INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 881627 G/A 1 44 34 78 20.6703840768154 18.0274304860972 2.64295359071813 A:G G A 10 0.530218543708742 0.57232696219004 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 887801 A/G 1 52 39 91 24.4286357271454 20.6785232046409 3.75011252250448 A:G A G 10 0.530218543708742 0.463182881827768 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_887792_887980:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_887792_887980:NOC2L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 888639 T/C 1 29 26 55 13.6236622324465 13.7856821364273 -0.162019903980809 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_888555_888668:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_888555_888668:NOC2L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 888659 T/C 1 24 28 52 11.2747549509902 14.8461192238448 -3.57136427285458 T:C T C 10 0.530218543708742 0.333931596904285 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_888555_888668:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_888555_888668:NOC2L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 889238 G/A 1 31 30 61 14.563225145029 15.9065563112623 -1.34333116623326 A:G G A 10 0.530218543708742 0.79789049806096 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_889162_889272:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_889162_889272:NOC2L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 897325 G/C 1 11 5 16 5.16759601920384 2.65109271854371 2.51650330066013 C:G G C 10 0.530218543708742 0.223429926014640 ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_897206_897427:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_897206_897427:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000455747:exon_897206_897652:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000463212:exon_897206_897858:KLHL17 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 897738 C/T 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 T:C C T 10 0.530218543708742 0.296231759838006 ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_897735_897851:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_897735_897851:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000463212:exon_897206_897858:KLHL17 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 898467 C/T 1 10 6 16 4.69781456291258 3.18131126225245 1.51650330066013 T:C C T 10 0.530218543708742 0.617951383515179 ENSG00000187961:ENST00000466300:exon_898412_898633:KLHL17 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 949608 G/A 1 649 630 1279 304.888165133026 334.037682536507 -29.149517403481 A:G G A 10 0.530218543708742 0.104243138192291 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 1190685 G/A 1 150 140 290 70.4672184436887 74.2305961192239 -3.76337767553518 A:G G A 10 0.530218543708742 0.680642327966117 ENSG00000160087:ENST00000450390:exon_1189289_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000347370:exon_1189294_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000349431:exon_1189850_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000339385:exon_1190304_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000348298:exon_1190304_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000400929:exon_1190365_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000464036:exon_1190428_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000360466:exon_1190544_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000400930:exon_1190558_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000467339:exon_1190644_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000473215:exon_1190648_1190867:UBE2J2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 1246390 C/G 1 22 22 44 10.3351920384077 11.6648079615923 -1.32961592318465 C:G C G 10 0.530218543708742 0.763212211288356 ENSG00000169972:ENST00000379031:exon_1246289_1246451:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000470520:exon_1246289_1246408:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000467712:exon_1246289_1246449:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000493657:exon_1245416_1246451:PUSL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 50 39 89 23.4890728145629 20.6785232046409 2.81054960992196 C:G C G 10 0.530218543708742 0.596075951731781 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 1262966 C/T 1 33 18 51 15.5027880576115 9.54393378675736 5.95885427085416 A:T:C:G C T 10 0.530218543708742 0.121977427050431 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 1263144 G/A 1 29 19 48 13.6236622324465 10.0741523304661 3.54950990198038 A:G G A 10 0.530218543708742 0.315879658313046 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 1277833 G/A 1 10 11 21 4.69781456291258 5.83240398079616 -1.13458941788358 A:G G A 10 0.530218543708742 0.666334924600774 ENSG00000107404:ENST00000378891:exon_1277743_1277864:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000378888:exon_1277743_1277864:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000345100:exon_1277743_1277864:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000263743:exon_1277743_1277864:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000472445:exon_1277743_1277864:DVL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 1309185 T/C 1 214 185 399 100.533231646329 98.0904305861173 2.44280106021195 T:C T C 10 0.530218543708742 0.841034963814071 ENSG00000175756:ENST00000338370:exon_1309110_1309282:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000338338:exon_1309110_1309282:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000321751:exon_1309112_1309282:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000470457:exon_1309116_1309282:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000378853:exon_1309117_1309282:AURKAIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 1341185 A/G 1 7 10 17 3.28847019403881 5.30218543708742 -2.01371524304861 A:G A G 10 0.530218543708742 0.343429778687472 ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1340489_1341266:MRPL20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 1430985 C/T 1 40 43 83 18.7912582516503 22.7993973794759 -4.00813912782559 T:C C T 10 0.530218543708742 0.381642811337983 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 1458150 T/C 1 22 12 34 10.3351920384077 6.3626225245049 3.97256951390277 T:C T C 10 0.530218543708742 0.228654342632051 ENSG00000197785:ENST00000378756:exon_1458124_1458279:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000378759:exon_1458124_1458279:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000378755:exon_1458124_1458279:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000339113:exon_1458124_1458279:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000429957:exon_1458124_1458160:ATAD3A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 90 86 176 42.2803310662132 45.5987947589518 -3.31846369273859 A:T:C:G A G 10 0.530218543708742 0.650688947624395 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 1563105 G/A 0 41 0 41 19.2610397079416 0 19.2610397079416 G G 10 0.530218543708742 6.71118895677656e-12 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505370:exon_1562676_1563210:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000473511:exon_1562840_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000464570:exon_1562902_1563209:MIB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 1635565 C/T 1 21 12 33 9.86541058211642 6.3626225245049 3.50278805761151 T:C C T 10 0.530218543708742 0.295304940575471 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 63 52 115 29.5962317463493 27.5713642728546 2.02486747349467 T:C C T 10 0.530218543708742 0.779418447643703 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 12 15 27 5.6373774754951 7.95327815563113 -2.31590068013603 T:C C T 10 0.530218543708742 0.442054176507922 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 2340200 T/C 1 16 27 43 7.51650330066013 14.315900680136 -6.79939737947591 T:C T C 10 0.530218543708742 0.046195001058485 ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000510434:exon_2339895_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000508384:exon_2339969_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000515760:exon_2340022_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000502666:exon_2340043_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000504111:exon_2340074_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000514502:exon_2340194_2340297:PEX10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 2452569 T/C 1 12 15 27 5.6373774754951 7.95327815563113 -2.31590068013603 T:C T C 10 0.530218543708742 0.442054176507922 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000486396:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502770:exon_2452540_2453380:PANK4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 3701663 T/C 1 11 23 34 5.16759601920384 12.1950265053011 -7.02743048609723 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0240301020681640 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3701651_3701767:LRRC47 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 3756226 C/T 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3756172_3756340:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3756172_3756340:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3756172_3756340:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3756172_3756340:KIAA0562 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 3761479 C/T 1 9 12 21 4.22803310662132 6.3626225245049 -2.13458941788358 T:C C T 10 0.530218543708742 0.387625542901861 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494951:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378223:exon_3761471_3761547:KIAA0562 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 3800242 A/G 1 2 7 9 0.939562912582516 3.71152980596119 -2.77196689337868 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0932648737406713 ENSG00000169598:ENST00000378209:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000491998:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000430539:exon_3800071_3801984:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000468793:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000477548:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000339350:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000378206:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000475969:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000448632:exon_3800071_3800305:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000461150:exon_3800071_3800364:DFFB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 139 136 275 65.2996224244849 72.1097219443889 -6.81009951990404 A:G A G 10 0.530218543708742 0.432383706015427 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 6698357 C/T 1 20 17 37 9.39562912582516 9.01371524304861 0.381913882776546 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6698355_6698424:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6697507_6698424:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6698355_6698424:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6698355_6698424:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000472414:exon_6698143_6698424:DNAJC11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 9324372 A/G 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 9324571 T/C 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 T:C T C 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 9324670 A/G 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 A:G A G 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 10460485 T/C 1 54 59 113 25.3681986397279 31.2828940788158 -5.91469543908785 T:C T C 10 0.530218543708742 0.299889522487559 ENSG00000142657:ENST00000491493:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000477958:exon_10460433_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000465632:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10460450_10460629:PGD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 65 72 137 30.5357946589318 38.1757351470294 -7.63994048809765 T:C C T 10 0.530218543708742 0.199792063575958 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 10596341 C/T 1 7 12 19 3.28847019403881 6.3626225245049 -3.0741523304661 T:C C T 10 0.530218543708742 0.173987244767743 ENSG00000142655:ENST00000472851:exon_10596270_10596629:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000491661:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000492696:exon_10596270_10596346:PEX14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 10708142 A/G 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 A:G A G 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10707858_10708196:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10707270_10708196:CASZ1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 10713765 T/C 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 T:C T C 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10713041_10714275:CASZ1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 T:C C T 10 0.530218543708742 0.797017339461022 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 12 6 18 5.6373774754951 3.18131126225245 2.45606621324264 T:C C T 10 0.530218543708742 0.345504636527756 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 15 24 39 7.04672184436887 12.7252450490098 -5.67852320464094 A:G A G 10 0.530218543708742 0.07786717866728 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 12186058 A/G 1 12 12 24 5.6373774754951 6.3626225245049 -0.725245049009807 A:G A G 10 0.530218543708742 0.8392917887424 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12185956_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000479933:exon_12185991_12186109:TNFRSF8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 12198297 T/C 1 43 34 77 20.2006026205241 18.0274304860972 2.17317213442687 T:C T C 10 0.530218543708742 0.649254997019824 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 12248942 A/G 1 25 26 51 11.7445364072814 13.7856821364273 -2.04114572914584 A:G A G 10 0.530218543708742 0.577904259838491 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 12252955 T/G 1 53 53 106 24.8984171834367 28.1015828165633 -3.20316563312665 T:G T G 10 0.530218543708742 0.56007062244457 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 14143003 A/G 1 3 9 12 1.40934436887377 4.77196689337868 -3.3626225245049 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0792634794421136 ENSG00000116731:ENST00000376048:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000503842:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000505823:exon_14142922_14143065:PRDM2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 16255644 C/T 1 14 10 24 6.57694038807761 5.30218543708742 1.27475495099019 T:C C T 10 0.530218543708742 0.685036120735498 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN;ENSG00000065526:ENST00000375753:exon_16254586_16255713:SPEN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 16256007 T/C 1 13 12 25 6.10715893178635 6.3626225245049 -0.25546359271855 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 16259813 A/G 1 38 37 75 17.8516953390678 19.6180861172235 -1.76639077815565 A:G A G 10 0.530218543708742 0.729102566209411 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 16260916 C/T 1 19 19 38 8.9258476695339 10.0741523304661 -1.1483046609322 T:C C T 10 0.530218543708742 0.746968586285852 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 16262404 C/T 1 26 23 49 12.2143178635727 12.1950265053011 0.0192913582716425 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 16271180 T/C 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 T:C T C 10 0.530218543708742 0.186865472805043 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 16272250 A/G 1 13 7 20 6.10715893178635 3.71152980596119 2.39562912582516 A:G A G 10 0.530218543708742 0.371488020282974 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 33 46 79 15.5027880576115 24.3900530106021 -8.88726495299062 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0547367454348738 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 17752089 C/T 1 28 23 51 13.1538807761552 12.1950265053011 0.958854270854159 T:C C T 10 0.530218543708742 0.888637210039816 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17752037_17752180:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17752037_17752180:RCC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 19499560 T/C 1 8 11 19 3.75825165033006 5.83240398079616 -2.0741523304661 T:C T C 10 0.530218543708742 0.366451934145480 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000419533:exon_19499358_19499587:UBR4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 19566881 C/T 1 15 4 19 7.04672184436887 2.12087417483497 4.9258476695339 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0357459509933053 ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000467423:exon_19566791_19567198:KIAA0090 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 20009737 G/A 1 15 19 34 7.04672184436887 10.0741523304661 -3.02743048609723 A:G G A 10 0.530218543708742 0.308346500587601 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20008706_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20008735_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20008754_20009937:TMCO4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 20020994 C/T 1 13 4 17 6.10715893178635 2.12087417483497 3.98628475695139 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0859391418136884 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000490234:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000494342:exon_20020985_20021044:TMCO4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 22852904 G/A 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 A:G G A 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000184677:ENST00000374651:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000404138:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000375647:exon_22852695_22857647:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000374649:exon_22852695_22857647:ZBTB40 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 23885498 T/C 1 142 138 280 66.7089667933586 73.1701590318064 -6.46119223844775 T:C T C 10 0.530218543708742 0.472542518987136 ENSG00000117318:ENST00000374561:exon_23885426_23885510:ID3;ENSG00000117318:ENST00000463312:exon_23885426_23885566:ID3;ENSG00000117318:ENST00000486541:exon_23884936_23885510:ID3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 23885599 T/C 1 3 7 10 1.40934436887377 3.71152980596119 -2.30218543708742 T:C T C 10 0.530218543708742 0.206122472271196 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 25890189 A/G 1 2 7 9 0.939562912582516 3.71152980596119 -2.77196689337868 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0932648737406713 ENSG00000157978:ENST00000374338:exon_25890152_25890282:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000488127:exon_25890152_25891698:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000484476:exon_25890152_25890282:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000474283:exon_25890125_25890282:LDLRAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 26644537 C/A 1 2409 2955 5364 1131.70352820564 1566.79579665933 -435.092268453692 A:T:C C A 10 0.530218543708742 1.41283502930859e-32 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26644448_26644562:CD52;ENSG00000169442:ENST00000492808:exon_26644449_26644562:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26644449_26644562:CD52 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 22 20 42 10.3351920384077 10.6043708741748 -0.269178835767164 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 26883511 A/C 1 29 32 61 13.6236622324465 16.9669933986797 -3.34333116623326 A:C A C 10 0.530218543708742 0.442040008137854 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000488985:exon_26883489_26883527:RPS6KA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 39 32 71 18.3214767953591 16.9669933986797 1.35448339667932 T:C T C 10 0.530218543708742 0.812407430006937 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 26900735 C/G 1 118 93 211 55.4342118423684 49.310324564913 6.12388727745544 C:G C G 10 0.530218543708742 0.408648753692283 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 27878144 G/A 1 2 11 13 0.939562912582516 5.83240398079616 -4.89284106821365 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00952090942007516 ENSG00000126705:ENST00000247087:exon_27873772_27878700:AHDC1;ENSG00000126705:ENST00000482400:exon_27877380_27878361:AHDC1;ENSG00000126705:ENST00000374011:exon_27873772_27878700:AHDC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 95 42 137 44.6292383476695 22.2691788357672 22.3600595119023 A:G A G 10 0.530218543708742 0.000146139149174597 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 95 38 133 44.6292383476695 20.1483046609322 24.4809336867373 T:C T C 10 0.530218543708742 1.73948279512354e-05 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 107 60 167 50.2666158231646 31.8131126225245 18.4535032006401 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00409885681942691 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 31898234 T/C 1 13 34 47 6.10715893178635 18.0274304860972 -11.9202715543109 T:C T C 10 0.530218543708742 0.000617048756302465 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31898177_31898256:SERINC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 31898687 C/T 1 7 10 17 3.28847019403881 5.30218543708742 -2.01371524304861 T:C C T 10 0.530218543708742 0.343429778687472 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31898623_31898760:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31898623_31898705:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31898623_31898760:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31898623_31898760:SERINC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 107 105 212 50.2666158231646 55.6729470894179 -5.4063312662533 A:G A G 10 0.530218543708742 0.491521788253965 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 32841926 A/T 1 19 22 41 8.9258476695339 11.6648079615923 -2.73896029205842 A:T A T 10 0.530218543708742 0.435664976115865 ENSG00000160058:ENST00000455895:exon_32841863_32842342:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000426769:exon_32841863_32842342:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000413080:exon_32841863_32842342:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000444377:exon_32841863_32842342:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000341071:exon_32841863_32842342:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000526031:exon_32841863_32842342:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000419121:exon_32841863_32842342:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000446293:exon_32841863_32842342:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000373520:exon_32841863_32842342:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000449308:exon_32841863_32842342:BSDC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 33960505 A/T 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 A:T A T 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000121903:ENST00000373411:exon_33959818_33961991:ZSCAN20;ENSG00000121903:ENST00000326544:exon_33959818_33961253:ZSCAN20;ENSG00000121903:ENST00000361328:exon_33959818_33961995:ZSCAN20;ENSG00000121903:ENST00000401072:exon_33959818_33961991:ZSCAN20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 35 31 66 16.442350970194 16.436774854971 0.00557611522302892 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 35919979 A/G 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000485551:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000335883:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000440579:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000467109:exon_35919963_35920237:KIAA0319L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 36029343 C/T 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 T:C C T 10 0.530218543708742 0.51496433390393 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 36225948 T/C 1 12 18 30 5.6373774754951 9.54393378675736 -3.90655631126226 T:C T C 10 0.530218543708742 0.199822740571968 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 36556867 C/T 1 27 26 53 12.684099319864 13.7856821364273 -1.10158281656333 T:C C T 10 0.530218543708742 0.78452676553072 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36556845_36556941:ADPRHL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 36602943 C/T 1 8 3 11 3.75825165033006 1.59065563112623 2.16759601920384 T:C C T 10 0.530218543708742 0.235945069885030 ENSG00000054116:ENST00000462715:exon_36602182_36603579:TRAPPC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 36638206 G/A 1 46 41 87 21.6099469893979 21.7389602920584 -0.129013302660553 A:T:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000116871:ENST00000429533:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000462118:exon_36637569_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36638070_36638228:MAP7D1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 37948780 A/C 1 41 25 66 19.2610397079416 13.2554635927186 6.00557611522303 A:C A C 10 0.530218543708742 0.174482948167114 ENSG00000163874:ENST00000373087:exon_37948338_37949978:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000373082:exon_37948338_37949817:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000492829:exon_37948035_37949976:ZC3H12A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 38327982 G/T 1 45 58 103 21.1401655331066 30.752675535107 -9.61251000200042 T:G G T 10 0.530218543708742 0.0609629156561865 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 38338795 A/G 1 31 25 56 14.563225145029 13.2554635927186 1.30776155231045 A:G A G 10 0.530218543708742 0.789538741261735 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 38449910 T/C 1 32 24 56 15.0330066013203 12.7252450490098 2.30776155231045 T:C T C 10 0.530218543708742 0.593336865130439 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000489537:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000461869:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000470585:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000462258:exon_38449790_38449932:SF3A3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 22 36 58 10.3351920384077 19.0878675735147 -8.75267553510703 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0248407825375541 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 40726630 A/G 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000084073:ENST00000372759:exon_40726511_40726657:ZMPSTE24;ENSG00000084073:ENST00000479131:exon_40726511_40726657:ZMPSTE24;ENSG00000084073:ENST00000472583:exon_40726511_40726657:ZMPSTE24 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 40928731 G/A 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 A:G G A 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000187801:ENST00000469416:exon_40928093_40929386:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000484445:exon_40928093_40929352:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000411995:exon_40928093_40929390:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000361584:exon_40928093_40929388:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000431552:exon_40928093_40929261:ZNF643 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 40961355 T/C 1 14 11 25 6.57694038807761 5.83240398079616 0.74453640728145 T:C T C 10 0.530218543708742 0.842713046828003 ENSG00000187815:ENST00000372706:exon_40960593_40962015:ZNF642;ENSG00000187815:ENST00000372705:exon_40960593_40961960:ZNF642 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 8 20 28 3.75825165033006 10.6043708741748 -6.84611922384478 T:G G T 10 0.530218543708742 0.0126042496806408 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 40981251 G/A 1 18 18 36 8.45606621324264 9.54393378675736 -1.08786757351471 A:G G A 10 0.530218543708742 0.740965509128219 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 41013015 C/T 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000117010:ENST00000372699:exon_41012234_41013841:ZNF684;ENSG00000117010:ENST00000493756:exon_41012234_41013457:ZNF684 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 8 18 26 3.75825165033006 9.54393378675736 -5.78568213642729 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0293505626310909 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 41493811 C/T 1 27 20 47 12.684099319864 10.6043708741748 2.07972844568913 T:C C T 10 0.530218543708742 0.562644391736884 ENSG00000010803:ENST00000372597:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372596:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000337495:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372595:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000326197:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361191:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361705:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397174:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397171:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000456518:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000402904:exon_41492877_41493991:SCMH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 41979156 A/G 1 39 49 88 18.3214767953591 25.9807086417284 -7.6592318463693 A:G A G 10 0.530218543708742 0.109555232232382 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 11 45 56 5.16759601920384 23.8598344668934 -18.6922384476896 T:C T C 10 0.530218543708742 5.43987876542025e-07 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 43408966 G/A 1 17 18 35 7.98628475695139 9.54393378675736 -1.55764902980597 A:G G A 10 0.530218543708742 0.615523468429842 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000415851:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43408897_43408992:SLC2A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 43825644 T/C 1 45 21 66 21.1401655331066 11.1345894178836 10.005576115223 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0136530464302737 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000478882:exon_43825438_43825768:CDC20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 43828752 G/A 1 62 66 128 29.126450290058 34.994423884777 -5.86797359471898 A:G G A 10 0.530218543708742 0.330138211799039 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43828622_43828874:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43828622_43828858:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43828622_43828874:CDC20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 43917637 G/A 1 11 11 22 5.16759601920384 5.83240398079616 -0.664807961592324 A:G G A 10 0.530218543708742 0.832858519551156 ENSG00000198198:ENST00000372442:exon_43916008_43918304:KIAA0467;ENSG00000198198:ENST00000460536:exon_43916008_43918321:KIAA0467;ENSG00000178922:ENST00000372433:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372434:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000470662:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000487366:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372430:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372432:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372427:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372425:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000403034:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372426:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000486909:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000496142:exon_43917606_43917890:HYI HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 45205598 T/C 1 6 9 15 2.81868873774755 4.77196689337868 -1.95327815563113 T:C T C 10 0.530218543708742 0.438985732589774 ENSG00000142945:ENST00000452259:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000493027:exon_45205497_45205674:KIF2C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 45218895 A/T 1 24 16 40 11.2747549509902 8.48349669933987 2.79125825165032 A:T A T 10 0.530218543708742 0.429974963920427 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000455186:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45218804_45218926:KIF2C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 45224901 G/A 1 35 36 71 16.442350970194 19.0878675735147 -2.64551660332068 A:G G A 10 0.530218543708742 0.553692259698282 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45224878_45225020:KIF2C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 45224998 A/C 1 59 61 120 27.7171059211842 32.3433311662333 -4.62622524504904 A:C A C 10 0.530218543708742 0.411517942436248 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45224878_45225020:KIF2C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 45226084 G/A 1 41 42 83 19.2610397079416 22.2691788357672 -3.00813912782559 A:G G A 10 0.530218543708742 0.511833300574409 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45225952_45226156:KIF2C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 45270024 G/C 1 21 26 47 9.86541058211642 13.7856821364273 -3.92027155431087 C:G G C 10 0.530218543708742 0.306385560408984 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45270011_45270451:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461769:exon_45270011_45270173:PLK3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 45444038 G/A 1 10 8 18 4.69781456291258 4.24174834966994 0.456066213242644 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000480675:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000477953:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372182:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000487532:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000497010:exon_45443987_45444132:EIF2B3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 45476663 G/A 1 17 17 34 7.98628475695139 9.01371524304861 -1.02743048609723 A:G G A 10 0.530218543708742 0.734625445132276 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45476561_45477001:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45476561_45477027:HECTD3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 45479772 G/T 1 7 7 14 3.28847019403881 3.71152980596119 -0.423059611922388 T:G G T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD;ENSG00000126088:ENST00000472254:exon_45479722_45480248:UROD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 45797505 C/G 1 19 17 36 8.9258476695339 9.01371524304861 -0.0878675735147123 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45797333_45797544:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45797333_45797755:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000412971:exon_45797406_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000462388:exon_45797419_45797758:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000466231:exon_45797442_45797521:MUTYH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 45810923 G/A 1 11 4 15 5.16759601920384 2.12087417483497 3.04672184436887 A:G G A 10 0.530218543708742 0.128499041794511 ENSG00000070759:ENST00000372084:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372086:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000341771:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372083:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000486676:exon_45809556_45811230:TESK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 45973928 G/A 1 11 7 18 5.16759601920384 3.71152980596119 1.45606621324264 A:G G A 10 0.530218543708742 0.638243716970554 ENSG00000132763:ENST00000401061:exon_45973884_45974036:MMACHC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 27 32 59 12.684099319864 16.9669933986797 -4.28289407881578 A:G G A 10 0.530218543708742 0.297336160824213 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 119 73 192 55.9039932986597 38.7059536907382 17.1980396079215 A:T:G A G 10 0.530218543708742 0.0138245442661263 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 129 81 210 60.6018078615723 42.9477020404081 17.6541058211642 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0154337171694776 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 88 64 152 41.3407681536307 33.9339867973595 7.40678135627122 A:G A G 10 0.530218543708742 0.255272512816952 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 67 89 156 31.4753575715143 47.189450390078 -15.7140928185637 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0127649863135947 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 46195375 T/C 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000197429:ENST00000359942:exon_46195286_46195441:IPP;ENSG00000197429:ENST00000396478:exon_46195286_46195441:IPP;ENSG00000197429:ENST00000396474:exon_46195286_46195441:IPP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 46493460 T/G 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 T:G T G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000498364:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372008:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46493403_46493535:MAST2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 46496709 A/G 1 18 12 30 8.45606621324264 6.3626225245049 2.09344368873774 A:G A G 10 0.530218543708742 0.470477748346769 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 16 26 42 7.51650330066013 13.7856821364273 -6.26917883576716 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0629915045132466 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 46500744 G/C 1 28 21 49 13.1538807761552 11.1345894178836 2.01929135827164 C:G G C 10 0.530218543708742 0.668106289257097 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 46660295 T/C 1 9 11 20 4.22803310662132 5.83240398079616 -1.60437087417484 T:C T C 10 0.530218543708742 0.508309614769096 ENSG00000085998:ENST00000371984:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371992:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000396420:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371986:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000477114:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000497439:exon_46660254_46660323:POMGNT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 30 31 61 14.0934436887377 16.436774854971 -2.34333116623326 A:G A G 10 0.530218543708742 0.608451011362773 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 47078637 T/C 0 11 0 11 5.16759601920384 0 5.16759601920384 T T 10 0.530218543708742 0.00117707091712435 ENSG00000142961:ENST00000396291:exon_47078576_47079043:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000319928:exon_47078576_47079043:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000271139:exon_47078576_47079043:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000371940:exon_47078576_47082137:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000477318:exon_47078576_47079043:MOBKL2C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 46 32 78 21.6099469893979 16.9669933986797 4.64295359071813 A:T:G A G 10 0.530218543708742 0.309036210253679 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 53792651 A/C 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:C A C 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000496580:exon_53792545_53792664:LRP8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 55 58 113 25.8379800960192 30.752675535107 -4.91469543908784 C:G G C 10 0.530218543708742 0.396455666853986 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 209 189 398 98.1843243648729 100.211304760952 -2.02698039607931 C:G C G 10 0.530218543708742 0.840987379411736 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 54683925 G/A 1 77 61 138 36.1731721344269 32.3433311662333 3.8298409681936 A:G G A 10 0.530218543708742 0.550904535112363 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 55182300 T/A 1 5 8 13 2.34890728145629 4.24174834966994 -1.89284106821365 A:T T A 10 0.530218543708742 0.406203894191414 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000486621:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55182273_55182390:TTC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 59125683 C/T 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 T:C C T 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000162601:ENST00000472487:exon_59120411_59125827:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000493821:exon_59120412_59125827:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000401044:exon_59124825_59125827:MYSM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 62456014 G/A 1 4 7 11 1.87912582516503 3.71152980596119 -1.83240398079616 A:G G A 10 0.530218543708742 0.367650802678922 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000494842:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000490547:exon_62455840_62456108:INADL;ENSG00000132849:ENST00000307297:exon_62455840_62456036:INADL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 62579907 C/T 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 64114301 T/C 1 36 35 71 16.9121324264853 18.557649029806 -1.64551660332068 T:C T C 10 0.530218543708742 0.722392202140731 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64114188_64114323:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64114188_64114323:PGM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 66831370 G/A 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 A:G G A 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000184588:ENST00000329654:exon_66831350_66831449:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000341517:exon_66831350_66831449:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000371049:exon_66831350_66831449:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000423207:exon_66831350_66831449:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000371045:exon_66831350_66831449:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000480109:exon_66831350_66831449:PDE4B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 67470025 A/T 1 11 5 16 5.16759601920384 2.65109271854371 2.51650330066013 A:T A T 10 0.530218543708742 0.223429926014640 ENSG00000116704:ENST00000235345:exon_67465015_67470131:SLC35D1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 67852335 G/A 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:G G A 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67852262_67852352:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67852262_67852352:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000465396:exon_67852262_67852352:IL12RB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 67861520 C/A 1 9 41 50 4.22803310662132 21.7389602920584 -17.5109271854371 A:C C A 10 0.530218543708742 5.09454766028189e-07 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67861230_67862583:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67861230_67862583:IL12RB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 70904800 G/T 1 40 29 69 18.7912582516503 15.3763377675535 3.4149204840968 T:G G T 10 0.530218543708742 0.469702863568243 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70904784_70905253:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70904784_70905252:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70904784_70904887:CTH;ENSG00000116761:ENST00000482383:exon_70904784_70904915:CTH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 74665493 G/A 1 5 8 13 2.34890728145629 4.24174834966994 -1.89284106821365 A:G G A 10 0.530218543708742 0.406203894191414 ENSG00000254685:ENST00000467578:exon_74665348_74665529:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000524915:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000482102:exon_74665348_74665529:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370898:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000529485:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370894:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000534056:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000472069:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000116783:ENST00000370899:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000370895:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000534632:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000533006:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000370891:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000370893:exon_74665348_74665515:TNNI3K HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 74670172 A/G 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 A:G A G 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000254685:ENST00000467578:exon_74670075_74670277:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000482102:exon_74670075_74670175:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370898:exon_74670075_74672918:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000472069:exon_74670075_74670261:FPGT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 75172001 T/A 1 120 103 223 56.373774754951 54.6125100020004 1.76126475295053 A:T T A 10 0.530218543708742 0.840650903119859 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000492102:exon_75171172_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75171174_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75171656_75172141:CRYZ HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 20 45 65 9.39562912582516 23.8598344668934 -14.4642053410682 T:C T C 10 0.530218543708742 0.000414520486579266 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 35 24 59 16.442350970194 12.7252450490098 3.71710592118422 A:G A G 10 0.530218543708742 0.362876411209585 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 76227022 A/G 1 199 245 444 93.4865098019603 129.903543208642 -36.4170334066815 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00060414551691896 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76226807_76227300:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000481374:exon_76226807_76227055:ACADM HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 76255228 G/A 1 14 17 31 6.57694038807761 9.01371524304861 -2.436774854971 A:G G A 10 0.530218543708742 0.472338437680562 ENSG00000137955:ENST00000496055:exon_76253182_76256202:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000461653:exon_76254844_76256202:RABGGTB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 76257892 A/T 1 65 77 142 30.5357946589318 40.8268278655731 -10.2910332066414 A:T A T 10 0.530218543708742 0.0925221732976633 ENSG00000137955:ENST00000496055:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000319942:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000370824:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000485459:exon_76257866_76257939:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000470201:exon_76257866_76257971:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000471759:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000491266:exon_76257866_76257987:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000461653:exon_76257866_76257935:RABGGTB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 77558057 G/C 1 9 10 19 4.22803310662132 5.30218543708742 -1.0741523304661 C:G G C 10 0.530218543708742 0.652256323352804 ENSG00000142892:ENST00000370812:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000445065:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000370813:exon_77557389_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000487906:exon_77557887_77558175:PIGK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 78098403 T/C 1 13 18 31 6.10715893178635 9.54393378675736 -3.436774854971 T:C T C 10 0.530218543708742 0.280193232704031 ENSG00000036549:ENST00000370801:exon_78097535_78099090:ZZZ3;ENSG00000036549:ENST00000476275:exon_78097535_78098561:ZZZ3;ENSG00000036549:ENST00000420374:exon_78097535_78099090:ZZZ3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 85488030 G/A 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 A:G G A 10 0.530218543708742 0.296231759838006 ENSG00000055732:ENST00000370589:exon_85487982_85488083:MCOLN3;ENSG00000055732:ENST00000474447:exon_85487982_85489203:MCOLN3;ENSG00000055732:ENST00000302814:exon_85487982_85488083:MCOLN3;ENSG00000055732:ENST00000370588:exon_85487982_85488083:MCOLN3;ENSG00000055732:ENST00000341115:exon_85487982_85488083:MCOLN3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 85724328 C/T 1 18 9 27 8.45606621324264 4.77196689337868 3.68409931986397 T:C C T 10 0.530218543708742 0.179544318052189 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 85741921 G/C 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 C:G G C 10 0.530218543708742 0.565817448386735 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 T:C T C 10 0.530218543708742 0.797017339461022 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 10 6 16 4.69781456291258 3.18131126225245 1.51650330066013 T:C C T 10 0.530218543708742 0.617951383515179 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 86847955 G/A 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 A:G G A 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000480440:exon_86847625_86848041:ODF2L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 89426902 G/A 1 23 31 54 10.8049734946989 16.436774854971 -5.63180136027207 A:G G A 10 0.530218543708742 0.134832638644875 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 89525966 T/C 0 0 10 10 0 5.30218543708742 -5.30218543708742 C T C 10 0.530218543708742 0.000523550644442822 ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89525880_89526007:GBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 89732237 G/A 1 9 3 12 4.22803310662132 1.59065563112623 2.6373774754951 A:G G A 10 0.530218543708742 0.154808266842262 ENSG00000154451:ENST00000481145:exon_89732029_89732262:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000343435:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000417291:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000370459:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000443807:exon_89732029_89732271:GBP5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 91406207 T/C 1 9 13 22 4.22803310662132 6.89284106821365 -2.66480796159232 T:C T C 10 0.530218543708742 0.289698673189133 ENSG00000122482:ENST00000370440:exon_91403829_91406866:ZNF644;ENSG00000122482:ENST00000337393:exon_91403829_91406866:ZNF644 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 93620328 A/T 1 49 42 91 23.0192913582716 22.2691788357672 0.750112522504477 A:T A T 10 0.530218543708742 0.916578128356446 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 34 41 75 15.9725695139028 21.7389602920584 -5.76639077815565 A:G G A 10 0.530218543708742 0.203465493901469 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 93646300 C/T 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 T:C C T 10 0.530218543708742 0.296231759838006 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000448243:exon_93646273_93646409:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 40 51 91 18.7912582516503 27.0411457291458 -8.24988747749552 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0927865926418887 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 94342564 C/A 1 212 172 384 99.5936687337467 91.1975895179036 8.39607921584307 A:C C A 10 0.530218543708742 0.413433724744035 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 94343023 A/G 1 121 121 242 56.8435562112422 64.1564437887578 -7.31288757751557 A:G A G 10 0.530218543708742 0.367405349067418 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 94344716 C/T 1 37 30 67 17.3819138827765 15.9065563112623 1.47535757151429 T:C C T 10 0.530218543708742 0.806861792475761 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94344633_94344762:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94344633_94344718:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94344104_94345474:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94344633_94344720:DNTTIP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 98348885 G/A 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G G A 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000188641:ENST00000370192:exon_98348820_98348930:DPYD;ENSG00000188641:ENST00000394160:exon_98348820_98348930:DPYD;ENSG00000188641:ENST00000423006:exon_98348820_98348930:DPYD;ENSG00000188641:ENST00000306031:exon_98348820_98348930:DPYD;ENSG00000188641:ENST00000370191:exon_98348820_98348930:DPYD;ENSG00000188641:ENST00000460019:exon_98348820_98348930:DPYD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 100316589 A/G 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G A G 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100316531_100316680:AGL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 100335977 A/G 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100335956_100336137:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100335956_100336137:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100335956_100336137:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100335956_100336137:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100335956_100336137:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100335956_100336137:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100335956_100336137:AGL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 100361925 G/A 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 A:G G A 10 0.530218543708742 0.797017339461022 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100361842_100361944:AGL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 109351501 A/G 1 31 29 60 14.563225145029 15.3763377675535 -0.813112622524519 A:G A G 10 0.530218543708742 0.897315749512172 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109351405_109352148:STXBP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 109486196 A/G 1 7 3 10 3.28847019403881 1.59065563112623 1.69781456291258 A:G A G 10 0.530218543708742 0.352695224731846 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369976:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000482889:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369972:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109486097_109486237:CLCC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 110163879 G/A 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110163536_110163888:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110163276_110163888:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110163276_110163888:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110163696_110163888:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110163725_110163888:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000486282:exon_110163737_110163888:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528270:exon_110163774_110163888:AMPD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 110279701 C/T 0 0 12 12 0 6.3626225245049 -6.3626225245049 T C T 10 0.530218543708742 0.000115544808785328 ENSG00000134202:ENST00000256594:exon_110276554_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000361066:exon_110279124_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000486823:exon_110279552_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000476321:exon_110279597_110280189:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000488824:exon_110279598_110279791:GSTM3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 110466338 C/A 1 52 31 83 24.4286357271454 16.436774854971 7.99186087217441 A:C C A 10 0.530218543708742 0.098458780049418 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 110466466 T/C 1 32 50 82 15.0330066013203 26.5109271854371 -11.4779205841168 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0144316346475353 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 22 26 48 10.3351920384077 13.7856821364273 -3.45049009801962 A:C C A 10 0.530218543708742 0.385835479841323 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 110888948 G/A 1 90 80 170 42.2803310662132 42.4174834966994 -0.13715243048614 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110888930_110889299:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110888930_110889299:RBM15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 710 512 1222 333.544833966793 271.471894378876 62.0729395879173 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000376685349381344 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 112269872 G/A 1 10 3 13 4.69781456291258 1.59065563112623 3.10715893178635 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0999408957936294 ENSG00000197852:ENST00000357260:exon_112264686_112270426:C1orf183;ENSG00000197852:ENST00000444059:exon_112269128_112270426:C1orf183 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 112308953 T/C 1 38 32 70 17.8516953390678 16.9669933986797 0.884701940388059 T:C T C 10 0.530218543708742 0.90485675819602 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 112308972 G/A 1 35 33 68 16.442350970194 17.4972119423885 -1.05486097219445 A:G G A 10 0.530218543708742 0.809185652065666 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 113456546 A/T 1 80 71 151 37.5825165033006 37.6455166033207 -0.0630001000200409 A:T A T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000155380:ENST00000369626:exon_113454469_113456787:SLC16A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 114301335 C/T 1 8 10 18 3.75825165033006 5.30218543708742 -1.54393378675736 T:C C T 10 0.530218543708742 0.488609852310515 ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114301281_114301470:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000446739:exon_114301281_114301780:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000493212:exon_114301281_114302111:PHTF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 114354654 T/C 1 30 27 57 14.0934436887377 14.315900680136 -0.222456991398294 A:T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000081019:ENST00000261441:exon_114354332_114355098:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000434941:exon_114354332_114354662:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000476412:exon_114354332_114354915:RSBN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 114443035 C/G 1 10 3 13 4.69781456291258 1.59065563112623 3.10715893178635 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0999408957936294 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 114448389 C/T 1 12 13 25 5.6373774754951 6.89284106821365 -1.25546359271855 T:C C T 10 0.530218543708742 0.690551486586856 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114447763_114448397:DCLRE1B;ENSG00000118655:ENST00000466480:exon_114448031_114448397:DCLRE1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 114449662 T/C 1 6 9 15 2.81868873774755 4.77196689337868 -1.95327815563113 T:C T C 10 0.530218543708742 0.438985732589774 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114449618_114449783:DCLRE1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 116931628 C/A 1 257 229 486 120.733834266853 121.420046509302 -0.686212242448605 A:C C A 10 0.530218543708742 0.963771550024593 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000445896:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000491156:exon_116931524_116931641:ATP1A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 116947051 G/A 1 447 351 798 209.992310962192 186.106708841768 23.8856021204239 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.095497455975552 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116947038_116947394:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116947038_116947396:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116947038_116947396:ATP1A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 118165577 C/G 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 C:G C G 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000183508:ENST00000369448:exon_118165464_118170994:FAM46C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 118165973 C/T 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 T:C C T 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000183508:ENST00000369448:exon_118165464_118170994:FAM46C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 120285546 G/A 1 50 28 78 23.4890728145629 14.8461192238448 8.64295359071812 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0538594149420195 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120285430_120285667:PHGDH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 144909956 G/A 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144909869_144909960:PDE4DIP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 0 0 58 58 0 30.752675535107 -30.752675535107 A G A 10 0.530218543708742 9.33169318619909e-20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 73 73 0 38.7059536907382 -38.7059536907382 C T C 10 0.530218543708742 1.11788852729045e-24 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 36 36 0 19.0878675735147 -19.0878675735147 T G T 10 0.530218543708742 1.54259285199754e-12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 29 29 0 15.3763377675535 -15.3763377675535 A C A 10 0.530218543708742 3.05478201942448e-10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 104 0 104 48.8572714542908 0 48.8572714542908 G G 10 0.530218543708742 4.22999758612598e-29 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 70 70 0 37.1152980596119 -37.1152980596119 C T C 10 0.530218543708742 1.07822870484272e-23 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 1 1 116 117 0.469781456291258 61.5053510702141 -61.0355696139228 T:C C T 10 0.530218543708742 5.44299708144226e-37 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 146740502 C/G 1 10 11 21 4.69781456291258 5.83240398079616 -1.13458941788358 C:G C G 10 0.530218543708742 0.666334924600774 ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146740441_146740537:CHD1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 149858575 G/A 1 19 16 35 8.9258476695339 8.48349669933987 0.442350970194029 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000184260:ENST00000331380:exon_149858525_149858961:HIST2H2AC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 149915754 G/A 1 5 12 17 2.34890728145629 6.3626225245049 -4.01371524304861 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0555950391100387 ENSG00000163113:ENST00000369135:exon_149912231_149916964:OTUD7B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 150123137 C/G 1 78 76 154 36.6429535907181 40.2966093218644 -3.65365573114627 C:G C G 10 0.530218543708742 0.572648337283449 ENSG00000023902:ENST00000369126:exon_150123102_150123248:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150123102_150123248:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000025469:exon_150123102_150123248:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150123102_150123248:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000479194:exon_150122797_150123248:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000492304:exon_150122827_150123248:PLEKHO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 111 83 194 52.1457416483296 44.0081391278256 8.13760252050405 T:C:G G T 10 0.530218543708742 0.250435788200129 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 150239478 T/G 1 163 210 373 76.5743773754751 111.345894178836 -34.7715168033608 T:G T G 10 0.530218543708742 0.000334862790396702 ENSG00000117362:ENST00000414276:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000452164:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000433443:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000369109:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000360244:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000461320:exon_150239475_150239654:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000236017:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000486308:exon_150239356_150239878:APH1A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 150418796 C/T 1 10 2 12 4.69781456291258 1.06043708741748 3.6373774754951 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0427166045006331 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150418702_150418877:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150418702_150418877:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150418702_150418877:RPRD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 150460348 C/T 1 24 36 60 11.2747549509902 19.0878675735147 -7.81311262252452 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0517551129255817 ENSG00000143374:ENST00000369054:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369064:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000438568:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369052:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369053:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369051:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000479372:exon_150460334_150461108:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000467982:exon_150460346_150460530:TARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 151156801 C/T 1 44 59 103 20.6703840768154 31.2828940788158 -10.6125100020004 T:C C T 10 0.530218543708742 0.038259159011019 ENSG00000163159:ENST00000491094:exon_151156793_151156969:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000368892:exon_151156793_151156969:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000354473:exon_151156793_151156969:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000496809:exon_151156793_151156969:VPS72 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 151215011 A/G 1 34 21 55 15.9725695139028 11.1345894178836 4.83798009601919 A:G A G 10 0.530218543708742 0.224266661808679 ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000489625:exon_151214914_151215043:PIP5K1A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 151735576 T/C 1 34 45 79 15.9725695139028 23.8598344668934 -7.88726495299062 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0903492560041197 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151735426_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000478926:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000486707:exon_151735431_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000481777:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000461182:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000462783:exon_151735093_151735622:MRPL9;ENSG00000143450:ENST00000418982:exon_151735445_151735643:OAZ3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 151867560 G/A 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 A:G G A 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000159445:ENST00000368814:exon_151867484_151867670:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000471464:exon_151867484_151867670:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000344296:exon_151867484_151867670:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000489410:exon_151867306_151867670:THEM4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 153517172 T/C 1 17 12 29 7.98628475695139 6.3626225245049 1.62366223244648 T:C T C 10 0.530218543708742 0.581764914655282 ENSG00000196154:ENST00000368715:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000481009:exon_153517130_153517573:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000354332:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000468373:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368716:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368714:exon_153517130_153517285:S100A4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 153945908 A/C 1 22 19 41 10.3351920384077 10.0741523304661 0.261039707941578 A:C A C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000143578:ENST00000368607:exon_153945856_153945940:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000271889:exon_153945856_153945940:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368603:exon_153945856_153945940:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368600:exon_153945856_153945940:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000405694:exon_153945856_153945940:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000468845:exon_153945856_153945940:CREB3L4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 154317153 C/T 1 5 9 14 2.34890728145629 4.77196689337868 -2.42305961192239 T:C C T 10 0.530218543708742 0.284180524640790 ENSG00000143515:ENST00000368489:exon_154317117_154317261:ATP8B2;ENSG00000143515:ENST00000341831:exon_154317117_154317261:ATP8B2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 28 31 59 13.1538807761552 16.436774854971 -3.28289407881578 T:C:G C G 10 0.530218543708742 0.434717106145806 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 155028450 C/A 1 10 6 16 4.69781456291258 3.18131126225245 1.51650330066013 A:C C A 10 0.530218543708742 0.617951383515179 ENSG00000143537:ENST00000473905:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000480331:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000360674:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368412:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000487956:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000447332:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000534019:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000470779:exon_155028408_155028737:ADAM15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 84 74 158 39.4616423284657 39.2361722344469 0.225470094018767 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 155289545 T/G 1 3 9 12 1.40934436887377 4.77196689337868 -3.3626225245049 T:G T G 10 0.530218543708742 0.0792634794421136 ENSG00000160752:ENST00000492887:exon_155289402_155289676:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000489324:exon_155289446_155289719:FDPS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 155735012 T/C 1 14 22 36 6.57694038807761 11.6648079615923 -5.08786757351471 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0967141233002735 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 155829511 C/T 1 7 4 11 3.28847019403881 2.12087417483497 1.16759601920384 T:C C T 10 0.530218543708742 0.557007995713773 ENSG00000132718:ENST00000368324:exon_155829300_155829586:SYT11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 156011444 T/C 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000160803:ENST00000368309:exon_156011276_156011462:UBQLN4;ENSG00000160803:ENST00000368307:exon_156011276_156011462:UBQLN4;ENSG00000160803:ENST00000368308:exon_156011276_156011462:UBQLN4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 156107534 C/T 1 19 27 46 8.9258476695339 14.315900680136 -5.39005301060213 T:C C T 10 0.530218543708742 0.138965910246916 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156107499_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156107445_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156107445_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000498722:exon_156107445_156107952:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000506981:exon_156107253_156107534:LMNA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 156213921 C/T 1 12 3 15 5.6373774754951 1.59065563112623 4.04672184436887 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0400605809351377 ENSG00000160781:ENST00000292291:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000492619:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000360733:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000335852:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000356983:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368271:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000340183:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000491107:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368270:exon_156213214_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000468632:exon_156213214_156214194:PAQR6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 156233189 C/T 1 20 18 38 9.39562912582516 9.54393378675736 -0.148304660932196 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156233186_156233361:SMG5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 156263940 T/C 1 18 7 25 8.45606621324264 3.71152980596119 4.74453640728145 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0706504826508123 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 156264000 G/A 1 18 19 37 8.45606621324264 10.0741523304661 -1.61808611722345 A:G G A 10 0.530218543708742 0.624171639477041 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 156264648 C/T 1 11 8 19 5.16759601920384 4.24174834966994 0.925847669533902 T:C C T 10 0.530218543708742 0.8192074586227 ENSG00000198715:ENST00000472870:exon_156264550_156264807:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156264550_156264807:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156264156_156264783:C1orf85 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 156446903 T/C 1 11 11 22 5.16759601920384 5.83240398079616 -0.664807961592324 T:C T C 10 0.530218543708742 0.832858519551156 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000353795:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000340875:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000454816:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000493077:exon_156446721_156446994:MEF2D HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 20 23 43 9.39562912582516 12.1950265053011 -2.79939737947591 A:G G A 10 0.530218543708742 0.445966586496333 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 22 20 42 10.3351920384077 10.6043708741748 -0.269178835767164 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 156499969 T/C 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000183856:ENST00000361170:exon_156499897_156500109:IQGAP3;ENSG00000183856:ENST00000491900:exon_156499897_156500109:IQGAP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 156518379 G/A 1 3 7 10 1.40934436887377 3.71152980596119 -2.30218543708742 A:G G A 10 0.530218543708742 0.206122472271196 ENSG00000183856:ENST00000361170:exon_156518373_156518540:IQGAP3;ENSG00000183856:ENST00000491900:exon_156518373_156518540:IQGAP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 160062340 G/A 1 15 22 37 7.04672184436887 11.6648079615923 -4.61808611722345 A:G G A 10 0.530218543708742 0.140191429203817 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 24 15 39 11.2747549509902 7.95327815563113 3.32147679535906 A:G G A 10 0.530218543708742 0.336866611015545 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 1279 1150 2429 600.850482596519 609.751325265053 -8.90084266853432 A:C:G G A 10 0.530218543708742 0.729678411043759 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 160990875 T/C 1 9 2 11 4.22803310662132 1.06043708741748 3.16759601920384 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0707395200860403 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 160990876 C/A 1 9 1 10 4.22803310662132 0.530218543708742 3.69781456291258 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0237480022218031 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 160990878 C/T 0 8 0 8 3.75825165033006 0 3.75825165033006 C C 10 0.530218543708742 0.0086188222890866 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161013121 C/T 1 27 25 52 12.684099319864 13.2554635927186 -0.571364272854584 T:C C T 10 0.530218543708742 0.890341998270227 ENSG00000158773:ENST00000368020:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368021:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000442467:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000435396:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368019:exon_161013058_161013149:USF1;ENSG00000158773:ENST00000473969:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000531842:exon_161013058_161013132:USF1;ENSG00000158773:ENST00000496363:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000491629:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000534633:exon_161013043_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000529476:exon_161013058_161013150:USF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161019040 G/C 1 116 134 250 54.4946489297859 71.0492848569714 -16.5546359271855 T:C:G G C 10 0.530218543708742 0.0366400906880699 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161020997 C/T 1 2 7 9 0.939562912582516 3.71152980596119 -2.77196689337868 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0932648737406713 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161088583 T/G 1 13 19 32 6.10715893178635 10.0741523304661 -3.96699339867974 T:G T G 10 0.530218543708742 0.214467679943302 ENSG00000158793:ENST00000368009:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000392190:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000453609:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000486962:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000492411:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000478277:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000496861:exon_161088010_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000491497:exon_161088171_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000485594:exon_161088576_161088671:NIT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161094190 A/G 1 26 30 56 12.2143178635727 15.9065563112623 -3.69223844768955 A:G A G 10 0.530218543708742 0.350191986521019 ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161093931_161095235:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000479728:exon_161093931_161094601:NIT1;ENSG00000158796:ENST00000368006:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000392188:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000458050:exon_161094130_161094252:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000368005:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000464113:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000473679:exon_161094130_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000490843:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000463227:exon_161093928_161094316:DEDD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161139738 G/A 1 8 3 11 3.75825165033006 1.59065563112623 2.16759601920384 A:G G A 10 0.530218543708742 0.235945069885030 ENSG00000143224:ENST00000352210:exon_161139696_161139814:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000435935:exon_161139696_161139814:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000367999:exon_161139696_161139814:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000495483:exon_161139696_161139814:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000460611:exon_161139696_161139775:PPOX HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161139830 G/A 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G G A 10 0.530218543708742 0.73053574105774 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161143801 G/A 1 16 15 31 7.51650330066013 7.95327815563113 -0.436774854971002 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000158850:ENST00000319769:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000470882:exon_161143395_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000407555:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000310413:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367998:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367997:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000466504:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000465740:exon_161143649_161143839:B4GALT3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161145005 C/T 1 33 35 68 15.5027880576115 18.557649029806 -3.05486097219445 T:C C T 10 0.530218543708742 0.468600827401806 ENSG00000158850:ENST00000319769:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000470882:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000407555:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000310413:exon_161144924_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367998:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367997:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000466504:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000465740:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000493164:exon_161144697_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000496313:exon_161144785_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000487004:exon_161144842_161145018:B4GALT3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 84 37 121 39.4616423284657 19.6180861172235 19.8435562112422 A:G A G 10 0.530218543708742 0.000341740201276561 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161721707 C/T 1 17 10 27 7.98628475695139 5.30218543708742 2.68409931986397 T:C C T 10 0.530218543708742 0.339242316991111 ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161748056 C/T 1 8 3 11 3.75825165033006 1.59065563112623 2.16759601920384 T:C C T 10 0.530218543708742 0.235945069885030 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161748034_161748110:ATF6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161751741 A/G 1 12 14 26 5.6373774754951 7.42305961192239 -1.78568213642729 A:G A G 10 0.530218543708742 0.557496480025126 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161751702_161751789:ATF6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161753802 T/C 1 17 2 19 7.98628475695139 1.06043708741748 6.9258476695339 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0010246883570897 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161753841 G/A 1 11 8 19 5.16759601920384 4.24174834966994 0.925847669533902 A:G G A 10 0.530218543708742 0.8192074586227 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161761276 G/C 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 C:G G C 10 0.530218543708742 0.797017339461022 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161761312 C/T 1 10 21 31 4.69781456291258 11.1345894178836 -6.436774854971 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0292043627397844 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 52 34 86 24.4286357271454 18.0274304860972 6.40120524104819 A:G A G 10 0.530218543708742 0.194683759354813 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 165697341 G/A 1 88 92 180 41.3407681536307 48.7801060212043 -7.43933786757356 A:G G A 10 0.530218543708742 0.295819907916619 ENSG00000143183:ENST00000367881:exon_165696032_165697358:TMCO1;ENSG00000143183:ENST00000464650:exon_165696775_165697358:TMCO1;ENSG00000143183:ENST00000392129:exon_165696779_165697358:TMCO1;ENSG00000143183:ENST00000476143:exon_165696828_165697358:TMCO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 169293721 G/A 1 7 1 8 3.28847019403881 0.530218543708742 2.75825165033006 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0743148409803516 ENSG00000143156:ENST00000367811:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000525440:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000528517:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000524967:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000485609:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000491225:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000527460:exon_169293631_169293738:NME7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 79 34 113 37.1127350470094 18.0274304860972 19.0853045609122 A:G A G 10 0.530218543708742 0.000309221374301189 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 169762807 T/G 1 16 34 50 7.51650330066013 18.0274304860972 -10.5109271854371 T:G T G 10 0.530218543708742 0.00412031100998359 ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000454472:exon_169762283_169763038:C1orf156 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 169799880 G/T 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 T:G G T 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000000460:ENST00000498289:exon_169799837_169799888:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000359326:exon_169799837_169799888:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000459772:exon_169799837_169799888:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000286031:exon_169799837_169799888:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000413811:exon_169799837_169799888:C1orf112 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 169823718 T/C 1 22 20 42 10.3351920384077 10.6043708741748 -0.269178835767164 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 169823790 C/G 1 9 16 25 4.22803310662132 8.48349669933987 -4.25546359271855 C:G C G 10 0.530218543708742 0.108729977869397 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 169824068 A/G 1 4 14 18 1.87912582516503 7.42305961192239 -5.54393378675736 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00939623378327308 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 169824104 G/A 1 14 12 26 6.57694038807761 6.3626225245049 0.214317863572709 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 169828327 G/A 1 10 5 15 4.69781456291258 2.65109271854371 2.04672184436887 A:G G A 10 0.530218543708742 0.315050043511805 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169828182_169828353:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169828182_169828353:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169828182_169828353:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169828182_169828353:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000470238:exon_169828260_169828353:SCYL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 171483717 A/C 1 33 43 76 15.5027880576115 22.7993973794759 -7.29660932186439 A:C A C 10 0.530218543708742 0.107397732885002 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000467601:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000463586:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171483675_171483784:BAT2L2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 171510055 A/G 1 96 70 166 45.0990198039608 37.1152980596119 7.98372174434883 A:G A G 10 0.530218543708742 0.243387962210601 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171509400_171511368:BAT2L2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 55 57 112 25.8379800960192 30.2224569913983 -4.3844768953791 A:G G A 10 0.530218543708742 0.449071990172564 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 172411768 T/C 1 31 32 63 14.563225145029 16.9669933986797 -2.40376825365075 T:C T C 10 0.530218543708742 0.614051697587201 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 228 180 408 107.110172034407 95.4393378675736 11.6708341668333 A:T:C C T 10 0.530218543708742 0.254221363274540 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 174188285 G/A 1 18 12 30 8.45606621324264 6.3626225245049 2.09344368873774 A:G G A 10 0.530218543708742 0.470477748346769 ENSG00000152061:ENST00000357444:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367689:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174188263_174188433:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000457696:exon_174188263_174188433:RABGAP1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 90 68 158 42.2803310662132 36.0548609721945 6.22547009401877 T:C C T 10 0.530218543708742 0.339416642914767 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 179051300 T/C 1 90 77 167 42.2803310662132 40.8268278655731 1.45350320064009 T:C T C 10 0.530218543708742 0.876851155242737 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179050512_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000367625:exon_179051205_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179051213_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179051221_179051522:TOR3A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 179310262 C/T 1 11 6 17 5.16759601920384 3.18131126225245 1.98628475695139 T:C C T 10 0.530218543708742 0.46729790202122 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 180885735 G/A 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 A:G G A 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000135835:ENST00000367588:exon_180885290_180886236:KIAA1614 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 180905263 C/T 1 8 3 11 3.75825165033006 1.59065563112623 2.16759601920384 T:C C T 10 0.530218543708742 0.235945069885030 ENSG00000135835:ENST00000367588:exon_180904251_180905806:KIAA1614;ENSG00000135835:ENST00000367587:exon_180904251_180905806:KIAA1614 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 180905448 G/T 1 7 11 18 3.28847019403881 5.83240398079616 -2.54393378675736 T:G G T 10 0.530218543708742 0.246988872578824 ENSG00000135835:ENST00000367588:exon_180904251_180905806:KIAA1614;ENSG00000135835:ENST00000367587:exon_180904251_180905806:KIAA1614 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 181018236 A/G 1 15 16 31 7.04672184436887 8.48349669933987 -1.436774854971 A:G A G 10 0.530218543708742 0.719617548007844 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181018188_181018833:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181018188_181018448:MR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 29 27 56 13.6236622324465 14.315900680136 -0.692238447689551 A:G G A 10 0.530218543708742 0.893945371002138 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 182993025 C/T 1 7 9 16 3.28847019403881 4.77196689337868 -1.48349669933987 T:C C T 10 0.530218543708742 0.46678737179182 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_182992597_182993269:LAMC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 183072590 T/C 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 T:C T C 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183072463_183072767:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000484114:exon_183072462_183072767:LAMC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 183085755 A/G 1 15 6 21 7.04672184436887 3.18131126225245 3.86541058211642 A:G A G 10 0.530218543708742 0.124647738959612 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183085712_183085810:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000479499:exon_183085712_183085810:LAMC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 183086757 A/C 1 15 3 18 7.04672184436887 1.59065563112623 5.45606621324264 A:C A C 10 0.530218543708742 0.0156221239745499 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183086669_183086858:LAMC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 183094547 T/C 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183094532_183094685:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000466964:exon_183094323_183094685:LAMC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 183105534 T/C 1 17 17 34 7.98628475695139 9.01371524304861 -1.02743048609723 T:C T C 10 0.530218543708742 0.734625445132276 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 183105705 G/A 1 29 16 45 13.6236622324465 8.48349669933987 5.14016553310661 A:G G A 10 0.530218543708742 0.136796734894440 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 183515428 G/A 1 21 21 42 9.86541058211642 11.1345894178836 -1.26917883576716 A:G G A 10 0.530218543708742 0.75806865433379 ENSG00000116698:ENST00000367537:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000458370:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000367539:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000392015:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000413782:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000508461:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000347615:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000507469:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000515829:exon_183515101_183515472:SMG7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 184801065 T/C 1 14 7 21 6.57694038807761 3.71152980596119 2.86541058211642 T:C T C 10 0.530218543708742 0.275142109059742 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000461167:exon_184800981_184801096:FAM129A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 186310238 C/T 1 55 57 112 25.8379800960192 30.2224569913983 -4.3844768953791 T:C C T 10 0.530218543708742 0.449071990172564 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186310160_186310291:TPR;ENSG00000047410:ENST00000481347:exon_186310160_186310291:TPR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 192545099 G/A 1 8 3 11 3.75825165033006 1.59065563112623 2.16759601920384 A:G G A 10 0.530218543708742 0.235945069885030 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 192780268 T/C 1 10 11 21 4.69781456291258 5.83240398079616 -1.13458941788358 T:C T C 10 0.530218543708742 0.666334924600774 ENSG00000116741:ENST00000235382:exon_192780111_192780277:RGS2;ENSG00000116741:ENST00000464302:exon_192780111_192780369:RGS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 192780657 C/T 1 14 25 39 6.57694038807761 13.2554635927186 -6.67852320464094 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0367495834874574 ENSG00000116741:ENST00000235382:exon_192780532_192781403:RGS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 197070776 C/T 1 18 26 44 8.45606621324264 13.7856821364273 -5.32961592318465 T:C C T 10 0.530218543708742 0.130486551743866 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 197094030 C/T 1 5 13 18 2.34890728145629 6.89284106821365 -4.54393378675736 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0351116074210844 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197094000_197094085:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000294732:exon_197094000_197094085:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367408:exon_197094000_197094085:ASPM HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 200534248 C/T 1 10 16 26 4.69781456291258 8.48349669933987 -3.78568213642729 T:C C T 10 0.530218543708742 0.169180403169051 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200534197_200534381:KIF14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 200558363 T/C 1 2 8 10 0.939562912582516 4.24174834966994 -3.30218543708742 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0537596124644068 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200558345_200558497:KIF14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 200635550 T/C 1 10 25 35 4.69781456291258 13.2554635927186 -8.55764902980597 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00386031314232724 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 200635560 T/C 1 22 24 46 10.3351920384077 12.7252450490098 -2.39005301060213 T:C T C 10 0.530218543708742 0.555218088560173 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 200776641 C/T 1 7 1 8 3.28847019403881 0.530218543708742 2.75825165033006 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0743148409803516 ENSG00000118200:ENST00000358823:exon_200776504_200776665:CAMSAP1L1;ENSG00000118200:ENST00000367344:exon_200776504_200776665:CAMSAP1L1;ENSG00000118200:ENST00000413307:exon_200776504_200776665:CAMSAP1L1;ENSG00000118200:ENST00000236925:exon_200776504_200776665:CAMSAP1L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 8 11 19 3.75825165033006 5.83240398079616 -2.0741523304661 A:T A T 10 0.530218543708742 0.366451934145480 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 202117832 A/G 1 9 8 17 4.22803310662132 4.24174834966994 -0.0137152430486136 A:G A G 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 202119546 C/G 1 33 25 58 15.5027880576115 13.2554635927186 2.24732446489296 C:G C G 10 0.530218543708742 0.600126751912356 ENSG00000143851:ENST00000309017:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000367279:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000308986:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000495688:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000462815:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000496197:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000480836:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000477554:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000492977:exon_202118979_202119552:PTPN7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 202888947 T/C 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 T:C T C 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000117153:ENST00000367261:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000435533:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367260:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367258:exon_202888883_202889036:KLHL12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 202935911 T/C 1 12 14 26 5.6373774754951 7.42305961192239 -1.78568213642729 T:C T C 10 0.530218543708742 0.557496480025126 ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000473599:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000478009:exon_202935877_202936026:CYB5R1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 206757857 C/A 1 47 36 83 22.0797284456891 19.0878675735147 2.99186087217442 A:T:C C A 10 0.530218543708742 0.582715011322533 ENSG00000136653:ENST00000355294:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367117:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000338603:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367118:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000435226:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000304534:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000491368:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000481486:exon_206757807_206758627:RASSF5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 206944233 A/G 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 A:G A G 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 207941191 G/T 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 T:G G T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000117335:ENST00000469535:exon_207940358_207943707:CD46 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 209933331 A/G 1 36 25 61 16.9121324264853 13.2554635927186 3.65666883376674 A:G A G 10 0.530218543708742 0.371464434574911 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 209933540 A/G 1 60 32 92 28.1868873774755 16.9669933986797 11.2198939787957 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0212442282436458 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 209936914 C/T 1 29 14 43 13.6236622324465 7.42305961192239 6.2006026205241 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0666092845021738 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 41 37 78 19.2610397079416 19.6180861172235 -0.357046409281875 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 210004199 C/G 1 5 10 15 2.34890728145629 5.30218543708742 -2.95327815563113 C:G C G 10 0.530218543708742 0.194384351758500 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210004148_210004388:C1orf107 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 211840498 T/C 1 20 19 39 9.39562912582516 10.0741523304661 -0.678523204640939 T:C T C 10 0.530218543708742 0.873357648525083 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000489633:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211839772_211840573:NEK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 211848807 A/C 1 12 7 19 5.6373774754951 3.71152980596119 1.9258476695339 A:C A C 10 0.530218543708742 0.492071463010612 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211848726_211848960:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211848726_211848899:NEK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 212276276 A/G 1 22 31 53 10.3351920384077 16.436774854971 -6.10158281656333 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0997508481897577 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212276184_212278348:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212276184_212278186:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212276184_212277936:DTL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 212515613 C/T 1 15 13 28 7.04672184436887 6.89284106821365 0.153880776155224 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000066027:ENST00000261461:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000498129:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000479259:exon_212515530_212515622:PPP2R5A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 89 56 145 41.810549609922 29.6922384476896 12.1183111622324 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0458930489268185 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 213414543 A/G 1 11 9 20 5.16759601920384 4.77196689337868 0.395629125825161 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000136643:ENST00000366960:exon_213414045_213415640:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000366959:exon_213414045_213415640:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000490299:exon_213414045_213415640:RPS6KC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 214492286 G/A 1 11 2 13 5.16759601920384 1.06043708741748 4.10715893178635 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0255493171127343 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214492202_214492326:SMYD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 214510115 T/G 1 44 40 84 20.6703840768154 21.2087417483497 -0.538357671534328 T:G T G 10 0.530218543708742 0.913424098350087 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214510047_214510473:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214510047_214510445:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000416415:exon_214510047_214510474:SMYD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 214826196 G/A 1 34 23 57 15.9725695139028 12.1950265053011 3.77754300860171 A:G G A 10 0.530218543708742 0.354064983035272 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000391896:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000467765:exon_214826171_214826332:CENPF HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 81 78 159 38.0522979595919 41.3570464092819 -3.30474844968998 A:G A G 10 0.530218543708742 0.63382986732593 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 19 20 39 8.9258476695339 10.6043708741748 -1.67852320464094 T:C C T 10 0.530218543708742 0.63239273066813 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 223954080 A/C 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 A:C A C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000433674:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000474026:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000487223:exon_223954069_223954133:CAPN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 226032919 G/A 1 6 10 16 2.81868873774755 5.30218543708742 -2.48349669933987 A:G G A 10 0.530218543708742 0.316586227617054 ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226032847_226033260:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226032847_226033260:EPHX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 6 12 18 2.81868873774755 6.3626225245049 -3.54393378675736 T:G T G 10 0.530218543708742 0.103457190750381 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 226555302 A/G 1 162 142 304 76.1045959191838 75.2910332066414 0.813562712542435 A:G A G 10 0.530218543708742 0.954206123994014 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226555181_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226555181_226555309:PARP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 226570840 T/C 1 186 191 377 87.379350870174 101.27174184837 -13.8923909781957 T:C T C 10 0.530218543708742 0.163516121480375 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 163 157 320 76.5743773754751 83.2443113622725 -6.66993398679745 A:T:G A G 10 0.530218543708742 0.466894253084092 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 121 150 271 56.8435562112422 79.5327815563113 -22.6892253450691 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00611570998120336 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 226595647 C/G 1 58 76 134 27.247324464893 40.2966093218644 -13.0492848569714 A:C:G C G 10 0.530218543708742 0.0245507526944772 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226595511_226595774:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226595511_226595776:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226595511_226595717:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226595511_226595683:PARP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 226923264 G/A 1 26 35 61 12.2143178635727 18.557649029806 -6.34333116623326 A:G G A 10 0.530218543708742 0.123309871832907 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 226924642 C/T 1 21 27 48 9.86541058211642 14.315900680136 -4.45049009801962 T:C C T 10 0.530218543708742 0.247095355795215 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 227172290 C/T 1 13 5 18 6.10715893178635 2.65109271854371 3.45606621324264 T:C C T 10 0.530218543708742 0.15477553907908 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227172249_227172356:ADCK3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 227174210 T/C 1 18 19 37 8.45606621324264 10.0741523304661 -1.61808611722345 T:C T C 10 0.530218543708742 0.624171639477041 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 227216662 T/C 1 18 18 36 8.45606621324264 9.54393378675736 -1.08786757351471 T:C T C 10 0.530218543708742 0.740965509128219 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000429440:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000441725:exon_227216358_227216951:CDC42BPA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 227216775 C/T 1 19 12 31 8.9258476695339 6.3626225245049 2.563225145029 T:C C T 10 0.530218543708742 0.375031576291977 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000429440:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000441725:exon_227216358_227216951:CDC42BPA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 227920061 T/G 1 50 42 92 23.4890728145629 22.2691788357672 1.21989397879574 T:G T G 10 0.530218543708742 0.835009666673078 ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 227922918 A/C 1 23 25 48 10.8049734946989 13.2554635927186 -2.45049009801962 A:C A C 10 0.530218543708742 0.563458294966744 ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227922697_227923200:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227922713_227923112:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227922713_227923090:JMJD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 22 23 45 10.3351920384077 12.1950265053011 -1.85983446689339 A:G A G 10 0.530218543708742 0.654795510593742 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 229461024 C/T 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000154429:ENST00000366687:exon_229456758_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000284617:exon_229456763_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000366686:exon_229457262_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000483092:exon_229459286_229461158:C1orf96 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 27 18 45 12.684099319864 9.54393378675736 3.14016553310661 A:T T A 10 0.530218543708742 0.373499961576001 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 234546245 C/T 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 T:C C T 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234546191_234546277:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000481183:exon_234546191_234546277:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000463793:exon_234546150_234546277:TARBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 20 29 49 9.39562912582516 15.3763377675535 -5.98070864172836 A:G A G 10 0.530218543708742 0.114492268995664 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 19 19 38 8.9258476695339 10.0741523304661 -1.1483046609322 T:C T C 10 0.530218543708742 0.746968586285852 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 25 15 40 11.7445364072814 7.95327815563113 3.79125825165032 A:T T A 10 0.530218543708742 0.268524574525293 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 23 12 35 10.8049734946989 6.3626225245049 4.44235097019403 T:C T C 10 0.530218543708742 0.174770231743044 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 24 2 26 11.2747549509902 1.06043708741748 10.2143178635727 T:C C T 10 0.530218543708742 3.14522616709355e-05 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236702209 C/T 1 9 5 14 4.22803310662132 2.65109271854371 1.57694038807761 T:C C T 10 0.530218543708742 0.43589870850422 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 25 9 34 11.7445364072814 4.77196689337868 6.97256951390277 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0164596205745622 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236706278 G/T 0 8 0 8 3.75825165033006 0 3.75825165033006 G G 10 0.530218543708742 0.0086188222890866 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236706215_236706290:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236706300 T/A 1 9 1 10 4.22803310662132 0.530218543708742 3.69781456291258 A:T T A 10 0.530218543708742 0.0237480022218031 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236708224 A/C 1 3 7 10 1.40934436887377 3.71152980596119 -2.30218543708742 A:C A C 10 0.530218543708742 0.206122472271196 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 28 42 70 13.1538807761552 22.2691788357672 -9.11529805961194 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0311758007080315 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 9 24 33 4.22803310662132 12.7252450490098 -8.49721194238849 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00447836537919969 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 36 33 69 16.9121324264853 17.4972119423885 -0.585079515903196 T:C T C 10 0.530218543708742 0.904523173564931 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 47 38 85 22.0797284456891 20.1483046609322 1.93142378475693 T:C T C 10 0.530218543708742 0.744702791319919 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 43 34 77 20.2006026205241 18.0274304860972 2.17317213442687 A:G A G 10 0.530218543708742 0.649254997019824 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236723074 G/C 1 25 6 31 11.7445364072814 3.18131126225245 8.563225145029 C:G G C 10 0.530218543708742 0.00189608089535249 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236723108 C/T 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236737983 A/G 1 28 33 61 13.1538807761552 17.4972119423885 -4.34333116623326 A:G A G 10 0.530218543708742 0.30507523164127 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236737961_236738203:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000490339:exon_236737961_236738075:HEATR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236748433 G/A 1 9 8 17 4.22803310662132 4.24174834966994 -0.0137152430486136 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236749626 C/T 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 T:C C T 10 0.530218543708742 0.247617633272995 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236749649 T/C 1 10 3 13 4.69781456291258 1.59065563112623 3.10715893178635 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0999408957936294 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236749730 C/T 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 T:C C T 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 236751269 C/T 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 T:C C T 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236751248_236751343:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236751248_236751343:HEATR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 237058744 C/A 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 A:C C A 10 0.530218543708742 0.247617633272995 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000470570:exon_237057641_237058850:MTR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 237058828 C/T 1 9 10 19 4.22803310662132 5.30218543708742 -1.0741523304661 T:C C T 10 0.530218543708742 0.652256323352804 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000470570:exon_237057641_237058850:MTR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 241798631 C/T 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 T:C C T 10 0.530218543708742 0.565817448386735 ENSG00000203668:ENST00000366553:exon_241792155_241799232:CHML HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 242035382 C/T 1 18 10 28 8.45606621324264 5.30218543708742 3.15388077615522 T:C C T 10 0.530218543708742 0.260090119705735 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242035334_242035580:EXO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 242042301 G/A 1 12 13 25 5.6373774754951 6.89284106821365 -1.25546359271855 A:G G A 10 0.530218543708742 0.690551486586856 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 246755124 T/C 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 T:C T C 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000162852:ENST00000483271:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366513:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366512:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366511:exon_246754814_246755243:CNST HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 246922390 A/G 1 44 30 74 20.6703840768154 15.9065563112623 4.76382776555309 A:G A G 10 0.530218543708742 0.295371881670627 ENSG00000143653:ENST00000366510:exon_246922336_246922453:SCCPDH;ENSG00000143653:ENST00000366509:exon_246922336_246922453:SCCPDH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 247006051 G/C 1 36 26 62 16.9121324264853 13.7856821364273 3.126450290058 C:G G C 10 0.530218543708742 0.44780349152123 ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000498601:exon_247005996_247006078:AHCTF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 249142169 C/T 1 60 51 111 28.1868873774755 27.0411457291458 1.14574164832964 T:C C T 10 0.530218543708742 0.84967107456268 ENSG00000171161:ENST00000306562:exon_249141251_249143716:ZNF672;ENSG00000171161:ENST00000394454:exon_249141474_249142832:ZNF672 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 249144610 G/A 1 48 31 79 22.5495099019804 16.436774854971 6.11273504700938 A:G G A 10 0.530218543708742 0.177561939082113 ENSG00000171163:ENST00000463519:exon_249144205_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000306601:exon_249144205_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000427146:exon_249144205_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366470:exon_249144205_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366471:exon_249144207_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000533927:exon_249144208_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000476503:exon_249144223_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366469:exon_249144239_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000477070:exon_249144241_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000482023:exon_249144244_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000412341:exon_249144244_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000451251:exon_249144265_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000315492:exon_249144265_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000470787:exon_249144481_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000462037:exon_249144576_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000474351:exon_249144583_249144715:ZNF692 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 1 249150116 G/C 1 30 23 53 14.0934436887377 12.1950265053011 1.89841718343667 C:G G C 10 0.530218543708742 0.680319572184063 ENSG00000171163:ENST00000463519:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000306601:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000427146:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366471:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000533927:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000476503:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366469:exon_249149924_249150138:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000477070:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000412341:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000451251:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000315492:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000470787:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000474351:exon_249149924_249150285:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000478107:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000491971:exon_249149794_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000496411:exon_249149927_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000468455:exon_249149981_249150142:ZNF692 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 35 31 66 16.442350970194 16.436774854971 0.00557611522302892 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 3172145 C/T 1 76 80 156 35.7033906781356 42.4174834966994 -6.71409281856376 T:C C T 10 0.530218543708742 0.297485250046714 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 3178814 T/A 1 122 177 299 57.3133376675335 93.8486822364473 -36.5353445689139 A:T T A 10 0.530218543708742 2.78118662454582e-05 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 3178815 G/C 1 178 121 299 83.6210992198439 64.1564437887578 19.4646554310861 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0275238936523330 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 21 21 42 9.86541058211642 11.1345894178836 -1.26917883576716 T:C C T 10 0.530218543708742 0.75806865433379 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 3190265 A/G 1 1 9 10 0.469781456291258 4.77196689337868 -4.30218543708742 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0081887012090889 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189764_3191591:PITRM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 3191823 C/T 1 19 13 32 8.9258476695339 6.89284106821365 2.03300660132026 T:C C T 10 0.530218543708742 0.485860889811232 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3191813_3191945:PITRM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 3197856 C/G 1 15 14 29 7.04672184436887 7.42305961192239 -0.376337767553518 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3197783_3197921:PITRM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 3207632 A/G 1 9 7 16 4.22803310662132 3.71152980596119 0.516503300660129 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3207605_3207719:PITRM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 5498724 G/A 1 15 16 31 7.04672184436887 8.48349669933987 -1.436774854971 A:G G A 10 0.530218543708742 0.719617548007844 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 5498810 A/G 1 10 10 20 4.69781456291258 5.30218543708742 -0.60437087417484 A:G A G 10 0.530218543708742 0.825709894540955 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 5782022 C/A 1 6 14 20 2.81868873774755 7.42305961192239 -4.60437087417484 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0445921710114037 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5781581_5782460:C10orf18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 5784151 A/G 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5784060_5784489:C10orf18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 5808086 G/A 1 448 436 884 210.462092418484 231.175285057012 -20.7131926385279 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.167160091744449 ENSG00000057608:ENST00000380191:exon_5807186_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000435969:exon_5807186_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380131:exon_5807187_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380153:exon_5807187_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000479928:exon_5807192_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000447751:exon_5807812_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380181:exon_5807917_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380132:exon_5807917_5808115:GDI2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 5926034 T/C 1 19 11 30 8.9258476695339 5.83240398079616 3.09344368873774 T:C T C 10 0.530218543708742 0.277968900623872 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000492368:exon_5925932_5926040:ANKRD16 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 5929962 G/C 1 15 19 34 7.04672184436887 10.0741523304661 -3.02743048609723 C:G G C 10 0.530218543708742 0.308346500587601 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5929810_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5929884_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5929810_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5929810_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5929810_5930030:ANKRD16 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 5979117 T/C 1 59 57 116 27.7171059211842 30.2224569913983 -2.50535107021407 T:C T C 10 0.530218543708742 0.643300398176827 ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5979073_5979556:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5979073_5979555:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5979073_5979556:FBXO18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 5995052 C/T 1 17 31 48 7.98628475695139 16.436774854971 -8.45049009801962 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0197350498720883 ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_5994756_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_5994784_5995289:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_5994861_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_5995008_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_5995014_5995169:IL15RA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 6002368 T/G 1 12 3 15 5.6373774754951 1.59065563112623 4.04672184436887 T:G T G 10 0.530218543708742 0.0400605809351377 ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 6263457 C/T 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 T:C C T 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000170525:ENST00000379784:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379789:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379781:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000490474:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000467491:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000477914:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379785:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000461744:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000317350:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379782:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000360521:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379775:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000358499:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000444592:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000450232:exon_6263367_6263490:PFKFB3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 11 7 18 5.16759601920384 3.71152980596119 1.45606621324264 T:C C T 10 0.530218543708742 0.638243716970554 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 11505175 A/G 1 16 9 25 7.51650330066013 4.77196689337868 2.74453640728145 A:G A G 10 0.530218543708742 0.319417784881298 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 65 59 124 30.5357946589318 31.2828940788158 -0.747099419884009 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.928417848488968 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 97 103 200 45.568801260252 54.6125100020004 -9.0437087417484 A:G A G 10 0.530218543708742 0.203031656348924 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 12292348 G/T 1 99 92 191 46.5083641728345 48.7801060212043 -2.27174184836972 T:G G T 10 0.530218543708742 0.772026643956082 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 13364914 C/G 1 20 36 56 9.39562912582516 19.0878675735147 -9.69223844768955 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0106475813851908 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13364835_13365047:SEPHS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 9 11 20 4.22803310662132 5.83240398079616 -1.60437087417484 A:G A G 10 0.530218543708742 0.508309614769096 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 14943176 C/G 1 11 6 17 5.16759601920384 3.18131126225245 1.98628475695139 C:G C G 10 0.530218543708742 0.46729790202122 ENSG00000152455:ENST00000378331:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000433779:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000378325:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000354919:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000313519:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000358298:exon_14943132_14943261:SUV39H2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 16547058 A/G 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 A:G A G 10 0.530218543708742 0.296231759838006 ENSG00000165983:ENST00000343656:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000378000:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000298942:exon_16547019_16547159:PTER HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 21827796 G/A 1 12 7 19 5.6373774754951 3.71152980596119 1.9258476695339 A:G G A 10 0.530218543708742 0.492071463010612 ENSG00000078403:ENST00000377100:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377072:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000307729:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377091:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000471315:exon_21827762_21827893:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000446906:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000495130:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377059:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000396529:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000476557:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000430455:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000462999:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000480415:exon_21827762_21827841:MLLT10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 22015245 A/G 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 A:G A G 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000078403:ENST00000377072:exon_22015173_22015284:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000307729:exon_22015173_22015284:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000446906:exon_22015173_22015284:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377059:exon_22015173_22015284:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000438473:exon_22015173_22015284:MLLT10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 24813454 G/A 1 9 17 26 4.22803310662132 9.01371524304861 -4.78568213642729 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0760303242140064 ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000307544:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396446:exon_24813252_24813693:KIAA1217 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 24831846 C/T 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24831812_24833101:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000492009:exon_24831812_24832637:KIAA1217 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 24873743 G/A 1 65 63 128 30.5357946589318 33.4037682536507 -2.86797359471898 A:G G A 10 0.530218543708742 0.658166332319637 ENSG00000107863:ENST00000396432:exon_24872538_24875035:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000320481:exon_24872538_24875035:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000486374:exon_24872543_24875035:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000447364:exon_24873316_24875035:ARHGAP21 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 25312689 A/G 1 4 12 16 1.87912582516503 6.3626225245049 -4.48349669933987 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0415849614694493 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 24 18 42 11.2747549509902 9.54393378675736 1.73082116423284 T:C C T 10 0.530218543708742 0.644735540163763 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 31134214 A/G 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 A:G A G 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000183621:ENST00000331737:exon_31133563_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000361310:exon_31133563_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000413025:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000436087:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000442986:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000452305:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000444692:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000430896:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000375311:exon_31133710_31134502:ZNF438 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 31134425 C/T 1 7 1 8 3.28847019403881 0.530218543708742 2.75825165033006 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0743148409803516 ENSG00000183621:ENST00000331737:exon_31133563_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000361310:exon_31133563_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000413025:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000436087:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000442986:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000452305:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000444692:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000430896:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000375311:exon_31133710_31134502:ZNF438 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 31138817 G/A 1 2 7 9 0.939562912582516 3.71152980596119 -2.77196689337868 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0932648737406713 ENSG00000183621:ENST00000331737:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000361310:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000413025:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000436087:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000442986:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000452305:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000444692:exon_31137460_31139296:ZNF438 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 32141460 T/C 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 T:C T C 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000165322:ENST00000311380:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000375250:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000396144:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000375245:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000344936:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000454919:exon_32141445_32141525:ARHGAP12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 32635834 G/A 1 17 11 28 7.98628475695139 5.83240398079616 2.15388077615522 A:G G A 10 0.530218543708742 0.453884491531812 ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32635691_32636146:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32635691_32636113:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000480402:exon_32635691_32636146:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000469059:exon_32635691_32636049:EPC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 33200468 G/A 1 7 16 23 3.28847019403881 8.48349669933987 -5.19502650530107 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0360477029013052 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000494395:exon_33200455_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33200376_33200598:ITGB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 34620220 C/T 1 15 7 22 7.04672184436887 3.71152980596119 3.33519203840768 T:C C T 10 0.530218543708742 0.200272681658531 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000466092:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34620045_34620272:PARD3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 38344700 C/G 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 43089156 C/T 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 43089965 G/A 1 6 9 15 2.81868873774755 4.77196689337868 -1.95327815563113 A:G G A 10 0.530218543708742 0.438985732589774 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 43289407 G/A 1 56 38 94 26.3077615523104 20.1483046609322 6.15945689137825 A:G G A 10 0.530218543708742 0.216001653888206 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43289300_43289439:BMS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 239 212 451 112.277768053611 112.406331266253 -0.128563212642646 A:T:C T A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 44111806 G/A 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 A:G G A 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000198298:ENST00000361807:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374437:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000430885:exon_44111739_44111843:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374435:exon_44111739_44113351:ZNF485 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 44112245 G/A 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000198298:ENST00000361807:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374437:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374435:exon_44111739_44113351:ZNF485 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 59956041 C/T 1 15 13 28 7.04672184436887 6.89284106821365 0.153880776155224 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000151151:ENST00000373935:exon_59951278_59956459:IPMK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 61552692 G/T 1 23 6 29 10.8049734946989 3.18131126225245 7.62366223244648 T:G G T 10 0.530218543708742 0.00468074559780811 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552607_61552732:CCDC6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 61552774 C/T 1 17 12 29 7.98628475695139 6.3626225245049 1.62366223244648 T:C C T 10 0.530218543708742 0.581764914655282 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552735_61552869:CCDC6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 705 792 1497 331.195926685337 419.933086617324 -88.7371599319868 A:G G A 10 0.530218543708742 4.49663462392775e-06 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 71906150 T/C 1 16 14 30 7.51650330066013 7.42305961192239 0.0934436887377403 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 32 47 79 15.0330066013203 24.9202715543109 -9.88726495299062 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0316371402918859 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 75529087 C/T 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 T:C C T 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 81926718 A/G 1 140 138 278 65.7694038807761 73.1701590318064 -7.40075515103027 A:G A G 10 0.530218543708742 0.400294197794532 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 86131003 T/C 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 T:C T C 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000107771:ENST00000359979:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86130770_86132225:FAM190B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 86131059 A/G 1 6 9 15 2.81868873774755 4.77196689337868 -1.95327815563113 A:G A G 10 0.530218543708742 0.438985732589774 ENSG00000107771:ENST00000359979:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86130770_86132225:FAM190B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 88730312 T/C 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 T:C T C 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000148671:ENST00000372013:exon_88730233_88730672:C10orf116;ENSG00000148671:ENST00000372012:exon_88730233_88730487:C10orf116 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 88946848 G/A 1 16 12 28 7.51650330066013 6.3626225245049 1.15388077615522 A:G G A 10 0.530218543708742 0.708452101922698 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88946842_88946957:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88946842_88946957:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88946842_88946957:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88946842_88946957:FAM35A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 9 8 17 4.22803310662132 4.24174834966994 -0.0137152430486136 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 90767482 A/G 1 34 34 68 15.9725695139028 18.0274304860972 -2.05486097219445 A:G A G 10 0.530218543708742 0.62907070985465 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494410:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000460510:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000477270:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000466081:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000371857:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90767457_90767594:FAS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 91066075 A/G 1 17 10 27 7.98628475695139 5.30218543708742 2.68409931986397 A:G A G 10 0.530218543708742 0.339242316991111 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 91066460 T/A 1 7 23 30 3.28847019403881 12.1950265053011 -8.90655631126226 A:T T A 10 0.530218543708742 0.00143263319734475 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 91066769 C/A 1 11 22 33 5.16759601920384 11.6648079615923 -6.49721194238849 A:C C A 10 0.530218543708742 0.034731606057632 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 91099630 T/C 1 35 77 112 16.442350970194 40.8268278655731 -24.3844768953791 T:C T C 10 0.530218543708742 4.08100722835664e-06 ENSG00000119917:ENST00000371818:exon_91098418_91100728:IFIT3;ENSG00000119917:ENST00000371811:exon_91098418_91100728:IFIT3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 91178000 C/T 1 38 30 68 17.8516953390678 15.9065563112623 1.94513902780554 T:C C T 10 0.530218543708742 0.715854803603245 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 93608142 G/A 1 12 21 33 5.6373774754951 11.1345894178836 -5.49721194238849 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0795650337651618 ENSG00000107854:ENST00000371627:exon_93608140_93608392:TNKS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 95276742 G/C 1 51 35 86 23.9588542708542 18.557649029806 5.40120524104819 C:G G C 10 0.530218543708742 0.280082860273786 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 42 22 64 19.7308211642328 11.6648079615923 8.06601320264051 A:T A T 10 0.530218543708742 0.0454702248062927 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 97607165 G/A 1 7 10 17 3.28847019403881 5.30218543708742 -2.01371524304861 A:G G A 10 0.530218543708742 0.343429778687472 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 88 101 189 41.3407681536307 53.5520729145829 -12.2113047609522 A:T:G A G 10 0.530218543708742 0.0802928347266517 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 98469507 C/A 1 11 11 22 5.16759601920384 5.83240398079616 -0.664807961592324 A:C C A 10 0.530218543708742 0.832858519551156 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 99410790 T/C 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 T:C T C 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000155252:ENST00000416867:exon_99410698_99410898:PI4K2A;ENSG00000155252:ENST00000370631:exon_99410698_99410898:PI4K2A;ENSG00000249967:ENST00000370649:exon_99410698_99410898:RP11-548K23.11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 101157438 G/C 1 78 83 161 36.6429535907181 44.0081391278256 -7.36518553710746 C:G G C 10 0.530218543708742 0.269020879804539 ENSG00000120053:ENST00000370508:exon_101156627_101157443:GOT1;ENSG00000120053:ENST00000489349:exon_101157222_101157443:GOT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 101166544 C/T 1 36 44 80 16.9121324264853 23.3296159231846 -6.41748349669936 T:C C T 10 0.530218543708742 0.178601066457800 ENSG00000120053:ENST00000370508:exon_101166483_101166606:GOT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 101502968 A/G 1 43 32 75 20.2006026205241 16.9669933986797 3.23360922184435 A:C:G A G 10 0.530218543708742 0.488865153822642 ENSG00000119929:ENST00000493385:exon_101502910_101503080:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370476:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000471520:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370472:exon_101502910_101503119:CUTC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 101639796 G/A 1 27 5 32 12.684099319864 2.65109271854371 10.0330066013203 A:G G A 10 0.530218543708742 0.000280136612987798 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 101639877 A/C 1 26 13 39 12.2143178635727 6.89284106821365 5.32147679535906 A:C A C 10 0.530218543708742 0.108077807697263 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 101715899 G/A 1 10 7 17 4.69781456291258 3.71152980596119 0.986284756951386 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.808994386671346 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101714971_101716962:DNMBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 102295836 C/G 1 5 9 14 2.34890728145629 4.77196689337868 -2.42305961192239 C:G C G 10 0.530218543708742 0.284180524640790 ENSG00000166135:ENST00000299163:exon_102295616_102295892:HIF1AN;ENSG00000166135:ENST00000442724:exon_102295659_102295892:HIF1AN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 102684380 C/A 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 A:C C A 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000119906:ENST00000238961:exon_102683732_102684729:FAM178A;ENSG00000119906:ENST00000370271:exon_102683732_102684729:FAM178A;ENSG00000119906:ENST00000370269:exon_102683732_102684729:FAM178A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 179 134 313 84.0908806761352 71.0492848569714 13.0415958191638 T:C C T 10 0.530218543708742 0.141370728806794 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 102750783 C/A 1 6 9 15 2.81868873774755 4.77196689337868 -1.95327815563113 A:C C A 10 0.530218543708742 0.438985732589774 ENSG00000107815:ENST00000476766:exon_102750626_102750811:C10orf2;ENSG00000107815:ENST00000370228:exon_102750626_102750811:C10orf2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 102762256 C/T 1 35 26 61 16.442350970194 13.7856821364273 2.65666883376674 T:C C T 10 0.530218543708742 0.523485596436726 ENSG00000107816:ENST00000426584:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000489526:exon_102762254_102762934:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000429732:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000481129:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102759233_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000454422:exon_102762254_102762703:LZTS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 102766574 A/G 1 50 80 130 23.4890728145629 42.4174834966994 -18.9284106821365 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00107349281145278 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 103908080 G/A 1 12 6 18 5.6373774754951 3.18131126225245 2.45606621324264 A:G G A 10 0.530218543708742 0.345504636527756 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 104436641 C/T 1 22 46 68 10.3351920384077 24.3900530106021 -14.0548609721945 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000893784171021917 ENSG00000138175:ENST00000260746:exon_104436315_104436698:ARL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 104572963 T/C 1 10 15 25 4.69781456291258 7.95327815563113 -3.25546359271855 T:C T C 10 0.530218543708742 0.230578617079935 ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 49 59 108 23.0192913582716 31.2828940788158 -8.26360272054414 A:G G A 10 0.530218543708742 0.122936876690727 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 105362104 G/A 1 12 2 14 5.6373774754951 1.06043708741748 4.57694038807761 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0151598116441243 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 105759018 G/A 1 5 11 16 2.34890728145629 5.83240398079616 -3.48349669933987 A:G G A 10 0.530218543708742 0.130369289858938 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105758877_105759071:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105758877_105759071:SLK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 105762591 G/A 1 29 32 61 13.6236622324465 16.9669933986797 -3.34333116623326 A:G G A 10 0.530218543708742 0.442040008137854 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 115489152 C/G 1 20 11 31 9.39562912582516 5.83240398079616 3.563225145029 C:G C G 10 0.530218543708742 0.213136876174016 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 115489167 G/A 1 18 13 31 8.45606621324264 6.89284106821365 1.563225145029 A:G G A 10 0.530218543708742 0.595148843392745 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 120920588 T/C 1 8 3 11 3.75825165033006 1.59065563112623 2.16759601920384 T:C T C 10 0.530218543708742 0.235945069885030 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 120933324 G/A 1 57 38 95 26.7775430086017 20.1483046609322 6.62923834766951 A:G G A 10 0.530218543708742 0.182530411976691 ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000463322:exon_120933257_120933384:PRDX3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 121196335 G/A 1 16 15 31 7.51650330066013 7.95327815563113 -0.436774854971002 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121196163_121196353:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000369108:exon_121196163_121196353:GRK5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 123503187 T/C 1 36 17 53 16.9121324264853 9.01371524304861 7.89841718343668 T:C T C 10 0.530218543708742 0.038035223938997 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123502626_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123502710_123503373:ATE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 123549691 T/G 1 12 16 28 5.6373774754951 8.48349669933987 -2.84611922384478 T:G T G 10 0.530218543708742 0.344613553609419 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000485281:exon_123549684_123549741:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000470613:exon_123549378_123549804:ATE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 123596254 T/C 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 T:C T C 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123596233_123596332:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123596233_123596332:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123596233_123596332:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123596233_123596332:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000470613:exon_123596233_123596332:ATE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 123673339 T/C 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 T:C T C 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000455628:exon_123673305_123673408:ATE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 123687456 G/A 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 A:G G A 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123687359_123687551:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123687359_123687551:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123687359_123687550:ATE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 123724863 G/A 1 34 29 63 15.9725695139028 15.3763377675535 0.596231746349256 A:G G A 10 0.530218543708742 0.900280665569595 ENSG00000107672:ENST00000369023:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000489266:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000468209:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000482078:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000369017:exon_123724801_123724900:NSMCE4A;ENSG00000107672:ENST00000464321:exon_123724858_123724900:NSMCE4A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 21 19 40 9.86541058211642 10.0741523304661 -0.208741748349681 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 124793921 A/G 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 A:G A G 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000196177:ENST00000358776:exon_124793872_124794031:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000368869:exon_124793872_124794031:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000411816:exon_124793872_124794031:ACADSB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 124800853 C/T 1 7 4 11 3.28847019403881 2.12087417483497 1.16759601920384 T:C C T 10 0.530218543708742 0.557007995713773 ENSG00000196177:ENST00000358776:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000368869:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000496730:exon_124800725_124800895:ACADSB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 126311832 A/G 1 13 12 25 6.10715893178635 6.3626225245049 -0.25546359271855 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000189319:ENST00000337318:exon_126307861_126312173:FAM53B;ENSG00000189319:ENST00000392754:exon_126307861_126312173:FAM53B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 127541184 A/C 1 48 28 76 22.5495099019804 14.8461192238448 7.70339067813561 A:C A C 10 0.530218543708742 0.0847967421997049 ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127541112_127541211:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127541112_127541211:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127541112_127541211:DHX32 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129900858 C/T 1 249 223 472 116.975582616523 118.238735247049 -1.26315263052622 T:C:G C T 10 0.530218543708742 0.926544405817338 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129901066 C/A 1 185 215 400 86.9095694138827 113.99698689738 -27.0874174834968 A:C C A 10 0.530218543708742 0.006815981751291 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 223 212 435 104.761264752951 112.406331266253 -7.64506651330277 T:C T C 10 0.530218543708742 0.471472023293883 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129901501 G/C 1 199 245 444 93.4865098019603 129.903543208642 -36.4170334066815 A:C:G G C 10 0.530218543708742 0.00060414551691896 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 227 170 397 106.640390578116 90.1371524304861 16.5032381476294 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0973614792187266 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129901747 C/T 1 162 236 398 76.1045959191838 125.131576315263 -49.0269803960793 T:C C T 10 0.530218543708742 9.88188808416392e-07 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 270 221 491 126.84099319864 117.178298159632 9.66269503900769 T:C T C 10 0.530218543708742 0.390595969201231 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129901946 T/G 1 265 226 491 124.492085917183 119.829390878176 4.66269503900769 T:G T G 10 0.530218543708742 0.684280490889696 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129902158 C/T 1 233 245 478 109.459079315863 129.903543208642 -20.4444638927787 A:T:C C T 10 0.530218543708742 0.066706928509806 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129902368 T/A 1 284 231 515 133.417933586717 122.480483596719 10.9374499899979 A:T:G T A 10 0.530218543708742 0.353915792493266 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129903179 T/C 1 195 158 353 91.6073839767953 83.7745299059812 7.83285407081407 T:C T C 10 0.530218543708742 0.42394252056623 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129903465 A/G 1 191 197 388 89.7282581516303 104.453053110622 -14.7247949589919 A:G A G 10 0.530218543708742 0.140270957588314 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129904477 C/T 1 161 139 300 75.6348144628925 73.7003775755151 1.9344368873774 T:C C T 10 0.530218543708742 0.862285595155844 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129905896 T/A 1 101 98 199 47.4479270854171 51.9614172834567 -4.51349019803966 A:T T A 10 0.530218543708742 0.523705114632429 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129906468 C/T 1 86 85 171 40.4012052410482 45.0685762152431 -4.66737097419488 T:C C T 10 0.530218543708742 0.491091920233489 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129906980 C/T 1 112 88 200 52.6155231046209 46.6592318463693 5.9562912582516 T:C C T 10 0.530218543708742 0.435931836318936 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 66 75 141 31.005576115223 39.7663907781557 -8.76081466293262 C:G G C 10 0.530218543708742 0.151540290139014 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 131506192 C/T 1 36 37 73 16.9121324264853 19.6180861172235 -2.70595369073816 T:C C T 10 0.530218543708742 0.55875239082406 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 131506283 C/T 1 43 26 69 20.2006026205241 13.7856821364273 6.4149204840968 T:C C T 10 0.530218543708742 0.147383035847567 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 133769482 G/C 1 45 99 144 21.1401655331066 52.4916358271655 -31.3514702940588 C:G G C 10 0.530218543708742 1.54833250139537e-07 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 21 12 33 9.86541058211642 6.3626225245049 3.50278805761151 A:G A G 10 0.530218543708742 0.295304940575471 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 10 134161633 A/G 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 A:G A G 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000148814:ENST00000368615:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000392638:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000432555:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000344079:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368614:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000462656:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368613:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000356571:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368612:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000450442:exon_134161488_134161853:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368610:exon_134161488_134161860:LRRC27 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 236091 G/A 1 14 8 22 6.57694038807761 4.24174834966994 2.33519203840768 A:G G A 10 0.530218543708742 0.394985358070535 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_236048_236431:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_236048_236354:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_236048_236352:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_236048_236330:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525237:exon_236048_236326:SIRT3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 250886 C/T 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000185627:ENST00000527982:exon_250784_252983:PSMD13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 98 60 158 46.0385827165433 31.8131126225245 14.2254700940188 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0254471099656009 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 408 365 773 191.670834166833 193.529768453691 -1.85893428685756 A:G A G 10 0.530218543708742 0.91392803928601 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 420983 C/G 1 14 28 42 6.57694038807761 14.8461192238448 -8.26917883576716 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0127298391094514 ENSG00000185101:ENST00000412024:exon_420945_421042:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000526142:exon_420945_421042:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000534161:exon_420945_421042:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_420945_421042:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_420945_421042:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_420945_421042:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000525804:exon_420929_421042:ANO9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 428385 A/G 1 21 20 41 9.86541058211642 10.6043708741748 -0.738960292058422 A:G A G 10 0.530218543708742 0.876235151511188 ENSG00000185101:ENST00000412024:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000526142:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000534161:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_428358_428394:ANO9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 428489 T/C 1 28 14 42 13.1538807761552 7.42305961192239 5.73082116423284 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0889577267783979 ENSG00000185101:ENST00000412024:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000526142:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000534161:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_428475_428639:ANO9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 431834 A/G 1 13 4 17 6.10715893178635 2.12087417483497 3.98628475695139 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0859391418136884 ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_431694_433459:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_431694_431906:ANO9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 490035 C/T 1 8 12 20 3.75825165033006 6.3626225245049 -2.60437087417484 T:C C T 10 0.530218543708742 0.269017553119515 ENSG00000174915:ENST00000308020:exon_489883_490068:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000526878:exon_489883_490068:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000531411:exon_489883_490068:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000530029:exon_489791_490068:PTDSS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 490036 G/A 1 12 8 20 5.6373774754951 4.24174834966994 1.39562912582516 A:G G A 10 0.530218543708742 0.655843927791304 ENSG00000174915:ENST00000308020:exon_489883_490068:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000526878:exon_489883_490068:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000531411:exon_489883_490068:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000530029:exon_489791_490068:PTDSS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 494662 G/A 1 185 128 313 86.9095694138827 67.867973594719 19.0415958191638 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0314589007418244 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494512_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494513_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494513_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494515_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494515_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494516_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494523_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494546_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494548_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494552_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494561_494778:RNH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 494942 G/C 1 165 124 289 77.5139402880576 65.747099419884 11.7668408681736 T:C:G G C 10 0.530218543708742 0.175357819356926 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 534242 A/G 1 9 17 26 4.22803310662132 9.01371524304861 -4.78568213642729 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0760303242140064 ENSG00000174775:ENST00000397594:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000397596:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000493230:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000451590:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000417302:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000311189:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000468682:exon_534212_534375:HRAS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 562421 G/A 1 14 23 37 6.57694038807761 12.1950265053011 -5.61808611722345 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0708425436120568 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_562385_562776:RASSF7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 562437 G/A 1 24 17 41 11.2747549509902 9.01371524304861 2.26103970794158 A:G G A 10 0.530218543708742 0.533344251281401 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_562385_562776:RASSF7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 563257 G/A 1 18 19 37 8.45606621324264 10.0741523304661 -1.61808611722345 A:G G A 10 0.530218543708742 0.624171639477041 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563189_563478:RASSF7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 563649 C/T 1 35 27 62 16.442350970194 14.315900680136 2.126450290058 T:C C T 10 0.530218543708742 0.612999178268555 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563558_564018:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563558_564021:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563558_563685:RASSF7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 587425 C/A 1 19 7 26 8.9258476695339 3.71152980596119 5.21431786357271 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0486706148796422 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_587259_588497:PHRF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 607175 G/A 1 16 18 34 7.51650330066013 9.54393378675736 -2.02743048609723 A:G G A 10 0.530218543708742 0.497520057256665 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 609068 G/A 1 28 29 57 13.1538807761552 15.3763377675535 -2.22245699139829 A:G G A 10 0.530218543708742 0.596760615886557 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 609353 G/A 1 44 49 93 20.6703840768154 25.9807086417284 -5.31032456491301 A:G G A 10 0.530218543708742 0.299139601543123 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 610724 C/T 1 36 29 65 16.9121324264853 15.3763377675535 1.53579465893177 T:C C T 10 0.530218543708742 0.711672869065587 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_610501_610761:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_610667_610735:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_610667_610761:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_610501_610761:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_610501_610761:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_610501_610761:PHRF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 612967 A/G 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 A:G A G 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 613165 G/C 1 12 9 21 5.6373774754951 4.77196689337868 0.865410582116419 C:G G C 10 0.530218543708742 0.828055654924615 ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 613192 A/G 1 10 5 15 4.69781456291258 2.65109271854371 2.04672184436887 A:G A G 10 0.530218543708742 0.315050043511805 ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 613208 T/C 1 204 185 389 95.8354170834166 98.0904305861173 -2.25501350270063 T:C:G T C 10 0.530218543708742 0.839064857386772 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 613297 T/G 1 210 236 446 98.6541058211642 125.131576315263 -26.4774704940989 T:G T G 10 0.530218543708742 0.0135447037900978 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 614318 T/C 1 109 142 251 51.2061787357471 75.2910332066414 -24.0848544708942 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00238085753329401 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614203_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000525750:exon_613785_614397:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614009_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614090_614399:IRF7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 615010 G/T 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 T:G G T 10 0.530218543708742 0.797017339461022 ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 615011 A/T 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 A:T A T 10 0.530218543708742 0.797017339461022 ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 617519 A/G 1 1 7 8 0.469781456291258 3.71152980596119 -3.24174834966994 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0300386507500581 ENSG00000099834:ENST00000430727:exon_616575_617770:CDHR5;ENSG00000099834:ENST00000397542:exon_616575_617770:CDHR5;ENSG00000099834:ENST00000358353:exon_616577_617770:CDHR5;ENSG00000099834:ENST00000531177:exon_617256_617770:CDHR5;ENSG00000099834:ENST00000349570:exon_617256_617770:CDHR5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 654043 G/A 1 29 13 42 13.6236622324465 6.89284106821365 6.73082116423284 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0438484687093267 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_653941_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_653962_654051:DEAF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 823827 G/A 1 75 75 150 35.2336092218443 39.7663907781557 -4.53278155631131 A:G G A 10 0.530218543708742 0.462894413236207 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_823694_823855:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_823527_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_823694_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000526083:exon_823648_823855:PNPLA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 840363 C/T 1 98 93 191 46.0385827165433 49.310324564913 -3.27174184836972 T:C C T 10 0.530218543708742 0.663848819502768 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 870446 G/A 1 25 27 52 11.7445364072814 14.315900680136 -2.57136427285458 A:G G A 10 0.530218543708742 0.490346034709667 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 977162 G/A 1 9 12 21 4.22803310662132 6.3626225245049 -2.13458941788358 A:G G A 10 0.530218543708742 0.387625542901861 ENSG00000183020:ENST00000529818:exon_977095_977193:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_977095_977224:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_977095_977224:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_977095_977224:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_977095_977224:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_977095_977224:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000525796:exon_977095_977224:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_977095_977224:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_977095_977224:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_977095_977224:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534485:exon_977095_977207:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_977095_977224:AP2A2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 4103524 A/G 1 16 8 24 7.51650330066013 4.24174834966994 3.27475495099019 A:G A G 10 0.530218543708742 0.221301455207229 ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533343:exon_4103435_4103581:STIM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 39 31 70 18.3214767953591 16.436774854971 1.88470194038806 A:C C A 10 0.530218543708742 0.719866384495976 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 137 119 256 64.3600595119023 63.0960067013403 1.26405281056205 A:G A G 10 0.530218543708742 0.900428656860241 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 4411241 C/T 1 38 43 81 17.8516953390678 22.7993973794759 -4.9477020404081 T:C C T 10 0.530218543708742 0.316434932778956 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4411232_4411688:TRIM21 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 5663706 G/C 1 12 10 22 5.6373774754951 5.30218543708742 0.335192038407676 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5663636_5663736:TRIM34 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 134 97 231 62.9507151430286 51.431198739748 11.5195164032806 T:C T C 10 0.530218543708742 0.130114930510971 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 6340525 A/T 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 A:T A T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 6530401 G/C 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 C:G G C 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6530392_6530502:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000354685:exon_6530392_6530502:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000472080:exon_6530392_6530502:DNHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 6541225 C/G 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 C:G C G 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6541195_6541332:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000354685:exon_6541195_6542090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000472080:exon_6541195_6542088:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000469814:exon_6541195_6541332:DNHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 6588228 G/A 1 14 7 21 6.57694038807761 3.71152980596119 2.86541058211642 A:G G A 10 0.530218543708742 0.275142109059742 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6588155_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525080:exon_6588155_6588582:DNHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 6588553 C/T 1 4 11 15 1.87912582516503 5.83240398079616 -3.95327815563113 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0665948341907382 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6588155_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525080:exon_6588155_6588582:DNHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 8977830 A/G 1 6 8 14 2.81868873774755 4.24174834966994 -1.42305961192239 A:G A G 10 0.530218543708742 0.594188084236152 ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 9225486 C/G 1 14 17 31 6.57694038807761 9.01371524304861 -2.436774854971 C:G C G 10 0.530218543708742 0.472338437680562 ENSG00000184014:ENST00000328194:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000530044:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000526707:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000532696:exon_9225079_9225864:DENND5A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 9305051 T/C 1 4 11 15 1.87912582516503 5.83240398079616 -3.95327815563113 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0665948341907382 ENSG00000166471:ENST00000299596:exon_9304918_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000524543:exon_9302201_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000429086:exon_9304918_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000528080:exon_9302218_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000533867:exon_9304686_9305140:TMEM41B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 9537904 G/C 1 21 17 38 9.86541058211642 9.01371524304861 0.851695339067804 C:G G C 10 0.530218543708742 0.871388814633707 ENSG00000166478:ENST00000396604:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396602:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000530463:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396597:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000299606:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000447186:exon_9537748_9537909:ZNF143 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 9607032 A/G 1 35 21 56 16.442350970194 11.1345894178836 5.30776155231045 A:G A G 10 0.530218543708742 0.180790153437642 ENSG00000166483:ENST00000450114:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000299613:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000524612:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530712:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530175:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000532275:exon_9606989_9607074:WEE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 9754221 C/T 1 28 44 72 13.1538807761552 23.3296159231846 -10.1757351470294 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0179845182287855 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9754076_9754257:SWAP70 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 9769562 C/G 1 39 59 98 18.3214767953591 31.2828940788158 -12.9614172834567 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0110323666549939 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 13441126 A/G 1 7 9 16 3.28847019403881 4.77196689337868 -1.48349669933987 A:G A G 10 0.530218543708742 0.46678737179182 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13441040_13441292:BTBD10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 13443250 C/T 1 6 11 17 2.81868873774755 5.83240398079616 -3.01371524304861 T:C C T 10 0.530218543708742 0.153573028313809 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13443189_13443362:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13443189_13443385:BTBD10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 17095967 T/A 1 353 275 628 165.832854070814 145.810099519904 20.02275455091 A:T:G T A 10 0.530218543708742 0.109988359264654 ENSG00000110700:ENST00000531008:exon_17095936_17096013:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000531908:exon_17095936_17096013:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000228140:exon_17095936_17096013:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000526895:exon_17095936_17096013:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000525634:exon_17095936_17096013:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000525828:exon_17095940_17096013:RPS13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 17111272 A/G 1 15 17 32 7.04672184436887 9.01371524304861 -1.96699339867974 A:G A G 10 0.530218543708742 0.595927881466323 ENSG00000011405:ENST00000265970:exon_17108119_17111467:PIK3C2A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 17191019 A/G 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000011405:ENST00000265970:exon_17190224_17191288:PIK3C2A;ENSG00000011405:ENST00000533645:exon_17190224_17191353:PIK3C2A;ENSG00000011405:ENST00000532035:exon_17190899_17191353:PIK3C2A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 7 16 23 3.28847019403881 8.48349669933987 -5.19502650530107 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0360477029013052 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 18309464 G/A 1 14 14 28 6.57694038807761 7.42305961192239 -0.846119223844775 A:G G A 10 0.530218543708742 0.850434684608347 ENSG00000110756:ENST00000438420:exon_18309440_18309560:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000349215:exon_18309440_18309560:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000396253:exon_18309440_18309560:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000352460:exon_18309440_18309560:HPS5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 18327684 G/T 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 T:G G T 10 0.530218543708742 0.797017339461022 ENSG00000110756:ENST00000438420:exon_18327682_18327894:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000349215:exon_18327682_18327894:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000396253:exon_18327682_18327894:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000352460:exon_18327682_18327894:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000531848:exon_18327682_18327894:HPS5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 18357419 A/G 1 15 9 24 7.04672184436887 4.77196689337868 2.27475495099019 A:G A G 10 0.530218543708742 0.416361226154525 ENSG00000110768:ENST00000453096:exon_18357301_18357493:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000531757:exon_18357301_18357451:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000418116:exon_18357301_18357493:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000525831:exon_18357301_18357431:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000265963:exon_18357301_18357493:GTF2H1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 18422487 C/A 1 521 687 1208 244.756138727745 364.260139527906 -119.50400080016 A:C C A 10 0.530218543708742 5.98085713889501e-12 ENSG00000134333:ENST00000422447:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000396222:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000379412:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000445376:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000227157:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000478970:exon_18422384_18422517:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000486690:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000460405:exon_18422384_18422557:LDHA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 18555901 C/G 1 11 4 15 5.16759601920384 2.12087417483497 3.04672184436887 C:G C G 10 0.530218543708742 0.128499041794511 ENSG00000151116:ENST00000396197:exon_18555877_18556000:UEVLD;ENSG00000151116:ENST00000379387:exon_18555877_18556000:UEVLD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 18555949 T/C 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 T:C T C 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000151116:ENST00000396197:exon_18555877_18556000:UEVLD;ENSG00000151116:ENST00000379387:exon_18555877_18556000:UEVLD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 18633971 G/A 1 12 5 17 5.6373774754951 2.65109271854371 2.98628475695139 A:G G A 10 0.530218543708742 0.223474867867513 ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 19174130 C/G 1 5 8 13 2.34890728145629 4.24174834966994 -1.89284106821365 C:G C G 10 0.530218543708742 0.406203894191414 ENSG00000177054:ENST00000446113:exon_19174106_19174231:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000527094:exon_19174106_19174231:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000319776:exon_19174106_19174231:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000399351:exon_19174106_19174231:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000525490:exon_19174106_19174231:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000532812:exon_19174106_19174231:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000530698:exon_19174106_19174172:ZDHHC13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 27362359 T/G 1 11 24 35 5.16759601920384 12.7252450490098 -7.55764902980597 T:G T G 10 0.530218543708742 0.0110753528554956 ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 32955122 A/G 1 7 11 18 3.28847019403881 5.83240398079616 -2.54393378675736 A:G A G 10 0.530218543708742 0.246988872578824 ENSG00000060749:ENST00000399302:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000078652:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000428421:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000527788:exon_32954638_32956981:QSER1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 33065394 C/T 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 T:C C T 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000176148:ENST00000532687:exon_33065296_33065658:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33065301_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528898:exon_33065296_33065482:TCP11L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 33076191 T/C 1 9 6 15 4.22803310662132 3.18131126225245 1.04672184436887 T:C T C 10 0.530218543708742 0.617171705992842 ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33076139_33076271:TCP11L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 19 12 31 8.9258476695339 6.3626225245049 2.563225145029 T:C T C 10 0.530218543708742 0.375031576291977 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 33886294 A/G 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 A:G A G 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33886148_33886475:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33886148_33886697:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33886148_33886363:LMO2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 34482908 C/T 1 10 15 25 4.69781456291258 7.95327815563113 -3.25546359271855 T:C C T 10 0.530218543708742 0.230578617079935 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34482798_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000530343:exon_34482280_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000525707:exon_34482750_34482936:CAT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 35198201 C/T 1 36 33 69 16.9121324264853 17.4972119423885 -0.585079515903196 T:C C T 10 0.530218543708742 0.904523173564931 ENSG00000026508:ENST00000263398:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000360158:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000449691:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526025:exon_35198122_35198684:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528086:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000425428:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433892:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000278386:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000434472:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000352818:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000442151:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525211:exon_35198118_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526669:exon_35198118_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526000:exon_35198121_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000279452:exon_35198175_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000527889:exon_35198188_35198287:CD44 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 43472746 C/T 1 11 10 21 5.16759601920384 5.30218543708742 -0.134589417883582 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000052841:ENST00000039989:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525135:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525543:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000533554:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000418561:exon_43472730_43472815:TTC17 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 32 26 58 15.0330066013203 13.7856821364273 1.24732446489296 T:G G T 10 0.530218543708742 0.79330489030335 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 44104981 C/T 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 44129290 C/A 1 10 11 21 4.69781456291258 5.83240398079616 -1.13458941788358 A:C C A 10 0.530218543708742 0.666334924600774 ENSG00000151348:ENST00000533608:exon_44129233_44129798:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000395673:exon_44129178_44129798:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000532479:exon_44129233_44129409:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000527014:exon_44129233_44129599:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000358681:exon_44129233_44129798:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000343631:exon_44129233_44129798:EXT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 402 390 792 188.852145429086 206.785232046409 -17.9330866173237 A:G A G 10 0.530218543708742 0.212759082083478 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 47182985 G/A 1 6 8 14 2.81868873774755 4.24174834966994 -1.42305961192239 A:G G A 10 0.530218543708742 0.594188084236152 ENSG00000149179:ENST00000395460:exon_47182678_47183798:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000532031:exon_47181656_47183796:C11orf49 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 47303275 T/C 1 10 15 25 4.69781456291258 7.95327815563113 -3.25546359271855 T:C T C 10 0.530218543708742 0.230578617079935 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000489415:exon_47303126_47303304:MADD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 47306585 G/A 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 A:G G A 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000524530:exon_47306497_47306616:MADD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 47640429 G/C 1 52 45 97 24.4286357271454 23.8598344668934 0.568801260252027 C:G G C 10 0.530218543708742 0.919399414561509 ENSG00000109919:ENST00000302503:exon_47638868_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000534074:exon_47640256_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000531669:exon_47640262_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000525649:exon_47640391_47640471:MTCH2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 58940278 G/T 1 13 6 19 6.10715893178635 3.18131126225245 2.9258476695339 T:G G T 10 0.530218543708742 0.250330538073418 ENSG00000110042:ENST00000227451:exon_58939965_58940279:DTX4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 58978940 C/T 1 30 35 65 14.0934436887377 18.557649029806 -4.46420534106823 T:C C T 10 0.530218543708742 0.320189288280246 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 63988045 G/A 1 199 204 403 93.4865098019603 108.164582916583 -14.678073114623 A:G G A 10 0.530218543708742 0.147934435765673 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 63988102 C/T 1 362 326 688 170.060887177435 172.85124524905 -2.79035807161449 T:C C T 10 0.530218543708742 0.84857861183645 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 63991801 T/C 1 74 74 148 34.7638277655531 39.2361722344469 -4.47234446889381 T:C T C 10 0.530218543708742 0.510157532221599 ENSG00000149743:ENST00000394547:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63991757_63991813:TRPT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 64026144 G/A 1 11 10 21 5.16759601920384 5.30218543708742 -0.134589417883582 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64025945_64026185:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64025945_64026185:PLCB3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 64107735 G/A 1 13 15 28 6.10715893178635 7.95327815563113 -1.84611922384478 A:G G A 10 0.530218543708742 0.571296577994255 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64107695_64107798:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64107695_64107798:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64107695_64107798:CCDC88B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 64109118 T/G 1 22 18 40 10.3351920384077 9.54393378675736 0.791258251650321 T:G T G 10 0.530218543708742 0.874748993044135 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 64109208 G/C 1 38 22 60 17.8516953390678 11.6648079615923 6.18688737747548 A:C:G G C 10 0.530218543708742 0.121192996059796 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 64111928 T/C 1 71 44 115 33.3544833966793 23.3296159231846 10.0248674734947 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0622365743114635 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 64124515 T/C 1 138 149 287 64.8298409681936 79.0025630126026 -14.1727220444089 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0978351825719228 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64124511_64125006:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64124511_64124958:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64124511_64124997:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64124511_64125002:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64122666_64125000:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64124511_64124842:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000472524:exon_64124511_64125003:CCDC88B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 64127744 A/G 1 14 5 19 6.57694038807761 2.65109271854371 3.9258476695339 A:G A G 10 0.530218543708742 0.105397064107856 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64127635_64127853:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64127635_64127853:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64127635_64127853:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000531659:exon_64127635_64127853:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64127635_64127853:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64127635_64127853:RPS6KA4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 64138805 T/C 1 30 28 58 14.0934436887377 14.8461192238448 -0.752675535107036 T:C T C 10 0.530218543708742 0.895658325358999 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64138755_64138813:RPS6KA4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 64138905 T/G 1 10 13 23 4.69781456291258 6.89284106821365 -2.19502650530107 T:G T G 10 0.530218543708742 0.407163540617657 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 64534502 A/T 1 78 81 159 36.6429535907181 42.9477020404081 -6.30474844968998 A:T A T 10 0.530218543708742 0.340590374528141 ENSG00000168066:ENST00000377387:exon_64534372_64534551:SF1;ENSG00000168066:ENST00000377390:exon_64534372_64534551:SF1;ENSG00000168066:ENST00000227503:exon_64534372_64534551:SF1;ENSG00000168066:ENST00000448404:exon_64534372_64534551:SF1;ENSG00000168066:ENST00000377394:exon_64534372_64534551:SF1;ENSG00000168066:ENST00000334944:exon_64534372_64534551:SF1;ENSG00000168066:ENST00000443908:exon_64534372_64534551:SF1;ENSG00000168066:ENST00000422298:exon_64534372_64534551:SF1;ENSG00000168066:ENST00000413725:exon_64534372_64534551:SF1;ENSG00000168066:ENST00000433274:exon_64534372_64534551:SF1;ENSG00000168066:ENST00000486867:exon_64534372_64534551:SF1;ENSG00000168066:ENST00000477596:exon_64533886_64534551:SF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 64622869 G/C 1 110 92 202 51.6759601920384 48.7801060212043 2.89585417083412 C:G G C 10 0.530218543708742 0.724647114760552 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 64645871 A/G 1 116 110 226 54.4946489297859 58.3240398079616 -3.82939087817569 A:G A G 10 0.530218543708742 0.641023081120065 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 64799998 T/C 1 9 8 17 4.22803310662132 4.24174834966994 -0.0137152430486136 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000525648:exon_64799903_64800023:SNX15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 31 27 58 14.563225145029 14.315900680136 0.247324464892964 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 79 76 155 37.1127350470094 40.2966093218644 -3.18387427485501 T:C C T 10 0.530218543708742 0.629735012452515 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 65064690 G/A 1 27 21 48 12.684099319864 11.1345894178836 1.54950990198038 A:G G A 10 0.530218543708742 0.66785288455756 ENSG00000014138:ENST00000265465:exon_65064591_65066156:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000527618:exon_65064591_65065087:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000534785:exon_65064591_65065023:POLA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 58 51 109 27.247324464893 27.0411457291458 0.206178735747123 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 65631326 A/G 1 25 31 56 11.7445364072814 16.436774854971 -4.69223844768955 A:G A G 10 0.530218543708742 0.229357689316443 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631275_65631372:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631275_65631559:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631275_65631372:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631275_65631372:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631272_65631372:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65631275_65631361:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631275_65631559:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631277_65631372:MUS81 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 66031660 C/T 1 30 19 49 14.0934436887377 10.0741523304661 4.01929135827164 T:C C T 10 0.530218543708742 0.256788037035895 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66031517_66031690:KLC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 66043253 T/C 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 T:C T C 10 0.530218543708742 0.73053574105774 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 66206169 C/T 1 19 12 31 8.9258476695339 6.3626225245049 2.563225145029 T:C C T 10 0.530218543708742 0.375031576291977 ENSG00000174547:ENST00000310999:exon_66206103_66206319:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000534488:exon_66206103_66206297:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000329819:exon_66206103_66206305:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000394025:exon_66206103_66206295:MRPL11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 66259184 C/T 1 27 35 62 12.684099319864 18.557649029806 -5.873549709942 T:C C T 10 0.530218543708742 0.161281510813741 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66259169_66259227:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66259169_66259227:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66259169_66259227:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66259169_66259227:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66259169_66259227:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526250:exon_66259076_66259227:DPP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 13 23 36 6.10715893178635 12.1950265053011 -6.08786757351471 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0457431861260959 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 66276576 G/A 1 42 40 82 19.7308211642328 21.2087417483497 -1.47792058411684 A:G G A 10 0.530218543708742 0.741664818493153 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66276550_66277021:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66276550_66277128:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66276550_66277130:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66276550_66277130:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66276550_66276816:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66276550_66277127:DPP3;ENSG00000174483:ENST00000419755:exon_66276546_66276785:BBS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 66299515 A/G 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 A:G A G 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000174483:ENST00000419755:exon_66299422_66301084:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000526760:exon_66299127_66301084:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000318312:exon_66299422_66301098:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000455748:exon_66299422_66299551:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529955:exon_66299127_66299676:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000393994:exon_66299127_66299690:BBS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 66610645 G/C 1 33 20 53 15.5027880576115 10.6043708741748 4.89841718343667 C:G G C 10 0.530218543708742 0.215379109297661 ENSG00000173715:ENST00000360962:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000346672:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000527634:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000528340:exon_66610640_66610793:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532565:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000525449:exon_66610640_66610795:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532727:exon_66610640_66610763:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000531415:exon_66610640_66610744:C11orf80;ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66610306_66611332:RCE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 66626234 T/C 1 30 25 55 14.0934436887377 13.2554635927186 0.837980096019189 A:T:C T C 10 0.530218543708742 0.892846109412022 ENSG00000173621:ENST00000393952:exon_66625206_66626347:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000309602:exon_66624973_66626564:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000525479:exon_66624996_66626528:LRFN4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67050292 G/A 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G G A 10 0.530218543708742 0.73053574105774 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67120530 C/G 1 233 237 470 109.459079315863 125.661794858972 -16.2027155431087 C:G C G 10 0.530218543708742 0.139262952578159 ENSG00000175482:ENST00000529704:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000533429:exon_67120162_67120549:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000530584:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000312419:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000532830:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000534515:exon_67119024_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000528087:exon_67119036_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000531239:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000524743:exon_67120459_67120631:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000525255:exon_67119995_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000529000:exon_67120364_67120582:POLD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67164791 T/C 1 9 7 16 4.22803310662132 3.71152980596119 0.516503300660129 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000172613:ENST00000307980:exon_67164650_67164857:RAD9A;ENSG00000172613:ENST00000529100:exon_67164650_67164861:RAD9A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67165015 T/C 1 26 18 44 12.2143178635727 9.54393378675736 2.67038407681535 T:C T C 10 0.530218543708742 0.453104727395328 ENSG00000172613:ENST00000307980:exon_67164935_67165880:RAD9A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67171736 C/T 1 23 22 45 10.8049734946989 11.6648079615923 -0.859834466893389 T:C C T 10 0.530218543708742 0.881561350298545 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67171662_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67171600_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67171658_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67171660_67171825:TBC1D10C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 73 59 132 34.2940463092618 31.2828940788158 3.01115223044606 T:C C T 10 0.530218543708742 0.663005542646445 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 66 57 123 31.005576115223 30.2224569913983 0.783119123824736 A:T:C C T 10 0.530218543708742 0.928142502993839 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67205978 G/A 1 10 3 13 4.69781456291258 1.59065563112623 3.10715893178635 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0999408957936294 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67209515 C/T 1 17 17 34 7.98628475695139 9.01371524304861 -1.02743048609723 T:C C T 10 0.530218543708742 0.734625445132276 ENSG00000172725:ENST00000393893:exon_67209437_67209559:CORO1B;ENSG00000172725:ENST00000341356:exon_67209437_67209559:CORO1B;ENSG00000172725:ENST00000393886:exon_67209437_67209559:CORO1B;ENSG00000172725:ENST00000453768:exon_67209437_67209559:CORO1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67209869 T/G 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 T:G T G 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67351297 G/A 1 478 249 727 224.555536107221 132.024417383477 92.5311187237446 A:T:G G A 10 0.530218543708742 4.80349229476798e-12 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67351066_67351315:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67351213_67351315:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351293_67351315:GSTP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67351585 C/G 1 8 13 21 3.75825165033006 6.89284106821365 -3.13458941788358 A:C:G C G 10 0.530218543708742 0.193644496250896 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 1312 879 2191 616.35327065413 466.062099919984 150.291170734146 A:G A G 10 0.530218543708742 1.10602085184839e-10 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67353970 T/C 1 1089 768 1857 511.59200590118 407.207841568314 104.384164332866 T:C T C 10 0.530218543708742 1.15644703554167e-06 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67378838 C/G 1 6 13 19 2.81868873774755 6.89284106821365 -4.0741523304661 C:G C G 10 0.530218543708742 0.068469288507053 ENSG00000167792:ENST00000527923:exon_67378619_67379040:NDUFV1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 28 16 44 13.1538807761552 8.48349669933987 4.67038407681535 T:C C T 10 0.530218543708742 0.175662824860251 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 68204381 G/C 1 9 7 16 4.22803310662132 3.71152980596119 0.516503300660129 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68204357_68204467:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68204357_68204467:LRP5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 70049523 A/G 1 66 54 120 31.005576115223 28.6318013602721 2.37377475495096 A:G A G 10 0.530218543708742 0.714774692704921 ENSG00000168040:ENST00000301838:exon_70049269_70049851:FADD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 70221160 A/G 1 12 7 19 5.6373774754951 3.71152980596119 1.9258476695339 A:G A G 10 0.530218543708742 0.492071463010612 ENSG00000131626:ENST00000253925:exon_70221024_70221199:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000389547:exon_70221024_70221199:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000532504:exon_70221024_70221199:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526262:exon_70221024_70221199:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530548:exon_70221024_70221199:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000531657:exon_70221024_70221199:PPFIA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 71726785 A/G 1 74 84 158 34.7638277655531 44.5383576715343 -9.77452990598123 A:G A G 10 0.530218543708742 0.129910077295818 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71723941_71727306:NUMA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 71806603 A/G 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 A:G A G 10 0.530218543708742 0.565817448386735 ENSG00000241994:ENST00000289488:exon_71806425_71807941:AP000812.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 71941212 A/G 1 30 29 59 14.0934436887377 15.3763377675535 -1.28289407881578 A:G A G 10 0.530218543708742 0.794709103237718 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71941165_71941315:INPPL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 71948233 A/G 1 47 76 123 22.0797284456891 40.2966093218644 -18.2168808761753 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00108832159792422 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71948168_71948840:INPPL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 71949064 C/G 1 7 14 21 3.28847019403881 7.42305961192239 -4.13458941788358 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0817226986734783 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 72408055 G/C 1 65 52 117 30.5357946589318 27.5713642728546 2.96443038607719 C:G G C 10 0.530218543708742 0.643503210158802 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72407594_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408028_72408240:ARAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 72438145 G/A 1 5 11 16 2.34890728145629 5.83240398079616 -3.48349669933987 A:G G A 10 0.530218543708742 0.130369289858938 ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72437665_72438217:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72437665_72438217:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72437665_72438217:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72437665_72438217:ARAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 73789648 C/T 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 T:C C T 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000168014:ENST00000334126:exon_73789160_73789762:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313663:exon_73789160_73789762:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000289350:exon_73789160_73789762:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000414160:exon_73789160_73789762:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000442398:exon_73789160_73789762:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000415191:exon_73789160_73789762:C2CD3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 20 11 31 9.39562912582516 5.83240398079616 3.563225145029 T:C T C 10 0.530218543708742 0.213136876174016 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 75110589 A/G 1 397 336 733 186.503238147629 178.153430686137 8.34980746149211 A:G A G 10 0.530218543708742 0.553875868021257 ENSG00000149273:ENST00000531188:exon_75110530_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000529173:exon_75110559_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000531810:exon_75110561_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000528439:exon_75110562_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530164:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530689:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530721:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000405680:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000422465:exon_75110564_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000278572:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000532872:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000534440:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527446:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000526608:exon_75110581_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527273:exon_75110586_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000524851:exon_75110587_75110621:RPS3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 75277757 C/G 1 38 37 75 17.8516953390678 19.6180861172235 -1.76639077815565 C:G C G 10 0.530218543708742 0.729102566209411 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 75279846 C/T 1 33 21 54 15.5027880576115 11.1345894178836 4.36819863972793 T:C C T 10 0.530218543708742 0.275690598471385 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 44 31 75 20.6703840768154 16.436774854971 4.23360922184435 A:G G A 10 0.530218543708742 0.355874035669637 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 76372052 A/G 1 17 6 23 7.98628475695139 3.18131126225245 4.80497349469893 A:G A G 10 0.530218543708742 0.058496969078827 ENSG00000137507:ENST00000260061:exon_76368568_76372552:LRRC32;ENSG00000137507:ENST00000407242:exon_76368569_76372552:LRRC32;ENSG00000137507:ENST00000404995:exon_76370627_76372552:LRRC32 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 76372418 T/C 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000137507:ENST00000260061:exon_76368568_76372552:LRRC32;ENSG00000137507:ENST00000407242:exon_76368569_76372552:LRRC32;ENSG00000137507:ENST00000404995:exon_76370627_76372552:LRRC32;ENSG00000137507:ENST00000421973:exon_76372079_76372552:LRRC32 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 77378388 T/C 1 24 17 41 11.2747549509902 9.01371524304861 2.26103970794158 T:C T C 10 0.530218543708742 0.533344251281401 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 77378505 A/G 1 37 24 61 17.3819138827765 12.7252450490098 4.65666883376674 A:G A G 10 0.530218543708742 0.250123746841947 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 77409568 T/C 1 12 15 27 5.6373774754951 7.95327815563113 -2.31590068013603 T:C T C 10 0.530218543708742 0.442054176507922 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531026:exon_77409532_77409573:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531768:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000532556:exon_77409532_77409738:RSF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 77825320 T/C 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 T:C T C 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532306:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532440:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000524925:exon_77825312_77825422:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000529139:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525755:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000530454:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525870:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532050:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000527099:exon_77825312_77825438:ALG8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 77920563 G/T 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 T:G G T 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530521:exon_77920494_77920597:USP35 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 77920863 C/A 1 14 6 20 6.57694038807761 3.18131126225245 3.39562912582516 A:C C A 10 0.530218543708742 0.178098088864002 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 77920930 A/G 1 14 9 23 6.57694038807761 4.77196689337868 1.80497349469893 A:G A G 10 0.530218543708742 0.533565745005242 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 77924870 C/T 1 22 10 32 10.3351920384077 5.30218543708742 5.03300660132026 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0789671207756157 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77924692_77925072:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77924692_77925184:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77924692_77925757:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77924692_77925465:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77924692_77925753:USP35 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 77930345 T/C 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000033327:ENST00000304401:exon_77926342_77930461:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000340149:exon_77926343_77930461:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000361507:exon_77926343_77930461:GAB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 78277277 A/G 1 5 9 14 2.34890728145629 4.77196689337868 -2.42305961192239 A:G A G 10 0.530218543708742 0.284180524640790 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000525345:exon_78277178_78277313:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78277178_78277318:NARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 78279790 T/G 1 11 11 22 5.16759601920384 5.83240398079616 -0.664807961592324 T:G T G 10 0.530218543708742 0.832858519551156 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000526709:exon_78279761_78279798:NARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 82643760 G/T 1 13 9 22 6.10715893178635 4.77196689337868 1.33519203840768 T:G G T 10 0.530218543708742 0.671305989890035 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 82644764 C/G 1 7 7 14 3.28847019403881 3.71152980596119 -0.423059611922388 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 88027209 T/C 1 187 230 417 87.8491323264653 121.950265053011 -34.1011327265454 A:T:C T C 10 0.530218543708742 0.000840305100869492 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 88027393 A/C 1 152 157 309 71.4067813562712 83.2443113622725 -11.8375300060013 A:C A C 10 0.530218543708742 0.189895024909167 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 93464175 A/C 1 37 28 65 17.3819138827765 14.8461192238448 2.53579465893177 A:C A C 10 0.530218543708742 0.537727874290254 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 93480545 T/C 1 6 8 14 2.81868873774755 4.24174834966994 -1.42305961192239 T:C T C 10 0.530218543708742 0.594188084236152 ENSG00000182919:ENST00000528288:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000331239:exon_93480468_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000533585:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000528099:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000354421:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000527003:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000531650:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000530279:exon_93480468_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000527363:exon_93480468_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000526335:exon_93479651_93480614:C11orf54 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 39 24 63 18.3214767953591 12.7252450490098 5.59623174634925 C:G C G 10 0.530218543708742 0.166812332381145 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 136 108 244 63.8902780556111 57.2636027205441 6.62667533506696 A:G A G 10 0.530218543708742 0.405068329410767 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 95580926 G/A 1 16 13 29 7.51650330066013 6.89284106821365 0.623662232446482 A:G G A 10 0.530218543708742 0.854455190101058 ENSG00000087053:ENST00000346299:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000393223:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000409459:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000352297:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000444541:exon_95580878_95581063:MTMR2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 95657111 T/G 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 T:G T G 10 0.530218543708742 0.565817448386735 ENSG00000087053:ENST00000346299:exon_95657039_95657459:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000409459:exon_95657039_95657260:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000352297:exon_95657039_95657264:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000481642:exon_95657039_95657271:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000470011:exon_95657039_95657164:MTMR2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 95712897 G/T 1 9 5 14 4.22803310662132 2.65109271854371 1.57694038807761 T:G G T 10 0.530218543708742 0.43589870850422 ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95709762_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95711440_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95712112_95713127:MAML2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 115 152 267 54.0248674734947 80.5932186437288 -26.5683511702341 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00138642685202722 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 102272884 C/T 1 83 97 180 38.9918608721744 51.431198739748 -12.4393378675736 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0728271906046996 ENSG00000152558:ENST00000361236:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000398136:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000532161:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000528969:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000529492:exon_102272475_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000525577:exon_102272656_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000531103:exon_102272765_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000526676:exon_102272830_102272937:TMEM123 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 107917087 A/G 1 6 8 14 2.81868873774755 4.24174834966994 -1.42305961192239 A:G A G 10 0.530218543708742 0.594188084236152 ENSG00000166266:ENST00000299351:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000393094:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000526303:exon_107916997_107917220:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000531427:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000532782:exon_107916997_107917096:CUL5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 108009660 C/A 1 23 38 61 10.8049734946989 20.1483046609322 -9.34333116623326 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0203156715559974 ENSG00000075239:ENST00000265838:exon_108009625_108009768:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000531813:exon_108009625_108009768:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000528370:exon_108009625_108009891:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000534773:exon_108009447_108009768:ACAT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 108043988 C/T 1 19 19 38 8.9258476695339 10.0741523304661 -1.1483046609322 T:C C T 10 0.530218543708742 0.746968586285852 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000533535:exon_108041859_108044578:NPAT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 111747297 A/G 1 8 2 10 3.75825165033006 1.06043708741748 2.69781456291258 A:G A G 10 0.530218543708742 0.115795579122128 ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527377:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000528274:exon_111747205_111747363:AP001781.3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 44 33 77 20.6703840768154 17.4972119423885 3.17317213442687 A:C A C 10 0.530218543708742 0.494974229307286 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 116633862 G/A 1 17 9 26 7.98628475695139 4.77196689337868 3.21431786357271 A:G G A 10 0.530218543708742 0.241222081320482 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 116655600 G/A 1 43 34 77 20.2006026205241 18.0274304860972 2.17317213442687 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.649254997019824 ENSG00000109917:ENST00000429220:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000444935:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000227322:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000449430:exon_116655575_116655637:ZNF259 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 116728630 G/C 1 17 15 32 7.98628475695139 7.95327815563113 0.0330066013202561 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 117100257 C/T 1 20 13 33 9.39562912582516 6.89284106821365 2.50278805761151 T:C C T 10 0.530218543708742 0.48604755372549 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117100093_117100572:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117100093_117100956:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000524507:exon_117100222_117100572:PCSK7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 117163824 C/G 1 6 13 19 2.81868873774755 6.89284106821365 -4.0741523304661 C:G C G 10 0.530218543708742 0.068469288507053 ENSG00000186318:ENST00000313005:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000392937:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000528053:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510630:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000428381:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000513780:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000445823:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000292095:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530824:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530844:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510915:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000504995:exon_117163787_117163904:BACE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 117222592 G/A 1 2 9 11 0.939562912582516 4.77196689337868 -3.83240398079616 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0305374290985922 ENSG00000110274:ENST00000525734:exon_117222506_117222658:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533153:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000525416:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527324:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527609:exon_117222506_117222675:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533570:exon_117222506_117222676:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117222506_117222704:CEP164 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 117691386 G/A 1 79 55 134 37.1127350470094 29.1620199039808 7.95071514302857 A:G G A 10 0.530218543708742 0.19405967376184 ENSG00000137731:ENST00000532119:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000528014:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000292079:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000260287:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000534383:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000533281:exon_117691275_117691411:FXYD2;ENSG00000254844:ENST00000531850:exon_117691176_117691436:RP11-728F11.3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 117864047 A/G 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 A:G A G 10 0.530218543708742 0.247617633272995 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534335:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117863723_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117863773_117864125:IL10RA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 118074337 A/G 1 13 7 20 6.10715893178635 3.71152980596119 2.39562912582516 A:G A G 10 0.530218543708742 0.371488020282974 ENSG00000160593:ENST00000356289:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000292067:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000534294:exon_118071189_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000533261:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526595:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000531530:exon_118074143_118076105:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526620:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000529164:exon_118074143_118074380:AMICA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 118076642 T/C 1 6 9 15 2.81868873774755 4.77196689337868 -1.95327815563113 T:C T C 10 0.530218543708742 0.438985732589774 ENSG00000160593:ENST00000356289:exon_118076597_118076706:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000292067:exon_118076597_118076706:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000534294:exon_118076597_118076706:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000533261:exon_118076630_118076706:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526595:exon_118076597_118076706:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526620:exon_118076597_118076706:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000529164:exon_118076597_118076706:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000531536:exon_118076374_118076706:AMICA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 118250246 G/T 1 10 8 18 4.69781456291258 4.24174834966994 0.456066213242644 T:G G T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000110344:ENST00000252108:exon_118250161_118250465:UBE4A;ENSG00000110344:ENST00000431736:exon_118250161_118250465:UBE4A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 119205830 A/G 1 28 18 46 13.1538807761552 9.54393378675736 3.60994698939787 A:G A G 10 0.530218543708742 0.304617773336652 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 121393684 G/A 1 12 9 21 5.6373774754951 4.77196689337868 0.865410582116419 A:G G A 10 0.530218543708742 0.828055654924615 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121393625_121393698:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532451:exon_121393625_121393698:SORL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 121456996 G/C 1 10 3 13 4.69781456291258 1.59065563112623 3.10715893178635 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0999408957936294 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121456931_121457038:SORL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 22 21 43 10.3351920384077 11.1345894178836 -0.799397379475906 A:T T A 10 0.530218543708742 0.878965825852265 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 44 37 81 20.6703840768154 19.6180861172235 1.0522979595919 C:G C G 10 0.530218543708742 0.824962147964015 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 7 14 21 3.28847019403881 7.42305961192239 -4.13458941788358 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0817226986734783 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 125769354 T/C 1 16 18 34 7.51650330066013 9.54393378675736 -2.02743048609723 T:C T C 10 0.530218543708742 0.497520057256665 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 126074192 A/G 1 19 11 30 8.9258476695339 5.83240398079616 3.09344368873774 A:G A G 10 0.530218543708742 0.277968900623872 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000530903:exon_126074126_126074223:RPUSD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 126162468 G/A 1 1 7 8 0.469781456291258 3.71152980596119 -3.24174834966994 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0300386507500581 ENSG00000150455:ENST00000488598:exon_126162372_126162582:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000438974:exon_126162372_126163012:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392678:exon_126162372_126163139:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126162372_126162950:TIRAP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 126174038 C/T 1 48 30 78 22.5495099019804 15.9065563112623 6.64295359071813 T:C C T 10 0.530218543708742 0.141169888986080 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 126174164 C/T 1 68 76 144 31.9451390278055 40.2966093218644 -8.35147029405885 T:C C T 10 0.530218543708742 0.181534052817335 ENSG00000255062:ENST00000524964:exon_126174103_126174213:RP11-712L6.5;ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 11 126201403 T/C 1 41 35 76 19.2610397079416 18.557649029806 0.703390678135609 T:C T C 10 0.530218543708742 0.908863380428481 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126201300_126201445:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000530860:exon_126201299_126201445:DCPS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 547683 T/C 1 8 11 19 3.75825165033006 5.83240398079616 -2.0741523304661 T:C T C 10 0.530218543708742 0.366451934145480 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_547501_547720:CCDC77 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 990912 A/C 1 47 55 102 22.0797284456891 29.1620199039808 -7.08229145829168 A:C:G A C 10 0.530218543708742 0.16596272028809 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_990858_990955:WNK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 993930 C/T 1 49 69 118 23.0192913582716 36.5850795159032 -13.5657881576316 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0127707160206032 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 994014 C/T 1 81 68 149 38.0522979595919 36.0548609721945 1.99743698739744 A:T:C C T 10 0.530218543708742 0.805614449691162 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 2937013 G/C 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 C:G G C 10 0.530218543708742 0.186865472805043 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 54 61 115 25.3681986397279 32.3433311662333 -6.97513252650533 A:G A G 10 0.530218543708742 0.224403868933692 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 4388084 C/G 1 55 67 122 25.8379800960192 35.5246424284857 -9.68666233246652 C:G C G 10 0.530218543708742 0.08490814345229 ENSG00000118971:ENST00000261254:exon_4387926_4388085:CCND2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 8 11 19 3.75825165033006 5.83240398079616 -2.0741523304661 A:G G A 10 0.530218543708742 0.366451934145480 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 4461485 G/A 1 27 8 35 12.684099319864 4.24174834966994 8.44235097019403 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0058888314500307 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4461426_4469188:C12orf5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 4662210 T/C 1 12 16 28 5.6373774754951 8.48349669933987 -2.84611922384478 T:C T C 10 0.530218543708742 0.344613553609419 ENSG00000111247:ENST00000321524:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000352618:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000228843:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000442992:exon_4662149_4662313:RAD51AP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 6450945 T/C 1 12 13 25 5.6373774754951 6.89284106821365 -1.25546359271855 T:C T C 10 0.530218543708742 0.690551486586856 ENSG00000067182:ENST00000162749:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A;ENSG00000067182:ENST00000440083:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 6560573 G/T 1 301 249 550 141.404218343669 132.024417383477 9.37980096019189 T:G G T 10 0.530218543708742 0.44199805325044 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6560434_6560884:CD27 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 23 15 38 10.8049734946989 7.95327815563113 2.8516953390678 A:G A G 10 0.530218543708742 0.417545477422256 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 24 34 58 11.2747549509902 18.0274304860972 -6.75267553510703 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0870272899501851 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 6567907 C/T 1 26 20 46 12.2143178635727 10.6043708741748 1.60994698939787 T:C C T 10 0.530218543708742 0.660552718164373 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6567811_6568113:TAPBPL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 77 62 139 36.1731721344269 32.873549709942 3.29962242448486 A:G A G 10 0.530218543708742 0.610584518715541 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 6631169 C/A 1 74 82 156 34.7638277655531 43.4779205841168 -8.71409281856375 A:C C A 10 0.530218543708742 0.17291484577481 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6630964_6631203:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6630964_6631203:NCAPD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 6635274 G/A 1 62 64 126 29.126450290058 33.9339867973595 -4.80753650730149 A:G G A 10 0.530218543708742 0.422146016691116 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6635234_6635366:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6635234_6635366:NCAPD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 6637941 C/T 1 108 105 213 50.7363972794559 55.6729470894179 -4.93654980996205 T:C C T 10 0.530218543708742 0.53681011218442 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6637845_6638022:NCAPD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 119 81 200 55.9039932986597 42.9477020404081 12.9562912582516 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0762998971394195 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 7602 4 7606 3571.27863072614 2.12087417483497 3569.15775655131 T:C T C 10 0.530218543708742 4.94065645841247e-324 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 6657538 T/G 1 9 7 16 4.22803310662132 3.71152980596119 0.516503300660129 T:G T G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000010295:ENST00000488007:exon_6657231_6657711:IFFO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 38 55 93 17.8516953390678 29.1620199039808 -11.310324564913 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0219020205540033 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 9833524 C/G 1 69 46 115 32.4149204840968 24.3900530106021 8.02486747349467 A:C:G C G 10 0.530218543708742 0.136221174046171 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 9833628 C/T 1 203 145 348 95.3656356271254 76.8816888377676 18.4839467893578 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0530371788047304 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 10854625 G/A 1 146 159 305 68.5880926185237 84.30474844969 -15.7166558311663 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0753354849577915 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10854559_10854733:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10854559_10854733:CSDA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 10854718 G/A 1 169 188 357 79.3930661132226 99.6810862172435 -20.2880201040209 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.0338348131247447 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10854559_10854733:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10854559_10854733:CSDA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 12967127 C/T 1 39 20 59 18.3214767953591 10.6043708741748 7.71710592118422 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0500766346845696 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000426619:exon_12967065_12967158:DDX47 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 900 864 1764 422.803310662132 458.108821764353 -35.3055111022209 A:C:G C G 10 0.530218543708742 0.0949606560071627 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 16516994 G/A 1 2 364 366 0.939562912582516 192.999549909982 -192.0599869974 A:G G A 10 0.530218543708742 7.01227320479694e-116 ENSG00000008394:ENST00000010404:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396210:exon_16516729_16517342:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396209:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396207:exon_16516729_16517343:MGST1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 30 23 53 14.0934436887377 12.1950265053011 1.89841718343667 T:G T G 10 0.530218543708742 0.680319572184063 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 25242595 C/G 1 91 83 174 42.7501125225045 44.0081391278256 -1.25802660532111 C:G C G 10 0.530218543708742 0.879385413314362 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242548_25242611:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242548_25242611:LRMP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 143 145 288 67.1787482496499 76.8816888377676 -9.70294058811768 A:T:C:G G C 10 0.530218543708742 0.262239276323380 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 27143508 G/A 1 27 19 46 12.684099319864 10.0741523304661 2.60994698939787 A:G G A 10 0.530218543708742 0.463889576367042 ENSG00000064115:ENST00000343028:exon_27143383_27143560:TM7SF3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 29486745 T/C 1 18 14 32 8.45606621324264 7.42305961192239 1.03300660132026 T:C T C 10 0.530218543708742 0.727799998593614 ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29486565_29487005:FAR2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 31604928 G/C 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 C:G G C 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 31944691 A/C 0 27 0 27 12.684099319864 0 12.684099319864 A A 10 0.530218543708742 3.77156092743199e-08 ENSG00000188375:ENST00000340398:exon_31944119_31945175:H3F3C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 32134815 G/A 1 30 27 57 14.0934436887377 14.315900680136 -0.222456991398294 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 32134943 A/G 1 40 44 84 18.7912582516503 23.3296159231846 -4.53835767153433 A:G A G 10 0.530218543708742 0.327478683520545 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 32137901 A/G 1 83 67 150 38.9918608721744 35.5246424284857 3.4672184436887 A:G A G 10 0.530218543708742 0.623733781500059 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 39695445 G/A 1 11 12 23 5.16759601920384 6.3626225245049 -1.19502650530107 A:G G A 10 0.530218543708742 0.679029978421074 ENSG00000139116:ENST00000341813:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000395670:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361418:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361961:exon_39695282_39695481:KIF21A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 42481732 G/A 1 5 11 16 2.34890728145629 5.83240398079616 -3.48349669933987 A:G G A 10 0.530218543708742 0.130369289858938 ENSG00000151233:ENST00000398675:exon_42475650_42481749:GXYLT1;ENSG00000151233:ENST00000280876:exon_42475650_42481749:GXYLT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 48238757 A/G 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 A:G A G 10 0.530218543708742 0.797017339461022 ENSG00000111424:ENST00000395324:exon_48235322_48238788:VDR;ENSG00000111424:ENST00000229022:exon_48235322_48238788:VDR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 21 23 44 9.86541058211642 12.1950265053011 -2.32961592318465 T:G G T 10 0.530218543708742 0.546627888447434 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 49086963 G/A 1 9 11 20 4.22803310662132 5.83240398079616 -1.60437087417484 A:G G A 10 0.530218543708742 0.508309614769096 ENSG00000129315:ENST00000261900:exon_49086752_49088219:CCNT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 48 68 116 22.5495099019804 36.0548609721945 -13.5053510702141 T:G T G 10 0.530218543708742 0.0152218047226127 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 49425978 T/C 1 13 12 25 6.10715893178635 6.3626225245049 -0.25546359271855 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49424958_49427747:MLL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 51442944 G/A 1 19 17 36 8.9258476695339 9.01371524304861 -0.0878675735147123 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000050426:ENST00000262055:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000418425:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000448283:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380135:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380123:exon_51442817_51442968:LETMD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 51457697 A/G 1 12 13 25 5.6373774754951 6.89284106821365 -1.25546359271855 A:G A G 10 0.530218543708742 0.690551486586856 ENSG00000110925:ENST00000228515:exon_51454990_51458452:CSRNP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 51693021 C/T 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 T:C C T 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51692987_51693072:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51692987_51693072:BIN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 51773557 G/A 1 8 4 12 3.75825165033006 2.12087417483497 1.6373774754951 A:G G A 10 0.530218543708742 0.398218675970565 ENSG00000139629:ENST00000356317:exon_51773075_51773668:GALNT6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 52450935 G/A 1 32 24 56 15.0330066013203 12.7252450490098 2.30776155231045 A:G G A 10 0.530218543708742 0.593336865130439 ENSG00000123358:ENST00000360284:exon_52450841_52451043:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394825:exon_52450841_52451043:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000243050:exon_52450841_52451043:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394824:exon_52450841_52451043:NR4A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 53581376 C/T 1 4 9 13 1.87912582516503 4.77196689337868 -2.89284106821365 T:C C T 10 0.530218543708742 0.162918845921506 ENSG00000139651:ENST00000416904:exon_53581285_53584654:ZNF740;ENSG00000139651:ENST00000267122:exon_53581285_53584654:ZNF740 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 53587468 T/G 1 10 3 13 4.69781456291258 1.59065563112623 3.10715893178635 T:G T G 10 0.530218543708742 0.0999408957936294 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 53588016 C/T 1 75 61 136 35.2336092218443 32.3433311662333 2.89027805561108 T:C C T 10 0.530218543708742 0.667779421674531 ENSG00000139626:ENST00000422257:exon_53587982_53588128:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000338737:exon_53587982_53588128:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000267082:exon_53587982_53588128:ITGB7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 53589511 A/G 1 13 4 17 6.10715893178635 2.12087417483497 3.98628475695139 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0859391418136884 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 49 46 95 23.0192913582716 24.3900530106021 -1.37076165233049 T:C T C 10 0.530218543708742 0.837293811584858 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 53670545 C/A 1 10 5 15 4.69781456291258 2.65109271854371 2.04672184436887 A:C C A 10 0.530218543708742 0.315050043511805 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53670404_53670643:ESPL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 53671005 G/A 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53670867_53671011:ESPL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 53682326 G/A 1 22 23 45 10.3351920384077 12.1950265053011 -1.85983446689339 A:G G A 10 0.530218543708742 0.654795510593742 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 53682457 G/A 1 25 35 60 11.7445364072814 18.557649029806 -6.81311262252452 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0922273245745394 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 53777171 A/G 1 5 11 16 2.34890728145629 5.83240398079616 -3.48349669933987 A:G A G 10 0.530218543708742 0.130369289858938 ENSG00000185591:ENST00000327443:exon_53775894_53777406:SP1;ENSG00000185591:ENST00000426431:exon_53775894_53777406:SP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 54575458 T/C 1 28 24 52 13.1538807761552 12.7252450490098 0.428635727145418 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 54675113 G/A 1 12 12 24 5.6373774754951 6.3626225245049 -0.725245049009807 A:G G A 10 0.530218543708742 0.8392917887424 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 54905815 C/G 1 26 25 51 12.2143178635727 13.2554635927186 -1.04114572914584 C:G C G 10 0.530218543708742 0.780903316468754 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54905733_54905889:NCKAP1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 54925081 C/A 1 59 41 100 27.7171059211842 21.7389602920584 5.9781456291258 A:C C A 10 0.530218543708742 0.270382871937534 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54925044_54925141:NCKAP1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 55806134 T/C 0 12 0 12 5.6373774754951 0 5.6373774754951 T T 10 0.530218543708742 0.000609240060901668 ENSG00000179899:ENST00000326184:exon_55805506_55808295:PHC1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 55806238 A/G 0 14 0 14 6.57694038807761 0 6.57694038807761 A A 10 0.530218543708742 0.000164293504813582 ENSG00000179899:ENST00000326184:exon_55805506_55808295:PHC1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 56151291 T/C 1 47 48 95 22.0797284456891 25.4504900980196 -3.37076165233049 T:C T C 10 0.530218543708742 0.537734326716997 ENSG00000205323:ENST00000444631:exon_56151167_56151337:SARNP;ENSG00000205323:ENST00000336133:exon_56151058_56151337:SARNP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 56711371 C/T 1 42 26 68 19.7308211642328 13.7856821364273 5.94513902780554 T:C C T 10 0.530218543708742 0.181056037179701 ENSG00000135473:ENST00000425394:exon_56710718_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000379495:exon_56710721_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000257931:exon_56710721_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000440411:exon_56710721_56711427:PAN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 35 43 78 16.442350970194 22.7993973794759 -6.35704640928187 A:G G A 10 0.530218543708742 0.173238169056154 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 27 13 40 12.684099319864 6.89284106821365 5.79125825165032 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0807887930034327 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 56822378 T/A 1 10 14 24 4.69781456291258 7.42305961192239 -2.72524504900981 A:T T A 10 0.530218543708742 0.309127957783389 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822333_56822436:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822333_56822436:TIMELESS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 56825311 C/T 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56825255_56825388:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56825255_56825388:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56825255_56825388:TIMELESS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 56827694 C/G 1 20 23 43 9.39562912582516 12.1950265053011 -2.79939737947591 C:G C G 10 0.530218543708742 0.445966586496333 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56827557_56827710:TIMELESS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 56865338 A/G 1 9 13 22 4.22803310662132 6.89284106821365 -2.66480796159232 A:G A G 10 0.530218543708742 0.289698673189133 ENSG00000135423:ENST00000479952:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000390288:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000311966:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000424141:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000486433:exon_56864738_56865427:GLS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 57106660 A/T 1 2204 2128 4332 1035.39832966593 1128.3050610122 -92.9067313462704 A:T A T 10 0.530218543708742 0.00485829307508199 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57106570_57106692:NACA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 57106810 G/A 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:G G A 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 2118 2125 4243 994.997124424884 1126.71440538108 -131.717280956192 A:G A G 10 0.530218543708742 5.21338643324054e-05 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 57114307 A/T 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 A:T A T 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57109655_57115243:NACA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 57133140 T/G 1 15 22 37 7.04672184436887 11.6648079615923 -4.61808611722345 T:G T G 10 0.530218543708742 0.140191429203817 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57133078_57133147:PRIM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 57649840 C/T 1 8 12 20 3.75825165033006 6.3626225245049 -2.60437087417484 T:C C T 10 0.530218543708742 0.269017553119515 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57649773_57649857:R3HDM2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 57869582 T/C 0 9 0 9 4.22803310662132 0 4.22803310662132 T T 10 0.530218543708742 0.00442648537498891 ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57869559_57869714:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57869559_57869714:ARHGAP9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 46 59 105 21.6099469893979 31.2828940788158 -9.67294708941791 A:C A C 10 0.530218543708742 0.0632621029332106 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 58010163 A/G 1 8 6 14 3.75825165033006 3.18131126225245 0.576940388077612 A:G A G 10 0.530218543708742 0.795824909862849 ENSG00000240771:ENST00000333972:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000286494:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000471370:exon_58010067_58010278:ARHGEF25 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 163 199 362 76.5743773754751 105.51349019804 -28.9391128225646 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00264102098301814 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 58126234 C/A 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 A:C C A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000135439:ENST00000257897:exon_58126186_58126295:AGAP2;ENSG00000135439:ENST00000328568:exon_58126186_58126295:AGAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 44 40 84 20.6703840768154 21.2087417483497 -0.538357671534328 A:G A G 10 0.530218543708742 0.913424098350087 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 58163704 G/A 1 31 28 59 14.563225145029 14.8461192238448 -0.282894078815778 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58163555_58163739:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58163555_58163739:METTL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 58174306 T/C 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000123427:ENST00000300209:exon_58174038_58176321:FAM119B;ENSG00000123427:ENST00000333012:exon_58174038_58176321:FAM119B;ENSG00000123427:ENST00000414072:exon_58174039_58174429:FAM119B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 58176614 T/C 1 30 34 64 14.0934436887377 18.0274304860972 -3.93398679735949 T:C T C 10 0.530218543708742 0.380877330106916 ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58176372_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58176559_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000417094:exon_58176564_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000434359:exon_58176586_58176660:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000457189:exon_58176601_58176690:TSFM HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 58197231 G/T 1 3 11 14 1.40934436887377 5.83240398079616 -4.42305961192239 T:G G T 10 0.530218543708742 0.0285048765274962 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 58335626 A/T 1 15 11 26 7.04672184436887 5.83240398079616 1.21431786357271 A:T A T 10 0.530218543708742 0.697339873549611 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58335360_58335671:XRCC6BP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 58345606 T/C 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58345541_58345678:XRCC6BP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 62696599 C/T 1 1 7 8 0.469781456291258 3.71152980596119 -3.24174834966994 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0300386507500581 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000312635:exon_62696571_62696701:USP15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 64202890 C/G 1 9 15 24 4.22803310662132 7.95327815563113 -3.72524504900981 C:G C G 10 0.530218543708742 0.153222777387596 ENSG00000118600:ENST00000261234:exon_64202455_64203300:TMEM5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 64813864 T/C 1 40 29 69 18.7912582516503 15.3763377675535 3.4149204840968 T:C:G T C 10 0.530218543708742 0.469702863568243 ENSG00000184575:ENST00000332707:exon_64813850_64814034:XPOT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 65146532 C/T 1 9 12 21 4.22803310662132 6.3626225245049 -2.13458941788358 T:C C T 10 0.530218543708742 0.387625542901861 ENSG00000135677:ENST00000258145:exon_65146478_65146537:GNS;ENSG00000135677:ENST00000418919:exon_65146478_65146537:GNS;ENSG00000135677:ENST00000432885:exon_65146478_65146537:GNS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 66725202 C/T 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 69082805 G/A 1 9 3 12 4.22803310662132 1.59065563112623 2.6373774754951 A:G G A 10 0.530218543708742 0.154808266842262 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69082742_69082833:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69082742_69082833:NUP107 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 69085801 C/T 1 3 8 11 1.40934436887377 4.24174834966994 -2.83240398079616 T:C C T 10 0.530218543708742 0.129086131769062 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69085748_69085892:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69085748_69085892:NUP107 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 69090684 A/G 1 12 17 29 5.6373774754951 9.01371524304861 -3.37633776755352 A:G A G 10 0.530218543708742 0.264391425279974 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69090599_69090702:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69090599_69090702:NUP107 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 69115698 G/A 1 16 8 24 7.51650330066013 4.24174834966994 3.27475495099019 A:G G A 10 0.530218543708742 0.221301455207229 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69115621_69115766:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69115621_69115766:NUP107 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 94 116 210 44.1594568913783 61.5053510702141 -17.3458941788358 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0185691082233445 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 70195439 A/G 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000127328:ENST00000247833:exon_70195389_70195501:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000483530:exon_70195389_70195501:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000362025:exon_70195389_70195501:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000325555:exon_70195389_70195501:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000378809:exon_70195389_70195501:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000325596:exon_70195389_70195501:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000526994:exon_70195389_70195501:RAB3IP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 75900588 A/G 1 24 22 46 11.2747549509902 11.6648079615923 -0.390053010602131 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75900562_75900696:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75900562_75900696:KRR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 31 28 59 14.563225145029 14.8461192238448 -0.282894078815778 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 10 12 22 4.69781456291258 6.3626225245049 -1.66480796159232 C:G G C 10 0.530218543708742 0.526195123533414 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 88500847 T/C 1 10 2 12 4.69781456291258 1.06043708741748 3.6373774754951 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0427166045006331 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88500773_88500875:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88500773_88500875:CEP290 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 94972290 C/T 1 17 9 26 7.98628475695139 4.77196689337868 3.21431786357271 T:C C T 10 0.530218543708742 0.241222081320482 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94972170_94972305:TMCC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 94975799 G/A 1 21 18 39 9.86541058211642 9.54393378675736 0.321476795359063 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 94976084 T/C 1 26 18 44 12.2143178635727 9.54393378675736 2.67038407681535 T:C T C 10 0.530218543708742 0.453104727395328 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 94976159 T/C 1 20 15 35 9.39562912582516 7.95327815563113 1.44235097019403 T:C T C 10 0.530218543708742 0.735513376094186 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 98928103 C/T 1 51 38 89 23.9588542708542 20.1483046609322 3.81054960992196 T:C C T 10 0.530218543708742 0.457917802467929 ENSG00000120802:ENST00000266732:exon_98926601_98928321:TMPO HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 99007356 T/C 1 38 49 87 17.8516953390678 25.9807086417284 -8.12901330266056 T:C T C 10 0.530218543708742 0.086103958264519 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 99007623 C/T 1 89 114 203 41.810549609922 60.4449139827966 -18.6343643728746 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0092231965891063 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 100452564 G/T 1 15 10 25 7.04672184436887 5.30218543708742 1.74453640728145 T:G G T 10 0.530218543708742 0.551192924360965 ENSG00000111647:ENST00000279907:exon_100451807_100453311:UHRF1BP1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 101018161 C/T 1 7 3 10 3.28847019403881 1.59065563112623 1.69781456291258 T:C C T 10 0.530218543708742 0.352695224731846 ENSG00000139354:ENST00000266754:exon_101017340_101018681:GAS2L3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 101723197 C/T 0 8 0 8 3.75825165033006 0 3.75825165033006 C C 10 0.530218543708742 0.0086188222890866 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101723019_101723227:UTP20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 101732655 C/T 1 5 8 13 2.34890728145629 4.24174834966994 -1.89284106821365 T:C C T 10 0.530218543708742 0.406203894191414 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101732591_101732735:UTP20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 101734349 G/A 1 7 3 10 3.28847019403881 1.59065563112623 1.69781456291258 A:G G A 10 0.530218543708742 0.352695224731846 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101734301_101734388:UTP20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 101755809 T/C 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 T:C T C 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101755740_101755838:UTP20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 101757446 T/C 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 T:C T C 10 0.530218543708742 0.296231759838006 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101757354_101757521:UTP20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 102455729 G/A 1 31 31 62 14.563225145029 16.436774854971 -1.873549709942 A:G G A 10 0.530218543708742 0.703099655403951 ENSG00000120860:ENST00000240079:exon_102455690_102455899:CCDC53 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 104327979 C/T 1 426 371 797 200.126900380076 196.711079715943 3.41582066413264 T:C C T 10 0.530218543708742 0.831411048978332 ENSG00000166598:ENST00000299767:exon_104327734_104328065:HSP90B1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 104341398 T/A 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:T T A 10 0.530218543708742 0.487231208629639 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 104376693 G/A 1 9 17 26 4.22803310662132 9.01371524304861 -4.78568213642729 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0760303242140064 ENSG00000139372:ENST00000392872:exon_104376577_104376712:TDG;ENSG00000139372:ENST00000266775:exon_104376577_104376712:TDG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 104709559 C/T 1 19 18 37 8.9258476695339 9.54393378675736 -0.618086117223454 T:C C T 10 0.530218543708742 0.870320364950046 ENSG00000198431:ENST00000525566:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000429002:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526266:exon_104709555_104709604:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000503506:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526691:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531691:exon_104709555_104709679:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000388854:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526390:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531689:exon_104709555_104709610:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000529546:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526580:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000354940:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000524698:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527688:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000378070:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527335:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000397736:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000427956:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526950:exon_104709555_104709674:TXNRD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 107360943 G/A 1 9 18 27 4.22803310662132 9.54393378675736 -5.31590068013603 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0524474966934978 ENSG00000151135:ENST00000280756:exon_107360889_107360958:C12orf23 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 107364873 C/T 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 T:C C T 10 0.530218543708742 0.186865472805043 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 108954862 G/C 1 30 27 57 14.0934436887377 14.315900680136 -0.222456991398294 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 109182049 T/C 1 28 8 36 13.1538807761552 4.24174834966994 8.91213242648529 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00386379727058845 ENSG00000084112:ENST00000326495:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000360239:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000303438:exon_109180971_109183020:SSH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 109186071 G/A 1 14 19 33 6.57694038807761 10.0741523304661 -3.49721194238849 A:G G A 10 0.530218543708742 0.228268891065024 ENSG00000084112:ENST00000326495:exon_109186062_109186605:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000360239:exon_109186062_109186605:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000303438:exon_109186062_109186605:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000326470:exon_109185730_109186605:SSH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 109894028 A/G 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 A:G A G 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000110906:ENST00000228495:exon_109893923_109894118:KCTD10;ENSG00000110906:ENST00000440541:exon_109893923_109894049:KCTD10;ENSG00000110906:ENST00000424763:exon_109893923_109894171:KCTD10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 73 72 145 34.2940463092618 38.1757351470294 -3.88168883776758 A:T A T 10 0.530218543708742 0.560501668072523 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 110019338 C/T 1 17 13 30 7.98628475695139 6.89284106821365 1.09344368873774 T:C C T 10 0.530218543708742 0.718556699845737 ENSG00000110921:ENST00000392727:exon_110019200_110019355:MVK;ENSG00000110921:ENST00000447878:exon_110019200_110019355:MVK;ENSG00000110921:ENST00000228510:exon_110019200_110019355:MVK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 110937404 T/C 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 T:C T C 10 0.530218543708742 0.296231759838006 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 113386779 C/G 1 65 29 94 30.5357946589318 15.3763377675535 15.1594568913783 C:G C G 10 0.530218543708742 0.00181173535789404 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113386666_113387010:OAS3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 113398919 G/A 1 39 58 97 18.3214767953591 30.752675535107 -12.431198739748 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0142274047693096 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113398876_113399051:OAS3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 113403684 C/T 1 27 19 46 12.684099319864 10.0741523304661 2.60994698939787 T:C C T 10 0.530218543708742 0.463889576367042 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113403549_113403834:OAS3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 113424893 C/G 1 104 105 209 48.8572714542908 55.6729470894179 -6.81567563512708 C:G C G 10 0.530218543708742 0.367809395514273 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 113596736 G/A 1 105 126 231 49.3270529105821 66.8075365073015 -17.4804835967194 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0248067863730603 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113594986_113596917:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113594986_113596914:DDX54 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 113737574 G/T 1 2 7 9 0.939562912582516 3.71152980596119 -2.77196689337868 T:G G T 10 0.530218543708742 0.0932648737406713 ENSG00000089060:ENST00000202831:exon_113736572_113737779:SLC24A6;ENSG00000089060:ENST00000377458:exon_113736572_113737779:SLC24A6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 11 9 20 5.16759601920384 4.77196689337868 0.395629125825161 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 16 26 42 7.51650330066013 13.7856821364273 -6.26917883576716 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0629915045132466 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 120171995 T/C 1 2 8 10 0.939562912582516 4.24174834966994 -3.30218543708742 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0537596124644068 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120171969_120172162:CIT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 120189879 A/G 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 A:G A G 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120189855_120190052:CIT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 120189888 T/C 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 T:C T C 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120189855_120190052:CIT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 9 6 15 4.22803310662132 3.18131126225245 1.04672184436887 A:G G A 10 0.530218543708742 0.617171705992842 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 10 14 24 4.69781456291258 7.42305961192239 -2.72524504900981 T:C T C 10 0.530218543708742 0.309127957783389 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 121666646 A/G 1 30 23 53 14.0934436887377 12.1950265053011 1.89841718343667 A:G A G 10 0.530218543708742 0.680319572184063 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121666528_121666669:P2RX4;ENSG00000135124:ENST00000359949:exon_121666528_121666669:P2RX4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 121691096 G/A 1 22 19 41 10.3351920384077 10.0741523304661 0.261039707941578 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121691076_121691275:CAMKK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 89 165 254 41.810549609922 87.4860597119424 -45.6755101020205 T:C C T 10 0.530218543708742 1.08287221361839e-08 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 117 206 323 54.9644303860772 109.225020004001 -54.2605896179237 T:C T C 10 0.530218543708742 1.74497305980013e-09 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 27 20 47 12.684099319864 10.6043708741748 2.07972844568913 C:G G C 10 0.530218543708742 0.562644391736884 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 30 24 54 14.0934436887377 12.7252450490098 1.36819863972793 T:C C T 10 0.530218543708742 0.785615629829279 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 123467163 C/G 1 28 21 49 13.1538807761552 11.1345894178836 2.01929135827164 A:C:G C G 10 0.530218543708742 0.668106289257097 ENSG00000182196:ENST00000392435:exon_123467016_123467460:ARL6IP4;ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123467016_123467452:ARL6IP4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 123645803 G/A 1 5 10 15 2.34890728145629 5.30218543708742 -2.95327815563113 A:G G A 10 0.530218543708742 0.194384351758500 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 123664514 G/A 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 A:G G A 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123664473_123664537:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123664473_123664537:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000392425:exon_123664473_123664537:MPHOSPH9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 123950471 G/A 1 80 60 140 37.5825165033006 31.8131126225245 5.76940388077612 A:G G A 10 0.530218543708742 0.352135439510747 ENSG00000184209:ENST00000438124:exon_123950085_123950941:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000526639:exon_123950085_123951483:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000392420:exon_123950085_123950941:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000361485:exon_123950085_123950937:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000412157:exon_123950085_123950936:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000350887:exon_123950085_123950937:SNRNP35 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 124102311 C/T 1 11 8 19 5.16759601920384 4.24174834966994 0.925847669533902 T:C C T 10 0.530218543708742 0.8192074586227 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124102305_124102419:DDX55;ENSG00000111364:ENST00000354291:exon_124102305_124102419:DDX55 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 124821696 C/T 1 74 73 147 34.7638277655531 38.7059536907382 -3.94212592518507 T:C C T 10 0.530218543708742 0.563140107901388 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000440187:exon_124821650_124821726:NCOR2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 124826462 C/T 1 28 32 60 13.1538807761552 16.9669933986797 -3.81311262252452 T:C C T 10 0.530218543708742 0.365836243225964 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 124856660 T/A 1 40 39 79 18.7912582516503 20.6785232046409 -1.88726495299062 A:T T A 10 0.530218543708742 0.735537943833874 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 124979789 T/G 1 9 10 19 4.22803310662132 5.30218543708742 -1.0741523304661 T:G T G 10 0.530218543708742 0.652256323352804 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124979693_124979798:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000420698:exon_124979693_124979914:NCOR2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 125298877 G/A 1 28 44 72 13.1538807761552 23.3296159231846 -10.1757351470294 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0179845182287855 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125298748_125298951:SCARB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 125434716 G/A 1 15 22 37 7.04672184436887 11.6648079615923 -4.61808611722345 A:G G A 10 0.530218543708742 0.140191429203817 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434695_125434789:DHX37 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 125448960 C/T 1 22 18 40 10.3351920384077 9.54393378675736 0.791258251650321 T:C C T 10 0.530218543708742 0.874748993044135 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 129299385 G/A 1 38 41 79 17.8516953390678 21.7389602920584 -3.88726495299062 A:G G A 10 0.530218543708742 0.430385773091741 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129299320_129299615:SLC15A4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 132400653 C/T 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000177169:ENST00000321867:exon_132400436_132400704:ULK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 132405879 G/A 1 10 15 25 4.69781456291258 7.95327815563113 -3.25546359271855 A:G G A 10 0.530218543708742 0.230578617079935 ENSG00000177169:ENST00000321867:exon_132405851_132407696:ULK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 132416813 G/A 1 14 18 32 6.57694038807761 9.54393378675736 -2.96699339867974 A:G G A 10 0.530218543708742 0.376191240179242 ENSG00000177192:ENST00000443358:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000440818:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000376649:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000322060:exon_132416720_132416857:PUS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 132490820 G/A 1 9 7 16 4.22803310662132 3.71152980596119 0.516503300660129 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132490657_132490847:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132490657_132490847:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132490657_132490847:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132490657_132490847:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132490657_132490847:EP400 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 132491322 A/G 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132491245_132491422:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132491245_132491422:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132491245_132491422:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132491245_132491422:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132491245_132491422:EP400 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 132527986 G/A 1 9 18 27 4.22803310662132 9.54393378675736 -5.31590068013603 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0524474966934978 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132527849_132528007:EP400 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 132539551 G/A 1 12 13 25 5.6373774754951 6.89284106821365 -1.25546359271855 A:G G A 10 0.530218543708742 0.690551486586856 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132539519_132539564:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132539519_132539564:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132539519_132539564:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132539519_132539564:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132539519_132539564:EP400 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 15 14 29 7.04672184436887 7.42305961192239 -0.376337767553518 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 21562948 G/A 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 A:G G A 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000150457:ENST00000382592:exon_21562020_21563443:LATS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 21742311 C/T 0 41 0 41 19.2610397079416 0 19.2610397079416 C C 10 0.530218543708742 6.71118895677656e-12 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21742127_21742538:SKA3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 23905711 A/G 1 28 33 61 13.1538807761552 17.4972119423885 -4.34333116623326 A:G A G 10 0.530218543708742 0.30507523164127 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 23907909 A/G 1 18 12 30 8.45606621324264 6.3626225245049 2.09344368873774 A:G A G 10 0.530218543708742 0.470477748346769 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 23908034 A/G 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 A:G A G 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 23909162 A/G 1 5 14 19 2.34890728145629 7.42305961192239 -5.0741523304661 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0218531141296597 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 23911820 A/G 1 4 15 19 1.87912582516503 7.95327815563113 -6.0741523304661 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00550735300045354 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 24876752 T/C 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000182957:ENST00000466831:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382095:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000424834:exon_24876736_24881207:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382108:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000438694:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000434675:exon_24876736_24877259:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000399949:exon_24876736_24878042:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000409126:exon_24876736_24877344:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000343003:exon_24876736_24881204:SPATA13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 24876845 G/A 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000182957:ENST00000466831:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382095:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000424834:exon_24876736_24881207:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382108:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000438694:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000434675:exon_24876736_24877259:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000399949:exon_24876736_24878042:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000409126:exon_24876736_24877344:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000343003:exon_24876736_24881204:SPATA13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 25466955 T/C 1 17 25 42 7.98628475695139 13.2554635927186 -5.26917883576716 T:C T C 10 0.530218543708742 0.122001853647201 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 25480145 G/A 1 26 21 47 12.2143178635727 11.1345894178836 1.07972844568913 A:G G A 10 0.530218543708742 0.772348404612883 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 25487096 T/C 1 7 13 20 3.28847019403881 6.89284106821365 -3.60437087417484 T:C T C 10 0.530218543708742 0.120271474866196 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25486720_25487229:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25486720_25487229:CENPJ HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 25487103 T/A 1 5 9 14 2.34890728145629 4.77196689337868 -2.42305961192239 A:T T A 10 0.530218543708742 0.284180524640790 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25486720_25487229:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25486720_25487229:CENPJ HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 26789638 T/C 1 31 24 55 14.563225145029 12.7252450490098 1.83798009601919 T:C T C 10 0.530218543708742 0.68605964523595 ENSG00000127870:ENST00000468480:exon_26789611_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000498039:exon_26789276_26789729:RNF6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 26793644 T/C 1 24 31 55 11.2747549509902 16.436774854971 -5.16201990398081 T:C T C 10 0.530218543708742 0.177873658383388 ENSG00000127870:ENST00000468480:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000498039:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000476347:exon_26793433_26793804:RNF6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 28197436 C/T 1 154 140 294 72.3463442688537 74.2305961192239 -1.88425185037015 T:C C T 10 0.530218543708742 0.860900861007576 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 28239940 G/C 1 116 106 222 54.4946489297859 56.2031656331267 -1.70851670334072 C:G G C 10 0.530218543708742 0.840292640738304 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 161 155 316 75.6348144628925 82.183874274855 -6.54905981196248 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.464341907210422 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 31722171 G/C 1 16 8 24 7.51650330066013 4.24174834966994 3.27475495099019 C:G G C 10 0.530218543708742 0.221301455207229 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31722096_31722229:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31722096_31722229:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31722096_31722229:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31722096_31722229:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31722096_31722229:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31722096_31722229:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31722096_31722229:HSPH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 31735675 G/T 1 30 35 65 14.0934436887377 18.557649029806 -4.46420534106823 T:G G T 10 0.530218543708742 0.320189288280246 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31735613_31736064:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31735613_31736064:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31735613_31736064:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31735613_31736117:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31735613_31735761:HSPH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 32930598 T/C 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 T:C T C 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000139618:ENST00000380152:exon_32930565_32930746:BRCA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 33017043 T/C 1 8 4 12 3.75825165033006 2.12087417483497 1.6373774754951 T:C T C 10 0.530218543708742 0.398218675970565 ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33016525_33017553:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 33232435 A/G 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 A:G A G 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000083642:ENST00000315596:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000482955:exon_33232376_33232486:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000400481:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000421084:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000456898:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000498550:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000450460:exon_33232376_33232462:PDS5B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 15 23 38 7.04672184436887 12.1950265053011 -5.1483046609322 A:G G A 10 0.530218543708742 0.105093151328245 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 45 41 86 21.1401655331066 21.7389602920584 -0.598794758951811 A:G G A 10 0.530218543708742 0.914326332283584 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 39603498 G/A 1 9 6 15 4.22803310662132 3.18131126225245 1.04672184436887 A:G G A 10 0.530218543708742 0.617171705992842 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000436678:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000418503:exon_39603418_39603512:C13orf23 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 40229957 T/A 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 A:T T A 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000133103:ENST00000255468:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000416691:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000422759:exon_40229799_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000455146:exon_40229814_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000356576:exon_40229881_40230016:COG6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 43474521 T/C 0 0 9 9 0 4.77196689337868 -4.77196689337868 C T C 10 0.530218543708742 0.00111445574837298 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 17 24 41 7.98628475695139 12.7252450490098 -4.73896029205842 A:C A C 10 0.530218543708742 0.159539034519144 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 0 79 0 79 37.1127350470094 0 37.1127350470094 G G 10 0.530218543708742 2.18828411084029e-22 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 46103935 A/G 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 A:G A G 10 0.530218543708742 0.565817448386735 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46103926_46104053:COG3;ENSG00000136152:ENST00000486940:exon_46103926_46104053:COG3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 47255902 G/A 1 10 10 20 4.69781456291258 5.30218543708742 -0.60437087417484 A:G G A 10 0.530218543708742 0.825709894540955 ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47255876_47255981:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47255876_47255981:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000443945:exon_47255876_47255981:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47255876_47255981:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47255876_47255981:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000463929:exon_47255876_47255981:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000478412:exon_47255876_47255981:LRCH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 48528283 C/T 1 21 38 59 9.86541058211642 20.1483046609322 -10.2828940788158 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00866990122480653 ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378645:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378642:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000331052:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000467222:exon_48528275_48528689:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000434484:exon_48528278_48528417:SUCLA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 48547467 A/T 1 16 12 28 7.51650330066013 6.3626225245049 1.15388077615522 A:T A T 10 0.530218543708742 0.708452101922698 ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378645:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378642:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000331052:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000434484:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000433022:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000497202:exon_48547399_48547527:SUCLA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 48619942 G/A 1 18 8 26 8.45606621324264 4.24174834966994 4.21431786357271 A:G G A 10 0.530218543708742 0.116685221469150 ENSG00000136159:ENST00000258662:exon_48619796_48621282:NUDT15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 50057633 A/G 1 10 9 19 4.69781456291258 4.77196689337868 -0.0741523304660978 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50057600_50057699:SETDB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 106 102 208 49.7968343668733 54.0822914582917 -4.28545709141834 A:G G A 10 0.530218543708742 0.578637268519688 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 50108252 T/C 1 12 9 21 5.6373774754951 4.77196689337868 0.865410582116419 T:C T C 10 0.530218543708742 0.828055654924615 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50106082_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50106090_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000471984:exon_50108054_50108398:RCBTB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 50204880 G/A 1 24 20 44 11.2747549509902 10.6043708741748 0.670384076815353 A:G G A 10 0.530218543708742 0.88086557780696 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 50283819 T/C 1 13 10 23 6.10715893178635 5.30218543708742 0.804973494698934 T:C T C 10 0.530218543708742 0.835821884898682 ENSG00000102753:ENST00000261667:exon_50283708_50283836:KPNA3;ENSG00000102753:ENST00000457886:exon_50283708_50283836:KPNA3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 52332329 C/T 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000139668:ENST00000298125:exon_52332328_52332436:WDFY2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 52343391 C/T 1 4 7 11 1.87912582516503 3.71152980596119 -1.83240398079616 T:C C T 10 0.530218543708742 0.367650802678922 ENSG00000102796:ENST00000444610:exon_52343292_52343429:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000218981:exon_52342131_52343429:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000469957:exon_52343292_52343429:DHRS12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 52598189 A/G 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 A:G A G 10 0.530218543708742 0.797017339461022 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52598142_52599073:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52598142_52599073:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000519151:exon_52598142_52599073:ALG11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 53049267 T/C 1 48 41 89 22.5495099019804 21.7389602920584 0.810549609921964 T:C T C 10 0.530218543708742 0.91559757237652 ENSG00000136108:ENST00000258607:exon_53049030_53050484:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378037:exon_53049030_53050485:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000490903:exon_53049030_53050484:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000459902:exon_53049030_53049277:CKAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 79940811 T/C 1 16 12 28 7.51650330066013 6.3626225245049 1.15388077615522 T:C T C 10 0.530218543708742 0.708452101922698 ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000461008:exon_79940768_79940845:RBM26 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 80911525 G/A 1 7 7 14 3.28847019403881 3.71152980596119 -0.423059611922388 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000136158:ENST00000377104:exon_80910111_80911891:SPRY2;ENSG00000136158:ENST00000377102:exon_80910111_80911891:SPRY2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 95714976 C/T 1 6 9 15 2.81868873774755 4.77196689337868 -1.95327815563113 T:C C T 10 0.530218543708742 0.438985732589774 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95714958_95715113:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95714958_95715113:ABCC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 95726541 A/G 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 A:T:G A G 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95726468_95726578:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95726468_95726578:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000467685:exon_95726470_95726578:ABCC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 95727780 T/C 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95727686_95727805:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95727686_95727805:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000467685:exon_95727686_95728273:ABCC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 95815415 C/T 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95815376_95815470:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95815376_95815470:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95815376_95815470:ABCC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 95861804 A/G 1 8 3 11 3.75825165033006 1.59065563112623 2.16759601920384 A:G A G 10 0.530218543708742 0.235945069885030 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95861688_95861851:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95861688_95861851:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95861688_95861851:ABCC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 132 100 232 62.0111522304461 53.0218543708742 8.98929785957186 A:G G A 10 0.530218543708742 0.263461742993199 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 99890742 C/T 1 3 7 10 1.40934436887377 3.71152980596119 -2.30218543708742 T:C C T 10 0.530218543708742 0.206122472271196 ENSG00000134882:ENST00000403766:exon_99890681_99890808:UBAC2;ENSG00000134882:ENST00000355700:exon_99890681_99890808:UBAC2;ENSG00000134882:ENST00000325028:exon_99890681_99890808:UBAC2;ENSG00000134882:ENST00000468067:exon_99890681_99890808:UBAC2;ENSG00000134882:ENST00000473091:exon_99890681_99890808:UBAC2;ENSG00000134882:ENST00000376440:exon_99890681_99890808:UBAC2;ENSG00000134882:ENST00000457666:exon_99890681_99890808:UBAC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 100888122 A/G 1 2 7 9 0.939562912582516 3.71152980596119 -2.77196689337868 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0932648737406713 ENSG00000175198:ENST00000376285:exon_100888096_100888132:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376286:exon_100888096_100888132:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376279:exon_100888096_100888132:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376277:exon_100888096_100888132:PCCA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 101287340 C/T 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 T:C C T 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000496511:exon_101287319_101287449:TMTC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 101287404 G/A 1 11 10 21 5.16759601920384 5.30218543708742 -0.134589417883582 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000496511:exon_101287319_101287449:TMTC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 23 30 53 10.8049734946989 15.9065563112623 -5.10158281656333 T:C T C 10 0.530218543708742 0.170603297427766 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 111290630 T/C 1 17 27 44 7.98628475695139 14.315900680136 -6.32961592318465 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0690799718985868 ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 111293915 T/G 1 69 66 135 32.4149204840968 34.994423884777 -2.57950340068017 T:G T G 10 0.530218543708742 0.667250386718844 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000375781:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000490421:exon_111293764_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111293764_111293957:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111293787_111293955:CARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 8 27 35 3.75825165033006 14.315900680136 -10.557649029806 T:C T C 10 0.530218543708742 0.000495198253768103 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 111368316 C/T 0 8 0 8 3.75825165033006 0 3.75825165033006 C C 10 0.530218543708742 0.0086188222890866 ENSG00000153487:ENST00000375774:exon_111367329_111368355:ING1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 111870037 T/C 1 22 19 41 10.3351920384077 10.0741523304661 0.261039707941578 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000449979:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000491775:exon_111870026_111870147:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000469877:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000466143:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000467053:exon_111870026_111870212:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426768:exon_111870026_111870232:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111870026_111870227:ARHGEF7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 113536132 T/C 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 T:C T C 10 0.530218543708742 0.247617633272995 ENSG00000068650:ENST00000487903:exon_113536127_113541482:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375630:exon_113536130_113541482:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000419631:exon_113536130_113538272:ATP11A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 13 113975754 C/T 1 59 46 105 27.7171059211842 24.3900530106021 3.32705291058209 T:C C T 10 0.530218543708742 0.557968125433931 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113974660_113975785:LAMP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 20764585 A/C 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 A:C A C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20764549_20764605:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20764549_20764605:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20764549_20764605:TTC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 20784431 G/A 1 235 245 480 110.398642228446 129.903543208642 -19.5049009801962 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.0747168466744817 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20784386_20784731:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 21 9 30 9.86541058211642 4.77196689337868 5.09344368873774 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0685994032009711 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 20841707 C/T 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20841666_20841742:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20841666_20841742:TEP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 20847202 A/G 1 8 3 11 3.75825165033006 1.59065563112623 2.16759601920384 A:G A G 10 0.530218543708742 0.235945069885030 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20847140_20847264:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20847140_20847264:TEP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 20852029 A/G 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20851902_20852077:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20851902_20852077:TEP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 20916249 T/C 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 T:C T C 10 0.530218543708742 0.73053574105774 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 41 43 84 19.2610397079416 22.7993973794759 -3.53835767153433 T:C T C 10 0.530218543708742 0.446430141319354 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 8 6 14 3.75825165033006 3.18131126225245 0.576940388077612 T:C T C 10 0.530218543708742 0.795824909862849 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 363 329 692 170.530668633727 174.441900880176 -3.91123224644946 T:C:G T G 10 0.530218543708742 0.789811600375377 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 21250124 G/A 1 21 23 44 9.86541058211642 12.1950265053011 -2.32961592318465 A:G G A 10 0.530218543708742 0.546627888447434 ENSG00000169413:ENST00000304677:exon_21249854_21250626:RNASE6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 23020706 C/A 1 453 511 964 212.81099969994 270.941675835167 -58.1306761352272 A:C C A 10 0.530218543708742 0.000180115014032667 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 23020919 C/T 1 338 200 538 158.786132226445 106.043708741748 52.7424234846968 T:C C T 10 0.530218543708742 5.38907871160594e-06 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 23020921 G/C 1 398 247 645 186.973019603921 130.963980296059 56.0090393078614 C:G G C 10 0.530218543708742 9.54022464325907e-06 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 23020970 G/T 1 543 355 898 255.091330766153 188.227583016603 66.8637477495497 T:G G T 10 0.530218543708742 7.26826710099804e-06 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 23021039 G/A 1 308 248 556 144.692688537707 131.494198839768 13.1984896979394 A:G G A 10 0.530218543708742 0.269464285484383 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 23240302 C/T 1 686 561 1247 322.270079015803 297.452603020604 24.8174759951987 T:C C T 10 0.530218543708742 0.164485965809564 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 64 53 117 30.0660132026405 28.1015828165633 1.96443038607719 C:G G C 10 0.530218543708742 0.781276628054746 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 23374435 G/A 1 33 30 63 15.5027880576115 15.9065563112623 -0.403768253650746 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374303_23374455:RBM23 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 23374862 C/T 1 32 21 53 15.0330066013203 11.1345894178836 3.89841718343667 T:C C T 10 0.530218543708742 0.335740894351592 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374815_23374868:RBM23 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24026493 A/G 1 11 14 25 5.16759601920384 7.42305961192239 -2.25546359271855 A:G A G 10 0.530218543708742 0.425252421915307 ENSG00000157306:ENST00000288014:exon_24025198_24026513:THTPA;ENSG00000157306:ENST00000404535:exon_24025952_24026513:THTPA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24458162 G/C 1 7 3 10 3.28847019403881 1.59065563112623 1.69781456291258 C:G G C 10 0.530218543708742 0.352695224731846 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 A:T A T 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 25 18 43 11.7445364072814 9.54393378675736 2.20060262052409 A:G G A 10 0.530218543708742 0.543613482576868 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 17 8 25 7.98628475695139 4.24174834966994 3.74453640728145 T:C C T 10 0.530218543708742 0.161813179944607 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 327 355 682 153.618536207241 188.227583016603 -34.609046809362 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0081091663579351 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24647814 T/C 1 19 10 29 8.9258476695339 5.30218543708742 3.62366223244648 T:C T C 10 0.530218543708742 0.196655030325250 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647812_24647878:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647812_24647878:REC8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24649669 C/T 1 50 49 99 23.4890728145629 25.9807086417284 -2.49163582716546 T:C C T 10 0.530218543708742 0.616521538254699 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24649425_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24649432_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24649432_24649778:IPO4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 47 26 73 22.0797284456891 13.7856821364273 8.29404630926184 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0601779031753903 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 17 16 33 7.98628475695139 8.48349669933987 -0.497211942388486 T:C T C 10 0.530218543708742 0.863707634497805 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24760808 C/T 1 22 39 61 10.3351920384077 20.6785232046409 -10.3433311662333 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00980786216627846 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24761805 A/C 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 A:C A C 10 0.530218543708742 0.76511742461274 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24771285 G/A 1 11 9 20 5.16759601920384 4.77196689337868 0.395629125825161 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24771171_24771312:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24771171_24771312:C14orf21 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24773387 T/C 1 32 9 41 15.0330066013203 4.77196689337868 10.2610397079416 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00144217703319884 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24773247_24773483:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24773247_24773394:C14orf21 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24839083 G/C 1 7 22 29 3.28847019403881 11.6648079615923 -8.37633776755352 C:G G C 10 0.530218543708742 0.00233354556210652 ENSG00000100968:ENST00000440487:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000424781:exon_24838705_24839800:NFATC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24839165 C/T 1 47 8 55 22.0797284456891 4.24174834966994 17.8379800960192 T:C C T 10 0.530218543708742 5.04487252758719e-07 ENSG00000100968:ENST00000440487:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000424781:exon_24838705_24839800:NFATC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24843620 T/C 1 2 18 20 0.939562912582516 9.54393378675736 -8.60437087417484 T:C T C 10 0.530218543708742 0.000130534807977430 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24843532_24843672:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24843532_24843672:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24843532_24843672:NFATC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24845841 T/C 1 21 50 71 9.86541058211642 26.5109271854371 -16.6455166033207 T:C T C 10 0.530218543708742 7.26922474259781e-05 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 29 5 34 13.6236622324465 2.65109271854371 10.9725695139028 A:C A C 10 0.530218543708742 0.000102831344065675 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 24901433 C/T 1 8 36 44 3.75825165033006 19.0878675735147 -15.3296159231846 T:C C T 10 0.530218543708742 2.6126134391959e-06 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 31099738 A/G 1 2 6 8 0.939562912582516 3.18131126225245 -2.24174834966994 A:G A G 10 0.530218543708742 0.158929006468168 ENSG00000092108:ENST00000311943:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000463622:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000458591:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000484733:exon_31099683_31099771:SCFD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 31354296 T/G 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 T:G T G 10 0.530218543708742 0.742825095475742 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 37 98 135 17.3819138827765 51.9614172834567 -34.5795034006802 C:G C G 10 0.530218543708742 2.09346253801882e-09 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 31583512 C/T 1 25 12 37 11.7445364072814 6.3626225245049 5.38191388277655 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0985041554161858 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31583492_31583546:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31583492_31583546:HECTD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 31647448 G/A 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 A:G G A 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 39517925 T/C 1 8 16 24 3.75825165033006 8.48349669933987 -4.72524504900981 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0651871577391257 ENSG00000100934:ENST00000307712:exon_39517856_39517933:SEC23A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 39648629 C/T 1 278 89 367 130.59924484897 47.189450390078 83.4097944588917 A:T:C C T 10 0.530218543708742 3.67587513052376e-19 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39648528_39648666:PNN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 17 60 77 7.98628475695139 31.8131126225245 -23.8268278655731 A:G G A 10 0.530218543708742 3.40753975596357e-08 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 50065717 G/C 1 9 21 30 4.22803310662132 11.1345894178836 -6.90655631126226 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0160275400640519 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 50074122 T/A 1 14 26 40 6.57694038807761 13.7856821364273 -7.20874174834968 A:T T A 10 0.530218543708742 0.026056722115848 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 50074520 C/T 1 26 74 100 12.2143178635727 39.2361722344469 -27.0218543708742 T:C C T 10 0.530218543708742 5.42621328371757e-08 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 50085571 G/A 1 647 2387 3034 303.948602220444 1265.63166383277 -961.683061612323 A:T:C:G G A 10 0.530218543708742 7.39737345588916e-281 ENSG00000165502:ENST00000298289:exon_50085407_50085858:RPL36AL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 19 72 91 8.9258476695339 38.1757351470294 -29.2498874774955 T:C T C 10 0.530218543708742 5.30914751531144e-10 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 50101370 G/A 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 A:G G A 10 0.530218543708742 0.565817448386735 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 51224417 G/C 1 5 17 22 2.34890728145629 9.01371524304861 -6.66480796159232 C:G G C 10 0.530218543708742 0.00489256326978541 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 51224658 T/A 1 11 3 14 5.16759601920384 1.59065563112623 3.57694038807761 A:T T A 10 0.530218543708742 0.0636441704976374 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 51237701 A/G 1 22 4 26 10.3351920384077 2.12087417483497 8.21431786357271 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00121310232849308 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453401:exon_51237570_51237710:NIN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 56086005 G/C 1 43 18 61 20.2006026205241 9.54393378675736 10.6566688337667 C:G G C 10 0.530218543708742 0.00673813331900423 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56085900_56086030:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56085900_56086030:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56085900_56086030:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56085900_56086030:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56085900_56086030:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56085900_56086030:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56085900_56086030:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56085900_56086030:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56085900_56086030:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56085900_56086030:KTN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 57755564 G/A 1 48 17 65 22.5495099019804 9.01371524304861 13.5357946589318 A:G G A 10 0.530218543708742 0.000707892404886425 ENSG00000053770:ENST00000431972:exon_57755520_57756794:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000261558:exon_57755520_57756797:MUDENG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 57938124 C/T 1 3 12 15 1.40934436887377 6.3626225245049 -4.95327815563113 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0167711993403857 ENSG00000100557:ENST00000216445:exon_57936019_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534126:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000530417:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534528:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000422976:exon_57937973_57938308:C14orf105 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 64518321 A/G 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 A:G A G 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 64519455 A/G 1 22 3 25 10.3351920384077 1.59065563112623 8.74453640728145 A:G A G 10 0.530218543708742 0.000392229177270352 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 64519709 A/T 1 8 22 30 3.75825165033006 11.6648079615923 -7.90655631126226 A:T A T 10 0.530218543708742 0.00519996987292726 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 64522674 G/C 1 8 6 14 3.75825165033006 3.18131126225245 0.576940388077612 C:G G C 10 0.530218543708742 0.795824909862849 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64522662_64522984:SYNE2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 64637147 C/A 1 6 38 44 2.81868873774755 20.1483046609322 -17.3296159231846 A:C C A 10 0.530218543708742 6.90684939417057e-08 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64636946_64637180:SYNE2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 64656855 T/C 1 12 20 32 5.6373774754951 10.6043708741748 -4.96699339867974 T:C T C 10 0.530218543708742 0.109522418077362 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64656789_64656955:SYNE2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 64676098 A/G 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 A:G A G 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 64908845 G/A 1 141 39 180 66.2391853370674 20.6785232046409 45.5606621324264 A:G G A 10 0.530218543708742 2.29671222932847e-12 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64908772_64908883:MTHFD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 64954683 A/G 1 9 27 36 4.22803310662132 14.315900680136 -10.0878675735147 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00116572777673124 ENSG00000089775:ENST00000261683:exon_64953555_64954775:ZBTB25;ENSG00000089775:ENST00000394715:exon_64953557_64954775:ZBTB25 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 64988830 C/A 1 99 52 151 46.5083641728345 27.5713642728546 18.93699989998 A:C C A 10 0.530218543708742 0.00191670134466825 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 65417070 C/A 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 A:C C A 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000139998:ENST00000267512:exon_65417043_65417132:RAB15;ENSG00000139998:ENST00000436278:exon_65417043_65417132:RAB15;ENSG00000139998:ENST00000533601:exon_65417043_65417132:RAB15;ENSG00000139998:ENST00000426039:exon_65417043_65417132:RAB15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 66028446 A/G 1 9 56 65 4.22803310662132 29.6922384476896 -25.4642053410682 A:G A G 10 0.530218543708742 5.79789409296902e-11 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66028055_66028484:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66028055_66028484:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66028055_66028484:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66028055_66028484:FUT8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 66096297 G/A 1 7 20 27 3.28847019403881 10.6043708741748 -7.31590068013603 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0060444119579707 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000358307:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394581:exon_66096210_66096324:FUT8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 71137844 G/T 1 61 22 83 28.6566688337667 11.6648079615923 16.9918608721744 T:G G T 10 0.530218543708742 0.000159377841017331 ENSG00000133985:ENST00000256367:exon_71137793_71142077:TTC9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 71199452 G/A 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000006432:ENST00000005198:exon_71199256_71200059:MAP3K9;ENSG00000006432:ENST00000381250:exon_71199256_71200059:MAP3K9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 71444788 G/A 1 3 9 12 1.40934436887377 4.77196689337868 -3.3626225245049 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0792634794421136 ENSG00000100731:ENST00000238570:exon_71443659_71445365:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000304743:exon_71443659_71445365:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000439984:exon_71443659_71445365:PCNX HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 73440864 C/T 1 8 10 18 3.75825165033006 5.30218543708742 -1.54393378675736 T:C C T 10 0.530218543708742 0.488609852310515 ENSG00000165861:ENST00000394207:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73440788_73440901:ZFYVE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 73491270 C/T 1 19 2 21 8.9258476695339 1.06043708741748 7.86541058211642 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000585476629564703 ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73490734_73491650:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73490734_73491650:ZFYVE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 82 15 97 38.5220794158832 7.95327815563113 30.568801260252 T:C T C 10 0.530218543708742 1.17799556806719e-10 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 74206481 T/C 1 16 12 28 7.51650330066013 6.3626225245049 1.15388077615522 T:C T C 10 0.530218543708742 0.708452101922698 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 75558152 C/T 1 13 29 42 6.10715893178635 15.3763377675535 -9.26917883576716 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00493600308351276 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75557973_75558181:NEK9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 7 21 28 3.28847019403881 11.1345894178836 -7.84611922384478 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00377157217935466 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 77492891 G/A 1 38 85 123 17.8516953390678 45.0685762152431 -27.2168808761753 A:G G A 10 0.530218543708742 1.14870344960786e-06 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 77794283 T/C 1 21 4 25 9.86541058211642 2.12087417483497 7.74453640728145 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00200997139160578 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393741:exon_77794123_77794380:GSTZ1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 77926011 C/T 1 114 52 166 53.5550860172034 27.5713642728546 25.9837217443488 T:C C T 10 0.530218543708742 4.73152472031234e-05 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77925959_77926149:AHSA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 77928525 A/G 1 146 52 198 68.5880926185237 27.5713642728546 41.0167283456691 A:C:G A G 10 0.530218543708742 3.14694553881055e-09 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77928503_77928585:AHSA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 77935520 G/A 1 177 53 230 83.1513177635527 28.1015828165633 55.0497349469893 A:G G A 10 0.530218543708742 7.72066868893805e-14 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77935420_77935807:AHSA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 78028803 A/G 1 15 8 23 7.04672184436887 4.24174834966994 2.80497349469893 A:G A G 10 0.530218543708742 0.298108306919805 ENSG00000100596:ENST00000216484:exon_78028739_78028832:SPTLC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 88477882 A/C 1 19 67 86 8.9258476695339 35.5246424284857 -26.5987947589518 A:C A C 10 0.530218543708742 6.48622164282765e-09 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 90744672 G/A 1 3 19 22 1.40934436887377 10.0741523304661 -8.66480796159232 A:G G A 10 0.530218543708742 0.000171068727048304 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90744398_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90744402_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90744402_90744805:C14orf102 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 90745422 T/C 1 2 18 20 0.939562912582516 9.54393378675736 -8.60437087417484 T:C T C 10 0.530218543708742 0.000130534807977430 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90745406_90745477:C14orf102 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 136 305 441 63.8902780556111 161.716655831166 -97.8263777755552 T:G T G 10 0.530218543708742 7.62997376001782e-21 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 93170993 C/T 1 95 288 383 44.6292383476695 152.702940588118 -108.073702240448 T:C C T 10 0.530218543708742 3.29968560857173e-29 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 93412743 G/A 1 30 4 34 14.0934436887377 2.12087417483497 11.9725695139028 A:G G A 10 0.530218543708742 1.83695093637357e-05 ENSG00000100605:ENST00000354313:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000405174:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000267615:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000311458:exon_93412676_93412838:ITPK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 94524216 T/C 1 200 87 287 93.9562912582516 46.1290133026606 47.827277955591 A:T:C T C 10 0.530218543708742 1.03289348653339e-08 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94524168_94524243:DDX24 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 94849201 C/T 0 8 0 8 3.75825165033006 0 3.75825165033006 C C 10 0.530218543708742 0.0086188222890866 ENSG00000197249:ENST00000440909:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000355814:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000449399:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437397:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000426226:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437074:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448140:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448921:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393087:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000489769:exon_94848929_94849583:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393088:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000404814:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000402629:exon_94848929_94849578:SERPINA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 96781912 T/C 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 T:C T C 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000066739:ENST00000359933:exon_96781721_96781920:ATG2B;ENSG00000066739:ENST00000261834:exon_96781721_96781920:ATG2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 99967186 A/T 1 12 53 65 5.6373774754951 28.1015828165633 -22.4642053410682 A:T A T 10 0.530218543708742 1.28192684721396e-08 ENSG00000090061:ENST00000389879:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000216279:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000411691:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000380246:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000437596:exon_99967103_99967208:CCNK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 100563943 G/A 1 148 67 215 69.5276555311062 35.5246424284857 34.0030131026205 A:G G A 10 0.530218543708742 2.86244943671533e-06 ENSG00000196405:ENST00000402714:exon_100563818_100563995:EVL;ENSG00000196405:ENST00000392920:exon_100563818_100563995:EVL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 102792386 T/C 1 4 9 13 1.87912582516503 4.77196689337868 -2.89284106821365 T:C T C 10 0.530218543708742 0.162918845921506 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 102792631 G/A 1 6 17 23 2.81868873774755 9.01371524304861 -6.19502650530107 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0113478316534068 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 102798055 G/A 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 A:G G A 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102797959_102798183:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102797959_102798183:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102797959_102798183:ZNF839 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 102808493 C/T 1 3 31 34 1.40934436887377 16.436774854971 -15.0274304860972 T:C C T 10 0.530218543708742 7.87274063785288e-08 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102808440_102808516:ZNF839 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 102815042 C/T 1 195 50 245 91.6073839767953 26.5109271854371 65.0964567913582 T:C C T 10 0.530218543708742 7.63874365772675e-18 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 102901201 A/G 1 12 2 14 5.6373774754951 1.06043708741748 4.57694038807761 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0151598116441243 ENSG00000196663:ENST00000359520:exon_102900572_102901548:TECPR2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 103342049 T/C 1 12 69 81 5.6373774754951 36.5850795159032 -30.9477020404081 T:C T C 10 0.530218543708742 1.60765113475309e-12 ENSG00000131323:ENST00000392745:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000347662:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000351691:exon_103341961_103342065:TRAF3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 104029449 G/A 1 19 40 59 8.9258476695339 21.2087417483497 -12.2828940788158 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00156562298247812 ENSG00000126214:ENST00000409074:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000472726:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000247618:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104029300_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000440963:exon_104029302_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000458117:exon_104029316_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000489117:exon_104029390_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000495778:exon_104029414_104029461:C14orf153 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 105180706 A/C,G 0 0 38 38 0 20.1483046609322 -20.1483046609322 C:G A G 10 0.530218543708742 3.40441938157402e-13 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 64 14 78 30.0660132026405 7.42305961192239 22.6429535907181 T:C C T 10 0.530218543708742 1.43785468913524e-07 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 105239894 C/T 1 79 25 104 37.1127350470094 13.2554635927186 23.8572714542908 T:C C T 10 0.530218543708742 1.72023563254215e-06 ENSG00000142208:ENST00000349310:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000407796:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000402615:exon_105239792_105239917:AKT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 40 153 193 18.7912582516503 81.1234371874375 -62.3321789357872 A:G G A 10 0.530218543708742 6.08836659411508e-20 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 14 105930406 G/A 1 13 40 53 6.10715893178635 21.2087417483497 -15.1015828165633 A:G G A 10 0.530218543708742 4.19244329447102e-05 ENSG00000182979:ENST00000435036:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000490198:exon_105930369_105930484:MTA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 21937964 A/G 0 10 0 10 4.69781456291258 0 4.69781456291258 A A 10 0.530218543708742 0.00227965016978733 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 22939192 G/A 1 10 20 30 4.69781456291258 10.6043708741748 -5.90655631126226 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0425277168588607 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22939175_22939266:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22939175_22939266:CYFIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 22960868 G/C 1 25 28 53 11.7445364072814 14.8461192238448 -3.10158281656333 C:G G C 10 0.530218543708742 0.411702638901328 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22960793_22960889:CYFIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 23006707 C/A 1 120 119 239 56.373774754951 63.0960067013403 -6.72223194638934 A:C C A 10 0.530218543708742 0.399843929004759 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23004684_23006855:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23005349_23006855:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23005349_23006855:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23005349_23006855:NIPA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 43 51 94 20.2006026205241 27.0411457291458 -6.84054310862175 T:C C T 10 0.530218543708742 0.179060984481073 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 35273620 C/T 1 17 19 36 7.98628475695139 10.0741523304661 -2.08786757351471 T:C C T 10 0.530218543708742 0.508258820331903 ENSG00000198146:ENST00000356321:exon_35270542_35275691:ZNF770 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 35665765 G/C 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000134146:ENST00000256538:exon_35665722_35665809:ATPBD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 40265799 A/G 1 26 31 57 12.2143178635727 16.436774854971 -4.22245699139829 A:G A G 10 0.530218543708742 0.289476275417347 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40265793_40265950:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40265793_40265950:EIF2AK4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 40269052 G/A 0 10 0 10 4.69781456291258 0 4.69781456291258 G G 10 0.530218543708742 0.00227965016978733 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 40313141 C/T 1 10 15 25 4.69781456291258 7.95327815563113 -3.25546359271855 T:C C T 10 0.530218543708742 0.230578617079935 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40313100_40313228:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40313100_40313228:EIF2AK4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 40327290 A/G 1 70 70 140 32.8847019403881 37.1152980596119 -4.23059611922388 A:G A G 10 0.530218543708742 0.498678039255334 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 77 66 143 36.1731721344269 34.994423884777 1.17874824964989 A:G G A 10 0.530218543708742 0.867234928997547 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 40328665 G/A 1 832 848 1680 390.858171634327 449.625325065013 -58.7671534306866 A:C:G G A 10 0.530218543708742 0.00422997664376071 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40327891_40328701:SRP14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 40488851 G/A 1 21 16 37 9.86541058211642 8.48349669933987 1.38191388277655 A:G G A 10 0.530218543708742 0.742655841774882 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40488746_40488975:BUB1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 40581543 T/C 1 19 10 29 8.9258476695339 5.30218543708742 3.62366223244648 T:C T C 10 0.530218543708742 0.196655030325250 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40581473_40581559:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40581473_40581559:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40581473_40581559:PLCB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 41813279 C/A 1 13 12 25 6.10715893178635 6.3626225245049 -0.25546359271855 A:T:C C A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41812589_41813345:RPAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 42453963 T/C 1 30 20 50 14.0934436887377 10.6043708741748 3.4890728145629 T:C T C 10 0.530218543708742 0.395529499115235 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42453880_42453971:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42453880_42453971:VPS39 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 42565588 C/A 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 A:C C A 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000103978:ENST00000389834:exon_42565453_42565755:TMEM87A;ENSG00000103978:ENST00000448392:exon_42565453_42565638:TMEM87A;ENSG00000103978:ENST00000307216:exon_42565453_42565755:TMEM87A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 42570718 A/G 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000214013:ENST00000440615:exon_42570680_42570788:GANC;ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42570680_42570788:GANC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 42579984 G/A 1 7 3 10 3.28847019403881 1.59065563112623 1.69781456291258 A:G G A 10 0.530218543708742 0.352695224731846 ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42579889_42580016:GANC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 42740369 C/T 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42740270_42740903:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42740270_42740903:ZFP106 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 42742464 A/G 1 3 18 21 1.40934436887377 9.54393378675736 -8.13458941788358 A:G A G 10 0.530218543708742 0.000315917296670304 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42741969_42744152:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42741969_42744152:ZFP106 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 43017426 T/G 1 7 10 17 3.28847019403881 5.30218543708742 -2.01371524304861 T:G T G 10 0.530218543708742 0.343429778687472 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43017342_43017449:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43017342_43017449:CDAN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 43023482 T/C 1 6 11 17 2.81868873774755 5.83240398079616 -3.01371524304861 T:C T C 10 0.530218543708742 0.153573028313809 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43023409_43023529:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43023409_43023529:CDAN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 43621947 A/G 1 5 11 16 2.34890728145629 5.83240398079616 -3.48349669933987 A:G A G 10 0.530218543708742 0.130369289858938 ENSG00000168806:ENST00000305641:exon_43619976_43622891:LCMT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 43632549 T/C 1 1 12 13 0.469781456291258 6.3626225245049 -5.89284106821365 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00111247918936552 ENSG00000168803:ENST00000428046:exon_43632463_43632550:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000422466:exon_43632463_43632550:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000389651:exon_43632463_43632550:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000305605:exon_43632463_43632550:ADAL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 43661802 T/C 1 3 8 11 1.40934436887377 4.24174834966994 -2.83240398079616 T:C T C 10 0.530218543708742 0.129086131769062 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43661794_43662246:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43661794_43662258:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43661794_43662258:ZSCAN29 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 43669249 A/G 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:G A G 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000137822:ENST00000260383:exon_43669212_43669265:TUBGCP4;ENSG00000137822:ENST00000399460:exon_43669212_43669265:TUBGCP4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 43724646 T/G 1 19 25 44 8.9258476695339 13.2554635927186 -4.32961592318465 T:G T G 10 0.530218543708742 0.22705525237632 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43724392_43724875:TP53BP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 43748304 A/G 1 16 19 35 7.51650330066013 10.0741523304661 -2.55764902980597 A:G A G 10 0.530218543708742 0.402194597510979 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43748090_43748529:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000480860:exon_43748090_43748350:TP53BP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 43762196 C/T 1 4 10 14 1.87912582516503 5.30218543708742 -3.42305961192239 T:C C T 10 0.530218543708742 0.105064392873074 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43762056_43762264:TP53BP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 43767774 G/C 1 1 7 8 0.469781456291258 3.71152980596119 -3.24174834966994 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0300386507500581 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43767763_43767892:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43767763_43767892:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43767763_43767892:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43767763_43767892:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43767763_43767892:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43767763_43767892:TP53BP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 76 145 221 35.7033906781356 76.8816888377676 -41.178298159632 A:T:C C T 10 0.530218543708742 3.37755389330648e-08 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 44061802 C/T 1 60 113 173 28.1868873774755 59.9146954390878 -31.7278080616124 T:C C T 10 0.530218543708742 1.30706299317601e-06 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44061716_44061844:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44061716_44061844:PDIA3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 44069069 G/C 1 7 15 22 3.28847019403881 7.95327815563113 -4.66480796159232 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0546658878313038 ENSG00000128886:ENST00000319359:exon_44068968_44069741:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000486851:exon_44068968_44069164:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000433927:exon_44068968_44069162:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000497700:exon_44068968_44069166:ELL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 58 68 126 27.247324464893 36.0548609721945 -8.80753650730149 T:C T C 10 0.530218543708742 0.129078188696529 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 44102010 A/C 1 38 45 83 17.8516953390678 23.8598344668934 -6.00813912782559 A:C A C 10 0.530218543708742 0.189089254399735 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 44943757 A/G 1 19 22 41 8.9258476695339 11.6648079615923 -2.73896029205842 A:G A G 10 0.530218543708742 0.435664976115865 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 45047134 G/A 1 18 2 20 8.45606621324264 1.06043708741748 7.39562912582516 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00103977099881327 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 45047573 C/T 1 22 2 24 10.3351920384077 1.06043708741748 9.27475495099019 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000102154317505427 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 1 8 1 9 3.75825165033006 0.530218543708742 3.22803310662132 A:T A T 10 0.530218543708742 0.0421575176018681 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 48626647 A/G 1 161 153 314 75.6348144628925 81.1234371874375 -5.488622724545 A:G A G 10 0.530218543708742 0.534684797242035 ENSG00000128951:ENST00000331200:exon_48626614_48626705:DUT;ENSG00000128951:ENST00000450740:exon_48626614_48626705:DUT;ENSG00000128951:ENST00000249783:exon_48626614_48626705:DUT;ENSG00000128951:ENST00000455976:exon_48626614_48626705:DUT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 49325289 A/C 1 11 9 20 5.16759601920384 4.77196689337868 0.395629125825161 A:C A C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000138593:ENST00000261847:exon_49325162_49325297:SECISBP2L;ENSG00000138593:ENST00000380927:exon_49325162_49325297:SECISBP2L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 50867142 C/T 1 14 22 36 6.57694038807761 11.6648079615923 -5.08786757351471 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0967141233002735 ENSG00000092439:ENST00000313478:exon_50867049_50867332:TRPM7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 51040384 T/C 1 14 13 27 6.57694038807761 6.89284106821365 -0.315900680136034 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000138600:ENST00000261854:exon_51040310_51040399:AC012100.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 5 11 16 2.34890728145629 5.83240398079616 -3.48349669933987 A:G A G 10 0.530218543708742 0.130369289858938 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 52613593 G/C 1 5 13 18 2.34890728145629 6.89284106821365 -4.54393378675736 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0351116074210844 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52613556_52613706:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52613556_52613706:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52613556_52613706:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52613556_52613706:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52613556_52613706:MYO5A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 52901433 C/T 1 8 16 24 3.75825165033006 8.48349669933987 -4.72524504900981 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0651871577391257 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 52901638 T/C 1 18 26 44 8.45606621324264 13.7856821364273 -5.32961592318465 T:C T C 10 0.530218543708742 0.130486551743866 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 52901977 G/A 1 10 11 21 4.69781456291258 5.83240398079616 -1.13458941788358 A:G G A 10 0.530218543708742 0.666334924600774 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 12 22 34 5.6373774754951 11.6648079615923 -6.02743048609723 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0404069054441445 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 56387859 T/C 1 11 10 21 5.16759601920384 5.30218543708742 -0.134589417883582 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000181827:ENST00000422057:exon_56385831_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000423270:exon_56382732_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000317318:exon_56382732_56388818:RFX7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 56388033 T/C 1 15 14 29 7.04672184436887 7.42305961192239 -0.376337767553518 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000181827:ENST00000422057:exon_56385831_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000423270:exon_56382732_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000317318:exon_56382732_56388818:RFX7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 59323048 C/G 1 9 5 14 4.22803310662132 2.65109271854371 1.57694038807761 C:G C G 10 0.530218543708742 0.43589870850422 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59323003_59323901:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59323003_59323901:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59323003_59323901:RNF111 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 59347929 C/A 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 A:C C A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59347881_59348044:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59347881_59348044:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59347881_59348044:RNF111 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 59368167 G/A 1 10 8 18 4.69781456291258 4.24174834966994 0.456066213242644 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59368153_59368414:RNF111 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 21 38 59 9.86541058211642 20.1483046609322 -10.2828940788158 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00866990122480653 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 59963488 A/G 1 13 13 26 6.10715893178635 6.89284106821365 -0.785682136427292 A:G A G 10 0.530218543708742 0.845120861383123 ENSG00000140299:ENST00000267859:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000415213:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000409352:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000439052:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000448414:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000464390:exon_59963380_59963513:BNIP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 60639874 G/A 1 68 90 158 31.9451390278055 47.7196689337868 -15.7745299059812 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0133080981941918 ENSG00000182718:ENST00000396024:exon_60639333_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000332680:exon_60639351_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000421017:exon_60639351_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000451270:exon_60639351_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000356292:exon_60639536_60639888:ANXA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 45 32 77 21.1401655331066 16.9669933986797 4.17317213442687 T:G T G 10 0.530218543708742 0.362660118135799 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 60734697 A/G 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 A:G A G 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60734615_60734744:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60734615_60734744:NARG2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 134 122 256 62.9507151430286 64.6866623324665 -1.73594718943795 A:G G A 10 0.530218543708742 0.851108334619268 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 A:C:G G A 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 63918307 G/C 1 12 4 16 5.6373774754951 2.12087417483497 3.51650330066013 C:G G C 10 0.530218543708742 0.085348639876271 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63918184_63918353:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63918184_63918353:HERC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 63922752 T/A 1 8 4 12 3.75825165033006 2.12087417483497 1.6373774754951 A:T T A 10 0.530218543708742 0.398218675970565 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63922665_63922834:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63922665_63922834:HERC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 63932513 G/C 1 14 5 19 6.57694038807761 2.65109271854371 3.9258476695339 C:G G C 10 0.530218543708742 0.105397064107856 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63932351_63932644:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63932351_63932644:HERC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 63954029 C/T 1 1 7 8 0.469781456291258 3.71152980596119 -3.24174834966994 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0300386507500581 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63953952_63954220:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63953952_63954220:HERC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 63988357 C/G 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 C:G C G 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63988323_63988538:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63988323_63988538:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000425434:exon_63988323_63988538:HERC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 64966526 C/T 1 12 13 25 5.6373774754951 6.89284106821365 -1.25546359271855 T:C C T 10 0.530218543708742 0.690551486586856 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64966115_64968455:ZNF609 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 65108479 T/C 1 46 40 86 21.6099469893979 21.2087417483497 0.401205241048189 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 65153690 G/A 1 13 19 32 6.10715893178635 10.0741523304661 -3.96699339867974 A:G G A 10 0.530218543708742 0.214467679943302 ENSG00000249240:ENST00000502574:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000249240:ENST00000437723:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65153676_65153774:PLEKHO2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 65157482 C/T 1 31 37 68 14.563225145029 19.6180861172235 -5.05486097219445 T:C C T 10 0.530218543708742 0.226654346102020 ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65157098_65160206:PLEKHO2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 65553246 C/T 1 6 11 17 2.81868873774755 5.83240398079616 -3.01371524304861 T:C C T 10 0.530218543708742 0.153573028313809 ENSG00000138617:ENST00000261888:exon_65553223_65553364:PARP16;ENSG00000138617:ENST00000444347:exon_65553223_65553364:PARP16;ENSG00000138617:ENST00000432843:exon_65553223_65553364:PARP16 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 67528374 T/G 1 11 12 23 5.16759601920384 6.3626225245049 -1.19502650530107 T:G T G 10 0.530218543708742 0.679029978421074 ENSG00000103591:ENST00000261880:exon_67528317_67528406:AAGAB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 62 52 114 29.126450290058 27.5713642728546 1.55508601720341 A:G A G 10 0.530218543708742 0.779328065534663 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 66 56 122 31.005576115223 29.6922384476896 1.31333766753348 T:G G T 10 0.530218543708742 0.856254263360564 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 74336633 T/C 1 18 19 37 8.45606621324264 10.0741523304661 -1.61808611722345 T:C T C 10 0.530218543708742 0.624171639477041 ENSG00000140464:ENST00000418568:exon_74336562_74336640:PML;ENSG00000140464:ENST00000417341:exon_74336562_74340151:PML;ENSG00000140464:ENST00000436891:exon_74336562_74340151:PML;ENSG00000140464:ENST00000268058:exon_74336562_74339112:PML HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 78337303 C/T 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 T:C C T 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000167202:ENST00000418039:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000409931:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000300584:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000420639:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000435468:exon_78337242_78337410:TBC1D2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 78441769 T/C 1 25 20 45 11.7445364072814 10.6043708741748 1.14016553310661 T:C T C 10 0.530218543708742 0.767083104578006 ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78441663_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78441719_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000379576:exon_78441720_78441772:IDH3A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 78789488 C/T 1 21 13 34 9.86541058211642 6.89284106821365 2.97256951390277 T:C C T 10 0.530218543708742 0.390710959106296 ENSG00000136381:ENST00000258886:exon_78789468_78789653:IREB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 21 142 163 9.86541058211642 75.2910332066414 -65.4256226245249 T:C T C 10 0.530218543708742 8.58795497651357e-27 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 296 336 632 139.055311062212 178.153430686137 -39.0981196239249 A:C A C 10 0.530218543708742 0.00187241991425464 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 396 388 784 186.033456691338 205.724794958992 -19.6913382676537 T:C C T 10 0.530218543708742 0.162945352738582 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 181 249 430 85.0304435887177 132.024417383477 -46.9939737947591 A:G A G 10 0.530218543708742 6.5005321784151e-06 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 81593796 A/G 1 129 103 232 60.6018078615723 54.6125100020004 5.98929785957186 A:G A G 10 0.530218543708742 0.46944729122237 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81593685_81593853:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81593685_81593853:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81593685_81593853:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81593685_81593853:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81593685_81593853:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81593685_81593853:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81593685_81593853:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81593685_81593853:IL16 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 82443824 C/T 1 8 31 39 3.75825165033006 16.436774854971 -12.6785232046409 T:C C T 10 0.530218543708742 3.95920823651526e-05 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 83687561 G/A 1 39 29 68 18.3214767953591 15.3763377675535 2.94513902780554 A:G G A 10 0.530218543708742 0.543946067829344 ENSG00000064726:ENST00000261721:exon_83687459_83687605:BTBD1;ENSG00000064726:ENST00000379403:exon_83687459_83687605:BTBD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 85188994 T/C 1 17 13 30 7.98628475695139 6.89284106821365 1.09344368873774 T:C T C 10 0.530218543708742 0.718556699845737 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 85189464 T/G 1 5 8 13 2.34890728145629 4.24174834966994 -1.89284106821365 T:G T G 10 0.530218543708742 0.406203894191414 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000419751:exon_85189293_85189579:WDR73 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 85333953 A/G 1 15 7 22 7.04672184436887 3.71152980596119 3.33519203840768 A:G A G 10 0.530218543708742 0.200272681658531 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85333936_85334114:ZNF592 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 85341859 G/A 1 13 17 30 6.10715893178635 9.01371524304861 -2.90655631126226 A:G G A 10 0.530218543708742 0.360849883752274 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85341819_85342106:ZNF592 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 86123364 G/A 1 9 2 11 4.22803310662132 1.06043708741748 3.16759601920384 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0707395200860403 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 86286787 C/T 1 22 47 69 10.3351920384077 24.9202715543109 -14.5850795159032 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000620807795332033 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86286723_86287056:AKAP13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 86311593 C/A 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 A:C C A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000183655:ENST00000337975:exon_86311248_86313051:KLHL25 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 89169858 A/G 1 24 22 46 11.2747549509902 11.6648079615923 -0.390053010602131 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 89172558 G/C 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 C:G G C 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89172457_89172657:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89172457_89172657:AEN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 89421405 G/A 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:G G A 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000140511:ENST00000359595:exon_89420519_89421487:HAPLN3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 89804043 C/T 1 17 11 28 7.98628475695139 5.83240398079616 2.15388077615522 T:C C T 10 0.530218543708742 0.453884491531812 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 24 20 44 11.2747549509902 10.6043708741748 0.670384076815353 C:G G C 10 0.530218543708742 0.88086557780696 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 47 49 96 22.0797284456891 25.9807086417284 -3.90098019603923 T:C T C 10 0.530218543708742 0.474387035006886 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 89860786 A/C 1 3 7 10 1.40934436887377 3.71152980596119 -2.30218543708742 A:C A C 10 0.530218543708742 0.206122472271196 ENSG00000140521:ENST00000526671:exon_89860607_89861059:POLG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 90164769 T/C 1 21 18 39 9.86541058211642 9.54393378675736 0.321476795359063 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90164624_90164781:C15orf42 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 90167658 G/A 1 16 14 30 7.51650330066013 7.42305961192239 0.0934436887377403 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 90168108 C/T 1 18 20 38 8.45606621324264 10.6043708741748 -2.1483046609322 T:C C T 10 0.530218543708742 0.518508107539554 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 90168693 T/A 1 14 12 26 6.57694038807761 6.3626225245049 0.214317863572709 A:T T A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 90226947 C/A 1 13 18 31 6.10715893178635 9.54393378675736 -3.436774854971 A:C C A 10 0.530218543708742 0.280193232704031 ENSG00000166821:ENST00000300056:exon_90224762_90227179:PEX11A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 90610807 C/A 1 13 25 38 6.10715893178635 13.2554635927186 -7.1483046609322 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0226309972513541 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90610342_90611827:ZNF710 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 90611818 C/A 1 19 20 39 8.9258476695339 10.6043708741748 -1.67852320464094 A:C C A 10 0.530218543708742 0.63239273066813 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90610342_90611827:ZNF710 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 90768320 C/T 1 9 3 12 4.22803310662132 1.59065563112623 2.6373774754951 T:C C T 10 0.530218543708742 0.154808266842262 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000379122:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90768200_90768410:SEMA4B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 90771446 A/G 1 12 27 39 5.6373774754951 14.315900680136 -8.67852320464094 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00601328589106936 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000379122:exon_90771141_90771496:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 90771704 G/A 1 16 20 36 7.51650330066013 10.6043708741748 -3.08786757351471 A:G G A 10 0.530218543708742 0.320546928577092 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 90814559 A/G 1 60 43 103 28.1868873774755 22.7993973794759 5.38748999799957 A:G A G 10 0.530218543708742 0.323752193400410 ENSG00000182768:ENST00000331497:exon_90814420_90816463:NGRN;ENSG00000182768:ENST00000379095:exon_90814420_90815440:NGRN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 91010776 T/C 1 14 28 42 6.57694038807761 14.8461192238448 -8.26917883576716 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0127298391094514 ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91010682_91010824:IQGAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 91337479 G/A 1 11 10 21 5.16759601920384 5.30218543708742 -0.134589417883582 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91337397_91337587:BLM HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 91346923 C/A 1 17 10 27 7.98628475695139 5.30218543708742 2.68409931986397 A:C C A 10 0.530218543708742 0.339242316991111 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91346751_91346950:BLM HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 91354505 C/T 1 18 15 33 8.45606621324264 7.95327815563113 0.502788057611514 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 91424574 G/C 1 46 30 76 21.6099469893979 15.9065563112623 5.70339067813561 C:G G C 10 0.530218543708742 0.207054072652655 ENSG00000140564:ENST00000268171:exon_91424516_91426688:FURIN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 100246936 T/C 1 32 8 40 15.0330066013203 4.24174834966994 10.7912582516503 T:C T C 10 0.530218543708742 0.000669308220243525 ENSG00000068305:ENST00000354410:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000346108:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000449277:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000338042:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000453228:exon_100246934_100247060:MEF2A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 100269680 G/C 1 9 12 21 4.22803310662132 6.3626225245049 -2.13458941788358 C:G G C 10 0.530218543708742 0.387625542901861 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 26 32 58 12.2143178635727 16.9669933986797 -4.75267553510704 A:G G A 10 0.530218543708742 0.237038182104505 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 101464915 T/C 1 23 21 44 10.8049734946989 11.1345894178836 -0.329615923184647 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 101569467 T/C 0 0 8 8 0 4.24174834966994 -4.24174834966994 C T C 10 0.530218543708742 0.00237228552436099 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 101595257 G/A 1 17 8 25 7.98628475695139 4.24174834966994 3.74453640728145 A:G G A 10 0.530218543708742 0.161813179944607 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101595151_101595428:LRRK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 101606261 C/T 1 61 43 104 28.6566688337667 22.7993973794759 5.85727145429083 T:C C T 10 0.530218543708742 0.280043418281355 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 101606889 G/A 1 43 35 78 20.2006026205241 18.557649029806 1.64295359071813 A:G G A 10 0.530218543708742 0.734843540379643 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 101606890 C/A 1 43 35 78 20.2006026205241 18.557649029806 1.64295359071813 A:C C A 10 0.530218543708742 0.734843540379643 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 101717680 G/T 1 41 29 70 19.2610397079416 15.3763377675535 3.88470194038806 T:G G T 10 0.530218543708742 0.402350145227632 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 101718927 G/A 1 9 11 20 4.22803310662132 5.83240398079616 -1.60437087417484 A:G G A 10 0.530218543708742 0.508309614769096 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 102192502 G/A 1 22 12 34 10.3351920384077 6.3626225245049 3.97256951390277 A:G G A 10 0.530218543708742 0.228654342632051 ENSG00000184277:ENST00000428002:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000347970:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000333202:exon_102192474_102192570:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000453041:exon_102192474_102192594:TM2D3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 102192540 T/G 1 17 3 20 7.98628475695139 1.59065563112623 6.39562912582516 T:G T G 10 0.530218543708742 0.00564003660922332 ENSG00000184277:ENST00000428002:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000347970:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000333202:exon_102192474_102192570:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000453041:exon_102192474_102192594:TM2D3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 102224341 G/A 1 13 9 22 6.10715893178635 4.77196689337868 1.33519203840768 A:G G A 10 0.530218543708742 0.671305989890035 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102224278_102224440:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102224278_102224440:TARSL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 15 102264304 G/C 1 29 13 42 13.6236622324465 6.89284106821365 6.73082116423284 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0438484687093267 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102264294_102264807:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102264294_102264645:TARSL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 105444 C/T 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000161981:ENST00000466183:exon_104960_105549:SNRNP25 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 132 125 257 62.0111522304461 66.2773179635928 -4.26616573314669 A:G A G 10 0.530218543708742 0.617318194776807 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 449345 G/C 1 13 2 15 6.10715893178635 1.06043708741748 5.04672184436887 C:G G C 10 0.530218543708742 0.00893461932137095 ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449295_449480:NME4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 183 101 284 85.9700065013002 53.5520729145829 32.4179335867173 A:G G A 10 0.530218543708742 0.000106903737781154 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 254 158 412 119.32448989798 83.7745299059812 35.5499599919983 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000447685357310073 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 602672 C/T 1 47 54 101 22.0797284456891 28.6318013602721 -6.55207291458294 T:C C T 10 0.530218543708742 0.196425571852334 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602605_602771:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_602605_602771:SOLH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 685360 C/T 1 25 19 44 11.7445364072814 10.0741523304661 1.67038407681535 T:C C T 10 0.530218543708742 0.652859406652356 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 845754 C/T 1 13 21 34 6.10715893178635 11.1345894178836 -5.02743048609723 T:C C T 10 0.530218543708742 0.088419909813975 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 845797 G/C 1 14 17 31 6.57694038807761 9.01371524304861 -2.436774854971 C:G G C 10 0.530218543708742 0.472338437680562 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 846798 C/T 1 19 9 28 8.9258476695339 4.77196689337868 4.15388077615522 T:C C T 10 0.530218543708742 0.131859826541765 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_846615_846861:CHTF18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 904551 G/C 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 C:G G C 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_903638_904706:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_903638_904706:LMF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 1004554 C/T 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 T:C C T 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_1004357_1004666:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_1004357_1004666:LMF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 2012398 C/T 1 42 42 84 19.7308211642328 22.2691788357672 -2.53835767153433 T:C C T 10 0.530218543708742 0.586632159191578 ENSG00000140988:ENST00000526586:exon_2012062_2012657:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000534461:exon_2012375_2012910:RPS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 2014283 A/G 1 304 51 355 142.813562712542 27.0411457291458 115.772416983397 A:G A G 10 0.530218543708742 8.3754461844447e-39 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533186:exon_2014277_2014357:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000532746:exon_2014277_2014368:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533872:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2013654_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000534461:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 2014591 C/T 1 1114 512 1626 523.336542308461 271.471894378876 251.864647929585 T:C C T 10 0.530218543708742 7.97083530324462e-37 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 26 50 76 12.2143178635727 26.5109271854371 -14.2966093218644 A:C A C 10 0.530218543708742 0.00117265271527456 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 2025604 G/C 1 54 62 116 25.3681986397279 32.873549709942 -7.50535107021407 C:G G C 10 0.530218543708742 0.164351649128548 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 2025678 C/A 1 35 26 61 16.442350970194 13.7856821364273 2.65666883376674 A:C C A 10 0.530218543708742 0.523485596436726 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 61 75 136 28.6566688337667 39.7663907781557 -11.1097219443889 A:C A C 10 0.530218543708742 0.058950208174021 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 2036048 T/C 1 53 54 107 24.8984171834367 28.6318013602721 -3.73338417683539 T:C T C 10 0.530218543708742 0.498446096343974 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 2048796 C/T 1 58 51 109 27.247324464893 27.0411457291458 0.206178735747123 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 2048826 C/G 1 32 33 65 15.0330066013203 17.4972119423885 -2.46420534106823 C:G C G 10 0.530218543708742 0.619497823245845 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 68 54 122 31.9451390278055 28.6318013602721 3.31333766753348 A:G A G 10 0.530218543708742 0.586757550645978 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 2049728 C/T 1 85 45 130 39.9314237847569 23.8598344668934 16.0715893178635 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00483010263111148 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 2049849 T/C 1 77 88 165 36.1731721344269 46.6592318463693 -10.4860597119424 T:C T C 10 0.530218543708742 0.118525160408858 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 2050192 G/T 1 49 41 90 23.0192913582716 21.7389602920584 1.28033106621322 T:G G T 10 0.530218543708742 0.83310067450754 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3170188 C/T 1 23 20 43 10.8049734946989 10.6043708741748 0.200602620524094 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3339435 G/C 1 16 23 39 7.51650330066013 12.1950265053011 -4.67852320464094 C:G G C 10 0.530218543708742 0.149894979971503 ENSG00000006194:ENST00000219069:exon_3339393_3341460:ZNF263 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3367229 T/C 1 10 17 27 4.69781456291258 9.01371524304861 -4.31590068013603 T:C T C 10 0.530218543708742 0.122247567538511 ENSG00000162086:ENST00000293995:exon_3367190_3368574:ZNF75A;ENSG00000162086:ENST00000498240:exon_3367190_3368574:ZNF75A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3454526 G/A 1 5 14 19 2.34890728145629 7.42305961192239 -5.0741523304661 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0218531141296597 ENSG00000103343:ENST00000344823:exon_3454426_3454648:ZNF174;ENSG00000103343:ENST00000268655:exon_3454426_3454648:ZNF174 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 32 47 79 15.0330066013203 24.9202715543109 -9.88726495299062 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0316371402918859 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3613207 G/T 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 T:G G T 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000167984:ENST00000448023:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000301749:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000359128:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000419350:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000324659:exon_3611703_3614613:NLRC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3613904 C/G 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 C:G C G 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000167984:ENST00000448023:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000301749:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000359128:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000419350:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000324659:exon_3611703_3614613:NLRC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3639139 A/G 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 A:G A G 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3639977 G/A 1 11 7 18 5.16759601920384 3.71152980596119 1.45606621324264 A:G G A 10 0.530218543708742 0.638243716970554 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3640274 G/A 1 10 8 18 4.69781456291258 4.24174834966994 0.456066213242644 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3640784 G/A 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 A:G G A 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3640785 C/T 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 T:C C T 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3647692 A/C 1 8 4 12 3.75825165033006 2.12087417483497 1.6373774754951 A:C A C 10 0.530218543708742 0.398218675970565 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3647380_3647696:SLX4;ENSG00000188827:ENST00000466154:exon_3647380_3647696:SLX4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3650987 T/C 1 7 3 10 3.28847019403881 1.59065563112623 1.69781456291258 T:C T C 10 0.530218543708742 0.352695224731846 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3650980_3651192:SLX4;ENSG00000188827:ENST00000466154:exon_3650980_3652308:SLX4;ENSG00000188827:ENST00000486524:exon_3650622_3652308:SLX4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3650991 T/C 1 8 2 10 3.75825165033006 1.06043708741748 2.69781456291258 T:C T C 10 0.530218543708742 0.115795579122128 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3650980_3651192:SLX4;ENSG00000188827:ENST00000466154:exon_3650980_3652308:SLX4;ENSG00000188827:ENST00000486524:exon_3650622_3652308:SLX4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3707747 G/A 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 A:G G A 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000213918:ENST00000407479:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000414110:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000246949:exon_3707721_3707817:DNASE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3708170 C/T 1 39 39 78 18.3214767953591 20.6785232046409 -2.35704640928188 T:C C T 10 0.530218543708742 0.650403582211796 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3708038_3708231:TRAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3724352 G/A 1 159 146 305 74.69525155031 77.4119073814763 -2.71665583116631 A:G G A 10 0.530218543708742 0.774394898477223 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 69 66 135 32.4149204840968 34.994423884777 -2.57950340068017 C:G G C 10 0.530218543708742 0.667250386718844 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3726074 G/C 1 62 10 72 29.126450290058 5.30218543708742 23.8242648529706 C:G G C 10 0.530218543708742 3.80767967383458e-09 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3726037_3726146:TRAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 3726075 G/A 1 62 10 72 29.126450290058 5.30218543708742 23.8242648529706 A:G G A 10 0.530218543708742 3.80767967383458e-09 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3726037_3726146:TRAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 4390358 G/T 1 9 14 23 4.22803310662132 7.42305961192239 -3.19502650530107 T:G G T 10 0.530218543708742 0.21251004606754 ENSG00000217930:ENST00000318059:exon_4390252_4390406:PAM16 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 11 12 23 5.16759601920384 6.3626225245049 -1.19502650530107 T:C C T 10 0.530218543708742 0.679029978421074 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 24 22 46 11.2747549509902 11.6648079615923 -0.390053010602131 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 22 16 38 10.3351920384077 8.48349669933987 1.8516953390678 A:T A T 10 0.530218543708742 0.627019735057937 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 21 16 37 9.86541058211642 8.48349669933987 1.38191388277655 A:T T A 10 0.530218543708742 0.742655841774882 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 4511868 G/C 1 54 36 90 25.3681986397279 19.0878675735147 6.28033106621322 C:G G C 10 0.530218543708742 0.205369569244048 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4511695_4511960:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4511696_4511960:NMRAL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 5075542 G/A 1 6 8 14 2.81868873774755 4.24174834966994 -1.42305961192239 A:G G A 10 0.530218543708742 0.594188084236152 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 5075633 G/A 1 7 3 10 3.28847019403881 1.59065563112623 1.69781456291258 A:G G A 10 0.530218543708742 0.352695224731846 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 5128817 G/A 1 2 11 13 0.939562912582516 5.83240398079616 -4.89284106821365 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00952090942007516 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5128758_5128879:ALG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 5140561 C/T 1 11 12 23 5.16759601920384 6.3626225245049 -1.19502650530107 T:C C T 10 0.530218543708742 0.679029978421074 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5140433_5140566:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5140433_5140566:FAM86A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 8722629 G/C 1 29 24 53 13.6236622324465 12.7252450490098 0.898417183436676 C:G G C 10 0.530218543708742 0.890787573017204 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 8999138 T/C 1 38 51 89 17.8516953390678 27.0411457291458 -9.18945039007804 A:T:C T C 10 0.530218543708742 0.0558829104129402 ENSG00000187555:ENST00000344836:exon_8999044_8999188:USP7;ENSG00000187555:ENST00000381886:exon_8999044_8999188:USP7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 10525230 T/C 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 T:C T C 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10524468_10525312:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10524468_10525312:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10524452_10525312:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10524452_10525312:ATF7IP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 10575824 C/A 1 12 23 35 5.6373774754951 12.1950265053011 -6.55764902980597 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0281747725584307 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10575693_10577494:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10575693_10577494:ATF7IP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 10989219 C/G 1 13 5 18 6.10715893178635 2.65109271854371 3.45606621324264 C:G C G 10 0.530218543708742 0.15477553907908 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_10989139_10989285:CIITA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 11017058 G/A 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 A:G G A 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 11647492 T/C 1 56 90 146 26.3077615523104 47.7196689337868 -21.4119073814763 T:C T C 10 0.530218543708742 0.000459104160025438 ENSG00000189067:ENST00000339430:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000413364:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000381810:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000405528:exon_11647389_11647545:LITAF HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 11852354 A/C 1 14 24 38 6.57694038807761 12.7252450490098 -6.14830466093219 A:C A C 10 0.530218543708742 0.0513011836401719 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11852287_11852395:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11852287_11852395:ZC3H7A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 11933678 G/C 1 421 449 870 197.77799309862 238.068126125225 -40.2901330266055 C:G G C 10 0.530218543708742 0.00655807201386332 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11933552_11933842:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11933552_11933842:RSL1D1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 12009781 G/A 1 59 72 131 27.7171059211842 38.1757351470294 -10.4586292258452 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0796199773173235 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 12061626 G/A 1 92 114 206 43.2198939787957 60.4449139827966 -17.2250200040008 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0175195056896081 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 12061674 G/A 1 78 77 155 36.6429535907181 40.8268278655731 -4.18387427485501 A:G G A 10 0.530218543708742 0.520319134032799 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 12662420 C/T 1 11 6 17 5.16759601920384 3.18131126225245 1.98628475695139 T:C C T 10 0.530218543708742 0.46729790202122 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12662363_12668145:SNX29 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 14029204 C/T 1 9 3 12 4.22803310662132 1.59065563112623 2.6373774754951 T:C C T 10 0.530218543708742 0.154808266842262 ENSG00000175595:ENST00000311895:exon_14029003_14029600:ERCC4;ENSG00000175595:ENST00000389138:exon_14029003_14029601:ERCC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 15082865 C/T 0 9 0 9 4.22803310662132 0 4.22803310662132 C C 10 0.530218543708742 0.00442648537498891 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 6 14 20 2.81868873774755 7.42305961192239 -4.60437087417484 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0445921710114037 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 15098047 C/G 1 5 17 22 2.34890728145629 9.01371524304861 -6.66480796159232 C:G C G 10 0.530218543708742 0.00489256326978541 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15098044_15098190:PDXDC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 15818141 A/C 1 21 46 67 9.86541058211642 24.3900530106021 -14.5246424284857 A:C A C 10 0.530218543708742 0.000509600355297814 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 18823379 T/C 1 11 22 33 5.16759601920384 11.6648079615923 -6.49721194238849 T:C T C 10 0.530218543708742 0.034731606057632 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18823270_18823449:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18823270_18823449:SMG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 18847416 G/A 1 13 8 21 6.10715893178635 4.24174834966994 1.86541058211642 A:G G A 10 0.530218543708742 0.513989696790461 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18847255_18847534:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18847255_18847534:SMG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 18861335 A/G 1 9 1 10 4.22803310662132 0.530218543708742 3.69781456291258 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0237480022218031 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18861271_18861448:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18861271_18861448:SMG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 18908268 C/T 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 T:C C T 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18908115_18908278:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18908115_18908278:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000532700:exon_18908115_18908278:SMG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 11 5 16 5.16759601920384 2.65109271854371 2.51650330066013 T:C C T 10 0.530218543708742 0.223429926014640 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 19547357 A/G 1 8 3 11 3.75825165033006 1.59065563112623 2.16759601920384 A:G A G 10 0.530218543708742 0.235945069885030 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 19547503 C/T 1 5 9 14 2.34890728145629 4.77196689337868 -2.42305961192239 T:C C T 10 0.530218543708742 0.284180524640790 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 19547747 C/G 1 10 9 19 4.69781456291258 4.77196689337868 -0.0741523304660978 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 19548740 A/G 1 16 13 29 7.51650330066013 6.89284106821365 0.623662232446482 A:G A G 10 0.530218543708742 0.854455190101058 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 20811681 C/T 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 T:C C T 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000196678:ENST00000300005:exon_20811624_20811724:ERI2;ENSG00000196678:ENST00000396074:exon_20811624_20811724:ERI2;ENSG00000196678:ENST00000357967:exon_20811624_20811724:ERI2;ENSG00000196678:ENST00000389345:exon_20811624_20811724:ERI2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 23489711 C/G 1 30 38 68 14.0934436887377 20.1483046609322 -6.05486097219446 C:G C G 10 0.530218543708742 0.146576644614350 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23489689_23489822:GGA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 23535680 A/C 1 15 22 37 7.04672184436887 11.6648079615923 -4.61808611722345 A:C A C 10 0.530218543708742 0.140191429203817 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23533335_23535775:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23534832_23535775:EARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 23536684 T/C 1 11 12 23 5.16759601920384 6.3626225245049 -1.19502650530107 T:C T C 10 0.530218543708742 0.679029978421074 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23536448_23536700:EARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 23546561 G/C 1 10 9 19 4.69781456291258 4.77196689337868 -0.0741523304660978 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23546209_23546681:EARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 23563501 C/T 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23563470_23563625:EARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 23607504 G/C 1 43 56 99 20.2006026205241 29.6922384476896 -9.49163582716546 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0693821202280338 ENSG00000004779:ENST00000007516:exon_23607444_23607677:NDUFAB1;ENSG00000004779:ENST00000484769:exon_23607444_23607624:NDUFAB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 23677006 A/G 1 29 56 85 13.6236622324465 29.6922384476896 -16.0685762152431 A:G A G 10 0.530218543708742 0.000662526872279885 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23676947_23677049:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23676996_23677049:DCTN5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 23701538 A/G 1 216 170 386 101.472794558912 90.1371524304861 11.3356421284256 A:G A G 10 0.530218543708742 0.261992451772121 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 23847575 C/A 1 128 87 215 60.132026405281 46.1290133026606 14.0030131026205 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0560337207866538 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_23847322_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_23847345_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000498058:exon_23847403_23847669:PRKCB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 24834233 C/T 1 9 7 16 4.22803310662132 3.71152980596119 0.516503300660129 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834195_24834334:TNRC6A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 24931557 G/A 1 142 114 256 66.7089667933586 60.4449139827966 6.26405281056206 A:G G A 10 0.530218543708742 0.452730675963216 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24930710_24931581:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24930710_24931581:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24931320_24931581:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24931320_24931581:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24931480_24931568:ARHGAP17 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 28123226 G/A 1 20 23 43 9.39562912582516 12.1950265053011 -2.79939737947591 A:G G A 10 0.530218543708742 0.445966586496333 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28123138_28123327:XPO6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 28877805 C/T 1 30 17 47 14.0934436887377 9.01371524304861 5.07972844568913 T:C C T 10 0.530218543708742 0.146284874540836 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28877333_28878354:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28877333_28878354:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28877333_28878354:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28875314_28878354:SH2B1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 28878329 G/A 1 32 21 53 15.0330066013203 11.1345894178836 3.89841718343667 A:G G A 10 0.530218543708742 0.335740894351592 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28877333_28878354:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28877333_28878354:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28877333_28878354:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28875314_28878354:SH2B1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 31075175 G/A 1 11 10 21 5.16759601920384 5.30218543708742 -0.134589417883582 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31075134_31075802:ZNF668 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 31088347 G/A 1 8 6 14 3.75825165033006 3.18131126225245 0.576940388077612 A:G G A 10 0.530218543708742 0.795824909862849 ENSG00000167395:ENST00000428260:exon_31087567_31088365:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 31088625 A/G 1 8 9 17 3.75825165033006 4.77196689337868 -1.01371524304861 A:G A G 10 0.530218543708742 0.636531694867648 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 31090407 G/C 1 4 7 11 1.87912582516503 3.71152980596119 -1.83240398079616 C:G G C 10 0.530218543708742 0.367650802678922 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 31091209 T/C 1 14 22 36 6.57694038807761 11.6648079615923 -5.08786757351471 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0967141233002735 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 31092075 G/A 1 15 10 25 7.04672184436887 5.30218543708742 1.74453640728145 A:G G A 10 0.530218543708742 0.551192924360965 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 31095171 C/T 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000151006:ENST00000486499:exon_31094758_31096581:PRSS53 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 31121793 G/A 1 68 51 119 31.9451390278055 27.0411457291458 4.9039932986597 A:G G A 10 0.530218543708742 0.408713242930109 ENSG00000103507:ENST00000394951:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000219794:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394950:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000287507:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394952:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000441132:exon_31121722_31121801:BCKDK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 31193942 C/A 1 304 310 614 142.813562712542 164.36774854971 -21.5541858371676 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0822340419724756 ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 31202263 A/T 1 4 10 14 1.87912582516503 5.30218543708742 -3.42305961192239 A:T A T 10 0.530218543708742 0.105064392873074 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 31388355 A/G 1 11 4 15 5.16759601920384 2.12087417483497 3.04672184436887 A:G A G 10 0.530218543708742 0.128499041794511 ENSG00000140678:ENST00000268296:exon_31388321_31388400:ITGAX;ENSG00000140678:ENST00000394880:exon_31388321_31388400:ITGAX HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 46642286 G/A 1 12 14 26 5.6373774754951 7.42305961192239 -1.78568213642729 A:G G A 10 0.530218543708742 0.557496480025126 ENSG00000171241:ENST00000303383:exon_46642209_46642301:SHCBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 46956292 G/C 1 11 5 16 5.16759601920384 2.65109271854371 2.51650330066013 C:G G C 10 0.530218543708742 0.223429926014640 ENSG00000166123:ENST00000340124:exon_46956154_46956328:GPT2;ENSG00000166123:ENST00000440783:exon_46956154_46956328:GPT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 53341748 T/G 1 9 10 19 4.22803310662132 5.30218543708742 -1.0741523304661 T:G T G 10 0.530218543708742 0.652256323352804 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53341593_53341817:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53341593_53341817:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53341593_53341865:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53341593_53341865:CHD9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 56518779 A/G 1 27 26 53 12.684099319864 13.7856821364273 -1.10158281656333 A:G A G 10 0.530218543708742 0.78452676553072 ENSG00000125124:ENST00000245157:exon_56518366_56518779:BBS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 56855496 C/G 1 21 13 34 9.86541058211642 6.89284106821365 2.97256951390277 C:G C G 10 0.530218543708742 0.390710959106296 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56855416_56855505:NUP93 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 56864618 C/T 1 9 4 13 4.22803310662132 2.12087417483497 2.10715893178635 T:C C T 10 0.530218543708742 0.278259851701685 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 56969148 G/A 1 390 268 658 183.214767953591 142.098569713943 41.1161982396478 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.00134879149434303 ENSG00000051108:ENST00000439977:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000379792:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000300302:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000344114:exon_56969147_56969224:HERPUD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57015091 G/C 1 30 39 69 14.0934436887377 20.6785232046409 -6.5850795159032 C:G G C 10 0.530218543708742 0.118047423785627 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57015070_57015137:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57015070_57015137:CETP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57015545 C/T 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 T:C C T 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57017319 G/A 1 55 80 135 25.8379800960192 42.4174834966994 -16.5795034006802 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00439181714733474 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57017238_57017323:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57017238_57017323:CETP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57060340 T/C 1 29 35 64 13.6236622324465 18.557649029806 -4.93398679735949 T:C T C 10 0.530218543708742 0.25958431006496 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57060353 T/C 1 36 38 74 16.9121324264853 20.1483046609322 -3.23617223444691 T:C T C 10 0.530218543708742 0.485621767460341 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57068106 A/G 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:G A G 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57068080_57068163:NLRC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57068107 C/T 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 T:C C T 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57068080_57068163:NLRC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57071113 T/C 0 9 0 9 4.22803310662132 0 4.22803310662132 T T 10 0.530218543708742 0.00442648537498891 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57071107_57071196:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57071107_57071196:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57071107_57071196:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57071107_57071196:NLRC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57080528 C/A 1 13 7 20 6.10715893178635 3.71152980596119 2.39562912582516 A:C C A 10 0.530218543708742 0.371488020282974 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57080464_57080553:NLRC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57085465 C/T 1 5 11 16 2.34890728145629 5.83240398079616 -3.48349669933987 T:C C T 10 0.530218543708742 0.130369289858938 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57085450_57085533:NLRC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57108465 G/C 1 10 11 21 4.69781456291258 5.83240398079616 -1.13458941788358 C:G G C 10 0.530218543708742 0.666334924600774 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57180158 C/A 1 2 8 10 0.939562912582516 4.24174834966994 -3.30218543708742 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0537596124644068 ENSG00000140848:ENST00000290776:exon_57179997_57180233:CPNE2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57290788 C/T 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 T:C C T 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000102934:ENST00000219207:exon_57290009_57290941:PLLP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57786711 C/T 1 15 10 25 7.04672184436887 5.30218543708742 1.74453640728145 T:C C T 10 0.530218543708742 0.551192924360965 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786690_57786840:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786690_57786840:KATNB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57787027 C/T 1 33 26 59 15.5027880576115 13.7856821364273 1.71710592118422 T:C C T 10 0.530218543708742 0.696883551484802 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786989_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786989_57787179:KATNB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 57787906 C/T 1 25 28 53 11.7445364072814 14.8461192238448 -3.10158281656333 T:C C T 10 0.530218543708742 0.411702638901328 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57787857_57787907:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57787857_57787907:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57787857_57787907:KATNB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 58030401 T/C 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 T:C T C 10 0.530218543708742 0.797017339461022 ENSG00000166188:ENST00000299237:exon_58028573_58032426:ZNF319 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 58030634 C/T 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000166188:ENST00000299237:exon_58028573_58032426:ZNF319 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 58575489 G/A 1 75 78 153 35.2336092218443 41.3570464092819 -6.12343718743753 A:G G A 10 0.530218543708742 0.331904529380991 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58575405_58575524:CNOT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 58579274 C/T 1 93 77 170 43.689675435087 40.8268278655731 2.86284756951386 T:C C T 10 0.530218543708742 0.701051846975507 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58579265_58579395:CNOT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 58587737 C/T 1 47 47 94 22.0797284456891 24.9202715543109 -2.84054310862174 T:C C T 10 0.530218543708742 0.605764301095931 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58587686_58587764:CNOT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 66764069 G/C 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 C:G G C 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000135720:ENST00000258198:exon_66764015_66764126:DYNC1LI2;ENSG00000135720:ENST00000443351:exon_66764015_66764126:DYNC1LI2;ENSG00000135720:ENST00000440564:exon_66764015_66764126:DYNC1LI2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 67911517 T/C 1 31 18 49 14.563225145029 9.54393378675736 5.01929135827164 T:C T C 10 0.530218543708742 0.155699176755540 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 44 32 76 20.6703840768154 16.9669933986797 3.70339067813561 A:G G A 10 0.530218543708742 0.422585528605311 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 69782855 C/T 1 106 132 238 49.7968343668733 69.9888477695539 -20.1920134026806 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00931640582177869 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782821_69783021:NOB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 70726810 C/T 1 22 18 40 10.3351920384077 9.54393378675736 0.791258251650321 T:C C T 10 0.530218543708742 0.874748993044135 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70726724_70726874:VAC14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 71318577 T/C 1 23 15 38 10.8049734946989 7.95327815563113 2.8516953390678 T:C T C 10 0.530218543708742 0.417545477422256 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 71319539 C/T 1 19 7 26 8.9258476695339 3.71152980596119 5.21431786357271 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0486706148796422 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 71319646 G/A 1 13 22 35 6.10715893178635 11.6648079615923 -5.55764902980597 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0639738152903924 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 72042682 A/C 1 11 12 23 5.16759601920384 6.3626225245049 -1.19502650530107 A:C A C 10 0.530218543708742 0.679029978421074 ENSG00000102967:ENST00000219240:exon_72042643_72042684:DHODH;ENSG00000102967:ENST00000378782:exon_72042643_72042684:DHODH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 72130203 C/G 1 30 23 53 14.0934436887377 12.1950265053011 1.89841718343667 C:G C G 10 0.530218543708742 0.680319572184063 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 72130815 C/A 1 19 16 35 8.9258476695339 8.48349669933987 0.442350970194029 A:C C A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 72135014 T/C 1 20 19 39 9.39562912582516 10.0741523304661 -0.678523204640939 T:C T C 10 0.530218543708742 0.873357648525083 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 72137561 G/A 1 33 24 57 15.5027880576115 12.7252450490098 2.77754300860171 A:G G A 10 0.530218543708742 0.508293528660295 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 72139184 C/A 1 37 56 93 17.3819138827765 29.6922384476896 -12.310324564913 A:C:G C A 10 0.530218543708742 0.0123322991798132 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72139131_72139247:DHX38 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 72828403 A/G 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 A:T:G A G 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72827154_72832613:ZFHX3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 75269534 C/T 1 24 37 61 11.2747549509902 19.6180861172235 -8.34333116623326 A:T:C C T 10 0.530218543708742 0.0394344227791425 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 75573884 T/C 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000205084:ENST00000258173:exon_75572017_75574072:TMEM231;ENSG00000205084:ENST00000398114:exon_75572017_75574072:TMEM231 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 75646576 G/T 1 17 7 24 7.98628475695139 3.71152980596119 4.27475495099019 T:G G T 10 0.530218543708742 0.10134572559357 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 75646685 G/T 1 10 6 16 4.69781456291258 3.18131126225245 1.51650330066013 T:G G T 10 0.530218543708742 0.617951383515179 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 77228866 T/C 1 22 14 36 10.3351920384077 7.42305961192239 2.91213242648529 T:C T C 10 0.530218543708742 0.404475621314381 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 81010073 C/T 1 133 148 281 62.4809336867373 78.4723444688938 -15.9914107821565 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0637330627213241 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 81056441 T/G 1 10 15 25 4.69781456291258 7.95327815563113 -3.25546359271855 T:G T G 10 0.530218543708742 0.230578617079935 ENSG00000166451:ENST00000299572:exon_81056360_81056490:CENPN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 81061827 G/A 1 14 12 26 6.57694038807761 6.3626225245049 0.214317863572709 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000439957:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000393335:exon_81061776_81061902:CENPN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 81076821 T/C 1 33 38 71 15.5027880576115 20.1483046609322 -4.64551660332068 T:C T C 10 0.530218543708742 0.286039720016814 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 81077915 T/C 1 70 80 150 32.8847019403881 42.4174834966994 -9.5327815563113 T:C T C 10 0.530218543708742 0.120902204327489 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 119 127 246 55.9039932986597 67.3377550510102 -11.4337617523505 T:C T C 10 0.530218543708742 0.159820931625074 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 82182286 C/G 1 46 51 97 21.6099469893979 27.0411457291458 -5.43119873974797 C:G C G 10 0.530218543708742 0.309063368928608 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 82182354 G/A 1 28 32 60 13.1538807761552 16.9669933986797 -3.81311262252452 A:G G A 10 0.530218543708742 0.365836243225964 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 82203742 T/C 1 7 1 8 3.28847019403881 0.530218543708742 2.75825165033006 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0743148409803516 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 84088047 C/T 1 29 31 60 13.6236622324465 16.436774854971 -2.81311262252452 T:C C T 10 0.530218543708742 0.518540790819036 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 84115393 G/A 1 15 10 25 7.04672184436887 5.30218543708742 1.74453640728145 A:G G A 10 0.530218543708742 0.551192924360965 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84115352_84115513:MBTPS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 84115483 G/A 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 A:G G A 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84115352_84115513:MBTPS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 84158248 G/C 1 8 11 19 3.75825165033006 5.83240398079616 -2.0741523304661 C:G G C 10 0.530218543708742 0.366451934145480 ENSG00000103160:ENST00000219439:exon_84155746_84158333:HSDL1;ENSG00000103160:ENST00000434463:exon_84155888_84158333:HSDL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 44 33 77 20.6703840768154 17.4972119423885 3.17317213442687 A:C C A 10 0.530218543708742 0.494974229307286 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 84213114 C/T 1 56 30 86 26.3077615523104 15.9065563112623 10.4012052410482 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0301488740670212 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 36 34 70 16.9121324264853 18.0274304860972 -1.11529805961194 A:T A T 10 0.530218543708742 0.811602787908563 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 84215390 T/C 1 22 17 39 10.3351920384077 9.01371524304861 1.32147679535906 T:C T C 10 0.530218543708742 0.749339393350759 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84215352_84215664:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84215352_84215469:TAF1C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 84516309 G/A 1 2 7 9 0.939562912582516 3.71152980596119 -2.77196689337868 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0932648737406713 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84516198_84516316:KIAA1609 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 156 141 297 73.2859071814362 74.7608146629326 -1.47490748149637 A:G A G 10 0.530218543708742 0.861817156747452 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 107 131 238 50.2666158231646 69.4586292258452 -19.1920134026806 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0135215767530482 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 52 51 103 24.4286357271454 27.0411457291458 -2.61251000200043 T:G T G 10 0.530218543708742 0.622697596610087 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 49 69 118 23.0192913582716 36.5850795159032 -13.5657881576316 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0127707160206032 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 85015541 G/A 1 8 16 24 3.75825165033006 8.48349669933987 -4.72524504900981 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0651871577391257 ENSG00000153786:ENST00000313732:exon_85015476_85015600:ZDHHC7;ENSG00000153786:ENST00000344861:exon_85015476_85015600:ZDHHC7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 85954801 G/A 1 338 314 652 158.786132226445 166.488622724545 -7.70249049809979 A:G G A 10 0.530218543708742 0.556303910295168 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85954712_85956197:IRF8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 87446053 G/A 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000140948:ENST00000268616:exon_87445122_87446582:ZCCHC14;ENSG00000140948:ENST00000412336:exon_87445027_87446582:ZCCHC14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 88713236 A/G 1 470 414 884 220.797284456891 219.510477095419 1.28680736147206 A:G A G 10 0.530218543708742 0.946283034876712 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88713163_88713246:CYBA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 88713473 G/A 1 6 9 15 2.81868873774755 4.77196689337868 -1.95327815563113 A:G G A 10 0.530218543708742 0.438985732589774 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 88713501 A/G 1 7 16 23 3.28847019403881 8.48349669933987 -5.19502650530107 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0360477029013052 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 20 14 34 9.39562912582516 7.42305961192239 1.97256951390277 A:G A G 10 0.530218543708742 0.606984246302857 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 27 32 59 12.684099319864 16.9669933986797 -4.28289407881578 A:C:G A G 10 0.530218543708742 0.297336160824213 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 88781125 T/C 1 40 32 72 18.7912582516503 16.9669933986797 1.82426485297058 T:C T C 10 0.530218543708742 0.723766416969586 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 62 64 126 29.126450290058 33.9339867973595 -4.80753650730149 A:G A G 10 0.530218543708742 0.422146016691116 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 88872511 T/C 1 78 75 153 36.6429535907181 39.7663907781557 -3.12343718743753 T:C T C 10 0.530218543708742 0.627684961554642 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872429_88872529:CDT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 88874632 C/G 1 98 93 191 46.0385827165433 49.310324564913 -3.27174184836972 C:G C G 10 0.530218543708742 0.663848819502768 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 89294381 T/C 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 T:C T C 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 89294439 G/T 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 T:G G T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 89294697 C/T 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 89346774 G/T 1 19 17 36 8.9258476695339 9.01371524304861 -0.0878675735147123 T:G G T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 89348038 G/C 1 50 36 86 23.4890728145629 19.0878675735147 4.40120524104819 C:G G C 10 0.530218543708742 0.387734893728314 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 89350038 G/A 1 54 59 113 25.3681986397279 31.2828940788158 -5.91469543908785 A:G G A 10 0.530218543708742 0.299889522487559 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 89350178 G/A 1 51 61 112 23.9588542708542 32.3433311662333 -8.38447689537911 A:G G A 10 0.530218543708742 0.129573123989648 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 89644001 T/C 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 T:C T C 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89643947_89644129:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89643947_89644129:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000525982:exon_89643947_89644129:CPNE7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 89836223 C/T 1 5 8 13 2.34890728145629 4.24174834966994 -1.89284106821365 T:C C T 10 0.530218543708742 0.406203894191414 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 16 89971316 G/T 1 8 13 21 3.75825165033006 6.89284106821365 -3.13458941788358 T:G G T 10 0.530218543708742 0.193644496250896 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 617869 G/A 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 A:G G A 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_617863_618096:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_617863_618096:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_617863_618096:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_617863_618096:VPS53 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 96 95 191 45.0990198039608 50.3707616523305 -5.27174184836971 A:C:G G A 10 0.530218543708742 0.468796604899338 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 648498 C/T 1 99 80 179 46.5083641728345 42.4174834966994 4.09088067613518 T:C C T 10 0.530218543708742 0.550109546460247 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 109 108 217 51.2061787357471 57.2636027205441 -6.05742398479701 T:C C T 10 0.530218543708742 0.415254496583408 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 97 69 166 45.568801260252 36.5850795159032 8.98372174434883 C:G G C 10 0.530218543708742 0.186046843372249 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 649935 G/C 1 52 43 95 24.4286357271454 22.7993973794759 1.62923834766951 C:G G C 10 0.530218543708742 0.758783701861045 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 38 29 67 17.8516953390678 15.3763377675535 2.47535757151429 T:G G T 10 0.530218543708742 0.6247954890252 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 1940232 A/G 1 16 18 34 7.51650330066013 9.54393378675736 -2.02743048609723 A:G A G 10 0.530218543708742 0.497520057256665 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1940129_1940250:DPH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 1960974 C/T 1 67 33 100 31.4753575715143 17.4972119423885 13.9781456291258 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00497169463858907 ENSG00000177374:ENST00000399849:exon_1959965_1962980:HIC1;ENSG00000177374:ENST00000322941:exon_1959965_1962980:HIC1;ENSG00000177374:ENST00000416386:exon_1959965_1962980:HIC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 2091765 C/T 1 4 11 15 1.87912582516503 5.83240398079616 -3.95327815563113 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0665948341907382 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2091693_2091809:SMG6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 2186100 C/T 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 T:C C T 10 0.530218543708742 0.296231759838006 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2185941_2186153:SMG6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 2203025 T/G 1 13 9 22 6.10715893178635 4.77196689337868 1.33519203840768 T:G T G 10 0.530218543708742 0.671305989890035 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 2203175 C/G 1 20 9 29 9.39562912582516 4.77196689337868 4.62366223244648 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0956512825929837 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 2203453 A/G 1 18 14 32 8.45606621324264 7.42305961192239 1.03300660132026 A:G A G 10 0.530218543708742 0.727799998593614 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 45 54 99 21.1401655331066 28.6318013602721 -7.49163582716546 A:G G A 10 0.530218543708742 0.15829816281812 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 2600186 G/A 1 61 66 127 28.6566688337667 34.994423884777 -6.33775505101023 A:G G A 10 0.530218543708742 0.286182374613647 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2600013_2600236:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2600013_2600236:KIAA0664 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 2606715 G/A 1 9 11 20 4.22803310662132 5.83240398079616 -1.60437087417484 A:G G A 10 0.530218543708742 0.508309614769096 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2606612_2606783:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2606612_2606783:KIAA0664 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 3563963 C/G 1 15 10 25 7.04672184436887 5.30218543708742 1.74453640728145 C:G C G 10 0.530218543708742 0.551192924360965 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 3719447 G/A 1 12 5 17 5.6373774754951 2.65109271854371 2.98628475695139 A:G G A 10 0.530218543708742 0.223474867867513 ENSG00000074356:ENST00000389005:exon_3719410_3719564:C17orf85;ENSG00000074356:ENST00000158149:exon_3719410_3719564:C17orf85;ENSG00000074356:ENST00000433699:exon_3719410_3719564:C17orf85 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 3916908 C/T 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 T:C C T 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3916743_3916908:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000414864:exon_3916743_3916908:ZZEF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 4700993 C/G 1 119 151 270 55.9039932986597 80.06300010002 -24.1590068013603 C:G C G 10 0.530218543708742 0.00338960965263982 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 110 143 253 51.6759601920384 75.8212517503501 -24.1452915583117 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00246765015557158 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 4722785 G/A 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4722724_4722877:PLD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 4797305 G/A 1 34 35 69 15.9725695139028 18.557649029806 -2.5850795159032 A:G G A 10 0.530218543708742 0.548540249353601 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4797283_4797388:MINK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 4875628 A/G 1 18 20 38 8.45606621324264 10.6043708741748 -2.1483046609322 A:G A G 10 0.530218543708742 0.518508107539554 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 4883818 C/G 1 1 8 9 0.469781456291258 4.24174834966994 -3.77196689337868 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0157469533588810 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4882979_4883916:CAMTA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 4926882 A/G 1 63 90 153 29.5962317463493 47.7196689337868 -18.1234371874375 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00349287510359898 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 5085893 C/T 1 3 7 10 1.40934436887377 3.71152980596119 -2.30218543708742 T:C C T 10 0.530218543708742 0.206122472271196 ENSG00000180626:ENST00000399604:exon_5082830_5087571:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000381752:exon_5083373_5086253:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000315777:exon_5085505_5086312:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000389222:exon_5085505_5086312:ZNF594 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 77 45 122 36.1731721344269 23.8598344668934 12.3133376675335 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0291489797353919 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 5126689 G/A 1 80 47 127 37.5825165033006 24.9202715543109 12.6622449489898 A:G G A 10 0.530218543708742 0.02610083148922 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 6353679 A/C 1 33 1 34 15.5027880576115 0.530218543708742 14.9725695139028 A:C:G A C 10 0.530218543708742 1.85922717109137e-08 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 6663895 C/G 1 8 11 19 3.75825165033006 5.83240398079616 -2.0741523304661 C:G C G 10 0.530218543708742 0.366451934145480 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 6902179 G/A 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 A:G G A 10 0.530218543708742 0.51496433390393 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 6919093 T/C 1 137 110 247 64.3600595119023 58.3240398079616 6.03601970394073 T:C T C 10 0.530218543708742 0.445250300500726 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6919093_6919194:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6919093_6919194:C17orf49 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 6920257 C/T 1 167 127 294 78.4535032006401 67.3377550510102 11.1157481496299 T:C C T 10 0.530218543708742 0.199047386393751 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6920229_6920333:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000455303:exon_6920229_6920333:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6920229_6920333:C17orf49 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 6941625 C/T 1 7 7 14 3.28847019403881 3.71152980596119 -0.423059611922388 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 6942108 C/T 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 T:C C T 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 6943266 G/A 1 7 10 17 3.28847019403881 5.30218543708742 -2.01371524304861 A:G G A 10 0.530218543708742 0.343429778687472 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6943082_6943438:SLC16A13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 6945087 G/T 1 8 24 32 3.75825165033006 12.7252450490098 -8.96699339867974 T:G G T 10 0.530218543708742 0.00207346788785625 ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6944949_6945227:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6944949_6945227:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6944949_6945227:SLC16A11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 6945483 C/T 1 12 18 30 5.6373774754951 9.54393378675736 -3.90655631126226 T:C C T 10 0.530218543708742 0.199822740571968 ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6945315_6946082:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6945315_6945492:SLC16A11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 6945940 A/G 1 16 16 32 7.51650330066013 8.48349669933987 -0.966993398679744 A:G A G 10 0.530218543708742 0.859791229190276 ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6945315_6946082:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6945508_6946082:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6945517_6946082:SLC16A11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 6946287 T/C 1 14 30 44 6.57694038807761 15.9065563112623 -9.32961592318465 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00600624737134713 ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6946249_6946392:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6946249_6946392:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6946249_6946392:SLC16A11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 6946330 C/T 1 8 15 23 3.75825165033006 7.95327815563113 -4.19502650530107 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0951873011194316 ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6946249_6946392:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6946249_6946392:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6946249_6946392:SLC16A11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 39 24 63 18.3214767953591 12.7252450490098 5.59623174634925 T:C C T 10 0.530218543708742 0.166812332381145 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7144146 C/A 1 420 539 959 197.308211642328 285.787795059012 -88.4795834166836 A:C:G C A 10 0.530218543708742 1.14114805064519e-08 ENSG00000170296:ENST00000302386:exon_7143333_7144238:GABARAP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 268 208 476 125.901430286057 110.285457091418 15.6159731946388 A:G G A 10 0.530218543708742 0.154790135705817 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7216540 G/A 1 65 74 139 30.5357946589318 39.2361722344469 -8.70037757551513 A:G G A 10 0.530218543708742 0.14880747611243 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7216531_7216610:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7216531_7216610:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7216531_7216610:GPS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7217463 T/C 1 53 35 88 24.8984171834367 18.557649029806 6.34076815363071 T:C T C 10 0.530218543708742 0.200032146302674 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7217399_7217478:GPS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7224736 T/G 1 14 16 30 6.57694038807761 8.48349669933987 -1.90655631126226 T:G T G 10 0.530218543708742 0.584066368115557 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7224680_7224778:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7224680_7224778:NEURL4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7366651 C/G 1 25 14 39 11.7445364072814 7.42305961192239 4.32147679535906 C:G C G 10 0.530218543708742 0.199605240311865 ENSG00000174282:ENST00000311403:exon_7362685_7367209:ZBTB4;ENSG00000174282:ENST00000380599:exon_7362688_7367209:ZBTB4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7405937 C/T 1 9 11 20 4.22803310662132 5.83240398079616 -1.60437087417484 T:C C T 10 0.530218543708742 0.508309614769096 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7405837_7406020:POLR2A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7412403 T/C 1 24 39 63 11.2747549509902 20.6785232046409 -9.40376825365075 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0223819849339422 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7412263_7412509:POLR2A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7460517 G/C 1 5 14 19 2.34890728145629 7.42305961192239 -5.0741523304661 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0218531141296597 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7460416_7460549:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7460685 G/A 1 13 20 33 6.10715893178635 10.6043708741748 -4.49721194238849 A:G G A 10 0.530218543708742 0.120690611676804 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7462555 G/A 1 4 18 22 1.87912582516503 9.54393378675736 -7.66480796159232 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00104634480628101 ENSG00000161955:ENST00000380535:exon_7461609_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396542:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7461793_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7461914_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462104_7462614:TNFSF13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7479892 C/T 1 373 302 675 175.228483196639 160.12600020004 15.1024829965992 T:C C T 10 0.530218543708742 0.247568431270716 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7479842_7480010:EIF4A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7490379 G/C 1 2 9 11 0.939562912582516 4.77196689337868 -3.83240398079616 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0305374290985922 ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490217_7490589:MPDU1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7530147 G/C 1 6 8 14 2.81868873774755 4.24174834966994 -1.42305961192239 C:G G C 10 0.530218543708742 0.594188084236152 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7530271 C/T 1 66 38 104 31.005576115223 20.1483046609322 10.8572714542908 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0386590450013444 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7530261_7530362:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7530261_7530362:SAT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7579472 G/C 1 126 101 227 59.1924634926985 53.5520729145829 5.64039057811556 C:G G C 10 0.530218543708742 0.46517212729307 ENSG00000141510:ENST00000413465:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000269305:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000455263:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000420246:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000445888:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000419024:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000359597:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000505014:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000414315:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000508793:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000503591:exon_7579312_7579590:TP53 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7592560 C/T 1 12 20 32 5.6373774754951 10.6043708741748 -4.96699339867974 T:C C T 10 0.530218543708742 0.109522418077362 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7592542_7592640:WRAP53 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7606722 C/G 1 12 8 20 5.6373774754951 4.24174834966994 1.39562912582516 C:G C G 10 0.530218543708742 0.655843927791304 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7750436 C/T 1 19 17 36 8.9258476695339 9.01371524304861 -0.0878675735147123 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750423_7750770:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750423_7750770:KDM6B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7751778 G/A 1 9 10 19 4.22803310662132 5.30218543708742 -1.0741523304661 A:G G A 10 0.530218543708742 0.652256323352804 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7754460 C/A 1 21 22 43 9.86541058211642 11.6648079615923 -1.79939737947591 A:C C A 10 0.530218543708742 0.647676991808468 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7754339_7754544:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7754339_7754544:KDM6B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 132 140 272 62.0111522304461 74.2305961192239 -12.2194438887778 A:G G A 10 0.530218543708742 0.14495228202457 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7761512 C/A 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 A:C C A 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000182224:ENST00000332439:exon_7761064_7761612:CYB5D1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 7802454 A/C 1 11 11 22 5.16759601920384 5.83240398079616 -0.664807961592324 A:C A C 10 0.530218543708742 0.832858519551156 ENSG00000170004:ENST00000380358:exon_7802329_7802520:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000403047:exon_7802329_7802520:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000358181:exon_7802329_7802520:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000330494:exon_7802329_7802520:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000412940:exon_7802329_7802520:CHD3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 8076811 C/T 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 T:C C T 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 8132763 T/C 1 38 25 63 17.8516953390678 13.2554635927186 4.59623174634925 T:C T C 10 0.530218543708742 0.258469706559169 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8132620_8132764:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8132620_8132764:C17orf68 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 8157310 C/T 1 2 13 15 0.939562912582516 6.89284106821365 -5.95327815563113 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00286872413296721 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8157177_8157397:PFAS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 8192922 C/T 1 37 28 65 17.3819138827765 14.8461192238448 2.53579465893177 T:C C T 10 0.530218543708742 0.537727874290254 ENSG00000125434:ENST00000312524:exon_8192892_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000396278:exon_8192892_8192961:SLC25A35 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 8700982 C/T 1 8 9 17 3.75825165033006 4.77196689337868 -1.01371524304861 T:C C T 10 0.530218543708742 0.636531694867648 ENSG00000185156:ENST00000329805:exon_8700481_8702586:MFSD6L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 57 36 93 26.7775430086017 19.0878675735147 7.689675435087 A:G A G 10 0.530218543708742 0.119488906654677 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 12899963 T/C 1 20 15 35 9.39562912582516 7.95327815563113 1.44235097019403 T:C T C 10 0.530218543708742 0.735513376094186 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 12915009 G/A 1 9 10 19 4.22803310662132 5.30218543708742 -1.0741523304661 A:G G A 10 0.530218543708742 0.652256323352804 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12914980_12915099:ELAC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 14005439 G/A 1 9 8 17 4.22803310662132 4.24174834966994 -0.0137152430486136 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_14005435_14005559:COX10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 15611495 T/C 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 T:C T C 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 16285404 C/T 1 2885 2447 5332 1355.31950140028 1297.44477645529 57.8747249449875 A:T:C:G C T 10 0.530218543708742 0.114609142271255 ENSG00000170315:ENST00000302182:exon_16285216_16286054:UBB;ENSG00000170315:ENST00000395839:exon_16285216_16286054:UBB;ENSG00000170315:ENST00000395837:exon_16285216_16286054:UBB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 17046024 C/A 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 A:C C A 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17045941_17046079:MPRIP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 17062241 C/G 1 20 39 59 9.39562912582516 20.6785232046409 -11.2828940788158 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0038192372855106 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000423885:exon_17061811_17062316:MPRIP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 17250159 C/T 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 T:C C T 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000205309:ENST00000446264:exon_17250127_17250977:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000478373:exon_17250119_17250977:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000379552:exon_17250119_17250975:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000389022:exon_17250119_17250975:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000470418:exon_17250119_17250172:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000483704:exon_17250119_17250977:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000480529:exon_17250119_17250466:NT5M HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 116 117 233 54.4946489297859 62.0355696139228 -7.54092068413688 A:G G A 10 0.530218543708742 0.325682360769773 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 18193941 G/A 1 12 7 19 5.6373774754951 3.71152980596119 1.9258476695339 A:G G A 10 0.530218543708742 0.492071463010612 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18193871_18194000:TOP3A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 18219835 T/C 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 18220674 C/T 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 18221134 C/T 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 18226177 G/T 1 11 6 17 5.16759601920384 3.18131126225245 1.98628475695139 T:G G T 10 0.530218543708742 0.46729790202122 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18225931_18226517:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18225931_18226384:SMCR8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 18232096 G/A 1 26 24 50 12.2143178635727 12.7252450490098 -0.510927185437099 A:G G A 10 0.530218543708742 0.888445961195408 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 18630995 G/A 1 1 8 9 0.469781456291258 4.24174834966994 -3.77196689337868 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0157469533588810 ENSG00000108448:ENST00000395902:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000414850:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000395672:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000424146:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000395671:exon_18630838_18631071:TRIM16L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 18907098 G/A 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 A:G G A 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000188522:ENST00000388995:exon_18906833_18907381:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000345041:exon_18906833_18907482:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000399096:exon_18906833_18907482:FAM83G HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 19812541 T/C 1 8 9 17 3.75825165033006 4.77196689337868 -1.01371524304861 T:C T C 10 0.530218543708742 0.636531694867648 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19812494_19812589:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19812494_19812589:AKAP10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 19861458 C/T 1 12 13 25 5.6373774754951 6.89284106821365 -1.25546359271855 T:C C T 10 0.530218543708742 0.690551486586856 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19861327_19861884:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19861327_19861884:AKAP10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 20107773 T/C 1 16 9 25 7.51650330066013 4.77196689337868 2.74453640728145 T:C T C 10 0.530218543708742 0.319417784881298 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 20108239 A/T 1 15 17 32 7.04672184436887 9.01371524304861 -1.96699339867974 A:T A T 10 0.530218543708742 0.595927881466323 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 16 14 30 7.51650330066013 7.42305961192239 0.0934436887377403 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 20924523 G/A 1 17 18 35 7.98628475695139 9.54393378675736 -1.55764902980597 A:G G A 10 0.530218543708742 0.615523468429842 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000476111:exon_20924426_20924539:USP22 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 44 0 44 20.6703840768154 0 20.6703840768154 T T 10 0.530218543708742 9.37041728058456e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 52 0 52 24.4286357271454 0 24.4286357271454 G G 10 0.530218543708742 5.21339999518503e-15 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 57 0 57 26.7775430086017 0 26.7775430086017 C C 10 0.530218543708742 2.09734606327571e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 37 0 37 17.3819138827765 0 17.3819138827765 C C 10 0.530218543708742 9.47890294919352e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 81 0 81 38.0522979595919 0 38.0522979595919 C C 10 0.530218543708742 5.91469654194366e-23 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 63 0 63 29.5962317463493 0 29.5962317463493 C C 10 0.530218543708742 4.52575084082722e-18 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 44 0 44 20.6703840768154 0 20.6703840768154 C C 10 0.530218543708742 9.37041728058456e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 61 0 61 28.6566688337667 0 28.6566688337667 C C 10 0.530218543708742 1.62264611708506e-17 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 1 71 1 72 33.3544833966793 0.530218543708742 32.8242648529706 A:G G A 10 0.530218543708742 1.15015603599764e-18 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 146 0 146 68.5880926185237 0 68.5880926185237 G G 10 0.530218543708742 9.67042434852617e-41 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 25628820 T/C 1 41 46 87 19.2610397079416 24.3900530106021 -5.12901330266055 T:C T C 10 0.530218543708742 0.284090942604995 ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000427287:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25628814_25628982:WSB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 25909850 G/T 1 16 15 31 7.51650330066013 7.95327815563113 -0.436774854971002 T:G G T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 25932816 G/A 0 29 0 29 13.6236622324465 0 13.6236622324465 G G 10 0.530218543708742 2.05179540918006e-08 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398988:exon_25932460_25932839:KSR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 26943898 C/T 1 7 4 11 3.28847019403881 2.12087417483497 1.16759601920384 T:C C T 10 0.530218543708742 0.557007995713773 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 27085564 A/G 1 12 11 23 5.6373774754951 5.83240398079616 -0.195026505301065 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000173065:ENST00000452648:exon_27082996_27086894:C17orf63;ENSG00000173065:ENST00000341217:exon_27082996_27086894:C17orf63 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 27185827 C/T 1 57 63 120 26.7775430086017 33.4037682536507 -6.62622524504904 T:C:G C T 10 0.530218543708742 0.235340166024157 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27185594_27185842:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27185594_27185842:ERAL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 27207571 C/T 1 49 67 116 23.0192913582716 35.5246424284857 -12.5053510702141 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0251599065521636 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 27208326 C/T 1 28 18 46 13.1538807761552 9.54393378675736 3.60994698939787 T:C C T 10 0.530218543708742 0.304617773336652 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27208210_27208393:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27208210_27208393:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394910:exon_27208210_27208393:FLOT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 27228115 T/A 1 11 10 21 5.16759601920384 5.30218543708742 -0.134589417883582 A:T T A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000167536:ENST00000378895:exon_27228008_27228319:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000394901:exon_27228008_27228319:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000426464:exon_27228008_27228319:DHRS13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 21 14 35 9.86541058211642 7.42305961192239 2.44235097019403 T:C C T 10 0.530218543708742 0.498927835684863 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 27438469 G/A 1 17 15 32 7.98628475695139 7.95327815563113 0.0330066013202561 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27438442_27438601:MYO18A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 27441077 C/G 1 12 13 25 5.6373774754951 6.89284106821365 -1.25546359271855 C:G C G 10 0.530218543708742 0.690551486586856 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533399:exon_27441029_27441286:MYO18A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 27613677 G/A 1 35 29 64 16.442350970194 15.3763377675535 1.06601320264051 A:G G A 10 0.530218543708742 0.803759347261332 ENSG00000108256:ENST00000225388:exon_27613010_27614734:NUFIP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 27869968 G/A 1 9 6 15 4.22803310662132 3.18131126225245 1.04672184436887 A:G G A 10 0.530218543708742 0.617171705992842 ENSG00000160551:ENST00000261716:exon_27869579_27871502:TAOK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 27899526 G/A 1 43 23 66 20.2006026205241 12.1950265053011 8.00557611522303 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0492799209334502 ENSG00000167543:ENST00000301057:exon_27899160_27899715:TP53I13;ENSG00000167543:ENST00000378818:exon_27899477_27899530:TP53I13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 27959903 G/A 1 9 11 20 4.22803310662132 5.83240398079616 -1.60437087417484 A:G G A 10 0.530218543708742 0.508309614769096 ENSG00000141298:ENST00000269033:exon_27952956_27959949:SSH2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 28511884 G/A 1 121 147 268 56.8435562112422 77.9421259251851 -21.0985697139429 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0101382093299219 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 28511978 G/A 1 107 139 246 50.2666158231646 73.7003775755151 -23.4337617523505 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00322348290566326 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 28576076 T/C 1 70 42 112 32.8847019403881 22.2691788357672 10.6155231046209 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0468848869049996 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28575223_28576186:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28575223_28576186:BLMH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 28612448 G/C 1 25 27 52 11.7445364072814 14.315900680136 -2.57136427285458 C:G G C 10 0.530218543708742 0.490346034709667 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28612406_28612498:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28612406_28612498:BLMH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 29111125 T/G 1 55 33 88 25.8379800960192 17.4972119423885 8.34076815363071 T:G T G 10 0.530218543708742 0.0871033610839718 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 29113016 A/G 1 19 13 32 8.9258476695339 6.89284106821365 2.03300660132026 A:G A G 10 0.530218543708742 0.485860889811232 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29112937_29113049:CRLF3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 29159404 G/C 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 C:G G C 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29158988_29159431:ATAD5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 29161202 A/T 1 10 5 15 4.69781456291258 2.65109271854371 2.04672184436887 A:T A T 10 0.530218543708742 0.315050043511805 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 29161845 G/A 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 A:G G A 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 29162173 T/C 1 9 11 20 4.22803310662132 5.83240398079616 -1.60437087417484 T:C T C 10 0.530218543708742 0.508309614769096 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 29187497 A/G 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29187451_29187630:ATAD5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 29214387 T/C 1 10 3 13 4.69781456291258 1.59065563112623 3.10715893178635 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0999408957936294 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29214210_29214390:ATAD5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 29226228 T/C 1 17 12 29 7.98628475695139 6.3626225245049 1.62366223244648 T:C T C 10 0.530218543708742 0.581764914655282 ENSG00000172171:ENST00000306049:exon_29226001_29226624:C17orf42 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 12 7 19 5.6373774754951 3.71152980596119 1.9258476695339 A:T T A 10 0.530218543708742 0.492071463010612 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 29857460 G/A 1 9 8 17 4.22803310662132 4.24174834966994 -0.0137152430486136 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000131242:ENST00000394744:exon_29857344_29857487:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000325874:exon_29857344_29857487:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000394742:exon_29857344_29857487:RAB11FIP4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 30696292 C/T 1 13 2 15 6.10715893178635 1.06043708741748 5.04672184436887 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00893461932137095 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 33289046 G/C 1 30 29 59 14.0934436887377 15.3763377675535 -1.28289407881578 C:G G C 10 0.530218543708742 0.794709103237718 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 33433487 C/T 1 4 10 14 1.87912582516503 5.30218543708742 -3.42305961192239 T:C C T 10 0.530218543708742 0.105064392873074 ENSG00000185379:ENST00000345365:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000474236:exon_33433405_33433490:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000360276:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000335858:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000394589:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000489139:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000345766:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000460118:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000494406:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000418935:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000415064:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000339934:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000486323:exon_33433460_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000467861:exon_33433460_33433500:RAD51L3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 33592621 C/T 0 21 0 21 9.86541058211642 0 9.86541058211642 C C 10 0.530218543708742 1.76390287787440e-06 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 33749546 A/G 1 8 6 14 3.75825165033006 3.18131126225245 0.576940388077612 A:G A G 10 0.530218543708742 0.795824909862849 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 33998802 G/C 1 13 12 25 6.10715893178635 6.3626225245049 -0.25546359271855 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 35771468 C/T 1 3 9 12 1.40934436887377 4.77196689337868 -3.3626225245049 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0792634794421136 ENSG00000108264:ENST00000394395:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000490992:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000225396:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000417170:exon_35771356_35771477:TADA2A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 35896123 T/C 1 9 7 16 4.22803310662132 3.71152980596119 0.516503300660129 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000508220:exon_35896081_35897580:SYNRG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 35902225 C/G 1 25 33 58 11.7445364072814 17.4972119423885 -5.75267553510704 C:G C G 10 0.530218543708742 0.148046028538233 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 35937637 T/C 1 10 8 18 4.69781456291258 4.24174834966994 0.456066213242644 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000378189:exon_35937478_35937711:SYNRG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 22 13 35 10.3351920384077 6.89284106821365 3.44235097019403 T:C T C 10 0.530218543708742 0.309763403900544 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 5 11 16 2.34890728145629 5.83240398079616 -3.48349669933987 T:C C T 10 0.530218543708742 0.130369289858938 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 36926731 T/G 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 T:G T G 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 36926767 G/A 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 A:G G A 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 45 49 94 21.1401655331066 25.9807086417284 -4.84054310862175 A:G A G 10 0.530218543708742 0.352633152643491 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 37814080 G/A 1 9 10 19 4.22803310662132 5.30218543708742 -1.0741523304661 A:G G A 10 0.530218543708742 0.652256323352804 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000484773:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000443521:exon_37814028_37814105:STARD3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 37884037 C/G 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 C:G C G 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000141736:ENST00000406381:exon_37883942_37884915:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000269571:exon_37883942_37884915:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000445658:exon_37883942_37884915:ERBB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 37922259 G/A 1 28 30 58 13.1538807761552 15.9065563112623 -2.75267553510704 A:G G A 10 0.530218543708742 0.511768099836550 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37913968_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_37921198_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439167:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000394189:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377952:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000351680:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346243:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37922043_37922746:IKZF3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 38062196 G/A 1 21 6 27 9.86541058211642 3.18131126225245 6.68409931986397 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0112471836139720 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 23 11 34 10.8049734946989 5.83240398079616 4.97256951390277 T:C C T 10 0.530218543708742 0.120766761298837 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 14 14 28 6.57694038807761 7.42305961192239 -0.846119223844775 A:G A G 10 0.530218543708742 0.850434684608347 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 38457151 G/A 1 19 16 35 8.9258476695339 8.48349669933987 0.442350970194029 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38457080_38457282:CDC6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 38990834 G/C 1 39 26 65 18.3214767953591 13.7856821364273 4.53579465893177 C:G G C 10 0.530218543708742 0.266678622807761 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 25 24 49 11.7445364072814 12.7252450490098 -0.980708641728357 A:T:C T A 10 0.530218543708742 0.777156675800136 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 39925925 A/G 1 15 5 20 7.04672184436887 2.65109271854371 4.39562912582516 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0706985595466848 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000449889:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437187:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000420370:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000424457:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437369:exon_39925878_39925929:JUP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 55 56 111 25.8379800960192 29.6922384476896 -3.85425835167036 A:C C A 10 0.530218543708742 0.5059364193319 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 72 85 157 33.8242648529706 45.0685762152431 -11.2443113622725 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0784923456611476 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 41267763 C/T 1 8 3 11 3.75825165033006 1.59065563112623 2.16759601920384 T:C C T 10 0.530218543708742 0.235945069885030 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000470026:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000477152:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000492859:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000494123:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000476777:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461798:exon_41267743_41267796:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000489037:exon_41267743_41267796:BRCA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 42152103 G/A 1 17 11 28 7.98628475695139 5.83240398079616 2.15388077615522 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.453884491531812 ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 42155892 G/A 1 33 52 85 15.5027880576115 27.5713642728546 -12.0685762152431 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00907235791155034 ENSG00000108840:ENST00000336057:exon_42155868_42156033:HDAC5;ENSG00000108840:ENST00000393622:exon_42155868_42156033:HDAC5;ENSG00000108840:ENST00000225983:exon_42155868_42156033:HDAC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 42225547 A/C 1 15 16 31 7.04672184436887 8.48349669933987 -1.436774854971 A:C A C 10 0.530218543708742 0.719617548007844 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42225226_42226395:C17orf53;ENSG00000125319:ENST00000245382:exon_42225226_42226395:C17orf53 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 16 11 27 7.51650330066013 5.83240398079616 1.68409931986397 C:G C G 10 0.530218543708742 0.567178184787279 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 42254281 A/G 1 5 8 13 2.34890728145629 4.24174834966994 -1.89284106821365 A:G A G 10 0.530218543708742 0.406203894191414 ENSG00000161664:ENST00000293414:exon_42254106_42254598:ASB16;ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 42254527 T/G 1 13 12 25 6.10715893178635 6.3626225245049 -0.25546359271855 T:G T G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000161664:ENST00000293414:exon_42254106_42254598:ASB16;ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 42268274 C/T 1 44 23 67 20.6703840768154 12.1950265053011 8.47535757151429 T:C C T 10 0.530218543708742 0.049373663401992 ENSG00000168591:ENST00000357984:exon_42267869_42269098:TMUB2;ENSG00000168591:ENST00000319511:exon_42267869_42269098:TMUB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 135 119 254 63.4204965993198 63.0960067013403 0.324489897979532 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 43003484 T/C 1 22 21 43 10.3351920384077 11.1345894178836 -0.799397379475906 T:C T C 10 0.530218543708742 0.878965825852265 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43003360_43003554:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43003448_43003554:KIF18B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 43010064 G/A 1 17 12 29 7.98628475695139 6.3626225245049 1.62366223244648 A:G G A 10 0.530218543708742 0.581764914655282 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43010041_43010141:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43010041_43010141:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000376982:exon_43010041_43010141:KIF18B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 43111558 G/A 1 20 19 39 9.39562912582516 10.0741523304661 -0.678523204640939 A:G G A 10 0.530218543708742 0.873357648525083 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 43 69 112 20.2006026205241 36.5850795159032 -16.3844768953791 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00231512665260833 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 130 145 275 61.0715893178635 76.8816888377676 -15.810099519904 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0609700683495358 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 44117135 C/T 1 3 9 12 1.40934436887377 4.77196689337868 -3.3626225245049 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0792634794421136 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44117068_44117250:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44117068_44117250:KIAA1267 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 44248499 G/C 1 15 14 29 7.04672184436887 7.42305961192239 -0.376337767553518 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 45822579 G/A 1 70 51 121 32.8847019403881 27.0411457291458 5.84355621124222 A:G G A 10 0.530218543708742 0.316672061136488 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45822114_45823485:TBX21 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 45885687 A/G 1 18 18 36 8.45606621324264 9.54393378675736 -1.08786757351471 A:G A G 10 0.530218543708742 0.740965509128219 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 20 22 42 9.39562912582516 11.6648079615923 -2.26917883576716 T:C C T 10 0.530218543708742 0.537663745178036 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 45915395 T/C 1 12 10 22 5.6373774754951 5.30218543708742 0.335192038407676 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 45915788 T/C 1 51 46 97 23.9588542708542 24.3900530106021 -0.431198739747973 T:C:G T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45915636_45915816:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 46000406 T/C 1 24 16 40 11.2747549509902 8.48349669933987 2.79125825165032 T:C T C 10 0.530218543708742 0.429974963920427 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46000328_46000640:SP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 46020698 C/T 1 7 7 14 3.28847019403881 3.71152980596119 -0.423059611922388 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000108439:ENST00000225573:exon_46020672_46020796:PNPO;ENSG00000108439:ENST00000434554:exon_46020672_46020796:PNPO HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 46262171 C/T 1 12 10 22 5.6373774754951 5.30218543708742 0.335192038407676 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 46474118 G/T 1 13 20 33 6.10715893178635 10.6043708741748 -4.49721194238849 T:G G T 10 0.530218543708742 0.120690611676804 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46474042_46474147:SKAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 46929908 T/C 1 34 32 66 15.9725695139028 16.9669933986797 -0.994423884776971 T:C T C 10 0.530218543708742 0.806715550493579 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514006:exon_46929868_46930220:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000511816:exon_46929868_46930007:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509112:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000506971:exon_46929702_46929990:CALCOCO2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 69 57 126 32.4149204840968 30.2224569913983 2.19246349269851 C:G C G 10 0.530218543708742 0.721724196079293 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 47000251 C/T 1 58 39 97 27.247324464893 20.6785232046409 6.56880126025203 T:C C T 10 0.530218543708742 0.187555667827222 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 47007963 C/T 1 94 75 169 44.1594568913783 39.7663907781557 4.3930661132226 T:C C T 10 0.530218543708742 0.537765654728836 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47006678_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47007733_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47007736_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514089:exon_47007743_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515572:exon_47007750_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000504000:exon_47007752_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509989:exon_47007788_47007974:SNF8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 47783602 G/A 1 28 24 52 13.1538807761552 12.7252450490098 0.428635727145418 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47782486_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47783228_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000503334:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508520:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000435059:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000514907:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000515850:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000511763:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508926:exon_47783566_47783717:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000511657:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000509781:exon_47783230_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508607:exon_47783438_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000505765:exon_47783564_47783671:SLC35B1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 48226811 C/T 1 103 85 188 48.3874899979996 45.0685762152431 3.3189137827565 T:C C T 10 0.530218543708742 0.661360062827091 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 48431032 G/A 1 13 12 25 6.10715893178635 6.3626225245049 -0.25546359271855 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000509778:exon_48430991_48431035:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 48431197 C/T 1 11 14 25 5.16759601920384 7.42305961192239 -2.25546359271855 T:C C T 10 0.530218543708742 0.425252421915307 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 48432324 G/C 1 1 10 11 0.469781456291258 5.30218543708742 -4.83240398079616 C:G G C 10 0.530218543708742 0.00423062977992106 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48432215_48432417:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48432215_48432417:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48432215_48432417:XYLT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 48455985 A/T 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:T A T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511519:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48455956_48456042:EME1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 48456193 T/C 1 7 11 18 3.28847019403881 5.83240398079616 -2.54393378675736 T:C T C 10 0.530218543708742 0.246988872578824 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48456135_48456256:EME1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 48539035 T/C 1 17 9 26 7.98628475695139 4.77196689337868 3.21431786357271 T:C T C 10 0.530218543708742 0.241222081320482 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539018_48539047:ACSF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 48557326 G/A 1 5 8 13 2.34890728145629 4.24174834966994 -1.89284106821365 A:G G A 10 0.530218543708742 0.406203894191414 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 48557348 T/C 1 3 7 10 1.40934436887377 3.71152980596119 -2.30218543708742 T:C T C 10 0.530218543708742 0.206122472271196 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 48559559 A/G 1 10 6 16 4.69781456291258 3.18131126225245 1.51650330066013 A:G A G 10 0.530218543708742 0.617951383515179 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000515221:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000451010:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000504284:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000506211:exon_48559458_48559817:RSAD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 48628160 A/G 1 27 19 46 12.684099319864 10.0741523304661 2.60994698939787 A:G A G 10 0.530218543708742 0.463889576367042 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48627897_48628252:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48628069_48628163:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511347:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505656:exon_48628069_48628212:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508528:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000513618:exon_48627761_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628095_48628278:SPATA20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 48628470 T/A 1 14 24 38 6.57694038807761 12.7252450490098 -6.14830466093219 A:T T A 10 0.530218543708742 0.0513011836401719 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628359_48628583:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628359_48628745:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628359_48628551:SPATA20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 48629458 A/G 1 20 10 30 9.39562912582516 5.30218543708742 4.09344368873774 A:G A G 10 0.530218543708742 0.146787236795718 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48629146_48629541:SPATA20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 48633043 G/A 1 59 70 129 27.7171059211842 37.1152980596119 -9.39819213842772 A:G G A 10 0.530218543708742 0.112045873470030 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48632853_48633211:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48632853_48633211:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48632853_48633211:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48632853_48633137:SPATA20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 48774319 G/A 1 14 7 21 6.57694038807761 3.71152980596119 2.86541058211642 A:G G A 10 0.530218543708742 0.275142109059742 ENSG00000154945:ENST00000285243:exon_48774301_48774482:ANKRD40 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 49239036 C/A 1 7 4 11 3.28847019403881 2.12087417483497 1.16759601920384 A:C C A 10 0.530218543708742 0.557007995713773 ENSG00000239672:ENST00000511355:exon_49238459_49239789:NME1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 53851228 C/T 1 12 6 18 5.6373774754951 3.18131126225245 2.45606621324264 T:C C T 10 0.530218543708742 0.345504636527756 ENSG00000141179:ENST00000268896:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000417982:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000325214:exon_53851085_53851256:PCTP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 55027850 T/C 1 34 21 55 15.9725695139028 11.1345894178836 4.83798009601919 T:C T C 10 0.530218543708742 0.224266661808679 ENSG00000121058:ENST00000240316:exon_55027250_55028357:COIL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 55183203 T/C 1 26 23 49 12.2143178635727 12.1950265053011 0.0192913582716425 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 55183716 T/C 1 26 26 52 12.2143178635727 13.7856821364273 -1.57136427285458 T:C T C 10 0.530218543708742 0.679097790739333 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 56769979 C/T 1 11 4 15 5.16759601920384 2.12087417483497 3.04672184436887 T:C C T 10 0.530218543708742 0.128499041794511 ENSG00000108384:ENST00000461271:exon_56769934_56770046:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000337432:exon_56769934_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487921:exon_56769937_56769993:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000476741:exon_56769963_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000475762:exon_56769963_56771011:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000486827:exon_56769967_56771172:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487525:exon_56769967_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000482007:exon_56769976_56770149:RAD51C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 57287454 A/G 1 16 10 26 7.51650330066013 5.30218543708742 2.21431786357271 A:G A G 10 0.530218543708742 0.435912924593876 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57287371_57289171:C17orf71 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 45 55 100 21.1401655331066 29.1620199039808 -8.0218543708742 A:G G A 10 0.530218543708742 0.110080627018345 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 58012574 T/C 1 12 8 20 5.6373774754951 4.24174834966994 1.39562912582516 T:C T C 10 0.530218543708742 0.655843927791304 ENSG00000108443:ENST00000393021:exon_58012554_58012661:RPS6KB1;ENSG00000108443:ENST00000472940:exon_58012554_58012661:RPS6KB1;ENSG00000108443:ENST00000406116:exon_58012554_58012661:RPS6KB1;ENSG00000108443:ENST00000225577:exon_58012554_58012661:RPS6KB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 58031412 A/G 1 12 8 20 5.6373774754951 4.24174834966994 1.39562912582516 A:G A G 10 0.530218543708742 0.655843927791304 ENSG00000189050:ENST00000305783:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000482446:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000343124:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000442346:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000466544:exon_58031406_58031507:RNFT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 59760996 A/G 1 16 17 33 7.51650330066013 9.01371524304861 -1.49721194238849 A:G A G 10 0.530218543708742 0.606414146278630 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59759985_59761501:BRIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 59763347 A/G 1 7 10 17 3.28847019403881 5.30218543708742 -2.01371524304861 A:G A G 10 0.530218543708742 0.343429778687472 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59763197_59763526:BRIP1;ENSG00000136492:ENST00000416542:exon_59763117_59763526:BRIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 59763465 T/C 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 T:C T C 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59763197_59763526:BRIP1;ENSG00000136492:ENST00000416542:exon_59763117_59763526:BRIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 61901197 T/A 1 32 62 94 15.0330066013203 32.873549709942 -17.8405431086217 A:T T A 10 0.530218543708742 0.000260465933968048 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901177_61901312:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901177_61901312:FTSJ3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 61903445 G/C 1 19 27 46 8.9258476695339 14.315900680136 -5.39005301060213 C:G G C 10 0.530218543708742 0.138965910246916 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903416_61903495:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903416_61903495:FTSJ3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 61908271 C/T 1 191 161 352 89.7282581516303 85.3651855371075 4.36307261452282 T:C C T 10 0.530218543708742 0.669354373325914 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908169_61908295:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908169_61908295:PSMC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 245 254 499 115.096456791358 134.67551010202 -19.5790533106623 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0803888388221115 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 147 135 282 69.0578740748149 71.5795034006802 -2.52162932586523 A:G A G 10 0.530218543708742 0.76586740860485 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 62476429 G/A 1 7 10 17 3.28847019403881 5.30218543708742 -2.01371524304861 A:G G A 10 0.530218543708742 0.343429778687472 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62476406_62476506:POLG2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 62481801 A/G 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 A:G A G 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 62492582 C/T 1 6 10 16 2.81868873774755 5.30218543708742 -2.48349669933987 T:C C T 10 0.530218543708742 0.316586227617054 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62492525_62493169:POLG2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 62528179 A/G 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 A:G A G 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 65988049 T/C 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 T:C T C 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000186665:ENST00000449250:exon_65987218_65988219:C17orf58;ENSG00000186665:ENST00000334461:exon_65987218_65988219:C17orf58 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 238 254 492 111.807986597319 134.67551010202 -22.8675235047011 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0420132568798217 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 72 80 152 33.8242648529706 42.4174834966994 -8.59321864372878 A:G A G 10 0.530218543708742 0.167817404353318 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 110 104 214 51.6759601920384 55.1427285457092 -3.46676835367079 A:T:C:G T A 10 0.530218543708742 0.681240512825627 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 66449122 G/A 1 9 2 11 4.22803310662132 1.06043708741748 3.16759601920384 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0707395200860403 ENSG00000070540:ENST00000262139:exon_66449051_66449133:WIPI1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 71192663 G/A 1 11 5 16 5.16759601920384 2.65109271854371 2.51650330066013 A:G G A 10 0.530218543708742 0.223429926014640 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71192646_71192890:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71192646_71192890:COG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 71196809 A/G 1 9 3 12 4.22803310662132 1.59065563112623 2.6373774754951 A:G A G 10 0.530218543708742 0.154808266842262 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71196705_71196915:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71196705_71196915:COG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 31 22 53 14.563225145029 11.6648079615923 2.89841718343667 A:G G A 10 0.530218543708742 0.492045506110349 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 71232687 T/C 1 9 11 20 4.22803310662132 5.83240398079616 -1.60437087417484 T:C T C 10 0.530218543708742 0.508309614769096 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 71232807 T/C 1 19 6 25 8.9258476695339 3.18131126225245 5.74453640728145 T:C T C 10 0.530218543708742 0.026160962969293 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 27 10 37 12.684099319864 5.30218543708742 7.38191388277655 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0198949037192017 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 71233130 A/G 1 8 9 17 3.75825165033006 4.77196689337868 -1.01371524304861 A:G A G 10 0.530218543708742 0.636531694867648 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 71239087 G/T 1 2 8 10 0.939562912582516 4.24174834966994 -3.30218543708742 T:G G T 10 0.530218543708742 0.0537596124644068 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71239035_71239142:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71239035_71239142:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71239035_71239142:C17orf80 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 72758210 C/T 1 36 32 68 16.9121324264853 16.9669933986797 -0.0548609721944544 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000109062:ENST00000262613:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1;ENSG00000109062:ENST00000413388:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 72769739 A/G 1 9 5 14 4.22803310662132 2.65109271854371 1.57694038807761 A:G A G 10 0.530218543708742 0.43589870850422 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72769715_72769827:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72769715_72769824:NAT9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 72771766 C/G 1 11 7 18 5.16759601920384 3.71152980596119 1.45606621324264 C:G C G 10 0.530218543708742 0.638243716970554 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72771761_72771846:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72771761_72771846:NAT9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 55 52 107 25.8379800960192 27.5713642728546 -1.73338417683539 T:C C T 10 0.530218543708742 0.771784870052255 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 60 60 120 28.1868873774755 31.8131126225245 -3.62622524504904 T:C T C 10 0.530218543708742 0.523061856047144 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 10 15 25 4.69781456291258 7.95327815563113 -3.25546359271855 C:G G C 10 0.530218543708742 0.230578617079935 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 73269676 C/T 1 56 54 110 26.3077615523104 28.6318013602721 -2.32403980796162 T:C C T 10 0.530218543708742 0.702693541188314 ENSG00000125454:ENST00000375261:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73269062_73269720:SLC25A19 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 73488794 C/T 1 27 22 49 12.684099319864 11.6648079615923 1.01929135827164 T:C C T 10 0.530218543708742 0.886388015528235 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73488555_73488870:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73488555_73488870:KIAA0195 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 73489567 C/G 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 C:G C G 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 73513677 A/C 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 A:C A C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73513638_73513736:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73513638_73513736:TSEN54 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 73518284 G/C 1 9 16 25 4.22803310662132 8.48349669933987 -4.25546359271855 C:G G C 10 0.530218543708742 0.108729977869397 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 73520359 C/G 1 17 14 31 7.98628475695139 7.42305961192239 0.563225145028999 C:G C G 10 0.530218543708742 0.859518475209004 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73520343_73520820:TSEN54 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 73870612 C/T 1 3 10 13 1.40934436887377 5.30218543708742 -3.89284106821365 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0478690744855084 ENSG00000132481:ENST00000254816:exon_73870247_73871204:TRIM47 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 37 26 63 17.3819138827765 13.7856821364273 3.59623174634926 T:C C T 10 0.530218543708742 0.37983667650144 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 56 68 124 26.3077615523104 36.0548609721945 -9.74709941988401 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0872939032275958 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 74077797 C/T 1 52 25 77 24.4286357271454 13.2554635927186 11.1731721344269 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0117069791465446 ENSG00000186919:ENST00000334586:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000425015:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000441571:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000421794:exon_74077681_74077836:ZACN;ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 74152366 A/G 1 5 8 13 2.34890728145629 4.24174834966994 -1.89284106821365 A:G A G 10 0.530218543708742 0.406203894191414 ENSG00000141576:ENST00000269391:exon_74152291_74152402:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000319945:exon_74152291_74152402:RNF157 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 76809902 G/A 1 13 14 27 6.10715893178635 7.42305961192239 -1.31590068013603 A:G G A 10 0.530218543708742 0.701068808163555 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76809855_76809955:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76809855_76809955:USP36 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 76817090 C/T 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 T:C C T 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76817073_76817143:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76817073_76817143:USP36 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 77081788 G/A 1 11 6 17 5.16759601920384 3.18131126225245 1.98628475695139 A:G G A 10 0.530218543708742 0.46729790202122 ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77081702_77081816:ENGASE HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 78078470 C/T 1 15 5 20 7.04672184436887 2.65109271854371 4.39562912582516 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0706985595466848 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78078354_78078931:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78078354_78078931:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78078354_78078931:GAA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 78293189 A/T 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 A:T A T 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78292990_78295258:RNF213 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 78327358 G/A 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 A:G G A 10 0.530218543708742 0.797017339461022 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78327312_78327466:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78327312_78327466:RNF213;ENSG00000234591:ENST00000434136:exon_78327100_78327744:AC124319.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 78350110 G/A 1 25 28 53 11.7445364072814 14.8461192238448 -3.10158281656333 A:G G A 10 0.530218543708742 0.411702638901328 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78350101_78350343:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78350101_78350343:RNF213 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 78354661 C/T 1 14 19 33 6.57694038807761 10.0741523304661 -3.49721194238849 T:C C T 10 0.530218543708742 0.228268891065024 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78354631_78354787:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78354631_78354787:RNF213 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79220224 G/C 1 42 55 97 19.7308211642328 29.1620199039808 -9.43119873974797 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0665744051949383 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79244802 T/C 1 12 6 18 5.6373774754951 3.18131126225245 2.45606621324264 T:C T C 10 0.530218543708742 0.345504636527756 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79244718_79244824:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79244718_79244824:SLC38A10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79255998 G/A 1 11 9 20 5.16759601920384 4.77196689337868 0.395629125825161 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79255989_79256132:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79255989_79256132:SLC38A10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79478019 G/A 1 3848 4095 7943 1807.71904380876 2171.2449364873 -363.525892678538 A:T:G G A 10 0.530218543708742 3.48388275522354e-16 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79478870 C/A 1 26 6 32 12.2143178635727 3.18131126225245 9.03300660132026 A:C C A 10 0.530218543708742 0.00119629392851303 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79478871 C/T 1 26 6 32 12.2143178635727 3.18131126225245 9.03300660132026 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00119629392851303 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79478916 G/T 1 20 4 24 9.39562912582516 2.12087417483497 7.27475495099019 T:G G T 10 0.530218543708742 0.00331081185899457 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79507989 C/T 1 7 3 10 3.28847019403881 1.59065563112623 1.69781456291258 T:C C T 10 0.530218543708742 0.352695224731846 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 34 25 59 15.9725695139028 13.2554635927186 2.71710592118422 A:G G A 10 0.530218543708742 0.516014587140935 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79526402 G/C 1 43 40 83 20.2006026205241 21.2087417483497 -1.00813912782559 C:G G C 10 0.530218543708742 0.82696364195968 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79523915_79526442:NPLOC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79571637 C/G 1 13 15 28 6.10715893178635 7.95327815563113 -1.84611922384478 C:G C G 10 0.530218543708742 0.571296577994255 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79571574_79571753:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79571574_79571753:NPLOC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79632363 C/T 1 125 105 230 58.7226820364072 55.6729470894179 3.04973494698934 T:C C T 10 0.530218543708742 0.692516257097021 ENSG00000204237:ENST00000374741:exon_79632067_79632614:C17orf90 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79637367 C/G 1 25 5 30 11.7445364072814 2.65109271854371 9.09344368873774 C:G C G 10 0.530218543708742 0.00075104116584353 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79637255_79637483:CCDC137 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79639550 G/A 1 35 22 57 16.442350970194 11.6648079615923 4.77754300860171 A:G G A 10 0.530218543708742 0.233021265252914 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79639708 C/T 1 35 24 59 16.442350970194 12.7252450490098 3.71710592118422 T:C C T 10 0.530218543708742 0.362876411209585 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79662067 A/G 1 40 18 58 18.7912582516503 9.54393378675736 9.24732446489296 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0173223165989109 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79661954_79662097:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79661954_79662097:HGS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79663880 T/C 1 86 50 136 40.4012052410482 26.5109271854371 13.8902780556111 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0200418174492870 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79663931 T/C 1 47 35 82 22.0797284456891 18.557649029806 3.52207941588316 A:T:C T C 10 0.530218543708742 0.507059323189648 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79668135 G/T 1 94 65 159 44.1594568913783 34.4642053410682 9.69525155031003 T:G G T 10 0.530218543708742 0.131369243834071 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668075_79668161:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668075_79668161:HGS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79668552 C/T 1 96 74 170 45.0990198039608 39.2361722344469 5.86284756951387 T:C C T 10 0.530218543708742 0.398202604700126 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668538_79669143:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668538_79669149:HGS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79671714 T/C 1 252 251 503 118.384926985397 133.084854470894 -14.6999274854972 T:C T C 10 0.530218543708742 0.195272532875527 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79671663_79671746:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79671663_79671746:MRPL12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 21 21 42 9.86541058211642 11.1345894178836 -1.26917883576716 T:C T C 10 0.530218543708742 0.75806865433379 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79991603 C/T 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 T:C C T 10 0.530218543708742 0.565817448386735 ENSG00000169750:ENST00000306897:exon_79991575_79992077:RAC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 79993919 C/T 1 75 55 130 35.2336092218443 29.1620199039808 6.07158931786354 T:C C T 10 0.530218543708742 0.293154025164516 ENSG00000169738:ENST00000306869:exon_79993757_79993939:DCXR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80012449 G/A 1 66 66 132 31.005576115223 34.994423884777 -3.98884776955394 A:G G A 10 0.530218543708742 0.487134410894594 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80012374_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000320548:exon_80012408_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80014305 G/A 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G G A 10 0.530218543708742 0.73053574105774 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80019207 G/C 1 51 61 112 23.9588542708542 32.3433311662333 -8.38447689537911 A:T:C:G G C 10 0.530218543708742 0.129573123989648 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80019085_80019229:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80019085_80019229:DUS1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80042792 C/T 1 75 62 137 35.2336092218443 32.873549709942 2.36005951190234 T:C C T 10 0.530218543708742 0.732318352825001 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80042675_80042829:FASN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80045086 G/C 1 64 52 116 30.0660132026405 27.5713642728546 2.49464892978593 C:G G C 10 0.530218543708742 0.71001672334033 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80044926_80045129:FASN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80320561 G/A 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 A:G G A 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000182459:ENST00000333437:exon_80319756_80321652:TEX19 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 31 21 52 14.563225145029 11.1345894178836 3.42863572714542 A:G G A 10 0.530218543708742 0.404921775339174 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80373452 C/T 1 13 14 27 6.10715893178635 7.42305961192239 -1.31590068013603 T:C C T 10 0.530218543708742 0.701068808163555 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80377690 T/G 1 13 7 20 6.10715893178635 3.71152980596119 2.39562912582516 T:G T G 10 0.530218543708742 0.371488020282974 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80377625_80377759:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80377665_80377759:HEXDC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80401946 A/G 1 71 54 125 33.3544833966793 28.6318013602721 4.72268203640725 A:C:G A G 10 0.530218543708742 0.42075991951058 ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80401498_80401980:C17orf62 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80402045 T/C 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 T:C T C 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80684442 G/A 1 49 42 91 23.0192913582716 22.2691788357672 0.750112522504477 A:G G A 10 0.530218543708742 0.916578128356446 ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80684356_80684478:FN3KRP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 49 27 76 23.0192913582716 14.315900680136 8.70339067813561 T:C T C 10 0.530218543708742 0.050534110815455 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80895933 A/G 1 14 9 23 6.57694038807761 4.77196689337868 1.80497349469893 A:G A G 10 0.530218543708742 0.533565745005242 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80895925_80896012:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80895925_80896012:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80895925_80896012:TBCD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 29 14 43 13.6236622324465 7.42305961192239 6.2006026205241 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0666092845021738 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 17 80904844 C/T 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 T:C C T 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_80904755_80904859:B3GNTL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 204602 G/C 1 23 25 48 10.8049734946989 13.2554635927186 -2.45049009801962 C:G G C 10 0.530218543708742 0.563458294966744 ENSG00000101557:ENST00000400266:exon_204564_204692:USP14;ENSG00000101557:ENST00000261601:exon_204564_204692:USP14;ENSG00000101557:ENST00000383589:exon_204564_204692:USP14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 674320 A/G 1 33 44 77 15.5027880576115 23.3296159231846 -7.82682786557313 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0863737834316801 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_674161_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_673859_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_673861_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_674038_674406:ENOSF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 2595443 G/T 1 34 26 60 15.9725695139028 13.7856821364273 2.18688737747548 T:G G T 10 0.530218543708742 0.606676288545274 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2595415_2595620:NDC80 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 2707619 G/A 1 10 12 22 4.69781456291258 6.3626225245049 -1.66480796159232 A:G G A 10 0.530218543708742 0.526195123533414 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2707561_2707643:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2707561_2707643:SMCHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 2724930 A/T 1 8 6 14 3.75825165033006 3.18131126225245 0.576940388077612 A:T A T 10 0.530218543708742 0.795824909862849 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2724897_2724993:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2724897_2724993:SMCHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 2740714 A/G 1 2 6 8 0.939562912582516 3.18131126225245 -2.24174834966994 A:G A G 10 0.530218543708742 0.158929006468168 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2740701_2740819:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2740701_2740819:SMCHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 2750444 C/T 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2750348_2750505:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2750348_2750505:SMCHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 2750477 A/G 1 7 10 17 3.28847019403881 5.30218543708742 -2.01371524304861 A:G A G 10 0.530218543708742 0.343429778687472 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2750348_2750505:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2750348_2750505:SMCHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 2763697 C/T 1 9 4 13 4.22803310662132 2.12087417483497 2.10715893178635 T:C C T 10 0.530218543708742 0.278259851701685 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2763635_2763787:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2763635_2763787:SMCHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 2909700 C/T 1 2 8 10 0.939562912582516 4.24174834966994 -3.30218543708742 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0537596124644068 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2909689_2909817:EMILIN2;ENSG00000132205:ENST00000308080:exon_2909689_2909817:EMILIN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 2920288 G/A 1 9 12 21 4.22803310662132 6.3626225245049 -2.13458941788358 A:G G A 10 0.530218543708742 0.387625542901861 ENSG00000101577:ENST00000261596:exon_2916992_2920435:LPIN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 9255270 A/G 1 149 131 280 69.9974369873974 69.4586292258452 0.538807761552249 A:G A G 10 0.530218543708742 0.952354744700062 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000359158:exon_9254209_9255428:ANKRD12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 9535817 C/T 1 62 50 112 29.126450290058 26.5109271854371 2.61552310462089 T:C C T 10 0.530218543708742 0.637201754166287 ENSG00000017797:ENST00000019317:exon_9535669_9538112:RALBP1;ENSG00000017797:ENST00000383432:exon_9535669_9538105:RALBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 12308793 G/C 1 23 101 124 10.8049734946989 53.5520729145829 -42.747099419884 C:G G C 10 0.530218543708742 3.20977724849631e-15 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12308686_12308794:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12308686_12308794:TUBB6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 142 125 267 66.7089667933586 66.2773179635928 0.431648829765891 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 27 30 57 12.684099319864 15.9065563112623 -3.22245699139829 T:C T C 10 0.530218543708742 0.4272225851722 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 25 30 55 11.7445364072814 15.9065563112623 -4.16201990398081 T:C C T 10 0.530218543708742 0.281496677720489 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 14105016 C/A 1 7 1 8 3.28847019403881 0.530218543708742 2.75825165033006 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0743148409803516 ENSG00000175322:ENST00000309305:exon_14104724_14106408:ZNF519 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 21100240 C/T 1 8 12 20 3.75825165033006 6.3626225245049 -2.60437087417484 T:C C T 10 0.530218543708742 0.269017553119515 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 21109250 T/C 1 18 16 34 8.45606621324264 8.48349669933987 -0.0274304860972272 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 21119777 G/A 1 9 10 19 4.22803310662132 5.30218543708742 -1.0741523304661 A:G G A 10 0.530218543708742 0.652256323352804 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21119775_21119965:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21119775_21119965:NPC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 21120444 T/C 1 12 7 19 5.6373774754951 3.71152980596119 1.9258476695339 T:C T C 10 0.530218543708742 0.492071463010612 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21120412_21120501:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21120412_21120501:NPC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 29104698 C/T 1 11 24 35 5.16759601920384 12.7252450490098 -7.55764902980597 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0110753528554956 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29104666_29104851:DSG2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 32834095 T/C 1 3 13 16 1.40934436887377 6.89284106821365 -5.48349669933987 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00976645421972823 ENSG00000186814:ENST00000333206:exon_32832819_32834345:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000420878:exon_32833423_32834187:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000360932:exon_32833423_32834285:ZSCAN30 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 32834186 T/G 1 11 8 19 5.16759601920384 4.24174834966994 0.925847669533902 T:G T G 10 0.530218543708742 0.8192074586227 ENSG00000186814:ENST00000333206:exon_32832819_32834345:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000420878:exon_32833423_32834187:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000360932:exon_32833423_32834285:ZSCAN30 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 36 25 61 16.9121324264853 13.2554635927186 3.65666883376674 T:C T C 10 0.530218543708742 0.371464434574911 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 33048554 C/T 1 40 26 66 18.7912582516503 13.7856821364273 5.00557611522303 T:C C T 10 0.530218543708742 0.266925145577366 ENSG00000153391:ENST00000441607:exon_33048293_33048706:INO80C;ENSG00000153391:ENST00000334598:exon_33048297_33048706:INO80C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 33257678 C/T 1 20 17 37 9.39562912582516 9.01371524304861 0.381913882776546 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000141429:ENST00000392829:exon_33257555_33257721:GALNT1;ENSG00000141429:ENST00000269195:exon_33257555_33257721:GALNT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 51820805 G/A 1 13 5 18 6.10715893178635 2.65109271854371 3.45606621324264 A:G G A 10 0.530218543708742 0.15477553907908 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 56202768 C/A 1 11 3 14 5.16759601920384 1.59065563112623 3.57694038807761 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0636441704976374 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 56203120 C/T 1 7 1 8 3.28847019403881 0.530218543708742 2.75825165033006 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0743148409803516 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 23 4 27 10.8049734946989 2.12087417483497 8.68409931986397 C:G G C 10 0.530218543708742 0.000728324008210962 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 25 4 29 11.7445364072814 2.12087417483497 9.62366223244648 A:G A G 10 0.530218543708742 0.000258971812638295 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 10 3 13 4.69781456291258 1.59065563112623 3.10715893178635 T:G G T 10 0.530218543708742 0.0999408957936294 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 7 4 11 3.28847019403881 2.12087417483497 1.16759601920384 T:G T G 10 0.530218543708742 0.557007995713773 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 12 3 15 5.6373774754951 1.59065563112623 4.04672184436887 A:C A C 10 0.530218543708742 0.0400605809351377 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 56204489 C/G 1 2 9 11 0.939562912582516 4.77196689337868 -3.83240398079616 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0305374290985922 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 56204671 A/T 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 A:T A T 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 56204747 G/A 1 14 1 15 6.57694038807761 0.530218543708742 6.04672184436887 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00126641823156487 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 56204932 T/G 0 10 0 10 4.69781456291258 0 4.69781456291258 T T 10 0.530218543708742 0.00227965016978733 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 56204945 C/G 0 12 0 12 5.6373774754951 0 5.6373774754951 C C 10 0.530218543708742 0.000609240060901668 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 56204977 C/T 1 17 1 18 7.98628475695139 0.530218543708742 7.45606621324264 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000212389015557338 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 56204991 C/T 1 17 1 18 7.98628475695139 0.530218543708742 7.45606621324264 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000212389015557338 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 56205262 A/C 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 A:C A C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 57022754 T/C 1 11 18 29 5.16759601920384 9.54393378675736 -4.37633776755352 T:C T C 10 0.530218543708742 0.135661579784991 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57022736_57022890:LMAN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 59780393 T/A 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:T T A 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000197563:ENST00000400334:exon_59780367_59780549:PIGN;ENSG00000197563:ENST00000357637:exon_59780367_59780549:PIGN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 22 16 38 10.3351920384077 8.48349669933987 1.8516953390678 T:C C T 10 0.530218543708742 0.627019735057937 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 61582751 T/G 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 T:G T G 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 61587053 G/A 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 A:G G A 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 61602495 C/T 1 30 23 53 14.0934436887377 12.1950265053011 1.89841718343667 T:C C T 10 0.530218543708742 0.680319572184063 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61602072_61603345:SERPINB10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 46 85 131 21.6099469893979 45.0685762152431 -23.4586292258452 T:C T C 10 0.530218543708742 4.79808366673505e-05 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 67992684 C/T 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 T:C C T 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000170677:ENST00000397942:exon_67991779_67997436:SOCS6;ENSG00000170677:ENST00000302056:exon_67991778_67994308:SOCS6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 71920855 G/A 1 42 80 122 19.7308211642328 42.4174834966994 -22.6866623324665 A:G G A 10 0.530218543708742 3.90654540460148e-05 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71920531_71920900:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71920628_71920900:CYB5A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 71928150 C/T 1 105 51 156 49.3270529105821 27.0411457291458 22.2859071814362 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000383824502424422 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71928150_71928179:CYB5A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 71959075 G/A 1 34 23 57 15.9725695139028 12.1950265053011 3.77754300860171 A:G G A 10 0.530218543708742 0.354064983035272 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71958982_71959251:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71958982_71959170:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71958982_71959179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71958982_71959179:CYB5A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 72775777 G/A 0 13 0 13 6.10715893178635 0 6.10715893178635 G G 10 0.530218543708742 0.000316047186151113 ENSG00000215421:ENST00000299687:exon_72775106_72777628:ZNF407 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 36 19 55 16.9121324264853 10.0741523304661 6.83798009601919 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0783908610829587 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 72997677 C/T 1 2 7 9 0.939562912582516 3.71152980596119 -2.77196689337868 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0932648737406713 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 72998004 T/C 1 13 12 25 6.10715893178635 6.3626225245049 -0.25546359271855 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 72998268 T/C 1 12 10 22 5.6373774754951 5.30218543708742 0.335192038407676 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 72998427 G/A 1 7 13 20 3.28847019403881 6.89284106821365 -3.60437087417484 A:G G A 10 0.530218543708742 0.120271474866196 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 72998886 T/C 1 12 5 17 5.6373774754951 2.65109271854371 2.98628475695139 T:C T C 10 0.530218543708742 0.223474867867513 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 72999359 T/C 1 18 22 40 8.45606621324264 11.6648079615923 -3.20874174834968 T:C T C 10 0.530218543708742 0.343762189169256 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 74091718 G/A 1 12 6 18 5.6373774754951 3.18131126225245 2.45606621324264 A:G G A 10 0.530218543708742 0.345504636527756 ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 77246406 T/G 1 26 34 60 12.2143178635727 18.0274304860972 -5.81311262252452 T:G T G 10 0.530218543708742 0.154664753821473 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 18 77703341 G/A 1 45 42 87 21.1401655331066 22.2691788357672 -1.12901330266055 A:G G A 10 0.530218543708742 0.830509923847557 ENSG00000122490:ENST00000397778:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000409073:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000466449:exon_77703329_77704324:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000351365:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000357575:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000474967:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000494607:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000478144:exon_77703329_77703462:PQLC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 313537 G/A 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_313492_313643:MIER2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 617614 G/A 1 43 37 80 20.2006026205241 19.6180861172235 0.582516503300642 A:G G A 10 0.530218543708742 0.911350065532593 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_617570_617655:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_617570_617655:POLRMT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 18 7 25 8.45606621324264 3.71152980596119 4.74453640728145 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0706504826508123 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 621063 A/G 1 10 10 20 4.69781456291258 5.30218543708742 -0.60437087417484 A:G A G 10 0.530218543708742 0.825709894540955 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 621070 G/A 1 17 12 29 7.98628475695139 6.3626225245049 1.62366223244648 A:G G A 10 0.530218543708742 0.581764914655282 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 622336 T/G 1 27 18 45 12.684099319864 9.54393378675736 3.14016553310661 T:G T G 10 0.530218543708742 0.373499961576001 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_622149_622373:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_622149_622373:POLRMT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 629846 G/A 1 38 26 64 17.8516953390678 13.7856821364273 4.06601320264051 A:G G A 10 0.530218543708742 0.319543629364691 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_629540_630168:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_629540_630168:POLRMT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 651832 C/T 1 64 77 141 30.0660132026405 40.8268278655731 -10.7608146629326 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0763011698933557 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_651611_651855:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_651611_651855:RNF126 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 804327 C/T 1 271 224 495 127.310774654931 118.768953790758 8.54182086417272 T:C C T 10 0.530218543708742 0.44443880984396 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 804396 C/T 1 268 289 557 125.901430286057 153.233159131826 -27.3317288457693 A:T:C C T 10 0.530218543708742 0.0218241826569825 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 804612 C/T 1 209 200 409 98.1843243648729 106.043708741748 -7.85938437687548 T:C C T 10 0.530218543708742 0.457514546853548 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 804642 C/T 1 242 247 489 113.687112422484 130.963980296059 -17.2768678735748 A:T:C C T 10 0.530218543708742 0.123458702389742 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 808586 C/G 1 214 174 388 100.533231646329 92.2580266053211 8.27520504100811 C:G C G 10 0.530218543708742 0.415961136357971 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 808742 G/T 1 293 290 583 137.645966693339 153.763377675535 -16.1174109821966 T:C:G G T 10 0.530218543708742 0.184424783656832 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 971986 C/T 1 88 68 156 41.3407681536307 36.0548609721945 5.28590718143625 T:C C T 10 0.530218543708742 0.422914866184466 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_971878_972781:ARID3A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 990281 G/A 1 45 18 63 21.1401655331066 9.54393378675736 11.5962317463493 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00348514432884005 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_990223_990364:WDR18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 990819 G/A 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 A:G G A 10 0.530218543708742 0.76511742461274 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 1036444 G/A 1 175 137 312 82.2117548509702 72.6399404880977 9.5718143628725 A:G G A 10 0.530218543708742 0.281792466029595 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 1271274 C/T 1 6 9 15 2.81868873774755 4.77196689337868 -1.95327815563113 T:C C T 10 0.530218543708742 0.438985732589774 ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271139_1271364:CIRBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 1271529 C/T 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 T:C C T 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 1272040 T/C 1 501 501 1002 235.36050960192 265.63949039808 -30.2789807961595 A:T:C T C 10 0.530218543708742 0.0575431124732145 ENSG00000099622:ENST00000320936:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000413636:exon_1271980_1272442:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000444172:exon_1271980_1272442:CIRBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 60 49 109 28.1868873774755 25.9807086417284 2.20617873574712 T:C C T 10 0.530218543708742 0.701829846549835 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 1611856 G/A 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 A:G G A 10 0.530218543708742 0.797017339461022 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 1619333 G/A 1 107 49 156 50.2666158231646 25.9807086417284 24.2859071814362 A:G G A 10 0.530218543708742 0.000104780898796659 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 1622116 G/A 1 170 171 341 79.8628475695139 90.6673709741949 -10.804523404681 A:G G A 10 0.530218543708742 0.254632135951828 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1622053_1622222:TCF3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 1819125 T/C 1 23 14 37 10.8049734946989 7.42305961192239 3.38191388277655 T:C T C 10 0.530218543708742 0.323605368798571 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 1828023 G/A 1 34 30 64 15.9725695139028 15.9065563112623 0.0660132026405122 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 1912986 C/T 1 23 13 36 10.8049734946989 6.89284106821365 3.91213242648529 T:C C T 10 0.530218543708742 0.242386499243203 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 165 164 329 77.5139402880576 86.9558411682337 -9.44190088017612 A:G A G 10 0.530218543708742 0.320134645376180 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 128 112 240 60.132026405281 59.3844768953791 0.747549509901923 A:G G A 10 0.530218543708742 0.948490340496804 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 44 46 90 20.6703840768154 24.3900530106021 -3.71966893378678 A:G A G 10 0.530218543708742 0.460613919102025 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2041017 C/T 1 15 40 55 7.04672184436887 21.2087417483497 -14.1620199039808 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000125742058207123 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2041032 T/C 1 15 34 49 7.04672184436887 18.0274304860972 -10.9807086417284 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00229774395015624 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2050823 G/T 1 314 301 615 147.511377275455 159.595781656331 -12.0844043808764 T:G G T 10 0.530218543708742 0.332521806076496 ENSG00000099875:ENST00000309340:exon_2050800_2050946:MKNK2;ENSG00000099875:ENST00000250896:exon_2050800_2050946:MKNK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2109834 G/A 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:G G A 10 0.530218543708742 0.487231208629639 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 49 42 91 23.0192913582716 22.2691788357672 0.750112522504477 A:G G A 10 0.530218543708742 0.916578128356446 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 24 18 42 11.2747549509902 9.54393378675736 1.73082116423284 A:G A G 10 0.530218543708742 0.644735540163763 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2138654 T/G 1 24 18 42 11.2747549509902 9.54393378675736 1.73082116423284 T:G T G 10 0.530218543708742 0.644735540163763 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2138618_2138713:AP3D1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2226676 G/A 1 78 87 165 36.6429535907181 46.1290133026606 -9.48605971194243 A:G G A 10 0.530218543708742 0.160150893616768 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2226772 G/C 1 91 106 197 42.7501125225045 56.2031656331267 -13.4530531106222 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0632101335060843 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2427266 G/A 1 187 172 359 87.8491323264653 91.1975895179036 -3.34845719143837 A:G G A 10 0.530218543708742 0.751125301422347 ENSG00000099800:ENST00000215570:exon_2427254_2427322:TIMM13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2732741 G/A 1 50 50 100 23.4890728145629 26.5109271854371 -3.0218543708742 A:G G A 10 0.530218543708742 0.549613142195421 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 54 43 97 25.3681986397279 22.7993973794759 2.56880126025203 T:C T C 10 0.530218543708742 0.612799614019839 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 26 32 58 12.2143178635727 16.9669933986797 -4.75267553510704 A:C A C 10 0.530218543708742 0.237038182104505 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 36 42 78 16.9121324264853 22.2691788357672 -5.35704640928187 T:G G T 10 0.530218543708742 0.256692679145205 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2834808 T/C 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000172006:ENST00000317243:exon_2833679_2836733:ZNF554 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2994903 T/C 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 T:C T C 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 2994921 G/A 1 7 4 11 3.28847019403881 2.12087417483497 1.16759601920384 A:G G A 10 0.530218543708742 0.557007995713773 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 12 5 17 5.6373774754951 2.65109271854371 2.98628475695139 A:G G A 10 0.530218543708742 0.223474867867513 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 3186085 G/T 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 T:G G T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3185875_3186212:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3185875_3186212:NCLN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 42 47 89 19.7308211642328 24.9202715543109 -5.18945039007804 T:C T C 10 0.530218543708742 0.289126233553662 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 87 81 168 40.8709866973394 42.9477020404081 -2.07671534306866 A:G A G 10 0.530218543708742 0.757729474276064 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 17 5 22 7.98628475695139 2.65109271854371 5.33519203840768 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0305968416347052 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 4362691 G/C 1 23 30 53 10.8049734946989 15.9065563112623 -5.10158281656333 C:G G C 10 0.530218543708742 0.170603297427766 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4362609_4362733:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4362609_4362733:SH3GL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 4409756 A/G 1 27 26 53 12.684099319864 13.7856821364273 -1.10158281656333 A:G A G 10 0.530218543708742 0.78452676553072 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 4454083 C/T 1 62 46 108 29.126450290058 24.3900530106021 4.73639727945586 T:C C T 10 0.530218543708742 0.386418524541364 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 4457650 C/T 1 30 29 59 14.0934436887377 15.3763377675535 -1.28289407881578 T:C C T 10 0.530218543708742 0.794709103237718 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4457612_4457694:UBXN6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 4538599 G/A 1 25 35 60 11.7445364072814 18.557649029806 -6.81311262252452 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0922273245745394 ENSG00000171236:ENST00000306390:exon_4537227_4538963:LRG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 4816719 G/A 1 98 85 183 46.0385827165433 45.0685762152431 0.970006501300212 A:G G A 10 0.530218543708742 0.940993471006507 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 73 52 125 34.2940463092618 27.5713642728546 6.72268203640725 T:C T C 10 0.530218543708742 0.244604967360086 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 4910889 G/T 1 7 7 14 3.28847019403881 3.71152980596119 -0.423059611922388 T:G G T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4910888_4911050:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4910566_4911050:UHRF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 4910924 C/T 1 6 8 14 2.81868873774755 4.24174834966994 -1.42305961192239 T:C C T 10 0.530218543708742 0.594188084236152 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4910888_4911050:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4910566_4911050:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4910898_4911050:UHRF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 4929413 T/C 1 10 10 20 4.69781456291258 5.30218543708742 -0.60437087417484 T:C T C 10 0.530218543708742 0.825709894540955 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 4929473 A/G 1 20 20 40 9.39562912582516 10.6043708741748 -1.20874174834968 A:G A G 10 0.530218543708742 0.752661496369806 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 5041178 T/C 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 T:C T C 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000127663:ENST00000159111:exon_5041148_5041262:KDM4B;ENSG00000127663:ENST00000381759:exon_5041148_5041262:KDM4B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 18 12 30 8.45606621324264 6.3626225245049 2.09344368873774 A:G G A 10 0.530218543708742 0.470477748346769 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 5789565 T/C 1 31 21 52 14.563225145029 11.1345894178836 3.42863572714542 T:C T C 10 0.530218543708742 0.404921775339174 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 27 32 59 12.684099319864 16.9669933986797 -4.28289407881578 T:G G T 10 0.530218543708742 0.297336160824213 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 6535080 T/C 1 113 135 248 53.0853045609122 71.5795034006802 -18.494198839768 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0218201370470864 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 635 535 1170 298.311224744949 283.666920884177 14.6443038607719 A:G G A 10 0.530218543708742 0.395797486620997 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 6669934 G/A 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 A:G G A 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000125735:ENST00000245912:exon_6669862_6670169:TNFSF14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 6731057 T/C 1 66 37 103 31.005576115223 19.6180861172235 11.3874899979996 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0294077593201123 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7083629 A/G 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 A:G A G 10 0.530218543708742 0.296231759838006 ENSG00000130544:ENST00000439035:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000414706:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000252840:exon_7082889_7087979:ZNF557 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7166376 C/T 1 15 23 38 7.04672184436887 12.1950265053011 -5.1483046609322 T:C C T 10 0.530218543708742 0.105093151328245 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7524846 C/T 1 17 7 24 7.98628475695139 3.71152980596119 4.27475495099019 T:C C T 10 0.530218543708742 0.10134572559357 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7524789_7524880:ARHGEF18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7524855 C/T 1 15 6 21 7.04672184436887 3.18131126225245 3.86541058211642 T:C C T 10 0.530218543708742 0.124647738959612 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7524789_7524880:ARHGEF18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7527216 C/T 1 27 15 42 12.684099319864 7.95327815563113 4.73082116423284 T:C C T 10 0.530218543708742 0.164947238581477 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7527038_7527220:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7527038_7527220:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7527038_7527220:ARHGEF18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7528734 A/G 1 14 13 27 6.57694038807761 6.89284106821365 -0.315900680136034 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7528704_7528841:ARHGEF18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7533767 T/G 1 23 12 35 10.8049734946989 6.3626225245049 4.44235097019403 T:G T G 10 0.530218543708742 0.174770231743044 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7533850 A/G 1 21 14 35 9.86541058211642 7.42305961192239 2.44235097019403 A:G A G 10 0.530218543708742 0.498927835684863 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7584223 A/G 1 13 23 36 6.10715893178635 12.1950265053011 -6.08786757351471 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0457431861260959 ENSG00000198816:ENST00000361576:exon_7584091_7585912:ZNF358;ENSG00000198816:ENST00000394341:exon_7584088_7585911:ZNF358 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7594052 C/T 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 T:C C T 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000090674:ENST00000264079:exon_7593987_7594088:MCOLN1;ENSG00000090674:ENST00000394321:exon_7593987_7594088:MCOLN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7675369 C/T 1 11 9 20 5.16759601920384 4.77196689337868 0.395629125825161 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000076826:ENST00000160298:exon_7675362_7675501:KIAA1543;ENSG00000076826:ENST00000446248:exon_7675362_7675501:KIAA1543 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7694393 G/A 1 15 6 21 7.04672184436887 3.18131126225245 3.86541058211642 A:G G A 10 0.530218543708742 0.124647738959612 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7694363_7694439:XAB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 109 75 184 51.2061787357471 39.7663907781557 11.4397879575915 T:C T C 10 0.530218543708742 0.103953178866348 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 80 62 142 37.5825165033006 32.873549709942 4.70896679335863 A:G A G 10 0.530218543708742 0.450010318204965 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7712425 G/C 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 C:G G C 10 0.530218543708742 0.758367997662058 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7712585 T/G 1 9 6 15 4.22803310662132 3.18131126225245 1.04672184436887 T:G T G 10 0.530218543708742 0.617171705992842 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7761812 A/G 1 10 5 15 4.69781456291258 2.65109271854371 2.04672184436887 A:G A G 10 0.530218543708742 0.315050043511805 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 7913974 T/C 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 T:C T C 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000142459:ENST00000270530:exon_7913807_7914031:EVI5L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 8028544 A/G 1 144 151 295 67.6485297059412 80.06300010002 -12.4144703940789 A:G A G 10 0.530218543708742 0.161445674544084 ENSG00000066044:ENST00000351593:exon_8023458_8028691:ELAVL1;ENSG00000066044:ENST00000407627:exon_8023458_8028691:ELAVL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 8376431 G/A 1 75 51 126 35.2336092218443 27.0411457291458 8.1924634926985 A:G G A 10 0.530218543708742 0.153664729721699 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8376234_8376479:NDUFA7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 9721401 A/T 1 36 18 54 16.9121324264853 9.54393378675736 7.36819863972793 A:T A T 10 0.530218543708742 0.0554286261760784 ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 9922223 G/A 1 26 27 53 12.2143178635727 14.315900680136 -2.10158281656333 A:G G A 10 0.530218543708742 0.584374617619714 ENSG00000127452:ENST00000247977:exon_9920947_9922393:FBXL12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 9949152 G/A 1 130 95 225 61.0715893178635 50.3707616523305 10.7008276655331 A:G G A 10 0.530218543708742 0.160952719954286 ENSG00000127445:ENST00000247970:exon_9949112_9949324:PIN1;ENSG00000127445:ENST00000424497:exon_9949112_9949324:PIN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10224548 G/A 1 74 76 150 34.7638277655531 40.2966093218644 -5.5327815563113 A:G G A 10 0.530218543708742 0.369546075201817 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10291181 T/C 1 21 18 39 9.86541058211642 9.54393378675736 0.321476795359063 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10291026_10291245:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10291026_10291245:DNMT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10444603 C/G 1 332 376 708 155.967443488698 199.362172434487 -43.3947289457893 C:G C G 10 0.530218543708742 0.00118967681291056 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10444454_10444735:ICAM3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10445165 C/A 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 A:C C A 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10449392 A/G 1 297 276 573 139.525092518504 146.340318063613 -6.81522554510914 A:G A G 10 0.530218543708742 0.586458375077956 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 38 24 62 17.8516953390678 12.7252450490098 5.126450290058 A:G A G 10 0.530218543708742 0.205079864596166 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 43 36 79 20.2006026205241 19.0878675735147 1.11273504700938 A:C C A 10 0.530218543708742 0.822587882580093 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10488926 C/T 1 82 57 139 38.5220794158832 30.2224569913983 8.29962242448486 T:C C T 10 0.530218543708742 0.174017843586534 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10488890_10489184:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10488890_10489102:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10488890_10489102:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000531836:exon_10488890_10489102:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000530829:exon_10488890_10489102:TYK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10568668 C/T 1 13 11 24 6.10715893178635 5.83240398079616 0.274754950990192 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10568555_10568778:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10568555_10568778:PDE4A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10599965 G/A 1 37 29 66 17.3819138827765 15.3763377675535 2.00557611522303 A:G G A 10 0.530218543708742 0.711726685061048 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10599868_10600044:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10599868_10600044:KEAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 26 22 48 12.2143178635727 11.6648079615923 0.549509901980384 C:G G C 10 0.530218543708742 0.886303655646963 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10664632 A/G 1 45 60 105 21.1401655331066 31.8131126225245 -10.6729470894179 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0399843080597633 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10668383 T/C 1 12 7 19 5.6373774754951 3.71152980596119 1.9258476695339 T:C T C 10 0.530218543708742 0.492071463010612 ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10668452 A/G 1 41 46 87 19.2610397079416 24.3900530106021 -5.12901330266055 A:G A G 10 0.530218543708742 0.284090942604995 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668445_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668445_10668571:KRI1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 35 25 60 16.442350970194 13.2554635927186 3.18688737747548 C:G C G 10 0.530218543708742 0.439731269478125 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 13 12 25 6.10715893178635 6.3626225245049 -0.25546359271855 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 67 65 132 31.4753575715143 34.4642053410682 -2.98884776955394 T:C T C 10 0.530218543708742 0.602295438139827 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 11034846 C/T 1 31 26 57 14.563225145029 13.7856821364273 0.777543008601706 T:C C T 10 0.530218543708742 0.89481917076846 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 11332570 T/A 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 A:T T A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11332527_11332696:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11332527_11332696:DOCK6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 13 6 19 6.10715893178635 3.18131126225245 2.9258476695339 C:G G C 10 0.530218543708742 0.250330538073418 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 11558275 G/A 1 180 182 362 84.5606621324264 96.499774954991 -11.9391128225646 A:G G A 10 0.530218543708742 0.225823522548179 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11558254_11558433:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11558254_11558412:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11558254_11558433:PRKCSH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 11560188 G/T 1 475 460 935 223.146191738348 243.900530106021 -20.7543383676738 A:T:G G T 10 0.530218543708742 0.179194265475378 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11560081_11560243:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11560081_11560243:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11560081_11560243:PRKCSH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 11891003 G/A 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 A:G G A 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000197044:ENST00000454339:exon_11890834_11894886:ZNF441;ENSG00000197044:ENST00000409902:exon_11890834_11893301:ZNF441;ENSG00000197044:ENST00000357901:exon_11890834_11894893:ZNF441 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 12542653 T/G 0 0 8 8 0 4.24174834966994 -4.24174834966994 G T G 10 0.530218543708742 0.00237228552436099 ENSG00000180855:ENST00000301547:exon_12540521_12542794:ZNF443;ENSG00000180855:ENST00000411622:exon_12541336_12542794:ZNF443;ENSG00000180855:ENST00000436821:exon_12542383_12542794:ZNF443 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 12542654 T/A 1 1 8 9 0.469781456291258 4.24174834966994 -3.77196689337868 A:T T A 10 0.530218543708742 0.0157469533588810 ENSG00000180855:ENST00000301547:exon_12540521_12542794:ZNF443;ENSG00000180855:ENST00000411622:exon_12541336_12542794:ZNF443;ENSG00000180855:ENST00000436821:exon_12542383_12542794:ZNF443 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 12691335 G/A 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 A:G G A 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000188033:ENST00000311437:exon_12688775_12692538:ZNF490 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 12774208 G/C 1 30 34 64 14.0934436887377 18.0274304860972 -3.93398679735949 C:G G C 10 0.530218543708742 0.380877330106916 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12774131_12774276:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12774131_12774276:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12774131_12774276:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12774131_12774232:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000486847:exon_12774122_12774276:MAN2B1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 12780179 G/A 1 89 84 173 41.810549609922 44.5383576715343 -2.72780806161236 A:G G A 10 0.530218543708742 0.703631470781761 ENSG00000105583:ENST00000222190:exon_12780168_12780465:C19orf56 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 53 83 136 24.8984171834367 44.0081391278256 -19.1097219443889 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00106220337145643 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 13008607 G/T 1 18 15 33 8.45606621324264 7.95327815563113 0.502788057611514 T:G G T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008517_13008677:GCDH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 13010520 A/G 1 34 52 86 15.9725695139028 27.5713642728546 -11.5987947589518 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0129048309634973 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13010514_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13010282_13010782:GCDH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 13039284 A/G 1 7 1 8 3.28847019403881 0.530218543708742 2.75825165033006 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0743148409803516 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 13054781 G/T 1 798 786 1584 374.885602120424 416.751775355071 -41.8661732346474 A:T:C:G G T 10 0.530218543708742 0.0366548367371342 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 13211821 C/T 1 24 20 44 11.2747549509902 10.6043708741748 0.670384076815353 T:C C T 10 0.530218543708742 0.88086557780696 ENSG00000104903:ENST00000264824:exon_13211651_13212009:LYL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 13249244 A/G 1 122 86 208 57.3133376675335 45.5987947589518 11.7145429085817 A:G A G 10 0.530218543708742 0.110178432622969 ENSG00000160877:ENST00000292431:exon_13248961_13251955:NACC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 13264549 C/T 1 256 199 455 120.264052810562 105.51349019804 14.7505626125224 T:C C T 10 0.530218543708742 0.173248701523495 ENSG00000160888:ENST00000292433:exon_13263758_13265716:IER2;ENSG00000160888:ENST00000393152:exon_13263893_13265716:IER2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 32 27 59 15.0330066013203 14.315900680136 0.717105921184222 A:G A G 10 0.530218543708742 0.896712526856488 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 14231243 C/T 1 164 148 312 77.0441588317663 78.4723444688938 -1.4281856371275 T:C C T 10 0.530218543708742 0.909710113445004 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 14231256 T/C 1 125 147 272 58.7226820364072 77.9421259251851 -19.2194438887778 A:T:C T C 10 0.530218543708742 0.0208980307594921 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 14231325 C/G 1 134 95 229 62.9507151430286 50.3707616523305 12.5799534906981 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0982215306062518 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 14231330 A/G 1 131 94 225 61.5413707741548 49.8405431086217 11.7008276655331 A:T:G A G 10 0.530218543708742 0.124625754898910 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 14492265 T/C 1 7 15 22 3.28847019403881 7.95327815563113 -4.66480796159232 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0546658878313038 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 14492272 T/C 1 10 24 34 4.69781456291258 12.7252450490098 -8.02743048609723 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00890536741796934 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 14581063 A/G 1 124 106 230 58.252900580116 56.2031656331267 2.04973494698934 A:G A G 10 0.530218543708742 0.792074128328804 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580975_14581117:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580975_14581117:PKN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 14682804 G/C 1 51 42 93 23.9588542708542 22.2691788357672 1.68967543508699 C:G G C 10 0.530218543708742 0.756079436008445 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14682701_14682886:NDUFB7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 14884751 G/A 1 39 2 41 18.3214767953591 1.06043708741748 17.2610397079416 A:G G A 10 0.530218543708742 4.01370935917668e-09 ENSG00000127507:ENST00000353005:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000353876:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392967:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000346057:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392965:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000315576:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000360222:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392964:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392962:exon_14884750_14884866:EMR2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 14884841 G/A 0 19 0 19 8.9258476695339 0 8.9258476695339 G G 10 0.530218543708742 6.39972768049084e-06 ENSG00000127507:ENST00000353005:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000353876:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392967:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000346057:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392965:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000315576:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000360222:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392964:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392962:exon_14884750_14884866:EMR2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 25 27 52 11.7445364072814 14.315900680136 -2.57136427285458 A:T:C C A 10 0.530218543708742 0.490346034709667 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 16296244 G/A 1 44 34 78 20.6703840768154 18.0274304860972 2.64295359071813 A:G G A 10 0.530218543708742 0.57232696219004 ENSG00000105058:ENST00000263384:exon_16296234_16296327:FAM32A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 17000632 G/A 1 2 6 8 0.939562912582516 3.18131126225245 -2.24174834966994 A:G G A 10 0.530218543708742 0.158929006468168 ENSG00000127533:ENST00000248076:exon_17000384_17002830:F2RL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 14 10 24 6.57694038807761 5.30218543708742 1.27475495099019 T:C C T 10 0.530218543708742 0.685036120735498 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 17173563 G/C 1 8 12 20 3.75825165033006 6.3626225245049 -2.60437087417484 C:G G C 10 0.530218543708742 0.269017553119515 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17173508_17173589:HAUS8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 17173588 G/A 1 10 5 15 4.69781456291258 2.65109271854371 2.04672184436887 A:G G A 10 0.530218543708742 0.315050043511805 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17173508_17173589:HAUS8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 17660300 G/A 1 13 2 15 6.10715893178635 1.06043708741748 5.04672184436887 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00893461932137095 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17660253_17660494:FAM129C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 17664418 G/A 1 10 16 26 4.69781456291258 8.48349669933987 -3.78568213642729 A:G G A 10 0.530218543708742 0.169180403169051 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17664122_17664647:FAM129C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 66 64 130 31.005576115223 33.9339867973595 -2.92841068213646 T:C T C 10 0.530218543708742 0.660593890576186 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 19105105 G/C 1 22 21 43 10.3351920384077 11.1345894178836 -0.799397379475906 C:G G C 10 0.530218543708742 0.878965825852265 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 19243175 C/T 1 21 19 40 9.86541058211642 10.0741523304661 -0.208741748349681 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19243161_19243317:TMEM161A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 19391045 G/A 1 29 34 63 13.6236622324465 18.0274304860972 -4.40376825365074 A:G G A 10 0.530218543708742 0.312692955753394 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19390994_19391100:SUGP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 19613287 G/A 1 46 46 92 21.6099469893979 24.3900530106021 -2.78010602120426 A:G G A 10 0.530218543708742 0.60203361709891 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19613140_19613335:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19613140_19613335:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19613140_19613335:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19613140_19613335:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19613140_19613335:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000418032:exon_19613140_19613335:GATAD2A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 19737686 C/T 1 8 11 19 3.75825165033006 5.83240398079616 -2.0741523304661 T:C C T 10 0.530218543708742 0.366451934145480 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19737352_19738093:LPAR2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 19738097 G/A 1 2 7 9 0.939562912582516 3.71152980596119 -2.77196689337868 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0932648737406713 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 20003109 A/G 1 15 5 20 7.04672184436887 2.65109271854371 4.39562912582516 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0706985595466848 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000355095:exon_20003002_20003556:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000427401:exon_20003035_20003166:ZNF90 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 20003576 C/G 1 7 7 14 3.28847019403881 3.71152980596119 -0.423059611922388 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 20044041 G/T 1 9 6 15 4.22803310662132 3.18131126225245 1.04672184436887 T:G G T 10 0.530218543708742 0.617171705992842 ENSG00000213988:ENST00000427325:exon_20043991_20045259:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000343769:exon_20043991_20045766:ZNF90 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 21131728 A/G 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 A:G A G 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 24310413 G/C 1 16 18 34 7.51650330066013 9.54393378675736 -2.02743048609723 C:G G C 10 0.530218543708742 0.497520057256665 ENSG00000213096:ENST00000357002:exon_24309056_24312643:ZNF254 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 32973077 C/T 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 T:C C T 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000178904:ENST00000342179:exon_32972985_32975236:DPY19L3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 33096786 G/A 1 14 6 20 6.57694038807761 3.18131126225245 3.39562912582516 A:G G A 10 0.530218543708742 0.178098088864002 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 21 21 42 9.86541058211642 11.1345894178836 -1.26917883576716 T:C C T 10 0.530218543708742 0.75806865433379 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 9 7 16 4.22803310662132 3.71152980596119 0.516503300660129 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 33183352 G/C 1 28 14 42 13.1538807761552 7.42305961192239 5.73082116423284 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0889577267783979 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 33444707 C/T 1 3 7 10 1.40934436887377 3.71152980596119 -2.30218543708742 T:C C T 10 0.530218543708742 0.206122472271196 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000427840:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000415324:exon_33444521_33444707:CCDC123 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 6 12 18 2.81868873774755 6.3626225245049 -3.54393378675736 A:G G A 10 0.530218543708742 0.103457190750381 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 33467515 T/C 1 11 13 24 5.16759601920384 6.89284106821365 -1.72524504900981 T:C T C 10 0.530218543708742 0.542520732761998 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 34706531 A/G 1 79 66 145 37.1127350470094 34.994423884777 2.11831116223241 A:G A G 10 0.530218543708742 0.740004076415077 ENSG00000105216:ENST00000324222:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000356258:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000433627:exon_34706501_34706566:LSM14A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 34842488 T/C 1 2 9 11 0.939562912582516 4.77196689337868 -3.83240398079616 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0305374290985922 ENSG00000166398:ENST00000299505:exon_34842419_34842497:KIAA0355 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 35435589 C/T 1 2 6 8 0.939562912582516 3.18131126225245 -2.24174834966994 T:C C T 10 0.530218543708742 0.158929006468168 ENSG00000168661:ENST00000303586:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000439785:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000426813:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000342559:exon_35434996_35435724:ZNF30 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 35501051 T/C 1 51 54 105 23.9588542708542 28.6318013602721 -4.67294708941791 T:C T C 10 0.530218543708742 0.379829491672644 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35500996_35501099:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35500996_35501099:GRAMD1A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 35506729 G/A 1 59 29 88 27.7171059211842 15.3763377675535 12.3407681536307 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00999098438476664 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35506728_35506871:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35506728_35506871:GRAMD1A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 35741456 T/C 1 28 33 61 13.1538807761552 17.4972119423885 -4.34333116623326 T:C T C 10 0.530218543708742 0.30507523164127 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 35757427 G/A 1 48 39 87 22.5495099019804 20.6785232046409 1.87098669733945 A:G G A 10 0.530218543708742 0.747634049379356 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35757262_35757435:LSR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 35770056 G/A 1 31 12 43 14.563225145029 6.3626225245049 8.20060262052409 A:C:G G A 10 0.530218543708742 0.0138692084713453 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 35837428 G/A 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:G G A 10 0.530218543708742 0.487231208629639 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 35843086 G/A 1 14 2 16 6.57694038807761 1.06043708741748 5.51650330066013 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00523540194443503 ENSG00000126266:ENST00000246553:exon_35842455_35843357:FFAR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 50 65 115 23.4890728145629 34.4642053410682 -10.9751325265053 A:T:G A G 10 0.530218543708742 0.0493067056238605 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 36205695 G/T 1 115 79 194 54.0248674734947 41.8872649529906 12.1376025205041 A:T:G G T 10 0.530218543708742 0.0844576992646022 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36205529_36206409:ZBTB32 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 36224705 A/G 1 15 21 36 7.04672184436887 11.1345894178836 -4.08786757351471 A:G A G 10 0.530218543708742 0.184727154715863 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 36230174 T/C 1 129 117 246 60.6018078615723 62.0355696139228 -1.43376175235053 T:C T C 10 0.530218543708742 0.898382174929743 ENSG00000126246:ENST00000246532:exon_36230153_36230527:TMEM149;ENSG00000126246:ENST00000344990:exon_36230153_36230527:TMEM149 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 36259494 C/A 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 A:C C A 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36259306_36260077:C19orf55 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 36273308 G/A 1 2 9 11 0.939562912582516 4.77196689337868 -3.83240398079616 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0305374290985922 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36273275_36273419:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36273275_36273419:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36273275_36273419:ARHGAP33 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 36273534 G/A 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G G A 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36273499_36273581:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36273499_36273581:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36273499_36273581:ARHGAP33 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 36275074 G/A 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 A:G G A 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36275074_36275219:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36275074_36275219:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36275074_36275219:ARHGAP33 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 36278470 C/G 1 9 3 12 4.22803310662132 1.59065563112623 2.6373774754951 C:G C G 10 0.530218543708742 0.154808266842262 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36278070_36279724:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36278070_36279724:ARHGAP33 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 12 14 26 5.6373774754951 7.42305961192239 -1.78568213642729 A:T:C A C 10 0.530218543708742 0.557496480025126 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 37005298 A/G 1 7 18 25 3.28847019403881 9.54393378675736 -6.25546359271855 A:G A G 10 0.530218543708742 0.015088681467336 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 37039069 A/C 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 A:C A C 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 37117302 A/G 1 8 9 17 3.75825165033006 4.77196689337868 -1.01371524304861 A:G A G 10 0.530218543708742 0.636531694867648 ENSG00000161298:ENST00000423582:exon_37117032_37118894:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000292928:exon_37117032_37119499:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000441040:exon_37117035_37118452:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000439428:exon_37117032_37119469:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000435416:exon_37117035_37119172:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000455093:exon_37117032_37119498:ZNF382 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 37129806 G/A 1 3 11 14 1.40934436887377 5.83240398079616 -4.42305961192239 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0285048765274962 ENSG00000197808:ENST00000360357:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396893:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396896:exon_37129686_37130439:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396892:exon_37129591_37129890:ZNF461 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 37209866 T/C 1 11 6 17 5.16759601920384 3.18131126225245 1.98628475695139 T:C T C 10 0.530218543708742 0.46729790202122 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 37210805 C/T 1 9 12 21 4.22803310662132 6.3626225245049 -2.13458941788358 T:C C T 10 0.530218543708742 0.387625542901861 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 37441462 T/C 1 2 6 8 0.939562912582516 3.18131126225245 -2.24174834966994 T:C T C 10 0.530218543708742 0.158929006468168 ENSG00000198453:ENST00000333987:exon_37440414_37441990:ZNF568;ENSG00000198453:ENST00000415168:exon_37440414_37443645:ZNF568 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 37441980 A/G 1 2 7 9 0.939562912582516 3.71152980596119 -2.77196689337868 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0932648737406713 ENSG00000198453:ENST00000333987:exon_37440414_37441990:ZNF568;ENSG00000198453:ENST00000415168:exon_37440414_37443645:ZNF568 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 37677748 T/A 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 A:T T A 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000245680:ENST00000531805:exon_37675722_37678146:ZNF585B;ENSG00000245680:ENST00000532828:exon_37675722_37678146:ZNF585B;ENSG00000245680:ENST00000527838:exon_37675724_37677830:ZNF585B;ENSG00000245680:ENST00000501522:exon_37676129_37678146:ZNF585B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 41 38 79 19.2610397079416 20.1483046609322 -0.88726495299062 T:G G T 10 0.530218543708742 0.910365302188702 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 37879589 A/G 1 6 8 14 2.81868873774755 4.24174834966994 -1.42305961192239 A:G A G 10 0.530218543708742 0.594188084236152 ENSG00000189164:ENST00000317566:exon_37879208_37883966:ZNF527;ENSG00000189164:ENST00000356178:exon_37879208_37883966:ZNF527;ENSG00000189164:ENST00000436120:exon_37879208_37883968:ZNF527 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 38055553 T/C 1 2 10 12 0.939562912582516 5.30218543708742 -4.3626225245049 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0171375315357398 ENSG00000180479:ENST00000328550:exon_38054726_38057193:ZNF571;ENSG00000180479:ENST00000451802:exon_38055156_38057193:ZNF571 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 38055612 A/T 1 12 4 16 5.6373774754951 2.12087417483497 3.51650330066013 A:T A T 10 0.530218543708742 0.085348639876271 ENSG00000180479:ENST00000328550:exon_38054726_38057193:ZNF571;ENSG00000180479:ENST00000451802:exon_38055156_38057193:ZNF571 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 38189616 T/C 1 2 7 9 0.939562912582516 3.71152980596119 -2.77196689337868 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0932648737406713 ENSG00000198182:ENST00000355202:exon_38187276_38190796:ZNF607 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 38652993 C/T 1 18 15 33 8.45606621324264 7.95327815563113 0.502788057611514 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38652893_38653011:SIPA1L3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 38673298 C/G 1 5 10 15 2.34890728145629 5.30218543708742 -2.95327815563113 C:G C G 10 0.530218543708742 0.194384351758500 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38673159_38673380:SIPA1L3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 130 126 256 61.0715893178635 66.8075365073015 -5.73594718943795 A:T:C T C 10 0.530218543708742 0.491240693376293 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 39307103 C/T 1 139 185 324 65.2996224244849 98.0904305861173 -32.7908081616324 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000286776186611986 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39307093_39307163:ECH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 39879613 C/T 1 97 71 168 45.568801260252 37.6455166033207 7.92328465693134 T:C C T 10 0.530218543708742 0.246261447906126 ENSG00000006712:ENST00000221265:exon_39879587_39879655:PAF1;ENSG00000006712:ENST00000416728:exon_39879587_39879655:PAF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 31 34 65 14.563225145029 18.0274304860972 -3.46420534106823 A:G G A 10 0.530218543708742 0.456188255130796 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 42 41 83 19.7308211642328 21.7389602920584 -2.00813912782559 A:G G A 10 0.530218543708742 0.661934956406193 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 39 51 90 18.3214767953591 27.0411457291458 -8.71966893378678 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0725304942643784 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 39924129 T/C 1 22 28 50 10.3351920384077 14.8461192238448 -4.5109271854371 T:C T C 10 0.530218543708742 0.205879660974989 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 39926509 A/C 1 2184 2067 4251 1026.00270054011 1095.96172984597 -69.9590293058623 A:T:C A C 10 0.530218543708742 0.0326824187338693 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 39926521 G/A 1 2126 2013 4139 998.755376075214 1067.3299284857 -68.5745524104831 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.0328977747045476 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 39955533 G/A 1 70 62 132 32.8847019403881 32.873549709942 0.0111522304460578 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39955438_39955689:SUPT5H HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 40023308 A/G 1 8 12 20 3.75825165033006 6.3626225245049 -2.60437087417484 A:G A G 10 0.530218543708742 0.269017553119515 ENSG00000176401:ENST00000326282:exon_40021630_40023494:EID2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 40480501 C/T 1 108 91 199 50.7363972794559 48.2498874774955 2.48650980196035 T:C C T 10 0.530218543708742 0.776442547052393 ENSG00000013275:ENST00000157812:exon_40480431_40480540:PSMC4;ENSG00000013275:ENST00000455878:exon_40480431_40480540:PSMC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 40486136 G/A 1 11 8 19 5.16759601920384 4.24174834966994 0.925847669533902 A:G G A 10 0.530218543708742 0.8192074586227 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 40719497 A/G 1 13 20 33 6.10715893178635 10.6043708741748 -4.49721194238849 A:G A G 10 0.530218543708742 0.120690611676804 ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40719424_40720128:MAP3K10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 40721004 T/C 1 10 10 20 4.69781456291258 5.30218543708742 -0.60437087417484 T:C T C 10 0.530218543708742 0.825709894540955 ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40720877_40721481:MAP3K10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 41096189 A/G 1 32 46 78 15.0330066013203 24.3900530106021 -9.35704640928187 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0405969291145979 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41096150_41096328:SHKBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44278580 T/G 1 79 72 151 37.1127350470094 38.1757351470294 -1.06300010002004 T:G T G 10 0.530218543708742 0.870824108514992 ENSG00000104783:ENST00000262888:exon_44278344_44278771:KCNN4;ENSG00000104783:ENST00000407385:exon_44278344_44278771:KCNN4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44278779 T/G 0 15 0 15 7.04672184436887 0 7.04672184436887 T T 10 0.530218543708742 8.55703100456327e-05 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44418680 G/C 1 15 18 33 7.04672184436887 9.54393378675736 -2.49721194238849 C:G G C 10 0.530218543708742 0.390101898562569 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44418776 G/A 1 8 9 17 3.75825165033006 4.77196689337868 -1.01371524304861 A:G G A 10 0.530218543708742 0.636531694867648 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44418824 C/T 1 9 10 19 4.22803310662132 5.30218543708742 -1.0741523304661 T:C C T 10 0.530218543708742 0.652256323352804 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44496070 A/G 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44495994_44496086:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44495994_44496086:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44495994_44496086:ZNF155 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44501518 G/A 1 7 18 25 3.28847019403881 9.54393378675736 -6.25546359271855 A:G G A 10 0.530218543708742 0.015088681467336 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44515074 C/A 1 10 6 16 4.69781456291258 3.18131126225245 1.51650330066013 A:C C A 10 0.530218543708742 0.617951383515179 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44515352 T/G 1 16 13 29 7.51650330066013 6.89284106821365 0.623662232446482 T:G T G 10 0.530218543708742 0.854455190101058 ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44515341_44515400:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44515514 C/A 1 7 7 14 3.28847019403881 3.71152980596119 -0.423059611922388 A:C C A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44570551 G/A 1 6 13 19 2.81868873774755 6.89284106821365 -4.0741523304661 A:G G A 10 0.530218543708742 0.068469288507053 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44610798 A/T 1 16 12 28 7.51650330066013 6.3626225245049 1.15388077615522 A:T A T 10 0.530218543708742 0.708452101922698 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44611162 G/T 1 25 21 46 11.7445364072814 11.1345894178836 0.609946989397868 T:G G T 10 0.530218543708742 0.883661229929805 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 10 13 23 4.69781456291258 6.89284106821365 -2.19502650530107 T:C T C 10 0.530218543708742 0.407163540617657 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44660967 A/G 1 15 8 23 7.04672184436887 4.24174834966994 2.80497349469893 A:G A G 10 0.530218543708742 0.298108306919805 ENSG00000159905:ENST00000426739:exon_44660405_44664462:ZNF234;ENSG00000159905:ENST00000244316:exon_44660405_44664462:ZNF234 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44680489 G/A 1 13 13 26 6.10715893178635 6.89284106821365 -0.785682136427292 A:G G A 10 0.530218543708742 0.845120861383123 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44732658 C/G 1 14 10 24 6.57694038807761 5.30218543708742 1.27475495099019 C:G C G 10 0.530218543708742 0.685036120735498 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44732599_44732725:ZNF227 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44739303 T/C 1 17 21 38 7.98628475695139 11.1345894178836 -3.1483046609322 T:C T C 10 0.530218543708742 0.332347856683635 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 44740602 G/A 1 24 28 52 11.2747549509902 14.8461192238448 -3.57136427285458 A:G G A 10 0.530218543708742 0.333931596904285 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 123 101 224 57.7831191238247 53.5520729145829 4.23104620924179 T:C T C 10 0.530218543708742 0.592690764882963 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 45396144 C/T 1 73 62 135 34.2940463092618 32.873549709942 1.42049659931983 T:C C T 10 0.530218543708742 0.863190392837112 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45396094_45396186:TOMM40 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 37 26 63 17.3819138827765 13.7856821364273 3.59623174634926 A:C A C 10 0.530218543708742 0.37983667650144 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 55 40 95 25.8379800960192 21.2087417483497 4.62923834766951 A:G A G 10 0.530218543708742 0.356549479032539 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 50 42 92 23.4890728145629 22.2691788357672 1.21989397879574 A:G G A 10 0.530218543708742 0.835009666673078 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 45 36 81 21.1401655331066 19.0878675735147 2.0522979595919 A:C:G C A 10 0.530218543708742 0.658188048601972 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 46133251 C/T 1 36 14 50 16.9121324264853 7.42305961192239 9.4890728145629 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00699804337389165 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 46133256 G/A 1 36 14 50 16.9121324264853 7.42305961192239 9.4890728145629 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00699804337389165 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 46141845 T/C 1 23 22 45 10.8049734946989 11.6648079615923 -0.859834466893389 T:C T C 10 0.530218543708742 0.881561350298545 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46141763_46141892:EML2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 46275976 G/C 1 11 18 29 5.16759601920384 9.54393378675736 -4.37633776755352 C:G G C 10 0.530218543708742 0.135661579784991 ENSG00000104936:ENST00000458663:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000447742:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000291270:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000377750:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000342805:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000343373:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000348168:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000354227:exon_46275899_46276010:DMPK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 46333349 C/T 1 51 51 102 23.9588542708542 27.0411457291458 -3.08229145829169 T:C C T 10 0.530218543708742 0.553123518150681 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46333312_46333462:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46333312_46333462:SYMPK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 46341824 C/T 1 43 39 82 20.2006026205241 20.6785232046409 -0.477920584116845 T:C C T 10 0.530218543708742 0.91250847565861 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46341719_46341873:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46341719_46341873:SYMPK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 46352122 A/G 1 24 25 49 11.2747549509902 13.2554635927186 -1.98070864172836 A:G A G 10 0.530218543708742 0.571240381545247 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46352008_46352134:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46352008_46352134:SYMPK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 46376217 C/A 1 16 7 23 7.51650330066013 3.71152980596119 3.80497349469893 A:C C A 10 0.530218543708742 0.143492512622874 ENSG00000170608:ENST00000302177:exon_46375333_46377054:FOXA3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 46387503 T/C 1 63 61 124 29.5962317463493 32.3433311662333 -2.74709941988401 T:C T C 10 0.530218543708742 0.653265581033096 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 30 45 75 14.0934436887377 23.8598344668934 -9.76639077815565 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0275434742474148 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 46394095 G/T 1 6 12 18 2.81868873774755 6.3626225245049 -3.54393378675736 T:G G T 10 0.530218543708742 0.103457190750381 ENSG00000176182:ENST00000322217:exon_46393285_46394581:MYPOP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 46857015 C/T 1 45 44 89 21.1401655331066 23.3296159231846 -2.18945039007804 T:C C T 10 0.530218543708742 0.671789118332548 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46857005_46857164:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46857005_46857246:PPP5C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 47258842 C/T 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 T:C C T 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000181027:ENST00000391909:exon_47258669_47261832:FKRP;ENSG00000181027:ENST00000318584:exon_47258669_47261832:FKRP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 122 152 274 57.3133376675335 80.5932186437288 -23.2798809761953 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00529745731907012 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 47585517 G/C 1 1 7 8 0.469781456291258 3.71152980596119 -3.24174834966994 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0300386507500581 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47585441_47585552:ZC3H4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 47588325 G/A 1 13 6 19 6.10715893178635 3.18131126225245 2.9258476695339 A:G G A 10 0.530218543708742 0.250330538073418 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47588313_47588452:ZC3H4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 47858424 G/A 1 6 9 15 2.81868873774755 4.77196689337868 -1.95327815563113 A:G G A 10 0.530218543708742 0.438985732589774 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47858296_47858607:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47858296_47858607:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47858296_47858607:DHX34 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 47865911 A/G 1 13 12 25 6.10715893178635 6.3626225245049 -0.25546359271855 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47865733_47865950:DHX34 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 47879279 G/A 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 A:G G A 10 0.530218543708742 0.247617633272995 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47879181_47879354:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47879181_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47879181_47879354:DHX34 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 47978671 G/A 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 A:G G A 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 47978739 C/T 1 14 15 29 6.57694038807761 7.95327815563113 -1.37633776755352 T:C C T 10 0.530218543708742 0.710719764615262 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 48622427 A/G 1 38 43 81 17.8516953390678 22.7993973794759 -4.9477020404081 A:G A G 10 0.530218543708742 0.316434932778956 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48622394_48622447:LIG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 48640928 C/T 1 32 34 66 15.0330066013203 18.0274304860972 -2.99442388477697 T:C C T 10 0.530218543708742 0.46274576326601 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48640779_48640945:LIG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 48668830 G/A 1 18 17 35 8.45606621324264 9.01371524304861 -0.557649029805969 A:G G A 10 0.530218543708742 0.867108963295299 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48668807_48668880:LIG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 14 18 32 6.57694038807761 9.54393378675736 -2.96699339867974 T:C T C 10 0.530218543708742 0.376191240179242 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 15 7 22 7.04672184436887 3.71152980596119 3.33519203840768 T:C C T 10 0.530218543708742 0.200272681658531 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 48863386 C/T 1 6 8 14 2.81868873774755 4.24174834966994 -1.42305961192239 T:C C T 10 0.530218543708742 0.594188084236152 ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48863329_48863433:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48863329_48863433:TMEM143 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 48954421 G/A 1 20 15 35 9.39562912582516 7.95327815563113 1.44235097019403 A:G G A 10 0.530218543708742 0.735513376094186 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48954291_48954488:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48954291_48954488:GRWD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 49458262 C/T 1 3 13 16 1.40934436887377 6.89284106821365 -5.48349669933987 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00976645421972823 ENSG00000087088:ENST00000502487:exon_49458072_49458856:BAX HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 A:G A G 10 0.530218543708742 0.53110315873658 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 49950298 C/T 1 53 56 109 24.8984171834367 29.6922384476896 -4.79382126425288 T:C C T 10 0.530218543708742 0.388179016383454 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 49950356 C/G 1 55 49 104 25.8379800960192 25.9807086417284 -0.142728545709168 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 72 38 110 33.8242648529706 20.1483046609322 13.6759601920384 T:C:G C T 10 0.530218543708742 0.00969732962306635 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 69 36 105 32.4149204840968 19.0878675735147 13.3270529105821 T:G T G 10 0.530218543708742 0.0106994609920524 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 50098423 G/A 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 A:G G A 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50097954_50101270:PRR12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 50124798 C/T 1 8 12 20 3.75825165033006 6.3626225245049 -2.60437087417484 T:C C T 10 0.530218543708742 0.269017553119515 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50124782_50124879:PRR12;ENSG00000126464:ENST00000246798:exon_50124782_50124879:PRR12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 50128905 C/T 1 23 23 46 10.8049734946989 12.1950265053011 -1.39005301060213 T:C C T 10 0.530218543708742 0.768112232140901 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50128718_50129695:PRR12;ENSG00000126464:ENST00000314734:exon_50128718_50129695:PRR12;ENSG00000126464:ENST00000246798:exon_50128718_50129695:PRR12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 50140092 G/A 1 9 2 11 4.22803310662132 1.06043708741748 3.16759601920384 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0707395200860403 ENSG00000126458:ENST00000246792:exon_50140081_50140183:RRAS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 50157946 T/C 1 76 57 133 35.7033906781356 30.2224569913983 5.48093368673731 T:C T C 10 0.530218543708742 0.385096190510204 ENSG00000126461:ENST00000360565:exon_50157909_50158127:SCAF1;ENSG00000126461:ENST00000447618:exon_50157909_50158127:SCAF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 126 153 279 59.1924634926985 81.1234371874375 -21.930973694739 T:C:G C G 10 0.530218543708742 0.00978715779628148 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 50435747 T/C 1 276 149 425 129.659681936387 79.0025630126026 50.6571189237847 A:T:C T C 10 0.530218543708742 8.19892004760055e-07 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 50435998 C/T 1 285 177 462 133.887715043009 93.8486822364473 40.0390328065612 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000187307842938462 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 50863023 A/G 1 3 11 14 1.40934436887377 5.83240398079616 -4.42305961192239 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0285048765274962 ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50862997_50863119:NAPSA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 50967640 G/A 1 25 3 28 11.7445364072814 1.59065563112623 10.1538807761552 A:G G A 10 0.530218543708742 7.5108853658775e-05 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50967603_50967789:MYBPC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 50967686 G/A 1 3 12 15 1.40934436887377 6.3626225245049 -4.95327815563113 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0167711993403857 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50967603_50967789:MYBPC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 52537576 T/G 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 T:G T G 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000197619:ENST00000221315:exon_52536361_52538693:ZNF615 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 52729030 C/T 1 358 270 628 168.18176135227 143.15900680136 25.02275455091 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0456866293745025 ENSG00000105568:ENST00000391791:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000322088:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000423369:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000436460:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000462990:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000444322:exon_52728970_52729061:PPP2R1A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 52887437 A/C 1 4 16 20 1.87912582516503 8.48349669933987 -6.60437087417484 A:C A C 10 0.530218543708742 0.00319477136948976 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 1 4 17 21 1.87912582516503 9.01371524304861 -7.13458941788358 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00183606271552568 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 53056953 G/A 1 11 7 18 5.16759601920384 3.71152980596119 1.45606621324264 A:G G A 10 0.530218543708742 0.638243716970554 ENSG00000198482:ENST00000487863:exon_53056360_53059303:ZNF808;ENSG00000198482:ENST00000359798:exon_53056360_53059589:ZNF808 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 53302942 C/T 1 4 7 11 1.87912582516503 3.71152980596119 -1.83240398079616 T:C C T 10 0.530218543708742 0.367650802678922 ENSG00000198538:ENST00000360272:exon_53300659_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000438150:exon_53300661_53304940:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000457749:exon_53300662_53304955:ZNF28 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 53303527 A/G 1 4 7 11 1.87912582516503 3.71152980596119 -1.83240398079616 A:G A G 10 0.530218543708742 0.367650802678922 ENSG00000198538:ENST00000360272:exon_53300659_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000438150:exon_53300661_53304940:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000457749:exon_53300662_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000391783:exon_53303301_53304955:ZNF28 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 53303745 T/C 1 5 8 13 2.34890728145629 4.24174834966994 -1.89284106821365 T:C T C 10 0.530218543708742 0.406203894191414 ENSG00000198538:ENST00000360272:exon_53300659_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000438150:exon_53300661_53304940:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000457749:exon_53300662_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000391783:exon_53303301_53304955:ZNF28 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 53571306 T/C 1 37 31 68 17.3819138827765 16.436774854971 0.945139027805546 T:C T C 10 0.530218543708742 0.903440347134904 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 53572494 G/T 1 16 22 38 7.51650330066013 11.6648079615923 -4.1483046609322 T:G G T 10 0.530218543708742 0.195573772819002 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 53994061 A/G 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 A:G A G 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000198346:ENST00000396403:exon_53993629_53999509:ZNF813 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 54080144 A/G 0 0 19 19 0 10.0741523304661 -10.0741523304661 G A G 10 0.530218543708742 5.8347402526368e-07 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 54647479 T/C 1 78 55 133 36.6429535907181 29.1620199039808 7.48093368673731 T:C T C 10 0.530218543708742 0.223783629903917 ENSG00000088038:ENST00000221232:exon_54647396_54647485:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000358389:exon_54647396_54647485:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000411507:exon_54647396_54647485:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000445408:exon_54647396_54647485:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000482247:exon_54647396_54647870:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000406403:exon_54647396_54647485:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000440571:exon_54647466_54647485:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000447684:exon_54647473_54647485:CNOT3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 54848741 T/C 1 4 20 24 1.87912582516503 10.6043708741748 -8.72524504900981 T:C T C 10 0.530218543708742 0.000332355133523291 ENSG00000239961:ENST00000291759:exon_54848671_54848967:LILRA4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 54849463 C/T 1 5 9 14 2.34890728145629 4.77196689337868 -2.42305961192239 T:C C T 10 0.530218543708742 0.284180524640790 ENSG00000239961:ENST00000291759:exon_54849207_54849506:LILRA4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 54849481 T/G 1 8 10 18 3.75825165033006 5.30218543708742 -1.54393378675736 T:G T G 10 0.530218543708742 0.488609852310515 ENSG00000239961:ENST00000291759:exon_54849207_54849506:LILRA4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 54962467 G/A 1 39 25 64 18.3214767953591 13.2554635927186 5.06601320264051 A:G G A 10 0.530218543708742 0.213004969317428 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376514:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000443957:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54962467_54962559:LENG8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 54965860 G/A 1 55 49 104 25.8379800960192 25.9807086417284 -0.142728545709168 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54965609_54965861:LENG8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 54966579 C/G 1 41 35 76 19.2610397079416 18.557649029806 0.703390678135609 C:G C G 10 0.530218543708742 0.908863380428481 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 54974318 T/C 1 7 17 24 3.28847019403881 9.01371524304861 -5.72524504900981 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0234618116857242 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 27 14 41 12.684099319864 7.42305961192239 5.26103970794158 T:C T C 10 0.530218543708742 0.117670367987536 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 55624113 G/A 1 13 15 28 6.10715893178635 7.95327815563113 -1.84611922384478 A:G G A 10 0.530218543708742 0.571296577994255 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55624033_55624163:PPP1R12C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 55738746 G/A 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 A:G G A 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55738116_55738931:TMEM86B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 55739605 C/T 1 7 9 16 3.28847019403881 4.77196689337868 -1.48349669933987 T:C C T 10 0.530218543708742 0.46678737179182 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55739559_55739805:TMEM86B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 55739689 G/A 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 A:G G A 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55739559_55739805:TMEM86B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 55739813 G/A 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 A:G G A 10 0.530218543708742 0.296231759838006 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 55741961 G/C 1 4 7 11 1.87912582516503 3.71152980596119 -1.83240398079616 C:G G C 10 0.530218543708742 0.367650802678922 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 12 8 20 5.6373774754951 4.24174834966994 1.39562912582516 T:C C T 10 0.530218543708742 0.655843927791304 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 56599405 C/G 1 31 42 73 14.563225145029 22.2691788357672 -7.70595369073817 C:G C G 10 0.530218543708742 0.078600361372402 ENSG00000142409:ENST00000270459:exon_56598732_56600461:ZNF787 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 56935527 A/G 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 A:G A G 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000198440:ENST00000291598:exon_56934260_56936400:ZNF583 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 57132968 G/A 1 14 10 24 6.57694038807761 5.30218543708742 1.27475495099019 A:G G A 10 0.530218543708742 0.685036120735498 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58231807 A/G 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 A:G A G 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58319906 C/G 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000178935:ENST00000391701:exon_58318450_58320471:ZNF552 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58453342 T/C 1 12 24 36 5.6373774754951 12.7252450490098 -7.08786757351471 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0194342133626546 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58452206_58454015:ZNF256 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58596449 C/T 1 17 10 27 7.98628475695139 5.30218543708742 2.68409931986397 T:C C T 10 0.530218543708742 0.339242316991111 ENSG00000176293:ENST00000515535:exon_58595587_58597677:ZNF135;ENSG00000121413:ENST00000240727:exon_58595210_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000433686:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000402070:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000421612:exon_58595212_58596743:ZSCAN18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58755366 G/A 1 11 6 17 5.16759601920384 3.18131126225245 1.98628475695139 A:G G A 10 0.530218543708742 0.46729790202122 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58755331_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58755328_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000333581:exon_58755328_58755422:ZNF544 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58772579 C/G 1 23 18 41 10.8049734946989 9.54393378675736 1.26103970794158 C:G C G 10 0.530218543708742 0.755611920589358 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58772955 G/T 1 23 18 41 10.8049734946989 9.54393378675736 1.26103970794158 T:G G T 10 0.530218543708742 0.755611920589358 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 32 48 80 15.0330066013203 25.4504900980196 -10.4174834966994 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0245008452204479 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58806083 T/C 1 7 9 16 3.28847019403881 4.77196689337868 -1.48349669933987 T:C T C 10 0.530218543708742 0.46678737179182 ENSG00000083842:ENST00000196548:exon_58805464_58807254:ZNF8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58928299 A/T 1 7 1 8 3.28847019403881 0.530218543708742 2.75825165033006 A:T A T 10 0.530218543708742 0.0743148409803516 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 22 15 37 10.3351920384077 7.95327815563113 2.38191388277655 A:G G A 10 0.530218543708742 0.511058987485558 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58929136 G/A 1 14 5 19 6.57694038807761 2.65109271854371 3.9258476695339 A:G G A 10 0.530218543708742 0.105397064107856 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58929194 A/G 1 25 2 27 11.7445364072814 1.06043708741748 10.684099319864 A:G A G 10 0.530218543708742 1.73997061700776e-05 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58929200 A/C 1 28 1 29 13.1538807761552 0.530218543708742 12.6236622324465 A:C A C 10 0.530218543708742 4.40946882635962e-07 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58945089 A/G 1 10 1 11 4.69781456291258 0.530218543708742 4.16759601920384 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0133054426964171 ENSG00000131849:ENST00000254166:exon_58944182_58946578:ZNF132;ENSG00000131849:ENST00000391695:exon_58944768_58945214:ZNF132;ENSG00000131849:ENST00000418193:exon_58944768_58945209:ZNF132 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 58989495 A/C 1 3 9 12 1.40934436887377 4.77196689337868 -3.3626225245049 A:C A C 10 0.530218543708742 0.0792634794421136 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58989454_58989548:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58989454_58989548:ZNF446 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 59010593 A/G 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:G A G 10 0.530218543708742 0.487231208629639 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 59028585 G/A 1 12 15 27 5.6373774754951 7.95327815563113 -2.31590068013603 A:G G A 10 0.530218543708742 0.442054176507922 ENSG00000119574:ENST00000354590:exon_59027762_59029040:ZBTB45 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 59058693 G/A 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 A:G G A 10 0.530218543708742 0.742825095475742 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 59061357 C/T 1 443 403 846 208.113185137027 213.678073114623 -5.56488797759573 T:C C T 10 0.530218543708742 0.704910177032009 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59061316_59061402:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59061316_59061402:TRIM28 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 59073613 A/G 1 35 25 60 16.442350970194 13.2554635927186 3.18688737747548 A:G A G 10 0.530218543708742 0.439731269478125 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 19 59074429 C/T 1 26 14 40 12.2143178635727 7.42305961192239 4.79125825165032 T:C C T 10 0.530218543708742 0.154080041631287 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 1 54 64 118 25.3681986397279 33.9339867973595 -8.56578815763156 T:C T C 10 0.530218543708742 0.117682855860043 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 26 16 42 12.2143178635727 8.48349669933987 3.73082116423284 C:G G C 10 0.530218543708742 0.28095596155657 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 45 51 96 21.1401655331066 27.0411457291458 -5.90098019603923 T:C C T 10 0.530218543708742 0.260653582432360 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 10059770 G/T 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 T:G G T 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 10059844 C/T 1 7 1 8 3.28847019403881 0.530218543708742 2.75825165033006 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0743148409803516 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 10262920 T/G 1 184 213 397 86.4397879575915 112.936549809962 -26.4967618523706 T:G T G 10 0.530218543708742 0.0088498504140022 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10262839_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10262866_10263184:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498343:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000463887:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10262879_10263024:RRM2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 10580967 G/A 1 540 521 1061 253.681986397279 276.243861272255 -22.5618748749753 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.166460662619853 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10580094_10580994:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10580727_10580994:ODC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 10712278 C/T 1 26 23 49 12.2143178635727 12.1950265053011 0.0192913582716425 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10710892_10712316:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10711781_10712316:NOL10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 10784491 A/G 1 21 14 35 9.86541058211642 7.42305961192239 2.44235097019403 A:G A G 10 0.530218543708742 0.498927835684863 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000431319:exon_10784446_10784498:NOL10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 10930903 T/C 1 108 106 214 50.7363972794559 56.2031656331267 -5.46676835367079 T:C T C 10 0.530218543708742 0.493534372940666 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10930845_10930959:PDIA6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 79 90 169 37.1127350470094 47.7196689337868 -10.6069338867774 T:C C T 10 0.530218543708742 0.105935126743860 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 34 24 58 15.9725695139028 12.7252450490098 3.24732446489297 T:C C T 10 0.530218543708742 0.431418385499287 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 11332408 C/A 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 A:C C A 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000134318:ENST00000315872:exon_11332274_11332487:ROCK2;ENSG00000134318:ENST00000399089:exon_11332274_11332487:ROCK2;ENSG00000134318:ENST00000401753:exon_11332274_11332487:ROCK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 11943082 C/T 1 12 6 18 5.6373774754951 3.18131126225245 2.45606621324264 T:C C T 10 0.530218543708742 0.345504636527756 ENSG00000134324:ENST00000396099:exon_11943033_11943159:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000256720:exon_11943033_11943159:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000449576:exon_11943033_11943159:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000425416:exon_11943033_11943159:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000396097:exon_11943033_11943159:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000454151:exon_11943033_11943159:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000404113:exon_11943033_11943159:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000453987:exon_11943033_11943159:LPIN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 15735648 T/C 1 14 15 29 6.57694038807761 7.95327815563113 -1.37633776755352 T:C T C 10 0.530218543708742 0.710719764615262 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15735614_15735677:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15735614_15735677:DDX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 20234122 C/A 1 58 47 105 27.247324464893 24.9202715543109 2.32705291058209 A:C C A 10 0.530218543708742 0.696159518662054 ENSG00000068697:ENST00000175091:exon_20234078_20234176:LAPTM4A;ENSG00000068697:ENST00000483117:exon_20234078_20234176:LAPTM4A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 20824559 C/T 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 20838302 G/T 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 T:G G T 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 23980568 A/G 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:G A G 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000119778:ENST00000238789:exon_23980288_23980971:ATAD2B;ENSG00000119778:ENST00000381024:exon_23980288_23980971:ATAD2B;ENSG00000119778:ENST00000474583:exon_23980288_23980971:ATAD2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 25064157 G/C 1 8 22 30 3.75825165033006 11.6648079615923 -7.90655631126226 C:G G C 10 0.530218543708742 0.00519996987292726 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 25064193 G/A 1 21 16 37 9.86541058211642 8.48349669933987 1.38191388277655 A:G G A 10 0.530218543708742 0.742655841774882 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 26455127 G/A 1 87 77 164 40.8709866973394 40.8268278655731 0.0441588317663104 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000457468:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000461025:exon_26455070_26455147:HADHA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 26502875 T/C 1 80 96 176 37.5825165033006 50.9009801960392 -13.3184636927386 T:C T C 10 0.530218543708742 0.049380748725692 ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26502862_26502983:HADHB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 27599470 C/T 1 5 17 22 2.34890728145629 9.01371524304861 -6.66480796159232 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00489256326978541 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 49 54 103 23.0192913582716 28.6318013602721 -5.61251000200043 T:C T C 10 0.530218543708742 0.278747473678726 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 32690189 A/G 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32690133_32690232:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32690133_32690232:BIRC6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 32822957 G/A 1 18 12 30 8.45606621324264 6.3626225245049 2.09344368873774 A:G G A 10 0.530218543708742 0.470477748346769 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32822818_32823035:BIRC6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 36782886 G/A 1 7 9 16 3.28847019403881 4.77196689337868 -1.48349669933987 A:G G A 10 0.530218543708742 0.46678737179182 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36782805_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000414288:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000475815:exon_36782826_36786398:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000441005:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000432869:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487919:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487282:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000484205:exon_36782432_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36782831_36782891:FEZ2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 36810586 T/C 1 7 9 16 3.28847019403881 4.77196689337868 -1.48349669933987 T:C T C 10 0.530218543708742 0.46678737179182 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36810496_36810612:FEZ2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 37230734 C/T 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 T:C C T 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37230685_37230829:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37230685_37230829:HEATR5B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 37458668 G/A 1 16 27 43 7.51650330066013 14.315900680136 -6.79939737947591 A:G G A 10 0.530218543708742 0.046195001058485 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 37471114 C/A 1 16 18 34 7.51650330066013 9.54393378675736 -2.02743048609723 A:C C A 10 0.530218543708742 0.497520057256665 ENSG00000003509:ENST00000455230:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000414639:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37471054_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000336237:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000431821:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000483999:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000439218:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474257:exon_37471006_37471116:C2orf56 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 37505105 T/G 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 T:G T G 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37505009_37505132:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37505009_37505132:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000469275:exon_37505009_37506533:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000494667:exon_37505009_37505132:PRKD3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 37506939 A/G 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:G A G 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37506889_37507072:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37506889_37507072:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000494667:exon_37506889_37507072:PRKD3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 39082344 T/C 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 T:C T C 10 0.530218543708742 0.565817448386735 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39082199_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39081196_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39082199_39082417:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000474104:exon_39080187_39082394:DHX57 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 39988478 T/C 1 2 12 14 0.939562912582516 6.3626225245049 -5.42305961192239 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00524482616189066 ENSG00000138050:ENST00000460072:exon_39988471_39988558:THUMPD2;ENSG00000138050:ENST00000505747:exon_39988471_39988558:THUMPD2;ENSG00000138050:ENST00000260619:exon_39988471_39988558:THUMPD2;ENSG00000138050:ENST00000378727:exon_39988471_39988558:THUMPD2;ENSG00000138050:ENST00000454352:exon_39988471_39988558:THUMPD2;ENSG00000138050:ENST00000530522:exon_39988471_39988558:THUMPD2;ENSG00000138050:ENST00000510781:exon_39988472_39988558:THUMPD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 42515388 A/G 1 24 35 59 11.2747549509902 18.557649029806 -7.28289407881578 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0673890884461558 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 23 10 33 10.8049734946989 5.30218543708742 5.50278805761151 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0570082576648625 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 42990101 G/C 1 20 6 26 9.39562912582516 3.18131126225245 6.21431786357271 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0172300094673906 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 42990522 C/T 1 17 8 25 7.98628475695139 4.24174834966994 3.74453640728145 T:C C T 10 0.530218543708742 0.161813179944607 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 A:T T A 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 43625184 T/A 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 A:T T A 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000473004:exon_43625110_43625197:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485353:exon_43625110_43625278:THADA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 44036913 T/C 1 15 29 44 7.04672184436887 15.3763377675535 -8.32961592318465 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0148849592107602 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 18 12 30 8.45606621324264 6.3626225245049 2.09344368873774 T:C T C 10 0.530218543708742 0.470477748346769 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 44201376 T/C 1 80 87 167 37.5825165033006 46.1290133026606 -8.54649679935991 T:C T C 10 0.530218543708742 0.188399214378426 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44201289_44201434:LRPPRC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 44209477 C/T 1 19 11 30 8.9258476695339 5.83240398079616 3.09344368873774 T:C C T 10 0.530218543708742 0.277968900623872 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44209377_44209573:LRPPRC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 46739157 A/G 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:G A G 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000250565:ENST00000306448:exon_46738986_46739951:ATP6V1E2;ENSG00000250565:ENST00000522587:exon_46739006_46739951:ATP6V1E2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 47220622 G/A 1 5 16 21 2.34890728145629 8.48349669933987 -6.13458941788358 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00814768405022494 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000474321:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47220589_47220667:TTC7A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 48010488 G/A 1 15 7 22 7.04672184436887 3.71152980596119 3.33519203840768 A:G G A 10 0.530218543708742 0.200272681658531 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48010267_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000493177:exon_48010309_48010632:MSH6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 53955850 C/T 1 9 8 17 4.22803310662132 4.24174834966994 -0.0137152430486136 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406687:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000394717:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000498475:exon_53955849_53955984:ASB3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 54035447 A/G 1 30 24 54 14.0934436887377 12.7252450490098 1.36819863972793 A:G A G 10 0.530218543708742 0.785615629829279 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 25 13 38 11.7445364072814 6.89284106821365 4.8516953390678 A:G A G 10 0.530218543708742 0.143078279521696 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 10 14 24 4.69781456291258 7.42305961192239 -2.72524504900981 A:T A T 10 0.530218543708742 0.309127957783389 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 14 19 33 6.57694038807761 10.0741523304661 -3.49721194238849 A:G G A 10 0.530218543708742 0.228268891065024 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 54127041 C/T 1 14 21 35 6.57694038807761 11.1345894178836 -4.55764902980597 T:C C T 10 0.530218543708742 0.130448708001807 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54127018_54127154:PSME4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 54133744 T/C 1 10 21 31 4.69781456291258 11.1345894178836 -6.436774854971 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0292043627397844 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54133735_54133830:PSME4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 54858664 C/T 1 85 68 153 39.9314237847569 36.0548609721945 3.87656281256248 T:C C T 10 0.530218543708742 0.571001491839739 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 55201038 C/T 1 2 6 8 0.939562912582516 3.18131126225245 -2.24174834966994 T:C C T 10 0.530218543708742 0.158929006468168 ENSG00000115310:ENST00000491592:exon_55200699_55201155:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000485749:exon_55200957_55201327:RTN4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 55277226 C/T 1 148 89 237 69.5276555311062 47.189450390078 22.3382051410282 T:C:G C T 10 0.530218543708742 0.0040992384121895 ENSG00000115310:ENST00000337526:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000317610:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000357732:exon_55276881_55277680:RTN4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 55481322 T/A 1 35 42 77 16.442350970194 22.2691788357672 -5.82682786557313 A:T T A 10 0.530218543708742 0.209177239471468 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55481177_55481337:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55481177_55481337:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55481177_55481337:MTIF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 25 12 37 11.7445364072814 6.3626225245049 5.38191388277655 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0985041554161858 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 29 21 50 13.6236622324465 11.1345894178836 2.4890728145629 A:G A G 10 0.530218543708742 0.571370632667936 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 165 144 309 77.5139402880576 76.3514702940588 1.16246999399873 A:G A G 10 0.530218543708742 0.909353099550538 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 62067433 T/C 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 T:C T C 10 0.530218543708742 0.247617633272995 ENSG00000170264:ENST00000450831:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000456262:exon_62066556_62067660:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000418113:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000404929:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000405894:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000307507:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000478822:exon_62066556_62067716:FAM161A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 64778662 T/C 1 59 59 118 27.7171059211842 31.2828940788158 -3.56578815763156 T:C T C 10 0.530218543708742 0.519899427966469 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 21 21 42 9.86541058211642 11.1345894178836 -1.26917883576716 A:G G A 10 0.530218543708742 0.75806865433379 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 65248271 G/A 1 42 45 87 19.7308211642328 23.8598344668934 -4.12901330266055 A:G G A 10 0.530218543708742 0.391633577188581 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65248046_65250997:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65248046_65248528:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65248046_65250999:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65248046_65250997:SLC1A4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 65495887 G/A 1 388 372 760 182.275205041008 197.241298259652 -14.9660932186439 A:G G A 10 0.530218543708742 0.291937396477470 ENSG00000138071:ENST00000260641:exon_65495698_65498387:ACTR2;ENSG00000138071:ENST00000377982:exon_65495698_65497280:ACTR2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 67637141 G/A 1 21 27 48 9.86541058211642 14.315900680136 -4.45049009801962 A:G G A 10 0.530218543708742 0.247095355795215 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67637043_67637677:ETAA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 68364478 T/C 1 10 8 18 4.69781456291258 4.24174834966994 0.456066213242644 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68364431_68364565:PPP3R1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 68385097 A/G 1 41 24 65 19.2610397079416 12.7252450490098 6.53579465893177 A:G A G 10 0.530218543708742 0.107874678966140 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68384928_68385254:PPP3R1;ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68384976_68385273:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68385049_68385273:PNO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 111 115 226 52.1457416483296 60.9751325265053 -8.82939087817569 T:G G T 10 0.530218543708742 0.257305964291013 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 68622914 G/A 1 277 333 610 130.129463392678 176.562775055011 -46.4333116623326 A:G G A 10 0.530218543708742 0.000185437197038590 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 69642390 A/G 1 13 18 31 6.10715893178635 9.54393378675736 -3.436774854971 A:G A G 10 0.530218543708742 0.280193232704031 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000474230:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000462320:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69642317_69642431:NFU1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 70037739 C/G 1 30 27 57 14.0934436887377 14.315900680136 -0.222456991398294 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70035038_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000409920:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70037726_70037752:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000487351:exon_70037726_70037857:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000468815:exon_70037726_70038034:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000472124:exon_70037726_70037805:ANXA4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 70068151 G/A 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 A:G G A 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000087338:ENST00000282570:exon_70068074_70068171:GMCL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 70408938 A/G 1 17 5 22 7.98628475695139 2.65109271854371 5.33519203840768 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0305968416347052 ENSG00000115998:ENST00000264434:exon_70408295_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000420306:exon_70408295_70409127:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000447804:exon_70408612_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000417865:exon_70408641_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000419381:exon_70408735_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000470096:exon_70408762_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000457952:exon_70408782_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000428010:exon_70408938_70409129:C2orf42 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 71221822 A/G 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G A G 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000144043:ENST00000453130:exon_71221818_71221879:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000272438:exon_71221818_71222075:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000433258:exon_71221818_71221962:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000466731:exon_71221771_71221834:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000489894:exon_71221818_71221933:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000473055:exon_71221818_71222003:TEX261 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 71305456 C/T 1 128 57 185 60.132026405281 30.2224569913983 29.9095694138827 T:C C T 10 0.530218543708742 8.62469657015032e-06 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71305448_71305484:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 71337203 C/T 1 28 31 59 13.1538807761552 16.436774854971 -3.28289407881578 T:C C T 10 0.530218543708742 0.434717106145806 ENSG00000124370:ENST00000413592:exon_71336814_71337252:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71336814_71337252:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000462609:exon_71336944_71337252:MCEE HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 71351487 G/A 1 16 15 31 7.51650330066013 7.95327815563113 -0.436774854971002 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000494660:exon_71351477_71351673:MCEE HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 63 43 106 29.5962317463493 22.7993973794759 6.79683436687335 A:C A C 10 0.530218543708742 0.206065860719673 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 76 77 153 35.7033906781356 40.8268278655731 -5.12343718743753 T:G G T 10 0.530218543708742 0.418822489708893 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 37 23 60 17.3819138827765 12.1950265053011 5.18688737747548 A:G G A 10 0.530218543708742 0.197066165775893 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 39 31 70 18.3214767953591 16.436774854971 1.88470194038806 A:G G A 10 0.530218543708742 0.719866384495976 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 71377014 G/A 1 30 35 65 14.0934436887377 18.557649029806 -4.46420534106823 A:G G A 10 0.530218543708742 0.320189288280246 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 73457287 C/T 1 8 3 11 3.75825165033006 1.59065563112623 2.16759601920384 T:C C T 10 0.530218543708742 0.235945069885030 ENSG00000135617:ENST00000258083:exon_73457241_73457341:C2orf7;ENSG00000135617:ENST00000480093:exon_73457241_73457341:C2orf7;ENSG00000135617:ENST00000470391:exon_73456927_73457341:C2orf7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 73461483 C/A 1 73 142 215 34.2940463092618 75.2910332066414 -40.9969868973795 A:C C A 10 0.530218543708742 2.18355160670124e-08 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73461366_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73461397_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73461435_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73461448_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473786:exon_73461464_73461512:CCT7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 73478461 A/T 1 191 170 361 89.7282581516303 90.1371524304861 -0.408894278855854 A:T A T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 73989927 G/A 1 31 23 54 14.563225145029 12.1950265053011 2.36819863972793 A:G G A 10 0.530218543708742 0.586291804658606 ENSG00000144048:ENST00000272444:exon_73989311_73989986:DUSP11;ENSG00000144048:ENST00000432812:exon_73989325_73989986:DUSP11;ENSG00000144048:ENST00000480948:exon_73989721_73989986:DUSP11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 74652086 C/T 1 119 98 217 55.9039932986597 51.9614172834567 3.94257601520298 A:T:C C T 10 0.530218543708742 0.634153249875138 ENSG00000005448:ENST00000461531:exon_74652002_74652102:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000409791:exon_74652002_74652102:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000348227:exon_74652002_74652102:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000480089:exon_74652002_74652102:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000482880:exon_74652002_74652103:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000468778:exon_74652002_74652102:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000482605:exon_74652000_74652364:WDR54 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 74682512 C/T 0 15 0 15 7.04672184436887 0 7.04672184436887 C C 10 0.530218543708742 8.55703100456327e-05 ENSG00000115274:ENST00000471577:exon_74682235_74682725:INO80B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 47 58 105 22.0797284456891 30.752675535107 -8.67294708941791 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0967003181407322 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 47 74 121 22.0797284456891 39.2361722344469 -17.1564437887578 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00189284817027588 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 333 186 519 156.437224944989 98.620649129826 57.8165758151629 A:T:C C A 10 0.530218543708742 3.08709849404229e-07 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 74710491 C/T 1 12 17 29 5.6373774754951 9.01371524304861 -3.37633776755352 T:C C T 10 0.530218543708742 0.264391425279974 ENSG00000135637:ENST00000474681:exon_74710195_74710535:CCDC142;ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463704:exon_74710449_74710832:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74710449_74710690:TTC31 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 74761539 T/A 1 8 23 31 3.75825165033006 12.1950265053011 -8.436774854971 A:T T A 10 0.530218543708742 0.00329647774094348 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74761443_74761558:LOXL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 74763258 C/G 1 18 1 19 8.45606621324264 0.530218543708742 7.9258476695339 C:G C G 10 0.530218543708742 0.000116824387141766 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000481835:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000420535:exon_74763123_74763277:LOXL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 75882399 G/A 1 122 65 187 57.3133376675335 34.4642053410682 22.8491323264652 A:G G A 10 0.530218543708742 0.000928152779280952 ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75882190_75884986:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75882190_75882428:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000453233:exon_75882190_75882428:MRPL19 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 85553784 C/T 1 29 35 64 13.6236622324465 18.557649029806 -4.93398679735949 T:C C T 10 0.530218543708742 0.25958431006496 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000282120:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000398263:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 85554080 G/A 1 35 38 73 16.442350970194 20.1483046609322 -3.70595369073817 A:G G A 10 0.530218543708742 0.412877348598645 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 85570388 G/T 1 34 4 38 15.9725695139028 2.12087417483497 13.8516953390678 T:G G T 10 0.530218543708742 2.11537010841621e-06 ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85569079_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85569079_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85569211_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85569211_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85569805_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000438611:exon_85570114_85570504:RETSAT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 85571433 G/A 1 8 2 10 3.75825165033006 1.06043708741748 2.69781456291258 A:G G A 10 0.530218543708742 0.115795579122128 ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000438611:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000475624:exon_85571362_85571444:RETSAT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 85622059 T/C 1 8 4 12 3.75825165033006 2.12087417483497 1.6373774754951 T:C T C 10 0.530218543708742 0.398218675970565 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85621871_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85621876_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85621890_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85621951_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85622016_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85622018_85622081:CAPG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 262 236 498 123.08274154831 125.131576315263 -2.04883476695352 C:G C G 10 0.530218543708742 0.857611371932978 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 85769975 A/G 1 34 34 68 15.9725695139028 18.0274304860972 -2.05486097219445 A:G A G 10 0.530218543708742 0.62907070985465 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 85806266 C/T 1 308 198 506 144.692688537707 104.983271654331 39.7094168833765 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000424203826658314 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 414 324 738 194.489522904581 171.790808161632 22.6987147429484 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0970307003007226 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 246 160 406 115.566238247649 84.8349669933987 30.7312712542507 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00238589136852777 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 85824251 T/C 1 254 254 508 119.32448989798 134.67551010202 -15.3510202040409 T:C T C 10 0.530218543708742 0.182352035924148 ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85824227_85824704:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000456023:exon_85824076_85824301:RNF181 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 85852667 G/A 1 26 30 56 12.2143178635727 15.9065563112623 -3.69223844768955 A:G G A 10 0.530218543708742 0.350191986521019 ENSG00000168883:ENST00000459775:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000448971:exon_85852662_85852712:USP39;ENSG00000168883:ENST00000442708:exon_85852662_85852740:USP39;ENSG00000168883:ENST00000450066:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409268:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409025:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000452873:exon_85852662_85852719:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409470:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000487400:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000323701:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000458268:exon_85852662_85852813:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409766:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000493829:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000467885:exon_85852662_85852814:USP39 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 86371883 T/C 1 194 151 345 91.137602520504 80.06300010002 11.074602420484 T:C T C 10 0.530218543708742 0.235864839389698 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86371063_86372004:IMMT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 86385668 T/C 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 T:C T C 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 86385728 C/T 1 7 4 11 3.28847019403881 2.12087417483497 1.16759601920384 T:C C T 10 0.530218543708742 0.557007995713773 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86385715_86385793:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 86400824 G/A 1 59 78 137 27.7171059211842 41.3570464092819 -13.6399404880977 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0207688956077735 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86400773_86400885:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86400631_86400884:IMMT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 89160093 T/A 1 8 29 37 3.75825165033006 15.3763377675535 -11.6180861172235 A:T T A 10 0.530218543708742 0.000185143385739631 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 89160714 T/A 0 9 0 9 4.22803310662132 0 4.22803310662132 T T 10 0.530218543708742 0.00442648537498891 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 89160715 T/C 0 9 0 9 4.22803310662132 0 4.22803310662132 T T 10 0.530218543708742 0.00442648537498891 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 96789787 T/C 1 18 25 43 8.45606621324264 13.2554635927186 -4.79939737947591 T:C T C 10 0.530218543708742 0.169106472031763 ENSG00000188886:ENST00000342380:exon_96789589_96790010:ASTL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 96795608 T/G 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 T:G T G 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000188886:ENST00000342380:exon_96795563_96795717:ASTL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 96943473 T/C 1 3 8 11 1.40934436887377 4.24174834966994 -2.83240398079616 T:C T C 10 0.530218543708742 0.129086131769062 ENSG00000144028:ENST00000480835:exon_96943272_96943688:SNRNP200 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 96944553 G/A 1 106 123 229 49.7968343668733 65.2168808761753 -15.4200465093019 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0468003930252709 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000484372:exon_96944547_96944736:SNRNP200 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 96952833 A/G 1 89 78 167 41.810549609922 41.3570464092819 0.453503200640085 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96952744_96952898:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000480615:exon_96952744_96952898:SNRNP200 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 96993757 C/T 1 24 32 56 11.2747549509902 16.9669933986797 -5.69223844768955 T:C C T 10 0.530218543708742 0.141432664294549 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 96993884 A/G 1 27 32 59 12.684099319864 16.9669933986797 -4.28289407881578 A:G A G 10 0.530218543708742 0.297336160824213 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 97020049 T/C 1 15 10 25 7.04672184436887 5.30218543708742 1.74453640728145 T:C T C 10 0.530218543708742 0.551192924360965 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000477409:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97019921_97020126:NCAPH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 97030247 T/C 1 22 26 48 10.3351920384077 13.7856821364273 -3.45049009801962 T:C T C 10 0.530218543708742 0.385835479841323 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435349:exon_97030218_97030329:NCAPH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 97526787 T/A 1 10 14 24 4.69781456291258 7.42305961192239 -2.72524504900981 A:T T A 10 0.530218543708742 0.309127957783389 ENSG00000168758:ENST00000305476:exon_97525453_97527192:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000474420:exon_97525473_97527386:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000482925:exon_97525479_97527192:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000467747:exon_97525485_97527192:SEMA4C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 97526788 C/A 1 11 14 25 5.16759601920384 7.42305961192239 -2.25546359271855 A:C C A 10 0.530218543708742 0.425252421915307 ENSG00000168758:ENST00000305476:exon_97525453_97527192:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000474420:exon_97525473_97527386:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000482925:exon_97525479_97527192:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000467747:exon_97525485_97527192:SEMA4C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 15 30 45 7.04672184436887 15.9065563112623 -8.85983446689339 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0104015357240442 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 23 50 73 10.8049734946989 26.5109271854371 -15.7059536907382 T:C T C 10 0.530218543708742 0.000240708246152304 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 31 46 77 14.563225145029 24.3900530106021 -9.82682786557313 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0295520286219090 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 101624471 T/C 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 T:C T C 10 0.530218543708742 0.296231759838006 ENSG00000204634:ENST00000463751:exon_101622395_101624492:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101624079_101624735:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101624079_101624735:TBC1D8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 103334969 G/A 1 3 8 11 1.40934436887377 4.24174834966994 -2.83240398079616 A:G G A 10 0.530218543708742 0.129086131769062 ENSG00000135953:ENST00000258436:exon_103332299_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000438943:exon_103333497_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000437075:exon_103334030_103335666:MFSD9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 105885961 T/C 1 34 28 62 15.9725695139028 14.8461192238448 1.126450290058 T:C T C 10 0.530218543708742 0.800406262585794 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 105897003 G/A 1 7 21 28 3.28847019403881 11.1345894178836 -7.84611922384478 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00377157217935466 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105896839_105897180:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105896839_105897180:TGFBRAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 105915128 G/A 1 8 13 21 3.75825165033006 6.89284106821365 -3.13458941788358 A:G G A 10 0.530218543708742 0.193644496250896 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105914968_105915162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105914968_105915162:TGFBRAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 105924510 A/G 1 12 10 22 5.6373774754951 5.30218543708742 0.335192038407676 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105924071_105924775:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105924071_105924778:TGFBRAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 113308516 T/A 1 8 14 22 3.75825165033006 7.42305961192239 -3.66480796159232 A:T T A 10 0.530218543708742 0.136895748142305 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113308284_113308579:POLR1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 113309473 C/T 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 T:C C T 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113309352_113309556:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113309352_113309575:POLR1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 63 59 122 29.5962317463493 31.2828940788158 -1.68666233246653 T:C T C 10 0.530218543708742 0.785948802316862 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 31 43 74 14.563225145029 22.7993973794759 -8.23617223444691 C:G G C 10 0.530218543708742 0.062185801867112 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 36 47 83 16.9121324264853 24.9202715543109 -8.00813912782558 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0796282760883459 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 122106262 T/G 1 19 8 27 8.9258476695339 4.24174834966994 4.68409931986397 T:G T G 10 0.530218543708742 0.083079679391696 ENSG00000074054:ENST00000429969:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000442289:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000263710:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000455322:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000397587:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000376194:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000409078:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000452274:exon_122106088_122106294:CLASP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 128396807 A/G 1 31 48 79 14.563225145029 25.4504900980196 -10.8872649529906 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0174234131945245 ENSG00000072163:ENST00000426981:exon_128395956_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000469300:exon_128396000_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000494613:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409286:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409754:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000476932:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000324938:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000484252:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000466410:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409455:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000410109:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409808:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000410011:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000324864:exon_128396005_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000355119:exon_128396005_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000342067:exon_128396005_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000410038:exon_128396045_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000413578:exon_128396558_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409254:exon_128396772_128397003:LIMS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 128495645 G/A 1 5 12 17 2.34890728145629 6.3626225245049 -4.01371524304861 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0555950391100387 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 128757995 A/C 1 9 13 22 4.22803310662132 6.89284106821365 -2.66480796159232 A:C A C 10 0.530218543708742 0.289698673189133 ENSG00000136715:ENST00000259235:exon_128757881_128758028:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000357702:exon_128757881_128758028:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000259234:exon_128757881_128758028:SAP130 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 128939799 C/T 1 8 4 12 3.75825165033006 2.12087417483497 1.6373774754951 T:C C T 10 0.530218543708742 0.398218675970565 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 10 6 16 4.69781456291258 3.18131126225245 1.51650330066013 A:G G A 10 0.530218543708742 0.617951383515179 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 130910910 C/T 1 39 43 82 18.3214767953591 22.7993973794759 -4.47792058411684 T:C C T 10 0.530218543708742 0.376224134234112 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000491319:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000491128:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000482171:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000453750:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130910892_130911023:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130910892_130911023:SMPD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 132258593 A/G 1 2 6 8 0.939562912582516 3.18131126225245 -2.24174834966994 A:G A G 10 0.530218543708742 0.158929006468168 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 132277686 C/T 1 15 14 29 7.04672184436887 7.42305961192239 -0.376337767553518 T:C C T 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 135214259 G/A 1 1 7 8 0.469781456291258 3.71152980596119 -3.24174834966994 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0300386507500581 ENSG00000152128:ENST00000281924:exon_135213330_135214347:TMEM163;ENSG00000152128:ENST00000467316:exon_135213331_135214347:TMEM163;ENSG00000152128:ENST00000476823:exon_135213335_135214347:TMEM163 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 135711516 C/T 1 14 15 29 6.57694038807761 7.95327815563113 -1.37633776755352 T:C C T 10 0.530218543708742 0.710719764615262 ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 135711657 G/A 1 25 27 52 11.7445364072814 14.315900680136 -2.57136427285458 A:G G A 10 0.530218543708742 0.490346034709667 ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 135911393 A/C 1 36 36 72 16.9121324264853 19.0878675735147 -2.17573514702942 A:C A C 10 0.530218543708742 0.637856479514091 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 136409574 A/C 1 27 15 42 12.684099319864 7.95327815563113 4.73082116423284 A:C A C 10 0.530218543708742 0.164947238581477 ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000429703:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000487294:exon_136409300_136409591:R3HDM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 144764874 G/A 1 7 4 11 3.28847019403881 2.12087417483497 1.16759601920384 A:G G A 10 0.530218543708742 0.557007995713773 ENSG00000121964:ENST00000392869:exon_144764749_144765102:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000409214:exon_144764749_144765102:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000344850:exon_144764749_144765102:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000241391:exon_144764749_144765102:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392867:exon_144764749_144765102:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392871:exon_144764749_144765102:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000415569:exon_144764749_144765102:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000463875:exon_144764749_144765110:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000491448:exon_144763318_144765102:GTDC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 145156393 A/G 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G A G 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000169554:ENST00000303660:exon_145155868_145157837:ZEB2;ENSG00000169554:ENST00000409487:exon_145155868_145157837:ZEB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 150432976 C/T 1 106 93 199 49.7968343668733 49.310324564913 0.486509801960345 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150432951_150432992:MMADHC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 159497223 G/A 1 14 7 21 6.57694038807761 3.71152980596119 2.86541058211642 A:G G A 10 0.530218543708742 0.275142109059742 ENSG00000144283:ENST00000426248:exon_159497139_159497271:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000389757:exon_159497139_159497271:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000389759:exon_159497139_159497271:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000428353:exon_159497139_159497271:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000452162:exon_159497139_159497271:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000421462:exon_159497139_159497271:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000389756:exon_159497143_159497271:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000494945:exon_159497139_159497271:PKP4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 171 170 341 80.3326290258051 90.1371524304861 -9.80452340468102 T:C C T 10 0.530218543708742 0.30271741986006 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 163137871 C/G 1 30 30 60 14.0934436887377 15.9065563112623 -1.81311262252452 C:G C G 10 0.530218543708742 0.698589548875233 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 163137983 T/C 1 30 35 65 14.0934436887377 18.557649029806 -4.46420534106823 T:C T C 10 0.530218543708742 0.320189288280246 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 171822576 C/T 1 125 124 249 58.7226820364072 65.747099419884 -7.02441738347676 T:C C T 10 0.530218543708742 0.374911455274951 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 171850329 T/G 1 107 113 220 50.2666158231646 59.9146954390878 -9.64807961592324 T:G T G 10 0.530218543708742 0.199734557906526 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171850202_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000356075:exon_171850007_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171850017_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171850237_171850466:TLK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 174828642 G/A 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G G A 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000172845:ENST00000418194:exon_174828489_174828947:SP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 175436376 A/C 1 36 48 84 16.9121324264853 25.4504900980196 -8.53835767153432 A:C A C 10 0.530218543708742 0.0638609187959408 ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 182780126 G/A 1 34 29 63 15.9725695139028 15.3763377675535 0.596231746349256 A:G G A 10 0.530218543708742 0.900280665569595 ENSG00000138434:ENST00000431877:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000320370:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000409001:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000261006:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000428267:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000454579:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000440623:exon_182779943_182781732:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000416081:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000491720:exon_182779943_182783402:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000409136:exon_182779943_182781154:SSFA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 184025875 G/T 1 28 32 60 13.1538807761552 16.9669933986797 -3.81311262252452 T:G G T 10 0.530218543708742 0.365836243225964 ENSG00000163002:ENST00000409798:exon_184025782_184026166:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000295119:exon_184025782_184026408:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000374930:exon_184025782_184025972:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000479162:exon_184024216_184026408:NUP35 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 184025876 A/T 1 28 31 59 13.1538807761552 16.436774854971 -3.28289407881578 A:T A T 10 0.530218543708742 0.434717106145806 ENSG00000163002:ENST00000409798:exon_184025782_184026166:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000295119:exon_184025782_184026408:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000374930:exon_184025782_184025972:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000479162:exon_184024216_184026408:NUP35 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 190323530 A/G 1 11 7 18 5.16759601920384 3.71152980596119 1.45606621324264 A:G A G 10 0.530218543708742 0.638243716970554 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190323479_190323598:WDR75 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 191224927 C/T 1 4 7 11 1.87912582516503 3.71152980596119 -1.83240398079616 T:C C T 10 0.530218543708742 0.367650802678922 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 191224981 G/T 1 7 10 17 3.28847019403881 5.30218543708742 -2.01371524304861 T:G G T 10 0.530218543708742 0.343429778687472 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 200790216 C/T 1 32 19 51 15.0330066013203 10.0741523304661 4.95885427085416 T:C C T 10 0.530218543708742 0.206361817545954 ENSG00000178074:ENST00000319974:exon_200789785_200792996:C2orf69 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 201397724 G/A 1 7 3 10 3.28847019403881 1.59065563112623 1.69781456291258 A:G G A 10 0.530218543708742 0.352695224731846 ENSG00000163535:ENST00000418045:exon_201397697_201397831:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201397697_201397831:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201397697_201397831:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000409203:exon_201397697_201397831:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000460534:exon_201397697_201398098:SGOL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 202245244 A/G 1 26 8 34 12.2143178635727 4.24174834966994 7.97256951390277 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00583106984027068 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202241930_202245941:TRAK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 202626242 C/T 1 9 2 11 4.22803310662132 1.06043708741748 3.16759601920384 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0707395200860403 ENSG00000003393:ENST00000264276:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000457679:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000482891:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000482789:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000467448:exon_202624183_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000409666:exon_202625526_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000496244:exon_202626126_202626541:ALS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 207008763 C/A 1 35 38 73 16.442350970194 20.1483046609322 -3.70595369073817 A:T:C C A 10 0.530218543708742 0.412877348598645 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 207025444 T/C 1 10 6 16 4.69781456291258 3.18131126225245 1.51650330066013 T:C T C 10 0.530218543708742 0.617951383515179 ENSG00000114942:ENST00000479587:exon_207025312_207025841:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000460760:exon_207025312_207025914:EEF1B2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 27 34 61 12.684099319864 18.0274304860972 -5.34333116623326 A:G A G 10 0.530218543708742 0.1994952793227 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 12 10 22 5.6373774754951 5.30218543708742 0.335192038407676 A:C C A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 209190632 T/G 1 6 8 14 2.81868873774755 4.24174834966994 -1.42305961192239 T:G T G 10 0.530218543708742 0.594188084236152 ENSG00000115020:ENST00000264380:exon_209189994_209191153:PIKFYVE;ENSG00000115020:ENST00000443896:exon_209189994_209190831:PIKFYVE;ENSG00000115020:ENST00000451223:exon_209189994_209191153:PIKFYVE;ENSG00000115020:ENST00000453820:exon_209189994_209191153:PIKFYVE;ENSG00000115020:ENST00000392200:exon_209189994_209191153:PIKFYVE;ENSG00000115020:ENST00000452564:exon_209189994_209191153:PIKFYVE HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 209190649 A/G 1 7 7 14 3.28847019403881 3.71152980596119 -0.423059611922388 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000115020:ENST00000264380:exon_209189994_209191153:PIKFYVE;ENSG00000115020:ENST00000443896:exon_209189994_209190831:PIKFYVE;ENSG00000115020:ENST00000451223:exon_209189994_209191153:PIKFYVE;ENSG00000115020:ENST00000453820:exon_209189994_209191153:PIKFYVE;ENSG00000115020:ENST00000392200:exon_209189994_209191153:PIKFYVE;ENSG00000115020:ENST00000452564:exon_209189994_209191153:PIKFYVE HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 216908679 C/T 1 6 8 14 2.81868873774755 4.24174834966994 -1.42305961192239 T:C C T 10 0.530218543708742 0.594188084236152 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216908627_216908738:PECR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 219103580 A/G 0 0 9 9 0 4.77196689337868 -4.77196689337868 G A G 10 0.530218543708742 0.00111445574837298 ENSG00000163466:ENST00000465395:exon_219103387_219103918:ARPC2;ENSG00000163466:ENST00000472753:exon_219103387_219103740:ARPC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 219130802 T/C 1 55 48 103 25.8379800960192 25.4504900980196 0.387489997999577 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000127837:ENST00000248450:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000444053:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000475678:exon_219130302_219131310:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000420660:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000489767:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000422731:exon_219130778_219130804:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000465442:exon_219130787_219130870:AAMP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 27 25 52 12.684099319864 13.2554635927186 -0.571364272854584 C:G G C 10 0.530218543708742 0.890341998270227 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 219563504 C/T 1 9 6 15 4.22803310662132 3.18131126225245 1.04672184436887 T:C C T 10 0.530218543708742 0.617171705992842 ENSG00000163482:ENST00000295709:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000392106:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000392105:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000440309:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000431040:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000419433:exon_219563325_219564071:STK36 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 15 14 29 7.04672184436887 7.42305961192239 -0.376337767553518 A:T:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 220037666 A/G 1 135 82 217 63.4204965993198 43.4779205841168 19.942576015203 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00784696436064704 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 220037756 A/G 1 111 114 225 52.1457416483296 60.4449139827966 -8.29917233446695 A:G A G 10 0.530218543708742 0.285355735264132 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 220040330 A/G 1 40 46 86 18.7912582516503 24.3900530106021 -5.59879475895181 A:G A G 10 0.530218543708742 0.236130759572378 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000451647:exon_220040313_220040394:C2orf24 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 220045454 G/A 1 29 24 53 13.6236622324465 12.7252450490098 0.898417183436676 A:G G A 10 0.530218543708742 0.890787573017204 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443757:exon_220045392_220045473:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452293:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430747:exon_220045392_220045472:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045390_220045476:FAM134A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 220046975 C/A 1 62 68 130 29.126450290058 36.0548609721945 -6.92841068213646 A:C C A 10 0.530218543708742 0.25327064078568 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 220047173 A/T 1 71 56 127 33.3544833966793 29.6922384476896 3.66224494898977 A:T A T 10 0.530218543708742 0.534770081699047 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220047136_220047351:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 220047393 C/T 1 56 73 129 26.3077615523104 38.7059536907382 -12.3981921384277 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0338929068389101 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 220115026 C/T 1 88 85 173 41.3407681536307 45.0685762152431 -3.72780806161236 T:C C T 10 0.530218543708742 0.594294152469315 ENSG00000115661:ENST00000409638:exon_220113143_220115059:STK16;ENSG00000127824:ENST00000248437:exon_220114433_220116045:TUBA4A;ENSG00000127824:ENST00000392088:exon_220114433_220116045:TUBA4A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 220406722 T/C 1 15 20 35 7.04672184436887 10.6043708741748 -3.55764902980597 T:C T C 10 0.530218543708742 0.240286553276909 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 220480958 G/T 1 9 12 21 4.22803310662132 6.3626225245049 -2.13458941788358 T:G G T 10 0.530218543708742 0.387625542901861 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220480766_220481173:AC009955.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 225346646 T/C 1 73 85 158 34.2940463092618 45.0685762152431 -10.7745299059812 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0940761655826187 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225346609_225346795:CUL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 225362478 C/T 1 68 59 127 31.9451390278055 31.2828940788158 0.662244948989766 T:C C T 10 0.530218543708742 0.929358873823759 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000451538:exon_225362470_225362536:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000487558:exon_225362470_225362566:CUL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 230632268 G/A 1 157 150 307 73.7556886377275 79.5327815563113 -5.7770929185838 A:G G A 10 0.530218543708742 0.529550145921572 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230631930_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230632157_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230632157_230632466:TRIP12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 230656629 G/A 1 67 47 114 31.4753575715143 24.9202715543109 6.55508601720341 A:G G A 10 0.530218543708742 0.224100714521537 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230656582_230656781:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230656582_230656781:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230656582_230656781:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000470302:exon_230656504_230656781:TRIP12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 231077112 G/A 1 65 57 122 30.5357946589318 30.2224569913983 0.313337667533478 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077111_231077145:SP110 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 8 13 21 3.75825165033006 6.89284106821365 -3.13458941788358 T:C T C 10 0.530218543708742 0.193644496250896 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 71 68 139 33.3544833966793 36.0548609721945 -2.70037757551513 A:G G A 10 0.530218543708742 0.671409026713221 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 231406680 T/C 1 10 15 25 4.69781456291258 7.95327815563113 -3.25546359271855 T:C T C 10 0.530218543708742 0.230578617079935 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406607_231406750:SP100 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 28 27 55 13.1538807761552 14.315900680136 -1.16201990398081 T:C C T 10 0.530218543708742 0.788032161313036 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 41 33 74 19.2610397079416 17.4972119423885 1.76382776555309 A:C:G G A 10 0.530218543708742 0.727559649280646 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 166 36 202 77.9837217443488 19.0878675735147 58.8958541708341 T:C C T 10 0.530218543708742 4.9803520016896e-18 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 1 152 6 158 71.4067813562712 3.18131126225245 68.2254700940188 A:G G A 10 0.530218543708742 5.07887136682191e-34 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 233201328 A/G 1 2 8 10 0.939562912582516 4.24174834966994 -3.30218543708742 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0537596124644068 ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_233201179_233201907:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_233201179_233201908:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_233200924_233201687:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_233201179_233201340:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000429283:exon_233199079_233201686:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000418143:exon_233201020_233201684:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000417808:exon_233200851_233201683:DIS3L2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 233925166 G/A 1 30 36 66 14.0934436887377 19.0878675735147 -4.99442388477697 A:G G A 10 0.530218543708742 0.220569865147207 ENSG00000168918:ENST00000422935:exon_233924677_233925322:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000451407:exon_233925062_233925322:INPP5D HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 234113057 G/A 1 123 124 247 57.7831191238247 65.747099419884 -7.96398029605928 A:G G A 10 0.530218543708742 0.338996789602994 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 234749269 G/A 1 51 46 97 23.9588542708542 24.3900530106021 -0.431198739747973 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 61 58 119 28.6566688337667 30.752675535107 -2.0960067013403 C:G G C 10 0.530218543708742 0.714168319487087 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 234761225 C/T 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234761211_234761266:HJURP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 238668802 A/G 1 77 63 140 36.1731721344269 33.4037682536507 2.76940388077612 A:G A G 10 0.530218543708742 0.672485096907848 ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 149 116 265 69.9974369873974 61.5053510702141 8.49208591718338 A:C:G A G 10 0.530218543708742 0.324790886837831 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 238671609 A/G 1 179 135 314 84.0908806761352 71.5795034006802 12.511377275455 A:G A G 10 0.530218543708742 0.158082611061957 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 238671889 G/A 1 225 168 393 105.700827665533 89.0767153430687 16.6241123224644 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.0954951119389689 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 238671940 C/T 1 233 207 440 109.459079315863 109.75523854771 -0.296159231846474 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 192 150 342 90.1980396079215 79.5327815563113 10.6652580516102 C:G C G 10 0.530218543708742 0.255584939136034 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 238672795 C/T 1 124 161 285 58.252900580116 85.3651855371075 -27.1122849569915 A:T:C:G C T 10 0.530218543708742 0.00133425303095602 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 14 11 25 6.57694038807761 5.83240398079616 0.74453640728145 T:C T C 10 0.530218543708742 0.842713046828003 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 239006933 C/T 1 9 13 22 4.22803310662132 6.89284106821365 -2.66480796159232 T:C C T 10 0.530218543708742 0.289698673189133 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 38 24 62 17.8516953390678 12.7252450490098 5.126450290058 T:C T C 10 0.530218543708742 0.205079864596166 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 242380748 T/A 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 A:T T A 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000006607:ENST00000264042:exon_242380719_242380971:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000373287:exon_242380719_242380971:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000413432:exon_242380719_242381167:FARP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 242573211 T/C 1 84 91 175 39.4616423284657 48.2498874774955 -8.78824514902985 T:C T C 10 0.530218543708742 0.198002226168427 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 242610773 T/A 1 51 50 101 23.9588542708542 26.5109271854371 -2.55207291458294 A:T T A 10 0.530218543708742 0.619621409087707 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 46 39 85 21.6099469893979 20.6785232046409 0.93142378475693 A:G A G 10 0.530218543708742 0.913572524541748 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 242648761 C/T 1 11 6 17 5.16759601920384 3.18131126225245 1.98628475695139 T:C C T 10 0.530218543708742 0.46729790202122 ENSG00000168395:ENST00000492488:exon_242648631_242648797:ING5;ENSG00000168395:ENST00000313552:exon_242648631_242648797:ING5;ENSG00000168395:ENST00000482774:exon_242648631_242648797:ING5;ENSG00000168395:ENST00000406941:exon_242648631_242648797:ING5;ENSG00000168395:ENST00000493261:exon_242648631_242648797:ING5;ENSG00000168395:ENST00000445620:exon_242648631_242648797:ING5;ENSG00000168395:ENST00000489509:exon_242648631_242648797:ING5;ENSG00000168395:ENST00000484145:exon_242648501_242648797:ING5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 242674803 G/A 1 20 21 41 9.39562912582516 11.1345894178836 -1.73896029205842 A:G G A 10 0.530218543708742 0.64021821439979 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000342518:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000463932:exon_242674547_242674931:D2HGDH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 242690675 G/A 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 A:G G A 10 0.530218543708742 0.797017339461022 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 242690745 C/T 1 4 11 15 1.87912582516503 5.83240398079616 -3.95327815563113 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0665948341907382 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 242690770 T/C 1 15 2 17 7.04672184436887 1.06043708741748 5.98628475695139 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00305248997300566 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 242793273 A/G 1 24 22 46 11.2747549509902 11.6648079615923 -0.390053010602131 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 2 242793433 G/A 1 24 21 45 11.2747549509902 11.1345894178836 0.140165533106611 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000343705:exon_242793385_242793449:PDCD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 371972 T/C 1 16 18 34 7.51650330066013 9.54393378675736 -2.02743048609723 T:C T C 10 0.530218543708742 0.497520057256665 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 68 52 120 31.9451390278055 27.5713642728546 4.37377475495096 T:C C T 10 0.530218543708742 0.464705106672832 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 83 74 157 38.9918608721744 39.2361722344469 -0.244311362272491 T:G T G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 36 50 86 16.9121324264853 26.5109271854371 -9.59879475895181 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0402847590077851 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 1291076 G/C 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000125775:ENST00000381812:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000381808:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000360779:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000339987:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000467129:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000245974:exon_1290627_1291139:SDCBP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 32 43 75 15.0330066013203 22.7993973794759 -7.76639077815565 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0824562105570668 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 2464984 T/C 1 9 4 13 4.22803310662132 2.12087417483497 2.10715893178635 T:C T C 10 0.530218543708742 0.278259851701685 ENSG00000088876:ENST00000278772:exon_2462463_2465302:ZNF343;ENSG00000088876:ENST00000465019:exon_2462463_2465302:ZNF343 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 2635212 A/G 1 127 94 221 59.6622449489898 49.8405431086217 9.82170184036802 A:G A G 10 0.530218543708742 0.200437726590641 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000496775:exon_2634880_2635221:NOP56 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 2636218 C/A 1 13 28 41 6.10715893178635 14.8461192238448 -8.73896029205842 A:C C A 10 0.530218543708742 0.00731801018902205 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 2638492 G/A 1 70 45 115 32.8847019403881 23.8598344668934 9.02486747349467 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0935129018610452 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 3765373 G/A 1 148 128 276 69.5276555311062 67.867973594719 1.65968193638722 A:G G A 10 0.530218543708742 0.856620834807847 ENSG00000125817:ENST00000379751:exon_3764500_3767337:CENPB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 3842984 C/T 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 T:C C T 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3842901_3843060:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000416600:exon_3842901_3843060:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3842901_3843060:MAVS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 5550862 G/A 1 20 10 30 9.39562912582516 5.30218543708742 4.09344368873774 A:G G A 10 0.530218543708742 0.146787236795718 ENSG00000125772:ENST00000378992:exon_5550793_5550885:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000379019:exon_5550793_5550885:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000481038:exon_5550793_5550885:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000418646:exon_5550793_5550885:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000473797:exon_5550793_5550885:GPCPD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 40 22 62 18.7912582516503 11.6648079615923 7.126450290058 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0753212344081365 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 5924828 A/G 1 9 17 26 4.22803310662132 9.01371524304861 -4.78568213642729 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0760303242140064 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000493972:exon_5924808_5924899:TRMT6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 5935303 A/C 1 5 12 17 2.34890728145629 6.3626225245049 -4.01371524304861 A:C A C 10 0.530218543708742 0.0555950391100387 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5935254_5935336:MCM8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 5974265 A/G 1 7 9 16 3.28847019403881 4.77196689337868 -1.48349669933987 A:G A G 10 0.530218543708742 0.46678737179182 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5974152_5974341:MCM8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 33 77 110 15.5027880576115 40.8268278655731 -25.3240398079616 T:C C T 10 0.530218543708742 1.25094374588562e-06 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 10386013 C/A 1 18 23 41 8.45606621324264 12.1950265053011 -3.73896029205842 A:C C A 10 0.530218543708742 0.274614379098915 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 10386059 G/A 1 17 22 39 7.98628475695139 11.6648079615923 -3.67852320464094 A:G G A 10 0.530218543708742 0.263459903622888 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 10393629 G/A 1 12 14 26 5.6373774754951 7.42305961192239 -1.78568213642729 A:G G A 10 0.530218543708742 0.557496480025126 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10393178_10394162:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10393178_10394579:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10393178_10394579:MKKS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 10394046 G/A 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 A:G G A 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10393178_10394162:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10393178_10394579:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10393178_10394579:MKKS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 10594363 G/A 0 57 0 57 26.7775430086017 0 26.7775430086017 G G 10 0.530218543708742 2.09734606327571e-16 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 10620275 G/A 1 9 10 19 4.22803310662132 5.30218543708742 -1.0741523304661 A:G G A 10 0.530218543708742 0.652256323352804 ENSG00000101384:ENST00000254958:exon_10618332_10620603:JAG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 13695680 C/T 1 46 43 89 21.6099469893979 22.7993973794759 -1.18945039007804 T:C C T 10 0.530218543708742 0.832244419111085 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 12 16 28 5.6373774754951 8.48349669933987 -2.84611922384478 A:C C A 10 0.530218543708742 0.344613553609419 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 23 15 38 10.8049734946989 7.95327815563113 2.8516953390678 A:G G A 10 0.530218543708742 0.417545477422256 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 18131563 T/C 1 3 11 14 1.40934436887377 5.83240398079616 -4.42305961192239 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0285048765274962 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18131465_18131586:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18131465_18131586:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18131465_18131586:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18131465_18131586:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18131465_18131586:CSRP2BP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 18143355 C/T 1 11 18 29 5.16759601920384 9.54393378675736 -4.37633776755352 T:C C T 10 0.530218543708742 0.135661579784991 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18143021_18143589:CSRP2BP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 18462421 A/G 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000132664:ENST00000377603:exon_18462263_18462454:POLR3F;ENSG00000132664:ENST00000462997:exon_18462263_18462454:POLR3F HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 18523002 C/G 1 38 30 68 17.8516953390678 15.9065563112623 1.94513902780554 C:G C G 10 0.530218543708742 0.715854803603245 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18522940_18523046:SEC23B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 T:C T C 10 0.530218543708742 0.565817448386735 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 23345844 A/C 1 15 13 28 7.04672184436887 6.89284106821365 0.153880776155224 A:C A C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 25038484 G/T 1 21 19 40 9.86541058211642 10.0741523304661 -0.208741748349681 T:G G T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_25038405_25038818:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376726:exon_25038405_25039616:ACSS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 25260931 A/G 1 12 4 16 5.6373774754951 2.12087417483497 3.51650330066013 A:G A G 10 0.530218543708742 0.085348639876271 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25260902_25261048:PYGB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 25262769 G/A 1 9 5 14 4.22803310662132 2.65109271854371 1.57694038807761 A:G G A 10 0.530218543708742 0.43589870850422 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25262669_25262783:PYGB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 25264814 T/C 1 10 5 15 4.69781456291258 2.65109271854371 2.04672184436887 T:C T C 10 0.530218543708742 0.315050043511805 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25264740_25264887:PYGB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 25276297 G/A 1 25 28 53 11.7445364072814 14.8461192238448 -3.10158281656333 A:G G A 10 0.530218543708742 0.411702638901328 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000428458:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000471359:exon_25276240_25276306:PYGB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 25282944 A/G 1 20 10 30 9.39562912582516 5.30218543708742 4.09344368873774 A:G A G 10 0.530218543708742 0.146787236795718 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 25288632 G/A 1 23 11 34 10.8049734946989 5.83240398079616 4.97256951390277 A:G G A 10 0.530218543708742 0.120766761298837 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000491682:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000481556:exon_25288602_25288681:ABHD12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 25398790 G/A 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 A:G G A 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000101003:ENST00000429262:exon_25398741_25398831:GINS1;ENSG00000101003:ENST00000262460:exon_25398741_25398831:GINS1;ENSG00000101003:ENST00000484893:exon_25398741_25398831:GINS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 30449181 G/A 1 5 13 18 2.34890728145629 6.89284106821365 -4.54393378675736 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0351116074210844 ENSG00000149599:ENST00000398084:exon_30448870_30449478:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000339738:exon_30448870_30449478:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000486996:exon_30448870_30449478:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000375966:exon_30448870_30449478:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000398083:exon_30448870_30449478:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000375952:exon_30448870_30449478:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000375953:exon_30448870_30449478:DUSP15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 30915461 T/C 1 18 10 28 8.45606621324264 5.30218543708742 3.15388077615522 T:C T C 10 0.530218543708742 0.260090119705735 ENSG00000101350:ENST00000375712:exon_30915359_30915464:KIF3B;ENSG00000101350:ENST00000418717:exon_30915359_30915464:KIF3B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 31022469 G/A 1 15 24 39 7.04672184436887 12.7252450490098 -5.67852320464094 A:G G A 10 0.530218543708742 0.07786717866728 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 31024274 T/C 1 59 60 119 27.7171059211842 31.8131126225245 -4.0960067013403 T:C T C 10 0.530218543708742 0.46374408829259 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 31025163 A/G 1 14 21 35 6.57694038807761 11.1345894178836 -4.55764902980597 A:G A G 10 0.530218543708742 0.130448708001807 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 32264533 C/A 1 36 50 86 16.9121324264853 26.5109271854371 -9.59879475895181 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0402847590077851 ENSG00000101412:ENST00000343380:exon_32263489_32264785:E2F1;ENSG00000101412:ENST00000402461:exon_32263489_32264785:E2F1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 33356388 C/T 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33356267_33356389:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33356267_33356389:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33356267_33356389:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000397669:exon_33356267_33356389:NCOA6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 12 7 19 5.6373774754951 3.71152980596119 1.9258476695339 T:C C T 10 0.530218543708742 0.492071463010612 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 34090519 G/A 1 22 24 46 10.3351920384077 12.7252450490098 -2.39005301060213 A:G G A 10 0.530218543708742 0.555218088560173 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425525:exon_34090218_34090632:CEP250 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 34218673 G/C 1 134 31 165 62.9507151430286 16.436774854971 46.5139402880576 A:T:C:G G C 10 0.530218543708742 4.83300003567934e-14 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34218361_34218956:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34218663_34218717:CPNE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 34219496 T/C 1 149 32 181 69.9974369873974 16.9669933986797 53.0304435887177 T:C T C 10 0.530218543708742 1.96017210583457e-16 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34219481_34219500:CPNE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 34243017 C/T 1 94 88 182 44.1594568913783 46.6592318463693 -2.49977495499104 T:C:G C T 10 0.530218543708742 0.711194130515495 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000431148:exon_34242815_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000435161:exon_34242843_34243266:RBM12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 35128751 G/A 1 67 63 130 31.4753575715143 33.4037682536507 -1.92841068213646 A:G G A 10 0.530218543708742 0.792214896527408 ENSG00000080845:ENST00000373913:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000373907:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000401952:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000339266:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000475894:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000482872:exon_35128602_35128763:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000495241:exon_35128602_35129000:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000340491:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000489701:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000479951:exon_35128602_35128930:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000478910:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000483381:exon_35128742_35128821:DLGAP4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 39797465 T/C 1 6 13 19 2.81868873774755 6.89284106821365 -4.0741523304661 T:C T C 10 0.530218543708742 0.068469288507053 ENSG00000124181:ENST00000244007:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373271:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373272:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000477870:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000483175:exon_39797396_39797510:PLCG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 40034097 A/G 1 3 7 10 1.40934436887377 3.71152980596119 -2.30218543708742 A:G A G 10 0.530218543708742 0.206122472271196 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40030741_40034129:CHD6;ENSG00000124177:ENST00000480022:exon_40033163_40034129:CHD6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 40043913 C/T 1 8 16 24 3.75825165033006 8.48349669933987 -4.72524504900981 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0651871577391257 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40043826_40044278:CHD6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 42328639 T/C 1 184 100 284 86.4397879575915 53.0218543708742 33.4179335867173 T:C T C 10 0.530218543708742 6.4707025469559e-05 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42328397_42328684:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42328397_42328684:MYBL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 27 36 63 12.684099319864 19.0878675735147 -6.40376825365074 A:G G A 10 0.530218543708742 0.129298741108337 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 44505830 C/T 1 3 8 11 1.40934436887377 4.24174834966994 -2.83240398079616 T:C C T 10 0.530218543708742 0.129086131769062 ENSG00000132801:ENST00000255152:exon_44505353_44507761:ZSWIM3;ENSG00000132801:ENST00000454862:exon_44505353_44507767:ZSWIM3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 44506661 G/A 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 A:G G A 10 0.530218543708742 0.247617633272995 ENSG00000132801:ENST00000255152:exon_44505353_44507761:ZSWIM3;ENSG00000132801:ENST00000454862:exon_44505353_44507767:ZSWIM3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 44507307 T/C 1 10 7 17 4.69781456291258 3.71152980596119 0.986284756951386 T:C T C 10 0.530218543708742 0.808994386671346 ENSG00000132801:ENST00000255152:exon_44505353_44507761:ZSWIM3;ENSG00000132801:ENST00000454862:exon_44505353_44507767:ZSWIM3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 44520579 C/G 1 21 26 47 9.86541058211642 13.7856821364273 -3.92027155431087 C:G C G 10 0.530218543708742 0.306385560408984 ENSG00000064601:ENST00000372471:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000372484:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000354880:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000191018:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000419493:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000372459:exon_44520555_44520666:CTSA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 44596207 C/G 1 11 8 19 5.16759601920384 4.24174834966994 0.925847669533902 C:G C G 10 0.530218543708742 0.8192074586227 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44595506_44596273:ZNF335 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 44596545 G/A 1 10 8 18 4.69781456291258 4.24174834966994 0.456066213242644 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44596373_44597497:ZNF335 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 28 26 54 13.1538807761552 13.7856821364273 -0.631801360272068 T:G T G 10 0.530218543708742 0.892174189122599 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 44757524 C/G 1 185 200 385 86.9095694138827 106.043708741748 -19.1341393278657 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0523839526843985 ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44757521_44758502:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44757521_44758502:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44756969_44758153:CD40;ENSG00000101017:ENST00000466205:exon_44757521_44757765:CD40;ENSG00000101017:ENST00000489304:exon_44757521_44758502:CD40;ENSG00000101017:ENST00000477696:exon_44757521_44757643:CD40 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 45315346 C/T 1 37 29 66 17.3819138827765 15.3763377675535 2.00557611522303 T:C C T 10 0.530218543708742 0.711726685061048 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 45318042 G/A 1 13 26 39 6.10715893178635 13.7856821364273 -7.67852320464094 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0156775209399902 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 45318069 C/G 1 27 32 59 12.684099319864 16.9669933986797 -4.28289407881578 C:G C G 10 0.530218543708742 0.297336160824213 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 45853037 A/G 1 26 41 67 12.2143178635727 21.7389602920584 -9.52464242848571 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0202919493912678 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45852970_45853209:ZMYND8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 45867852 A/G 1 45 43 88 21.1401655331066 22.7993973794759 -1.65923184636929 A:G A G 10 0.530218543708742 0.74941430360033 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45866054_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45867242_45867882:ZMYND8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 47258763 C/T 1 42 25 67 19.7308211642328 13.2554635927186 6.47535757151429 T:C C T 10 0.530218543708742 0.141341941503143 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000496915:exon_47258651_47258796:PREX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 47261017 T/C 1 56 57 113 26.3077615523104 30.2224569913983 -3.91469543908784 T:C T C 10 0.530218543708742 0.509641432067124 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47260947_47261035:PREX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 47267480 A/G 1 34 25 59 15.9725695139028 13.2554635927186 2.71710592118422 A:G A G 10 0.530218543708742 0.516014587140935 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267432_47267593:PREX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 47267940 G/A 1 34 41 75 15.9725695139028 21.7389602920584 -5.76639077815565 A:G G A 10 0.530218543708742 0.203465493901469 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267934_47268121:PREX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 47269233 C/G 1 20 15 35 9.39562912582516 7.95327815563113 1.44235097019403 C:G C G 10 0.530218543708742 0.735513376094186 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47269124_47269244:PREX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 47273726 C/T 1 22 15 37 10.3351920384077 7.95327815563113 2.38191388277655 T:C C T 10 0.530218543708742 0.511058987485558 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47273578_47273726:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47273578_47273726:PREX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 47630449 C/T 1 7 13 20 3.28847019403881 6.89284106821365 -3.60437087417484 T:C C T 10 0.530218543708742 0.120271474866196 ENSG00000124198:ENST00000371917:exon_47630368_47630497:ARFGEF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 36 33 69 16.9121324264853 17.4972119423885 -0.585079515903196 T:C C T 10 0.530218543708742 0.904523173564931 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 47855496 C/T 1 99 99 198 46.5083641728345 52.4916358271655 -5.98327165433092 T:C C T 10 0.530218543708742 0.394121786953117 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47855486_47855592:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47855486_47855592:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000471144:exon_47855486_47855592:DDX27;ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47854483_47855837:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000469991:exon_47855480_47855837:ZNFX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 47864833 G/A 1 57 40 97 26.7775430086017 21.2087417483497 5.56880126025203 A:G G A 10 0.530218543708742 0.265054218707592 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 47865372 G/A 1 39 27 66 18.3214767953591 14.315900680136 4.00557611522303 A:G G A 10 0.530218543708742 0.388177399257759 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 33 41 74 15.5027880576115 21.7389602920584 -6.23617223444691 A:G G A 10 0.530218543708742 0.162530708052508 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 47886684 G/A 1 9 18 27 4.22803310662132 9.54393378675736 -5.31590068013603 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0524474966934978 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47886479_47887760:ZNFX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 47886876 T/C 1 19 30 49 8.9258476695339 15.9065563112623 -6.98070864172836 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0616923123395674 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47886479_47887760:ZNFX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 48257065 A/G 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 A:G A G 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000158470:ENST00000371711:exon_48257015_48257202:B4GALT5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 22 39 61 10.3351920384077 20.6785232046409 -10.3433311662333 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00980786216627846 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 48522392 G/A 1 37 28 65 17.3819138827765 14.8461192238448 2.53579465893177 A:G G A 10 0.530218543708742 0.537727874290254 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 49196284 C/T 1 42 48 90 19.7308211642328 25.4504900980196 -5.71966893378678 A:T:C C T 10 0.530218543708742 0.245963103687510 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49196240_49196463:PTPN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 50092027 T/G 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 T:G T G 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000101096:ENST00000371564:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000396009:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000371567:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000414705:exon_50091995_50092197:NFATC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 50803444 C/T 1 5 9 14 2.34890728145629 4.77196689337868 -2.42305961192239 T:C C T 10 0.530218543708742 0.284180524640790 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 50803573 G/A 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 A:G G A 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 52192408 C/T 1 31 15 46 14.563225145029 7.95327815563113 6.60994698939787 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0551954486270533 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000437222:exon_52192266_52192566:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 52193368 C/T 1 21 20 41 9.86541058211642 10.6043708741748 -0.738960292058422 T:C C T 10 0.530218543708742 0.876235151511188 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 52193660 G/A 1 14 16 30 6.57694038807761 8.48349669933987 -1.90655631126226 A:G G A 10 0.530218543708742 0.584066368115557 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 52193698 G/A 1 13 18 31 6.10715893178635 9.54393378675736 -3.436774854971 A:G G A 10 0.530218543708742 0.280193232704031 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 52198967 A/G 1 15 20 35 7.04672184436887 10.6043708741748 -3.55764902980597 A:G A G 10 0.530218543708742 0.240286553276909 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52198000_52199707:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52198000_52199636:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52198000_52199707:ZNF217 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 57016062 G/A 1 14 12 26 6.57694038807761 6.3626225245049 0.214317863572709 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000124164:ENST00000475243:exon_57015963_57016139:VAPB;ENSG00000124164:ENST00000520497:exon_57015963_57016139:VAPB;ENSG00000124164:ENST00000265619:exon_57015963_57016139:VAPB;ENSG00000124164:ENST00000463370:exon_57015963_57016139:VAPB;ENSG00000124164:ENST00000341195:exon_57015963_57016139:VAPB;ENSG00000124164:ENST00000476395:exon_57014033_57016139:VAPB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 57564070 C/T 1 24 17 41 11.2747549509902 9.01371524304861 2.26103970794158 T:C C T 10 0.530218543708742 0.533344251281401 ENSG00000101158:ENST00000344018:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000482747:exon_57563969_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000460601:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000477741:exon_57563969_57564076:TH1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 96 94 190 45.0990198039608 49.8405431086217 -4.74152330466097 A:G A G 10 0.530218543708742 0.513375876557652 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 60572663 C/A 1 12 8 20 5.6373774754951 4.24174834966994 1.39562912582516 A:C C A 10 0.530218543708742 0.655843927791304 ENSG00000130699:ENST00000474089:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60572606_60572725:TAF4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 60585107 C/T 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 T:C C T 10 0.530218543708742 0.565817448386735 ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60585102_60585221:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60585102_60585221:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000486599:exon_60585102_60585189:TAF4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 60770931 A/G 1 5 11 16 2.34890728145629 5.83240398079616 -3.48349669933987 A:G A G 10 0.530218543708742 0.130369289858938 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000472005:exon_60770858_60771005:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466099:exon_60770858_60771005:GTPBP5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 60879598 A/C 1 99 84 183 46.5083641728345 44.5383576715343 1.97000650130021 A:C A C 10 0.530218543708742 0.82426068106271 ENSG00000130706:ENST00000423787:exon_60879517_60879633:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000370744:exon_60879517_60879633:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000253003:exon_60879517_60879633:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000465805:exon_60879215_60879633:ADRM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 60883273 A/C 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 A:C A C 10 0.530218543708742 0.565817448386735 ENSG00000130702:ENST00000492698:exon_60883011_60883502:LAMA5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 60966318 G/T 1 10 6 16 4.69781456291258 3.18131126225245 1.51650330066013 T:G G T 10 0.530218543708742 0.617951383515179 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60966305_60966509:CABLES2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 60968596 A/G 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60968496_60968661:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60968496_60968661:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60968496_60968661:CABLES2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 61287939 C/T 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 T:C C T 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000101187:ENST00000370512:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000217159:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000497209:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000370507:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000342674:exon_61287807_61288563:SLCO4A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 61528074 T/C 1 9 6 15 4.22803310662132 3.18131126225245 1.04672184436887 T:C T C 10 0.530218543708742 0.617171705992842 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61527883_61528348:DIDO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 61528306 A/G 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61527883_61528348:DIDO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 61588159 A/G 1 29 31 60 13.6236622324465 16.436774854971 -2.81311262252452 A:G A G 10 0.530218543708742 0.518540790819036 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000411611:exon_61588117_61588314:SLC17A9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 61595636 C/T 1 27 29 56 12.684099319864 15.3763377675535 -2.69223844768955 T:C:G C T 10 0.530218543708742 0.504815235804649 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61595580_61595667:SLC17A9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 20 61910270 G/A 1 12 2 14 5.6373774754951 1.06043708741748 4.57694038807761 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0151598116441243 ENSG00000101199:ENST00000370283:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000353546:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000370275:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519604:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000520485:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519531:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000518601:exon_61910251_61910347:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000522403:exon_61910251_61910347:ARFGAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 19169218 G/C 1 28 17 45 13.1538807761552 9.01371524304861 4.14016553310661 C:G G C 10 0.530218543708742 0.234761523153090 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 26976222 C/T 1 82 67 149 38.5220794158832 35.5246424284857 2.99743698739744 T:C C T 10 0.530218543708742 0.681680448071997 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 26976237 C/T 1 103 81 184 48.3874899979996 42.9477020404081 5.43978795759147 T:C C T 10 0.530218543708742 0.46030033449491 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 34925304 A/G 1 84 80 164 39.4616423284657 42.4174834966994 -2.95584116823369 A:G A G 10 0.530218543708742 0.695811152539236 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 34926043 G/A 1 111 174 285 52.1457416483296 92.2580266053211 -40.1122849569915 A:G G A 10 0.530218543708742 2.38666665912345e-06 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 216 242 458 101.472794558912 128.312887577516 -26.8400930186038 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0130276734170925 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 13 59 72 6.10715893178635 31.2828940788158 -25.1757351470294 T:C T C 10 0.530218543708742 1.49295281635640e-09 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 36080290 C/T 1 19 1 20 8.9258476695339 0.530218543708742 8.39562912582516 T:C C T 10 0.530218543708742 6.41927280257948e-05 ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36080242_36080367:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36080242_36080367:CLIC6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 37420650 G/A 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 A:G G A 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000185917:ENST00000399215:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399212:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000332131:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399205:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399208:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399201:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399207:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000414900:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000424303:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000429161:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000485865:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000446166:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000442559:exon_37420620_37420694:SETD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 37442632 G/C 1 38 48 86 17.8516953390678 25.4504900980196 -7.59879475895181 C:G G C 10 0.530218543708742 0.105866495574898 ENSG00000159228:ENST00000466328:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000439427:exon_37442313_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000399191:exon_37442333_37442702:CBR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 37444973 C/T 1 57 59 116 26.7775430086017 31.2828940788158 -4.50535107021407 T:C C T 10 0.530218543708742 0.404403902783422 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 31 32 63 14.563225145029 16.9669933986797 -2.40376825365075 A:G A G 10 0.530218543708742 0.614051697587201 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 40670460 G/C 1 5 12 17 2.34890728145629 6.3626225245049 -4.01371524304861 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0555950391100387 ENSG00000185658:ENST00000333229:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000342449:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380804:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380800:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380783:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000341322:exon_40668363_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000470108:exon_40670016_40670508:BRWD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 42771176 T/C 1 48 62 110 22.5495099019804 32.873549709942 -10.3240398079616 T:C T C 10 0.530218543708742 0.055729432434337 ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000482953:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000496774:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000493753:exon_42771123_42771693:MX2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 42812891 C/T 1 153 135 288 71.8765628125625 71.5795034006802 0.297059411882302 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42812814_42812952:MX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 42817930 G/A 1 394 332 726 185.093893778756 176.032556511302 9.0613372674533 A:G G A 10 0.530218543708742 0.503606436781722 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 241 261 502 113.217330966193 138.387039907982 -25.1697089417885 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0253456716527084 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 43161022 C/T 1 4 7 11 1.87912582516503 3.71152980596119 -1.83240398079616 T:C C T 10 0.530218543708742 0.367650802678922 ENSG00000183421:ENST00000332512:exon_43159529_43162157:RIPK4;ENSG00000183421:ENST00000352483:exon_43159545_43162157:RIPK4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 43221826 T/C 1 21 10 31 9.86541058211642 5.30218543708742 4.563225145029 T:C T C 10 0.530218543708742 0.108262387816145 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000486812:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000470586:exon_43221154_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000465955:exon_43221788_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000477633:exon_43221817_43221882:PRDM15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 43236176 G/A 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G G A 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000495217:exon_43236061_43236192:PRDM15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 C:G C G 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 44323461 G/A 1 24 26 50 11.2747549509902 13.7856821364273 -2.5109271854371 A:C:G G A 10 0.530218543708742 0.482818735216208 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 60 41 101 28.1868873774755 21.7389602920584 6.44792708541706 T:G T G 10 0.530218543708742 0.231480305464899 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 50 51 101 23.4890728145629 27.0411457291458 -3.55207291458294 A:G G A 10 0.530218543708742 0.487024503361101 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 45168884 G/A 1 22 38 60 10.3351920384077 20.1483046609322 -9.81311262252452 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0134660216223908 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398085:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45168876_45168961:PDXK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 46951556 A/G 1 7 11 18 3.28847019403881 5.83240398079616 -2.54393378675736 A:G A G 10 0.530218543708742 0.246988872578824 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000477688:exon_46951332_46952062:SLC19A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 46957794 T/C 1 7 14 21 3.28847019403881 7.42305961192239 -4.13458941788358 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0817226986734783 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000427839:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000443742:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000486303:exon_46957685_46957847:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000528477:exon_46957692_46957922:SLC19A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 21 47642625 C/T 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47642544_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47642577_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47642544_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47642577_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47642544_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000450351:exon_47642544_47642652:LSS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 17589209 C/T 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 T:C C T 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 17589517 G/A 1 12 11 23 5.6373774754951 5.83240398079616 -0.195026505301065 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 17589567 C/T 1 13 9 22 6.10715893178635 4.77196689337868 1.33519203840768 T:C C T 10 0.530218543708742 0.671305989890035 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 17590269 C/T 1 15 26 41 7.04672184436887 13.7856821364273 -6.73896029205842 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0413721336617821 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 17630486 C/A 1 26 22 48 12.2143178635727 11.6648079615923 0.549509901980384 A:C C A 10 0.530218543708742 0.886303655646963 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000480451:exon_17630432_17630635:CECR5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 17662793 A/G 1 9 6 15 4.22803310662132 3.18131126225245 1.04672184436887 A:G A G 10 0.530218543708742 0.617171705992842 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17662710_17662912:CECR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 17690430 C/G 1 11 4 15 5.16759601920384 2.12087417483497 3.04672184436887 C:G C G 10 0.530218543708742 0.128499041794511 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17690246_17690575:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17690246_17690779:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17690246_17690614:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000441548:exon_17690246_17690613:CECR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 18111431 T/C 1 19 29 48 8.9258476695339 15.3763377675535 -6.45049009801962 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0816416313054049 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18111369_18111584:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18111369_18111513:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18111369_18111499:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000478963:exon_18111369_18111514:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000460085:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 18165995 T/G 1 16 27 43 7.51650330066013 14.315900680136 -6.79939737947591 T:G T G 10 0.530218543708742 0.046195001058485 ENSG00000099968:ENST00000399781:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000464649:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000337612:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18165980_18166087:BCL2L13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 18209613 A/G 1 38 30 68 17.8516953390678 15.9065563112623 1.94513902780554 A:G A G 10 0.530218543708742 0.715854803603245 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 18209718 C/T 1 36 63 99 16.9121324264853 33.4037682536507 -16.4916358271655 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00116187002928214 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 18220831 A/G 1 115 120 235 54.0248674734947 63.626225245049 -9.60135777155437 A:G A G 10 0.530218543708742 0.214836305300826 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399765:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000494097:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18220824_18220995:BID HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 18300240 T/C 1 4 9 13 1.87912582516503 4.77196689337868 -2.89284106821365 T:C T C 10 0.530218543708742 0.162918845921506 ENSG00000093100:ENST00000252134:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000425874:exon_18300077_18301895:MICAL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 18300594 G/A 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000093100:ENST00000252134:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000425874:exon_18300077_18301895:MICAL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 18300879 G/A 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 A:G G A 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000093100:ENST00000252134:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000425874:exon_18300077_18301895:MICAL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 18301693 T/C 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 T:C T C 10 0.530218543708742 0.296231759838006 ENSG00000093100:ENST00000252134:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000425874:exon_18300077_18301895:MICAL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 18609642 C/T 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 T:C C T 10 0.530218543708742 0.247617633272995 ENSG00000215193:ENST00000474897:exon_18609121_18609801:PEX26;ENSG00000183785:ENST00000316027:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000330423:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000416740:exon_18609121_18609801:TUBA8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 19124865 C/T 1 6 12 18 2.81868873774755 6.3626225245049 -3.54393378675736 T:C C T 10 0.530218543708742 0.103457190750381 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19124836_19124945:DGCR14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 117 119 236 54.9644303860772 63.0960067013403 -8.13157631526311 A:G G A 10 0.530218543708742 0.297237524017244 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 19867771 C/T 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462330:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000487165:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000495655:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000485358:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462843:exon_19867702_19867794:TXNRD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 19868218 A/G 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462330:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000487165:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000495655:exon_19868145_19868870:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000485358:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462843:exon_19868145_19868240:TXNRD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 19907099 C/A 1 12 12 24 5.6373774754951 6.3626225245049 -0.725245049009807 A:C C A 10 0.530218543708742 0.8392917887424 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 19907118 G/A 1 12 11 23 5.6373774754951 5.83240398079616 -0.195026505301065 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 57 39 96 26.7775430086017 20.6785232046409 6.09901980396077 T:C C T 10 0.530218543708742 0.221291853369604 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 19951207 C/G 1 32 18 50 15.0330066013203 9.54393378675736 5.4890728145629 T:C:G C G 10 0.530218543708742 0.155846275551544 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 84 77 161 39.4616423284657 40.8268278655731 -1.36518553710746 A:G G A 10 0.530218543708742 0.874606498371637 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 20100409 C/T 1 9 5 14 4.22803310662132 2.65109271854371 1.57694038807761 T:C C T 10 0.530218543708742 0.43589870850422 ENSG00000099899:ENST00000487668:exon_20099851_20100530:TRMT2A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 20102750 C/T 1 12 5 17 5.6373774754951 2.65109271854371 2.98628475695139 T:C C T 10 0.530218543708742 0.223474867867513 ENSG00000099899:ENST00000471040:exon_20102488_20102962:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000463710:exon_20102488_20102915:TRMT2A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 20113777 T/C 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 T:C T C 10 0.530218543708742 0.487231208629639 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 20131115 C/T 1 23 31 54 10.8049734946989 16.436774854971 -5.63180136027207 T:C C T 10 0.530218543708742 0.134832638644875 ENSG00000099904:ENST00000334554:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000320602:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000405930:exon_20130279_20131279:ZDHHC8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 20307256 G/A 1 22 20 42 10.3351920384077 10.6043708741748 -0.269178835767164 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000128185:ENST00000248879:exon_20307162_20307322:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000405465:exon_20307162_20307309:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000443409:exon_20307162_20307322:DGCR6L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 1 33 17 50 15.5027880576115 9.01371524304861 6.4890728145629 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0880778375171355 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 22277571 A/C 1 6 8 14 2.81868873774755 4.24174834966994 -1.42305961192239 A:C A C 10 0.530218543708742 0.594188084236152 ENSG00000100034:ENST00000406981:exon_22273793_22277844:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000263212:exon_22273793_22277844:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000407142:exon_22273800_22277844:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000496143:exon_22277498_22277844:PPM1F HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 22330082 T/C 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 T:C T C 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22330012_22330087:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449517:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000424393:exon_22330012_22330116:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437929:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000430142:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000489581:exon_22330012_22330168:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000456075:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449704:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000442653:exon_22330012_22330341:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437103:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000434517:exon_22330018_22330179:TOP3B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 23223278 A/T 0 47 0 47 22.0797284456891 0 22.0797284456891 A A 10 0.530218543708742 1.32547663427467e-13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 23223281 C/T 0 47 0 47 22.0797284456891 0 22.0797284456891 C C 10 0.530218543708742 1.32547663427467e-13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 23223285 G/A 1 44 3 47 20.6703840768154 1.59065563112623 19.0797284456891 A:G G A 10 0.530218543708742 2.54857253937213e-09 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 23237860 A/G 1 69 52 121 32.4149204840968 27.5713642728546 4.84355621124222 A:G A G 10 0.530218543708742 0.41275326939309 ENSG00000254709:ENST00000532223:exon_23237555_23238005:D87023.8;ENSG00000254709:ENST00000526893:exon_23237555_23238005:D87023.8;ENSG00000254709:ENST00000531372:exon_23237555_23238005:D87023.8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 25017036 C/T 0 11 0 11 5.16759601920384 0 5.16759601920384 C C 10 0.530218543708742 0.00117707091712435 ENSG00000100031:ENST00000248923:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000412658:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000400382:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000430030:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000400383:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000417817:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000446402:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000421833:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000400380:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000406383:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000425895:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000450398:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000480228:exon_25016295_25018006:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000428338:exon_25016880_25017037:GGT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 25747749 G/A 1 11 16 27 5.16759601920384 8.48349669933987 -3.31590068013603 A:G G A 10 0.530218543708742 0.247863936906869 ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25747385_25747869:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25747388_25747869:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25747424_25747781:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25747579_25747869:LRP5L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 26853905 C/A 1 23 25 48 10.8049734946989 13.2554635927186 -2.45049009801962 A:C C A 10 0.530218543708742 0.563458294966744 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26853825_26853933:HPS4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 26854441 G/A 1 15 12 27 7.04672184436887 6.3626225245049 0.684099319863966 A:G G A 10 0.530218543708742 0.848884432554504 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26854411_26854543:HPS4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 26859942 C/T 1 18 16 34 8.45606621324264 8.48349669933987 -0.0274304860972272 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26859883_26859981:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26859883_26860158:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 26862212 T/C 1 4 13 17 1.87912582516503 6.89284106821365 -5.01371524304861 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0256327282179872 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26861421_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26862192_26864589:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26861421_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000459918:exon_26862192_26862228:HPS4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 29755888 T/C 1 19 26 45 8.9258476695339 13.7856821364273 -4.85983446689339 T:C T C 10 0.530218543708742 0.178583058926666 ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000421126:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000473606:exon_29755662_29755948:AP1B1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 29908072 C/T 1 22 21 43 10.3351920384077 11.1345894178836 -0.799397379475906 T:C C T 10 0.530218543708742 0.878965825852265 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29908010_29908125:THOC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 29913272 C/T 1 11 14 25 5.16759601920384 7.42305961192239 -2.25546359271855 T:C C T 10 0.530218543708742 0.425252421915307 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 29925221 C/T 1 6 14 20 2.81868873774755 7.42305961192239 -4.60437087417484 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0445921710114037 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29924926_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000484924:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000443089:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000492707:exon_29925151_29925228:THOC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 30163526 A/G 1 254 311 565 119.32448989798 164.897967093419 -45.5734771954392 A:G A G 10 0.530218543708742 0.000144213808161956 ENSG00000184076:ENST00000330029:exon_30163358_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000401406:exon_30163363_30163596:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000332801:exon_30163440_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000406782:exon_30163388_30163558:UQCR10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 102 96 198 47.9177085417083 50.9009801960392 -2.98327165433091 A:G A G 10 0.530218543708742 0.670101361754763 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 30189642 C/T 1 53 44 97 24.8984171834367 23.3296159231846 1.56880126025203 T:C C T 10 0.530218543708742 0.76143509329071 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30189566_30189665:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30189349_30189665:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30189566_30189665:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30189566_30189665:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000411532:exon_30189566_30189665:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000483380:exon_30189576_30189665:ASCC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 30198025 C/T 1 44 42 86 20.6703840768154 22.2691788357672 -1.59879475895181 T:C C T 10 0.530218543708742 0.746867039651337 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30197983_30198197:ASCC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 30689998 G/A 1 18 15 33 8.45606621324264 7.95327815563113 0.502788057611514 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000248751:ENST00000330168:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434987:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434291:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000418047:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000447976:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30689974_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30689640_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000466666:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000437122:exon_30689910_30690099:TBC1D10A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 30782731 G/A 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 A:G G A 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000099999:ENST00000382363:exon_30782605_30782748:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000215798:exon_30782605_30782748:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000473077:exon_30782605_30782875:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000431544:exon_30782605_30782748:RNF215 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 30823196 T/C 1 54 67 121 25.3681986397279 35.5246424284857 -10.1564437887578 T:C T C 10 0.530218543708742 0.068635738408646 ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 30975861 C/T 1 80 95 175 37.5825165033006 50.3707616523305 -12.7882451490298 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0581439235254401 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30975738_30975910:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30974824_30976061:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30975738_30975922:PES1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 30987864 C/T 1 9 5 14 4.22803310662132 2.65109271854371 1.57694038807761 T:C C T 10 0.530218543708742 0.43589870850422 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 31006860 A/G 1 5 15 20 2.34890728145629 7.95327815563113 -5.60437087417484 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0134232039892383 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000423350:exon_31006858_31007101:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31006858_31007050:TCN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 31011610 G/C 0 8 0 8 3.75825165033006 0 3.75825165033006 G G 10 0.530218543708742 0.0086188222890866 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31011588_31011774:TCN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 31491295 G/C 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 C:G G C 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 31494813 G/C 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31494653_31494826:SMTN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 31621792 G/A 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G G A 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000182541:ENST00000462625:exon_31621706_31621805:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000444929:exon_31621706_31621805:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31621706_31621805:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000331728:exon_31621706_31621805:LIMK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 43 39 82 20.2006026205241 20.6785232046409 -0.477920584116845 T:C T C 10 0.530218543708742 0.91250847565861 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 32352791 G/A 1 287 311 598 134.827277955591 164.897967093419 -30.0706891378277 A:C:G G A 10 0.530218543708742 0.01396867426015 ENSG00000128245:ENST00000248975:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000397492:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000471374:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000427094:exon_32352126_32353589:YWHAH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 32871365 G/A 1 26 24 50 12.2143178635727 12.7252450490098 -0.510927185437099 A:G G A 10 0.530218543708742 0.888445961195408 ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32871244_32871385:FBXO7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 34022284 G/A 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 A:G G A 10 0.530218543708742 0.247617633272995 ENSG00000133424:ENST00000452586:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000354992:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000337431:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000397394:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000402320:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000437602:exon_34022228_34022310:LARGE HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 35660875 G/T 1 27 19 46 12.684099319864 10.0741523304661 2.60994698939787 T:G G T 10 0.530218543708742 0.463889576367042 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 177 134 311 83.1513177635527 71.0492848569714 12.1020329065812 T:C T C 10 0.530218543708742 0.173118415617239 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 176 102 278 82.6815363072614 54.0822914582917 28.5992448489697 A:C C A 10 0.530218543708742 0.000595456997215549 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 36684980 G/A 1 419 388 807 196.838430186037 205.724794958992 -8.88636477295481 A:G G A 10 0.530218543708742 0.548856724758022 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684773_36684985:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684773_36684985:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684773_36684985:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684773_36684985:MYH9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 36900812 C/T 1 14 11 25 6.57694038807761 5.83240398079616 0.74453640728145 T:C C T 10 0.530218543708742 0.842713046828003 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900562_36900813:FOXRED2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 37271802 C/T 1 26 21 47 12.2143178635727 11.1345894178836 1.07972844568913 T:C C T 10 0.530218543708742 0.772348404612883 ENSG00000100365:ENST00000447071:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37271695_37271825:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000439078:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 37273742 G/A 1 68 71 139 31.9451390278055 37.6455166033207 -5.70037757551513 A:G G A 10 0.530218543708742 0.350505790673462 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 63 73 136 29.5962317463493 38.7059536907382 -9.10972194438891 A:T:C C T 10 0.530218543708742 0.122520627834739 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 38151170 G/A 1 20 25 45 9.39562912582516 13.2554635927186 -3.85983446689339 A:G G A 10 0.530218543708742 0.296072263822351 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38151108_38151197:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000407319:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000428075:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000413051:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000418339:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000452519:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000417857:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000331103:exon_38151108_38151517:TRIOBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 38153920 G/A 1 68 50 118 31.9451390278055 26.5109271854371 5.43421184236844 A:G G A 10 0.530218543708742 0.356504396400813 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38153620_38154145:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38153620_38154145:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38153620_38154145:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000407319:exon_38153620_38154145:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38153620_38154145:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38153620_38154145:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38153620_38154145:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000428075:exon_38153620_38154142:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000413051:exon_38153620_38153970:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38153620_38154145:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000418339:exon_38153620_38153989:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000417857:exon_38153620_38154054:TRIOBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 38164106 C/T 1 38 15 53 17.8516953390678 7.95327815563113 9.89841718343667 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00830269704916365 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 38204089 C/T 1 9 8 17 4.22803310662132 4.24174834966994 -0.0137152430486136 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38203912_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38203919_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000445195:exon_38203923_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000415371:exon_38203930_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000478203:exon_38203941_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000426858:exon_38203945_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000451984:exon_38204021_38204170:GCAT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 38205989 T/C 0 0 8 8 0 4.24174834966994 -4.24174834966994 C T C 10 0.530218543708742 0.00237228552436099 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38205956_38206164:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000445195:exon_38205956_38206164:GCAT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 22 24 46 10.3351920384077 12.7252450490098 -2.39005301060213 A:G A G 10 0.530218543708742 0.555218088560173 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 38323507 G/T 1 13 16 29 6.10715893178635 8.48349669933987 -2.37633776755352 T:G G T 10 0.530218543708742 0.45770905214884 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 10 17 27 4.69781456291258 9.01371524304861 -4.31590068013603 A:G G A 10 0.530218543708742 0.122247567538511 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 28 18 46 13.1538807761552 9.54393378675736 3.60994698939787 A:C C A 10 0.530218543708742 0.304617773336652 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 28 22 50 13.1538807761552 11.6648079615923 1.4890728145629 T:C T C 10 0.530218543708742 0.777252620534398 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 39477123 T/C 1 85 86 171 39.9314237847569 45.5987947589518 -5.66737097419488 T:C T C 10 0.530218543708742 0.399972045212498 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000486357:exon_39476938_39477199:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39475667_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39476640_39477232:APOBEC3G HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 8 2 10 3.75825165033006 1.06043708741748 2.69781456291258 T:G G T 10 0.530218543708742 0.115795579122128 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 25 4 29 11.7445364072814 2.12087417483497 9.62366223244648 C:G G C 10 0.530218543708742 0.000258971812638295 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 8 1 9 3.75825165033006 0.530218543708742 3.22803310662132 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0421575176018681 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 39497452 A/G 0 8 0 8 3.75825165033006 0 3.75825165033006 A A 10 0.530218543708742 0.0086188222890866 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 39497454 G/C 0 11 0 11 5.16759601920384 0 5.16759601920384 G G 10 0.530218543708742 0.00117707091712435 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 27 10 37 12.684099319864 5.30218543708742 7.38191388277655 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0198949037192017 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 39714580 G/A 1 780 824 1604 366.429535907181 436.900080016003 -70.4705441088222 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.000458270964096868 ENSG00000100316:ENST00000401609:exon_39714405_39714619:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000216146:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000465618:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000495832:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000437815:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000402527:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000453303:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000427905:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000420536:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000484615:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000460589:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000461967:exon_39713860_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000498462:exon_39714117_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000459859:exon_39714405_39714597:RPL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 376 475 851 176.637827565513 251.853808261652 -75.2159806961394 A:C A C 10 0.530218543708742 2.90041654825492e-07 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 40820213 G/C 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 C:G G C 10 0.530218543708742 0.797017339461022 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40820210_40820385:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40820210_40820385:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40820210_40820385:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40820210_40820385:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40820210_40820385:MKL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 24 16 40 11.2747549509902 8.48349669933987 2.79125825165032 T:C C T 10 0.530218543708742 0.429974963920427 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 42473860 C/G 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 C:G C G 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000177096:ENST00000321753:exon_42473284_42475445:FAM109B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 42486723 G/A 1 212 101 313 99.5936687337467 53.5520729145829 46.0415958191638 A:G G A 10 0.530218543708742 1.55682828072172e-07 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 44 42 86 20.6703840768154 22.2691788357672 -1.59879475895181 T:C C T 10 0.530218543708742 0.746867039651337 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 71 67 138 33.3544833966793 35.5246424284857 -2.17015903180639 T:C:G G C 10 0.530218543708742 0.733480756233735 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 36 46 82 16.9121324264853 24.3900530106021 -7.47792058411684 C:G G C 10 0.530218543708742 0.120877872376161 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 43576904 G/A 1 25 26 51 11.7445364072814 13.7856821364273 -2.04114572914584 A:G G A 10 0.530218543708742 0.577904259838491 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000357017:exon_43576762_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43576748_43576946:TTLL12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 44489896 T/C 1 57 56 113 26.7775430086017 29.6922384476896 -2.91469543908784 T:C:G T C 10 0.530218543708742 0.63769423825189 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 45258324 C/T 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 T:C C T 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000241484:ENST00000503508:exon_45258155_45258551:ARHGAP8;ENSG00000241484:ENST00000517296:exon_45258155_45258586:ARHGAP8;ENSG00000241484:ENST00000389773:exon_45258155_45258664:ARHGAP8;ENSG00000241484:ENST00000389774:exon_45258155_45258664:ARHGAP8;ENSG00000241484:ENST00000336995:exon_45258155_45258664:ARHGAP8;ENSG00000241484:ENST00000336963:exon_45258155_45258665:ARHGAP8;ENSG00000241484:ENST00000356099:exon_45258155_45258664:ARHGAP8;ENSG00000241484:ENST00000389772:exon_45258155_45258664:ARHGAP8;ENSG00000241484:ENST00000389775:exon_45258155_45258664:ARHGAP8;ENSG00000241484:ENST00000469342:exon_45258155_45258343:ARHGAP8;ENSG00000248405:ENST00000361473:exon_45258155_45258551:PRR5-ARHGAP8;ENSG00000248405:ENST00000352766:exon_45258155_45258586:PRR5-ARHGAP8;ENSG00000248405:ENST00000515632:exon_45258155_45258551:PRR5-ARHGAP8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 45723807 G/C 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 C:G G C 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000427777:exon_45723723_45723841:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 45723842 G/A 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 A:G G A 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 45723854 C/G 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 C:G C G 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 45728370 G/A 1 17 5 22 7.98628475695139 2.65109271854371 5.33519203840768 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0305968416347052 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 47083010 T/C 1 10 14 24 4.69781456291258 7.42305961192239 -2.72524504900981 T:C T C 10 0.530218543708742 0.309127957783389 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 47083012 T/A 1 10 15 25 4.69781456291258 7.95327815563113 -3.25546359271855 A:T T A 10 0.530218543708742 0.230578617079935 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 47085924 G/A 1 12 10 22 5.6373774754951 5.30218543708742 0.335192038407676 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47085889_47086097:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47085889_47086097:CERK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 47087670 G/A 1 9 8 17 4.22803310662132 4.24174834966994 -0.0137152430486136 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47087469_47087674:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47087469_47087674:CERK;ENSG00000100422:ENST00000471929:exon_47087469_47087674:CERK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50354819 C/A 1 155 119 274 72.816125725145 63.0960067013403 9.72011902380468 A:C:G C A 10 0.530218543708742 0.250428319806757 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50354773_50354882:PIM3;ENSG00000198355:ENST00000467480:exon_50354416_50354882:PIM3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50356302 C/T 1 25 15 40 11.7445364072814 7.95327815563113 3.79125825165032 T:C C T 10 0.530218543708742 0.268524574525293 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50356555 T/C 1 18 39 57 8.45606621324264 20.6785232046409 -12.2224569913983 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00130309003690668 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 275 235 510 129.189900480096 124.601357771554 4.58854270854158 T:C T C 10 0.530218543708742 0.689967888465345 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50635638 C/G 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 C:G C G 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000170638:ENST00000472677:exon_50635322_50636615:TRABD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50648577 C/T 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 T:C C T 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50682865 G/A 1 11 5 16 5.16759601920384 2.65109271854371 2.51650330066013 A:G G A 10 0.530218543708742 0.223429926014640 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50682148_50682993:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50682148_50683421:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50682148_50683400:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50682148_50683400:TUBGCP6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50684296 T/C 1 13 18 31 6.10715893178635 9.54393378675736 -3.436774854971 T:C T C 10 0.530218543708742 0.280193232704031 ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50684312 G/A 1 16 11 27 7.51650330066013 5.83240398079616 1.68409931986397 A:G G A 10 0.530218543708742 0.567178184787279 ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50688348 A/G 1 22 29 51 10.3351920384077 15.3763377675535 -5.04114572914584 A:G A G 10 0.530218543708742 0.163313378431045 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496909:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000488270:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000489424:exon_50688288_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000470965:exon_50688297_50688393:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50688289_50688393:MAPK12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50694297 A/G 1 24 29 53 11.2747549509902 15.3763377675535 -4.10158281656332 A:G A G 10 0.530218543708742 0.273399132525010 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000496942:exon_50694044_50694628:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000497738:exon_50694239_50694582:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50694239_50694310:MAPK12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50699668 A/G 1 12 8 20 5.6373774754951 4.24174834966994 1.39562912582516 A:G A G 10 0.530218543708742 0.655843927791304 ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50699596_50699737:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50699596_50700137:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50699596_50699725:MAPK12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50704661 T/C 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 T:C T C 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704655_50704734:MAPK11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50719165 T/C 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 T:C T C 10 0.530218543708742 0.247617633272995 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50720622 C/T 1 20 23 43 9.39562912582516 12.1950265053011 -2.79939737947591 T:C C T 10 0.530218543708742 0.445966586496333 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720613_50720991:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720613_50720742:PLXNB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50751529 G/C 1 53 45 98 24.8984171834367 23.8598344668934 1.03858271654329 C:G G C 10 0.530218543708742 0.840507373106281 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50751428_50751537:FAM116B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50877166 G/C 1 21 21 42 9.86541058211642 11.1345894178836 -1.26917883576716 C:G G C 10 0.530218543708742 0.75806865433379 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50877028_50877191:PPP6R2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50879447 T/G 1 18 18 36 8.45606621324264 9.54393378675736 -1.08786757351471 T:G T G 10 0.530218543708742 0.740965509128219 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50879251_50879503:PPP6R2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50882299 G/A 1 31 38 69 14.563225145029 20.1483046609322 -5.5850795159032 A:G G A 10 0.530218543708742 0.186279497898258 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000470046:exon_50881516_50882546:PPP6R2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 83 115 198 38.9918608721744 60.9751325265053 -21.9832716543309 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00212427030599582 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50895020 C/T 1 35 24 59 16.442350970194 12.7252450490098 3.71710592118422 T:C C T 10 0.530218543708742 0.362876411209585 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000476293:exon_50895018_50895102:SBF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50898026 G/A 1 36 25 61 16.9121324264853 13.2554635927186 3.65666883376674 A:G G A 10 0.530218543708742 0.371464434574911 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50897899_50898095:SBF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50901009 C/T 1 16 22 38 7.51650330066013 11.6648079615923 -4.1483046609322 T:C C T 10 0.530218543708742 0.195573772819002 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000356279:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50900988_50901146:SBF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 16 12 28 7.51650330066013 6.3626225245049 1.15388077615522 A:G G A 10 0.530218543708742 0.708452101922698 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 99 126 225 46.5083641728345 66.8075365073015 -20.299172334467 T:G T G 10 0.530218543708742 0.00744405422252302 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 79 55 134 37.1127350470094 29.1620199039808 7.95071514302857 C:G C G 10 0.530218543708742 0.19405967376184 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50964236 G/A 1 143 111 254 67.1787482496499 58.8542583516704 8.32448989797954 A:G G A 10 0.530218543708742 0.314669762161316 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50988062 G/T 1 8 10 18 3.75825165033006 5.30218543708742 -1.54393378675736 T:G G T 10 0.530218543708742 0.488609852310515 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 50988193 A/G 1 4 15 19 1.87912582516503 7.95327815563113 -6.0741523304661 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00550735300045354 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 51009953 C/T 1 7 29 36 3.28847019403881 15.3763377675535 -12.0878675735147 T:C C T 10 0.530218543708742 6.72810311494964e-05 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000497224:exon_51009587_51009968:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51009804_51009968:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51009804_51009962:CTA-384D8.32 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 51011376 G/C 1 13 1 14 6.10715893178635 0.530218543708742 5.57694038807761 C:G G C 10 0.530218543708742 0.00228884504353901 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000475238:exon_51011304_51011529:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 51015838 T/C 1 13 1 14 6.10715893178635 0.530218543708742 5.57694038807761 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00228884504353901 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000460853:exon_51015785_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000461117:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000417176:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51015753_51015892:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51015753_51015892:CTA-384D8.32 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 51018579 A/G 1 3 7 10 1.40934436887377 3.71152980596119 -2.30218543708742 A:G A G 10 0.530218543708742 0.206122472271196 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 22 51064416 T/C 1 25 16 41 11.7445364072814 8.48349669933987 3.26103970794158 T:C T C 10 0.530218543708742 0.34958142257827 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064364_51064491:ARSA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 3189279 A/G 1 16 20 36 7.51650330066013 10.6043708741748 -3.08786757351471 A:G A G 10 0.530218543708742 0.320546928577092 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3189134_3189387:TRNT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 4354802 A/G 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:G A G 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000170364:ENST00000358065:exon_4354582_4355445:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000413809:exon_4354582_4354913:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000430981:exon_4354582_4356086:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000307483:exon_4354582_4355445:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000425863:exon_4354582_4354913:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000406657:exon_4354582_4355445:SETMAR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 4508742 C/T 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 T:C C T 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000144455:ENST00000448413:exon_4508660_4508945:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000272902:exon_4508660_4508965:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000383843:exon_4508660_4508948:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000458465:exon_4508660_4508953:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000405420:exon_4508660_4508957:SUMF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 4817057 T/C 1 23 16 39 10.8049734946989 8.48349669933987 2.32147679535906 T:C T C 10 0.530218543708742 0.522510725948018 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4816926_4817126:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4816926_4817126:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4816926_4817126:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4816926_4817126:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4816926_4817126:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4816926_4817126:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4816926_4817126:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4816926_4817126:ITPR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 5024771 T/C 1 271 329 600 127.310774654931 174.441900880176 -47.1311262252452 T:C T C 10 0.530218543708742 0.000118639703465002 ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5024521_5027008:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5024521_5024953:BHLHE40 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 8809703 G/A 1 6 16 22 2.81868873774755 8.48349669933987 -5.66480796159232 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0181307678279333 ENSG00000180914:ENST00000316793:exon_8808952_8810015:OXTR;ENSG00000180914:ENST00000449615:exon_8809598_8810015:OXTR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 9515054 T/C 1 54 67 121 25.3681986397279 35.5246424284857 -10.1564437887578 T:C T C 10 0.530218543708742 0.068635738408646 ENSG00000168137:ENST00000402198:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000402466:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000406341:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000407969:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000302463:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000493918:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000399686:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000413704:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000466242:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000421188:exon_9514920_9515056:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000486465:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000492939:exon_9514920_9515221:SETD5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 11 3 14 5.16759601920384 1.59065563112623 3.57694038807761 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0636441704976374 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 9885615 G/C 1 14 6 20 6.57694038807761 3.18131126225245 3.39562912582516 C:G G C 10 0.530218543708742 0.178098088864002 ENSG00000156990:ENST00000433535:exon_9885574_9885698:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000383820:exon_9885574_9885700:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000287624:exon_9885574_9885678:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000424438:exon_9885409_9885626:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000427174:exon_9885574_9885670:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000484134:exon_9885574_9885700:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000418713:exon_9885574_9885686:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000472381:exon_9885149_9885702:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433972:exon_9885574_9885743:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433555:exon_9885574_9885660:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000451405:exon_9885409_9885679:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000460909:exon_9885574_9885700:RPUSD3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 86 85 171 40.4012052410482 45.0685762152431 -4.66737097419488 T:C T C 10 0.530218543708742 0.491091920233489 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 9985656 C/T 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000163703:ENST00000295982:exon_9985586_9985779:CRELD1;ENSG00000163703:ENST00000326434:exon_9985586_9985779:CRELD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 15 7 22 7.04672184436887 3.71152980596119 3.33519203840768 C:G G C 10 0.530218543708742 0.200272681658531 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 26 20 46 12.2143178635727 10.6043708741748 1.60994698939787 C:G C G 10 0.530218543708742 0.660552718164373 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 22 19 41 10.3351920384077 10.0741523304661 0.261039707941578 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 10264480 C/G 1 4 10 14 1.87912582516503 5.30218543708742 -3.42305961192239 C:G C G 10 0.530218543708742 0.105064392873074 ENSG00000134070:ENST00000256458:exon_10264320_10264515:IRAK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 10302045 C/T 1 34 26 60 15.9725695139028 13.7856821364273 2.18688737747548 T:C C T 10 0.530218543708742 0.606676288545274 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 10302056 A/G 1 31 27 58 14.563225145029 14.315900680136 0.247324464892964 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 10302172 G/A 1 39 35 74 18.3214767953591 18.557649029806 -0.236172234446908 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 11596302 T/C 1 26 22 48 12.2143178635727 11.6648079615923 0.549509901980384 T:C T C 10 0.530218543708742 0.886303655646963 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 11684957 C/T 1 21 18 39 9.86541058211642 9.54393378675736 0.321476795359063 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11684911_11685398:VGLL4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 118 112 230 55.4342118423684 59.3844768953791 -3.95026505301066 T:C C T 10 0.530218543708742 0.643880897250704 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 13361446 C/T 1 102 112 214 47.9177085417083 59.3844768953791 -11.4667683536708 T:C C T 10 0.530218543708742 0.13171060440239 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 52 64 116 24.4286357271454 33.9339867973595 -9.50535107021407 T:C:G G T 10 0.530218543708742 0.077978388813502 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 13367357 G/A 1 42 38 80 19.7308211642328 20.1483046609322 -0.417483496699361 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 13367406 C/T 1 41 52 93 19.2610397079416 27.5713642728546 -8.31032456491301 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0961999225026196 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 63 44 107 29.5962317463493 23.3296159231846 6.26661582316461 A:G G A 10 0.530218543708742 0.245573110816387 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 13379400 C/T 1 38 46 84 17.8516953390678 24.3900530106021 -6.53835767153433 T:C C T 10 0.530218543708742 0.156906792910705 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13379337_13379417:NUP210 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 13383540 A/G 1 63 68 131 29.5962317463493 36.0548609721945 -6.4586292258452 A:G A G 10 0.530218543708742 0.293519860436655 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13383496_13383623:NUP210 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 13395475 G/C 1 24 23 47 11.2747549509902 12.1950265053011 -0.920271554310872 C:G G C 10 0.530218543708742 0.88403225030225 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 13395579 C/A 1 48 24 72 22.5495099019804 12.7252450490098 9.82426485297058 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0242899974871166 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 13407556 T/C 1 13 12 25 6.10715893178635 6.3626225245049 -0.25546359271855 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13407446_13407591:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13407446_13407591:NUP210 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 13421150 C/T 1 13 7 20 6.10715893178635 3.71152980596119 2.39562912582516 T:C C T 10 0.530218543708742 0.371488020282974 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13421063_13421221:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13421063_13421221:NUP210 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 14174427 A/T 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 A:T A T 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14174366_14174435:TMEM43 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 14175262 T/C 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 T:C T C 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14175239_14175309:TMEM43 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 14187449 G/T 1 57 79 136 26.7775430086017 41.8872649529906 -15.1097219443889 T:G G T 10 0.530218543708742 0.00990170465674486 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14186647_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14186650_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14187229_14187659:XPC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 14193889 C/T 1 18 30 48 8.45606621324264 15.9065563112623 -7.45049009801962 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0418147191221751 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14193835_14193916:XPC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 20 28 48 9.39562912582516 14.8461192238448 -5.45049009801962 A:G G A 10 0.530218543708742 0.147423798782951 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 15276541 A/G 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 A:G A G 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000131375:ENST00000253693:exon_15276532_15276652:CAPN7;ENSG00000131375:ENST00000415565:exon_15276532_15276652:CAPN7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 15311325 A/G 1 5 11 16 2.34890728145629 5.83240398079616 -3.48349669933987 A:G A G 10 0.530218543708742 0.130369289858938 ENSG00000131370:ENST00000448619:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000383791:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000426925:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000253688:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000408919:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000366391:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000450625:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000417936:exon_15311220_15311384:SH3BP5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 15737689 G/A 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15737641_15737738:ANKRD28 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 15737698 T/C 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 T:C T C 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15737641_15737738:ANKRD28 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 17051450 C/A 1 16 9 25 7.51650330066013 4.77196689337868 2.74453640728145 A:C C A 10 0.530218543708742 0.319417784881298 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 19992432 G/T 1 10 9 19 4.69781456291258 4.77196689337868 -0.0741523304660978 T:G G T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000144566:ENST00000273047:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000443878:exon_19992298_19992436:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000412966:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000446547:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000422242:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000476544:exon_19992298_19992717:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000455772:exon_19992298_19992553:RAB5A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 20113830 G/A 1 11 11 22 5.16759601920384 5.83240398079616 -0.664807961592324 A:G G A 10 0.530218543708742 0.832858519551156 ENSG00000114166:ENST00000263754:exon_20113825_20113951:KAT2B;ENSG00000114166:ENST00000426228:exon_20113825_20113951:KAT2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 20216519 T/A 1 16 13 29 7.51650330066013 6.89284106821365 0.623662232446482 A:T T A 10 0.530218543708742 0.854455190101058 ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000383774:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000443724:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000456624:exon_20216214_20216547:SGOL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 33161898 C/T 1 12 20 32 5.6373774754951 10.6043708741748 -4.96699339867974 T:C C T 10 0.530218543708742 0.109522418077362 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000485310:exon_33161836_33161985:CRTAP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 33877626 G/A 1 23 30 53 10.8049734946989 15.9065563112623 -5.10158281656333 A:G G A 10 0.530218543708742 0.170603297427766 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 46 29 75 21.6099469893979 15.3763377675535 6.23360922184435 T:C C T 10 0.530218543708742 0.165515135141723 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 84 96 180 39.4616423284657 50.9009801960392 -11.4393378675736 A:C:G A G 10 0.530218543708742 0.100168799612472 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 38170810 C/G 1 14 11 25 6.57694038807761 5.83240398079616 0.74453640728145 C:G C G 10 0.530218543708742 0.842713046828003 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000418880:exon_38170781_38170879:ACAA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 39431081 G/A 1 3 8 11 1.40934436887377 4.24174834966994 -2.83240398079616 A:G G A 10 0.530218543708742 0.129086131769062 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39430986_39431107:SLC25A38;ENSG00000144659:ENST00000431510:exon_39430986_39431107:SLC25A38 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 108 39 147 50.7363972794559 20.6785232046409 30.0578740748149 T:C T C 10 0.530218543708742 5.02669993883833e-07 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 39450065 C/T 1 11 18 29 5.16759601920384 9.54393378675736 -4.37633776755352 T:C C T 10 0.530218543708742 0.135661579784991 ENSG00000168028:ENST00000490490:exon_39449695_39450215:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39450028_39450215:RPSA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 39453160 G/A 1 137 204 341 64.3600595119023 108.164582916583 -43.804523404681 A:G G A 10 0.530218543708742 2.12933259596383e-06 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000495394:exon_39451750_39453268:RPSA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 41280827 C/T 1 110 104 214 51.6759601920384 55.1427285457092 -3.46676835367079 T:C C T 10 0.530218543708742 0.681240512825627 ENSG00000168036:ENST00000405570:exon_41280625_41280844:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396183:exon_41280625_41280845:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000349496:exon_41280625_41281936:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000447363:exon_41280625_41281936:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000453024:exon_41280625_41280845:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396190:exon_41280625_41281939:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396185:exon_41280625_41280845:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000471014:exon_41280624_41280845:CTNNB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 43641935 T/C 1 5 8 13 2.34890728145629 4.24174834966994 -1.89284106821365 T:C T C 10 0.530218543708742 0.406203894191414 ENSG00000160746:ENST00000292246:exon_43641876_43642073:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000350459:exon_43641876_43642073:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000414522:exon_43641876_43642073:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000427171:exon_43641876_43642073:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000444344:exon_43641876_43642073:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000456438:exon_43641876_43642073:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000413397:exon_43641876_43642073:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000439141:exon_43641876_43642073:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000428831:exon_43641876_43642073:ANO10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 44692564 C/G 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 C:G C G 10 0.530218543708742 0.296231759838006 ENSG00000169981:ENST00000396056:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000415571:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000432115:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000296092:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000399560:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000453164:exon_44692433_44692751:ZNF35 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 6 8 14 2.81868873774755 4.24174834966994 -1.42305961192239 A:C C A 10 0.530218543708742 0.594188084236152 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 50 53 103 23.4890728145629 28.1015828165633 -4.61251000200043 C:G G C 10 0.530218543708742 0.375631005153612 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 45153708 G/A 1 11 7 18 5.16759601920384 3.71152980596119 1.45606621324264 A:G G A 10 0.530218543708742 0.638243716970554 ENSG00000163814:ENST00000296129:exon_45153575_45153937:CDCP1;ENSG00000163814:ENST00000425231:exon_45153575_45153937:CDCP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 45557707 G/A 1 9 4 13 4.22803310662132 2.12087417483497 2.10715893178635 A:G G A 10 0.530218543708742 0.278259851701685 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45557586_45557768:LARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 45637253 C/T 1 5 15 20 2.34890728145629 7.95327815563113 -5.60437087417484 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0134232039892383 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 45637439 T/C 1 19 8 27 8.9258476695339 4.24174834966994 4.68409931986397 T:C T C 10 0.530218543708742 0.083079679391696 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 45779136 A/T 1 7 15 22 3.28847019403881 7.95327815563113 -4.66480796159232 A:T A T 10 0.530218543708742 0.0546658878313038 ENSG00000211456:ENST00000455997:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000418611:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000389061:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000441228:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000433336:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000464102:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000471207:exon_45778736_45779144:SACM1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 46008087 G/A 1 1 8 9 0.469781456291258 4.24174834966994 -3.77196689337868 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0157469533588810 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 46008790 G/A 1 10 3 13 4.69781456291258 1.59065563112623 3.10715893178635 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0999408957936294 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 46009487 G/A 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G G A 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 46010007 T/C 1 2 6 8 0.939562912582516 3.18131126225245 -2.24174834966994 T:C T C 10 0.530218543708742 0.158929006468168 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 47043238 C/T 1 18 32 50 8.45606621324264 16.9669933986797 -8.5109271854371 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0224207563052681 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000475689:exon_47043179_47043316:NBEAL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 118 88 206 55.4342118423684 46.6592318463693 8.77497999599915 C:G C G 10 0.530218543708742 0.235565000331599 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 47049193 A/G 1 1 11 12 0.469781456291258 5.83240398079616 -5.3626225245049 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00217415496574063 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 67 54 121 31.4753575715143 28.6318013602721 2.84355621124222 A:G G A 10 0.530218543708742 0.64919998366826 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 47162886 C/T 1 31 31 62 14.563225145029 16.436774854971 -1.873549709942 T:C C T 10 0.530218543708742 0.703099655403951 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 52014566 C/G 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000248487:ENST00000360889:exon_52014481_52014644:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000273596:exon_52014409_52014644:ABHD14A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 52242103 G/A 1 77 66 143 36.1731721344269 34.994423884777 1.17874824964989 A:G G A 10 0.530218543708742 0.867234928997547 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52242099_52242263:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52242099_52242263:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52242099_52242263:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52242099_52242263:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52242099_52242263:ALAS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 52266056 G/A 1 17 19 36 7.98628475695139 10.0741523304661 -2.08786757351471 A:G G A 10 0.530218543708742 0.508258820331903 ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52265960_52266138:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52265960_52266138:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000472755:exon_52265960_52266244:TWF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 53326142 G/A 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 A:G G A 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 53851910 G/A 1 95 48 143 44.6292383476695 25.4504900980196 19.1787482496499 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00138303676257161 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53850387_53852222:CHDH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 57542173 C/T 1 9 12 21 4.22803310662132 6.3626225245049 -2.13458941788358 T:C C T 10 0.530218543708742 0.387625542901861 ENSG00000174840:ENST00000487257:exon_57542003_57543414:PDE12;ENSG00000174840:ENST00000311180:exon_57542004_57543414:PDE12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 57882601 C/T 1 7 12 19 3.28847019403881 6.3626225245049 -3.0741523304661 T:C C T 10 0.530218543708742 0.173987244767743 ENSG00000163681:ENST00000295951:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000295952:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416870:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000383718:exon_57882600_57887872:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000428312:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000449503:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416658:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000442599:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000459654:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000472546:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000417128:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000438794:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000495364:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000494088:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000461354:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000466255:exon_57882600_57882659:SLMAP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 58109162 G/A 1 28 18 46 13.1538807761552 9.54393378675736 3.60994698939787 A:G G A 10 0.530218543708742 0.304617773336652 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58108820_58109417:FLNB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 58112440 A/G 1 11 9 20 5.16759601920384 4.77196689337868 0.395629125825161 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58112329_58112489:FLNB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 58112488 C/T 1 21 23 44 9.86541058211642 12.1950265053011 -2.32961592318465 T:C C T 10 0.530218543708742 0.546627888447434 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58112329_58112489:FLNB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 58118555 G/A 1 25 15 40 11.7445364072814 7.95327815563113 3.79125825165032 A:G G A 10 0.530218543708742 0.268524574525293 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58117805_58118658:FLNB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 46 49 95 21.6099469893979 25.9807086417284 -4.37076165233049 T:C C T 10 0.530218543708742 0.411156496422159 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 73111809 A/G 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 A:G A G 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 73111973 A/G 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 A:G A G 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 73111998 C/T 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 T:C C T 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 75471230 C/T 1 5 9 14 2.34890728145629 4.77196689337868 -2.42305961192239 T:C C T 10 0.530218543708742 0.284180524640790 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 75471295 C/T 1 9 8 17 4.22803310662132 4.24174834966994 -0.0137152430486136 T:C C T 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 75471341 G/A 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 A:G G A 10 0.530218543708742 0.817705507349235 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 75472209 C/T 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 T:C C T 10 0.530218543708742 0.565817448386735 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 81698130 T/C 1 20 13 33 9.39562912582516 6.89284106821365 2.50278805761151 T:C T C 10 0.530218543708742 0.48604755372549 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 88189580 T/G 1 12 11 23 5.6373774754951 5.83240398079616 -0.195026505301065 T:G T G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000175105:ENST00000309495:exon_88188254_88190198:ZNF654 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 98250986 C/T 1 105 119 224 49.3270529105821 63.0960067013403 -13.7689537907582 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0706107387919015 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 59 71 130 27.7171059211842 37.6455166033207 -9.92841068213646 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0946666329073428 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 105260518 G/A 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000481337:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105260477_105260609:ALCAM HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 105266274 T/C 1 15 11 26 7.04672184436887 5.83240398079616 1.21431786357271 T:C T C 10 0.530218543708742 0.697339873549611 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000389927:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000465413:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000491388:exon_105266234_105266371:ALCAM HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 30 19 49 14.0934436887377 10.0741523304661 4.01929135827164 A:G A G 10 0.530218543708742 0.256788037035895 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 105422844 C/T 1 20 32 52 9.39562912582516 16.9669933986797 -7.57136427285458 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0375785290251267 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 105438957 T/G 1 10 16 26 4.69781456291258 8.48349669933987 -3.78568213642729 T:G T G 10 0.530218543708742 0.169180403169051 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 105439026 G/A 1 10 8 18 4.69781456291258 4.24174834966994 0.456066213242644 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 111710446 A/C 1 57 76 133 26.7775430086017 40.2966093218644 -13.5190663132627 A:C A C 10 0.530218543708742 0.0235414835508263 ENSG00000144827:ENST00000491580:exon_111710224_111711118:ABHD10;ENSG00000144827:ENST00000273359:exon_111710224_111712210:ABHD10;ENSG00000144827:ENST00000493784:exon_111710224_111710823:ABHD10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 111842431 T/C 1 226 208 434 106.170609121824 110.285457091418 -4.11484796959402 A:T:C T C 10 0.530218543708742 0.700661336889469 ENSG00000174500:ENST00000308910:exon_111839688_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000438451:exon_111839692_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000484193:exon_111841943_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000470085:exon_111842072_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000495418:exon_111842152_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000460387:exon_111842302_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000383684:exon_111842302_111842622:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000488580:exon_111842408_111842619:GCET2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 112727184 A/T 1 15 21 36 7.04672184436887 11.1345894178836 -4.08786757351471 A:T A T 10 0.530218543708742 0.184727154715863 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 113374633 C/A 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 A:C C A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000176542:ENST00000316407:exon_113367232_113380272:KIAA2018;ENSG00000176542:ENST00000496826:exon_113372086_113380272:KIAA2018;ENSG00000176542:ENST00000478658:exon_113372086_113380272:KIAA2018 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 118931389 C/T 1 27 16 43 12.684099319864 8.48349669933987 4.20060262052409 T:C C T 10 0.530218543708742 0.223326637996935 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118930579_118931528:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118930587_118935191:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118930589_118931528:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118930589_118931528:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118930626_118931528:B4GALT4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 118945796 G/C 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000460321:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000491906:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118945733_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118945786_118945888:B4GALT4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 118948716 G/A 1 14 32 46 6.57694038807761 16.9669933986797 -10.3900530106021 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00274695544721568 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000471675:exon_118948694_118948900:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118948694_118949091:B4GALT4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 119013714 C/A 1 12 9 21 5.6373774754951 4.77196689337868 0.865410582116419 A:C C A 10 0.530218543708742 0.828055654924615 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119013220_119013851:ARHGAP31 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 119196166 T/C 1 9 4 13 4.22803310662132 2.12087417483497 2.10715893178635 T:C T C 10 0.530218543708742 0.278259851701685 ENSG00000163389:ENST00000295588:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000419577:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000497447:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000486607:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000476573:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000460339:exon_119196160_119196254:POGLUT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 119211294 A/G 1 15 13 28 7.04672184436887 6.89284106821365 0.153880776155224 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000163389:ENST00000295588:exon_119211129_119213555:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000486607:exon_119211129_119211324:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000473648:exon_119211129_119211993:POGLUT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 119301139 C/T 1 23 22 45 10.8049734946989 11.6648079615923 -0.859834466893389 T:C C T 10 0.530218543708742 0.881561350298545 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119300912_119301314:ADPRH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 119305379 T/A 1 21 23 44 9.86541058211642 12.1950265053011 -2.32961592318465 A:T T A 10 0.530218543708742 0.546627888447434 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 121154974 T/C 1 12 5 17 5.6373774754951 2.65109271854371 2.98628475695139 T:C T C 10 0.530218543708742 0.223474867867513 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121154969_121155122:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121154969_121155122:POLQ HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 121208176 T/C 1 4 7 11 1.87912582516503 3.71152980596119 -1.83240398079616 T:C T C 10 0.530218543708742 0.367650802678922 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121206149_121209255:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121206149_121209255:POLQ HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 121208833 G/C 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 C:G G C 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121206149_121209255:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121206149_121209255:POLQ HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 121208894 T/C 1 7 1 8 3.28847019403881 0.530218543708742 2.75825165033006 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0743148409803516 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121206149_121209255:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121206149_121209255:POLQ HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 121712051 A/C 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:C A C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 121712805 G/C 1 13 8 21 6.10715893178635 4.24174834966994 1.86541058211642 C:G G C 10 0.530218543708742 0.513989696790461 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000383663:exon_121712627_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 122864436 G/A 1 5 8 13 2.34890728145629 4.24174834966994 -1.89284106821365 A:G G A 10 0.530218543708742 0.406203894191414 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 123665902 T/G 1 16 22 38 7.51650330066013 11.6648079615923 -4.1483046609322 T:G T G 10 0.530218543708742 0.195573772819002 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000426152:exon_123665651_123665904:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000435910:exon_123665860_123666166:CCDC14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 124456742 G/C 1 78 63 141 36.6429535907181 33.4037682536507 3.23918533706738 C:G G C 10 0.530218543708742 0.613279140065347 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124456639_124457086:UMPS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 124462808 C/T 1 65 47 112 30.5357946589318 24.9202715543109 5.6155231046209 T:C C T 10 0.530218543708742 0.299111123764584 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 124492632 G/T 0 0 8 8 0 4.24174834966994 -4.24174834966994 T G T 10 0.530218543708742 0.00237228552436099 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124492537_124492759:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000461306:exon_124492537_124492759:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124492537_124492759:ITGB5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 124515308 A/G 1 26 1 27 12.2143178635727 0.530218543708742 11.684099319864 A:G A G 10 0.530218543708742 1.56792162664106e-06 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 124515509 G/A 1 27 1 28 12.684099319864 0.530218543708742 12.1538807761552 A:G G A 10 0.530218543708742 8.31470884258632e-07 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000474838:exon_124515387_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000496703:exon_124515438_124515664:ITGB5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 124627024 T/G 1 14 11 25 6.57694038807761 5.83240398079616 0.74453640728145 T:G T G 10 0.530218543708742 0.842713046828003 ENSG00000173702:ENST00000311075:exon_124626994_124627195:MUC13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 124646594 A/G 1 15 13 28 7.04672184436887 6.89284106821365 0.153880776155224 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000173702:ENST00000311075:exon_124646379_124646837:MUC13;ENSG00000173702:ENST00000490147:exon_124646379_124646618:MUC13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 124826408 T/C 1 27 39 66 12.684099319864 20.6785232046409 -7.99442388477697 T:C T C 10 0.530218543708742 0.063520507717019 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124826325_124826615:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124826325_124826475:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124826321_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000461616:exon_124826325_124826421:SLC12A8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 124829057 A/G 1 5 8 13 2.34890728145629 4.24174834966994 -1.89284106821365 A:G A G 10 0.530218543708742 0.406203894191414 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000485954:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479231:exon_124829033_124829562:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465777:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000495105:exon_124829033_124829179:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000485849:exon_124829033_124829179:SLC12A8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 126180820 G/A 1 30 22 52 14.0934436887377 11.6648079615923 2.42863572714542 A:G G A 10 0.530218543708742 0.578975522227774 ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126180378_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000515545:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000336332:exon_126179926_126181063:ZXDC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 126194076 T/C 1 2 8 10 0.939562912582516 4.24174834966994 -3.30218543708742 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0537596124644068 ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126193802_126194762:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126193802_126194708:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000336332:exon_126193802_126194708:ZXDC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 128344786 G/A 1 77 60 137 36.1731721344269 31.8131126225245 4.36005951190234 A:G G A 10 0.530218543708742 0.493820668846115 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344717_128344855:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344717_128344855:RPN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 105 105 210 49.3270529105821 55.6729470894179 -6.34589417883582 T:C C T 10 0.530218543708742 0.406900491325187 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 129034578 G/A 1 139 101 240 65.2996224244849 53.5520729145829 11.7475495099019 A:G G A 10 0.530218543708742 0.136974310308460 ENSG00000184897:ENST00000333762:exon_129033615_129035117:H1FX HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 129155451 C/T 1 92 61 153 43.2198939787957 32.3433311662333 10.8765628125625 T:C C T 10 0.530218543708742 0.088701084634769 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 129275206 C/T 1 2 6 8 0.939562912582516 3.18131126225245 -2.24174834966994 T:C C T 10 0.530218543708742 0.158929006468168 ENSG00000004399:ENST00000324093:exon_129274018_129275271:PLXND1;ENSG00000004399:ENST00000393239:exon_129274018_129275271:PLXND1;ENSG00000004399:ENST00000501038:exon_129274057_129275271:PLXND1;ENSG00000004399:ENST00000504524:exon_129274057_129275271:PLXND1;ENSG00000004399:ENST00000512744:exon_129274061_129275271:PLXND1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 133341988 T/C 1 33 26 59 15.5027880576115 13.7856821364273 1.71710592118422 T:C T C 10 0.530218543708742 0.696883551484802 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133341935_133342037:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133341935_133342037:TOPBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 134225969 T/C 1 16 10 26 7.51650330066013 5.30218543708742 2.21431786357271 T:C T C 10 0.530218543708742 0.435912924593876 ENSG00000182923:ENST00000332047:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000354446:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000511574:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000413794:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000438820:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000383229:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000504013:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000512894:exon_134225951_134226095:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134225951_134226128:CEP63 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 134898742 C/T 1 9 3 12 4.22803310662132 1.59065563112623 2.6373774754951 T:C C T 10 0.530218543708742 0.154808266842262 ENSG00000154928:ENST00000398015:exon_134898702_134898824:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000360935:exon_134898702_134898824:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000425716:exon_134898702_134898824:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000493838:exon_134898702_134898824:EPHB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 26 27 53 12.2143178635727 14.315900680136 -2.10158281656333 A:G G A 10 0.530218543708742 0.584374617619714 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 137881265 T/A 1 15 16 31 7.04672184436887 8.48349669933987 -1.436774854971 A:T T A 10 0.530218543708742 0.719617548007844 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 140695307 C/A 1 43 33 76 20.2006026205241 17.4972119423885 2.70339067813561 A:C C A 10 0.530218543708742 0.566922974994677 ENSG00000114120:ENST00000446041:exon_140695105_140698775:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000324194:exon_140695102_140695492:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000502594:exon_140695102_140695325:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000453248:exon_140695102_140695323:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000511757:exon_140695102_140695489:SLC25A36 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 46 0 46 21.6099469893979 0 21.6099469893979 G G 10 0.530218543708742 2.54050705021127e-13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 148786108 C/T 1 16 14 30 7.51650330066013 7.42305961192239 0.0934436887377403 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392913:exon_148786027_148786122:HLTF HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 148872987 G/A 1 9 5 14 4.22803310662132 2.65109271854371 1.57694038807761 A:G G A 10 0.530218543708742 0.43589870850422 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148872894_148873002:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148872894_148873002:HPS3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 148881673 C/T 1 10 12 22 4.69781456291258 6.3626225245049 -1.66480796159232 T:C C T 10 0.530218543708742 0.526195123533414 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148881629_148881736:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148881629_148881736:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460822:exon_148881629_148881736:HPS3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 149459413 C/T 1 28 29 57 13.1538807761552 15.3763377675535 -2.22245699139829 T:C C T 10 0.530218543708742 0.596760615886557 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149459362_149459505:COMMD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 24 20 44 11.2747549509902 10.6043708741748 0.670384076815353 T:G T G 10 0.530218543708742 0.88086557780696 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 138 0 138 64.8298409681936 0 64.8298409681936 T T 10 0.530218543708742 9.76676825393718e-39 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 68 35 103 31.9451390278055 18.557649029806 13.3874899979996 C:G C G 10 0.530218543708742 0.00993211853225217 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 155571275 T/C 1 18 9 27 8.45606621324264 4.77196689337868 3.68409931986397 T:C T C 10 0.530218543708742 0.179544318052189 ENSG00000169359:ENST00000392845:exon_155571012_155572167:SLC33A1;ENSG00000169359:ENST00000359479:exon_155571012_155572218:SLC33A1;ENSG00000169359:ENST00000475842:exon_155571160_155571280:SLC33A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 155632314 A/G 1 86 62 148 40.4012052410482 32.873549709942 7.52765553110618 A:G A G 10 0.530218543708742 0.218078053938724 ENSG00000163655:ENST00000496455:exon_155632208_155632359:GMPS;ENSG00000163655:ENST00000295920:exon_155632208_155632359:GMPS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 47 57 104 22.0797284456891 30.2224569913983 -8.14272854570916 T:C C T 10 0.530218543708742 0.116434845124615 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 170802910 C/T 1 8 16 24 3.75825165033006 8.48349669933987 -4.72524504900981 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0651871577391257 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000496492:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170802907_170803018:TNIK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 170811667 G/A 1 12 16 28 5.6373774754951 8.48349669933987 -2.84611922384478 A:G G A 10 0.530218543708742 0.344613553609419 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000496492:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170811628_170811757:TNIK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 170825920 G/A 1 15 10 25 7.04672184436887 5.30218543708742 1.74453640728145 A:G G A 10 0.530218543708742 0.551192924360965 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170825854_170825951:TNIK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 170843782 C/A 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 A:C C A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170843701_170843940:TNIK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 170893070 G/A 1 8 13 21 3.75825165033006 6.89284106821365 -3.13458941788358 A:G G A 10 0.530218543708742 0.193644496250896 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000468757:exon_170893041_170893119:TNIK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 170946002 A/G 1 11 7 18 5.16759601920384 3.71152980596119 1.45606621324264 A:G A G 10 0.530218543708742 0.638243716970554 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170945954_170946010:TNIK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 31 19 50 14.563225145029 10.0741523304661 4.4890728145629 A:G G A 10 0.530218543708742 0.256822400808394 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 179298999 C/T 1 65 66 131 30.5357946589318 34.994423884777 -4.4586292258452 T:C C T 10 0.530218543708742 0.483917531023604 ENSG00000136518:ENST00000429709:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000450518:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000392662:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000259034:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000484312:exon_179298952_179299008:ACTL6A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 180325487 T/C 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000163728:ENST00000296015:exon_180325436_180325553:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000412756:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000465065:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000470669:exon_180325436_180326059:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000382584:exon_180325436_180325553:TTC14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 180334623 C/T 1 11 9 20 5.16759601920384 4.77196689337868 0.395629125825161 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000145075:ENST00000476379:exon_180334614_180334754:CCDC39;ENSG00000145075:ENST00000273654:exon_180334614_180334754:CCDC39;ENSG00000145075:ENST00000442201:exon_180334614_180334754:CCDC39 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 38 34 72 17.8516953390678 18.0274304860972 -0.175735147029425 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 183211906 A/G 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 A:G A G 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000172578:ENST00000341319:exon_183211867_183212069:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000468734:exon_183211867_183212069:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000489245:exon_183208798_183212069:KLHL6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 80 64 144 37.5825165033006 33.9339867973595 3.64852970594115 C:G C G 10 0.530218543708742 0.559879602673807 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 183560195 A/G 1 25 21 46 11.7445364072814 11.1345894178836 0.609946989397868 A:G A G 10 0.530218543708742 0.883661229929805 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 24 43 67 11.2747549509902 22.7993973794759 -11.5246424284857 A:C C A 10 0.530218543708742 0.00663761455304127 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 185135338 T/A 1 5405 6 5411 2539.16877125425 3.18131126225245 2535.987459992 A:T:C:G T C 10 0.530218543708742 0 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 185331165 C/A 1 10 2 12 4.69781456291258 1.06043708741748 3.6373774754951 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0427166045006331 ENSG00000163904:ENST00000296257:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000427465:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000437107:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000413407:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000473760:exon_185331133_185331299:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000478001:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000476011:exon_185331133_185331432:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000444509:exon_185331143_185331196:SENP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 185639840 T/C 1 105 100 205 49.3270529105821 53.0218543708742 -3.69480146029211 T:C T C 10 0.530218543708742 0.624643997790986 ENSG00000136527:ENST00000453386:exon_185639799_185639914:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000492417:exon_185639799_185639914:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000463328:exon_185639799_185639914:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000259043:exon_185639799_185639914:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000414862:exon_185639799_185639895:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000487615:exon_185639799_185639914:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000466832:exon_185639799_185641597:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000392502:exon_185639799_185639914:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000448735:exon_185639799_185639914:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000456380:exon_185639799_185639914:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000382191:exon_185639799_185639914:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000465245:exon_185639831_185639914:TRA2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 186502665 C/T 1 11 9 20 5.16759601920384 4.77196689337868 0.395629125825161 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000156976:ENST00000465222:exon_186502221_186502831:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000491473:exon_186502218_186502733:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000486805:exon_186502353_186502830:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000485101:exon_186502353_186503840:EIF4A2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 67 57 124 31.4753575715143 30.2224569913983 1.25290058011599 T:C C T 10 0.530218543708742 0.857470261556153 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 191093080 A/G 1 12 12 24 5.6373774754951 6.3626225245049 -0.725245049009807 A:G A G 10 0.530218543708742 0.8392917887424 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 192516430 C/T 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 T:C C T 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000180611:ENST00000392452:exon_192514604_192517439:C3orf59;ENSG00000180611:ENST00000315470:exon_192514607_192517439:C3orf59 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 195453064 T/G 1 9 2 11 4.22803310662132 1.06043708741748 3.16759601920384 T:G T G 10 0.530218543708742 0.0707395200860403 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000498018:exon_195453052_195453443:MUC20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 195594950 G/A 1 45 40 85 21.1401655331066 21.2087417483497 -0.0685762152430698 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 195800811 C/T 1 76 83 159 35.7033906781356 44.0081391278256 -8.30474844968998 T:C C T 10 0.530218543708742 0.203693726180830 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 24 15 39 11.2747549509902 7.95327815563113 3.32147679535906 T:C T C 10 0.530218543708742 0.336866611015545 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 196386964 C/G 1 62 68 130 29.126450290058 36.0548609721945 -6.92841068213646 T:C:G C G 10 0.530218543708742 0.25327064078568 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 196743130 T/C 1 11 7 18 5.16759601920384 3.71152980596119 1.45606621324264 T:C T C 10 0.530218543708742 0.638243716970554 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196743060_196743240:MFI2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 196743994 G/A 1 15 14 29 7.04672184436887 7.42305961192239 -0.376337767553518 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196743974_196744161:MFI2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 196746629 T/C 1 19 11 30 8.9258476695339 5.83240398079616 3.09344368873774 T:C T C 10 0.530218543708742 0.277968900623872 ENSG00000163975:ENST00000296351:exon_196745824_196746672:MFI2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 196753538 G/A 1 15 15 30 7.04672184436887 7.95327815563113 -0.906556311262261 A:G G A 10 0.530218543708742 0.855305205345657 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196753531_196753630:MFI2;ENSG00000163975:ENST00000296351:exon_196753531_196753630:MFI2;ENSG00000163975:ENST00000439320:exon_196753531_196753630:MFI2;ENSG00000163975:ENST00000491399:exon_196753531_196753935:MFI2;ENSG00000163975:ENST00000473501:exon_196752413_196753630:MFI2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 196865242 C/T 1 8 10 18 3.75825165033006 5.30218543708742 -1.54393378675736 T:C C T 10 0.530218543708742 0.488609852310515 ENSG00000075711:ENST00000346964:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000357674:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000381807:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000314062:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000359922:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419354:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000452595:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000422288:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000448528:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000443183:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392382:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000450955:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419227:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392381:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000471733:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000447466:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000477312:exon_196865093_196865262:DLG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 3 197566254 T/C 1 7 3 10 3.28847019403881 1.59065563112623 1.69781456291258 T:C T C 10 0.530218543708742 0.352695224731846 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000494069:exon_197566192_197566268:LRCH3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 509858 G/A 1 8 10 18 3.75825165033006 5.30218543708742 -1.54393378675736 A:G G A 10 0.530218543708742 0.488609852310515 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_509762_509974:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_509762_509974:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504187:exon_509762_509974:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_509762_509974:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_509762_509974:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_509762_509974:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503111:exon_509762_509974:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506402:exon_509762_509974:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_509762_509974:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000509768:exon_509762_509974:PIGG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 517376 T/C 1 12 9 21 5.6373774754951 4.77196689337868 0.865410582116419 T:C T C 10 0.530218543708742 0.828055654924615 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 517461 T/C 1 12 9 21 5.6373774754951 4.77196689337868 0.865410582116419 T:C T C 10 0.530218543708742 0.828055654924615 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 517622 C/T 1 8 12 20 3.75825165033006 6.3626225245049 -2.60437087417484 T:C C T 10 0.530218543708742 0.269017553119515 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_517621_517702:PIGG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 520853 G/A 1 9 8 17 4.22803310662132 4.24174834966994 -0.0137152430486136 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_520828_521329:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000510235:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_520739_521019:PIGG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 527677 T/C 1 11 5 16 5.16759601920384 2.65109271854371 2.51650330066013 T:C T C 10 0.530218543708742 0.223429926014640 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_524629_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_525903_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504879:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_527421_527770:PIGG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 533001 T/C 1 21 24 45 9.86541058211642 12.7252450490098 -2.85983446689339 T:C T C 10 0.530218543708742 0.455878924318537 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_532942_533154:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_532942_533985:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000515237:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000505800:exon_532942_533312:PIGG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 23 21 44 10.8049734946989 11.1345894178836 -0.329615923184647 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 673772 C/T 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000507804:exon_673703_673807:MYL5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 843498 G/A 1 109 82 191 51.2061787357471 43.4779205841168 7.72825815163028 A:G G A 10 0.530218543708742 0.277266512271525 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843064_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843065_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843096_843562:GAK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 843720 T/C 1 73 72 145 34.2940463092618 38.1757351470294 -3.88168883776758 T:C T C 10 0.530218543708742 0.560501668072523 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843680_844197:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843680_843856:GAK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 941518 C/T 1 7 4 11 3.28847019403881 2.12087417483497 1.16759601920384 T:C C T 10 0.530218543708742 0.557007995713773 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000507319:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505734:exon_941497_942377:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504744:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513682:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504505:exon_941497_941942:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514546:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504850:exon_941497_942298:TMEM175 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 1018705 C/A 1 7 4 11 3.28847019403881 2.12087417483497 1.16759601920384 A:C C A 10 0.530218543708742 0.557007995713773 ENSG00000127418:ENST00000398484:exon_1018693_1020679:FGFRL1;ENSG00000127418:ENST00000510644:exon_1018693_1019775:FGFRL1;ENSG00000127418:ENST00000504138:exon_1018693_1019135:FGFRL1;ENSG00000127418:ENST00000264748:exon_1018693_1020686:FGFRL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 1019011 C/T 1 13 8 21 6.10715893178635 4.24174834966994 1.86541058211642 T:C C T 10 0.530218543708742 0.513989696790461 ENSG00000127418:ENST00000398484:exon_1018693_1020679:FGFRL1;ENSG00000127418:ENST00000510644:exon_1018693_1019775:FGFRL1;ENSG00000127418:ENST00000504138:exon_1018693_1019135:FGFRL1;ENSG00000127418:ENST00000264748:exon_1018693_1020686:FGFRL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 1244879 A/G 1 13 15 28 6.10715893178635 7.95327815563113 -1.84611922384478 A:G A G 10 0.530218543708742 0.571296577994255 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 84 75 159 39.4616423284657 39.7663907781557 -0.304748449689981 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 2746285 A/C 1 8 15 23 3.75825165033006 7.95327815563113 -4.19502650530107 A:C A C 10 0.530218543708742 0.0951873011194316 ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2746114_2746590:TNIP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 26 33 59 12.2143178635727 17.4972119423885 -5.28289407881578 T:C T C 10 0.530218543708742 0.192326092740709 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 53 49 102 24.8984171834367 25.9807086417284 -1.08229145829169 A:G A G 10 0.530218543708742 0.843315293971353 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 3213832 G/A 1 18 15 33 8.45606621324264 7.95327815563113 0.502788057611514 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000509751:exon_3213639_3213869:HTT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 27 27 54 12.684099319864 14.315900680136 -1.63180136027207 T:C T C 10 0.530218543708742 0.684201018751443 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 3227419 A/G 1 28 33 61 13.1538807761552 17.4972119423885 -4.34333116623326 A:G A G 10 0.530218543708742 0.30507523164127 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 31 25 56 14.563225145029 13.2554635927186 1.30776155231045 A:G G A 10 0.530218543708742 0.789538741261735 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 3234980 G/A 1 16 18 34 7.51650330066013 9.54393378675736 -2.02743048609723 A:G G A 10 0.530218543708742 0.497520057256665 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3234890_3235080:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3234890_3235080:HTT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 3514689 T/C 1 100 97 197 46.9781456291258 51.431198739748 -4.45305311062218 T:C T C 10 0.530218543708742 0.56809653651861 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 3526645 C/T 1 51 56 107 23.9588542708542 29.6922384476896 -5.73338417683539 T:C C T 10 0.530218543708742 0.287214975763733 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3526634_3526873:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3526634_3526778:LRPAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 4304522 A/C 1 2 8 10 0.939562912582516 4.24174834966994 -3.30218543708742 A:C A C 10 0.530218543708742 0.0537596124644068 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4304038_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000504302:exon_4304354_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000511458:exon_4304459_4304818:ZBTB49 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 4322570 G/A 1 3 8 11 1.40934436887377 4.24174834966994 -2.83240398079616 A:G G A 10 0.530218543708742 0.129086131769062 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4322367_4323512:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4322367_4323125:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4322367_4323513:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4322367_4323513:ZBTB49 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 4322665 T/C 1 9 2 11 4.22803310662132 1.06043708741748 3.16759601920384 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0707395200860403 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4322367_4323512:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4322367_4323125:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4322367_4323513:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4322367_4323513:ZBTB49 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 4322770 T/C 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 T:C T C 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4322367_4323512:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4322367_4323125:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4322367_4323513:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4322367_4323513:ZBTB49 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 6606864 A/G 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6606782_6607056:MAN2B2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 6864690 T/C 1 23 27 50 10.8049734946989 14.315900680136 -3.5109271854371 T:C T C 10 0.530218543708742 0.325568668953658 ENSG00000170871:ENST00000425103:exon_6862628_6865910:KIAA0232;ENSG00000170871:ENST00000307659:exon_6862628_6865910:KIAA0232 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 8207083 A/G 1 12 15 27 5.6373774754951 7.95327815563113 -2.31590068013603 A:G A G 10 0.530218543708742 0.442054176507922 ENSG00000125089:ENST00000510763:exon_8206894_8207093:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000507123:exon_8206894_8207339:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8206894_8207093:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8206894_8207093:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8206894_8207093:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382521:exon_8206894_8207093:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8206894_8207093:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000457650:exon_8206894_8207093:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8206894_8207093:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000503284:exon_8206894_8207093:SH3TC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 10446906 A/G 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 10447168 C/G 1 5 11 16 2.34890728145629 5.83240398079616 -3.48349669933987 C:G C G 10 0.530218543708742 0.130369289858938 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 13604182 T/C 1 33 20 53 15.5027880576115 10.6043708741748 4.89841718343667 T:C T C 10 0.530218543708742 0.215379109297661 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 13604418 G/C 1 45 33 78 21.1401655331066 17.4972119423885 3.64295359071813 C:G G C 10 0.530218543708742 0.429070061908439 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 13606670 C/T 1 21 28 49 9.86541058211642 14.8461192238448 -4.98070864172836 T:C C T 10 0.530218543708742 0.197219206274554 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 13615174 G/A 1 28 11 39 13.1538807761552 5.83240398079616 7.32147679535906 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0236186207804395 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000482713:exon_13615130_13615285:BOD1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 17581449 C/T 1 44 32 76 20.6703840768154 16.9669933986797 3.70339067813561 T:C C T 10 0.530218543708742 0.422585528605311 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17581447_17581562:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508497:exon_17581447_17581562:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000512397:exon_17581447_17581562:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000509583:exon_17581447_17581562:LAP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 24578097 C/T 1 188 179 367 88.3189137827565 94.9091193238648 -6.5902055411083 T:C C T 10 0.530218543708742 0.497005961258332 ENSG00000109606:ENST00000336812:exon_24577866_24578301:DHX15;ENSG00000109606:ENST00000511553:exon_24578092_24578301:DHX15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 25253995 C/T 1 46 21 67 21.6099469893979 11.1345894178836 10.4753575715143 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0101676139567916 ENSG00000038210:ENST00000512921:exon_25253943_25254097:PI4K2B;ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25253943_25254097:PI4K2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 25363901 T/A 1 3 7 10 1.40934436887377 3.71152980596119 -2.30218543708742 A:T T A 10 0.530218543708742 0.206122472271196 ENSG00000168228:ENST00000450254:exon_25363848_25363923:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000302874:exon_25363848_25363923:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000507760:exon_25363848_25363923:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000505412:exon_25363848_25363923:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000508058:exon_25363848_25363923:ZCCHC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 26 20 46 12.2143178635727 10.6043708741748 1.60994698939787 T:C T C 10 0.530218543708742 0.660552718164373 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 176 194 370 82.6815363072614 102.862397479496 -20.1808611722345 A:G A G 10 0.530218543708742 0.037193053494259 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 135 130 265 63.4204965993198 68.9284106821365 -5.50791408281663 A:G A G 10 0.530218543708742 0.499207894183335 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 81 69 150 38.0522979595919 36.5850795159032 1.4672184436887 T:G T G 10 0.530218543708742 0.870123375693051 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 78 71 149 36.6429535907181 37.6455166033207 -1.00256301260256 A:C C A 10 0.530218543708742 0.870063728455012 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 38776235 A/G 1 77 79 156 36.1731721344269 41.8872649529906 -5.71409281856376 A:G A G 10 0.530218543708742 0.378084460409484 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 38776320 C/T 1 60 40 100 28.1868873774755 21.2087417483497 6.9781456291258 T:C C T 10 0.530218543708742 0.192535230975382 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 139 115 254 65.2996224244849 60.9751325265053 4.32448989797954 T:G T G 10 0.530218543708742 0.615246623354411 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 38776725 C/A 1 137 168 305 64.3600595119023 89.0767153430687 -24.7166558311663 A:C C A 10 0.530218543708742 0.00489031026170601 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 38777059 C/T 1 119 129 248 55.9039932986597 68.3981921384277 -12.494198839768 T:C C T 10 0.530218543708742 0.126640247108945 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 59 69 128 27.7171059211842 36.5850795159032 -8.86797359471898 A:T A T 10 0.530218543708742 0.132004031416847 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 82 80 162 38.5220794158832 42.4174834966994 -3.89540408081621 T:G T G 10 0.530218543708742 0.581809943774173 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 18 16 34 8.45606621324264 8.48349669933987 -0.0274304860972272 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 39122697 C/T 1 30 15 45 14.0934436887377 7.95327815563113 6.14016553310661 T:C C T 10 0.530218543708742 0.073574391341372 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39122630_39123829:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39122630_39123828:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39122630_39122825:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39122630_39123826:KLHL5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 35 48 83 16.442350970194 25.4504900980196 -9.00813912782558 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0609048758472188 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 39303925 A/G 1 43 49 92 20.2006026205241 25.9807086417284 -5.78010602120426 A:G A G 10 0.530218543708742 0.250870034173367 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39303898_39303996:RFC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 21 14 35 9.86541058211642 7.42305961192239 2.44235097019403 A:G A G 10 0.530218543708742 0.498927835684863 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 40440215 T/C 1 9 18 27 4.22803310662132 9.54393378675736 -5.31590068013603 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0524474966934978 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40439788_40440814:RBM47 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 40440854 G/C 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000515053:exon_40440259_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000513473:exon_40440332_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000505414:exon_40440435_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514782:exon_40440499_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000507180:exon_40440540_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000511598:exon_40440570_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000511902:exon_40440732_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000505220:exon_40440733_40440941:RBM47 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 41015823 G/A 1 4 10 14 1.87912582516503 5.30218543708742 -3.42305961192239 A:G G A 10 0.530218543708742 0.105064392873074 ENSG00000163697:ENST00000295974:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513140:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513611:exon_41015600_41016402:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000508593:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000316212:exon_41015600_41016419:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000506352:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000509475:exon_41015600_41016402:APBB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 42003734 G/A 1 2 7 9 0.939562912582516 3.71152980596119 -2.77196689337868 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0932648737406713 ENSG00000014824:ENST00000264451:exon_42003633_42003797:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000513699:exon_42003633_42003797:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000510460:exon_42003633_42003797:SLC30A9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 44682465 T/C 1 14 22 36 6.57694038807761 11.6648079615923 -5.08786757351471 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0967141233002735 ENSG00000151806:ENST00000281543:exon_44682458_44682569:GUF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 47525054 T/C 1 7 4 11 3.28847019403881 2.12087417483497 1.16759601920384 T:C T C 10 0.530218543708742 0.557007995713773 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47525029_47525233:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000504445:exon_47525029_47525233:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47525029_47525233:ATP10D HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 48147309 T/C 1 16 13 29 7.51650330066013 6.89284106821365 0.623662232446482 T:C T C 10 0.530218543708742 0.854455190101058 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000511471:exon_48147095_48147312:TEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 48172266 G/A 1 7 7 14 3.28847019403881 3.71152980596119 -0.423059611922388 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48172265_48172393:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48172262_48172395:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48172265_48172393:TEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 57221348 T/C 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 T:C T C 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57221348_57221589:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57221348_57221589:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57221348_57221589:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57221348_57221589:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57221348_57221589:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57221348_57221589:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57221348_57221589:AASDH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 57248716 G/C 1 8 4 12 3.75825165033006 2.12087417483497 1.6373774754951 C:G G C 10 0.530218543708742 0.398218675970565 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000510012:exon_57247925_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514796:exon_57248590_57248763:AASDH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 57250285 T/C 1 8 3 11 3.75825165033006 1.59065563112623 2.16759601920384 T:C T C 10 0.530218543708742 0.235945069885030 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000510012:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514796:exon_57250236_57250465:AASDH HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 57268328 T/C 1 16 14 30 7.51650330066013 7.42305961192239 0.0934436887377403 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57268275_57268347:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57268275_57268347:PPAT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 57356588 A/G 1 15 22 37 7.04672184436887 11.6648079615923 -4.61808611722345 A:G A G 10 0.530218543708742 0.140191429203817 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57356499_57356602:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57356499_57356602:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000505314:exon_57356499_57356602:SRP72 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 73942678 C/T 1 42 49 91 19.7308211642328 25.9807086417284 -6.24988747749552 T:C C T 10 0.530218543708742 0.207889770116191 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 75937971 C/T 1 26 29 55 12.2143178635727 15.3763377675535 -3.16201990398081 T:C C T 10 0.530218543708742 0.419552358023717 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 75938179 G/A 1 15 31 46 7.04672184436887 16.436774854971 -9.39005301060213 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00721020268309736 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 75938236 A/G 1 16 25 41 7.51650330066013 13.2554635927186 -5.73896029205842 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0850219156675743 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 76720885 T/C 1 37 37 74 17.3819138827765 19.6180861172235 -2.2361722344469 T:C T C 10 0.530218543708742 0.642121669933544 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76720775_76720885:USO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 76730195 A/G 1 48 39 87 22.5495099019804 20.6785232046409 1.87098669733945 A:G A G 10 0.530218543708742 0.747634049379356 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76730106_76730204:USO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 76857388 C/T 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 T:C C T 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000399490:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507187:exon_76856352_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507940:exon_76857317_76857388:NAAA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 76878688 G/A 1 44 44 88 20.6703840768154 23.3296159231846 -2.65923184636929 A:G G A 10 0.530218543708742 0.594428021332067 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 77039174 G/C 1 2 8 10 0.939562912582516 4.24174834966994 -3.30218543708742 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0537596124644068 ENSG00000138750:ENST00000508604:exon_77038817_77039347:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77039099_77039347:NUP54 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 77055474 A/G 1 26 26 52 12.2143178635727 13.7856821364273 -1.57136427285458 A:G A G 10 0.530218543708742 0.679097790739333 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77055329_77055515:NUP54 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 77057501 A/G 1 22 23 45 10.3351920384077 12.1950265053011 -1.85983446689339 A:G A G 10 0.530218543708742 0.654795510593742 ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77057341_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77057474_77057565:NUP54 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 77065580 T/C 1 21 13 34 9.86541058211642 6.89284106821365 2.97256951390277 T:C T C 10 0.530218543708742 0.390710959106296 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508583:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514901:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510569:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510884:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000513352:exon_77065543_77065626:NUP54 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 77871016 T/G 1 16 13 29 7.51650330066013 6.89284106821365 0.623662232446482 T:G T G 10 0.530218543708742 0.854455190101058 ENSG00000138758:ENST00000264893:exon_77870856_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000502584:exon_77870904_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000510641:exon_77870919_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000505788:exon_77870962_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000512575:exon_77870989_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000510515:exon_77870990_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000504637:exon_77871015_77871083:SEPT11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 22 12 34 10.3351920384077 6.3626225245049 3.97256951390277 T:C C T 10 0.530218543708742 0.228654342632051 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 84380955 G/T 1 9 2 11 4.22803310662132 1.06043708741748 3.16759601920384 T:G G T 10 0.530218543708742 0.0707395200860403 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 84383810 C/T 1 10 9 19 4.69781456291258 4.77196689337868 -0.0741523304660978 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000163322:ENST00000321945:exon_84382092_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000475656:exon_84382098_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000506553:exon_84383162_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000504777:exon_84383228_84384055:FAM175A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 89361323 C/T 1 9 8 17 4.22803310662132 4.24174834966994 -0.0137152430486136 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000138642:ENST00000511939:exon_89361300_89361402:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000380265:exon_89361300_89361402:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000438983:exon_89361300_89361402:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000264346:exon_89361300_89361402:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000506842:exon_89361300_89361792:HERC6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 90034686 A/G 1 9 12 21 4.22803310662132 6.3626225245049 -2.13458941788358 A:G A G 10 0.530218543708742 0.387625542901861 ENSG00000180346:ENST00000317005:exon_90033968_90036050:TIGD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 102751076 G/A 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G G A 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000153064:ENST00000504592:exon_102750965_102751363:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000322953:exon_102750965_102751363:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000444316:exon_102750965_102751363:BANK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 103518717 G/A 1 79 95 174 37.1127350470094 50.3707616523305 -13.2580266053211 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0481547600906646 ENSG00000109320:ENST00000226574:exon_103518677_103518818:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000394820:exon_103518677_103518818:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000505458:exon_103518677_103518818:NFKB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 104061551 T/G 1 37 36 73 17.3819138827765 19.0878675735147 -1.70595369073816 T:G T G 10 0.530218543708742 0.725782494814103 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061413_104061571:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061413_104061571:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061413_104061571:CENPE HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 106394792 C/T 1 4 9 13 1.87912582516503 4.77196689337868 -2.89284106821365 T:C C T 10 0.530218543708742 0.162918845921506 ENSG00000138777:ENST00000502596:exon_106394497_106394866:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000505713:exon_106394515_106394932:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000310267:exon_106394625_106394941:PPA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 108575989 G/A 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 A:G G A 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108575851_108576056:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108575851_108576056:PAPSS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 108581223 A/G 1 15 6 21 7.04672184436887 3.18131126225245 3.86541058211642 A:G A G 10 0.530218543708742 0.124647738959612 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108581115_108581228:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108581115_108581228:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000502431:exon_108581116_108581228:PAPSS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 108969883 G/A 1 22 20 42 10.3351920384077 10.6043708741748 -0.269178835767164 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000138795:ENST00000265165:exon_108968701_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000379951:exon_108968701_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000503879:exon_108968729_108969930:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000504426:exon_108968748_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000505379:exon_108969325_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000514444:exon_108969456_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000505297:exon_108969510_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000510135:exon_108969533_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000438313:exon_108969573_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000507470:exon_108969683_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000509428:exon_108969753_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000512407:exon_108969791_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000510624:exon_108969795_108969907:LEF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 248 191 439 116.505801160232 101.27174184837 15.2340593118623 A:T:G A G 10 0.530218543708742 0.151504039462043 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 113360925 G/A 1 2 6 8 0.939562912582516 3.18131126225245 -2.24174834966994 A:G G A 10 0.530218543708742 0.158929006468168 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113360842_113361028:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113360842_113361028:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113360842_113361028:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113360842_113361028:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113360842_113361028:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113360842_113361028:ALPK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 113362316 A/G 1 11 8 19 5.16759601920384 4.24174834966994 0.925847669533902 A:G A G 10 0.530218543708742 0.8192074586227 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 123814308 C/T 1 15 21 36 7.04672184436887 11.1345894178836 -4.08786757351471 T:C C T 10 0.530218543708742 0.184727154715863 ENSG00000138685:ENST00000264498:exon_123813366_123819391:FGF2;ENSG00000138685:ENST00000394350:exon_123813366_123819376:FGF2;ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123813730_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123813801_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000510735:exon_123813805_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123813806_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000502270:exon_123813896_123814380:NUDT6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 123949389 G/C 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000145375:ENST00000274008:exon_123949341_123949550:SPATA5;ENSG00000145375:ENST00000422835:exon_123949341_123949550:SPATA5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 130023759 A/T 1 19 12 31 8.9258476695339 6.3626225245049 2.563225145029 A:T A T 10 0.530218543708742 0.375031576291977 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502360:exon_130023757_130024192:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508622:exon_130023757_130023946:C4orf33 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 130030652 A/G 1 10 10 20 4.69781456291258 5.30218543708742 -0.60437087417484 A:G A G 10 0.530218543708742 0.825709894540955 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 140036422 T/C 1 2 57 59 0.939562912582516 30.2224569913983 -29.2828940788158 T:C T C 10 0.530218543708742 1.53826289827067e-16 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 39 30 69 18.3214767953591 15.9065563112623 2.4149204840968 A:G G A 10 0.530218543708742 0.629950581930727 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 48 37 85 22.5495099019804 19.6180861172235 2.93142378475693 T:C T C 10 0.530218543708742 0.587250081481055 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 42 41 83 19.7308211642328 21.7389602920584 -2.00813912782559 T:C C T 10 0.530218543708742 0.661934956406193 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 146823970 G/A 1 11 12 23 5.16759601920384 6.3626225245049 -1.19502650530107 A:G G A 10 0.530218543708742 0.679029978421074 ENSG00000151612:ENST00000508784:exon_146823318_146824367:ZNF827;ENSG00000151612:ENST00000379448:exon_146823318_146824367:ZNF827;ENSG00000151612:ENST00000281318:exon_146823318_146824367:ZNF827;ENSG00000151612:ENST00000440280:exon_146823318_146824367:ZNF827 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 151773593 G/C 1 18 16 34 8.45606621324264 8.48349669933987 -0.0274304860972272 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151773037_151774095:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151773037_151774095:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000507224:exon_151773037_151774095:LRBA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 151829824 T/C 1 5 14 19 2.34890728145629 7.42305961192239 -5.0741523304661 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0218531141296597 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151829812_151830009:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151829812_151830009:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000507224:exon_151829812_151830009:LRBA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 154525138 A/G 1 87 98 185 40.8709866973394 51.9614172834567 -11.0904305861173 A:G A G 10 0.530218543708742 0.105503470997808 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154524954_154525534:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154524954_154525582:KIAA0922 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 154553833 A/G 1 7 1 8 3.28847019403881 0.530218543708742 2.75825165033006 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0743148409803516 ENSG00000121210:ENST00000478919:exon_154553516_154553990:KIAA0922 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 154553877 C/T 1 27 32 59 12.684099319864 16.9669933986797 -4.28289407881578 T:C C T 10 0.530218543708742 0.297336160824213 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000478919:exon_154553516_154553990:KIAA0922 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 156274469 T/C 1 3 9 12 1.40934436887377 4.77196689337868 -3.3626225245049 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0792634794421136 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156274405_156274492:MAP9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 160277276 C/T 1 12 13 25 5.6373774754951 6.89284106821365 -1.25546359271855 T:C C T 10 0.530218543708742 0.690551486586856 ENSG00000109756:ENST00000264431:exon_160277005_160277310:RAPGEF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 164085425 T/C 1 8 13 21 3.75825165033006 6.89284106821365 -3.13458941788358 T:C T C 10 0.530218543708742 0.193644496250896 ENSG00000145414:ENST00000422287:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000274054:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000509232:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000502973:exon_164085369_164085543:NAF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 169158531 T/C 1 3 9 12 1.40934436887377 4.77196689337868 -3.3626225245049 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0792634794421136 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169158437_169158578:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000507815:exon_169158437_169158639:DDX60 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 169176996 G/A 1 6 10 16 2.81868873774755 5.30218543708742 -2.48349669933987 A:G G A 10 0.530218543708742 0.316586227617054 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169176862_169177020:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000505393:exon_169176862_169177020:DDX60 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 170038894 A/G 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:G A G 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000154447:ENST00000284637:exon_170038674_170038933:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000511421:exon_170038674_170038933:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000508685:exon_170038674_170038933:SH3RF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 174292472 G/T 1 49 42 91 23.0192913582716 22.2691788357672 0.750112522504477 T:G G T 10 0.530218543708742 0.916578128356446 ENSG00000164105:ENST00000296504:exon_174292094_174292648:SAP30 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 178231071 G/A 0 8 0 8 3.75825165033006 0 3.75825165033006 G G 10 0.530218543708742 0.0086188222890866 ENSG00000109674:ENST00000264596:exon_178230990_178231263:NEIL3;ENSG00000109674:ENST00000513321:exon_178231057_178231263:NEIL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 178256913 C/G 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000109674:ENST00000264596:exon_178256842_178256976:NEIL3;ENSG00000109674:ENST00000513321:exon_178256842_178256976:NEIL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 178274835 A/C 1 6 9 15 2.81868873774755 4.77196689337868 -1.95327815563113 A:C A C 10 0.530218543708742 0.438985732589774 ENSG00000109674:ENST00000264596:exon_178274462_178274882:NEIL3;ENSG00000109674:ENST00000513321:exon_178274462_178275433:NEIL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 184426387 C/T 1 10 14 24 4.69781456291258 7.42305961192239 -2.72524504900981 T:C C T 10 0.530218543708742 0.309127957783389 ENSG00000168556:ENST00000302327:exon_184426147_184426520:ING2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 184600601 A/G 1 3 7 10 1.40934436887377 3.71152980596119 -2.30218543708742 A:G A G 10 0.530218543708742 0.206122472271196 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184600506_184600639:C4orf41 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 81 76 157 38.0522979595919 40.2966093218644 -2.2443113622725 T:C C T 10 0.530218543708742 0.749378187137892 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 185599542 A/T 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 A:T A T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185599386_185599548:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185599386_185599548:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185599386_185599548:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185599386_185599548:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000508001:exon_185599431_185599548:CCDC111 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 185599578 T/A 1 2 6 8 0.939562912582516 3.18131126225245 -2.24174834966994 A:T T A 10 0.530218543708742 0.158929006468168 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 185687129 G/A 1 15 11 26 7.04672184436887 5.83240398079616 1.21431786357271 A:G G A 10 0.530218543708742 0.697339873549611 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000503407:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687045_185687140:ACSL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 186097045 C/T 1 17 23 40 7.98628475695139 12.1950265053011 -4.20874174834968 T:C C T 10 0.530218543708742 0.206250018537793 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 62 61 123 29.126450290058 32.3433311662333 -3.21688087617527 T:C T C 10 0.530218543708742 0.588397856196248 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 46 25 71 21.6099469893979 13.2554635927186 8.35448339667932 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0564889253198046 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 4 187113041 C/G 1 9 5 14 4.22803310662132 2.65109271854371 1.57694038807761 C:G C G 10 0.530218543708742 0.43589870850422 ENSG00000145476:ENST00000378802:exon_187112674_187113191:CYP4V2;ENSG00000145476:ENST00000274118:exon_187112978_187113097:CYP4V2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 205565 G/A 1 40 47 87 18.7912582516503 24.9202715543109 -6.12901330266055 A:G G A 10 0.530218543708742 0.198469259573243 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 226160 A/C 1 114 95 209 53.5550860172034 50.3707616523305 3.18432436487293 A:C A C 10 0.530218543708742 0.678009028777794 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_225748_226162:SDHA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 228362 T/C 1 63 58 121 29.5962317463493 30.752675535107 -1.15644378875778 T:C T C 10 0.530218543708742 0.855790539212078 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_227724_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_228300_228448:SDHA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 231111 T/C 1 76 72 148 35.7033906781356 38.1757351470294 -2.47234446889382 A:T:C T C 10 0.530218543708742 0.681676422996893 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_231058_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_231058_231115:SDHA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 233734 C/G 1 124 105 229 58.252900580116 55.6729470894179 2.57995349069808 C:G C G 10 0.530218543708742 0.741154446669599 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_233718_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_233592_233744:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_233592_234253:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_233592_234253:SDHA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 256472 G/A 1 245 170 415 115.096456791358 90.1371524304861 24.9593043608721 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0158622566630075 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 256509 G/A 1 218 164 382 102.412357471494 86.9558411682337 15.4565163032606 A:G G A 10 0.530218543708742 0.124002399556802 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 432905 C/A 1 2 10 12 0.939562912582516 5.30218543708742 -4.3626225245049 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0171375315357398 ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_432140_433062:AHRR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 434722 G/C 1 38 36 74 17.8516953390678 19.0878675735147 -1.23617223444691 C:G G C 10 0.530218543708742 0.816281957772935 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_433968_434972:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 434998 C/T 1 30 26 56 14.0934436887377 13.7856821364273 0.307761552310447 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 442571 A/C 1 8 12 20 3.75825165033006 6.3626225245049 -2.60437087417484 A:C A C 10 0.530218543708742 0.269017553119515 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 442586 G/C 1 16 6 22 7.51650330066013 3.18131126225245 4.33519203840768 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0859604098113894 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 442790 G/A 1 27 8 35 12.684099319864 4.24174834966994 8.44235097019403 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0058888314500307 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 44 38 82 20.6703840768154 20.1483046609322 0.522079415883155 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 462465 C/A 1 2 9 11 0.939562912582516 4.77196689337868 -3.83240398079616 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0305374290985922 ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_462272_462644:EXOC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 476353 C/T 1 24 28 52 11.2747549509902 14.8461192238448 -3.57136427285458 T:C C T 10 0.530218543708742 0.333931596904285 ENSG00000066230:ENST00000264938:exon_476317_476493:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000514375:exon_476317_476493:SLC9A3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 640705 A/G 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000112877:ENST00000264935:exon_640523_640719:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000444221:exon_640523_640719:CEP72 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 1057615 A/G 1 14 2 16 6.57694038807761 1.06043708741748 5.51650330066013 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00523540194443503 ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000514994:exon_1057326_1057764:SLC12A7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 1063998 G/A 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 A:G G A 10 0.530218543708742 0.565817448386735 ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1063959_1064090:SLC12A7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 1065399 C/T 1 10 13 23 4.69781456291258 6.89284106821365 -2.19502650530107 T:C C T 10 0.530218543708742 0.407163540617657 ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1065398_1065593:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1065398_1065593:SLC12A7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 1467004 A/G 1 43 54 97 20.2006026205241 28.6318013602721 -8.43119873974797 A:G A G 10 0.530218543708742 0.103159187949077 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 1479678 G/C 1 9 5 14 4.22803310662132 2.65109271854371 1.57694038807761 C:G G C 10 0.530218543708742 0.43589870850422 ENSG00000153395:ENST00000513757:exon_1479591_1479790:LPCAT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 6604787 C/T 1 69 53 122 32.4149204840968 28.1015828165633 4.31333766753348 T:C C T 10 0.530218543708742 0.468546121049185 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604718_6604995:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6604718_6604821:NSUN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 6633042 C/T 1 28 42 70 13.1538807761552 22.2691788357672 -9.11529805961194 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0311758007080315 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6632997_6633404:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6632997_6633404:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6632997_6633155:NSUN2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 6633779 C/G 1 33 28 61 15.5027880576115 14.8461192238448 0.656668833766739 C:G C G 10 0.530218543708742 0.8985314289423 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 6651970 A/G 1 17 15 32 7.98628475695139 7.95327815563113 0.0330066013202561 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 6652009 G/A 1 9 11 20 4.22803310662132 5.83240398079616 -1.60437087417484 A:G G A 10 0.530218543708742 0.508309614769096 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 6656210 G/A 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 A:G G A 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6656191_6656292:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6656191_6656292:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6656191_6656292:SRD5A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 6748659 T/C 1 9 8 17 4.22803310662132 4.24174834966994 -0.0137152430486136 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000112941:ENST00000230859:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000511764:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000514697:exon_6748577_6748703:PAPD7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 7866967 G/C 1 10 8 18 4.69781456291258 4.24174834966994 0.456066213242644 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000511261:exon_7866759_7867502:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 7868030 T/C 1 11 7 18 5.16759601920384 3.71152980596119 1.45606621324264 T:C T C 10 0.530218543708742 0.638243716970554 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000504695:exon_7867463_7868220:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507572:exon_7867603_7868145:FASTKD3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 7878192 T/C 1 11 20 31 5.16759601920384 10.6043708741748 -5.436774854971 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0702936040050714 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7878057_7878262:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514220:exon_7878057_7878348:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 7885959 A/G 1 4 16 20 1.87912582516503 8.48349669933987 -6.60437087417484 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00319477136948976 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7885898_7885967:MTRR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 7897191 C/T 1 18 13 31 8.45606621324264 6.89284106821365 1.563225145029 T:C C T 10 0.530218543708742 0.595148843392745 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508354:exon_7897178_7897213:MTRR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 7897283 G/A 1 23 22 45 10.8049734946989 11.6648079615923 -0.859834466893389 A:G G A 10 0.530218543708742 0.881561350298545 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 10239261 G/A 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 10250430 G/A 1 23 22 45 10.8049734946989 11.6648079615923 -0.859834466893389 A:G G A 10 0.530218543708742 0.881561350298545 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 10250443 T/C 1 36 32 68 16.9121324264853 16.9669933986797 -0.0548609721944544 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000423695:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000510326:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000512975:exon_10250431_10250557:CCT5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 10254817 A/G 1 120 97 217 56.373774754951 51.431198739748 4.94257601520298 A:G A G 10 0.530218543708742 0.54060792795263 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10254786_10254835:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10254786_10255142:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10254786_10254950:CCT5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 10256161 T/C 1 52 74 126 24.4286357271454 39.2361722344469 -14.8075365073015 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00943127931531904 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503454:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000506600:exon_10256067_10256265:CCT5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 10262740 C/A 1 8 10 18 3.75825165033006 5.30218543708742 -1.54393378675736 A:C C A 10 0.530218543708742 0.488609852310515 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 14420027 A/C 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 A:C A C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509354:exon_14419887_14420295:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512979:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000507714:exon_14419923_14420130:TRIO HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 14462890 C/T 1 15 8 23 7.04672184436887 4.24174834966994 2.80497349469893 T:C C T 10 0.530218543708742 0.298108306919805 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14462864_14463034:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14462864_14463034:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14462864_14463034:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14462864_14463034:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515710:exon_14462864_14463034:TRIO HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 14498727 G/A 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 A:G G A 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000344135:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508343:exon_14498628_14499290:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508283:exon_14498625_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508717:exon_14498625_14498749:TRIO HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 16 10 26 7.51650330066013 5.30218543708742 2.21431786357271 A:G A G 10 0.530218543708742 0.435912924593876 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 31423007 T/C 1 6 14 20 2.81868873774755 7.42305961192239 -4.60437087417484 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0445921710114037 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31422894_31423428:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000510178:exon_31422894_31423051:DROSHA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 33998883 A/G 1 8 16 24 3.75825165033006 8.48349669933987 -4.72524504900981 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0651871577391257 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33998746_33998887:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33998746_33998932:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33998746_33998932:C1QTNF3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 34004707 C/T 1 4 7 11 1.87912582516503 3.71152980596119 -1.83240398079616 T:C C T 10 0.530218543708742 0.367650802678922 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_34004679_34004839:AMACR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 34008100 C/T 1 3 18 21 1.40934436887377 9.54393378675736 -8.13458941788358 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000315917296670304 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_34007878_34008213:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_34007878_34008133:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_34007878_34008209:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_34007878_34008189:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_34007878_34008133:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_34007878_34008133:AMACR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 42800808 C/T 1 26 10 36 12.2143178635727 5.30218543708742 6.91213242648529 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0285530516549205 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 43039793 T/C 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 43297144 A/G 1 66 62 128 31.005576115223 32.873549709942 -1.86797359471898 A:G A G 10 0.530218543708742 0.790665048337446 ENSG00000112972:ENST00000325110:exon_43297104_43297268:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000433297:exon_43297104_43297268:HMGCS1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 44809162 G/C 1 58 63 121 27.247324464893 33.4037682536507 -6.15644378875778 C:G G C 10 0.530218543708742 0.275208903363365 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 52397311 T/C 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000164172:ENST00000510818:exon_52397189_52397339:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000450852:exon_52397189_52397339:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000396954:exon_52397189_52397339:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000502402:exon_52396241_52397339:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000338412:exon_52397189_52397339:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000508922:exon_52397189_52397339:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000527216:exon_52397189_52397339:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000514553:exon_52396956_52397339:MOCS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 52398005 T/C 1 8 6 14 3.75825165033006 3.18131126225245 0.576940388077612 T:C T C 10 0.530218543708742 0.795824909862849 ENSG00000164172:ENST00000361377:exon_52397927_52398054:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000510818:exon_52397927_52398054:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000450852:exon_52397927_52398054:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000396954:exon_52397927_52398054:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000502402:exon_52397927_52398054:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000338412:exon_52397927_52398054:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000508922:exon_52397927_52398054:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000527216:exon_52397927_52398054:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000514553:exon_52397927_52398054:MOCS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 10 13 23 4.69781456291258 6.89284106821365 -2.19502650530107 C:G G C 10 0.530218543708742 0.407163540617657 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 52942197 A/G 1 36 35 71 16.9121324264853 18.557649029806 -1.64551660332068 A:G A G 10 0.530218543708742 0.722392202140731 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506765:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000509443:exon_52942025_52942235:NDUFS4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 25 23 48 11.7445364072814 12.1950265053011 -0.450490098019616 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 65350374 A/G 1 66 58 124 31.005576115223 30.752675535107 0.252900580115995 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 65350481 C/T 1 59 64 123 27.7171059211842 33.9339867973595 -6.21688087617527 T:C C T 10 0.530218543708742 0.278860415914234 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511671:exon_65350461_65350779:ERBB2IP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 66481777 G/C 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 C:G G C 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66481679_66481845:CD180;ENSG00000134061:ENST00000515027:exon_66481679_66482125:CD180 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 68695940 T/G 1 21 20 41 9.86541058211642 10.6043708741748 -0.738960292058422 T:G T G 10 0.530218543708742 0.876235151511188 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000513214:exon_68695876_68695996:RAD17 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 73930751 C/T 1 13 1 14 6.10715893178635 0.530218543708742 5.57694038807761 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00228884504353901 ENSG00000171617:ENST00000302351:exon_73930509_73932323:ENC1;ENSG00000171617:ENST00000510316:exon_73930509_73932187:ENC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 73931246 T/C 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000171617:ENST00000302351:exon_73930509_73932323:ENC1;ENSG00000171617:ENST00000510316:exon_73930509_73932187:ENC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 73932315 T/C 1 8 1 9 3.75825165033006 0.530218543708742 3.22803310662132 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0421575176018681 ENSG00000171617:ENST00000302351:exon_73930509_73932323:ENC1;ENSG00000171617:ENST00000508331:exon_73932162_73932323:ENC1;ENSG00000171617:ENST00000509127:exon_73932299_73932323:ENC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 73985215 A/G 1 19 20 39 8.9258476695339 10.6043708741748 -1.67852320464094 A:G A G 10 0.530218543708742 0.63239273066813 ENSG00000049860:ENST00000511181:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000515528:exon_73985153_73985674:HEXB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 75001582 A/G 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 A:G A G 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75001064_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75001398_75001612:POC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 75003678 T/C 1 5 9 14 2.34890728145629 4.77196689337868 -2.42305961192239 T:C T C 10 0.530218543708742 0.284180524640790 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000507421:exon_75003309_75003700:POC5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 75906851 T/C 1 18 14 32 8.45606621324264 7.42305961192239 1.03300660132026 T:C T C 10 0.530218543708742 0.727799998593614 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000504254:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000513534:exon_75906845_75907008:IQGAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 75960865 T/C 1 24 30 54 11.2747549509902 15.9065563112623 -4.63180136027207 T:C T C 10 0.530218543708742 0.221600994196595 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75960851_75961000:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75960851_75960876:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75960851_75961000:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75960851_75961000:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75960851_75961000:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75960851_75961000:IQGAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 75969360 G/T 1 12 21 33 5.6373774754951 11.1345894178836 -5.49721194238849 T:G G T 10 0.530218543708742 0.0795650337651618 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75969274_75969414:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75969274_75969414:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75969274_75969414:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75969274_75969414:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000512383:exon_75969274_75969414:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000504558:exon_75969274_75969606:IQGAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 75991420 C/T 1 31 14 45 14.563225145029 7.42305961192239 7.14016553310661 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0363611637887275 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75991279_75991491:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75991279_75991491:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75991279_75991491:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75991279_75991491:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000504477:exon_75991279_75991491:IQGAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 77412011 A/G 1 21 18 39 9.86541058211642 9.54393378675736 0.321476795359063 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517940:exon_77411950_77412011:AP3B1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 77425028 A/T 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 A:T A T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77424945_77425131:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77424945_77425131:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517561:exon_77424945_77425131:AP3B1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 77473165 A/G 1 21 27 48 9.86541058211642 14.315900680136 -4.45049009801962 A:G A G 10 0.530218543708742 0.247095355795215 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77473163_77473260:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77473163_77473260:AP3B1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 77784738 A/G 1 34 29 63 15.9725695139028 15.3763377675535 0.596231746349256 A:G A G 10 0.530218543708742 0.900280665569595 ENSG00000145685:ENST00000274345:exon_77781038_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000380345:exon_77781040_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000515007:exon_77781054_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000502722:exon_77784635_77784976:LHFPL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 78181477 C/T 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 T:C C T 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000113273:ENST00000264914:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000341088:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000396151:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000521800:exon_78181407_78181653:ARSB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 78964729 T/G 1 26 19 45 12.2143178635727 10.0741523304661 2.14016553310661 T:G T G 10 0.530218543708742 0.553366095069931 ENSG00000164329:ENST00000453514:exon_78964715_78964851:PAPD4;ENSG00000164329:ENST00000428308:exon_78964715_78964851:PAPD4;ENSG00000164329:ENST00000423041:exon_78964715_78964851:PAPD4;ENSG00000164329:ENST00000504233:exon_78964715_78964851:PAPD4;ENSG00000164329:ENST00000296783:exon_78964715_78964851:PAPD4;ENSG00000164329:ENST00000504982:exon_78964715_78964828:PAPD4;ENSG00000164329:ENST00000513735:exon_78964715_78964851:PAPD4;ENSG00000164329:ENST00000515298:exon_78964715_78964851:PAPD4;ENSG00000164329:ENST00000510721:exon_78964544_78964851:PAPD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 79950508 C/T 1 17 9 26 7.98628475695139 4.77196689337868 3.21431786357271 T:C C T 10 0.530218543708742 0.241222081320482 ENSG00000228716:ENST00000439211:exon_79950223_79950802:DHFR;ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_79950467_79950783:MSH3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 79950512 A/G 1 17 8 25 7.98628475695139 4.24174834966994 3.74453640728145 A:G A G 10 0.530218543708742 0.161813179944607 ENSG00000228716:ENST00000439211:exon_79950223_79950802:DHFR;ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_79950467_79950783:MSH3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 80063924 A/G 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 A:G A G 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80063752_80063939:MSH3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 80736444 A/G 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 A:G A G 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000145687:ENST00000320672:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000509053:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000514493:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504985:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000512923:exon_80736357_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000510060:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000505980:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000515395:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000380182:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504136:exon_80736377_80736455:SSBP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 88119575 T/C 1 85 67 152 39.9314237847569 35.5246424284857 4.40678135627122 T:C T C 10 0.530218543708742 0.515854634909817 ENSG00000081189:ENST00000340208:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000424173:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000514028:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000437473:exon_88119552_88119744:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000510942:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000506554:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000508569:exon_88119552_88119744:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000514015:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000513252:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000506716:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000504921:exon_88119557_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000507984:exon_88119552_88119744:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000502983:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000508610:exon_88119552_88119744:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000502831:exon_88119552_88119744:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000503075:exon_88119552_88119744:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000511086:exon_88119552_88119744:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000509373:exon_88119552_88120092:MEF2C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 96076487 G/A 0 44 0 44 20.6703840768154 0 20.6703840768154 G G 10 0.530218543708742 9.37041728058456e-13 ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000421689:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512620:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96076449_96076487:CAST HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 96127833 G/A 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96127764_96127895:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96127764_96127895:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503311:exon_96127764_96127895:ERAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 96139250 C/G 1 19 9 28 8.9258476695339 4.77196689337868 4.15388077615522 C:G C G 10 0.530218543708742 0.131859826541765 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 96139464 C/T 1 37 24 61 17.3819138827765 12.7252450490098 4.65666883376674 T:C C T 10 0.530218543708742 0.250123746841947 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 17 4 21 7.98628475695139 2.12087417483497 5.86541058211642 T:G G T 10 0.530218543708742 0.0141785704432622 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 1 29 2 31 13.6236622324465 1.06043708741748 12.563225145029 A:T T A 10 0.530218543708742 1.60797475648365e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 96237326 G/A 1 13 1 14 6.10715893178635 0.530218543708742 5.57694038807761 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00228884504353901 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96237210_96237385:ERAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 96244638 A/G 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 A:G A G 10 0.530218543708742 0.51496433390393 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 24 3 27 11.2747549509902 1.59065563112623 9.68409931986397 A:T:C C T 10 0.530218543708742 0.000130733154740599 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 48 6 54 22.5495099019804 3.18131126225245 19.3681986397279 T:C C T 10 0.530218543708742 2.52084745017687e-08 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 96248496 T/C 1 6 59 65 2.81868873774755 31.2828940788158 -28.4642053410682 T:C T C 10 0.530218543708742 1.27552310757075e-13 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96248341_96248502:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96248341_96248502:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96248341_96248502:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96248341_96248502:ERAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 35 3 38 16.442350970194 1.59065563112623 14.8516953390678 T:C C T 10 0.530218543708742 2.63562072521225e-07 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 99897866 G/A 1 14 9 23 6.57694038807761 4.77196689337868 1.80497349469893 A:G G A 10 0.530218543708742 0.533565745005242 ENSG00000174132:ENST00000312637:exon_99897758_99897892:FAM174A;ENSG00000174132:ENST00000505792:exon_99897756_99897892:FAM174A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 108672946 C/T 1 29 30 59 13.6236622324465 15.9065563112623 -2.28289407881578 T:C C T 10 0.530218543708742 0.602689469998719 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108670410_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108670411_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108670411_108673057:PJA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 108713970 C/T 1 15 40 55 7.04672184436887 21.2087417483497 -14.1620199039808 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000125742058207123 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 108713982 T/C 1 25 40 65 11.7445364072814 21.2087417483497 -9.46420534106823 T:C T C 10 0.530218543708742 0.024554644237834 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 108714298 T/C 1 51 55 106 23.9588542708542 29.1620199039808 -5.20316563312665 T:C T C 10 0.530218543708742 0.331235510523288 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 108719151 G/A 1 6 10 16 2.81868873774755 5.30218543708742 -2.48349669933987 A:G G A 10 0.530218543708742 0.316586227617054 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000511624:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000512822:exon_108719097_108719221:PJA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 110439509 A/G 1 5 10 15 2.34890728145629 5.30218543708742 -2.95327815563113 A:G A G 10 0.530218543708742 0.194384351758500 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505303:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000504122:exon_110439485_110439559:WDR36 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 110456704 A/T 1 11 20 31 5.16759601920384 10.6043708741748 -5.436774854971 A:T A T 10 0.530218543708742 0.0702936040050714 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456697_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456694_110456839:WDR36 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 28 25 53 13.1538807761552 13.2554635927186 -0.101582816563326 A:C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 112176654 G/A 1 12 14 26 5.6373774754951 7.42305961192239 -1.78568213642729 A:G G A 10 0.530218543708742 0.557496480025126 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 17 11 28 7.98628475695139 5.83240398079616 2.15388077615522 A:T:C T C 10 0.530218543708742 0.453884491531812 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 115428334 G/T 1 7 10 17 3.28847019403881 5.30218543708742 -2.01371524304861 T:G G T 10 0.530218543708742 0.343429778687472 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 115428381 T/G 1 10 9 19 4.69781456291258 4.77196689337868 -0.0741523304660978 T:G T G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 115469773 C/T 1 10 17 27 4.69781456291258 9.01371524304861 -4.31590068013603 T:C C T 10 0.530218543708742 0.122247567538511 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115469765_115469875:COMMD10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 118506603 A/C 1 9 12 21 4.22803310662132 6.3626225245049 -2.13458941788358 A:C A C 10 0.530218543708742 0.387625542901861 ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118505885_118506975:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000507552:exon_118506411_118506975:DMXL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 118506685 G/A 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 A:G G A 10 0.530218543708742 0.797017339461022 ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118505885_118506975:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000507552:exon_118506411_118506975:DMXL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 118506805 A/T 1 8 4 12 3.75825165033006 2.12087417483497 1.6373774754951 A:T A T 10 0.530218543708742 0.398218675970565 ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118505885_118506975:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000507552:exon_118506411_118506975:DMXL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 122682334 C/T 1 18 19 37 8.45606621324264 10.0741523304661 -1.61808611722345 T:C C T 10 0.530218543708742 0.624171639477041 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 122682348 A/G 1 16 19 35 7.51650330066013 10.0741523304661 -2.55764902980597 A:G A G 10 0.530218543708742 0.402194597510979 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 132051559 T/C 1 15 29 44 7.04672184436887 15.3763377675535 -8.32961592318465 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0148849592107602 ENSG00000131437:ENST00000378746:exon_132051449_132051623:KIF3A;ENSG00000131437:ENST00000378735:exon_132051449_132051623:KIF3A;ENSG00000131437:ENST00000403231:exon_132051449_132051623:KIF3A;ENSG00000131437:ENST00000450914:exon_132051450_132051623:KIF3A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 132094205 G/A 1 45 40 85 21.1401655331066 21.2087417483497 -0.0685762152430698 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000164402:ENST00000296873:exon_132091697_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000412572:exon_132091697_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000448933:exon_132091697_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378706:exon_132092025_132094699:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378699:exon_132093835_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378701:exon_132093836_132094248:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000458488:exon_132093892_132094248:SEPT8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 132099999 A/G 1 19 16 35 8.9258476695339 8.48349669933987 0.442350970194029 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000164402:ENST00000378719:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378721:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000296873:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000412572:exon_132099951_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000448933:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378706:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378699:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378701:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000458488:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371478:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000453480:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000414594:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371493:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000481794:exon_132099653_132100111:SEPT8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 134076812 G/A 1 49 54 103 23.0192913582716 28.6318013602721 -5.61251000200043 A:G G A 10 0.530218543708742 0.278747473678726 ENSG00000164615:ENST00000297156:exon_134076753_134077213:CAMLG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 137661568 T/C 1 9 5 14 4.22803310662132 2.65109271854371 1.57694038807761 T:C T C 10 0.530218543708742 0.43589870850422 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137661504_137661593:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000357274:exon_137661504_137661593:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137661504_137661593:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137661504_137661593:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137661504_137661593:CDC25C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 11 10 21 5.16759601920384 5.30218543708742 -0.134589417883582 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 137717213 G/A 1 5 16 21 2.34890728145629 8.48349669933987 -6.13458941788358 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00814768405022494 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000512928:exon_137717205_137717437:KDM3B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 137722107 C/T 1 13 25 38 6.10715893178635 13.2554635927186 -7.1483046609322 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0226309972513541 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137721711_137722310:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137721978_137722310:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000394866:exon_137721978_137722310:KDM3B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 138856982 C/T 0 8 0 8 3.75825165033006 0 3.75825165033006 C C 10 0.530218543708742 0.0086188222890866 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138856953_138857100:TMEM173 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 138857925 C/G 1 9 2 11 4.22803310662132 1.06043708741748 3.16759601920384 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0707395200860403 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 138861078 C/T 1 7 4 11 3.28847019403881 2.12087417483497 1.16759601920384 T:C C T 10 0.530218543708742 0.557007995713773 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 138861146 C/G 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 139574050 G/A 1 64 88 152 30.0660132026405 46.6592318463693 -16.5932186437288 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00728352296125973 ENSG00000120306:ENST00000261811:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000509589:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000504227:exon_139574031_139574237:C5orf32 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 139682663 G/C 1 9 13 22 4.22803310662132 6.89284106821365 -2.66480796159232 C:G G C 10 0.530218543708742 0.289698673189133 ENSG00000113068:ENST00000261813:exon_139682626_139682706:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000510217:exon_139682626_139682698:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000524074:exon_139682626_139682668:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000507185:exon_139682626_139682671:PFDN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 140057535 G/A 1 50 58 108 23.4890728145629 30.752675535107 -7.26360272054414 A:G G A 10 0.530218543708742 0.177265768759690 ENSG00000170445:ENST00000504156:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000457527:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000431330:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000504366:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000307633:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000448240:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000438307:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000415192:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512655:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000506579:exon_140057240_140058712:HARS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 140856265 G/C 1 10 6 16 4.69781456291258 3.18131126225245 1.51650330066013 C:G G C 10 0.530218543708742 0.617951383515179 ENSG00000240184:ENST00000308177:exon_140855580_140858113:PCDHGC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 140857798 T/C 1 10 18 28 4.69781456291258 9.54393378675736 -4.84611922384478 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0870895955278204 ENSG00000240184:ENST00000308177:exon_140855580_140858113:PCDHGC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 141014494 T/C 1 43 46 89 20.2006026205241 24.3900530106021 -4.18945039007804 T:C T C 10 0.530218543708742 0.396573906225293 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141014378_141014731:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141014378_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141014460_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141014378_141014520:HDAC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 148747902 G/C 1 10 10 20 4.69781456291258 5.30218543708742 -0.60437087417484 C:G G C 10 0.530218543708742 0.825709894540955 ENSG00000145882:ENST00000274569:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000511945:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000505669:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000503240:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000514349:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000507621:exon_148747556_148749216:PCYOX1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 149212243 G/C 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 C:G G C 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 149212430 G/A 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 149212471 G/A 1 10 5 15 4.69781456291258 2.65109271854371 2.04672184436887 A:G G A 10 0.530218543708742 0.315050043511805 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 149216256 C/T 1 6 9 15 2.81868873774755 4.77196689337868 -1.95327815563113 T:C C T 10 0.530218543708742 0.438985732589774 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149215826_149216636:PPARGC1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 149216304 C/T 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 T:C C T 10 0.530218543708742 0.247617633272995 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149215826_149216636:PPARGC1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 149826526 C/T 1 3843 3670 7513 1805.3701365273 1945.90205541108 -140.531918883779 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00120954777311648 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 149827098 G/A 1 19 22 41 8.9258476695339 11.6648079615923 -2.73896029205842 A:G G A 10 0.530218543708742 0.435664976115865 ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 150578574 A/G 1 27 21 48 12.684099319864 11.1345894178836 1.54950990198038 A:G A G 10 0.530218543708742 0.66785288455756 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 150647012 A/G 1 150 134 284 70.4672184436887 71.0492848569714 -0.582066413282732 A:G A G 10 0.530218543708742 0.952659335028222 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 151043103 G/C 1 8 31 39 3.75825165033006 16.436774854971 -12.6785232046409 C:G G C 10 0.530218543708742 3.95920823651526e-05 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151040657_151043160:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000520687:exon_151042049_151043160:SPARC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 153783753 C/T 1 9 12 21 4.22803310662132 6.3626225245049 -2.13458941788358 T:C C T 10 0.530218543708742 0.387625542901861 ENSG00000164574:ENST00000297107:exon_153783664_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000520647:exon_153783664_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377661:exon_153783664_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000519544:exon_153783664_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000519235:exon_153783664_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000517958:exon_153783337_153783776:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000427235:exon_153783337_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377657:exon_153783595_153783776:GALNT10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 159912418 C/G 1 18 17 35 8.45606621324264 9.01371524304861 -0.557649029805969 C:G C G 10 0.530218543708742 0.867108963295299 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 169267784 G/A 1 51 34 85 23.9588542708542 18.0274304860972 5.93142378475693 A:C:G G A 10 0.530218543708742 0.231848916718207 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520836:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520181:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519628:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169267761_169267856:DOCK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 169435713 A/C 1 44 46 90 20.6703840768154 24.3900530106021 -3.71966893378678 A:C A C 10 0.530218543708742 0.460613919102025 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169435692_169435750:DOCK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 42 44 86 19.7308211642328 23.3296159231846 -3.59879475895181 C:G C G 10 0.530218543708742 0.451201954643949 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 62 54 116 29.126450290058 28.6318013602721 0.494648929785928 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 169504743 T/C 1 47 41 88 22.0797284456891 21.7389602920584 0.340768153630705 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 171523436 G/A 1 58 59 117 27.247324464893 31.2828940788158 -4.03556961392281 A:G G A 10 0.530218543708742 0.460346453833744 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171523430_171523564:STK10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 176382995 G/A 1 5 14 19 2.34890728145629 7.42305961192239 -5.0741523304661 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0218531141296597 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176382960_176383036:UIMC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 176517797 C/T 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 T:C C T 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000160867:ENST00000292408:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000503708:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000393648:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000502906:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000292410:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000453701:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000393637:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000430285:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000426612:exon_176517746_176518097:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000509511:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000377207:exon_176517755_176518105:FGFR4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 176798166 C/G 1 30 28 58 14.0934436887377 14.8461192238448 -0.752675535107036 C:G C G 10 0.530218543708742 0.895658325358999 ENSG00000169220:ENST00000408923:exon_176798166_176798247:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000398128:exon_176798166_176798247:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000336477:exon_176798166_176798247:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000511890:exon_176798166_176798247:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000425155:exon_176798166_176798247:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000502731:exon_176798166_176798247:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000514102:exon_176798166_176798247:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000509289:exon_176798067_176798247:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000503044:exon_176798108_176798247:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000506944:exon_176798114_176798247:RGS14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 176830627 G/A 1 4 9 13 1.87912582516503 4.77196689337868 -2.89284106821365 A:G G A 10 0.530218543708742 0.162918845921506 ENSG00000131187:ENST00000502854:exon_176830482_176831091:F12;ENSG00000131187:ENST00000504406:exon_176830255_176830751:F12;ENSG00000131187:ENST00000510358:exon_176830482_176831473:F12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 92 107 199 43.2198939787957 56.7333841768354 -13.5134901980397 A:C:G G C 10 0.530218543708742 0.0554996844905621 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 41 31 72 19.2610397079416 16.436774854971 2.82426485297058 A:G A G 10 0.530218543708742 0.555716659089689 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 50 10 60 23.4890728145629 5.30218543708742 18.1868873774755 T:C T C 10 0.530218543708742 1.50857096770344e-06 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 176894756 C/T 1 24 3 27 11.2747549509902 1.59065563112623 9.68409931986397 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000130733154740599 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176894482_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000477391:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000506117:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000514833:exon_176894744_176894818:DBN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 176931706 G/C 1 23 21 44 10.8049734946989 11.1345894178836 -0.329615923184647 C:G G C 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 176951318 C/T 1 30 43 73 14.0934436887377 22.7993973794759 -8.70595369073817 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0460295572593813 ENSG00000146067:ENST00000514747:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000505569:exon_176951186_176952488:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000510479:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000506955:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000398118:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000329540:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000510163:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000524677:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000442143:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000443375:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000507212:exon_176951186_176951495:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000505241:exon_176951186_176951422:FAM193B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 176958397 G/A 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 A:G G A 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000146067:ENST00000510479:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000506955:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000329540:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000510163:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000524677:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000442143:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000443375:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000513502:exon_176958283_176958835:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000506064:exon_176958339_176958522:FAM193B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 177031348 T/C 1 18 14 32 8.45606621324264 7.42305961192239 1.03300660132026 T:C T C 10 0.530218543708742 0.727799998593614 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000502420:exon_177031280_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000510761:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505468:exon_177031067_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000507061:exon_177031313_177031542:B4GALT7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 15 13 28 7.04672184436887 6.89284106821365 0.153880776155224 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 178140090 C/T 1 23 14 37 10.8049734946989 7.42305961192239 3.38191388277655 T:C C T 10 0.530218543708742 0.323605368798571 ENSG00000169131:ENST00000335815:exon_178138593_178140622:ZNF354A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 178310395 T/C 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 T:C T C 10 0.530218543708742 0.247617633272995 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178309710_178312029:ZNF354B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 179036433 G/A 1 38 55 93 17.8516953390678 29.1620199039808 -11.310324564913 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0219020205540033 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 179045142 G/A 1 2 14 16 0.939562912582516 7.42305961192239 -6.48349669933987 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00155968752948041 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 108 86 194 50.7363972794559 45.5987947589518 5.13760252050405 A:G A G 10 0.530218543708742 0.472749444338576 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 5 180661980 T/C 1 30 32 62 14.0934436887377 16.9669933986797 -2.873549709942 T:C T C 10 0.530218543708742 0.525139145715532 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180661932_180661995:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180661174_180662809:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180661174_180662806:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180661932_180661995:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180657744_180662803:TRIM41 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 181 144 325 85.0304435887177 76.3514702940588 8.67897329465886 A:G G A 10 0.530218543708742 0.345163803869609 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 20 12 32 9.39562912582516 6.3626225245049 3.03300660132026 A:G G A 10 0.530218543708742 0.294923757423222 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 3077141 T/C 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000137275:ENST00000259808:exon_3076998_3077221:RIPK1;ENSG00000137275:ENST00000380409:exon_3077058_3077221:RIPK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 35 51 86 16.442350970194 27.0411457291458 -10.5987947589518 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0233078087895074 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 5260936 A/C 1 39 44 83 18.3214767953591 23.3296159231846 -5.00813912782559 A:C A C 10 0.530218543708742 0.273974881200684 ENSG00000214113:ENST00000468929:exon_5260881_5260975:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000330636:exon_5260881_5261172:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000464010:exon_5260881_5260966:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000480566:exon_5260881_5260975:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000455814:exon_5260881_5260954:LYRM4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 7230680 G/T 1 12 10 22 5.6373774754951 5.30218543708742 0.335192038407676 T:G G T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7230073_7232140:RREB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 7247248 T/C 1 21 11 32 9.86541058211642 5.83240398079616 4.03300660132026 T:C T C 10 0.530218543708742 0.16141196150245 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7247244_7247454:RREB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 7884652 C/T 1 67 84 151 31.4753575715143 44.5383576715343 -13.06300010002 T:C:G C T 10 0.530218543708742 0.0341683246019372 ENSG00000239264:ENST00000379757:exon_7884592_7884721:TXNDC5;ENSG00000239264:ENST00000460138:exon_7884592_7884721:TXNDC5;ENSG00000239264:ENST00000473453:exon_7884592_7884721:TXNDC5;ENSG00000239264:ENST00000475802:exon_7884592_7884721:TXNDC5;ENSG00000188428:ENST00000439343:exon_7884592_7884721:MUTED HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 8413890 A/G 1 30 24 54 14.0934436887377 12.7252450490098 1.36819863972793 A:G A G 10 0.530218543708742 0.785615629829279 ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8413301_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8413303_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8413303_8413932:SLC35B3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 10702799 G/A 1 31 18 49 14.563225145029 9.54393378675736 5.01929135827164 A:G G A 10 0.530218543708742 0.155699176755540 ENSG00000111845:ENST00000379568:exon_10702798_10702872:PAK1IP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 11185533 G/A 1 53 53 106 24.8984171834367 28.1015828165633 -3.20316563312665 A:G G A 10 0.530218543708742 0.56007062244457 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 11193860 G/A 1 11 11 22 5.16759601920384 5.83240398079616 -0.664807961592324 A:G G A 10 0.530218543708742 0.832858519551156 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11193824_11193925:NEDD9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 11213832 T/C 1 31 23 54 14.563225145029 12.1950265053011 2.36819863972793 T:C T C 10 0.530218543708742 0.586291804658606 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 12122773 T/C 1 4 11 15 1.87912582516503 5.83240398079616 -3.95327815563113 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0665948341907382 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 12124587 C/G 1 11 20 31 5.16759601920384 10.6043708741748 -5.436774854971 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0702936040050714 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 12163575 G/A 1 18 12 30 8.45606621324264 6.3626225245049 2.09344368873774 A:G G A 10 0.530218543708742 0.470477748346769 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12163516_12165232:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000399469:exon_12163516_12164808:HIVEP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 13622567 A/G 1 48 46 94 22.5495099019804 24.3900530106021 -1.84054310862174 A:G A G 10 0.530218543708742 0.756839702083175 ENSG00000010017:ENST00000011619:exon_13621730_13622724:RANBP9;ENSG00000010017:ENST00000469916:exon_13622565_13622724:RANBP9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 13711279 A/G 1 14 14 28 6.57694038807761 7.42305961192239 -0.846119223844775 A:G A G 10 0.530218543708742 0.850434684608347 ENSG00000010017:ENST00000011619:exon_13711167_13711796:RANBP9;ENSG00000010017:ENST00000283152:exon_13711167_13711953:RANBP9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 16327330 T/C 1 11 4 15 5.16759601920384 2.12087417483497 3.04672184436887 T:C T C 10 0.530218543708742 0.128499041794511 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16326625_16328574:ATXN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 18121828 T/C 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 T:C T C 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000187566:ENST00000340650:exon_18120718_18122851:NHLRC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 18256625 A/G 1 74 81 155 34.7638277655531 42.9477020404081 -8.18387427485501 A:G A G 10 0.530218543708742 0.198288448453967 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18256592_18256670:DEK;ENSG00000124795:ENST00000503715:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18256604_18256686:DEK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 24653273 G/C 1 25 23 48 11.7445364072814 12.1950265053011 -0.450490098019616 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 25605091 G/A 1 17 12 29 7.98628475695139 6.3626225245049 1.62366223244648 A:G G A 10 0.530218543708742 0.581764914655282 ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25605040_25605121:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25605040_25605121:LRRC16A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 26031875 C/G 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 C:G C G 10 0.530218543708742 0.76511742461274 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 28 29 57 13.1538807761552 15.3763377675535 -2.22245699139829 T:C T C 10 0.530218543708742 0.596760615886557 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 26370707 T/C 1 15 18 33 7.04672184436887 9.54393378675736 -2.49721194238849 T:C T C 10 0.530218543708742 0.390101898562569 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 26370748 G/A 1 26 24 50 12.2143178635727 12.7252450490098 -0.510927185437099 A:G G A 10 0.530218543708742 0.888445961195408 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000531055:exon_26370719_26370831:BTN3A2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 26391005 C/A 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 A:C C A 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000124508:ENST00000467485:exon_26390233_26391136:BTN2A2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 26393021 G/A 1 50 54 104 23.4890728145629 28.6318013602721 -5.14272854570917 A:G G A 10 0.530218543708742 0.326981514365656 ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 26405835 G/A 1 9 5 14 4.22803310662132 2.65109271854371 1.57694038807761 A:G G A 10 0.530218543708742 0.43589870850422 ENSG00000026950:ENST00000476549:exon_26405770_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000289361:exon_26405600_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000396934:exon_26405600_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000450085:exon_26405732_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000425234:exon_26405600_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000427334:exon_26405600_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000506698:exon_26405586_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000414912:exon_26405600_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000082468:exon_26405600_26405876:BTN3A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 26413368 T/G 1 6 13 19 2.81868873774755 6.89284106821365 -4.0741523304661 T:G T G 10 0.530218543708742 0.068469288507053 ENSG00000026950:ENST00000476549:exon_26412933_26413474:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000513047:exon_26412933_26413445:BTN3A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 26413744 C/A 1 17 19 36 7.98628475695139 10.0741523304661 -2.08786757351471 A:C C A 10 0.530218543708742 0.508258820331903 ENSG00000026950:ENST00000289361:exon_26413397_26415444:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000414912:exon_26413397_26414301:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000082468:exon_26413397_26415432:BTN3A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 26446209 C/T 1 19 12 31 8.9258476695339 6.3626225245049 2.563225145029 T:C C T 10 0.530218543708742 0.375031576291977 ENSG00000111801:ENST00000244519:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000361232:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000496719:exon_26445932_26446211:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000480110:exon_26444185_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000457225:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000339789:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000396921:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000487272:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000483179:exon_26445766_26446213:BTN3A3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 25 22 47 11.7445364072814 11.6648079615923 0.0797284456891258 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 75 70 145 35.2336092218443 37.1152980596119 -1.88168883776759 A:G A G 10 0.530218543708742 0.803026710169862 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 27925827 A/G 1 3 9 12 1.40934436887377 4.77196689337868 -3.3626225245049 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0792634794421136 ENSG00000124657:ENST00000244623:exon_27925019_27925960:OR2B6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 28097193 G/A 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 A:G G A 10 0.530218543708742 0.76511742461274 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 28120898 G/A 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 A:G G A 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000198315:ENST00000330236:exon_28120834_28124089:ZNF192;ENSG00000198315:ENST00000457389:exon_28120834_28121857:ZNF192 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 28120995 C/T 1 2 6 8 0.939562912582516 3.18131126225245 -2.24174834966994 T:C C T 10 0.530218543708742 0.158929006468168 ENSG00000198315:ENST00000330236:exon_28120834_28124089:ZNF192;ENSG00000198315:ENST00000457389:exon_28120834_28121857:ZNF192 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 28219661 G/A 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 A:G G A 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000187626:ENST00000423974:exon_28219336_28220044:ZKSCAN4;ENSG00000187626:ENST00000377294:exon_28219336_28220002:ZKSCAN4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 28269663 A/G 1 3 9 12 1.40934436887377 4.77196689337868 -3.3626225245049 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0792634794421136 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 28269869 T/C 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 T:C T C 10 0.530218543708742 0.296231759838006 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 28891423 G/A 1 55 56 111 25.8379800960192 29.6922384476896 -3.85425835167036 A:G G A 10 0.530218543708742 0.5059364193319 ENSG00000204713:ENST00000377199:exon_28890990_28891766:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000377194:exon_28890990_28891765:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000481474:exon_28890990_28891690:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000444898:exon_28890990_28891768:TRIM27 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 500 620 1120 234.890728145629 328.73549709942 -93.8447689537911 A:T:G G A 10 0.530218543708742 2.03804996360332e-08 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 29691713 A/C 1 40 46 86 18.7912582516503 24.3900530106021 -5.59879475895181 A:C A C 10 0.530218543708742 0.236130759572378 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 29691744 C/G 1 33 49 82 15.5027880576115 25.9807086417284 -10.4779205841168 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0263122142569417 ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29691717_29692225:HLA-F HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 17 16 33 7.98628475695139 8.48349669933987 -0.497211942388486 T:C C T 10 0.530218543708742 0.863707634497805 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 32 14 46 15.0330066013203 7.42305961192239 7.60994698939787 A:C A C 10 0.530218543708742 0.0265343816059487 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 32 14 46 15.0330066013203 7.42305961192239 7.60994698939787 A:T A T 10 0.530218543708742 0.0265343816059487 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 29910402 G/A 1 214 43 257 100.533231646329 22.7993973794759 77.7338342668533 A:G G A 10 0.530218543708742 2.91274526508754e-24 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29910325_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910326_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910329_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910331_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910331_29910403:HLA-A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 29911360 A/G 1 34 18 52 15.9725695139028 9.54393378675736 6.42863572714542 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0945952140685466 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 29912297 A/G 1 437 173 610 205.29449639928 91.7278080616124 113.566688337667 A:G A G 10 0.530218543708742 7.88759211835372e-21 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 0 612 0 612 287.50625125025 0 287.50625125025 A A 10 0.530218543708742 4.03554517385582e-169 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 29912386 G/C 1 214 45 259 100.533231646329 23.8598344668934 76.6733971794358 C:G G C 10 0.530218543708742 2.00441200541165e-23 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 50 47 97 23.4890728145629 24.9202715543109 -1.43119873974797 A:G A G 10 0.530218543708742 0.838926130114196 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 56 46 102 26.3077615523104 24.3900530106021 1.91770854170832 A:C C A 10 0.530218543708742 0.766241975531846 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 40 19 59 18.7912582516503 10.0741523304661 8.71710592118422 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0261110128483315 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30228379 A/G 1 8 2 10 3.75825165033006 1.06043708741748 2.69781456291258 A:G A G 10 0.530218543708742 0.115795579122128 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30231071 G/A 1 9 1 10 4.22803310662132 0.530218543708742 3.69781456291258 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0237480022218031 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30231108 G/T 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 T:G G T 10 0.530218543708742 0.296231759838006 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30297529 T/C 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 T:C T C 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000449040:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000428728:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000420746:exon_30297306_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30297359_30297547:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30297359_30297547:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30309508 T/C 1 7 12 19 3.28847019403881 6.3626225245049 -3.0741523304661 T:C T C 10 0.530218543708742 0.173987244767743 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30309489_30311505:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30309489_30309673:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30309489_30309673:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30313268 G/A 1 21 28 49 9.86541058211642 14.8461192238448 -4.98070864172836 A:G G A 10 0.530218543708742 0.197219206274554 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 35 32 67 16.442350970194 16.9669933986797 -0.524642428485713 T:G T G 10 0.530218543708742 0.903274520452281 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 36 32 68 16.9121324264853 16.9669933986797 -0.0548609721944544 A:C C A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30460232 C/T 1 21 21 42 9.86541058211642 11.1345894178836 -1.26917883576716 T:C C T 10 0.530218543708742 0.75806865433379 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30656509 G/A 1 80 82 162 37.5825165033006 43.4779205841168 -5.89540408081621 A:G G A 10 0.530218543708742 0.386685038938733 ENSG00000137404:ENST00000259953:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000470733:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000482141:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000462857:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376420:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000474864:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000444096:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000495946:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376421:exon_30655829_30656719:NRM HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30672326 T/C 1 27 31 58 12.684099319864 16.436774854971 -3.75267553510704 T:C T C 10 0.530218543708742 0.358090490781215 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30672342 A/G 1 33 36 69 15.5027880576115 19.0878675735147 -3.5850795159032 A:G A G 10 0.530218543708742 0.400790073263585 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30675425 C/T 1 16 13 29 7.51650330066013 6.89284106821365 0.623662232446482 T:C C T 10 0.530218543708742 0.854455190101058 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30675343_30676134:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30675343_30676134:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000492462:exon_30675161_30675462:MDC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30680916 C/T 1 20 9 29 9.39562912582516 4.77196689337868 4.62366223244648 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0956512825929837 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30680733_30681131:MDC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30698541 A/G 1 4 14 18 1.87912582516503 7.42305961192239 -5.54393378675736 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00939623378327308 ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30698459_30698877:FLOT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30862423 C/T 1 10 4 14 4.69781456291258 2.12087417483497 2.57694038807761 T:C C T 10 0.530218543708742 0.190682709033609 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30862365_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30862365_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000465966:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513514:exon_30862365_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000514434:exon_30862351_30862448:DDR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30865204 A/C 1 20 5 25 9.39562912582516 2.65109271854371 6.74453640728145 A:C A C 10 0.530218543708742 0.00805497618166254 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30865138_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30865156_30865374:DDR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 27 15 42 12.684099319864 7.95327815563113 4.73082116423284 T:C C T 10 0.530218543708742 0.164947238581477 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 21 7 28 9.86541058211642 3.71152980596119 6.15388077615522 A:C A C 10 0.530218543708742 0.0223809122618693 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30887972 C/T 1 13 14 27 6.10715893178635 7.42305961192239 -1.31590068013603 T:C C T 10 0.530218543708742 0.701068808163555 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30888161 T/C 1 16 24 40 7.51650330066013 12.7252450490098 -5.20874174834968 T:C T C 10 0.530218543708742 0.113530346485057 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30889389 T/C 1 18 21 39 8.45606621324264 11.1345894178836 -2.67852320464094 T:C T C 10 0.530218543708742 0.424951586486616 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30889366_30889468:VARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 11 20 31 5.16759601920384 10.6043708741748 -5.436774854971 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0702936040050714 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 30893941 G/A 1 47 44 91 22.0797284456891 23.3296159231846 -1.24988747749552 A:G G A 10 0.530218543708742 0.833953152107661 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893886_30894236:VARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31110391 G/C 1 58 51 109 27.247324464893 27.0411457291458 0.206178735747123 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 44 48 92 20.6703840768154 25.4504900980196 -4.78010602120426 T:C T C 10 0.530218543708742 0.347663185308409 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31112737 C/A 1 50 39 89 23.4890728145629 20.6785232046409 2.81054960992196 A:C C A 10 0.530218543708742 0.596075951731781 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112662_31112892:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31113030 A/G 1 37 25 62 17.3819138827765 13.2554635927186 4.126450290058 A:G A G 10 0.530218543708742 0.311139721893800 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 42 28 70 19.7308211642328 14.8461192238448 4.88470194038806 A:G G A 10 0.530218543708742 0.281333807137608 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31116210 G/A 1 25 19 44 11.7445364072814 10.0741523304661 1.67038407681535 A:G G A 10 0.530218543708742 0.652859406652356 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 14 13 27 6.57694038807761 6.89284106821365 -0.315900680136034 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 30 29 59 14.0934436887377 15.3763377675535 -1.28289407881578 C:G C G 10 0.530218543708742 0.794709103237718 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 21 19 40 9.86541058211642 10.0741523304661 -0.208741748349681 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31122482 G/A 1 21 9 30 9.86541058211642 4.77196689337868 5.09344368873774 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0685994032009711 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31122500 G/A 1 26 12 38 12.2143178635727 6.3626225245049 5.8516953390678 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0727371291033269 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31124849 C/T 1 20 15 35 9.39562912582516 7.95327815563113 1.44235097019403 T:C C T 10 0.530218543708742 0.735513376094186 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000480060:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000475684:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31129310 C/T 1 39 36 75 18.3214767953591 19.0878675735147 -0.76639077815565 T:C C T 10 0.530218543708742 0.908106254272822 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129261_31129354:TCF19 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 26 41 67 12.2143178635727 21.7389602920584 -9.52464242848571 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0202919493912678 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C 1 39 39 78 18.3214767953591 20.6785232046409 -2.35704640928188 A:C A C 10 0.530218543708742 0.650403582211796 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 61 94 155 28.6566688337667 49.8405431086217 -21.183874274855 T:C T C 10 0.530218543708742 0.000694030603200164 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31239449 C/G 1 980 727 1707 460.385827165433 385.468881276255 74.9169458891774 T:C:G C G 10 0.530218543708742 0.000274321484929406 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 34 17 51 15.9725695139028 9.01371524304861 6.95885427085416 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0671455347782272 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 43 5 48 20.2006026205241 2.65109271854371 17.5495099019804 T:C T C 10 0.530218543708742 9.91936831377884e-08 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 1282 716 1998 602.259826965393 379.636477295459 222.623349669934 A:T:C C T 10 0.530218543708742 8.34728627852365e-24 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31431813 A/G 1 97 91 188 45.568801260252 48.2498874774955 -2.6810862172435 A:G A G 10 0.530218543708742 0.715212521474953 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31431820 C/T 1 90 93 183 42.2803310662132 49.310324564913 -7.02999349869978 T:C C T 10 0.530218543708742 0.300882381214499 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31473561 A/G 1 15 9 24 7.04672184436887 4.77196689337868 2.27475495099019 A:G A G 10 0.530218543708742 0.416361226154525 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31473957 C/G 1 19 17 36 8.9258476695339 9.01371524304861 -0.0878675735147123 C:G C G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31474000 G/A 1 7 7 14 3.28847019403881 3.71152980596119 -0.423059611922388 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31525448 C/T 1 21 18 39 9.86541058211642 9.54393378675736 0.321476795359063 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000204498:ENST00000376146:exon_31525405_31525626:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376148:exon_31525405_31525626:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376145:exon_31525405_31525581:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000496233:exon_31525405_31525482:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000473655:exon_31525405_31525736:NFKBIL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31540556 T/C 1 171 206 377 80.3326290258051 109.225020004001 -28.8923909781957 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00322295143154168 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 376 347 723 176.637827565513 183.985834666933 -7.34800710142045 A:C C A 10 0.530218543708742 0.601981086887879 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31598489 A/G 1 27 39 66 12.684099319864 20.6785232046409 -7.99442388477697 A:G A G 10 0.530218543708742 0.063520507717019 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598368_31598578:BAT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 205 163 368 96.3051985397079 86.4256226245249 9.87957591518294 A:G G A 10 0.530218543708742 0.321124522304677 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 280 294 574 131.538807761552 155.88425185037 -24.3454440888179 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0446591928497363 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31604010 C/G 1 219 230 449 102.882138927786 121.950265053011 -19.0681261252251 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0725182300986406 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 254 260 514 119.32448989798 137.856821364273 -18.5323314662934 T:C:G C T 10 0.530218543708742 0.102246065699735 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 23 19 42 10.8049734946989 10.0741523304661 0.730821164232836 C:G G C 10 0.530218543708742 0.877900895402444 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31609272 T/C 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 T:C T C 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000204463:ENST00000462875:exon_31608602_31609369:BAT3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 68 87 155 31.9451390278055 46.1290133026606 -14.183874274855 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0241457414807612 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 34 46 80 15.9725695139028 24.3900530106021 -8.41748349669936 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0724926206121009 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31727897 C/T 1 11 18 29 5.16759601920384 9.54393378675736 -4.37633776755352 T:C C T 10 0.530218543708742 0.135661579784991 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000494646:exon_31727867_31727950:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31727867_31727993:MSH5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 19 18 37 8.9258476695339 9.54393378675736 -0.618086117223454 A:G A G 10 0.530218543708742 0.870320364950046 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31762843 G/C 1 15 11 26 7.04672184436887 5.83240398079616 1.21431786357271 C:G G C 10 0.530218543708742 0.697339873549611 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31762844 G/T 1 14 12 26 6.57694038807761 6.3626225245049 0.214317863572709 T:G G T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31777946 C/T 1 7 4 11 3.28847019403881 2.12087417483497 1.16759601920384 T:C C T 10 0.530218543708742 0.557007995713773 ENSG00000204390:ENST00000375654:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000417199:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000375653:exon_31777824_31779230:HSPA1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31852703 T/C 1 43 24 67 20.2006026205241 12.7252450490098 7.47535757151429 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0858556766775251 ENSG00000204371:ENST00000461880:exon_31852689_31852918:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000494816:exon_31852689_31854214:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31852668_31852793:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31852689_31852793:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31852689_31852793:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31852689_31852793:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31852689_31852793:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31852689_31852793:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000436026:exon_31852689_31852832:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000477678:exon_31852689_31852793:EHMT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31860337 T/C 1 16 13 29 7.51650330066013 6.89284106821365 0.623662232446482 T:C T C 10 0.530218543708742 0.854455190101058 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000463484:exon_31860195_31860339:EHMT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31864547 G/T 1 12 12 24 5.6373774754951 6.3626225245049 -0.725245049009807 T:G G T 10 0.530218543708742 0.8392917887424 ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000465429:exon_31864383_31864601:EHMT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31929014 A/C 1 10 18 28 4.69781456291258 9.54393378675736 -4.84611922384478 A:C A C 10 0.530218543708742 0.0870895955278204 ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31928973_31929163:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31928818_31929452:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31928973_31929163:SKIV2L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31935788 C/T 1 29 25 54 13.6236622324465 13.2554635927186 0.368198639727932 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31935733_31935859:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31935733_31935859:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31935733_31935859:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31935733_31935859:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000461915:exon_31935733_31935896:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000494058:exon_31935733_31936225:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31935733_31935859:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31935733_31935859:SKIV2L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 31936668 T/C 1 47 52 99 22.0797284456891 27.5713642728546 -5.49163582716546 T:C T C 10 0.530218543708742 0.270283580256725 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32147696 G/A 1 59 2 61 27.7171059211842 1.06043708741748 26.6566688337667 A:G G A 10 0.530218543708742 3.19126723199026e-14 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147654_32147708:RNF5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32148031 A/G 1 139 62 201 65.2996224244849 32.873549709942 32.4260727145429 A:G A G 10 0.530218543708742 3.72970390442661e-06 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32148006_32148570:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375085:exon_32148006_32148541:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32148006_32148541:RNF5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32151934 A/G 1 5 11 16 2.34890728145629 5.83240398079616 -3.48349669933987 A:G A G 10 0.530218543708742 0.130369289858938 ENSG00000204305:ENST00000484849:exon_32151658_32152023:AGER HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 135 184 319 63.4204965993198 97.5602120424085 -34.1397154430887 T:C T C 10 0.530218543708742 0.000132135743181807 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 1329 1371 2700 624.339555411082 726.929623424685 -102.590068013603 A:T:C C A 10 0.530218543708742 8.32193931360736e-05 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32410210 T/C 1 21 23 44 9.86541058211642 12.1950265053011 -2.32961592318465 T:C T C 10 0.530218543708742 0.546627888447434 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32410215 T/C 1 21 24 45 9.86541058211642 12.7252450490098 -2.85983446689339 T:C T C 10 0.530218543708742 0.455878924318537 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32410941 T/C 1 11 5 16 5.16759601920384 2.65109271854371 2.51650330066013 T:C T C 10 0.530218543708742 0.223429926014640 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 1501 1474 2975 705.141965893178 781.542133426686 -76.4001675335074 A:C A C 10 0.530218543708742 0.00523251015941319 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32411523 T/C 1 4 7 11 1.87912582516503 3.71152980596119 -1.83240398079616 T:C T C 10 0.530218543708742 0.367650802678922 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 3751 4183 7934 1762.15024254851 2217.90416833367 -455.753925785159 A:T:G T G 10 0.530218543708742 1.38470396763195e-24 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32783086 A/G 1 16 14 30 7.51650330066013 7.42305961192239 0.0934436887377403 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32782821_32783090:HLA-DOB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32784741 A/G 1 10 3 13 4.69781456291258 1.59065563112623 3.10715893178635 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0999408957936294 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32784638_32784753:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32784638_32784825:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32784638_32784765:HLA-DOB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32796751 T/C 1 37 42 79 17.3819138827765 22.2691788357672 -4.88726495299062 T:C T C 10 0.530218543708742 0.310465941465848 ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32793192_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32796683_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32796721_32796811:TAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 19 26 45 8.9258476695339 13.7856821364273 -4.85983446689339 T:C T C 10 0.530218543708742 0.178583058926666 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 36 46 82 16.9121324264853 24.3900530106021 -7.47792058411684 A:C C A 10 0.530218543708742 0.120877872376161 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32818678 G/A 1 4 17 21 1.87912582516503 9.01371524304861 -7.13458941788358 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00183606271552568 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 159 208 367 74.69525155031 110.285457091418 -35.5902055411083 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.00024146804129643 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 162 187 349 76.1045959191838 99.1508676735347 -23.046271754351 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0136436169644506 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 44 46 90 20.6703840768154 24.3900530106021 -3.71966893378678 A:G G A 10 0.530218543708742 0.460613919102025 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 32974551 G/T 1 125 139 264 58.7226820364072 73.7003775755151 -14.9776955391079 T:G G T 10 0.530218543708742 0.0735595286814792 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32971955_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32971959_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32973372_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974384_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974523_32974618:HLA-DOA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 698 166 864 327.907456491298 88.0162782556512 239.891178235647 T:C T C 10 0.530218543708742 5.39252923353541e-65 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 855 231 1086 401.663145129026 122.480483596719 279.182661532306 T:C C T 10 0.530218543708742 3.78505185387373e-69 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33052981 C/A 1 208 809 1017 97.7145429085817 428.946801860372 -331.232258951791 A:T:C:G C A 10 0.530218543708742 7.18541312727777e-101 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 831 227 1058 390.388390178035 120.359609421884 270.028780756151 A:T:C T C 10 0.530218543708742 1.67391445541575e-66 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33095684 A/G 1 2 37 39 0.939562912582516 19.6180861172235 -18.6785232046409 A:G A G 10 0.530218543708742 1.76101064080400e-10 ENSG00000224557:ENST00000470997:exon_33095595_33095875:HLA-DPB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33095737 G/A 0 38 0 38 17.8516953390678 0 17.8516953390678 G G 10 0.530218543708742 4.87703524962034e-11 ENSG00000224557:ENST00000470997:exon_33095595_33095875:HLA-DPB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33095748 C/G 0 38 0 38 17.8516953390678 0 17.8516953390678 C C 10 0.530218543708742 4.87703524962034e-11 ENSG00000224557:ENST00000470997:exon_33095595_33095875:HLA-DPB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33095762 G/A 0 33 0 33 15.5027880576115 0 15.5027880576115 G G 10 0.530218543708742 1.37629813422861e-09 ENSG00000224557:ENST00000470997:exon_33095595_33095875:HLA-DPB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33173842 G/A 1 9 7 16 4.22803310662132 3.71152980596119 0.516503300660129 A:G G A 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33232521 C/T 1 8 3 11 3.75825165033006 1.59065563112623 2.16759601920384 T:C C T 10 0.530218543708742 0.235945069885030 ENSG00000223501:ENST00000493379:exon_33232151_33232677:VPS52 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 11 18 29 5.16759601920384 9.54393378675736 -4.37633776755352 A:G G A 10 0.530218543708742 0.135661579784991 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33239878 C/T 1 326 526 852 153.14875475095 278.894953990798 -125.746199239848 A:T:C:G C T 10 0.530218543708742 5.68176684861251e-18 ENSG00000231500:ENST00000439602:exon_33239787_33239899:RPS18;ENSG00000231500:ENST00000474973:exon_33239852_33239899:RPS18;ENSG00000231500:ENST00000474626:exon_33239865_33239899:RPS18;ENSG00000231500:ENST00000476222:exon_33239873_33239899:RPS18;ENSG00000231500:ENST00000496813:exon_33239876_33239899:RPS18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33256653 G/A 1 87 79 166 40.8709866973394 41.8872649529906 -1.01627825565117 A:G G A 10 0.530218543708742 0.876778888367392 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256581_33256790:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256581_33256664:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256581_33256790:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256581_33256790:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256581_33256789:WDR46 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 7 14 21 3.28847019403881 7.42305961192239 -4.13458941788358 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0817226986734783 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33272712 C/A 1 6 13 19 2.81868873774755 6.89284106821365 -4.0741523304661 A:C C A 10 0.530218543708742 0.068469288507053 ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 153 113 266 71.8765628125625 59.9146954390878 11.9618673734746 C:G G C 10 0.530218543708742 0.157589016861919 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33281842 G/T 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 T:G G T 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33281843 A/T 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:T A T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33283766 T/C 1 5 14 19 2.34890728145629 7.42305961192239 -5.0741523304661 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0218531141296597 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 62 65 127 29.126450290058 34.4642053410682 -5.33775505101023 A:G A G 10 0.530218543708742 0.374224266290856 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33359716 G/C 1 35 19 54 16.442350970194 10.0741523304661 6.36819863972793 C:G G C 10 0.530218543708742 0.101178631820510 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000450504:exon_33359638_33359774:KIFC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33636907 C/T 1 16 18 34 7.51650330066013 9.54393378675736 -2.02743048609723 T:C C T 10 0.530218543708742 0.497520057256665 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33636751_33636933:ITPR3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33641379 T/C 1 15 10 25 7.04672184436887 5.30218543708742 1.74453640728145 T:C T C 10 0.530218543708742 0.551192924360965 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33641368_33641497:ITPR3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33643558 G/A 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 A:G G A 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33643468_33643633:ITPR3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33653448 C/T 1 8 18 26 3.75825165033006 9.54393378675736 -5.78568213642729 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0293505626310909 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33653420_33653604:ITPR3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 33659472 C/G 1 20 16 36 9.39562912582516 8.48349669933987 0.912132426485288 C:G C G 10 0.530218543708742 0.86779583464454 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 34214348 C/T 1 28 24 52 13.1538807761552 12.7252450490098 0.428635727145418 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 34827085 A/T 1 6 7 13 2.81868873774755 3.71152980596119 -0.892841068213646 A:T A T 10 0.530218543708742 0.782691411716169 ENSG00000065060:ENST00000452449:exon_34825901_34827348:UHRF1BP1;ENSG00000065060:ENST00000192788:exon_34825901_34827348:UHRF1BP1;ENSG00000065060:ENST00000399008:exon_34825901_34827348:UHRF1BP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 104 130 234 48.8572714542908 68.9284106821365 -20.0711392278456 A:C C A 10 0.530218543708742 0.00878626380595328 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 36652339 C/G 1 3 7 10 1.40934436887377 3.71152980596119 -2.30218543708742 C:G C G 10 0.530218543708742 0.206122472271196 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 36653597 C/T 1 140 138 278 65.7694038807761 73.1701590318064 -7.40075515103027 T:C C T 10 0.530218543708742 0.400294197794532 ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36653528_36655116:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36653528_36653701:CDKN1A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 36713263 A/G 1 7 7 14 3.28847019403881 3.71152980596119 -0.423059611922388 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000124772:ENST00000459703:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000244751:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000493411:exon_36713164_36713292:CPNE5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 25 24 49 11.7445364072814 12.7252450490098 -0.980708641728357 A:G A G 10 0.530218543708742 0.777156675800136 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 37349033 G/A 1 14 10 24 6.57694038807761 5.30218543708742 1.27475495099019 A:G G A 10 0.530218543708742 0.685036120735498 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 37414212 G/A 1 15 15 30 7.04672184436887 7.95327815563113 -0.906556311262261 A:G G A 10 0.530218543708742 0.855305205345657 ENSG00000137200:ENST00000373420:exon_37414067_37414225:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373427:exon_37414067_37414225:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373451:exon_37414067_37414225:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000455891:exon_37414067_37414225:FTSJD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 36 40 76 16.9121324264853 21.2087417483497 -4.29660932186439 A:G G A 10 0.530218543708742 0.358414616922133 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 231 198 429 108.519516403281 104.983271654331 3.53624474894968 T:C C T 10 0.530218543708742 0.735257181018353 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 41658566 C/T 1 121 151 272 56.8435562112422 80.06300010002 -23.2194438887778 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00514326092144705 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658401_41658655:TFEB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 98 128 226 46.0385827165433 67.867973594719 -21.8293908781757 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00407860167962363 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 89 69 158 41.810549609922 36.5850795159032 5.22547009401877 A:C A C 10 0.530218543708742 0.426052543977397 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 41903783 G/A 1 87 68 155 40.8709866973394 36.0548609721945 4.81612572514499 A:G G A 10 0.530218543708742 0.469292576764778 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 42233518 C/T 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000124496:ENST00000372922:exon_42233489_42233535:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000372917:exon_42233489_42233535:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000340840:exon_42233489_42233535:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000354325:exon_42233489_42233535:TRERF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 42933526 C/T 1 11 18 29 5.16759601920384 9.54393378675736 -4.37633776755352 T:C C T 10 0.530218543708742 0.135661579784991 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42933419_42933527:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42933419_42933527:PEX6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 42985375 T/C 1 74 62 136 34.7638277655531 32.873549709942 1.89027805561109 A:T:C T C 10 0.530218543708742 0.796793831453423 ENSG00000124702:ENST00000326974:exon_42985257_42985433:KLHDC3;ENSG00000124702:ENST00000432243:exon_42985257_42985433:KLHDC3;ENSG00000124702:ENST00000394096:exon_42985257_42985433:KLHDC3;ENSG00000124702:ENST00000244670:exon_42985257_42985433:KLHDC3;ENSG00000124702:ENST00000426116:exon_42985257_42985433:KLHDC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 42992808 T/C 1 11 17 28 5.16759601920384 9.01371524304861 -3.84611922384478 T:C T C 10 0.530218543708742 0.184722657193932 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 42992825 C/G 1 13 16 29 6.10715893178635 8.48349669933987 -2.37633776755352 C:G C G 10 0.530218543708742 0.45770905214884 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 42995211 A/G 1 80 98 178 37.5825165033006 51.9614172834567 -14.3789007801561 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0352468980777998 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42995098_42995215:RRP36 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 43008298 C/T 1 31 34 65 14.563225145029 18.0274304860972 -3.46420534106823 T:C C T 10 0.530218543708742 0.456188255130796 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43008268_43008484:CUL7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 43307861 G/A 1 70 58 128 32.8847019403881 30.752675535107 2.13202640528103 A:G G A 10 0.530218543708742 0.723990867407596 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 43412865 T/C 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 T:C T C 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000124574:ENST00000372530:exon_43412863_43413052:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000244533:exon_43412863_43413052:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000463024:exon_43412863_43413052:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000372512:exon_43412838_43413052:ABCC10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 43487998 A/C 1 17 25 42 7.98628475695139 13.2554635927186 -5.26917883576716 A:C A C 10 0.530218543708742 0.122001853647201 ENSG00000171453:ENST00000481352:exon_43487444_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000455605:exon_43487444_43488786:POLR1C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 43738977 C/T 1 53 68 121 24.8984171834367 36.0548609721945 -11.1564437887578 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0451025867643182 ENSG00000112715:ENST00000476772:exon_43737921_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000426830:exon_43737948_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372067:exon_43737950_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000532514:exon_43737950_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372064:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000425836:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372055:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000324450:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000413642:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000482630:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000417285:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000531362:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000530947:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000531781:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372077:exon_43738519_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000519767:exon_43738530_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000520948:exon_43738820_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000518538:exon_43738890_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000523950:exon_43738946_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000523873:exon_43738946_43739049:VEGFA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 44115169 G/A 1 5 6 11 2.34890728145629 3.18131126225245 -0.832403980796162 A:G G A 10 0.530218543708742 0.76511742461274 ENSG00000137216:ENST00000259746:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000323267:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000534326:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000456124:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371915:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371893:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000497371:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000525873:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000533121:exon_44115114_44115237:TMEM63B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 44117607 C/T 1 9 7 16 4.22803310662132 3.71152980596119 0.516503300660129 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000137216:ENST00000259746:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000323267:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371915:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371893:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000533121:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000482966:exon_44117596_44117702:TMEM63B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 44119676 A/G 1 9 7 16 4.22803310662132 3.71152980596119 0.516503300660129 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000137216:ENST00000259746:exon_44119583_44119745:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000323267:exon_44119583_44119745:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371915:exon_44119583_44119745:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371893:exon_44119583_44119745:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000533121:exon_44119583_44119745:TMEM63B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 178 134 312 83.6210992198439 71.0492848569714 12.5718143628725 T:C:G G T 10 0.530218543708742 0.156606877090768 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 44269193 C/T 1 6 8 14 2.81868873774755 4.24174834966994 -1.42305961192239 T:C C T 10 0.530218543708742 0.594188084236152 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 49403301 C/T 1 14 9 23 6.57694038807761 4.77196689337868 1.80497349469893 T:C C T 10 0.530218543708742 0.533565745005242 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 54186147 T/C 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 T:C T C 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000137251:ENST00000486436:exon_54186095_54186184:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370869:exon_54186095_54186184:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000259782:exon_54186095_54186184:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370864:exon_54186095_54186184:TINAG HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 16 0 16 7.51650330066013 0 7.51650330066013 G G 10 0.530218543708742 4.46469601621613e-05 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 57246925 A/G 0 8 0 8 3.75825165033006 0 3.75825165033006 A A 10 0.530218543708742 0.0086188222890866 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 57393112 T/C 1 11 3 14 5.16759601920384 1.59065563112623 3.57694038807761 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0636441704976374 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 57393125 A/G 0 0 12 12 0 6.3626225245049 -6.3626225245049 G A G 10 0.530218543708742 0.000115544808785328 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 17 17 0 9.01371524304861 -9.01371524304861 A G A 10 0.530218543708742 2.64380723940611e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 10 10 0 5.30218543708742 -5.30218543708742 G T G 10 0.530218543708742 0.000523550644442822 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 57512678 G/A 0 0 10 10 0 5.30218543708742 -5.30218543708742 A G A 10 0.530218543708742 0.000523550644442822 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 71236216 C/T 1 9 6 15 4.22803310662132 3.18131126225245 1.04672184436887 T:C C T 10 0.530218543708742 0.617171705992842 ENSG00000082269:ENST00000418814:exon_71234046_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000370479:exon_71234634_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505769:exon_71235567_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000457062:exon_71234634_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000361499:exon_71234634_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000194672:exon_71234634_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505868:exon_71234046_71236401:FAM135A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 71269459 C/T 1 9 6 15 4.22803310662132 3.18131126225245 1.04672184436887 T:C C T 10 0.530218543708742 0.617171705992842 ENSG00000082269:ENST00000418814:exon_71269419_71270877:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000370479:exon_71269419_71270875:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505769:exon_71269419_71270735:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000457062:exon_71269419_71270727:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000361499:exon_71269419_71270362:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000194672:exon_71269419_71270874:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000442251:exon_71269419_71270873:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505675:exon_71269419_71270874:FAM135A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 71269632 G/A 1 10 3 13 4.69781456291258 1.59065563112623 3.10715893178635 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0999408957936294 ENSG00000082269:ENST00000418814:exon_71269419_71270877:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000370479:exon_71269419_71270875:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505769:exon_71269419_71270735:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000457062:exon_71269419_71270727:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000361499:exon_71269419_71270362:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000194672:exon_71269419_71270874:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000442251:exon_71269419_71270873:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505675:exon_71269419_71270874:FAM135A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 71289189 A/G 1 14 16 30 6.57694038807761 8.48349669933987 -1.90655631126226 A:G A G 10 0.530218543708742 0.584066368115557 ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71289117_71289269:C6orf57 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 8 12 20 3.75825165033006 6.3626225245049 -2.60437087417484 T:C C T 10 0.530218543708742 0.269017553119515 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 28 20 48 13.1538807761552 10.6043708741748 2.54950990198038 T:C C T 10 0.530218543708742 0.474204145509126 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 74155346 G/T 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 T:G G T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000459924:exon_74155251_74155408:C6orf150 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 74228049 A/G 1 46 47 93 21.6099469893979 24.9202715543109 -3.310324564913 A:G A G 10 0.530218543708742 0.533538975855579 ENSG00000156508:ENST00000490569:exon_74227753_74228333:EEF1A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 74229258 G/T 1 14 18 32 6.57694038807761 9.54393378675736 -2.96699339867974 T:G G T 10 0.530218543708742 0.376191240179242 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 76344431 C/T 1 11 16 27 5.16759601920384 8.48349669933987 -3.31590068013603 T:C C T 10 0.530218543708742 0.247863936906869 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000493959:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000483859:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000487548:exon_76344423_76344772:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76344423_76344527:SENP6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 76376552 G/A 1 15 21 36 7.04672184436887 11.1345894178836 -4.08786757351471 A:G G A 10 0.530218543708742 0.184727154715863 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76376428_76376657:SENP6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 76425288 A/G 1 59 49 108 27.7171059211842 25.9807086417284 1.73639727945586 A:G A G 10 0.530218543708742 0.772932555356896 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76425101_76425620:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76425101_76427997:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76425101_76427994:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000503501:exon_76425101_76425593:SENP6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 76564897 T/C 1 8 17 25 3.75825165033006 9.01371524304861 -5.25546359271855 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0440227837752885 ENSG00000196586:ENST00000428345:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369981:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369985:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369977:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369978:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369975:exon_76564856_76565000:MYO6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 79657391 G/A 1 11 8 19 5.16759601920384 4.24174834966994 0.925847669533902 A:G G A 10 0.530218543708742 0.8192074586227 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79657340_79657492:PHIP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 7 9 16 3.28847019403881 4.77196689337868 -1.48349669933987 A:G A G 10 0.530218543708742 0.46678737179182 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 79708000 A/C 1 14 15 29 6.57694038807761 7.95327815563113 -1.37633776755352 A:C A C 10 0.530218543708742 0.710719764615262 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79707971_79708108:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79707971_79708108:PHIP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 80910680 A/T 1 11 9 20 5.16759601920384 4.77196689337868 0.395629125825161 A:T A T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000083123:ENST00000320393:exon_80910651_80910748:BCKDHB;ENSG00000083123:ENST00000356489:exon_80910651_80910748:BCKDHB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 84894942 C/T 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 T:C C T 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000135315:ENST00000257766:exon_84894905_84895166:KIAA1009;ENSG00000135315:ENST00000461137:exon_84894905_84895166:KIAA1009;ENSG00000135315:ENST00000403245:exon_84894905_84895166:KIAA1009;ENSG00000135315:ENST00000369671:exon_84894905_84895166:KIAA1009;ENSG00000135315:ENST00000418491:exon_84894905_84895166:KIAA1009;ENSG00000135315:ENST00000497936:exon_84894905_84895166:KIAA1009 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 87967636 A/G 1 24 24 48 11.2747549509902 12.7252450490098 -1.45049009801961 A:G A G 10 0.530218543708742 0.772786883901876 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 87968565 A/G 1 26 10 36 12.2143178635727 5.30218543708742 6.91213242648529 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0285530516549205 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 87969737 C/T 1 34 34 68 15.9725695139028 18.0274304860972 -2.05486097219445 T:C C T 10 0.530218543708742 0.62907070985465 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 87970301 C/G 1 62 48 110 29.126450290058 25.4504900980196 3.67596019203838 C:G C G 10 0.530218543708742 0.504847473580036 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000496806:exon_87969793_87970363:ZNF292 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 88046800 G/A 1 3 8 11 1.40934436887377 4.24174834966994 -2.83240398079616 A:G G A 10 0.530218543708742 0.129086131769062 ENSG00000111850:ENST00000392863:exon_88046727_88046884:C6orf162;ENSG00000111850:ENST00000229570:exon_88046727_88046884:C6orf162 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 88239266 T/C 1 13 10 23 6.10715893178635 5.30218543708742 0.804973494698934 T:C T C 10 0.530218543708742 0.835821884898682 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88239260_88239366:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88239260_88239366:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88239260_88239366:RARS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 90039670 G/C 1 219 215 434 102.882138927786 113.99698689738 -11.114847969594 C:G G C 10 0.530218543708742 0.290356734802173 ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90039279_90039676:UBE2J1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 97613163 T/C 1 2 9 11 0.939562912582516 4.77196689337868 -3.83240398079616 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0305374290985922 ENSG00000146263:ENST00000275053:exon_97613122_97613333:MMS22L;ENSG00000146263:ENST00000369251:exon_97613122_97613333:MMS22L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 99323424 C/T 1 12 7 19 5.6373774754951 3.71152980596119 1.9258476695339 T:C C T 10 0.530218543708742 0.492071463010612 ENSG00000112234:ENST00000369244:exon_99323291_99323603:FBXL4;ENSG00000112234:ENST00000229971:exon_99323291_99323603:FBXL4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 99819379 T/C 1 10 7 17 4.69781456291258 3.71152980596119 0.986284756951386 T:C T C 10 0.530218543708742 0.808994386671346 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369240:exon_99819304_99819463:COQ3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 9 11 20 4.22803310662132 5.83240398079616 -1.60437087417484 T:C T C 10 0.530218543708742 0.508309614769096 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 99883694 T/C 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 T:C T C 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000123552:ENST00000392738:exon_99880190_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000500704:exon_99880255_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000496518:exon_99880312_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000327681:exon_99880315_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369233:exon_99883420_99883722:USP45 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 100964147 G/C 1 19 13 32 8.9258476695339 6.89284106821365 2.03300660132026 C:G G C 10 0.530218543708742 0.485860889811232 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100964056_100964203:ASCC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 82 57 139 38.5220794158832 30.2224569913983 8.29962242448486 T:C C T 10 0.530218543708742 0.174017843586534 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 105776866 A/C 1 31 21 52 14.563225145029 11.1345894178836 3.42863572714542 A:C A C 10 0.530218543708742 0.404921775339174 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 105821449 A/G 1 15 22 37 7.04672184436887 11.6648079615923 -4.61808611722345 A:G A G 10 0.530218543708742 0.140191429203817 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105821244_105821453:PREP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 106727570 T/C 1 19 9 28 8.9258476695339 4.77196689337868 4.15388077615522 T:C T C 10 0.530218543708742 0.131859826541765 ENSG00000057663:ENST00000369076:exon_106727536_106727698:ATG5;ENSG00000057663:ENST00000343245:exon_106727536_106727698:ATG5;ENSG00000057663:ENST00000369070:exon_106727536_106727698:ATG5;ENSG00000057663:ENST00000476518:exon_106727536_106727698:ATG5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 106960447 G/A 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 A:G G A 10 0.530218543708742 0.247617633272995 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106959730_106960914:AIM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 106967185 A/C 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 A:C A C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106967006_106969328:AIM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 106999822 G/A 1 11 20 31 5.16759601920384 10.6043708741748 -5.436774854971 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0702936040050714 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106999727_107000189:AIM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 107076783 A/T 1 3 12 15 1.40934436887377 6.3626225245049 -4.95327815563113 A:T A T 10 0.530218543708742 0.0167711993403857 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 107113715 G/A 1 36 39 75 16.9121324264853 20.6785232046409 -3.76639077815565 A:G G A 10 0.530218543708742 0.418796724702282 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 108197775 G/A 1 9 18 27 4.22803310662132 9.54393378675736 -5.31590068013603 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0524474966934978 ENSG00000025796:ENST00000369002:exon_108197768_108197866:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000437345:exon_108197768_108197866:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000459782:exon_108197768_108198604:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000473746:exon_108197768_108197866:SEC63 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 109762332 C/T 1 17 13 30 7.98628475695139 6.89284106821365 1.09344368873774 T:C C T 10 0.530218543708742 0.718556699845737 ENSG00000185250:ENST00000440797:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000521072:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000368958:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109761966_109762374:SMPD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 23 18 41 10.8049734946989 9.54393378675736 1.26103970794158 T:G G T 10 0.530218543708742 0.755611920589358 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 109766409 G/A 1 67 61 128 31.4753575715143 32.3433311662333 -0.867973594718976 A:G G A 10 0.530218543708742 0.929496028146613 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000335266:exon_109766400_109766493:MICAL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 41 10 51 19.2610397079416 5.30218543708742 13.9588542708542 T:G G T 10 0.530218543708742 6.23322193511857e-05 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 41 10 51 19.2610397079416 5.30218543708742 13.9588542708542 T:C C T 10 0.530218543708742 6.23322193511857e-05 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 38 21 59 17.8516953390678 11.1345894178836 6.71710592118422 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0899969331557099 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 109770869 G/A 1 39 33 72 18.3214767953591 17.4972119423885 0.824264852970575 A:G G A 10 0.530218543708742 0.906231480531694 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000433205:exon_109770860_109770986:MICAL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 109775436 T/C 1 15 17 32 7.04672184436887 9.01371524304861 -1.96699339867974 T:C T C 10 0.530218543708742 0.595927881466323 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 19 19 38 8.9258476695339 10.0741523304661 -1.1483046609322 T:C T C 10 0.530218543708742 0.746968586285852 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 109787476 C/T 1 21 24 45 9.86541058211642 12.7252450490098 -2.85983446689339 T:C C T 10 0.530218543708742 0.455878924318537 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 109802651 C/T 1 32 50 82 15.0330066013203 26.5109271854371 -11.4779205841168 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0144316346475353 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109802278_109803257:ZBTB24 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 110107517 T/C 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 T:C T C 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110107505_110107652:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110107505_110107652:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000419951:exon_110107209_110107652:FIG4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 19 9 28 8.9258476695339 4.77196689337868 4.15388077615522 A:G G A 10 0.530218543708742 0.131859826541765 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 111588316 C/T 1 7 12 19 3.28847019403881 6.3626225245049 -3.0741523304661 T:C C T 10 0.530218543708742 0.173987244767743 ENSG00000173214:ENST00000368847:exon_111587079_111592370:KIAA1919 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 111913070 G/A 1 47 47 94 22.0797284456891 24.9202715543109 -2.84054310862174 A:G G A 10 0.530218543708742 0.605764301095931 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000532708:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000528599:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 111913262 C/T 1 25 29 54 11.7445364072814 15.3763377675535 -3.63180136027207 T:C C T 10 0.530218543708742 0.342139309669937 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000532708:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000528599:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 116575083 C/A 1 7 7 14 3.28847019403881 3.71152980596119 -0.423059611922388 A:C C A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 116575116 G/T 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 T:G G T 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 116720487 C/T 1 14 22 36 6.57694038807761 11.6648079615923 -5.08786757351471 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0967141233002735 ENSG00000111817:ENST00000430252:exon_116720361_116720829:DSE;ENSG00000111817:ENST00000452085:exon_116720361_116720829:DSE;ENSG00000111817:ENST00000331677:exon_116720361_116720829:DSE;ENSG00000111817:ENST00000359564:exon_116720361_116720829:DSE HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 116784850 C/G 1 30 18 48 14.0934436887377 9.54393378675736 4.54950990198038 C:G C G 10 0.530218543708742 0.196591593171147 ENSG00000188820:ENST00000368606:exon_116784446_116784931:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000532607:exon_116784446_116784931:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000368605:exon_116784446_116784934:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000368604:exon_116784446_116784931:FAM26F HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 116973182 T/C 1 12 11 23 5.6373774754951 5.83240398079616 -0.195026505301065 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 1911 0 1911 897.752362972594 0 897.752362972594 C C 10 0.530218543708742 0 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 119510941 C/A 1 16 20 36 7.51650330066013 10.6043708741748 -3.08786757351471 A:T:C C A 10 0.530218543708742 0.320546928577092 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119510829_119511048:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119510829_119511048:MAN1A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 119669877 C/T 1 28 31 59 13.1538807761552 16.436774854971 -3.28289407881578 T:C C T 10 0.530218543708742 0.434717106145806 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119669628_119670452:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119669628_119670452:MAN1A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 126210395 T/G 1 28 12 40 13.1538807761552 6.3626225245049 6.79125825165032 T:G T G 10 0.530218543708742 0.0384919936078499 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000413085:exon_126210118_126211127:NCOA7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 126342360 C/T 1 21 23 44 9.86541058211642 12.1950265053011 -2.32961592318465 T:C C T 10 0.530218543708742 0.546627888447434 ENSG00000066651:ENST00000334379:exon_126342306_126342426:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000368333:exon_126342306_126342426:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000479748:exon_126342306_126342426:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000368332:exon_126342306_126342411:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000481529:exon_126342306_126342426:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000466316:exon_126342306_126342426:TRMT11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 130031215 T/C 1 7 8 15 3.28847019403881 4.24174834966994 -0.95327815563113 T:C T C 10 0.530218543708742 0.797017339461022 ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_130031169_130031370:ARHGAP18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 131190838 G/A 1 69 33 102 32.4149204840968 17.4972119423885 14.9177085417083 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.00379960631355879 ENSG00000079819:ENST00000337057:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000257986:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000368128:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527411:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000524581:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000529208:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527423:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000456097:exon_131190799_131191266:EPB41L2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 1236 624 1860 580.649879975995 330.856371274255 249.79350870174 A:G A G 10 0.530218543708742 8.70621595111507e-32 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 13 9 22 6.10715893178635 4.77196689337868 1.33519203840768 T:C T C 10 0.530218543708742 0.671305989890035 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 134493397 G/A 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 A:G G A 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000118515:ENST00000367858:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000474427:exon_134490386_134495724:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000413996:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000477460:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000237305:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000367855:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000367857:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000528577:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000475719:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000531782:exon_134493331_134493435:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000525877:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000489458:exon_134493331_134493454:SGK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 135287533 A/G 1 30 35 65 14.0934436887377 18.557649029806 -4.46420534106823 A:G A G 10 0.530218543708742 0.320189288280246 ENSG00000112339:ENST00000367837:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000445176:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367824:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527005:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527578:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000415177:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367826:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000533274:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000526100:exon_135287467_135287611:HBS1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 220 0 220 103.351920384077 0 103.351920384077 T T 10 0.530218543708742 4.44390814621461e-61 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 250 0 250 117.445364072814 0 117.445364072814 A A 10 0.530218543708742 1.36286995854211e-69 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 251 0 251 117.915145529106 0 117.915145529106 A A 10 0.530218543708742 7.19508307345912e-70 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 225 0 225 105.700827665533 0 105.700827665533 G G 10 0.530218543708742 1.54132602317843e-62 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 269 0 269 126.371211742348 0 126.371211742348 T T 10 0.530218543708742 1.00114417467974e-74 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 137026266 T/G 1 17 12 29 7.98628475695139 6.3626225245049 1.62366223244648 T:G T G 10 0.530218543708742 0.581764914655282 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137026248_137026271:MAP3K5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 137113137 G/A 1 3 8 11 1.40934436887377 4.24174834966994 -2.83240398079616 A:G G A 10 0.530218543708742 0.129086131769062 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137112848_137113656:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137112848_137113656:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137112848_137113656:MAP3K5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 138195991 A/G 1 98 88 186 46.0385827165433 46.6592318463693 -0.620649129826013 A:G A G 10 0.530218543708742 0.941544182821136 ENSG00000118503:ENST00000420009:exon_138195982_138196172:TNFAIP3;ENSG00000118503:ENST00000237289:exon_138195982_138196172:TNFAIP3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 15 16 31 7.04672184436887 8.48349669933987 -1.436774854971 T:C T C 10 0.530218543708742 0.719617548007844 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 41 39 80 19.2610397079416 20.6785232046409 -1.41748349669936 T:C C T 10 0.530218543708742 0.82292963959905 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 24 29 53 11.2747549509902 15.3763377675535 -4.10158281656332 C:G G C 10 0.530218543708742 0.273399132525010 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 153296541 G/C 1 32 40 72 15.0330066013203 21.2087417483497 -6.17573514702942 C:G G C 10 0.530218543708742 0.157194082801017 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 153323594 C/T 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 T:C C T 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000482526:exon_153323562_153323671:MTRF1L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 155635585 A/C 1 16 12 28 7.51650330066013 6.3626225245049 1.15388077615522 A:C A C 10 0.530218543708742 0.708452101922698 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000470239:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000475849:exon_155635430_155635627:TFB1M HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 157405930 G/A 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 A:G G A 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000049618:ENST00000350026:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000346085:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000367148:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000275248:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000354354:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000414678:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000319584:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000452544:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000493658:exon_157405900_157406039:ARID1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 16 21 37 7.51650330066013 11.1345894178836 -3.61808611722345 A:G A G 10 0.530218543708742 0.252017528719174 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 160174456 T/G 1 13 7 20 6.10715893178635 3.71152980596119 2.39562912582516 T:G T G 10 0.530218543708742 0.371488020282974 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 104 134 238 48.8572714542908 71.0492848569714 -22.1920134026806 A:G A G 10 0.530218543708742 0.00421726052735679 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 55 63 118 25.8379800960192 33.4037682536507 -7.56578815763156 T:C C T 10 0.530218543708742 0.167560105589348 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 56 59 115 26.3077615523104 31.2828940788158 -4.97513252650533 A:G G A 10 0.530218543708742 0.400563553508829 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 160505207 A/G 1 41 25 66 19.2610397079416 13.2554635927186 6.00557611522303 A:G A G 10 0.530218543708742 0.174482948167114 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160504982_160505216:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160504982_160505216:IGF2R HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 160517481 C/T 1 22 24 46 10.3351920384077 12.7252450490098 -2.39005301060213 T:C C T 10 0.530218543708742 0.555218088560173 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 161507618 C/T 1 9 5 14 4.22803310662132 2.65109271854371 1.57694038807761 T:C C T 10 0.530218543708742 0.43589870850422 ENSG00000085511:ENST00000366920:exon_161507616_161507699:MAP3K4;ENSG00000085511:ENST00000392142:exon_161507616_161507699:MAP3K4;ENSG00000085511:ENST00000348824:exon_161507616_161507699:MAP3K4;ENSG00000085511:ENST00000366919:exon_161507616_161507699:MAP3K4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 167352104 C/A 1 11 5 16 5.16759601920384 2.65109271854371 2.51650330066013 A:C C A 10 0.530218543708742 0.223429926014640 ENSG00000026297:ENST00000358165:exon_167352084_167352496:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000477674:exon_167351486_167352475:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000310843:exon_167352100_167352141:RNASET2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 168349011 C/T 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 T:C C T 10 0.530218543708742 0.296231759838006 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000509296:exon_168348709_168349158:MLLT4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 170068180 A/G 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G A G 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170068078_170068191:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170068078_170068281:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170068078_170068281:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000496752:exon_170068078_170068191:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000474869:exon_170068157_170068281:WDR27 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 170176647 C/T 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 T:C C T 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 170176648 A/G 1 6 3 9 2.81868873774755 1.59065563112623 1.22803310662132 A:G A G 10 0.530218543708742 0.51496433390393 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 170627651 G/A 1 30 36 66 14.0934436887377 19.0878675735147 -4.99442388477697 A:G G A 10 0.530218543708742 0.220569865147207 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 99 82 181 46.5083641728345 43.4779205841168 3.0304435887177 T:C:G G C 10 0.530218543708742 0.656024800694258 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 T:C T C 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 9 7 16 4.22803310662132 3.71152980596119 0.516503300660129 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 618965 G/A 1 9 11 20 4.22803310662132 5.83240398079616 -1.60437087417484 A:G G A 10 0.530218543708742 0.508309614769096 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_618893_619014:PRKAR1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 940181 C/T 1 17 18 35 7.98628475695139 9.54393378675736 -1.55764902980597 T:C C T 10 0.530218543708742 0.615523468429842 ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000495809:exon_940170_941036:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000437486:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000454383:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453823:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_940170_940253:COX19 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 1097952 C/T 1 24 29 53 11.2747549509902 15.3763377675535 -4.10158281656332 T:C C T 10 0.530218543708742 0.273399132525010 ENSG00000164849:ENST00000444847:exon_1097128_1098097:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000397095:exon_1097128_1098894:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000297468:exon_1097141_1098897:GPR146 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 1131356 T/C 1 33 16 49 15.5027880576115 8.48349669933987 7.01929135827164 T:C T C 10 0.530218543708742 0.045957208763923 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 1131411 C/T 1 26 15 41 12.2143178635727 7.95327815563113 4.26103970794158 A:T:C C T 10 0.530218543708742 0.211607653742908 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 1131430 G/A 1 17 25 42 7.98628475695139 13.2554635927186 -5.26917883576716 A:G G A 10 0.530218543708742 0.122001853647201 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 1132456 C/T 1 19 17 36 8.9258476695339 9.01371524304861 -0.0878675735147123 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 1132505 G/A 1 24 27 51 11.2747549509902 14.315900680136 -3.04114572914584 A:G G A 10 0.530218543708742 0.403670062892651 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 1192797 C/A 1 38 14 52 17.8516953390678 7.42305961192239 10.4286357271454 A:C C A 10 0.530218543708742 0.0049495649217988 ENSG00000178381:ENST00000401903:exon_1192709_1192860:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000316495:exon_1192543_1192860:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000397083:exon_1192543_1192877:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1192544_1192860:ZFAND2A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 1195215 A/C 1 20 10 30 9.39562912582516 5.30218543708742 4.09344368873774 A:C A C 10 0.530218543708742 0.146787236795718 ENSG00000178381:ENST00000401903:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000316495:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000397083:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1195089_1195313:ZFAND2A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 1976457 C/T 1 23 13 36 10.8049734946989 6.89284106821365 3.91213242648529 T:C C T 10 0.530218543708742 0.242386499243203 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 30 18 48 14.0934436887377 9.54393378675736 4.54950990198038 A:G G A 10 0.530218543708742 0.196591593171147 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 2290522 C/T 1 56 62 118 26.3077615523104 32.873549709942 -6.56578815763156 T:C C T 10 0.530218543708742 0.231791825609746 ENSG00000106268:ENST00000356714:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397049:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000447457:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397047:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397046:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397048:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000449983:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000343985:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000339737:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000431585:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000487426:exon_2290464_2290781:NUDT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 2946461 T/C 1 132 101 233 62.0111522304461 53.5520729145829 8.45907931586311 T:C T C 10 0.530218543708742 0.293660706626998 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 2954846 G/C 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 C:G G C 10 0.530218543708742 0.247617633272995 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 2954962 G/A 1 52 40 92 24.4286357271454 21.2087417483497 3.21989397879574 A:G G A 10 0.530218543708742 0.531926579766128 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2954871_2955006:CARD11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 44 24 68 20.6703840768154 12.7252450490098 7.94513902780555 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0676251524908106 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 2969680 G/A 1 34 25 59 15.9725695139028 13.2554635927186 2.71710592118422 A:G G A 10 0.530218543708742 0.516014587140935 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2969626_2969708:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2969626_2969694:CARD11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 2976767 G/A 1 16 18 34 7.51650330066013 9.54393378675736 -2.02743048609723 A:G G A 10 0.530218543708742 0.497520057256665 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2976671_2976868:CARD11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 5347914 G/A 1 34 29 63 15.9725695139028 15.3763377675535 0.596231746349256 A:G G A 10 0.530218543708742 0.900280665569595 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 5352949 G/C 1 40 29 69 18.7912582516503 15.3763377675535 3.4149204840968 T:C:G G C 10 0.530218543708742 0.469702863568243 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 5353253 G/T 1 37 27 64 17.3819138827765 14.315900680136 3.06601320264051 T:G G T 10 0.530218543708742 0.455645626198959 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 5353344 G/A 1 33 19 52 15.5027880576115 10.0741523304661 5.42863572714542 A:G G A 10 0.530218543708742 0.164221371183642 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 21 28 49 9.86541058211642 14.8461192238448 -4.98070864172836 A:C:G G C 10 0.530218543708742 0.197219206274554 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 5427652 G/A 1 23 16 39 10.8049734946989 8.48349669933987 2.32147679535906 A:G G A 10 0.530218543708742 0.522510725948018 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5427303_5427660:TNRC18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 5427950 G/A 1 38 12 50 17.8516953390678 6.3626225245049 11.4890728145629 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00100459911792976 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 5541009 C/A 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 A:C C A 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000458142:exon_5540119_5541550:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 5541657 G/A 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 5568366 A/G 1 113 152 265 53.0853045609122 80.5932186437288 -27.5079140828166 A:G A G 10 0.530218543708742 0.000856593034781766 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 50 27 77 23.4890728145629 14.315900680136 9.17317213442687 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0396862991099155 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 6026988 G/A 1 13 32 45 6.10715893178635 16.9669933986797 -10.8598344668934 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00144683577192050 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 6063283 C/T 1 93 85 178 43.689675435087 45.0685762152431 -1.37890078015607 T:C:G C T 10 0.530218543708742 0.880686788682878 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6062934_6063465:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6062934_6063326:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6062934_6063378:AIMP2;ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6061881_6064432:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000422786:exon_6062807_6063377:EIF2AK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 6204999 A/C 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 A:C A C 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000008256:ENST00000350796:exon_6204904_6205058:CYTH3;ENSG00000008256:ENST00000396741:exon_6204904_6205058:CYTH3;ENSG00000008256:ENST00000465320:exon_6204904_6205058:CYTH3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 22 20 42 10.3351920384077 10.6043708741748 -0.269178835767164 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 6370194 C/T 1 28 12 40 13.1538807761552 6.3626225245049 6.79125825165032 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0384919936078499 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 6370305 C/G 1 14 20 34 6.57694038807761 10.6043708741748 -4.02743048609723 C:G C G 10 0.530218543708742 0.173723082513316 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 6370406 C/T 1 22 12 34 10.3351920384077 6.3626225245049 3.97256951390277 T:C C T 10 0.530218543708742 0.228654342632051 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 6621277 G/A 1 17 18 35 7.98628475695139 9.54393378675736 -1.55764902980597 A:G G A 10 0.530218543708742 0.615523468429842 ENSG00000136247:ENST00000405731:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396707:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396713:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000335965:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000493944:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396709:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000474097:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000483589:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396706:exon_6621238_6621311:ZDHHC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 6776956 A/G 1 11 9 20 5.16759601920384 4.77196689337868 0.395629125825161 A:G A G 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 8125964 C/T 1 37 39 76 17.3819138827765 20.6785232046409 -3.29660932186439 T:C:G C T 10 0.530218543708742 0.491114475022330 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8125823_8126968:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8125823_8128710:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000489405:exon_8125823_8126569:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000482540:exon_8125823_8128707:GLCCI1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 19744417 T/C 1 36 30 66 16.9121324264853 15.9065563112623 1.00557611522303 T:C T C 10 0.530218543708742 0.901980230463185 ENSG00000105849:ENST00000222567:exon_19744402_19744543:TWISTNB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 21469700 A/G 1 6 11 17 2.81868873774755 5.83240398079616 -3.01371524304861 A:G A G 10 0.530218543708742 0.153573028313809 ENSG00000105866:ENST00000222584:exon_21468907_21470461:SP4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 21956405 G/A 1 26 21 47 12.2143178635727 11.1345894178836 1.07972844568913 A:G G A 10 0.530218543708742 0.772348404612883 ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000373934:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000405437:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000465490:exon_21956372_21956515:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000396561:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000447180:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000435031:exon_21956372_21956512:CDCA7L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 23240263 G/A 1 107 144 251 50.2666158231646 76.3514702940588 -26.0848544708942 A:G G A 10 0.530218543708742 0.000992580437784797 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23239787_23240628:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23239787_23240574:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23239787_23240625:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23239787_23240324:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23239787_23240586:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23239787_23240630:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000489145:exon_23239787_23240443:NUPL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 23313171 T/C 1 3 8 11 1.40934436887377 4.24174834966994 -2.83240398079616 T:C T C 10 0.530218543708742 0.129086131769062 ENSG00000136235:ENST00000258733:exon_23313140_23313233:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000381990:exon_23313140_23313233:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000425903:exon_23313140_23313233:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000453162:exon_23313140_23313233:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000435486:exon_23313140_23313233:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000470994:exon_23313140_23313544:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000463011:exon_23313140_23313233:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000478451:exon_23313140_23313233:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000468723:exon_23312912_23313233:GPNMB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 24703298 G/A 1 8 6 14 3.75825165033006 3.18131126225245 0.576940388077612 A:G G A 10 0.530218543708742 0.795824909862849 ENSG00000105926:ENST00000222644:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409761:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000396475:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000430180:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409253:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000472674:exon_24703093_24703340:MPP6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 24742436 T/C 1 143 125 268 67.1787482496499 66.2773179635928 0.901430286057149 T:C T C 10 0.530218543708742 0.951223643373734 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 24854765 G/A 1 10 8 18 4.69781456291258 4.24174834966994 0.456066213242644 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000070882:ENST00000313367:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000353930:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000352860:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409863:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396431:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409452:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409759:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409555:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396429:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409069:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000486214:exon_24854732_24854822:OSBPL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 42 47 89 19.7308211642328 24.9202715543109 -5.18945039007804 A:G G A 10 0.530218543708742 0.289126233553662 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 30831082 C/T 1 2 6 8 0.939562912582516 3.18131126225245 -2.24174834966994 T:C C T 10 0.530218543708742 0.158929006468168 ENSG00000254959:ENST00000458257:exon_30830781_30831190:RP4-740D2.1;ENSG00000240583:ENST00000434909:exon_30830781_30831190:AQP1;ENSG00000106125:ENST00000265299:exon_30830781_30831190:FAM188B;ENSG00000106125:ENST00000381693:exon_30830781_30831190:FAM188B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 36438709 C/G 1 10 1 11 4.69781456291258 0.530218543708742 4.16759601920384 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0133054426964171 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36438688_36439002:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36438688_36439002:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000424865:exon_36438688_36439002:ANLN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 36445856 G/A 1 8 4 12 3.75825165033006 2.12087417483497 1.6373774754951 A:G G A 10 0.530218543708742 0.398218675970565 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36445790_36446175:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36445790_36446175:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000424865:exon_36445790_36445875:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000460598:exon_36445790_36446175:ANLN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 36446121 A/G 1 10 2 12 4.69781456291258 1.06043708741748 3.6373774754951 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0427166045006331 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36445790_36446175:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36445790_36446175:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000460598:exon_36445790_36446175:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000429082:exon_36446011_36446175:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000441696:exon_36446012_36446179:ANLN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 36455477 T/C 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36455367_36455493:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36455367_36455493:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000452877:exon_36455367_36455494:ANLN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 36492212 C/T 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 T:C C T 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36492086_36493400:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36492086_36493400:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000491782:exon_36492086_36493264:ANLN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 37988589 C/T 1 13 6 19 6.10715893178635 3.18131126225245 2.9258476695339 T:C C T 10 0.530218543708742 0.250330538073418 ENSG00000086289:ENST00000476620:exon_37988442_37988650:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000199448:exon_37988442_37988650:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000425345:exon_37988442_37988650:EPDR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 38393403 G/A 1 6 6 12 2.81868873774755 3.18131126225245 -0.362622524504904 A:G G A 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 43830888 T/C 1 43 25 68 20.2006026205241 13.2554635927186 6.94513902780554 T:C T C 10 0.530218543708742 0.113618117818002 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43830848_43831446:BLVRA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 43843423 G/A 1 126 114 240 59.1924634926985 60.4449139827966 -1.25245049009808 A:G G A 10 0.530218543708742 0.897166848743763 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000486984:exon_43843275_43843434:BLVRA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 44606098 C/T 1 41 41 82 19.2610397079416 21.7389602920584 -2.47792058411684 T:C C T 10 0.530218543708742 0.582664376242436 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000479602:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000448192:exon_44605737_44606123:DDX56 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 44609631 G/A 1 41 42 83 19.2610397079416 22.2691788357672 -3.00813912782559 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.511833300574409 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44609614_44609727:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44609614_44609727:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44609583_44609727:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44609614_44609727:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44609614_44609727:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44609614_44609727:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44609614_44609727:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44609583_44609727:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000473924:exon_44609351_44609727:DDX56 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 44612229 G/A 1 41 43 84 19.2610397079416 22.7993973794759 -3.53835767153433 A:G G A 10 0.530218543708742 0.446430141319354 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44612162_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44612173_44612343:DDX56 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 44620836 C/A 1 59 56 115 27.7171059211842 29.6922384476896 -1.97513252650533 A:C C A 10 0.530218543708742 0.70999611712827 ENSG00000158604:ENST00000457408:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000419520:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000481238:exon_44619496_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000477639:exon_44619503_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000444131:exon_44620692_44620838:TMED4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 44836314 A/G 1 47 45 92 22.0797284456891 23.8598344668934 -1.78010602120426 A:G A G 10 0.530218543708742 0.754400564644774 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 31 10 41 14.563225145029 5.30218543708742 9.26103970794158 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00431880619916959 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 45144494 T/C 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 T:C T C 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 45148667 G/A 1 139 130 269 65.2996224244849 68.9284106821365 -3.62878825765159 A:G G A 10 0.530218543708742 0.669307676663166 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45148426_45148682:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 45148773 C/A 1 59 58 117 27.7171059211842 30.752675535107 -3.03556961392281 A:C C A 10 0.530218543708742 0.579829591173177 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 45148857 G/C 1 132 127 259 62.0111522304461 67.3377550510102 -5.32660282056418 C:G G C 10 0.530218543708742 0.533755809285895 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45148822_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 48147879 T/C 1 9 9 18 4.22803310662132 4.77196689337868 -0.543933786757355 T:C T C 10 0.530218543708742 0.817705507349235 ENSG00000183696:ENST00000331803:exon_48147815_48148330:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000457596:exon_48147815_48147899:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000341253:exon_48147815_48148314:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000395564:exon_48147815_48148016:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000395560:exon_48147815_48148016:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000482015:exon_48147815_48148016:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000417464:exon_48147815_48148016:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000495446:exon_48147815_48148012:UPP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 50467767 C/A 1 10 24 34 4.69781456291258 12.7252450490098 -8.02743048609723 A:C C A 10 0.530218543708742 0.00890536741796934 ENSG00000185811:ENST00000331340:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000359197:exon_50467616_50470223:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000343574:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000346667:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000349824:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000357364:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000438033:exon_50467616_50468574:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000439701:exon_50467616_50470264:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000471793:exon_50467616_50468325:IKZF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 50514577 C/T 1 10 8 18 4.69781456291258 4.24174834966994 0.456066213242644 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000132436:ENST00000395556:exon_50511831_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000356889:exon_50511831_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000451252:exon_50511834_50515055:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000451735:exon_50511834_50515078:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000433017:exon_50512175_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000419119:exon_50512840_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000435566:exon_50514485_50514714:FIGNL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 55433880 G/C 1 7 3 10 3.28847019403881 1.59065563112623 1.69781456291258 C:G G C 10 0.530218543708742 0.352695224731846 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55433141_55433922:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55433815_55433922:LANCL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 55433884 A/C 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 A:C A C 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55433141_55433922:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55433815_55433922:LANCL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 55459563 A/G 1 7 9 16 3.28847019403881 4.77196689337868 -1.48349669933987 A:G A G 10 0.530218543708742 0.46678737179182 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 55540707 G/A 1 30 33 63 14.0934436887377 17.4972119423885 -3.40376825365075 A:G G A 10 0.530218543708742 0.449195583889017 ENSG00000154978:ENST00000285279:exon_55538306_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428648:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000433959:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428097:exon_55539630_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000418904:exon_55539896_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000454227:exon_55540402_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000453256:exon_55540447_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000427700:exon_55540470_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000455023:exon_55540578_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000414113:exon_55540610_55540738:VOPP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 56125757 A/G 1 118 128 246 55.4342118423684 67.867973594719 -12.4337617523505 A:G A G 10 0.530218543708742 0.125114906215505 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56125686_56125796:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56125686_56125796:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56125686_56125796:CCT6A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 56136194 C/T 1 30 28 58 14.0934436887377 14.8461192238448 -0.752675535107036 T:C C T 10 0.530218543708742 0.895658325358999 ENSG00000129103:ENST00000395436:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000418349:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000434526:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395437:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000275607:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395435:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000420966:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413952:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000342190:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000436782:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000442826:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000437307:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413756:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000483327:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000423763:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000498777:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000438133:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000447501:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000451338:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000529457:exon_56136175_56136331:SUMF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 64169019 G/A 1 11 16 27 5.16759601920384 8.48349669933987 -3.31590068013603 A:G G A 10 0.530218543708742 0.247863936906869 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 64169061 G/A 1 6 12 18 2.81868873774755 6.3626225245049 -3.54393378675736 A:G G A 10 0.530218543708742 0.103457190750381 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 64389067 G/A 1 15 17 32 7.04672184436887 9.01371524304861 -1.96699339867974 A:G G A 10 0.530218543708742 0.595927881466323 ENSG00000198039:ENST00000527278:exon_64388032_64389502:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000476120:exon_64388032_64389635:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000319636:exon_64388032_64389416:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000395375:exon_64388032_64391344:ZNF273 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 66774604 G/C 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 C:G G C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 72300332 G/A 1 7 11 18 3.28847019403881 5.83240398079616 -2.54393378675736 A:G G A 10 0.530218543708742 0.246988872578824 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 48 38 86 22.5495099019804 20.1483046609322 2.40120524104819 T:C C T 10 0.530218543708742 0.666019562455158 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 73151644 A/G 1 12 9 21 5.6373774754951 4.77196689337868 0.865410582116419 A:G A G 10 0.530218543708742 0.828055654924615 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 73969541 A/G 0 8 0 8 3.75825165033006 0 3.75825165033006 A A 10 0.530218543708742 0.0086188222890866 ENSG00000006704:ENST00000265755:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000455841:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000424337:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000476977:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000489094:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000470715:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 75615006 C/T 1 41 17 58 19.2610397079416 9.01371524304861 10.247324464893 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00804638775411801 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 10 12 22 4.69781456291258 6.3626225245049 -1.66480796159232 T:C T C 10 0.530218543708742 0.526195123533414 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 17 13 30 7.98628475695139 6.89284106821365 1.09344368873774 T:C T C 10 0.530218543708742 0.718556699845737 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 75677504 C/T 1 152 167 319 71.4067813562712 88.5464967993599 -17.1397154430887 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0565423511536555 ENSG00000146701:ENST00000461263:exon_75677369_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000315758:exon_75677385_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000443006:exon_75677403_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000461665:exon_75677454_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000490105:exon_75677479_75677840:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000432020:exon_75677479_75677544:MDH2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 75931974 C/T 1 69 80 149 32.4149204840968 42.4174834966994 -10.0025630126026 T:C C T 10 0.530218543708742 0.101497660122129 ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75931861_75932393:HSPB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 76111835 G/A 1 23 14 37 10.8049734946989 7.42305961192239 3.38191388277655 A:G G A 10 0.530218543708742 0.323605368798571 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 76131695 A/G 1 12 10 22 5.6373774754951 5.30218543708742 0.335192038407676 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000434948:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000467729:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000435251:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000479915:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000468546:exon_76131206_76131773:DTX2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 76610095 C/T 1 8 1 9 3.75825165033006 0.530218543708742 3.22803310662132 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0421575176018681 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 87082292 G/A 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000005471:ENST00000359206:exon_87082260_87082451:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000265723:exon_87082260_87082451:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000358400:exon_87082260_87082451:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000453593:exon_87082260_87082451:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000473795:exon_87081688_87082451:ABCB4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 87537177 A/G 1 105 90 195 49.3270529105821 47.7196689337868 1.60738397679531 A:G A G 10 0.530218543708742 0.829964326851122 ENSG00000006634:ENST00000413643:exon_87536503_87537691:DBF4;ENSG00000006634:ENST00000265728:exon_87536503_87538856:DBF4;ENSG00000006634:ENST00000431138:exon_87536503_87537688:DBF4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 89983808 T/G 1 13 11 24 6.10715893178635 5.83240398079616 0.274754950990192 T:G T G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89983772_89983863:GTPBP10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 89984409 A/G 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000474503:exon_89984400_89984544:GTPBP10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 90014408 G/A 1 42 17 59 19.7308211642328 9.01371524304861 10.7171059211842 A:G G A 10 0.530218543708742 0.00578084871449292 ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90014206_90015204:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90014206_90020769:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90014206_90020327:GTPBP10;ENSG00000157224:ENST00000422604:exon_90014206_90014552:CLDN12;ENSG00000157224:ENST00000416322:exon_90014206_90014552:CLDN12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 92166194 G/A 1 18 29 47 8.45606621324264 15.3763377675535 -6.92027155431087 A:G G A 10 0.530218543708742 0.056372034512017 ENSG00000127993:ENST00000265732:exon_92166165_92166848:C7orf64;ENSG00000127993:ENST00000481551:exon_92163716_92167319:C7orf64 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 92764419 A/G 1 31 24 55 14.563225145029 12.7252450490098 1.83798009601919 A:G A G 10 0.530218543708742 0.68605964523595 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 92970847 C/T 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 T:C C T 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92970739_92970887:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92970739_92970887:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92970739_92970887:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000480943:exon_92970739_92970887:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92970739_92970887:CCDC132 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 92985252 T/C 1 10 7 17 4.69781456291258 3.71152980596119 0.986284756951386 T:C T C 10 0.530218543708742 0.808994386671346 ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92985203_92985390:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000443443:exon_92985203_92985498:CCDC132 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 94230021 G/A 0 0 35 35 0 18.557649029806 -18.557649029806 A G A 10 0.530218543708742 3.28363929937915e-12 ENSG00000127990:ENST00000379889:exon_94229958_94230169:SGCE;ENSG00000127990:ENST00000522045:exon_94229958_94230052:SGCE;ENSG00000127990:ENST00000265735:exon_94229958_94230169:SGCE;ENSG00000127990:ENST00000445866:exon_94229958_94230169:SGCE;ENSG00000127990:ENST00000437425:exon_94229958_94230169:SGCE;ENSG00000127990:ENST00000447873:exon_94229958_94230169:SGCE;ENSG00000127990:ENST00000428696:exon_94229958_94230169:SGCE;ENSG00000127990:ENST00000415788:exon_94229958_94230169:SGCE;ENSG00000127990:ENST00000462731:exon_94229937_94230169:SGCE HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 97847040 G/A 1 9 14 23 4.22803310662132 7.42305961192239 -3.19502650530107 A:G G A 10 0.530218543708742 0.21251004606754 ENSG00000205356:ENST00000447648:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000490842:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000463402:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000379795:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000485716:exon_97847004_97847150:TECPR1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 T:C C T 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 98650051 G/C 1 3 8 11 1.40934436887377 4.24174834966994 -2.83240398079616 C:G G C 10 0.530218543708742 0.129086131769062 ENSG00000198742:ENST00000361368:exon_98649828_98650069:SMURF1;ENSG00000198742:ENST00000361125:exon_98649828_98650069:SMURF1;ENSG00000198742:ENST00000394240:exon_98649828_98650069:SMURF1;ENSG00000198742:ENST00000480055:exon_98649835_98650069:SMURF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 99032458 C/T 1 9 7 16 4.22803310662132 3.71152980596119 0.516503300660129 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000485746:exon_99032413_99032642:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430982:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430029:exon_99032433_99032891:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99032413_99032891:RP5-900K19.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 99047978 T/C 1 25 15 40 11.7445364072814 7.95327815563113 3.79125825165032 T:C T C 10 0.530218543708742 0.268524574525293 ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99047948_99047994:CPSF4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 99217424 G/A 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 A:G G A 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000197037:ENST00000481424:exon_99217184_99219197:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394152:exon_99217184_99217616:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394150:exon_99217184_99217620:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000431485:exon_99217184_99217439:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000334715:exon_99217173_99217616:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000262941:exon_99217173_99217616:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394151:exon_99217230_99217620:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000466948:exon_99217288_99217616:ZNF498 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 99227172 A/G 1 4 9 13 1.87912582516503 4.77196689337868 -2.89284106821365 A:G A G 10 0.530218543708742 0.162918845921506 ENSG00000197037:ENST00000481424:exon_99226814_99230022:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394152:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394150:exon_99226814_99228527:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000334715:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000262941:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394151:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000485586:exon_99226814_99229994:ZNF498 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 101916647 A/G 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 A:G A G 10 0.530218543708742 0.247617633272995 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101916637_101916764:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101916637_101916764:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101916637_101916764:CUX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 101917521 G/A 1 10 9 19 4.69781456291258 4.77196689337868 -0.0741523304660978 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101917445_101917581:CUX1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 102087202 T/C 1 72 63 135 33.8242648529706 33.4037682536507 0.420496599319833 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 102107848 C/T 1 10 7 17 4.69781456291258 3.71152980596119 0.986284756951386 T:C C T 10 0.530218543708742 0.808994386671346 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102107786_102107926:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102107786_102107926:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102107786_102107926:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102107786_102107926:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485417:exon_102107789_102107926:LRWD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 102112704 G/A 1 13 17 30 6.10715893178635 9.01371524304861 -2.90655631126226 A:G G A 10 0.530218543708742 0.360849883752274 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112665_102112756:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112665_102112756:LRWD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 1 27 11 38 12.684099319864 5.83240398079616 6.8516953390678 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0333837378282381 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 102114087 C/T 1 83 64 147 38.9918608721744 33.9339867973595 5.05787407481493 T:C C T 10 0.530218543708742 0.41010075799009 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 102760511 A/C 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:C A C 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000161048:ENST00000455523:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000341533:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000417955:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000422589:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000465647:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000427257:exon_102760024_102760670:NAPEPLD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 104717517 C/T 1 41 31 72 19.2610397079416 16.436774854971 2.82426485297058 T:C C T 10 0.530218543708742 0.555716659089689 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000478990:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000476671:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000482560:exon_104717410_104717640:MLL5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 106826381 C/T 1 16 10 26 7.51650330066013 5.30218543708742 2.21431786357271 T:C C T 10 0.530218543708742 0.435912924593876 ENSG00000105856:ENST00000468410:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000222574:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000485846:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000463202:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000417005:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000498408:exon_106826246_106826387:HBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 107559722 A/T 1 112 111 223 52.6155231046209 58.8542583516704 -6.23873524704946 A:T A T 10 0.530218543708742 0.421085016480002 ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107559639_107560360:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107559639_107560038:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107559639_107559828:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107559639_107560158:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107559639_107560100:DLD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 107569517 A/G 0 10 0 10 4.69781456291258 0 4.69781456291258 A A 10 0.530218543708742 0.00227965016978733 ENSG00000091136:ENST00000472714:exon_107569509_107570422:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000393561:exon_107569509_107569650:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000412968:exon_107569509_107569650:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000222399:exon_107569509_107569650:LAMB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 27 54 81 12.684099319864 28.6318013602721 -15.9477020404081 C:G G C 10 0.530218543708742 0.000483227950002190 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 116528240 C/T 1 22 9 31 10.3351920384077 4.77196689337868 5.563225145029 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0486832008531794 ENSG00000198898:ENST00000464223:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000484325:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000449080:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000490693:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000461878:exon_116528181_116528753:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000417431:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000464669:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116528181_116528244:CAPZA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 116557939 C/T 1 84 71 155 39.4616423284657 37.6455166033207 1.81612572514499 T:C C T 10 0.530218543708742 0.809443818940087 ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116557781_116559315:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116557781_116558242:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116557781_116559312:CAPZA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 128587342 G/C 1 196 127 323 92.0771654330866 67.3377550510102 24.7394103820763 C:G G C 10 0.530218543708742 0.00623340512492046 ENSG00000128604:ENST00000357234:exon_128587284_128587589:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000342930:exon_128587284_128587363:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000419641:exon_128587332_128587363:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000430204:exon_128587332_128587589:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000461416:exon_128587077_128587589:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000402030:exon_128587332_128587589:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000249375:exon_128587332_128587589:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473745:exon_128587332_128587589:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000412326:exon_128587332_128587360:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000465603:exon_128587332_128587589:IRF5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 21 21 42 9.86541058211642 11.1345894178836 -1.26917883576716 T:C T C 10 0.530218543708742 0.75806865433379 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 129813738 T/C 1 18 10 28 8.45606621324264 5.30218543708742 3.15388077615522 T:C T C 10 0.530218543708742 0.260090119705735 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129813665_129813779:TMEM209 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 133979545 A/T 1 9 4 13 4.22803310662132 2.12087417483497 2.10715893178635 A:T:C A T 10 0.530218543708742 0.278259851701685 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 1 9 3 12 4.22803310662132 1.59065563112623 2.6373774754951 T:C C T 10 0.530218543708742 0.154808266842262 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 134849213 G/A 1 43 30 73 20.2006026205241 15.9065563112623 4.29404630926183 A:G G A 10 0.530218543708742 0.348972969962769 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 134849577 A/C 1 32 39 71 15.0330066013203 20.6785232046409 -5.64551660332068 A:C A C 10 0.530218543708742 0.192012723342852 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 137600690 C/T 1 9 15 24 4.22803310662132 7.95327815563113 -3.72524504900981 T:C C T 10 0.530218543708742 0.153222777387596 ENSG00000182158:ENST00000330387:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000456390:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000452463:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000458726:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000417785:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000420629:exon_137600583_137600758:CREB3L2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 138270657 G/A 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 A:G G A 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000122779:ENST00000343526:exon_138269487_138274738:TRIM24;ENSG00000122779:ENST00000378381:exon_138270552_138270693:TRIM24 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 11 9 20 5.16759601920384 4.77196689337868 0.395629125825161 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 10 8 18 4.69781456291258 4.24174834966994 0.456066213242644 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 139415775 G/C 1 15 16 31 7.04672184436887 8.48349669933987 -1.436774854971 C:G G C 10 0.530218543708742 0.719617548007844 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 37 35 72 17.3819138827765 18.557649029806 -1.17573514702942 A:G G A 10 0.530218543708742 0.813967877254512 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 26 23 49 12.2143178635727 12.1950265053011 0.0192913582716425 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 13 9 22 6.10715893178635 4.77196689337868 1.33519203840768 A:G G A 10 0.530218543708742 0.671305989890035 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 141364712 G/A 1 14 16 30 6.57694038807761 8.48349669933987 -1.90655631126226 A:G G A 10 0.530218543708742 0.584066368115557 ENSG00000127359:ENST00000297761:exon_141364704_141364854:KIAA1147;ENSG00000127359:ENST00000482493:exon_141364704_141364854:KIAA1147 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 0 0 175 175 0 92.7882451490298 -92.7882451490298 A G A 10 0.530218543708742 3.81748398528922e-58 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 243 0 243 114.156893878776 0 114.156893878776 T T 10 0.530218543708742 1.20887282131007e-67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 148506396 A/C 1 12 10 22 5.6373774754951 5.30218543708742 0.335192038407676 A:C A C 10 0.530218543708742 1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 149191568 C/T 1 9 10 19 4.22803310662132 5.30218543708742 -1.0741523304661 T:C C T 10 0.530218543708742 0.652256323352804 ENSG00000181220:ENST00000340622:exon_149191295_149191594:ZNF746;ENSG00000181220:ENST00000458143:exon_149191295_149191594:ZNF746;ENSG00000181220:ENST00000461958:exon_149191295_149191595:ZNF746 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 149545115 T/C 1 6 2 8 2.81868873774755 1.06043708741748 1.75825165033006 T:C T C 10 0.530218543708742 0.296231759838006 ENSG00000106479:ENST00000223210:exon_149544824_149545521:ZNF862 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 27 51 78 12.684099319864 27.0411457291458 -14.3570464092819 T:C T C 10 0.530218543708742 0.00135260489621963 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 19 45 64 8.9258476695339 23.8598344668934 -14.9339867973595 A:T:G A G 10 0.530218543708742 0.000223904192195804 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 139 102 241 65.2996224244849 54.0822914582917 11.2173309661932 T:C T C 10 0.530218543708742 0.155830969012964 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 249 116 365 116.975582616523 61.5053510702141 55.4702315463092 A:G G A 10 0.530218543708742 4.50407019873989e-09 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 210 105 315 98.6541058211642 55.6729470894179 42.9811587317463 A:T:C C T 10 0.530218543708742 1.05396052089983e-06 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 210 175 385 98.6541058211642 92.7882451490298 5.86586067213433 T:C:G T C 10 0.530218543708742 0.574469838094061 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 150094851 A/G 1 31 30 61 14.563225145029 15.9065563112623 -1.34333116623326 A:G A G 10 0.530218543708742 0.79789049806096 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 150094853 G/A 1 29 32 61 13.6236622324465 16.9669933986797 -3.34333116623326 A:G G A 10 0.530218543708742 0.442040008137854 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 150163837 A/G 1 9 10 19 4.22803310662132 5.30218543708742 -1.0741523304661 A:G A G 10 0.530218543708742 0.652256323352804 ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150163759_150164422:GIMAP8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 150171710 T/C 1 8 12 20 3.75825165033006 6.3626225245049 -2.60437087417484 T:C T C 10 0.530218543708742 0.269017553119515 ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150171100_150171726:GIMAP8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 37 30 67 17.3819138827765 15.9065563112623 1.47535757151429 C:G G C 10 0.530218543708742 0.806861792475761 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 150733025 T/A 1 9 6 15 4.22803310662132 3.18131126225245 1.04672184436887 A:T T A 10 0.530218543708742 0.617171705992842 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150732668_150733257:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000491920:exon_150732969_150733054:ABCB8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 154738409 T/C 1 24 17 41 11.2747549509902 9.01371524304861 2.26103970794158 T:C T C 10 0.530218543708742 0.533344251281401 ENSG00000214106:ENST00000411526:exon_154738350_154738546:AC093726.6;ENSG00000214106:ENST00000449486:exon_154738303_154738501:AC093726.6;ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000464717:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154738389_154738523:PAXIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 155503920 A/T 1 16 13 29 7.51650330066013 6.89284106821365 0.623662232446482 A:T A T 10 0.530218543708742 0.854455190101058 ENSG00000184863:ENST00000401878:exon_155503897_155504149:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000307403:exon_155503897_155504149:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000440108:exon_155503867_155504149:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000392761:exon_155503897_155504149:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000486747:exon_155503897_155504149:RBM33 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 155530954 T/C 1 12 7 19 5.6373774754951 3.71152980596119 1.9258476695339 T:C T C 10 0.530218543708742 0.492071463010612 ENSG00000184863:ENST00000401878:exon_155530754_155531097:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000307403:exon_155530754_155532720:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000392761:exon_155530754_155531097:RBM33 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 155531080 A/G 1 15 16 31 7.04672184436887 8.48349669933987 -1.436774854971 A:G A G 10 0.530218543708742 0.719617548007844 ENSG00000184863:ENST00000401878:exon_155530754_155531097:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000307403:exon_155530754_155532720:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000392761:exon_155530754_155531097:RBM33 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 156469096 C/T 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 T:C C T 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000105982:ENST00000311822:exon_156468989_156469824:RNF32 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 156469133 C/G 1 9 2 11 4.22803310662132 1.06043708741748 3.16759601920384 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0707395200860403 ENSG00000105982:ENST00000317955:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000405335:exon_156469113_156469789:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000311822:exon_156468989_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392747:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000343665:exon_156469113_156469818:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392743:exon_156469113_156469818:RNF32 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 156742779 C/A 1 23 23 46 10.8049734946989 12.1950265053011 -1.39005301060213 A:C C A 10 0.530218543708742 0.768112232140901 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 156761818 G/A 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 A:G G A 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 11 12 23 5.16759601920384 6.3626225245049 -1.19502650530107 C:G G C 10 0.530218543708742 0.679029978421074 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 14 12 26 6.57694038807761 6.3626225245049 0.214317863572709 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 30 24 54 14.0934436887377 12.7252450490098 1.36819863972793 T:C T C 10 0.530218543708742 0.785615629829279 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 21 17 38 9.86541058211642 9.01371524304861 0.851695339067804 A:G A G 10 0.530218543708742 0.871388814633707 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 618728 A/G 1 23 21 44 10.8049734946989 11.1345894178836 -0.329615923184647 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523415:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523053:exon_618598_619277:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_615992_618792:ERICH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 1728557 C/G 1 11 7 18 5.16759601920384 3.71152980596119 1.45606621324264 C:G C G 10 0.530218543708742 0.638243716970554 ENSG00000182372:ENST00000331222:exon_1728416_1734738:CLN8;ENSG00000182372:ENST00000519254:exon_1728416_1728938:CLN8;ENSG00000182372:ENST00000523237:exon_1728416_1728932:CLN8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 6566351 C/G 1 35 22 57 16.442350970194 11.6648079615923 4.77754300860171 C:G C G 10 0.530218543708742 0.233021265252914 ENSG00000155189:ENST00000285518:exon_6565878_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000523234:exon_6566187_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000518327:exon_6566214_6566408:AGPAT5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 8176221 C/T 1 56 21 77 26.3077615523104 11.1345894178836 15.1731721344269 T:C C T 10 0.530218543708742 0.000536021047333496 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 8176554 C/T 1 52 46 98 24.4286357271454 24.3900530106021 0.038582716543285 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 8234077 G/C 1 32 10 42 15.0330066013203 5.30218543708742 9.73082116423284 C:G G C 10 0.530218543708742 0.00289542523665645 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 8234192 G/C 1 47 2 49 22.0797284456891 1.06043708741748 21.0192913582716 C:G G C 10 0.530218543708742 6.16144378185463e-11 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 8234218 C/T 1 49 4 53 23.0192913582716 2.12087417483497 20.8984171834367 T:C C T 10 0.530218543708742 7.09671635363976e-10 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 8234219 G/A 1 50 5 55 23.4890728145629 2.65109271854371 20.8379800960192 A:G G A 10 0.530218543708742 1.9764204972281e-09 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 8234714 C/T 1 50 25 75 23.4890728145629 13.2554635927186 10.2336092218443 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0202639783126318 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 8235523 G/A 1 2 19 21 0.939562912582516 10.0741523304661 -9.13458941788358 A:G G A 10 0.530218543708742 6.96866895403507e-05 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 8869199 T/G 1 3 14 17 1.40934436887377 7.42305961192239 -6.01371524304861 T:G T G 10 0.530218543708742 0.00563722381008593 ENSG00000104626:ENST00000523898:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000250263:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000519292:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000520684:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000520332:exon_8869173_8869262:ERI1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 11406593 T/C 1 39 36 75 18.3214767953591 19.0878675735147 -0.76639077815565 T:C T C 10 0.530218543708742 0.908106254272822 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 11414237 T/C 1 109 149 258 51.2061787357471 79.0025630126026 -27.7963842768554 T:C T C 10 0.530218543708742 0.000581154803940656 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000526778:exon_11414167_11414297:BLK;ENSG00000136573:ENST00000525206:exon_11414166_11414346:BLK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 11418766 G/A 1 15 13 28 7.04672184436887 6.89284106821365 0.153880776155224 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 11418773 C/T 1 14 18 32 6.57694038807761 9.54393378675736 -2.96699339867974 T:C C T 10 0.530218543708742 0.376191240179242 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 11667179 C/T 1 185 157 342 86.9095694138827 83.2443113622725 3.66525805161024 T:C C T 10 0.530218543708742 0.704807994360026 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531733:exon_11667176_11667485:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531249:exon_11667176_11667448:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11666765_11667359:FDFT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 11689119 G/C 1 375 341 716 176.168046109222 180.804523404681 -4.63647729545926 C:G G C 10 0.530218543708742 0.73625111712937 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11689027_11689176:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529521:exon_11689027_11689303:FDFT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 11706581 T/G 1 12 11 23 5.6373774754951 5.83240398079616 -0.195026505301065 T:G T G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11706555_11707087:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11706570_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11706571_11706673:CTSB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 11710888 G/C 1 12 12 24 5.6373774754951 6.3626225245049 -0.725245049009807 C:G G C 10 0.530218543708742 0.8392917887424 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11710838_11711023:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526645:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525315:exon_11710838_11710971:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530573:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532370:exon_11710838_11711328:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000505496:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524500:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531502:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527215:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532656:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534382:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000528965:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524654:exon_11710867_11710988:CTSB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 17796382 A/G 1 24 22 46 11.2747549509902 11.6648079615923 -0.390053010602131 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 17796383 C/T 1 23 22 45 10.8049734946989 11.6648079615923 -0.859834466893389 T:C C T 10 0.530218543708742 0.881561350298545 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 17814915 A/G 1 28 30 58 13.1538807761552 15.9065563112623 -2.75267553510704 A:G A G 10 0.530218543708742 0.511768099836550 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17814773_17814930:PCM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 17819572 C/T 1 52 44 96 24.4286357271454 23.3296159231846 1.09901980396077 T:C C T 10 0.530218543708742 0.838711893716519 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17819543_17819722:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17819543_17819683:PCM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 121 112 233 56.8435562112422 59.3844768953791 -2.54092068413689 T:C T C 10 0.530218543708742 0.743262088698929 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 68 47 115 31.9451390278055 24.9202715543109 7.02486747349467 T:C C T 10 0.530218543708742 0.192522980601599 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 19678014 G/A 1 13 5 18 6.10715893178635 2.65109271854371 3.45606621324264 A:G G A 10 0.530218543708742 0.15477553907908 ENSG00000104613:ENST00000397977:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000522114:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000523869:exon_19677890_19678029:INTS10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 21959726 G/A 1 14 16 30 6.57694038807761 8.48349669933987 -1.90655631126226 A:G G A 10 0.530218543708742 0.584066368115557 ENSG00000158863:ENST00000450006:exon_21959686_21959826:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000289921:exon_21959686_21959826:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000436711:exon_21959686_21959826:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000356512:exon_21959686_21959826:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000496599:exon_21959219_21959826:FAM160B2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 21996546 C/T 1 27 27 54 12.684099319864 14.315900680136 -1.63180136027207 T:C C T 10 0.530218543708742 0.684201018751443 ENSG00000168476:ENST00000306306:exon_21996439_21996574:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000523293:exon_21996439_21996574:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000518664:exon_21996416_21996574:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000519074:exon_21996420_21997042:REEP4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 22106638 C/T 1 14 9 23 6.57694038807761 4.77196689337868 1.80497349469893 T:C C T 10 0.530218543708742 0.533565745005242 ENSG00000168495:ENST00000306433:exon_22106557_22106822:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000397802:exon_22106557_22106822:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000517789:exon_22106557_22106822:POLR3D HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 22262321 T/C 1 8 4 12 3.75825165033006 2.12087417483497 1.6373774754951 T:C:G T C 10 0.530218543708742 0.398218675970565 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520644:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000524285:exon_22262209_22262490:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520832:exon_22262209_22262383:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000519960:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000522881:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517552:exon_22262030_22262493:SLC39A14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 22262379 C/T 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 T:C C T 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520644:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000524285:exon_22262209_22262490:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520832:exon_22262209_22262383:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000519960:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000522881:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517552:exon_22262030_22262493:SLC39A14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 22273687 T/C 1 11 6 17 5.16759601920384 3.18131126225245 1.98628475695139 T:C T C 10 0.530218543708742 0.46729790202122 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517370:exon_22273586_22273782:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000518348:exon_22273586_22273793:SLC39A14 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 22463623 C/T 1 26 28 54 12.2143178635727 14.8461192238448 -2.63180136027207 T:C C T 10 0.530218543708742 0.497676421413227 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523801:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521301:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521837:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523349:exon_22463598_22463689:KIAA1967 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 22471824 G/A 1 46 39 85 21.6099469893979 20.6785232046409 0.93142378475693 A:G G A 10 0.530218543708742 0.913572524541748 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000522599:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521020:exon_22471398_22471827:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 22481449 A/G 1 29 27 56 13.6236622324465 14.315900680136 -0.692238447689551 A:G A G 10 0.530218543708742 0.893945371002138 ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520489:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000399977:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519863:exon_22481428_22481562:BIN3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 82 70 152 38.5220794158832 37.1152980596119 1.40678135627122 C:G G C 10 0.530218543708742 0.870991061638917 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 23290451 C/T 1 14 7 21 6.57694038807761 3.71152980596119 2.86541058211642 T:C C T 10 0.530218543708742 0.275142109059742 ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23286665_23290667:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522255:exon_23290159_23290667:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23290439_23290667:ENTPD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 23291835 T/C 1 18 10 28 8.45606621324264 5.30218543708742 3.15388077615522 T:C T C 10 0.530218543708742 0.260090119705735 ENSG00000197217:ENST00000518471:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000521321:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522255:exon_23291830_23292251:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23291606_23291991:ENTPD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 23292985 A/G 1 12 7 19 5.6373774754951 3.71152980596119 1.9258476695339 A:G A G 10 0.530218543708742 0.492071463010612 ENSG00000197217:ENST00000518471:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000521321:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522913:exon_23292905_23292990:ENTPD4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 25287397 T/C 1 19 21 40 8.9258476695339 11.1345894178836 -2.20874174834968 T:C T C 10 0.530218543708742 0.528299779534935 ENSG00000104756:ENST00000221200:exon_25285366_25287489:KCTD9;ENSG00000104756:ENST00000519665:exon_25286778_25287489:KCTD9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 25364331 G/A 1 73 61 134 34.2940463092618 32.3433311662333 1.95071514302857 A:G G A 10 0.530218543708742 0.795279505819708 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 25364834 A/T 1 34 43 77 15.9725695139028 22.7993973794759 -6.82682786557313 A:T A T 10 0.530218543708742 0.137516852282894 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 25364960 A/G 1 55 58 113 25.8379800960192 30.752675535107 -4.91469543908784 A:G A G 10 0.530218543708742 0.396455666853986 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 25365278 G/A 1 24 25 49 11.2747549509902 13.2554635927186 -1.98070864172836 A:G G A 10 0.530218543708742 0.571240381545247 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 26240646 A/G 1 30 23 53 14.0934436887377 12.1950265053011 1.89841718343667 A:G A G 10 0.530218543708742 0.680319572184063 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 45 21 66 21.1401655331066 11.1345894178836 10.005576115223 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0136530464302737 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 42 10 52 19.7308211642328 5.30218543708742 14.4286357271454 T:C T C 10 0.530218543708742 3.98385443395735e-05 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 40 8 48 18.7912582516503 4.24174834966994 14.5495099019804 A:G G A 10 0.530218543708742 1.58160523800441e-05 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 51 45 96 23.9588542708542 23.8598344668934 0.0990198039607684 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 54 47 101 25.3681986397279 24.9202715543109 0.44792708541706 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 70 63 133 32.8847019403881 33.4037682536507 -0.519066313262684 C:G C G 10 0.530218543708742 0.931027973316554 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 98 105 203 46.0385827165433 55.6729470894179 -9.63436437287463 A:C A C 10 0.530218543708742 0.181951449342916 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 3 17 20 1.40934436887377 9.01371524304861 -7.60437087417484 A:C A C 10 0.530218543708742 0.000579796487605195 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 27634064 C/T 1 14 23 37 6.57694038807761 12.1950265053011 -5.61808611722345 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0708425436120568 ENSG00000171320:ENST00000523566:exon_27633879_27634387:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000305188:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000397418:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000522378:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000519637:exon_27633879_27634224:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000524293:exon_27633879_27637612:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000523910:exon_27634027_27634686:ESCO2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 43 36 79 20.2006026205241 19.0878675735147 1.11273504700938 C:G C G 10 0.530218543708742 0.822587882580093 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 27679981 T/C 1 20 13 33 9.39562912582516 6.89284106821365 2.50278805761151 T:C T C 10 0.530218543708742 0.48604755372549 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000521226:exon_27679836_27680005:PBK HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 29197672 A/G 1 113 164 277 53.0853045609122 86.9558411682337 -33.8705366073215 A:G A G 10 0.530218543708742 5.12419835772297e-05 ENSG00000120875:ENST00000240100:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000404690:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000462477:exon_29197615_29197760:DUSP4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 30565624 G/A 1 37 22 59 17.3819138827765 11.6648079615923 5.71710592118422 A:G G A 10 0.530218543708742 0.151951299005717 ENSG00000104687:ENST00000221130:exon_30565589_30565658:GSR;ENSG00000104687:ENST00000414019:exon_30565589_30565658:GSR;ENSG00000104687:ENST00000523295:exon_30565589_30565658:GSR;ENSG00000104687:ENST00000520888:exon_30565589_30565658:GSR;ENSG00000104687:ENST00000521479:exon_30565589_30565658:GSR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 16 18 34 7.51650330066013 9.54393378675736 -2.02743048609723 A:G A G 10 0.530218543708742 0.497520057256665 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 6 17 23 2.81868873774755 9.01371524304861 -6.19502650530107 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0113478316534068 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 15 19 34 7.04672184436887 10.0741523304661 -3.02743048609723 A:G A G 10 0.530218543708742 0.308346500587601 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 33416222 C/T 1 7 12 19 3.28847019403881 6.3626225245049 -3.0741523304661 T:C C T 10 0.530218543708742 0.173987244767743 ENSG00000133874:ENST00000256257:exon_33416133_33416289:RNF122 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 56 65 121 26.3077615523104 34.4642053410682 -8.15644378875778 A:G A G 10 0.530218543708742 0.145491336603979 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 37728017 A/G 1 34 15 49 15.9725695139028 7.95327815563113 8.01929135827164 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0222018230246366 ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 37728019 T/G 1 34 17 51 15.9725695139028 9.01371524304861 6.95885427085416 T:C:G T G 10 0.530218543708742 0.0671455347782272 ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 37730368 G/A 1 11 11 22 5.16759601920384 5.83240398079616 -0.664807961592324 A:G G A 10 0.530218543708742 0.832858519551156 ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37728796_37730697:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37728796_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 37963239 C/T 1 25 13 38 11.7445364072814 6.89284106821365 4.8516953390678 T:C C T 10 0.530218543708742 0.143078279521696 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37962760_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37963011_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517719:exon_37963018_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37963068_37963256:ASH2L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 37985897 A/G 1 13 17 30 6.10715893178635 9.01371524304861 -2.90655631126226 A:G A G 10 0.530218543708742 0.360849883752274 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000428278:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000521652:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000524247:exon_37985858_37985976:ASH2L HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 38095662 C/T 1 8 10 18 3.75825165033006 5.30218543708742 -1.54393378675736 T:C C T 10 0.530218543708742 0.488609852310515 ENSG00000085788:ENST00000397166:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000519857:exon_38095607_38096576:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000526237:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000532222:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000520272:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000319246:exon_38095607_38095727:DDHD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 38677322 C/T 1 22 29 51 10.3351920384077 15.3763377675535 -5.04114572914584 T:C C T 10 0.530218543708742 0.163313378431045 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521528:exon_38677040_38677438:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521935:exon_38677040_38677761:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000524193:exon_38677040_38677529:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 38677932 A/G 1 29 38 67 13.6236622324465 20.1483046609322 -6.52464242848571 A:G A G 10 0.530218543708742 0.113279324341926 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38677850_38678153:TACC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 38684853 T/C 1 5 8 13 2.34890728145629 4.24174834966994 -1.89284106821365 T:C T C 10 0.530218543708742 0.406203894191414 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521642:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521050:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38684686_38685585:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38684686_38684893:TACC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 38695996 T/C 1 13 13 26 6.10715893178635 6.89284106821365 -0.785682136427292 T:C T C 10 0.530218543708742 0.845120861383123 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522752:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38695988_38696025:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38695988_38696028:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38695988_38696064:TACC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 41525914 C/T 1 18 21 39 8.45606621324264 11.1345894178836 -2.67852320464094 T:C C T 10 0.530218543708742 0.424951586486616 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000518061:exon_41525859_41526082:ANK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 41553928 C/G 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 C:G C G 10 0.530218543708742 0.565817448386735 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41553881_41554105:ANK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 59508134 T/C 1 11 8 19 5.16759601920384 4.24174834966994 0.925847669533902 T:C T C 10 0.530218543708742 0.8192074586227 ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523177:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523106:exon_59508119_59508218:NSMAF HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 16 16 32 7.51650330066013 8.48349669933987 -0.966993398679744 T:C T C 10 0.530218543708742 0.859791229190276 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 67592152 T/C 1 10 13 23 4.69781456291258 6.89284106821365 -2.19502650530107 T:C T C 10 0.530218543708742 0.407163540617657 ENSG00000104205:ENST00000520044:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000104205:ENST00000519289:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000213865:ENST00000521113:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000519561:exon_67591956_67593393:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000390159:exon_67591956_67593235:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000396609:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000518860:exon_67591774_67592259:C8orf44 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 70594420 C/A 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 A:C C A 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000137571:ENST00000260126:exon_70594419_70594578:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000524945:exon_70594419_70594578:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000526750:exon_70594419_70594578:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000530307:exon_70594419_70594578:SLCO5A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 86089787 C/G 1 11 5 16 5.16759601920384 2.65109271854371 2.51650330066013 C:G C G 10 0.530218543708742 0.223429926014640 ENSG00000133740:ENST00000418930:exon_86089460_86089889:E2F5;ENSG00000133740:ENST00000256117:exon_86089619_86089889:E2F5;ENSG00000133740:ENST00000416274:exon_86089622_86089889:E2F5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 86389403 T/C 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 T:C T C 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000104267:ENST00000285379:exon_86389349_86389504:CA2;ENSG00000104267:ENST00000520127:exon_86389349_86389504:CA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 14 11 25 6.57694038807761 5.83240398079616 0.74453640728145 T:C T C 10 0.530218543708742 0.842713046828003 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 24 34 58 11.2747549509902 18.0274304860972 -6.75267553510703 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0870272899501851 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 90995019 C/T 1 8 12 20 3.75825165033006 6.3626225245049 -2.60437087417484 T:C C T 10 0.530218543708742 0.269017553119515 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000519426:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000523444:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517337:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000494804:exon_90994632_90995083:NBN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 92083424 A/G 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:G A G 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000155100:ENST00000285420:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000404789:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000522894:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000524027:exon_92083366_92083517:OTUD6B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 94747536 G/A 1 16 20 36 7.51650330066013 10.6043708741748 -3.08786757351471 A:G G A 10 0.530218543708742 0.320546928577092 ENSG00000183808:ENST00000399300:exon_94741584_94748666:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000517700:exon_94746777_94748666:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000329529:exon_94746777_94748638:RBM12B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 95419698 A/G 1 19 14 33 8.9258476695339 7.42305961192239 1.50278805761151 A:G A G 10 0.530218543708742 0.727855955892719 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95419667_95419948:RAD54B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 95479680 G/C 1 7 9 16 3.28847019403881 4.77196689337868 -1.48349669933987 C:G G C 10 0.530218543708742 0.46678737179182 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95479633_95479783:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95479633_95479783:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000518998:exon_95479633_95479783:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000523839:exon_95479633_95479783:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000297592:exon_95479633_95479783:RAD54B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 103663912 T/G 1 93 45 138 43.689675435087 23.8598344668934 19.8298409681936 T:G T G 10 0.530218543708742 0.000818377350250426 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103663377_103664289:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103663377_103664289:KLF10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 120790304 T/C 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 T:C T C 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120790259_120790369:TAF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 120803637 C/G 1 6 4 10 2.81868873774755 2.12087417483497 0.69781456291258 C:G C G 10 0.530218543708742 0.758367997662058 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120803564_120803699:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000523904:exon_120803564_120803699:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000523734:exon_120803564_120804114:TAF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 120847188 T/C 1 22 17 39 10.3351920384077 9.01371524304861 1.32147679535906 T:C T C 10 0.530218543708742 0.749339393350759 ENSG00000136982:ENST00000313655:exon_120846216_120847241:DSCC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 121519081 A/G 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 A:G A G 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000172167:ENST00000305949:exon_121518946_121519101:MTBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 121530190 A/G 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 A:G A G 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000172167:ENST00000305949:exon_121530091_121530340:MTBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 124027628 T/C 1 69 78 147 32.4149204840968 41.3570464092819 -8.94212592518507 T:C T C 10 0.530218543708742 0.15988785858495 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 124162363 C/T 1 11 8 19 5.16759601920384 4.24174834966994 0.925847669533902 T:C C T 10 0.530218543708742 0.8192074586227 ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124162276_124162368:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124162276_124162368:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124162276_124162368:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124162276_124162368:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124162276_124162368:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124162276_124162368:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124162276_124162368:WDR67 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 126448497 C/T 1 62 54 116 29.126450290058 28.6318013602721 0.494648929785928 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000173334:ENST00000311922:exon_126448248_126450647:TRIB1;ENSG00000173334:ENST00000520847:exon_126448248_126449170:TRIB1;ENSG00000173334:ENST00000519576:exon_126448248_126449433:TRIB1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 131124559 T/C 1 5 14 19 2.34890728145629 7.42305961192239 -5.0741523304661 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0218531141296597 ENSG00000153317:ENST00000524124:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000357668:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000521075:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000518721:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000343135:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000519483:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000520189:exon_131124340_131124660:ASAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 134488007 G/A 1 8 8 16 3.75825165033006 4.24174834966994 -0.483496699339872 A:G G A 10 0.530218543708742 0.808666363254929 ENSG00000008513:ENST00000319914:exon_134487962_134488847:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000395320:exon_134487962_134488317:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000399640:exon_134487962_134488317:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000521180:exon_134487962_134488843:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000522652:exon_134487962_134488317:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000522204:exon_134487962_134488177:ST3GAL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 141263015 G/A 1 14 9 23 6.57694038807761 4.77196689337868 1.80497349469893 A:G G A 10 0.530218543708742 0.533565745005242 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521667:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520532:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000518839:exon_141262876_141263028:TRAPPC9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 143396446 C/T 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143396364_143396450:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143396364_143396453:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143396364_143396453:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143396364_143396450:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000519651:exon_143396364_143396450:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000518928:exon_143396364_143396453:TSNARE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 143413136 C/T 1 5 13 18 2.34890728145629 6.89284106821365 -4.54393378675736 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0351116074210844 ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000519651:exon_143413115_143413192:TSNARE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 143425720 T/C 1 2 9 11 0.939562912582516 4.77196689337868 -3.83240398079616 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0305374290985922 ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520462:exon_143425621_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000518720:exon_143425714_143425833:TSNARE1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 37 32 69 17.3819138827765 16.9669933986797 0.414920484096804 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144620342 T/C 1 28 34 62 13.1538807761552 18.0274304860972 -4.873549709942 T:C T C 10 0.530218543708742 0.252154620195353 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144620855 C/A 1 16 22 38 7.51650330066013 11.6648079615923 -4.1483046609322 A:C C A 10 0.530218543708742 0.195573772819002 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144621084 T/G 1 22 22 44 10.3351920384077 11.6648079615923 -1.32961592318465 T:G T G 10 0.530218543708742 0.763212211288356 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144893084 G/A 1 32 27 59 15.0330066013203 14.315900680136 0.717105921184222 A:G G A 10 0.530218543708742 0.896712526856488 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144893076_144893242:SCRIB HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 28 36 64 13.1538807761552 19.0878675735147 -5.93398679735949 A:G A G 10 0.530218543708742 0.16788960409796 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144991176 T/C 1 51 63 114 23.9588542708542 33.4037682536507 -9.44491398279659 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0908025843392088 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144992103 T/C 1 24 21 45 11.2747549509902 11.1345894178836 0.140165533106611 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144992361 T/C 1 10 21 31 4.69781456291258 11.1345894178836 -6.436774854971 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0292043627397844 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144992862 A/G 1 29 29 58 13.6236622324465 15.3763377675535 -1.75267553510703 A:G A G 10 0.530218543708742 0.693940532222882 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144993324 C/T 1 35 43 78 16.442350970194 22.7993973794759 -6.35704640928187 T:C C T 10 0.530218543708742 0.173238169056154 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144993377 A/G 1 31 27 58 14.563225145029 14.315900680136 0.247324464892964 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144994566 G/A 1 26 22 48 12.2143178635727 11.6648079615923 0.549509901980384 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.886303655646963 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144995494 C/T 1 30 11 41 14.0934436887377 5.83240398079616 8.26103970794158 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0115263914373494 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144995736 G/A 1 15 22 37 7.04672184436887 11.6648079615923 -4.61808611722345 A:G G A 10 0.530218543708742 0.140191429203817 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144996029 A/G 1 8 19 27 3.75825165033006 10.0741523304661 -6.31590068013603 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0193386730950281 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144996408 T/G 1 13 23 36 6.10715893178635 12.1950265053011 -6.08786757351471 T:G T G 10 0.530218543708742 0.0457431861260959 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_144996100_144996563:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144997656 C/T 1 11 8 19 5.16759601920384 4.24174834966994 0.925847669533902 T:C C T 10 0.530218543708742 0.8192074586227 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144997927 G/A 1 11 23 34 5.16759601920384 12.1950265053011 -7.02743048609723 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0240301020681640 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144998169 C/T 1 11 16 27 5.16759601920384 8.48349669933987 -3.31590068013603 A:T:C C T 10 0.530218543708742 0.247863936906869 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144998190 A/G 1 8 20 28 3.75825165033006 10.6043708741748 -6.84611922384478 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0126042496806408 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144999621 C/T 1 9 5 14 4.22803310662132 2.65109271854371 1.57694038807761 T:C C T 10 0.530218543708742 0.43589870850422 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 144999642 A/C 1 10 6 16 4.69781456291258 3.18131126225245 1.51650330066013 A:C A C 10 0.530218543708742 0.617951383515179 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 145001031 T/C 1 12 7 19 5.6373774754951 3.71152980596119 1.9258476695339 T:C T C 10 0.530218543708742 0.492071463010612 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_145000952_145001050:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 145001588 C/T 1 14 16 30 6.57694038807761 8.48349669933987 -1.90655631126226 T:C C T 10 0.530218543708742 0.584066368115557 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 145001784 A/G 1 18 16 34 8.45606621324264 8.48349669933987 -0.0274304860972272 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 145621556 A/G 1 9 1 10 4.22803310662132 0.530218543708742 3.69781456291258 A:T:G A T 10 0.530218543708742 0.0237480022218031 ENSG00000071894:ENST00000527827:exon_145621230_145621715:CPSF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 39 22 61 18.3214767953591 11.6648079615923 6.65666883376674 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0959044696197517 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 8 145999498 T/A 1 8 4 12 3.75825165033006 2.12087417483497 1.6373774754951 A:T T A 10 0.530218543708742 0.398218675970565 ENSG00000196378:ENST00000527190:exon_145997611_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000343459:exon_145998499_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000429371:exon_145998499_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000527740:exon_145998505_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000449516:exon_145998508_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000534337:exon_145999357_145999990:ZNF34 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 334337 A/G 1 12 5 17 5.6373774754951 2.65109271854371 2.98628475695139 A:G A G 10 0.530218543708742 0.223474867867513 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_334225_334384:DOCK8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 421032 C/G 1 3 11 14 1.40934436887377 5.83240398079616 -4.42305961192239 C:G C G 10 0.530218543708742 0.0285048765274962 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000493666:exon_420949_421078:DOCK8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 2029018 G/A 1 17 23 40 7.98628475695139 12.1950265053011 -4.20874174834968 A:G G A 10 0.530218543708742 0.206250018537793 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000457226:exon_2028987_2029221:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2029006_2029247:SMARCA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 2032957 C/T 1 20 25 45 9.39562912582516 13.2554635927186 -3.85983446689339 T:C C T 10 0.530218543708742 0.296072263822351 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2032952_2033081:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2032952_2033081:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2032952_2033081:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2032952_2033081:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2032952_2033081:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2032952_2033081:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2032952_2033081:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000491574:exon_2032952_2033081:SMARCA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 2054630 A/G 1 23 10 33 10.8049734946989 5.30218543708742 5.50278805761151 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0570082576648625 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2054597_2054723:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2054597_2054723:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2054597_2054723:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2054597_2054723:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2054597_2054723:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2054597_2054723:SMARCA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 2804393 A/G 1 42 34 76 19.7308211642328 18.0274304860972 1.70339067813561 A:G A G 10 0.530218543708742 0.731250594891672 ENSG00000080608:ENST00000490444:exon_2804257_2804465:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2804164_2804463:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000382032:exon_2804167_2804463:KIAA0020 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 32 32 64 15.0330066013203 16.9669933986797 -1.93398679735949 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.707476795069227 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 33 42 75 15.5027880576115 22.2691788357672 -6.76639077815565 C:G C G 10 0.530218543708742 0.132598956239060 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 4576680 T/C 1 9 4 13 4.22803310662132 2.12087417483497 2.10715893178635 T:C T C 10 0.530218543708742 0.278259851701685 ENSG00000106688:ENST00000262352:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000381910:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000422398:exon_4576569_4576763:SLC1A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 4662394 A/G 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G A G 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000205808:ENST00000381883:exon_4662298_4665256:PPAPDC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 5090783 G/A 1 8 6 14 3.75825165033006 3.18131126225245 0.576940388077612 A:G G A 10 0.530218543708742 0.795824909862849 ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5090739_5090911:JAK2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 5968416 A/G 1 44 53 97 20.6703840768154 28.1015828165633 -7.43119873974797 A:G A G 10 0.530218543708742 0.154081516711827 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 6012734 A/C 1 30 27 57 14.0934436887377 14.315900680136 -0.222456991398294 A:C A C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 6506038 C/T 1 24 20 44 11.2747549509902 10.6043708741748 0.670384076815353 T:C C T 10 0.530218543708742 0.88086557780696 ENSG00000147854:ENST00000468435:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000276893:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000485617:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000492853:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000481243:exon_6506033_6506112:UHRF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 6610326 C/T 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 T:C C T 10 0.530218543708742 0.565817448386735 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6610192_6610356:GLDC HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 12 20 32 5.6373774754951 10.6043708741748 -4.96699339867974 A:G G A 10 0.530218543708742 0.109522418077362 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 7477141 G/C 0 127 0 127 59.6622449489898 0 59.6622449489898 G G 10 0.530218543708742 1.11825379127892e-35 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 19341045 A/G 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000137145:ENST00000380437:exon_19340990_19341112:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000307015:exon_19340990_19341112:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000453857:exon_19340990_19341112:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380432:exon_19340990_19341112:DENND4C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 19346710 A/G 1 18 10 28 8.45606621324264 5.30218543708742 3.15388077615522 A:G A G 10 0.530218543708742 0.260090119705735 ENSG00000137145:ENST00000380437:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000307015:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000453857:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380432:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380427:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000361024:exon_19346554_19347084:DENND4C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 19376255 A/C 1 4 8 12 1.87912582516503 4.24174834966994 -2.3626225245049 A:C A C 10 0.530218543708742 0.247617633272995 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 19376258 G/C 1 5 10 15 2.34890728145629 5.30218543708742 -2.95327815563113 C:G G C 10 0.530218543708742 0.194384351758500 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 20933030 A/C 1 38 28 66 17.8516953390678 14.8461192238448 3.00557611522303 A:C A C 10 0.530218543708742 0.537836078957309 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20933013_20933102:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20933013_20933102:KIAA1797 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 20953049 A/G 1 15 13 28 7.04672184436887 6.89284106821365 0.153880776155224 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20952984_20953064:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20952984_20953064:KIAA1797 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 21029330 T/C 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000188921:ENST00000495827:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000513293:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000521505:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000531631:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000380233:exon_21029294_21029397:PTPLAD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 26892654 G/A 1 15 9 24 7.04672184436887 4.77196689337868 2.27475495099019 A:G G A 10 0.530218543708742 0.416361226154525 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26892411_26892802:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26892411_26892801:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26892257_26892785:C9orf82 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 32425910 A/G 1 2 6 8 0.939562912582516 3.18131126225245 -2.24174834966994 A:G A G 10 0.530218543708742 0.158929006468168 ENSG00000122729:ENST00000432017:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379921:exon_32425836_32425943:ACO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 32450187 T/C 1 12 18 30 5.6373774754951 9.54393378675736 -3.90655631126226 T:C T C 10 0.530218543708742 0.199822740571968 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 32459450 T/G 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 T:G T G 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32459369_32459512:DDX58 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 201 212 413 94.4260727145429 112.406331266253 -17.9802585517104 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0843321120176342 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 35705759 G/A 1 92 67 159 43.2198939787957 35.5246424284857 7.69525155031003 A:G G A 10 0.530218543708742 0.233858320633121 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35705747_35705848:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000486788:exon_35705747_35705848:TLN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 35712003 G/A 1 51 39 90 23.9588542708542 20.6785232046409 3.28033106621322 A:G G A 10 0.530218543708742 0.527117515051514 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35712002_35712121:TLN1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 37429814 A/G 1 140 113 253 65.7694038807761 59.9146954390878 5.85470844168828 A:G A G 10 0.530218543708742 0.4885893361084 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000377824:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000491488:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000497693:exon_37427703_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000480596:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000438860:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000494290:exon_37428992_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000482603:exon_37429783_37429833:GRHPR HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 38 17 55 17.8516953390678 9.01371524304861 8.83798009601919 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0208738739168110 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 1 49 9 58 23.0192913582716 4.77196689337868 18.247324464893 A:G G A 10 0.530218543708742 9.21382648774774e-07 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 13 7 20 6.10715893178635 3.71152980596119 2.39562912582516 T:C C T 10 0.530218543708742 0.371488020282974 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 38395928 C/T 1 36 15 51 16.9121324264853 7.95327815563113 8.95885427085416 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0162203919610654 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 38396002 C/T 1 45 44 89 21.1401655331066 23.3296159231846 -2.18945039007804 T:C C T 10 0.530218543708742 0.671789118332548 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 38396065 G/T 1 49 57 106 23.0192913582716 30.2224569913983 -7.20316563312665 T:C:G G T 10 0.530218543708742 0.173475495399873 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 71549847 G/A 1 10 6 16 4.69781456291258 3.18131126225245 1.51650330066013 A:G G A 10 0.530218543708742 0.617951383515179 ENSG00000107242:ENST00000377290:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000265382:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000419747:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000478500:exon_71549806_71549961:PIP5K1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 11 17 28 5.16759601920384 9.01371524304861 -3.84611922384478 T:C C T 10 0.530218543708742 0.184722657193932 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 14 16 30 6.57694038807761 8.48349669933987 -1.90655631126226 A:G G A 10 0.530218543708742 0.584066368115557 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 31 34 65 14.563225145029 18.0274304860972 -3.46420534106823 T:C C T 10 0.530218543708742 0.456188255130796 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 8 2 10 3.75825165033006 1.06043708741748 2.69781456291258 A:C A C 10 0.530218543708742 0.115795579122128 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 19 12 31 8.9258476695339 6.3626225245049 2.563225145029 A:G A G 10 0.530218543708742 0.375031576291977 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 80912115 G/C 1 1 7 8 0.469781456291258 3.71152980596119 -3.24174834966994 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0300386507500581 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80911992_80912186:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80912059_80912186:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80912059_80912186:PSAT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 80919756 T/G 1 11 17 28 5.16759601920384 9.01371524304861 -3.84611922384478 T:G T G 10 0.530218543708742 0.184722657193932 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80919651_80919856:PSAT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 88959938 C/T 1 3 6 9 1.40934436887377 3.18131126225245 -1.77196689337868 T:C C T 10 0.530218543708742 0.321457471611285 ENSG00000083223:ENST00000277141:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375960:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375961:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375963:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000427388:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000432440:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000449875:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375947:exon_88959785_88960069:ZCCHC6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 91978397 C/T 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000187764:ENST00000492386:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000420101:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000469653:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000475255:exon_91978345_91980569:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000455551:exon_91978345_91978442:SEMA4D HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 94172992 C/T 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 T:C C T 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000165030:ENST00000375724:exon_94171327_94173370:NFIL3;ENSG00000165030:ENST00000297689:exon_94171331_94173188:NFIL3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 94985637 T/C 1 77 93 170 36.1731721344269 49.310324564913 -13.1371524304861 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0457780786167118 ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_94985628_94985711:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000421189:exon_94985628_94985771:IARS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 8 7 15 3.75825165033006 3.71152980596119 0.0467218443688702 A:C C A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 96238578 C/T 1 45 49 94 21.1401655331066 25.9807086417284 -4.84054310862175 T:C C T 10 0.530218543708742 0.352633152643491 ENSG00000048828:ENST00000437660:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000375389:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000277165:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000340893:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000333936:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000446420:exon_96238538_96238620:FAM120A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 97522829 G/A 1 5 3 8 2.34890728145629 1.59065563112623 0.758251650330064 A:G G A 10 0.530218543708742 0.73053574105774 ENSG00000148120:ENST00000428218:exon_97521931_97523015:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000277198:exon_97521931_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000297979:exon_97521931_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000375315:exon_97522066_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000395357:exon_97522066_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000427193:exon_97522444_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000489318:exon_97522588_97523015:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000424143:exon_97522597_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000428313:exon_97522720_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000375316:exon_97522720_97522862:C9orf3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 98638288 A/G 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000182150:ENST00000375266:exon_98637900_98638366:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000405401:exon_98637900_98638366:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000288985:exon_98637983_98638366:C9orf102 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 100190780 A/G 1 8 6 14 3.75825165033006 3.18131126225245 0.576940388077612 A:G A G 10 0.530218543708742 0.795824909862849 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100190742_100190954:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100190742_100190954:TDRD7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 100823084 T/C 1 47 39 86 22.0797284456891 20.6785232046409 1.40120524104819 T:C T C 10 0.530218543708742 0.829161108516402 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 101984093 G/C 1 26 9 35 12.2143178635727 4.77196689337868 7.44235097019403 C:G G C 10 0.530218543708742 0.0164672443463554 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101983829_101984224:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101983829_101984238:ALG2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 104297693 T/A 1 11 14 25 5.16759601920384 7.42305961192239 -2.25546359271855 A:T T A 10 0.530218543708742 0.425252421915307 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000478347:exon_104297680_104297798:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000488264:exon_104297680_104297729:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000374819:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000479306:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000481046:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000466817:exon_104297680_104297834:RNF20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 104302625 A/G 1 7 12 19 3.28847019403881 6.3626225245049 -3.0741523304661 A:G A G 10 0.530218543708742 0.173987244767743 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000478347:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000488264:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000374819:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000479306:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000466817:exon_104302485_104302652:RNF20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 108147763 T/G 1 23 28 51 10.8049734946989 14.8461192238448 -4.04114572914584 T:G T G 10 0.530218543708742 0.265186168265862 ENSG00000070214:ENST00000374723:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000470972:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374720:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374724:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000361080:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000343170:exon_108147703_108147783:SLC44A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 110084328 C/T 1 67 57 124 31.4753575715143 30.2224569913983 1.25290058011599 T:C C T 10 0.530218543708742 0.857470261556153 ENSG00000119318:ENST00000416373:exon_110084264_110084399:RAD23B;ENSG00000119318:ENST00000358015:exon_110084264_110084399:RAD23B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 112900199 T/C 1 31 42 73 14.563225145029 22.2691788357672 -7.70595369073817 T:C T C 10 0.530218543708742 0.078600361372402 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 112900785 A/G 1 48 40 88 22.5495099019804 21.2087417483497 1.34076815363071 A:G A G 10 0.530218543708742 0.83115155211217 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 147 153 300 69.0578740748149 81.1234371874375 -12.0655631126226 T:C T C 10 0.530218543708742 0.165479506875936 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 186 175 361 87.379350870174 92.7882451490298 -5.40889427885585 T:C C T 10 0.530218543708742 0.598067696129954 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 115925104 C/T 1 2 6 8 0.939562912582516 3.18131126225245 -2.24174834966994 T:C C T 10 0.530218543708742 0.158929006468168 ENSG00000136867:ENST00000259392:exon_115925029_115926417:SLC31A2;ENSG00000136867:ENST00000374220:exon_115925029_115926417:SLC31A2;ENSG00000136867:ENST00000394724:exon_115925029_115926421:SLC31A2;ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115923286_115928435:FKBP15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 115931692 A/G 1 25 25 50 11.7445364072814 13.2554635927186 -1.5109271854371 A:G A G 10 0.530218543708742 0.673830331466563 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 116152891 A/G 1 7 6 13 3.28847019403881 3.18131126225245 0.107158931786354 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116152873_116153213:ALAD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 116153900 A/G 1 5 5 10 2.34890728145629 2.65109271854371 -0.30218543708742 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000448137:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482001:exon_116153807_116153903:ALAD HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 116346287 C/T 1 45 30 75 21.1401655331066 15.9065563112623 5.23360922184435 T:C C T 10 0.530218543708742 0.248183965157027 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 55 57 112 25.8379800960192 30.2224569913983 -4.3844768953791 A:G A G 10 0.530218543708742 0.449071990172564 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 34 21 55 15.9725695139028 11.1345894178836 4.83798009601919 T:C C T 10 0.530218543708742 0.224266661808679 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 16 28 44 7.51650330066013 14.8461192238448 -7.32961592318465 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0335498616113404 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 117139186 T/C 1 96 80 176 45.0990198039608 42.4174834966994 2.68153630726141 T:C T C 10 0.530218543708742 0.706240402867222 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117138746_117139340:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117138746_117139244:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117138746_117139915:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394574:exon_117138387_117139812:AKNA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 119461275 G/A 1 21 8 29 9.86541058211642 4.24174834966994 5.62366223244648 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0407076543164158 ENSG00000119401:ENST00000394497:exon_119459944_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000450136:exon_119459941_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000373983:exon_119459935_119463579:TRIM32 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 123201733 T/C 1 25 33 58 11.7445364072814 17.4972119423885 -5.75267553510704 T:C T C 10 0.530218543708742 0.148046028538233 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 123605126 T/C 1 12 9 21 5.6373774754951 4.77196689337868 0.865410582116419 T:C T C 10 0.530218543708742 0.828055654924615 ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123605015_123605200:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123605015_123605190:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000435107:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000476949:exon_123605015_123605189:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000471789:exon_123605015_123605160:PSMD5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 123671520 G/A 1 283 260 543 132.948152130426 137.856821364273 -4.90866923384689 A:G G A 10 0.530218543708742 0.698845843110678 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 123860689 C/T 1 8 9 17 3.75825165033006 4.77196689337868 -1.01371524304861 T:C C T 10 0.530218543708742 0.636531694867648 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123860664_123860850:CEP110 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 123917020 T/A 1 13 10 23 6.10715893178635 5.30218543708742 0.804973494698934 A:T T A 10 0.530218543708742 0.835821884898682 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123916999_123917230:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000431571:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123916999_123917230:CEP110 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 123929770 C/T 1 27 28 55 12.684099319864 14.8461192238448 -2.16201990398081 T:C C T 10 0.530218543708742 0.590657874048649 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123929767_123929955:CEP110 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 124065224 G/A 1 5 4 9 2.34890728145629 2.12087417483497 0.228033106621322 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000432226:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449773:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477863:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000456109:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000475428:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477104:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124065189_124065343:GSN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 124081137 C/T 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 T:C C T 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124080943_124081158:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124080943_124081158:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124080943_124081158:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124080943_124081158:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124080943_124081158:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124080943_124081158:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124080943_124081158:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124080943_124081158:GSN;ENSG00000148180:ENST00000456109:exon_124080943_124081158:GSN;ENSG00000148180:ENST00000483960:exon_124081012_124081158:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124080943_124081158:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373807:exon_124080943_124081158:GSN HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 28 37 65 13.1538807761552 19.6180861172235 -6.46420534106823 T:C C T 10 0.530218543708742 0.135311721365199 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 125652757 G/A 1 5 7 12 2.34890728145629 3.71152980596119 -1.3626225245049 A:G G A 10 0.530218543708742 0.565817448386735 ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125652591_125652829:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000478216:exon_125652449_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000471874:exon_125652450_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125652517_125652824:RC3H2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 125673051 T/G 1 8 4 12 3.75825165033006 2.12087417483497 1.6373774754951 T:G T G 10 0.530218543708742 0.398218675970565 ENSG00000186130:ENST00000373659:exon_125670335_125674360:ZBTB6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 127177161 A/G 1 66 41 107 31.005576115223 21.7389602920584 9.26661582316461 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0811006022741087 ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 21 15 36 9.86541058211642 7.95327815563113 1.91213242648529 A:G G A 10 0.530218543708742 0.617323175934535 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 130523902 G/A 1 22 13 35 10.3351920384077 6.89284106821365 3.44235097019403 A:G G A 10 0.530218543708742 0.309763403900544 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130523890_130523931:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000440630:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000464239:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000488685:exon_130523890_130523929:SH2D3C HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 130630233 G/T 1 22 9 31 10.3351920384077 4.77196689337868 5.563225145029 T:G G T 10 0.530218543708742 0.0486832008531794 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130628759_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630118_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630169_130630355:AK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 130705434 G/A 1 58 52 110 27.247324464893 27.5713642728546 -0.324039807961618 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130702858_130705516:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000465821:exon_130703160_130706963:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000373084:exon_130703160_130705516:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000300434:exon_130703162_130705516:FAM102A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 131027963 A/G 1 7 15 22 3.28847019403881 7.95327815563113 -4.66480796159232 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0546658878313038 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 131515547 G/T 1 15 14 29 7.04672184436887 7.42305961192239 -0.376337767553518 T:G G T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131515443_131515879:ZER1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 131517791 C/T 1 3 14 17 1.40934436887377 7.42305961192239 -6.01371524304861 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00563722381008593 ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131517687_131517938:ZER1;ENSG00000160445:ENST00000414921:exon_131517687_131517938:ZER1;ENSG00000160445:ENST00000427848:exon_131517687_131517938:ZER1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 131565554 T/C 1 6 12 18 2.81868873774755 6.3626225245049 -3.54393378675736 T:C T C 10 0.530218543708742 0.103457190750381 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131565529_131565739:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000466056:exon_131565529_131565727:TBC1D13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 131570178 T/C 1 8 6 14 3.75825165033006 3.18131126225245 0.576940388077612 T:C T C 10 0.530218543708742 0.795824909862849 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131570093_131572711:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131570093_131572703:TBC1D13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 131585069 A/G 1 18 20 38 8.45606621324264 10.6043708741748 -2.1483046609322 A:G A G 10 0.530218543708742 0.518508107539554 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 10 18 28 4.69781456291258 9.54393378675736 -4.84611922384478 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0870895955278204 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 16 19 35 7.51650330066013 10.0741523304661 -2.55764902980597 C:G G C 10 0.530218543708742 0.402194597510979 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 131670457 T/C 1 4 9 13 1.87912582516503 4.77196689337868 -2.89284106821365 T:C T C 10 0.530218543708742 0.162918845921506 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 131670919 T/C 1 15 10 25 7.04672184436887 5.30218543708742 1.74453640728145 T:C T C 10 0.530218543708742 0.551192924360965 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 131849036 C/T 1 4 7 11 1.87912582516503 3.71152980596119 -1.83240398079616 T:C C T 10 0.530218543708742 0.367650802678922 ENSG00000167130:ENST00000372546:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000406974:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000327812:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000412363:exon_131848988_131849077:DOLPP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 131860917 C/T 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 T:C C T 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000095321:ENST00000351352:exon_131860810_131860929:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000372536:exon_131860810_131860929:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000440434:exon_131860810_131860929:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000318080:exon_131860810_131860929:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000458362:exon_131860810_131860929:CRAT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 131862903 T/C 0 0 9 9 0 4.77196689337868 -4.77196689337868 C T C 10 0.530218543708742 0.00111445574837298 ENSG00000095321:ENST00000372536:exon_131862790_131862968:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000440434:exon_131862790_131862968:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000318080:exon_131862790_131862968:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000458362:exon_131862790_131862968:CRAT HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 132569553 C/T 1 13 5 18 6.10715893178635 2.65109271854371 3.45606621324264 T:C C T 10 0.530218543708742 0.15477553907908 ENSG00000136816:ENST00000259339:exon_132569467_132569642:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000437263:exon_132569467_132569642:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000488169:exon_132569467_132569642:TOR1B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 132638424 C/T 1 17 7 24 7.98628475695139 3.71152980596119 4.27475495099019 T:C C T 10 0.530218543708742 0.10134572559357 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000496927:exon_132638409_132638517:USP20 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 132720770 A/G 1 118 81 199 55.4342118423684 42.9477020404081 12.4865098019603 A:G A G 10 0.530218543708742 0.0880442593213035 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 133760029 C/G 1 30 20 50 14.0934436887377 10.6043708741748 3.4890728145629 C:G C G 10 0.530218543708742 0.395529499115235 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 134136248 G/A 1 63 63 126 29.5962317463493 33.4037682536507 -3.80753650730149 A:G G A 10 0.530218543708742 0.532477715592241 ENSG00000126882:ENST00000247295:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372269:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372271:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000464831:exon_134136176_134136737:FAM78A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 134346315 T/C 1 10 9 19 4.69781456291258 4.77196689337868 -0.0741523304660978 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134346175_134346370:BAT2L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 134350231 C/T 1 45 34 79 21.1401655331066 18.0274304860972 3.11273504700938 T:C C T 10 0.530218543708742 0.50095118973645 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000456307:exon_134349841_134350234:BAT2L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 134350323 C/G 1 34 36 70 15.9725695139028 19.0878675735147 -3.11529805961194 C:G C G 10 0.530218543708742 0.474365254486268 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 134350458 C/T 1 31 35 66 14.563225145029 18.557649029806 -3.99442388477697 T:C C T 10 0.530218543708742 0.327330787832225 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 134351065 G/T 1 23 30 53 10.8049734946989 15.9065563112623 -5.10158281656333 T:G G T 10 0.530218543708742 0.170603297427766 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 134351500 C/T 1 17 15 32 7.98628475695139 7.95327815563113 0.0330066013202561 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134351317_134351922:BAT2L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 134358108 A/G 1 25 20 45 11.7445364072814 10.6043708741748 1.14016553310661 A:G A G 10 0.530218543708742 0.767083104578006 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134358097_134358294:BAT2L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 134371165 C/T 1 84 53 137 39.4616423284657 28.1015828165633 11.3600595119023 T:C C T 10 0.530218543708742 0.059364002021608 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134371127_134375558:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000320547:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000465931:exon_134371127_134375584:BAT2L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 134387488 T/C 1 7 2 9 3.28847019403881 1.06043708741748 2.22803310662132 T:C T C 10 0.530218543708742 0.186865472805043 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134387428_134387514:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134387279_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 134401335 C/T 1 30 17 47 14.0934436887377 9.01371524304861 5.07972844568913 T:C C T 10 0.530218543708742 0.146284874540836 ENSG00000130717:ENST00000372215:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372208:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000491309:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372211:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372210:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000484876:exon_134401316_134401546:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000494584:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000459858:exon_134401332_134401364:UCK1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 134497321 C/T 1 17 34 51 7.98628475695139 18.0274304860972 -10.0411457291458 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00707015043243626 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000419442:exon_134497183_134497385:RAPGEF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 135554566 G/A 1 33 21 54 15.5027880576115 11.1345894178836 4.36819863972793 A:G G A 10 0.530218543708742 0.275690598471385 ENSG00000125484:ENST00000372146:exon_135553364_135555190:GTF3C4;ENSG00000125484:ENST00000483873:exon_135554265_135554697:GTF3C4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 135771793 G/A 1 13 9 22 6.10715893178635 4.77196689337868 1.33519203840768 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.671305989890035 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135766735_135772141:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135766736_135772141:TSC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 135772717 G/A 1 8 5 13 3.75825165033006 2.65109271854371 1.10715893178635 A:G G A 10 0.530218543708742 0.590152794800775 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135772571_135772732:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135772571_135772732:TSC1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 135985796 C/T 1 16 10 26 7.51650330066013 5.30218543708742 2.21431786357271 T:C C T 10 0.530218543708742 0.435912924593876 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135985683_135985876:RALGDS HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 136029045 G/A 1 2 9 11 0.939562912582516 4.77196689337868 -3.83240398079616 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0305374290985922 ENSG00000148288:ENST00000372040:exon_136028340_136029648:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000372043:exon_136028340_136029629:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000470431:exon_136028340_136030699:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000472281:exon_136028340_136030699:GBGT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 136199466 G/A 1 48 37 85 22.5495099019804 19.6180861172235 2.93142378475693 A:G G A 10 0.530218543708742 0.587250081481055 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 136199503 G/A 1 28 33 61 13.1538807761552 17.4972119423885 -4.34333116623326 A:G G A 10 0.530218543708742 0.30507523164127 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 136213521 T/C 1 2 7 9 0.939562912582516 3.71152980596119 -2.77196689337868 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0932648737406713 ENSG00000148297:ENST00000491289:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000486395:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000343730:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000344469:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000476080:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000422801:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000371999:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000446777:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000494177:exon_136213395_136213548:MED22;ENSG00000148297:ENST00000457204:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000482295:exon_136213262_136213555:MED22 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 28 37 65 13.1538807761552 19.6180861172235 -6.46420534106823 A:G A G 10 0.530218543708742 0.135311721365199 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 136320444 G/A 1 7 3 10 3.28847019403881 1.59065563112623 1.69781456291258 A:G G A 10 0.530218543708742 0.352695224731846 ENSG00000160323:ENST00000485925:exon_136320407_136320557:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371929:exon_136320407_136320725:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371916:exon_136320407_136320725:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000338351:exon_136320407_136320557:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000355699:exon_136320407_136320557:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000356589:exon_136320407_136320557:ADAMTS13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 136324239 C/A 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 A:C C A 10 0.530218543708742 0.487231208629639 ENSG00000160323:ENST00000485925:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371929:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371916:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000338351:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000355699:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000356589:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371910:exon_136324096_136324508:ADAMTS13 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 136338580 G/A 1 17 14 31 7.98628475695139 7.42305961192239 0.563225145028999 A:G G A 10 0.530218543708742 0.859518475209004 ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136338537_136339210:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136338537_136338722:SLC2A6 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 136643908 G/A 1 9 2 11 4.22803310662132 1.06043708741748 3.16759601920384 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0707395200860403 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136643884_136644011:VAV2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 137005023 C/T 1 9 14 23 4.22803310662132 7.42305961192239 -3.19502650530107 T:C C T 10 0.530218543708742 0.21251004606754 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 137711997 G/C 1 29 12 41 13.6236622324465 6.3626225245049 7.26103970794158 C:G G C 10 0.530218543708742 0.027618210577255 ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137711962_137712069:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137711962_137712069:COL5A1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 138908250 C/T 1 7 1 8 3.28847019403881 0.530218543708742 2.75825165033006 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0743148409803516 ENSG00000148411:ENST00000371753:exon_138908111_138908275:NACC2;ENSG00000148411:ENST00000277554:exon_138908111_138908275:NACC2;ENSG00000148411:ENST00000467669:exon_138908137_138908275:NACC2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139100805 T/C 1 27 19 46 12.684099319864 10.0741523304661 2.60994698939787 T:C T C 10 0.530218543708742 0.463889576367042 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139098179_139101121:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139098185_139101121:QSOX2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139110654 C/T 1 10 6 16 4.69781456291258 3.18131126225245 1.51650330066013 T:C C T 10 0.530218543708742 0.617951383515179 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139110525_139110654:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139110525_139110654:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000455222:exon_139110525_139110654:QSOX2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139265801 C/T 1 15 7 22 7.04672184436887 3.71152980596119 3.33519203840768 T:C C T 10 0.530218543708742 0.200272681658531 ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139265776_139265913:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139265776_139265913:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139265776_139265913:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139265776_139265913:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139265776_139265913:CARD9 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139270975 C/T 1 3 5 8 1.40934436887377 2.65109271854371 -1.24174834966994 T:C C T 10 0.530218543708742 0.487231208629639 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 24 14 38 11.2747549509902 7.42305961192239 3.85169533906781 T:C C T 10 0.530218543708742 0.255672673316409 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139273402 C/T 1 21 31 52 9.86541058211642 16.436774854971 -6.57136427285458 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0719103880915448 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139298580 C/T 1 11 19 30 5.16759601920384 10.0741523304661 -4.90655631126226 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0982774490138774 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139299637 C/T 1 21 22 43 9.86541058211642 11.6648079615923 -1.79939737947591 T:C C T 10 0.530218543708742 0.647676991808468 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139299543_139299800:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139299570_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139299570_139299654:SDCCAG3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139306467 C/T 1 74 74 148 34.7638277655531 39.2361722344469 -4.47234446889381 T:C C T 10 0.530218543708742 0.510157532221599 ENSG00000165688:ENST00000371720:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000446975:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139306449_139306651:PMPCA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139311471 C/T 1 78 67 145 36.6429535907181 35.5246424284857 1.11831116223241 T:C C T 10 0.530218543708742 0.868224188710028 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139324737 C/A 1 21 18 39 9.86541058211642 9.54393378675736 0.321476795359063 A:C C A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139324729_139324865:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139324729_139324865:INPP5E HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139324740 C/T 1 16 21 37 7.51650330066013 11.1345894178836 -3.61808611722345 T:C C T 10 0.530218543708742 0.252017528719174 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139324729_139324865:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139324729_139324865:INPP5E HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139326304 G/A 1 6 11 17 2.81868873774755 5.83240398079616 -3.01371524304861 A:G G A 10 0.530218543708742 0.153573028313809 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139326276_139326437:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139326276_139326437:INPP5E HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139328551 T/C 1 6 5 11 2.81868873774755 2.65109271854371 0.167596019203838 T:C T C 10 0.530218543708742 1 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139328489_139328586:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139328489_139328586:INPP5E HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139368953 G/A 1 21 8 29 9.86541058211642 4.24174834966994 5.62366223244648 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0407076543164158 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139369062 C/T 1 26 8 34 12.2143178635727 4.24174834966994 7.97256951390277 T:C C T 10 0.530218543708742 0.00583106984027068 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139371234 G/A 1 19 17 36 8.9258476695339 9.01371524304861 -0.0878675735147123 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139371342 G/A 1 28 15 43 13.1538807761552 7.95327815563113 5.20060262052409 A:G G A 10 0.530218543708742 0.127251684279560 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139371405 G/C 1 17 20 37 7.98628475695139 10.6043708741748 -2.61808611722345 C:G G C 10 0.530218543708742 0.413802900188653 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139391338 C/T 1 18 25 43 8.45606621324264 13.2554635927186 -4.79939737947591 T:C C T 10 0.530218543708742 0.169106472031763 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139391636 G/A 1 17 18 35 7.98628475695139 9.54393378675736 -1.55764902980597 A:G G A 10 0.530218543708742 0.615523468429842 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139397707 G/A 1 7 5 12 3.28847019403881 2.65109271854371 0.637377475495096 A:G G A 10 0.530218543708742 0.779313043354264 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139397634_139397782:NOTCH1;ENSG00000148400:ENST00000494783:exon_139397634_139397782:NOTCH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139407932 A/G 1 4 4 8 1.87912582516503 2.12087417483497 -0.241748349669936 A:G A G 10 0.530218543708742 1 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139407844_139407989:NOTCH1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139617662 T/C 1 13 24 37 6.10715893178635 12.7252450490098 -6.61808611722345 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0323447969280066 ENSG00000165716:ENST00000371692:exon_139617414_139618502:FAM69B;ENSG00000165716:ENST00000371691:exon_139617414_139618502:FAM69B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139617836 C/T 1 7 40 47 3.28847019403881 21.2087417483497 -17.9202715543109 T:C C T 10 0.530218543708742 7.89538946535271e-08 ENSG00000165716:ENST00000371692:exon_139617414_139618502:FAM69B;ENSG00000165716:ENST00000371691:exon_139617414_139618502:FAM69B HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139620637 G/A 1 16 5 21 7.51650330066013 2.65109271854371 4.86541058211642 A:G G A 10 0.530218543708742 0.0467900441463735 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139620695 C/T 1 13 4 17 6.10715893178635 2.12087417483497 3.98628475695139 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0859391418136884 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139621120 A/G 1 21 20 41 9.86541058211642 10.6043708741748 -0.738960292058422 A:G A G 10 0.530218543708742 0.876235151511188 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139621168 G/A 1 24 25 49 11.2747549509902 13.2554635927186 -1.98070864172836 A:G G A 10 0.530218543708742 0.571240381545247 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139726239 A/G 1 42 42 84 19.7308211642328 22.2691788357672 -2.53835767153433 A:G A G 10 0.530218543708742 0.586632159191578 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000425121:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000466096:exon_139726173_139726822:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139726173_139726313:C9orf86 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139837062 C/T 1 74 62 136 34.7638277655531 32.873549709942 1.89027805561109 T:C C T 10 0.530218543708742 0.796793831453423 ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139836999_139837147:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139836999_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139836498_139837147:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000487794:exon_139836999_139837120:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000433269:exon_139836999_139837178:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000491246:exon_139836999_139837147:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000480818:exon_139836999_139837395:FBXW5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139943112 A/G 1 4 5 9 1.87912582516503 2.65109271854371 -0.771966893378678 A:G A G 10 0.530218543708742 0.742825095475742 ENSG00000054179:ENST00000355097:exon_139942550_139943312:ENTPD2;ENSG00000054179:ENST00000460614:exon_139942559_139943312:ENTPD2;ENSG00000054179:ENST00000312665:exon_139943049_139943312:ENTPD2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 139973820 C/T 1 18 13 31 8.45606621324264 6.89284106821365 1.563225145029 T:C C T 10 0.530218543708742 0.595148843392745 ENSG00000197355:ENST00000409858:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000360271:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 140002989 T/C 1 55 38 93 25.8379800960192 20.1483046609322 5.68967543508699 T:C T C 10 0.530218543708742 0.254114207975488 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140002840_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001983_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000475449:exon_140002983_140003529:MAN1B1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 363 261 624 170.530668633727 138.387039907982 32.143628725745 A:T:G G A 10 0.530218543708742 0.0102338549406507 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 140006425 C/G 1 253 165 418 118.854708441688 87.4860597119424 31.3686487297458 A:C:G C G 10 0.530218543708742 0.00234192410988542 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006393_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140006360_140006481:DPP7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 140008750 G/C 1 71 44 115 33.3544833966793 23.3296159231846 10.0248674734947 T:C:G G C 10 0.530218543708742 0.0622365743114635 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008695_140008830:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 140167022 G/A 1 61 46 107 28.6566688337667 24.3900530106021 4.26661582316461 A:G G A 10 0.530218543708742 0.439164517729736 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166959_140167067:COBRA1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 140477516 G/A 1 38 24 62 17.8516953390678 12.7252450490098 5.126450290058 A:G G A 10 0.530218543708742 0.205079864596166 ENSG00000165724:ENST00000298585:exon_140477435_140477615:ZMYND19 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 140611436 T/C 1 49 45 94 23.0192913582716 23.8598344668934 -0.840543108621748 T:C T C 10 0.530218543708742 0.91780119705242 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 140638416 G/A 1 59 37 96 27.7171059211842 19.6180861172235 8.09901980396077 A:G G A 10 0.530218543708742 0.102513775228923 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 51 28 79 23.9588542708542 14.8461192238448 9.11273504700938 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0425298708367584 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 200860 T/C 1 6 11 17 2.81868873774755 5.83240398079616 -3.01371524304861 T:C T C 10 0.530218543708742 0.153573028313809 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000445062:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000429181:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000443019:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_200401_200981:PLCXD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 207362 C/T 1 11 11 22 5.16759601920384 5.83240398079616 -0.664807961592324 T:C C T 10 0.530218543708742 0.832858519551156 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_207315_207459:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_207315_207424:PLCXD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 21 6 27 9.86541058211642 3.18131126225245 6.68409931986397 T:C T C 10 0.530218543708742 0.0112471836139720 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 18 13 31 8.45606621324264 6.89284106821365 1.563225145029 A:G A G 10 0.530218543708742 0.595148843392745 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 299362 A/G 1 24 16 40 11.2747549509902 8.48349669933987 2.79125825165032 A:G A G 10 0.530218543708742 0.429974963920427 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 299591 A/G 1 21 16 37 9.86541058211642 8.48349669933987 1.38191388277655 A:G A G 10 0.530218543708742 0.742655841774882 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 322193 C/T 1 4 6 10 1.87912582516503 3.18131126225245 -1.30218543708742 T:C C T 10 0.530218543708742 0.53110315873658 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000496630:exon_322140_322251:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000381625:exon_322140_322325:PPP2R3B HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 1471138 G/T 1 9 12 21 4.22803310662132 6.3626225245049 -2.13458941788358 T:G G T 10 0.530218543708742 0.387625542901861 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 1537002 C/G 1 29 21 50 13.6236622324465 11.1345894178836 2.4890728145629 C:G C G 10 0.530218543708742 0.571370632667936 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 23 26 49 10.8049734946989 13.7856821364273 -2.98070864172836 T:C C T 10 0.530218543708742 0.395451834346756 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 1546792 G/A 1 60 57 117 28.1868873774755 30.2224569913983 -2.03556961392281 A:G G A 10 0.530218543708742 0.712087480695043 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 1546876 A/G 1 62 63 125 29.126450290058 33.4037682536507 -4.27731796359275 A:G A G 10 0.530218543708742 0.473883451176063 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 1720315 C/T 1 130 146 276 61.0715893178635 77.4119073814763 -16.3403180636128 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0534936242095579 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 2407207 G/A 1 39 35 74 18.3214767953591 18.557649029806 -0.236172234446908 A:G G A 10 0.530218543708742 1 ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 2408437 G/A 1 33 31 64 15.5027880576115 16.436774854971 -0.933986797359488 A:G G A 10 0.530218543708742 0.900474277117563 ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000461691:exon_2407946_2408813:ZBED1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 2632482 C/T 1 70 53 123 32.8847019403881 28.1015828165633 4.78311912382474 T:C C T 10 0.530218543708742 0.416769051689041 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 6995315 C/T 1 38 41 79 17.8516953390678 21.7389602920584 -3.88726495299062 T:C C T 10 0.530218543708742 0.430385773091741 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000412827:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_6995261_6995490:HDHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 6995417 C/T 1 17 15 32 7.98628475695139 7.95327815563113 0.0330066013202561 T:C C T 10 0.530218543708742 1 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000412827:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_6995261_6995490:HDHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 6995438 C/T 1 31 31 62 14.563225145029 16.436774854971 -1.873549709942 T:C C T 10 0.530218543708742 0.703099655403951 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000412827:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_6995261_6995490:HDHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 7023678 G/A 1 50 48 98 23.4890728145629 25.4504900980196 -1.96141728345671 A:G G A 10 0.530218543708742 0.761611035118788 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000498474:exon_7023661_7023879:HDHD1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 12809661 G/A 1 1 41 42 0.469781456291258 21.7389602920584 -21.2691788357672 A:G G A 10 0.530218543708742 8.0260390264427e-13 ENSG00000101911:ENST00000380663:exon_12809474_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000380668:exon_12809489_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000398491:exon_12809525_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000489404:exon_12809607_12809738:PRPS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 12904282 G/A 1 61 1 62 28.6566688337667 0.530218543708742 28.126450290058 A:G G A 10 0.530218543708742 7.19592471517562e-16 ENSG00000196664:ENST00000380659:exon_12903631_12908499:TLR7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 13681115 C/T 1 7 3 10 3.28847019403881 1.59065563112623 1.69781456291258 T:C C T 10 0.530218543708742 0.352695224731846 ENSG00000176896:ENST00000314720:exon_13680620_13682247:TCEANC;ENSG00000176896:ENST00000490617:exon_13680620_13682947:TCEANC;ENSG00000176896:ENST00000380600:exon_13680620_13683528:TCEANC;ENSG00000176896:ENST00000467590:exon_13680863_13681679:TCEANC HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 15415583 C/T 1 32 1 33 15.0330066013203 0.530218543708742 14.5027880576115 T:C C T 10 0.530218543708742 3.49865597388167e-08 ENSG00000087842:ENST00000380420:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000380421:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000492432:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000484433:exon_15415571_15415653:PIR HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 15838366 C/T 1 4 7 11 1.87912582516503 3.71152980596119 -1.83240398079616 T:C C T 10 0.530218543708742 0.367650802678922 ENSG00000169249:ENST00000307771:exon_15838330_15838439:ZRSR2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 21861434 A/G 0 10 0 10 4.69781456291258 0 4.69781456291258 A A 10 0.530218543708742 0.00227965016978733 ENSG00000012174:ENST00000379484:exon_21861288_21861436:MBTPS2;ENSG00000012174:ENST00000465888:exon_21861288_21861436:MBTPS2;ENSG00000012174:ENST00000365779:exon_21861288_21861436:MBTPS2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 23858452 G/A 0 0 35 35 0 18.557649029806 -18.557649029806 A G A 10 0.530218543708742 3.28363929937915e-12 ENSG00000184831:ENST00000379226:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000476598:exon_23858430_23858522:APOO;ENSG00000184831:ENST00000439528:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000379220:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000490078:exon_23858430_23858494:APOO HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 39932907 T/C 0 0 24 24 0 12.7252450490098 -12.7252450490098 C T C 10 0.530218543708742 1.33506028372381e-08 ENSG00000183337:ENST00000417733:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000378455:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000397354:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000378444:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000342274:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000406200:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000490976:exon_39931159_39934433:BCOR HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 40460040 T/C 1 42 1 43 19.7308211642328 0.530218543708742 19.2006026205241 T:C T C 10 0.530218543708742 6.4773443931496e-11 ENSG00000182220:ENST00000378438:exon_40460014_40460133:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000486558:exon_40460014_40460133:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000447485:exon_40460014_40460128:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000423649:exon_40460014_40460133:ATP6AP2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 46472826 G/A 0 0 15 15 0 7.95327815563113 -7.95327815563113 A G A 10 0.530218543708742 1.1979482233125e-05 ENSG00000065923:ENST00000328306:exon_46472724_46472829:SLC9A7;ENSG00000065923:ENST00000464933:exon_46472724_46472829:SLC9A7;ENSG00000065923:ENST00000491894:exon_46472724_46472829:SLC9A7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 46618321 C/G 0 9 0 9 4.22803310662132 0 4.22803310662132 C C 10 0.530218543708742 0.00442648537498891 ENSG00000065923:ENST00000328306:exon_46618140_46618490:SLC9A7 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 47444985 T/C 1 3 178 181 1.40934436887377 94.3789007801561 -92.9695564112823 T:C T C 10 0.530218543708742 5.82032044156989e-54 ENSG00000102265:ENST00000218388:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377018:exon_47444335_47445482:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000456754:exon_47444604_47445422:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377017:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377013:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000445623:exon_47444741_47445066:TIMP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 47445940 C/T 1 291 5 296 136.706403780756 2.65109271854371 134.055311062212 T:C C T 10 0.530218543708742 2.94193061762971e-72 ENSG00000102265:ENST00000218388:exon_47445920_47446188:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377017:exon_47445920_47446188:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377013:exon_47445920_47446187:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000445623:exon_47445920_47446188:TIMP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 48317386 A/G 1 2 137 139 0.939562912582516 72.6399404880977 -71.7003775755151 A:G A G 10 0.530218543708742 3.06255689313442e-42 ENSG00000017483:ENST00000376876:exon_48316920_48317420:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000376875:exon_48316922_48317420:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000317669:exon_48316928_48317420:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000462359:exon_48317076_48317420:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000453124:exon_48317346_48317420:SLC38A5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 48382174 G/T 1 152 2 154 71.4067813562712 1.06043708741748 70.3463442688537 T:G G T 10 0.530218543708742 6.01709920305291e-39 ENSG00000147155:ENST00000495186:exon_48382087_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000498425:exon_48382142_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000446158:exon_48382087_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000414061:exon_48382087_48382460:EBP HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 48418126 A/G 0 33 0 33 15.5027880576115 0 15.5027880576115 A A 10 0.530218543708742 1.37629813422861e-09 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000481090:exon_48418002_48418274:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 48418659 G/A 1 43 1 44 20.2006026205241 0.530218543708742 19.6703840768154 A:G G A 10 0.530218543708742 3.46497739515862e-11 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 48435402 T/C 0 11 0 11 5.16759601920384 0 5.16759601920384 T T 10 0.530218543708742 0.00117707091712435 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 48435405 C/T 0 11 0 11 5.16759601920384 0 5.16759601920384 C C 10 0.530218543708742 0.00117707091712435 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 48547032 T/A 0 0 22 22 0 11.6648079615923 -11.6648079615923 A T A 10 0.530218543708742 6.04935591015813e-08 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 48751471 A/G 1 189 4 193 88.7886952390478 2.12087417483497 86.6678210642128 A:G A G 10 0.530218543708742 2.59588662105101e-46 ENSG00000126768:ENST00000376582:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000466995:exon_48751183_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000396779:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000495490:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000472645:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000465150:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000490755:exon_48751380_48751508:TIMM17B HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 48847497 T/C 0 0 43 43 0 22.7993973794759 -22.7993973794759 C T C 10 0.530218543708742 7.78972997714003e-15 ENSG00000068400:ENST00000376425:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376444:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376441:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000473581:exon_48847338_48847798:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376423:exon_48847338_48847514:GRIPAP1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 48888074 T/C 1 1 34 35 0.469781456291258 18.0274304860972 -17.557649029806 T:C T C 10 0.530218543708742 1.32996348990876e-10 ENSG00000068323:ENST00000315869:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000493583:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000478476:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000336239:exon_48887729_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000495940:exon_48888024_48888110:TFE3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 48980062 G/C 0 16 0 16 7.51650330066013 0 7.51650330066013 G G 10 0.530218543708742 4.46469601621613e-05 ENSG00000068394:ENST00000156109:exon_48979897_48980151:GPKOW;ENSG00000068394:ENST00000327905:exon_48980037_48980072:GPKOW HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 49032208 G/A 0 74 0 74 34.7638277655531 0 34.7638277655531 G G 10 0.530218543708742 5.92194678859677e-21 ENSG00000012211:ENST00000376317:exon_49031151_49032614:PRICKLE3;ENSG00000012211:ENST00000453382:exon_49031970_49032614:PRICKLE3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 49035732 C/T 0 0 20 20 0 10.6043708741748 -10.6043708741748 T C T 10 0.530218543708742 2.74105277296494e-07 ENSG00000012211:ENST00000376317:exon_49035600_49035737:PRICKLE3;ENSG00000012211:ENST00000453382:exon_49035600_49035737:PRICKLE3;ENSG00000012211:ENST00000432913:exon_49035600_49035737:PRICKLE3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 54836361 A/G 1 2 223 225 0.939562912582516 118.238735247049 -117.299172334467 A:G A G 10 0.530218543708742 4.85875369357859e-70 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 54836505 A/G 0 0 123 123 0 65.2168808761753 -65.2168808761753 G A G 10 0.530218543708742 4.39735969634447e-41 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 54837340 C/T 0 0 109 109 0 57.7938212642529 -57.7938212642529 T C T 10 0.530218543708742 1.72444685152830e-36 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54837254_54837563:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54837254_54837562:MAGED2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 54838077 C/T 1 1 71 72 0.469781456291258 37.6455166033207 -37.1757351470294 T:C C T 10 0.530218543708742 1.95751850647348e-22 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54838007_54838077:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000487482:exon_54837965_54838086:MAGED2 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 69550098 T/C 0 11 0 11 5.16759601920384 0 5.16759601920384 T T 10 0.530218543708742 0.00117707091712435 ENSG00000090889:ENST00000374388:exon_69550007_69550182:KIF4A;ENSG00000090889:ENST00000374403:exon_69550007_69550182:KIF4A HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 71493691 C/T 1 1566 1741 3307 735.67776055211 923.11048459692 -187.43272404481 A:T:C C T 10 0.530218543708742 6.96011415198346e-11 ENSG00000198034:ENST00000316084:exon_71493651_71493822:RPS4X;ENSG00000198034:ENST00000486733:exon_71493651_71495000:RPS4X HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 71549512 G/C 0 48 0 48 22.5495099019804 0 22.5495099019804 G G 10 0.530218543708742 6.92410959623952e-14 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71549366_71549559:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71549367_71549926:HDAC8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 71791912 C/T 0 0 19 19 0 10.0741523304661 -10.0741523304661 T C T 10 0.530218543708742 5.8347402526368e-07 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373568:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000436675:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000415409:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000440442:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000412342:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373571:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000439122:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373560:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373559:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373561:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000478743:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000421523:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373556:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373554:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000340176:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000444609:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000486704:exon_71791796_71791959:HDAC8 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 73045809 T/C 0 0 97 97 0 51.431198739748 -51.431198739748 C T C 10 0.530218543708742 1.49244857441598e-32 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 78216024 A/C 1 27 148 175 12.684099319864 78.4723444688938 -65.7882451490298 A:C A C 10 0.530218543708742 5.98410600866486e-25 ENSG00000078589:ENST00000171757:exon_78216005_78217451:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000475374:exon_78216005_78216577:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000461541:exon_78216005_78216368:P2RY10 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 107396958 A/G 0 47 0 47 22.0797284456891 0 22.0797284456891 A A 10 0.530218543708742 1.32547663427467e-13 ENSG00000101844:ENST00000372232:exon_107396872_107397901:ATG4A;ENSG00000101844:ENST00000345734:exon_107396872_107397901:ATG4A;ENSG00000101844:ENST00000372254:exon_107396872_107397893:ATG4A;ENSG00000101844:ENST00000372246:exon_107396872_107397901:ATG4A;ENSG00000101844:ENST00000343524:exon_107396872_107397901:ATG4A;ENSG00000101844:ENST00000489247:exon_107396872_107397098:ATG4A HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 117521338 G/A 0 11 0 11 5.16759601920384 0 5.16759601920384 G G 10 0.530218543708742 0.00117707091712435 ENSG00000131725:ENST00000435384:exon_117521303_117521377:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000254029:exon_117521303_117521377:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371822:exon_117521303_117521377:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371825:exon_117521303_117521377:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000534809:exon_117521303_117521377:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000493448:exon_117521303_117521377:WDR44 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 117528056 G/A 0 8 0 8 3.75825165033006 0 3.75825165033006 G G 10 0.530218543708742 0.0086188222890866 ENSG00000131725:ENST00000435384:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000254029:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371822:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371825:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000534809:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000446173:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371848:exon_117528018_117528148:WDR44 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 117528142 C/T 0 8 0 8 3.75825165033006 0 3.75825165033006 C C 10 0.530218543708742 0.0086188222890866 ENSG00000131725:ENST00000435384:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000254029:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371822:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371825:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000534809:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000446173:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371848:exon_117528018_117528148:WDR44 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 117819773 A/C 1 35 2 37 16.442350970194 1.06043708741748 15.3819138827765 A:C A C 10 0.530218543708742 4.42537785931882e-08 ENSG00000147251:ENST00000276204:exon_117819651_117820126:DOCK11;ENSG00000147251:ENST00000276202:exon_117819651_117820110:DOCK11 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 118587003 C/T 1 4 60 64 1.87912582516503 31.8131126225245 -29.9339867973595 T:C C T 10 0.530218543708742 1.23069138446717e-15 ENSG00000077713:ENST00000217909:exon_118586828_118588441:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000488158:exon_118586918_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000326714:exon_118586828_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000336249:exon_118586828_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000493093:exon_118586828_118587145:SLC25A43 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 118604436 T/C 1 21 1240 1261 9.86541058211642 657.47099419884 -647.605583616724 T:C T C 10 0.530218543708742 0 ENSG00000005022:ENST00000317881:exon_118604336_118604476:SLC25A5;ENSG00000005022:ENST00000460013:exon_118604336_118604476:SLC25A5;ENSG00000005022:ENST00000463551:exon_118604225_118604476:SLC25A5 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 119760629 A/T 1 1 84 85 0.469781456291258 44.5383576715343 -44.0685762152431 A:T A T 10 0.530218543708742 1.25207525124584e-26 ENSG00000171155:ENST00000304661:exon_119759648_119761026:C1GALT1C1;ENSG00000171155:ENST00000371313:exon_119759786_119761026:C1GALT1C1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 129283520 A/G 1 1 49 50 0.469781456291258 25.9807086417284 -25.5109271854371 A:G A G 10 0.530218543708742 2.25918072887514e-15 ENSG00000156709:ENST00000416073:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000527892:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000319908:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000287295:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000529877:exon_129283444_129283543:AIFM1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 132437337 G/A 0 21 0 21 9.86541058211642 0 9.86541058211642 G G 10 0.530218543708742 1.76390287787440e-06 ENSG00000076716:ENST00000370828:exon_132437194_132437369:GPC4 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 134421168 C/T 1 1 8 9 0.469781456291258 4.24174834966994 -3.77196689337868 T:C C T 10 0.530218543708742 0.0157469533588810 ENSG00000186376:ENST00000370766:exon_134419720_134421778:ZNF75D;ENSG00000186376:ENST00000439821:exon_134419720_134421778:ZNF75D;ENSG00000186376:ENST00000370764:exon_134419724_134421778:ZNF75D;ENSG00000186376:ENST00000469456:exon_134420812_134421778:ZNF75D HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 134711265 A/T 0 12 0 12 5.6373774754951 0 5.6373774754951 A A 10 0.530218543708742 0.000609240060901668 ENSG00000165359:ENST00000370752:exon_134711118_134711352:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000356856:exon_134711118_134711352:DDX26B HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 134713855 G/A 1 1 52 53 0.469781456291258 27.5713642728546 -27.1015828165633 A:G G A 10 0.530218543708742 2.48036851841246e-16 ENSG00000165359:ENST00000370752:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000481908:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000356856:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000493637:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000494957:exon_134713810_134714087:DDX26B HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 135310785 T/C 0 0 49 49 0 25.9807086417284 -25.9807086417284 C T C 10 0.530218543708742 8.37331872514682e-17 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000495432:exon_135310782_135311154:MAP7D3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 135313034 T/G 1 1 32 33 0.469781456291258 16.9669933986797 -16.4972119423885 T:G T G 10 0.530218543708742 5.69040586686455e-10 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000477124:exon_135312998_135313314:MAP7D3 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 135593629 C/T 1 210 3 213 98.6541058211642 1.59065563112623 97.063450190038 A:T:C C T 10 0.530218543708742 4.23342505456376e-53 ENSG00000102241:ENST00000218364:exon_135592967_135594505:HTATSF1;ENSG00000102241:ENST00000415377:exon_135592967_135593831:HTATSF1 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 150572136 G/C 0 0 37 37 0 19.6180861172235 -19.6180861172235 C G C 10 0.530218543708742 7.24681516475891e-13 ENSG00000160131:ENST00000477649:exon_150572103_150572212:VMA21;ENSG00000160131:ENST00000370361:exon_150572103_150572212:VMA21;ENSG00000160131:ENST00000456920:exon_150572103_150572212:VMA21;ENSG00000160131:ENST00000330374:exon_150572103_150572212:VMA21 HGDP00858_parsed_pileup.txt . X 153296046 G/A 1 61 1 62 28.6566688337667 0.530218543708742 28.126450290058 A:G G A 10 0.530218543708742 7.19592471517562e-16 ENSG00000169057:ENST00000303391:exon_153287024_153296901:MECP2;ENSG00000169057:ENST00000453960:exon_153295685_153296901:MECP2