_146066740_146067121:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 421032 C/G 1 8 20 28 3.92990894068839 10.175227648279 -6.24531870759063 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0222539481115549 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000493666:exon_420949_421078:DOCK8 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 2039973 C/T 1 13 16 29 6.38610202861864 8.14018211862322 -1.75408009000458 T:C C T 10 0.508761382413951 0.579672735950497 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 2039983 A/C 1 13 16 29 6.38610202861864 8.14018211862322 -1.75408009000458 A:C A C 10 0.508761382413951 0.579672735950497 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 2073292 A/G 1 17 14 31 8.35105649896283 7.12265935379531 1.22839714516752 A:G A G 10 0.508761382413951 0.721386502145606 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2073212_2073342:SMARCA2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 2804393 A/G 1 29 25 54 14.2459199099954 12.7190345603488 1.52688534964665 A:G A G 10 0.508761382413951 0.685975762819668 ENSG00000080608:ENST00000490444:exon_2804257_2804465:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2804164_2804463:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000382032:exon_2804167_2804463:KIAA0020 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 2828742 C/A 1 40 34 74 19.649544703442 17.2978870020743 2.35165770136763 A:C C A 10 0.508761382413951 0.642406694528942 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 41 37 78 20.140783321028 18.8241711493162 1.31661217171182 C:G C G 10 0.508761382413951 0.821166990607552 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 2838470 C/T 1 62 59 121 30.456794290335 30.0169215624231 0.439872727911933 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2838426_2838517:KIAA0020 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 5774225 T/G 1 44 50 94 21.6144991737862 25.4380691206975 -3.82356994691139 T:G T G 10 0.508761382413951 0.470692337789552 ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5773958_5776552:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5773958_5774298:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5773958_5776557:KIAA1432 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 5923065 T/C 1 17 11 28 8.35105649896283 5.59637520655346 2.75468129240937 T:C T C 10 0.508761382413951 0.347013425966047 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5919008_5923309:KIAA2026;ENSG00000183354:ENST00000381461:exon_5919022_5923309:KIAA2026 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 6604637 G/C 1 31 24 55 15.2283971451675 12.2102731779348 3.0181239672327 C:G G C 10 0.508761382413951 0.42268646690346 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6604588_6604784:GLDC HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 7477141 G/C 0 203 0 203 99.721439369968 0 99.721439369968 G G 10 0.508761382413951 3.09876670380492e-60 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 21816758 G/A 1 12 6 18 5.89486341103259 3.05256829448371 2.84229511654888 A:G G A 10 0.508761382413951 0.239188352827104 ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000404796:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000460874:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21816713_21816771:MTAP HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 26892654 G/A 1 7 16 23 3.43867032310234 8.14018211862322 -4.70151179552087 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0601911044527136 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26892411_26892802:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26892411_26892801:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26892257_26892785:C9orf82 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 26978170 A/G 1 4 6 10 1.9649544703442 3.05256829448371 -1.08761382413951 A:G A G 10 0.508761382413951 0.542216324022944 ENSG00000096872:ENST00000519968:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517444:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000518614:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000429045:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517866:exon_26978126_26978261:IFT74 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 26978259 A/G 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 A:G A G 10 0.508761382413951 0.770813353200887 ENSG00000096872:ENST00000519968:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517444:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000518614:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000429045:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517866:exon_26978126_26978261:IFT74 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 33624601 C/G 0 424 0 424 208.285173856485 0 208.285173856485 C C 10 0.508761382413951 3.77141052722539e-125 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 33941759 T/C 1 11 8 19 5.40362479344654 4.07009105931161 1.33353373413493 T:C T C 10 0.508761382413951 0.648578515706695 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379225:exon_33941647_33941860:UBAP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 34017106 C/T 1 9 7 16 4.42114755827444 3.56132967689766 0.859817881376784 T:C C T 10 0.508761382413951 0.804101251762597 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000351580:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000412543:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000480885:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000459988:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000418786:exon_34017048_34017146:UBAP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 21 11 32 10.316010969307 5.59637520655346 4.71963576275357 T:C C T 10 0.508761382413951 0.111927046152469 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 35705759 G/A 1 54 51 105 26.5268853496466 25.9468305031115 0.580054846535148 A:G G A 10 0.508761382413951 0.922576680216528 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35705747_35705848:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000486788:exon_35705747_35705848:TLN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 35712003 G/A 1 37 36 73 18.1758288506838 18.3154097669022 -0.139580916218421 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35712002_35712121:TLN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 16 9 25 7.85981788137678 4.57885244172556 3.28096543965123 T:C C T 10 0.508761382413951 0.231316073459551 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 1 30 3 33 14.7371585275815 1.52628414724185 13.2108743803396 A:G G A 10 0.508761382413951 1.5555701565539e-06 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 19 12 31 9.33353373413493 6.10513658896741 3.22839714516752 T:C C T 10 0.508761382413951 0.283338682080454 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 38395928 C/T 1 7 21 28 3.43867032310234 10.683989030693 -7.24531870759063 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00729833715218201 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 38396002 C/T 1 15 45 60 7.36857926379074 22.8942622086278 -15.5256829448371 T:C C T 10 0.508761382413951 7.5981059074265e-05 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 18 9 27 8.84229511654888 4.57885244172556 4.26344267482332 T:C C T 10 0.508761382413951 0.123621607685646 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 15 9 24 7.36857926379074 4.57885244172556 2.78972682206518 A:G G A 10 0.508761382413951 0.309249018183124 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 72897434 G/A 1 12 3 15 5.89486341103259 1.52628414724185 4.36857926379074 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0355657976378936 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72897338_72897499:SMC5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 73028142 C/A 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 A:C C A 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000119138:ENST00000377126:exon_73027775_73029540:KLF9 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 16 35 51 7.85981788137678 17.8066483844883 -9.9468305031115 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00718236427252446 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 77752510 C/T 1 16 13 29 7.85981788137678 6.61389797138136 1.24591990999542 T:C C T 10 0.508761382413951 0.712310635717891 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77752454_77752532:OSTF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 77761642 T/C 1 83 66 149 40.7728052596421 33.5782512393208 7.19455402032131 T:C T C 10 0.508761382413951 0.251870773441078 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77761599_77762181:OSTF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 79003516 C/G 1 12 6 18 5.89486341103259 3.05256829448371 2.84229511654888 C:G C G 10 0.508761382413951 0.239188352827104 ENSG00000135002:ENST00000376736:exon_79003470_79003572:AL391868.1;ENSG00000135002:ENST00000490113:exon_79003470_79003572:AL391868.1;ENSG00000135002:ENST00000483155:exon_79003470_79003572:AL391868.1;ENSG00000135002:ENST00000476087:exon_79003470_79003572:AL391868.1;ENSG00000135002:ENST00000472900:exon_79003470_79003572:AL391868.1;ENSG00000135002:ENST00000479197:exon_79002500_79003572:AL391868.1;ENSG00000250683:ENST00000257452:exon_79003470_79003572:RFK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 79117751 A/G 1 12 10 22 5.89486341103259 5.08761382413951 0.807249586893079 A:G A G 10 0.508761382413951 0.832379092287417 ENSG00000187210:ENST00000442371:exon_79117155_79122330:GCNT1;ENSG00000187210:ENST00000376730:exon_79117155_79122332:GCNT1;ENSG00000187210:ENST00000444201:exon_79117155_79122330:GCNT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 79118329 G/A 1 16 12 28 7.85981788137678 6.10513658896741 1.75468129240937 A:G G A 10 0.508761382413951 0.573255486177598 ENSG00000187210:ENST00000442371:exon_79117155_79122330:GCNT1;ENSG00000187210:ENST00000376730:exon_79117155_79122332:GCNT1;ENSG00000187210:ENST00000444201:exon_79117155_79122330:GCNT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 88 73 161 43.2289983475723 37.1395809162184 6.08941743135389 A:C C A 10 0.508761382413951 0.345278170632963 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 86284178 C/A 1 50 46 96 24.5619308793025 23.4030235910417 1.15890728826071 A:C C A 10 0.508761382413951 0.838769776864437 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86281265_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86284100_86284206:UBQLN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 90321583 C/T 1 22 32 54 10.8072495868931 16.2803642372464 -5.47311465035335 T:C C T 10 0.508761382413951 0.172952783231279 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 92006275 G/A 1 2 8 10 0.982477235172098 4.07009105931161 -3.08761382413951 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0611719145334834 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92006179_92006330:SEMA4D HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 93637015 C/T 1 14 7 21 6.87734064620469 3.56132967689766 3.31601096930703 T:C C T 10 0.508761382413951 0.190676404068772 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93636954_93637131:SYK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 93639973 G/C 1 28 12 40 13.7546812924094 6.10513658896741 7.64954470344196 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0172461182932664 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 93640009 G/A 1 34 7 41 16.7021129979257 3.56132967689766 13.140783321028 A:G G A 10 0.508761382413951 2.81355761513815e-05 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 93641175 C/T 1 18 21 39 8.84229511654888 10.683989030693 -1.84169391414409 T:C C T 10 0.508761382413951 0.631877546635296 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 93641199 T/C 1 20 23 43 9.82477235172098 11.7015117955209 -1.87673944379989 T:C T C 10 0.508761382413951 0.64798810832134 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 96212813 C/T 1 12 13 25 5.89486341103259 6.61389797138136 -0.719034560348774 T:C C T 10 0.508761382413951 0.84288335090626 ENSG00000188938:ENST00000479094:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000423591:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375412:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375409:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000523407:exon_96212757_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520403:exon_96212757_96212869:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520470:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483149:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483056:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000476484:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428152:exon_96212761_96212869:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428378:exon_96212761_96212881:FAM120AOS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 96291646 G/A 1 65 48 113 31.9305101430932 24.4205463558696 7.50996378722354 A:G G A 10 0.508761382413951 0.159646278950700 ENSG00000048828:ENST00000437660:exon_96291635_96291862:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000375389:exon_96291635_96293688:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000277165:exon_96291635_96291862:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000340893:exon_96291635_96291862:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000333936:exon_96291635_96291862:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000446420:exon_96291635_96291862:FAM120A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 97522829 G/A 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 A:G G A 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000148120:ENST00000428218:exon_97521931_97523015:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000277198:exon_97521931_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000297979:exon_97521931_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000375315:exon_97522066_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000395357:exon_97522066_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000427193:exon_97522444_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000489318:exon_97522588_97523015:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000424143:exon_97522597_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000428313:exon_97522720_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000375316:exon_97522720_97522862:C9orf3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 98638306 C/T 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000182150:ENST00000375266:exon_98637900_98638366:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000405401:exon_98637900_98638366:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000288985:exon_98637983_98638366:C9orf102 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 98775459 G/A 1 8 8 16 3.92990894068839 4.07009105931161 -0.140182118623216 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000182150:ENST00000407474:exon_98774507_98776845:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000320486:exon_98774507_98776842:C9orf102 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 100286431 C/A 1 7 3 10 3.43867032310234 1.52628414724185 1.91238617586049 A:C C A 10 0.508761382413951 0.344505314881063 ENSG00000136842:ENST00000259365:exon_100286423_100286590:TMOD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 100388197 C/T 1 3 5 8 1.47371585275815 2.54380691206975 -1.07009105931161 T:C C T 10 0.508761382413951 0.500623361388982 ENSG00000136925:ENST00000375172:exon_100387963_100388279:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000341170:exon_100387963_100388279:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000375165:exon_100387963_100388279:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000354801:exon_100387963_100388279:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000375171:exon_100387963_100388279:TSTD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 100459578 T/C 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 T:C T C 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000136936:ENST00000375128:exon_100459403_100459639:XPA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 11 17 28 5.40362479344654 8.64894350103717 -3.24531870759063 T:C C T 10 0.508761382413951 0.258527448393057 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 100675816 A/G 1 8 2 10 3.92990894068839 1.0175227648279 2.91238617586049 A:G A G 10 0.508761382413951 0.109914731512069 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375117:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000325350:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000471580:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000421165:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000455506:exon_100675534_100675840:C9orf156 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 100684719 A/C 1 12 3 15 5.89486341103259 1.52628414724185 4.36857926379074 A:C A C 10 0.508761382413951 0.0355657976378936 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100684700_100684754:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375117:exon_100684700_100684772:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000325350:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000471580:exon_100684700_100684750:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000421165:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000455506:exon_100684700_100684769:C9orf156 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 100684757 A/G 1 9 2 11 4.42114755827444 1.0175227648279 3.40362479344654 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0658750571190468 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375117:exon_100684700_100684772:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000325350:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000421165:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000455506:exon_100684700_100684769:C9orf156 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 101984093 G/C 1 19 22 41 9.33353373413493 11.1927504131069 -1.85921667897199 C:G G C 10 0.508761382413951 0.640197803860353 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101983829_101984224:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101983829_101984238:ALG2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 104297693 T/A 1 8 7 15 3.92990894068839 3.56132967689766 0.368579263790735 A:T T A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000478347:exon_104297680_104297798:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000488264:exon_104297680_104297729:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000374819:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000479306:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000481046:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000466817:exon_104297680_104297834:RNF20 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 104302625 A/G 1 18 11 29 8.84229511654888 5.59637520655346 3.24591990999542 A:G A G 10 0.508761382413951 0.267065366288356 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000478347:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000488264:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000374819:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000479306:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000466817:exon_104302485_104302652:RNF20 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 23 21 44 11.2984882044791 10.683989030693 0.614499173786157 A:G G A 10 0.508761382413951 0.88120115288746 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 108147763 T/G 1 24 12 36 11.7897268220652 6.10513658896741 5.68459023309777 T:G T G 10 0.508761382413951 0.0667224725018708 ENSG00000070214:ENST00000374723:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000470972:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374720:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374724:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000361080:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000343170:exon_108147703_108147783:SLC44A1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 111727670 C/G 1 18 18 36 8.84229511654888 9.15770488345112 -0.315409766902235 C:G C G 10 0.508761382413951 1 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111727658_111727808:CTNNAL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 111755008 C/T 1 8 3 11 3.92990894068839 1.52628414724185 2.40362479344654 T:C C T 10 0.508761382413951 0.227353863226797 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374593:exon_111754912_111755099:CTNNAL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 114125854 T/A 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 A:T T A 10 0.508761382413951 0.601558196465461 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 22 20 42 10.8072495868931 10.175227648279 0.632021938614059 T:C T C 10 0.508761382413951 0.878401052374126 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 114184259 G/C 1 7 12 19 3.43867032310234 6.10513658896741 -2.66646626586507 C:G G C 10 0.508761382413951 0.256095565288392 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114184201_114184323:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114184201_114184323:KIAA0368 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 114190337 G/A 1 13 6 19 6.38610202861864 3.05256829448371 3.33353373413493 A:G G A 10 0.508761382413951 0.168307374643700 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114190322_114190441:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114190322_114190441:KIAA0368 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 114195587 G/A 1 6 14 20 2.94743170551629 7.12265935379531 -4.17522764827902 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0740332550078218 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114195513_114195652:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114195513_114195652:KIAA0368 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 114359624 C/A 1 3 7 10 1.47371585275815 3.56132967689766 -2.08761382413951 A:C C A 10 0.508761382413951 0.219001271230579 ENSG00000106853:ENST00000309195:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374324:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000407693:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000333580:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000238248:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000422125:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374313:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374308:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000485319:exon_114359597_114359693:PTGR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 114694486 A/G 1 29 34 63 14.2459199099954 17.2978870020743 -3.05196709207891 A:G A G 10 0.508761382413951 0.452664973030388 ENSG00000148154:ENST00000374279:exon_114694450_114694639:UGCG HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 115941046 T/C 1 17 11 28 8.35105649896283 5.59637520655346 2.75468129240937 T:C T C 10 0.508761382413951 0.347013425966047 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115940910_115941081:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115940910_115941081:FKBP15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 115983540 G/A 1 10 4 14 4.91238617586049 2.0350455296558 2.87734064620469 A:G G A 10 0.508761382413951 0.180503112624562 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115983471_115983598:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115983471_115983641:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115983471_115983598:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000462889:exon_115983471_115983559:FKBP15 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 35 25 60 17.1933516155117 12.7190345603488 4.47431705516294 T:C C T 10 0.508761382413951 0.301609621418647 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 119187839 C/T 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000148219:ENST00000288520:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000341734:exon_119187507_119187905:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373986:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000361209:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000313400:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373996:exon_119187507_119188367:ASTN2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 123605126 T/C 1 14 19 33 6.87734064620469 9.66646626586507 -2.78912561966038 T:C T C 10 0.508761382413951 0.385544935151851 ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123605015_123605200:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123605015_123605190:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000435107:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000476949:exon_123605015_123605189:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000471789:exon_123605015_123605160:PSMD5 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 123671520 G/A 1 267 227 494 131.160710895475 115.488833807967 15.6718770875082 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.163144660940005 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 123860689 C/T 1 9 8 17 4.42114755827444 4.07009105931161 0.351056498962834 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123860664_123860850:CEP110 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 123917020 T/A 1 8 11 19 3.92990894068839 5.59637520655346 -1.66646626586507 A:T T A 10 0.508761382413951 0.497078070201239 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123916999_123917230:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000431571:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123916999_123917230:CEP110 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 123929770 C/T 1 20 20 40 9.82477235172098 10.175227648279 -0.350455296558039 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123929767_123929955:CEP110 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 124094800 T/C 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124094712_124095121:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373806:exon_124094712_124094940:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373805:exon_124094712_124095016:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477553:exon_124094712_124094867:GSN HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 124855211 C/T 1 4 5 9 1.9649544703442 2.54380691206975 -0.578852441725559 T:C C T 10 0.508761382413951 0.749901411398711 ENSG00000175764:ENST00000321582:exon_124854966_124855885:TTLL11;ENSG00000175764:ENST00000474723:exon_124854966_124855563:TTLL11;ENSG00000175764:ENST00000422852:exon_124854966_124855885:TTLL11;ENSG00000175764:ENST00000373776:exon_124854966_124855885:TTLL11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 125652757 G/A 1 3 6 9 1.47371585275815 3.05256829448371 -1.57885244172556 A:G G A 10 0.508761382413951 0.335736887982477 ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125652591_125652829:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000478216:exon_125652449_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000471874:exon_125652450_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125652517_125652824:RC3H2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 125673051 T/G 1 15 12 27 7.36857926379074 6.10513658896741 1.26344267482332 T:G T G 10 0.508761382413951 0.702298904497837 ENSG00000186130:ENST00000373659:exon_125670335_125674360:ZBTB6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 126520068 T/C 1 3 8 11 1.47371585275815 4.07009105931161 -2.59637520655346 T:C T C 10 0.508761382413951 0.139557898450825 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126519982_126520101:DENND1A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 127982839 C/A 1 47 38 85 23.0882150265443 19.3329325317301 3.75528249481417 A:C C A 10 0.508761382413951 0.44849925795198 ENSG00000136933:ENST00000373544:exon_127982818_127984666:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127982818_127982979:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127982818_127982979:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127982818_127982979:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127982818_127982979:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000416065:exon_127982818_127982937:RABEPK HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 3 11 14 1.47371585275815 5.59637520655346 -4.12265935379531 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0323929383164566 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 130677112 G/A 1 27 25 52 13.2634426748233 12.7190345603488 0.54440811447455 A:G G A 10 0.508761382413951 0.890759681127834 ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000361444:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000483438:exon_130676935_130677145:ST6GALNAC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 66 67 133 32.4217487606792 34.0870126217347 -1.66526386105548 C:G G C 10 0.508761382413951 0.795167938116939 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 130698845 C/T 1 52 62 114 25.5444081144745 31.543205709665 -5.99879759519041 T:C C T 10 0.508761382413951 0.262948108135477 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130698832_130698934:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130698832_130699802:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130698832_130698934:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000373110:exon_130698313_130698934:DPM2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 130707081 A/G 1 11 16 27 5.40362479344654 8.14018211862322 -2.73655732517668 A:G A G 10 0.508761382413951 0.338377400229792 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000465821:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000373084:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000300434:exon_130707056_130707177:FAM102A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 130742374 T/C 1 23 24 47 11.2984882044791 12.2102731779348 -0.911784973455696 T:C T C 10 0.508761382413951 0.884246456780131 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130742271_130742792:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000464641:exon_130742271_130742812:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000494606:exon_130742271_130742740:FAM102A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 131088076 G/A 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 A:G G A 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000167113:ENST00000300452:exon_131088058_131088160:COQ4;ENSG00000167113:ENST00000372875:exon_131088058_131088679:COQ4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 131110892 G/A 1 3 10 13 1.47371585275815 5.08761382413951 -3.61389797138136 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0535384651887407 ENSG00000167114:ENST00000300456:exon_131110824_131110982:SLC27A4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 131196695 C/T 1 8 2 10 3.92990894068839 1.0175227648279 2.91238617586049 T:C C T 10 0.508761382413951 0.109914731512069 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000463535:exon_131196689_131196886:CERCAM HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 131196704 G/A 1 7 2 9 3.43867032310234 1.0175227648279 2.42114755827444 A:G G A 10 0.508761382413951 0.180291906522768 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000463535:exon_131196689_131196886:CERCAM HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 11 15 26 5.40362479344654 7.63142073620926 -2.22779594276273 T:C C T 10 0.508761382413951 0.435788589890287 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 33 50 83 16.2108743803396 25.4380691206975 -9.22719474035793 T:C C T 10 0.508761382413951 0.0479023865012905 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 13 4 17 6.38610202861864 2.0350455296558 4.35105649896283 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0496218514424198 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 11 7 18 5.40362479344654 3.56132967689766 1.84229511654888 T:C C T 10 0.508761382413951 0.481911196747905 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 131403096 A/G 1 13 11 24 6.38610202861864 5.59637520655346 0.789726822065177 A:G A G 10 0.508761382413951 0.839412619839394 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131402970_131403218:WDR34 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 131515547 G/T 1 9 12 21 4.42114755827444 6.10513658896741 -1.68398903069297 T:G G T 10 0.508761382413951 0.517408343711901 ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131515443_131515879:ZER1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 131670952 C/T 1 12 5 17 5.89486341103259 2.54380691206975 3.35105649896283 T:C C T 10 0.508761382413951 0.144506573427302 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 62 53 115 30.456794290335 26.9643532679394 3.49244102239564 A:C A C 10 0.508761382413951 0.575954719660071 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 131771505 C/T 1 18 13 31 8.84229511654888 6.61389797138136 2.22839714516752 T:C C T 10 0.508761382413951 0.475249037707381 ENSG00000148341:ENST00000372564:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000479237:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372559:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372554:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000461811:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000417224:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000416629:exon_131771385_131771625:SH3GLB2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 131857687 C/G 1 8 1 9 3.92990894068839 0.508761382413951 3.42114755827444 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0393216639345302 ENSG00000095321:ENST00000351352:exon_131857075_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000372536:exon_131857075_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000440434:exon_131857075_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000318080:exon_131857089_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000455396:exon_131857485_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000458362:exon_131857676_131857891:CRAT HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 25 28 53 12.2809654396512 14.2453187075906 -1.9643532679394 A:G G A 10 0.508761382413951 0.680648228895746 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 132580901 C/G 1 39 48 87 19.1583060858559 24.4205463558696 -5.26224027001373 C:G C G 10 0.508761382413951 0.284128848098264 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000474192:exon_132580632_132580926:TOR1A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 132637641 G/T 1 7 7 14 3.43867032310234 3.56132967689766 -0.122659353795314 T:G G T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132637589_132637758:USP20 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 133760635 A/G 1 24 33 57 11.7897268220652 16.7891256196604 -4.99939879759521 A:G A G 10 0.508761382413951 0.188593785183929 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 133761001 A/G 1 24 25 49 11.7897268220652 12.7190345603488 -0.929307738283597 A:G A G 10 0.508761382413951 0.886596358619732 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 134074264 G/C 1 12 15 27 5.89486341103259 7.63142073620926 -1.73655732517668 A:C:G G C 10 0.508761382413951 0.566352319356245 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000453861:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000483497:exon_134072603_134074402:NUP214 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 134346315 T/C 1 6 8 14 2.94743170551629 4.07009105931161 -1.12265935379531 T:C T C 10 0.508761382413951 0.601558196465461 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134346175_134346370:BAT2L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 134350231 C/T 1 46 36 82 22.5969764089583 18.3154097669022 4.28156664205602 T:C C T 10 0.508761382413951 0.377619595805511 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000456307:exon_134349841_134350234:BAT2L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 134350323 C/G 1 26 45 71 12.7722040572373 22.8942622086278 -10.1220581513905 A:C:G C G 10 0.508761382413951 0.0174550330141107 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 134350458 C/T 1 29 30 59 14.2459199099954 15.2628414724185 -1.01692156242311 T:C C T 10 0.508761382413951 0.796321729221659 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 134351065 G/T 1 41 29 70 20.140783321028 14.7540800900046 5.38670323102343 T:G G T 10 0.508761382413951 0.231880869745622 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 134351500 C/T 1 19 16 35 9.33353373413493 8.14018211862322 1.19335161551172 T:C C T 10 0.508761382413951 0.73725408039855 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134351317_134351922:BAT2L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 134358108 A/G 1 26 15 41 12.7722040572373 7.63142073620926 5.14078332102801 A:G A G 10 0.508761382413951 0.119576956898043 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134358097_134358294:BAT2L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 134371165 C/T 1 64 60 124 31.4392715255071 30.5256829448371 0.91358858067008 T:C C T 10 0.508761382413951 0.928491526213202 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134371127_134375558:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000320547:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000465931:exon_134371127_134375584:BAT2L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 134385436 A/G 1 2 8 10 0.982477235172098 4.07009105931161 -3.08761382413951 A:G A G 10 0.508761382413951 0.0611719145334834 ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134385290_134385449:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134385290_134385449:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000448212:exon_134385290_134385449:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134385290_134385802:POMT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 134386744 T/C 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134386724_134386855:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 134386781 G/A 1 4 4 8 1.9649544703442 2.0350455296558 -0.0700910593116078 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134386724_134386855:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 134401335 C/T 1 19 11 30 9.33353373413493 5.59637520655346 3.73715852758147 T:C C T 10 0.508761382413951 0.202564131606526 ENSG00000130717:ENST00000372215:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372208:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000491309:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372211:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372210:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000484876:exon_134401316_134401546:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000494584:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000459858:exon_134401332_134401364:UCK1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135139826 T/C 1 59 38 97 28.9830784375769 19.3329325317301 9.65014590584676 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0537117585314395 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135139901 T/C 1 60 35 95 29.4743170551629 17.8066483844883 11.6676686706747 T:C T C 10 0.508761382413951 0.018058726075363 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135172412 A/G 1 14 22 36 6.87734064620469 11.1927504131069 -4.31540976690223 A:G A G 10 0.508761382413951 0.182386388153018 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135172274_135172441:SETX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135173685 T/C 1 26 37 63 12.7722040572373 18.8241711493162 -6.05196709207891 T:C T C 10 0.508761382413951 0.132296936114495 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135173467_135173699:SETX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135202829 T/C 1 66 37 103 32.4217487606792 18.8241711493162 13.5975776113631 T:C T C 10 0.508761382413951 0.00767276137340085 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135203231 C/T 1 60 64 124 29.4743170551629 32.5607284744929 -3.08641141932992 T:C C T 10 0.508761382413951 0.591118286592342 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135203409 A/C 1 31 62 93 15.2283971451675 31.543205709665 -16.3148085644974 A:C A C 10 0.508761382413951 0.000818201353774793 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135203838 G/A 1 68 43 111 33.4042259958513 21.8767394437999 11.5274865520514 A:G G A 10 0.508761382413951 0.0291850081958778 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135206460 A/G 1 21 19 40 10.316010969307 9.66646626586507 0.649544703441961 A:G A G 10 0.508761382413951 0.875396965359485 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000419901:exon_135206439_135206526:SETX HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135273607 C/G 1 7 11 18 3.43867032310234 5.59637520655346 -2.15770488345112 C:G C G 10 0.508761382413951 0.352056460206795 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135273528_135273713:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135273528_135273713:TTF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135277301 A/G 1 28 33 61 13.7546812924094 16.7891256196604 -3.03444432725101 A:G A G 10 0.508761382413951 0.445671791651679 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135277341 C/A 1 24 27 51 11.7897268220652 13.7365573251767 -1.9468305031115 A:C C A 10 0.508761382413951 0.674827429252413 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 39 31 70 19.1583060858559 15.7716028548325 3.38670323102343 A:G G A 10 0.508761382413951 0.473670452539532 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135975738 A/C 1 16 24 40 7.85981788137678 12.2102731779348 -4.35045529655804 A:C A C 10 0.508761382413951 0.205766923687008 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135975655_135975769:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135975655_135975769:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135975655_135975769:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135975655_135975769:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135975655_135975769:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135975655_135975769:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135975655_135975769:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135975655_135975932:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000477660:exon_135975358_135975769:RALGDS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135982088 A/C 1 7 9 16 3.43867032310234 4.57885244172556 -1.14018211862322 A:C A C 10 0.508761382413951 0.623757634359657 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000424572:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000460587:exon_135982032_135982135:RALGDS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 135983504 T/C 1 9 16 25 4.42114755827444 8.14018211862322 -3.71903456034877 T:C:G T C 10 0.508761382413951 0.162748026974591 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135983375_135983793:RALGDS HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 136643908 G/A 1 5 6 11 2.45619308793025 3.05256829448371 -0.596375206553461 A:G G A 10 0.508761382413951 0.770813353200887 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136643884_136644011:VAV2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 136915508 C/T 1 7 8 15 3.43867032310234 4.07009105931161 -0.631420736209265 T:C C T 10 0.508761382413951 0.800607341092145 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136915496_136915710:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136915496_136915710:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136915496_136915710:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000494743:exon_136915496_136915549:BRD3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 137734163 C/T 1 8 15 23 3.92990894068839 7.63142073620926 -3.70151179552087 T:C C T 10 0.508761382413951 0.145808138014843 ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137734003_137736686:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137734003_137734174:COL5A1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 138395624 C/T 1 154 133 287 75.6507471082516 67.6652638610555 7.98548324719607 T:C C T 10 0.508761382413951 0.375887626865179 ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138395388_138396519:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138395388_138396516:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000488610:exon_138395388_138395806:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000485333:exon_138395388_138395822:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000472852:exon_138395388_138395801:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000453385:exon_138395388_138395856:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000472946:exon_138395388_138395832:MRPS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 18 27 45 8.84229511654888 13.7365573251767 -4.89426220862779 A:G A G 10 0.508761382413951 0.179215403314933 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 1 20 11 31 9.82477235172098 5.59637520655346 4.22839714516752 T:C T C 10 0.508761382413951 0.151548626044045 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139275204 A/C 1 16 11 27 7.85981788137678 5.59637520655346 2.26344267482332 A:T:C A C 10 0.508761382413951 0.443974308913854 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139275294 G/C 1 10 4 14 4.91238617586049 2.0350455296558 2.87734064620469 C:G G C 10 0.508761382413951 0.180503112624562 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139279173 G/A 1 8 5 13 3.92990894068839 2.54380691206975 1.38610202861864 A:G G A 10 0.508761382413951 0.581825911412537 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139279172_139279266:SNAPC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139289825 A/G 1 8 14 22 3.92990894068839 7.12265935379531 -3.19275041310692 A:G A G 10 0.508761382413951 0.203509391186301 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139289750_139289875:SNAPC4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 13 7 20 6.38610202861864 3.56132967689766 2.82477235172098 A:G A G 10 0.508761382413951 0.264650309181708 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139311471 C/T 1 40 43 83 19.649544703442 21.8767394437999 -2.22719474035793 T:C C T 10 0.508761382413951 0.661366635520884 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139324737 C/A 1 15 15 30 7.36857926379074 7.63142073620926 -0.262841472418529 A:C C A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139324729_139324865:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139324729_139324865:INPP5E HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139324740 C/T 1 14 13 27 6.87734064620469 6.61389797138136 0.263442674823324 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139324729_139324865:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139324729_139324865:INPP5E HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139326304 G/A 1 3 8 11 1.47371585275815 4.07009105931161 -2.59637520655346 A:G G A 10 0.508761382413951 0.139557898450825 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139326276_139326437:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139326276_139326437:INPP5E HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139368953 G/A 1 26 14 40 12.7722040572373 7.12265935379531 5.64954470344196 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.0825442331888902 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139369062 C/T 1 41 20 61 20.140783321028 10.175227648279 9.96555567274899 T:C C T 10 0.508761382413951 0.014288141541875 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139371234 G/A 1 14 19 33 6.87734064620469 9.66646626586507 -2.78912561966038 A:G G A 10 0.508761382413951 0.385544935151851 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139371342 G/A 1 22 25 47 10.8072495868931 12.7190345603488 -1.9117849734557 A:T:G G A 10 0.508761382413951 0.662187762538901 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139371405 G/C 1 16 16 32 7.85981788137678 8.14018211862322 -0.280364237246431 C:G G C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139391338 C/T 1 19 16 35 9.33353373413493 8.14018211862322 1.19335161551172 T:C C T 10 0.508761382413951 0.73725408039855 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139391636 G/A 1 9 15 24 4.42114755827444 7.63142073620926 -3.21027317793482 A:G G A 10 0.508761382413951 0.222993356359584 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139726239 A/G 1 42 27 69 20.6320219386141 13.7365573251767 6.89546461343738 A:G A G 10 0.508761382413951 0.117000678402820 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000425121:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000466096:exon_139726173_139726822:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139726173_139726313:C9orf86 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139731969 C/T 1 48 53 101 23.5794536441304 26.9643532679394 -3.38489962380905 T:C C T 10 0.508761382413951 0.55073772990487 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139731798_139732067:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139731798_139732042:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139729623_139732114:C9orf86 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139732331 G/C 1 45 58 103 22.1057377913722 29.5081601800092 -7.40242238863695 C:G G C 10 0.508761382413951 0.167451950317227 ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139732314_139732432:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139732314_139732467:C9orf86 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139973820 C/T 1 6 10 16 2.94743170551629 5.08761382413951 -2.14018211862322 T:C C T 10 0.508761382413951 0.324879272681718 ENSG00000197355:ENST00000409858:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000360271:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 139990813 C/T 1 5 4 9 2.45619308793025 2.0350455296558 0.421147558274441 T:C C T 10 0.508761382413951 1 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_139990689_139990843:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000371587:exon_139990689_139990843:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_139990689_139990843:MAN1B1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 263 253 516 129.195756425131 128.71662975073 0.4791266744013 A:T:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 140006491 C/T 1 13 17 30 6.38610202861864 8.64894350103717 -2.26284147241853 T:C C T 10 0.508761382413951 0.467323702180597 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 140008934 A/G 1 25 35 60 12.2809654396512 17.8066483844883 -5.52568294483706 A:G A G 10 0.508761382413951 0.158008127137868 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008915_140009165:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008915_140008944:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008915_140009170:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008915_140009178:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 140100224 A/G 1 6 7 13 2.94743170551629 3.56132967689766 -0.613897971381363 A:G A G 10 0.508761382413951 0.787249172600548 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . 9 140115554 G/A 1 15 17 32 7.36857926379074 8.64894350103717 -1.28036423724643 A:G G A 10 0.508761382413951 0.72498863519702 ENSG00000212864:ENST00000392827:exon_140114707_140115760:RNF208;ENSG00000212864:ENST00000391553:exon_140114707_140115775:RNF208 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 200860 T/C 1 6 6 12 2.94743170551629 3.05256829448371 -0.105136588967412 T:C T C 10 0.508761382413951 1 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000445062:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000429181:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000443019:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_200401_200981:PLCXD1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 12809661 G/A 1 32 7 39 15.7196357627536 3.56132967689766 12.1583060858559 A:G G A 10 0.508761382413951 7.693086293036e-05 ENSG00000101911:ENST00000380663:exon_12809474_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000380668:exon_12809489_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000398491:exon_12809525_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000489404:exon_12809607_12809738:PRPS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 12903659 A/T 1 7 45 52 3.43867032310234 22.8942622086278 -19.4555918855255 A:T A T 10 0.508761382413951 2.80456983710385e-08 ENSG00000196664:ENST00000380659:exon_12903631_12908499:TLR7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 13681115 C/T 1 10 6 16 4.91238617586049 3.05256829448371 1.85981788137678 T:C C T 10 0.508761382413951 0.455622877460238 ENSG00000176896:ENST00000314720:exon_13680620_13682247:TCEANC;ENSG00000176896:ENST00000490617:exon_13680620_13682947:TCEANC;ENSG00000176896:ENST00000380600:exon_13680620_13683528:TCEANC;ENSG00000176896:ENST00000467590:exon_13680863_13681679:TCEANC HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 14929375 G/A 1 7 1 8 3.43867032310234 0.508761382413951 2.92990894068839 A:G G A 10 0.508761382413951 0.070648384509694 ENSG00000130150:ENST00000380492:exon_14929359_14929535:MOSPD2;ENSG00000130150:ENST00000482354:exon_14929359_14929535:MOSPD2;ENSG00000130150:ENST00000495110:exon_14929359_14929535:MOSPD2;ENSG00000130150:ENST00000460386:exon_14929359_14929535:MOSPD2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 15415583 C/T 1 8 10 18 3.92990894068839 5.08761382413951 -1.15770488345112 T:C C T 10 0.508761382413951 0.642640691319775 ENSG00000087842:ENST00000380420:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000380421:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000492432:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000484433:exon_15415571_15415653:PIR HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 15838366 C/T 1 4 9 13 1.9649544703442 4.57885244172556 -2.61389797138136 T:C C T 10 0.508761382413951 0.172726937801510 ENSG00000169249:ENST00000307771:exon_15838330_15838439:ZRSR2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 21861434 A/G 1 1 11 12 0.491238617586049 5.59637520655346 -5.10513658896741 A:G A G 10 0.508761382413951 0.00295241573596456 ENSG00000012174:ENST00000379484:exon_21861288_21861436:MBTPS2;ENSG00000012174:ENST00000465888:exon_21861288_21861436:MBTPS2;ENSG00000012174:ENST00000365779:exon_21861288_21861436:MBTPS2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 23858452 G/A 1 21 5 26 10.316010969307 2.54380691206975 7.77220405723727 A:G G A 10 0.508761382413951 0.00258909152202861 ENSG00000184831:ENST00000379226:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000476598:exon_23858430_23858522:APOO;ENSG00000184831:ENST00000439528:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000379220:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000490078:exon_23858430_23858494:APOO HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 40460040 T/C 1 59 5 64 28.9830784375769 2.54380691206975 26.4392715255071 T:C T C 10 0.508761382413951 1.32441087087275e-12 ENSG00000182220:ENST00000378438:exon_40460014_40460133:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000486558:exon_40460014_40460133:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000447485:exon_40460014_40460128:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000423649:exon_40460014_40460133:ATP6AP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 44938563 G/A 1 5 5 10 2.45619308793025 2.54380691206975 -0.0876138241395097 A:G G A 10 0.508761382413951 1 ENSG00000147050:ENST00000382899:exon_44938391_44938596:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000334516:exon_44938391_44938596:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000377967:exon_44938391_44938596:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000414389:exon_44938391_44938596:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000433797:exon_44938391_44938596:KDM6A HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 46466348 C/G 1 5 19 24 2.45619308793025 9.66646626586507 -7.21027317793482 C:G C G 10 0.508761382413951 0.0035774155183165 ENSG00000065923:ENST00000328306:exon_46464753_46466638:SLC9A7;ENSG00000065923:ENST00000464933:exon_46466343_46466638:SLC9A7 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 47062534 G/A 1 49 139 188 24.0706922617164 70.7178321555392 -46.6471398938228 A:C:G G A 10 0.508761382413951 4.72157828475576e-12 ENSG00000130985:ENST00000377351:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000335972:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000424033:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000377271:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000490869:exon_47062533_47062613:UBA1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 47085673 C/T 1 4 8 12 1.9649544703442 4.07009105931161 -2.10513658896741 T:C C T 10 0.508761382413951 0.259199063292902 ENSG00000102225:ENST00000522234:exon_47085364_47085977:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000428400:exon_47085364_47086102:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000523699:exon_47085495_47085801:CDK16 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 47444985 T/C 1 9 102 111 4.42114755827444 51.893661006223 -47.4725134479486 T:C T C 10 0.508761382413951 4.84685639422597e-22 ENSG00000102265:ENST00000218388:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377018:exon_47444335_47445482:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000456754:exon_47444604_47445422:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377017:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377013:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000445623:exon_47444741_47445066:TIMP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 48675012 G/T 1 12 2 14 5.89486341103259 1.0175227648279 4.87734064620469 T:G G T 10 0.508761382413951 0.0131238438594985 ENSG00000094631:ENST00000444343:exon_48674872_48675040:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000334136:exon_48674872_48675040:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000376619:exon_48674872_48675040:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000477528:exon_48674872_48675040:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000436813:exon_48674872_48675040:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000486227:exon_48674872_48675040:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000465457:exon_48674872_48675040:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000495515:exon_48674872_48675360:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000486665:exon_48674880_48675040:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000470942:exon_48674977_48675040:HDAC6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 48682972 A/G 1 86 12 98 42.2465211124002 6.10513658896741 36.1413845234328 A:G A G 10 0.508761382413951 1.62719965775252e-14 ENSG00000094631:ENST00000444343:exon_48682954_48683380:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000334136:exon_48682954_48683386:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000376619:exon_48682954_48683386:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000477528:exon_48682954_48683392:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000486227:exon_48682954_48683386:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000488543:exon_48682954_48683386:HDAC6;ENSG00000094631:ENST00000430858:exon_48682954_48683386:HDAC6 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 48751471 A/G 1 26 118 144 12.7722040572373 60.0338431248462 -47.2616390676089 A:G A G 10 0.508761382413951 4.04945039760308e-16 ENSG00000126768:ENST00000376582:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000466995:exon_48751183_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000396779:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000495490:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000472645:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000465150:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000490755:exon_48751380_48751508:TIMM17B HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 48847497 T/C 1 17 5 22 8.35105649896283 2.54380691206975 5.80724958689308 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0172615913671775 ENSG00000068400:ENST00000376425:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376444:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376441:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000473581:exon_48847338_48847798:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376423:exon_48847338_48847514:GRIPAP1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 53641647 T/C 1 7 1 8 3.43867032310234 0.508761382413951 2.92990894068839 T:C T C 10 0.508761382413951 0.070648384509694 ENSG00000086758:ENST00000342160:exon_53641495_53641706:HUWE1;ENSG00000086758:ENST00000262854:exon_53641495_53641706:HUWE1;ENSG00000086758:ENST00000276009:exon_53641495_53641706:HUWE1;ENSG00000086758:ENST00000375220:exon_53641495_53641706:HUWE1;ENSG00000086758:ENST00000218328:exon_53641495_53641706:HUWE1;ENSG00000086758:ENST00000396323:exon_53641495_53641706:HUWE1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 70597546 C/G 1 2 7 9 0.982477235172098 3.56132967689766 -2.57885244172556 C:G C G 10 0.508761382413951 0.103646439844753 ENSG00000147133:ENST00000373790:exon_70597453_70597671:TAF1;ENSG00000147133:ENST00000449580:exon_70597453_70597671:TAF1;ENSG00000147133:ENST00000423759:exon_70597453_70597671:TAF1;ENSG00000147133:ENST00000395779:exon_70597453_70597671:TAF1;ENSG00000147133:ENST00000276072:exon_70597453_70597671:TAF1;ENSG00000147133:ENST00000483365:exon_70597453_70597835:TAF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 71416721 C/T 1 14 2 16 6.87734064620469 1.0175227648279 5.85981788137678 T:C C T 10 0.508761382413951 0.00426766297702038 ENSG00000102309:ENST00000373662:exon_71416635_71416951:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000218432:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000423432:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000373669:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000475071:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000439980:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000496835:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000446576:exon_71416635_71417204:PIN4 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 71493691 C/T 1 1386 3616 5002 680.856723974264 1839.68115880885 -1158.82443483458 T:C:G C T 10 0.508761382413951 2.88276817401011e-243 ENSG00000198034:ENST00000316084:exon_71493651_71493822:RPS4X;ENSG00000198034:ENST00000486733:exon_71493651_71495000:RPS4X HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 73043817 T/C 1 40 232 272 19.649544703442 118.032640720037 -98.3830960165947 T:C T C 10 0.508761382413951 1.28078616329094e-35 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 73045740 A/C 1 19 85 104 9.33353373413493 43.2447175051858 -33.9111837710509 A:T:C A C 10 0.508761382413951 8.634810448452e-12 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 73045809 T/C 1 78 20 98 38.3166121717118 10.175227648279 28.1413845234328 T:C T C 10 0.508761382413951 5.9411608234294e-09 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 73053171 G/C 1 11 2 13 5.40362479344654 1.0175227648279 4.38610202861864 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0227184069815744 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 100608191 G/A 1 59 260 319 28.9830784375769 132.277959427627 -103.29488099005 A:G G A 10 0.508761382413951 6.88965116352805e-33 ENSG00000010671:ENST00000372880:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372869:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372855:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372859:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372860:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000395179:exon_100608182_100608203:BTK;ENSG00000010671:ENST00000308731:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000443591:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000470069:exon_100608031_100608339:BTK HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 112024157 G/T 1 7 1 8 3.43867032310234 0.508761382413951 2.92990894068839 T:G G T 10 0.508761382413951 0.070648384509694 ENSG00000126016:ENST00000304758:exon_112024114_112024346:AMOT;ENSG00000126016:ENST00000371959:exon_112024114_112024346:AMOT;ENSG00000126016:ENST00000371962:exon_112024114_112024346:AMOT;ENSG00000126016:ENST00000524145:exon_112024114_112024346:AMOT;ENSG00000126016:ENST00000432214:exon_112024114_112024346:AMOT;ENSG00000126016:ENST00000371958:exon_112023583_112024346:AMOT HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 117819773 A/C 1 5 24 29 2.45619308793025 12.2102731779348 -9.75408009000458 A:C A C 10 0.508761382413951 0.000268412308294247 ENSG00000147251:ENST00000276204:exon_117819651_117820126:DOCK11;ENSG00000147251:ENST00000276202:exon_117819651_117820110:DOCK11 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 118533366 G/A 0 0 13 13 0 6.61389797138136 -6.61389797138136 A G A 10 0.508761382413951 9.70068733318358e-05 ENSG00000077713:ENST00000217909:exon_118533023_118533641:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000447694:exon_118533296_118533641:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000488158:exon_118533343_118533641:SLC25A43 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 118892888 G/C 1 13 4 17 6.38610202861864 2.0350455296558 4.35105649896283 C:G G C 10 0.508761382413951 0.0496218514424198 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 118893137 T/C 1 15 6 21 7.36857926379074 3.05256829448371 4.31601096930703 T:C T C 10 0.508761382413951 0.0793074128043104 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 118893413 T/C 1 20 3 23 9.82477235172098 1.52628414724185 8.29848820447913 T:C T C 10 0.508761382413951 0.000509126858913234 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 119590533 T/A 1 6 44 50 2.94743170551629 22.3855008262138 -19.4380691206975 A:T T A 10 0.508761382413951 1.24561641966456e-08 ENSG00000005893:ENST00000434600:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000200639:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371335:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371345:exon_119590506_119590624:LAMP2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 122760484 C/T 1 31 7 38 15.2283971451675 3.56132967689766 11.6670674682699 T:C C T 10 0.508761382413951 0.000126326645226877 ENSG00000125676:ENST00000245838:exon_122760372_122760513:THOC2;ENSG00000125676:ENST00000408933:exon_122760372_122760513:THOC2;ENSG00000125676:ENST00000433414:exon_122760372_122760513:THOC2;ENSG00000125676:ENST00000355725:exon_122760372_122760513:THOC2;ENSG00000125676:ENST00000491737:exon_122760372_122760513:THOC2;ENSG00000125676:ENST00000438358:exon_122760372_122760487:THOC2;ENSG00000125676:ENST00000472687:exon_122760372_122760513:THOC2 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 123041043 A/G 1 7 4 11 3.43867032310234 2.0350455296558 1.40362479344654 A:G A G 10 0.508761382413951 0.549520355276029 ENSG00000101966:ENST00000468691:exon_123040838_123041101:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000371199:exon_123040838_123047829:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000434753:exon_123040838_123047829:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000355640:exon_123040838_123047815:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000531762:exon_123040838_123047815:XIAP HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 134185997 T/A 1 8 31 39 3.92990894068839 15.7716028548325 -11.8416939141441 A:T T A 10 0.508761382413951 0.000151271009127376 ENSG00000203950:ENST00000518153:exon_134185947_134186120:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000370775:exon_134184962_134186205:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000520964:exon_134185947_134186226:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000522309:exon_134185947_134186171:FAM127B HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 134711265 A/T 1 11 4 15 5.40362479344654 2.0350455296558 3.36857926379074 A:T A T 10 0.508761382413951 0.119313325605239 ENSG00000165359:ENST00000370752:exon_134711118_134711352:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000356856:exon_134711118_134711352:DDX26B HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 134713855 G/A 1 5 31 36 2.45619308793025 15.7716028548325 -13.3154097669022 A:G G A 10 0.508761382413951 5.63179351844595e-06 ENSG00000165359:ENST00000370752:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000481908:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000356856:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000493637:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000494957:exon_134713810_134714087:DDX26B HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 135310785 T/C 1 26 4 30 12.7722040572373 2.0350455296558 10.7371585275815 T:C T C 10 0.508761382413951 6.37940534791764e-05 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000495432:exon_135310782_135311154:MAP7D3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 135313034 T/G 1 24 4 28 11.7897268220652 2.0350455296558 9.75468129240937 T:G T G 10 0.508761382413951 0.000190747903896715 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000477124:exon_135312998_135313314:MAP7D3 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 135593629 C/T 1 44 203 247 21.6144991737862 103.278560630032 -81.6640614562459 T:C C T 10 0.508761382413951 6.20213300409901e-27 ENSG00000102241:ENST00000218364:exon_135592967_135594505:HTATSF1;ENSG00000102241:ENST00000415377:exon_135592967_135593831:HTATSF1 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 153195393 G/A 1 157 32 189 77.1244629610097 16.2803642372464 60.8440987237633 A:G G A 10 0.508761382413951 2.98237387668846e-20 ENSG00000102030:ENST00000464845:exon_153194695_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000482485:exon_153195280_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370015:exon_153195367_153195760:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000393712:exon_153195374_153195756:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370009:exon_153195377_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000466877:exon_153195379_153195676:NAA10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 153196345 G/A 1 6 2 8 2.94743170551629 1.0175227648279 1.92990894068839 A:G G A 10 0.508761382413951 0.289666844678132 ENSG00000102030:ENST00000482485:exon_153196216_153196893:NAA10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 153595205 T/C 1 95 20 115 46.6676686706747 10.175227648279 36.4924410223956 T:C T C 10 0.508761382413951 1.73978104744643e-12 ENSG00000196924:ENST00000420627:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000360319:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369854:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369863:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369852:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000422373:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000428077:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369850:exon_153595100_153595218:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000344736:exon_153595100_153595218:FLNA HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 153596066 G/A 1 124 26 150 60.9135885806701 13.2277959427627 47.6857926379074 A:G G A 10 0.508761382413951 7.75321761318066e-16 ENSG00000196924:ENST00000420627:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000360319:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369854:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369863:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369852:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000422373:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000428077:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369850:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000344736:exon_153596009_153596106:FLNA HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 153626892 T/A 0 16 0 16 7.85981788137678 0 7.85981788137678 T T 10 0.508761382413951 3.16472623419428e-05 ENSG00000147403:ENST00000479366:exon_153626838_153626960:RPL10 HGDP00857_parsed_pileup.txt . X 154020114 C/A 0 9 0 9 4.42114755827444 0 4.42114755827444 C C 10 0.508761382413951 0.00394947493673441 ENSG00000130830:ENST00000369534:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000413259:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000439370:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000393531:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000393529:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000417435:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000488694:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000369531:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000471821:exon_154019906_154020122:MPP1